JP2023537131A - Igsf8を標的化することによる自己免疫疾患および癌を治療するための組成物および方法 - Google Patents
Igsf8を標的化することによる自己免疫疾患および癌を治療するための組成物および方法 Download PDFInfo
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Abstract
本発明は、IGSF8およびその結合リガンドの発現および/または活性をモジュレートすることによって癌、および/または自己免疫疾患を処置するための方法および組成物を提供する。医薬組成物は、これらに限定されないが、ヒトIGSF8と特異的に結合し、それを必要とする対象におけるIGSF8によって媒介される免疫抑制を阻害する活性を有する抗体を含む。医薬組成物は、ヒトIGSF8に特異的に結合し、それを必要とする対象においてIGSF8媒介免疫抑制を阻害する活性を有する抗体を含み得るが、これに限定されない。
Description
本国際特許出願は、2020年8月10日に出願された国際特許出願番号PCT/CN2020/108129の優先権を主張し、全ての図面および配列を含むその内容全体は、参照により本明細書に組み込まれる。
IGSF8(Immunoglobulin Superfamily Member 8、EWI-2、CD316、および多数の他の別名としても知られている)は、免疫グロブリンタンパクスーパーファミリーのEWIサブファミリーのメンバーである613アミノ酸(または65kDa)タンパク質をコードしている。このサブファミリーは、膜貫通ドメイン、EWI(Glu-Trp-Ile)モチーフ(したがってEWIサブファミリー)、および可変数の免疫グロブリンドメインを含む。
ヒトとマウスのIGSF8タンパク質の配列は91%一致している。2つの種におけるIGSF8転写物は、試験したほとんど全ての組織で発現しているが、IGSF8の生物学的機能についてはほとんど分かっていない。IGSF8は、テトラスパニンCD81およびCD9と特異的に直接相互作用するが、他のテトラスパニンまたはインテグリンとは特異的に直接相互作用しないことが報告されており、細胞移動およびウイルス感染等の特定の細胞機能においてCD9およびCD81の役割を制御することが推測されている(Stippら、J.Biol.Chem.276(44):40545~40554、2001)。また、IGSF8は、癌転移抑制因子である、他のテトラスパニンKAI1/CD82と直接相互作用することが見出されているため、癌抑制因子としての可能性も特定されている。IGSF8は、KAI1/CD82が媒介する癌細胞の移動抑制に重要であるか、または必要である可能性が高いと推測されている(Zhangら、Cancer Res.63(10):2665~2674、2003)。IGSF8はまた、MOLT-4 T白血病細胞からインテグリンα4β1に結合することが見出されており、細胞表面上のα4β1-CD81複合体のIGSF8依存性の再編成が、インテグリン依存性の形態および運動機能に対するIGSF8効果に関係していると示唆されている(Kolesnikovaら、Blood 103(8):3013~3019、2004)。最後に、IGSF8は、ラミニン-5上のα3β1インテグリン依存性細胞機能を制御することが見出されている(Stippら、JCB 163(5):1167~1177、2003)。
例えば、抗CTLA-4抗体および抗PD-1/PD-L1抗体を使用したチェックポイントベースの免疫療法は、多くの患者で顕著な臨床効果が認められているが、これらの治療に応答しない癌患者が依然として大多数を占めている。研究者は、このようなT細胞ベースの免疫療法が、これらのいわゆる「ノンレスポンダー」に有効でない理由を理解しようとしている。
腫瘍は主要組織適合性複合体クラスI(MHC-I)分子の発現を下方制御することによって、T細胞媒介性免疫を回避することができる。癌細胞表面のMHC-I発現の部分的または完全な喪失は、特定のT細胞ベースの免疫療法に対する獲得耐性の主要な機構であることが実証されている。さらに重要なことに、抗PD-1/PD-L1またはCTLA4免疫療法に耐性を獲得した癌患者の約40%が、癌細胞上のMHC-I発現の完全な喪失を示した。これらの腫瘍は「免疫不活性」腫瘍であり、不幸なことに癌患者の全腫瘍の70%超を構成している。
MHC-I欠損腫瘍細胞は、少なくとも理論的にはT細胞による殺滅を完全に回避することができるが、自然免疫系のナチュラルキラー(NK)細胞による破壊を受ける可能性は依然として残されている。しかし、腫瘍微小環境(TME)では、まだ十分に解明されていない理由により、ほとんどのNK細胞は不活性化されており、MHC-Iを発現しない癌細胞を特異的に認識し殺滅することはできない。
一方、特定の免疫抑制受容体(例えば、NKG2A、PD-1、LAG-3、TIGIT、およびTIM-3)は、エフェクターT/NK細胞の両方に発現することが判明している。これらの標的に対するモノクローナル抗体のいくつかは、腫瘍内のNK細胞の機能枯渇を逆転させることができるため、NK細胞ベースの癌免疫療法がT細胞ベースの免疫療法の限界を補完し得ると期待されている。しかし、腫瘍微小環境においてNK細胞活性を抑制することができると特定された癌細胞上のリガンドのほとんど全てはHLAリガンドであり、これらは個人と他の関連のない個人間で極めて多様であるため、この戦略がより大きな患者集団に一般的に適用できないのではないかという疑念が生じている。一方、腫瘍微小環境においてNK細胞活性を抑制することができる癌細胞上の非HLAリガンドは、ほとんど特定されていない。
したがって、NK細胞ベースの癌免疫療法を促進するために、腫瘍微小環境におけるNK細胞媒介性の殺滅を回避するために癌細胞に乗っ取られた可能性のあるNK細胞抑制性の非HLAリガンド、およびNK細胞の抑制を遮断し得る試薬を特定する必要性が残っている。
本発明の一態様は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)単離された、もしくは組換えモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片であって、前記モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、VH CDR1、VH CDR2、およびVH CDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびにVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む軽鎖可変領域(VL)を含み、(a1)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ配列番号714、715および716のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ配列番号717、718および719のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または(a2)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ配列番号754、755および756のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ配列番号757、758および759のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または(b1)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ配列番号720、721および722のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ配列番号723、724および725のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または(b2)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ配列番号760、761および762のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ配列番号763、764および765のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または(c)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ表Dおよび表GのVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3配列のいずれかのアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ表Dおよび表GのVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3配列のいずれかのアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または(d)VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3は、それぞれ表Dおよび表Gのいずれか1つの抗体のVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3配列のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり、必要に応じて、抗体およびその抗原結合性断片は、L1抗体の同じVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3配列を有さず、L2抗体のそれら配列を有さない(例えば、抗体は、L1ではなく、L2でもない)、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
特定の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、(1)表Dのいずれか1つの抗体の、それぞれVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3配列のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3;または(2)表Gのいずれか1つの抗体の、それぞれVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3配列のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、VHおよびVLを含み、(a)VHは、(i)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVH FR配列のアミノ酸配列、(ii)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVH FR配列と、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または(iii)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVH FR配列と比較して、最大で1、2、3、4、または5個の置換、欠失、および/または付加を有するアミノ酸配列を含むVH FR1、VH FR2、VH FR3、および/またはVH FR4を含み;および/または(b)VLは、(i)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体のアミノ酸配列の対応するVL FR配列、(ii)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVL FR配列と、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または(iii)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVL FR配列と比較して、最大で1、2、3、4、または5個の置換、欠失、および/または付加を有するアミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3、および/またはVL FR4を含む。
一部の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、VHおよびVLを含み、(a1)VHは、それぞれ配列番号734、735および736のアミノ酸配列を含み;VLは、それぞれ配列番号737、738および739のアミノ酸配列を含むか;または(a2)VHは、それぞれ配列番号774、775および776のアミノ酸配列を含み;VLは、それぞれ配列番号777、778および779のアミノ酸配列を含むか;または(b1)VHは、それぞれ配列番号740、741および742のアミノ酸配列を含み;VLは、それぞれ配列番号743、744および745のアミノ酸配列を含むか;または(b2)VHは、それぞれ配列番号780、781および782のアミノ酸配列を含み;VLは、それぞれ配列番号783、784および785のアミノ酸配列を含むか;または(c)VHは、表Dおよび表GのいずれかのVH配列のアミノ酸配列を含み;VLは、表Dおよび表GのいずれかのVL配列のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、VHおよびVL配列は、それぞれ表Dおよび表Gのいずれか1つの抗体のVHおよびVL配列のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、ヒト-マウスキメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、CDRグラフト抗体、または再表面化抗体である。
一部の実施形態において、前記その抗原結合性断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、単鎖FvもしくはscFv、ジスルフィド連結されたFv、V-NARドメイン、IgNar、イントラボディ、IgGΔCH2、ミニボディ、F(ab’)3、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、単一ドメイン抗体、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2、またはscFv-Fcである。
一部の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、重鎖定常領域を含み、(a)重鎖定常領域が、野生型ヒトIgG1、ヒトIgG2、ヒトIgG3、ヒトIgG4であるか;または(b)重鎖定常領域が、抗体依存性細胞傷害(ADCC)、補体依存性細胞傷害(CDC)および/または抗体依存性細胞貪食(ADCP)に欠損があるFcドメインを有する。
一部の実施形態において、欠損Fcドメインを有する重鎖定常領域は、IgG1-L234A/L235A(IgG1-LALA)、IgG1-L234A/L235A/P329G(IgG1-LALA-PG)、IgG1-N297A/Q/G(IgG1-NA)、IgG1-L235A/G237A/E318A(IgG1-AAA)、IgG1-G236R/L328R(IgG1-RR)、IgG1-S298G/T299A(IgG1-GA)、IgG1-L234F/L235E/P331S(IgG1-FES)、IgG1-L234F/L235E/D265A(IgG1-FEA)、IgG4-L234A/L235A(IgG4-LALA)、IgG4-S228P/L235E(IgG4-PE)、IgG1-E233P/L234V/L235A/G236del/S267K、IgG2-H268Q/V309L/A30S/P331S(IgG2m4)およびIgG2-V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S(IgG2c4d)からなる群から選択される。
一部の実施形態において、前記モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、約25nM未満、20nM未満、15nM未満、10nM未満、5nM未満、2nM未満、または1nM未満のKdでIGSF8と結合する。
特定の態様において、本発明は、IGSF8への結合に関して、本発明のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片と競合するモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
本発明の別の態様は、IGSF8に特異的なモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片であって、モノクローナル抗体は、(1)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つの、それぞれHCVR CDR1~CDR3と少なくとも95%(例えば、100%)同一な、またはそれにおいて最大で1、2、3、4、5、6、7、8、または9個の置換を有するHCVR CDR1~CDR3配列を含む重鎖可変領域(HCVR);および(2)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つの、それぞれLCVR CDR1~CDR3と少なくとも95%(例えば、100%)同一な、またはそれにおいて最大で1、2、3、4、5、6、7、8、または9個の置換を有するLCVR CDR1~CDR3配列を含む軽鎖可変領域(LCVR)を含む、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
本発明の関連する態様は、IGSF8への結合に関して、本発明のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片と競合するモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
さらに別の関連する態様において、本発明は、IGSF8のD1 ECD(またはIg-Vセットドメイン)と特異的に結合し、KIR3DL1/2への結合、例えば、KIR3DL1/2のD2ドメイン(例えば、KIR3DL1/2のS165、I171、および/またはM186を含むエピトープ)への結合を阻害するモノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片を提供する。
本発明の別の態様は、本発明のモノクローナル抗体をコードするポリヌクレオチド、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を提供する。
関連する態様において、本発明は、ストリンジェントな条件下で、本発明のポリヌクレオチドまたはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチドを提供する。
本発明の別の態様は、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。
本発明の別の態様は、本発明のコードされたモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現させるための、本発明のポリヌクレオチド、または本発明のベクターを含む宿主細胞を提供する。
本発明の別の態様は、本発明のモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、または本発明のその抗原結合性部位/断片を生産する方法であって、(i)モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現させるのに好適な条件下で、本発明のモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現することが可能な本発明の宿主細胞を培養する工程;および(ii)本発明の発現されたモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を回収/単離/精製する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、それを必要とする対象における免疫応答をモジュレートする方法であって、IGSF8と、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体との相互作用を阻害する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、それを必要とする対象における癌を処置するための免疫療法の方法であって、IGSF8と、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体との相互作用を阻害する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量のIGSF8(免疫グロブリンスーパーファミリー8)モジュレーター(例えば、アンタゴニスト)を対象に投与する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量の、IGSF8との相互作用を阻害するKIR3DL1アンタゴニストを対象に投与する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量の、IGSF8との相互作用を阻害するKIR3DL2アンタゴニストを対象に投与する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量の、IGSF8との相互作用を阻害するKLRC1/D1アンタゴニストを対象に投与する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、対象における癌を処置するための、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体へのIGSF8の結合を阻害する、IGSF8アンタゴニスト、KIR3DL1アンタゴニスト、KIR3DL2アンタゴニスト、またはKLRC1/D1アンタゴニストの使用を提供する。
本発明の別の態様は、前記の方法の請求項のいずれかにおける使用のための、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体へのIGSF8の結合を阻害する、IGSF8アンタゴニスト、KIR3DL1アンタゴニスト、KIR3DL2アンタゴニスト、またはKLRC1/D1アンタゴニストを含む組成物を提供する。
本発明の他の態様は、好ましくはT細胞および/またはNK細胞の活性化を刺激することによる、癌を治療する方法における使用のための、IGSF8に特異的に結合する抗体を提供する。
本発明の別の態様は、癌を処置する方法における使用のための、好ましくは本明細書に記載される第2の治療剤、例えばチェックポイント阻害剤によって媒介される免疫療法剤との組合せを介して癌を処置する方法における使用のための、IGSF8と特異的に結合する抗体を提供する。
本発明の別の態様は、少なくとも1種の本発明の抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を含むデバイスまたはキットであって、必要に応じて、少なくとも1種の前記抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、もしくはその抗原結合性部位/断片、または少なくとも1種の前記抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、もしくはその抗原結合性部位/断片を含む複合体を検出するための標識を含むデバイスまたはキットを提供する。
本発明の別の態様は、IGSF8ポリペプチドと、抗体のFc領域とを含む融合タンパク質を提供する。
本発明の別の態様は、本発明の融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを提供する。
本発明の別の態様は、本発明の融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。
本発明の別の態様は、コードされた融合タンパク質を発現させるための、本発明の融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド、または本発明の融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含むベクターを含む宿主細胞を提供する。
本発明の別の態様は、本発明の融合タンパク質を生産する方法であって、(i)前記融合タンパク質を発現させるのに好適な条件下で、前記融合タンパク質を発現することが可能な本発明の宿主細胞を培養する工程;および(ii)発現された融合タンパク質を回収/単離/精製する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、初代NK細胞またはT細胞の活性を抑制する方法であって、前記初代NK細胞または前記T細胞を、本発明の融合タンパク質と接触させる工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、試料中のIGSF8ポリペプチドの存在またはレベルを検出する方法であって、試料中のIGSF8ポリペプチドを、本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片と接触させる工程を含み、前記抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片は、検出可能な標識によって標識されているか、または検出可能な標識に付着されていてもよい、方法を提供する。
本発明の別の態様は、対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害の進行をモニターするための方法であって、a)対象から得られた試料において、第1の時点で、本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用してIGSF8の第1のレベルを検出する工程;b)後続の時点で、工程a)を繰り返して、IGSF8の第2のレベルを得る工程;およびc)それぞれ工程a)およびb)で検出されたIGSF8の第1および第2のレベルを比較して、対象における障害の進行をモニターする工程を含み、第2のレベルが第1のレベルより高いことは、疾患が進行したことを示す、方法を提供する。
本発明の別の態様は、異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害を患う対象の臨床転帰を予測するための方法であって、a)本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、対象から得られた第1の試料におけるIGSF8のレベルを決定する工程;b)本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、優れた臨床転帰を有する対照対象から得られた第2の試料におけるIGSF8のレベルを決定する工程;およびc)第1および第2の試料におけるIGSF8のレベルを比較する工程を含み;第2の試料におけるIGSF8のレベルと比較して、第1の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に高いこと(例えば、>20%、>50%またはそれより高い増加)は、対象がより劣った臨床転帰を有することの指標であるか、および/または、第2の試料におけるIGSF8のレベルと比較して、第1の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に低いこと(例えば、>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、対象がより優れた臨床転帰を有することの指標である、方法を提供する。
本発明の別の態様は、対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害のための療法の有効性を評価する方法であって、a)対象に療法の少なくとも一部を提供する前に、対象から得られた第1の試料において、本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、IGSF8のレベルを決定する工程、およびb)前記療法の一部の提供に続いて、対象から得られた第2の試料において工程a)を繰り返す工程を含み、第1の試料と比べて第2の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に低いこと(>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、療法が対象における障害を阻害することに関して有効であることの指標であるか;および/または、第1の試料と比べて第2の試料における実質的に同一な、またはより高いIGSF8のレベルは、療法が対象における障害を阻害することに関して有効ではないことの指標である、方法を提供する。
本発明の別の態様は、対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害を阻害するための試験化合物の有効性を評価する方法であって、a)対象から得られた第1の試料において、本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、IGSF8のレベルを決定する工程であって、第1の試料は、ある量の試験化合物に曝露された、工程;およびb)本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、対象から得られた第2の試料において、IGSF8のレベルを決定する工程であって、第2の試料は、試験化合物に曝露されたことがない、工程を含み、第1の試料におけるIGSF8のレベルが第2の試料のレベルと比べてより有意に低いこと(>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、試験化合物の量が対象における障害を阻害することに関して有効であることの指標であるか、および/または、第1の試料におけるIGSF8のレベルが第2の試料のレベルと比べて実質的に同一であることは、試験化合物の量が対象における障害を阻害することに関して有効ではないことの指標である、方法を提供する。
本発明の別の態様は、機能的なIGSF8アンタゴニストのためのスクリーニング方法であって、候補薬剤(例えば、小分子、ペプチド、アプタマー、ポリヌクレオチドなど)を、NK細胞と、IGSF8を発現し、NK細胞媒介細胞傷害に耐性である標的細胞との共培養物と接触させる工程、および標的細胞に対するNK細胞によって媒介される細胞溶解活性を促進する候補薬剤を同定し、それによって候補薬剤を、IGSF8アンタゴニストとして同定する工程を含む方法を提供する。
本発明の別の態様は、機能的なIGSF8アンタゴニストのためのスクリーニング方法であって、T細胞活性化シグナルおよびIGSF8の存在下で、候補薬剤(例えば、小分子、ペプチド、アプタマー、ポリヌクレオチドなど)を、Jurkat NFATレポーター細胞と接触させる工程を含み、レポーター細胞が、候補薬剤の非存在下で活性化されず、候補薬剤の存在下で活性化される場合、その候補薬剤は機能的なIGSF8アンタゴニストとして同定される、方法を提供する。
本発明の別の態様は、KIR3DL1/2-IGSF8の相互作用を阻害し、それによってNK細胞活性化を刺激することによる、癌を処置する方法における使用のための、KIR3DL1/2と特異的に結合する抗体を提供する。
本発明の別の態様は、癌を処置する方法における使用のための、好ましくは本明細書に記載される発明の第2の治療剤、例えばチェックポイント阻害剤によって媒介される免疫療法剤との組合せを介して癌を処置する方法における使用のための、KIR3DL1/2と特異的に結合する抗体を提供する。
本発明の別の態様は、KIR3DL1/2に特異的な、好ましくはKIR3DL1/2のECDの第2/中間/D2 Ig様ドメイン、または残基S165、I171、および/もしくはM186を含むエピトープに特異的なモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
本発明の別の態様は、KIR3DL1/2への結合に関して、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片と競合するモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
本発明の別の態様は、KIR3DL1/2の中間/D2 ECDと特異的に結合する(例えば、残基S165、I171、および/またはM186を含むエピトープと特異的に結合する)モノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片であって、KIR3DL1/2へのIGSF8の結合を阻害する、モノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片を提供する。
実施例または特許請求の範囲にのみ記載された実施形態を含む本発明のいずれか1つの実施形態は、明示的および明確に除外されない限り、または不適切でない限り、本発明の他のいずれか1つまたは複数の追加の実施形態と自由に組み合わせることができることが理解されるものとする。
1.概要
免疫グロブリンスーパーファミリーメンバー8(IGSF8)遺伝子は、単一の膜貫通(TM)ドメインを有する、免疫グロブリンたんぱく質スーパーファミリーのメンバーをコードする。IGSF8は、細胞外Ig V-セットドメインを含み、これは、CD2、CD4、CD80、およびCD86等のT細胞受容体ならびにPD1、LAG3、PDL1等の免疫チェックポイントを含む、多様なタンパク質ファミリーに見られる。ヒトでは、IGSF8は、正常ヒト組織における対照レベルと比較して、選択された癌患者の組織学的組織において過剰発現していると考えられる。
免疫グロブリンスーパーファミリーメンバー8(IGSF8)遺伝子は、単一の膜貫通(TM)ドメインを有する、免疫グロブリンたんぱく質スーパーファミリーのメンバーをコードする。IGSF8は、細胞外Ig V-セットドメインを含み、これは、CD2、CD4、CD80、およびCD86等のT細胞受容体ならびにPD1、LAG3、PDL1等の免疫チェックポイントを含む、多様なタンパク質ファミリーに見られる。ヒトでは、IGSF8は、正常ヒト組織における対照レベルと比較して、選択された癌患者の組織学的組織において過剰発現していると考えられる。
本明細書に記載の発明は、IGSF8が新規の癌治療標的であり、したがってIGSF8のアンタゴニストがそのような癌を治療するために使用できるという知見に部分的に基づいている。本明細書に示すデータは、IGSF8が癌細胞で特異的に発現し、複数種の癌、特に黒色腫、子宮頸癌、非小細胞肺癌、結腸直腸癌、および他の多くの癌で高度に発現することを示す。IGSF8は、T細胞およびNK(ナチュラルキラー)細胞と相互作用し、NK細胞およびT細胞の増殖を阻害、および/またはNK細胞およびT細胞の生存を低下させる。一方、IGSF8遺伝子をノックアウトするか、または代わりにIGSF8の機能を不活性化することは、T細胞およびNK細胞による腫瘍浸潤を改善し、インビボでの細胞溶解活性を増強させる。
より具体的には、本発明は、IGSF8が活性化NK細胞の新規阻害リガンドとしてこれまで認識されていなかった機能を有し、NK細胞媒介性の癌の免疫監視を制御する免疫チェックポイントとして機能するという知見に部分的に基づいている。IGSF8組換えタンパク質は、活性化初代NK細胞またはT細胞の増殖および細胞溶解活性を抑制する。一方、IGSF8阻害(抗IGSF8モノクローナル抗体等による)は、複数の齧歯類腫瘍学的動物モデルにおいてin vivoの有効性をもたらす。
IGSF8媒介性のNK細胞機能の阻害に部分的に基づく本明細書に記載の発明は、MHCクラスI(HLA)ベースのNK細胞阻害よりも好都合であるが、これは、一部には、MHC I分子が関連のない個体間で非常に多様である一方で、IGSF8は異なる個体間で非多型であるだけではなく、種を越えて高度に保存されている(例えば、ヒトとマウスのような実験動物との間で高度に保存されている)ため、抗ヒトIGSF8モノクローナル抗体を含む抗IGSF8剤を直接的に動物(例えばマウス)モデルで試験することができることによる。
本明細書に記載の発明は、さらに、細胞外ドメインとしてD1ドメインのみを有する切断型IGSF8はNK細胞抑制に十分であり、一方D1ドメインのみを持たない他の切断型IGSF8タンパク質はNK細胞の抑制機能を完全に喪失しているので、IGSF8がそのD1ドメイン-Ig Vセットドメインを介して初代NK細胞に特異的に結合することができるという知見に基づくものである。
さらに、本明細書に記載の発明は、IGSF8が、NK細胞の表面に発現するKIRファミリー受容体KIR3DL2(およびより少ない程度でKIR3DL1)に特異的に結合することによってNK細胞に結合するという知見に基づく。腫瘍が、MHC-Iを下方制御する、またはPD-L1リガンドを発現させてT細胞上のPD1に結合することによってT細胞機能を阻害することによってT細胞媒介性免疫を回避することができるように、腫瘍は、同様に、NK細胞上のIGSF8に対する特異的なKIR受容体(例えばKIR3DL1/2)に結合することによって、IGSF8を上方制御してNK細胞媒介性の癌に対する免疫監視を回避し得る。
本明細書に記載の発明は、さらに、IGSF8が、NK細胞の表面に発現するKLRC1/KLRD1ヘテロ二量体受容体(KLRC1またはKLRD1単量体単独ではない)に特異的に結合することによってNK細胞に結合するという知見に基づく。上述したように、腫瘍は、NK細胞上のIGSF8に特異的なKLRC1/D1ヘテロ二量体受容体に結合することにより、IGSF8を上方制御してNK細胞媒介性の癌の免疫監視を回避し得る。
IGSF8は複数の種類の腫瘍で高いレベルで発現していることが分かっているため、チェックポイント阻害剤として抗IGSF8 mAbを用いた免疫療法は、チェックポイント阻害剤治療に応答する患者のプールを増加させることができる。さらに、PD-l療法に耐性を獲得した腫瘍を有する患者は、代替免疫回避戦略としてIGSF8も発現している可能性があり、IGSF8遮断は、PD-l免疫療法に対する耐性を克服するための追加の道を提供し得る。
本明細書に記載の発明は、さらに、本明細書の動物モデルによって実証されるように、抗IGSF8療法が、部分的には腫瘍微小環境におけるT細胞およびNK細胞の両方を活性化することによって、抗PD1/PD-L1療法と相乗的に作用するという知見に基づいている。
したがって、本発明は、IGSF8(特にそのIg V-セット細胞外ドメイン)に特異的に結合するモノクローナル抗体、およびその抗原結合性断片を提供する。そのような抗体は、NK細胞表面受容体(例えば、KIR3DL1またはKIR3DL2またはKLRC1/D1)へのIGSF8の結合等のIGSF8の1つまたは複数の機能を阻害してもよく、NK細胞活性および/または生存率のIGSF8媒介性阻害を逆転または低減する。本発明はさらに、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片をコードする核酸、適当な宿主細胞で発現するためのこのような核酸コード配列を有するベクター、ならびにこのような抗体またはその抗原結合性断片を発現できる宿主細胞を培養することにより、そのような抗体またはその抗原結合性断片を産生する方法を提供する。本発明はさらに、そのような抗体を診断、予後予測、および治療の目的で使用する方法を提供する。
IGSF8に対する抗体は複数作製されており、その多くはIGSF8との結合、遮断が検証されており、IGSF8を発現している癌細胞に対するADCCおよびNKおよび/またはT細胞による癌細胞殺滅の増強を示している。さらに重要なことに、本明細書に示されたデータは、IGSF8機能およびPD-1/PD-L1免疫チェックポイントを同時に阻害することが、癌(黒色腫)のインビボマウスモデルにおいて相乗効果をもたらすことを示した。
本明細書に記載される抗体は、IGSF8に対する抗体の高い結合親和性によって部分的に特徴付けられる。本明細書に記載される抗体はさらに、エフェクター機能が低下した抗体の特定のフォーマットが、完全なエフェクター機能を有する抗体よりも優れた抗腫瘍有効性を示すという驚くべき発見に部分的に基づいている。
本発明はまた、NK細胞および/またはT細胞上のIGSF8受容体、例えばKIR3DL1またはKIR3DL2またはKLRC1/D1の1つに特異的に結合し、IGSF8がこれらの受容体の1つまたは複数に結合することによってNK/T細胞活性および/または生存率の阻害を逆転または低減するモノクローナル抗体およびその抗原結合性断片を提供する。KIR3DL2またはKIR3DL1に特異的な抗体は、IGSF8結合を担うKIR3DL1/2のD2細胞外ドメインに特異的であってもよく、KIR3DL1/2の残基S165、I171、および/またはM186へのIGSF8結合を特異的に遮断する抗体を含む。そのような抗体は、IGSF8結合等のKIR3DL1/2および/またはKLRC1/D1の1つまたは複数の機能を阻害してもよく、NK細胞活性および/または生存率のIGSF8媒介性阻害を逆転または減少させる。本発明はさらに、KIR3DL1またはKIR3DL2またはKLRC1/D1に対するそのような抗体またはその抗原結合性断片をコードする核酸、適当な宿主細胞で発現するためのそのような核酸コード配列を有するベクター、ならびにそのような抗体またはその抗原結合性断片を発現できる宿主細胞を培養することによって、そのような抗体または抗原結合性断片を産生する方法を提供する。本発明はさらに、そのような抗体を診断、予後予測、および治療の目的で使用する方法を提供する。
したがって、本明細書に記載の発明は、PD-1/PD-L1免疫チェックポイントを標的とする任意の第2の治療剤との任意の組合せで、IGSF8活性を調節(例えば阻害)/IGSF8機能に拮抗する、NK/T細胞上の受容体の1つまたは複数(例えば、KIR3DL1またはKIR3DL2またはKLRC1/D1)との相互作用を妨害/拮抗することにより、免疫応答を調節する、または癌を治療する方法および試薬を特に提供する。
本発明の詳細な態様は、以下の種々のセクションでさらに個別に説明される。しかしながら、実施例または図面にのみ記載される実施形態、および以下の1つのセクションの下でのみ記載される実施形態を含む本発明の任意の1つの実施形態は、本発明の任意の他の実施形態(複数可)と組み合わせることができることは理解されるべきである。
2.定義
用語「抗体」は、最も広義には、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、および多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)を含むがこれらに限定されない、種々の抗体構造を包含する。また、用語「抗体」は、広義には、重鎖の相補性決定領域(CDR)1、CDR2、およびCDR3と軽鎖のCDR1、CDR2、およびCDR3とを含み、抗原に結合することができる分子を指す場合もある。また、用語「抗体」は、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、およびマウス、ヒト、カニクイザル等の種々の種の抗体も含むが、これに限定されない。
用語「抗体」は、最も広義には、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、および多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)を含むがこれらに限定されない、種々の抗体構造を包含する。また、用語「抗体」は、広義には、重鎖の相補性決定領域(CDR)1、CDR2、およびCDR3と軽鎖のCDR1、CDR2、およびCDR3とを含み、抗原に結合することができる分子を指す場合もある。また、用語「抗体」は、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、およびマウス、ヒト、カニクイザル等の種々の種の抗体も含むが、これに限定されない。
ただし、より狭義には、「抗体」は、キメラモノクローナル抗体、ヒト化モノクローナル抗体、およびヒトモノクローナル抗体を含む種々のモノクローナル抗体を指す。
いくつかの実施形態において、抗体は、重鎖可変領域(HCVRまたはVH)と軽鎖可変領域(LCVRまたはVL)とを含む。いくつかの実施形態において、抗体は、重鎖可変領域と重鎖定常領域の少なくとも一部を含む少なくとも1つの重鎖(HC)を含み、および軽鎖可変領域および軽鎖定常領域の少なくとも一部を含む少なくとも1つの軽鎖(LC)を含む。いくつかの実施形態において、抗体は2つの重鎖を含み、各重鎖は重鎖可変領域と重鎖定常領域の少なくとも一部、および2つの軽鎖を含み、ここで、各軽鎖は軽鎖可変領域および軽鎖定常領域の少なくとも一部を含む。
本明細書中で使用される、一本鎖Fv(scFv)、または例えば6つのCDR(3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR)全てを含むポリペプチド一本鎖を含む他の任意の抗体は、重鎖および軽鎖を有すると見なされる。いくつかのこのような実施形態において、重鎖は、3つの重鎖CDRを含む抗体の領域であり、軽鎖は、3つの軽鎖CDRを含む抗体の領域である。
本明細書中で使用される用語「重鎖可変領域(HCVRまたはVH)」は、少なくとも、重鎖CDR1(CDR-H1またはVH-CDR1)、フレームワーク2(HFR2またはVH-FR2)、CDR2(CDR-H2またはVH-CDR2)、FR3(HFR3またはVH-FR3)、およびCDR3(CDR-H3またはVH-CDR3)を指す。また、いくつかの実施形態において、重鎖可変領域は、CDR-H1に対してN末端であるFR1(HFR1またはVH-FR1)の少なくとも一部、および/またはCDR-H3に対してC末端であるFR4(HFR4またはVH-FR4)の少なくとも一部を含む。
本明細書中で使用される用語「重鎖定常領域」は、少なくとも3つの重鎖定常ドメイン、CH1、CH2、およびCH3を含む領域を指す。非限定的な例示的重鎖定常領域は、γ、δ、およびαを含む。非限定的な例示的重鎖定常領域は、ε、およびμも含む。各重定常領域は、抗体のアイソタイプに対応する。例えば、γ定常領域を含む抗体はIgG抗体(例えば、IgGl、IgG2、IgG3、IgG4)であり、δ定常領域を含む抗体はIgD抗体であり、α定常領域を含む抗体はIgA抗体であり、ε定常領域を含む抗体はIgE抗体であり、およびμ定常領域を含む抗体はIgM抗体である。
特定のアイソタイプは、さらにサブクラスに細分化し得る。例えば、IgG抗体は、IgGl(γ1定常領域を含む)、IgG2(γ2定常領域を含む)、IgG3(γ3定常領域を含む)、およびIgG4(γ4定常領域を含む)抗体が含むが、これらに限定されず、IgA抗体は、IgAl(α1定常領域を含む)抗体、およびIgA2(α2定常領域を含む)抗体を含むが、これらに限定されず、およびIgM抗体は、IgM1(μ1定常領域を含む)抗体およびIgM2(μ2定常領域を含む)抗体を含むが、これらに限定されない。
重鎖定常領域は、分子のC末端にFc(Fragment Crystalizatble)ドメインを含む。Fc領域の主要な機能は、Fc受容体(FcR)と呼ばれる細胞表面の受容体および補体系のいくつかのタンパク質(例えば、C1q)との相互作用を介して、抗体依存性細胞傷害(ADCC)、補体依存性細胞傷害(CDC)、および抗体依存性細胞貪食(ADCP)等の免疫エフェクター機能を誘発することである。抗体のアイソタイプが異なれば、免疫エフェクター機能への関与の程度も異なっていてもよく、Fc操作戦略も免疫エフェクター機能を増強または低減するために採用されてきた。
本明細書中で使用される用語「重鎖」は、少なくとも重鎖可変領域を含み、リーダー配列を有するかまたは有さないポリペプチドを指す。いくつかの実施形態において、重鎖は重鎖定常領域の少なくとも一部を含む。本明細書中で使用される用語「全長重鎖」は、重鎖可変領域および重鎖定常領域を含み、リーダー配列を有するかまたは有さない、ならびにC末端リジンを有するかまたは有さないポリペプチドを指す。
本明細書中で使用される用語「軽鎖可変領域(LCVRまたはVL)」は、軽鎖CDR1(CDR-L1またはVL-CDR1)、フレームワーク(FR)2(LFR2またはVL-FR2)、CDR2(CDR-L2またはVL-CDR2)、FR3(LFR3またはVL-FR3)およびCDR3(CDR-L3またはVL-CDR3)を含む領域を指す。いくつかの実施形態において、軽鎖可変領域はまた、FR1(LFR1またはVL-FR1)の少なくとも一部および/またはFR4(LFR4またはVL-FR4)の少なくとも一部を含む。
本明細書中で使用される用語「軽鎖定常領域」は、軽鎖定常ドメインCLを含む領域を指す。非限定的な例示的軽鎖定常領域は、λおよびκを含む。
本明細書中で使用される「軽鎖」は、少なくとも軽鎖可変領域を含み、リーダー配列を有する、または有さないポリペプチドを指す。いくつかの実施形態において、軽鎖は軽鎖定常領域の少なくとも一部を含む。本明細書中で使用される用語「全長軽鎖」は、軽鎖可変領域および軽鎖定常領域を含み、リーダー配列を有する、または有さないポリペプチドを指す。
用語(抗体の)「抗体断片」または「抗原結合断片」は、Fv、一本鎖Fv(scFv)、Fab、Fab’、および(Fab’)2等の抗原結合が可能な断片を含むが、これらに限定されない。
参照抗体として「同一エピトープに結合する抗体」は、抗体競合アッセイによって決定し得る。これは、競合アッセイにおいて参照抗体とその抗原との結合を50%以上遮断する抗体を指し、逆に、参照抗体は、競合アッセイにおいて抗体とその抗原との結合を50%以上遮断する。同一エピトープに対して競合する抗体の文脈で使用される場合の用語「競合」は、抗体間の競合が、試験される抗体が共通の抗原への参照抗体の特異的結合を防止または阻害する、アッセイによって決定されることを意味する。
多数の種類の競合結合アッセイ、例えば、固相直接または間接ラジオイムノアッセイ(RIA)、固相直接または間接酵素イムノアッセイ(EIA)、サンドイッチ競合アッセイ(例えば、Stahliら、1983、Methods in Enzymology 9:242~253);固相直接ビオチン-アビジンEIA(例えば、Kirklandら、1986、J.Immunol.137:3614~3619);固相直接標識アッセイ;固相直接標識サンドイッチアッセイ(例えば、HarlowおよびLane、1988、Antibodies,A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Press参照);I125標識を用いる固相直接標識RIA(例えば、Morelら、1988、Molec.Immunol.25:7~15参照);固相直接ビオチン-アビジンEIA(例えば、Chungら、1990、Virology 176:546~552参照);および直接標識RIA(Moldenhauerら、1990、Scand.J.Immunol.)が使用され得る。
典型的には、このようなアッセイは、固体表面またはこれらのいずれかを有する細胞に結合した精製抗原、非標識試験抗原結合タンパク質および標識参照抗体の使用を伴う。競合阻害は、試験抗体の存在下で固体表面または細胞に結合した標識の量を決定することによって測定される。通常、試験抗体は過剰に存在する。競合アッセイによって特定される抗体(競合抗体)は、参照抗体と同一のエピトープに結合する抗体と、参照抗体によって結合するエピトープに十分に近接して立体障害が起こるように隣接エピトープに結合する抗体を含む。いくつかの実施形態において、競合抗体が過剰に存在する場合、共通抗原に対する参照抗体の特異的結合を少なくとも40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%または75%阻害することになる。いくつかの例において、結合は少なくとも80%、85%、90%、95%、または97%以上阻害される。
用語「抗原」は、抗体またはその免疫学的機能的断片等の選択的結合剤の結合を受けることが可能であり、さらに、哺乳動物において、その抗原に結合することができる抗体を産生するために使用することが可能である分子または分子の一部を指す。抗原は、抗体と相互作用することができる1つまたは複数のエピトープを有していてもよい。
用語「エピトープ」は、抗体またはその断片等の選択的結合剤の結合を受ける抗原分子の部分である。本用語は、抗体と特異的に結合することができる任意の決定基を含む。エピトープは、連続したものであってもまたは非連続のものであってもよい(例えば、ポリペプチドでは、ポリペプチド配列内で互いに連続しないが、分子の文脈内では抗原結合タンパク質の結合を受けるアミノ酸残基)。いくつかの実施形態において、エピトープは、抗体を生成するために使用されるエピトープに類似した三次元構造を含むが、抗体を生成するために使用されるそのエピトープに見られるアミノ酸残基を全く含まないか一部しか含んでいないという点で模倣的であり得る。エピトープ決定基は、アミノ酸、糖側鎖、ホスホリル基またはスルホニル基等の化学的に活性な表面基を含んでいてもよく、特定の三次元構造特性、および/または特定の電荷特性を有していてもよい。
いくつかの実施形態において、「エピトープ」は、それを決定するために使用される方法によって定義される。例えば、いくつかの実施形態において、水素-重水素交換(HDX)により決定された抗原の同じ領域に結合する場合、抗体は参照抗体と同一のエピトープに結合する。
特定の実施形態において、X線結晶構造解析により決定される抗原の同一の領域に結合する場合、抗体は参照抗体と同一のエピトープに結合する。
本明細書中で使用される「キメラ抗体」は、第1の種(例えば、マウス、ラット、カニクイザル等)由来の少なくとも1つの可変領域と、第2の種(例えば、ヒト、カニクイザル、ニワトリ等)由来の少なくとも1つの定常領域とを含む抗体を指す。いくつかの実施形態において、キメラ抗体は、少なくとも1つのマウス可変領域と少なくとも1つのヒト定常領域とを含む。いくつかの実施形態において、キメラ抗体の可変領域は全てが第1の種由来であり、キメラ抗体の定常領域は全てが第2の種由来である。
本明細書中で使用される「ヒト化抗体」は、非ヒト可変領域(例えば、マウス、ラット、カニクイザル、ニワトリ等)のフレームワーク領域の少なくとも1つのアミノ酸が、ヒト可変領域由来の対応するアミノ酸に置き換えられた抗体を指す。いくつかの実施形態において、ヒト化抗体は少なくとも1つのヒト定常領域またはその断片を含む。いくつかの実施形態において、ヒト化抗体断片は、Fab、scFv、(Fab’)2等である。
本明細書中で使用される「CDR-グラフト化抗体」は、第1の種(非ヒト)の1つまたは複数の相補性決定領域(CDR)が第2の種(ヒト)のフレームワーク領域(FR)にグラフト化されたヒト化抗体を指す。
本明細書中で使用される「ヒト抗体」は、ヒトで産生される抗体、XENOMOUSE(登録商標)等のヒト免疫グロブリン遺伝子を持つ非ヒト動物で産生される抗体、およびファージディスプレイ等のインビトロ方法を用いて選択された抗体を指し、ここで抗体レパートリーはヒト免疫グロブリン配列に基づいている。
「宿主細胞」は、ベクターまたは単離されたポリヌクレオチドのレシピエントである可能性のある細胞、またはレシピエントであったことのある細胞を指す。宿主細胞は、原核細胞または真核細胞であってよい。例示的な真核細胞は、霊長類または非霊長類動物細胞等の哺乳動物細胞;酵母等の真菌細胞;植物細胞;および昆虫細胞が挙げられる。非限定的な例示的哺乳動物細胞は、NSO細胞、PER.C6(登録商標)細胞(Crucell)、および293およびCHO細胞、ならびにその誘導体、例えばそれぞれ293-6EおよびDG44細胞を含むが、これらに限定されない。
本明細書中で使用される用語「単離された」は、それが自然界で通常見られる構成要素の少なくとも一部から分離された、またはそれが通常産生される構成要素の少なくとも一部から分離された分子を指す。例えば、ポリペプチドは、それが産生された細胞の構成要素の少なくとも一部から分離された際、「単離された」と称する。ポリペプチドが発現後、細胞から分泌される場合、ポリペプチドを含む上清を、それを産生した細胞から物理的に分離することは、ポリペプチドを「分離」することと考えられる。同様に、ポリヌクレオチドは、それが自然界に通常見られる大きなポリヌクレオチド(例えば、DNAポリヌクレオチドの場合には、ゲノムDNAまたはミトコンドリアDNA等)の一部ではない場合、または例えば、RNAポリヌクレオチドの場合には、それが産生された細胞の構成要素の少なくとも一部から分離されている場合に「分離された」と称する。したがって、宿主細胞内のベクターに含まれるDNAポリヌクレオチドは、そのポリヌクレオチドが自然界でそのベクターに見出されない限り、「分離された」と称されることがある。
本明細書において、用語「対象」および「患者」は、ヒト等の哺乳動物を指すために互換的に使用される。いくつかの実施形態において、他の非ヒト哺乳動物、例えば非限定的には、齧歯類、類人猿、ネコ科、イヌ科、ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、哺乳動物実験動物、哺乳動物農場動物、哺乳動物スポーツ動物、および哺乳動物ペットを治療する方法も提供される。いくつかの例において、「対象」または「患者」は、疾患または障害の治療を必要とする(ヒトの)対象または患者を指す。
本明細書中で使用される用語「対象」または「患者対象」という用語は、物理的、生化学的、化学的および/または生理学的特性に基づいて特徴付けおよび/または特定されるべき細胞および/または他の分子実体を含む、目的の対象から得られるまたは由来する物質を指す。例えば、「疾患試料」という句およびその変形は、特徴付けされるべき細胞および/または分子実体を含むことが予想される、または知られている対象から得られた任意の試料を指す。
「組織または細胞試料」は、対象または患者の組織から得られた類似の細胞の集合体を意味する。組織または細胞試料の供給源は、新鮮、凍結および/または保存された臓器または組織試料または生検または吸引物等の固体組織;血液または任意の血液成分;痰、脳脊髄液、羊水、腹膜液または間質液等の体液;対象の妊娠または発症における任意の時期の細胞であってよい。組織試料はまた、初代細胞または培養細胞または細胞株であってもよい。任意選択で、組織または細胞試料は、疾患組織/臓器から得られる。組織試料は、保存剤、抗凝固剤、緩衝剤、固定剤、栄養剤、または抗生物質等、自然界では組織と混在しない化合物を含み得る。
本明細書中で使用される「参照試料」、「参照細胞」、または「参照組織」は、本発明の方法または組成物が特定に使用される疾患または状態に罹患していないことが知られている、またはそう考えられている供給源から得られた試料、細胞または組織を指す。一実施形態において、参照試料、参照細胞または参照組織は、本発明の組成物または方法を用いて疾患または状態を特定しようとしている同一の対象または患者の身体の健康な部分から得られる。一実施形態において、参照試料、参照細胞または参照組織は、本発明の組成物または方法を用いて疾患または状態を同定しようとしている対象または患者ではない少なくとも1人の個人の身体の健康な部分から得られる。いくつかの実施形態において、参照試料、参照細胞または参照組織は、疾患または状態を発症する前、または疾患または状態のより早い段階で、患者から以前に得られたものである。
「障害」または「疾患」は、1つまたは複数の本発明のIGSF8アンタゴニストによる治療から利益を得ることであろう任意の状態である。これは、問題の障害に哺乳動物を素因付けるそれらの病理学的状態を含む慢性および急性の障害または疾患を含む。本明細書において治療されるべき障害の非限定的な例は、癌を含む。
本明細書において、用語「癌」は、異常に高いレベルの増殖および成長を示す細胞群を指すために使用される。癌は、良性(良性腫瘍とも呼ばれる)、前悪性、または悪性であってもよい。癌細胞は、固形癌細胞(すなわち、固形腫瘍を形成する)であっても、または白血病癌細胞であってもよい。本明細書において、用語「癌成長」は、癌のサイズまたは程度における対応する増加をもたらす、癌を含む細胞による増殖または成長を指す。
「化学療法剤」は、癌の治療に有用であり得る化合物である。化学療法剤の例としては、チオテパ、およびCYTOXAN(登録商標)シクロホスファミド等のアルキル化剤、ブスルファン、インプロスルファン、およびピポスルファン等のアルキルスルホネート、ベンゾドパ、カルボコン、メチュアドパ、およびウレドパ等のアジリジン、アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミドおよびトリメチロールメラミン等のエチレンイミンおよびメチルメラミン、アセトゲニン(特に、ブラタシンおよびブラタシノン)、カンプトテシン(合成類似体トポテカンを含む)、ブリオスタチン、カリスタチン、CC-1065(そのアドゼレシン、カルゼレシンおよびビゼレシン合成類似体を含む)、クリプトフィシン(特にクリプトフィシン1およびクリプトフィシン8)、ドラスタチン、デュオカルマイシン(合成類似体KW-2189およびCB1-TM1を含む)、エレウテロビン、パンクラチスタチン、サルコジクチン、スポンジスタチン、クロラムブシル、クロルナファジン、コロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノベンビチン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード等の窒素マスタード、カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、およびラニムスチン等のニトロソレア、エネディイン抗生物質等の抗生物質(例えば、カリケアマイシン、特にカリケアミンガモールおよびカリケアミンオメガモール(例えば、Agnew,Chem lntl.Ed.Engl、33.183~186(1994)参照)、ダイネミシンAを含むダイネミシン、クロドロネート等のビスホスホネート、エスペラミシン、ならびにネオカルジノスタチンクロモフォアおよび関連するクロモプロテインエネディイン抗生物質クロモフォア)、アクラシノミシン、アクチノマイシン、アウトラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ADRIAMYCIN(登録商標)ドキソルビシン(モルホリノ-ドキソルビシン、シアノモルホリノ-ドキソルビシン、2-ピロリノ-ドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、例えばマイトマイシンC、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン、ピューロマイシン、ケラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメックス、ジノスタチン、ゾルビシン、メトトレキサートおよび5-フルオロウラシル(5-FU)等の抗代謝物、デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート等の葉酸類似体、フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン等のプリン類似体、アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン等のピリミジン類似体、カルスステロン、プロピオン酸ドロモスタノン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン等のアンドロゲン、アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン等の抗アドレナリン、フロリン酸等の葉酸補充剤、アセグラトン、アルドホスファミドグリコシド、アミノレブリン酸、エニルウラシル、アムサクリン;ベストラブシル、ビサントレン、エダトラキサート、デフォファミン、デメコルシン、ダイアジコン、エルホミチン、酢酸エリプチニウム、エポチロン、エトグルシド、硝酸ガリウム、ヒドロキシウレア、レンチナン、ロニダイニン、メイタンシンおよびアンサミトシン等のメイタンシノイド、ミトグアゾン、ミトキサントロン、モピダンモール、ニトラエリン、ペントスタチン、フェナメット、ピラルビシン、ロソキサントロン、ポドフィリン酸、2-エチルヒドラジド、プロカルバジン、PSK(登録商標)多糖体(JHS Natural Products、Eugene、OR)、ラゾキサン、リゾキシン、シゾフィラン、スピロゲルマニウム、テヌアゾン酸、トリアジコン、2,2’,2”-トリクロロトリエチルアミン。トリコテセン(特にT-2トキシン、ベラクリンA、ロリジンAおよびアンギジン)、ウレタン、ビンデシン、ダカルバジン、マンノムスチン、ミトブロニトール、ミトラクトール、ピポブロマン。ガシトシン、アラビノサイド(「Ara-C」)、シクロホスファミド、チオテパ、タキソイド、例えば、TAXOL(登録商標)パクリタキセル(Bristol-Myers Squibb Oncology、Princeton、N.J.)、ABRAXANE(登録商標)クレモホール非含有、パクリタキセルのアルブミン工学的ナノ粒子製剤(American Pharmaceutical Partners、Schaumberg、Illinois)、およびTAXOTERE(登録商標)ドキセタキセル(Rhone-Poulenc Rorer、Antony、France)、クロランブシル、GEMZAR(登録商標)ゲムシタビン、6-チオグアニン、メルカプトプリン、メトトレキサート、シスプラチン、オキサリプラチン、およびカルボプラチン等のプラチナ類似体、ビンブラスチン、プラチナ、エトポシド(VP-16)、イホスファミド、ミトキサントロン、ビンクリスチン、NAVELBINE(登録商標)ビノレルビン、ノバントロン、テニポシド、エダトレキサート、ダウノマイシン、アミノプテリン、ゼローダ、イバンドロネート、イリノテカン(Camptosar、CPT-11)(イリノテカンと5-FUおよびロイコボリンとの治療レジメンを含む)、トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000、ジフルオロメチルオルニチン(DMFO)、レチノイン酸等のレチノイド、カペシタビン、コンブレタスタチン、ロイコボリン(LV)、オキサリプラチン治療レジメン(FOLFOX)を含むオキサリプラチン、細胞増殖を軽減するPKC-α、Raf、H-Ras、EGFRの阻害剤(例えばエルロチニブ(TARCEVA(登録商標)))およびVEGF-A、ならびに上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸または誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。
「化学療法剤」は、癌の治療に有用であり得る化合物である。化学療法剤の例としては、チオテパ、およびCYTOXAN(登録商標)シクロホスファミド等のアルキル化剤、ブスルファン、インプロスルファン、およびピポスルファン等のアルキルスルホネート、ベンゾドパ、カルボコン、メチュアドパ、およびウレドパ等のアジリジン、アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミドおよびトリメチロールメラミン等のエチレンイミンおよびメチルメラミン、アセトゲニン(特に、ブラタシンおよびブラタシノン)、カンプトテシン(合成類似体トポテカンを含む)、ブリオスタチン、カリスタチン、CC-1065(そのアドゼレシン、カルゼレシンおよびビゼレシン合成類似体を含む)、クリプトフィシン(特にクリプトフィシン1およびクリプトフィシン8)、ドラスタチン、デュオカルマイシン(合成類似体KW-2189およびCB1-TM1を含む)、エレウテロビン、パンクラチスタチン、サルコジクチン、スポンジスタチン、クロラムブシル、クロルナファジン、コロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノベンビチン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード等の窒素マスタード、カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、およびラニムスチン等のニトロソレア、エネディイン抗生物質等の抗生物質(例えば、カリケアマイシン、特にカリケアミンガモールおよびカリケアミンオメガモール(例えば、Agnew,Chem lntl.Ed.Engl、33.183~186(1994)参照)、ダイネミシンAを含むダイネミシン、クロドロネート等のビスホスホネート、エスペラミシン、ならびにネオカルジノスタチンクロモフォアおよび関連するクロモプロテインエネディイン抗生物質クロモフォア)、アクラシノミシン、アクチノマイシン、アウトラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ADRIAMYCIN(登録商標)ドキソルビシン(モルホリノ-ドキソルビシン、シアノモルホリノ-ドキソルビシン、2-ピロリノ-ドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、例えばマイトマイシンC、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン、ピューロマイシン、ケラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメックス、ジノスタチン、ゾルビシン、メトトレキサートおよび5-フルオロウラシル(5-FU)等の抗代謝物、デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート等の葉酸類似体、フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン等のプリン類似体、アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン等のピリミジン類似体、カルスステロン、プロピオン酸ドロモスタノン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン等のアンドロゲン、アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン等の抗アドレナリン、フロリン酸等の葉酸補充剤、アセグラトン、アルドホスファミドグリコシド、アミノレブリン酸、エニルウラシル、アムサクリン;ベストラブシル、ビサントレン、エダトラキサート、デフォファミン、デメコルシン、ダイアジコン、エルホミチン、酢酸エリプチニウム、エポチロン、エトグルシド、硝酸ガリウム、ヒドロキシウレア、レンチナン、ロニダイニン、メイタンシンおよびアンサミトシン等のメイタンシノイド、ミトグアゾン、ミトキサントロン、モピダンモール、ニトラエリン、ペントスタチン、フェナメット、ピラルビシン、ロソキサントロン、ポドフィリン酸、2-エチルヒドラジド、プロカルバジン、PSK(登録商標)多糖体(JHS Natural Products、Eugene、OR)、ラゾキサン、リゾキシン、シゾフィラン、スピロゲルマニウム、テヌアゾン酸、トリアジコン、2,2’,2”-トリクロロトリエチルアミン。トリコテセン(特にT-2トキシン、ベラクリンA、ロリジンAおよびアンギジン)、ウレタン、ビンデシン、ダカルバジン、マンノムスチン、ミトブロニトール、ミトラクトール、ピポブロマン。ガシトシン、アラビノサイド(「Ara-C」)、シクロホスファミド、チオテパ、タキソイド、例えば、TAXOL(登録商標)パクリタキセル(Bristol-Myers Squibb Oncology、Princeton、N.J.)、ABRAXANE(登録商標)クレモホール非含有、パクリタキセルのアルブミン工学的ナノ粒子製剤(American Pharmaceutical Partners、Schaumberg、Illinois)、およびTAXOTERE(登録商標)ドキセタキセル(Rhone-Poulenc Rorer、Antony、France)、クロランブシル、GEMZAR(登録商標)ゲムシタビン、6-チオグアニン、メルカプトプリン、メトトレキサート、シスプラチン、オキサリプラチン、およびカルボプラチン等のプラチナ類似体、ビンブラスチン、プラチナ、エトポシド(VP-16)、イホスファミド、ミトキサントロン、ビンクリスチン、NAVELBINE(登録商標)ビノレルビン、ノバントロン、テニポシド、エダトレキサート、ダウノマイシン、アミノプテリン、ゼローダ、イバンドロネート、イリノテカン(Camptosar、CPT-11)(イリノテカンと5-FUおよびロイコボリンとの治療レジメンを含む)、トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000、ジフルオロメチルオルニチン(DMFO)、レチノイン酸等のレチノイド、カペシタビン、コンブレタスタチン、ロイコボリン(LV)、オキサリプラチン治療レジメン(FOLFOX)を含むオキサリプラチン、細胞増殖を軽減するPKC-α、Raf、H-Ras、EGFRの阻害剤(例えばエルロチニブ(TARCEVA(登録商標)))およびVEGF-A、ならびに上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸または誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。
