JP2023536818A - Hla-g抗原結合ドメインを含むタンパク質及びそれらの使用 - Google Patents

Hla-g抗原結合ドメインを含むタンパク質及びそれらの使用 Download PDF

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Abstract

本発明は、ヒト白血球抗原G(HLA-G)に結合する抗原結合ドメインを含むHLA-Gタンパク質に結合する抗原結合ドメイン、それをコードするポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、それを作製及び使用する方法を提供する。【選択図】なし

Description

(関連出願の相互参照)
本出願は、2020年7月29日に出願された米国仮出願第63/057,960号に対する優先権を主張する。前述の出願の各々の開示は、その全体が参照により本明細書に組み入れられる。
(配列表)
本出願は、ASCIIフォーマットで電子的に提出済みである、その全体が参照により本明細書に組み込まれる配列表を含む。2021年7月12日に作成された当該ASCIIコピーは、JBI6358WOPCT1_SL.txtと名付けられており、サイズは747KBである。
(発明の分野)
本開示は、ヒト白血球抗原G(human leukocyte antigen G、HLA-G)タンパク質に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質、それらをコードするポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、それらを作製及び使用する方法を提供する。
ヒト白血球抗原G(HLA-G)は、タンパク質の非古典的MHCクラスIbファミリーに属する。4つの膜結合(HLA-G1、G2、G3、G4)タンパク質アイソフォーム及び3つの可溶性(HLA-G5、G6、G7)タンパク質アイソフォームをコードする、7つの代替的mRNAが説明されている(Carosella et al.,2003)。高度に多型の古典的HLAクラスI遺伝子とは対照的に、HLA-G遺伝子多型は、非常に限定されている。16個の全長タンパク質をコードするHLA-Gについて、50個の対立遺伝子のみが列挙されている。HLA-G1及びその可溶性対応物HLA-G5は、古典的HLAクラスI様である、ベータ-2-ミクログロブリン(beta-2-microglobulin、β2m)に非共有結合し、ヒストンH2Aペプチドなどの制限ペプチドに結合するのに好適な3つの球状ドメインの重鎖である、同一の細胞外構造を有する1-3。HLA-G1単量体は、そのペプチド結合溝(HLA分子の活性化機能に重要な構造的要素)及びそのα3ドメイン(HLAクラスI分子の阻害機能に重要な構造的要素)のレベルで、古典的HLAクラスI分子とは異なる。膜アイソフォームのタンパク質分解性シェディングは、可溶性分子を更に作り出す(Dong et al.,2003、Park et al.,2004)。単量体、ホモ及び可能なヘテロ多量体、並びにユビキチン化タンパク質は、HLA-Gについて報告されている構造である。HLA-Gの阻害機能は、最もよく特徴付けられた受容体としてのヒト阻害受容体Ig様転写物2及び4(inhibitory receptors lg-like transcript 2 and 4、ILT2及びILT4)を遮断する、単量体ではなく二量体に主に起因すると考えられている。HLA-G1ホモ二量体は、α3ドメインのILT2結合部位及びILT4結合部位を露出させる斜め配向をとり、それによって、HLA-G単量体よりも高い親和性及び遅い解離速度で結合する。
HLA-Gの既知の受容体としては、末梢免疫細胞上の主要なHLA-G受容体である(Colonna et al.,1997,1998)、阻害性受容体ILT2(単球、DC、B細胞、並びにナチュラルキラー細胞及びT細胞のサブセット上に発現する)及びILT4(骨髄単球系統の細胞によって排他的に発現する)、非阻害性受容体CD8及びCD160、並びにKIR2DL4受容体(その状態はHLA-Gに関して曖昧なままである)が挙げられる。ILT2及びILT4は、MHCIのα3ドメイン及びβ2mを認識し結合する。
HLA-Gについて記載された機能のうちのほとんどは免疫機能であるが、血管新生及び骨形成の阻害などの非免疫機能も報告されている。HLA-G-ILT2相互作用は、NK細胞機能を阻害し、したがってNK媒介性細胞溶解からHLA-G発現細胞を保護することが繰り返し示された。更に、ILT-2発現T細胞(活性化及び/又はクローンT細胞)及びB細胞の機能は、HLA-Gによって直接阻害される。HLA-Gはまた、骨髄性APCにおける代替分化を誘導し、調節性骨髄性細胞及び調節性T細胞の分化を誘導し、好中球の貪食機能を阻害する。
NK媒介性細胞溶解、T細胞増殖、及び調節性/抑制性細胞の誘導に必要とされるシグナル伝達経路を阻害し、それによって免疫系を回避するHLA-Gのこの免疫抑制能力は、腫瘍細胞によって活用されて、免疫監視を逃れ、より高い侵襲能力及び転移能力で細胞の制御されない増殖をもたらし得る。HLA-Gは、宿主免疫監視を回避することが可能であるだけでなく、悪性腫瘍の進行中に転移を増強する。無数の研究が、疾患ステージ又は患者転帰の悪化と相関し得る、腫瘍によるHLA-G発現(正常な周囲領域には存在しない)を実証している。HLA-G発現は、腫瘍の進化及び進行、並びに進行した腫瘍ステージ、より高い侵襲能力及び転移能力、並びに不良な臨床予後を暗示している。その異常発現は、生存時間の減少と関連していた。
様々ながんが、HLA-Gの発現を示すが、正常組織における発現は、主に絨毛外栄養膜細胞層上の胎児-母体界面、胎盤、羊膜、並びに胸腺、角膜、気管支上皮細胞、膵臓などの特定の健康な成人組織、並びに間葉系幹細胞、活性化単球、赤血球及び内皮前駆体などの特定のタイプの細胞に限定される(Carosella et al.,2015に概説されている)。
正常組織におけるその強力かつ広範な免疫抑制機能の役割及び制限された発現パターンを考慮すると、HLA-Gは、HLA-Gを過剰発現する固形腫瘍及びB細胞悪性腫瘍における魅力的な治療標的として指定することができる。
生成されている数少ない特異的抗HLA-G抗体のうち、以下の利用可能な抗体(87G、MEM-G9、MEM-G11、G223)のみが天然細胞発現HLA-Gに結合する。これらの抗体によるリガンドILT-2及び/又はILT-4とのHLA-G相互作用の阻害の割合は、それぞれ高用量の抗体でさえ完全ではない。更に、特に87G抗体がインビトロで腫瘍殺傷を増強することが可能であることが記載されているが、インビボで抗体を投与することによってHLA-Gを遮断する有効性の報告は存在しない。
治療及び診断目的のための次世代HLA-G結合ドメインに対する必要性が存在する。
本発明は、HLA-Gとその同族受容体ILT-2及び/又はILT-4との間の結合を強力に遮断する、特異的抗HLA-Gモノクローナル抗体を提供する。生成された抗HLA-G抗体は、古典的MHCクラスI分子との交差反応性の非存在下で、組換え又は内因性HLA-Gタンパク質のいずれかに結合する。本発明の抗体は、HLA-Gに対する特異性、HLA-A、HLA-B、HLA-C、及びHLA-Eとの交差反応性がないこと、並びに/又はILT-2/4リガンドとのHLA-G相互作用の完全な遮断を実証する、本発明者らの知る限り最初のHLA-G特異的抗体である。加えて、本発明の抗体は、インビボ投与後に腫瘍成長阻害を実証した。
本発明はまた、HLA-Gと免疫抑制リガンドとの相互作用を遮断すること、又はFc若しくは二重特異性タンパク質媒介性の免疫細胞の動員のいずれかによって免疫系に関与することによって、表面上のHLA-Gの発現が上昇した腫瘍細胞を排除するための、そのような抗体、又はこれらの抗体に由来する可変ドメインを含むタンパク質の使用に関する。したがって、抗体は、患者において診断された状態が、患者におけるHLA-Gの誘導された発現を利用する場合、当該状態を治療又は緩和するのに好適である。
本開示は、ヒト白血球抗原G(HLA-G)に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
a)配列番号50の重鎖可変領域(heavy chain variable region、VH)の重鎖相補性決定領域(heavy chain complementarity determining region、HCDR)1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号51の軽鎖可変領域(light chain variable region、VL)の軽鎖相補性決定領域(light chain complementarity determining region、LCDR)1、LCDR2、及びLCDR3、又は
b)配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号53のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号55のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
d)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号57のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
e)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号59のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
f)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号61のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
g)配列番号62のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号63のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
h)配列番号64のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号65のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
i)配列番号66のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号67のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
j)配列番号68のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号69のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、単離タンパク質を提供する。
ある特定の実施形態では、単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
b)それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
c)それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
d)それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
e)それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
f)それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
g)それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
h)それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
i)それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
ある特定の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)2、Fv、Fab、F(ab’)2、Fd、dAb、又はVHHである。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Fabである。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、VHHである。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、scFvである。
他の実施形態では、scFvは、N末端からC末端に向かって、VH、第1のリンカー(L1)、及びVL(VH-L1-VL)、又はVL、L1、及びVH(VL-L1-VH)を含む。
ある特定の実施形態では、L1は、
a)約5~50個のアミノ酸、
b)約5~40個のアミノ酸、
c)約10~30個のアミノ酸、又は
d)約10~20個のアミノ酸を含む。
ある特定の実施形態では、L1は、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、L1は、配列番号8のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH、及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
b)配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
c)配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
d)配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
e)配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
f)配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
g)配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
h)配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
i)配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
j)配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、本開示のタンパク質は、半減期延長部分にコンジュゲートされる。
他の実施形態では、半減期延長部分は、免疫グロブリン(immunoglobulin、Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン、又はポリエチレングリコールである。
他の実施形態では、単離タンパク質は、単一特異性タンパク質である。
他の実施形態では、単離タンパク質は、多重特異性タンパク質である。
他の実施形態では、多重特異性タンパク質は、二重特異性タンパク質である。
他の実施形態では、多重特異性タンパク質は、三重特異性タンパク質である。
他の実施形態では、本開示の単離タンパク質は、免疫グロブリン(Ig)定常領域又はIg定常領域のその断片を更に含む。
他の実施形態では、Ig定常領域の断片は、Fc領域を含む。
他の実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH2ドメインを含む。
他の実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH3ドメインを含む。
他の実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。
他の実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部分、CH2ドメイン、及びCH3ドメインを含む。
他の実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン、及びCH3ドメインを含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端にコンジュゲートされる。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端にコンジュゲートされる。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートされる。
他の実施形態では、L2は、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、多重特異性タンパク質は、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む。
他の実施形態では、リンパ球は、T細胞である。
他の実施形態では、T細胞は、CD8+T細胞である。
他の実施形態では、リンパ球は、ナチュラルキラー(natural killer、NK)細胞である。
他の実施形態において、多重特異性タンパク質は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む。
他の実施形態では、多重特異性タンパク質は、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む。
他の実施形態では、CD3εに結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号361の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号368のLCDR2、及び配列番号369のLCDR3、
b)配列番号339のVH及び配列番号340のVL、
c)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号370のLCDR3、
d)配列番号339のVH及び配列番号341のVL、
e)配列番号339のVH及び配列番号342のVL、
f)配列番号339のVH及び配列番号343のVL、
g)配列番号339のVH及び配列番号344のVL、
h)配列番号339のVH及び配列番号345のVL、
i)配列番号364のHCDR1、配列番号365のHCDR2、配列番号366のHCDR3、配列番号371のLCDR1、配列番号372のLCDR2、及び配列番号373のLCDR3、
j)配列番号346のVH及び配列番号347のVL、又は
k)配列番号348のVH及び配列番号349のVLを含む。
他の実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4アイソタイプである。
他の実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、タンパク質のFcγ受容体(Fcγreceptor、FcγR)への低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む。
他の実施形態では、タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異は、L235A/D265S、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S、及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
他の実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、タンパク質のFcγRへの増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む。
他の実施形態では、タンパク質のFcγRへの増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
他の実施形態では、FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、若しくはFcγRIII、又はそれらの任意の組み合わせである。
他の実施形態では、Ig定常領域の断片のIg定常領域は、タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異を含む。
他の実施形態では、タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A、及びH435Rからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
他の実施形態では、タンパク質は、Ig定常領域のCH3ドメインに少なくとも1つの変異を含む。
他の実施形態では、Ig定常領域のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V、及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
ある特定の実施形態では、本開示は、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインと、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、単離多重特異性タンパク質を提供する。
他の実施形態では、リンパ球抗原は、T細胞抗原である。
他の実施形態では、T細胞抗原は、CD8+T細胞抗原である。
他の実施形態では、リンパ球抗原は、NK細胞抗原である。
他の実施形態では、リンパ球抗原は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、又はNKG2Cである。
他の実施形態では、リンパ球抗原は、CD3εである。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)2、Fv、Fab、F(ab’)2、Fd、dAb、又はVHHを含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む。
他の実施形態では、scFvは、N末端からC末端に向かって、VH、第1のリンカー(L1)、及びVL(VH-L1-VL)、又はVL、L1、及びVH(VL-L1-VH)を含む。
他の実施形態では、L1は、
a)約5~50個のアミノ酸、
b)約5~40個のアミノ酸、
c)約10~30個のアミノ酸、又は
d)約10~20個のアミノ酸を含む。
他の実施形態では、L1は、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、L1は、配列番号8のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号70、73、75、78、81、又は85のHCDR1、配列番号71、76、79、82、又は86のHCDR2、配列番号72、74、77、80、83、84、又は87のHCDR3、配列番号88、91、93、95、97、99、101、又は102のLCDR1、配列番号89又は103のLCDR2、及び配列番号90、92、94、96、98、100、又は104のLCDR3を含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
b)それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
c)それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
d)それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
e)それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
f)それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
g)それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
h)それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
i)それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
b)配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
c)配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
d)配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
e)配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
f)配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
g)配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
h)配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
i)配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
j)配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH、及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
a)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号369のLCDR3、
b)配列番号339のVH及び配列番号340のVL、
c)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号370のLCDR3、
d)配列番号339のVH及び配列番号341のVL、
e)配列番号339のVH及び配列番号342のVL、
f)配列番号339のVH及び配列番号343のVL、
g)配列番号339のVH及び配列番号344のVL、
h)配列番号339のVH及び配列番号345のVL、
i)配列番号364のHCDR1、配列番号365のHCDR2、配列番号366のHCDR3、配列番号371のLCDR1、配列番号372のLCDR2、及び配列番号373のLCDR3、
j)配列番号346のVH及び配列番号347のVL、又は
k)配列番号348のVH及び配列番号349のVLを含む。
他の実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域若しくは第1のIg定常領域の断片にコンジュゲートされ、かつ/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域若しくは第2のIg定常領域の断片にコンジュゲートされる。
他の実施形態では、単離多重特異性タンパク質は、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインと第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間、及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に、第2のリンカー(L2)を更に含む。
他の実施形態では、L2は、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4アイソタイプである。
他の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多重特異性タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む。
他の実施形態では、多重特異性タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異は、L235A/D265S、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S、及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
他の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多重特異性タンパク質のFcγ受容体(FcγR)への増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む。
他の実施形態では、多重特異性タンパク質のFcγRへの増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
他の実施形態では、FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、若しくはFcγRIII、又はそれらの任意の組み合わせである。
他の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多重特異性タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異を含む。
他の実施形態では、多重特異性タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A、及びH435Rからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
他の実施形態では、第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインに少なくとも1つの変異、及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインに少なくとも1つの変異。
他の実施形態では、第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V、及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
他の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、以下の変異:
a)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V、及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W、又は
b)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W、及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407Vを含む。
ある特定の実施形態では、本開示は、治療剤又は造影剤にコンジュゲートされた本開示の単離タンパク質を含む、免疫コンジュゲートを提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離タンパク質をコードするポリヌクレオチドを提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む、ベクターを提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離タンパク質をコードするベクターを含む、宿主細胞を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離タンパク質を産生する方法であって、タンパク質を発現する条件で本開示の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されたタンパク質を収集することと、を含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、治療剤又は造影剤にコンジュゲートされた本開示の単離多重特異性タンパク質を含む、免疫コンジュゲートを提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離多重特異性タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、dosclosureの単離多重特異性タンパク質をコードするポリヌクレオチドを提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、dosclosureの単離多重特異性タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む、ベクターを提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、dosclosureの単離多重特異性タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含むベクターを含む、宿主細胞を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離多重特異性タンパク質を産生する方法であって、多重特異性タンパク質を発現する条件で宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生された多重特異性タンパク質を収集することと、を含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、対象におけるHLA-G発現がんを治療する方法であって、治療有効量の本開示の単離タンパク質、本開示の単離多重特異性タンパク質、本開示の免疫コンジュゲート、又は本開示の医薬組成物を、HLA-G発現がんを治療するのに十分な時間の間、対象に投与することを含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、対象におけるHLA-G発現腫瘍細胞の量を低減する方法であって、本開示の単離タンパク質、本開示の単離多重特異性タンパク質、本開示の免疫コンジュゲート、又は本開示の医薬組成物を、HLA-G発現腫瘍細胞の量を低減するのに十分な時間の間、対象に投与することを含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、対象におけるHLA-G発現がんの確立を予防する方法であって、本開示の単離タンパク質、本開示の単離多重特異性タンパク質、本開示の免疫コンジュゲート、又は本開示の医薬組成物を対象に投与して、対象におけるHLA-G発現がんの確立を予防することを含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、HLA-G発現がんを発症するリスクがある対象における非がん性状態を治療する方法であって、本開示の単離タンパク質、本開示の単離多重特異性タンパク質、本開示の免疫コンジュゲート、又は本開示の医薬組成物を対象に投与して、非がん性状態を治療することを含む、方法を提供する。
他の実施形態では、HLA-G発現がんは、肺がん、膵臓がん、腎がん、頭頸部がん、卵巣がん、食道がん、又は乳がんである。
他の実施形態では、単離タンパク質又は単離多重特異性タンパク質は、第2の治療剤と組み合わせて投与される。
他の実施形態では、第2の治療剤は、手術、化学療法、ホルモン受容体遮断療法、若しくは放射線、又はそれらの任意の組み合わせである。
ある特定の実施形態では、本開示は、対象における存在を検出する方法であって、がんを有することが疑われる対象に本開示の免疫コンジュゲートを投与することと、免疫コンジュゲートが結合している生物学的構造を可視化し、それによってがんの存在を検出することと、を含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離タンパク質、本開示の単離多重特異性タンパク質、本開示の免疫コンジュゲート、又は本開示の医薬組成物を含む、キットを提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、本開示の単離タンパク質に結合する抗イディオタイプ抗体を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、HLA-G上のエピトープに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、エピトープが、HHPVFDYE(配列番号485)のアミノ酸配列及びVPSを含む、不連続エピトープである、単離タンパク質を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号478又は479のアミノ酸配列を含む単離タンパク質を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号478のアミノ酸配列を含む単離タンパク質を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号479のアミノ酸配列を含む単離タンパク質を提供する。
ある特定の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号490のアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号489及び447のアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号439のアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号465及び468のアミノ酸配列を含む単離タンパク質を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号466及び469のアミノ酸配列を含む単離タンパク質を提供する。
ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号467及び470のアミノ酸配列を含む単離タンパク質を提供する。
前述は、以下の付属の図面に示される例示的実施形態のより詳細な説明から明らかとなるであろう。
scFvとしてフォーマットされた場合の熱処理後の組換えHLA-Gに結合するv領域の能力を示す。 水素-重水素交換ベースのLC-MSを使用した、HLA-G(配列番号1)上の選択された抗体のエピトープマッピングを示す。示される配列は、成熟HLA-Gの最初の残基から始まるアミノ酸残基番号付け(残基183~274が示される、配列番号497)を有する、配列番号1の断片である。 IgG1(MHGB665)又はIgG4(MHGB523)のいずれかに対して操作されたMHGB665由来の可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図3Aは、NKL細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB665)又はIgG4(MHGB523)のいずれかに対して操作されたMHGB665由来の可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図3Bは、NK-92細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB669)又はIgG4(MHGB526)のいずれかに対して操作されたMHGB669由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図4Aは、NKL細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB669)又はIgG4(MHGB526)のいずれかに対して操作されたMHGB669由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図4Bは、NK-92細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB688)又はIgG4(MHGB596)のいずれかに対して操作されたMHGB688由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図5Aは、NKL細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB688)又はIgG4(MHGB596)のいずれかに対して操作されたMHGB688由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図5Bは、NK-92細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB694)又はIgG4(MHGB616)のいずれかに対して操作されたMHGB694由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図6Aは、NKL細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB694)又はIgG4(MHGB616)のいずれかに対して操作されたMHGB694由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図6Bは、NK-92細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB687)又はIgG4(MHGB585)のいずれかに対して操作されたMHGB687由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図7Aは、NKL細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB687)又はIgG4(MHGB585)のいずれかに対して操作されたMHGB687由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図7Bは、NK-92細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB672)又はIgG4(MHGB508)のいずれかに対して操作されたMHGB672由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図8Aは、NKL細胞媒介性細胞傷害を示す。 IgG1(MHGB672)又はIgG4(MHGB508)のいずれかに対して操作されたMHGB672由来可変領域によるK562-HLA-G細胞のNK細胞媒介性細胞傷害の増強を示す。図8Bは、NK-92細胞媒介性細胞傷害を示す。 選択された抗体MHGB665(「B665」)、MHGB669(「B669」)、MHGB672(「B672」)、MHGB682(「B682」)、MHGB687(「B687」)、及びMHGB688(「B688」)によって媒介される、JEG-3細胞に対するADCC活性を示す。 選択された抗体のADCC活性を示す。 選択された抗体のADCC活性を示す。 選択された抗体のCDC活性を示す。 選択された抗体のCDC活性を示す。 初代ヒトT細胞へのハイブリドーマ上清の結合を示す。クローンUCHT1を陽性対照として使用し(11B)、マウスIgG1アイソタイプ(mouse IgG1 isotype、mIgG1)を陰性対照として使用した。 初代ヒトT細胞へのハイブリドーマ上清の結合を示す。クローンUCHT1を陽性対照として使用し(11B)、マウスIgG1アイソタイプ(mouse IgG1 isotype、mIgG1)を陰性対照として使用した。 E.coliで発現した抗CD3 scFvバリアントのCD3への結合を示す。 CD3B815(配列番号340)、CD3W244(配列番号341)、CD3W245(配列番号342)、CD3W246(配列番号343)、CD3W247(配列番号344)、及びCD3W248(配列番号345)のVL領域のアラインメントを示す。 ヒトCD3ε(CD3ε:CD3W245)に結合したCD3W245の複合体又はヒトCD3ε(CD3ε:OKT3)に結合したOKT3の複合体について測定された、水素-重水素交換質量分析(hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry、HDX-MS)を使用して決定された水素-重水素交換速度を示す(配列番号375の断片である配列番号484が示されている)。一重下線は、CD3ε単独と比較して、抗体の存在下で10%~30%の重水素化レベルの減少を有するセグメントを示し、二重下線は、>30%の重水素化レベル減少を有するセグメントを示す。 HLA-G発現腫瘍細胞HUP-T3に対するHC3B125の細胞傷害、及びT細胞活性化%を示す。 HLA-G発現腫瘍細胞HUP-T3に対するHC3B125の細胞傷害、及びT細胞活性化%を示す。 HLA-G発現腫瘍細胞RERF-LC-Ad-1に対するHC3B125の細胞傷害、及びT細胞活性化%を示す。 HLA-G発現腫瘍細胞RERF-LC-Ad-1に対するHC3B125の細胞傷害、及びT細胞活性化%を示す。 RERF-LC-Ad-1細胞に対するHC3B258及びHC3B125の細胞傷害を示し、エフェクター(T細胞):標的(RERF-LC-Ad1)比は、示されるように、1:3、1:1、又は3:1であった。 対照(HLA-G×ヌル)又はHCB125のいずれかで処置したCD34細胞ヒト化NSG-SGM3マウスにおける確立された膵臓PDXの27日目の群平均腫瘍体積(17A)及び個々の腫瘍体積を示す。 対照(HLA-G×ヌル)又はHCB125のいずれかで処置したCD34細胞ヒト化NSG-SGM3マウスにおける確立された膵臓PDXの27日目の群平均腫瘍体積(17A)及び個々の腫瘍体積を示す。 対照(CD3×ヌル)又はHCB125のいずれかで処置したT細胞ヒト化NSGマウスにおける確立されたHup-T3異種移植片の群平均腫瘍体積を示す。
本開示の方法は、本開示の一部を形成する、添付の図面に関連してなされる以下の詳細な説明を参照することにより、より容易に理解することができる。本開示の方法は、本明細書に記載及び/又は示される特定の方法に限定されないこと、更に、本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を例によって説明することのみを目的とし、請求項に記載の方法に限定することを意図しないことを理解されたい。
本明細書に引用する全ての特許、公開された特許出願及び刊行物は、参照によってあたかもその全体が本明細書に記載されているように組み込まれる。
リストが提示される場合、特に指定されない限り、そのリストの各個々の要素及びそのリストの全ての組み合わせは別個の実施形態であることを、理解されたい。例えば、「A、B、又はC」として提示される実施形態のリストは、実施形態「A」、「B」、「C」、「A又はB」、「A又はC」、「B又はC」、又は「A、B、又はC」を含むと解釈されるべきである。
本明細書及び添付の「特許請求の範囲」において使用される場合、「a」、「an」、及び「the」という単数形は、その内容について特に明確に指示されない限り、複数の指示対象を含む。したがって、例えば、「細胞(a cell)」という言及には、2つ又は3つ以上の細胞の組み合わせなどが含まれる。
「備える/含む(comprising)」、「から本質的になる(consisting essentially of)」、及び「からなる(consisting)」という移行句は、特許用語において概ね受け入れられている意味を含意することを意図しており、すなわち、(i)「備える/含む(comprising)」は、「含む」、「含有する」、又は「特徴とする」と同義であり、包括的又は非制限的なものであり、その他の列挙されていない要素又は方法工程を除外するものではなく、(ii)「からなる(consisting of)」は、特許請求の範囲において特定されていない、あらゆる要素、工程、又は成分を除外し、並びに(iii)「から本質的になる」は、特定される材料又は工程、並びに、特許請求される発明の「基本的かつ新しい特徴に実質的に影響しないもの」に、特許請求の範囲を制限する。「備える/含む」という語句(又はその同等語)を伴って記載される実施形態はまた、「からなる」及び「から本質的になる」を伴って独立して記載される実施形態として提供する。
「約」は、当業者によって求められた特定の値について許容される誤差範囲内であることを意味し、これは、その値が測定又は決定される方法、すなわち、測定システムの制限事項にある程度依存する。特定のアッセイ、結果、又は実施形態の文脈において、実施例又は明細書の他の箇所に別途明示的に記載されない限り、「約」は、当該技術分野の実施につき1つの標準偏差、又は5%までの範囲のうちのいずれか大きい方の範囲内であることを意味する。
「活性化」又は「刺激」又は「活性化された」又は「刺激された」は、活性化マーカーの発現、サイトカイン産生、増殖、又は標的細胞の細胞傷害の媒介をもたらす、細胞の生物学的状態の変化の誘導を指す。細胞は、一次刺激シグナルによって活性化され得る。共刺激シグナルは、一次シグナルの大きさを増幅し、初期刺激後の細胞死を抑制することができ、その結果、より耐久性のある活性化状態、ひいてはより高い細胞傷害能をもたらす。「共刺激シグナル」は、TCR/CD3ライゲーションなどの一次シグナルと組み合わせて、T細胞及び/若しくはNK細胞の増殖、並びに/又は鍵となる分子の上方制御若しくは下方制御を引き起こすシグナルを指す。
「オルタナティブスカフォールド」は、立体配座許容度が高い可変ドメインに会合する構造化コアを含有する、単鎖タンパク質フレームワークを指す。可変ドメインは、スカフォールドの完全性を損なうことなく導入される多型を許容するため、可変ドメインは、特異的抗原に結合するように遺伝子操作及び選択され得る。
「抗体依存性細胞傷害」、「抗体依存性細胞介在性細胞傷害」、又は「antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity、ADCC」は、抗体でコーティングされた標的細胞と、ナチュラルキラー細胞(NK)、単球、マクロファージ、及び好中球などの溶解活性を有するエフェクター細胞との、エフェクター細胞上で発現するFcガンマ受容体(FcγR)を介した相互作用に依存する細胞死を誘導する機序を指す。
「抗体依存性細胞貪食作用」又は「Antibody-dependent cellular phagocytosis、ADCP」は、マクロファージ、又は樹状細胞などの貪食細胞による内在化によって、抗体でコーティングされた標的細胞を排除する機序を指す。
「抗原」は、免疫応答を媒介することができる抗原結合ドメイン又はT細胞受容体が結合することができる任意の分子(例えば、タンパク質、ペプチド、多糖類、糖タンパク質、糖脂質、核酸、それらの一部分、又はそれらの組み合わせ)を指す。例示的な免疫応答には、抗体産生、及びT細胞、B細胞又はNK細胞などの免疫細胞の活性化が含まれる。抗原は、組織サンプル、腫瘍サンプル、細胞、又は他の生物学的成分を有する流体、生物、タンパク質/抗原のサブユニット、殺傷若しくは不活性化された全細胞又は溶解物などの生体サンプルからの遺伝子によって発現し得る、当該サンプルから合成され得る、又は当該サンプルから精製され得る。
「抗原結合断片」又は「抗原結合ドメイン」は、抗原に結合するタンパク質の一部分を指す。抗原結合断片は、合成ポリペプチド、酵素的に入手可能なポリペプチド、又は遺伝的に操作されたポリペプチドであってよく、これには、抗原に結合する免疫グロブリンの一部、例えば、VH、VL、VH及びVL、Fab、Fab’、F(ab’)、Fd及びFv断片、1つのVHドメイン又は1つのVLドメインからなるドメイン抗体(dAb)、サメ可変IgNARドメイン、ラクダ化VHドメイン、VHHドメイン、FR3-CDR3-FR4部分などの抗体のCDRを模倣するアミノ酸残基からなる最小認識ユニット、HCDR1、HCDR2、及び/又はHCDR3、並びにLCDR1、LCDR2、及び/又はLCDR3、抗原に結合するオルタナティブスカフォールド、並びに抗原結合断片を含む多重特異性タンパク質が挙げられる。抗原結合断片(VH及びVLなど)は、合成リンカーを介して互いに連結して、VH及びVLドメインが別々の一本鎖により発現された場合にVH/VLドメインが分子内又は分子間で対合して一価の抗原結合ドメイン、例えば一本鎖Fv(single chain Fv、scFv)又はダイアボディを形成することができる、様々な種類の一本鎖抗体設計を形成することができる。抗原結合断片はまた、二重特異性及び多重特異性タンパク質を遺伝子操作するために、単一特異性又は多重特異性であり得る他の抗体、タンパク質、抗原結合断片、又はオルタナティブスカフォールドにコンジュゲートされてもよい。
「抗体」は、広義の意味を有し、マウス、ヒト、ヒト化、及びキメラモノクローナル抗体を含むモノクローナル抗体、抗原結合断片、二重特異性、三重特異性、四重特異性などの多重特異性抗体、二量体、四量体、又は多量体抗体、一本鎖抗体、ドメイン抗体、及び必要とされる特異性の抗原結合部位を含む免疫グロブリン分子の任意の他の修飾された形態を含む免疫グロブリン分子を含む。「完全長抗体」は、ジスルフィド結合により相互接続された、2本の重鎖(heavy chain、HC)及び2本の軽鎖(light chain、LC)、並びにそれらの多量体(例えばIgM)から構成される。各重鎖は、重鎖可変領域(VH)、並びに重鎖定常領域(ドメインCH1、ヒンジ、CH2、及びCH3からなる)から構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(VL)及び軽鎖定常領域(CL)から構成される。VH領域及びVL領域は、フレームワーク領域(framework region、FR)が散在しており相補性決定領域(complementarity determining region、CDR)と称される超可変領域に更に分類され得る。各VH及びVLは、アミノ末端からカルボキシ末端に向かって以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、及びFR4で配置された、3つのCDR及び4つのFRセグメントで構成される。免疫グロブリンは、重鎖定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、5つの主要なクラス、すなわちIgA、IgD、IgE、IgG、及びIgMに割り当てられ得る。IgA及びIgGは、アイソタイプのIgA1、IgA2、IgG1、IgG2、IgG3及びIgG4として更に細分類される。どのような脊椎動物種の抗体軽鎖も、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、2つの明確に異なるタイプ、すなわち、カッパ(κ)及びラムダ(λ)のうちの一方に割り当てられ得る。
「二重特異性」は、同じ抗原内の2つの異なる抗原、又は2つの異なるエピトープに特異的に結合する分子(抗体など)を指す。二重特異性分子は、他の関連抗原、例えば、ヒト又はサル、例えば、カニクイザル(Macaca cynomolgus)(cynomolgus、cyno)又はチンパンジー(Pan troglodytes)などの他の種由来の同じ抗原(ホモログ)に対して交差反応性を有する場合もあり、2つ又は3つ以上の異なる抗原間で共有されているエピトープに結合する場合もある。
「がん」は、身体における異常細胞の制御されていない成長を特徴とする様々な疾患の広範な群を指す。制御されていない細胞分裂及び成長は、隣接組織を浸潤する悪性腫瘍の形成をもたらし、リンパ系又は血流を介して身体の遠位部分にも転移し得る。「がん」又は「がん組織」は、腫瘍を含み得る。
「補体依存性細胞傷害」又は「Complement-dependent cytotoxicity、CDC」は、標的に結合したタンパク質のFcエフェクタードメインが補体成分C1qに結合し、これを活性化し、次に、補体カスケードを活性化して標的細胞死をもたらす、細胞死を誘導する機序を指す。補体の活性化はまた、標的細胞表面に対する補体成分の沈着をもたらし得、白血球への補体受容体(例えば、CR3)の結合によって、CDCを容易にする
「相補性決定領域」(CDR)は、抗原に結合する抗体の領域である。VHには3つのCDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3)が存在し、VLには3つのCDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)が存在する。CDRは、Kabat(Wu et al.(1970)J Exp Med 132:211-50、Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.,1991)、Chothia(Chothia et al.(1987)J Mol Biol 196:901-17)、IMGT(Lefranc et al.(2003)Dev Comp Immunol 27:55-77)、及びAbM(Martin and Thornton J Bmol Biol 263:800-15,1996)などの様々な描写を用いて定義することができる。様々な描写と、可変領域の付番との対応が記載されている(例えば、Lefranc et al.(2003)Dev Comp Immunol 27:55-77、Honegger and Pluckthun,J Mol Biol(2001)309:657-70、International ImMunoGeneTics(IMGT)データベース、ウェブリソース、http://www_imgt_orgを参照されたい)。UCL Business PLCによるabYsisなどの利用可能なプログラムを使用して、CDRを描写することができる。本明細書で使用される場合、「CDR」、「HCDR1」、「HCDR2」、「HCDR3」、「LCDR1」、「LCDR2」、及び「LCDR3」という用語は、明細書に別途明示的に記載されない限り、上述したKabat、Chothia、IMGT、又はAbMの方法のいずれかにより定義されるCDRを含む。
「減少する」、「低下する」、「低くする」、「低減する」、又は「軽減する」は、一般に、対照又はビヒクルによって媒介される応答と比較した場合に、試験分子が低減された応答(すなわち、下流効果)を媒介する能力を指す。例示的な応答は、T細胞拡大、T細胞活性化、又はT細胞媒介性腫瘍細胞殺傷、又はタンパク質のその抗原若しくは受容体への結合、増強されたFcγへの結合、又は増強されたADCC、CDC及び/若しくはADCPなどの増強されたFcエフェクター機能である。減少は、試験分子と対照(又はビヒクル)との間の測定された応答の統計的に有意な差、又は約1.1、1.2、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、若しくは30倍、若しくはそれ以上、例えば、500、600、700、800、900、若しくは1000倍、若しくはそれ以上(1を上回る全ての整数及びその間の小数点、例えば、1.5、1.6、1.7.1.8等を含む)の減少などの、測定された応答の減少であってもよい。
