JP2023533751A - Mybpc3ポリペプチドおよびその使用 - Google Patents
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Abstract
本明細書において提供されるのは、異常なRYR2機能に関連する障害(例えば、不整脈または心不全)を処置するための組成物および方法である。いくつかの態様において、方法は、必要とする対象に、心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチド、またはかかるポリペプチドをコードする核酸またはrAAVの有効量を投与することを含む。
Description
関連出願
本願は、2020年7月8日に出願された米国仮出願番号63/049,398の35U.S.C.§119(e)下における利益を主張し、当該仮出願は、その全体において本明細書において参考として援用される。
本願は、2020年7月8日に出願された米国仮出願番号63/049,398の35U.S.C.§119(e)下における利益を主張し、当該仮出願は、その全体において本明細書において参考として援用される。
政府の支援
本発明は、国立衛生研究所により付与された助成金番号R01HL146634およびUG3HL141798下における政府の支援によりなされた。政府は、本発明において一定の権利を有する。
本発明は、国立衛生研究所により付与された助成金番号R01HL146634およびUG3HL141798下における政府の支援によりなされた。政府は、本発明において一定の権利を有する。
EFS-WEBを介してテキストファイルとして提出された配列表への参照
本願は、配列表を含み、これは、ASCIIフォーマットにおいてEFS-Webを介して提出され、その全体において本明細書により参考として援用される。2021年7月6日に作成された前記ASCIIのコピーは、C123370191WO00-SEQ-REと命名され、257,367バイトのサイズである。
本願は、配列表を含み、これは、ASCIIフォーマットにおいてEFS-Webを介して提出され、その全体において本明細書により参考として援用される。2021年7月6日に作成された前記ASCIIのコピーは、C123370191WO00-SEQ-REと命名され、257,367バイトのサイズである。
背景
心臓疾患および心臓不整脈の多くの形態は、直接的に、または間接的に、心臓の筋細胞におけるCa2+放出の不適切な制御により引き起こされる。心臓の筋細胞におけるCa2+放出は、dyadとして知られる特化した構造において起こる。Ca2+放出の重要な調節因子は、RYR2(リアノジン受容体2型)であり、これはCa2+チャネルであり、これを通して筋小胞体から細胞質中にCa2+が放出される。異常なCa2+放出により引き起こされる心臓不整脈の一例は、CPVT(カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍)であり、これは、患者が運動の間に致死的な不整脈についてのリスクを有する、悪性の遺伝性不整脈である。CPVTは、1:10000の推定有病率を有し、突然の不明な若年死の剖検陰性症例のうちの約15%を引き起こす。CPVT症例の60%は、RYR2における変異により引き起こされる。RYR2中で、コード配列の4つの「ホットスポット」領域中でクラスター化される160個を超える異なる変異が、CPVTを引き起こす。現在、CPVTは、利用可能な選択肢により適切に処置されておらず、患者は、突然死または中断された突然死、ならびに現在の治療から生じる病的状態に苦しみ続ける。心房細動などの不整脈の他の形態は、RYR2からのCa2+放出の異常な調節に関連する。RYR2からの異常なCa2+放出はまた、心不全の遺伝性および後天性の形態における収縮不全にも寄与し得る。
心臓疾患および心臓不整脈の多くの形態は、直接的に、または間接的に、心臓の筋細胞におけるCa2+放出の不適切な制御により引き起こされる。心臓の筋細胞におけるCa2+放出は、dyadとして知られる特化した構造において起こる。Ca2+放出の重要な調節因子は、RYR2(リアノジン受容体2型)であり、これはCa2+チャネルであり、これを通して筋小胞体から細胞質中にCa2+が放出される。異常なCa2+放出により引き起こされる心臓不整脈の一例は、CPVT(カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍)であり、これは、患者が運動の間に致死的な不整脈についてのリスクを有する、悪性の遺伝性不整脈である。CPVTは、1:10000の推定有病率を有し、突然の不明な若年死の剖検陰性症例のうちの約15%を引き起こす。CPVT症例の60%は、RYR2における変異により引き起こされる。RYR2中で、コード配列の4つの「ホットスポット」領域中でクラスター化される160個を超える異なる変異が、CPVTを引き起こす。現在、CPVTは、利用可能な選択肢により適切に処置されておらず、患者は、突然死または中断された突然死、ならびに現在の治療から生じる病的状態に苦しみ続ける。心房細動などの不整脈の他の形態は、RYR2からのCa2+放出の異常な調節に関連する。RYR2からの異常なCa2+放出はまた、心不全の遺伝性および後天性の形態における収縮不全にも寄与し得る。
要旨
本開示は、少なくとも部分的に、内在性心臓タンパク質であるMYBPC3のC末端とRYR2との間の相互作用の驚くべき発見、およびこの相互作用するドメインの過剰発現が、異常なRYR2活性を抑制し不整脈を軽減したということに基づく。いくつかの側面において、本開示は、異常なRYR2機能に関連する障害(例えば、遺伝性または後天性のいずれかである不整脈または心不全)を処置するための組成物および方法を提供する。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法を用いて処置される対象は、不整脈を有する対象であって、既存の医学的管理に対するその応答が、最適以下であるものである。
本開示は、少なくとも部分的に、内在性心臓タンパク質であるMYBPC3のC末端とRYR2との間の相互作用の驚くべき発見、およびこの相互作用するドメインの過剰発現が、異常なRYR2活性を抑制し不整脈を軽減したということに基づく。いくつかの側面において、本開示は、異常なRYR2機能に関連する障害(例えば、遺伝性または後天性のいずれかである不整脈または心不全)を処置するための組成物および方法を提供する。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法を用いて処置される対象は、不整脈を有する対象であって、既存の医学的管理に対するその応答が、最適以下であるものである。
本開示のいくつかの側面は、異常なリアノジン受容体2型(RYR2)機能に関連する障害を処置する方法を提供する。いくつかの態様において、方法は、必要とする対象に心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドの有効量を投与することを含む。いくつかの態様において、方法は、必要とする対象に心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸の有効量を投与することを含む。
いくつかの態様において、異常なRYR2機能は、RYR2における1つ以上の変異により引き起こされる。いくつかの態様において、RYR2における変異は、対象における心筋細胞における過剰な拡張期Ca2+放出を引き起こす。
いくつかの態様において、ポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つに対して少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、ポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、ポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つに対して少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、ポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、ヌクレオチド配列は、プロモーターに作動可能に連結されている。いくつかの態様において、核酸は、ベクターである。いくつかの態様において、ベクターは、発現ベクターである。いくつかの態様において、発現ベクターは、ウイルスベクターである。いくつかの態様において、ウイルスベクターは、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、または組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクターから選択される。
いくつかの態様において、ウイルスベクターは、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列およびプロモーターに隣接する2つのAAV逆位末端反復配列(ITRs)をさらに含む、rAAVベクターである。いくつかの態様において、ここで、rAAVベクターは、rAAV粒子中にパッケージングされる。いくつかの態様において、rAAV粒子は、キャプシドタンパク質をさらに含む。いくつかの態様において、キャプシドタンパク質は、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV6.2、AAV7、AAV8、AAV9、AAV.rh8、AAV.rh10、AAV.rh39、AAV.43、AAV2/2-66、AAV2/2-84、およびAAV2/2-125、またはそれらのバリアントから選択される血清型のものである。いくつかの態様において、キャプシドタンパク質は、血清型AAV9のものである。いくつかの態様において、rAAVは、自己相補的AAV(scAAV)である。いくつかの態様において、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、コドン最適化されている。いくつかの態様において、核酸は、メッセンジャーRNA(mRNA)である。いくつかの態様において、mRNAは、修飾されたmRNAである。
いくつかの態様において、ポリペプチドまたは核酸は、対象における心筋細胞に送達される。
いくつかの態様において、障害は、不整脈である。いくつかの態様において、不整脈は、遺伝性または後天性である。いくつかの態様において、遺伝性不整脈は、カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍(CPVT)である。いくつかの態様において、後天性不整脈は、心室性不整脈または上室性不整脈である。いくつかの態様において、心室性不整脈は、心室頻拍、心室細動、または心室性期外収縮である。いくつかの態様において、上室性不整脈は、心房細動、心房粗動、心房頻拍、心房性期外収縮、または発作性上室性頻拍である。いくつかの態様において、障害は、心不全である。
いくつかの態様において、障害は、不整脈である。いくつかの態様において、不整脈は、遺伝性または後天性である。いくつかの態様において、遺伝性不整脈は、カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍(CPVT)である。いくつかの態様において、後天性不整脈は、心室性不整脈または上室性不整脈である。いくつかの態様において、心室性不整脈は、心室頻拍、心室細動、または心室性期外収縮である。いくつかの態様において、上室性不整脈は、心房細動、心房粗動、心房頻拍、心房性期外収縮、または発作性上室性頻拍である。いくつかの態様において、障害は、心不全である。
いくつかの態様において、ポリペプチドまたは核酸を投与することが、対象における心筋細胞における過剰な拡張期Ca2+放出を減少させる。
いくつかの態様において、対象は、ヒトである。いくつかの態様において、投与することは、注射を介するものである。
いくつかの態様において、対象は、ヒトである。いくつかの態様において、投与することは、注射を介するものである。
本開示のいくつかの側面は、不整脈を処置する方法を提供し、該方法は、必要とする対象に組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)の有効量を投与することを含み、ここで、rAAVは、血清型AAV9のキャプシドタンパク質、および心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。
本開示の他の側面は、キャプシドタンパク質および心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)を提供する。
いくつかの態様において、ポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、ポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
本明細書においてさらに提供されるのは、異常なリアノジン受容体2型(RYR2)機能に関連する障害を処置することにおける、本明細書において記載されるrAAVの使用である。いくつかの態様において、障害は、不整脈である。いくつかの態様において、不整脈は、遺伝性または後天性である。いくつかの態様において、遺伝性不整脈は、カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍(CPVT)である。いくつかの態様において、後天性不整脈は、心室性不整脈または上室性不整脈である。いくつかの態様において、心室性不整脈は、心室頻拍、心室細動、または心室性期外収縮である。いくつかの態様において、上室性不整脈は、心房細動、心房粗動、心房頻拍、心房性期外収縮、または発作性上室性頻拍である。いくつかの態様において、障害は、心不全である。
上の要旨は、本明細書において開示される技術の態様、利点、特徴、および用途のうちのいくつかを、非限定的な様式において説明することを意図する。本明細書において開示される技術の他の態様、利点、特徴、および用途は、詳細な説明、図面、例、および請求の範囲から明らかであろう。
添付の図面は、実寸において描画されることを意図されていない。図面において、各々の同一またはほぼ同一の構成成分であって、多様な図において図示されるものは、類似の数字により表される。明確性のために、全ての構成成分が全ての図面においてラベルされているわけではない。特許または出願のファイルは、カラーにおいて実行された少なくとも1つの図面を含む。カラー図面を含む本特許または特許出願の公報のコピーは、請求および必要な料金の支払いに応じて庁により提供されるであろう。図面において:
ある態様の詳細な説明
CPVT(カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍)は、患者が運動の間に致死的な心室性不整脈についてのリスクを有する、悪性の遺伝性不整脈である。CPVTは、心筋細胞のCa2+ハンドリング遺伝子における変異により引き起こされる。症例のうちの60%を超えるものが、主要な細胞内Ca2+放出チャネルをコードする遺伝子RYR2(リアノジン受容体2型)における変異により引き起こされる。本発明者らは、内在性心臓タンパク質のC末端とRYR2との間の新規の相互作用を発見した。この相互作用するドメインの過剰発現は、CPVTにおける不整脈の根本原因である異常なRYR2活性を抑制した。この過剰発現戦略は、ヒトiPSC由来の心筋細胞においてCa2+ハンドリングを正常化し、CPVTのマウスモデルにおいて不整脈を抑制した。重要なことに、RYR2の機能不全は、多様な心不整脈の根底にある最終的な共通の経路である。CPVTについての本発明者らの知見は、概念実証として役立つ。本発明者らは、本発明者らの治療概念は、他の遺伝性および後天性不整脈に適用可能である可能性があると考える。
CPVT(カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍)は、患者が運動の間に致死的な心室性不整脈についてのリスクを有する、悪性の遺伝性不整脈である。CPVTは、心筋細胞のCa2+ハンドリング遺伝子における変異により引き起こされる。症例のうちの60%を超えるものが、主要な細胞内Ca2+放出チャネルをコードする遺伝子RYR2(リアノジン受容体2型)における変異により引き起こされる。本発明者らは、内在性心臓タンパク質のC末端とRYR2との間の新規の相互作用を発見した。この相互作用するドメインの過剰発現は、CPVTにおける不整脈の根本原因である異常なRYR2活性を抑制した。この過剰発現戦略は、ヒトiPSC由来の心筋細胞においてCa2+ハンドリングを正常化し、CPVTのマウスモデルにおいて不整脈を抑制した。重要なことに、RYR2の機能不全は、多様な心不整脈の根底にある最終的な共通の経路である。CPVTについての本発明者らの知見は、概念実証として役立つ。本発明者らは、本発明者らの治療概念は、他の遺伝性および後天性不整脈に適用可能である可能性があると考える。
本開示は、いくつかの側面において、異常なRYR2機能に関連する障害のための、組成物および方法(例えば、遺伝子治療またはタンパク質治療)を提供する。本明細書において、心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチド、またはかかるポリペプチドをコードする核酸は、不整脈を処置することにおいて有効であることが示された。いくつかの態様において、本明細書において記載される組成物および方法は、遺伝性または後天性のいずれかである、動脈性の細動を含む、不整脈または心不全を処置するために用いることができる。
したがって、本開示のいくつかの側面は、不整脈を処置する方法を提供する。いくつかの態様において、方法は、必要とする対象に、心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドの有効量を投与することを含む。いくつかの態様において、方法は、必要とする対象に、MYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸の有効量を投与することを含む。
「心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)」は、心筋細胞において見出される。これらの細胞において、MYBPC3は、筋収縮の基本単位であるサルコメアと称される構造に関連することが知られている。サルコメアは、太いフィラメントおよび細いフィラメントから作られている。本明細書において、驚くべきことに、MYBPC3タンパク質のC末端ドメインフラグメントは、RYR2タンパク質が局在するサルコメア中のdyadに局在し、一方で、全長MYBPC3は、サルコメアの異なる部分に局在することが見出された。ヒトMYBPC3タンパク質配列は、GenBankアクセッション番号NP_000247のもとにおいて提供される。マウスMYBPC3タンパク質配列は、GenBankアクセッション番号NP_032679.2のもとにおいて提供される。MYBPC3のドメイン構造は、Sadayappanら(本明細書において参考として援用されるBiophys Rev. 2012 Jun; 4(2): 93-106)において記載され、また図2Aにおいて図示される。
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC末端ドメイン(例えば、図2Aにおいて示されるようなC7-C8ドメイン)を含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC7およびC8ドメインを含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC7およびC8ドメインからなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC7ドメインを含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC7ドメインからなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC8ドメインを含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC8ドメインからなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC6、C7、C8、C9、およびC10ドメインを含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC6、C7、C8およびC9ドメインを含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC6、C7、およびC8ドメインを含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、MYBPC3のC6およびC7ドメインを含む。いくつかの態様において、記載される方法において用いられるポリペプチドは、全長MYBPC3を含む。本明細書において記載される方法において用いることができるポリペプチドのアミノ酸配列またはポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の例は、表1において提供される。
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、配列番号1の全長マウスMYBPC3を含むか、配列番号1の全長マウスMYBPC3から本質的になるか、または配列番号1の全長マウスMYBPC3からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C6-C7(配列番号2)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C7(配列番号2)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C7(配列番号2)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C6-C8(配列番号3)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C8(配列番号3)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C8(配列番号3)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C6-C9(配列番号4)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C9(配列番号4)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C9(配列番号4)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C6-C10(配列番号5)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C10(配列番号5)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C10(配列番号5)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C8-C10(配列番号6)を含むか、マウスMYBPC3 C8-C10(配列番号6)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C8-C10(配列番号6)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C9-C10(配列番号7)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C7(配列番号7)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C7(配列番号7)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C10(配列番号8)を含むか、マウスMYBPC3 C10(配列番号8)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C10(配列番号8)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C7-C8(配列番号59)を含むか、マウスMYBPC3 C7-C8(配列番号59)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C7-C8(配列番号59)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C7(配列番号60)を含むか、マウスMYBPC3 C7(配列番号60)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C7(配列番号60)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C8(配列番号61)を含むか、マウスMYBPC3 C8(配列番号61)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C8(配列番号61)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C7-C10(配列番号62)を含むか、マウスMYBPC3 C7-C10(配列番号62)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C7-C10(配列番号62)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C6、C8-C10(配列番号63)を含むか、マウスMYBPC3 C6、C8-C10(配列番号63)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6、C8-C10(配列番号63)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、マウスMYBPC3 C6-C7、C9-C10(配列番号64)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C7、C9-C10(配列番号64)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C7、C9-C10(配列番号64)からなる。