さらなる非限定的な例示的化学療法剤としては、癌に対するホルモン作用を調節または阻害する作用を有する抗ホルモン剤、例えば抗エストロゲン剤および選択的エストロゲン受容体モジュレーター(SERM)、例えば、タモキシフェン(NOLVADEX(登録商標)タモキシフェンを含む)、ラロキシフェン、ドロロキシフェン、4-ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン、ケオキシフェン、LY117018、オナプリストンおよびFARESTON(登録商標)トレミフェン、副腎におけるエストロゲン産生を調節する酵素アロマターゼを阻害するアロマターゼ阻害剤、例えば、4(5)-イミダゾール、アミノグルテチミド、MEGASE(登録商標)酢酸メゲストロール、AROMASIN(登録商標)エキセメスタン、ホルメスタニー、ファドロゾール、RIVISOR(登録商標)ボロゾール、FEMARA(登録商標)レトロゾール、およびARIMIDEX(登録商標)アナストロゾールおよび抗アンドロゲン、例えばフルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、リュープロリド、およびゴセレリンならびにトロキサシタビン(1,3-ジオキソランヌクレオシドシトシン類似体)、アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に、例えば、PKC-α、RalfおよびH-Ras等の異常細胞増殖に関与するシグナル伝達経路の遺伝子の発現を阻害するもの、VEGF発現阻害剤等のリボザイム(例えば、ANGIOZYME(登録商標)リボザイム)、およびHER2発現阻害剤、遺伝子治療ワクチン、例えば、ALLOVECTIN(登録商標)ワクチン、LEUVECTIN(登録商標)ワクチン、およびVAXID(登録商標)ワクチン等のワクチン、PROLEUKIN(登録商標)rIL-2、LURTOTECAN(登録商標)トポイソメラーゼ1阻害剤、ABARELIX(登録商標)rmRH、および上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体が挙げられる。
「抗血管新生剤」または「血管新生阻害剤」は、直接的または間接的のいずれかで血管新生、脈管形成、または望ましくない血管透過性を阻害する低分子量物質、ポリヌクレオチド(例えば、阻害RNA(RNAiまたはsiRNA)を含む)、ポリペプチド、単離されたタンパク質、組換えタンパク質、抗体またはそのコンジュゲートもしくは融合タンパク質を指す。抗血管新生剤は、血管新生因子またはその受容体の血管新生活性に結合して遮断する剤が含まれることが理解されるべきである。例えば、抗血管新生剤は、血管新生剤に対する抗体または他のアンタゴニスト、例えば、VEGF-Aに対する抗体(例えば、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標)))またはVEGF-A受容体(例えば、KDR受容体またはFlt-1受容体)に対する抗体、GLEEVEC(登録商標)(メシル酸イマチニブ)等の抗PDGFR阻害剤、VEGF受容体シグナル伝達を遮断する低分子(例えば、PTK787/ZK2284、SU6668、SUTENT(登録商標)/SUl1248(スニチニブマレート)、AMG706、または例えば国際特許出願、国際公開第2004/113304号に記載されたもの)である。抗血管新生剤には、ネイティブな血管新生阻害剤、例えば、アンジオスタチン、エンドスタチン等も含まれる。例えば、KlagsbrunおよびD’Amore(1991)Annu.Rev.Physiol.53:217~39;Streit and Detmar(2003)Oncogene 22:3172~3179(例えば、悪性黒色腫における抗血管新生療法を記載した表3);Ferrara & Alitalo(1999)Nature Medicine 5(12):1359~1364;Toniniら(2003)Oncogene 22:6549~6556(例えば、公知の抗血管新生因子を記載した表2);および、Sato(2003)Int.J.Clin.Oncol.8:200~206(例えば、臨床試験で使用される血管新生剤を記載した表1)を参照されたい。
本明細書中で使用される「増殖阻害剤」は、インビトロまたはインビボにおいて細胞(例えば、VEGFを発現している細胞)の増殖を阻害する化合物または組成物を指す。したがって、増殖阻害剤の例は、S期の細胞(例えば、VEGFを発現している細胞)の割合を著しく減少させるものであってもよい。増殖阻害剤の例としては、細胞周期の進行を(S期以外の場所で)遮断する剤、例えば、G1停止およびM期停止を誘導する剤が挙げられるが、これらに限定されない。古典的なM期遮断剤としては、ビンカス(ビンクリスチンおよびビンブラスチン)、タキサン、およびドキソルビシン、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシド、およびブレオマイシン等のトポイソメラーゼII阻害剤等が挙げられる。G1を停止させるこれらの薬剤は、S期停止、例えば、タモキシフェン、プレドニゾン、ダカルバジン、メクロレタミン、シスプラチン、メトトレキサート、5-フルオロウラシル、およびara-C等のDNAアルキル化剤にも波及している。さらなる情報は、MurakamiらによるMendelsohnおよびIsrael編、The Molecular Basis of Cancer、Chapter 1、Title「Cell cycle regulation,oncogenees,and antineoplastic drugs」(W.B.Saunders、Philadelphia、1995)例えば13頁に見出すことができる。タキサン(パクリタキセルおよびドセタキセル)は、いずれもイチイの木に由来する抗癌剤である。ドセタキセル(TAXOTERE(登録商標)、Rhone-Poulenc Rorer)はヨーロッパイチイの木に由来し、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、Bristol-Myers Squibb)の半合成類似体である。パクリタキセルおよびドセタキセルは、チューブリン二量体からの微小管の集合を促進し、脱重合を防止して微小管を安定化させ、その結果、細胞における有糸分裂を阻害する。
用語「抗新生物性組成物」は、少なくとも1つの活性治療剤を含む、癌の治療に有用な組成物を指す。治療剤の例としては、例えば、化学療法剤、増殖阻害剤、細胞障害剤、放射線療法に用いられる薬剤、抗血管新生剤、癌免疫治療剤(免疫腫瘍学薬剤とも称する)、アポトーシス剤、抗チューブリン剤、および癌を治療するための他の剤、例えば、抗HER-2抗体、抗CD20抗体、上皮成長因子受容体(EGFR)アンタゴニスト(例えばチロシンキナーゼ阻害剤)、HER1/EGFR阻害剤(例えば、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標)))、血小板由来成長因子阻害剤(例えば、GLEEVEC(登録商標)(メシル酸イマチニブ))、COX2阻害剤(例えば、セレコキシブ)、インターフェロン、CTLA4阻害剤(例えば、抗CTLA抗体イピリムマブ(YERVOY(登録商標)))、PD-1阻害剤(例えば、抗PDl抗体、BMS-936558)、PDL1阻害剤(例えば、抗PDLl抗体、MPDL3280A)、PDL2阻害剤(例えば、抗PDL2抗体)、VISTA阻害剤(例えば、抗VISTA抗体)、サイトカイン、以下の標的ErbB2、ErbB3、ErbB4、PDGFR-β、BlyS、APRIL、BCMA、PD-1、PDL1、PDL2、CTLA4、VISTA、またはVEGF受容体、TRAIL/Apo2のうちの1つまたは複数に結合するアンタゴニスト(例えば中和抗体)、および他の生物活性剤および有機化学剤等が挙げられるが、これらに限定されない。また、その組合せも本発明に含まれる。
「治療」は、治療的な治療を指し、ここで、例えば、目的は、標的となる状態または障害を遅延化させる(軽減する)ことであり、ならびに、目的は状態または障害の再発を阻害することである。「治療」は、ヒトを含む哺乳動物における疾患(本明細書では「障害」または「状態」とも呼ばれる)に対する治療薬の任意の投与または適用を網羅し、疾患またはその進行を抑制または遅らせること、その発症を阻止すること、疾患を部分的または完全に緩和すること、疾患の1つまたは複数の症状を部分的または完全に緩和すること、または、喪失、欠損または欠陥機能を回復または修復すること、または非効率な過程を刺激することを含む。用語「治療」はまた、任意の表現型特性の重症度を低減すること、および/またはその特性の発生率、程度、もしくは可能性を低減することを含む。治療を必要とする者は、既に障害を有する者ならびに障害の再発のリスクがある者、または障害の再発を防止または減速させるべき者を含む。
用語「有効量」または「治療上有効量」は、対象における疾患または障害の治療に有効な薬剤の量を指す。いくつかの実施形態において、有効量は、所望の治療または予防上の結果を得るために必要な用量および期間を指す。本発明のIGSF8アンタゴニストの治療上有効量は、個体の病状、年齢、性別、体重などの要因、および個体において所望の反応を引き出すアンタゴニストの能力に応じて変化し得る。治療上有効量は、IGSF8アンタゴニストの任意の障害性または有害な効果が、治療上有益な効果に優る量を包含する。
「予防上有効量」は、所望の予防上の結果を達成するために必要な用量および期間において有効な量を指す。必ずしもそうではないが、一般的に、予防的な用量は、疾患の前または早期段階の対象に使用されるため、予防上有効量は、治療上有効量より少ないであろう。
「薬学的に許容される担体」は、対象への投与のための「医薬組成物」を共に構成する治療剤と共に使用するための、当技術分野で慣用されている非毒性の固体、半固体、または液体の充填剤、希釈剤、カプセル化材料、製剤補助剤、または担体を指す。薬学的に許容される担体は、使用される用量および濃度においてレシピエントに対して非毒性であり、製剤の他の成分と適合性がある。薬学的に許容される担体は、使用される製剤に適切である。例えば、治療剤が経口投与される場合、担体はゲルカプセルであってもよい。治療剤が皮下投与される場合、担体は理想的には皮膚に対して刺激性がなく、注射部位反応を引き起こさないものである。
「製造品」は、少なくとも1つの試薬、例えば、疾患または障害の治療のための医薬、または本明細書に記載するバイオマーカーを特異的に検出するためのプローブを含む任意の製造品(例えば、パッケージまたは容器)またはキットである。いくつかの実施形態において、製造品またはキットは、本明細書に記載された方法を実施するためのユニットとして宣伝、配布、または販売される。
3.癌を治療する方法
本明細書に記載の発明は、ヒトおよび他の非ヒト哺乳動物、例えば癌の動物モデルを治療する方法において使用するための、IGSF8(例えば、IGSF8に特異的な単離されたまたは組換えモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)およびその受容体(例えば、KIR3DL1/2、KLRC1/D1)に対するモジュレーター、例えば、アンタゴニストを提供する。
本明細書に記載の発明は、ヒトおよび他の非ヒト哺乳動物、例えば癌の動物モデルを治療する方法において使用するための、IGSF8(例えば、IGSF8に特異的な単離されたまたは組換えモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)およびその受容体(例えば、KIR3DL1/2、KLRC1/D1)に対するモジュレーター、例えば、アンタゴニストを提供する。
一態様では、本発明は、それを必要とする対象における免疫応答を調節する方法であって、IGSF8と、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体との間の相互作用を阻害する工程を含む方法を提供する。特定の実施形態において、前記方法は、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片(本明細書に記載のもの等)を対象に投与する工程を含む。
他の態様において、本発明は、それを必要とする対象における癌を治療するための免疫療法の方法であって、IGSF8と、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体との間の相互作用を阻害する工程を含む方法を提供する。特定の実施形態において、前記方法は、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片(本明細書に記載のもの等)を対象に投与する工程を含む。
さらに別の態様において、本発明は、それを必要とする対象における癌を治療または予防する方法であって、そのような治療を必要とする対象に、治療有効量の本発明のIGSF8、KIR3DL1/2、またはKLRC1/D1のモジュレーター(例えば、抗体またはその抗原結合性部分/断片等のアンタゴニスト)を投与する工程を含む方法を提供する。
具体的には、本発明は、それを必要とする対象において癌を治療する方法であって、治療有効量のIGSF8(免疫グロブリンスーパーファミリー8)モジュレーター(例えば、アンタゴニスト)を対象に投与する工程を含む方法を提供する。
本発明はまた、それを必要とする対象において癌を治療する方法であって、IGSF8との相互作用を阻害する治療有効量のKIR3DL1アンタゴニストを対象に投与する工程を含む方法を提供する。
本発明はさらに、それを必要とする対象における癌を治療する方法であって、IGSF8との相互作用を阻害する治療有効量のKIR3DL2アンタゴニストを対象に投与する工程を含む方法を提供する。
本発明はさらに、それを必要とする対象において癌を治療する方法であって、IGSF8との相互作用を阻害する治療有効量のKLRC1/D1アンタゴニストを対象に投与する工程を含む方法を提供する。
いくつかの実施形態において、癌を治療する方法であって、治療を必要とする癌を有する対象に、有効量の本発明のIGSF8、KIR3DL1/2またはKLRC1/D1モジュレーター(例えば、アンタゴニスト、例えば抗体または抗原結合性部分/断片)を投与する工程を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態において、癌を治療するための、有効量の本発明のIGSF8、KIR3DL1/2またはKLRC1/D1モジュレーター(例えば、抗体またはその抗原結合性部分/断片等のアンタゴニスト)の使用が提供される。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗-IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)で治療され得る非限定的な例示的な癌が本明細書で提供され、癌腫、リンパ腫、胚芽腫、肉腫、および白血病が含まれる。このような癌のより特定の非限定的な例は、黒色腫、子宮頸癌、扁平上皮癌、小細胞肺癌、下垂体癌、食道癌、星細胞腫、軟組織肉腫、非小細胞肺癌、肺の腺癌、肺の扁平上皮癌、腹膜の癌、肝細胞癌、消化器癌、膵臓癌、膠芽腫、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、結腸癌、大腸癌、子宮内膜癌または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝臓癌、前立腺癌、外陰部癌、甲状腺癌、肝癌、脳癌、子宮内膜癌、精巣癌、胆管癌、胆嚢癌、胃癌、黒色腫、各種頭頸部癌が含まれる。
特定の実施形態において、本発明のIGSF8、KIR3DL1/2、またはKLRC1/D1モジュレーター(例えば、抗体または抗原結合性部分/断片等のアンタゴニスト)を用いた、本発明の方法で治療可能な癌としては癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫、および白血病が挙げられるが、これらに限定されない。このような癌のより具体的な非限定的な例としては、扁平上皮癌、小細胞肺癌、下垂体癌、食道癌、星細胞腫、軟組織肉腫、非小細胞肺癌、肺の腺癌、肺の扁平上皮癌、腹膜の癌、肝細胞癌、消化器癌、膵臓癌、膠芽腫、子宮頸癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、結腸癌、大腸癌、子宮内膜または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝臓癌、前立腺癌、外陰部癌、甲状腺癌、肝癌、脳癌、子宮内膜癌、精巣癌、胆管細胞癌、胆嚢癌、胃癌、黒色腫、および種々の頭頸部癌が挙げられる。
追加の治療可能な癌としては、黒色腫(皮膚の皮膚黒色腫を含む)、子宮頸癌、肺癌(例えば、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌)、大腸癌、リンパ腫(B細胞リンパ腫およびDLBCLを含む)、白血病(CLLおよび急性骨髄性白血病(AML)を含む)、BLCA腫瘍、乳癌、頭頸部癌腫、頭頸部扁平上皮癌、PRAD、THCA、またはUCEC、甲状腺癌、尿路癌、子宮癌、食道癌、肝臓癌、または神経節癌、腎臓癌、膵臓癌、膵管癌、卵巣癌、前立腺癌、神経膠腫、膠芽腫、神経芽腫、胸腺腫、B-CLL、およびIGSF8に対する受容体を発現する免疫細胞が浸潤した癌が挙げられる。
特定の実施形態において、治療可能な癌は、肺癌、腎臓癌、膵臓癌、大腸癌、急性骨髄性白血病(AML)、頭頸部癌腫、肝臓癌、卵巣癌、前立腺癌、または子宮癌である。
いくつかの実施形態において、肺癌は非小細胞肺癌または肺扁平上皮癌である。
いくつかの実施形態において、白血病は急性骨髄性白血病(AML)または慢性リンパ性白血病(CLL)である。
いくつかの実施形態において、乳癌は乳房浸潤癌である。
いくつかの実施形態において、卵巣癌は卵巣漿液性嚢胞腺癌である。
いくつかの実施形態において、腎臓癌は腎明細胞癌である。
いくつかの実施形態において、結腸癌は大腸腺癌である。
いくつかの実施形態において、膀胱癌は膀胱尿路上皮癌である。
いくつかの実施形態において、対象における癌細胞および/または腫瘍免疫浸潤細胞は、IGSF8を発現する。
特定の理論に束縛されることを望むものではないが、本発明の方法は、NK細胞および/または(CD8+)T細胞等の宿主自然免疫系/適応免疫系のエフェクター細胞に及ぼされる、IGSF8媒介性の宿主自然免疫系/適応免疫系の阻害を少なくとも部分的に緩和することに基づいてもよい。このような阻害は、IGSF8結合時に1つまたは複数のIGSF8受容体(例えば、KIR3DL1/2およびKLRC1/D1)と会合することによってもたらされてもよく、このような阻害は、宿主自然免疫系/適応免疫系のエフェクター(例えばNK細胞またはT細胞)上に発現するこれらの受容体へのIGSF8結合を阻害することによって少なくとも部分的に緩和し得る。したがって、本発明の方法は、IGSF8受容体(KIR3DL1/2およびKLRC1/D1等)の1つを過剰発現するこれらの標的細胞の表面上の抗体に基づく自然免疫系細胞(例えば、NK細胞)による標的細胞の従来のADCC-またはCDC-媒介性の殺滅に依存しない(しかし必ずしも排除されない)場合がある。
したがって、いくつかの実施形態において、癌は、IGSF8と、KIR3DL1/2およびKLRC1/D1等のその受容体の少なくとも1つとの間の結合を阻害することによって治療可能である。いくつかの実施形態において、癌はIGSF8を発現する。例えば、IGSF8発現を示す図6A、図6Bまたは図6Cに記載された任意の癌を参照のこと。
いくつかの実施形態において、癌は、KIR3DL1/2の発現または過剰発現によって特徴付けられるものではない。いくつかの実施形態において、癌は、セザリー症候群、CD30+皮膚リンパ腫、および形質転換菌状息肉症等の皮膚T細胞リンパ腫でない。
いくつかの実施形態において、癌は、KLRC1/D1の発現または過剰発現によって特徴付けられるものではない。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1アンタゴニストは、抗KIR3DL1抗体またはその抗原結合性部分/断片、KIR3DL1の阻害性ペプチド、KIR3DL1を標的とする核酸(アプタマー、アンチセンスポリヌクレオチド、siRNA、miRNA、shRNA等のRNAi試薬;タイプ2のCRISPR/Casエフェクター酵素のガイドRNA)、またはKIR3DL1を標的とする低分子(例えば、分子量<1000Daまたは<500Da)から選択され;必要に応じて、KIR3DL1アンタゴニストは、抗KIR3DL1抗体またはその抗原結合性部分/断片である。
いくつかの実施形態において、KIR3DL2アンタゴニストは、抗KIR3DL2抗体またはその抗原結合性部分/断片、KIR3DL2の阻害性ペプチド、KIR3DL2を標的とする核酸(アプタマー、アンチセンスポリヌクレオチド、siRNA、miRNA、shRNA等のRNAi試薬;タイプ2のCRISPR/Casエフェクター酵素のガイドRNA)、またはKIR3DL2を標的とする低分子(例えば、分子量<1000Daまたは<500Da)から選択され;必要に応じて、KIR3DL2アンタゴニストは、抗KIR3DL2抗体またはその抗原結合性部分/断片である。
いくつかの実施形態において、抗KIR3DL1/2抗体またはその抗原結合性部分/断片、KIR3DL1/2に対する阻害性ペプチド、KIR3DL1/2を標的とする核酸、またはKIR3DL1/2を標的とする低分子は、残基S165、I171、および/またはM186を含むKIR3DL1/2のエピトープに結合し、それによってKIR3DL1/2のD2ドメインへのIGSF8結合が阻害される。
いくつかの実施形態において、抗KIR3DL1/2抗体またはその抗原結合性部分/断片は、KIR3DL1/2のECDの中間/D2 Ig様ドメインに特異的に結合し、必要に応じて、抗KIR3DL1/2抗体またはその抗原結合性部分/断片は、残基S165、I171、および/またはM186を含むエピトープに特異的に結合する。
いくつかの実施形態において、KLRC1/D1アンタゴニストは、抗KLRC1/D1抗体またはその抗原結合性部分/断片、KLRC1/D1の阻害性ペプチド、KLRC1/D1を標的とする核酸(アプタマー、アンチセンスポリヌクレオチド、siRNA、miRNA、shRNA等のRNAi試薬;タイプ2のCRISPR/Casエフェクター酵素のガイドRNA)、またはKLRC1/D1を標的とする低分子(例えば、分子量<1000Daまたは<500Da)から選択され;必要に応じて、KLRC1/D1アンタゴニストは、抗KLRC1/D1抗体またはその抗原結合性部分/断片である。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部分/断片、IGSF8の阻害性ペプチド、IGSF8を標的とする核酸(アプタマー、アンチセンスポリヌクレオチド、siRNA、miRNA、shRNA等のRNAi試薬;タイプ2のCRISPR/Casエフェクター酵素のガイドRNA)、またはIGSF8を標的とする低分子(例えば、分子量<1000Daまたは<500Da)から選択され;必要に応じて、IGSF8アンタゴニストは、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部分/断片である。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片から選択される。いくつかの実施形態において、抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体、またはヒト抗体である。いくつかの実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、IGSF8の末端Ig-VセットECDまたはD1に結合する。いくつかの実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、KIR3DL1/2、例えばKIR3DL1および/またはKIR3DL2の中間/D2ドメイン、例えばKIR3DL1/2の残基S165、I171、および/またはM186を含むエピトープへのIGSF8の結合を阻害する。
いくつかの実施形態において、抗原結合性部分/断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、一本鎖FvまたはscFv、ジスルフィド結合Fv、V-NARドメイン、IgNar、イントラボディ、IgGΔCH2、ミニボディ、F(ab’)3、テトラボディ、トリアボディ、ディアボディ、単一ドメイン抗体、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2またはscFv-FCである。
いくつかの実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部分/断片は、本明細書に記載されるモノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片のいずれか1つである(IGSF8アンタゴニスト、例えば抗IGSF8抗体の項を参照のこと)。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)は、CXCL10、CXCL9、TNFα、CD8b、CD8a、Prf1、IFNγ、Gzma、Gzmb、CD274、PDCD1、PDCD1 Ig2、LAG3、Havcr2、Tigit、またはCTLA4からなる群から選択されるサイトカインまたは標的遺伝子の発現、分泌を促進するか、または他の方法で活性を増加させる。
いくつかの実施形態において、前記サイトカインまたは前記標的遺伝子の発現、分泌、またはその他の活性の増加は、腫瘍微小環境内で起こる。
いくつかの実施形態において、前記サイトカインまたは前記標的遺伝子の発現、分泌、または他の活性の増加は、免疫細胞(例えば、Tリンパ球またはNK細胞)の腫瘍微小環境への浸潤に起因する。
いくつかの実施形態において、抗IGSF8および/または抗KIR3DL1/2および/または抗KLRC1/D1抗体またはその抗原結合性部分/断片は、細胞傷害性剤にコンジュゲートされる。細胞傷害性剤は、化学療法剤、生物学的剤、毒素、および放射性同位体からなる群から選択し得る。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニスト、KIR3DL1アンタゴニスト、KIR3DL2アンタゴニスト、またはKLRC1/D1アンタゴニストは、免疫刺激性分子である。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)、KIR3DL1アンタゴニスト、KIR3DL2アンタゴニスト、またはKLRC1/D1アンタゴニストは、T細胞またはNK細胞の活性化および/または腫瘍微小環境への浸潤を刺激する。
いくつかの実施形態において、抗IGSF8および/または抗KIR3DL1/2および/または抗KLRC1/D1抗体またはその抗原結合性部分/断片は、癌の増殖細胞の数を減少させ、および/または癌の腫瘍の体積またはサイズを低下させる。
いくつかの実施形態において、抗IGSF8および/または抗KIR3DL1/2および/または抗KLRC1/D1抗体もしくはその抗原結合性部分/断片は、薬学的に許容される製剤で投与される。
いくつかの実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、F(ab’)2断片)は、第2の治療剤(参照により本明細書に組み込まれる組合せ療法の項を参照)と共に投与される。
いくつかの実施形態において、抗IGSF8、抗KIR3DL1/2、または抗KLRC1/D1抗体もしくはその抗原結合性断片は、第2の免疫チェックポイント阻害剤、例えばT細胞媒介性免疫療法を回復または促進する免疫チェックポイント阻害剤と共に投与される。
いくつかの実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1、PD-L1、PD-L2、LAG3、TIGIT、TIM3、NKG2A、CD276、VTCN1、VISRまたはHHLA2に特異的な抗体またはその抗原結合性断片である。
いくつかの実施形態において、抗IGSF8、抗KIR3DL1/2、または抗KLRC1/D1抗体もしくはその抗原結合性断片は、抗PD-1抗体もしくはその抗原結合性断片、抗PD-L1抗体もしくはその抗原結合性断片、および/または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合性断片と共に投与される。いくつかの実施形態において、抗IGSF8抗体は、ヒト抗体である。
いくつかの実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、セミプリマブ、ニボルマブ、またはペムブロリズマブ等の抗PD-1抗体である。
いくつかの実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、アベルマブ、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、KN035、またはCK-301等の抗PD-L1抗体である。
いくつかの実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、AUNP12等のPD-1/PD-L1の(非抗体)ペプチド阻害剤;CA-170等のPD-L1の低分子阻害剤、またはBMS-986189等の大環状ペプチドである。
特定の実施形態において、組合せ療法は、癌または免疫学的状態を治療するのに有効な治療用抗体をさらに含む。例示的な治療用抗体としては、以下が含まれる:3F8、8H9、アバゴボマブ、アブシキシマブ、アビツズマブ、アブレゼキマブ、アブリルマブ、アクトキスマブ、アダリムマブ、アデカツムマブ、アデュカヌマブ、アファセビクマブ、アフェリモマブ、アラシズマブペゴル、アレムツズマブ、アリロクマブ、アルツモマブペンテテート、アマツキシマブ、アミバンタマブ、アナツモマブマフェナトクス、アンデカリキシマブ、アネツマブラブタンシン、アニフロルマブ、アンルキンズマブ、アポリズマブ、アプルツマブイキサドチン、アルシツモマブ、アスクリンバクマブ、アセリズマブ、アテゾリズマブ、アチドルトクスマブ、アチヌマブ、アトロリムマブ、アベルマブ、アジンツキシズマブベドチン、バピネオズマブ、バシリキシマブ、バビツキシマブ、BCD-100、ベクツモマブ、ベゲロマブ、ベランタマブマホドチン、ベリムマブ、ベマリツズマブ、ベンラリズマブ、ベルリマトクスマブ、ベルメキマブ、ベルサンリマブ、ベルチリムマブ、ベシレソマブ、ベバシズマブ、ベズロトクスマブ、ビシロマブ、ビマグルマブ、ビメキズマブ、ビルタミマブ、ビバツズマブ、ブレセルマブ、ブリナツモマブ、ブロンツベトマブ、ブロソズマブ、ボコシズマブ、ブラジクマブ、ブレンツキシマブベドチン、ブリアキヌマブ、ブロダルマブ、ブロルシズマブ、ブロンチクツズマブ、ブロスマブ、カビラリズマブ、カミダンルマブテシリン、カムレリズマブ、カナキヌマブ、カンツズマブメルタンシン、カンツズマブラブタンシン、カプラシズマブ、カプロマブ、カルルマブ、カロツキシマブ、カツマキソマブ、cBR-ドキソルビシンイムノコンジュゲート、セデリズマブ、セミプリマブ、セルグツズマブアムナロイキン、セルトリズマブペゴル、セトレリマブ、セツキシマブ、シビサタマブ、シルムツズマブ、シタツズマブボガトクス、シクスツムマブ、クラザキズマブ、クレノリキシマブ、クリバツズマブテトラキセタン、コドリツズマブ、コフェツズマブペリドチン、コルツキシマブラブタンシン、コナツムマブ、コンシズマブ、コスフロビキシマブ、クレネズマブ、クリザンリズマブ、クロテデュマブ、CR6261、クサツズマブ、ダセツズマブ、ダクリズマブ、ダロツズマブ、ダピロリズマブペゴル、ダラツムマブ、デクトレクマブ、デムシズマブ、デニンツズマブマホドチン、デノスマブ、デパツキシズマブマホドチン、デルロツキシマブビオチン、デツモマブ、デザミズマブ、ジヌツキシマブ、ジリダブマブ、ドマグロズマブ、ドルリモマブアリトクス、ドスタルリマブ、ドロジツマブ、DS-8201、ドゥリゴツズマブ、デュピルマブ、デュルバルマブ、ドゥシギツマブ、ドゥボルツキシズマブ、エクロメキシマブ、エクリズマブ、エドバコマブ、エドレコロマブ、エファリズマブ、エファングマブ、エルデルマブ、エレザヌマブ、エルゲムツマブ、エロツズマブ、エルシリモマブ、エマクツズマブ、エマパルマブ、エミベツズマブ、エミシズマブ、エナポタマブベドチン、エナバツズマブ、エンホルツマブベドチン、エンリモマブペゴル、エノブリツズマブ、エノキズマブ、エノチクマブ、エンシツキシマブ、エピツモマブシツキセタン、エプラツズマブ、エプチネズマブ、エレヌマブ、エルリズマブ、エルツマクソマブ、エタラシズマブ、エチギリマブ、エトロリズマブ、エビナクマブ、エボロクマブ、エクスビビルマブ、ファノレソマブ、ファラリモマブ、ファリシマブ、ファーレツズマブ、ファシヌマブ、FBTA05、フェルビズマブ、フェザキヌマブ、フィバツズマブ、フィクラツズマブ、フィギツムマブ、フィリブマブ、フランボツマブ、フレチクマブ、フロテツズマブ、フォントリズマブ、フォラルマブ、フォラビルマブ、フレマネズマブ、フレソリムマブ、フロボシマブ、フルネベトマブ、フルラヌマブ、フツキシマブ、ガルカネズマブ、ガリキシマブ、ガンコタマブ、ガニツマブ、ガンテネルマブ、ガチポツズマブ、ガビリモマブ、ゲジブマブ、ゲムツズマブオゾガマイシン、ゲボキズマブ、ジルベトマブ、ジムシルマブ、ジレンツキシマブ、グレンバツムマブベドチン、ゴリムマブ、ゴミリキシマブ、ゴスラネマブ、グセルクマブ、ラナルマブ、イバリズマブ、IBI308、イブリツモマブチウキセタン、イクルクマブ、イダルシズマブ、イファボツズマブ、イゴボマブ、イラダツズマブベドチン、IMAB363、イマルマブ、イマプレリマブ、イムシロマブ、イムガツズマブ、インクラクマブ、インダツキシマブラブタンシン、インデュサツマブベドチン、イネビリズマブ、インフリキシマブ、インテツムマブ、イノリモマブ、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ、Iomab-B、イラツムマブ、イサツキシマブ、イスカリマブ、イスチラツマブ、イトリズマブ、イキセキズマブ、ケリキシマブ、ラベツズマブ、ラクノツズマブ、ラジラツズマブベドチン、ランパリズマブ、ラナデルマブ、ランドグロズマブ、ラプリツキシマブエムタンシン、ラルカビキシマブ、レブリキズマブ、レマレソマブ、レンダリズマブ、レンベルビマブ、レンジルマブ、レルデリムマブ、レロンリマブ、レソファブマブ、レトリズマブ、レキサツムマブ、リビビルマブ、リファスツズマブベドチン、リゲリズマブ、ロンカスツキシマブテシリン、ロサツキシズマブベドチン、リロトマブサテトラキセタン、リンツズマブ、リリルマブ、ロデルシズマブ、ロキベトマブ、ロルボツズマブメルタンシン、ルカツムマブ、ルリズマブペゴル、ルミリキシマブ、ルムレツズマブ、ルパルツマブ、ルパルツマブアマドチン、ルチキズマブ、マパツムマブ、マルジェツキシマブ、マルスタシマブ、マスリモマブ、マブリリムマブ、マツズマブ、メポリズマブ、メテリムマブ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミリキズマブ、ミルベツキシマブソラブタンシン、ミツモマブ、モドツキシマブ、モガムリズマブ、モナリズマブ、モロリムマブ、モスネツズマブ、モタビズマブ、モキセツモマブパスドトクス、ムロモナブ-CD3、ナコロマブタフェナトクス、ナミルマブ、ナプツモマブエスタフェナトクス、ナラツキシマブエムタンシン、ナルナツマブ、ナタリズマブ、ナビシキシズマブ、ナビブマブ、ナキシタマブ、ネバクマブ、ネシツムマブ、ネモリズマブ、NEOD001、ネレリモマブ、ネスバクマブ、ネタキマブ、ニモツズマブ、ニルセビマブ、ニボルマブ、ノフェツモマブメルペンタン、オビルトキサキシマブ、オビヌツズマブ、オカラツズマブ、オクレリズマブ、オドゥリモマブ、オファツムマブ、オララツマブ、オレクルマブ、オレンダリズマブ、オロキズマブ、オマリズマブ、オムブルタマブ、OMS721、オナルツズマブ、オンツキシズマブ、オンバチリマブ、オピシヌマブ、オポルツズマブモナトクス、オレゴボマブ、オルチクマブ、オテリキシズマブ、オチリマブ、オトレルツズマブ、オキセルマブ、オザネズマブ、オゾラリズマブ、パジバキシマブ、パリビズマブ、パムレブルマブ、パニツムマブ、パンコマブ、パノバクマブ、パルサツズマブ、パスコリズマブ、パソツキシズマブ、パテクリズマブ、パトリツマブ、PDR001、ペンブロリズマブ、ペムツモマブ、ペラキズマブ、パーツズマブ、パキセリズマブ、ピディリズマブ、ピナツズマブベドチン、ピンツモマブ、プラクルマブ、プレザルマブ、プロザリズマブ、ポガリズマブ、ポラツズマブベドチン、ポネズマブ、ポルガビキシマブ、プラシネズマブ、プレザリズマブ、プリリキシマブ、プリトキサキシマブ、プリツムマブ、PRO140、キリズマブ、ラコツモマブ、ラドレツマブ、ラフィビルマブ、ラルパンシズマブ、ラムシルマブ、ラネベトマブ、ラニビズマブ、ラキシバクマブ、ラバガリマブ、ラブリズマブ、レファネズマブ、レガビルマブ、REGN-EB、レラトリマブ、レムトルマブ、レスリズマブ、リロツムマブ、リヌクマブ、リサンキズマブ、リツキシマブ、リババズマブペゴル、ロバツムマブ、Rmab、ロレヅマブ、ロミルキマブ、ロモソズマブ、ロンタリズマブ、ロスマンツズマブ、ロバルピツズマブテシリン、ロベリズマブ、ロザノリキシズマブ、ルプリズマブ、SA237、サシツズマブゴビテカン、サマリズマブ、サムロタマブベドチン、サリルマブ、サトラリズマブ、サツモマブペンデチド、セクキヌマブ、セリクレルマブ、セリバンツマブ、セトキサキシマブ、セトルスマブ、セビルマブ、シブロツズマブ、SGN-CD19A、SHP647、シファリムマブ、シルツキシマブ、シムツズマブ、シプリズマブ、シルトラツマブベドチン、シルクマブ、ソフィツズマブベドチン、ソラネズマブ、ソリトマブ、ソネプシズマブ、ソンツズマブ、スパルタリズマブ、スタムルマブ、スレソマブ、スプタブマブ、スチムリマブ、スビズマブ、スブラトクスマブ、タバルマブ、タカツズマブテトラキセタン、タドシズマブ、タラコツズマブ、タリズマブ、タルケタマブ、タムツベトマブ、タネズマブ、タプリツモマブパプトクス、タレクスツマブ、タボリマブ、テクリスタマブ、テフィバズマブ、テリモマブアリトクス、テリソツズマブ、テリソツズマブベドチン、テナツモマブ、テネリキシマブ、テプリズマブ、テポジタマブ、テプロツムマブ、テシドルマブ、テツロマブ、テゼペルマブ、TGN1412、チブリズマブ、チルドラキズマブ、ティガツズマブ、チミグツズマブ、チモルマブ、チラゴルマブ、チラゴツマブ、チスレリズマブ、チソツマブベドチン、TNX-650、トシリズマブ、トムゾツキシマブ、トラリズマブ、トサトクスマブ、トシツモマブ、トベツマブ、トラロキヌマブ、トラスツズマブ、トラスツズマブデュオカルマジン、トラスツズマブエムタンシン、TRBS07、トレガリズマブ、トレメリムマブ、トレボグルマブ、ツコツズマブセルモロイキン、ツビルマブ、ウブリツキシマブ、ウロクプルマブ、ウレルマブ、ウルトキサズマブ、ウステキヌマブ、ウトミルマブ、バダスツキシマブタリリン、バナリマブ、バンドルツズマブベドチン、バンチクツマブ、バヌシズマブ、バパリキシマブ、バリサクマブ、バルリルマブ、バテリズマブ、ベドリズマブ、ベルツズマブ、ベパリモマブ、ベセンクマブ、ビジリズマブ、ボバリリズマブ、ボロシキシマブ、ボンレロリズマブ、ボプラテリマブ、ボルセツズマブマホドチン、ボツムマブ、ブナキズマブ、キセンツズマブ、XMAB-5574、ザルツムマブ、ザノリムマブ、ザツキシマブ、ゼノクツズマブ、ジラリムマブ、ゾルベツキシマブ、(=IMAB362、クラウジキシマブ)、ゾリモマブアリトックス、またはそれらの組合せ。
特定の実施形態において、第2の治療剤は、ADCC、ADCP、および/またはCDCを誘導するのに有効な抗体またはその抗原結合性部分/断片を含む。
いくつかの実施形態において、癌を治療するためのIGSF8アンタゴニストは、非抗体タンパク質、例えば、IGSF8とそのリガンドとの間の相互作用を阻害するIGSF8タンパク質またはその一部(例えば、Ig-VセットECD)の可溶性バージョンであってもよく、必要に応じて融合パートナーをさらに含み、(IgG1)Fc融合等の融合分子の形態である。様々な例示的なIGSF8アンタゴニストは、以下の項でより詳細に説明される。
いくつかの実施形態において、癌を治療するためのKIR3DL1/2アンタゴニストは、非抗体タンパク質、例えば、IGSF8とKIR3DL1/2との間の相互作用を阻害するKIR3DL1/2タンパク質またはその一部(例えば、ECDの第2のIgドメイン)の可溶性バージョンであってもよく、必要に応じて融合パートナーをさらに含み、(IgG1)Fc融合等の融合分子の形態である。
いくつかの実施形態において、癌を治療するためのKLRC1/D1アンタゴニストは、非抗体タンパク質、例えば、IGSF8とKLRC1/D1との間の相互作用を阻害するKLRC1/D1タンパク質またはその一部(例えば、ECD)の可溶性バージョンであってもよく、必要に応じて融合パートナーをさらに含み、(IgG1)Fc融合等の融合分子の形態である。
本明細書に記載の発明は、ヒトおよび他の非ヒト哺乳類を治療する方法において使用するためのKIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストも提供する。
いくつかの実施形態において、癌を治療または予防するための方法であって、そのような治療を必要とする対象に有効量のKIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストを投与する工程を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態において、NK細胞を活性化する方法、例えば、NK細胞媒介性免疫療法(これは、癌を治療または予防するのに有用であり得る)を活性化する方法であって、NK細胞をKIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストと接触させる、または有効量のKIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストを、そのようなNK細胞媒介性免疫療法を必要としている対象に対して投与する工程を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態において、癌を治療する方法であって、癌を有する対象にKIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストを投与する工程を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態において、癌を治療するためのKIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストの使用が提供される。
いくつかの実施形態において、癌は、IGSF8とKIR3DL1/2および/またはKLRC1/D1との間の結合を阻害することによって治療可能である。いくつかの実施形態において、癌は、IGSF8を発現する。いくつかの実施形態において、癌は、KIR3DL1/2の発現または過剰発現によって特徴付けられない。いくつかの実施形態において、癌は、セザリー症候群、CD30+皮膚リンパ腫、および形質転換型菌状息肉症等の皮膚T細胞リンパ腫ではない。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストは、抗KIR3DL1/2または抗KLRC1/D1抗体、またはその抗原結合性断片である。一実施形態において、KIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストは、KIR3DL1/2またはKLRC1/D1に特異的に結合し、KIR3DL1/2またはKLRC1/D1へのIGSF8結合を阻害する(例えば、NK細胞におけるKIR3DL1/2媒介性のIFNγ分泌を少なくとも約20%、40%、50%、60%、80%、90%またはそれ以上で阻害する)抗体またはその抗体結合性断片である。一実施形態において、抗KIR3DL1/2または抗KLRC1/D1抗体は、ヒト抗体である。
特定の実施形態において、抗KIR3DL1/2抗体またはその抗原結合性断片は、KIR3DL1/2のD2ドメインに特異的に結合し、IGSF8結合を阻害する。特定の実施形態において、抗KIR3DL1/2抗体またはその抗原結合性断片は、KIR3DL1/2のD2ドメイン内のエピトープに特異的に結合し、KIR3DL1/2の残基S165、I171、および/またはM186へのIGSF8結合を阻害する。一実施形態において、抗KIR3DL2抗体は、IPH4102ではない。
一実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、NK細胞の活性化、増殖、および/または生存率に対するKIR3DL1/2の阻害性機能を引き起こすことなく、IGSF8のKIR3DL1/2への結合、例えば、KIR3DL1/2の残基S165、I171および/またはM186への結合を阻害するIGSF8の細胞外ドメイン(ECD)である。
一実施形態において、KIR3DL1/2またはKLRC1/D1アンタゴニストは、NK細胞活性化、増殖および/または生存率に対するKIR3DL1/2の阻害性機能を引き起こすことなく、KIR3DL1/2またはKLRC1/D1に結合し、IGSF8のKIR3DL1/2またはKLRC1/D1への結合、例えば、KIR3DL1/2の残基S165、I171、および/またはM186への結合を阻害する低分子である。
一実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、CpG-オリゴデオキシヌクレオチド(CpG-ODN)であり、これは、KIR3DL1/2のECDの第1(またはD1)のIg様ドメインに結合すると、細胞表面からのKIR3DL1/2の下方調節およびエンドソームへの移行を引き起こしてCpG-ODNをToll様受容体9に送達し、NK細胞を活性化させる。
関連する態様において、本発明は、対象における癌を治療するための、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体へのIGSF8結合を阻害するIGSF8アンタゴニスト、KIR3DL1アンタゴニスト、KIR3DL2アンタゴニスト、またはKLRC1/D1アンタゴニストの使用を提供する。
特定の実施形態において、使用は、本明細書に記載の第2の治療剤のいずれか1つまたは複数との組合せ使用のためである。
本発明の関連する態様は、本明細書に記載のいずれかの本発明の方法において使用するための、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)、KIR3DL1アンタゴニスト、KIR3DL2アンタゴニスト、またはKLRC1/D1アンタゴニストを含む組成物であって、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体へのIGSF8の結合を阻害する、組成物を提供する。
4.投与経路および担体
種々の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗-IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、皮下または静脈内に投与することができる。
種々の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗-IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、皮下または静脈内に投与することができる。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗-IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、経口、動脈内、非経口、鼻腔内、筋肉内、心臓内、脳室内、気管内、頬部、直腸、腹腔内、吸入による、皮内、局所、経皮、および髄腔内、またはそれ以外の方法で、例えば移植による等、種々の経路によってin vivoで投与することができるが、これらに限定されない。
対象組成物は、固体、半固体、液体、または気体の形態で製剤化することができ、錠剤、カプセル剤、散剤、顆粒剤、軟膏剤、液剤、坐剤、浣腸剤、注射、吸入剤、およびエアロゾルを含むが、これらに限定されない。
一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、遺伝子療法を使用して送達される。非限定的な例として、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1をコードする核酸分子(例えばCas9およびsgRNA、またはCas12aおよびcrRNA)を、金マイクロパーティクル上にコーティングし、例えば、文献に記載されたように(例えば、Tangら、Nature 356:152~154(1992)を参照)、粒子衝撃デバイス、または「ジーンガン」によって皮内に送達してもよい。
様々な実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストを含む組成物は、様々な薬学的に許容される担体との配合物の形態で提供される(例えば、Gennaro、Remington: The Science and Practice of Pharmacy with Facts and Comparisons:Drugfacts Plus、第20版(2003);Anselら、Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems、第7版、Lippencott Williams and Wilkins(2004);Kibbeら、Handbook of Pharmaceutical Excipients、第3版、Pharmaceutical Press(2000)を参照)。ビヒクル、アジュバント、および希釈剤を含む種々の薬学的に許容される担体が利用可能である。さらに、pH調整剤および緩衝剤、張力調整剤、安定化剤、湿潤剤等の薬学的に許容される種々の補助物質も利用可能である。非限定的な例示的担体としては、生理食塩水、緩衝生理食塩水、ブドウ糖、水、グリセロール、エタノール、およびその組合せが挙げられる。
様々な実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストを含む組成物は、皮下投与などの注射のために、水性または非水性溶媒、例えば植物性油または他の油、合成脂肪酸グリセリド、高級脂肪酸のエステル、またはプロピレングリコール中に、必要に応じて、従来の添加剤、例えば可溶化剤、等張剤、懸濁化剤、乳化剤、安定剤および保存剤と共に、それを溶解、懸濁、または乳化させることによって製剤化されてもよい。
種々の実施形態において、組成物は、例えばジクロロジフルオロメタン、プロパン、および窒素等の加圧許容噴霧剤を用いて、吸入用に製剤化されてもよい。
組成物はまた、種々の実施形態において、生分解性または非生分解性ポリマーを用いて、徐放性マイクロカプセルに製剤化することもできる。非定常的な例示的生分解性製剤は、ポリ乳酸-グリコール酸(PLGA)ポリマーを含む。非限定的な例示的非生分解性製剤は、ポリグリセリン脂肪酸エステルを含む。このような配合物を作製する特定の方法は、例えば、EP1125584A1に記載されている。
それぞれ、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストの1つまたは複数の用量を含有する1つまたは複数の容器を含む医薬投薬パックも提供される。一部の実施形態において、単位投薬量が提供され、単位投薬量は、1つまたは複数の追加の薬剤と共に、またはそれを含まずに、予め決定された量の、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストを含む組成物を含有する。いくつかの実施形態において、このような単位用量は、注射用の単回使用事前充填シリンジで供給される。種々の実施形態において、単位用量に含まれる組成物は、生理食塩水、またはスクロース等、リン酸塩等の緩衝剤および/または安定かつ有効なpH範囲内で製剤化されてもよい。あるいは、いくつかの実施形態において、組成物は、適切な液体、例えば、滅菌水を添加すると再構成され得る凍結乾燥粉末として提供され得る。いくつかの実施形態において、組成物は、スクロースおよびアルギニンを含むがこれらに限定されない、タンパク質凝集を阻害する1つまたは複数の物質を含む。いくつかの実施形態において、本発明の組成物は、ヘパリンおよび/またはプロテオグリカンを含む。
医薬組成物は、特定の適応症の治療または予防のために有効量で投与される。治療上有効量は、典型的には、治療される対象の体重、その身体的または健康状態、治療される状態の拡張性、または治療される対象の年齢に依存する。
一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1用量当たり約50μg/kg体重~約50mg/kg体重の範囲量で投与してもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1用量当たり約100μg/kg体重~約50mg/kg体重の範囲量で投与してもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1用量当たり約100μg/kg体重~約20mg/kg体重の範囲量で投与してもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1用量当たり約0.5mg/kg体重~約20mg/kg体重の範囲量で投与してもよい。
一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1用量当たり約10mg~約1,000mgの範囲量で投与してもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1用量当たり約20mg~約500mgの範囲量で投与してもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1用量当たり約20mg~約300mgの範囲量で投与してもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1用量当たり約20mg~約200mgの範囲量で投与してもよい。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト組成物は、必要に応じて対象に投与してもよい。一部の実施形態において、有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1回または複数回、対象に投与される。様々な実施形態において、有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、月1回、月1回未満、例えば、2カ月に1回、3カ月に1回、または6カ月に1回などで対象に投与される。他の実施形態において、有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストは、月1回より多く、例えば、2週間に1回、週1回、週2回、週3回、1日1回、または1日複数回などで投与される。有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、少なくとも1回、対象に投与される。一部の実施形態において、有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、少なくとも1カ月、少なくとも6カ月、または少なくとも1年などの期間中に、複数回投与してもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、条件の1つまたは複数の症状を軽減するために、要求に応じて対象に投与される。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト組成物は、必要に応じて対象に投与してもよい。一部の実施形態において、有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、1回または複数回、対象に投与される。様々な実施形態において、有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、月1回、月1回未満、例えば、2カ月に1回、3カ月に1回、または6カ月に1回などで対象に投与される。他の実施形態において、有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストは、月1回より多く、例えば、2週間に1回、週1回、週2回、週3回、1日1回、または1日複数回などで投与される。有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、少なくとも1回、対象に投与される。一部の実施形態において、有効量のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、少なくとも1カ月、少なくとも6カ月、または少なくとも1年などの期間中に、複数回投与してもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、条件の1つまたは複数の症状を軽減するために、要求に応じて対象に投与される。
5.併用療法
本発明のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、あらゆる抗体およびそれらの機能的な断片を含み、これらは、疾患の処置のための他の生物学的に活性な物質または他の処置手順と組み合わせて、それを必要とする対象に投与してもよい。例えば、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、単独で投与してもよいし、または他の処置様式と共に投与してもよい。これらは、他の処置様式、例えば放射線療法の前に、それと実質的に同時に、またはその後に提供してもよい。
本発明のIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、あらゆる抗体およびそれらの機能的な断片を含み、これらは、疾患の処置のための他の生物学的に活性な物質または他の処置手順と組み合わせて、それを必要とする対象に投与してもよい。例えば、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、単独で投与してもよいし、または他の処置様式と共に投与してもよい。これらは、他の処置様式、例えば放射線療法の前に、それと実質的に同時に、またはその後に提供してもよい。
一部の実施形態において、本発明の方法は、免疫療法剤、免疫チェックポイント阻害剤、癌ワクチン、キメラ抗原受容体、化学療法剤、放射線療法剤、抗血管新生剤、増殖阻害剤、免疫腫瘍学薬剤、抗新生物性組成物、外科手術、またはそれらの組合せを含む有効量の第2の治療剤を対象に投与する工程を含んでいてもよい。
癌を処置するために、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、抗癌剤、例えば免疫チェックポイント阻害剤、化学療法剤、増殖阻害剤、抗血管新生剤または抗新生物性組成物の1つまたは複数と併用して投与してもよい。
一部の実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1、PD-L1、PD-L2、LAG3、TIGIT、TIM3、NKG2A、CD276、VTCN1、VISRまたはHHLA2に特異的な抗体またはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD-1抗体、例えばセミプリマブ、ニボルマブ、またはペンブロリズマブである。
一部の実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD-L1抗体、例えばアベルマブ、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、KN035、またはCK-301である。
一部の実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1/PD-L1の(非抗体)ペプチド阻害剤、例えばAUNP12;PD-L1の小分子阻害剤、例えばCA-170、または大環状ペプチド、例えばBMS-986189である。
特定の実施形態において、IGSF8に特異的に結合するIGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)(「IGSF8結合アンタゴニスト」)、例えばIGSF8アンタゴニストまたはその抗原結合断片は、第2の免疫チェックポイント阻害剤(例えば、PD-1またはPD-L1経路の阻害剤)と共に、免疫系の刺激が有益である疾患、例えば、癌または感染性疾患を有する対象に投与される。2つのアンタゴニストは、例えば、IGSF8アンタゴニストと免疫腫瘍学薬剤との組合せについて以下に記載するように、同時にまたは連続して投与することができる。癌または感染性疾患の治療のために、IGSF8結合アンタゴニストによる治療に、1つまたは複数のさらなる治療剤、例えばチェックポイントモジュレーターを加えてもよい。一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、IGSF8のD1(Ig-Vセットドメイン)に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
特定の実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、KIR3DL1/2に特異的に結合し(「KIR3DL1/2に結合するアンタゴニスト」)、例えば、KIR3DL1/2アンタゴニスト抗体またはその抗原結合性断片は、免疫系の刺激が有益と予想される疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象に、第2のアンタゴニスト、例えば免疫チェックポイント阻害剤(例えば、PD-1またはPD-L1経路の阻害剤)と共に投与される。2つのアンタゴニストは、同時に投与してもよいし、または連続的に投与してもよく、例えば、KIR3DL1/2アンタゴニストと、免疫腫瘍学薬剤(immuno-oncology agent)との組合せに関して後述する通り投与してもよい。癌または感染性疾患を処置するためのKIR3DL1/2結合アンタゴニストでの処置に、1つまたは複数の追加の治療剤、例えば、チェックポイントモジュレーターが追加されてもよい。一部の実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、KIR3DL1/2のD2(中間のIg様ドメイン)に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片、例えば、KIR3DL1/2のS165、I171、および/またはM186に結合するか、またはS165、I171、および/またはM186を介したIGSF8結合を阻害する抗体または抗原結合性断片である。
特定の実施形態において、KLRC1/D1アンタゴニストは、KLRC1/D1(「KLRC1/D1に結合するアンタゴニスト」)に特異的に結合し、例えば、KLRC1/D1アンタゴニスト抗体またはその抗原結合性断片は、免疫系の刺激が有益と予想される疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象に、第2のアンタゴニスト、例えば免疫チェックポイント阻害剤(例えば、PD-1またはPD-L1経路の阻害剤)と共に投与される。2つのアンタゴニストは、と同時に投与してもよいし、または連続的に投与してもよく、例えば、KLRC1/D1アンタゴニストと免疫腫瘍学薬剤との組合せに関して後述する通り投与してもよい。1つまたは複数の追加の治療剤、例えば、チェックポイントモジュレーターが、癌または感染性疾患を処置するためのKLRC1/D1結合アンタゴニストでの処置に追加されてもよい。
特定の実施形態において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、別の処置と、同時または連続的のいずれかで、対象に、例えば癌を有する対象に投与される。例えば、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、放射線療法、外科手術、または化学療法、例えば、標的化化学療法もしくは免疫療法の1つまたは複数と共に投与してもよい。免疫療法、例えば、癌免疫療法としては、癌ワクチンおよび免疫腫瘍学薬剤が挙げられる。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、例えば、それぞれIGSF8またはKIR/3DL1/2またはKLRC1/D1に結合する、タンパク質、抗体、抗体断片または小分子であり得る。IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、それぞれIGSF8またはKIR3DL1/2またはKLRC1/D1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり得る。
特定の実施形態において、癌を有する対象の処置方法は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、例えば、IGSF8抗体および/またはKIR3DL1/2抗体および/またはKLRC1/D1抗体、ならびに1つまたは複数の免疫腫瘍学薬剤、例えば免疫チェックポイント阻害剤を、癌を有する対象に投与する工程を含む。
免疫療法、例えば、免疫腫瘍学薬剤を用いた療法は、対象における免疫応答を強化する、刺激する、および/または上方調節するのに効果的である。一態様において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストを、免疫腫瘍学薬剤(例えばPD-1阻害剤)と共に投与することは、癌の処置において、例えば、腫瘍増殖を阻害することにおいて共働的な作用を有する。
一態様において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、免疫腫瘍学薬剤の投与の前に、逐次的に投与される。一態様において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、免疫腫瘍学薬剤(例えばPD-1阻害剤)と同時に投与される。さらなる一態様において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、免疫腫瘍学薬剤(例えばPD-1阻害剤)の投与の後に逐次的に投与される。
2つの剤の投与は、例えば30分間、60分間、90分間、120分間、3時間、6時間、12時間、24時間、36時間、48時間、3日間、5日間、7日間、または1または複数週間の間隔で開始してよく、または第2の剤の投与は、第1の剤が投与されてから、例えば、30分間、60分間、90分間、120分間、3時間、6時間、12時間、24時間、36時間、48時間、3日間、5日間、7日間、または1または複数週間後に開始してもよい。
特定の態様において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストおよび免疫腫瘍学薬剤(例えば、PD-1阻害剤)は、患者に同時に投与され、例えば30または60分間にわたり、例えば同時に注入される。IGSF8アンタゴニストは、免疫腫瘍学薬剤(例えばPD-1阻害剤)と共に共製剤化し得る。
免疫腫瘍学薬剤としては、例えば、低分子薬剤、抗体もしくはその断片、または他の生物学的もしくは小分子が挙げられる。生物学的免疫腫瘍学薬剤の例としては、非限定的であるが、抗体、抗体断片、ワクチンおよびサイトカインが挙げられる。一態様において、抗体はモノクローナル抗体である。特定の態様において、モノクローナル抗体はヒト化抗体またはヒト抗体である。
一態様において、免疫腫瘍学薬剤は、免疫細胞、例えばT細胞上の(i)刺激(共刺激を含む)分子(例えば、受容体またはリガンド)のアゴニストまたは(ii)阻害(共阻害を含む)分子(例えば、受容体またはリガンド)のアンタゴニストであり、これらはいずれも抗原特異的T細胞応答の増幅をもたらす。特定の態様において、免疫腫瘍学薬剤は、自然免疫に関わる細胞上の(i)刺激(共刺激を含む)分子(例えば、受容体またはリガンド)のアゴニストまたは(ii)阻害(共阻害を含む)分子(例えば、受容体またはリガンド)のアンタゴニストであり、ここで、免疫腫瘍学薬剤は自然免疫を増強する。このような免疫腫瘍学薬剤はしばしば免疫チェックポイント調節因子、例えば免疫チェックポイント阻害剤または免疫チェックポイント刺激因子と称する。
特定の実施形態において、免疫腫瘍学薬剤は、免疫グロブリンスーパーファミリー(IgSF)のメンバーである刺激または阻害分子を標的とする。例えば、免疫腫瘍学薬剤は、B7-1、B7-2、B7-H1(PD-L1)、B7-DC(PD-L2)、B7-H2(ICOS-L)、B7-H3、B7-H4、B7-H5およびB7-H6を含む、膜結合リガンドのB7ファミリーのメンバーまたはB7ファミリーメンバーに特異的に結合する共刺激もしくは共阻害受容体を標的とする(またはそこに特異的に結合する)。免疫腫瘍学薬剤は、膜結合リガンドのTNFファミリーのメンバーまたはそこに特異的に結合する共刺激もしくは共阻害受容体を標的とする剤であり得る。免疫腫瘍学薬剤が標的とし得る例示的なTNFおよびTNFRファミリーメンバーとしては、CD40およびCD40L、OX-40、OX-40L、GITR、GITRL、CD70、CD27L、CD30、CD30L、4-1BBL、CD137(4-1BB)、TRAIL/Apo2-L、TRAILR1/DR4、TRAILR2/DR5、TRAILR3、TRAILR4、OPG、RANK、RANKL、TWEAKR/Fnl4、TWEAK、BAFFR、EDAR、XEDAR、TACI、APRIL、BCMA、LTfiR、LIGHT、DcR3、HVEM、VEGI/TL1A、TRAMP/DR3、EDAR、EDA1、XEDAR、EDA2、TNFR1、リンホトキシンα/ΤΝΡβ、TNFR2、TNFa、LTfiR、リンホトキシンa 1β2、FAS、FASL、RELT、DR6、TROYおよびNGFRが挙げられる。癌を治療するためにIGSF8アンタゴニストと組み合わせて使用し得る免疫腫瘍学薬剤は、例えば、IgSFメンバー、例えばB7ファミリーメンバー、B7受容体ファミリーメンバー、TNFファミリーメンバーまたはTNFRファミリーメンバー、例えば上記を標的とする抗体である。