「分化」は、細胞の能力若しくは増殖を減少させるか、又は細胞をより発達的に制限された状態に移動させる方法を指す。
「コードする」又は「コードすること」は、定義されたヌクレオチドの配列(例えば、rRNA、tRNA、及びmRNA)か、又は定義されたアミノ酸の配列のいずれかを有する、生物学的プロセスにおける他のポリマー及び巨大分子の合成のためのテンプレートとして機能する、遺伝子、cDNA、又はmRNAなどのポリヌクレオチド中のヌクレオチドの特異性配列の固有の特性、並びにそれから生じる生物学的特性を指す。したがって、細胞又は他の生物系において、遺伝子に対応するmRNAの転写及び翻訳がタンパク質を産生する場合、その遺伝子、cDNA、又はRNAは、タンパク質をコードする。ヌクレオチド配列がmRNA配列と同一であるコード鎖と、遺伝子又はcDNAの転写のテンプレートとして使用される非コード鎖とはいずれも、その遺伝子又はcDNAのタンパク質又は他の産物をコードするとして言及され得る。
「増強する」、「促進する」、「増加させる」、「拡大する」、又は「改善する」は、一般に、対照又はビヒクルによって媒介される応答と比較した場合に、より大きな応答(すなわち、下流効果)を媒介する試験分子の能力を指す。例示的な応答は、T細胞拡大、T細胞活性化、又はT細胞媒介性腫瘍細胞殺傷、又はタンパク質のその抗原若しくは受容体への結合、増強されたFcγへの結合、又は増強されたADCC、CDC及び/若しくはADCPなどの増強されたFcエフェクター機能である。増強は、試験分子と対照(又はビヒクル)との間の測定された応答の統計的に有意な差、又は約1.1、1.2、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、若しくは30倍、若しくはそれ以上、例えば、500、600、700、800、900、若しくは1000倍、若しくはそれ以上(1を上回る全ての整数及びその間の小数点、例えば、1.5、1.6、1.7.1.8等を含む)の増加などの、測定された応答の増加であってもよい。
「拡大」は、細胞分裂及び細胞死の結果を指す。
「発現する」及び「発現」は、細胞内又はインビトロで起こる周知の転写及び翻訳を指す。したがって、発現産物、例えば、タンパク質は、細胞によって又はインビトロで発現し、細胞内、細胞外、又は膜貫通タンパク質であってもよい。
「発現ベクター」は、発現ベクター中に存在するポリヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドの翻訳を指示するために、生物系又は再構成された生物系で利用することができるベクターを指す。
「dAb」又は「dAb断片」は、VHドメインで構成される抗体断片を指す(Ward et al.,Nature 341:544 546(1989))。
「Fab」又は「Fab断片」は、VH、CH1、VL、及びCLドメインで構成される抗体断片を指す。
「F(ab’)」又は「F(ab’)断片」は、ヒンジ領域内のジスルフィド架橋によって接続された2つのFab断片を含む抗体断片を指す。
「Fd」又は「Fd断片」は、VH及びCH1ドメインで構成される抗体断片を指す。
「Fv」又は「Fv断片」は、抗体の単一のアーム由来のVHドメイン及びVLドメインで構成される抗体断片を指す。
「完全長抗体」は、ジスルフィド結合によって相互に接続された、2本の重鎖(HC)及び2本の軽鎖(LC)、並びにそれらの多量体(例えば、IgM)で構成される。各重鎖は、重鎖可変ドメイン(VH)及び重鎖定常ドメインで構成され、重鎖定常ドメインは、サブドメインCH1、ヒンジ、CH2及びCH3で構成される。各軽鎖は、軽鎖可変ドメイン(VL)及び軽鎖定常ドメイン(CL)で構成される。VH及びVLは、フレームワーク領域(FR)が散在している、相補性決定領域(CDR)と称される超可変性の領域に更に細分化され得る。各VH及びVLは、アミノ末端からカルボキシ末端に向かって以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、及びFR4で配置された、3つのCDR及び4つのFRセグメントで構成される。
「遺伝子修飾」は、宿主細胞が、導入された遺伝子又は配列を発現して、所望の物質、典型的には、導入された遺伝子又は配列によってコードされるタンパク質又は酵素を産生するように、「外来」(すなわち、外因性又は細胞外)遺伝子、DNA又はRNA配列を宿主細胞に導入することを指す。導入された遺伝子又は配列はまた、「クローニングされた」又は「外来」遺伝子又は配列と呼ばれる場合もあり、開始、終止、プロモータ、シグナル、分泌、又は細胞の遺伝機序によって使用される他の配列などのキメラ抗原受容体をコードするポリヌクレオチドに操作可能に連結した調節配列又は制御配列を含んでいてよい。遺伝子又は配列は、既知の機能を有さない非機能的配列を含んでいてよい。導入されたDNA又はRNAを受け取って発現する宿主細胞は、「遺伝的に操作されている」。宿主細胞に導入されたDNA又はRNAは、宿主細胞と同じ属若しくは種の細胞を含む任意の起源、又は異なる属若しくは種に由来し得る。
「異種」は、自然界では互いに対して同じ関係で見られない、2つ又は3つ以上のポリヌクレオチド又は2つ又は3つ以上のポリペプチドを指す。
「異種ポリヌクレオチド」は、本明細書に記載される2つ又は3つ以上のネオ抗原をコードする、天然には存在しないポリヌクレオチドを指す。
「異種ポリペプチド」は、本明細書に記載される2つ又は3つ以上のネオ抗原ポリペプチドを含む、天然には存在しないポリペプチドを指す。
「宿主細胞」は、異種核酸を含有する任意の細胞を指す。例示的な異種核酸は、ベクター(例えば、発現ベクター)である。
「ヒト抗体」は、ヒト対象に投与されたときに免疫応答が最小限になるように最適化された抗体を指す。ヒト抗体の可変領域は、ヒト免疫グロブリン配列に由来する。ヒト抗体が定常領域又は定常領域の一部を含む場合、その定常領域もヒト免疫グロブリン配列に由来する。ヒト抗体は、ヒト抗体の可変領域がヒト生殖系列免疫グロブリン又は再編成された免疫グロブリン遺伝子を使用する系から得られた場合、ヒト起源の配列に「由来する」重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。このような例示的な系は、ファージにディスプレイされたヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリ、及びヒト免疫グロブリン遺伝子座を保有するトランスジェニック非ヒト動物、例えばマウス又はラットを含む。「ヒト抗体」は、典型的には、ヒト抗体及びヒト免疫グロブリン遺伝子座を得るために使用した系の違い、フレームワーク若しくはCDRへの体細胞変異の導入若しくは置換の意図的な導入、又はそれらの両方により、ヒトで発現した免疫グロブリンと比較したときにアミノ酸の違いを含有する。典型的には、「ヒト抗体」は、ヒト生殖系列免疫グロブリン又は再編成された免疫グロブリン遺伝子によってコードされているアミノ酸配列に対して、アミノ酸配列が少なくとも約80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%同一である。場合によっては、「ヒト抗体」は、例えばKnappik et al.,(2000)J Mol Biol 296:57-86に記載されるヒトフレームワーク配列分析に由来するコンセンサスフレームワーク配列、又は例えばShi et al.,(2010)J Mol Biol 397:385-96及び国際公開第2009/085462号に記載される、ファージ上に提示されたヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリに組み込まれた合成HCDR3を含有し得る。少なくとも1つのCDRが非ヒト種に由来する抗体は、「ヒト抗体」の定義には含まれない。
「ヒト化抗体」は、少なくとも1つのCDRが非ヒト種に由来し、少なくとも1つのフレームワークがヒト免疫グロブリン配列に由来する抗体を指す。ヒト化抗体は、フレームワークに置換を含むことができるため、フレームワークは、発現したヒト免疫グロブリン又はヒト免疫グロブリン生殖細胞系列遺伝子配列の厳密なコピーではない場合がある。
「~と組み合わせて」は、2つ又は3つ以上の治療剤を、混合物の状態で一緒に、単剤として同時に、又は単剤として任意の順序で順次、対象に投与することを意味する。
「単離された」は、組換え細胞などにおいて分子が産生される系の他の成分から離して実質的に分離及び/又は精製された分子の均質な集団(例えば、合成ポリヌクレオチド又はポリペプチド)に加えて、少なくとも1つの精製又は単離工程に供されたタンパク質を指す。「単離/単離された」は、他の細胞材料及び/又は化学物質を実質的に含まない分子を指し、より高い純度、例えば80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の純度まで単離された分子を包含する。
「ヒト白血球抗原G」又は「HLA-G」は、「HLAクラスI組織適合抗原、アルファ鎖G」又は「MHCクラスI抗原G」とも称される、既知のタンパク質を指す。全てのHLA-Gアイソフォーム及びバリアントは、「HLA-G」に包含される。様々なアイソフォームのアミノ酸配列は、Uniprot ID番号P17693-1~P17693-7から検索可能であり、表1に示される。
「調節する」は、対照又はビヒクルによって媒介される応答と比較したときに、より多い又はより少ない応答を媒介する(すなわち、下流効果)試験分子の増強された又は低減された能力のいずれかを指す。
「モノクローナル抗体」は、抗体重鎖からC末端リジンを除去する、又はアミノ酸の異性化若しくは脱アミド、メチオニンの酸化、又はアスパラギン若しくはグルタミンの脱アミドなどの翻訳後修飾といった、可能な周知の変更を除いて同一である、抗体分子の実質的に均質な母集団から得られた抗体、すなわち、集団を構成する個別の抗体を意味する。モノクローナル抗体は、典型的には、1つの抗原性エピトープに結合する。二重特異性モノクローナル抗体は、2つの異なる抗原性エピトープに結合する。モノクローナル抗体は、抗体集団内で不均一なグリコシル化を有し得る。モノクローナル抗体は、単一特異性であってよく、又は、二重特異性などの多重特異性であってよく、一価、二価、又は多価であってもよい。
「多重特異性」は、2つ又は3つ以上の異なる抗原、又は同じ抗原内の2つ又は3つ以上の異なるエピトープに特異的に結合する、抗体などの分子を指す。多重特異性分子は、他の関連抗原、例えば、ヒト又はサル、例えば、カニクイザル(Macaca fascicularis)(cynomolgus、cyno)又はチンパンジー(Pan troglodytes)などの他の種由来の同じ抗原(ホモログ)に対して交差反応性を有する場合もあり、2つ又は3つ以上の異なる抗原間で共有されているエピトープに結合する場合もある。
「ナチュラルキラー細胞」及び「NK細胞」は、本明細書では互換的かつ同義的に使用される。本明細書で使用するとき、NK細胞は、CD16CD56及び/又はCD57TCR表現型を有する分化リンパ球を指す。NK細胞は、特定の細胞溶解性酵素の活性化によって「自己」MHC/HLA抗原を発現できない細胞に結合し、殺傷する能力、腫瘍細胞又はNK活性化受容体のリガンドを発現する他の疾患細胞を殺傷する能力、及び免疫応答を刺激又は阻害するサイトカインと呼ばれるタンパク質分子を放出する能力を特徴とする。
「動作可能に連結された」及び類似の語句は、核酸又はアミノ酸に関して使用される場合、それぞれ、互いに機能的な関係で配置された核酸配列又はアミノ酸配列の動作上の連結を指す。例えば、動作可能に連結されたプロモータ、エンハンサエレメント、オープンリーディングフレーム、5’及び3’UTR、並びにターミネータ配列は、核酸分子(例えば、RNA)の正確な産生をもたらし、場合によっては、ポリペプチドの産生(すなわち、オープンリーディングフレームの発現)をもたらす。動作可能に連結されたペプチドは、ペプチドの機能ドメインが互いに適切な距離で配置されて、各ドメインの意図された機能を付与するペプチドを指す。
「医薬的組み合わせ」は、一緒に又は別々に投与される2つ又は3つ以上の活性成分の組み合わせを指す。
「医薬組成物」は、活性成分と医薬的に許容される担体とを組み合わせて得られる組成物を指す。
「医薬的に許容される担体」又は「賦形剤」は、対象に対して毒性のない、活性成分以外の医薬組成物中の成分を指す。例示的な医薬的に許容される担体は、バッファ、安定剤、又は防腐剤である。
「ポリヌクレオチド」又は「核酸」は、糖-リン酸骨格又は他の同等の共有結合化学によって共有結合されたヌクレオチド鎖を含む、合成分子を指す。cDNAは、ポリヌクレオチドの典型例である。ポリヌクレオチドは、DNA又はRNA分子であり得る。
疾患又は障害を「予防する」、「予防すること」、「予防」、又は「予防法」は、対象において障害が発生するのを防ぐことを意味する。
「増殖」は、細胞の対称的又は非対称的な分裂のいずれかである細胞分裂の増加を指す。
「プロモータ」は、転写を開始させるために必要な最小配列を指す。プロモータはまた、それぞれ転写を増強又は抑制するエンハンサ又はリプレッサエレメントを含み得る。
本明細書では互換的に使用される「タンパク質」又は「ポリペプチド」は、各々がペプチド結合によって連結された少なくとも2つのアミノ酸残基で構成されている1つ又は2つ以上のポリペプチドを含む分子を指す。タンパク質は、モノマーであってもよく、又は同一若しくは異なる2つ若しくは3つ以上のサブユニットのタンパク質複合体であってもよい。50個未満のアミノ酸からなる小分子ポリペプチドは、「ペプチド」と称され得る。タンパク質は、異種融合タンパク質、糖タンパク質、又はリン酸化、アセチル化、ミリストイル化、パルミトイル化、グリコシル化、酸化、ホルミル化、アミド化、シトルリン化、ポリグルタミル化、ADP-リボシル化、ペグ化又はビオチン化などの翻訳後改変によって修飾されたタンパク質であり得る。タンパク質は、組換え発現し得る。
「組換え体」は、組換え手段によって調製、発現、創出、又は単離されたポリヌクレオチド、ポリペプチド、ベクター、ウイルス、及び他の巨大分子を指す。
「調節エレメント」は、核酸配列の発現のある側面を制御する任意のシス又はトランス作用性遺伝要素を指す。
「再発性」は、治療薬による以前の治療の後の改善期間後に疾患又は疾患の徴候及び症状が再開することを指す。
「難治性」は、治療に応答しない疾患を指す。難治性疾患は、治療前若しくは治療開始時に治療に抵抗性であり得るか、又は難治性疾患は、治療中に抵抗性疾患となり得る。
「一本鎖Fv」又は「scFv」は、軽鎖可変領域(VL)を含む少なくとも1つの抗体断片と、重鎖可変領域(VH)を含む少なくとも1つの抗体断片と、を含む融合タンパク質を指し、VL及びVHは、ポリペプチドリンカーを介して連続的に連結され、一本鎖ポリペプチドとして発現することができる。特に指定されない限り、本明細書で使用される場合、scFvは、VL及びVH可変領域をいずれの順序で有していてもよく、例えば、ポリペプチドのN末端及びC末端に関して、scFvは、VL-リンカー-VHを含んでいてもよく、又はVH-リンカー-VLを含んでいてもよい。
「特異的に結合する」、「特異的結合」、「特異的に結合している」、又は「結合する」は、タンパク質性分子が、抗原又は抗原内のエピトープに、他の抗原に対する親和性よりも高い親和性で結合することを指す。典型的には、タンパク質性分子は、約1×10-7M以下、例えば約5×10-8M以下、約1×10-8M以下、約1×10-9M以下、約1×10-10M以下、約1×10-11M以下、又は約1×10-12M以下の平衡解離定数(K)で抗原又は抗原内のエピトープに結合し、典型的には、Kは、非特異的抗原(例えば、BSA、カゼイン)への結合についてのKよりも少なくとも100倍小さい。本明細書に記載の前立腺ネオ抗原の文脈において、「特異的結合」は、タンパク質性分子が、前立腺ネオ抗原がそのバリアントである野生型タンパク質に検出可能には結合することなく、前立腺ネオ抗原に結合することを指す。
「対象」は、任意のヒト又は非ヒト動物を含む。「非ヒト動物」としては、あらゆる脊椎動物、例えば、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ニワトリ、両生類、爬虫類などの哺乳類及び非哺乳類が挙げられる。「対象」及び「患者」という用語は、本明細書において互換的に使用され得る。
「T細胞」及び「Tリンパ球」は、互換的であり、本明細書では同義的に使用される。T細胞には、胸腺細胞、ナイーブTリンパ球、メモリT細胞、未成熟Tリンパ球、成熟Tリンパ球、静止Tリンパ球、又は活性化Tリンパ球が含まれる。T細胞は、Tヘルパー(T helper、Th)細胞、例えば、Tヘルパー1(Th1)又はTヘルパー2(Th2)細胞であり得る。T細胞は、ヘルパーT細胞(HTL、CD4T細胞)、CD4T細胞、細胞傷害性T細胞(CTL、CD8T細胞)、腫瘍浸潤細胞傷害性T細胞(TIL、CD8T細胞)、CD4CD8T細胞、又はT細胞の任意の他のサブセットであり得る。また、「NKT細胞」も含まれ、これは、半不変αβT細胞受容体を発現するだけでなく、NK1.1などの典型的にはNK細胞に関連する様々な分子マーカーも発現する、T細胞の特殊な集団を指す。NKT細胞には、NK1.1及びNK1.1、並びにCD4、CD4、CD8、及びCD8細胞が含まれる。NKT細胞のTCRは、MHC I様分子CD Idによって提示される糖脂質抗原を認識するという点で独特である。NKT細胞は、炎症又は免疫寛容のいずれかを促進するサイトカインを産生する能力により、保護効果又は有害効果のいずれかを有し得る。また、「ガンマデルタT細胞(γδT細胞)」も含まれ、これは、それらの表面に異なるTCRを有するT細胞の小さなサブセットの特殊な集団を指し、TCRがα及びβ-TCR鎖と表記される2つの糖タンパク質鎖から構成されるT細胞の大部分とは異なり、γδT細胞におけるTCRは、γ鎖及びδ鎖から構成される。γδT細胞は、免疫監視及び免疫調節において役割を果たすことができ、IL-17の重要な供給源であること、及び強力なCD8細胞傷害性T細胞応答を誘導することが見出された。また、「調節性T細胞」又は「Treg」も含まれ、これは、異常又は過剰な免疫応答を抑制し、免疫寛容における役割を果たす、T細胞を指す。Tregは、典型的には、転写因子Foxp3陽性CD4T細胞であり、かつ、IL-10産生CD4T細胞である転写因子Foxp3陰性調節性T細胞も含み得る。
本明細書において互換的に使用される「治療有効量」又は「有効量」は、所望の治療結果を達成するのに必要な投薬量及び期間で有効な量を指す。治療有効量は、個体の病態、年齢、性別、及び体重などの要因、並びに個体において所望の応答を引き出す治療薬又は治療薬の組み合わせの能力によって様々であってよい。有効な治療剤又は治療剤の組み合わせの例示的な指標としては、例えば、患者の健康状態の改善、腫瘍量の低減、腫瘍の増殖の停止若しくは鈍化、及び/又は体内の他の場所へのがん細胞の転移の非存在が含まれる。
「形質導入」は、ウイルスベクターを使用する、外来核酸の細胞への導入を指す。
がんなどの疾患又は障害を「治療する」、「治療している」、又は「治療」は、以下のうちの1つ又は2つ以上を達成することを指す:障害の重症度及び/若しくは期間を低減する、治療される障害の特徴的な症状の悪化を阻害する、以前障害を有していた対象における障害の再発を制限若しくは予防する、又は以前に障害の症状を有していた対象における症状の再発を制限若しくは予防する。
「腫瘍細胞」又は「がん細胞」は、インビボ、エクスビボ、又は組織培養のいずれかにおいて、自発的な又は誘導された表現型の変化を有するがん性、前がん性、又は形質転換細胞を指す。これらの変化は、必ずしも新たな遺伝物質の取り込みを伴うものではない。形質転換は、形質転換ウイルスの感染及び新たなゲノム核酸の組み込み、外因性核酸の取り込みにより発生させることもでき、自然発生的に又は発がん物質に曝露した後に発生し、それによって内因性の遺伝子が変異する場合もある。形質転換/がんは、インビトロ、インビボ、及びエクスビボにおける、形態学的変化、細胞の不死化、異常な増殖制御、病巣の形成、増殖、悪性病変、腫瘍特異的マーカーレベルの調節、浸潤性、ヌードマウスなどの好適な動物宿主における腫瘍の増殖などによって例示される。
「バリアント」、「変異体」、又は「変化した」は、1つ又は2つ以上の修飾、例えば、1つ又は2つ以上の置換、挿入、又は欠失によって参照ポリペプチド又は参照ポリヌクレオチドとは異なる、ポリペプチド又はポリヌクレオチドを指す。
本明細書全体を通して、抗体定常領域におけるアミノ酸残基番号付けは、本明細書に別途明示的に記載されない限り、Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD.(1991)に記載のEUインデックスに従う。
Ig定常領域の変異は、以下のように称される。L351Y_F405A_Y407Vは、1つの免疫グロブリン定常領域におけるL351Y、F405A及びY407V変異を指す。L351Y_F405A_Y407V/T394Wは、1つの多量体タンパク質中に存在する、第1のIg定常領域におけるL351Y、F405A、及びY407V変異並びに第2のIg定常領域におけるT394W変異を指す。
HLA-Gに結合する抗原結合ドメイン。
本開示は、HLA-Gに結合する抗原結合ドメイン、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む単一特異性又は多重特異性タンパク質、それをコードするポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、並びにそれを作製及び使用する方法を提供する。本明細書で同定されるHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、1)改善された熱安定性、2)脱アミド化リスクを低減することによって達成される改善された発展性、3)減少した免疫原性、4)HLA-A、HLA-B、HLA-C、及びHLA-Eとの交差反応性の欠如を伴うHLA-Gに対する特異性、並びに5)腫瘍細胞上の免疫チェックポイントリガンド発現を克服し、T細胞媒介性細胞傷害を介した腫瘍細胞死滅を確実にする能力などの、いくつかの独特の特性を実証した。
本開示は、ヒト白血球抗原G(HLA-G)に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
配列番号50の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号51の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号53のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号55のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号57のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号59のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号61のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号62のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号63のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号64のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号65のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号66のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号67のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号68のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号69のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、単離タンパク質を提供する。
本開示は、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR1、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、単離タンパク質を提供する。
本開示は、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む、単離タンパク質を提供する。
本開示は、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、単離タンパク質を提供する。
本開示は、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質を提供する。
本開示はまた、ヒト白血球抗原G(HLA-G)に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、生殖系列最適化を提供するように操作された変異を含み、変異が、VHドメインにおけるE1Q、L5Q、E6Q、S71P、D46E、及びH77N変異、並びにVLドメインにおけるK30E及びG66Vからなる群から選択される、単離タンパク質を提供する。本開示はまた、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、翻訳後修飾のリスクを低減するように操作された変異を含み、変異が、VLドメインにおけるN92Hである、単離タンパク質を提供する。
本開示はまた、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号50のVH及び配列番号53のVL、
配列番号50のVH及び配列番号55のVL、
配列番号50のVH及び配列番号57のVL、
配列番号50のVH及び配列番号59のVL、
配列番号50のVH及び配列番号61のVL、
配列番号50のVH及び配列番号63のVL、
配列番号50のVH及び配列番号65のVL、
配列番号50のVH及び配列番号67のVL、
配列番号50のVH及び配列番号69のVL、
配列番号52のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号52のVH及び配列番号55のVL、
配列番号52のVH及び配列番号57のVL、
配列番号52のVH及び配列番号59のVL、
配列番号52のVH及び配列番号61のVL、
配列番号52のVH及び配列番号63のVL、
配列番号52のVH及び配列番号65のVL、
配列番号52のVH及び配列番号67のVL、
配列番号52のVH及び配列番号69のVL、
配列番号54のVH及び配列番号51のVL、
配列番号54のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号54のVH及び配列番号57のVL、
配列番号54のVH及び配列番号59のVL、
配列番号54のVH及び配列番号61のVL、
配列番号54のVH及び配列番号63のVL、
配列番号54のVH及び配列番号65のVL、
配列番号54のVH及び配列番号67のVL、
配列番号54のVH及び配列番号69のVL、
配列番号56のVH及び配列番号51のVL、
配列番号56のVH及び配列番号53のVL、
配列番号56のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号56のVH及び配列番号59のVL、
配列番号56のVH及び配列番号61のVL、
配列番号56のVH及び配列番号63のVL、
配列番号56のVH及び配列番号65のVL、
配列番号56のVH及び配列番号67のVL、
配列番号56のVH及び配列番号69のVL、
配列番号58のVH及び配列番号51のVL、
配列番号58のVH及び配列番号53のVL、
配列番号58のVH及び配列番号55のVL、
配列番号58のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号58のVH及び配列番号61のVL、
配列番号58のVH及び配列番号63のVL、
配列番号58のVH及び配列番号65のVL、
配列番号58のVH及び配列番号67のVL、
配列番号58のVH及び配列番号69のVL、
配列番号60のVH及び配列番号51のVL、
配列番号60のVH及び配列番号53のVL、
配列番号60のVH及び配列番号55のVL、
配列番号60のVH及び配列番号57のVL、
配列番号60のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号60のVH及び配列番号63のVL、
配列番号60のVH及び配列番号65のVL、
配列番号60のVH及び配列番号67のVL、
配列番号60のVH及び配列番号69のVL、
配列番号62のVH及び配列番号51のVL、
配列番号62のVH及び配列番号53のVL、
配列番号62のVH及び配列番号55のVL、
配列番号62のVH及び配列番号57のVL、
配列番号62のVH及び配列番号59のVL、
配列番号62のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号62のVH及び配列番号65のVL、
配列番号62のVH及び配列番号67のVL、
配列番号62のVH及び配列番号69のVL、
配列番号64のVH及び配列番号51のVL、
配列番号64のVH及び配列番号53のVL、
配列番号64のVH及び配列番号55のVL、
配列番号64のVH及び配列番号57のVL、
配列番号64のVH及び配列番号59のVL、
配列番号64のVH及び配列番号61のVL、
配列番号64のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号64のVH及び配列番号67のVL、
配列番号64のVH及び配列番号69のVL、
配列番号66のVH及び配列番号51のVL、
配列番号66のVH及び配列番号53のVL、
配列番号66のVH及び配列番号55のVL、
配列番号66のVH及び配列番号57のVL、
配列番号66のVH及び配列番号59のVL、
配列番号66のVH及び配列番号61のVL、
配列番号66のVH及び配列番号63のVL、
配列番号66のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、
配列番号66のVH及び配列番号69のVL、
配列番号68のVH及び配列番号51のVL、
配列番号68のVH及び配列番号53のVL、
配列番号68のVH及び配列番号55のVL、
配列番号68のVH及び配列番号57のVL、
配列番号68のVH及び配列番号59のVL、
配列番号68のVH及び配列番号61のVL、
配列番号68のVH及び配列番号63のVL、
配列番号68のVH及び配列番号65のVL、
配列番号68のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、単離タンパク質を提供する。
本開示はまた、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、scFvである。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、(scFv)である。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Fvである。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Fabである。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、F(ab’)である。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Fdである。
いくつかの実施形態では、HLA-G抗原結合ドメインは、dAbである。
いくつかの実施形態では、HLA-G抗原結合ドメインは、VHHである。
HLA-G結合scFv
HLA-Gに結合する本明細書で同定されたVHドメイン及びVLドメインのいずれも、VH-リンカー-VL又はVL-リンカー-VH配向のいずれかのscFvフォーマットに操作され得る。また、本明細書で同定されたVHドメイン及びVLドメインのいずれも、VH-リンカー-VL-リンカー-VL-リンカー-VH、VH-リンカー-VL-リンカー-VH-リンカー-VL。VH-リンカー-VH-リンカー-VL-リンカー-VL。VL-リンカー-VH-リンカー-VH-リンカー-VL。VL-リンカー-VH-リンカー-VL-リンカー-VH、又はVL-リンカー-VL-リンカー-VH-リンカー-VHなどのsc(FV)構造を生成するために使用され得る。
本明細書で同定されたVH及びVLドメインは、scFvフォーマットに組み込むことができ、得られたscFvのHLA-Gへの結合及び熱安定性は、既知の方法を使用して評価することができる。結合は、ProteOn XPR36、Biacore3000、若しくはKinExA機器、ELISA、又は当業者に公知の競合的結合アッセイを使用して評価することができる。結合は、精製されたscFv又はE.coli上清又は発現したscFvを含有する溶解細胞を使用して評価することができる。試験scFvのHLA-Gに対する親和性の測定値は、異なる条件(例えば、モル浸透圧濃度、pH)下で測定した場合に異なり得る。したがって、親和性及びその他の結合パラメータ(例えば、K、Kon、Koff)の測定は、通常、標準的な条件、及び標準化緩衝液を用いて行われる。熱安定性は、試験scFvを50℃、55℃、又は60℃などの高温で、5分(min)、10分、15分、20分、25分、又は30分などの期間の間加熱し、HLA-Gへの試験scFvの結合を測定することによって評価することができる。非加熱scFvサンプルと比較した場合に、HLA-Gへの同等の結合を保持するscFvは、熱安定性であると称される。
組換え発現系にて、リンカーはペプチドリンカーであり、任意の天然に存在するアミノ酸を含み得る。リンカーに含まれ得る例示的なアミノ酸は、Gly、Ser Pro、Thr、Glu、Lys、Arg、Ile、Leu、His及びTheである。リンカーは、HLA-Gへの結合などの所望の活性を保持するように、互いに対して正確な高次構造を形成するような方法でVH及びVLを連結させるのに適切な長さを有している必要がある。
リンカーは、約5~50個のアミノ酸長であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~40個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~35個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~30個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~25個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~20個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約15~20個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、6個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、7個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、8個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、9個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、10個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、11個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、12個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、13個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、14個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、15個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、16個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、17個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、18個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、19個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、20個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、21個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、22個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、23個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、24個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、25個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、26個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、27個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、28個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、29個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、30個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、31個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、32個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、33個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、34個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、35個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、36個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、37個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、38個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、39個のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、40個のアミノ酸長である。使用され得る例示的なリンカーは、Glyリッチリンカー、Gly及びSer含有リンカー、Gly及びAla含有リンカー、Ala及びSer含有リンカー、並びに他の柔軟なリンカーである。
他のリンカー配列は、免疫グロブリン重鎖又は軽鎖アイソタイプに由来する免疫グロブリンヒンジ領域、CL又はCH1の部分を含み得る。代替的に、ポリエチレングリコール(polyethylene glycol、PEG)、ポリプロピレングリコール、ポリオキシアルキレン、又はポリエチレングリコールとポリプロピレングリコールとのコポリマーを含む様々な非タンパク質性ポリマーは、リンカーとしての使用が見出され得る。使用され得る例示的なリンカーを表2に示す。追加のリンカーは、例えば、国際公開第2019/060695号に記載されている。
いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に向かって、VH、第1のリンカー(L1)、及びVL(VH-L1-VL)を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に向かって、VL、L1、及びVH(VL-L1-VH)を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号8のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号9のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号10のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号11のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号12のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号13のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号14のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号15のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号16のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号17のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号18のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号19のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号20のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号21のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号22のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号23のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号24のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号25のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号26のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号27のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号28のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号29のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号30のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号31のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号32のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号33のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号34のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号35のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号36のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号37のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号38のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号39のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号40のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、
配列番号50の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号51の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号53のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号55のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号57のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号59のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号61のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号62のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号63のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号64のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号65のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号66のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号67のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号68のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号69のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、
それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号50のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号52のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号54のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号56のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号58のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号60のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号62のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号64のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号66のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFVは、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号248のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号249のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号250のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号251のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号252のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号253のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号254のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号255のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号256のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号257のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号258のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号259のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号260のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号261のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号262のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号263のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号264のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号265のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号266のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号267のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号268のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号269のアミノ酸配列を含む。
HLA-Gに結合する他の抗原結合ドメイン
HLA-Gに結合する本明細書で同定されたVHドメイン及びVLドメインのいずれも、Fab、F(ab’)、Fd、又はFvフォーマットに操作することができ、それらのHLA-Gへの結合及び熱安定性は、本明細書に記載されるアッセイを使用して評価することができる。
いくつかの実施形態では、Fabは、
配列番号50の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号51の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号53のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号55のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号57のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号59のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号61のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号62のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号63のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号64のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号65のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号66のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号67のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号68のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号69のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、
それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号50のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号54のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号56のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号58のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号60のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号62のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号64のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号66のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、
配列番号50の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号51の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号53のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号55のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号57のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号59のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号61のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号62のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号63のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号64のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号65のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号66のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号67のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号68のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号69のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、
それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号50のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号52のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号54のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号56のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号58のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号60のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号62のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号64のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号66のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号66のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)2は、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、