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、配列番号9の全長ヒトMYBPC3を含むか、配列番号9の全長ヒトMYBPC3から本質的になるか、または配列番号9の全長ヒトMYBPC3からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号10)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号10)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号10)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C6-C8(配列番号11)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C8(配列番号11)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C8(配列番号11)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C6-C9(配列番号12)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C9(配列番号12)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C9(配列番号12)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C6-C10(配列番号13)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C10(配列番号13)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C10(配列番号13)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C8-C10(配列番号14)を含むか、ヒトMYBPC3 C8-C10(配列番号14)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C8-C10(配列番号14)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C9-C10(配列番号15)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号15)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号15)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C10(配列番号16)を含むか、ヒトMYBPC3 C10(配列番号16)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C10(配列番号16)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C7-C8(配列番号53)を含むか、ヒトMYBPC3 C7-C8(配列番号53)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C7-C8(配列番号53)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C7(配列番号54)を含むか、ヒトMYBPC3 C7(配列番号54)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C7(配列番号54)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C8(配列番号55)を含むか、ヒトMYBPC3 C8(配列番号55)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C8(配列番号55)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C7-C10(配列番号56)を含むか、ヒトMYBPC3 C7-C10(配列番号56)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C7-C10(配列番号56)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYBPC3 C6、C8-C10(配列番号57)を含むか。ヒトMYBPC3 C6、C8-C10(配列番号57)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6、C8-C10(配列番号57)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、ヒトMYPBC3 C6-C7、C9-C10(配列番号58)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C7、C9-C10(配列番号58)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C7、C9-C10(配列番号58)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、全長マウスMYBPC3(配列番号17)を含むか、全長マウスMYBPC3(配列番号17)から本質的になるか、または全長マウスMYBPC3(配列番号17)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C6-C7(配列番号18)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C7(配列番号18)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C7(配列番号18)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C6-C8(配列番号19)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C8(配列番号19)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C8(配列番号19)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C6-C9(配列番号20)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C9(配列番号20)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C9(配列番号20)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C6-C10(配列番号21)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C10(配列番号21)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C10(配列番号21)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C8-C10(配列番号22)を含むか、マウスMYBPC3 C8-C10(配列番号22)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C8-C10(配列番号22)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C9-C10(配列番号23)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C7(配列番号23)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C7(配列番号23)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C10(配列番号24)を含むか、マウスMYBPC3 C10(配列番号24)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C10(配列番号24)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C7-C8(配列番号71)を含むか、マウスMYBPC3 C7-C8(配列番号71)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C7-C8(配列番号71)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C7(配列番号72)を含むか、マウスMYBPC3 C7(配列番号72)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C7(配列番号72)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C8(配列番号73)を含むか、マウスMYBPC3 C8(配列番号73)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C8(配列番号73)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C7-C10(配列番号74)を含むか、マウスMYBPC3 C7-C10(配列番号74)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C7-C10(配列番号74)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C6,C8-C10(配列番号75)を含むか、マウスMYBPC3 C6,C8-C10(配列番号75)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6,C8-C10(配列番号75)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、マウスMYBPC3 C6-C7,C9-C10(配列番号76)を含むか、マウスMYBPC3 C6-C7,C9-C10(配列番号76)から本質的になるか、またはマウスMYBPC3 C6-C7,C9-C10(配列番号76)からなる。
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、全長ヒトMYBPC3(配列番号25)を含むか、全長ヒトMYBPC3(配列番号25)から本質的になるか、または全長ヒトMYBPC3(配列番号25)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号26)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号26)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号26)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C6-C8(配列番号27)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C8(配列番号27)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C8(配列番号27)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C6-C9(配列番号28)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C9(配列番号28)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C9(配列番号28)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C6-C10(配列番号29)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C10(配列番号29)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C10(配列番号29)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C8-C10(配列番号30)を含むか、ヒトMYBPC3 C8-C10(配列番号30)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C8-C10(配列番号30)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C9-C10(配列番号31)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号31)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C7(配列番号31)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C10(配列番号32)を含むか、ヒトMYBPC3 C10(配列番号32)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C10(配列番号32)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C7-C8(配列番号65)を含むか、ヒトMYBPC3 C7-C8(配列番号65)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C7-C8(配列番号65)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C7(配列番号66)を含むか、ヒトMYBPC3 C7(配列番号66)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C7(配列番号66)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C8(配列番号67)を含むか、ヒトMYBPC3 C8(配列番号67)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C8(配列番号67)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C7-C10(配列番号68)を含むか、ヒトMYBPC3 C7-C10(配列番号68)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C7-C10(配列番号68)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYBPC3 C6,C8-C10(配列番号69)を含むか、ヒトMYBPC3 C6,C8-C10(配列番号69)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6,C8-C10(配列番号69)からなる。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリヌクレオチドは、ヒトMYPBC3 C6-C7,C9-C10(配列番号70)を含むか、ヒトMYBPC3 C6-C7,C9-C10(配列番号70)から本質的になるか、またはヒトMYBPC3 C6-C7,C9-C10(配列番号70)からなる。
表1.MYBPC3ポリペプチド
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つに対して、少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つに対して、80%、85%、90%、95%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられるポリペプチドは、配列番号1~16または53~64のアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられる核酸は、ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられる核酸は、配列番号17~32または65~76のうちのいずれか1つに対して、少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられる核酸は、配列番号17~32または65~76のうちのいずれか1つに対して、80%、85%、90%、95%、または99%同一であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられる核酸は、配列番号17~32または65~76のヌクレオチド配列を含む。
本明細書において用いられる場合、「核酸」は、例えば、リボ核酸(RNA)、デオキシリボ核酸(DNA)、トレオース核酸(TNA)、グリコール核酸(GNA)、ペプチド核酸(PNA)、ロックド核酸(β-D-リボ立体配置を有するLNA、α-L-リボ立体配置を有するα-LNA(LNAのジアステレオマー)、2’-アミノ官能化を有する2’-アミノ-LNA、および2’-アミノ官能化を有する2’-アミノ-α-LNAを含むLNA)、エチレン核酸(ENA)、シクロヘキセニル核酸(CeNA)、またはそれらのキメラもしくは組み合わせであっても、またはこれを含んでもよい。本開示の核酸分子は、DNAであってもRNAであってもよい。当業者は、別段に記述される場合を除いて、本開示において記載される核酸配列は、代表的なDNA配列においては「T」を列記するであろうが、配列がRNAを表す場合には、「T」は「U」に置き換えられるであろうことを、理解するであろう。
いくつかの態様において、ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列は、プロモーターに作動可能に連結されている。
「プロモーター」は、核酸の残りの転写の開始および速度がそこで制御される、核酸の制御領域である。プロモーターはまた、転写因子などの調節性のタンパク質および分子がそこで結合する、部分領域を含んでもよい。本開示のプロモーターは、構成的、誘導性、活性化可能、抑制可能、組織特異的、またはそれらの任意の組み合わせであってよい。プロモーターは、それが制御する核酸の発現を駆動するか、または核酸の転写を駆動する。プロモーターは、それが、それがその核酸転写開始および/または発現を制御するように調節する(「駆動する」)核酸に対して、正確な機能的位置および配向にある場合に、「作動可能に連結されている」とみなされる。いくつかの態様において、プロモーターは、構成的プロモーターである。いくつかの態様において、プロモーターは、誘導性プロモーター(また、調節可能プロモーターとしても言及される)である。
構成的プロモーターの例として、限定することなく、以下が挙げられる:レトロウイルスラウス肉腫ウイルス(RSV)LTRプロモーター(任意にRSVエンハンサーと共に)、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター(任意にCMVエンハンサーと共に)[例えば、Boshart et al., Cell, 41:521-530 (1985)を参照]、SV40プロモーター、ジヒドロ葉酸レダクターゼプロモーター、β-アクチンプロモーター、ホスホグリセロールキナーゼ(PGK)プロモーター、およびEF1αプロモーター[Invitrogen]。いくつかの態様において、プロモーターは、エンハンストニワトリβ-アクチンプロモーターである。いくつかの態様において、プロモーターは、U6プロモーターである。いくつかの態様において、本開示において用いられるプロモーターは、CAGプロモーターである(例えば、本明細書において参考として援用されるOkabe et al., FEBS Lett. 1997 May 5;407(3):313-9;およびAlexopoulou et al., BMC Cell Biology 9: 2, 2008において記載されるような、CMVエンハンサー、ニワトリベータ-アクチン遺伝子からのプロモーターならびに第1エクソンおよび第1イントロン、ならびにウサギベータ-グロビン遺伝子のスプライスアクセプターを含むもの)。
誘導性プロモーターは、遺伝子発現の調節を可能にし、外因的に供給される化合物、温度などの環境因子、または特定の生理学的状態の存在、例えば、急性期、細胞の特定の分化状態により、または複製中の細胞においてのみ、調節することができる。誘導性プロモーターおよび誘導性の系は、限定することなくInvitrogen、ClontechおよびAriadを含む多様な商業的ソースから入手可能である。多くの他の系が記載されており、当業者により容易に選択することができる。外因的に供給されるプロモーターにより調節される誘導性プロモーターの例として、亜鉛誘導性ヒツジメタロチオネイン(MT)プロモーター、デキサメタゾン(Dex)-誘導性マウス乳房腫瘍ウイルス(MMTV)プロモーター、T7ポリメラーゼプロモーター系(WO 98/10088);エクジソン昆虫プロモーター(No et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93:3346-3351 (1996))、テトラサイクリンにより抑制可能な系(Gossen et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:5547-5551 (1992))、テトラサイクリン誘導性の系(Gossen et al., Science, 268:1766-1769 (1995)、またHarvey et al., Curr. Opin. Chem. Biol., 2:512-518 (1998)を参照)、RU486誘導性の系(Wang et al., Nat. Biotech., 15:239-243 (1997)およびWang et al., Gene Ther., 4:432-441 (1997))ならびにラパマイシン誘導性の系(Magari et al., J. Clin. Invest., 100:2865-2872 (1997))が挙げられる。この文脈において有用であり得るなお他の型の誘導性プロモーターは、特定の生理学的状態、例えば、温度、急性期、細胞の特定の分化状態により、または複製中の細胞においてのみ、調節されるものである。