一態様において、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、(i)T細胞活性化を阻害するタンパク質のアンタゴニスト(例えば、免疫チェックポイント阻害剤)、例えばCTLA-4、PD-1、PD-L1、PD-L2、LAG-3、TIM3、ガレクチン9、CEACAM-1、BTLA、CD69、ガレクチン-1、TIGIT、CD113、GPR56、VISTA、B7-H3、B7-H4、2B4、CD48、GARP、PDIH、LAIRl、TIM-1、TIM-4、およびPSGL-1、ならびに(ii)T細胞活性化を刺激するタンパク質のアゴニスト、例えばB7-1、B7-2、CD28、4-1BB(CD137)、4-1BBL、ICOS、ICOS-L、OX40、OX40L、GITR、GITRL、CD70、CD27、CD40、CD40L、DR3およびCD28Hの1つまたは複数と共に投与される。
一態様において、免疫腫瘍学薬剤は、T細胞活性化を阻害するサイトカイン(例えばIL-6、IL-10、TGF-β、VEGFおよび他の免疫抑制サイトカイン)を阻害する剤(すなわち、そのアンタゴニスト)であるか、またはT細胞活性化を刺激する、および免疫応答を刺激するサイトカイン、例えばIL-2、IL-7、IL-12、IL-15、IL-21およびIFNαのアゴニスト(例えばサイトカイン自体)である。
免疫系を刺激するために、例えば、癌および感染性疾患の処置のために、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストと組み合わせることができる他の薬剤としては、NK細胞上の阻害性受容体のアンタゴニストまたはNK細胞上の活性化受容体のアゴニストが挙げられる。例えば、抗IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)は、KIRのアンタゴニスト、例えばKIR3DL1/2アンタゴニスト、および/またはKLRC1/D1に対するアンタゴニストと組み合わせることができる。
組合せ療法のためのさらなる他の剤としては、マクロファージまたは単球を阻害するかまたは枯渇させる剤、非限定的な例としてはCSF-IRアンタゴニスト、例えばCSF-IRアンタゴニスト抗体、例えばRG7155(国際公開第1/70024号、国際公開第11/107553号、国際公開第11/131407号、国際公開第13/87699号、国際公開第13/119716号、国際公開第13/132044号)またはFPA008(国際公開第l1/140249号、国際公開第13169264号、国際公開第14/036357号)が挙げられる。
免疫腫瘍学薬剤としてはまた、TGF-βシグナル伝達を阻害する剤が挙げられる。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストと組み合わせてもよい追加の薬剤としては、腫瘍抗原提示を強化する薬剤、例えば、樹状細胞ワクチン、GM-CSFを分泌する細胞ワクチン、CpGオリゴヌクレオチド、およびイミキモド、または腫瘍細胞の免疫原性を強化する療法剤(例えば、アントラサイクリン)が挙げられる。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストと組み合わせてもよいさらに他の療法としては、Treg細胞を枯渇させるかまたはブロックする療法剤、例えば、CD25に特異的に結合する薬剤が挙げられる。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストと組み合わせてもよい別の療法は、インドールアミンジオキシゲナーゼ(IDO)、ジオキシゲナーゼ、アルギナーゼ、または一酸化窒素合成酵素などの代謝酵素を阻害する療法剤である。
使用し得る他のクラスの剤としては、アデノシンの形成を阻害するか、またはアデノシンA2A受容体を阻害する剤が挙げられる。
癌を処置するための、IGSF8アンタゴニストおよび/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストと組み合わせてもよい他の療法としては、T細胞アネルギーまたは枯渇を逆転/防止する療法、ならびに腫瘍部位において自然免疫の活性化および/または炎症を引き起こす療法が挙げられる。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、互いに組み合わせてもよいし、および/または1種より多くの免疫腫瘍学薬剤(例えば免疫チェックポイント阻害剤)と組み合わせてもよく、例えば、以下の1つまたは複数などの免疫経路の複数のエレメントを標的化するコンビナトリアルアプローチと組み合わせてもよい:腫瘍抗原提示を強化する療法剤(例えば、樹状細胞ワクチン、GM-CSFを分泌する細胞ワクチン、CpGオリゴヌクレオチド、イミキモド);例えば、CTLA-4および/もしくはPD1/PD-L1/PD-L2経路を阻害することおよび/またはTregもしくは他の免疫抑制細胞を枯渇させるかもしくはそれをブロックすることによって、陰性免疫調節を阻害する療法;陽性免疫調節を刺激する療法剤、例えば、CD-137、OX-40および/またはGITR経路を刺激するか、および/またはT細胞エフェクター機能を刺激するアゴニストと併用される陽性免疫調節を刺激する療法剤;抗腫瘍T細胞の頻度を全身的に増加させる療法剤;例えば、CD25のアンタゴニスト(例えば、ダクリズマブ)を使用して、またはex vivoにおける抗CD25ビーズの枯渇によって、Treg、例えば腫瘍中のTregを枯渇させるかまたは阻害する療法剤;腫瘍における抑制性骨髄性細胞の機能に影響を与える療法剤;腫瘍細胞の免疫原性を強化する療法剤(例えば、アントラサイクリン);養子T細胞またはNK細胞の移動、例えば遺伝子改変された細胞、例えば、キメラ抗原受容体によって改変された細胞(CAR-T療法)など;インドールアミンジオキシゲナーゼ(IDO)、ジオキシゲナーゼ、アルギナーゼまたは一酸化窒素合成酵素などの代謝酵素を阻害する療法;T細胞アネルギーまたは枯渇を逆転/防止する療法剤;腫瘍部位において自然免疫の活性化および/または炎症を引き起こす療法剤;免疫刺激性サイトカインの投与または免疫抑制性サイトカインのブロック。
例えば、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストは、陽性共刺激受容体を連結する1つまたは複数のアゴニスト剤;阻害性受容体を介してシグナル伝達を弱める1つまたは複数のアンタゴニスト(ブロッキング剤)、例えば腫瘍微小環境内の別個の免疫抑制経路に打ち勝つ(例えば、PD-L1/PD-1/PD-L2相互作用をブロックする)アンタゴニスト;抗腫瘍免疫細胞、例えばT細胞の頻度を全身的に増加させる、Tregを枯渇させるかまたは阻害する(例えば、CD25を阻害することによって)1つまたは複数の薬剤;IDOなどの代謝酵素を阻害する1つまたは複数の薬剤;T細胞のアネルギーまたは枯渇を逆転/防止させる1つまたは複数の薬剤;および腫瘍部位において自然免疫の活性化および/または炎症を引き起こす1つまたは複数の薬剤と共に使用することができる。
一実施形態において、免疫系の刺激によって利益を得る可能性がある疾患、例えば、癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストおよび免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって処置され、免疫腫瘍学薬剤は、CTLA-4アンタゴニスト、例えばアンタゴニストCTLA-4抗体である。好適なCTLA-4抗体としては、例えば、YERVOY(イピリムマブ)またはトレメリムマブが挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激によって利益を得る可能性がある疾患、例えば、癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって処置され、免疫腫瘍学薬剤は、PD-1アンタゴニスト、例えばアンタゴニストPD-1抗体である。好適なPD-1抗体としては、例えば、OPDIVO(ニボルマブ)、KEYTRUDA(ペンブロリズマブ)、またはMEDI-0680(AMP-514;WO2012/145493)が挙げられる。また、免疫腫瘍学薬剤は、ピジリズマブ(CT-011)を含んでもよい。PD-1受容体を標的とする他のアプローチは、IgGlのFc部分に融合させたPD-L2の細胞外ドメイン(B7-DC)から構成された組合せタンパク質であり、これはAMP-224と称する。
一実施形態において、免疫系の刺激により利益を得る可能性のある疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8 アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、PD-L1 アンタゴニスト、例えば、アンタゴニスト性PD-L1抗体である。適切なPD-L1抗体としては、例えば、MPDL3280A(RG7446;国際公開第2010/077634号)、デュルバルマブ(MEDI4736)、BMS-936559(国際公開第2007/005874号)、MSB0010718C(国際公開第2013/79174号)またはrHigM12B7が挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得る可能性のある疾患、例えば、癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、LAG-3アンタゴニスト、例えば、アンタゴニスト性LAG-3抗体である。適切なLAG3抗体としては、例えば、BMS-986016(国際公開第10/19570号、国際公開第14/08218号)、またはIMP-731もしくはIMP-321(国際公開第08/132601号、国際公開第09/44273号)が挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激により利益を得ることができる疾患、例えば、癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、CD137(4-1BB)アゴニスト、例えば、アゴニスト性CD137抗体である。適切なCD137抗体としては、例えば、ウレルマブまたはPF-05082566(国際公開第12/32433号)が挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得ることができる疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、GITRアゴニスト、例えばアゴニスト性GITR抗体である。適切なGITR抗体としては、例えば、TRX-518(国際公開第06/105021号、国際公開第09/009116号)、MK-4166(国際公開第11/028683号)または国際公開第2015/031667号に開示されるGITR抗体が挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得る可能性のある疾患、例えば、癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、OX40アゴニスト、例えばアゴニスト性OX40抗体である。適切なOX40抗体としては、例えば、MEDI-6383、MEDI-6469またはMOXR0916(RG7888;国際公開第06/029879号)が挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激により利益を得ることができる疾患、例えば、癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、CD40アゴニスト、例えば、アゴニスト性CD40抗体である。特定の実施形態において、免疫腫瘍学薬剤は、CD40アンタゴニスト、例えばアンタゴニスト性CD40抗体である。適切なCD40抗体としては、例えば、ルカツムマブ(HCD122)、ダセツズマブ(SGN-40)、CP-870,893またはチロブ7/4が挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得る可能性のある疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、CD27アゴニスト、例えば、アゴニスト性CD27抗体である。適切なCD27抗体としては、例えば、バリルマブ(CDX-1127)が挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得る可能性のある疾患。例えば癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤はMGA271(~B7H3)(国際公開第11/109400号)である。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得る可能性のある疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、KIRアンタゴニスト、例えば、リリルマブである。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得る可能性のある疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、IDOアンタゴニストである。適切なIDOアンタゴニストとしては、例えば、INCB-024360(国際公開第2006/122150号、国際公開第07/75598号、国際公開第08/36653号、国際公開第08/36642号)、インドキシモド、NLG-919(国際公開第09/73620号、国際公開第09/1156652号、国際公開第l1/56652号、国際公開第12/142237号)またはF001287が挙げられる。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得る可能性のある疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、Toll様受容体アゴニスト、例えばTLR2/4アゴニスト(例えば、Bacillus Calmette-Guerin)、TLR7アゴニスト(例えば、HiltonolまたはImiquimod)、TLR7/8アゴニスト(例えば、Resiquimod)、またはTLR9アゴニスト(例えばCpG7909)である。
一実施形態において、免疫系の刺激から利益を得る可能性のある疾患、例えば癌または感染性疾患を有する対象は、IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニスト、および免疫腫瘍学薬剤の対象への投与によって治療され、ここで、免疫腫瘍学薬剤は、TGF-β阻害剤、例えばGC1008、LY2157299、TEW7197またはIMC-TR1である。
IGSF8アンタゴニスト(例えば、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片)および/またはKIR3DL1/2アンタゴニストおよび/またはKLRC1/D1アンタゴニストと組み合わせてもよい別の療法は、治療抗体、例えば癌を処置するのに有効な治療抗体である。例示的な、ただし非限定的な治療抗体としては、3F8、8H9、アバゴボマブ、アブシキシマブ、アビツズマブ、アブレゼキマブ、アブリルマブ、アクトキスマブ、アダリムマブ、アデカツムマブ、アデュカヌマブ、アファセビクマブ、アフェリモマブ、アラシズマブペゴル、アレムツズマブ、アリロクマブ、アルツモマブペンテテート、アマツキシマブ、アミバンタマブ、アナツモマブマフェナトクス、アンデカリキシマブ、アネツマブラブタンシン、アニフロルマブ、アンルキンズマブ、アポリズマブ、アプルツマブイキサドチン、アルシツモマブ、アスクリンバクマブ、アセリズマブ、アテゾリズマブ、アチドルトクスマブ、アチヌマブ、アトロリムマブ、アベルマブ、アジンツキシズマブベドチン、バピネオズマブ、バシリキシマブ、バビツキシマブ、BCD-100、ベクツモマブ、ベゲロマブ、ベランタマブマホドチン、ベリムマブ、ベマリツズマブ、ベンラリズマブ、ベルリマトクスマブ、ベルメキマブ、ベルサンリマブ、ベルチリムマブ、ベシレソマブ、ベバシズマブ、ベズロトクスマブ、ビシロマブ、ビマグルマブ、ビメキズマブ、ビルタミマブ、ビバツズマブ、ブレセルマブ、ブリナツモマブ、ブロンツベトマブ、ブロソズマブ、ボコシズマブ、ブラジクマブ、ブレンツキシマブベドチン、ブリアキヌマブ、ブロダルマブ、ブロルシズマブ、ブロンチクツズマブ、ブロスマブ、カビラリズマブ、カミダンルマブテシリン、カムレリズマブ、カナキヌマブ、カンツズマブメルタンシン、カンツズマブラブタンシン、カプラシズマブ、カプロマブ、カルルマブ、カロツキシマブ、カツマキソマブ、cBR-ドキソルビシンイムノコンジュゲート、セデリズマブ、セミプリマブ、セルグツズマブアムナロイキン、セルトリズマブペゴル、セトレリマブ、セツキシマブ、シビサタマブ、シルムツズマブ、シタツズマブボガトクス、シクスツムマブ、クラザキズマブ、クレノリキシマブ、クリバツズマブテトラキセタン、コドリツズマブ、コフェツズマブペリドチン、コルツキシマブラブタンシン、コナツムマブ、コンシズマブ、コスフロビキシマブ、クレネズマブ、クリザンリズマブ、クロテデュマブ、CR6261、クサツズマブ、ダセツズマブ、ダクリズマブ、ダロツズマブ、ダピロリズマブペゴル、ダラツムマブ、デクトレクマブ、デムシズマブ、デニンツズマブマホドチン、デノスマブ、デパツキシズマブマホドチン、デルロツキシマブビオチン、デツモマブ、デザミズマブ、ジヌツキシマブ、ジリダブマブ、ドマグロズマブ、ドルリモマブアリトクス、ドスタルリマブ、ドロジツマブ、DS-8201、ドゥリゴツズマブ、デュピルマブ、デュルバルマブ、ドゥシギツマブ、ドゥボルツキシズマブ、エクロメキシマブ、エクリズマブ、エドバコマブ、エドレコロマブ、エファリズマブ、エファングマブ、エルデルマブ、エレザヌマブ、エルゲムツマブ、エロツズマブ、エルシリモマブ、エマクツズマブ、エマパルマブ、エミベツズマブ、エミシズマブ、エナポタマブベドチン、エナバツズマブ、エンホルツマブベドチン、エンリモマブペゴル、エノブリツズマブ、エノキズマブ、エノチクマブ、エンシツキシマブ、エピツモマブシツキセタン、エプラツズマブ、エプチネズマブ、エレヌマブ、エルリズマブ、エルツマクソマブ、エタラシズマブ、エチギリマブ、エトロリズマブ、エビナクマブ、エボロクマブ、エクスビビルマブ、ファノレソマブ、ファラリモマブ、ファリシマブ、ファーレツズマブ、ファシヌマブ、FBTA05、フェルビズマブ、フェザキヌマブ、フィバツズマブ、フィクラツズマブ、フィギツムマブ、フィリブマブ、フランボツマブ、フレチクマブ、フロテツズマブ、フォントリズマブ、フォラルマブ、フォラビルマブ、フレマネズマブ、フレソリムマブ、フロボシマブ、フルネベトマブ、フルラヌマブ、フツキシマブ、ガルカネズマブ、ガリキシマブ、ガンコタマブ、ガニツマブ、ガンテネルマブ、ガチポツズマブ、ガビリモマブ、ゲジブマブ、ゲムツズマブオゾガマイシン、ゲボキズマブ、ジルベトマブ、ジムシルマブ、ジレンツキシマブ、グレンバツムマブベドチン、ゴリムマブ、ゴミリキシマブ、ゴスラネマブ、グセルクマブ、ラナルマブ、イバリズマブ、IBI308、イブリツモマブチウキセタン、イクルクマブ、イダルシズマブ、イファボツズマブ、イゴボマブ、イラダツズマブベドチン、IMAB363、イマルマブ、イマプレリマブ、イムシロマブ、イムガツズマブ、インクラクマブ、インダツキシマブラブタンシン、インデュサツマブベドチン、イネビリズマブ、インフリキシマブ、インテツムマブ、イノリモマブ、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ、Iomab-B、イラツムマブ、イサツキシマブ、イスカリマブ、イスチラツマブ、イトリズマブ、イキセキズマブ、ケリキシマブ、ラベツズマブ、ラクノツズマブ、ラジラツズマブベドチン、ランパリズマブ、ラナデルマブ、ランドグロズマブ、ラプリツキシマブエムタンシン、ラルカビキシマブ、レブリキズマブ、レマレソマブ、レンダリズマブ、レンベルビマブ、レンジルマブ、レルデリムマブ、レロンリマブ、レソファブマブ、レトリズマブ、レキサツムマブ、リビビルマブ、リファスツズマブベドチン、リゲリズマブ、ロンカスツキシマブテシリン、ロサツキシズマブベドチン、リロトマブサテトラキセタン、リンツズマブ、リリルマブ、ロデルシズマブ、ロキベトマブ、ロルボツズマブメルタンシン、ルカツムマブ、ルリズマブペゴル、ルミリキシマブ、ルムレツズマブ、ルパルツマブ、ルパルツマブアマドチン、ルチキズマブ、マパツムマブ、マルジェツキシマブ、マルスタシマブ、マスリモマブ、マブリリムマブ、マツズマブ、メポリズマブ、メテリムマブ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミリキズマブ、ミルベツキシマブソラブタンシン、ミツモマブ、モドツキシマブ、モガムリズマブ、モナリズマブ、モロリムマブ、モスネツズマブ、モタビズマブ、モキセツモマブパスドトクス、ムロモナブ-CD3、ナコロマブタフェナトクス、ナミルマブ、ナプツモマブエスタフェナトクス、ナラツキシマブエムタンシン、ナルナツマブ、ナタリズマブ、ナビシキシズマブ、ナビブマブ、ナキシタマブ、ネバクマブ、ネシツムマブ、ネモリズマブ、NEOD001、ネレリモマブ、ネスバクマブ、ネタキマブ、ニモツズマブ、ニルセビマブ、ニボルマブ、ノフェツモマブメルペンタン、オビルトキサキシマブ、オビヌツズマブ、オカラツズマブ、オクレリズマブ、オドゥリモマブ、オファツムマブ、オララツマブ、オレクルマブ、オレンダリズマブ、オロキズマブ、オマリズマブ、オムブルタマブ、OMS721、オナルツズマブ、オンツキシズマブ、オンバチリマブ、オピシヌマブ、オポルツズマブモナトクス、オレゴボマブ、オルチクマブ、オテリキシズマブ、オチリマブ、オトレルツズマブ、オキセルマブ、オザネズマブ、オゾラリズマブ、パジバキシマブ、パリビズマブ、パムレブルマブ、パニツムマブ、パンコマブ、パノバクマブ、パルサツズマブ、パスコリズマブ、パソツキシズマブ、パテクリズマブ、パトリツマブ、PDR001、ペンブロリズマブ、ペムツモマブ、ペラキズマブ、パーツズマブ、パキセリズマブ、ピディリズマブ、ピナツズマブベドチン、ピンツモマブ、プラクルマブ、プレザルマブ、プロザリズマブ、ポガリズマブ、ポラツズマブベドチン、ポネズマブ、ポルガビキシマブ、プラシネズマブ、プレザリズマブ、プリリキシマブ、プリトキサキシマブ、プリツムマブ、PRO140、キリズマブ、ラコツモマブ、ラドレツマブ、ラフィビルマブ、ラルパンシズマブ、ラムシルマブ、ラネベトマブ、ラニビズマブ、ラキシバクマブ、ラバガリマブ、ラブリズマブ、レファネズマブ、レガビルマブ、REGN-EB、レラトリマブ、レムトルマブ、レスリズマブ、リロツムマブ、リヌクマブ、リサンキズマブ、リツキシマブ、リバブズマブペゴル、ロバツムマブ、Rmab、ロレヅマブ、ロミルキマブ、ロモソズマブ、ロンタリズマブ、ロスマンツズマブ、ロバルピツズマブテシリン、ロベリズマブ、ロザノリキシズマブ、ルプリズマブ、SA237、サシツズマブゴビテカン、サマリズマブ、サムロタマブベドチン、サリルマブ、サトラリズマブ、サツモマブペンデチド、セクキヌマブ、セリクレルマブ、セリバンツマブ、セトキサキシマブ、セトルスマブ、セビルマブ、シブロツズマブ、SGN-CD19A、SHP647、シファリムマブ、シルツキシマブ、シムツズマブ、シプリズマブ、シルトラツマブベドチン、シルクマブ、ソフィツズマブベドチン、ソラネズマブ、ソリトマブ、ソネプシズマブ、ソンツズマブ、スパルタリズマブ、スタムルマブ、スレソマブ、スプタブマブ、スチムリマブ、スビズマブ、スブラトクスマブ、タバルマブ、タカツズマブテトラキセタン、タドシズマブ、タラコツズマブ、タリズマブ、タルケタマブ、タムツベトマブ、タネズマブ、タプリツモマブパプトクス、タレクスツマブ、タボリマブ、テクリスタマブ、テフィバズマブ、テリモマブアリトクス、テリソツズマブ、テリソツズマブベドチン、テナツモマブ、テネリキシマブ、テプリズマブ、テポジタマブ、テプロツムマブ、テシドルマブ、テツロマブ、テゼペルマブ、TGN1412、チブリズマブ、チルドラキズマブ、ティガツズマブ、チミグツズマブ、チモルマブ、チラゴルマブ、チラゴツマブ、チスレリズマブ、チソツマブベドチン、TNX-650、トシリズマブ、トムゾツキシマブ、トラリズマブ、トサトクスマブ、トシツモマブ、トベツマブ、トラロキヌマブ、トラスツズマブ、トラスツズマブデュオカルマジン、トラスツズマブエムタンシン、TRBS07、トレガリズマブ、トレメリムマブ、トレボグルマブ、ツコツズマブセルモロイキン、ツビルマブ、ウブリツキシマブ、ウロクプルマブ、ウレルマブ、ウルトキサズマブ、ウステキヌマブ、ウトミルマブ、バダスツキシマブタリリン、バナリマブ、バンドルツズマブベドチン、バンチクツマブ、バヌシズマブ、バパリキシマブ、バリサクマブ、バルリルマブ、バテリズマブ、ベドリズマブ、ベルツズマブ、ベパリモマブ、ベセンクマブ、ビジリズマブ、ボバリリズマブ、ボロシキシマブ、ボンレロリズマブ、ボプラテリマブ、ボルセツズマブマホドチン、ボツムマブ、ブナキズマブ、キセンツズマブ、XMAB-5574、ザルツムマブ、ザノリムマブ、ザツキシマブ、ゼノクツズマブ、ジラリムマブ、ゾルベツキシマブ、(=IMAB362、クラウジキシマブ)、ゾリモマブアリトックス、またはそれらの組合せが挙げられる。
6.例示的IGSF8アンタゴニスト
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストとは、IGSF8抗体である。いくつかの実施形態において、癌を治療するためのIGSF8アンタゴニストとは、非抗体タンパク質、例えば、IGSF8とそのリガンドとの間の相互作用を阻害する可溶性IGSF8またはその一部(例えば、ECD)であってよく、任意でさらに融合パートナーを融合分子の形態で含む。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストとは、IGSF8抗体である。いくつかの実施形態において、癌を治療するためのIGSF8アンタゴニストとは、非抗体タンパク質、例えば、IGSF8とそのリガンドとの間の相互作用を阻害する可溶性IGSF8またはその一部(例えば、ECD)であってよく、任意でさらに融合パートナーを融合分子の形態で含む。
一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、IGSF8に結合する、KIR3DL1/2の可溶性ECD、例えばKIR3DL1/2のD2ドメインまたはその断片であり、これらは、必要に応じて、融合パートナー、例えば配列タグ(例えば、Hisタグ、FLAGタグなど)をさらに含んでいてもよい。このようなIGSF8アンタゴニストは、IGSF8に結合し、それがNK細胞上のKIR3DL1/2受容体に結合することをブロックすることができ、したがって、NK細胞活性および/または生存可能性のIGSF8によって媒介される下方調節をブロックすることができる。
一部の実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、IGSF8に結合する、KLRC1/D1の可溶性ECD、例えばKLRC1もしくはKLRD1のECD、またはその断片であり、これらは、必要に応じて、融合パートナー、例えば配列タグ(例えば、Hisタグ、FLAGタグなど)をさらに含んでいてもよい。このようなIGSF8アンタゴニストは、IGSF8に結合し、それがNK細胞上のKLRC1/D1受容体に結合することをブロックすることができ、したがって、NK細胞活性および/または生存可能性のIGSF8によって媒介される下方調節をブロックすることができる。
他の実施形態において、アンタゴニストはまた、小分子または小さいペプチドであってもよい。
IGSF8抗体
本発明の一態様は、IGSF8に特異的なモノクローナル抗体を提供する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8の細胞外ドメイン(ECD)に特異的である。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8のIg-Vセット細胞外ドメイン(D1ドメイン)に特異的である。一部の実施形態において、IGSF8およびそのリガンドの結合をブロックする抗体が提供される。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、KIR3DL2および/またはKIR3DL1へのIGSF8の結合を阻害し、例えば、残基S165、I171、および/またはM186へのIGSF8の結合を阻害する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、KLRC1/D1へのIGSF8の結合を阻害する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、異種間の反応性を有し、例えば、モノクローナル抗体は、ヒトおよびマウスIGSF8の両方と結合する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、ヒトIGSF8に特異的である。一部の実施形態において、IGSF8抗体は、IGSF8によって媒介されるシグナル伝達を阻害する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8への結合に関して、本明細書で開示された抗IGSF8抗体のいずれか1つと競合する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、本明細書で開示された抗IGSF8抗体のいずれか1つと同じIGSF8上のエピトープと結合する。
本発明の一態様は、IGSF8に特異的なモノクローナル抗体を提供する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8の細胞外ドメイン(ECD)に特異的である。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8のIg-Vセット細胞外ドメイン(D1ドメイン)に特異的である。一部の実施形態において、IGSF8およびそのリガンドの結合をブロックする抗体が提供される。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、KIR3DL2および/またはKIR3DL1へのIGSF8の結合を阻害し、例えば、残基S165、I171、および/またはM186へのIGSF8の結合を阻害する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、KLRC1/D1へのIGSF8の結合を阻害する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、異種間の反応性を有し、例えば、モノクローナル抗体は、ヒトおよびマウスIGSF8の両方と結合する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、ヒトIGSF8に特異的である。一部の実施形態において、IGSF8抗体は、IGSF8によって媒介されるシグナル伝達を阻害する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8への結合に関して、本明細書で開示された抗IGSF8抗体のいずれか1つと競合する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、本明細書で開示された抗IGSF8抗体のいずれか1つと同じIGSF8上のエピトープと結合する。
一部の実施形態において、本発明のIGSF8抗体は、IGSF8に対して、例えばヒトIGSF8に対して、≦1μΜ、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM、または≦0.001nM(例えば10-8Mまたはそれ未満、例えば10-8M~10-13M、例えば、10-9M~10-13M)の解離定数(Kd)を有する。特定の実施形態において、IGSF8抗体は、解離定数(Kd)が、IGSF8について、例えば、ヒトIGSF8について≦1μΜ、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM、または≦0.001nM(例えば、10-8M以下、例えば10-8M~10-13M、例えば、10-9M~10-13M)である。
一部の実施形態において、本明細書で提供される特徴のいずれかを有するIGSF8抗体は、IGSF8のシグナル伝達の、例えば、KIR3DL1/2および/またはKLRC1/D1を介したシグナル伝達の、少なくとも25%、50%、75%、80%、90%または100%を阻害する。例えば、KIR3DL1/2および/またはKLRC1/D1シグナル伝達は、IGSF8に結合すると、NK細胞において、IFNγ分泌に基づきアッセイでき、このような分泌は、ELISAなどの標準的な技術を使用して分析することができる。一部の実施形態において、IGSF8抗体は、NK細胞における、例えば、図2D(例えば、細胞周期、DNA複製など)または図2E(例えば、PRF1、GZMB、またはGZMA)に記載されるシグナル伝達経路のいずれか1つにおけるシグナル伝達を阻害する。
一部の実施形態において、本発明のIGSF8抗体としては、本明細書に記載される抗体、例えば実施例7に記載されるC1~C39、またはC30~C39など、加えて実施例24に記載される抗体L1-01~L1-033、およびL2-01~L2-010(全ての参照により本明細書に組み入れられる)のいずれか1つ、加えてこのセクションに記載される抗体のいずれかが挙げられる。
明示的に示されない限り、全ての抗体およびCDR配列はIMGT番号付けスキームに基づき、ただしC1~C29はKabat番号付けスキームによって注釈が付けられる(一方で、その他、例えばC30~C39およびL1/L2誘導体に基づくものは、IMGT番号付けスキームに基づく)。加えて、C39後の重鎖のみの配列コンセンサス/モチーフ、加えて、CDR領域突然変異分析におけるCDR配列(L1/L2誘導体)も、IMGT番号付けスキームに基づく。
クエリー配列として高親和性抗IGSF8抗体C30~C39のHCVR CDR1~3配列を使用して、多数の類似したCDR配列が、権利化されているヒト抗体ライブラリーにおいて同定され、このような小さいCDRのバリエーションを有する抗体も、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)本発明の抗IGSF8抗体である。
同様に、クエリー配列として高親和性抗IGSF8抗体C30~C39のLCVR CDR1~3配列を使用して、多数の類似したCDR配列が、権利化されているヒト抗体ライブラリーにおいて同定され、このような小さいCDRのバリエーションを有する抗体も、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)本発明の抗IGSF8抗体である。
したがって、一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号469、470および471のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C30/B34のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号562、563および564のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C30/B34のLCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、LCVRを含む。
配列番号469:G Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 A、式中、Xaa1=FまたはY;Xaa2=SまたはT;Xaa3=L、FまたはI;Xaa4=R、SまたはI;Xaa5=DまたはS;およびXaa6=YまたはS。
配列番号470:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=NまたはS。
配列番号471:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=E、AまたはS、Xaa2=R、LまたはS、Xaa3=W、A、Y、V、GまたはS、Xaa4=R、LまたはS、Xaa5=L、Y、P、T、I、N、K、HまたはQ、Xaa6=L、V、F、I、G、RまたはH、Xaa7=A、Y、Vまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa8=Y、A、T、P、K、SまたはQ。
配列番号562:Xaa1 Xaa2 Xaa3 H Xaa4 Y、式中、Xaa1=K、Q、PまたはH、Xaa2=S、V、IまたはR、Xaa3=N、S、L、IまたはM、Xaa4=K、NまたはT、
配列番号563:AAS、および、
配列番号564:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 P Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=L、Q、KまたはH、Xaa2=L、Q、KまたはH、Xaa3=S、IまたはR、Xaa4=YまたはF、Xaa5=P、N、SまたはT、Xaa6=P、N、SまたはT、Xaa7=L、IまたはR、Xaa8=P、N、SまたはT。
配列番号469:G Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 A、式中、Xaa1=FまたはY;Xaa2=SまたはT;Xaa3=L、FまたはI;Xaa4=R、SまたはI;Xaa5=DまたはS;およびXaa6=YまたはS。
配列番号470:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=NまたはS。
配列番号471:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=E、AまたはS、Xaa2=R、LまたはS、Xaa3=W、A、Y、V、GまたはS、Xaa4=R、LまたはS、Xaa5=L、Y、P、T、I、N、K、HまたはQ、Xaa6=L、V、F、I、G、RまたはH、Xaa7=A、Y、Vまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa8=Y、A、T、P、K、SまたはQ。
配列番号562:Xaa1 Xaa2 Xaa3 H Xaa4 Y、式中、Xaa1=K、Q、PまたはH、Xaa2=S、V、IまたはR、Xaa3=N、S、L、IまたはM、Xaa4=K、NまたはT、
配列番号563:AAS、および、
配列番号564:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 P Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=L、Q、KまたはH、Xaa2=L、Q、KまたはH、Xaa3=S、IまたはR、Xaa4=YまたはF、Xaa5=P、N、SまたはT、Xaa6=P、N、SまたはT、Xaa7=L、IまたはR、Xaa8=P、N、SまたはT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号472、473および474のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C31/B46のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号565、566および567のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C31/B46のLCVR CDR1~3である、LCVRを含む。
配列番号472:GFTFSTYG、
配列番号473:IWDDGSYK、および、
配列番号474:A Xaa1 GYS Xaa2 S Xaa3 Xaa4 A Xaa5、式中、Xaa1=VまたはG、Xaa2=DまたはY、Xaa3=Y、DまたはS、Xaa4=R、LまたはM、Xaa5=L、IまたはS。
配列番号565:QGISTF、
配列番号566:AAS、および、
配列番号567:QQTYSTQWT。
配列番号472:GFTFSTYG、
配列番号473:IWDDGSYK、および、
配列番号474:A Xaa1 GYS Xaa2 S Xaa3 Xaa4 A Xaa5、式中、Xaa1=VまたはG、Xaa2=DまたはY、Xaa3=Y、DまたはS、Xaa4=R、LまたはM、Xaa5=L、IまたはS。
配列番号565:QGISTF、
配列番号566:AAS、および、
配列番号567:QQTYSTQWT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号475、476および477のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C32/B104のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号568、569および570のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C32/B104のLCVR CDR1~3である、LCVRを含む。
配列番号475:GYTFTNDI、
配列番号476:INAGYGNT、および、
配列番号477:ARGYYRSPTW Xaa1 D Xaa2、式中、Xaa1=FまたはI、およびXaa2=WまたはY。
配列番号568:QSISSW、
配列番号569:KAS、および、
配列番号570:QQYGDYPYT。
配列番号475:GYTFTNDI、
配列番号476:INAGYGNT、および、
配列番号477:ARGYYRSPTW Xaa1 D Xaa2、式中、Xaa1=FまたはI、およびXaa2=WまたはY。
配列番号568:QSISSW、
配列番号569:KAS、および、
配列番号570:QQYGDYPYT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号478、479および480のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C33/1C2のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号571、572および573のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C33/1C2のLCVR CDR1~3である、LCVRを含む。
配列番号478:GFTFSTYG、
配列番号479:IWDDGSYK、および、
配列番号480:ARD Xaa1 S Xaa2 W Xaa3 YAFD Xaa4、式中、Xaa1=GまたはC、Xaa2=VまたはG、Xaa3=VまたはG、およびXaa4=LまたはI。
配列番号571:Xaa1 D Xaa2 Xaa3 Xaa4 Y、式中、Xaa1=K、Q、PまたはH、Xaa2=S、N、IまたはL、Xaa3=S、IまたはR、Xaa4=いずれかの酸性残基(D/E)。
配列番号572:DAA、および、
配列番号573:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9、式中、Xaa1=L、Q、KまたはH、Xaa2=Q、K、HまたはL、Xaa3=Y、S、DまたはF、Xaa4=V、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa5=S、IまたはR、Xaa6=L、FまたはV、Xaa7=H、PまたはT、Xaa8=Y、S、FまたはD、Xaa9=P、N、SまたはT。
配列番号478:GFTFSTYG、
配列番号479:IWDDGSYK、および、
配列番号480:ARD Xaa1 S Xaa2 W Xaa3 YAFD Xaa4、式中、Xaa1=GまたはC、Xaa2=VまたはG、Xaa3=VまたはG、およびXaa4=LまたはI。
配列番号571:Xaa1 D Xaa2 Xaa3 Xaa4 Y、式中、Xaa1=K、Q、PまたはH、Xaa2=S、N、IまたはL、Xaa3=S、IまたはR、Xaa4=いずれかの酸性残基(D/E)。
配列番号572:DAA、および、
配列番号573:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9、式中、Xaa1=L、Q、KまたはH、Xaa2=Q、K、HまたはL、Xaa3=Y、S、DまたはF、Xaa4=V、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa5=S、IまたはR、Xaa6=L、FまたはV、Xaa7=H、PまたはT、Xaa8=Y、S、FまたはD、Xaa9=P、N、SまたはT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号481、482および483のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C34/1D7のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号574、575および576のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C34/1D7のLCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、LCVRを含む。
配列番号481:GFT Xaa1 Xaa2 S Xaa3 A、式中、Xaa1=VまたはF、Xaa2=NまたはS、およびXaa3=FまたはY、
配列番号482:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=SまたはG、および、
配列番号483:AR Xaa1 V Xaa2 GYGAF Xaa3 Xaa4、式中、Xaa1=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa2=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa4=LまたはI。
配列番号574:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Y、式中、Xaa1=Q、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa2=S、NまたはT、Xaa3=N、S、L、IまたはM、Xaa4=H、R、IまたはS、Xaa5=H、N、D、S、K、TまたはI、
配列番号575:GAS、および、
配列番号576:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9、式中、Xaa1=H、Q、K、LまたはP、Xaa2=H、E、Q、K、LまたはP、Xaa3=N、A、S、TまたはP、Xaa4=Y、S、V、LまたはF、Xaa5=S、IまたはR、Xaa6=V、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa7=A、Q、K、R、TまたはP、Xaa8=YまたはF、Xaa9=P、N、SまたはT。
配列番号481:GFT Xaa1 Xaa2 S Xaa3 A、式中、Xaa1=VまたはF、Xaa2=NまたはS、およびXaa3=FまたはY、
配列番号482:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=SまたはG、および、
配列番号483:AR Xaa1 V Xaa2 GYGAF Xaa3 Xaa4、式中、Xaa1=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa2=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa4=LまたはI。
配列番号574:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Y、式中、Xaa1=Q、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa2=S、NまたはT、Xaa3=N、S、L、IまたはM、Xaa4=H、R、IまたはS、Xaa5=H、N、D、S、K、TまたはI、
配列番号575:GAS、および、
配列番号576:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9、式中、Xaa1=H、Q、K、LまたはP、Xaa2=H、E、Q、K、LまたはP、Xaa3=N、A、S、TまたはP、Xaa4=Y、S、V、LまたはF、Xaa5=S、IまたはR、Xaa6=V、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa7=A、Q、K、R、TまたはP、Xaa8=YまたはF、Xaa9=P、N、SまたはT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号484、485および486のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C35/1B1のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号577、578および579のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C35/1B1のLCVR CDR1~3である、LCVRを含む。
配列番号484:GFTF Xaa1 Xaa2 Xaa3 A、式中、Xaa1=R、NまたはS、Xaa2=DまたはS、およびXaa3=FまたはY、
配列番号485:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、&Xaa2=N、SまたはG、
配列番号486:A Xaa1 Xaa2 GWE Xaa3 RTPG Xaa4 Xaa5 D Xaa6、式中、Xaa1=RまたはS、Xaa2=Vまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=VまたはG、Xaa4=DまたはY、Xaa5=L、FまたはI、およびXaa6=D、Y、HまたはS。
配列番号577:HRIFSY、
配列番号578:GAS、および、
配列番号579:QQSFSDPYT。
配列番号484:GFTF Xaa1 Xaa2 Xaa3 A、式中、Xaa1=R、NまたはS、Xaa2=DまたはS、およびXaa3=FまたはY、
配列番号485:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、&Xaa2=N、SまたはG、
配列番号486:A Xaa1 Xaa2 GWE Xaa3 RTPG Xaa4 Xaa5 D Xaa6、式中、Xaa1=RまたはS、Xaa2=Vまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=VまたはG、Xaa4=DまたはY、Xaa5=L、FまたはI、およびXaa6=D、Y、HまたはS。
配列番号577:HRIFSY、
配列番号578:GAS、および、
配列番号579:QQSFSDPYT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号487、488および489のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C36/1B4’のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVRならびに/または(b)それぞれ配列番号580、581および582のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C36/1B4のLCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、LCVRを含む。
配列番号487:GFTFSS Xaa1 A、式中、Xaa1=YまたはS、
配列番号488:ITGSGGST、および、
配列番号489:AR Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 L Xaa5 Xaa6、式中、Xaa1=DまたはG、Xaa2=Rまたは非存在、Xaa3=GまたはC、Xaa4=A、GまたはS、Xaa5=いずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa6=L、Y、IまたはV。
配列番号580:Xaa1 Xaa2 Xaa3 H Xaa4 Y、式中、Xaa1=K、Q、PまたはH、Xaa2=S、V、IまたはR、Xaa3=N、S、L、IまたはM、Xaa4=K、NまたはT、
配列番号581:SAS、および、
配列番号582:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 P Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=L、Q、KまたはH、Xaa2=L、Q、KまたはH、Xaa3=S、IまたはR、Xaa4=YまたはF、Xaa5=P、N、SまたはT、Xaa6=P、N、SまたはT、Xaa7=L、IまたはR、Xaa8=P、N、SまたはT。
配列番号487:GFTFSS Xaa1 A、式中、Xaa1=YまたはS、
配列番号488:ITGSGGST、および、
配列番号489:AR Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 L Xaa5 Xaa6、式中、Xaa1=DまたはG、Xaa2=Rまたは非存在、Xaa3=GまたはC、Xaa4=A、GまたはS、Xaa5=いずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa6=L、Y、IまたはV。
配列番号580:Xaa1 Xaa2 Xaa3 H Xaa4 Y、式中、Xaa1=K、Q、PまたはH、Xaa2=S、V、IまたはR、Xaa3=N、S、L、IまたはM、Xaa4=K、NまたはT、
配列番号581:SAS、および、
配列番号582:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 P Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=L、Q、KまたはH、Xaa2=L、Q、KまたはH、Xaa3=S、IまたはR、Xaa4=YまたはF、Xaa5=P、N、SまたはT、Xaa6=P、N、SまたはT、Xaa7=L、IまたはR、Xaa8=P、N、SまたはT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号490、491および492のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C37/3F12のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号583、584および585のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C37/3F12のLCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、LCVRを含む。
配列番号490:GFTFSSYS、
配列番号491:ISSSSSYI、
配列番号492:Xaa1 RXaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 D Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13、式中、Xaa1=CまたはG、Xaa2=PまたはQ、Xaa3=YまたはD、Xaa4=Y、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa5=FまたはL、Xaa6=WまたはL、Xaa7=S、RまたはI、Xaa8=C、VまたはG、Xaa9=W、CまたはL、Xaa10=W、CまたはG、Xaa11=Y、FまたはV、Xaa12=DまたはA、およびXaa13=H、PまたはT。
配列番号583:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6、式中、Xaa1=Q、L、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa2=D、S、G、R、TまたはI、Xaa3=N、S、L、V、TまたはI、Xaa4=H、N、S、G、R、TまたはI、Xaa5=N、A、S、E、T、PまたはI、Xaa6=Q、D、SまたはY、
配列番号584:DAS、および、
配列番号585:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10、式中、Xaa1=N、E、Q、L、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa2=N、E、Q、L、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa3=S、G、R、TまたはI、Xaa4=Y、H、D、SまたはF、Xaa5=S、G、R、T、IまたはM、Xaa6=N、A、S、T、PまたはI、Xaa7=H、L、V、RまたはI、Xaa8=A、S、Q、T、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa9=Y、H、N、S、Fまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa10=N、A、S、TまたはP。
配列番号490:GFTFSSYS、
配列番号491:ISSSSSYI、
配列番号492:Xaa1 RXaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 D Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13、式中、Xaa1=CまたはG、Xaa2=PまたはQ、Xaa3=YまたはD、Xaa4=Y、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa5=FまたはL、Xaa6=WまたはL、Xaa7=S、RまたはI、Xaa8=C、VまたはG、Xaa9=W、CまたはL、Xaa10=W、CまたはG、Xaa11=Y、FまたはV、Xaa12=DまたはA、およびXaa13=H、PまたはT。
配列番号583:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6、式中、Xaa1=Q、L、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa2=D、S、G、R、TまたはI、Xaa3=N、S、L、V、TまたはI、Xaa4=H、N、S、G、R、TまたはI、Xaa5=N、A、S、E、T、PまたはI、Xaa6=Q、D、SまたはY、
配列番号584:DAS、および、
配列番号585:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10、式中、Xaa1=N、E、Q、L、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa2=N、E、Q、L、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa3=S、G、R、TまたはI、Xaa4=Y、H、D、SまたはF、Xaa5=S、G、R、T、IまたはM、Xaa6=N、A、S、T、PまたはI、Xaa7=H、L、V、RまたはI、Xaa8=A、S、Q、T、Pまたはいずれかの塩基性残基(R/H/K)、Xaa9=Y、H、N、S、Fまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa10=N、A、S、TまたはP。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号493、494および495のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C38/2B4のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号586、587および588のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C38/2B4のLCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、LCVRを含む。
配列番号493:GFT Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 A、式中、Xaa1=FまたはC、Xaa2=R、NまたはS、Xaa3=DまたはS、およびXaa4=FまたはY、
配列番号494:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=N、SまたはG、
配列番号495:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 Xaa14 Xaa15、式中、Xaa1=E、AまたはS、Xaa2=R、SまたはI、Xaa3=VまたはG、Xaa4=Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa5=D、YまたはS、Xaa6=YまたはS、Xaa7=R、SまたはI、Xaa8=V、GまたはC、Xaa9=L、W、GまたはC、Xaa10=P、HまたはT、Xaa11=R、SまたはI、Xaa12=L、W、C、GまたはR、Xaa13=L、F、VまたはC、Xaa14=Y、DまたはA、およびXaa15=P、H、SまたはT。
配列番号586:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6、式中、Xaa1=Q、RまたはL、Xaa2=A、S、NまたはT、Xaa3=V、FまたはL、Xaa4=GまたはD、Xaa5=A、S、K、TまたはP、Xaa6=Y、L、V、FまたはI、
配列番号587:GVS、および
配列番号588:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 P Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=K、Q、LまたはH、Xaa2=Q、K、HまたはL、Xaa3=S、I、TまたはR、Xaa4=N、H、DまたはQ、Xaa5=V、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa6=A、G、V、LまたはF、Xaa7=G、RまたはL、Xaa8=K、S、PまたはT。
配列番号493:GFT Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 A、式中、Xaa1=FまたはC、Xaa2=R、NまたはS、Xaa3=DまたはS、およびXaa4=FまたはY、
配列番号494:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=N、SまたはG、
配列番号495:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 Xaa14 Xaa15、式中、Xaa1=E、AまたはS、Xaa2=R、SまたはI、Xaa3=VまたはG、Xaa4=Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa5=D、YまたはS、Xaa6=YまたはS、Xaa7=R、SまたはI、Xaa8=V、GまたはC、Xaa9=L、W、GまたはC、Xaa10=P、HまたはT、Xaa11=R、SまたはI、Xaa12=L、W、C、GまたはR、Xaa13=L、F、VまたはC、Xaa14=Y、DまたはA、およびXaa15=P、H、SまたはT。
配列番号586:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6、式中、Xaa1=Q、RまたはL、Xaa2=A、S、NまたはT、Xaa3=V、FまたはL、Xaa4=GまたはD、Xaa5=A、S、K、TまたはP、Xaa6=Y、L、V、FまたはI、
配列番号587:GVS、および
配列番号588:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 P Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=K、Q、LまたはH、Xaa2=Q、K、HまたはL、Xaa3=S、I、TまたはR、Xaa4=N、H、DまたはQ、Xaa5=V、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa6=A、G、V、LまたはF、Xaa7=G、RまたはL、Xaa8=K、S、PまたはT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、(a)それぞれ配列番号496、497および498のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)であって、モノクローナル抗体C39/8G4のHCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、HCVR;ならびに/または(b)それぞれ配列番号589、590および591のLCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む軽鎖可変領域(LCVR)であって、モノクローナル抗体C39/8G4のLCVR CDR1~3に類似しており、それを包含する、LCVRを含む。
配列番号496:GFTFSSYA、
配列番号497:ITGSGGST、および、
配列番号498:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 D Xaa7、式中、Xaa1=AまたはW、Xaa2=F、P、RまたはY、Xaa3=D、H、PまたはS、Xaa4=RまたはS、Xaa5=D、IまたはN、Xaa6=LまたはP、およびXaa7=SまたはW。
配列番号589:Xaa1 Xaa2 Xaa3 H Xaa4 Y、式中、Xaa1=K、Q、PまたはH、Xaa2=S、V、IまたはR、Xaa3=N、S、L、IまたはM、Xaa4=K、NまたはT、
配列番号590:AAS、および、
配列番号591:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 P Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=L、Q、KまたはH、Xaa2=L、Q、KまたはH、Xaa3=S、IまたはR、Xaa4=YまたはF、Xaa5=P、N、SまたはT、Xaa6=P、N、SまたはT、Xaa7=L、IまたはR、Xaa8=P、N、SまたはT。
配列番号496:GFTFSSYA、
配列番号497:ITGSGGST、および、
配列番号498:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 D Xaa7、式中、Xaa1=AまたはW、Xaa2=F、P、RまたはY、Xaa3=D、H、PまたはS、Xaa4=RまたはS、Xaa5=D、IまたはN、Xaa6=LまたはP、およびXaa7=SまたはW。
配列番号589:Xaa1 Xaa2 Xaa3 H Xaa4 Y、式中、Xaa1=K、Q、PまたはH、Xaa2=S、V、IまたはR、Xaa3=N、S、L、IまたはM、Xaa4=K、NまたはT、
配列番号590:AAS、および、
配列番号591:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 P Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=L、Q、KまたはH、Xaa2=L、Q、KまたはH、Xaa3=S、IまたはR、Xaa4=YまたはF、Xaa5=P、N、SまたはT、Xaa6=P、N、SまたはT、Xaa7=L、IまたはR、Xaa8=P、N、SまたはT。
以下の重鎖のみの配列コンセンサス/モチーフでは、CDR配列もIMGT番号付けスキームに基づく。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号499、500および501のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号499:GGTFSS Xaa1 G、式中、Xaa1=Y、NまたはD、
配列番号500:IIPIFGTA、および、
配列番号501:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 S Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=S、EまたはA、Xaa2=S、RまたはI、Xaa3=Y、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa4=Y、S、FまたはD、Xaa5=S、Cまたはあらゆる芳香族残基(F/Y/W)、Xaa6=Y、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa7=C、VまたはG、およびXaa8=YまたはD。
配列番号499:GGTFSS Xaa1 G、式中、Xaa1=Y、NまたはD、
配列番号500:IIPIFGTA、および、
配列番号501:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 S Xaa7 Xaa8、式中、Xaa1=S、EまたはA、Xaa2=S、RまたはI、Xaa3=Y、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa4=Y、S、FまたはD、Xaa5=S、Cまたはあらゆる芳香族残基(F/Y/W)、Xaa6=Y、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa7=C、VまたはG、およびXaa8=YまたはD。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号502、503および504のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号502:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Y Xaa7、式中、Xaa1=C、VまたはG、Xaa2=YまたはS、Xaa3=PまたはT、Xaa4=Y、F、LまたはI、Xaa5=NまたはT、Xaa6=H、NまたはK、およびXaa7=YまたはS、
