JP2024500268A - 高スループットマイクロウェルアレイプレートおよび製造方法 - Google Patents
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Abstract
細胞を研究するための高スループットマイクロ流体デバイス用のマイクロウェルアレイプレート(MWAP)アセンブリおよびその製造方法が提供される。MWAPアセンブリは、フレーム内にアレイ状に配置された複数のマクロウェルを有する上部プレートを含む。MWAPアセンブリはまた、フレームの底面に固定されるように使用可能な底部プレートを含み、底部プレートはマイクロウェルの複数のアレイを有する。MWAPアセンブリは、底部プレートが複数のマクロウェルおよび複数のアレイマイクロウェルを介して上部プレートに固定されるときに形成されるウェルグリッドを含む。複数のマクロウェルおよび複数のアレイマイクロウェルを有するウェルグリッドは、高スループットによる細胞の可視化を可能にする。
Description
(関連出願の相互参照)
本出願は、2020年10月22日に出願された米国仮特許出願第63/104,105号の利益を主張し、その内容全体が参照により組み込まれている。
本出願は、2020年10月22日に出願された米国仮特許出願第63/104,105号の利益を主張し、その内容全体が参照により組み込まれている。
1.分野
本発明の概念は、単一細胞用途および多細胞用途のためのマイクロウェルの高密度アレイを有する細胞培養プレート、およびその製造方法を対象とする。細胞培養プレートは、腫瘍および癌薬剤のスクリーニングに使用できる。
本発明の概念は、単一細胞用途および多細胞用途のためのマイクロウェルの高密度アレイを有する細胞培養プレート、およびその製造方法を対象とする。細胞培養プレートは、腫瘍および癌薬剤のスクリーニングに使用できる。
2.関連技術の考察
薬剤開発は、時間がかかり、非常に高価なプロセスである。腫瘍薬剤の高い失敗率は、部分的には、インビトロスクリーニング中の薬剤分子の選択性が低いことに起因する可能性がある。腫瘍薬剤をスクリーニングするための従来のデバイスは、インビトロでの薬剤スクリーニングの感度が低いという欠点がある。
薬剤開発は、時間がかかり、非常に高価なプロセスである。腫瘍薬剤の高い失敗率は、部分的には、インビトロスクリーニング中の薬剤分子の選択性が低いことに起因する可能性がある。腫瘍薬剤をスクリーニングするための従来のデバイスは、インビトロでの薬剤スクリーニングの感度が低いという欠点がある。
薬剤を試験するための従来のマイクロウェルデバイスは、単細胞用途および多細胞用途に限定される。これらの従来のデバイスは、数ある欠点の中でも、スループットが低いという欠点がある。
したがって、前述の欠点を被らず、改善されたインビトロ薬剤スクリーニング感度を有し、さまざまな用途要件に対応するように適応可能であり、効率的で経済的で、製造と利用が簡単である高スループット薬剤および癌スクリーニング用途のための装置および関連技術を開発する必要がある。
本発明の概念は、細胞を研究するための高スループットマイクロ流体デバイスとして機能するように使用可能な複数のマイクロウェルアレイプレート(MWAP)アセンブリ、マイクロ流体デバイスを製造する方法、およびMWAPアセンブリを使用する画像分析手順を提供する。
前述のことは、本発明の概念の一態様において、上部プレートおよび底部プレートによって画定されるMWAPアセンブリを形成することによって達成することができる。上部プレートは、上部プレートによって画定されるフレーム内にアレイ状に配置された複数のマクロウェルを有する。アレイは、複数の列および複数の行を含む。底部プレートは、アレイ状に配置された複数のマイクロウェルを有する。底部プレートは、上部プレートのフレームの底面に固定されるよう使用可能である。MWAPアセンブリには、底部プレートが上部プレートに固定されたときに形成されるウェルグリッドが含まれる。ウェルグリッドは、複数のマクロウェルのそれぞれが複数のマイクロウェルの別のセットから複数のマイクロウェルのセットを隔離した状態で、複数のマクロウェルおよび複数のマイクロウェルにより画定される。底部プレートおよび/または上部プレートは、細胞培養プレートとして使用できる微細加工プレートであってもよい。複数のマイクロウェルは、単一細胞または複数の細胞を閉じ込めるように使用可能なさまざまな形状およびサイズのマイクロ流体ウェルの高密度アレイを形成する。上部プレートと底部プレートは、プレートが恒久的に一緒に固定されるように接合または接着され、それは例えば、プレートを一緒にレーザ溶接するか、選択的に互いに取り外し可能にすることにより、例えば、摩擦嵌合係合および/または再利用可能な接着剤を使用してプレートを接合することにより行われる。複数のマイクロウェルは、互いに対して、さまざまな程度の空間閉じ込めの非対称性を提供するために形成される。いくつかの変形例では、上部プレートは、標準的な96ウェルプレートの単一のウェルと同じサイズを有し得る分割されたセクションを備えた底のないフレームであってもよい。いくつかの変形例では、底部プレートは、微細加工された光学的に透明なシートから形成されてもよく、複数のマクロウェルのうちの1つまたは複数のサイズおよび形状に対応するマイクロウェルのアレイを含む。
本開示は、異なるMWAPアセンブリ、例えば、大型アレイフォーマットおよび小型アレイフォーマットを提供する。いくつかの実施形態では、8×12パターンで配置された96セットのマイクロウェルのアレイを備えた大型アレイフォーマットのMWAPアセンブリは、業界標準の細胞培養用96ウェルプレートと寸法的に同じサイズである。大型アレイフォーマットでのMWAPアセンブリの用途の1つは、高スループットである。いくつかの実施形態では、2×2パターンで配置された4セットのマクロウェルのアレイを有する小型アレイフォーマットのMWAPアセンブリは、標準的な顕微鏡スライドと同じサイズを有する。小型アレイフォーマットのMWAPアセンブリは、細胞を研究するための低スループットの基礎研究用途向けに設計される。MWAPアセンブリは、腫瘍細胞の休眠を誘導し、固定サイズのクローンスフェロイドを生成するためのMWAPアセンブリの使用を含む、さまざまなインビトロ診断およびスクリーニング用途用のアッセイプロトコルを提供する。
本発明の概念の追加の態様、利点、および有用性は、以下の説明で部分的に説明され、一部は、説明から明らかであるか、または本発明の概念を実践することによって習得することができる。
上記は、例示を意図したものであり、限定的な意味を意味するものではない。本発明の概念の多くの特徴およびサブコンビネーションが可能であり、以下の明細書およびその一部を含む添付図面を検討することにより、それらは容易に明らかになるであろう。これらの特徴およびサブコンビネーションは、他の特徴およびサブコンビネーションを参照せずに使用することができる。
説明は、以下の図およびデータグラフを参照してより完全に理解され、これらは本発明の概念のさまざまな実施形態として提示され、本発明の概念の範囲の完全な説明として解釈されるべきではない。
図面は、本発明の概念を、本明細書で開示および説明する特定の実施形態に限定するものではない。図面は必ずしも一定の縮尺ではなく、代わりに、本発明の概念の特定の実施形態の原理を明確に示すことに重点が置かれている。
以下の発明を実施するための形態は、本発明の概念のさまざまな実施形態を示す添付の図面を参照する。図および説明は、当業者が本発明の概念を実施できるように、本発明の概念の態様および実施形態を十分に詳細に説明することを意図している。本発明の概念の範囲から逸脱することなく、他の構成要素を利用することができ、変更を行うことができる。したがって、以下の説明は、限定的な意味で解釈されるべきではない。本発明の概念の範囲は、そのような特許請求の範囲が権利を有する均等物の全範囲とともに添付の特許請求の範囲によってのみ定義される。
I.用語
本明細書で使用される表現および専門用語は、説明を目的とするものであり、限定するものと見なされるべきではない。例えば、「ある(a)」などの単数形の用語の使用は、アイテムの数を限定することを意図したものではない。また、以下に限定されないが、「上(top)」、「下(bottom)」、「左(left)」、「右(right)」、「上(upper)」、「下(lower)」、「下(down)」、「上(up)」および「横(side)」などの関係用語の使用は、図面を特に参照して明確にするために説明で使用され、本発明の概念または添付の特許請求の範囲を限定することを意図するものではない。
本明細書で使用される表現および専門用語は、説明を目的とするものであり、限定するものと見なされるべきではない。例えば、「ある(a)」などの単数形の用語の使用は、アイテムの数を限定することを意図したものではない。また、以下に限定されないが、「上(top)」、「下(bottom)」、「左(left)」、「右(right)」、「上(upper)」、「下(lower)」、「下(down)」、「上(up)」および「横(side)」などの関係用語の使用は、図面を特に参照して明確にするために説明で使用され、本発明の概念または添付の特許請求の範囲を限定することを意図するものではない。
さらに、本発明の概念は、多くの異なる形態の実施形態に影響を受けやすいので、本開示は、本発明の概念の原理の例として考えられることが意図されており、本発明の概念を示され、説明される特定の実施形態に限定することは意図されていない。本発明の概念の特徴のいずれか1つは、別個に、または任意の他の特徴と組み合わせて使用することができる。説明における用語「実施形態」、「実施形態(複数)」などへの言及は、言及される特徴および/または特徴(複数)が、説明の少なくとも1つの態様に含まれることを意味する。説明における用語「実施形態」、「実施形態(複数)」などへの別個の言及は、必ずしも同じ実施形態を指すわけではなく、また、そのように述べられていない限り、および/または説明から当業者に容易に明らかであることを除いて、相互に排他的ではない。例えば、一実施形態で説明された特徴、構造、プロセス、ステップ、アクションなどは、他の実施形態にも含まれ得るが、必ずしも含まれるわけではない。したがって、本発明の概念は、本明細書に記載された実施形態のさまざまな組み合わせおよび/または統合を含むことができる。さらに、本明細書に記載される本開示のすべての態様は、その実施に必須ではない。同様に、本発明の概念の他のシステム、方法、特徴、および利点は、図面および説明を検討することにより、当業者には明らかになるか、または明らかになるであろう。そのような追加のシステム、方法、特徴、および利点はすべて、この説明に含まれ、本発明の概念の範囲内にあり、特許請求の範囲に含まれ得ることが意図される。