いくつかの態様において、オペロンと共にリプレッサーを含む誘導性プロモーターを用いてもよい。一態様において、Escherichia coliからのlacリプレッサーは、lacオペレーターを保有する哺乳動物細胞プロモーターから転写を調節するための転写修飾因子として機能し得[M. Brown et al., Cell, 49:603-612 (1987)];Gossen and Bujard (1992);[M. Gossen et al., Natl. Acad. Sci. USA, 89:5547-5551 (1992)]、テトラサイクリンリプレッサー(tetR)を、転写アクチベーター(VP16)と組み合わせてtetR哺乳動物細胞転写アクチベーター融合タンパク質を作製し、tTa(tetR-VP16)を、ヒトサイトメガロウイルス(hCMV)主要最初期プロモーターに由来するtetO保有最小プロモーターと組み合わせて、哺乳動物細胞において遺伝子発現を制御するためのtetR-tetオペレーター系を作製する。一態様において、テトラサイクリン誘導性スイッチが用いられる(Yao et al., Human Gene Therapy; Gossen et al., Natl. Acad. Sci. USA, 89:5547-5551 (1992);Shockett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92:6522-6526 (1995))。
いくつかの態様においては、MYBPC3についてのネイティブのプロモーターが用いられる。ネイティブのプロモーターは、導入遺伝子の発現がネイティブな発現を模倣すべきであることが所望される場合に、好ましい場合がある。導入遺伝子の発現を、時間的にもしくは発生的に、または組織特異的な様式において、または特定の転写刺激に応答して、調節しなくてはならない場合には、ネイティブなプロモーターを用いてもよい。さらなる態様において、エンハンサーエレメント、ポリアデニル化部位またはKozakコンセンサス配列などの他のネイティブな発現制御エレメントもまた、ネイティブな発現を模倣するために用いてよい。
いくつかの態様において、プロモーターは、組織特異的な遺伝子発現能力を付与する調節配列を含む組織特異的プロモーターである。いくつかの場合において、組織特異的な調節配列は、組織特異的な様式において転写を誘導する組織特異的な転写因子に結合する。かかる組織特異的な調節配列(例えば、プロモーター、エンハンサーなど)、当該分野において周知である。例示的な組織特異的な調節配列として、これらに限定されないが、以下の組織特異的なプロモーターが挙げられる:肝臓特異的チロキシン結合グロブリン(TBG)プロモーター、インスリンプロモーター、グルカゴンプロモーター、ソマトスタチンプロモーター、膵臓ポリペプチド(PPY)プロモーター、シナプシン-1(Syn)プロモーター、クレアチンキナーゼ(MCK)プロモーター、哺乳動物デスミン(DES)プロモーター、α-ミオシン重鎖(a-MHC)プロモーター、または心臓トロポニンT(cTnT)プロモーター。他の例示的なプロモーターとして、ベータ-アクチンプロモーター、肝炎Bウイルスコアプロモーター(Sandig et al., Gene Ther., 3:1002-9 (1996));アルファ-フェトプロテイン(AFP)プロモーター(Arbuthnot et al., Hum. Gene Ther., 7:1503-14 (1996))、骨オステオカルシンプロモーター(Stein et al., Mol. Biol. Rep., 24:185-96 (1997));骨シアロタンパク質プロモーター(Chen et al., J. Bone Miner. Res., 11:654-64 (1996))、CD2プロモーター(Hansal et al., J. Immunol., 161:1063-8 (1998));免疫グロブリン重鎖プロモーター;T細胞受容体α-鎖プロモーター、神経性のもの、例えば、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)プロモーター(Andersen et al., Cell. Mol. Neurobiol., 13:503-15 (1993))、神経フィラメント軽鎖遺伝子プロモーター(Piccioli et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88:5611-5 (1991))、およびニューロン特異的vgf遺伝子プロモーター(Piccioli et al., Neuron, 15:373-84 (1995))が挙げられ、その他のものは当業者には明らかであろう。
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられる核酸は、メッセンジャーRNA(mRNA)である。「メッセンジャーRNA」(mRNA)とは、(少なくとも1つの)ポリペプチド(天然に存在する、天然に存在しない、または修飾されたアミノ酸のポリマー)をコードし、翻訳されて、コードされたポリペプチドをin vitro、in vivo、in situまたはex vivoで生成することができる、任意のポリヌクレオチドを指す。いくつかの好ましい態様において、mRNAは、in vivoで翻訳される。当業者は、別段に記述される場合を除いて、本願において記載されるポリヌクレオチド配列は、代表的なDNA配列においては「T」を列記するが、配列がRNA(例えばmRNA)を表す場合には、「T」は「U」で置き換えられるであろうことを理解するであろう。したがって、特定の配列アイデンティティー番号により同定されるDNAによりコードされるRNAポリヌクレオチドのうちのいずれかはまた、当該DNAによりコードされる対応するRNA(例えばmRNA)配列を含んでもよく、ここで、当該DNA配列の各々の「T」は、「U」で置き換えられる。当業者は、対応するDNA配列に基づいてmRNA配列を同定する方法を理解するであろう。
mRNA分子の基本的な構成成分は、典型的には、少なくとも1つのコード領域、5’非翻訳領域(UTR)、3’UTR、5’capおよびポリAテイルを含む。本開示のポリヌクレオチドは、mRNAとして機能してもよいが、核酸ベースの治療を用いる効果的なポリペプチド発現の既存の課題を克服するために役立つそれらの機能および/または構造的設計の特徴において、野生型mRNAと区別することができる。
いくつかの態様において、本明細書において記載されるmRNAは、1つ以上の化学修飾を含む(例えば、1つ以上の修飾されたヌクレオチドを含む)。用語「化学修飾」および「化学修飾された」とは、アデノシン(A)、グアノシン(G)、ウリジン(U)、チミジン(T)またはシチジン(C)リボヌクレオシドまたはデオキシリボヌクレオシドに関して、それらの位置、パターン、パーセントまたは集団のうちの少なくとも1つにおける修飾を指す。一般に、これらの用語は、天然に存在する5’末端mRNA cap部分におけるリボヌクレオチド修飾のことは指さない。
本明細書において記載されるmRNAは、いくつかの態様において、多様な(1つより多くの)異なる修飾を含む。いくつかの態様において、mRNAの特定の領域は、1つ、2つまたはそれより多くの(任意に異なる)ヌクレオシドまたはヌクレオチド修飾を含む。いくつかの態様において、細胞または生物に導入された修飾されたmRNAは、それぞれ当該細胞または生物において、未修飾のmRNAと比較して低下した分解を示す。いくつかの態様において、細胞または生物に導入された修飾されたmRNAは、それぞれ当該細胞または生物において、低下した免疫原性を示す場合がある(例えば、低下した自然免疫応答)。
ポリヌクレオチドの修飾として、限定することなく、本明細書において記載されるものが挙げられる。本開示の修飾されたmRNAは、天然に存在する、天然に存在しない修飾を含んでもよく、または、ポリヌクレオチドは、天然に存在する修飾と天然に存在しない修飾との組み合わせを含んでもよい。mRNAは、例えば糖の、ヌクレオベースの、またはヌクレオシド間の連結の(例えば、連結するリン酸に対しての、ホスホジエステル連結に対しての、またはホスホジエステル骨格に対しての)任意の有用な修飾を含んでもよい。
本明細書において記載されるmRNAは、いくつかの態様において、所望される機能または特性を達成するためにポリヌクレオチドの合成の間に、または合成後に導入される、非天然の修飾されたヌクレオチドを含む。修飾は、ヌクレオチド間の連結、プリンもしくはピリミジン塩基、または糖の上に存在してもよい。修飾は、化学合成により、またはポリメラーゼ酵素により、鎖の末端に、または鎖のどこかほかの場所に導入することができる。ポリヌクレオチドの領域のうちの任意ものを、化学修飾することができる。
いくつかの態様において、修飾されたmRNAは、1つ以上の修飾されたヌクレオシドおよびヌクレオチドを含む。「ヌクレオシド」とは、糖分子(例えば、ペントースもしくはリボース)またはその誘導体を、有機塩基(例えば、プリンもしくはピリミジン)またはその誘導体(本明細書においてまた「ヌクレオベース」としても言及される)と組み合わせて含む化合物を指す。「ヌクレオチド」とは、リン酸基を含むヌクレオシドを指す。修飾されたヌクレオチドは、任意の有用な方法により、例えば化学的に、酵素により、または組み換えなどにより、1つ以上の修飾されたまたは非天然のヌクレオシドを含むように合成してもよい。ポリヌクレオチドは、連結されたヌクレオシドの領域を含んでもよい。かかる領域は、可変性の骨格の連結を有していてもよい。連結は、標準的なホスホジエステル連結であってもよく、この場合、ポリヌクレオチドは、ヌクレオチドの領域を含むであろう。
いくつかの態様において、本明細書において記載される修飾されたmRNAにおける修飾されたヌクレオベースは、シュードウリジン(ψ)、N1-メチルシュードウリジン(m1ψ)、N1-エチルシュードウリジン、2-チオウリジン、4’-チオウリジン、5-メチルシトシン、2-チオ-1-メチル-1-デアザ-シュードウリジン、2-チオ-1-メチル-シュードウリジン、2-チオ-5-アザ-ウリジン、2-チオ-ジヒドロシュードウリジン、2-チオ-ジヒドロウリジン、2-チオ-シュードウリジン、4-メトキシ-2-チオ-シュードウリジン、4-メトキシ-シュードウリジン、4-チオ-1-メチル-シュードウリジン、4-チオ-シュードウリジン、5-アザ-ウリジン、ジヒドロシュードウリジン、5-メトキシウリジンおよび2’-O-メチルウリジンからなる群より選択される。
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法において用いられる核酸は、ベクター(例えば、クローニングベクターまたは発現ベクター)である。ベクターは、例えば、以下のうちのいくつかまたは全てを含んでもよい:選択可能なマーカー遺伝子、例えば、哺乳動物細胞における安定または一過性の遺伝子導入体の選択のためのネオマイシン遺伝子;高レベルの転写のためのヒトCMVの最初期遺伝子からのエンハンサー/プロモーター配列;mRNA安定性のためのSV40からの転写終結およびRNAプロセッシングシグナル;適切なエピソーム複製のためのSV40ポリオーマ複製起点およびColE1;内部リボソーム結合部位(internal ribosome binding site:IRES)、多用途なマルチクローニング部位;ならびにin vitroでのセンスおよびアンチセンスRNAの転写のためのT7およびSP6 RNAプロモーター。好適なベクターおよび導入遺伝子を含むベクターを生成するための方法は、周知であり、当該分野において利用可能である。
核酸を含む発現ベクターは、従来の技術(例えば、エレクトロポレーション、リポソームトランスフェクション、およびリン酸カルシウム沈殿)により宿主細胞にトランスファーすることができ、遺伝子導入された細胞を、次いで、従来の技術により培養して、本明細書において記載されるポリペプチドを産生させる。いくつかの態様において、本明細書において記載されるポリペプチドの発現は、構成的、誘導性または組織特異的プロモーターにより調節される。
本開示により、多様な宿主-発現ベクター系を利用することができる。かかる宿主-発現系の代表は、本明細書において記載されるヌクレオチド配列を生成することができ、その後精製することができるビヒクルであるが、また、適切なヌクレオチド配列で形質転換されるかまたはこれを遺伝子導入された場合に、ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をin situで発現することができる細胞も、代表的なものである。これらは、これらに限定されないが、ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列を含む組み換えバクテリオファージDNA、プラスミドDNAもしくはコスミドDNA発現ベクターで形質転換された細菌などの微生物(例えば、E. coliおよびB. subtilis);ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列を含む組み換え酵母発現ベクターで形質転換された酵母(例えば、Saccharomyces pichia);ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列を含む組み換えウイルス発現ベクター(例えば、バキュロウイルス)に感染させた昆虫細胞系;ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列を含む組み換えウイルス発現ベクター(例えば、カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)およびタバコモザイクウイルス(TMV)に感染させたか、またはポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列を含む組み換えプラスミド発現ベクター(例えば、Tiプラスミド)で形質転換した植物細胞系;または、哺乳動物細胞のゲノムから(例えば、メタロチオネインプロモーター)もしくは哺乳動物ウイルスから誘導されたプロモーター(例えば、アデノウイルス後期プロモーター;ワクシニアウイルス7.5Kプロモーター)を含む組み換え発現コンストラクトを保有する哺乳動物細胞系(例えば、COS、CHO、BHK、293、293T、3T3細胞、リンパ管細胞(lymphotic cells)(米国特許第5,807,715号を参照)、Per C.6細胞(Crucellにより開発されたヒト網膜細胞)を含む。
いくつかの態様において、本開示のベクターは、ウイルスベクターである。いくつかの態様において、ウイルスベクターは、ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)の哺乳動物発現のために好適である。好適なウイルスベクターとして、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、または組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクターが挙げられる。
「レンチウイルスベクター」とは、レンチウイルスゲノム(例えばHIV)から誘導されたベクターを指す。レンチウイルスベクターは、例えば、有益な遺伝子を宿主細胞または生物中に挿入するために、または宿主細胞または生物における遺伝子を削除または修飾するために、遺伝子治療において一般的に用いられてきた。レンチウイルスベクターは、非分裂中および分裂中の細胞において目的の遺伝子を安定に発現するそれらの能力に起因して、哺乳動物細胞における遺伝子導入のための有効なビヒクルである。
「レトロウイルスベクター」とは、レトロウイルスゲノムから誘導されたベクターを指す。レトロウイルスベクターは、目的の遺伝子を収容して標的細胞中への両方の組み込みを可能にすることができるプロウイルス配列からなる。ベクターはまた、標的細胞における目的の遺伝子の発現を増強するために、CMVプロモーターなどのウイルスおよび細胞の遺伝子プロモーターを含む。レトロウイルスベクターもまた、遺伝子治療において一般的に用いられてきた。
「組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクター」は、典型的には、最小限、導入遺伝子およびその調節配列(例えばプロモーター)、および5’および3’AAV逆位末端反復配列(ITR)を含んでなる。導入遺伝子は、本明細書においてどこか他の場所で開示されるように、例えば、本開示においてどこか他の場所で記載されるようなMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含んでもよい。
一般的に、ITR配列は、約145bpの長さである。好ましくは、実質的にITRをコードする配列全体が、分子中で用いられるが、これらの配列のある程度のマイナーな修飾が許容可能である。これらのITR配列を修飾する能力は、当該分野における技術の範囲内である(例えば、Sambrookら、「Molecular Cloning. A Laboratory Manual」、第2版、Cold Spring Harbor Laboratory, New York (1989);およびK. Fisher et al., J Virol., 70:520 532 (1996)などの教科書を参照)。本発明において使用されるかかる分子の一例は、導入遺伝子を含む「シス-作動性」プラスミドであり、ここで、選択された導入遺伝子配列および関連する調節性エレメントは、5’および3’AAV ITR配列に隣接する。AAV ITR配列は、現在同定されている哺乳動物AAV型を含む任意の既知のAAVから得ることができる。いくつかの態様において、本明細書において記載されるrAAVベクターは、ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列に隣接する2つのITRを含む(隣接する配列の各々の末端において1つのITR)。いくつかの態様において、ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列は、プロモーターに作動可能に連結されており、本明細書において記載されるrAAVベクターは、ポリペプチド(例えば、本明細書において記載されるMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列およびプロモーターに隣接する2つのITRを含む(隣接する配列の各々の末端において1つのITR)。
いくつかの態様において、ITRは、AAV1、AAV2、AAV2i8、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV6.2、AAV7、AAV8、AAVrh8、AAV9、AAVrh10、AAVrh39、AAVrh43、AAV2/2-66、AAV2/2-84、AAV2/2-125、およびこれらのバリアントから選択される血清型のものである。いくつかの態様において、rAAVベクターは、血清型AAV2のITRを含む。いくつかの態様において、本明細書において記載されるrAAVベクターにおいて用いられるITRは:
CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTTGTAGTTAATGATTAACCCGCCATGCTACTTATCTACG(配列番号33)
のヌクレオチド配列を含む。
CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTTGTAGTTAATGATTAACCCGCCATGCTACTTATCTACG(配列番号33)
のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、本開示のrAAVベクターは、自己相補的AAVベクター(scAAV)である。「自己相補的AAVベクター」(scAAV)とは、AAVのITRのうちの1つからの末端分離部位(terminal resolution site:TR)の不在下において作製された二本鎖ベクターゲノムを含むベクターを指す(例えば、本明細書において参考として援用されるMcCarthy (2008) Molecular Therapy 16(10):1648-1656において記載されるように)。TRの不在は、ベクターのTRが存在しない末端における複製の開始を防止する。一般的に、scAAVベクターは、一本鎖の、野生型(wt)AAV TRを両端に、および変異したTR(mTR)を中央に有する逆方向反復ゲノムを生じる。本発明は、部分的に、RNAヘアピン構造(例えばshRNA、miRNAおよびAmiRNA)をコードするDNAフラグメントが、ウイルスゲノム複製の間に、変異した逆方向末端反復(mTR)と類似の機能を果たし、自己相補的AAVベクターゲノムを生じ得るという認識に基づく。いくつかの態様において、本明細書において記載されるscAAVベクターにおいて用いられるITRは:
CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGG(配列番号34)
のヌクレオチド配列を含む。
CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGG(配列番号34)
のヌクレオチド配列を含む。
本明細書においてさらに提供されるのは、いくつかの側面において、キャプシドタンパク質および本明細書において記載される核酸分子のうちのいずれか1つを含む、組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)である。いくつかの態様において、「キャプシドタンパク質」とは、AAVのCAP遺伝子によりコードされる構造タンパク質を指す。AAVは、3つのキャプシドタンパク質、ビリオンタンパク質1~3(VP1、VP2およびVP3と命名される)を含み、これらの全てが、選択的スプライシングを介して単一のcap遺伝子から転写される。いくつかの態様において、VP1、VP2およびVP3の分子量は、それぞれ、約87kDa、約72kDaおよび約62kDaである。いくつかの態様において、翻訳後に、キャプシドタンパク質は、ウイルスゲノムの周囲に球状の60マーのタンパク質のシェルを形成する。いくつかの態様において、キャプシドタンパク質の機能は、ウイルスゲノムを保護し、ゲノムを送達し、宿主と相互作用することである。
いくつかの態様において、AAVキャプシドタンパク質は、AAV1、AAV2、AAV2i8、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV6.2、AAV7、AAV8、AAVrh8、AAV9、AAVrh10、AAVrh39、AAVrh43、AAV2/2-66、AAV2/2-84、AAV2/2-125からなる群より選択されるAAV血清型のものである。いくつかの態様において、AAVキャプシドタンパク質は、非ヒト霊長類に由来する血清型、例えばscAAV.rh8、AAV.rh39、またはAAV.rh43血清型のものである。いくつかの態様において、AAVキャプシドタンパク質は、AAV9血清型のものである。いくつかの態様において、AAVキャプシドタンパク質は、AAV2i8血清型のものである。キャプシドタンパク質のアミノ酸配列の非限定的な例は、配列番号35~52として提供される。
配列番号35:AAV-キャプシド1