配列番号503:INPYTGSA、および、
配列番号504:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 Xaa14、式中、Xaa1=S、EまたはA、Xaa2=S、R、KまたはG、Xaa3=H、N、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa4=S、D、TまたはA、Xaa5=P、KまたはT、Xaa6=E、R、VまたはG、Xaa7=S、H、RまたはL、Xaa8=H、N、P、LまたはQ、Xaa9=Y、SまたはD、Xaa10=H、N、K、IまたはT、Xaa11=S、G、V、CまたはA、Xaa12=M、R、LまたはI、Xaa13=H、N、G、V、Y、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa14=I、V、F、LまたはA。
配列番号502:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Y Xaa7、式中、Xaa1=C、VまたはG、Xaa2=YまたはS、Xaa3=PまたはT、Xaa4=Y、F、LまたはI、Xaa5=NまたはT、Xaa6=H、NまたはK、およびXaa7=YまたはS、
配列番号503:INPYTGSA、および、
配列番号504:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 Xaa14、式中、Xaa1=S、EまたはA、Xaa2=S、R、KまたはG、Xaa3=H、N、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa4=S、D、TまたはA、Xaa5=P、KまたはT、Xaa6=E、R、VまたはG、Xaa7=S、H、RまたはL、Xaa8=H、N、P、LまたはQ、Xaa9=Y、SまたはD、Xaa10=H、N、K、IまたはT、Xaa11=S、G、V、CまたはA、Xaa12=M、R、LまたはI、Xaa13=H、N、G、V、Y、Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa14=I、V、F、LまたはA。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号505、506および507のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号505:GFT Xaa1 NSFA、式中、Xaa1=C、FまたはV、
配列番号506:ISGSGGGT、および、
配列番号507:Xaa1 Xaa2 D Xaa3 SP Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 SGA Xaa8 D Xaa9、式中、Xaa1=EまたはA、Xaa2=N、K、TまたはQ、Xaa3=S、RまたはL、Xaa4=Y、SまたはD、Xaa5=Yまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa6=FまたはL、Xaa7=W、LまたはG、Xaa8=F、LまたはI、およびXaa9=Y、SまたはD。
配列番号505:GFT Xaa1 NSFA、式中、Xaa1=C、FまたはV、
配列番号506:ISGSGGGT、および、
配列番号507:Xaa1 Xaa2 D Xaa3 SP Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 SGA Xaa8 D Xaa9、式中、Xaa1=EまたはA、Xaa2=N、K、TまたはQ、Xaa3=S、RまたはL、Xaa4=Y、SまたはD、Xaa5=Yまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa6=FまたはL、Xaa7=W、LまたはG、Xaa8=F、LまたはI、およびXaa9=Y、SまたはD。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号508、509および510のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号508:Xaa1 FTF Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5、式中、Xaa1=CまたはG、Xaa2=N、SまたはR、Xaa3=S、NまたはD、Xaa4=Y、SまたはF、およびXaa5=SまたはA、
配列番号509:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、および、Xaa2=S、N、TまたはG、および、
配列番号510:Xaa1 Xaa2 R Xaa3 Xaa4 Xaa5 F Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 D Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13、式中、Xaa1=EまたはA、Xaa2=CまたはG、Xaa3=PまたはQ、Xaa4=YまたはD、Xaa5=Yまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa6=W、LまたはG、Xaa7=S、RまたはI、Xaa8=C、VまたはG、Xaa9=W、CまたはG、Xaa10=W、CまたはG、Xaa11=F、LまたはV、Xaa12=Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa13=H、PまたはT。
配列番号508:Xaa1 FTF Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5、式中、Xaa1=CまたはG、Xaa2=N、SまたはR、Xaa3=S、NまたはD、Xaa4=Y、SまたはF、およびXaa5=SまたはA、
配列番号509:I Xaa1 GSGG Xaa2 T、式中、Xaa1=SまたはT、および、Xaa2=S、N、TまたはG、および、
配列番号510:Xaa1 Xaa2 R Xaa3 Xaa4 Xaa5 F Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 D Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13、式中、Xaa1=EまたはA、Xaa2=CまたはG、Xaa3=PまたはQ、Xaa4=YまたはD、Xaa5=Yまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa6=W、LまたはG、Xaa7=S、RまたはI、Xaa8=C、VまたはG、Xaa9=W、CまたはG、Xaa10=W、CまたはG、Xaa11=F、LまたはV、Xaa12=Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa13=H、PまたはT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号511、512および513のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号511:Xaa1 Xaa2 TF Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6、式中、Xaa1=VまたはG、Xaa2=Y、FまたはL、Xaa3=N、SまたはR、Xaa4=S、NまたはD、Xaa5=Y、SまたはF、およびXaa6=S、DまたはA、
配列番号512:I Xaa1 GS Xaa2 G Xaa3 T、式中、Xaa1=SまたはT、Xaa2=SまたはG、およびXaa3=S、N、TまたはG、および、
配列番号513:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 GM Xaa11 Xaa12、式中、Xaa1=S、EまたはA、Xaa2=R、KまたはT、Xaa3=Nまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa4=D、TまたはA、Xaa5=KまたはT、Xaa6=E、RまたはG、Xaa7=H、RまたはL、Xaa8=HまたはP、Xaa9=YまたはD、Xaa10=S、N、K、I、YまたはT、Xaa11=Y、Vまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa12=G、IまたはV。
配列番号511:Xaa1 Xaa2 TF Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6、式中、Xaa1=VまたはG、Xaa2=Y、FまたはL、Xaa3=N、SまたはR、Xaa4=S、NまたはD、Xaa5=Y、SまたはF、およびXaa6=S、DまたはA、
配列番号512:I Xaa1 GS Xaa2 G Xaa3 T、式中、Xaa1=SまたはT、Xaa2=SまたはG、およびXaa3=S、N、TまたはG、および、
配列番号513:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 GM Xaa11 Xaa12、式中、Xaa1=S、EまたはA、Xaa2=R、KまたはT、Xaa3=Nまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa4=D、TまたはA、Xaa5=KまたはT、Xaa6=E、RまたはG、Xaa7=H、RまたはL、Xaa8=HまたはP、Xaa9=YまたはD、Xaa10=S、N、K、I、YまたはT、Xaa11=Y、Vまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa12=G、IまたはV。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号514、515および516のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号514:GYTL Xaa1 Xaa2 LS、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=いずれかの酸性残基(D/E)、
配列番号515:FDP Xaa1 Xaa2 Xaa3 E Xaa4、式中、Xaa1=EまたはQ、Xaa2=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=NまたはG、およびXaa4=IまたはT、および、
配列番号516:A Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Y Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Y Xaa11 G Xaa12 Xaa13 Xaa14 Xaa15 Xaa16 DV、式中、Xaa1=N、KまたはT、Xaa2=YまたはD、Xaa3=LまたはV、Xaa4=W、VまたはG、Xaa5=Y、SまたはD、Xaa6=Y、SまたはD、Xaa7=Yまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa8=S、RまたはI、Xaa9=SまたはR、Xaa10=VまたはG、Xaa11=Y、SまたはD、Xaa12=RまたはL、Xaa13=NまたはT、Xaa14=Y、SまたはD、Xaa15=VまたはG、およびXaa16=MまたはI。
配列番号514:GYTL Xaa1 Xaa2 LS、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=いずれかの酸性残基(D/E)、
配列番号515:FDP Xaa1 Xaa2 Xaa3 E Xaa4、式中、Xaa1=EまたはQ、Xaa2=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=NまたはG、およびXaa4=IまたはT、および、
配列番号516:A Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Y Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Y Xaa11 G Xaa12 Xaa13 Xaa14 Xaa15 Xaa16 DV、式中、Xaa1=N、KまたはT、Xaa2=YまたはD、Xaa3=LまたはV、Xaa4=W、VまたはG、Xaa5=Y、SまたはD、Xaa6=Y、SまたはD、Xaa7=Yまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa8=S、RまたはI、Xaa9=SまたはR、Xaa10=VまたはG、Xaa11=Y、SまたはD、Xaa12=RまたはL、Xaa13=NまたはT、Xaa14=Y、SまたはD、Xaa15=VまたはG、およびXaa16=MまたはI。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号517、518および519のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号517:GYT Xaa1 T Xaa2 Y Xaa3、式中、Xaa1=FまたはL、Xaa2=S、RまたはN、およびXaa3=SまたはG、
配列番号518:Xaa1 S Xaa2 Xaa3 Xaa4 G Xaa5 T、式中、Xaa1=IまたはV、Xaa2=T、F、VまたはA、Xaa3=YまたはN、Xaa4=SまたはN、およびXaa5=NまたはD、および、
配列番号519:Xaa1 K Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 Xaa14 Xaa15 Xaa16 Xaa17 Xaa18 Xaa19 D Xaa20、式中、Xaa1=EまたはA、Xaa2=YまたはD、Xaa3=F、LまたはV、Xaa4=VまたはG、Xaa5=YまたはD、Xaa6=YまたはD、Xaa7=Y、SまたはD、Xaa8=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa9=SまたはR、Xaa10=S、RまたはN、Xaa11=VまたはG、Xaa12=YまたはD、Xaa13=Y、SまたはD、Xaa14=RまたはG、Xaa15=RまたはL、Xaa16=NまたはT、Xaa17=YまたはD、Xaa18=S、CまたはG、Xaa19=M、LまたはI、およびXaa20=F、IまたはV。
配列番号517:GYT Xaa1 T Xaa2 Y Xaa3、式中、Xaa1=FまたはL、Xaa2=S、RまたはN、およびXaa3=SまたはG、
配列番号518:Xaa1 S Xaa2 Xaa3 Xaa4 G Xaa5 T、式中、Xaa1=IまたはV、Xaa2=T、F、VまたはA、Xaa3=YまたはN、Xaa4=SまたはN、およびXaa5=NまたはD、および、
配列番号519:Xaa1 K Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 Xaa14 Xaa15 Xaa16 Xaa17 Xaa18 Xaa19 D Xaa20、式中、Xaa1=EまたはA、Xaa2=YまたはD、Xaa3=F、LまたはV、Xaa4=VまたはG、Xaa5=YまたはD、Xaa6=YまたはD、Xaa7=Y、SまたはD、Xaa8=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa9=SまたはR、Xaa10=S、RまたはN、Xaa11=VまたはG、Xaa12=YまたはD、Xaa13=Y、SまたはD、Xaa14=RまたはG、Xaa15=RまたはL、Xaa16=NまたはT、Xaa17=YまたはD、Xaa18=S、CまたはG、Xaa19=M、LまたはI、およびXaa20=F、IまたはV。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号520、521および522のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号520:Xaa1 Xaa2 T Xaa3 Xaa4 DYXaa5、式中、Xaa1=RまたはG、Xaa2=FまたはL、Xaa3=C、FまたはV、Xaa4=NまたはD、およびXaa5=SまたはA、
配列番号521:I Xaa1 WNSG Xaa2 I、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=S、HまたはR、および、
配列番号522:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 F Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 D Xaa14、式中、Xaa15=EまたはA、Xaa16=CまたはG、Xaa17=RまたはL、Xaa18=PまたはQ、Xaa19=YまたはD、Xaa20=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa21=WまたはG、Xaa22=SまたはR、Xaa23=CまたはG、Xaa24=G、L、Cまたはあらゆる芳香族残基(F/Y/W)、Xaa25=Hまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa26=WまたはG、Xaa27=C、FまたはV、およびXaa28=LまたはP。
配列番号520:Xaa1 Xaa2 T Xaa3 Xaa4 DYXaa5、式中、Xaa1=RまたはG、Xaa2=FまたはL、Xaa3=C、FまたはV、Xaa4=NまたはD、およびXaa5=SまたはA、
配列番号521:I Xaa1 WNSG Xaa2 I、式中、Xaa1=SまたはT、およびXaa2=S、HまたはR、および、
配列番号522:Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 F Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 D Xaa14、式中、Xaa15=EまたはA、Xaa16=CまたはG、Xaa17=RまたはL、Xaa18=PまたはQ、Xaa19=YまたはD、Xaa20=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa21=WまたはG、Xaa22=SまたはR、Xaa23=CまたはG、Xaa24=G、L、Cまたはあらゆる芳香族残基(F/Y/W)、Xaa25=Hまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa26=WまたはG、Xaa27=C、FまたはV、およびXaa28=LまたはP。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号523、524および525のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号523:RFTFDDY Xaa1、式中、Xaa1=SまたはA、
配列番号524:ISWNSGRI、および、
配列番号525:ARYG Xaa1 P Xaa2 Xaa3 Xaa4 D Xaa5、式中、Xaa1=YまたはD、Xaa2=C、FまたはV、Xaa3=Y、SまたはD、Xaa4=C、FまたはL、およびXaa5=Y、SまたはD。
配列番号523:RFTFDDY Xaa1、式中、Xaa1=SまたはA、
配列番号524:ISWNSGRI、および、
配列番号525:ARYG Xaa1 P Xaa2 Xaa3 Xaa4 D Xaa5、式中、Xaa1=YまたはD、Xaa2=C、FまたはV、Xaa3=Y、SまたはD、Xaa4=C、FまたはL、およびXaa5=Y、SまたはD。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号526、527および528のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号526:Xaa1 Xaa2 Xaa3 F Xaa4 NY Xaa5、式中、Xaa1=VまたはG、Xaa2=YまたはS、Xaa3=YまたはS、Xaa4=SまたはR、およびXaa5=W、CまたはL、
配列番号527:IDPSNSYT、および、
配列番号528:A Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 D Xaa12、式中、Xaa1=SまたはR、Xaa2=Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=R、L、IまたはA、Xaa4=K、TまたはA、Xaa5=A、TまたはG、Xaa6=S、C、RまたはG、Xaa7=R、HまたはN、Xaa8=Y、SまたはD、Xaa9=N、K、または非存在、YまたはT、Xaa10=CまたはG、Xaa11=MまたはR、およびXaa12=F、VまたはG。
配列番号526:Xaa1 Xaa2 Xaa3 F Xaa4 NY Xaa5、式中、Xaa1=VまたはG、Xaa2=YまたはS、Xaa3=YまたはS、Xaa4=SまたはR、およびXaa5=W、CまたはL、
配列番号527:IDPSNSYT、および、
配列番号528:A Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 D Xaa12、式中、Xaa1=SまたはR、Xaa2=Aまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=R、L、IまたはA、Xaa4=K、TまたはA、Xaa5=A、TまたはG、Xaa6=S、C、RまたはG、Xaa7=R、HまたはN、Xaa8=Y、SまたはD、Xaa9=N、K、または非存在、YまたはT、Xaa10=CまたはG、Xaa11=MまたはR、およびXaa12=F、VまたはG。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号529、530および531のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号529:GFTF Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4、式中、Xaa1=SまたはN、Xaa2=SまたはN、Xaa3=YまたはF、およびXaa4=SまたはA、
配列番号530:I Xaa1 Xaa2 S Xaa3 Xaa4 Xaa5 T、式中、Xaa1=S、NまたはT、Xaa2=AまたはG、Xaa3=SまたはG、Xaa4=TまたはG、およびXaa5=S、R、TまたはG、および、
配列番号531:A Xaa1 DLGY Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 GY Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 G Xaa12 Xaa13 V、式中、Xaa1=KまたはT、Xaa2=YまたはD、Xaa3=YまたはD、Xaa4=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa5=S、RまたはI、Xaa6=SまたはR、Xaa7=YまたはS、Xaa8=E、RまたはG、Xaa9=HまたはR、Xaa10=N、KまたはT、Xaa11=Y、SまたはD、Xaa12=MまたはI、およびXaa13=NまたはD。
配列番号529:GFTF Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4、式中、Xaa1=SまたはN、Xaa2=SまたはN、Xaa3=YまたはF、およびXaa4=SまたはA、
配列番号530:I Xaa1 Xaa2 S Xaa3 Xaa4 Xaa5 T、式中、Xaa1=S、NまたはT、Xaa2=AまたはG、Xaa3=SまたはG、Xaa4=TまたはG、およびXaa5=S、R、TまたはG、および、
配列番号531:A Xaa1 DLGY Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 GY Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 G Xaa12 Xaa13 V、式中、Xaa1=KまたはT、Xaa2=YまたはD、Xaa3=YまたはD、Xaa4=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa5=S、RまたはI、Xaa6=SまたはR、Xaa7=YまたはS、Xaa8=E、RまたはG、Xaa9=HまたはR、Xaa10=N、KまたはT、Xaa11=Y、SまたはD、Xaa12=MまたはI、およびXaa13=NまたはD。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号532、533および534のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号532:GFTF Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4、式中、Xaa1=N、SまたはR、Xaa2=SまたはD、Xaa3=YまたはF、およびXaa4=SまたはA、
配列番号533:I Xaa1 Xaa2 S Xaa3 Xaa4 Xaa5 T、式中、Xaa1=S、NまたはT、Xaa2=AまたはG、Xaa3=SまたはG、Xaa4=TまたはG、およびXaa5=S、N、G、RまたはT、および、
配列番号534:A Xaa1 RG Xaa2 Y Xaa3 Xaa4 S Xaa5 Xaa6 Xaa7 YR Xaa8 Xaa9 R Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 Xaa14、式中、Xaa1=SまたはR、Xaa2=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=Y、SまたはD、Xaa4=S、TまたはA、Xaa5=E、VまたはG、Xaa6=SまたはR、Xaa7=YまたはS、Xaa8=HまたはP、Xaa9=HまたはR、Xaa10=YまたはD、Xaa11=C、DまたはG、Xaa12=MまたはL、Xaa13=NまたはD、およびXaa14=IまたはV。
配列番号532:GFTF Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4、式中、Xaa1=N、SまたはR、Xaa2=SまたはD、Xaa3=YまたはF、およびXaa4=SまたはA、
配列番号533:I Xaa1 Xaa2 S Xaa3 Xaa4 Xaa5 T、式中、Xaa1=S、NまたはT、Xaa2=AまたはG、Xaa3=SまたはG、Xaa4=TまたはG、およびXaa5=S、N、G、RまたはT、および、
配列番号534:A Xaa1 RG Xaa2 Y Xaa3 Xaa4 S Xaa5 Xaa6 Xaa7 YR Xaa8 Xaa9 R Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13 Xaa14、式中、Xaa1=SまたはR、Xaa2=いずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=Y、SまたはD、Xaa4=S、TまたはA、Xaa5=E、VまたはG、Xaa6=SまたはR、Xaa7=YまたはS、Xaa8=HまたはP、Xaa9=HまたはR、Xaa10=YまたはD、Xaa11=C、DまたはG、Xaa12=MまたはL、Xaa13=NまたはD、およびXaa14=IまたはV。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号535、536および537のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号535:G Xaa1 Xaa2 FTRYG、式中、Xaa1=YまたはS、およびXaa2=NまたはT、
配列番号536:ISTYSGNT、および、
配列番号537:Xaa1 R Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13、式中、Xaa1=SまたはA、Xaa2=A、Sまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=R、L、IまたはA、Xaa4=S、TまたはA、Xaa5=S、A、TまたはG、Xaa6=G、R、V、DまたはC、Xaa7=Y、H、RまたはQ、Xaa8=Y、SまたはD、Xaa9=Y、Nまたは非存在、Xaa10=C、VまたはG、Xaa11=MまたはI、Xaa12=いずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa13=IまたはV。
配列番号535:G Xaa1 Xaa2 FTRYG、式中、Xaa1=YまたはS、およびXaa2=NまたはT、
配列番号536:ISTYSGNT、および、
配列番号537:Xaa1 R Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 Xaa13、式中、Xaa1=SまたはA、Xaa2=A、Sまたはいずれかの酸性残基(D/E)、Xaa3=R、L、IまたはA、Xaa4=S、TまたはA、Xaa5=S、A、TまたはG、Xaa6=G、R、V、DまたはC、Xaa7=Y、H、RまたはQ、Xaa8=Y、SまたはD、Xaa9=Y、Nまたは非存在、Xaa10=C、VまたはG、Xaa11=MまたはI、Xaa12=いずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa13=IまたはV。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号538、539および540のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号538:G Xaa1 TFSTYG、式中、Xaa1=FまたはV、
配列番号539:IWDDGSYK、および、
配列番号540:A Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 D Xaa13、式中、Xaa1=S、RまたはI、Xaa2=SまたはA、Xaa3=MまたはR、Xaa4=YまたはS、Xaa5=PまたはT、Xaa6=M、R、LまたはI、Xaa7=S、DまたはA、Xaa8=RまたはL、Xaa9=R、LまたはI、Xaa10=W、VまたはG、Xaa11=W、C、LまたはG、Xaa12=F、LまたはV、およびXaa13=H、PまたはT。
配列番号538:G Xaa1 TFSTYG、式中、Xaa1=FまたはV、
配列番号539:IWDDGSYK、および、
配列番号540:A Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 D Xaa13、式中、Xaa1=S、RまたはI、Xaa2=SまたはA、Xaa3=MまたはR、Xaa4=YまたはS、Xaa5=PまたはT、Xaa6=M、R、LまたはI、Xaa7=S、DまたはA、Xaa8=RまたはL、Xaa9=R、LまたはI、Xaa10=W、VまたはG、Xaa11=W、C、LまたはG、Xaa12=F、LまたはV、およびXaa13=H、PまたはT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号541、542および543のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号541:GFTF Xaa1 Xaa2 Xaa3 A、式中、Xaa1=N、SまたはR、Xaa2=SまたはD、およびXaa3=YまたはF、
配列番号542:I Xaa1 Xaa2 SG Xaa3 Xaa4 T、式中、Xaa1=S、NまたはT、Xaa2=AまたはG、Xaa3=TまたはG、およびXaa4=S、R、NまたはG、および、
配列番号543:ARDS Xaa1 VAS Xaa2 GRG Xaa3 V Xaa4 H Xaa5 Xaa6 GM Xaa7 V、式中、Xaa1=H、NまたはT、Xaa2=T、KまたはQ、Xaa3=VまたはG、Xaa4=YまたはD、Xaa5=Y、SまたはD、Xaa6=HまたはP、およびXaa7=NまたはD。
配列番号541:GFTF Xaa1 Xaa2 Xaa3 A、式中、Xaa1=N、SまたはR、Xaa2=SまたはD、およびXaa3=YまたはF、
配列番号542:I Xaa1 Xaa2 SG Xaa3 Xaa4 T、式中、Xaa1=S、NまたはT、Xaa2=AまたはG、Xaa3=TまたはG、およびXaa4=S、R、NまたはG、および、
配列番号543:ARDS Xaa1 VAS Xaa2 GRG Xaa3 V Xaa4 H Xaa5 Xaa6 GM Xaa7 V、式中、Xaa1=H、NまたはT、Xaa2=T、KまたはQ、Xaa3=VまたはG、Xaa4=YまたはD、Xaa5=Y、SまたはD、Xaa6=HまたはP、およびXaa7=NまたはD。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号544、545および546のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号544:Xaa1 FTF Xaa2 Xaa3 Y Xaa4、式中、Xaa1=RまたはG、Xaa2=NまたはD、Xaa3=YまたはD、およびXaa4=SまたはA、
配列番号545:ISWNSG Xaa1 I、式中、Xaa1=SまたはR、および、
配列番号546:A Xaa1 Xaa2 R Xaa3 Xaa4 D Xaa5、式中、Xaa1=RまたはL、Xaa2=S、VまたはG、Xaa3=T、H、NまたはQ、Xaa4=R、LまたはV、およびXaa5=S、K、Y、Q、TまたはA。
配列番号544:Xaa1 FTF Xaa2 Xaa3 Y Xaa4、式中、Xaa1=RまたはG、Xaa2=NまたはD、Xaa3=YまたはD、およびXaa4=SまたはA、
配列番号545:ISWNSG Xaa1 I、式中、Xaa1=SまたはR、および、
配列番号546:A Xaa1 Xaa2 R Xaa3 Xaa4 D Xaa5、式中、Xaa1=RまたはL、Xaa2=S、VまたはG、Xaa3=T、H、NまたはQ、Xaa4=R、LまたはV、およびXaa5=S、K、Y、Q、TまたはA。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号547、548および549のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号547:GYTFTNYY、
配列番号548:INPYTGSA、および、
配列番号549:ARDP Xaa1 G Xaa2 VNH Xaa3 Y Xaa4 Xaa5 D Xaa6、式中、Xaa1=C、F、LまたはV、Xaa2=VまたはG、Xaa3=FまたはL、Xaa4=Y、SまたはD、Xaa5=M、R、LまたはI、およびXaa6=VまたはG。
配列番号547:GYTFTNYY、
配列番号548:INPYTGSA、および、
配列番号549:ARDP Xaa1 G Xaa2 VNH Xaa3 Y Xaa4 Xaa5 D Xaa6、式中、Xaa1=C、F、LまたはV、Xaa2=VまたはG、Xaa3=FまたはL、Xaa4=Y、SまたはD、Xaa5=M、R、LまたはI、およびXaa6=VまたはG。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号550、551および552のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号550:GGSFSGYY、
配列番号551:INHSGST、および、
配列番号552:Xaa1 Xaa2 P Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 ES Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 D Xaa13、式中、Xaa1=EまたはA、Xaa2=MまたはR、Xaa3=Y、SまたはD、Xaa4=H、NまたはT、Xaa5=SまたはR、Xaa6=SまたはA、Xaa7=W、CまたはL、Xaa8=Y、SまたはD、Xaa9=Y、SまたはD、Xaa10=Y、SまたはD、Xaa11=VまたはG、Xaa12=M、RまたはL、およびXaa13=FまたはV。
配列番号550:GGSFSGYY、
配列番号551:INHSGST、および、
配列番号552:Xaa1 Xaa2 P Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 ES Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11 Xaa12 D Xaa13、式中、Xaa1=EまたはA、Xaa2=MまたはR、Xaa3=Y、SまたはD、Xaa4=H、NまたはT、Xaa5=SまたはR、Xaa6=SまたはA、Xaa7=W、CまたはL、Xaa8=Y、SまたはD、Xaa9=Y、SまたはD、Xaa10=Y、SまたはD、Xaa11=VまたはG、Xaa12=M、RまたはL、およびXaa13=FまたはV。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号553、554および555のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号543:GYTFTNYY、
配列番号554:INPYTGSA、および、
配列番号555:AR Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11、式中、Xaa1=S、F、VまたはA、Xaa2=R、LまたはI、Xaa3=GまたはA、Xaa4=S、TまたはA、Xaa5=C、IまたはG、Xaa6=RまたはL、Xaa7=Y、SまたはD、Xaa8=C、D、VまたはG、Xaa9=M、RまたはI、Xaa10=NまたはD、およびXaa11=IまたはV。
配列番号543:GYTFTNYY、
配列番号554:INPYTGSA、および、
配列番号555:AR Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10 Xaa11、式中、Xaa1=S、F、VまたはA、Xaa2=R、LまたはI、Xaa3=GまたはA、Xaa4=S、TまたはA、Xaa5=C、IまたはG、Xaa6=RまたはL、Xaa7=Y、SまたはD、Xaa8=C、D、VまたはG、Xaa9=M、RまたはI、Xaa10=NまたはD、およびXaa11=IまたはV。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号556、557および558のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号556:GFT Xaa1 NSFA、式中、Xaa1=FまたはV、
配列番号557:ISGSGGGT、および、
配列番号558:A Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7、式中、Xaa1=RまたはL、Xaa2=S、WまたはG、Xaa3=RまたはL、Xaa4=T、H、NまたはQ、Xaa5=G、R、I、VまたはL、Xaa6=いずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa7=S、KまたはT。
配列番号556:GFT Xaa1 NSFA、式中、Xaa1=FまたはV、
配列番号557:ISGSGGGT、および、
配列番号558:A Xaa1 Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7、式中、Xaa1=RまたはL、Xaa2=S、WまたはG、Xaa3=RまたはL、Xaa4=T、H、NまたはQ、Xaa5=G、R、I、VまたはL、Xaa6=いずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa7=S、KまたはT。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体は、IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)モノクローナル抗体または抗原結合性部位/それらの断片を含み、前記モノクローナル抗体は、それぞれ配列番号559、560および561のHCVR CDR1、CDR2、およびCDR3を含む重鎖可変領域(HCVR)を含む。
配列番号559:G Xaa1 TFTRY Xaa2、式中、Xaa1=YまたはS、&Xaa2=CまたはG、
配列番号560:ISTYSGNT、および、
配列番号561:A Xaa1 G Xaa2 Xaa3 P Xaa4 R Xaa5 H Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10、式中、Xaa1=RまたはK、Xaa2=W、VまたはG、Xaa3=RまたはL、Xaa4=Y、SまたはD、Xaa5=W、VまたはG、Xaa6=YまたはD、Xaa7=C、DまたはG、Xaa8=MまたはI、Xaa9=Nまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa10=F、IまたはV。
配列番号559:G Xaa1 TFTRY Xaa2、式中、Xaa1=YまたはS、&Xaa2=CまたはG、
配列番号560:ISTYSGNT、および、
配列番号561:A Xaa1 G Xaa2 Xaa3 P Xaa4 R Xaa5 H Xaa6 Xaa7 Xaa8 Xaa9 Xaa10、式中、Xaa1=RまたはK、Xaa2=W、VまたはG、Xaa3=RまたはL、Xaa4=Y、SまたはD、Xaa5=W、VまたはG、Xaa6=YまたはD、Xaa7=C、DまたはG、Xaa8=MまたはI、Xaa9=Nまたはいずれかの酸性残基(D/E)、およびXaa10=F、IまたはV。
一部の実施形態において、本発明は、IGSF8に特異的な抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片であって、モノクローナル抗体は、(1)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つの、それぞれHCVR CDR1~CDR3と少なくとも95%(例えば、100%)同一な、またはそれにおいて最大で1、2、3、4、5、6、7、8、または9個の置換を有するHCVR CDR1~CDR3配列を含む重鎖可変領域(HCVR);および、(2)前記抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つの、それぞれLCVR CDR1~CDR3と少なくとも95%(例えば、100%)同一な、またはそれにおいて最大で1、2、3、4、5、6、7、8、または9個の置換を有するLCVR CDR1~CDR3配列を含む軽鎖可変領域(LCVR)を含む、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。特定の実施形態において、抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、抗体C1~C39の1つ、例えばC30~C39のいずれか1つのHCVR CDR1~CDR3およびLCVR CDR1~CDR3を有する。
一部の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、(a)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つのHCVR配列と少なくとも95%(例えば、100%)同一なHCVR配列;および/または、(b)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つのLCVR配列と少なくとも95%(例えば、100%)同一なLCVR配列を含む。特定の実施形態において、抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、抗体C1~C39の1つ、例えばC30~C39のいずれか1つのHCVRおよびLCVRを有する。
一部の実施形態において、本発明は、IGSF8に特異的な抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片であって、(1)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つの、それぞれHCVR CDR1~CDR3と比較して最大で1、2、または3個の残基の置換を有するHCVR CDR1~CDR3配列を含む重鎖可変領域(HCVR);および、(2)前記抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つの、それぞれLCVR CDR1~CDR3と比較して最大で1、2、または3個の残基の置換を有するLCVR CDR1~CDR3配列を含む軽鎖可変領域(LCVR)を含む、モノクローナル抗体を提供する。一部の実施形態において、CDRが5、4、または3個の残基のみを有する場合、保存された置換以外の置換は許容されない(例えば、5、4、または3個以下の残基を有するCDR中に、最大1または2個の保存的置換を有する)。
網羅的なCDR領域変異誘発分析に基づく高親和性IGSF8抗体
各CDR領域残基の相対的な重要性、加えてCDR領域を取り囲むフレームワーク領域残基を決定するために、IGSF8結合に重要な主要な残基を同定するために(または重要ではないとして同定するために)、2つの特異的な高親和性抗体を、さらなるCDR領域配列分析のために選択した。具体的には、2つのリード抗体中のそれぞれの現存する残基を、個々に19個の他のアミノ酸で置き換えて、あらゆる考えられる突然変異体を生成し、このような置換の影響を評価した。図29~36に、各置換の結果をまとめて提示する。この研究に基づいて、全ての許容できる置換(例えば、抗原結合に実質的に影響を与えないもの)に加えて好ましい置換(例えば、元の配列と比較して抗原結合を増加させるもの)を象徴するコンセンサス配列を構築し、それらを本明細書で示す。
各CDR領域残基の相対的な重要性、加えてCDR領域を取り囲むフレームワーク領域残基を決定するために、IGSF8結合に重要な主要な残基を同定するために(または重要ではないとして同定するために)、2つの特異的な高親和性抗体を、さらなるCDR領域配列分析のために選択した。具体的には、2つのリード抗体中のそれぞれの現存する残基を、個々に19個の他のアミノ酸で置き換えて、あらゆる考えられる突然変異体を生成し、このような置換の影響を評価した。図29~36に、各置換の結果をまとめて提示する。この研究に基づいて、全ての許容できる置換(例えば、抗原結合に実質的に影響を与えないもの)に加えて好ましい置換(例えば、元の配列と比較して抗原結合を増加させるもの)を象徴するコンセンサス配列を構築し、それらを本明細書で示す。
したがって、本発明の開示は、CDR領域配列のための(一部の場合において、IMGT番号付けスキームに基づきフレームワーク領域配列を取り囲む)アミノ酸コンセンサス配列であって、例えば表A1およびA2に記載されたような、抗体アミノ酸配列において修飾、置換されてもよい具体的なアミノ酸(変数「X」または「Xaa」を使用して示される)を示す配列を含む。明示的に示されない限り、全ての抗体およびCDR配列は、IMGT番号付けスキームによって注釈が付けられる。
抗体の同じVHおよび/またはVL配列に出現する可能性がある関連のCDR配列は、同列中に一緒にグループ分けされる。例えば、本発明の抗体は、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3のいずれか1つを含んでいてもよく、ここで前記VH CDR1-VH CDR3およびVL CDR1-VL CDR3は、それぞれ配列番号714、715、716、717、718および719によって表される。
さらに、各Xi位におけるアミノ酸(式中、i=1、2、3、~)は、各コンセンサス配列で特定された通り、アミノ酸の選択されたサブセットであり得る。各Xi位における列挙された具体的なアミノ酸のいずれか1つまたは複数は、そのXi位において許容される値であり得ることが予期される。例えば、配列番号714において、X2は、どのような残基であってもよく、例えばA、C、D、E、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、T、またはWであってもよい。一部の実施形態において、X2は、AまたはC、FまたはG;M、N、またはQなどである。
明示的に示されない限り、全ての抗体およびCDR配列は、IMGT番号付けスキームによって注釈が付けられる。
特定の実施形態において、表A1に記載のXi残基の定義のいずれかにおいて、「例えば」の後の残基は、元の残基と比較して、同じ位置に強化された結合を有する。表A2に、このような強化された結合を有する抗体コンセンサス配列を提供する。
したがって、特定の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、それぞれ配列番号714、715、716、717、718、および719のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3を含む。
特定の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、それぞれ配列番号720、721、722、723、724、および725のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3を含む。
特定の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、それぞれ配列番号754、755、756、757、758、および759のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3を含む。
特定の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、それぞれ配列番号760、761、762、763、764、および765のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3を含む。
特定の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、それぞれ、配列番号734、735および736のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH;および配列番号737、738および739のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVLを含む。
特定の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、それぞれ、配列番号740、741および742のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH;および配列番号743、744および745のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVLを含む。
特定の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、それぞれ、配列番号774、775および776のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH;および配列番号777、778および779のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVLを含む。
特定の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、それぞれ、配列番号780、781および782のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH;および配列番号783、784および785のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVLを含む。
例えば、一部の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、
(i)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8(配列番号714)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR1(式中、
X1は、A、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X2は、A、C、D、E、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、TまたはWであり、
X3は、A、C、D、E、F、G、H、K、L、M、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X4は、A、C、D、E、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、TまたはWであり、
X5は、A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、VまたはWであり、
X6は、C、D、E、F、G、H、I、L、N、P、Q、T、V、WまたはYであり、
X7は、A、D、E、F、G、I、K、L、M、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X8は、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、WまたはYである);
(ii)アミノ酸配列X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10(配列番号715)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR2(式中、
X3は、A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、WまたはYであり、
X4は、A、D、E、F、H、I、K、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、例えば、Rであり、
X5は、CまたはDであり、
X6は、A、D、E、FまたはGであり、例えば、G、E、またはAであり、最も好ましくはGであり、
X7は、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、T、WまたはYであり、
X8は、C、F、H、K、P、R、S、T、WまたはYであり、例えば、KまたはRであり、最も好ましくはKであり、
X9は、A、D、E、F、G、I、K、L、M、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X10は、A、C、D、F、G、H、I、K、L、P、Q、S、V、WまたはYである);
(iii)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13(配列番号716)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR3(式中、
X1は、A、C、D、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、WまたはYであり、
X2は、A、C、D、E、F、H、L、M、N、P、Q、R、V、WまたはYであり、
X3は、C、D、F、IまたはQであり、
X4は、E、F、G、H、I、K、L、M、N、PまたはQであり、
X5は、A、D、E、F、H、I、K、L、M、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X6は、A、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、WまたはYであり、
X7は、A、D、E、F、H、I、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、例えば、Yであり、
X8は、A、C、D、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、WまたはYであり、
X9は、A、E、G、I、K、L、M、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X10は、A、C、E、F、H、I、K、L、M、N、QまたはRであり、
X11は、D、F、G、H、M、N、P、R、TまたはWであり、
X12は、C、D、F、K、L、M、P、Q、RまたはWであり、例えば、RまたはKであり、
X13は、G、H、I、K、M、P、Q、R、WまたはYである);
(iv)アミノ酸配列X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号717)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR1(式中、
X4は、A、C、D、E、F、G、I、K、L、M、N、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X5は、A、C、D、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、VまたはWであり、
X6は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、M、P、Q、R、V、WまたはYであり、
X7は、C、D、E、F、G、K、L、M、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、E、G、K、M、T、V、またはWであり、
X8は、C、D、E、F、G、H、I、L、M、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、例えば、D、F、G、L、M、P、Q、S、T、V、W、またはYであり、
X9は、A、C、F、G、H、I、Q、S、T、WまたはYであり、例えば、A、C、G、Q、S、T、またはWであり、最も好ましくはWである);
(v)アミノ酸配列X6-X7-X8(配列番号718)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR2(式中、
X6は、A、C、D、F、G、H、N、RまたはSであり、例えば、A、G、H、N、RまたはSであり、最も好ましくはGであり、
X7は、A、C、D、I、K、SまたはTであり、例えば、D、S、またはTであり、最も好ましくはSであり、
X8は、A、C、D、E、F、H、I、N、P、S、T、VまたはWであり、例えば、A、D、E、F、H、N、P、T、V、またはWであり、最も好ましくはPである)
(vi)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号719)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR3(式中、
X1は、A、C、D、E、F、G、I、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X2は、A、C、D、E、F、G、I、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X3は、A、C、D、E、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X4は、D、E、F、P、QまたはYであり、例えば、E、Q、またはYであり、
X5は、G、K、L、M、N、P、Q、RまたはSであり、例えば、G、RまたはKであり、
X6は、C、D、E、F、H、I、L、M、N、P、Q、S、T、VまたはYであり、例えば、D、E、L、M、N、Q、S、T、またはVであり、
X7は、A、C、D、E、F、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、V、WまたはYであり、
X8は、A、E、F、G、I、K、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X9は、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、T、V、WまたはYである)
を含む。
(i)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8(配列番号714)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR1(式中、
X1は、A、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X2は、A、C、D、E、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、TまたはWであり、
X3は、A、C、D、E、F、G、H、K、L、M、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X4は、A、C、D、E、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、TまたはWであり、
X5は、A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、VまたはWであり、
X6は、C、D、E、F、G、H、I、L、N、P、Q、T、V、WまたはYであり、
X7は、A、D、E、F、G、I、K、L、M、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X8は、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、WまたはYである);
(ii)アミノ酸配列X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10(配列番号715)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR2(式中、
X3は、A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、WまたはYであり、
X4は、A、D、E、F、H、I、K、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、例えば、Rであり、
X5は、CまたはDであり、
X6は、A、D、E、FまたはGであり、例えば、G、E、またはAであり、最も好ましくはGであり、
X7は、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、T、WまたはYであり、
X8は、C、F、H、K、P、R、S、T、WまたはYであり、例えば、KまたはRであり、最も好ましくはKであり、
X9は、A、D、E、F、G、I、K、L、M、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X10は、A、C、D、F、G、H、I、K、L、P、Q、S、V、WまたはYである);
(iii)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13(配列番号716)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR3(式中、
X1は、A、C、D、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、WまたはYであり、
X2は、A、C、D、E、F、H、L、M、N、P、Q、R、V、WまたはYであり、
X3は、C、D、F、IまたはQであり、
X4は、E、F、G、H、I、K、L、M、N、PまたはQであり、
X5は、A、D、E、F、H、I、K、L、M、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X6は、A、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、WまたはYであり、
X7は、A、D、E、F、H、I、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、例えば、Yであり、
X8は、A、C、D、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、WまたはYであり、
X9は、A、E、G、I、K、L、M、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X10は、A、C、E、F、H、I、K、L、M、N、QまたはRであり、
X11は、D、F、G、H、M、N、P、R、TまたはWであり、
X12は、C、D、F、K、L、M、P、Q、RまたはWであり、例えば、RまたはKであり、
X13は、G、H、I、K、M、P、Q、R、WまたはYである);
(iv)アミノ酸配列X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号717)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR1(式中、
X4は、A、C、D、E、F、G、I、K、L、M、N、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X5は、A、C、D、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、VまたはWであり、
X6は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、M、P、Q、R、V、WまたはYであり、
X7は、C、D、E、F、G、K、L、M、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、E、G、K、M、T、V、またはWであり、
X8は、C、D、E、F、G、H、I、L、M、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、例えば、D、F、G、L、M、P、Q、S、T、V、W、またはYであり、
X9は、A、C、F、G、H、I、Q、S、T、WまたはYであり、例えば、A、C、G、Q、S、T、またはWであり、最も好ましくはWである);
(v)アミノ酸配列X6-X7-X8(配列番号718)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR2(式中、
X6は、A、C、D、F、G、H、N、RまたはSであり、例えば、A、G、H、N、RまたはSであり、最も好ましくはGであり、
X7は、A、C、D、I、K、SまたはTであり、例えば、D、S、またはTであり、最も好ましくはSであり、
X8は、A、C、D、E、F、H、I、N、P、S、T、VまたはWであり、例えば、A、D、E、F、H、N、P、T、V、またはWであり、最も好ましくはPである)
(vi)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号719)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR3(式中、
X1は、A、C、D、E、F、G、I、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X2は、A、C、D、E、F、G、I、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X3は、A、C、D、E、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X4は、D、E、F、P、QまたはYであり、例えば、E、Q、またはYであり、
X5は、G、K、L、M、N、P、Q、RまたはSであり、例えば、G、RまたはKであり、
X6は、C、D、E、F、H、I、L、M、N、P、Q、S、T、VまたはYであり、例えば、D、E、L、M、N、Q、S、T、またはVであり、
X7は、A、C、D、E、F、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、V、WまたはYであり、
X8は、A、E、F、G、I、K、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X9は、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、T、V、WまたはYである)
を含む。
別の例として、一部の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、
(i)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8(配列番号720)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR1(式中、
X1は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、Rであり、
X2は、A、C、D、E、F、G、H、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、VまたはWであり、例えば、Gであり、
X3は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X4は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X5は、I、K、L、M、P、Q、V、WまたはYであり、例えば、Kであり、
X6は、F、G、H、I、K、L、M、P、Q、T、V、WまたはYであり、
X7は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、F、SまたはNであり、より好ましくはFであり、
X8は、A、C、D、E、F、H、K、L、M、N、P、Q、R、TまたはVである);
(ii)アミノ酸配列X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号721)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR2(式中、
X2は、A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X3は、A、C、E、F、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、S、VまたはYであり、
X4は、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、SまたはVであり、
X5は、A、C、F、H、K、L、M、P、Q、R、S、T、VまたはWであり、例えば、Mであり、
X6は、A、C、E、F、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、VまたはWであり、例えば、Fであり、
X7は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X8は、A、C、F、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、G、N、R、S、またはTであり、より好ましくはGまたはSであり、
