JP2023549946A - 酵母によるネルボン酸および油脂の合成における脂肪酸伸長酵素遺伝子およびエステラーゼ遺伝子の使用 - Google Patents
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Abstract
ネルボン酸および/または油脂を生産するための工学菌であって、当該工学菌のゲノムに3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼ遺伝子によってコードされるタンパク質を発現する発現カセットが組み込まれている工学菌を提供する。
Description
本発明は、生物技術の分野に関し、より具体的に、酵母によるネルボン酸の合成における脂肪酸伸長酵素遺伝子およびエステラーゼ遺伝子の使用に関する。
ネルボン酸(cis-15-テトラコセン酸、cis-15-Tetracosenoic acid、24:1Δ15)は、超長鎖モノ不飽和脂肪酸(very long chain monounsaturated fatty acids、VLCMFAs)であり、主にスフィンゴ糖脂質およびスフィンゴリン脂質の形態で動物の大脳白質および髄鞘の神経線維に存在し、生物膜の重要な構成成分である。ネルボン酸は医学や保健の面において重要な作用があり、大脳発育の促進、記憶の改善、血中脂質の調節、免疫の増強といった効果を有し、多発性硬化症などの神経失調疾患の治療に有用である。また、研究では、ネルボン酸は神経系の発達に対して促進作用を有し、特に嬰幼児の脳神経細胞および視神経細胞の成長と発達の過程において重要な作用がある。
現在、リグノセリン酸(C24:0)、ネルボン酸などの超長鎖脂肪酸の合成は、植物において比較的に明確に認識されている。植物は、オレイン酸を基質とし、超長鎖脂肪酸鎖の伸長サイクルによって炭素鎖の伸長を行い、1サイクルで元の脂肪酸の炭素鎖が2つの炭素原子ずつ伸長する。この伸長過程は4つの酵素(KCS、KCR、HCDおよびECR)からなる酵素複合体の組み合わせによって触媒および調節され、現在、そのうちのKCS(3-ケトアシル-CoAシンターゼ)が植物組織における超長鎖脂肪酸鎖の長さおよび合成速度を決定するキー酵素とされている。
ネルボン酸は用途が幅広く、人体の健康に非常に有益であるが、人体自身で合成することが困難で、外から摂取する必要がある。現在、化学法によってネルボン酸を合成するが、副産物が多く、スキームが長く、収率が低く、価格が1000ドル/キロを超え、市場競争力がない。ネルボン酸の市場は需要が莫大であるが、主に植物由来で、生長が遅く、生長環境の要求が高いといった特徴によってネルボン酸の生産量が制限され、微生物によるネルボン酸の生産に良い将来性がある。しかしながら、既知のネルボン酸生産微生物の多くは病原性があるか、潜在的な生産力が不足しているため、産業化生産に応用することができない。
生物油脂は再生可能エネルギーの原料、機能性食品、健康食品、特殊食事サプリメントなどとして有用で、現在、主に植物から得られ、大量の耕地を占用する必要がある。油生産微生物は再生可能な原料で油脂を合成することができ、油脂の獲得方法の重要な補充になる。また、合成生物学的方法により、微生物油脂の構成を調節することができ、機能性食品、医薬などの分野で優れた将来性を示している。
微生物の選択および原料の転換効率は、油脂の合成コストに大きく影響される。近十数年、藻類などの光合成微生物による油脂の合成は重要視されているが、低コスストの二酸化炭素を炭素源としても、微藻類による油脂生産は低生物量、高水消耗、汚染しやすいといった課題を克服することが困難で、コストが高く、産業化が難しい。微藻類と違い、油脂生産酵母は従属栄養微生物で、糖類を利用して大量の油脂を合成することができ、油脂含有量が細胞の乾燥重量の70%を占め、油脂生産量が90 g/L超である。そして、油脂生産酵母の遺伝的ツールは比較的に豊富で、改変が容易で、特殊な機能性脂肪酸を開発する優れたシャーシ細胞である。酵母によって合成されるネルボン酸は、細胞内における主な存在形態がトリグリセリドである。ネルボン酸合成の前駆体が主にオレイン酸で、オレイン酸がトリグリセリドの形態にエステル化されると、さらに伸長してネルボン酸になることがなく、ネルボン酸の生産量が影響される。そのため、超長鎖脂肪酸エステラーゼのスクリーニングは、迅速なネルボン酸のトリグリセリドへの転換に有利で、上流の前駆体の転換を促進し、さらにネルボン酸の生産量を向上させる。
そのため、本分野では、ネルボン酸および油脂の生産量が向上するように、特定の基質嗜好性を有する脂肪酸伸長酵素およびエステラーゼの開発が切望されている。
本発明の目的は、高生産量でネルボン酸および油脂を生産する、新たな方法を提供することにある。
本発明の第一の側面では、ネルボン酸および/または油脂を生産するための工学菌であって、前記工学菌のゲノムに遺伝子発現カセットが組み込まれており、前記の遺伝子発現カセットは3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼ遺伝子によってコードされるタンパク質を発現する工学菌を提供する。
もう一つの好適な例において、前記工学菌は酵母菌を含む。
もう一つの好適な例において、前記工学菌は、ヤロウイア・リポリティカ、出芽酵母、メタノール酵母、ピキア・パストリス、ハンセヌラ酵母、クルイウェロマイセス酵母、カンジダ酵母、クリプトコッカス酵母、イサチェンキア・オリエンタリス、ロドトルラ酵母、またはこれらの組み合わせからなる群から選ばれる。
もう一つの好適な例において、前記工学菌は、ヤロウイア・リポリティカ、出芽酵母、メタノール酵母、ピキア・パストリス、ハンセヌラ酵母、クルイウェロマイセス酵母、カンジダ酵母、クリプトコッカス酵母、イサチェンキア・オリエンタリス、ロドトルラ酵母、またはこれらの組み合わせからなる群から選ばれる。
もう一つの好適な例において、前記3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子は、マラニア・オレイフェラ(Malania oleifera)、カルダミネ・グラエカ(Cardamine graeca)、マンシュウイタヤ(Acer truncatum)、ゴウダソウ(Lunaria annua)、シメニア・カフラ(Ximenia caffra)、トロパエオラム・スペシオサム(Tropaeolum speciosum)、ブンカンカ(Xanthoceras sorbifolia)、油菜(Brassica)、ナズナ(Capsella)由来のものである。
もう一つの好適な例において、前記工学菌はヤロウイア・リポリティカ(Yarrowia lipolytica)、好ましくはヤロウイア・リポリティカ Po1g-G3-MaoleKCSまたはヤロウイア・リポリティカ YL-88-B1である。
もう一つの好適な例において、前記エステラーゼ遺伝子はマラニア・オレイフェラ(Malania oleifera)、カルダミネ・グラエカ(Cardamine graeca)、マンシュウイタヤ(Acer truncatum)、ゴウダソウ(Lunaria annua)、シメニア・カフラ(Ximenia caffra)、トロパエオラム・スペシオサム(Tropaeolum speciosum)、ブンカンカ(Xanthoceras sorbifolia)、油菜(Brassica)、ナズナ(Capsella)由来のものである。
もう一つの好適な例において、前記エステラーゼ遺伝子は、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)遺伝子、またはこれらの組み合わせからなる群から選ばれる。
もう一つの好適な例において、前記のゲノムに、1-20個(好ましくは1-10個、より好ましくは1-5個)の前記の遺伝子発現カセットが組み込まれている。
もう一つの好適な例において、前記遺伝子発現カセットは、TEF、TEFintro、EXP、GPD、 GPAT、YAT、hp4d、hp8d、XPRからなる群から選ばれる一つまたは複数のプロモーターに組み込まれている。
もう一つの好適な例において、前記遺伝子発現カセットは、TEF、TEFintro、EXP、GPD、 GPAT、YAT、hp4d、hp8d、XPRからなる群から選ばれる一つまたは複数のプロモーターに組み込まれている。
もう一つの好適な例において、前記3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子はコドンが最適化された3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子である。
もう一つの好適な例において、前記エステラーゼ遺伝子はコドンが最適化されたエステラーゼ遺伝子である。
もう一つの好適な例において、前記エステラーゼ遺伝子はコドンが最適化されたエステラーゼ遺伝子である。
もう一つの好適な例において、前記3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子の配列は配列番号1-11のいずれかで示される。
もう一つの好適な例において、前記エステラーゼ遺伝子の配列は配列番号48、49、50、51、52のいずれかで示される。
もう一つの好適な例において、前記エステラーゼ遺伝子の配列は配列番号48、49、50、51、52のいずれかで示される。
もう一つの好適な例において、前記3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子またはエステラーゼ遺伝子は、構成型または誘導型プロモーターであるTEF、TEFintro、EXP、GPD、 GPAT、YAT、hp4d、hp8d、XPRによって駆動される。
もう一つの好適な例において、前記のプロモーターは、TEF、TEFintro、EXP、GPD、 GPAT、YAT、hp4d、hp8d、XPR、またはこれらの組み合わせからなる群から選ばれる。
もう一つの好適な例において、前記の工学菌のネルボン酸の生産量が≧20 g/L、好ましくは20-30 g/Lである。
もう一つの好適な例において、前記の工学菌のネルボン酸の生産量が≧20 g/L、好ましくは20-30 g/Lである。
もう一つの好適な例において、前記工学菌のネルボン酸の生産量が≧25%、好ましくは26-30%向上した。
もう一つの好適な例において、前記工学菌の振とう発酵の油脂生産量が≧16 g/L、好ましくは16-18 g/Lである。
もう一つの好適な例において、前記工学菌の振とう発酵の油脂生産量が≧16 g/L、好ましくは16-18 g/Lである。
もう一つの好適な例において、前記の工学菌のネルボン酸/全油脂の比率(質量百分率)が≧18%、好ましくは18-20%である。
もう一つの好適な例において、前記油脂の脂肪酸の構成が主にC16:1、C18:1、C24:1を含み、単一の成分の質量百分率が15-40%、好ましくは18-40%である。
もう一つの好適な例において、前記油脂の脂肪酸の構成が主にC16:1、C18:1、C24:1を含み、単一の成分の質量百分率が15-40%、好ましくは18-40%である。
もう一つの好適な例において、前記の工学菌の発酵生物量(細胞乾燥重量)が≧120 g/L、好ましくは130-200 g/Lである。
もう一つの好適な例において、前記の工学菌のネルボン酸/全脂肪酸の比率が≧20%、好ましくは20-65%、より好ましくは25-65%である。
もう一つの好適な例において、前記の工学菌のネルボン酸/全脂肪酸の比率が≧20%、好ましくは20-65%、より好ましくは25-65%である。
本発明の第二の側面では、ネルボン酸および/または油脂を生産する方法であって、以下の工程を含む方法を提供する:
(i)本発明の第一の側面に記載の工学菌を培養することにより、ネルボン酸および/または油脂を含む発酵産物を得る;ならびに
(ii)前記発酵産物からネルボン酸および/または油脂を分離する。
(i)本発明の第一の側面に記載の工学菌を培養することにより、ネルボン酸および/または油脂を含む発酵産物を得る;ならびに
(ii)前記発酵産物からネルボン酸および/または油脂を分離する。
本発明の第三の側面では、本発明の第一の側面に記載の工学菌を構築する方法であって、以下の工程を含む方法を提供する:
(a)スクリーニングマーカー遺伝子、耐性遺伝子エレメント、rDNA相同組換え遺伝子断片、および3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼ遺伝子である、標的遺伝子というエレメントを有する、遺伝子発現カセットを含有するベクターを構築する;ならびに
(b)工程(a)で得られた前記遺伝子発現カセットを含有するベクターをレセプター菌株に導入し、レセプターのゲノムに前記遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を得る。
(a)スクリーニングマーカー遺伝子、耐性遺伝子エレメント、rDNA相同組換え遺伝子断片、および3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼ遺伝子である、標的遺伝子というエレメントを有する、遺伝子発現カセットを含有するベクターを構築する;ならびに
(b)工程(a)で得られた前記遺伝子発現カセットを含有するベクターをレセプター菌株に導入し、レセプターのゲノムに前記遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を得る。
もう一つの好適な例において、さらに、以下の工程を含む:工程(c):PCRおよびDNAシークエンシングによって工程(b)で得られた遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株の遺伝子型を検証する;ならびに/あるいは
工程(d):遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を発酵させて得られたネルボン酸および/または油脂の生産量を検出する。
工程(d):遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を発酵させて得られたネルボン酸および/または油脂の生産量を検出する。
もう一つの好適な例において、工程(a)の前記のベクターはプラスミド、コスミドまたは核酸断片である。
もう一つの好適な例において、工程(a)の前記の発現カセットは、さらに、強プロモーターエレメントを含む。
もう一つの好適な例において、工程(a)の前記の発現カセットは、さらに、強プロモーターエレメントを含む。
もう一つの好適な例において、前記の強プロモーターエレメントは、TEFintro、GPAT、EXP、GPD、GPAT、YAT、hp4d、hp8d、XPRを含む。
もう一つの好適な例において、前記の強プロモーターエレメントはTEFintroである。
もう一つの好適な例において、前記の強プロモーターエレメントはTEFintroである。
もう一つの好適な例において、前記強プロモーターエレメントは1-3個、好ましくは1-2個、より好ましくは2個である。
もう一つの好適な例において、前記スクリーニングマーカー遺伝子は、URA、leu、HGR、またはこれらの組み合わせからなる群から選ばれる。
もう一つの好適な例において、前記耐性遺伝子エレメントはアンピシリン耐性遺伝子を含む。
もう一つの好適な例において、前記スクリーニングマーカー遺伝子は、URA、leu、HGR、またはこれらの組み合わせからなる群から選ばれる。
もう一つの好適な例において、前記耐性遺伝子エレメントはアンピシリン耐性遺伝子を含む。
もう一つの好適な例において、工程(a)の前記の発現カセットは、強プロモーターエレメントとしてTEFintro、標的遺伝子として3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼ遺伝子、URA、leuまたはHGRのうちの一つまたは複数を含む酵母スクリーニングマーカー遺伝子、ならびにアンピシリン耐性遺伝子AMPというエレメントを含む。
もう一つの好適な例において、工程(b)の前記のレセプターのゲノムに組み込まれた遺伝子発現カセットの数が1-5個、好ましくは1-3個である。
もう一つの好適な例において、工程(b)の前記のレセプターのゲノムに組み込まれた遺伝子発現カセットの数が1-5個、好ましくは1-3個である。
本発明の第四の側面では、本発明の第一の側面に記載の工学菌株の使用であって、発酵によってネルボン酸および/または油脂を生産する菌株として用いられる使用を提供する。
もちろん、本発明の範囲内において、本発明の上記の各技術特徴および下記(たとえば実施例)の具体的に記述された各技術特徴は互いに組合せ、新しい、または好適な技術方案を構成できることが理解される。紙数に限りがあるため、ここで逐一説明しない。
ここで、図10-12において、CKはPo1g-G3-CgKCSである。
本発明者は、幅広く深く研究したところ、初めて、意外に、1種類の酵母工学菌を構築したが、前記工学菌のゲノムに遺伝子発現カセットが組み込まれており、前記の遺伝子発現カセットは3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼ遺伝子によってコードされるタンパク質を発現し、本発明の工学菌は顕著にネルボン酸および/または油脂の生産量を向上させることができ、そして油脂の脂肪酸の構成を変えることもできる。これに基づき、本発明を完成させた。
用語
別途に定義しない限り、本明細書で用いられるすべての技術と科学の用語はいずれも本発明が属する分野の当業者が通常理解する意味と同様である。
別途に定義しない限り、本明細書で用いられるすべての技術と科学の用語はいずれも本発明が属する分野の当業者が通常理解する意味と同様である。
本明細書で用いられるように、具体的に例示される数値で使用される場合、用語「約」とは当該値が例示される数値から1%以内で変わってもよい。たとえば、本明細書で用いられるように、「約100」という表示は99と101およびその間の全部の値(たとえば、99.1、99.2、99.3、99.4など)を含む。
本明細書で用いられるように、用語「含有」または「含む」は開放式、半閉鎖式および閉鎖式のものでもよい。言い換えれば、前記用語は「基本的に・・・で構成される」、または「・・・で構成される」も含む。
本明細書で用いられるように、用語「以上」および「以下」はその数字を含み、例えば、「20%以上」とは≧20%で、「8:1以上」とは≧8:1である。
本明細書で用いられるように、用語「以上」および「以下」はその数字を含み、例えば、「20%以上」とは≧20%で、「8:1以上」とは≧8:1である。
開始菌株
本明細書で用いられるように、用語「本発明の開始菌株」または「本発明の開始微生物」は、入れ替えて使用することができるが、いずれもヤロウイア・リポリティカであるY. lipolytica Po1g(MATa, leu2-270, ura3-302::URA3, xpr2-3)およびY. lipolytica Po1g-KCS(MATa, leu2-270, ura3-302::URA3, xpr2-3,KCS)のことで、ここで、Y. lipolytica Po1gはYeastern Biotech Co., Ltdから購入されたもので、Y. lipolytica Po1g-KCSは中科院青島生物エネルギーと過程研究所から得られたものである。
もちろん、開始菌株は、本発明のヤロウイア・リポリティカY. lipolytica Po1gのみならず、その誘導菌株も含む。
本明細書で用いられるように、用語「本発明の開始菌株」または「本発明の開始微生物」は、入れ替えて使用することができるが、いずれもヤロウイア・リポリティカであるY. lipolytica Po1g(MATa, leu2-270, ura3-302::URA3, xpr2-3)およびY. lipolytica Po1g-KCS(MATa, leu2-270, ura3-302::URA3, xpr2-3,KCS)のことで、ここで、Y. lipolytica Po1gはYeastern Biotech Co., Ltdから購入されたもので、Y. lipolytica Po1g-KCSは中科院青島生物エネルギーと過程研究所から得られたものである。
もちろん、開始菌株は、本発明のヤロウイア・リポリティカY. lipolytica Po1gのみならず、その誘導菌株も含む。
ネルボン酸
ネルボン酸(cis-15-テトラコセン酸、cis-15-Tetracosenoic acid、24:1Δ15)は、超長鎖モノ不飽和脂肪酸(very long chain monounsaturated fatty acids、VLCMFAs)であり、主にスフィンゴ糖脂質およびスフィンゴリン脂質の形態で動物の大脳白質および髄鞘の神経線維に存在し、生物膜の重要な構成成分である。ネルボン酸は医学や保健の面において重要な作用があり、大脳発育の促進、記憶の改善、血中脂質の調節、免疫の増強といった効果を有し、多発性硬化症などの神経失調疾患の治療に有用である。また、研究では、ネルボン酸は神経系の発達に対して促進作用を有し、特に嬰幼児の脳神経細胞および視神経細胞の成長と発達の過程において重要な作用がある。
ネルボン酸(cis-15-テトラコセン酸、cis-15-Tetracosenoic acid、24:1Δ15)は、超長鎖モノ不飽和脂肪酸(very long chain monounsaturated fatty acids、VLCMFAs)であり、主にスフィンゴ糖脂質およびスフィンゴリン脂質の形態で動物の大脳白質および髄鞘の神経線維に存在し、生物膜の重要な構成成分である。ネルボン酸は医学や保健の面において重要な作用があり、大脳発育の促進、記憶の改善、血中脂質の調節、免疫の増強といった効果を有し、多発性硬化症などの神経失調疾患の治療に有用である。また、研究では、ネルボン酸は神経系の発達に対して促進作用を有し、特に嬰幼児の脳神経細胞および視神経細胞の成長と発達の過程において重要な作用がある。
油脂
微生物油脂は、生物エネルギー、食品、医薬などの分野で重要な応用価値がある。ヤロウイア・リポリティカ(Yarrowia lipolytica )は偏性好気性の油脂生産酵母で、大量の中性脂質を蓄積することができ、そのうち、最も重要な成分はパルミトレイン酸およびオレイン酸を含み、強化油脂生産経路によって両者の含有量の合計が全脂肪酸における比率が70%以上になる。パルミトレイン酸(palmitoleic acid)は一部の慢性疾患、たとえば、代謝症候群、糖尿病および炎症において治療作用があり、ヒト細胞におけるメラニン因子を抑制し、皮膚の色素沈着を改善することができる。オレイン酸はシス構造で、血管軟化にある程度の作用があり、ヒトおよび動物の新陳代謝の過程においても重要な役割を担い、オレイン酸含有量の高い食用油の摂取が健康に有益である。また、オレイン酸はペイントのドライヤー、潤滑油の増稠剤、毛糸紡績工業、印刷染色業界の重要な原料でもある。油脂生産酵母によって合成される混合油脂はバイオリディーゼルファイナリーの原料として有用である。