配列番号50の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号51の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号53のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号55のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号57のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号59のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号61のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号62のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号63のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号64のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号65のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号66のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号67のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
配列番号68のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号69のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、
それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号50のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号54のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号56のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号58のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号60のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号62のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号64のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号66のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号50のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号52のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号54のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号56のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号58のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号60のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号62のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号64のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号66のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号68のVHを含む。
相同な抗原結合ドメイン及び保存的置換を有する抗原結合ドメイン
HLA-Gに結合する抗原結合ドメインのバリアントは、本開示の範囲内である。例えば、バリアントは、親抗原結合ドメインと比較したときに改善された機能的性質を保持するか又は有する限り、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインに1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、又は29個のアミノ酸置換を含んでいてよい。いくつかの実施形態では、配列同一性は、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインに対して約80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%であり得る。いくつかの実施形態では、多様性はフレームワーク領域に存在する。いくつかの実施形態では、バリアントは、保存的置換により生成される。
例えば、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、VHにおけるE1Q、L5Q、E6Q、S71P、E1Q、L5Q、E6Q、及びS71P(配列番号52のMHGB688-VHに従う残基番号付け)並びにVLにおけるK30E及びG66V(配列番号53のMHGB688-VLに従う残基番号付け)の残基位置での置換を含み得る。保存的置換は、任意の指定の位置で行うことができ、得られたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインのバリアントを、本明細書に記載のアッセイで所望の特性について試験する。
また、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLと少なくとも80%同一であるVH及びVLを含む、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインも提供される。
いくつかの実施形態では、同一性は、85%である。いくつかの実施形態では、同一性は、90%である。いくつかの実施形態では、同一性は、91%である。いくつかの実施形態では、同一性は、91%である。いくつかの実施形態では、同一性は、92%である。いくつかの実施形態では、同一性は、93%である。いくつかの実施形態では、同一性は、94%である。いくつかの実施形態では、同一性は、94%である。いくつかの実施形態では、同一性は、95%である。いくつかの実施形態では、同一性は、96%である。いくつかの実施形態では、同一性は、97%である。いくつかの実施形態では、同一性は、98%である。いくつかの実施形態では、同一性は、99%である。
2つの配列間の同一性パーセントは、2つの配列の最適なアラインメントのために導入する必要があるギャップの数及び各ギャップの長さを考慮した、配列により共有される同一の位置の数の関数(すなわち、同一性%=同一の位置の数/位置の総数×100)である。
2つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれているE.Meyers及びW.Miller(Comput Appl Biosci4:11-17(1988))のアルゴリズムを使用し、PAM120重み残基表、ギャップ長ペナルティ12、及びギャップペナルティ4を使用して決定することができる。更に、2つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、GCGソフトウェアパッケージ(http_//_www_gcg_comで入手可能)のGAPプログラムに組み込まれているNeedleman及びWunsch(J Mol Biol 48:444-453(1970))のアルゴリズムを使用して、Blossum 62マトリクス又はPAM250マトリクスのいずれかと、ギャップ重み付け16、14、12、10、8、6、又は4、及び長さ重み付け1、2、3、4、5、又は6を使用して決定することもできる。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインのバリアントは、HLA-Gに結合する親抗原結合断片の所望の機能的特性を保持しながら、CDR領域のいずれかに1つ又は2つの保存的置換を含む。
「保存的改変」は、アミノ酸修飾を含む抗体の結合特性に著しく影響を与えることも変化させることもないアミノ酸修飾を指す。保存的改変は、アミノ酸の置換、付加、及び欠失を含む。保存的アミノ酸置換は、あるアミノ酸が、類似の側鎖を有するアミノ酸残基に置き換えられる置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、明確に定義されており、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、塩基性側鎖(例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン)、非荷電極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、システイン、セリン、スレオニン、チロシン、トリプトファン)、芳香族側鎖(例えば、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン、チロシン)、脂肪族側鎖(例えば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、セリン、スレオニン)、アミド(例えば、アスパラギン、グルタミン)、β分岐側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)、及び含硫黄側鎖(システイン、メチオニン)を有するアミノ酸を含む。更に、ポリペプチド中の任意の天然残基はまた、アラニンスキャニング変異誘発(MacLennan et al.,(1988)Acta Physiol Scand Suppl 643:55-67;Sasaki et al.,(1988)Adv Biophys 35:1-24)について以前に記載されているように、アラニンで置換され得る。本発明の抗体に対するアミノ酸置換は、既知の方法、例えばPCR突然変異誘発(米国特許第4,683,195号)により行うことができる。代替的に、バリアントのライブラリは、例えば、ランダムコドン(NNK)又は非ランダムコドン(例えば11個のアミノ酸(Ala、Cys、Asp、Glu、Gly、Lys、Asn、Arg、Ser、Tyr、Trp)をコードするDVKコドン)を用いて生成することもできる。得られるバリアントは、本明細書に記載のアッセイを用いて、その特徴について試験することができる。
HLA-Gに結合する抗原結合断片を生成する方法
本開示で提供されるHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、様々な技術を使用して生成することができる。例えば、Kohler及びMilsteinのハイブリドーマ法を使用して、HLA-Gに結合するVH/VL対を同定することができる。ハイブリドーマ法では、マウス、又はハムスター、ラット、若しくはニワトリなどの他の宿主動物をヒト及び/又はカニクイザルHLA-Gで免疫化し、続いて標準的な方法を使用して免疫化した動物由来の脾臓細胞を骨髄腫細胞と融合してハイブリドーマ細胞を形成する。結合特異性、交差反応性又はその欠如、抗原に対する親和性、及び任意の所望の機能性などの所望の特性を有するHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含有する抗体の生成について、1つの不死化したハイブリドーマ細胞から生じたコロニーをスクリーニングすることができる。
非ヒト動物を免疫することによって生成されたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインをヒト化してもよい。ヒトアクセプタフレームワークの選択を含む例示的なヒト化技術としては、CDR移植(米国特許第5,225,539号)、SDR移植(米国特許第6,818,749号)、リサーフェシング(Padlan,(1991)Mol Immunol 28:489-499)、特異性決定残基リサーフェシング(米国特許出願公開第2010/0261620号)、ヒトフレームワーク適合(米国特許第8,748,356号)、又は超ヒト化(米国特許第7,709,226号)が挙げられる。これらの方法では、CDRの長さの類似性若しくはカノニカル構造の同一性、又はそれらの組み合わせに基づいて、親フレームワークに対する全体的な相同性に基づき選択され得るヒトフレームワークに、親抗体のCDR又はCDR残基のサブセットを移植する。
ヒト化抗原結合ドメインは、国際公開第1090/007861号及び同第1992/22653号に記載されているものなどの技術により、変化させたフレームワーク支持残基を組み込んで結合親和性を保持することによって(復帰変異)、又はCDRのいずれかに多様性を導入して、例えば抗原結合ドメインの親和性を改善することによって、所望の抗原に対するその選択性又は親和性を改善するように更に最適化してもよい。
自身のゲノムにヒト免疫グロブリン(Ig)遺伝子座を保有するマウス、ラット、又はニワトリなどのトランスジェニック動物を使用して、HLA-Gに結合する抗原結合断片を生成することができ、これらは例えば、米国特許第6,150,584号、国際公開第1999/45962号、同第2002/066630号、同第2002/43478号、同第2002/043478号、及び同第1990/04036号に記載されている。このような動物の内因的な免疫グロブリン遺伝子座を破壊又は欠失させてもよく、相同又は非相同組換えを使用して、導入染色体(transchromosome)を使用して、又はミニ遺伝子を使用して、少なくとも1つの完全な又は部分的なヒト免疫グロブリン遺伝子座を動物のゲノムに挿入してもよい。Regeneron(http://_www_regeneron_com)、Harbour Antibodies(http://_www_harbourantibodies_com)、Open Monoclonal Technology,Inc.(OMT)(http://_www_omtinc_net)、KyMab(http://_www_kymab_com)、Trianni(http://_www.trianni_com)、及びAblexis(http://_www_ablexis_com)などの企業は、上記の技術を使用して、選択抗原を標的としたヒト抗体を提供するべく取り組んでいる場合がある。
HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、ヒト免疫グロブリン又はその一部、例えばFab、一本鎖抗体(scFv)、又は不対若しくは対合抗体可変領域を発現するようにファージが操作されているファージディスプレイライブラリから選択することができる。HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、例えば、Shi et al.,(2010)J Mol Biol 397:385-96、及び国際公開第09/085462号)に記載されるバクテリオファージpIX被覆タンパク質との融合タンパク質として抗体の重鎖及び軽鎖可変領域を発現するファージディスプレイライブラリから単離され得る。ライブラリを、ヒト及び/又はカニクイザルHLA-Gへのファージ結合についてスクリーニングしてよく、得られた陽性クローンを更に特性評価し、クローン溶解物からFabを単離し、scFv又は抗原結合断片の他の構成に変換してよい。
免疫原性抗原の調製並びに本開示の抗原結合ドメインの発現及び生成は、組換えタンパク質生成などの任意の好適な技術を用いて行うことができる。免疫原性抗原は、精製タンパク質、あるいは全細胞又は細胞若しくは組織抽出物を含むタンパク質混合物の形態で動物に投与されてもよく、あるいは、抗原は、当該抗原又はその一部分をコードする核酸から動物の体内で新規に(de novo)形成されてもよい。
半減期延長部分へのコンジュゲーション
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、半減期延長部分にコンジュゲートさせてもよい。例示的な半減期延長部分は、アルブミン、アルブミンバリアント、アルブミン結合タンパク質及び/又はドメイン、トランスフェリン並びにその断片及び類似体、免疫グロブリン(Ig)又はその断片、例えばFc領域である。前述の半減期延長部分のアミノ酸配列は公知である。Ig又はその断片は、全てのアイソタイプ、すなわち、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA、及びIgEを含む。
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインにコンジュゲートされ得る追加の半減期延長部分としては、所望の特性のための、ポリエチレングリコール(PEG)分子、例えば、PEG5000又はPEG20,000、異なる鎖長の脂肪酸及び脂肪酸エステル、例えば、ラウリン酸エステル、ミリスチン酸エステル、ステアリン酸エステル、アラキジン酸エステル、ベヘン酸エステル、オレイン酸エステル、アラキドン酸エステル、オクタン二酸、テトラデカン二酸、オクタデカン二酸、ドコサン二酸など、ポリリジン、オクタン、炭水化物(デキストラン、セルロース、オリゴ糖又は多糖類)が挙げられる。これら部分は、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインと直接融合させてよく、標準的なクローニング及び発現技術によって生成することができる。代替的に、周知の化学的カップリング方法を使用して、組換えで生成された本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインにその部分を結合させてもよい。
例えば、システイン残基を本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインのC末端に組み込むか、又は操作してシステインをHLA-G結合部位から離れる方向に面する残基位置にし、周知の方法を使用してペギル基をシステインに結合させることによって、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインにペギル部分をコンジュゲートさせることができる。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合断片は、半減期延長部分にコンジュゲートされる。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、免疫グロブリン(Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン、又はポリエチレングリコールである。いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、Ig定常領域である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、Igである。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、Igの断片である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、Ig定常領域である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、Ig定常領域の断片である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、Fc領域である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、アルブミンである。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、アルブミン結合ドメインである。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、トランスフェリンである。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、ポリエチレングリコールである。
半減期延長部分にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、既知のインビボモデルを利用して、それらの薬物動態特性について評価することができる。
免疫グロブリン(Ig)定常領域又はIg定常領域の断片へのコンジュゲーション
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートして、Fcエフェクター機能C1q結合、補体依存性細胞傷害(complement dependent cytotoxicity、CDC)、Fc受容体結合、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity、ADCC)、貪食作用、又は細胞表面受容体(例えば、B細胞受容体(B cell receptor、BCR))のダウンレギュレーションを含む、抗体様特性を付与することができる。Ig定常領域又はIg定常領域の断片はまた、本明細書で論じられるように、半減期延長部分としても機能する。本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、標準的な方法を使用して操作して従来の完全長抗体にすることができる。HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む完全長抗体は、本明細書に記載のとおり、更に操作されてもよい。
免疫グロブリン重鎖定常領域は、サブドメインCH1、ヒンジ、CH2、及びCH3で構成される。EUインデックスに従う残基番号付けで、重鎖においてCH1ドメインは残基A118~V215に及び、CH2ドメイン残基はA231~K340に及び、CH3ドメイン残基G341~K447に及ぶ。場合によっては、G341は、CH2ドメイン残基と称される。ヒンジは、概して、E216を含み、ヒトIgG1のP230で終結すると定義される。Ig Fc領域は、Ig定常領域の少なくともCH2及びCH3ドメインを含み、したがって、Ig重鎖定常領域の少なくともおよそA231からK447までの領域を含む。
本発明はまた、免疫グロブリン(Ig)定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを提供する。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域は、重鎖定常領域である。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域は、軽鎖定常領域である。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、Fc領域を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH2ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部分、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。ヒンジの一部分は、Igヒンジの1つ又は2つ以上のアミノ酸残基を指す。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端にコンジュゲートされる。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端にコンジュゲートされる。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートされる。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号8のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号9のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号10のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号11のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号12のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号13のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号14のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号15のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号16のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号17のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号18のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号19のアミノ酸配列を含む
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号20のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号21のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号22のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号23のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号24のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号25のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号26のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号27のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号28のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号29のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号30のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号31のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号32のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号33のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号34のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号35のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号36のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号37のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号38のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号39のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号40のアミノ酸配列を含む。
Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートした本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、いくつかの既知のアッセイを使用してそれらの機能性について評価することができる。HLA-Gへの結合は、本明細書に記載の方法を使用して評価され得る。Ig定常ドメイン又はIg定常領域の断片、例えばFc領域によって付与される変化した特性は、FcγRI、FcγRII、FcγRIII、若しくはFcRn受容体などの受容体の可溶性形態を使用するFc受容体結合アッセイにおいて、又は例えばADCC、CDC、若しくはADCPを測定する細胞ベースのアッセイを使用して、アッセイすることができる。
ADCCは、HLA-G発現細胞を標的細胞として、またNK細胞をエフェクター細胞として使用するインビトロアッセイを使用して評価することができる。細胞溶解は、溶解した細胞からの標識(例えば、放射性基質、蛍光染料、又は天然の細胞内タンパク質)の放出によって検出することができる。例示的なアッセイでは、標的細胞を、1つの標的細胞の、4つのエフェクター細胞に対する比で使用する。標的細胞はBATDAで予め標識し、エフェクター細胞及び試験抗体と組み合わせる。サンプルを2時間インキュベートし、上清に放出したBATDAを測定することにより、細胞溶解を測定する。0.67%Triton X-100(Sigma Aldrich)による最大の細胞傷害に対してデータを正規化し、また任意の抗体の非存在下における標的細胞からのBATDAの自然放出によって最小対照を求める。
ADCPは、単球由来マクロファージをエフェクター細胞として、また、GFP又は他の標識分子を発現するように操作された任意のHLA-G発現細胞を標的細胞として使用することによって評価することができる。例示的なアッセイでは、エフェクター:標的細胞比は、例えば4:1とすることができる。エフェクター細胞は、本発明の抗体を添加して、又は添加せずに、標的細胞と共に4時間インキュベートしてよい。インキュベーション後、細胞は、アクターゼを用いて剥離できる。マクロファージは、蛍光標識に結合した抗CD11b抗体及び抗CD14抗体を用いて特定することができ、貪食作用の割合は、標準的な方法を用いて、CD11CD14マクロファージにおけるGFP蛍光%に基づいて求めることができる。
細胞のCDCは、例えば、Daudi細胞を、RPMI-B(1%のBSAを補給したRPMI)に1×10個の細胞/ウェル(50μL/ウェル)で播種し、50μLの試験タンパク質を0~100μg/mLの最終濃度でウェルに添加し、反応物を室温で15分間インキュベートし、11μLのプールヒト血清をウェルに添加し、反応物を37℃で45分間インキュベートすることによって測定され得る。溶解した細胞の割合(%)は、標準法を使用して、FACSアッセイにおけるヨウ化プロピジウム染色細胞の%として検出され得る。
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、標準的な方法を使用して様々な設計の単一特異性又は多重特異性タンパク質に操作され得る。
本開示はまた、本開示のHLA-Gに結合する単離抗原結合ドメインを含む単一特異性タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、単一特異性タンパク質は、抗体である。
本開示はまた、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質は、二重特異性である。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質は、三重特異性である。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質は、四重特異性である。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質は、HLA-Gへの結合について一価である。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質は、HLA-Gへの結合について二価である。
本開示はまた、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインと、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む単離多重特異性タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、T細胞抗原である。
いくつかの実施形態では、T細胞抗原は、CD8T細胞抗原である。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、NK細胞抗原である。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、又はNKG2Cである。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、CD3εである。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb、又はVHHを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、F(ab’)を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fvを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fdを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に向かって、VH、第1のリンカー(L1)、及びVL(VH-L1-VL)、又はVL、L1、及びVH(VL-L1-VH)を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、約5~50個のアミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、約5~40個のアミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、約10~30個のアミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、約10~20個のアミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号8のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号9のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号10のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号11のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号12のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号13のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号14のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号15のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号16のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号17のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号18のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号19のアミノ酸配列を含む
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号20のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号21のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号22のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号23のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号24のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号25のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号26のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号27のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号28のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号29のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号30のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号31のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号32のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号33のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号34のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号35のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号36のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号37のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号38のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号39のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号40のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号70、73、75、78、81、又は85のHCDR1、配列番号71、76、79、82、又は86のHCDR2、配列番号72、74、77、80、83、84、又は87のHCDR3、配列番号88、91、93、95、97、99、101、又は102のLCDR1、配列番号89又は103のLCDR2、及び配列番号90、92、94、96、98、100、又は104のLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、
それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号50のVH及び配列番号51のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号52のVH及び配列番号53のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号54のVH及び配列番号55のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号57のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号58のVH及び配列番号59のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号60のVH及び配列番号61のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号62のVH及び配列番号63のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号64のVH及び配列番号65のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号66のVH及び配列番号67のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH、及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号50のVH及び配列番号53のVL、
配列番号50のVH及び配列番号55のVL、
配列番号50のVH及び配列番号57のVL、
配列番号50のVH及び配列番号59のVL、
配列番号50のVH及び配列番号61のVL、
配列番号50のVH及び配列番号63のVL、
配列番号50のVH及び配列番号65のVL、
配列番号50のVH及び配列番号67のVL、
配列番号50のVH及び配列番号69のVL、
配列番号52のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号52のVH及び配列番号55のVL、
配列番号52のVH及び配列番号57のVL、
配列番号52のVH及び配列番号59のVL、
配列番号52のVH及び配列番号61のVL、
配列番号52のVH及び配列番号63のVL、
配列番号52のVH及び配列番号65のVL、
配列番号52のVH及び配列番号67のVL、
配列番号52のVH及び配列番号69のVL、
配列番号54のVH及び配列番号51のVL、
配列番号54のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号54のVH及び配列番号57のVL、
配列番号54のVH及び配列番号59のVL、
配列番号54のVH及び配列番号61のVL、
配列番号54のVH及び配列番号63のVL、
配列番号54のVH及び配列番号65のVL、
配列番号54のVH及び配列番号67のVL、
配列番号54のVH及び配列番号69のVL、
配列番号56のVH及び配列番号51のVL、
配列番号56のVH及び配列番号53のVL、
配列番号56のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号56のVH及び配列番号59のVL、
配列番号56のVH及び配列番号61のVL、
配列番号56のVH及び配列番号63のVL、
配列番号56のVH及び配列番号65のVL、
配列番号56のVH及び配列番号67のVL、
配列番号56のVH及び配列番号69のVL、
配列番号58のVH及び配列番号51のVL、
配列番号58のVH及び配列番号53のVL、
配列番号58のVH及び配列番号55のVL、
配列番号58のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号58のVH及び配列番号61のVL、
配列番号58のVH及び配列番号63のVL、
配列番号58のVH及び配列番号65のVL、
配列番号58のVH及び配列番号67のVL、
配列番号58のVH及び配列番号69のVL、
配列番号60のVH及び配列番号51のVL、
配列番号60のVH及び配列番号53のVL、
配列番号60のVH及び配列番号55のVL、
配列番号60のVH及び配列番号57のVL、
配列番号60のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号60のVH及び配列番号63のVL、
配列番号60のVH及び配列番号65のVL、
配列番号60のVH及び配列番号67のVL、
配列番号60のVH及び配列番号69のVL、
配列番号62のVH及び配列番号51のVL、
配列番号62のVH及び配列番号53のVL、
配列番号62のVH及び配列番号55のVL、
配列番号62のVH及び配列番号57のVL、
配列番号62のVH及び配列番号59のVL、
配列番号62のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号62のVH及び配列番号65のVL、
配列番号62のVH及び配列番号67のVL、
配列番号62のVH及び配列番号69のVL、
配列番号64のVH及び配列番号51のVL、
配列番号64のVH及び配列番号53のVL、
配列番号64のVH及び配列番号55のVL、
配列番号64のVH及び配列番号57のVL、
配列番号64のVH及び配列番号59のVL、
配列番号64のVH及び配列番号61のVL、
配列番号64のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号64のVH及び配列番号67のVL、
配列番号64のVH及び配列番号69のVL、
配列番号66のVH及び配列番号51のVL、
配列番号66のVH及び配列番号53のVL、
配列番号66のVH及び配列番号55のVL、
配列番号66のVH及び配列番号57のVL、
配列番号66のVH及び配列番号59のVL、
配列番号66のVH及び配列番号61のVL、
配列番号66のVH及び配列番号63のVL、
配列番号66のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、
配列番号66のVH及び配列番号69のVL、
配列番号68のVH及び配列番号51のVL、
配列番号68のVH及び配列番号53のVL、
配列番号68のVH及び配列番号55のVL、
配列番号68のVH及び配列番号57のVL、
配列番号68のVH及び配列番号59のVL、
配列番号68のVH及び配列番号61のVL、
配列番号68のVH及び配列番号63のVL、
配列番号68のVH及び配列番号65のVL、
配列番号68のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号248のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号249のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号250のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号251のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号252のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号253のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号254のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号255のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号256のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号257のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号258のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号259のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号260のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号261のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号262のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号263のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号264のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号265のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号266のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号267のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号268のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の結合ドメインは、配列番号269のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号370のLCDR3、
配列番号339のVH、及び配列番号340、341、342、343、344、又は345のVL、
配列番号364のHCDR1、配列番号365のHCDR2、配列番号366のHCDR3、配列番号371のLCDR1、配列番号372のLCDR2、及び配列番号373のLCDR3、又は
配列番号346又は348のVH及び配列番号347又は349のVLを含む。
いくつかの実施形態では、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域若しくは第1のIg定常領域の断片にコンジュゲートされ、かつ/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域若しくは第2のIg定常領域の断片にコンジュゲートされる。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、Fc領域を含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、CH2ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、CH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン、及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質は、HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインと第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間、及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に、第2のリンカー(L2)を更に含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG2アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG3アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG4アイソタイプである。
第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、本明細書に記載のとおり更に遺伝子操作されてもよい。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多重特異性タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異は、L235A/D265S、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S、及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、FcγRへの多重特異性タンパク質の結合の低減をもたらす少なくとも1つの変異は、L234A/L235A/D265Sである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多重特異性タンパク質のFcγ受容体(FcγR)への増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質のFcγRへの増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
いくつかの実施形態では、FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、若しくはFcγRIII、又はそれらの任意の組み合わせである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多重特異性タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異を含む。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A、及びH435Rからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
いくつかの実施形態では、多重特異性タンパク質は、第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異を含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V、及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基番号付けは、EUインデックスに従う。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、以下の変異:
第1のIg定常領域におけるL235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V、及び第2のIg定常領域におけるL235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W、又は
第1のIg定常領域におけるL235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W、及び第2のIg定常領域におけるL235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407Vを含む。
HLA-Gに結合する抗原結合断片を含む多重特異性タンパク質の生成。
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合断片は、多重特異性抗体に操作してもよく、これらもまた、本発明の範囲内に包含される。
HLA-Gに結合する抗原結合断片は、Fabアーム交換を使用して生成される完全長多重特異性抗体に操作してもよく、インビトロでFabアーム交換を促進する、Ig定常領域CH3ドメイン内の2つの単一特異性二価抗体に置換が導入される。この方法では、ヘテロ二量体の安定性を促進する特定の置換をCH3ドメインに有するように、2つの単一特異性二価抗体を遺伝子操作する。これらの抗体は、ヒンジ領域におけるシステインがジスルフィド結合を異性化させるために十分な還元条件下において共にインキュベーションされ、それにより、Fabアーム交換により二重特異性抗体が生成される。インキュベート条件は、最適には、非還元条件に戻され得る。使用され得る代表的な還元剤は、2-メルカプトエチルアミン(2-mercaptoethylamine、2-MEA)、ジチオスレイトール(dithiothreitol、DTT)、ジチオエリスリトール(dithioerythritol、DTE)、グルタチオン、トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン(tris(2-carboxyethyl)phosphine、TCEP)、L-システイン、及びβ-メルカプトエタノールであり、好ましくは、2-メルカプトエチルアミン、ジチオスレイトール、及びトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィンからなる群から選択される還元剤である。例えば、少なくとも20℃の温度で、少なくとも25mMの2-MEAの存在下又は少なくとも0.5mMのジチオスレイトールの存在下で、pH5~8、例えばpH7.0又はpH7.4で、少なくとも90分間のインキュベートを用いることができる。
使用され得るCH3変異としては、ノブインホール変異(Genentech)、静電的マッチ変異(Chugai、Amgen、NovoNordisk、Oncomed)、鎖交換遺伝子操作ドメインボディ(Strand Exchange Engineered Domain body、SEEDbody)(EMD Serono)、Duobody(登録商標)変異(Genmab)、及び他の非対称変異(例えば、Zymeworks)などの技術が挙げられる。
ノブインホール変異は、例えば、国際公開第1996/027011号に開示されており、小さい側鎖(ホール)を有するアミノ酸が第1のCH3領域に導入され、大きな側鎖(ノブ)を有するアミノ酸が第2のCH3領域に導入され、第1のCH3領域と第2のCH3領域との間に優先的な相互作用をもたらす、CH3領域の界面上の変異が含まれる。ノブ及びホールを形成する例示的なCH3領域変異は、T366Y/F405A、T366W/F405W、F405W/Y407A、T394W/Y407T、T394S/Y407A、T366W/T394S、F405W/T394S、及びT366W/T366S_L368A_Y407Vである。
重鎖ヘテロ二量体形成は、米国特許出願公開第2010/0015133号、同第2009/0182127号、同第2010/028637号、又は同第2011/0123532号に記載のように、第1のCH3領域上の正に荷電した残基及び第2のCH3領域上の負に荷電した残基を置換することにより、静電相互作用を使用することによって促進され得る。
重鎖ヘテロ二量体化を促進するために使用することができる他の非対称変異は、米国特許出願公開第2012/0149876号又は同第2013/0195849号(Zymeworks)に記載のL351Y_F405A_Y407V/T394W、T366I_K392M_T394W/F405A_Y407V、T366L_K392M_T394W/F405A_Y407V、L351Y_Y407A/T366A_K409F、L351Y_Y407A/T366V_K409F、Y407A/T366A_K409F、又はT350V_L351Y_F405A_Y407V/T350V_T366L_K392L_T394Wである。
SEEDボディ変異は、米国特許出願公開第2007/0287170号に記載のように、選択されたIgG残基をIgA残基と置換して、重鎖ヘテロ二量体化を促進することを伴う。