説明および添付の特許請求の範囲で使用される「実質的に」などであるがそれに限定されない任意の程度の用語は、正確な、または類似の、しかし正確ではない構成を含むと理解されるべきである。例えば、「実質的に平面の表面」は、正確な平面または類似の、しかし正確な平面ではない表面を有することを意味する。同様に、説明および添付の特許請求の範囲で使用される「約」または「およそ」という用語は、列挙された値、または列挙された値の3倍もしくは3分の1である値を含むと理解されるべきである。例えば、約3mmには1mmから9mmまでのすべての値が含まれ、約50度には16.6度から150度までのすべての値が含まれる。例えば、それらは、±2%以下、±1%以下、±0.5%以下、±0.2%以下、±0.1%以下、±0.05%以下など、±5%以下を指し得る。
「含む(comprising)」、「含む(including)」、および「有する」という用語は、本開示において交換可能に使用される。「含む」、「含む」、および「有する」という用語は、そのように記載されたものを含むことを意味するが、必ずしも限定されない。
最後に、用語「または」および「および/または」は、本明細書で使用される場合、包括的または任意の1つもしくは任意の組み合わせを意味すると解釈されるべきである。したがって、「A、BまたはC」または「A、Bおよび/またはC」は、次のいずれかを意味する。「A」、「B」または「C」、「AとB」、「AとC」、「BとC」、「A、BとC」。この定義の例外は、要素、機能、ステップ、または行為の組み合わせが何らかの形で本質的に相互に排他的である場合にのみ発生する。
II.一般的なアーキテクチャ
図1A~図1Fを参照すると、本発明の概念の一実施形態による大型フォーマットのマイクロウェルアッセイプレート(MWAP)アセンブリが示される。MWAPアセンブリ100は、一般に、上部プレート102および底部プレート104によって画定される。
図1A~図1Fを参照すると、本発明の概念の一実施形態による大型フォーマットのマイクロウェルアッセイプレート(MWAP)アセンブリが示される。MWAPアセンブリ100は、一般に、上部プレート102および底部プレート104によって画定される。
上部プレート102は、上部プレート102を完全に貫通して延びる96個のマクロウェル106を含む。マクロウェル106は、8行110および12列112を有するマクロウェルアレイ108に配置される。上部プレート102はまた、上部プレート102の一方の側に面取りされた角を任意に含んでもよい。面取りされた角は、マクロウェル106の一方の側を閉じるために、例えば、対応する面取りされた角を有する同様の形状のカバーの上部プレート102への組み立てを容易にするための位置合わせマーカーとして機能することができる。
マクロウェル106のそれぞれは、上部周縁118および下部周縁116を有する周囲側壁114によって画定される。このように、マクロウェルは実質的に底なしである。
底部プレート104は、底部プレート104の一方の側126上に実質的に平面の表面124に形成された96個のマイクロウェルセット122を含む。マイクロウェルセット122のそれぞれは、さまざまな形状および/またはサイズを有するマイクロウェル130のマイクロウェルアレイ128を含み、マイクロウェル130は、平面部分132によって互いに離間される。マイクロウェルセット122は、任意の数のマイクロウェル130を含むことができ、マイクロウェル130の異なるものは、異なる形状、サイズ、および/またはパターンであることが予想され、本発明の概念の範囲から逸脱することはない。実際、図によって示されるマイクロウェル130の数、サイズ、形状、およびパターンは、本発明の概念を理解するための例示目的のためだけのものである。例えば、マイクロウェル130の数に関して、マイクロウェルセット122の異なるものは、3000から4000個のマイクロウェル130を含み得る。したがって、底部プレート104は、300,000個を超えるマイクロウェル130を含むように微細加工され得る。このように、MWAPアセンブリ100は、本明細書でさらに説明するように、高スループットを提供するように有利に使用し得る。マイクロウェル130のサイズおよび形状に関して、マイクロウェル130のさまざまなものは、1つまたは複数の立方体、1つまたは複数の角錐、1つまたは複数の四角錐などであるがこれらに限定されない形状にすることができる。このように、マイクロウェルセット122の異なるものにおいて、マイクロウェル130の異なるものは、MWAPアセンブリ100のユーザによってその中に配置され保存された1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cに対して三次元(3D)空間閉じ込めをさまざまな程度で提供するように有利に使用し得る。このように、マイクロウェル130は、MWAPアセンブリ100のユーザが、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cが3D空間閉じ込めのさまざまな程度にどのように応答するかを調べることを有利に可能にする。本明細書で論じるように、細胞を閉じ込めることは、細胞の閉じ込めの程度に応じて隔離し、休眠を誘導することを含むさまざまな機能を果たす。非対称マイクロウェル、例えば非対称角錐マイクロウェルにおける空間閉じ込めの非対称性は、細胞分裂を止めるのに有益である。細胞が分裂するには、均等に分離するために対称的な空間が必要である。例えば、角錐マイクロウェルでは、細胞の表面が角錐マイクロウェルのすべての側面に接触している場合、角錐の背側と腹側の非対称性により、細胞は分裂しにくくなる。ほとんどの腫瘍細胞は一定の分裂状態にあるため、分裂できないと、腫瘍細胞が細胞周期停止、つまり「休眠」状態になる可能性がある。
底部プレート104は、上部プレート102のレシーバ140内に固定される。レシーバ140は、底部プレート104が上部プレート102に固定されると、上部プレート102から垂下し、底部プレート104を取り囲む周囲壁142を含む。上部プレート102が底部プレート104と位置合わせされると、マクロウェル106のそれぞれは、マイクロウェルセット122のうちの1つに対応し、それと位置合わせし、マクロウェル106のそれぞれの上部周縁118が周囲当接面150に当接し、これは、マイクロウェルセット122のそれぞれを取り囲み、平面部分132まで同一平面上に延びる。このようにして、マクロウェル106のそれぞれの上部周縁118とマイクロウェルセット122のそれぞれの周囲当接面150は、それらの間の界面として機能する。
上部プレート102が底部プレート104に固定されると、マクロウェル106の各々は、マイクロウェルセット122の1つをマイクロウェルセット122の別の1つから流体的に隔離し、マイクロウェルセット122のマクロウェル106およびマイクロウェル130を介して画定されるウェルネットワークまたはウェルグリッド156が形成される。このようにして、本明細書でさらに説明されるように、マクロウェル106のそれぞれは、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cを、マイクロウェルセット122のうちの選択された1つ、およびマイクロウェルセット122のうちの選択された1つのマイクロウェル130のうちの1つに誘導するための播種リザーバとして機能するように使用し得る。さらに、マクロウェル106のそれぞれおよびマイクロウェルセット122の関連するものは、そこに保存された1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cを協働して隔離するように使用し得る。温度および/または湿度などであるがこれらに限定されないさまざまな環境条件は、MWAPアセンブリ100全体で変化し得る。したがって、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cを含むマイクロウェルセット122は、その中に保存された1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cに最も近い第1のレベルで第1の隔離ゾーンを提供し、一方、マクロウェル106のうちの関連する1つは、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cからさらに離れた第2のレベルで第2の隔離ゾーンを提供し、第1の隔離ゾーンは、第2の隔離ゾーンと1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cとの間に延びる。
示されるように図1Aおよび1Cは、それぞれ、底部プレート104に組み立てる前のMWAPアセンブリ100の上部プレート102の底面および上面斜視図を示しており、これは図1Bによって示される。図1Dは、上部プレート102を底部プレート104に固定してMWAPアセンブリ100を形成する前に、底部プレート104と位置合わせされた上部プレート102の上面斜視図である。