微生物油脂は、生物エネルギー、食品、医薬などの分野で重要な応用価値がある。ヤロウイア・リポリティカ(Yarrowia lipolytica )は偏性好気性の油脂生産酵母で、大量の中性脂質を蓄積することができ、そのうち、最も重要な成分はパルミトレイン酸およびオレイン酸を含み、強化油脂生産経路によって両者の含有量の合計が全脂肪酸における比率が70%以上になる。パルミトレイン酸(palmitoleic acid)は一部の慢性疾患、たとえば、代謝症候群、糖尿病および炎症において治療作用があり、ヒト細胞におけるメラニン因子を抑制し、皮膚の色素沈着を改善することができる。オレイン酸はシス構造で、血管軟化にある程度の作用があり、ヒトおよび動物の新陳代謝の過程においても重要な役割を担い、オレイン酸含有量の高い食用油の摂取が健康に有益である。また、オレイン酸はペイントのドライヤー、潤滑油の増稠剤、毛糸紡績工業、印刷染色業界の重要な原料でもある。油脂生産酵母によって合成される混合油脂はバイオリディーゼルファイナリーの原料として有用である。
3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子
本発明において、本明細書に記載の「3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子」によってコードされるタンパク質産物は3-ケトアシル-CoAシンターゼで、ネルボン酸の合成の触媒に関与する。
本発明において、本明細書に記載の「3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子」によってコードされるタンパク質産物は3-ケトアシル-CoAシンターゼで、ネルボン酸の合成の触媒に関与する。
3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子によってコードされるタンパク質産物は3-ケトアシル-CoAシンターゼで、触媒して最終的にネルボン酸を合成する。3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)は単一の読み枠を含み、512-653アミノ酸のタンパク質をコードする。
本発明において、大量の創造的実験を経て工学菌へ3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子を発現する発現カセットを組み込むことでネルボン酸の生産量を向上させ、不飽和脂肪酸の含有量を低下させることができることが見出された。そのため、本方案によって提供される改変後の工学菌は幅広い実用の価値および将来性がある。
当業者は汎用の方法によって3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子の配列を得ることができるが、たとえば、NCBIから得られる。
本発明の3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子は、さらに、異なる由来の3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子、同一の由来の異なる相同配列、およびコドンが最適化された3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子を含む。
エステラーゼ
本発明において、本明細書に記載の「エステラーゼ遺伝子」は、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)およびグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)遺伝子で、コードされるタンパク質産物は、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)およびグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)で、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼはトリアシルグリセロールの触媒に、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼはリゾホスファチジン酸の合成の触媒に関与する。
本発明において、本明細書に記載の「エステラーゼ遺伝子」は、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)およびグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)遺伝子で、コードされるタンパク質産物は、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)およびグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)で、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼはトリアシルグリセロールの触媒に、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼはリゾホスファチジン酸の合成の触媒に関与する。
ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)はMoDGAT2(Maole_015949)、MoDGAT2(Maole_010035)を含み、403-522アミノ酸のタンパク質をコードする。
グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)遺伝子はMoGPAT(Maole_006088)、MoGPAT(Maole_006089)、MoGPAT(Maole_006090)を含み、231-370アミノ酸のタンパク質をコードする。
本発明において、大量の創造的実験を経て工学菌へ3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼを発現する発現カセットを組み込むことでネルボン酸または油脂の生産量を向上させ、不飽和脂肪酸の含有量を低下させ、油脂の脂肪酸の構成を変え、オレイン酸の全油脂における比率を向上させ、ネルボン酸の全油脂における比率を向上させ、ネルボン酸の発酵濃度を向上させることができることが見出された。そのため、本方案によって提供される改変後の工学菌は幅広い実用の価値および将来性がある。
当業者は汎用の方法によってエステラーゼ遺伝子の配列を得ることができるが、たとえば、NCBIから得られる。
本発明のエステラーゼ遺伝子は、さらに、異なる由来のエステラーゼ遺伝子、同一の由来の異なる相同配列を含む。
本発明のエステラーゼ遺伝子は、さらに、異なる由来のエステラーゼ遺伝子、同一の由来の異なる相同配列を含む。
プライマー
本明細書で用いられるように、用語「プライマー」とは、鋳型にマッチし、DNAポリメラーゼの作用下でそれを起点として鋳型と相補的なDNA鎖を合成するオリゴヌクレオチドの総称である。プライマーは天然のRNA、DNAでもよく、あらゆる形態の天然ヌクレオチドでもよい。プライマーは非天然のヌクレオチド、たとえば、LNAやZNAなどでもよい。
本明細書で用いられるように、用語「プライマー」とは、鋳型にマッチし、DNAポリメラーゼの作用下でそれを起点として鋳型と相補的なDNA鎖を合成するオリゴヌクレオチドの総称である。プライマーは天然のRNA、DNAでもよく、あらゆる形態の天然ヌクレオチドでもよい。プライマーは非天然のヌクレオチド、たとえば、LNAやZNAなどでもよい。
プライマーは「ほぼ」(または「基本的に」)鋳型の一本の鎖における一つの特殊な配列と相補的である。プライマーは鋳型の一本の鎖と十分に相補的でないと、伸長しないが、プライマーの配列は鋳型の配列と完全に相補的なものではなくてもよい。たとえば、一つの3’末端が鋳型と相補的なプライマーの5’末端に鋳型と相補的でない配列を加えても、このようなプライマーはほぼ鋳型と相補的である。十分に長いプライマーが鋳型と十分に結合する限り、完全に相補的でないプライマーも鋳型とプライマー-鋳型複合体を形成することで、増幅することが可能である。
工学菌の構築
本発明は、遺伝子工学菌のネルボン酸高生産菌株を構築する方法であって、以下の工程を含むが、これらに限定されない方法を提供する。
本発明は、遺伝子工学菌のネルボン酸高生産菌株を構築する方法であって、以下の工程を含むが、これらに限定されない方法を提供する。
1.遺伝子発現カセットを含有するベクターの構築
コドン最適化後、遺伝子を合成し、3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子のPCRプライマーを設計し、クローニングによって標的遺伝子を得、ギブソン・アッセンブリー(Gibson assembly)のシームレスクローニング法によってプラスミドを構築した。2.得られた前記遺伝子発現カセットを含有するベクターをレセプター菌株に導入し、レセプターのゲノムに遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を得る。一つの好適な例において、構築された発現カセットを有するベクターを属間接合伝達によって開始菌株に導入し、所定の耐性スクリーニング条件において陽性接合子を選択する。
コドン最適化後、遺伝子を合成し、3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子のPCRプライマーを設計し、クローニングによって標的遺伝子を得、ギブソン・アッセンブリー(Gibson assembly)のシームレスクローニング法によってプラスミドを構築した。2.得られた前記遺伝子発現カセットを含有するベクターをレセプター菌株に導入し、レセプターのゲノムに遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を得る。一つの好適な例において、構築された発現カセットを有するベクターを属間接合伝達によって開始菌株に導入し、所定の耐性スクリーニング条件において陽性接合子を選択する。
一つの好適な例において、さらに、工程3:PCRによって工程2で得られた遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株の遺伝子型を検証する;ならびに/あるいは工程4:遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を発酵させて得られたネルボン酸の生産量を検出する。一つの好適な例において、所定の耐性を有する陽性接合子を液体培地において培養し、菌体の全DNAを抽出し、遺伝子型のPCRによる検証を行う。標的遺伝子に対して複数対のプライマーを設計することにより、標的ゲノムに相応する遺伝子が組み込まれたことを検証してもよい。PCRによって増幅された正確な大きさの塩基断片を回収し、DNAシークエンシングの方法によって最終的に遺伝子工学菌株の正確さを確認する。
本発明で得られた菌株であるヤロウイア・リポリティカ菌株Po1g-G3--MaoleKCSは、発酵によるネルボン酸の生産能力が顕著に向上した。
一つの好適な実施様態において、本発明に使用される技術方案は、以下の通りである。
(1)バイオインフォマティクス分析により、マラニア・オレイフェラの3-ケトアシル-CoAシンターゼに対してスクリーニングおよび分析を行う。
(2)ヤロウイア・リポリティカを開始菌株とし、マラニア・オレイフェラの3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子(配列番号1-11を参照する)を導入し、ヤロウイア・リポリティカにネルボン酸の合成能力を持たせるか、増強させる。
(1)バイオインフォマティクス分析により、マラニア・オレイフェラの3-ケトアシル-CoAシンターゼに対してスクリーニングおよび分析を行う。
(2)ヤロウイア・リポリティカを開始菌株とし、マラニア・オレイフェラの3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子(配列番号1-11を参照する)を導入し、ヤロウイア・リポリティカにネルボン酸の合成能力を持たせるか、増強させる。
さらに、ヤロウイア・リポリティカPo1g-G3を開始菌株とし、相同組換えの手段によってMaoleKCS遺伝子を導入し、菌株Po1g-G3-MaoleKCSを得る。
またさらに、まず相同組換えプラスミドpYLEX-rDNA-MaoleKCS-URAを構築し、さらに得られたプラスミドを酵素切断してヤロウイア・リポリティカ菌株Po1g-G3-ΔURAを形質転換し、ウラシル栄養要求性プレートで形質転換体をスクリーニングし、MaoleKCS遺伝子が導入された組換え菌株Po1g-G3-MaoleKCSを得る。
またさらに、前記相同組換えプラスミドpYLEX-rDNA-MaoleKCS-URAはプラスミドpYLEX-URAを骨格鋳型とし、MaoleKCS発現カセットの上流と下流がそれぞれヤロウイア・リポリティカ26S rDNAの2つの断片である(配列番号12と配列番号13を参照する)。
(3)ヤロウイア・リポリティカを開始菌株とし、マラニア・オレイフェラの3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子(配列番号1-11を参照する)を過剰発現させ、ヤロウイア・リポリティカにネルボン酸の合成能力を持たせるか、増強させる。
さらに、ヤロウイア・リポリティカPo1g-G3-MaoleKCSを開始菌株とし、相同組換えの手段によってMaoleKCS遺伝子を導入し、菌株Po1g-G3-3MaoleKCSを得る。
またさらに、まず相同組換えプラスミドpYLEX-FAD2-MaoleKCS-URAを構築し、さらに得られたプラスミドを酵素切断してヤロウイア・リポリティカ菌株Po1g-G3-MaoleKCS-ΔURAを形質転換し、ウラシル栄養要求性プレートで形質転換体をスクリーニングし、MaoleKCS遺伝子が導入された組換え菌株Po1g-G3-3MaoleKCSを得る。
またさらに、前記相同組換えプラスミドpYLEX-FAD2-MaoleKCS-URAはプラスミドpYLEX-URAを骨格鋳型とし、MaoleKCS発現カセットの上流と下流がそれぞれヤロウイア・リポリティカFAD2遺伝子の2つの断片である(配列番号14と配列番号15を参照する)。
(4)上記組換え菌株に対して発酵タンク培養を行い、ネルボン酸の全脂肪酸における比率が36.9%に、ネルボン酸生産量が25.7 g/Lに達する。
本発明は、ネルボン酸遺伝子工学菌株を構築する方法を提供するとともに、油脂高生産菌株を構築する方法であって、以下の工程を含む、これらに限定されない方法を提供する。
1.遺伝子発現カセットを含有するベクターの構築
コドン最適化後、遺伝子を合成し、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)酵素遺伝子のPCRプライマーを設計し、クローニングによって標的遺伝子を得、ギブソン・アッセンブリー(Gibson assembly)のシームレスクローニング法によってプラスミドを構築する。
2.得られた前記遺伝子発現カセットを含有するベクターをレセプター菌株に導入し、レセプターのゲノムに遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を得る。一つの好適な例において、構築された発現カセットを有するベクターを属間接合伝達によって開始菌株に導入し、所定の耐性スクリーニング条件において陽性接合子を選択する。
コドン最適化後、遺伝子を合成し、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)酵素遺伝子のPCRプライマーを設計し、クローニングによって標的遺伝子を得、ギブソン・アッセンブリー(Gibson assembly)のシームレスクローニング法によってプラスミドを構築する。
2.得られた前記遺伝子発現カセットを含有するベクターをレセプター菌株に導入し、レセプターのゲノムに遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を得る。一つの好適な例において、構築された発現カセットを有するベクターを属間接合伝達によって開始菌株に導入し、所定の耐性スクリーニング条件において陽性接合子を選択する。
一つの好適な例において、さらに、工程3:PCRによって工程2で得られた遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株の遺伝子型を検証する;ならびに/あるいは工程4:遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を発酵させて得られたネルボン酸の生産量を検出する。一つの好適な例において、所定の耐性を有する陽性接合子を液体培地において培養し、菌体の全DNAを抽出し、遺伝子型のPCRによる検証を行う。標的遺伝子に対して複数対のプライマーを設計することにより、標的ゲノムに相応する遺伝子が組み込まれたことを検証してもよい。PCRによって増幅された正確な大きさの塩基断片を回収し、DNAシークエンシングの方法によって最終的に遺伝子工学菌株の正確さを確認する。
本発明で得られる菌株であるヤロウイア・リポリティカ菌株YL-88-B1は、発酵による油脂およびネルボン酸の生産能力が顕著に向上した。
本発明で得られる菌株であるヤロウイア・リポリティカ菌株YL-88-B1は、発酵による油脂およびネルボン酸の生産能力が顕著に向上した。
もう一つの好適な実施様態において、本発明に使用される技術方案は、以下の通りである。
(1)バイオインフォマティクス分析により、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)酵素に対してスクリーニングおよび分析を行う。
(2)既に脂肪酸伸長酵素CgKCSを発現するヤロウイア・リポリティカ菌株Po1g-G3-CgKCSを開始菌株とし、マラニア・オレイフェラのジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)酵素(配列番号48、49、50、51、52を参照する)を導入し、ヤロウイア・リポリティカに油脂およびネルボン酸の合成能力を持たせるか、増強させる。
(1)バイオインフォマティクス分析により、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)酵素に対してスクリーニングおよび分析を行う。
(2)既に脂肪酸伸長酵素CgKCSを発現するヤロウイア・リポリティカ菌株Po1g-G3-CgKCSを開始菌株とし、マラニア・オレイフェラのジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)酵素(配列番号48、49、50、51、52を参照する)を導入し、ヤロウイア・リポリティカに油脂およびネルボン酸の合成能力を持たせるか、増強させる。
さらに、ヤロウイア・リポリティカPo1g-G3-CgKCSを開始菌株とし、相同組換えの手段によってジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)酵素遺伝子を導入し、菌株YL-35-F5、YL-49-C6、YL-88-B1、YL-90-B6を得る。そして、本発明の方法によって伸長酵素CgKCSおよびエステラーゼを発現される場合、菌株YL-88-B1の振とう発酵レベルの油脂生産量が22.1%向上し、ネルボン酸の全脂肪酸における比率が18-20%に達する。
発酵によるネルボン酸の生産
本発明の遺伝子改変菌株は、発酵によるネルボン酸の生産に有用で、一つの好適な例において、培地は以下のものを含むが、これらに限定されず、培地の総体積に対して、重量体積比で計算する。
YPD液体培地:ブドウ糖20 g/L、ペプトン20 g/L、酵母抽出物10 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。通常の培養に使用される。
本発明の遺伝子改変菌株は、発酵によるネルボン酸の生産に有用で、一つの好適な例において、培地は以下のものを含むが、これらに限定されず、培地の総体積に対して、重量体積比で計算する。
YPD液体培地:ブドウ糖20 g/L、ペプトン20 g/L、酵母抽出物10 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。通常の培養に使用される。
ウラシル栄養要求性培地(YNB-Δura):YNB (アミノ酸・硫酸アンモニウム不含酵母ニトロゲンベース、Yeast nitrogen base without amino acids and ammonium sulfate) 1.7 g/L、ブドウ糖 20.0 g/L、CSM-Ura (MP Biomedicals) 0.67 g/L、硫酸アンモニウム5 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。組換え菌株のスクリーニングおよび活性化培養に使用される。
振とう発酵培地:ブドウ糖150 g/L、酵母抽出物6 g/L、硫酸アンモニウム12 g/L。
振とう発酵培地:ブドウ糖150 g/L、酵母抽出物6 g/L、硫酸アンモニウム12 g/L。
大腸菌に使用される培養温度が37℃で、液体培養の場合、シェーカーの回転数が200 rpmで、使用される培地は以下の通りである。
LB培地:トリプトン10 g/L、酵母抽出物5 g/L、塩化ナトリウム10 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。通常の培養に使用される。
Amp耐性培地:LB培地に、Ampの最終濃度が100 μg/mlになるように、高濃度Amp溶液が加え、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。組換え細菌菌株のスクリーニングおよび増幅培養に使用される。
本発明の菌株の発酵産物はネルボン酸の製造に使用することができる。