X9は、C、D、E、F、G、H、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYである);
(iii)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15(配列番号722)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR3(式中、
X1は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X2は、F、G、H、IまたはTであり、
X3は、A、C、D、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X4は、D、E、F、H、N、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、Dであり、
X5は、A、H、I、L、M、N、QまたはYであり、
X6は、A、C、D、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、S、T、VまたはYであり、
X7は、A、C、E、F、H、K、M、N、P、Q、S、T、WまたはYであり、
X8は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、VまたはWであり、
X9は、A、C、D、E、F、H、I、K、L、N、Q、R、S、V、WまたはYであり、
X10は、A、C、D、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、V、WまたはYであり、
X11は、A、C、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X12は、F、H、I、K、N、P、Q、R、V、WまたはYであり、例えば、FまたはYであり、
X13は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X14は、D、F、G、H、P、QまたはTであり、例えば、Tであり、
X15は、D、E、F、G、I、K、L、N、P、Q、R、SまたはTである);
(iv)アミノ酸配列X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号723)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR1(式中、
X4は、A、C、D、E、F、G、I、K、M、N、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、Eであり、
X5は、C、D、E、H、K、L、M、Q、T、WまたはYであり、例えば、Dであり、
X6は、A、C、D、E、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X7は、C、E、G、I、L、M、P、Q、V、WまたはYであり、
X8は、C、M、P、Q、TまたはWであり、例えば、Pであり、
X9は、A、C、E、F、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、VまたはYであり、例えば、Yである);
(v)アミノ酸配列X6-X7-X8(配列番号724)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR2(式中、
X6は、C、H、I、L、M、N、P、Q、WまたはYであり、例えば、HまたはQであり、
X7は、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、S、T、またはVであり、より好ましくはSまたはTであり、
X8は、C、D、E、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、S、WまたはYである);および
(vi)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号725)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR3(式中、
X1は、C、D、F、G、I、K、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X2は、A、C、D、F、G、I、L、M、N、P、Q、R、S、T、VまたはWである、
X3は、C、E、G、K、M、P、S、VまたはWである、
X4は、C、H、L、M、P、Q、R、VまたはWであり、例えば、Pであり、
X5は、C、D、E、F、L、M、P、VまたはWであり、例えば、Fであり、
X6は、A、C、E、G、H、K、M、N、P、Q、R、VまたはWであり、例えば、A、N、P、R、またはWであり、
X7は、A、C、D、E、G、H、I、K、M、N、P、R、S、T、V、WまたはYであり、
X8は、A、C、D、E、G、K、M、N、P、Q、R、SまたはWであり、例えば、D、P、S、またはWであり、
X9は、C、D、E、F、G、H、K、L、M、Q、R、T、V、WまたはYである)
を含む。
(i)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8(配列番号720)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR1(式中、
X1は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、Rであり、
X2は、A、C、D、E、F、G、H、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、VまたはWであり、例えば、Gであり、
X3は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X4は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X5は、I、K、L、M、P、Q、V、WまたはYであり、例えば、Kであり、
X6は、F、G、H、I、K、L、M、P、Q、T、V、WまたはYであり、
X7は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、F、SまたはNであり、より好ましくはFであり、
X8は、A、C、D、E、F、H、K、L、M、N、P、Q、R、TまたはVである);
(ii)アミノ酸配列X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号721)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR2(式中、
X2は、A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X3は、A、C、E、F、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、S、VまたはYであり、
X4は、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、SまたはVであり、
X5は、A、C、F、H、K、L、M、P、Q、R、S、T、VまたはWであり、例えば、Mであり、
X6は、A、C、E、F、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、VまたはWであり、例えば、Fであり、
X7は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X8は、A、C、F、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、G、N、R、S、またはTであり、より好ましくはGまたはSであり、
X9は、C、D、E、F、G、H、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYである);
(iii)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15(配列番号722)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVH CDR3(式中、
X1は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X2は、F、G、H、IまたはTであり、
X3は、A、C、D、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X4は、D、E、F、H、N、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、Dであり、
X5は、A、H、I、L、M、N、QまたはYであり、
X6は、A、C、D、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、S、T、VまたはYであり、
X7は、A、C、E、F、H、K、M、N、P、Q、S、T、WまたはYであり、
X8は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、VまたはWであり、
X9は、A、C、D、E、F、H、I、K、L、N、Q、R、S、V、WまたはYであり、
X10は、A、C、D、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、V、WまたはYであり、
X11は、A、C、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X12は、F、H、I、K、N、P、Q、R、V、WまたはYであり、例えば、FまたはYであり、
X13は、A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、
X14は、D、F、G、H、P、QまたはTであり、例えば、Tであり、
X15は、D、E、F、G、I、K、L、N、P、Q、R、SまたはTである);
(iv)アミノ酸配列X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号723)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR1(式中、
X4は、A、C、D、E、F、G、I、K、M、N、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、Eであり、
X5は、C、D、E、H、K、L、M、Q、T、WまたはYであり、例えば、Dであり、
X6は、A、C、D、E、F、G、H、K、M、N、P、Q、R、T、V、WまたはYであり、
X7は、C、E、G、I、L、M、P、Q、V、WまたはYであり、
X8は、C、M、P、Q、TまたはWであり、例えば、Pであり、
X9は、A、C、E、F、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、VまたはYであり、例えば、Yである);
(v)アミノ酸配列X6-X7-X8(配列番号724)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR2(式中、
X6は、C、H、I、L、M、N、P、Q、WまたはYであり、例えば、HまたはQであり、
X7は、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、WまたはYであり、例えば、S、T、またはVであり、より好ましくはSまたはTであり、
X8は、C、D、E、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、S、WまたはYである);および
(vi)アミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9(配列番号725)を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるVL CDR3(式中、
X1は、C、D、F、G、I、K、M、N、P、Q、S、T、V、WまたはYであり、
X2は、A、C、D、F、G、I、L、M、N、P、Q、R、S、T、VまたはWである、
X3は、C、E、G、K、M、P、S、VまたはWである、
X4は、C、H、L、M、P、Q、R、VまたはWであり、例えば、Pであり、
X5は、C、D、E、F、L、M、P、VまたはWであり、例えば、Fであり、
X6は、A、C、E、G、H、K、M、N、P、Q、R、VまたはWであり、例えば、A、N、P、R、またはWであり、
X7は、A、C、D、E、G、H、I、K、M、N、P、R、S、T、V、WまたはYであり、
X8は、A、C、D、E、G、K、M、N、P、Q、R、SまたはWであり、例えば、D、P、S、またはWであり、
X9は、C、D、E、F、G、H、K、L、M、Q、R、T、V、WまたはYである)
を含む。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、上述したコンセンサスCDR配列を有するもの)は、表DおよびGに列挙された抗体のいずれか1つの、少なくとも1、2、または3つの(例えば、3つ全ての)対応するVH CDRを含む。
例えば、一実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された抗体のいずれか1つのVH CDR1配列に同一なVH CDR1配列を有していてもよい。一実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR2配列を有していてもよい。一実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された抗体のいずれか1つのVH CDR3配列に同一なVH CDR3配列を有していてもよい。
別の実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVH CDR1配列に同一なVH CDR1配列;および表Dに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR2配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR1配列;および表Dに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVH CDR3配列に同一なVH CDR3配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR2配列;および表Dに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVH CDR3配列に同一なVH CDR3配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。
さらに別の実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVH CDR1配列に同一なVH CDR1配列;表Dに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR2配列;および表Dに列挙された第3の抗体のいずれか1つのVH CDR3配列に同一なVH CDR3配列を有していてもよく、第1、第2、および第3の抗体は、同一であるか、または異なる(例えば、2つが同じ抗体由来であり、1つが別の抗体由来であるか、または3つ全てが異なる抗体由来である)。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、上述したコンセンサスCDR配列を有するもの)は、表Gに列挙された抗体のいずれか1つの少なくとも1、2、または3つの(例えば、3つ全ての)対応するVH CDRを含む。
例えば、一実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された抗体のいずれか1つのVH CDR1配列に同一なVH CDR1配列を有していてもよい。一実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR2配列を有していてもよい。一実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された抗体のいずれか1つのVH CDR3配列に同一なVH CDR3配列を有していてもよい。
別の実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVH CDR1配列に同一なVH CDR1配列;および表Gに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR2配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR1配列;および表Gに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVH CDR3配列に同一なVH CDR3配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR2配列;および表Gに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVH CDR3配列に同一なVH CDR3配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。
さらに別の実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVH CDR1配列に同一なVH CDR1配列;表Gに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVH CDR2配列に同一なVH CDR2配列;および表Gに列挙された第3の抗体のいずれか1つのVH CDR3配列に同一なVH CDR3配列を有していてもよく、第1、第2、および第3の抗体は、同一であるか、または異なる(例えば、2つが同じ抗体由来であり、1つが別の抗体由来であるか、または3つ全てが異なる抗体由来である)。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、上述したコンセンサスCDR配列を有するもの)のVH CDR1、VH CDR2、および/またはVH CDR3は、それぞれ、または集合的に、表Dに列挙された抗体のいずれか1つの対応するVH CDR1、VH CDR2、および/またはVH CDR3のアミノ酸配列と比べて、1、2、3、4、5、またはそれより多くの変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、上述したコンセンサスCDR配列を有するもの)のVH CDR1、VH CDR2、および/またはVH CDR3は、それぞれ、または集合的に、表Gに列挙された抗体のいずれか1つの対応するVH CDR1、VH CDR2、および/またはVH CDR3のアミノ酸配列と比べて、1、2、3、4、5、またはそれより多くの変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、上述したコンセンサスCDR配列を有するもの)は、表Dに列挙された抗体のいずれか1つの少なくとも1、2、または3つの(例えば、3つ全ての)対応するVL CDRを含む。
例えば、一実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された抗体のいずれか1つのVL CDR1配列に同一なVL CDR1配列を有していてもよい。一実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR2配列を有していてもよい。一実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された抗体のいずれか1つのVL CDR3配列に同一なVL CDR3配列を有していてもよい。
別の実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVL CDR1配列に同一なVL CDR1配列;および表Dに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR2配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR1配列;および表Dに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVL CDR3配列に同一なVL CDR3配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR2配列;および表Dに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVL CDR3配列に同一なVL CDR3配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。
さらに別の実施形態において、本発明の抗体は、表Dに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVL CDR1配列に同一なVL CDR1配列;表Dに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR2配列;および表Dに列挙された第3の抗体のいずれか1つのVL CDR3配列に同一なVL CDR3配列を有していてもよく、第1、第2、および第3の抗体は、同一であるか、または異なる(例えば、2つが同じ抗体由来であり、1つが別の抗体由来であるか、または3つ全てが異なる抗体由来である)。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、上述したコンセンサスCDR配列を有するもの)は、表Gに列挙された抗体のいずれか1つの少なくとも1、2、または3つの(例えば、3つ全ての)対応するVL CDRを含む。
例えば、一実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された抗体のいずれか1つのVL CDR1配列に同一なVL CDR1配列を有していてもよい。一実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR2配列を有していてもよい。一実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された抗体のいずれか1つのVL CDR3配列に同一なVL CDR3配列を有していてもよい。
別の実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVL CDR1配列に同一なVL CDR1配列;および表Gに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR2配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR1配列;および表Gに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVL CDR3配列に同一なVL CDR3配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR2配列;および表Gに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVL CDR3配列に同一なVL CDR3配列を有していてもよく、第1および第2の抗体は、同一であるか、または異なる。
さらに別の実施形態において、本発明の抗体は、表Gに列挙された第1の抗体のいずれか1つのVL CDR1配列に同一なVL CDR1配列;表Gに列挙された第2の抗体のいずれか1つのVL CDR2配列に同一なVL CDR2配列;および表Gに列挙された第3の抗体のいずれか1つのVL CDR3配列に同一なVL CDR3配列を有していてもよく、第1、第2、および第3の抗体は、同一であるか、または異なる(例えば、2つが同じ抗体由来であり、1つが別の抗体由来であるか、または3つ全てが異なる抗体由来である)。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、上述したコンセンサスCDR配列を有するもの)のVL CDR1、VL CDR2、および/またはVL CDR3は、それぞれ、または集合的に、表Dに列挙された抗体のいずれか1つの対応するVL CDR1、VL CDR2、および/またはVL CDR3のアミノ酸配列と比べて、1、2、3、4、5、またはそれより多くの変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
一部の実施形態において、本発明の抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片(例えば、上述したコンセンサスCDR配列を有するもの)のVL CDR1、VL CDR2、および/またはVL CDR3は、それぞれ、または集合的に、表Gに列挙された抗体のいずれか1つの対応するVL CDR1、VL CDR2、および/またはVL CDR3のアミノ酸配列と比べて、1、2、3、4、5、またはそれより多くの変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
6つのCDR領域配列によって定義された具体的な抗体に関する以下の実施形態のいずれかにおいて、VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれの列挙された配列番号のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、それからなり、VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれの列挙された配列番号のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、それからなることが明示的に予期されるが、簡単にするために、以下の記載のみ移行句「含む」を使用する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号611、623および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号612、623および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号611、624および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号611、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号613、623および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、623および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号615、623および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号616、623および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号611、626および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号611、627および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号617、623および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号611、628および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号611、629および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号611、630および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号618、623および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、629および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号619、629および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号615、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号620、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号621、635および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号620、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号619、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号622、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号615、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、629および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、602および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、628および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、603および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、624および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、604および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号601、603および605のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号614、625および631のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号643、644および646のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号652、653および655のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号643、644および646のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号652、654および655のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号643、645および646のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号652、653および655のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号643、645および646のアミノ酸配列を含むVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3、ならびにそれぞれ配列番号652、654および655のアミノ酸配列を含むVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む。
フレームワーク領域(FR)
本発明の開示による抗IGSF抗体またはその抗原結合性断片は、表Dおよび/もしくは表Gに記載されるアミノ酸配列のフレームワーク領域(FR)、または表Dおよび/もしくは表Gに記載されるFRのアミノ酸配列と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)配列のいずれかを使用して調製することができる。
本発明の開示による抗IGSF抗体またはその抗原結合性断片は、表Dおよび/もしくは表Gに記載されるアミノ酸配列のフレームワーク領域(FR)、または表Dおよび/もしくは表Gに記載されるFRのアミノ酸配列と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)配列のいずれかを使用して調製することができる。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、表DまたはGに列挙された抗体のいずれか1つの対応する重鎖フレームワーク領域の、重鎖フレームワーク領域1(VH FR1)、重鎖フレームワーク領域2(VH FR2)、重鎖フレームワーク領域3(VH FR3)、および/もしくは重鎖フレームワーク領域4(VH FR4)の1、2、3つ、もしくは全て(すなわち、4つ)、または表Dまたは表Gに記載の抗体のいずれか1つの対応するVH FRアミノ酸配列と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含むVH FR1、VH FR2、VH FR3および/もしくはVH FR4を含む重鎖可変領域(VH)を有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、配列番号606、647もしくは648のVH FR1、または配列番号606、647もしくは648と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、配列番号607、649もしくは650のVH FR2、または配列番号607、649もしくは650と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、配列番号608もしくは651のVH FR3、または配列番号608もしくは651と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、配列番号609もしくは610のVH FR4、または配列番号609もしくは610と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号606、607、608および/もしくは609のアミノ酸配列、または配列番号606、607、608、および/もしくは609と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む、VH FR1、VH FR2、VH FR3および/またはVH FR4の1、2、3つ、または全てを含むVHを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号606、607、608および/もしくは609のアミノ酸配列、または配列番号606、607、608、および/もしくは610と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む、VH FR1、VH FR2、VH FR3および/またはVH FR4の1、2、3つ、または全てを含むVHを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号647、649、651および/もしくは610のアミノ酸配列、または配列番号647、649、651および/または610と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む、VH FR1、VH FR2、VH FR3および/またはVH FR4の1、2、3つ、または全てを含むVHを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号648、649、651および/もしくは610のアミノ酸配列、または配列番号648、649、651および/または610と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む、VH FR1、VH FR2、VH FR3および/またはVH FR4の1、2、3つ、または全てを含むVHを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号648、650、651および/もしくは610のアミノ酸配列、または配列番号648、650、651および/または610と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含む、VH FR1、VH FR2、VH FR3および/またはVH FR4の1、2、3つ、または全てを含むVHを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性断片は、表DまたはGに列挙された抗体のいずれか1つの対応する軽鎖フレームワーク領域の、軽鎖フレームワーク領域1(VL FR1)、軽鎖フレームワーク領域2(VL FR2)、軽鎖フレームワーク領域3(VL FR3)、および/もしくは軽鎖フレームワーク領域4(VL FR4)、または表Dまたは表Gに記載の抗体のいずれか1つの対応するVL FRアミノ酸配列と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全て(すなわち、4つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、配列番号632、633、656もしくは657、または配列番号632、633、656または657と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列のVL FR1を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、配列番号634、635、636、637、658もしくは659、または配列番号634、635、636、637、658または659と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列のVL FR2を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、配列番号638、639、640、660、661、662もしくは663、または配列番号638、639、640、660、661、662または663と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列のVL FR3を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、配列番号641、642、664もしくは665、または配列番号641、642、664または665と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列のVL FR4を含む。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号632、634、638および/もしくは641のアミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4、または配列番号632、634、638および/または641と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号633、635、639および/もしくは642のアミノ酸配列、または配列番号633、635、639および/または642と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号632、635、639および/もしくは64247のアミノ酸配列、または配列番号632、635、639および/または642と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号632、636、639および/もしくは642のアミノ酸配列、または配列番号632、636、639および/または642と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号632、637、640および/もしくは642のアミノ酸配列、または配列番号632、637、639および/または642と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号656、658、660および/もしくは664のアミノ酸配列、または配列番号656、658、660および/または664と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号657、659、661および/もしくは665のアミノ酸配列、または配列番号657、659、661および/または665と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号657、659、662および/もしくは665のアミノ酸配列、または配列番号657、659、662および/または665と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
一部の実施形態において、抗IGSF8抗体は、それぞれ配列番号657、659、663および/もしくは665のアミノ酸配列、または配列番号657、659、663および/または665と実質的に同一な(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、または99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3および/またはVL FR4の1、2、3つ、または全てを含むVLを有する。
いくつかの実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片は、ヒト-マウスキメラ抗体、ヒト化抗体、CDRグラフト化抗体、または再表面化抗体である。
いくつかの実施形態において、その抗原結合断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、単鎖FvまたはscFv、ジスルフィド連結Fv、V-NARドメイン、IgNar、イントラボディ、IgGΔCH2、ミニボディ、F(ab’)3、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、単一ドメイン抗体、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2、またはscFv-FCである。
いくつかの実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片は、約25nM、20nM、15nM、10nM、5nM、2nM、または1nM未満のKdでIGSF8と結合する。
いくつかの実施形態において、抗体は複数の生物種由来のIGSF8に結合する。例えば、いくつかの実施形態において、抗体はヒトIGSF8に結合し、また、マウス、ラット、イヌ、モルモット、およびカニクイザルから選択される少なくとも1つの非ヒト哺乳動物のIGSF8に結合する。
いくつかの実施形態において、多選択性抗体が提供される。いくつかの実施形態において、二重特異性抗体が提供される。非限定的な例示的二重特異性抗体は、第1の抗原と結合する重鎖/軽鎖の組合せを含む第1のアームと、第2の抗原と結合する重鎖/軽鎖の組合せを含む第2のアームとを含む抗体を含む。さらなる非限定的な例示的多特異性抗体は、二重可変ドメイン抗体である。いくつかの実施形態において、二重特異性抗体は、IGSF8の結合を阻害する第1のアームと、例えばCD3と結合することによりT細胞を刺激する第2のアームとを含む。
本発明の他の態様は、上記の本発明のモノクローナル抗体またはその抗原結合断片と競合するモノクローナル抗体またはその抗原結合断片を提供する。
特定の実施形態において、抗体またはその抗原結合性部位/断片は、好ましくは5nM以下、2nM以下、または1nM以下のKDで、IGSF8のD1 ECD(またはIg-Vセットドメイン)と特異的に結合する。
特定の実施形態において、抗体またはその抗原結合性部位/断片は、KIR3DL1/2へのIGSF8の結合を阻害する。
特定の実施形態において、抗体またはその抗原結合性部位/断片は、KIR3DL1/2のD2ドメインへの、例えばKIR3DL1/2のS165、I171、および/またはM186を含むエピトープへのIGSF8の結合を阻害する。
本発明の別の態様は、IGSF8のD1 ECD(またはIg-Vセットドメイン)と特異的に結合し、KIR3DL1/2への結合、例えば、KIR3DL1/2のD2ドメイン(例えば、KIR3DL1/2のS165、I171、および/またはM186を含むエピトープ)への結合を阻害するモノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片を提供する。
一部の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片は、5nM以下、2nM以下、または1nM以下のKDを有する。
関連する態様において、本発明はまた、本発明のモノクローナル抗体をコードするポリヌクレオチド、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片も提供する。以下の別のセクションを参照されたい。
関連する態様において、本発明はまた、ストリンジェントな条件下で、本発明のポリヌクレオチド、またはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチドも提供する。
関連する態様において、本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターも提供する。以下の別のセクションを参照されたい。
関連する態様において、本発明はまた、コードされたモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現させるための、本発明のポリヌクレオチド、または本発明のベクターを含む宿主細胞も提供する。以下の別のセクションを参照されたい。
関連する態様において、本発明はまた、本発明のモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を生産する方法であって、(i)前記モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現させるのに好適な条件下で、前記モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現することが可能な本発明の宿主細胞を培養する工程;および(ii)発現されたモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を回収/単離/精製する工程を含む方法も提供する。
関連する態様において、本発明はまた、少なくとも1種の本発明の抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を含むデバイスまたはキットであって、必要に応じて、少なくとも1種の前記抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、もしくはその抗原結合性部位/断片、または少なくとも1種の前記抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、もしくはその抗原結合性部位/断片を含む複合体を検出するための標識を含むデバイスまたはキットも提供する。
本発明の開示による抗IGSF8抗体は、本明細書で示される抗体配列(例えば、可変ドメインアミノ酸配列、可変ドメインアミノ酸配列対、CDRアミノ酸配列、可変ドメインCDRアミノ酸配列セット、可変ドメインCDRアミノ酸配列セット対、および/またはフレームワーク領域アミノ酸配列)のいずれかを使用して調製でき、いずれも、例えば、モノクローナル抗体、多重特異性抗体、キメラ抗体、抗体ミメティック、scFv、または抗体断片として調製することができる。
KIR3DL1/2抗体
本発明の一態様は、KIR3DL1/2に特異的なモノクローナル抗体を提供する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、KIR3DL1/2の細胞外ドメイン(ECD)に特異的である。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8結合に関与するKIR3DL1/2の第2のIg様細胞外ドメイン(D2ドメイン)に特異的である。一部の実施形態において、IGSF8への結合をブロックする抗体が提供される。特定の実施形態において、抗KIR3DL1/2モノクローナル抗体は、KIR3DL2および/またはKIR3DL1へのIGSF8の結合を阻害し、例えば、KIR3DL1/2の残基S165、I171、および/またはM186へのIGSF8の結合を阻害する。
本発明の一態様は、KIR3DL1/2に特異的なモノクローナル抗体を提供する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、KIR3DL1/2の細胞外ドメイン(ECD)に特異的である。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8結合に関与するKIR3DL1/2の第2のIg様細胞外ドメイン(D2ドメイン)に特異的である。一部の実施形態において、IGSF8への結合をブロックする抗体が提供される。特定の実施形態において、抗KIR3DL1/2モノクローナル抗体は、KIR3DL2および/またはKIR3DL1へのIGSF8の結合を阻害し、例えば、KIR3DL1/2の残基S165、I171、および/またはM186へのIGSF8の結合を阻害する。
特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、ヒトKIR3DL1/2に特異的である。一部の実施形態において、抗KIR3DL1/2抗体は、KIR3DL1/2を介してIGSF8によって媒介されるシグナル伝達を阻害する。特定の実施形態において、モノクローナル抗体は、IGSF8への結合に関して、抗KIR3DL1/2抗体のいずれか1つと競合する。
特定の実施形態において、抗KIR3DL1/2抗体は、ヒト-マウスキメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、CDRグラフト抗体、または再表面化抗体である。
特定の実施形態において、その抗原結合性断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、単鎖FvもしくはscFv、ジスルフィド連結されたFv、V-NARドメイン、IgNar、イントラボディ、IgGΔCH2、ミニボディ、F(ab’)3、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、単一ドメイン抗体、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2、またはscFv-Fcである。
特定の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、約25nM未満、20nM未満、15nM未満、10nM未満、5nM未満、2nM未満、または1nM未満のKdでKIR3DL1/2と結合する。
関連する態様は、KIR3DL1/2への結合に関して、本発明のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片と競合するモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
特定の実施形態において、抗体またはその抗原結合性部位/断片は、KIR3DL1/2の第2/中間/D2 ECDと、好ましくは5nM以下、2nM以下、または1nM以下のKDで特異的に結合する。
特定の実施形態において、抗体またはその抗原結合性部位/断片は、KIR3DL1/2へのIGSF8の結合を阻害する。
本発明の別の態様は、KIR3DL1/2の中間/D2 ECDと特異的に結合する(例えば、残基S165、I171、および/またはM186を含むエピトープと特異的に結合する)モノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片であって、KIR3DL1/2へのIGSF8の結合を阻害する、モノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片を提供する。
特定の実施形態において、モノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片は、5nM以下、2nM以下、または1nM以下のKDを有する。
7.ヒト化抗体
いくつかの実施形態において、IGSF8抗体はヒト化抗体である。ヒト化抗体は、抗体治療剤に対する免疫応答が生じ、治療薬の有効性が低下させ得る、非ヒト抗体に対するヒトの免疫応答(例えばヒト抗マウス抗体(HAMA)応答)を低減または排除するために、治療用分子として有用である。
いくつかの実施形態において、IGSF8抗体はヒト化抗体である。ヒト化抗体は、抗体治療剤に対する免疫応答が生じ、治療薬の有効性が低下させ得る、非ヒト抗体に対するヒトの免疫応答(例えばヒト抗マウス抗体(HAMA)応答)を低減または排除するために、治療用分子として有用である。
抗体は、標準的な方法によってヒト化し得る。ヒト化の非限定的な例示的方法には、例えば、米国特許第5,530,101号;第5,585,089号;第5,693,761号;第5,693,762号;第6,180,370号;Jonesら、Nature 321:522~525(1986);Riechmannら、Nature 332:323~27(1988);Verhoeyenら、Science 239:1534~36(1988);および米国特許公開第2009/0136500号に記載の方法が含まれ、これらは全て参照により組み込まれる。
ヒト化抗体は、非ヒト可変領域のフレームワーク領域の少なくとも1つのアミノ酸が、ヒトフレームワーク領域の対応する位置のアミノ酸に置換されている抗体である。いくつかの実施形態において、非ヒト可変領域のフレームワーク領域の少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、少なくとも6つ、少なくとも7つ、少なくとも8つ、少なくとも9つ、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも15、または少なくとも20のアミノ酸が、1つまたは複数のヒトフレームワーク領域の1つまたは複数の対応する位置からのアミノ酸に置換されている。
いくつかの実施形態において、置換に使用される対応するヒトアミノ酸のいくつかは、異なるヒト免疫グロブリン遺伝子のフレームワーク領域由来である。すなわち、いくつかのそのような実施形態において、非ヒトアミノ酸の1つまたは複数は、第1のヒト抗体のヒトフレームワーク領域由来の、または第1のヒト免疫グロブリン遺伝子によってコードされる対応するアミノ酸で置換されてもよく、非ヒトアミノ酸の1つまたは複数は、第2のヒト抗体のヒトフレームワーク領域由来の、または第2のヒト免疫グロブリン遺伝子によってコードされる対応するアミノ酸で置換されていてもよく、非ヒトアミノ酸の1つまたは複数は、第3のヒト抗体のヒトフレームワーク領域由来の、または第3のヒト免疫グロブリン遺伝子によってコードされる対応するアミノ酸で置換されていてもよい。さらに、いくつかの実施形態において、単一のフレームワーク領域、例えば、FR2において置換のために使用される対応するヒトアミノ酸の全てが、同一のヒトフレームワーク由来のものである必要はない。しかし、いくつかの実施形態において、置換に使用される対応するヒトアミノ酸の全てが同一ヒト抗体由来であるか、または同一のヒト免疫グロブリン遺伝子によってコードされている。
いくつかの実施形態において、1つまたは複数のフレームワーク領域全体を対応するヒトフレームワーク領域で置換することにより、抗体がヒト化される。いくつかの実施形態において、置換される非ヒトフレームワーク領域に対して最も高いレベルの相同性を有するヒトフレームワーク領域が選択される。いくつかの実施形態において、このようなヒト化抗体はCDRグラフト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CDRグラフト化に続いて、1つまたは複数のフレームワークアミノ酸がマウスフレームワーク領域で対応するアミノ酸に戻される。このような「戻し変異」は、いくつかの実施形態において、1つまたは複数のCDRの構造に寄与すると思われる、および/または抗原接触に関与し得る、および/または抗体の全体的な構造的統合性に関与すると思われる、1つまたは複数のマウスフレームワークアミノ酸を保持するために行われる。いくつかの実施形態において、10以下、9以下、8以下、7以下、6以下、5以下、4以下、3以下、2以下、1、または0の変異が、CDRグラフト化後の抗体のフレームワーク領域になされる。
いくつかの実施形態において、ヒト化抗体はまた、ヒト重鎖定常領域および/またはヒト軽鎖定常領域を含む。
8.キメラ抗体
いくつかの実施形態において、IGSF8抗体はキメラ抗体である。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体は、少なくとも1つの非ヒト可変領域と少なくとも1つのヒト定常領域を含む。いくつかのこのような実施形態において、IGSF8抗体の全ての可変領域は、非ヒト可変領域であり、IGSF8抗体の全ての定常領域は、ヒト定常領域である。いくつかの実施形態において、キメラ抗体の1つまたは複数の可変領域はマウス可変領域である。キメラ抗体のヒト定常領域は、もしあれば、置換する非ヒト定常領域と同じアイソタイプである必要はない。キメラ抗体は、例えば、米国特許第4,816,567号;およびMorrisonら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:6851~55(1984)に記載されている。
いくつかの実施形態において、IGSF8抗体はキメラ抗体である。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体は、少なくとも1つの非ヒト可変領域と少なくとも1つのヒト定常領域を含む。いくつかのこのような実施形態において、IGSF8抗体の全ての可変領域は、非ヒト可変領域であり、IGSF8抗体の全ての定常領域は、ヒト定常領域である。いくつかの実施形態において、キメラ抗体の1つまたは複数の可変領域はマウス可変領域である。キメラ抗体のヒト定常領域は、もしあれば、置換する非ヒト定常領域と同じアイソタイプである必要はない。キメラ抗体は、例えば、米国特許第4,816,567号;およびMorrisonら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:6851~55(1984)に記載されている。
9.ヒト抗体
いくつかの実施形態において、IGSF8抗体はヒト抗体である。ヒト抗体は、任意の適切な方法によって作製し得る。非定常的な例示的方法には、ヒト免疫グロブリン遺伝子座を含むトランスジェニックマウスでヒト抗体を作製することが含まれる。例えば、Jakobovitsら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:2551~55(1993);Jakobovitsら、Nature 362:255~8(1993);onbergら、Nature 368:856~9(1994);および米国特許第5,545,807号;第6,713,610号;第6,673,986号;第6,162,963号;第5,545,807号;第6,300,129号;第6,255,458号;第5,877,397号;第5,874,299号;および第5,545,806号を参照されたい。
いくつかの実施形態において、IGSF8抗体はヒト抗体である。ヒト抗体は、任意の適切な方法によって作製し得る。非定常的な例示的方法には、ヒト免疫グロブリン遺伝子座を含むトランスジェニックマウスでヒト抗体を作製することが含まれる。例えば、Jakobovitsら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:2551~55(1993);Jakobovitsら、Nature 362:255~8(1993);onbergら、Nature 368:856~9(1994);および米国特許第5,545,807号;第6,713,610号;第6,673,986号;第6,162,963号;第5,545,807号;第6,300,129号;第6,255,458号;第5,877,397号;第5,874,299号;および第5,545,806号を参照されたい。
非限定的な例示的方法は、ファージディスプレイライブラリーを用いてヒト抗体を作製することも含む。例えば、Hoogenboomら、J.Mol.Biol.227:381~8(1992);Marksら、J.Mol.Biol.222:581~97(1991);およびPCT公開、国際公開第99/10494号を参照されたい。
ヒト抗体定常領域
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のヒト化、キメラ、またはヒト抗体は、1つまたは複数のヒト定数領域を含む。いくつかの実施形態において、ヒト重鎖定常領域は、IgA、IgG、およびIgDから選択されるアイソタイプである。いくつかの実施形態において、ヒト軽鎖定常領域は、Kおよびλから選択されるアイソタイプである。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体は、ヒトIgG定数領域、例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはFc融合パートナーは、例えばIgG1定常領域におけるC237S変異を含む。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体は、ヒトIgG2重鎖定常領域を含む。いくつかのこのような実施形態において、IgG2定常領域は、米国特許第6,900,292号に記載されているような、P331S変異を含む。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体は、ヒトIgG4重鎖定常領域を含む。いくつかのこのような実施形態において、本明細書に記載される抗体は、ヒトIgG4定常領域にS241P変異を含む。例えば、Angalら、Mol.Immunol.30(1):105~108(1993)を参照されたい。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体は、ヒトIgG4定常領域およびヒトκ軽鎖を含む。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のヒト化、キメラ、またはヒト抗体は、1つまたは複数のヒト定数領域を含む。いくつかの実施形態において、ヒト重鎖定常領域は、IgA、IgG、およびIgDから選択されるアイソタイプである。いくつかの実施形態において、ヒト軽鎖定常領域は、Kおよびλから選択されるアイソタイプである。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体は、ヒトIgG定数領域、例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはFc融合パートナーは、例えばIgG1定常領域におけるC237S変異を含む。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体は、ヒトIgG2重鎖定常領域を含む。いくつかのこのような実施形態において、IgG2定常領域は、米国特許第6,900,292号に記載されているような、P331S変異を含む。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体は、ヒトIgG4重鎖定常領域を含む。いくつかのこのような実施形態において、本明細書に記載される抗体は、ヒトIgG4定常領域にS241P変異を含む。例えば、Angalら、Mol.Immunol.30(1):105~108(1993)を参照されたい。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体は、ヒトIgG4定常領域およびヒトκ軽鎖を含む。
重鎖定常領域の選択によって、抗体がin vivoでエフェクター機能を有するか否かを決定することができる。いくつかの実施形態において、このようなエフェクター機能は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)および/または補体依存性細胞傷害(CDC)および/または抗体依存性細胞貪食(ADCP),を含み、抗体が結合している細胞の殺滅をもたらすことができる。典型的には、ヒトIgG1またはIgG3重鎖を含む抗体は、エフェクター機能を有する。
いくつかの実施形態において、エフェクター機能は望ましいものではない。例えば、いくつかの実施形態において、エフェクター機能は、炎症性状態および/または自己免疫疾患の治療において望ましくない場合がある。いくつかのこのような実施形態において、ヒトIgG4またはIgG2重鎖定常領域が選択されるか、または操作される。いくつかの実施形態において、IgG4定常領域は、S241P変異を含む。
いくつかの他の実施形態において、抗体の目的が受容体とリガンドとの相互作用を遮断することであるが、標的細胞の枯渇が望ましくない場合、エフェクター機能は望ましくないかもしれない。いくつかのそのような実施形態において、エフェクター機能が欠損したFcを有する重鎖定常領域が選択または操作される。エフェクター機能が低下したFcおよびFcに低減したエフェクター機能を付与する変異の非限定的な例は、例えば、Liuら、Antibodies 9:64(2020)に記載されており、その内容全体は、参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、C1q結合部位のL234A/L235A変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、それぞれIgG1-L234A/L235A(IgG1-LALA)またはIgG4-L234A/L235A(IgG4-LALA)としても知られる、L234A/L235A変異を含むヒトIgG1またはIgG4である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、ヒトIgGとヒトFcγRとの間の相互作用を妨害することができるP329G変異である。いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、L234A/L235A/P329Gである。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG1-L234A/L235A/P329G(IgG1-LALA-PG)としても知られる、L234A/L235A/P329G変異を含むヒトIgG1である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、N297A、N297QまたはN297G変異であり、これはヒトIgGとC1qおよびFcγRとの間の結合の中心となるグリカンを除去する。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG1-N297A/Q/G(IgG1-NA)としても知られるN297A、N297QまたはN297G変異を含むヒトIgG1である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、L235A/G237A/E318A変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG1-L235A/G237A/E318A(IgG1-AAA)としても知られる、L235A/G237A/E318A変異を含むヒトIgG1である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、複数のFcγRへの結合の減少または完全な消失をもたらし得るG236R/L328Rである。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG1-G236R/L328R(IgG1-RR)としても知られるG236R/L328R変異を含むヒトIgG1である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、C1qおよびほとんどのFcγRへの結合を消失させるかまたは著しく低減させ得るS298G/T299A変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG1-S298G/T299A(IgG1-GA)としても知られる、S298G/T299A変異を含むIgG1である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、低親和性FcγRへの結合の低減およびFcγRIへの結合が検出できないことをもたらし得るL234F/L235E/P331S変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG1-L234F/L235E/P331S(IgG1-FES)としても知られる、L234F/L235E/P331S変異を含むヒトIgG1である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、Fc領域の強力なサイレンシングをもたらし得るL234F/L235E/D265A変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG1-L234F/L235E/D265A(IgG1-FEA)としても知られる、L234F/L235E/D265A変異を含むヒトIgG1である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、複数のFcγRへの結合がないことをもたらし得るE233P/L234V/L235A/G236del/S267K変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG1--E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kとしても知られる、E233P/L234V/L235A/G236del/S267K変異を含むヒトIgG1である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、ヒトIgG4におけるF9ab)アーム交換を防止する228P/L235E変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG4-S228P/L235E(IgG4-PE)としても知られる、228P/L235E変異を含むヒトIgG4である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、H268Q/V309L/A30S/P331S変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG2-H268Q/V309L/A30S/P331S(IgG2m4)としても知られる、H268Q/V309L/A30S/P331S変異を含むヒトIgG2である。