図1Eは、底部プレート104のマイクロウェルセット122のうちの1つのマイクロウェル130のうちの1つの拡大上面図を示す。図1Fは、MWAPアセンブリ100の組み立て後、底部プレート104のマイクロウェルセット122のうちの1つに固定され、流体隔離する上部プレート102のマクロウェル106のうちの1つの拡大断面図を示す。マイクロウェル130は、平面部分132によって互いに離間される。マイクロウェルセット122の1つのこの例では、マイクロウェル130は、四角錐の均一または同じパターンを有するものとして示される。四角錐のそれぞれは、複数の傾斜した側壁面160と、平面部分132に垂直に延びる平面底面162とを含む。複数の傾斜した側壁面160のそれぞれは、平面部分132のうちの1つと平面底面162との間に延びて、マイクロウェル130のうちの1つの四角錐のうちの1つを部分的に画定する。前述のように、マイクロウェルセット122は、任意の数のマイクロウェル130を含むことができる。
図2A~図2Cを参照すると、上部プレート102のマクロウェル106の別の1つが、MWAPアセンブリ100の組み立て後に、底部プレート104のマイクロウェルセット122の別の1つに固定され、流体的に隔離し、さまざまな倍率で示される。前述のように、マイクロウェル130の異なるものは、本発明の概念の範囲から逸脱することなく、異なる形状、サイズ、および/またはパターンであってもよい。異なるサイズおよび/または異なるパターンに関しては、図2Aおよび2Bは、マイクロウェルセット122のうちの1つのマイクロウェル130を、複数の異なるパターンおよび複数の異なる形状を有するものとして示している。図示のように、マイクロウェルセット122の1つは、正方形の形状を有する中央領域202と、中央領域202を取り囲む3つの同心領域204、206、および208とを含む。領域208は、領域202、204、206、および208のうちの最も外側の領域であり、周囲当接面150に直接隣接している。分割面222、224、226は、互いに異なる領域202、204、206、208の間に延びる。このようにして、領域202、204、206、208の異なるパターンは、分割面222、224、226によって互いに離間される。
図2Bは、図2Aのマイクロウェル130の拡大図である。図2Bは、領域202、204、206、208の異なるパターンを示す。示されるように、領域202、204、206、208の異なる領域におけるマイクロウェル130は、さまざまな、それぞれ増加するサイズである。マイクロウェル130の最大サイズのものは、領域202、204、206、および208の最も外側の1つ、すなわち領域208内にあり、マイクロウェル130の中サイズのものから分割面226によって分離される。マイクロウェル130の中サイズのものは、領域206内にあり、領域204内のマイクロウェル130のより小さいものを取り囲む。マイクロウェル130の中サイズのものと小さいものは、分割面224によって互いに分離される。マイクロウェル130のより小さいものは、領域202内でマイクロウェル130の最も小さいものを取り囲み、分割面222によってマイクロウェル130のより小さいものから分離される。領域202、204、206、および208のうちの1つまたは複数内のマイクロウェル130の異なるものは、異なるサイズに加えて、異なる形状を有し得ることが予想される。
図2Cは、図2Bのマイクロウェル130の6つの拡大図である。示されるように、マイクロウェル130は、この例では、角錐として成形される。角錐のそれぞれは、複数の傾斜面260を含み、共通点262まで延びる。複数の傾斜した側壁面160のそれぞれは、平面部分132のうちの1つと共通点262との間に延びて、領域204内のマイクロウェル130のうちの1つの角錐のうちの1つを部分的に画定する。
領域202、204、206、および208のうちの同じ領域内のマイクロウェル130は、1つまたは複数の共通の特徴、例えば、同じ形状であるが異なる深さおよび/または異なる幅を有し得ることが予想される。これにより、ユーザは、1つまたは複数の異なる特徴を隔離し、1つまたは複数の異なる特徴が1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cにどのように影響するかを決定することができる。例えば、特定の実施形態では、領域202、204、206、および208のそれぞれは、角錐として成形されたマイクロウェル130を含み、異なるサイズの領域202、204、206、および208のそれぞれを備え、例えば、傾斜側壁面160は、それぞれ10μm、25μm、50μm、および100μmの長さを有する。
図3Aを参照すると、MWAPアセンブリ100のマイクロウェル130のうちの1つの斜視図が示され、それは四角錐、すなわち四角錐マイクロウェル302の形状を有する。四角錐マイクロウェル302は、平面底面362に対して斜めに延びる4つの傾斜した側壁面360によって画定され、それによって幅および深さを有するマイクロウェル130のうちの1つの内部370を画定する。複数の傾斜した側壁面360のそれぞれは、平面部分132のうちの1つと平面底面362との間に延びて、マイクロウェル130のうちの1つの四角錐マイクロウェル302を部分的に画定する。図3Bは、図3Aの四角錐マイクロウェル302の平面図である。図3Aは、平面部分132と平面底面362との間に延びる4つの傾斜した側壁面360のそれぞれを示す。図3Cは、図3Bの四角錐マイクロウェル302の断面図である。図3Bは、4つの傾斜した側壁面360のそれぞれと、平面部分132に垂直に延びる平面底面362とを示している。図3Cに示すように、四角錐マイクロウェル302は、垂直Y軸に関して対称であり、水平X軸に関して非対称である。このように、単一の細胞、例えば、腫瘍細胞132A、132B、132Cのうちの1つが、底部プレート104の四角錐マイクロウェル302内に、Y軸に沿って、上部プレート102のマクロウェル106のうちの対応する1つを通って配置されるとき、単一細胞は、複数の表面、例えば、平面底面362と、4つの傾斜した側壁面360のうちの1つまたは複数を介して3D空間閉じ込めを経験する。このように、四角錐マイクロウェル302は、MWAPアセンブリ100のユーザが、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cが、四角錐マイクロウェル302によって提供される3D空間閉じ込めにどのように応答するかを調べることを有利に可能にする。これは、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cがマイクロウェル130の1つまたは複数の他のものでどのように応答するかとは異なり得る。
図4Aを参照すると、MWAPアセンブリ100のマイクロウェル130のうちの1つの斜視図が示され、それは角錐の形状、すなわち角錐マイクロウェル402を有する。角錐マイクロウェル402は、共通の底点462まで延びる4つの傾斜した側壁面460によって画定され、それによって幅と深さを有するマイクロウェル130のうちの1つの内部470を画定する。複数の傾斜した側壁面460のそれぞれは、平面部分132のうちの1つと共通の底点462との間に延びて、マイクロウェル130のうちの1つの角錐マイクロウェル402を部分的に画定する。図4Bは、図4Aの角錐マイクロウェル402の平面図である。図4Aは、平面部分132と共通の底点462との間に延びる4つの傾斜した側壁面460のそれぞれを示す。図4Cは、図4Bの角錐マイクロウェル402の断面図である。図4Bは、4つの傾斜した側壁面460のそれぞれと共通の底点462を示している。図4Cに示すように、角錐マイクロウェル402は、垂直Y軸に関して対称であり、水平X軸に関して非対称である。再び、単一の細胞、例えば腫瘍細胞132A、132B、132Cのうちの1つが、上部プレート102のマクロウェル106のうちの対応する1つを通して、Y軸に沿って底部プレート104の角錐マイクロウェル402に配置されるとき、単一細胞は、複数の表面、例えば複数の4つの角度付き側壁面460を介して3D空間閉じ込めを受ける。このように、角錐マイクロウェル402は、MWAPアセンブリ100のユーザが、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cが、角錐マイクロウェル402によって提供される3D空間閉じ込めにどのように応答するかを調べることを有利に可能にし、これは、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cがマイクロウェル130の1つまたは複数の他のものでどのように応答するかとは異なり得る。
図5Aを参照すると、MWAPアセンブリ100のマイクロウェル130のうちの1つの斜視図が示され、それは正方形、すなわち正方形マイクロウェル502の形状を有する。正方形マイクロウェル502は、平面底面562に対して垂直に延びる4つの直線側壁面560によって画定され、それによって幅と深さを有するマイクロウェル130のうちの1つの内部570を画定する。複数の直線側壁面560のそれぞれは、平面部分132のうちの1つと平面底面562との間に延びて、マイクロウェル130のうちの1つの正方形マイクロウェル502を部分的に画定する。図5Bは、図5Aの正方形マイクロウェル502の平面図である。図5Aは、平面部分132と平面底面562との間に延びる4つの直線側壁面560のそれぞれを示す。図5Cは、図5Bの正方形マイクロウェル502の断面図である。図5Bは、4つの直線側壁面560のそれぞれと、平面部分132に垂直に延びる平面底面562とを示している。図5Cに示すように、正方形マイクロウェル502は、垂直Y軸に関して対称であり、水平X軸に関して非対称である。単一細胞、例えば腫瘍細胞132A、132B、132Cのうちの1つが、上部プレート102のマクロウェル106のうちの対応する1つを通して、Y軸に沿って底部プレート104の正方形マイクロウェル502に配置される場合、単一細胞は対称的な閉じ込めを経験するが、これは細胞分裂を止めるのに有益ではない。このように、正方形マイクロウェル502は、有利には、MWAPアセンブリ100のユーザが、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cが、正方形マイクロウェル502によって提供される対称閉じ込めにどのように応答するか、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cがマイクロウェル130の1つまたは複数の他のものでどのように応答するかを研究して対比することを可能にする。例えば、正方形マイクロウェル502は、マイクロウェルが横方向に、例えばXZ平面上に1つの細胞のみを保持できる場合、閉じ込めを調査するために使用され得る。この場合、細胞には横方向に分裂する空間がないが、y軸に沿って分裂する可能性がある。正方形マイクロウェル502はまた、本明細書で説明されるクローン原性アッセイにも使用することができる。