LB培地:トリプトン10 g/L、酵母抽出物5 g/L、塩化ナトリウム10 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。通常の培養に使用される。
Amp耐性培地:LB培地に、Ampの最終濃度が100 μg/mlになるように、高濃度Amp溶液が加え、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。組換え細菌菌株のスクリーニングおよび増幅培養に使用される。
本発明の菌株の発酵産物はネルボン酸の製造に使用することができる。
薬物組成物および施用方法
本発明の菌株の発酵産物におけるネルボン酸は薬物の製造に有用である。本発明のネルボン酸および油脂は、哺乳動物(たとえば、ヒト)に施用することができ、経口、直腸、胃腸外(静脈内、筋肉内または皮下)、局部などの手段で投与することができる。前記ネルボン酸および油脂は、単独で投与してもよいし、あるいは他の薬学的に許容される化合物と併用して投与してもよい。なお、本発明のネルボン酸および油脂は混合して投与することができる。
本発明の菌株の発酵産物におけるネルボン酸は薬物の製造に有用である。本発明のネルボン酸および油脂は、哺乳動物(たとえば、ヒト)に施用することができ、経口、直腸、胃腸外(静脈内、筋肉内または皮下)、局部などの手段で投与することができる。前記ネルボン酸および油脂は、単独で投与してもよいし、あるいは他の薬学的に許容される化合物と併用して投与してもよい。なお、本発明のネルボン酸および油脂は混合して投与することができる。
経口投与に用いられる固体剤形は、カプセル剤、錠剤、丸剤、散剤および顆粒剤を含む。これらの固体剤形において、活性化合物は通常、少なくとも一種の不活性賦形剤(または担体)、たとえばクエン酸ナトリウムまたはリン酸二カルシウムと混合されるが、あるいは、(a)フィラーまたは相溶剤、たとえば、でん粉、乳糖、ショ糖、グルコース、マンニトールやケイ酸、(b)バインダー、たとえば、ヒドロメチルセルロース、アルギン酸塩、ゼラチン、ポリビニルピロリドン、ショ糖やアラビアゴム、(c)保湿剤、たとえば、グリセリン、(d)崩壊剤、たとえば、寒天、炭酸カルシウム、馬鈴薯澱粉やタピオカ澱粉、アルギン酸、ある複合ケイ酸塩や炭酸ナトリウム、(e)溶液遅延剤、たとえばパラフィン、(f)吸収促進剤、たとえば、アンモニウム化合物、(g)湿潤剤、たとえばセタノール、グリセリンモノステアレート、(h)吸着剤、たとえば、カオリン、また(i)潤滑剤、たとえば、タルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固体ポリエチレングリコール、ドデシル硫酸ナトリウム、またはこれらの混合物、のような成分と混合される。カプセル剤、錠剤および丸剤において、剤形に緩衝剤を含んでもよい。
固体剤形、たとえば錠剤、ピル、カプセル剤、丸剤や顆粒剤は、コーディングやシェル剤、たとえば、腸衣および他の本分野で公知の材料で製造することができる。不透明剤を含んでもよく、且つこのような組成物において、活性物または化合物の放出は遅延の様態で消化管のある部分で放出してもよい。使用できる包埋成分の実例として、重合物質やワックス系物質が挙げられる。必要な場合、活性化合部も上記賦形剤のうちの一種または複数種とマイクロカプセルの様態に形成してもよい。
経口投与に用いられる液体剤形は、薬学的に許容される乳液、溶液、懸濁液、シロップまたはチンキ剤を含む。活性化合物のほか、液体剤形は、本分野で通常使用される不活性希釈剤、たとえば、水または他の溶媒、相溶剤および乳化剤、たとえば、エタノール、イソプロパノール、炭酸エチル、酢酸エチル、プロピレングリコール、1,3-ブタンジオール、ジメチルホルムアミドおよび油、特に、綿実油、落花生油、コーン油、オリーブ油、ヒマシ油やゴマ油またはこれらの物質の混合物などを含んでもよい。
これらの不活性希釈剤のほか、組成物は助剤、たとえば、湿潤剤、乳化剤、懸濁剤、甘味料や香料を含んでもよい。
活性化合物のほか、懸濁液は、懸濁剤、たとえば、エトキシ化イソオクタデカノール、ポリオキシエチレンソルビトールやソルビタンエステル、微晶質セルロース、メトキシアルミニウムや寒天またはこれらの物質の混合物などを含んでもよい。
胃腸外注射用組成物は、生理的に許容される無菌の水含有または無水溶液、分散液、懸濁液や乳液、および再溶解して無菌の注射可能な溶液または分散液にするための無菌粉末を含む。適切な水含有または非水性担体、希釈剤、溶媒または賦形剤は、水、エタノール、多価アルコールおよびその適切な混合物を含む。
局所投与のための本発明の化合物の剤形は、軟膏剤、散剤、湿布剤、噴霧剤や吸入剤を含む。活性成分は、無菌条件で生理学的に許容される担体および任意の防腐剤、緩衝剤、または必要よって駆出剤と一緒に混合される。
薬物組成物を使用する場合、安全な有効量の本発明のネルボン酸および油脂を治療の必要のある哺乳動物(たとえばヒト)に使用し、使用の際の用量は薬学上で効果があるとされる投与量で、体重60kgの個体の場合、毎日の投与量は、通常1~1000 mg、好ましくは20~500 mgである。勿論、具体的な投与量は、さらに投与の様態、個体の健康状況などの要素を考えるべきで、すべて熟練の医者の技能範囲以内である。
本発明の主な利点は以下の通りである。
(1) 本発明において、3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子を発現させることで、顕著にネルボン酸の生産量を向上させる。
(2) 本発明において、単一の酵素の有効な発現だけで酵母工学菌、たとえば、ヤロウイア・リポリティカにネルボン酸の合成能力を持たせるか、増強させる。
(1) 本発明において、3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子を発現させることで、顕著にネルボン酸の生産量を向上させる。
(2) 本発明において、単一の酵素の有効な発現だけで酵母工学菌、たとえば、ヤロウイア・リポリティカにネルボン酸の合成能力を持たせるか、増強させる。
(3) 本発明の組換え菌株において、ネルボン酸の全脂肪酸における比率が36.9%に、ネルボン酸生産量が25.7 g/Lに達する。本発明によって提供されるマラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼはネルボン酸高生産酵母工学菌の構築に有用で、化学工業、医薬や保健などの分野において幅広い応用の将来性がある。
(4) 本発明において、エステラーゼの単独発現またはエステラーゼとケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子の共発現により、顕著にネルボン酸および油脂の生産量を向上させ、油脂の脂肪酸の構成を変え、オレイン酸の全油脂における比率を向上させ、ネルボン酸の全油脂における比率を向上させ、ネルボン酸の発酵濃度を向上させる。
以下、具体的な実施例によって、さらに本発明を説明する。これらの実施例は本発明を説明するために用いられるものだけで、本発明の範囲の制限にはならないと理解されるものである。下記実施例で具体的な条件が示されていない実験方法は、通常、たとえばSambrookら、「モレキュラー・クローニング:研究室マニュアル」(ニューヨーク、コールド・スプリング・ハーバー研究所出版社、1989) に記載の条件などの通常の条件に、あるいは、メーカーのお薦めの条件に従う。特に説明しない限り、百分率および部は重量百分率および重量部である。
特に説明しない限り、本発明の実施例における材料および試薬はいずれも市販品である。
特に説明しない限り、本発明の実施例における材料および試薬はいずれも市販品である。
実施例1:酵母におけるMaoleKCSの発現によるネルボン酸の合成
1.材料と方法
1.1 菌株および培養条件
実施例で使用されたヤロウイア・リポリティカ開始菌株はY. lipolytica Po1g (MATa、leu2-270、ura3-302::URA3、xpr2-3)で、Yeastern Biotech Co., Ltdから購入されたものである。下記方法によって菌株Po1g-G3-ΔURAを得たが、具体的に、菌株Po1g-G3はヤロウイア・リポリティカの内因性遺伝子DGAT1、ACC1およびSCD遺伝子を過剰発現させて得たもので(QiaoおよびStephanopoulos.、Metabolic Engineering、2015、29:56-65)、さらに5-FOA法によって逆スクリーニングしてウラシル栄養要求性菌株Po1g-G3-ΔURAを得た。
1.材料と方法
1.1 菌株および培養条件
実施例で使用されたヤロウイア・リポリティカ開始菌株はY. lipolytica Po1g (MATa、leu2-270、ura3-302::URA3、xpr2-3)で、Yeastern Biotech Co., Ltdから購入されたものである。下記方法によって菌株Po1g-G3-ΔURAを得たが、具体的に、菌株Po1g-G3はヤロウイア・リポリティカの内因性遺伝子DGAT1、ACC1およびSCD遺伝子を過剰発現させて得たもので(QiaoおよびStephanopoulos.、Metabolic Engineering、2015、29:56-65)、さらに5-FOA法によって逆スクリーニングしてウラシル栄養要求性菌株Po1g-G3-ΔURAを得た。
ヤロウイア・リポリティカに使用された培養温度が28℃で、液体培養の場合、シェーカーの回転数が220 rpmで、使用された培地は以下の通りである。
YPD液体培地:ブドウ糖20 g/L、ペプトン20 g/L、酵母抽出物10 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。通常の培養に使用される。
YPD液体培地:ブドウ糖20 g/L、ペプトン20 g/L、酵母抽出物10 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。通常の培養に使用される。
ウラシル栄養要求性培地(YNB-Δura):YNB (アミノ酸・硫酸アンモニウム不含酵母ニトロゲンベース、Yeast nitrogen base without amino acids and ammonium sulfate) 1.7 g/L、ブドウ糖 20.0 g/L、CSM-Ura (MP Biomedicals) 0.67 g/L、硫酸アンモニウム5 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。組換え菌株のスクリーニングおよび活性化培養に使用される。
振とう発酵培地:ブドウ糖150 g/L、酵母抽出物6 g/L、硫酸アンモニウム12 g/L。
振とう発酵培地:ブドウ糖150 g/L、酵母抽出物6 g/L、硫酸アンモニウム12 g/L。
大腸菌に使用される培養温度が37℃で、液体培養の場合、シェーカーの回転数が200 rpmで、使用される培地は以下の通りである。
LB培地:トリプトン10 g/L、酵母抽出物5 g/L、塩化ナトリウム10 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。通常の培養に使用される。
Amp耐性培地:LB培地に、Ampの最終濃度が100 μg/mlになるように、高濃度Amp溶液が加え、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。組換え細菌菌株のスクリーニングおよび増幅培養に使用される。
LB培地:トリプトン10 g/L、酵母抽出物5 g/L、塩化ナトリウム10 g/Lで、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。通常の培養に使用される。
Amp耐性培地:LB培地に、Ampの最終濃度が100 μg/mlになるように、高濃度Amp溶液が加え、固体培地が必要な場合、1.5%の寒天を添加する。組換え細菌菌株のスクリーニングおよび増幅培養に使用される。
1.2 マラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子のスクリーニングと発現
1.2.1 マラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子のバイオインフォマティクス分析
文献(Xuら、GigaScience、2019、8:1-14)のゲノムデータから12の潜在的なマラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子を得たが、それぞれMaole_002411、Maole_003085、Maole_004215、Maole_005654、Maole_008020、Maole_009817、Maole_016461、Maole_016463、Maole_016466、Maole_016467、Maole_017397およびMaole_017398である。さらに、そのうちの6つの遺伝子を選び、それぞれKCS397 (Maole_017397)、KCS398 (Maole_017398)、KCS461 (Maole_016461)、KCS463 (Maole_016463)、KCS467 (Maole_016467)およびKCS817 (Maole_009817)と名付け、そして相応するアミノ酸配列を得たが、順にMaole_017397.T1、Maole_017398.T1、Maole_016461.T1、Maole_016463.T1、Maole_016467.T1およびMaole_009817.T1で、詳細は表1を参照する。NCBIデータベースから3-ケトアシル-CoAシンターゼと確認されたMoKCS(GenBank: QDA34238.1、M. oleifera由来)、CgKCS(GenBank: ACJ61778.1、C. graeca由来)、LaKCS (GenBank:EU871787.1、Lunaria annua由来)、BrKCS (GenBank:GU325723、Brassica rapa由来)、BtKCS (GenBank:KF664165、Brassica tournefortii由来)、BeKCS (GenBank:KF664168、Brassica elongata由来)、およびその遺伝子とアミノ酸配列を見つけた。MEGA5.1に付属したClusterWによってKCS397、KCS398、KCS461、KCS463、KCS467、KCS817、MoKCS、CgKCS、LaKCS、BrKCS、BtKCSおよびBeKCSのアミノ酸配列に対してタンパク質配列の多重アラインメントを行った後、近隣結合法(Neighbor-joining)のアルゴリズム(ブートストラップ1000回)を利用し、系統樹を作成し、図1に示す。4つのKCS(KCS398、KCS461、KCS467およびKCS817)遺伝子を選び、NCBIオンラインドメイン分析ソフト (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Structure/cdd/wrpsb.cgi) およびDNAMANソフトによってCgKCS、MoKCSおよび選ばれた4つのKCSのタンパク質配列に対してアラインメントを行い、図2に示す。
1.2.1 マラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子のバイオインフォマティクス分析
文献(Xuら、GigaScience、2019、8:1-14)のゲノムデータから12の潜在的なマラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子を得たが、それぞれMaole_002411、Maole_003085、Maole_004215、Maole_005654、Maole_008020、Maole_009817、Maole_016461、Maole_016463、Maole_016466、Maole_016467、Maole_017397およびMaole_017398である。さらに、そのうちの6つの遺伝子を選び、それぞれKCS397 (Maole_017397)、KCS398 (Maole_017398)、KCS461 (Maole_016461)、KCS463 (Maole_016463)、KCS467 (Maole_016467)およびKCS817 (Maole_009817)と名付け、そして相応するアミノ酸配列を得たが、順にMaole_017397.T1、Maole_017398.T1、Maole_016461.T1、Maole_016463.T1、Maole_016467.T1およびMaole_009817.T1で、詳細は表1を参照する。NCBIデータベースから3-ケトアシル-CoAシンターゼと確認されたMoKCS(GenBank: QDA34238.1、M. oleifera由来)、CgKCS(GenBank: ACJ61778.1、C. graeca由来)、LaKCS (GenBank:EU871787.1、Lunaria annua由来)、BrKCS (GenBank:GU325723、Brassica rapa由来)、BtKCS (GenBank:KF664165、Brassica tournefortii由来)、BeKCS (GenBank:KF664168、Brassica elongata由来)、およびその遺伝子とアミノ酸配列を見つけた。MEGA5.1に付属したClusterWによってKCS397、KCS398、KCS461、KCS463、KCS467、KCS817、MoKCS、CgKCS、LaKCS、BrKCS、BtKCSおよびBeKCSのアミノ酸配列に対してタンパク質配列の多重アラインメントを行った後、近隣結合法(Neighbor-joining)のアルゴリズム(ブートストラップ1000回)を利用し、系統樹を作成し、図1に示す。4つのKCS(KCS398、KCS461、KCS467およびKCS817)遺伝子を選び、NCBIオンラインドメイン分析ソフト (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Structure/cdd/wrpsb.cgi) およびDNAMANソフトによってCgKCS、MoKCSおよび選ばれた4つのKCSのタンパク質配列に対してアラインメントを行い、図2に示す。
1.2.2 ベクターの構築
KCS398、KCS461、KCS467およびKCS817遺伝子は無錫青蘭生物科技有限公司によってコドンを最適化して合成されたもので(最適化された遺伝子配列が順に配列番号2、3、5、6である)、MaoleKCS遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子を持つシャトルプラスミドを得たが、pMv-MaoleKCS#-AMPと名付けた(注:#は異なるMaoleKCS遺伝子の番号、すなわち、398, 461, 467または817を表す。以下同様。)。
KCS398、KCS461、KCS467およびKCS817遺伝子は無錫青蘭生物科技有限公司によってコドンを最適化して合成されたもので(最適化された遺伝子配列が順に配列番号2、3、5、6である)、MaoleKCS遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子を持つシャトルプラスミドを得たが、pMv-MaoleKCS#-AMPと名付けた(注:#は異なるMaoleKCS遺伝子の番号、すなわち、398, 461, 467または817を表す。以下同様。)。
プラスミドベクターの構築はギブソン・アセンブリ法を利用し、すべての組み立て断片はPCR増幅法によって得られた。プラスミド骨格はpYLEXプラスミド由来のものである(Yeastern Biotech Co., Ltd)。すべてのPCR増幅はKAPA HiFi高正確性DNAポリメラーゼを利用し、増幅系はいずれも50 μlで(2× KAPA Mix 25 ul、10 μMプライマー 1.5 ulずつ、鋳型 1 μlで、50 μlまで水を加えた)、各DNA配列を得た。増幅条件は、95℃で3分間予備変性し、98℃で20秒変性し、60~72℃で15秒アニーリングし、72℃で伸長し、伸長時間は30秒/kbで計算し、サイクル数は29~35で、72℃で10分間伸長した。
プラスミドpYLEX-URAはギブソン・アッセンブリー法を利用し、pYLEXプラスミドにおけるLEU2遺伝子の代わりにURA3遺伝子を用いて得られたものである。さらに、pYLEX-URAを骨格として相同組換えプラスミドpYLEX-rDNA-CgKCS-URA(CgKCSは1.2におけるカルダミネ属KCS遺伝子である)を構築した。ここで、CgKCS発現カセットの上流と下流はそれぞれヤロウイア・リポリティカ26S rDNAの配列の一部で(配列番号12および配列番号13を参照する)、よって位置特異的組み込み部位が26S rDNA領域にある相同組換えプラスミドを得た。プラスミドpYLEX-rDNA-CgKCS-URAを骨格とし、ギブソン・アッセンブリー法を利用し、CgKCS遺伝子の代わりにMaoleKCS遺伝子を使用し、相同組換えプラスミドpYLEX-rDNA-MaoleKCS-URAを構築した。
具体的な構築の過程は以下の通りである。
プラスミドpYLEX-rDNA-CgKCS-URAは特許出願者によって実験室において直接得られたものである。まず、P#-FおよびP#-RプライマーでpYLEX-rDNA-CgKCS-URAプラスミドを鋳型とし、増幅してAMPとURAスクリーニングマーカーを持つ骨格DNA断片を得た。さらに、pMv#-FおよびpMv#-Rプライマーで、MaoleKCS遺伝子を持つプラスミドpMv-MaoleKCS#-AMPを鋳型とし、それぞれMaoleKCS遺伝子断片を増幅させた。骨格およびMaoleKCS遺伝子断片に対してギブソン・アッセンブリーを行った後、感受性大腸菌Trans-T1(北京全式金生物技術有限公司)を形質転換させ、さらにプライマーrDNA-SFおよびrDNA-SRで集落のPCRおよびシークエンシングによる検証を行った後、相同組換えプラスミドpYLEX-rDNA-MaoleKCS#-URAを得た(前記プライマーは表2を参照する)。
