JP2023535261A - 抗ｃｔｌａ４モノクローナル抗体及びキメラ抗原受容体 - Google Patents

抗ｃｔｌａ４モノクローナル抗体及びキメラ抗原受容体 Download PDF

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Abstract

選択されたポリペプチド化合物がＣＴＬＡ－４に結合する組成物及び方法が提示される。最も典型的には、結合は、選択されたＶＨ及び／又はＶＬドメインによって媒介され、好ましい化合物は、ｓｃＦｖ、ＩｇＧ、又はＣＡＲとして調製される。

Description

本出願は、その全体が参照として援用される、２０２０年６月１１日に出願された米国仮特許出願第６３／０３８，１１１号明細書の同時係属中の優先権を主張する。
配列表
サイズが１１０ＫＢであり、ファイル名が１０２７１９．００３２ＰＣＴ＿ＲＥＶ００５＿ＳＴ２５．ｔｘｔである配列表のＡＳＣＩＩテキストファイルの内容は、２０２１年６月１日に作成され、本出願と共にＥＦＳ－Ｗｅｂを介して電子的に提出され、その全体が参照により援用される。
発明の分野
本発明の分野は、細胞傷害性Ｔリンパ球関連抗原－４（ＣＴＬＡ－４）に結合する化合物、特に抗体、抗体断片、ｓｃＦｖ、及び本明細書に提示されるＶＨ及びＶＬドメインを含む融合分子の組成物及び方法である。
背景説明には、本発明の理解に有用であってもよい情報が含まれる。本明細書で提供される情報のいずれかが先行技術であること、又は現在請求されている発明に関連していることを認めるものではなく、又は具体的に又は暗黙的に参照されるいかなる出版物も先行技術であることを認めるものではない。
本明細書におけるすべての出版物及び特許出願は、あたかも各個々の出版物又は特許出願が参照により援用されることが具体的且つ個別に示されたかのように、参照により援用される。援用された参照における用語の定義又は使用が、本明細書で提供されるその用語の定義と矛盾し又は相反する場合、本明細書で提供されるその用語の定義が適用され、参照におけるその用語の定義は適用されない。
免疫療法は、様々ながんに対する有望な治療戦略になりつつある。他の選択肢の中でも、典型的には免疫刺激薬と組み合わせられるがんワクチン組成物は、少なくともいくつかのアプローチで有意な治療効果を示している。残念なことに、腫瘍微小環境は、多くの場合、Ｔ細胞及びＮＫ細胞の免疫抑制効果を有し、免疫療法の効果を低減することがよくある。細胞傷害性Ｔリンパ球関連抗原－４（ＣＴＬＡ－４、ＣＤ１５２）は、活性化されたエフェクターＴ細胞（Ｔｅｆｆ）によって発現される膜糖タンパク質であり、Ｔ細胞の増殖、細胞周期の進行、及びサイトカイン（ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ）の抑制に関与する。ＣＴＬＡ－４は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）上の共通のＢ７リガンド（ＣＤ８０／ＣＤ８６）への結合に対するＣＤ２８陽性共刺激との競合、及びシグナル伝達分子と関連する細胞質尾部を介した直接的な阻害効果をはじめとする、複数のメカニズムを通じて阻害機能を発揮すると考えられている。
ＣＴＬＡ－４活性による免疫抑制を克服するために、抗ＣＴＬＡ－４抗体を治療エフェクターとして使用することができる。現在知られている抗ＣＴＬＡ－４抗体には、黒色腫、非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）、乳がん、前立腺がん、膵臓がん、肝細胞がん、及び中皮腫をはじめとする、様々ながんの治療において、単独で、又は化学療法、がんワクチン、若しくは他の抗体（抗ＰＤ－１若しくは抗ＯＸ４０）と組み合わせて使用されているイピリムマブ及びトレメリムマブが含まれる。イピリムマブは、黒色腫において１０ｍｇ／ｋｇの用量で長期生存率を高め、Ｂ細胞リンパ腫の患者において抗腫瘍活性を有していた。しかし、イピリムマブは、転移性去勢抵抗性前立腺がんの患者では効果が示されなかった。イピリムマブと同様の利点は示されなかったが、トレメリムマブの臨床試験では、黒色腫、難治性転移性大腸がん、肝細胞がん、及び悪性中皮腫の患者において許容可能な忍容性と臨床的に意味のある活性が示された。
残念ながら、イピリムマブ及びトレメリムマブには重大な有害作用があり、免疫抑制の軽減に常に効果があるわけではない。したがって、ＣＴＲＬＡ－４シグナル伝達を妨害する様々なシステム及び方法が当技術分野で知られているにもかかわらず、それらのすべて又はほとんどすべてがいくつかの欠点を抱えている。したがって、ＣＴＬＡ－４に結合する改善された化合物のための組成物及び方法が依然として必要とされている。
本発明の主題は、ＣＴＬＡ－４に高い特異性及び親和性で結合するポリペプチドの様々な組成物及び方法に関する。好ましい実施形態では、ポリペプチドは、ｓｃＦｖ、抗体、又はその一部として、又はＣＡＲ、Ｎ－８０３、若しくはＴｘＭ誘導体などのキメラ分子として構成される。さらに好ましい実施形態では、ポリペプチドは、ＶＨ及び／又はＶＬドメインを含み、配列番号１～５９に記載のアミノ酸配列を有し、又は配列番号６０～７１に記載の抗体の重鎖若しくは軽鎖を含む。容易に理解されるように、これらのポリペプチドは、様々な診断用途及び治療用途、特に免疫抑制の低減及びがんの治療において使用することができる。
本発明の主題の一態様では、本発明者らは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、４９、５１、５４、５６、及び５８からなる群から選択される第１のアミノ酸配列を含むＶＨセグメント、並びに／又は配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３７、３９、４１、４３、４５、４７、５０、５３、５５、５７、及び５９からなる群から選択される第２のアミノ酸配列を含むＶＬセグメントを含む一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチドを考察する。最も典型的には、ＶＨセグメント及びＶＬセグメントは、リンカーペプチド（例えば、グリシンに富むペプチド）と共役されている。さらに、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチドは、ＶＨセグメント及びＶＬセグメントの少なくとも２つの対をさらに含み得ることが考察され、少なくとも２つの対は、連結されて多価ｓｃＦｖを形成する。望ましい場合、ペプチドは、薬理学的に許容可能な担体中に存在し得る。
本発明の主題の別の態様では、本発明者らは、配列番号６０、６１、６２、６４、６５、６６、６８、及び７０からなる群から選択される第１のアミノ酸配列を含む重鎖、並びに／又は配列番号６３、６７、６９、及び７１からなる群から選択される第２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体を考察する。例えば、適切な抗体には、配列番号６８の第１のアミノ酸配列を含む重鎖と配列番号６９の第２のアミノ酸配列を含む軽鎖、又は配列番号７０の第１のアミノ酸配列を含む重鎖と配列番号７１の第２のアミノ酸配列を含む軽鎖を有する抗体が含まれる。