図6A~図6Bを参照すると、本発明の概念の一実施形態による小型フォーマットのマイクロウェルアッセイプレート(MWAP)アセンブリ600が示される。MWAPアセンブリ600は、一般に、上部プレート602および底部プレート604によって画定される。
上部プレート602は、上部プレート602を完全に貫通する4つのマクロウェル606を含む。マクロウェル606は、2つの行611および2つの列612を有するマクロウェルアレイ608に配置される。マクロウェル606のそれぞれは、周囲側壁614の上部周縁618から離間した下部周縁616を有する周囲側壁614によって画定される。周囲側壁614は、上部プレート602を完全に貫通して延びるリザーバ620を画定し、それによってマクロウェル606の各々を実質的に底なしにする。
底部プレート604は、底部プレート604の一方の側626上に実質的に平坦な表面624に形成された4つのマイクロウェルセット622を含む。マイクロウェルセット622のそれぞれは、さまざまな形状および/またはサイズを有するマイクロウェル630のマイクロウェルアレイ628を含み、マイクロウェル630は、平面部分632によって互いに離間される。マイクロウェルセット622は、任意の数のマイクロウェル630を含むことができ、マイクロウェル630の異なるものは、異なる形状、サイズ、および/またはパターンであることが予想され、本発明の概念の範囲から逸脱することはない。実際、図によって示されるマイクロウェル630の数、サイズ、形状、およびパターンは、本発明の概念を理解するための例示目的のためだけのものである。例えば、マイクロウェル630の数に関して、マイクロウェルセット622の異なるものは、3000から4000個のマイクロウェル630を含み得る。したがって、底部プレート604は、300,000個を超えるマイクロウェル630を含むように微細加工され得る。このように、MWAPアセンブリ600は、本明細書で説明するように、高スループットを提供するように有利に使用し得る。マイクロウェル630のサイズおよび形状に関して、マイクロウェル630のさまざまなものは、1つまたは複数の立方体、1つまたは複数の角錐、1つまたは複数の四角錐などであるがこれらに限定されない形状にすることができる。したがって、マイクロウェルセット622の異なるものにおいて、マイクロウェル630の異なるものは、有利には、1つまたは複数の腫瘍細胞に対してさまざまな程度の三次元(3D)空間閉じ込めを提供するように使用可能であり、例えば、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cは、小型フォーマットMWAPアセンブリ600のユーザによってそこに配置および保存される。このように、マイクロウェル630は、小型フォーマットMWAPアセンブリ600のユーザが、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cがさまざまな程度の3D空間閉じ込めにどのように応答するかを調べることを有利に可能にする。本明細書で論じるように、細胞を閉じ込めることは、細胞の閉じ込めの程度に応じて隔離し、休眠を誘導することを含むさまざまな機能を果たす。非対称な閉じ込めは、非対称角錐マイクロウェルなどの細胞分裂を止めるのに役立つ。
底部プレート604は、上部プレート602のレシーバ640内に固定される。レシーバ640は、底部プレート604が上部プレート602に固定されたときに、上部プレート602から垂下し、底部プレート604を取り囲む周囲壁642を含む。上部プレート602が底部プレート604と位置合わせされると、マクロウェル606のそれぞれは、マイクロウェルセット622のうちの1つに対応し、位置合わせし、マクロウェル106のそれぞれの上部周縁618は、マイクロウェルセット622のそれぞれを取り囲み、平面部分132に対して同一平面上に延びる周囲当接面650に当接する。このようにして、マクロウェル606のそれぞれの上部周縁618と、マイクロウェルセット622のそれぞれの周囲当接面650とは、それらの間の界面として機能する。
上部プレート602が底部プレート604に固定されると、マクロウェル606の各々は、マイクロウェルセット622の1つをマイクロウェルセット622の別の1つから流体的に隔離し、マイクロウェルセット622のマクロウェル606およびマイクロウェル630を介して画定されるウェルネットワークまたはウェルグリッド656が形成される。このようにして、マクロウェル606のそれぞれは、播種リザーバとして機能するように使用可能であり、本明細書でさらに論じるように、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cを、マイクロウェルセット622のうちの選択された1つ、およびマイクロウェルセット622のうちの選択された1つのマイクロウェル630のうちの1つに誘導する。さらに、マクロウェル606のそれぞれおよびマイクロウェルセット622の関連するものは、そこに保存された1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cを協働して隔離するように使用し得る。温度および/または湿度などであるがこれらに限定されないさまざまな環境条件は、小型フォーマットMWAPアセンブリ600全体にわたって変化し得る。したがって、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cを含むマイクロウェルセット622は、その中に保存された1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cに最も近い第1のレベルで第1の隔離ゾーンを提供し、一方、マクロウェル606のうちの関連する1つは、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cからさらに離れた第2のレベルで第2の隔離ゾーンを提供し、第1の隔離ゾーンは、第2の隔離ゾーンと1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cとの間に延びる。
示されるように、図6Aは、底部プレート604に組み立てる前の小型フォーマットMWAPアセンブリ600の上部プレート602の底面斜視図を示す。図6Bは、上部プレート602を底部プレート604に固定して小型フォーマットMWAPアセンブリ600を形成する前に、底部プレート604と位置合わせされた上部プレート602の上面斜視図である。
[マイクロウェル設計]
論じたように、マイクロウェル130、630は、底部プレート104、604にわたって形状および/またはサイズが異なり、マクロウェル106、406のうちの同じものにおいてさまざまなサイズの細胞の形成および研究を可能にすることができる。図1E、1F、2A、2B、2C、3A、3B、3C、4A、4B、4C、5A、5B、および5Cは、MWAPアセンブリ100に関して、本明細書で前述したように、小型フォーマットMWAPアセンブリ600に同様に適用可能である。実際、MWAPアセンブリ100および小型フォーマットMWAPアセンブリ600の特徴は、マクロウェル106、606およびマイクロウェル130、630を含むがこれらに限定されないが、本発明の概念の範囲から逸脱することなく同じであってもよい。
論じたように、マイクロウェル130、630は、底部プレート104、604にわたって形状および/またはサイズが異なり、マクロウェル106、406のうちの同じものにおいてさまざまなサイズの細胞の形成および研究を可能にすることができる。図1E、1F、2A、2B、2C、3A、3B、3C、4A、4B、4C、5A、5B、および5Cは、MWAPアセンブリ100に関して、本明細書で前述したように、小型フォーマットMWAPアセンブリ600に同様に適用可能である。実際、MWAPアセンブリ100および小型フォーマットMWAPアセンブリ600の特徴は、マクロウェル106、606およびマイクロウェル130、630を含むがこれらに限定されないが、本発明の概念の範囲から逸脱することなく同じであってもよい。
いくつかの変形例では、底部プレート104、604は、同じ断面および一定の深さを有し、側壁が直線である正方形の形状のマイクロウェル130、630を有し得る。いくつかの変形例では、底部プレート104、604は、同じ断面および一定の深さを有し、側壁が傾斜した正方形の形状のマイクロウェル130、630を有し得る。いくつかの変形例では、底部プレート104、604は、さまざまな断面およびさまざまな深さを有し、側壁が傾斜した正方形の形状のマイクロウェル130、630を有し得る。いくつかの変形例では、底部プレート104、604は、さまざまな断面およびさまざまな深さを有し、側壁が直線である正方形の形状のマイクロウェル130、630を有し得る。
いくつかの変形例では、底部プレート104、604は、同じ断面および一定の深さを有し、側壁が直線である三角形の形状のマイクロウェル130、630を有し得る。いくつかの変形例では、底部プレート104、604は、同じ断面および一定の深さを有し、側壁が傾斜した三角形の形状のマイクロウェル130、630を有し得る。いくつかの変形例では、底部プレート104、604は、さまざまな断面およびさまざまな深さを有し、側壁が直線である三角形の形状のマイクロウェル130、630を有し得る。いくつかの変形例では、底部プレート104、604は、さまざまな断面およびさまざまな深さを有し、側壁が傾斜した三角形の形状のマイクロウェル130、630を有し得る。