プラスミドpYLEX-rDNA-CgKCS-URAは特許出願者によって実験室において直接得られたものである。まず、P#-FおよびP#-RプライマーでpYLEX-rDNA-CgKCS-URAプラスミドを鋳型とし、増幅してAMPとURAスクリーニングマーカーを持つ骨格DNA断片を得た。さらに、pMv#-FおよびpMv#-Rプライマーで、MaoleKCS遺伝子を持つプラスミドpMv-MaoleKCS#-AMPを鋳型とし、それぞれMaoleKCS遺伝子断片を増幅させた。骨格およびMaoleKCS遺伝子断片に対してギブソン・アッセンブリーを行った後、感受性大腸菌Trans-T1(北京全式金生物技術有限公司)を形質転換させ、さらにプライマーrDNA-SFおよびrDNA-SRで集落のPCRおよびシークエンシングによる検証を行った後、相同組換えプラスミドpYLEX-rDNA-MaoleKCS#-URAを得た(前記プライマーは表2を参照する)。
1.2.3 酵母の形質転換
Not I制限酵素で組換えプラスミド pYLEX-rDNA-MaoleKCS-URAを酵素切断し、アガロースゲル電気泳動によって確認し、形質転換用断片を回収した後、LiAc形質転換法によってヤロウイア・リポリティカPo1g-G3-ΔURAを形質転換させ、形質転換系が表3に示す通りで、方法の工程が以下の通りである。
Not I制限酵素で組換えプラスミド pYLEX-rDNA-MaoleKCS-URAを酵素切断し、アガロースゲル電気泳動によって確認し、形質転換用断片を回収した後、LiAc形質転換法によってヤロウイア・リポリティカPo1g-G3-ΔURAを形質転換させ、形質転換系が表3に示す通りで、方法の工程が以下の通りである。
(1)表3の形質転換系に従って各成分を添加し、均一に混合した。
(2)30℃水浴で1 h処理した後、ボルテックスで振とうし、39℃で10 min熱刺激を与えた。
(3)そのまま形質転換系の混合液を取ってYNB-Δura培地のスクリーニングプレートに塗布し、28℃で2-4日培養し、MaoleKCS遺伝子が導入された組換え菌株を得たが、Po1g-G3-MaoleKCS#と名付けた。
(2)30℃水浴で1 h処理した後、ボルテックスで振とうし、39℃で10 min熱刺激を与えた。
(3)そのまま形質転換系の混合液を取ってYNB-Δura培地のスクリーニングプレートに塗布し、28℃で2-4日培養し、MaoleKCS遺伝子が導入された組換え菌株を得たが、Po1g-G3-MaoleKCS#と名付けた。
1.2.4 組換え菌株の診断PCRによる検証
上記で得られた各組換え菌株の異なる形質転換体に対して診断PCRによる検証を行った。
スクリーニングプレートから組換え菌株の単一集落を取ってYPDプレートに接種し、約24時間生長させた後、菌体を取り、真菌ゲノム快速抽出キット(生工生物工程股ふん有限公司)で組換え菌株のゲノムDNAを抽出し、ゲノムDNAを鋳型とし、遺伝子MaoleKCSが導入された上流部分はプライマーylr-dufとylr-durでPCRによる検証を、下流部分はプライマーylr-ddfとylr-ddrで検証を行った(前記プライマーは表1を参照する)。
上記で得られた各組換え菌株の異なる形質転換体に対して診断PCRによる検証を行った。
スクリーニングプレートから組換え菌株の単一集落を取ってYPDプレートに接種し、約24時間生長させた後、菌体を取り、真菌ゲノム快速抽出キット(生工生物工程股ふん有限公司)で組換え菌株のゲノムDNAを抽出し、ゲノムDNAを鋳型とし、遺伝子MaoleKCSが導入された上流部分はプライマーylr-dufとylr-durでPCRによる検証を、下流部分はプライマーylr-ddfとylr-ddrで検証を行った(前記プライマーは表1を参照する)。
PCR増幅はEasyTaq DNAポリメラーゼを利用し、増幅系はいずれも20 μlで(2× EasyTaq Mix 10 ul、10 μMプライマー 0.6 μlずつ、鋳型 1 μlで、20 μlまで水を加えた)、増幅断片はアガロースゲル電気泳動によって確認した。増幅条件は、94℃で3分間予備変性し、94℃で30秒変性し、55℃で30秒アニーリングし、72℃で伸長し、伸長時間は60秒/kbで計算し、サイクル数は36で、72℃で10分間伸長した。
1.2.5 組換え菌株の振とう発酵培養
上流と下流のいずれも成功したと検証された(図3を参照する)組換え菌株20 ml YPD培地(250 ml三角フラスコにおいて)に接種し、約24時間生長させた後、YPD培地プレートに移し、約24時間生長させた後、5 ml YNB-Δura培地(50 ml三角フラスコにおいて)に接種し、36時間生長させた後、100 μl吸い取って新鮮な5 ml YNB-Δura培地に移して36時間培養し、さらに30 ml振とう発酵培地に移し、開始ODを0.08で統一させ、各群で3つの平行設け、168時間培養した。菌株の乾燥重量は秤量法によって得られた。
上流と下流のいずれも成功したと検証された(図3を参照する)組換え菌株20 ml YPD培地(250 ml三角フラスコにおいて)に接種し、約24時間生長させた後、YPD培地プレートに移し、約24時間生長させた後、5 ml YNB-Δura培地(50 ml三角フラスコにおいて)に接種し、36時間生長させた後、100 μl吸い取って新鮮な5 ml YNB-Δura培地に移して36時間培養し、さらに30 ml振とう発酵培地に移し、開始ODを0.08で統一させ、各群で3つの平行設け、168時間培養した。菌株の乾燥重量は秤量法によって得られた。
1.2.6 酸熱法による全油脂の抽出
(1)50 ml遠心管でヤロウイア・リポリティカ発酵培養液を収集し、6000 rpmで5 min高速遠心して酵母菌体を収集した。
(2)湿潤菌体1 gあたりに約10 mlの4 M塩酸を入れ、均一に振とうし、28℃のシェーカーで約1-2 h振とうさせた。
(3)沸騰水浴で6-8 min処理し、すぐに-20℃で30 min冷却した。
(4)クロロホルム:メタノール=1: 1(V/V)を20 ml入れて十分に混合した。
(5)下層のクロロホルムを分離して体積を量り、等体積の0.15%塩化ナトリウムを入れ、4000 rpmで10 min遠心した。
(6)下層を取って新たな秤量しておいたガラス管に移し、窒素ブロー機器で溶媒相を乾燥させ、さらに重量を秤量して油脂生産量を計算し、全脂質含有量が全脂質生産量の乾燥重量における比率である。
(1)50 ml遠心管でヤロウイア・リポリティカ発酵培養液を収集し、6000 rpmで5 min高速遠心して酵母菌体を収集した。
(2)湿潤菌体1 gあたりに約10 mlの4 M塩酸を入れ、均一に振とうし、28℃のシェーカーで約1-2 h振とうさせた。
(3)沸騰水浴で6-8 min処理し、すぐに-20℃で30 min冷却した。
(4)クロロホルム:メタノール=1: 1(V/V)を20 ml入れて十分に混合した。
(5)下層のクロロホルムを分離して体積を量り、等体積の0.15%塩化ナトリウムを入れ、4000 rpmで10 min遠心した。
(6)下層を取って新たな秤量しておいたガラス管に移し、窒素ブロー機器で溶媒相を乾燥させ、さらに重量を秤量して油脂生産量を計算し、全脂質含有量が全脂質生産量の乾燥重量における比率である。
1.2.7 脂肪酸のメチルエステル化
(1)ガラス管に2.6 mlのメタノール:硫酸=98: 2(V/V)溶液を添加し、均一に混合した後、85℃において3 h反応させ、さらに冷蔵庫において冷却した。
(2)1 mlの飽和NaCl溶液および1 mlのn-ヘキサンを添加し、振とうした後、5000 rpmで5 min高速遠心し、上清をepチューブに吸い取り、そして有機相ろ膜でろ過した後、ガスクロマトグラフィー実験を行った。
(1)ガラス管に2.6 mlのメタノール:硫酸=98: 2(V/V)溶液を添加し、均一に混合した後、85℃において3 h反応させ、さらに冷蔵庫において冷却した。
(2)1 mlの飽和NaCl溶液および1 mlのn-ヘキサンを添加し、振とうした後、5000 rpmで5 min高速遠心し、上清をepチューブに吸い取り、そして有機相ろ膜でろ過した後、ガスクロマトグラフィー実験を行った。
1.2.8 脂肪酸成分のガスクロマトグラフィーによる分析
脂肪酸成分の分析にガスクロマトグラフィーを使用した(Agilent 7890B-GC)。クロマトグラフィーの検出条件:クロマトグラフィーカラムがHP-INOWAX(30 m × 0.32 mm × 0.5 μm)である。仕込み温度:250℃、検出器温度:250℃、仕込み体積:1 μL。カラム初期温度は140℃で、1min維持し、10℃/minで180℃に昇温し、2min維持し、5℃/minで210℃に昇温し、4min維持し、さらに5℃/minで250℃に昇温し、4min維持した。面積百分率法によって各脂肪酸成分の相対的含有量を得た。
脂肪酸成分の分析にガスクロマトグラフィーを使用した(Agilent 7890B-GC)。クロマトグラフィーの検出条件:クロマトグラフィーカラムがHP-INOWAX(30 m × 0.32 mm × 0.5 μm)である。仕込み温度:250℃、検出器温度:250℃、仕込み体積:1 μL。カラム初期温度は140℃で、1min維持し、10℃/minで180℃に昇温し、2min維持し、5℃/minで210℃に昇温し、4min維持し、さらに5℃/minで250℃に昇温し、4min維持した。面積百分率法によって各脂肪酸成分の相対的含有量を得た。
1.3 ヤロウイア・リポリティカにおけるMaoleKCSの過剰発現
1.3.1 過剰発現遺伝子組換えプラスミドの構築
プラスミドベクターの構築はギブソン・アセンブリ法を利用し、すべての組み立て断片はPCR増幅法によって得られたが、具体的な方法は1.2.2におけるものと同様である。pYLEX-URAを骨格として構築される相同組換えプラスミドpYLEX-FAD2-CgKCS-URAは特許出願者の実験室において直接得られたもので、ここで、CgKCS発現カセットの上流と下流はそれぞれヤロウイア・リポリティカFAD2遺伝子の配列の一部で(配列番号14および配列番号15を参照する)、よって位置特異的組み込み部位がFAD2遺伝子座にある相同組換えプラスミドを得た。プラスミドpYLEX-FAD2-CgKCS-URAを骨格とし、ギブソン・アッセンブリー法を利用し、CgKCS発現カセットの代わりに連続した2つのMaoleKCS発現カセットを使用し、相同組換えプラスミドpYLEX-FAD2-MaoleKCS-URAを構築した。
1.3.1 過剰発現遺伝子組換えプラスミドの構築
プラスミドベクターの構築はギブソン・アセンブリ法を利用し、すべての組み立て断片はPCR増幅法によって得られたが、具体的な方法は1.2.2におけるものと同様である。pYLEX-URAを骨格として構築される相同組換えプラスミドpYLEX-FAD2-CgKCS-URAは特許出願者の実験室において直接得られたもので、ここで、CgKCS発現カセットの上流と下流はそれぞれヤロウイア・リポリティカFAD2遺伝子の配列の一部で(配列番号14および配列番号15を参照する)、よって位置特異的組み込み部位がFAD2遺伝子座にある相同組換えプラスミドを得た。プラスミドpYLEX-FAD2-CgKCS-URAを骨格とし、ギブソン・アッセンブリー法を利用し、CgKCS発現カセットの代わりに連続した2つのMaoleKCS発現カセットを使用し、相同組換えプラスミドpYLEX-FAD2-MaoleKCS-URAを構築した。
1.3.2 酵母の形質転換、組換え菌株の診断PCRによる検証
5-FOA法によって逆スクリーニングしてPo1g-G3-MaoleKCSのウラシル栄養要求性菌株Po1g-G3-MaoleKCS-ΔURAを得た。Not I制限酵素で組換えプラスミド pYLEX-FAD2-MaoleKCS-URAを酵素切断し、アガロースゲル電気泳動によって確認し、形質転換用断片を回収した後、LiAc形質転換法によってヤロウイア・リポリティカPo1g-G3-MaoleKCS-ΔURAを形質転換させ、MaoleKCS遺伝子が導入された組換え菌株を得たが、Po1g-G3-3MaoleKCSと名付けた。異なる形質転換体を選んで診断PCRによる検証を行ったが、方法は1.2.4と同様で、上流部分はプライマーFAD-df (5’-CTACGGCACGATAAAGATGG-3’) およびylr-durで、下流部分はプライマーylr-ddfおよびFAD-dr (5’-TTACAATGGGACCGTGCTTG-3’) でPCRによる検証を行い、上流と下流で同時に成功と検証されたた異なる形質転換体を振とう発酵培養し、培養方法および培養後の各指標の分析方法は1.2におけるものと同様である。
5-FOA法によって逆スクリーニングしてPo1g-G3-MaoleKCSのウラシル栄養要求性菌株Po1g-G3-MaoleKCS-ΔURAを得た。Not I制限酵素で組換えプラスミド pYLEX-FAD2-MaoleKCS-URAを酵素切断し、アガロースゲル電気泳動によって確認し、形質転換用断片を回収した後、LiAc形質転換法によってヤロウイア・リポリティカPo1g-G3-MaoleKCS-ΔURAを形質転換させ、MaoleKCS遺伝子が導入された組換え菌株を得たが、Po1g-G3-3MaoleKCSと名付けた。異なる形質転換体を選んで診断PCRによる検証を行ったが、方法は1.2.4と同様で、上流部分はプライマーFAD-df (5’-CTACGGCACGATAAAGATGG-3’) およびylr-durで、下流部分はプライマーylr-ddfおよびFAD-dr (5’-TTACAATGGGACCGTGCTTG-3’) でPCRによる検証を行い、上流と下流で同時に成功と検証されたた異なる形質転換体を振とう発酵培養し、培養方法および培養後の各指標の分析方法は1.2におけるものと同様である。
2. 結果と分析
2.1 マラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子のスクリーニングと発現
2.1.1 マラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子のバイオインフォマティクス分析
マラニア・オレイフェラゲノムにおいて12の3-ケトアシル-CoAシンターゼが検索されたが、これらの遺伝子の機能と応用が報告されておらず、そのうち、6つの3-ケトアシル-CoAシンターゼが文献の作者によって同時に脂肪酸伸長過程におけるKCS、KCR、HCDおよびECRの作用を有すると注釈されている。6つのKCSのアミノ酸配列とNCBIデータベースにおけるMoKCS (GenBank: QDA34238.1)およびCgKCS (GenBank: ACJ61778.1)とでタンパク質配列の多重アラインメントを行った後、近隣結合法(Neighbor-joining)のアルゴリズムによって系統樹(図1を参照する)を作成したところ、MaoleKCS463はMoKCSとアミノ酸配列が完全に一致し、そしてMaoleKCS397はMaoleKCS398と類似度が高いことが見出された。図2からわかるように、KCS398、KCS461、KCS467およびKCS817と既に報告されたCgKCSおよびMoKCSはいずれもKCSファミリーの3つの機能保存ドメイン「FGNTSSSS」、「GSGFKCNSAVW」および「GMGCSA」(赤い枠の部分)を含有することから、これらのタンパク質はKCSファミリーに属するタンパク質であることが示され、KCS398、KCS461、KCS467およびKCS817を選んで後続の研究に供した。この4つのKCS遺伝子は無錫青蘭生物科技有限公司によってコドンを最適化して合成されたもので、MaoleKCS遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子を持つシャトルプラスミドpMv-MaoleKCS#-AMPを得た(#は数字番号398、463、467、817を表す)。
2.1 マラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子のスクリーニングと発現
2.1.1 マラニア・オレイフェラ3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子のバイオインフォマティクス分析
マラニア・オレイフェラゲノムにおいて12の3-ケトアシル-CoAシンターゼが検索されたが、これらの遺伝子の機能と応用が報告されておらず、そのうち、6つの3-ケトアシル-CoAシンターゼが文献の作者によって同時に脂肪酸伸長過程におけるKCS、KCR、HCDおよびECRの作用を有すると注釈されている。6つのKCSのアミノ酸配列とNCBIデータベースにおけるMoKCS (GenBank: QDA34238.1)およびCgKCS (GenBank: ACJ61778.1)とでタンパク質配列の多重アラインメントを行った後、近隣結合法(Neighbor-joining)のアルゴリズムによって系統樹(図1を参照する)を作成したところ、MaoleKCS463はMoKCSとアミノ酸配列が完全に一致し、そしてMaoleKCS397はMaoleKCS398と類似度が高いことが見出された。図2からわかるように、KCS398、KCS461、KCS467およびKCS817と既に報告されたCgKCSおよびMoKCSはいずれもKCSファミリーの3つの機能保存ドメイン「FGNTSSSS」、「GSGFKCNSAVW」および「GMGCSA」(赤い枠の部分)を含有することから、これらのタンパク質はKCSファミリーに属するタンパク質であることが示され、KCS398、KCS461、KCS467およびKCS817を選んで後続の研究に供した。この4つのKCS遺伝子は無錫青蘭生物科技有限公司によってコドンを最適化して合成されたもので、MaoleKCS遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子を持つシャトルプラスミドpMv-MaoleKCS#-AMPを得た(#は数字番号398、463、467、817を表す)。
2.1.2 組換え酵母菌株の診断PCRによる検証
スクリーニングプレートから組換え菌株の異なる形質転換体を取ってYPDプレートに接種し、そのうち、菌株Po1g-G3-MaoleKCS398では7つ、菌株Po1g-G3-MaoleKCS461、Po1g-G3-MaoleKCS467およびPo1g-G3-MaoleKCS817ではそれぞれ8つ選び、同時に対照菌株Po1g-G3をYPDプレートに接種し、約24時間生長させた後、組換え菌株の異なる形質転換体および対照菌株のゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAを鋳型とし、導入された遺伝子MaoleKCSの上流と下流の部分に対してPCR増幅を行い、遺伝子の組み込みと発現を検証した。Po1g-G3のゲノムDNAを対照とし、PCR産物のアガロースゲル電気泳動パターンを図3に示す。まず、対照群Po1g-G3では、上流または下流のPCR産物がなく(図3Aと図3Cの最も左側のレーンCKを参照する)、また、下流部分のPCR結果が陽性を示した(標的バンドが1632 bpである)形質転換体は、
Po1g-G3-MaoleKCS398の1、3、4、5および6番、
Po1g-G3-MaoleKCS461の1、2、3および4番、
Po1g-G3-MaoleKCS467の2、3、4、6および7番、
Po1g-G3-MaoleKCS817の2、4、6および8番(図3B)である。
スクリーニングプレートから組換え菌株の異なる形質転換体を取ってYPDプレートに接種し、そのうち、菌株Po1g-G3-MaoleKCS398では7つ、菌株Po1g-G3-MaoleKCS461、Po1g-G3-MaoleKCS467およびPo1g-G3-MaoleKCS817ではそれぞれ8つ選び、同時に対照菌株Po1g-G3をYPDプレートに接種し、約24時間生長させた後、組換え菌株の異なる形質転換体および対照菌株のゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAを鋳型とし、導入された遺伝子MaoleKCSの上流と下流の部分に対してPCR増幅を行い、遺伝子の組み込みと発現を検証した。Po1g-G3のゲノムDNAを対照とし、PCR産物のアガロースゲル電気泳動パターンを図3に示す。まず、対照群Po1g-G3では、上流または下流のPCR産物がなく(図3Aと図3Cの最も左側のレーンCKを参照する)、また、下流部分のPCR結果が陽性を示した(標的バンドが1632 bpである)形質転換体は、
Po1g-G3-MaoleKCS398の1、3、4、5および6番、
Po1g-G3-MaoleKCS461の1、2、3および4番、
Po1g-G3-MaoleKCS467の2、3、4、6および7番、
Po1g-G3-MaoleKCS817の2、4、6および8番(図3B)である。
そして、さらに下流部分が陽性を示した組換え菌株の形質転換体に対して上流部分の組み込みの検証を行ったところ、上流部分が陽性を示した(標的バンドが1555 bpである)ものは、
Po1g-G3-MaoleKCS398の1、3、4、5および6番、
Po1g-G3-MaoleKCS461の1、2および4番、
Po1g-G3-MaoleKCS467の2、3、4、6および7番、
Po1g-G3-MaoleKCS817の2、4、6および8番である。
Po1g-G3-MaoleKCS398の1、3、4、5および6番、
Po1g-G3-MaoleKCS461の1、2および4番、
Po1g-G3-MaoleKCS467の2、3、4、6および7番、
Po1g-G3-MaoleKCS817の2、4、6および8番である。
上・下流部分のPCR産物の輝度を合わせ、最終的にPo1g-G3-MaoleKCS
398の1番、Po1g-G3-MaoleKCS461の2号、Po1g-G3-MaoleKCS467の3番およびPo1g-G3-MaoleKCS817の8番を選んで後続の振とう発酵培養に供した。
398の1番、Po1g-G3-MaoleKCS461の2号、Po1g-G3-MaoleKCS467の3番およびPo1g-G3-MaoleKCS817の8番を選んで後続の振とう発酵培養に供した。
2.1.3 組換え菌株の振とう発酵の結果
図4に示すように、対照菌株Po1g-G3と比べ、菌株Po1g-G3-MaoleKCS817の乾燥重量、全脂質生産量および全脂質含有量のいずれも大幅に低下し、菌株Po1g-G3-MaoleKCS398およびPo1g-G3-MaoleKCS467の乾燥重量、全脂質生産量および全脂質含有量が少し向上し、菌株の乾燥重量、全脂質生産量および全脂質含有量が顕著に変わっていない。
図4に示すように、対照菌株Po1g-G3と比べ、菌株Po1g-G3-MaoleKCS817の乾燥重量、全脂質生産量および全脂質含有量のいずれも大幅に低下し、菌株Po1g-G3-MaoleKCS398およびPo1g-G3-MaoleKCS467の乾燥重量、全脂質生産量および全脂質含有量が少し向上し、菌株の乾燥重量、全脂質生産量および全脂質含有量が顕著に変わっていない。