本発明の主題のさらなる態様では、本発明者らは、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は本明細書に提示される抗体を含む、がんを有する患者を治療するための医薬組成物を考察し、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は抗体は、薬理学的に許容可能な担体中に存在する。
本発明の主題のさらに別の態様では、本発明者らは、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は本明細書に提示される抗体を含む診断用組成物を考察し、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は抗体は、検出可能な標識をさらに含む。
さらに、本発明者らは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、４９、５１、５４、５６、及び５８からなる群から選択される第１のアミノ酸配列をコード化する第１の核酸セグメント、並びに／又は配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３７、３９、４１、４３、４５、４７、５０、５３、５５、５７、及び５９からなる群から選択される第２のアミノ酸配列を含む組換え核酸も考察する。好ましくは、必須ではないが、第１及び第２のセグメントは、同一読み枠に存在する。さらに、本発明者らは、配列番号６０、６１、６２、６４、６５、６６、６８、及び７０からなる群から選択される第１のアミノ酸配列をコード化する第１の核酸セグメント、並びに／又は配列番号６３、６７、６９、及び７１からなる群から選択される第２のアミノ酸配列を含む組換え核酸を考察する。好ましくは、必須ではないが、第１及び第２のセグメントは、バイシストロン配置である。
例えば、考察される組換え核酸は、配列番号６８の第１のアミノ酸配列をコード化する第１の核酸セグメントと配列番号６９の第２のアミノ酸配列をコード化する第２の核酸セグメント、又は配列番号７０の第１のアミノ酸配列をコード化する第１の核酸セグメントと配列番号７１の第２のアミノ酸配列をコード化する第２の核酸セグメントを含み得る。
容易に理解されるように、組換え核酸は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）の少なくとも一部をコード化するポリペプチドをコード化する第３のセグメントをさらに含んでもよく、ＣＡＲは、細胞内で発現されると、第１及び／又は第２の核酸セグメントを含む抗原結合細胞外ドメインを有する。代替として、組換え核酸は、Ｎ－８０３又はＴｘＭの少なくとも一部をコード化するポリペプチドをコード化する第３のセグメントをさらに含んでもよく、Ｎ－８０３又はＴｘＭは、細胞内で発現されると、第１及び／又は第２の核酸セグメントを含む抗原結合ドメインを有する。
したがって、本発明者らはまた、上記の組換え核酸を（例えば、トランスフェクション又は遺伝子工学によって）含む組換え細胞を考察する。他の適切な細胞型の中でも、組換え細胞は、組換えＴ細胞、組換えＮＫ細胞、組換えＮＫＴ細胞、組換え単球、組換えマクロファージ、又は組換え樹状細胞であり得る。代替として、組換え細胞は、ＣＨＯ細胞又はＥＣ７細胞などの組換えタンパク質を産生するようにエンジニアリングされた産生細胞であってもよい。
なおさらに考察される態様では、細胞又は組織におけるＣＴＬＡ－４媒介効果を低減する方法が提示され、この方法は、細胞又は組織を、細胞又は組織におけるＣＴＡＬＡ－４媒介効果を低減する量の本明細書で提示される抗体である一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチドと接触させるステップを含む。
そのため、本発明者らはまた、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド若しくは本明細書に提示される抗体を含む医薬組成物、又は本明細書に提示される組換え細胞を患者に投与するステップを含む、腫瘍を有する患者を治療する方法を考察する。最も好ましくは、医薬組成物は、腫瘍を治療するのに有効な用量及びスケジュールで患者に投与される。
したがって、異なる観点から見ると、本発明者らは、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド若しくは本明細書に提示される抗体を含む医薬組成物、又は本明細書に提示される組換え細胞を患者に投与するステップを含む、腫瘍を有する患者における免疫抑制を低減する方法も考察する。最も好ましくは、医薬組成物は、腫瘍微小環境における免疫抑制を低減するのに有効な用量及びスケジュールで患者に投与される。
したがって、本明細書に提示される一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）又は抗体又は組換え細胞の使用は、医学における使用のため、特にがんを治療するため、及び／又は腫瘍を有する患者における免疫抑制を低減するために考察される。
本発明の主題の様々な目的、特徴、態様、及び利点は、同様の数字が同様の構成要素を表す添付の図面と併せて、好ましい実施形態の以下の詳細な説明からより明らかになるであろう。
図１は、本明細書に提示される様々なｓｃＦｖ構築物についての例示的なＳＰＲの結果を示す。 図２Ａ～２Ｄは、抗ＣＴＬＡ－４抗体及び本明細書に示される対照が投与された、処置された腫瘍の例示的な結果を示す。 図２Ｅは、図２Ａ～２Ｄの処置群についてのカプラン・マイヤープロットである。 図３Ａ～３Ｄは、抗ＣＴＬＡ－４抗体及び本明細書に提示される対照が投与された、処置されていない腫瘍についての例示的な結果を示す。 図３Ｅは、図３Ａ～３Ｄの処置群についてのカプラン・マイヤープロットである。
本発明者らは、ＣＴＬＡ－４、特に抗体のＶＨ及びＶＬドメイン、又はＶＨ及び／若しくはＶＬドメイン（及びその中に含まれるＣＤＲ）を含む断片又は融合タンパク質に有意に結合する様々なポリペプチドを発見した。最も有利には、ＶＨ及び／又はＶＬドメイン又はその中に含まれるＣＤＲを使用して、ＣＴＬＡ－４に対して高い親和性及び特異性を有する様々な治療剤又は診断剤を生成することができる。
本明細書で考察されるＶＨ及びＶＬドメインに関して、ドメインは一般に周知の命名法に従うことが理解されるべきである。そのため、ＶＨドメインは、典型的にはいくつかの定常ドメインに結合する抗体の重鎖の可変断片（例えば、ＩｇＧのＣＨ１、ＣＨ２、及びＣＨ３ドメインに結合するＶＨドメイン）を表す。同様に、ＶＬドメインは、典型的には定常ドメインに結合する抗体の軽鎖の可変断片（例えば、ＩｇＧ中のＣＬに結合したＶＬドメイン）を表す。したがって、容易に理解されるように、ＶＨ及びＶＬドメインのそれぞれは、典型的にはＦＲ１－ＣＤＲ１－ＦＲ２－ＣＤＲ２－ＦＲ３ＣＤＲ３－ＦＲ４として連続して配置された、それぞれのフレームワーク領域（ＦＲ）及び相補性決定領域（ＣＤＲ）を有する。そのため、ＶＨ及びＶＬドメインの既知のフレームワーク領域に基づいて、当業者は、ＶＨ又はＶＬドメインのそれぞれのＣＤＲを容易に認識するであろう。「ドメイン」及び「セグメント」という用語は、ＶＨ又はＶＬと併せて、本明細書では互換的に使用される。