いくつかの変形例では、上部プレート102、602および/または底部プレート104、604は、さまざまな剛性のポリマーまたはゲルコーティングを使用することができる。いくつかの変形例では、上部プレート102、602および/または底部プレート104、604は、上部プレート102、602および/または底部プレート104、604の1つまたは複数の特性を変更するために、1つまたは複数の化学物質でコーティングすることができ、例えば、デュロタクティックおよび/またはアドヒアランスである。
いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの断面寸法は、8μmから100μmの範囲であってもよい。例えば、マイクロウェル130、630のそれぞれの正方形の断面は、8μmから100μmまでの一辺の長さを有し得る。マイクロウェル130、630のそれぞれの正三角形の断面は、8μmから100μmまでの辺の長さを有することができる。
いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のうち、断面寸法が8μmから25μmの小さい寸法のものを、単一細胞用途に使用することができる。いくつかの変形例では、断面寸法が26μmから100μmであるマイクロウェル130、630の大きな寸法のものを、多細胞用途に使用することができる。
マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、側面の長さ、側面の幅、および/または深さを含み得る。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、8μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、10μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、15μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、20μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、25μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、30μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、40μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、50μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、60μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、70μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、80μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、90μm以上であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、100μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、90μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、80μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130のそれぞれの寸法は、70μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、60μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、50μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、40μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、30μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、25μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、20μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、15μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの寸法は、10μm以下であってもよい。いくつかの変形例では、マイクロウェル130、630のそれぞれの深さは、8μmから100μmの範囲であってもよい。マイクロウェル130、630のそれぞれの深さは、マイクロウェル130、630のそれぞれの側壁によって部分的に画定される。
[MWAPアセンブリの製造]
製造プロセス700は、黒色の環状オレフィンポリマー(COP)を使用して上部プレート102、602を形成することを含む。このようにして、上部プレート102、602のレーザ溶接を容易にすることができ、黒色COPを介して反射および蛍光の減少によるアーティファクトのない撮像を得ることができる。動作702で、黒色COPを使用して、上部プレート102、602が射出成形プロセスを使用して形成される。射出成形は、溶融材料を金型に射出することによってプラスチック部品を製造する製造プロセスである。例えば、金型は、マクロウェル106、606およびリザーバ120、620を含むなど、上部プレート102、602のパターンを有してもよい。COPペレットは、加熱されたバレルに供給され、金型キャビティに射出され、そこでCOPが冷却されて上部プレート102、602を形成する。
製造プロセス700は、黒色の環状オレフィンポリマー(COP)を使用して上部プレート102、602を形成することを含む。このようにして、上部プレート102、602のレーザ溶接を容易にすることができ、黒色COPを介して反射および蛍光の減少によるアーティファクトのない撮像を得ることができる。動作702で、黒色COPを使用して、上部プレート102、602が射出成形プロセスを使用して形成される。射出成形は、溶融材料を金型に射出することによってプラスチック部品を製造する製造プロセスである。例えば、金型は、マクロウェル106、606およびリザーバ120、620を含むなど、上部プレート102、602のパターンを有してもよい。COPペレットは、加熱されたバレルに供給され、金型キャビティに射出され、そこでCOPが冷却されて上部プレート102、602を形成する。
次に、製造プロセス700は、光学的に透明なCOPを使用して底部プレート104、604を形成することを含み、これは、底部プレート104、604のマイクロウェル130、630とともに保存された1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cを見るときに、光学的に透明なウィンドウを提供する。このように、底部プレート104、604は、MWAPアセンブリ100、600内の細胞の検査または撮像、および細胞を視覚化するための画像の分析を可能にする。動作704で、光学的に透明なCOPを使用して、底部プレート104、604がホットエンボスプロセスを使用して形成される。ホットエンボスプロセスは、ポリマーをガラス転移温度付近まで加熱しながらスタンプをポリマーに押し付けることによって、ポリマーフィルムまたはシートを構造化するプロセスである。ポリマーは、スタンプ構造の高さよりもはるかに厚い。レリーフは、ポリマーの総厚さの摂動である。ホットエンボス加工は、ナノインプリントリソグラフィよりも欠陥が発生しにくく、ナノ構造やマイクロ構造に限定されない。最初に、所望のマイクロウェルセット122、622のインプリントを有するシリコンマスター金型が作成される。SU-8は、一般的に使用されるエポキシ系ネガ型フォトレジストである。マイクロウェルセット122、622の各セットは、マイクロウェル130、630、例えば3000から4000個のマイクロウェル130を含む。シリコンSU-8マスター金型は、シリコンウエハー上にSU-8フォトレジストをスピンコーティングし、マスクアライナでUV光を照射するリソグラフィプロセスを使用して製造される。次に、架橋されていないフォトレジストが洗い流される。マイクロウェルセット122、622内の各マイクロウェル130、630の特徴を備えたシリコンSU-8マスター金型が製造される。次に、シリコンマスターにシリコンを流し込んで剥がし、シリコンのネガスタンプを作製する。最終ステップでは、底部プレート104、604は、シリコンスタンプの特徴をホットエンボスプロセスによってCOPのプレーンシートに転写またはインプリントすることによって製造される。いくつかの実施形態では、COPシートは、100μmから800μmの範囲の厚さを有し得る。いくつかの実施形態では、COPシートは、100μmから400μmの範囲の厚さを有し得る。いくつかの実施形態では、COPシートは188μmの厚さであり得る。このようにして、底部プレート104、604は微細加工される。
次に、製造プロセス700は、動作706で、上部プレート102、602と底部プレート104、604とを位置合わせすることを含む。位置合わせしたら、上部プレート102、602および底部プレート104、604は固定具および真空によって保持される。例えば、上部プレート102、602および底部プレート104、604は、マクロウェル106、406に対してマイクロウェルセット122、622を正確に位置決めするために位置合わせすることができ、次に、動作708で、接合プロセス中に3D自動並進ステージシステム上で真空を介して吸引下に保持される。
接合プロセスは、上部プレート102、602および底部プレート104、604を一緒に接合または接着して、MWAPアセンブリ100、600を形成することを含む。上部プレート102、602および底部プレート104、604は、以下でさらに説明するようにマイクロウェルセット122、622およびマクロウェル106、406の周囲に沿った上部プレート102、602と底部プレート104、604との間の界面または接合部におけるレーザ溶接プロセスによって、一緒に接合または接着され、流動的にシールされる。