脂肪酸の構成分析から、対照菌株Po1g-G3と比べ、すべての菌株が明らかにネルボン酸およびリグノセリン酸を生成し、そして生産量が近く、全脂肪酸における比率がそれぞれ8.9%および6.2%に達したことが示された(図5)。同時に、菌株のC18:1およびC18:0の比率が対照よりも明らかに低下し、また少量のC20およびC22脂肪酸が検出されたことから(図5を参照する)、MaoleKCSがC18:1およびC18:0の炭素鎖を少しずつ伸長させ、ネルボン酸およびリグノセリン酸を生成させることができる。そのため、本発明は脂肪酸伸長酵素のスクリーニングおよび酵母体内における発現の分析により、マラニア・オレイフェラ由来の脂肪酸伸長酵素MaoleKCSがネルボン酸の合成を触媒し、相応する遺伝子がネルボン酸高生産酵母の構築に有用であることを見出した。
2.2 ヤロウイア・リポリティカにおけるMaoleKCSの過剰発現
図6Aに示すように、対照菌株の29.2 g/Lと比べ、組換え菌株の異なる形質転換体の乾燥重量がいずれも異なる程度で低下し、順に26.7 g/L、27.4 g/L、25.8 g/Lおよび28.7 g/Lであった。全脂質生産量において、対照菌株は14.16 g/Lで、1、2および3番の形質転換体は明らかに低下し、そのうち、3番は最も明らかで、32%低下し、4番の形質転換体の全脂質生産量が14.18 g/Lで、顕著な変化がなかった。全脂質含有量において、全脂質生産量の場合と類似し、1、2および3番の形質転換体は明らかに低下し、そのうち、3番は最も明らかで、4番の形質転換体の油脂含有量に顕著な変化がなかった。
図6Aに示すように、対照菌株の29.2 g/Lと比べ、組換え菌株の異なる形質転換体の乾燥重量がいずれも異なる程度で低下し、順に26.7 g/L、27.4 g/L、25.8 g/Lおよび28.7 g/Lであった。全脂質生産量において、対照菌株は14.16 g/Lで、1、2および3番の形質転換体は明らかに低下し、そのうち、3番は最も明らかで、32%低下し、4番の形質転換体の全脂質生産量が14.18 g/Lで、顕著な変化がなかった。全脂質含有量において、全脂質生産量の場合と類似し、1、2および3番の形質転換体は明らかに低下し、そのうち、3番は最も明らかで、4番の形質転換体の油脂含有量に顕著な変化がなかった。
組換え菌株の各形質転換体の異なる脂肪酸の比率は図6Bおよび図7に示す。対照菌株では、ネルボン酸の全脂肪酸における比率が8.96%で(図7a)、1、2および4番の形質転換体では、ネルボン酸が占める比率がいずれも大幅に向上し、それぞれ13.27%、13.26%および12.60%であったが(図7b、c、e)、3番の形質転換体では、比率が少し低下し、8.61%であった(図7d)。同時に、4つの形質転換体のリグノセリン酸の全脂肪酸における比率がいずれも大幅に向上し、そのうち、3番の形質転換体は最も突出しており、対照よりも2倍近く向上した。相応的に、対照菌株のC18:0およびC18:1の比率がいずれも異なる程度で低下したことから、MaoleKCSの過剰発現がさらにC18:0およびC18:1の炭素鎖の伸長を触媒したことが示され、そのうち、4番の形質転換体のネルボン酸の合成効果が最も顕著であった。4番の形質転換体では、全脂質生産量が対照と比べて顕著に変わっておらず、ネルボン酸が占める比率が40%向上し、酵母のネルボン酸を合成する能力が増強した。
実施例2:組換え菌株の発酵タンク発酵
1. 材料と方法
1.1 発酵培地
シード培地(YNB培地):YNB 3 g/L、ブドウ糖60 g/L、硫酸アンモニウム35 g/Lで、YNBと硫酸アンモニウムは滅菌後、ろ過除菌して入れた。
発酵培地(FM培地):ブドウ糖50 g/L、硫酸アンモニウム35 g/L、酵母粉末38 g/L、リン酸二水素カリウム8 g/L、リン酸水素二ナトリウム・十二水和物6 g/L、硫酸マグネシウム・七水和物 5 g/L、消泡剤1 mL/L。
追加による制御:発酵タンクにおける残留糖濃度に応じて制御し、滅菌された600 g/Lのブドウ糖で追加した。
1. 材料と方法
1.1 発酵培地
シード培地(YNB培地):YNB 3 g/L、ブドウ糖60 g/L、硫酸アンモニウム35 g/Lで、YNBと硫酸アンモニウムは滅菌後、ろ過除菌して入れた。
発酵培地(FM培地):ブドウ糖50 g/L、硫酸アンモニウム35 g/L、酵母粉末38 g/L、リン酸二水素カリウム8 g/L、リン酸水素二ナトリウム・十二水和物6 g/L、硫酸マグネシウム・七水和物 5 g/L、消泡剤1 mL/L。
追加による制御:発酵タンクにおける残留糖濃度に応じて制御し、滅菌された600 g/Lのブドウ糖で追加した。
1.2 50 L発酵タンクの発酵プロセス
寄託菌種を-80℃から取り出した後、氷上に置いて解凍した。100 μl吸い取って250 mLのYNB培地に接種し、220 rpm、28℃におけるシェーカーで24 h培養した後、接種後OD約0.01を基準に5 Lシード発酵タンクに移し、シードタンクの培地がFM発酵培地で、液体充填量が2.5 Lで、シードタンクの培養条件は、温度28℃で、冷却機で循環冷却し、pHは5 mol/Lの水酸化ナトリウムで5.5になるように制御し、DOを20%とし、24 h培養した後、50 L発酵タンク(鎮江匯能達公司、HND-BJ-5L-50L型)に移して発酵を開始した。
実験プランに従ってFM発酵培地を調製し、十分に均一に混合した後、50 L発酵タンクに入れた。発酵タンクの液体充填量が25 Lである。接種量が10%で、温度が28℃に低下した時点で、接種口から150 mlのシード液を接種した。
寄託菌種を-80℃から取り出した後、氷上に置いて解凍した。100 μl吸い取って250 mLのYNB培地に接種し、220 rpm、28℃におけるシェーカーで24 h培養した後、接種後OD約0.01を基準に5 Lシード発酵タンクに移し、シードタンクの培地がFM発酵培地で、液体充填量が2.5 Lで、シードタンクの培養条件は、温度28℃で、冷却機で循環冷却し、pHは5 mol/Lの水酸化ナトリウムで5.5になるように制御し、DOを20%とし、24 h培養した後、50 L発酵タンク(鎮江匯能達公司、HND-BJ-5L-50L型)に移して発酵を開始した。
実験プランに従ってFM発酵培地を調製し、十分に均一に混合した後、50 L発酵タンクに入れた。発酵タンクの液体充填量が25 Lである。接種量が10%で、温度が28℃に低下した時点で、接種口から150 mlのシード液を接種した。
発酵条件:発酵温度が28℃で、冷却機で循環冷却し、pHは5 mol/Lの水酸化ナトリウムで5.5になるように制御し、初期通気量が1 vvmで、最初の24 h内で少しずつ最大通気量の2 vvmまで上げた。溶存酸素の制御手段は回転数とのカスケード制御を使用し、DOを20%とし、48 h後、10%になるように調整し、回転数の範囲が200 rpm-600 rpmである。追加ブドウ糖濃度が600 g/Lで、タンクにおける残量糖濃度の変化に応じて追加し、その濃度が30 g/L以下に低下すると追加した。
発酵過程における指標の分析方法は実施例1を参照する。粗製ネルボン酸生産量(g/L)=全脂質生産量(g/L)×ネルボン酸の全脂肪酸における比率(%)。
発酵過程における指標の分析方法は実施例1を参照する。粗製ネルボン酸生産量(g/L)=全脂質生産量(g/L)×ネルボン酸の全脂肪酸における比率(%)。
2. 結果と分析
振とう発酵に基づき、50 L発酵タンクで組換え菌株Po1g-G3-3Maole398の発酵培養を行ったが、その結果を図8に示す。組換え菌の油脂、乾燥重量および脂肪酸の構成を検出することにより、以下の結論が得られた。168 hの発酵で、乾燥重量(DCW)が149.4 g/Lに達し、全脂質生産量(Lipid titer)が69.6 g/Lで、全脂質含有量(Lipid Content)が46.6%に達し、ネルボン酸の全脂肪酸における比率が36.9%で、脂肪酸成分のガスクロマトグラフィーのスペクトルの結果が図9に示すように、ネルボン酸生産量が25.7 g/Lに達した。
振とう発酵に基づき、50 L発酵タンクで組換え菌株Po1g-G3-3Maole398の発酵培養を行ったが、その結果を図8に示す。組換え菌の油脂、乾燥重量および脂肪酸の構成を検出することにより、以下の結論が得られた。168 hの発酵で、乾燥重量(DCW)が149.4 g/Lに達し、全脂質生産量(Lipid titer)が69.6 g/Lで、全脂質含有量(Lipid Content)が46.6%に達し、ネルボン酸の全脂肪酸における比率が36.9%で、脂肪酸成分のガスクロマトグラフィーのスペクトルの結果が図9に示すように、ネルボン酸生産量が25.7 g/Lに達した。
実施例3 マラニア・オレイフェラにおけるエステラーゼの発掘と分析
バイオインフォマティクス分析に基づき、マラニア・オレイフェラのゲノムデータ(Xuら、8、2019、8:1-14)から2つのジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)および3つのグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)の酵素遺伝子が得られた。DGAT2の2種類は、それぞれMoDGAT2(Maole_010035)、MoDGAT2(Maole_015949)と、GPATの3種類は、それぞれMoGPAT(Maole_006088)、MoGPAT(Maole_006089)、MoGPAT(Maole_006090)と名付けられた。
バイオインフォマティクス分析に基づき、マラニア・オレイフェラのゲノムデータ(Xuら、8、2019、8:1-14)から2つのジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)および3つのグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)の酵素遺伝子が得られた。DGAT2の2種類は、それぞれMoDGAT2(Maole_010035)、MoDGAT2(Maole_015949)と、GPATの3種類は、それぞれMoGPAT(Maole_006088)、MoGPAT(Maole_006089)、MoGPAT(Maole_006090)と名付けられた。
>配列番号38
MoDGAT2(Maole_010035) 遺伝子配列
ATGGACGGCTCTTCGCAAATCAAGGAGCTTTCATGTCTTGTGAAATTTGTAGAAGAAACTGTGAGGATAGAGCATGCTTCAAACCCAAATAAGCCAGTTTATTTGGTAGGGGATTCTTTTGGTGGATGCTTGGCACTTGCTGTTGCTGCTCGTAATCCTACATTTGATCTGGTTCTGATTTTAGTCAATCCAGCAACGTCATTTGGCAGGTCACAGCTGCAACCTCTGCTGCCTGTCTTAGAGGCTTTGCCGGATGGGCTTCATTTCACTGTTCCTTATCTCCTTAGCTTTATCATGGGTACGTGTTCTGCTGCTTTGAAGCCTTACCGTGATCCACTGAAGTTGGCAATGGTCAATATTGAAACTAGGTTTCCTCCTGCACTAGTACTAGAGCAATTGTCTGGCAACCTCACAGCTTTGCTACCACGCCTTTCTGGCTTGGCTAATATTATACCGAAGGAGACTCTTCTTTGGAAGCTAAAGCTCCTAAAATCAGCTGCTGCTTATGCTAATTCACGTCTCCATGCTGTTAAAGCTGAAGTACTTGTTCTGGCTAGTGGCAGTGATAACATGCTACCTAGCAAAGATGAAGCTGAACGCCTTTCACGTTCATTACAGAATTGCATAGTTCGTCTCTTTAAGGACAATGGGCATACCCTTCTATTGGAAGATGGCTATAGTCTGCTGACCATCATTAAATGTACTTCCAAATACCGTTGTTCAAGGAAGCATGATTTCATCACGGATTTTCTGCCTCCAAGTATGTCTGAATTCAAACAGGAATTGAACCAGAGATTTGGGTTATTTCGTGTTGCTACTAGTCCCATACTGTTCTCAACACTACCAGATGGGAAGATAGTTAAAGGTCTTGCCGGAATCCCAAATGAAGGTCCCGTCTTATTAGTTGGTTACCACATGTTGTTGGGATGTGAACTAGGTCCACTTGTTGAAGCATTCTTGAAAGAGAAGAATATTATGATTCGCGGTGTAGCGCACCCAGAGATGTTTTCAAAGAAGCATGAAGGTCCATCAAATGAATTTGGACCTTTTGATTTGGTGAAACTGTTTGGTGGCCTTCCTGTCACACCAAGAAACCTTTTCAAATTGTTTTCAACAAAATCACATATACTCCTTTATCCAGGAGGTGCACGTGAGGCTCTTCATCGCAAGGGCGAAAAGTACAAGTTATTGTGGCCCAACCAGCCTGAATTTGTTAGAATGGCTGCAAGATTTGGTGCCACCATTGTACCGTTTGGGACTGTTGGAGAAGACGACATAGCAGAAGCGGAATCGACTATGTTGGCAAAGAAGATCACGCTGAGGAGCTCTGACGGCGAGACCTTTGAGGTTGACAAGATCGTGGCTCTTGAGTCTCAGATGATCAAGCACATGATTGAGGATGACTGTGCGGACAATGGAATACCCTTGCCCAACGTCACCAGCTGGATCTTGGTGAAGGTCATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCAAGGCTCCCAAGATCGAGAAACGAGGCGACGTCAACAAGGAGCTCAAGTCGTGGGACGCTGAGTTTGTCAAAATTGACTAG
MoDGAT2(Maole_010035) 遺伝子配列
ATGGACGGCTCTTCGCAAATCAAGGAGCTTTCATGTCTTGTGAAATTTGTAGAAGAAACTGTGAGGATAGAGCATGCTTCAAACCCAAATAAGCCAGTTTATTTGGTAGGGGATTCTTTTGGTGGATGCTTGGCACTTGCTGTTGCTGCTCGTAATCCTACATTTGATCTGGTTCTGATTTTAGTCAATCCAGCAACGTCATTTGGCAGGTCACAGCTGCAACCTCTGCTGCCTGTCTTAGAGGCTTTGCCGGATGGGCTTCATTTCACTGTTCCTTATCTCCTTAGCTTTATCATGGGTACGTGTTCTGCTGCTTTGAAGCCTTACCGTGATCCACTGAAGTTGGCAATGGTCAATATTGAAACTAGGTTTCCTCCTGCACTAGTACTAGAGCAATTGTCTGGCAACCTCACAGCTTTGCTACCACGCCTTTCTGGCTTGGCTAATATTATACCGAAGGAGACTCTTCTTTGGAAGCTAAAGCTCCTAAAATCAGCTGCTGCTTATGCTAATTCACGTCTCCATGCTGTTAAAGCTGAAGTACTTGTTCTGGCTAGTGGCAGTGATAACATGCTACCTAGCAAAGATGAAGCTGAACGCCTTTCACGTTCATTACAGAATTGCATAGTTCGTCTCTTTAAGGACAATGGGCATACCCTTCTATTGGAAGATGGCTATAGTCTGCTGACCATCATTAAATGTACTTCCAAATACCGTTGTTCAAGGAAGCATGATTTCATCACGGATTTTCTGCCTCCAAGTATGTCTGAATTCAAACAGGAATTGAACCAGAGATTTGGGTTATTTCGTGTTGCTACTAGTCCCATACTGTTCTCAACACTACCAGATGGGAAGATAGTTAAAGGTCTTGCCGGAATCCCAAATGAAGGTCCCGTCTTATTAGTTGGTTACCACATGTTGTTGGGATGTGAACTAGGTCCACTTGTTGAAGCATTCTTGAAAGAGAAGAATATTATGATTCGCGGTGTAGCGCACCCAGAGATGTTTTCAAAGAAGCATGAAGGTCCATCAAATGAATTTGGACCTTTTGATTTGGTGAAACTGTTTGGTGGCCTTCCTGTCACACCAAGAAACCTTTTCAAATTGTTTTCAACAAAATCACATATACTCCTTTATCCAGGAGGTGCACGTGAGGCTCTTCATCGCAAGGGCGAAAAGTACAAGTTATTGTGGCCCAACCAGCCTGAATTTGTTAGAATGGCTGCAAGATTTGGTGCCACCATTGTACCGTTTGGGACTGTTGGAGAAGACGACATAGCAGAAGCGGAATCGACTATGTTGGCAAAGAAGATCACGCTGAGGAGCTCTGACGGCGAGACCTTTGAGGTTGACAAGATCGTGGCTCTTGAGTCTCAGATGATCAAGCACATGATTGAGGATGACTGTGCGGACAATGGAATACCCTTGCCCAACGTCACCAGCTGGATCTTGGTGAAGGTCATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCAAGGCTCCCAAGATCGAGAAACGAGGCGACGTCAACAAGGAGCTCAAGTCGTGGGACGCTGAGTTTGTCAAAATTGACTAG
(a)配列の特徴:
●長さ:1566
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)である。
●長さ:1566
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)である。
>配列番号39
MoDGAT2(Maole_010035) アミノ酸配列
MDGSSQIKELSCLVKFVEETVRIEHASNPNKPVYLVGDSFGGCLALAVAARNPTFDLVLILVNPATSFGRSQLQPLLPVLEALPDGLHFTVPYLLSFIMGTCSAALKPYRDPLKLAMVNIETRFPPALVLEQLSGNLTALLPRLSGLANIIPKETLLWKLKLLKSAAAYANSRLHAVKAEVLVLASGSDNMLPSKDEAERLSRSLQNCIVRLFKDNGHTLLLEDGYSLLTIIKCTSKYRCSRKHDFITDFLPPSMSEFKQELNQRFGLFRVATSPILFSTLPDGKIVKGLAGIPNEGPVLLVGYHMLLGCELGPLVEAFLKEKNIMIRGVAHPEMFSKKHEGPSNEFGPFDLVKLFGGLPVTPRNLFKLFSTKSHILLYPGGAREALHRKGEKYKLLWPNQPEFVRMAARFGATIVPFGTVGEDDIAEAESTMLAKKITLRSSDGETFEVDKIVALESQMIKHMIEDDCADNGIPLPNVTSWILVKVIEYCKKHVKAPKIEKRGDVNKELKSWDAEFVKID
MoDGAT2(Maole_010035) アミノ酸配列
MDGSSQIKELSCLVKFVEETVRIEHASNPNKPVYLVGDSFGGCLALAVAARNPTFDLVLILVNPATSFGRSQLQPLLPVLEALPDGLHFTVPYLLSFIMGTCSAALKPYRDPLKLAMVNIETRFPPALVLEQLSGNLTALLPRLSGLANIIPKETLLWKLKLLKSAAAYANSRLHAVKAEVLVLASGSDNMLPSKDEAERLSRSLQNCIVRLFKDNGHTLLLEDGYSLLTIIKCTSKYRCSRKHDFITDFLPPSMSEFKQELNQRFGLFRVATSPILFSTLPDGKIVKGLAGIPNEGPVLLVGYHMLLGCELGPLVEAFLKEKNIMIRGVAHPEMFSKKHEGPSNEFGPFDLVKLFGGLPVTPRNLFKLFSTKSHILLYPGGAREALHRKGEKYKLLWPNQPEFVRMAARFGATIVPFGTVGEDDIAEAESTMLAKKITLRSSDGETFEVDKIVALESQMIKHMIEDDCADNGIPLPNVTSWILVKVIEYCKKHVKAPKIEKRGDVNKELKSWDAEFVKID
(a)配列の特徴:
●長さ:521
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該アミノ酸配列がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)のアミノ酸配列である。
●長さ:521
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該アミノ酸配列がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)のアミノ酸配列である。
>配列番号40
MoDGAT2(Maole_015949) 遺伝子配列