さらに容易に認識されるように、当業者は、ＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントのアミノ配列を使用して、組換え単離抗体又はその断片を生成することができる。本明細書の用法では、「抗体」という用語は、免疫グロブリン分子、及び免疫グロブリン分子の免疫学的活性部分、すなわち、抗原と免疫特異的に結合する抗原結合部位を含有する分子を指す。したがって、「抗体及びその断片」には、免疫グロブリン分子全体（例えば、完全サイズ、全ＩｇＧ１、ＩｇＡなど）、及びその免疫グロブリン分子全体の抗原結合断片が含まれる。したがって、考察される断片としては、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆ（ａｂ’）２、ジスルフィド連結されたＦｖ（ｓｄＦｖ）、Ｆｖ、及びＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントのどちらかを含んでなる任意の断片が挙げられる。抗体が免疫グロブリンである場合、免疫グロブリンは、任意のタイプ（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、又はＩｇＹ）及び任意のクラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、又はＩｇＡ２）の重鎖又は定常ドメインを含んで、異なるタイプの免疫グロブリンを構成し得ることが考察される。さらに、「抗体」としては、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体が特に挙げられるであろう。したがって、配列番号１～５９のＶＨ及び／又はＶＬドメインは、当該技術分野で周知の方法を用いて、任意の既存の（典型的にはヒト又はヒト化）抗体又は抗体断片にグラフト化され得ることが理解されるべきである。
本発明者らは、配列番号１～５９に示されるＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントのアミノ配列を使用して、担体タンパク質と共役させ、ＣＴＬＡ－４がハイブリッドタンパク質によって捕捉され得るか又は妨げられ得るように、その表面上にＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントを有するハイブリッドタンパク質を生成させ得ることを（ｔｈａｔ ｔｈｅ ｔｈａｔ ｔｈｅ）さらに考察する。ＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントを安定に保有し、好ましくは腫瘍微小環境へのアクセスを提供し得る、担体タンパク質の任意の適切な形態が考察される。特に好ましい１つの担体タンパク質としては、１つ又は複数のＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントと共役される抗体部分（例えば、タンパク質Ａ、タンパク質Ｇ、タンパク質Ｚ）への親和性を有する、アルブミン、再折り畳みアルブミン、及びその他のタンパク質が挙げられる。
典型的には、ＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントは、アンカー分子と共役され、それによってＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントは、担体タンパク質と共役され得る。例えば、担体タンパク質がアルブミンである場合、アンカー分子は、アルブミンのＳｕｄｌｏｗ部位Ｉ及びＩＩ、又はアルブミンのその他の任意の疎水性領域の１つに適合する、任意の適切なサイズの疎水性ペプチド又は糖脂質であり得る。例えば、上記のＣＴＬＡ－４に対する組換え免疫グロブリンタンパク質は、そのＦｃドメインを介して担体タンパク質と共役され得る。その他の実施形態では、アンカー分子は、疎水性ペプチド（少なくとも１０アミノ酸、１５アミノ酸、２０アミノ酸、３０アミノ酸などの長さ）を含んでもよい。これらの実施形態では、ＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメント（例えば、ｓｃＦｖの形態としての）及び疎水性ペプチドの様々な構成が考察され得る。例えば、一価のｓｃＦｖドメインは疎水性ペプチドに直接連結され得て、又は多価のｓｃＦｖは疎水性ペプチドに直接連結され得る。代案としては、１つのｓｃＦｖドメインは複数の疎水性ペプチドに直接連結され得て、又は複数のｓｃＦｖドメインは複数の疎水性ペプチドに直接連結され得る。
代案としては、又はそれに加えて、１つ又は複数のＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントは、担体タンパク質に結合するアンカー部分を有する中間分子と共役され得る。好ましい実施形態では、本発明者らは、複数の標的認識ドメインが、担体タンパク質上の単一結合部位を介して保有され得るように、中間分子が、ＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントに対する複数の結合部位を提供することを考察する。適切な中間分子は、ナイーブ組織にいかなる有意な毒性も提供しない、任意のタンパク質、糖脂質、有機分子、又は無機分子を含んでもよい。例えば、適切な中間分子は、ナノ粒子（例えば、量子ドット、金ナノ粒子、磁性ナノ粒子、ナノチューブ、高分子ナノ粒子、デンドリマーなど）、又はビーズ（例えば、ポリスチレンビーズ、ラテックスビーズ、ダイナビーズなど）を含んでもよい。好ましくは、ナノ粒子及び／又はビーズは、１μｍ未満、好ましくは１００ｎｍ未満の寸法を有する。ナノ粒子は、担体タンパク質（例えば、アルブミン）へのアンカーを提供する疎水性尾部に架橋され、又はそれで部分的に被覆されてもよい。１つ又は複数のＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントもまた、ナノ粒子上に架橋され又はそれを部分的に被覆し得る（例えば、架橋などのために標的認識ドメインに連結された追加の尾部ドメインを介して）。
別の例では、適切な中間分子は、担体タンパク質に対する抗体と共役されたビーズ（例えば、ポリスチレンビーズ、ラテックスビーズ、ダイナビーズなど）を含んでもよい。したがって、担体タンパク質がアルブミンである場合、ビーズが高い親和性及び特異性で担体タンパク質に結合し得るように、ビーズはα－アルブミン抗体と共役され得る（例えば、架橋、被覆など）。１つ又は複数のＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントもまた、ビーズ上に架橋され又はそれを部分的に被覆し得る（例えば、架橋、チオール媒介架橋などのために標的認識ドメインに連結された追加の尾部ドメインを介して）。
