JP2024518331A - 生体試料のハイスループット核酸検査 - Google Patents

生体試料のハイスループット核酸検査 Download PDF

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Abstract

本明細書で開示される主題は、生体試料、例えば、ドナーからの血液、血清、または血漿試料の迅速、高感度、及びハイスループット核酸検査のための方法、ならびにそのようなハイスループット核酸検査を行うことができるシステムに関する。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０２２年１月２５日出願の米国仮特許出願第６３／３０２，９５７号、２０２２年１月２５日出願の米国仮特許出願第６３／３０２，９５９号、及び２０２２年１月２５日出願の米国仮特許出願第６３／３０２，９８２号、及び２０２２年１月２５日出願の米国仮特許出願第６３／３０２，９３９号、２０２１年４月２９日出願の米国仮特許出願第６３／１８１，７９９号、及び２０２１年４月２９日出願の米国仮特許出願第６３／１８１，８２２号、及び２０２１年４月２９日出願の米国仮特許出願第６３／１８１，８７４号、及び２０２１年４月２９日出願の米国仮特許出願第６３／１８１，８８０号に対する優先権を主張し、それらのそれぞれの内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。
開示対象の分野
本明細書で開示される主題は、生体試料、例えば、ドナー及び／または患者からの血液、血清、または血漿試料の迅速、高感度、及びハイスループット核酸検査のための方法、ならびにそのようなハイスループット核酸検査を実行することができるシステムに関する。
関連技術の説明
献血された血液及び血漿のスクリーニングは、救命用全血、血漿、血小板、赤血球、及び全血または血漿から製造された血液製剤の供給を保護する上で重要な役割を果たす。当然のことながら、献血された血液及び血漿のスクリーニングは、多くの場合、血液及び血漿に病原体及び感染因子が含まれていないことを確認するために厳しく規制されている。政府機関及びその他の認証機関は、それぞれの管轄区域の全血及び血漿スクリーニングのプロセスに関する詳細な指針を提供している。例えば、米国食品医薬品局は、適切な献血された血液のスクリーニングプロセスに関する米国における指針を提供している。世界保健機関（ＷＨＯ）または国の特定保健機関などの他の機関も、献血スクリーニングに関する指針を提供している。さまざまな管轄区域において、献血された血液のスクリーニングに共通のアプローチが存在するが、普遍的な要件は存在しないため、スクリーニングの指針は管轄区域ごとに異なる。
献血された血液供給物中の病原体及び感染因子の検出は、現在、多くの場合、血清検査及び核酸検査（「ＮＡＴ」）を伴う。血清検査は、病原体または感染因子からの抗原、及び／または病原体または感染因子に対してドナーが産生した抗体の存在を検出するためのイムノアッセイによる検査を指す。対照的に、ＮＡＴは、病原体または感染因子に関連する遺伝物質（例えば、ＤＮＡ及び／またはＲＮＡ）の検出を指す。輸血のために献血された血液をスクリーニングするための例示的なワークフローでは、採取場所でドナーから血液バッグ及び複数の試料採取チューブに血液を採取する。ドナーはまた、献血された血液に関する情報を求める調査に回答する。血液バッグは、さらなる処理及び保存のために採血施設に搬送する。採取チューブを血液スクリーニング検査室に搬送して、病原体または感染症の検査、ならびに血液型分類及び判定の検査に試料を供する。試料は、例えば、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）特異的抗原、例えば、Ｂ型肝炎表面抗原（ＨＢｓＡｇ）、ヒトＴ細胞リンパ向性ウイルス（ＨＴＬＶ）、シャーガス、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、梅毒、抗ＨＢｃ及び抗ＨＣＶ抗体などの抗ウイルス抗体のためのイムノアッセイ検査に供してもよい。試料はまた、例えば、ＨＩＶ、ＨＣＶ、ＨＢＶ、バベシア、ジカ及び西ナイルウイルスのためにＮＡＴに供してもよい。一般に、インフォマティクスシステムは、各試料の各検査の検査結果を追跡する。分析物の検査結果が陽性の場合、献血された血液を隔離し、ドナーにスクリーニング結果を通知する。特定の試料についてすべての検査が陰性である場合、献血された血液を臨床使用のために出荷する。
同様に、献血された血漿をスクリーニングするための例示的なワークフローにおいて、血漿は、血漿交換などを通じてドナーから採取する。このプロセス中に、全血を取り出し、血漿を採取し、残りの血液成分をドナーに返す。血漿スクリーニングには、上記のイムノアッセイ及びＮＡＴを含めてもよく、さらにパルボウイルスＢ１９及びＡ型肝炎ウイルス（ＨＡＶ）のＮＡＴを含めてもよい。上記の検査は一般的にスクリーニングに使用されるが、種々の管轄区域で、または新しい大流行及び感染が発生する場合、新しい分析物または目的の対象に対するさまざまな検査を使用する場合がある。
多くの管轄区域では、血清学的アッセイでの検出限界を下回る場合がある低レベルの病原体の検出における感度がより高いため、ＮＡＴが必要である。管轄区域は、多くの場合、重複検査戦略に依存しており、したがって、低コストでハイスループットの血清学アッセイによって献血された血液をスクリーニングして、ドナーが輸血伝染病原体または感染因子に感染したことがある（または現在感染している）かどうかを確認し、次にＮＡＴについての時間のかかるより直接的なプロセスによって現在感染しているかどうかを確認する。
しかし、現在のＮＡＴベースのスクリーニングは、血清検査よりも数時間長いことがある検査時間を伴う。比較的高額な費用及び長いターンアラウンドタイムのために、献血された血液及び血漿のＮＡＴベースのスクリーニングによって、全血及び血漿のスクリーニングにおいて重大なボトルネック及び費用が生じる。全血または血漿の献血時間と、献血された全血または血漿の出荷までの時間との間の時間差は、国家的／世界的な健康上の緊急事態の際に特に重要になる。加えて、全血の出荷までの時間が長いと、全血、ならびに全血から分画され得る血小板及び赤血球などのその一部の貯蔵寿命が短縮される。ワークフロー戦略の最適化及び実行によって、ＮＡＴベースのスクリーニングに対する多大な時間投資の影響を鈍らようとする試みが行われてきた。これらの技法には、現在のＮＡＴベースのスクリーニングが複雑なケイデンスによって遅くなるにもかかわらず、効率を確実に得ることができるようにするための、プーリング及び要員のスケジューリングが含まれる。しかし、これらのワークフロー戦略によってそれぞれ独自の問題が生じる。ＮＡＴベースのスクリーニングの要員スケジューリングは、費用がかかる可能性がある。特にプーリングに関しては、より高いスループットを促進するために、複雑な試料プーリング戦略が開発されている。さらに、従来のプーリングでは、プールするための追加の時間及び装置が必要であり、プール試料に病原体または感染因子が検出された場合、プール試料の分解に関連する時間及び費用が追加される。また、プールの調製中、各プール内の個々の試料を記録する場合、及びその後、プール試料を再スクリーニングして、検査された病原体または感染因子に対して陽性である個々の試料を同定する場合に、低品質の手順によってもたらされるエラーが発生するリスクも高くなる。これらのプーリングの欠点は、大規模なプーリングが業界標準となっており、大規模なプールの分解及び再スクリーニングが必要な場合がある血漿センターなど、ある特定の状況ではさらに悪化する。
さらに、血清学的スクリーニングは比較的低コストで結果が出るまでの時間が短いにもかかわらず、並行スクリーニング制度を実行することに関連する人件費及びインフラストラクチャの費用が負担となり、特に資源が少ない地域ではさらなる物流上の課題が生じる。現在の並行スクリーニング制度は費用及び時間がかかるため、資源集中型のさまざまな対応策が導入されている。多くの場合、ＮＡＴベースのスクリーニングは規模の経済を利用するために集中化される。しかし、このような対応策には、欠点がないというわけではなく、それには、採血、処理、及び保存施設から離れた遠方の中央スクリーニング検査機関に試料を搬送するのにかかる費用及び時間が含まれ、したがって出荷プロセスに時間がさらにかかる。
したがって、全血及び血漿スクリーニングに現在利用可能なＮＡＴよりも所要時間が短いＮＡＴなど、より高いスループットで実行することができるＮＡＴが必要とされている。また、血清学とＮＡＴの両方を必要とする現在のプロセスを置き換えることができる、全血及び血漿のスクリーニングアッセイも必要とされている。本発明は、これら及び他の必要性を満たす。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法を提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示すものであり、臨床使用のためのドナー血液の出荷は、核酸分析を実行するための１つ以上の試料の最初の吸引から約１５～約６０分、例えば、約２０～約６０分で起こる、方法を提供する。
本開示はまた、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液の出荷を示すものであり、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷に関してドナー血液の複数の試料をスクリーニングすることを含み、核酸分析に基づく決定を、核酸分析を実行するための第１の試料の最初の吸引から約２０分～約３．５時間以内に実行する、方法を提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、核酸分析は、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、方法をさらに提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各測定は、核酸分析を実行するための１つ以上の試料の最初の吸引から約２０～約４５分で完了する、方法を提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各測定は、結果が得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、方法を提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、方法を提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、方法を提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、プール試料中に所定のレベルを超える複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、プール試料に含まれる個々のドナー血液またはそのサブプールの試料をスクリーニングすることであって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示す、スクリーニングすることをさらに含む、方法を提供する。
本開示は、１つ以上の試料をスクリーニングして、１つ以上の試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製ステップ及び増幅ステップを含む、試料に対して核酸分析を実行することと；核酸分析の結果を決定することと；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷は、核酸分析を実行するための１つ以上の試料の最初の吸引から約１５～約６０分、例えば、約２０～約６０分で起こる、方法を提供する。
本開示はまた、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製ステップ及び増幅ステップを含む、試料に対して核酸分析を実行することと；核酸分析の結果を決定することと；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、核酸分析に基づく決定を、核酸分析を実行するための第１の試料の最初の吸引から約１５分～約３．５時間以内、例えば、約２０分～約３．５時間以内に実行する、方法を提供する。
本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製ステップ及び増幅ステップを含む、試料に対して核酸分析を実行することと；核酸分析の結果を決定することと；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、核酸分析は、持続時間が約１分～約２０分、例えば８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、方法を提供する。
本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製ステップ及び増幅ステップを含む、試料に対して核酸分析を実行することと；核酸分析の結果を決定することと；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約１５～約４５分、例えば約２０～約４５分で完了する、方法をさらに提供する。
本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製ステップ及び増幅ステップを含む、試料に対して核酸分析を実行することと；核酸分析の結果を決定することと；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各測定は、結果が得られるまでの時間が約１５～約４５分、例えば約２０～約４５分である、方法を提供する。
本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製ステップ及び増幅ステップを含む、試料に対して核酸分析を実行することと；試料の核酸分析それぞれの結果を決定することと；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、例えば、本方法を実行するために使用される自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、方法を提供する。
本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製ステップ及び増幅ステップを含む、試料に対して核酸分析を実行することと；試料の核酸分析それぞれの結果を決定することと；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、例えば、本方法を実行するために使用される自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、方法を提供する。
ある特定の実施形態では、核酸分析は核酸増幅反応を含む。ある特定の実施形態では、核酸増幅反応は等温反応である。ある特定の実施形態では、核酸分析は、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は、試料を試料溶解緩衝液及びプロテアーゼと同時に接触させることを含む。ある特定の実施形態では、等温反応はリコンビナーゼポリメラーゼ増幅である。ある特定の実施形態では、等温反応はニッキング酵素増幅反応である。ある特定の実施形態では、核酸分析は増幅プロセスを含み、増幅プロセスは核酸増幅反応を含み得る。ある特定の実施形態では、増幅プロセスの核酸増幅反応は等温反応を含む。ある特定の実施形態では、増幅プロセスの核酸増幅反応は、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅を含む。ある特定の実施形態では、増幅プロセスの核酸増幅反応は、ニッキング酵素増幅反応を含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は、検出プロセスを含む。ある特定の実施形態では、検出プロセスは、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在または非存在の光学検出を含むことができる。ある特定の実施形態では、検出プロセスは、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在または非存在のデジタル検出を含むことができる。ある特定の実施形態では、核酸分析は、増幅及び検出プロセスを含む。ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスは、核酸増幅反応、及び複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在または非存在の光学検出を含むことができる。ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスは、核酸増幅反応、及び複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在または非存在のデジタル検出を含むことができる。ある特定の実施形態では、核酸分析は、試料調製プロセスを含む。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、試料と試料溶解緩衝液との、任意選択でプロテアーゼ、例えばプロテイナーゼＫとの同時接触を含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、溶解プロセスを含み、溶解プロセスは、試料と試料溶解緩衝液との、任意選択でプロテアーゼとの同時接触を含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、本明細書でさらに記載されるように、溶解プロセス、前処理溶解プロセス、及び／またはオンボードプーリングプロセスを含む。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、クラミジア、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、インフルエンザ、バベシア、マラリア、ウスツウイルス及びＨＥＶ、からなる群から選択される。追加的または代替的に、ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、１つ以上の新興病原体、ウイルス、及び／または因子を含んでもよい。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１及びＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－２及びＨＣＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、チクングニアウイルス及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析はバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む。
ある特定の実施形態では、核酸分析は、試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は、試料を複数の微粒子と接触させること、及び磁力を介して表面上で微粒子を平行移動させることを含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は、ドナー血液の試料からの核酸を精製すること；精製された核酸を複数の画分に分割すること；及び少なくとも１つの画分をさらなるスクリーニングのために保留することを含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は試料調製プロセスを含み、試料調製プロセスは、試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含むことができる。限定ではなく例として、試料調製プロセスは、溶解プロセスを含むことができ、溶解プロセスは、試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、洗浄プロセスを含むことができる。例えば、限定するものではないが、洗浄プロセスは、磁力による表面上の微粒子の平行移動を含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、試料調製領域で実行することができる。ある特定の実施形態では、試料調製領域は、試料搬送機、例えば試料調製カルーセル、ならびに洗浄及び溶出システムを含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製領域は、粒子移送機構を含むことができ、粒子移送機構は、ＣｕＴｉコーティング微粒子を試料搬送機、例えば試料調製カルーセルから洗浄及び溶出システムに移送することができる。例えば、粒子移送機構は、例えば磁気チップを介して、ＣｕＴｉコーティング微粒子を移送する磁力であり得る。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子及び所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるクラミジア；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１０～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるインフルエンザ；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルは、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析はバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、ヒトドナー血液である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、全血である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、溶解全血である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、血清である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、血漿である。
ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、プールされている。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９６人のドナーからの血液を含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液の出荷は輸血のためのものである。ある特定の実施形態では、ドナー血液の出荷は、医薬品で使用するためのものである。ある特定の実施形態では、ドナー血液の出荷は、治療処置に使用するためのものである。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、献血として使用するためのものである。ある特定の実施形態では、臨床使用は輸血である。ある特定の実施形態では、臨床使用は、医薬品における使用である。ある特定の実施形態では、臨床使用は、治療処置における使用である。ある特定の実施形態では、臨床使用は、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングするための自動システムを提供する。ある特定の実施形態では、自動システムは、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであってプロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷は、核酸分析を実行するための１つ以上の試料の最初の吸引から約１５～約６０分、例えば、約２０～約６０分で起こる。ある特定の実施形態では、核酸増幅領域及び核酸検出領域は、単一の領域、例えば増幅及び検出システムであり得る。
本開示はまた、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し；システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷に関してドナー血液の複数の試料をスクリーニングするように構成されており、核酸分析に基づく決定を、核酸分析を実行するための第１の試料の最初の吸引から約１５分～約３．５時間以内、例えば、約２０分～約３．５時間以内に実行する、自動システムを提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、核酸分析は、持続時間が約１分～約２０分、例えば持続時間が約８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、自動システムをさらに提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各測定は、核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約３０～約４５分で完了する、自動システムを提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各測定は、結果が得られるまでの時間が約３０分～約４５分である、自動システムを提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析の結果として複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、自動システムを提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析の結果として複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、自動システムを提供する。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液の１つ以上の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示し；システムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷に関してドナー血液の複数の試料をスクリーニングするように構成されており、核酸分析を、複数の試料のバッチ処理の非存在下で実行する、自動システムをさらに提供する。
ある特定の実施形態では、核酸分析は、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む。ある特定の実施形態では、システムは、例えば、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を定量的に検出するために、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を複数回、光学的に検出するように構成される。ある特定の実施形態では、核酸分析は核酸増幅反応を含む。ある特定の実施形態では、核酸増幅反応は等温反応である。ある特定の実施形態では、等温反応はリコンビナーゼポリメラーゼ増幅である。ある特定の実施形態では、核酸分析は、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む。
ある特定の実施形態では、システムは、例えば、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を定量的に検出するために、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を複数回、デジタル的に検出するように構成される。ある特定の実施形態では、核酸分析は、試料を試料溶解緩衝液、及び任意選択でプロテアーゼと同時に接触させることを含む。ある特定の実施形態では、等温反応はリコンビナーゼポリメラーゼ増幅である。ある特定の実施形態では、等温反応はニッキング酵素増幅反応である。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、クラミジア、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、インフルエンザ、バベシア、マラリア、ウスツウイルス及びＨＥＶ、からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス及びＷＮＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、チクングニアウイルス及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子はＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析はバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む。
ある特定の実施形態では、核酸分析は、例えば試料調製プロセス中に、試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は、試料を複数の微粒子と接触させること、及び磁力を介して表面上で微粒子を平行移動させることを含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は、ドナー血液の試料からの核酸を精製すること；精製された核酸を複数の画分に分割すること；及び少なくとも１つの画分をさらなるスクリーニングのために保留することを含む。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子及び所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるクラミジア；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１０～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるインフルエンザ；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルは、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析はバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、ヒトドナー血液である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、全血である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、溶解全血である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、血清である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、血漿である。
ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、プールされている。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９６人のドナーからの血液を含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液の出荷は輸血のためのものである。ある特定の実施形態では、ドナー血液の出荷は、医薬品で使用するためのものである。ある特定の実施形態では、ドナー血液の出荷は、治療処置に使用するためのものである。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、献血として使用するためのものである。ある特定の実施形態では、臨床使用は輸血である。ある特定の実施形態では、臨床使用は、医薬品における使用である。ある特定の実施形態では、臨床使用は、治療処置における使用である。
本開示は、核酸分析のための微粒子を洗浄する方法であって、第１のウェル、第１のウェルに隣接する第２のウェル、及び第２のウェルに隣接する第３のウェルを含む洗浄容器を提供することであって、ここで、第１の側壁は、第１、第２、及び第３のウェルの第１の側面を画定し、第１の側壁の反対側にある第２の側壁は、第１、第２、及び第３のウェルの第２の側面を画定し、第１及び第２の側壁は、第１、第２、及び第３のウェルに面する内面と、内面の反対側の外面とを含み、第１の仕切りは、第１のウェルと第２のウェルを分離し、第１の側壁は第１の仕切りよりも高く、第１の側壁の内面は、少なくとも第１のウェルと第２のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第２の仕切りは、第２のウェルと第３のウェルを分離し、第２の側壁の内面は、少なくとも第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面である、提供することと、磁性微粒子を、第１のウェルに導入することであって、ここで、第１のウェルは洗浄溶液を含む、導入することと、磁力を加えて第１のウェル中の第１の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することと；捕捉された磁性微粒子を、第１の仕切りを越えて第１のウェルから第１の側壁の内側平面に沿って第２のウェルまで平行移動させることであって、ここで、第２のウェルは洗浄溶液を含む、平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を内面から第２のウェル内に放出させることと；磁力を加えて、第１の側壁の反対側の第２の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することとであって、ここで、第２の側壁は第２の仕切りよりも高い、捕捉することと、捕捉された磁性微粒子を、第２の仕切り越えて第２のウェルから第２の側壁の内側平面に沿って第３のウェルまで平行移動させることであって、ここで、第３のウェルは洗浄溶液または溶出溶液を含む、平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を第２の側壁の内面から第３のウェル内に放出させることと、を含む、方法を提供する。ある特定の実施形態では、本明細書に開示される微粒子の洗浄方法は、試料調製プロセス中に使用することができる。
ある特定の実施形態では、第３のウェルは溶出溶液を含み、方法は、第３のウェル内の磁性微粒子に磁力を加えて第１の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することと、溶出溶液を除去することとをさらに含む。ある特定の実施形態では、洗浄容器は第４のウェルを含み、ここで、第３のウェルは洗浄溶液を含み、第４のウェルは溶出溶液を含み、第３及び第４のウェルを、第３の仕切りによって分離する。ある特定の実施形態では、第１及び第２の側壁は、第１、第２、第３及び第４のウェルに沿って延びており、ウェルの対向側面を画定し、第１及び第２の側壁の内面はウェルに面しており、第１の側壁の内面は、第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、第３のウェルと第４ウェルとの間に延びる領域では平面であり、第２の側壁の内面は、第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、平面領域は、捕捉された磁性微粒子が内面を横断して平行移動するのに役立ち、非平面領域では、捕捉された磁性微粒子が内面を横断して平行移動することはできない。
ある特定の実施形態では、方法は、磁力を加えて、第１の側壁の内面上に第３のウェル内の磁性粒子を捕捉することであって、ここで、第１の側壁は第３の仕切りよりも高い、捕捉することと；捕捉された磁性微粒子を、第３の仕切りを越えて第３のウェルから第１の側壁の内側平面に沿って第４のウェルまで平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を第１の側壁の内面から第４のウェル内に放出させることと、をさらに含む。ある特定の実施形態では、第３のウェルは洗浄溶液を含み、第４のウェルは溶出溶液を含み、方法は、第４のウェル内の磁性微粒子に磁力を加えて第２の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することと、溶出溶液を除去することとをさらに含む。ある特定の実施形態では、磁力は、電磁石を使用して生成する。ある特定の実施形態では、電磁石は第１及び第２の側壁の外面に沿って配置され、捕捉された磁性微粒子を平行移動させることは、電磁石の異なる領域を連続的に作動させる及び非作動にすることを含む。ある特定の実施形態では、磁力を、永久磁石を使用して生成する。ある特定の実施形態では、捕捉された磁性微粒子を平行移動させることは、第１または第２の側壁の外面に沿って永久磁石を移動させることを含む。ある特定の実施形態では、非平面の内面は、内面にノッチを備え、ノッチは内面から外に延びているか、または内面内で延びている。
本開示はまた、第２のウェルに隣接する第１のウェル及び第２のウェルに隣接する第３のウェルと、第１、第２、及び第３のウェルの第１の側面を画定する第１の側壁、第１の側壁の反対側にあり、第１、第２、及び第３のウェルの第２の側面を画定する第２の側壁であって、第１、第２、及び第３のウェルに面する内面と、内面の反対側の外面とを含む、第１の側壁及び第２の側壁と、第１のウェルと第２のウェルを分離する、第１の仕切りと、第２のウェルと第３のウェルを分離する、第２の仕切り、を備える、洗浄容器であって、ここで、第１の側壁は第１の仕切りよりも高く、第１の側壁の内面は、第１のウェルに捕捉された磁性微粒子を、第１の仕切りを越えて第２のウェルに平行移動させるため、少なくとも第１のウェルと第２のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第１の側壁の内面は、第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、そうして、その非平面の内面が、第２のウェルの内面の領域で捕捉された磁性粒子が第３のウェルの内面の領域へ平行移動するのを防止し、第２の側壁は第２の仕切りよりも高く、第２の側壁の内面は、少なくとも第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第２のウェル内で磁性微粒子を捕捉し、捕捉された磁性粒子を第２の仕切りを越えて第３のウェルに平行移動させるための実質的に平坦な表面を提供する、洗浄容器を提供する。
ある特定の実施形態では、第１及び第２のウェルは洗浄溶液を含み、第３のウェルは洗浄溶液または溶出溶液を含む。ある特定の実施形態では、洗浄容器は、第３のウェルに隣接する第４のウェルと、第３のウェルと第４のウェルを分離する第３の仕切りとを含み、ここで、第１の側壁は、第４のウェルの第１の側面を画定し、第２の側壁は、第４のウェルの第２の側面を画定し、第１の側壁は第３の仕切りよりも高く、第１の側壁の内面は、第３のウェルに捕捉された磁性微粒子を、第３の仕切りを越えて第４のウェルに平行移動させるため、少なくとも第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第２の側壁の内面は、第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、そうして、その非平面の内面が、第３のウェル内の第２の側壁の内面の領域で捕捉された磁性粒子が、第４のウェルの第２の側壁の内面の領域へ平行移動するのを防止する。ある特定の実施形態では、第１、第２、及び第３のウェルは、洗浄溶液を含む。ある特定の実施形態では、第１、第２、及び第３のウェルは洗浄溶液を含み、第４のウェルは溶出溶液を含む。ある特定の実施形態では、非平面の内面は、内面にノッチを備え、ノッチは内面から外に延びているか、または内面内で延びている。
本開示は、臨床使用のためのドナー血液またはドナーからの物質の出荷に関してドナー血液に関連する試料をスクリーニングする方法であって、ある体積の溶出液中に試料から単離された核酸を提供することを含む、核酸分析のための試料を調製すること；及び前記体積の溶出液を少なくとも２つの増幅容器に分注することを含む、方法をさらに提供する。ある特定の実施形態では、方法は、少なくとも２つの増幅容器内の溶出液を核酸増幅反応に供すること（例えば、増幅及び検出プロセス中に）；及び病原体または感染因子の核酸が溶出液中に存在するか存在しないかを検出すること、をさらに含むことができる。
ある特定の実施形態では、分注することは、前記体積の溶出液を少なくとも３つ、４つ、またはそれ以上の増幅容器に分注すること：増幅容器内の溶出液を核酸増幅反応に供すること（例えば、増幅及び検出プロセス中）；及び病原体または感染因子の核酸が溶出液中に存在するか存在しないかを検出すること、を含む。ある特定の実施形態では、等しい体積の溶出液を、増幅容器に分注する。ある特定の実施形態では、異なる体積の溶出液を、増幅容器に分注する。ある特定の実施形態では、各増幅容器における増幅反応は、異なる病原体または感染因子に存在する核酸を増幅するためのものである。ある特定の実施形態では、各増幅容器における増幅反応は、複数の異なる病原体または感染因子に存在する核酸を増幅するためのものである。ある特定の実施形態では、増幅反応は等温反応を含む。ある特定の実施形態では、等温反応はリコンビナーゼポリメラーゼ増幅である。ある特定の実施形態では、等温反応はニッキング酵素増幅反応である。
本開示はさらに、試料中の標的核酸を検出するための方法を提供する。限定ではなく例として、この方法は、等温増幅反応のために試料から核酸を調製することと；等温増幅反応により標的核酸を増幅することと；反応において増幅された標的核酸の量を決定すること、及び／または反応において増幅された標的核酸の存在または非存在を決定することと、を含むことができ、ここで、試料の調製、増幅反応、及び増幅反応において増幅された標的核酸の量、存在または不存在の決定は、約６０分未満で完了し、例えば、約２０分未満で完了する。ある特定の実施形態では、本開示は、試料中の病原体または感染因子の標的核酸を検出するための方法であって、等温増幅反応のために試料から核酸を調製することと；等温増幅反応により標的核酸を増幅することと；反応において増幅された標的核酸の量を決定すること、及び／または反応において増幅された標的核酸の存在または非存在を決定することと、を含み、ここで、試料の調製、増幅反応、及び増幅反応において増幅された標的核酸の量、存在または不存在の決定は、約６０分未満で完了し、例えば、約２０分未満で完了する、方法を提供する。
ある特定の実施形態では、標的核酸の量を決定することは、増幅反応中に複数回、標的核酸の量に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む。ある特定の実施形態では、標的核酸の存在または非存在を決定することは、増幅反応中に複数回、標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む。ある特定の実施形態では、複数回は、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む。ある特定の実施形態では、複数回の蛍光シグナルの光学検出は、約１２分間にわたって行われる。ある特定の実施形態では、この方法は、臨床使用のためのドナー血液の出荷に関してドナー血液に関連する試料をスクリーニングするためのものである。ある特定の実施形態では、試料の調製、増幅反応、及び増幅反応において増幅された標的核酸の量、存在または不存在の決定は、約１５分～約６０分で、例えば、約２０分～約６０分で完了する。ある特定の実施形態では、標的核酸は、パルボウイルスＢ１９及びＡ型肝炎ウイルス（ＨＡＶ）からの核酸を含む。ある特定の実施形態では、標的核酸は、複数の病原体または感染因子からの核酸を含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、及びＨＣＶを含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１及びＨＢＶを含む。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－２及びＨＣＶを含む。
本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法をさらに提供する。ある特定の実施形態では、ドナー物質は、例えば、全血、血小板、赤血球、及び血漿などの血液製剤であり得る。ある特定の実施形態では、ドナー物質は、例えば、組織、臓器、ワクチン、細胞、遺伝子治療、及び組換え治療用タンパク質であり得る。
開示された主題の別の態様によれば、本開示の方法及びシステムを使用して、ドナー血液以外の生体試料を分析することができる。例えば、ある特定の実施形態では、生体試料は、例えば、唾液または口腔液、汗、涙、粘液、尿、リンパ液、脳脊髄液、間質液、気管支肺胞洗浄液などの体分泌物、または本明細書に記載の方法及び技法を使用した分析に好適な任意の他の試料である。
開示された主題のある特定の実施形態による例示的なＨＴＮＡＴ試料分析プロセスならびに本開示の試料調製、増幅、及び検出戦略のある特定の実施形態に関連する例示的な利点を示す。３つのプロセス、すなわち試料調製プロセス、増幅プロセス、及び検出プロセスを含む、開示される主題のある特定の実施形態による例示的なＨＴＮＡＴ試料分析プロセスを示す。ある特定の実施形態では、増幅プロセス及び検出プロセスは、増幅及び検出プロセスにおいて同時に実行される。 開示された主題による例示的なＨＴＮＡＴ自動試料分析プロセスを示すダイアグラムである。３つのプロセス、すなわち、試料調製プロセス（例えば、前溶解プロセス、試料溶解プロセス、ならびに洗浄及び溶出プロセス）、増幅プロセス（試薬添加を含む）、及び検出／読み取りプロセスを含む、例示的なＨＴＮＡＴ自動試料分析プロセスを示す。 開示された主題による例示的なＨＴＮＡＴ自動試料分析プロセスを示すダイアグラムである。開示された主題による血漿／血清または全血試料タイプを処理するための例示的なＨＴＮＡＴ自動試料調製プロトコールを示すダイアグラムである。 ３つのプロセス、すなわち、試料調製プロセス（例えば、前処理溶解プロセス、試料溶解プロセス、ならびに洗浄及び溶出プロセス）、増幅プロセス、及び検出／読み取りプロセスを含む、開示された主題による例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムを示すダイアグラムである。 開示された主題による試料調製プロセス（直接捕捉及びＣｕＴｉ全核酸捕捉）の例示的な実施形態を示すダイアグラムである。 開示された主題による例示的な前処理溶解プロセス（本明細書では溶解前とも呼ばれる）（試料調製）システムを示すダイアグラムである。 開示された主題による例示的な試料溶解プロセス（試料調製）システムを示すダイアグラムである。 開示された主題による例示的な洗浄プロセス（本明細書では洗浄及び溶出とも呼ばれる）（試料調製）システムを示すダイアグラムである。 開示された主題による例示的な増幅及び検出システムを示すダイアグラムである。 開示された主題の例示的なＣｕＴｉ全核酸捕捉プロセスの改善（強調表示）を示すダイアグラムである。 開示された主題の例示的な直接捕捉プロセスの改善を示すダイアグラムである。 開示された主題のデジタル検出（左）または蛍光（右）の実施に伴うＨＢＶのＲＰＡ増幅に関連する例示的な結果を示す。 開示された主題のＮＥＡＲＨＣＶ増幅及び蛍光検出の実施に関連する例示的な結果を示す。表には使用したオリゴヌクレオチドを示す。 例示的なデジタル及び光学的（蛍光ベースの）標的検出戦略を示す図である。 開示された主題のＲＰＡ実施に関連する例示的な結果を示す。紫色のトレースは、同じ実験内の別個の反復を表し；灰色のトレースは陰性対照である。表には使用したＲＰＡオリゴヌクレオチドを示す。 磁性粒子の固定電磁石ベースの捕捉及び洗浄を組み込むことができる１８の異なる位置を特定する、例示的な混合及び洗浄の実施形態のダイアグラムである。 磁性粒子の固定電磁石ベースの移送を組み込むことができる４対の位置を特定する、例示的な混合及び洗浄の実施形態のダイアグラムである。 Ａは、可動永久磁石または固定電磁石と組み合わせて使用するための洗浄容器の例示的な設計、及び容器の４つのウェルのおよその容積を示す。Ｂは、可動永久磁石または固定電磁石と組み合わせて使用するための洗浄容器の例示的な設計、及び容器の４つのウェルのおよその容積を示す。 増幅及びオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した、遺伝子（ＯＲＦ）：パルボウイルスＢ１９のＶＰ１（サイクルは６０秒ごとの蛍光読み取りを示す）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。 増幅及びオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した、遺伝子（ＯＲＦ）：パルボウイルスＢ１９のＶＰ１（サイクルは６０秒ごとの蛍光読み取りを示す）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。 増幅及びオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した、遺伝子（ＯＲＦ）：パルボウイルスＢ１９のＮＳ１（サイクルは６０秒ごとの蛍光読み取りを示す）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。 増幅及びオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した、遺伝子（ＯＲＦ）：パルボウイルスＢ１９のＮＳ１（サイクルは６０秒ごとの蛍光読み取りを示す）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。 増幅及びオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した、単一ＨＡＶポリペプチドの５’非翻訳領域（ＵＴＲ）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。 増幅及びオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した、単一ＨＡＶポリペプチドの５’非翻訳領域（ＵＴＲ）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。 Ａは、示されるように、増幅及びプローブオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した種々のバベシア寄生虫種のＲＰＡのグラフである。各サイクルは、６０秒ごとの蛍光読み取りを表す。Ｂは、示されるように、増幅及びプローブオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した種々のバベシア寄生虫種のＲＰＡのグラフである。各サイクルは、６０秒ごとの蛍光読み取りを表す。Ｃは、示されるように、増幅及びプローブオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した種々のバベシア寄生虫種のＲＰＡのグラフである。各サイクルは、６０秒ごとの蛍光読み取りを表す。Ｄは、示されるように、増幅及びプローブオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせを使用した種々のバベシア寄生虫種のＲＰＡのグラフである。各サイクルは、６０秒ごとの蛍光読み取りを表す。 Ａは、ヒト免疫不全ウイルス１（ＨＩＶ－１）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。Ｂは、ヒト免疫不全ウイルス２（ＨＩＶ－２）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。Ｃは、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。Ｄは、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）のＲＰＡのグラフである。プロット上の各トレースは、異なる複製を示す。 開示された主題による例示的なＲＰＡ増幅プロトコールを示すダイアグラムである。 選択された逆転写酵素の使用によって促進される改善されたＲＮＡ検出に関連する例示的な結果を示す。ＨＣＶ ＲＮＡ増幅を例として使用する。ボックス内の値は、標的（ＨＣＶ ＲＮＡ）濃度及び使用した逆転写酵素を示す。 Ａは、ＨＢＶに対するプライマーの存在下でのＨＣＶのＲＰＡ増幅の改善に関連する例示的な結果を示し、ＨＢＶオリゴヌクレオチドの存在下でのＨＣＶの阻害を示す。図示されていないが、ＨＢＶ増幅はこの変化の影響を受けない。Ｂは、ＨＢＶに対するプライマーの存在下でのＨＣＶのＲＰＡ増幅の改善に関連する例示的な結果を示し、ＨＢＶオリゴヌクレオチドの全体濃度の減少によるＨＣＶ増幅の回復を示す。図示されていないが、ＨＢＶ増幅はこの変化の影響を受けない。 示されるように、所望の検出限界（ＬＯＤ）またはその近くのレベルでの増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したＨＩＶ－１のシングルプレックスＲＰＡのグラフである。各曲線は、留意された標的濃度での単一の複製（ｎ＝６）を表す。 示されるように、所望の検出限界（ＬＯＤ）またはその近くのレベルでの増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したＨＩＶ－２のシングルプレックスＲＰＡのグラフである。各曲線は、留意された標的濃度での単一の複製（ｎ＝６）を表す。 示されるように、所望の検出限界（ＬＯＤ）またはその近くのレベルでの増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したＨＢＶのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。各曲線は、留意された標的濃度での単一の複製（ｎ＝６）を表す。 示されるように、所望の検出限界（ＬＯＤ）またはその近くのレベルでの増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したＨＣＶのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。各曲線は、反応あたり１０ＩＵでの単一の複製（ｎ＝６）を表す。 示された標的レベルにおけるＨＩＶ－１、ＨＢＶ、及び内部対照のマルチプレックスＲＰＡのグラフである。留意すべきことに、ＨＩＶ－１の１×ＬＯＤは、２０コピー／ｍＬ、ＨＢＶの場合は５ＩＵ／ｍＬである。プロットの左上の数字は、検査された総数による陽性反復数を表す。 示された標的レベルにおけるＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及び内部対照のマルチプレックスＲＰＡのグラフである。留意すべきことに、ＨＩＶ－２の１×ＬＯＤは、２０ＩＵ／ｍＬ、ＨＣＶの場合は１０ＩＵ／ｍＬである。プロットの左上の数字は、検査された総数による陽性反復数を表す。 Ａは、示されるように、増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを使用した、ＨＡＶのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。Ｂは、示されるように、増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを使用した、パルボのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。各サイクルは、３０秒ごとの蛍光読み取りを表す。標的レベル及びプローブ蛍光色素分子は、増幅プロットの上に示されている。 異なる標的核酸濃度におけるパルボのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。 図３１Ａのデータをグラフ化して、ｙ軸にサイクル閾値（Ｃｔ）、ｘ軸に対数での標的レベル濃度を示す標準曲線を確立する（各データ点は単一の複製を表す）。 図３１Ｂの回帰式によって決定される、ｙ軸上の計算によるウイルス力価とｘ軸上の実際のウイルス力価との間の相関をグラフ化する。 表は、プロットからのデータの数値出力であり、検査したウイルス力価全体にわたって許容される直線性を示している。 Ａは、チクングニアウイルスゲノムに対するプライマー及びプローブの場所を示す。Ｂは、示された増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したチクングニアウイルスのシングルプレックスＲＰＡ、ならびにインビトロ転写されたＲＮＡの反応当たりのコピー数での標的レベルのグラフを示す。Ｃは、示された増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したチクングニアウイルスのシングルプレックスＲＰＡ、ならびにインビトロ転写されたＲＮＡの反応当たりのコピー数での標的レベルのグラフを示す。Ｄは、示されたプライマー及びプローブの配列を表に列挙する。 Ａは、Ｂに示された条件を使用したデングウイルスのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。Ｂは、条件を示す。Ｃは、示されたプライマー及びプローブの配列を含む。 Ａは、西ナイルウイルス（ＷＮＶ）ゲノムに対するプライマー及びプローブの位置を示す。Ｂは、示された増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したＷＮＶのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。Ｃは、示された増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したＷＮＶのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。Ｄは、示されたプライマー及びプローブの配列である。Ｅは、示された増幅オリゴヌクレオチド及び異なる標的核酸濃度でのプローブオリゴヌクレオチドを使用したＷＮＶのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。 Ａは、ジカウイルスゲノムに対するプライマー及びプローブの場所を示す。Ｂは、示された増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したジカウイルスのシングルプレックスＲＰＡのグラフである。Ｃは、示されたプライマー及びプローブの配列である。 Ａは、Ｃの表に提供される配列を有する、示されたバベシア増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドを使用した、バベシアのマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。Ｂは、内部対照のグラフを含む。Ｃは、示されたバベシア増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドの配列を示す。 Ａは、Ｃの表に提供される配列を有する、示されたマラリア増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドを使用した、マラリアのマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。Ｂは、内部対照のグラフを含む。Ｃは、示されたマラリア増幅プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドの配列を示す。 Ａは、ＲｄＲｐゲノム領域を標的とするＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）のＲＰＡ増幅及び検出のグラフを含む。Ｂは、Ｎゲノム領域を標的とするＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）のＲＰＡ増幅及び検出のグラフを含む。 Ａは、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す、ＨＩＶ－１のマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。Ｂは、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す、ＨＢＶのマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。 Ａは、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す、ＨＩＶ－２のマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。Ｂは、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す、ＨＣＶのマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。 Ａは、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す、パルボウイルスＢ１９のマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。Ｂは、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す、ＨＡＶのマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。 Ａは、本開示のシステムに関連して有用な、電磁石ベースまたは可動永久磁石ベースの試料処理及び関連戦略の例示的な実施形態を示す。Ｂは、本開示のシステムに関連して有用な、電磁石ベースまたは可動永久磁石ベースの試料処理及び関連戦略の例示的な実施形態を示す。Ｃは、本開示のシステムに関連して有用な、電磁石ベースまたは可動永久磁石ベースの試料処理及び関連戦略の例示的な実施形態を示す。Ｄは、本開示のシステムに関連して有用な、電磁石ベースまたは可動永久磁石ベースの試料処理及び関連戦略の例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムに関連して有用な分割溶出液試料処理システム及び関連戦略の例示的な実施形態を示す。 Ａは、本開示の方法を使用して、示された検出限界が達成され得ることを示す、ＨＩＶ－１についてのマルチプレックスＨｘＶＲＰＡ結果のグラフを含む。Ｂは、本開示の方法を使用して、示された検出限界が達成され得ることを示す、ＨＩＶ－２についてのマルチプレックスＨｘＶＲＰＡ結果のグラフを含む。Ｃは、本開示の方法を使用して、示された検出限界が達成され得ることを示す、ＨＢＶについてのマルチプレックスＨｘＶＲＰＡ結果のグラフを含む。Ｄは、本開示の方法を使用して、示された検出限界が達成され得ることを示す、ＨＣＶについてのマルチプレックスＨｘＶＲＰＡ結果のグラフを含む。 本開示のシステムに関連して有用な試料処理カートリッジ及び関連戦略の例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムに関連して有用な加熱ブロック及び関連する加熱戦略の例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムに関連して有用な加熱ブロック及び関連する加熱戦略の例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムに関連して有用な加熱ブロック及び関連する加熱戦略の例示的な実施形態を示す。 Ａは、システム全体のアーキテクチャ、例えば試料取り扱い位置、試薬の場所、及び関連するコンピュータ処理ユニット、ならびに本開示のシステムに関連して有用な関連する試料処理戦略の例示的な実施形態を示す。Ｂは、システム全体のアーキテクチャ、例えば試料取り扱い位置、試薬の場所、及び関連するコンピュータ処理ユニット、ならびに本開示のシステムに関連して有用な関連する試料処理戦略の例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムに関連して有用な、試料チューブ及び試料チューブ処理戦略、例えば特定のレーンの使用の例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムに関連して有用な装填棚戦略の例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムに関連して有用なコードリーダ戦略の例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムに関連して有用なコンベヤ戦略の例示的な実施形態を示す。 Ａは、ピペットチップラックローダに関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。Ｂは、ピペットチップラックローダに関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 試料調製カートリッジ装填領域及び関連する試薬容器の構成に関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 一実施形態による例示的な試料調製カートリッジ搬送ステーション及び試料調製カートリッジ充填ステーションを示す。 一実施形態による例示的な試料調製カートリッジ搬送ステーション及び試料調製カートリッジ充填ステーションを示す。 一実施形態による例示的な試料調製カートリッジ搬送ステーション及び試料調製カートリッジ充填ステーションを示す。 一実施形態による例示的な試料調製カートリッジ搬送ステーション及び試料調製カートリッジ充填ステーションを示す。 一実施形態による例示的な試料調製カートリッジ搬送ステーション及び試料調製カートリッジ充填ステーションを示す。 試料調製カートリッジのロボットによる取り扱いに関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 試料調製カートリッジのロボットによる取り扱いに関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 試料調製カートリッジのロボットによる取り扱いに関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 試料調製カートリッジの充填に関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 補助的試薬の保存に関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 バルク試薬の保存に関する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 ピペットチップ内の磁性粒子を単離するために、磁石ベースのシステム、例えば、Ｍａｇｔｒａｔｉｏｎ（登録商標）システムを利用する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 増幅容器がトラックを介して場所を通過する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 増幅容器がトラックを介して場所を通過する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 増幅容器がトラックを介して場所を通過する本開示のシステムの例示的な実施形態を示す。 本開示のシステムの例示的な実施形態を示しており、リーダ、例えば光学検出器は可動である一方、増幅容器は静止している。 試料の調製、増幅及び検出を実行するための例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システム、ならびに試料取り扱い、消耗品の装填及び廃棄物の処理など、ＨＴＮＡＴ試料分析システムからの結果の取得に関連する追加の構成要素の平面図を示す。 試料の調製、増幅及び検出を実行するための例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システム、ならびに試料取り扱い、消耗品の装填及び廃棄物の処理など、ＨＴＮＡＴ試料分析システムからの結果の取得に関連する追加の構成要素の斜視図を示す。 例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムからの結果の取得に関連して試料調製を実行するための例示的な試料搬送機を示す。 試料混合を実行するための試料搬送機の例示的な概略図及び試料搬送機の例示的な回転動作を示す。 図６４Ａに示される試料搬送機の回転動作中の溶解チューブの例示的な概略図を示す。 図６４Ａに示される試料搬送機の回転動作中の溶解チューブの例示的な概略図を示す。 例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムからの結果の取得に関連して試料調製を実行するための例示的な洗浄及び溶出システムを示す。 例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムからの結果の取得に関連した例示的な増幅及び検出システムを示す。 本開示の分割溶出液の態様の例示的な実施形態を示す。分割しないシナリオ（上部プロセス経路）、奇数のアッセイで分割するシナリオ（中央プロセス経路）、及び偶数のアッセイで分割するシナリオ（下部プロセス経路）を示す。 本開示の分割溶出液の態様の例示的な実施形態を示す。アッセイの組み合わせと溶出液分割の種々のシナリオは、溶出液分割の利点及び有用性を示している。 例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムのピペッタを備えた例示的な処理デッキを示す。 例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムのピペッタを備えた例示的な処理デッキを示す。 例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムのピペッタを備えた例示的な処理デッキを示す。 例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムのピペッタを備えた例示的な処理デッキを示す。 ＨＴＮＡＴ試料分析システムで使用するための溶解チューブ及び移送チップの例示的な実施形態、ならびに溶解チューブ及び移送チップの例示的なスタッキング構成を示す。 ＨＴＮＡＴ試料分析システムで使用するための溶解チューブ及び移送チップの追加の例示的な実施形態、ならびに溶解チューブ及び移送チップの例示的なスタッキング構成を示す。 ＨＴＮＡＴ試料分析システムで使用するための溶解チューブの別の例示的な実施形態の上面図を示す。 図６９Ｃに示すようなＡ－Ａ線に沿った、図６９Ｃに示される例示的な溶解チューブの側断面図を示す。 ＨＴＮＡＴ試料分析システムで使用するための溶解チューブの別の例示的な実施形態の上面図を示す。 図６９Ｅに示すようなＢ－Ｂ線に沿った、図６９Ｅに示される例示的な溶解チューブの側断面図を示す。 図６８Ａの例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムの例示的な洗浄トラックを示す。 図４３の例示的な洗浄トラックで使用するための例示的な洗浄容器を示す。 図６８Ａの例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムの例示的な増幅及び検出システムを示す。 図７２の増幅及び検出システムで使用するための例示的な増幅容器を示す。 例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムで使用するための例示的な試料装填ベイを示す。 試料トレイラックを備えた装填ベイの例示的な実施形態を示す。 開示された主題の一態様による、回転式カルーセルの回転動作を使用した溶解チューブの内容物の混合を示す。 開示された主題によるシステム及びデバイスを使用した例示的な全血試料処理方法を示す。 開示された主題による例示的なシステムを示す。 開示された主題による例示的な方法を示す。 洗浄容器の例示的な実施形態を示す。 図６８Ａ～６８Ｄの例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムの例示的な試料調製カルーセルの上面図である。 Ａは、図８１の試料調製カルーセルの概略上面図であり、開示される主題の一態様による、試料調製カルーセル上のチューブ内に第１の試料及び第２の試料をプールする例を示す。Ｂは、図８１の試料調製カルーセルの概略上面図であり、開示される主題の一態様による、試料調製カルーセル上のチューブ内に第１の試料及び第２の試料をプールする例を示す。 Ａは、図８１の試料調製カルーセルの概略上面図であり、第３の試料及び第４の試料をプールする例を示す。Ｂは、図８１の試料調製カルーセルの概略上面図であり、第３の試料及び第４の試料をプールする例を示す。 図８１の試料調製カルーセルの概略上面図であり、開示される主題の別の態様による、例示的な前処理プロセス及び前処理済試料のプーリングを示す。 図８１の試料調製カルーセルの概略上面図であり、開示される主題の別の態様による、例示的な前処理プロセス及び前処理済試料のプーリングを示す。 図８１の試料調製カルーセルの概略上面図であり、開示される主題の別の態様による、例示的な前処理プロセス及び前処理済試料のプーリングを示す。 例示的なプール分解戦略を示す。 例示的なプール分解戦略を示す。 例示的なプール分解戦略を示す。 例示的なプール分解戦略を示す。 例示的なプール分解戦略を示す。 例示的なプール分解戦略を示す。 Ａは、開示された主題による、例示的な試料タイプの例示的なスループット及び例示的なシステムのプロセスを示す。Ｂは、開示された主題による、例示的な試料タイプの例示的なスループット及び例示的なシステムのプロセスを示す。 Ａは、開示される主題の一態様による、１２個の試料のオンボードプーリングの例示的な方法を示す。Ｂは、開示される主題の一態様による、１２個の試料のオンボードプーリングの例示的な方法を示す。 Ａは、開示される主題の一態様による、１８個の試料のオンボードプーリングの例示的な方法を示す。Ｂは、開示される主題の一態様による、１８個の試料のオンボードプーリングの例示的な方法を示す。 Ａは、開示される主題の一態様による、２４個の試料のオンボードプーリングの例示的な方法を示す。Ｂは、開示される主題の一態様による、２４個の試料のオンボードプーリングの例示的な方法を示す。 開示された主題の一態様による、例示的な前処理プロセス及び前処理済試料のオンボードプーリングを示す。
本明細書に開示される主題は、試料中の標的核酸を迅速に検出するための種々の方法及びシステムに関する。例えば、限定するものではないが、本明細書に開示される主題は、従来の技法よりも効率的に１つ以上の病原体または感染因子を検出するための固有の核酸分析を使用して、ドナー血液またはドナー物質（例えば、全血、溶解全血、血清、または血漿）を迅速にスクリーニングするための種々の方法及びシステムを対象とし、ここで、開示される主題の核酸分析は、病原体または感染因子に由来する核酸の所定のレベルの決定が、ドナー血液またはドナー由来の物質（すなわち、ドナー物質）を、輸血、移植、または治療薬への組み込みなどの臨床使用のために出荷することができるかどうかを示す程度に、十分に感度が高い。
本明細書に開示される方法及びシステムによって、試料のＮＡＴベースの分析の現在のプロセス／システムが変更される、例えば、ドナー血液スクリーニングの現在のプロセス／システムが変更される。従来のスクリーニングアッセイによって引き起こされる血液及び血漿のスクリーニングにおける重大なボトルネックを排除することによって、本開示の方法及びシステムは、ドナー血液プロセスを大幅に変更し、同時に効率及び安全性を向上させる。例えば、現在のＮＡＴベースのスクリーニングでは、血清学ベースのスクリーニングよりもアッセイ時間が数時間長くなる可能性があり（例えば、最初の結果が得られるまでの時間が３．５時間）、典型的に、有意義なスループットを達成するには試料のプーリング及び検査のバッチ処理が必要であり、これにより従来の血液スクリーニング検査室の運用にそれ自体の非効率が生じる可能性がある。対照的に、本明細書に開示される方法及びシステムは、ＮＡＴベースのスクリーニングの最初の結果が得られるまでの時間を数時間から数分に短縮すると同時に、機器のサイズを維持、またはさらに大幅に縮小して全体の試料スループットの改善を達成する。重要なことには、本明細書に記載される方法及びシステムは、単にドナー血液の迅速なスクリーニングを提供するだけでなく、ドナー血液を効率的に監視するために必要なスループットを達成するために、血液検査センターが試料プーリング及び制限的なバッチ処理を実行する必要性を低減させることができる。
ドナー血液をスクリーニングするために本明細書に記載される固有のＮＡＴベースのスクリーニング開発によってもたらされるスループットの増加に加えて、本開示の方法及びシステム、例えば、本明細書に開示される試料調製、増幅、及び検出の展開によって、非常に柔軟な試料処理も可能になる。例えば、本明細書に記載される方法及びシステムは、優先試料を処理するためにワークフローを中断する能力、ならびに試料を調製して、増幅のために核酸を単離した後でも、実行されている特定のＮＡＴベースのスクリーニング展開を改変する能力を有する。このような柔軟性はスループットのさらなる向上につながり、プール試料の非効率的な分解を排除することで液体及び固形廃棄物が削減される。このような柔軟性により、現在のシステムで一般に必要とされるバッチオーダー以外に試料を処理することができる「ｓｔａｔ」ＮＡＴベースのスクリーニング展開を実行する機能も提供される。
本開示の方法及びシステムの向上したスループット及び柔軟性により、血液の処理に必要な時間が短縮されることによってドナー血液及び血液製剤へのアクセスを増加させることができ、ドナーは病原体または感染因子の存在に関する、より適時に情報を受け取ることが可能になる。
上述の改善を達成するために、本開示は、種々の実施形態において、本明細書に開示されるように、試料調製、増幅もしくは検出の態様、あるいはそのような態様の組み合わせを組み込んだ、ドナー血液（例えば、全血、溶解全血、血清、もしくは血漿）試料の迅速、高感度、及びハイスループットのＮＡＴベースのスクリーニングのための革新的な方法及びシステムを対象とする。
ここで、開示された主題の種々の例示的な実施形態を詳細に参照するが、それらは添付の図面に示されており、以下でより詳細に説明される。開示された主題の方法は、システムの詳細な説明と併せて説明される。添付の図面は、別々の図全体にわたって同じ参照番号が同一または機能的に同様の要素を指し、開示される主題に従って種々の実施形態をさらに図示し、種々の原理及び利点を説明するのに役立つ。
導入の目的で、図１は、開示された主題のＮＡＴベースのスクリーニングの一般的なステップを概略的に示す。特に、限定ではなく例示として、図１は、改善された速度及びスループットを有する自動ＮＡＴベースのスクリーニングのための方法及びシステムの基礎を概略的に表す。開示された主題によれば、限定ではなく例示の目的で、ＮＡＴベースのスクリーニングのためのシステムを、開示されたステップと併せて提供する。このシステムは、核酸分析用の試料を調製するように構成された試料調製構成要素と、試料中の１つ以上の標的（例えば、標的核酸）を増幅するように構成された増幅構成要素と、試料中の１つ以上複数の標的（例えば、標的核酸）の存在または不存在無を検出するように構成された検出構成要素とを含む。ある特定の実施形態では、増幅が完了した後に検出を実行する。追加的に、または代替的に、図１に示され、本明細書で詳細に説明される一般的なステップによって具体化される方法及びシステムは、増幅及び検出の態様を組み合わせたものを含むことができる。例えば、限定するものではないが、検出から増幅に戻る図１の破線の矢印（任意性を伝えるために戻りの矢印は破線で示されている）によって具体化されるように、検出は、増幅の過程にわたって繰り返すことができ、またはさらに連続的であることもできる。開示された主題のこれらのステップのそれぞれ及び対応する構成要素は、種々の態様を有し、開示された主題の利点について、さらに詳細に説明される。さらに、後述するように、各ステップ及び対応する構成要素の種々の態様を選択的に組み合わせて、本明細書に開示する方法及びシステムの所望の利点を達成できることが認識される。
この一般的な理解により、以下でさらに詳細に説明するように、１つ以上のステップのさまざまな固有の態様を組み込んで、開示された主題の所望の利点を達成することができる。例えば、限定するものではないが、開示された主題の一態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができる。この決定により、ドナー血液またはドナー物質を、臨床使用またはさらなる処理のために出荷できるかどうかを示すことができる。例えば、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質が輸血、移植または治療薬の製造に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、所定のレベル以上の病原体または感染因子のレベルの検出は、ドナーに由来する物質が輸血、移植または治療薬の製造に許容されないことを示す。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子の存在は、ドナーに由来する物質が輸血、移植または治療薬の製造に許容されないことを示す。ある特定の実施形態では、所定のレベルよりも低い病原体または感染性因子のレベルの検出は、ドナーに由来する物質が輸血、移植または治療薬の製造に許容されることを示す。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子の不存在は、ドナーに由来する物質が輸血、移植、または治療薬の製造に許容されることを示す。臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷は、開示された主題に従って核酸分析を実行するために、例えば、試料装填領域の試料容器から、または吸引位置にある試料チューブラックの試料容器から、試料の最初の吸引から約１５分～約６０分、例えば、約２０～約６０分、約２０分～約４５分、約１５分～約４５分、約２０分～約４０分、または約１５分～約４０分で起こり得る。
追加的または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することを含むことができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、実行された核酸分析に基づいて、病原体または感染因子のそれぞれに由来する所定のレベルの核酸を決定することをさらに含むことができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、実行された核酸分析に基づいて、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または不存在を決定することをさらに含むことができる。ある特定の実施形態では、核酸分析は、持続時間が約１分～約２０分、例えば、持続時間が約５分～約２０分または約８分～約２０分である、開示された主題による核酸増幅反応を含む。ある特定の実施形態では、増幅反応は、例えば本明細書では増幅及び検出プロセスと呼ばれる検出プロセスを含む。この決定により、ドナー血液またはドナー物質を、臨床使用に出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質が輸血、移植または治療薬の製造に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、所定のレベル以上の病原体または感染因子のレベルの検出は、ドナーに由来する物質が輸血、移植または治療薬の製造に許容されないことを示す。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子の存在は、ドナーまたはドナー血液に由来する材料が輸血、移植または治療薬の製造に許容されないことを示す。ある特定の実施形態では、所定のレベルよりも低い病原体または感染性因子のレベルの検出は、ドナーまたはドナー血液に由来する材料が輸血、移植または治療薬の製造に許容されることを示す。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子の不存在は、ドナーまたはドナー血液に由来する材料が輸血、移植または治療薬の製造に許容されることを示す。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができ、ここで、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができ、ここで、病原体または感染因子のうちの１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、開示される主題による核酸分析の実行のための試料の最初の吸引から約１５～約４５分、例えば約２０～約４５分、約２０～約４０分、または約１５～約４０分で完了する。この決定により、ドナー血液を、臨床使用に出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液の試料を提供したドナーに由来する物質を、臨床使用のために出荷できるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することを含むことができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、実行された核酸分析に基づいて、病原体または感染因子のそれぞれに由来する所定のレベルの核酸を決定することを含むことができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、実行された核酸に基づいて（ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｈｅ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ ａｎａｌｙｓｅｓ ｐｅｒｆｏｒｍｅｄ）、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または不存在を決定することを含むことができる。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子のうちの１つからの核酸の所定のレベルの各決定の結果が得られるまでの時間は、約１５～約４５分、例えば、約２０～約４５分、約２０～約４０分、または約１５分～約４０分である。この決定により、ドナー血液の試料を臨床使用のために出荷できるか、またはドナー物質を臨床使用のために出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムでは、複数の試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。複数の試料のそれぞれにおける病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、実行された核酸に基づいて（ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｈｅ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ ａｎａｌｙｓｅｓ ｐｅｒｆｏｒｍｅｄ）、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または不存在を決定することを含むことができる。核酸分析に基づく決定を、開示された主題による核酸分析の実行のための、例えば試料調製領域からの第１の試料の最初の吸引から、約１５分～約３．５時間以内、例えば、または約１５分～約３．５時間以内、又は約２０分～約３．５時間以内に実行する。この決定により、ドナー血液を臨床使用のために出荷できるか、またはドナー物質を臨床使用のために出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質を、臨床使用のために出荷できるかどうかを決定することができる。例えば、限定するものではないが、病原体または感染因子の存在の検出は、ドナーまたはドナー血液に由来する物質が許容されず、臨床使用のために出荷できないことを示す。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子の不存在は、ドナーまたはドナー血液に由来する物質を、臨床使用のために出荷することができることを示す。
追加的または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムでは、複数の試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、開示された主題に従って、スクリーニングを実行して、自動システム（例えば、方法を実行するために使用される）によって占有される容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果を、またはさらには自動システム（例えば、方法を実行するために使用される）の設置面積１ｍ２当たり１時間当たり少なくとも約１４０件の結果を得ることができる。この決定により、ドナー血液を臨床使用のために出荷できるか、またはドナー物質を臨床使用のために出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質が移植または治療薬の製造に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、スクリーニングする方法及びシステムを、プールされたドナー血試料とともに使用して、プール試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができる。プール試料中に、病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸が、例えば所定のレベルでまたはそれを超えて存在することが決定される場合、方法及びシステムは、試料の核酸分析によって、プール試料に含まれる個々のドナー血液の試料またはドナー血液のサブプールをスクリーニングして、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができる。この決定により、ドナー血液を臨床使用のために出荷できるか、またはドナー物質を臨床使用のために出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質が移植または治療薬の製造に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料分析ステーション、ならびにプロセッサ及び実行される命令を含むメモリを含むことができる。試料分析ステーションは、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含むことができる。プロセッサが命令を実行すると、システムはドナー血液の試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。ある特定の実施形態では、核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、方法及びシステムは、臨床使用のためにドナー血液が出荷されることを示すか、またはドナー物質を臨床使用のために出荷することができる。ある特定の実施形態では、核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、方法及びシステムは、ドナー血液またはドナー物質を臨床使用のために出荷することができることを示す。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。本明細書に具体化されるように、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷に関する複数のドナー血液の試料のスクリーニング及び核酸分析は、独立して、すなわち、試料溶解緩衝液と接触させる前に所定の順序で複数の試料をスクリーニングすること、または試料溶解緩衝液と接触させる前に特定の核酸分析を事前決定することを必要とせずに実行する。追加的に、または代替的に、そのような独立した核酸分析により、試料が特定の試料に先立つかまたはそれに続くものであるかに関係なく、試料のスループットまたは結果が得られるまでの時間（ＴＴＲ）に影響を与えることなく、個別の分析を実行することが可能になる。
本開示の方法及びシステムの特定の態様を以下に詳細に説明する前に、まず、本明細書で使用する例示的な方法及びシステムについて説明することが望ましい。本明細書で具体化されるように、例示的な方法は、試料分析ステーションを含むシステム上で実行することができる。限定ではなく例示の目的で、試料分析ステーションは、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含むことができる。例示的な方法は、試料調製領域で試料調製プロセスを実行することを含むことができる。追加的または代替的に、例示的な方法は、増幅領域で増幅プロセスを実行することを含むことができる。追加的または代替的に、例示的な方法は、検出領域で検出プロセスを実行することを含むことができる。限定ではなく例として、例示的な方法は、試料調製領域で試料調製プロセスを実行すること、増幅領域で増幅プロセスを実行すること、及び検出領域で検出プロセスを実行することを含むことができる。
限定ではなく例として、試料調製領域には、試料搬送システムならびに洗浄及び溶出システムを含めることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料調製領域は、容器内の１つ以上の試料を試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで搬送経路に沿って搬送するように構成された試料搬送機を含むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料搬送機は、試料調製カルーセル、例えば溶解カルーセルを含むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、例示的な試料調製プロセスは、試料搬送機の試料分注位置で容器内に試料を分注することを含むことができる。例えば、限定するものではないが、試料はピペッタを使用して分注することができる。例示的な試料調製プロセスは、試料搬送機の搬送経路に沿って容器内の試料を試料捕捉及び移送位置まで搬送することをさらに含むことができる。限定ではなく例として、本明細書でさらに説明されるように、例示的な試料調製プロセスは、試料調製領域の試料搬送機において溶解プロセス、前処理プロセス、及び／またはオンボードプーリングプロセスを実行することを含むことができる。本明細書でさらに説明されるように、例示的な前処理及びオンボードプーリングプロセスは、容器が搬送経路に沿って搬送される際に、試料搬送機上の容器間で試料を移送することを含むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料調製領域はピペッタを含むことができ、ピペッタは、試料搬送機上の容器から、試料搬送機上の容器内に、試料を移送して、例えば吸引して、分注することができる。
例示的な試料調製プロセスは、試料を試料搬送機から洗浄及び溶出システムに移送することをさらに含むことができる。例えば、本明細書で具体化されるように、試料調製領域は、粒子移送機構を含むことができ、粒子移送機構は、粒子及びそれに結合した核酸、例えばＣｕＴｉでコーティング微粒子を、洗浄及び溶出システムに移送することができる。本明細書でさらに説明されるように、例示的な試料調製プロセスは、洗浄プロセスを含むことができる。例示的な洗浄プロセスは、例えば、核酸と結合したＣｕＴｉコーティング微粒子などの、核酸と結合した微粒子を洗浄するための、１つ以上の洗浄ステップを含むことができる。追加的または代替的に、例示的な洗浄プロセスは、溶出ステップを含むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、洗浄プロセスは、３つの洗浄ステップ及び１つの溶出ステップを含むことができる。
追加的または代替的に、例示的な方法は、増幅領域で増幅プロセスを実行し、検出領域で検出プロセスを実行することを含むことができる。例示の目的であり、本明細書で具体化されるように、増幅領域及び検出領域は、増幅及び検出システムを含むことができ、増幅プロセス及び検出プロセスは、増幅及び検出プロセスを含むことができる。増幅及び検出システムは、例えば、１つ以上の増幅容器及び１つ以上の検出器を有するカルーセルを含むことができる。本明細書で具体化されるように、試料は、増幅及び検出プロセスのために試料調製領域から増幅及び検出領域に移送することができる。限定ではなく例として、洗浄プロセスからの溶出液は、例えばピペッタを用いて増幅及び検出システムに移送することができる。例示的な増幅及び検出方法は、例えば、本明細書にさらに記載されるように、標的核酸を増幅することと、得られるアンプリコンを同時に検出することを含むことができる。
ある特定の実施形態では、例示的な方法は、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析は試料調製プロセスならびに増幅及び検出プロセスを含む。ある特定の実施形態では、核酸分析は、約１５分～約３４分で完了し、核酸分析において、試料調製プロセスは、約１４分で完了し、増幅及び検出プロセスは、約１～約２０分で完了する。
ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、図７９の７９０１に示すように、ドナー血液の試料、例えば、全血試料、血漿試料、または血清試料を、例えば試料装填領域から提供することを含む。ある特定の実施形態では、例示的な方法は、試料調製プロセスをさらに含むことができる。例えば、図７９の７９０２に示すように、試料調製プロセスは、溶解プロセス、例えば溶解容器内で試料を溶解することを含むことができる。溶解プロセスは、試料搬送機、例えば溶解カルーセル６８０５または８００１などの試料調製カルーセルで実行することができる。ある特定の実施形態では、溶解プロセスは、試料を溶解緩衝液、微粒子、例えばＣｕＴｉコーティング微粒子、及びプロテイナーゼＫと組み合わせて混合物を生成することを含むことができる。ある特定の実施形態では、溶解プロセス及び試料の溶解は、別個のプロテイナーゼＫ処理ステップを必要としない。ある特定の実施形態では、溶解プロセス、例えば試料を溶解することは、混合物を内部対照核酸またはキャリブレータと合わせることをさらに含むことができる。ある特定の実施形態では、例示的な方法は、混合物をインキュベートして、混合物内の核酸の微粒子への結合を促進することをさらに含むことができる。図４に示すように、ＣｕＴｉ微粒子は、標的核酸（例えば、病原性核酸）及び非標的核酸（例えば、宿主核酸）を含む試料中のＲＮＡ及びＤＮＡの両方に結合することができる。
ある特定の実施形態では、例示的な方法の試料調製プロセスは、洗浄プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、第１の洗浄で核酸と結合した微粒子を洗浄することを含むことができる。例えば、洗浄プロセスは、図７９の７９０３に示すように、第１の洗浄を含むことができる。ある特定の実施形態では、第１の洗浄は、溶解緩衝液を含むことができる。ある特定の実施形態では、核酸と結合した微粒子は、第１の洗浄を行うために、試料搬送機から、例えば溶解容器から別の容器に移送することができる。例えば、核酸と結合した微粒子は、試料搬送機から洗浄及び溶出システムに移送することができる。例えば、限定するものではないが、微粒子は、粒子移送機構６８０３を使用して、試料搬送機内の溶解容器、例えば、溶解カルーセル６８０５または８００１から、洗浄及び溶出システム、例えば、洗浄トラック６８０１または８００２の洗浄容器に移送することができる。ある特定の実施形態では、本開示で使用するための洗浄容器は、図４２、７１、及び７９に示される構造を有する。例えば、限定するものではないが、本開示で使用するための洗浄容器は、２つ以上のウェル、例えば４つのウェルを含むことができる。本明細書で具体化されるように、洗浄及び溶出システムは、洗浄トラック、例えば、洗浄トラック６８０１または８００２を含むことができる。開示されたシステムの洗浄トラックは、開示された方法の洗浄ステップを実行するように構成することができ、複数の洗浄容器をさらに含むことができる。限定ではなく例示の目的で、洗浄トラック、例えば洗浄トラック６８０１または８００２は、レーストラックの形状であってもよい。ある特定の実施形態では、例示的な方法の洗浄プロセスは、続いて、例えば、図７９の７９０４に示されるように、核酸と結合した微粒子を水により２回洗浄すること、例えば、水による第２の洗浄と水による第３の洗浄を含むことができる。ある特定の実施形態では、第２及び第３の洗浄は、例えば、磁力を加えて第１のウェルの第１の壁の内面上に微粒子を捕捉し、捕捉された微粒子を第１の壁の内面に沿って第２／第３のウェルに移動させることによって、第１の洗浄とは異なるウェル内で実行する。限定ではなく例示の目的で、図７８に示すように、粒子は約２４秒でウェル内を移動するか、またはウェルを越えて移動することができる。ある特定の実施形態では、例えば図７９の７９０５に示すように、微粒子に結合した核酸を溶出させて（例えば、溶出緩衝液を使用することにより、及び／または熱により）、洗浄容器の第４のウェル内に溶出液を生成することができる。
ある特定の実施形態では、例示的な方法は、増幅及び検出プロセスを実行することをさらに含む。特定の実施形態では、増幅と検出を、同時に実行する。ある特定の実施形態では、例示的な方法の増幅及び検出プロセスは、例えば、図７９の７９０６に示されるように、溶出液中の目的の標的核酸を増幅するために等温増幅反応のための溶出液を調製することと、増幅された標的核酸の同時検出とを含む。本明細書に具体化されるように、溶出後、標的核酸を、増幅及び検出システム６８０７に移送することができる。限定ではなく例示の目的で、増幅及び検出システムはカルーセルを含むことができる。例えば、増幅及び検出システム６８０７は、カルーセル８００３を含む。ある特定の実施形態では、増幅及び検出のために溶出液を調製することは、溶出液を試薬混合物及び活性化剤、例えばマグネシウムと接触させることを含む。ある特定の実施形態では、試薬混合物は、本明細書で言及される場合、例えば図７９に示されるような「ＲＰＡマスターミックス」であり得る。ある特定の実施形態では、ＲＰＡマスターミックスは、増幅反応におけるプライマーの結合及び伸長を促進する７つの酵素、例えば、（ｉ）リコンビナーゼ（例えば、ＵｖｓＸ）、（ｉｉ）一本鎖結合タンパク質（例えば、ＧＰ３２）、（ｉｉｉ）リコンビナーゼローディング剤（例えば、ＵｖｓＹ）、（ｉｖ）ＤＮＡポリメラーゼ、（ｖ）エキソヌクレアーゼ（例えば、エキソヌクレアーゼＩＩＩ）、（ｖｉ）クレアチンキナーゼ、及び（ｖｉｉ）逆転写酵素（例えば、ＥＩＡＶ－ＲＴ）を含む。ある特定の実施形態では、例えば標的核酸がＤＮＡである場合、逆転写酵素はＲＰＡマスターミックスに含まれない。ある特定の実施形態では、ＲＰＡマスターミックスは、標的核酸に結合する１つ以上のプライマー、アンプリコンに結合してシグナル生成を促進する１つ以上のプローブをさらに含むことができる。ある特定の実施形態では、ＲＰＡマスターミックスは、１つ以上の非タンパク質成分（例えば、プライマー（例えば、ｄＮＴＰ）を伸長するため、エネルギー源として使用するため（例えば、ＡＴＰ及びホスホクレアチン）、タンパク質及び反応を安定化するため（例えば、反応緩衝液（例えば、トリス及び塩））、ならびにクラウディング剤（例えば、ポリエチレングリコール）として使用するため）をさらに含むことができる。
ある特定の実施形態では、例示的な方法は、等温増幅反応を使用して目的の標的核酸を増幅することと、同時に、例えば蛍光検出によって、結果として生じるアンプリコンを検出することとを含むことができる。例えば、限定するものではないが、例示的な方法は、図７９の７９０７に示すように、等温増幅反応を使用して目的の標的核酸を増幅することと、同時に、例えば蛍光検出によって、結果として生じるアンプリコンを検出することとを含むことができる。等温増幅反応の非限定的な例としては、転写媒介増幅（ＴＭＡ）、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅（ＲＰＡ）、及びニッキング酵素増幅反応（ＮＥＡＲ）を挙げることができる。ある特定の実施形態では、等温増幅反応はＲＰＡである。等温増幅を使用すると、時間のかかる温度遷移が不要になる。本明細書で具体化されるように、増幅及び検出システムは、例えば増幅反応中に約２４秒ごとの所定の間隔で蛍光シグナルを検出するための独立した蛍光検出器、例えば約５つの独立した蛍光検出器を含むことができる。例えば、限定するものではないが、増幅及び検出システム６８０７は、図７８に示すように、約２４秒ごとの所定の間隔で蛍光シグナルを検出するための約５つの独立した蛍光検出器を含むことができる。ある特定の実施形態では、例示的な方法は、核酸分析からの結果を決定すること、例えば、ドナー血液の試料中の所定のレベル以上の複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を決定すること、ドナー血液の試料中の所定のレベル未満の量の、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を決定すること、ドナー血液の試料中の複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を決定すること、またはドナー血液の試料中の複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の不存在を決定すること、をさらに含むことができる。
ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを使用して、試料に対して核酸分析を実行することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを使用して、個々のまたはプールされた血液ドナー（例えば、全血、溶解全血、血清、または血漿）をスクリーニングすること、例えば、ドナー試料が輸血に許容されるかどうかを決定すること、及びドナーに由来する物質（すなわち、ドナー物質）が臨床使用に許容されるかどうかを決定するために臓器及び／または組織ドナーをスクリーニングすることができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、試料、例えばドナー血液の試料中の病原体または感染因子に由来する核酸の定量的及び／または定性的検出に使用することができる。開示された方法及びシステムを使用して分析される試料の追加の例が、本明細書に記載される。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、試料、例えばドナー血液の試料中の病原体または感染因子に由来する核酸の定性的検出に使用することができる。例えば、限定するものではないが、本開示の例示的な方法及びシステムを、試料、例えばドナー血液の試料中の病原体または感染因子に由来する核酸の存在または不存在を決定するために使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、試料、例えばドナー血液の試料中の病原体または感染因子に由来する核酸の定量的検出に使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを使用して、限定するものではないが、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア（例えば、マラリアを引き起こすＰｌａｓｍｏｄｉｕｍ（プラスモジウム）の検出及び／または定量化による）、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ及び／またはＨＥＶを含む病原体に由来する核酸を検出及び／または定量化することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、１つ以上の病原体または感染因子に由来する核酸の定性的検出に使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス及び／またはＨＥＶに由来する核酸の定性的検出に使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、コロナウイルス、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、ヒトＴリンパ球指向性ウイルス（ＨＴＬＶ）、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、梅毒、クラミジア、淋菌、デング、チクングニア、ＷＮＶ、ＨＥＶ、ウスツウイルス及び／またはクロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ）に由来する核酸の定性的検出に使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、血清または血漿試料中のＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶに由来する核酸の定性的検出に使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、血清または血漿試料中のＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析に使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、全血試料中のバベシア由来の核酸の定性的検出に使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、血漿試料中のＨＡＶ由来の核酸の定性的検出に使用することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、血漿試料中のパルボウイルスＢ１９由来の核酸の定量的検出に使用することができる。
ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを、本明細書に開示される１つ以上の病原体または感染因子に由来する核酸の定量的検出に使用することができる。例えば、限定するものではないが、本開示の例示的な方法及びシステムを、パルボウイルスＢ１９由来の核酸の定量的検出に使用することができる。
ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法は、本明細書に開示されるシステムを使用して約１５分～約６０分で、例えば、試料容器、例えば、試料装填領域に存在する試料容器、または吸引位置にある試料チューブラック内の試料容器から溶解のための試料を最初に吸引してから約１５分～約６０分で、完了することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法は、本明細書に開示されるシステムを使用して、約１５分～約４５分、本明細書に開示されるシステムを使用して約１５分～約４０分、または本明細書に開示されるシステムを使用して約１５分～約３４分で、例えば、吸引位置にある試料チューブラック内の試料容器から、または試料装填領域から、溶解のための試料を吸引してから約１５分～約４５分で、完了することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法は、本明細書に開示されるシステムを使用して約２０分～約６０分で、例えば、溶解のための試料を最初に吸引してから約２０分～約６０分で、完了することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法は、本明細書に開示されるシステムを使用して約２０分～約４５分で、例えば、試料容器、例えば、吸引位置にある試料チューブラック内の試料容器、または試料装填領域に存在する試料容器から、溶解のための試料を最初に吸引してから約２０分～約４５分で、または約２０分～約３４分で完了することができる。例えば、限定するものではないが、本開示の例示的な方法は、本明細書に開示されるシステムを使用して、溶解のための試料の最初の吸引から約３５分以下で、例えば増幅反応において増幅された標的核酸の量を決定するという結果を生み出すために完了することができる。
ある特定の実施形態では、核酸分析は、例えば試料装填領域にあるかまたは吸引位置にある試料チューブラック内の試料容器からの試料の吸引で開始し、結果の決定で終了する。ある特定の実施形態では、核酸分析は、例えば試料装填領域にあるかまたは吸引位置にある試料チューブラック内の試料容器からの試料の吸引で開始し、増幅及び検出システム上の増幅容器内の試料のインキュベーションの終了時に終了する。ある特定の実施形態では、核酸分析を、約１５分～約３６分、約１６分～約３６分、約１７分～約３６分、約１８分～約３６分、約１９分～約３６分、約２０分～約３０分、約３３分～約３５分、または約３２分～約３６分で完了することができる。ある特定の実施形態では、核酸分析を、約１５分、約１６分、約１７分、約１８分、約１９分、約２０分、約２１分、約２２分、約２３分、約２４分、約２５分、約２６分、約２７分、約２８分、約２９分、約３０分、約３１分、約３２分、約３３分、約３４分、約３５分、約３６分、約３７分、約３８分、約３９分、約４０分、約４１分、約４２分、約４３分、約４４分、または約４５分で完了することができる。ある特定の実施形態では、核酸分析を、約１５分で完了することができる。ある特定の実施形態では、核酸分析を、約３４分で完了することができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを使用して、１時間当たり少なくとも約１５０～約３００の結果を得ることができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを使用して、８時間当たり少なくとも約１，０００～約２，５００の結果、例えば、８時間当たり約１，１００～約２，３００の結果を得ることができる。ある特定の実施形態では、本開示の例示的な方法及びシステムを使用して、１ｍ２当たり８時間当たり少なくとも約５００～約１，２００の結果、例えば、自動システムの設置面積１ｍ２当たり８時間当たり少なくとも約５７０～約１，１５０の結果を得ることができる。
明確にするために、限定するものではないが、本明細書で開示される主題の詳細な説明は、以下のサブセクションに分割される：
１． 試料収集の態様；
２． 試料調製の態様；
３． 核酸増幅の態様；
４． 核酸検出の態様；
５． 使用方法；
６． 分析システム；
７． 追加のスクリーニング及び調製の態様；ならびに
８． 例示的な実施形態。
本明細書で使用される用語は、一般に、本開示との関係内において、及び各用語が使用される特定の関係において、当技術分野における通常の意味を有する。ある特定の用語は、本開示の組成物及び方法、ならびにそれらの作製法及び使用方法を説明する際に、実践者に追加の指針を提供するために、以下または明細書の他の場所で考察される。
本明細書で使用される場合、「ドナー」という用語は、生体試料を提供する、限定するものではないが、ヒト、非ヒト霊長類、げっ歯類などを含む任意の動物（例えば、哺乳動物）を指す。例えば、限定するものではないが、生体試料は、例えば輸血に使用される血液、血清、または血漿であり得る。
本明細書で使用される場合、「ドナー血液」は、ドナーから得られた血液、例えば全血、溶解全血、血清、または血漿、ならびにそのような血液に由来する製剤、例えば血小板、濃厚赤血球、及び血漿に由来する製剤、例として、限定するものではないが、（１）凝固因子、例えば第ＶＩＩＩ因子、フォン・ヴィレブランド因子、フィブリノーゲン；（２）プロテアーゼ阻害剤、例えば、α１－アンチトリプシン及びＣ１－エステラーゼ阻害剤；（３）アルブミン；及び（４）免疫グロブリンＧ（ＩｇＧ）、を指す。
本明細書で使用される場合、「患者」という用語は、特定の臨床治療、例えば輸血を受けることになる、限定するものではないが、ヒト、非ヒト霊長類、げっ歯類を含む任意の動物（例えば、哺乳動物）を指す。
本明細書で使用される場合、「臨床使用」という語句は、「インビボ臨床使用」及び「インビトロ臨床使用」を指す。本明細書で使用される場合、「インビボ臨床使用」とは、全血の輸血、ならびに全血の成分、本明細書では「血液製剤」と集合的に称される、例えば、濃厚赤血球、血漿（例えば、未処理凍結血漿または解凍血漿）、血小板、または寒冷沈降物（未処理凍結血漿を解凍し、沈殿物を収集することによって調製される）の輸血を指す。「インビボ臨床使用」はまた、治療薬の製造におけるドナー血液、またはそれに由来する物質の組み込み、ならびにドナーからの１つ以上の物質、例えば臓器、組織などの提供及び／または移植を包含する。例えば、限定するものではないが、ドナー血液は、全血として採取した後、またはドナーから血液を取り出し、血漿を採取し、残りの血液はドナーに返す自動アフェレシス法を介して直接血漿提供としてのいずれかで、血漿に処理することができ、その血漿は未処理凍結血漿として直接使用するかまたは、さらに処理して血漿由来生成物として知られるさまざまな治療用生物製剤を製造することができる。例えば、限定するものではないが、血漿は、典型的にはかなりの程度までプールすることができ、例えば、１０，０００～５０，０００提供のプールを産業的処理のために合わせ、プールされた血漿を分画して、限定するものではないが、（１）凝固因子、例えば第ＶＩＩＩ因子、フォン・ヴィレブランド因子、フィブリノーゲン；（２）プロテアーゼ阻害剤、例えば、α１－アンチトリプシン及びＣ１－エステラーゼ阻害剤；（３）アルブミン；及び（４）免疫グロブリンＧ（ＩｇＧ）を含む血漿由来生成物を製造することができる。本明細書で使用される場合、「インビトロ臨床使用」とは、例えば、新しい医療デバイスの研究開発、治療プロセス、または疾患の診断における、ならびに品質保証／検査室診断に関連する、血液製剤、血漿由来生成物、またはドナー物質の患者への直接輸血または移植以外の生物学的物質の使用を指す。
本明細書で使用される場合、「ドナー物質」という語句は、血液製剤及び他の生物学的製剤を指し、これには、例えば、組織、臓器、ワクチン、細胞、遺伝子治療、及び組換え治療用タンパク質が含まれる。ドナー物質は、複数のドナー物質を含むことができる。例えば、ドナー物質は、単一のドナーからの複数の血液製剤及び／または他の生物学的製剤を含むことができる。追加的または代替的に、ドナー物質は、複数のドナーからの血液製剤、複数のドナーからの生物学的製剤、または１人のドナーからの血液製剤及び１人以上の他のドナーからの他の生物学的製剤を含むことができる。
本明細書で使用される場合、結果が得られるまでの時間（「ＴＴＲ」）という語句は、例えば試料調製、増幅、及び検出を含む核酸分析の開始から、核酸分析の検出ステップの完了までの時間を指す。ある特定の実施形態では、開示された主題に従って核酸分析を実行するための、核酸分析の開始は、例えば、試料装填領域の試料容器から、または吸引位置の試料チューブラック内の試料容器から、試料の最初の吸引時に起こる。ある特定の実施形態では、試料容器は、試料装填領域内の容器を含む。例えば、ある特定の実施形態では、核酸分析のための試料の吸引は、吸引位置、例えば吸引位置６２９２で行うことができる。追加的または代替的に、核酸分析のための試料の吸引は、試料装填領域、例えば、図５４Ｂの試料装填領域３１０２の内側部分で行うことができる。ある特定の実施形態では、ＴＴＲは、核酸分析の開始から、例えば、試料装填領域からの、または吸引位置の試料チューブラック内の試料容器からの試料の最初の吸引から、増幅及び検出プロセス中に結果が得られるまでの時間を指す。ある特定の実施形態では、ＴＴＲは、核酸分析の開始から、例えば、試料装填領域からの、または吸引位置の試料チューブラック内の試料容器からの試料の最初の吸引から、増幅及び検出プロセスの完了までの時間を指す。
本明細書で使用される「結果」は、１つ以上の標的核酸の存在の検出を指す。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムを使用して得られる結果は、１つ以上の標的核酸の不存在を決定することを含むことができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムを使用して得られる結果は、所定のレベルまたはそれを超える１つ以上の標的核酸の検出を含むことができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムを使用して得られる結果は、所定のレベルよりも少ない量での１つ以上の標的核酸の検出を含むことができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムを使用して得られる結果は、１つ以上の標的核酸の定量を含むことができる。ある特定の実施形態では、図６７Ａ及び６７Ｂに具体化されるように、単一の試料吸引によって、ある特定の実施形態では、２つの増幅反応に分注される溶出液（例えば、本明細書では「分注溶出液」と呼ばれる）が生じ、それによって２つ以上の「結果」を生み出すことができる。本明細書で使用される場合、結果は、例えば、１つ以上の標的核酸の存在または不存在の検出を含むことができる。例えば、限定するものではないが、図６７Ｂのシナリオ２及び４は、それぞれ、単一の試料調製プロセスの使用とそれに続く２つの増幅反応を示しており、これらの増幅は、それぞれが異なる病原体または感染因子に由来する２つの標的核酸を検出するためにマルチプレックス化される。これらの各シナリオでは、各増幅反応が２つの標的核酸に関する情報を提供するため、４つの結果が得られることを示しており、そのため、これらのシナリオでは、単一の試料で、２つの増幅反応により４つの病原体または感染因子の存在または不存在を検出することが可能になる。追加的に、または代替的に、より高次のマルチプレックス増幅を、本開示の方法及びシステムとに関連して利用することができ、そうして単一の試料で、５、６、７、８、９、１０もしくはそれ以上の病原体または感染因子の存在を検出し、これによりそれぞれ５、６、７、８、９、１０以上の結果を提供することができる。ある特定の実施形態では、各結果は、標的核酸の存在、非存在、またはレベルの識別可能な検出を含む。
本明細書で使用されるＴＴＲは、核酸分析の開始からの時間を指すため、必然的に、提供と本明細書に記載のＨＴＮＡＴ分析システムまたは方法によるそのスクリーニングとの間に生じる時間を除外する。例えば、限定するものではないが、サンプリングに費やされる時間、例えばドナー血液の採取、または試料搬送時間、例えばスクリーニングのための地元の採血センターまたは血漿センターから中央検査室への試料の搬送は、ＴＴＲから除外される。
本明細書で使用される場合、「スループット」という用語は、単位時間当たり、例えば時間当たりに得られる核酸分析結果の数を指す。追加的または代替的に、スループットは、限定するものではないが、単位時間当たり、例えば時間当たりに分析される試料の数を指すことができる。ある特定の実施形態では、スループットは、限定するものではないが、単位時間当たり、例えば、時間当たりに実行される検査の数を指すことができる。
本明細書で使用される場合、「ａ」または「ａｎ」という単語の使用は、特許請求の範囲及び／または明細書において「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という用語と組み合わせて使用される場合、「１つ」を意味する場合があるが、「１以上」「少なくとも１つ」、及び「１または１を超える（ｏｎｅ ｏｒ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ ｏｎｅ）」という意味とも一致する。
例えば、「ある特定の実施形態」及び「ある特定の態様」に関して使用される「ある特定の」という用語は、「例示的」を指すものであり、限定するものではない。
本明細書で使用される「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ（ｓ））」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｅ（ｓ））」、「有する（ｈａｖｉｎｇ）」、「有する（ｈａｓ）」、「できる（ｃａｎ）」、「含有する（ｃｏｎｔａｉｎ（ｓ））」という用語、及びそれらの変形は、追加の行為もしくは構造を妨げない非限定的移行句、用語、または単語であることを意図している。本開示は、明示的に記載されているかどうかにかかわらず、本明細書に提示される実施形態または要素「を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｏｆ）」、及び「から本質的になる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ ｏｆ）」、他の実施形態も企図している。
「約」または「およそ」という用語は、当業者によって決定される特定の値の許容誤差範囲内を意味し、これは値がどのように測定または決定されるか、すなわち測定システムの制限に部分的に依存する。例えば、「約」は、当技術分野の慣例に従って、３標準偏差以内または３を超える標準偏差を意味し得る。あるいは、「約」は、所定の値の最大２０％、好ましくは最大１０％、より好ましくは最大５％、さらにより好ましくは最大１％の範囲を意味し得る。あるいは、特に生物学的システムまたはプロセスに関して、この用語は、値の桁内、好ましくは５倍以内、より好ましくは２倍以内を意味し得る。
本明細書で使用される「発現」という用語は、細胞内で起こる転写及び翻訳を指す。細胞内の遺伝子及び／または核酸の発現レベルは、細胞内に存在する対応するｍＲＮＡの量、あるいは細胞によって生成される遺伝子及び／または核酸によってコードされるタンパク質の量のいずれかに基づいて決定することができる。例えば、遺伝子及び／または核酸から転写されたｍＲＮＡは、ノーザンハイブリダイゼーションによって定量されることが望ましい。Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， ｐｐ． ７．３－７．５７ （Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， １９８９）。遺伝子及び／または核酸によってコードされるタンパク質は、タンパク質の生物学的活性をアッセイすることによって、またはそのような活性とは独立した、例えばタンパク質と反応できる抗体を使用するウェスタンブロッティングまたはラジオイムノアッセイなどのアッセイを利用することによってのいずれかで、定量することができる。Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， ｐｐ． １８．１－１８．８８ （Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， １９８９）。
本明細書で使用される「核酸」、「核酸分子」または「ポリヌクレオチド」という用語は、ヌクレオチドのポリマーを含む任意の化合物及び／または物質を指す。各ヌクレオチドは塩基、具体的にはプリンまたはピリミジン塩基（すなわち、シトシン（Ｃ）、グアニン（Ｇ）、アデニン（Ａ）、チミン（Ｔ）またはウラシル（Ｕ））、糖（すなわち、デオキシリボースまたはリボース）、及びリン酸基で構成されている。多くの場合、核酸分子は塩基の配列によって記述され、塩基は核酸分子の一次構造（直鎖状構造）を表す。塩基の配列は、典型的には、５’から３’までで表す。本明細書において、核酸分子という用語は、例えば相補的ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）及びゲノムＤＮＡを含むデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）、リボ核酸（ＲＮＡ）、特にメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）、ＤＮＡまたはＲＮＡの合成形態、及びこれらの分子を２つ以上含む混合ポリマーを包含する。核酸分子は直鎖状または環状であり得る。加えて、核酸分子という用語は、センス鎖とアンチセンス鎖の両方、ならびに一本鎖及び二本鎖の形態を含む。さらに、本明細書に記載の核酸分子は、天然に存在するヌクレオチドまたは天然に存在しないヌクレオチドを含むことができる。天然に存在しないヌクレオチドの例には、誘導体化糖もしくはリン酸主鎖結合、または化学的に修飾された残基を有する修飾ヌクレオチド塩基が含まれる。
本明細書で使用される「オリゴヌクレオチド」という用語は、約２～約１００ヌクレオチド（例えば、約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、９９、もしくは１００ヌクレオチド、または前述の値のいずれかによって定義される範囲）を含む短い核酸配列を指す。本明細書で使用される「核酸」及び「ポリヌクレオチド」という用語は、リボヌクレオチド（ＲＮＡ）またはデオキシリボヌクレオチド（ＤＮＡ）のいずれかである、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態を指す。これらの用語は分子の一次構造を指すため、二本鎖ＤＮＡと一本鎖ＤＮＡ、二本鎖ＲＮＡと一本鎖ＲＮＡを含む。この用語は、等価物として、ヌクレオチド類似体及び修飾ポリヌクレオチド、例えばメチル化及び／またはキャップされたポリヌクレオチドから作製されたＲＮＡまたはＤＮＡのいずれかの類似体を含む。核酸は、典型的にはリン酸結合を介して連結して核酸配列またはポリヌクレオチドを形成するが、当技術分野では他の多くの連結（例えば、ホスホロチオエート、ボラノホスフェートなど）が知られている。
オリゴヌクレオチドは一本鎖または二本鎖であり得、あるいは二本鎖と一本鎖の両方の配列の一部を含むことができる。オリゴヌクレオチドは、ＤＮＡ、ゲノムＤＮＡと相補ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）の両方、ＲＮＡ、またはハイブリッドであり得、ここで、核酸は、デオキシリボヌクレオチドとリボヌクレオチドの組み合わせ、及びウラシル、アデニン、チミン、シトシン、グアニン、イノシン、キサンチン、ヒポキサンチン、イソシトシン及びイソグアニンを含む塩基の組み合わせを含有することができる。オリゴヌクレオチドは、化学合成法または組換え法によって得ることができる。
本明細書に記載されるオリゴヌクレオチドのいずれも、その標的に対するオリゴヌクレオチドの結合親和性を安定化または増強するために、任意の好適な様式で修飾することができる。例えば、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド配列は、１つ以上の修飾オリゴヌクレオチド塩基を含むことができる。
本明細書に記載されるオリゴヌクレオチド配列のいずれも、本明細書に開示される配列のいずれかの相補体を含むか、それから本質的になるか、またはそれからなることができる。本明細書で使用される「相補体」または「相補配列」という用語は、ワトソン・クリック塩基対合則を介して本明細書に記載のオリゴヌクレオチドと安定な二重鎖を形成する核酸配列を指し、典型的には、開示されたオリゴヌクレオチドと、約８０％、約８１％、約８２％、約８３％、約８４％、約８５％、約８６％、約８７％、約８８％、約８９％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、または約９９％より高い同一性を共有する。
本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、当技術分野で公知の任意の好適な方法を使用して調製することができる。（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ． Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， １９８９， ２． Ｓｕｐｐ． Ｅｄ．， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｕｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ： Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， Ｎ．Ｙ．；Ｍ． Ａ． Ｉｎｎｉｓ （Ｅｄ．）， ＰＣＲ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ． Ａ Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ， Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ： Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， Ｎ．Ｙ． （１９９０）；Ｐ． Ｔｉｊｓｓｅｎ， Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｐｒｏｂｅｓ － Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ｉｎ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ （Ｐａｒｔｓ Ｉ ａｎｄ ＩＩ）， Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ （１９９３）；Ｍ． Ａ． Ｉｎｎｉｓ （Ｅｄ．）， ＰＣＲ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ， Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ： Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， Ｎ．Ｙ． （１９９５）；及びＦ． Ｍ． Ａｕｓｕｂｅｌ （Ｅｄ．）， Ｓｈｏｒｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ： Ｓｅｃａｕｃｕｓ， Ｎ．Ｊ． （２００２）；Ｎａｒａｎｇ ｅｔ ａｌ．， Ｍｅｔｈ． Ｅｎｚｙｍｏｌ．， ６８： ９０－９８ （１９７９）；Ｂｒｏｗｎ ｅｔ ａｌ．， Ｍｅｔｈ． Ｅｎｚｙｍｏｌ．， ６８： １０９－１５１ （１９７９）；及びＢｅｌｏｕｓｏｖ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．， ２５： ３４４０－３４４４ （１９９７）を参照のこと、これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）。オリゴヌクレオチド対は、国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）によって提供されるＰｒｉｍｅｒ－ＢＬＡＳＴツールなどのさまざまなツールを使用して設計することもできる。オリゴヌクレオチド合成は、Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ／Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ， Ｉｎｃ． （Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ、ＣＡ）、ＤｕＰｏｎｔ （Ｗｉｌｍｉｎｇｔｏｎ、ＤＥ）、またはＭｉｌｌｉｇｅｎ （Ｂｅｄｆｏｒｄ、ＭＡ）から市販されているオリゴ合成装置などで行うことができる。あるいは、オリゴヌクレオチドを特注で作製し、例えば、Ｍｉｄｌａｎｄ Ｃｅｒｔｉｆｉｅｄ Ｒｅａｇｅｎｔ Ｃｏｍｐａｎｙ （Ｍｉｄｌａｎｄ、ＴＸ）、Ｅｕｒｏｆｉｎｓ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ （Ｌｏｕｉｓｖｉｌｌｅ、ＫＹ）、ＢｉｏＳｅａｒｃｈ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ， Ｉｎｃ． （Ｎｏｖａｔｏ， ＣＡ）などを含む当技術分野で周知の様々な商業的供給元から入手することができる。オリゴヌクレオチドは、例えば、ネイティブアクリルアミドゲル電気泳動、陰イオン交換ＨＰＬＣ（例えば、本明細書に組み込まれるＰｅａｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｃｈｒｏｍ．， ２５５： １３７－１４９ （１９８３）を参照のこと）、及び逆相ＨＰＬＣ（例えば、参照により本明細書に組み込まれるＭｃＦａｒｌａｎｄ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．， ７： １０６７－１０８０ （１９７９）を参照のこと）などの当技術分野で公知の任意の好適な方法を使用して精製することができる。