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKTGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPATPAAVGPTTMASGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSASTGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTTNDGVTTIANNLTSTVQVFSDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEEVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLNRTQNQSGSAQNKDLLFSRGSPAGMSVQPKNWLPGPCYRQQRVSKTKTDNNNSNFTWTGASKYNLNGRESIINPGTAMASHKDDEDKFFPMSGVMIFGKESAGASNTALDNVMITDEEEIKATNPVATERFGTVAVNFQSSSTDPATGDVHAMGALPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKNPPPQILIKNTPVPANPPAEFSATKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEVQYTSNYAKSANVDFTVDNNGLYTEPRPIGTRYLTRPL
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKTGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPATPAAVGPTTMASGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSASTGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTTNDGVTTIANNLTSTVQVFSDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEEVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLNRTQNQSGSAQNKDLLFSRGSPAGMSVQPKNWLPGPCYRQQRVSKTKTDNNNSNFTWTGASKYNLNGRESIINPGTAMASHKDDEDKFFPMSGVMIFGKESAGASNTALDNVMITDEEEIKATNPVATERFGTVAVNFQSSSTDPATGDVHAMGALPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKNPPPQILIKNTPVPANPPAEFSATKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEVQYTSNYAKSANVDFTVDNNGLYTEPRPIGTRYLTRPL
配列番号36:AAV-キャプシド2
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配列番号37:AAV-キャプシド3B
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MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGVPQPKANQQHQDNRRGLVLPGYKYLGPGNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLKYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRILEPLGLVEEAAKTAPGKKRPVDQSPQEPDSSSGVGKSGKQPARKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPAAPTSLGSNTMASGGGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSQWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKKLSFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLNRTQGTTSGTTNQSRLLFSQAGPQSMSLQARNWLPGPCYRQQRLSKTANDNNNSNFPWTAASKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPMHGNLIFGKEGTTASNAELDNVMITDEEEIRTTNPVATEQYGTVANNLQSSNTAPTTRTVNDQGALPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQIMIKNTPVPANPPTTFSPAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号38:AAV-キャプシド4
MTDGYLPDWLEDNLSEGVREWWALQPGAPKPKANQQHQDNARGLVLPGYKYLGPGNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLKYNHADAEFQQRLQGDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEQAGETAPGKKRPLIESPQQPDSSTGIGKKGKQPAKKKLVFEDETGAGDGPPEGSTSGAMSDDSEMRAAAGGAAVEGGQGADGVGNASGDWHCDSTWSEGHVTTTSTRTWVLPTYNNHLYKRLGESLQSNTYNGFSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGMRPKAMRVKIFNIQVKEVTTSNGETTVANNLTSTVQIFADSSYELPYVMDAGQEGSLPPFPNDVFMVPQYGYCGLVTGNTSQQQTDRNAFYCLEYFPSQMLRTGNNFEITYSFEKVPFHSMYAHSQSLDRLMNPLIDQYLWGLQSTTTGTTLNAGTATTNFTKLRPTNFSNFKKNWLPGPSIKQQGFSKTANQNYKIPATGSDSLIKYETHSTLDGRWSALTPGPPMATAGPADSKFSNSQLIFAGPKQNGNTATVPGTLIFTSEEELAATNATDTDMWGNLPGGDQSNSNLPTVDRLTALGAVPGMVWQNRDIYYQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLIGGFGLKHPPPQIFIKNTPVPANPATTFSSTPVNSFITQYSTGQVSVQIDWEIQKERSKRWNPEVQFTSNYGQQNSLLWAPDAAGKYTEPRAIGTRYLTHHL
MTDGYLPDWLEDNLSEGVREWWALQPGAPKPKANQQHQDNARGLVLPGYKYLGPGNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLKYNHADAEFQQRLQGDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEQAGETAPGKKRPLIESPQQPDSSTGIGKKGKQPAKKKLVFEDETGAGDGPPEGSTSGAMSDDSEMRAAAGGAAVEGGQGADGVGNASGDWHCDSTWSEGHVTTTSTRTWVLPTYNNHLYKRLGESLQSNTYNGFSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGMRPKAMRVKIFNIQVKEVTTSNGETTVANNLTSTVQIFADSSYELPYVMDAGQEGSLPPFPNDVFMVPQYGYCGLVTGNTSQQQTDRNAFYCLEYFPSQMLRTGNNFEITYSFEKVPFHSMYAHSQSLDRLMNPLIDQYLWGLQSTTTGTTLNAGTATTNFTKLRPTNFSNFKKNWLPGPSIKQQGFSKTANQNYKIPATGSDSLIKYETHSTLDGRWSALTPGPPMATAGPADSKFSNSQLIFAGPKQNGNTATVPGTLIFTSEEELAATNATDTDMWGNLPGGDQSNSNLPTVDRLTALGAVPGMVWQNRDIYYQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLIGGFGLKHPPPQIFIKNTPVPANPATTFSSTPVNSFITQYSTGQVSVQIDWEIQKERSKRWNPEVQFTSNYGQQNSLLWAPDAAGKYTEPRAIGTRYLTHHL
配列番号39:AAV-キャプシド5
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MSFVDHPPDWLEEVGEGLREFLGLEAGPPKPKPNQQHQDQARGLVLPGYNYLGPGNGLDRGEPVNRADEVAREHDISYNEQLEAGDNPYLKYNHADAEFQEKLADDTSFGGNLGKAVFQAKKRVLEPFGLVEEGAKTAPTGKRIDDHFPKRKKARTEEDSKPSTSSDAEAGPSGSQQLQIPAQPASSLGADTMSAGGGGPLGDNNQGADGVGNASGDWHCDSTWMGDRVVTKSTRTWVLPSYNNHQYREIKSGSVDGSNANAYFGYSTPWGYFDFNRFHSHWSPRDWQRLINNYWGFRPRSLRVKIFNIQVKEVTVQDSTTTIANNLTSTVQVFTDDDYQLPYVVGNGTEGCLPAFPPQVFTLPQYGYATLNRDNTENPTERSSFFCLEYFPSKMLRTGNNFEFTYNFEEVPFHSSFAPSQNLFKLANPLVDQYLYRFVSTNNTGGVQFNKNLAGRYANTYKNWFPGPMGRTQGWNLGSGVNRASVSAFATTNRMELEGASYQVPPQPNGMTNNLQGSNTYALENTMIFNSQPANPGTTATYLEGNMLITSESETQPVNRVAYNVGGQMATNNQSSTTAPATGTYNLQEIVPGSVWMERDVYLQGPIWAKIPETGAHFHPSPAMGGFGLKHPPPMMLIKNTPVPGNITSFSDVPVSSFITQYSTGQVTVEMEWELKKENSKRWNPEIQYTNNYNDPQFVDFAPDSTGEYRTTRPIGTRYLTRPL
配列番号40:AAV-キャプシド6
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MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPFGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKTGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPATPAAVGPTTMASGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSASTGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTTNDGVTTIANNLTSTVQVFSDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLNRTQNQSGSAQNKDLLFSRGSPAGMSVQPKNWLPGPCYRQQRVSKTKTDNNNSNFTWTGASKYNLNGRESIINPGTAMASHKDDKDKFFPMSGVMIFGKESAGASNTALDNVMITDEEEIKATNPVATERFGTVAVNLQSSSTDPATGDVHVMGALPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPPAEFSATKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEVQYTSNYAKSANVDFTVDNNGLYTEPRPIGTRYLTRPL
配列番号41:AAV-キャプシド6.2
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MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKTGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPATPAAVGPTTMASGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSASTGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTTNDGVTTIANNLTSTVQVFSDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLNRTQNQSGSAQNKDLLFSRGSPAGMSVQPKNWLPGPCYRQQRVSKTKTDNNNSNFTWTGASKYNLNGRESIINPGTAMASHKDDKDKFFPMSGVMIFGKESAGASNTALDNVMITDEEEIKATNPVATERFGTVAVNLQSSSTDPATGDVHVMGALPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPPAEFSATKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEVQYTSNYAKSANVDFTVDNNGLYTEPRPIGTRYLTRPL
配列番号42:AAV-キャプシド7
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDNGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPAKKRPVEPSPQRSPDSSTGIGKKGQQPARKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPAAPSSVGSGTVAAGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSETAGSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKKLRFKLFNIQVKEVTTNDGVTTIANNLTSTIQVFSDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQSVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYSFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLARTQSNPGGTAGNRELQFYQGGPSTMAEQAKNWLPGPCFRQQRVSKTLDQNNNSNFAWTGATKYHLNGRNSLVNPGVAMATHKDDEDRFFPSSGVLIFGKTGATNKTTLENVLMTNEEEIRPTNPVATEEYGIVSSNLQAANTAAQTQVVNNQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPPEVFTPAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNFEKQTGVDFAVDSQGVYSEPRPIGTRYLTRNL
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDNGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPAKKRPVEPSPQRSPDSSTGIGKKGQQPARKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPAAPSSVGSGTVAAGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSETAGSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKKLRFKLFNIQVKEVTTNDGVTTIANNLTSTIQVFSDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQSVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYSFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLARTQSNPGGTAGNRELQFYQGGPSTMAEQAKNWLPGPCFRQQRVSKTLDQNNNSNFAWTGATKYHLNGRNSLVNPGVAMATHKDDEDRFFPSSGVLIFGKTGATNKTTLENVLMTNEEEIRPTNPVATEEYGIVSSNLQAANTAAQTQVVNNQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPPEVFTPAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNFEKQTGVDFAVDSQGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号43:AAV-キャプシド8
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MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLQAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEPSPQRSPDSSTGIGKKGQQPARKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPAAPSGVGPNTMAAGGGAPMADNNEGADGVGSSSGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNGTSGGATNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLSFKLFNIQVKEVTQNEGTKTIANNLTSTIQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFTYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQTTGGTANTQTLGFSQGGPNTMANQAKNWLPGPCYRQQRVSTTTGQNNNSNFAWTAGTKYHLNGRNSLANPGIAMATHKDDEERFFPSNGILIFGKQNAARDNADYSDVMLTSEEEIKTTNPVATEEYGIVADNLQQQNTAPQIGTVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFNQSKLNSFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTSVDFAVNTEGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号44:AAV-キャプシド9
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MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGAPQPKANQQHQDNARGLVLPGYKYLGPGNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRLLEPLGLVEEAAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSAGIGKSGAQPAKKRLNFGQTGDTESVPDPQPIGEPPAAPSGVGSLTMASGGGAPVADNNEGADGVGSSSGNWHCDSQWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNSTSGGSSNDNAYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTDNNGVKTIANNLTSTVQVFTDSDYQLPYVLGSAHEGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNDGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFSYEFENVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSKTINGSGQNQQTLKFSVAGPSNMAVQGRNYIPGPSYRQQRVSTTVTQNNNSEFAWPGASSWALNGRNSLMNPGPAMASHKEGEDRFFPLSGSLIFGKQGTGRDNVDADKVMITNEEEIKTTNPVATESYGQVATNHQSAQAQAQTGWVQNQGILPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGMKHPPPQILIKNTPVPADPPTAFNKDKLNSFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSNNVEFAVNTEGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号45:AAV-キャプシドrh8
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MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKTGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPAAPSGLGPNTMASGGGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNGTSGGSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTTNEGTKTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQALGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLVRTQTTGTGGTQTLAFSQAGPSSMANQARNWVPGPCYRQQRVSTTTNQNNNSNFAWTGAAKFKLNGRDSLMNPGVAMASHKDDDDRFFPSSGVLIFGKQGAGNDGVDYSQVLITDEEEIKATNPVATEEYGAVAINNQAANTQAQTGLVHNQGVIPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPLTFNQAKLNSFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTNVDFAVNTEGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号46:AAV-キャプシドrh10
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MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEPSPQRSPDSSTGIGKKGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPIGEPPAGPSGLGSGTMAAGGGAPMADNNEGADGVGSSSGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNGTSGGSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNEGTKTIANNLTSTIQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYQFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQSTGGTAGTQQLLFSQAGPNNMSAQAKNWLPGPCYRQQRVSTTLSQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGVAMATHKDDEERFFPSSGVLMFGKQGAGKDNVDYSSVMLTSEEEIKTTNPVATEQYGVVADNLQQQNAAPIVGAVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFSQAKLASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTNVDFAVNTDGTYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号47:AAV-キャプシドrh39