いくつかの実施形態において、低減したエフェクター機能を付与する変異は、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S変異である。いくつかの実施形態において、エフェクター機能が低減した重鎖定常領域は、IgG2-V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S(IgG2c4d)としても知られる、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S変異を含むヒトIgG2である。
本明細書に記載される任意の抗体は、任意の適切な方法によって精製することができる。このような方法は、親和性マトリックスまたは疎水性相互作用クロマトグラフィーの使用を含むが、これらに限定されるものではない。適切な親和性リガンドは、抗体が結合する抗原および/またはエピトープ、ならびに抗体定常領域に結合するリガンドを含む。例えば、プロテインA、プロテインG、プロテインA/G、または抗体親和性カラムを使用して定常領域を結合させ、抗体を精製することができる。
いくつかの実施形態において、疎水性相互作用クロマトグラフィー(HIC)、例えば、ブチルまたはフェニルカラムも、いくつかのポリペプチドの精製に使用されている。ポリペプチドを精製する多くの方法は、当技術分野で知られている。
あるいは、いくつかの実施形態において、本明細書に記載される抗体は、無細胞系で産生される。非限定的な例示的無細胞系は、例えば、Sitaramanら、Methods Mol.Biol.498:229~44(2009);Sprin、Trends Biotechnol.22:538~45(2004);Endoら、Biotechnol.Adv.21:695~713(2003)に記載されている。
10.抗体の特性
いくつかの実施形態において、対象のIGSF8抗体は、IGSF8に結合し、IGSF8媒介シグナル伝達、例えば図4および5A~5Dに示されるような下流遺伝子の上方制御または下方制御を阻害する。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体は、50nM未満、20nM未満、10nM未満、または1nM未満の結合親和性(KD)またはEC50値でIGSF8に結合する。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体と無関係の非IGSF8タンパク質との結合の程度は、例えばラジオイムノアッセイ(RIA)により測定したIGSF8への抗体の結合の約10%未満である。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体は、異なる生物種由来のIGSF8間で保存されているIGSF8のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体はhumIGSF8と結合するヒトまたはヒト化IGSF8抗体と同一のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態において、IGSF8抗体は、抗体の検出を容易にする、および/または抗体が結合する分子の検出を容易にする部分である標識と結合している。非限定的な例示的標識としては、放射性同位体、蛍光基、酵素基、化学発光基、ビオチン、エピトープタグ、金属結合タグ等が挙げられるが、これらに限定されない。当技術分野の当業者は、意図する用途に応じて適切な標識を選択することができる。
いくつかの実施形態において、対象のIGSF8抗体は、IGSF8に結合し、IGSF8媒介シグナル伝達、例えば図4および5A~5Dに示されるような下流遺伝子の上方制御または下方制御を阻害する。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体は、50nM未満、20nM未満、10nM未満、または1nM未満の結合親和性(KD)またはEC50値でIGSF8に結合する。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体と無関係の非IGSF8タンパク質との結合の程度は、例えばラジオイムノアッセイ(RIA)により測定したIGSF8への抗体の結合の約10%未満である。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体は、異なる生物種由来のIGSF8間で保存されているIGSF8のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、IGSF8抗体はhumIGSF8と結合するヒトまたはヒト化IGSF8抗体と同一のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態において、IGSF8抗体は、抗体の検出を容易にする、および/または抗体が結合する分子の検出を容易にする部分である標識と結合している。非限定的な例示的標識としては、放射性同位体、蛍光基、酵素基、化学発光基、ビオチン、エピトープタグ、金属結合タグ等が挙げられるが、これらに限定されない。当技術分野の当業者は、意図する用途に応じて適切な標識を選択することができる。
いくつかの実施形態において、インビトロで化学的方法を用いて標識が抗体にコンジュゲートされる。コンジュゲーションの非限定的な例示的化学的方法は当技術分野で知られており、例えば、Thermo Scientific Life Science Research Produces(旧Pierce;Rockford、IL)、Prozyme(Hayward、CA)、SACRI Antibody Services(Calgary、カナダ)、AbD Serotec(Raleigh、NC)等から市販のサービス、方法および/または試薬を含む。いくつかの実施形態において、標識がポリペプチドである場合、少なくとも1つの抗体鎖と同一の発現ベクターから標識が発現し、抗体鎖に融合した標識を含むポリペプチドを産生することができる。
11.IGSF8 ECD、融合、および低ペプチド
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、全長IGSF8またはIGSF8のそのリガンドへの結合を阻害するその断片等のIGSF8ポリペプチドである。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、全長IGSF8またはIGSF8のそのリガンドへの結合を阻害するその断片等のIGSF8ポリペプチドである。
いくつかの実施形態において、IGSF8断片は、IGSF8細胞外ドメイン(ECD)である。いくつかの実施形態において、IGSF8断片は、全長IGSF8 ECDである。特定の実施形態において、ECDは、野生型IGSF8結合から生じるKIR3dL1/2等のIGSF8受容体の機能を阻害する拮抗性ポリペプチドとして機能する。しかし、他の実施形態では、ECDは、KIR3DL1/2等のその受容体上で野生型全長IGSF8と同様に機能するアゴニストポリペプチドとして機能する。
いくつかの実施形態において、本発明は、例えば、それが由来する全長IGSF8 ECDアミノ酸配列の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を含む、IGSF8 ECD断片を提供する。いくつかの実施形態において、IGSF8 ECD断片は、IGSF8のD1(または、ほとんどのN末端Ig-Vセット)ドメインを含む、これから本質的になる、またはこれからなる。
いくつかの実施形態において、本発明は、例えば、それが由来する全長IGSF8 ECDまたは断片(例えばIg-VセットD1ドメイン)と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%の配列同一性を含む、IGSF8 ECDバリアントを提供する。いくつかの実施形態において、バリアントは、KIR3DL1/2を結合する能力を保持する。
他の実施形態において、IGSF8 ECDは、非ヒトIGSF8 ECD由来であり、全長、断片(例えば、D1またはIg-Vセットドメイン)、またはバリアント(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有し、KIR3DL1/2を結合する能力を保持するもの)のいずれかであってよい。
関連する実施形態において、本発明は、ECDのD2-D4 Ig様C2ドメインを欠くが、ECDのD1 Ig-Vセットドメインを保持するIGSF8バリアントを提供する。そのようなバリアントは、KIR3DL1/2結合能等の、wt IGSF8の機能を実質的に維持し得る。
いくつかの実施形態において、IGSF8またはIGSF8断片またはIGSF8バリアントは、少なくとも1つの融合のパートナーと組み合わされる。
したがって、いくつかのそのような実施形態において、本発明は、Ig Fc領域との、C末端融合等の全長IGSF8の融合体を提供する。一実施形態において、Ig Fc融合体は、ヒトIgG1 Fc融合体である。
本発明は、IGSF8 ECD融合分子を形成する、全長IGSF8 ECDおよび少なくとも1つの融合パートナーをさらに提供する。いくつかの実施形態において、融合分子のIGSF8 ECD部分は、例えば、それが由来する全長IGSF8 ECDアミノ酸配列(例えば、D1またはIg-Vセットドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を含むIGSF8 ECD断片を含む。いくつかの実施形態において、融合分子のIGSF8 ECD部分は、KIR3DL1/2への結合を維持する、例えば、それが由来する全長IGSF8 ECD(またはD1またはIg-Vセットドメイン)と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する、IGSF8 ECDバリアントである。
他の実施形態において、IGSF8構成要素は、非ヒトIGSF8由来であり、全長、断片(例えば、ECD)、またはバリアントであり得る。
上記の融合分子の実施形態のいずれかにおいて(例えば、ヒトIgG1 Fc)、融合パートナーは、免疫グロブリンFc分子、例えば、ヒトFc分子を含み得る。他の実施形態において、融合パートナーは、アルブミンまたはポリエチレングリコール(PEG)等の異なる分子であってもよい。いくつかの実施形態において、1つを超える融合パートナーがIGSF8またはそのECDに結合している場合がある。いくつかの実施形態において、融合パートナー(または複数のパートナー)はC末端に結合されるが、アミノ酸側鎖上またはN末端等、他の結合も可能である。IGSF8または断片(例えば、ECD)またはバリアントへの融合パートナーの結合は、直接的(すなわち、共有結合による)またはリンカーを介した間接的であり得る。リンカーは、例えば、少なくとも1つの介在アミノ酸または他の化学部分を含んでいてもよく、これは共有結合または非共有結合のいずれかによって融合パートナーをECDに連結する役割を果たす。
上記の実施形態のいずれかにおいて、IGSF8ポリペプチドは、シグナル配列を含むか、または成熟形態、すなわち、シグナル配列を含まない形態のいずれかであり得る。シグナル配列は、ネイティブなIGSF8分子由来であっても、または他のタンパク質からのシグナル配列、例えば、細胞培養におけるIGSF8ポリペプチドの発現を増強するために選択されたものであってもよい。
上記のいずれの場合においても、IGSF8 ECDは、上記のアミノ酸配列が直接的に、またはFc、アルブミン、またはPEG等のリンカーを介して融合パートナーに結合されるような融合分子の一部であってもよい。例えば、いくつかの実施形態において、IGSF8 ECD融合分子は、上記の配列の1つと免疫グロブリンFc配列、またはヒトIgG1由来のFcを含み得る。IGSF8 ECD Fc融合分子は、IGSF8 ECDアミノ酸配列のFcアミノ酸配列への直接結合によって、またはリンカー(介在アミノ酸もしくはアミノ酸配列または他の化学部分のいずれか)を介して形成され得る。
関連する態様において、本発明は、NKおよび/またはT細胞の機能、生存率、および/または活性化を下方制御する方法であって、NKおよび/またはT細胞を本発明のIGSF8ポリペプチド、またはその融合体と接触させる工程を含む方法を提供する。
関連する態様において、本発明は、NK細胞および/またはT細胞の活性化によって媒介される自己免疫疾患または過剰な炎症応答(例えば、慢性炎症性疾患におけるように)等の疾患または状態を治療する方法であって、NK細胞および/またはT細胞を本発明のIGSF8ポリペプチド、またはその融合体と接触させる工程を含む方法を提供する。
特定の実施形態において、自己免疫疾患は、過剰なNK細胞および/またはT細胞の機能または活性化に関連している。特定の実施形態において、自己免疫疾患は、関節リウマチ(RA)、1型糖尿病等の糖尿病、乾癬、乾癬性関節炎、強直性脊椎炎、全身性硬化症、多発性硬化症、SLE、シェーグレン病、抗リン脂質症候群、尋常性天フィガス、脊椎関節症、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、またはクローン病である。
特定の実施形態において、慢性炎症性疾患は、心血管、神経変性疾患、糖尿病、メタボリックシンドローム、歯周炎、およびアテローム性動脈硬化症を含む。
特定の実施形態において、IGSF8ポリペプチドは、IGSF8の全長、ECD、または可溶性断片を含み、これは、NKおよび/またはT細胞の増殖、生存率、および/または機能を阻害する。いくつかの実施形態において、IGSF8のECDは、KIR3DL1/2に結合するIGSF8のD1(またはIg-Vセット)ドメインのFc融合体等のECDのFc融合体を含む、これから本質的になる、またはこれからなる。いくつかの実施形態において、Fcは、ヒトIgG1 Fc融合体、ヒトIgG2 Fc融合体、ヒトIgG3 Fc融合体、またはヒトIgG4 Fc融合体である。いくつかの実施形態において、Fcは、ヒトIgG1 Fc融合体である。融合体は、IGSF8またはその断片のC末端にあってもよい。
いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、低分子またはペプチド、例えば、低分子ペプチドであり得る。いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、IGSF8 ECD断片のアミノ酸配列を含む低分子ペプチドであり得る。いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、KIR3DL1/2の残基S165~M186を含む小ペプチドであってもよい。いくつかの実施形態において、IGSF8アンタゴニストは、例えば、5~50、3~20、例えば、3~15または3~10のアミノ酸を有する小さなペプチドであり、このペプチドは、IGSF8断片、IGSF8 ECD断片、またはIGSF8断片、もしくはIGSF8 ECD断片のバリアントを含む配列を有する、直鎖または環状であってよい。IGSF8のそのようなバリアントは、例えば、それが由来するネイティブの断片配列に対して少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%の配列同一性を有し得る。特定の実施形態では、IGSF8由来のアンタゴニスト(IGSF8 ECD断片またはその誘導体等)は、KIR3DL1/2に対するIGSF8の阻害性機能を引き起こすことなくKIR3DL1/2への結合能を保持し、アンタゴニストが、IGSF8媒介性KIR3DL1/2の機能に対する支配的な陰性阻害剤のように機能するようになっている。
特定の実施形態において、抗体その抗原結合断片、IGSF8ポリペプチドおよびそのECDを含む任意の本発明のポリペプチドは、合成時に異種性シグナルペプチドを有し得る。いくつかの分泌タンパク質が大量に発現および分泌されるためには、異種性タンパク質由来のシグナルペプチドが望ましい場合がある。異種性シグナルペプチドを使用することは、シグナルペプチドが分泌プロセス中にERで除去されるため、得られる成熟ポリペプチドが変化せずに残るという点で好都合であり得る。異種性シグナルペプチドの付加は、いくつかのタンパク質の発現および分泌に必要とされる場合がある。
非限定的な例示的シグナルペプチドの配列は、例えば、Department of Biochemistry、National University of Singaporeによって維持されているオンラインのシグナルペプチドデータベースに記載されている。Chooら、BMC Bioinformatics、6:249(2005);およびPCT公開、国際公開第2006/081430号を参照されたい。
12.KIR3DL1/2 ECD、融合体、および小ペプチド
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、KIR3DL1/2ポリペプチド、例えば、KIR3DL1/2の断片またはIGSF8へのKIR3DL1/2の結合を阻害する(例えば、IGSF8のD1またはIg-VセットドメインへのKIR3DL1/2の結合を阻害する)IGSF8の断片である。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、KIR3DL1/2ポリペプチド、例えば、KIR3DL1/2の断片またはIGSF8へのKIR3DL1/2の結合を阻害する(例えば、IGSF8のD1またはIg-VセットドメインへのKIR3DL1/2の結合を阻害する)IGSF8の断片である。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2断片は、KIR3DL1/2細胞外ドメイン(ECD)である。いくつかの実施形態において、本発明は、例えば、それが由来する全長KIR3DL1/2 ECDアミノ酸配列の少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、または少なくとも95%を含むKIR3DL1/2断片を提供する。いくつかの実施形態において、断片は、IGSF8と結合するKIR3DL1/2の中間(第2、またはD2)Ig様ドメインを含む。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2断片は、全長KIR3DL1/2 ECDである。いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2断片は、IGSF8と結合する中間(第2、またはD2)Ig様ドメインを含む部分的なKIR3DL1/2 ECDである。いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2断片は、IGSF8と結合するKIR3DL1/2の中間(第2、またはD2)Ig様ドメインを含む、これから本質的になる、またはこれからなる。いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2断片は、一緒になってIGSF8と結合するKIR3DL1/2の第2および第3(D2およびD3)Ig様ドメインを含む、本質的にそれらからなる、またはそれらからなる。いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2断片は、IGSF8と結合し、KIR3DL1/2へのIGSF8結合を阻害する、KIR3DL1/2の残基S165およびM186を含むポリペプチドまたはエピトープを含む、本質的にそれらからなる、またはそれらからなる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドまたはエピトープは、約25残基、30残基、35残基、40残基、45残基、または約50残基である。いくつかの実施形態において、ポリペプチドまたはエピトープは、独立して、S165のすぐN末端、M186のすぐC末端、またはS165のすぐN末端およびM186のすぐC末端の両方のKIR3DL1/2の約1~20、約2~15、約3~10、約5~8、約2~7、または約3~5残基を含む。
いくつかの実施形態において、本発明は、例えば、全長のIGSF8 ECDまたはそれが由来する断片(例えば、Ig-VセットD1ドメイン)と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を含むKIR3DL1/2 ECDバリアントを提供する。いくつかの実施形態において、バリアントは、KIR3DL1/2への結合能を保持する。
他の実施形態において、KIR3DL1/2 ECDは、非ヒトKIR3DL1/2 ECD由来であり、全長、断片(例えば、D2または中間Ig様ドメイン)、またはバリアント(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%配列同一性を有し、IGSF8との結合能を保持するもの)のいずれかであり得る。
関連する実施形態において、本発明は、KIR3DL1/2のECDの第1またはD Ig様C2ドメインを欠くが、ECDのD2 Ig様ドメインを保持するKIR3DL1/2バリアントを提供する。そのようなバリアントは、IGSF8への結合能等のwt KIR3DL1/2の機能を実質的に維持し得る。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2または断片もしくはバリアントは、少なくとも1つの融合パートナーと組み合わされる。
したがって、いくつかのそのような実施形態において、本発明は、Ig Fc領域とのECD C末端融合体等の全長KIR3DL1/2の融合体を提供する。一実施形態において、Ig Fc融合体は、ヒトIgG1 Fc融合体である。
上記の融合分子の実施形態のいずれかにおいて、融合パートナーは、免疫グロブリンFc分子、例えば、ヒトFc分子(例えば、ヒトIgG1 Fc)を含み得る。他の実施形態において、融合パートナーは、アルブミンまたはポリエチレングリコール(PEG)等の異なる分子であってもよい。いくつかの実施形態において、1つを超える融合パートナーがKIR3DL1/2またはそのECD(例えば、IGSF8に結合するD2ドメインを含むECD断片)に結合されてもよい。いくつかの実施形態において、融合パートナー(または複数のパートナー)はECDのC末端に結合されるが、アミノ酸側鎖上またはN末端等、他の結合も可能である。KIR3DL1/2または断片(例えば、ECDまたはECDのD2)またはバリアントへの融合パートナーの結合は、直接的(すなわち、共有結合による)またはリンカーを介した間接的なものであってもよい。リンカーは、例えば、少なくとも1つの介在アミノ酸または他の化学部分を含んでいてもよく、これは共有結合または非共有結合のいずれかによって融合パートナーをECDに連結する役割を果たす。
上記の実施形態のいずれかにおいて、KIR3DL1/2ポリペプチドは、シグナル配列を含むか、または成熟形態、すなわち、シグナル配列を含まない形態のいずれかであり得る。シグナル配列は、ネイティブなKIR3DL1/2分子由来であっても、または他のタンパク質からのシグナル配列、例えば、細胞培養におけるKIR3DL1/2ポリペプチド/断片の発現および/または分泌を増強するために選択されたものであってもよい。いくつかの実施形態において、濃縮または精製を容易にするために、タンパク質タグが含まれる場合がある。
上記のいずれの場合においても、KIR3DL1/2 ECDは、上記のアミノ酸配列が直接的に、またはFc、アルブミン、またはPEG等のリンカーを介して融合パートナーに結合されるような融合分子の一部であってもよい。例えば、いくつかの実施形態において、ECD融合分子は、上記の配列の1つと免疫グロブリンFc配列、またはヒトIgG1由来のFcを含み得る。ECD Fc融合分子は、KIR3DL1/2 ECDアミノ酸配列のFcアミノ酸配列への直接結合によって、またはリンカー(介在アミノ酸もしくはアミノ酸配列または他の化学部分のいずれか)を介して形成され得る。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、低分子またはペプチド、例えば、小ペプチドであり得る。いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、KIR3DL1/2のD2ドメインに結合し、IGSF8-KIR3DL1/2相互作用を阻害するが、NK細胞上でKIR3DL1/2の阻害機能を引き起こさない(NK細胞によるIFNγ分泌によって定量し得る)IGSF8 ECD断片のアミノ酸配列を含む小ペプチドであり得る。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、低分子またはペプチド、例えば、小ペプチドであり得る。いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、KIR3DL1/2のD2ドメインに結合し、IGSF8-KIR3DL1/2相互作用を阻害するが、NK細胞上でKIR3DL1/2の阻害機能を引き起こさない(NK細胞によるIFNγ分泌によって定量し得る)IGSF8 ECD断片のアミノ酸配列を含む小ペプチドであり得る。
いくつかの実施形態において、KIR3DL1/2アンタゴニストは、例えば、5~50、3~20、例えば3~15または3~10のアミノ酸を有する小ペプチドであり、このペプチドは、IGSF8-KIR3DL1/2結合を阻害する、IGSF8断片、IGSF8 ECD断片、またはIGSF8断片、もしくはIGSF8 ECD断片のバリアントを含む配列を有する、線形または環状であってよい。このようなIGSF8のバリアントは、例えば、それが由来するネイティブな断片配列に対して、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%の配列同一性を有していてもよい。
特定の実施形態において、抗体その抗原結合断片、ポリペプチドおよびそのECDを含む任意の本発明のポリペプチドは、合成時に異種性シグナルペプチドを有し得る。いくつかの分泌タンパク質が大量に発現および分泌されるためには、異種性タンパク質由来のシグナルペプチドが望ましい場合がある。異種性シグナルペプチドを使用することは、シグナルペプチドが分泌プロセス中にERで除去されるため、得られる成熟ポリペプチドが変化せずに残るという点で好都合であり得る。異種性シグナルペプチドの付加は、いくつかのタンパク質の発現および分泌に必要とされる場合がある。
非限定的な例示的シグナルペプチドの配列は、例えば、Department of Biochemistry、National University of Singaporeによって維持されているオンラインのシグナルペプチドデータベースに記載されている。Chooら、BMC Bioinformatics、6:249(2005);およびPCT公開、国際公開第2006/081430号を参照されたい。
13.共翻訳修飾および翻訳後修飾
いくつかの実施形態において、IGSF8および/またはKIR3DL1/2またはそのECD等のポリペプチドは、翻訳中または翻訳後に、例えばグリコシル化、シアリル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、公知の保護/遮断基による誘導体化、タンパク質分解切断、または抗体分子もしくは他の細胞リガンドへの結合によって、異なる形で修飾される。多数の化学修飾はいずれも、公知の技術によって実施されてもよく、例えば、臭化シアノゲン、トリプシン、キモトリプシン、パパイン、V8プロテアーゼによる特異的な化学切断、NABH4、アセチル化、ホルミル化、酸化、還元、および/またはツニカマイシン存在下の代謝性合成が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、IGSF8および/またはKIR3DL1/2またはそのECD等のポリペプチドは、翻訳中または翻訳後に、例えばグリコシル化、シアリル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、公知の保護/遮断基による誘導体化、タンパク質分解切断、または抗体分子もしくは他の細胞リガンドへの結合によって、異なる形で修飾される。多数の化学修飾はいずれも、公知の技術によって実施されてもよく、例えば、臭化シアノゲン、トリプシン、キモトリプシン、パパイン、V8プロテアーゼによる特異的な化学切断、NABH4、アセチル化、ホルミル化、酸化、還元、および/またはツニカマイシン存在下の代謝性合成が含まれるが、これらに限定されない。
本発明によって包含されるさらなる翻訳後修飾としては、例えば、N-結合型またはO-結合型糖鎖、N末端またはC末端のプロセシング、アミノ酸骨格への化学部分の結合、N-結合型またはO-結合型糖鎖の化学修飾、および原核生物宿主細胞発現の結果としてN末端のメチオニン残基の付加または欠失が挙げられる。
14.IGSF8アンタゴニストおよび/またはKIR3DL1/2アンタゴニストをコードする核酸分子
本発明はまた、IGSF8抗体および/またはKIR3DL1/2抗体等の本明細書に記載の抗体の1つまたは複数の鎖をコードするポリヌクレオチドを含む核酸分子を提供する。いくつかの実施形態において、核酸分子は、本明細書に記載される抗体の重鎖または軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、核酸分子は、本明細書に記載される抗体の重鎖をコードするポリヌクレオチドおよび軽鎖をコードするポリヌクレオチドの両方を含む。いくつかの実施形態において、第1の核酸分子は、重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドを含み、第2の核酸分子は、軽鎖をコードする第2のポリヌクレオチドを含む。
本発明はまた、IGSF8抗体および/またはKIR3DL1/2抗体等の本明細書に記載の抗体の1つまたは複数の鎖をコードするポリヌクレオチドを含む核酸分子を提供する。いくつかの実施形態において、核酸分子は、本明細書に記載される抗体の重鎖または軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、核酸分子は、本明細書に記載される抗体の重鎖をコードするポリヌクレオチドおよび軽鎖をコードするポリヌクレオチドの両方を含む。いくつかの実施形態において、第1の核酸分子は、重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドを含み、第2の核酸分子は、軽鎖をコードする第2のポリヌクレオチドを含む。
いくつかのこのような実施形態において、重鎖および軽鎖は、1つの核酸分子、または2つの別々の核酸分子から、2つの別々のポリペプチドとして発現される。いくつかの実施形態において、例えば、抗体がscFvである場合、単一のポリヌクレオチドは、共に連結された重鎖および軽鎖の両方を含む単一ポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体の重鎖または軽鎖をコードするポリヌクレオチドは、翻訳時に重鎖または軽鎖のN末端に位置するリーダー配列をコードするヌクレオチド配列を含む。上述したように、リーダー配列は、ネイティブな重鎖または軽鎖リーダー配列であってもよく、または別の異種性リーダー配列であってもよい。
他のIGSF8アンタゴニストおよび/またはKIR3DL1/2アンタゴニストをコードする核酸も提供され、例えば、IGSF8 ECD分子(例えば、KIR3DL1/2-結合D1 Ig-Vセットドメイン)、またはIGSF8 ECD融合分子を含むIGSF8の断片またはバリアント、ならびにKIR3DL1/2 ECD 分子(例えば、KIR3DL1/2の中間またはD2 IGSF8-結合Ig-様ドメイン)を含むKIR3DL1/2の断片またはバリアント、またはKIR3DL1/2 ECD融合分子およびその断片またはバリアントが含まれる。核酸分子は、当技術分野において慣用的な組換えDNA技術を使用して構築し得る。いくつかの実施形態において、核酸分子は、選択された宿主細胞における発現に適している発現ベクターである。
15.ベクター
本明細書に記載される抗体の重鎖および/または軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含むベクターが提供される。このようなベクターは、DNAベクター、ファージベクター、ウイルスベクター、レトロウイルスベクター等を含むが、これらに限定されるものではない。いくつかの実施形態において、ベクターは、重鎖をコードする第1のポリヌクレオチド配列と軽鎖をコードする第2のポリヌクレオチド配列とを含む。いくつかの実施形態において、重鎖および軽鎖は、2つの別々のポリペプチドとしてベクターから発現される。いくつかの実施形態において、重鎖および軽鎖は、例えば、抗体がscFvである場合単一のポリペプチドの一部として発現される。
本明細書に記載される抗体の重鎖および/または軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含むベクターが提供される。このようなベクターは、DNAベクター、ファージベクター、ウイルスベクター、レトロウイルスベクター等を含むが、これらに限定されるものではない。いくつかの実施形態において、ベクターは、重鎖をコードする第1のポリヌクレオチド配列と軽鎖をコードする第2のポリヌクレオチド配列とを含む。いくつかの実施形態において、重鎖および軽鎖は、2つの別々のポリペプチドとしてベクターから発現される。いくつかの実施形態において、重鎖および軽鎖は、例えば、抗体がscFvである場合単一のポリペプチドの一部として発現される。
いくつかの実施形態において、第1のベクターは、重鎖をコードするポリヌクレオチドを含み、第2のベクターは、軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、第1のベクターと第2のベクターは同量(例えば、同モル量または同質量)で宿主細胞にトランスフェクトされる。いくつかの実施形態において、第1ベクターと第2ベクターはモル比または質量比が5:1~1:5で宿主細胞に導入される。いくつかの実施形態において、重鎖をコードするベクターと軽鎖をコードするベクターについて、質量比1:1~1:5が使用される。いくつかの実施形態において、重鎖をコードするベクターと軽鎖をコードするベクターについて質量比1:2が使用される。
いくつかの実施形態において、CHO細胞またはCHO由来の細胞、あるいはNSO細胞におけるポリペプチドの発現に最適化されたベクターが選択される。例示的なこのようなベクターは、例えば、Running Deerら、Biotechnol.Prog.20:880~889(2004)に記載されている。いくつかの実施形態において、ベクターは、ヒトを含む動物におけるIGSF8アンタゴニストのインビボ発現のために選択される。いくつかのこのような実施形態において、ポリペプチドまたは複数のポリペプチドの発現は、組織特異的に機能するプロモーターまたは複数のプロモーターの制御下にある。例えば、肝臓特異的プロモーターは、例えば、PCT公開、国際公開第2006/076288号に記載されている。
16.宿主細胞
種々の実施形態において、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖は、細菌細胞等の原核生物細胞、または真菌細胞(例えば、酵母)、植物細胞、昆虫細胞、哺乳動物細胞等の真核生物細胞で発現させることができる。このような発現は、例えば、当技術分野で既知の手順に従って実施され得る。ポリペプチドを発現するために使用され得る例示的な真核生物細胞としては、COS7細胞を含むCOS細胞、293-6E細胞を含む293細胞、CHO-SおよびDG44細胞を含むCHO細胞、PER.C6(登録商標)細胞(Crucell);およびNSO細胞等を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖は、酵母で発現させてもよい。例えば、米国特許出願公開第2006/0270045号を参照されたい。いくつかの実施形態において、特定の真核生物宿主細胞は、IGSF8抗体の重鎖および/または軽鎖に所望の翻訳後修飾を行う能力に基づいて選択される。例えば、いくつかの実施形態において、CHO細胞は、293細胞で産生される同一のポリペプチドよりも高いレベルのシアル化度を有するポリペプチドを産生する。
種々の実施形態において、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖は、細菌細胞等の原核生物細胞、または真菌細胞(例えば、酵母)、植物細胞、昆虫細胞、哺乳動物細胞等の真核生物細胞で発現させることができる。このような発現は、例えば、当技術分野で既知の手順に従って実施され得る。ポリペプチドを発現するために使用され得る例示的な真核生物細胞としては、COS7細胞を含むCOS細胞、293-6E細胞を含む293細胞、CHO-SおよびDG44細胞を含むCHO細胞、PER.C6(登録商標)細胞(Crucell);およびNSO細胞等を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖は、酵母で発現させてもよい。例えば、米国特許出願公開第2006/0270045号を参照されたい。いくつかの実施形態において、特定の真核生物宿主細胞は、IGSF8抗体の重鎖および/または軽鎖に所望の翻訳後修飾を行う能力に基づいて選択される。例えば、いくつかの実施形態において、CHO細胞は、293細胞で産生される同一のポリペプチドよりも高いレベルのシアル化度を有するポリペプチドを産生する。
所望の宿主細胞への1つまたは複数の核酸の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、DEAE-デキストラン媒介トランスフェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、形質導入、感染等を含むがこれらに限定されない任意の方法によって達成することができる。非限定的な例示的方法は、例えば、Sambrookら、Molecular Cloning,A Laboratory Manual、第3版 Cold Spring Harbor Laboratory Press(2001)に記載されている。核酸は、任意の適切な方法に従って、所望の宿主細胞において一過性にまたは安定的にトランスフェクトされ得る。
いくつかの実施形態において、1つまたは複数のポリペプチドは、任意の適切な方法に従って、ポリペプチドをコードする1つまたは複数の核酸分子で操作またはトランスフェクトされた動物においてインビボで産生され得る。
17.アッセイ、診断、予後診断の方法
関連する態様において、本発明はまた、IGSF8-KIR3DL1/2結合を阻害する抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KIR3DL1/2アンタゴニストの能力を決定するためのin vitroアッセイ方法、またはIGSF8-KIR3DL1/2結合を阻害する抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KIR3DL1/2アンタゴニスト(低分子またはペプチドアンタゴニスト等)を特定するためのスクリーニング方法であって、候補抗IGSF8アンタゴニストまたは候補抗KIR3DL1/2アンタゴニスト(例えば抗体、ペプチド断片、または低分子)をIGSF8ポリペプチドおよびKIR3DL1/2ポリペプチドと接触させる工程を含み、ここで、IGSF8ポリペプチドおよび/またはKIR3DL1/2ポリペプチドが検出可能なシグナルによって標識され、候補抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KIR3DL1/2アンタゴニストによる、IGSF8-KIR3DL1/2結合の阻害が、検出可能なシグナルの検出可能または計測可能な変化をもたらす、方法も提供する。
関連する態様において、本発明はまた、IGSF8-KIR3DL1/2結合を阻害する抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KIR3DL1/2アンタゴニストの能力を決定するためのin vitroアッセイ方法、またはIGSF8-KIR3DL1/2結合を阻害する抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KIR3DL1/2アンタゴニスト(低分子またはペプチドアンタゴニスト等)を特定するためのスクリーニング方法であって、候補抗IGSF8アンタゴニストまたは候補抗KIR3DL1/2アンタゴニスト(例えば抗体、ペプチド断片、または低分子)をIGSF8ポリペプチドおよびKIR3DL1/2ポリペプチドと接触させる工程を含み、ここで、IGSF8ポリペプチドおよび/またはKIR3DL1/2ポリペプチドが検出可能なシグナルによって標識され、候補抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KIR3DL1/2アンタゴニストによる、IGSF8-KIR3DL1/2結合の阻害が、検出可能なシグナルの検出可能または計測可能な変化をもたらす、方法も提供する。
関連する態様において、本発明はまた、IGSF8-KLRC1/D1結合を阻害するための、抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KLRC1/D1アンタゴニストの能力を決定するためのin vitroアッセイ方法、またはIGSF8-KLRC1/D1結合を阻害するための抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KLRC1/D1アンタゴニスト(低分子またはペプチドアンタゴニスト等)を同定するためのスクリーニング方法であって、候補抗IGSF8アンタゴニストまたは候補抗KLRC1/D1アンタゴニスト(例えば、抗体、ペプチド断片、または低分子)をIGSF8ポリペプチドおよびKLRC1/D1ポリペプチドと接触させる工程を含み、IGSF8ポリペプチドおよび/またはKLRC1/D1ポリペプチドが検出可能なシグナルで標識され、候補抗IGSF8アンタゴニストまたは抗KLRC1/D1アンタゴニストによるIGSF8-KLRC1/D1結合の阻害が、検出可能なシグナルの検出可能または計測可能な変化をもたらす、方法も提供する。
一実施形態において、IGSF8ポリペプチドは、KIR3DL1/2結合を担うIGSF8のD1またはIg-Vセットドメインを含み、KIR3DL1/2ポリペプチドは、KIR3DL1/2のD2(または中間)Ig様ドメインを含む。
一実施形態において、IGSF8ポリペプチドは、固体支持体上に固定化されるか、またはMHCクラスI(HLA)受容体を発現しない細胞等の細胞上で発現される。例示的な細胞は、外因性IGSF8を安定的にまたは誘導的に発現するK562であり、これは、IGSF8ポリペプチドをコードするレンチウイルスベクター等のベクターによってK562細胞に導入され得る。他の実施形態において、細胞は、外因性IGSF8を発現するCT26細胞(ATCC CRL-2638(商標)マウス結腸癌種)である。
一実施形態において、KIR3DL1/2ポリペプチドは、ビオチン等の検出可能なシグナルで標識される。ビオチン標識は、PE-ストレプトアビジン等のストレプトアビジン連結シグナルによって検出され得る。
代替的な実施形態において、IGSF8ポリペプチドおよびKIR3DL1/2ポリペプチドは、蛍光分子および抑制剤が互いに近接している場合は蛍光発光を抑制するが、アンタゴニストがIGSF8-KIR3DL1/2結合を阻害すると蛍光シグナルが発生する分子により標識することができる。
関連する態様において、本発明は、試料中のIGSF8ポリペプチドの存在またはレベルを検出する方法であって、試料中のIGSF8ポリペプチドを本発明の抗体、モノクローナル抗体、または抗原結合性部分/その断片と接触させる工程を含み、前記抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片が検出可能な標識によって標識されているか、または検出可能な標識に付着されることができる、方法を提供する。
特定の実施形態において、前記抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片は、IGSF8ポリペプチドと複合体を形成し、その複合体は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、放射免疫アッセイ(RIA)、免疫化学方法、ウェスタンブロット、または細胞内フローアッセイの形で検出される。
関連する態様において、本発明は、対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害の進行をモニターするための方法であって、a)対象から得られた試料において、第1の時点で、本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片を使用して、IGSF8の第1のレベルを検出する工程;b)後続の時点で工程a)を繰り返し、IGSF8の第2のレベルを取得する工程;およびc)工程a)およびb)でそれぞれ検出されたIGSF8の第1のレベルおよび第2のレベルを比較して、対象における障害の進行をモニターする工程を含む方法を提供し、ここで、第1のレベルよりも高い第2のレベルは、疾患が進行していることを示す。
特定の実施形態において、第1の時点と後続の時点との間に、対象は、障害を緩和するための治療を受けたことがある。
関連する態様において、本発明は、異常な(例えば、正常より高い)IGSF8と関連する障害に罹患した対象の臨床転帰を予測するための方法であって、a)本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片を使用して、対象から得られた第1の試料におけるIGSF8のレベルを決定する工程;b)本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片を使用して、良好な臨床転帰を有する対照対象から得られた第2の試料におけるIGSF8のレベルを決定する工程;およびc)第1および第2の試料におけるIGSF8のレベルを比較する工程を含む方法を提供し、ここで、第2の試料中のIGSF8のレベルと比較した第1の試料中のIGSF8の有意に高い(例えば、>20%、>50%またはそれ以上の増加)レベルは、対象がより不良な臨床転帰を有することを示す、および/または、第2の試料中のIGSF8のレベルと比較した第1の試料中のIGSF8の有意に低い(例えば、>20%、>50%またはそれ以上の低下)レベルは対象がより良好な臨床転帰を有することを示す。
関連する態様において、本発明は、対象における異常な(例えば、正常よりも高い)IGSF8発現に関連する障害の療法の有効性を評価する方法であって、a)対象に療法の少なくとも一部を提供する前に、対象から得られた第1の試料において、本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片を用いて、IGSF8のレベルを決定する工程、およびb)前記療法の一部を提供した後に対象から得られた第2の試料において工程a)を繰り返す工程を含む方法を提供し、ここで、第1の試料と比較して第2の試料におけるIGSF8のレベルが有意に低い(>20%、>50%またはそれを超える低下)ことは、療法が対象の障害を阻害するのに有効であることを示すものであり、および/または、第1の試料と比較して第2の試料におけるIGSF8のレベル実質的に同一またはより高いことは、対象における障害の阻害に療法が有効でないことを示す。
特定の実施形態において、疾患は癌である。
関連する態様において、本発明は、対象における異常な(例えば、正常よりも高い)IGSF8発現に関連する障害を阻害するための試験化合物の有効性を評価する方法であって、a)対象から得られた第1の試料において、本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片を用いてIGSF8のレベルを決定する工程であって、第1のサンプルは、ある量の試験化合物に曝露されている、工程、およびb)対象から得られた第2の試料において、本発明の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片を用いてIGSF8のレベルを決定する工程であって、第2の試料は試験化合物に曝露されていない工程を含む方法を提供し、ここで、第2の試料のレベルに対して第1の試料のIGSF8のレベルが著しく低い(>20%、>50%またはそれを超える低下)ことは、前記量の試験化合物が対象における障害の阻害に有効であることを示すものであり、および/または、第2の試料のIGSF8に対して第1の試料のIGSF8のレベルが実質的に同じであることは、前記量の試験化合物が対象における障害の阻害に有効でないことを示す。
特定の実施形態において、第1および第2の試料は、対象から得られた単一の試料の一部または対象から得られたプールされた試料の一部である。
特定の実施形態において、障害は、癌である。
特定の実施形態において、癌は、肺癌、腎癌、膵臓癌、大腸癌、急性骨髄性白血病(AML)、頭頸部癌腫、肝臓癌、卵巣癌、前立腺癌、子宮癌、神経膠腫、膠芽腫、神経芽腫、乳癌、膵管癌、胸腺腫、B-CLL、白血病、B細胞リンパ腫、およびIGSF8(例えば、KIR3DL1、KIR3DL2、および/またはKLRC1/D1)に対する受容体を発現する免疫細胞(例えば、T細胞および/またはNK細胞)が浸潤した癌である。
特定の実施形態において、試料は、対象から得られた細胞、血清、腫瘍周囲組織、および/または腫瘍内組織を含む。
特定の実施形態において、対象は、ヒトである。
関連する態様において、本発明は、機能的なIGSF8アンタゴニストのスクリーニング方法であって、候補剤(例えば、低分子、ペプチド、アプタマー、ポリヌクレオチド等)を、NK細胞およびIGSF8を発現しNK細胞媒介性細胞傷害に耐性を有する標的細胞の共培養に接触させ、標的細胞に対するNK細胞媒介性細胞溶解活性を促進する候補剤を特定し、それにより候補剤をIGSF8アンタゴニストとして特定する、方法を提供する。
関連する態様において、本発明は、機能的IGSF8アンタゴニストをスクリーニングする方法であって、T細胞活性化シグナルおよびIGSF8の存在下で、候補剤(例えば、低分子、ペプチド、アプタマー、ポリヌクレオチド等)をJurkat NFATレポーター細胞と接触させる工程を含み、レポーター細胞が候補薬剤の非存在下では活性化せず、候補剤の存在下で活性化する場合、前記候補剤を機能的IGSF8アンタゴニストとして特定する、方法を提供する。
関連する態様において、本発明は、KIR3DL1/2-IGSF8相互作用を阻害し、それによってNK細胞活性化を刺激することによって、癌を治療する方法において使用するための、KIR3DL1/2に特異的に結合する抗体を提供する。
関連する態様において、本発明は、好ましくは本明細書に記載の本発明の第2の治療剤との組合せを通じて、癌を治療する方法において使用するためのKIR3DL1/2と特異的に結合する抗体を提供する。
実施例1
Colo205癌細胞におけるIGSF8の喪失はColo205細胞に対するナチュラルキラー(NK)細胞の細胞傷害性を増強する
この実験は、IGSF8の活性/発現が、癌細胞(例えば、Colo205大腸癌細胞)に対するNK細胞の細胞傷害性を負に制御し、IGSF8の活性/発現の喪失がNK細胞の細胞傷害性を増強することを実証するものである。
Colo205癌細胞におけるIGSF8の喪失はColo205細胞に対するナチュラルキラー(NK)細胞の細胞傷害性を増強する
この実験は、IGSF8の活性/発現が、癌細胞(例えば、Colo205大腸癌細胞)に対するNK細胞の細胞傷害性を負に制御し、IGSF8の活性/発現の喪失がNK細胞の細胞傷害性を増強することを実証するものである。
Colo205癌細胞がNK細胞による殺滅を回避するために必要な遺伝子、あるいは必須な遺伝子を決定するために、NK細胞およびColo205癌細胞を用いたゲノムワイドな共培養スクリーニングが行われた。具体的には、Colo205腫瘍細胞に全ゲノムガイドRNA(gRNA)Cas9ライブラリーを導入し、次いで典型的な活性化表現型を示す初代ヒトNK細胞と2回連続した一晩の共培養を行った。得られた細胞集団は、NK細胞による殺滅に対して腫瘍細胞を感作させる枯渇したgRNAを特定するために配列決定された。その後、Model-based Analysis of Genome-wide CRISPR/Cas9 Knockout(MAGeCK)ソフトウェアを使用してリードをカウントし、処理試料と未処理(対照)試料間の遺伝子/gRNA倍数変化、選択スコア、および統計解析を実行した。
選択スコアとgRNAの倍数変化を包含するヴォルケーノドットプロットをアッセイで試験した各遺伝子について作成し、NK細胞との共培養後に枯渇した上部遺伝子を表示した。抗原提示に関連する遺伝子(例えば、HLA-C、Tap1、Tap2、およびB2m)は、枯渇すると、腫瘍細胞がNK細胞による殺滅に最も感受性が高くなることが見出された。さらに、IGSF8は、2つのトップヒットのうちの1つであり、Colo205細胞における、その活性/発現の喪失はNK細胞の細胞傷害性を増強した。その結果を図1にまとめた。
実施例2
IGSF8は、健康なドナー由来の初代ナチュラルキラー細胞および初代T細胞の生存能力を低下させた
NK細胞活性に対するIGSF8の負の影響をさらに実証するために、漸増濃度の、ヒトFc領域によってタグ付けされた組換えヒトIGSF8(IGSF8-hFc)を、2人の健常ドナーから単離した初代ヒトNK細胞と共インキュベートし、IGSF8-hFc濃度に対するこれらの初代NK細胞の生存率(用量応答曲線)を測定した。
IGSF8は、健康なドナー由来の初代ナチュラルキラー細胞および初代T細胞の生存能力を低下させた
NK細胞活性に対するIGSF8の負の影響をさらに実証するために、漸増濃度の、ヒトFc領域によってタグ付けされた組換えヒトIGSF8(IGSF8-hFc)を、2人の健常ドナーから単離した初代ヒトNK細胞と共インキュベートし、IGSF8-hFc濃度に対するこれらの初代NK細胞の生存率(用量応答曲線)を測定した。
初代NK細胞またはT細胞は、市販の陰性/陽性分離キット(StemCell Technologies,Inc.)を使用して、健常ドナーの末梢血単核細胞(PBMC)から分離した。NK細胞またはT細胞は、10%ウシ胎仔血清(FBS)、ペニシリン/ストレプトマイシン、L-グルタミン、非必須アミノ酸、ピルビン酸ナトリウム、HEPES、2-メルカプトエタノールおよび組換えヒトIL-2(1,000IU/mL)を添加したRPMI培地で培養し、37℃、5% CO2でインキュベートした。T細胞は、1週間に1回、抗CD3および抗CD28ビーズにより活性化した。
その後、初代NK細胞またはT細胞を96ウェルプレートに播種し(3,000細胞/ウェル)、18~24時間培養した後、IGSF8-hFc融合タンパク質または陰性対照としてのヒトFcタンパク質を添加した。細胞生存率は、72時間後に3つの生物学的複製を用いたCell Counting Kit 8(CCK8)法により決定した。
図2Aのデータは、IGSF8-hFcの濃度が増加するにつれて、NK細胞の生存率がインビトロで低下したことを示す。一方、同じアッセイで対照として使用したヒトFcは、NK細胞の生存率に実質的に影響を与えなかった。このデータは、Colo205癌細胞上のIGSF8の存在が、おそらく少なくとも部分的にNK細胞の生存率の低下を通じてNK細胞の機能を阻害するという実施例1における観察と一致する。
図2Aのデータは、IGSF8-hFcの濃度が増加するにつれて、NK細胞の生存率がインビトロで低下したことを示す。一方、同じアッセイで対照として使用したヒトFcは、NK細胞の生存率に実質的に影響を与えなかった。このデータは、Colo205癌細胞上のIGSF8の存在が、おそらく少なくとも部分的にNK細胞の生存率の低下を通じてNK細胞の機能を阻害するという実施例1における観察と一致する。
同様の結果が、ドナー2から単離された初代Tリンパ球についても得られた。図2Bを参照のこと。
これらのデータは、IGSF8がインビトロで初代NK細胞および初代T細胞の両方の生存率を低下させることを示し、これは、IGSF8活性をそれによって拮抗することがNK/T細胞活性を回復または促進するために使用できるメカニズムを示唆した。一方、IGSF8(そのhFc融合体を含む)は、特定の自己免疫疾患または移植片対宿主病等、過剰なT細胞および/またはNK細胞の活性が有害である疾患治療において、T細胞および/またはNK細胞の活性を阻害するために使用することができる。
実施例3
B16-F10腫瘍細胞におけるCRISPR/Cas9媒介性IGSF8ノックアウトは、同系腫瘍モデルにおいてインビボで腫瘍成長を遅延させる
腫瘍に発現したIGSF8が宿主免疫系に及ぼす陰性の影響をさらに実証するため、IGSF8の機能/発現を有するB16-F10黒色腫細胞またはIGSF8の機能/発現を有さない(IGSF8ヌル)細胞を、野生型(WT)マウスで同系腫瘍として増殖する能力を比較した。IGSF8遺伝子は、IGSF8特異的な一本鎖ガイドRNA(sgRNA)配列を用いたCRISPR/Cas9媒介性遺伝子編集によって欠失/不活性化された。IGSF8を不活性化した2つの個別のB16-F10癌細胞株、すなわち、IGSF8の異なる領域を標的としたsg IGSF8-1とsg IGSF8-2が確立された。IGSF8発現の下方制御はフローサイトメトリーで確認された(データは示さない)。陰性対照として、アデノ随伴ウイルス組込み配列AAVS1も同様に、B16-F10細胞においてCRISPR/Cas9媒介性遺伝子編集により欠失/不活性化した(sg AAVS1)。そして、0日目に、改変していないB16-F10癌細胞、sgIGSF8-1細胞、sgIGSF8-2細胞、sgAAVS1細胞をそれぞれ100万個ずつC57BL/6マウス(1群当たり8マウス)に移植し、各マウスの腫瘍量を標準法に従って2週間測定して算出した。その結果を標準偏差で各群の平均をとり、図3Aにプロットした。
B16-F10腫瘍細胞におけるCRISPR/Cas9媒介性IGSF8ノックアウトは、同系腫瘍モデルにおいてインビボで腫瘍成長を遅延させる
腫瘍に発現したIGSF8が宿主免疫系に及ぼす陰性の影響をさらに実証するため、IGSF8の機能/発現を有するB16-F10黒色腫細胞またはIGSF8の機能/発現を有さない(IGSF8ヌル)細胞を、野生型(WT)マウスで同系腫瘍として増殖する能力を比較した。IGSF8遺伝子は、IGSF8特異的な一本鎖ガイドRNA(sgRNA)配列を用いたCRISPR/Cas9媒介性遺伝子編集によって欠失/不活性化された。IGSF8を不活性化した2つの個別のB16-F10癌細胞株、すなわち、IGSF8の異なる領域を標的としたsg IGSF8-1とsg IGSF8-2が確立された。IGSF8発現の下方制御はフローサイトメトリーで確認された(データは示さない)。陰性対照として、アデノ随伴ウイルス組込み配列AAVS1も同様に、B16-F10細胞においてCRISPR/Cas9媒介性遺伝子編集により欠失/不活性化した(sg AAVS1)。そして、0日目に、改変していないB16-F10癌細胞、sgIGSF8-1細胞、sgIGSF8-2細胞、sgAAVS1細胞をそれぞれ100万個ずつC57BL/6マウス(1群当たり8マウス)に移植し、各マウスの腫瘍量を標準法に従って2週間測定して算出した。その結果を標準偏差で各群の平均をとり、図3Aにプロットした。
IGSF8の発現/機能の欠如は、11日目という早期段階で腫瘍成長を著しく遅らせ(p<0.05)、腫瘍体積の差は14日目で有意であった(p<0.0001)ことが明らかである。このインビボでの結果は、IGSF8がインビトロでNKおよびT細胞の生存率を低下させるという以前の観察と一致している。
興味深いことに、IGSF8の存在も不在も、腫瘍成長それ自体に必要なわけではないことが明らかになった。上記試験細胞株のそれぞれについてインビトロで測定された、6日間の経過における相対的腫瘍細胞増殖率は、本質的に区別できなかった(図3Bを参照)。
この結果は、625種類の癌細胞株に基づくゲノムワイドCRISPRスクリーニング(DepMap Portalからダウンロードしたデータ)におけるIGSF8の平均必須スコアが、ごくわずかに負であり、0に非常に近い(約-0.05)(データは示さない)という観察とも一致しており、IGSF8が細胞増殖において(もしあれば)非常に小さな直接的役割を果たすことを示唆している。一方、myc等の代表的な癌遺伝子およびCDK1等の細胞周期遺伝子は、いずれも-1.0を大きく下回り、癌抑制遺伝子Tp53の平均必須スコアは+0.2である(データは示さない)。
これらのデータを総合すると、腫瘍細胞上のIGSF8の不在は、腫瘍細胞の増殖速度それ自体を低下させることによってではなく、おそらく宿主免疫系に負の影響を与える(例えば、阻害する)ことによって、インビボでの腫瘍細胞の増殖を遅延化することを強く示唆している。
実施例4
TNFαシグナル伝達経路はIGSF8によって負に制御される
腫瘍細胞におけるIGSF8の喪失によって腫瘍細胞が免疫監視から逃れることができる機構を特定するために、実施例3に記載のように、IGSF8ヌルおよびAAVS1対照B16-F10黒色腫細胞の両方についてRNA配列決定を行った。
TNFαシグナル伝達経路はIGSF8によって負に制御される
腫瘍細胞におけるIGSF8の喪失によって腫瘍細胞が免疫監視から逃れることができる機構を特定するために、実施例3に記載のように、IGSF8ヌルおよびAAVS1対照B16-F10黒色腫細胞の両方についてRNA配列決定を行った。
重要なことに、B16-F10細胞におけるIGSF8の枯渇が、TNFαシグナル伝達経路を活性化し、多くの免疫関連サイトカイン(特に、CXCL10およびCXCL9、図5A~5B参照)の遺伝子発現を増加させることが見出された。CXCL10は、CXCケモカインファミリーに属する低サイトカインであり、走化性誘導、白血球の分化および増殖促進、および組織外遊走の原因となる役割を担っている。CXCL10は、IFN-γに応答して、いくつかの細胞種から分泌される。
CXCL9およびCXCL10は、免疫細胞遊走、分化、および活性化を制御し、腫瘍抑制につながることが知られていたため(Tokunagaら、Cancer Treat Rev.63:40~47、2018)、他のヒト癌細胞におけるCXCL10発現に対するIGSF8の影響を検討した。
具体的には、6つのヒト癌細胞株において、CRISPR/Cas9によりIGSF8をノックアウトし、これらのIGSF8ヌルおよびAAVS1対照ヒト癌細胞についてRNA配列決定を行った。図4は、種々の試験した腫瘍細胞株におけるCXCL10の相対的発現が、インタクトなIGSF8を有する対応する癌細胞株と比較して、IGSF8ヌル癌細胞において増加し、時にはほぼ10倍まで劇的に増加したことを示している。試験された癌細胞株は以下を含んでいた:H292(NCI-H292)はヒト粘表皮肺癌細胞株であり、A549はヒト肺癌細胞株、Colo205はDukesのD型大腸腺癌細胞株であり、N87はヒト胃癌細胞株である、およびA375は他のヒト黒色腫細胞株である。
これらのデータは、IGSF8が種々の癌におけるCXCL10発現の普遍的な負の調節因子であり、IGSF8の欠失または不活性化がCXCL10発現を促進する可能性を示唆する。
実施例5
IGSF8の喪失は、NKおよびT細胞の活性を改善するために腫瘍微小環境(TME)を再プログラムした
B16-F10腫瘍におけるIGSF8の不活性化が腫瘍成長を有意に減少させる機構を特定するために(図3A参照)、IGSF8-ヌルおよびAAVS1-対照B16-F10細胞をC57BL6マウスに皮下接種した。腫瘍が1~2mm3程度に成長した時点で腫瘍を単離し、単離した腫瘍についてRNA配列決定を実施した。
IGSF8の喪失は、NKおよびT細胞の活性を改善するために腫瘍微小環境(TME)を再プログラムした
B16-F10腫瘍におけるIGSF8の不活性化が腫瘍成長を有意に減少させる機構を特定するために(図3A参照)、IGSF8-ヌルおよびAAVS1-対照B16-F10細胞をC57BL6マウスに皮下接種した。腫瘍が1~2mm3程度に成長した時点で腫瘍を単離し、単離した腫瘍についてRNA配列決定を実施した。
腫瘍の免疫細胞溶解活性(CYT)を表す遺伝子(Gzmb、Prf1等)が、IGSF8-ヌル腫瘍(図5B)において著しく発現が上昇し、IGSF8-ヌル細胞(図5A)では上昇しないことが明らかとなった。さらに、IGSF8-ヌル腫瘍におけるCD8遺伝子(CD8aおよびCD8b)発現(ただし、IGSF8ヌル細胞では発現しない、図5A)も劇的に増加し(図5B)、これは、IGSF8-ヌル腫瘍へのCD8+T細胞の浸潤がより多いことが示された。
これらのデータは、B16-F10腫瘍におけるIGSF8の枯渇が、おそらくCD8+T細胞浸潤の増加によって、腫瘍抑制のためのインビボでの免疫による細胞溶解活性を改善するために、腫瘍微小環境(TME)を再プログラムしたことを示唆する。
さらに重要なことに、IGSF8の喪失は、よく確立されたIO標的(PDCD1、CD274、LAG3、TIM3またはTIGIT)の発現を増加させ(図5D)、これは、IGSF8アンタゴニストをPDCD1、CD274、Lag3、TIM3またはTIGITのアンタゴニストと組合せ療法において組み合わせることが、癌治療に有効であることを示す。下記参照。
実施例6
IGSF8は、多くの癌種で過剰発現しており、より悪い臨床転帰をもたらした
この実施例は、IGSF8が、おそらく宿主免疫応答を回避する機構として、多くの癌細胞によって過剰発現されることを実証するものである。
IGSF8は、多くの癌種で過剰発現しており、より悪い臨床転帰をもたらした
この実施例は、IGSF8が、おそらく宿主免疫応答を回避する機構として、多くの癌細胞によって過剰発現されることを実証するものである。
図6Aは、Broad Institute Cancer Cell Line Encyclopedia(CCLE)のデータに基づく、多くのヒト癌細胞株におけるIGSF8の遺伝子発現を示す。CCLEデータセットで最も高いIGSF8発現を有する上部30癌細胞株を以下に示す。
さらに、The Cancer Genome Atlas(TCGA)データセットの解析に基づき、IGSF8は多くの種類の癌:BLCA:膀胱癌、BRCA:乳癌、HNSC:頭頸部扁平上皮癌、LUAD:肺腺癌、LUSC:肺扁平上皮癌、PRAD:前立腺腺癌、SKCM:皮膚黒色腫、THCA:甲状腺癌、UCEC:子宮体部内膜癌、READ:直腸腺癌、COAD:大腸腺癌で有意に過剰発現していることが見出された(図6B)。
IGSF8発現の臨床的関連性は、The Cancer Genome Atlas(TCGA)に基づくデータによっても実証された。具体的には、図6Cは、異なる癌種において、IGSF8の高い発現がより悪い臨床転帰と関連していることを示す。例えば、黒色腫では、IGSF8の発現量が高い13人の患者(「上部」)は、IGSF8の発現量が低い304人の患者(「下部」)の生存曲線よりもはるかに悪い。この差は統計学的に有意である(p<0.0018)。
同じことが、子宮頸癌、LUAD(肺腺癌)、リンパ腫(びまん性大細胞型B細胞リンパ腫またはDLBCLを含む)、LUSC(肺扁平上皮癌)、READ(直腸腺癌)、COAD(結腸腺癌)、白血病(CLLを含む)でも観察されている。
したがって、抗IGSF8抗体またはその抗原結合断片等の本発明のIGSF8アンタゴニストは、IGSF8過剰発現を有する癌、例えば上記の表および図6A~6Cに記載の癌を治療できることが期待される。
したがって、抗IGSF8抗体またはその抗原結合断片等の本発明のIGSF8アンタゴニストは、IGSF8過剰発現を有する癌、例えば上記の表および図6A~6Cに記載の癌を治療できることが期待される。
実施例7
抗IGSF8抗体は、IGSF8細胞外ドメイン(ED)に対してナノモル(nM)の親和性を示す
約50の抗IGSF8モノクローナル抗体を作製し、そのうちの12の抗IGSF8 C1~C12をELISAを用いた親和性結合アッセイで試験したところ、全てがIGSF8の細胞外ドメイン(ED)に対して高い親和性を示した。図7を参照されたい。最も強い結合親和性を示す抗体は、約中間~低nMの範囲のEC50値を有する。C1~C4、C8、およびC11を参照されたい。
抗IGSF8抗体は、IGSF8細胞外ドメイン(ED)に対してナノモル(nM)の親和性を示す
約50の抗IGSF8モノクローナル抗体を作製し、そのうちの12の抗IGSF8 C1~C12をELISAを用いた親和性結合アッセイで試験したところ、全てがIGSF8の細胞外ドメイン(ED)に対して高い親和性を示した。図7を参照されたい。最も強い結合親和性を示す抗体は、約中間~低nMの範囲のEC50値を有する。C1~C4、C8、およびC11を参照されたい。
これらの代表的な抗体の、軽鎖(LC)および重鎖(HC)の可変領域、CDR領域、フレームワーク領域(FR)、および定常領域を含む配列を以下の表に示す(H=重鎖;L=軽鎖;CDR-H1~H3:3つの重鎖CDR配列;CDR-L1~L3:3つの軽鎖CDR配列;FR:フレームワーク領域)。
下記の抗体配列において、HCVRおよびLCVRの配列には下線を付し、6つのCDR配列には二重線を付す。残りの配列は重鎖および軽鎖のフレームワーク領域HFR1-HFR4およびLFR1-LFR4である。したがって、各表には次の16個の配列がこの順序で含まれる:CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、HFR1~HFR4、LFR1~LFR4、HCVRおよびLCVR(すなわち、抗体C1については配列番号1~16、抗体C2については配列番号17~32等)。簡潔性のため、二重下線CDR配列を有するHCVRおよびLCVR配列のみを示す。
下記の表では、HCVRおよびLCVRの配列にのみ配列番号を付与する。
上記全ての配列において、HCVR(重鎖可変領域)配列は、HFR1/CDR-H1/HFR2/CDR-H2/HFR3/CDR-H3/HFR4(NからC末端)の開示された配列に加えて、MHSSALLCCLVLTGVRA(配列番号465)の最もN末端のシグナルペプチド配列に基づいて組み立てられることが可能である。
同様に、LCVR(軽鎖可変領域)配列は、LFR1/CDR-L1/LFR2/CDR-L2/LFR3/CDR-L3/LFR4(NからC末端)の開示された配列に加えて、MHSSALLCCLVLLTGVRA(配列番号465)の最もN末端のシグナル配列に基づいて組み立てられることが可能である。
同様に、LCVR(軽鎖可変領域)配列は、LFR1/CDR-L1/LFR2/CDR-L2/LFR3/CDR-L3/LFR4(NからC末端)の開示された配列に加えて、MHSSALLCCLVLLTGVRA(配列番号465)の最もN末端のシグナル配列に基づいて組み立てられることが可能である。
本出願に記載のインビボアッセイは、ヒトIgG1抗IGSF8抗体のみを使用したが、他のIg定常領域(例えばIgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgE、IgM、IgD定常領域)を有する他の抗IGSF8抗体も企図され、本発明の範囲内である。
実施例8
抗IGSF8抗体は、強力なADCC効果を発揮する
この実験は、NK細胞をエフェクター細胞として、A431癌細胞を標的細胞として、本発明の抗IGSF8抗体が強いADCC効果を示すことを実証するものである。
抗IGSF8抗体は、強力なADCC効果を発揮する
この実験は、NK細胞をエフェクター細胞として、A431癌細胞を標的細胞として、本発明の抗IGSF8抗体が強いADCC効果を示すことを実証するものである。