使用され得る他の例示的な変異は、国際公開第2007/147901号、国際公開第2011/143545号、国際公開第2013/157954号、国際公開第2013/096291号、及び米国特許出願公開第2018/0118849号に記載のR409D_K370E/D399K_E357K、S354C_T366W/Y349C_T366S_L368A_Y407V、Y349C_T366W/S354C_T366S_L368A_Y407V、T366K/L351D、L351K/Y349E、L351K/Y349D、L351K/L368E、L351Y_Y407A/T366A_K409F、L351Y_Y407A/T366V_K409F、K392D/D399K、K392D/E356K、K253E_D282K_K322D/D239K_E240K_K292D、K392D_K409D/D356K_D399Kである。
Duobody(登録商標)変異(Genmab)は、例えば、米国特許第9150663号及び米国特許出願公開第2014/0303356号に開示されており、F405L/K409R、野生型/F405L_R409K、T350I_K370T_F405L/K409R、K370W/K409R、D399AFGHILMNRSTVWY/K409R、T366ADEFGHILMQVY/K409R、L368ADEGHNRSTVQ/K409AGRH、D399FHKRQ/K409AGRH、F405IKLSTVW/K409AGRH、及びY407LWQ/K409AGRHの変異が含まれる。
HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを組み込むことができる更なる二重又は多重特異性構造としては、二重可変ドメイン免疫グロブリン(Dual Variable Domain Immunoglobulin、DVD)(国際公開第2009/134776号;DVDは、VH1-リンカー-VH2-CH構造を有する重鎖と、VL1-リンカー-VL2-CL構造を有する軽鎖とを含む完全長抗体であり、リンカーは任意である)、異なる特異性を有する2つの抗体アームを結合するための様々な二量化ドメインを含む構造、例えば、ロイシンジッパー又はコラーゲン二量化ドメイン(国際公開第2012/022811号、米国特許第5,932,448号、米国特許第6,833,441号)、一緒にコンジュゲートされた2つ又は3つ以上のドメイン抗体(dAbs)、ダイアボディ、ラクダ科抗体及び遺伝子操作されたラクダ科抗体などの重鎖のみ抗体、Dual Targeting(DT)-Ig(GSK/Domantis)、Two-in-one Antibody(Genentech)、Cross-linked Mab(Karmanos Cancer Center)、mAb2(F-Star)及びCovX-body(CovX/Pfizer)、IgG-like Bispecific(InnClone/Eli Lilly)、Ts2Ab(MedImmune/AZ)及びBsAb(Zymogenetics)、HERCULES(Biogen Idec)及びTvAb(Roche)、ScFv/Fc Fusions(Academic Institution)、SCORPION(Emergent BioSolutions/Trubion,Zymogenetics/BMS))、Dual Affinity Retargeting Technology(Fc-DART)(MacroGenics)及びDual(ScFv)-Fab(National Research Center for Antibody Medicine--China)、Dual-Action又はBis-Fab(Genentech)、Dock-and-Lock(DNL)(ImmunoMedics)、Bivalent Bispecific(Biotecnol)並びにFab-Fv(UCB-Celltech)が挙げられる。ScFv抗体、ダイアボディベースの抗体、及びドメイン抗体としては、二重特異性T細胞エンゲージャー(Bispecific T Cell Engager、BiTE)(Micromet)、タンデムダイアボディ(Tandem Diabody、Tandab)(Affimed)、二重親和性再標的技術(Dual Affinity Retargeting Technology、DART)(MacroGenics)、一本鎖ダイアボディ(Academic)、TCR様抗体(AIT、ReceptorLogics)、ヒト血清アルブミンScFv融合体(Merrimack)、及びCOMBODY(Epigen Biotech)、二重標的ナノボディ(Ablynx)、二重標的重鎖のみドメイン抗体が挙げられるが、これらに限定されない。
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインはまた、3本のポリペプチド鎖を含む多重特異性タンパク質に操作してもよい。このような設計では、少なくとも1つの抗原結合ドメインが、scFvの形態である。例示的な設計としては次の設計1~4が挙げられる(「1」が第1の抗原結合ドメインを示し、「2」が第2の抗原結合ドメインを示し、「3」が第3の抗原結合ドメインを示す)。
設計1:鎖A)scFv1-CH2-CH3、鎖B)VL2-CL、鎖C)VH2-CH1-ヒンジ-CH2-CH3
設計2:鎖A)scFv1-ヒンジ-CH2-CH3、鎖B)VL2-CL、鎖C)VH2-CH1-ヒンジ-CH2-CH3
設計3:鎖A)scFv1-CH1-ヒンジ-CH2-CH3、鎖B)VL2-CL、鎖C)VH2-CH1-ヒンジ-CH2-CH3
設計4:鎖A)CH2-CH3-scFv1、鎖B)VL2-CL、鎖C)VH2-CH1-ヒンジ-CH2-CH3
CH3操作は、米国特許出願公開第2012/0149876号又は米国特許出願公開第2013/0195849号(Zymeworks)に記載のL351Y_F405A_Y407V/T394W、T366I_K392M_T394W/F405A_Y407V、T366L_K392M_T394W/F405A_Y407V、L351Y_Y407A/T366A_K409F、L351Y_Y407A/T366V_K409F、Y407A/T366A_K409F、又はT350V_L351Y_F405A_Y407V/T350V_T366L_K392L_T394Wの変異など、設計1~4に組み込まれ得る。
アイソタイプ、アロタイプ、及びFc遺伝子操作
本開示のタンパク質中に存在するIg定常領域又はFc領域などのIg定常領域の断片は、任意のアロタイプ又はアイソタイプのものであってよい。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG2アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG3アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG4アイソタイプである。
Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、任意のアロタイプであり得る。アロタイプは結合又はFc媒介性エフェクター機能などのIg定常領域の特性に影響を与えないことが予想される。断片のIg定常領域を含む治療用タンパク質の免疫原性は、輸注反応のリスク増大及び治療応答の期間短縮に関連している(Baert et al.,(2003)N Engl J Med 348:602-08)。断片のIg定常領域を含む治療用タンパク質が宿主において免疫応答を誘導する程度は、Ig定常領域のアロタイプによってある程度決定され得る(Stickler et al.,(2011)Genes and Immunity 12:213-21)。Ig定常領域のアロタイプは、抗体の定常領域配列における特定の位置のアミノ酸配列の変異に関連する。表3は、選択IgG1、IgG2、及びIgG4アロタイプを示す。
C末端リジン(C-terminal lysine、CTL)は、Ig定常領域から、血流中の内因性循環カルボキシペプチダーゼによって除去され得る(Cai et al.,(2011)Biotechnol Bioeng 108:404-412)。製造中、米国特許出願公開第2014/0273092号に記載のとおり細胞外Zn2+、EDTA、又はEDTA-Fe3+の濃度を制御することによって、CTLの除去を最高レベル未満に制御することができる。タンパク質のCTL含量を、既知の方法を使用して測定することができる。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域にコンジュゲートした、HLA-Gに結合する抗原結合断片は、約10%~約90%のC末端リジン含量を有する。いくつかの実施形態では、C末端リジン含量は、約20%~約80%である。いくつかの実施形態では、C末端リジン含量は、約40%~約70%である。いくつかの実施形態では、C末端リジン含量は、約55%~約70%である。いくつかの実施形態では、C末端リジン含量は、約60%である。
Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインに対してFc領域変異を行って、ADCC、ADCP、及び/若しくはADCPなどのエフェクター機能、並びに/又は薬物動態特性を調節することができる。これは、活性化FcγR(FcγRI、FcγRIIa、FcγRIII)、阻害性FcγRIIb及び/又はFcRnへの変異Fcの結合を調節する変異をFcに導入することによって達成することができる。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域又はIg定常領域の断片に少なくとも1つの変異を含む。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの変異は、Fc領域にある。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、Fc領域に少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、又は15個の変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、抗体のFcRnへの結合を調節するFc領域における少なくとも1つの変異を含む。
半減期(例えば、FcRnへの結合)を調節するために変異させることが可能なFcの位置としては、位置250、252、253、254、256、257、307、376、380、428、434、及び435が挙げられる。単独で、又は組み合わせで行われることができる例示的な変異は、変異T250Q、M252Y、I253A、S254T、T256E、P257I、T307A、D376V、E380A、M428L、H433K、N434S、N434A、N434H、N434F、H435A、及びH435Rである。抗体の半減期を増加させるように行われ得る例示的な単独で又は組み合わせでの変異は、変異M428L/N434S、M252Y/S254T/T256E、T250Q/M428L、N434A及びT307A/E380A/N434Aである。半減期を低減させるように行われ得る例示的な単独で又は組み合わせでの変異は、変異H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rである。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、M252Y/S254T/T256E変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、タンパク質の活性化Fcγ受容体(FcγR)への結合を低減する、かつ/又はC1q結合、補体依存性細胞傷害(CDC)、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)、若しくは貪食作用(ADCP)などのFcエフェクター機能を低減させる少なくとも1つの変異をFc領域に含む。
タンパク質の活性化FcγRへの結合を低減させ、続いて、エフェクター機能を低減させるために変異させることが可能なFc位置としては、位置214、233、234、235、236、237、238、265、267、268、270、295、297、309、327、328、329、330、331、及び365が挙げられる。単独で、又は組み合わせで加えることができる例示的な変異は、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4における、変異K214T、E233P、L234V、L234A、G236の欠失、V234A、F234A、L235A、G237A、P238A、P238S、D265A、S267E、H268A、H268Q、Q268A、N297A、A327Q、P329A、D270A、Q295A、V309L、A327S、L328F、A330S、及びP331Sである。ADCCが低減したタンパク質をもたらす例示的な組み合わせの変異は、IgG1におけるL234A/L235A、IgG1におけるL234A/L235A/D265S、IgG2におけるV234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、IgG4におけるF234A/L235A、IgG4におけるS228P/F234A/L235A、全てのIgアイソタイプにおけるN297A、IgG2におけるV234A/G237A、IgG1におけるK214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、IgG2におけるH268Q/V309L/A330S/P331S、IgG1におけるS267E/L328F、IgG1におけるL234F/L235E/D265A、IgG1におけるL234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、IgG4におけるS228P/F234A/L235A/G237A/P238S、及び、IgG4におけるS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sの変異である。また、IgG2由来の残基117~260及びIgG4由来の残基261~447を有するFcなどのハイブリッドIgG2/4 Fcドメインを使用してもよい。
CDCが低減したタンパク質をもたらす例示的な変異は、K322A変異である。
周知のS228P変異をIgG4抗体に加えて、IgG4の安定性を増強することができる。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、K214T、E233P、L234V、L234A、G236の欠失、V234A、F234A、L235A、G237A、P238A、P238S、D265A、S267E、H268A、H268Q、Q268A、N297A、A327Q、P329A、D270A、Q295A、V309L、A327S、L328F、K322、A330S、及びP331Sからなる群から選択される、少なくとも1つの変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、L234A/L235A/D265S変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインはL234A/L235A変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、タンパク質のFcγ受容体(FcγR)への結合を増強する、かつ/又はC1q結合、補体依存性細胞傷害(CDC)、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)、若しくは貪食作用(ADCP)などのFcエフェクター機能を増強する少なくとも1つの変異を、Fc領域に含む。
タンパク質の活性化FcγRへの結合を増加させる、かつ/又はFcエフェクター機能を増強するために変異させることが可能なFc位置としては、位置236、239、243、256,290,292、298、300、305、312、326、330、332、333、334、345、360、339、378、396、又は430(EUインデックスに従う残基番号付け)が挙げられる。単一で又は組み合わせて行われ得る例示的な変異は、G236A、S239D、F243L、T256A、K290A、R292P、S298A、Y300L、V305L、K326A、A330K、I332E、E333A、K334A、A339T及びP396Lである。ADCC又はADCPが増加したタンパク質をもたらす例示的な組み合わせの変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eである。
CDCを増強させるように変異され得るFc位置としては、位置267、268、324、326、333、345及び430が挙げられる。単一で又は組み合わせで行われ得る例示的な変異は、S267E、F1268F、S324T、K326A、K326W、E333A、E345K、E345Q、E345R、E345Y、E430S、E430F及びE430Tである。CDCが増加したタンパク質をもたらす例示的な組み合わせの変異は、K326A/E333A、K326W/E333A、H268F/S324T、S267E/H268F、S267E/S324T、及びS267E/H268F/S324Tである。
本明細書に記載の特異性変異は、配列番号130、131、及び132それぞれのIgG1、IgG2及びIgG4野生型アミノ酸配列と比較した場合の変異である。
配列番号486、野生型IgG1
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRT
PEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAK
GQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号487、野生型IgG2
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTVERKCCVECPPCPAPPVAGPSVF
LFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTFR
VVSVLTVVHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPAPIEKTISKTKGQPREPQVYTLPPSREEMTKN
QVSLTCLVKGFYPSDISVEWESNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGN
VFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号488、野生型IgG4
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPSCPAPEFLGGPSV
FLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTY
RVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTK
NQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEG
NVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
FcγR又はFcRnへの抗体の結合は、フローサイトメトリーを使用して、各受容体を発現するように操作された細胞で評価することができる。例示的な結合アッセイでは、96ウェルプレートに2×10個/ウェルの細胞を播種し、BSA Stain Buffer(BD Biosciences,San Jose,USA)中にて4℃で30分間ブロッキングする。細胞を、氷上で、4℃で1.5時間、試験抗体と共にインキュベートする。BSA染色緩衝液で2回洗浄した後、細胞を、R-PE標識抗ヒトIgG二次抗体(Jackson Immunoresearch Laboratories)と共に4℃で45分間、インキュベートする。細胞を、染色緩衝液で2回洗浄し、次いで、1:200希釈したDRAQ7生/死細胞染色試薬(Cell Signaling Technology,Danvers,USA)を含有する150μLのStain Buffer中に再懸濁する。染色された細胞のPE及びDRAQ7シグナルを、Miltenyi MACSQuantフローサイトメーター(Miltenyi Biotec,Auburn,USA)によって、それぞれB2及びB4チャネルを使用して検出する。生細胞をDRAQ7除外でゲートし、収集された少なくとも10,000生細胞イベントについて、幾何平均蛍光シグナルを決定する。分析にはFlowJoソフトウェア(Tree Star)を使用する。データを、平均蛍光シグナルに対する抗体濃度の対数としてプロットする。非線形回帰分析を実行する。
糖鎖遺伝子操作
Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインのADCCを媒介する能力は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のオリゴ糖成分を操作することによって増強することができる。ヒトIgG1又はIgG3は、Asn297においてN-グリコシル化される。ここで、グリカンの大部分は、公知の二分岐G0、G0F、G1、G1F、G2、又はG2Fの形態である。操作されていないCHO細胞により産生され得るIg定常領域含有タンパク質は、典型的には、少なくとも約85%のグリカンフコース含量を有する。Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインに結合した二分岐複合体型オリゴ糖からコアフコースを除去すると、抗原結合もCDC活性も変化させることなく、改善されたFcγRIIIa結合を介してタンパク質のADCCが増強される。このようなタンパク質は、二分岐の複合型のFcオリゴ糖を有する比較的高い脱フコシル化免疫グロブリンの発現の成功に導くと報告された異なる方法を使用して達成することができ、以下が含まれる:培養物の浸透圧の制御(Konno et al.,Cytotechnology 64(:249-65,2012)、宿主細胞株としてのバリアントCHO株Lec13の適用(Shields et al.,J Biol Chem 277:26733-26740,2002)、宿主細胞株としてのバリアントCHO株EB66の適用(Olivier et al.,MAbs;2(4):405-415,2010;PMID:20562582)、宿主細胞株としてのラットハイブリドーマ細胞株YB2/0の適用(Shinkawa et al.,J Biol Chem278:3466-3473,2003)、1,6-フコシルトランスフェラーゼ(FUT8)遺伝子に対して特異的な低分子干渉RNAの導入(Mori et al.,Biotechnol Bioeng 88:901-908,2004)、又はβ-1,4-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII及びゴルジα-マンノシダーゼII若しくは強力なアルファ-マンノシダーゼI阻害物質であるキフネンシンの共発現(Ferrara et al.,J Biol Chem 281:5032-5036,2006、Ferrara et al.,Biotechnol Bioeng 93:851-861,2006、Xhou et al.,Biotechnol Bioeng 99:652-65,2008)。
いくつかの実施形態では、本開示のIg定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、約1%~約15%、例えば、約15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、又は1%のフコース含量を有する二分岐グリカン構造を有する。いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、約50%、40%、45%、40%、35%、30%、25%、又は20%のフコース含量を有するグリカン構造を有する。
「フコース含量」は、Asn297における糖鎖内のフコース単糖類の量を意味する。フコースの相対量は、フコース含有構造の全糖構造に対する割合である。これらの糖構造は、複数の方法、例えば、1)国際公開第2008/077546 2号に記載されるような、N-グリコシダーゼF処理サンプル(例えば、複合体、ハイブリッド、及びオリゴ-並びに高マンノース構造)のMALDI-TOFの使用、2)Asn297グリカンの酵素放出、その後の誘導体化、並びに蛍光検出を備えたHPLC(UPLC)及び/又はHPLC-MS(UPLC-MS)による検出/定量化、3)第1のGlcNAc単糖類と第2のGlcNAc単糖類との間を切断し、フコースを第1のGlcNAcに付加されたままにさせる、Endo S又は他の酵素によるAsn297グリカンの処理を伴うか又はこの処理なしでの、天然又は還元mAbのインタクトプロテイン分析、4)酵素消化(例えば、トリプシン又はエンドペプチダーゼLys-C)によるmAbの構成ペプチドへの消化、その後のHPLC-MS(UPLC-MS)による分離、検出及び定量、5)Asn 297にPNGase Fを有する特異的な酵素脱グリコシル化により、mAbタンパク質からmAbオリゴ糖を分離すること、により特性評価及び定量化され得る。このように放出されるオリゴ糖は、フルオロフォアで標識し、実測された質量の理論上の質量との比較によるマトリクス支援レーザー脱離イオン化(matrix-assisted laser desorption ionization、MALDI)質量分析によるグリカン構造の細かな特性評価、イオン交換HPLC(GlycoSep C)によるシアル化の程度の決定、順相HPLC(GlycoSep N)による親水性基準に準拠するオリゴ糖型の分離及び定量、並びに高性能キャピラリー電気泳動-レーザー誘起蛍光(high performance capillary electrophoresis-laser induced fluorescence、HPCE-LIF)によるオリゴ糖の分離及び定量、を可能にする様々な補足的技術によって分離及び特定することができる。
本明細書で使用される場合、「低フコース」又は「低フコース含量」は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、約1%~15%のフコース含量を有することを指す。
本明細書で使用される場合、「正常フコース」又は「正常フコース含量」は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、約50%超、典型的には80%超又は85%超のフコース含量を有することを指す。
抗イディオタイプ抗体
抗イディオタイプ抗体は、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する抗体である。
本発明はまた、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する抗イディオタイプ抗体を提供する。
本発明はまた、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する抗イディオタイプ抗体を提供する。
抗イディオタイプ(idiotypic、Id)抗体は、抗体の抗原決定基(例えば、パラトープ又はCDR)を認識する抗体である。Id抗体は、抗原をブロッキングするものであっても、しないものであってもよい。抗原ブロッキングIdは、サンプル中の遊離抗原結合ドメイン(例えば、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメイン)を検出するために使用され得る。ブロッキングしないIdを使用して、サンプル中の全抗体(遊離しているもの、抗原に一部結合しているもの、又は抗原に完全に結合しているもの)を検出することができる。Id抗体は、抗Idが調製されている抗体で動物を免疫することによって調製することができる。
また、更に別の動物で免疫応答を誘導する免疫原として抗Id抗体を使用して、いわゆる抗-抗Id抗体を生成することもできる。抗-抗Idは、抗Idを誘導した元の抗原結合ドメインとエピトープが同一であり得る。したがって、抗原結合ドメインのイディオタイプ決定基に対する抗体を使用することによって、同一の特異性の抗原結合ドメインを発現する他のクローンを同定することが可能である。抗Id抗体は、本明細書の他の箇所に記載のものなどの任意の好適な技術によって変動(それにより、抗Id抗体バリアントを産生する)、及び/又は誘導することができる。
免疫コンジュゲート(Immunoconjugates)
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメイン、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質、又はHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質(本明細書ではHLA-G結合タンパク質と総称する)は、異種分子にコンジュゲートされ得る。
いくつかの実施形態では、異種分子は、検出可能な標識又は細胞傷害性剤である。
本発明はまた、検出可能な標識にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する、抗原結合ドメインを提供する。
本発明はまた、検出可能な標識にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む、タンパク質を提供する。
本発明はまた、検出可能な標識にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む、多重特異性タンパク質を提供する。
本発明はまた、細胞傷害性剤にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する、抗原結合ドメインを提供する。
本発明はまた、細胞傷害性剤にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む、タンパク質を提供する。
本発明はまた、細胞傷害性剤にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む、多重特異性タンパク質を提供する。
本開示のHLA-G結合タンパク質は、前立腺がん又は乳がん細胞などのHLA-G発現細胞に治療薬を向けるために使用することができる。代替的に、内在化させた後、細胞機能を修飾することを意図する治療薬に結合させた本開示のHLA-G結合タンパク質を用いて、HLA-G発現細胞を標的とすることもできる。
いくつかの実施形態では、検出可能な標識は細胞毒性剤でもある。
検出可能な標識にコンジュゲートした本開示のHLA-G結合タンパク質は、様々なサンプルにおけるHLA-Gの発現を評価するために使用することができる。
検出可能な標識は、本開示のHLA-G結合タンパク質にコンジュゲートさせた場合、分光的、光化学的、生化学的、免疫化学的、又は化学的手段を介して後者を検出可能にする組成物を含む。
例示的な検出可能な標識としては、放射性同位体、磁気ビーズ、金属ビーズ、コロイド粒子、蛍光染料、電子密度試薬、酵素(例えば、一般的にELISAにおいて使用される)、ビオチン、ジゴキシゲニン、ハプテン、発光分子、化学発光分子、蛍光色素、フルオロフォア、蛍光消光剤、有色分子、放射性同位体、シンチレート(scintillates)、アビジン、ストレプトアビジン、プロテインA、プロテインG、抗体又はその断片、ポリヒスチジン、Ni2+、Flagタグ、mycタグ、重金属、酵素、アルカリホスファターゼ、ペルオキシダーゼ、ルシフェラーゼ、電子供与体/受容体、アクリジニウムエステル、及び比色基質が挙げられる。
検出可能な標識は、例えば、検出可能な標識が放射性同位体であるときなど、自発的にシグナルを発し得る。他の場合、検出可能な標識は、外部場によって刺激された結果として、シグナルを発する。
例示的な放射性同位体は、γ放出、オージェ放出、β放出、α放出、又はポジトロン放出性の放射性同位体であり得る。例示的な放射性同位体としては、H、11C、13C、15N、18F、19F、55Co、57Co、60Co、61Cu、62Cu、64Cu、67Cu、68Ga、72As、75Br、86Y、89Zr、90Sr、94mTc、99mTc、115In、1231、1241、125I、1311、211At、212Bi、213Bi、223Ra、226Ra、225Ac、及び227Acが挙げられる。
例示的な金属原子は、20超の原子番号を有する金属、例えば、カルシウム原子、スカンジウム原子、チタン原子、バナジウム原子、クロム原子、マンガン原子、鉄原子、コバルト原子、ニッケル原子、銅原子、亜鉛原子、ガリウム原子、ゲルマニウム原子、ヒ素原子、セレン原子、臭素原子、クリプトン原子、ルビジウム原子、ストロンチウム原子、イットリウム原子、ジルコニウム原子、ニオブ原子、モリブデン原子、テクネチウム原子、ルテニウム原子、ロジウム原子、パラジウム原子、銀原子、カドミウム原子、インジウム原子、スズ原子、アンチモン原子、テルル原子、ヨウ素原子、キセノン原子、セシウム原子、バリウム原子、ランタン原子、ハフニウム原子、タンタル原子、タングステン原子、レニウム原子、オスミウム原子、イリジウム原子、白金原子、金原子、水銀原子、タリウム原子、鉛原子、ビスマス原子、フランシウム原子、ラジウム原子、アクチニウム原子、セリウム原子、プラセオジム原子、ネオジム原子、プロメチウム原子、サマリウム原子、ユーロピウム原子、ガドリニウム原子、テルビウム原子、ジスプロシウム原子、ホルミウム原子、エルビウム原子、ツリウム原子、イッテルビウム原子、ルテチウム原子、トリウム原子、プロトアクチニウム原子、ウラン原子、ネプツニウム原子、プルトニウム原子、アメリシウム原子、キュリウム原子、バーケリウム原子、カリホルニウム原子、アインスタイニウム原子、フェルミウム原子、メンデレビウム原子、ノーベリウム原子、又はローレンシウム原子である。
いくつかの実施形態では、金属原子は、20超の原子番号を有するアルカリ土類金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、ランタニドであり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、アクチニドであり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、遷移金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、卑金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、金原子、ビスマス原子、タンタル原子、及びガドリニウム原子であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、53(すなわち、ヨウ素)~83(すなわち、ビスマス)の原子番号を有する金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、磁気共鳴映像法に好適な原子であり得る。
金属原子は、Ba2+、Bi3+、Cs、Ca2+、Cr2+、Cr3+、Cr6+、Co2+、Co3+、Cu、Cu2+、Cu3+、Ga3+、Gd3+、Au、Au3+、Fe2+、Fe3+、F3+、Pb2+、Mn2+、Mn3+、Mn4+、Mn7+、Hg2+、Ni2+、Ni3+、Ag、Sr2+、Sn2+、Sn4+、及びZn2+などの+1、+2、又は+3酸化状態の形態の金属イオンであり得る。金属原子は、金属酸化物、例えば、酸化鉄、酸化マンガン、又は酸化ガドリニウムを含み得る。
好適な色素としては、例えば、5(6)-カルボキシフルオレセイン、IRDye 680RDマレイミド、又はIRDye 800CW、ルテニウムポリピリジル色素などの任意の市販の色素が挙げられる。
好適なフルオロフォアは、フルオレセインイソチオシアネート(fluorescein isothiocyanate、FITC)、フルオレセインチオセミカルバジド、ローダミン、テキサスレッド、CyDye(例えば、Cy3、Cy5、Cy5.5)、Alexa Fluors(例えば、Alexa488、Alexa555、Alexa594、Alexa647)、近赤外(near infrared、NIR)(700~900nm)蛍光染料、並びにカルボシアニン及びアミノスチリル染料である。
検出可能な標識にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、造影剤として使用することができる。
検出可能な標識にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質は、造影剤として使用することができる。
検出可能な標識にコンジュゲートしたHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質は、造影剤として使用することができる。
いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤は、化学療法剤、薬物、増殖阻害剤、毒素(例えば、細菌、真菌、植物、若しくは動物由来の酵素活性を有する毒素、又はその断片)、又は放射性同位体(すなわち、放射性コンジュゲート)である。
いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤は、ダウノマイシン、ドキソルビシン、メトトレキサート、ビンデシン、ジフテリア毒素などの細菌毒素、リシン、ゲルダナマイシン、マイタンシノイド、又はカリケアマイシンである。細胞傷害性剤は、チューブリン結合、DNA結合、又はトポイソメラーゼ阻害を含む機構によってその細胞傷害性又は細胞増殖抑制作用を誘発し得る。
いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤は、ジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の未結合活性断片、エキソトキシンA鎖(Pseudomonas aeruginosa)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデシンA鎖、α-サルシン、シナアブラギリ(Aleurites fordii)タンパク質、ジアンチンタンパク質、ヨウシュヤマゴボウ(Phytolaca americana)タンパク質(PAPI、PAPII、及びPAP-S)、ニガウリ(momordica charantia)阻害剤、クルシン、クロチン、サボン草(sapaonaria officinalis)阻害剤、ゲロニン、マイトジェリン(mitogellin)、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン、並びにトリコテセン(tricothecenes)などの酵素活性毒素である。
いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤は、212Bi、131I、131In、90Y、及び186Reなどの放射性核種である。
いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤は、ドラスタチン又はドロスタチンのペプチド類似体及び誘導体、アウリスタチン又はモノメチルアウリスタチンフェニルアラニンである。例示的な分子は、米国特許第5,635,483号及び同第5,780,588号に開示されている。ドラスタチン及びアウリスタチンは、微小管動態、GTPの加水分解、並びに核及び細胞の分裂に干渉し(Woyke et al(2001)Antimicrob Agents and Chemother.45(12):3580~3584)、抗がん及び抗真菌活性を有することが示されている。ドラスタチン及びアウリスタチン薬剤部位は、ペプチド薬剤部位のN(アミノ)末端若しくはC(カルボキシル)末端を介して(国際公開第02/088172号)、又は抗体内に遺伝子操作された任意のシステインを介して、本発明の抗体に結合することができる。
本開示のHLA-G結合タンパク質は、既知の方法を使用して検出可能な標識にコンジュゲートさせることができる。
いくつかの実施形態では、検出可能な標識は、キレート剤と複合体を形成している。
いくつかの実施形態では、検出可能な標識は、リンカーを介して本開示のHLA-G結合タンパク質にコンジュゲートされる。
検出可能な標識又は細胞傷害性部分は、既知の方法を使用して、本開示のHLA-G結合タンパク質に直接又は間接的に連結させることができる。好適なリンカーは、当該技術分野において既知であり、例えば、補欠分子族、非フェノールリンカー(N-スクシミジル-ベンゾエートの誘導体、ドデカボラート)、大環状及び非環式の両キレート剤のキレート部分、例えば、1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-1,4,7,10,四酢酸(DOTA)の誘導体、ジエチレントリアミン五酢酸(diethylenetriaminepentaacetic avid、DTPA)の誘導体、S-2-(4-イソチオシアナトベンジル)-1,4,7-トリアザシクロノナン-1,4,7-三酢酸(NOTA)の誘導体、及び1,4,8,11-テトラアザシクロドデカン-1,4,8,11-四酢酸(TETA)の誘導体、N-スクシンイミジル-3-(2-ピリジルジチオール)プロピオナート(SPDP)、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの二官能性誘導体(例えば、ジメチルアジピミダートHCl)、活性エステル(例えば、ジスクシンイミジルスベラート)、アルデヒド(例えば、グルタルアルデヒド)、ビスアジド化合物(例えば、ビス(p-アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビス-ジアゾニウム誘導体(例えば、ビス-(p-ジアゾニウムベンゾイル)-エチレンジアミン)、ジイソシアナート(例えば、トルエン2,6-ジイソシアナート)、及びビス-活性フッ素化合物(例えば、1,5-ジフルオロ-2,4-ジニトロベンゼン)、並びに他のキレート部分が挙げられる。好適なペプチドリンカーは周知である。
いくつかの実施形態では、本開示のHLA-G結合タンパク質は、腎クリアランスを介して血液から除去される。
キット
本発明はまた、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むキットを提供する。
本発明はまた、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質を含むキットを提供する。
本発明はまた、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質を含むキットを提供する。
キットは、治療的使用のために、及び診断キットとして使用することができる。
キットは、サンプル中のHLA-Gの存在を検出するために使用することができる。
いくつかの実施形態では、キットは、本開示のHLA-G結合タンパク質と、HLA-G結合タンパク質を検出するための試薬とを含む。キットは、使用説明書;他の試薬、例えば、標識、治療剤、又はキレート化若しくは別の方法のカップリングに有用な薬剤、標識若しくは治療剤に対する抗体、又は放射線防護組成物;投与するために抗体を調製するためのデバイス又は他の材料;医薬的に許容される担体、及び対象に投与するためのデバイス又は他の材料を含む、1つ又は2つ以上の他の要素を含み得る。
いくつかの実施形態では、キットは、容器内のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインと、キットの使用説明書とを含む。
いくつかの実施形態では、キットは、容器内のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質と、キットの使用説明書とを含む。
いくつかの実施形態では、キットは、容器内のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質と、キットの使用説明書とを含む。
いくつかの実施形態では、キットにおけるHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、標識される。
いくつかの実施形態では、キットにおけるHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質は、標識される。
いくつかの実施形態では、キットにおけるHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質は、標識される。
いくつかの実施形態では、キットは、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、キットは、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269を含む、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む。
HLA-Gを検出する方法
本発明はまた、サンプル中のHLA-Gを検出する方法であって、サンプルを入手することと、サンプルを本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインと接触させることと、サンプル中の結合したHLA-Gを検出することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、サンプルは、尿、血液、血清、血漿、唾液、腹水、循環細胞、滑液、循環細胞、組織に会合していない細胞(すなわち、遊離細胞)、組織(例えば、外科的に切除された組織、穿刺吸引を含む生検材料)、組織プレパラートなどに由来し得る。
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、既知の方法を使用して検出することができる。例示的な方法としては、蛍光若しくは化学発光標識、又は放射線標識を使用して抗体を直接標識すること、又は本発明の抗体に、ビオチン、酵素、又はエピトープタグなどの容易に検出可能な部分を結合させることが挙げられる。例示的な標識及び部分は、ルテニウム、111In-DOTA、111In-ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA)、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ及びベータガラクトシダーゼ、ポリ-ヒスチジン(HISタグ)、アクリジン染料、シアニン染料、フルオロン染料、オキサジン染料、フェナントリジン染料、ローダミン染料、及びAlexafluor(登録商標)染料である。
本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインは、サンプル中のHLA-Gを検出するための様々なアッセイで使用することができる。例示的なアッセイは、ウェスタンブロット分析、ラジオイムノアッセイ、表面プラズモン共鳴、免疫沈降、平衡透析、免疫拡散、電気化学発光(electrochemiluminescence、ECL)イムノアッセイ、免疫組織化学的検査、蛍光活性化細胞選別(fluorescence-activated cell sorting、FACS)、又はELISAアッセイである。
ポリヌクレオチド、ベクター、及び宿主細胞
本開示はまた、本開示のHLA-G結合タンパク質のいずれかをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。HLA-G結合タンパク質は、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメイン、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質を含む。
本発明はまた、HLA-G結合タンパク質又はその断片のいずれかをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号50のVHをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号51のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号52のVHをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号53のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号54のVHをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号55のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号56のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号57のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号58のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号59のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号60のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号61のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号62のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号63のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号64のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号65のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号66のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号67のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号68のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号69のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVHをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67又は69のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLをコードする、単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号248のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号249のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号250のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号251のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号252のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号253のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号254のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号255のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号256のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号257のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号258のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号259のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号260のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号261のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号262のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号263のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号264のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号265のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号266のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号267のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号268のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本発明はまた、配列番号269のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本開示のいくつかの実施形態はまた、本開示のHLA-G結合タンパク質をコードするポリヌクレオチド又は本開示のHLA-G結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチドを含む、単離又は精製核酸を提供する。
ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドは、高ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズし得る。「高ストリンジェンシー条件」は、ポリヌクレオチドが、非特異的なハイブリダイゼーションよりも強い検出可能な量で標的配列(本明細書に記載される核酸のいずれかのヌクレオチド配列)に特異的にハイブリダイズすることを意味する。高ストリンジェンシー条件は、正確に相補的な配列を有するポリヌクレオチド又は点在するミスマッチをほんのわずかに含むポリヌクレオチドを、ヌクレオチド配列とマッチしたいくつかの小領域(例えば、3~12塩基)を有することになったランダム配列と識別する条件を含む。そのような相補的な小領域は、14~17又はそれ以上の塩基の完全長相補体よりも容易に融解され、高ストリンジェンシーのハイブリダイゼーションにより、それらが容易に識別可能となる。比較的高ストリンジェンシーな条件は、例えば、約50~70℃の温度で約0.02~0.1MのNaCl又は等価物によって提供されるものなど、低塩及び/又は高温条件を含む。このような高ストリンジェンシー条件は、ヌクレオチド配列と鋳型又は標的鎖との間の不一致を、たとえあったとしても、ほとんど許容しない。条件は、漸増量のホルムアミドの添加によって、よりストリンジェントになり得ることが、概ね理解される。
本開示のポリヌクレオチド配列は、意図とする宿主細胞においてヌクレオチド配列を発現させる1つ又は2つ以上の制御エレメント(例えばプロモータ又はエンハンサ)に動作可能に連結し得る。ポリヌクレオチドは、cDNAであってもよい。プロモータは、強い、弱い、組織特異的、誘導性、又は発生段階特異的なプロモータであってよい。使用され得る例示的なプロモータは、ヒポキサンチンホスホリボシルトランスフェラーゼ(hypoxanthine phosphoribosyl transferase、HPRT)、アデノシンデアミナーゼ、ピルビン酸キナーゼ、ベータアクチン、ヒトミオシン、ヒトヘモグロビン、ヒト筋肉クレアチンなどである。加えて、多くのウイルスプロモータが、真核細胞中で構成的に機能し、記載される実施形態での使用に好適である。このようなウイルスプロモータとしては、サイトメガロウイルス(Cytomegalovirus、CMV)最初期プロモータ、SV40の初期及び後期プロモータ、マウス乳がんウイルス(Mouse Mammary Tumor Virus、MMTV)プロモータ、モロニー白血病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス(Human Immunodeficiency Virus、HIV)、エプスタインバーウイルス(Epstein Barr Virus、EBV)、ラウス肉腫ウイルス(Rous Sarcoma Virus、RSV)、及び他のレトロウイルスの長端末反復配列(long terminal repeat、LTR)、並びに単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼプロモータが挙げられる。メタロチオネインプロモータ、テトラサイクリン誘導性プロモータ、ドキシサイクリン誘導性プロモータ、タンパク質キナーゼR2’,5’-オリゴアデニル酸合成酵素、Mx遺伝子、ADAR1などの1つ又は2つ以上のインターフェロン刺激応答エレメント(interferon-stimulated response element、ISRE)を含有するプロモータなどの誘導性プロモータを使用してもよい。
本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。本開示はまた、本発明のポリヌクレオチドを含む発現ベクターを提供する。そのようなベクターは、プラスミドベクター、ウイルスベクター、バキュロウイルス発現用ベクター、トランスポゾンベースのベクター、又は任意の手段によって所与の生物又は遺伝子的バックグラウンドに本発明の合成ポリヌクレオチドを導入するのに好適な任意の他のベクターであってもよい。本開示のHLA-G結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、HLA-G結合タンパク質の発現を確実にする発現ベクター中の制御配列に動作可能に連結され得る。そのような調節エレメントとしては、転写プロモータ、好適なmRNAリボソーム結合部位をコードする配列、並びに転写及び翻訳の終了を制御する配列を挙げることができる。発現ベクターはまた、1つ又は2つ以上の非転写エレメント、例えば、複製起点、発現する遺伝子に連結された好適なプロモータ及びエンハンサ、他の5’又は3’隣接非転写配列、5’又は3’非翻訳配列(例えば、必須リボソーム結合部位)、ポリアデニル化部位、スプライスドナー及びアクセプタ部位、又は転写終結配列を含んでいてもよい。宿主において複製する能力を付与する複製の起点もまた、組み込まれ得る。