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEAAKTAPGKKRPVEPSPQRSPDSSTGIGKKGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPIGEPPAGPSGLGSGTMAAGGGAPMADNNEGADGVGSSSGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNGTSGGSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLSFKLFNIQVKEVTQNEGTKTIANNLTSTIQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQSTGGTQGTQQLLFSQAGPANMSAQAKNWLPGPCYRQQRVSTTLSQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGVAMATHKDDEERFFPSSGVLMFGKQGAGRDNVDYSSVMLTSEEEIKTTNPVATEQYGVVADNLQQTNTGPIVGNVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFSQAKLASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTNVDFAVNTEGTYSEPRPIGTRYLTRNL
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配列番号48:AAV-キャプシドrh43
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配列番号49:AAV-キャプシド2/2-66
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配列番号50:AAV-キャプシド2/2-84
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配列番号51:AAV-キャプシド2/2-125
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配列番号52:AAV-キャプシド2i8(AAV2-キャプシドのRGNRQA(アミノ酸585-590)のQQNTAPによる置換)
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配列番号77:AAV-cTnT-HA-hC7C8-P2A-GFP
CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTTGTAGTTAATGATTAACCCGCCATGCTACTTATCTACCAGGGTAATGGGGATCCTCTAGAACTATAGCTAGAATTCGCCCTTACGGGCCCCCCCTCGAGGTCGGGATAAAAGCAGTCTGGGCTTTCACATGACAGCATCTGGGGCTGCGGCAGAGGGTCGGGTCCGAAGCGCTGCCTTATCAGCGTCCCCAGCCCTGGGAGGTGACAGCTGGCTGGCTTGTGTCAGCCCCTCGGGCACTCACGTATCTCCGTCCGACGGGTTTAAAATAGCAAAACTCTGAGGCCACACAATAGCTTGGGCTTATATGGGCTCCTGTGGGGGAAGGGGGAGCACGGAGGGGGCCGGGGCCGCTGCTGCCAAAATAGCAGCTCACAAGTGTTGCATTCCTCTCTGGGCGCCGGGCACATTCCTGCTGGCTCTGCCCGCCCCGGGGTGGGCGCCGGGGGGACCTTAAAGCCTCTGCCCCCCAAGGAGCCCTTCCCAGACAGCCGCCGGCACCCACCGCTCCGTGGGACGATCCCCGAAGCTCTAGAGCTTTATTGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGCAGTCAGTGCTTCTGACACAACAGTCTCGAACTTAAGCTGCAGAAGTTGGTCGTGAGGCACTGGGCAGGTAAGTATCAAGGTTACAAGACAGGTTTAAGGAGACCAATAGAAACTGGGCTTGTCGAGACAGAGAAGACTCTTGCGTTTCTGATAGGCACCTATTGGTCTTACTGACATCCACTTTGCCTTTCTCTCCACAGGTGTCCACTCCCAGTTCAATTACAGCTCTTAAGGCTAGAGTACTTAATACGACTCACTATAGGCTAGCCTCGAGAAGcggccgcactactccgcggactactactagtATGGCCGTTTACCCATACGATGTTCCTGACTATGCGGGCTATCCCTATGACGTCCCGGACTATGCAGGATCCTATCCATATGACGTTCCAGATTACGCTaccggtCCCCCCAGCGAACCCACCCACCTGGCAGTAGAGGACGTCTCTGACACCACGGTCTCCCTCAAGTGGCGGCCCCCAGAGCGCGTGGGAGCAGGAGGCCTGGATGGCTACAGCGTGGAGTACTGCCCAGAGGGCTGCTCAGAGTGGGTGGCTGCCCTGCAGGGGCTGACAGAGCACACATCGATACTGGTGAAGGACCTGCCCACGGGGGCCCGGCTGCTTTTCCGAGTGCGGGCACACAATATGGCAGGGCCTGGAGCCCCTGTTACCACCACGGAGCCGGTGACAGTGCAGGAGATCCTGCAACGGCCACGGCTTCAGCTGCCCAGGCACCTGCGCCAGACCATTCAGAAGAAGGTCGGGGAGCCTGTGAACCTTCTCATCCCTTTCCAGGGCAAGCCCCGGCCTCAGGTGACCTGGACCAAAGAGGGGCAGCCCCTGGCAGGCGAGGAGGTGAGCATCCGCAACAGCCCCACAGACACCATCCTGTTCATCCGGGCCGCTCGCCGCGTGCATTCAGGCACTTACCAGGTGACGGTGCGCATTGAGAACATGGAGGACAAGGCCACGCTGGTGCTGCAGGTTGTTGACAAGCCAAGTCCTaagcttGGAcaattgGGAgagctcGGATCCGGAGCCACGAACTTCTCTCTGTTAAAGCAAGCAGGAGACGTGGAAGAAAACCCCGGTCCTGCCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAACGTCTATATCATGGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGATCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTAATAAGCTCGCGTGGTACCTCTAGAGTCGACCCGGGCGGCCTCGAGGACGGGGTGAACTACGCCTGAGGATCCGATCTTTTTCCCTCTGCCAAAAATTATGGGGACATCATGAAGCCCCTTGAGCATCTGACTTCTGGCTAATAAAGGAAATTTATTTTCATTGCAATAGTGTGTTGGAATTTTTTGTGTCTCTCACTCGGAAGCAATTCGTTGATCTGAATTTCGACCACCCATAATACCCATTACCCTGGTAGATAAGTAGCATGGCGGGTTAATCATTAACTACAAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGCCTTAATTAACCTAATTCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTCCCAACAGTTGCGCAGCCTGAATGGCGAATGGGACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGACCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCGCCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTTTAGGGTTCCGATTTAGTGCTTTACGGCACCTCGACCCCAAAAAACTTGATTAGGGTGATGGTTCACGTAGTGGGCCATCGCCCTGATAGACGGTTTTTCGCCCTTTGACGTTGGAGTCCACGTTCTTTAATAGTGGACTCTTGTTCCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATCTCGGTCTATTCTTTTGATTTATAAGGGATTTTGCCGATTTCGGCCTATTGGTTAAAAAATGAGCTGATTTAACAAAAATTTAACGCGAATTTTAACAAAATATTAACGCTTACAATTTAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATATTGAAAAAGGAAGAGTATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCCCTTATTCCCTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTGCTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACTGGATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTCAGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGCAGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCTAACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCATACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAACTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCGCTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGGTCTCGCGGTATCATTGCAGCACTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGATGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAACTGTCAGACCAAGTTTACTCATATATACTTTAGATTGATTTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTG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CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTTGTAGTTAATGATTAACCCGCCATGCTACTTATCTACCAGGGTAATGGGGATCCTCTAGAACTATAGCTAGAATTCGCCCTTACGGGCCCCCCCTCGAGGTCGGGATAAAAGCAGTCTGGGCTTTCACATGACAGCATCTGGGGCTGCGGCAGAGGGTCGGGTCCGAAGCGCTGCCTTATCAGCGTCCCCAGCCCTGGGAGGTGACAGCTGGCTGGCTTGTGTCAGCCCCTCGGGCACTCACGTATCTCCGTCCGACGGGTTTAAAATAGCAAAACTCTGAGGCCACACAATAGCTTGGGCTTATATGGGCTCCTGTGGGGGAAGGGGGAGCACGGAGGGGGCCGGGGCCGCTGCTGCCAAAATAGCAGCTCACAAGTGTTGCATTCCTCTCTGGGCGCCGGGCACATTCCTGCTGGCTCTGCCCGCCCCGGGGTGGGCGCCGGGGGGACCTTAAAGCCTCTGCCCCCCAAGGAGCCCTTCCCAGACAGCCGCCGGCACCCACCGCTCCGTGGGACGATCCCCGAAGCTCTAGAGCTTTATTGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGCAGTCAGTGCTTCTGACACAACAGTCTCGAACTTAAGCTGCAGAAGTTGGTCGTGAGGCACTGGGCAGGTAAGTATCAAGGTTACAAGACAGGTTTAAGGAGACCAATAGAAACTGGGCTTGTCGAGACAGAGAAGACTCTTGCGTTTCTGATAGGCACCTATTGGTCTTACTGACATCCACTTTGCCTTTCTCTCCACAGGTGTCCACTCCCAGTTCAATTACAGCTCTTAAGGCTAGAGTACTTAATACGACTCACTATAGGCTAGCCTCGAGAAGcggccgcactactccgcggactactactagtATGGCCGTTTACCCATACGATGTTCCTGACTATGCGGGCTATCCCTATGACGTCCCGGACTATGCAGGATCCTATCCATATGACGTTCCAGATTACGCTaccggtCCCCCCAGCGAACCCACCCACCTGGCAGTAGAGGACGTCTCTGACACCACGGTCTCCCTCAAGTGGCGGCCCCCAGAGCGCGTGGGAGCAGGAGGCCTGGATGGCTACAGCGTGGAGTACTGCCCAGAGGGCTGCTCAGAGTGGGTGGCTGCCCTGCAGGGGCTGACAGAGCACACATCGATACTGGTGAAGGACCTGCCCACGGGGGCCCGGCTGCTTTTCCGAGTGCGGGCACACAATATGGCAGGGCCTGGAGCCCCTGTTACCACCACGGAGCCGGTGACAGTGCAGGAGATCCTGCAACGGCCACGGCTTCAGCTGCCCAGGCACCTGCGCCAGACCATTCAGAAGAAGGTCGGGGAGCCTGTGAACCTTCTCATCCCTTTCCAGGGCAAGCCCCGGCCTCAGGTGACCTGGACCAAAGAGGGGCAGCCCCTGGCAGGCGAGGAGGTGAGCATCCGCAACAGCCCCACAGACACCATCCTGTTCATCCGGGCCGCTCGCCGCGTGCATTCAGGCACTTACCAGGTGACGGTGCGCATTGAGAACATGGAGGACAAGGCCACGCTGGTGCTGCAGGTTGTTGACAAGCCAAGTCCTaagcttGGAcaattgGGAgagctcGGATCCGGAGCCACGAACTTCTCTCTGTTAAAGCAAGCAGGAGACGTGGAAGAAAACCCCGGTCCTGCCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAACGTCTATATCATGGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGATCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTAATAAGCTCGCGTGGTACCTCTAGAGTCGACCCGGGCGGCCTCGAGGACGGGGTGAACTACGCCTGAGGATCCGATCTTTTTCCCTCTGCCAAAAATTATGGGGACATCATGAAGCCCCTTGAGCATCTGACTTCTGGCTAATAAAGGAAATTTATTTTCATTGCAATAGTGTGTTGGAATTTTTTGTGTCTCTCACTCGGAAGCAATTCGTTGATCTGAATTTCGACCACCCATAATACCCATTACCCTGGTAGATAAGTAGCATGGCGGGTTAATCATTAACTACAAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGCCTTAATTAACCTAATTCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTCCCAACAGTTGCGCAGCCTGAATGGCGAATGGGACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGACCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCGCCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTTTAGGGTTCCGATTTAGTGCTTTACGGCACCTCGACCCCAAAAAACTTGATTAGGGTGATGGTTCACGTAGTGGGCCATCGCCCTGATAGACGGTTTTTCGCCCTTTGACGTTGGAGTCCACGTTCTTTAATAGTGGACTCTTGTTCCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATCTCGGTCTATTCTTTTGATTTATAAGGGATTTTGCCGATTTCGGCCTATTGGTTAAAAAATGAGCTGATTTAACAAAAATTTAACGCGAATTTTAACAAAATATTAACGCTTACAATTTAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATATTGAAAAAGGAAGAGTATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCCCTTATTCCCTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTGCTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACTGGATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTCAGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGCAGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCTAACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCATACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAACTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCGCTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGGTCTCGCGGTATCATTGCAGCACTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGATGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAACTGTCAGACCAAGTTTACTCATATATACTTTAGATTGATTTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTG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配列番号78:AAV-cTnT-HA-mC7C8-P2A-GFP
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所望されるキャプシドタンパク質を有する組み換えAAVを得るための方法は、当該分野において周知である(例えば、US2003/0138772を参照;その内容は、その全体において本明細書において参考として援用される)。典型的には、方法は、AAVキャプシドタンパク質をコードする核酸配列;機能的なrep遺伝子;AAV逆位末端反復配列(ITRs)および導入遺伝子を含んでなる組み換えAAVベクター;ならびに組み換えAAVベクターのAAVキャプシドタンパク質中へのパッケージングを可能にするために十分なヘルパー機能を含む、宿主細胞を培養することを含む。
rAAVベクターをAAVキャプシド中にパッケージングするために宿主細胞において培養されるべき構成成分は、宿主細胞にトランスで(in trans)提供されてもよい。あるいは、必要とされる構成成分(例えば、組み換えAAVベクター、rep配列、cap配列、および/またはヘルパー機能)のうちのいずれか1つ以上は、当業者に公知の方法を用いて必要とされる構成成分のうちの1つ以上を含むように操作された安定な宿主細胞により提供されてもよい。最も好適には、かかる安定な宿主細胞は、必要とされる構成成分を誘導性プロモーターの制御下において含むであろう。しかし、必要とされる構成成分は、構成的プロモーターの制御下にあってもよい。好適な誘導性および構成的プロモーターの例は、本明細書において、導入遺伝子と共に使用するために好適な調節性エレメントの議論において提供される。なお別の選択肢において、選択された安定な宿主細胞は、構成的プロモーターの制御下において選択された構成成分を、および1つ以上の誘導性プロモーターの制御下において他の選択された構成成分を含んでもよい。例えば、293細胞から誘導された安定な宿主細胞(これは、構成的プロモーターの制御下においてE1ヘルパー機能を含む)を、作製してもよいが、これは、誘導性プロモーターの制御下においてrepおよび/またはcapタンパク質を含む。なお他の安定な宿主細胞が、当業者ににより作製され得る。
組み換えAAVベクター、本開示のrAAVを生成するために要求されるrep配列、cap配列、およびヘルパー機能は、任意の適切な遺伝子エレメント(ベクター)を用いてパッケージング宿主細胞に送達することができる。選択された遺伝子エレメントは、本明細書において記載されるものを含む任意の好適な方法により送達することができる。本開示の任意の態様を構築するために用いられる方法は、核酸操作の分野における当業者に公知であり、遺伝子工学、組み換え工学、および合成技術を含む。例えば、Sambrookら、Molecular Cloning: A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Press、Cold Spring Harbor, N.Y.を参照。同様に、rAAVビリオンを作製する方法は、周知であり、好適な方法の選択は、本開示に対する限定ではない。例えば、K. Fisher et al., J. Virol., 70:520-532 (1993)および米国特許第5,478,745号を参照。