いくつかの実施形態では、ｓｃＦｖペプチドは、ＡＬＴ－８０３（ＩＬ－１５スーパーアゴニスト複合体、例えば、Ｂｌｏｏｄ ２０１５ １２６：１９５７を参照されたい）又はＴｘＭ（標的化ＡＬＴ－８０３ベースのスキャフォールドプラットフォーム、例えば、ＵＲＬ、ａｌｔｏｒｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ．ｃｏｍ／ｏｕｒ－ｓｃｉｅｎｃｅ／ｉｌ－１５－ｐｒｏｔｅｉｎ－ｓｕｐｅｒａｇｏｎｉｓｔ－ａｎｄ－ｓｃａｆｆｏｌｄ－ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ／を参照されたい）構造を含んでなり又はそれを模倣する、組換え免疫グロブリンタンパク質複合体を形成し得る。好ましくは、本発明者らは、免疫グロブリンタンパク質複合体がＴｘＭ構造を模倣する場合、ｓｃＦｖペプチドは、１つ又は複数のインターロイキン－１５（ＩＬ－１５）結合モチーフと、及び／又はＩＬ－１５結合モチーフ（例えば、ＩＬ－１５、ＩＬ－１５Ｎ７２Ｄなど）に対する１つ又は複数のリガンドと、直接（又はリンカーを介して間接的に）共役され得ることを考察する。したがって、組換え免疫グロブリンタンパク質複合体がＴｘＭ ＩｇＧ１構造を模倣する場合、組換え免疫グロブリンタンパク質複合体は、ＣＴＬＡ－４に対する１－４ ｓｃＦｖペプチドを含んでもよい。
さらに、ＩＬ－１５結合モチーフ又はそのリガンドと共役された１つ又は複数のｓｃＦｖペプチドを有するＴｘＭ構造を模倣する、組換え免疫グロブリンタンパク質複合体は、腫瘍特異的抗原又は患者特異的及び腫瘍特異的ネオエピトープに対する結合ドメイン（例えば、ネオエピトープなどに対するｓｃＦｖペプチドなど）もまた含んでもよい。例えば、組換え免疫グロブリンタンパク質複合体は、２つのＩＬ－１５結合モチーフと共役されたＣＴＬＡ－４に対する２つのｓｃＦｖペプチド、及び２つのＩＬ－１５結合モチーフリガンドと共役されたネオエピトープに対する２つのＳｃＦｖペプチドを含んでもよい。好ましくは、ネオエピトープは、患者特異的且つ腫瘍特異的であり、例えば、米国特許出願公開第２０１２／００５９６７０Ａ１号明細書及び米国特許出願公開第２０１２／００６６００１Ａ１号明細書で開示されるような配列データのオミクス解析によって同定される。
いくつかの実施形態では、ｓｃＦｖ又はその断片は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、４９、５１、５４、５６、及び５８の中のＶＨセグメントをコード化する１つの配列を使用して生成することができる。他の実施形態では、ｓｃＦｖ、組換え抗体又はその断片は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３７、３９、４１、４３、４５、４７、５０、５３、５５、５７、及び５９の中のＶＬセグメントをコード化する１つの配列を使用して生成することができる。さらに他の実施形態では、ｓｃＦｖ、組換え抗体又はその断片は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、４９、５１、５４、５６、及び５８の中のＶＨセグメントをコード化する１つの配列、並びに配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３７、３９、４１、４３、４５、４７、５０、５３、５５、５７、及び５９の中のＶＬセグメントをコード化する１つの配列を使用して生成することができる。これらの実施形態では、区別するＶＨ及びＶＬ識別子（例えば、それぞれ配列番号１及び２に示される７３－２ＶＨ及び７３－２ＶＬ）を用いて配列表中の共通の指定配列（ｄｅｓｉｇｎａｔｏｒ）を有するＶＨセグメントをコード化する配列及びＶＬセグメントをコード化する配列を対にすることが好ましい。しかし、以下により詳細に示されるように、配列番号ｘｘから１つのＶＨセグメントを選択し、配列番号ｙｙから１つのＶＬセグメントを選択することによって、ＶＨセグメント及びＶＬセグメントの任意の対を生成して、ＣＴＬＡ－４結合分子を形成できることも考察され、ｘｘは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、４９、５１、５４、５６、及び５８のうちのいずれか１つであり、ｙｙは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３７、３９、４１、４３、４５、４７、５０、５３、５５、５７、及び５９のうちのいずれか１つである。
本発明者らはまた、ｓｃＦｖ、組換え抗体又はその断片が、配列番号ｘｘ又はｙｙのいずれか１つと少なくとも８５％同一、好ましくは少なくとも９０％同一、より好ましくは少なくとも９５％同一であるＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントをコード化するアミノ酸配列を用いて生成できることを考察する。最も典型的には、同一性が１００％でない場合、異なるアミノ酸は、配列のフレームワーク領域の１つ又は複数に位置し、所与の配列のＣＤＲ領域に影響を与えない。さらなる実施形態では、ｓｃＦｖペプチド、組換え抗体又はその断片の結合親和性は、１００ｎＭ以下、又は５０ｎＭ以下、又は２０ｎＭ以下、又は１０ｎＭ以下、又は５ｎＭ以下、又は２ｎＭ以下、又は１ｎＭ以下であることが好ましい。例えば、本明細書に提示される特定のＶＨ及び／又はＶＬドメインを有する任意のｓｃＦｖを選択し、次にＶＨ及びＶＬのＣＤＲ領域におけるランダム変異誘発を介して、ｓｃＦｖを親和性成熟に供することができる。そのような例では、典型的には、所与の配列のすべてのＣＤＲ領域にわたって４個以下、又は３個以下、又は２個以下のアミノ酸が変更されることが考察される。したがって、認識されるように、結合特性が改善される親和性成熟プロセスから複数の結合剤を単離することができる。
最も典型的には、ｓｃＦｖペプチド又は同様の構築物中のＶＨセグメント及びＶＬセグメントは、典型的には５～４０アミノ酸、好ましくは１０～３０アミノ酸、より好ましく２０～３０アミノ酸である、リンカー又はスペーサーを介して共役される。いくつかの実施形態では、リンカーは、ＶＨセグメントのＮ末端及びＶＬセグメントのＣ末端に共役し得る。その他の実施形態では、リンカーは、ＶＬセグメントのＮ末端及びＶＨセグメントのＣ末端に共役し得る。本発明者らは、ＶＨセグメントとＶＬセグメントとの間に構造的可撓性を提供するために、リンカーのためのグリシンに富む配列（例えば、（Ｇ４Ｓ）ｎ、式中、ｎは１～５であるなど）が好ましいことをさらに考察する。１つ又は複数のセリン又はスレオニン残基をリンカーに含めて、ｓｃＦｖペプチド、組換え抗体又はその断片の溶解度を高めることもまた考察される。当該技術分野で公知の多数のリンカー及びｓｃＦｖを作製する方法があり、このような既知の方法は、すべて本明細書での使用に適すると見なされる。