オリゴヌクレオチドの配列は、限定するものではないが、化学的分解（例えば、参照により本明細書に組み込まれる、Ｍａｘａｍ ｅｔ ａｌ．， Ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ， ６５： ４９９－５６０ （１９８０）を参照）、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ）質量分析法（例えば、参照により本明細書に組み込まれるＰｉｅｌｅｓ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．， ２１： ３１９１－３１９６ （１９９３）を参照のこと）、アルカリホスファターゼ消化とエキソヌクレアーゼ消化の組み合わせ後の質量分析（参照により本明細書に組み込まれる、Ｗｕ ｅｔ ａｌ．， Ａｎａｌ． Ｂｉｏｃｈｅｍ．， ２９０： ３４７－３５２ （２００１））などを含む、当技術分野で公知の任意の好適な配列決定方法を使用して検証することができる。
本明細書で使用される「プライマー」、「プライマー配列」、「プライマーオリゴヌクレオチド」、及び「増幅オリゴヌクレオチド」という用語は、ヌクレオチド及び核酸重合剤（例えば、ＤＮＡ依存性またはＲＮＡ依存性ポリメラーゼ）の存在下での好適な増幅条件（例えば、緩衝液、塩、温度及びｐＨ）下に置かれた場合の核酸（あらゆる種類のＤＮＡまたはＲＮＡ）の相補鎖である、伸長産物の合成の開始点として作用することができるオリゴヌクレオチドを指す。本開示の増幅オリゴヌクレオチドは、任意の好適なサイズであり得、望ましくは、約１５～５０ヌクレオチド、好ましくは約２０～４０ヌクレオチドを含む、それらから本質的になる、またはそれらからなる。本開示のオリゴヌクレオチドは、本明細書に記載されるヌクレオチドに加えて、追加のヌクレオチドを含有することができる。
「プローブ」、「プローブ配列」、及び「プローブオリゴヌクレオチド」という用語は、適切なハイブリダイゼーション条件下で標的配列の少なくとも一部（例えば、増幅した標的配列の一部）に選択的にハイブリダイズすることができるオリゴヌクレオチドを指す。一般に、プローブ配列は「相補的」（すなわち、コード鎖もしくはセンス鎖（＋）に相補的）、または「逆相補的」（すなわち、アンチセンス鎖（－）に相補的）のいずれかとして同定される。本開示のプローブは、任意の好適なサイズであり得、望ましくは、約１０～５０ヌクレオチド、好ましくは約１２～３５ヌクレオチドを含む、それらから本質的になる、またはそれらからなる。
本明細書で使用される場合、「セット」、「プライマーセット」、「プローブセット」、及び「プライマー及びプローブセット」という用語は、一緒になって目的の標的配列または標的核酸（例えば、感染性病原体内の標的配列）の増幅をプライミングすることができる２つ以上のオリゴヌクレオチド、及び／または標的配列もしくは標的核酸を検出することができる少なくとも１つのプローブを指す。ある特定の実施形態では、「セット」という用語は、増幅する標的配列または標的核酸の５’末端とハイブリダイズする、本明細書では「フォワードプライマー」と称する第１のオリゴヌクレオチドと、増幅する標的配列または標的核酸の相補体とハイブリダイズする、本明細書では「リバースプライマー」と称する第２のオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドの対を指す。
本明細書で使用される「標的核酸」、「標的配列」、または「標的核酸配列」という用語は、本明細書に記載のウイルス、細菌もしくは真核生物寄生虫などの病原体もしくは感染因子の核酸配列、またはその相補体を指す。ある特定の実施形態では、標的配列または標的核酸配列は、本開示の方法及びシステムを使用して検出することができる。
本明細書で使用される場合、２つのポリヌクレオチド配列もしくはポリペプチド配列との関係における「配列同一性」または「同一性」は、指定された比較ウィンドウにわたって最大の一致を得るためにアラインメントさせた場合に同一である２つの配列中のヌクレオチド塩基またはアミノ酸残基を指す。配列の同一性または類似性のパーセンテージがタンパク質に関して使用される場合、同一ではない残基位置は、アミノ酸残基が、同様の物理化学的特性を有するアミノ酸残基の機能的に同等の残基で置換されており、したがって分子の機能的特性は変わらない保存的アミノ酸置換によって、多くの場合異なることが認識される。
本明細書で使用される場合、「配列同一性のパーセンテージ」または「同一性のパーセンテージ」は、最適にアラインメントさせた２つの配列を比較ウィンドウにわたって比較することによって決定される値を意味し、ここで、比較ウィンドウ内のポリヌクレオチド配列の一部は、２つの配列の最適なアライメントのために、参照配列（付加または欠失を含まない）と比較して付加または欠失（ギャップ）を含むことができる。パーセンテージは、両方の配列で同一の核酸塩基またはアミノ酸残基が存在する位置の数を決定し、一致した位置の数を求め、一致した位置の数を比較ウィンドウ内の位置の総数で割り、その結果に１００を乗算して、配列同一性のパーセンテージを求めることによって計算する。
当業者には理解されるように、任意の２つの配列間の同一性パーセントの決定は、ある周知の数学的アルゴリズムを使用して達成することができる。このような数学的アルゴリズムの非限定的な例は、Ｍｙｅｒｓ及びＭｉｌｌｅｒのアルゴリズム、Ｓｍｉｔｈらの局所相同性アルゴリズム；Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ及びＷｕｎｓｃｈの相同性アラインメントアルゴリズム；Ｐｅａｒｓｏｎ及びＬｉｐｍａｎの類似点検索法；Ｋａｒｌｉｎ及びＡｌｔｓｃｈｕｌにおけるように改変された、Ｋａｒｌｉｎ及びＡｌｔｓｃｈｕｌのアルゴリズム、である。好適な数学的アルゴリズムのコンピュータ実装を、配列の比較に利用して、配列同一性を決定することができる。そのような実装には、特に、当業者によって識別可能な、ＣＬＵＳＴＡＬ、ＡＬＩＧＮ、ＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡが含まれるが、これらに限定されない。配列アライメントアルゴリズムは、例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌ．， ２１５（３）： ４０３－４１０ （１９９０）；Ｂｅｉｇｅｒｔ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ， １０６（１０）： ３７７０－３７７５ （２００９）， Ｄｕｒｂｉｎ ｅｔ ａｌ．， ｅｄｓ．， Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ： Ｐｒｏｂａｌｉｓｔｉｃ Ｍｏｄｅｌｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ａｎｄ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ， Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ， ＵＫ （２００９）；Ｓｏｄｉｎｇ， Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ， ２１（７）： ９５１－９６０ （２００５）；Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．， ２５（１７）： ３３８９－３４０２ （１９９７）；及びＧｕｓｆｉｅｌｄ， Ａｌｇｏｒｉｔｈｍｓ ｏｎ Ｓｔｒｉｎｇｓ， Ｔｒｅｅｓ ａｎｄ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ， Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ ＵＫ （１９９７）にも開示されており、これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「参照配列」は、配列比較の基礎として使用される定義された配列である。参照配列は、例えば、全長タンパク質またはタンパク質断片のセグメントとして、指定された配列のサブセットまたは全体であり得る。参照配列は、例えば、ＧｅｎＢａｎｋ及びＵｎｉＰｒｏｔなどのデータベースにおいて同定可能な配列、ならびに当業者に同定可能な他の配列であり得る。
本明細書で使用される場合、「増幅された」という用語は、単一またはより少ないコピー数の核酸配列分子から核酸の複数のコピーを作製するプロセスを指す。増幅された核酸は、アンプリコンと呼ぶことができる。
本明細書で使用される「検出する」または「検出」という用語は、限定するものではないが、試料、反応混合物、分子複合体及び基質を含む、空間の限られた部分における標的核酸の実在（ｅｘｉｓｔｅｎｃｅ）及び／または存在の決定を示す。本明細書で使用される「検出する」または「検出」は、限定するものではないが、当業者が本開示を読めば識別可能である、他の化合物と相互作用する能力、特に結合する能力、別の化合物を活性化する能力、及び追加の特性を含む、標的の化学的及び／または生物学的特性の決定を含むことができる。検出は、定量的または定性的であり得る。検出は、標的またはシグナルの数量または量の測定（定量とも呼ばれる）に言及する、関連する、または関与する場合に「定量的」であり、これには、限定するものではないが、標的またはシグナルの量または割合を決定するために設計された分析が含まれる。検出は、存在もしくは非存在の他に標的またはシグナルの数量もしくは量に依存することなく、標的またはシグナルの存在もしくは非存在の識別に言及する、関連する、または関与する場合、検出は「定性的」である。
本明細書で使用される場合、「病原体低減技術」という用語は、試料中に存在する可能性のある病原体を低減、排除、及び／または不活化するための技法、戦略及び／または技術を指す。溶媒／界面活性剤処理、光処理（光増感剤を用いるまたは用いない場合）、及び化学処理を含む、いくつかの病原体低減技術が開発されている。
本明細書で使用される場合、「最初の吸引」という用語は広義の用語であり、当業者にとって通常の慣用的な意味が与えられるべきであり（また、それは特別な意味または専用の意味に限定されるものではない）、試料もしくはその部分に対する核酸分析を実行するために、限定するものではないが、試料チューブまたは試料容器から試料もしくはその部分を最初に吸引することを指すことができる。限定ではなく例として、本明細書でさらに説明するように、最初の吸引は、ピペッタを用いて試料チューブから試料またはその部分を吸引することを含むことができる。例示の目的において、本明細書に具体化されるように、最初の吸引は、臨床使用のためのドナー物質の出荷についてドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システム内の吸引位置にある試料チューブラック内の試料チューブまたは試料容器から試料またはその部分を吸引することを含むことができる。追加的または代替的に、限定ではなく例として、本明細書でさらに具体化されるように、最初の吸引は、臨床使用のためのドナー物質の出荷についてドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムの試料装填領域から試料を吸引することを含むことができる。限定ではなく例として、最初の吸引後、試料またはその部分に対して核酸分析を行うことができる。限定ではなく例として、本明細書でさらに説明されるように、最初の吸引後、吸引試料またはその部分は、試料調製プロセスのための試料調製領域に移送することができ、例えば、試料は、溶解プロセス用の試料調製カルーセル上の溶解チューブに分注することができる。
１． 試料採取の態様；
開示された主題に従って、本明細書に具体化されるように、方法及びシステムは、対象から試料を得るための試料採取を含むことができる。限定ではなく例示の目的で、試料はドナーまたは患者から得ることができる。次に、試料採取によって得られた試料を、本明細書でさらに説明されるように、開示された主題に従って、下流分析及び検出のために調製及び増幅することができる。限定ではなく例として、試料採取には、対象から試料を得るための任意の好適な方法及び／または技法を含めることができる。
１．１試料タイプ
ある特定の実施形態では、本開示は、対象から試料を得るための方法を提供する。ある特定の実施形態では、試料は生体試料、例えば体液試料である。ある特定の実施形態では、体液試料は体分泌物である。体液及び体分泌物の試料の非限定的な例としては、血液（例えば、全血、溶解全血、血清、または血漿）、唾液もしくは口腔液、汗、涙、粘液、尿、リンパ液、脳脊髄液、間質液、気管支肺胞洗浄液などの体分泌物、または本明細書に記載の方法及び技法を使用した分析に好適な任意の他の試料である。ある特定の実施形態では、体液試料は、臨床使用を目的としており、例えば、輸血に使用するドナー血液である。
ある特定の実施形態では、試料は、同時に、例えば対象の献血前、献血中、または献血後に得られた血液に由来する。例えば、限定するものではないが、献血が別個のコンテナ、例えば献血採取バッグに採取されるのと同時に、例えば採血チューブに血液を採取することができ、献血と同時に採取される血液は、本明細書に記載の試料の供給源を提供することができる。したがって、本明細書で詳細に説明するような、そのような試料の分析は、同時に採取された献血が１つ以上の病原体または感染因子を含有するかどうかを示す。さらに、献血の出荷は、部分的または全体的に、そのような同時に採取された血液から得られた１つ以上の試料の分析に基づいて行うことができる。
本明細書に記載の方法及びシステムは、試料、例えば体液試料の核酸検査に使用できる。例えば、限定するものではないが、本明細書に記載の方法及びシステムは、試料が献血と同時に採取されるかどうかに関係なく、一般に血液試料のスクリーニングに使用することができる。しかし、本明細書に記載の方法及びシステムがドナー血液のスクリーニングに関連して使用される場合には、そのようなスクリーニングは、例えば血漿、血小板、赤血球、及び全血などの物質の提供に関連して使用することができる。ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法及びシステムに関連してスクリーニングされる血液試料は、全血試料である。ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法及びシステムに関連してスクリーニングされる血液試料は、溶解全血試料である。ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法及びシステムに関連してスクリーニングされる血液試料は、血清試料である。ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法及びシステムに関連してスクリーニングされる血液試料は、血漿試料である。
ある特定の実施形態では、ドナー生体試料は、全血である。本明細書で使用される場合、「全血」は、いかなる成分も除去されていない血液（流体成分と固体成分の両方を含有する血液）を指す。全血、または全血の赤血球（ＲＢＣ）成分を輸血すると、患者のＲＢＣ数が効果的に増加し、それによって利用可能な酸素を運搬するヘモグロビンの量が増加することにより、患者の酸素運搬能力を高めることができる。全血輸血は、酸素運搬能力に加えて、血液凝固を助ける血小板の供給源になり得る。ある特定の実施形態では、血小板の臨床使用、輸血の使用により、血小板減少症、ある特定のがん、再生不良性貧血、ならびに骨髄移植を処置することができる。
ある特定の実施形態では、ドナー生体試料は、溶解全血である。本明細書で使用される場合、「溶解全血」とは、いかなる成分も除去されていない血液（液体成分と固体成分の両方を含有する血液）を指すが、例えば塩化アンモニウム、炭酸カリウム、及びＥＤＴＡを含む緩衝液への曝露によって赤血球が溶解されているものを指す。塩化アンモニウムは、ＲＢＣを溶解し、リンパ球への影響は最小限である。溶解全血の使用は、バベシア及びマラリアなどの一部のＮＡＴスクリーニングアッセイに関連する可能性がある。バベシア及びマラリアは、ＲＢＣ内で感染し、ＲＢＣ内に常在して、宿主の免疫系による検出を回避する寄生虫である。したがって、バベシア及びマラリアは、ＲＢＣを欠く血漿または血清試料中に典型的には存在しないが、溶解全血試料では、感染ＲＢＣが溶解するため、バベシア及びマラリアが検出される可能性がある。
ある特定の実施形態では、ドナー生体試料は、血漿である。血漿は、血液の細胞成分を遠心分離して除去した後に残る血液の水性部分である。ある特定の実施形態では、血漿は、アルブミン、凝固因子、線維素溶解タンパク質、免疫グロブリン及び他のタンパク質を含み得る。血漿提供に由来する製剤は、ある特定の実施形態では、出血性障害及び／または生命を脅かす外傷／出血を処置するために使用することができる。
ある特定の実施形態では、ドナー生体試料は、血清である。本明細書で使用される場合、「血清」は、フィブリノーゲン、細胞、またはいかなる固体要素も含有しない血漿の透明な部分である。
本明細書に記載の方法及びシステムは、単一の個体ならびに複数の個体に由来する試料のスクリーニングに使用することができる。
効率の向上を考慮して、開示の主題によれば、時間を節約する目的で、開示のシステム及び方法には試料プーリングが必要ではない場合がある。しかし、開示された主題の一態様によれば、試料プーリングは、時間増加及び／または費用節約のために所望の程度に使用することができる。
例えば、限定するものではないが、複数の個体からの生体試料を一緒にプールして、ＮＡＴベースのスクリーニング用のプール試料を生成することができる。ある特定の実施形態では、試料プールは、個体、例えばドナーからのミニプール、または少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、少なくとも２１、少なくとも２２、少なくとも２３、少なくとも２４の試料で行われることになる。ある特定の実施形態では、プールされる個々の試料の数は、８の因数に基づき、例えば、８試料のプール、１６試料のプール、２４試料のプール、３２試料のプール、４０試料のプール、４８試料のプール、５６試料のプール、６４試料のプール、７２試料のプール、８０試料のプール、８８試料のプール、９６試料のプール、１０４試料のプール、１１２試料のプール、１２０試料のプール、１２８試料のプール、１３６試料のプール、１４４試料のプール、１５２試料のプール、１６０試料のプール、１６８試料のプール、１７６試料のプール、１８４試料のプール、１９２試料のプール試料、２００試料のプールとなる。ある特定の実施形態では、プールされる個々の試料の数は、２の因数に基づき、例えば、２試料のプール、４試料のプール、６試料のプール、８試料のプール、１０試料のプール、１２試料のプール、１４試料のプール、１６試料のプール、１８試料のプール、２０試料のプール、２２試料のプール、２４試料のプールとなる。ある特定の実施形態では、プール試料は、約２～約１００の個体、例えば、約５～約５０、約５～約２０、約５～約１０、または約１０～約２０の異なる個体からの血液を含む。ある特定の実施形態では、例えば、プール試料がプール血漿試料である場合、プール試料は、２～約１０，０００個体、例えば、約２～約９，０００、約２～約８，０００、約２～約７，０００、約２～約５，０００、約２～約４，０００、約２～約３，０００、約２～約２，０００、約２～約１，０００、約２～約９００、約２～約８００、約２～約７００、約２～約６００、約２～約５００、約２～約４００、約２～約３００、約２～約２００、約２～約１５０、約２～約１００、約２～約５０の個体の血漿を含むことができる。
開示された主題の一態様によれば、例えば、全血溶解物または血漿試料などの試料は、オンボードハードウェア（すなわち、オンボードプール）を使用してプールすることができる。限定ではなく例の目的で、本明細書に具体化されるように、個々の試料調製を管理する同じハードウェアを使用して、例えば全血及び／または血漿の試料プールを作成することができる。例えば、限定するものではないが、本明細書に具体化されるように、個々の試料は、例えば溶解カルーセルなどの試料搬送機などの試料調製領域に導入することができ、２つ以上の個々の試料をプーリング用に指定することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、プール用に指定された試料調製領域内の個々の試料を、試料調製領域の始点に戻し、一緒にプールすることができる。次に、プール試料の処理は、本明細書にさらに記載されるように、非プール試料を処理するための本明細書に記載のシステム及び方法を使用して実行することができる。
個々の試料を管理することができる同じハードウェアを使用したオンボードプーリングにより、別個のリキッドハンドラまたはプーラーなどの追加の検査室資本の必要性を軽減することができる。追加的にまたは代替的に、オンボードプーリングの使用により、試料の手動プーリングの必要性及び／または外部リキッドハンドラまたはプーリングシステムの必要性が軽減または排除され、検査室ワークフローを改善することができる。ある特定の実施形態では、試料プーリングの使用により、試料スループットを増加させることができる。限定ではなく例及び例示として、個々の試料について１時間当たりおよそ１５０の検査のスループットを有するシステムは、６試料のプールサイズを組み込むことができ、これにより、６試料のプールで個々の試料について１時間当たりの検査数を、１時間当たりおよそ１５０の検査から、１時間あたり約５０の検査に削減することができる。本明細書で具体化されるように、１時間当たりの検査数の削減は、例えば溶解カルーセルなどの試料調製装置が、試料をプールするために再配置された結果であり得る。限定ではなく例として、本明細書に具体化されるように、６試料のプールサイズを使用すると、１時間当たりに検査される個々の試料数はおよそ３００にもなり得、これは総スループットの１００％の増加を表すことができる。
上で述べたように、本開示の方法によって得られた試料は、代わりに、個体ごとに分析することができ、これにより、より迅速な処理が可能となる。実際、本明細書に記載の方法及びシステムによって結果が得られるまでの時間及び全体のスループットが大幅に改善されるため、現在実施されている戦略とは「程度」が異なるだけでなく、「種類」が異なるスケールでのそのような個々のドナーＮＡＴ（「ＩＤ－ＮＡＴ」）スクリーニングが可能になる。この方法及びシステムによって、単にドナー血液スクリーニングの迅速化が促進されるだけでなく、そのようなＩＤ－ＮＡＴスクリーニングを行う方法に段階的変化がもたらされ、ドナー及び患者の安全性及びアクセスを強化するための全く新しい戦略がもたらされる。例えば、本明細書に記載の方法及びシステムによって、中央試料処理施設へのプーリング及び／または搬送を必要とせずに、ドナー血液の大規模及び小規模の両方の迅速スクリーニングが可能になる。ドナー血液スクリーニング施設の運営におけるこのような違いにより、安全性が改善され、血液及び血液製剤へのアクセスが改善される。この改善は、資源が限られている地域、ならびに地震及びハリケーンなどの大規模災害、ならびに例えば、ＣＯＶＩＤ－１９のパンデミック中にボランティアの提供レベルが急激に低下した状況において、特に顕著である。
１．２サンプリングの態様
ある特定の実施形態では、試料、例えば生体試料は、当技術分野で公知の任意の方法によって対象から得ることができる。例えば、限定するものではないが、サンプリングには、動脈サンプリングまたは静脈穿刺サンプリングによって対象から生体試料を得ることを含めることができる。追加的または代替的に、限定ではなく例として、試料は、例えば鼻咽頭スワブなどのスワブを使用して得ることができる。
ある特定の実施形態では、生体試料は静脈穿刺サンプリングによって得られる。例えば、限定するものではないが、サンプリングは、針を皮膚に通して静脈の内腔に挿入し、１つ以上の採血容器（例えば、採血チューブ、サテライトバッグ、または血漿交換バッグ）を静脈からの血液で満たすことによって行う。典型的には、サンプリングは、静脈穿刺サンプリングによって行い、ここで、初期体積の血液が分流バッグに入り、皮膚からの針の挿入によって導入された皮膚ならびに皮膚上に存在する細菌が捕捉される。好適な量の血液が分流バッグに入った後、血液は、検査用の採血容器、例えば採血チューブ、または保存用の、例えば採血バッグに送られる。ある特定の実施形態では、採血チューブは、所定の体積の液体の吸引を容易にする、通常「バキュテナ」と呼ばれる。真空シールを備えた滅菌ガラスまたはプラスチックの試験チューブである。サンプリングには、対照に関する情報を採血容器にラベル付けすることをさらに含むことができる。ある特定の実施形態では、採血容器は、血液凝固を防止するために、抗凝固剤、例えば粉末抗凝固剤または液体凝固剤（ｌｉｑｕｉｄ ｃｏａｇｕｌａｎｔ）を含む。
ある特定の実施形態では、生体試料を遠心分離する。例えば、限定するものではないが、血液試料を遠心分離して、試料の残部から血漿を分離する。ある特定の実施形態では、血液試料を遠心分離して、試料の細胞、例えば、赤血球、血小板、及び／または白血球から血漿を分離する。ある特定の実施形態では、血清は、採取時から約２時間以内に、遠心分離によって試料の残部から物理的に分離する。ある特定の実施形態では、全血のＲＢＣ成分は、ドナーから血液を取り出し、ＲＢＣを採取し、残りの血液及び血漿をドナーに返す自動アフェレーシス法によって調製することができる。同様に、血漿は、ドナーから血液を取り出し、血漿を採取し、残りの血液をドナーに返す自動アフェレーシス法によって得ることができる。ある特定の実施形態では、試料は、アフェレーシスプロセスの前にアフェレーシスラインから逸れて１つ以上の採血チューブ、例えばバキュテナを満たすことによって得られる。追加的に、または代替的に、試料は、採取血漿から得ることができる。
２． 試料調製の態様
開示された主題に従って、本明細書に具体化されるように、試料、例えばドナー血液の試料の迅速スクリーニングのための方法及びシステムは、試料、例えばドナー血液の試料から核酸を単離するための固有の試料調製態様を含む。例えば、限定するものではないが、本開示の方法及びシステムにおいて企図される例示的な試料調製方法及びシステム構成要素をここで参照する。
図１に示すように、試料の調製は、目的の核酸の増幅及び検出の前に実行する。ある特定の実施形態では、本明細書で具体化される試料調製は、試料からの目的の核酸の単離を含む。本開示はまた、試料調製が、試料調製と併せて実行される１つ以上の追加動作、例えば、試薬調製動作を含むことができることも企図する。ある特定の実施形態では、試料調製には試薬調製動作は含まれない。
本明細書に記載される試料調製の態様は、核酸を単離するための様々な好適な試料調製技法の使用を含むことができる。例えば、限定するものではないが、試料調製には、様々な試料緩衝液、核酸固定化技法（例えば、磁性粒子上での固定化）、及び／または溶出態様の使用を組み込むことができる。したがって、方法及びシステムは、例示的な緩衝液、固定化技法、及び溶出態様を参照して本明細書に記載されるが、当業者であれば、方法及びシステムがそれらの例示的な緩衝液、技法及び態様のみに限定されないことを理解するであろう。
本明細書で具体化されるように、試料調製方法及びシステム構成要素は、ＮＡＴベースのスクリーニング用の試料を調製するように構成することができる。限定ではなく例示の目的で、試料調製方法及び構成要素は、任意の好適な試料調製技法を使用して試料中の核酸を単離及び／または精製するように構成することができる。ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、試料中の核酸を単離及び／または精製するための溶解プロセス及び洗浄プロセスを含む。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、１つ以上の洗浄ステップ及び１つ以上の溶出ステップを含むことができる。ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、前処理プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、オンボードプーリングプロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、オンボードプーリングプロセス、及び溶解プロセス、及び洗浄プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、前処理プロセス、及び溶解プロセス、及び洗浄プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、前処理プロセス、オンボードプーリングプロセス、及び溶解プロセス、及び洗浄プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、分析される１つ以上の試料に基づいて選択することができる。限定ではなく例として、血清、血漿、及び／または溶解全血試料を分析する場合、試料調製プロセスは、溶解プロセス及び洗浄プロセスを含むことができる。追加的または代替的に、血清、血漿、及び／または溶解全血試料を分析する場合、試料調製プロセスは、オンボードプーリングプロセス、溶解プロセス、及び洗浄プロセスを含むことができる。本明細書でさらに説明するように、試料調製プロセスにオンボードプーリングプロセスを組み込むことにより、例えば、スループット（例えば、単位時間当たりに分析される試料の数）を向上させることができる。追加的または代替的に、全血試料を分析する場合、試料調製プロセスは、前処理プロセス、例えば、前処理溶解プロセス、溶解プロセス及び洗浄プロセスを含むことができる。追加的または代替的に、全血試料を分析する場合、試料前処理プロセスは、前処理プロセス、オンボードプーリングプロセス、溶解プロセス、及び洗浄プロセスを含むことができる。本明細書でさらに説明するように、試料調製プロセスにオンボードプーリングプロセスを組み込むことにより、例えば、スループット（例えば、単位時間当たりに分析される試料の数）を向上させることができる。
ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、例えば、前処理プロセス及び／または溶解プロセス中の１つ以上の試料と１つ以上の試薬との混合などの混合を含むことができる。ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、オンボードプーリングプロセス中の混合を含むことができる。ある特定の実施形態では、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、前処理プロセス、オンボードプーリングプロセス、及び溶解プロセス中の混合を含むことができる。ある特定の実施形態では、前処理プロセスは、前処理溶解プロセスである。
例えば、限定するものではないが、図２Ａに示されるように、本明細書で具体化される試料調製方法及びシステム構成要素は、例えば内部対照（ＩＣ）、微粒子（μＰ）及びプロテアーゼ、例えばプロテイナーゼＫ（ＰＫ）、試料、及び試料溶解緩衝液の組み合わせ４、続いて、μＰへの核酸の結合を促進するための、ＰＫ／溶解／試料の組み合わせのインキュベーション５を含む試料調製プロセス２を実行するように構成することができる。ある特定の実施形態では、図２Ａに具体化されるように、迅速試料調製プロセス２は、洗浄プロセス６をさらに含むことができる。ある特定の実施形態では、洗浄プロセス６は、細胞破片及び溶解緩衝液成分、例えば、ＧＩＴＣなど、その後の増幅及び／または検出動作を妨げる可能性があるものを実質的に除去するために、微粒子結合核酸を、洗浄液、例えば、溶解緩衝液または水と、好適な時間及び好適な洗浄回数で接触させることを含むことができる。例えば、限定するものではないが、図２Ａに具体化されるように、微粒子結合核酸を３回洗浄することができ、最初は溶解緩衝液で室温にて約１分間、次に水で２回、各洗浄で約３０秒間洗浄することができる（ただし、本明細書で詳細に説明するように、他の好適な持続時間及び温度も企図される）。図２Ａに具体化されるように、迅速試料調製プロセス２は、迅速溶出動作７を含むことができる。ある特定の実施形態では、迅速溶出動作は、洗浄微粒子結合核酸を溶出緩衝液と約８０℃で約３分間接触させることを含むことができ（ただし、本明細書で詳細に説明するように、他の好適な持続時間及び温度も企図される）、その後、微粒子を、例えば、溶出核酸を含む溶出緩衝液が移送されている間に微粒子の磁気移送によって、または微粒子の磁気保持によって分離することができ、冷却して、増幅及び検出プロセス、例えば、増幅及び検出プロセス３のための核酸を調製することができる。図２Ａに具体化されるように、増幅及び検出プロセス３は、溶出核酸を、本明細書では「マスターミックス」と呼ばれる増幅試薬の組み合わせと接触させることによって開始することができる。ある特定の実施形態では、溶出核酸及び「マスターミックス」を活性化剤、例えば二価の金属イオン、例えばマグネシウムと接触させることができる。ある特定の実施形態では、本明細書でより詳細に考察するように、増幅及び検出プロセス３について、増幅反応は４０℃で約２０分間継続することができるが、他の持続時間、例えば、約１分～約２０分、約５分～約２０分、または約１０分～約６０分、及び他の温度、例えば、約２５℃～約６０℃を利用することができる。本明細書に具体化されるように、試料調製方法及び構成要素では、試料調製プロセスを実行することができる。本明細書で具体化される、実施例５～２３、図２Ａ～Ｂ、５～７、及び３９～４１を参照すると、試料調製プロセスは約１０分で完了することができる。例えば、限定するものではないが、試料調製方法及びシステム構成要素は、例えば図９に示すような全核酸の磁性微粒子ベースの捕捉、または例えば図１０に示すような標的核酸の磁性微粒子ベースの直接捕捉を組み込むことができる。例えば、限定するものではないが、図９に示す磁気ビーズベースの全核酸捕捉プロセスで具体化されるように、本明細書に記載されるある特定の方法及びシステムは、図９の下部のプロセスで概説される１つ以上の試料調製展開を利用して、例えば、プロテアーゼ（ＰＫ）及び試料溶解緩衝液のインキュベーション、迅速な洗浄、及び／または迅速な溶出を組み合わせて、約１０分以下で試料調製を達成することができる。個別にまたは組み合わせて、このような試料調製開発は、例えば図９の上部のプロセスに概説されているような、従来の試料調製を利用するプロセスと比較して、全体のプロセス時間を大幅に短縮する。代替的例では、図１０に示される直接捕捉ベースの標的核酸捕捉プロセスで具体化されるように、本明細書に記載されるある特定の方法及びシステムは、図１０の下部のプロセスに概説される１つ以上の迅速な試料調製展開を利用して、例えば、プロテアーゼ（ＰＫ）、試料溶解緩衝液、及び核酸結合インキュベーション、迅速な微粒子結合、迅速な洗浄、及び／または迅速な溶出を組み合わせて、約１２分で試料調製を達成することができる。個別にまたは組み合わせて、そのような迅速な試料調製展開によって、例えば図１０の上部のプロセスに概説されているように、従来の試料調製を利用するプロセスと比較してプロセス時間全体が大幅に短縮される。追加的に、または代替的に、本明細書に具体化される、例えば図９及び１０に記載の試料調製展開を使用すると、試料調製プロセスは、全血試料の場合は約２０分～約２２分で、血清／血漿試料の場合は約１０分～約１５分で、または約１２分～約１６分で、約１２分～約１４分で、約１０分～約１４分で、または約１０分～約１３分で、または約１０分～約１２分で、またはさらに約１０分～１１分で完了させることができる。限定ではなく例示の目的で、試料調製プロセスは、約３分～約７分、例えば約５分間または約６分の溶解プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、約６分～約８分間の洗浄プロセス、例えば、１つ以上の洗浄ステップ及び／または１つ以上の溶出ステップを含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、約１分～約３分の１つ以上の試料洗浄ステップ、例えば、約２分～約３分の１つ以上の試料洗浄ステップを含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製は、約２分～約４分、または約２分～約５分の１つ以上の溶出ステップ、例えば約３分の１つ以上の溶出ステップを含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、約４～約８分の溶解プロセス及び約５～約９分の洗浄プロセスを含む。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、第１の洗浄ステップ、第２の洗浄ステップ、第３の洗浄ステップ、及び溶出ステップを含む。
ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、試料容器から、例えば、吸引位置にある試料チューブラック内の試料容器から、または試料装填領域にある試料容器から、試料を吸引することで開始し、溶出液を増幅及び検出システムの容器に分注することで終了させることができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、約１２分～約１６分、約１２分～約１５分、約１３分～約１５分、または約１３分～約１４分で完了することができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、約１２分、約１３分、約１４分、または約１５分で完了することができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、約８４０秒、すなわち約１４分で完了することができる。
例えば図２Ａ及び図９を参照して本明細書に具体化されるように、試料調製について本明細書に記載される方法及び構成要素では、試料調製時間全体を短縮するためにプロテアーゼを含む試料溶解緩衝液を利用することができる。追加的または代替的に、例えば図２Ａ及び図９を参照して本明細書に具体化されるように、迅速試料調製について本明細書に記載される方法及び構成要素では、試料調製時間全体を短縮するために全核酸捕捉のためのプロテアーゼ及び微粒子を含む試料溶解緩衝液を利用することができる。追加的または代替的に、例えば図２Ａ及び図１０を参照して本明細書に具体化されるように、迅速試料調製について本明細書に記載される方法及び構成要素では、試料調製時間全体を短縮するために標的核酸捕捉のためのプロテアーゼ及び微粒子を含む試料溶解緩衝液を利用することができる。
追加的または代替的に、図２Ｂ及び実施例５～２３を参照して本明細書で具体化されるように、システム及び方法は、例えば異なる試料タイプに対する溶解、洗浄、及び溶出の統合プロセス経路を含むことができる。限定ではなく例示の目的で、異なる試料タイプ（例えば、溶解全血、血漿、血清など）は、その後実行される特定の核酸分析に関係なく、試料調製プロセス経路、例えば、図２Ｂに示される試料調製プロセス経路に沿って同じ様式で処理することができる。この技法は、利点の中でも特に、試料調製の開始後に実行される特定の核酸分析を改変する機能を提供することにより、試料調製の効率ならびに方法及びシステム全体の柔軟性を向上させる。図２Ｂに示すように、統合プロセス経路は、試料容器から試料を吸引し、微粒子の存在下でその試料を試料溶解緩衝液と接触させて、微粒子への核酸の結合を可能にすることによって開始することができる。ある特定の実施形態では、吸引し、溶解緩衝液と接触させる試料は、血漿試料、血清試料、または溶解全血試料である。ある特定の実施形態では、血漿、血清、または溶解全血試料は、吸引前にオフライン処理を受けていることになり、例えば、本明細書に記載されるように、全血をオフラインで遠心分離して、血漿または血清試料を生成することができ、または以下に説明するように、全血をＲＢＣ溶解溶液で処理して、溶解全血試料を生成することができる。ある特定の実施形態では、血漿または血清試料の試料調製時間は約１５分、例えば約１４分であり得る。ある特定の実施形態では、全血試料の試料調製時間は約２２分、例えば約２０分であり得る。微粒子の存在下で吸引し、試料溶解緩衝液と接触させる試料の量は、例えば試料のタイプに応じて変化し得る。ある特定の実施形態では、微粒子の存在下で吸引し、試料溶解緩衝液と接触させる試料の量は、約５０μＬ～約２０００μＬの範囲であり得、ある特定の実施形態では、例えば、血漿試料に関しては、吸引された試料の量は約１０００μＬであり、溶解された全血に関しては、その量は約１５０μＬである。ある特定の実施形態では、微粒子の存在下で試料溶解緩衝液と接触させた試料は、約６０℃の温度で、約３分～約７分間、例えば約５～約７分間、または約５～約６分間インキュベートすることができる。ある特定の実施形態では、統合プロセス経路は、微粒子に結合した核酸の第１の洗浄緩衝液への移送を伴う。ある特定の実施形態では、洗浄緩衝液は、試料溶解緩衝液であり得る。ある特定の実施形態では、約５００μＬの試料溶解緩衝液を第１の洗浄緩衝液として使用するが、他の好適な緩衝液及び堆積が、本明細書に記載の方法及びシステムによって企図される。ある特定の実施形態では、微粒子に結合した核酸を、第１の洗浄で約９６秒間洗浄するが、本明細書に記載の方法及びシステムでは他の好適な洗浄持続時間が企図される。ある特定の実施形態では、統合プロセス経路は、微粒子に結合した核酸の第２の洗浄緩衝液への移送を伴う。ある特定の実施形態では、第２の洗浄緩衝液は水であり得る。ある特定の実施形態では、約２５０μＬの水を第２の洗浄緩衝液として使用するが、他の好適な緩衝液及び堆積が、本明細書に記載の方法及びシステムによって企図される。ある特定の実施形態では、微粒子に結合した核酸を、第２の洗浄で約２４秒間洗浄するが、本明細書に記載の方法及びシステムでは他の好適な洗浄持続時間が企図される。ある特定の実施形態では、統合プロセス経路は、ある特定の実施形態では水であり得る第３の洗浄緩衝液を利用する、微粒子に結合した核酸の第３の洗浄緩衝液への移送を伴う。ある特定の実施形態では、約１１０μＬの水を、第３の洗浄緩衝液による第３の洗浄に使用するが、他の好適な緩衝液及び堆積が、本明細書に記載の方法及びシステムによって企図される。ある特定の実施形態では、微粒子に結合した核酸を、第３の洗浄緩衝液による第３の洗浄で約２４秒間洗浄するが、本明細書に記載の方法及びシステムでは他の好適な洗浄持続時間が企図される。ある特定の実施形態では、統合プロセス経路は、微粒子に結合した核酸を、ある特定の実施形態では５ｍＭのＰＯ４を含むことができる溶出緩衝液への移送を伴う。ある特定の実施形態では、約５０μＬの溶出緩衝液を溶出に使用するが、他の好適な緩衝液及び堆積が、本明細書に記載の方法及びシステムによって企図される。ある特定の実施形態では、微粒子に結合した核酸を、約８０℃で約３～約４分間、例えば約１９２秒間、溶出緩衝液と接触させるが、本明細書に記載の方法及びシステムによって他の好適な溶出持続時間が企図される。微粒子を除去したら、統合プロセス経路によって調製された溶出液を、本明細書に記載の実施形態による核酸分析の１つ以上の増幅及び／または検出プロセスで使用することができる。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化されるように、図２Ｂ及び実施例５～２３を参照すると、システム及び方法は、試料ごとに独立して試料調製技法を含むことができ、したがってバッチ処理を使用する必要がなくなる。本発明で使用される場合、バッチ処理は、（１）群内で試料に優先順位を付ける機能がなく、（２）すでに処理中の試料よりも新しい試料に優先順位を付ける機能がなく、及び／または（３）試料調製の開始後に、特定の試料に関連する核酸分析、例えば、試料調製によって単離された核酸に対して実行される特定の増幅反応を変更する機能がなく、複数の試料を処理することを指す。本明細書で詳細に説明するように、バッチ処理の排除により、特定の試料及び／または特定の核酸分析に優先順位を付けるための大幅な柔軟性が提供され、血液監視の全体的な効率が向上する。
追加的または代替的に、図４及び９、ならびに実施例３及び５～２３を参照して本明細書に具体化されるように、本明細書に開示される試料調製システム及び方法は、溶解ステップ中に全試料核酸を捕捉して、低濃度の核酸の捕捉を促進することができる。限定ではなく例示の目的で、実施例３及び図２Ａ～２Ｂを参照すると、システム及び方法は、全試料核酸を捕捉するために微粒子を利用することができる。本明細書に具体化されるように、微粒子は、ＣｕＴｉでコーティング微粒子を含むことができる。追加的に、または代替的に、微粒子をプロテアーゼ及び試料溶解緩衝液と組み合わせて、全核酸の捕捉時間を短縮することができる。ある特定の実施形態では、本開示の試料調製プロセスは、微粒子、例えばＣｕＴｉコーティング微粒子を使用して、全試料核酸を捕捉することができる。
追加的に、または代替的に、以下の実施例４、図２Ａ～２Ｂ及び１０を参照すると、システム及び方法は、標的核酸のみの単離を容易にするために、微粒子上に固定化された捕捉オリゴヌクレオチドを使用して標的核酸を直接捕捉することができる。追加的に、または代替的に、微粒子をプロテアーゼ及び試料溶解緩衝液と組み合わせて、標的核酸の捕捉時間を短縮することができる。ある特定の実施形態では、本開示の試料調製プロセスは、微粒子上に固定化された捕捉オリゴヌクレオチドを使用して、標的核酸のみを捕捉することができる。
追加的に、または代替的に、本明細書に具体化されるように、システム及び方法は、例えば実施例２ならびに図１５～１７及び４２に記載されるように、磁力下で微粒子を混合及び／または移送して、混合及び反応効率を高めることができる。限定ではなく例示の目的で、磁力を提供する磁石のタイプは、本明細書に開示されるように、電磁石、例えば固定電磁石、または可動永久磁石であり得る。この技法は、微粒子を使用する実施形態において、全核酸または標的核酸の捕捉時間、微粒子に結合したそのような核酸の洗浄時間を短縮し、及び／または溶出溶液への移送を容易にすることができる。
限定ではなく例の目的で、全血試料の例示的な試料調製プロセスを図７７に示す。ある特定の実施形態では、全血試料の試料調製プロセスは、前処理プロセスを含むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、ステップ７８０１で、全血試料を容器に加えることができる。ステップ７８０１からステップ７８０３まで、全血試料は、例えば、本明細書でさらに説明されるように、塩化アンモニウム、炭酸カリウム、及びＥＤＴＡを含む緩衝液を使用して溶解させることができる。ステップ７８０３からステップ７８０５まで、溶解全血を、例えば溶解緩衝液及びプロテアーゼなどの試薬、例えばＣｕＴｉ微粒子などの微粒子、及び／または内部対照と混合することができる。本明細書でさらに説明されるように、ステップ７８０５で、目的の核酸を、微粒子に結合させることができる。本明細書で具体化されるように、ステップ７８０１から７８０５は、本明細書でさらに説明されるように、例えば溶解カルーセルなどの試料搬送機上で実行することができる。ステップ７８０５からステップ７８０７までで、試料を洗浄して試料から核酸を精製することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料は３回洗浄することができる。本明細書で具体化されるように、１回目の洗浄は、試料から細胞破片を除去するため、及び／または粒子への結合が弱い可能性のある物質を除去するために実行することができる。本明細書に具体化されるように、２回目及び３回目の洗浄を実行して、試料から溶解緩衝液及び／またはプロテアーゼを除去することができる。本明細書でさらに具体化されるように、洗浄後、ステップ７８０９で、試料を溶出して、微粒子に以前に結合した核酸を捕捉することができる。例えば、本明細書でさらに説明するように、微粒子を溶出緩衝液に曝露することができる。限定ではなく例の目的で、本明細書で具体化されるように、洗浄及び溶出ステップ７８０７及び７８０９は、本明細書でさらに説明されるように、洗浄容器及び洗浄トラックを使用して実行することができる。
２．１ 試料溶解プロセス
限定ではなく例示の目的で、開示される主題の方法及びシステムは、溶解プロセス、すなわち試料溶解プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、試料溶解プロセスは、１つ以上の生体試料、例えばプール試料または非プール試料を試料溶解緩衝液と合わせることを含む。ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液は、試料内に存在する病原体、感染因子、及び／または細胞の膜または壁を破壊し、病原体、感染因子、及び／または細胞の内容物、例えば、病原体、感染因子、及び／または細胞内に存在する核酸を放出するように適合された溶液である。
本明細書に詳細に記載されるように、試料溶解緩衝液の試料への導入により、試料の病原体、感染因子、及び／または細胞からの核酸の放出が促進される。このような試料溶解緩衝液の導入は、本明細書において「溶解全血」と呼ばれる「試料タイプ」の調製とは区別される。本明細書に記載されるように、溶解全血は、前処理溶解プロセス中に、ＲＢＣを、溶解緩衝液、例えば、ＲＢＣ溶解溶液（例えば、塩化アンモニウム、炭酸カリウム、及びＥＤＴＡを含む緩衝液）に曝露することによって溶解させる、本開示の試料タイプである。このような塩化アンモニウム含有緩衝液によってＲＢＣを溶解するが、そのような緩衝液はリンパ球に対する影響が最小限であるため、本明細書で使用する「試料溶解緩衝液」の範囲には入らないであろう。
ある特定の実施形態では、例えば図２Ａ及び図９の下部のプロセス経路に示すように、開示された主題の方法及びシステムは、利点の中でも特に、迅速試料調製を実行するための特定の試料溶解緩衝液の使用に少なくとも部分的に起因して、結果が得られるまでの時間の改善及び単位サイズ当たりのスループットの改善を達成することができる。ある特定の実施形態では、試料調製プロセスは、試料を、以下の両方を含む試料溶解緩衝液と接触させることによって達成される：（１）試料内に存在する病原体、感染因子、及び／または細胞の膜または壁を破壊し、病原体、感染因子、及び／または細胞の内容物を放出するように適合された溶液、例えば、従来の試料溶解緩衝液；ならびに（２）プロテアーゼ、例えば、プロテイナーゼＫであって、従来、別個の前溶解溶液と組み合わせて使用され、ヌクレアーゼ（試料溶解緩衝液への試料の曝露中に放出される核酸を分解する酵素）を不活化させ、核酸に共有結合または非共有結合したタンパク質、例えばＨＢＶ ＤＮＡに共有結合したタンパク質を分解する、従来、別個の溶解前溶液と組み合わせて使用される、プロテイナーゼＫ。ある特定の実施形態では、試料へのプロテアーゼ、例えばプロテイナーゼＫの添加は任意である。例えば、限定するものではないが、試料調製プロセスは、試料を、試料溶解緩衝液と接触させることによって（例えば、プロテアーゼ、例えばプロテイナーゼＫの非存在下で）達成することができる。
追加的または代替的に、例えば図９の上部のプロセス経路に示されるように、試料溶解プロセスは、従来の試料溶解緩衝液、例えば、プロテアーゼを含まない緩衝液を利用する。例えば、そのような試料調製方法及び構成要素は、試料を従来の試料溶解緩衝液と接触させる前に、ヌクレアーゼを不活化して、核酸に共有結合または非共有結合するタンパク質、例えばＨＢＶ ＤＮＡに共有結合するタンパク質を分解するプロテアーゼを含有するプレコンディショニング溶液と試料を接触させることによる試料のプレコンディショニングを利用することができる。
追加的に、または代替的に、例えば、図２～３及び５～６に示される方法及びシステム、すなわち本開示は、「前溶解システム」と呼ばれるものにおいて、試料と試料溶解緩衝液との接触を開始するように構成された方法及びシステムに関する。ある特定の実施形態では、その後、試料溶解緩衝液の存在下で試料をインキュベートするように構成されたシステムを、本明細書では「溶解システム」と呼ぶ。したがって、本明細書で使用される場合、前溶解システムでは一般に、ドナー（またはドナーのプール）からの試料を、試料溶解緩衝液及び微粒子含有試薬と合わせ、その後、試料溶解システム内で溶解及び核酸捕捉を受ける。したがって、これらのシステムとの関係における「前溶解」の使用は、ヌクレアーゼを不活化し、核酸に共有結合または非共有結合したタンパク質を分解する目的でのプロテアーゼを含む溶液との関係における「プレコンディショニング」の使用とは異なっている。
追加的に、または代替的に、本開示で使用するための試料溶解緩衝液は、以下の成分：プロテアーゼ、界面活性剤、タンパク質変性剤、及び緩衝液のうちの１つ以上を含むことができる。ある特定の実施形態では、本開示で使用するための試料溶解緩衝液は、プロテアーゼ、界面活性剤、緩衝液、及びタンパク質変性剤を含む。ある特定の実施形態では、プロテアーゼは任意である。
追加的または代替的に、プロテアーゼは、１つ以上のヌクレアーゼを分解または不活化し、及び／または核酸に共有結合または非共有結合したタンパク質を分解する酵素である。ある特定の実施形態では、プロテアーゼは、セリンプロテアーゼである。ある特定の実施形態では、プロテアーゼは、プロテイナーゼＫである。
ある特定の実施形態では、界面活性剤は、非イオン性、アニオン性、及び／または両性イオン性であり得る。界面活性剤の非限定的な例としては、Ｔｒｉｔｏｎ－Ｘ、例えばＴｒｉｔｏｎＸ－１００（２－［４－（２，４，４－トリメチルペンタン－２－イル）フェノキシ］エタノール）またはＴｒｉｔｏｎＸ－１１４（２－［２－［４－（２，４，４－トリメチルペンタン－２－イル）フェノキシ］エトキシ］エタノール）、Ｔｗｅｅｎ（ポリオキシエチレンソルビタンモノラウレート）、例えば、Ｔｗｅｅｎ－２０（ポリオキシエチレン（２０）ソルビタンモノラウレート）またはＴｗｅｅｎ－８０（ポリオキシエチレン）（８０）ソルビタンモノラウレート）、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）、オクチルチオグルコシド、オクチルグルコシド及び３－［（３－コールアミドプロピル）ジメチルアンモニオ］－１－プロパンスルホネート（ＣＨＡＰＳ）が挙げられる。ある特定の実施形態では、界面活性剤は、非イオン性界面活性剤、例えばＴｗｅｅｎである。
ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液は、ｐＨが、約５．５～約８．０、例えばｐＨが、約６．０、約６．５、約７．０または約７．５である。ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液のｐＨは、溶解される試料に依存する。例えば、限定するものではないが、試料溶解緩衝液のｐＨは、６．０であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液のｐＨは、約７．８であり得る。
ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液は、カオトロピック剤、緩衝液及び界面活性剤を含む。カオトロピック剤の非限定的な例としては、グアニジニウム塩（例えば、チオシアン酸グアニジニウム、塩酸グアニジニウム、塩化グアニジニウム及びイソチオシアン酸グアニジニウム）、尿素、ヨウ化カリウム、過塩素酸塩（例えば、過塩素酸カリウム）及び他のタイプのチオシアン酸塩が挙げられる。ある特定の実施形態では、カオトロピック剤はチオシアン酸グアニジニウム（ＧＩＴＣ）である。ある特定の実施形態では、溶解緩衝液はプロテアーゼをさらに含むことができる。
ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液は、約２．５～約４．７ＭのＧＩＴＣ及び約２％～約１０％のＴｗｅｅｎ－２０を含む。ある特定の実施形態では、例えば、血漿または血清試料用の試料溶解緩衝液は、約４．７ＭのＧＩＴＣ、約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約７．８のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、例えば、全血試料用の試料溶解緩衝液は、約３．５ＭのＧＩＴＣ、約２．５％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約６．０のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液は、３．１３ＭのＧＩＴＣ、６．７％のＴｗｅｅｎ－２０、１００ｍＭのトリス、及び約７．８のｐＨを含む。
追加的に、または代替的に、試料に加えられる試料溶解緩衝液の体積は、試料の体積に依存する。ある特定の実施形態では、約１０μｌ～約１０００μｌ、例えば、約１００μｌ～約１０００μｌの試料溶解緩衝液を試料に加えることができる。ある特定の実施形態では、約７５０μｌの溶解緩衝液を、試料に加えることができる。ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液の体積対試料の体積の比は、約１：１００～約１００：１である。ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液の体積対試料の体積との比は約１：１である。ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液の体積対試料の体積の比は約０．７５：１である。
追加的に、または代替的に、溶解を促進するのに十分な時間で試料をインキュベートすることができる。例えば、限定するものではないが、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約６００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約５４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約４８０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約４２０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約３６０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約３００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約２４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約１８０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６０秒～約１２０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約６００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約５４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約４８０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約４２０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約３６０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約３００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約１８０秒～約２４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約６００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約５４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約４８０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約４２０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約３６０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約２４０秒～約３００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約６００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約５４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約４８０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約４２０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３００秒～約３６０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約６００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約５４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約４８０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約４２０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３６０秒～約４００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約６００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約５４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４２０秒～約４８０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４８０秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４８０秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４８０秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４８０秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４８０秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４８０秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４８０秒～約６００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約４８０秒～約５４０秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約５４０秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約５４０秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約５４０秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約５４０秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約５４０秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約５４０秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約５４０秒～約６００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６００秒～約６０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６００秒～約５０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６００秒～約４０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６００秒～約３０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６００秒～約２０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約６００秒～約１０００秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、約３８４秒であり得る。ある特定の実施形態では、試料溶解の総インキュベーション時間は、少なくとも約６０秒、少なくとも約１２０秒、少なくとも約１８０秒、少なくとも約２４０秒、少なくとも約３００秒、少なくとも約３６０秒、少なくとも約３６０秒、少なくとも約４２０秒、少なくとも約４８０秒、少なくとも約５４０秒、または少なくとも約６００秒であり得る。
ある特定の実施形態では、試料は、約３７℃～約６０℃、例えば約５０℃～約６０℃の温度でインキュベートすることができる。例えば、限定するものではないが、温度は、約５０℃、約５１℃、約５２℃、約５３℃、約５４℃、約５５℃、約５６℃、５７℃、約５８℃、約５８℃、または約６０℃であり得る。ある特定の実施形態では、試料は、約５０℃～約６０℃の温度でインキュベートすることができる。
追加的または代替的に、特に図２Ｂ及び実施例５～２３を参照して、システム及び方法は、溶解、洗浄、及び溶出の統合プロセス経路を含むことができる。限定ではなく例示の目的で、同じ試料タイプ（例えば、全血、血漿、血清など）は、その後実行される特定の核酸分析に関係なく、試料調製プロセス経路、例えば、図２Ｂに示される試料調製プロセス経路に沿って同じ様式で処理することができる。したがって、例えば試料容器から試料を吸引することによって試料溶解プロセスを開始し、本明細書に開示されるようなその後の増幅及び検出のための溶出液を生成するための核酸の溶出で終了するか、または本明細書に開示される増幅及び検出システムの容器への溶出液の移送で終了し、この統合プロセス経路技法は、利点の中でも特に、試料調製の開始後に実行される特定の核酸分析を改変する機能を提供して、試料調製の効率及び方法及びシステム全体の柔軟性を改善させることができる。
２．２洗浄及び溶出ステップ
開示された主題の別の態様によれば、本明細書の方法及びシステムは、１つ以上の洗浄及び溶出ステップを含む洗浄プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、第１の洗浄ステップにおける微粒子の洗浄によって始まり、増幅及び検出システムの容器への溶出液の移送によって終了する。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、試料調製プロセスの一部である。例えば、限定するものではないが、洗浄プロセスは、試料調製プロセスにおける溶解プロセスの後に続く。
以下により本明細書に詳細に記載するように、本開示の洗浄及び溶出ステップ（例えば、洗浄プロセスのそれぞれ）は、利点の中でも特に、本開示の方法及びシステムによって達成される、結果が得られるまでの時間の大幅な改善及び単位サイズ当たりのスループットの改善を少なくとも部分的に支持する、明確な利点を提供する。例えば、洗浄及び溶出ステップは、病原体または感染因子を検出するために本明細書に記載される種々の核酸分析のいずれかによって分析することができる核酸を溶出するように構成することができ、これにより、試料を増幅及び検出のために調製した後でも検出される病原体または感染因子の変更が可能になる。
ある特定の実施形態では、少なくとも１回の洗浄ステップにより、少なくとも１回の洗浄が生成され、少なくとも１回の溶出により、少なくとも１つの溶出液が生成される。ある特定の実施形態では、図２Ａ～２Ｂ及び図７９に示すように、洗浄及び溶出ステップを、溶解ステップの後に実行する。洗浄及び溶出のステップは一般に、試料から核酸を精製するため、ならびに増幅及び／または検出動作を阻害する可能性がある細胞破片及び／または溶解緩衝液成分、例えばＧＩＴＣ、を除去するために利用する。
試料から核酸を精製するための様々な好適な技法または方法を、洗浄及び／または溶出ステップと関連して使用することができる。例えば、限定するものではないが、試料内に存在する核酸は、目的の核酸を含む、核酸に結合できる微粒子、例えばＣｕＴｉ微粒子の使用によって単離することができる。ある特定の実施形態では、例えば図４に示すように、直接的な核酸捕捉、例えば、微粒子（例えば、磁性ガラス粒子）を使用するか、または標的核酸に相補的な核酸でコーティングされた他の固体支持体を使用することができる。限定ではなく例示の目的で、洗浄及び溶出ステップは、洗浄容器が装填された複数の位置を備えた洗浄トラックシステム上で実行することができる。
ある特定の実施形態では、試料とともに存在する核酸は、試料を溶解緩衝液、微粒子、例えばＣｕＴｉ微粒子、及び任意選択でプロテアーゼ、例えばプロテイナーゼＫと接触させることによって単離することができる。ある特定の実施形態では、試料とともに存在する核酸は、試料を溶解緩衝液、内部対照（ＩＣ）核酸、微粒子、例えばＣｕＴｉ微粒子、及び任意選択でプロテアーゼ、例えばプロテイナーゼＫと接触させることによって単離することができる。
２．３ 微粒子ベースの全核酸捕捉
さらに、開示された主題によれば、本開示の方法及びシステムによって、利点の中でも特に、感度を犠牲にすることなく、時間及び効率の大幅な改善が達成され、これによりユニットサイズ当たりのスループットの向上がもたらされ、これは、少なくとも部分的には、微粒子ベースの全核酸捕捉の使用によるものである。微粒子ベースの全核酸捕捉は、ある特定の実施形態では、核酸に非選択的に結合することができ、したがって配列に関係なく核酸の捕捉が可能になる微粒子の使用を指す。本明細書に開示されるように、結合核酸を有する微粒子を、洗浄プロセスの１つ以上の洗浄ステップ中に洗浄して、試料の非核酸成分を除去することができる。次に、洗浄された微粒子を、結合核酸の溶出を引き起こす条件に曝露することができる。微粒子ベースの全核酸捕捉は、配列特異的相互作用に依存しないため、これにより、配列特異的アプローチで結合を巡って競合する可能性のある、存在量の少ない核酸及び／または類似の配列を有する核酸の捕捉が容易になる可能性がある。微粒子ベースの全核酸捕捉に関連して使用することができる微粒子の１つのタイプは、銅チタン（「ＣｕＴｉ」）微粒子である。本明細書に開示されるように、試料の溶解、洗浄、及び溶出のステップでは、微粒子ベースの全核酸捕捉を利用する。本開示で使用するための例示的なＣｕＴｉ微粒子ベースの全核酸捕捉態様は、米国特許公開第２０１７／００８１６５５号に提供されており、その内容はその全体が本明細書に組み込まれる。
図４に示すように、例示的な微粒子ベースの全核酸捕捉の態様には、試料、例えば溶解試料内の核酸に結合するためのＣｕＴｉ微粒子の使用が含まれる。特に、ＣｕＴｉ微粒子によって、複数の有機抽出手順を含む従来の態様と比較して、核酸の迅速な精製が可能になり得る。ＣｕＴｉ微粒子の使用のさらなる利点は、米国特許第１０，５２６，５９６号に詳細に記載されており、その全体が本明細書に組み込まれる。
追加的または代替的に、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子は、約０．５～約５０μｍ、例えば、約０．５μｍ、約１．０μｍ、約１．５μｍ、約２．０μｍ、約５．０μｍ、約１０．０μｍ、約２０．０μｍ、約３０．０μｍ、約４０．０μｍまたは約５０．０μｍの直径を有する。ある特定の実施形態では、ＣｕＴｉは、Ｃｕ対Ｔｉの比が約２：１、例えば、約３対約１、約２対約１、約１対約１、約１対約２、または約１：３の比で、ＣｕＴｉ微粒子中に存在する。
ある特定の実施形態では、微粒子は、約１μｌ～約１００μｌの粒子体積で、本開示の方法に使用することができる。例えば、限定するものではないが、微粒子は、約５μｌ～約１００μｌ、約５μｌ～約５０μｌ、または約１０μｌ～約５０μｌの粒子体積で本開示の方法において使用することができる。
追加的または代替的に、本開示の方法に関連して使用される微粒子、例えばＣｕＴｉ微粒子は、試料中の少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または少なくとも約１００％のＤＮＡ及びＲＮＡなどの核酸に結合することができる。
追加的または代替的に、本開示の方法に関連して使用される微粒子、例えばＣｕＴｉ微粒子への核酸の結合に続いて、微粒子を、本明細書に開示される洗浄プロセスを使用して洗浄し、試料中の微粒子から汚染物質及び／または望ましくない物質を除去する。ある特定の実施形態では、洗浄プロセス、例えば洗浄及び溶出ステップは、複数回の洗浄を含むことができる。例えば、限定するものではないが、洗浄プロセスは、少なくとも約２回の洗浄、少なくとも３回の洗浄、または少なくとも４回の洗浄を含む。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、少なくとも約３回の洗浄を含む。ある特定の実施形態では、例えば全核酸の捕捉に使用するために、実施例８に示すように、洗浄プロセスは３回の洗浄を含む。ある特定の実施形態では、例えば標的核酸の捕捉に使用するために、実施例４に示すように、洗浄プロセスは２回の洗浄を含む。
ある特定の実施形態では、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子を、各洗浄溶液中で約１０秒～約５分、例えば、約２０秒～約２分、約２０秒～約１分、約２０秒～約４８秒、約２０秒～約３０秒、約３０秒～約９０秒、または約３０秒～約５０秒間洗浄する。ある特定の実施形態では、微粒子を、各洗浄溶液中で約４０秒間洗浄する。ある特定の実施形態では、洗浄剤の少なくとも１つは界面活性剤及び／またはタンパク質変性剤を含む。界面活性剤の非限定的な例を本明細書に記載する。
追加的に、または代替的に、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子を、試料から除去し、洗浄溶液中に入れることができる。例えば、限定するものではないが、本開示の方法に関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子は、磁石を使用して捕捉し、洗浄溶液を含むウェルに移送することができる。限定ではなく例として、磁気チップを使用して微粒子を移送することができる。追加的または代替的に、特定の実施形態では、プランジャを用いて微粒子を移送することができる。追加的または代替的に、微粒子は移動磁石または固定磁石を使用して移送することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子を、捕捉して、別の洗浄溶液中に入れることができる。
追加的に、または代替的に、本開示で使用するための洗浄溶液は、約５．５～約８．０のｐＨ、例えば、約６．０、約６．５、約７．０または約７．５のｐＨを有する。ある特定の実施形態では、洗浄溶液のｐＨは試料に依存する。例えば、限定するものではないが、洗浄緩衝液のｐＨは、６．０であり得る。ある特定の実施形態では、洗浄溶液のｐＨは、約７．８であり得る。
追加的に、または代替的に、約１０μｌ～約５００μｌの体積の洗浄溶液を各洗浄に使用することができる。例えば、限定するものではないが、約１００μｌ～約５００μｌの体積の洗浄溶液、例えば約２５０μｌを、各洗浄に使用することができる。
ある特定の実施形態では、洗浄のうちの少なくとも１回は、溶解緩衝液を使用して実行する。ある特定の実施形態では、洗浄のうちの１回は、約２．５Ｍ～約４．７ＭのＧＩＴＣ及び約２％～約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約５．５～約８．０のｐＨを含む洗浄溶液、例えば第１の洗浄溶液を使用して実行する。ある特定の実施形態では、洗浄のうちの１回は、約４．７ＭのＧＩＴＣ、約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約７．８のｐＨを含む血漿または血清試料を洗浄するための第１の洗浄溶液を使用して実行する。ある特定の実施形態では、洗浄のうちの１回は、約３．５ＭのＧＩＴＣ、約２．５％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約６．０のｐＨを含む全血試料を洗浄するための第１の洗浄溶液を使用して実行する。ある特定の実施形態では、洗浄のうちの１回は、約３．１３ＭのＧＩＴＣ、約６．７％のＴｗｅｅｎ－２０、１００ｍＭトリス、及び約７．８のｐＨを含む全血試料を洗浄するための第１の洗浄溶液を使用して実行する。ある特定の実施形態では、洗浄のうちの少なくとも１回は、水を使用して実行する。例えば、限定するものではないが、第１、第２及び第３の洗浄は、水を使用して実行することができる。ある特定の実施形態では、第２及び第３の洗浄は、水を使用して実行することができる。ある特定の実施形態では、第１の洗浄は、溶解緩衝液を使用して実行する。ある特定の実施形態では、第１の洗浄は、溶解緩衝液を使用して実行し、第２及び第３の洗浄は、水を使用して実行する
追加的に、または代替的に、結合核酸を、洗浄後に、続いて、本開示の方法に関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子から溶出する。例えば、限定するものではないが、本開示の方法に関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子を、最終洗浄溶液、例えば、第３の洗浄溶液から捕捉し、溶出緩衝液中に入れる。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液を使用した、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えばＣｕＴｉ微粒子からの核酸の溶出により、予め結合した核酸を含む溶出液を生成する。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液は、約５ｍＭ～約１０ｍＭのリン酸塩を含み、約７．５～約９．０のｐＨを有する。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液は、５ｍＭのＰＯ４溶液を含む。ある特定の実施形態では、溶出ステップは、結合核酸を有する微粒子を、５ｍＭのＰＯ４溶液中で８０ｏＣにて、例えば約３分間インキュベートすることを含む。
追加的または代替的に、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子を、溶出緩衝液中で約１分～約１０分間、例えば、約２分～約９分間、約３分～約８分間、約２分～約４分間、または約３分～約４分間インキュベートする。ある特定の実施形態では、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子を、溶出緩衝液中で約３分間インキュベートする。ある特定の実施形態では、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えば、ＣｕＴｉ微粒子を、溶出緩衝液中で約２００秒以下、例えば約１９２秒以下の間インキュベートする。ある特定の実施形態では、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えばＣｕＴｉ微粒子を、約６０ｏＣ～約１００ｏＣ、例えば約７０ｏＣ～約９０ｏＣ、または約７５ｏＣ～約８５ｏＣの温度にて溶出緩衝液中でインキュベートする。ある特定の実施形態では、本開示の方法と関連して使用される微粒子、例えばＣｕＴｉ微粒子を、約８０ｏＣの温度にて溶出緩衝液中でインキュベートする。次に、得られた溶出液は、その後の増幅反応に使用することができ、ある特定の実施形態では、病原体または感染因子を検出するために、本明細書に記載の種々の核酸分析のいずれかに使用することができる。ある特定の実施形態では、得られる溶出液は、約５μＬ～約５００μＬ、例えば、約１０μＬ～約２５０μＬ、または約１０μＬ～約１００μＬの体積を有する。
上述の例示的な実施形態はＣｕＴｉ微粒子の使用に言及しているが、本開示の方法及びシステムは、ＣｕＴｉ微粒子に加えて、またはＣｕＴｉ微粒子の代替物として、多種多様な粒子及び／または固体支持体を組み込んで、核酸、例えば標的核酸の単離を促進する。例えば、限定するものではないが、本開示の方法及びシステムは、粒子、例えば、微粒子、及び／または多種多様な金属酸化物を含むか、またはそれでコーティングされた固体支持体を利用することができる（例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第６，９３６，４１４号を参照のこと）。しかし、本開示は特定の金属酸化物に限定されない。ある特定の実施形態では、金属または金属酸化物は、ＡｌＴｉ、ＣａＴｉ、ＣｏＴｉ、Ｆｅ２Ｔｉ、Ｆｅ３Ｔｉ、ＭｇＴｉ、ＭｎＴｉ、ＮｉＴｉ、ＳｎＴｉ、ＺｎＴｉ、Ｆｅ２Ｏ３、Ｆｅ３Ｏ４、Ｍｇ、Ｍｎ、Ｓｎ、Ｔｉ、またはＺｎ（例えば、無水または水和形態）である。さらに、ある特定の実施形態では、粒子及び／または固体表面は、有機ポリマー、例としてポリスチレン及びその誘導体、ポリアクリレート及びポリメタクリレート及びその誘導体、またはポリウレタン、ナイロン、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリブチレン、及びこれらの材料のコポリマーから構成される。ある特定の実施形態では、粒子は、多糖、特にヒドロゲル、例としてアガロース、セルロース、デキストラン、Ｓｅｐｈａｄｅｘ、Ｓｅｐｈａｃｒｙｌ、キトサン、無機材料、例としてガラス、またはさらなる金属酸化物及びメタロイド酸化物（例えば、式ＭｅＯの酸化物、式中、Ｍｅは、例えばＡｌ、Ｔｉ、Ｚｒ、Ｓｉ、Ｂ、特にＡｌ２Ｏ３、ＴｉＯ２、シリカ及び酸化ホウ素から選択される）または金属表面、例えば金である。
追加的に、または代替的に、粒子は磁性（例えば、常磁性、フェリ磁性、強磁性、または超常磁性）であるが、本開示の方法及びシステムは非磁性である。いくつかの実施形態では、粒子及び／または固体表面は、平面、針状、立方体、管状、繊維状、柱状または非晶質形状を有することができるが、他の幾何学的形状も企図される。
２．４ 微粒子による標的核酸の直接捕捉
本明細書でさらに開示されるように、本開示の方法及びシステムによって、利点の中でも特に、感度を犠牲にすることなく、時間及び効率の大幅な改善により、ユニットサイズ当たりのスループットを向上させることができ、これは、少なくとも部分的には、試料溶解、洗浄、及び溶出ステップにおける標的核酸の微粒子ベースの直接捕捉の使用に基づいている。図４に示すように、微粒子ベースの標的核酸の直接捕捉は、捕捉オリゴヌクレオチド、すなわち、配列選択的な様式で、目的の標的核酸を捕捉するために微粒子に結合した、目的の標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチドの使用を含むことができる。したがって、標的核酸の直接捕捉は、配列選択的ではない、全核酸を捕捉する他のシステムとは異なる。捕捉され、したがって最終的に溶出される核酸を標的核酸に限定することにより、標的核酸を直接捕捉することによって、潜在的に競合する非標的核酸が存在しないため、標的核酸の増幅及び検出が容易になり得る。
ある特定の実施形態では、微粒子は、は、約０．５～約５０μｍ、例えば、約０．５μｍ、約１．０μｍ、約１．５μｍ、約２．０μｍ、約５．０μｍ、約１０．０μｍ、約２０．０μｍ、約３０．０μｍ、約４０．０μｍまたは約５０．０μｍの直径を有する。
ある特定の実施形態では、微粒子は、試料中の少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または少なくとも約１００％のＤＮＡ及びＲＮＡなどの核酸に結合することができる。
追加的または代替的に、微粒子への核酸の結合に続いて、微粒子を洗浄し、試料中の微粒子から汚染物質及び／または望ましくない物質を除去する。ある特定の実施形態では、洗浄及び溶出ステップは、複数回の洗浄を含む。例えば、限定するものではないが、洗浄プロセスには、少なくとも約２回の洗浄、少なくとも３回の洗浄、または少なくとも４回の洗浄が含まれる。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、少なくとも約２回の洗浄を含む。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、少なくとも約３回の洗浄を含む。
追加的に、または代替的に、洗浄剤の少なくとも１つは界面活性剤及び／またはタンパク質変性剤を含む。界面活性剤の非限定的な例を本明細書に記載する。
追加的に、または代替的に、本開示で使用するための洗浄溶液は、約５．５～約８．０のｐＨ、例えば、約６．０、約６．５、約７．０または約７．５のｐＨを有する。ある特定の実施形態では、洗浄溶液のｐＨは試料に依存する。例えば、限定するものではないが、洗浄緩衝液のｐＨは、６．０であり得る。ある特定の実施形態では、洗浄緩衝液のｐＨは、約７．８であり得る。ある特定の実施形態では、洗浄のうちの少なくとも１回は、水を使用して実行する。例えば、第１及び第２の洗浄は、水を使用して実行することができる。ある特定の実施形態では、第２及び第３の洗浄は、水を使用して実行することができる。ある特定の実施形態では、第１の洗浄は、溶解緩衝液を使用して実行し、第２及び第３の洗浄は、水を使用して実行する
追加的または代替的に、約１０μｌ～約５００μｌの体積の洗浄溶液を各洗浄に使用することができる。例えば、限定するものではないが、約１００μｌ～約５００μｌの体積の洗浄溶液、例えば約２５０μｌを、各洗浄に使用することができる。
ある特定の実施形態では、結合した核酸を、微粒子の洗浄後に微粒子から溶出させる。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液を使用して微粒子から核酸を溶出させ、溶出液を生成する。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液は、約５ｍＭ～約１０ｍＭのリン酸塩、及び約７．５～約９．０のｐＨを含む。
追加的または代替的に、微粒子を、溶出緩衝液中で約１分～約１０分間、例えば約１分～約９分間、約１分～約７分間、約１分～約６分間、約１分～約５分間、約１分～約４分間、または約１分～約３分間インキュベートする。ある特定の実施形態では、微粒子を、全核酸を捕捉するために、溶出緩衝液中で約３分間インキュベートする。ある特定の実施形態では、微粒子を、溶出緩衝液中で約２分間インキュベートする。ある特定の実施形態では、微粒子を、オリゴヌクレオチドを直接捕捉するために、溶出緩衝液中で約２分間インキュベートする。ある特定の実施形態では、微粒子を、溶出緩衝液中で約１９２秒（すなわち、約３．２分間）インキュベートする。ある特定の実施形態では、微粒子を、約６０ｏＣ～約１００ｏＣ、例えば約７０ｏＣ～約９０ｏＣ、または約７５ｏＣ～約８５ｏＣの温度にて溶出緩衝液中でインキュベートする。ある特定の実施形態では、微粒子を、約８０ｏＣの温度にて溶出緩衝液中でインキュベートする。得られた溶出液はその後の増幅反応に使用することができ、ある特定の実施形態では、病原体または感染因子を検出するために、本明細書に記載の種々の核酸分析のいずれかに使用することができる。
２．５ 磁気移送
例えば、本明細書でさらに開示され、実施例２、図１５～１７、及び４２を参照して本明細書で具体化されるように、利点の中でも特に、結果が得られるまでの時間の大幅な改善及び単位サイズ当たりのスループットの改善が、本開示のシステムの方法及び方法によって達成され、これは、少なくとも部分的には、磁性粒子の磁気捕捉を伴う動作ステップの組み込みによるものである。このような動作ステップには、限定するものではないが、混合；洗浄；磁性粒子の移送、が含まれる。磁性粒子を混合及び洗浄する既存の方法は、一般に、機械的撹拌及び可動永久磁石を使用する磁気混合に依存している。しかし、ある特定の実施形態では、そのような混合、洗浄、及び／または移送は、少なくとも１つの固定電磁石ベースの磁性粒子の捕捉を組み込んだシステムを用いて実行することができる。例えば、限定するものではないが、本明細書で識別される１つ以上の別個の混合または洗浄位置は、磁性粒子の固定電磁石ベースの捕捉を使用して達成することができる。加えて、本明細書に記載されるある特定の実施形態は、本明細書に記載されるシステム内の１つ以上の移送位置における１つ以上の移送動作に関連して、磁性粒子の少なくとも１つの固定電磁石ベースの捕捉を組み込んだシステムを用いて実行することができる。当業者には理解されるように、個々の位置の具体的な数、配向、及び動作上の割り当て（例えば、混合、洗浄、移送、または溶出）は、所望の場合、変更することができ、それでも本開示の範囲内にとどまる。
本開示は、ある特定の実施形態では、適切な混合、洗浄、及び移送動作を達成するために、様々な位置で可動永久磁石及び／または固定電磁石を使用することを企図する。例えば、限定するものではないが、可動永久磁石及び／または電磁石をウェルの右側、左側、及び／または底部に位置決めすることができる。加えて、可動永久磁石及び／または電磁石は、一方の側が他方の側よりも高い位置に位置決めすることができる。本開示の可動永久磁石及び／または固定電磁石は、当技術分野で公知のさまざまなウェル形式と組み合わせて使用することもできる。
ある特定の実施形態では、磁性粒子を、洗浄ウェルの反対側に交互に引き付けるように、対向する可動永久磁石及び／または電磁石を配置することができる。しかし、可動永久磁石及び／または電磁石の位置、タイミング、電力、及びシーケンスは完全に柔軟性がある。例えば、限定するものではないが、固定電磁石を使用して磁性粒子を部分的に収集し、収集した粒子をウェルの底部に落下させることができる。追加的に、または代替的に、混合、洗浄、及び／または移送を容易にするために、磁性粒子をウェルの側面に収集することができる。さらに、より低い電力で磁性粒子をゆっくりと収集することができ、またはより高い電力でより迅速に磁性粒子を収集することができる。
本明細書に開示される実施形態に関連して使用するために、異なるタイプの電磁石を企図することができる。例えば、ＤＣ電磁石を使用することもできるが、ＤＣ電磁石は磁性粒子を磁化する場合があるため、スイッチング周波数を変えることによって磁性粒子の残留磁気の生成を避けるために、ＤＣ電磁石と組み合わせて、またはＤＣ電磁石の代わりにＡＣ電磁石を使用することもできる。
永久磁石に加えて、またはその代わりに（または他の混合、洗浄、または移送の態様で）電磁石を使用すると、いくつかの利点が提供される。試料調製中の混合または移送動作では、典型的には、永久磁石を磁性粒子の範囲内または範囲外に移動させる必要がある。電磁石を使用すると、電磁石をスイッチオン／オフするだけで動作機構を排除することができる。さらに、アレイ内の隣接する磁石を連続的にスイッチオン及びオフにすることによって、磁性粒子をあるウェルから別のウェルに移動させることができる。固定電磁石ベースの粒子捕捉アプローチを組み込むと、検査ごとに１つ以上の使い捨て製品を排除することができるため、発生する固形廃棄物の量を削減することができる。固定電磁石を使用すると、特定の容積要件、及び磁性粒子をあるウェルから別のウェルに移送する際のウェルの使い捨てカバーまたは可動永久磁石も不要になる。本態様はまた、洗浄容器の側面に隣接する可動電磁石を使用してウェル間で磁性粒子を移送することもできるが、ウェル内の磁性粒子または液体には接触せず、磁性粒子の損失及びソースウェルから行先のウェルへの液体キャリーオーバーを最小限に抑え、したがってアッセイ性能を最大化することができる。例えば、試料からの汚染物質が少なく、より多くの核酸を含む溶出液を提供することによる。
いくつかの実施形態では、移送は、ウェルの下の可動磁石を使用してウェルの底部の内部チャネル内の微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。ある特定の実施形態では、例えば磁性粒子の移動を達成するために隣接する磁石を選択的にスイッチオン／オフする固定電磁石を利用することができる。逆粒子処理などの微粒子を移送する他の方法も、使用することができる。
２．６前処理プロセス
本開示は、ある特定の実施形態では、前処理プロセスで試料を処理する使用を企図する。例えば、限定するものではないが、微粒子の存在下でさらなる試料処理を行う前に、全血試料を前処理溶解プロセスで処理して、溶解全血試料を生成することができる。
２．６．１ 全血の前処理
開示された主題の一態様によれば、前処理プロセスは、前処理溶解プロセスであり得る。例えば、前処理プロセスは、上述の溶解プロセス（例えば、微粒子の存在下での試料溶解緩衝液による溶解）及び洗浄プロセスの前に、試料（例えば、全血）に対して実行することができる。ある特定の実施形態では、前処理溶解プロセスは、全血試料を溶解緩衝液、例えばＲＢＣ溶解溶液と接触させることを含む。ある特定の実施形態では、前処理溶解プロセスは、例えば、全血試料対溶解緩衝液の比が約１：１で、全血試料を溶解緩衝液と接触させることを含む。
ある特定の実施形態では、前処理プロセス、例えば、前処理溶解プロセスは、試料調製領域内の試料搬送機において実行することができる。例えば、ある特定の実施形態では、前処理プロセスは、容器を、試料分注位置と試料捕捉及び移送位置との間で試料搬送機の搬送経路に沿って連続的に搬送するときに、試料搬送機上の容器内で実行することができる。ある特定の実施形態では、前処理プロセス及び前処理溶解プロセスは、試料搬送機において実行することができる。追加的または代替的に、本明細書でさらに説明するように、ある特定の実施形態では、前処理プロセス、オンボードプーリングプロセス、及び溶解プロセスを試料搬送機において実行することができる。例えば、ある特定の実施形態では、試料が試料搬送機上の容器内で前処理プロセスを完了した後、試料を容器から吸引し、試料搬送機上の別の容器に、例えば最初の試料分注位置で分注し、試料調製プロセスの別の態様で続ける。例えば、前処理後、試料を最初の分注位置で容器に分注して、溶解プロセスを開始することができる。
例の目的で、また本明細書で具体化されるように、前処理プロセスは、試料調製カルーセル、例えば溶解カルーセル上で実行することができる。前処理プロセスに関する例示的な動作を、以下の表Ａに示す。
Figure 2024518331000001
本実施形態では、例示的な位置Ｌ１は、試料調製カルーセル、例えば溶解カルーセル６４１１への溶解チューブの装填に対応する。ある特定の実施形態では、装填は、装填可能なスタックからの公知の「ピックアンドプレース（Ｐｉｃｋ＆Ｐｌａｃｅ）」戦略によって達成する。Ｌ２は、溶解緩衝液分注位置に対応する。Ｌ４は、試料分注位置に対応する。この位置で分注される試料は、公知の「シップアンドスピット（Ｓｉｐ＆Ｓｐｉｔ）」戦略によって試料コンテナから分注することができる。
例示的な位置Ｌ５～Ｌ１６は、インキュベーション及び混合位置に対応する。例えば、インキュベーション及び混合位置Ｌ５～Ｌ１６には、抵抗ヒーター、カルーセル動作、ポップアップミキサー、ロックステップ移送、及び／または時間優先スケジューリングの使用を組み込むことができる。ある特定の実施形態では、位置Ｌ５～Ｌ１６には、１つ以上の試料溶解緩衝液中でのインキュベーションを組み込むことができる。ある特定の実施形態では、試料は、約３分～約６分間、約４分～約６分間、または約５分～約６分間インキュベート及び混合することができる。ある特定の実施形態では、試料は、約３分間、約４分間、約５分間、または約６分間インキュベート及び混合することができる。ある特定の実施形態では、試料は約２８８秒間、すなわち約４．８分間インキュベート及び混合することができる。
例示的な位置Ｌ１７は、試料調製カルーセルから試料を吸引すること、及び試料を最初の試料分注位置（例えば、例示的な位置Ｌ４）に戻すことに対応する。上述したように、ある特定の実施形態では、前処理プロセスの完了後、試料を試料用想機上の別の容器に移送して、試料調製プロセスの別の態様を開始することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料を最初の分注位置に戻して、溶解プロセスを開始することができる。例示的な位置Ｌ２０は、前処理プロセスからの残りの内容物、例えば、残りの溶解内容物を吸引することに対応する。例示的な位置Ｌ２１は、溶解チューブを移送して廃棄することに対応する。
ある特定の実施形態では、核酸分析を実行する時間（例えば、結果が得られるまでの時間またはＴＴＲ）には、前処理プロセスを実行するのに必要な時間を含めることができる。ある特定の実施形態では、試料前処理プロセスは、核酸分析のための試料の最初の吸引から開始することができる。例えば、ある特定の実施形態では、前処理プロセスは、試料調製カルーセル上に分注するための（例えば、例示的な位置Ｌ４で分注するための）試料容器からの試料の吸引時に開始することができ、前処理済試料を試料搬送機上の別の容器に移送し、試料調製プロセスの別の態様、例えば、微粒子を含む溶解緩衝液を含む溶解チューブへ前処理済試料を分注することで終了する（例えば、前処理済試料を吸引する例示的な位置Ｌ１７から、及び前処理済試料を分注する例示的な位置Ｌ４へ）。あるいは、前処理プロセスは、試料調製カルーセル上に分注するための試料容器からの試料の吸引で開始し（例えば、例示的な位置Ｌ４）、溶解緩衝液中での試料のインキュベーションの完了で終了することができる（例えば、例示的な位置Ｌ１６）。
ある特定の実施形態では、前処理プロセス、例えば、前処理溶解プロセスは、約３分～約７分、約４分～約６分、または約５分～約６分で完了することができる。ある特定の実施形態では、前処理プロセスは、約３分、約４分、約５分、約６分、または約７分である。ある特定の実施形態では、前処理プロセスは約３３６秒、すなわち約５．６分であり得る。例えば、表Ａを参照すると、前処理プロセスは、位置Ｌ４で容器に試料を分注することで開始することができ、これは約２４秒で実行することができる。前処理プロセスは、約２８８秒間のインキュベーション及び混合をさらに含むことができる。さらに、前処理プロセスは、試料搬送上の容器、例えば溶解チューブから前処理済試料を吸引すること、及び試料搬送上の別の容器に前処理済試料を分注することを含むことができ、これを約２４秒で実行することができる。ある特定の実施形態では、前処理プロセスは、例えば、試料搬送機上の容器、例えば溶解チューブから前処理済を吸引し、試料搬送上の別の容器に前処理済を分注する時間が含まれない場合、例えば、例示的な位置Ｌ１７に対応する手順を実行する時間が含まれない場合、約３１２秒、すなわち約５．２分であり得る。
ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ１、Ｌ２、及びＬ４に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ１、Ｌ２、及びＬ４に対応する手順を実行する時間は、前処理プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ１及びＬ２に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ１及びＬ２に対応する手順を実行する時間は、前処理プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ１７、Ｌ２０、及びＬ２１に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ１７、Ｌ２０、及びＬ２１に対応する手順を実行する時間は、前処理プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ２０及びＬ２１に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ２０及びＬ２１に対応する手順を実行する時間は、前処理プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
３． 核酸増幅の態様；
開示された主題に従って、また本明細書に具体化されるように、試料の迅速な核酸検査のための本明細書に開示される方法及びシステムは、試料から単離された標的核酸を増幅するための固有の核酸増幅態様を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本明細書に開示される方法及びシステムは、ドナー試料から単離された標的核酸を増幅するための固有の核酸増幅態様を含む。例えば、限定するものではないが、本開示の方法及びシステムにおいて企図される核酸増幅方法及びシステム構成要素をここで参照する。
典型的には、核酸増幅は、試料中の標的核酸の数を増加させるために、例えば、それによって標的核酸の検出を容易にするために利用される。本明細書に具体化されるように、核酸増幅方法及びシステム構成要素は、好適な増幅技法の様々なものまたは組み合わせを使用して、標的核酸を増幅するように構成することができる。
本明細書でさらに開示され、図１、２Ａ～２Ｂ、９～１０、６６及び７９を参照して本明細書で具体化されるように、試料を調製した後、例えば、核酸を試料から単離した後、単離核酸を増幅することができる。開示された主題の一態様によれば、例えば、図６６に具体化されるように、増幅方法及びシステム構成要素は、単離核酸を、増幅オリゴヌクレオチド、例えば、フォワードプライマーオリゴヌクレオチド及びリバースプライマーオリゴヌクレオチド、ならびに本明細書に記載のプローブと接触させて、反応混合物を形成することを含む。次いで、反応混合物を増幅条件下に置く。本明細書で使用される「増幅条件」という用語は、増幅オリゴヌクレオチドのアニーリング及び／または伸長を促進する条件を指す。ある特定の実施形態では、このような条件には、例えば、図２Ｂ及び図２１に具体化されるように、単離核酸を「Ｅ－ミックス（Ｅ－Ｍｉｘ）」または「コアミックス（Ｃｏｒｅ Ｍｉｘ）」と接触させることが含まれる。典型的には、Ｅ－ミックスは、ＡＴＰ、ホスホクレアチン、及び緩衝液を含む溶液である。対照的に、コアミックスは、典型的には、核酸標的の増幅に必要なタンパク質の集合体を含む。例えば、限定するものではないが、ＲＰＡ増幅のための典型的なコアミックスは、ｇｐ３２、ｕｖｓＸ、ｕｖｓＹ、及びポリメラーゼを含むことができる。ある特定の実施形態では、このような条件には、単離核酸を「マスターミックス（ＭａｓｔｅｒＭｉｘ）」と接触させることが含まれる。本明細書で使用される場合、マスターミックスは、例えば、図６６に示す例示的な実施形態に示すように、増幅を開始させるために別個に提供することができる活性化剤を除き、その後の検出のために標的核酸を増幅するために必要なすべての成分、例えばヌクレオチド三リン酸、ポリメラーゼ、プライマー、及びプローブを含む溶液を指す。例えば、限定するものではないが、図６６は、活性化剤を最初に増幅容器に分注し（位置Ｒ４）、次いで、単離核酸を含む溶出液を増幅容器に分注し（位置Ｒ５）、最後にマスターミックスを増幅容器に分注する（位置Ｒ６）実施形態を示し、ただし、代替的添加順序が本明細書に記載の方法及びシステムの範囲内で企図される。増幅条件は、当技術分野で周知であり、選択された増幅方法に依存する。開示された主題によれば、増幅条件は、限定するものではないが、温度及び／または温度サイクル、緩衝液、塩、イオン強度、ｐＨなどを含む、広範囲の反応条件を包含する。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の増幅方法及びシステム構成要素は、標的核酸（複数可）が存在する場合、溶出核酸の試料の増幅を開始するのに十分な試薬の添加から、約１分～約６０分、約５分～約６０分、約８分～約６０分、または約８分～約５０分、または約８分～約４０分、または約８分～約３５分、または約８分～約３０分、または約８分～約２５分、または約８分～約２０分、約１分～約２２分、約５分～約２２分、約８分～約２２分、１分～約２０分、約５分～約２０分、約８分～約２０分、または約８分～約１５分の持続時間を有する迅速な増幅戦略の使用を含む。限定ではなく例示の目的で、本開示の増幅方法及びシステム構成要素は、増幅及び検出システム上で実行することができる。本明細書で具体化されるように、サブシステムは、例えば図７８に示されるような回転カルーセルを含む。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の増幅方法及びシステム構成要素は、当技術分野において公知の任意の好適な核酸配列増幅方法、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、逆転写酵素ＰＣＲ（ＲＴ－ＰＣＲ）、リアルタイムＰＣＲ、転写媒介増幅（ＴＭＡ）、ローリングサークル増幅、核酸配列ベースの増幅（ＮＡＳＢＡ）、鎖置換増幅（ＳＤＡ）、転写媒介増幅（ＴＭＡ）、シングルプライマー等温増幅（ＳＰＩＡ）、ヘリカーゼ依存性増幅（ＨＤＡ）、ループ媒介増幅（ＬＡＭＰ）、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅（ＲＰＡ）、ニッキング酵素増幅反応（ＮＥＡＲ）及びリガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、を使用して、試料中の病原体または感染因子の核酸配列を増幅することを含む。ある特定の実施形態では、増幅は、等温増幅、例えば、限定するものではないが、ＲＰＡまたはＮＥＡＲを介した等温増幅を使用して実行する。ある特定の実施形態では、等温増幅方法は、ＲＰＡである。ある特定の実施形態では、等温増幅方法は、ＮＥＡＲである。等温増幅方法に関する追加の非限定的な開示は、Ｏｌｉｖｅｉｒａ ｅｔ ａｌ．， Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ ｉｎ Ｓｅｎｓｏｒｓ ２：７５２６００ （２０２１）に提供されており、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。
３．１ ＲＰＡ
開示された主題に従って、また本明細書に具体化されるように、試料の核酸検査、例えばドナー血液の迅速なスクリーニングのための開示された主題の方法及びシステムは、標的核酸、例えば、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅（ＲＰＡ）を使用した感染因子の核酸配列の増幅を含むことができる。ＲＰＡは、リコンビナーゼ及び関連タンパク質成分の特性に依存して、一本鎖相同核酸を有する二本鎖核酸に侵入し、これにより、核酸ポリメラーゼ反応の配列特異的プライミングが可能になる。
典型的には、ＲＰＡ核酸増幅反応では、オリゴヌクレオチドプライマーと複合体を形成し、プライマーを二重鎖核酸の相同配列と対にする、リコンビナーゼとして知られる酵素を利用する。一本鎖核酸結合（ＳＳＢ）タンパク質は、置換核酸鎖に結合し、結果として生じるループを安定化させる。次に、核酸増幅を、プライマーから開始するが、これは標的配列が存在する場合のみである。増幅反応は、開始すると迅速に進行するため、核酸のわずか少数の標的コピーから開始して、高度に特異的な増幅が数分以内に検出可能なレベルに達する。
いくつかの実施形態では、ＲＰＡ反応は、リコンビナーゼ、一本鎖結合タンパク質、ポリメラーゼ、ｄＮＴＰ、ＡＴＰ、プライマー、及び鋳型核酸の混合物を含む。いくつかの実施形態では、ＲＰＡ反応は、以下：少なくとも１つのリコンビナーゼ；少なくとも１つの一本鎖ＤＮＡ結合タンパク質；少なくとも１つのＤＮＡポリメラーゼ；ｄＮＴＰ；密集剤（ｃｒｏｗｄｉｎｇ ａｇｅｎｔ）；緩衝液；還元剤；ＡＴＰまたはＡＴＰ類似体；少なくとも１つのリコンビナーゼローディングタンパク質；第１のプライマー及び任意選択で第２のプライマー；プローブ；逆転写酵素；及び鋳型核酸分子、例えば一本鎖（例えばＲＮＡ）または二本鎖核酸、のうちの１つ以上を（任意の組み合わせで）含むことができる。いくつかの実施形態では、ＲＰＡ反応は、例えば逆転写酵素を含むことができる。ある特定の実施形態では、ＲＰＡ反応は逆転写酵素を含まない。例示的なＲＰＡ反応容器は、米国特許第９，５３５，０８２号に記載されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、第１のステップで、第１及び第２の一本鎖核酸プライマーをリコンビナーゼ（例えば、ＵｖｓＸ）、リコンビナーゼローディング剤（例えば、ＵｖｓＹ）及び一本鎖ＤＮＡ結合タンパク質（例えば、ｇｐ３２）と接触させて、第１及び第２の核タンパク質プライマーを形成する。一本鎖核酸プライマーは、標的核酸分子に特異的であり、標的核酸分子に相補的である。第２のステップでは、第１の核タンパク質プライマーを二本鎖標的核酸分子に接触させて、二本鎖標的核酸分子の第１の部分に第１のＤループ構造を作出する（ステップ２ａ）。さらに、第２の核タンパク質プライマーを二本鎖標的核酸分子に接触させて、二本鎖標的核酸分子の第２の部分に第２のＤループ構造を作出する（ステップ２ｂ）。Ｄループ構造は、第１の核酸プライマー及び前記第２の核酸プライマーの３’末端が、標的核酸分子を完全に変性させることなく、同じ二本鎖標的核酸分子上で互いに向けて配向されるように形成される。ステップ２ａ及びステップ２ｂは、任意の順序で実行するか、または同時に実行することができることに注意すべきである。
Ｄループ構造では、プライマーは二本鎖標的核酸分子の一方の鎖にハイブリダイズして二本鎖構造を形成する。標的核酸分子の第２の鎖は、プライマーによって置き換えられる。この構造は大文字のＤに似ており、Ｄの直線部分は、構造の二本鎖部分を表し、Ｄの曲線部分は、標的核酸の一本鎖の置換された第２の鎖を表す。
第３のステップでは、第１及び第２の核タンパク質プライマーの３’末端を、鎖置換合成及びｄＮＴＰが可能な１つ以上のポリメラーゼで伸長して、第１及び第２の二本鎖標的核酸分子ならびに核酸の第１及び第２の置換鎖を生成する。第１及び第２の二本鎖標的核酸分子は、その後の増幅ラウンド中のステップ２における標的核酸分子として機能し得る。
ステップ２及びステップ３を、標的核酸の所望の増幅度が達成されるまで繰り返す。
上述の増幅プロセス中、核酸の第１及び第２の置換鎖は、ステップ（ｃ）の後に互いにハイブリダイズして、第３の二本鎖標的核酸分子を形成し得る。
ある特定の実施形態では、本開示で使用するためのＲＰＡ反応は、反応緩衝液、「Ｅ－ミックス」、ｄＮＴＰ、及びオリゴを組み合わせることを含む（例えば、第１のステップとして）。特定の実施形態では、「コアミックス」、すなわち、ｅｘｏプローブ、ｇｐ３２、ｕｖｓＸ、ｕｖｓＹ、ポリメラーゼ及び逆転写酵素を、反応物に加える（例えば、第２のステップとして）。次いで、単離核酸及び活性化剤、例えばマグネシウムを反応物に加え、（例えば、第３のステップとして）、続いて反応物を４０ｏＣでインキュベートする（例えば、第４のステップとして）。ある特定の実施形態では、リコンビナーゼ（例えば、ＵｖｓＸ）、リコンビナーゼローディング剤（例えば、ＵｖｓＹ）及び一本鎖ＤＮＡ結合タンパク質（例えば、ｇｐ３２）は、マイオウイルス科ファージに由来し得る。マイオウイルス科ファージは、例えば、Ｔ４、Ｔ２、Ｔ６、Ｒｂ６９、Ａｅｈ１、ＫＶＰ４０、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ（アシネトバクター）ファージ１３３、Ａｅｒｏｍｏｎａｓ（アエロモナス）ファージ６５、シアノファージＰ－ＳＳＭ２、シアノファージＰＳＳＭ４、シアノファージＳ－ＰＭ２、Ｒｂ１４、Ｒｂ３２、Ａｅｒｏｍｏｎａｓ（アエロモナス）ファージ２５、Ｖｉｂｒｉｏ（ビブリオ）ファージｎｔ－１、ｐｈｉ－１、Ｒｂ１６、Ｒｂ４３、ファージ３１、ファージ４４ＲＲ２．８ｔ、Ｒｂ４９、ファージＲｂ３、またはファージＬＺ２、であり得る。いくつかの実施形態では、Ｒｂ６９ＵｖｓＸ、Ｒｂ６９ＵｖｓＹ及びＲｂ６９ｇｐ３２の組み合わせを使用することができる。別の好ましい実施形態では、Ａｅｈ１ ＵｖｓＸ、Ａｅｈ１ ＵｖｓＹ及びＲｂ６９ ｇｐ３２の組み合わせを使用することができる。別の好ましい実施形態では、Ｔ４ ＵｖｓＸ、Ｔ４ ＵｖｓＹ及びＲｂ６９ ｇｐ３２の組み合わせを使用することができる。別の好ましい実施形態では、Ｔ４ ＵｖｓＸ、Ｒｂ６９ ＵｖｓＹ及びＴ４ ｇｐ３２の組み合わせを使用することができる。
さらに、本開示のプロセスのいずれかにおいて、リコンビナーゼ（例えば、ＵｖｓＸ）、リコンビナーゼローディング剤（例えば、ＵｖｓＹ）及び一本鎖ＤＮＡ結合タンパク質（例えば、ｇｐ３２）はそれぞれ、同じまたは異なるミオウイルス科ファージソースに由来する、ネイティブタンパク質、ハイブリッドタンパク質、または変異タンパク質であり得る。ネイティブタンパク質は、タンパク質の野生型または天然バリアントであり得る。変異タンパク質（遺伝子操作タンパク質とも呼ばれる）は、Ｎ末端、Ｃ末端、または内部（Ｎ末端とＣ末端の間）に挿入、欠失、置換、またはそれらの組み合わせなどの天然または人為的な変異を含むネイティブタンパク質である。ハイブリッドタンパク質（キメラタンパク質とも呼ばれる）は、少なくとも２つの異なる生物に由来する配列を含む。例えば、ハイブリッドＵｖｓＸタンパク質は、ある種（例えば、Ｔ４）からのアミノ酸を含むが、別の種（例えば、Ｔ６）からのＤＮＡ結合ループを含有し得る。ハイブリッドタンパク質は、ネイティブタンパク質と比較して改善された性質を含有し得る。改善された性質は、ＲＰＡ増幅率が増加し、もしくはより迅速であり得る、またはＲＰＡ増幅率が低下し、もしくはより制御可能であり得ることである。
いくつかの実施形態では、リコンビナーゼ（例えば、ＵｖｓＸ）は、変異体ＵｖｓＸであり得る。好ましい実施形態では、変異体ＵｖｓＸは、Ｒｂ６９ ＵｖｓＸアミノ酸配列中に少なくとも１つの変異を含むＲｂ６９ ＵｖｓＸであり、この変異は、（ａ）６４位でのヒスチジンではないアミノ酸、６４位でのセリン、Ｃ末端への１つ以上のグルタミン酸残基の付加、Ｃ末端への１つ以上のアスパラギン酸残基の付加、及びそれらの組み合わせから選択される。別の好ましい実施形態では、変異体ＵｖｓＸは、Ｔ６ ＵｖｓＸアミノ酸配列中に少なくとも１つの変異を有するＴ６ ＵｖｓＸであり、この変異は、（ａ）６６位でヒスチジンではないアミノ酸；（ｂ）６６位でのセリン；（ｃ）Ｃ末端への１つ以上のグルタミン酸残基の付加；（ｄ）Ｃ末端への１つ以上のアスパラギン酸残基の付加；及び（ｅ）それらの組み合わせから選択される。
ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、クラウディング剤の存在下で実行する。クラウディング剤は、ポリエチレングリコール（例えば、ＰＥＧ１４５０、ＰＥＧ３０００、ＰＥＧ８０００、ＰＥＧ１００００、ＰＥＧ１４０００、ＰＥＧ１５０００、ＰＥＧ２００００、ＰＥＧ２５００００、ＰＥＧ３００００、ＰＥＧ３５０００、ＰＥＧ４００００、分子量１５，０００～２０，０００ダルトンの間のＰＥＧ化合物）、及びポリエチレン酸化物、ポリビニルアルコール、ポリスチレン、フィコール、デキストラン、ＰＶＰ、アルブミン、及びそれらの組み合わせを含む群から選択してもよい。いくつかの実施形態では、クラウディング剤は２００，０００ダルトン未満の分子量を有する。さらに、クラウディング剤は、約０．５％～約１５％重量対体積（ｗ／ｖ）の量で存在し得る。特定の実施形態では、クラウディング剤は、約１％～約１０％ｗ／ｖの量で存在することができる。
いくつかの実施形態では、ＲＰＡプロセスは、大型断片ポリメラーゼであるポリメラーゼを用いて実行する。大型断片ポリメラーゼは、Ｅ． Ｃｏｌｉ Ｐｏｌ Ｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ Ｐｏｌ Ｉ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ Ｐｏｌ Ｉ、及びそれらの相同体からなる群から選択してもよい。ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのＤＮＡポリメラーゼ、例えば、約０．０８ｍｇ／ｍＬ～約０．２ｍｇ／ｍＬのＤＮＡポリメラーゼの存在下で実行する。ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、約１０単位／ｍＬ～約１０，０００単位／ｍＬのＤＮＡポリメラーゼ、例えば約５００単位／ｍＬ～約５，０００単位／ｍＬのＤＮＡポリメラーゼの存在下で実行する。
いくつかの実施形態では、ＲＰＡプロセスは、ヘパリンの存在下で実行する。ヘパリンは、非特異的プライマーノイズのレベルを低減し、Ｅ． ｃｏｌｉエキソヌクレアーゼＩＩＩまたはＥ． ｃｏｌｉエキソヌクレアーゼ ＩＶが組換え中間体から３’ブロッキング基または末端残基を迅速に整える（ｐｏｌｉｓｈ）能力を高める薬剤として機能し得る。
いくつかの実施形態では、ＲＰＡプロセスは、ブロックプライマーを用いて実行する。ブロックプライマーは、ポリメラーゼによる伸長が可能ではないプライマーである。ブロックプライマーが使用される場合、またブロック解除剤を使用してプライマーのブロックを解除して、伸長を可能にする。ブロック解除剤は、プライマーからブロッキング基を切断することができるエンドヌクレアーゼまたはエキソヌクレアーゼであり得る。いくつかの実施形態では、ブロック解除剤は、Ｅ． ｃｏｌｉエキソヌクレアーゼＩＩＩ及びＥ． ｃｏｌｉエンドヌクレアーゼＩＶを含む。特定の実施形態では、ブロック解除剤は、Ｅ． ｃｏｌｉエキソヌクレアーゼＩＩＩである。ある特定の実施形態では、ブロック解除剤は、Ｅ． ｃｏｌｉエンドヌクレアーゼＩＶである。
ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、２つ以上のプライマー、例えば、（ｉ）少なくとも１つ以上のフォワードプライマー、（ｉｉ）少なくとも１つ以上のリバースプライマー、または（ｉｉｉ）少なくとも１つ以上のフォワードプライマー及びリバースプライマー、及び／または少なくとも１つ以上のプローブ、の存在下で実行する。いくつかの実施形態では、ＲＰＡプロセスは、少なくとも３つのプライマーの存在下で実行する。いくつかの実施形態では、ＲＰＡプロセスは、少なくとも２つのプローブの存在下で実行する。ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、約１ｎＭ～約１，０００ｎＭの１つ以上のプライマー及び／またはプローブ、例えば、約１０ｎＭ～約５００ｎＭの１つ以上のプライマー及び／またはプローブの存在下で実行する。ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、約１ｎＭ～約１，０００ｎＭの１つ以上のプライマー、例えば、約１０ｎＭ～約５００ｎＭの１つ以上のプライマーの存在下で実行する。ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、約１ｎＭ～約１，０００ｎＭの１つ以上のフォワードプライマー、例えば、約１０ｎＭ～約５００ｎＭの１つ以上のフォワードプライマーの存在下で実行する。ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、約１ｎＭ～約１，０００ｎＭの１つ以上のリバースプライマー、例えば、約１０ｎＭ～約５００ｎＭの１つ以上のリバースプライマーの存在下で実行する。ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、約１ｎＭ～約１，０００ｎＭの１つ以上のプローブ、例えば、約１０ｎＭ～約５００ｎＭの１つ以上のプローブ、例えば、検出プローブの存在下で実行する。
ある特定の実施形態では、ＲＰＡプロセスは、約１ｍＭ～約２５ｍＭの二価マンガンイオン、例えば、約１ｍＭ～約２０ｍＭ、約１ｍＭ～約１０ｍＭ、または約１ｍＭ～約３ｍＭの二価マンガンイオンの存在下で実行する。いくつかの実施形態では、マンガンイオンをマグネシウムイオンに置換し、反応は、マグネシウムを使用してまたは使用せずに実行することができる。
さらに、いくつかの実施形態では、ＵｖｓＹを省略する。すなわち、本開示のＲＰＡ反応のいずれも、ＵｖｓＹの非存在下で実行することができる。
ある特定の実施形態では、逆転写酵素は、ＲＰＡ反応から省略する。例えば、限定するものではないが、本開示のＲＰＡ反応のいずれも、逆転写酵素の非存在下で実行することができる。ある特定の実施形態では、分析される標的核酸がＤＮＡである場合、本発明の開示のＲＰＡ反応は、逆転写酵素の非存在下で実行する。
ある特定の実施形態では、核酸プライマーのうちの１つだけを、リコンビナーゼ／リコンビナーゼローディング剤／一本鎖ＤＮＡ結合タンパク質でコーティングする。すなわち、ＲＰＡは、コーティングされていない１つのプライマーと、リコンビナーゼ、リコンビナーゼローディング剤、及び一本鎖ＤＮＡ結合タンパク質のいずれか１つまたは組み合わせでコーティングされた１つのプライマーとを用いて実行することができる。
本開示の方法及びシステムに関連して有用なＲＰＡ増幅戦略の例については、米国特許第７，２７０，９８１号；同第８，４６０，８７５号；同第７，３９９，５９０号；同第７，４３５，５６１号；同第７，４８５，４２８号；同第７，６６６，５９８号；同第７，７６３，４２７号；同第７，７５９，０６１号；同第８，０２２，９１４号；同第８，０３０，０００号；同第８，２２９，２２６号；同第８，４２６，１３４号；同第８，５８０，５０７号；同第８，９４５，８４５号；同第９，０５７，０９７号；同第９，１５７，１２７号；同第９，３４０，８２５号；同第９，４６９，８６７号；同第９，６６３，８２０号；同第９，８９６，７１９号；同第９，９３２，５７７号；同第１０，３２９，６０３号；同第１０，３２９，６０２号；同第１０，５３８，７６０号；同第８，０１７，３３９号；同第８，５７４，８４６号；同第８，９６２，２５５号；同第１０，０３６，０５７号；同第８，０７１，３０８号；同第１０，０９３，９０８号；同第１０，９４７，５８４号；及び同第８，６３７，２５３号ならびに米国特許出願第１５／０９９，７５４号；同第１４／７０５，１５０号；及び同第１６／１５５，１３３号を参照のこと、これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。本開示の方法及びシステムに関連して有用な追加のＲＰＡ増幅戦略は、Ｌｏｂａｔｏ ａｎｄ Ｏ’Ｓｕｌｌｉｖａｎ， Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ９８：１９－３５ （２０１８）、及びＤａｈｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ６２（７）：９４７－９５８ （２０１６）に開示されており、それぞれの内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
追加的に、または代替的に、ＲＮＡを初期鋳型として使用するＲＰＡ核酸増幅を、例えば、ＲＮＡウイルスに由来する標的核酸を増幅するために、逆転写酵素を使用して最初にＲＮＡ鋳型のＤＮＡコピーを生成し、その後、そのＤＮＡコピーをＲＰＡベースの核酸増幅にかけることにより利用することができる。ＲＮＡ鋳型を用いてＲＰＡを実行することは、当技術分野では通常、逆転写酵素ＲＰＡまたはＲＴ－ＲＰＡと呼ばれる。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムで使用される逆転写酵素は、ＯｍｎｉＳｃｒｉｐｔ （Ｑｉａｇｅｎ）、ＳｅｎｓｉＳｃｒｉｐｔ （Ｑｉａｇｅｎ）、ＭｏｎｓｔｅｒＳｃｒｉｐｔ （Ｅｐｉｃｅｎｔｒｅ）、Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｒ （Ｒｏｃｈｅ）、ＨＩＶ ＲＴ （Ａｍｂｉｏｎ）、Ｓｕｐｅｒｓｃｒｉｐｔ ＩＩＩ （Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ＴｈｅｒｍｏＳｃｒｉｐｔ （Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、Ｔｈｅｒｍｏ－Ｘ （Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ＩｍＰｒｏｍ ＩＩ（Ｐｒｏｍｅｇａ）及びＥＩＡＶ－ＲＴから選択することができる。ある特定の実施形態では、逆転写酵素は、ＥＩＡＶ－ＲＴである。
ある特定の実施形態では、ＡＴＰまたはその類似体は、約１及び約１０ｍＭの濃度で使用することができる。ＡＴＰ類似体の非限定的な例としては、ＡＴＰ－γ－Ｓ、ＡＴＰ－β－Ｓ及びｄｄＡＴＰが挙げられる。
ある特定の実施形態では、ＲＰＡ反応を実行するために以下の試薬を利用することができる：トリス－ＨＣｌ、ＤＴＴ、酢酸カリウム、クラウディング剤（例えば、ＰＥＧ）、ｄＮＴＰ、ＡＴＰ、ホスホクレアチン、グリセロール、クレアチンキナーゼ、ＵｖｓＸ、ＵｖｓＹ、ＤＮＡポリメラーゼ、ＧＰ３２、エキソヌクレアーゼＩＩＩ、ＢＳＡ、活性化剤（例えば、マグネシウム、例えば、酢酸Ｍｇ）、及びＥＩＡＶ。ある特定の実施形態では、限定するものではないが、フォワードプライマー、リバースプライマー、プローブ及びＲＯＸ参照色素を含む追加の試薬を利用することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、以下の試薬を以下の濃度で利用することができる：約５ｍＭ～約１００ｍＭのトリス－ＨＣｌ、ｐＨ約６．５～９．０、例えば８．３；約５ｍＭ～約１０ｍＭのＤＴＴ；約５０ｍＭ～約１００ｍＭの酢酸カリウム；約２％～約１０％のクラウディング剤、例えばＰＥＧ；約１ｍＭ～約５ｍＭのｄＮＴＰ；約１ｍＭ～約１０ｍＭのＡＴＰ、例えば、約２ｍＭ～約５ｍＭのＡＴＰ；約２０ｍＭ～約１００ｍＭのホスホクレアチン、例えば、約４０ｍＭ～約１００ｍＭのホスホクレアチン；約５ｍＭ～約４０ｍＭの酢酸Ｍｇ、例えば約１０ｍＭ～約４０ｍＭの酢酸Ｍｇ；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約１０ｍｇ／ｍＬのＢＳＡ；約５％～約１０％のグリセロール；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのクレアチンキナーゼ、例えば、約０．１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのクレアチンキナーゼ；約０．１ｍｇ／ｍＬ～約１．０ｍｇ／ｍＬのＵｖｓＸ、例えば約０．３ｍｇ／ｍＬ～約１．０ｍｇ／ｍＬのＵｖｓＸ；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．２５ｍｇ／ｍＬのＵｖｓＹ、例えば約０．０９ｍｇ／ｍＬ～約０．２５ｍｇ／ｍＬのＵｖｓＹ；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのＤＮＡポリメラーゼ、例えば約０．０８ｍｇ／ｍＬ～約０．２ｍｇ／ｍＬのＤＮＡポリメラーゼ；約０．１ｍｇ／ｍＬ～約２．０ｍｇ／ｍＬのＧＰ３２、例えば約０．４ｍｇ／ｍＬ～約０．８ｍｇ／ｍＬのＧＰ３２；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのエキソヌクレアーゼＩＩＩ、例えば約０．１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのエキソヌクレアーゼＩＩＩ；及び約０．５μｇ／ｍＬ～約２０．０μｇ／ｍＬのウマ伝染性貧血ウイルス逆転写酵素（ＥＩＡＶ－ＲＴ）、例えば、約０．５μｇ／ｍＬ～約１．５μｇ／ｍＬのＥＩＡＶ－ＲＴ。ある特定の実施形態では、限定するものではないが、フォワードプライマー、リバースプライマー、プローブ及びＲＯＸ参照色素を含む追加の試薬を利用することができる。
ある特定の実施形態では、本開示において、例えばＲＰＡ反応において使用するための試薬は、表１６または表１７に提供される濃度を有することができる。例えば、限定するものではないが、病原体または感染因子、例えばパルボウイルスＢ１９またはＨＡＶを検出するためのシングルプレックス反応では、表１７に提供される濃度の試薬を含むことができる。ある特定の実施形態では、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを検出するためのマルチプレックス反応では、表１７に提供される濃度の試薬を含むことができる。ある特定の実施形態では、シングルプレックス反応は、以下の濃度で利用される以下の試薬を含むことができる：５０ｍＭのトリス－ＨＣｌ １Ｍ、ｐＨ８．３、５ｍＭのＤＴＴ、１００ｍＭの酢酸カリウム、５．５％の２０％ポリエチレングリコール、１．８ｍＭの１００ｍＭ ｄＮＴＰ、２．５ｍＭのＡＴＰ、５０ｍＭのホスホクレアチン、４２０ｎＭのフォワードプライマー、４２０ｎＭのリバースプライマー、１２０ｎＭのＥｘｏプローブ、１５ｎＭのＲＯＸ参照色素、６．５％のグリセロール、０．１ｍｇ／ｍｌのクレアチンキナーゼ、０．３ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＸ、０．０９ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＹ、０．０７９８ｍｇ／ｍｌのＤＮＡポリメラーゼ、０．４８ｍｇ／ｍｌのＧｐ３２、０．１ｍｇ／ｍｌのエキソヌクレアーゼＩＩＩ、０．０２ｍｇ／ｍｌのウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、０．０００８ｍｇ／ｍｌのＥＩＡＶ逆転写酵素、及び１４ｍＭの酢酸マグネシウム。ある特定の実施形態では、マルチプレックス反応は、以下の濃度で利用される以下の試薬を含むことができる：５０ｍＭのトリス－ＨＣｌ １Ｍ、ｐＨ８．３、５ｍＭのＤＴＴ、１００ｍＭの酢酸カリウム、５．５％の２０％ポリエチレングリコール、１．８ｍＭの１００ｍＭ ｄＮＴＰ、３．５ｍＭのＡＴＰ、５０ｍＭのホスホクレアチン、１４７．５ｎＭのパルボウイルスＢ１９フォワードプライマー、１４７．５ｎＭのパルボウイルスＢ１９リバースプライマー、８５ｎＭのパルボウイルスＢ１９ Ｅｘｏプローブ、３９３．８ｎＭのＨＡＶフォワードプライマー、２３６．３ｎＭのＨＡＶリバースプライマー、１２０ｎＭのＨＡＶ Ｅｘｏプローブ、１５ｎＭのＲＯＸ参照色素、８．４％のグリセロール、０．０３５ｍｇ／ｍｌのクレアチンキナーゼ、０．４２ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＸ、０．１２６ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＹ、０．１６８ｍｇ／ｍｌのＤＮＡポリメラーゼ、０．６７２ｍｇ／ｍｌのＧｐ３２、０．１ｍｇ／ｍｌのエキソヌクレアーゼＩＩＩ、０．０２ｍｇ／ｍｌのウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、０．００１６ｍｇ／ｍｌのＥＩＡＶ逆転写酵素、及び１４ｍＭの酢酸マグネシウム。
ある特定の実施形態では、病原体または感染因子、例えば、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶまたはＨＢＶを検出するためのシングルプレックス反応では、表１６に提供される濃度の試薬を含むことができる。ある特定の実施形態では、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ及び／またはＨＢＶを検出するためのマルチプレックス反応では、表１６に提供される濃度の試薬を含むことができる。ある特定の実施形態では、シングルプレックス反応は、以下の濃度で利用される以下の試薬を含むことができる：５０ｍＭのトリス－ＨＣｌ １Ｍ、ｐＨ８．３、５ｍＭのＤＴＴ、１００ｍＭの酢酸カリウム、５．５％の２０％ポリエチレングリコール、１．８ｍＭの１００ｍＭ ｄＮＴＰ、２．５ｍＭのＡＴＰ、５０ｍＭのホスホクレアチン、４２０ｎＭのフォワードプライマー、４２０ｎＭのリバースプライマー、１２０ｎＭのＥｘｏプローブ、１５ｎＭのＲＯＸ参照色素、６．５％のグリセロール、０．１ｍｇ／ｍｌのクレアチンキナーゼ、０．３ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＸ、０．０９ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＹ、０．０７９８ｍｇ／ｍｌのＤＮＡポリメラーゼ、０．４８ｍｇ／ｍｌのＧｐ３２、０．１ｍｇ／ｍｌのエキソヌクレアーゼＩＩＩ、０．０２ｍｇ／ｍｌのウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、０．０００８ｍｇ／ｍｌのＥＩＡＶ逆転写酵素、及び１４ｍＭの酢酸マグネシウム。ある特定の実施形態では、例えばＨＩＶ－１及びＨＢＶを検出するためのマルチプレックス反応は、以下の濃度で利用される以下の試薬を含むことができる：５０ｍＭのトリス－ＨＣｌ １Ｍ、ｐＨ８．３、５ｍＭのＤＴＴ、１００ｍＭの酢酸カリウム、５．５％の２０％ポリエチレングリコール、２．７ｍＭの１００ｍＭ ｄＮＴＰ、３．５ｍＭのＡＴＰ、５０ｍＭのホスホクレアチン、１５７．５０ｎＭのＨＩＶ－１ＩＮＴフォワードプライマー、２３６．３７ｎＭのＨＩＶ－１ ＩＮＴリバースプライマー、９０ｎＭのＨＩＶ－１ ＩＮＴ Ｅｘｏプローブ、３９．３７ｎＭのＨＩＶ－１ ＬＴＲフォワードプライマー、３９．３７ｎＭのＨＩＶ－１ ＬＴＲリバースプライマー、２２．５ｎＭのＨＩＶ－１ ＩＮＴ Ｅｘｏプローブ、８６．１３ｎＭのＨＢＶフォワードプライマー、８６．１３ｎＭのＨＢＶリバースプライマー、９０ｎＭのＨＢＶ Ｅｘｏプローブ、４５ｎＭのＲＯＸ参照色素、８．４％のグリセロール、０．１ｍｇ／ｍｌのクレアチンキナーゼ、０．３７５ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＸ、０．０６７５ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＹ、０．１３９６ｍｇ／ｍｌのＤＮＡポリメラーゼ、１．２ｍｇ／ｍｌのＧｐ３２、０．１ｍｇ／ｍｌのエキソヌクレアーゼＩＩＩ、０．０２ｍｇ／ｍｌのウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、０．００１６ｍｇ／ｍｌのＥＩＡＶ逆転写酵素、及び１４ｍＭの酢酸マグネシウム。ある特定の実施形態では、例えばＨＩＶ－１及びＨＢＶを検出するためのマルチプレックス反応は、以下の濃度で利用される以下の試薬を含むことができる：５０ｍＭのトリス－ＨＣｌ １Ｍ、ｐＨ８．３、５ｍＭのＤＴＴ、１００ｍＭの酢酸カリウム、５．５％の２０％ポリエチレングリコール、２．７ｍＭの１００ｍＭ ｄＮＴＰ、３．５ｍＭのＡＴＰ、５０ｍＭのホスホクレアチン、１５７．５０ｎＭのＨＩＶ－１フォワードプライマー、２３６．３７ｎＭのＨＩＶ－１リバースプライマー、９０ｎＭのＨＩＶ－１Ｅｘｏプローブ、８６．１３ｎＭのＨＢＶフォワードプライマー、８６．１３ｎＭのＨＢＶリバースプライマー、９０ｎＭのＨＢＶ Ｅｘｏプローブ、４５ｎＭのＲＯＸ参照色素、８．４％のグリセロール、０．１ｍｇ／ｍｌのクレアチンキナーゼ、０．３７５ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＸ、０．０６７５ｍｇ／ｍｌのＵｖｓＹ、０．１３９６ｍｇ／ｍｌのＤＮＡポリメラーゼ、１．２ｍｇ／ｍｌのＧｐ３２、０．１ｍｇ／ｍｌのエキソヌクレアーゼＩＩＩ、０．０２ｍｇ／ｍｌのウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、０．００１６ｍｇ／ｍｌのＥＩＡＶ逆転写酵素、及び１４ｍＭの酢酸マグネシウム。