ATGGCGGAGACCGAGGTCAGAGAGTCGCCGTTGACCGCCGCCCCTGCCCCCGAGGTGACTGTCATCGAGAGCCCCCGAGTTCCCCTGCTCCATTCCGTGCTCGCCACCGCCCTGTGGATTGGTTGCATCCACCTGTTCTTCGCCGTCATGTTCACCGCCACTTTCCTGCTCCCCCTCTCCAAATCCATTGCGGTGTTTGCTCTGCTACTGGTTCTTATTGTGGTTCCTGTTGAGGCTGATAGTAAATTTGGGATGAAAGTAAGGAGGGGCAATAACCATCATGATAATGAAGGTGATGATGAAGAGTTCTCCAACATACATGGTTGGGTTGTAAAAAAAATGGTGGTGGTTTATTGCCACAGTGTCACTATGCCAGAACTGGAGGTGACAATGCTGCCAAGTAACGGTTCTGTTTTGTCCTTCACAGTCTTTGCGTTGGAGCCACATTCAGTGTTGCCTGTTGGTGTCATCTCACTTATGCACCTTTCAAATGCTGTGCCCCTCCCAAAAACTAGGGTTCTTGCCAGTAGCGCTGTGTTTAGAACACCATTCCTGAGGCATATATGGACATGGATGGGCCTTGCAGCTGTAACAAGGAAAAATTTTATCTCCCTTTTGGCAGCTGGTTATAGTTGCGCCATAATACCAGGTGGGACGAGGGAGACATTGCTTATGGTGCAAGATCATGAGGTTTATCTCTTGAAACTCTCTGTGGCTCTATTGCGTATTGCTGCACGCTCTACAGCTTTGGAGTGGAACTTGTGCCCATTCCAGAAGATTGCTTTCCTTAAGACGAGAAAAGGATTTGTTCGCACGGCTATAGAGACCGGTGTGCCTCTAATCCCTGTTTTCTCTTTCGGCCAGGTATTTTTTTTTTTTTGGAAAGATCAAGTTTACACCGATGTTCTTCTGGGGAGTTTTGGGATGCTACATCTCATAACATGGACAGGGCTCCTTTCCACACATCACACACGAATGCCTTCTTTCTTCATCATGAGGAGAGCTGCCACTGTTCCCCTAACTCCTATGCCTCGTCGGCTTCCATTGCATGTGGTTGTGGGTAGACCAATTGAGGTTAAGCAAAATTCACAACCCACAGCAGAAGAGGTGAATGAAGTGCACAGTCAGTTTGTGGGGGCATTGCAAGATCTGTTCGAGAGGCACAAAGCAAGGGTTGGGCACGCTGATCGTGAGCTGAAAATCATTTGA
MoDGAT2(Maole_015949) 遺伝子配列
ATGGCGGAGACCGAGGTCAGAGAGTCGCCGTTGACCGCCGCCCCTGCCCCCGAGGTGACTGTCATCGAGAGCCCCCGAGTTCCCCTGCTCCATTCCGTGCTCGCCACCGCCCTGTGGATTGGTTGCATCCACCTGTTCTTCGCCGTCATGTTCACCGCCACTTTCCTGCTCCCCCTCTCCAAATCCATTGCGGTGTTTGCTCTGCTACTGGTTCTTATTGTGGTTCCTGTTGAGGCTGATAGTAAATTTGGGATGAAAGTAAGGAGGGGCAATAACCATCATGATAATGAAGGTGATGATGAAGAGTTCTCCAACATACATGGTTGGGTTGTAAAAAAAATGGTGGTGGTTTATTGCCACAGTGTCACTATGCCAGAACTGGAGGTGACAATGCTGCCAAGTAACGGTTCTGTTTTGTCCTTCACAGTCTTTGCGTTGGAGCCACATTCAGTGTTGCCTGTTGGTGTCATCTCACTTATGCACCTTTCAAATGCTGTGCCCCTCCCAAAAACTAGGGTTCTTGCCAGTAGCGCTGTGTTTAGAACACCATTCCTGAGGCATATATGGACATGGATGGGCCTTGCAGCTGTAACAAGGAAAAATTTTATCTCCCTTTTGGCAGCTGGTTATAGTTGCGCCATAATACCAGGTGGGACGAGGGAGACATTGCTTATGGTGCAAGATCATGAGGTTTATCTCTTGAAACTCTCTGTGGCTCTATTGCGTATTGCTGCACGCTCTACAGCTTTGGAGTGGAACTTGTGCCCATTCCAGAAGATTGCTTTCCTTAAGACGAGAAAAGGATTTGTTCGCACGGCTATAGAGACCGGTGTGCCTCTAATCCCTGTTTTCTCTTTCGGCCAGGTATTTTTTTTTTTTTGGAAAGATCAAGTTTACACCGATGTTCTTCTGGGGAGTTTTGGGATGCTACATCTCATAACATGGACAGGGCTCCTTTCCACACATCACACACGAATGCCTTCTTTCTTCATCATGAGGAGAGCTGCCACTGTTCCCCTAACTCCTATGCCTCGTCGGCTTCCATTGCATGTGGTTGTGGGTAGACCAATTGAGGTTAAGCAAAATTCACAACCCACAGCAGAAGAGGTGAATGAAGTGCACAGTCAGTTTGTGGGGGCATTGCAAGATCTGTTCGAGAGGCACAAAGCAAGGGTTGGGCACGCTGATCGTGAGCTGAAAATCATTTGA
(a)配列の特徴:
●長さ:1209
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)である。
●長さ:1209
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)である。
>配列番号41
MoDGAT2(Maole_015949) アミノ酸配列
MAETEVRESPLTAAPAPEVTVIESPRVPLLHSVLATALWIGCIHLFFAVMFTATFLLPLSKSIAVFALLLVLIVVPVEADSKFGMKVRRGNNHHDNEGDDEEFSNIHGWVVKKMVVVYCHSVTMPELEVTMLPSNGSVLSFTVFALEPHSVLPVGVISLMHLSNAVPLPKTRVLASSAVFRTPFLRHIWTWMGLAAVTRKNFISLLAAGYSCAIIPGGTRETLLMVQDHEVYLLKLSVALLRIAARSTALEWNLCPFQKIAFLKTRKGFVRTAIETGVPLIPVFSFGQVFFFFWKDQVYTDVLLGSFGMLHLITWTGLLSTHHTRMPSFFIMRRAATVPLTPMPRRLPLHVVVGRPIEVKQNSQPTAEEVNEVHSQFVGALQDLFERHKARVGHADRELKII
MoDGAT2(Maole_015949) アミノ酸配列
MAETEVRESPLTAAPAPEVTVIESPRVPLLHSVLATALWIGCIHLFFAVMFTATFLLPLSKSIAVFALLLVLIVVPVEADSKFGMKVRRGNNHHDNEGDDEEFSNIHGWVVKKMVVVYCHSVTMPELEVTMLPSNGSVLSFTVFALEPHSVLPVGVISLMHLSNAVPLPKTRVLASSAVFRTPFLRHIWTWMGLAAVTRKNFISLLAAGYSCAIIPGGTRETLLMVQDHEVYLLKLSVALLRIAARSTALEWNLCPFQKIAFLKTRKGFVRTAIETGVPLIPVFSFGQVFFFFWKDQVYTDVLLGSFGMLHLITWTGLLSTHHTRMPSFFIMRRAATVPLTPMPRRLPLHVVVGRPIEVKQNSQPTAEEVNEVHSQFVGALQDLFERHKARVGHADRELKII
(a)配列の特徴:
●長さ:402
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該アミノ酸配列がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)のアミノ酸配列である。
●長さ:402
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該アミノ酸配列がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)のアミノ酸配列である。
>配列番号42
MoGPAT(Maole_006088) 遺伝子配列
ATGGACTTTGTACCCGACATCTCCGCCATCAAGACCGACAAGATTAAAATTGACAAGGAAACCACCGACATGCTTACCGCTCGGCATGACGGATCTTCTGAAGTTAGGGAGGACGAGTTGGTGGCTGCGCCAGTGCCAACTTCTCCGTTCGGTTGTTGGGCCGGCGGACCCGGTAGGAGCATCAACCGTCGCACAAATCAAATACCTCTCGAACCTTGCAGAGACATCTCAGTTCATAAACTAATCGAACCGATGTGCTCAAAAAGACTAGGGAGTGATTTCTCCGACCAGTTAGCGTCACCTTGTGTGTCTCATTCGTGGTTGCCGGCGACGACGAAGTGCGATCATGTGCACTGCCTGTGCATGGAACGTGCCTGCTGCTGGAATTGGTCCTCTGATGATGTGCTTTCAGCTGCTGGCGGATCAAGTCGTGTTGAATCTAATAGTGTTCATGGCGTATTAAGAAAACTCCAGCAATGGTCTGCAATGAACAGTGCTGCCGATGGGGGGACAAAGGGGCTGGAATTTGACAGAAAAGACACGAAGAACAAGAATGTGATGAAAGAGAGTACAGTGACCACTCCAAAGACCTTGAGGGTTGCATTGAAATGCTGCACAAGGGAAGATACTGCACCGGAGGCAAAAGAGAATATGAATTATTTCCGTGGTATAGAATGTTGTGAGGTTAAGGAGGCATATTCGAAGGCACTGCATGATTCTGTTACTGAACAATACAATGTGCTCAAATCTGCCATACATGGCAAACAAGGACTGGAGGCATCCATTCCAGATGTCTCATTATCACAACCATGGCAGTAG
MoGPAT(Maole_006088) 遺伝子配列
ATGGACTTTGTACCCGACATCTCCGCCATCAAGACCGACAAGATTAAAATTGACAAGGAAACCACCGACATGCTTACCGCTCGGCATGACGGATCTTCTGAAGTTAGGGAGGACGAGTTGGTGGCTGCGCCAGTGCCAACTTCTCCGTTCGGTTGTTGGGCCGGCGGACCCGGTAGGAGCATCAACCGTCGCACAAATCAAATACCTCTCGAACCTTGCAGAGACATCTCAGTTCATAAACTAATCGAACCGATGTGCTCAAAAAGACTAGGGAGTGATTTCTCCGACCAGTTAGCGTCACCTTGTGTGTCTCATTCGTGGTTGCCGGCGACGACGAAGTGCGATCATGTGCACTGCCTGTGCATGGAACGTGCCTGCTGCTGGAATTGGTCCTCTGATGATGTGCTTTCAGCTGCTGGCGGATCAAGTCGTGTTGAATCTAATAGTGTTCATGGCGTATTAAGAAAACTCCAGCAATGGTCTGCAATGAACAGTGCTGCCGATGGGGGGACAAAGGGGCTGGAATTTGACAGAAAAGACACGAAGAACAAGAATGTGATGAAAGAGAGTACAGTGACCACTCCAAAGACCTTGAGGGTTGCATTGAAATGCTGCACAAGGGAAGATACTGCACCGGAGGCAAAAGAGAATATGAATTATTTCCGTGGTATAGAATGTTGTGAGGTTAAGGAGGCATATTCGAAGGCACTGCATGATTCTGTTACTGAACAATACAATGTGCTCAAATCTGCCATACATGGCAAACAAGGACTGGAGGCATCCATTCCAGATGTCTCATTATCACAACCATGGCAGTAG
(a)配列の特徴:
●長さ:819
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
●長さ:819
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
>配列番号43
MoGPAT(Maole_006088) アミノ酸配列
MAETEVRESPLTAAPAPEVTVIESPRVPLLHSVLATALWIGCIHLFFAVMFTATFLLPLSKSIAVFALLLVLIVVPVEADSKFGMKVRRGNNHHDNEGDDEEFSNIHGWVVKKMVVVYCHSVTMPELEVTMLPSNGSVLSFTVFALEPHSVLPVGVISLMHLSNAVPLPKTRVLASSAVFRTPFLRHIWTWMGLAAVTRKNFISLLAAGYSCAIIPGGTRETLLMVQDHEVYLLKLSVALLRIAARSTALEWNLCPFQKIAFLKTRKGFVRTAIETGVPLIPVFSFGQVFFFFWKDQVYTDVLLGSFGMLHLITWTGLLSTHHTRMPSFFIMRRAATVPLTPMPRRLPLHVVVGRPIEVKQNSQPTAEEVNEVHSQFVGALQDLFERHKARVGHADRELKII
MoGPAT(Maole_006088) アミノ酸配列
MAETEVRESPLTAAPAPEVTVIESPRVPLLHSVLATALWIGCIHLFFAVMFTATFLLPLSKSIAVFALLLVLIVVPVEADSKFGMKVRRGNNHHDNEGDDEEFSNIHGWVVKKMVVVYCHSVTMPELEVTMLPSNGSVLSFTVFALEPHSVLPVGVISLMHLSNAVPLPKTRVLASSAVFRTPFLRHIWTWMGLAAVTRKNFISLLAAGYSCAIIPGGTRETLLMVQDHEVYLLKLSVALLRIAARSTALEWNLCPFQKIAFLKTRKGFVRTAIETGVPLIPVFSFGQVFFFFWKDQVYTDVLLGSFGMLHLITWTGLLSTHHTRMPSFFIMRRAATVPLTPMPRRLPLHVVVGRPIEVKQNSQPTAEEVNEVHSQFVGALQDLFERHKARVGHADRELKII
(a)配列の特徴:
●長さ:402
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
●長さ:402
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
>配列番号44
MoGPAT(Maole_006089) 遺伝子配列
ATGGTGCTGTGGCAGTGCGGTGGGTCTGGACTCAGAGGCAGCGATGAAGGTTTGCGATGGCACGGCGCTGCTATGCTTGCAACTCGCACGGTGCCGGCAGCGGCAGGTCTGGACAGTGGACGCCACTCGCACAATGTCCAAGGTAGCCAACCTCAAATCCAGGAGATCTGTGCGAAAGAGAGCTTGGGGAATATTGACGGTGTGAGGGGTGACTCTATTAATGATGCGGAGTGGGCTGGTAAGGCTGTGACCTATGTAGCAGGGGATCGGGTTTTAACGGATATTCTTTGCAAGCCCTTCAGCATGGGCAGAAATCTTATGTGCGTCTACTCAAAAAAGCACATGCTTGATGATCCTAAGCTTGCTGAGATGAAGAAAAAAGCAAATATACGAAGTTTGAAAGAAATGGCCATGCTTTTGAGAGGAGGGTCACAAATAGTATGGATTGCACCAAGTGGTGGTAGGGACCGTCCAGATCCCCAGACAGGAGAATGGCATCCGGCACCCTTTGATGCTTCTTCAGTGGACAATATGAGGCGGCTTGCAGAAAATGCTGGTGTTCCTGCACATATTTATCCATTAGCATTAATTTGCTACAACATTATGCCGCCTCCACCCAAGGTTGAGAAAGAGATTGGAGAGAAAAGAGTGGTATCCTTTCATGGGGTTGGACTATCCGTGATACCAGATATAAGCTATGCTGAAATTGCCGCTGCTTGTGAAAACTCTGAAGAGACTGGCGATGCCGACACAAATCAGTCACACTACCAATGTCATCGCAGGATCCCGCAGGCGGAGAAATTTGGCATCTTGGCCGCATTGCCCGATGATGAGTCAAGGGCGAAGGCCACATCTCCCAGATCTACGCCATCCAAGCGCCTTCGTTACAAGATCGCCGGCTTCTCCGCCCACCTCATGAAGCGAATCCAGAAGGGTCCCTTTCGGGGTATTTCTCTGAAGCTGCAAGAGGAAGAGCACGAGAGGCGCATGGACTTCGTACCCGACATCTCCGCCATCAAGACCGACAAGATTAAAGTCGACAAGGAAACCAGATCTACACCATCCAGGCGCCTTCGCAACAAGATCGCGACTTCTCCACCCACCTCATGA
MoGPAT(Maole_006089) 遺伝子配列
ATGGTGCTGTGGCAGTGCGGTGGGTCTGGACTCAGAGGCAGCGATGAAGGTTTGCGATGGCACGGCGCTGCTATGCTTGCAACTCGCACGGTGCCGGCAGCGGCAGGTCTGGACAGTGGACGCCACTCGCACAATGTCCAAGGTAGCCAACCTCAAATCCAGGAGATCTGTGCGAAAGAGAGCTTGGGGAATATTGACGGTGTGAGGGGTGACTCTATTAATGATGCGGAGTGGGCTGGTAAGGCTGTGACCTATGTAGCAGGGGATCGGGTTTTAACGGATATTCTTTGCAAGCCCTTCAGCATGGGCAGAAATCTTATGTGCGTCTACTCAAAAAAGCACATGCTTGATGATCCTAAGCTTGCTGAGATGAAGAAAAAAGCAAATATACGAAGTTTGAAAGAAATGGCCATGCTTTTGAGAGGAGGGTCACAAATAGTATGGATTGCACCAAGTGGTGGTAGGGACCGTCCAGATCCCCAGACAGGAGAATGGCATCCGGCACCCTTTGATGCTTCTTCAGTGGACAATATGAGGCGGCTTGCAGAAAATGCTGGTGTTCCTGCACATATTTATCCATTAGCATTAATTTGCTACAACATTATGCCGCCTCCACCCAAGGTTGAGAAAGAGATTGGAGAGAAAAGAGTGGTATCCTTTCATGGGGTTGGACTATCCGTGATACCAGATATAAGCTATGCTGAAATTGCCGCTGCTTGTGAAAACTCTGAAGAGACTGGCGATGCCGACACAAATCAGTCACACTACCAATGTCATCGCAGGATCCCGCAGGCGGAGAAATTTGGCATCTTGGCCGCATTGCCCGATGATGAGTCAAGGGCGAAGGCCACATCTCCCAGATCTACGCCATCCAAGCGCCTTCGTTACAAGATCGCCGGCTTCTCCGCCCACCTCATGAAGCGAATCCAGAAGGGTCCCTTTCGGGGTATTTCTCTGAAGCTGCAAGAGGAAGAGCACGAGAGGCGCATGGACTTCGTACCCGACATCTCCGCCATCAAGACCGACAAGATTAAAGTCGACAAGGAAACCAGATCTACACCATCCAGGCGCCTTCGCAACAAGATCGCGACTTCTCCACCCACCTCATGA
(a)配列の特徴:
●長さ:1110
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
●長さ:1110
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
>配列番号45
MoGPAT(Maole_006089) アミノ酸配列
MVLWQCGGSGLRGSDEGLRWHGAAMLATRTVPAAAGLDSGRHSHNVQGSQPQIQEICAKESLGNIDGVRGDSINDAEWAGKAVTYVAGDRVLTDILCKPFSMGRNLMCVYSKKHMLDDPKLAEMKKKANIRSLKEMAMLLRGGSQIVWIAPSGGRDRPDPQTGEWHPAPFDASSVDNMRRLAENAGVPAHIYPLALICYNIMPPPPKVEKEIGEKRVVSFHGVGLSVIPDISYAEIAAACENSEETGDADTNQSHYQCHRRIPQAEKFGILAALPDDESRAKATSPRSTPSKRLRYKIAGFSAHLMKRIQKGPFRGISLKLQEEEHERRMDFVPDISAIKTDKIKVDKETRSTPSRRLRNKIATSPPTS
MoGPAT(Maole_006089) アミノ酸配列
MVLWQCGGSGLRGSDEGLRWHGAAMLATRTVPAAAGLDSGRHSHNVQGSQPQIQEICAKESLGNIDGVRGDSINDAEWAGKAVTYVAGDRVLTDILCKPFSMGRNLMCVYSKKHMLDDPKLAEMKKKANIRSLKEMAMLLRGGSQIVWIAPSGGRDRPDPQTGEWHPAPFDASSVDNMRRLAENAGVPAHIYPLALICYNIMPPPPKVEKEIGEKRVVSFHGVGLSVIPDISYAEIAAACENSEETGDADTNQSHYQCHRRIPQAEKFGILAALPDDESRAKATSPRSTPSKRLRYKIAGFSAHLMKRIQKGPFRGISLKLQEEEHERRMDFVPDISAIKTDKIKVDKETRSTPSRRLRNKIATSPPTS
(a)配列の特徴:
●長さ:272
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
●長さ:272
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
>配列番号46
MoGPAT(Maole_006090) 遺伝子配列
ATGCAGCTAAGAATACTTTTAGATGTTTTGACTCTTCTGTTTGCAGCATTTCTTTATTTGGAATCTAATTTGGAGGTATTGTTTTCTTGTCTTGCTGGGTTTCCTGCAGAGCTGCTTTCTGGAATAAAGAAGGAAACAGAAGCTGGCAGATTGCCTTCAAATTTTGCTTCAGTTCTGGTTTTCCAAAGTGGAATTCCAGATGCTGATGAAATTATATTGTCAAACACAACTGCTTTGTTTGATCGTGTTTTACTGGATGCAGAGGACTCTTTTGTTTTCCCCCCACATCATAAAGCAATGCGAGAGCCTTTTGATTACTACATGTTTGGTCAAAATTATATCCGTCCTTTGATAGATTTTGGGAATTCATATGTTGGCAATATCAACATTTTTCATGAAATGGAAGAGAAGCTGCAGCAGGTCAAGAATCTCAATGGGATTGAGTGGGGTCAGCCATGGAGGAGTCTCCACTCTCTGCAAATAGAGAGTAAATCCTTAGATCTGCGACTGGAAAAGGTTGGGAAGGGTTTCTTTTTGGCTGGATGCTGTTTTCGGTTGCAAAGGGAAATTGTCAAGTTAAATTCTTGGATTTGGGGTTATACTCATTTGGAAAGGCTTATTCTATTTTTGTTCTATGGGGTTTTGATGGGGAGTGATGGCAACGGTTTGTTGAGATGTTGCAGCCGACGGTAA