さらに、ｓｃＦｖペプチドは、複数のＶＨセグメント及びＶＬセグメントを含み、二価又は多価のｓｃＦｖを形成し得る。いくつかの実施形態では、複数のＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントは、同一アミノ配列を有してもよい（例えば、３つのＶＨセグメントと３つのＶＬセグメントとを有する多価のｓｃＦｖであって、すべてのＶＨセグメントが同一ＶＨを有し、すべてのＶＬセグメントが同一ＶＬドメインを有する。その他の実施形態では、ＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントの少なくとも２つが、異なるアミノ酸配列を有してもよい（例えば、３つのＶＨセグメントと３つのＶＬセグメントとを有する多価のｓｃＦｖであって、ＶＨセグメントの２つが同一のＶＨドメインであり、ＶＨセグメントの１つが異なり、ＶＬセグメントの２つが同一のＶＬドメインであり、ＶＨセグメントの１つが異なる。
好ましくは、ＣＴＬＡ－４（７２量体及び７７量体ＩＬ－８の少なくとも１つ）に対するｓｃＦｖ、組換え抗体又はその断片の結合親和性（Ｋｄ）は、２５℃～３７℃の温度での測定、及び５．５～７．５のｐＨ範囲での測定で、少なくとも１×１０－７Ｍ未満、好ましくは１×１０－８Ｍ未満、より好ましくは１×１０－９Ｍ未満である。本発明者らは、ＶＨセグメント及び／又はＶＬセグメントの同一アミノ酸配列を使用して、ｓｃＦｖ、組換え抗体、又はその断片が生成されても、構造の違いのために、ＣＴＬＡ－４に対するｓｃＦｖ、組換え抗体、又はその断片の結合親和性が異なってもよいことを考察する。例えば、表１～４は、異なるｓｃＦｖクローンの異なる親和性（ＫＤ値で測定）を提供し、表５は、様々な組換え抗体（ＩｇＧ１）クローンの様々な親和性（ＫＤ値で測定）を示す。
ｓｃＦｖペプチド（又は抗体のＶＨセグメント及びＶＬセグメント若しくはそれらの断片）は、単一の組換え核酸によってコード化できることがさらに考察される。そのような実施形態では、組換え核酸には、少なくとも２つの核酸セグメント：本発明の主題のＶＨセグメントをコード化する第１の核酸セグメント及びＶＬセグメントをコード化する第２の核酸セグメントが含まれる。しかし、それぞれＶＨ及びＶＬセグメントをコード化する第１及び第２の核酸セグメントが、配列番号１～５９のいずれか１つと、少なくとも８５％同一、好ましくは少なくとも９０％同一、より好ましくは少なくとも９５％同一であることもまた考察される。最も好ましくは、２つの核酸セグメントは、２つの核酸セグメントが、２つのペプチドセグメントを有する単一のタンパク質に翻訳され得るように、同一読み枠内にある。
さらに、組換え核酸は、リンカーペプチド（好ましくはＧに富む又はそうでなければ可撓性のリンカーペプチド）をコード化する、第１の核酸セグメントと第２の核酸セグメントとの間の第３の核酸セグメントを含んでもよく、これは、典型的には５～４０アミノ酸、好ましくは１０～３０アミノ酸、より好ましくは２０～３０アミノ酸である。この実施形態では、３つの核酸セグメントは、３つの核酸セグメントが、３つのペプチドセグメントを有する単一のタンパク質に翻訳され得るように、同一読み取り枠内にあることが特に好ましい。
一方、ＣＴＬＡ－４結合分子が抗体（例えば、ＩｇＧ）である場合、本明細書に提示されるＶＨセグメント及びＶＬセグメントは、単一の組換えバイシストロン構築物上でコード化され得るか、又はこれらのセグメントは、２つの別個の構築物上でコード化され得る。最も典型的には、ＶＨドメインをコード化する核酸は、１つ又は複数のＣＨドメイン（例えば、ＩｇＧの場合はＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３）もインフレームでコード化する。同様に、ＶＬドメインをコード化する核酸はまた、１つのＣＨドメイン（例えば、ＩｇＧの場合はＣＬ）をインフレームでコード化する。最も典型的には、重鎖及び軽鎖の定常ドメインは、ヒト化されるが、他の哺乳動物配列も適切であると考えられる。さらに、組換え核酸は、（必ずしも必要ではないが）好ましくは、抗体を発現する細胞に最適化されたコドン使用頻度を有することが認識されるべきである。
本発明者らは、ｓｃＦｖペプチド、抗体又はその断片を、腫瘍を有する患者に投与して、ＣＴＬＡ－４によるシグナル伝達及び付随する免疫抑制を低減又は阻害できるように、医薬組成物として処方できることをさらに考察する。したがって、ｓｃＦｖペプチド、抗体又はその断片は、任意の薬学的に許容可能な担体中に（例えば、無菌注射用組成物として）、治療製剤のための投与単位当たり、少なくとも１ｍｌ、好ましくは少なくとも５ｍｌ、より好ましくは少なくとも２０ｍｌの量で配合され得ることが考察される。しかし、代替製剤もまた本明細書での使用に適すると見なされ、すべての既知の投与経路及び投与様式が本明細書で考察される。本明細書の用法では、「投与する」という用語は、本明細書で考察される化合物及び組成物の直接投与及び間接投与の双方を指し、直接投与は、典型的には医療従事者（例えば、医師、看護師など）によって実施される一方で、間接投与は、典型的には、化合物及び組成物を直接投与のために医療専門家に提供するか、又は利用可能にするステップを含む。いくつかの実施形態では、医薬製剤は、皮下注射、真皮下注射、又は静脈内注射をはじめとする、全身注射によって投与される。他の実施形態では、以下により詳細に示されるように、腫瘍内注射を介して製剤を投与することが考察される。
上記のＶＨ及びＶＬセグメントを含む、ｓｃＦｖペプチド、抗体又はその断片を含む、医薬組成物の１つの例示的な方法及び使用は、標的組織又は標的細胞におけるＣＴＬＡ－４媒介効果を減少させることである。本明細書の用法では、ＣＴＬＡ－４媒介効果は、組織における又は組織の微小環境におけるＣＴＬＡ－４の活性によって、直接的又は間接的に誘導される任意の生物学的帰結を指す。最も典型的には、この効果は、Ｔ細胞活性（及び特にＴ細胞とＮＫ細胞による細胞障害性細胞死滅）の減少として観察可能であり、これは、腫瘍微小環境で増強又は観察され得る。別の観点から見ると、インビボでのＩＬ－８媒介効果の減少は、生理学的現象によっても観察することができる。例えば、ＣＴＬＡ－４シグナル伝達の減少は、腫瘍の収縮、腫瘍細胞のアポトーシス、又は壊死によって腫瘍の成長の低減又は阻害を介して観察することができる。同様に、患者、特に腫瘍微小環境におけるＣＴＬＡ－４シグナル伝達の減少は、腫瘍が局所又は遠隔転移を引き起こす傾向を低減する。