追加的に、または代替的に、開示される主題の別の態様によれば、ＲＰＡ反応量は約５０μＬ～約１００μＬであろう。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ＲＰＡ反応温度は、約２０℃～約５０℃、約２０℃～約４０℃、約２０℃～約３０℃、または約３７℃～約４２℃の間である。ある特定の実施形態では、ＲＰＡ反応温度は約４０℃である。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ＲＰＡ反応時間は、ＲＰＡ増幅を開始するのに十分な試薬の添加から約１０分～約３０分、または約１０分～約２５分、または約１０分～約２０分、またはさらには約１０分～約１５分である。ある特定の実施形態では、ＲＰＡ反応時間は、ＲＰＡ増幅を開始するのに十分な試薬の添加から約１分～約２０分、約５分～約２０分、約８分～約２０分、約１分～約１０分、または約５分～約１０分である。ある特定の実施形態では、ＲＰＡ反応時間は約１分である。ある特定の実施形態では、ＲＰＡ反応時間は約５分である。ある特定の実施形態では、ＲＰＡ反応時間は約２０分である。ある特定の実施形態では、ＲＰＡ反応は、結果を得るのに十分である。
３．２ ＮＥＡＲ
開示された主題に従って、また本明細書に具体化されるように、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本明細書に開示される方法及びシステムは、従来の増幅反応よりも、より短い時間枠でより短い配列を増幅するためにニッキング及び伸長増幅反応（ＮＥＡＲ）に依存する等温増幅方法を含むことができる。これらの方法には、例えば、等温条件下で、２つの増幅オリゴヌクレオチド、１つまたは２つのニッキング酵素、及びポリメラーゼのみを使用する反応を含めることができる。
典型的には、ニッキング増幅及び伸長増幅では、センス鎖及びアンチセンス鎖を有する標的核酸配列を、一対の増幅オリゴヌクレオチドと接触させる。第１の増幅オリゴヌクレオチドは、標的配列アンチセンス鎖の３’末端に相補的な３’末端の認識領域、前記認識領域の上流のニッキング酵素部位、及び前記ニッキング酵素部位の上流の安定化領域を含む核酸配列を含む（例えば、米国特許第９，６８９，０３１号；第９，６１７，５８６号；第９，５６２，２６４号；及び第９，５６２，２６３号を参照のこと、これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）。第２の増幅オリゴヌクレオチドは、標的配列センス鎖の３’末端に相補的な３’末端の認識領域、前記認識領域の上流のニッキング酵素部位、及び前記ニッキング酵素部位の上流の安定化領域を含むヌクレオチド配列を含む。２つのニッキング酵素が提供される。１つのニッキング酵素は、第１の増幅オリゴヌクレオチドのニッキング酵素部位でニッキングすることができるが、前記標的配列内でニッキングすることはできない。他のニッキング酵素は、第２の増幅オリゴヌクレオチドのニッキング酵素部位でニッキングすることができるが、前記標的配列内でニッキングすることはできない。ＤＮＡポリメラーゼを、増幅オリゴヌクレオチドの複数サイクルの伸長を伴う増幅条件下で利用し、それにより二本鎖ニッキング酵素部位が生成され、ニッキング酵素によってニッキングされて増幅産物が生成される。例えば、米国特許第９，６８９，０３１号；同第９，６１７，５８６号；同第９，５６２，２６４号；同第９，５６２，２６３号；及び同第１０，８５１，４０６号ならびに米国特許出願第１５／４６７，８９３号及び同第１６／２４３／８２９号を参照のこと、これらのそれぞれはその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、反応では、等温条件下で、プライミングに２つの鋳型、１つまたは２つのニッキング酵素、及びポリメラーゼのみを使用する。例示的な実施形態では、ポリメラーゼ及びニッキング酵素は好熱性であり、反応温度はハイブリダイズした標的領域の融解温度を大幅に上回る。ニッキング酵素は二本鎖二重鎖の一方の鎖にのみニックを入れるため、鎖置換のように修飾ヌクレオチドを組み込む必要はない。いくつかの実施形態では、この方法は、別個の逆転写ステップを行わずにＲＮＡを増幅することができるが、所望であれば、逆転写によるＲＮＡからＤＮＡへの変換を使用することができる。
いくつかの実施形態では、この方法は、センス鎖及びアンチセンス鎖を有する二本鎖標的配列を含む標的ＤＮＡ分子を、フォワード鋳型及びリバース鋳型と接触させることであって、前記フォワード鋳型は、標的配列アンチセンス鎖の３’末端に相補的な３’末端の認識領域；前記認識領域の上流のニッキング酵素部位、及び前記ニッキング酵素部位の上流の安定化領域を含む核酸配列を含み；リバース鋳型は、標的配列センス鎖の３’末端に相補的な３’末端の認識領域、認識領域の上流のニッキング酵素部位、及びニッキング酵素部位の上流の安定化領域を含むヌクレオチド配列を含む、接触させること；フォワード鋳型のニッキング酵素部位にニックを入れることができ、標的配列内にニックを入れない第１のニッキング酵素を提供すること；リバース鋳型のニッキング酵素部位にニックを入れることができ、標的配列内にはニックを入れない第２のニッキング酵素を提供すること；及びＤＮＡポリメラーゼを提供すること；増幅を、二本鎖ニッキング酵素部位を生成する標的配列に沿ってフォワード鋳型及びリバース鋳型を伸長するポリメラーゼの複数サイクルによって実行する条件下で、ニッキング酵素がニッキング酵素部位にニックを入れて増幅産物を生成すること、を含む。
ある特定の実施形態では、ＤＮＡポリメラーゼは、好熱性ポリメラーゼである。他の例では、ポリメラーゼ及び前記ニッキング酵素は、最高３７℃、４２℃、６０℃、６５℃、７０℃、７５℃、８０℃、または８５℃の温度で安定である。ある特定の実施形態では、ポリメラーゼは、最高６０℃で安定である。ポリメラーゼは、例えば、Ｂｓｔ（ｌａｒｇｅ ｆｒａｇｍｅｎｔ）、９°Ｎ、ＶｅｎｔＲ（登録商標）（エキソ－）ＤＮＡポリメラーゼ、ＴＨＥＲＭＩＮＡＴＯＲ、及びＴＨＥＲＭＩＮＡＴＯＲ ＩＩ（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ）からなる群から選択することができる。
例えば、ニッキング酵素は、ニッキング酵素結合部位の上流にニックを入れてもよく、またはニッキング酵素は、ニッキング酵素結合部位の下流にニックを入れてもよい。ある特定の実施形態では、フォワード鋳型及びリバース鋳型は、同じニッキング酵素によって認識されるニッキング酵素部位を含み、第１及び第２のニッキング酵素は同じである。ニッキング酵素は、例えば、Ｎｔ．ＢｓｐＱＩ、Ｎｂ．ＢｂｖＣｉ、Ｎｂ．ＢｓｍＩ、Ｎｂ．ＢｓｒＤＩ、Ｎｂ．ＢｔｓＩ、Ｎｔ．ＡｌｗＩ、Ｎｔ．ＢｂｖＣＩ、Ｎｔ．ＢｓｔＮＢＩ、Ｎｔ．ＣｖｉＰＩＩ、Ｎｂ．Ｂｐｕ１０Ｉ、及びＮｔ．Ｂｐｕ１０Ｉからなる群から選択することができる。
いくつかの実施形態では、標的配列は、前記フォワード鋳型認識領域と前記リバース鋳型認識領域のヌクレオチドの合計よりも１～５ヌクレオチド多いものを含む。
いくつかの実施形態では、フォワード鋳型は、リバース鋳型と同じ濃度で提供する。他の例では、フォワード鋳型のリバース鋳型に対する比が１：１００～１００：１の範囲で提供される。
本明細書で具体化されるように、ＮＥＡＲ反応時間は、ＮＥＡＲ増幅を開始するのに十分な試薬の添加から約１０分～約３０分、または約８分～約２５分、または約８分～約２０分、またはさらには約８分～約１５分であり得る。ある特定の実施形態では、ＮＥＡ反応時間は、ＮＥＡ増幅を開始するのに十分な試薬の添加から約１分～約２０分、約５分～約２０分、約８分～約２０分、約１分～約１０分、または約５分～約１０分である。
４． 核酸検出の態様
開示された主題に従って、また本明細書に具体化されるように、開示された主題の方法及びシステムは、試料から標的核酸を検出するのに有用な固有の核酸検出態様を含み、例えば、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための開示された主題の方法及びシステムは、ドナー試料から標的核酸を検出するのに有用な固有の核酸検出態様を含むことができる。例えば、限定するものではないが、本開示の方法及びシステムにおいて企図される種々の検出方法及びシステム構成要素をここで参照する。
本明細書で利用される核酸検出を使用して、試料中の核酸または複数の異なる核酸の存在を決定する。追加的に、または代替的に、開示された主題に従って、例えば図３１におけるように、核酸検出を利用して、試料中の１つの核酸または複数の異なる核酸の量を定量する。本明細書に具体化されるように、核酸検出方法及びシステム構成要素は、好適な検出技法の様々なまたは組み合わせのいずれかを使用して、標的核酸または複数の異なる核酸を検出するように構成することができる。
さらに詳細に説明するように、本明細書で具体化される検出方法及びシステム構成要素は、ＮＡＴベースのスクリーニングを容易にするように構成することができる。例えば、図１及び２Ａに示すように、検出は、１つ以上の標的核酸の増幅後、または増幅と同時に実行する。
追加的に、または代替的に、本明細書に具体化されるように、試料中に存在する１つまたは複数の標的核酸の増幅後、核酸検出用に構成された方法及びシステム構成要素により、ハイブリダイゼーションを介してそのような増幅核酸（複数可）を検出する。例えば、限定するものではないが、そのような検出は、増幅標的核酸に十分に相補的なプローブオリゴヌクレオチドをハイブリダイズさせて標的核酸の検出を容易にすることを含むことができる。ある特定の実施形態では、プローブオリゴヌクレオチドの標的核酸へのハイブリダイゼーションに続いて、方法は、標的核酸へのプローブオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションを検出することを含む。例えば、限定するものではないが、そのような検出は、検出可能な標識からのシグナルを観察することによって達成することができ、それにより、（ｉ）１つ以上のシグナルの存在は、プローブオリゴヌクレオチドの標的核酸へのハイブリダイゼーションを示し、標的核酸の存在を示し、試料中に病原体または感染因子が存在することを示し、（ｉｉ）シグナルの不存在は、試料中に病原体または感染因子が存在しないことを示す。プローブオリゴヌクレオチドからのシグナルの検出は、検出可能な標識のタイプに応じて、さまざまな好適な方法を使用して実行することができる。
ある特定の実施形態では、検出動作には、光学検出、デジタル検出、及び／または当技術分野で公知の他の検出方法を利用することができる。図１３は、例示的なデジタル及び光学（例えば、蛍光ベースの）標的検出戦略を示す図である。本明細書で具体化されるように、検出動作は標的核酸の存在または非存在を検出する。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化されるように、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本開示の方法及びシステムは、本明細書で詳細に開示される光学検出の使用を含むことができる。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化されるように、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本開示の方法及びシステムは、本明細書で詳細に開示されるデジタル検出の使用を含むことができる。
追加的に、または代替的に、本明細書に具体化されるように、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本開示の方法及びシステムは、標的核酸の迅速な検出が可能になる特定の標的核酸検出態様の使用を含むことができ、これにより、ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷に関する政府機関及び非政府組織の規制及び／または指針に従うのに必要な感度で、標的核酸の検出が可能になる。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化されるように、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本開示の方法及びシステムは、本明細書で詳細に開示される、スループットを向上させるためのマルチプレックス増幅及び／または検出態様の使用を含むことができる。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化されるように、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本開示の方法及びシステムは、本明細書で詳細に開示されるのと同じまたは異なるシグナルを検出できる複数の検出器の使用を含むことができる。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化されるように、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本開示の方法及びシステムは、本明細書で詳細に開示される増幅戦略中に反復検出態様の使用を含むことができる。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化されるように、ドナー血液の迅速なスクリーニングのための本開示の方法及びシステムは、本明細書で詳細に開示されるように、検出を強化するために、遠心分離力を使用して液滴を増幅／検出容器の底部に移動させることを含むことができる。
ある特定の実施形態では、核酸増幅領域及び核酸検出領域は、例えば増幅及び検出システムにおいて同時に行うことができる。ある特定の実施形態では、本明細書に開示される増幅及び検出プロセスは、試料、例えば溶出液中の核酸の同時の増幅及び検出を含む。特定の実施形態では、本開示の増幅及び検出プロセスは、溶出核酸の試料の増幅を開始するのに十分な試薬の添加から、約１分～約６０分、約５分～約６０分、約８分～約６０分、約８分～約５０分、約８分～約４０分、約８分～約３５分、約８分～約３０分、約８分～約２５分、約８分～約２０分、約１分～約２２分、約５分～約２２分、約８分～約２２分、１分～約２０分、約５分～約２０分、約８分～約２０分、または約８分～約１５分の持続時間を有する。特定の実施形態では、本開示の増幅及び検出プロセスは、約１分の持続時間を有する。特定の実施形態では、本開示の増幅及び検出プロセスは、約５分の持続時間を有する。特定の実施形態では、本開示の増幅及び検出プロセスは、約２０分の持続時間を有する。ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスは、試料中に標的核酸が存在する場合、その増幅を開始するのに十分な試薬と溶出液とのインキュベーションで始まり、試料中の結果の決定、例えば、溶出液中の標的核酸の検出（例えば、所定のレベルよりも高い試料中のレベルの検出、または所定のレベルよりも低い試料中のレベルの検出）、または試料中の標的核酸の検出がないこと、で終わる。
４．１ 光学検出
前述したように、開示された主題の一態様によれば、検出動作は光学的（例えば、蛍光的）検出方法を利用することができる。ある特定の実施形態では、増幅標的核酸の検出は、標識プローブの結合によって、または標的核酸の増幅コピーへの標識の組み込みによって媒介される。
本明細書において互換的に使用される「標識」または「検出可能な標識」は、プローブと分析物との間の反応、または分析物自体（分析物が標識されている場合）を検出可能にするためにプローブ（ｐｒｏｐ）または分析物に付着した部分を指し、またそのように標識されたプローブまたは分析物は、「検出可能に標識された」と呼ばれる。標識は、視覚的または機器的手段で検出可能なシグナルを生成することができる。種々の標識には以下が含まれる：（ｉ）切断可能なリンカーによって特異的結合メンバーまたは分析物に付着したタグ；または（ｉｉ）シグナル生成物質、例として色素原（ｃｈｒｏｍａｇｅｎ）、蛍光化合物、酵素、化学発光化合物、放射性化合物など。標識の代表的な例には、光を生成する部分、例えばアクリジニウム化合物、及び蛍光を生成する部分、例えばフルオレセインが含まれる。他の標識については本明細書で説明する。この点において、その部分自体は検出可能ではないが、さらに別の部分と反応すると検出可能になる可能性がある。「検出可能に標識された」という用語の使用は、そのような標識を包含することを意図している。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、検出は、蛍光標識（例えば、フルオレセイン（例えば、５－フルオレセイン、６－カルボキシフルオレセイン（例えば、ＦＡＭ）、３’６－カルボキシフルオレセイン、５（６）－カルボキシフルオレセイン、６－ヘキサクロロフルオレセイン、６－テトラクロロフルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネートなど））ローダミン、フィコビリタンパク質、Ｒ－フィコエリトリン、量子ドット（例えば、硫化亜鉛でキャップされたセレン化カドミウム）、Ｆｌｕｏｒ Ｏｒａｎｇｅ５６０蛍光色素分子、Ｑｕａｓａｒ６７０蛍光色素分子、及びＱｕａｓａｒ７０５蛍光色素分子によって媒介される。標識、標識手順、及び標識の検出の紹介は、Ｐｏｌａｋ ａｎｄ Ｖａｎ Ｎｏｏｒｄｅｎ， Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｔｏ Ｉｍｍｕｎｏｃｙｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ， ２ｎｄ ｅｄ．， Ｓｐｒｉｎｇｅｒ Ｖｅｒｌａｇ， Ｎ．Ｙ． （１９９７）、及び、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ， Ｉｎｃ．， Ｅｕｇｅｎｅ， Ｏｒｅｇが発行するハンドブック及びカタログを組み合わせたものである、Ｈａｕｇｌａｎｄ， Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ Ｐｒｏｂｅｓ ａｎｄ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ （１９９６）に見出される。蛍光標識は、ＦＰＩＡにおいて使用することができる（例えば、米国特許第５，５９３，８９６号、同第５，５７３，９０４号、同第５，４９６，９２５号、同第５，３５９，０９３号、及び同第５，３５２，８０３号を参照のこと、これらは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、光学検出は、蛍光、化学発光、または分析物の存在に応答してシグナルを生成する他の手段を使用して実行する。多くのアッセイは、反応混合物の全体積で生成される光シグナルの強度を測定することによって実行する。生成された光シグナルは光学的手段によって測定することができ、生成された光シグナルは多数の分子によって放出される。典型的には、本明細書に記載されるように、アッセイは、標的核酸、例えば、本明細書に記載のように増幅された標的核酸を含有すると疑われる試料と、標的核酸とハイブリダイズすることができる標識プローブを含む試薬とを合わせて反応混合物を形成することを含むことができる。次いで、典型的には洗浄ステップを実行することによって、未結合のプローブを反応混合物から除去した後、標識に起因するシグナルを測定する。ある特定の実施形態では、検出可能なシグナルの存在は、試料中の標的核酸の存在を確認するのに十分である。ある特定の実施形態では、反応混合物の総量に由来するシグナルを測定し、次いで検量線と比較して、試料中に存在する標的核酸の濃度を確立する。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、光学検出戦略は、検出可能な標識と「クエンチャー分子」の両方で標識されたプローブの使用を含み、ここで、クエンチャー分子は、検出可能な標識と相互作用して、検出可能な標識によって放出されるシグナルを低減または除去することができる。例えば、限定するものではないが、本開示の方法及びシステムで利用される検出プローブは、例えばプローブの５’末端に共有結合した蛍光部分を有することができ、クエンチャー分子を有し、例えば、プローブの３’末端である。標的配列が不存在である場合、プローブは、クエンチャーを励起された蛍光色素分子に十分近づけて、蛍光を発光する前にそのエネルギーを吸収する立体構造を使用する。プローブが標的内のその相補的配列に結合すると、蛍光色素分子及びクエンチャーは、蛍光の発光及び検出が可能になるのに十分な距離を置いて位置決めされる。ある特定の実施形態では、クエンチャーは、当技術分野で公知の任意の好適なクエンチャー、例えば、ＢＬＡＣＫ ＨＯＬＥ ＱＵＥＮＣＨＥＲ（登録商標）１（ＢＨＱ－１（登録商標））、ＢＬＡＣＫ ＨＯＬＥ ＱＵＥＮＣＨＥＲ（登録商標）２（ＢＨＱ－２（登録商標））、ＢＬＡＣＫ ＨＯＬＥ ＱＵＥＮＣＨＥＲ（登録商標）－１－ｄＴ（ＢＨＱ－１ｄＴ（登録商標））、ＢＬＡＣＫ ＨＯＬＥ ＱＵＥＮＣＨＥＲ（登録商標）－２－ｄＴ（ＢＨＱ－２ｄＴ（登録商標））、ＩＯＷＡ ＢＬＡＣＫ（登録商標）ＦＱ、及びＩＯ ＷＡ ＢＬＡＣＫ（登録商標）ＲＱ、から選択することができる。例えば、限定するものではないが、本開示の方法及びシステムで使用されるオリゴヌクレオチドプローブは、ＦＡＭ蛍光色素分子及びＢＨＱ－１ ｄＴ（登録商標）クエンチャーまたはＢＨＱ－２ｄＴ（登録商標）クエンチャーを含むことができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムで使用されるオリゴヌクレオチドプローブは、Ｑｕａｓａｒ ６７０蛍光色素分子及びＢＨＱ－１（登録商標）クエンチャーまたはＢＨＱ－２（登録商標）クエンチャーを含むことができる。例えば、限定するものではないが、本開示の方法及びシステムで使用されるオリゴヌクレオチドプローブは、Ｑｕａｓａｒ ６７０蛍光色素分子及びＢＨＱ－１ｄＴ（登録商標）クエンチャーまたはＢＨＱ－２ｄＴ（登録商標）クエンチャーを含むことができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、特定のプローブ、例えば、特定の標的核酸及び／または内部対照用のプローブを、それぞれ異なる蛍光色素分子で標識し、したがって、複数の増幅産物の同時検出が可能になる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、光強度は、励起用の発光ダイオード（ＬＥＤ）及び／またはレーザー、ならびに発光の検出用の任意の好適な検出器とを使用して測定することができる。集束レーザービームを使用してチップの表面を走査する蛍光光学検出「スキャナ」を使用すると、発光した蛍光の検出が可能になる。例示的な蛍光スキャナは、例えば、米国特許第５，８３７，４７５号及び同第５，９４５，６７９号に記載されている。共焦点励起及び検出システムが落射蛍光顕微鏡に統合されたスキャナも知られている。発光した蛍光を検出するためにスキャナで使用されるシステムは、通常「１チャネルシステム」、すなわち、例えば個別の光電池または二次電子増倍管（光電子増倍管）である。例えば、電荷結合素子（ＣＣＤ）カメラなどの二次元検出システムも、試料の蛍光または化学発光を検出するために使用する。市販のシステムは、レンズ光学系を使用して化学発光マーカーまたは蛍光マーカーを施した結合表面をＣＣＤセンサに投影する光学イメージングシステム、またはイメージインテンシファイアとＣＣＤカメラの組み合わせのいずれかを有する。
４．２ デジタル検出
開示された主題の別の態様によれば、検出動作はデジタル検出方法を利用することができる。デジタル検出との関係においては、エンドポイント実体としてのあらゆる単一標的核酸を原理的に検出できるため、デジタル検出に関連する構成要素及び方法は、アナログ光学検出を使用するシステムと比較して、試料分析の検出感度を大幅に向上させることができる。したがって、デジタル検出は、より低濃度の分析物、例えば標的核酸を使用して実行することができ、これにより、検出のために試料を処理する時間を短縮することができる。追加的に、または代替的に、より少ない試料量、より少ない試薬材料、より少ないコンジュゲート材料、より少ない微粒子、またはこれらの任意の組み合わせを使用して検出を実行することができ、それにより各アッセイを実行する費用を削減することができる。したがって、本明細書に記載されるように、試料調製時間を、少なくとも部分的には、関与するより少ない試料動作（例えば、より速い洗浄時間）により改善して、及び／またはより少ない試料体積、より少ない試薬またはコンジュゲート材料、及び／またはより少ない粒子またはビーズを使用して反応速度論の改善を達成して、検出に好適な分析濃度を得る。より少ない試料体積及び／または試薬材料を使用するアッセイは、より小型の装置を使用して実行することができ、これにより、本明細書でさらに説明するように、アッセイを実行するための検査室システムの設置面積を削減することができる。加えて、またはさらなる代替として、マルチプレクシングと併用すると検出感度の向上により追加の利点が得られる。例えば、限定するものではないが、複数の分析物及び対応するシグナルを、単一のマルチプレックスアッセイに組み合わせる場合、各分析物シグナルの検出に関連するノイズレベルを乗じて、マルチプレックスシステムの総ノイズレベルを得ることができる。検出される各シグナルの検出感度を高めることにより、改善された感度を乗じて、マルチプレックスシステムの総ノイズレベルをさらに低減することができる。
デジタル検出は、少なくとも部分的には、測定されるべきシグナルに対する検出中のノイズの低減、例えばより高いシグナル対ノイズ比の生成により、感度の向上を提供することができる。このようなシグナル対ノイズ比の改善は、目的の分析物、例えば特定の標的核酸を独立して検出可能なエンドポイント実体に結合させることによって可能となる。例えば、限定するものではないが、図１３に示す戦略で具体化されるように、増幅標的核酸を微粒子に固定化し、検出可能なコンジュゲートで標識することができ、ここで、コンジュゲートは、直接にまたは基質の変換を介してのいずれかで、独立して検出可能なシグナルを放出することができるという点で、検出可能なエンドポイント実体である。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、検出動作ではデジタルナノウェル検出プロセスを利用する。追加的に、または代替的に、増幅後にデジタル検出プロセスを実行するために、限定するものではないが、微粒子、ビーズ、または他の標識などの支持媒体を試料と混合することができる。ある特定の実施形態では、抗体及びコーティング微粒子を含む試薬を組み合わせることができる。
例えば、限定するものではないが、微粒子を組み込んだデジタルナノウェル検出プロセスは、抗ジゴキシン微粒子を利用することができる。ある特定の実施形態では、微粒子を組み込んだデジタルナノウェル検出は、トリス－ＨＣｌ、ＮａＣｌ、ＢＳＡ、Ｔｅｒｇｉｔｏｌ１５－ｓ－４０、アジ化ナトリウム、及び０．０２％抗ジゴキシンμＰ（微粒子）を含む製剤中で実行することができる。例えば、限定するものではないが、微粒子を組み込んだデジタルナノウェル検出は、以下の状況下で実施することができる：約５０ｍＭのトリス－ＨＣｌ、ｐＨ約８．０；約１５０ｍＭのＮａＣｌ；約０．２％のＢＳＡ；約０．５％のＴｅｒｇｉｔｏｌ １５－ｓ－４０；約０．０８％のアジ化ナトリウム；約０．０２％の抗ジゴキシンμＰ（微粒子）。溶液は、例えば過剰な試薬及び／または非結合分析物を除去するために洗浄することができる。１回、２回、または３回以上の洗浄を含む任意の好適な回数の洗浄を各洗浄ステップで実行することができ、各洗浄は単一のチャンバーもしくは場所で、または異なるチャンバーもしくは場所の間で実行することができる。例えば、限定するものではないが、本明細書で具体化されるように、３回の洗浄を実行することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、コンジュゲートを加えて、試料中の目的の分析物と結合させることができる。ある特定の実施形態では、コンジュゲート、例えば、アルカリホスファターゼ－ＳＡを試料に加えることができる。ある特定の実施形態では、限定するものではないが、トリス－ＨＣｌ、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＺｎＣｌ２、魚ゼラチン、ウサギＩｇＧ、サポニン、子ウシ血清、ヤギＩｇＧ、及びアジ化ナトリウムを含む追加の試薬を試料に加えることができる。例えば、限定するものではないが、コンジュゲートは、目的の分析物と反応して検出成分による検出のためのシグナルを生成するように選択または構成された１つ以上の試薬または酵素を含むことができる。ある特定の実施形態では、デジタルナノウェル検出プロセスは、以下の状況下でコンジュゲートを利用することになる：約３０００ｐＭのアルカリホスファターゼ－ＳＡ；約１００ｍＭのトリス－ＨＣｌ、ｐＨ約７．５；約５００ｍＭのＮａＣｌ；約１ｍＭのＭｇＣｌ２；約０．１のＺｎＣｌ２；約８．９ｇ／Ｌの魚ゼラチン；約３０ｕｇ／ｍＬのウサギＩｇＧ；約０．１％のサポニン；約１０％の子ウシ血清；約５ｍｇ／ｍＬのヤギＩｇＧ；及び約０．１％のアジ化ナトリウム。溶液は、例えば目的の分析物に結合していない過剰なコンジュゲートを除去するために洗浄することができる。１回、２回、または３回以上の洗浄を含む任意の好適な回数の洗浄を各洗浄ステップで実行することができ、各洗浄は単一のチャンバーもしくは場所で、または異なるチャンバーもしくは場所の間で実行することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、分析物及びコンジュゲートと結合した微粒子の検出は、単一のチャンバーもしくは場所で、または異なるチャンバーもしくは場所間で実行することができる。限定ではなく例示の目的で、検出チャンバーまたは検出場所は、表面及び検出領域を含むことができる。微粒子は、限定するものではないが、ピペット動作、磁力または誘電泳動を含む任意の好適な技法を使用して、検出チャンバーまたは検出場所に加えることができる。ある特定の実施形態では、デジタルナノウェル検出プロセスは、検出基質、例えば、ＡＪ Ｐｈｏｓを利用することになる。ある特定の実施形態では、限定するものではないが、ＤＥＡ、ＭｇＣｌ２及びＴｗｅｅｎ２０を含む追加の試薬を、検出基質と組み合わせて加えることができる。例えば、限定するものではないが、デジタルナノウェル検出プロセスは、以下の状況で検出基質を利用する：約２００μＭのＡＪ Ｐｈｏｓ；約１ＭのＤＥＡ；約１ｍＭのＭｇＣｌ２；及び約０．０５％のＴｗｅｅｎ２０。本明細書で具体化されるように、検出領域は１つ以上のナノウェルを含むことができる。微粒子は、例えば、本明細書で具体化されるように、ナノウェルのアレイなどの検出領域に移動させることができる。微粒子は、限定するものではないが、ピペット動作、磁力または誘電泳動を含む任意の好適な技法を使用して、ナノウェルに移動させることができる。ある特定の実施形態では、油、例えば、ＦＣ－４０油中の３ｍＭのグアイアズレンを加えて、ナノウェルを封止する。ある特定の実施形態では、コントラストを高めるため、または別様にナノウェル内の目的の分析物の検出のための光学条件を改善するために、色素を加えることができる。ある特定の実施形態では、微粒子を組み込んだデジタルナノウェル検出プロセスでは、以下の状況で色素を利用することになる：約０．１％のＴｗｅｅｎ２０；約１０ｍＭのＰＢＳ；及び約５０ｍＭのニグロシン。ある特定の実施形態では、微粒子の１つ以上の画像を撮影し、分析して、目的の分析物の存在若しくは不存在、及び／または試料中の目的の分析物の濃度を決定する。
４．３ 特定の標的核酸についてのＮＡＴベースのスクリーニング
開示された主題の別の態様によれば、本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上に関連する標的核酸の特定のセットを検出するために、ＮＡＴベースのスクリーニングを実行する際に利用することができる。例えば、限定するものではないが、病原体または感染因子のセットは、政府機関または非政府組織によって同定されたセットであり得る。追加的に、または代替的に、病原体または感染因子のセットは、ドナー血液の安全な出荷を確保するために必要であるとして政府機関または非政府組織によって同定されたものである。例えば、限定するものではないが、病原体または感染因子のセットは、ドナー血液の安全な出荷を確保するために必要なものとして米国食品医薬品局（Ｕ．Ｓ． Ｆｏｏｄ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ａｇｅｎｃｙ）によって同定されたものであり得る。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子のセットは、２１ ＣＦＲ § １２７１及びそこで引用される関連コードで同定されるものであり得、それらのすべてが参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。追加的に、または代替的に、病原体または感染因子のセットは、世界保健機関（Ｗｏｒｌｄ Ｈｅａｌｔｈ Ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ）によって、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、「輸血感染症に対する献血のスクリーニング： 勧告」（Ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ Ｄｏｎａｔｅｄ Ｂｌｏｏｄ ｆｏｒ Ｔｒａｎｓｆｕｓｉｏｎ－Ｔｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｌｅ Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎｓ： Ｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎｓ）世界保健機関 （２００９年） で同定されたものであり得る。
追加的に、または代替的に、標的核酸は、細菌、真核生物（例えば、真核生物の寄生虫）、またはウイルスの核酸である。ある特定の実施形態では、標的核酸は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、コロナウイルス、ＨＩＶ（例えば、ＨＩＶ－１及び／またはＨＩＶ－２）、Ｂ型肝炎（ＨＢＶ）、Ｃ型肝炎（ＨＣＶ）、Ａ型肝炎（ＨＡＶ）、Ｅ型肝炎（ＨＥＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、パルボウイルスＢ１９、クロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ）、クラミジア、淋菌、西ナイルウイルス（ＷＮＶ）、ジカウイルス（ＺＩＫＶ）、デング、チクングニア、インフルエンザ（例えば、インフルエンザＡウイルス、インフルエンザＢウイルス、またはインフルエンザＣウイルス）、バベシア、マラリア、風疹、水痘・帯状疱疹、単純ヘルペス、ポリオ、梅毒、天然痘、ワクシニア、狂犬病、ヒトＴリンパ指向性ウイルス（ＨＴＬＶ）、ウスツウイルス、またはエプスタイン・バーウイルス、に由来する核酸である。ある特定の実施形態では、標的核酸は、１つ以上の新しいまたは新興の病原体、ウイルス及び／または因子に由来する核酸である。
追加的に、または代替的に、特定の標的核酸の選択は、ウイルスのゲノムを構成する核酸のタイプに依存する。例えば、限定するものではないが、ウイルスがＲＮＡベースのウイルス、例えばＨＩＶ－１及びＨＣＶである場合、検出される核酸はＲＮＡとなる。ウイルスがＤＮＡベースのウイルス（例えば、ＨＢＶ）である場合、検出される核酸はＤＮＡとなる。ある特定の実施形態では、この方法は、寄生虫バベシアのリボソームＲＮＡを検出することができる。
追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、その方法及びシステムの感度により、ドナー血液スクリーニングとの関係において、特別な使用が見出される。本明細書で使用される「感度」とは、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の所定のレベルを検出する方法またはシステムの能力を指す。実施例２３に示すように、本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の所定のレベルを検出することができ、それらの所定のレベルは、現在のＮＡＴベースのスクリーニング方法によって達成される所定のレベルと同等またはそれよりも低い。
追加的に、または代替的に、核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、細菌、真核生物（例えば、真核寄生生物）、及び／またはウイルスの核酸のメニューのそれぞれの存在または非存在についてスクリーニングすることができる。ある特定の実施形態では、核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、細菌、真核生物（例えば、真核寄生生物）、及び／またはウイルスの核酸のメニューのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、スクリーニングのために選択された細菌、真核生物（例えば、真核寄生生物）、またはウイルスの核酸のメニューは、１つ以上の試料を使用してスクリーニングすることができる。例えば、ある特定の実施形態では、１つの試料を使用してメニューの第１のサブセットをスクリーニングすることができ、１つ以上（例えば、第２、第３、第４、または第５）の追加の試料を、選択されたメニューの残りのメンバーについてスクリーニングする。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９のそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。
追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ジカウイルス及びＷＮＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、チクングニアウイルス及びデングウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。及び追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。
追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、バベシア及びマラリアのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。
追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９のそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。追加的または代替的に、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである。
追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。
追加的に、または代替的に、本開示の方法及びシステムでは、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶのそれぞれの所定のレベルについてスクリーニングすることができる。
４．４ 特定の標的核酸についてのＮＡＴベースのスクリーニングの感度
本開示の方法及びシステムは、他の重要な病原体及び感染因子検出の取り組みの中でも特に、ドナー血液のＮＡＴベースのスクリーニングを実行する際に利用することができるので、開示された主題の方法及びシステムは、政府機関及び非政府組織の規制及び／または指針に準拠するために必要な感度を備えて構成され得る。例えば、限定するものではないが、病原体または感染因子をスクリーニングするための本明細書に記載の方法及びシステムの感度、すなわち「検出限界」は、政府機関または非政府組織によって同定することができる。例えば、限定するものではないが、病原体または感染因子の検出限界は、ドナー血液の安全な出荷を確保するために必要であるとして政府機関または非政府組織によって同定されたものである。
特定の標的アンプリコン領域、特定のプライマー配列、及び特定のプローブ配列を本明細書で参照するが、そのような配列は非限定的な例示的な領域及び／または配列として提供する。当業者には理解されるように、任意の特定の病原体または感染因子に対する様々な好適な標的アンプリコン領域を、本開示の方法及びシステムの関係内で単独でまたは組み合わせて利用することができる。同様に、当業者であれば、開示された配列の変異体、例えば、明示的に列挙されたプライマーまたはプローブによって標的化される１つ以上のヌクレオチドと重複する配列を標的とするプライマー及びプローブ配列、だけでなく、同様に、ある特定の完全に別個のプライマー及びプローブ配列、例えば、明示的に列挙されたプライマー及びプローブ配列と重複しないターゲティング配列も、本開示の方法及びシステムでの使用に好適であることを理解しているので、本開示は、明示的に列挙されたプライマー配列及びプローブ配列に限定されない。
ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるプライマー配列及びプローブ配列は、本開示の核酸分析の感度を高めるために修飾することができる。例えば、限定するものではないが、感度を高めるために、開示されたプライマー配列及び／またはプローブ配列のヌクレオチド配列に１つ以上の修飾を導入することができ、例えば、感度を高めるために、開示されたプライマー配列及び／またはプローブ配列のヌクレオチド配列に、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上の修飾を導入することができる。ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるプライマー配列及びプローブ配列は、相補的標的核酸の配列に１つ以上のミスマッチ、例えば、相補的標的核酸の配列に対する１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、または５つ以上のミスマッチを導入するように修飾することができる。ある特定の実施形態では、ミスマッチは、本明細書に開示されるプライマーまたはプローブの３’末端に向かって導入することができる。ある特定の実施形態では、ミスマッチは、本明細書に開示されるプライマーまたはプローブの５’末端に向かって導入することができる。ある特定の実施形態では、本開示の１つ以上のプライマー、例えば、フォワードプライマー及び／またはリバースプライマーにおけるミスマッチの導入により、同じ等温増幅反応において使用されるプローブとプライマーとの相互作用を低減させることができる。ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるプライマー配列及び／またはプローブ配列は、１つ以上の非カノニカルなヌクレオチドを導入するように修飾することができ、例えば、本明細書で開示されるプライマー配列及び／またはプローブ配列の１つ以上のヌクレオチドを、非カノニカルなヌクレオシドで置換する。非カノニカルなヌクレオシドの非限定的な例としては、イノシン、キサンチン、ヒポキサンチン、イソシトシン、及びイソグアニンが挙げられる。ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるプライマー配列及び／またはプローブ配列は、１つ以上のロックド核酸（ＬＮＡ）を導入するように修飾することができ、例えば、本明細書で開示されるプライマー配列及び／またはプローブ配列の１つ以上のヌクレオチドをＬＮＡで置換する。ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるプローブは、感度を向上させるために、プローブへの蛍光色素分子及び／またはクエンチャーの連結を修飾することによって修飾することができる。
ある特定の実施形態では、本開示で使用するプライマーまたはプローブは、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドに対し同一性が約８０％、約８１％、約８２％、約８３％、約８４％、約８５％、約８６％、８７％、約８８％、約８９％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、または約９９％より高いヌクレオチド配列を有する。ある特定の実施形態では、本開示で使用するためのプライマーまたはプローブは、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドに対し同一性が約９５％より高いヌクレオチド配列を有することができる。ある特定の実施形態では、本開示で使用するためのプライマーまたはプローブは、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドに対し同一性が約９９％より高いヌクレオチド配列を有することができる。ある特定の実施形態では、本開示で使用するためのプライマーまたはプローブは、本明細書に開示されるヌクレオチド配列からの５ヌクレオチドと同一であるか、または本明細書に開示されるヌクレオチド配列と、５ヌクレオチド以下異なる、例えば、４ヌクレオチド以下異なる、３ヌクレオチド以下異なる、２ヌクレオチド以下異なる、または１ヌクレオチド以下異なる、ヌクレオチド配列を含むことができる。
追加的に、または代替的に、本明細書に記載される試料分析のための方法及びシステムは、ＨＩＶ－１の検出について１～１００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、ＨＩＶ－１の検出について１～５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、ＨＩＶ－１の検出について１～２５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、ＨＩＶ－１の検出について１～２０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。
ＨＩＶ－１のゲノム構成は、両端に長鎖末端リピート配列（ＬＴＲ）が隣接するｇａｇ、ｐｏｌ、及びｅｎｖ遺伝子領域を含むコア領域で構成される。ある特定の実施形態では、ＨＩＶ－１ＲＰＡ設計は、１つの標的アンプリコン領域で構成される。ある特定の実施形態では、ＨＩＶ－１ＲＰＡ設計は、２つ以上の標的アンプリコン領域で構成される。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、ｐｏｌ遺伝子内に位置するＩＮＴ遺伝子領域内にある（「ＦＰ」はフォワードプライマーであり、「ＲＰ」はリバースプライマーであり、「Ｐ」はプローブである）。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、５’ＬＴＲ領域内にある。ある特定の実施形態では、増幅／検出の標的は、ｇａｇ遺伝子内にある。ＨＩＶ－１を検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び表１４、表１５、表１８、図２４、実施例１３及び実施例２４に提供される。
Figure 2024518331000002
Figure 2024518331000003
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ＨＩＶ－２の１～４０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＩＶ－２の検出について１～２０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＩＶ－２の検出について１～１５ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＩＶ－２の検出について１０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。
ＨＩＶ－２のゲノム構成は、ＨＩＶ－１のゲノム構成に非常に似ており、両端に長鎖末端リピート配列（ＬＴＲ）が隣接するｇａｇ、ｐｏｌ、及びｅｎｖ遺伝子のコア領域がある。ある特定の実施形態では、増幅／検出の標的は、ｐｏｌ遺伝子である。ある特定の実施形態では、増幅／検出の標的は、ｇａｇ遺伝子及び／または５’ＬＴＲ領域である。ＨＩＶ－２を検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び表１４、表１５、表１８、図２５、実施例１３及び実施例２４に提供される。
Figure 2024518331000004
Figure 2024518331000005
Figure 2024518331000006
Figure 2024518331000007
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ＨＢＶの検出について１～２０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＢＶの検出について１～１５ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＢＶの検出について１～１０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＢＶの検出について５ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出の標的は、ＨｂＳ遺伝子である。ＨＢＶを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び表１４、表１５、表１８、図２６、実施例１３及び実施例２４に提供される。
Figure 2024518331000008
Figure 2024518331000009
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ＨＣＶの検出について１～１００ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＣＶの検出について１～５０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＣＶの検出について１～２５ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＣＶの検出について１０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する（ここで、「ＲＣ」はプローブである）。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、５’ＵＴＲ領域内にある。ＨＣＶを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び表１４、表１５、表１８、図２７、実施例１３及び実施例２４に提供される。
Figure 2024518331000010
追加的または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、パルボウイルスＢ１９の検出について１～８０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、パルボウイルスＢ１９の検出について１～５０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、パルボウイルスＢ１９の検出について１～２５ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、パルボウイルスＢ１９の検出について１０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、ヌクレオカプシドタンパク質をコードする遺伝子、例えば、ＶＰ１遺伝子内にある。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、ＮＳ１遺伝子内にある。パルボウイルスＢ１９を検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び表１２、図３０、実施例８、実施例１４、実施例１５、及び実施例２３に提供される。
Figure 2024518331000011
Figure 2024518331000012
Figure 2024518331000013
Figure 2024518331000014
Figure 2024518331000015
Figure 2024518331000016
Figure 2024518331000017
Figure 2024518331000018
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ＷＮＶの検出について１～１００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＷＮＶの検出について１～５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＷＮＶの検出について１～２５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＷＮＶの検出について１０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、５’ＵＴＲ領域内にある。ＷＮＶを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び図３４に提供される。
Figure 2024518331000019
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ジカの検出について１～１００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ジカの検出について１～５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ジカの検出について１～２５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ジカの検出について１０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、ＮＳ３遺伝子内にある。ジカを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び実施例１９及び図３５に提供される。
Figure 2024518331000020
追加的または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、デングの検出について１～１００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、デングの検出について１～５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、デングの検出について１～２５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、デングの検出について１０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、３’ＵＴＲ領域内にある。デングを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び実施例１７及び図３３に提供される。
Figure 2024518331000021
追加的または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、チクングニアの検出について１～１００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、チクングニアの検出について１～５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、チクングニアの検出について１～２５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、チクングニアの検出について１０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、Ｅ１遺伝子内にある。チクングニアを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び実施例１６及び図３２に提供される。
Figure 2024518331000022
追加的または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、バベシアの検出について１～５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、バベシアの検出について１～２５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、バベシアの検出について１～１５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、バベシアの検出について１０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、１８ｓ ｒＲＮＡ遺伝子内にある。バベシアを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び図３６、表１３、実施例９及び実施例２０に提供される。
Figure 2024518331000023
追加的または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、マラリアの検出について１～１００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、マラリアの検出について１～５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、マラリアの検出について１～２５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、マラリアの検出について１０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、１８ｓ ｒＲＮＡ遺伝子内にある。マラリアを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び実施例２１及び図３７に提供される。
Figure 2024518331000024
追加的または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ＨＡＶの検出について１～４０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＡＶの検出について１～２０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＡＶの検出について１～１０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＡＶの検出について５ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、５’ＵＴＲ領域内にある。ＨＡＶを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び図３０、表１２、実施例８及び実施例２３に提供される。
Figure 2024518331000025
Figure 2024518331000026
Figure 2024518331000027
Figure 2024518331000028
追加的または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ＨＥＶの検出について１～４０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＥＶの検出について１～２０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＥＶの検出について１～１０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＨＥＶの検出について５ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、ＯＲＦ１及び／またはＯＲＦ２／３の５’ＵＴＲ内にある。ＨＥＶを検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下に提供される。
Figure 2024518331000029
Figure 2024518331000030
Figure 2024518331000031
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の方法及びシステム構成要素は、内部対照、例えば、本明細書に記載の内部対照核酸を含む。ある特定の実施形態では、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、バベシア、マラリア、ＷＮＶ、ジカ、チクングニア、デング、ＨＡＶ、パルボＢ１９、及びＨＥＶ配列に関連がないカボチャ植物由来のヒドロキシピルビン酸レダクターゼ遺伝子（ＨＰＲ）の３５１塩基配列は、大腸菌ファージＭＳ２パッケージング配列（ａｒｍｏｒｅｄ ＲＮＡ）とともにバクテリオファージタンパク質内に封入され、内部対照の標的として機能する。内部対照を検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下に提供される。
Figure 2024518331000032
追加的または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）の検出について１～５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）の検出について１～２５コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）の検出について１～２０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）の検出に使用される生体試料は、唾液、汗、涙、粘液、尿、または本明細書に記載の方法及び技法を使用した分析に好適な任意の他の試料であろう。ある特定の実施形態では、スワブ、例えば鼻咽頭スワブを使用して試料を取得し、スワブを試料移送緩衝液と接触させて、本開示のシステムに吸引され得る試料を取得する。ある特定の実施形態では、増幅／検出標的は、ＲｄＲｐ遺伝子及び／またはＮ遺伝子内にある。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）を検出するためのプライマー及びプローブの非限定的な例は、以下及び実施例２２に提供される。
Figure 2024518331000033
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、ＣＭＶの検出について１０～５０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＣＭＶの検出について１０～２５ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、ＣＭＶの検出について１０ＩＵ／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、ＣＭＶの検出に使用される生体試料は、唾液、汗、涙、粘液、尿、または本明細書に記載の方法及び技法を使用した分析に好適な任意の他の試料であろう。ある特定の実施形態では、スワブ、例えば鼻咽頭スワブを使用して試料を取得し、スワブを試料移送緩衝液と接触させて、本開示のシステムに吸引され得る試料を取得する。
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、インフルエンザの検出について１０～１０００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、インフルエンザの検出について１０～５００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、インフルエンザの検出について１０～２５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、インフルエンザの検出について１００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、インフルエンザの検出に使用される生体試料は、唾液、汗、涙、粘液、尿、または本明細書に記載の方法及び技法を使用した分析に好適な任意の他の試料であろう。ある特定の実施形態では、スワブ、例えば鼻咽頭スワブを使用して試料を取得し、スワブを試料移送緩衝液と接触させて、本開示のシステムに吸引され得る試料を取得する。
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、クラミジアの検出について１００～１０００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、クラミジアの検出について１００～５００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、クラミジアの検出について１００～２５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、クラミジアの検出について２００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、クラミジアの検出に使用される生体試料は、唾液、汗、涙、粘液、尿、または本明細書に記載の方法及び技法を使用した分析に好適な任意の他の試料であろう。ある特定の実施形態では、スワブ、例えば鼻咽頭スワブを使用して試料を取得し、スワブを試料移送緩衝液と接触させて、本開示のシステムに吸引され得る試料を取得する。
追加的に、または代替的に、本明細書に記載の核酸検出のための方法及びシステム構成要素は、淋菌の検出について１００～５００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、淋菌の検出について１００～２５０コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、方法及びシステム構成要素は、淋菌の検出について２００コピー／ｍＬの検出限界を達成するのに十分な感度を有する。ある特定の実施形態では、淋菌の検出に使用される生体試料は、唾液、汗、涙、粘液、尿、または本明細書に記載の方法及び技法を使用した分析に好適な任意の他の試料であろう。ある特定の実施形態では、スワブ、例えば鼻咽頭スワブを使用して試料を取得し、スワブを試料移送緩衝液と接触させて、本開示のシステムに吸引され得る試料を取得する。
５． 使用方法
限定ではなく理解の目的で、開示された主題の種々の例示的な方法及びその態様を詳細に参照するが、それらは添付の図面に示され、以下でより詳細に説明される。開示された主題の上記の態様のそれぞれ、例えば、試料調製の態様、増幅の態様、及び検出の態様は、種々の利点を提供し、種々の態様及び対応するシステム構成要素を選択的に組み合わせて、本明細書に開示される方法及びシステムの所望の利点を達成できることが認識される。
スループット及び速度の向上により、特に血液または組織などの複雑な試料を使用する場合、分子アッセイを利用する場合、検出されるべき分析物が複雑な試料の微量成分である場合、及び複数成分の機器を利用する場合、試料分析の他の必須または非常に望ましい機能が多くの場合犠牲になる。スループット及び速度の向上により、感度、特異度、及び検出限界の損失につながる可能性がある。また、エラー及び間違いの増加にもつながる可能性がある。ドナー血液検査の分野では、エラー及び間違い、ならびに感度、特異度、及び検出限界の低下によって重大な結果がもたらされる可能性があり、対象が臨床製剤またはプロセスによって感染する可能性が高まり、重要な臨床材料の損失を元に戻し（ｃａｕｓｉｎｇ ｕｎｄｏ ｌｏｓｓ）、及び／または重要な医療システムに対する信頼の喪失を引き起こす。この分野で必要とされる感度、特異度、検出限界、及び信頼性を提供しながら、可能な限り高速かつ効率的になるように設計された既存のシステムは、ドナー試料のポイントオブコレクション／採取点などの、さまざまな場所でのそのような検査が可能になるために必要なスループット、速度、サイズ、及び費用プロファイルを欠いている。むしろ、そのような検査の大部分は、多くの場合ドナー採取場所から離れた専用のスクリーニングセンターで行う。搬送の調製及び試料の搬送により、結果が得られるまでの費用及び時間がさらに増加する。現在までのところ、専門のスクリーニング施設以外でのドナー血液の試料の定型的検査の適応を容易にする、複雑な検査試料中の複雑な分析物の検出に十分な精度及び信頼性を有する、高スループットで高速かつ費用対効果の高いシステムは利用可能ではない。本明細書に記載のシステム及び方法は、速度／スループット対精度／信頼性という競合する、歴史的に未解決の課題を克服し、複雑な試料タイプにおいて、低い検出限界値で複数の複雑な分析物の検出が可能になる、高速、高スループット、高感度、特異的で費用対効果の高い解決策を提供する。この解決策により、ポイントオブコレクションの場所、ならびに血液バンクに出荷される前にドナー血液が保持されている地元の及び／または地域の場所など、幅広い場所でドナー血液の試料のスクリーニングを実行することが可能になる。
本明細書に記載の高スループットＮＡＴベースのスクリーニング方法及びシステムは、多種多様な適応症及び運用形態において使用が見出される。例えば、限定するものではないが、本明細書に記載の方法及びシステムを、臨床使用のためのドナー血液の出荷またはドナー物質の出荷のためのドナー血液のスクリーニングに使用できる。現在、ドナー血液は、多くの場合、長期間保持され、その間、ドナー血液に関連する試料を、１つ以上の病原体または感染因子の存在についてスクリーニングする。一般に、そのようなドナー血液は、そのようなスクリーニングであって、他の潜在的なスクリーニングステップの中でも特に、ＨＬＡタイピング及び血液型同定などの追加のスクリーニング態様も含めることができるスクリーニングが完了した場合にのみ臨床使用のために出荷する。したがって、本開示のハイスループット方法及びシステムは、特定の性能属性、例えば結果が得られるまでの時間及びシステムのユニットサイズ当たりのスループットを介して、そのような試料の出荷を加速するように、特に適合させる。さらに、本開示の方法及びシステムは、ドナー及び患者の安全性及びアクセスを動作上強化することができる、例えば、特定の試料の優先順位付け及び／または特定の病原体もしくは感染因子のスクリーニングなど、試料のスクリーニングのためのプロセス選択肢も提供する。
追加的に、または代替的に、本明細書に記載のシステムは、既存の採血、保存、及び使用パラダイムと比較して、それらの配置に基づいて特定の利点を提供することができる。本明細書で述べたように、ドナー血液は、典型的に全血として、またはアフェレーシスを使用して血漿として採取する。全血と血漿の両方の採取は、典型的にドナーの地元の血液及び血漿採取場所で行われる。献血は、地元の血液センターに送られるか、血液センターが採取場所の場合は地元の血液センターに保持され、ＲＢＣ、血小板、及び／または血漿を生成するための遠心分離などのさらなる処理を行う。しかし、同時に採取された試料は、血液センターから数時間離れた地域の、または集中型スクリーニング施設に搬送する。処理済血液製剤は、同時に採取された試料をスクリーニングするまで血液センターに保持する。しかし、試料を集中型スクリーニングセンターに搬送する物流により、献血された血液を使用することができるまでに遅延が生じる。血液センターからの試料の受け取り時間は１日に１回になる場合があり、夕方になる場合がある。したがって、１日の早い時間に血液が採取された場合、スクリーニングのために試料を受け取るまでにも数時間かかる場合がある。上で述べたように、受け取り後、検査センターは血液センターから数時間離れたところにある場合があり、したがって、検査及び血液の出荷にさらに遅延が発生することになる。さらに、受け取り時間は夕方であることが多いため、試料が検査センターに到着するのは、検査センターが閉まった後の遅い時間になる。したがって、検査は、典型的には提供の翌日まで行われない。現在、検査が完了するまでに１日かかる場合があるため、検査結果が得られるのは翌日遅くになる場合がある。さらに厄介なことに、病院は１日の早い時間に血液製剤を注文し、また試料検査は完了する前であり得る。その結果、完全に検査されていない試料は注文のために利用可能ではなく、関連するドナー血液が注文のために利用可能になるまでさらに１日待たなくてはならない。ある特定の血液製剤の貯蔵期間が非常に短いことを考慮すると、例えば、血小板の貯蔵期間は５日間であるが、同時に採取された試料のＮＡＴベースのスクリーニングの集中化に関連する搬送時間及びその他の物流上の問題によって、システムの効率が大きな影響を受け、有効期限までに実質量の血小板が使用されない可能性がある。したがって、本明細書に記載のシステムを地元の血液センターに配置すると、従来のＮＡＴベースのスクリーニング時間だけでなく、搬送時間に関連する出荷の遅延も解消され、ドナー血液の採取から使用のために利用可能になるまでの時間枠が大幅に短縮される。
この一般的な理解により、例えば、限定するものではないが、開示された主題の一態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、血液が処理されて血液成分が生成される血液センターで行うことができる。ドナー血液は、ドナー血液に関連する試料を遠方の検査センターに搬送することなく、血液センターから出荷する。いくつかの実施形態では、ドナー血液は、ドナー血液が血液センターに受入れられるのと同じ日に、血液センターでＮＡＴスクリーニングを受けてもよい。いくつかの実施形態では、ドナー血液は、血液センターで受入れられてから８時間以内にドナー血液の出荷に関連するＮＡＴ結果を得るために、ＮＡＴスクリーニングを受けることができる。いくつかの実施形態では、病院は、同日に血液センターに受入れられる血液を発注することができる。
現在の全血献血の分散保存とは対照的に、血漿献血及びそのような血漿献血と同時に採取された試料を、集中型血漿センターに一緒に搬送する。したがって、血漿収集センターにおける本開示のシステムの配置は、例えば、血漿アフェレーシスプロセス中にドナーをスクリーニングすることによってパラダイム全体の効率の改善を提供し、これにより、血漿スクリーニングが現在直面しているプーリング及び潜在的なプール分解を回避するか、または血漿が集中型施設に到着すると、それ以上ＮＡＴベースのスクリーニング遅延によって血漿のプーリング及び血漿由来生成物への分画のための血漿の放出が妨げられないような結果を提供することができる。
５．１ ドナー血液またはドナー物質の出荷
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法及びシステムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷のためのドナー血液の試料のスクリーニングに使用することができる。本明細書で使用される、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷のためのドナー血液の試料のスクリーニングは、１つ以上の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対する核酸分析を行うことを指す。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子に由来する核酸の存在または不存在の決定によって、ドナー血液またはドナー物質を出荷することができるかどうかを示す。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子に由来する所定のレベルの核酸の存在または不存在の決定によって、ドナー血液またはドナー物質を出荷することができるかどうかを示す。
一般に、ドナー血液またはドナー物質の出荷は、１つ以上の病原体または感染因子のセットに関する陰性結果、及びドナー血液またはドナー物質に関する追加情報、例えば、ＨＬＡ型及び血液型検査の収集を前提としている。したがって、ドナー血液出荷またはドナー物質出荷のための本開示の方法は、本明細書に記載のＨＴＮＡＴスクリーニングを超える追加のスクリーニングステップを含むことができる。例えば、限定するものではないが、そのような追加のスクリーニングは、出荷検査の中でもとりわけ、血液型検査及び／またはＨＬＡ組織型分類を含むことができる。
追加的に、または代替的に、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷のためのドナー血液の試料のスクリーニングのための本開示の方法及びシステムは、試料がヒトドナーのものであるドナー血液の試料のスクリーニングを含む。例えば、ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、全血である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、溶解全血である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、血清である。ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料は、血漿である。
追加的に、または代替的に、臨床使用のためのドナー血液の出荷は、輸血に関連して使用するための出荷である。ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー血液の出荷は、医薬品で使用するための出荷である。ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー血液の出荷は、治療処置に使用するための出荷である。ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー血液の出荷は、献血として使用するための出荷である。
ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー物質の出荷は、輸血に関連して使用するための出荷である。ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー物質の出荷は、医薬品で使用するための出荷である。ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー物質の出荷は、治療処置に使用するための出荷である。ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー物質の出荷は、献血として使用するための出荷である。
開示された主題によれば、臨床使用のためにそのドナー血液またはそのドナーからの物質を出荷するためにドナー血液の試料をスクリーニングするための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行すること、を含む。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子に由来する核酸の存在または不存在の決定によって、ドナー血液またはドナー物質を出荷することができるかどうかを示す。ある特定の実施形態では、核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示す。例えば、限定するものではないが、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上に由来する少なくとも所定のレベルの核酸がドナー血液の試料中に存在するという核酸分析の決定は、ドナー血液、またはドナー物質を臨床使用のために出荷することができないことを示す（例えば、確認検査のために隔離、破棄、または非臨床使用のために出荷することができる）。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上に由来する核酸がドナー血液の試料中に存在するという核酸分析の決定は、ドナー血液、またはドナー物質を臨床使用のために出荷することができないことを示す（例えば、確認検査のために隔離、破棄、または非臨床使用のために出荷することができる）。逆に、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上に由来する少なくとも所定のレベルの核酸がドナー血液の試料中に存在しないという核酸分析の決定は、ドナー血液、またはドナー物質を臨床使用のためにさらに考慮することができることを示す。上で述べたように、そのようなさらなる考慮事項は、他の出荷検査の中でも特に、血液型検査及び／またはＨＬＡ組織型分類を含むことができる。
ある特定の実施形態では、臨床使用のためにそのドナー血液またはそのドナーからの物質を出荷するためにドナー血液の試料をスクリーニングするための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析のみを実行すること、を含む。ある特定の実施形態では、核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷を示す。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子に由来する核酸の存在または不存在の決定によって、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質を出荷することができるかどうかを示す。
ある特定の実施形態では、所定のレベル以上の病原体または感染因子のレベルを決定することは、病原体または感染因子の存在を検出することと同等である。ある特定の実施形態では、所定のレベル未満の病原体または感染因子のレベルを決定することは、病原体または感染因子の不存在を決定することと同等である。
ある特定の実施形態では、臨床使用のためにドナー血液を出荷するためにドナー血液の試料をスクリーニングするための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、ドナー血液のイムノアッセイ分析の非存在下での臨床使用のためのドナー血液の出荷を示す。
ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料をスクリーニングするための、例えば、臨床使用のためのそのドナー血液またはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、例えば、血清学的検査を使用する試料の追加のスクリーニングをさらに含むことができる。追加的に、または代替的に、ドナー血液の試料をスクリーニングするための、例えば臨床使用のためにそのドナー血液またはドナーからの物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、病原体低減技術を使用して、ドナー血液またはドナー物質を処理することをさらに含むことができる。
５．２ ある特定の性能基準が可能になる出荷方法
開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液出荷またはドナー物質出荷のための本開示の方法及びシステムは、アッセイが特定の性能基準を達成できるドナー血液の試料のスクリーニングを含む。本明細書で使用される性能基準は、アッセイの１つ以上のステップの持続時間に関連するアッセイパラメータを指す。例えば、限定するものではないが、性能基準には、増幅反応の持続時間、単一のアッセイまたは複数のアッセイの結果が得られるまでの時間、及び１つ以上のアッセイのスループットをシステムのサイズの関数として含めることができる（例えば、自動システムの設置面積１ｍ２あたり、１時間あたりに分析される試料）。
例えば、限定するものではないが、開示された主題の一態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料に対して核酸分析を実行して、１つ以上の病原体または感染因子を検出することができ、ここで、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、実行された核酸分析に基づくことができ、この決定は、ドナー血液またはドナー物質を臨床使用のために出荷できるかどうかを示すことができ、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷は、開示された主題に従って核酸分析を実行するために、試料の最初の吸引から約１５分～約６０分、例えば、約２０～約６０分、約２０分～約４５分、約３４分、または約３９分で起こり得る。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の一態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料に対して核酸分析を実行して、１つ以上の病原体または感染因子を検出することができ、ここで、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定及び／または核酸の存在もしくは不存在の決定は、実行された核酸分析に基づくことができ、ここで、核酸分析は、開示された主題によれば、持続時間は約１分～約２０分、例えば約８分～約２０分の核酸増幅反応（例えば、増幅及び検出プロセス）を含む。この決定により、ドナー血液またはドナー物質を、臨床使用に出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質が移植または治療薬の製造に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の一態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料に対して核酸分析を実行して、１つ以上の病原体または感染因子を検出することができ、ここで、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定及び／または核酸の存在もしくは不存在の決定は、実行された核酸分析に基づくことができる。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子のうちの１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、開示される主題による核酸分析の実行のための試料の最初の吸引から約２０～約４５分で完了する。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子のうちの１つからの核酸の存在もしくは不存在の各決定は、開示される主題による核酸分析の実行のための試料の最初の吸引から約１５～約４５分、例えば約２０～約４５分で完了する。この決定は、ドナー血液またはドナー物質を臨床使用のために出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質が移植または治療薬の製造に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の一態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料に対して核酸分析を実行して、１つ以上の病原体または感染因子を検出することができ、ここで、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができ、ここで、病原体または感染因子のうちの１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、結果が得られるまでの時間が約２０分～約４５分である。この決定により、ドナー血液を、臨床使用に出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質を、臨床使用のために出荷できるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムでは、複数の試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。複数の試料のそれぞれにおける病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができる。核酸分析に基づく決定を、開示された主題による核酸分析の実行のための第１の試料の最初の吸引から、約２０分～約３．５時間以内に実行する。この決定により、ドナー血液を、臨床使用に出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナーに由来する物質を、臨床使用のために出荷できるかどうかを決定することができる。
開示される主題の別の態様によれば、本開示の方法及びシステムに基づく臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷は、システムが占める面積または体積の単位当たりの試料スループット（時間当たりの核酸分析結果の数として定義される）、例えば、システムの「効率」に関するある特定の性能基準を達成することができる。例えば、限定するものではではないが、本明細書、例えば図３、５～８、１５～１６、４３、及び４５～６６で具体化されるシステムは、約１ｍ２～約３ｍ２、または約１ｍ２～約２．５ｍ２、または約１ｍ２～約２ｍ２、１ｍ２～約１．５ｍ２、またはさらには約１ｍ２～約１．２ｍ２の設置面積を有することができる。本明細書で具体化されるように、そのようなシステムは、一般に６フィート（約２ｍ）未満の高さを有し、ある特定の実施形態では、システムを操作することを意図した個体群の９０％に関連する身長以下の高さを有するように構成される。ある特定の実施形態では、本開示のシステムは、システムを操作することを意図した女性個体群の９０％に関連する身長以下の高さを有するように構成することができる。したがって、ある特定の実施形態では、本明細書、例えば図３、５～８、１５～１６、４３、及び４５～６６で具体化されるシステムは、約１ｍ～約２ｍの高さに基づいて、約１ｍ３～約３ｍ３、または約１ｍ３～約３．５ｍ３、または約１ｍ３～約３ｍ３、または約１ｍ３～約２．５ｍ３、またはさらに約１ｍ３～約２ｍ３の体積を有することができる。
開示される主題の別の態様によれば、本開示の方法は、複数の試料分析用に構成されたシステムとの関係で利用することができ、したがって、限られた設置面積内で高効率の複数の試料分析を実行する本開示の方法及びシステムの能力は、既存の血液スクリーニングシステムに比べて大きな利点を提供するであろう。したがって、高効率システム、例えば、１ｍ２当たり１時間当たり少なくとも３０の核酸分析結果、または１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも１７の核酸分析結果を達成するシステム（システムの設置面積が約１ｍ２～約２ｍ２である場合、及び／または約１ｍ～約２ｍの高さに基づいて約１ｍ３～約４ｍ３の体積）は、設置の容易さ、操作者の使用の容易さ、及びリソース要件全体（例えば、専用の検査室スペースに関連する費用）に関して、既存のシステムに比べて実質的な利点を提供する。
以下の表、すなわち表１は、時間当たりの結果で測定される、異なる面積、体積、及びスループットを有するシステムの方法の種々の実施形態に関連する効率を概説する。本明細書で考察する「結果」という用語は、核酸分析によって行われる、病原体または感染因子に由来する標的核酸、またはその所定量の存在または非存在の数の決定を指す。例えば、限定でされるものはないが、本明細書に記載のシステムは、２４秒ごとに試料を試料調製サブシステムに吸引することができ、したがって１時間当たり１５０の試料吸引がもたらされる。ある特定の実施形態では、吸引された各試料を試料調製サブシステムを使用して調製し、単一の標的核酸を増幅及び検出し、吸引された最初の試料を調製し、増幅させ、検出する間の最初の起動期間の後、１時間あたり１５０件の個々の結果が得られる。ある特定の実施形態では、吸引された各試料を調製し、２つの増幅に分割し、各増幅反応は、検出のために単一の標的核酸を増幅し、吸引された最初の試料を調製し、増幅させ、検出する間の最初の起動期間の後、１時間あたり３００件の個々の結果が得られる。ある特定の実施形態では、吸引された各試料を調製し、２つの増幅に分割し、各増幅反応は、検出のために２つ以上の標的核酸を増幅し（例えば、デュプレックス、トリプレックス、または他の高次のマルチプレックス増幅及び検出）、吸引された最初の試料を調製し、増幅させ、検出する間の最初の起動期間の後、１時間あたり６００件の個々の結果が得られる。ある特定の実施形態では、溶出が２つの増幅に分割されるか、または増幅がマルチプレックス化されるかに関係なく、その最初の開始時間は２０～４５分となる。
Figure 2024518331000034
上の表に示された本開示によって具体化される方法及びシステムに関連する例示的な効率によって、現在市販されているシステムと比較した場合に、本開示の方法及びシステムに関連する顕著な利点が強調される。例えば、限定するものではないが、現在市販されているＮＡＴベースのスクリーニングシステムは、設置面積が１．１ｍ２（例えば、１．２ｍ×０．９ｍ）であり、８時間のスループットは２７５件の結果を有し、これにより、１ｍ２あたり８時間あたり２５０件の結果という８時間の効率（起動時間を含む）が得られる。現在市販されている他のＮＡＴベースのスクリーニングシステムは、それぞれ設置面積が３．６ｍ２（例えば、３ｍ×１．２ｍ）または５．２ｍ２（例えば、４．３ｍ×１．２ｍ）であり、８時間のスループットは３８４件の結果及び９６０件の結果（起動を含む）を有する。したがって、現在市販されているＮＡＴベースのスクリーニングシステムのこれらの追加の例では、８時間効率はそれぞれ、１ｍ２あたり８時間あたり１０７件の結果、及び１ｍ２あたり８時間あたり１８４件の結果を有する。対照的に、本明細書で具体化される方法及びシステムは、８時間当たり１，１１３件の結果（起動を含む）を達成することができ、１．４ｍ２（例えば、１．２ｍ×１．２ｍ）の設置面積では、１ｍ２あたり８時間当たり７９５件の結果という８時間効率を達成することになる。ある特定の実施形態では、本明細書で具体化される方法及びシステムは、８時間当たり１，１１３件の結果（起動を含む）を達成することができ、およそ１．９４ｍ２（例えば、およそ１．３２ｍ×１．４７ｍ）の設置面積では、１ｍ２あたり８時間当たり５７４件の結果という８時間効率を達成することになる。ある特定の実施形態では、本明細書で具体化される方法及びシステムは、８時間当たり２，２２５件の結果（起動を含む）を達成することができ、およそ１．９４ｍ２（例えば、およそ１．３２ｍ×１．４７ｍ）の設置面積では、１ｍ２あたり８時間当たり１，１４７件の結果という８時間効率を達成することになる。追加的に、または代替的に、本明細書で具体化される方法及びシステムで利用される試料が、溶出液の分割を介して、または単一の増幅反応における複数の標的核酸の増幅を介してのいずれかでマルチプレックス化されている場合、８時間効率は比例して増加するであろう。例えば、限定するものではないが、マルチプレックス反応を使用した追加の標的核酸の検出は、１ｍ２当たり８時間当たり約５７４件の結果ほど８時間効率を高めることができる。ある特定の実施形態では、２つの標的核酸を決定するためのマルチプレックス分析を、溶出液分割の非存在下で実行する場合、８時間効率は、１ｍ２あたり８時間あたり約１，１４８件の結果であり得る。ある特定の実施形態では、４つの標的核酸を決定するためのマルチプレックス分析を、溶出液分割の非存在下で実行する場合、８時間効率は、１ｍ２あたり８時間あたり約２，２９６件の結果であり得る。ある特定の実施形態では、２つの標的核酸を決定するためのマルチプレックス分析を、溶出液分割と組み合わせて実行する場合、８時間効率は、８時間あたり１ｍ２あたり約４，５９２の結果であり得る。
追加的に、または代替的に、開示された主題の一態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、複数の試料に対して核酸分析を実行して、１つ以上の病原体または感染因子を検出することができ、ここで、病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができ、方法及びシステムは、開示された主題に従って、スクリーニングを実行して、１時間当たり１ｍ３当たり少なくとも約７０件の結果、またはさらに１時間当たり１ｍ２当たり少なくとも約１４０件の結果を達成することができる。ある特定の実施形態では、この決定により、ドナー血液を、臨床使用に出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。
例えば、限定するものではないが、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムは、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約３５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約４５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約５５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約６５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約７５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約８５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約９０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約９５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１００件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１０５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１１０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１１５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１２０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムは、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１２５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１３５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１４５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１５５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１６５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１７５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１８５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１９０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約１９５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２００件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２０５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２１０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２１５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２２０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法及びシステムは、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２２５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２３５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２４５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２５５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２６５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２７５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２８５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２９０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約２９５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ３あたり少なくとも約３００件の結果の効率を達成することができる。
ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約６５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約７５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約８５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約９０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約９５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１００件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１０５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１１０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１１５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１２０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１２５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１３５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１４５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１５５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１６５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１７５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１８５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１９０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約１９５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２００件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２０５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２１０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２１５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２２０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２２５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２３５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２４５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２５５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２６５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２７５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２８５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２９０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約２９５件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３００件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３１０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３２０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約３８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４００件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４１０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４２０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約４９０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５００件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５１０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５２０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５３０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当た
り１ｍ２あたり少なくとも約５４０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５５０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５６０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５７０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５８０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約５９０件の結果の効率を達成することができる。ある特定の実施形態では、本開示の方法は、１時間当たり１ｍ２あたり少なくとも約６００件の結果の効率を達成することができる。
５．３ 特定のプロセスステップを組み込んだ出荷方法
開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液またはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、核酸分析は特定のプロセスステップを含む。本明細書で使用される「特定のプロセスステップ」は、試料調製、増幅、または検出のうちの１つ以上に関連する特に特定された戦略、ならびに特定の試料処理戦略、例として、試料の優先順位付け、または特定の病原体もしくは感染因子の検出が可能になるようなものを指す。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、スクリーニングする方法及びシステムを、プールされたドナー血試料とともに使用して、プール試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、実行された核酸分析に基づくことができる。プール試料中に、病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸が、所定のレベルでまたはそれを超えて存在することが決定される場合、方法及びシステムは、試料の核酸分析によって、プール試料に含まれる個々のドナー血液の試料またはドナー血液のサブプールをスクリーニングして、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定は、実行された核酸分析に基づくことができる。この決定により、ドナー血液を、臨床使用に出荷できるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。ある特定の実施形態では、方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液の試料に由来する物質が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、スクリーニングする方法及びシステムを、プールされたドナー血試料とともに使用して、プール試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。プール試料の核酸分析に基づく、複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または不存在の決定により、ドナー血液及び／またはドナー物質を臨床使用のために出荷することができるかどうかを示すことができる。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、プール試料中に複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を決定する場合、スクリーニングの方法及びシステムは、プール試料に含まれる個々の試料またはそのサブプールの核酸分析をさらに含むことができ、個々の試料またはそのサブプールに関連するドナー血液及び／またはドナー物質を、臨床使用のために出荷することができるかどうかを決定する。例えば、システム及び方法は、個々の試料またはそのサブプールの核酸分析に少なくとも部分的に基づいて、個々の試料またはそのサブプールに関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化される迅速なＮＡＴスクリーニングのための方法及びシステムは、プール試料を分解する際に特定の利点を提供する。この利点は、血漿のスクリーニングに関連する広範なプーリング、例えば、現在５１２個の個別の血漿試料のプーリングが利用可能であるが、この広範なプーリングに関連して特に顕著であるが、本開示の方法及びシステムの利点は、より小型のプール、例えば、血漿以外のドナー血液をスクリーニングする状況で定型的に利用されるプールでも顕著である。追加的に、または代替的に、本明細書で具体化される迅速なＮＡＴスクリーニングのための方法及びシステムは、本明細書でさらに説明されるように、個々の試料に使用されるのと同じオンボード試料処理ハードウェアを使用して、全血試料、または血清もしくは血漿試料をプールすることができる。限定ではなく例の目的で、本明細書で具体化される迅速なＮＡＴスクリーニングのための方法及びシステムは、６つの溶解全血試料または２４の血清または血漿試料をプールすることができる。以下の表、すなわち表２は、例示的なプールサイズに対する現在の分解戦略に関連する時間を、本明細書に記載の方法及びシステムを利用する分解戦略に関連する時間と比較する（提供される時間はスクリーニングのみのためのものである）。図示された分解経路に関して、太字の試料は、さらなる分解を保証する病原体または感染因子が同定されたプールである。表２に記載されている分解方法は、限定ではなく例及び例示のみを目的としている。システム及びアプリケーションの所望の性能に応じて、追加または代替の分解アルゴリズム及び方法を使用することができる。表２で参照されている従来のシステム及び迅速なＮＡＴシステムには、試料プールを分解するためのリキッドハンドラまたはプーラーが組み込まれている。表２の従来のシステムについて分解にかかる時間は、分解プールをスクリーニングするための機器の検査時間を指しており、分解プールの調製及び／または分解プールの手動搬送に必要な追加の分解時間は除外されている。分解プールの調製にかかる追加の分解時間は、使用される分解プールのサイズによって異なる可能性がある。限定ではなく例の目的で、分解プールを調製するための追加の分解時間は、分解されるプールのサイズ及び使用される分解プールのサイズに応じて、数分から最長１時間以上の範囲となる場合がある。表２に提供されている迅速なＮＡＴによる分解の時間には、分解プールの調製に必要な時間が含まれている。
Figure 2024518331000035
ある特定の実施形態では、陽性のプール試料は、８つの個別のドナー試料に直ちに分解することができる。このような状況では、従来のシステムではスクリーニング単独の場合少なくとも７時間（最初の試料について３．５時間、その後個々の試料について約３．５時間）を必要とするであろう。対照的に、この方法及びシステムは、スクリーニング単独の場合、約１．２時間（最初の試料について０．６時間、その後個々の試料について約０．６時間）を必要とするであろう。追加的または代替的に、陽性のプール試料は、６つの個別のドナー試料からなる２つのプールなど、他のプールサイズに分解することができる。
例及び例示の目的で、追加の例示的なプール分解技法を図８５Ａ～８５Ｆに示す。図８５Ａを参照すると、プールサイズが増大するにつれて、プール試料を分解するために１ラウンド以上のサブプール検査を使用することによって、プール分解効率を改善することができる。例えば、図８５Ａに示すように、１ラウンド以上のサブプール検査を使用すると、試料を分解するのに必要な検査の数を減らすことができる。例えば、２４のプール試料は、３ラウンドの分解検査及び合計９回の検査を使用して分解することができる。あるいは、２４のプール試料は、２ラウンドの分解検査（すなわち、１ラウンドのサブプール検査とそれに続く個別のドナー試料検査、またはＩＤＴ検査）及び合計１０回の検査を使用して分解することができる。追加的または代替的に、２４のプール試料は、個々のドナー試料検査のみ、すなわちＩＤＴ検査のみ、及び合計２４の検査を使用して分解することができる。
１ラウンド以上のサブプール検査を使用すると分解効率が改善するが、従来の分解方法では、多くの場合、サブプール検査が単一ラウンドのみ組み込まれるか、またはサブプール検査がまったく組み込まれない。例えば、プール試料またはプール試料のサブプールを形成するための試料のプーリングは、従来、専用のリキッドハンドラ上で実行することができる。プール試料を分解するためのサブプールの形成は、プール試料を形成するために使用される成分試料を手動で取得してリキッドハンドラに移送してサブプールにプールすること、次いで、サブプールを分析用の機器に手動で移送することを含むことができる。従来の分解では、次いで、成分試料を手動でリキッドハンドラに出入りさせるプロセスを繰り返して、追加の分解検査ラウンド用に追加のサブプールを形成することができる。専用のリキッドハンドラを使用して分解用のサブプールを形成することに伴う追加の時間及び複雑さは、追加ラウンドの分解検査を使用する利点を上回る可能性があるため、従来の分解方法は単一ラウンドのサブプール検査に限定される可能性がある。追加的または代替的に、従来の分解検査には、分解のためのＩＤＴ検査のみを含めることができる。
本明細書で具体化されるようなオンボードプーリングのための自動システム及び方法は、分解効率を増大させることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、プール試料を形成するために使用される成分試料は、プール試料の核酸分析中、及びプール試料が反応性であると決定された場合に、試料装填領域に保存することができる。システムは、さらにオンボードプーリング及び成分試料の核酸分析を自動的に開始して、プール試料を分解することができる。追加的または代替的に、分解効率を最大化するようにサブプールのサイズ及びサブプール検査のラウンド数を選択することができる。
例えば、限定するものではないが、本明細書で具体化されるドナー血液、例えば全血、溶解全血、血清、または血漿のプール試料は、２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、３９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、４９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、６９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、８９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９１人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９２人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９３人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９４人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９５人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９６人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９７人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９８人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、９９人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１００人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１，０００人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～５００人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～２５０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１５０人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１００人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２５～１００人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、５０～１００人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、７５～１００人のドナーからの血液を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、１００人超のドナーからの血液を含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１０，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～９，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～８，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～７，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～６，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～５，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～４，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～３，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～２，５００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～２，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１，５００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１，０００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～９００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～８００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～７００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～６００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～５００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～４００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～３００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～２５０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～２００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１５０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１００人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～９０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～８０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～７０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～６０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～５０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～４０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～３０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～２０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～１０人のドナーからの血漿を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液のプール試料は、２～５人のドナーからの血漿を含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、核酸分析は核酸増幅反応を含む。例えば、限定するものではないが、核酸増幅反応は等温反応であり得る。ある特定の実施形態では、等温反応はリコンビナーゼポリメラーゼ増幅である。ある特定の実施形態では、等温反応はニッキング酵素増幅反応である。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、核酸分析は、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、核酸分析は、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、核酸分析は、試料を試料溶解緩衝液及びプロテアーゼと同時に接触させることを含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、核酸分析は、試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、核酸分析は、試料を複数の微粒子と接触させること、及び磁力を介して表面上で微粒子を平行移動させることを含む。ある特定の実施形態では、磁力を介した表面上の微粒子の平行移動は、可動永久磁石及び／または電磁石、例えば固定電磁石によって提供される。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、核酸分析は、ドナー血液の試料から核酸を精製すること；精製された核酸を複数の画分に分割すること；及び少なくとも１つの画分を、さらなるスクリーニングのために保留することを含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するための本開示の方法によって、「Ｓｔａｔ」試料処理が可能になる。本明細書で使用される「Ｓｔａｔ」試料処理は、本開示の方法に関連してすでに処理されている試料を優先するか、または本開示の方法に関連して現在処理されている試料よりも優先される新しい試料を導入する能力を指す。例えば、限定するものではないが、ドナー血液を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の複数の試料に対して核酸分析を実行することを含み、複数のドナー試料の個々の試料の核酸分析の順序は変更可能であり、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する所定のレベルの核酸が存在しないと決定される場合、分析されたドナー試料に関連するドナー血液が臨床使用のために出荷されることが示される。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するための本開示の方法は、ドナー血液のイムノアッセイ分析の非存在下で行われる。
５．４ 特定の標的核酸のスクリーニングを含む出荷方法
開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含む。例えば、限定するものではないが、複数の病原体または感染因子は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、クラミジア、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、インフルエンザ、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、からなる群から選択することができる。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、コロナウイルス、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、ヒトＴリンパ指向性ウイルス（ＨＴＬＶ） パルボＢ１９ウイルス、ＨＡＶ、梅毒、クラミジア、淋菌、デング、チクングニア、ＷＮＶ、ＨＥＶ、ウスツウイルス、及びクロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ）からなる群から選択することができる。
ある特定の実施形態では、核酸分析は、例えば試料、例えばドナー血液の試料中の１つ以上の病原体または感染因子の存在または非存在を決定するために使用する。ある特定の実施形態では、核酸分析は、例えば試料、例えばドナー血液の試料中の１つ以上の病原体または感染因子のレベルを決定するために使用する。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、チクングニアウイルス及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである。ある特定の実施形態では、パルボウイルスＢ１９を検出するための核酸分析は、定量的核酸分析である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である。ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ及びＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ及びＨＥＶである。
５．５ マルチプレックス戦略を組み込んだ出荷方法
開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、１つもしくは複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、核酸分析はマルチプレックス分析を含む。本明細書で使用される場合、「マルチプレックス分析」は、例えば、各標的核酸が病原体または感染因子に由来する、２つ以上の標的核酸についての同時スクリーニングを指す。本明細書で使用される場合、「マルチプレックス分析」は、単一の反応容器、例えば増幅容器内での２つ以上の標的核酸の同時スクリーニング、ならびに２つ以上の標的核酸の別個の反応容器内でのスクリーニングを包含し、例えば、ここで、試料溶出液を、本明細書に記載されているように、さらに２つの別個の反応容器、例えば増幅容器に分割する。ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるマルチプレックス戦略によって、本明細書に記載される方法を実装するシステムの、結果が得られるまでの時間及び効率、例えば単位サイズ当たりの時間当たりの結果の数の実質的な改善が少なくとも部分的に可能になる。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析熱のマルチプレックス分析を含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析は、バベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む。ある特定の実施形態では、パルボウイルスＢ１９を検出するための核酸分析は、定量的核酸分析である。
５．６ 所定のレベルの標的核酸に基づく出荷方法
開示される主題の別の態様によれば、本明細書に記載される試料調製、標的増幅、及び検出戦略により、記載される方法を実装するシステムの結果が得られるまでの時間及び単位サイズ当たりのスループットの実質的な改善が少なくとも部分的に可能になり、そのようなドナー血液を効果的に監視するために関連する所定のレベルの標的核酸でのドナー血液のスクリーニングが可能になる。例えば、限定するものではないが、そのような所定のレベルは、政府機関または非政府組織によって提供される指針によって特定されるレベルとすることができる。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法及びシステムは、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子及び所定のレベルは、以下の：少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるクラミジア；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１０～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるインフルエンザ；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス及びＷＮＶであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。ある特定の実施形態では、パルボウイルスＢ１９を検出するための核酸分析は、定量的核酸分析である。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア及びマラリアであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０コピー／ｍＬのＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのＨＥＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり、ここで、所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析は、ジカウイルス及びびデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するまたはドナー物質を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を所定のレベルで検出することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析にはバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである。