レーザ溶接は、接着などの他の接着プロセスよりも多くの利点を提供する。レーザ溶接は接着よりも高速で、自動プロセスや大規模プロセスにも使用できる。さらに、接着剤を介して提供される接着は、一般に低スループットで、細胞との化学的相互作用により複雑になる可能性がある。本発明の概念のレーザ溶接プロセスは、自動で高速であるため、スループットが高くなる。さらに、本発明の概念のレーザ溶接プロセスは、漏れが形成されず、化学薬品を必要としないことをより確実に保証する。摩擦嵌め係合および/または接着などの他の取り付けプロセスは、溶接よりも多くの利点を提供する。例えば、上部プレート102、602および底部プレート104、604は、上部プレート102、602が底部プレート104、604から選択的に取り外し可能であるように、一緒に接合されてMWAPアセンブリ100、600を形成することができる。例えば、接合プロセスは、ユーザが底部プレート104、604から上部プレート102、602を選択的に取り付けおよび取り外すことを可能にするために、摩擦嵌め係合および/または再利用可能な接着剤を利用し得る。このようにして、ユーザは有利には、マイクロウェル130、630内の細胞への直接アクセスを提供され、それによってさらなる試験および/または検査が可能になる。
図8Aを参照すると、MWAPアセンブリ100を形成する動作706が示される。上部プレート102と底部プレート104は、レーザ溶接プロセス中、並進ステージを含む3D自動並進ステージシステム上で位置合わせされ、吸引下に保持される。次に、動作708を介して、レーザ源802からのレーザスポットが、上部プレート102と底部プレート104との間の第1の界面に集束される。底部プレート104上の基準として位置合わせマーカーを使用して、並進ステージは、レーザ源802をアクティブにして、固定された2Dパターンで移動し、これにより、底部プレート104は、マクロウェル106の各周縁に沿って正方形のパターンで上部プレート102に溶接され、接合され、固定される。このようにして、上部プレート102と底部プレート104は互いに流体シールされ、ウェルグリッド156を有するMWAPアセンブリ100が形成される。
図8Bを参照すると、小型フォーマットMWAPアセンブリ600を形成するための動作506が示される。上部プレート602と底部プレート604は、レーザ溶接プロセス中、並進ステージを含む3D自動並進ステージシステム上で位置合わせされ、吸引下に保持される。次に、動作508を介して、レーザ源652からのレーザスポットが、上部プレート602と底部プレート604との間の第1の界面に集束される。底部プレート604上の基準として位置合わせマーカーを使用して、並進ステージは固定された2Dパターンで移動し、レーザ源652がアクティブになり、これにより、底部プレート604は、マクロウェル606の各周縁に沿って正方形パターンで上部プレート602に溶接される。次に、レーザ源852からのレーザスポットは、上部プレート602と底部プレート604との間の第2の界面に集束される。底部プレート604上の基準として位置合わせマーカーを使用して、並進ステージは、レーザスポットに対して別の固定2Dパターンで移動し、これにより、底部プレート604は、四角形のパターンでリザーバ周縁のそれぞれに沿って上部プレート602にさらに溶接される。このようにして、上部プレート602と底部プレート604は互いに流体シールされ、ウェルグリッド656を有するMWAPアセンブリ600が形成される。
[細胞の可視化のための画像解析]
本発明の概念は、蛍光走査型電子顕微鏡(SEM)を利用して顕微鏡写真を撮り、マイクロウェル130、630のそれぞれの細胞を検査する。マイクロウェルアレイ128、628が1つまたは複数の蛍光標識された腫瘍細胞を含む場合、SEMによって画像が撮影される。例えば、図1Eは、16個のマイクロウェル130を有するマイクロウェルアレイ128の蛍光画像の例である。腫瘍細胞134A、134Bは、蛍光標識された腫瘍細胞であり、マイクロウェルアレイ128内に配置され、保存される。SEMまたはその他の分析ツールを使用すると、ユーザは、さまざまな種類の薬剤の下での細胞の増殖および/または分裂を視覚化できる。このように、マイクロウェル130、630は、MWAPアセンブリ100、600のユーザが、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cがさまざまな程度の3D空間閉じ込めにどのように応答するかを調べることを有利に可能にする。
本発明の概念は、蛍光走査型電子顕微鏡(SEM)を利用して顕微鏡写真を撮り、マイクロウェル130、630のそれぞれの細胞を検査する。マイクロウェルアレイ128、628が1つまたは複数の蛍光標識された腫瘍細胞を含む場合、SEMによって画像が撮影される。例えば、図1Eは、16個のマイクロウェル130を有するマイクロウェルアレイ128の蛍光画像の例である。腫瘍細胞134A、134Bは、蛍光標識された腫瘍細胞であり、マイクロウェルアレイ128内に配置され、保存される。SEMまたはその他の分析ツールを使用すると、ユーザは、さまざまな種類の薬剤の下での細胞の増殖および/または分裂を視覚化できる。このように、マイクロウェル130、630は、MWAPアセンブリ100、600のユーザが、1つまたは複数の腫瘍細胞134A、134B、134Cがさまざまな程度の3D空間閉じ込めにどのように応答するかを調べることを有利に可能にする。
[用途]
薬剤開発は、時間がかかり法外に費用のかかるプロセスである。腫瘍薬剤の高い失敗率は、部分的には、インビトロスクリーニング中の薬剤分子の選択性が低いことに起因する可能性がある。MWAPアセンブリ100、600は、腫瘍薬剤のインビトロ薬剤スクリーニング感度を著しく改善する。
薬剤開発は、時間がかかり法外に費用のかかるプロセスである。腫瘍薬剤の高い失敗率は、部分的には、インビトロスクリーニング中の薬剤分子の選択性が低いことに起因する可能性がある。MWAPアセンブリ100、600は、腫瘍薬剤のインビトロ薬剤スクリーニング感度を著しく改善する。
MWAPアセンブリ100、600は、例えば薬剤分子の大きなライブラリーをスクリーニングする必要がある場合など、高スループットおよび高含有能力が有益な薬剤スクリーニング用途を容易にする。3000から4000のマイクロウェル130を備えたMWAPアセンブリ100は、光学的に透明な底部プレートまたはウィンドウを提供し、高スループットを可能にし、薬剤スクリーニングアッセイ用のハイコンテントプレートイメージャーと互換性があるように特に設計される。
MWAPアセンブリ100、600は、サイズおよび対称性の空間的閉じ込めの程度がさまざまなマイクロウェル130、630内に単一細胞または複数の細胞を空間的に閉じ込めるように使用し得る。サイズおよび対称性における空間閉じ込めの程度は、マイクロウェル130、630の形状およびサイズによって異なり得る。マイクロウェル130、630は、特定の用途のために変化し得る複数の機能を有し得る空間的閉じ込めを作り出すことができる。
マイクロウェル130、630の1つまたは複数が十分に小さい場合、例えば、マイクロウェル130、630の側壁および底壁に触れることによって、単一の腫瘍細胞または多細胞細胞をマイクロウェル130、630内に空間的に閉じ込めることができ、マイクロウェル130、630の物理的閉じ込めは、細胞の3D閉じ込めを提供することができる。
空間的閉じ込めに加えて、マイクロウェル130、630の閉じ込め空間の対称性は、細胞の分裂能力に大きな影響を与える。マイクロウェル130、630は、細胞の単一の細胞を捕捉し、さまざまな程度の閉じ込め対称性を導入し、これによりさまざまな結果が得られる。マイクロウェル130、630の閉じ込め対称性は、直線壁を有する対称(背腹および前後)正方形ウェル(立方体)から、傾斜壁を有する非対称三角形ウェル(例えば角錐)までの範囲であり得る。
腫瘍細胞は、分裂および増殖するために対称空間を必要とし得ることが予想される。いくつかの実施形態では、マイクロウェル130、630のうちの1つまたは複数が非対称であり、それによって腫瘍細胞が分裂および増殖するのを防止する。例えば、マイクロウェル130、630は、各辺がさまざまな長さまたは等しい長さを有する三角形の形状または角錐形状を有してもよい。
いくつかの実施形態では、細胞培養プロトコルが提供される。
MWAPアセンブリ100、600は、癌に関連する3つの用途向けに設計されるが、これらに限定されない。つまり、1)休眠アッセイ(さまざまな程度の対称性における単一細胞の閉じ込め)、2)スフェロイドアッセイ(クローンスフェロイドの標準化されたサイズ)、および3)クローン原性アッセイである。
[休眠アッセイ]
休眠細胞は、一次部位および/または転移した二次部位での治療から数年後の癌の再発の原因である。これらの休眠細胞は、休眠細胞が細胞周期停止の何らかの形態、例えばアイドリングモードにあるため、初期治療を免れ、したがって、休眠細胞が分裂していない場合、分裂細胞を標的とする化学療法または放射線療法に耐性がある。休眠細胞を標的とする薬剤を処方する際の課題の1つは、薬剤を試験するためのインビトロまたはインビボモデルがないことである。腫瘍細胞の休眠を空間的に誘導し、薬剤を試験することができる従来の技術はない。
休眠細胞は、一次部位および/または転移した二次部位での治療から数年後の癌の再発の原因である。これらの休眠細胞は、休眠細胞が細胞周期停止の何らかの形態、例えばアイドリングモードにあるため、初期治療を免れ、したがって、休眠細胞が分裂していない場合、分裂細胞を標的とする化学療法または放射線療法に耐性がある。休眠細胞を標的とする薬剤を処方する際の課題の1つは、薬剤を試験するためのインビトロまたはインビボモデルがないことである。腫瘍細胞の休眠を空間的に誘導し、薬剤を試験することができる従来の技術はない。