患者への医薬組成物の投与の用量及びスケジュールに関して、用量及び／又はスケジュールは、ペプチドのタイプ（例えば、ｓｃＦｖ、抗体、抗体断片、これらの任意の２つの組み合わせ、すべての組み合わせなど）、疾患のタイプ及び予後（例えば、腫瘍のタイプ、サイズ、位置）、患者の健康状態（例えば、年齢、性別などをはじめとする）次第で変動してもよいことが考察される。変動してもよいものの、用量及びスケジュールは、製剤が、宿主の正常細胞にいかなる有意な毒性効果ももたらさないが、なおも腫瘍微小環境におけるＣＴＬＡ－４の効果が、３時間以内、６時間以内、１２時間以内、２４時間以内、７２時間以内、又は１週間以内に、少なくとも２０％、好ましくは少なくとも３０％、より好ましくは少なくとも４０％、最も好ましくは少なくとも５０％減少するのに十分であるように選択及び調整されてもよい。例えば、ＣＴＬＡ－４結合剤が抗体である場合、抗体の適切な用量は、１回の投与につき０．１～１．０ｍｇ、又は１．０～５．０ｍｇ、又は５．０～１０．０ｍｇ、又は１０～５０ｍｇ、又は５０～１００ｍｇであり得る。
さらに、本発明者らは、ＣＴＬＡ－４に対するｓｃＦｖ、抗体又はその断片の効果が、１つ又は複数のがん薬物療法の同時投与によって増強され得ることを考察する。がん薬物療法としては、フルベストラント、アルドキソルビシン、ドセタキセル、腫瘍壊死治療剤（例えば、１３１Ｉ－ｃｈＴＮＴ－３など）、アベルマブ（ＰＤ－Ｌ１とその受容体との間の相互作用を妨げるヒトモノクローナルＩｇＧ１抗体）、ブラキュリ標的化ワクチン（例えば、ＥＴＢＸ－０５１（Ａｄ５［Ｅ１－、Ｅ２ｂ－］－ブラキュリ））、Ｈｅｒ２標的化ワクチン（例えば、ＥＴＢＸ－０２１など）、ＭＵＣ－１標的化ワクチン（例えば、ＥＴＢＸ－０６１（Ａｄ５［Ｅ１－、Ｅ２ｂ－］－ＭＵＣ１））、及び酵母ワクチン（例えば、ＧＩ－４０００（ＧＩ－４０１４、ＧＩ－４０１５、ＧＩ－４０１６、ＧＩ－４０２０）、ＧＩ－６２０７、ＧＩ－６３０１）、及び腫瘍特異的ネオエピトープに対するアデノウイルス又は酵母ベースのワクチンが挙げられるが、これに限定されるものではない。これらのがん薬物療法の例となる詳細は、その全体が参照として本明細書に援用される、国際公開第ＰＣＴ／ＵＳ１７／４０２９７号に記載される。
望ましい場合は、ＣＴＬＡ－４結合剤を細胞ベースの治療と同時投与することもでき（同時に、又は１日以上間隔をあけて）、特に好ましい細胞ベースの治療には、ＮＫ細胞及び／又はＴ細胞の輸血が含まれる。もちろん、そのような細胞は、標的特異的な腫瘍細胞死滅を増加させるために、１つ又は複数の組換え分子を発現するように遺伝子改変され得ることが理解されるべきである。
特に好ましい態様では、そのような改変されたＮＫ細胞又はＴ細胞は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を発現するようにエンジニアリングすることができる。いくつかの実施形態では、ＮＫ細胞又はＴ細胞のＣＡＲは、１つ又は複数のがん又は腫瘍に特異的な抗原を標的とし得るが、特に考察される実施形態では、ＮＫ細胞又はＴ細胞によって発現されるＣＡＲは、ＣＴＬＡ－４を標的とする。一般に、適切なＣＡＲは、少なくとも１つの細胞内シグナル伝達ドメインに連結された一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）を含むことが知られている。ｓｃＦｖは、標的細胞上の抗原（例えば、抗原又はＣＴＬＡ－４）を認識して結合し、エフェクター細胞の活性化を引き起こす。シグナル伝達ドメインには、ほとんどの場合、受容体による細胞内シグナル伝達に重要な免疫受容体チロシンベースの活性化ドメイン（ＩＴＡＭ）が含まれる。適切なＣＡＲには、様々な細胞、特にＴ細胞及びＮＫ細胞で発現され得る第１世代、第２世代、及び第３世代ＣＡＲが含まれる。
第１世代ＣＡＲは、典型的には、１つの細胞質シグナル伝達ドメインを含む。例えば、Ｔ細胞の第１世代ＣＡＲの１つの型には、１つのＩＴＡＭを含むＦｃイプシロン受容体ガンマ（ＦｃεＲＩγ）からのシグナル伝達ドメインが含まれ得、別の型には、３つのＩＴＡＭを含むＣＤ３ζからのシグナル伝達ドメインが含まれ得る。第２世代ＣＡＲは、典型的には、ＣＤ３ζと並んで最も一般的な細胞内共刺激ドメインとしてＣＤ２８を使用する。代替として、第２世代ＣＡＲは、ＣＤ３ζと共に４－１ＢＢ細胞内シグナル伝達ドメインも包含し得る。第３世代ＣＡＲには、典型的には、ＣＤ３ζ、ＣＤ２８、及び４－１ＢＢ細胞内シグナル伝達ドメインが含まれる。さらなる第３世代ＣＡＲについては、国際公開第２０１６／２０１３０４号パンフレット及び同第２０１８／０７６３９１号パンフレットも参照されたい。
選択されたｓｃＦｖ分子のヒトＣＴＬＡ－４への親和性を、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）を介して実施した。より具体的には、Ｐｉｏｎｅｅｒ ＦＥ装置を使用して、２５℃でのｓｃＦｖと組換えＣＴＬＡ－４タンパク質との間の結合親和性を測定した。簡単に言えば、ビオチン化抗ＦＬＡＧ Ｍ２抗体を、ニュートラアビジンでコーティングされたＰＣＨバイオセンサー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ／ＦｏｒｔｅＢｉｏ）に固定した。３×ＦＬＡＧタグ付きｓｃＦｖをセンサー上の抗ＦＬＡＧ Ｍ２で捕捉し、組換えヒトＣＴＬＡ－４タンパク質を用いるワンステップインジェクションを使用して結合親和性を測定した。選択されたｓｃＦｖの例示的な結果を以下の表１及び２に示す。以下の表１～４のクローンの表示において、ｓｃＦｖのクローンは、示された配列番号を有するＶＨ及びＶＬドメインの両方を含むことに注意すべきである。
同様に、選択されたｓｃＦｖ分子のマウスＣＴＬＡ－４に対する親和性を、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）によって測定した。より具体的には、Ｐｉｏｎｅｅｒ ＦＥ装置を使用して、２５℃でのｓｃＦｖと組換えＣＴＬＡ－４タンパク質との間の結合親和性を測定した。簡単に言えば、ビオチン化抗ＦＬＡＧ Ｍ２抗体を、ニュートラアビジンでコーティングされたＰＣＨバイオセンサー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ／ＦｏｒｔｅＢｉｏ）に固定した。３×ＦＬＡＧタグ付きｓｃＦｖをセンサー上の抗ＦＬＡＧ Ｍ２で捕捉し、組換えマウスＣＴＬＡ－４タンパク質を用いるワンステップインジェクションを使用して結合親和性を測定した。選択されたｓｃＦｖについての例示的な結果を以下の表３及び４に示す。
なおさらなる実験では、選択されたＶＨ及びＶＬドメインをヒトＩｇＧ足場に移植し、２５℃又は３７℃でＳＰＲ（Ｐｉｏｎｅｅｒ ＦＥ）又はＯｃｔｅｔ（Ｒｅｄ９６ｅ）によってＫＤ測定を行った。表５に示されるすべての値は×１０－９Ｍである。抗ヒトＦｃ抗体（ＳＰＲ）又はＡＨＣセンサー（Ｏｃｔｅｔ）を使用して抗体をチップ表面に捕捉した。表５に示すように、ヒト又はマウスのＣＴＬＡ－４を分析物とした。