いくつかの態様において、組み換えAAVは、トリプルトランスフェクション法(米国特許第6,001,650号において詳細に記載される)を用いて生成してもよい。典型的には、組み換えAAVは、宿主細胞に、AAV粒子中にパッケージングされるべき組み換えAAVベクター(導入遺伝子を含む)、AAVヘルパー機能ベクター、およびアクセサリー機能ベクターで遺伝子導入することにより生成される。AAVヘルパー機能ベクターは、「AAVヘルパー機能」配列(すなわち、repおよびcap)をコードし、これらは、トランスで、生産的なAAV複製およびキャプシド形成のために機能する。好ましくは、AAVヘルパー機能ベクターは、任意の検出可能な野生型AAVビリオン(すなわち、機能的なrepおよびcap遺伝子を含むAAVビリオン)を生じることなく、効率的なAAVベクター生成を支援する。本開示と共に使用するために好適なベクターの非限定的な例として、米国特許第6,001,650号において記載されるpHLP19、および米国特許第6,156,303号において記載されるpRep6cap6ベクターが挙げられ、両方の全体は、本明細書において参考として援用される。アクセサリー機能ベクターは、AAVが複製のために依存する非AAV由来のウイルスおよび/または細胞の機能(すなわち、「アクセサリー機能」)のためのヌクレオチド配列をコードする。アクセサリー機能は、AAV複製のために要求される機能を含み、これは、限定することなく、AAV遺伝子転写の活性化、ステージ特異的なAAVのmRNAスプライシング、AAVのDNA複製、cap発現生成物の合成、およびAAVキャプシドアセンブリーに関与する部分を含む。ウイルスに基づくアクセサリー機能は、アデノウイルス、ヘルペスウイルス(単純ヘルペスウイルス1型以外のもの)、およびワクシニアウイルスなどの既知のヘルパーウイルスのうちのいずれかに由来するものであってよい。
いくつかの側面において、本開示は、rAAVベクターにより遺伝子導入された宿主細胞を提供する。用語「遺伝子導入」は、細胞による外来DNAの取り込みを指すように用いられ、外来DNAが細胞膜の内側に導入された場合に、細胞は「遺伝子導入されて」いる。多数の遺伝子導入技術が、当該分野において一般に公知である。例えば、Graham et al. (1973) Virology, 52:456、Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning, a laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratories, New York、Davis et al. (1986) Basic Methods in Molecular Biology, Elsevier、およびChu et al. (1981) Gene 13:197を参照。かかる技術は、ヌクレオチド組み込みベクターなどの1つ以上の外来核酸、および他の核酸分子を、好適な宿主細胞中に導入するために用いることができる。
「宿主細胞」とは、目的の物質を収容するか、またはこれを収容することができる、任意の細胞を指す。しばしば、宿主細胞は、哺乳動物細胞である。いくつかの態様において、宿主細胞は、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞(Sf9)、または哺乳動物(例えば、ヒト、げっ歯類、非ヒト霊長類など)の細胞である。宿主細胞は、AAVヘルパーコンストラクト、AAVミニ遺伝子プラスミド、アクセサリー機能ベクター、または組み換えAAVの生成に関連する他のトランスファーDNAのレシピエントして用いてもよい。用語は、遺伝子導入された元の細胞の子孫を含む。したがって、本明細書において用いられる「宿主細胞」は、外来DNA配列で遺伝子導入された細胞を指してもよい。単一の親細胞の子孫は、天然の、偶発的な、または計画的な変異に起因して、形態学においてまたはゲノムもしくは総DNAの相補性において、元の親と必ずしも完全に同一でない場合があることが理解される。いくつかの態様において、本開示による宿主細胞は、心筋細胞である。
いくつかの態様において、ポリペプチドまたはポリペプチドをコードする核酸(例えば、mRNA、ウイルスベクター、またはrAAV)は、不整脈を処置するための対象への投与のために、組成物(例えば、医薬組成物)中に処方される。いくつかの態様において、組成物は、薬学的に受入可能な担体をさらに含む。
句「薬学的に受入可能な」とは、本明細書において、健全な医学的判断の範囲内において、過剰な毒性、刺激、アレルギー性応答、または他の問題もしくは合併症を伴わない、ヒトのおよび動物の組織と接触しての使用のために好適な化合物、材料、組成物、および/または投与形態であって、妥当な利益/リスク比により釣り合うものを指すように使用される。句「薬学的に受入可能な担体」とは、液体もしくは固体の充填剤、希釈剤、賦形剤、溶媒またはカプセル化材料などの薬学的に受入可能な材料、組成物またはビヒクルであって、対象の剤を、身体の1つの臓器または部分から、身体の別の臓器または部分に運搬または輸送することに関与するものを意味する。各々の担体は、処方物の他の成分と適合性であり、患者の組織に対して傷害性でない(例えば、生理学的に適合性、無菌、生理学的pHなど)という意味において、「受入可能」でなければならない。用語「担体」は、活性成分が組み合わされて適用を促進する、天然または合成の、有機または無機の成分を表す。医薬組成物の構成成分はまた、所望される薬学的有効性を実質的に損なうであろう相互作用が存在しない様式において、本開示の分子と共に混合されるか、または互いに混合されることができる。薬学的に受入可能な担体として役立ち得る材料のいくつかの例として、以下が挙げられる:(1)ラクトース、グルコースおよびスクロースなどの糖;(2)コーンスターチおよびバレイショデンプンなどのデンプン;(3)セルロースおよびその誘導体、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、エチルセルロース、微結晶性セルロースおよび酢酸セルロース;(4)粉末トラガカント;(5)モルト;(6)ゼラチン;(7)ステアリン酸マグネシウム、ラウリル硫酸ナトリウム、およびタルクなどの潤滑剤;(8)カカオバターおよび坐剤用ワックスなどの賦形剤;(9)ピーナッツ油、綿実油、ベニバナ油、ゴマ油、オリーブ油、トウモロコシ油およびダイズ油などの油脂;(10)ポリエチレングリコールなどのグリコール;(11)グリセリン、ソルビトール、マンニトールおよびポリエチレングリコール(PEG)などのポリオール;(12)オレイン酸エチルおよびラウリン酸エチルなどのエステル;(13)寒天;(14)水酸化マグネシウムおよび水酸化アルミニウムなどの緩衝化剤;(15)アルギン酸;(16)パイロジェンフリー水;(17)等張生理食塩水;(18)リンガー溶液;(19)エチルアルコール;(20)pH緩衝化溶液;(21)ポリエステル、ポリカーボネートおよび/またはポリ無水物;(22)ポリペプチドおよびアミノ酸などの嵩高剤;(23)血清アルブミン、HDLおよびLDLなどの血清構成成分;(22)エタノールなどのC2-C12アルコール;ならびに(23)医薬処方物中で使用される他の非毒性の適合性の物質。湿潤剤、着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味剤、香味剤、芳香剤、保存剤および抗酸化剤もまた、処方物中に存在することができる。
好適な担体は、組成物(例えば、医薬組成物)が向けられる適応症を考慮して、当業者により容易に選択され得る。例えば、1つの好適な担体として、生理食塩水が挙げられ、これは、多様な緩衝化溶液(例えばリン酸緩衝化生理食塩水)と共に処方することができる。他の例示的な担体として、無菌の生理食塩水、ラクトース、スクロース、リン酸カルシウム、ゼラチン、デキストラン、寒天、ペクチン、ピーナツ油、ゴマ油、および水が挙げられる。担体の選択は、本開示の限定ではない。
典型的には、組成物(例えば、医薬組成物)は、活性化合物の少なくとも約0.1%、またはそれより多くを含んでもよいが、活性成分のパーセンテージは、勿論、変化してもよく、便利に、処方物全体の重量または容積の約1または2%~約70%または80%、またはそれより多くであってもよい。当然、各々の治療上有用な組成物中の活性化合物の量は、当該化合物の任意の所与の単位用量において好適な投与量が得られるであろう方法において調製することができる。可溶性、バイオアベイラビリティー、生物学的半減期、投与の経路、製品の有効期間などの要因、ならびに他の薬理学的考慮点は、かかる医薬処方物を調製する分野の当業者により企図され、したがって、多様な投与量および処置レジメンが望ましい場合がある。
いくつかの態様において、組成物は、本明細書において記載されるrAAVのうちのいずれか1つを含む。いくつかの態様において、これらの組成物は、高いrAAV濃度が存在する場合(例えば、約1013GC/ml以上)は特に、組成物中でのAAV粒子の凝集を軽減するために処方される。rAAVの凝集を軽減するための方法は、当該分野において周知であり、例えば、界面活性剤の添加、pH調整、塩濃度の調整などを含む(例えば、Wright FR, et al., Molecular Therapy (2005) 12, 171-178を参照;この内容は、本明細書において参考として援用される)。
医薬組成物は、単位投与形態において便利に提示されてもよく、製薬の分野において周知の方法のうちのいずれかにより調製してもよい。用語「単位用量」とは、本開示の医薬組成物に関して用いられる場合、対象のための単位投与量として好適な物理的に別々の単位を指し、各々の単位が、必要とされる希釈剤;すなわち、担体またはビヒクルと関連して所望される治療効果をもたらすために計算された、予め決定された量の活性材料を含む。
医薬組成物の処方は、投与の経路に依存してもよい。非経口投与または腫瘍内、腫瘍周囲、病変内または病変周囲投与のために好適な注射可能な調製物は、例えば、無菌の注射可能な水性または油性の懸濁液を含み、好適な分散剤または湿潤剤および懸濁剤を用いて、既知の技術に従って処方することができる。無菌の注射可能な調製物はまた、非毒性の非経口で受入可能な希釈剤または溶媒中の、例えば、1,3プロパンジオールまたは1,3ブタンジオール中の溶液としての、無菌の注射可能な溶液、懸濁液または乳液であってよい。使用してもよい受入可能なビヒクルおよび溶媒の中には、水、リンガー溶液、U.S.P.および等張塩化ナトリウム溶液がある。加えて、無菌の硬化油は、溶媒または懸濁媒として、便利に使用される。この目的のために、合成のモノ-またはジ-グリセリドを含む任意の無刺激性(bland)の硬化油を用いてもよい。加えて、オレイン酸などの脂肪酸も、注射可能物の調製において有用である。注射可能な処方物は、例えば、除菌フィルターを通してのろ過により、または使用前に無菌の水もしくは他の無菌の注射可能な媒体中に溶解もしくは分散することができる無菌の固体組成物の形態において無菌化剤を組み込むことにより、無菌化することができる。
局所投与のために、医薬組成物は、当該分野において一般に公知であるように、軟膏(ointment)、軟膏(salve)、ゲル、またはクリームに処方することができる。局所投与は、当該分野において周知の経皮送達系を利用することができる。一例は、経皮貼付剤である。
経口投与のために好適な組成物は、各々が予め決定された量の抗炎症剤を含む、カプセル、錠剤、ロゼンジなどの別々の単位として提示することができる。他の組成物は、シロップ、エリキシル、またはエマルジョンなどの、水性の液体または非水性の液体中の懸濁液を含む。
他の送達系として、時間放出型、遅延放出型または持続放出型の送達系を挙げることができる。かかる系は、抗炎症剤の繰り返しの投与を回避し、対象および医師の利便性を増大させることができる。多くの型の放出送達系が利用可能であり、当業者に公知である。それらは、ポリ(ラクチド-グリコリド)、コポリオキサレート(copolyoxalate)、ポリカプロラクトン、ポリエステルアミド、ポリオルトエステル、ポリヒドロキシ酪酸、およびポリ無水物などのポリマーベースの系を含む。薬物を含む前述のポリマーのマイクロカプセルは、例えば、米国特許第5,075,109号において記載される。送達系はまた、非ポリマーの系を含み、これは:コレステロールなどのステロール、コレステロールエステルおよび脂肪酸、またはモノ-、ジ-、およびトリ-グリセリドなどの中性脂肪を含む脂質;ハイドロゲル放出系;シラスティック(sylastic)系;ペプチドベースの系;ワックスコーティング剤;従来の結合剤および賦形剤を用いた加圧錠剤;部分的に融合したインプラントなどである。具体例として、これらに限定されないが、以下が挙げられる:(a)マトリックス中の形態において抗炎症剤が含まれる浸食系、例えば、米国特許第4,452,775号、同第4,667,014号、同第4,748,034号、および同第5,239,660号において記載されるもの、ならびに(b)活性な構成成分が、制御された速度でポリマーから浸透する拡散系、例えば、米国特許第3,832,253号および同第3,854,480号において記載されるもの。加えて、ポンプベースのハードウェア送達系を用いてもよく、その一部は、移植のために適応させられる。
長期持続放出インプラントの使用は、慢性の状態の処置のために特に好適である場合がある。長期放出は、本明細書において用いられる場合、インプラントが、治療レベルの活性成分を、少なくとも30日間、好ましくは60日間にわたり送達するように構築および配置されることを意味する。長期持続放出放出インプラントは、当業者に周知であり、上記の放出系のうちのいくつかを含む。
いくつかの態様において、治療的投与のために用いられる医薬組成物は、無菌でなければならない。無菌性は、無菌のろ過膜(例えば、0.2マイクロンの膜)を通したろ過により容易に達成される。あるいは、微生物の増殖または活動を防止するために、保存剤を用いることができる。多様な保存剤が周知であり、これらは、例えば、フェノールおよびアスコルビン酸を含む。ポリペプチド、核酸、rAAV、または医薬組成物は、通常、凍結乾燥形態において、またはそれが温度および酸化による変性に対して高度に安定である場合には水溶液として、貯蔵されるであろう。調製物のpHは、典型的には、約6~8であろうが、より高い、またはより低いpH値もまた、特定の場合には適切であり得る。
注射可能用途のために好適な医薬形態として、無菌の水溶液または分散、および無菌の注射可能な溶液または分散の即時調製のための無菌の粉末が挙げられる。分散はまた、グリセロール、液体ポリエチレングリコール、およびこれらの組み合わせ中で、ならびに油脂中で調製してもよい。通常の貯蔵および使用の条件下において、これらの調製物は、微生物の増殖を防止するために保存剤を含む。多くの場合において、形態は、無菌であり、容易な通針性(syringability)が存在する程度まで液体である。それは、製造および貯蔵の条件下において安定でなければならず、細菌または真菌の微生物の汚染作用に対して保存されなければならない。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコールおよび液体ポリエチレングリコールなど)、これらの好適な混合物、および/または植物油を含む、溶媒または分散媒であってよい。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング剤の使用により、分散の場合には必要とされる粒子サイズの維持により、および界面活性剤の使用により、維持することができる。微生物の作用の防止は、多様な抗菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールなどにより、もたらすことができる。多くの場合において、等張化剤、例えば糖または塩化ナトリウムを含むことが好ましいであろう。注射可能な組成物の長期の吸収は、組成物における吸収を遅延させる剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンの使用によりもたらすことができる。
注射可能な水溶液の投与のために、例えば、溶液は、必要な場合には、好適に緩衝化することができ、液体の希釈剤は、初めに十分な生理食塩水またはグルコースにより等張にされる。これらの特定の水溶液は、静脈内、筋肉内、皮下および腹腔内投与のために特に好適である。このことに関して、使用することができる無菌の水性媒体は、当業者に公知でああろう。例えば、1つの投与量を、1mlの等張NaCl溶液中で溶解し、1000mlの皮下点滴液に添加するか、または提案される点滴の部位に注射してもよい(例えば、「Remington's Pharmaceutical Sciences」、第15版、1035-1038頁および1570-1580頁を参照)。投与量におけるいくつかのバリエーションが、宿主の状態に依存して、必然的に生じるであろう。投与の責任者は、いかなる場合であっても、個々の宿主のために適切な用量を決定するであろう。
無菌の注射可能な溶液は、活性剤を、必要とされる量において、適切な溶媒中に、必要に応じて本明細書において列記される多様な他の材料と共に組み込み、その後無菌ろ過することにより、調製される。一般的に、分散は、多様な無菌の活性成分を、基本の分散媒、および上に列記されるものからの必要とされる他の材料を含む無菌のビヒクル中に組み込むことにより、調製される。無菌の注射可能な溶液の調製のための無菌の粉末の場合、好ましい調製の方法は、真空乾燥および凍結乾燥技術であり、これらは、活性成分プラス任意の追加の所望される材料の粉末を、事前に無菌ろ過されたその溶液から生じる。
リポソーム、ナノカプセル、微粒子、マイクロスフェア、脂質粒子、小胞などの送達ビヒクルを、好適な宿主細胞中への本開示の組成物の導入のために用いてもよい。特に、核酸、タンパク質、またはrAAVを、送達のために、脂質粒子、リポソーム、小胞、ナノスフェア、またはナノ粒子などのいずれかの中にカプセル化して処方してもよい。
かかる処方物は、本明細書において開示される核酸、タンパク質、またはrAAVの薬学的に受入可能な処方物の導入のために、好ましい場合がある。リポソームの形成および使用は、当業者に一般的に公知である。最近、血清安定性および循環半減時間が改善されたリポソームが開発された(米国特許第5,741,516号)。さらに、潜在的な薬物担体としてのリポソームおよびリポソーム様調製物の多様な方法が記載されている(米国特許第5,567,434号;同第5,552,157号;同第5,565,213号;同第5,738,868号および同第5,795,587号)。
リポソームは、他の手段によっては通常では遺伝子導入に対して耐性である多数の細胞型と共に、首尾よく用いられてきた。加えて、リポソームは、ウイルスベースの送達系の典型であるDNAの長さの制約から自由である。リポソームは、遺伝子、薬物、放射線治療剤、ウイルス、転写因子およびアロステリックなエフェクターを多様な培養細胞株および動物に導入するために、効果的に用いられてきた。加えて、リポソームにより媒介される薬物送達の有効性を試験するいくつかの首尾よい臨床治験が完了している。
リポソームは、水性の媒体中に分散したリン脂質から形成され、自発的に多重層の同心円状の二分子膜小胞(また多重層小胞(MLV)とも称される)を形成する。MLVは、一般に、25nm~4μmの直径を有する。MLVの超音波処理は、200~500Åの範囲の直径を有し、コア中に水溶液を含む、小さな単層小胞(SUV)の形成をもたらす。
あるいは、活性剤のナノカプセル処方物を用いてもよい。ナノカプセルは、一般に、物質を安定かつ再現可能な方法において捕捉することができる。細胞内のポリマー過負荷に起因する副作用を回避するために、かかる超微細粒子(約0.1μmのサイズ)は、in vivoで分解されることができるポリマーを用いて設計すべきである。これらの要件を満たす生分解性ポリアルキル-シアノアクリレートナノ粒子が、使用のために企図される。
上記の送達の方法に加えて、以下の技術もまた、組成物を宿主に送達する代替的な方法として企図される。ソノフォレーシス(すなわち超音波)が用いられており、米国特許第5,656,016号において、循環系中への、またはこれを通しての薬物の浸透の速度および有効性を増強するためのデバイスとして記載されている。企図される他の薬物送達の選択肢は、骨内注射(米国特許第5,779,708号)、マイクロチップデバイス(米国特許第5,797,898号)、眼用処方物(Bourlais et al., 1998)、経皮マトリックス(米国特許第5,770,219号および同第5,783,208号)、ならびにフィードバック制御された送達(米国特許第5,697,899号)である。
本明細書において開示される組成物はまた、中性または塩の形態において処方してもよい。薬学的に受入可能な塩は、酸付加塩(タンパク質の遊離のアミノ基により形成される)を含み、これは、例えば塩酸もしくはリン酸などの無機酸、または酢酸、シュウ酸、酒石酸、マンデル酸、その他などの有機酸により形成される。遊離のカルボキシル基により形成される塩もまた、例えばナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウムもしくは水酸化第二鉄などの無機塩基、またはイソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、プロカイン、その他などの有機塩基から誘導することができる。処方の後で、溶液は、投与処方物に適合性の様式において、および治療的に有効な量において、投与されるであろう。処方物は、注射可能な溶液、薬物放出カプセル、その他などの多様な投与形態において、容易に投与される。
本開示の他の側面は、本明細書において記載されるポリペプチド、核酸、rAAV、または組成物のうちのいずれか1つの、不整脈を処置することにおける使用のための使用を提供する。いくつかの態様において、不整脈を処置する方法は、必要とする対象に組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)の有効量を投与することを含み、ここで、rAAVは、キャプシドタンパク質(例えば、血清型AAV9のキャプシドタンパク質)およびMYBPC3のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列(例えば、配列番号1~16のうちのいずれか1つのポリペプチド)を含む。
その最も広義において、用語「処置」または「処置すること」とは、治療的および予防的処置の両方を指す。対象が疾患(例えば不整脈)の処置を必要とする場合、「状態を処置すること」とは、当該疾患(例えば不整脈)に関連する1つ以上の症状を寛解させるか、軽減するか、もしくはこれを取り除く、または当該疾患の任意のさらなる進行を予防することを指す。処置を必要とする対象が不整脈を有するリスクがあるものである場合は、対象を処置することとは、対象が不整脈を有するリスクを減少させること、または対象が不整脈を発症することを予防することを指す。
対象は、ヒトまたは脊椎動物または哺乳動物を意味するべきであり、これは、これらに限定されないが、げっ歯類、例えばラットまたはマウス、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、シチメンチョウ、ニワトリ、および霊長類、例えばサルを含む。本開示の方法は、必要とする対象を処置するために有用である。
本開示の「治療有効量」という用語は、所望される生物学的効果を実現するために必要または十分な量を指す。例えば、本開示に関連するポリペプチドまたはこれをコードする核酸の治療有効量は、不整脈の1つ以上の症状を寛解させるために十分な量であってよい。本明細書において提供される教示と組み合わせて、多様な活性化合物、ならびに効力、相対的バイオアベイラビリティー、患者の体重、有害副作用の重篤度および好ましい投与の様式などの重みづけ因子の中から選択することにより、実質的な毒性を引き起こさず、しかし特定の対象を処置するために全体的に有効である、有効な予防または治療処置レジメンを計画することができる。任意の特定の適用のための有効量は、処置されている疾患もしくは状態、投与されている特定の治療用化合物、対象のサイズ、または疾患もしくは状態の重篤度などの因子に依存して変化し得る。当業者は、過度の実験を必要とすることなく、本開示に関連する特定の治療用化合物の有効量を経験的に決定することができる。
いくつかの態様において、rAAVの「有効量」は、動物を標的として感染させる、所望される組織(例えば心臓組織)を標的とするために十分な量である。有効量は、対象の種、年齢、体重、健康、および標的とされるべき組織などの要因に主に依存し、したがって、動物および組織の間で異なり得る。例えば、rAAVの有効量は、一般に、約109~1016個のゲノムコピーを含む約1ml~約100mlの溶液の範囲である。いくつかの態様において、約1013~1015個のrAAVゲノムコピーの投与量が適切である。
rAAVは、過度の有害効果を伴うことなく、所望される組織の細胞に遺伝子導入するために、および十分なレベルの遺伝子の導入および発現を提供するために、十分な量において投与される。従来のおよび薬学的に受入可能な投与の経路として、これらに限定されないが、選択された臓器への直接送達(例えば、心臓への送達)、経口、吸入(鼻内および気管内送達を含む)、眼内、静脈内、筋肉内、皮下、皮内、腫瘍内、および他の非経口の投与の経路が挙げられる。投与の経路は、所望される場合、組み合わせてもよい。