ある特定の実施形態では、ドナー血液を出荷するための本開示の方法は、複数の病原体または感染因子を検出するためにドナー血液の試料に対する核酸分析を実行することを含み、ここで、複数の病原体または感染因子は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析は、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである。
ある特定の実施形態では、所定のレベル以上の病原体または感染因子のレベルを決定することは、例えば試料、例えば血液試料中の病原体または感染因子の存在を検出することと同等である。ある特定の実施形態では、所定のレベル未満の病原体または感染因子のレベルを決定することは、例えば試料、例えば血液試料中に病原体または感染性因子の不存在を決定することと同等である。
６． 分析システム；
ここで、開示された主題の種々の例示的なシステム及びその構成要素を詳細に参照するが、それらは添付の図面に示されており、以下でより詳細に説明される。開示された主題の上記の態様のそれぞれ、例えば、試料調製態様、増幅態様、及び検出態様は、種々の利点を有し、先に詳細に説明した種々の態様及び対応する方法及び性能パラメータを選択的に組み合わせて、本明細書に開示される方法及びシステムの所望の利点を達成できることが認識される。したがって、開示された主題によって企図される方法の異なる態様の多用途性及び柔軟性、及びその結果として生じる利益は、本明細書の開示によって企図されるように固有に組み合わせることができる種々のシステム及び構成要素と併せてさらに理解されるであろう。
例えば、開示された主題の別の態様によれば、ドナー血液の試料をスクリーニングする方法及びシステムは、試料分析ステーション、ならびにプロセッサ及び実行される命令を含むメモリを含むことができる。試料分析ステーションは、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含むことができる。プロセッサが命令を実行すると、システムはドナー血液の試料に対して核酸分析を実行して、１つまたは複数の病原体または感染因子を検出することができる。核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、方法及びシステムは、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質が出荷されることを示す。さらに、この方法及びシステムは、核酸分析結果に部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定することができる。本明細書に具体化されるように、臨床使用のためのドナー血液またはドナー物質の出荷のための複数のドナー血液の試料のスクリーニング及び核酸分析は、独立して、すなわち、試料溶解緩衝液と接触させる前に所定の順序で複数の試料をスクリーニングすること、または試料溶解緩衝液と接触させる前に特定の核酸分析を事前決定することを必要とせずに実行する。
追加的に、または代替的に、本明細書に具体化されるように、本明細書に記載のシステムは、そのような放出に影響を与えるために必要な結果を通信する追加のシステムを備えるか、または追加のシステムとインターフェースすることができる。例えば、限定するものではないが、本明細書に記載されるシステムは、血液選別コンピュータシステム（Ｂｌｏｏｄ Ｅｓｔａｂｌｉｓｈｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｓｙｓｔｅｍ ）（ＢＥＣＳ）などの情報システムを備えるか、またはそれとインターフェースすることができる。このようなＢＥＣＳシステムは、ドナー情報を追跡し、ドナー血液スクリーニング結果を追跡し、血液及び血液成分の出荷を、１つ以上のＮＡＴベースのアッセイ用に特定の出荷基準を満たすことが示されているもの、例えば陰性結果、のみに制限することにより、ヒトにおける疾患の不用意な伝染を低減するように設計されたソフトウェアで構成されている。
追加的に、または代替的に、本明細書で具体化されるように、システムのある特定の態様（例えば、試料チューブ、反応容器、ロボットピペッタ、及び種々のタイプの磁石の使用）は、互いに協調して動作するものとして説明されるが、当業者は、システムの種々の態様に対して様々な種々の選択肢が存在し、本開示はそのような態様の代替を組み込んだシステムを企図していることを認識するであろう。例えば、限定するものではないが、ある特定の実施形態では、１つ以上の試料調製、増幅、及び／または検出ステップは、流体移送及び試薬の導入のためにロボットピペッタを使用して達成することができるが、ある特定の実施形態では、磁石を、１つ以上のロボットピペッタ媒介ステップの代わりに使用することができる。同様に、ある特定の実施形態では、試料調製、増幅、及び／または検出は、静止チューブ、ウェル、または他の容器内で行うことができ、一方、他の実施形態では、試料調製、増幅、及び／または検出のうちの１つまたは以上は、例えばトラック上をシステム内の第１の位置から第２（第３、第４、第５、またはそれ以上）の位置に移動するチューブ、ウェル、または他の容器内で行うことができる。
開示された主題によるシステムは分析ステーションを含むことができ、分析ステーションは、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含むことができる。限定ではなく例として、試料装填領域は、１つ以上の試料チューブを受入れ、保存するように構成することができる。限定ではなく例として、試料チューブをラックに含めることができ、試料装填領域は試料チューブの１つ以上のラックを受入れることができる。本明細書でさらに説明されるように、試料チューブに含まれる試料の部分は、例えば試料ピペッタなどによって試料チューブから吸引し、核酸分析のためにシステム内に移送することができる。限定ではなく例として、試料チューブに含まれる試料の部分を試料チューブから吸引し、試料調製領域に移送することができる。核酸分析のための試料チューブからの試料またはその一部の吸引は、システム内の任意の好適な位置で行うことができる。例の目的で、吸引は試料装填領域内の場所で行うことができる。追加的または代替的に、吸引は試料吸引位置で行うことができる。例えば、限定するものではないが、試料チューブのラックは、例えばロボット試料ハンドラなどのロボットを用いて、装填領域からシステム内の吸引位置まで移送することができる。
本明細書で具体化されるように、核酸分析のために吸引された試料の部分に対して核酸分析を実行している間、試料チューブはシステム上に、例えば試料装填領域に留まることができる。本明細書でさらに説明されるように、開示された主題によるシステム及び方法の結果が得られるまでの時間の性能により、核酸分析が実行されている間、システム上、例えば装填領域に試料を保存することが容易になる。試料の部分に対して核酸処理を実行している間に、試料チューブをシステム上に保存すると、例えば、限定するものではないが、本明細書でさらに説明するように、オンボードプール分解などの利点を有することができる。
開示された主題によるシステムは、試料調製領域をさらに含むことができる。ある特定の実施形態では、試料は、核酸分析のための試料の最初の吸引に続く試料調製プロセスのために、試料調製領域に移送することができる。例えば、限定するものではないが、試料調製領域には、試料搬送システムならびに洗浄及び溶出システムを含めることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料調製領域は、容器内の１つ以上の試料を試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで搬送経路に沿って搬送するように構成された試料搬送機を含むことができる。例えば、本明細書で具体化されるように、試料搬送は、試料調製カルーセル、例えば溶解カルーセルを含むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、例示的な試料調製プロセスは、試料搬送機の試料分注位置で容器内に試料を分注することを含むことができる。例えば、限定するものではないが、試料はピペッタを使用して分注することができる。例示的な試料調製プロセスは、試料搬送機の搬送経路に沿って容器内の試料を試料捕捉及び移送位置まで搬送することをさらに含むことができる。所望の試料調製プロセスに応じて、例えば溶解緩衝液及び／またはＣｕＴｉコーティング微粒子などの１つ以上の試薬を、試料とともに容器に含めることができる。例えば、限定するものではないが、本明細書でさらに説明されるように、例示的な試料調製プロセスは、試料調製領域の試料搬送機において溶解プロセス、前処理プロセス、及び／またはオンボードプーリングプロセスを実行することを含むことができる。本明細書でさらに説明されるように、例示的な前処理及びオンボードプーリングプロセスは、容器が搬送経路に沿って搬送される際に、試料搬送機上の容器間で試料を移送することを含むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料調製領域はピペッタを含むことができ、ピペッタは、試料搬送機上の容器から、及び試料搬送機上の容器内に、試料を移送する、例えば吸引及び分注することができる。
例示的なシステムは、１つ以上の粒子移送機構を含むこともできる。例えば、システムは、核酸と結合したＣｕＴｉコーティング微粒子などの微粒子を試料搬送機から洗浄及び溶出システムに移送するための粒子移送機構を含むことができる。ある特定の実施形態では、洗浄及び溶出システムは、１つ以上の洗浄容器を含むことができる。例えば、本明細書で具体化されるように、洗浄及び溶出システムは、複数の洗浄容器を有する洗浄トラックを含むことができる。洗浄及び溶出システムでは、本明細書でさらに説明されるように、洗浄プロセスを実行することができる。例えば、限定されものではないが、洗浄及び溶出システムは、洗浄容器内で微粒子を移動させるための磁石を含むことができる。
開示された主題によるシステムは、増幅領域及び検出領域を含むこともできる。例示の目的であり、本明細書で具体化されるように、増幅領域及び検出領域は、増幅及び検出システムを含むことができる。増幅及び検出システムは、例えば、１つ以上の増幅容器及び１つ以上の検出器を有するカルーセルを含むことができる。本明細書で具体化されるように、試料は、増幅及び検出プロセスのために試料調製領域から増幅及び検出領域に移送することができる。例えば、限定するものではないが、洗浄プロセスからの溶出液は、例えばピペッタを用いて増幅及び検出システムに移送することができる。
図６２は、本明細書で開示される発明を実施するための例示的なシステムを示しており、図６２のシステムは、約３５分未満でＮＡＴ結果を提供することができる。図６２は、試料調製プロセス、増幅プロセス、及び検出プロセスを実行するためのＨＴＮＡＴ試料分析システム６２００、ならびに試料取り扱い、消耗品の装填及び廃棄物処理などのＨＴＮＡＴ試料分析システムからの結果の取得に関連する追加の構成要素の平面図である。図６２は、試料搬送機６２１０、洗浄及び溶出システム６２３０、ならびに増幅及び検出システム６２５０を有する試料調製領域を含む、一般にカルーセルベースのシステムを示す。本明細書で具体化されるように、試料搬送機は、試料調製カルーセル、例えば、回転カルーセル６２１１を含むことができる。
図６２に例示されるように、ＨＴＮＡＴ試料分析システム６２００の非限定的な実施形態は、試料チューブ６２０２のラック内に試料チューブ６２０４を含む。試料チューブ６２０４内に含まれる試料の部分を、試料ピペッタ６２１４によって吸引し、試料調製領域に移送することができる。試料調製領域は、試料搬送機を含むことができ、本明細書に具体化されるように、試料搬送機は、試料調製カルーセル、例えば溶解カルーセルを含むことができる。本明細書で具体化されるように、試料チューブ６２０４内に含まれる試料の部分を、試料ピペッタ６２１４によって吸引し、試料調製領域内の試料搬送機６２１０に、例えば、回転カルーセル６２１１内に配置された溶解チューブ６２２０に移送することができる。溶解チューブ及び溶解移送チップなどの消耗品は、回転カルーセル６２１１と組み合わせて使用するために、試料調製領域、例えば位置６２４２で使用するためにシステム内に保存することができる。例えば、溶解チューブ及び溶解移送チップローダ６２０８などの１つ以上のローダを利用して、溶解チューブ及び溶解移送チップを試料搬送機、例えば、回転カルーセル６２１１内にピックアンドプレースすることができる。ある特定の実施形態では、溶解チューブには、溶解試薬添加位置６２１２で試料溶解緩衝液を満たすことができる。試料溶解緩衝液は、１つ以上の棚または引出し、例えば位置６２３８に、保存することができる。追加的または代替的に、試料溶解が完了した後、核酸、例えば微粒子に結合した核酸を洗浄及び溶出システム６２３０に移送することができ、一方、溶解チューブ内に残った液体は、吸引して液体廃棄物として処分し、溶解チューブは固形廃棄物として処分する。核酸、例えば磁性微粒子に結合した核酸は、試料搬送上の容器から、例えば回転カルーセル６２１１上の溶解チューブから、試料移送機構を介して、例えば、溶解移送チップでの採取などを介して、例えば、磁性微粒子に結合した核酸を洗浄及び溶出システム６２３０上に存在する洗浄容器内にピックアンドプレースすることを容易にするために、溶解移送チップ内に磁石を配置することによって、洗浄及び溶出システム６２３０に移送することができる。洗浄容器は、洗浄及び溶出システムで使用するためにシステム上に保存することができ、１つ以上のローダを使用して洗浄及び溶出システムに移送することができる。例えば、洗浄容器は位置６２２８に保存することができ、洗浄／増幅容器ローダ６２２４を介してピックアンドプレースすることができる。本明細書で具体化されるように、洗浄及び溶出システムは、トラックを含むことができ、トラックはシステム内で洗浄容器を移動させることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、洗浄及び溶出システムはトラックを含むことができ、洗浄容器を、トラックに沿って連続的に搬送することができる。例えば、本明細書で具体化されるように、洗浄及び溶出システムは、ラウンドトラックを含むことができる。洗浄容器が洗浄及び溶出システム６２３０の周りを回転すると、洗浄容器内に含まれる核酸を、例えば本明細書で詳細に説明されるように磁石を使用して混合し、例えば、本明細書に記載の磁石を使用して、１つの洗浄容器から別の洗浄容器に移送することができる。例えば、洗浄プロセスは、本明細書に記載されるように、洗浄及び溶出システム６２３０上で実行することができ、洗浄プロセスは、１つ以上の洗浄ステップ及び溶出ステップを含むことができる。例えば、溶出ステップのために、溶出容器に移送する際に、核酸を溶出緩衝液と接触させることができる。溶出容器は洗浄容器に含めることができ、または別個の容器とすることができる。本明細書に具体化されるように、溶出緩衝液はシステム上に保存することができ、例えば溶出ステップのために洗浄容器または溶出容器に移送することができる。例えば、限定するものではないが、溶出緩衝液はピペッタを使用して移送することができる。本明細書で具体化されるように、溶出緩衝液を、棚または引出し６２３４に保存し、試薬ピペッタ６２２２を介して分注することができ、例えば、抵抗式従来型ヒーターを介して加熱することができる。ある特定の実施形態では、例えば洗浄プロセスの溶出ステップにおいて、核酸を磁性微粒子から溶出した後、例えば、本明細書で詳細に説明するように、磁石を使用して磁性微粒子を洗浄容器に移送することによって、磁性微粒子を溶出容器から除去することができる。次いで、溶出液を、例えばピペッタなどを使用して増幅及び検出システムに移送することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、溶出液を、溶出液ピペッタ６２１８を介して溶出容器から増幅及び検出システム６２５０に移送することができる。６２５０である。本明細書で具体化されるように、増幅及び検出システム６２５０は、増幅容器を配置することができる回転式カルーセルを含むことができ、例えば増幅容器は６２２６に保存され、洗浄／増幅容器ローダ６２２４によって増幅及び検出システム６２３０に移送される。以下に詳細に説明するように、溶出液、増幅試薬及び活性化剤の添加は、所定の順序、例えば、増幅試薬（「マスターミックス」）、その後に活性化剤、その後に溶出液で行うことができるが、本明細書に記載の方法及びシステム内で任意の好適な添加順序が意図されている。増幅試薬及び活性化剤は、ピペッタを介して、例えば試薬ピペッタ６２２２を介して増幅容器に分注することができる。活性化剤は、棚または引出し、例えば位置６２３２に保存することができる。増幅及び検出システム６２３０の周りの増幅容器の回転によって、増幅に好適な時間が可能になるだけでなく、検出を容易にするために、増幅容器が１つ以上の検出器６２４４と連通する位置に配置される。
図６３は、図６２の機器６２００の斜視図である。図６２～６３の例示的な実施形態では、試料分析システム６２００は、試料の検査を支持する追加のサブシステムを含むこともできる。試料チューブラック６２０２内の試料チューブ６２０４は、試料装填領域の装填ベイ６３００でシステムに装填することができる。一実施形態では、試料チューブラック６１０２は、５本の試料チューブ６１０４を保持する。装填ベイ６３００は、試料チューブラック６１０２を受入れるための複数の場所６３０４を含む。操作者は、さらなる処理のために複数の試料チューブラック６１０４をシステムに装填することができる。図６２～６３の実施形態では、装填ベイ６３００は、試料ラック６１０２を受けるための２つのレベル６３０１を備え、それぞれが試料チューブラック６１０２を受けるための３０個の位置を有する。試料チューブラック６１０２当たり５本の試料チューブ６１０４がある場合、装填ベイは、最大６０の試料チューブラック６１０２及び最大３００本の試料チューブ６１０４を受入れることができる。装填ベイ６３００は、追加の試料チューブラック６１０２を受入れるために１つまたは３つ以上のレベルを有することを含む、異なる構成を有することができる。
図６２～６３の試料分析システムはまた、ピペットを使用して試料チューブ６１０４内の試料の部分を吸引するなどの、さらなる処理のために試料ラック６１０２を装填ベイ６３００から試料装填領域内の別の位置に搬送するロボット試料ハンドラ６２４０を有してもよい。例えば、図６２に示すように、ロボット試料ハンドラ６２４０は、装填ベイ６３０４上の位置から試料チューブラック６１０２を取り上げ、それを、試料チューブラック６２０２を移動することができるシャトル６２９０上のロボット試料ハンドラ６２４０からのハンドオフ位置６２９１と試料ピペッタ６２１４による吸引位置６２９２との間に置く。その地点で、試料は本明細書に記載の核酸分析プロセスを受ける。
図６８Ａ～６８Ｄは、本明細書に記載の開示された主題を実施するための別の例示的なシステムを示す。図６８Ａは、例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システム６８００の上面図である。図６８Ｂは、例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システムの正面図である。本明細書で具体化されるように、例示的なシステム６８００は、約１．４７ｍ×約１．２７ｍの設置面積を有する。システム６８００は分析ステーションを含み、分析ステーションは試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む。本明細書でさらに説明するように、システムの構成（例えば、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域の構成）及びシステムの配置は、システムの高レベルの効率に寄与することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、開示の主題による例示的なシステムは、従来のシステムと比較して、システム設置面積の単位面積当たり、より多数の結果を提供することができる。
図６８Ａに示すように、システム６８００は、以下に開示する他の特徴の中でも、消耗品装填ベイを含む。限定ではなく例として、システムは、例えばピペットチップ、溶解チューブ、洗浄容器、及び増幅容器などの核酸分析用の消耗品を使用することができる。本明細書で具体化されるように、消耗品は、本明細書で説明されるシステムで使用するためにシステムに（例えば、ラックに）装填することができる。例えば、図６８Ｂに示すように、システムは、溶出液チップ６８３１、試料チップ６８３３、溶解容器６８３５、洗浄容器６８３７、及び増幅容器６８３９用の消耗品装填ベイ６８４１を含むことができる。消耗品、例えば、溶出液チップ６８３１、試料チップ６８３３、溶解容器６８３５、洗浄容器６８３７、及び増幅容器６８３９は、本明細書に記載されるシステム（例えば、試料調製システムならびに増幅及び検出システム）と併せて使用することができる。
図６８Ｃは、試料調製、増幅及び検出を実行するためのシステム６８００の試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域、ならびにＨＴＮＡＴ試料分析システムから試料取り扱い、消耗品の装填、及び廃棄物の処理などの、結果を取得することに関連する追加の構成要素を含む例示的な分析ステーションを示す平面図である。
本明細書で具体化されるように、試料調製領域は、試料搬送機６８０５、洗浄及び溶出システム６８５２、ならびに粒子移送機構６８０３を含む。本明細書で具体化されるように、試料搬送機６８０５は、溶解カルーセルを含むことができる。本明細書に記載されるように、試料搬送機は、搬送経路に沿って試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで容器を搬送することができる。本明細書に記載されるように、試料搬送機、例えば溶解カルーセルは、例えば溶解プロセス、前処理プロセス、及び／またはオンボードプーリングプロセスなどの１つ以上の試料調製プロセスを実行するために使用することができる。本明細書で具体化されるように、試料調製領域は少なくとも１つのピペッタを含むこともできる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料調製領域は試料／試薬ピペッタ６８１１を含むことができる。本明細書に記載されるように、試料／試薬ピペッタは、例えば、核酸分析のために試料チューブから試料の部分の最初の吸引を実行することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料／試薬ピペッタ６８１１は、吸引位置６８９２で試料チューブから試料の部分を吸引することができる。本明細書で具体化されるように、本明細書でさらに説明されるように、試料チューブを、１つ以上のシャトル及び／またはロボットハンドラを使用して、試料装填領域６８４２から移送して、試料吸引位置に位置決めすることができる。本明細書で具体化されるように、試料／試薬ピペッタ６８１１は、試料搬送機６８０５上に試料をプールするために使用することもできる。
本明細書に記載されるように、試料調製プロセスは、試料搬送機における溶解プロセスを含むことができ、溶解プロセスは、試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含むことができる。限定ではなく例示の目的で、溶解プロセスは、試料搬送機（例えば、試料調製カルーセル）６８０５上の容器、例えば、溶解チューブに１つ以上の試料を分注することを含むことができる。本明細書で具体化されるように、試料には、血清試料または血漿試料及び／または全血試料を含めることができる。溶解カルーセル６８０５では、試料を、溶解緩衝液、ＣｕＴｉ微粒子、内部対照、及び必要に応じてプロテイナーゼＫタンパク質と組み合わせることができる。本明細書にさらに記載されるように、溶解プロセスは、試料内に存在する病原体、感染因子、及び／または細胞の膜もしくは壁を破壊して、試料中に存在する病原体、感染因子、及び／または細胞内に存在する核酸を放出することができる。限定ではなく例示の目的で、核酸を、微粒子の表面上に捕捉することができる。本明細書で具体化されるように、試料調製プロセスの複数の態様は、試料搬送機、例えば試料調製カルーセル６８０５上で実行することができる。例えば、溶解プロセスを実行することができる。ある特定の実施形態では、オンボードプーリングプロセス及び溶解プロセスを実行することができる。ある特定の実施形態では、前処理プロセス、オンボードプーリングプロセス及び溶解プロセスを実行することができる。
所望の試料調製態様を、試料搬送機６８０５上で実行した後、微粒子を、洗浄及び溶出システム６８５２に移送することができる。本明細書で具体化されるように、粒子移送機構６８０３は、試料搬送機６８０５（例えば、溶解カルーセルまたは試料調製カルーセル）と洗浄及び溶出システム６８５２を接続し、試料処理における汚染を低減することができる。試料移送機構は、本明細書でさらに説明されるように、例えば磁気チップなどの磁石を使用して微粒子を移送することができる。洗浄及び溶出システムを使用して、本明細書でさらに説明される追加の試料調製プロセスの態様を実行することができる。本明細書で具体化されるように、洗浄及び溶出システムは、洗浄トラックを含むことができ、洗浄トラックに沿って容器を搬送することができる。本明細書で具体化されるように、洗浄及び溶出システム６８５２の洗浄トラックは、ロックステップ方式で連続的に移動することができる。例えば、洗浄及び溶出システム６８５２を使用して、本明細書でさらに説明される洗浄プロセスを実行することができる。本明細書で具体化されるように、洗浄プロセスは、複数の洗浄ステップ、例えば、３つの洗浄ステップを含むことができ、洗浄容器を使用して洗浄トラック６８０１上で実行することができる。限定ではなく例として、洗浄プロセスは、磁石、例えば外部磁石を使用してウェル内またはウェル間で微粒子を移動させることを含むことができる。１回目の洗浄は、核酸の変性条件を維持するために溶解緩衝液を使用して実行することができる。２回目及び３回目の洗浄は、溶解中に使用された化学物質を除去するために水で実行することができる。例えば、本明細書で具体化されるように、微粒子は、各ロックステップにおける各洗浄ステップに対し、例えば約２４秒ごとにウェル間を移動することができる。洗浄後、洗浄プロセスの一部として溶出ステップを実行することもできる。溶出ステップは、例えば、熱を使用してＣｕＴｉ微粒子から核酸を除去して、最終溶出液を提供することを含むことができる。例えば、溶出ステップは、洗浄及び溶出システム６８５２上で実行することもできる。例えば、本明細書に具体化されるように、溶出ステップは、洗浄トラック上の洗浄容器内で実行することができる。
限定ではなく例示の目的で、増幅及び検出ステップ（例えば、増幅及び検出プロセス）は、増幅及び検出システム、例えば、増幅及び検出サブシステム６８０７上で実行することができる。本明細書で具体化されるように、増幅及び検出サブシステム６８０７は、１つ以上のリーダ、及び増幅容器用の位置を有する増幅及び検出カルーセルを含むことができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、増幅及び検出サブシステム６８０７は、５つの独立した蛍光検出器を含むことができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、増幅及び検出カルーセルは、各増幅容器を、各ロックステップで、または約２４秒ごとに、５つの検出器のそれぞれを通過する各増幅容器を回転させて、約２４秒ごとにすべての試料について５つの独立した蛍光検出器上に検出シグナルを生成することができる。限定ではなく例として、増幅及び検出は、活性化剤としてマグネシウムを使用して試料からの精製核酸と混合する増幅容器内で行うことができる。追加的に、または代替的に、本明細書にさらに記載されるように、精製核酸に対して等温インキュベーションを適用し、同時に蛍光検出を行うことができる。
上述のように、例示的なシステム６８００などの自動システムでの核酸分析は、消耗品を消費する場合がある。限定ではなく例として、消耗品には、ピペットチップ、溶解チューブ、洗浄容器、及び増幅容器を含めることができる。消耗品は、ラックなどにパッケージングしてシステムに装填することができる。例えば、本明細書で具体化されるように、システムは、例えば装填領域６８４１などの装填領域を含むことができる。消耗品は、核酸分析で使用するために装填ベイからシステムに、例えば１つ以上のロボットローダによって導入することができる。例えば、増幅容器６８３９は、例えばシャトルを使用して装填領域６８４１からシステム内に移送することができ、増幅容器ローダ６８２４は、例えばピックアンドプレース技法を使用して増幅容器を増幅及び検出システムに移送することができる。追加的または代替的に、溶解チップ及び／または溶解容器６８３５は、例えばシャトルを使用して装填領域６８４１からシステム内に移送することができ、溶解容器及び溶解チップローダ６８０８は、溶解容器、例えば溶解チューブを、試料搬送機６８０５に移送することができる。
図６８Ｄは、図６８Ｃに示す処理デッキの上方のピペッタの平面図である。図示されているように、システムには、試料及び／または試薬をシステム全体に移動させるために１つ以上のピペッタを組み込むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、システムは、試料／試薬ピペッタ６８１１、溶出液移送ピペッタ６８１３、増幅試薬ピペッタ６８１５、及び試料調製試薬ピペッタ６８１７を含むことができる。
６．１ 試料調製システム
図６４～６５は、搬送機ならびに洗浄及び溶出システムを組み込んだ、本開示の一態様による例示的な調製システムを示す。加えて、限定ではなく例示の目的で、図５～７は、異なる試料移送及び回転タイミングが可能になる、本開示によって企図される代替調製プロセスを備えた例示的な調製システムを示す。試料調製は一般に、試料中に存在する核酸を単離及び／または精製するために利用され、溶解プロセス及び洗浄プロセスを含むことができる。ある特定の実施形態では、溶解プロセスは、試料溶解及び核酸捕捉のステップを含む。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスは、核酸洗浄（例えば、１つ以上の洗浄ステップ）及び核酸溶出（例えば、１つ以上の溶出ステップ）を含む。
６．１．１ 試料溶解及び核酸捕捉システム
上述したように、本明細書で使用するための試料調製プロセスは、溶解プロセスを含むことができる。上述したように、試料溶解は、試料内に存在する病原体、感染因子、及び／または細胞の膜もしくは壁を破壊して、試料中に存在する病原体、感染因子、及び／または細胞内に存在する核酸を放出する。一般に、システムは、分析対象のドナー試料と溶解溶液を自動的に接触させるために利用する。ある特定の実施形態では、本開示は、ドナー試料を試料溶解緩衝液と接触させるように構成されたシステムを対象とする。
ある特定の実施形態では、図６４に示すように、試料搬送機６４１０は、試料調製カルーセル、例えば、溶解チューブ６４２０を保持する位置を有する回転式カルーセル６４１１である。溶解チューブ６４２０は、溶解プロセス中に試料及び溶解緩衝液を保持する。図６４は、試料搬送機６４１０を単一のカルーセルとして示しているが、溶解プロセスは２つ以上のプロセス経路に分離することができる。例えば、図５～７において、試料と試料溶解緩衝液との接触を開始するように構成された特定のシステムは、本明細書において「前溶解システム」と呼ばれるが、試料溶解緩衝液の存在下で試料をインキュベートするように構成されたシステムは、本明細書において「溶解システム」と呼ばれる。したがって、前溶解システムでは一般に、個々のドナーからの試料を、試料溶解緩衝液及び微粒子含有試薬と合わせ、その後、試料溶解システム内で溶解及び核酸捕捉を受ける。
図６４は、溶解チューブ６４２０を保持できる２２個の位置（中央カルーセルの周りを時計回り）を含む。図６４のシステム例では、カルーセルはロックステップ原理に基づいて動作し、各ロックステップ後にカルーセルは時計回り方向に１位置移動する。ロックステップ、またはカルーセルの移動間隔の時間は、この実施形態では２４秒である。カルーセル６４１１上のすべての位置を、試料溶解プロセスで使用するわけではなく、一部の位置は、カルーセルへの溶解チューブの装填、溶解緩衝液の分注、または溶解チューブの取り外しに使用する。以下の表、すなわち表３は、溶解プロセスに関する例示的な時間及び動作を示す。２４秒のロックステップを使用するこの例示的な実施形態に示されるように、溶解プロセスの試料処理時間は３８４秒、すなわち６．４分である。
Figure 2024518331000036
図６４に示され、表３に開示される例示的な実施形態では、位置Ｌ１は、プロセスキューへの溶解チューブ１２０の装填に対応する。ある特定の実施形態では、装填は、装填可能なスタックからの公知の「ピックアンドプレース」戦略によって達成する。Ｌ２は、溶解緩衝液分注位置に対応する。Ｌ４は、溶解チューブへの微粒子の分注に対応する。この位置で分注される試薬は、公知の「シップアンドスピット」戦略によって試薬コンテナから分注することができる。この位置で分注される試薬としては、限定するものではないが、以下が挙げられる：内部対照、例えば、５０μｌ（＋／－５％）の体積で分注されるが、他の体積も本開示の範囲内で企図される、微粒子、例えば、３０μｌ（＋／－５％）または６０μｌ（＋／－５％）の体積で分注されるが、他の体積も本開示の範囲内で企図される、プロテイナーゼＫ、例えば、約２０μｌ～約１００μｌの体積で、約４０μｌ（＋／－５％）の体積で、または約２０μｌ（＋／－５％）の体積で分注されるが、他の体積も本開示の範囲内で企図される。ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ１、Ｌ２、及びＬ４に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。例えば、限定するものではないが、例示的な位置Ｌ１、Ｌ２、及びＬ４に対応する手順を実行する時間は、溶解プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
表３に開示された例示的な位置Ｌ５は、試料分注位置に対応する。この位置で分注される試料は、公知の「シップアンドスピット」戦略によって試料コンテナから分注することができる。図６２に示すように、個々のドナーまたは患者からの試料を、試料チューブ６２０２のラック内の試料チューブ６２０４から吸引する。ある特定の実施形態では、試料を、開いた試料チューブから吸引する。ある特定の実施形態では、試料を、例えば、吸引を容易にするために閉じた試料チューブに穴をあけることができるシステムを介して、閉じた試料チューブから吸引する。この位置で分注される試料は、１００～１０００μｌ（＋／－５％）の体積で分注することができるが、他の体積も本開示の範囲内で企図される。
表３に開示される例示的な位置Ｌ６～Ｌ１８は、インキュベーション、混合、及びインデックス付け位置に対応する。例えば、位置Ｌ６～Ｌ１８でのインキュベーション、混合、及びインデックス付けには、抵抗ヒーター、カルーセル動作、ポップアップミキサー、ロックステップ移送、及び／または時間優先スケジューリングの使用を組み込むことができる。ある特定の実施形態では、位置Ｌ６～Ｌ１８には、１つ以上の試料溶解緩衝液中でのインキュベーションを組み込むことができる。ある特定の実施形態では、試料は、約３分～約６分間、約４分～約６分間、または約５分～約６分間インキュベート、混合、及びインデックス付けすることができる。ある特定の実施形態では、試料は、約３分間、約４分間、約５分間、または約６分間インキュベート、混合、及びインデックス付けすることができる。ある特定の実施形態では、試料は約３１２秒間、すなわちは約５．２分間インキュベート、混合、及びインデックス付けすることができる。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法及びシステムで使用される試料溶解緩衝液は、約２．５～約４．７ＭのＧＩＴＣ、約２％～約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約５．５～約８．０のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、例えば、血漿または血清試料に関する実施形態では、試料溶解緩衝液は、約４．７ＭのＧＩＴＣ、約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約７．８のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、例えば全血試料に関する実施形態では、試料溶解緩衝液は、約３．５ＭのＧＩＴＣ、約２．５％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約６．０のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、Ｌ２～Ｌ１６は、ヒーター、例えば抵抗ヒーターを利用して、溶解試料を約５０℃～約６０℃に加熱する。ある特定の実施形態では、試料の混合を、約１５００ｒｐｍでのオフラインオービタル混合を介して達成する。
表３に開示される例示的な位置Ｌ１９は、微粒子捕捉に対応し、磁石は溶解チューブ１２０の底部で微粒子を捕捉して微粒子を収集する。これは、洗浄及び溶出システム６５３０に移送する前に微粒子を一緒に収集するのに役立つ。Ｌ２０は、微粒子の捕捉位置及び移送位置に対応する。この位置では、微粒子が溶解チューブの底部から放出され、その後、他の方法を使用して再捕捉される。ある特定の実施形態では、微粒子を、移送チップの構造要素に対する磁気捕捉を介して移送チップ内に捕捉する。ある特定の実施形態では、そのような構造要素は、限定するものではないが、例えばフィン間の微粒子の磁気捕捉のための、そのようなフィンを含むことができる。ある特定の実施形態では、捕捉された微粒子を含む移送チップをコンテナ内またはコンテナ上に位置決めし、捕捉磁石を後退させ、チップを振とうさせるかまたは振動させることによって、微粒子を、移送チップから後続のプロセスコンテナ（例えば、洗浄及び溶出サブシステム内のウェル）に移送する。
特定の実施形態では、例示的な位置Ｌ２１（例えば、表３に開示）は、溶解内容物の吸引に対応する。ある特定の実施形態では、例示的な位置Ｌ２２は、溶解チューブを移送して廃棄することに対応する。ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ２１及びＬ２２に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ２１及びＬ２２に対応する手順を実行する時間は、前処理プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
ある特定の実施形態では、カルーセルの位置は、表３．１に示すようにシフトすることができる。例えば、限定するものではないが、ある特定の実施形態では、例示的な位置Ｌ３は、溶解チューブ内に微粒子を分注することに対応する；例示的な位置Ｌ４は、試料分注位置に対応する；例示的な位置Ｌ５～Ｌ１７は、インキュベーション、混合、及びインデックス付け位置に対応する；例示的な位置Ｌ１８は、微粒子捕捉位置に対応する；例示的な位置Ｌ１９は、微粒子捕捉及び移送位置に対応する；例示的な位置Ｌ２０は、溶解内容物の吸引に対応する；例示的な位置Ｌ２１は、溶解チューブを移送して廃棄することに対応する。ある特定の態様では、例示的な位置Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３、Ｌ２０及びＬ２１に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の実施形態では、カルーセルの例示的な位置Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３、Ｌ２０及びＬ２１に対応する手順を実行する時間は、溶解プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
上記の例示的なシステムでは、２４秒のロックステップを使用し、試料は１６ロックステップ（表３に示すようにＬ５～Ｌ２０、または表３．１に示すようにＬ４～Ｌ１９）の試料搬送機で処理し、試料搬送の合計処理時間は３８４秒、すなわち６．４分となる。
ある特定の実施形態では、試料搬送における試料の処理時間は、試料容器（例えば、例示的な位置Ｌ４またはＬ５）からの試料の吸引で開始し、洗浄容器（例えば、例示的な位置Ｌ１９またはＬ２０）への微粒子の移送で終了する。ある特定の実施形態では、試料搬送における総試料処理時間は、約４分～約８分、約５分～約７分、または約６分～約７分であり得る。ある特定の実施形態では、試料搬送における総試料処理時間は、約４分、約５分、約６分、約７分、または約８分であり得る。ある特定の実施形態では、試料搬送における総試料処理時間は、約３８４秒、すなわち約６．４分であり得る。
ＴＴＲ計算のある特定の実施形態では、試料搬送上の試料の処理時間には、プロセスキュー（例えば、例示的な位置Ｌ１）へ溶解チューブを装填すること、溶解緩衝液を分注すること（例えば、例示的な位置Ｌ２）、微粒子を溶解チューブ内に分注すること（例えば、それぞれ表３．１及び３の例示的な位置Ｌ３またはＬ４）、溶解内容物を吸引すること（例えば、それぞれ表３．１及び３の例示的な位置Ｌ２０またはＬ２１）、及び溶解チューブを移送して廃棄すること（例えば、それぞれ表３．１及び３の例示的な位置Ｌ２１またはＬ２２）は含まれない。
限定ではなく例の目的で、以下の表、すなわち表３．１は、溶解プロセスに関する例示的な時間及び動作を含む、別の例示的な溶解プロセスを示す。２４秒のロックステップを使用するこの例示的な実施形態に示されるように、溶解プロセスの試料処理時間は３８４秒、すなわち６．４分である（例えば、位置Ｌ４～Ｌ１９で費やされる合計時間）。
Figure 2024518331000037
代替実施形態では、試料搬送は別個のカルーセルで実行することができる。例えば、限定するものではないが、図５に具体化されるように、第１のカルーセルは、前溶解１（「ＰＬ１」）から前溶解６（「ＰＬ６」）として識別できる６つの位置（中央カルーセルの周囲で時計回り）を含むことができる。本開示の実施形態は、代替システム構成に応じて、そのような前溶解位置を６つより多いか、または６つより少なく含むことができる。
図５に示される例示的な実施形態では、位置ＰＬ１は、プロセスキューへの溶解チューブの装填に対応する。ある特定の実施形態では、装填は、装填可能なスタックからの公知の「ピックアンドプレース」戦略によって達成する。ＰＬ２は、試薬分注位置に対応する。この位置で分注される試薬は、公知の「シップアンドスピット」戦略によって試薬コンテナから分注することができる。この位置で分注される試薬としては、限定するものではないが、以下が挙げられる：内部対照、例えば、５０μｌ（＋／－５％）の体積で分注されるが、他の体積も本開示の範囲内で企図される、微粒子、例えば、２０～４０μｌ（＋／－５％）の体積で分注されるが、他の体積も本開示の範囲内で企図される、プロテイナーゼＫ、例えば、約５０μｌ（＋／－５％）の体積で分注されるが、他の体積も本開示の範囲内で企図される。
例示的な位置ＰＬ３は、試料分注位置に対応する。この位置で分注される試料は、公知の「シップアンドスピット」戦略によって試料コンテナから分注することができる。図５に示すように、個々のドナーまたは患者からの試料を、試料チューブ９のラック内の試料チューブ８から吸引する。ある特定の実施形態では、試料を、開いた試料チューブから吸引する。ある特定の実施形態では、試料を、例えば、吸引を容易にするために閉じた試料チューブに穴をあけることができるシステムを介して、閉じた試料チューブから吸引する。この位置で分注される試料は、１００～１０００μｌ（＋／－５％）の体積で分注することができるが、他の体積も本開示の範囲内で企図される。
例示的な位置ＰＬ４は、試料溶解緩衝液の分注／混合位置に対応する。この位置で分注される試薬は、バルクリザーバから直接配管を介して分注するか、または公知の「シップアンドスピット」戦略によって試薬コンテナから分注することができる。この位置で分注される試料溶解緩衝液は、１００～１０００μｌ（＋／－５％）の体積で分注することができるが、他の量も本開示の範囲内で企図される。
例示的な位置ＰＬ５は、溶解チューブの封止位置に対応する。この位置での溶解チューブの封止は、当技術分野で公知の方法、例えば熱かしめテープ、プレスオンキャップ、及びＰＳＡテープによって達成することができる。
例示的な位置ＰＬ６は、溶解チューブの移送位置に対応する。この位置での溶解チューブの移送は、当技術分野で公知の方法、例えば、横方向シャッフル戦略及び／または「ピックアンドプレース」戦略によって達成することができる。ある特定の実施形態では、前溶解カルーセルから溶解カルーセルに移送されるチューブは、伝搬及び／または飛散を最小限に抑えるために封止する。
以下の表、すなわち表４は、前溶解プロセスに関する例示的な動作を示す。
Figure 2024518331000038
図６は、開示された主題による例示的な試料溶解システムを示すダイアグラムである。一般に、試料溶解システムは、試料に溶解及び捕捉のための適切な時間、温度、及び混合を提供する。
図６は、１８個の位置（中央カルーセルの周りを時計回り）を含み、これらは、溶解１（「Ｌ１」）から溶解１８（「Ｌ１８」）として識別することができる。本開示の実施形態は、代替システム構成及び所望の能力及びスループットに応じて、１８個より多いかまたは少ない位置を含むことができる。
図６に示される例示的な実施形態では、位置Ｌ１は、溶解チューブが例えば前溶解移送位置からカルーセルに移送される移送位置に対応する。この位置への溶解チューブの移送は、当技術分野で公知の方法、例えば、横方向シャッフル戦略及び／または「ピックアンドプレース」戦略によって達成することができる。例示的な位置Ｌ２～Ｌ１６は、インキュベーション、混合、及びインデックス付け位置に対応する。例えば、位置Ｌ２～Ｌ１６でのインキュベーション、混合、及びインデックス付けには、抵抗ヒーター、カルーセル動作、ポップアップミキサー、ロックステップ移送、及び／または時間優先スケジューリングの使用を組み込むことができる。ある特定の実施形態では、Ｌ２～Ｌ１６は、例えば約２４秒ごと（場合によってはそれより長く）のロックステップ移送を利用して、約３００～約６００秒の総インキュベーション持続時間を達成するが、他の持続時間も本開示の範囲内で企図される。ある特定の実施形態では、位置Ｌ２～Ｌ１６には、１つ以上の試料溶解緩衝液中でのインキュベーションを組み込むことができる。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法及びシステムで使用される試料溶解緩衝液は、約２．５～約４．７ＭのＧＩＴＣ、約２％～約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約５．５～約８．０のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、例えば、血漿または血清試料に関する実施形態では、試料溶解緩衝液は、約４．７ＭのＧＩＴＣ、約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約７．８のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、例えば全血試料に関する実施形態では、試料溶解緩衝液は、約３．５ＭのＧＩＴＣ、約２．５％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約６．０のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、Ｌ２～Ｌ１６は、ヒーター、例えば抵抗対流ヒーターを利用して、溶解試料を約５０℃～約６０℃に加熱する。ある特定の実施形態では、試料の混合を、約１５００ｒｐｍでのオフラインオービタル混合を介して達成する。
例示的な位置Ｌ１７は、微粒子の捕捉位置及び移送位置に対応する。位置Ｌ１７での微粒子の捕捉及び移送は、取り上げ移送チップの使用及び溶解チューブシールの穴開けを伴ってもよい。ある特定の実施形態では、移送チップの取り上げは、例えば、装填可能なラックからの公知の「ピックアンドプレース」戦略によって達成する。ある特定の実施形態では、溶解チューブシールを貫通して移送チップを押すことによって、溶解チューブに穴を開ける。ある特定の実施形態では、溶解チューブシールに穴を開けている間または穴を開けた後に、移送チップをひねることによって、穴クリアランスを増加させることができる。ある特定の実施形態では、微粒子を、移送チップの構造要素に対する磁気捕捉を介して移送チップ内に捕捉する。ある特定の実施形態では、そのような構造要素は、限定するものではないが、例えばフィン間の微粒子の磁気捕捉のための、そのようなフィンを含むことができる。ある特定の実施形態では、捕捉された微粒子を含む移送チップをコンテナ内またはコンテナ上に位置決めし、捕捉磁石を後退させ、チップを振とうさせるかまたは振動させることによって、微粒子を、移送チップから後続のプロセスコンテナ（例えば、洗浄及び溶出システム内のウェル）に移送する。
図６は１８個の位置（カルーセルの周囲で時計回り）を含み、カルーセルはロックステップ原理に基づいて動作し、各ロックステップ後にカルーセルは時計回り方向に１位置移動する。ロックステップ、またはカルーセルの移動間隔の時間は、この実施形態では２４秒である。以下の表、すなわち表５は、溶解プロセスに関する例示的な時間及び動作を示す。２４秒のロックステップを使用するこの例示的な実施形態に示されるように、溶解プロセスの試料処理時間は３００～６００秒、すなわち５～１０分である。
Figure 2024518331000039
限定ではなく例の目的で、以下の表、すなわち表５．１は、２４秒のロックステップを使用する別の例示的な溶解プロセス実施形態を示しており、溶解プロセスのためのサンプル処理時間は、３００～６００秒、すなわち５～１０分である。
Figure 2024518331000040
限定ではなく例の目的で、図６９Ａ及び６９Ｂは、本明細書に記載されるシステム及び方法で使用するための溶解チューブ及び移送チップの種々の実施形態を示す。例の目的で、本明細書で具体化されるように、溶解チューブ６９２０は、円錐形の底部を含むことができる。円錐形の底部は、任意の好適な抜き勾配を含むことができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、溶解チューブ６９２０は、約１度の抜き勾配を有する円錐形の底部を有することができる。例の目的であり、本明細書でさらに説明するように、溶解チューブ底部の構成は、例えば、溶解混合を試料搬送機、例えば溶解カルーセルの連続振動によって実行する場合など、所望の混合性能を達成するように選択することができる。本明細書でさらに具体化されるように、溶解チューブ６９２０は、入れ子防止機構６９０２を含むことができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、入れ子防止機構６９０２は、チューブ直径が減少した領域を含むことができ、複数の溶解チューブを積み重ねる場合、第１の溶解チューブの底部は、第２の溶解チューブの入れ子防止機構６９０２と係合して、第１の溶解チューブが第２の溶解チューブ内に完全に入れ子になるのを防止することができる。第１の溶解チューブが第２の溶解チューブ内に完全に入れ子になっていると、第１の溶解チューブが第２の溶解チューブ内に挟まれたり詰まったりする可能性があり、積み重ねた溶解チューブから単一の溶解チューブを取り出すことがより困難になるため、望ましくない場合がある。例の目的で、溶解チューブ６９２０は、６９０２として示される入れ子防止機構を有し、個々のウェルに詰めることができる。限定ではなく例示の目的で、汚染を避け、搬送を容易にするために、各チューブの底部に接触せずにチューブを積み重ねることができる。追加的または代替的に、チューブの側壁は、積み重ねられたチューブ間の動きを避けるために適合する溝を含むことができる。本明細書でさらに具体化されるように、移送チップ６９２０は、入れ子防止機構６９０１を含むことができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、入れ子防止機構６９０１は、移送チップ６９２０の外側側壁の周囲に配置された１つ以上の突起を含むことができる。本明細書で具体化されるように、複数の移送チップが一緒に積み重ねられる場合、第１の移送チップ６９２０の１つ以上の突起は、第２の移送チップの内側壁と係合して、第１の移送チップ６９２０が第２の移送チップ内に完全に入れ子になるのを防止することができる。例の目的であり、本明細書に具体化されるように、溶解チューブ及び移送チップの材料は、医療グレードのコポリマーＰＰであり得る。
追加的または代替的に、本明細書でさらに具体化されるように、溶解チューブ及び移送チップは、単一のスタックで一緒に積み重ねられるように構成することができる。例えば、図６９Ｂに示すように、移送チップ６９３１は、積み重ねるために溶解チューブ６９３０内に同心円状に配置することができる。本明細書で具体化されるように、積み重ねるためにセンタリングリング６９３５を使用して、溶解チューブ６９３０内で移送チップ６９３１を中心に置くことができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、センタリングリング６９３５を溶解チューブ６９３０内に押し込むことができ、移送チップ６９３１をセンタリングリング６９３５によって溶解チューブ６９３０内の適切な位置に保持することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、センタリングリング６９３５は、移送チップ６９３５上のフランジと係合することができる。本明細書で具体化されるように、溶解チューブと移送チップを同心円状に積み重ねることにより、パッケージング密度を改善することができる。限定ではなく例として、溶解チューブ及び移送チップそれぞれの別個のスタックではなく、単一のスタックで溶解チューブ及び移送チップを使用することができる。追加的または代替的に、センタリングリング６９３５によって、例えば試料調製中に、溶解チューブ６９３０からの液体内容物の飛散を低減することができる。
限定ではなく例及び例示の目的で、追加の溶解チューブの実施形態を、図６９Ｃ～６９Ｆに、示されている溶解チューブの例示的な寸法とともに示す。本明細書でさらに説明するように、溶解チューブの寸法は、システムの所望の性能に従って選択することができる。例えば、溶解チューブの寸法は、溶解チューブの内容物の混合を促進し、混合動作中に溶解チューブの内容物がチューブから飛散するリスクを低減するように選択することができる。追加的または代替的に、本明細書に具体化されるように、溶解チューブ寸法は、所望のスタッキング効率を達成するために選択することができる。
６．１．２ 混合システム
上記のように、本明細書で使用するための試料調製プロセスには、例えば、前処理プロセス（例えば、前処理溶解プロセス）、溶解プロセス、オンボードプーリングプロセス、及びそれらの組み合わせを含めることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料調製プロセスは試料調製領域で実行することができ、試料調製領域は試料搬送機を含むことができる。本明細書で使用するための試料プロセスは、混合を含むことができる。限定ではなく例として、溶解プロセスは、溶解チューブ内で試料と試薬を混合する混合を含むことができる。追加的または代替的に、オンボードプーリングプロセスは、例えばプール試料内で２つ以上の試料をより均一に分配するために、容器内で２つ以上の試料を混合することを含むことができる。
上述したように、試料調製プロセスにおける容器または溶解チューブ６４２０の内容物の混合は、試料搬送時に行うことができる。限定ではなく例として、混合は、溶解カルーセル６４１１上の１つ以上の位置で行うことができる。溶解チューブ６４２０の内容物の混合は、例えば、溶解チューブ内で試料と溶解緩衝液を混合することが望しい場合がある。混合は、例えば、溶解チューブ６４２０内に挿入することができる機械的チップなどを用いた機械的攪拌を使用して実行することができる。追加的または代替的に、混合は、溶解チューブ６４２０とインターフェースして、例えば溶解チューブ６４２０を振動及び／または回転させてその内容物を混合することができるボルテクサなどの機構を使用して実行することができる。追加的または代替的に、混合は、例えば、溶解チューブ６４２０内の磁性粒子と相互作用して溶解チューブ６４２０の内容物を撹拌することができる磁石を使用して実行することができる。例えば、永久磁石は、溶解チューブに対して移動することができ、溶解チューブ６４２０内の磁性粒子を撹拌することができる。追加的または代替的に、電磁石を、溶解チューブ６４２０に隣接して位置決めし、これを使用して溶解チューブ６４２０内の磁性粒子を攪拌することができる。
追加的または代替的に、本明細書に具体化されるように、混合は、試料搬送機の連続振動を使用して実行することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料搬送機は、本明細書でさらに説明されるように、容器内の１つ以上の試料を試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで搬送経路に沿って搬送するように構成することができる。限定ではなく例として、試料搬送機は、蛇行経路、チェーンコンベヤなどのコンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、ベルト、または車両システムを含むことができる。本明細書に具体化されるように、試料搬送機は、試料調製カルーセル、例として溶解カルーセルを含む。試料搬送機の連続振動は、試料搬送機の各振動を伴って円弧状に移動する混合すべき容器を用いて実行することができる。円弧状に移動する場合、少なくとも２つの移動軸を含めることができる。例えば、本明細書で具体化されるように、円弧状での移動には、カルーセルの連続する時計回り及び反時計回りの回転を含めることができる。限定ではなく例として、溶解チューブ６４２０の内容物の混合は、回転式カルーセル６４１１の回転動作を使用して実行することができる。例えば、カルーセル６４１１は時計回り及び反時計回りに素早く連続して回転することができ、カルーセル６４１１の回転により溶解チューブ６４２０の内容物を混合することができる。追加的または代替的に、円弧状の移動は、一方向への連続的な移動とそれに続く別の方向への移動を含むことができ、例えば、ベルトの第１の方向への連続的な移動とそれに続くベルトを画定する部分に沿った、例えば、少なくとも２つの軸の移動を含む、部分に沿った円弧状の第２の方向への移動を含むことができる。
理論に束縛されることを望むものではないが、連続振動、例えば、回転式カルーセル６４１１の連続的な回転動作を使用して実行することができる混合の例示的な物理原理を、図６４Ａを参照して説明する。限定ではなく例示及び説明の目的で、回転式カルーセル６４１１は、回転式カルーセル６４１１の回転によって、位置Ｐ１から位置Ｐ２に移動することができる単一の溶解チューブ６４２０を備えて示されている。示されるように、第１の半径Ｒ１を、回転式カルーセル６４１１の中心と、回転式カルーセル６４１１の中心に最も近い溶解チューブ６４２０の壁６４２０ａの部分との間で測定することができ、第２の半径Ｒ２を、回転式カルーセル６４１１の中心と、回転式カルーセル６４１１の中心から最も遠い溶解チューブ６４２０の壁６４２０ｂの部分との間で測定することができる。本明細書で具体化されるように、Ｒ２はＲ２より大きくてもよい。回転式カルーセル６４１１は、溶解チューブ６４２０を位置Ｐ１から位置Ｐ２まで回転させることができる。示されるように、内壁部分６４２０ａは、溶解チューブ６４２０の位置Ｐ１から位置Ｐ２への回転中に距離Ｄ１を移動し、外壁部分６４２０ｂは、溶解チューブ６４２０の位置Ｐ１から位置Ｐ２への回転中に距離Ｄ２を移動する。本明細書で具体化されるように、カルーセル６４１１の回転及び溶解チューブ６４２０の位置Ｐ１から位置Ｐ２への移動中、内壁部分６４２０ａは、外壁部分６４２０ｂがＤ２を移動するのにかかる時間と同じ時間で、距離Ｄ１を移動することができる。したがって、本明細書に具体化されるように、カルーセル６４１１の回転及び溶解チューブ６４２０の位置Ｐ１から位置Ｐ２への移動中の外壁部分６４２０ｂの加速度は、カルーセル６４１１の回転及び溶解チューブ６４２０の位置Ｐ１から位置Ｐ２への移動中の内壁部分６４２０ａの加速度よりも大きい。換言すれば、本明細書で具体化されるように、カルーセル６４１１の回転中、カルーセルの外側で移動する距離はカルーセルの内側で移動する距離よりも長く、両方の距離が同時に移動するため、カルーセルの内側よりもカルーセルの外側の方が加速度が大きい。
限定ではなく例及び説明の目的で、例示的な実施形態の動作をさらに例示及び説明するために、例示的な計算が本明細書に含まれる。例えば、カルーセルが位置Ｐ１から位置Ｐ２に回転する間にカルーセルの内側で移動する距離は、円弧長Ｄ１を有する円弧として表すことができ、カルーセルの外側で移動する距離は、円弧長Ｄ２を有する円弧として表すことができる。説明及び例示の目的で、本明細書に具体化されるように、カルーセル６４１１は、およそ１１７ｍｍの内半径Ｒ１及びおよそ１３３ｍｍの外半径Ｒ２を有することができ、位置Ｐ１と位置Ｐ２は、およそ１．３３度回転離れていてもよい。説明及び例示の目的で、円弧長Ｄ１は２＊Ｒ１＊π＊１．３３／３６０として計算することができる。Ｄ２は、２＊Ｒ２＊π＊１．３３／３６０として計算することができる。説明及び例示の目的で、本明細書で具体化されるように、Ｄ１は、およそ２．７２ｍｍであり得、Ｄ２は、およそ３．０８ｍｍであり得る。
上述したように、カルーセル６４１１の位置Ｐ１から位置Ｐ２への回転動作中、内壁部分６４２０ａは、外壁部分６４２０ｂが距離Ｄ２を移動するのと同じ時間内に距離Ｄ１を移動する。限定ではなく説明及び例示の目的で、時間「ｔ」にわたる位置Ｐ１から位置Ｐ２への回転中の内壁部分６４２０ａの加速度は、加速度１＝２＊Ｄ１／ｔ２として計算することができ、外壁部分６４２０ｂの加速度は、加速度２＝２＊Ｄ２／ｔ２として計算することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、Ｄ１が２．７２ｍｍ及びＤ２が３．０８ｍｍの場合、内壁部分６４２０ａの加速度１は、外壁部分６４２０ｂの加速度２のおよそ８８％であり得る。
上述したように、本明細書に具体化されるように、カルーセル６４１１の回転及び溶解チューブ６４２０の位置Ｐ１から位置Ｐ２への移動中の外壁部分６４２０ｂの加速度は、カルーセル６４１１の回転及び溶解チューブ６４２０の位置Ｐ１から位置Ｐ２への移動中の内壁部分６４２０ａの加速度よりも大きい可能性がある。本明細書で具体化されるように、外壁部分６４２０ｂのより大きな加速度は、溶解チューブ６４２０の直径に関係する可能性がある。例えば、図６４Ａを参照すると、Ｒ２とＲ１の間の差は、溶解チューブの直径に関係する可能性があり、溶解チューブは、Ｒ２とＲ１との間のより大きな差、及び外壁部分６４２０ｂと内壁部分６４２０ａとの間のより大きな加速度の差に対応するより大きな直径を有する。限定ではなく例として、チューブの底部の抜き勾配が小さい溶解チューブは、溶解チューブの底部でより大きな直径を有することができ、これにより、外壁部分６４２０ｂと内壁部分６４２０ａとの間の加速度に対応してより大きな差が提供され得る。限定ではなく例として、１°の抜き勾配を有する溶解チューブは、２．５°の抜き勾配を有する溶解チューブよりも、チューブの底部に向かってより大きなチューブ直径を有することになる。さらに、本明細書でさらに説明するように、溶解チューブの直径が大きくなると、溶解チューブ内の流体の高さが低くなり、これにより、例えば、混合中に液体が溶解チューブから飛散するリスクを低減することができる。
図６４Ｂは、カルーセル６４１１が第１の位置から第２の位置まで反時計回りに回転する間の溶解チューブ６４２０の概略図を示す。上述したように、カルーセル６４１１が第１の位置から第２の位置まで回転する間、外壁部分６４２０ｂは内壁部分６４２０ａよりも速く加速することができる。内壁部分６４２０ａと外壁部分６４２０ｂとの間のこの加速度の差により、溶解チューブ６４２０に含まれる液体、例えば試料及び溶解緩衝液が回転し、第１の位置から第２の位置までのカルーセル６４１１の移動中にチューブ内に波を作出する可能性がある。限定ではなく例の目的で、図６４Ｂは、カルーセル６４１１の反時計回りの回転中に外壁部分６４２０ｂに沿って溶解チューブ６４２０内に形成される液体波面６４３０を示す。示されるように、波面６４３０は、溶解チューブ６４２０の外壁に沿って、カルーセル６４１１の回転動作とは反対の方向に移動することができる。例えば、図６４Ｂに示すように、カルーセル６４１１の反時計回りの回転により、波面６４３０が形成され、溶解チューブ６４２０の外壁部分６４２０ｂに沿って時計回り方向に移動することができる。
本明細書でさらに具体化されるように、限定ではなく例の目的で、カルーセル６４１１の回転方向を逆転させることは、溶解チューブ６４２０の内容物の混合にさらに寄与することができる。例えば、図６４Ｃを参照すると、カルーセル６４１１が位置Ｐ２から位置Ｐ３まで時計回りに回転している間の溶解チューブ６４２０が示されている。説明及び考察の目的で示されるように、カルーセル６４１１及び溶解チューブ６４２０が位置Ｐ１から位置Ｐ２まで反時計回りに回転した後、波面６４３０は、外壁部分６４２０ｂから内壁部分６４２０ａまで外壁に沿って溶解チューブ６４２０内を移動することができる。本明細書で具体化されるように、カルーセル６４１１の回転方向を逆転させて（例えば、反時計回りの回転から時計回りの回転へ）波面が外壁部分６４２０ｂから内壁部分６４２０ａに移動する場合、溶解チューブの内容物にさらなる回転力を与えることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、カルーセルの方向を逆転させると、波面６４３０が内壁部分６４２０ａに沿って波面が時計回りに回転し続けることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、溶解チューブ６４２０は、例えば全血試料及び溶解液などの液体、ならびに本明細書に記載の磁性粒子を含むことができる。本明細書で具体化されるように、カルーセルを一方向に連続的に回転させ、次に反対方向に回転させる（例えば、反時計回りに続いて時計回りに回転させる、またはその逆）と、溶解チューブ６４２０の液体内に磁性粒子の渦を形成することができる。回転速度、回転距離、逆転、及び遅延タイミングは、システムの所望の性能及びシステムの寸法、例として溶解チューブ６４２０の寸法及びカルーセル６４１１の寸法に基づいて選択することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、回転速度、回転距離、逆転、及び遅延タイミングは、およそ１．３秒以内に溶解チューブの液体内容物内に渦を形成するように選択することができる。本明細書で具体化されるように、溶解チューブの液体内容物内での渦の形成は、混合の指標を提供することができる。
例えば回転式カルーセル６４１１の回転動作などの試料搬送機の連続振動を使用する試料調製プロセスにおいて、容器、例えば溶解チューブ６４２０の内容物を混合することにより、利点を提供することができる。限定ではなく例として、回転式カルーセル６４１１の回転動作などの試料搬送機の連続振動を使用した混合により、溶解チューブ６４２０の内容物を混合するために必要なハードウェアを削減または排除することができる。例えば、本明細書で具体化されるように、カルーセルの回転動作を混合に使用する場合、磁石及び／または機械的撹拌機もしくはボルテクサなどの別個の混合ハードウェアを省略することができる。追加的または代替的に、回転式カルーセル６４１１の回転動作を使用した混合により、使用される消耗品の数を削減することができる。例えば、回転式カルーセル６４１１の回転動作を使用した混合により、使い捨ての機械的撹拌チップの必要性を低減または排除することができる。追加的または代替的に、回転式カルーセル６４１１の回転動作を使用した混合により、溶解チューブのための飛沫またはエアロゾル封じ込めカバーの必要性を低減または排除することができ、これにより消耗品の使用をさらに削減することができる。追加的または代替的に、本明細書でさらに具体化されるように、回転式カルーセル６４１１の回転動作を使用した混合により、混合に必要な時間を短縮し、システムのスループットを向上させることができる。限定ではなく例として、回転式カルーセル６４１１の回転動作を使用した混合により、追加の処理時間を必要とする可能性がある機械的撹拌などの他の混合ステップを削減または排除することができる。
追加的または代替的に、例えば、回転式カルーセル６４１１の回転動作などの試料搬送機の連続振動を使用した混合は、例えば、短距離の回転式カルーセルの時計回り及び反時計回りの回転などの、例えば、溶解チューブの直径のおよそ＋／－１０％に相当する回転などの、小さな連続振動を使用して実行することができる。本明細書で具体化されるように、ロボットピペッタは、試料搬送機の振動中の試料搬送機上の容器及び試料搬送機上の容器にアクセスすることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、ロボットピペッタは、回転可能な混合動作中に回転式カルーセル上の溶解チューブにアクセスすることができ、これは試料処理時間を短縮するのに有利であり得る。追加的または代替的に、本明細書で具体化されるように、回転式カルーセル６４１１の回転動作を使用した溶解チューブの内容物の混合は、カルーセル上の任意の位置で実行することができる。
６．１．３ プーリングシステム
開示された主題の別の態様によれば、開示された方法及びシステムは、プール試料に対して核酸分析を実行するために、プール試料とともに使用することができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、試料は、オンボードハードウェアを使用してプールすることができる。本明細書で使用される「オンボード」という用語は広義の用語であり、当業者に通常の慣用的な意味が与えられるべきであり（また、特別な意味または専用の意味に限定されるものではない）、限定するものではないが、単一のシステム（例えば、単一の検査装置）上での構成要素及び／または方法ステップの実行を含むことを指す。例えば、限定するものではないが、オンボードプーリングには、試料をプールすること、及びプーリングと分析との間に手動介入を行わずに同じ検査室機器上でプール試料の分析を実行することが含まれる。
本明細書で具体化されるように、システム及び方法は、プール試料を形成するために、検査またはスクリーニングされる複数の試料のサブセットのオンボードプーリングを含むことができ、プール試料に対して核酸分析を実行して、１つ以上の病原体もしくは感染因子の存在を検出することができる。
限定ではなく例の目的で、本明細書に具体化されるように、個々の試料調製を管理する同じハードウェアをプーリングに使用して、プール試料を形成することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、核酸分析は試料調製プロセスを含むことができ、試料調製プロセスは試料調製領域で実行することができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、オンボードプーリングは、図６８Ａ～６８Ｄに示す例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システム６８００の試料調製領域で実行することができる。試料調製領域には試料搬送機を含めることができ、試料搬送機は、搬送経路に沿って試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで、その間の中間位置を伴って、個々の容器を連続的に搬送するように構成することができる。本明細書で使用される「連続的に搬送する」という用語は広義の用語であり、当業者にはその通常の慣用的な意味が与えられるべきであり（また、特別な意味または専用の意味に限定されるものではない）、限定するものではないが、試料をある位置から別の位置へ自動的に、次々とストリーム状に搬送、移送、及び／または運搬することを指し、少なくとも定常状態の動作中に、第１の位置で試料搬送機に第１の容器を追加することは、第２の下流位置で試料搬送機から別の容器を取り外すことと同時に起こり得る。試料搬送機は、任意の好適な構成を含むことができる。例えば、限定するものではないが、試料搬送機は、蛇行経路、チェーンコンベヤなどのコンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、ベルト、または車両システムを含むことができる。本明細書で具体化されるように、例示的なＨＴＮＡＴ試料分析システム６８００の試料搬送機は、試料調製カルーセル６８０５を含むことができ、オンボードプーリングは試料調製カルーセル６８０５上で実行することができる。本明細書で具体化されるように、試料調製カルーセルは溶解カルーセルであり得る。例の目的で、本明細書に具体化されるように、試料調製カルーセル６８０５は、搬送経路に沿って試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで、その間の中間位置を伴って、個々の容器を連続的に搬送するように構成することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、搬送経路は、試料分注位置Ｌ４と試料捕捉及び移送位置Ｌ１９との間の中間位置Ｌ５～Ｌ１８を伴って、試料調製カルーセル６８０５の周囲に延びることができる。本明細書で具体化されるように、搬送経路に沿って個々の容器を連続的に搬送することは、試料調製カルーセル６８０５を回転させることを含むことができる。本明細書で具体化されるように、試料調製カルーセル６８０５は、本明細書でさらに説明されるように、ロックステップ方式で回転することができる。限定ではなく例の目的で、各ロックステップの持続時間は約１５秒～約３０秒の間であり得る。
例えば、本明細書に具体化されるように、オンボードプーリングは、試料分注位置Ｌ４と試料捕捉及び移送位置Ｌ１８との間の搬送経路に沿って試料調製カルーセル６８０５上で溶解チューブなどの個々の容器を連続的に搬送すること、及び試料調製カルーセル６８０５上の容器内の第１の試料及び第２の試料をプールして、プール試料を形成すること、を含むことができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、第１の試料及び第２の試料をプールすることは、試料調製カルーセル６８０５が第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５まで搬送する前に、試料分注位置Ｌ４で第１の試料及び第２の試料を第１の容器１２２１内に分注することを含むことができる。本明細書で具体化されるように、第１の容器１２２１は、本明細書で説明されるように、溶解緩衝液などの１つ以上の試薬を含むことができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、試料搬送機６８０５は、上述したようにロックステップ方式で移動することができ、図８２Ａ及び図８２Ｂを参照すると、試料／試薬ピペッタ６８１１は、試料装填領域の第１の試料チューブから試料分注位置Ｌ４の第１の容器１２２１に第１の試料を移送することができる。本明細書でさらに具体化されるように、試料／試薬ピペッタ６８１１は、試料吸引位置６８９２にある第２の試料チューブから試料分注位置Ｌ４にある第１の容器１２２１に第２の試料を移送して、試料調製カルーセル６８０５が第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５まで搬送する前に、第１の試料と第２の試料を組み合わせることができる。限定ではなく例の目的で、プールされると、第１の容器１２２１内のプールされた第１及び第２の試料を、搬送経路に沿って試料捕捉及び移送位置Ｌ１８まで搬送することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、溶解プロセスは、本明細書に記載されるように、プールされた第１及び第２の試料に対して実行することができる。
限定ではなく例の目的で、試料分注位置Ｌ４で第１の容器１２２１に移送される第１及び第２の試料は、プール試料であり得る。限定ではなく例として、第１及び第２の試料はそれぞれ、４８個の試料のプールを含むことができる。本明細書でさらに説明されるように、第１及び第２の試料はそれぞれ、試料吸引位置６８９２への導入前にリキッドハンドラまたはプーラー上で調製されたプール試料などの、プール試料であり得る。追加的または代替的に、第１及び第２の試料はそれぞれ、個々のドナー試料であり得る。
追加的または代替的に、本明細書で具体化されるように、オンボードプーリングは、追加の試料を組み合わせてプールすることをさらに含むことができる。例えば、オンボードプーリングは、追加の試料を組み合わせて第１の容器１２２１内にプールすることを含むことができる。例及び例示の目的で、図８３Ａを参照し、図８３Ａは、中間位置Ｌ５に第１の試料及び第２の試料を含有する第１の容器１２２１を備えた試料調製カルーセル６８０５を示す。例の目的で、本明細書に具体化されるように、第３の試料及び第４の試料を、中間位置Ｌ５で第１の容器１２２１に分注して、第３の試料及び第４の試料をプール試料に追加することができる。本明細書で具体化されるように、試料をプールすることは、試料吸引位置６８９２にある第３の試料チューブから第３の試料を、及び試料吸引位置６８９２にある第４の試料チューブから第４の試料を、第１中間位置Ｌ５にある第１容器１２２１に移送することを含むことができる。
追加的または代替的に、本明細書に具体化されるように、開示される主題の一態様による試料調製プロセスは、本明細書に記載される溶解プロセスを含むことができ、ある特定の実施形態では、オンボードプーリングは、溶解プロセスなどのさらなる試料調製のためにプール試料を試料調製カルーセル６８０５上で移送することをさらに含むことができる。例えば、引き続き図８３Ａを参照すると、プール試料は、試料調製カルーセル６８０５上の中間位置から試料分配位置Ｌ４にある第２の容器１２２２に移送することができる。例示の目的で、本明細書に具体化されるように、第１の容器１２２１内のプールされた第１、第２、第３、及び第４の試料は、図８３Ａに矢印１３０１により示すように、第１の容器１２２１から試料分注位置Ｌ４にある第２の容器１２２２に移送することができる。例の目的で、本明細書でさらに説明するように、第１、第２、第３、及び第４の試料を、試料調製カルーセル６８０５上の第１の容器１２２１内で組み合わせることができ、次いで、プール試料を、試料分注位置Ｌ４にある内部に１つ以上の試薬を有する第２の容器１２２２に移送して、プール試料の溶解プロセスを開始することができる。
本明細書で具体化されるように、個々の試料及び／またはプール試料を、試料／試薬ピペッタ６８１１を使用して、試料調製カルーセル６８０５上の容器間で移送することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料／試薬ピペッタ６８１１は、使い捨てチップを使用して試料を吸引し、分注することができる。例及び説明の目的で、試料／試薬ピペッタ６８１１は、プールされた第１、第２、第３及び第４の試料を第１の中間位置Ｌ５にある第１の容器１２２１から吸引し、プール試料を、１つの使い捨てピペットチップを使用して試料分注位置Ｌ４にある第２の容器１２２２に分注することができる。追加的または代替的に、第１、第２、第３、及び第４の試料は、試料分注位置Ｌ４の第２の容器１２２２内にプールすることができる。例えば、第１の中間位置Ｌ５にプールされた第１及び第２の試料を有する第１の容器１２２１の場合、試料／試薬ピペッタ６８１１により、試料吸引位置６８９２でその試料コンテナから第３の試料を吸引し、第３の試料を、第１の使い捨てピペットチップを使用して、試料分注位置Ｌ４の第２の容器１２２２へ 次いで、試料／試薬ピペッタ６８１１は、第１のチップを廃棄し、第２の使い捨てチップを取り上げ、試料吸引位置６８９２でその試料コンテナから第４の試料を吸引することができる。次に、試料／試薬ピペッタ６８１１は、同じ使い捨てチップを使用して、第１の中間位置Ｌ５で第１の容器１２２１から第１及び第２の試料をさらに吸引することができる。次に、試料／試薬ピペッタ６８１１は、第１、第２、及び第４の試料を試料分注位置Ｌ４で第２の容器１２２２内に分注して、第１、第２、第３、及び第４の試料を第２の容器１２２２内にプールすることができる。次に、本明細書で具体化されるように、プール試料に対して追加の試料調製プロセスを開始することができる。
追加的または代替的に、本明細書で具体化されるように、追加の試料をプールすることができる。例えば、限定するものではないが、追加の試料を、試料吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料コンテナから試料調製カルーセル６８０５に移送し、第１の容器１２２１にプールすることができる。例えば、試料搬送機が第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５に移送する前に、追加の試料を、試料吸引位置６８９２の各試料チューブから試料分注位置Ｌ４の第１の容器１２２１に移送することができる。追加的または代替的に、試料搬送機が第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５から第２の中間位置Ｌ６に移送する前に、追加の試料を試料吸引位置６８９２の各試料チューブから第１の中間位置Ｌ５の第１の容器１２２１に移送することができる。追加的または代替的に、追加の試料を、試料吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから、試料調製カルーセル６８０５の搬送経路に沿った他の中間位置にある第１の容器１２２１に移送することができる。限定ではなく例として、１つの試料は、試料吸引位置６８９２にある試料チューブから各中間位置にある第１の容器１２２１に移送することができる。追加的または代替的に、２つの試料を、試料吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから各中間位置にある第１の容器１２２１に移送することができる。追加的または代替的に、３つの試料を、試料吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから各中間位置にある第１の容器１２２１に移送することができる。追加的または代替的に、４つの試料を、試料吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから各中間位置にある第１の容器１２２１に移送することができる。
限定ではなく例の目的で、第１の容器を搬送経路に沿って搬送する際に、試料調製カルーセル６８０５上の第１の容器１２２１に２～５０個の間の試料をプールすることができる。追加的または代替的に、第１の容器１２２１を搬送経路に沿って搬送する際に、試料調製カルーセル６８０５上の第１の容器１２２１内に２～３０個の間の試料をプールすることができる。追加的または代替的に、本明細書に具体化されるように、第１の容器１２２１を搬送経路に沿って搬送する際に、試料調製カルーセル６８０５上の第１の容器１２２１内に２～２４個の間の試料をプールすることができる。
プールサイズは、所望の場合、選択することができる。限定ではなく例の目的で、所望のプールサイズは、例えば、プール試料体積を調整することによって支持することができる。例えば、プール内の試料の数が、所定のプール試料体積に対して増加するにつれて、プールの各成分試料からの液体の体積は減少する。したがって、プールサイズが大きくなると、プール試料の体積を増加させることができ、十分な体積の各成分試料をプール試料に含めることができる。例示の目的で、本明細書に具体化されるように、ピペットチップ、溶解チューブ、及び／または増幅及び検出容器のサイズは、所望のプール試料体積に従って選択することができる。追加的または代替的に、追加のシステムパラメータを調整することができる。例えば、ロックステップの持続時間を長くして、試料搬送機の移動の間に少なくとも１つのピペッタの移動に追加の時間を与えることができ、これにより、ピペッタは、追加の試料をプールするための追加の時間を提供することができる。追加的または代替的に、少なくとも１つのピペッタの速度を増加させることができる。追加的または代替的に、少なくとも１つのピペッタは、２つ以上のピペットチャネルを含むことができる。
例及び説明の目的で、試料調製カルーセル６８０５上に２４個の試料をプールするための例示的なプールプロセスを、以下の表５．２に提供する。
Figure 2024518331000041
Figure 2024518331000042
本明細書で具体化されるように、試料調製カルーセル６８０５には、２４秒のロックステップを使用することができる。表５．２に示すように、オンボードプーリングプロセスは、プーリング用の第１の試料の吸引から開始することができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、２４秒のロックステップごとに２つの試料を試料プールに追加することができ、２４個の試料をプールするためのプーリングプロセスの持続時間は約２８８秒であり得る。本明細書で具体化されるように、プール試料は、さらなる試料調製のために試料分注位置Ｌ４で新しい溶解チューブに分注することができ、これは、オンボードプールプロセスの終了を示すことができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、２２個の試料を約２６４秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、２０個の試料を約２４０秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、１８個の試料を約２１６秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、１６個の試料を約１９２秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、１４個の試料を約１６８秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、１２個の試料を約１４４秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、１０個の試料を約１２０秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、８個の試料を約９６秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、６個の試料を約７２秒でプールすることができる。限定ではなく例として、本明細書で具体化されるように、４個の試料を約４８秒でプールすることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、血漿または血清試料などの２４個の試料を約５分以下でプールすることができる。
開示された主題の別の態様によれば、開示された方法及びシステムは、前処理プロセスを含むことができ、オンボードプーリングは、前処理済試料のオンボードプーリングを含むことができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、前処理プロセスは、全血溶解前処理プロセスを含むことができ、オンボードプーリングは全血溶解物のプーリングを含むことができる。
例示的な前処理プロセスは、上でより詳細に説明されている。本明細書で具体化されるように、前処理プロセスは試料調製カルーセル６８０５上で実行することができ、試料を試料調製カルーセル６８０５上の容器に分注することを含むこと、及び試料分注位置と捕捉及び移送位置との間に中間位置を伴って画定された搬送経路に沿って、試料及び試薬をその中に含む容器を連続的に搬送すること、を含むことができる。例の目的で、図８４Ａ～図８４Ｃを参照すると、前処理プロセスは、試料調製カルーセルが第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５まで搬送する前に、試料分注位置Ｌ４で第１の試料を第１の容器１２２１内に分注することを含むことができる。次に、試料調製カルーセルが第２の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５に、及び第１の容器１２２１を第２の中間位置Ｌ６に移送する前に、試料分注位置Ｌ４で第２の試料を第２の容器１２２２に分注することによって、第２の容器１２２２内の第２の試料の前処理を開始することができる。本明細書で具体化されるように、容器１２２１及び１２２２は、例えば溶解緩衝液などの試薬をその中に含むことができ、第１及び第２の試料を、搬送経路に沿って試料捕捉及び移送位置Ｌ１８に向かって搬送するときに溶解することができる。本明細書で具体化されるように、前処理プロセスは、各中間位置で試料と試薬を混合することを含むことができる。例示的な混合システムについては、本明細書でさらに説明する。本明細書でさらに具体化されるように、前処理プロセスは、試料を約３～約６分間の間溶解することを含む。
開示された主題の一態様によれば、本明細書に具体化されるように、全血溶解前処理プロセスなどの前処理プロセスの後、オンボードプーリングは、全血溶解物のプーリングを含むことができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、前処理済試料のサブセットを試料調製カルーセル６８０５上にプールすることができ、プール試料に対して核酸分析を実行することができる。本明細書で具体化されるように、前処理済試料をプールすることは、第１の中間位置で第１の容器１２２１から第１の前処理済試料を吸引すること、及び第２の中間位置で第２の容器１２２２から第２の前処理済試料を吸引することを含むことができる。例の目的で、図８４Ｃを参照すると、第１の試料は位置Ｌ１７から吸引することができ、第２の試料は位置Ｌ１６から吸引することができる。本明細書で具体化されるように、前処理済試料を吸引する中間位置は、前処理プロセスの態様に基づいて選択することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、２４秒のロックステップにより、前処理プロセス中に第１及び第２の試料を位置Ｌ１６及び位置Ｌ１７に搬送して、第１及び第２の試料を溶解するのに十分な時間を提供することができる。
前処理済試料をプールすることは、第１の前処理済試料及び第２の前処理済試料を第３の容器１２２３に分注して、第１及び第２の前処理済試料を組み合わせてプールすることをさらに含むことができる。例えば、本明細書に具体化されるように、第１及び第２の前処理済試料を、試料分注位置Ｌ４で第３の容器１２２３に分注して、前処理済試料を組み合わせてプールすることができる。本明細書でさらに具体化されるように、試料分注位置Ｌ４で前処理済試料を分注及びプールすることにより、追加の溶解プロセスなどのさらなる試料調製を開始することができる。
例及び説明の目的で、試料調製カルーセル６８０５上に６つの試料を前処理及びプールするための前処理及びプールプロセスを含む例示的な試料調製プロセスを、以下の表５．３に提供する。
Figure 2024518331000043
本明細書で具体化されるように、試料調製カルーセル６８０５は、２４秒のロックステップを使用することができる。表５．３に示すように、前処理及びプーリングプロセスは、前処理用の第１の試料の吸引から開始することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、約３３６秒の前処理時間に相当する、試料１が中間位置Ｌ１７に到達するまで、試料１をインキュベート及び混合することができる。本明細書に具体化されているように、試料２～５は、試料１よりも短い時間で前処理することができる。例えば、約２６４秒の前処理時間に相当し得る、試料６が中間位置Ｌ１４に到達するまで、試料１をインキュベート及び混合することができる。本明細書で具体化されるように、前処理されプールされる試料の数は、前処理プロセスのパラメータに基づいて選択することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、前処理時間は、前処理済試料をプールする前の、全血試料の溶解前処理プロセスに関して約３～約７分の間の範囲であり得る。例えば、本明細書に具体化されるように、前処理済試料１～６を、単一の２４秒のロックステップで試料分注位置Ｌ４で吸引し、新しい溶解チューブに分注することができ、これにより、前処理及びプーリングプロセスを終了させることができる。本明細書で具体化されるように、６つの全血試料の前処理及びプーリングプロセスは、約６分以下で実行することができる。
開示された主題の別の態様によれば、オンボードプーリングは、プール試料のオンボード分解を支持するために使用することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、複数の病原体または感染因子のうちの１つに由来する核酸がプール試料中に存在すると決定された場合、オンボード分解を実行して、成分試料のうちのどれが、病原体または感染因子からの核酸を含んでいるかを同定することができる。
本明細書で具体化されるように、プール試料のオンボード分解は、サブプールの形成を含むことができ、各サブプールはプール試料を形成するために使用される試料のサブセットから形成される。例の目的で、本明細書で具体化されるように、本明細書に記載のオンボードを使用して、所望の分解戦略に従ってサブプールを調製することができる。上述したように、また図８５Ａ～８５Ｆに示される例示的な分解戦略を参照すると、本明細書で具体化されるオンボード分解は、複数ラウンドのサブプール検査を含むことができる。
追加的または代替的に、また本明細書でさらに具体化されるように、オンボード分解によって、分解効率を向上させることができ、例えば、プール試料を分解するのに必要な検査の数及びプール試料を分解するのに必要な時間を削減することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、プール試料を形成するために使用される試料は、プール試料の核酸分析中にオンボードで保存することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、プール試料を形成するために使用される試料は、プール試料の分析中に装填領域１０２に保存することができる。追加的または代替的に、また本明細書でさらに具体化されるように、複数の病原体または感染因子のうちの１つに由来する核酸がプール試料中に存在すると決定された場合、プール試料を形成するために使用される成分試料を、さらなる核酸分析のために装填領域１０２から自動的に移送することができる。
限定ではなく例の目的で、本明細書に記載のオンボードプーリングのシステム及び方法を使用して、９６個の試料のプールを形成及び検査することができる。追加的または代替的に、９６個のプール試料中の複数の病原体または感染因子のうちの１つに由来する核酸の存在が検出されると、本明細書に記載のオンボード分解のためのシステム及び方法を使用して、９６個の試料のプールを分解することができる。本明細書で具体化されるように、９６個の試料のプールを形成及び分解することができ、９６個の成分試料のそれぞれに関連するドナー物質を臨床使用のために出荷することができるかどうかについて、核酸分析用の第１の成分試料の最初の吸引から約４時間未満で、決定を行うことができる。
追加的または代替的に、本明細書でさらに具体化されるように、オンボードプーリングによって、システムのスループットを向上させることができる。限定ではなく例の目的で、本明細書で具体化されるように、図８６Ａ及び図８６Ｂを参照し、これらは、例示的な試料タイプの例示的なスループット及び図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されている例示的なシステムなどの例示的なＨＴＮＡＴシステムのプロセスを示す。図８６Ａは、血清、血漿、及び／または溶解全血試料の例示的なスループットを示す。例の目的で、本明細書に具体化されるように、血清、血漿、及び／または溶解全血試料のＨＴＮＡＴは、本明細書に記載される溶解プロセス、洗浄及び溶出プロセス、ならびに増幅及び検出プロセスを含むことができる。限定ではなく例の目的で、本明細書で具体化されるように、個々の試料を処理する場合、１時間あたり約１５０個の試料のスループットを達成することができる。本明細書で具体化されるように、１時間あたり約１５０個の試料のスループットは、試料調製のために、２４秒のロックステップごとに１つの試料を、試料吸引位置６８９２から試料調製カルーセルに移送することに相関する場合があり、したがって１時間あたり１５０の試料吸引がもたらされる。本明細書で具体化されるように、１時間あたり約１５０試料のスループットにより、本明細書で具体化されるＨＴＮＡＴシステムは、例えば、分割溶出構成及び／またはマルチプレックス増幅及び検出戦略が使用されるかどうかに応じて、１時間あたり１５０の個々の結果、及び１時間あたり最大６００以上の個々の結果を達成することができる。
図８６Ａを参照すると、開示された主題によるオンボードプーリングは、スループットを増加させることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、２つの試料のオンボードプーリングは、２４秒のロックステップごとに、試料調製のために試料吸引位置６８９２から試料調製カルーセルに２つの試料を移送することを含むことができ、これは、１時間あたり３００の試料吸引につながる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、開示された主題によるオンボードプーリングにより、１時間あたりの試料吸引数を２倍にすることができる。本明細書に具体化されるように、試料は、血清、血漿、及び／または溶解全血試料であり得、ＨＴＮＡＴは、本明細書に記載さのオンボードプーリングプロセス、溶解プロセス、洗浄及び溶出プロセス、ならびに増幅及び検出プロセスを含むことができる。図８６Ａを参照すると、２つの血清、血漿、及び／または溶解全血試料のプールを処理する場合、スループットは約１５０プール／時間であり得る。本明細書で具体化されるように、１時間あたり約１５０プールのスループットにより、本明細書で具体化されるＨＴＮＡＴシステムは、例えば、分割溶出構成及び／またはマルチプレックス増幅及び検出戦略が使用されるかどうかに応じて、１時間あたり１５０プールの結果、及び１時間あたり最大６００以上のプール結果を達成することができる。本明細書に具体化されるように、各プール結果、すなわちプール試料の各結果によって、２つ以上の個々の試料中に１つ以上の標的核酸が不存在であることの決定が容易になる場合がある。例えば、プール結果にプール内に標的核酸が不存在であるという決定が含まれる場合、プール結果には、２つの個々の試料に、すなわち、２のプールサイズを使用すると、標的核酸が不存在であるという決定が含まれる可能性がある。例えば、１２のプールサイズを使用すると、各プールの結果には、１２の個々の試料に、標的核酸が不存在であるという決定が含まれる可能性がある。本明細書に具体化されるように、開示された主題によるオンボードプーリングによって、プーリングを用いない場合の個々の試料のハイスループット分析と比較して、１時間当たりより多くの個々の試料について標的核酸が不存在であるという決定を容易に行うことができる。
限定ではなく例の目的で、開示された主題の一態様によれば、１時間あたり約２４０～約３４０個の試料を試料吸引位置６８９２から試料調製カルーセルに移送することができる。
図８６Ｂは、本明細書に記載の前処理プロセスを含む全血試料の例示的なスループットを示す。例の目的で、本明細書に具体化されるように、全血試料のＨＴＮＡＴは、本明細書に記載される前処理プロセス、溶解プロセス、洗浄及び溶出プロセス、ならびに増幅及び検出プロセスを含むことができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、個々の試料を処理する場合、１時間あたり約７５個の試料のスループットを達成することができる。本明細書で具体化されるように、個々の全血試料を処理することは、１つの試料を、試料吸引位置６８９２から試料調製用カルーセルに、２４秒のロックステップの１つおきに移送することを含むことができ、したがって１時間あたり約７５の試料吸引がもたらされる。本明細書で具体化されるように、１時間あたり約７５個の試料のスループットにより、本明細書で具体化されるＨＴＮＡＴシステムは、例えば、分割溶出構成及び／またはマルチプレックス増幅及び検出戦略が使用されるかどうかに応じて、１時間あたり７５の個々の結果、及び１時間あたり最大３００以上の個々の結果を達成することができる。
図８６Ｂを参照すると、開示された主題によるオンボードプーリングは、全血試料を処理する際のスループットを増加させることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、６つの全血試料のオンボードプーリングは、６つの２４秒ロックステップごとに５回、１つの試料を試料吸引位置６８９２から試料調製カルーセルに移送することを含むことができ、したがって１時間当たり約１２５の試料吸引がもたらされる。本明細書に具体化されるように、全血試料のハイスループット分析は、本明細書に記載される前処理プロセス、オンボードプーリングプロセス、溶解プロセス、洗浄及び溶出プロセス、ならびに増幅及び検出プロセスを含むことができる。図８６Ｂを参照すると、６つの全血試料のプールを処理する場合、スループットは約２１プール／時間であり得る。本明細書で具体化されるように、１時間あたり約２１プールのスループットにより、本明細書で具体化されるＨＴＮＡＴシステムは、例えば、分割溶出構成及び／またはマルチプレックス増幅及び検出戦略が使用されるかどうかに応じて、１時間あたり２１のプール結果、及び１時間あたり最大約８４以上のプール結果を達成することができる。本明細書に具体化されるように、各プール結果によって、２つ以上の個々の試料中に１つ以上の標的核酸が不存在であることの決定が容易になる場合がある。例えば、プール結果に、プール内に標的核酸が不存在であるという決定が含まれる場合、プール結果には、６つの個々の試料に、すなわち、６のプールサイズを使用すると、標的核酸が不存在であるという決定が含まれる可能性がある。
本明細書で具体化されるオンボードプーリングのためのシステム及び方法は、多数の利点を提供することができる。限定ではなく例の目的で、開示されたオンボードプーリング用システム及び方法によって、検査スループットを増加させ、必要な検査の数を削減することができる。例えば、個々の試料のＨＴＮＡＴと比較して、本明細書に記載のオンボードプーリングによって、１時間あたりに検査される個々の試料の数を増加させることができる。追加的または代替的に、病原体または感染因子をスクリーニングするためにオンボードプーリング及びＨＴＮＡＴを使用すると、臨床使用のためのプール試料に関連するドナー物質の出荷効率を向上させることができ、特に、試料集団内での蔓延率が低い病原体または感染因子をスクリーニングする場合に、所定の数の試料を評価するために必要な検査の総数を削減することができる。追加的または代替的に、開示されたオンボードプーリングシステム及び方法は、別個のリキッドハンドラまたはプーラーでの従来のプーリングに関連する検査室におけるボトルネックを低減することによって、検査室におけるスループットを向上させることができる。
開示されたオンボードプーリングシステム及び方法の追加の利点には、例えば、限定するものではないが、ハイスループット検査を支持するために検査室で必要とされるリキッドハンドラまたはプーラーの数を削減することが含まれる。限定ではなく例として、試料をオンボードでプールすることにより、検査室のリキッドハンドラまたはプーラーの数を削減することができ、これにより費用を削減することができ（たとえば、必要な装置の数が減る）、検査室の床スペースを別の使用のために解放することができる。
開示されたオンボードプーリングのシステム及び方法のさらなる利点には、限定するものではないが、例えば、プールサイズの柔軟性を含めることができる。例えば、従来のリキッドハンドラまたはプーラーにプールする場合、プールサイズは一般に、リキッドハンドラまたはプーラーのピペットチャネルの数に従って選択される。開示された主題の一態様によれば、プールサイズは、所望の場合、選択することができる。限定ではなく例の目的で、試料集団における病原体または感染因子の蔓延に基づいてプールサイズを選択することができる。
開示されたオンボードプーリングのシステム及び方法のさらなる利点には、限定するものではないが、例えば、検査室の床スペースの効率的な使用を含めることができる。例えば、本明細書で具体化されるように、オンボードプーリング及びＨＴＮＡＴのためのシステム及び方法では、複数のプロセスにシステムリソースを使用することができる。例えば、本明細書で具体化されるように、試料調製カルーセルは、プール、前処理、及び溶解プロセスに使用することができる。複数のプロセスにシステム構成要素を使用することにより、プロセスごとに別個のシステム及び床スペースを必要とすることがあるシステム及び方法と比較して、ハイスループット分析に必要な床スペースを削減することができる。追加的または代替的に、上述のように、プーラーなどの追加の装置を削減することができる。
開示されたオンボードのシステム及び方法のさらなる利点により、限定するものではないが、例えば、検査エラーが減少する。限定ではなく例の目的で、本明細書に記載の自動オンボード分解によって、従来の分解方法に関連する可能性のある手動ステップ及びエラーの機会を削減することができる。
６．１．４ 核酸洗浄及び溶出システム
図６５は、開示された主題による例示的な洗浄及び溶出サブシステム６５３０を示すダイアグラムである。一般に、洗浄及び溶出システムでは、試料を洗浄して微粒子から不要な物質を排除し、その後、捕捉された物質、例えば核酸を微粒子から溶出する。ある特定の実施形態では、図６５に示すように、試料搬送機６５３０は、洗浄容器６５４０を保持する位置を有する回転式カルーセル６５３１である。洗浄容器６５４０は、洗浄及び溶出プロセス中に洗浄緩衝液及び溶出緩衝液を保持する。図６５は、洗浄１（「Ｗ１」）～洗浄２４（「Ｗ２４」）として識別される２４の位置（中央カルーセルの周囲で時計回り）を含む。図６５の実施形態では、一般に１２個の放射状に配向されたスロット６５３５があり、各スロットは洗浄容器６５４０を保持するための２つの位置を有する。例えば、位置Ｗ１及びＷ１３は一般に、同じスロット６５３５上にある。図６５の実施形態では、２４個の位置のそれぞれに複数の洗浄容器６５４０が示されている。カルーセル６５３１上のすべての位置を、試料洗浄及び溶出プロセスで使用するわけではなく、一部の位置は、カルーセルへの洗浄容器の装填、洗浄緩衝液の分注、または洗浄容器の取り外しに使用する。図１７の一実施形態に示すように、洗浄容器はそれぞれ、洗浄及び溶出プロセスのために複数のウェル（Ｐ１～Ｐ４）を画定する。本開示の実施形態は、代替システム構成またはシステムの所望の能力またはスループットに応じて、２４より多いかまたは少ない位置を含むことができ、個々の位置は、図示されているように配置される必要はなく、むしろ、カルーセル、線形、または本開示のスループット要件と互換性のある本質的に他の任意の方向に配置することができる。
以下の表、すなわち表６は、洗浄及び溶出プロセス（本明細書では洗浄プロセスとも呼ばれる）に関する例示的な時間及び動作を示す。２４秒のロックステップを使用するこの例示的な実施形態に示されるように、洗浄及び溶の試料処理時間は４８０秒、すなわち８分である。溶解プロセスからの微粒子の移送を考慮しない場合（例えば、表６の位置Ｗ３）、洗浄及び溶出プロセス（本明細書では洗浄プロセスとも呼ばれる）の試料処理時間は４５６秒、すなわち７．６分である。
Figure 2024518331000044
図６５に示す例示的な実施形態では、Ｗ１は、洗浄容器を、例えば物品装填領域からカルーセルに移送する移送位置に対応する。この位置への洗浄容器の移送は、当技術分野で公知の方法、例えば、横方向シャッフル戦略及び／または「ピックアンドプレース」戦略によって達成することができる。ある特定の実施形態では、図６５において識別される複数の洗浄容器６４４０は、図１７に示されるように配置することができる。例えば、限定するものではないが、以下に説明する位置Ｐ１、Ｐ２、Ｐ３、及びＰ４は、図１７の洗浄１、洗浄２、洗浄３、及び溶出液に対応することができる。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ１に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ１に対応する手順を実行する時間は、洗浄プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
例示的な位置Ｗ２は、洗浄溶液をウェルＰ１～Ｐ３に分注するための分注位置に対応する。洗浄溶液のウェルＰ１への分注は、例えば、バルクリザーバから直接配管を介して達成することができる。ある特定の実施形態では、ウェルＰ１の洗浄溶液を、５００μｌ（＋／－５％）の体積で分注するが、本開示内では他の体積も企図する。ある特定の実施形態では、ウェルＰ１の洗浄溶液は、約２．５Ｍ～約４．７ＭのＧＩＴＣ、約２％～約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約５．５～約８．０のｐＨを含む。ある特定の実施形態において、例えば、血漿及び血清試料に関して、Ｐ１のウェルの洗浄溶液は、約３．１３ＭのＧＩＴＣ、６．７％Ｔｗｅｅｎ－２０、１００ｍＭのトリス、及び約７．８のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、Ｐ１のウェルの洗浄溶液は、約４．７ＭのＧＩＴＣ、約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約７．８のｐＨを含むある特定の実施形態では、例えば、全血試料に関して、ウェルＰ１の洗浄溶液は、約３．５ＭのＧＩＴＣ、約２．５％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約６．０のｐＨを含む。位置Ｗ２は、ウェルアレイへの残りの流体分注位置及び溶出緩衝液の分注位置にも対応する。Ｗ２では、追加の洗浄溶液をウェルＰ２に分注し、洗浄溶液をウェルＰ３に分注し、溶出緩衝液をウェルＰ４に分注する。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液は、約５ｍＭ～約１０ｍＭのリン酸塩を含み、ｐＨが約７．５～約９．０である。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ２に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ２に対応する手順を実行する時間は、洗浄プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
例示的な位置Ｗ３は、微粒子の移送位置に対応する。ある特定の実施形態では、捕捉磁石を後退させ、チップを振とうさせ微粒子をＷ３のウェルＰ１内に堆積させることによって移送を達成する。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ３に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ３に対応する手順を実行する時間は、洗浄プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
ある特定の実施形態では、例示的な位置Ｗ１、Ｗ２、及びＷ３に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ１、Ｗ２、及びＷ３に対応する手順を実行する時間は、洗浄プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
例示的な位置Ｗ４～Ｗ７は、インキュベーション及び混合位置に対応する。位置Ｗ４～Ｗ７でのインキュベーション及び混合には、抵抗ヒーターの使用、上部及び／または下部の磁石、例えば、可動永久磁石、ならびにカルーセル動作、ポップアップミキサー、及び／または電磁石による混合を組み込むことができる（磁性微粒子の固定電磁石ベースの混合の使用については、以下の実施例２で詳細に説明する）。ある特定の実施形態では、位置Ｗ４～Ｗ７は、ヒーター、例えば抵抗ヒーターを利用して、溶解試料を約３７℃に加熱する。ある特定の実施形態では、Ｗ４～Ｗ７では、洗浄１で約９６秒すなわち約１．６分間インキュベーションを利用する（それぞれ２４秒で４つのロックステップ）。ある特定の実施形態では、位置Ｗ８は、洗浄２及び混合のためのウェルＰ２での洗浄溶液への微粒子の移送を含む。ある特定の実施形態では、第１の洗浄ステップ（すなわち、洗浄１）は、インキュベーション及び混合位置（例えば、例示的な位置Ｗ４～Ｗ７）及びウェルＰ２への微粒子の移送（例えば、例示的な位置Ｗ８）を含むことができ、第１の洗浄ステップの持続時間は約１２０秒、すなわち約２分になる（各２４秒で５つのロックステップ）。ある特定の実施形態では、第１の洗浄ステップ（すなわち、洗浄１）は、ウェルＰ２への微粒子の移送（例えば、例示的な位置Ｗ８）を含まず、したがって、第１の洗浄ステップの持続時間は約９６秒、すなわち約１．６分となる（各２４秒で４つのロックステップ）。ある特定の実施形態では、移送は、ウェル上の可動磁石を使用してシールの内面を横断して微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。いくつかの実施形態では、移送は、ウェルの下の可動磁石を使用してウェルの底部の内部チャネル内の微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。ある特定の実施形態では、例えば磁性粒子の移動を達成するために隣接する磁石を選択的にスイッチオン／オフする固定電磁石を利用することができる。逆粒子処理などの微粒子を移送する他の方法も、使用することができる。
ある特定の実施形態では、位置Ｗ９は、ウェルＰ２での洗浄溶液中での約２４秒間のインキュベーション及び混合を含む（２４秒で１ロックステップ）。ある特定の実施形態では、洗浄２は水である。ある特定の実施形態では、混合を、カルーセル動作、ポップアップミキサー、及び／または電磁石を介して達成する。ある特定の実施形態では、例示的な位置Ｗ１０は、洗浄３及び混合のためのウェルＰ３での洗浄溶液への微粒子の移送を含む。ある特定の実施形態では、洗浄２におけるインキュベーション、すなわち第２の洗浄ステップは、インキュベーション及び混合位置（例えば、例示的な位置Ｗ９）、ならびに洗浄３及び混合のためのウェルＰ３での洗浄溶液への微粒子の移送（例えば、例示的な位置Ｗ１０）を含むことができ、したがって洗浄２は約４８秒間である（各２４秒で２つのロックステップ）。ある特定の実施形態では、第２の洗浄ステップは、ウェルＰ３への微粒子の移送（例えば、例示的な位置Ｗ１０）を含まず、したがって第２の洗浄ステップは約２４秒間（各２４秒で１つのロックステップ）である。ある特定の実施形態では、移送は、ウェル上の可動磁石を使用してシールの内面を横断して微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。
ある特定の実施形態では、位置Ｗ１１は、ウェルＰ３での洗浄溶液中での約２４秒間のインキュベーション及び混合を含む（２４秒で１つのロックステップ）。ある特定の実施形態では、ウェルＰ３での洗浄溶液は水である。ある特定の実施形態では、混合を、カルーセル動作、ポップアップミキサー、及び／または電磁石を介して達成する。ある特定の実施形態では、オフラインオービタルミキサーを１５００ｒｐｍで使用して、混合を達成する。
ある特定の実施形態では、位置Ｗ１２～Ｗ２０は、微粒子から標的を除去するために試料が溶出緩衝液内でインキュベートされる移送位置及びインキュベーション位置に対応する。例えば、限定するものではないが、Ｗ１２は、微粒子が例えば可動永久磁石または固定電磁石を介してウェルＰ４の溶出緩衝液に移送される移送位置である。ある特定の実施形態では、洗浄３（すなわち、第３の洗浄ステップ）の持続時間には、インキュベーション及び混合位置（例えば、例示的な位置Ｗ１１）での時間、及びウェルＰ４への微粒子の移送（例えば、例示的な位置Ｗ１２）を含めることができ、したがって洗浄３は約４８秒間である（各２４秒の２つのロックステップ）。ある特定の実施形態では、洗浄３（すなわち、第３の洗浄ステップ）の持続時間は、ウェルＰ４への微粒子の移送（例えば、例示的な位置Ｗ１２）を含まず、したがって第３の洗浄ステップは約２８秒間（各２４秒で１つのロックステップ）である。
固体支持体、例えば微粒子から核酸を溶出する戦略は、当技術分野で知られている。例えば、限定するものではないが、核酸、例えばＲＮＡ及び／またはＤＮＡは、核酸が結合している固体支持体、例えば微粒子を、同時加熱があるかまたは同時加熱がない場合で溶出緩衝液と接触させることによって溶出することができる。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液は、１～１０ｍＭ（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０ｍＭ）の濃度のリン酸塩（例えば、無機リン酸塩または有機リン酸塩）を含む。いくつかの実施形態では、リン酸塩濃度は、核酸、例えばＤＮＡまたはＲＮＡに優先的に結合及び／または溶出するように選択する。一実施形態では、位置Ｗ１２にある洗浄及び溶出液カルーセル１３１の外側部分１３７上の洗浄容器を、Ｗ１３に移送する際に、スロット１３５内の内側部分１３９へと半径方向内側に移動させる。
位置Ｗ１３～Ｗ２０のインキュベーション中の加熱は、例えば抵抗対流ヒーターを使用して達成することができる。例えば、本明細書で具体化されるように、抵抗対流ヒーターは、強制空気を使用して、１つ以上の抵抗ヒーターから溶出ウェルに熱を伝達することができる。ある特定の実施形態では、Ｐ４での溶出緩衝液中でのインキュベーション（すなわち、溶出ステップ）を、約１９２秒間、すなわちは約３．２分間継続する（例えば、それぞれ２４秒で８つのロックステップ）。インキュベーションの完了時に、微粒子を、ウェルＰ３の洗浄溶液に移送して戻し、実質的に微粒子を含まない溶出液がウェルＰ４に残る。例えば、このような移送は、例示的な位置Ｗ２１（２４秒で１つのロックステップ）で発生する場合がある。Ｗ２２では、約４２μｌ（＋／－５％）の溶出液を吸引し（例えば、溶出液を４０℃に冷却するために約１２秒遅延後）、溶出液の半分を１つ以上の増幅容器に分注する。ある特定の実施形態では、溶出ステップの持続時間には、インキュベーション位置（例えば、例示的な位置Ｗ１３～Ｗ２０）、ウェルＰ３への微粒子の移送（例えば、例示的な位置Ｗ２１）、ならびに増幅及び検出システムにおける増幅容器への溶出液の吸引及び移送（例えば、例示的な位置Ｗ２２）における時間を含めることができ、したがって、溶出ステップは約２４０秒間である（各２４秒で１０のロックステップ）。ある特定の実施形態では、溶出ステップの持続時間には、ウェルＰ３への微粒子の移送（例えば、例示的な位置Ｗ２１）を含めず、ならびに増幅及び検出システムにおける増幅容器への溶出液の吸引及び移送（例えば、例示的な位置Ｗ２２）における時間を含めず、したがって、溶出ステップは約１９２秒間である（各２４秒で８のロックステップ）。ある特定の実施形態では、溶出ステップの持続時間には、増幅及び検出システムにおける増幅容器への溶出液の吸引（例えば、例示的な位置Ｗ２２）を含めず、したがって、溶出ステップは約２１６秒間である（各２４秒で９のロックステップ）。
例示的な位置Ｗ２３は、洗浄内容物を吸引して廃棄することに対応する。例示的な位置Ｗ２４は、洗浄容器を移送して廃棄することに対応する。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ２３及びＷ２４に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。ある特定の態様では、例示的な位置Ｗ２３及びＷ２４に対応する手順を実行する時間は、ＴＴＲの計算において考慮されない。例えば、限定するものではないが、例示的な位置Ｗ２３及びＷ２４に対応する手順を実行する時間は、洗浄プロセスの持続時間の計算において考慮されない。
２４秒のロックステップを使用する上記の例示的なシステムでは、試料は２０ロックステップ（例えば、例示的な位置Ｗ３～Ｗ２２）の洗浄プロセスにあり、したがって、洗浄プロセスの合計処理は約４８０秒、すなわち約８分となる。溶解プロセスからの微粒子の移送を考慮しない場合、試料は１９ロックステップ（例えば、例示的な位置Ｗ４～Ｗ２２）の洗浄プロセスにあり、これにより、洗浄及び溶出プロセスの合計処理時間は約４５６秒、すなわち約７．６分になる。
ある特定の実施形態では、洗浄プロセスのための試料の処理時間は、第１の洗浄ウェル（例えば、例示的な位置Ｗ４）でのインキュベーションから開始し、増幅及び検出システム内の容器（例えば、例示的な位置Ｗ２２）に溶出液を分注することで終了する。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスにおける試料の総処理時間は、約５分～約９分、約５分～約８分、または約７分～８分であり得る。ある特定の実施形態では、洗浄プロセスにおける試料の総処理時間は、約５分、約６分、約７分、約８分、または約９分であり得る。特定の実施形態では、洗浄プロセスにおける総試料処理時間は、約４５６秒、すなわち約７．６分、または約３３６秒、すなわち５．６分であり得る。
洗浄プロセスは、第１の洗浄ステップ（例えば、洗浄１）、第２の洗浄ステップ（例えば、洗浄２）、第３の洗浄ステップ（例えば、洗浄３）、及び溶出ステップを含むことができる。ある特定の態様では、第１の洗浄ステップは、第１の洗浄ウェル（例えば、例示的な位置Ｗ４～Ｗ７）でのインキュベーションの開始時に始まり、第２の洗浄ウェル（例えば、例示的な位置Ｗ８）への微粒子の移送で終了する。ある特定の実施形態では、第１の洗浄ステップは、第１の洗浄ウェルでのインキュベーションの開始で始まり、第１の洗浄ウェルでのインキュベーションの終了で終了する（例えば、例示的な位置Ｗ４～Ｗ７）。ある特定の実施形態では、第１の洗浄ステップは、約０．５分～約３分、約１分～約３分、または約１．５分～約３分で完了することができる。ある特定の実施形態では、第１の洗浄ステップは、約０．５分、約１分、約２分、または約３分である。ある特定の実施形態では、第１の洗浄ステップは、約９６秒、すなわちは約１．６分、または約１２０秒、すなわち約２分である。ある特定の態様では、第２の洗浄ステップは、第２の洗浄ウェル（例えば、例示的な位置Ｗ９）でのインキュベーションの開始時に始まり、第３の洗浄ウェル（例えば、例示的な位置Ｗ１０）への微粒子の移送で終了する。ある特定の実施形態では、第２の洗浄ステップは、第２の洗浄ウェルでのインキュベーションの開始で始まり、第２の洗浄ウェルでのインキュベーションの終了で終了する（例えば、例示的な位置Ｗ９）。ある特定の実施形態では、第２の洗浄ステップは、約０．１分～約２分、約０．４分～約１分、または約０．４分～約０．８分で完了することができる。ある特定の実施形態では、第２の洗浄ステップは、約０．１分、約０．４分、約０．８分、約１分、約１．５分、または約２分である。特定の実施形態では、第２の洗浄ステップは、約４８秒、すなわち約０．８分、または約２４秒、すなわち約０．４分である。ある特定の態様では、第３の洗浄ステップは、第３の洗浄ウェル（例えば、例示的な位置Ｗ１１）でのインキュベーションの開始時に始まり、溶出ウェル（例えば、例示的な位置Ｗ１２）への微粒子の移送で終了する。ある特定の実施形態では、第３の洗浄ステップは、第３の洗浄ウェルでのインキュベーションの開始で始まり、第１の洗浄ウェルでのインキュベーションの終了で終了する（例えば、例示的な位置Ｗ１１）。ある特定の実施形態では、第３の洗浄ステップは、約０．１分～約２分、約０．４分～約１分、または約０．４分～約０．８分で完了することができる。ある特定の実施形態では、第２の洗浄ステップは、約０．１分、約０．４分、約０．８分、約１分、約１．２分、または約２分である。特定の実施形態では、第２の洗浄ステップは、約４８秒、すなわち約０．８分、または約２４秒、すなわち約０．４分である。ある特定の態様では、溶出ステップは、インキュベーションの開始及び溶出物の混合（例えば、例示的な位置Ｗ１３～Ｗ２０）で始まり、溶出液を吸引し、溶出液を増幅及び検出システム内の容器（例えば、例示的な位置Ｗ２２）に移送することで終了する。ある特定の実施形態では、溶出ステップは、インキュベーション及び溶出物の混合の開始で始まり、インキュベーション及び溶出物の混合の終了で終了する（例えば、例示的な位置Ｗ１３～Ｗ２０）。ある特定の実施形態では、溶出ステップは、約２分～約６分、約３分～約５分、または約３分～約４分で完了することができる。ある特定の実施形態では、溶出ステップは、約２分、約２．４分、約３分、または約４分である。特定の実施形態では、溶出ステップは、約１９２秒、すなわち約３．２分、または約２４０秒、すなわち約４分である。
ＴＴＲの計算には、洗浄プロセスにおける試料の処理時間は、洗浄容器をカルーセル（例えば、例示的な位置Ｗ１）に移送にいそうすること、洗浄溶液をウェルＰ１～Ｐ３（例えば、例示的な位置Ｗ２）に分注すること、微粒子をウェルＰ１（例えば、例示的な位置Ｗ３）に移送すること、洗浄内容物を吸引して廃棄すること（例えば、例示的な位置Ｗ２３）、及び／または洗浄容器を移送して廃棄するステップ（例えば、例示的な位置Ｗ２４）を含まない。
ある特定の実施形態では、本開示の文脈において３回を超える洗浄を利用することができる。さらに、本開示のシステムは、上述のステップまたは以下に説明する任意のステップに関して、異なる試料、例えば、血清／血漿試料及び全血試料を処理することができ、したがって、個々の試料を単一のバッチで異なる様式により処理することができる。例えば、限定するものではないが、バッチ内の個々の試料は、より長い期間またはより短い期間インキュベートすることができ、及び／または異なる温度で加熱または冷却することができる。
図７０は、図６８Ａ～６８Ｄに示される例示的なシステムに従って開示される発明を実施するための例示的な洗浄トラック６８０１を示す。本明細書で具体化されるように、洗浄トラック６８０１は、反時計回り方向に回転するレーストラック形状とすることであり得る。限定ではなく例示の目的で、洗浄トラック６８０１のレーストラック形状は、システム全体の設置面積を節約することができる。限定ではなく例示の目的で、洗浄トラック６８０１は２４個のトラック位置を含む。トラック位置ごとに、洗浄容器で最大3回まで洗浄を実行することができる。洗浄容器は、図１７Ａ～１７Ｂに開示された主題による例示的な実施形態であり得る。代替的に、または追加的に、洗浄容器は、図４２Ａ～４２Ｄに示されるような例示的な実施形態であり得る。ある特定の実施形態では、洗浄容器は、図７１に示すような例示的な実施形態であり得、洗浄容器は、容器の水平方向に沿って湾曲した設計を有することができ、洗浄トラック６８０１の曲率と同様の曲率を有することができる。
固定電磁石ベースの磁性粒子の捕捉を伴う動作ステップには、限定するものではないが、混合すること；洗浄すること;及び磁性粒子を移送することが含まれる。磁性粒子を混合及び洗浄する既存の方法は、一般に、機械的撹拌及び可動永久磁石を使用する磁気混合に依存している。しかし、ある特定の実施形態では、例えば図４２Ａ～４２Ｄに例示されるように、そのような混合、洗浄、及び／または移送は、少なくとも１つの固定電磁石ベースの磁性粒子の捕捉を組み込んだシステムを用いて実行することができる。例えば、限定するものではないが、図４２Ａに具体化されるように、磁性微粒子４２０２は、複数の容器４２０６のうちの第１の容器内に存在することができる。代替的に、または追加的に、図４２Ｂに示すように、電磁石４２０４を使用して磁性微粒子を容器４２０６の壁に捕捉することができる。代替的に、または追加的に、図４２Ｃに示すように、電磁石４２０４の第２の容器への移動は、第１の容器から第２の容器への磁性微粒子４２０２の移送を誘導する。代替的に、または追加的に、磁性微粒子４２０２が第２の容器に移送された後に電磁石４２０４への電流を除去すると、図４２Ｄに示すように磁性微粒子４２０２の放出が可能になる。代替的に、または追加的に、本明細書で識別される１つ以上の別個の混合または洗浄位置は、磁性粒子の固定電磁石ベースの捕捉を使用して達成することができる。加えて、本明細書に記載されるある特定の実施形態は、本明細書に記載されるシステム内の１つ以上の移送位置における１つ以上の移送動作に関連して、磁性粒子の少なくとも１つの固定電磁石ベースの捕捉を組み込んだシステムを用いて実行することができる。当業者には理解されるように、個々の位置の具体的な数、配向、及び動作上の割り当て（例えば、混合、洗浄、移送、または溶出）は、所望の場合、変更することができ、それでも本開示の範囲内にとどまる。
本開示は、ある特定の実施形態では、適切な混合、洗浄、及び移送動作を達成するために、様々な位置で固定電磁石を使用することを企図する。例えば、限定するものではないが、電磁石をウェルの右側、左側、及び／または底部に位置決めすることができる。加えて、電磁石は、一方の側が他方の側よりも高い位置に位置決めすることができる。本開示の固定電磁石は、当技術分野で公知のさまざまなウェル形式と組み合わせて使用することもできる。
ある特定の実施形態では、磁性粒子を、洗浄ウェルの反対側に交互に引き付けるように、対向する電磁石を配置することができる。しかし、電磁石の位置、タイミング、電力、及びシーケンスは完全に柔軟性がある。例えば、限定するものではないが、固定電磁石を使用して磁性粒子を部分的に収集し、この磁性粒子をウェルの底部に落下させることができる。代替的に、または追加的に、混合、洗浄、及び／または移送を容易にするために、代替的に磁性粒子をウェルの側面に、完全に収集することができる。さらに、より低い電力で磁性粒子をゆっくりと収集することができ、またはより高い電力でより迅速に磁性粒子を収集することができる。
本明細書に開示される実施形態に関連して使用するために、異なるタイプの電磁石も企図される。例えば、ＤＣ電磁石を使用することもできるが、ＤＣ電磁石は磁性粒子を磁化する場合があるため、スイッチング周波数を変えることによって磁性粒子の残留磁気の生成を避けるために、ＤＣ電磁石と組み合わせて、またはＤＣ電磁石の代わりにＡＣ電磁石を使用することもできる。
永久磁石に加えて、またはその代わりに（または他の混合、洗浄、または移送の戦略で）電磁石を使用すると、いくつかの利点が提供される。試料調製中の混合または移送動作では、典型的には、永久磁石を磁性粒子の範囲内または範囲外に移動させる必要がある。電磁石を使用すると、電磁石をスイッチオン／オフするだけで動作機構を排除することができる。さらに、アレイ内の隣接する磁石を連続的にスイッチオン及びオフにすることによって、磁性粒子をあるウェルから別のウェルに移動させることができる。固定電磁石ベースの粒子捕捉アプローチを組み込むと、検査ごとに１つ以上の使い捨て製品を排除することができるため、発生する固形廃棄物の量を削減することができる。固定電磁石を使用すると、特定の容積要件、及び磁性粒子をあるウェルから別のウェルに移送する際のウェルの使い捨てカバーまたは可動永久磁石も不要になる。本戦略はまた、洗浄容器の側面に隣接する可動電磁石を使用してウェル間で磁性粒子を移送することもできるが、ウェル内の磁性粒子または液体には接触せず、磁性粒子の損失及びソースウェルから行先のウェルへの液体キャリーオーバーを最小限に抑え、したがってアッセイ性能を最大化することができる。
いくつかの実施形態では、移送は、ウェルの下の可動永久磁石を使用してウェルの底部の内部チャネル内の微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。ある特定の実施形態では、例えば磁性粒子の移動を達成するために隣接する磁石を選択的にスイッチオン／オフする固定電磁石を利用することができる。逆粒子処理などの微粒子を移送する他の方法も、使用することができる。
代替の洗浄及び溶出システムを図７に例示する。例えば、限定するものではないが、図７は、洗浄１（「Ｗ１」）～洗浄２１（「Ｗ２１」）として識別される２１個の位置（中央カルーセルの周囲で時計回り）を含むシステムを示す。図７の例示的な実施形態では、２１個の位置のそれぞれに複数のウェルプレート（１０）が示されている。ウェルプレートはそれぞれ、洗浄及び溶出プロセスのための複数のウェル（＃Ｐ１～Ｐ４）を画定する。本開示の実施形態は、代替システム構成またはシステムの所望の能力またはスループットに応じて、２１より多いかまたは少ない位置を含むことができ、個々の位置は、図示されているように配置される必要はなく、むしろ、カルーセル、線形、または本開示のスループット要件と互換性のある本質的に他の任意の方向に配置することができる。
図７に示す例示的な実施形態では、Ｗ１は、洗浄容器を、例えば物品装填領域からカルーセルに移送する移送位置に対応する。この位置への洗浄容器の移送は、当技術分野で公知の方法、例えば、横方向シャッフル戦略及び／または「ピックアンドプレース」戦略によって達成することができる。
例示的な位置Ｗ２は、洗浄溶液をウェルＰ１に分注するための部分分注位置に対応する。洗浄溶液のウェルＰ１への分注は、例えば、バルクリザーバから直接配管を介して達成することができる。ある特定の実施形態では、ウェルＰ１の洗浄溶液を、２５０μｌ（＋／－５％）の体積で分注するが、本開示内では他の体積、例えば５００μｌ（＋／－５％）も企図する。ある特定の実施形態では、ウェルＰ１の洗浄溶液は、約２．５Ｍ～約４．７ＭのＧＩＴＣ、約２％～約１０％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約５．５～約８．０のｐＨを含む。ある特定の実施形態において、例えば、血漿及び血清試料に関して、ウェルＰ１の洗浄溶液は、約４．７ＭのＧＩＴＣ、約１０％Ｔｗｅｅｎ－２０、及び約７．８のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、例えば、全血試料に関して、ウェルＰ１の洗浄溶液は、約３．５ＭのＧＩＴＣ、約２．５％のＴｗｅｅｎ－２０、及び約６．０のｐＨを含む。ある特定の実施形態では、例えば、溶解チューブにまだ穴を開けていない場合、システムはまた、以下：移送チップの取り上げ（例えば、装填可能なラックからの「ピック＆プレース」による）；例えば、移送チップを溶解チューブシールに押し込む（及び所望する場合、穴のクリアランスを増大させるためにひねる）ことによる、溶解チューブの穴開け；例えば、移送チップの構造要素に対する磁気捕捉を介した微粒子の捕捉、を実行することができる。ある特定の実施形態では、そのような構造要素は、限定するものではないが、フィン間の微粒子の磁気捕捉のためのフィンを含むことができる。
例示的な位置Ｗ３は、微粒子の移送位置に対応する。ある特定の実施形態では、捕捉磁石を後退させ、チップを振とうさせ微粒子をＷ３のウェルＰ１内に堆積させることによって移送を達成する。
例示的な位置Ｗ４は、ウェルアレイへの残りの流体分注位置及び溶出緩衝液の分注位置に対応する。Ｗ４では、追加の洗浄溶液をウェルＰ１に分注し、洗浄溶液をウェルＰ２に分注し、洗浄溶液をウェルＰ３に分注し、溶出緩衝液をウェルＰ４に分注する。洗浄溶液の分注は、例えば、バルクリザーバから直接配管を介して、または試薬コンテナから「シップアンドスピット」戦略によって、達成することができる。ある特定の実施形態では、ウェルＰ１の洗浄溶液の残りを、２５０μｌ（＋／－５％）、１００～５００μｌ（＋／－５％）、及び／又は６０μｌ（＋／－５％）の体積で分注するが、本開示内では他の体積も企図する。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液は、約５ｍＭ～約１０ｍＭのリン酸塩を含み、ｐＨが約７．５～約９．０である。