本発明者らは、ヒトＣＴＬＡ－４／ヒトＣＤ８０又はマウスＣＴＬＡ－４／マウスＣＤ８０を用いたＢＬＩによってＣＤ８０／ＣＴＬＡ４複合体を遮断する抗体（ＩｇＧ１）をさらに調べた。ここでは、Ｏｃｔｅｔ Ｒｅｄ９６ｅ装置を使用して、ＣＴＬＡ－４へのＣＤ８０の結合を遮断するαＣＴＬＡ－４抗体の能力を試験した。簡単に説明すると、ビオチン化ＣＴＬＡ－４をＳＡバイオセンサー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ／ＦｏｒｔｅＢｉｏ）に固定した。次に、１０μｇ／ｍＬ（６７ｎＭ）のαＣＴＬＡ－４を使用して、ＣＴＬＡ－４でコーティングされたバイオセンサーにロードした。最後に、２５０ｎＭのＣＤ８０を使用して、αＣＴＬＡ－４抗体の存在下でＣＴＬＡ－４への結合を試験し、例示的な結果を図１に示す。
上記のインビトロ試験に続いて、本発明者らは、選択されたＩｇＧ構築物の抗腫瘍活性を調べるために、様々なインビボ実験を実施することに着手した。具体的には、本発明者らは、酵母溶解物（ｐＴＫ１７０、腫瘍特異的ネオエピトープを発現する酵母）、抗ＯＸ４０抗体、及び示されている選択された抗ＣＴＬＡ－４抗体を使用して、Ｂ１６Ｆ１０マウス腫瘍モデルにおいて腫瘍内免疫化を試験した。４つの群の動物を使用した：１．ＰＢＳ；２．ｐＴＫ１７０＋ａＯＸ４０＋ａ－ＣＴＬＡ４－７（配列番号６８、配列番号６９）；３．ｐＴＫ１７０＋ａＯＸ４０＋ａ－ＣＴＬＡ４－８（配列番号７０、配列番号７１）；及び４．ｐＴＫ１７０＋ａＯＸ４０＋ａ－ＣＴＬＡ４－９Ｈ１０。ｐＴＫ１７０酵母の投与量は５ＹＵ／注射であり、抗ＯＸ４０及び抗ＣＴＬＡ４は、注射当たりそれぞれ１００μｇで投与した。
腫瘍体積の例示的な結果を図２Ａ～２Ｄに示し、動物のカプラン・マイヤープロットを図２Ｅに示す。容易に分かるように、すべての抗ＣＴＬＡ４群（図２Ｂ～図２Ｄ）は、ＰＢＳ（図２Ａ）と比較して、処置済み及び未処置の両方の腫瘍の腫瘍増殖を有意に減少させる。１００μｇの用量でのクローン７、８、及び９Ｈ１０の間には統計的に有意な差はまだない。注射されていない腫瘍体積を図３Ａ～３Ｄに示し、図３ＡはＰＢＳ対照であり、図３Ｂ～３Ｄは、抗ＣＴＬＡ４化合物での処置を示す。動物の対応するカプラン・マイヤープロットを図３Ｅに示す。
いくつかの実施形態では、本発明の特定の実施形態を説明及び請求するために使用される、成分、濃度などの特性、及び反応条件などの量を表す数字は、場合によっては「約」という用語によって修正されることを理解されたい。したがって、いくつかの実施形態では、書面による説明及び添付の特許請求の範囲に示される数値パラメータは、特定の実施形態によって得られることが求められる所望の特性に応じて変化し得る近似値である。本明細書における値の範囲の記載は、単に、範囲内の個々の値を個別に参照する簡単な方法として機能することを意図している。本明細書で別段の指示がない限り、個々の値は、あたかも本明細書で個別に列挙されたかのように本明細書に援用される。
本明細書の用法では、医薬組成物又は薬物を「投与する」という用語は、医薬組成物又は薬物の直接投与及び間接投与の両方を指し、ここで、医薬組成物又は薬物の直接投与は、典型的には医療専門家（例えば、医師、看護師など）によって実施され、間接投与には、直接投与（例えば、注射、注入、経口送達、局所送達などを介した）のために医療専門家に医薬組成物又は薬物を提供又は利用可能にするステップを含む。状態、疾患の発症に対する感受性、又は意図した治療に対する反応を「予知する」又は「予測する」という用語は、対象における状態の進行、改善、及び／又は期間をはじめとする、状態、感受性、及び／又は反応を予測する行為又は予測（ただし、治療又は診断は含まれない）を含むことを意味することにさらに留意されたい。
本明細書に記載のすべての方法は、本明細書に別段の指示がない限り、又は文脈と明らかに矛盾しない限り、任意の適切な順序で実施することができる。本明細書の特定の実施形態に関して提供されるありとあらゆる例又は例示的な言葉（例えば、「など」）の使用は、単に本発明の理解をより容易にすることを意図しており、別の方法で請求される本発明の範囲を限定するものではない。明細書中の文言は、本発明の実施に不可欠な請求されていない要素を示すものと解釈されるべきではない。
本明細書の説明、及びそれに続く特許請求の範囲全体にわたる用法では、「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」、及び「その（ｔｈｅ）」の意味は、文脈上例外が明記されていない限り複数への言及を含む。本明細書の説明で使用されるように、文脈上例外が明記されていない限り、「ｉｎ」の意味は、「ｉｎ」及び「ｏｎ」を含む。また、本明細書の用法では、文脈上例外が明記されていない限り、「～に共役された」という用語は、直接結合（互いに共役される２つの要素が互いに接触する）及び間接結合（少なくとも１つの追加の要素が２つの要素間に位置する）の両方を含むことを意図している。したがって、「～に共役された」及び「～と共役された」という用語は同義的に使用される。
本明細書の発明的概念から逸脱することなく、既に記載されたもの以外のより多くの修正が可能であることは、当業者には明らかであろう。したがって、本発明の主題は、添付の特許請求の範囲を除き、制限されるものではない。さらに、本明細書と特許請求の範囲の双方の解釈において、すべての用語は、文脈に沿った可能な限り広範な様式で解釈されるべきである。特に、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」及び「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という用語は、非排他的様式で、要素、構成要素、又はステップを指し、参照される要素、構成要素、又はステップが存在しても、又は利用されても、あるいは明示的に参照されないその他の要素、構成要素、又はステップと組み合わされてもよいことを示唆するものと解釈されるべきである。本明細書の請求項が、Ａ、Ｂ、Ｃ、．．．．及びＮからなる群から選択されるものの少なくとも１つを指す場合、本文は、Ａ＋Ｎ、又はＢ＋Ｎなどではなく、群からの１つの要素のみを必要とするものと解釈すべきである。

Claims (25)

  1. 配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、４９、５１、５４、５６、及び５８からなる群から選択される第１のアミノ酸配列を含むＶＨセグメント、並びに／又は配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３７、３９、４１、４３、４５、４７、５０、５３、５５、５７、及び５９からなる群から選択される第２のアミノ酸配列を含むＶＬセグメント
    を含む、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド。
  2. 前記ＶＨセグメント及びＶＬセグメントが、リンカーペプチドと共役される、請求項１に記載のペプチド。
  3. 前記リンカーペプチドが、グリシンに富むペプチドである、請求項２に記載のペプチド。
  4. 前記ペプチドが、薬理学的に許容可能な担体中に存在する、請求項１～３のいずれか一項に記載のペプチド。
  5. 前記ペプチドが、前記ＶＨセグメント及びＶＬセグメントの少なくとも２つの対をさらに含み、前記少なくとも２つの対が連結されて多価のｓｃＦｖを形成する、請求項１～４のいずれか一項に記載のペプチド。