本開示のポリペプチド、核酸、rAAV、およびこれらを含む組成物は、当該分野において公知の任意の適切な方法に従って、組成物中で対象に送達してもよい。例えば、rAAVは、好ましくは生理学的に適合性の担体中で懸濁され(例えば、組成物中で)、対象、例えば、ヒト、マウス、ラット、ネコ、イヌ、ヒツジ、ウサギ、ウマ、ウシ、ヤギ、ブタ、モルモット、ハムスター、ニワトリ、シチメンチョウ、または非ヒト霊長類(例えば、マカク)などの宿主動物に投与してもよい。いくつかの態様において、宿主動物は、ヒトを含まない。
ポリペプチド、核酸、rAAV、および組成物の哺乳動物対象への送達は、例えば、筋肉内注射によるもの、または哺乳動物対象の血流中への投与によるものであってよい。血流中への投与は、静脈、動脈、または任意の他の導血管(vascular conduit)中への注射によるものであってよい。いくつかの態様において、本開示において記載されるようなポリペプチド、核酸、rAAV、および組成物は、静脈内注射により投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、および組成物は、筋肉内注射により投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、および組成物は、心臓中への注射により投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、および組成物は、対象における心筋細胞へ送達される。
いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、または組成物の用量は、1暦日(例えば、24時間の期間)あたり1回以下で、筋肉内注射により対象に投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、または組成物の用量は、2、3、4、5、6、または7暦日あたり1回以下で、筋肉内注射により対象に投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、または組成物の用量は、1暦週(例えば、7暦日)あたり1回以下で、対象に投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、または組成物の用量は、2週間毎(例えば、2暦週の期間において1回)以下で、対象に投与される。いくつかの態様において、rAAVの用量は、1暦月あたり1回以下(例えば、30暦日において1回)で、対象に投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、または組成物の用量は、6暦月あたり1回以下で、対象に投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、または組成物の用量は、1暦年(例えば、365日またはうるう年においては366日)あたり1回以下で、対象に投与される。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、rAAV、または組成物の用量は、単一用量の治療として、対象に投与される。
本明細書において記載される方法を用いて処置することができる障害は、異常なリアノジン受容体2型(RYR2)機能に関連する。いくつかの態様において、異常なRYR2機能は、RYR2における1つ以上(例えば、1、2、3、4、5、またはそれより多く)の変異により引き起こされる。いくつかの態様において、異常なRYR2機能(例えば、RYR2における変異により引き起こされるもの)は、対象における心筋細胞における過剰な(例えば、少なくとも20%、少なくとも50%、少なくとも100%、少なくとも2倍、少なくとも10倍、少なくとも100倍、またはそれより多い)拡張期Ca2+放出に関連する。心筋細胞において過剰な拡張期Ca2+放出を引き起こすRYR2における変異は、例えば、本明細書において参考として援用されるJiang et al., PNAS August 31, 2004 101 (35) 13062-13067;Liu et al., PLoS One. 2017; 12(9): e0184177;およびPostma et al., J Med Genet. Nov;42(11):863-70において記載されるように、当該分野において公知である。
いくつかの態様において、異常なRYR2機能に関連する障害は、不整脈である。いくつかの態様において、不整脈は、遺伝性または後天性である。いくつかの態様において、遺伝性不整脈は、カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍(CPVT)である。いくつかの態様において、CPVTは、RYR2における変異と関連する。いくつかの態様において、後天性不整脈は、心室性不整脈または上室性不整脈である。いくつかの態様において、心室性不整脈は、心室頻拍、心室細動、または心室性期外収縮である。いくつかの態様において、上室性不整脈は、心房細動、心房粗動、心房頻拍、心房性期外収縮、または発作性上室性頻拍である。いくつかの態様において、異常なRYR2機能に関連する障害は、心不全である。
いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、またはrAAVを投与することは、対象における心筋細胞における過剰な拡張期Ca2+放出を(例えば、少なくとも20%、少なくとも50%、または少なくとも90%)減少させる。いくつかの態様において、ポリペプチド、核酸、またはrAAVを投与することは、対象における心筋細胞における拡張期Ca2+放出を正常なレベルに回復させる。いくつかの態様において、正常なレベルとは、健康な対象における拡張期Ca2+放出のレベルである。
例
例1
CPVT(カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍)は、患者が運動の間に致死的な不整脈についてのリスクを有する悪性の遺伝性不整脈である1。CPVTは、1:10000の推定有病率を有し、突然の不明な若年死の剖検陰性症例のうちの約15%を引き起こす2。CPVT症例の60%は、心筋細胞の主要な細胞内Ca2+放出チャネルであるリアノジン受容体2型(RYR2)における変異により引き起こされる1,3。RYR2内において、コード配列の4つの「ホットスポット」領域中でクラスター化される160個を超える異なる変異4が、CPVTを引き起こすことが知られている。現在、CPVTは、利用可能な選択肢により適切に処置されておらず、患者は、突然死または中断された突然死、ならびに現在の治療から生じる病的状態に苦しみ続ける5。したがって、即時の概念実証の市場空間は、CPVTを有する患者であって、医学的管理に対するその応答が最適以下であるものである。最終的には、遺伝子治療アプローチが、CPVTのための標準的な処置となり得ることが見込まれる。
例1
CPVT(カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍)は、患者が運動の間に致死的な不整脈についてのリスクを有する悪性の遺伝性不整脈である1。CPVTは、1:10000の推定有病率を有し、突然の不明な若年死の剖検陰性症例のうちの約15%を引き起こす2。CPVT症例の60%は、心筋細胞の主要な細胞内Ca2+放出チャネルであるリアノジン受容体2型(RYR2)における変異により引き起こされる1,3。RYR2内において、コード配列の4つの「ホットスポット」領域中でクラスター化される160個を超える異なる変異4が、CPVTを引き起こすことが知られている。現在、CPVTは、利用可能な選択肢により適切に処置されておらず、患者は、突然死または中断された突然死、ならびに現在の治療から生じる病的状態に苦しみ続ける5。したがって、即時の概念実証の市場空間は、CPVTを有する患者であって、医学的管理に対するその応答が最適以下であるものである。最終的には、遺伝子治療アプローチが、CPVTのための標準的な処置となり得ることが見込まれる。
CPVTにおける変異は、正常な心筋細胞のCa2+ハンドリングを妨げる。各々の心拍により、Ca2+レベルは収縮期において上昇し、サルコメアに収縮するようにシグナル伝達し、拡張期において低下して、サルコメアを弛緩させる。細胞質Ca2+濃度におけるこれらの変化は、細胞膜の脱分極により開始され、これは、L型Ca2+チャネルを開いて、少量の細胞外Ca2+が細胞に入ることを可能にする。このCa2+の流入が筋小胞体上に位置するRYR2を刺激して開かせ、はるかにより多くのCa2+を放出させる。このCa2+により誘導されるCa2+の放出は、サイトゾルのCa2+を迅速に増大させ、これは、サルコメア収縮を協調させる。時間依存的なL型Ca2+チャネルおよびRYR2の閉鎖は、ATP依存性ポンプ(SERCA2A)によるサイトゾルのCa2+の筋小胞体への能動的な回帰と共に、Ca2+濃度を拡張期における低レベルへと戻す。少量のCa2+は、Na+/Ca2+交換体であるNCXを介して細胞外空間に戻る。CPVTの変異は、RYR2を通して過剰な拡張期Ca2+放出を引き起こす。上昇した拡張期Ca2+は、より大きなNa+/Ca2+交換を駆動する。この交換は起電性であるので、増加した交換は、膜の脱分極をもたらし(脱分極後の)、これは、別の活動電位をもたらし得る(「撃発活動」)か、または再分極の不均一性を作り出し得、これは、不整脈性のインパルスの伝播(「リエントリー」)を引き起こし得る6,7。
本明細書において記載される治療剤の作用機序は、CPVTの病態形成の中心であるRYR2の過剰な活性を限定することである。重要なことに、RYR2の機能不全は、多くの型の心疾患の最終的な共通の経路であり、したがって、この抗不整脈治療についての適応症は、心房細動を含む他の型の遺伝性または後天性の心筋症に拡大することができる可能性がある8(有病率、人口の1%、および患者の9%が80歳を超える)。
CPVTを有する患者は、現在の医学的および外科的選択肢によっては、不完全に処置される5,9,10。現在の医学的選択肢は、実質的な副作用を有し、不完全な保護を提供する。
CPVTを有する患者は、現在の医学的および外科的選択肢によっては、不完全に処置される5,9,10。現在の医学的選択肢は、実質的な副作用を有し、不完全な保護を提供する。
我々の現在の医学的選択肢は、運動制限である。運動制限は、小児および青年においては困難であり、運動を限定することは、生涯の心理社会的および医学的な影響を有する。運動の長期的利益は、ますます認識されており、心血管、代謝、および炎症性の障害ならびに乳房、子宮内膜および結腸の悪性病変の生涯のリスクに関連付けられている。11-13
別の現在の選択肢は、高用量ベータ-ブロッカーを利用することである。高用量のベータ-遮断は、全体的なエネルギーレベルおよび気分に対する効果に起因して、しばしば耐容することが困難である。結果として、ベータ-ブロッカーについての不履行、または治療用量以下となることが一般的である。最近の研究において、処置の失敗(失神(syncope)または心停止)は、主にベータ-ブロッカーにより管理された患者の25%~33%において発生した5,14。最適以下の投薬およびおよび所望された治療に対するノンアドヒアランスは、これらの処置の失敗のうちのそれぞれ41%および48%において発生した5。
別の現在の医学的選択肢は、フレカイニドである。ベータ-ブロッカーに、ナトリウムチャネルブロッカーであるフレカイニドとの組み合わせは、CPVTを有する患者にとって有効であることが見出されている15。成人心疾患の治験において、フレカイニドは、実質的な不整脈誘発効果を有し、死亡率を増加させた16。フレカイニドがCPVTにおける長期生存率を増大させるか否かは、知られていない。急性の運動試験において、患者の76%はフレカイニドに応答し、24%はこれに応答しなかった17。限定された経過観察による後向き研究において(中央値1.7年)、フレカイニドは、有望であると考えられるが、患者の38%は、持続性の症状を有した5。
さらに別の現在の医学的選択肢は、左心臓交感除神経術(left cardiac sympathetic denervation:LCSD)である。左頸部交感神経鎖の外科的中断は、心臓に対するアドレナリン作動性刺激を低下させ、医学的管理上で破綻的な(breakthrough)不整脈を有する一部のCPVT患者にとって有益であった。LCSDは、専門のセンターにおいて行われるべきであり、ホルネル症候群などの手術合併症は珍しくない。LCSDは、心臓イベントの頻度を低下させるが、中央値が37か月の追跡調査において、患者の24%は、少なくとも1回の再発性心臓イベントを有した18。
なお別の現在の医学的選択肢は、移植心臓除細動器(ICD)である。CPVTを有する小児および青年において、ICDの合併症は一般的であり、ショックの高い負荷を伴う10。ICDは、心室細動を終わらせることにおいては有効であったが、心室頻拍においては有効ではなかった9。さらに、覚醒中の患者におけるICDの放電は、カテコールアミン放出をもたらし、これは、さらなる不整脈を誘発させ得、潜在的に致死性の「電気的嵐(electrical storm)」をもたらし得る。最近のエビデンスは、CPVTに続発的な心停止を示す患者について、ICDからの延命効果は存在しないことを示す。これらの理由のために、CPVTのためのICDの留置は、可能である場合は避けるべきであるが、これは、患者を、薬物療法に依存的にし、関連するコンプライアンスおよび破綻的なイベントの問題を残す19。
CPVTは、疾患の相対的な希少性にもかかわらず、非常に顕著な社会的および経済的コストにより、他では健康で機能的な小児における病的状態および死亡の主要な原因であり続ける。臨床的な評価および手順のための繰り返しの来院は、患者および施設を顕著なコストに曝す。
本開示は、CPVTを処置するための組成物および方法を提案する。組成物は、AAV-CTDPを含み、ここで、心筋細胞選択的なプロモーターを有するアデノ随伴ウイルスは、CPVTおよび多くの他の遺伝性および後天性不整脈における不整脈の根底にある原因であるRYR2の異常な活性を低下させるペプチドである、CTDP(MYBPC3のC末端由来のペプチド)を発現する。
標的集団は、CPVTを有する全ての患者であるが、医学的管理を失敗した患者(ベータ-ブロッカーおよびフレカイニドに対する破綻的な不整脈)から始める。遺伝子治療ベクターは、静脈内注入により、単一用量処置として送達される。本明細書において記載される遺伝子治療方法は、死亡率および破綻的不整脈を減少させ、LCSDおよびICDについての必要性を減少させ、高用量ベータ-ブロッカーについての必要性を減少させるかまたはこれを取り除き、何らかのレベルの運動を可能にする。これらの変化は、CPVT患者のクオリティ・オブ・ライフを大いに改善するであろう。首尾よい遺伝子治療は、これらの10代および若年成人の患者における生存または死亡の結果を伴う困難な問題である、患者の医学的コンプライアンスの治療成績に対する影響を軽減するであろう。これらの利点は、CPVTマウスモデルにおける、およびCPVT変異を有するヒトiPSC由来の心筋細胞における効力の予備的な決定に基づいて期待される。
本明細書において記載される組成物および方法は、RYR2からの異常なCa2+放出が疾患の病態形成に対する中心である、CPVTよりも一般的な他の不整脈に拡大し得ることが予測される20。1つの可能性が高い拡大適応症は、心房細動であり、これは、80歳以上の患者の9%で発症する。
CTDPのAAV媒介性送達に対する1つの潜在的な代替物は、細胞浸透性ペプチドとしての送達である。AAV遺伝子治療と比較して、ペプチド治療は、従来の医薬品により類似する特製およびコストを有する。しかし、ペプチドのレベルおよび心臓特異性は、AAV遺伝子治療よりも低い可能性が高いであろう。加えて、臨床的に有効であるために、製品は、経口で利用可能である必要があり、これは、ペプチド治療のための課題であり得る。これらの理由のために、一次戦略はAAV遺伝子治療であり、ペプチドベースの治療は、細胞浸透性ペプチド技術における改善に随伴性の潜在的な代替物である。
結果
RYR2が局在するdyadに局在するタンパク質を同定するために、近接プロテオミクスを行った。これは、サルコメアタンパク質であるMYBPC3のC末端から誘導されるペプチドを同定した(図1A~1F)。全長MYBPC3は、サルコメアの異なる部分(「A帯」)に局在する。この知見の一致して、MYBPC3-RYR2相互作用は、酵母ツーハイブリッドスクリーニングにおいて先に記述された22。タンパク質の最もC末端のドメインであるC10ドメインに特異的なモノクローナル抗体を用いる免疫染色は、内在性C10がRYR2と共局在することを示した(図2B)。対照実験において、このモノクローナル抗体が、MYBPC3 KOマウスにおいて顕著な免疫蛍光シグナルを生じないことを示した。MYBPC3-C10とRYR2との近接性を、2つのタンパク質の間の相互作用についてのin situアッセイである近接ライゲーションアッセイ(PLA)を用いて、さらに確認した(図2Cおよび2D)。
RYR2が局在するdyadに局在するタンパク質を同定するために、近接プロテオミクスを行った。これは、サルコメアタンパク質であるMYBPC3のC末端から誘導されるペプチドを同定した(図1A~1F)。全長MYBPC3は、サルコメアの異なる部分(「A帯」)に局在する。この知見の一致して、MYBPC3-RYR2相互作用は、酵母ツーハイブリッドスクリーニングにおいて先に記述された22。タンパク質の最もC末端のドメインであるC10ドメインに特異的なモノクローナル抗体を用いる免疫染色は、内在性C10がRYR2と共局在することを示した(図2B)。対照実験において、このモノクローナル抗体が、MYBPC3 KOマウスにおいて顕著な免疫蛍光シグナルを生じないことを示した。MYBPC3-C10とRYR2との近接性を、2つのタンパク質の間の相互作用についてのin situアッセイである近接ライゲーションアッセイ(PLA)を用いて、さらに確認した(図2Cおよび2D)。
この相互作用の機能的な重要性を決定するために、MYBPC3 C末端の部分をマウスの心臓に送達するためのAAVを開発した。MYBPC3は、C1-C10とラベルされるいくつかの免疫グロブリン様およびフィブロネクチン様ドメインを含んでなる(図2A)。C10の分布を、いずれもAAVにより送達された全長MYBPC3と比較し、これらのタンパク質が異なる部位に局在することを確認した:C10は、RYR2と一致するパターンにおいてサルコメアZ線付近(dyadが位置する場所)に局在し、一方、全長タンパク質は、サルコメアA帯内のMYBPC3のよく確立された位置に局在した(図2E)。
ヒト遺伝子治療の実現可能性についての重要な考察は、有効性を達成するために形質導入される必要がある心筋細胞のパーセントである。並行する問題は、部分的な心筋形質導入および結果として生じる心筋の不均一性が、不整脈誘発性であるか否かである。これらの質問に対する解答は、特にAAV-MYBPC3に関して、まだ決定されておらず、CPVTについての他の遺伝子治療研究からの結果は情報的に有益である。CASQ2欠損(CPVTの常染色体劣勢形態)により引き起こされるCPVTのためのAAVの遺伝子置き換え治療において、Prioriおよび同僚らは、約40%の心筋細胞が形質導入されたマウスにおける治療有効性および不整脈誘発の不在を報告した24,25。同様に、RYR2変異により引き起こされるCPVTを処置するためのAAVにより媒介されるCaMKII阻害の報告において、50%の心筋細胞が形質導入されたマウスにおいて、不整脈誘発を伴わない治療有効性が観察された21。有効性のために必要とされる最小形質導入効率を決定するための、公式の用量-応答実験が進行中である;少数の複製によるパイロット実験に基づいて、それは、約20%であると考えられる。機序は、「ソース・シンク・ミスマッチ(source-sink mis-match)」として知られる概念に基づく可能性がある。心筋細胞は、それらの近接細胞(neighbor)に電気的に連結され、1つの心筋細胞の活性は、隣接する細胞とのその相互作用により安定化される。異常に脱分極する心筋細胞について、隣接する細胞をも脱分極させるためには、十分な電流を発生させることが必要である。この方法において、異常な活性に対して抵抗性である低い割合の心筋細胞が、細胞のネットワークを安定化することができる。
ヒトCPVT患者由来のiPSC-CMのCa2+ハンドリングに対するMYBPC3の効果を評価した。MYBPC3の発現は、ベータ-アドレナリン作動剤であるイソプロテレノールで刺激されたCPVT iPSC-CMにおけるCa2+スパークの頻度を低下させた(図3D)。このことは、ヒト細胞における有効性およびヒトiPSC-CM培養物における専門的意見、ならびにこれらの細胞におけるCa2+ハンドリングの特徴づけを示す。
レポーター遺伝子なしで治療剤候補ベクターによる用量応答実験を行うことは、形質導入効率の測定を困難にする。しかし、これは、種の間で投与量を調整するための重要なパラメーターである。この困難を克服するために、研究室においてRNA in situハイブリダイゼーション法を確立した。例えば、バース症候群のマウスモデルを処置するためのAAV-TAZを用いる別々のプロジェクトについて、RNAscope RNA in situハイブリダイゼーションを用いて、形質導入された心筋細胞の割合を測定した。この同じ技術を、ここで、治療剤候補ベクター中に埋め込まれたレポーター遺伝子に依存することなく形質導入効率を測定するために用いる。
現在のケアの標準は、CPVT患者について、心停止および死亡のリスクを低下させることにおいて有効となっている。しかし、保護は不完全であり、心停止および死亡は、脅威であり続ける。現在のSOCからの不完全な保護は、(1)現在の管理の耐えられない副作用が不履行をもたらすこと;および(2)CPVTの根本原因であるRYR2の機能不全を標的とすることの失敗に起因する。運動制限、ベータ-ブロッカー、および心臓交感除神経術は、CPVT患者において不整脈を引き起こすベータ-アドレナリン作動性シグナル伝達の不整脈誘発性効果を最小限にするように設計される。しかし、最近の後向き研究は、CPVTにおける心臓イベントのうちの約5分の1は、同定可能な興奮性刺激5によって誘発されないことを示し、このことは、アドレナリン作動性シグナル伝達それ自体の除去は、完全には保護的でない場合があることを示唆する。運動制限、ベータ-ブロッカー5,14、およびさらには外科的な交感除神経術による、多くの患者の不完全な保護は、このシグナル伝達経路のみを標的とすることは不十分であることを示す18。同様に、フレカイニドは、不完全に保護的である-急性試験において、患者の24%は応答せず、短期の経過観察において、患者の38%はフレカイニドを投与されている間に重要なイベントを有し続けた17。
本明細書において、AAV-CTDPは、現在のケアの標準によるこれらの問題の両方に取り組むことにより、治療成績を改善したことを示す。RYR2およびMYBPC3はいずれも、心臓特異的なタンパク質であり、AAVは、発現を心臓に選択的に向かわせるであろう。したがって、心筋細胞の外側では最小限の効果が予測される。CTDPは、RYR2と直接的に相互作用し、変異体RYR2チャネルを通して自発的なCa2+放出を減少させる。影響を受けたチャネルに対するこの作用機序は、ベータ-遮断またはフレカイニドの現在の戦略よりも直接的である。重要なことに、これらの戦略は、相補的である可能性が高く、それにより、副作用を最小限にしつつ最大の保護を得るための、多層式の戦略を想起することができる。例えば、AAV-CTDPの投与は、異常なRYR2活性を直接的に低下させることができる。さらなる保護は、(おそらくはより容易に耐容されるより低い用量における)ベータ-ブロッカーにより、またはフレカイニドにより、得ることができる。治療が高度に有効である場合、一部の患者は、装着型心拍モニタによりガイドされて、いくらかのレベルの身体活動性まで戻ることができる。
まとめると、本明細書において記載されるAAV-CTDPは、現在のケアの標準にとって代わることができ、単独療法として十分であり得る。少なくとも、AAV-CTDPは、現在のケアの標準と協同することができ、より低いレベルのベータ-遮断およびより厳密性の低い運動制限を可能にし、それにより、副作用を軽減してそれによりコンプライアンスを増強しつつ、患者を、突然死のリスクから、より良好に保護することができる。
例2.