発現ベクターは、天然に存在する若しくは天然に存在しないヌクレオチド間結合、又は両方の種類の結合を含み得る。天然に存在しない又は改変されたヌクレオチド又はヌクレオチド間連結は、ベクターの転写又は複製を阻害しない。
ベクターが適切な宿主に組み込まれた後、組み込まれたポリヌクレオチドによってコードされる本開示のHLA-G結合タンパク質を高レベルで発現させるのに好適な条件下で宿主を維持する。脊椎動物細胞を形質転換するのに使用される発現ベクター中の転写及び翻訳制御配列は、ウイルス源により提供することができる。例示的なベクターは、Okayama and Berg,3 Mol.Cell.Biol.280(1983)によって記載されるように構築され得る。
本開示のベクターはまた、1つ又は2つ以上の内部リボソーム侵入部位(Internal Ribosome Entry Site、IRES)を含有してもよい。IRES配列を融合ベクターに含めることは、一部のタンパク質の発現を増強させるのに有益であり得る。いくつかの実施形態では、ベクター系は、1つ又は2つ以上のポリアデニル化部位(例えば、SV40)を含み、その部位は、前述の核酸配列のうちいずれかの上流又は下流にあってもよい。ベクターの成分は、近接して連結されてもよいか、又は遺伝子産物を発現させるのに最適な間隔を提供するように(すなわち、ORF間に「スペーサー」ヌクレオチドを導入することにより)配置されてもよいか、又は別の方法で位置付けられてもよい。また、調節エレメント、例えば、IRESモチーフが、発現に最適な間隔を提供するように配置されてもよい。
本開示のベクターは、環状であっても線形であってもよい。これらは、原核生物又は真核生物の宿主細胞において機能的な複製系を含有するように調製され得る。複製系は、例えば、ColE1、SV40、2μプラスミド、λ、ウシパピローマウイルスなどに由来していてよい。
組換え発現ベクターは、一過性の発現のため、安定な発現のためのいずれか、又はその両方のために設計され得る。また、組換え発現ベクターは、構成的発現又は誘導性発現のために作製され得る。
更に、組換え発現ベクターは、自殺遺伝子を含むように作製され得る。本明細書で使用される場合、「自殺遺伝子」という用語は、自殺遺伝子を発現する細胞を死に至らしめる遺伝子を指す。自殺遺伝子は、遺伝子を発現する細胞に対し薬剤(例えば、薬物)に対する感受性を付与し、細胞が薬剤と接触したとき又は薬剤に曝露されたときに細胞を死に至らしめる遺伝子であり得る。自殺遺伝子は、当該技術分野において既知であり、例えば、単純ヘルペスウイルス(Herpes Simplex Virus、HSV)チミジンキナーゼ(thymidine kinase、TK)遺伝子、シトシンデアミナーゼ、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、及びニトロレダクターゼが挙げられる。
ベクターはまた、当技術分野において周知の選択マーカーを含んでいてもよい。選択マーカーは、陽性及び陰性選択マーカーを含む。マーカー遺伝子は、殺生物剤耐性(例えば、抗生物質、重金属などに対する耐性)、栄養要求性宿主における原栄養を提供するための補完などを含む。例示的なマーカー遺伝子としては、抗生物質耐性遺伝子(例えば、ネオマイシン耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子、カナマイシン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子、ペニシリン耐性遺伝子、ヒスチジノール耐性遺伝子、ヒスチジノール×耐性遺伝子)、グルタミン合成酵素遺伝子、ガンシクロビル選択用のHSV-TK、HSV-TK誘導体、又は6-メチルプリン選択用の細菌プリンヌクレオシドホスホリラーゼ遺伝子が挙げられる(Gadi et al.,7 Gene Ther.1738-1743(2000))。選択マーカーをコードする核酸配列又はクローニング部位は、目的のポリペプチドをコードする核酸配列又はクローニング部位の上流又は下流にあってもよい。
使用され得る例示的なベクターは、細菌:pBs、phagescript、PsiX174、pBluescript SK、pBs KS、pNH8a、pNH16a、pNH18a、pNH46a(Stratagene,La Jolla,Calif.,USA);pTrc99A、pKK223-3、pKK233-3、pDR540、及びpRIT5(Pharmacia、Uppsala,Sweden)である。真核生物:pWLneo、pSV2cat、pOG44、PXR1、pSG(Stratagene)pSVK3、pBPV、pMSG及びpSVL(Pharmacia)、pEE6.4(Lonza)並びにpEE12.4(Lonza)である。追加のベクターとしては、pUCシリーズ(Fermentas Life Sciences,Glen Burnie,Md.)、pBluescriptシリーズ(Stratagene,LaJolla、Calif.)、pETシリーズ(Novagen,Madison,Wis.)、pGEXシリーズ(Pharmacia Biotech,Uppsala,Sweden)、及びpEXシリーズ(Clontech,Palo Alto,Calif.)が挙げられる。λGT10、λGT11、λEMBL4、及びλNM1149、λZapII(Stratagene)などのバクテリオファージベクターを使用することができる。例示的な植物発現ベクターとしては、pBI01、pBI01.2、pBI121、pBI101.3、及びpBIN19(Clontech)が挙げられる。例示的な動物発現ベクターとしては、pEUK-Cl、pMAM、及びpMAMneo(Clontech)が挙げられる。発現ベクターは、ウイルスベクター、例えば、レトロウイルスベクター、例えば、ガンマレトロウイルスベクターであってよい。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号50のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号51のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号52のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号53のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号54のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号55のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号56のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号57のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号58のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号59のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号60のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号61のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号62のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号63のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号64のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号65のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号66のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号67のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号68のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号69のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLをコードする、ポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号248のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号249のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号250のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号251のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号252のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号253のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号254のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号255のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号256のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号257のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号258のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号259のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号260のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号261のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号262のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号263のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号264のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号265のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号266のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号267のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号268のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号269のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
また、本発明は、本発明の1つ又は2つ以上のベクターを含む、宿主細胞を提供する。「宿主細胞」は、ベクターが導入された細胞を指す。宿主細胞という用語は、特定の対象細胞だけでなく、そのような細胞の後代、また特定の対象細胞から生成された安定な細胞株も指すことを意図すると理解される。変異又は環境による影響のいずれかにより、後続世代においてある特定の改変が生じることがあるため、そのような後代は親細胞と同一ではないことがあるが、本明細書で使用される「宿主細胞」という用語の範囲内には依然として含まれる。そのような宿主細胞は、真核細胞、原核細胞、植物細胞、又は古細菌細胞であってもよい。原核宿主細胞の例は、大腸菌、バチルス・ズブチルス(Bacillus subtilis)などの桿菌(bacilli)、及びサルモネラ(Salmonella)、セラチア(Serratia)、及び様々なシュードモナス種(Pseudomonas species)などの他の腸内細菌科である。酵母などの他の微生物も発現に有用である。好適な酵母宿主細胞の例は、サッカロミセス(Saccharomyces)(例えば、S.セレビジアエ(S.cerevisiae))及びピキア(Pichia)である。例示的な真核細胞は、哺乳動物、昆虫、鳥類、又は他の動物由来のものであってもよい。哺乳類真核細胞としては、SP2/0(American Type Culture Collection(ATCC),Manassas,VA,CRL-1581)、NS0(European Collection of Cell Cultures(ECACC),Salisbury,Wiltshire,UK,ECACC No.85110503)、FO(ATCC CRL-1646)、及びAg653(ATCC CRL-1580)ネズミ細胞株などのハイブリドーマ又は骨髄腫の細胞株などの不死化細胞株が挙げられる。例示的なヒト骨髄腫細胞株は、U266(ATTC CRL-TIB-196)である。他の有用な細胞株としては、CHO-K1SV(Lonza Biologics(Walkersville,MD))、CHO-K1(ATCC CRL-61)、又はDG44などの、チャイニーズハムスターの卵巣(Chinese Hamster Ovary、CHO)細胞に由来するものが挙げられる。
本開示はまた、K2結合タンパク質を発現する条件で本開示の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されたHLA-G結合タンパク質を回収することと、を含む、本開示のHLA-G結合タンパク質を産生する方法を提供する。タンパク質を作製し、それを精製する方法は既知である。(化学的に又は組換えによって)合成された後、硫酸アンモニウム沈殿、アフィニティカラム、カラムクロマトグラフィ、高速液体クロマトグラフィ(high performance liquid chromatography、HPLC)精製、ゲル電気泳動などを含む標準的な手順に従ってHLA-G結合タンパク質を精製することができる(全般的には、Scopes,Protein Purification(Springer-Verlag,N.Y.,(1982)を参照)。対象タンパク質は、実質的に純粋、例えば、純度が少なくとも約80%~85%、純度が少なくとも約85%~90%、純度が少なくとも約90%~95%、又は純度が少なくとも約98%~99%、若しくはそれ以上であってよく、例えば、細胞残屑、対象タンパク質以外の巨大分子などの夾雑物を含んでいなくてよい。
標準的な分子生物学的方法を使用して、本開示のHLA-G結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドをベクターに組み込むことができる。宿主細胞の形質転換、培養、抗体発現、及び精製は、周知の方法を使用して行われる。
修飾ヌクレオチドを使用して、本開示のポリヌクレオチドを生成することができる。例示的な修飾ヌクレオチドは、5-フルオロウラシル、5-ブロモウラシル、5-クロロウラシル、5-ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、4-アセチルシトシン、5-(カルボキシヒドロキシメチル)ウラシル、カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、N-置換アデニン、7-メチルグアニン、5-メチルアミノメチルウラシル、5-メトキシアミノメチル-2-チオウラシル、ベータ-D-マンノシルキューオシン、5″-メトキシカルボキシメチルウラシル、5-メトキシウラシル、2-メチルチオ-N-イソペンテニルアデニン、ウラシル-5-オキシ酢酸(v)、ウィブトキソシン(wybutoxosine)、シュードウラシル、キューオシン、ベータ-D-ガラクトシルキューオシン、イノシン、N-イソペンテニルアデニン、1-メチルグアニン、1-メチルイノシン、2,2-ジメチルグアニン、2-メチルアデニン、2-メチルグアニン、3-メチルシトシン、5-メチルシトシン、2-チオシトシン、5-メチル-2-チオウラシル、2-チオウラシル、4-チオウラシル、5-メチルウラシル、ウラシル-5-オキシ酢酸メチルエステル、3-(3-アミノ-3-N-2-カルボキシプロピル)ウラシル、及び2,6-ジアミノプリンである。
医薬組成物/投与
本開示はまた、本開示のHLA-G結合タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物を提供する。
本開示はまた、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインと、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物を提供する。
本開示はまた、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物を提供する。
本開示はまた、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物を提供する。
本開示はまた、本開示のHLA-Gに結合する抗原結合ドメイン及びHLA-G以外の腫瘍抗原に結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物を提供する。
本開示のHLA-G結合タンパク質は、医薬的に許容される担体中に活性成分として有効量の抗体を含有する医薬組成物として調製することができる。これらの溶液は滅菌され、概して粒子状物質を含まない。これらは、従来周知の滅菌技術(例えば、濾過)によって滅菌することができる。この組成物は、生理学的条件に近づけるために必要とされる医薬的に許容可能な補助物質、例えばpH調整剤及び緩衝剤、安定化剤、増粘剤、潤滑剤及び着色剤などを含むことができる。
医薬組成物に関して本明細書で使用される場合、「医薬的に許容される」という用語は、動物及び/又はヒトにおける使用について、連邦政府若しくは州政府の規制機関によって承認されているか、又は米国薬局方若しくは他の一般に認められている薬局方に列挙されていることを意味する。
治療及び使用方法
本開示はまた、治療に使用するための、本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメインと、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、二重又は多重特異性タンパク質を提供する。
本開示はまた、細胞増殖性障害の治療に使用するための、本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメインと、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、二重又は多重特異性タンパク質を提供する。
本開示はまた、がんの治療に使用するための、本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメインと、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、二重又は多重特異性タンパク質を提供する。
本開示はまた、治療に使用するための医薬品の製造に使用するための、本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメインと、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、二重又は多重特異性タンパク質を提供する。
本開示はまた、細胞増殖性障害の治療に使用するための医薬品の製造に使用するための、本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメインと、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、二重又は多重特異性タンパク質を提供する。
本開示はまた、がんを治療するための医薬品の製造に使用するための、本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメインと、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、二重又は多重特異性タンパク質を提供する。
本開示はまた、対象におけるがんを治療する方法であって、治療有効量のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質を対象に投与してがんを治療することを含み、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、方法を提供する。
本開示はまた、対象におけるがんを治療する方法であって、治療有効量のHLA-Gに結合する抗原結合ドメインを含む多重特異性タンパク質を対象に投与して、がんを治療することを含み、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む、方法を提供する。
本開示の更なる態様は、細胞増殖性障害の治療を必要とする対象においてそれを行う方法であって、治療有効量の、本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメインと、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む二重又は多重特異性タンパク質を対象に投与することを含む、方法である。他の実施形態では、本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメインと、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、二重又は多重特異性タンパク質が対象に投与される。
前述の使用又は方法のいずれかにおいて、細胞増殖性疾患は、がんである。他の実施形態では、がんは、肺がん、膵臓がん、腎がん、頭頸部がん、卵巣がん、食道がん、乳がん、子宮がん、黒色腫、神経芽種、膠芽腫、大腸がん、胃がん、副甲状腺がん、膀胱がん、肝臓がん、肝細胞がん、胸膜中皮腫、前立腺がん、胆管がん、甲状腺がん、胎児性がん、セミノーマ、ブドウ膜黒色腫、褐色細胞腫、奇形腫、胸腺腫、副腎皮質がん、星状細胞腫、滑膜肉腫、骨髄異形成症候群、急性骨髄白血病(acute myeloid leukemia、AML)、ホジキンリンパ腫、多発性ミエローマ(multiple myeloma、MM)、非ホジキンリンパ腫、及びB細胞慢性リンパ性白血病からなる群から選択される。
他の実施形態では、がんは、肺がんである。他の実施形態では、肺がんは、非小細胞肺がん(non-small cell lung cancer、NSCLC)、小細胞肺がん(small cell lung cancer、SCLC)、又は肺腺がんである。他の実施形態では、がんは、膵臓がんである。他の実施形態では、がんは、腺がん、例えば、転移性腺がん(例えば、肺腺がん、胃腺がん、又は膵臓腺がん)である。
他の実施形態では、腎がんは、淡明細胞型腎細胞がん(Clear Cell Renal Cell Carcinoma、CCRCC)である。
他の実施形態では、腎がんは、乳頭状タイプである。
他の実施形態では、卵巣がんは、卵巣、腹膜、又は卵管の高悪性度漿液性がんである。
他の実施形態では、卵巣がんは、監視することができる上昇した血液マーカー(例えば、CA125)又はがん関連流体を有する。
他の実施形態では、乳がんは、トリプルネガティブ乳がん(triple-negative breast cancer、TNBC)である。
別の態様では、本開示は、(a)本開示の、HLA-Gに特異的に結合する第1の抗原結合ドメイン、及び第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合ドメインを含む、前述の二重又は多重特異性タンパク質のうちのいずれか1つを含む組成物と、(b)細胞増殖性障害を治療又は進行を遅延させるために、対象に組成物を投与するための指示書を含む添付文書と、を含む、キットを特色とする。
前述の使用又は方法のいずれかにおいて、対象はヒトであってよい。
実施形態:
本発明は、以下の非限定的な実施形態を提供する。
1)ヒト白血球抗原G(HLA-G)に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
a)配列番号50の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号51の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2、及びLCDR3、又は
b)配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号53のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号55のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
d)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号57のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
e)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号59のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
f)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号61のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
g)配列番号62のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号63のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
h)配列番号64のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号65のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
i)配列番号66のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号67のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
j)配列番号68のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号69のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、単離タンパク質。
2)
a)それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
b)それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
c)それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
d)それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
e)それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
f)それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
g)それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
h)それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
i)それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、実施形態1に記載の単離タンパク質。
3)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb、又はVHHである、実施形態1又は2に記載の単離タンパク質。
4)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、Fabである、実施形態3に記載の単離タンパク質。
5)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、scFvである、実施形態3に記載の単離タンパク質。
6)scFvが、N末端からC末端に向かって、VH、第1のリンカー(L1)、及びVL(VH-L1-VL)、又はVL、L1、及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態5に記載の単離タンパク質。
7)L1が、
a)約5~50個のアミノ酸、
b)約5~40個のアミノ酸、
c)約10~30個のアミノ酸、又は
d)約10~20個のアミノ酸を含む、実施形態6に記載の単離タンパク質。
8)L1が、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む、実施形態6に記載の単離タンパク質。
9)L1が、配列番号8のアミノ酸配列を含む、実施形態8に記載の単離タンパク質。
10)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む、実施形態1~9のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
11)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
a)配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
b)配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
c)配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
d)配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
e)配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
f)配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
g)配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
h)配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
i)配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
j)配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、実施形態10に記載の単離タンパク質、
12)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む、実施形態1~11のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
13)タンパク質が、半減期延長部分にコンジュゲートされる、実施形態1~12のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
14)半減期延長部分が、免疫グロブリン(Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン、又はポリエチレングリコールである、実施形態13に記載の単離タンパク質。
15)単離タンパク質が、単一特異性タンパク質である、実施形態1~14のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
16)単離タンパク質が、多重特異性タンパク質である、実施形態1~14のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
17)多重特異性タンパク質が、二重特異性タンパク質である、実施形態16に記載の単離タンパク質。
18)多重特異性タンパク質が、三重特異性タンパク質である、実施形態16に記載の単離タンパク質。
19)免疫グロブリン(Ig)定常領域又はIg定常領域のその断片を更に含む、実施形態1~18のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
20)Ig定常領域の断片が、Fc領域を含む、実施形態19に記載の単離タンパク質。
21)Ig定常領域の断片が、CH2ドメインを含む、実施形態19に記載の単離タンパク質。
22)Ig定常領域の断片が、CH3ドメインを含む、実施形態19に記載の単離タンパク質。
23)Ig定常領域の断片が、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態19に記載の単離タンパク質。
24)Ig定常領域の断片が、ヒンジの少なくとも一部分、CH2ドメイン、及びCH3ドメインを含む、実施形態19に記載の単離タンパク質。
25)Ig定常領域の断片が、ヒンジ、CH2ドメイン、及びCH3ドメインを含む、実施形態19に記載の単離タンパク質。
26)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端にコンジュゲートされる、実施形態19~25のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
27)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端にコンジュゲートされる、実施形態19~25のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
28)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片にコンジュゲートされる、実施形態19~27のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
29)L2が、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む、実施形態41に記載の単離タンパク質。
30)多重特異性タンパク質が、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態16~29のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
31)リンパ球が、Tリンパ球である、実施形態30に記載の単離タンパク質。
32)T細胞が、CD8T細胞である、実施形態30に記載の単離タンパク質。
33)リンパ球が、ナチュラルキラー(NK)細胞である、実施形態30に記載の単離タンパク質。
34)多重特異性タンパク質が、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態16~33のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
35)多重特異性タンパク質が、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態34に記載の単離タンパク質。
36)CD3εに結合する抗原結合ドメインが、
a)配列番号361の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号368のLCDR2、及び配列番号369のLCDR3、
b)配列番号339のVH及び配列番号340のVL、
c)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号370のLCDR3、
d)配列番号339のVH及び配列番号341のVL、
e)配列番号339のVH及び配列番号342のVL、
f)配列番号339のVH及び配列番号343のVL、
g)配列番号339のVH及び配列番号344のVL、
h)配列番号339のVH及び配列番号345のVL、
i)配列番号364のHCDR1、配列番号365のHCDR2、配列番号366のHCDR3、配列番号371のLCDR1、配列番号372のLCDR2、及び配列番号373のLCDR3、
j)配列番号346のVH及び配列番号347のVL、又は
k)配列番号348のVH及び配列番号349のVLを含む、実施形態48に記載の単離タンパク質。
37)Ig定常領域又はIg定常領域の断片が、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4アイソタイプである、実施形態19~36のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
38)Ig定常領域又はIg定常領域の断片が、タンパク質のFcγ受容体(FcγR)への低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む、実施形態19~37のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
39)タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異が、L235A/D265S、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S、及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、実施形態38に記載の単離タンパク質。
40)Ig定常領域又はIg定常領域の断片が、タンパク質のFcγRへの増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む、実施形態19~37のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
41)タンパク質のFcγRへの増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異が、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、実施形態40に記載の単離タンパク質。
42)FcγRが、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、若しくはFcγRIII、又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態38~41のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
43)Ig定常領域又はIg定常領域の断片が、タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異を含む、実施形態19~42のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
44)タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異が、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A、及びH435Rからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、実施形態43に記載の単離タンパク質。
45)タンパク質が、Ig定常領域のCH3ドメインに少なくとも1つの変異を含む、実施形態19~44のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
46)Ig定常領域のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異が、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V、及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、実施形態45に記載の単離タンパク質。
47)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインと、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、単離多重特異性タンパク質。
48)リンパ球抗原が、T細胞抗原である、実施形態47に記載の単離多重特異性タンパク質。
49)T細胞抗原が、CD8T細胞抗原である、実施形態47に記載の単離多重特異性タンパク質。
50)リンパ球抗原が、NK細胞抗原である、実施形態47に記載の単離多重特異性タンパク質。
51)リンパ球抗原が、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、又はNKG2Cである、実施形態47~50のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
52)リンパ球抗原が、CD3εである、実施形態51に記載の単離多重特異性タンパク質。
53)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインが、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb、又はVHHを含む、実施形態47~52のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
54)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインが、Fabを含む、実施形態53に記載の単離多重特異性タンパク質。
55)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインが、scFvを含む、実施形態53に記載の単離多重特異性タンパク質。
56)scFvが、N末端からC末端に向かって、VH、第1のリンカー(L1)、及びVL(VH-L1-VL)、又はVL、L1、及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態55に記載の単離多重特異性タンパク質。
57)L1が、
a)約5~50個のアミノ酸、
b)約5~40個のアミノ酸、
c)約10~30個のアミノ酸、又は
d)約10~20個のアミノ酸を含む、実施形態56に記載の単離多重特異性タンパク質。
58)L1が、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む、実施形態57に記載の単離多重特異性タンパク質。
59)L1が、配列番号8のアミノ酸配列を含む、実施形態58に記載の単離多重特異性タンパク質。
60)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、配列番号70、73、75、78、81、又は85のHCDR1、配列番号71、76、79、82、又は86のHCDR2、配列番号72、74、77、80、83、84、又は87のHCDR3、配列番号88、91、93、95、97、99、101、又は102のLCDR1、配列番号89又は103のLCDR2、及び配列番号90、92、94、96、98、100、又は104のLCDR3を含む、実施形態47~59のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
61)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、
a)それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
b)それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
c)それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
d)それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
e)それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
f)それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
g)それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
h)それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
i)それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、実施形態47~60のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
62)HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
a)配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
b)配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
c)配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
d)配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
e)配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
f)配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
g)配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
h)配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
i)配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
j)配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、実施形態47~61のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
63)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む、実施形態47~61のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
64)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む、実施形態47~63のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
65)リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインが、
a)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号369のLCDR3、
b)配列番号339のVH及び配列番号340のVL、
c)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号370のLCDR3、
d)配列番号339のVH及び配列番号341のVL、
e)配列番号339のVH及び配列番号342のVL、
f)配列番号339のVH及び配列番号343のVL、
g)配列番号339のVH及び配列番号344のVL、
h)配列番号339のVH及び配列番号345のVL、
i)配列番号364のHCDR1、配列番号365のHCDR2、配列番号366のHCDR3、配列番号371のLCDR1、配列番号372のLCDR2、及び配列番号373のLCDR3、
j)配列番号346のVH及び配列番号347のVL、又は
k)配列番号348のVH及び配列番号349のVLを含む、実施形態47~56のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
66)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域若しくは第1のIg定常領域の断片にコンジュゲートされ、かつ/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインが、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域若しくは第2のIg定常領域の断片にコンジュゲートされる、実施形態47~65のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
67)HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインと第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間、及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に、第2のリンカー(L2)を更に含む、実施形態66に記載の単離多重特異性タンパク質。
68)L2が、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む、実施形態67に記載の単離多重特異性タンパク質。
69)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片が、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4アイソタイプである、実施形態66~68のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
70)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片が、多重特異性タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む、実施形態66~69のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
71)多重特異性タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異が、L235A/D265S、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S、及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、実施形態70に記載の単離多重特異性タンパク質。
72)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片が、多重特異性タンパク質のFcγ受容体(FcγR)への増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む、実施形態66~69のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
73)多重特異性タンパク質のFcγRへの増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異が、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、実施形態72に記載の単離多重特異性タンパク質。
74)FcγRが、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、若しくはFcγRIII、又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態70~73のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
75)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片が、多重特異性タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異を含む、実施形態66~74のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
76)多重特異性タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異が、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A、及びH435Rからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、実施形態75に記載の単離多重特異性タンパク質。
77)第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインに少なくとも1つの変異、及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインに少なくとも1つの変異を含む、実施形態66~76のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
78)第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異が、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V、及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、実施形態77に記載の単離多重特異性タンパク質。
79)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片、及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片が、以下の変異:
a)第1のIg定常領域におけるL235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V、及び第2のIg定常領域におけるL235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W、又は
b)第1のIg定常領域におけるL235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W、及び第2のIg定常領域におけるL235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407Vを含む、実施形態66~78のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
80)治療剤又は造影剤にコンジュゲートされた、実施形態1~46のいずれかに一項に記載の単離タンパク質を含む、免疫コンジュゲート。
81)実施形態1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
82)実施形態1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
83)実施形態82に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
84)実施形態83に記載のベクターを含む、宿主細胞。
85)実施形態1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質を産生する方法であって、タンパク質を発現する条件で実施形態84に記載の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されたタンパク質を収集することと、を含む、方法。
86)治療剤又は造影剤にコンジュゲートされた、実施形態47~79のいずれかに一項に記載の単離多重特異性タンパク質を含む、免疫コンジュゲート。
87)実施形態47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
88)実施形態47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
89)実施形態88に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
90)実施形態89に記載のベクターを含む、宿主細胞。
91)実施形態47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質を産生する方法であって、多重特異性タンパク質を発現する条件で実施形態90に記載の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生された多重特異性タンパク質を収集することと、を含む、方法。
92)対象におけるHLA-G発現がんを治療する方法であって、治療有効量の、実施形態1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質、実施形態47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質、実施形態80若しくは86に記載の免疫コンジュゲート、又は実施形態81若しくは87に記載の医薬組成物を、HLA-G発現がんを治療するのに十分な時間の間、対象に投与することを含む、方法。
93)対象におけるHLA-G発現腫瘍細胞の量を低減する方法であって、実施形態1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質、実施形態47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質、実施形態80若しくは86に記載の免疫コンジュゲート、又は実施形態81若しくは87に記載の医薬組成物を、HLA-G発現腫瘍細胞の量を低減するのに十分な時間の間、対象に投与することを含む、方法。