  6. 配列番号６０、６１、６２、６４、６５、６６、６８、及び７０からなる群から選択される第１のアミノ酸配列を含む重鎖、並びに／又は配列番号６３、６７、６９、及び７１からなる群から選択される第２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、抗体。
  7. 配列番号６０、６１、６２、６４、６５、６６、６８、及び７０からなる群から選択される前記第１のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号６３、６７、６９、及び７１からなる群から選択される前記第２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項６に記載の抗体。
  8. 配列番号６８の第１のアミノ酸配列を含む重鎖と配列番号６９の第２のアミノ酸配列を含む軽鎖、又は配列番号７０の第１のアミノ酸配列を含む重鎖と配列番号７１の第２のアミノ酸配列を含む軽鎖
    を含む、抗体。
  9. 請求項１～５のいずれか一項に記載の一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は請求項６～８のいずれか一項に記載の抗体を含み、
    前記一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は前記抗体が、薬理学的に許容可能な担体中に存在する、がんを有する患者を治療するための医薬組成物。
  10. 請求項１～５のいずれか一項に記載の一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は請求項６～８のいずれか一項に記載の抗体を含み、
    前記一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は前記抗体が、検出可能な標識をさらに含む、診断用組成物。
  11. 配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、４９、５１、５４、５６、及び５８からなる群から選択される第１のアミノ酸配列をコード化する第１の核酸セグメント、並びに／又は配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３７、３９、４１、４３、４５、４７、５０、５３、５５、５７、及び５９からなる群から選択される第２のアミノ酸配列を含み、
    前記第１及び第２のセグメントが、任意選択的に同一読み枠中に存在する、組換え核酸。
  12. 配列番号６０、６１、６２、６４、６５、６６、６８、及び７０からなる群から選択される第１のアミノ酸配列をコード化する第１の核酸セグメント、並びに／又は配列番号６３、６７、６９、及び７１からなる群から選択される第２のアミノ酸配列を含み、
    前記第１及び第２のセグメントが、任意選択的にバイシストロン配置中にある、組換え核酸。
  13. 配列番号６８の第１のアミノ酸配列をコード化する第１の核酸セグメント及び配列番号６９の第２のアミノ酸配列をコード化する第２の核酸セグメント、又は
    配列番号７０の第１のアミノ酸配列をコード化する第１の核酸セグメント及び配列番号７１の第２のアミノ酸配列をコード化する第２の核酸セグメントを含む、組換え核酸。
  14. キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）の少なくとも一部をコード化するポリペプチドをコード化する第３のセグメントをさらに含み、前記ＣＡＲが、細胞内で発現されると、前記第１及び／又は第２の核酸セグメントを含む抗原結合細胞外ドメインを有する、請求項１１に記載の組換え核酸。
  15. Ｎ－８０３又はＴｘＭの少なくとも一部をコード化するポリペプチドをコード化する第３のセグメントをさらに含み、前記Ｎ－８０３又はＴｘＭが、細胞内で発現されると、前記第１及び／又は第２の核酸セグメントを含む抗原結合ドメインを有する、請求項１１に記載の組換え核酸。
  16. 請求項１１～１５のいずれか一項に記載の組換え核酸を含む、組換え細胞。
  17. 前記細胞が、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、単球、マクロファージ、又は樹状細胞である、請求項１６に記載の組換え細胞。
  18. 前記細胞が、ＣＨＯ細胞又はＥＣ７細胞である、請求項１６に記載の組換え細胞。
  19. 細胞又は組織を、細胞又は組織におけるＣＴＡＬＡ－４媒介効果を減少させる量の請求項１～５のいずれか一項に記載の一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド又は請求項６～８のいずれか一項に記載の抗体に接触させるステップを含む、前記細胞又は組織におけるＣＴＬＡ－４媒介効果を減少させる方法。
  20. 請求項１～６のいずれか一項に記載の一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド、又は請求項６～８のいずれか一項に記載の抗体、又は請求項１６若しくは１７に記載の組換え細胞を含む医薬組成物を、腫瘍を有する患者に投与するステップを含み、
    前記医薬組成物が、前記腫瘍を治療するのに有効な用量及びスケジュールで前記患者に投与される、前記患者を治療する方法。
  21. 請求項１～６のいずれか一項に記載の一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド、又は請求項６～８のいずれか一項に記載の抗体、又は請求項１６若しくは１７に記載の組換え細胞を含む医薬組成物を、腫瘍を有する患者に投与するステップを含み、
    前記医薬組成物が、腫瘍微小環境における免疫抑制を低減するのに有効な用量及びスケジュールで前記患者に投与される、前記患者の免疫抑制を低減する方法。
  22. がんを治療するため、及び／又は腫瘍を有する患者の免疫抑制を低減するための、請求項１～５のいずれか一項に記載の一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）の使用。
  23. がんを治療するため、及び／又は腫瘍を有する患者の免疫抑制を低減するための、請求項６～８のいずれか一項に記載の抗体の使用。
  24. がんを治療するため、及び／又は腫瘍を有する患者の免疫抑制を低減するための、請求項１６又は１７に記載の組換え細胞の使用。
  25. 請求項１～６のいずれか一項に記載の一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）ペプチド、又は請求項６～８のいずれか一項に記載の抗体、又は請求項１６若しくは１７に記載の組換え細胞の医薬における使用。
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