例示的な位置Ｗ５は、洗浄容器の封止位置に対応する。この位置での洗浄容器の封止は、当技術分野で公知の方法、例えば熱かしめテープ、プレスオンキャップ、及びＰＳＡテープによって達成することができる。
例示的な位置Ｗ６～Ｗ８は、インキュベーション及び混合位置に対応する。位置Ｗ６～Ｗ８でのインキュベーション及び混合には、抵抗ヒーターの使用、上部及び／または下部の磁石、例えば、永久磁石、ならびにカルーセル動作、ポップアップミキサー、及び／または電磁石による混合を組み込むことができる（磁性微粒子の固定電磁石ベースの混合の使用については、以下の実施例２で詳細に説明する）。ある特定の実施形態では、位置Ｗ６～Ｗ８は、ヒーター、例えば抵抗ヒーターを利用して、溶解試料を約４０℃に加熱する。ある特定の実施形態では、Ｗ６～Ｗ７は、洗浄１での約７２秒間のインキュベーションを利用する。ある特定の実施形態では、位置Ｗ８は、ウェルＰ２への微粒子の移送及び混合を含む。ある特定の実施形態では、洗浄２は水である。ある特定の実施形態では、移送は、ウェル上の可動磁石を使用してシールの内面を横断して微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。いくつかの実施形態では、移送は、ウェルの下の可動永久磁石を使用してウェルの底部の内部チャネル内の微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。ある特定の実施形態では、例えば磁性粒子の移動を達成するために隣接する磁石を選択的にスイッチオン／オフする固定電磁石を利用することができる。逆粒子処理などの微粒子を移送する他の方法も、使用することができる。ある特定の実施形態では、位置Ｗ８は、ウェルＰ２での洗浄溶液中での約２４秒間の混合を含む。ある特定の実施形態では、混合を、カルーセル動作、ポップアップミキサー、及び／または電磁石を介して達成する。
ある特定の実施形態では、例示的な位置Ｗ９は、ウェルＰ３での洗浄溶液への微粒子の移送及び混合を含む。ある特定の実施形態では、ウェルＰ３での洗浄溶液は水である。ある特定の実施形態では、移送は、ウェル上の可動磁石を使用してシールの内面を横断して微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。ある特定の実施形態では、位置Ｗ９は、ウェルＰ３での洗浄溶液中での約２４秒間の混合を含む。ある特定の実施形態では、混合を、カルーセル動作、ポップアップミキサー、及び／または電磁石を介して達成する。ある特定の実施形態では、オフラインオービタルミキサーを１５００ｒｐｍで使用して、混合を達成する。ある特定の実施形態では、例えば磁性粒子の混合を達成するために隣接する磁石を選択的にスイッチオン／オフする固定電磁石を利用することができる。
ある特定の実施形態では、位置Ｗ１０～Ｗ１７は、微粒子から標的を除去するために試料が溶出緩衝液内でインキュベートされるインキュベーション位置に対応する。固体支持体、例えば微粒子から核酸を溶出する戦略は、当技術分野で知られている。例えば、限定するものではないが、核酸、例えばＲＮＡ及び／またはＤＮＡは、核酸が結合している固体支持体、例えば微粒子を、同時加熱があるかまたは同時加熱がない場合で溶出緩衝液と接触させることによって溶出することができる。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液は、１～１０ｍＭ（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０ｍＭ）の濃度のリン酸塩（例えば、無機リン酸塩または有機リン酸塩）を含む。いくつかの実施形態では、リン酸塩濃度は、核酸、例えばＤＮＡまたはＲＮＡに優先的に結合及び／または溶出するように選択する。ある特定の実施形態では、溶出緩衝液は、５ｍＭのＰＯ４を含む。
位置Ｗ１０～Ｗ１７のインキュベーション中の加熱は、例えば、抵抗対流ヒーターを使用して達成することができる。例えば、限定するものではないが、抵抗対流ヒーターは、これらの位置で試料を約８０℃まで加熱することができる。ある特定の実施形態では、インキュベーションを、約１９２秒間継続する。インキュベーションの完了時に、位置Ｗ１８で微粒子を、例えば可動永久磁石または電磁石の使用を介して、ウェルＰ３の洗浄溶液に移送して戻し、実質的に微粒子非含有溶出液がウェルＰ４に残る。例えば、そのような移送は例示的な位置Ｗ１８で行われ、およそ４０μｌ（＋／－５％）の溶出液を吸引し（例えば、溶出液を４０℃～６０℃に冷却するために約１２秒遅延後）、溶出液の半分を１つ以上の増幅容器に分注する。
以下の表、すなわち表７は、洗浄及び溶出プロセスに関する例示的な時間及び動作を示す。２４秒のロックステップを使用するこの例示的な実施形態に示されるように、洗浄及び溶の試料処理時間は３２４秒、すなわち５．４分である。
Figure 2024518331000045
Figure 2024518331000046
限定ではなく例の目的で、洗浄及び溶出プロセスに関する例示的な時間及び動作を含む、追加の例示的な洗浄及び溶出プロセスを、以下の表７．１に示す。
Figure 2024518331000047
例えば、本明細書で具体化されるように、洗浄及び溶出プロセスは、図８０に示すような洗浄容器内で実行することができ、この洗浄容器は、図７０に示すように洗浄トラックの周りを移動することができる。追加的または代替的に、本明細書でさらに説明するように、例えば永久磁石を使用してu粒子を洗浄容器のウェル間で移送することができる。
限定ではなく例の目的で、洗浄容器の温度を制御することができる。追加的または代替的に、容器の異なる領域を異なる温度で制御することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、洗浄１及び洗浄２は、およそ摂氏４０度の温度を有することができる。追加的または代替的に、本明細書でさらに具体化されるように、溶出ウェルを所望の温度まで徐々に加熱することができる。例えば、洗浄トラック位置Ｗ９では、溶出ウェルの内容物をおよそ４０℃～およそ７０℃の間の温度に予熱することができ、洗浄トラック位置Ｗ１０では、溶出ウェルの内容物をおよそ６０℃～およそ７０℃の間の温度に予熱することができ、洗浄トラック位置Ｗ１１では、溶出ウェルの内容物をおよそ７０℃の温度に予熱することができ、位置Ｗ１２～Ｗ２０では、溶出ウェルの内容物を約８０℃の温度でインキュベートすることができる。本明細書でさらに具体化されるように、溶出ウェルの内容物を位置Ｗ２１で冷却することができる。
ある特定の実施形態では、本開示の文脈において３回を超える洗浄を利用することができる。さらに、本開示のシステムは、上述のステップまたは以下に説明する任意のステップに関して、異なる試料、例えば、血清／血漿試料及び全血試料を処理することができ、したがって、個々の試料を単一のバッチで異なる様式により処理することができる。例えば、限定するものではないが、バッチ内の個々の試料は、より長い期間またはより短い期間インキュベートすることができ、及び／または異なる温度で加熱または冷却することができる。
ある特定の実施形態では、図７において識別される複数のウェルプレート１０は、図１７に示されるように配置することができる。例えば、限定するものではないが、図７の位置Ｐ１、Ｐ２、Ｐ３、及びＰ４は、図１７の洗浄１、洗浄２、洗浄３、及び溶出液に対応することができる。複数のウェルプレートが図１７に示されるように配置されるある特定の実施形態では、試料調製プロセスの１つ以上のステップは、磁性粒子の固定電磁石ベースの捕捉及び移動によって実行することができる。
図１７は、本開示の一実施形態による洗浄容器の概略図を示す。側面図及び上面図を示す。洗浄容器１７００は、洗浄１～３及び溶出液とラベル付けされた４つのウェルを含むことができ、第１のウェルは第２のウェルに隣接し、第３のウェルは第２のウェルに隣接し、第４のウェルは第３のウェルに隣接する。第１の側壁１７０１は、第１、第２、第３、及び第４のウェルの第１の側面を画定する。第１の側壁の反対側の第２の側壁１７０２は、第１、第２、第３、及び第４のウェルの第２の側面を画定する。第１及び第２の側壁は、第１、第２、第３、及び第４のウェルに面する内面と、内面の反対側の外面とを含む。第１の仕切り１７０３は、第１のウェルと第２のウェルとを分離し、第２の仕切り１７０４は第２のウェルと第３のウェルとを分離する。第１の側壁１７０１は第１の仕切り１７０３より高く、第１の側壁の内面は、第１のウェルに捕捉された磁性微粒子を、第１の仕切りを越えて第２のウェルに平行移動させるため、少なくとも第１のウェルと第２のウェルとの間に延びる領域において少なくとも実質的に平面である。第１の側壁１７０１の内面は、第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、そうして、その非平面の内面が、第２のウェルの内面の領域で捕捉された磁性粒子が第３のウェルの内面の領域へ平行移動するのを防止する。第２の側壁１７０２は第２の仕切り１７０４よりも高い。第２の側壁の内面１７０２は、少なくとも第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第２のウェル内で磁性微粒子を捕捉し、捕捉された磁性粒子を第２の仕切り１７０４を越えて第３のウェルに平行移動させるための実質的に平坦な表面を提供する。第１及び第２のウェルは洗浄溶液を含むことができ、第３のウェルは洗浄溶液または溶出溶液を含むことができる。第３の仕切り１７０５は、第３のウェルを第４のウェルから分離する。第１の側壁は第３の仕切り１７０５よりも高く、第１の側壁の内面は、第３のウェルに捕捉された磁性微粒子を、第３の仕切り１７０５を越えて第４のウェルに平行移動させるため、少なくとも第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第２の側壁１７０２の内面は、第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、そうして、その非平面の内面が、第３のウェル内の第２の側壁の内面の領域で捕捉された磁性粒子が、第４のウェルの第２の側壁の内面の領域へ平行移動するのを防止する。第１、第２、及び第３のウェルは洗浄溶液を含むことができ、第４のウェルは溶出溶液を含むことができる。非平面内面は、内面にノッチ１７０６、１７０７が存在することによって非平面にすることができ、ノッチは内面から外に延びているか、または内面内で延びている。
固定電磁石ベースの磁性粒子の捕捉を伴う動作ステップには、限定するものではないが、混合すること；洗浄すること；及び磁性粒子を移送することが含まれる。磁性粒子を混合及び洗浄する既存の方法は、一般に、機械的撹拌及び可動永久磁石を使用する磁気混合に依存している。しかし、ある特定の実施形態では、例えば図４２Ａ～４２Ｄに例示されるように、そのような混合、洗浄、及び／または移送は、少なくとも１つの固定電磁石ベースの磁性粒子の捕捉を組み込んだシステムを用いて実行することができる。例えば、限定するものではないが、図４２Ａに具体化されるように、磁性微粒子４２０２は、複数の容器４２０６のうちの第１の容器内に存在することができる。代替的に、または追加的に、図４２Ｂに示すように、電磁石４２０４を使用して磁性微粒子を容器４２０６の壁に捕捉することができる。代替的に、または追加的に、図４２Ｃに示すように、電磁石４２０４の第２の容器への移動は、第１の容器から第２の容器への磁性微粒子４２０２の移送を誘導する。代替的に、または追加的に、磁性微粒子４２０２が第２の容器に移送された後に電磁石４２０４への電流を除去すると、図４２Ｄに示すように磁性微粒子４２０２の放出が可能になる。代替的に、または追加的に、本明細書で識別される１つ以上の別個の混合または洗浄位置は、磁性粒子の固定電磁石ベースの捕捉を使用して達成することができる。加えて、本明細書に記載されるある特定の実施形態は、本明細書に記載されるシステム内の１つ以上の移送位置における１つ以上の移送動作に関連して、磁性粒子の少なくとも１つの固定電磁石ベースの捕捉を組み込んだシステムを用いて実行することができる。当業者には理解されるように、個々の位置の具体的な数、配向、及び動作上の割り当て（例えば、混合、洗浄、移送、または溶出）は、所望の場合、変更することができ、それでも本開示の範囲内にとどまる。
ある特定の実施形態では、核酸分析用の微粒子を洗浄する方法は、図４２Ａ～４２Ｄに示すように、第１のウェル、第１のウェルに隣接する第２のウェル、第２のウェルに隣接する第３のウェル、及び第３のウェルに隣接する第４のウェルを含む洗浄容器を提供することを含み得る。第１の側壁４２０１は、第１、第２、第３のウェル、及び第４のウェルの第１の側面を画定する。第１の側壁４２０１の反対側の第２の側壁４２０３は、第１、第２、第３、及び第４のウェルの第２の側面を画定する。第１及び第２の側壁は、第１、第２、第３、及び第４のウェルに面する内面と、内面の反対側の外面とを含む。第１の仕切り４２０６は、第１のウェルと第２のウェルを分離し、第１の側壁は第１の仕切りよりも高く、第１の側壁の内面は、少なくとも第１のウェルと第２のウェルとの間に延びる領域において少なくとも実質的に平面である。第２の仕切り４２０７は、第２のウェルと第３のウェルを分離し、第２の側壁の内面は、少なくとも第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面である。この方法は、磁性微粒子を、第１のウェルに導入することであって、ここで、第１のウェルは洗浄溶液を含む、導入することと、磁力を加えて第１のウェル中の第１の側壁の内面上に磁性微粒子４２０２を捕捉することと；捕捉された磁性微粒子を、第１のウェルから第１の仕切りを越えて第１の側壁の内側平面に沿って第２のウェルまで平行移動させることであって、ここで、第２のウェルは洗浄溶液を含有する、平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を内面から第２のウェル内に放出させることと；磁力を加えて、第１の側壁の反対側の第２の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することとであって、ここで、第２の側壁は第２の仕切りよりも高い、捕捉することと、捕捉された磁性微粒子を、第２のウェルから第２の仕切りを越えて第２の側壁の内側平面に沿って第３のウェルまで平行移動させることであって、ここで、第３のウェルは洗浄溶液または溶出溶液を含有する、平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を第２の側壁の内面から第３のウェル内に放出させることと、を含んでもよい。ある特定の実施形態では、第３のウェルは洗浄溶液を含有し、方法は、第３のウェル内の磁性微粒子に磁力を加えて第１の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することと、溶出溶液を除去することとをさらに含んでもよい。別の実施形態では、第３のウェルは洗浄溶液を含有し、第４のウェルは溶出溶液を含有する。第１の側壁の内面は、第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、第３のウェルと第４ウェルとの間に延びる領域では平面であってもよい。第２の側壁の内面は、第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域では非平面であってもよい。平面領域は、捕捉された磁性微粒子が内面を横断して平行移動するのに役立ち、非平面領域では、捕捉された磁性微粒子が内面を横断して平行移動することはできない。この方法は、磁力を加えて、第１の側壁の内面上に第３のウェル内の磁性粒子を捕捉することであって、ここで、第１の側壁は、第３のウェルを第４のウェルから分離する第３の仕切り４２０８よりも高い、捕捉することと；捕捉された磁性微粒子を、第３のウェルから第３の仕切りを越えて第１の側壁の内側平面に沿って第４のウェルまで平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を第１の側壁の内面から第４のウェル内に放出させることと、をさらに含む。方法は、第４のウェル内の磁性微粒子に磁力を加えて第２の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することと、溶出溶液を除去することとをさらに含んでもよい。非平面の内面は、内面にノッチ４２０９、４２１０を含むことができる。ノッチは内面から外に延びていてもよく、または内面に延びている。
本開示は、ある特定の実施形態では、適切な混合、洗浄、及び移送動作を達成するために、様々な位置で固定電磁石を使用することを企図する。例えば、限定するものではないが、電磁石をウェルの右側、左側、及び／または底部に位置決めすることができる。加えて、電磁石は、一方の側が他方の側よりも高い位置に位置決めすることができる。本開示の固定電磁石は、当技術分野で公知のさまざまなウェル形式と組み合わせて使用することもできる。
ある特定の実施形態では、磁性粒子を、洗浄ウェルの反対側に交互に引き付けるように、対向する電磁石を配置することができる。しかし、電磁石の位置、タイミング、電力、及びシーケンスは完全に柔軟性がある。例えば、限定するものではないが、固定電磁石を使用して磁性粒子を部分的に収集し、この磁性粒子をウェルの底部に落下させることができる。代替的に、または追加的に、混合、洗浄、及び／または移送を容易にするために、代替的に磁性粒子をウェルの側面に、完全に収集することができる。さらに、より低い電力で磁性粒子をゆっくりと収集することができ、またはより高い電力でより迅速に磁性粒子を収集することができる。
本明細書に開示される実施形態に関連して使用するために、異なるタイプの電磁石も企図される。例えば、ＤＣ電磁石を使用することもできるが、ＤＣ電磁石は磁性粒子を磁化する場合があるため、スイッチング周波数を変えることによって磁性粒子の残留磁気の生成を避けるために、ＤＣ電磁石と組み合わせて、またはＤＣ電磁石の代わりにＡＣ電磁石を使用することもできる。
永久磁石に加えて、またはその代わりに（または他の混合、洗浄、または移送の戦略で）電磁石を使用すると、いくつかの利点が提供される。試料調製中の混合または移送動作では、典型的には、永久磁石を磁性粒子の範囲内または範囲外に移動させる必要がある。電磁石を使用すると、電磁石をスイッチオン／オフするだけで動作機構を排除することができる。さらに、アレイ内の隣接する磁石を連続的にスイッチオン及びオフにすることによって、磁性粒子をあるウェルから別のウェルに移動させることができる。固定電磁石ベースの粒子捕捉アプローチを組み込むと、検査ごとに１つ以上の使い捨て製品を排除することができるため、発生する固形廃棄物の量を削減することができる。固定電磁石を使用すると、特定の容積要件、及び磁性粒子をあるウェルから別のウェルに移送する際のウェルの使い捨てカバーまたは可動永久磁石も不要になる。本戦略はまた、洗浄容器の側面に隣接する可動電磁石を使用してウェル間で磁性粒子を移送することもできるが、ウェル内の磁性粒子または液体には接触せず、磁性粒子の損失及びソースウェルから行先のウェルへの液体キャリーオーバーを最小限に抑え、したがってアッセイ性能を最大化することができる。
ある特定の実施形態では、移送は、ウェルの下の可動永久磁石を使用してウェルの底部の内部チャネル内の微粒子をスライドさせて、微粒子を収集、移送、及び放出して達成することができる。ある特定の実施形態では、例えば磁性粒子の移動を達成するために隣接する磁石を選択的にスイッチオン／オフする固定電磁石を利用することができる。逆粒子処理などの微粒子を移送する他の方法も、使用することができる。
６．１．３溶出液移送システム
標的核酸が微粒子から溶出した後、得られた溶出液は、例えば、溶出ウェルから溶出液をピペッティングし、それを増幅のために別の容器に吸引するか、または溶出ウェルから微粒子を除去することによって、微粒子から分離することができる。ある特定の実施形態では、溶出液の一部または全部を単一の反応容器に移送し、その後、増幅プロセスが行われる。
ある特定の実施形態では、溶出液を、複数の増幅容器に分割する。ある特定の実施形態では、溶出液の第１の部分を第１の増幅容器に移送し、溶出液の第２の部分を第２の増幅容器に分注することができる。例示的な実施形態による増幅プロセスへの溶出液の移送及び分割の例示的な実施形態は、図６４及び図６５に示されており、図６７Ａ及び図６７Ｂに関して以下で説明する。
特定の実施形態では、「溶出液の分割」アプローチは、本明細書に記載の任意の溶出戦略に適用可能である。例えば、図６７Ａ及び図６７Ｂに示すように、実行される試料調製の数（及び関連する消耗品）を削減することに加えて、溶出液の分割を使用して、例えば、単一の試料吸引からマルチプレックス化増幅反応のための追加の機会を作出することによって、実行される核酸分析の数を増加させることができる。
例えば、特定の実施形態では、本明細書に記載のシステムは、試料調製のために２４秒ごとに単一の試料を吸引することができ、その結果、１時間当たり１５０の試料吸引が行われることになる。ある特定の実施形態では、図６７Ａの上部のプロセスに示すように、吸引された各試料を調製し、単一の標的核酸を増幅及び検出し、１５０の結果がもたらされる。ある特定の実施形態では、例えば図６７Ａの下部のプロセスで具体化されるように、吸引された各試料を調製し、増幅用の核酸を含有する溶出液を２つの増幅容器に分割し、各増幅反応によって検出用の単一の標的核酸を増幅し、３００の結果がもたらされる。ある特定の実施形態、例えば、図６７Ｂのシナリオ２及び４では、吸引された各試料を調製し、溶出液を２つの増幅に分割し、各増幅反応によって検出用の２つの標的核酸を増幅し、６００の結果がもたらされる。ある特定の実施形態、吸引された各試料を調製し、溶出液を２つの増幅に分割し、各増幅反応によって検出用の４つ以上の標的核酸を増幅し、１，２００以上の結果がもたらされる。
図７２は、本明細書に記載の開示された主題で使用するための例示的な増幅及び検出システム６８０７を示す。本明細書で具体化されるように、増幅及び検出システム６８０７は、反時計回りまたは時計回りの方向に回転する円形であってもよい。本明細書で具体化されるように、増幅及び検出システム６８０７は、増幅及び検出システム６８０７の周囲に１０７個の位置を含むことができる。増幅及び検出システムの形状、サイズ及び構成は、システムの所望の性能に基づいて選択することができる。本明細書でさらに具体化されるように、増幅及び検出システム６８０７上の各位置は、２つの増幅容器を受入れるための２つの開口部を含むことができる。限定ではなく例示の目的で、増幅及び検出システム６８０７は、２つの増幅容器内に２つの別個の試薬を含む。本明細書で具体化されるように、各試薬は増幅容器中で約２４秒で混合することができる。限定ではなく例示の目的で、例示的なピペッタによって、試料を吸引し、予め装填された増幅容器内に分注することができる。本明細書で具体化されるように、増幅及び検出システム６８０７上に配置された増幅容器は、特定のＲＰＡ反応成分、試薬、及び／または酵素をアッセイすることができる。本明細書で具体化されるように、増幅及び検出システム６８０７は回転し、約１２秒ごとに１位置進む。限定ではなく例示の目的で、増幅及び検出システム６８０７は、増幅容器の光学検出を行うために、異なる波長の５つの蛍光リーダ６８３２を含むことができる。限定ではなく例示として、本明細書で具体化されるように、増幅及び検出システム６８０７は、本明細書でさらに説明されるように、試料分析システムの他の構成要素と統合することができる。例えば、本明細書で具体化され、図６８Ａ～６８Ｄを参照すると、溶出液は、本明細書でさらに説明されるロボットピペッタであり得る溶出液ピペッタ６８１３を使用して増幅及び検出システム６８０７に導入することができる。本明細書で具体化されるように、溶出液ピペッタ６８１３は、例えば洗浄容器４２００などの洗浄容器から溶出液を移送することができ、この洗浄容器は、例えば洗浄トラック８００２などの洗浄トラックによって運搬することができる。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるように溶出液を分割することにより、アッセイ展開の複雑さ及びスケジュールを軽減することができる。さらに、本明細書に記載されるように溶出液を分割すると、１つの試料調製で実行される核酸分析の数を２倍にすることができる。例えば、限定するものではないが、チクングニア及びデング、または西ナイル及びジカの「蚊パネル」など、同時に要求されたアッセイをグループ化して、溶出液の分割を利用することができる。代替的に、または追加的に、単一の試料吸引を本明細書に記載の方法及びシステムによって調製することができ、そのように調製された核酸溶出液を２つの増幅反応に分割することができ、ここで、１つの増幅反応には、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶを増幅するのに好適な試薬が含まれ（たとえば、ＨｘＶマルチプレックス増幅）、第２の増幅反応には、パルボウイルス及びＨＡＶを増幅するのに好適な試薬が含まれる。ある特定の実施形態では、単一試料吸引からＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルス、及びＨＡＶを検出する能力によって、血漿試料のスクリーニングに関連した具体的な使用が見出される。本明細書に記載されるように溶出液を分割することにより、アッセイごとに実行する試料調製が少なくなった結果、排除された試料調製に関連する固形廃棄物を削減させることができる。さらに、本明細書に記載されるように溶出液を分割することにより、アッセイごとに実行する試料調製が少なくなった結果、排除された試料調製に関連する液体及び固体の廃棄物が削減される。例えば、限定するものではないが、溶出液を分割すると、所定の数の結果を生成するために使用される試薬、緩衝液及び／または微粒子を減少させることができる。追加的または代替的に、溶出液を分割すると、所定の数の結果を生成するために使用される溶解チューブ及び／または溶解チップの数を削減することができる。追加的または代替的に、溶出液を分割すると、所定の数の結果を生成するために使用される洗浄容器の数を削減することができる。
６．１．５ 追加の試料調製システムの実施形態
あるいは、または上記のシステムに加えて、本開示は、以下のプロセス及び／またはシステム構成要素のうちの１つ以上を含む試料調製システムを包含する。
６．１．５（ａ）静止試料前処理
本明細書で具体化されるように、限定ではなく例示のために、また開示される主題の別の態様によれば、本開示の自動分析システムは、例えば図５４Ｂに示されるように、試料調製ステーション３１１０を含む。試料調製ステーションは、１つ以上（例えば、２、３、４、またはそれ以上）の試料調製位置を含むことができる。ある特定の実施形態では、試料調製容器は、ロボットハンドラによって１つ以上の試料調製位置に搬送することができる。ある特定の実施形態では、試料調製位置に搬送される容器は試料を含むが、試料調製プロセスに必要な試薬の一部またはすべてを含むこともできる。
追加的または代替的に、試料の溶解、洗浄、及び溶出は、単一の静止試料調製容器内で実行することができる。例えば、限定するものではないが、試料を、試料チューブ３１０２から吸引し、試料溶解緩衝液及び磁性微粒子と接触させる試料調製容器内に分注し、例えば可動ロボットピペッタ３１１４によって分注することができる。核酸が磁性微粒子に結合する場合、可動永久磁石または固定電磁石を使用して試料調製容器内に磁性微粒子を保持することができ、その間、試料溶解緩衝液を吸引し、洗浄緩衝液を調製容器に分注する。試料溶解緩衝液の吸引及び洗浄緩衝液の分注は、複数の位置にわたり、例えば、試薬供給コンテナから試薬を吸引し、試薬を試料調製容器に分注し、廃棄物を液体廃棄物コンテナに分注することができる可動ロボットピペッタ３１１４によって実行することができる。次に、核酸が結合した磁性微粒子を、微粒子の機械的または磁石駆動動作によって洗浄することができる。第１の洗浄が完了したら、容器を可動永久磁石または固定電磁石と接触させることにより、核酸結合磁性微粒子を試料調製容器内に再び保持することができ、その間、洗浄液を吸引し、第２の洗浄液を試料調製容器に分注する。この方式で複数の洗浄を実行することができる。最終洗浄後、可動永久磁石または固定電磁石を使用して磁性微粒子を試料調製容器内に保持することができ、その間、洗浄液を吸引し、溶出緩衝液を試料調製容器に分注する。溶出が完了したら、磁性微粒子を、可動永久磁石または固定電磁石により試料調製容器内に再び保持し、その間、溶出液を、例えば、溶出した核酸を増幅するための１つ以上の増幅容器内に吸引及び分注する。このような増幅システムの非限定的な例は、ＥＰ１６２３７６４及びＵＳ２０１９／０２８４６１２に詳細に記載されており、その全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
追加的に、または代替的に、そのような試料調製システムは、試料調製容器を配置することができる処理デッキ、例えば試料調製ステーション３１１０を備える。ある特定の実施形態では、処理デッキは、例えば図５４Ｂに示すように、複数のアセンブルリング、片持ち梁型の支持構造、または処理デッキ上に固定された支持構造が可能になるハウジングによって囲まれる。ある特定の実施形態では、ハウジングまたは支持構造は、処理デッキ上に配置された試料調製容器に流体を導入または吸引できる１つ以上のロボットピペッタ３１１４を位置決めするように構成することができる。ある特定の実施形態では、追加のアセンブリリングまたは支持構造は、試料調製試薬及び／または廃棄レセプタクルを保持するように構成することができる。ある特定の実施形態では、処理デッキは、試料調製容器の加熱及び冷却を容易にするように構成された複数の加熱及び／または冷却ユニットを備えることになる。追加的に、または代替的に、そのような加熱ユニットは、試料調製反応が起こるオーブンであってもよい。ある特定の実施形態では、処理デッキは、試料調製容器の混合を容易にするように構成された混合ユニットを備えることができる。追加的に、または代替的に、試料調製システムは、試料調製容器を所定の温度で所定の時間維持するように構成されたインキュベーター、例えば回転インキュベーターを含むことができる。
６．１．５（ｂ） 目的に合わせた形状のチップにおける試料前処理
ある特定の実施形態では、例えば、図５９に例示されるように、試料調製を、チップの外部の磁石５９０８と相互作用するように構成された目的に合わせた形状のプラスチック使い捨てチップ５９００を使用して実行する。例えば、限定するものではないが、このような目的に合わせた形状のチップ５９００を使用して、試料５９０２を吸引することができる。次に、試料を、チップから試料溶解緩衝液、例えば、本明細書に具体化される任意の好適な試料溶解緩衝液中に排出することができる。ある特定の実施形態では、試料溶解緩衝液は磁性微粒子５９０６を含むが、ある特定の実施形態では、例えば図５９に示すように、このような磁性微粒子５９０６は、試料が試料溶解緩衝液と接触した後に導入することができる。磁性微粒子、例えば全核酸捕捉のためのＣｕＴｉ微粒子、または標的核酸捕捉を促進するための固定化オリゴヌクレオチドを含む微粒子の導入により、例えば図５９に示すように、さらなる処理のための試料核酸の捕捉が可能になる。例えば、限定するものではないが、目的に合わせた形状のチップ５９００によって、流体、例えば、細胞溶解物、洗浄緩衝液、または溶出緩衝液中に懸濁された磁性微粒子５９０６の吸引、外部磁石５９０８によって磁力を加えることによる粒子の保持、及びチップからの液体の分注、及び新しい（同一または異なる）液体の吸引が可能になる。例えば、図５９に示されるように、磁性微粒子５９０６が目的に合わせた形状のチップ５９００内に保持されている間に、洗浄液を繰り返し吸引及び分注することによって連続的な洗浄が媒介され、磁性微粒子５９０６に結合した核酸を、図５９に示されるように、目的に合わせた形状のチップ５９００内に保持された磁性微粒子５９０６と接触する溶出液の吸引によって溶出することができる。磁性微粒子５９０６との接触後の溶出液を、好適な容器、例えばウェルまたはチューブへ分注することは、図５９に示すように、磁性微粒子５９０６を目的に合わせた形状のチップ５９００内に保持しながら、目的に合わせた形状のチップ５９００から溶出液を分注することによって達成することができる。
ある特定の実施形態では、目的に合わせた形状のチップ５９００の内部からの磁性粒子の放出は、磁力を時限的に除去することによって達成することができる。ある特定の実施形態では、この技術は、Ｍａｇｔｒａｔｉｏｎ（登録商標）技術（Ｐｒｅｃｉｓｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｃｏ．）と呼ばれる（図５９）。このような試料調製戦略の例示的な実施形態は、例えば、米国特許第７，１５７，０４７号及び第８，１４２，７３７号に見出すことができ、このそれぞれの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
６．１．５（ｃ）逆磁性粒子処理
ある特定の実施形態では、本開示の試料調製システムによって利用される動作原理は、逆磁性粒子処理技術である。例えば、上記セクション６．１．５（ａ）で説明したように磁石を介して、磁性粒子を試料調製容器内に保持しながら液体を移動させるのではなく、逆磁性粒子処理アプローチで磁性粒子自体を移動させる。ある特定の実施形態では、例えば、図４６Ｃに示すように、逆粒子処理は、プランジャ２９１４の外壁２９１５に磁性粒子２９１３を引き付けるプランジャ２９１４に磁石２９１２を挿入することによって、洗浄関連溶液を保持するコンテナ内のあるウェルから別のウェル２９１１に磁性微粒子を移動させることを含む。粒子２９１３がプランジャ２９１４に磁気的に付着すると、プランジャ２９１４は次のウェル２９１１に移動する。粒子２９１３は、プランジャ２９１４の内側から磁石２９１２を取り外すことによって放出される。
限定ではなく例示の目的で、本開示の一実施形態による自動分析システムの外観図を図４７Ａに示す。この例では、システム１００は、試料装填領域１０２、ピペットチップ装填領域１０４、補助試薬装填領域１０６、アッセイ試薬プレート装填領域１０８、試料処理（ＳＰ）カートリッジ装填領域１１０、バルク流体保存領域１１２及び固形廃棄物保存領域１１４、を含む自動核酸調製及び分析システムである。補助試薬には、例えば、システムの試料調製ステーションでの核酸の単離、精製及び溶出に使用できる磁性粒子、溶出緩衝液及び／または類似物を含めることができる。このシステムは、ローカルユーザインターフェース（ＬＵＩ）１１６を含む。ＬＵＩ１１６は、操作者にグラフィカルユーザインターフェースを表示するためのタッチスクリーン表示装置を含む。この表示装置により、操作者は、患者の結果を局所的に表示し、機器の状態を評価することなどが可能になる。試料充填ステーション、試料調製ステーション、試料分析ステーション、及び他の内部システム構成要素を含むシステムの内部構成要素は、図４７Ａには示されていない。
さらに限定ではなく例示のために、本開示の一実施形態による別の自動分析システムの外観図を図４７Ｂに示す。この例では、システム２００は、試料装填領域２０２、ピペットチップ装填領域２０４、補助試薬装填領域２０６、アッセイ試薬プレート装填領域２０８、試料処理（ＳＰ）カートリッジ装填領域２１０、反応容器廃棄物保存領域２１２、バルク流体保存領域２１４及び固形廃棄物保存領域２１６、を含む自動核酸調製及び分析システムである。図４７Ｂに示されるように、各装填または保存領域は、システムの操作者による関連項目の装填及び／または取り外しを容易にするための棚または引出しを含み、システム２００の棚または引出しは、図４７Ｂでは開いた位置で示されている。この例では、試料は、チューブ内に存在しており、システムにおいて試料チューブラック２０３を含む試料チューブラック内に装填する。システムのロボットピペッタによって使用されるピペットチップ２０５を、ピペットチップ装填領域２０４に示す。補助試薬パック２０７を含む補助試薬パックを、補助試薬装填領域２０６に示す。アッセイ試薬プレート２０９を含むアッセイ試薬プレートを、アッセイ試薬プレート装填領域２０８に示す。ＳＰカートリッジ２１１を含むＳＰカートリッジを、ＳＰカートリッジ装填領域２１０に示す。バルク流体コンテナ２１５を含むバルク流体（バルク試薬）コンテナを、バルク流体保存領域２１４内に示す。試料充填ステーション、試料調製ステーション、試料分析ステーション、及び他の内部システム構成要素を含むシステムの内部構成要素は、図４７Ｂには示されていない。
ある特定の実施形態によれば、システムに装填される試料は、試料チューブ内に存在する。試料チューブは、システムに個別に装填することができ、または、例えば、図４８に示すように、他の試料チューブと一緒に試料チューブラック３０６内に装填することができる。試料チューブラック３０６が利用される場合、２つ以上の試料装填位置は、ラックが装填される２つ以上のレーンであり得る。例えば、試料チューブ装填領域３０２は、ユーザが試料チューブラック３０６を配置する２つ以上のレーンを有するプラットフォーム３０４を含むことができる。レーンはレーン仕切りで区切ることができる。レーンの数は変動してもよい。ある特定の態様では、装填領域３０２は、２～２０レーン、例えば５～１５レーン（例えば、１２レーン）を含む。
ある特定の実施形態によれば、例えば図４９に示されるように、試料装填領域４０２は、閉／上（利用不可）装填位置と開／下（利用可能）装填位置との間で旋回する装填棚４０４を含む。ある特定の実施形態では、システムは、試料が調製に利用可能である場合に、システムから離れた操作者によって装填され得る、分離された試料ラック棚４０６を含むことができる。所望の数のラックを棚４０４に装填すると、ラックは、例えば単一操作で棚からシステムの試料装填領域４０２に装填することができる。この機能には、例えば、大量の試料と少量の試料を１つのプラットフォームに統合するための使用が見出される。
ある特定の実施形態によれば、例えば、図４９に示されるように、試料装填領域４０２は、レーン／処理ステータス、レーンの利用可能性、及び／または類似物を含む情報を操作者に示すために、各レーンと整列されたレーン表示灯４０８を含む。
ある特定の態様では、例えば図５０に示すように、試料装填領域は、試料チューブ識別コードリーダ５０８を含む。試料チューブ識別コードリーダ５０８は、試料チューブバーコードリーダであってもよい。識別コードは変更することができ、ある特定の態様では、一次元コード、二次元コード（例えば、ＱＲコード）または類似物のいずれかである。特定の試料チューブラックが試料ラック棚５０２から内部試料ラック領域５０４に搬送されることを決定すると、システムは、試料チューブ識別コードリーダ５０８を試料チューブラックの移動位置に隣接する位置に移動させ、試料チューブラックが試料ラック棚５０２から内部試料ラック領域５０４に移動する際、バーコードリーダは、試験チューブラック内にある試験チューブ上に存在するバーコードを連続的に読み取る。また、リーダは、潜在的なユーザエラーを防ぐためにシステムで使用することができる固有のラック及びチューブの特徴を識別することもできる。
したがって、ある特定の実施形態によれば、本開示の方法は、試料チューブラックがシステムに装填されるときに、試料ラック及び試料チューブ上に存在する試料識別情報（例えば、試料バーコード）を読み取ることを含むことができる。
ある特定の態様では、試料装填領域は、試料チューブラック識別コードリーダを含む。例えば、図５０に示すように、試料装填領域は、ラック上に存在するバーコードを読み取るために、装填領域の試料チューブラック領域の近位に配置された１つ以上のカメラ５０８を含むことができる。
ある特定の実施形態によれば、例えば、図５０に示すように、試料装填領域は、レーン内（例えば、試料装填領域の試料ラック棚５０２及び／または内部試料ラック領域５０４）のラックの存在及び／または位置を検出するための検出システム、例えばカメラを含む。検出システムは、ラックが部分的に挿入されたか、完全に挿入されたか、または試料分析の完了時にシステムによって排出されたかを検出するために、試料装填領域の前部及び／または後部に設けられた位置センサを含むことができる。ある特定の実施形態によれば、ラックがレーンに完全に挿入されると、ラックは固定機構によって所定の位置に固定される。例えば、ラックは、ラックの下側にあるノッチと嵌合するレーンの表面に存在するロッキングリブによって所定の位置に固定することができる。完全に挿入するとラックが可逆的に固定されるため、ユーザは工程中のラックを取り外すことができなくなるが、例えば、システムの電源喪失の場合には取り外すことができる。
ある特定の態様では、システムの試料装填領域を、例えば、図５１に示されるコンベヤシステム９０２を使用して、異なる自動システムから試料を自動的に受入れるように適合させる。例えば、システム９００は、別個の自動試料調製及び分析システムとして機能することができ、または、１つ以上の他のシステム、例えば、１つ以上の他の自動試料調製及び分析システムと統合する（たとえば、ワークセル内に構成する）ことができる。ワークセルは、ワークセルの個々のシステム間での試料チューブ（例えば、試料チューブラック内に存在する）の自動搬送に適合させることができる。例えば、第１のシステムに存在する１つ以上の試料チューブを含むラックを、例えばシステム間の特定の核酸分析の選択を含む作業負荷のバランスをとるために、ワークセルの異なるシステムに搬送することができる。例えば、図５１に示すように、ワークセルのシステム間で試料チューブを搬送するために、各システム９００は、コンベヤベルト９０４を含む内部試料チューブ（または試料チューブラック）コンベヤシステム９０２を含むことができる。これらのシステムは、隣接するシステムの内部コンベヤシステム９０２のコンベヤベルト９０４が整列するように位置決めすることができ、これにより、システム間のチューブラックの搬送が可能になる。システム／モジュール間でコンテナを搬送する際に使用できる内部試料チューブ（または試料チューブラック）コンベヤシステム９０２に関する詳細は、米国特許出願第６２／２６９，５３５号に記載されており、その開示内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本開示の自動試料分析システムは、試料調製を容易にするために試料調製（ＳＰ）カートリッジを利用することができ、したがって、例えば図５３に示すように、ＳＰカートリッジ装填領域１３００を含むことができる。試料調製カートリッジとともに使用するための例示的な穴開け可能な隔壁は、米国特許第１０，４５６，７８６号に記載されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。例示的なＳＰカートリッジキャリア設計は、米国意匠第９３７，４３５号に開示されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。例示的な試料デッキ設計は、米国意匠第７９９，９９９号に開示されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。例示的な試料トレイ設計は、米国意匠第７９１，９６５号に開示されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ＳＰカートリッジ装填領域１３００は、装填領域の内側部分への操作者のアクセスを提供するドア１３０２及び１３０４を含むことができる。ある特定の例では、内側部分はドアの後ろにＳＰカートリッジ保存ユニット１３０６及び１３０８を含む。ある特定の態様では、各保存ユニットは、１つ以上のＳＰカートリッジエレベータを含む（保存ユニット１３０６のエレベータ１３１０及び１３１２を参照）。エレベータは、スタックの底部にかかる上向きの力を利用して、スタックの最上部にあるＳＰカートリッジを一度に１つずつ解放するように適合させる。ある特定の態様では、操作者はスリーブプルタブを取り外して、ＳＰカートリッジスタックをエレベータに露出させる。スタック／スリーブ内のＳＰカートリッジの数は、変動してもよい。ある特定の態様では、各スタック／スリーブは、１０～３０のＳＰカートリッジ、例えば２０のＳＰカートリッジを有する。
ある特定の例、例えば、図４５に示される試料調製カートリッジでは、ＳＰカートリッジ１８００は、取り外し可能な反応容器（ＲＶ）１８０２、取り外し可能なＲＶキャップ１８０４、及び取り外し可能なプランジャ１８０６を含むことができる。ある特定の態様では、ＲＶ１８０２及びＲＶキャップ１８０４は、米国特許出願公開第２０１７／０２６８０３９号に記載されており、その開示内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。本明細書でより詳細に説明するように、プランジャ１８０６は、例えば試料調製が磁性粒子ベースの核酸の捕捉を伴う実施形態で使用される。ある特定の実施形態では、本明細書に記載される試料調製システムは、複数のウェル１８０８～１８２２を備えることになる。例えば、ウェルは、溶出ウェル１８０８、補助的ウェル１８１０（例えば、凍結乾燥アッセイ試薬の再水和のためにこれを使用して水を保持することができる）、洗浄ウェル１８１２～１８１６（例えば、磁性粒子上に存在する核酸を洗浄する洗浄溶液を有する）；溶解ウェル１８１８（例えば、試料内の病原体、感染因子、及び／または細胞の膜または壁を溶解して核酸を放出するための溶解溶液を有する）、前処理ウェル１８２０（例えば、溶解前に試料を前処理するためのプロテアーゼを含む溶液を含むことができる）；またはプランジャ１８０６（例えば、試料調製プロセス中にすでに使用されているプランジャ１８０６）を保持するサイズのウェル、であり得る。
ある特定の実施形態では、プランジャ１８０６は、すべてのウェル１８０８～１８２２の底部の容積をほぼ完全に充填する形状を有することができる。これにより、ウェル内の液体が、試薬を適切に混合するのに十分な範囲で上下に駆動される。ある特定の実施形態では、プランジャ１８０６のチップには、混合中にプランジャが液体中に浸漬されるときに流体が容易に流れ上がることを保証するのに十分な空間を提供するために、溝を付けることができる。ある特定の実施形態によれば、プランジャ１８０６は、米国特許出願公開第２０１７／０２６７９９６号に記載されているようなプランジャであり、その開示内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態によれば、本開示のシステム及び方法は、米国特許出願公開第２０１７／０２６８０３８号に記載されている試料調製（ＳＰ）カートリッジのいずれかを含みかつ利用し、その開示はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。例えば、限定するものではないが、本開示のＳＰカートリッジは、フレームを含み、フレームは、それに一体化された複数のウェルであって、閉じた底部及び開いた上部を有する、複数のウェル；及び反応容器（ＲＶ）またはＲＶキャップがその中に取り外し可能に配置されているフレーム内の開口部を含み、複数のウェル及び開口部は、互いに対して直線状に配置される。
本開示のＳＰカートリッジエレベータは、エレベータの上部にＳＰカートリッジの存在を感知するためのセンサを含むことができる。例えば、センサは、エレベータの上部の位置にあるＳＰカートリッジの存在または不存在を決定できる光学センサであってもよい。ＳＰカートリッジが上部の位置で検出されない場合、システムはロボットＳＰハンドラに、別のＳＰカートリッジエレベータからＳＰカートリッジの取り出しを開始するように指示することができる。ある特定の実施形態では、システムは、ＳＰエレベータをリロードする必要があることを、操作者に通知することもできる。
ある特定の態様では、本開示のシステムは、試料調製ステーションの１つ以上の位置に存在するＳＰカートリッジ内で試料調製を実行する。ＳＰカートリッジは、試料調製プロセスに必要な試薬及び試料がすでに充填されて、試料調製ステーションの位置に搬送され、配置されてもよい。
ある特定の実施形態では、例えば、図４６Ａ～４６Ｂに示すように、試料調製ステーションは、１つ以上の試料調製（ＳＰ）モジュール２８００を含むことができる。ある特定の実施形態では、ＳＰモジュール２８００は、核酸を抽出するために必要な機械的動作を実行する。例えば、限定するものではないが、ＳＰモジュール２８００は、試薬を混合するために、カートリッジ２８０２及び２８０４から混合プランジャを引き出し、それをＳＰカートリッジ２８０２及び２８０４に沿って異なるウェルに移動させる特徴を有することができる。ある特定の実施形態では、混合は、垂直方向に平行移動するプランジャ棒に取り付けられたプランジャ２９０４を使用して行われる。ある特定の実施形態では、ＳＰモジュールは、２つの独立して制御可能かつ可動なヒーターを有することもできる。ある特定の実施形態では、第１のヒーターを使用して、前処理ウェル及び溶解ウェル内の試薬を加熱することができる。ある特定の実施形態では、第２のヒーターを使用して、溶出液ウェル内の流体を加熱することができる。両方のヒーターは、それぞれのウェルでの混合中に作動させることができる。
ある特定の実施形態では、例えば、図４６Ｂに示すように、ＳＰモジュールは、粒子をプランジャ２９０４の外壁に引き付ける磁石２９０２をプランジャ２９０４に挿入することによって、磁性微粒子を、あるウェルから別のウェルに移動させることができる。粒子が磁気的にプランジャ２９０４に付着すると、粒子は、次のウェルに移動する。粒子は、プランジャ２９０４の内側から磁石２９０２を取り外すことによって放出される。ある特定の実施形態では、ＳＰモジュールによるプランジャ２９０４の垂直動作もウェル内での混合を引き起こすことができる。
試料調製前にＳＰカートリッジを充填するための任意の適切なアプローチを利用することができる。ある特定の実施形態では、例えば、図５４Ａに示すように、ＳＰカートリッジは、ＳＰカートリッジ装填領域（図５４Ａでは「１」とラベル付けされている）にあるＳＰカートリッジエレベータの上部からロボットＳＰカートリッジハンドラによって取り上げられ、ハンドラによって、ＳＰカートリッジバルク試薬充填ステーションの２つ以上の位置のうちの１つ（図５４Ａでは「２」とラベル付けされている）に搬送される。ある特定の実施形態では、例えば、図５６に示すように、バルク試薬を、ＳＰカートリッジバルク試薬充填ステーション２７００でＳＰカートリッジ２７０２及び２７０４の適切なウェルに分注する。ある特定の実施形態では、例えば図５４Ａに示すように、ロボットＳＰカートリッジハンドラは、ＳＰカートリッジ２７０２及び２７０４を、ＳＰカートリッジ試料充填ステーションの２つ以上の位置のうちの１つ（図５４Ａでは「３」と表示）に搬送する。ある特定の実施形態では、試料（及び任意選択で追加の試薬）を、ＳＰカートリッジ試料充填ステーションでＳＰカートリッジ２７０２及び２７０４の適切なウェルに分注した後、ロボットＳＰカートリッジハンドラは、ＳＰカートリッジ２７０２及び２７０４を、試料調製（例えば、核酸の単離及び精製）が行われる試料調製ステーションの２つ以上の位置のうちの１つ、例えば、図５４Ａにおいて「４」とラベル付けされている位置、に搬送する。ある特定の実施形態では、システムは、例えば図５４Ａに示すように、試料処理の完了時にＳＰカートリッジを取り上げ、使用済ＳＰカートリッジをＳＰカートリッジ廃棄物コンテナに廃棄するＳＰカートリッジ廃棄ロボットを含むことができる。代替的に、または追加的に、廃棄ロボットは、選択されたトレイ内の試料がなくなった後、トレイを水平方向または垂直方向にゴミ箱領域まで移動させることができる。代替的に、または追加的に、ユーザは使用済トレイをゴミ箱領域から取り除くことができる。
本開示のロボットＳＰカートリッジハンドラ、例えば、図５５Ａ～図５５ＣのロボットＳＰカートリッジハンドラ２５００は、ＳＰカートリッジ装填領域のエレベータ、バルク充填ステーション、試料充填ステーション、及び試料処理ステーション（例えば、それぞれ図５４Ａの「１」～「４」とラベル付けされた位置）からの、ＳＰカートリッジ２６０６の取り出しを含む様々な機能を有することができる。ロボットＳＰカートリッジハンドラ２５００はまた、ＳＰカートリッジ２６０６を、バルク充填ステーション、試料充填ステーション、試料処理ステーション、及び／または廃棄ロボットに分配するように機能することもできる。ロボットＳＰカートリッジハンドラ２５００は、ロボットピペッティングデバイスが、隣接する試料調製ユニットで干渉なく動作できるように、システムがＳＰカートリッジ２６０６を有するかどうかを示す情報をシステムに提供するように、任意の位置にＳＰカートリッジ２６０６の存在または不存在を決定するように、などを、設計することができる。
本開示のロボットＳＰカートリッジハンドラ２５００は、ある特定の実施形態では、Ｘ、Ｙ、及びＺ方向に移動することができる。例えば、デュアルリンクアームによって、例えば図５５Ｃに示すように、Ｙ軸に沿った移動が可能になり得る。ある特定の実施形態では、例えば図５５Ｃに示すように、レールに沿った移動により、それぞれＺ軸及びＸ軸に沿った移動が可能になる。本開示のＳＰカートリッジハンドラ２５００は、ＳＰカートリッジ２６０６を把持するための１つ以上のＳＰカートリッジグリッパ２６００を含むこともできる。
ある特定の実施形態では、本開示のＳＰカートリッジグリッパ２６００は、下方に移動してから前方に移動して、受動フィンガ２６０２をカートリッジ２６０６に係合させることによって、ＳＰカートリッジ２６０６の対応するスロット２６０４に挿入される２つの受動フィンガ２６０２を含むことができる。次に、ある特定の実施形態では、ＳＰカートリッジ２６０６の対応するスロット２６１０内に能動フィンガ２６０８を挿入するために、２つの能動フィンガ２６０８を屈曲／把持させる。ある特定の実施形態では、把持を完了するために、能動フィンガ２６０８を、受動フィンガ２６０２に対して駆動させる。システム内の所望の位置でＳＰカートリッジ２６０６を解放することは、ある特定の実施形態では、能動フィンガ２６０８のグリップを解除し、ＳＰカートリッジ２６０６の対応するスロットから能動フィンガ２６０８及び受動フィンガ２６０２を取り外すことによって実行することができる。ロボットＳＰカートリッジハンドラ２５００は、例えば、ホーム位置、カートリッジの存在などのための１つ以上の光センサを含むことができる。
システムがバルク試薬充填ステーション、例えば、図５４Ａの「２」とラベル付けされた位置を含むある特定の実施形態では、そのような充填ステーションは、１つ以上（例えば、２、３、４、またはそれ以上）のＳＰカートリッジバルク試薬充填位置を含むことができる。バルク試薬充填ステーションは、バルク試薬保存領域、例えば、図５８に示されるバルク試薬保存領域５８００と流体連通することができ、ＳＰカートリッジの適切なウェルに、試料調製プロセス中に利用できるバルク試薬、例えば、分子グレードの水、エタノール、溶解試薬、洗浄試薬、蒸気バリア液体（たとえば、油）、などのうちの１つ以上を分注する。
ある特定の実施形態では、本開示の試料調製システムは、ＳＰカートリッジ試料充填ステーション、例えば、図５４Ａの「３」とラベル付けされた位置を含むことができる。このようなステーションは、１つ以上（例えば、２つ、３つ、４つ以上）のＳＰカートリッジ試料充填位置を含むことができる。ある特定の実施形態では、試料充填のために、ロボットピペッタ、例えば図５４Ａのロボットピペッタ３１１４は、試料装填領域、例えば図５４Ｂの試料装填領域３１０２の内側部分に存在する試料チューブから試料を吸引し、試料充填ステーションに搬送され、試料充填ステーションの１つ以上のＳＰカートリッジ試料充填位置に存在するＳＰカートリッジの適切なウェルに試料を分注する。
ある特定の態様によれば、本開示の方法は、ＳＰカートリッジをＳＰカートリッジ装填領域からＳＰカートリッジバルク試薬充填ステーションの２つ以上の位置のうちの１つに搬送することを含む。ある特定の態様によれば、方法は、ＳＰカートリッジをＳＰカートリッジバルク試薬充填ステーションからＳＰカートリッジ試料充填ステーションの２つ以上の位置のうちの１つに搬送することを含む。この方法は、ＳＰカートリッジをＳＰカートリッジ試料充填ステーションから試料調製ステーションの２つ以上の試料調製位置のうちの１つ、例えば、図５４Ａの「４」とラベル付けされた試料調製ステーションに搬送することを含むことができる。上記の搬送ステップのいずれか（例えば、それぞれ）は、ロボットＳＰカートリッジハンドラ、例えば図５５のロボットＳＰカートリッジハンドラ２５００によって実行することができる。
加えて、またはさらなる代替として、及び本明細書で具体化されるように、本明細書に記載される試料調製プロセスは、粒子またはビーズが液体の表面を通過し、及び／または空気－水境界または油－水境界を通過する動作を含むことができる。例えば、例としてのみで、限定するものではないが、開示された主題で使用するための試料調製プロセスは、これらのそれぞれはその全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第８，６０３，４１６号、第１０，０４０，０６２号、及び第１０，４４１，９５０号に開示された態様を含む、ＥＸＴＲＡＣＴＭＡＮ（商標）、ＳＬＩＤＥ（商標）、またはＡｉｒＪｕｍｐ（商標）試料調製ベースの態様及び／またはシステム（それぞれＳａｌｕｓ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ、ＬＬＣによる）を含むか組み込むことができる。
６．２標的核酸増幅システム
開示される主題の別の態様によれば、本開示のＨＴＮＡＴシステムは、標的核酸の増幅を促進するように構成された増幅システムを含む。例えば、限定するものではないが、増幅システムは、本明細書に記載の試料調製方法及びシステムを介して単離された核酸が移送される反応容器を含むことになる。ある特定の実施形態では、反応容器は、増幅システム内の複数の位置、例えば、試薬添加位置、加熱位置、及び／または冷却位置にわたることになる。他の実施形態では、反応容器は本質的に静止しており、試薬の添加は、例えばロボットピペッタを介して達成され、加熱及び冷却は、反応容器の静止位置に局所的加熱及び／または冷却を行うことを介して達成することができる。
６．２．１ カルーセルベースの核酸増幅システム
本明細書で具体化されるように、開示される主題の別の態様によれば、開示される主題による例示的な増幅システムは、増幅／検出組み合わせシステム（本明細書では増幅及び検出システムとも呼ばれる）である。例示的な増幅／検出システムを、図８に、及び図６６の６６５０として示す。一般に、増幅／検出組み合わせシステムでは、標的を増幅して検出可能なシグナルを取得し、そのシグナルを検出する。本明細書で具体化されるように、増幅プロセスは、標的核酸を増幅するための様々な戦略のいずれかであり得る。例えば、限定するものではないが、増幅プロセスは等温増幅を利用することができる。上記で詳細に考察したように、開示された主題に関連して有用な等温増幅動作の非限定的な例には、ＲＰＡ、ＮＥＡＲ、及び転写媒介増幅（「ＴＭＡ」）、ならびに任意の他の好適な等温増幅技法が含まれる。
以下の表、すなわち表８は、図６６の増幅及び検出プロセスに関する例示的な時間及び動作を示す。ある特定の実施形態では、増幅及び検出システムは、増幅容器を保持する位置を有する回転式カルーセルである。例えば、限定ではなく説明のために図６６に示すように、増幅及び検出システム６６５０は、増幅容器６６６０を保持する位置を有する回転式カルーセル６６５１である。増幅容器６６６０は、増幅及び検出プロセス中に増幅試薬及び溶出液を保持する。図６６の実施形態では、カルーセルは、１０７個の位置（Ｒ１～Ｒ１０６）を有する。カルーセル６６５１上のすべての位置を、試料増幅プロセスで使用するわけではなく、一部の位置は、カルーセル６６５１への増幅容器６６６０の装填、増幅試薬の分注、または増幅容器の取り外しに使用する。１２秒のロックステップを使用するこの例示的な実施形態に示されるように、増幅及び検出プロセスの試料処理時間は１２２４秒、すなわち２０．４分である。
Figure 2024518331000048
図６６は、位置Ｒ１～Ｒ１０７を含み、そのサブセットは、１つ以上の蛍光リーダ６６６３に対して位置決めされるが、増幅位置としても機能する。図６６の例示的な位置Ｒ３は、例えば試薬コンテナから「シップアンドスピット」戦略を介して、例えば増幅容器内に活性化剤が分注される位置に対応する。ある特定の実施形態では、活性化剤は、増幅反応を開始する物質、例えば、酵素または補因子である。
次に、溶出液を、図６６の増幅及び検出システムに移送する。一実施形態では、約４０μｌの溶出液を、洗浄及び溶出システム６５３０の洗浄容器６５４０のＰ４から吸引する。上述したように、図６５の実施形態では、ロックステップは１２秒であり、カルーセルは各ロックステップで１つ前方の位置をインデックス付けする。この実施形態では、位置Ｒ５で、約２０μＬの溶出液を、増幅及び検出カルーセル６６５１上に位置する増幅容器６６６０に分注する。増幅容器は位置Ｒ６にインデックス付けされており、Ｒ６において、「マスターミックス」とも呼ばれる増幅試薬を増幅容器に分注し、増幅容器にキャップをする。同時に、残りの約２０μｌの溶出液を、Ｒ５で別の増幅容器に分注する。ロックステップの後、増幅容器はＲ６にインデックス付けされ、そこで増幅試薬を加え、容器にキャップをする。以下でより詳細に説明するように、溶出液の２番目の部分にキャップをした後、カルーセルは同じロックステップ内で３６０度迅速に回転し、カルーセル上の各増幅容器を１つ以上の複数の検出器で２４秒ごとに読み取ることができる。カルーセルを１２秒のロックステップごと（すなわち２４秒ごと）に３６０度回転させることで、キャップをした増幅容器のみが回転し、アンプリコンが反応カルーセルを汚染する可能性が低減する。増幅容器にキャップをすることは、例えば、プレスオンキャップ、熱かしめテープ、及び／またはＰＳＡテープの使用を介して行うことができる。
ある特定の実施形態では、位置Ｒ８～Ｒ１０６は、ある特定の実施形態では、連続混合しながら増幅インキュベーションを達成するために利用する。ある特定の実施形態では、増幅インキュベーションの持続時間は、約１１８８秒である。ある特定の実施形態では、Ｒ８～Ｒ１０６インキュベーションは４０℃で行われ、加熱は、ある特定の実施形態では、抵抗ヒーターを介して行われる。ある特定の実施形態では、位置Ｒ８～Ｒ１０６での連続混合は、カルーセル動作及び／またはポップアップミキサーを介して実行することができる。ある特定の実施形態では、１つ以上の位置、例えば、限定するものではないが、位置Ｒ７及びＲ３１を含む位置は、激しい混合、例えば、ポップアップミキサーによる混合の部位である。
以下の表、すなわち表８．１は、増幅及び検出プロセスに関する例示的な時間及び動作を示す。１２秒のロックステップを使用するこの例示的な実施形態に示されるように、増幅及び検出プロセスの試料処理時間は１２００秒、すなわち２０分である。
Figure 2024518331000049
上記の例示的なシステムでは、１２秒のロックステップが使用されており、試料は１００ロックステップ（Ｒ１７～Ｒ１１６）の増幅及び検出プロセスにあり、その結果、増幅及び検出プロセスの合計インキュベーション時間は約１２００秒、すなわち約２０分になる。
ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスのための試料の処理時間は、増幅及び検出システムの容器（例えば、例示的な位置Ｒ１７）内でのインキュベーションの開始から始まり、増幅及び検出システムにおけるインキュベーションの終了とともに停止する（例えば、例示的な位置Ｒ１１６）。ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスにおける試料の総処理時間は、約１分～約２２分、約５分～約２２分、１８分～約２２分、約１９分～約２１分、または約２０分～約２１分であり得る。ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスにおける試料の総処理時間は、約１分、約５分、約１０分、約１１分、約１２分、約１３分、約１４分、約１５分、約１６分、約１７分、１８分、約１９分、約２０分、約２１分、または約２２分であり得る。ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスにおける試料の総処理時間は、約１２００秒、すなわち約２０分、または約１２２４秒、すなわち約２０．４分であり得る。
代替的または追加的に、増幅及び検出プロセスのための試料の処理時間は、増幅及び検出システムの容器内での試料のインキュベーション（例えば、例示的な位置Ｒ１７）の開始で始まり、結果の決定で終了する。ある特定の実施形態では、結果は、所定のレベルを超える、少なくとも１つの病原体または感染因子に由来する１つ以上の標的核酸の検出である。
ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスは、約１分以下の持続時間を有することができる。例えば、限定するものではないが、試料中に高力価で存在する病原体または感染性因子の核酸の増幅及び検出は、増幅及び検出システムの容器内でのインキュベーションの開始から約１分後に起こり得る。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子の高力価には、少なくとも１×１０１２ＩＵ／ｍｌの力価を含めることができる。例えば、限定するものではないが、少なくとも１×１０１２ＩＵ／ｍｌ以上の病原体または感染因子力価を有する試料は、増幅及び検出システム容器内でのインキュベーションの開始後約１分以下で検出することができる。ある特定の実施形態では、所定のレベルを超えるレベルの検出は、高力価の試料の増幅及び検出プロセスに入ってから約１分以下で得ることができる。
ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスは、約５分以下の持続時間を有することができる。例えば、限定するものではないが、試料中に中力価で存在する病原体または感染性因子の核酸の増幅及び検出は、増幅及び検出システムの容器内でのインキュベーションの開始から約５分以下で起こり得る。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子の中力価には、少なくとも１×１０６ＩＵ／ｍｌの力価を含めることができる。例えば、限定するものではないが、少なくとも１×１０６ＩＵ／ｍｌ以上の病原体または感染因子力価を有する試料は、増幅及び検出システム容器内でのインキュベーションの開始後約５分以下で検出することができる。ある特定の実施形態では、所定のレベルを超えるレベルの検出は、中力価の試料の増幅及び検出プロセスに入ってから約５分以下で得ることができる。
ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスは、約２０分の持続時間を有することができる。例えば、限定するものではないが、試料中に存在する病原体または感染性因子の核酸の増幅及び検出は、増幅及び検出システムの容器内でのインキュベーションの開始から約２０分後に起こり得る。ある特定の実施形態では、病原体もしくは感染因子の核酸が試料中に存在しないこと、または所定の量より低いレベルで存在することを確認するために、増幅及び検出プロセスは約２０分間の持続時間を有することができる。
ある特定の実施形態では、増幅及び検出プロセスは、約２０分の持続時間を有することができる。例えば、限定するものではないが、試料中に病原体または感染因子の核酸が存在しないという決定は、増幅及び検出システムの容器内でのインキュベーションの開始から約２０分後に起こり得る。あるいは、病原体または感染因子の核酸が試料中に所定のレベルを超えて存在するという決定は、増幅及び検出システムの容器内でのインキュベーションの開始から１分以内に得ることができる。ある特定の実施形態では、病原体または感染因子の核酸が試料中に所定のレベルを超えて存在するという決定は、増幅及び検出システムの容器内でのインキュベーションの開始から５分以内に得ることができる。
ＴＴＲ計算の場合、増幅及び検出プロセスにおける試料の処理時間は、増幅／検出容器のキャップを装填すること（例えば、例示的な位置Ｒ１）、増幅／検出容器を装填すること（たとえば、例示的な位置Ｒ２）、活性化剤を分注すること（例えば、例示的な位置Ｒ１３）、溶出液を増幅／検出容器に分注すること（例えば、例示的な位置Ｒ１６）、増幅／検出容器を移送して廃棄すること（例えば、例示的な位置Ｒ１１７）、及び動作のない任意の位置に移送すること（例えば、例示的な位置Ｒ３～Ｒ１２及びＲ１４）、を含まない。
限定ではなく例示の目的で、開示された主題による例示的な増幅システムは、図７及び図８に示される増幅／検出組み合わせシステム（例えば、増幅及び検出システム）である。例示的な図７～８では、位置Ｗ１９は、上述のマスターミックスが、例えば試薬コンテナから「シップ＆スピット」戦略によって第１及び第２の増幅容器に分注される位置に対応する。
図８の例示的な位置Ｗ１９は、例えば試薬コンテナから「シップアンドスピット」戦略を介して、例えば第１及び第２の増幅容器に活性化剤が分注される位置に対応する。ある特定の実施形態では、活性化剤は、増幅反応を開始する物質、例えば、酵素または補因子である。例示的な位置Ｗ２０はまた、例えば、プレスオンキャップ、熱かしめテープ、及び／またはＰＳＡテープの使用を介して、例示的な第１及び第２の増幅容器を封止するように機能する。位置Ｗ２０はまた、例えば「プレスダウン（ｐｒｅｓｓ ｄｏｗｎ）／脆質タブ破壊（ｂｒｅａｋ ｆｒａｎｇｉｂｌｅ ｔａｂ）」及び／または「ピックアンドプレース」戦略の使用によって、第１及び第２の増幅容器を検出／読み取りカルーセル内に移送することを可能にすることができる。位置Ｗ２０から検出／読み取りカルーセルへ試料を移送するための代替戦略には、洗浄容器の位置内に置かれた別個の容器及びキャップ、または種々のラックに装填された別個の容器及びキャップの使用が含まれ、これらを必要に応じて、適切な場所にピックアンドプレースして配置することができる。
図８は、位置Ｗ１８～Ｗ２０（上記の図７の説明を参照のこと）及び検出（「読み取り」）位置Ｒ１～Ｒ５０を含み、そのサブセットは、１つ以上のリーダに対して位置決めされるが、これは、増幅位置、及び廃棄位置Ｒ５１としても機能する。例えば、ある特定の実施形態では、位置Ｒ１～Ｒ５０は、ある特定の実施形態では、連続混合しながら増幅インキュベーションを達成するために利用される。ある特定の実施形態では、増幅インキュベーションの持続時間は、約１２００秒である。ある特定の実施形態では、Ｒ１～Ｒ５０インキュベーションは４０℃で行われ、加熱は、ある特定の実施形態では、抵抗ヒーターを介して行われる。ある特定の実施形態では、位置Ｒ１～Ｒ５０での連続混合は、カルーセル動作及び／またはポップアップミキサーを介して実行することができる。ある特定の実施形態では、１つ以上の位置、例えば、位置Ｒ１２を含むがこれに限定されないＲ１～Ｒ２５の位置は、激しい混合の部位、例えば、ポップアップミキサーを介して２８８秒間混合する部位である。
ある特定の実施形態では、増幅／検出組み合わせシステムは、ロックステップ内の各インデックス付け期間においてリーダを通過するすべての増幅容器を回転させ、例えば、各インデックス付け期間において３６０度＋１位置の移動を達成する。ある特定の実施形態では、ロックステップは２４秒ごとであるが、異なるロックステップを使用することもできる。ある特定の実施形態では、カルーセルの移動を完了するためのインデックス付け期間は約０．５秒～約２秒である。代替実施形態では、スループット及びＴＴＲ要件に応じて、ロックステップ及び／またはインデックス付け期間を短縮または延長することができる。
ある特定の実施形態では、増幅／検出組み合わせシステムの回転中に作出される遠心力を利用して、試料処理を強化する。最終的なカルーセルの直径と、カルーセルとモータの間のギア比に応じて、このカルーセルを約６００ＲＰＭで回転させ、各増幅容器にておおよそで約５０ＲＣＦ（Ｇ力）を生成することができる。この遠心力によって、ある特定の実施形態では、増幅容器の側面または上部カバー上の液滴が底部に戻されるであろう（例えば、回転中に増幅容器が傾くことが可能である場合）。液滴は、激しい混合及び／または増幅／検出組み合わせシステムの回転によって生成することができる。液滴を増幅容器の底部（読み取り領域）に戻すことにより、読み取られた体積からのシグナル及びその完全性を最大化することができる。
図７３は、本明細書に開示されるシステムにおいて使用するための例示的な増幅容器を示す。本明細書で具体化されるように、増幅容器には試薬及び／または酵素を予め装填することができる。増幅容器は増幅及び検出システム６８０７内に配置される。本明細書で具体化されるように、増幅容器は、より狭い底部を備えた上部フランジを有することができ、封止用のキャップを有することができる。増幅容器は、溶出液の添加後２秒未満でキャップにより封止することができる。限定ではなく例示の目的で、増幅容器のキャップは圧入することができる。本明細書で具体化されるように、キャップは医療グレードのコポリマーＰＰで作成することができる。
以下の表、すなわち表９は、図８の増幅及び検出プロセスに関する例示的な時間及び動作を示す。２４秒のロックステップを使用するこの例示的な実施形態に示されるように、増幅及び検出プロセスの試料処理時間は１２００秒、すなわち２０分である。
Figure 2024518331000050
６．２．２ 追加の標的核酸増幅システムの実施形態
本明細書に記載される増幅容器のいくつかの実施形態は個別であり、個別に処理されるが、本発明は、複数で形成される増幅（または溶解、または洗浄など）容器も企図する。例えば、図５４Ｄは、複数として処理される増幅（または溶解、または洗浄など）の例である。図５４Ｄにおける例では、５つの容器が互いに接続されており、複数として処理することができる。
追加的に、または代替的に、開示される主題の別の態様によれば、本開示の増幅システムは、トラック上の位置、例えば試料処理経路にわたる反応６０１０を備えることができる（図６０Ａ～６０Ｃ）。
追加的に、または代替的に、増幅容器６０１０は、トラック６０３０の間隔をあけたインキュベーショントラックスロット６０２０内に配置される（図６０Ａ～６０Ｂ）。増幅容器は、試料及び１つ以上の増幅反応を実行するための１つ以上の試薬を収容するように動作可能である。ある特定の実施形態では、プロセッサは、インキュベーショントラックを制御して移動させ、インキュベーショントラック内に存在する反応容器を、増幅システム内の次の場所に反応容器を前進させることができる。
ある特定の実施形態では、少なくとも１つのプロセッサは、インキュベーショントラックを制御して、増幅容器を複数の場所を通って移動させ、増幅容器内の試料及び試薬を増幅させて所望の反応を完了させることができる。トラックは、所望の増幅時間が可能になるように、増幅容器が増幅プロセス経路の増幅トラック内に存在するような速度で移動する。
具体的には、図６０Ｃに関して、追加的に、または代替的に、増幅を含む追加の処理ステップを補助的トラック６０５０上で実行することができ、ここで、核酸増幅反応に関連する容器、またはそれらの容器の内容物を補助的トラック６０５０のプロセス経路からトラック６０３０のプロセス経路へ移送することができる。当業者には理解されるように、補助的トラック（複数可）及び増幅トラック（複数可）の構成は変動してもよい。
ある特定の実施形態では、処理トラック（複数可）は、プーリの周囲に配置される連続直線状のベルト様トラックとして形成される（図６０）。ある特定の実施形態では、プーリは、スプロケットホイール係合、摩擦係合、または他の形態の係合で処理トラックと係合して、処理トラック（複数可）の平行移動または移動をもたらすことができる（図６０）。ある特定の実施形態では、プーリを回転させるために、モータがプーリのうちの１つ以上に電力を供給する。ある特定の実施形態では、プーリの回転により、インターフェースされた処理トラック（複数可）がプーリと一緒に、またプーリの周囲で回転し、それによって処理トラック（複数可）が同時に移動する。
上記の説明は、種々の場所を通る反応容器の横断の例を提供するが、ある特定の実施形態では、増幅システムの構成要素は変動してもよく、増幅システムの構成要素は異なる場所に配向もしくは構成することができるか、または、１つ以上の追加の構成要素を増幅システムに加えることができ、当業者であれば、そのような改変には、種々の場所を通る反応容器の横断に関与する方法及びシステムの相互改変が含まれることを理解するであろう、ということに留意されたい。
本開示の試料調製システムに関して詳細に説明したように、本開示の増幅システムは、ある特定の実施形態では、例えば、本明細書に記載されるように構成された、ピペットチップ装填領域、バルク流体保存領域、ならびに液体及び固形廃棄物保存領域を利用することができる。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の増幅システムは、増幅容器を配置できる処理デッキ、例えば、図５４Ｂに示す試料分析ステーション３１１２を備えることができる。ある特定の実施形態では、処理デッキは、例えば図５４Ｂに示すように、複数のアセンブルリング、片持ち梁型の支持構造、または処理デッキ上に固定された支持構造が可能になるハウジングによって囲まれる。ある特定の実施形態では、ハウジングまたは支持構造は、処理デッキ上に配置された増幅容器に流体を導入または吸引できる１つ以上のロボットピペッタ３１１４を位置決めするように構成することができる。ある特定の実施形態では、追加のアセンブリリングまたは支持構造は、増幅試薬及び／または廃棄レセプタクルを保持するように構成することができる。ある特定の実施形態では、処理デッキは、増幅容器の加熱及び冷却を容易にするように構成された複数の加熱及び／または冷却ユニットを備えることになる。追加的に、または代替的に、そのような加熱及び／または冷却ユニットは、増幅反応が起こる部分的または完全に密閉されたサブシステムに組み込むことができる。例えば、限定するものではないが、部分的または完全に密閉されたサブシステムは、Ｕ．Ｓ．７，１４８，０４３に記載されているサーモサイクラーであり、その内容は、その全体が参照により組み込まれる。ある特定の実施形態では、部分的または完全に密閉されたサブシステムは、１つ以上のウェルを含む支持構造を備えることができる。支持構造は、増幅容器が支持構造によって支持されている場合に、加熱及び／または冷却ユニットが増幅容器を加熱及び／または冷却できるように位置決めすることができる。例えば、限定するものではないが、支持構造は、増幅を容易にするために、個々にまたは集合的に、例えば、支持構造のウェルと整列する９６ウェルプレート内に、個々にまたは集合的に移送することができる１つ以上の増幅容器を保持するように設計することができる。ある特定の実施形態では、本明細書で詳細に説明するように、加熱及び／または冷却サブシステムは、固定または可動の検出システムを組み込むことができる。ある特定の実施形態では、処理デッキは、増幅容器の混合を容易にするように構成された混合ユニットを備えることができる。追加的に、または代替的に、増幅システムは、増幅容器を所定の温度で所定の時間維持するように構成されたインキュベーター、例えば回転インキュベーターを含むことができる。
６．３ 標的核酸検出システム
開示される主題の別の態様によれば、ＨＴＮＡＴシステムは、標的核酸の検出を促進するように構成された検出システムを含む。例えば、限定するものではないが、検出システムは、洗浄及び溶出された核酸が標的核酸を増幅するのに必要な物質と接触する反応容器を含むことができる。ある特定の実施形態では、反応容器は、検出システム内の複数の位置、例えば、１つ以上のリーダを横断することになる。他の実施形態では、反応容器は本質的に静止しており、検出は、反応容器の静止位置に可動に、例えばロボット制御で配置することができる検出器を介して達成する。追加的に、または代替的に、限定するものではないが、部分的または完全に密閉された加熱及び／または冷却サブシステムを含む、静止増幅容器を利用するシステムにおいて、本開示の検出システムは、静止リーダを組み込むことができ、例えば、部分的または完全に密閉された加熱及び／または冷却サブシステムのハウジングに組み込むことができる。
６．３．１ カルーセルベースの検出システム
限定ではなく例示の目的で、開示された主題による例示的な増幅システムは、増幅／検出組み合わせシステムである。例えば、限定するものではないが、例示的な増幅システムは増幅／検出組み合わせシステム、すなわち、図６６に示される増幅及び検出システムである。一般に、増幅／検出組み合わせシステムでは、標的を増幅して検出可能なシグナルを取得し、そのシグナルを検出する。本明細書で具体化されるように、増幅動作は、標的核酸を増幅するための様々な戦略のいずれかであり得る。例えば、限定するものではないが、増幅動作は、等温増幅を利用することができる。上記で詳細に考察したように、開示された主題に関連して有用な等温増幅動作の非限定的な例には、ＲＰＡ、ＮＥＡＲ、及び転写媒介増幅（「ＴＭＡ」）、ならびに任意の他の好適な等温増幅技法が含まれる。ある特定の実施形態では、等温増幅反応はＲＰＡである。ある特定の実施形態では、等温増幅反応はＮＥＡＲである。
開示された主題による例示的な検出システムは、図６６に示される増幅／検出組み合わせシステムである。上述したように、ある特定の実施形態では、増幅／検出組み合わせシステムは、ロックステップの１つおき（すなわち、２４秒ごと）にリーダを通過するすべての増幅容器を回転させることができ、例えば、２番目のロックステップ期間ごとに３６０度を達成することができる。ある特定の実施形態では、ロックステップは１２秒ごとであるが、異なるロックステップを使用することもできる。代替実施形態では、スループット及びＴＴＲ要件に応じて、ロックステップ及び／またはインデックス付け期間を短縮または延長することができる。
ある特定の実施形態では、増幅／検出組み合わせシステムの回転中に作出される遠心力を利用して、試料処理を強化する。最終的なカルーセルの直径と、カルーセルとモータの間のギア比に応じて、このカルーセルを約６００ＲＰＭで回転させ、各増幅容器にておおよそで約５０ＲＣＦ（Ｇ力）を生成することができる。この遠心力によって、ある特定の実施形態では、増幅容器の側面または上部カバー上の液滴が底部に戻されるであろう（例えば、回転中に増幅容器が傾くことが可能である場合）。液滴は、激しい混合及び／または増幅／検出組み合わせシステムの回転によって生成することができる。液滴を増幅容器の底部（読み取り領域）に戻すことにより、読み取られた体積からのシグナル及びその完全性を最大化することができる。
開示された主題による代替の例示的な検出システムは、図８に示される増幅／検出組み合わせシステムである。上で述べたように、図８は、位置Ｗ１８～Ｗ２１（上記の図７の説明を参照）及び検出（「読み取り」）位置Ｒ１～Ｒ５０を含み、そのサブセットは、１つ以上のリーダ、例えば蛍光光度計に対して配置される。ある特定の実施形態では、システム及び方法は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、またはそれ以上のリーダを利用することができる。ある特定の実施形態では、システムは、５つのリーダを利用する。ある特定の実施形態では、システムは、６つのリーダを利用する。前記リーダのそれぞれは、特定のシグナル、例えば特定の蛍光シグナルを検出するように較正することができる。ある特定の実施形態では、各リーダを、異なるシグナルまたはシグナル範囲を検出するように較正する。ある特定の実施形態では、各シグナルは、特定の目的分析物、例えば、内部対照または標的配列と関連付けることができる。本開示の実施形態は、代替システム構成に応じて、図８で特定されるよりも含まれる位置が多くても少なくてもよい。限定ではなく例示の目的で、図７２を参照すると、増幅及び検出システム６８０７は、増幅容器の光学検出を行うために、異なる波長の５つの蛍光リーダ６８３２を含むことができる。
６．３．２ 追加の標的核酸検出システムの実施形態
６．３．２（ａ）静止試料／移動リーダを備えた検出システム
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の検出システムは、例えば、図６１に示される例示的な移動式リーダ６１００によって具体化されるように、複数の位置にわたって往復運動することができるリーダ、例えば、ガントリリーダまたはスライド可能な光学系を組み込んで、静止試料（増幅反応容器など）と光学的に連通することができる。例えば、限定するものではないが、複数の反応容器６１０２、例えば、チューブ、ウェルなどに配置された試料を分析するための蛍光検出装置は、静止反応容器を含む増幅システムに取り付け可能な支持構造６１０３；支持構造６１０３上に可動に取り付けられるシャトル；及び１つ以上のリーダ６１００、を備えることができる。追加的に、または代替的に、システムは、フラグ６１０４及びフラグセンサ６１０５を含む、１つ以上の制御要素及び／または位置監視要素を含むことができる。このようなフラグ及びフラグ監視構成要素は、例えば自動動作中に、コンベヤに沿ったリーダの位置をプロセッサに提供するか、または、例えば光学分析デバイスの移動速度などを含む他の有用なデータを生成する手段を提供する。追加的に、または代替的に、場所、移動速度、及び光学分析デバイスの動作に関する他の情報を、好適なアブソリュートエンコーダを使用して監視することができる。追加的に、または代替的に、リーダ６１００は、複数の反応容器６１０２に向けられた開口部を有するハウジング；ハウジング内に配置された励起光発生器；及びハウジング内に配置された発光光検出器を備える。
追加的に、または代替的に、リーダ６１００、例えばガントリリーダの往復運動は、ステッピングモータによって駆動することができる。追加的に、または代替的に、本開示の検出システムは、ｘ軸ステッピングモータ及び／またはｙ軸ステッピングモータを備えることができる。ある特定の実施形態では、ステッピングモータ及びリーダは、当技術分野で知られているように設計することができる。さらに、図６１に示すように、チェーンドライブ、ベルトドライブ、または他の駆動機構を使用してリーダを位置決めすることができる。追加的に、または代替的に、リーダ６１００、例えばガントリリーダの往復運動は、サーボモータによって駆動することができる。
追加的に、または代替的に、リーダ６１００は、検出システムの他の構成要素と電子的に連通することになる。ある特定の実施形態では、そのような連通により、リーダと検出システム全体との間の情報中継が可能になる。例えば、限定するものではないが、検出システムから中継された情報は、ドナー試料の放出などの処理を容易にするためにＢＥＣＳシステムに中継される。ある特定の実施形態では、そのような検出情報は、追加のドナー試料情報、例えば、血液型、ＨＬＡ組織型、及び／またはドナーアンケートを介して得られたデータと組み合わせて、例えば、ドナー試料の放出などの処理を容易にするためにＢＥＣＳシステムに中継される。
６．３．２（ｂ） 移動試料／静止リーダを備えた検出システム
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の検出システムは、複数の位置を横断して、それによって、１つ以上の静止リーダ、例えば、図８のチャネル１～５として識別されるリーダ、または図６６のリーダ６６６３と光学的連通を始めることができる増幅反応容器を組み込むことができる。例えば、限定するものではないが、検出システムは、少なくとも１つの検出トラック、例えば、図６６のカルーセル６６５１を備えることができ、これを移動させて、その中に保持されている増幅反応容器を少なくとも１つのリーダ６６６３に移動させる。増幅反応容器がリーダ６６６３に移動すると、反応容器に含まれる核酸の読み取りを行う。
追加的に、または代替的に、リーダは、検出システムの他の構成要素と電子的に連通して、これによりリーダと検出システム全体との間で情報を中継できるようになる。ある特定の実施形態では、検出システムから中継された情報は、ドナー試料の放出などの処理を容易にするためにＢＥＣＳシステムに中継される。
６．３．２（ｃ） 定量分析用の検出システム
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の検出システムは、１つの増幅反応の過程で複数の読み取りを実行することができる。例えば、限定されるものではないが、検出システムは、ロックステップ内の各インデックス付け期間においてリーダを通過するすべての増幅容器を回転させ、例えば、ある特定の実施形態では、各インデックス付け期間において３６０度の移動を達成し、代替実施形態では、各インデックス付け期間において３６０度＋１位置の移動を達成する。ある特定の実施形態では、ロックステップは１２秒ごとであるが、異なるロックステップ、例えば２４秒ごとを使用することもできる。ある特定の実施形態では、カルーセルの移動を完了するためのインデックス付け期間は約０．５秒～約２秒である。代替実施形態では、スループット及びＴＴＲ要件に応じて、ロックステップ及び／またはインデックス付け期間を短縮または延長することができる。上記の実施形態では、インデックス期間は、例示的なＲＰＡ増幅プロセス中に各増幅容器に対応する各検出器から約５０の個々の読み取りを生成することができる。この特定の実施形態では、カルーセルベースの検出システムの利用について説明するが、可動リーダ及び静止増幅容器を利用する代替システム、ならびに静止リーダ及び可動増幅容器を利用する代替システムを利用して、単一の増幅反応の過程にわたる複数の読み取りを得ることもできる。以下に概説するように、増幅反応の過程にわたる複数の読み取りを得る能力により、定量的結果を得るための必要なデータが得られる。
特定の実施形態では、本開示の検出システムは、１つの増幅反応（本明細書では増幅及び検出プロセスとも呼ばれる）の過程中に複数の読み取りを実行することができる。増幅反応中、特定の態様では、増幅反応の開始から定量的結果の最初の決定までの時間は、約１分以下、約５分以下、約１０分以下、約１５分以下、約２０分以下、または約２５分以下であり得る。増幅反応中、特定の態様では、増幅反応の開始から定量的結果の最初の決定までの時間は、約１分～約２５分、約１分～約１５分、または約１０分～約２５分であり得る。増幅反応中、特定の態様では、増幅反応の開始から定量的結果の最初の決定までの時間は、約１分、約５分、約１０分、約１５分、約２０分、または約２５分であり得る。ある特定の実施形態では、本開示の検出システムによって複数の読み取りを実行して、定量的結果の第１の決定を提供することができる。ある特定の実施形態では、少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、または少なくとも１０の読み取りを使用して、試料の増幅を検出することができる。例えば、限定するものではないが、第１の定量的結果の決定までの時間には、少なくとも２つの読み取り、例えば、ベースライン用の読み取りと、標的核酸の増幅を検出するための読み取りが含めることができ、第１の定量的結果の決定は約１分以内に提供される。特定の態様では、比較的高い力価含有量を有する試料は、比較的低い力価含有量を有する試料よりも短い時間で検出することができる。
例えば、限定するものではないが、パルボウイルスＢ１９の定量的増幅を実行するために、陽性血漿試料の段階希釈物を試料調製にかけて核酸を単離した。試料調製後、本明細書に記載されているようにＲＰＡ反応を設定した、例えば、実施例１５を参照のこと。この検査は、ＲＰＡ反応が直線性を示したかどうかを決定するために必要であり、実施例１５で概説したように、配合変更（例えば、酵素濃度）を行うことにより、標的レベル間のより大きな分離及び直線性の改善が可能になった。定量のために、反応中に増幅シグナルが指定された閾値（サイクル閾値、Ｃｔ）にわたる時間を測定する。次に、これを公知の濃度の試料のシグナルと比較する（キャリブレータ）。未知の試料の濃度は、キャリブレータのＣｔと比較して決定することができる。
本明細書では特にパルボウイルスＢ１９の検出に関して説明するが、本明細書で考察する検出システム、特に公知の標準に関連するシグナルとの比較と組み合わせて、単一の増幅反応過程の複数の読み取りを可能にする検出システムを使用することにより、この定量的戦略を他の病原体及び感染因子の分析に拡張することが可能である。
６．４ 補助的システム
６．４．１ ランダムアクセスシステム
開示された主題の別の態様によれば、本開示のシステムは、すべての試料及び核酸分析へのランダムアクセスを提供することができ、これは、要求された核酸分析に必要な試薬／消耗品がシステムに備わっていることを条件として、システムによって、任意の順序での任意の試料及び／または任意の核酸分析の順序付け及び処理が可能になることを意味する。例えば、限定するものではないが、本開示のシステムはバッチ処理を必要としないため、システムは試料の優先順位付けが可能になり、例えば、「ｓｔａｔ」試料を既にキュー内にある試料より優先させることが可能になる。このことは、バッチ処理により、すでにキューにある試料の優先順位付け、または、すでにキューにある試料よりも優先されるべき試料の導入が不可能になっている現在のドナー血液スクリーニングシステムに比べて、大幅な改善である。ある特定の実施形態では、本開示のシステムのランダムアクセスアプローチによって、病原体または感染因子が検出された場合に、プール試料の迅速な分解が提供される。例えば、本開示のシステムにより、陽性プール試料を含むバッチ全体が処理されるのを待つのではなく、サブプールまたは個々のドナー試料の再スクリーニングを優先順位付けして、陽性プール試料を分解することが可能になり、これにより、ドナー血液スクリーニングプロセスの全体的な効率が実質的に向上する。
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、試料がシステムに装填された後であるが、試料調製が開始される前、または試料調製が完了した後であるが、標的増幅が開始される前、試料の優先順位付けの変更が可能になり、本開示のシステムのランダムアクセスアプローチによって、試料の調製後に、１つまたは複数の試料に適用される核酸分析の変更も可能になる場合がある。例えば、限定するものではないが、本開示のシステムはバッチ処理を必要としないため、任意の特定の試料に関して実施される特定の核酸分析の変更は、試料の核酸分析の開始前に改変することができる。加えて、本開示の方法及びシステムは、例えば、図１７に示すように、統合試料調製プロセス経路を使用することができるため、ある特定の実施形態では、試料調製が完了した後でも核酸分析に対する変更を行うことができる。
追加的に、または代替的に、本開示のシステムによって実行することができる核酸分析の総数は、試料調製、増幅、及び検出を実行して試料中の特定の病原体もしくは感染因子の存在もしくは不存在を決定するために必要な核酸分析試薬を保持及びこれにアクセスするシステムの能力に基づいて変動する場合がある。例えば、ある特定の実施形態では、本開示のシステムで利用可能な核酸分析の数は、２以上、３以上、４以上、５以上、６以上、７以上、８以上、９以上、１０以上、１５以上、２０以上、３０以上、４０以上（例えば、４８以上）、または５０以上の核酸分析である。ある特定の実施形態では、核酸分析は並行して実行することができる。
追加的に、または代替的に、本開示のシステムによって実行することができる核酸分析の総数は、試料調製、増幅、及び検出を実行して試料中の特定の病原体もしくは感染因子の存在もしくは不存在を決定するために必要な核酸分析試薬を保持及びこれにアクセスするシステムの能力に基づいて変動する場合がある。限定ではなく例示の目的で、図７４は、バッチ及び個別のラック試料の装填が可能になるように構成された例示的な試料装填ベイ７４００を示す。試料装填ベイ７４００には、ラックステータスＬＥＤ７４０１、優先ライト７４０５、及びトレイステータスＬＥＤ７４１０が含まれる。本明細書で具体化されるように、試料装填ベイは、最大３６０個の試料を装填することができ、バッチまたは個別の装填のために試料の異なるトレイの装填が可能になる。限定ではなく例示の目的で、図７５は装填ベイ７４００で使用するための例示的なトレイスタック７５１０を示す。本明細書で具体化されるように、トレイスタック７５１０は、試料を備えた複数のトレイ７５０１を含むことができる。７５１５として示されているように、ユーザはトレイの前面に直接アクセスすることができる。
６．４．２ バッチ試料分析システム
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示のシステムは、試料及び／または核酸分析を「バッチ」形式で処理することができる。本明細書で使用されるバッチ形式には、２つ以上の試料及び／または核酸分析を同時に処理することが含まれる。バッチ処理試料及び／または核酸分析の総数は変動する場合があり、ある特定の態様では、バッチ処理試料及び／または核酸分析の数は、２以上、５以上、１０以上、１５以上、２０以上、３０以上、４０以上（例えば、４８以上）、または９６以上の、協調して処理される試料及び／または核酸分析である。
６．４．３ 継続的アクセスシステム
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、ランダムアクセス処理またはバッチ処理が可能なシステムを含む本開示のシステムは、試料処理及び核酸分析のための冗長構成要素、例えば試料、試薬、試料処理カートリッジ、ピペットチップなどのための冗長装填／保存領域、を含むことができる。冗長構成要素により、システムを継続的に実行すること（試料結果／データの表示を含む）が可能になり、試料、バルク流体、試薬、物品（例えば、反応容器及び反応容器のキャップ、試料前処理（ＳＰ）カートリッジ、ピペットチップ及びトレイ、アッセイプレート、補助試薬パックなど）及び廃棄物の補充または除去中に、システムの動作を停止することなく、操作者が継続的にアクセスすることが可能になる。「継続的な操作者アクセス」とは、システムの操作者が、システムの操作を停止することなく、例えば、試料調製及びシステムの分析機能のいかなる態様も中断することなく、試料、バルク流体、試薬、物品、及び廃棄物を補充及び／または除去することができることを意味する。限定ではなく例示の目的で、本開示のシステムは、バイオハザード廃棄物引出し、試薬保存庫、バルク溶液引出し、固形廃棄物引出し、消耗品ローダベイ、バルク溶液リザーバ及びポンプベイ、真空ポンプベイ、ピペッタポンプベイ、及び／または液体廃棄物リザーバを含むことができる。継続的アクセスが可能になり、試料及び試薬をシステムに追加するためにシステムを停止する必要がない例示的な継続的操作者アクセスシステムが、米国特許第９，３３５，３３８号に開示されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
６．４．４ ロボットピペッタ
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、例えば図５４Ｂに示すように、本開示の自動分析システム３１００はロボットピペッタ３１１４を含むことができる。ある特定の実施形態では、ロボットピペッタは、試料の調製及び処理、ならびにＲＶキャッピング及び搬送を達成するためにピペッティングに必要なシステム位置にアクセスすることができる。
追加的に、または代替的に、ロボットピペッタ３１１４は、例えば、ピペットチップ装填領域３１０４にある内部位置のピペットチップ、試料装填領域３１０２の内部位置にある試料チューブ、補助試薬装填領域３１０６の内部位置に存在する補助試薬、試料調製ステーション３１１０、アッセイ試薬（例えば、アッセイ試薬装填領域３１０８の内部位置に存在する凍結乾燥アッセイ試薬）、ピペットチップ及び／またはＲＶ廃棄位置、ならびに試料分析ステーション３１１２、と相互作用することができる。特定の実施形態では、ピペッタ３１１４は、例えば、前処理ウェルまたは溶解ウェルへの試料及び試薬の移送；前処理済試料の前処理ウェルから溶解ウェルへの移送；溶出液ウェル、補助的ウェル、及びプランジャ廃棄位置へのアクセス；ＲＶキャップへのアクセス；ＲＶへの溶出液及び試薬の充填；充填されたＲＶへのアクセス；ならびに分析ステーションのＲＶウェルへのアクセス、を実行することができる。
追加的に、または代替的に、例えば図５４Ｃに示されるように、本開示のロボットピペッタは、ここに記載されているシステム領域／ステーションのうちの１つと相互作用するために（例えば、駆動／サーボモータアセンブリを介して）Ｘ軸、Ｙ軸及びＺ軸に沿って可動である。
追加的に、または代替的に、例えば図５４Ｄに示されるように、ロボットピペッタ３３００は、試料調製戦略に関連して使用されるレーンと同じ数のピペッティングバレル３３０２を有する。例えば、試料調製システムが４つのレーンを有する場合（例えば、４チャネルＳＰカートリッジを使用する場合）、ロボットピペッタ３３００は、４つのピペッティングバレル３３０２を有することができ、したがって、ロボットピペッタ３３００は、ＳＰカートリッジの各レーン／チャネルの対応するウェルから試薬、試料、精製核酸などを同時に吸引及び／または分注することができる。
追加的に、または代替的に、ロボットピペッタ３３００は、保守、性能、自動補正などの目的で、ローカル分析及び遠隔分析のためにシステムの画像をキャプチャするためのカメラを含むことができる。いくつかの実施形態では、カメラは、アッセイプレート及び補助ボトル上に存在するバーコードを読み取る際にも使用することができる。また、チップのタイプなどの消耗品の特性を識別するために使用することもできる。
追加的に、または代替的に、例えば、図５４Ｂに示すように、ロボットピペッタ３１１４は、ピペットチップ保存領域３１０４から使い捨てピペットチップを取り上げ、試料導入領域３１０２に存在する試料チューブから試料を吸引し、試料を分注して第１のウェルに入れることができる。ある特定の態様では、ロボットピペッタ３１１４は、第２のウェルから精製試料を吸引し、精製試料をアッセイ試薬ウェル（例えば、アッセイ試薬プレートのウェル）に分注することができる。ある特定の実施形態では、アッセイ試薬ウェルは、凍結乾燥アッセイ試薬を含むことができる。ある特定の実施形態によれば、ロボットピペッタ３１１４は、精製試料及びアッセイ試薬を含む混合物をアッセイ試薬プレートから反応容器に移送することができる。ある特定の実施形態によれば、ロボットピペッタ３１１４は、反応容器のキャップを取り上げて、反応容器にキャップをすることができる。ある特定の態様では、ロボットピペッタ３１１４は、キャップをした反応容器を取り上げ、キャップをした反応容器を、本明細書に記載の試料分析ステーション３１１２の試料分析ユニットのうちの１つのウェルに搬送することができる。
限定ではなく例及び説明の目的で、ロボットピペッタ３１１４で使い捨てピペットチップを使用すると、システムのスループットなどの利点が得られる。限定ではなく例として、本明細書に具体化されているように、使い捨てピペットチップを使用すると、試料調製カルーセルの回転間の２４秒間に、可動ロボットピペッタが試料を吸引し分注するための追加の時間を確保することができる。本明細書で具体化されるように、カルーセルの移動間に追加の吸引及び／または分注動作を実行する能力により、システム全体のスループットへの影響を最小限に抑えながら、試料プールなどの追加の試料調製ステップが可能になる場合がある。限定ではなく例及び説明の目的で、再利用可能なピペットチップの洗浄には、可動ロボットピペッタでの使い捨てピペットチップの交換よりも時間がかかることがある。追加的または代替的に、使い捨てピペットチップを使用する場合、ピペットチップ洗浄ハードウェアなどの追加のハードウェアを省略することができる。
追加的に、または代替的に、例えば、図５４Ｂに示すように、ロボットピペッタ３１１２は、例えば、相互汚染を低減または排除する際に使用できる機能を含む。例えば、ある特定の態様では、ロボットピペッタは、以下の特徴のうちの１つ以上（例えば、任意の組み合わせ）を有する：空気ベースのピペッティング機構；コンテナ内の液体のレベル（例えば、試料チューブ、試薬チューブ、ウェル内などの液体レベル）を検出する能力；ピペットチップの外側の液滴汚染防止するために、液体の上方レベル（例えば、上部）から吸引する能力；ピペットチップの外側に液体が付着するのを阻止または防止するピペットチップ材料；移動前に、吸引された液体をピペットチップのさらに上方に移動させるための、例えば、移動中（例えば、試料チューブから、吸引された試料が分注されるコンテナまで）の滴下を防止するための、空隙の形成（または「吸引」）；例えばピペットチップ内の流体の動き（例えばチップ内の予期せぬ流体の動き）を感知するためのピペッタ内の１つ以上の圧力センサ（例えばピペッタの１つ以上のバレル）；ピペッタ（例えば、試料を含む）がＳＰカートリッジの上を移動しないような移動経路。
６．４．５ ピペットチップ装填領域
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の自動試料調製システムは、例えば、図５２Ａ及び図５２Ｂに示されるように、ピペットチップ装填領域６００を含むことができる。ある特定の態様では、ピペットチップ装填領域６００は、システムへのチップラックの装填を容易にするために、それぞれが２つ以上のピペットチップラック６１０～６１８のための位置を有する１つ以上（例えば、２、３、または４つ）のピペットチップ引出し６０２及び６０４を含み、フロントパネル６０８を構成することができる。ある特定の実施形態によれば、例えば、図５２Ｂに示すように、１つ以上の引出しをシステムから完全に取り外して、システムから離れた場所、例えば施設内の異なる領域で、チップラック６１０～６１８を装填できるようにすることができる。
追加的に、または代替的に、チップラックを側面装填する（ｓｉｄｅ－ｌｏａｄｉｎｇ）ことにより、チップラックを引出しに装填する際に、チップラックからのチップのずれが発生することを低減することができ、このずれは、チップラックを上部から装填するときに、例えば、上から装填するときに引出しの開いた位置にチップラックを不正確に配置することにより、かなりのレベルで発生する。
６．４．６ 補助試薬装填領域
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の自動試料調製システムは、例えば、図５７に示されるように、１つ以上の補助（ａｎｃｉｌｌａｒｙ）（または補助的（ａｕｘｉｌｉａｒｙ））試薬装填領域５７００を含むことができる。補助試薬には、例えば、核酸を捕捉するための磁性粒子、精製された核酸を溶出するための溶出緩衝液などを含めることができる。
ある特定の実施形態によれば、補助試薬装填領域５７００は、個々の補助試薬チューブ５７０６、または連結された補助試薬チューブのパックが装填される１つ以上の引出し５７０２及び５７０４を含む。１つ以上の補助試薬装填引出し５７０２及び５７０４に装填してこれを閉じると、システムは、補助試薬が装填されたことを検出することができる。
ある特定の態様では、１つ以上の補助試薬チューブ５７０６が磁性粒子を含む場合、補助試薬装填領域５７００は、磁性粒子を混合するための混合モータ５７０８を含み、それによって、システムのピペッタロボットによる一貫した吸引のために粒子を懸濁状態に維持する。混合モータ５７０８は、補助試薬チューブ５７０６を反時計回り及び時計回りの方向に交互に回転させることによって作動させることができる。
ある特定の実施形態によれば、操作者は補助試薬チューブ８０６を、補助試薬パックの形態でシステムに装填する。補助試薬パックのチューブ内の試薬のタイプはさまざまであり得、システムの操作者が選択することができる。
６．４．７ 液体及び固形廃棄物の保存場所
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の自動分析システムは、１つ以上の液体廃棄物保存領域及び／または１つ以上の固形廃棄物保存領域を含み、これには、限定するものではないが、そのような保存領域が、バルク試薬保存領域も含む引出し、例えば、図５８の引出し５８００内に配置される場合が含まれる。ある特定の態様では、本開示のシステムは、１つ以上の液体廃棄物保存領域で１つ以上の液体廃棄物コンテナに液体廃棄物を処分するように適合されており、液体廃棄物は、例えば、使用済の反応容器、充填ステーション（例えば、オーバーフロー液、洗浄液、プライム液、及びパージ液）、バルク試薬クレードルのオーバーフローなどからのものであり得る。ある特定の実施形態によれば、システムは、２つの液体廃棄物コンテナ、例えば２つの２リットル液体廃棄物コンテナを含む。つまり、液体廃棄物保存領域は、より効率的に液体廃棄物を保存することができる。代替的に、または追加的に、固形廃棄ロボットは、選択されたトレイ内の試料がなくなった後、使用済トレイを水平方向または垂直方向にゴミ箱領域まで移動させることができる。代替的に、または追加的に、ユーザは使用済のトレイをゴミ箱領域から取り除くことができる。例示的なバルク試薬システムは、米国特許第９，８２３，２６３号に開示されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
システムは、１つ以上の固形廃棄物保存領域を含むことができる。一実施形態によれば、本開示の分析システムは、システムの引出、例えば、図５８の引出し５８００内に存在する固形廃棄物保存領域を含む。ある特定の実施形態では、キャップをした反応容器（例えば、すでに試料分析を受けたもの）、ピペットチップなどを処分するための１つ以上のコンテナ、例えば図５８の５８１０が、引出し、例えば、図５８の５８００内に存在する。例えば、それは、バルク試薬保存領域及び液体廃棄物保存領域も含む引出し５８００であり得る。固形廃棄物品は、コンテナ５８１０の上に配置されたシュート（例えば、図５８の５８０８）の上部開口の上に、システムによって（例えば、システムのロボット式ピペッタによって）放出することができる。引出し５８００及びシュート５８０８は、引出し５８００が閉じているときにのみシュート５８０８がコンテナ５８１０と連通するように構成することができる。
引出し５８００が閉じているときにシュート５８０８がコンテナ５８１０とのみ連通することを保証するために、特定の機構／構成を実装することができる。例えば、ある特定の態様では、モータは、シュートフラップに動作可能に接続される。モータはシステム電子機器によって制御され、引出しが閉じているときにシュートがコンテナ５８１０と連通し、引出しが開いているときにコンテナと連通しないようにシュートフラップを位置決めする。いくつかの実施形態によれば、引出し５８００の内容物にアクセスすることが望ましい場合、システムのユーザは、例えば、ユーザインターフェース（例えば、ボタン、タッチスクリーン、及び／または同様のもの）を介して、そのようなアクセスを要求することができる。このような要求に応じて、システム電子機器は、シュート５８０８がコンテナ５８１０と連通しないようにシュートフラップを位置決めするように、モータに命令する。任意選択で、そのような要求がなされると、システム電子機器は、例えば、シュートがもはやコンテナと連通しないようにシュートフラップハンドルを位置決めした後、引出し５８００上のロック機構に、引出し５８００をロック構成からロック解除構成に切り替えるように命令する。引出しを安全に開けることができることを示すために、インジケータ（例えば、ライトまたはその特定の色）をシステムのユーザに提供することができる。
ある特定の態様では、本開示の分析システムは、使用済の反応容器が配置される１つ以上の固形廃棄物コンテナ５８１０を含む固形廃棄物保存領域を含む。反応容器は、反応容器を２つのコンテナのうちの一方の上の位置に搬送し、かつ反応容器をコンテナ５８１０内に落下させる、固形（または液体／固形）廃棄物取り扱いモジュール（例えば、液体／固形廃棄物取り扱いモジュール）によって、試料処理ステーションの試料処理ユニットから容器を取り外すことにより処分することができる。
６．４．８ バルク流体保存領域
追加的に、または代替的に、開示された主題の別の態様によれば、本開示の自動試料調製システムは、例えば図５８に示されるように、ある特定の実施形態では、フロントカバー５８０２を含む、バルク流体（または「バルク試薬」）保存領域（または「引出し」）５８００を含むことができる。バルク試薬は、ポンプ及びノズル５８１２を用いて容器、例えば洗浄容器または溶解チューブに分注することができ、特別な操作、例えばコンテナの内容物の再懸濁を必要としない、一般的に使用される試薬である。ある特定の態様では、バルク流体／試薬には、試料溶解緩衝液、アルコール（例えば、エタノール）、核酸洗浄溶液、分子グレードの水、蒸気バリア試薬（複数可）及び／または同様のものが含まれる。
ある特定の態様では、バルク試薬を、バルク流体保存領域５８００内のボトル５８０４及び５８０６に保存する。バルク試薬ボトル５８０４及び５８０６は、所望の体積のバルク試薬を含有するようなサイズにすることができる。例えば、ボトル５８０４及び５８０６は、５００ｍｌ～１．５Ｌ（例えば１Ｌ）のバルク流体を含有するような大きさにすることができる。限定ではなく例示の目的で、溶解緩衝液のコンテナ容積は約２Ｌであり得る。溶出緩衝液のコンテナ容積は約６５０ｍＬであり得る。Ｍｇ活性化剤のコンテナ容量は、約６５０ｍＬである。
ある特定の実施形態によれば、１つ以上のバルク試薬は、キー付きキャップを含むボトル内で提供される。キー付きキャップは、少なくとも１つの環状リング突起を備えるキー要素を含むことができる。１つ以上の環状リングは、リング及びリングによって画定される空間の特定の構成を提供する。１つ以上の環状リングによって作出される特定の構成は、キャップ上のキー要素を受入れることができるようにするために、バルク試薬保存領域内の受入れデバイス上で対応する構成を必要とする「キー」として機能する。例えば、Ｃｕ－Ｔｉ粒子カートリッジの容量は、約３１．５ｍＬであり得る。ＰＫカートリッジの容量は、約１１ｍＬであり得る。ＩＣカートリッジの容量は、約２６．２ｍＬであり得る。例えば、受入れデバイス上の対応するキー要素は、キー付きキャップの１つ以上の環状リングを適切に整列させて受入れるような形状決め及びサイズ決めされるであろう。例えば、受入れデバイス上のキー要素は、キー付きキャップ上の１つ以上の環状リングと整列するように適切に位置決めされた１つ以上の環状溝またはウェルを含むことができる。さらに、受入れ装置上のキー付き要素は、キー付きキャップ上の１つ以上の環状リングによって画定されるキー付きキャップ上のキー要素上の１つ以上の空間と整列するように適切に位置決めされる１つ以上の環状リングを含み得る。本開示のシステムのバルク試薬ボトル及びバルク試薬保存領域に有用なキー付きキャップに関するさらなる詳細は、米国特許出願公開第２０１４／０２６３３１６号に見出すことができる。
ある特定の実施形態では、バルク試薬保存領域５８００は、ＳＰカートリッジの適切なウェルにバルク流体を分注するバルク流体分注ステーションと（例えば、ホースを介して）インターフェースする流体インターフェース５８１２を含む。
バルク試薬保存領域は、１つ以上のバルク試薬ボトル５８０４と流体連通する１つ以上のリザーバを含むことができる。例えば、バルク試薬ボトル５８０４がバルク試薬保存領域に装填されると、ボトルの液体内容物がリザーバ内で空になり、システムの連続的な動作中で任意の好都合な時間に、システムの操作者がボトル５８０４を取り外す（かつ必要に応じて、新しい（充填）試薬ボトル５８０６とボトルを交換する）ことができるようになる。
限定ではなく例の目的で、図６８Ａ及び図６８Ｂは、バルク試薬保存領域６８３６を含む例示的なシステムを示す。例示の目的で、本明細書に具体化されるように、試料調製ならびに核酸増幅及び検出用の試薬を含む試薬は、バルク試薬保存領域６８３６で保存及び管理することができる。例示の目的で、本明細書に具体化されるように、試薬はバルク試薬保存領域６８３６のコンテナに保存することができる。システムの所望の性能に応じて、各試薬に使用するコンテナの種類、サイズ、位置を選択することができる。追加的または代替的に、本明細書で具体化されるように、一部またはすべての試薬コンテナは、直接配管及び／または連続充填用に構成することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、バルク試薬保存領域６８３６は、溶解緩衝液、溶出緩衝液、及びＭｇ活性化剤用のコンテナを含むことができる。本明細書で具体化されるように、溶解緩衝液、溶出緩衝液、及びＭｇ活性化剤のコンテナは、連続充填のために直接配管することができる。追加的または代替的に、１つ以上の満杯の試薬コンテナをバルク試薬保存領域に装填し、コンテナ内の試薬がなくなったときに交換することができる。各試薬コンテナの容量及び構成は、使用する試薬の体積（試料前処理など）を考慮するなど、システムの所望の性能に基づいて選択することができる。例示の目的で、本明細書に具体化されるように、試薬保存領域６８３６は、上述のような、溶解緩衝液、溶出緩衝液、Ｍｇ活性化剤、ＣｕＴｉ粒子、プロテイナーゼＫ（ＰＫ）、内部対照（ＩＣ）、オリゴ、及びＲＰＡマスターミックス試薬を保存するための試薬コンテナを含むことができる。
例の目的で、本明細書に具体化されるように、１つ以上のロボットピペッタを使用して、システム６８００によってバルク試薬保存領域６８３６から所望の場所に試薬を移送することができる。限定ではなく例として、本明細書に具体化されるように、システム６８００は、バルク試薬保存領域６８３６から、例えば、溶解カルーセル６８０５に試薬を移送するために使用することができる、試料調製試薬ピペッタ６８１７を含むことができる。追加的または代替的に、本明細書でさらに具体化されるように、システム６８００は、例えば、試薬をバルク試薬保存領域６８３６から、例えば、増幅及び検出システム６８０７に移送するために使用することができる増幅試薬ピペッタ６８１５を含むことができる。追加的または代替的に、本明細書でさらに具体化されるように、システム６８００は、例えば、試薬をバルク試薬保存領域６８３６から、例えば、洗浄トラック６８０１に移送するために使用することができる試料／試薬ピペッタ６８１１を含むことができる。バルク試薬保存領域６８３６の位置及び構成及びバルク試薬保存領域６８３６内の試薬コンテナは、システムの所望の性能に基づいて選択することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、バルク試薬保存領域は、例えば試料調製試薬ピペッタ６８１７、増幅試薬ピペッタ６８１５、及び試料／試薬ピペッタ６８１１などの複数のロボットピペッタによる試薬アクセスを容易にするように構成することができる。追加的または代替的に、本明細書でさらに具体化されるように、バルク試薬保存領域６８３６は、例えば、ロボットピペッタによるバルク試薬保存領域からの試薬の移動を容易にするなど、例えば所望に応じて試薬を位置決めすることができる１つ以上のロボットを含むことができる。
７． 追加のスクリーニング、調製及び処理態様
上述のように、本明細書に記載の高スループットＮＡＴ（ＨＴＮＡＴ）システム及び方法は、追加のスクリーニング及び／または処理技術と併せて使用することができる。追加のスクリーニング及び／または処理技術の非限定的な例には、血清学的検査、代替核酸分析、及び病原体低減技術が含まれる。
７．１ 血清学的検査
ある特定の実施形態では、本明細書に記載される、試料をスクリーニングする方法、例えば、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関して血液試料をスクリーニングする方法は、試料、例えば、ドナー血液の試料内の病原体または感染因子を同定するためのＨＴＮＡＴスクリーニング及び血清学的検査を含み得る。ば例えば、限定するものではないが、本明細書に記載されるように、ＨＴＮＡＴ及び血清学的検査は、個々の試料またはプール試料に対して実行することができる。例えば、限定するものではないが、ＨＴＮＡＴはプール試料に対して実行することができ、血清学的検査は個々の試料に対して実行することができる。追加的または代替的に、ＨＴＮＡＴは個々の試料に対して実行でき、血清学的検査はプール試料に対して実行することができる。追加的または代替的に、ＨＴＮＡＴ検査及び血清学的検査は両方とも、それぞれ個々の試料またはプール試料に対して実行することができる。
ある特定の実施形態では、ＨＴＮＡＴは、試料、例えば、ドナー血液の試料中の１つ以上の病原体または感染因子を同定するために実行することができ、血清学的検査は、同じ試料、例えば、ドナー血液の同じ試料、または第２の試料、例えば同じドナーからの血液の第２の試料中の１つ以上の異なる病原体または感染因子を同定するために実行することができる。例えば、限定するものではないが、ＨＴＮＡＴは、試料、例えば、ドナー血液の試料中の１つ以上のウイルスを同定するために実行することができ、血清学的検査は、同じ試料、例えば、ドナー血液の同じ試料、または第２の試料、例えば同じドナーからの血液の第２の試料中の１つ以上の細菌を同定するために実行することができる。
７．２ 病原体低減技術（ＰＲＴ）
ある特定の実施形態では、本明細書に開示される試料、例えば血液試料をスクリーニングする方法は、病原体低減技術と組み合わせて実行することができる。限定ではなく例の目的で、本明細書に記載されるようにドナー試料に対して核酸分析を実行し、病原体または感染因子に由来する所定のレベルの核酸の不存在が決定された後、ドナーからの物質またはドナーからの血液は、病原体低減技術を使用して処理することができる。
当技術分野で公知の任意の病原体低減技術を、開示された主題とともに使用することができる。ある特定の実施形態では、病原体低減技術は、少なくとも１つの光増感剤を含むことができる。ある特定の実施形態では、病原体低減技術は、ドナー物質内に存在する核酸にインターカレートする薬剤であり得る。ある特定の実施形態では、病原体低減技術は、ドナー物質内に存在する核酸に二量体を生じさせる薬剤であり得る。例えば、限定するものではないが、アモトサレン及び／またはリボフラビンなどの化合物をドナー物質に加え、次いでドナー物質をＵＶ光、例えば、ＵＶＡまたはＵＶＡ／ＵＶＢに曝露することができ、これによりアモトサレンまたはリボフラビンが核酸に結合して、病原体の複製を防止することができる。ある特定の実施形態では、限定するものではないが、病原体低減技術は、アモトサレン及びＵＶＡを使用することができる。ある特定の実施形態では、病原体低減技術は、リボフラビン及びＵＶＡ／ＵＶＢを使用することができる。ある特定の実施形態では、病原体低減技術は、アムスタリン及びグルタチオンを使用することができる。ある特定の実施形態では、病原体低減技術は、メチレンブルー及び可視光を使用することができる。追加的または代替的に、病原体低減には、ドナー物質に光活性化合物を添加することなく、ドナー物質をＵＶ光、例えばＵＶＣに曝露することを含むことができる。ある特定の実施形態では、病原体低減には、ドナー物質を、溶媒及び／または界面活性剤、例えば、エーテル、アルコール、低沸点有機塩素化合物、アセトン及び／またはクロロホルムで処理することが含めることができる。
病原体低減技術のさらなる詳細及び説明は、Ｌｕ ａｎｄ Ｆｕｎｇ， Ｐｌａｔｅｌｅｔｓ ｔｒｅａｔｅｄ ｗｉｔｈ ｐａｔｈｏｇｅｎ ｒｅｄｕｃｔｉｏｎ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ： ｃｕｒｒｅｎｔ ｓｔａｔｕｓ ａｎｄ ｆｕｔｕｒｅ ｄｉｒｅｃｔｉｏｎ， Ｆ１０００ Ｆａｃｕｌｔｙ Ｒｅｖ－４０ （２０２０）に記載されており、その内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。病原体低減技術の追加の非限定的な例は、米国特許第６，９６９，３６７号に開示されており、その内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
病原体の低減は、広範囲のドナー物質に対して実行することができる。例えば、限定するものではないが、病原体低減は、全血、例えば、プールドナー全血または個々のドナー全血に対して使用することができる。ある特定の実施形態では、ドナー物質は、血漿、赤血球、血小板、及び／または血漿由来生成物であり得る。ある特定の実施形態では、病原体低減は、血漿、例えば、プールドナー血漿または個々のドナー血漿に対して使用され得る。ある特定の実施形態では、病原体低減は、限定するものではないが、凝固因子、例えば、第ＶＩＩＩ因子、フォン・ヴィレブランド因子、及びフィブリノーゲン；プロテアーゼ阻害剤、例えば、α１－アンチトリプシン及びＣ１－エステラーゼ阻害剤；アルブミン；免疫グロブリンＧ（ＩｇＧ）、を含む血漿由来生成物に対して使用することができる。
ある特定の実施形態では、臨床使用のためのドナー物質の出荷についてドナー血液の試料をスクリーニングする方法は、ドナー血液の試料の第１の部分に対して核酸分析を実行して、ドナー血液の試料中の病原体または感染因子を検出することを含むことができる。ある特定の実施形態では、核酸分析の結果が、ドナー物質を臨床使用のために出荷することができることを示している場合、ドナー物質を病原体低減技術で処理することができる。ある特定の実施形態では、ドナー物質を臨床使用のために出荷することができるという決定は、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の吸引から約１５分～約４５分、例えば約２０分～約４５分で行われる。ある特定の実施形態では、臨床使用のために出荷されたドナー物質は、核酸分析からの結果を受けてから約１分～約５日以内に病原体低減技術で処理される。ある特定の実施形態では、病原体低減技術を用いてドナー物質をどの程度迅速に処理できるかは、処理されるドナー物質のタイプに依存する。例えば、限定するものではないが、病原体低減技術は、血漿由来生成物の製造直後に実行することができる。
ある特定の実施形態では、ドナー血液の試料の核酸分析は、分散型の場所で実行することができ、病原体低減技術は、放出されたドナー物質を病原体低減技術により即時処理することが可能になるために、同じ場所、例えば物理的場所で実行することもできる。分散型の場所の非限定的な例としては、診療所、緊急治療施設、救急部門、及び試料収集場所などが挙げられる。
ある特定の実施形態では、本方法は、ドナー血液の試料中の１つ以上の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料の第２の部分に対してイムノアッセイを実行することをさらに含むことができる。例えば、限定するものではないが、核酸分析の前に、ドナー血液の試料の部分に対してイムノアッセイを実行する。あるいは、イムノアッセイの前に、ドナー血液の試料の部分に対して核酸分析を実行する。ある特定の実施形態では、核酸分析は、イムノアッセイと同時に実行する。ある特定の実施形態では、本開示の方法が病原体低減技術による処理を含む場合、この方法はイムノアッセイを実行することを含まない。
ある特定の実施形態では、ドナー物質を病原体低減技術で処理すると、ある特定の病原体をスクリーニングする必要性を排除することができる。例えば、限定するものではないが、病原体低減技術による処理を含む本開示の方法は、検査される試料中のジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア及び／またはＰｌａｓｍｏｄｉｕｍ ｆａｌｃｉｐａｒｕｍ（熱帯熱マラリア原虫） （マラリア）のスクリーニングを含まない。ある特定の実施形態では、病原体低減技術による処理を含む本開示の方法は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、コロナウイルス、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、ヒトＴリンパ指向性ウイルス（ＨＴＬＶ） パルボＢ１９ウイルス、ＨＡＶ、梅毒、クラミジア、淋菌、デング、チクングニア、ＷＮＶ、ＨＥＶ、クロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ）、及びそれらの組み合わせ、などの１つ以上の病原体の存在について試料、例えば血液試料をスクリーニングするために使用することができる。ある特定の実施形態では、病原体低減技術による処理を含む本開示の方法は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、クラミジア、淋菌、ＷＮＶ、ＨＥＶ、及びそれらの組み合わせ、などの１つ以上の病原体の存在について試料、例えば血液試料をスクリーニングするために使用することができる。
ある特定の実施形態では、ドナー物質を病原体低減技術で処理することにより、ドナー物質が、１つ以上の病原体または感染因子、例えば新規または新興の病原体または感染症を含み得るリスクを低減することができる。例えば、限定するものではないが、病原体低減技術によって不活化または低減させることができる病原体または感染因子は、本明細書に開示される方法を使用して検出できないレベルで試料中に存在する可能性がある。ある特定の実施形態では、病原体低減技術を、２つ以上の血液ドナー試料のプーリングを含む核酸分析と組み合わせて使用することができる。
８． 例示的な実施形態
Ａ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものであり、臨床使用のためのドナー物質の出荷は、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の最初の吸引から約１５分～約６０分で起こる、方法を提供する。
Ａ１． 臨床使用のためのドナー物質の出荷が、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の最初の吸引から約２０～約６０分で起こる、Ａに記載の方法。
Ａ２． 臨床使用のためのドナー物質の出荷が、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の最初の吸引から約２０分～約４５分で起こる、Ａ－Ａ１に記載の方法。
Ａ３． 核酸分析が、持続時間約１分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、Ａ～Ａ１に記載の方法。
Ａ４． 複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、結果が得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、Ａ～Ａ３に記載の方法。
Ａ５． 核酸分析を自動システムで実行し、自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、Ａ～Ａ４に記載の方法。
Ａ６． 核酸分析を自動システムで実行し、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、Ａ～Ａ５に記載の方法。
Ａ７． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質、ドナー血液、生体試料、または血漿が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質、ドナー血液、生体試料、または血漿が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、ウスツウイルス、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１３． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１５． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１６． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４６． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４７． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４８． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ４９． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５３． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５７． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５８． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ５９． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６３． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６５． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６６． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ９９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１００． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０１． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０３． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０６． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０７． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０８． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１０９． ドナー血液の試料が、全血である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１１０． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１１１． ドナー血液の試料が、血清である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１１２． ドナー血液の試料が、血漿である、Ａ～Ａ６に記載の方法。
Ａ１１３． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ａ～Ａ６及びＡ９～Ａ１１２に記載の方法。
Ａ１１４． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ａ～Ａ６及びＡ９～Ａ１１２に記載の方法。
Ａ１１５． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ａ～Ａ６及びＡ８～Ａ１１２に記載の方法。
Ａ１１６． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ａ～Ａ６及びＡ９～Ａ１１２に記載の方法。
Ａ１１７． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ａ～Ａ６及びＡ９～Ａ１１２に記載の方法。
Ａ１１８． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ａ～Ａ６及びＡ９～Ａ１１２に記載の方法。
Ａ１１８． 臨床使用が輸血である、Ａ～Ａ６、Ａ９～Ａ１１２及びＡ１１７に記載の方法。
Ａ１１９． 臨床使用が医薬品における使用である、Ａ～Ａ６、Ａ９～Ａ１１２及びＡ１１７に記載の方法。
Ａ１２０． 臨床使用が治療処置における使用である、Ａ～Ａ６、Ａ９～Ａ１１２及びＡ１１７に記載の方法。
Ａ１２１． 臨床使用が臓器または組織の提供である、Ａ～Ａ６、Ａ９～Ａ１１２及びＡ１１７に記載の方法。
Ａ１２２． 臨床使用が血漿由来生成物における使用である、Ａ～Ａ６、Ａ９～Ａ１１２及びＡ１１７に記載の方法。
Ａ１２３． 臨床使用が、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である、Ａ～Ａ６、Ａ９～Ａ１１２及びＡ１１８に記載の方法。
Ａ１２４． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ａ～Ａ１２３に記載の方法。
Ａ１２５． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ａ１２４に記載の方法。
Ａ１２６． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ａ１２５に記載の方法。