MWAPアセンブリ100、600は、腫瘍細胞の休眠を空間的に誘導し、抗休眠薬を含む薬剤を休眠アッセイとして試験するように使用可能であり、これは、さまざまな形状および空間的閉じ込めを有するマイクロウェルアレイ128、628を含み、単一の腫瘍細胞の休眠を誘導することができる。アッセイとしての細胞分裂の対称性の使用は、本発明の概念を介して、腫瘍細胞においてさまざまな程度の休眠を誘導する可能性があることも予想される。
上部プレート102、602のマクロウェル106、606のうちの1つまたは複数に、単一の腫瘍細胞とともに多数の抗休眠薬を導入することができる。次いで、さまざまな形状のマイクロウェル130、630の異なるもの、および底部プレート104、604の空間的閉じ込めを使用して、多数の抗休眠薬を試験することができる。このようにして、MWAPアセンブリ100、600を使用して、単一の腫瘍細胞の休眠を誘導するのにどの薬剤がより効果的であるかを決定することができる。
マイクロウェル130、630のより小さなものにおける単一細胞の閉じ込めは、空間的閉じ込めの程度に応じて、隔離および休眠の誘導を含む機能を果たし得ることが予想される。マイクロウェル130、630の小さい寸法のもの、例えば、断面寸法が8μmから25μmのものは、単一細胞閉じ込めまたは単一細胞用途に使用できることが予想される。
単一細胞休眠アッセイで実験を行い、単一細胞休眠アッセイでは、単一の腫瘍細胞が角錐マイクロウェル内で分裂しないことを実証した。
図9Aは、本発明の概念の実施形態による、単一細胞休眠アッセイのための角錐マイクロウェル906を含む底部プレート908の上面図である。図9Aに示すように、底部プレート908は、底部プレート908に垂直な方向に延びる分割壁910によって互いに分離または隔離された多数の角錐マイクロウェル906を含む。マイクロウェル906は、約10μmの幅を有する側面914を含む。
図9Bは、本発明の概念の実施形態による、図9Aの単一細胞休眠アッセイのための底部プレート908内の単一の腫瘍細胞を示す蛍光画像である。図9Bに示すように、輝点902A~902Eは、単一の腫瘍細胞を表す。
図9Cは、本発明の概念の実施形態による、角錐マイクロウェル908内に捕捉された単一の腫瘍細胞902A~902Eを含む底部プレート908の上面図である。図9Cは、図9Aおよび図9Bを合成した図である。図9Cに示すように、単一の腫瘍細胞902A~902Eが、矢印912によって示されるように、角錐マイクロウェル906内に捕捉される。単一の腫瘍細胞902A~902Eは、被覆、すなわち、単一の腫瘍細胞902A~902Eを角錐マイクロウェル908に導入した後6日後に分裂しなかった。注目すべきは、典型的な倍加時間は36時間である。角錐マイクロウェル908の形状および/またはサイズは、本発明の概念の範囲から逸脱することなく、単一細胞休眠アッセイのために変化し得ることが当業者によって理解される。
[クローン原性アッセイ]
クローン原性アッセイは、腫瘍薬剤および放射線治療の効果を定量化するために一般的に使用され、クローン細胞、例えば50以上のクローン細胞のコロニーへの単一の腫瘍細胞の増殖を妨害する。従来のウェルプレートは、各ウェルに単一細胞を播種することにより、伝統的にアッセイに使用される。従来のウェルプレートを使用することにはいくつかの欠点があり、従来のウェルには制限があり、ユーザが変動を試験および観察することができないことが含まれる。例えば、従来のウェルはプレート当たりのウェルの数が限られている。また、重複するコロニーは、カウントする際に問題になる。
クローン原性アッセイは、腫瘍薬剤および放射線治療の効果を定量化するために一般的に使用され、クローン細胞、例えば50以上のクローン細胞のコロニーへの単一の腫瘍細胞の増殖を妨害する。従来のウェルプレートは、各ウェルに単一細胞を播種することにより、伝統的にアッセイに使用される。従来のウェルプレートを使用することにはいくつかの欠点があり、従来のウェルには制限があり、ユーザが変動を試験および観察することができないことが含まれる。例えば、従来のウェルはプレート当たりのウェルの数が限られている。また、重複するコロニーは、カウントする際に問題になる。
MWAPアセンブリ100、600は、クローン原性アッセイとして使用するために設計される。クローン原性アッセイでは、多数のクローン細胞、例えば50以上のクローン細胞を保持するのに十分な大きさの正方形マイクロウェルに単一の腫瘍細胞を播種することができる。腫瘍細胞は、マイクロウェルの接着性および非接着性表面特性の下で、薬剤治療の前後にコロニー/スフェロイドを形成する能力に基づいて定量化される。薬剤や放射線療法は、クローン細胞のコロニーへの単一の腫瘍細胞の増殖を妨害できる可能性がある。単一の腫瘍細胞とともに、多数の薬剤をマイクロウェル130、630に導入することができる。次に、正方形マイクロウェル502、四角錐マイクロウェル302、および角錐マイクロウェル402を含むマイクロウェル130、630は、クローン細胞のコロニーへの単一の腫瘍細胞の増殖を妨害するのにどの薬剤がより効果的であるかを調べるために、これらの多数の薬剤を試験するために使用できる。
単一細胞クローン原性アッセイで実験を行い、単一細胞クローン原性アッセイにおいてクローン細胞のコロニーへの単一クローン細胞の増殖を実証した。
図10Aは、本発明の概念の実施形態による、単一細胞クローン原性アッセイのために単一クローン細胞が捕捉された四角錐マイクロウェル1006を含む底部プレート1008の上面図である。図10Aに示されるように、底部プレート1008は、底部プレート1008に垂直な方向に延びる隔壁1010によって互いに分離または隔離された多数の四角錐マイクロウェル1006を含む。四角錐マイクロウェル1006は、前に四角錐マイクロウェル302として論じられ、図3A-3Cに示される。図10Aに示すように、単一クローン細胞1002A~1002Dが、四角錐マイクロウェル1006に捕捉された。単一クローン細胞1002A~1002Dは、単一クローン細胞1002A~1002Dがマイクロウェル1006内で増殖するための空間があるように、マイクロウェル1006のサイズと比較して小さい。
図10Bは、本発明の概念の実施形態による、単一細胞クローン原性アッセイにおけるクローン細胞1002A~1002Dのコロニーが捕捉された四角錐マイクロウェル1006を含む底部プレート1008の上面図である。図10Bに示すように、1つのクローン細胞1002Dが増殖してクローン細胞1002A~1002Dのコロニー1004になり、それによって、マイクロウェル1006によって提供される空間が拡大し、満たされた。
図11Aは、本発明の概念の実施形態による、単一細胞クローン原性アッセイのための単一クローン細胞が捕捉された角錐マイクロウェル1106を含む底部プレート1108の上面図である。図11Aに示されるように、底部プレート1108は、底部プレート1108に垂直な方向に延びる分割壁1110によって互いに分離または隔離された多数の角錐マイクロウェル1106を含む。角錐マイクロウェル1106は、角錐マイクロウェル402として前に論じられ、図4A-4Cに示される。図11Aに示すように、単一のクローン細胞1102A~1102Dが角錐マイクロウェル1106に捕捉された。単一クローン細胞1102A~1102Dは、単一クローン細胞1102A~1102Dがマイクロウェル1106内で増殖するための空間があるように、マイクロウェル1106のサイズと比較して小さい。
図11Bは、本発明の概念の実施形態による、単一細胞クローン原性アッセイにおけるクローン細胞1102A~1102Dのコロニーが捕捉された角錐マイクロウェル1106を含む底部プレート1108の上面図である。図11Bに示されるように、いくつかのクローン細胞1102A~1102Dは、クローン細胞1102A~1102Dのコロニー1104A~1104Dに増殖し、それによって、マイクロウェル1106内の空間を拡張および満たした。角錐マイクロウェル1106の形状および/またはサイズは、本発明の概念の範囲から逸脱することなく、単一細胞クローン原性アッセイのために変化し得ることが当業者によって理解される。
[スフェロイドアッセイ]
多細胞腫瘍スフェロイド(MCTS)は、基礎研究および薬剤スクリーニング用途のための固形腫瘍の3Dインビトロモデルである。ユーザがMCTSの作成を試みるために利用できる従来のプラットフォームがいくつかあるが、そのような従来のプラットフォームは限定されており、固定サイズのクローンMCTSを生成することはできない。実際、従来のプラットフォームのいずれも、固定サイズまたは標準化されたクローンMCTSを生成するために動作できない。
多細胞腫瘍スフェロイド(MCTS)は、基礎研究および薬剤スクリーニング用途のための固形腫瘍の3Dインビトロモデルである。ユーザがMCTSの作成を試みるために利用できる従来のプラットフォームがいくつかあるが、そのような従来のプラットフォームは限定されており、固定サイズのクローンMCTSを生成することはできない。実際、従来のプラットフォームのいずれも、固定サイズまたは標準化されたクローンMCTSを生成するために動作できない。
MWAPアセンブリ100、600は、スフェロイドアッセイとして設計され、研究または薬剤スクリーニング用途に使用できるMCTSの標準化されたサイズを生成するように使用し得る。マイクロウェル130、630内の多細胞閉じ込めは、細胞を誘導および制限して固定サイズまたは標準サイズのスフェロイドを形成するように機能するように使用可能であることが予想される。断面寸法が26μmから300μmであるマイクロウェル130、630のより大きなサイズのものは、多細胞閉じ込めまたは適用のために使用され得ることが予想される。
実験はスフェロイドアッセイで実施され、スフェロイドアッセイの四角錐マイクロウェルで乳癌細胞の小さなクローンの増殖が実証され、固定サイズまたは標準化されたサイズの乳癌細胞を得るために、四角錐マイクロウェルの空間を満たす。