MoGPAT(Maole_006090) 遺伝子配列
ATGCAGCTAAGAATACTTTTAGATGTTTTGACTCTTCTGTTTGCAGCATTTCTTTATTTGGAATCTAATTTGGAGGTATTGTTTTCTTGTCTTGCTGGGTTTCCTGCAGAGCTGCTTTCTGGAATAAAGAAGGAAACAGAAGCTGGCAGATTGCCTTCAAATTTTGCTTCAGTTCTGGTTTTCCAAAGTGGAATTCCAGATGCTGATGAAATTATATTGTCAAACACAACTGCTTTGTTTGATCGTGTTTTACTGGATGCAGAGGACTCTTTTGTTTTCCCCCCACATCATAAAGCAATGCGAGAGCCTTTTGATTACTACATGTTTGGTCAAAATTATATCCGTCCTTTGATAGATTTTGGGAATTCATATGTTGGCAATATCAACATTTTTCATGAAATGGAAGAGAAGCTGCAGCAGGTCAAGAATCTCAATGGGATTGAGTGGGGTCAGCCATGGAGGAGTCTCCACTCTCTGCAAATAGAGAGTAAATCCTTAGATCTGCGACTGGAAAAGGTTGGGAAGGGTTTCTTTTTGGCTGGATGCTGTTTTCGGTTGCAAAGGGAAATTGTCAAGTTAAATTCTTGGATTTGGGGTTATACTCATTTGGAAAGGCTTATTCTATTTTTGTTCTATGGGGTTTTGATGGGGAGTGATGGCAACGGTTTGTTGAGATGTTGCAGCCGACGGTAA
(a)配列の特徴:
●長さ:693
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
●長さ:693
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
>配列番号47
MoGPAT(Maole_006090) アミノ酸配列
MQLRILLDVLTLLFAAFLYLESNLEVLFSCLAGFPAELLSGIKKETEAGRLPSNFASVLVFQSGIPDADEIILSNTTALFDRVLLDAEDSFVFPPHHKAMREPFDYYMFGQNYIRPLIDFGNSYVGNINIFHEMEEKLQQVKNLNGIEWGQPWRSLHSLQIESKSLDLRLEKVGKGFFLAGCCFRLQREIVKLNSWIWGYTHLERLILFLFYGVLMGSDGNGLLRCCSRR
MoGPAT(Maole_006090) アミノ酸配列
MQLRILLDVLTLLFAAFLYLESNLEVLFSCLAGFPAELLSGIKKETEAGRLPSNFASVLVFQSGIPDADEIILSNTTALFDRVLLDAEDSFVFPPHHKAMREPFDYYMFGQNYIRPLIDFGNSYVGNINIFHEMEEKLQQVKNLNGIEWGQPWRSLHSLQIESKSLDLRLEKVGKGFFLAGCCFRLQREIVKLNSWIWGYTHLERLILFLFYGVLMGSDGNGLLRCCSRR
(a)配列の特徴:
●長さ:230
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
上記5つのエステラーゼのコドンのヤロウイア・リポリティカ(Yarrowia lipolytica)で最適化された配列は以下の通りである。
●長さ:230
●種類:アミノ酸配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:アミノ酸
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
上記5つのエステラーゼのコドンのヤロウイア・リポリティカ(Yarrowia lipolytica)で最適化された配列は以下の通りである。
>配列番号48
MoDGAT2(Maole_010035) 遺伝子配列
ATGGACGGCTCTTCTCAGATCAAGGAGCTGTCTTGCCTGGTGAAGTTCGTGGAGGAGACTGTGCGAATCGAGCACGCCTCTAATCCCAATAAGCCCGTGTACCTGGTGGGCGACTCTTTCGGCGGATGTCTGGCTCTGGCTGTGGCTGCTAGAAATCCTACTTTCGACCTGGTGCTGATCCTGGTGAACCCCGCCACTTCTTTCGGCAGATCTCAGCTGCAACCTCTGCTGCCCGTGCTGGAGGCTCTGCCTGATGGACTGCATTTCACCGTGCCCTACCTGCTGTCTTTCATCATGGGCACCTGCTCTGCCGCCCTGAAACCCTATAGAGATCCCCTGAAACTGGCCATGGTGAACATCGAGACTCGATTCCCCCCCGCCCTGGTGCTGGAACAACTTTCTGGAAATCTGACCGCCCTGCTGCCCAGACTGTCTGGACTGGCTAATATCATCCCCAAGGAAACCCTGCTGTGGAAGCTGAAGCTGCTGAAGTCTGCCGCCGCCTATGCTAATTCTCGACTGCACGCCGTGAAAGCCGAGGTGCTGGTGCTGGCTTCTGGATCTGATAACATGCTGCCCTCTAAGGACGAGGCCGAGCGACTTTCTAGATCTCTGCAAAATTGCATCGTGCGACTGTTCAAGGACAACGGCCACACCCTGCTGCTGGAGGATGGATATTCTCTGCTGACCATCATCAAGTGCACCTCTAAGTACCGATGCTCTCGAAAGCACGACTTCATCACCGACTTCCTGCCCCCCTCTATGTCTGAGTTCAAGCAGGAGCTGAACCAGCGATTCGGCCTGTTCCGAGTGGCCACTTCTCCTATTCTGTTTTCTACCCTGCCCGACGGCAAAATCGTGAAGGGCCTGGCTGGAATTCCCAATGAGGGCCCTGTGCTGCTGGTGGGCTATCATATGCTGCTGGGATGTGAGCTGGGCCCCCTGGTTGAAGCTTTTCTGAAAGAGAAAAACATCATGATCCGAGGCGTGGCCCACCCCGAAATGTTTTCTAAAAAGCACGAGGGCCCCTCTAACGAGTTCGGCCCTTTCGATCTGGTGAAGCTGTTCGGCGGACTGCCCGTGACTCCTAGAAATCTGTTTAAGCTGTTCTCTACCAAGTCCCACATCCTGCTGTACCCCGGCGGCGCTAGAGAAGCTTTACATAGAAAAGGCGAAAAGTACAAGCTGCTGTGGCCCAACCAGCCCGAGTTTGTGAGAATGGCTGCTCGATTTGGCGCCACTATCGTGCCTTTCGGAACCGTGGGAGAGGACGACATTGCCGAGGCTGAGTCTACCATGCTGGCTAAGAAAATCACCCTGCGATCTTCTGACGGCGAAACCTTCGAGGTGGACAAGATCGTGGCCCTGGAGTCTCAGATGATCAAGCACATGATCGAGGACGACTGCGCCGACAACGGCATTCCTTTACCTAATGTGACCTCTTGGATCCTGGTGAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTGAAGGCCCCCAAGATCGAGAAGCGAGGCGATGTGAATAAGGAGCTGAAGTCTTGGGACGCCGAGTTCGTGAAGATCGACTAA
MoDGAT2(Maole_010035) 遺伝子配列
ATGGACGGCTCTTCTCAGATCAAGGAGCTGTCTTGCCTGGTGAAGTTCGTGGAGGAGACTGTGCGAATCGAGCACGCCTCTAATCCCAATAAGCCCGTGTACCTGGTGGGCGACTCTTTCGGCGGATGTCTGGCTCTGGCTGTGGCTGCTAGAAATCCTACTTTCGACCTGGTGCTGATCCTGGTGAACCCCGCCACTTCTTTCGGCAGATCTCAGCTGCAACCTCTGCTGCCCGTGCTGGAGGCTCTGCCTGATGGACTGCATTTCACCGTGCCCTACCTGCTGTCTTTCATCATGGGCACCTGCTCTGCCGCCCTGAAACCCTATAGAGATCCCCTGAAACTGGCCATGGTGAACATCGAGACTCGATTCCCCCCCGCCCTGGTGCTGGAACAACTTTCTGGAAATCTGACCGCCCTGCTGCCCAGACTGTCTGGACTGGCTAATATCATCCCCAAGGAAACCCTGCTGTGGAAGCTGAAGCTGCTGAAGTCTGCCGCCGCCTATGCTAATTCTCGACTGCACGCCGTGAAAGCCGAGGTGCTGGTGCTGGCTTCTGGATCTGATAACATGCTGCCCTCTAAGGACGAGGCCGAGCGACTTTCTAGATCTCTGCAAAATTGCATCGTGCGACTGTTCAAGGACAACGGCCACACCCTGCTGCTGGAGGATGGATATTCTCTGCTGACCATCATCAAGTGCACCTCTAAGTACCGATGCTCTCGAAAGCACGACTTCATCACCGACTTCCTGCCCCCCTCTATGTCTGAGTTCAAGCAGGAGCTGAACCAGCGATTCGGCCTGTTCCGAGTGGCCACTTCTCCTATTCTGTTTTCTACCCTGCCCGACGGCAAAATCGTGAAGGGCCTGGCTGGAATTCCCAATGAGGGCCCTGTGCTGCTGGTGGGCTATCATATGCTGCTGGGATGTGAGCTGGGCCCCCTGGTTGAAGCTTTTCTGAAAGAGAAAAACATCATGATCCGAGGCGTGGCCCACCCCGAAATGTTTTCTAAAAAGCACGAGGGCCCCTCTAACGAGTTCGGCCCTTTCGATCTGGTGAAGCTGTTCGGCGGACTGCCCGTGACTCCTAGAAATCTGTTTAAGCTGTTCTCTACCAAGTCCCACATCCTGCTGTACCCCGGCGGCGCTAGAGAAGCTTTACATAGAAAAGGCGAAAAGTACAAGCTGCTGTGGCCCAACCAGCCCGAGTTTGTGAGAATGGCTGCTCGATTTGGCGCCACTATCGTGCCTTTCGGAACCGTGGGAGAGGACGACATTGCCGAGGCTGAGTCTACCATGCTGGCTAAGAAAATCACCCTGCGATCTTCTGACGGCGAAACCTTCGAGGTGGACAAGATCGTGGCCCTGGAGTCTCAGATGATCAAGCACATGATCGAGGACGACTGCGCCGACAACGGCATTCCTTTACCTAATGTGACCTCTTGGATCCTGGTGAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTGAAGGCCCCCAAGATCGAGAAGCGAGGCGATGTGAATAAGGAGCTGAAGTCTTGGGACGCCGAGTTCGTGAAGATCGACTAA
(a)配列の特徴:
●長さ:1566
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)である。
●長さ:1566
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)である。
>配列番号49
MoDGAT2(Maole_015949) 遺伝子配列
ATGGCCGAGACTGAAGTGCGAGAGTCTCCCCTGACTGCCGCCCCTGCTCCTGAGGTGACTGTGATTGAATCTCCCAGAGTGCCCCTGCTGCACTCTGTGCTTGCTACTGCTCTGTGGATCGGCTGTATTCATCTGTTTTTCGCCGTGATGTTCACCGCCACCTTCCTGCTGCCTCTGTCTAAATCTATCGCCGTGTTCGCCCTGCTGCTGGTGCTGATTGTGGTGCCCGTTGAAGCCGATTCTAAGTTCGGCATGAAGGTGCGACGAGGCAACAACCACCACGACAACGAGGGCGATGACGAGGAGTTTTCTAACATCCACGGCTGGGTGGTGAAGAAGATGGTGGTGGTGTACTGCCACTCTGTGACCATGCCCGAGCTGGAGGTTACTATGCTGCCCTCTAATGGCTCTGTGCTGTCTTTCACCGTGTTCGCCCTGGAGCCCCACTCTGTGCTGCCTGTTGGAGTTATTTCTCTGATGCACCTGTCTAACGCCGTGCCCCTGCCTAAAACTAGAGTGCTGGCTTCTTCTGCCGTGTTCCGAACCCCTTTCCTGCGACATATCTGGACCTGGATGGGCCTGGCCGCTGTTACTAGAAAAAATTTCATCTCTCTGCTGGCCGCCGGCTACTCTTGCGCTATTATTCCCGGAGGAACTCGAGAAACCCTGCTGATGGTGCAAGACCACGAGGTGTACCTGCTGAAGCTGTCTGTGGCCCTGCTGCGAATTGCCGCTAGATCTACTGCCCTGGAATGGAACCTGTGTCCCTTTCAGAAAATCGCCTTCCTGAAGACCCGAAAGGGCTTCGTGCGAACCGCCATTGAAACCGGAGTGCCCCTTATTCCTGTGTTCTCTTTCGGCCAGGTGTTCTTCTTCTTCTGGAAGGACCAGGTGTACACCGACGTGCTGCTGGGCTCTTTTGGCATGCTGCACCTGATCACCTGGACCGGCTTACTGTCTACTCACCATACCCGAATGCCCTCTTTCTTCATCATGCGACGAGCCGCCACCGTGCCCCTTACTCCCATGCCTAGAAGACTGCCTCTGCATGTGGTGGTGGGACGACCTATTGAGGTGAAACAGAACTCTCAGCCCACCGCCGAGGAAGTGAATGAGGTGCATTCTCAGTTCGTGGGCGCCCTGCAAGATCTGTTCGAGCGACATAAGGCCAGAGTGGGCCACGCCGATAGAGAACTGAAAATCATTTAA
MoDGAT2(Maole_015949) 遺伝子配列
ATGGCCGAGACTGAAGTGCGAGAGTCTCCCCTGACTGCCGCCCCTGCTCCTGAGGTGACTGTGATTGAATCTCCCAGAGTGCCCCTGCTGCACTCTGTGCTTGCTACTGCTCTGTGGATCGGCTGTATTCATCTGTTTTTCGCCGTGATGTTCACCGCCACCTTCCTGCTGCCTCTGTCTAAATCTATCGCCGTGTTCGCCCTGCTGCTGGTGCTGATTGTGGTGCCCGTTGAAGCCGATTCTAAGTTCGGCATGAAGGTGCGACGAGGCAACAACCACCACGACAACGAGGGCGATGACGAGGAGTTTTCTAACATCCACGGCTGGGTGGTGAAGAAGATGGTGGTGGTGTACTGCCACTCTGTGACCATGCCCGAGCTGGAGGTTACTATGCTGCCCTCTAATGGCTCTGTGCTGTCTTTCACCGTGTTCGCCCTGGAGCCCCACTCTGTGCTGCCTGTTGGAGTTATTTCTCTGATGCACCTGTCTAACGCCGTGCCCCTGCCTAAAACTAGAGTGCTGGCTTCTTCTGCCGTGTTCCGAACCCCTTTCCTGCGACATATCTGGACCTGGATGGGCCTGGCCGCTGTTACTAGAAAAAATTTCATCTCTCTGCTGGCCGCCGGCTACTCTTGCGCTATTATTCCCGGAGGAACTCGAGAAACCCTGCTGATGGTGCAAGACCACGAGGTGTACCTGCTGAAGCTGTCTGTGGCCCTGCTGCGAATTGCCGCTAGATCTACTGCCCTGGAATGGAACCTGTGTCCCTTTCAGAAAATCGCCTTCCTGAAGACCCGAAAGGGCTTCGTGCGAACCGCCATTGAAACCGGAGTGCCCCTTATTCCTGTGTTCTCTTTCGGCCAGGTGTTCTTCTTCTTCTGGAAGGACCAGGTGTACACCGACGTGCTGCTGGGCTCTTTTGGCATGCTGCACCTGATCACCTGGACCGGCTTACTGTCTACTCACCATACCCGAATGCCCTCTTTCTTCATCATGCGACGAGCCGCCACCGTGCCCCTTACTCCCATGCCTAGAAGACTGCCTCTGCATGTGGTGGTGGGACGACCTATTGAGGTGAAACAGAACTCTCAGCCCACCGCCGAGGAAGTGAATGAGGTGCATTCTCAGTTCGTGGGCGCCCTGCAAGATCTGTTCGAGCGACATAAGGCCAGAGTGGGCCACGCCGATAGAGAACTGAAAATCATTTAA
(a)配列の特徴:
●長さ:1209
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)である。
●長さ:1209
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT)である。
>配列番号50
MoGPAT(Maole_006088) 遺伝子配列
ATGGACTTCGTGCCCGACATCTCTGCCATCAAGACCGACAAGATCAAGATCGACAAGGAGACTACCGACATGCTGACCGCCAGACATGATGGCTCTTCTGAGGTGAGAGAAGACGAGCTGGTGGCCGCCCCTGTGCCTACTTCTCCTTTTGGATGTTGGGCTGGCGGACCCGGCAGATCTATCAACAGAAGAACTAATCAGATCCCCCTGGAGCCCTGCCGAGACATTTCTGTGCATAAACTGATCGAGCCCATGTGCTCTAAGCGACTGGGCTCTGACTTCTCTGACCAGCTGGCCTCTCCCTGCGTGTCTCACTCTTGGCTGCCTGCTACTACCAAATGCGACCATGTGCACTGCCTGTGCATGGAGCGAGCCTGTTGTTGGAATTGGTCTTCTGACGACGTGCTGTCTGCCGCCGGAGGATCTTCTAGAGTGGAATCTAACTCTGTGCACGGCGTGCTGCGAAAGCTGCAGCAATGGTCTGCCATGAACTCTGCCGCCGATGGAGGCACTAAAGGACTGGAGTTTGATCGAAAGGACACCAAGAACAAGAACGTGATGAAGGAGTCTACCGTGACCACCCCCAAGACCCTGAGAGTGGCTCTGAAATGCTGTACCCGAGAGGATACCGCCCCCGAAGCTAAAGAGAACATGAACTACTTCCGAGGCATCGAGTGCTGCGAGGTGAAGGAGGCTTATTCTAAGGCCCTGCACGACTCTGTGACCGAGCAGTATAATGTGCTGAAGTCTGCCATCCACGGCAAGCAGGGCCTGGAGGCTTCTATTCCCGATGTGTCTCTGTCTCAGCCCTGGCAGTAA
MoGPAT(Maole_006088) 遺伝子配列
ATGGACTTCGTGCCCGACATCTCTGCCATCAAGACCGACAAGATCAAGATCGACAAGGAGACTACCGACATGCTGACCGCCAGACATGATGGCTCTTCTGAGGTGAGAGAAGACGAGCTGGTGGCCGCCCCTGTGCCTACTTCTCCTTTTGGATGTTGGGCTGGCGGACCCGGCAGATCTATCAACAGAAGAACTAATCAGATCCCCCTGGAGCCCTGCCGAGACATTTCTGTGCATAAACTGATCGAGCCCATGTGCTCTAAGCGACTGGGCTCTGACTTCTCTGACCAGCTGGCCTCTCCCTGCGTGTCTCACTCTTGGCTGCCTGCTACTACCAAATGCGACCATGTGCACTGCCTGTGCATGGAGCGAGCCTGTTGTTGGAATTGGTCTTCTGACGACGTGCTGTCTGCCGCCGGAGGATCTTCTAGAGTGGAATCTAACTCTGTGCACGGCGTGCTGCGAAAGCTGCAGCAATGGTCTGCCATGAACTCTGCCGCCGATGGAGGCACTAAAGGACTGGAGTTTGATCGAAAGGACACCAAGAACAAGAACGTGATGAAGGAGTCTACCGTGACCACCCCCAAGACCCTGAGAGTGGCTCTGAAATGCTGTACCCGAGAGGATACCGCCCCCGAAGCTAAAGAGAACATGAACTACTTCCGAGGCATCGAGTGCTGCGAGGTGAAGGAGGCTTATTCTAAGGCCCTGCACGACTCTGTGACCGAGCAGTATAATGTGCTGAAGTCTGCCATCCACGGCAAGCAGGGCCTGGAGGCTTCTATTCCCGATGTGTCTCTGTCTCAGCCCTGGCAGTAA
(a)配列の特徴:
●長さ:819
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
●長さ:819
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
>配列番号51
MoGPAT(Maole_006089) 遺伝子配列