Ａ１２７． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ａ１２５に記載の方法。
Ａ１２８． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ａ～Ａ１２７に記載の方法。
Ａ１２９． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ａ～Ａ１２８に記載の方法。
Ａ１３０． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ａ～Ａ１２９に記載の方法。
Ａ１３１． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ａ１３０に記載の方法。
Ａ１３２． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ａ１３０及びＡ１３１に記載の方法。
Ｂ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものであり、臨床使用のためのドナー物質の出荷についてドナー血液の複数の試料をスクリーニングすることを含み、核酸分析に基づく決定を、核酸分析を実行するためのドナー血液の最初の試料の最初の吸引から約２０分～約３．５時間以内に実行する、方法を提供する。
Ｂ１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｂに記載の方法。
Ｂ２． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｂに記載の方法。
Ｂ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｂ～Ｂ２に記載の方法。
Ｂ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｂに記載の方法。
Ｂ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｂに記載の方法。
Ｂ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４３． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４５． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ５１． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ５２． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｂに記載の方法。
Ｂ５３． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｂに記載の方法。
Ｂ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ５７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ５９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｂに記載の方法。
Ｂ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｂに記載の方法。
Ｂ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１００． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１０１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｂに記載の方法。
Ｂ１０２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｂ～Ｂ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｂ１０３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｂ～Ｂ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｂ１０４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｂ～Ｂ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｂ１０５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｂ～Ｂ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｂ１０６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｂ～Ｂ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｂ１０７． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｂ及びＢ３～Ｂ１０６に記載の方法。
Ｂ１０８． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｂ及びＢ３～Ｂ１０６に記載の方法。
Ｂ１０９． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｂ及びＢ３～Ｂ１０６に記載の方法。
Ｂ１１０． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ｂ及びＢ３～Ｂ１０６に記載の方法。
Ｂ１１１． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｂ及びＢ３～Ｂ１０６に記載の方法。
Ｂ１１２． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｂ及びＢ３～Ｂ１０６に記載の方法。に記載の方法。
Ｂ１１３． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｂ～Ｂ１１２に記載の方法。
Ｂ１１４． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｂ１１３に記載の方法。
Ｂ１１５． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｂ１１４に記載の方法。
Ｂ１１６． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｂ１１４に記載の方法。
Ｂ１１７． 核酸分析が、例えば、増幅反応中の複数回の、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｂ～Ｂ１１６に記載の方法。
Ｂ１１８． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｂ～Ｂ１１６に記載の方法。
Ｂ１１９． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｂ～Ｂ１１８に記載の方法。
Ｂ１２０． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｂ１１７またはＢ１１９に記載の方法。
Ｂ１２１． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｂ１１７、Ｂ１１９、及びＢ１２０に記載の方法。
Ｃ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものであり、核酸分析は、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、方法を提供する。
Ｃ１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｃに記載の方法。
Ｃ２． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｃに記載の方法。
Ｃ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｃ～Ｃ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｃ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｃに記載の方法。
Ｃ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｃに記載の方法。
Ｃ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４３． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４５． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ５１． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ５２． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｃに記載の方法。
Ｃ５３． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｃに記載の方法。
Ｃ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ５７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ５９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｃに記載の方法。
Ｃ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｃに記載の方法。
Ｃ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１００． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１０１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｃに記載の方法。
Ｃ１０２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｃに記載の方法。
Ｃ１０３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｃに記載の方法。
Ｃ１０４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｃに記載の方法。
Ｃ１０５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｃに記載の方法。
Ｃ１０６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｃに記載の方法。
Ｃ１０７． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｃ及びＣ２～Ｃ１０６に記載の方法。
Ｃ１０８． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｃ及びＣ３～Ｃ１０６に記載の方法。
Ｃ１０９． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｃ及びＣ２～Ｃ１０６に記載の方法。
Ｃ１１０． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ｃ及びＣ２～Ｃ１０６に記載の方法。
Ｃ１１１． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｃ及びＣ２～Ｃ１０６に記載の方法。
Ｃ１１２． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｃ及びＣ２～Ｃ１０６に記載の方法。
Ｃ１１３． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｃ～Ｃ１１２に記載の方法。
Ｃ１１４． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｃ１１４に記載の方法。
Ｃ１１５． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｃ１１４に記載の方法。
Ｃ１１６． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｃ１１４に記載の方法。
Ｃ１１７． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｃ～Ｃ１１６に記載の方法。
Ｃ１１８． 核酸分析が、例えば、増幅反応中の複数回の、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｃ～Ｃ１１６に記載の方法。
Ｃ１１９． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｃ～Ｃ１１８に記載の方法。
Ｃ１２０． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｃ１１８またはＣ１１９に記載の方法。
Ｃ１２１． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｃ１１８、Ｃ１１９、及びＣ１２０に記載の方法。
Ｄ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものであり、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の最初の吸引から約２０～約４５分で完了する、方法を提供する。
Ｄ１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｄに記載の方法。
Ｄ２． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｄに記載の方法。
Ｄ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｄに記載の方法。
Ｄ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｄに記載の方法。
Ｄ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｄに記載の方法。
Ｄ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４３． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４５． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ５１． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ５２． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｄに記載の方法。
Ｄ５３． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｄに記載の方法。
Ｄ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ５７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ５９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｄに記載の方法。
Ｄ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｄに記載の方法。
Ｄ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１００． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１０１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｄに記載の方法。
Ｄ１０２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｄ～Ｄ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｄ１０３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｄ～Ｄ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｄ１０４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｄ～Ｄ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｄ１０５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｄ～Ｄ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｄ１０６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｄ～Ｄ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｄ１０７． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｄ及びＤ２～Ｄ１０６に記載の方法。
Ｄ１０８． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｄ及びＤ２～Ｄ１０６に記載の方法。
Ｄ１０９． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｄ及びＤ２～Ｄ１０６に記載の方法。
Ｄ１１０． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ｄ及びＤ２～Ｄ１０６に記載の方法。
Ｄ１１１． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｄ及びＤ２～Ｄ１０６に記載の方法。
Ｄ１１２． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｄ及びＤ２～Ｄ１０６に記載の方法。
Ｄ１１３． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｄ～Ｄ１１８に記載の方法。
Ｄ１１４． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｄ１１９に記載の方法。
Ｄ１１５． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｄ１２０に記載の方法。
Ｄ１１６． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｄ１２０に記載の方法。
Ｄ１１７． 核酸分析が、例えば、増幅反応中の複数回の、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｄ～Ｄ１１６に記載の方法。
Ｄ１１８． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｄ～Ｄ１１６に記載の方法。
Ｄ１１９． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｄ～Ｄ１１８に記載の方法。
Ｄ１２０． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｄ１１７またはＤ１１９に記載の方法。
Ｄ１２７． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｄ１１７、Ｄ１１９、またはＤ１１９に記載の方法。
Ｅ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものであり、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各測定は、結果が得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、方法を提供する。
Ｅ１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｅに記載の方法。
Ｅ２． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｅに記載の方法。
Ｅ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｅに記載の方法。
Ｅ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｅに記載の方法。
Ｅ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｅに記載の方法。
Ｅ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４３． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４５． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ５１． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ５２． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｅに記載の方法。
Ｅ５３． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｅに記載の方法。
Ｅ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ５７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ５９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｅに記載の方法。
Ｅ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｅに記載の方法。
Ｅ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１００． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１０１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｅに記載の方法。
Ｅ１０２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｅ～Ｅ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｅ１０３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｅ～Ｅ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｅ１０４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｅ～Ｅ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｅ１０５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｅ～Ｅ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｅ１０６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｅ～Ｅ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｅ１０７． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｅ及びＥ２～Ｅ１０６に記載の方法。
Ｅ１０８． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｅ及びＥ２～Ｅ１０６に記載の方法。
Ｅ１０９． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｅ及びＥ２～Ｅ１０６に記載の方法。
Ｅ１１０． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ｅ及びＥ２～Ｅ１０６に記載の方法。
Ｅ１１１． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｅ及びＥ２～Ｅ１０６に記載の方法。
Ｅ１１２． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｅ及びＥ２～Ｅ１０６に記載の方法。
Ｅ１１３． 臨床使用が、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である、Ｅ、Ｅ３～Ｅ１０６及びＥ１１２に記載の方法。
Ｅ１１４． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｅ～Ｅ１１３に記載の方法。
Ｅ１１５． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｅ１１４に記載の方法。
Ｅ１１６． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｅ１１５に記載の方法。
Ｅ１１７． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｅ１１５に記載の方法。
Ｅ１１８． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｅ～Ｅ１１７に記載の方法。
Ｅ１１９． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｅ～Ｅ１１７に記載の方法。
Ｅ１２０． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｅ～Ｅ１１９に記載の方法。
Ｅ１２１． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｅ１２０に記載の方法。
Ｅ１２２． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｅ１２０及びＥ１２１に記載の方法。
Ｆ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、自動システム上でドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものであり、自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、方法を提供する。
Ｆ１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｆに記載の方法。
Ｆ２． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｆに記載の方法。
Ｆ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｆ～Ｆ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｆ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｆに記載の方法。
Ｆ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｆに記載の方法。
Ｆ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４３． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４５． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ５１． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ５２． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｆに記載の方法。
Ｆ５３． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｆに記載の方法。
Ｆ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ５７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ５９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｆに記載の方法。
Ｆ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｆに記載の方法。
Ｆ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１００． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１０１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｆに記載の方法。
Ｆ１０２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｆに記載の方法。
Ｆ１０３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｆに記載の方法。
Ｆ１０４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｆに記載の方法。
Ｆ１０５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｆに記載の方法。
Ｆ１０６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｆに記載の方法。
Ｆ１０７． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｆ及びＦ２～Ｆ１０６に記載の方法。
Ｆ１０８． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｆ及びＦ２～Ｆ１０６に記載の方法。
Ｆ１０９． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｆ及びＦ２～Ｆ１０６に記載の方法。
Ｆ１１０． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ｆ及びＦ２～Ｆ１０６に記載の方法。
Ｆ１１１． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｆ及びＦ２～Ｆ１０６に記載の方法。
Ｆ１１２． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｆ及びＦ２～Ｆ１０６に記載の方法。
Ｆ１１３． 臨床使用が、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である、Ｆ及びＦ２～Ｆ１０６に記載の方法。
Ｆ１１４． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｆ～Ｆ１１３に記載の方法。
Ｆ１１５． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｆ１１４に記載の方法。
Ｆ１１６． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｆ１１５に記載の方法。
Ｆ１１７． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｆ１１５に記載の方法。
Ｆ１１８． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｆ～Ｆ１１７に記載の方法。
Ｆ１１９． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｆ～Ｆ１１７に記載の方法。
Ｆ１２０． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｆ～Ｆ１１９に記載の方法。
Ｆ１２１． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｆ１２０に記載の方法。
Ｆ１２７． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｆ１１９及びＦ１２０に記載の方法。
Ｇ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、自動システム上でドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものであり、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、自動システムを提供する。
Ｇ１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｇに記載の方法。
Ｇ２． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｇに記載の方法。
Ｇ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｇ～Ｇ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｇ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｇに記載の方法。
Ｇ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｇに記載の方法。
Ｇ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４３． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４５． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ５１． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ５２． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｇに記載の方法。
Ｇ５３． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｇに記載の方法。
Ｇ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ５７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ５９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｇに記載の方法。
Ｇ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｇに記載の方法。
Ｇ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１００． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１０１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｇに記載の方法。
Ｇ１０２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｇ～Ｇ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｇ１０３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｇ～Ｇ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｇ１０４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｇ～Ｇ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｇ１０５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｇ～Ｇ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｇ１０６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｇ～Ｇ１０１のいずれか１つに記載の方法。
Ｇ１０７． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｇ及びＧ２～Ｇ１０６に記載の方法。
Ｇ１０８． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｇ及びＧ２～Ｇ１０６に記載の方法。
Ｇ１０９． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｇ及びＧ２～Ｇ１０６に記載の方法。
Ｇ１１０． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ｇ及びＧ２～Ｇ１０６に記載の方法。
Ｇ１１１． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｇ及びＧ３～Ｇ１０６に記載の方法。
Ｇ１１２． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｇ及びＧ３～Ｇ１０６に記載の方法。
Ｇ１１３． 臨床使用が、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である、Ｇ及びＧ３～Ｇ１０６に記載の方法。
Ｇ１１４． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｇ～Ｇ１１４に記載の方法。
Ｇ１１５． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｇ１１５に記載の方法。
Ｇ１１６． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｇ１１６に記載の方法。
Ｇ１１７． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｇ１１６に記載の方法。
Ｇ１１８． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｇ～Ｇ１１７に記載の方法。
Ｇ１１９． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｇ～Ｇ１１７に記載の方法。
Ｇ１２０． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｇ～Ｇ１１９に記載の方法。
Ｇ１２１． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｇ１２０に記載の方法。
Ｇ１２２． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｇ１１９及びＧ１２０に記載の方法。
Ｈ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものであり、プール試料中に所定のレベルであるかまたはそれを超える複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、プール試料に含まれる個々のドナー血液またはそのサブプールの試料をスクリーニングすることであって、複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の試料に対して核酸分析を実行することを含み、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示すものである、スクリーニングすることをさらに含む、方法を提供する。
Ｈ１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｈに記載の方法。
Ｈ２． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｈに記載の方法。
Ｈ３． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｈ～Ｈ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｈ４． ドナー血液の試料が、全血である、Ｈ～Ｈ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｈ５． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｈ～Ｈ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｈ６． ドナー血液の試料が、血清である、Ｈ～Ｈ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｈ７． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｈ～Ｈ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｈ８． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｈ及びＨ２～Ｈ７に記載の方法。
Ｈ９． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｈ及びＨ２～Ｈ７に記載の方法。
Ｈ１０． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｈ及びＨ２～Ｈ７に記載の方法。
Ｈ１１． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ｈ及びＨ２～Ｈ７に記載の方法。
Ｈ１２． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｈ及びＨ２～Ｈ７に記載の方法。
Ｈ１３． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｈ及びＨ２～Ｈ７に記載の方法。
Ｈ１９． 臨床使用が、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である、Ｈ及びＨ２～Ｈ７のいずれか１つに記載の方法。
Ｈ２０． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｈ～Ｈ１９に記載の方法。
Ｈ２１． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｈ２０に記載の方法。
Ｈ２２． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｈ２１に記載の方法。
Ｈ２３． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｈ２１に記載の方法。
Ｈ２４． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｈ～Ｈ２３に記載の方法。
Ｈ２５． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｈ～Ｈ２４に記載の方法。
Ｈ２６． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｈ～Ｈ２５に記載の方法。
Ｈ２７． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｈ２６に記載の方法。
Ｈ２８． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｈ２６及びＨ２７に記載の方法。
Ｉ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液に関連する試料をスクリーニングする方法であって、ある体積の溶出液中に試料から単離された核酸を提供することを含む試料調製プロセス；前記体積の溶出液を少なくとも２つの増幅容器に分注すること；少なくとも２つの増幅容器内の溶出液に対して増幅プロセスを実行すること；及び１つ以上の病原体または感染因子に由来する核酸が溶出液中に存在するかどうかを検出するための検出プロセスを実行すること、を含む、試料に対して核酸分析を実行すること、を含む、方法を提供する。
Ｉ１． 検出プロセスが、複数の病原体または感染因子に由来する核酸が溶出液中に存在するか存在しないかを検出することを含む、Ｉの方法。
Ｉ２． 分注することが、前記体積の溶出液を少なくとも３つ、４つ、またはそれ以上の増幅容器に分注すること：増幅容器内の溶出液を核酸増幅反応に供すること；及び病原体または感染因子に存在する核酸が溶出液中に存在するかどうかを検出すること、を含む、Ｉ～Ｉ１に記載の方法。
Ｉ３． 等しい体積の溶出液を、増幅容器に分注する、Ｉ～Ｉ２に記載の方法。
Ｉ４． 異なる体積の溶出液を、増幅容器に分注する、Ｉ～Ｉ２に記載の方法。
Ｉ５． 各増幅容器における増幅反応が、異なる病原体または感染因子に存在する核酸を増幅するためのものである、Ｉ～Ｉ４に記載の方法。
Ｉ６． 各増幅容器における増幅反応は、複数の異なる病原体または感染因子に存在する核酸を増幅するためのものであるＩ～Ｉ５に記載の方法。
Ｉ７． 核酸増幅反応が、等温反応を含む、Ｉ～Ｉ６に記載の方法。
Ｉ８． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｉ７に記載の方法。
Ｉ９． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｉ７に記載の方法。
Ｉ１０． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｉ及びＩ１～Ｉ９のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質、ドナー血液、生体試料、または血漿が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｉ及びＩ１～Ｉ９のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ４９． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ５９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６０． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６２． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ６９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ９９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１００． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１０９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｉ～Ｉ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１１． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｉ～Ｉ１１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｉ～Ｉ１１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｉ～Ｉ１１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｉ～Ｉ１１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｉ～Ｉ１１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｉ～Ｉ１１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１７． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｉ～Ｉ１１７のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１８． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｉ～Ｉ１１７のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１１９． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｉ～Ｉ１１７のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１２０． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｉ～Ｉ１１７のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１２１． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｉ～Ｉ１１７のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１２７． 臨床使用が、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である、Ｉ～Ｉ１１７のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１２８． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｉ～Ｉ１２７のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１２９． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｉ１２８に記載の方法。
Ｉ１３０． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｉ１２９に記載の方法。
Ｉ１３１． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｉ１２９に記載の方法。
Ｉ１３２． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｉ～Ｉ１３１のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１３３． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｉ～Ｉ１３２のいずれか１つに記載の方法。
Ｉ１３４． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｉ～Ｉ１３３に記載の方法。
Ｉ１３５． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｉ１３４に記載の方法。
Ｉ１３６． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｉ１３４及びＩ１３５に記載の方法。
Ｊ．本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む試料に対して核酸分析を実行すること；核酸分析の結果を決定すること；ならびに核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、輸血のためのドナー血液の出荷は、核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約１５分～約６０分で起こる、方法を提供する。
Ｊ１． 核酸分析が、持続時間約１分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、Ｊに記載の方法。
Ｊ１－１． 輸血のためのドナー物質の出荷が、核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約２０分～約６０分で起こる、Ｊに記載の方法。
Ｊ２． 核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約１５～約４５分で結果が完了する、Ｊ、Ｊ１－１、またはＪ１に記載の方法。
Ｊ３． 各結果は、得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、Ｊ～Ｊ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ４． 核酸分析を自動システムで実行し、自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、Ｊ～Ｊ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ５． 核酸分析を自動システムで実行し、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、Ｊ～Ｊ４のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ６． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定を含む、Ｊ～Ｊ５のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１１． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１３． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１４． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４４． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４５． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４６． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４７． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ４９． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５１． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５３． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５５． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５６． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５７． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ５９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６１． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６３． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６４． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１００． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１０１． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１０２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１０３． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１０４． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１０５． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｊ６に記載の方法。
Ｊ１０６． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｊ～Ｊ５に記載の方法。
Ｊ１０７． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｊ～Ｊ１０６のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ１０８． ドナー血液の試料が、全血である、Ｊ～Ｊ１０６のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ１０９． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｊ～Ｊ１０６のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ１１０． ドナー血液の試料が、血清である、Ｊ～Ｊ１０６のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ１１１． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｊ～Ｊ１０６のいずれか１つに記載の方法。
Ｊ１１２． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｊ～Ｊ１１１に記載の方法。
Ｊ１１３． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｊ１１２に記載の方法。
Ｊ１１４． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｊ１１３に記載の方法。
Ｊ１１５． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｊ１１３に記載の方法。
Ｊ１１６． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｊ～Ｊ１１５に記載の方法。
Ｊ１１７． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｊ～Ｊ１１６に記載の方法。
Ｊ１１８． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｊ～Ｊ１１７に記載の方法。
Ｊ１１９． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｊ１１８に記載の方法。
Ｊ１２０． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｊ１１８及びＪ１１９に記載の方法。
Ｋ．本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む試料に対して核酸分析を実行すること；核酸分析の結果を決定すること；及び核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、核酸分析に基づく決定を、核酸分析を実行するための最初の試料の最初の吸引から約２０分～約３．５時間以内に実行する、方法を提供する。
Ｋ１． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定を含む、Ｋに記載の方法。
Ｋ２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、ＫまたはＫ１に記載の方法。
Ｋ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ３９． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４４． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５０． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５２． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ５９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ９９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１００． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｋ１に記載の方法。
Ｋ１０１． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｋ～Ｋ１００のいずれか１つに記載の方法。
Ｋ１０２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｋ～Ｋ１００のいずれか１つに記載の方法。
Ｋ１０３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｋ～Ｋ１００のいずれか１つに記載の方法。
Ｋ１０４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｋ～Ｋ１００のいずれか１つに記載の方法。
Ｋ１０５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｋ～Ｋ１００のいずれか１つに記載の方法。
Ｋ１０６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｋ～Ｋ１００のいずれか１つに記載の方法。
Ｋ１０７． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｋ～Ｋ１０６に記載の方法。
Ｋ１０８． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｋ１０７に記載の方法。
Ｋ１０９． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｋ１０８に記載の方法。
Ｋ１１０． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｋ１０８に記載の方法。
Ｋ１１１． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｋ～Ｋ１１０に記載の方法。
Ｋ１１２． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｋ～Ｋ１１１に記載の方法。
Ｋ１１３． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｋ～Ｋ１１２に記載の方法。
Ｋ１１４． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｋ１１３に記載の方法。
Ｋ１１５． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｋ１１３及びＫ１１４に記載の方法。
Ｌ．本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む試料に対して核酸分析を実行すること；核酸分析の結果を決定すること；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、核酸分析は、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、方法を提供する。
Ｌ１． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定を含む、Ｌに記載の方法。
Ｌ２． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｌ１に記載の方法。
Ｌ３． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｌ１に記載の方法。
Ｌ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４４． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５１． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５２． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５３． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５４． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５８． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ５９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６０． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１００． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０１． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０２． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｌ１～Ｌ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０３． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｌ～Ｌ１０２のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０４． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｌ～Ｌ１０２のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０５． ドナー血液の試料が、全血である、Ｌ～Ｌ１０２のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０６． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｌ～Ｌ１０２のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０７． ドナー血液の試料が、血清である、Ｌ～Ｌ１０２のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０８． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｌ～Ｌ１０２のいずれか１つに記載の方法。
Ｌ１０９． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｌ～Ｌ１０８に記載の方法。
Ｌ１１０． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｌ１０９に記載の方法。
Ｌ１１１． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｌ１１０に記載の方法。
Ｌ１１２． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｌ１１０に記載の方法。
Ｌ１１３． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｌ～Ｌ１１２に記載の方法。
Ｌ１１４． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｌ～Ｌ１１３に記載の方法。
Ｌ１１５． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｌ～Ｌ１１４に記載の方法。
Ｌ１１６． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｌ１１５に記載の方法。
Ｌ１１７． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｌ１１５及びＬ１１６に記載の方法。
Ｍ．本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む試料に対して核酸分析を実行すること；核酸分析の結果を決定すること；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、各結果には、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定が含まれ、各決定は、核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約２０分～約４５分で完了する、方法を提供する。
Ｍ１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｍに記載の方法。
Ｍ２． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｍに記載の方法。
Ｍ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｍ～Ｍ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｍ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｍ～Ｍ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｍ５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｍに記載の方法。
Ｍ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｍに記載の方法。
Ｍ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４３． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４５． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ５０． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ５１． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ５２． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｍに記載の方法。
Ｍ５３． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｍに記載の方法。
Ｍ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ５７． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ５９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｍに記載の方法。
Ｍ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｍに記載の方法。
Ｍ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ９９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１００． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１０１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｍに記載の方法。
Ｍ１０２． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｍに記載の方法。
Ｍ１０３． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｍ１０２に記載の方法。
Ｍ１０４． ドナー血液の試料が、全血である、Ｍ１０２に記載の方法。
Ｍ１０５． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｍ１０２に記載の方法。
Ｍ１０６． ドナー血液の試料が、血清である、Ｍ１０２に記載の方法。
Ｍ１０７． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｍ１０２に記載の方法。
Ｍ１０８． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｍ～Ｍ１０７のいずれか１つに記載の方法。
Ｍ１０９． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｍ１０８に記載の方法。
Ｍ１１０． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｍ１０９に記載の方法。
Ｍ１１１． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｍ１０９に記載の方法。
Ｍ１１２． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｍ～Ｍ１１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｍ１１３． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｍ～Ｍ１１２のいずれか１つに記載の方法。
Ｍ１１４． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｍ～Ｍ１１３に記載の方法。
Ｍ１１５． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｍ１１４に記載の方法。
Ｍ１１６． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｍ１１４及びＭ１１５に記載の方法。
Ｎ．本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む試料に対して核酸分析を実行すること；核酸分析の結果を決定すること；核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、各結果には、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定が含まれ、各決定は、結果が得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、方法を提供する。
Ｎ１． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｎに記載の方法。
Ｎ２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｎ１に記載の方法。
Ｎ３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｎ１に記載の方法。
Ｎ４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｎ１に記載の方法。
Ｎ５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｎ１に記載の方法。
Ｎ６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｎ１に記載の方法。
Ｎ７． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｎ～Ｎ６に記載の方法。
Ｎ８． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｎ７に記載の方法。
Ｎ９． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｎ８に記載の方法。
Ｎ１０． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｎ８に記載の方法。
Ｎ１１． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｎ～Ｎ１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｎ１２． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｎ～Ｎ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｎ１３． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｎ～Ｎ１２に記載の方法。
Ｎ１４． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｎ１３に記載の方法。
Ｎ１５． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｎ１３及びＮ１４に記載の方法。
Ｏ．本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、自動システム上で試料に対して核酸分析を実行すること；試料の核酸分析それぞれの結果を決定することと；及び、核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、方法を提供する。
Ｏ１． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの核酸の存在または非存在の決定を含む、Ｏに記載の方法。
Ｏ１－１． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定を含む、Ｏに記載の方法。
Ｏ２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツ、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ３９． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４１． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４４． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ４９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５０． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５２． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ５９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ９９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１００． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｏ１に記載の方法。
Ｏ１０１． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｏ～Ｏ１００のいずれか１つに記載の方法。
Ｏ１０２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｏ１０１に記載の方法。
Ｏ１０３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｏ１０１に記載の方法。
Ｏ１０４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｏ１０１に記載の方法。
Ｏ１０５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｏ１０１に記載の方法。
Ｏ１０６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｏ１０１に記載の方法。
Ｏ１０７． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｏ～Ｏ１０６に記載の方法。
Ｏ１０８． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｏ１０７に記載の方法。
Ｏ１０９． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｏ１０８に記載の方法。
Ｏ１１０． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｏ１０８に記載の方法。
Ｏ１１１． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｏ～Ｏ１１０に記載の方法。
Ｏ１１２． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｏ～Ｏ１１１に記載の方法。
Ｏ１１３． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｏ～Ｏ１１２に記載の方法。
Ｏ１１３－１． 前記光学検出が、増幅反応中に、所定の間隔で複数回シグナルを光学的に検出することを含む、Ｏ１１１に記載の方法。
Ｏ１１４． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｏ１１３またはＯ１１３－１に記載の方法。
Ｏ１１５． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｏ１１３、Ｏ１１３－１、及びＯ１１４に記載の方法。
Ｏ１１６． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約２０分間にわたって行われる、Ｏ１１３、Ｏ１１３－１、及びＯ１１４に記載の方法。
Ｏ１１７． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１分間にわたって行われる、Ｏ１１３、Ｏ１１３－１、及びＯ１１４に記載の方法。
Ｏ１１８． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約５分間にわたって行われる、Ｏ１１３、Ｏ１１３－１、及びＯ１１４に記載の方法。
Ｏ．本開示は、複数の試料をスクリーニングして、試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、自動システム上で試料に対して核酸分析を実行すること；試料の核酸分析それぞれの結果を決定することと；及び、核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、方法を提供する。
Ｐ１． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在または非存在を含む、Ｐに記載の方法。
Ｐ１－１． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定を含む、Ｐに記載の方法。
Ｐ２． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｐ～Ｐ１－１のいずれか１つに記載の方法。
Ｐ３． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｐ２に記載の方法。
Ｐ４． ドナー血液の試料が、全血である、Ｐ２に記載の方法。
Ｐ５． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｐ２に記載の方法。
Ｐ６． ドナー血液の試料が、血清である、Ｐ２に記載の方法。
Ｐ７． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｐ２に記載の方法。
Ｐ８． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｐ～Ｐ７に記載の方法。
Ｐ９． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｐ８に記載の方法。
Ｐ１０． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｐ９に記載の方法。
Ｐ１１． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｐ９に記載の方法。
Ｐ１２． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｐ～Ｐ１１に記載の方法。
Ｐ１３． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｐ～Ｐ１２に記載の方法。
Ｐ１４． 前記光学検出が、増幅反応中に、所定の間隔で複数回シグナルを光学的に検出することを含む、Ｐ～Ｐ１３に記載の方法。
Ｐ１４－１． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｐ～Ｐ１３に記載の方法。
Ｐ１５． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｐ１４またはＰ１４－１に記載の方法。
Ｐ１６． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｐ１４、Ｐ１４－１、及びＰ１５に記載の方法。
Ｐ１７． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約２０分間にわたって行われる、Ｐ１４、Ｐ１４－１、及びＰ１５に記載の方法。
Ｐ１８． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１分間にわたって行われる、Ｐ１４、Ｐ１４－１、及びＰ１５に記載の方法。
Ｐ１９． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約５分間にわたって行われる、Ｐ１４、Ｐ１４－１、及びＰ１５に記載の方法。
Ｑ．本開示は、試料中の病原体または感染因子に由来する標的核酸を検出するための方法であって、ａ）増幅反応のために試料から核酸を調製することを含む試料調製プロセス；ｂ）増幅反応により標的核酸を増幅することを含む増幅プロセス；及びｃ）反応において増幅された標的核酸の存在または非存在を検出することを含む検出プロセス、を含み、試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスは、核酸分析のための試料の最初の吸引から約６０分未満で完了する、自動システム上で核酸分析を実行することを含む、方法を提供する。
Ｑ１． 複数の試料中の病原体または感染因子に由来する標的核酸を検出するための方法であって、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、Ｑに記載の方法。
Ｑ２． 自動システムの設置面積１ｍ２あたり、１時間当たり約１４０～３００の間の結果が得られる、Ｑ～Ｑ１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３． 自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、Ｑ～Ｑ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４． 標的核酸の存在または非存在を決定することが、増幅反応中に複数回、標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｑ～Ｑ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５． 標的核酸の存在または非存在を検出することが、標的核酸の量を決定することを含む、Ｑ～Ｑ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６． 量を決定することは、増幅反応中に複数回、標的核酸の量に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｑ５に記載の方法。
Ｑ７． 複数回が、約１２秒ごと、約２０秒ごと、約３０秒ごと、または約４８秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｑ４及びＱ６のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｑ４、Ｑ６、及びＱ７のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９． 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関して試料をスクリーニングするためのものである、Ｑ～Ｑ８のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０． 試料が、ドナー血液に関連する試料である、Ｑ～Ｑ９のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１． 試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスが、約１５分～約６０分で完了する、Ｑ～Ｑ１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１２． 試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスが、約２０分～約６０分で完了する、Ｑ～Ｑ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１３． 標的核酸が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、クラミジア、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、インフルエンザ、バベシア、マラリア、ウスツウイルス及びＨＥＶ、のうちの少なくとも１つに由来する核酸を含む、Ｑ～Ｑ１２のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１４． 標的核酸が、複数の病原体または感染因子に由来する核酸を含む、Ｑ～Ｑ１３のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、クラミジア、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、インフルエンザ、バベシア、マラリア、ウスツウイルス及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｑ１４に記載の方法。
Ｑ１６． 臨床使用のためのドナー物質の出荷が、核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約１５～約６０分で起こる、Ｑ９に記載の方法。
Ｑ１７． 臨床使用のためのドナー物質の出荷が、核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約２０～約４５分で起こる、Ｑ９に記載の方法。
Ｑ１８． 増幅及び検出プロセスが、核酸増幅及び検出プロセスの組み合わせであり、核酸増幅及び検出プロセスは、約１分～約２０分の持続時間を有する、Ｑ～Ｑ１７に記載の方法。
Ｑ１９． 標的核酸の存在または非存在を検出することが、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上に由来する所定のレベルの核酸の決定を含む、Ｑ～Ｑ１８に記載の方法。
Ｑ２０． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、ドナー物質、ドナー血液、生体試料、またはドナー血漿が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２１． 所定のレベル未満のレベルの決定が、ドナー物質、ドナー血液、生体試料、または血漿が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ２９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ４９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ５９． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ６９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７０． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７２． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ７９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ９９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１００． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１０９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルは、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１１９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１２０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｑ１４～Ｑ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１２１． 試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、Ｑ～Ｑ１２０に記載の方法。
Ｑ１２２． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｑ１２１に記載の方法。
Ｑ１２３． ドナー血液の試料が、全血である、Ｑ１２１に記載の方法。
Ｑ１２４． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｑ１２１に記載の方法。
Ｑ１２５． ドナー血液の試料が、血清である、Ｑ１２１に記載の方法。
Ｑ１２６． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｑ１２１に記載の方法。
Ｑ１２７． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｑ１９及びＱ２２～Ｑ１２６のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１２８． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｑ１９及びＱ２２～Ｑ１２６のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１２９． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｑ１９及びＱ２２～Ｑ１２６のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１３０． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｑ６、Ｑ１１～Ｑ１９、及びＱ２２～Ｑ１２６のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１３１． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｑ６、Ｑ１１～Ｑ１９、及びＱ２２～Ｑ１２６に記載の方法。
Ｑ１３２． 臨床使用が輸血である、Ｑ６、Ｑ１１～Ｑ１９、Ｑ２２～Ｑ１２６及びＱ１３０に記載の方法。
Ｑ１３３． 臨床使用が医薬品における使用である、Ｑ６、Ｑ１１～Ｑ１９、Ｑ２２～Ｑ１２６及びＱ１３０に記載の方法。
Ｑ１３４． 臨床使用が治療的処置における使用である、Ｑ６、Ｑ１１～Ｑ１９、Ｑ２２～Ｑ１２６及びＱ１３０のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１３５． 臨床使用が臓器または組織の提供である、Ｑ６、Ｑ１１～Ｑ１９、Ｑ２２～Ｑ１２６及びＱ１３０のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１３６． 臨床使用が血漿由来生成物における使用である、Ｑ６、Ｑ１１～Ｑ１９、Ｑ２２～Ｑ１２６及びＱ１３０のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１３７． 臨床使用が、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である、Ｑ６、Ｑ１１～Ｑ１９、Ｑ２２～Ｑ１２６及びＱ１３１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１３８． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｑ～Ｑ１３７のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１３９． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｑ１３８に記載の方法。
Ｑ１４０． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｑ１３９に記載の方法。
Ｑ１４１． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｑ１３９に記載の方法。
Ｑ１４２． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｑ～Ｑ１４１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１４３． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｑ～Ｑ１４２のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１４４． 光学検出が、増幅反応中に標的核酸に対応する蛍光シグナルを複数回検出することを含む、Ｑ１４３に記載の方法。
Ｑ１４４． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｑ～Ｑ１４３に記載の方法。
Ｑ１４５． 複数回が、約１２秒ごと、約２０秒ごと、約３０秒ごと、または約４８秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｑ１４４またはＱ１４４－１のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１４６． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｑ１４４、Ｑ１４４－１、及びＱ１４５のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１４７． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１分間にわたって行われる、Ｑ１４４、Ｑ１４４－１、及びＱ１４５のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１４８． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約５分間にわたって行われる、Ｑ１４４、Ｑ１４４－１、及びＱ１４５のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１４６． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約２０分間にわたって行われる、Ｑ１４４、Ｑ１４４－１、及びＱ１４５のいずれか１つに記載の方法。
Ｑ１４７． 増幅プロセス及び検出プロセスが、増幅及び検出プロセスの組み合わせである、Ｑ～Ｑ１４６のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ．本開示は、血漿由来生成物を生成するための方法であって、ａ）試料調製プロセス及び増幅プロセスを含むドナー血漿試料に対して核酸分析を実行すること；ｂ）核酸分析の結果を決定すること；及びｃ）核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血漿試料に関連する血漿が血漿由来生成物の生成に許容されるかどうかを決定すること、を含み、血漿由来生成物を生成するための血漿の放出は、核酸分析を実行するためのドナー血漿試料の最初の吸引から約１５分～約６０分で起こる、方法を提供する。
Ｒ１． 臨床使用のための血漿の放出が、核酸分析の実行のためのドナー血漿試料の最初の吸引から約２０～約６０分で起こる、Ｒに記載の方法。
Ｒ２． 臨床使用のための血漿の放出が、核酸分析の実行のためのドナー血漿試料の最初の吸引から約２０～約４５分で起こる、Ｒに記載の方法。
Ｒ３． 核酸分析が、持続時間約１分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、Ｒ～Ｒ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ４． 核酸分析からの各結果は、得られるまでの時間が約２０～約４５分である、Ｒ～Ｒ３のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ５． 核酸分析を自動システムで実行し、自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、Ｒ～Ｒ４のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ６． 核酸分析を自動システムで実行し、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、Ｒ～Ｒ５のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ７． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの核酸の存在または非存在の決定を含む、Ｒ～Ｒ６のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ７－１． 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定を含む、Ｒ～Ｒ６のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ＨＥＶ、ウスツウイルス、及びそれらの組み合わせ、からなる群から選択される、Ｒ７またはＲ７－１に記載の方法。
Ｒ９． 血漿由来生成物が、凝固因子、プロテアーゼ阻害剤、アルブミン、免疫グロブリンＧ（ＩｇＧ）及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、Ｒ～Ｒ８のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ１０． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、血漿が臨床使用のために出荷されていないことを示す、Ｒ７－１に記載の方法。
Ｒ１１． 所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、血漿が臨床使用のために出荷されていることを示す、Ｒ７－１に記載の方法。
Ｒ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｒ８～Ｒ１２のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ３９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４１ 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ４９． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５１ 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５２． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５４． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ５９． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６０． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６１． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６２． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６６． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６８． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ６９． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ９９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１００． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０７ 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１０９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１１０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｒ８に記載の方法。
Ｒ１１１． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｒ～Ｒ１１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ１１２． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｒ１１１に記載の方法。
Ｒ１１３． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｒ１１２に記載の方法。
Ｒ１１３． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｒ１１２に記載の方法。
Ｒ１１４． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｒ～Ｒ１１３のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ１１５． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｒ～Ｒ１１４のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ１１６． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｒ～Ｒ１１５のいずれか１つに記載の方法。
Ｒ１１７． 複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出が、増幅反応中に複数回、標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｒ１１４に記載の方法。
Ｒ１１８． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｒ１１６またはＲ１１７に記載の方法。
Ｒ１１９． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｒ１１６、Ｒ１１７またはＲ１１８に記載の方法。
Ｒ１２０． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１分間にわたって行われる、Ｒ１１６、Ｒ１１７またはＲ１１８に記載の方法。
Ｒ１２１． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約５分間にわたって行われる、Ｒ１１６、Ｒ１１７またはＲ１１８に記載の方法。
Ｒ１２２． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約２０分間にわたって行われる、Ｒ１１６、Ｒ１１７またはＲ１１８に記載の方法。
Ｒ１２４． 複数回が、約４８秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｒ１１６またはＲ１１７に記載の方法。
Ｓ．本開示は、核酸分析のための洗浄プロセスを実行する方法であって、第１のウェル、第１のウェルに隣接する第２のウェル、及び第２のウェルに隣接する第３のウェルを含む洗浄容器を提供することであって、ここで、第１の側壁は、第１、第２、及び第３のウェルの第１の側面を画定し、第１の側壁の反対側にある第２の側壁は、第１、第２、及び第３のウェルの第２の側面を画定し、第１及び第２の側壁は、第１、第２、及び第３のウェルに面する内面と、内面の反対側の外面とを含み、第１の仕切りは、第１のウェルと第２のウェルを分離し、第１の側壁は第１の仕切りよりも高く、第１の側壁の内面は、少なくとも第１のウェルと第２のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第２の仕切りは、第２のウェルと第３のウェルを分離し、第２の側壁の内面は、少なくとも第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面である、提供することと、試料由来の核酸が結合した磁性微粒子を第１のウェルに導入することであって、ここで、第１のウェルは洗浄溶液を含む、導入することと、磁力を加えて第１のウェル中の第１の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することと；捕捉された磁性微粒子を、第１の仕切りを越えて第１のウェルから第１の側壁の内側平面に沿って第２のウェルまで平行移動させることであって、ここで、第２のウェルは洗浄溶液を含む、平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を内面から第２のウェル内に放出させることと；磁力を加えて、第１の側壁の反対側の第２の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することとであって、ここで、第２の側壁は第２の仕切りよりも高い、捕捉することと、捕捉された磁性微粒子を、第２の仕切り越えて第２のウェルから第２の側壁の内側平面に沿って第３のウェルまで平行移動させることであって、ここで、第３のウェルは洗浄溶液または溶出溶液を含む、平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を第２の側壁の内面から第３のウェル内に放出させることと、を含む、方法を提供する。
Ｓ１． 第３のウェルが溶出溶液を含み、第３のウェル内の磁性微粒子に磁力を加えて第１の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することと、溶出溶液を除去することとをさらに含む、Ｓに記載の方法。
Ｓ２． 洗浄容器が第４のウェルを含み、ここで、第３のウェルは洗浄溶液を含み、第４のウェルは溶出溶液を含み、第３及び第４のウェルを、第３の仕切りによって分離する、Ｓに記載の方法。
Ｓ３． 第１及び第２の側壁は、第１、第２、第３及び第４のウェルに沿って延びており、ウェルの対向側面を画定し、第１及び第２の側壁の内面はウェルに面しており、第１の側壁の内面は、第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、第３のウェルと第４ウェルとの間に延びる領域では平面であり、第２の側壁の内面は、第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、平面領域は、捕捉された磁性微粒子が内面を横断して平行移動するのに役立ち、非平面領域では、捕捉された磁性微粒子が内面を横断して平行移動することはできない、Ｓ２に記載の方法
Ｓ４． 磁力を加えて、第１の側壁の内面上に第３のウェル内の磁性粒子を捕捉することであって、ここで、第１の側壁は第３の仕切りよりも高い、捕捉することと；捕捉された磁性微粒子を、第３の仕切りを越えて第３のウェルから第１の側壁の内側平面に沿って第４のウェルまで平行移動させることと；磁力を除去し、磁性微粒子を第１の側壁の内面から第４のウェル内に放出させることと、をさらに含む、Ｓ３に記載の方法。
Ｓ５． 第３のウェルが洗浄溶液を含み、第４のウェルは溶出溶液を含み、第４のウェル内の磁性微粒子に磁力を加えて第２の側壁の内面上に磁性微粒子を捕捉することと、溶出溶液を除去することとをさらに含む、Ｓ４に記載の方法。
Ｓ６． 磁力を、電磁石を使用して生成する、Ｓ～Ｓ５に記載の方法。
Ｓ７． 電磁石が第１及び第２の側壁の外面に沿って配置され、捕捉された磁性微粒子を平行移動させることは、電磁石の異なる領域を連続的に活性化及び非活性化することを含む、Ｓ６に記載の方法。
Ｓ８． 磁力を、永久磁石を使用して生成する、Ｓ～Ｓ５に記載の方法。
Ｓ９． 捕捉された磁性微粒子を平行移動させることが、第１または第２の側壁の外面に沿って永久磁石を移動させることを含む、Ｓ８に記載の方法。
Ｓ１０． 非平面の内面が、内面にノッチを備え、ノッチが内面から外に延びているか、または内面内で延びている、Ｓ８に記載の方法。
Ｓ１１． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｓ～Ｓ１０のいずれか１つに記載の方法。
Ｓ１２． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｓ１１に記載の方法。
Ｓ１３． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｓ１２に記載の方法。
Ｓ１４． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｓ１２に記載の方法。
Ｓ１５． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｓ～Ｓ１４のいずれか１つに記載の方法。
Ｓ１６． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｓ～Ｓ１５のいずれか１つに記載の方法。
Ｓ１７． 複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出が、増幅反応中に複数回、標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｓ１５に記載の方法。
Ｓ１８． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｓ～Ｓ１６のいずれか１つに記載の方法。
Ｓ１９． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｓ１７またはＳ１８に記載の方法。
Ｓ１９． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｓ１７～Ｓ１９のいずれか１つに記載の方法。
Ｓ２０． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１分間にわたって行われる、Ｓ１７～Ｓ１９のいずれか１つに記載の方法。
Ｓ２１． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約５分間にわたって行われる、Ｓ１７～Ｓ１９のいずれか１つに記載の方法。
Ｓ２２． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約２０分間にわたって行われる、Ｓ１７～Ｓ１９のいずれか１つに記載の方法。
Ｓ２４． 複数回が、約４８秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｓ１７～Ｓ１９のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ．本開示は、１つ以上の病原体または感染因子を検出するために、試料に対して核酸分析を実行するための方法であって、試料調製プロセス、増幅プロセス、及び試料中の１つ以上の病原体または感染因子を検出するための検出プロセスを実行することを含み、ここで、試料調製プロセスは、試料文中位置から試料捕捉及び移送位置まで搬送経路に沿って試料搬送機上の容器内の試料及び１つ以上の試薬を搬送すること、ならびに試料搬送機を連続的に振動させて容器内の試料と１つ以上の試薬を混合すること、を含み、振動のたびに容器が円弧状に移動する、方法を提供する。
Ｔ１． 試料搬送機が、蛇行経路、カルーセル、コンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、またはベルトを含む、Ｔに記載の方法。
Ｔ２． 試料搬送機を連続的に振動させることが、試料搬送機を時計回りに約１度～約５度の間で連続的に移動させ、続いて試料搬送機を反時計回りに約１度～約５度の間で移動させることを含む、Ｔ～Ｔ１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３． 容器内で試料と１つ以上の試薬を混合することが、容器の内容物内に渦を形成するステップを含む、Ｔ～Ｔ２のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４． 渦が、約１秒～約２秒で形成される、Ｔ３の方法。
Ｔ５． 容器が約０．５度～約１．５度の間の抜き勾配を有する、Ｔ～Ｔ４のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ６． 容器が円錐形の底部を有する、Ｔ～Ｔ５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ７． Ｔ～Ｔ６のいずれか１つに記載の方法であって、試料搬送機が連続的に振動している間に、容器から試料を吸引することをさらに含む、前記方法。
Ｔ８． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｔ～Ｔ７のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ９． 核酸増幅反応が、等温反応である、Ｔ８に記載の方法。
Ｔ１０． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、Ｔ９に記載の方法。
Ｔ１１． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、Ｔ９に記載の方法。
Ｔ１２． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｔ～Ｔ１１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１３． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｔ～Ｔ１２のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１４． 核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、決定が、増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｔ～Ｔ１３に記載の方法。
Ｔ１４－１． 複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出が、増幅反応中に複数回、標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｔ～Ｔ１３のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１５． 複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｔ１４またはＴ１４－１に記載の方法。
Ｔ１６． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１２分間にわたって行われる、Ｔ１４、Ｔ１４－１、またはＴ１５に記載の方法。
Ｔ１７． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約１分間にわたって行われる、Ｔ１４、Ｔ１４－１、またはＴ１５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１８． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約５分間にわたって行われる、Ｔ１４、Ｔ１４－１、またはＴ１５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１９． 複数回の蛍光シグナルの光学検出が、約２０分間にわたって行われる、Ｔ１４、Ｔ１４－１、またはＴ１５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２０． 複数回が、約４８秒ごとの所定の間隔でシグナルを光学的に検出することを含む、Ｔ１４、Ｔ１４－１、またはＴ１５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２１． 核酸分析が約１５～約３６分で完了する、Ａ～Ｔ２０のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２２． 核酸分析が約３２～約３６分で完了する、Ａ～Ｔ２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２３． 核酸分析が、試料調製プロセスならびに増幅及び検出プロセスを含む、Ａ～Ｔ２２に記載の方法。
Ｔ２４． 試料調製プロセスが、溶解プロセス及び洗浄プロセスを含む、Ａ～Ｔ２３のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２５． 試料調製プロセスが、約１２～約１６分で完了する、Ａ～Ｔ２４のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２６． 増幅及び検出プロセスが約１～約２２分で完了する、Ａ～Ｔ２５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２７． 増幅及び検出プロセスが約５～約２２分で完了する、Ａ～Ｔ２６のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２８． 増幅及び検出プロセスが約１８～約２２分で完了する、Ａ～Ｔ２７のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ２９． 溶解プロセスが約４～約８分で完了する、Ａ～Ｔ２８のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３０． 洗浄プロセスが約５～約９分で完了する、Ａ～Ｔ２９のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３１． 洗浄プロセスが、第１の洗浄ステップ、第２の洗浄ステップ、第３の洗浄ステップ、及び溶出ステップを含む、Ａ～Ｔ３０のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３２． 第１の洗浄ステップが約１～約３分で完了する、Ａ～Ｔ３１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３３． 第２の洗浄ステップが約０．１～約１分で完了する、Ａ～Ｔ３２のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３４． 第３の洗浄ステップが約０．１～約１分で完了する、Ａ～Ｔ３３のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３５． 溶出ステップが約２～約５分で完了する、Ａ～Ｔ３４のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３６． 試料調製プロセスが前処理プロセスをさらに含む、Ａ～Ｔ３５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３７． 前処理プロセスが約３～約７分で完了する、Ａ～Ｔ３６のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３８． 試料調製プロセスがオンボードプーリングプロセスをさらに含み、最大６個のドナー血液の試料を約６分以下で前処理し、プールする、Ａ～Ｔ３７のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ３９． 試料調製プロセスがオンボードプーリングプロセスをさらに含み、最大２４個の試料を約５分以下でプールする、Ａ～Ｔ３８のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４０． 第１の洗浄ステップが溶解緩衝液中でのインキュベーションを含む、Ｔ３１～Ｔ３９のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４１． 第２の洗浄ステップが水中でのインキュベーションを含む、Ｔ３１～Ｔ４０のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４２． 第３の洗浄ステップが水中でのインキュベーションを含む、Ｔ３１～Ｔ４１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４３． 溶出ステップが溶出緩衝液中でのインキュベーションを含む、Ｔ３１～Ｔ４２に記載のいずれか１つの方法。
Ｔ４４． 第１の洗浄ステップが溶解緩衝液中でのインキュベーションを含み、第２の洗浄ステップが水中でのインキュベーションを含み、第３の洗浄ステップが水中でのインキュベーションを含み、溶出ステップが溶出緩衝液中でのインキュベーションを含む、Ｔ３１～Ｔ４０のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４５． 溶解ステップが、試料を、溶解緩衝液及び微粒子を含む組成物と接触させることを含む、Ｔ２４～Ｔ４４のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４６． 組成物が内部対照核酸をさらに含む、Ｔ２４～Ｔ４４のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４７． 増幅及び検出プロセスが増幅反応を含む、Ｔ２３～Ｔ４６のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ４８． 増幅反応が、等温反応である、Ｔ４７に記載の方法。
Ｔ４９． 等温反応が、ＲＰＡである、Ｔ４７の方法。
Ｔ５０． 増幅反応が、洗浄プロセスによって生成された溶出液を、リコンビナーゼ（例えば、ＵｖｓＸ）、リコンビナーゼローディング剤（例えば、ＵｖｓＹ）及び一本鎖ＤＮＡ結合タンパク質（例えば、Ｇｐ３２）を含む組成物と接触させることを含む、Ｔ４７～Ｔ４９のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ５１． 増幅反応が、洗浄プロセスによって生成された溶出液を、約５ｍＭ～約１００ｍＭのトリス－ＨＣｌ、ｐＨ約６．５～９．０、例えば８．３；約５ｍＭ～約１０ｍＭのＤＴＴ；約５０ｍＭ～約１００ｍＭの酢酸カリウム；約２％～約１０％のクラウディング剤、例えばＰＥＧ；約１ｍＭ～約５ｍＭのｄＮＴＰ；約１ｍＭ～約１０ｍＭのＡＴＰ、例えば、約２ｍＭ～約５ｍＭのＡＴＰ；約２０ｍＭ～約１００ｍＭのホスホクレアチン、例えば、約４０ｍＭ～約１００ｍＭのホスホクレアチン；約５ｍＭ～約４０ｍＭの酢酸Ｍｇ、例えば約１０ｍＭ～約４０ｍＭの酢酸Ｍｇ；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約１０ｍｇ／ｍＬのＢＳＡ；約５％～約１０％のグリセロール；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのクレアチンキナーゼ、例えば、約０．１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのクレアチンキナーゼ；約０．１ｍｇ／ｍＬ～約１．０ｍｇ／ｍＬのＵｖｓＸ、例えば約０．３ｍｇ／ｍＬ～約１．０ｍｇ／ｍＬのＵｖｓＸ；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．２５ｍｇ／ｍＬのＵｖｓＹ、例えば約０．０９ｍｇ／ｍＬ～約０．２５ｍｇ／ｍＬのＵｖｓＹ；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのＤＮＡポリメラーゼ、例えば約０．０８ｍｇ／ｍＬ～約０．２ｍｇ／ｍＬのＤＮＡポリメラーゼ；約０．１ｍｇ／ｍＬ～約２．０ｍｇ／ｍＬのＧＰ３２、例えば約０．４ｍｇ／ｍＬ～約０．８ｍｇ／ｍＬのＧＰ３２；約０．０１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのエキソヌクレアーゼＩＩＩ、例えば約０．１ｍｇ／ｍＬ～約０．５ｍｇ／ｍＬのエキソヌクレアーゼＩＩＩ；及び約０．５μｇ／ｍＬ～約２０．０μｇ／ｍＬのウマ伝染性貧血ウイルス逆転写酵素（ＥＩＡＶ－ＲＴ）、例えば、約０．５μｇ／ｍＬ～約１．５μｇ／ｍＬのウマ伝染性貧血ウイルス逆転写酵素ＥＩＡＶ－ＲＴ、を含む組成物と接触させることを含む、Ｔ４７～Ｔ５０のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ５１－１． 溶解プロセスが、試料を溶解緩衝液と接触させることを含む、Ｔ２４～Ｔ５１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ５１－２． 溶解緩衝液がプロテアーゼ、界面活性剤、タンパク質変性剤及び緩衝液を含む、Ｔ５１－１に記載の方法。
Ｔ５１－３． 溶解緩衝液がプロテアーゼ、界面活性剤、カオトロピック剤及び緩衝液を含む、Ｔ５１－１に記載の方法。
Ｔ５１－４． カオトロピック剤がチオシアン酸グアニジニウム（ＧＩＴＣ）である、Ｔ５１－３に記載の方法。
Ｔ５１－５． 溶解緩衝液が約６．０～約８．０のｐＨを有する、Ｔ５１－１～Ｔ５１－４のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ５１－６． 溶解緩衝液が約７．０～約８．０のｐＨを有する、Ｔ５１－１～Ｔ５１－５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ５２． 臨床使用のための出荷が指示されたドナー物質、または輸血に許容されると決定されたドナー血液を、病原体低減技術で処理することをさらに含む、Ａ～Ｔ５１－５のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ５３． 病原体低減技術が、ドナー物質もしくはドナー血液内に存在する核酸にインターカレートするか、またはドナー物質もしくはドナー血液内に存在する核酸に二量体を生じさせる薬剤を含む、Ｔ５２に記載の方法。
Ｔ５４． 病原体低減技術が、以下の：（ｉ）アモトサレン及び紫外線Ａ（ＵＶＡ）光、（ｉｉ）リボフラビン及びＵＶＡ／紫外線Ｂ（ＵＶＢ）光、（ｉｉｉ）アムスタリン及びグルタチオン、（ｉｖ）紫外線Ｃ（ＵＶＣ）光；ならびに（ｖ）メチレンブルー及び可視光、のうちの少なくとも１つを含む、Ｔ５２に記載の方法。
Ｔ５５． ドナー物質が、以下：（ｉ）全血、（ｉｉ）血漿、（ｉｉｉ）血小板、（ｉｖ）赤血球；及び（ｖ）血漿由来生成物、のうちの少なくとも１つを含む、Ｔ５２～Ｔ５４のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ５６． Ｔ５２～Ｔ５５のいずれか１つに記載の方法であって、
試料またはドナー血液の試料中の１つ以上の病原体または感染因子を検出するために、試料またはドナー血液の試料の第２の部分に対してイムノアッセイを実行することをさらに含む、方法。
Ｔ５７． イムノアッセイを、核酸分析と同時に実行する、Ｔ５６に記載の方法。
Ｔ５８． イムノアッセイを、核酸分析の前に実行する、Ｔ５６に記載の方法。
Ｔ５９． 核酸分析を、イムノアッセイを実行する前に実行する、Ｔ５６に記載の方法。
Ｔ６０． 臨床使用のための出荷が指示されたドナー物質、または輸血に許容されると決定されたドナー血液を、病原体低減技術で処理する前にイムノアッセイを実行する、Ｔ５６に記載の方法。