図12Aは、本発明の概念の実施形態による、スフェロイドアッセイのために乳癌細胞が捕捉された四角錐マイクロウェル1206を含む底部プレート1208の上面図である。図12Aに示されるように、底部プレート1208は、底部プレート1208に垂直な方向に延びる分割壁1210によって互いに分離または隔離された多数の四角錐マイクロウェル1206を含む。四角錐マイクロウェル1206は、前に四角錐マイクロウェル302として論じられ、図3A-3Cに示される。図12Aに示すように、複数の乳癌細胞または乳癌細胞1202A~1202Dの小さなクローンは、四角錐マイクロウェル1206に捕捉された。小さなクローン細胞2002A~2002Dは、マイクロウェル1206内で乳癌細胞1202A~1202Dの小さなクローンが増殖するための空間が存在するように、四角錐マイクロウェル1206のサイズと比較して小さかった。また、すべての四角錐マイクロウェル1206は、スフェロイドアッセイのために同じサイズまたは固定サイズを有していた。
図12Bは、本発明の概念の実施形態による、図12Aのスフェロイドアッセイにおいて増殖した乳癌細胞が捕捉された四角錐マイクロウェルを含む底部プレートの上面図である。図12Bに示すように、乳癌細胞1202A~1202Dの小さなクローンは、3日後に乳癌細胞1204A~1204Dのより大きなクローンに増殖する。乳癌細胞のより大きなクローンは、乳癌細胞のクローンが四角錐マイクロウェル1206の空間を満たすまで、より多くの時間とともに増殖し続けることができ、四角錐マイクロウェル1206によって画定される固定サイズのMCTSのクローンを形成する。四角錐マイクロウェル1206の形状および/またはサイズは、本発明の概念の範囲から逸脱することなく、スフェロイドアッセイのために変更できることを当業者は理解するであろう。
いくつかの実施形態を説明してきたが、当業者であれば、本発明の概念の趣旨から逸脱することなく、さまざまな修正、代替構造、および均等物を使用できることが理解されよう。さらに、本発明の概念を不必要に曖昧にすることを避けるために、多くの周知のプロセスおよび要素については説明していない。したがって、この説明は、本発明の概念の範囲を限定するものと解釈されるべきではない。
当業者は、現在開示される実施形態が限定ではなく例として教示していることを理解するであろう。したがって、この説明に含まれる、または添付の図面に示される事項は、例示として解釈されるべきであり、限定的な意味で解釈されるべきではない。以下の特許請求の範囲は、本明細書に記載されたすべての一般的および特定の特徴、ならびに方法およびアセンブリの範囲のすべての記述をカバーすることを意図しており、言語の問題として、それらの間にあると言える。
Claims (28)
- アレイ状に配置された複数のマクロウェルを有する上部プレートと、
前記上部プレートに固定されるように使用可能であり、複数のマイクロウェルを有する、底部プレートと、
前記底部プレートが前記上部プレートに固定されたときに形成されるウェルグリッドであって、前記複数のマクロウェルのそれぞれが前記複数のマイクロウェルの1つのセットを前記複数のマイクロウェルの別のセットから隔離した状態で、前記複数のマクロウェルおよび前記複数のマイクロウェルにより画定される、ウェルグリッドと、
を含む、マイクロウェルアレイプレート(MWAP)アセンブリ。 - 前記複数のマイクロウェルは、さまざまな程度の三次元(3D)空間閉じ込めを提供するように使用可能である、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数のマクロウェルのそれぞれは、前記上部プレートの底面から前記上部プレートの上面まで延びる周壁によって取り囲まれたキャビティを含み、
前記複数のマクロウェルのうちの隣接する2つのマクロウェルは、前記周壁の一部を共有する、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。 - 前記複数のマイクロウェルの少なくとも一部は、非対称な閉じ込めを提供するために、1つもしくは複数の三角形のマイクロウェル、底面を有する四角錐、または底部共通点を有する角錐を含み、
前記複数のマイクロウェルのそれぞれは、下部周囲の第2の長さ以上である第1の長さの上部周囲を有するマイクロウェル周囲壁を含む、請求項3に記載のMWAPアセンブリ。 - 前記隔離した状態は、前記複数のマイクロウェルの前記1つのセットが、前記複数のマイクロウェルの前記別のセットから流体的にシールされている状態である、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記上部プレートの前記マクロウェルの複数の下部周縁が前記底部プレートの前記複数のマイクロウェルの複数の上部周縁に当接する場合に、前記ウェルグリッドが形成される、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数の下部周縁のそれぞれは、前記複数のマクロウェルの1つを取り囲む、請求項6に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数の上部周縁のそれぞれは、前記複数のマイクロウェルの異なるセットを取り囲む、請求項6に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記上部プレートと前記底部プレートとが恒久的に接着される、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数のマイクロウェルの少なくとも一部は、直線側壁または傾斜した側壁と同じ深さとを含む、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数のマイクロウェルの少なくとも一部は、さまざまな深さの底面を備えた直線側壁を有する、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数のマイクロウェルのそれぞれは、底面を有する基部に対して垂直に延びる直線側壁、または前記底面のない前記基部に対して斜めに延びる傾斜した側壁を含む、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数のマイクロウェルのそれぞれは、底面に対して垂直に延びる複数の側壁によって画定され、
前記複数の側壁は、前記複数のマイクロウェルの異なるものの間でさまざまな深さを有し、それによって、前記複数のマイクロウェルの前記異なるものの間でさまざまな深さを画定する、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。 - 前記MWAPアセンブリは、休眠アッセイとして腫瘍細胞の休眠を空間的に誘導するように使用可能な単細胞MWAPアセンブリである、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記マイクロウェルは、8μmから25μmの範囲の断面寸法を有する、請求項14に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記MWAPアセンブリは、スフェロイドアッセイとして固定サイズのクローン多細胞腫瘍スフェロイド(MCTS)を生成するように使用可能である、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記マイクロウェルは、26μmから300μmの範囲の断面寸法を有する、請求項16に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記MWAPアセンブリは、腫瘍薬剤および放射線療法の効果を定量化して、クローン原性アッセイとして、複数の薬剤のうちの少なくとも1つを用いて単一の腫瘍細胞のクローン細胞のコロニーへの増殖を妨害するように使用可能であり、
前記複数のマクロウェルのそれぞれは、前記複数の薬剤のうちの前記少なくとも1つを含む前記単一の腫瘍細胞を播種するように使用可能であり、
前記複数のマイクロウェルは、96セットのマイクロウェルを含む、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。 - 前記複数のマイクロウェルのそれぞれは、正方形マイクロウェルである、請求項18に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数のマイクロウェルのそれぞれは、50以上のクローン細胞を保持するように構成される、請求項18に記載のMWAPアセンブリ。
- 前記複数のマイクロウェルが2000個から5000個のマイクロウェルを含むため、前記MWAPアセンブリが高スループットを有するように使用可能である、請求項1に記載のMWAPアセンブリ。
- マイクロウェルアレイプレートアセンブリを製造する方法であって、
フレーム内にアレイ状に配置された複数のマクロウェルを有する上部プレートを形成することと、
さまざまな程度の三次元(3D)空間閉じ込めを提供するように使用可能なマイクロウェルの複数のアレイを有する底部プレートを形成することと、
前記底部プレートを前記上部プレートに固定することによりウェルグリッドを形成することであって、前記ウェルグリッドは、前記複数のマクロウェルのそれぞれが前記複数のマイクロウェルの1つのセットを前記複数のマイクロウェルの別のセットから隔離した状態で、前記複数のマクロウェルおよび前記複数のマイクロウェルにより画定される、前記ヴェルグリッドを形成することと、
を含む、方法。 - 前記上部プレートと前記底部プレートを位置合わせすることをさらに含む、請求項22に記載の方法。
- 前記上部プレートが射出成形プロセスによって形成される、請求項22に記載の方法。
- 前記底部プレートは、エンボス加工によって形成される、請求項22に記載の方法。
- 少なくとも前記複数のマイクロウェルの内部の検査を可能にするために、光学的に透明または透明な生体適合性環状オレフィンポリマー(COP)を使用して前記底部プレートが形成される、請求項22に記載の方法。
- 前記上部プレートが、黒色環状オレフィンポリマー(COP)を使用して形成される、請求項22に記載の方法。
- 前記上部プレートおよび前記底部プレートが一緒に固定されて、レーザ溶接プロセスによって前記マイクロウェルプレートを形成する、請求項22に記載の方法。
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