94)HLA-G発現がんが、肺がん、膵臓がん、腎がん、頭頸部がん、卵巣がん、食道がん、又は乳がんである、実施形態92~93のいずれか一項に記載の方法。
95)単離タンパク質又は単離多重特異性タンパク質が、第2の治療剤と組み合わせて投与される、実施形態92~94のいずれか一項に記載の方法。
96)第2の治療剤が、手術、化学療法、若しくは放射線、又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態95に記載の方法。
97)対象におけるがんの存在を検出する方法であって、がんを有することが疑われる対象に実施形態80又は86に記載の免疫コンジュゲートを投与することと、免疫コンジュゲートが結合している生物学的構造を可視化し、それによってがんの存在を検出することと、を含む、方法。
98)実施形態1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質、実施形態47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質、実施形態80若しくは86に記載の免疫コンジュゲート、又は実施形態81若しくは87に記載の医薬組成物を含む、キット。
99)実施形態1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質に結合する、抗イディオタイプ抗体。
100)HLA-G上のエピトープに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、エピトープが、HHPVFDYE(配列番号485)のアミノ酸配列及びVPSを含む、不連続エピトープである、単離タンパク質。
101)配列番号478又は479のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
102)配列番号478のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
103)配列番号479のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
104)配列番号490のアミノ酸配列を含む、実施形態102に記載の単離タンパク質。
105)配列番号489及び447のアミノ酸配列を更に含む、実施形態102又は104に記載の単離タンパク質。
106)配列番号439のアミノ酸配列を更に含む、実施形態105に記載の単離タンパク質。
107)配列番号465及び468のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
108)配列番号466及び469のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
109)配列番号467及び470のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
本明細書において開示した実施形態のいくつかを更に説明するために、以下の実施例を提供する。これらの実施例は、例示を目的とするものであって、本開示の実施形態を制限するものではない。
実施例1.HLA-G細胞株の生成。
MHCクラスIタンパク質:HLA-A(Uniprot P01892)、HLA-B(Uniprot P18464)、HLA-C(Uniprot P30508)、及びHLA-E(Uniprot P13747)を含む全てのHLAの発現を欠く(したがって、NK細胞ベースの殺傷に好適である)K562慢性骨髄性白血病細胞株(ATCC、CCL-243)を、pCDHレンチウイルスベクターを使用して形質導入して、レンチウイルス粒子においてHLA-G1-IRES(内部リボソーム侵入部位)-β-2-ミクログロブリン(β2M、LPP-CS-Z7412-I0035-02-200、Genecopoeia)又はヒトHLA-G(C42S)-IRES-β2M(LPP-CS-Z7412-I0035-01-200、Genecopoeia)を発現させ、IMDM、10%FBS中で培養した。第1継代における、安定なHLA-G発現を確実にするための、10μg/mlのピューロマイシン(Gibco、A1113803)での選択。密度がおよそ3~4日ごとに約3×10個/mlに達したら、細胞を1:10に分割した。
実施例2:HLA-G抗体の生成。
抗HLA-G抗体は、OmniRat(登録商標)トランスジェニックヒト化ラットを使用して生成した。OmniRat(登録商標)は、キメラヒト/ラットIgH遺伝子座(ラットC遺伝子座に連結された天然立体構造の22のヒトV、全てのヒトD及びJセグメントを含む)を、完全なヒトIgL遺伝子座(Jκ-Cκに連結された12のVκ及びJλ-Cλに連結された16のVλ)と共に含有する。(例えば、Osborn,et al.(2013)J Immunol 190(4):1481-1490を参照のこと)。したがって、このラットは、ラット免疫グロブリンの発現減少を示し、免疫化に応答して、導入されたヒト重鎖及び軽鎖の導入遺伝子がクラススイッチ及び体細胞変異を受けて、完全にヒトの可変領域を有する高親和性キメラヒト/ラットIgGモノクローナル抗体が生成される。OmniRat(登録商標)の調製及び使用、並びにこのようなラットが有しているゲノム改変は、国際公開第14/093908号に記載されている。
OmniRat(登録商標)ラットを、組換えヒトHLA-G1又は組換えヒトHLA-G5のいずれかのαサブユニット、α1、α2、及びα3ドメインを含有するが、膜貫通領域を欠く、β2mサブユニット及びヒストンH2Aに融合されたHLA-Gの可溶性アイソフォーム、HLA-G1を発現するK562細胞、又はC42S変異を有するHLA-G1細胞外ドメインをコードするDNAを含む構築物を使用して免疫した(表1)。場合によっては、安定性を高めるためにヒストンH2Aペプチドを抗原に融合させた。表4は、抗原の配列を示す。OmniRat(登録商標)ラットの免疫化は、ベルギーで行った。
表4.抗体を生成するために使用される抗原の配列。
H2Aペプチドに下線を付す。β2Mサブユニットを太字で強調する。His、Avi-、及びGly-Serタグは、イタリック体である。
HYB:420については、OmniRatを、組換えヒトHLA-G1、ヒトHLA-G5、及びカニクイザルMafa-AG(HLA-G1のホモログ)タンパク質を用いた反復免疫複数部位(Repetitive Immunizations Multiple Site、RIMMS)プロトコルに従うことによって、週2回、合計12回の追加免疫のために免疫した。最終細胞追加免疫を、K562細胞由来のhHLA-G1 K562発現細胞株(ATCC(登録商標)CCL-243(商標))を使用して行った。血清力価は、免疫原をプレート上にコーティングした固相ELISAによって決定した。流入領域リンパ節を、ハイブリドーマ生成のためのFO骨髄腫細胞(ATCC(登録商標)CRL-1646(商標))とのリンパ球融合のために採取した。
HYB:423に関しては、OmniRatをヒトHLA-G pDNA(pDR000057441(表3);C>Sバリアント)で脛骨筋を介して免疫し、その直後にインビボ電気穿孔を複数回行った。ラットは、ヒト及びカニクイザルHLA-G過剰発現細胞の両方の組み合わせの最終追加免疫を受けた。流入領域リンパ節を収集し、ハイブリドーマ生成のためにFO骨髄腫細胞と融合させた。
HYB:421については、OmniRatをヒトHLA-G pDNAで各脛骨筋に免疫し、続いてインビボ電気穿孔を行った。力価を評価し、25日目に0~800の範囲であった。ラットを数ヶ月間休ませ、次いでpDNAで更に免疫し、続いてヒトHLA-Gを外因的に過剰発現するK562細胞で最終追加免疫した。より低い流入領域リンパ節を下流のハイブリドーマ生成に使用した。
下流スクリーニングのための抗体クローンを選択するために、ハイブリドーマ上清を、ヒトHLA-Gのみを発現する細胞に結合し、HLA-A、HLA-B、及びHLA-Cを外因的に発現する細胞、又は細胞表面MHCクラスI抗原を発現しない野生型K562細胞には結合しないそれらの能力についてスクリーニングした。K562-HLA-Gへの>20倍高い結合及びK562-HLA-A/B/Cへの10倍低い結合(アイソタイプ対照と比較して)を示した上清を、v領域配列決定及びクローニングのために選択した。モノクローナル抗体を、エフェクター機能を欠くサイレントフォーマット(IgG4 PAA又はIgG1 AAS、ここで、「PAA」は、EU番号付けにおけるP228S、L234A、L235Aを示し、「AAS」は、L234A、L235A、D265Sの変異を示す)及び正常なエフェクター機能を有する活性フォーマット(IgG1)の両方で生成した。抗体をCHO細胞からの上清中で発現させ、プロテインA親和性クロマトグラフィによって単離した。次いで、組換え抗体を、HLAーG発現細胞に対する選択性について、並びに組換えHLAーG(MHGW2)に結合するそれらの能力について(上記のように)再スクリーニングした。これらの分析から、48個の独特なv領域のパネルを同定し、8個の独特なv領域を更なる分析のために選択した。MHGB688及びMHGB694に由来する、これらの8つのv領域のうちの2つは、それぞれMHGB738及びMHGB737をもたらすように生殖系列最適化した。
実施例3.抗HLA-G抗体の構造的特性評価
選択抗HLA-G抗体の可変ドメインは、fabフォーマット、VH-リンカーVL配向のscFvフォーマット、又はVL-リンカー-VH配向のscFvフォーマットで発現させた。
可変ドメインVH、VL、及びCDR
表5は、選択された抗HLA-G抗体のVH及びVLアミノ酸配列を示す。表6は、選択された抗HLA-G抗体のKabat HCDR1、HCDR2、及びHCDR3を示す。表7は、選択された抗HLA-G抗体のKabat LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を示す。表8は、選択された抗HLA-G抗体のChothia HCDR1、HCDR2、及びHCDR3を示す。表9は、抗HLA-GのChothia LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を示す。表10は、選択された抗HLA-G抗体のIMGT HCDR1、HCDR2、及びHCDR3を示す。表11は、抗HLA-GのIMGT LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を示す。表12は、選択された抗HLA-G抗体のAbM HCDR1、HCDR2、及びHCDR3を示す。表13は、抗HLA-GのAbM LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を示す。
生殖系列最適化
抗体のv領域配列を、潜在的な翻訳後修飾のリスク、生殖系列適合性、及びscFvとしてフォーマットするそれらの能力について分析した。2つの抗体、MHGB694及びMHGB688を、生殖系列最適化した。MHGB694のv領域は、2つの生殖系列変異(E46D及びN77H)を含有し、したがって、このv領域を、これらの部位における生殖系列配列へのこれらの残基の逆変異によって最適化して、VHドメインにおけるD46E及びH77Nの変異によってMHGB737可変領域を生成した。MHGB688のv領域は、VHドメインにおけるE1Q、L5Q、E6Q、及びS71Pの変異によって、及びVLにおけるK30E、G66Vの変異によって同様に最適化した。本発明者らは、MHGB688が、脱アミド化のリスクを提示する92~93位(Kabat)での「NS」モチーフも含有することを見出した。MHGB672のVLは、92~93位に「HS」を含有することを除いて、同一のLC-CDRを有していたので、本発明者らは、N92Hを変異させた。この変化の組み合わせは、MHGB738をもたらした。
Fab-Fc及びscFv
HLA-G特異的VH/VLドメインを遺伝子操作して、抗体フォーマットで、又はscFvとして、又は二重特異性抗体のアームとして(Fab-Fc又はscFv-Fcのいずれかとして)発現させた。抗体フォーマット及びFab-Fc二重特異性アームフォーマットは、VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3としての重鎖及びVL-CLとしての軽鎖を含み、IgG2又はIgG4として発現させた。scFv-Fcフォーマットは、VH-リンカー-VL-Fc又はVL-リンカー-VH-Fc配向のいずれかを含んだ。scFvに使用したリンカーは、上記の配列番号8のリンカーであった。scFv-Fc及びFab-Fcを使用して、実施例10に記載されるように二重特異性抗体を生成した。
表14は、選択された抗HLAーG抗体のHCアミノ酸配列を示す。表15は、選択された抗HLAーG抗体のLCアミノ酸配列を示す。表16に、選択された抗HLA-G抗体のHC及びLC DNA配列番号を要約する。表17は、VH-リンカー-VL又はVL-リンカー-VH配向の選択されたscFvのアミノ酸配列を示す。表18は、選択されたscFv-Fcのアミノ酸配列を示す。表19は、scFv-Fcフォーマットの選択された抗HLA-G抗体のscFv及びscFv-Fc DNA配列番号を示す。
配列番号226
CAGGTGCAGCTGCAGCAGAGCGGCCCTGGACTGGTGAAGCCCAGCCAGACCCTGAGCCTGACCTGCGCTATCAGCGGCGATAGCGTGAGCTCCAACAGCGCCGCCTGGAACTGGATCAGGCAGAGCCCTAGCAGGGGCCTGGAATGGCTGGGCAGGACCTACTACAGGAGCAAGTGGTACAACGACTACGCCGTGTCCGTGAAGAGCAGGATCACCATCAACCCCGACACCAGCAAGAACCAGATCAGCCTGCAGCTGAACAGCGTGACCCCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCGGCGACAGAAGGTACGGCATCGTGGGCCTGCCTTTCGCCTACTGGGGCCAGGGAACCCTGGTGACCGTGAGCAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号227
GACATCGTGATGACCCAGAGCCCCGATAGCCTGGCTGTGAGCCTGGGCGAGAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCGTGCTGCACAGCAGCAACAACAAGAACTACCTGACCTGGTTCCAGCAGAAGCCCGGCCAGCCTCCCAAGCTGCTGATCTACTGGGCTAGCACCAGAGAGTCCGGCGTGCCTGACAGGTTCAGCGGAAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCACCAGTACTACAGCACCCCCCCTACCTTTGGCCAGGGCACCAAGGTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号228
CAGGTGCAGCTGCAGCAGAGCGGACCCGGCCTGGTGAAACCCAGCCAGACCCTGAGCCTGACCTGCGCCATCAGCGGCGACAGCGTGAGCAACAACAGCGCCGCCTGGAACTGGATCAGGCAGAGCCCCAGCAGAGGCCTGGAATGGCTGGGCAGGACCTACTACAGGAGCAAGTGGTACAACGACTACGCCGTGAGCGTGAAGAGCAGGATCACCATCAACCCCGACACCTCCAAGAACCAGTTCAGCCTGCAGCTGAACAGCGTGACCCCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGGTATGGCAGCGGCACCCTGCTGTTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGAGCAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号229
GACATCGTGATGACCCAGAGCCCCGATAGCCTGGCTGTGAGCCTGGGAGAGAGGGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCGTGCTGTACAGCAGCAAGAACAAGAACTACCTGGCCTGGTACCAGCAGAAACCCGGCCAGCCCCCCAAGCTGCTGATCTACTGGGCCAGCACAAGGGAAAGCGGCGTGCCCGACAGATTCAGCGGAAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGGCCGAGGATGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAGCACCTTCCCCTACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号230
CAGGTGCAGCTGCAGCAGAGCGGACCCGGACTGGTGAGACCCAGCCAGACCCTGAGCGTGACCTGCGCCATCAGCGGCGACAGCGTGAGCAGCAACAGCGCCAGCTGGAACTGGATCAGGCAGAGCCCCAGCAGAGGCCTGGAGTGGCTGGGAAGGACATACTACAGGAGCGAGTGGTTCAACGACTACGCCGTGAGCGTGAAGAGCAGGGTGACCATCAACCCCGACACCAGCAAGAACCAGCTGAGCCTGCAGCTGAACAGCGTGATCCCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGAGAGGCCAGAATCGGCGTGGCCGGCAAAGGCTTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGTCCAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号231
GACATCGTGATGACCCAGAGCCCTGACTCCCTGGCTGTGAGCCTGGGCGAGAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCGTGCTGTTCAGGAGCAACAACAAGAACTACCTGGCCTGGTTCCAGCAGAAGCCCGGCCAGCCTCCCAAGCTGCTGATCTACTGGGCCAGCACCAGAGAGAGCGGCGTGCCCGATAGATTTAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTTACCCTGACCATCAGCTCCCTGCAGGCCGAGGATGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAGCACCCCCAGAACCTTCGGCCAGGGCACCAAGGTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号232
CAGGTGCAGCTGCAGCAGAGCGGACCTGGCCTGGTGAAGCCCAGCCAGACCCTGAGCCTGACATGCGCCATCAGCGGCGACAGCGTGAGCAGCAATAGGGCCGCCTGGAACTGGATCAGGCAGACCCCTAGCAGGGGCCTGGAATGGCTGGGCAGGACATACTACAGGAGCGAGTGGTACAACGACTACGCCGTGTCCGTGAAGAGCAGGATCACCATCAACCCCGACACCAGCAAGAACCAGTTCAGCCTGCAGCTGAACAGCGTGACCCCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGAGTGAGAGCCGCCGTGCCTTTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGAGCAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号233
GACATCGTGATGACCCAGAGCCCCGATAGCCTGGCTGTGAGCCTGGGCGAGAGGGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCGTGCTGTTTTCCAGCAACAACAAGAACTACCTGGCCTGGTACCAGCAGAAACCCGGCCAGCCCCCCAACCTGCTGATCTACTGGGCCAGCACCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGACAGGTTTAGCGGCAGCGTGAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGGCCGAGGACGTGGCCATCTACTACTGCCAGCAGTACCACAGCACCCCCTGGACATTCGGCCAGGGCACCAAGGTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号234
CAGCTGCAGCTGCAGGAGAGCGGCCCTGGACTGGTGAAGCCCAGCGAGACCCTGAGCCTGATGTGCACCGTGAGCGGCGGCAGCATCACCAGCAGCAGCTACTACTGGGGATGGATCAGACAGCCCCCTGGCAAGGGCCTGGAGTGGATCGGCAACATCTACTACAGCGGCACCACCTACTACAACCCCAGCCTGAAGAGCAGGGTGACCATCAGCGTGGACACCAGCAAGAACCAGTTCAGCCTGAAGCTGAGCAGCGTGACAGCTGCCGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCGCCGGAGCCAGAGACTTCGACAGCTGGGGACAGGGCAGCCTGGTGACCGTGTCCAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号235
GACATCGTGATGACCCAGAGCCCTGATAGCCTGGCCGTGAGCCTGGGAGAGAGAGCCACCATCAACTGCAAGTCCTCCCAGAGCGTGCTGTACAGCTCCAGCAACAAGAGCTACCTGGCCTGGTACCAGCAGAGGCCCGGACAGCCTCCCAAGCTGCTGATCTACTGGGCCAGCACCAGAGAGAGCGGCGTGCCTGACAGGTTTAGCGGCTCCGGCTCCGGCACCGACTTTACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGGCCGAGGATGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAGCACCCCCAGGATGTACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号236
GAGGTGCAGCTGTTGGAGTCAGGTCCAGGACTGGTGAAGCCCTCGCAGACCCTCTCACTCACCTGTGTCATCTCCGGGGACAGTGTCTCTAGCAACAGAGCTGCTTGGAACTGGATCAGGCAGTCCCCATCGAGAGGCCTTGAGTGGCTGGGAAGGACATACTACAGGTCCAAGTGGTATAATGATTATGCAGTATCTGTGAAAAGTCGAATAACCATCAATTCAGACACATCCAAGAACCAGATCTCCCTGCAGTTGAACTCTGTGACTCCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCAAGAGTGAGACCGGGGATCCCATTTGACTACTGGGGCCAGGGAACCCCGGTCACCGTCTCCTCAGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号237
GACATCGTGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGGGCCACCATCAACTGCAAGTCCAGCCAGAGTGTTTTATTCAGCTCCAACAAAAAGAACTACTTAGCTTGGTACCAGCAGAAACCAGGACAGCCCCCTAAGCTGCTCATTTACTGGGCATCTACCCGGGAATCCGGGGTCCCTGACCGATTCAGTGGCAGCGGGTCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGGCTGAAGATGTGGCAGTTTATTACTGTCAGCAATATAATAGTACTCCGTGGACGTTCGGCCAAGGGACCAAGGTGGAGATCAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号238
CAGGTACAGCTGCAGCAGTCAGGTCCAGGACTGGTGAAGCCCTCGCAGACCCTCTCACTCACCTGTGTCATCTCCGGGGACAGTGTCTCTAGCAACAGAGCTGCCTGGAACTGGATCAGGCAGTCCCCATCGAGAGGCCTTGAGTGGCTGGGAAGGACATACTACAGGTCCAAGTGGTATAATGATTATGCAGTTTCTGTGAAAAGTCGAATAACCATCAATTCAGACACATCCAAGAACCAGATCTCCCTGCAGTTGAACTCTGTGACTCCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCAAGAGTGAGACCGGGGATCCCTTTTGACTACTGGGGCCAGGGAACCACGGTCACCGTCTCCTCAGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号239
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGGGCCACCATCAACTGCGAGTCCAGCCAGAGTGTTTTATTCAGCTCCAACAAAAAGAACTACTTAGCTTGGTACCAGCAGAAACCAGGACAGCCCCCTAAGCTGCTCATTTACTGGGCATCTACCCGGGAATCCGGGGTCCCTGACCGATTCAGTGGCAGCGGGTCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAACCGCCTGCAGGCTGAAGATGTGGCAGTTTATTACTGTCAGCAATATAATAGTACTCCGTGGACGTTCGGCCAAGGGACCAAGGTGGAGATCAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号240
GAGGTGCAGCTGTTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCTTTAGCAGCTATGCCATGCACTGGGTCCGCCAGGCCCCAGGGAAGGGGCTGGACTGGGTCTCAGGTATTAGTGGTAGTGGCTTTAGCACATACTATGTAGACTCCGTGAAGGGCCGGTTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGCACACGCTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCCGTATATTACTGTGCGAAAGATAATTTAGTGGCTGGTACCGTCTTTGACTACTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCCTCAGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号241
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCGGGCCAGTCAGAGTATTAGTAGCTGGTTGGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATAAGGCGTCTAGTTTAGAAAGTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAACAGTATAATAGTTATTCGCTCACTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGATATCAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号242
CAAGTACAACTGCAACAAAGTGGTCCTGGGCTCGTGAAGCCTTCCCAGACTCTCAGCCTCACATGCGCTATAAGTGGGGATTCTGTTTCCTCAAATTCAGCAGCCTGGAATTGGATACGACAGTCTCCATCCCGTGGCCTTGAGTGGCTTGGTAGAACTTATTACCGATCCAAGTGGTACAATGATTACGCCGTTTCAGTGAAGTCCCGCATTACTATTAATCCCGACACATCTAAGAATCAAATTTCATTGCAACTGAATAGCGTAACACCCGAAGATACAGCAGTTTATTATTGTGCAGGTGATCGACGCTACGGCATAGTGGGACTTCCTTTCGCCTATTGGGGCCAAGGGACACTGGTCACTGTGTCATCCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTGCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGT
配列番号243
GACATCGTAATGACACAGTCACCAGATTCATTGGCAGTTAGTCTGGGTGAAAGGGCAACAATCAACTGCAAGTCTTCTCAGAGTGTACTGCATAGTTCTAACAATAAGAACTACCTTACCTGGTTTCAACAGAAACCAGGTCAGCCCCCCAAGTTGCTGATTTACTGGGCAAGCACCCGCGAATCCGGCGTTCCCGATCGATTTTCAGGTTCCGGGAGTGGGACCGACTTTACCTTGACCATCTCTTCCTTGCAGGCCGAAGATGTAGCCGTCTATTACTGCCATCAGTATTACTCTACTCCCCCCACATTCGGTCAAGGTACAAAAGTTGAGATAAAACGGACAGTGGCCGCTCCTTCCGTGTTCATCTTCCCACCTTCCGACGAGCAGCTGAAGTCCGGCACAGCTTCTGTCGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCTCGGGAAGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAATGCCCTGCAGTCCGGCAACTCCCAAGAGTCTGTGACCGAGCAGGACTCCAAGGACAGCACCTACAGCCTGTCCTCCACACTGACCCTGTCCAAGGCCGACTACGAGAAGCACAAGGTGTACGCCTGCGAAGTGACCCATCAGGGCCTGTCTAGCCCTGTGACCAAGTCTTTCAACCGGGGCGAGTGT
配列番号244
GAGGTGCAACTCCTTGAATCAGGCGGAGGACTCGTCCAACCTGGAGGGAGTCTTAGGCTTAGCTGTGCAGCCAGTGGCTTTACTTTTAGCAGCTATGCAATGCACTGGGTCAGGCAGGCTCCTGGTAAGGGGCTCGAATGGGTCAGCGGCATATCCGGGTCAGGTTTCTCTACATATTATGTCGATTCTGTAAAAGGACGATTCACCATATCCAGAGACAATTCTAAAAATACCTTGTATCTCCAGATGAACAGCCTGAGAGCAGAAGATACCGCAGTTTATTACTGTGCAAAGGATAATCTGGTTGCCGGGACAGTTTTTGATTATTGGGGGCAAGGCACCCTCGTCACAGTATCCAGTGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTGCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGT
配列番号245
GATATTCAGATGACTCAATCACCTTCAACCCTTAGCGCCTCCGTTGGAGATCGCGTTACCATTACCTGCCGAGCCTCCCAAAGTATCAGCTCATGGTTGGCATGGTATCAACAGAAGCCTGGAAAGGCACCCAAACTTCTGATTTACAAAGCCAGCTCCTTGGAGTCAGGAGTCCCAAGCCGGTTCAGCGGATCTGGGTCAGGGACAGAATTTACCCTGACCATATCTTCCCTTCAGCCCGACGACTTCGCCACTTACTATTGTCAGCAATACAACTCCTATTCCCTGACTTTCGGCGGTGGCACAAAGGTTGACATCAAGCGGACAGTGGCCGCTCCTTCCGTGTTCATCTTCCCACCTTCCGACGAGCAGCTGAAGTCCGGCACAGCTTCTGTCGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCTCGGGAAGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAATGCCCTGCAGTCCGGCAACTCCCAAGAGTCTGTGACCGAGCAGGACTCCAAGGACAGCACCTACAGCCTGTCCTCCACACTGACCCTGTCCAAGGCCGACTACGAGAAGCACAAGGTGTACGCCTGCGAAGTGACCCATCAGGGCCTGTCTAGCCCTGTGACCAAGTCTTTCAACCGGGGCGAGTGT
配列番号246
CAGGTGCAGCTTCAACAGAGCGGACCTGGTCTGGTTAAGCCTTCCCAAACCCTGAGCCTGACTTGTGCTATTTCCGGGGATAGTGTTAGCTCCAATAGGGCAGCATGGAACTGGATCAGACAGTCCCCAAGCCGTGGACTTGAGTGGCTTGGACGTACTTATTACAGGAGTAAATGGTACAATGATTATGCCGTTTCTGTGAAGAGCCGTATTACTATAAACCCAGATACTTCTAAAAATCAAATTTCCCTTCAGCTCAACTCAGTTACACCAGAGGATACTGCAGTCTATTATTGCGCAAGAGTTCGACCTGGCATTCCCTTCGATTATTGGGGGCAGGGGACACCCGTTACTGTGTCCTCAGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTGCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGT
配列番号247
GATATTGTTATGACACAGTCCCCAGATTCATTGGCAGTAAGCCTCGGTGAACGGGCTACTATTAACTGTAAGTCTTCCCAGAGTGTATTGTTCTCTTCAAATAACAAAAACTACCTGGCATGGTATCAGCAAAAGCCTGGTCAACCCCCTAAACTTCTCATATACTGGGCATCCACTCGGGAGAGCGGTGTGCCAGACCGTTTCTCAGGGAGTGTGTCAGGTACAGATTTTACACTCACAATTTCCAGCCTCCAAGCCGAAGACGTTGCAGTATATTATTGCCAACAATATCACTCTACACCTTGGACATTTGGTCAAGGTACTAAAGTCGAAATCAAACGGACAGTGGCCGCTCCTTCCGTGTTCATCTTCCCACCTTCCGACGAGCAGCTGAAGTCCGGCACAGCTTCTGTCGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCTCGGGAAGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAATGCCCTGCAGTCCGGCAACTCCCAAGAGTCTGTGACCGAGCAGGACTCCAAGGACAGCACCTACAGCCTGTCCTCCACACTGACCCTGTCCAAGGCCGACTACGAGAAGCACAAGGTGTACGCCTGCGAAGTGACCCATCAGGGCCTGTCTAGCCCTGTGACCAAGTCTTTCAACCGGGGCGAGTGT
実施例4.抗HLA-G抗体の生物物理学的特性評価
抗HLA-G抗体の熱安定性。
元のv領域及び生殖系列最適化v領域を、scFvフォーマットにおける熱安定性についてスクリーニングした。簡潔に述べると、v領域をscFvフォーマットにクローニングし、Ecoliにおいて発現させた。培養上清を、組換えHLA-Gに結合するそれらの能力についてELISAによって評価した。また、上清サンプルに55、60、又は65℃のいずれかで熱ショックを与え、熱ショックを与えたサンプルの結合を非加熱サンプルと比較した。この分析は、scFvとしてフォーマットされた場合のv領域の熱安定性の推定値を提供した。この分析に基づいて、それぞれMHGB694及びMHGB688の生殖系列最適化バージョンである、MHGB732、MHGB737、及びMHGB738が好ましかった。
図1及び表20は、scFvとしてフォーマットされた場合の熱処理後の組換えHLA-Gに結合するv領域の能力を示す。V領域をEcoliからの上清においてscFvとして発現させ、組換えHLA-Gに結合するそれらの能力についてELISAによって分析した。サンプルを室温で、又は55、60、若しくは65℃で10分間熱処理した後に試験した。B23は、アイソタイプ対照であった。
結合特異性及び親和性
IgG1 mAbフォーマットのv領域を、HLA-Gを発現するが他のMHCクラスI分子を発現しない細胞に特異的に結合するそれらの能力について試験した(表21)。簡単に説明すると、1.5×10個の細胞を1×PBSで2回洗浄し、7mLの1×PBSに再懸濁し、10分間インキュベートした。インキュベーション後、8mLのウシ胎児血清(fetal bovine serum、FBS)を添加し、細胞を300×gで5分間遠心分離することによって洗浄し、10%FBSを補充したDMEM中1×10個の細胞/mLで再懸濁した。次いで、細胞を300×gで5分間遠心分離することによって洗浄し、ヤギ抗ヒトFc A647(Jacksonカタログ番号109-606-098)を補充した染色緩衝液に再懸濁し、4℃で30分間インキュベートした。インキュベーション後、150μLの染色緩衝液を添加し、細胞を300×gで5分間の遠心分離によって洗浄した。細胞を200μLのランニング緩衝液(1mM EDTA、0.1%(v/v)プルロニック酸を補充した染色緩衝液)に再懸濁し、300×gで5分間遠心分離することによって洗浄した。細胞を30mLのランニング緩衝液に再懸濁し、フローサイトメトリーによって抗体結合について分析した。
次に、表面プラズモン共鳴(surface plasmon resonance、SPR)を使用して、mAbとして組換えHLA-Gに結合するそれらの能力について試験した。SPRは、複合体の形成及び解離時の質量の変化を測定することによって、2つの結合パートナー間の相互作用の強度を試験するための無標識技術である。簡潔に述べると、抗体をセンサチップ上に固定化し、これをヤギ抗ヒトFcと結合させた。可溶性HLA-G1細胞外ドメイン(MHGW8)を、固定化した抗体上に流し、会合/解離応答を監視した。センサグラムを1:1ラングミュアモデルに適合させることによって、速度情報(オンレート及びオフレート定数)を抽出した。結合親和性(K)は、速度定数の比(koff/kon)として報告した。抗体親和性(K)は、約77pM~2.6nMの範囲であり、表22に示される。
実施例5.リガンド遮断
HLA-Gは、ある特定の腫瘍型上で過剰発現され、したがって、腫瘍細胞のマーカーとして機能することができる。更に、HLA-Gは、NK細胞などの免疫エフェクター細胞上で発現されるリガンドILT2及びILT4に結合する4,5。HLA-GとILT2/ILT4との間の相互作用は、NK細胞活性の阻害をもたらす。したがって、本発明者らは、ILT2/4と競合的にHLA-Gに結合する抗体が、腫瘍細胞とNK細胞との間の阻害性相互作用を防止し、NK媒介性腫瘍細胞殺傷の増加をもたらすと仮定した。この仮説に取り組むために、本発明者らはまず、競合アッセイを使用して、抗体がHLA-GとILT2/4との間の相互作用を遮断し得るかどうかをアッセイした。HLA-G-デキストラマー複合体とILT2又はILT4受容体を外因的に発現するHEK293T細胞との間の結合は、蛍光シグナルをもたらす。HLA-G-デキストラマーとILT-2/4細胞との間の相互作用と競合するmAbの添加は、蛍光シグナルの減少をもたらす。蛍光シグナル阻害の逆数は、mAbのリガンド遮断阻害に関連した(表22)。簡単に説明すると、組換えビオチン化HLA-G1(MHGW8)は、ストレプトアビジンAPC-デキストラマー(Immudexカタログ番号DX01-APC)に、1つのデキストラマー分子当たりおよそ4つのHLA-G1タンパク質の最終比まで結合した。デキストラマー-HLA-G複合体を、ILT-2を外因的に発現するHEK293T細胞又はILT-4を外因的に発現する細胞と混合し、4℃で30分間インキュベートした。抗HLA-G抗体を各濃度で添加し、デキストラマー-HLA-G複合体と共に30分間、℃でインキュベートした。細胞を添加し(25,000細胞)、4℃で30分間インキュベートした。インキュベーション後、細胞とデキストラマーHLA-G複合体との混合物を遠心分離によって洗浄し、30μLのランニング緩衝液(Thermo BDカタログ番号554657)に再懸濁した。再懸濁した混合物を、Intellicyt(登録商標)iQue Screener Plusを使用するフローサイトメトリーによって蛍光シグナルについて分析した。ゲーティングは、最初に一重項細胞に対して、次いでSytox(商標)Blue Dead Cell染色剤(ThermoFisher)を使用して生細胞に対して、次いでILT-2/4を発現する細胞についてはGFPに対して、次いで結合したデキストラマー-HLA-G複合体についてはAPCに対して行った。MHGB737を除く全ての抗体は、ILT4とのHLA-G相互作用を阻害することができ、MHGB737及びMHGB687を除く全ての抗体は、ILT2との相互作用を阻害することができた(表23)。これは、このキャンペーンにおいて発見された抗体が、腫瘍を標的とし、腫瘍細胞による免疫阻害を軽減することの両方ができることを示唆した。
実施例6.エピトープのマッピング
次いで、本発明者らは、このリガンド結合の阻害が、HLA-G上の同じ結合部位に対するILT2/4との直接競合によるものであるかどうかを問うた。この仮説に取り組むために、本発明者らは、水素-重水素交換ベースのLC-MS(実施例9に記載される)を使用して、ILT-2、ILT-4、MHGB732、又はMHGB738のいずれかについてのHLA-G上のエピトープを同定した(図2)。MHGB732及びMHGB738 Abの両方の結合は、α3ドメイン(成熟タンパク質のアミノ酸残基191~198、配列HHPVFDYE(配列番号485))における同じペプチドを強力に保護し、>30%の重水素化レベルでの平均変化をもたらした。このペプチドはまた、ILT2の存在下で保護され、ILT4の存在下ではより低い程度で保護された。MHGB732及びMHGB738抗体は両方とも、成熟タンパク質、配列VPSの残基249~251からなる第2のエピトープを著しく保護した(10%~30%の重水素化レベルでの平均変化)。エピトープをHLA-G(PDB ID 1YDP)の結晶構造上にマッピングしたところ、MHGB732及びMHGB738 Ab並びにILT2/4についてのエピトープがα3ドメインの膜近位領域に存在することが示された。
実施例7.NK細胞ベースの細胞傷害に対する効果
次いで、本発明者らは、HLA-GとILT-2/4との相互作用の阻害が、NK細胞ベースの細胞傷害を介して抗腫瘍活性を媒介し得るかどうかを問うた。これに取り組むために、本発明者らは、各可変領域を、IgG1、又はエフェクター機能を欠くサイレントIgG4-PAA定常領域のいずれかにクローニングした。次いで、本発明者らは、Fc受容体を発現するNK細胞(NK-92)又はFc受容体を欠くNK細胞(NK cell which lack Fc receptor、NKL)のいずれかによって媒介されるK562-HLA-G細胞の細胞傷害を媒介する各抗体の能力を試験した。簡潔に述べると、HLA-G細胞を過剰発現するK562細胞を、細胞増殖色素として機能するカルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル(Carboxyfluorescein succinimidyl ester、CFSE)で標識した。抗体を、図3A~図8Bにおける希釈に従って96ウェルプレートに希釈した。K562-HLA-G細胞を抗体の各ウェルに添加し、4℃で1時間インキュベートした。NKL細胞を約100,000個の細胞/ウェルで添加し、混合物をIL2及びNKp46(NKL細胞を活性化するため)の存在下、4℃で一晩(NKL細胞)又は4時間(NK-92細胞)インキュベートした。細胞を遠心分離によって洗浄し、生/死染色を含む緩衝液中に再懸濁した。混合物を130μLの染色緩衝液に再懸濁し、FACS Fortessaサイトメーターを使用してフローサイトメトリーによって分析した。NK受容体の非存在下で細胞傷害を媒介し得る抗体は、HLA-GとILT-2/4との間の免疫チェックポイント相互作用を遮断することを介してこの相互作用を媒介すると考えられた(図3A~図8B)。本発明者らは、ILT2を遮断することができる全ての抗体(MHGB687を除く全てのAb)が、24時間アッセイにおいてK562-HLA-G細胞に対するNKL細胞媒介性細胞傷害を増強することができた(図3A、図4A、図5A、図6A、図7A、図8A)が、IgG1ベースの抗体のみがFc受容体媒介性細胞傷害を増強することができたことを見出した。これは、Fc受容体媒介性エフェクター機能の非存在下であっても、リガンド遮断が重要な抗腫瘍機構として機能し得ることを示唆した。
実施例8.mAbのエフェクター機能
本発明者らは、HLA-Gを内因的に発現する絨毛がん細胞株JEG-3(ATCC HTB-36)に対する抗体依存性細胞傷害(ADCC)を介して腫瘍細胞殺傷を更に媒介する抗体の能力を試験した(図9)。抗体を、細胞内に一方向に浸透することができるBATDA色素(Perkin Elmerカタログ番号C136-100)で標識されたJEG-3細胞に添加した。細胞溶解時に、色素は、ユーロピウムを含有する溶液中に放出され、ユーロピウムは、色素と反応して蛍光キレートを形成し、その蛍光シグナルを測定することができる。一晩培養したPBMCを、50:1のE:T比で、5,000個の細胞/ウェルでJEG-3細胞に添加し、混合物を37℃で4時間インキュベートした。細胞混合物をユーロピウム溶液に1:10で添加し、室温で15分間インキュベートし、610nmでの蛍光を監視して、シグナルを決定した。100%の殺傷についての蛍光シグナルを、Triton-X 100界面活性剤と混合したBADTA標識標的細胞を含有するウェルを使用して決定した。
抗HLA-G Abは、インビトロでADCCを示し得るので、本発明者らは、この活性が増強され得るか否かを問うた。いくつかの研究は、10%未満の末端フコシル化Fcを有する抗体が、Fc受容体へのより高い親和性結合に起因して、増強されたエフェクター機能を示すことを示した。したがって、本発明者らは、低フコースCHO宿主においてMHGB732及びMHGB738を生成して、<10%の末端フコースを有する抗体(MHGB738.CLF)を産生した(表24、図10A~D)。陰性対照として、本発明者らは、Fc受容体に結合することができないFc領域を有するMHGB738のバージョンを生成し、このタンパク質をMHGB745と称した。
正常フコース抗体及び低フコース抗体を、JEG-3細胞(図10A)又はRERF-LC-Ad-1細胞(ヒト肺腺がん細胞株、JCRB1020)(図10B)いずれかに対するNK細胞ベースのADCCを誘導するそれらの能力について試験した。フコシルトランスフェラーゼ酵素を天然に低レベルで発現するCHO細胞中における重鎖及び軽鎖をコードする構築物を発現させることによって低フコース抗体を生成し、10%未満のコアフコースを有する抗体の産生をもたらした。エフェクター細胞対標的細胞の比をグラフに示す。アッセイは、上記のADCCアッセイと同じ方法で行った。MHGB745及びアイソタイプ対照の両方は、アッセイにおいてADCCを誘導しなかった。2つのIgG1 Ab、MHGB732、及びMHGB738は、ADCCを誘導することができたが、低フコースFc領域を有する同じ抗体は、約10倍増強されたADCC活性を示した。これは、ADCC増強が低フコース抗体の使用によって得られ得ることを示した。
次に、本発明者らは、補体依存性細胞傷害(CDC)を媒介する抗体の能力を試験した(図10C及び図10D)。簡潔に述べると、アッセイは、DMEM(JEG-3)又はRPMI(RERF-LC-Ad-1)を含有する10%FBS中で実行した。抗体を標的細胞に添加し、37℃で30分間インキュベートした。インキュベーション後、15~20%(ストック濃度)のウサギ補体(Cedarlaneカタログ番号CL3441-S)及び熱不活性化補体をそれぞれ25μL/ウェルの体積でウェルに添加した。混合物を37℃で4~12時間インキュベートした。標的細胞溶解を、100μLのCellTitre-Glo(Promegaカタログ番号G9242)試薬を添加し、続いて室温で10分間インキュベートすることによって検出する。発光を、Tecan Microplate reader SPARK(登録商標)を用いて監視した。2つのIgG1抗体、MHGB732、及びMHGB738は、CDCを媒介しなかった。IgG1 Abは、CDCを媒介することができなかったので、本発明者らは、CDC活性を特異的に増強することが示されたK248E、T437R(RE)変異を有するIgG1 Fcにv領域をクローニングした。IgG1対応物と同一のv領域を有するこれらのAbは、CDC活性を媒介することができた。本発明者らは、RE Fcバリアントが低フコースAbにおけるADCC活性増強に影響を及ぼすかどうか、及び低フコースFcがRE FcバリアントのCDC活性に影響を及ぼすかどうかを問うた。低フコース宿主(<10%のフコシル化Fcを有する)、MHGB752、及びMHGB758において産生されたRE Abは、低フコースIgG1 Ab MHGB732及びMHGB738と同一のADCC活性を有した(図10A及び図10B)。同様に、低フコース宿主において産生されたRE Abは、正常フコース宿主において産生されたRE Abと同一のCDC活性を有した(図10C及び図10D)。
実施例9-CD3抗体の生成
免疫
抗CD3抗体CD3B376及びCD3B450の生成は、米国特許出願公開第2020/0048349号に記載されている。CD3B219が特色であるヒト化抗CD3v領域は、市販の抗体SP34-2(BD Biosciences 551916)に由来した。
以下に記載のAblexisトランスジェニックマウスプラットフォームを使用して、追加の抗CD3抗体を生成した。13匹のカッパマウス及び12匹のラムダマウスを含むAblexisマウスを、TRCW5(配列番号336)で免疫した。TRCW5は、Kim et al,JMB(2000)302(4):899-916によって報告されているように、26アミノ酸リンカーによってCD3δの細胞外領域に融合されたCD3εの細胞外領域で構成される。このポリペプチドは、そのC末端に、部位特異的ビオチン化に使用されるC末端Aviタグを有するヒトIgG1 Fcドメインを有していた(Fairhead & Howarth,Methods Mol Biol(2015);1266:171-184)。
TRCW5(配列番号336):
FKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYKDKESTVQVHYRMGSADDAKKDAAKKDDAKKDDAKKDGSDGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDEDHLSLKEFSELEQSGYYVCYPRGSKPEDANFYLYLRARVSPPSPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKGGGLNDIFEAQKIEWHE
マウスを週2回、7週間にわたって免疫した。42日目に、6箇所の皮下及び2箇所の皮内注射を含む8部位に広げて50μgのTRCW5及び50μgのCD40 mAbを投与することによって、マウスをハイブリドーマ融合のためにブーストした。最終的なブーストについては、マウスに、4.74×107細胞/mLで、CD3εを含むT細胞受容体複合体を内因的に発現するT細胞株であるJurkat細胞を20μL注射した((Schneider et al(1977)Int.J.Cancer,19(5):621-6)。
リンパ節及び脾臓をマウスから摘出し、コホートごとに融合を実施した。リンパ節細胞をカウントし、FO骨髄腫細胞(ATCC(CRL-1646))と1:1の比で合わせ、抗体スクリーニングの前に37℃で10日間インキュベートした。次いで、製造指示書に従って、プレート(ELISA、Thermoカタログ番号34022)上に非特異的に固定化されたTRCW5を使用するか、又はビオチン化TRCW5(SPARCL ELISA、Lumigen)へのストレプトアビジンコンジュゲーションのいずれかによって、ハイブリドーマ融合細胞からの上清を、TRCW5への結合についてELISAによってアッセイした。ELISAアッセイは、0.5ug/mLのTRCW5及び0.5ug/mLのHVEM-Fc(R&Dカタログ番号365-HV)でプレートをコーティングすることによって、4℃で一晩実施した。4℃で一晩、リン酸緩衝生理食塩水(phosphate-buffered saline、PBS)中0.4%(w/v)ウシ血清アルブミン(bovine serum albumin、BSA)を添加することによって、プレートをブロッキングした。0.02%(v/v)Tween 20を補充した1×PBSでプレートを洗浄した。各ウェルに対し、50uLのハイブリドーマ上清を適用し、室温で1時間インキュベートした。結合した抗体は、ブロッキング緩衝液で1:10,000に希釈した西洋ワサビペルオキシダーゼにコンジュゲートしたヤギ抗マウスIgG Fc(Jacksonカタログ番号115-036-071)の添加、続いて室温での30分間インキュベートによって検出した。3,3,5,5’-テトラメチルベンジジン(tetramethylbenzidine、TMB)基質緩衝液(Thermoカタログ番号34022)を25uL/ウェルで添加し、暗所で10分間インキュベートした。25uL/ウェルの4M H2SO4を添加することによって反応を停止させた。BioTek(登録商標)Epoch2マイクロプレートリーダーを使用して、450nmで発光を読み取った。バックグラウンドよりも少なくとも3倍高いシグナルを有するヒットを選択した。
2つのアッセイフォーマットの結果、426ヒット(ELISAから264ヒット、SPARCL ELISAから194、70ヒットは両方のアッセイで同定された)が得られた。これら426個の初期ヒットのうち、49個のELISA、及び32個のSPARCL ELISAヒットを確認した。陽性バインダーに対応するハイブリドーマ融合物を再度供給し、フローサイトメトリーを使用して、Jurkat細胞に結合する能力について試験した。結果は、平均蛍光指数(MFI、表25を参照されたい)に基づいて、クローン003_F12、クローン036_E10、及びクローン065_D03を含む3つの抗体が、CD3を内因的に発現するJurkat細胞に対して著しい結合を示すことを示唆した。クローン003_F12及び036_E10(ヒトカッパマウスから)は、ELISAによってヒトカッパ軽鎖について陽性であることが確認されたが、クローン065_D03(ヒトラムダマウスから)は、ヒトラムダについて陰性であった。次いで、これら3つのクローンの可変遺伝子を配列決定した。
次に、これら3つのクローンを、初代ヒト及びカニクイザルT細胞に結合する能力についてスクリーニングした。簡潔に述べると、初代ヒト及びカニクイザル汎T細胞をフロー染色緩衝液中1×10個の細胞/mLで再懸濁させ、細胞を50,000個の細胞/ウェルで播種した。各ウェルに、50uLのハイブリドーマ上清を添加し、混合物を氷上で30分間インキュベートした。インキュベーション後、200μLの染色バッファを添加し、300×Gで5分間遠心分離することによって細胞をペレット化した。Alexa-647にコンジュゲートした抗マウスIgGを、50μLの総体積で染色バッファ中2μg/mLで添加し、氷上で30分間インキュベートした。150μLの染色バッファを添加し、300×Gで5分間遠心分離することによって細胞をペレット化した。細胞を、1:1,000希釈したSytox green dead cell stainを含有するランニングバッファ30μLに再懸濁させ、iQue Screenerで実験した。細胞をFCS対SCSでゲーティングして、残屑を除去した。シングレットをSCS-A対SCS-Hでゲーティングし、シングレット集団から、Sytox greenによる低-陰性についてBL1チャネルを用いて生細胞を選択した。RL1(Alexa-647)幾何平均により試験物質を陰性対照と比較することによって、CD3結合を評価した。このアッセイにおいて、クローン065_D03は、最も高い細胞結合シグナルを示した(図11A~図11B)。
次いで、クローン065_D03の可変領域をIgG1骨格にクローニングして、CD3B815と称される抗体を得た(配列を表26に示す)。Jurkat細胞への結合についてCD3B815を再度スクリーニングしたところ、Jurkat細胞への陽性結合を示した。
CD3結合ドメインのヒト化及びscFvフォーマット化