Ｔ６１． 病原体または感染因子が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、コロナウイルス、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、ヒトＴリンパ指向性ウイルス（ＨＴＬＶ） パルボＢ１９ウイルス、ＨＡＶ、梅毒、クラミジア、淋菌、デング、チクングニア、ＷＮＶ、ＨＥＶ、クロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、Ｔ～Ｔ６１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ６２． 核酸分析及び病原体低減技術を、同じ物理的場所で実行する、Ｔ５２～Ｔ６１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ６３． ドナー物質が血小板を含む、Ｔ５５に記載の方法。
Ｔ６４． 試料の物理的場所が分散型の場所である、Ｔ６２に記載の方法。
Ｔ６５． 試料の物理的場所が集中型の場所である、Ｔ６２に記載の方法。
Ｔ６６． 核酸分析が、１時間当たり少なくとも約１４０の試料吸引を含む、Ａ～Ｔ６５のいずれかに記載の方法。
Ｔ６７． 核酸分析が、１時間当たり少なくとも約１４０回の増幅を含む増幅プロセスを含む、Ａ～Ｔ６６のいずれかに記載の方法。
Ｔ６８． 核酸分析が、マルチプレックス増幅を含む増幅プロセスを含む、Ａ～Ｔ６７のいずれかに記載の方法。
Ｔ６９． 核酸分析が、溶出液を調製することを含む試料調製プロセスを含み、溶出液を２つ以上の増幅容器に分割する、Ａ～Ｔ６８のいずれかに記載の方法。
Ｔ７０． 核酸分析を自動システムで実行し、自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり約１４０件の結果～約３００件の結果が得られる、Ａ～Ｔ６９のいずれかに記載の方法。
Ｔ７１． ドナー血液の試料、ドナー物質、血漿、または生体試料に対して血清学的検査を実行することをさらに含む、Ａ～Ｔ７０のいずれか１項に記載の方法。
Ｔ７２． ドナー血液の試料、試料、または生体試料がプール試料である、Ａ～Ｔ７１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ７３． プール試料が、２人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、Ｔ７２に記載の方法。
Ｔ７４． プール試料が、３人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、Ｔ７２に記載の方法。
Ｔ７５． プール試料が、４人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、Ｔ７２に記載の方法。
Ｔ７６． プール試料が、５人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、Ｔ７２に記載の方法。
Ｔ７７． プール試料が、１０人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、Ｔ７２に記載の方法。
Ｔ７８． プール試料が、１２人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、Ｔ７２に記載の方法。
Ｔ７９． プール試料が、９６人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、Ｔ７２に記載の方法。
Ｔ８０． 核酸分析が、複数の試料のサブセットをオンボードプーリングしてプール試料を形成することを含む試料調製プロセスを含み、プール試料に対して核酸分析を実行する、Ａ～Ｔ７９のいずれかに記載の方法。
Ｔ８２． オンボードプーリングが、搬送経路に沿って試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで、その間の中間位置を伴って、試料搬送機上の個々の容器を連続的に搬送すること；ならびに
試料搬送機上の容器内に第１の試料及び第２の試料をプールして、プール試料を形成すること、を含む、請求項Ｔ８０に記載の方法。
Ｔ８３． 試料搬送機が、蛇行経路、カルーセル、コンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、またはベルトを含む、Ｔ８２に記載の方法。
Ｔ８４． 第１の試料及び第２の試料が、個々のドナー試料である、Ｔ８２に記載の方法。
Ｔ８５． 第１の試料及び第２の試料が、プール試料である、Ｔ８２に記載の方法。
Ｔ８６． 第１の試料及び第２の試料が、それぞれ４８個のプール試料を含む、Ｔ８２に記載の方法。
Ｔ８７． 試料搬送機が試料調製カルーセルを含み、搬送経路に沿って個々の容器を連続的に搬送することが試料調製カルーセルを回転させることを含む、Ｔ８２に記載の方法。
Ｔ８８． 試料調製カルーセルが、ロックステップ方式で回転し、ロックステップごとに１つの位置を移動する、Ｔ８７に記載の方法。
Ｔ８９． 各ロックステップの持続時間が、約１５秒～約３０秒の間である、Ｔ８８に記載の方法。
Ｔ９０． 第１の試料及び第２の試料をプールすることは、試料調製カルーセルが第１の容器を第１の中間位置まで搬送する前に、試料分注位置で第１の試料及び第２の試料を第１の容器内に分注することを含む、Ｔ８２～Ｔ８９のいずれかに記載の方法。
Ｔ９１． 第３及び第４の試料を第１の中間位置で第１の容器に分注して、第３及び第４の試料をプール試料に加えることをさらに含む、Ｔ９０に記載の方法。
Ｔ９２． 試料調製プロセスが溶解プロセスを含み、オンボードプーリングが、プール試料を第１の容器から吸引し、試料分注位置でプール試料を第２の容器に分注して、プール試料の溶解プロセスを開始することを含む、Ｔ９０～Ｔ９１のいずれかに記載の方法。
Ｔ９３． 試料調製プロセスが前処理プロセスを含む、Ｔ８０～Ｔ９２のいずれかに記載の方法。
Ｔ９４． 前処理プロセスが、試料分注位置で試料搬送機上の容器に試料及び試薬を分注して、試料分注位置と捕捉及び移送位置との間に中間位置を伴って画定された搬送経路に沿って、容器を連続的に搬送すること；及び各中間位置で試料と試薬を混合すること、を含む、Ｔ９３に記載の方法。
Ｔ９５． 試料搬送機を連続的に振動させて容器内の試料と試薬を混合することを含み、振動のたびに容器が円弧状に移動する、Ｔ９４に記載の方法。
Ｔ９６． 試料が全血試料を含み、試薬が溶解緩衝液を含む、Ｔ９３～Ｔ９５のいずれかに記載の方法。
Ｔ９７． 前処理プロセスが、試料を約３～約６分間の間溶解することを含む、Ｔ９６に記載の方法。
Ｔ９８． 前処理済試料のサブセットをオンボードプーリングして、プール試料を形成することを含み、核酸分析を、プール試料に対して実行し、オンボードプーリングは、第１の前処理済試料を、第１の中間位置で第１の容器から吸引すること、第２の前処理済試料を、第２の中間位置で第２の容器から吸引すること、及び第１の前処理済試料及び第２の前処理済試料を、試料分注位置で第３の容器に分注することを含む、Ｔ９３～Ｔ９７のいずれかに記載の方法。
Ｔ９９． 最大約３００の試料を、１時間あたりの核酸分析のためにプールする、Ｔ８０～Ｔ９９のいずれかに記載の方法。
Ｔ１００． 最大約７５の前処理試料を、１時間あたりの核酸分析のためにプールする、Ｔ９８に記載の方法。
Ｔ１０１． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の検出を含む、Ｔ１００に記載の方法。
Ｔ１０２． 核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または不存在の決定が、（ａ）プール試料に関連しているドナー血液が輸血に許容されるかどうか、または（ｂ）プール試料に関連するドナー物質が臨床使用に許容されるかどうか、を示すものである、Ｔ１０１に記載の方法。
Ｔ１０３． Ｔ１０２に記載の方法であって、プール試料中に複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、プール試料に含まれる個々の試料またはそのサブプールの核酸分析をさらに含み、（ａ）個々の試料またはそのサブプールの核酸分析に少なくとも部分的に基づいて、個々の試料またはそのサブプールに関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうか、あるいは（ｂ）個々の試料またはそのサブプールの核酸分析に少なくとも部分的に基づいて、個々の試料またはそのサブプールに関連するドナー血液が臨床使用に許容されるかどうかを決定する、方法。
Ｔ１０４． プール試料の核酸分析中に、プール試料に含まれる個々の試料を装填領域に保存する、Ｔ１０３に記載の方法。
Ｔ１０５． サブプールの核酸分析が、サブプールを作成するためのオンボードプーリングを含む、Ｔ１０３～Ｔ１０４のいずれかに記載の方法。
Ｔ１０６． プール試料が９６個の個々のドナー試料を含み、プール試料中に複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、９６個の個々の試料のそれぞれに関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかの決定を、核酸分析を実行するためのプール試料に含まれる第１の試料の最初の吸引から約４時間未満で行う、Ｔ１０３～Ｔ１０５のいずれかに記載の方法。
Ｔ１０７． 核酸分析が、試料調製プロセスを含む、Ａ～Ｔ１０６のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１０８． 試料調製プロセスが、溶解プロセスを含む、Ｔ１０７に記載の方法。
Ｔ１０９． 試料調製プロセスが、前処理プロセス及び溶解プロセスを含む、Ｔ１０７に記載の方法。
Ｔ１１０． 試料調製プロセスが、前処理プロセス及びオンボードプーリングプロセスを含む、Ｔ１０７に記載の方法。
Ｔ１１１． 試料調製プロセスが、前処理プロセス、溶解プロセス、及びオンボードプーリングプロセスを含む、Ｔ１０７に記載の方法。
Ｔ１１２． 試料調製プロセスが、オンボードプーリングプロセス及び溶解プロセスを含む、Ｔ１０７に記載の方法。
Ｔ１１３． 試料調製プロセスが、オンボードプーリングプロセスを含む、Ｔ１０８に記載の方法。
Ｔ１１３． 前処理プロセスが、前処理溶解プロセスを含む、Ｔ１０９、Ｔ１１０、またはＴ１１１に記載の方法。
Ｔ１１４． 本開示の試料調製プロセスが、微粒子を使用することができる、Ｔ２３のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１１５． 微粒子が、例えば、全試料核酸を捕捉するために、ＣｕＴｉコーティング微粒子を含む、Ｔ１１４に記載の方法。
Ｔ１１６． 微粒子が溶解緩衝液中に存在する、Ｔ１１４及びＴ１１５に記載の方法。
Ｔ１１７．微粒子が、内部対照核酸、及び任意選択でプロテイナーゼを含む溶解緩衝液中に存在する、Ｔ１１５またはＴ１１６に記載の方法。
Ｔ１１８． 溶解緩衝液が、界面活性剤、タンパク質変性剤及び緩衝液、ならびに任意選択でプロテアーゼを含む、Ｔ１１６に記載の方法。
Ｔ１１９． 溶解緩衝液が、界面活性剤、カオトロピック剤及び緩衝液、ならびに任意選択でプロテアーゼを含む、Ｔ１１６に記載の方法。
Ｔ１２０． 溶解緩衝液が、２．５Ｍ～約４．７ＭのＧＩＴＣ及び約２％～約１０％のＴｗｅｅｎ－２０を含み、ｐＨが約５．５～約８．０である、Ｔ１１６に記載の方法。
Ｔ１２１． 第１の洗浄ステップが、例えば溶解緩衝液を含む第１の洗浄溶液中でのインキュベーションを含む、Ｔ３１～Ｔ１２０のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１２２． 第２の洗浄ステップが水中でのインキュベーションを含む、Ｔ３１～Ｔ１２１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１２３． 第３の洗浄ステップが水中でのインキュベーションを含む、Ｔ３１～Ｔ１２２のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１２４． 溶出工程が、例えば約５ｍＭ～約１０ｍＭの濃度のリン酸塩を含む溶出緩衝液中でのインキュベーションを含む、Ｔ３２～Ｔ１２３のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１２５． 溶出緩衝液が、ＰＯ４を含む、Ｔ１２４に記載の方法。
Ｔ１２６． 溶出緩衝液は、ｐＨが約７．５～約９．０である、Ｔ１２４またはＴ１２５の方法。
Ｔ１２７． 増幅反応が、単離された核酸を、ｇｐ３２、ＵｖｓＸ、ＵｖｓＹ、及びポリメラーゼを含む溶液と接触させることを含む、Ｔ４７～Ｔ１２６のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１２８． 溶液がＡＴＰ、ホスホクレアチン及び緩衝液をさらに含む、Ｔ１２７に記載の方法。
Ｔ１２９． 溶液がさらに逆転写酵素をさらに含む、Ｔ１２７またはＴ１２８に記載の方法。
Ｔ１３０． 増幅反応が、単離された核酸を、（ｉ）リコンビナーゼ（例えば、ＵｖｓＸ）、（ｉｉ）一本鎖結合タンパク質（例えば、ＧＰ３２）、（ｉｉｉ）リコンビナーゼローディング剤（例えば、ＵｖｓＹ）、（ｉｖ）ＤＮＡポリメラーゼ、（ｖ）エキソヌクレアーゼ（例えば、エキソヌクレアーゼＩＩＩ）、及び（ｖｉ）クレアチンキナーゼを含む溶液と接触させることを含む、Ｔ４７～Ｔ１２６のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１３１． 溶液が、逆転写酵素（例えば、ＥＩＡＶ－ＲＴ）をさらに含む、Ｔ１３０に記載の方法。
Ｔ１３２． 溶液が、フォワードプライマー、リバースプライマー及びプローブをさらに含む、Ｔ１２７～Ｔ１３１のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１３３． 増幅及び検出プロセスが、増幅反応中に複数回、標的核酸の量に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、Ｔ２３～Ｔ１３２のいずれか１つに記載の方法。
Ｔ１３４． 増幅プロセス中の複数回が、約２０～約３０秒ごと、例えば約２４秒ごとに蛍光シグナルを検出することを含む、Ｔ１３３に記載の方法。
Ｕ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示し、臨床使用のためのドナー物質の出荷は、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の最初の吸引から約１５分～約６０分で起こる、自動システムを提供する。
Ｕ１． 臨床使用のためのドナー物質の出荷が、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の最初の吸引から約２０～約６０分で起こる、Ｕに記載の方法。
Ｕ２． 核酸分析が、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、Ｕ～Ｕ１のいずれか１つに記載のシステム。
Ｕ３． 複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定が、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の最初の吸引から約３０～約４５分で完了する、Ｕ～Ｕ２のいずれか１つに記載のシステム。
Ｕ４． 複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、結果が得られるまでの時間が約３０分～約４５分である、Ｕ～Ｕ３のいずれか１つに記載のシステム。
Ｕ５． 自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、Ｕ～Ｕ４のいずれか１項に記載のシステム。
Ｕ６． 自動システムの設置面積１ｍ２当たり１時間当たり少なくとも約１４０の結果が得られる、Ｕ～Ｕ５のいずれか１つに記載のシステム。
Ｖ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示し、システムは、臨床使用のためのドナー物質の出荷についてドナー血液の複数の試料をスクリーニングするように構成されており、核酸分析に基づく決定を、核酸分析を実行するためのドナー血液の最初の試料の最初の吸引から約２０分～約３．５時間以内に実行する、自動システムを提供する。
Ｗ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示し、核酸分析は、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、自動システム提供する。
Ｘ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示し、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、核酸分析を実行するためのドナー血液の試料の最初の吸引から約３０～約４５分で完了する、自動システムを提供する。
Ｘ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示し、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、結果が得られるまでの時間が約３０分～約４５分である、自動システムを提供する。
Ｚ．本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析の結果として複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのはドナー物質の出荷を示し、自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、自動システムを提供する。
ＡＡ． 本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析の結果として複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのはドナー物質の出荷を示し；自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、自動システムを提供する。
ＢＢ． 本開示は、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え；核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示し；システムは、臨床使用のためのドナー物質の出荷についてドナー血液の複数の試料をスクリーニングするように構成されており、核酸分析を、複数の試料のバッチ処理の非存在下で実行する、自動システムを提供する。
ＣＣ． 本開示は、試料中の１つ以上の病原体または感染因子に由来する標的核酸を検出するための自動システムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；プロセッサ、及びメモリであって、プロセッサによって実行されると、システムは、ドナー血液の１つ以上の試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含むメモリ、を備え、核酸分析は、増幅反応のために試料から核酸を調製することを含む、試料調製領域における試料調製プロセス；増幅反応により標的核酸を増幅することを含む、核酸増幅領域における増幅プロセス；及び反応において増幅された標的核酸の量を決定することを含む、核酸検出領域における検出プロセス、を含み；試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスは、核酸分析のための試料の最初の吸引から約６０分未満で完了し、自動システムの設置面積１ｍ２メートル当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、自動システムを提供する。
ＣＣ１． 核酸増幅反応は、持続時間が約８分～約２０分である、ＣＣに記載のシステム。
ＣＣ２． 試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスが、約２０分～約６０分で完了する、ＣＣ～ＣＣ１のいずれか１つに記載のシステム。
ＣＣ３． ＣＣ～ＣＣ２のいずれか１つに記載のシステムであって、複数の試料中の標的核酸を検出するように構成され、自動システムの容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、システム。
ＣＣ４． ＣＣ～ＣＣ３のいずれか１つに記載のシステムであって、複数の試料中の標的核酸を検出するように構成され、システムの設置面積１ｍ２当たり１時間当たり約１４０件～約３００件の結果が得られる、システム。
ＣＣ５． 標的核酸が、複数の病原体または感染因子に由来する核酸を含む、ＣＣ～ＣＣ４のいずれか１つに記載のシステム。
ＣＣ６． ＣＣ５に記載のシステムであって、核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示す、システム。
ＣＣ７． ＣＣ５に記載のシステムであって、核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の検出または非存在が決定されると、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示す、システム。
ＣＣ８． 核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸が検出されると、ドナー物質が臨床使用のために出荷されない、ＣＣ７に記載のシステム。
ＣＣ９． 核酸分析に基づいて複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸が検出が不存在であると、ドナー物質が臨床使用のために出荷される、ＣＣ７に記載のシステム。
ＣＣ１０． 試料搬送機が、蛇行経路、カルーセル、コンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、またはベルトを含む、ＣＣ～ＣＣ９のいずれか１つに記載のシステム。
ＣＣ１１． 試料搬送機が、時計回りに約１度～約５度の間で連続的に移動し、続いて反時計回りに約１度～約５度の間で移動するように構成されている、ＣＣ～ＣＣ９のいずれか１つに記載のシステム。
ＣＣ１２． 試料搬送機が、容器の内容物内に渦を形成するように構成されている、ＣＣ～ＣＣ９のいずれか１つに記載のシステム。
ＣＣ１３． 容器が約０．５度～約１．５度の間の抜き勾配を有する、ＣＣ～ＣＣ９のいずれか１つに記載のシステム。
ＣＣ１４． 容器が円錐形の底部を有する、ＣＣ～ＣＣ９のいずれか１つに記載のシステム。
ＣＣ１５． ＣＣ～ＣＣ１４のいずれか１つに記載のシステムの方法であって、システムが、少なくとも１つのピペッタをさらに含み、少なくとも１つのピペッタは、試料搬送機が連続的に振動している間に、容器から１つ以上の試料を吸引するように構成されている、システムの方法。
ＤＤ．本開示は、第２のウェルに隣接する第１のウェル及び第２のウェルに隣接する第３のウェルと、第１、第２、及び第３のウェルの第１の側面を画定する第１の側壁、第１の側壁の反対側にあり、第１、第２、及び第３のウェルの第２の側面を画定する第２の側壁であって、第１、第２、及び第３のウェルに面する内面と、内面の反対側の外面とを含む、第１の側壁及び第２の側壁と、第１のウェルと第２のウェルを分離する、第１の仕切りと、第２のウェルと第３のウェルを分離する、第２の仕切り、を備える、核酸分析用の洗浄容器であって、ここで、第１の側壁は第１の仕切りよりも高く、第１の側壁の内面は、第１のウェルに捕捉された磁性微粒子を、第１の仕切りを越えて第２のウェルに平行移動させるため、少なくとも第１のウェルと第２のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第１の側壁の内面は、第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、そうして、その非平面の内面が、第２のウェルの内面の領域で捕捉された磁性粒子が第３のウェルの内面の領域へ平行移動するのを防止し、第２の側壁は第２の仕切りよりも高く、第２の側壁の内面は、少なくとも第２のウェルと第３のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第２のウェル内で磁性微粒子を捕捉し、捕捉された磁性粒子を第２の仕切りを越えて第３のウェルに平行移動させるための実質的に平坦な表面を提供する、洗浄容器を提供する。
ＤＤ１． 第１及び第２のウェルは洗浄溶液を含み、第３のウェルが洗浄溶液または溶出溶液を含む、ＤＤに記載の容器。
ＤＤ２． ＤＤに記載の容器であって、第３のウェルに隣接する第４のウェルと、第３のウェルと第４のウェルを分離する第３の仕切りとを含み、ここで、第１の側壁は、第４のウェルの第１の側面を画定し、第２の側壁は、第４のウェルの第２の側面を画定し、第１の側壁は第３の仕切りよりも高く、第１の側壁の内面は、第３のウェルに捕捉された磁性微粒子を、第３の仕切りを越えて第４のウェルに平行移動させるため、少なくとも第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、第２の側壁の内面は、第３のウェルと第４のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、そうして、その非平面の内面が、第３のウェル内の第２の側壁の内面の領域で捕捉された磁性粒子が、第４のウェルの第２の側壁の内面の領域へ平行移動するのを防止する、容器。
ＤＤ３． 第１、第２、及び第３のウェルが洗浄溶液を含む、ＤＤ２に記載の容器。
ＤＤ４． 特定の実施形態では、第１、第２、及び第３のウェルが洗浄溶液を含み、第４のウェルが溶出溶液を含む、ＤＤ１～ＤＤ２のいずれか１つに記載の容器。
ＤＤ５． 非平面の内面が、内面にノッチを備え、ノッチは内面から外に延びているか、または内面内で延びている、ＤＤ～ＤＤ４のいずれか１つに記載の容器。
ＤＤ６． 試料搬送機が、時計回りに約１度～約５度の間で連続的に移動し、続いて反時計回りに約１度～約５度の間で移動するように構成されている、ＤＤのいずれか１つに記載の容器。
ＤＤ７． 試料搬送機が、容器の内容物内に渦を形成するように構成されている、ＤＤ～ＤＤ１のいずれか１つに記載の容器。
ＤＤ８． 試料搬送機が、約１秒～約２秒で渦を形成するように構成されている、ＤＤ７のいずれか１つに記載の容器。
ＤＤ９． 容器が約０．５度～約１．５度の間の抜き勾配を有する、ＤＤ～ＤＤ３のいずれか１つに記載の容器。
ＤＤ１０． 容器が円錐形の底部を有する、ＤＤ～ＤＤ４のいずれか１つに記載の容器。
ＤＤ１１． システムが、少なくとも１つのピペッタをさらに含み、少なくとも１つのピペッタは、試料搬送機が連続的に振動している間に、容器から１つ以上の試料を吸引するように構成されている、ＤＤ～ＤＤ５のいずれか１つに記載の容器。
ＥＥ． 本開示は、１つ以上の病原体または感染因子を検出するために１つ以上の試料に対して核酸分析を実行するためのシステムであって、試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション、を備え、ここで、試料調製領域は、容器内の１つ以上の試料を試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで搬送経路に沿って搬送するように構成された試料搬送機であって、連続的に振動させて容器内の１つ以上の試料と１つ以上の試薬を混合するように構成されており、振動のたびに容器が円弧状に移動する、試料搬送機を含む、システムを提供する。
ＥＥ１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ウスツウイルス、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ２９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３８． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ３９． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４０． 複数の病原体または感染因子がＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析は、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析は、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析は、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４７． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４８． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ４９． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５０． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５１． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５５． 複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５７． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５８． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ５９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり、所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ６９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７７． ある特定の実施形態では、複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ７９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８２． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８３． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８４． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８５． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８６． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析がＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８７． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８８． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ８９． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９０． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９１． 複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９２． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９３． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９４． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９５． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９６． 複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス：及び少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルスである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９７． 複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；核酸分析がバベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシアである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９８． 複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；所定のレベルが、少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＣＣ５及びＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ９９． 試料または１つ以上の試料がドナー血液の試料である、ＣＣ～ＣＣ６及びＥＥ～ＥＥ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１００． ドナー血液の試料が、ヒトドナー血液である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ９９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０１． ドナー血液の試料が、全血である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ９９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０２． ドナー血液の試料が、溶解全血である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ９９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０３． ドナー血液の試料が、血清である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ９９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０４． ドナー血液の試料が、血漿である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ９９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０５． ドナー物質の出荷が、輸血のためのものである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ７～ＥＥ１０４のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０６． ドナー物質の出荷が、医薬品で使用するためのものである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ７～ＥＥ１０４のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０７． ドナー物質の出荷が、治療処置に使用するためのものである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ７～ＥＥ１０４のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０８． ドナー血液の試料が、献血として使用するためのものである、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ７～ＥＥ１０４のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１０９． 臨床使用がインビボ臨床使用である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ７～ＥＥ１０４のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１０． 臨床使用がインビトロ臨床使用である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、及びＥＥ７～ＥＥ１０４のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１１． 臨床使用が輸血である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＥＥ７～ＥＥ１０４、及びＥＥ１０９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１２． 臨床使用が医薬品における使用である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＥＥ７～ＥＥ１０４、及びＥＥ１０９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１３． 臨床使用が治療処置における使用である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＥＥ７～ＥＥ１０４、及びＥＥ１０９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１４． 臨床使用が臓器または組織の提供である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＥＥ７～ＥＥ１０４、及びＥＥ１０９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１５． 臨床使用が血漿由来生成物における使用である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＥＥ７～ＥＥ１０４、及びＥＥ１０９のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１６． 臨床使用が、診断使用である、Ｕ～Ｕ６、Ｖ、Ｗ、Ｘ、Ｙ、Ｚ、ＡＡ、ＢＢ、ＥＥ７～ＥＥ１０４、及びＥＥ１１０のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１７． 核酸分析が、核酸増幅反応を含む、Ｕ～ＥＥ１１６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１１８． 核酸増幅反応が、等温反応である、ＥＥ１１７に記載の方法。
ＥＥ１１９． 等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、ＥＥ１１８に記載の方法。
ＥＥ１２０． 等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、ＥＥ１１８に記載の方法。
ＥＥ１２１． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、Ｕ～ＥＥ１２０のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１２２． システムが、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を定量的に検出するために、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を複数回、デジタル的に検出するように構成される、ＥＥ１２１に記載のシステム。
ＥＥ１２３． 核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、Ｕ～ＥＥ１２０のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１２４． システムが、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を定量的に検出するために、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を複数回、光学的に検出するように構成される、ＥＥ１２３に記載のシステム。
ＥＥ１２５． 核酸分析が、試料を試料溶解緩衝液及びプロテアーゼと同時に接触させることを含む、Ｕ～ＥＥ１２４のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１２６． 核酸分析が、試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含む、Ｕ～ＥＥ１２５のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１２７． 核酸分析が、試料を複数の微粒子と接触させること、及び磁力を介して表面上で微粒子を平行移動させることを含む、Ｕ～ＥＥ１２６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１２８． 核酸分析が、ドナー血液の試料からの核酸を精製すること；精製された核酸を複数の画分に分割すること；及び少なくとも１つの画分をさらなるスクリーニングのために保留することを含む、Ｕ～ＥＥ１２７のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１２９． 核酸分析が約１５～約３６分で完了する、Ｕ～ＥＥ１２８のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３０． 核酸分析が約３２～約３６分で完了する、Ｕ～ＥＥ１２８のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３１． 核酸分析が、試料調製領域における試料調製プロセスと、増幅及び検出システムにおける増幅及び検出プロセスとを含む、Ｕ～ＥＥ１３０のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３２． 試料調製プロセスが、溶解プロセス及び洗浄プロセスを含む、ＥＥ１３１に記載のシステム。
ＥＥ１３３． 試料調製プロセスが、約１２～約１６分で完了する、ＥＥ１３１～ＥＥ１３２のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３４． 増幅及び検出プロセスが約１～約２２分で完了する、ＥＥ１３１～ＥＥ１３３のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３５． 増幅及び検出プロセスが約５～約２２分で完了する、ＥＥ１３１～ＥＥ１３４のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３６． 増幅及び検出プロセスが約１８～約２２分で完了する、ＥＥ１３１～ＥＥ１３５のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３７． 溶解プロセスが約４～約８分で完了する、ＥＥ１３１～ＥＥ１３６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３８． 溶解プロセスが約５～約９分で完了する、ＥＥ１３１～ＥＥ１３７のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１３９． 洗浄プロセスが、第１の洗浄ステップ、第２の洗浄ステップ、第３の洗浄ステップ、及び溶出ステップを含む、ＥＥ１３１～ＥＥ１３８のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１４０． 第１の洗浄ステップが約１～約３分で完了する、ＥＥ１３９に記載の方法。
ＥＥ１４１． 第２の洗浄ステップが約０．１～約１分で完了する、ＥＥ１３９またはＥＥ１４０に記載のシステム。
ＥＥ１４２． 第３の洗浄ステップが約０．１～約１分で完了する、ＥＥ１３９～ＥＥ１４１のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１４３． 溶出ステップが約２～約５分で完了する、ＥＥ１３９～ＥＥ１４２のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１４４． 試料調製が前処理プロセスをさらに含む、ＥＥ１３９～ＥＥ１４３のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１４５． 前処理プロセスが約３～約７分で完了する、ＥＥ１４４に記載のシステム。
ＥＥ１４６． 試料調製プロセスがオンボードプーリングプロセスをさらに含み、最大６個のドナー血液の試料を約６分以下で前処理し、プールする、ＥＥ１４４またはＥＥ１４５に記載のシステム。
ＥＥ１４７． 試料調製プロセスが、オンボードプーリングプロセスをさらに含む、ＥＥ１３１～ＥＥ１４３のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１４８． 最大２４個の試料を、約５分でプールする、ＥＥ１４７に記載のシステム。
ＥＥ１４９． 核酸分析が、１時間当たり少なくとも約１４０の試料吸引を含む、Ｕ～ＥＥ１４８のいずれかに記載のシステム。
ＥＥ１５０． 核酸分析が、１時間当たり少なくとも約１４０回の増幅を含む増幅プロセスを含む、Ｕ～ＥＥ１４９のいずれかに記載のシステム。
ＥＥ１５１． 核酸分析が、マルチプレックス増幅を含む増幅プロセスを含む、Ｕ～ＥＥ１５０のいずれかに記載のシステム。
ＥＥ１５２． 核酸分析が、溶出液を調製することを含む試料調製プロセスを含み、溶出液を２つ以上の増幅容器に分割する、Ｕ～ＥＥ１５１のいずれかに記載のシステム。
ＥＥ１５３． 自動システムの設置面積１ｍ２あたり、１時間当たり約１４０～約３００の間の結果が得られる、Ｕ～ＥＥ１５２のいずれかに記載のシステム。
ＥＥ１５４． ドナー血液の試料、試料、または１つ以上の試料がプール試料である、Ｕ～ＣＣ６及びＥＥ～ＥＥ１５３に記載のシステム。
ＥＥ１５５． プール試料が、２人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、ＥＥ１５４に記載の方法。
ＥＥ１５６． ドナー血液のプール試料が、３人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、ＥＥ１５４に記載の方法。
ＥＥ１５７． ドナー血液のプール試料が、４人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、ＥＥ１５４に記載の方法。
ＥＥ１５８． ドナー血液のプール試料が、５人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、ＥＥ１５４に記載の方法。
ＥＥ１５９． ドナー血液のプール試料が、１０人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、ＥＥ１５４に記載の方法。
ＥＥ１６０． ドナー血液のプール試料が、１２人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、ＥＥ１５４に記載の方法。
ＥＥ１６１． ドナー血液のプール試料が、９６人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、ＥＥ１５４に記載の方法。
ＥＥ１６２． 核酸分析が、試料調製領域で複数の試料のサブセットをオンボードプーリングして、プール試料を形成することを含む試料調製プロセスを含み、核酸分析を、プール試料に対して実行する、ＢＢ５３～ＢＢ６０のいずれかに記載のシステム。
ＥＥ１６３． 試料調製領域が少なくとも１つのピペッタ及び少なくとも１つの試料搬送機を含み、搬送機は、試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで、その間に中間位置を伴って、搬送経路に沿って個々の容器を連続的に搬送するように構成されており；オンボードプーリングは、プール試料を形成するために、試料搬送機上の容器内に第１の試料及び第２の試料を分注することを含む、ＥＥ１６２に記載のシステム。
ＥＥ１６４． 試料搬送機が、蛇行経路、カルーセル、コンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、またはベルトを含む、ＥＥ１６３に記載のシステム。
ＥＥ１６５． 試料搬送機が試料調製カルーセルを含み、試料調製カルーセルは、搬送経路に沿って個々の容器を連続的に搬送するために回転するように構成されている、ＥＥ１６３またはＥＥ１６４のいずれかに記載のシステム。
ＥＥ１６６． 試料調製カルーセルが、ロックステップ方式で回転し、ロックステップごとに１つの位置を移動するように構成されている、ＥＥ１６５に記載のシステム。
ＥＥ１６７． 各ロックステップの持続時間が、約１５秒～約３０秒の間である、ＥＥ１６６に記載のシステム。
ＥＥ１６８． ＥＥ１６２～ＥＥ１６７のいずれかに記載のシステムであって、プール試料の核酸分析中に、プール試料に含まれる試料を試料装填領域に保持するように構成されている、前期システム。
ＥＥ１６９． ＥＥ１６２～ＥＥ１６８のいずれかに記載のシステムであって、プール試料中に所定のレベルを超える複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、命令が、プロセッサによって実行されると、システムは、プール試料に含まれる個々の試料またはそのサブプールの核酸分析を実行し；個々の試料またはそのサブプールの核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、システムは、臨床使用のための個々の試料またはそのサブプールに関連するドナー物質の出荷を示す、システム。
ＥＥ１７０． 病原体または感染因子が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、コロナウイルス、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、ヒトＴリンパ指向性ウイルス（ＨＴＬＶ） パルボＢ１９ウイルス、ＨＡＶ、梅毒、クラミジア、淋菌、デング、チクングニア、ＷＮＶ、ＨＥＶ、クロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、ＣＣ～ＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
ＥＥ１８０． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるクラミジア；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１０～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるインフルエンザ；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、ＥＥ１７０に記載の方法。
ＥＥ１７１． 複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるクラミジア；少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定にあるレベルのＷＮＶ；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；少なくとも１０～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるインフルエンザ；少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、ＣＣ～ＣＣ６のいずれか１つに記載のシステム。
＊ ＊ ＊
開示された主題は、ある特定の実施形態に関して本明細書で説明されるが、当業者は、開示された主題に対して、その範囲から逸脱することなく、種々の修正及び改良を加えることができることを認識するであろう。さらに、開示された主題の一実施形態の個々の特徴は、本明細書で考察され、または一実施形態の図面に示され、他の実施形態では示されないが、一実施形態の個々の特徴は、別の実施形態の、または複数の実施形態の１つ以上の特徴と組み合わせることができることは明らかであるはずである。
以下に請求される特定の実施形態に加えて、開示された主題は、以下に請求される従属特徴と上に開示された従属特徴との他の可能な組み合わせを有する他の実施形態にも向けられる。したがって、従属請求項に提示され、上で開示された特定の特徴は、開示された主題の範囲内で他の様式で互いに組み合わせることができ、その結果、開示された主題は、他の任意の可能な組み合わせを有する他の実施形態にも特に向けられていると認識されるべきである。したがって、開示された主題の特定の実施形態の上記の説明は、例示及び説明の目的で提示されたものである。これは、網羅的であることを意図するものでも、開示される主題を開示される実施形態に限定することを意図するものでもない。
開示された主題の精神または範囲から逸脱することなく、開示された主題の方法及びシステムにおいて種々の修正及び変形を行うことができることは、当業者には明らかであろう。したがって、開示された主題は、添付の特許請求の範囲及びその均等物の範囲内にある修正及び変形を含むことが意図されている。
実施例１：アッセイあたり＜６０分の試料の核酸検査
図１は、開示された主題による例示的なＨＴＮＡＴ試料分析プロセスを示す。この例示的なＨＴＮＡＴ試料分析プロセスは、試料調製、増幅、及び検出という３つの動作を含む。
図２は、３つの動作、すなわち、試料調製プロセス（前処理溶解プロセス、試料溶解プロセス、ならびに洗浄及び溶出プロセスを含む）、増幅プロセス（試薬添加動作を含む）、及び検出／読み取りプロセスを含む、開示された主題による例示的なＨＴＮＡＴ試料分析プロセスを示すダイアグラムである。例示的な戦略を図２Ｂにさらに示し、図２Ｂでは、アッセイ固有のステップ（例えば、溶解全血試料を生成するための、ＲＢＣ溶解緩衝液による全血の前処理溶解プロセス）が、試料溶解緩衝液への曝露、それに続く複数回の洗浄、及び８０℃、５ｍＭ ＰＯ４での溶出を含む統合試料調製プロセス経路につながる。
図３は、図２に概説した３つのプロセス、具体的には、試料調製（２）（すなわち、前溶解（４）、試料溶解（５）、ならびに洗浄（６）及び溶出（７））、増幅及び検出／読み取り（３）、を達成するための要素を含む、開示された主題による例示的なＨＴＮＡＴ自動試料分析システムを示すダイアグラムである。
図４は、開示された主題による試料調製プロセス（直接捕捉及びＣｕＴｉ標的核酸（「ＴＮＡ」）捕捉）の例示的な実施形態を示すダイアグラムである。
実施例２．磁性粒子の固定電磁石ベースの捕捉及び洗浄を組み込んだ試料調製
実施例１で説明した実施形態のそれぞれは、磁性粒子の固定電磁石ベースの捕捉を伴う少なくとも１つのステップを組み込むことによって実行することができる。固定電磁石ベースの磁性粒子の捕捉を伴う動作ステップには、限定するものではないが、混合；洗浄；及び磁性粒子の移送が含まれる。磁性粒子を混合及び洗浄する既存の方法は、一般に、機械的撹拌及び可動永久磁石を使用する磁気混合に依存している。同様に、磁性粒子をウェル間で移送する既存の方法は、磁性粒子をスリーブで覆われた磁石上に捕捉し、別のウェルに移動させること；ウェル内の液体の上部、移動カバーの下面上で磁性粒子を捕捉し、別のウェルに移動させること；ウェル内の液体の上部、固定カバーの下面上で磁性粒子を捕捉し、別のウェルに移動させること；及び油圧ロックを使用して、磁性粒子を２つの隣接するウェルの底部の間で移動させること、を含む。しかし、図１５に概説されるように、本明細書に記載されるある特定の実施形態は、少なくとも１つの固定電磁石ベースの磁性粒子の捕捉を組み込んだシステムを用いて実行することができる。例えば、限定するものではないが、図１５で特定される１８の別個の混合または洗浄位置は、磁性粒子の固定電磁石ベースの捕捉を使用して達成することができる。加えて、図１６に概説されるように、本明細書に記載される実施形態は、移送位置の別個の対である４つの対のうちの１つ以上における１つ以上の移送動作に関連して、磁性粒子の少なくとも１つの固定電磁石ベースの捕捉を組み込んだシステムを用いて実行することができる。当業者には理解されるように、図１５及び図１６で特定される個々の位置の具体的な数、配向、及び動作上の割り当て（例えば、混合、洗浄、移送、または溶出）は、所望の場合、変更することができ、それでも本開示の範囲内にとどまる。
本開示は、適切な混合、洗浄、及び移送動作を達成するために、様々な位置で固定電磁石を使用することを企図する。例えば、限定するものではないが、電磁石をウェルの右側、左側、及び／または底部に位置決めすることができる。加えて、電磁石は、一方の側が他方の側よりも高い位置に位置決めすることができる。本開示の固定電磁石は、さまざまなウェル形式と組み合わせて使用することもできる。図１７は、本開示の方法及びシステムに関連して使用するための例示的なウェル形式を示す。図１７に示される設計に追加のウェルを容易に追加することができ、容積の変更に容易に対応することができる。
ある特定の実施形態では、磁性粒子を、洗浄ウェルの反対側に交互に引き付けるように、対向する電磁石を配置することができる。しかし、電磁石の位置、タイミング、電力、及びシーケンスは完全に柔軟性がある。例えば、限定するものではないが、固定電磁石を使用して磁性粒子を部分的に収集し、この磁性粒子をウェルの底部に落下させることができる。ある特定の実施形態では、例えば、図４２Ａ～図４２Ｄに例示されるように、磁性微粒子４２０２は、複数の容器４２０６のうちの第１の容器内に存在することができる。代替的に、または追加的に、図４２Ｂに示すように、電磁石４２０４を使用して磁性微粒子を容器４２０６の壁に捕捉することができる。代替的に、または追加的に、図４２Ｃに示すように、電磁石４２０４の第２の容器への移動は、第１の容器から第２の容器への磁性微粒子４２０２の移送を誘導する。代替的に、または追加的に、磁性微粒子４２０２が第２の容器に移送された後に電磁石４２０４への電流を除去すると、図４２Ｄに示すように磁性微粒子４２０２の放出が可能になる。代替的に、または追加的に、混合、洗浄、及び／または移送を容易にするために、代替的に磁性粒子をウェルの側面に、完全に収集することができる。さらに、より低い電力で磁性粒子をゆっくりと収集することができ、またはより高い電力でより迅速に磁性粒子を収集することができる。
本明細書に開示される実施形態に関連して使用するために、異なるタイプの電磁石も企図される。例えば、ＤＣ電磁石を使用することもできるが、ＤＣ電磁石は磁性粒子を磁化する場合があるため、スイッチング周波数を変えることによって磁性粒子の残留磁気の生成を避けるために、ＤＣ電磁石と組み合わせて、またはＤＣ電磁石の代わりにＡＣ電磁石を使用することもできる。
永久磁石その代わりに（または他の混合、洗浄、または移送の戦略で）電磁石を使用すると、いくつかの利点が提供される。試料調製中の混合または移送動作では、典型的には、永久磁石を磁性粒子の範囲内または範囲外に移動させる必要がある。電磁石を使用すると、電磁石をスイッチオン／オフするだけで動作機構を排除することができる。さらに、アレイ内の隣接する磁石を連続的にスイッチオン及びオフにすることによって、磁性粒子をあるウェルから別のウェルに移動させることができる。固定電磁石ベースの粒子捕捉アプローチを組み込むと、検査ごとに１つ以上の使い捨て製品を排除することができるため、発生する固形廃棄物の量を削減することができる。固定電磁石を使用すると、特定の容積要件、及び磁性粒子をあるウェルから別のウェルに移送する際のウェルの使い捨てカバーまたは可動永久磁石も不要になる。本戦略はまた、洗浄容器の側面に隣接する可動電磁石を使用してウェル間で磁性粒子を移送することもできるが、ウェル内の磁性粒子または液体には接触せず、磁性粒子の損失及びソースウェルから行先のウェルへの液体キャリーオーバーを最小限に抑え、したがってアッセイ性能を最大化することができる。
例示的な固定電磁石ベースの粒子洗浄及び移送機構及び使い捨て「サイドスライド」ウェル（図１７に示す）に関連する粒子損失の評価は、本明細書に開示される方法及びシステムの優れた性能能力を示す。以下の表１０は、２回の試料前処理の実行の過程で失われた粒子のパーセンテージを示す。粒子の損失は、５％未満であることが好ましく、アッセイ性能への影響が最小限に抑えられ、一方、損失が２％未満であれば優れており、アッセイ性能が最大化される。
例示的な固定電磁石ベースの粒子洗浄及び移送機構及び使い捨て「サイドスライド」ウェル（図１７に示す）に関連する液体キャリーオーバーの評価は、本明細書に開示される方法及びシステムの優れた性能能力を示す。以下の表１１は、ソースウェル－洗浄１から行先のウェル－洗浄２、及びその後の行先のウェル－洗浄３への液体キャリーオーバー（この場合、グアニジンイソチオシアネートＧＩＴＣ）を示す。１５ｍＭ未満が好ましく、検査性能への影響を最小限に抑え、一方、０．５ｍＭ未満は増幅反応（ＰＣＲ及びＲＰＡなど）が許容できる範囲をかなり下回る。
実施例３：ＣｕＴｉベースの試料前処理の実施
図９は、従来の動作（「約５０分」動作）と比較した例示的なＣｕＴｉベースの試料調製プロセス（「約１０分」動作）の実施を示す。約１０分の動作では、試料（血漿／血清）をプロテイナーゼＫ、試料溶解緩衝液、及び微粒子とともに加え、撹拌しながら５０～６０℃で約５分間インキュベートする。微粒子を、スリーブ磁石、例えばプランジャを介して捕捉し、試料溶解緩衝液を含有するウェルに移送し、約１～約２分間混合する。次いで、粒子を捕捉し、水を含有するウェルに移送し、約２４～約４０秒間混合して粒子を洗浄する。このような洗浄を複数回、例えば２～３回実行すると、洗浄が約２分になる。次に、粒子を溶出緩衝液に送達し、８０℃で約３分間加熱して固相から核酸を除去する。この溶出液を含有する液体を、その後の増幅反応に使用する。
実施例４：直接捕捉ベースの試料前処理の実施
図１０は、従来の動作（「約３０分」動作）と比較した直接捕捉ベースの試料調製プロセス（「約１２分」動作）の実施を示す。約１２分間の動作で、血漿または血清などの試料を、プロテイナーゼＫ、試料溶解緩衝液、及び特異的捕捉オリゴヌクレオチドとともに加える。溶液を５８℃で約１分間、続いて９５℃で約３分間、次いで６０℃で約３分間インキュベートする。次いで、微粒子を加え、室温で約２分間インキュベートする。次いで、粒子を磁石によって捕捉し、水を含有するウェルに移送し、約１分間（ｘ２）混合して微粒子を洗浄する。次に、粒子を溶出緩衝液に送達し、８０℃で約２分間加熱して固相から核酸を除去する。この溶出液を含有する液体を、その後の増幅反応に使用する。
実施例５：デジタル検出を使用したＲＰＡベースの増幅の実施
図１１は、デジタル検出戦略と組み合わせた、開示された主題のＲＰＡ実施に関連する例示的な結果を示す。以下のプライマー及びプローブを使用して、ＨＢＶ ＤＮＡを１×１０３ＩＵ／ｒｘｎでＲＰＡ反応物に加えた。蛍光検出にＥｘｏＩＩＩ酵素を使用するのではなく、Ｎｆｏエキソヌクレアーゼを加えた。リバースプライマーは、５’末端にジゴキシゲニン（ＤＩＧ）標識を含有し、プローブは、５’末端にビオチンタグを含有する。増幅すると、アンプリコンには、ビオチン及び微粒子に結合した抗ＤＩＧモノクローナル抗体によって認識されるＤＩＧ標識が含まれる。次に、この複合体を、コンジュゲート（アルカリホスファターゼに連結したストレプトアビジン）及び検出基質と結合させ、ナノウェルに装填して画像化する。左上のグラフは、ＲＰＡ反応にＨＢＶ ＤＮＡを加えなかった場合の対照（ＲＰＡ－Ｎｅｇ）と比較した陽性ウェル（ＲＰＡ－ＨＢＶ）のパーセンテージを示す。対照反応は、従来の蛍光プローブ検出を使用して生成した（右上）。図１３は、例示的なデジタル検出戦略を、例示的な蛍光検出戦略、例えば、以下の態様６に記載の蛍光検出戦略に対して比較したものである。
実施例６：ＮＥＡＲベースの増幅の実施
図１２は、開示された主題のＮＥＡＲ実施に関連する例示的な結果を示す。ＨＣＶ ＲＮＡは、列挙されたオリゴヌクレオチドを使用してＮＥＡＲによって増幅させた。蛍光は、５６℃でインキュベートしたサーモサイクラーで時間（分）の経過とともに測定した。５００ＩＵ／反応及び３０ＩＵ／反応の両方で、水対照（点線）と比較して、陽性シグナルが観察される（実線）。
実施例７：蛍光検出を使用したＲＰＡベースの増幅の実施
図１４は、蛍光検出戦略と組み合わせた、開示された主題のＲＰＡ実施に関連する例示的な結果を示す。ＨＢＶ ＤＮＡは、列挙されたオリゴヌクレオチドを使用してＲＰＡによって増幅させた。蛍光は、４０℃でインキュベートしたサーモサイクラーで時間（分）の経過とともに測定した。５ＩＵ／反応で、水対照（灰色の線）と比較して、陽性シグナルが観察される（紫色の線）。
実施例８：ヒトパルボウイルスＢ１９及びＡ型肝炎ウイルス
ヒトパルボウイルスＢ１９（Ｂ１９）とＡ型肝炎ウイルス（ＨＡＶ）は、どちらも非エンベロープ型正二十面体ウイルスである。Ｂ１９ゲノムは、線状ｓｓＤＮＡ（＋／－）で、サイズは５．６ｋｂであり、２つのオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）：ＮＳ１及びＶＰ１をコードする。４つのＢ１９サブタイプが同定されており、ＧＴ１が臨床症例の大部分を占める。ＨＡＶゲノムは、長さ７．５ｋｂの線状ｓｓＲＮＡ（＋）で構成されている。ＨＡＶは、５’非翻訳領域（ＵＴＲ）が先行する単一のポリペプチドをコードする。この５’ＵＴＲ領域は、同定された６つのＨＡＶ株の間で主に保存されている。
Ｂ１９とＨＡＶは両方とも、ヒト、特に妊婦及び免疫不全の個体などのリスク個体群に疾患を引き起こす。どちらのウイルスも、血漿由来生成物の製造に使用される微生物不活化ステップ（例えば、ＳＤＳ処理、低温殺菌）に耐性がある。したがって、いずれかの病原体による血漿成分献血の汚染は、ヒト血漿由来生成物のレシピエントに伝染のリスクをもたらす。
試料調製では、１ｍＬの血漿または血清を銅チタン（ＣｕＴｉ）微粒子とともに０．７５ｍＬの溶解緩衝液（３．１３Ｍ ＧＩＴＣ、６．７％Ｔｗｅｅｎ－２０、１００ｍＭ トリス、ｐＨ７．８）に加える。場合によっては、プロテイナーゼＫも加える。次に、溶液を回転させながら５分間インキュベートして試料を溶解し、放出された核酸を固相に結合させる。次いで、微粒子を、磁石によって５００μｌの溶解緩衝液（洗浄１）を含有するウェルに移送し、１分間混合する。次いで、粒子を捕捉し、２５０μｌの水を含有する別のウェルに移動させ、次に１００μｌの水を含む別のウェルに移動させる（洗浄２及び３）。次に、５ｍＭ リン酸塩溶液中で８０℃にて３分間インキュベートすることにより、結合核酸を微粒子から溶出させる。
ヒトパルボウイルスＢ１９及びＡ型肝炎ウイルスの核酸配列の増幅は、増幅オリゴヌクレオチドとプローブオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせによるリコンビナーゼ－ポリメラーゼ増幅（ＲＰＡ）を使用して実行した。検査した組み合わせを表１２に示す。
Figure 2024518331000053
図１８Ａ～１８Ｄは、２つのオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）、すなわちパルボウイルスのＮＳ１及びＶＰ１のそれぞれについての２つの異なる組み合わせについてのサイクル数に対するｄＲｎ値のグラフを示す。表５に記載されているように、図１８Ａは組み合わせ１であり、図１８Ｂは組み合わせ２～４を示し、図１８Ｃは組み合わせ５を示し、図１８Ｄは組み合わせ６～８を示す。パルボ標的を、すべての組み合わせの反応条件下で増幅させ、検出可能なレベルの増幅が１０サイクル以内に発生した。組み合わせ１及び４のアンプリコンは、ＴＡＴＣＴＧＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡＴＧＣＣＴＴＡＴＣＡＴＣＣＡＧＴＡＧＣＡＧＴＣＡＴＧＣＡＧＡＡＣＣＴＡＧＡＧＧＡＧＡＡＧＡＴＧＣＡＧＴＡＴＴＡＴＣＴＡＧＴＧＡＡＧＡＣＴＴＡＣＡＣＡＡＧＣＣＴＧＧＧＣＡＡＧＴＴＡＧＣＧＴＡＣＡＡＣＴＡＣＣＣＧＧＴＡＣＴＡＡＣＴＡＴＧＴＴＧＧＧＣＣＴＧＧＣＡＡＴＧＡＧＣＴＡＣＡＡＧＣＴＧＧＧＣＣＣＣＣＧＣＡＡＡＧＴＧＣＴＧＴＴＧＡＣＡＧＴＧＣＴＧＣＡＡＧＧＡＴＴＣＡＴＧＡＣＴＴＴＡＧＧＴＡＴＡＧＣＣＡの核酸配列と少なくとも７０％類似した核酸配列を含む。組み合わせ５のアンプリコンは、ＡＧＴＧＧＴＧＧＴＧＡＡＡＧＣＴＣＴＧＡＡＧＡＡＣＴＣＡＧＴＧＡＡＡＧＣＡＧＣＴＴＴＴＴＴＡＡＣＣＴＣＡＴＣＡＣＣＣＣＡＧＧＣＧＣＣＴＧＧＡＡＣＡＣＴＧＡＡＡＣＣＣＣＧＣＧＣＴＣＴＡＧＴＡＣＧＣＣＣＡＴＣＣＣＣＧＧＧＡＣＣＡＧＴＴＣＡＧＧＡＧＡＡＴＣＡＴＴＴＧＴＣＧＧＡＡＧＣＣＣＡＧＴＴＴＣＣＴＣの核酸配列と少なくとも７０％類似した核酸配列を含む。パルボウイルスＢ１９標的の代替組み合わせのアンプリコンは、ＡＴＴＴＴＣＡＡＡＧＴＣＡＴＧＧＡＣＡＧＴＴＡＴＣＴＧＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡＴＧＣＣＴＴＡＴＣＡＴＣＣＡＧＴＡＧＣＡＧＴＣＡＴＧＣＡＧＡＡＣＣＴＡＧＡＧＧＡＧＡＡＧＡＴＧＣＡＧＴＡＴＴＡＴＣＴＡＧＴＧＡＡＧＡＣＴＴＡＣＡＣＡＡＧＣＣＴＧＧＧＣＡＡＧＴＴＡＧＣＧＴＡＣＡＡＣＴＡＣＣＣＧＧＴＡＣＴＡＡＣＴＡＴＧＴＴＧＧＧＣＣＴＧＧＣＡＡＴＧＡＧＣＴＡＣＡＡＧＣＴＧＧＧＣＣＣＣＣＧＣＡＡＡＧＴＧＣＴＧＴＴＧＡＣＡＧＴＧＣＴＧＣＡＡＧＧＡＴＴＣＡＴＧＡＣＴＴＴＡＧＧＴＡＴＡＧＣまたはＡＧＴＡＴＣＡＧＣＡＧＣＡＧＴＧＧＴＧＧＴＧＡＡＡＧＣＴＣＴＧＡＡＧＡＡＣＴＣＡＧＴＧＡＡＡＧＣＡＧＣＴＴＴＴＴＴＡＡＣＣＴＣＡＴＣＡＣＣＣＣＡＧＧＣＧＣＣＴＧＧＡＡＣＡＣＴＧＡＡＡＣＣＣＣＧＣＧＣＴＣＴＡＧＴＡＣＧＣＣＣＡＴＣＣＣＣＧＧＧＡＣＣＡＧＴＴＣＡＧＧＡＧＡＡＴＣＡＴＴＴＧＴＣＧＧＡＡＧＣＣＣＡＧＴＴＴＣＣＴＣＣＧＡＡＧＴＴＧＴＡＧＣの核酸配列と少なくとも７０％類似した核酸配列を含む。
図１８Ｅ及び１８Ｆは、単一のＨＡＶポリペプチドの５’非翻訳領域（ＵＴＲ）を標的とする２つの異なる組み合わせについての経時的なｄＲｎ値のグラフを示す。表５に記載されているように、図１８Ｅは組み合わせ９であり、図１８Ｆは組み合わせ１０～１１を示す。ＨＡＶ標的を、すべての組み合わせについての反応条件下で増幅させ、そのほとんどが２０サイクル以内に検出可能なレベルに達した。組み合わせ９のアンプリコンは、ＴＣＣＡＴＧＡＴＴＡＧＣＡＴＧＧＡＧＣＴＧＴＡＧＧＡＧＴＣＴＡＡＡＴＴＧＧＧＧＡＣＧＣＡＧＡＴＧＴＴＴＧＧＧＡＣＧＴＣＡＣＣＴＴＧＣＡＧＴＧＴＴＡＡＣＴＴＧＧＣＴＴＴＣＡＴＧＡＡＣＣＴＣＴＴＴＧＡＴＣＴＴＴＣＡＣＡＡＧＡＧＧＴＡＧＧＣＴＡＣＧＧＧＴＧＡＡＡＣＣＴＣＴＴＡＧＧＣＴＡＡＴＡＣＴＴＣＴＡＴＧＡＡＧＡＧＡＴＧＣＣＴＴＧＧＡＴＡＧＧＧＴＡＡＣＡＧＣＧＧＣＧの核酸配列と少なくとも７０％類似した核酸配列を含む。パルボウイルスＢ１９標的の代替的組み合わせのアンプリコンは、ＴＣＣＡＴＧＡＴＴＡＧＣＡＴＧＧＡＧＣＴＧＴＡＧＧＡＧＴＣＴＡＡＡＴＴＧＧＧＧＡＣＧＣＡＧＡＴＧＴＴＴＧＧＧＡＣＧＴＣＡＣＣＴＴＧＣＡＧＴＧＴＴＡＡＣＴＴＧＧＣＴＴＴＣＡＴＧＡＡＣＣＴＣＴＴＴＧＡＴＣＴＴＴＣＡＣＡＡＧＡＧＧＴＡＧＧＣＴＡＣＧＧＧＴＧＡＡＡＣＣＴＣＴＴＡＧＧＣＴＡＡＴＡＣＴＴＣＴＡＴＧＡＡＧＡＧＡＴＧＣＣＴＴＧＧＡＴＡＧＧＧＴＡＡＣＡＧＣＧＧＣＧＧＡＴＡＴＴＧＧＴＧＡＧＴの核酸配列と少なくとも７０％類似した核酸配列を含む。
実施例９：バベシア寄生虫
バベシア原虫は、マダニによって人間に伝染し、バベシア症として知られる赤血球の感染を引き起こす。バベシアは、米国で最も一般的な輸血感染する寄生虫であり、主にヒトの全血中の４つの主要なバベシア種（Ｂ．ｍｉｃｒｏｔｉ、Ｂ．ｄｕｎｃａｎｉ、Ｂ．ｄｉｖｅｒｇｅｎｓ、Ｂ．ｖｅｎａｔｏｒｕｍ）によって発生する。
全血試料は、試料対溶解緩衝液を１：１の比率で混合する前処理ステップで、試料１５０ｕｌを溶解緩衝液８５０ｕｌに加えることによって処理することができる。前処理に続いて、溶解物は上記の実施例８と同じプロセスに従う。バベシア寄生虫の核酸配列の増幅は、増幅オリゴヌクレオチドとプローブオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせによるリコンビナーゼ－ポリメラーゼ増幅（ＲＰＡ）を使用して実行した。バベシアの標的核酸は、１８ＳリボソームＲＮＡ遺伝子内にある。検査した組み合わせを表１３に示す。それぞれの組み合わせで陽性のシグナルが得られた。
Figure 2024518331000054
図１９Ａ～１９Ｄは、組み合わせのそれぞれについてのサイクル数に対するｄＲｎ値のグラフを示す。バベシア寄生虫の核酸標的を、すべての組み合わせの反応条件下で、４つの主要なバベシア種すべてについて増幅させた。
実施例１０：ＨｘＶ
試料調製を、上記の実施例８で概説したように実行した。複数のＨｘＶウイルス標的（ヒト免疫不全ウイルス１（ＨＩＶ－１）、ヒト免疫不全ウイルス２（ＨＩＶ－２）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、及びＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ））の核酸配列の増幅は、増幅オリゴヌクレオチドとプローブオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせによるリコンビナーゼ－ポリメラーゼ増幅（ＲＰＡ）を使用して実行した。検査した組み合わせを表１４に示す。
加えて、このアッセイでは、カボチャ植物のヒドロキシピルビン酸レダクターゼ遺伝子（ＨＰＲ）内の、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、及びＨＣＶ配列に無関係な領域を増幅する内部対照を使用する。内部対照ＲＮＡを、コリファージＭＳ２パッケージング配列（ａｒｍｏｒｅｄ ＲＮＡ）及び、ＴＡＡＴＧＡＡＧＴＡＧ ＧＡＣＴＴＴＧＧＴＴＣＴＡＴＴＴＴＧＴＴＧＧＴＴＡＴＴＧＡＧＣＣＡＧＡＧＴＡＡＴＧＧＴＴＡＡＴＡＧＧＡＧＣＡＧＴＴＧＧＧＧＧＣＡＴＴＣＧＴＡＴＴＴＡＡＣＴＧＴＣＡＧＡＧＧＴＧＡＡＡＴＴＣＴＴＡＧＡＴＴＴＧＴＴＡＡＡＧＡＣＧＡＡＣＴＡＣＴＧＣＧＡＡＡＧＣＡＴＴＴＧＣＣＡＡＧＧＡＴＧＴＴＴＴＣＡＴＴＡＡＴＣＡＡＧＡＡＣＧＡＡＡＧＴＴＡＧＧＧＧを含むプローブオリゴヌクレオチド配列を有するＴＡＡＴＧＡＡＧＴＡＧＧＡＣＴＴＴＧＧＴＴＣＴＡＴＴＴＴＧＴＴＧＧＴ ＴＡＴＴＧＡＧＣＣＡＧＡＧＴＡＡＴＧＧＴＴＡＡＴＡＧＧＡＧＣＡＧＴＴＧＧＧＧＧＣＡＴＴＣＧＴＡＴＴＴＡＡＣＴＧＴＣＡＧＡＧＧＴＧＡＡＡＴＴＣＴＴＡＧＡＴＴＴＧＴＴＡＡＡＧＡＣＧＡＡＣＴＡＣＴＧＣＧＡＡＡＧＣＡＴＴＴＧＣＣＡＡＧＧＡ及びＴＡＡＴＧＡＡＧＴＡＧＧＡＣＴＴＴＧＧＴＴＣＴＡＴＴＴＴＧＴＴＧＧＴＴ ＡＴＴＧＡＧＣＣＡＧＡＧＴＡＡＴ ＧＧＴＴＡＡＴＡＧＧＡＧＣＡＧＴＴＧＧＧＧＧＣＡＴＴＣＧＴＡＴＴＴＡＡＣＴＧＴＣＡＧＡＧＧＴＧＡＡＡＴＴＣＴＴＡＧＡＴＴＴＧＴＴＡＡＡＧＡＣＧＡＡＣＴＡＣＴＧＣＧＡＡＡＧＣＡＴＴＴＧＣＣＡＡＧＧＡＴＧＴＴＴＴＣＡＴＴＡＡＴＣＡＡＧＡＡＣＧＡＡＡＧＴを含む増幅されたオリゴヌクレオチドとともに、バクテリオファージタンパク質内に封入した。
Figure 2024518331000055
包括性は、ＨｘＶウイルス配列の種々の遺伝子型または群との相同性について各プライマー及びプローブの配列を分析することによって実証した（表１５）。
Figure 2024518331000056
図２０Ａ～２０Ｄは、組み合わせのそれぞれについての経時的なｄＲｎ値のグラフを示す。反応条件下で、ＨＩＶ－１（図２０Ａ）、ＨＩＶ－２（図２０Ｂ）、ＨＣＶ（図２０Ｃ）、及びＨＢＶ（図２０Ｄ）のそれぞれについて増幅が見られ、検出可能なレベルの増幅は、ほとんどの場合、およそ１５分以内に発生した。
実施例１１：逆転写酵素の評価
図２２は、ＥＩＡＶ－ＲＴの存在下でのＨＣＶのＲＰＡベースの分析で得られた結果を示す。試料調製を、上記の実施例８で概説したように実行した。核酸配列の増幅は、図２１に示すプロトコールに従って、種々の酵素とともにＲＰＡを使用して実行した。以下の逆転写酵素（ＲＴ）：ＯｍｎｉＳｃｒｉｐｔ（Ｑｉａｇｅｎ）、ＳｅｎｓｉＳｃｒｉｐｔ（Ｑｉａｇｅｎ）、ＭｏｎｓｔｅｒＳｃｒｉｐｔ（Ｅｐｉｃｅｎｔｒｅ）、Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｒ（Ｒｏｃｈｅ）、ＨＩＶ ＲＴ（Ａｍｂｉｏｎ）、Ｓｕｐｅｒｓｃｒｉｐｔ ＩＩＩ （Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ＴｈｅｒｍｏＳｃｒｉｐｔ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、Ｔｈｅｒｍｏ－Ｘ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ＩｍＰｒｏｍ ＩＩ（Ｐｒｏｍｅｇａ）（データは示さず）を、図２１の方法を使用して比較した。図２２に示されるように、ＥＩＡＶ－ＲＴは、ＨＣＶに対して最適な活性を提供した。ＥＩＡＶ－ＲＴは、ＨＢＶ検出に影響を与えることなく、ＨＩＶ－１検出を改善した（データは示さず）。
実施例１２：ＨＣＶ／ＨＢＶマルチプレックス分析の改善
図２３Ａ～２３Ｂは、異なる濃度のＨＢＶオリゴヌクレオチド（すなわち、プライマー及びプローブ）の存在下でのＨＣＶ／ＨＢＶマルチプレックス分析で得られた結果を示す。試料調製を、上記の実施例８で概説したように実行した。ＨＣＶ及びＨＢＶ核酸配列の増幅は、図２１に示すプロトコールに従って、増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドの種々の組み合わせによるリコンビナーゼ－ポリメラーゼ増幅（ＲＰＡ）を使用して実行した。図２３Ｂに示すように、ＨＣＶ検出は、濃度が低減したＨＢＶオリゴヌクレオチドの存在下で改善された。ＨＢＶオリゴヌクレオチドの低減は、ＨＢＶ検出に影響を与えなかった（データは示さず）。
実施例１３：ＨｘＶシングルプレックス及びマルチプレックス分析
従来のシングルプレックスＲＰＡベースの分析に関連する試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）と本実施例のＨｘＶマルチプレックス分析に関連する試薬濃度の両方を、表１６に特定する。増幅前の試料調製を、上記の実施例８で概説したように実行した。
Figure 2024518331000057
Figure 2024518331000058
図２４は、ＨＩＶ－１シングルプレックス分析で得られた結果を示す。ＨＩＶ－１核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のシングルプレックス試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
図２５は、ＨＩＶ－２シングルプレックス分析で得られた結果を示す。ＨＩＶ－２核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のシングルプレックス試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
図２６は、ＨＢＶシングルプレックス分析で得られた結果を示す。ＨＢＶ核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のシングルプレックス試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
図２７は、ＨＣＶシングルプレックス分析で得られた結果を示す。ＨＣＶ核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のシングルプレックス試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
図２８は、ＨＩＶ－１／ＨＢＶ＋内部対照マルチプレックス分析で得られた結果を示す。ＨＩＶ－１／ＨＢＶ＋内部対照核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のマルチプレックス試薬濃度に従って、本明細書で同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した（図２６－ＨＩＶ－１；図２８－ＨＢＶ；及び実施例１０－内部対照）。
図２９は、ＨＩＶ－２／ＨＣＶ＋内部対照マルチプレックス分析で得られた結果を示すグラフである。ＨＩＶ－２／ＨＣＶ＋内部対照核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のマルチプレックス試薬濃度に従って、本明細書で同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した（図２５－ＨＩＶ－２；図２７－ＨＣＶ；及び実施例１０－内部対照）。
実施例１４：ＨＡＶ及びパルボウイルスＢ１９マルチプレックス分析
図３０Ａ～３０Ｂは、ＨＡＶ／パルボウイルスＢ１９マルチプレックス分析で得られた結果を示す。全血試料は、試料対溶解緩衝液を１：１の比率で混合する前処理ステップで、試料１５０ｕｌを溶解緩衝液８５０ｕｌに加えることによって処理することができる。前処理に続いて、溶解物は上記の実施例８と同じプロセスに従う。ＨＡＶ／パルボウイルスＢ１９核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１７のマルチプレックス試薬濃度に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
実施例１５：パルボウイルスＢ１９の定量分析
パルボウイルスＢ１９の定量的増幅を生成するために、陽性血漿試料の段階希釈物を調製し、試料抽出にかけて核酸を単離した。実施例１４で概説した試料抽出に続いて、表１７で特定した試薬濃度を使用して、本明細書に記載したようにＲＰＡ反応を設定した、例えば、図２１を参照のこと。
Figure 2024518331000059
この検査では、ＲＰＡ反応が直線性を示したかどうかを決定し、配合変更（例えば、酵素濃度、表１７を参照のこと）を行うことにより、標的レベル間のより大きな分離及び直線性の改善が可能になった。
定量のために、反応中に増幅シグナルが指定された閾値（サイクル閾値、Ｃｔ）にわたる時間を測定する。次に、これを公知の濃度の試料のシグナルと比較した（キャリブレータ）。未知の試料の濃度は、キャリブレータのＣｔと比較して決定することができる。図３１Ａは、異なる標的核酸濃度におけるパルボウイルスＢ１９のシングルプレックスＲＰＡのグラフである。図３１Ｂ及び図３１Ｃは、アッセイの直線性を示す結果、ならびにグラフの基礎となる特定のデータとの関係を示すグラフである（図３１Ｄ）。
実施例１６：チクングニアウイルスＲＰＡ分析
本明細書に記載のプライマー及びプローブと整列させたチクングニアウイルスゲノムを図３２Ａに示し、プライマー及びプローブオリゴヌクレオチドの配列を図３２Ｄに提示する。示された増幅及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したチクングニアウイルスのシングルプレックスＲＰＡのグラフを、図３２Ｂ及び図３２Ｃに提供する。試料調製を、上記の実施例８で概説したように実行した。チクングニアウイルス核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のシングルプレックス試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
実施例１７：デングウイルスのＲＰＡ分析
図３３Ａ～３３Ｃは、示された条件（図３３Ｂ）を使用したデングウイルスのシングルプレックスＲＰＡのグラフ、ならびに示されたプライマー及びプローブの配列（図３３Ｃ）を含む。試料調製は、上記の実施例８で概説したように実施した。デングウイルス核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のシングルプレックス試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
実施例１８：西ナイルウイルスＲＰＡ分析
図３４Ａは、西ナイルウイルス（ＷＮＶ）ゲノムに対するプライマー及びプローブの位置を示し、示されたプライマー及びプローブオリゴヌクレオチドの配列は、図３４Ｄに提示する。示された増幅及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したＷＮＶのシングルプレックスＲＰＡのグラフを、図３４Ｂ及び図３４Ｃに提示する。異なる濃度の標的核酸で示された増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したＷＮＶのシングルプレックスＲＰＡのグラフを、図３４Ｅに提示する。試料調製は、上記の実施例８で概説したように実施した。西ナイルウイルス核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のシングルプレックス試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
実施例１９：ジカウイルスＲＰＡ分析
図３５Ａは、ジカウイルスゲノムに対するプライマー及びプローブのオリゴヌクレオチドの位置を示し、示されたプライマー及びプローブの配列を図３５Ｃに提示する。示された増幅オリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを使用したジカウイルスのシングルプレックスＲＰＡのグラフを、図３５Ｂに示す。試料調製は、上記の実施例８で概説したように実施した。ジカウイルス核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のシングルプレックス試薬濃度（「シングルプレックス濃度」）に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
実施例２０：バベシアＲＰＡ分析
図３６Ａ～３６Ｂは、示されたバベシア増幅及びプローブオリゴヌクレオチド（図３６Ｃ）及び実施例１０に記載の内部対照核酸を使用した、バベシアのマルチプレックスＲＰＡ（図３６Ａ）及び内部対照（図３６Ｂ）のグラフである。試料調製は、上記の実施例１４で概説したように実施した。バベシア及び内部対照核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のマルチプレックス試薬濃度に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
実施例２１：マラリアＲＰＡ分析
図３７Ａ～３７Ｂは、示されたマラリア増幅及びプローブオリゴヌクレオチド（図３７Ｃ）及び実施例１０に記載の内部対照核酸を使用した、マラリアのマルチプレックスＲＰＡ（図３７Ａ）及び内部対照（図３７Ｂ）のグラフである。試料調製を、上記の実施例１４で概説したように実行した。マラリア及び内部対照核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のマルチプレックス試薬濃度に従って、同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した。
実施例２２：ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）ＲＰＡ分析
図３８Ａ～３８Ｂは、第１の標的配列（組み合わせ１）図３８Ａ、または第２の標的配列（組み合わせ２～５）図３８Ｂを対象としたＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）のＲＰＡ分析のグラフを含む。試料調製を、上記の実施例８で概説したように実行した。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）核酸の増幅は、以下のプライマーオリゴヌクレオチドとプローブオリゴヌクレオチドの組み合わせ（配列は上に提供する）を用いて、図２１に示すプロトコール及び表１６のマルチプレックス試薬濃度に従って、ＲＰＡを使用して実行した。
Figure 2024518331000060
実施例２３：病原体または感染因子検出の結果が出るまでの時間（ＴＴＲ）
図３９Ａ～３９Ｂは、ＨＩＶ－１（図３９Ａ）及びＨＢＶ（図３９Ｂ）のマルチプレックスＲＰＡのグラフを含み、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す。試料調製を、上記の実施例８で概説したように実行した。ＨＩＶ－１及びＨＢＶ核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のマルチプレックス試薬濃度に従って、本明細書で同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した（図２４－ＨＩＶ－１及び図２６－ＨＢＶ）。
図４０Ａ～４０Ｂは、ＨＩＶ－２（図４０Ａ）及びＨＣＶ（図４０Ｂ）のマルチプレックスＲＰＡのグラフを含み、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す。ＨＩＶ－２及びＨＣＶ核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のマルチプレックス試薬濃度に従って、本明細書で同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した（図２５－ＨＩＶ－２及び図２７－ＨＣＶ）。
図４１Ａ～４１Ｂは、パルボ（図４１Ａ）及びＨＡＶ（図４１Ｂ）のマルチプレックスＲＰＡのグラフを含み、示された検出限界が、示された時間枠内で本開示の方法を使用して達成され得ることを示す。ＨＡＶ及びパルボウイルスＢ１９核酸の増幅は、図２１に示されるプロトコール及び表１６のマルチプレックス試薬濃度に従って、本明細書で同定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドとともにＲＰＡを使用して実行した（図３０）。
実施例２４：ＨｘＶマルチプレックスＲＰＡ
図４４Ａ～４４Ｄは、本開示の方法を使用して、示された検出限界が達成され得ることを示す、ＨＩＶ－１（図４４Ａ）及びＨＩＶ－２（図４４Ｂ）、ＨＢＶ（図４４Ｃ）、及びＨＣＶ（図４４Ｄ）についてのマルチプレックスＲＰＡのグラフを含む。試料調製を、上記の実施例８で概説したように実行した。核酸の増幅は、表１８で特定されたプライマーオリゴヌクレオチド及びプローブオリゴヌクレオチドを用いたＲＰＡを使用して実行した。
Figure 2024518331000061
核酸の増幅は、表１９のマルチプレックス試薬濃度でＲＰＡを使用して実行した。
Figure 2024518331000062
実施例２５：カルーセル混合
溶解チューブの内容物の混合は、試料搬送機の連続振動、例えば回転式試料調製カルーセルの連続回転を使用して実行した。図６４Ａを参照すると、試料搬送機は回転式カルーセルを含むことができる。本明細書で具体化されるように、使用された試料搬送機は、１１７ｍｍの内半径Ｒ１及び１３３ｍｍの外半径Ｒ２を有していた。回転式カルーセルを回転させるために電気モータを使用した。使用した電気モータは、最大モータ速度が１秒あたり６，９００モータステップ、最大モータ加速度が１秒２あたり３４，５００モータステップ、モータ１回転あたり４，０００モータステップであった。電気モータは、カルーセル１回転あたりのモータ回転１３．４４に相当する３３６：２５のギア比を使用して、回転式カルーセルに結合させた。
円錐形の底部及び１度の抜き勾配を有する溶解チューブを、回転式カルーセルに装填した。この実施例で使用される溶解チューブの構成は、図６９Ｃ及び６９Ｄに示される例示的な溶解チューブの構成と同様であった。この実施例で使用される溶解チューブの１度の抜き勾配を、溶解チューブの垂直軸に対する溶解チューブ側壁の角度として測定した。この実施例で使用した溶解チューブは、側壁の高さが約５０ｍｍであり、溶解チューブの開口部で測定した直径が約１６ｍｍであった。さらに、この実施例で使用した溶解チューブは、直径が、円錐形の底部より上の溶解チューブの底部で測定するとおよそ１５ｍｍであった。この実施例で使用した溶解チューブは、円錐形の底部を有しており、円錐形の底部は溶解チューブの垂直軸に対しておよそ６０度の角度で溶解チューブの側壁から延びていた。２ｍｌの液体を各溶解チューブに入れた。
カルーセルを時計回り及び反時計回りに連続的に回転させることによって、カルーセルを連続的に振動させて、溶解チューブの内容物を混合した。例の目的で、カルーセルの回転を、以下のように実行した：カルーセルが２００モータカウント回転する１２８ミリ秒の往復周期を使用して、カルーセルを時計回りに２００モータカウント回転させた。カルーセルは、５ミリ秒の滞留時間の間一時停止し、その後１２８ミリ秒の往復周期を使用して２００モータカウントの反時計回り回転を行った。２００モータカウントの時計回り回転とそれに続く２００モータカウントの反時計回り回転のパターンを、およそ５．２秒間繰り返し、その後、溶解チューブの内容物が完全に混合していることが分かった。
図７６は、記載されたカルーセルの連続する時計回り及び反時計回りの回転中の溶解チューブの内容物を示す。示されているように、カルーセルの回転により溶解チューブが円弧状で移動し、溶解チューブの液体内容物中に渦が形成された。上述したように、溶解チューブの時計回り及び反時計回りの連続回転中に溶解チューブ内で渦が形成されるのは、カルーセルの回転及び加速の結果として、溶解チューブが円弧状で移動する間の、溶解チューブの内壁部分及び外壁部分での異なる加速力の結果である可能性がある。この実施例では、上述のように時計回り及び反時計回りに連続的に回転させると、およそ１．３秒以内に溶解チューブの液体内容物内に渦が形成された。この実施例では、溶解チューブの内容物の混合中、溶解チューブの液体内容物は、溶解チューブの底部上におよそ２４ｍｍの混合高さを有していた。上述のように、カルーセルの回転動作を利用して溶解チューブの内容物を混合することは有益であり、とりわけ、混合中に使い捨てカバーなどで溶解チューブを覆う必要性を低減または排除することができる。例えば、図７６に示されるように、およそ２４ｍｍの混合高さを有する溶解チューブ内に液体の渦を形成することによって、混合中に溶解チューブの液体内容物がこぼれるリスクを低減することができる。
実施例２６：ＨＴＮＡＴ用の１２個の試料のオンボードプーリング
この実施例は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なハイスループット核酸検査（ＨＴＮＡＴ）システムを使用して、試料調製カルーセル上で血清または血漿試料などの１２個の試料をオンボードプーリングするための例示的な方法を実証する。図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステムは、本明細書に記載されているように、試料搬送機、例えば試料調製カルーセル６８０５を含むことができる。図８７Ｂに示す例示的な試料調製カルーセル６８０５を参照すると、試料調製カルーセル６８０５は、試料調製カルーセルの外周の周りに容器を保持するための２８個の位置を含むことができる。本明細書で具体化されるように、容器は溶解チューブであり得る。ここでは、Ｌ１～Ｌ２１という表記を、試料調製カルーセル上の位置を参照して使用する。この例の目的で、カルーセルは、カルーセルの移動間に約２４秒の間隔を置いて、ロックステップ方式で動作するように構成できる。本明細書でさらに具体化されるように、ピペッタ、例えば試料／試薬ピペッタ６８１１は、ロボットガントリピペッタであってもよい。上述のように、ピペッタ、例えば試料／試薬ピペッタ６８１１は、使い捨てピペットチップを利用して、システム内の試料及び／またはプール試料を吸引及び分注することができる。
例の目的で、試料調製カルーセル６８０５上での１２個の試料のプーリングは、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムを参照して、以下のように実行することができる。複数の試料を、試料装填領域、例えば試料装填領域３１０２で受入れることができる。複数の試料は、少なくとも１２個の試料を含むことができる。少なくとも１２個の試料を試料装填領域から吸引位置６８９２に移送することができる。例えば、本明細書で具体化されるように、各試料は、試料チューブラック６８０２内のチューブ内に存在することができ、試料チューブラック６８０２及びその中の試料チューブは、本明細書でさらに説明されるように、シャトル６８９０を使用して吸引位置６８９２に移動することができる。第１及び第２の試料は、吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから、試料調製カルーセル６８０５上の試料分注位置Ｌ４にある第１容器１２２１に移送することができる。次いで、試料調製カルーセル６８０５は、第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５に移送することができ、第３及び第４の試料を、吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから第１の中間位置Ｌ５にある第１の容器に移送することができる。次いで、試料調製カルーセル６８０５は、第１の容器１２２１を第２の中間位置Ｌ６に搬送することができ、追加の試料を第１の容器１２２１に移送して、プール試料に追加の試料を加えることができる。このプロセスは継続することができ、追加の試料を、連続した中間位置でプール試料に加えることができる。
限定ではなく例の目的で、以下の表、すなわち表２０は、試料調製カルーセル６８０５上に１２個の試料をプールするための例示的なプーリングプロセスを示す。
Figure 2024518331000063
Figure 2024518331000064
表２０に示す例示的なプールプロセスに示すように、試料分注位置Ｌ４及び連続する中間位置（例えば、位置Ｌ５～Ｌ８）で、プール試料に２つの試料を加えることができる。本明細書でさらに具体化されるように、プール試料は、各中間位置で混合することができる。プール試料を混合することにより、プール試料内で個々のドナー試料のそれぞれを均一に分布させることができる。
本明細書に具体化されるように、中間位置Ｌ９において、試料１～１０を含むプール試料は、中間位置Ｌ９にある第１の容器１２２１から、試料調製カルーセル６８０５の試料分注位置Ｌ４にある第２の容器１２２２に移送することができ、試料１１及び１２を、試料分注位置Ｌ４で第２の容器１２２２に移送して、プール試料に試料１１及び１２を加えることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料／試薬ピペッタ６８１１は、吸引位置６８９２から試料１１を吸引し、試料分配位置Ｌ４で第２の容器１２２２に試料１１を分注することができる。試料／試薬ピペッタ６８１１は、吸引位置６８９２から試料１２をさらに吸引することができ、同じ使い捨てピペットチップを用いて、試料／試薬ピペッタ６８１１は、試料１～１０を含むプール試料を中間位置Ｌ９から吸引し、試料１～１０及び１２を、試料分注位置Ｌ４の第２の容器１２２２に分注し、プール試料に試料１１及び１２を加える。
試料プールの最後の試料（例えば、所望の１２のプールサイズの試料１１及び１２）を第２の容器１２２２に直接加えることにより、プール試料内の個々のドナー試料のそれぞれのより均一な分布を達成し、他方、所望のプールサイズを達成するために必要なロックステップの数を最小限に抑えることができる。例えば、試料１１及び１２を、第１の容器１２２１に移送し、プール試料を同じロックステップ内で第１の容器１２２１から吸引する場合、試料１１及び１２には、選択したロックステップ時間によっては、プール試料を吸引する前にプール試料と混合するのに十分な時間がなかった。例えば、ピペッタによって容器の内容物全体が吸引されない場合があるため、吸引後にプール試料の一部が第１の容器１２２１内に残る可能性がある。したがって、吸引される液体の体積が、プール試料中の個々の試料の均一な分布を含むことができるように、ピペッタによる吸引前にプール試料が適切に混合されることを保証することが有益であり得る。
限定ではなく例の目的で、吸引位置６８９２から吸引される各試料の体積は、約８０μＬ～約９０μＬの間であり得、プール試料は約９６０μＬ～約１０８０μＬの間であり得る。本明細書で具体化されるように、プール試料の体積は約１０００μＬであり得る。本明細書に具体化されるように、所望のプール試料体積が１０００μＬである場合、プール試料を形成するために使用される成分試料それぞれの体積は、１０００μＬをプール試料中の試料数で割ったものであり得る（例えば：１０００μＬを１２試料で割ったもの、すなわち約８３μＬ）。
本明細書に記載されるように、試料１～１２をプールした後、プール試料に対して追加の試料調製を実行して、ＨＴＮＡＴ用のプール試料をさらに調製することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、追加の試料調製は溶解プロセスであってもよく、溶解緩衝液、プロテアーゼ、及びＣｕＴｉ被覆微粒子を含む試薬を、第２の容器１２２２に加えることができ、プール試料を、搬送経路に沿って継続的に搬送しながら、試料調製カルーセル上の第２の容器１２２２内で溶解することができる。
プール試料からの核酸を、試料調製カルーセル６８０５の試料捕捉及び移送位置Ｌ１９で捕捉し、核酸分析のために移送することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、磁気チップを含む粒子移送機構６８０３を使用して、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、第２の容器１２２２から捕捉し、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、プール試料からの核酸の洗浄及び溶出のために移送することができる。本明細書でさらに具体化されるように、次いで、プール試料中の複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の増幅及び検出のために、溶出液を増幅及び検出システム、例えば増幅及び検出システム６８０７に移送することができる。
本明細書で具体化されるように、１２個の試料を約３分未満で、試料調製カルーセル上にプールすることができる。例示の目的で、本明細書に具体化されるように、血漿または血清の試料などの１２個の試料は、吸引位置６８９２からの第１の試料の吸引から試料分注位置にある第２の容器１２２２へのプール試料の分注まで、約１４４秒で試料調製カルーセル上にプールすることができる。
図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示すような例示的なＨＴＮＡＴシステムは、１時間あたりおよそ１５０個の個々のドナーの血清または血漿試料のスループットを有することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、血清または血漿試料の処理は、本明細書に記載されるように、溶解プロセスならびに増幅及び検出プロセスを含むことができる。追加的に、または代替的に、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定について、結果を得るまでの時間を約２０～約４５分とすることができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、血清または血漿の個々のドナー試料を処理する場合、結果が得られるまでの時間を約３５分とすることができる。
本明細書で具体化されるように、オンボード試料プーリングは、結果が得られるまでの時間の性能への影響を最小限に抑えながら、試料スループットを改善させることができる。例の目的であり、本明細書に具体化されるように、上述のように１２のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間当たり１２個の血清または血漿試料のおよそ２５プールのスループットを有することができ、これは、１時間あたりおよそ３００個の血清または血漿の個々のドナー試料及び／または１時間あたりおよそ３００個の試料吸引のスループットを表す。例の目的で、本明細書で具体化されるように、上述のように１２のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間あたり約２５回の増幅を実行することができる。追加的または代替的に、上述のように１２のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、本明細書でさらに説明するように、プール試料からの核酸を含む溶出液を分割して２つの増幅容器に入れることなどにより、１時間あたり約５０回の増幅を行うことができる。
追加的に、または代替的に、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、プール試料の核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または非存在を決定するために、結果が得られるまでの時間を約２０～約４５分とすることができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、１２個の血清または血漿試料のプールを処理する場合、結果が得られるまでの時間を約３８分とすることができる。例えば、本明細書で具体化されるように、本明細書に記載のオンボードプーリングは、結果が得られるまでの時間の性能への影響を最小限に抑えながら、スループットを約２倍にすることができる。
実施例２７：ＨＴＮＡＴ用の１８個の試料のオンボードプーリング
この実施例は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステムを使用して、試料調製カルーセル上で血清または血漿試料などの１８個の試料をオンボードプーリングするための例示的な方法を実証する。図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステムは、本明細書に記載されているように、試料調製カルーセルを含むことができる。図８８Ｂに示す例示的な試料調製カルーセル６８０５を参照すると、試料調製カルーセル６８０５は、試料搬送機の外周の周りに容器を保持するための２８個の位置を含むことができる。本明細書で具体化されるように、容器は溶解チューブであり得る。ここでは、Ｌ１～Ｌ２１という表記を、試料調製カルーセル上の位置を参照して使用する。この例の目的で、カルーセルは、カルーセルの移動間に約２４秒を置いて、ロックステップ方式で動作するように構成することができる。本明細書でさらに具体化されるように、ピペッタ、例えば試料／試薬ピペッタ６８１１は、ロボットガントリピペッタであってもよい。上述のように、ピペッタ、例えば試料／試薬ピペッタ６８１１は、使い捨てピペットチップを利用して、システム内の試料及び／またはプール試料を吸引及び移送することができる。
例の目的で、試料調製カルーセル６８０５上での１８個の試料のプーリングは、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムを参照して、以下のように実行することができる。複数の試料を、例えば吸引位置６８９２ ３１０２で受入れることができる。複数の試料は、少なくとも１８個の試料を含むことができる。第１及び第２の試料は、吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから、試料調製カルーセル６８０５上の試料分注位置Ｌ４にある第１容器１２２１に移送することができる。次いで、試料調製カルーセル６８０５は、第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５に移送することができ、第３及び第４の試料を、吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから第１の中間位置Ｌ５にある第１の容器に移送することができる。次いで、試料調製カルーセル６８０５は、第１の容器１２２１を第２の中間位置Ｌ６に搬送することができ、追加の試料を第１の容器１２２１に移送して、プール試料に追加の試料を加えることができる。このプロセスは継続することができ、追加の試料を、連続した中間位置でプール試料に加えることができる。
限定ではなく例の目的で、以下の表、すなわち表２１は、試料調製カルーセル６８０５上に１８個の試料をプールするための例示的なプーリングプロセスを示す。
Figure 2024518331000065
Figure 2024518331000066
表２１に示す例示的なプールプロセスに示すように、試料分注位置Ｌ４及び連続する中間位置（例えば、位置Ｌ５～Ｌ１１）で、プール試料に２つの試料を加えることができる。本明細書でさらに具体化されるように、プール試料は、各中間位置で混合することができる。プール試料を混合することにより、プール試料内で個々のドナー試料のそれぞれを均一に分布させることができる。
本明細書に具体化されるように、中間位置Ｌ１２において、試料１～１６を含むプール試料は、中間位置Ｌ１２にある第１の容器１２２１から、試料調製カルーセル６８０５の試料分注位置Ｌ４にある第２の容器１２２２に移送することができ、試料１７及び１８を、試料分注位置Ｌ４で第２の容器１２２２に移送して、プール試料に試料１７及び１８を加えることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料／試薬ピペッタ６８１１は、吸引位置６８９２から試料１７を吸引し、試料分配位置Ｌ４で第２の容器１２２２に試料１７を分注することができる。試料／試薬ピペッタ６８１１は、吸引位置６８９２から試料１８をさらに吸引することができ、同じ使い捨てピペットチップを用いて、試料／試薬ピペッタ６８１１は、試料１～１６を含むプール試料を中間位置Ｌ１２から吸引し、試料１～１６及び１８を、試料分注位置Ｌ４の第２の容器１２２２に分注し、プール試料に試料１７及び１８を加える。上記のように、試料プールの最後の試料（例えば、所望の１８のプールサイズの試料１７及び１８）を第２の容器１２２２に直接加えることにより、プール試料内の個々のドナー試料のそれぞれのより均一な分布を達成し、他方、所望のプールサイズを達成するために必要なロックステップの数を最小限に抑えることができる。
限定ではなく例の目的で、吸引位置６８９２から吸引される各試料の体積は、約５０μＬ～約６０μＬの間であり得、プール試料は約９００μＬ～約１０８０μＬの間であり得る。本明細書で具体化されるように、プール試料の体積は約１０００μＬであり得る。本明細書に具体化されるように、所望のプール試料体積が１０００μＬである場合、プール試料を形成するために使用される成分試料それぞれの体積は、１０００μＬをプール試料中の試料数で割ったものであり得る（例えば：１０００μＬを１８試料で割ったもの、すなわち約５６μＬ）。
本明細書に記載されるように、試料１～１８をプールした後、プール試料に対して追加の試料調製を実行して、ＨＴＮＡＴ用のプール試料をさらに調製することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、追加の試料調製は溶解プロセスであってもよく、溶解緩衝液、プロテアーゼ、及びＣｕＴｉ被覆微粒子を含む試薬を、第２の容器１２２２に加えることができ、プール試料を、搬送経路に沿って継続的に搬送しながら、試料調製カルーセル上の第２の容器１２２２内で溶解することができる。
プール試料からの核酸を、試料調製カルーセル６８０５の試料捕捉及び移送位置Ｌ１９で捕捉し、核酸分析のために移送することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、磁気チップを含む粒子移送機構６８０３を使用して、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、第２の容器１２２２から捕捉し、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、プール試料からの核酸の洗浄及び溶出のために、洗浄及び溶出システム、例えば洗浄及び溶出システム６８０１へ移送することができる。本明細書でさらに具体化されるように、次いで、プール試料中の複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の検出のために、溶出液を増幅及び検出システム、例えば増幅及び検出システム６８０７に移送することができる。
本明細書で具体化されるように、１８個の試料を約４分未満で、試料調製カルーセル上にプールすることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、血漿または血清の試料などの１８個の試料は、吸引位置６８９２からの第１の試料の吸引から試料分注位置にある第２の容器へのプール試料の分注まで、約２１６秒で試料搬送機上にプールすることができる。
図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示すような例示的なＨＴＮＡＴシステムは、１時間あたりおよそ１５０個の個々のドナーの血清または血漿試料のスループットを有することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、血清または血漿試料の処理は、本明細書に記載されるように、溶解プロセスならびに増幅及び検出プロセスを含むことができる。追加的に、または代替的に、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定について、結果を得るまでの時間を約２０～約４５分とすることができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、血清または血漿の個々のドナー試料を処理する場合、結果が得られるまでの時間を約３５分とすることができる。
本明細書で具体化されるように、オンボード試料プーリングは、結果が得られるまでの時間の性能への影響を最小限に抑えながら、試料スループットを改善させることができる。例示の目的であり、本明細書に具体化されるように、上述のように１８のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間当たり１８個の血清または血漿試料のおよそ１６～１７プールのスループットを有することができ、これは、１時間あたりおよそ２８８～３０６個の血清または血漿の個々のドナー試料のスループットを表す。例の目的であり、本明細書に具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間当たり１８個の血清または血漿試料のおよそ１６．７プールのスループットを有することができ、これは、１時間あたりおよそ３００個の血清または血漿の個々のドナー試料及び／または１時間あたりおよそ３００個の試料吸引のスループットを表す。例の目的で、本明細書で具体化されるように、上述のように１８のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間あたり約１６．７回の増幅を実行することができる。追加的または代替的に、上述のように１８のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、本明細書でさらに説明するように、プール試料からの核酸を含む溶出液を分割して２つの増幅容器に入れることなどにより、１時間あたり約３３．４回の増幅を行うことができる。
追加的に、または代替的に、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、プール試料の核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または非存在を決定するために、結果が得られるまでの時間を約２０～約４５分とすることができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、１８個の血清または血漿試料のプールを処理する場合、結果が得られるまでの時間を約３９分とすることができる。例えば、本明細書で具体化されるように、本明細書に記載のオンボードプーリングは、結果が得られるまでの時間の性能への影響を最小限に抑えながら、スループットを約２倍にすることができる。
実施例２８：２４個の試料のオンボードプーリング
この実施例は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステムを使用して、試料調製カルーセル上で血清または血漿試料などの２４個の試料をオンボードプーリングするための例示的な方法を実証する。図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステムは、本明細書に記載されているように、回転式試料調製カルーセルを含むことができる。図８９Ｂに示す例示的な試料調製カルーセル６８０５を参照すると、試料調製カルーセル６８０５は、試料搬送機の外周の周りに容器を保持するための２８個の位置を含むことができる。本明細書で具体化されるように、容器は溶解チューブであり得る。ここでは、Ｌ１～Ｌ２１という表記を、試料調製カルーセル上の位置を参照して使用する。この例の目的で、カルーセルは、カルーセルの移動間に約２４秒を置いて、ロックステップ方式で動作するように構成することができる。本明細書でさらに具体化されるように、ピペッタ、例えば試料／試薬ピペッタ６８１１は、ロボットガントリピペッタであってもよい。上述のように、ピペッタ、例えば試料／試薬ピペッタ６８１１は、使い捨てピペットチップを利用して、システム内の試料及び／またはプール試料を吸引及び移送することができる。
例の目的で、試料調製カルーセル６８０５上での２４個の試料のプーリングは、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムを参照して、以下のように実行することができる。複数の試料を、試料装填領域で受入れることができる。複数の試料は、少なくとも２４個の試料を含むことができる。少なくとも１２個の試料を試料装填領域から吸引位置６８９２に移送することができる。例えば、本明細書で具体化されるように、各試料は、１つ以上の試料チューブラック６８０２内のチューブ内に存在することができ、試料チューブラック６８０２及びその中の試料チューブは、本明細書でさらに説明されるように、シャトル６８９０を使用して吸引位置６８９２に移動することができる。第１及び第２の試料は、吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから、試料調製カルーセル６８０５上の試料分注位置Ｌ４にある第１容器１２２１に移送することができる。次いで、試料調製カルーセル６８０５は、第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５に移送することができ、第３及び第４の試料を、吸引位置６８９２にあるそれぞれの試料チューブから第１の中間位置Ｌ５にある第１の容器に移送することができる。次いで、試料調製カルーセル６８０５は、第１の容器１２２１を第２の中間位置Ｌ６に搬送することができ、追加の試料を第１の容器１２２１に移送して、プール試料に追加の試料を加えることができる。このプロセスは継続することができ、追加の試料を、連続した中間位置でプール試料に加えることができる。
限定ではなく例の目的で、以下の表、すなわち表２２は、試料調製カルーセル６８０５上に２４個の試料をプールするための例示的なプーリングプロセスを示す。
Figure 2024518331000067
Figure 2024518331000068
Figure 2024518331000069
表２２に示す例示的なプールプロセスに示すように、試料分注位置Ｌ４及び連続する中間位置（例えば、位置Ｌ５～Ｌ１４）で、プール試料に２つの試料を加えることができる。本明細書でさらに具体化されるように、プール試料は、各中間位置で混合することができる。プール試料を混合することにより、プール試料内で個々のドナー試料のそれぞれを均一に分布させることができる。
本明細書に具体化されるように、中間位置Ｌ１５において、試料１～２２を含むプール試料は、中間位置Ｌ１２にある第１の容器１２２１から、試料調製カルーセル６８０５の試料分注位置Ｌ４にある第２の容器１２２２に移送することができ、試料２３及び２４を、試料分注位置Ｌ４で第２の容器１２２２に移送して、プール試料に試料２３及び２４を加えることができる。例えば、本明細書に具体化されるように、試料／試薬ピペッタ６８１１は、吸引位置６８９２から試料２３を吸引し、試料分配位置Ｌ４で第２の容器１２２２に試料２３を分注することができる。試料／試薬ピペッタ６８１１は、吸引位置６８９２から試料２４をさらに吸引することができ、同じ使い捨てピペットチップを用いて、試料／試薬ピペッタ６８１１は、試料１～２２を含むプール試料を中間位置Ｌ１５から吸引し、試料１～２２及び２４を、試料分注位置Ｌ４の第２の容器１２２２に分注し、プール試料に試料２３及び２４を加える。上記のように、試料プールの最後の試料（例えば、所望の２４のプールサイズの試料２３及び２４）を第２の容器１２２２に直接加えることにより、プール試料内の個々のドナー試料のそれぞれのより均一な分布を達成し、他方、所望のプールサイズを達成するために必要なロックステップの数を最小限に抑えることができる。
限定ではなく例の目的で、吸引位置６８９２から吸引される各試料の体積は、約３５μＬ～約４５μＬの間であり得、プール試料は約８４０μＬ～約１０８０μＬの間であり得る。本明細書で具体化されるように、プール試料の体積は約１０００μＬであり得る。本明細書に具体化されるように、所望のプール試料体積が１０００μＬである場合、プール試料を形成するために使用される成分試料それぞれの体積は、１０００μＬをプール試料中の試料数で割ったものであり得る（例えば：１０００μＬを２４試料で割ったもの、すなわち約４２μＬ）。
本明細書に記載されるように、試料１～２４をプールした後、プール試料に対して追加の試料調製を実行して、ＨＴＮＡＴ用のプール試料をさらに調製することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、追加の試料調製は溶解プロセスであってもよく、溶解緩衝液、プロテアーゼ、及びＣｕＴｉ被覆微粒子を含む試薬を、第２の容器１２２２に加えることができ、プール試料を、搬送経路に沿って継続的に搬送しながら、試料調製カルーセル上の第２の容器１２２２内で溶解することができる。
プール試料からの核酸を、試料調製カルーセル６８０５の試料捕捉及び移送位置Ｌ１９で捕捉し、核酸分析のために移送することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、磁気チップを含む粒子移送機構６８０３を使用して、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、第２の容器１２２２から捕捉し、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、プール試料からの核酸の洗浄及び溶出のために、洗浄及び溶出システム、例えば洗浄及び溶出システム６８０１へ移送することができる。本明細書でさらに具体化されるように、次いで、プール試料中の複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の増幅及び検出のために、溶出液を増幅及び検出システム、例えば増幅及び検出システム６８０７に移送することができる。
本明細書で具体化されるように、２４個の試料を約５分未満で、試料調製カルーセル上にプールすることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、血漿または血清の試料などの２４個の試料は、吸引位置６８９２からの第１の試料の吸引から試料分注位置にある第２の容器へのプール試料の分注まで、約２８８秒で試料搬送機上にプールすることができる。
図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示すような例示的なＨＴＮＡＴシステムは、１時間あたりおよそ１５０個の個々のドナーの血清または血漿試料のスループットを有することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、血清または血漿試料の処理は、本明細書に記載されるように、溶解プロセスならびに増幅及び検出プロセスを含むことができる。追加的に、または代替的に、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定について、結果を得るまでの時間を約２０～約４５分とすることができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、血清または血漿の個々のドナー試料を処理する場合、結果が得られるまでの時間を約３５分とすることができる。
本明細書で具体化されるように、オンボード試料プーリングは、結果が得られるまでの時間の性能への影響を最小限に抑えながら、試料スループットを改善させることができる。例示の目的であり、本明細書に具体化されるように、上述のように２４のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間当たり２４個の血清または血漿試料のおよそ１２～１３プールのスループットを有することができ、これは、１時間あたりおよそ２８８～３１２個の血清または血漿の個々のドナー試料のスループットを表す。例の目的であり、本明細書に具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間当たり２４個の血清または血漿試料のおよそ１２．５プールのスループットを有することができ、これは、１時間あたりおよそ３００個の血清または血漿の個々のドナー試料及び／または１時間あたりおよそ３００個の試料吸引のスループットを表す。例の目的で、本明細書で具体化されるように、上述のように２４のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間あたり約１２．５回の増幅を実行することができる。追加的または代替的に、上述のように２４のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、本明細書でさらに説明するように、プール試料からの核酸を含む溶出液を分割して２つの増幅容器に入れることなどにより、１時間あたり約２５回の増幅を行うことができる。
追加的に、または代替的に、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、プール試料の核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または非存在を決定するために、結果が得られるまでの時間を約２０～約４５分とすることができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、２４個の血清または血漿試料のプールを処理する場合、結果が得られるまでの時間を約３９分とすることができる。例えば、本明細書で具体化されるように、本明細書に記載のオンボードプーリングは、結果が得られるまでの時間の性能への影響を最小限に抑えながら、スループットを約２倍にすることができる。
実施例２９：６つの試料溶解物のオンボード溶解前処理及びプーリング
この実施例は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステムを使用して、試料搬送上の６つの試料溶解物をオンボード溶解前処理及びプールするための例示的な方法を実証する。例えば、本明細書に具体化されるように、全血試料を前処理することができ、全血溶解物をプールすることができる。
図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステムは、本明細書に記載されているように、回転式試料調製カルーセルを含むことができる。図９０に示す例示的な試料調製カルーセル６８０５を参照すると、試料調製カルーセル６８０５は、試料搬送機の外周の周りに容器を保持するための２８個の位置を含むことができる。本明細書で具体化されるように、容器は溶解チューブであり得る。ここでは、Ｌ１～Ｌ２１という表記を、試料調製カルーセル上の位置を参照して使用する。この例の目的で、カルーセルは、カルーセルの移動間に約２４秒を置いて、ロックステップ方式で動作するように構成することができる。本明細書でさらに具体化されるように、ピペッタ、例えば試料／試薬ピペッタ６８１１は、ロボットガントリピペッタであってもよい。上述のように、ピペッタ、例えば試料／試薬ピペッタ６８１１は、使い捨てピペットチップを利用して、システム内の試料及び／またはプール試料を吸引及び移送することができる。
例の目的で、試料調製カルーセル６８０５上の６つの試料溶解物の溶解前処理及びプーリングは、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステム１００を参照して、以下のように実行することができる。複数の試料を、試料装填領域で受入れることができる。複数の試料は、少なくとも６個の試料を含むことができる。第１の試料は、吸引位置６８９２にある第１の試料チューブから、試料調製カルーセル６８０５上の試料分注位置Ｌ４にある第１の容器１２２１に移送することができる。次いで、試料調製カルーセル６８０５は、第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５に搬送することができる。第２の試料は、吸引位置６８９２にある第２の試料チューブから、試料調製カルーセル６８０５上の試料分注位置Ｌ４にある第２の容器１２２２に移送することができる。次いで、試料調製カルーセル６８０５は、第２の容器１２２２を第１の中間位置Ｌ５に搬送し、第１の容器１２２１を第２の中間位置Ｌ６に搬送することができる。このプロセスは継続することができ、試料調製カルーセル６８０５が搬送経路に沿って個々の容器を継続的に搬送しながら、試料分注位置Ｌ４で追加の試料を追加の容器に加えることができる。
例の目的で、本明細書に具体化されるように、溶解緩衝液は、第１の容器１２２１、第２の容器１２２２、及び試料３～６用の追加の容器に加えることができ、試料調製カルーセル６８０５が搬送経路に沿って容器を継続的に搬送しながら、試料１～６は、それぞれの容器内で溶解することができる。本明細書でさらに具体化されるように、試料１～６は、各中間位置で混合することができる。試料を搬送経路に沿って搬送しながら試料を混合することは、例えば試料と溶解緩衝液を混合するのに有益であり、試料の溶解を促進することができる。
限定ではなく例の目的で、以下の表、すなわち表２３は、試料調製カルーセル６８０５上での試料溶解物の前処理及びプーリングのための例示的なプロセスを示す。
Figure 2024518331000070
表２３及び図９０に示す例示的な前処理及びプーリングプロセスに示すように、第１の容器１２２１内の第１の試料が中間位置Ｌ１７に到達すると、第１の試料は、中間位置Ｌ１７にある第１の容器１２２１から試料分注位置Ｌ４にある新しい容器１２２９に移送することができ、第２の容器１２２２内の第２の試料は、中間位置Ｌ１６にある第２の容器１２２２から新しい容器１２２９に移送して、第１及び第２の試料溶解物をプールすることができる。さらに、試料３～６をそれぞれの容器及びそれぞれの中間位置から試料分注位置の新しい容器に移送して、試料３～６の溶解物をプール試料に加えることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、試料１～６は、１つの使い捨てチップを使用してそれぞれの容器及び中間位置から吸引することができ、試料１～６は、１回の分注動作で試料分注位置にある新しい容器に分注することができる。追加的または代替的に、試料１～６は、別個のチップ及び／または別個の吸引及び分注を使用して、それぞれの容器及び中間位置から吸引することができる。
例の目的で、本明細書に具体化されるように、前処理中、試料搬送機が搬送経路に沿って容器を継続的に搬送しながら、試料１～６を試料搬送機上で約３～約６分間溶解させることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、第１の試料は約５～約６分間溶解することができ、第６の試料は約３～約４分間溶解することができる。
限定ではなく例の目的で、それぞれの中間位置から吸引される前処理済試料のそれぞれの体積は、約４５μＬ～約５５μＬの間であり得、プール試料は、プール前処理済試料の約２７０μＬ～約３３０μＬの間を含み得る。本明細書で具体化されるように、プール前処理済試料の体積は約３００μＬであり得る。本明細書に具体化されるように、所望のプール前処理済試料体積が３００μＬである場合、プール試料を形成するために使用される成分前処理済試料それぞれの体積は、３００μＬをプール試料中の試料数で割ったものであり得る（例えば：３００μＬを６試料で割ったもの）。
本明細書に記載されるように、試料１～６をプールした後、プール試料に対して追加の試料調製を実行して、ＨＴＮＡＴ用のプール試料をさらに調製することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、追加の試料調製は溶解プロセスであってもよく、溶解緩衝液、プロテアーゼ、及びＣｕＴｉ被覆微粒子を含む試薬を、新しい容器１２２９に加えることができ、プール試料を、搬送経路に沿って継続的に搬送しながら、試料調製カルーセル上の新しい容器１２２９内で溶解することができる。
プール試料からの核酸を、試料調製カルーセル６８０５の試料捕捉及び移送位置Ｌ１９で捕捉し、核酸分析のために移送することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、磁気チップを含む粒子移送機構６８０３を使用して、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、新しい容器１２２９から捕捉し、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、プール試料からの核酸の洗浄及び溶出のために、洗浄及び溶出システム、例えば洗浄及び溶出システム６８０１へ移送することができる。本明細書でさらに具体化されるように、次いで、プール試料中の複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の増幅及び検出のために、溶出液を増幅及び検出システム、例えば増幅及び検出システム６８０７に移送することができる。
本明細書で具体化されるように、６個の試料を約６分未満で前処理し、試料搬送機上にプールすることができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、全血試料などの６つの試料を試料搬送機上で溶解することができ、６つの試料からの溶解物は、吸引位置６８９２からの第１の試料の吸引から試料分注位置での新しい容器１２２９への溶解物の分注まで約３３６秒でプールすることができる。
図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示すような例示的なＨＴＮＡＴシステムは、全血試料がオンボードで前処理されるがオンボードでプールされない場合、１時間当たりおよそ７５の個々のドナー全血試料のスループットを有することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、全血試料の処理には、本明細書に記載される前処理プロセス、溶解プロセス、ならびに増幅及び検出プロセスを含むことができる。追加的に、または代替的に、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルの決定について、結果を得るまでの時間を約２０～約４５分とすることができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、オンボード前処理を含む、全血の個々のドナー試料を処理する場合、結果が得られるまでの時間を約４２分とすることができる。