ここで、ADCC(antibody dependent cell-mediated cytotoxicity:抗体依存性細胞傷害)は、抗体が標的細胞を被覆することにより、免疫細胞による攻撃を受けやすくする免疫反応を意味する。具体的には、A431癌細胞表面に発現したIGSF8は、抗IGSF8抗体濃度を増加させることによって認識および結合を受けた。抗IGSF8抗体のFc領域は、次いでNK細胞上のCD16 Fc受容体に認識された。CD16 Fc受容体の架橋は、溶血性シナプスへの脱顆粒を引き起こす。その結果、標的化された腫瘍細胞はアポトーシスにより死滅した。
A431細胞をRPMI培地と共に96ウェルプレートに播種し、種々の濃度の抗IGSF8アイソタイプと約1時間インキュベートした。その後、ドナー由来の活性化初代NK細胞を、A431細胞と抗体を含むウェルに4,000細胞/ウェル(標的:エフェクター比1:2.5)で添加し、37℃でさらに4時間インキュベートした。細胞死は乳酸脱水素酵素(LDH)放出アッセイによって決定された。
試験した12の抗体C1~C12それぞれについて用量反応曲線を確立し、そのEC50値を決定した。
試験した12の抗IGSF8抗体(C1~C12)は全て、A431癌細胞に対して約3~12mMの範囲のADCC EC50値を示した。
実施例9
抗IGSF8抗体はCXCL10の発現を刺激する
上記図4は、CRISPR/Cas9媒介性遺伝子編集を用いてColo205癌細胞においてIGSF8を不活性化すると、Colo205細胞によるCXCL10の発現/分泌が約7~10倍増加することを示す。この実験は、Colo205癌細胞と本発明の抗IGSF8抗体(10μg/mL)をインキュベートすることで、同様にCXCL10の発現/分泌をもたらすことを、ELISA法に基づいて示す。
抗IGSF8抗体はCXCL10の発現を刺激する
上記図4は、CRISPR/Cas9媒介性遺伝子編集を用いてColo205癌細胞においてIGSF8を不活性化すると、Colo205細胞によるCXCL10の発現/分泌が約7~10倍増加することを示す。この実験は、Colo205癌細胞と本発明の抗IGSF8抗体(10μg/mL)をインキュベートすることで、同様にCXCL10の発現/分泌をもたらすことを、ELISA法に基づいて示す。
具体的には、Colo205癌細胞を96ウェルプレートに播種し(4,000細胞/ウェル)、RPMI培地で12時間培養した後、試験抗体の1つを5μg/mLで37℃、5%CO2の加湿雰囲気下で添加し24時間おくことにより、培養した。その後、培地の上清を標準的なELISAアッセイのために回収し、市販のCXCL10 ELISAキットを用いて、培地中のCXCL10の力価/量を測定した。抗体C1~C4、C8、およびC10は全て、Colo205細胞によって比較的高いレベルのCXCL10発現を誘導した。
実施例10
抗IGSF8抗体はインビボでの有効性を示した
図3A~3Bにおいて、CRISPR/Cas9媒介性遺伝子編集を用いてIGSF8をノックアウトすると、インビトロ腫瘍細胞増殖速度自体に影響を与えることなく、マウス異種移植モデルにおけるインビボでのB16-F10黒色腫増殖の遅延をもたらすことが示された。
抗IGSF8抗体はインビボでの有効性を示した
図3A~3Bにおいて、CRISPR/Cas9媒介性遺伝子編集を用いてIGSF8をノックアウトすると、インビトロ腫瘍細胞増殖速度自体に影響を与えることなく、マウス異種移植モデルにおけるインビボでのB16-F10黒色腫増殖の遅延をもたらすことが示された。
この実験では、本発明の代表的な抗IGSF8モノクローナル抗体の、B16同系マウスモデルにおける腫瘍増殖に対する効果が試験された。具体的には、100万個のB16-F10黒色腫細胞を、野生型(WT)C57BL/6マウスに皮下注射した。次に、マウスを尾静脈注射によって、6日目から3日ごとに、合計4回、4つの抗IGSF8抗体(C1~C4)のうちの1つを2mg/kgの用量で、または対照ヒトIgG1で処理した。データは平均±s.e.mで示した(1群当たりn=8マウス)。
野生型宿主マウスにおいて、対象の抗IGSF8モノクローナル抗体は、少なくともC3およびC4について約18日後にIgG1対照と比較した差が統計的に有意(p<0.005)になるように、B16-F10黒色腫腫瘍成長(体積増加)を同様に遅延させることが明らかである。図10を参照されたい。
同様の実験を、胸腺を欠き、成熟Tリンパ球を産生できないが、B細胞および強固なNK細胞応答を有するヌードマウス(Foxn1nu)において繰り返した。対象の抗IGSF8抗体の効果は、同様であるように見えた。14日目において、C2抗体の効果は統計的に有意であり(p<0.05)、C4抗体の効果も同様であった(p<0.005)。
注目すべきは、実験マウスの異なる群間で有意な体重差がないように見え(図11)、この結果は、CRISPR/Cas9を用いてIGSF8をノックアウトしても、腫瘍細胞成長速度それ自体に評価できるほどの影響を及ぼさないという事実と一致した。
実施例11
抗IGSF8抗体および抗PD-1抗体による相乗的な抗腫瘍効果
この実験は、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体と抗PD-1抗体が、同系マウスモデルにおいて、インビボでB16-F10黒色腫腫瘍成長を阻害する相乗効果を有することを実証するものである。
抗IGSF8抗体および抗PD-1抗体による相乗的な抗腫瘍効果
この実験は、本発明の抗IGSF8モノクローナル抗体と抗PD-1抗体が、同系マウスモデルにおいて、インビボでB16-F10黒色腫腫瘍成長を阻害する相乗効果を有することを実証するものである。
具体的には、100万個のB16-F10黒色腫細胞を、野生型(WT)C57BL/6マウスに皮下注射した。その後、尾静脈注射により、4種類の抗体または複数の抗体の組合せ:用量2mg/kgのIgG対照、用量2mg/kgの抗PD-1抗体、用量2mg/kgの抗IGSF8抗体C3、または半分の用量(1mg/kg)の抗PD-1抗体および半分の用量(1mg/kg)の抗IGSF8抗体の組合せのいずれか1つによりマウスを処理した。最初の投与は6日目に行い、その後の投与は3日ごとに行い、合計4回投与した。データは平均値±s.e.mで示した(1群当たりn=8マウス)。
組合せの各成分の50%用量(1mg/kg)で投与された組合せ療法は、(1)2倍の用量(2mg/kg)の抗IGSF8抗体C3単独(p<0.01)、(2)2倍の用量(2mg/kg)の市販の抗PD-1抗体(クローン29F.1A12、BioXcell)単独で(p<0.005)、および(3)IgG対照(p<0.001)よりも有意に高いという点で、対象の抗IGSF8抗体および抗PD-1抗体は、インビボでの黒色腫増殖抑制において相乗効果を示すことが明らかであった。
この驚くべき発見は、IGSF8経路とPD-1/PD-L1免疫チェックポイントを同時に阻害することが、インビボでの腫瘍増殖を相乗的に抑制できることを強く示唆している。
実施例12
免疫抑制遺伝子を発見するためのin vivo遺伝学的スクリーニング
本実施例は、免疫療法によって治療した動物において、in vivoで増殖する腫瘍細胞の「適応度」を増加または低減させる遺伝子を特定するために開発したプール型遺伝子スクリーニングアプローチの使用を示す(図1A)。
免疫抑制遺伝子を発見するためのin vivo遺伝学的スクリーニング
本実施例は、免疫療法によって治療した動物において、in vivoで増殖する腫瘍細胞の「適応度」を増加または低減させる遺伝子を特定するために開発したプール型遺伝子スクリーニングアプローチの使用を示す(図1A)。
具体的には、マウス黒色腫細胞株B16-F10において検出可能なレベルで発現している関連する機能クラスからの約1,000個の遺伝子を標的とするレンチウイルスベクター(約6,000個のsgRNAをコードする)のライブラリーを作製した。本スクリーニングは、CRISPR/Cas媒介性のノックダウンによって発現量が低下すると、腫瘍細胞の適応度スコアが変化する遺伝子を特定するために設計された。
遺伝子編集が可能になるようにB16-F10腫瘍細胞を形質導入し、in vitroで継代した後、B16-F10細胞を野生型C57BL/6マウスに移植し、ヒトIgG1-Fc断片または抗PD1、抗PD-L1、抗CTLA4モノクローナル抗体のいずれかで処理して、腫瘍細胞に免疫選択的に圧力をかけるのに十分な適応免疫応答を発生させた。並行して、ライブラリーを形質導入したB16-F10細胞をin vitroで維持した。
14日後、腫瘍および細胞を回収した。次いで、免疫療法処理を行ったマウスから単離した腫瘍におけるライブラリーの発現を、in vitroで維持した細胞の発現と比較した。CRISPRで欠失させると、in vivo(マウス)では腫瘍細胞の増殖を特異的に低下させるが、in vitroでは細胞増殖に影響を与えない免疫抑制遺伝子を特定した。
IGSF8、ならびに3つのよく知られた免疫調節因子(CD47、PDL1、およびIFNGR1)は、IgGまたはPD1、PDL1、CTLA4遮断のいずれかで処理した腫瘍で著しく枯渇した(データは示さない)。したがって、本実施例は、in vivo遺伝子スクリーニングにより、癌細胞に免疫回避特性を付与することが知られている遺伝子が回収されたことを示す。
実施例13
IGSF8ヒトFc融合タンパク質は健常ドナー由来の活性化した初代NKまたはT細胞の増殖および細胞溶解活性を抑制する
上記の実施例2は、ヒトFc領域によってタグ付加された組換えヒトIGSF8細胞外ドメイン(IGSF8-hFc)の濃度を上昇させると、健常ドナーから単離した初代ヒトNK細胞またはT細胞とインキュベートした際に、IGSF8-hFc濃度に対してこれらの初代NKまたはT細胞の生存率が低下するという点において、NKまたはT細胞活性に対するIGSF8の負の影響を示す(用量応答曲線)。図2Aおよび図2Bを参照のこと。
IGSF8ヒトFc融合タンパク質は健常ドナー由来の活性化した初代NKまたはT細胞の増殖および細胞溶解活性を抑制する
上記の実施例2は、ヒトFc領域によってタグ付加された組換えヒトIGSF8細胞外ドメイン(IGSF8-hFc)の濃度を上昇させると、健常ドナーから単離した初代ヒトNK細胞またはT細胞とインキュベートした際に、IGSF8-hFc濃度に対してこれらの初代NKまたはT細胞の生存率が低下するという点において、NKまたはT細胞活性に対するIGSF8の負の影響を示す(用量応答曲線)。図2Aおよび図2Bを参照のこと。
同様の実験をここで繰り返した。簡潔に説明すると、初代NKまたはT細胞は、市販の陰性/陽性分離キット(StemCell Technologies,Inc.)を使用して、健常ドナーの末梢血単核細胞(PBMC)から単離した。NK細胞は、10%ウシ胎児血清(FBS)、ペニシリン/ストレプトマイシン、L-グルタミン、非必須アミノ酸、ピルビン酸ナトリウム、HEPES、2-メルカプトエタノール、フィーダー細胞(ARK company,Hangzhou)および組換えヒトIL-2(1000 IU/mL)を補充したRPMI培地中で培養および活性化し、37℃、5%CO2でインキュベートした。T細胞は、ヒトIL-2(1,000 IU/mL)を添加したTexMACS培地で、37℃、5%CO2で培養し、抗CD3および抗CD28 mAbにより週1回活性化した。
その後、初代NK細胞を96ウェルプレートに播種し(1ウェルあたり約3,000細胞)、18~24時間培養した後、IGSF8-hFc融合タンパク質(5μg/mL)またはヒトFcタンパク質(5μg/mL、陰性対照として)を添加した。細胞生存率は、72時間後に3つの生物学的複製を用いてCell Counting Kit 8(CCK8)法により決定した。実験には、組換えIGSF8ヒトFc融合タンパク質であるIGSF8-hFc0601およびIGSF8-hFc0604の2つの生物学的複製を使用した。その結果、IGSF8-hFc融合タンパク質は、用量依存的に初代NK細胞の細胞増殖を統計的に有意に(p<0.005)阻害することが再び示された。図2Cを参照のこと。
IGSF8-hFc融合タンパク質がNK細胞の活性を阻害する機構をさらに理解するために、hFc(5μg/mL、陰性対照)またはIGSF8-hFcタンパク質(5μg/mL)のいずれかで24時間処理したNK細胞についてRNA-seqを行った。これら2つの細胞群間の差示的遺伝子発現を比較することによって、hFcタンパク質で処理したNK細胞と比較してIGSF8-hFcタンパク質で処理したNK細胞において発現量が下方制御されている最も濃縮されているGene Ontology(GO)項として、細胞周期遺伝子経路が特定された(図2)。しかし、IGSF8-hFcで処理したNK細胞では、細胞死遺伝子経路は有意に下方制御されたものはなかった。IGSF8-hFc融合タンパク質またはhFc対照タンパク質で処理したNK細胞における遺伝子の相対的mRNA発現を、図2Eに示した。これらの結果は、PBMC細胞における細胞増殖アッセイの結果(図2F参照、IGSF8-hFc融合タンパク質は、分裂2回を超えるNK細胞の増殖を阻害した)と一致した。
一方、T細胞増殖測定では、CD4+ T細胞を製造者の指示に従ってCFSE(Thermo)で標識した後、IGSF8-hFc融合タンパク質(5μg/mL)またはヒトFcタンパク質(5μg/mL、陰性対照として)を添加し、さらに24時間T細胞を培養した。データはフローサイトメトリーで解析した。興味深いことに、CD4+ T細胞の増殖もIGSF8-hFc処理により顕著に抑制された(図2G)。
RNA-seqによって、活性化したNK細胞の細胞溶解活性を表すいくつかの遺伝子(Gzmb、Prf1等)の活性が、IGSF8-hFcで処理したNK細胞において著しく低下していることが明らかになったため(図2E)、NK細胞の細胞溶解活性について、IGSF8-hFc処理がこの活性に影響するかどうかについて分析した。
NK細胞とK562細胞との細胞共培養モデルを用いて、IGSF8-hFc処理によりNK細胞の細胞溶解活性が劇的に低下することが確認され(図13A)、これはIGSF8-hFc処理によりNK細胞のパーフォリン発現が枯渇するためである(図13B)。
さらに、CD69を活性化マーカーとして用いると、CD4+ T細胞の活性化もIGSF8-hFc処理によって強く阻害された(図2H)。
これらのデータを総合すると、IGSF8-hFc融合タンパク質は、NKまたはT細胞媒介性免疫応答の抑制因子として機能することが強く示唆された。したがって、この融合タンパク質は、自己免疫疾患または臓器移植の急性拒絶反応の治療等、望ましくないT細胞および/またはNK細胞媒介性の免疫応答を下方制御する治療剤として有用であり得る。
実施例14
組換えIGSF8の活性化NK細胞およびT細胞への結合の増加
本実施例は、NK細胞およびT細胞が共にIGSF8の受容体を発現していることを示す。
組換えIGSF8の活性化NK細胞およびT細胞への結合の増加
本実施例は、NK細胞およびT細胞が共にIGSF8の受容体を発現していることを示す。
本実験では、8×Hisタグ(精製用)およびAVIタグ(Biotin Protein Ligase(GeneCopoeia)によるビオチン化用)に融合したヒトIGSF8の細胞外ドメインからなる融合タンパク質を発現するためのベクターを構築した。次いで、ビオチンを有する精製組換えタンパク質を用いて、フローサイトメトリー解析によりNK/T細胞上の推定IGSF8受容体の存在を検出した。
タグ付加した組換えIGSF8は新しく単離したヒトNK/T細胞と弱い結合を示すが、フィーダー細胞共培養により活性化したCD56+ NK細胞の約40%、および抗CD3 mAbで刺激したCD4+ T細胞の約20%が陽性染色された(FACSデータは示さない)。
これらのデータは、活性化したヒトNK細胞およびT細胞が共にIGSF8の推定受容体(複数可)を発現していることを示した。
実施例15
標的細胞表面のIGSF8の発現は初代NK細胞の細胞溶解活性に影響を及ぼす
本実施例は、標的細胞表面のIGSF8発現がNK細胞殺滅活性を調節し得ることを示す。
標的細胞表面のIGSF8の発現は初代NK細胞の細胞溶解活性に影響を及ぼす
本実施例は、標的細胞表面のIGSF8発現がNK細胞殺滅活性を調節し得ることを示す。
本実験では、NK細胞-K562共培養モデルを用い、NK細胞によって媒介される殺滅の標的細胞株として、公知のNK感受性細胞系であるMHC-I欠損K562細胞株を選択した。具体的には、96ウェルプレートに初代NK細胞を播種し(1ウェルあたり1万個)、K562細胞とE/T比=5:1で2時間共培養した。死細胞を7-AAD(Biolegend)で染色した後、フローサイトメトリーによって解析した。NK細胞の細胞傷害性は、NK細胞傷害性(%)=(NK細胞と共培養した7-AAD+%(死滅)K562細胞)-(NK細胞と共培養しない自発的7-AAD+%(死滅)K562細胞)により算出した。
第1に、IGSF8発現構築物のレンチウイルス送達によるK562細胞上のIGSF8タンパク質の強制発現により、IGSF8発現K562細胞を初代NK細胞の殺滅からほとんど保護した。図14を参照のこと。本実験では、2人の関連のないドナー由来のNK細胞が使用された。
第2に、K562細胞におけるあらゆる内在性IGSF8発現のレンチウイルス媒介性のCRISPR/Cas9ノックダウンによるIGSF8発現の喪失は、2人の関連のないドナーから得た初代NK細胞に対するK562細胞の感受性を顕著に増大させた(図14)。この結果は非常に強固であり、10人の異なるドナーから得た初代NK細胞を用いた場合の同一アッセイで一貫していた(データは示さない)。
これらのデータから、IGSF8はNK細胞によって媒介される免疫監視を制御する新規かつ重要なチェックポイント遺伝子であり、MHCクラスIが欠損した癌細胞上でIGSF8を過剰発現させると、NK細胞によって媒介される癌の免疫監視を回避し得ることが示唆された。
実施例16
ドメイン1はNK細胞免疫を抑制するIGSF8の主要な機能的ドメインである
本実施例は、IGSF8のドメイン1(他の細胞外部分ではない)がNK細胞によって媒介される殺滅の抑制に重要であることを実証している。
ドメイン1はNK細胞免疫を抑制するIGSF8の主要な機能的ドメインである
本実施例は、IGSF8のドメイン1(他の細胞外部分ではない)がNK細胞によって媒介される殺滅の抑制に重要であることを実証している。
IGSF8は4つのIg様トポロジー細胞外ドメインを有する。下記のドメイン構成を参照のこと。
IGSF8の2つの切断型バージョンを構築し、一方(「D1」)は第1の(最も外側の)細胞外ドメインD1を発現し、他方(「D24」)は膜貫通ドメインにより近い残りの3つの細胞外ドメイン(D2~D4)を発現する。図15Aを参照のこと。両方の構築物を、実施例14および15のような共培養実験に使用するためにK562細胞上で強制発現させた。
Ig V-セットドメインを含むIGSF8の第1のドメイン(D1)は、NK細胞結合のための主要機能的ドメインであることが実証された(図15B)一方、D1ドメインを含まない切断型IGSF8タンパク質(D24)は、NK細胞免疫に対するIGSF8の抑制機能を完全に失っていた(図15B)。
このデータは、D1ドメインがNK細胞抑制を担う主要な機能的ドメイン(唯一ではない)であることを示す。様々な種類の阻害剤(例えば、低分子、抗体、ペプチドまたは核酸)によってD1ドメインを標的とすることによって、NK細胞ベースの免疫療法を調節(阻害)し得る。
実施例17
KIR3DL1/2およびKLRC1&D1ヘテロ二量体はNK細胞のIGSF8受容体である
本実施例は、KIR3DL1/2およびKLRC1&D1ヘテロ二量体がNK細胞上のIGSF8受容体であり、IGSF8媒介性NK細胞免疫を調節するための潜在的な薬剤標的であることを示す。
KIR3DL1/2およびKLRC1&D1ヘテロ二量体はNK細胞のIGSF8受容体である
本実施例は、KIR3DL1/2およびKLRC1&D1ヘテロ二量体がNK細胞上のIGSF8受容体であり、IGSF8媒介性NK細胞免疫を調節するための潜在的な薬剤標的であることを示す。
実施例14では、組換えIGSF8タンパク質が活性化初代NK細胞に安定的に結合することが示され、これによりNK細胞がIGSF8に対する受容体を発現していることが示唆される。
IGSF8受容体を特定するために、健常ドナーから単離した初代NK細胞において、全てのヒト細胞表面タンパク質についてCRISPRスクリーニングを実施した。具体的には、レンチウイルスCRISPRライブラリーで細胞形質導入した後、蛍光活性化セルソーティング(FACS)を用いてIGSF8高結合細胞または低結合細胞を単離し、その後ハイスループットgRNA配列決定を行った。続いて、ゲノムワイドCRISPR/Cas9ノックアウト(MAGeCK)ソフトウェアのモデルベースの解析を使用して、gRNAリードをカウントし、IGSF8高結合細胞試料と低結合細胞試料との間で、遺伝子/gRNA倍数変化、選択スコアおよび統計解析を実施した。図16Aを参照のこと。
上記の解析に基づき、KIR3DL2がトップヒットとして特定され、KIR3DL1、KLRC1も外れヒットとして示され、このことからNK細胞上のこれらの遺伝子の発現の喪失によりIGSF8結合が低下することが示された(図16B)。
KIR3DL2およびKIR3DL1は、いずれもキラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)に属し、ナチュラルキラー(NK)細胞および少数のT細胞の細胞膜上に発現するI型膜貫通糖タンパク質のファミリーである。KIRファミリータンパク質をコードする少なくとも15個の遺伝子および2個の偽遺伝子が、ヒト染色体19q13.4上の白血球受容体複合体(LRC)の150kb領域にマッピングされる。KIR受容体は、全ての有核細胞種に発現する主要組織適合性(MHC)クラスI分子と相互作用することによって、これらの細胞の殺滅機能を制御していると考えられている。ほとんどのKIRは抑制型であり、MHC分子を認識することにより、KIRを発現するNK細胞の細胞傷害活性の抑制がもたらされる。これらの抑制型KIRは、比較的長い細胞質テイル(遺伝子名の「L」はこれによる)を有し、1つまたは2つのいわゆるITIMモチーフを有する。限られた数のKIRだけが活性化型であり、MHC分子を認識することによって活性化型KIRを発現するNK細胞の細胞傷害活性を活性化する。これらの活性化型KIRは、ITIMモチーフを持たない短い細胞質テイル(遺伝子名の「S」はこれによる)を有する。活性化型KIR(aKIR)の共通の特徴は、その膜貫通領域に荷電残基(Lys)が存在し、それにより免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ(ITAM)を含むシグナル伝達アダプタータンパク質KARAP/DAP12と結合できることである。
KLRC1(Killer cell Lectin-like Receptor,subfamily C,Member 1)は、代替スプライシングバリアントとしてNKG2AまたはNKG2Bとしても知られており、NK細胞で優先的かつ主に発現しNK細胞機能の調節に関与する膜貫通タンパク質ファミリーの1つであり、珍しいII型膜配向(細胞外C末端)とC型レクチンドメインの存在を特徴とする。また、NKG2遺伝子は、T細胞でも差次的に制御されている。これらのタンパク質の分布が限られていること、および公知の受容体分子と配列が類似していることから、NK細胞の受容体としての機能について恩恵を受けている。KIR受容体と同様に、NKG2AはSHP1またはSHP2と相互作用する2つのITIMを有する。NKG2Aは典型的には、全NK細胞の約半分ならびにCD8+T細胞のサブセットに発現している。NKG2Aはまた、配列の可変性が限られた非古典的なMHC分子であるHLA-Eを認識する。
KLRD1(Killer cell Lectin-like Receptor,subfamily D, Member 1)は、CD94としても知られ、NK細胞系では0.8、1.8および3.5kbの3つの主要転写物ならびに5.5kbの微量転写物として発現する。KLRD1もまた、KLRC1と同様に、外側C末端を有する珍しいII型膜タンパク質である。予想されるタンパク質は、C型レクチンに特徴的ないくつかのモチーフを有する147アミノ酸の細胞外ドメイン、26アミノ酸の膜貫通ドメインを含み、そして7アミノ酸の細胞質ドメインを除いて本質的に細胞質テイルを含まない。CD94は、NKG2A(KLRC1)を含むNKG2ファミリータンパク質と低い配列同一性(27~32%)を有する。細胞質ドメインが実質的に存在しないことは、KLRD1/CD94がIGSF8と結合するためにはKLRC1とヘテロ二量体を形成しなければならないという知見と一致する。KLRD1は、NKG2A(KLRC1)、NKG2C、およびNKG2Eとジスルフィド結合したヘテロ二量体を形成することが示されている。さらに、HLA-E四量体は末梢血由来のナチュラルキラー(NK)細胞およびT細胞の小さなサブセットに結合することが見出されており、これはCD94/NKG2A(KLRD1/C1ヘテロ二量体)、CD94/NKG2B、およびCD94/NKG2C NK細胞受容体の結合によるものであり得るが、HLA-E四量体は免疫グロブリン系列のKIR NK細胞受容体に結合しない。
KIR受容体はKIRファミリー受容体内で強い相同性を有するため、IGSF8がKIR3DL1/2に特異的に結合することを示すためにさらなる実験を行った。
この実験のために、異なるヒトKIR受容体(KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL4、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL3)を最初にthy1.1タグを含む独自のレンチウイルスベクター内にクローニングした(図17A)。次に、マウスCT26細胞を、これらのレンチウイルス構築物によって形質導入し、IGSF8結合をビオチン-標識組換えIGSF8 hFc融合タンパク質を用いて試験した。異なるCT26細胞へのIGSF8結合の平均蛍光強度(MFI)は、フローサイトメトリーにより抗thy1.1 mAb(Biolegend)を用いてCT26細胞上の異なるKIRの発現により正規化した。
KIR3DL1およびKIR3DL2を発現するCT26細胞へのIGSF8結合の選択性が示されたが、これは、他のKIR受容体(KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL4、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL3)に対して観察される結合が実験条件下では全くない、または観察されても弱かったためである(図17B)。
KIR3DL1およびKIR3DL2を発現するCT26細胞へのIGSF8結合の選択性が示されたが、これは、他のKIR受容体(KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL4、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL3)に対して観察される結合が実験条件下では全くない、または観察されても弱かったためである(図17B)。
他の不活性化型KIRと同様に、KIR3DL1/2の細胞質テイルは配列「VTYAQL」から構成されるITIMモチーフを含み、このことにより、KIR3DL1/2は、癌免疫療法のチェックポイント受容体標的として作用し得るIGSF8の阻害受容体であることが示されている。
KLRC1も以前のスクリーニングからヒットであることが示されていたため、これもIGSF8の受容体であることを確認するために追加実験を行った。
KLRC1も細胞内ドメインにITIMモチーフを含み、細胞表面上のKLRD1とのヘテロ二量体の一部として、NK細胞またはCD8+T細胞の阻害受容体であることが知られていた。本明細書で提供されるデータは、IGSF8が、KLRC1およびKLRD1をコトランスフェクトした細胞に特異的に結合するが、KLRC1またはKLRD1レンチウイルス構築物のいずれか単独でトランスフェクトした細胞には結合しないことを示す(図17C&17D)。具体的には、抗原(KIRまたはKLR)を過剰発現する10万個のCT26細胞を、2%FBSを含むPBS緩衝液で洗浄し、100μLのIGSF8組換えタンパク質または抗体(5μg/mL)と共に氷上で30分間インキュベートした。次に、細胞を洗浄緩衝液で2回洗浄し、100μLの1:100抗ヒトFc-PE抗体と共に氷上で15分間インキュベートした。細胞を洗浄緩衝液で2回洗浄し、FACSアナライザー(CytoFlex、Beckman)で解析した。これらの実験において、異なるCT26細胞へのIGSF8結合の平均蛍光強度(MFI)は、フローサイトメトリーを介して抗thy1.1 mAbを用いたCT26細胞上の異なるKLRの発現により正規化した。
実施例16のデータと一致して、IGSF8タンパク質のD1ドメインは、細胞表面のKIR3DL1/2およびKLRC1&D1ヘテロ二量体受容体に特異的に結合した一方で、D1ドメインのないIGSF8タンパク質はこれらの受容体に結合できなかった(図17E)。
これらのデータを総合すると、KIR3DL1/2、およびKLRC1&D1ヘテロ二量体受容体は、いずれもNK細胞またはT細胞上のIGSF8の阻害受容体であり、IGSF8のD1ドメインはこれらの受容体相互作用を媒介する重要なドメインであることが示された。
実施例18
組換えIGSF8はKIR3DL1/2のドメイン2に特異的に結合する
本実施例はKIR3DL1/2のドメイン2がIGSF8との結合に重要であることを実証する。
組換えIGSF8はKIR3DL1/2のドメイン2に特異的に結合する
本実施例はKIR3DL1/2のドメイン2がIGSF8との結合に重要であることを実証する。
IGSF8と同様に、KIR3DL1/2受容体もいくつかのIg様C2トポロジー細胞外ドメインを有する。以下のドメイン構成を参照のこと。
図18Aに示すように、KIR3DL1およびKIR3DL2は、非常に類似したトポロジー構造を共有する。KIR3DL1/2遺伝子の異なる切断型形態をクローニングしてレンチウイルスベクターに構築し(図17A参照)、次いでマウスCT26細胞のレンチウイルス形質導入およびビオチン標識した組換えIGSF8タンパク質によるIGSF8結合試験を行った。異なるCT26細胞へのIGSF8結合の平均蛍光強度(MFI)は、フローサイトメトリーにより異なるCT26細胞上のthy1.1タグの発現により正規化した。
KIR3DL1およびKIR3DL2タンパク質のドメイン2(D2)へのIGSF8の結合の選択性が示され、これは、2つの末端KIRドメインを含むD12構築物へのIGSF8の結合は全長KIR3DL1/2タンパク質と同等であったが、IGSF8と末端D1/D3ドメインのみを含むD1/D3構築物の間に結合は見られなかったためである(図18B)。
このデータは、KIR3DL1/2の中間D2ドメインが、IGSF8の結合を受ける主要な(唯一ではないにしても)機能的ドメインであることを示す。したがって、様々な種類の阻害剤(例えば、低分子、抗体、ペプチドまたは核酸)によってKIR3DL1/2の中間D2ドメインを標的とすることによって、NK細胞ベースの免疫療法を調節(阻害)し得る。
実施例19
S165、I171およびM186はKIR3DL1/2およびIGSF8遮断を引き起こすための3つの重要なアミノ酸である
本実施例は、KIR3DL1/2の3つの残基がIGSF8との相互作用に重要な役割を果たすことを示しており、IGSF8のKIR3DL1/2への結合を遮断する阻害剤(低分子、抗体、ペプチドまたは核酸等)を設計するために重要である可能性がある。
S165、I171およびM186はKIR3DL1/2およびIGSF8遮断を引き起こすための3つの重要なアミノ酸である
本実施例は、KIR3DL1/2の3つの残基がIGSF8との相互作用に重要な役割を果たすことを示しており、IGSF8のKIR3DL1/2への結合を遮断する阻害剤(低分子、抗体、ペプチドまたは核酸等)を設計するために重要である可能性がある。
KIR受容体はKIRファミリー内で強い配列相同性を共有しているが、実施例17のデータでは、IGSF8が多数のKIR受容体のうちKIR3DL1およびKIR3DL2の2つのみに選択的に結合することが示され、これによりIGSF8の特定のKIR受容体への結合はKIR3DL1/2の非保存残基によって媒介され得ることが示唆される。
したがって、KIRタンパク質の多重配列アライメントを行い、その結果を図19Aに示した。さらに、PDBデータベースからKIR3DL1(3VH8)タンパク質の結晶構造を取得した(図19B)。これらの情報と結合に関するさらなる変異スクリーニングに基づき、IGSF8結合に重要な役割を果たすKIR3DL1/2の2つの重要なアミノ酸(S163、I171、およびM186)の特定に成功した。KIR3DL1/2のS165A、I171A変異およびM186A変異は両方が、KIR3DL1/2受容体へのIGSF8結合に有意な影響を与えた(図20)。
このデータは、これら3つの残基がIGSF8の結合に重要であり、KIR3DL1/2とIGSF8との相互作用を遮断する阻害剤を設計するための鍵を握っている可能性があることを示している。
実施例20
抗IGSF8モノクローナル抗体(mAb)の特徴付け
IGSF8に対する多数のモノクローナル抗体を、独自のコンピュータ支援設計アルゴリズムを用いてインシリコで作製し、このアルゴリズムは、ヒト(B細胞受容体)BCRレパートリー由来の利用可能な配列を部分的に利用して、異なる標的に対する完全ヒトモノクローナル抗体の配列を作製する。この技術により、標的抗原の所与の機能的ドメインに対する多数のモノクローナル抗体の迅速な設計が可能になる。例えば、この方法によってヒトIGSF8に対する100超のヒトモノクローナル抗体が作製された。これらの抗体の重鎖および軽鎖の配列を得た後、これらの配列に基づくモノクローナル抗体をCHO細胞を用いて発現させ、さらにBiacore T100による表面プラズモン共鳴(SPR)を用いて全長IGSF8またはIGSF8のD1ドメインのいずれかに対する高親和性結合体のスクリーニングを行った。さらに、蛍光活性化セルソーティング(FACS)により細胞表面に発現したIGSF8への結合能を試験するため、結合親和性(KD)が50nM未満の抗体を選択した。細胞表面に発現した標的抗原(この場合、すなわちIGSF8)への結合能は、Biacoreによって測定した結合と比較して、より確実な結合を示すものである。
抗IGSF8モノクローナル抗体(mAb)の特徴付け
IGSF8に対する多数のモノクローナル抗体を、独自のコンピュータ支援設計アルゴリズムを用いてインシリコで作製し、このアルゴリズムは、ヒト(B細胞受容体)BCRレパートリー由来の利用可能な配列を部分的に利用して、異なる標的に対する完全ヒトモノクローナル抗体の配列を作製する。この技術により、標的抗原の所与の機能的ドメインに対する多数のモノクローナル抗体の迅速な設計が可能になる。例えば、この方法によってヒトIGSF8に対する100超のヒトモノクローナル抗体が作製された。これらの抗体の重鎖および軽鎖の配列を得た後、これらの配列に基づくモノクローナル抗体をCHO細胞を用いて発現させ、さらにBiacore T100による表面プラズモン共鳴(SPR)を用いて全長IGSF8またはIGSF8のD1ドメインのいずれかに対する高親和性結合体のスクリーニングを行った。さらに、蛍光活性化セルソーティング(FACS)により細胞表面に発現したIGSF8への結合能を試験するため、結合親和性(KD)が50nM未満の抗体を選択した。細胞表面に発現した標的抗原(この場合、すなわちIGSF8)への結合能は、Biacoreによって測定した結合と比較して、より確実な結合を示すものである。
細胞発現抗原に基づく抗体結合アッセイのために、抗原(全長IGSF8またはそのD1ドメインのいずれか)を過剰発現する10万個の細胞を、2%FBSを含むPBS緩衝液で洗浄し、次いで100μLの異なる濃度の抗体またはIgGと共に氷上で30分間インキュベートした。次に、細胞を洗浄緩衝剤で2回洗浄し、100μLの1:100抗ヒトFc-PE抗体と共に氷上で15分間インキュベートした。細胞を洗浄緩衝剤で2回洗浄し、FACSアナライザー(CytoFlex、Beckman)で解析した。
試験した約100の配列のうち、10の異なるモノクローナル抗体が、Biacore T100測定に基づく50nM未満のKD値で、D1ドメインと全長IGSF8の両方に結合できることが見出された(表1)。
しかし、Biacore測定に基づくこれらの高親和性結合体のうち3つは、細胞表面に発現したIGSF8との結合が弱いか、または実質的に結合しないため、さらなる機能解析から除外された。
残りの7つの抗体は、CT26細胞表面に発現するヒトIGSF8タンパク質と強い(1~10nMレベル)結合を示すことが示された。さらに重要なことであり、実施例16のデータと一致して、これらの抗IGSF8抗体の全てが、IGSF8のD1ドメインに特異的に結合することも示された(図21および図22)。
次いで、これらの7つのmAbがKIR3DL1/2またはKLRC1&D1ヘテロ二量体受容体へのIGSF8結合を遮断するかどうかを試験するために、競合アッセイ(図23A)を設計した。ヒトIGSF8発現構築物のレンチウイルス送達により細胞表面にIGSF8タンパク質を強制発現させたMC38細胞(NIHのC57BL6マウス結腸腺癌細胞由来の細胞株)をCFSE(カルボキシフルオレセインサクシニミディエステル、Thermo)で標識した。KIR3DL1/2またはKLRC1&D1のいずれかを強制発現させたCT26細胞を、CellTrace Far Red(Thermo)で標識した。次いで、室温で約1時間、MC38細胞をCT26細胞と1:1の割合で混合した。MC38とCT26の細胞/細胞コンジュゲートの形成をフローサイトメトリーにより評価した。
この解析に基づいて、1B4、3F12、2B4およびB46 mAbは、MC38細胞上のKIR3DL2へのIGSF8結合と競合し得ることが示されたが(図23B)、これはMC38およびCT26細胞/細胞コンジュゲートの数が著しく減少したためである。一方、7つのmAbの全てが、MC38細胞上におけるIGSF8のKLRC1&D1結合を遮断し得る(図23C)。これらのデータは、IGSF8のD1ドメインを標的とするこれらのmAbの全てが、NK細胞またはT細胞上の細胞表面受容体へのIGSF8の結合を機能的に遮断することを示唆している。
実施例21
K562-NK共培養におけるB46およびB104 mAbによる処理はNK細胞の細胞溶解活性を回復した
本実施例は、抗IGSF8モノクローナル抗体が、IGSF8によって抑制されたNK細胞の細胞溶解活性を回復できることを示す。
K562-NK共培養におけるB46およびB104 mAbによる処理はNK細胞の細胞溶解活性を回復した
本実施例は、抗IGSF8モノクローナル抗体が、IGSF8によって抑制されたNK細胞の細胞溶解活性を回復できることを示す。
図24Aに示す機能性アッセイは、IGSF8またはKIR3DL1/2に対する機能性分子をさらにスクリーニングするように設計された。実施例4では、レンチウイルス送達によるK562細胞上のIGSF8の強制発現が、初代NK細胞によって媒介される殺滅からK562細胞をほとんど保護したことが示された。ここで、IGSF8の発現によってもたらされた保護効果は、この共培養モデルにおける抗IGSF8 mAbによる処理によって逆転した。
本実験においてIgG1-Fc媒介性の抗体依存性細胞性細胞傷害(ADCC)の交絡因子を除外するために、ヒトIgG1のADCC効果をほとんど失っていることが知られているN297A変異IgG1-Fcをこのアッセイに使用した。図24Bに示すように、B46およびB104 mAbによる処理は、NK細胞の細胞溶解活性を有意に回復させた。
実施例22
B46およびB104 mAbはin vivoで抗腫瘍有効性を示した
B46およびB104のmAbは共に、ヒトならびにマウスのIGSF8に結合できるため、B16-F10同系マウスモデルを用いて、in vivoでのIGSF8-KIR3DL1/2結合の阻害能を試験した。
B46およびB104 mAbはin vivoで抗腫瘍有効性を示した
B46およびB104のmAbは共に、ヒトならびにマウスのIGSF8に結合できるため、B16-F10同系マウスモデルを用いて、in vivoでのIGSF8-KIR3DL1/2結合の阻害能を試験した。
具体的には、約100万個のB16-F10黒色腫細胞を、野生型(WT)C57BL/6マウスに皮下注射した。次に、3群のマウス(1群あたりn=8マウス)を、2つの抗IGSF8 mAbのうちの1つ、および1つのアイソタイプ適合対照抗体によって、それぞれ約4mg/kgの用量で、腫瘍細胞接種後7日目から、3日ごとに、合計4用量、尾静脈注射により処理した。データは、平均値±s.e.m.で示した。
図25Aに示すように、B16腫瘍をB46およびB104 mAbで処理することにより、アイソタイプ適合対照と比較して、腫瘍成長が有意かつ劇的に低下した。より顕著なことに、B46 mAbで処理した8匹のマウスのうち2匹が、処理後に腫瘍が検出されない完全奏効(CR)を達成した(図25B)。
実施例23
代表的なマウスモデルに抗IGSF8抗体および抗PD-1抗体を投与することによる相乗的な抗腫瘍効果
チェックポイント阻害剤は、選択したヒト悪性腫瘍に対するよく確立された治療である。この経路の免疫活性を増強し得る他の治療を見出すことが、主要な研究努力である。この特徴を踏まえ、実施例11では、IGSF8をT細胞ベースの免疫療法剤である抗PD-1抗体と組み合わせる可能性について検討した。本実施例の結果によって、抗IGSF8モノクローナル抗体および抗PD-1抗体は、同系マウスモデルにおいてin vivoのB16-F10黒色腫の腫瘍成長を阻害する相乗効果を示すことが示された。
代表的なマウスモデルに抗IGSF8抗体および抗PD-1抗体を投与することによる相乗的な抗腫瘍効果
チェックポイント阻害剤は、選択したヒト悪性腫瘍に対するよく確立された治療である。この経路の免疫活性を増強し得る他の治療を見出すことが、主要な研究努力である。この特徴を踏まえ、実施例11では、IGSF8をT細胞ベースの免疫療法剤である抗PD-1抗体と組み合わせる可能性について検討した。本実施例の結果によって、抗IGSF8モノクローナル抗体および抗PD-1抗体は、同系マウスモデルにおいてin vivoのB16-F10黒色腫の腫瘍成長を阻害する相乗効果を示すことが示された。
本実施例は、CT-26(結腸癌)およびLLC(ルイス肺癌)の両癌細胞株(図26Aおよび26B)を用いて、IGSF8モノクローナル抗体および抗PD-1モノクローナル抗体の組合せによる相乗活性の向上を実証するさらなる根拠を提供する。
具体的には、約100万個のCT26またはLLC細胞を、野生型(WT)C57BL/6マウスに皮下注射した。その後、尾静脈注射により、4種類の抗体または複数の抗体の組合せ:用量2mg/kgのIgG対照、用量2mg/kgの抗PD-1抗体、用量2mg/kgの抗IGSF8抗体B46、または半分の用量(1mg/kg)の抗PD-1抗体および半分の用量(1mg/kg)の抗IGSF8抗体B46の組合せのいずれか1つによりマウスを処理した。最初の投与は腫瘍細胞接種後6日目に行い、その後の投与は3日ごとに行い、合計4回投与した。データは平均値±s.e.mで示した(1群当たりn=8マウス)。
組合せの各成分の50%用量(1mg/kg)で投与された場合、組合せ療法において(1)2倍の用量(2mg/kg)の抗IGSF8抗体B46単独(p<0.01)、(2)2倍の用量(2mg/kg)の市販の抗PD-1抗体(クローン29F.1A12、BioXcell)単独(p<0.005)、および(3)IgG対照(p<0.001)よりも統計的に有意に高いという点で、抗IGSF8抗体と抗PD-1抗体の組合せは、in vivoでのB16黒色腫増殖抑制において相乗効果を示した。
さらに、抗IGSF8 B46 mAbで処理したLLC腫瘍では、活性化NK細胞の遺伝子マーカーが、抗PD-1 mAbまたはIgG対照で処理した腫瘍と比較して著しく増加しており(図27)、これにより抗IGSF8 B46処理によりLLC腫瘍において活性化NK細胞がより多く浸潤していることが示唆される。
これらのデータは、IGSF8の喪失または阻害が腫瘍微小環境をリプログラミングし、in vivoでNK細胞によって媒介される抗腫瘍機能を再活性化することを示した以前の知見と一致する。
特定の理論に縛られることを望むものではないが、この機構は、抗IGSF8処理と抗PD-1処理の組合せが示す相乗的な抗腫瘍効果に関する潜在的な理由を解明するのに有用である。
これらの結果は、IGSF8アンタゴニストを、T細胞ベースの免疫チェックポイント阻害または標的療法ベースの標的のいずれかのアンタゴニストと組み合わせることが、様々な癌治療に有効であり得ることを示している。
実施例24
IGSF8完全ヒトモノクローナル抗体の作製
IGSF8に対する多数のモノクローナル抗体を独自のコンピュータ支援設計アルゴリズムを用いてインシリコで作製し、これはヒトB細胞受容体(BCR)レパートリーから利用可能な配列を部分的に利用して、異なる標的に対する完全ヒトモノクローナル抗体の配列を生成する。この技術により、標的抗原の所与の機能的ドメインに対する多数のモノクローナル抗体の迅速な設計が可能になる。
IGSF8完全ヒトモノクローナル抗体の作製
IGSF8に対する多数のモノクローナル抗体を独自のコンピュータ支援設計アルゴリズムを用いてインシリコで作製し、これはヒトB細胞受容体(BCR)レパートリーから利用可能な配列を部分的に利用して、異なる標的に対する完全ヒトモノクローナル抗体の配列を生成する。この技術により、標的抗原の所与の機能的ドメインに対する多数のモノクローナル抗体の迅速な設計が可能になる。
この方法を用いて、ヒトIGSF8に対する100超のヒトモノクローナル抗体を作製した。これらの抗体の重鎖および軽鎖の配列をインシリコで得た後、これらの配列に基づくモノクローナル抗体をCHO細胞を用いて発現させ、さらにBiacore T100による表面プラズモン共鳴(SPR)を用いて全長のIGSF8、またはIGSF8のD1ドメインのいずれかに対する高親和性の結合体をスクリーニングした。50nM未満の高い結合親和性(KD)を有する抗体を選択し、蛍光活性化セルソーティング(FACS)による細胞表面に発現するIGSF8への結合能についてさらに試験した。細胞表面に発現した標的抗原(この場合はすなわちIGSF8)に対する結合能は、Biacoreで測定した結合と比較して、より確実な結合を示すものである。
試験された約100の配列の中から、2つの抗体(L1、L2)をさらなる検討のために選択した。L1およびL2の配列は、それぞれ、表DのL1-01および表GのL2-01の下に記載されている。
実施例25
Ab重鎖および軽鎖のCDRを標的とした変異原性試験
IGSF8標的抗原への結合に寄与する抗体重鎖および軽鎖のCDR領域内のアミノ酸を調べるために、L1抗体およびL2抗体(実施例24参照のこと)から重鎖および軽鎖のCDR1、2、3を、縮退コドンNNK(図28)を用いてランダム化するために選択した。
Ab重鎖および軽鎖のCDRを標的とした変異原性試験
IGSF8標的抗原への結合に寄与する抗体重鎖および軽鎖のCDR領域内のアミノ酸を調べるために、L1抗体およびL2抗体(実施例24参照のこと)から重鎖および軽鎖のCDR1、2、3を、縮退コドンNNK(図28)を用いてランダム化するために選択した。
最初に、各CDR領域を標的とする6つのサブライブラリーを作製した後、2回のファージディスプレイスクリーニングを行った。ファージパンニングの前後のライブラリーは、さらにIlluminaハイスループット配列決定プラットフォームによって評価した。IGSF8への結合に影響を与える各変異体の陽性選択または陰性選択の包括的な解析のために、重鎖および軽鎖のCDRの各位置内の各変異の頻度の倍数変化を算出し、プロットした(図29~36)。各CDR領域の各残基について、可能性のある19の変異を全て試験したことは留意されたい。
ヒートマップは、IGSF8への結合に重要な重鎖および軽鎖のCDR内の重要な位置、例えば、L1-VHのD53、D54、D99、G100G、A106、F107、D108およびI109が陰性選択において濃縮されており、このことは、この領域/これらの残基の変異体が抗体の親和性を低下させていることを示している。図29を参照のこと。
結合に必須と実証された変異体(上記の陰性選択に基づく)のさらなる検証のために、L1抗体については8つの変異体、およびL2抗体については10の変異体が、CHO細胞におけるさらなる発現のために選択され、IGSF8に対するそれらの結合親和性を表面プラズモン共鳴(SPR)により試験した。表1および表3により、変異体は親和性を低下させることが示された。
L1抗体およびL2抗体の親和性は、変異体の陽性選択に基づいてさらに最適化された。L1の32配列およびL2の9配列を試験し、これらが抗体の親和性を劇的に上昇させることが確認された(表2、および4)。
L1およびL2抗体のIGSF8組換えタンパク質への結合親和性は表面プラズモン共鳴(SPR)により決定した。簡潔に説明すると、抗ヒトFab抗体をアカルボキシル(acarboxyl)誘導体化したSPRチップ表面に固定化し、得られた表面に抗体を5μg/mlで30秒間捕捉した。その後、様々な濃度(0nM、3.7nM、11.1nM、33.3nM、100nM、300nM)のIGSF8-hFcタンパク質を表面上に流し、解離期に抗IGSF8抗体と結合させた。データは1:1結合モデルを用いて適合させ、代表的な結果を表1-4に要約する。
実施例26
細胞表面に発現するIGSF8へのモノクローナル抗体の結合の特徴付け
L1およびL2抗体の交差反応性を試験するために、ヒト、カニクイザル、またはマウスのIGSF8を強制発現させたCT26細胞をレンチウイルス送達により作製した。細胞発現抗原に基づく抗体結合アッセイでは、抗原を過剰発現した10万個の細胞を2%FBSを含むPBS緩衝液で洗浄した後、100μLの異なる濃度の抗体またはIgGと共に氷上で30分間インキュベートした。次に、細胞を洗浄緩衝液で2回洗浄し、100μLの1:100抗ヒトFc-PE抗体と共に氷上で15分間インキュベートした。細胞を洗浄緩衝液で2回洗浄し、FACSアナライザー(CytoFlex、Beckman)で解析した。MFIは、抗体濃度に対してプロットした。EC50細胞結合能は、非線形回帰曲線適合を用いて算出した。図37から、L1抗体は、これらの試験した全ての生物種由来のIGSF8抗原と交差反応性を有する一方で、L2抗体は、ヒトおよびサルのIGSF8と交差反応できるが、マウスの抗体とは交差反応しないことが示される。L1抗体およびL2抗体の元の配列と比較して、最適化されたバージョン(L1-20およびL1-10)はランダムに選択され、EC50細胞結合能が著しく上昇していることが見出された(表5)。
細胞表面に発現するIGSF8へのモノクローナル抗体の結合の特徴付け
L1およびL2抗体の交差反応性を試験するために、ヒト、カニクイザル、またはマウスのIGSF8を強制発現させたCT26細胞をレンチウイルス送達により作製した。細胞発現抗原に基づく抗体結合アッセイでは、抗原を過剰発現した10万個の細胞を2%FBSを含むPBS緩衝液で洗浄した後、100μLの異なる濃度の抗体またはIgGと共に氷上で30分間インキュベートした。次に、細胞を洗浄緩衝液で2回洗浄し、100μLの1:100抗ヒトFc-PE抗体と共に氷上で15分間インキュベートした。細胞を洗浄緩衝液で2回洗浄し、FACSアナライザー(CytoFlex、Beckman)で解析した。MFIは、抗体濃度に対してプロットした。EC50細胞結合能は、非線形回帰曲線適合を用いて算出した。図37から、L1抗体は、これらの試験した全ての生物種由来のIGSF8抗原と交差反応性を有する一方で、L2抗体は、ヒトおよびサルのIGSF8と交差反応できるが、マウスの抗体とは交差反応しないことが示される。L1抗体およびL2抗体の元の配列と比較して、最適化されたバージョン(L1-20およびL1-10)はランダムに選択され、EC50細胞結合能が著しく上昇していることが見出された(表5)。
実施例27
IGSF8による初代NK細胞傷害性の抑制はKIR3DL2によって媒介される
KIR3DL2はNK細胞またはT細胞におけるIGSF8の受容体であることが見出された。本実施例は、IGSF8が癌細胞に発現する抑制リガンドとして作用し、KIR3DL2と結合することによってNK細胞またはT細胞の細胞傷害性を調節することを示す。
IGSF8による初代NK細胞傷害性の抑制はKIR3DL2によって媒介される
KIR3DL2はNK細胞またはT細胞におけるIGSF8の受容体であることが見出された。本実施例は、IGSF8が癌細胞に発現する抑制リガンドとして作用し、KIR3DL2と結合することによってNK細胞またはT細胞の細胞傷害性を調節することを示す。
本実験には、NK細胞-K562共培養モデルを使用し、ここではNK感受性細胞株として知られるMHC-I欠損K562細胞株を、NK細胞によって媒介される殺滅の標的細胞株として選択した。具体的には、96ウェルプレートに初代NK細胞を播種し(1ウェルあたり1万個)、K562細胞とE/T比=5:1で2時間共培養した。死細胞を7-AAD(Biolegend)で染色した後、フローサイトメトリーで細胞を解析した。NK細胞の細胞傷害性は、NK細胞傷害性(%)=(NK細胞と共培養した7-AAD+%(死滅)K562細胞)-(NK細胞と共培養しない自発的7-AAD+%(死滅)K562細胞)により算出した。
第1に、IGSF8発現構築物のレンチウイルス送達によるK562細胞上のIGSF8タンパク質の強制発現は、IGSF8発現K562細胞を初代NK細胞の殺滅からほとんど保護した(図38B)。
第2に、初代NK細胞における任意の内在性KIR3DL2発現のレンチウイルス媒介性のCRISPR/Cas9ノックダウンによるKIR3DL2発現の喪失により、K562細胞およびK562-IGSF8細胞の両方の感受性を著しく増大させた。K562細胞とK562-IGSF8細胞の殺滅に差はない(図38A~38B参照のこと)。
これらのデータは、KIR3DL2をノックアウトしたNK細胞の細胞傷害性はIGSF8によって抑制できないことを示唆しており、これはIGSF8がNK細胞傷害性を媒介するKIR3DL2の機能的リガンドであることを示している。
実施例28
抗体はIGSF8とKIR3DL2との相互作用を遮断する
本実施例は、フローサイトメトリーベースのアッセイに基づいて、対象の抗IGSF8抗体が、IGSF8とそのリガンドKIR3DL2との間の相互作用を遮断することができることを示す。
抗体はIGSF8とKIR3DL2との相互作用を遮断する
本実施例は、フローサイトメトリーベースのアッセイに基づいて、対象の抗IGSF8抗体が、IGSF8とそのリガンドKIR3DL2との間の相互作用を遮断することができることを示す。
異所性/外因性ヒトKIR3DL2を強制発現したCT26細胞を、抗体L1-20、L2-10、およびアイソタイプ対照抗体の存在下で、ビオチン化IGSF8-hFc組換えタンパク質(1μg/mL)とインキュベートした。IGSF8-hFc-ビオチンのCt26細胞への結合は、ストレプトアビジン-PEを用いてフローサイトメトリー解析により決定した(図39)。結果により、L1-20およびL2-10の両方が、用量依存的にIGSF8とKIR3DL2との間の相互作用を完全に遮断し得るが、対照は効果を有さないことが示された。
実施例29
抗IGSF8 mAbは異なる癌細胞のNKまたはPBMCによる殺滅を増強する
IGSF8は多くの異なる癌細胞種/細胞株で発現していることが判明しているため、in vitroのNKまたはPBMC殺滅アッセイは本発明の抗体によるIGSF8遮断が異なる癌細胞に対するNKまたはPBMCの細胞傷害性を増強できることを示すために設計した。
抗IGSF8 mAbは異なる癌細胞のNKまたはPBMCによる殺滅を増強する
IGSF8は多くの異なる癌細胞種/細胞株で発現していることが判明しているため、in vitroのNKまたはPBMC殺滅アッセイは本発明の抗体によるIGSF8遮断が異なる癌細胞に対するNKまたはPBMCの細胞傷害性を増強できることを示すために設計した。
死細胞の7-AAD(Biolegend)染色を組み合わせた、癌細胞のカルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル(CFSE、ThermoFisher Scientific)標識は、フローサイトメトリーによるin vitro細胞殺滅を測定する信頼できる方法である。簡潔に説明すると、NK細胞またはPBMCを、U底96ウェルプレートでE/T比=1:1または5:1でCFSE標識した癌細胞と4時間共培養した。その後、各試料を7-AADと混合し、FACSで解析した。細胞溶解は、全癌細胞中の7-AAD陽性癌細胞の割合で算出した。NKまたはPBMCの非存在下での自発的な癌細胞死は5%未満であり、これをNKまたはPBMCの存在下における総殺滅から差し引いた。
本実験において、IgG1-Fc媒介性の抗体依存性細胞傷害(ADCC)の交絡因子を除外するために、ヒトIgG1のADCC効果をほとんど失っていることが以前に示されたL234AおよびL235A変異ヒトIgG1(IgG1-LALA)をこのアッセイに使用した。図40A~40D、41A~41Bおよび42A~42Bに示すように、L1-20およびL2-10 mAbによる処理は、Jurkat(T細胞白血病)、SU-DHL2(大細胞リンパ腫)、LNCaP(前立腺癌)、K562(慢性骨髄性白血病)、H1437(肺腺癌)、SKBR3(乳腺癌)、SW480(大腸腺癌)、およびH520(肺扁平上皮癌)等の多数の癌細胞株に対するNKまたはPBMCの細胞傷害性を著しく感作させた。
IgG1媒介性のADCCが欠損している抗IGSF8モノクローナル抗体でも、癌細胞に対するNKまたはPBMCの細胞傷害性を高めることができるため、エフェクター機能(例えば、補体依存性細胞傷害(CDC)、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞貪食(ADCP))が正常なIgG1の野生型定常領域配列を有する対象の抗IGSF8モノクローナル抗体が、PBMC細胞傷害性を維持する、またはさらに向上させることが期待される。
予期しないことに、IgG1エフェクター機能が欠損した抗IGSF8モノクローナル抗体(IgG1-LALA等)と比較して、エフェクター機能が正常な抗IGSF8モノクローナル抗体は、2種類の癌細胞株であるSW480およびH520に対するPBMC細胞傷害性が著しく低下することが見出された(図42A~42B)。これらのデータは、対象の抗IGSF8抗体を用いた癌治療が、これらの抗体のFcエフェクター機能に依存しないだけでなく、欠損Fcの存在から利益を得ることを示唆している。
実施例30
IgG1が欠損した抗IGSF8 mAbは正常なIgG1またはIgG4を有するmAbよりも優れたin vivo抗腫瘍有効性を示した
Fc機能が欠損したL1抗体およびL2抗体は、異なる癌細胞のNKまたはPBMCによる殺滅をより増強することが示されたため(実施例29)、これらの抗体のin vivo有効性を、現行の免疫療法(抗PD1/L1、抗CTLA4等)に耐性があることが知られているB16-F10同系マウスモデルによってさらに検討した。
IgG1が欠損した抗IGSF8 mAbは正常なIgG1またはIgG4を有するmAbよりも優れたin vivo抗腫瘍有効性を示した
Fc機能が欠損したL1抗体およびL2抗体は、異なる癌細胞のNKまたはPBMCによる殺滅をより増強することが示されたため(実施例29)、これらの抗体のin vivo有効性を、現行の免疫療法(抗PD1/L1、抗CTLA4等)に耐性があることが知られているB16-F10同系マウスモデルによってさらに検討した。
具体的には、約100万個のB16-F10黒色腫細胞を、野生型(WT)C57BL/6マウスに皮下接種した。次に、4群のマウス(1群あたりn=8マウス)に、ヒトIgG1、IgG4およびIgG1-LALA、ならびに1つのIgG1アイソタイプ抗体をそれぞれ約4mg/kgの用量で、腫瘍細胞接種後7日目から、3日ごとに、合計4回投与して、尾静脈注射によりL1-10抗体で処理した。データは平均値±s.e.m.で示した。
図43Aに示すように、L1-10-IgG1によるB16腫瘍の処理は、アイソタイプ適合対照と比較して、腫瘍成長を有意かつ劇的に減少させた。しかし、ADCCは弱いがADCPエフェクター機能は強いことが知られているL1-10-IgG4は、腫瘍成長を低減させるのに優れた効能を有していた。L1-10-IgG4群は、L1-10-IgG1群よりも37.5%(3/8)のマウスは腫瘍がなかった。より顕著には、ADCCまたはADCPエフェクター機能を枯渇させたL1-10-IgG1-LALAは、in vivoで最高の抗腫瘍効果を示した(図43B)。L1-10-IgG1-LALAで処理した8匹のマウスのうち4匹(50%)は、処理後に腫瘍が検出されない完全奏効(CR)を達成した(図43A)。これらのデータは、本発明の抗IGSF8抗体を用いた癌の治療が、ADCCまたはADCPエフェクター機能を枯渇させた欠損Fcの存在から利益を得ることを示唆する。
実施例31
エフェクターFc機能を有する抗IGSF8 mAbはB16腫瘍へのエフェクターNKおよびT細胞浸潤を損なった
Fc機能が欠損したIGSF8 mAbを用いたB16-F10腫瘍の処理が、正常なIgG1およびIgG4を有するIGSF8 mAb(実施例30)よりも優れた効果を示す機構を明らかにするために、in vivo試験が終了した時点で、異なるIGSF8 mAb(各アームにつき3試料)で処理したB16腫瘍を単離し、単離した腫瘍に対してRNA配列決定を行った。TPM(Transcript per million)スコアは、DESeq2(Genome Biology,15,550.doi:10.1186/s13059-014-0550-8)により算出した。
エフェクターFc機能を有する抗IGSF8 mAbはB16腫瘍へのエフェクターNKおよびT細胞浸潤を損なった
Fc機能が欠損したIGSF8 mAbを用いたB16-F10腫瘍の処理が、正常なIgG1およびIgG4を有するIGSF8 mAb(実施例30)よりも優れた効果を示す機構を明らかにするために、in vivo試験が終了した時点で、異なるIGSF8 mAb(各アームにつき3試料)で処理したB16腫瘍を単離し、単離した腫瘍に対してRNA配列決定を行った。TPM(Transcript per million)スコアは、DESeq2(Genome Biology,15,550.doi:10.1186/s13059-014-0550-8)により算出した。
RNA-seqデータに基づき、異なるIGSF8 mAbで処理した腫瘍では、対照群と比較して、エフェクターNK細胞を表す遺伝子マーカー(Klrk1、Klrb1b、およびKlra2)、ならびにエフェクターT細胞を表す遺伝子マーカー(CD8a、およびCD8b)が有意に上方制御されていたことが見出された(図44)。これらのことから、抗IGSF8治療により、腫瘍微小環境(TME)が強くリプログラミングされ、NK細胞およびT細胞の浸潤を増加させることが示唆された。さらに、これらのマーカー遺伝子は、IgG1およびIgG4を有するmAbで処理した群と比較して、Fcが欠損したIGSF8 mAbで処理した群で著しく増加しており、これにより、エフェクターFc機能が正常な抗IGSF8 mAbがB16腫瘍へのエフェクターNK細胞およびT細胞の浸潤を損なうことが示唆される。
これらのデータによって、抗IGSF8抗体による癌治療が、ADCC、CDC、およびADCPのエフェクター機能を枯渇させた欠損Fcから利益を受ける理由を説明できる。
Claims (144)
- IGSF8に特異的な(例えば、IGSF8のIg-VセットドメインまたはECDのD1ドメインに特異的な)単離された、もしくは組換えモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片であって、前記モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片は、VH CDR1、VH CDR2、およびVH CDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびにVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3を含む軽鎖可変領域(VL)を含み、
(a1)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ配列番号714、715および716のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ配列番号717、718および719のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または
(a2)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ配列番号754、755および756のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ配列番号757、758および759のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または
(b1)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ配列番号720、721および722のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ配列番号723、724および725のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または
(b2)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ配列番号760、761および762のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ配列番号763、764および765のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または
(c)VH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3は、それぞれ表Dおよび表GのVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3配列のいずれかのアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;VL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、それぞれ表Dおよび表GのVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3配列のいずれかのアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなるか;または
(d)VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3は、それぞれ表Dおよび表Gのいずれか1つの抗体のVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3配列のアミノ酸配列を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり;
必要に応じて、抗体およびその抗原結合性断片は、L1抗体の同じVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3配列を有さず、L2抗体のそれら配列を有さない(例えば、抗体は、L1ではなく、L2でもない)、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。 - (1)VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3が、それぞれ表Dのいずれか1つの抗体のVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3配列のアミノ酸配列を含むか;または
(2)VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3が、それぞれ表Gのいずれか1つの抗体のVH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、およびVL CDR3配列のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。 - (a)VHが、(i)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVH FR配列のアミノ酸配列、(ii)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVH FR配列と、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または(iii)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVH FR配列と比較して、最大で1、2、3、4、または5個の置換、欠失、および/または付加を有するアミノ酸配列を含むVH FR1、VH FR2、VH FR3、および/またはVH FR4を含むか;および/または
(b)VLが、(i)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVL FR配列のアミノ酸配列、(ii)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVL FR配列と、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または(iii)表D(または表G)におけるいずれか1つまたは複数の抗体の対応するVL FR配列と比較して、最大で1、2、3、4、または5個の置換、欠失、および/または付加を有するアミノ酸配列を含むVL FR1、VL FR2、VL FR3、および/またはVL FR4を含む、請求項1または2に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。 - (a1)VHが、それぞれ配列番号734、735および736のアミノ酸配列を含み;VLが、それぞれ配列番号737、738および739のアミノ酸配列を含むか;または
(a2)VHが、それぞれ配列番号774、775および776のアミノ酸配列を含み;VLが、それぞれ配列番号777、778および779のアミノ酸配列を含むか;または
(b1)VHが、それぞれ配列番号740、741および742のアミノ酸配列を含み;VLが、それぞれ配列番号743、744および745のアミノ酸配列を含むか;または
(b2)VHが、それぞれ配列番号780、781および782のアミノ酸配列を含み;VLが、それぞれ配列番号783、784および785のアミノ酸配列を含むか;または