CD3B815のv領域の軽鎖(LC)を、scFvフォーマットでヒト化した。簡潔に述べると、CD3B815からのLCをヒトIGHV3-2104生殖細胞系にグラフトし、ヒトからマウスへの復帰変異について2つの位置(Kabatに従うY49K及びL78V)を同定した。この結果、Y49K、L78Vのいずれか、又はY49K及びL78Vの両方を有するバリアントが得られた。CD3B815からのLCはまた、92~93位における脱アミド化のリスクを提示するNSモチーフを含んでいた。したがって、生成されたいくつかのバリアントもN92Gを含んでいた。これらのバリアント及び関連する変異を表27に記載し、VH及びVLアミノ酸及び核酸配列を表28及び29に示す。CDR配列を、表30~32に示す。
表28は、選択された抗CD3抗体のVH及びVLアミノ酸配列を示す。表29は、選択された抗CD3抗体のVH及びVL DNA配列を示す。表30は、選択された抗CD3抗体のHCDR1、HCDR2、及びHCDR3アミノ酸配列を示す。表31は、選択された抗CD3抗体のLCDR1、LCDR2、及びLCDR3アミノ酸配列を示す。表32は、抗CD3抗体のCDR及び可変ドメインを示す。図13は、CD3B815、CD3W244、CD3W245、CD3W246、及びCD3W247のVL領域のアラインメントを示す。
コンセンサス配列
図13は、CD3B815、CD3W244、CD3W245、CD3W246、及びCD3W247のVL領域のアラインメントを示す。配列番号374のコンセンサスアミノ酸配列をVL領域について決定し、HCDR及びLCDR残基に下線を付した。
配列番号374
DIQXTQSPXLSXSXGXRVXCRARQSIGTAIHWYQQKX10111213PX14LLIX15YASESISGX16PSRFSGSGSGTDFTLTIX17SX18QX19EDX20AX21YYCQQSX22SWPYTFGX23GTKLEIK
式中、Xは、L若しくはMである、Xは、G若しくはSである、Xは、I若しくはSである、Xは、V若しくはAである、Xは、P若しくはVである、Xは、E若しくはDである、Xは、S若しくはTである、Xは、F若しくはIである、Xは、S若しくはTである、X10は、T若しくはPである、X11は、N若しくはGである、X12は、G若しくはKである、X13は、S若しくはAである、X14は、R若しくはKである、X15は、K若しくはYである、X16は、I若しくはVである、X17は、N若しくはSである、X18は、V若しくはLである、X19は、S若しくはPである、X20は、I若しくはFである、X21は、D若しくはTである、X22は、N若しくはGである、又はX23は、G若しくはQである。
エピトープ同定
水素-重水素交換質量分析(HDX-MS)によって、CD3上のエピトープを決定した。抗体クローンOKT3をHDX実験の対照として使用し、それは、そのCD3ε上のエピトープが結晶構造(PDB ID 1SY6)から知られていたためである(Kjer-Nielsen,L.et al.;Proc Natl Acad Sci USA 101,7675-7680)。
HDX-MSのオンエクスチェンジ実験。血清アルブミンドメインに融合した26-aaリンカー領域と融合したCD3εγで構成された10μLの10μM CD3W220(配列番号375)を、1.2モル過剰のリガンド及び30μLのH2O又は重水素化緩衝液(20mM MES、pH6.4、95%のD2O中の150mM NaCl、又は20mM Tris、pH8.4、95%のD2O中の150mM NaCl)と混合して、又は混合せずにオンエクスチェンジ反応を開始させた。反応混合物を15、50、150、500、又は1,500秒間1.2℃でインキュベートした。オンエクスチェンジした溶液を、冷却した40μLの8M尿素、1M TCEP、pH3.0を添加することによってクエンチし、直ちに分析した。
CD3W220(CD3εγ-HSA-6xHis)(配列番号375):
QDGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDEDHLSLKEFSELEQSGYYVCYPRGSKPEDANFYLYLRARVGSADDAKKDAAKKDDAKKDDAKKDGSQSIKGNHLVKVYDYQEDGSVLLTCDAEAKNITWFKDGKMIGFLTEDKKKWNLGSNAKDPRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMGGGSDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQSPFEDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEPERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLFFAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAWAVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQDSISSKLKECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLYEYARRHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIKQNCELFEQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLSVVLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTFHADICTLSEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFAEEGKKLVAASQAALGLGGGSHHHHHHHH
HDX-MSデータ取得のための全般的な手順。自動HDxシステム(LEAP Technologies,Morrisville,NC)を用いて、HDX-MSサンプル調製を行った。カラム及びポンプは、プロテアーゼ、プロテアーゼXIII型(アスペルギルス・サイトイ(Aspergillus saitoi)由来のプロテアーゼ、XIII型)/ペプシンカラム(w/w、1:1、2.1×30mm)(NovaBioAssay Inc.,Woburn,MA)、トラップ、ACQUITY UPLC BEH C18 VanGuard Pre-column(2.1×5mm)(Waters,Milford,MA)、分析用、Accucore C18(2.1×100mm)(Thermo Fisher Scientific,Waltham,MA)、及びLCポンプ、VH-P10-A(Thermo Fisher Scientific)であった。ローディングポンプ(プロテアーゼカラムからトラップカラムに)を、99%の水、1%のアセトニトリル、0.1%のギ酸で600μL/分に設定した。勾配ポンプ(トラップカラムから分析カラムへ)は、100μL/分において20分間で0.1%ギ酸水溶液中8%→28%のアセトニトリルに設定した。
MSデータ取得。275℃のキャピラリー温度、分解能150,000、及び質量範囲(m/z)300~1,800で、LTQ(商標)Orbitrap Fusion Lumos質量分析計(Thermo Fisher Scientific)を使用して質量分析を実行した。
HDX-MSデータ抽出。BioPharma Finder3.0(Thermo Fisher Scientific)を、HDX実験の前に非重水素化サンプルのペプチド同定に使用した。HDExaminer version 2.5(Sierra Analytics,Modesto,CA)を使用して、HDX実験についてのMS生データファイルから質量中心値を抽出した。
HDX-MSデータ分析。抽出されたHDX-MSデータをExcelで更に分析した。全ての交換時点(1.2℃でpH6.4又はpH8.4)を、pH7.4及び23℃における等価時点に変換した(例えば、1.2℃、pH6.4で15秒は、23℃、pH7.4で0.15秒と等価である;表33)。
結果。抗CD3アームとしてCD3W245を含有する二重特異性抗体であるKLCB91を組換えCD3εと共にインキュベートすることによって、抗原の特定のセグメントにおいて、異なるパターンの全体的な保護及び保護の程度がもたらされた。KLCB91及びOKT3は両方とも、立体配座非同一エピトープを示す非連続セグメント(図14)を保護した。保護されたセグメントをCD3εの結晶構造(PDB 1SY6)にマッピングして、3次元で結合エピトープを可視化した。
CD3ε(Uniprot ID P07766)に結合したOKT3の結晶構造と一致して、OKT3のエピトープは、CD3εの残基29~37、79~84、及び87~89に及ぶペプチドからなることが見出された(配列番号375及び図14)。CD3W245は、OKT3のエピトープと部分的に重複するエピトープに結合し、CD3εのアミノ酸残基29~37、55~63、及び79~84を含んでいた(配列番号375及び図14)。
熱ショック後のヒト化抗CD3 scFvバリアントのCD3への結合。
E.coliにおける発現のために、リンカーGTEGKSSGSGSESKST(配列番号376)(表34)を使用して、VH-VL配向のscFvとして抗CD3分子の可変領域をフォーマットし、次いで、組換えCD3(ホモ二量体CD3εγ-Fc、CD3W147、配列番号377)への結合、T細胞への結合、及び熱安定性についてスクリーニングした。
CD3W147(配列番号377):
QDGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDEDHLSLKEFSELEQSGYYVCYPRGSKPEDANFYLYLRARVGSADDAKKDAAKKDDAKKDDAKKDGSQSIKGNHLVKVYDYQEDGSVLLTCDAEAKNITWFKDGKMIGFLTEDKKKWNLGSNAKDPRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMGSGSLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTFPPSQEEMTKNQVSLRCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTKPVLDSDGSFRLESRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSGGHHHHHH
簡潔に述べると、scFvをコードしている配列を、分泌のためにPelBリーダー配列を有するpADL(商標)-22cベクターにクローニングした。Ecoli細胞をプラスミドで形質転換し、100μg/mLのカルベニシリンを補充した2×YT微生物成長培地において37℃で一晩成長させた。1mMのIPTGを添加することによってタンパク質発現を誘導し、培養物を一晩成長させた。発現後、2,200×gで5分間遠心分離することによって細胞をペレット化し、上清を収集し、ELISAによってビオチン化CD3W147への結合について直接試験した。
ELISA分析のために、ビオチン化CD3W147(配列番号377)を2倍希釈で0.039ug/mL~2.5ug/mLの範囲の濃度でプレート上に固定化し、続いて、室温で45分間インキュベートした。結合したscFvを、ニワトリ抗HA-西洋ワサビペルオキシダーゼを使用して検出し、次いで、化学発光基質で検出した。CD3B815に由来する全ての試験したscFv分子は、CD3eに結合した(図12)。
次いで、フローサイトメトリーを使用して、T細胞に結合する能力についてscFv分子を試験した。簡潔に述べると、ヒトT細胞を解凍し、1×10^6細胞/mLでフロー染色バッファに再懸濁させ、50,000細胞/ウェルで播種した。陽性対照であるCD3W36は、LH-scFvとしてフォーマット化された抗CD3抗体SP34で構成されており、呼吸器合胞体ウイルスからのF-糖タンパク質を標的とするscFvである陰性対照B23を結合の比較のために使用した。Ecoli上清を150μL/ウェルで添加し、4℃で1時間インキュベートした。インキュベーション後、プレートを染色バッファで洗浄し、染色バッファ中のAlexa-647にコンジュゲートした抗His抗体で検出した。インキュベーション後、200μLのIntelliCytランニングバッファを混合物に添加し、細胞を1:1,000 Sytox Green dead cell stainを含有するランニングバッファ30μL中に再懸濁させ、iQue Screenerで分析した。上記のとおり、ゲーティング及び分析を行った。CD3B815に由来する全てのscFv分子が、T細胞結合と一致する平均蛍光指数を示した(表35)。
実施例10:二重特異性HLA-G×CD3抗体の生成
実施例1~3で生成した抗HLA-G抗体のVH/VL領域及び実施例4の抗CD3抗体のVH/VL領域を、二重特異性フォーマットに操作し、IgG1として発現させた。
HLA-G×CD3二重特異性生成のためのCD3 scFvの操作
CD3 VH/VL領域を、配列番号8のリンカーを使用して、VH-リンカー-VL又はVL-リンカー-VH配向のいずれかのscFvとして操作した(表36)。CD3に結合するVH-リンカー-VL又はVL-リンカー-VHのscFv分子を、Fcサイレンシング変異(L234A/L235A/D265S)及び選択的ヘテロ二量体化を促進するように設計されたT350V/L351Y/F405A/Y407V変異を含むscFv-ヒンジ-CH2-CH3フォーマットに更に操作した(表37)。配列番号387又は492のポリペプチドを定常ドメインヒンジ-CH2-CH3として使用した。scFvフォーマット及びscFv-ヒンジ-CH2-CH3フォーマットでの抗CD3分子のDNA配列番号を、表38に示す。
配列番号414(CD3W244_HL)
GAGGTGCAGCTGGTGGAGAGCGGTGGCGGTCTGGTGAAGCCAGGTGGCAGCCTGCGCCTGAGCTGTGCCGCCAGCGGTTTCACCTTCAGCCGCTACAACATGAACTGGGTGCGCCAAGCCCCAGGCAAGGGCCTGGAGTGGGTGAGCAGCATCAGCACCAGCAGCAACTACATCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGGCCGCTTCACCTTCAGCCGCGACAACGCCAAGAACAGCCTGGACCTGCAGATGAGCGGTCTGCGCGCCGAGGACACCGCCATCTACTACTGCACCCGCGGTTGGGGCCCATTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACCGTGAGCAGCGGCGGATCTGAGGGAAAGTCCAGCGGCTCCGGCAGCGAAAGCAAGTCCACCGGCGGAAGCGACATCCAGATGACCCAGAGCCCAAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTCGGCGACCGCGTGACCATCACCTGTCGTGCCCGCCAGAGCATCGGCACCGCCATCCACTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGCCCCAAAGCTGCTGATCTACTACGCCAGCGAGAGCATCAGCGGTGTGCCAAGCCGCTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCGTGCAGCCAGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAGCGGCAGCTGGCCATACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAG
配列番号415(CD3W244_LH)
GACATCCAGATGACCCAGAGCCCAAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTCGGCGACCGCGTGACCATCACCTGTCGTGCCCGCCAGAGCATCGGCACCGCCATCCACTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGCCCCAAAGCTGCTGATCTACTACGCCAGCGAGAGCATCAGCGGTGTGCCAAGCCGCTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCGTGCAGCCAGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAGCGGCAGCTGGCCATACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAGGGCGGATCTGAGGGAAAGTCCAGCGGCTCCGGCAGCGAAAGCAAGTCCACCGGCGGAAGCGAGGTGCAGCTGGTGGAGAGCGGTGGCGGTCTGGTGAAGCCAGGTGGCAGCCTGCGCCTGAGCTGTGCCGCCAGCGGTTTCACCTTCAGCCGCTACAACATGAACTGGGTGCGCCAAGCCCCAGGCAAGGGCCTGGAGTGGGTGAGCAGCATCAGCACCAGCAGCAACTACATCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGGCCGCTTCACCTTCAGCCGCGACAACGCCAAGAACAGCCTGGACCTGCAGATGAGCGGTCTGCGCGCCGAGGACACCGCCATCTACTACTGCACCCGCGGTTGGGGCCCATTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACCGTGAGCAGC
配列番号416(CD3W245_HL)
GAGGTGCAGCTGGTGGAGAGCGGTGGCGGTCTGGTGAAGCCAGGTGGCAGCCTGCGCCTGAGCTGTGCCGCCAGCGGTTTCACCTTCAGCCGCTACAACATGAACTGGGTGCGCCAAGCCCCAGGCAAGGGCCTGGAGTGGGTGAGCAGCATCAGCACCAGCAGCAACTACATCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGGCCGCTTCACCTTCAGCCGCGACAACGCCAAGAACAGCCTGGACCTGCAGATGAGCGGTCTGCGCGCCGAGGACACCGCCATCTACTACTGCACCCGCGGTTGGGGCCCATTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACCGTGAGCAGCGGCGGATCTGAGGGAAAGTCCAGCGGCTCCGGCAGCGAAAGCAAGTCCACCGGCGGAAGCGACATCCAGATGACCCAGAGCCCAAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTCGGCGACCGCGTGACCATCACCTGTCGTGCCCGCCAGAGCATCGGCACCGCCATCCACTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGCCCCAAAGCTGCTGATCAAGTACGCCAGCGAGAGCATCAGCGGTGTGCCAAGCCGCTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGCCAGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAGCGGCAGCTGGCCATACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAG
配列番号417(CD3W245_LH)
GACATCCAGATGACCCAGAGCCCAAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTCGGCGACCGCGTGACCATCACCTGTCGTGCCCGCCAGAGCATCGGCACCGCCATCCACTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGCCCCAAAGCTGCTGATCAAGTACGCCAGCGAGAGCATCAGCGGTGTGCCAAGCCGCTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGCCAGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAGCGGCAGCTGGCCATACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAGGGCGGATCTGAGGGAAAGTCCAGCGGCTCCGGCAGCGAAAGCAAGTCCACCGGCGGAAGCGAGGTGCAGCTGGTGGAGAGCGGTGGCGGTCTGGTGAAGCCAGGTGGCAGCCTGCGCCTGAGCTGTGCCGCCAGCGGTTTCACCTTCAGCCGCTACAACATGAACTGGGTGCGCCAAGCCCCAGGCAAGGGCCTGGAGTGGGTGAGCAGCATCAGCACCAGCAGCAACTACATCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGGCCGCTTCACCTTCAGCCGCGACAACGCCAAGAACAGCCTGGACCTGCAGATGAGCGGTCTGCGCGCCGAGGACACCGCCATCTACTACTGCACCCGCGGTTGGGGCCCATTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACCGTGAGCAGC
配列番号418(CD3W246_HL)
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配列番号419(CD3W246_LH)
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配列番号420(CD3W247_HL)
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配列番号421(CD3W247_LH)
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配列番号435(CD3W248_LH-scFv-Fc)
GACATCTTGCTGACTCAGTCTCCAGGCATCCTGTCTGTGAGTCCAGGAGAAAGAGTCAGTTTCTCCTGCAGGGCCAGACAGAGCATTGGCACAGCCATACACTGGTATCAGCAAAGAACAAATGGTTCTCCAAGGCTTCTCATAAAGTATGCTTCTGAGTCTATCTCTGGGATCCCTTCCAGGTTTAGCGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTTACTCTTACCATCAACAGTGTGGAGTCTGAAGATATTGCAGATTATTACTGTCAACAAAGTGGGAGCTGGCCGTACACGTTCGGAGGGGGGACCAAGCTGGAAATAAAAGGCGGATCTGAGGGAAAGTCCAGCGGCTCCGGCAGCGAAAGCAAGTCCACCGGCGGAAGCGAGGTGCAACTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCCTGGTCAAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCTTCAGTAGATATAACATGAACTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGGTCTCATCCATTAGTACTAGTAGTAATTACATATACTACGCAGACTCAGTGAAGGGCCGATTCACCTTCTCCAGAGACAACGCCAAGAACTCACTGGATCTGCAAATGAGCGGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCTATTTATTACTGTACGAGAGGCTGGGGGCCTTTTGACTACTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCCTCAGAGCCCAAATCTAGCGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCAGCAGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGAGCGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACGTGTACCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCGCCCTCGTGAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号424(CD3W450_LH-scFv)
CAGTCTGCTCTGACCCAGCCTGCCTCCGTGTCTGGCTCTCCCGGCCAGTCCATCACCATCAGCTGTACCGGCACCTCCTCCAACATCGGCACCTACAAGTTCGTGTCCTGGTATCAGCAGCACCCCGGCAAGGCCCCCAAAGTGATGATCTACGAGGTGTCCAAGCGGCCCTCCGGCGTGTCCAACAGATTCTCCGGCTCCAAGTCCGGCAACACCGCCTCCCTGACAATCAGCGGACTGCAGGCCGAGGACGAGGCCGACTACTACTGTGTGTCCTACGCCGGCTCTGGCACCCTGCTGTTTGGCGGCGGAACAAAGCTGACCGTGCTGGGCGGCTCCGAGGGCAAGAGCAGCGGCAGCGGCAGCGAGAGCAAGAGCACCGGCGGCAGCCAAGTGCAACTCCAACAAAGCGGCCCAGGGCTGGTAAAGCCTTCACAGACCCTCTCACTTACTTGCGCAATATCTGGGGACTCCGTGTTTAATAACAATGCTGCATGGAGCTGGATTCGCCAGAGCCCAAGTCGCGGGCTCGAGTGGCTTGGTCGAACCTATTACCGCTCCAAGTGGCTCTATGACTACGCAGTAAGCGTCAAATCACGGATAACAATCAACCCTGACACATCCAAGAATCAGTTTAGTCTGCAACTCAACTCAGTCACCCCTGAGGATACCGCAGTGTATTATTGTGCCAGAGGGTACAGCTCTTCCTTTGATTACTGGGGCCAAGGTACACTGGTAACAGTATCAAGC
配列番号436(CD3W450_LH-scFv-Fc)
CAGTCTGCTCTGACCCAGCCTGCCTCCGTGTCTGGCTCTCCCGGCCAGTCCATCACCATCAGCTGTACCGGCACCTCCTCCAACATCGGCACCTACAAGTTCGTGTCCTGGTATCAGCAGCACCCCGGCAAGGCCCCCAAAGTGATGATCTACGAGGTGTCCAAGCGGCCCTCCGGCGTGTCCAACAGATTCTCCGGCTCCAAGTCCGGCAACACCGCCTCCCTGACAATCAGCGGACTGCAGGCCGAGGACGAGGCCGACTACTACTGTGTGTCCTACGCCGGCTCTGGCACCCTGCTGTTTGGCGGCGGAACAAAGCTGACCGTGCTGGGCGGCTCCGAGGGCAAGAGCAGCGGCAGCGGCAGCGAGAGCAAGAGCACCGGCGGCAGCCAAGTGCAACTCCAACAAAGCGGCCCAGGGCTGGTAAAGCCTTCACAGACCCTCTCACTTACTTGCGCAATATCTGGGGACTCCGTGTTTAATAACAATGCTGCATGGAGCTGGATTCGCCAGAGCCCAAGTCGCGGGCTCGAGTGGCTTGGTCGAACCTATTACCGCTCCAAGTGGCTCTATGACTACGCAGTAAGCGTCAAATCACGGATAACAATCAACCCTGACACATCCAAGAATCAGTTTAGTCTGCAACTCAACTCAGTCACCCCTGAGGATACCGCAGTGTATTATTGTGCCAGAGGGTACAGCTCTTCCTTTGATTACTGGGGCCAAGGTACACTGGTAACAGTATCAAGCGAGCCCAAATCTAGCGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCAGCAGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGAGCGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACGTGTACCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCGCCCTCGTGAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGT
配列番号425(CD3B219_LH-scFv)
CAGACAGTGGTGACCCAGGAACCTAGCCTCACCGTGAGCCCCGGAGGAACCGTGACCCTGACCTGCAGAAGCAGCACCGGCGCCGTGACCACCAGCAACTACGCCAACTGGGTGCAGCAGAAACCTGGCCAGGCCCCTAGAGGCCTGATTGGCGGCACCAATAAGAGGGCCCCCGGAACCCCTGCCAGGTTTAGCGGCAGCCTGCTGGGCGGCAAGGCTGCTCTGACCCTGTCCGGAGTGCAGCCCGAGGATGAGGCCGAGTACTACTGCGCCCTGTGGTACAGCAACCTCTGGGTGTTCGGCGGCGGCACAAAGCTGACCGTGCTCGGCGGCTCCGAGGGCAAGAGCAGCGGCAGCGGCAGCGAGAGCAAGAGCACCGGCGGCAGCGAAGTGCAGCTGGTGGAGAGCGGAGGAGGACTGGTGCAGCCCGGAGGAAGCCTGAGACTGAGCTGCGCCGCCAGCGGCTTTACCTTCAACACCTACGCCATGAACTGGGTGAGACAGGCCCCCGGAAAGGGCCTGGAATGGGTCGCCAGGATCAGGTCCAAGTACAACAACTACGCCACCTACTACGCTGCCAGCGTGAAGGGCAGGTTCACCATCAGCAGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAGACCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGTGAGGCACGGAAACTTCGGCAACAGCTACGTGAGCTGGTTCGCCTACTGGGGCCAAGGCACACTGGTCACAGTGTCCAGC
配列番号437(CD3B219_LH-scFv-Fc)
CAGACAGTGGTGACCCAGGAACCTAGCCTCACCGTGAGCCCCGGAGGAACCGTGACCCTGACCTGCAGAAGCAGCACCGGCGCCGTGACCACCAGCAACTACGCCAACTGGGTGCAGCAGAAACCTGGCCAGGCCCCTAGAGGCCTGATTGGCGGCACCAATAAGAGGGCCCCCGGAACCCCTGCCAGGTTTAGCGGCAGCCTGCTGGGCGGCAAGGCTGCTCTGACCCTGTCCGGAGTGCAGCCCGAGGATGAGGCCGAGTACTACTGCGCCCTGTGGTACAGCAACCTCTGGGTGTTCGGCGGCGGCACAAAGCTGACCGTGCTCGGCGGCTCCGAGGGCAAGAGCAGCGGCAGCGGCAGCGAGAGCAAGAGCACCGGCGGCAGCGAAGTGCAGCTGGTGGAGAGCGGAGGAGGACTGGTGCAGCCCGGAGGAAGCCTGAGACTGAGCTGCGCCGCCAGCGGCTTTACCTTCAACACCTACGCCATGAACTGGGTGAGACAGGCCCCCGGAAAGGGCCTGGAATGGGTCGCCAGGATCAGGTCCAAGTACAACAACTACGCCACCTACTACGCTGCCAGCGTGAAGGGCAGGTTCACCATCAGCAGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAGACCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGTGAGGCACGGAAACTTCGGCAACAGCTACGTGAGCTGGTTCGCCTACTGGGGCCAAGGCACACTGGTCACAGTGTCCAGCGAGCCCAAATCTAGCGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCAGCAGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGAGCGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACGTGTACCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCGCCCTCGTGAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGT
HLA-G×CD3二重特異性生成のためのCD3 Fabの操作
CD3特異的VH及びVL領域を、それぞれVH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3(表39)及びVL-CL(表40)フォーマットに操作し、IgG1として発現させた。Fcサイレンシング変異L234A/L235A/D265S及び選択的ヘテロ二量体化を促進するように設計されたCH3変異T350V/L351Y/F405A/Y407Vを含む配列番号158又は493のポリペプチドを使用して、CD3特異的VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3を生成した(表39)。アイソタイプ対照として、B23B62を使用した。
配列番号158(huIgG1_G1m(17)_AAS_ZWA)
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVSVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYVYPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFALVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号493
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVSVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYVYPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFALVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
VH-CH1-リンカー-CH2-CH3フォーマットの抗CD3分子のDNA配列を表41に示す。
配列番号450(CD3W244、CDRW245、CD3W246、CD3W247、CD3W248 HC cDNA)
GAGGTGCAGCTGGTGGAGAGCGGTGGCGGTCTGGTGAAGCCAGGTGGCAGCCTGCGCCTGAGCTGTGCCGCCAGCGGTTTCACCTTCAGCCGCTACAACATGAACTGGGTGCGCCAAGCCCCAGGCAAGGGCCTGGAGTGGGTGAGCAGCATCAGCACCAGCAGCAACTACATCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGGCCGCTTCACCTTCAGCCGCGACAACGCCAAGAACAGCCTGGACCTGCAGATGAGCGGTCTGCGCGCCGAGGACACCGCCATCTACTACTGCACCCGCGGTTGGGGCCCATTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACCGTGAGCAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCAGCAGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGAGCGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACGTGTACCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCGCCCTCGTGAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号454(CD3W244 LC cDNA)
GACATCCAGATGACCCAGAGCCCAAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTCGGCGACCGCGTGACCATCACCTGTCGTGCCCGCCAGAGCATCGGCACCGCCATCCACTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGCCCCAAAGCTGCTGATCTACTACGCCAGCGAGAGCATCAGCGGTGTGCCAAGCCGCTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCGTGCAGCCAGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAGCGGCAGCTGGCCATACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号455(CD3W245 LC cDNA)
GACATCCAGATGACCCAGAGCCCAAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTCGGCGACCGCGTGACCATCACCTGTCGTGCCCGCCAGAGCATCGGCACCGCCATCCACTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGCCCCAAAGCTGCTGATCAAGTACGCCAGCGAGAGCATCAGCGGTGTGCCAAGCCGCTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGCCAGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAGCGGCAGCTGGCCATACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号456(CD3W246 LC cDNA)
GACATCCAGATGACCCAGAGCCCAAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTCGGCGACCGCGTGACCATCACCTGTCGTGCCCGCCAGAGCATCGGCACCGCCATCCACTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGCCCCAAAGCTGCTGATCAAGTACGCCAGCGAGAGCATCAGCGGTGTGCCAAGCCGCTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCGTGCAGCCAGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAGCGGCAGCTGGCCATACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号457(CD3W247 LC cDNA)
GACATCCAGATGACCCAGAGCCCAAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTCGGCGACCGCGTGACCATCACCTGTCGTGCCCGCCAGAGCATCGGCACCGCCATCCACTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGCCCCAAAGCTGCTGATCTACTACGCCAGCGAGAGCATCAGCGGTGTGCCAAGCCGCTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGCCAGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAGCGGCAGCTGGCCATACACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号458(CD3W248 LC cDNA)
GACATCTTGCTGACTCAGTCTCCAGGCATCCTGTCTGTGAGTCCAGGAGAAAGAGTCAGTTTCTCCTGCAGGGCCAGACAGAGCATTGGCACAGCCATACACTGGTATCAGCAAAGAACAAATGGTTCTCCAAGGCTTCTCATAAAGTATGCTTCTGAGTCTATCTCTGGGATCCCTTCCAGGTTTAGCGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTTACTCTTACCATCAACAGTGTGGAGTCTGAAGATATTGCAGATTATTACTGTCAACAAAGTGGGAGCTGGCCGTACACGTTCGGAGGGGGGACCAAGCTGGAAATAAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
配列番号451(CD3B376 HC cDNA)
CAGGTGCAGCTCCAACAGAGTGGTCCCAGACTCGTGAGACCCTCTCAAACACTCAGTTTGACTTGTGCCATCTCAGGCGATTCAGTTTTCAACAACAATGCAGCTTGGAGCTGGATTAGGCAGTCACCTAGTCGCGGTCTTGAATGGCTTGGGCGTACATACTATCGCTCTAAATGGTTGTATGATTACGCTGTGTCCGTGAAGAGCCGAATCACCGTAAACCCTGATACCTCCAGGAATCAGTTCACATTGCAACTGAATAGTGTGACTCCCGAGGATACTGCACTCTATTATTGTGCCCGAGGATATAGCAGTAGCTTCGACTATTGGGGACAAGGGACACTCGTTACCGTTAGTTCAGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCAGCAGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGAGCGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACGTGTACCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCGCCCTCGTGAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号499(CD3B376 HC cDNA)
CAGGTGCAGCTCCAACAGAGTGGTCCCAGACTCGTGAGACCCTCTCAAACACTCAGTTTGACTTGTGCCATCTCAGGCGATTCAGTTTTCAACAACAATGCAGCTTGGAGCTGGATTAGGCAGTCACCTAGTCGCGGTCTTGAATGGCTTGGGCGTACATACTATCGCTCTAAATGGTTGTATGATTACGCTGTGTCCGTGAAGAGCCGAATCACCGTAAACCCTGATACCTCCAGGAATCAGTTCACATTGCAACTGAATAGTGTGACTCCCGAGGATACTGCACTCTATTATTGTGCCCGAGGATATAGCAGTAGCTTCGACTATTGGGGACAAGGGACACTCGTTACCGTTAGTTCAGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCAGCAGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGAGCGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACGTGTACCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCGCCCTCGTGAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGT
配列番号459(CD3B376 LC cDNA)
CAGTCTGCTCTGACCCAGCCTGCCTCCGTGTCTGGCTCTCCCGGCCAGTCCATCACCATCAGCTGTACCGGCACCTCCTCCAACATCGGCACCTACAAGTTCGTGTCCTGGTATCAGCAGCACCCCGACAAGGCCCCCAAAGTGCTGCTGTACGAGGTGTCCAAGCGGCCCTCTGGCGTGTCCTCCAGATTCTCCGGCTCCAAGTCTGGCAACACCGCCTCCCTGACCATCAGCGGACTGCAGGCTGAGGACCAGGCCGACTACCACTGTGTGTCCTACGCTGGCTCTGGCACCCTGCTGTTTGGCGGAGGCACCAAGCTGACCGTGCTGGGTCAGCCCAAGGCTGCACCCAGTGTCACTCTGTTCCCGCCCTCCTCTGAGGAGCTTCAAGCCAACAAGGCCACACTGGTGTGTCTCATAAGTGACTTCTACCCGGGAGCCGTGACAGTGGCCTGGAAGGCCGATAGCAGCCCCGTCAAGGCGGGAGTGGAGACCACCACACCCTCCAAACAAAGCAACAACAAGTACGCGGCCAGCAGCTATCTGAGCCTGACGCCTGAGCAGTGGAAGTCCCACAGAAGCTACAGCTGCCAGGTCACGCATGAAGGGAGCACCGTGGAGAAGACAGTGGCCCCTACAGAATGTTCA
配列番号452(CD3B450 HC cDNA)
CAAGTGCAACTCCAACAAAGCGGCCCAGGGCTGGTAAAGCCTTCACAGACCCTCTCACTTACTTGCGCAATATCTGGGGACTCCGTGTTTAATAACAATGCTGCATGGAGCTGGATTCGCCAGAGCCCAAGTCGCGGGCTCGAGTGGCTTGGTCGAACCTATTACCGCTCCAAGTGGCTCTATGACTACGCAGTAAGCGTCAAATCACGGATAACAATCAACCCTGACACATCCAAGAATCAGTTTAGTCTGCAACTCAACTCAGTCACCCCTGAGGATACCGCAGTGTATTATTGTGCCAGAGGGTACAGCTCTTCCTTTGATTACTGGGGCCAAGGTACACTGGTAACAGTATCAAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCAGCAGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGAGCGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACGTGTACCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCGCCCTCGTGAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAA
配列番号460(CD3B450 LC cDNA)
CAGTCTGCTCTGACCCAGCCTGCCTCCGTGTCTGGCTCTCCCGGCCAGTCCATCACCATCAGCTGTACCGGCACCTCCTCCAACATCGGCACCTACAAGTTCGTGTCCTGGTATCAGCAGCACCCCGGCAAGGCCCCCAAAGTGATGATCTACGAGGTGTCCAAGCGGCCCTCCGGCGTGTCCAACAGATTCTCCGGCTCCAAGTCCGGCAACACCGCCTCCCTGACAATCAGCGGACTGCAGGCCGAGGACGAGGCCGACTACTACTGTGTGTCCTACGCCGGCTCTGGCACCCTGCTGTTTGGCGGCGGAACAAAGCTGACCGTGCTGGGTCAGCCCAAGGCTGCACCCAGTGTCACTCTGTTCCCGCCCTCCTCTGAGGAGCTTCAAGCCAACAAGGCCACACTGGTGTGTCTCATAAGTGACTTCTACCCGGGAGCCGTGACAGTGGCCTGGAAGGCCGATAGCAGCCCCGTCAAGGCGGGAGTGGAGACCACCACACCCTCCAAACAAAGCAACAACAAGTACGCGGCCAGCAGCTATCTGAGCCTGACGCCTGAGCAGTGGAAGTCCCACAGAAGCTACAGCTGCCAGGTCACGCATGAAGGGAGCACCGTGGAGAAGACAGTGGCCCCTACAGAATGTTCA
配列番号453(CD3B219 HC cDNA)
GAAGTGCAGCTGGTGGAGAGCGGAGGAGGACTGGTGCAGCCCGGAGGAAGCCTGAGACTGAGCTGCGCCGCCAGCGGCTTTACCTTCAACACCTACGCCATGAACTGGGTGAGACAGGCCCCCGGAAAGGGCCTGGAATGGGTCGCCAGGATCAGGTCCAAGTACAACAACTACGCCACCTACTACGCTGCCAGCGTGAAGGGCAGGTTCACCATCAGCAGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAGACCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGTGAGGCACGGAAACTTCGGCAACAGCTACGTGAGCTGGTTCGCCTACTGGGGCCAAGGCACACTGGTCACAGTGTCCAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGTCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCAGCAGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGAGCGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACGTGTACCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCGCCCTCGTGAGCAAGCTCACCGTGGACAAGTCTAGATGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGT
配列番号461(CD3B219 LC cDNA)
CAGACCGTCGTGACCCAGGAACCTAGCCTGACCGTGTCTCCTGGCGGCACCGTGACCCTGACCTGCAGATCTTCTACAGGCGCCGTGACCACCAGCAACTACGCCAACTGGGTGCAGCAGAAGCCAGGCCAGGCTCCCAGAGGACTGATCGGCGGCACCAACAAGAGAGCCCCTGGCACCCCTGCCAGATTCAGCGGATCTCTGCTGGGAGGAAAGGCCGCCCTGACACTGTCTGGCGTGCAGCCTGAAGATGAGGCCGAGTACTACTGCGCCCTGTGGTACAGCAACCTGTGGGTGTTCGGCGGAGGCACCAAGCTGACAGTGCTGGGTCAGCCCAAGGCTGCACCCAGTGTCACTCTGTTCCCGCCCTCCTCTGAGGAGCTTCAAGCCAACAAGGCCACACTGGTGTGTCTCATAAGTGACTTCTACCCGGGAGCCGTGACAGTGGCCTGGAAGGCCGATAGCAGCCCCGTCAAGGCGGGAGTGGAGACCACCACACCCTCCAAACAAAGCAACAACAAGTACGCGGCCAGCAGCTATCTGAGCCTGACGCCTGAGCAGTGGAAGTCCCACAGAAGCTACAGCTGCCAGGTCACGCATGAAGGGAGCACCGTGGAGAAGACAGTGGCCCCTACAGAATGTTCA
HLA-G/CD3二重特異性生成のためのHLA-G Fab-Fcの遺伝子操作
HLA-G特異性VH及びVL領域を、それぞれVH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3及びVL-CLフォーマットに遺伝子操作した。Fcサイレンシング変異L234A/L235A/D265S及び選択的ヘテロ二量体化を促進するように設計されたCH3変異T350V/T366L/K392L/T394Wを含む配列番号462又は494のポリペプチドを使用して、HLA-G特異性VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3を生成した。
配列番号462(huIgG1_G1m(17)_AAS_ZWB)
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVSVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYVLPPSREEMTKNQVSLLCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYLTWPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号494
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVSVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYVLPPSREEMTKNQVSLLCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYLTWPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
配列番号463又は464のポリペプチドを使用して、HLA-G特異性VL-CLを生成した。
配列番号463(ヒトカッパ軽鎖)
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号464(ヒトラムダ軽鎖)
GQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS
HLA-G Fab-Fc HC及びLCのアミノ酸配列をそれぞれ表42及び43に示す。HLA-G Fab-Fc HC及びLCのcDNA配列番号を表44に列挙する。
HLA-G/CD3二重特異性生成のためのHLA-G scFv-Fcの遺伝子操作
実施例2に記載される配列番号8のリンカー(表1)を使用してVH-リンカー-VL又はVL-リンカー-VH配向のいずれかのscFvとして操作されたHLA-G VH/VL領域を、Fcサイレンシング変異(L234A/L235A/D265S)及び選択的ヘテロ二量体化を促進するように設計されたT350V/T366L/K392L/T394W変異を含むscFv-ヒンジ-CH2-CH3フォーマットに更に操作し、IgG1として発現させた。配列番号477又は495のポリペプチドを定常ドメインヒンジ-CH2-CH3として使用した。
配列番号477(huIgG1_G1m(17)-ヒンジ-Fc_C220S_AAS_ZWB)
EPKSSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVSVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYVLPPSREEMTKNQVSLLCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYLTWPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
配列番号495
EPKSSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVSVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYVLPPSREEMTKNQVSLLCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYLTWPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
scFv-ヒンジ-CH2-CH3フォーマット(scFv-Fc)の抗HLA-G分子のアミノ酸配列を表45に示す。scFv-ヒンジ-CH2-CH3フォーマット(scFv-Fc)の抗HLA-G分子のcDNA配列を表46に列挙する。
HLA-G×CD3二重特異性
上記のとおりHL及びLH配向の両方の、Fab-Fcとして操作された抗CD3抗体CD3B376、CD3B450、CD3B219、及びCD3W246のVH/VL領域、並びにscFv-Fcとして操作された抗HLA-G抗体MHGB738、MHGB732、及びMHGB737のVH/VL領域を発現させて、二重特異性抗体を生成し、フォーマットscFv-ヒンジ-CH2-CH3のHLA-G結合アーム並びに重鎖:VH-CH1-リンカー-CH2-CH3及び軽鎖:VL-CLのフォーマットのCD3結合アームを有するHLA-G/CD3二重特異性抗体を得た(表47)。B23B62-Fab-Fcアームを、CD3特異的アームのアイソタイプ対照として使用した。