ATGGTGCTGTGGCAGTGCGGAGGATCTGGACTGAGAGGATCTGACGAAGGACTGCGATGGCACGGCGCTGCTATGTTAGCTACTAGAACTGTGCCTGCTGCTGCTGGACTGGACTCTGGAAGACATTCTCATAACGTGCAGGGCTCTCAGCCCCAGATCCAAGAGATTTGCGCCAAGGAGTCTCTGGGCAACATCGACGGCGTGCGAGGAGATTCTATTAACGACGCCGAATGGGCCGGCAAAGCCGTGACTTATGTGGCTGGCGATCGAGTGCTGACCGATATTCTGTGCAAGCCCTTCTCTATGGGCCGAAACCTGATGTGCGTGTACTCTAAGAAGCACATGCTGGACGACCCCAAGCTGGCCGAAATGAAGAAGAAGGCCAACATCCGATCTCTGAAGGAGATGGCCATGCTGCTGCGAGGCGGATCTCAAATCGTGTGGATCGCCCCCTCTGGCGGCAGAGATAGACCTGATCCTCAAACTGGAGAGTGGCACCCCGCTCCCTTTGACGCTTCTTCTGTGGACAACATGCGACGACTGGCCGAGAACGCCGGAGTTCCTGCTCATATTTATCCTCTGGCTCTGATCTGTTACAACATCATGCCCCCTCCCCCCAAGGTGGAAAAAGAGATTGGAGAGAAGCGAGTGGTGTCTTTCCACGGCGTGGGCCTTTCTGTGATTCCCGACATTTCTTACGCCGAGATCGCCGCCGCTTGTGAAAACTCTGAAGAGACTGGAGATGCCGACACCAACCAGTCTCATTATCAGTGCCACCGACGAATCCCCCAGGCTGAAAAATTTGGCATTCTGGCCGCTCTGCCTGACGATGAGTCTCGAGCTAAAGCCACCTCTCCCCGATCTACCCCTTCTAAACGACTGCGATACAAGATCGCCGGCTTCTCTGCCCACCTGATGAAGCGAATTCAGAAGGGCCCCTTCCGAGGCATTTCTCTGAAGCTGCAGGAGGAGGAGCACGAGCGACGAATGGATTTCGTGCCCGACATTTCTGCCATCAAGACCGACAAGATCAAGGTGGACAAGGAAACCCGATCTACCCCCTCTCGACGACTGCGAAATAAGATCGCCACCTCTCCCCCCACCTCTTAA
MoGPAT(Maole_006089) 遺伝子配列
ATGGTGCTGTGGCAGTGCGGAGGATCTGGACTGAGAGGATCTGACGAAGGACTGCGATGGCACGGCGCTGCTATGTTAGCTACTAGAACTGTGCCTGCTGCTGCTGGACTGGACTCTGGAAGACATTCTCATAACGTGCAGGGCTCTCAGCCCCAGATCCAAGAGATTTGCGCCAAGGAGTCTCTGGGCAACATCGACGGCGTGCGAGGAGATTCTATTAACGACGCCGAATGGGCCGGCAAAGCCGTGACTTATGTGGCTGGCGATCGAGTGCTGACCGATATTCTGTGCAAGCCCTTCTCTATGGGCCGAAACCTGATGTGCGTGTACTCTAAGAAGCACATGCTGGACGACCCCAAGCTGGCCGAAATGAAGAAGAAGGCCAACATCCGATCTCTGAAGGAGATGGCCATGCTGCTGCGAGGCGGATCTCAAATCGTGTGGATCGCCCCCTCTGGCGGCAGAGATAGACCTGATCCTCAAACTGGAGAGTGGCACCCCGCTCCCTTTGACGCTTCTTCTGTGGACAACATGCGACGACTGGCCGAGAACGCCGGAGTTCCTGCTCATATTTATCCTCTGGCTCTGATCTGTTACAACATCATGCCCCCTCCCCCCAAGGTGGAAAAAGAGATTGGAGAGAAGCGAGTGGTGTCTTTCCACGGCGTGGGCCTTTCTGTGATTCCCGACATTTCTTACGCCGAGATCGCCGCCGCTTGTGAAAACTCTGAAGAGACTGGAGATGCCGACACCAACCAGTCTCATTATCAGTGCCACCGACGAATCCCCCAGGCTGAAAAATTTGGCATTCTGGCCGCTCTGCCTGACGATGAGTCTCGAGCTAAAGCCACCTCTCCCCGATCTACCCCTTCTAAACGACTGCGATACAAGATCGCCGGCTTCTCTGCCCACCTGATGAAGCGAATTCAGAAGGGCCCCTTCCGAGGCATTTCTCTGAAGCTGCAGGAGGAGGAGCACGAGCGACGAATGGATTTCGTGCCCGACATTTCTGCCATCAAGACCGACAAGATCAAGGTGGACAAGGAAACCCGATCTACCCCCTCTCGACGACTGCGAAATAAGATCGCCACCTCTCCCCCCACCTCTTAA
(a)配列の特徴:
●長さ:1110
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
●長さ:1110
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(b)分子の種類:DNA
(c)仮定:否
(d)アンチセンス:否
(e)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
>配列番号52
MoGPAT(Maole_006089) 遺伝子配列
ATGCAGCTGCGAATCCTGCTGGACGTGCTGACCTTACTGTTTGCCGCTTTTCTGTACCTGGAGTCTAACCTGGAGGTGCTGTTCTCTTGCCTGGCCGGCTTTCCTGCTGAACTGCTGTCTGGAATTAAGAAGGAGACTGAGGCCGGCCGACTGCCCTCTAATTTTGCATCTGTGCTGGTGTTCCAGTCTGGCATCCCCGACGCTGATGAAATCATTCTGTCTAACACCACCGCCCTGTTCGACCGAGTGCTGCTTGATGCTGAAGACTCTTTCGTGTTCCCCCCCCACCACAAGGCCATGAGAGAACCTTTTGATTACTACATGTTCGGCCAGAACTACATCCGACCCCTGATCGACTTCGGCAACTCTTACGTGGGCAACATCAACATCTTCCACGAGATGGAGGAGAAGCTGCAGCAGGTGAAGAACCTGAACGGCATCGAGTGGGGCCAGCCCTGGAGATCTCTGCATTCTCTGCAGATCGAGTCTAAGTCTCTGGACCTGCGACTGGAGAAGGTGGGCAAAGGATTTTTCCTGGCCGGATGCTGTTTTCGACTGCAGCGAGAGATCGTGAAGCTGAACTCTTGGATCTGGGGCTACACCCACCTGGAGCGACTGATCCTTTTTCTGTTCTACGGCGTGCTGATGGGCTCTGACGGCAATGGACTGCTGAGATGTTGCTCTCGACGATAA
MoGPAT(Maole_006089) 遺伝子配列
ATGCAGCTGCGAATCCTGCTGGACGTGCTGACCTTACTGTTTGCCGCTTTTCTGTACCTGGAGTCTAACCTGGAGGTGCTGTTCTCTTGCCTGGCCGGCTTTCCTGCTGAACTGCTGTCTGGAATTAAGAAGGAGACTGAGGCCGGCCGACTGCCCTCTAATTTTGCATCTGTGCTGGTGTTCCAGTCTGGCATCCCCGACGCTGATGAAATCATTCTGTCTAACACCACCGCCCTGTTCGACCGAGTGCTGCTTGATGCTGAAGACTCTTTCGTGTTCCCCCCCCACCACAAGGCCATGAGAGAACCTTTTGATTACTACATGTTCGGCCAGAACTACATCCGACCCCTGATCGACTTCGGCAACTCTTACGTGGGCAACATCAACATCTTCCACGAGATGGAGGAGAAGCTGCAGCAGGTGAAGAACCTGAACGGCATCGAGTGGGGCCAGCCCTGGAGATCTCTGCATTCTCTGCAGATCGAGTCTAAGTCTCTGGACCTGCGACTGGAGAAGGTGGGCAAAGGATTTTTCCTGGCCGGATGCTGTTTTCGACTGCAGCGAGAGATCGTGAAGCTGAACTCTTGGATCTGGGGCTACACCCACCTGGAGCGACTGATCCTTTTTCTGTTCTACGGCGTGCTGATGGGCTCTGACGGCAATGGACTGCTGAGATGTTGCTCTCGACGATAA
(A)配列の特徴:
●長さ:693
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(B)分子の種類:DNA
(C)仮定:否
(D)アンチセンス:否
(E)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
●長さ:693
●種類:DNA配列
●鎖タイプ:一本鎖
●位相構造:線状
(B)分子の種類:DNA
(C)仮定:否
(D)アンチセンス:否
(E)最初の由来:マラニア・オレイフェラ
配列の特徴:当該遺伝子がコードする産物がグリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)である。
実施例3 マラニア・オレイフェラにおけるエステラーゼの合成、プラスミドの構築および酵母の形質転換
遺伝子MoDGAT2(Maole_010035)、MoDGAT2(Maole_015949)、GPAT、MoGPAT(Maole_006088)、MoGPAT(Maole_006089)、MoGPAT(Maole_006090)は無錫青蘭生物科技有限公司によってコドンを最適化して合成されたもので(最適化された遺伝子配列が順に配列番号48、49、50、51、52である)、エステラーゼ遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子を持つシャトルプラスミドを得たが、pMV-MoDGAT2(Maole_010035)-AMP、pMV- MoDGAT2(Maole_015949)-AMP、pMV-MoGPAT(Maole_006088)-AMP、pMV-MoGPAT(Maole_006089)-AMP、pMV- MoGPAT(Maole_006090)-AMPと名付けた。
遺伝子MoDGAT2(Maole_010035)、MoDGAT2(Maole_015949)、GPAT、MoGPAT(Maole_006088)、MoGPAT(Maole_006089)、MoGPAT(Maole_006090)は無錫青蘭生物科技有限公司によってコドンを最適化して合成されたもので(最適化された遺伝子配列が順に配列番号48、49、50、51、52である)、エステラーゼ遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子を持つシャトルプラスミドを得たが、pMV-MoDGAT2(Maole_010035)-AMP、pMV- MoDGAT2(Maole_015949)-AMP、pMV-MoGPAT(Maole_006088)-AMP、pMV-MoGPAT(Maole_006089)-AMP、pMV- MoGPAT(Maole_006090)-AMPと名付けた。
プラスミドベクターの構築はギブソン・アセンブリ法を利用し、すべての組み立て断片はPCR増幅法によって得られた。プラスミド骨格はpYL-PEX10-CgKCSプラスミド由来のものである(中国科学院青島生物エネルギーと過程研究所から得られた)。使用されたエステラーゼのプロモーターはTEFintroである。すべてのPCR増幅はKAPA HiFi高正確性DNAポリメラーゼを利用し、増幅系はいずれも50 μlで(2× KAPA Mix 25 ul、10 μMプライマー 1.5 ulずつ、鋳型 1 μlで、50 μlまで水を加えた)、各DNA配列を得た。増幅条件は、95℃で3分間予備変性し、98℃で20秒変性し、60~72℃で15秒アニーリングし、72℃で伸長し、伸長時間は30秒/kbで計算し、サイクル数は29~35で、72℃で10分間伸長した。
骨格およびエステラーゼ遺伝子断片をギブソンアッセンブリーした後、感受性大腸菌Trans-T1(北京全式金生物技術有限公司)を形質転換させ、さらにプライマーTEFin-PFとXPR2-PRで集落のPCRおよびシークエンシングによる検証を行った(青島けい科生物科技有限公司)後、相同組換えプラスミドpYLEX-PEX10-MoDGAT2(Maole_010035)-URA、pYLEX-PEX10-MoGPAT(Maole_006088)-URA、pYLEX-PEX10-MoGPAT(Maole_006089)-URA、pYLEX-PEX10- MoGPAT(Maole_006090)-URAを得た。前記プライマーを表1に示す。
10upと10dnで組換えプラスミドpYLEX-PEX10- MoDGAT2(Maole_010035)-URA、pYLEX-PEX10- MoGPAT(Maole_006088)-URA、pYLEX-PEX10- MoGPAT(Maole_006089)-URA、pYLEX-PEX10- MoGPAT(Maole_006090)-URAに対してPCR増幅を行って形質転換断片を得たが、すべてのPCR増幅にKAPA HiFi高正確性DNAポリメラーゼを利用し、増幅系のいずれも50 μlで(2× KAPA Mix 25 ul、10 μMプライマー 1.5 μlずつ、鋳型 1 μlで、50 μlまで水を追加した)、各DNA配列を得た。増幅条件は、95℃で3分間予備変性し、98℃で20秒変性し、60~72℃で15秒アニーリングし、72℃で伸長し、伸長時間は30秒/kbで計算し、サイクル数は29~35で、72℃で10分間伸長した。
PCRの結果をアガロースゲル電気泳動によって確認し、ゲルを切り出して形質転換断片を回収した後、LiAc形質転換法によって既に伸長酵素CgKCSを発現するヤロウイア・リポリティカPo1g-G3-CgKCSを形質転換させ、YNB-Δura培地のスクリーニングプレートに塗り、28℃で2-4日培養し、関連エステラーゼ遺伝子が導入された組換え菌株を得た。pYLEX-PEX10-MoDGAT2(Maole_010035)-URA、pYLEX-PEX10-MoDGAT2(Maole_015949)-URA、pYLEX-PEX10-MoGPAT(Maole_006088)-URA、pYLEX-PEX10-MoGPAT(Maole_006089)-URA、pYLEX-PEX10- MoGPAT(Maole_006090)-URAを形質転換させた菌株をそれぞれ、左から右へ順に、YL-35、YL-49、YL-88、YL-89、YL-90と略称する。組換え菌株の検証は診断PCR方法を使用し、スクリーニングプレートから単一集落を取り、YPDプレートに画線し、約24時間生長させ、新鮮な菌体を取り、真菌ゲノム快速抽出キット(生工生物工程股ふん有限公司)で組換え菌株のゲノムDNAを抽出し、ゲノムDNAを鋳型とし、表2に記載のプライマーで陽性クローンを検証した。PCR増幅はEasyTaq DNAポリメラーゼを利用し、増幅系はいずれも20 μlで(2× EasyTaq Mix 10 ul、10 μMプライマー 0.6 μlずつ、鋳型 1 μlで、20 μlまで水を加えた)、増幅断片はアガロースゲル電気泳動によって確認した。増幅条件は、94℃で3分間予備変性し、94℃で30秒変性し、55℃で30秒アニーリングし、72℃で伸長し、伸長時間は60秒/kbで計算し、サイクル数は36で、72℃で10分間伸長した。
スクリーニングプレートから組換え菌株を取ってYPDプレートに接種し、YL-35、YL-49、YL-88、YL-89、YL-90をそれぞれ48箇所選び、同時に対照菌株をYPDプレートに接種し、約24時間生長させた後、組換え菌株および対照菌株のゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAを鋳型とし、遺伝子が導入されたものに対してPCR増幅を行い、遺伝子の組み込みと発現を検証した。中から5株の陽性クローンを選び、それぞれYL-35-F5(CgKCSおよびMoDGAT2(Maole_010035)を共発現する)、YL-49-C6(CgKCSおよびMoDGAT2(Maole_015949)を共発現する)、YL-88-B1(CgKCSおよびMoGPAT(Maole_006088)を共発現する)、YL-90-B6(CgKCSおよびMoGPAT(Maole_006090)を共発現する)と名付け、図13に示すように、ここで、CK菌株は伸長酵素CgKCSを発現するPo1g-G3-CgKCSで、続いて振とう発酵を行い、開始菌株を対照群とした。
実施例4 マラニア・オレイフェラにおけるエステラーゼの油脂およびネルボン酸への影響
菌株および培養条件は実施例1の1.1と同様である。
振とう発酵培養の具体的な方法および工程は実施例1の1.2.5の部分と同様である。
菌株および培養条件は実施例1の1.1と同様である。
振とう発酵培養の具体的な方法および工程は実施例1の1.2.5の部分と同様である。
振とう発酵後、YL-35-F5、YL-49-C6、YL-88-B1、YL-90-B6の油脂を抽出し、YL-35-F5、YL-49-C6、YL-88-B1、YL-90-B6は対照Po1g-G3-CgKCS(CK)と比べ、いずれも明らかに向上し、それぞれ15.6%、17.2%、22.1%および18.7%向上し、結果を10に示す。ネルボン酸の全油脂における比率を合わせるとわかるように、YL-35-F5、YL-49-C6、YL-88-B1、YL-90-B6のネルボン酸生産量は対照と比べ、いずれも明らかに向上した。中でも、YL-88-B1は最も向上し、ネルボン酸が3.36 g/Lに達し、対照と比べ、28.16%向上し、結果を図11に示す。開始菌株Po1g-G3-CgKCSと比べ、YL-88-B1のオレイン酸の全油脂における比率が24.2%から28.0%へ、ネルボン酸の全油脂における比率が17.3%から18.1%へ、ネルボン酸発酵濃度が28.1%向上し、結果を図12に示す。
各文献がそれぞれ単独に引用されるように、本発明に係るすべての文献は本出願で参考として引用する。また、本発明の上記の内容を読み終わった後、当業者が本発明を各種の変動や修正をすることができるが、それらの等価の形態のものは本発明の請求の範囲に含まれることが理解されるはずである。
Claims (12)
- ネルボン酸および/または油脂を生産するための工学菌であって、前記工学菌のゲノムに遺伝子発現カセットが組み込まれており、前記の遺伝子発現カセットは3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼ遺伝子によってコードされるタンパク質を発現することを特徴とする、前記工学菌。
- 前記工学菌は酵母菌を含むことを特徴とする、請求項1に記載の工学菌。
- 前記工学菌は、ヤロウイア・リポリティカ、出芽酵母、メタノール酵母、ピキア・パストリス、ハンセヌラ酵母、クルイウェロマイセス酵母、カンジダ酵母、クリプトコッカス酵母、イサチェンキア・オリエンタリス、ロドトルラ酵母、またはこれらの組み合わせからなる群から選ばれることを特徴とする、請求項1に記載の工学菌。
- 前記3-ケトアシル-CoAシンターゼ遺伝子は、マラニア・オレイフェラ(Malania oleifera)、カルダミネ・グラエカ(Cardamine graeca)、マンシュウイタヤ(Acer truncatum)、ゴウダソウ(Lunaria annua)、シメニア・カフラ(Ximenia caffra)、トロパエオラム・スペシオサム(Tropaeolum speciosum)、ブンカンカ(Xanthoceras sorbifolia)、油菜(Brassica)、ナズナ(Capsella)由来のものであることを特徴とする、請求項1に記載の工学菌。
- 前記工学菌はヤロウイア・リポリティカ(Yarrowia lipolytica)、好ましくはヤロウイア・リポリティカ Po1g-G3-MaoleKCSまたはヤロウイア・リポリティカ YL-88-B1であることを特徴とする、請求項1に記載の工学菌。
- 前記3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子または前記エステラーゼ遺伝子はコドンが最適化された3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子またはコドンが最適化されたエステラーゼ遺伝子であることを特徴とする、請求項1に記載の工学菌。
- 前記3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子の配列は配列番号1-11のいずれかで示されることを特徴とする、請求項1に記載の工学菌。
- 前記エステラーゼ遺伝子は、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(DGAT2)、グリセロール―3―リン酸アシルトランスフェラーゼ(GPAT)酵素遺伝子、またはこれらの組み合わせからなる群から選ばれることを特徴とする、請求項1に記載の工学菌。
- 前記エステラーゼ遺伝子の配列は配列番号48、49、50、51、52のいずれかで示されることを特徴とする、請求項1に記載の工学菌。
- ネルボン酸および/または油脂を生産する方法であって、以下の工程:
(i)請求項1に記載の工学菌を培養することにより、ネルボン酸および/または油脂を含む発酵産物を得ること;ならびに
(ii)前記発酵産物からネルボン酸および/または油脂を分離すること
を含むことを特徴とする、前記方法。 - 請求項1に記載の工学菌を構築する方法であって、以下の工程:
(a)以下のエレメント:スクリーニングマーカー遺伝子、耐性遺伝子エレメント、相同組換え遺伝子断片、および標的遺伝子を有する遺伝子発現カセットを含有するベクターを構築すること、前記標的遺伝子は、3-ケトアシル-CoAシンターゼ(KCS)遺伝子および/またはエステラーゼ遺伝子である;ならびに
(b)工程(a)で得られた前記遺伝子発現カセットを含有するベクターをレシピエント菌株に導入し、レシピエントのゲノムに前記遺伝子発現カセットが組み込まれた菌株を得ること
を含むことを特徴とする、前記方法。 - 請求項1に記載の工学菌株の使用であって、発酵によってネルボン酸および/または油脂を生産する菌株として用いられることを特徴とする、前記使用。
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