本明細書で具体化されるように、オンボード前処理及び試料プーリングは、結果が得られるまでの時間の性能への影響を最小限に抑えながら、試料スループットを改善させることができる。例示の目的であり、本明細書に具体化されるように、上述のように６のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間当たり６個の全血試料のおよそ１９～２３プールのスループットを有することができ、これは、１時間あたり約１１４～１３８個の個々のドナーの全血試料のスループットを表す。例の目的であり、本明細書に具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間当たり６個の全血試料のおよそ２１プールのスループットを有することができ、これは、１時間あたりおよそ１２６個の血清または血漿の個々のドナー試料及び／または１時間あたりおよそ１２６個の試料吸引のスループットを表す。例の目的で、本明細書で具体化されるように、上述のように６のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、１時間あたり約２１回の増幅を実行することができる。追加的または代替的に、上述のように６のプールサイズを使用すると、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なシステムは、本明細書でさらに説明するように、プール試料からの核酸を含む溶出液を分割して２つの増幅容器に入れることなどにより、１時間あたり約４２回の増幅を行うことができる。
追加的に、または代替的に、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、プール試料の核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または非存在を決定するために、結果が得られるまでの時間を約２０～約４５分とすることができる。例の目的で、本明細書で具体化されるように、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムは、６個の全血試料のプールを処理する場合、結果が得られるまでの時間を約４２分とすることができる。例えば、本明細書で具体化されるように、本明細書に記載のオンボードプーリングは、結果が得られるまでの時間の性能への影響を最小限に抑えながら、スループットを増加させることができる。
実施例３０：リキッドハンドラによるプーリング及びオンボードプーリング
この例は、専用のリキッドハンドラまたはプーラーなどの従来のプーリングとオンボードプーリングの両方を使用して、試料をプールリングする例示的な方法を示す。例の目的であり、本明細書に記載されているように、別個のリキッドハンドラを備えた従来のプーリングとオンボードプーリングを組み合わせて使用すると、検査室効率及びスループットを改善させることができる。
本明細書で具体化されるように、９６個の試料のプール試料は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステム上の第１及び第２の試料のオンボードプーリングを使用して形成することができる。この例の目的で、第１及び第２の試料は、それぞれ４８個の試料のプールであり得る。本明細書で具体化されるように、第１及び第２の試料は、専用のリキッドハンドラで調製することができる。
本明細書で具体化される第１及び第２の試料のオンボードプーリングは、システムの吸引位置６８９２で第１及び第２の試料を受けること、ならびに吸引位置６８９２のそれぞれの試料コンテナから試料調製カルーセル６８０５上の試料分注位置Ｌ４の容器に、第１及び第２の試料を移送することを含む。本明細書で具体化されるように、容器は溶解チューブであり得る。本明細書に具体化されるように、第１及び第２の試料をプールすることは、試料搬送機が第１の容器１２２１を第１の中間位置Ｌ５まで搬送する前に、試料分注位置Ｌ４で第１の試料及び第２の試料を第１の容器１２２１内に移送することを含むことができる。次いで、プール試料を、搬送経路に沿って試料捕捉及び移送位置まで搬送することができ、そこで、粒子移送機構、例えば、粒子移送機構６８０３を使用して、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、第１の容器１２２１から捕捉し、ＣｕＴｉコーティング微粒子及びそれに結合した核酸を、プール試料からの核酸の洗浄及び溶出のために、洗浄及び溶出システム、例えば洗浄及び溶出システム６８０１へ移送することができる。本明細書でさらに具体化されるように、次いで、９６のプール試料中の複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の増幅及び検出のために、溶出液を増幅及び検出システム、例えば増幅及び検出システム６８０７に移送することができる。
背景及び説明の目的で、従来の血漿検査室では、機器のスループットではなく、リキッドハンドラのプーリングスループットが制限要因となる場合がある。例えば、血漿ラボでは、９６個の試料のプールサイズをよく使用し、これを、８チャンネルのリキッドハンドラで調製することができる。ＮＡＴ機器などの検査機器に対するリキッドハンドラの比率は、１つの検査機器に対して８台のリキッドハンドラにもなる場合がある。例及び説明の目的で、血漿ラボで使用される従来のＮＡＴプラットフォームは、従来のリキッドハンドラで調製された９６個のプール試料に対して１日あたり最大４，０３２件の検査を処理することができ、血漿ラボはプール試料ごとに２つの検査を実行することができ、したがって、単一の従来のＮＡＴ機器は１日あたりおよそ１９３，５３６試料を処理することができる（例えば：［（４，０３２検査）／（プール試料あたり２検査）］＊プールあたり９６試料＝１日あたり１９３，５３６試料）。
背景及び説明の目的で、従来のリキッドハンドラでは、多くの場合、８チャンネルピペッタを使用し、プーリング中に７６８個の試料をリキッドハンドラに配置し、一度に８個ずつ８つのマスタープールチューブにピペットで移す。９６サイクル後、９６のプールを８つ調製することができ、分析のために機器に移動させることができる。これは、従来のリキッドハンドラで９６個のプールを作成する最も効率的な方法である。例えば、リキッドハンドラにプーリングする場合、作成されるプールの数をリキッドハンドラのピペッティングチャネルの数の整数倍にして、各プールを形成するために必要なピペッティングサイクルの数を最小限に抑え、利用可能なピペットチャネルの使用を最大化することができる。
従来のリキッドハンドラでは８チャンネルピペッタが一般的であるが、従来のリキッドハンドラは最大１６チャンネルの構成で利用可能である。しかし、１６チャンネルのリキッドハンドラは、従来のリキッドハンドラのサイズのため、９６のプールを形成する場合には、多くの場合は使用されない。例えば、多くのリキッドハンドラは、１６チャンネルピペッタを使用して９６のプールを１６個作成するのに必要な１，５３６個の試料を保持することができない。その結果、リキッドハンドラが保持することができる試料数の制限により、１６チャネルのリキッドハンドラは、７６８個の試料を含む４８のプールを１６個作成することに制限される可能性がある。１６チャンネルのリキッドハンドラのプーリングスループットは、従来の８チャンネル構成のスループットの２倍になり得る。例えば、１６チャンネルピペッタの４８回の移動で７６８個の試料を４８の１６個のプールに移送することができるが、８チャンネルピペッタの９６回の移動で７６８個の試料を９６の８つのプールに移送することができる。しかし、プールサイズが大きいほど検査費用を削減することができるため、血漿ラボでは一般に、より大きなプールサイズを使用することが好まれる。９６のプールは４８のプールよりも優先される可能性がある。例えば、血漿検査室では、多くの場合、４８のプールよりも９６のプールが好まれる。
本明細書で具体化されるように、１６チャネルリキッドハンドラを備えた従来のプーリングとオンボードプーリングとの組み合わせを使用すると、検査室の全体的なプーリングスループットを向上させることができ、各検査機器を支持するために必要なリキッドハンドラの数を削減することができる。例えば、オンボードプーリングを使用して、リキッドハンドラで調製された４８のプールを含む第１及び第２の試料をプールして９６のプールを形成することにより、１６チャネルのリキッドハンドラ構成を使用することができ、これにより、検査室プールスループットが２倍になり、９６のプールサイズを維持しながら、リキッドハンドラ対機器の比率が半分の４：１になり得る。
この例は、リキッドハンドラ上で調製された４８の２つのプールをオンボードプーリングして９６のプールを形成するという文脈で説明されているが、追加または代替構成を使用することができることを理解すべきである。例えば、限定するものではないが、リキッドハンドラ上で調製された４８の２つ以上のプールをオンボードでプールして、１４４のプール、１９２のプール、または２４０のプールなどのより大きなプールを作成することができる。
実施例３１：リキッドハンドラによるプーリング及びオンボードプーリング及びオンボード分解
この実施例は、プール試料のオンボード分解のための例示的な方法を実証する。例えば、プール試料が陽性または反応性であると判定された場合、プール試料を分解して、プール試料を形成するために使用されたどの１つまたは複数の試料が陽性または反応性であるかを同定することができる。例の目的で、本明細書に具体化されるように、ＨＴＮＡＴを、プール試料に対して実行することができ、陽性のプール試料は、プール試料内の複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の決定に基づいて同定することができる。本明細書に具体化されるように、プール試料が陽性であると判定された場合、陽性のプール試料を形成するために使用された個々の試料またはそのサブプールに対して、さらなる核酸分析を実行することができる。
この実施例は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示されるような例示的なＨＴＮＡＴシステムを使用して、９６個の血漿試料のプール試料をオンボード分解するための例示的な方法を実証する。上述したように、９６個の試料のプールは、例えば、専用のリキッドハンドラまたはプーラーなどの従来のプーリングとオンボードプーリングの両方を使用して、形成することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、４８のプールを含む第１の試料と、４８のプールを含む第２の試料とを専用のリキッドハンドラ上で調製することができ、その後、第１及び第２の試料を、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステムなどの、オンボードプーリング及び高スループット分析のためのシステムの試料装填領域に移送することができる。本明細書で具体化されるように、プール試料を形成するために使用される第１の試料及び第２の試料は、プール試料に対してハイスループット分析を実行する間、試料装填領域に保存することができる。プール試料のオンボードプーリング及びＨＴＮＡＴ分析は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステム及び本明細書に記載の方法を使用して、実行することができる。
本明細書に具体化されるように、９６のプール試料内の複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定されると、それぞれ４８の試料のプールを含む、第１の試料及び第２の試料を、さらなる核酸分析のために、試料装填領域から試料調製カルーセル６８０５に自動的に移送することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、第１及び第２の試料を、試料調製、増幅及び検出のために試料調製カルーセル６８０５に移送し、第１の試料もしくは第２の試料における複数の病原体または感染因子の複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を決定することができる。第１の試料及び第２の試料の核酸分析の結果に基づいて、第１の試料、第２の試料、または第１及び第２の試料の両方が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸を含むかどうかを決定することができる。
次いで、陽性の第１及び／または第２の試料をさらに分解することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、陽性の第１または第２の試料を形成するために使用される４８個の個々の試料は、その後、核酸分析のためにシステムに移送することができる。４８個の個々の試料をシステムに移送することは、操作者が実行することも、検査室自動システムなどによって自動的に実行することもできる。次いで、陽性の第１及び／または第２の試料のさらなる分解を実行する間、４８の個々の試料を、試料装填領域に保存することができる。次いで、４８個の個々の試料のオンボードプール及び核酸分析を、本明細書に記載されるように実行することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、陽性の第１または第２の試料を分解することは、１６個の個々の試料の３つのサブプールを形成するためのオンボードプーリング、及びどのサブプールが陽性であるかを決定するための３つのサブプールの核酸分析を含むことができる。本明細書に具体化されるように、３つのサブプールのそれぞれは、陽性の第１または第２の試料を形成するために使用された個々の試料のサブセットを表す１６個の個々の試料を含有することができる。サブプールのオンボードプーリング及び核酸分析は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステム及び本明細書に記載の方法を使用して、実行することができる。３つのサブプールの核酸分析の結果に基づいて、どのサブプールが複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸を含むかを決定することができる。
本明細書で具体化されるように、その後、陽性のサブプールをさらに分解することができる。本明細書に具体化されるように、陽性サブプールの分解は、オンボードプーリングして４つの個々の試料の４つのサブプールを形成すること、及び４つの個々の試料の４つのサブプールのそれぞれに対して核酸分析を実行して、どのサブプールが陽性であるかを決定することを含むことができる。本明細書で具体化されるように、４つのサブプールのそれぞれは、１６個の個々の試料の陽性サブプールを形成するために使用された個々の試料のサブセットを表す、４つの個々の試料を含有することができる。サブプールのオンボードプーリング及び核酸分析は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示される例示的なＨＴＮＡＴシステム及び本明細書に記載の方法を使用して、実行することができる。４つのサブプールの核酸分析の結果に基づいて、４つのサブプールのうちのどれが複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸を含むかを決定することができる。
本明細書で具体化されるように、４つの個々の試料の陽性サブプールをさらに分解することができる。本明細書に具体化されるように、４つの個々の試料の陽性サブプールの分解は、陽性サブプールを形成するために使用された４つの個々の試料の核酸分析を実行することを含むことができる。個々の試料の核酸分析は、図３、６２、６３、及び６８Ａ～Ｄに示す例示的なＨＴＮＡＴシステム及び本明細書に記載の方法を使用して実行することができる。４つの個々の試料の核酸分析の結果に基づいて、４つの個々の試料のうちのどれが複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸を含むかを決定することができる。
本明細書に記載されるシステム及び方法により、プール試料を分解するために必要な手動ステップの数及び時間を削減することができる。例えば、従来の方法を使用して９６試料の陽性プールを分解するには１２時間以上かかり、複数の手動手順が必要になる場合がある。例えば、従来の方法では、９６個の陽性プールが同定された場合、ユーザは手動で９６個の成分試料を取得し、リキッドハンドラに戻して６の１６個のサブプールにプールすることができる。これら１６個のサブプールは、リキッドハンドラから分析用の機器まで手動で搬送することができる。１６個のサブプールの分析には最長３．５～４時間かかる場合があり、その後、反応性サブプールを分解することができる。従来の方法では、各反応性サブプール内の６つの試料は、検査中に機器に保存されず、個々の検査（ＩＤＴ）のために取り出して機器に戻す必要がある。各反応性サブプール内の６つの試料のＩＤＴでは、プール試料からの個々の試料（複数可）のどれが反応性であるかを決定するためにさらに３．５～４時間かかる場合がある。従来の方法を使用すると、９６個の試料のプールを分解するには１２時間より長くかかる場合がある。
ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるシステム及び方法により、プール分解のための時間及び手動ステップの数を削減することができる。例えば、本明細書に具体化されるように、核酸分析の結果に基づいて、プール試料を形成するために使用される９６個の個々の試料のどれが、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸を含むかについて、約４時間未満で決定することができる。本明細書でさらに具体化されるように、プール試料を形成するために使用される９６個の個々のドナー試料のそれぞれに関連するドナー物質が臨床使用に許容されるかどうかに関する決定は、核酸分析用の第１の試料の第１の吸引から約４時間未満で行うことができる。

Claims (503)

  1. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行すること、を含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し、
    臨床使用のための前記ドナー物質の出荷が、前記核酸分析を実行するためのドナー血液の前記試料の最初の吸引から約２０～約６０分で起こる、前記方法。
  2. 臨床使用のための前記ドナー物質の出荷が、前記核酸分析を実行するためのドナー血液の前記試料の最初の吸引から約２０～約６０分で起こる、請求項１に記載の方法。
  3. 臨床使用のための前記ドナー物質の出荷が、前記核酸分析を実行するためのドナー血液の前記試料の最初の吸引から約２０～約４５分で起こる、請求項１に記載の方法。
  4. 前記核酸分析が、持続時間約１分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、請求項１または２に記載の方法。
  5. 前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各測定は、結果が得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、請求項１～４に記載のいずれか１項に記載の方法。
  6. 前記核酸分析を自動システムで実行し、前記自動システムが占める体積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、請求項１～５のいずれか１項に記載の方法。
  7. 前記核酸分析を自動システムで実行し、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、請求項１～６のいずれか１項に記載の方法。
  8. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行すること、を含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示すものであり、
    臨床使用のための前記ドナー物質の出荷についてドナー血液の複数の試料をスクリーニングすることを含み、前記核酸分析に基づく前記決定を、前記核酸分析を実行するためのドナー血液の前記第１の試料の最初の吸引から約２０分～約３．５時間以内に実行する、前記方法。
  9. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行すること、を含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示すものであり、
    前記核酸分析は、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、前記方法。
  10. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行すること、を含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示すものであり、
    前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定が、前記核酸分析を実行するためのドナー血液の前記試料の最初の吸引から約２０～約４５分で完了する、前記方法。
  11. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行すること、を含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示すものであり、
    前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、結果が得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、前記方法。
  12. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、自動システム上でドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行することを含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示すものであり、
    前記自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、前記方法。
  13. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、自動システム上でドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行することを含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示すものであり、
    前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり１時間当たり少なくとも約１４０の結果が得られる、前記方法。
  14. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングする方法であって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行すること、を含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示すものであり、
    プール試料中に前記所定のレベルの、もしくはそれを超える前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、前記プール試料に含まれる個々のドナー血液またはそのサブプールの試料をスクリーニングすることであって、
    複数の病原体または感染因子を検出するために、ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行すること、を含み；
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示すものである、前記スクリーニングすることをさらに含む、前記方法。
  15. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液に関連する試料をスクリーニングする方法であって、
    前記試料に対して核酸分析を実行することであって、
    ある体積の溶出液中に前記試料から単離された核酸を提供することを含む試料調製プロセス；
    前記体積の溶出液を少なくとも２つの増幅容器に分注すること；
    前記少なくとも２つの増幅容器内の前記溶出液に対して増幅プロセスを実行すること；及び
    １つ以上の病原体または感染因子に由来する核酸が前記溶出液中に存在するかどうかを検出するための検出プロセスを実行すること、を含む、前記実行すること、を含む、前記方法
  16. 前記検出プロセスが、複数の病原体または感染因子に由来する核酸が前記溶出液中に存在するかどうかを検出することを含む、請求項１５に記載の方法。
  17. 前記分注することが、前記体積の溶出液を少なくとも３つ、４つ、またはそれ以上の増幅容器に分注すること：前記増幅容器内の前記溶出液を核酸増幅反応に供すること；及び病原体または感染因子に存在する核酸が前記溶出液中に存在するかどうかを検出すること、を含む、請求項１５及び１６のいずれか１項に記載の方法。
  18. 等しい体積の溶出液を、前記増幅容器に分注する、請求項１５～１７のいずれか１項に記載の方法。
  19. 異なる体積の前記溶出液を、前記増幅容器に分注する、請求項１５～１７のいずれか１項に記載の方法。
  20. 各増幅容器における前記増幅反応が、異なる病原体または感染因子に存在する核酸を増幅するためのものである、請求項１５～１９のいずれか１項に記載の方法。
  21. 各増幅容器における前記増幅反応が、複数の異なる病原体または感染因子に存在する核酸を増幅するためのものである、請求項１５～２０のいずれか１項に記載の方法。
  22. 前記増幅反応が、等温反応を含む、請求項１５～２１のいずれか１項に記載の方法。
  23. 前記等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、請求項２２に記載の方法。
  24. 前記等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、請求項２２に記載の方法。
  25. 複数の試料をスクリーニングして、前記試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、
    試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、前記試料に対して核酸分析を実行すること；
    前記核酸分析の結果を決定すること；ならびに
    前記核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、輸血のための前記ドナー血液の出荷は、前記核酸分析を実行するための前記試料の最初の吸引から約２０分～約６０分で起こる、前記方法。
  26. 前記核酸分析が、持続時間約１分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、請求項９に記載の方法。
  27. 前記核酸分析を実行するための試料の最初の吸引から約１５～約４５分で前記結果が完了する、請求項２５～２６のいずれか１項に記載の方法。
  28. 各結果は、得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、請求項２５～２７のいずれか１項に記載の方法。
  29. 前記核酸分析を自動システムで実行し、前記自動システムが占める体積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、請求項２５～２８のいずれか１項に記載の方法。
  30. 前記核酸分析を自動システムで実行し、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、請求項２５～２９のいずれか１項に記載の方法。
  31. 複数の試料をスクリーニングして、前記試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、
    試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、前記試料に対して核酸分析を実行すること；
    前記核酸分析の結果を決定すること；ならびに
    前記核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、前記核酸分析に基づく前記決定を、前記核酸分析を実行するための前記第１の試料の最初の吸引から約２０分～約３．５時間以内に実行する、前記方法。
  32. 複数の試料をスクリーニングして、前記試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、
    試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、前記試料に対して核酸分析を実行すること；
    前記核酸分析の結果を決定すること；ならびに
    前記核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、前記核酸分析は、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、前記方法。
  33. 複数の試料をスクリーニングして、前記試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、
    試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、前記試料に対して核酸分析を実行すること；
    前記核酸分析の結果を決定すること；ならびに
    前記核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、各結果には、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定が含まれ、各決定は、前記核酸分析を実行するための前記試料の最初の吸引から約２０分～約４５分で完了する、前記方法。
  34. 複数の試料をスクリーニングして、前記試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、
    試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、前記試料に対して核酸分析を実行すること；
    前記核酸分析の結果を決定すること；ならびに
    前記核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、各結果には、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定が含まれ、各決定は、結果が得られるまでの時間が約２０分～約４５分である、前記方法。
  35. 複数の試料をスクリーニングして、前記試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、
    試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、自動システム上で前記試料に対して核酸分析を実行すること；
    前記試料の前記核酸分析それぞれの結果を決定することと；ならびに
    前記核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、前記自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、前記方法。
  36. 複数の試料をスクリーニングして、前記試料に関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定するための方法であって、
    試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、自動システム上で前記試料に対して核酸分析を実行すること；
    前記試料の前記核酸分析それぞれの結果を決定すること；ならびに
    前記核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、ドナー血液が輸血に許容されるかどうかを決定すること、を含み、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、前記方法。
  37. 試料中の病原体または感染因子に由来する標的核酸を検出するための方法であって、
    自動システム上で核酸分析を実行することであって、
    ａ）増幅反応のために前記試料から核酸を調製することを含む試料調製プロセス；
    ｂ）前記増幅反応により前記標的核酸を増幅することを含む増幅プロセス；及び
    ｃ）前記反応において増幅された前記標的核酸の存在または非存在を検出することを含む検出プロセス、を含み、
    前記試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスは、前記核酸分析のための前記試料の最初の吸引から約６０分未満で完了する、前記実行することを含む、前記方法。
  38. 複数の試料中の病原体または感染因子に由来する標的核酸の検出を含み、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、請求項３７に記載の方法。
  39. 前記自動システムの設置面積１ｍ２あたり、１時間当たり約１４０～３００の間の結果が得られる、請求項３７～３８のいずれか１項に記載の方法。
  40. 前記自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、請求項３７～３９のいずれか１項に記載の方法。
  41. 前記標的核酸の存在または非存在を検出することが、前記増幅反応中に複数回、前記標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、請求項３７～４０のいずれか１項に記載の方法。
  42. 前記標的核酸の存在または非存在を検出することが、前記標的核酸の量を決定することを含む、請求項３７～４０のいずれか１項に記載の方法。
  43. 前記量を決定することが、前記増幅反応中に複数回、前記標的核酸の前記量に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、請求項４２のいずれか１項に記載の方法。
  44. 前記複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔で前記シグナルを光学的に検出することを含む、請求項４１及び４３のいずれか１項に記載の方法。
  45. 複数回の蛍光シグナルの前記光学的に検出することが、約１２分間にわたって行われる、請求項４１、４３、及び４４のいずれか１項に記載の方法。
  46. 請求項３７～４５のいずれか１項に記載の方法であって、臨床使用のためのドナー物質の出荷に関して試料をスクリーニングするためのものである、前記方法。
  47. 前記試料が、ドナー血液に関連する試料である、請求項３７～４６のいずれか１項に記載の方法。
  48. 前記試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスが、約１５分～約６０分で完了する、請求項３７～４７のいずれか１項に記載の方法。
  49. 前記試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスが、約２０分～約６０分で完了する、請求項３７～４８のいずれか１項に記載の方法。
  50. 前記標的核酸が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、クラミジア、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、インフルエンザ、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、のうちの少なくとも１つに由来する核酸を含む、請求項３７～４９のいずれか１項に記載の方法。
  51. 前記標的核酸が、複数の病原体または感染因子に由来する核酸を含む、請求項３７～５０のいずれか１項に記載の方法。
  52. 前記複数の病原体または感染因子が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、クラミジア、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、インフルエンザ、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、請求項４８に記載の方法。
  53. 臨床使用のための前記ドナー物質の出荷が、前記核酸分析を実行するための前記試料の最初の吸引から約１５～約６０分で起こる、請求項４６に記載の方法。
  54. 臨床使用のための前記ドナー物質の出荷が、前記核酸分析を実行するための前記試料の最初の吸引から約２０～約４５分で起こる、請求項４６に記載の方法。
  55. 前記核酸分析が、持続時間約１分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、請求項３７～５４のいずれか１項に記載の方法。
  56. 前記標的核酸の存在または非存在を検出することが、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上に由来する所定のレベルの核酸の決定を含む、請求項３７～５５のいずれか１項に記載の方法。
  57. 血漿由来生成物を生成するための方法であって、
    ａ）試料調製プロセス及び増幅プロセスを含む、ドナー血漿試料に対して核酸分析を実行すること；
    ｂ）前記核酸分析の結果を決定すること；ならびに
    ｃ）前記核酸分析結果に少なくとも部分的に基づいて、前記ドナー血漿試料に関連する血漿が血漿由来生成物の生成に許容されるかどうかを決定すること、を含み、
    血漿由来生成物を生成するための前記血漿の出荷は、前記核酸分析を実行するための前記ドナー血漿試料の最初の吸引から約１５分～約６０分で起こる、前記方法。
  58. 臨床使用のための前記血漿の出荷が、前記核酸分析を実行するための前記ドナー血漿試料の最初の吸引から約２０～約６０分で起こる、請求項５７に記載の方法。
  59. 臨床使用のための前記血漿の出荷が、前記核酸分析を実行するための前記ドナー血漿試料の最初の吸引から約２０～約４５分で起こる、請求項５７に記載の方法。
  60. 前記核酸分析が、持続時間約１分～約２０分の核酸増幅及び検出プロセスを含む、請求項５７～５９のいずれか１項に記載の方法。
  61. 前記核酸分析からの各結果は、得られるまでの時間が約２０～約４５分である、請求項５７～６０のいずれか１項に記載の方法。
  62. 前記核酸分析を自動システムで実行し、前記自動システムが占める体積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、請求項５７～６１のいずれか１項に記載の方法。
  63. 前記核酸分析を自動システムで実行し、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、請求項５７～６２のいずれか１項に記載の方法。
  64. 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定を含む、請求項５７～６３のいずれか１項に記載の方法。
  65. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、ＨＥＶ、及びそれらの組み合わせ、からなる群から選択される、請求項６４に記載の方法。
  66. 前記血漿由来生成物が、凝固因子、プロテアーゼ阻害剤、アルブミン、免疫グロブリンＧ（ＩｇＧ）及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項５７～６５のいずれか１項に記載の方法。
  67. 核酸分析のための洗浄プロセスを実行する方法であって、
    第１のウェル、前記第１のウェルに隣接する第２のウェル、及び前記第２のウェルに隣接する第３のウェルを含む洗浄容器を提供することであって、ここで
    第１の側壁が、前記第１、第２、及び第３のウェルの第１の側面を画定し、
    前記第１の側壁の反対側にある第２の側壁が、前記第１、第２、及び第３のウェルの第２の側面を画定し、
    前記第１及び第２の側壁は、前記第１、第２、及び第３のウェルに面する内面と、前記内面の反対側の外面とを含み、
    第１の仕切りが、前記第１のウェルと前記第２のウェルを分離し、
    前記第１の側壁は前記第１の仕切りよりも高く、
    前記第１の側壁の前記内面は、少なくとも前記第１のウェルと前記第２のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、
    第２の仕切りが、前記第２のウェルと前記第３のウェルを分離し、
    前記第２の側壁の前記内面は、少なくとも前記第２のウェルと前記第３のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面である、前記提供することと、
    試料由来の核酸が結合した磁性微粒子を前記第１のウェルに導入することであって、ここで、前記第１のウェルは洗浄溶液を含む、前記導入することと、
    磁力を加えて前記第１のウェル中の前記第１の側壁の内面上に前記磁性微粒子を捕捉することと；
    前記捕捉された磁性微粒子を、前記第１の仕切りを越えて前記第１のウェルから前記第１の側壁の内側平面に沿って前記第２のウェルまで平行移動させることであって、ここで、前記第２のウェルは洗浄溶液を含む、前記平行移動させることと；
    前記磁力を除去し、前記磁性微粒子を前記内面から前記第２のウェル内に放出させることと；
    磁力を加えて、前記第１の側壁の反対側の前記第２の側壁の前記内面上に前記磁性微粒子を捕捉することとであって、ここで、前記第２の側壁は前記第２の仕切りよりも高い、前記捕捉することと、
    前記捕捉された磁性微粒子を、前記第２の仕切りを越えて前記第２のウェルから前記第２の側壁の前記内側平面に沿って前記第３のウェルまで平行移動させることであって、ここで、前記第３のウェルは洗浄溶液または溶出溶液を含む、前記平行移動させることと；
    前記磁力を除去し、前記磁性微粒子を前記第２の側壁の前記内面から前記第３のウェル内に放出させることと、を含む、前記方法。
  68. 請求項６７に記載の方法であって、前記第３のウェルが溶出溶液を含み、前記第３のウェル内の前記磁性微粒子に磁力を加えて前記第１の側壁の内面上に前記磁性微粒子を捕捉することと、前記溶出溶液を除去することとをさらに含む、前記方法。
  69. 前記洗浄容器が第４のウェルを含み、前記第３のウェルは洗浄溶液を含み、前記第４のウェルは溶出溶液を含み、前記第３及び第４のウェルを、第３の仕切りによって分離する、請求項６７に記載の方法。
  70. 請求項２８６に記載の方法であって、
    前記第１及び第２の側壁は、前記第１、第２、第３及び第４のウェルに沿って延在し、前記ウェルの反対側を画定し、
    前記第１及び第２の側壁の前記内面は前記ウェルに面しており、
    前記第１の側壁の前記内面は、前記第２のウェルと前記第３のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、前記第３のウェルと前記第４のウェルとの間に延びる領域では平面であり、
    前記第２の側壁の前記内面は、前記第３のウェルと前記第４のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、
    前記平面領域は、捕捉された磁性微粒子が前記内面を横断して平行移動するのに役立ち、前記非平面領域では、捕捉された磁性微粒子が前記内面を横断して平行移動することはできない、前記方法。
  71. 請求項２８７に記載の方法であって、
    磁力を加えて、前記第１の側壁の内面上に前記第３のウェル内の前記磁性粒子を捕捉することであって、ここで、前記第１の側壁は前記第３の仕切りよりも高い、前記捕捉することと；
    前記捕捉された磁性微粒子を、前記第３の仕切りを越えて前記第３のウェルから前記第１の側壁の前記内面に沿って前記第４のウェルまで平行移動させることと；
    前記磁力を除去し、前記磁性微粒子を前記第１の側壁の前記内面から前記第４のウェル内に放出させることと、を含む、前記方法。
  72. 請求項２８８に記載の方法であって、前記第３のウェルが洗浄溶液を含み、前記第４のウェルが溶出溶液を含み、前記第４のウェル内の前記磁性微粒子に磁力を加えて前記第２の側壁の内面上に前記磁性微粒子を捕捉することと、前記溶出溶液を除去することとをさらに含む、前記方法。
  73. 前記磁力を、電磁石を使用して生成する、請求項２８４～２８９のいずれか１項に記載の方法。
  74. 前記電磁石が前記第１及び第２の側壁の前記外面に沿って配置され、前記捕捉された磁性微粒子を平行移動させることが、前記電磁石の異なる領域を連続的に活性化及び非活性化することを含む、請求項２９０に記載の方法。
  75. 前記磁力を、永久磁石を使用して生成する、請求項２８４～２８９のいずれか１項に記載の方法。
  76. 前記捕捉された磁性微粒子を前記平行移動させることが、前記第１または第２の側壁の前記外面に沿って前記永久磁石を移動させることを含む、請求項２９２に記載の方法。
  77. 前記非平面内面が、前記内面にノッチを備え、前記ノッチが前記内面から外に延びているか、または前記内面内で延びている、請求項２８４～２９３のいずれか１項に記載の方法。
  78. 前記所定のレベルに等しいかもしくはそれを超えるレベルの決定が、前記ドナー物質、ドナー血液、生体試料、または血漿が臨床使用のために出荷されていないことを示す、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、及び６４のいずれか１項に記載の方法。
  79. 前記所定のレベル未満のレベルの前記決定が、前記ドナー物質、ドナー血液、生体試料、または血漿が臨床使用のために出荷されていることを示す、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、及び６４のいずれか１項に記載の方法。
  80. 前記核酸分析が、試料調製プロセスを含む、請求項１～７９のいずれか１項に記載の方法。
  81. 前記試料調製プロセスが前処理プロセスを含む、請求項８０に記載の方法。
  82. 前記試料調製プロセスが、溶解プロセスを含む、請求項８０～８１のいずれか１項に記載の方法。
  83. 前記試料調製プロセスが、オンボードプーリングプロセスを含む、請求項８０～８２のいずれか１項に記載の方法。
  84. 前記試料調製プロセスが、洗浄プロセスを含む、請求項８０～８３のいずれか１項に記載の方法。
  85. 前記試料調製プロセスが、前処理プロセス、オンボードプーリングプロセス、溶解プロセス、及び洗浄プロセスを含む、請求項８０～８４のいずれか１項に記載の方法。
  86. １つ以上の病原体または感染因子を検出するために、試料に対して核酸分析を実行するための方法であって、
    試料調製プロセス、増幅プロセス、及び前記試料中の１つ以上の病原体または感染因子を検出するための検出プロセスを実行することを含み、ここで、前記試料調製プロセスは、
    試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで搬送経路に沿って試料搬送機上の容器内の前記試料及び１つ以上の試薬を搬送することと、
    前記試料搬送機を連続的に振動させて前記容器内の前記試料と１つ以上の試薬を混合し、振動のたびに前記容器が円弧状に移動すること、を含む、前記方法。
  87. 前記試料搬送機が、蛇行経路、カルーセル、コンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、またはベルトを含む、請求項８６に記載の方法。
  88. 前記試料搬送機を連続的に振動させることが、前記試料搬送機を時計回りに約１度～約５度の間で連続的に移動させ、続いて前記試料搬送機を反時計回りに約１度～約５度の間で移動させることを含む、請求項８６または８７のいずれか１項に記載の方法。
  89. 前記容器内で前記試料と１つ以上の試薬を混合することが、前記容器の内容物内に渦を形成することを含む、請求項８６～８８のいずれか１項に記載の方法。
  90. 前記渦が、約１秒～約２秒で形成される、請求項８９に記載の方法。
  91. 前記容器が約０．５度～約１．５度の間の抜き勾配を有する、請求項８６～９０のいずれか１項に記載の方法。
  92. 前記容器が円錐形の底部を有する、請求項８６～９１のいずれか１項に記載の方法。
  93. 請求項８６～９２のいずれか１項に記載の方法であって、前記試料搬送機が連続的に振動している間に、前記容器から前記試料を吸引することをさらに含む、前記方法。
  94. 各結果が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の決定を含む、請求項２５～３２または３５～３６のいずれか１項に記載の方法。
  95. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  96. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  97. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  98. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  99. 前記複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  100. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  101. 前記複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  102. 前記複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  103. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  104. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  105. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  106. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  107. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  108. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  109. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  110. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  111. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  112. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  113. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  114. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  115. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  116. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  117. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  118. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  119. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  120. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  121. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  122. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  123. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア及びバベシアである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  124. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  125. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  126. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  127. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  128. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  129. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  130. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  131. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  132. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  133. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  134. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  135. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  136. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  137. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  138. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  139. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  140. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  141. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  142. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  143. 前記複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；
    前記核酸分析が、バベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  144. 前記複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；
    前記核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  145. 前記複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  146. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  147. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  148. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  149. 前記複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  150. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  151. 前記複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  152. 前記複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  153. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  154. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  155. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  156. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  157. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  158. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  159. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  160. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  161. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  162. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  163. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  164. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  165. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  166. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  167. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  168. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルス、であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  169. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶ、であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  170. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  171. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルス、であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  172. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  173. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  174. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  175. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルス、であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  176. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルス、であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  177. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルス、であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  178. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルス、であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  179. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  180. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  181. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  182. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  183. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  184. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  185. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  186. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  187. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  188. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  189. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  190. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  191. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  192. 前記複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；
    前記核酸分析が、バベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  193. 前記複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；
    前記核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項１～１４、１６、２１、３３～３４、４６、４８～５６、６４及び９４のいずれか１項に記載の方法。
  194. 前記試料または生体試料が、ドナー血液の試料である、請求項１５～５６のいずれか１項に記載の方法。
  195. ドナー血液の前記試料が、ヒトドナー血液である、請求項１～１４及び１９４のいずれか１項に記載の方法。
  196. ドナー血液の前記試料が、全血である、請求項１～１４及び１９４のいずれか１項に記載の方法。
  197. ドナー血液の前記試料が、溶解全血である、請求項１～１４及び１９４のいずれか１項に記載の方法。
  198. ドナー血液の前記試料が、血清である、請求項１～１４及び１９４のいずれか１項に記載の方法。
  199. ドナー血液の前記試料が、血漿である、請求項１～１４及び１９４のいずれか１項に記載の方法。
  200. 前記ドナー物質の前記出荷が、輸血のためのものである、請求項１～２４、５６、及び９４～１９９のいずれか１項に記載の方法。
  201. 前記ドナー物質の前記出荷が、医薬品で使用するためのものである、請求項１～２４、５６、及び９４～１９９のいずれか１項に記載の方法。
  202. 前記ドナー物質の前記出荷が、治療処置に使用するためのものである、請求項１～２４、５６、及び９４～１９９のいずれか１項に記載の方法。
  203. ドナー血液の前記試料が、献血として使用するためのものである、請求項１～１４及び１９４～１９９のいずれか１項に記載の方法。
  204. 前記臨床使用がインビボ臨床使用である、請求項１～２４、４３、４８～５６、及び９４～１９９のいずれか１項に記載の方法。
  205. 前記臨床使用がインビトロ臨床使用である、請求項１～２４、４３、４８～５６、及び９４～１９９のいずれか１項に記載の方法。
  206. 前記臨床使用が輸血である、請求項１～２４、４３、４８～５６、９４～１９９、及び２０４のいずれか１項に記載の方法。
  207. 前記臨床使用が医薬品における使用である、請求項１～２４、４３、４８～５６、９４～１９９、及び２０４のいずれか１項に記載の方法。
  208. 前記臨床使用が治療処置における使用である、請求項１～２４、４３、４８～５６、及び９４～１９９、及び２０４のいずれか１項に記載の方法。
  209. 前記臨床使用が臓器または組織の提供である、請求項１～２４、４３、４８～５６、及び９４～１９９、及び２０４のいずれか１項に記載の方法。
  210. 前記臨床使用が血漿由来生成物における使用である、請求項１～２４、４３、４８～５６、及び９４～１９９、及び２０４のいずれか１項に記載の方法。
  211. 前記臨床使用が、疾患診断または品質保証／検査室診断における使用である、請求項１～２４、４３、４８～５６、及び９４～１９９、及び２０５のいずれか１項に記載の方法。
  212. 前記核酸分析が、核酸増幅反応を含む、請求項１～２１１のいずれか１項に記載の方法。
  213. 前記核酸増幅反応が、等温反応である、請求項２１２に記載の方法。
  214. 前記等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、請求項２１３に記載の方法。
  215. 前記等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、請求項２１３に記載の方法。
  216. 前記核酸分析が、前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、請求項１～２１５のいずれか１項に記載の方法。
  217. 前記核酸分析が、前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、請求項１～２１６のいずれか１項に記載の方法。
  218. 前記核酸分析が、核酸の所定のレベルの決定を含み、前記決定が、前記増幅反応中に複数回、所定のレベルの標的核酸に対応する蛍光シグナルを光学的に検出することを含む、請求項１～２１７のいずれか１項に記載の方法。
  219. 前記複数回が、約２０秒ごとまたは約３０秒ごとの所定の間隔で前記シグナルを光学的に検出することを含む、請求項２１８に記載の方法。
  220. 複数回の蛍光シグナルの前記光学検出が、約１２分間にわたって行われる、請求項２１８または２１９に記載の方法。
  221. 前記核酸分析が、前記試料を試料溶解緩衝液及びプロテアーゼと同時に接触させることを含む、請求項１～２２０のいずれか１項に記載の方法。
  222. 前記核酸分析が、前記試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含む、請求項１～２２１のいずれか１項に記載の方法。
  223. 前記核酸分析が、前記試料を複数の微粒子と接触させること、及び磁力を介して表面上で前記微粒子を移動させることを含む、請求項１～２２２のいずれか１項に記載の方法。
  224. 前記核酸分析が、
    ドナー血液の前記試料からの核酸を精製すること；
    前記精製された核酸を複数の画分に分割すること；
    及び少なくとも１つの画分をさらなるスクリーニングのために保留すること、を含む、請求項１～２２３のいずれか１項に記載の方法。
  225. 前記核酸分析が約１５～約３６分で完了する、請求項１～２２４のいずれか１項に記載の方法。
  226. 前記核酸分析が約３２～約３６分で完了する、請求項１～２２５のいずれか１項に記載の方法。
  227. 前記核酸分析が、試料調製プロセスならびに増幅及び検出プロセスを含む、請求項１～２２６のいずれか１項に記載の方法。
  228. 前記試料調製プロセスが、溶解プロセス及び洗浄プロセスを含む、請求項２２７に記載の方法。
  229. 前記試料調製プロセスが、約１２～約１６分で完了する、請求項２２７または２２８のいずれか１項に記載の方法。
  230. 前記増幅及び検出プロセスが、約１～約２２分で完了する、請求項２２７～２２９のいずれか１項に記載の方法。
  231. 前記増幅及び検出プロセスが、約５～約２２分で完了する、請求項２２７～２３０のいずれか１項に記載の方法。
  232. 前記増幅及び検出プロセスが、約１８～約２２分で完了する、請求項２２７～２３１のいずれか１項に記載の方法。
  233. 前記溶解プロセスが、約４～約８分で完了する、請求項２２８～２３２のいずれか１項に記載の方法。
  234. 前記洗浄プロセスが、約５～約９分で完了する、請求項２２８～２３３のいずれか１項に記載の方法。
  235. 前記洗浄プロセスが、第１の洗浄ステップ、第２の洗浄ステップ、第３の洗浄ステップ、及び溶出ステップを含む、請求項２２８～２３４のいずれか１項に記載の方法。
  236. 前記第１の洗浄ステップが約１～約３分で完了する、請求項２３５に記載の方法。
  237. 前記第２の洗浄ステップが約０．１～約１分で完了する、請求項２３５または２３６に記載の方法。
  238. 前記第３の洗浄ステップが約０．１～約１分で完了する、請求項２３５～２３７のいずれか１項に記載の方法。
  239. 前記溶出ステップが約２～約５分で完了する、請求項２３５～２３８のいずれか１項に記載の方法。
  240. 前記試料調製プロセスが前処理プロセスをさらに含む、請求項２２７～２３９のいずれか１項に記載の方法。
  241. 前記前処理プロセスが約３～約７分で完了する、請求項２４０に記載の方法。
  242. 前記試料調製プロセスがオンボードプーリングプロセスをさらに含み、最大６個のドナー血液の試料を約６分以下で前処理し、プールする、請求項２４０～２４１のいずれか１項に記載の方法。
  243. 前記試料調製プロセスがオンボードプーリングプロセスをさらに含み、最大２４個の試料を約５分以下でプールする、請求項２２７～２３９のいずれか１項に記載の方法。
  244. 前記核酸分析が、１時間当たり少なくとも約１４０の試料吸引を含む、請求項１～２４３のいずれか１項に記載の方法。
  245. 前記核酸分析が、１時間当たり少なくとも約１４０回の増幅を含む増幅プロセスを含む、請求項１～２４４のいずれか１項に記載の方法。
  246. 前記核酸分析が、マルチプレックス増幅を含む増幅プロセスを含む、請求項１～２４５のいずれか１項に記載の方法。
  247. 前記核酸分析が、溶出液を調製することを含む試料調製プロセスを含み、前記溶出液を２つ以上の増幅容器に分割する、請求項１～２４６のいずれか１項に記載の方法。
  248. 前記核酸分析を自動システムで実行し、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり約１４０件の結果～約３００件の結果が得られる、請求項１～２４７のいずれか１項に記載の方法。
  249. ドナー血液の前記試料、試料、または生体試料がプール試料である、請求項１～２４８のいずれか１項に記載の方法。
  250. 前記プール試料が、２人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項２４９に記載の方法。
  251. 前記プール試料が、３人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項２４９に記載の方法。
  252. 前記プール試料が、４人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項２４９に記載の方法。
  253. 前記プール試料が、５人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項２４９に記載の方法。
  254. 前記プール試料が、１０人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項２４９に記載の方法。
  255. 前記プール試料が、１２人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項２４９に記載の方法。
  256. 前記プール試料が、９６人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項２４９に記載の方法。
  257. 前記核酸分析が、複数の試料のサブセットをオンボードプーリングしてプール試料を形成することを含む試料調製プロセスを含み、前記プール試料に対して前記核酸分析を実行する、請求項１～２５６のいずれか１項に記載の方法。
  258. オンボードプーリングが、試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで、その間に中間位置を伴って、搬送経路に沿って搬送機上の個々の容器を連続的に搬送すること；ならびにプール試料を形成するために、前記試料搬送機上の容器内に第１の試料及び第２の試料をプールすることを含む、請求項２５７に記載の方法。
  259. 前記試料搬送機が、蛇行経路、カルーセル、コンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、またはベルトを含む、請求項２５８に記載の方法。
  260. 前記第１の試料及び前記第２の試料が、個々のドナー試料である、請求項２５８に記載の方法。
  261. 前記第１の試料及び前記第２の試料が、プール試料である、請求項２５８に記載の方法。
  262. 前記第１の試料及び前記第２の試料が、それぞれ４８個のプール試料を含む、請求項２５８に記載の方法。
  263. 前記試料搬送機が試料調製カルーセルを含み、前記搬送経路に沿って個々の容器を連続的に搬送することが前記試料調製カルーセルを回転させることを含む、請求項２５８に記載の方法。
  264. 前記試料調製カルーセルが、ロックステップ方式で回転し、ロックステップごとに１つの位置を移動する、請求項２６３に記載の方法。
  265. 各ロックステップの前記持続時間が、約１５秒～約３０秒の間である、請求項２６４に記載の方法。
  266. 前記第１の試料及び前記第２の試料をプールすることが、前記試料調製カルーセルが第１の容器を第１の中間位置まで搬送する前に、前記試料分注位置で前記第１の試料及び前記第２の試料を第１の容器内に分注することを含む、請求項２５８～２６５のいずれか１項に記載の方法。
  267. 第３及び第４の試料を前記第１の中間位置で前記第１の容器に分注して、前記第３及び第４の試料を前記プール試料に加えることをさらに含む、請求項２６６に記載の方法。
  268. 前記試料調製プロセスが溶解プロセスを含み、オンボードプーリングが、前記プール試料を前記第１の容器から吸引し、前記試料分注位置で前記プール試料を第２の容器に分注して、前記プール試料の前記溶解プロセスを開始することを含む、請求項２６６～２６７のいずれか１項に記載の方法。
  269. 前記試料調製プロセスが前処理プロセスを含む、請求項２５７～２６８のいずれか１項に記載の方法。
  270. 前記前処理プロセスが、前記試料分注位置で前記試料搬送機上の容器に試料及び試薬を分注して、前記試料分注位置と前記捕捉及び移送位置との間に中間位置を伴って画定された前記搬送経路に沿って、前記容器を連続的に搬送すること；及び各中間位置で前記試料と試薬を混合すること、を含む、請求項２６９に記載の方法。
  271. 前記試料と試薬を混合することが、前記試料搬送機を連続的に振動させて前記容器内の前記試料と試薬を混合することを含み、振動のたびに前記容器が円弧状に移動する、請求項４０４に記載の方法。
  272. 前記試料が全血試料を含み、前記試薬が溶解緩衝液を含む、請求項２６９～２７１のいずれか１項に記載の方法。
  273. 前記前処理プロセスが、前記試料を約３～約６分間の間溶解することを含む、請求項２７２に記載の方法。
  274. 前処理された試料のサブセットをオンボードプーリングして、プール試料を形成することを含み、前記核酸分析を、前記プール試料に対して実行し、オンボードプーリングは、第１の前処理試料を、第１の中間位置で第１の容器から吸引すること、第２の前処理試料を、第２の中間位置で第２の容器から吸引すること、及び前記第１の前処理試料及び第２の前処理試料を、前記試料分注位置で第３の容器に分注することを含む、請求項２６９～２７３のいずれか１項に記載の方法。
  275. 最大約３００の試料を、１時間あたりの核酸分析のためにプールする、請求項２５７～２６８のいずれか１項に記載の方法。
  276. 最大約７５の前処理試料を、１時間あたりの核酸分析のためにプールする、請求項２７４のいずれかに記載の方法。
  277. 前記核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上の検出を含む、請求項２５７～２７６のいずれか１項に記載の方法。
  278. 前記核酸分析に基づく複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の存在または不存在の決定が、（ａ）前記プール試料に関連しているドナー血液が輸血に許容されるかどうか、または（ｂ）前記プール試料に関連するドナー物質が臨床使用に許容されるかどうか、を示すものである、請求項２７７に記載の方法。
  279. 請求項２７８に記載の方法であって、プール試料中に前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、前記プール試料に含まれる個々の試料またはそのサブプールの核酸分析をさらに含み、（ａ）個々の試料またはそのサブプールの前記核酸分析に少なくとも部分的に基づいて、前記個々の試料またはそのサブプールに関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうか、または（ｂ）個々の試料またはそのサブプールの前記核酸分析に少なくとも部分的に基づいて、前記個々の試料またはそのサブプールに関連するドナー血液が臨床使用に許容されるかどうかを決定する、前記方法。
  280. 前記プール試料の核酸分析中に、前記プール試料に含まれる個々の試料を装填領域に保存する、請求項２７９に記載の方法。
  281. サブプールの核酸分析が、前記サブプールを作成するためのオンボードプーリングを含む、請求項２７９～２８０のいずれか１項に記載の方法。
  282. 前記プール試料が９６個の個々のドナー試料を含み、前記プール試料中に前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、前記９６個の個々の試料のそれぞれに関連するドナー血液が輸血に許容されるかどうかの決定を、前記核酸分析を実行するための前記プール試料に含まれる第１の試料の最初の吸引から約４時間未満で行う、請求項２７９～２８１のいずれか１項に記載の方法。
  283. ドナー血液の前記試料、前記ドナー物質、前記血漿、または前記生体試料を病原体低減技術で処理することをさらに含む、請求項１～２８２のいずれか１項に記載の方法。
  284. 臨床使用のための出荷が指示されたドナー物質、または輸血に許容されると決定されたドナー血液を、病原体低減技術で処理することをさらに含む、請求項１～３６のいずれか１項に記載の方法。
  285. 前記病原体低減技術が、前記ドナー物質もしくはドナー血液内に存在する核酸にインターカレートするか、または前記ドナー物質もしくはドナー血液内に存在する核酸に二量体を生じさせる薬剤を含む、請求項２８４に記載の方法。
  286. 前記病原体低減技術が、以下の：（ｉ）アモトサレン及び紫外線Ａ（ＵＶＡ）光、（ｉｉ）リボフラビン及びＵＶＡ／紫外線Ｂ（ＵＶＢ）光、（ｉｉｉ）アムスタリン及びグルタチオン、（ｉｖ）紫外線Ｃ（ＵＶＣ）光；ならびに（ｖ）メチレンブルー及び可視光、のうちの少なくとも１つを含む、請求項２８３～２８５のいずれか１項に記載の方法。
  287. 前記ドナー物質が、以下：（ｉ）全血、（ｉｉ）血漿、（ｉｉｉ）血小板、（ｉｖ）赤血球；及び（ｖ）血漿由来生成物、のうちの少なくとも１つを含む、請求項２８３～２８６のいずれか１項に記載の方法。
  288. 請求項２８３～２８７のいずれか１項に記載の方法であって、
    前記試料またはドナー血液の試料中の１つ以上の病原体または感染因子を検出するために、前記試料またはドナー血液の試料の第２の部分に対してイムノアッセイを実行することをさらに含む、前記方法。
  289. 前記イムノアッセイを、前記核酸分析と同時に実行する、請求項２８８に記載の方法。
  290. 前記イムノアッセイを、前記核酸分析の前に実行する、請求項２８８に記載の方法。
  291. 前記核酸分析を、前記イムノアッセイを実行する前に実行する、請求項２８８に記載の方法。
  292. 臨床使用のための出荷が指示された前記ドナー物質、または輸血に許容されると決定されたドナー血液を、前記病原体低減技術で処理する前に、前記イムノアッセイを実行する、請求項２８８に記載の方法。
  293. 前記病原体または感染因子が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、コロナウイルス、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、ヒトＴリンパ指向性ウイルス（ＨＴＬＶ） パルボＢ１９ウイルス、ＨＡＶ、梅毒、クラミジア、淋菌、デング、チクングニア、ＷＮＶ、ＨＥＶ、クロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項２８４～２９２のいずれか１項に記載の方法。
  294. 前記核酸分析及び前記病原体低減技術を、同じ物理的場所で実行する、請求項２８４～２９３のいずれか１項に記載の方法。
  295. ドナー血液の前記試料、前記ドナー物質、前記血漿、または前記生体試料に対して血清学的検査を実行することをさらに含む、請求項１～２９４のいずれか１項に記載の方法。
  296. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、
    ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し；
    臨床使用のための前記ドナー物質の前記出荷は、前記核酸分析を実行するためのドナー血液の前記試料の最初の吸引から約１５分～約６０分で起こる、前記自動システム。
  297. 臨床使用のための前記ドナー物質の出荷が、前記核酸分析を実行するためのドナー血液の前記試料の最初の吸引から約２０～約６０分で起こる、請求項２９６に記載のシステム。
  298. 前記核酸分析が、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、請求項２９６または２９７のいずれか１項に記載のシステム。
  299. 前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定が、前記核酸分析を行うためのドナー血液の前記試料の最初の吸引から約３０～約４５分で完了する、請求項２９６～２９８のいずれか１項に記載のシステム。
  300. 前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、結果が得られるまでの時間が約３０分～約４５分である、請求項２９６～２９９のいずれか１項に記載のシステム。
  301. 請求項２９６～３００のいずれか１項に記載のシステムであって、前記自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、前記システム。
  302. 請求項２９６～３０１のいずれか１項に記載のシステムであって、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり１時間当たり少なくとも約１４０の結果が得られる、前記システム。
  303. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、
    ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し；
    前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷についてドナー血液の複数の試料をスクリーニングするように構成されており、前記核酸分析に基づく前記決定を、前記核酸分析を実行するためのドナー血液の前記第１の試料の最初の吸引から約２０分～約３．５時間以内に実行する、前記自動システム。
  304. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、
    ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し；
    前記核酸分析が、持続時間約８分～約２０分の核酸増幅反応を含む、前記自動システム。
  305. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、
    ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し；
    前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定が、前記核酸分析を行うためのドナー血液の前記試料の最初の吸引から約３０～約４５分で完了する、前記自動システム。
  306. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、
    ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し；
    前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つからの所定のレベルの核酸の各決定は、結果が得られるまでの時間が約３０分～約４５分である、前記自動システム。
  307. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、
    ドナー血液の前記試料のそれぞれに対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、
    前記核酸分析の結果として前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し；
    前記自動システムが占める容積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、前記自動システム。
  308. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、
    ドナー血液の前記試料のそれぞれに対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、
    前記核酸分析の結果として前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し；
    前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり１時間当たり少なくとも約１４０の結果が得られる、前記自動システム。
  309. 臨床使用のためのドナー物質の出荷に関してドナー血液の試料をスクリーニングするための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、
    ドナー血液の前記試料に対して核酸分析を実行して、複数の病原体または感染因子のうちの１つ以上を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、
    前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷を示し；
    前記システムは、臨床使用のための前記ドナー物質の出荷についてドナー血液の複数の試料をスクリーニングするように構成されており、前記核酸分析を、前記複数の試料のバッチ処理の非存在下で実行する、前記自動システム。
  310. 試料中の１つ以上の病原体または感染因子に由来する標的核酸を検出するための自動システムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション；
    プロセッサ、及びメモリであって、前記プロセッサによって実行されると、前記システムは、前記試料に対して核酸分析を実行して、１つ以上の病原体または感染因子からの標的核酸を検出する命令を含む前記メモリ、を備え、前記核酸分析は、
    ａ）増幅反応のために前記試料から核酸を調製することを含む、前記試料調製領域における試料調製プロセス；
    ｂ）前記増幅反応により前記標的核酸を増幅することを含む、前記核酸増幅領域における増幅プロセス；及び
    前記反応において増幅された標的核酸の量を決定することを含む、前記核酸検出領域における検出プロセス、を含み；
    前記試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスは、前記核酸分析のための前記試料の最初の吸引から約６０分未満で完了し、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり、１時間当たり少なくとも約１４０件の結果が得られる、前記自動システム。
  311. 前記核酸増幅反応は、持続時間が約８分～約２０分である、請求項３１０に記載のシステム。
  312. 前記試料調製プロセス、増幅プロセス及び検出プロセスが、約２０分～約６０分で完了する、請求項３１０～３１１のいずれか１項に記載のシステム。
  313. 請求項３１０～３１２のいずれか１項に記載のシステムであって、複数の試料中の標的核酸を検出するように構成され、前記自動システムの体積１ｍ３当たり１時間当たり少なくとも約７０件の結果が得られる、前記システム。
  314. 請求項３１０～３１３のいずれか１項に記載のシステムであって、複数の試料中の標的核酸を検出するように構成され、前記システムの設置面積１ｍ２当たり１時間当たり約１４０件の結果～約３００件の結果が得られる、前記システム。
  315. 前記標的核酸が、複数の病原体または感染因子に由来する核酸を含む、請求項３１０～３１４のいずれか１項に記載のシステム。
  316. 請求項３１５に記載のシステムであって、前記核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、臨床使用のためのドナー物質の出荷を示す、前記システム。
  317. 核酸分析用の洗浄容器であって、
    第２のウェルに隣接する第１のウェル及び前記第２のウェルに隣接する第３のウェルと、
    前記第１、第２、及び第３のウェルの第１の側面を画定する第１の側壁、
    前記第１の側壁の反対側にあり、前記第１、第２、及び第３のウェルの第２の側面を画定する第２の側壁であって、
    前記第１、第２、及び第３のウェルに面する内面と、前記内面の反対側の外面とを含む、前記第１及び第２の側壁と、
    前記第１のウェルと前記第２のウェルを分離する、第１の仕切りと、
    前記第２のウェルと前記第３のウェルを分離する、第２の仕切りと、を備え、
    ここで：
    前記第１の側壁は前記第１の仕切りよりも高く、
    前記第１の側壁の前記内面は、前記第１のウェルに捕捉された磁性微粒子を、前記第１の仕切りを越えて前記第２のウェルに平行移動させるため、少なくとも前記第１のウェルと前記第２のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、
    前記第１の側壁の前記内面は、前記第２のウェルと前記第３のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、そうして、前記非平面の内面が、前記第２のウェルの前記内面の領域で捕捉された磁性粒子が前記第３のウェルの前記内面の領域へ平行移動するのを防止し、
    前記第２の側壁は前記第２の仕切りよりも高く、
    前記第２の側壁の前記内面は、少なくとも前記第２のウェルと前記第３のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、前記第２のウェル内で磁性微粒子を捕捉し、前記捕捉された磁性粒子を前記第２の仕切りを越えて前記第３のウェルに平行移動させるための実質的に平坦な表面を提供する、前記洗浄容器。
  318. 前記第１及び第２のウェルが洗浄溶液を含み、前記第３のウェルが洗浄溶液または溶出溶液を含む、請求項２９５に記載の容器。
  319. 請求項２９５に記載の容器であって、
    前記第３のウェルに隣接する第４のウェルと、
    前記第３のウェルと前記第４のウェルを分離する、第３の仕切りと、を備え、
    ここで：
    前記第１の側壁は前記第４のウェルの第１の側面を画定し、前記第２の側壁は前記第４のウェルの第２の側面を画定し、
    前記第１の側壁は前記第３の仕切りよりも高く、
    前記第１の側壁の前記内面は、前記第３のウェルに捕捉された磁性微粒子を、前記第３の仕切りを越えて前記第４のウェルに平行移動させるため、少なくとも前記第３のウェルと前記第４のウェルとの間に延びる領域において実質的に平面であり、
    前記第２の側壁の前記内面は、前記第３のウェルと前記第４のウェルとの間に延びる領域では非平面であり、そうして、前記非平面の内面が、前記第３のウェル内の前記第２の側壁の前記内面の領域で捕捉された磁性粒子が、前記第４のウェル内の前記第２の側壁の前記内面の領域へ平行移動するのを防止する、前記容器。
  320. 前記第１、第２、及び第３のウェルが洗浄溶液を含む、請求項２９７に記載の洗浄容器。
  321. 前記第１、第２、及び第３のウェルが洗浄溶液を含み、前記第４のウェルが溶出溶液を含む、請求項２９７または２９８に記載の洗浄容器。
  322. 前記非平面内面が、前記内面にノッチを備え、前記ノッチが前記内面から外に延びているか、または前記内面内で延びている、請求項２９５～２９９のいずれか１項に記載の洗浄容器。
  323. １つ以上の病原体または感染因子を検出するために、１つ以上の試料に対して核酸分析を実行するためのシステムであって、
    試料装填領域、試料調製領域、核酸増幅領域、及び核酸検出領域を含む試料分析ステーション、を備え、ここで、前記試料調製領域は、
    容器内の１つ以上の試料を試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで搬送経路に沿って搬送するように構成された試料搬送機であって、連続的に振動させて前記容器内の前記１つ以上の試料と１つ以上の試薬を混合するように構成されており、振動のたびに前記容器が円弧状に移動する、前記試料搬送機を含む、前記システム。
  324. 前記試料搬送機が、蛇行経路、カルーセル、コンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、またはベルトを含む、請求項３１６に記載のシステムの方法。
  325. 前記試料搬送機が、時計回りに約１度～約５度の間で連続的に移動し、続いて反時計回りに約１度～約５度の間で移動するように構成されている、請求項３１６または３１７のいずれか１項に記載の方法。
  326. 前記試料搬送機が、前記容器の内容物内に渦を形成するように構成されている、請求項３１６～３１８のいずれか１項に記載の方法。
  327. 前記試料搬送機が、約１秒～約２秒で渦を形成するように構成されている、請求項３１９に記載の方法。
  328. 前記容器が約０．５度～約１．５度の間の抜き勾配を有する、請求項３１６～３２０のいずれか１項に記載の方法。
  329. 前記容器が円錐形の底部を有する、請求項３１６～３２１のいずれか１項に記載の方法。
  330. 請求項３１６～３２２のいずれか１項に記載の方法であって、前記システムが、少なくとも１つのピペッタをさらに含み、前記少なくとも１つのピペッタは、前記試料搬送機が連続的に振動している間に、前記容器から前記１つ以上の試料を吸引するように構成されている、前記方法。
  331. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、淋菌、ＷＮＶ、ジカウイルス、デングウイルス、チクングニアウイルス、バベシア、マラリア、及びＨＥＶ、からなる群から選択される、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  332. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  333. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  334. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  335. 前記複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  336. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  337. 前記複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  338. 前記複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  339. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  340. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  341. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  342. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  343. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  344. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９である、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  345. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  346. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  347. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９である、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  348. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  349. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  350. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  351. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  352. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  353. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  354. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  355. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  356. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  357. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  358. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  359. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  360. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  361. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  362. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  363. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  364. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  365. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  366. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  367. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶである、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  368. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  369. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  370. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  371. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  372. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  373. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  374. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  375. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  376. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  377. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  378. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  379. 前記複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；
    前記核酸分析が、バベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  380. 前記複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；
    前記核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含む、請求項２９６～３０９及び３１５～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  381. 前記複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；
    少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；
    少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  382. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  383. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＷＮＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  384. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス及びＷＮＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  385. 前記複数の病原体または感染因子が、チクングニアウイルス及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  386. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  387. 前記複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアであり；所定のレベルは、
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  388. 前記複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  389. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びジカウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  390. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  391. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  392. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、及びバベシアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  393. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、及びマラリアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  394. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、及びパルボウイルスＢ１９であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  395. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  396. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、ジカウイルス、チクングニアウイルス、デングウイルス、バベシア、マラリア、パルボウイルスＢ１９、ＨＡＶ、及びＨＥＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ；及び
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  397. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びパルボウイルスＢ１９であり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  398. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、パルボウイルスＢ１９、及びＨＡＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  399. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びバベシアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  400. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＡＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  401. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＥＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＥＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  402. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びジカウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  403. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  404. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項１５５～１６１のいずれか１項に記載のシステム。
  405. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、デングウイルス、及びＷＮＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  406. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  407. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ジカウイルス、ＷＮＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  408. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びマラリアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  409. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、マラリア、及びバベシアであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  410. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  411. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  412. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、デングウイルス、ＷＮＶ、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  413. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、及びチクングニアウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  414. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、及びジカウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  415. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、チクングニアウイルス、ジカウイルス、及びＷＮＶであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  416. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＷＮＶ、及びデングウイルスであり；前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  417. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  418. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＣＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  419. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  420. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  421. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１及びＨＩＶ－２のマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、ＨＣＶ及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  422. 前記複数の病原体または感染因子が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶであり；
    前記核酸分析が、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＣＶ、及びＨＢＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬのＨＩＶ－２；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬのＨＣＶ；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＢＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  423. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  424. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  425. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  426. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びデングウイルスのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  427. 前記複数の病原体または感染因子が、ジカウイルス、ＷＮＶ、チクングニアウイルス、及びデングウイルスを含み；
    前記核酸分析が、ジカウイルス及びデングのマルチプレックス分析を含み；
    前記核酸分析が、チクングニアウイルス及びＷＮＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのチクングニアウイルス；及び
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのデングウイルス、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  428. 前記複数の病原体または感染因子が、バベシア及びマラリアを含み；
    前記核酸分析が、バベシア及びマラリアのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬのマラリア；及び
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬのバベシア、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  429. 前記複数の病原体または感染因子が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶを含み；
    前記核酸分析が、パルボウイルスＢ１９及びＨＡＶのマルチプレックス分析を含み；
    前記所定のレベルが、
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬのパルボウイルスＢ１９；及び
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬのＨＡＶ、である、請求項２９６～３０９及び３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  430. 前記試料または１つ以上の試料が、ドナー血液の試料である、請求項３１０～３１６及び３２３～３３０のいずれか１項に記載のシステム。
  431. ドナー血液の前記試料が、ヒトドナー血液である、請求項２９６～３０９及び４３０のいずれか１項に記載のシステム。
  432. ドナー血液の前記試料が、全血である、請求項２９６～３０９及び４３０のいずれか１項に記載のシステム。
  433. ドナー血液の前記試料が、溶解全血である、請求項２９６～３０９及び４３０のいずれか１項に記載のシステム。
  434. ドナー血液の前記試料が、血清である、請求項２９６～３０９及び４３０のいずれか１項に記載のシステム。
  435. ドナー血液の前記試料が、血漿である、請求項２９６～３０９及び４３０のいずれか１項に記載のシステム。
  436. 前記ドナー物質の前記出荷が、輸血のためのものである、請求項２９６～３０９及び３３１～４３５ １４５～２６３のいずれか１項に記載のシステム。
  437. 前記ドナー物質の前記出荷が、医薬品で使用するためのものである、請求項２９６～３０９及び３３１～４３５のいずれか１項に記載のシステム。
  438. 前記ドナー物質の前記出荷が、治療処置に使用するためのものである、請求項２９６～３０９及び３３１～４３５のいずれか１項に記載のシステム。
  439. ドナー血液の前記試料が、献血として使用するためのものである、請求項２９６～３０９及び３３１～４３５のいずれか１項に記載のシステム。
  440. 前記臨床使用がインビボ臨床使用である、請求項２９６～３０９及び３３１～４３５のいずれか１項に記載のシステム。
  441. 前記臨床使用がインビトロ臨床使用である、請求項２９６～３０９及び３３１～４３５のいずれか１項に記載のシステム。
  442. 前記臨床使用が輸血である、請求項２９６～３０９、３３１～４３５及び４４０のいずれか１項に記載のシステム。
  443. 前記臨床使用が医薬品における使用である、請求項２９６～３０９、３３１～４３５及び４４０のいずれか１項に記載のシステム。
  444. 前記臨床使用が治療処置における使用である、請求項２９６～３０９、３３１～４３５及び４４０のいずれか１項に記載のシステム。
  445. 前記臨床使用が臓器または組織の提供である、請求項２９６～３０９、３３１～４３５及び４４０のいずれか１項に記載のシステム。
  446. 前記臨床使用が血漿由来生成物における使用である、請求項２９６～３０９、３３１～４３５及び４４０のいずれか１項に記載のシステム。
  447. 前記臨床使用が診断使用である、請求項２９６～３０９、３３１～４３５及び４４１のいずれか１項に記載のシステム。
  448. 前記核酸分析が、核酸増幅反応を含む、請求項２９６～４４７のいずれか１項に記載のシステム。
  449. 前記核酸増幅反応が、等温反応である、請求項４４８に記載のシステム。
  450. 前記等温反応が、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅である、請求項４４９に記載のシステム。
  451. 前記等温反応が、ニッキング酵素増幅反応である、請求項４４９に記載のシステム。
  452. 前記核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在のデジタル検出を含む、請求項２９６～４５１のいずれか１項に記載のシステム。
  453. 前記システムが、前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を定量的に検出するために、前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を複数回、デジタル的に検出するように構成される、請求項４５２に記載のシステム。
  454. 前記核酸分析が、複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在の光学検出を含む、請求項２９６～４５１のいずれか１項に記載のシステム。
  455. 前記システムが、前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を定量的に検出するために、前記複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在を複数回、光学的に検出するように構成される、請求項４５４に記載のシステム。
  456. 前記核酸分析が、前記試料を試料溶解緩衝液及びプロテアーゼと同時に接触させることを含む、請求項２９６～４５５のいずれか１項に記載のシステム。
  457. 前記核酸分析が、前記試料をＣｕＴｉコーティング微粒子と接触させることを含む、請求項２９６～４５６のいずれか１項に記載のシステム。
  458. 前記核酸分析が、前記試料を複数の微粒子と接触させること、及び磁力を介して表面上で前記微粒子を平行移動させることを含む、請求項２９６～４５７のいずれか１項に記載のシステム。
  459. 前記核酸分析が、
    ドナー血液の前記試料からの核酸を精製すること；
    前記精製された核酸を複数の画分に分割すること；
    及び少なくとも１つの画分をさらなるスクリーニングのために保留すること、を含む、請求項２９６～４５８のいずれか１項に記載のシステム。
  460. 前記核酸分析が約１５～約３６分で完了する、請求項２９６～４５９のいずれか１項に記載のシステム。
  461. 前記核酸分析が約３２～約３６分で完了する、請求項２９６～４５９のいずれか１項に記載のシステム。
  462. 前記核酸分析が、前記試料調製領域における試料調製プロセスと、増幅及び検出システムにおける増幅及び検出プロセスとを含む、請求項２９６～４６１のいずれか１項に記載のシステム。
  463. 前記試料調製プロセスが、溶解プロセス及び洗浄プロセスを含む、請求項４６２に記載のシステム。
  464. 前記試料調製プロセスが、約１２～約１６分で完了する、請求項４６２～４６３のいずれか１項に記載のシステム。
  465. 前記増幅及び検出プロセスが、約１～約２２分で完了する、請求項４６２～４６４のいずれか１項に記載のシステム。
  466. 前記増幅及び検出プロセスが、約５～約２２分で完了する、請求項４６２～４６５のいずれか１項に記載のシステム。
  467. 前記増幅及び検出プロセスが、約１８～約２２分で完了する、請求項４６２～４６６のいずれか１項に記載のシステム。
  468. 前記溶解プロセスが、約４～約８分で完了する、請求項４６３～４６７のいずれか１項に記載のシステム。
  469. 前記洗浄プロセスが、約５～約９分で完了する、請求項４６３～４６８のいずれか１項に記載のシステム。
  470. 前記洗浄プロセスが、第１の洗浄ステップ、第２の洗浄ステップ、第３の洗浄ステップ、及び溶出ステップを含む、請求項４６３～４６９のいずれか１項に記載のシステム。
  471. 前記第１の洗浄ステップが約１～約３分で完了する、請求項４７０に記載のシステム。
  472. 前記第２の洗浄ステップが約０．１～約１分で完了する、請求項４７０または４７１に記載のシステム。
  473. 前記第３の洗浄ステップが約０．１～約１分で完了する、請求項４７０～４７２のいずれか１項に記載のシステム。
  474. 前記溶出ステップが約２～約５分で完了する、請求項４７０～４７３のいずれか１項に記載のシステム。
  475. 前記試料調製が前処理プロセスをさらに含む、請求項４６２～４７４ ３８４のいずれか１項に記載のシステム。
  476. 前記前処理プロセスが約３～約７分で完了する、請求項４７５に記載のシステム。
  477. 前記試料調製プロセスがオンボードプーリングプロセスをさらに含み、最大６個のドナー血液の試料を約６分以下で前処理し、プールする、請求項４７５～４７６のいずれか１項に記載のシステム。
  478. 前記試料調製プロセスが、オンボードプーリングプロセスをさらに含む、請求項４６２～４７４に記載のシステム。
  479. 最大２４個の試料を、約５分でプールする、請求項４７８に記載のシステム。
  480. 前記核酸分析が、１時間当たり少なくとも約１４０の試料吸引を含む、請求項２９６～４７９のいずれか１項に記載のシステム。
  481. 前記核酸分析が、１時間当たり少なくとも約１４０回の増幅を含む増幅プロセスを含む、請求項２９６～４８０のいずれか１項に記載のシステム。
  482. 前記核酸分析が、マルチプレックス増幅を含む増幅プロセスを含む、請求項２９６～４８１のいずれか１項に記載のシステム。
  483. 前記核酸分析が、溶出液を調製することを含む試料調製プロセスを含み、前記溶出液を２つ以上の増幅容器に分割する、請求項２９６～４８２のいずれか１項に記載のシステム。
  484. 請求項２９６～４８３のいずれか１項に記載のシステムであって、前記自動システムの設置面積１ｍ２当たり１時間当たり約１４０～約３００の間の結果が得られる、前記システム。
  485. ドナー血液の前記試料、試料、または１つ以上の試料がプール試料である、請求項２９６～３１６、及び３２３～４８４のいずれか１項に記載のシステム。
  486. 前記プール試料が、２人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項４８５に記載のシステム。
  487. ドナー血液の前記プール試料が、３人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項４８５に記載のシステム。
  488. ドナー血液の前記プール試料が、４人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項４８５に記載のシステム。
  489. ドナー血液の前記プール試料が、５人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項４８５に記載のシステム。
  490. ドナー血液の前記プール試料が、１０人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項４８５に記載のシステム。
  491. ドナー血液の前記プール試料が、１２人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項４８５に記載のシステム。
  492. ドナー血液の前記プール試料が、９６人のドナーからの血液または血漿または血清または生体試料を含む、請求項４８５に記載のシステム。
  493. 前記核酸分析が、前記試料調製領域で複数の試料のサブセットをオンボードプーリングして、プール試料を形成することを含む試料調製プロセスを含み、前記核酸分析を、前記プール試料に対して実行する、請求項１４５～１５２のいずれか１項に記載のシステム。
  494. 前記試料調製領域が少なくとも１つのピペッタ及び少なくとも１つの試料搬送機を含み、前記搬送機は、試料分注位置から試料捕捉及び移送位置まで、その間に中間位置を伴って、搬送経路に沿って個々の容器を連続的に搬送するように構成されており；
    前記オンボードプーリングは、プール試料を形成するために、前記試料搬送機上の容器内に第１の試料及び第２の試料を分注することを含む、請求項４９３に記載のシステム。
  495. 前記試料搬送機が、蛇行経路、カルーセル、コンベヤ、押出機、ロボットハンドラ、またはベルトを含む、請求項４９４に記載のシステム。
  496. 前記試料搬送機が試料調製カルーセルを含み、前記試料調製カルーセルは、前記搬送経路に沿って個々の容器を連続的に搬送するために回転するように構成されている、請求項４９４～４９５のいずれか１項に記載のシステム。
  497. 前記試料調製カルーセルが、ロックステップ方式で回転し、ロックステップごとに１つの位置を移動するように構成されている、請求項４９６に記載のシステム。
  498. 各ロックステップの前記持続時間が、約１５秒～約３０秒の間である、請求項４９７に記載のシステム。
  499. 請求項４９３～４９８のいずれか１項に記載のシステムであって、前記プール試料の核酸分析中に、前記プール試料に含まれる試料を前記試料装填領域に保持するように構成されている、前記システム。
  500. 請求項４９３～４９９のいずれか１項に記載のシステムであって、
    前記プール試料中に所定のレベルを超える複数の病原体または感染因子のうちの少なくとも１つに由来する核酸の存在が決定される場合、命令が、プロセッサによって実行されると、前記システムは、前記プール試料に含まれる個々の試料またはそのサブプールの核酸分析を実行し；
    前記個々の試料またはそのサブプールの核酸分析に基づいて前記複数の病原体または感染因子のそれぞれに由来する核酸の所定のレベルが決定される場合、前記システムは、臨床使用のための前記個々の試料またはそのサブプールに関連するドナー物質の出荷を示す、前記システム。
  501. 前記病原体または感染因子が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）、コロナウイルス、ＨＩＶ－１、ＨＩＶ－２、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＣＭＶ、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、ヒトＴリンパ指向性ウイルス（ＨＴＬＶ） パルボＢ１９ウイルス、ＨＡＶ、梅毒、クラミジア、淋菌、デング、チクングニア、ＷＮＶ、ＨＥＶ、クロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項３１０～３１６のいずれか１項に記載のシステム。
  502. 前記複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、以下の：
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；
    少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；
    少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるクラミジア；
    少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；
    少なくとも１０～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるインフルエンザ；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、請求項５６に記載のシステム。
  503. 前記複数の病原体または感染因子及び所定のレベルが、以下の：
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＣＯＶＩＤ－１９）；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－１；
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＩＶ－２；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＢＶ；
    少なくとも１～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＣＶ；
    少なくとも１０～５０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＣＭＶ；
    少なくとも１～４０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるパルボウイルスＢ１９；
    少なくとも１～１０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＡＶ；
    少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるクラミジア；
    少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにある淋菌；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるＷＮＶ；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるジカウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるデングウイルス；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるチクングニアウイルス；
    少なくとも１００～５００コピー／ｍＬの所定のレベルにあるインフルエンザ；
    少なくとも１～２０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるバベシア；
    少なくとも１～５０コピー／ｍＬの所定のレベルにあるマラリア；及び
    少なくとも１～２０ＩＵ／ｍＬの所定のレベルにあるＨＥＶ、から選択される、請求項３１０～３１６のいずれか１項に記載のシステム。

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