代替的に、上記のとおり、HL及び/又はLH配向のscFv-Fcとして操作された抗CD3抗体CD3W246、CD3B450、及びCD3B219のVH/VL領域(表47を参照されたい)、並びにFabとして操作された抗HLA-G抗体MHGB738、MHGB732、及びMHGB737のVH/VL領域を発現させて、二重特異性抗体を生成し、重鎖VH-CH1-リンカー-CH2-CH3の及び軽鎖VL-CLのフォーマットのHLA-G結合アーム並びにフォーマットscFv-ヒンジ-CH2-CH3のCD3結合アームを有するHLA-G/CD3二重特異性抗体を得た。抗scFvを生成するために使用されるリンカーは、配列番号8のリンカーである(表47)。
T350V_L351Y_F405A_Y407V CH3変異を1本の重鎖に遺伝子操作し、T350V_T366L_K392L_T394W CH3変異を上記のとおり他の重鎖に遺伝子操作した。加えて、HK2結合アーム及びCD3結合アームの両方を、上記のとおりFcエフェクターサイレンシング変異L234A_L235A_D265Sを含有するように遺伝子操作した。
遺伝子操作された鎖を発現させ、得られた二重特異性構築物を標準的な方法を使用して精製した。二重特異性は、実施例11~13に記載されるように、HLA-G及びCD3へのそれらの結合、それらのインビトロ細胞傷害、免疫チェックポイント応答、並びにインビボ有効性について特性評価した。
実施例11.BsAbフォーマッティング及びインビトロ試験
腫瘍細胞に対するT細胞再指向は、臨床において重要な有望性を示しており、本発明者らは、HLA-G及びT細胞受容体複合体のCD3サブユニットを標的とする二重特異性抗体(bispecific antibody、BsAb)が、HLA-G発現腫瘍細胞に対して細胞傷害を示すかどうかを問うた。リードv領域を、一連のCD3結合再指向アームを有するBsAbとしてフォーマットした(表48)。簡潔に述べると、1ウェル当たり50,000個の細胞の標的細胞(NCI-H2009-b2m)を、1ウェル当たり10nMから開始して、半対数増分で連続的に増加させた濃度の抗体と共にインキュベートした。精製した初代T細胞を3:1の比で添加し、混合物を37℃で72時間インキュベートした。染色溶液を、10^6個の細胞当たり1uLのLIVE/DEAD近赤外染色剤(Dead Cell Stain、L34976、Invitrogen)及び10^6個の細胞当たり5uLのBrilliant violet抗CD25(Biolegendカタログ番号302630)をBD FACS染色緩衝液中に添加して調製した。細胞混合物を、フローサイトメトリーによる加算分析の前にAccutaseで解離させた。細胞をFSC-A対SSC-A及びCFSE(BL-1)対SSC-Aでゲーティングし、非生存腫瘍細胞を、CFSE(BL-1)対近赤外Live/Dead(RL2-H)ゲーティングについて全腫瘍標的細胞集団によって同定した。ForeCyt(Sartorius)アドバンストメトリクスを使用してデータを分析して、腫瘍の細胞傷害を計算した。全てのBsAbは、HLA-G結合v領域がCD3結合アームと対になった場合にT細胞媒介性細胞傷害を増強する能力を示し、EC50値は、HLA-G標的アーム及びCD3標的アームの両方の結合親和性と相関した(表48)。
BsAbを、追加の細胞株Hup-T3及びRERF-LC-Ad-1に対するT細胞活性化及びT細胞ベースの細胞傷害を媒介するそれらの能力について更に試験した(図15A~図15D)。図15A~図15Dは、HLA-G発現腫瘍細胞に対するHC3B125によって媒介される細胞傷害を示す。
2つのBsAb、HC3B125、及びHC3B258は、重鎖におけるC末端リジン、K447を発現するためのコドンの存在(HC3B258)又は非存在(HC3B125)のみが異なっていた。抗体の重鎖のC末端リジンは、通常タンパク質分解的に処理されるので、2つのAbは、同一の質量スペクトルを示した(表49)。更に、それらは、T細胞及びK562-HLA-G細胞の両方に対する熱安定性及び結合親和性などの同一の生物物理学的特性を示した。更に、HC3B258は、HC3B125と同様の細胞傷害特性を示した(図16)。
実施例12.免疫チェックポイント応答の観察
本発明者らは、細胞傷害の機構がエフェクター機能(例えば、ADCC)を特徴とする抗HLA-G mAb、及びCD3×HLA-G BsAbが、HLA-Gを発現する全ての細胞型の殺傷を誘導し得ることを観察した。腫瘍は、多くの場合、PD-L1又はCTLA-4などの免疫細胞を阻害することができる、ある特定の免疫チェックポイントモジュレータの上方制御を介して免疫監視を逃れる。したがって、本発明者らは、CD3×HLA-G BsAbを介したT細胞媒介性細胞傷害のためにがん細胞を標的化することが、腫瘍細胞上の免疫チェックポイントモジュレータの発現を克服することができるかどうかを問うた。本発明者らは、HLA-G発現腫瘍細胞が免疫チェックポイントリガンドを発現したかどうかを測定した(表50)。簡潔に述べると、細胞を実施例11のように培養し、次いで、表50に示される受容体を標的とする市販の抗体で染色した。フローサイトメトリーを用いて蛍光を測定して、各受容体の相対的発現レベルを決定した。興味深いことに、本発明者らは、RERF-LC-Ad1細胞が他の標的細胞よりも有意に高いレベルでPD-L1を発現すること、及びCD3×HLA-G BsAbがRERF-LC-Ad1細胞に対するT細胞ベースの細胞傷害を依然として媒介し得ることを観察した(図15A~図15D)。本発明者らは、T細胞ベースの細胞傷害のための腫瘍細胞上のHLA-Gのα3ドメインを標的とする本発明者らのAbが、腫瘍細胞上の免疫チェックポイントリガンド発現を克服することができたことを観察した。
実施例13.インビボ有効性
患者におけるHLA-G発現と予後不良との間の相関は、ほとんどのタイプのがんにおいて確立されているが、インビボでの腫瘍エスケープにおけるHLA-Gの直接的な役割は、これまで実証されていない。HLA-Gのマウス相同体は存在しないが、ILT-2は存在し、したがって、HLA-Gの役割の研究は、異種移植モデル及びヒト化マウスを必要とする。
Ab及びBsAbを、一連のマウス研究においてインビボで抗腫瘍有効性を媒介するそれらの能力について試験した。(図17A~図17B、表51)に示される研究は、Jackson Laboratoryからのヒト化雌hNSG-SGM3マウス(NOD.Cg-PrkdcscidIl2rgtm1WjlTg(CMV-IL3、CSF2、KITLG)に皮下移植された膵臓腫瘍モデルPAXF1657(Charles River Discovery Research Services Germany GmbH)を用いた有効性実験からなった。3人の異なるドナー(#2595、#2597、及び#5867)からのヒト臍帯血由来のCD34造血幹細胞(hematopoietic stem cell、HSC)を移植されたマウスは、移植の10~11週間後に、HSCの十分な程度の生着(25%を超えるヒトCD45細胞)について、配給業者によってチェックされた。PAXF1657腫瘍を到着の18日後に移植し、生着の程度を無作為化の2日前に再チェックした。実験は、各々1つのPAXF1657腫瘍を有する10匹又は11匹のマウスの8つの群で構成された。絶対腫瘍体積(absolute tumor volume、ATV)を、無作為化の日に、次いで週2回、デジタルキャリパー(S_Cal EVO Bluetooth、Switzerland)を用いた二次元測定によって決定した。腫瘍体積は、式:腫瘍体積=(l×w)×0.5(式中、l=腫瘍の最大直径及びw=幅(垂直直径)(mm単位))に従って計算した。46.7mm~117.7mmの腫瘍体積で、3人のドナーからのHSCを用いてヒト化されたマウスの群の間で可能な限り均一な分布を同時に確保しながら、同等の群平均及び中央値腫瘍体積を目標として、マウスを8つの群に分配した。各抗体を2つ又は3つの用量レベルで評価し、0、3、7、10、14、17、21、24日目に投与した(静脈内、2回/週)。ビヒクル対照群を参照として用いて、全ての群の抗腫瘍効果を評価した。腫瘍成長阻害(Tumor growth inhibition、TGI)は、対照群における変化に対する試験群の腫瘍体積の変化の比較によって処置期間の終わりに決定され、パーセントでデルタTGI値(本文ではTGIと示される)として表される。TGIは、次式:デルタTGI[%]=(1-平均(T-T)/平均(C-C))×100に従って、絶対腫瘍体積を使用して計算し、式中、T及びCが、処置の開始時(すなわち無作為化の日)の試験群及び対照群における絶対腫瘍体積であり、T及びCが、処置期間の終わりの対応する絶対腫瘍体積である。これは、この研究において25日目であった。実験は、27日目に終了した。HC3B125は、hNSG-SGM3マウスにおける腫瘍モデルPAXF1657の成長を著しく阻害した。ビヒクル対照群と比較した腫瘍成長阻害は、評価された3つ全ての用量レベルについて統計的に有意であった(Dunnポスト検定と組み合わせたKruskal-Wallis検定、表50)。腫瘍は、0.002mgのHC3B125群の6/11匹の動物、0.006mgの8/11匹の動物、及び0.02mgの9/11匹の動物において完全に退縮した。実験の終わりに、0.002mg/0.006mg/0.02mgのHC3B125群において、それぞれ6/7/6匹の腫瘍のない生存者がいた。
腫瘍成長は、試験したいずれの用量レベルにおいてもHC3B128によって阻害されなかった。対照群と比較して高用量のHC3B128で群平均腫瘍体積のわずかな低減が観察されたが、その差は、統計的に有意ではなかった(表50)。
n/a=該当なしn.r.=到達していない(すなわち、群中央値RTVは、常に200%/400%未満である)。
抗体のビヒクル:PBS
各群におけるデルタTGI値を、最後の2QW処置が投与された後の最初の測定日(25日目)に、セクション誤差!に示される式に従って計算した。参照ソースが見つかりません。;追加のTGI、T/C、及び腫瘍退縮値については、付録1を参照されたい。
誤差!のセクションに従って、部分的退縮(Partial regression、PR)及び完全な退縮(complete regression、CR)を決定した参照ソースが見つかりません。TFS:腫瘍のない生存者、Td、腫瘍二倍加時間、tq、腫瘍四倍化時間。
HC3B125での処置はまた、HuP-T3細胞株由来異種移植片(cell line derived xenograft、CDX)モデルにおいて腫瘍増殖阻害をもたらし得た(図18、表52)。研究は、T細胞ヒト化NSG(Jackson Laboratories)マウスに皮下移植された膵臓腫瘍モデルHuP-T3(Sigma-Aldrich)(50%Cultrex(R&D Systems)における10e6個の細胞/マウス)を用いた有効性実験からなった。実験は、各々1つのHuP-T3腫瘍を有する10匹のマウスの6つの群を含んだ。7日目に、75mm~150mmの腫瘍体積で、同等の群平均及び中央値腫瘍体積を有することを目的として、マウスを6つの群に無作為化した。マウスに、無作為化と同日の無作為化後に、T細胞を腹腔内移植した(20e6個の細胞/マウス、0.2mL/動物、ALLCELLS 6093 T細胞ドナー)。HC3B125抗体を5つの用量レベルで評価した。全ての群の抗腫瘍効果を、参照としてヌル×CD3処置群を用いて評価した。処置は、T細胞生着の1日後に開始し、8、11、14、17、21、24、28、31、35、38、42、48日目に行った(腹腔内、2回/週)。腫瘍成長阻害は、処置期間の終わりに、ヌル×CD3処置対照群の群平均腫瘍体積の変化に対する試験群の群平均腫瘍体積の変化の比較によって決定し、パーセントでデルタTGI値(本文ではTGIと示される)として表した。腫瘍移植後42日目を最終日としてTGI計算に使用した。実験を、46日目に終了した。HC3B125は、hNSGマウスにおける腫瘍モデルHuPT3の成長を著しく阻害した。ヌル×CD3処置対照群と比較した腫瘍成長阻害は、評価した5つ全ての用量レベルについて統計的に有意であった(表52)。
実施例14.T細胞ヒト化NSGマウスにおける確立された患者由来異種移植片腫瘍モデルにおけるHC3B258の有効性
HLA-G発現とインビボ抗腫瘍効果との間の相関を調査するために、ヒト汎T細胞で腹腔内(intraperitoneally、ip)によってヒト化された雌NOD.Cg-PrkdcscidIl2rgtm1Wjl/SzJ(NSG)マウスにおける、10個のヒト患者由来異種移植片(patient-derived xenograft、PDX)固形腫瘍モデル(Charles River Discovery Research Services Germany GmbH)のパネルにおいてHC3B258抗体を評価した表53。パネル包含のために選択されたPDXモデルは、様々な固形腫瘍適応症にわたる腫瘍モデルを表し、ウェスタンブロット(Western blot、WB)評価によって決定して、HLA-G標的発現の様々なレベル(発現なしを含む)を実証した。
PDXモデルは、患者の外科標本に由来した。連続継代で異種移植片から採取した腫瘍を切除し、3~4mm長の断片に切断し、次いで、NSGマウスの側腹部に皮下(subcutaneously、SC)移植した。腫瘍が100~200mmに達したとき、腫瘍を有するマウスを、全ての群が同様の平均値を有するように、腫瘍体積に基づいて5匹の動物の3つの群に無作為化した。無作為化の日に、マウス当たり0.2mL中2×10細胞のip注射のために、インビトロで活性化及び増殖させたヒト汎T細胞(ALLCELLS、ドナー6093)を1×10細胞/mLの濃度で用いて、動物をヒト化した。T細胞ヒト化の翌日、マウスに、0.03若しくは0.3mg/kgのいずれかのHC3B258、又はビヒクルを合計6用量、週2回静脈内(intravenously、iv)投与した(T細胞ヒト化後1、5、8、12、15、及び19日目)。T-細胞ヒト化マウスに、HC3B258投与の少なくとも30分前に、Fcブロック(クローン2.4G2;BioXCell,)を0.2mg/マウスipで、静脈内免疫グロブリン(intravenous immunoglobulin、IVIG)(Gammagard、NDC#00944-2700-05)を10mg/マウスipで投与して、NSGマウスにおける低Ig環境を補正した。
腫瘍体積は、以下の式を使用して計算し、
腫瘍体積(mm)=(D×d/2)
式中、「D」は、キャリパー測定によって決定して、腫瘍のより大きい直径を表し、「d」は、より小さい直径を表す。少なくとも4匹のマウスが各群に残った場合、処置の終了時(34~42日の範囲)に、生物学的及び統計的有意性を含む抗腫瘍効果を、HC3B258処置群とビヒクル処置対照群との間で比較した。抗腫瘍効果は、腫瘍成長阻害パーセント(%ΔTGI)で表され、処置群と対照群との間の平均腫瘍量の差として定義し、以下のように計算した。
%ΔTGI=([(TVc-TVc0)-(TVt-TVt0)]/(TVc-TVc0))×100
式中、「TV」は、所与の対照群の平均腫瘍量であり、「TVc0」は、所与の対照群の平均初期腫瘍量であり、「TV」は、処置群の平均腫瘍量であり、「TVt0」は、処置群の平均初期腫瘍量である。完全応答(complete response、CR)は、分析の最終日に触知可能な腫瘍がないこととして定義した。ΔTGI分析(InVivoLDA Shiny App Version 4.0、Johnson&Johsnon)を使用して、腫瘍体積測定の統計的有意性を計算した。p≦0.05のとき、群間の差異は有意であるとみなした。
抗HLA-G抗体4H84(Abcam)を使用して、PDX総タンパク質溶解物に対して、ウェスタンブロット(WB)分析を行った。PDX総タンパク質溶解物(各々5mg/mL)をCharles River,Germanyから受領した。各サンプル(10μL)をNuPAGE(登録商標)4~12%Bis-Tris Miniゲルに充填した。MagicMark(商標)XP Western Protein Standard及びFull Range Rainbow Molecular Weight Markerをタンパク質マーカーとして使用した。NuPAGE(登録商標)MOPS SDS泳動緩衝液を使用した。70Vで15分間、続いて200Vで50分間、ゲルを泳動させた。電気泳動後、XCell II Blot Module(ThermoFisher Scientific)を製造業者のプロトコルに従って使用して、ポリフッ化ビニリデン(polyvinylidene fluoride、PVDF)膜にゲルを移した。30Vで2時間ブロッティングした後、膜を室温のOdysseyブロッキング緩衝液中に1時間移した。Odysseyブロッキング緩衝液中で、一次抗体4H84(1:200)及び希釈した抗ビンキュリン(1:5,000)と共に、膜を4℃で一晩インキュベートした。トリス緩衝生理食塩水/0.1%Tween20(TBST)による3~4回の洗浄工程の後、(0.1%Tween20を含有するOdysseyブロッキング緩衝液中1:1,000に希釈した)適切な二次抗体と共に、膜を室温で1時間インキュベートした。TBSTによる3~5回の洗浄工程の後、Odyssey IR造影システム(LI-COR Biosciences)で、700nmで膜をスキャンした。以下のようにデータを分析した。Odyssey Systemの2つのIR蛍光検出チャネルは、HLA-G、及び充填対照として使用されるビンキュリンについての同時2色標的分析を可能にする。両方のチャネルにおける各サンプルの蛍光強度(fluorescence intensity、FI)を決定し(Image Studio)、HLA-GのFI値をビンキュリンのFIで除算することによって正規化した。
いくつかのPDXモデルにおいて、0.03及び0.3mg/kgでのHC3B258処置後に、HLA-Gタンパク質発現がWB>1(PRXF MRI-H1579、LXFA2204、及びRXF488)及びWB0.1~1.0(RXF2706及びPAXF2175)レベルの、強い抗腫瘍効果及び完全応答(CR)が観察された。匹敵するレベルのHLA-Gを発現する他のPDXモデル(RXF616、BXF439、及びMEXF1792)におけるHC3B258による処置は、用量依存的な抗腫瘍効果をもたらし、0.03mg/kgでの処置に対して中程度に応答し、これらのモデルにおける可能な固有の耐性機序を実証した(表53)。いずれの用量レベルでのHC3B258による処置も、陰性HLA-Gタンパク質発現を有するPDXモデルにおいて生物学的に有意な抗腫瘍効果をもたらさなかった。総合すると、これらの結果は、様々なレベルのHLA-G標的発現での強力な特異的抗腫瘍効果を示すが、HLA-G発現の非存在下では効果は存在しない。
有意でない(not significant、ns)と注釈されている場合を除き、対照に対してp≦0.05;CR=完全応答。
参考文献
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3 Morales,P.J.,Pace,J.L.,Platt,J.S.,Langat,D.K.&Hunt,J.S.Synthesis of beta(2)-microglobulin-free,disulphide-linked HLA-G5 homodimers in human placental villous cytotrophoblast cells.Immunology 122,179-188,doi:10.1111/j.1365-2567.2007.02623.x(2007).
4 Carosella,E.D.,Favier,B.,Rouas-Freiss,N.,Moreau,P.&Lemaoult,J.Beyond the increasing complexity of the immunomodulatory HLA-G molecule.Blood 111,4862-4870,doi:10.1182/blood-2007-12-127662(2008).
5 Carosella,E.D.,Rouas-Freiss,N.,Tronik-Le Roux,D.,Moreau,P.&LeMaoult,J.HLA-G:An Immune Checkpoint Molecule.Adv Immunol 127,33-144,doi:10.1016/bs.ai.2015.04.001(2015).
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Claims (107)

  1. ヒト白血球抗原G(HLA-G)に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
    a)配列番号50の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号51の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    b)配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号53のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号55のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    d)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号57のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    e)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号59のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    f)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号61のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    g)配列番号62のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号63のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    h)配列番号64のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号65のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    i)配列番号66のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号67のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3、又は
    j)配列番号68のVHのHCDR1、HCDR2、及びHCDR3、並びに配列番号69のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、単離タンパク質。
  2. a)それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
    b)それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
    c)それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
    d)それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
    e)それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
    f)それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
    g)それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
    h)それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
    i)それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、請求項1に記載の単離タンパク質。
  3. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb、又はVHHである、請求項1又は2に記載の単離タンパク質。
  4. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、Fabである、請求項3に記載の単離タンパク質。
  5. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、scFvである、請求項3に記載の単離タンパク質。
  6. 前記scFvが、N末端からC末端に向かって、VH、第1のリンカー(L1)、及びVL(VH-L1-VL)、又は前記VL、前記L1、及び前記VH(VL-L1-VH)を含む、請求項5に記載の単離タンパク質。
  7. 前記L1が、
    a)約5~50個のアミノ酸、
    b)約5~40個のアミノ酸、
    c)約10~30個のアミノ酸、又は
    d)約10~20個のアミノ酸、を含む、請求項6に記載の単離タンパク質。
  8. 前記L1が、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む、請求項6に記載の単離タンパク質。
  9. 前記L1が、配列番号8のアミノ酸配列を含む、請求項8に記載の単離タンパク質。
  10. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む、請求項1~9のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  11. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
    a)配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
    b)配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
    c)配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
    d)配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
    e)配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
    f)配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
    g)配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
    h)配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
    i)配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
    j)配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、請求項10に記載の単離タンパク質。
  12. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、配列番号265、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む、請求項1~11のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  13. 前記タンパク質が、半減期延長部分にコンジュゲートされる、請求項1~12のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  14. 前記半減期延長部分が、免疫グロブリン(Ig)、前記Igの断片、Ig定常領域、前記Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン、又はポリエチレングリコールである、請求項13に記載の単離タンパク質。
  15. 前記単離タンパク質が、単一特異性タンパク質である、請求項1~14のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  16. 前記単離タンパク質が、多重特異性タンパク質である、請求項1~14のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  17. 前記多重特異性タンパク質が、二重特異性タンパク質である、請求項16に記載の単離タンパク質。
  18. 前記多重特異性タンパク質が、三重特異性タンパク質である、請求項16に記載の単離タンパク質。
  19. 免疫グロブリン(Ig)定常領域又は前記Ig定常領域のその断片を更に含む、請求項1~18のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  20. 前記Ig定常領域の前記断片が、Fc領域を含む、請求項19に記載の単離タンパク質。
  21. 前記Ig定常領域の前記断片が、CH2ドメインを含む、請求項19に記載の単離タンパク質。
  22. 前記Ig定常領域の前記断片が、CH3ドメインを含む、請求項19に記載の単離タンパク質。
  23. 前記Ig定常領域の前記断片が、前記CH2ドメイン及び前記CH3ドメインを含む、請求項19に記載の単離タンパク質。
  24. 前記Ig定常領域の前記断片が、ヒンジの少なくとも一部分、前記CH2ドメイン、及び前記CH3ドメインを含む、請求項19に記載の単離タンパク質。
  25. 前記Ig定常領域の前記断片が、ヒンジ、前記CH2ドメイン、及び前記CH3ドメインを含む、請求項19に記載の単離タンパク質。
  26. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片のN末端にコンジュゲートされる、請求項19~25のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  27. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片のC末端にコンジュゲートされる、請求項19~25のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  28. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、第2のリンカー(L2)を介して前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片にコンジュゲートされる、請求項19~27のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  29. 前記L2が、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む、請求項41に記載の単離タンパク質。
  30. 前記多重特異性タンパク質が、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む、請求項16~29のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  31. 前記リンパ球が、Tリンパ球である、請求項30に記載の単離タンパク質。
  32. 前記T細胞が、CD8T細胞である、請求項30に記載の単離タンパク質。
  33. 前記リンパ球が、ナチュラルキラー(NK)細胞である、請求項30に記載の単離タンパク質。
  34. 前記多重特異性タンパク質が、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む、請求項16~33のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  35. 前記多重特異性タンパク質が、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む、請求項34に記載の単離タンパク質。
  36. 前記CD3εに結合する抗原結合ドメインが、
    a)配列番号364のHCDR1、配列番号365のHCDR2、配列番号366のHCDR3、配列番号371のLCDR1、配列番号372のLCDR2、及び配列番号373のLCDR3、
    b)配列番号346のVH及び配列番号347のVL、
    c)配列番号348のVH及び配列番号349のVL、
    d)配列番号361の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号368のLCDR2、及び配列番号369のLCDR3、
    e)配列番号339のVH及び配列番号340のVL、
    f)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号370のLCDR3、
    g)配列番号339のVH及び配列番号341のVL、
    h)配列番号339のVH及び配列番号342のVL、
    i)配列番号339のVH及び配列番号343のVL、
    j)配列番号339のVH及び配列番号344のVL、又は
    k)配列番号339のVH及び配列番号345のVLを含む、請求項34に記載の単離タンパク質。
  37. 前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片が、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4アイソタイプである、請求項19~36のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  38. 前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片が、前記タンパク質のFcγ受容体(FcγR)への低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む、請求項19~37のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  39. 前記タンパク質の前記FcγRへの低減された結合をもたらす前記少なくとも1つの変異が、L234A/L235A/D265S、F234A/L235A、L234A/L235A、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S、及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、請求項38に記載の単離タンパク質。
  40. 前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片が、前記タンパク質の前記FcγRへの増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む、請求項19~37のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  41. 前記タンパク質の前記FcγRへの増強された結合をもたらす前記少なくとも1つの変異が、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、請求項40に記載の単離タンパク質。
  42. 前記FcγRが、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、若しくはFcγRIII、又はそれらの任意の組み合わせである、請求項38~41のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  43. 前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片が、前記タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異を含む、請求項19~42のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  44. 前記タンパク質の前記半減期を調節する前記少なくとも1つの変異が、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A、及びH435Rからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、請求項43に記載の単離タンパク質。
  45. 前記タンパク質が、前記Ig定常領域のCH3ドメインに少なくとも1つの変異を含む、請求項19~44のいずれか一項に記載の単離タンパク質。
  46. 前記Ig定常領域の前記CH3ドメインにおける前記少なくとも1つの変異が、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V、及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、請求項45に記載の単離タンパク質。
  47. HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインと、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、を含む、単離多重特異性タンパク質。
  48. 前記リンパ球抗原が、T細胞抗原である、請求項47に記載の単離多重特異性タンパク質。
  49. 前記T細胞抗原が、CD8T細胞抗原である、請求項47に記載の単離多重特異性タンパク質。
  50. 前記リンパ球抗原が、NK細胞抗原である、請求項47に記載の単離多重特異性タンパク質。
  51. 前記リンパ球抗原が、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、又はNKG2Cである、請求項47~50のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  52. 前記リンパ球抗原が、CD3εである、請求項51に記載の単離多重特異性タンパク質。
  53. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又は前記リンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインが、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb、又はVHHを含む、請求項47~52のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  54. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又は前記リンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインが、前記Fabを含む、請求項53に記載の単離多重特異性タンパク質。
  55. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又は前記リンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインが、前記scFvを含む、請求項53に記載の単離多重特異性タンパク質。
  56. 前記scFvが、N末端からC末端に向かって、VH、第1のリンカー(L1)、及びVL(VH-L1-VL)、又は前記VL、前記L1、及び前記VH(VL-L1-VH)を含む、請求項55に記載の単離多重特異性タンパク質。
  57. 前記L1が、
    a)約5~50個のアミノ酸、
    b)約5~40個のアミノ酸、
    c)約10~30個のアミノ酸、又は
    d)約10~20個のアミノ酸を含む、請求項56に記載の単離多重特異性タンパク質。
  58. 前記L1が、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む、請求項57に記載の単離多重特異性タンパク質。
  59. 前記L1が、配列番号8のアミノ酸配列を含む、請求項58に記載の単離多重特異性タンパク質。
  60. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、配列番号70、73、75、78、81、又は85のHCDR1、配列番号71、76、79、82、又は86のHCDR2、配列番号72、74、77、80、83、84、又は87のHCDR3、配列番号88、91、93、95、97、99、101、又は102のLCDR1、配列番号89又は103のLCDR2、及び配列番号90、92、94、96、98、100、又は104のLCDR3を含む、請求項47~59のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  61. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、
    a)それぞれ配列番号70、71、72、88、89、及び90、
    b)それぞれ配列番号73、71、74、91、89、及び92、
    c)それぞれ配列番号75、76、77、93、89、及び94、
    d)それぞれ配列番号78、79、80、95、89、及び96、
    e)それぞれ配列番号81、82、83、97、89、及び98、
    f)それぞれ配列番号78、71、84、99、89、及び100、
    g)それぞれ配列番号78、71、84、101、89、及び100、
    h)それぞれ配列番号85、86、87、102、103、及び104、又は
    i)それぞれ配列番号78、71、84、95、89、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、請求項47~60のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  62. 前記HLA-Gに結合する抗原結合ドメインが、
    a)配列番号50のVH及び配列番号51のVL、
    b)配列番号52のVH及び配列番号53のVL、
    c)配列番号54のVH及び配列番号55のVL、
    d)配列番号56のVH及び配列番号57のVL、
    e)配列番号58のVH及び配列番号59のVL、
    f)配列番号60のVH及び配列番号61のVL、
    g)配列番号62のVH及び配列番号63のVL、
    h)配列番号64のVH及び配列番号65のVL、
    i)配列番号66のVH及び配列番号67のVL、又は
    j)配列番号68のVH及び配列番号69のVLを含む、請求項47~61のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  63. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、配列番号50、52、54、56、58、60、62、64、66、又は68のVH及び配列番号51、53、55、57、59、61、63、65、67、又は69のVLを含む、請求項47~61のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  64. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、配列番号248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、又は269のアミノ酸配列を含む、請求項47~63のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  65. 前記リンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインが、
    a)配列番号364のHCDR1、配列番号365のHCDR2、配列番号366のHCDR3、配列番号371のLCDR1、配列番号372のLCDR2、及び配列番号373のLCDR3、
    b)配列番号346のVH及び配列番号347のVL、
    c)配列番号348のVH及び配列番号349のVL、
    d)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号369のLCDR3、
    e)配列番号339のVH及び配列番号340のVL、
    f)配列番号361のHCDR1、配列番号362のHCDR2、配列番号363のHCDR3、配列番号367のLCDR1、配列番号368のLCDR2、及び配列番号370のLCDR3、
    g)配列番号339のVH及び配列番号341のVL、
    h)配列番号339のVH及び配列番号342のVL、
    i)配列番号339のVH及び配列番号343のVL、
    j)配列番号339のVH及び配列番号344のVL、又は
    k)配列番号339のVH及び配列番号345のVLを含む、請求項47~56のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  66. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインが、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域若しくは前記第1のIg定常領域の断片にコンジュゲートされ、かつ/又は前記リンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインが、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域若しくは前記第2のIg定常領域の断片にコンジュゲートされる、請求項47~65のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  67. 前記HLA-Gに結合する第1の抗原結合ドメインと前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片との間、及び前記リンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片との間に、第2のリンカー(L2)を更に含む、請求項66に記載の単離多重特異性タンパク質。
  68. 前記L2が、配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、又は40のアミノ酸配列を含む、請求項67に記載の単離多重特異性タンパク質。
  69. 前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片、及び前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片が、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4アイソタイプである、請求項66~68のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  70. 前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片、及び前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片が、前記多重特異性タンパク質のFcγRへの低減された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む、請求項66~69のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  71. 前記多重特異性タンパク質の前記FcγRへの低減された結合をもたらす前記少なくとも1つの変異が、L234A/L235A/D265S、F234A/L235A、L234A/L235A、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S、及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、請求項70に記載の単離多重特異性タンパク質。
  72. 前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片、及び前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片が、前記多重特異性タンパク質のFcγ受容体(FcγR)への増強された結合をもたらす少なくとも1つの変異を含む、請求項66~69のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  73. 前記多重特異性タンパク質の前記FcγRへの増強された結合をもたらす前記少なくとも1つの変異が、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、請求項72に記載の単離多重特異性タンパク質。
  74. 前記FcγRが、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、若しくはFcγRIII、又はそれらの任意の組み合わせである、請求項70~73のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  75. 前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片、及び前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片が、前記多重特異性タンパク質の半減期を調節する少なくとも1つの変異を含む、請求項66~74のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  76. 前記多重特異性タンパク質の前記半減期を調節する前記少なくとも1つの変異が、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A、及びH435Rからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、請求項75に記載の単離多重特異性タンパク質。
  77. 前記第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは前記第1のIg定常領域の前記断片のCH3ドメインに少なくとも1つの変異、及び/又は前記第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは前記第2のIg定常領域の前記断片のCH3ドメインに少なくとも1つの変異を含む、請求項66~76のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  78. 前記第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは前記第1のIg定常領域の前記断片のCH3ドメインにおける前記少なくとも1つの変異及び/又は前記第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは前記第2のIg定常領域の前記断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの変異が、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V、及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基番号付けが、EUインデックスに従う、請求項77に記載の単離多重特異性タンパク質。
  79. 前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片、及び前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片が、以下の変異:
    a)前記第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V、及び前記第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W、又は
    b)前記第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W、及び前記第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407Vを含む、請求項66~78のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質。
  80. 治療剤又は造影剤にコンジュゲートされた、請求項1~46のいずれかに一項に記載の単離タンパク質を含む、免疫コンジュゲート。
  81. 請求項1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
  82. 請求項1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
  83. 請求項82に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
  84. 請求項83に記載のベクターを含む、宿主細胞。
  85. 請求項1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質を産生する方法であって、前記タンパク質を発現する条件で請求項84に記載の宿主細胞を培養することと、前記宿主細胞によって産生された前記タンパク質を収集することと、を含む、方法。
  86. 治療剤又は造影剤にコンジュゲートされた、請求項47~79のいずれかに一項に記載の単離多重特異性タンパク質を含む、免疫コンジュゲート。
  87. 請求項47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
  88. 請求項47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
  89. 請求項88に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
  90. 請求項89に記載のベクターを含む、宿主細胞。
  91. 請求項47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質を産生する方法であって、前記多重特異性タンパク質を発現する条件で請求項90に記載の宿主細胞を培養することと、前記宿主細胞によって産生された前記多重特異性タンパク質を収集することと、を含む、方法。
  92. 対象におけるHLA-G発現がんを治療する方法であって、治療有効量の、請求項1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質、請求項47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質、請求項80若しくは86に記載の免疫コンジュゲート、又は請求項81若しくは87に記載の医薬組成物を、前記HLA-G発現がんを治療するのに十分な時間の間、前記対象に投与することを含む、方法。
  93. 対象におけるHLA-G発現腫瘍細胞の量を低減する方法であって、請求項1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質、請求項47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質、請求項80若しくは86に記載の免疫コンジュゲート、又は請求項81若しくは87に記載の医薬組成物を、前記HLA-G発現腫瘍細胞の量を低減するのに十分な時間の間、前記対象に投与することを含む、方法。
  94. 前記HLA-G発現がんが、肺がん、膵臓がん、腎がん、頭頸部がん、卵巣がん、食道がん、大腸がん、子宮がん、又は乳がんである、請求項92~93のいずれか一項に記載の方法。
  95. 前記単離タンパク質又は前記単離多重特異性タンパク質が、第2の治療剤と組み合わせて投与される、請求項92~94のいずれか一項に記載の方法。
  96. 前記第2の治療剤が、手術、化学療法、若しくは放射線、又はそれらの任意の組み合わせである、請求項95に記載の方法。
  97. 対象におけるがんの存在を検出する方法であって、がんを有することが疑われる対象に請求項80又は86に記載の免疫コンジュゲートを投与することと、前記免疫コンジュゲートが結合している生物学的構造を可視化し、それによって前記がんの存在を検出することと、を含む、方法。
  98. 請求項1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質、請求項47~79のいずれか一項に記載の単離多重特異性タンパク質、請求項80若しくは86に記載の免疫コンジュゲート、又は請求項81若しくは87に記載の医薬組成物を含む、キット。
  99. 請求項1~46のいずれか一項に記載の単離タンパク質に結合する、抗イディオタイプ抗体。
  100. HLA-G上のエピトープに結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質であって、前記エピトープが、HHPVFDYE(配列番号485)のアミノ酸配列及びVPSを含む、不連続エピトープである、単離タンパク質。
  101. 配列番号478のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
  102. 配列番号490のアミノ酸配列を含む、請求項101に記載の単離タンパク質。
  103. 配列番号489及び447のアミノ酸配列を更に含む、請求項101又は102に記載の単離タンパク質。
  104. 配列番号439のアミノ酸配列を更に含む、請求項103に記載の単離タンパク質。
  105. 配列番号465及び468のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
  106. 配列番号466及び469のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
  107. 配列番号467及び470のアミノ酸配列を含む、単離タンパク質。
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