(c)VHが、表Dおよび表GのいずれかのVH配列のアミノ酸配列を含み;VLが、表Dおよび表GのいずれかのVL配列のアミノ酸配列を含む、請求項1または2に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。 - VHおよびVL配列が、それぞれ表Dおよび表Gのいずれか1つの抗体のVHおよびVL配列のアミノ酸配列を含む、請求項1~4のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- ヒト-マウスキメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、CDRグラフト抗体、または再表面化抗体である、請求項1~5のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記その抗原結合性断片が、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、単鎖FvもしくはscFv、ジスルフィド連結されたFv、V-NARドメイン、IgNar、イントラボディ、IgGΔCH2、ミニボディ、F(ab’)3、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、単一ドメイン抗体、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2、またはscFv-Fcである、請求項1~6のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 重鎖定常領域を含み、
(a)重鎖定常領域が、野生型ヒトIgG1、ヒトIgG2、ヒトIgG3、ヒトIgG4であるか;または
(b)重鎖定常領域が、抗体依存性細胞傷害(ADCC)、補体依存性細胞傷害(CDC)および/または抗体依存性細胞貪食(ADCP)に欠損があるFcドメインを有する、請求項1~7のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。 - 欠損Fcドメインを有する重鎖定常領域が、IgG1-L234A/L235A(IgG1-LALA)、IgG1-L234A/L235A/P329G(IgG1-LALA-PG)、IgG1-N297A/Q/G(IgG1-NA)、IgG1-L235A/G237A/E318A(IgG1-AAA)、IgG1-G236R/L328R(IgG1-RR)、IgG1-S298G/T299A(IgG1-GA)、IgG1-L234F/L235E/P331S(IgG1-FES)、IgG1-L234F/L235E/D265A(IgG1-FEA)、IgG4-L234A/L235A(IgG4-LALA)、IgG4-S228P/L235E(IgG4-PE)、IgG1-E233P/L234V/L235A/G236del/S267K、IgG2-H268Q/V309L/A30S/P331S(IgG2m4)およびIgG2-V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S(IgG2c4d)からなる群から選択される、請求項8に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片が、約25nM未満、20nM未満、15nM未満、10nM未満、5nM未満、2nM未満、または1nM未満のKdでIGSF8と結合する、請求項1~9のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- IGSF8への結合に関して、請求項1~10のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片と競合するモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1/2へのIGSF8の結合を阻害する、請求項1~11のいずれか一項に記載の抗体またはモノクローナル抗体。
- 請求項1~12のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片をコードするポリヌクレオチド。
- ストリンジェントな条件下で、請求項13に記載のポリヌクレオチド、または請求項13に記載のポリヌクレオチドの相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチド。
- 請求項13または14に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
- コードされたモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現させるための、請求項13もしくは14に記載のポリヌクレオチド、または請求項15に記載のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項1~12のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を生産する方法であって、
(i)前記モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現させるのに好適な条件下で、前記モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現することが可能な請求項15に記載の宿主細胞を培養する工程;および必要に応じて、
(ii)発現されたモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を回収/単離/精製する工程
を含む、前記方法。 - それを必要とする対象における免疫応答をモジュレートする方法であって、治療有効量の請求項1~12のいずれか一項に記載の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を対象に投与する工程を含む、前記方法。
- それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量の請求項1~12のいずれか一項に記載の抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を対象に投与する工程を含む、前記方法。
- 免疫療法剤、免疫チェックポイント阻害剤、癌ワクチン、キメラ抗原受容体、化学療法剤、放射線療法剤、抗血管新生剤、増殖阻害剤、免疫腫瘍学薬剤、抗新生物性組成物、外科手術、またはそれらの組合せを含む有効量の第2の治療剤を対象に投与する工程をさらに含む、請求項18または19に記載の方法。
- 抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片が、細胞傷害性物質にコンジュゲートしている、請求項18~20のいずれか一項に記載の方法。
- 細胞傷害性物質が、化学療法剤、生物剤、毒素、および放射性同位体からなる群から選択される、請求項21に記載の方法。
- 抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片が、癌における増殖している細胞の数を低減させるか、および/または癌の腫瘍の体積またはサイズを低減させる、請求項19~21のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片が、薬学的に許容される配合物の形態で投与される、請求項18~23のいずれか一項に記載の方法。
- 癌が、黒色腫(皮膚黒色腫を含む)、子宮頸癌、肺癌(例えば、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌)、結腸直腸癌、リンパ腫(B細胞リンパ腫およびDLBCLを含む)、白血病(CLLおよび急性骨髄性白血病(AML)を含む)、BLCA腫瘍、乳癌、頭頸部癌、頭頸部扁平上皮癌、PRAD、THCA、もしくはUCEC、甲状腺癌、尿路癌、子宮癌、食道癌、肝臓癌、神経節の癌、腎臓癌、膵臓癌、膵管癌、卵巣癌、前立腺癌、神経膠腫、膠芽腫、神経芽細胞腫、胸腺腫、B-CLL、およびIGSF8受容体を発現する免疫細胞が浸潤した癌である、請求項19~24のいずれか一項に記載の方法。
- 癌が、肺癌、腎臓癌、膵臓癌、結腸直腸癌、急性骨髄性白血病(AML)、頭頸部癌、肝臓癌、卵巣癌、前立腺癌、または子宮癌である、請求項19~25のいずれか一項に記載の方法。
- 対象における癌細胞および/または腫瘍免疫浸潤細胞が、IGSF8を発現する、請求項19~26のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片が、T細胞および/またはNK細胞の活性化および/または腫瘍微小環境への浸潤を刺激する、請求項19~27のいずれか一項に記載の方法。
- 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1、PD-L1、PD-L2、LAG3、TIGIT、TIM3、NKG2A、CD276、VTCN1、VISRまたはHHLA2に特異的な抗体またはその抗原結合性断片である、請求項20~28のいずれか一項に記載の方法。
- 免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-1抗体、例えばセミプリマブ、ニボルマブ、またはペンブロリズマブである、請求項29に記載の方法。
- 免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-L1抗体、例えばアベルマブ、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、KN035、またはCK-301である、請求項29に記載の方法。
- 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1/PD-L1の(非抗体)ペプチド阻害剤、例えばAUNP12;PD-L1の小分子阻害剤、例えばCA-170、または大環状ペプチド、例えばBMS-986189である、請求項20~28のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第2の治療剤が、癌を処置するのに有効な抗体またはその抗原結合性部位/断片、例えば3F8、8H9、アバゴボマブ、アブシキシマブ、アビツズマブ、アブレゼキマブ、アブリルマブ、アクトキスマブ、アダリムマブ、アデカツムマブ、アデュカヌマブ、アファセビクマブ、アフェリモマブ、アラシズマブペゴル、アレムツズマブ、アリロクマブ、アルツモマブペンテテート、アマツキシマブ、アミバンタマブ、アナツモマブマフェナトクス、アンデカリキシマブ、アネツマブラブタンシン、アニフロルマブ、アンルキンズマブ、アポリズマブ、アプルツマブイキサドチン、アルシツモマブ、アスクリンバクマブ、アセリズマブ、アテゾリズマブ、アチドルトクスマブ、アチヌマブ、アトロリムマブ、アベルマブ、アジンツキシズマブベドチン、バピネオズマブ、バシリキシマブ、バビツキシマブ、BCD-100、ベクツモマブ、ベゲロマブ、ベランタマブマホドチン、ベリムマブ、ベマリツズマブ、ベンラリズマブ、ベルリマトクスマブ、ベルメキマブ、ベルサンリマブ、ベルチリムマブ、ベシレソマブ、ベバシズマブ、ベズロトクスマブ、ビシロマブ、ビマグルマブ、ビメキズマブ、ビルタミマブ、ビバツズマブ、ブレセルマブ、ブリナツモマブ、ブロンツベトマブ、ブロソズマブ、ボコシズマブ、ブラジクマブ、ブレンツキシマブベドチン、ブリアキヌマブ、ブロダルマブ、ブロルシズマブ、ブロンチクツズマブ、ブロスマブ、カビラリズマブ、カミダンルマブテシリン、カムレリズマブ、カナキヌマブ、カンツズマブメルタンシン、カンツズマブラブタンシン、カプラシズマブ、カプロマブ、カルルマブ、カロツキシマブ、カツマキソマブ、cBR-ドキソルビシンイムノコンジュゲート、セデリズマブ、セミプリマブ、セルグツズマブアムナロイキン、セルトリズマブペゴル、セトレリマブ、セツキシマブ、シビサタマブ、シルムツズマブ、シタツズマブボガトクス、シクスツムマブ、クラザキズマブ、クレノリキシマブ、クリバツズマブテトラキセタン、コドリツズマブ、コフェツズマブペリドチン、コルツキシマブラブタンシン、コナツムマブ、コンシズマブ、コスフロビキシマブ、クレネズマブ、クリザンリズマブ、クロテデュマブ、CR6261、クサツズマブ、ダセツズマブ、ダクリズマブ、ダロツズマブ、ダピロリズマブペゴル、ダラツムマブ、デクトレクマブ、デムシズマブ、デニンツズマブマホドチン、デノスマブ、デパツキシズマブマホドチン、デルロツキシマブビオチン、デツモマブ、デザミズマブ、ジヌツキシマブ、ジリダブマブ、ドマグロズマブ、ドルリモマブアリトクス、ドスタルリマブ、ドロジツマブ、DS-8201、ドゥリゴツズマブ、デュピルマブ、デュルバルマブ、ドゥシギツマブ、ドゥボルツキシズマブ、エクロメキシマブ、エクリズマブ、エドバコマブ、エドレコロマブ、エファリズマブ、エファングマブ、エルデルマブ、エレザヌマブ、エルゲムツマブ、エロツズマブ、エルシリモマブ、エマクツズマブ、エマパルマブ、エミベツズマブ、エミシズマブ、エナポタマブベドチン、エナバツズマブ、エンホルツマブベドチン、エンリモマブペゴル、エノブリツズマブ、エノキズマブ、エノチクマブ、エンシツキシマブ、エピツモマブシツキセタン、エプラツズマブ、エプチネズマブ、エレヌマブ、エルリズマブ、エルツマクソマブ、エタラシズマブ、エチギリマブ、エトロリズマブ、エビナクマブ、エボロクマブ、エクスビビルマブ、ファノレソマブ、ファラリモマブ、ファリシマブ、ファーレツズマブ、ファシヌマブ、FBTA05、フェルビズマブ、フェザキヌマブ、フィバツズマブ、フィクラツズマブ、フィギツムマブ、フィリブマブ、フランボツマブ、フレチクマブ、フロテツズマブ、フォントリズマブ、フォラルマブ、フォラビルマブ、フレマネズマブ、フレソリムマブ、フロボシマブ、フルネベトマブ、フルラヌマブ、フツキシマブ、ガルカネズマブ、ガリキシマブ、ガンコタマブ、ガニツマブ、ガンテネルマブ、ガチポツズマブ、ガビリモマブ、ゲジブマブ、ゲムツズマブオゾガマイシン、ゲボキズマブ、ジルベトマブ、ジムシルマブ、ジレンツキシマブ、グレンバツムマブベドチン、ゴリムマブ、ゴミリキシマブ、ゴスラネマブ、グセルクマブ、ラナルマブ、イバリズマブ、IBI308、イブリツモマブチウキセタン、イクルクマブ、イダルシズマブ、イファボツズマブ、イゴボマブ、イラダツズマブベドチン、IMAB363、イマルマブ、イマプレリマブ、イムシロマブ、イムガツズマブ、インクラクマブ、インダツキシマブラブタンシン、インデュサツマブベドチン、イネビリズマブ、インフリキシマブ、インテツムマブ、イノリモマブ、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ、Iomab-B、イラツムマブ、イサツキシマブ、イスカリマブ、イスチラツマブ、イトリズマブ、イキセキズマブ、ケリキシマブ、ラベツズマブ、ラクノツズマブ、ラジラツズマブベドチン、ランパリズマブ、ラナデルマブ、ランドグロズマブ、ラプリツキシマブエムタンシン、ラルカビキシマブ、レブリキズマブ、レマレソマブ、レンダリズマブ、レンベルビマブ、レンジルマブ、レルデリムマブ、レロンリマブ、レソファブマブ、レトリズマブ、レキサツムマブ、リビビルマブ、リファスツズマブベドチン、リゲリズマブ、ロンカスツキシマブテシリン、ロサツキシズマブベドチン、リロトマブサテトラキセタン、リンツズマブ、リリルマブ、ロデルシズマブ、ロキベトマブ、ロルボツズマブメルタンシン、ルカツムマブ、ルリズマブペゴル、ルミリキシマブ、ルムレツズマブ、ルパルツマブ、ルパルツマブアマドチン、ルチキズマブ、マパツムマブ、マルジェツキシマブ、マルスタシマブ、マスリモマブ、マブリリムマブ、マツズマブ、メポリズマブ、メテリムマブ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミリキズマブ、ミルベツキシマブソラブタンシン、ミツモマブ、モドツキシマブ、モガムリズマブ、モナリズマブ、モロリムマブ、モスネツズマブ、モタビズマブ、モキセツモマブパスドトクス、ムロモナブ-CD3、ナコロマブタフェナトクス、ナミルマブ、ナプツモマブエスタフェナトクス、ナラツキシマブエムタンシン、ナルナツマブ、ナタリズマブ、ナビシキシズマブ、ナビブマブ、ナキシタマブ、ネバクマブ、ネシツムマブ、ネモリズマブ、NEOD001、ネレリモマブ、ネスバクマブ、ネタキマブ、ニモツズマブ、ニルセビマブ、ニボルマブ、ノフェツモマブメルペンタン、オビルトキサキシマブ、オビヌツズマブ、オカラツズマブ、オクレリズマブ、オドゥリモマブ、オファツムマブ、オララツマブ、オレクルマブ、オレンダリズマブ、オロキズマブ、オマリズマブ、オムブルタマブ、OMS721、オナルツズマブ、オンツキシズマブ、オンバチリマブ、オピシヌマブ、オポルツズマブモナトクス、オレゴボマブ、オルチクマブ、オテリキシズマブ、オチリマブ、オトレルツズマブ、オキセルマブ、オザネズマブ、オゾラリズマブ、パジバキシマブ、パリビズマブ、パムレブルマブ、パニツムマブ、パンコマブ、パノバクマブ、パルサツズマブ、パスコリズマブ、パソツキシズマブ、パテクリズマブ、パトリツマブ、PDR001、ペンブロリズマブ、ペムツモマブ、ペラキズマブ、パーツズマブ、パキセリズマブ、ピディリズマブ、ピナツズマブベドチン、ピンツモマブ、プラクルマブ、プレザルマブ、プロザリズマブ、ポガリズマブ、ポラツズマブベドチン、ポネズマブ、ポルガビキシマブ、プラシネズマブ、プレザリズマブ、プリリキシマブ、プリトキサキシマブ、プリツムマブ、PRO140、キリズマブ、ラコツモマブ、ラドレツマブ、ラフィビルマブ、ラルパンシズマブ、ラムシルマブ、ラネベトマブ、ラニビズマブ、ラキシバクマブ、ラバガリマブ、ラブリズマブ、レファネズマブ、レガビルマブ、REGN-EB、レラトリマブ、レムトルマブ、レスリズマブ、リロツムマブ、リヌクマブ、リサンキズマブ、リツキシマブ、リバブズマブペゴル、ロバツムマブ、Rmab、ロレヅマブ、ロミルキマブ、ロモソズマブ、ロンタリズマブ、ロスマンツズマブ、ロバルピツズマブテシリン、ロベリズマブ、ロザノリキシズマブ、ルプリズマブ、SA237、サシツズマブゴビテカン、サマリズマブ、サムロタマブベドチン、サリルマブ、サトラリズマブ、サツモマブペンデチド、セクキヌマブ、セリクレルマブ、セリバンツマブ、セトキサキシマブ、セトルスマブ、セビルマブ、シブロツズマブ、SGN-CD19A、SHP647、シファリムマブ、シルツキシマブ、シムツズマブ、シプリズマブ、シルトラツマブベドチン、シルクマブ、ソフィツズマブベドチン、ソラネズマブ、ソリトマブ、ソネプシズマブ、ソンツズマブ、スパルタリズマブ、スタムルマブ、スレソマブ、スプタブマブ、スチムリマブ、スビズマブ、スブラトクスマブ、タバルマブ、タカツズマブテトラキセタン、タドシズマブ、タラコツズマブ、タリズマブ、タルケタマブ、タムツベトマブ、タネズマブ、タプリツモマブパプトクス、タレクスツマブ、タボリマブ、テクリスタマブ、テフィバズマブ、テリモマブアリトクス、テリソツズマブ、テリソツズマブベドチン、テナツモマブ、テネリキシマブ、テプリズマブ、テポジタマブ、テプロツムマブ、テシドルマブ、テツロマブ、テゼペルマブ、TGN1412、チブリズマブ、チルドラキズマブ、ティガツズマブ、チミグツズマブ、チモルマブ、チラゴルマブ、チラゴツマブ、チスレリズマブ、チソツマブベドチン、TNX-650、トシリズマブ、トムゾツキシマブ、トラリズマブ、トサトクスマブ、トシツモマブ、トベツマブ、トラロキヌマブ、トラスツズマブ、トラスツズマブデュオカルマジン、トラスツズマブエムタンシン、TRBS07、トレガリズマブ、トレメリムマブ、トレボグルマブ、ツコツズマブセルモロイキン、ツビルマブ、ウブリツキシマブ、ウロクプルマブ、ウレルマブ、ウルトキサズマブ、ウステキヌマブ、ウトミルマブ、バダスツキシマブタリリン、バナリマブ、バンドルツズマブベドチン、バンチクツマブ、バヌシズマブ、バパリキシマブ、バリサクマブ、バルリルマブ、バテリズマブ、ベドリズマブ、ベルツズマブ、ベパリモマブ、ベセンクマブ、ビジリズマブ、ボバリリズマブ、ボロシキシマブ、ボンレロリズマブ、ボプラテリマブ、ボルセツズマブマホドチン、ボツムマブ、ブナキズマブ、キセンツズマブ、XMAB-5574、ザルツムマブ、ザノリムマブ、ザツキシマブ、ゼノクツズマブ、ジラリムマブ、ゾルベツキシマブ、(=IMAB362、クラウジキシマブ)、ゾリモマブアリトックス、またはそれらの組合せを含む、請求項20~32のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第2の治療剤が、ADCC、ADCPおよび/またはCDCを誘導するのに有効な抗体またはその抗原結合性部位/断片を含む、請求項20~33のいずれか一項に記載の方法。
- 対象が、癌の動物モデルである、請求項19~34のいずれか一項に記載の方法。
- 少なくとも1種の請求項1~12のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を含むデバイスまたはキットであって、必要に応じて、少なくとも1種の前記抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、もしくはその抗原結合性部位/断片、または少なくとも1種の前記抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、もしくはその抗原結合性部位/断片を含む複合体を検出するための標識を含むデバイスまたはキット。
- 試料中のIGSF8ポリペプチドの存在またはレベルを検出する方法であって、試料中のIGSF8ポリペプチドを、請求項1~12のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片と接触させる工程を含み、前記抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片は、検出可能な標識によって標識されているか、または検出可能な標識に付着されていてもよい、前記方法。
- 前記抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片が、IGSF8ポリペプチドとの複合体を形成し、複合体は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、放射免疫アッセイ(RIA)、免疫化学方法、ウェスタンブロット、または細胞内フローアッセイの形態で検出される、請求項37に記載の方法。
- 対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害の進行をモニターするための方法であって、
a)対象から得られた試料において、第1の時点で、請求項1~12のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用してIGSF8の第1のレベルを検出する工程;
b)後続の時点で、工程a)を繰り返して、IGSF8の第2のレベルを得る工程;および
c)それぞれ工程a)およびb)で検出されたIGSF8の第1および第2のレベルを比較して、対象における障害の進行をモニターする工程
を含み、
第2のレベルが第1のレベルより高いことは、疾患が進行したことを示す、前記方法。 - 第1の時点から後続の時点の間に、対象が、障害を緩和するための処置を受けた、請求項39に記載の方法。
- 異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害を患う対象の臨床転帰を予測するための方法であって、
a)請求項1~12のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、対象から得られた第1の試料におけるIGSF8のレベルを決定する工程;
b)請求項1~12のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、優れた臨床転帰を有する対照対象から得られた第2の試料におけるIGSF8のレベルを決定する工程;および
c)第1および第2の試料におけるIGSF8のレベルを比較する工程
を含み;
第2の試料におけるIGSF8のレベルと比較して、第1の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に高いこと(例えば、>20%、>50%またはそれより高い増加)は、対象がより劣った臨床転帰を有することの指標であるか、および/または、
第2の試料におけるIGSF8のレベルと比較して、第1の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に低いこと(例えば、>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、対象がより優れた臨床転帰を有することの指標である、前記方法。 - 対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害のための療法の有効性を評価する方法であって、
a)対象に療法の少なくとも一部を提供する前に、対象から得られた第1の試料において、請求項1~12のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、IGSF8のレベルを決定する工程、および
b)前記療法の一部の提供に続いて、対象から得られた第2の試料において工程a)を繰り返す工程
を含み、
第1の試料と比べて第2の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に低いこと(>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、療法が対象における障害を阻害することに関して有効であることの指標であるか;および/または、
第1の試料と比べて第2の試料における実質的に同一な、またはより高いIGSF8のレベルは、療法が対象における障害を阻害することに関して有効ではないことの指標である、前記方法。 - 疾患が、癌である、請求項41または42に記載の方法。
- 対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害を阻害するための試験化合物の有効性を評価する方法であって、
a)対象から得られた第1の試料において、請求項1~12のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、IGSF8のレベルを決定する工程であって、第1の試料は、ある量の試験化合物に曝露された、工程;および
b)請求項1~12のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、対象から得られた第2の試料において、IGSF8のレベルを決定する工程であって、第2の試料は、試験化合物に曝露されたことがない、工程
を含み、
第1の試料におけるIGSF8のレベルが第2の試料のレベルと比べてより有意に低いこと(>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、試験化合物の量が対象における障害を阻害することに関して有効であることの指標であるか、および/または、
第1の試料におけるIGSF8のレベルが第2の試料のレベルと比べて実質的に同一であることは、試験化合物の量が対象における障害を阻害することに関して有効ではないことの指標である、前記方法。 - 第1および第2の試料が、対象から得られた単一の試料の一部または対象から得られたプールされた試料の一部である、請求項44に記載の方法。
- 障害が、癌である、請求項44または45に記載の方法。
- 癌が、肺癌、腎臓癌、膵臓癌、結腸直腸癌、急性骨髄性白血病(AML)、頭頸部癌、肝臓癌、卵巣癌、前立腺癌、子宮癌、神経膠腫、膠芽腫、神経芽細胞腫、乳癌、膵管癌、胸腺腫、B-CLL、白血病、B細胞リンパ腫、およびIGSF8に対する受容体(例えば、KIR3DL1、KIR3DL2、および/またはKLRC1/D1)を発現する免疫細胞(例えば、T細胞および/またはNK細胞)が浸潤した癌である、請求項46に記載の方法。
- 試料が、対象から得られた細胞、血清、腫瘍周囲組織、および/または腫瘍内組織を含む、請求項37~47のいずれか一項に記載の方法。
- 対象が、ヒトである、請求項39~48のいずれか一項に記載の方法。
- IGSF8に特異的なモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片であって、前記モノクローナル抗体は、
(1)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つの、それぞれHCVR CDR1~CDR3と少なくとも95%(例えば、100%)同一な、またはそれにおいて最大で1、2、3、4、5、6、7、8、または9個の置換を有するHCVR CDR1~CDR3配列を含む重鎖可変領域(HCVR);および、
(2)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つの、それぞれLCVR CDR1~CDR3と少なくとも95%(例えば、100%)同一な、またはそれにおいて最大で1、2、3、4、5、6、7、8、または9個の置換を有するLCVR CDR1~CDR3配列を含む軽鎖可変領域(LCVR)
を含む、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。 - (a)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つのHCVR配列と少なくとも95%(例えば、100%)同一なHCVR配列;および/または、
(b)抗体C1~C39、例えばC30~C39のいずれか1つのLCVR配列と少なくとも95%(例えば、100%)同一なLCVR配列
を含む、請求項50に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。 - ヒト-マウスキメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、CDRグラフト抗体、または再表面化抗体である、請求項50または51に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記その抗原結合性断片が、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、単鎖FvもしくはscFv、ジスルフィド連結されたFv、V-NARドメイン、IgNar、イントラボディ、IgGΔCH2、ミニボディ、F(ab’)3、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、単一ドメイン抗体、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2、またはscFv-Fcである、請求項50~52のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片が、約25nM未満、20nM未満、15nM未満、10nM未満、5nM未満、2nM未満、または1nM未満のKdでIGSF8と結合する、請求項50~53のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- IGSF8への結合に関して、請求項50~54のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片と競合するモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 抗体またはその抗原結合性部位/断片が、IGSF8のD1 ECD(またはIg-Vセットドメイン)と、好ましくは5nM以下、2nM以下、または1nM以下のKDで特異的に結合する、請求項50~55のいずれか一項に記載の抗体またはモノクローナル抗体。
- 抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1/2へのIGSF8の結合を阻害する、請求項50~56のいずれか一項に記載の抗体またはモノクローナル抗体。
- 抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1/2のD2ドメインへの、例えばKIR3DL1/2のS165、I171、および/またはM186を含むエピトープへのIGSF8の結合を阻害する、請求項50~57のいずれか一項に記載の抗体またはモノクローナル抗体。
- IGSF8のD1 ECD(またはIg-Vセットドメイン)と特異的に結合し、KIR3DL1/2への結合、例えば、KIR3DL1/2のD2ドメイン(例えば、KIR3DL1/2のS165、I171、および/またはM186を含むエピトープ)への結合を阻害するモノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片。
- 5nM以下、2nM以下、または1nM以下のKDを有する、請求項59に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片。
- 請求項50~60のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片をコードするポリヌクレオチド。
- ストリンジェントな条件下で、請求項61に記載のポリヌクレオチド、または請求項61に記載のポリヌクレオチドの相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチド。
- 請求項61または62に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
- コードされたモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現させるための、請求項61もしくは62に記載のポリヌクレオチド、または請求項63に記載のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項50~60のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を生産する方法であって、
(i)前記モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現させるのに好適な条件下で、前記モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を発現することが可能な請求項64に記載の宿主細胞を培養する工程;および
(ii)発現されたモノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を回収/単離/精製する工程
を含む、前記方法。 - それを必要とする対象における免疫応答をモジュレートする方法であって、IGSF8と、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体との相互作用を阻害する工程を含む、前記方法。
- それを必要とする対象における癌を処置するための免疫療法の方法であって、IGSF8と、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体との相互作用を阻害する工程を含む、前記方法。
- それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量のIGSF8(免疫グロブリンスーパーファミリー8)モジュレーター(例えば、アンタゴニスト)を対象に投与する工程を含む、前記方法。
- それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量の、IGSF8との相互作用を阻害するKIR3DL1アンタゴニストを対象に投与する工程を含む、前記方法。
- それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量の、IGSF8との相互作用を阻害するKIR3DL2アンタゴニストを対象に投与する工程を含む、前記方法。
- それを必要とする対象における癌を処置する方法であって、治療有効量の、IGSF8との相互作用を阻害するKLRC1/D1アンタゴニストを対象に投与する工程を含む、前記方法。
- 免疫療法剤、免疫チェックポイント阻害剤、癌ワクチン、キメラ抗原受容体、化学療法剤、放射線療法剤、抗血管新生剤、増殖阻害剤、免疫腫瘍学薬剤、抗新生物性組成物、外科手術、またはそれらの組合せを含む有効量の第2の治療剤を対象に投与する工程をさらに含む、請求項66~71のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8抗体もしくはその抗原結合性部位/断片、IGSF8の阻害性ペプチド、IGSF8を標的化する核酸(アプタマー、アンチセンスポリヌクレオチド、RNAi試薬、例えばsiRNA、miRNA、shRNA;2型CRISPR/Casエフェクター酵素のためのガイドRNA)、またはIGSF8を標的化する小分子(例えば、<1000Daまたは<500DaのM.W.を有する)から選択されるIGSF8アンタゴニストを対象に投与する工程を含み;必要に応じて、IGSF8アンタゴニストは、抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部位/断片である、請求項66~68および72のいずれか一項に記載の方法。
- 抗KIR3DL1抗体もしくはその抗原結合性部位/断片、KIR3DL1の阻害性ペプチド、KIR3DL1を標的化する核酸(アプタマー、アンチセンスポリヌクレオチド、RNAi試薬、例えばsiRNA、miRNA、shRNA;2型CRISPR/Casエフェクター酵素のためのガイドRNA)、またはKIR3DL1を標的化する小分子(例えば、<1000Daまたは<500DaのM.W.を有する)から選択されるKIR3DL1アンタゴニストを対象に投与する工程を含み;必要に応じて、KIR3DL1アンタゴニストは、抗KIR3DL1抗体またはその抗原結合性部位/断片である、請求項66、67、69、および72のいずれか一項に記載の方法。
- 抗KIR3DL2抗体もしくはその抗原結合性部位/断片、KIR3DL2の阻害性ペプチド、KIR3DL2を標的化する核酸(アプタマー、アンチセンスポリヌクレオチド、RNAi試薬、例えばsiRNA、miRNA、shRNA;2型CRISPR/Casエフェクター酵素のためのガイドRNA)、またはKIR3DL2を標的化する小分子(例えば、<1000Daまたは<500DaのM.W.を有する)から選択されるKIR3DL2アンタゴニストを対象に投与する工程を含み;必要に応じて、KIR3DL2アンタゴニストは、抗KIR3DL2抗体またはその抗原結合性部位/断片である、請求項66、67、70、および72のいずれか一項に記載の方法。
- 抗KLRC1/D1抗体もしくはその抗原結合性部位/断片、KLRC1/D1の阻害性ペプチド、KLRC1/D1を標的化する核酸(アプタマー、アンチセンスポリヌクレオチド、RNAi試薬、例えばsiRNA、miRNA、shRNA;2型CRISPR/Casエフェクター酵素のためのガイドRNA)、またはKLRC1/D1を標的化する小分子(例えば、<1000Daまたは<500DaのM.W.を有する)から選択されるKLRC1/D1アンタゴニストを対象に投与する工程を含み;必要に応じて、KLRC1/D1アンタゴニストは、抗KLRC1/D1抗体またはその抗原結合性部位/断片である、請求項66、67、71、および72のいずれか一項に記載の方法。
- 抗体が、キメラ抗体、ヒト化抗体、またはヒト抗体である、請求項73~76のいずれか一項に記載の方法。
- 抗原結合性部位/断片が、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、単鎖FvもしくはscFv、ジスルフィド連結されたFv、V-NARドメイン、IgNar、イントラボディ、IgGΔCH2、ミニボディ、F(ab’)3、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、単一ドメイン抗体、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2、またはscFv-Fcである、請求項73~77のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部位/断片が、IGSF8のD1(またはIg-Vセットドメイン)と特異的に結合する、請求項73、77、および78のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1および/またはKIR3DL2へのIGSF8の結合を阻害する、請求項73、77、および78のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1および/またはKIR3DL2の中間/D2ドメインへのIGSF8の結合を阻害する、請求項73、77、および78のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1および/またはKIR3DL2のS165、I171および/またはM186へのIGSF8の結合を阻害する、請求項73、77、および78のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8抗体またはその抗原結合性部位/断片が、請求項50~60のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片のいずれか1つである、請求項73、および77~82のいずれか一項に記載の方法。
- 抗KIR3DL1/2抗体もしくはその抗原結合性部位/断片、KIR3DL1/2に対する阻害性ペプチド、KIR3DL1/2を標的化する核酸、またはKIR3DL1/2を標的化する小分子は、残基S165、I171、および/またはM186を含むKIR3DL1/2のエピトープに結合し、それによって、KIR3DL1/2のD2ドメインへのIGSF8の結合を阻害する、請求項74、75、77、および78のいずれか一項に記載の方法。
- 抗KIR3DL1/2抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1/2のECDの中間/D2 Ig様ドメインと特異的に結合し、必要に応じて、抗KIR3DL1/2抗体またはその抗原結合性部位/断片は、残基S165、I171、および/またはM186を含むエピトープと特異的に結合する、請求項74、75、77、および78のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8および/もしくは抗KIR3DL1/2および/もしくは抗KLRC1/D1抗体またはその抗原結合性部位/断片が、細胞傷害性物質にコンジュゲートしている、請求項73~85のいずれか一項に記載の方法。
- 細胞傷害性物質が、化学療法剤、生物剤、毒素、および放射性同位体からなる群から選択される、請求項86に記載の方法。
- 抗IGSF8および/もしくは抗KIR3DL1/2および/もしくは抗KLRC1/D1抗体またはその抗原結合性部位/断片が、癌における増殖している細胞の数を低減させるか、および/または癌の腫瘍の体積またはサイズを低減させる、請求項73~87のいずれか一項に記載の方法。
- 抗IGSF8および/もしくは抗KIR3DL1/2および/もしくは抗KLRC1/D1抗体またはその抗原結合性部位/断片が、薬学的に許容される配合物の形態で投与される、請求項73~88のいずれか一項に記載の方法。
- 癌が、黒色腫(皮膚黒色腫を含む)、子宮頸癌、肺癌(例えば、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌)、結腸直腸癌、リンパ腫(B細胞リンパ腫およびDLBCLを含む)、白血病(CLLおよび急性骨髄性白血病(AML)を含む)、BLCA腫瘍、乳癌、頭頸部癌、頭頸部扁平上皮癌、PRAD、THCA、もしくはUCEC、甲状腺癌、尿路癌、子宮癌、食道癌、肝臓癌、神経節の癌、腎臓癌、膵臓癌、膵管癌、卵巣癌、前立腺癌、神経膠腫、膠芽腫、神経芽細胞腫、胸腺腫、B-CLL、およびIGSF8受容体を発現する免疫細胞が浸潤した癌である、請求項67~89のいずれか一項に記載の方法。
- 癌が、肺癌、腎臓癌、膵臓癌、結腸直腸癌、急性骨髄性白血病(AML)、頭頸部癌、肝臓癌、卵巣癌、前立腺癌、または子宮癌である、請求項67~89のいずれか一項に記載の方法。
- 対象における癌細胞および/または腫瘍免疫浸潤細胞が、IGSF8を発現する、請求項67~91のいずれか一項に記載の方法。
- IGSF8アンタゴニストが、サイトカインの発現、分泌、またはCXCL10、CXCL9、TNFα、CD8b、CD8a、Prf1、IFNγ、Gzma、Gzmb、CD274、PDCD1、PDCD1Ig2、LAG3、Havcr2、Tigit、もしくはCTLA4からなる群から選択される標的遺伝子の発現、分泌を促進するか、またはそれ以外の方法でその活性を増加させる、請求項68、72、73、77~83、および86~92のいずれか一項に記載の方法。
- 前記サイトカインまたは前記標的遺伝子の発現、分泌、またはそれ以外の方法によるその活性増加が、腫瘍微小環境内で起こる、請求項93に記載の方法。
- 前記サイトカインまたは前記標的遺伝子の発現、分泌、またはそれ以外の方法で増加したその活性が、腫瘍微小環境への免疫細胞(例えば、Tリンパ球またはNK細胞)の浸潤に起因する、請求項93または94に記載の方法。
- 前記IGSF8アンタゴニスト、前記KIR3DL1アンタゴニスト、前記KIR3DL2アンタゴニスト、または前記KLRC1/D1アンタゴニストが、免疫刺激性分子である、請求項68~95のいずれか一項に記載の方法。
- 前記IGSF8アンタゴニスト、前記KIR3DL1アンタゴニスト、前記KIR3DL2アンタゴニスト、または前記KLRC1/D1アンタゴニストが、T細胞またはNK細胞の活性化および/または腫瘍微小環境への浸潤を刺激する、請求項96に記載の方法。
- 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1、PD-L1、PD-L2、LAG3、TIGIT、TIM3、NKG2A、CD276、VTCN1、VISRまたはHHLA2に特異的な抗体またはその抗原結合性断片である、請求項72~97のいずれか一項に記載の方法。
- 免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-1抗体、例えばセミプリマブ、ニボルマブ、またはペンブロリズマブである、請求項98に記載の方法。
- 免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-L1抗体、例えばアベルマブ、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、KN035、またはCK-301である、請求項98に記載の方法。
- 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1/PD-L1の(非抗体)ペプチド阻害剤、例えばAUNP12;PD-L1の小分子阻害剤、例えばCA-170、または大環状ペプチド、例えばBMS-986189である、請求項72~97のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第2の治療剤が、癌を処置するのに有効な抗体またはその抗原結合性部位/断片、例えば3F8、8H9、アバゴボマブ、アブシキシマブ、アビツズマブ、アブレゼキマブ、アブリルマブ、アクトキスマブ、アダリムマブ、アデカツムマブ、アデュカヌマブ、アファセビクマブ、アフェリモマブ、アラシズマブペゴル、アレムツズマブ、アリロクマブ、アルツモマブペンテテート、アマツキシマブ、アミバンタマブ、アナツモマブマフェナトクス、アンデカリキシマブ、アネツマブラブタンシン、アニフロルマブ、アンルキンズマブ、アポリズマブ、アプルツマブイキサドチン、アルシツモマブ、アスクリンバクマブ、アセリズマブ、アテゾリズマブ、アチドルトクスマブ、アチヌマブ、アトロリムマブ、アベルマブ、アジンツキシズマブベドチン、バピネオズマブ、バシリキシマブ、バビツキシマブ、BCD-100、ベクツモマブ、ベゲロマブ、ベランタマブマホドチン、ベリムマブ、ベマリツズマブ、ベンラリズマブ、ベルリマトクスマブ、ベルメキマブ、ベルサンリマブ、ベルチリムマブ、ベシレソマブ、ベバシズマブ、ベズロトクスマブ、ビシロマブ、ビマグルマブ、ビメキズマブ、ビルタミマブ、ビバツズマブ、ブレセルマブ、ブリナツモマブ、ブロンツベトマブ、ブロソズマブ、ボコシズマブ、ブラジクマブ、ブレンツキシマブベドチン、ブリアキヌマブ、ブロダルマブ、ブロルシズマブ、ブロンチクツズマブ、ブロスマブ、カビラリズマブ、カミダンルマブテシリン、カムレリズマブ、カナキヌマブ、カンツズマブメルタンシン、カンツズマブラブタンシン、カプラシズマブ、カプロマブ、カルルマブ、カロツキシマブ、カツマキソマブ、cBR-ドキソルビシンイムノコンジュゲート、セデリズマブ、セミプリマブ、セルグツズマブアムナロイキン、セルトリズマブペゴル、セトレリマブ、セツキシマブ、シビサタマブ、シルムツズマブ、シタツズマブボガトクス、シクスツムマブ、クラザキズマブ、クレノリキシマブ、クリバツズマブテトラキセタン、コドリツズマブ、コフェツズマブペリドチン、コルツキシマブラブタンシン、コナツムマブ、コンシズマブ、コスフロビキシマブ、クレネズマブ、クリザンリズマブ、クロテデュマブ、CR6261、クサツズマブ、ダセツズマブ、ダクリズマブ、ダロツズマブ、ダピロリズマブペゴル、ダラツムマブ、デクトレクマブ、デムシズマブ、デニンツズマブマホドチン、デノスマブ、デパツキシズマブマホドチン、デルロツキシマブビオチン、デツモマブ、デザミズマブ、ジヌツキシマブ、ジリダブマブ、ドマグロズマブ、ドルリモマブアリトクス、ドスタルリマブ、ドロジツマブ、DS-8201、ドゥリゴツズマブ、デュピルマブ、デュルバルマブ、ドゥシギツマブ、ドゥボルツキシズマブ、エクロメキシマブ、エクリズマブ、エドバコマブ、エドレコロマブ、エファリズマブ、エファングマブ、エルデルマブ、エレザヌマブ、エルゲムツマブ、エロツズマブ、エルシリモマブ、エマクツズマブ、エマパルマブ、エミベツズマブ、エミシズマブ、エナポタマブベドチン、エナバツズマブ、エンホルツマブベドチン、エンリモマブペゴル、エノブリツズマブ、エノキズマブ、エノチクマブ、エンシツキシマブ、エピツモマブシツキセタン、エプラツズマブ、エプチネズマブ、エレヌマブ、エルリズマブ、エルツマクソマブ、エタラシズマブ、エチギリマブ、エトロリズマブ、エビナクマブ、エボロクマブ、エクスビビルマブ、ファノレソマブ、ファラリモマブ、ファリシマブ、ファーレツズマブ、ファシヌマブ、FBTA05、フェルビズマブ、フェザキヌマブ、フィバツズマブ、フィクラツズマブ、フィギツムマブ、フィリブマブ、フランボツマブ、フレチクマブ、フロテツズマブ、フォントリズマブ、フォラルマブ、フォラビルマブ、フレマネズマブ、フレソリムマブ、フロボシマブ、フルネベトマブ、フルラヌマブ、フツキシマブ、ガルカネズマブ、ガリキシマブ、ガンコタマブ、ガニツマブ、ガンテネルマブ、ガチポツズマブ、ガビリモマブ、ゲジブマブ、ゲムツズマブオゾガマイシン、ゲボキズマブ、ジルベトマブ、ジムシルマブ、ジレンツキシマブ、グレンバツムマブベドチン、ゴリムマブ、ゴミリキシマブ、ゴスラネマブ、グセルクマブ、ラナルマブ、イバリズマブ、IBI308、イブリツモマブチウキセタン、イクルクマブ、イダルシズマブ、イファボツズマブ、イゴボマブ、イラダツズマブベドチン、IMAB363、イマルマブ、イマプレリマブ、イムシロマブ、イムガツズマブ、インクラクマブ、インダツキシマブラブタンシン、インデュサツマブベドチン、イネビリズマブ、インフリキシマブ、インテツムマブ、イノリモマブ、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ、Iomab-B、イラツムマブ、イサツキシマブ、イスカリマブ、イスチラツマブ、イトリズマブ、イキセキズマブ、ケリキシマブ、ラベツズマブ、ラクノツズマブ、ラジラツズマブベドチン、ランパリズマブ、ラナデルマブ、ランドグロズマブ、ラプリツキシマブエムタンシン、ラルカビキシマブ、レブリキズマブ、レマレソマブ、レンダリズマブ、レンベルビマブ、レンジルマブ、レルデリムマブ、レロンリマブ、レソファブマブ、レトリズマブ、レキサツムマブ、リビビルマブ、リファスツズマブベドチン、リゲリズマブ、ロンカスツキシマブテシリン、ロサツキシズマブベドチン、リロトマブサテトラキセタン、リンツズマブ、リリルマブ、ロデルシズマブ、ロキベトマブ、ロルボツズマブメルタンシン、ルカツムマブ、ルリズマブペゴル、ルミリキシマブ、ルムレツズマブ、ルパルツマブ、ルパルツマブアマドチン、ルチキズマブ、マパツムマブ、マルジェツキシマブ、マルスタシマブ、マスリモマブ、マブリリムマブ、マツズマブ、メポリズマブ、メテリムマブ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミリキズマブ、ミルベツキシマブソラブタンシン、ミツモマブ、モドツキシマブ、モガムリズマブ、モナリズマブ、モロリムマブ、モスネツズマブ、モタビズマブ、モキセツモマブパスドトクス、ムロモナブ-CD3、ナコロマブタフェナトクス、ナミルマブ、ナプツモマブエスタフェナトクス、ナラツキシマブエムタンシン、ナルナツマブ、ナタリズマブ、ナビシキシズマブ、ナビブマブ、ナキシタマブ、ネバクマブ、ネシツムマブ、ネモリズマブ、NEOD001、ネレリモマブ、ネスバクマブ、ネタキマブ、ニモツズマブ、ニルセビマブ、ニボルマブ、ノフェツモマブメルペンタン、オビルトキサキシマブ、オビヌツズマブ、オカラツズマブ、オクレリズマブ、オドゥリモマブ、オファツムマブ、オララツマブ、オレクルマブ、オレンダリズマブ、オロキズマブ、オマリズマブ、オムブルタマブ、OMS721、オナルツズマブ、オンツキシズマブ、オンバチリマブ、オピシヌマブ、オポルツズマブモナトクス、オレゴボマブ、オルチクマブ、オテリキシズマブ、オチリマブ、オトレルツズマブ、オキセルマブ、オザネズマブ、オゾラリズマブ、パジバキシマブ、パリビズマブ、パムレブルマブ、パニツムマブ、パンコマブ、パノバクマブ、パルサツズマブ、パスコリズマブ、パソツキシズマブ、パテクリズマブ、パトリツマブ、PDR001、ペンブロリズマブ、ペムツモマブ、ペラキズマブ、パーツズマブ、パキセリズマブ、ピディリズマブ、ピナツズマブベドチン、ピンツモマブ、プラクルマブ、プレザルマブ、プロザリズマブ、ポガリズマブ、ポラツズマブベドチン、ポネズマブ、ポルガビキシマブ、プラシネズマブ、プレザリズマブ、プリリキシマブ、プリトキサキシマブ、プリツムマブ、PRO140、キリズマブ、ラコツモマブ、ラドレツマブ、ラフィビルマブ、ラルパンシズマブ、ラムシルマブ、ラネベトマブ、ラニビズマブ、ラキシバクマブ、ラバガリマブ、ラブリズマブ、レファネズマブ、レガビルマブ、REGN-EB、レラトリマブ、レムトルマブ、レスリズマブ、リロツムマブ、リヌクマブ、リサンキズマブ、リツキシマブ、リバブズマブペゴル、ロバツムマブ、Rmab、ロレヅマブ、ロミルキマブ、ロモソズマブ、ロンタリズマブ、ロスマンツズマブ、ロバルピツズマブテシリン、ロベリズマブ、ロザノリキシズマブ、ルプリズマブ、SA237、サシツズマブゴビテカン、サマリズマブ、サムロタマブベドチン、サリルマブ、サトラリズマブ、サツモマブペンデチド、セクキヌマブ、セリクレルマブ、セリバンツマブ、セトキサキシマブ、セトルスマブ、セビルマブ、シブロツズマブ、SGN-CD19A、SHP647、シファリムマブ、シルツキシマブ、シムツズマブ、シプリズマブ、シルトラツマブベドチン、シルクマブ、ソフィツズマブベドチン、ソラネズマブ、ソリトマブ、ソネプシズマブ、ソンツズマブ、スパルタリズマブ、スタムルマブ、スレソマブ、スプタブマブ、スチムリマブ、スビズマブ、スブラトクスマブ、タバルマブ、タカツズマブテトラキセタン、タドシズマブ、タラコツズマブ、タリズマブ、タルケタマブ、タムツベトマブ、タネズマブ、タプリツモマブパプトクス、タレクスツマブ、タボリマブ、テクリスタマブ、テフィバズマブ、テリモマブアリトクス、テリソツズマブ、テリソツズマブベドチン、テナツモマブ、テネリキシマブ、テプリズマブ、テポジタマブ、テプロツムマブ、テシドルマブ、テツロマブ、テゼペルマブ、TGN1412、チブリズマブ、チルドラキズマブ、ティガツズマブ、チミグツズマブ、チモルマブ、チラゴルマブ、チラゴツマブ、チスレリズマブ、チソツマブベドチン、TNX-650、トシリズマブ、トムゾツキシマブ、トラリズマブ、トサトクスマブ、トシツモマブ、トベツマブ、トラロキヌマブ、トラスツズマブ、トラスツズマブデュオカルマジン、トラスツズマブエムタンシン、TRBS07、トレガリズマブ、トレメリムマブ、トレボグルマブ、ツコツズマブセルモロイキン、ツビルマブ、ウブリツキシマブ、ウロクプルマブ、ウレルマブ、ウルトキサズマブ、ウステキヌマブ、ウトミルマブ、バダスツキシマブタリリン、バナリマブ、バンドルツズマブベドチン、バンチクツマブ、バヌシズマブ、バパリキシマブ、バリサクマブ、バルリルマブ、バテリズマブ、ベドリズマブ、ベルツズマブ、ベパリモマブ、ベセンクマブ、ビジリズマブ、ボバリリズマブ、ボロシキシマブ、ボンレロリズマブ、ボプラテリマブ、ボルセツズマブマホドチン、ボツムマブ、ブナキズマブ、キセンツズマブ、XMAB-5574、ザルツムマブ、ザノリムマブ、ザツキシマブ、ゼノクツズマブ、ジラリムマブ、ゾルベツキシマブ、(=IMAB362、クラウジキシマブ)、ゾリモマブアリトックス、またはそれらの組合せを含む、請求項72~101のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第2の治療剤が、ADCCおよび/またはCDCを誘導するのに有効な抗体またはその抗原結合性部位/断片を含む、請求項72~102のいずれか一項に記載の方法。
- 対象が、癌の動物モデルである、請求項66~103のいずれか一項に記載の方法。
- 対象における癌を処置するための、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体へのIGSF8の結合を阻害する、IGSF8アンタゴニスト、KIR3DL1アンタゴニスト、KIR3DL2アンタゴニスト、またはKLRC1/D1アンタゴニストの使用。
- 請求項72および98~103のいずれか一項に記載の第2の治療剤との組合せの使用のための、請求項105に記載の使用。
- 請求項66~104のいずれか一項における使用のための、KIR3DL1、KIR3DL2、およびKLRC1/D2ヘテロ二量体から選択されるIGSF8の受容体へのIGSF8の結合を阻害する、IGSF8アンタゴニスト、KIR3DL1アンタゴニスト、KIR3DL2アンタゴニスト、またはKLRC1/D1アンタゴニストを含む組成物。
- 癌を処置する方法における使用のための、好ましくはT細胞および/またはNK細胞活性化を刺激することを介して癌を処置する方法における使用のための、IGSF8と特異的に結合する抗体。
- 癌を処置する方法における使用のための、好ましくは請求項72および98~103のいずれか一項に記載の第2の治療剤と組み合わせることによる、癌を処置する方法における使用のための、IGSF8と特異的に結合する抗体。
- 少なくとも1種の請求項50~60のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、またはその抗原結合性部位/断片を含むデバイスまたはキットであって、必要に応じて、少なくとも1種の前記抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、もしくはその抗原結合性部位/断片、または少なくとも1種の前記抗体、モノクローナル抗体、その重鎖もしくは軽鎖、もしくはその抗原結合性部位/断片を含む複合体を検出するための標識を含むデバイスまたはキット。
- IGSF8ポリペプチドと、抗体のFc領域とを含む融合タンパク質。
- IGSF8ポリペプチドが、全長IGSF8、IGSF8のECD、またはIGSF8のECDのD1(またはIg Vセット)ドメインである、請求項111に記載の融合タンパク質。
- 抗体のFc領域が、IgG1のFc領域、例えばヒトIgG1のFc領域である、請求項111または112に記載の融合タンパク質。
- 請求項111~113のいずれか一項に記載の融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項114に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
- コードされた融合タンパク質を発現させるための、請求項114に記載のポリヌクレオチド、または請求項115に記載のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項111~113のいずれか一項に記載の融合タンパク質を生産する方法であって、
(i)前記融合タンパク質を発現させるのに好適な条件下で、前記融合タンパク質を発現することが可能な請求項116に記載の宿主細胞を培養する工程;および
(ii)発現された融合タンパク質を回収/単離/精製する工程
を含む、前記方法。 - 初代NK細胞またはT細胞の活性を抑制する方法であって、前記初代NK細胞または前記T細胞を、請求項111~113のいずれか一項に記載の融合タンパク質と接触させる工程を含む、前記方法。
- 試料中のIGSF8ポリペプチドの存在またはレベルを検出する方法であって、試料中のIGSF8ポリペプチドを、請求項50~60のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片と接触させる工程を含み、前記抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片は、検出可能な標識によって標識されているか、または検出可能な標識に付着されていてもよい、前記方法。
- 前記抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部分/断片が、IGSF8ポリペプチドとの複合体を形成し、複合体は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、放射免疫アッセイ(RIA)、免疫化学方法、ウェスタンブロット、または細胞内フローアッセイの形態で検出される、請求項119に記載の方法。
- 対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害の進行をモニターするための方法であって、
a)対象から得られた試料において、第1の時点で、請求項50~60のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用してIGSF8の第1のレベルを検出する工程;
b)後続の時点で、工程a)を繰り返して、IGSF8の第2のレベルを得る工程;および
c)それぞれ工程a)およびb)で検出されたIGSF8の第1および第2のレベルを比較して、対象における障害の進行をモニターする工程
を含み、
第2のレベルが第1のレベルより高いことは、疾患が進行したことを示す、前記方法。 - 第1の時点から後続の時点の間に、対象が、障害を緩和するための処置を受けた、請求項121に記載の方法。
- 異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害を患う対象の臨床転帰を予測するための方法であって、
a)請求項50~60のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、対象から得られた第1の試料におけるIGSF8のレベルを決定する工程;
b)請求項50~60のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、優れた臨床転帰を有する対照対象から得られた第2の試料におけるIGSF8のレベルを決定する工程;および
c)第1および第2の試料におけるIGSF8のレベルを比較する工程
を含み;
第2の試料におけるIGSF8のレベルと比較して、第1の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に高いこと(例えば、>20%、>50%またはそれより高い増加)は、対象がより劣った臨床転帰を有することの指標であるか、および/または、
第2の試料におけるIGSF8のレベルと比較して、第1の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に低いこと(例えば、>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、対象がより優れた臨床転帰を有することの指標である、前記方法。 - 対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害のための療法の有効性を評価する方法であって、
a)対象に療法の少なくとも一部を提供する前に、対象から得られた第1の試料において、請求項50~60のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、IGSF8のレベルを決定する工程、および
b)前記療法の一部の提供に続いて、対象から得られた第2の試料において工程a)を繰り返す工程
を含み、
第1の試料と比べて第2の試料におけるIGSF8のレベルがより有意に低いこと(>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、療法が対象における障害を阻害することに関して有効であることの指標であるか;および/または、
第1の試料と比べて第2の試料における実質的に同一な、またはより高いIGSF8のレベルは、療法が対象における障害を阻害することに関して有効ではないことの指標である、前記方法。 - 疾患が、癌である、請求項121または122に記載の方法。
- 対象における異常な(例えば、正常より高い)IGSF8発現に関連する障害を阻害するための試験化合物の有効性を評価する方法であって、
a)対象から得られた第1の試料において、請求項50~60のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、IGSF8のレベルを決定する工程であって、第1の試料は、ある量の試験化合物に曝露された、工程;および
b)請求項50~60のいずれか一項に記載の抗体、モノクローナル抗体、またはその抗原結合性部位/断片を使用して、対象から得られた第2の試料において、IGSF8のレベルを決定する工程であって、第2の試料は、試験化合物に曝露されたことがない、工程
を含み、
第1の試料におけるIGSF8のレベルが第2の試料のレベルと比べてより有意に低いこと(>20%、>50%またはそれより大きい減少)は、試験化合物の量が対象における障害を阻害することに関して有効であることの指標であるか、および/または、
第1の試料におけるIGSF8のレベルが第2の試料のレベルと比べて実質的に同一であることは、試験化合物の量が対象における障害を阻害することに関して有効ではないことの指標である、前記方法。 - 第1および第2の試料が、対象から得られた単一の試料の一部または対象から得られたプールされた試料の一部である、請求項126に記載の方法。
- 障害が、癌である、請求項119~127のいずれか一項に記載の方法。
- 癌が、肺癌、腎臓癌、膵臓癌、結腸直腸癌、急性骨髄性白血病(AML)、頭頸部癌、肝臓癌、卵巣癌、前立腺癌、子宮癌、神経膠腫、膠芽腫、神経芽細胞腫、乳癌、膵管癌、胸腺腫、B-CLL、白血病、B細胞リンパ腫、およびIGSF8に対する受容体(例えば、KIR3DL1、KIR3DL2、および/またはKLRC1/D1)を発現する免疫細胞(例えば、T細胞および/またはNK細胞)が浸潤した癌である、請求項128に記載の方法。
- 試料が、対象から得られた細胞、血清、腫瘍周囲組織、および/または腫瘍内組織を含む、請求項119~129のいずれか一項に記載の方法。
- 対象が、ヒトである、請求項121~130のいずれか一項に記載の方法。
- 機能的なIGSF8アンタゴニストのためのスクリーニング方法であって、候補薬剤(例えば、小分子、ペプチド、アプタマー、ポリヌクレオチドなど)を、NK細胞と、IGSF8を発現し、NK細胞媒介細胞傷害に耐性である標的細胞との共培養物と接触させる工程、および標的細胞に対するNK細胞によって媒介される細胞溶解活性を促進する候補薬剤を同定し、それによって候補薬剤を、IGSF8アンタゴニストとして同定する工程を含む、前記方法。
- 機能的なIGSF8アンタゴニストのためのスクリーニング方法であって、T細胞活性化シグナルおよびIGSF8の存在下で、候補薬剤(例えば、小分子、ペプチド、アプタマー、ポリヌクレオチドなど)を、Jurkat NFATレポーター細胞と接触させる工程を含み、レポーター細胞が、候補薬剤の非存在下で活性化されず、候補薬剤の存在下で活性化される場合、その候補薬剤は機能的なIGSF8アンタゴニストとして同定される、前記方法。
- KIR3DL1/2-IGSF8の相互作用を阻害し、それによってNK細胞活性化を刺激することによる、癌を処置する方法における使用のための、KIR3DL1/2と特異的に結合する抗体。
- 癌を処置する方法における使用のための、好ましくは請求項72および98~103のいずれか一項に記載の第2の治療剤と組み合わせることによる、癌を処置する方法における使用のためのKIR3DL1/2と特異的に結合する抗体。
- KIR3DL1/2に特異的な、好ましくはKIR3DL1/2のECDの第2/中間/D2 Ig様ドメイン、または残基S165、I171、および/もしくはM186を含むエピトープに特異的なモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- ヒト-マウスキメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、CDRグラフト抗体、または再表面化抗体である、請求項136に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記その抗原結合性断片が、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、単鎖FvもしくはscFv、ジスルフィド連結されたFv、V-NARドメイン、IgNar、イントラボディ、IgGΔCH2、ミニボディ、F(ab’)3、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、単一ドメイン抗体、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2、またはscFv-Fcである、請求項136または137に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片が、約25nM未満、20nM未満、15nM未満、10nM未満、5nM未満、2nM未満、または1nM未満のKdでKIR3DL1/2と結合する、請求項136~138のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- KIR3DL1/2への結合に関して、請求項136~139のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片と競合するモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1/2の第2/中間/D2 ECDと、好ましくは5nM以下、2nM以下、または1nM以下のKDで特異的に結合する、請求項136~140のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体。
- 抗体またはその抗原結合性部位/断片が、KIR3DL1/2へのIGSF8の結合を阻害する、請求項136~141のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体。
- KIR3DL1/2の中間/D2 ECDと特異的に結合する(例えば、残基S165、I171、および/またはM186を含むエピトープと特異的に結合する)モノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片であって、KIR3DL1/2へのIGSF8の結合を阻害する、モノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片。
- 5nM以下、2nM以下、または1nM以下のKDを有する、請求項143に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性部位/断片。
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