次に、治療剤候補ベクターの設計を最適化する。これらの最適化実験は、ヒトiPSC-CMおよびCPVTマウス(RYR2-R176Q/+およびRYR2-R4650I/+)成体CMにおいて行う。考慮すべき2つのパラメーターが存在する。
次に、治療剤候補ベクターの設計を最適化する。これらの最適化実験は、ヒトiPSC-CMおよびCPVTマウス(RYR2-R176Q/+およびRYR2-R4650I/+)成体CMにおいて行う。考慮すべき2つのパラメーターが存在する。
考慮すべき第1のパラメーターは、RYR2阻害性ペプチドである。予備的データは、MYBPC3のC末端は、CPVT変異を含むRYR2の異常な活性を低下させることにおいて有効であることを示唆する。異なるC末端ペプチド(C6-C10、C6-C8、C8-10、C9-C10、C10、C6-C9、C7-C9、C8-C9、C9)を発現するAAVを構築した。最初のin vitroデータは、C6-C8およびC6-C9、およびC10ドメインを含むペプチドは、RYR2と同じ細胞内の位置に結合することを示した(図2A~2F)。C6、C7、C8、C9および/またはC10ドメインを含むペプチドフラグメントは、RYR2S404R/WTマウスにおけるVTを減少させる能力についてのさらなる試験であった。データは、C6-C8およびC6-C10が、VTを減少させることにおいて最も有効であり(図5B~5C)、心臓の収縮を損なわないことを示した(図5A~5C)。C6-C10フラグメントはまた、EKGを用いるCTを低下させ(図5C)、異常なカルシウムシグナルを減少させることが示された(図5D~5E)。
最小有効MYBPC3フラグメントのマッピング
RYR2と相互作用するMYPBC3のフラグメントを、図6において概説されるような二分子蛍光補完アッセイ(BiFC)を用いて同定した。BiFCアッセイにおいて、MYBPC3フラグメントおよびRYR2を、各々、Venus蛍光タンパク質の半分に融合させた。所与のMYBPC3フラグメントがRYR2と相互作用した場合、Venusの半分ずつが一緒になって、蛍光シグナルが同定される。MYBPC3フラグメントは、既知のドメイン構造に基づき(図9A)、表2において概説した。BiFCにおける相互作用について、PLN-Serca2の相互作用を陽性対照として用い、Serca-RYR2の相互作用を陰性対照として用いた(図7~8)。
RYR2と相互作用するMYPBC3のフラグメントを、図6において概説されるような二分子蛍光補完アッセイ(BiFC)を用いて同定した。BiFCアッセイにおいて、MYBPC3フラグメントおよびRYR2を、各々、Venus蛍光タンパク質の半分に融合させた。所与のMYBPC3フラグメントがRYR2と相互作用した場合、Venusの半分ずつが一緒になって、蛍光シグナルが同定される。MYBPC3フラグメントは、既知のドメイン構造に基づき(図9A)、表2において概説した。BiFCにおける相互作用について、PLN-Serca2の相互作用を陽性対照として用い、Serca-RYR2の相互作用を陰性対照として用いた(図7~8)。
表2:BiPCアッセイにおいて用いられたタンパク質およびタンパク質フラグメント.
BiFCからの結果は、MYBPC3のC7およびC8領域が、MYBPC3とRYR2との間の相互作用についての主要な貢献者であることを示した。MCBPC3の様々なフラグメントは、RYR2への結合のための試験であった。C9-C10、C10、C6-C10、C7-C10、およびC8-C10からの結果は、C7およびC8領域はいずれも結合に寄与することを、強く示唆した(図9C~9D)。MYBPC3のC6-C8領域を、次いで、RYR2への結合について試験し、C6フラグメントのみでは、RYR2に結合しないが、C6-C7およびC6-C8フラグメントはRYR2に結合することが見出された(図9E)。さららなる実験は、C7-C8が、RYR2への結合のために十分であること、およびC7またはC8を欠失するMYBPC3フラグメントは、より低いアフィニティーによってではあるが、RYR2に結合することができることを決定した(図9F)。図9A~9Fにおける蛍光画像を、図11において定量し、C7および/またはC8を含むフラグメントが、C7およびC8を有しないフラグメントと比較して、RYR2に結合することをさらに示した。さらなる実験は、MYBPC3とRYR2との間の相互作用が、C7フラグメントを通して主に生じることを示した(図13A~13B)。各々のMYBPC3のRYR2に対する結合の有効性を、図12においてグラフによりまとめ、より大きな数の「+++」は、より高い相互作用アフィニティーを示す。また、相互作用しないMYPBC3ドメインは、RYR2と共発現し、強力に発現することを示し、このことは、低いVenusシグナルについての理由として発現の技術的失敗を除外する(図10)。
心筋細胞におけるAAVにより発現されるMYBPC3フラグメントの局在
心筋細胞におけるMYBPC3の確立された局在は、サルコメアのA帯である。しかし、RYR2は、サルコメアZ線の近傍である接合部のSR/daysにおいて位置する。MYBCP3フラグメントが、Z線の近傍、したがってRYR2と同じ領域において位置するか否かを決定するために、実験を行った。これを行うために、N末端においてHAタグ、およびC末端においてMycタグを有する、MYBPC3コンストラクトを作製した(図14A)。このコンストラクトを、AAVにより心筋細胞に送達した。同じ視野中の異なる心筋細胞は、HA-MYBPC3-Mycタンパク質について、異なる染色パターンを有することが観察された。いくつかの細胞はZ線染色パターンを有し、一方、他の細胞は、A帯染色パターンを有した(図14B)。さらなる分析は、HAを含むフラグメントは、主にA帯に結合し、一方、Mycを含有するフラグメントは、主にZ線に結合することを示す(図14C~14E)。このことは、MYBCP3が、細胞への投与の後で切断されていることを示唆する。
心筋細胞におけるMYBPC3の確立された局在は、サルコメアのA帯である。しかし、RYR2は、サルコメアZ線の近傍である接合部のSR/daysにおいて位置する。MYBCP3フラグメントが、Z線の近傍、したがってRYR2と同じ領域において位置するか否かを決定するために、実験を行った。これを行うために、N末端においてHAタグ、およびC末端においてMycタグを有する、MYBPC3コンストラクトを作製した(図14A)。このコンストラクトを、AAVにより心筋細胞に送達した。同じ視野中の異なる心筋細胞は、HA-MYBPC3-Mycタンパク質について、異なる染色パターンを有することが観察された。いくつかの細胞はZ線染色パターンを有し、一方、他の細胞は、A帯染色パターンを有した(図14B)。さらなる分析は、HAを含むフラグメントは、主にA帯に結合し、一方、Mycを含有するフラグメントは、主にZ線に結合することを示す(図14C~14E)。このことは、MYBCP3が、細胞への投与の後で切断されていることを示唆する。
このことを試験するために、野生型、野生型+HA-MYBPC3-MYC、およびMYBPC3 KOの心臓からの心筋細胞ライセートを、HAまたはC10(MYBPC3の最C末端ドメインを認識するモノクローナルAb)抗体を用いて探索した(図15)。KO試料は、これらの抗体が、ライセート中の他のタンパク質を認識しないことを示す。C10抗体は、全長(矢印)およびより小さなタンパク質(矢頭)を認識し、一方、HA抗体は、全長タンパク質のみを認識する。より小さなタンパク質が、WTおよびWT+HA-MYBPC3-MYCの両方において存在し、このことは、外来および内在性MYBPC3の両方の画分が、内部で切断されて、そのC末端ドメインを含むより小さなタンパク質を生じることを示唆している。
C7-C8フラグメントが、in vivoで心筋細胞においてZ線パターンに局在するか否かを決定するために、マウスを、AAV-cTnT-HA-C7C8-P2A-GFP(配列番号78)で処置した。心臓切片を、HAおよびACTN2(Z線マーカー)で染色した。共焦点画像および心筋細胞の長軸に平行な線に沿ったシグナル強度は、HA染色が、Z線と共局在する染色されたパターンを有することを示し、このことは、C7-C8フラグメントが、in vivoでRYR2タンパク質と同じ位置に局在することを示している(図16A~16B)。
MYBPC3の過剰発現に対するヒトCPVT iPSC-CMの応答
C6-C10 MYBC3フラグメントは、RYR2-S404変異により引き起こされたCPVTを有するヒトiPSC-CMにおいて異常なカルシウム放出を抑制することをさらに示した(図17)。細胞に、Ca2+感受性色素をロードし、1Hzで電気的にペーシングした。20秒間あたりの異常なCa2+放出イベントの数を定量した。MYBPC3は、CPVT変異体細胞において異常なCa2+放出イベントを抑制した。
C6-C10 MYBC3フラグメントは、RYR2-S404変異により引き起こされたCPVTを有するヒトiPSC-CMにおいて異常なカルシウム放出を抑制することをさらに示した(図17)。細胞に、Ca2+感受性色素をロードし、1Hzで電気的にペーシングした。20秒間あたりの異常なCa2+放出イベントの数を定量した。MYBPC3は、CPVT変異体細胞において異常なCa2+放出イベントを抑制した。
例3
RYR2は、正常なCa2+により誘導されるCa2+放出のために重要である、高次のクラスター化を有する四量体である。この構造組織は、MYBPC3由来の相互作用するタンパク質を多量体化することにより、効力および有効性を増大し得るという可能性を示唆する。上で同定されたin vivoで抗不整脈効果のために要求される最小領域(例えば、C7-C8またはC7)を用いて、2または3コピーが可撓性のリンカーにより分離されているコンカテマーを作製する。これらのコンストラクトの有効性を、in vitroおよびin vivoアッセイを用いて比較する。心臓機能に対する効果はまた、心エコー図検査により試験する。最適化された治療用コンストラクトを、末端由来ペプチド、「CTDP」と命名する。治療剤候補ベクターを最適化する際に考慮すべき第2のパラメーターは、心筋細胞発現を駆動するために用いられるプロモーターである。プロモーターおよびエンハンサーを、最大レベルの発現および心筋細胞選択性を有する組み合わせを同定するために試験する。超並列(massively parallel)レポーターアッセイは、数千の候補エンハンサーを並行して試験するために先に開発され34、このアッセイは、現在、AAVからの発現を駆動するための最も強力かつ心臓特異的なエンハンサーおよびプロモーターを見出すために用いられている。
RYR2は、正常なCa2+により誘導されるCa2+放出のために重要である、高次のクラスター化を有する四量体である。この構造組織は、MYBPC3由来の相互作用するタンパク質を多量体化することにより、効力および有効性を増大し得るという可能性を示唆する。上で同定されたin vivoで抗不整脈効果のために要求される最小領域(例えば、C7-C8またはC7)を用いて、2または3コピーが可撓性のリンカーにより分離されているコンカテマーを作製する。これらのコンストラクトの有効性を、in vitroおよびin vivoアッセイを用いて比較する。心臓機能に対する効果はまた、心エコー図検査により試験する。最適化された治療用コンストラクトを、末端由来ペプチド、「CTDP」と命名する。治療剤候補ベクターを最適化する際に考慮すべき第2のパラメーターは、心筋細胞発現を駆動するために用いられるプロモーターである。プロモーターおよびエンハンサーを、最大レベルの発現および心筋細胞選択性を有する組み合わせを同定するために試験する。超並列(massively parallel)レポーターアッセイは、数千の候補エンハンサーを並行して試験するために先に開発され34、このアッセイは、現在、AAVからの発現を駆動するための最も強力かつ心臓特異的なエンハンサーおよびプロモーターを見出すために用いられている。
これらの実験は、AAV9キャプシドにより行う。なぜならば、AAV9キャプシドは、マウスにおいて効率的な遺伝子治療ベクターとして確立されており、FDAにより承認されたヒト製品において先に用いられているからである。
次に、治療の機序を評価する。MYBPC3のC末端領域は、RYR2と相互作用して、拡張期Ca2+フラックスを減少させると考えられる。RYR2WTおよびRYR2R176Q/+拡張期Ca2+フラックスに対するCTDPの効果を測定する。RYR2-R176Q/+および同腹仔対照マウスを、対照AAV(AAV-GFP)またはAAV-GFP-CTDPで処置する。確立されたプロトコルを用いて、6週齢の心筋細胞を単離し、拡張期筋小胞体Ca2+リークを測定する33。
次に、治療の機序を評価する。MYBPC3のC末端領域は、RYR2と相互作用して、拡張期Ca2+フラックスを減少させると考えられる。RYR2WTおよびRYR2R176Q/+拡張期Ca2+フラックスに対するCTDPの効果を測定する。RYR2-R176Q/+および同腹仔対照マウスを、対照AAV(AAV-GFP)またはAAV-GFP-CTDPで処置する。確立されたプロトコルを用いて、6週齢の心筋細胞を単離し、拡張期筋小胞体Ca2+リークを測定する33。
MYBPC3がRYR2と直接的に相互作用するか否かをさらに試験するために、異種性の発現系および平面状の脂質二重層を用いる。RYR2野生型またはRYR2R176Q発現プラスミドを、HEK293細胞中に遺伝子導入し、小胞体の小胞を精製する。小胞を用いて平面状の脂質二重層に播種する。漸増する濃度の組み換えCTDPによる処置の後で、二重層を通したCa2+電流を測定する。CTDPは、RYR2R176QによるCa2+放出を正常化する。
次に、マウスCPVTモデルにおける用量-応答および毒性の研究を行う。最適化された治療剤候補を用いて、CPVTマウスにおいて用量-応答実験を行い、不整脈を抑制するために形質導入されなければならない心筋細胞の最小のパーセントを決定する。予備実験において、AAV-CTDPによる用量を見出す、および体内分布の研究を行う。4週齢のマウスに、AAV-CTDPまたは対照(AAV-GFP)を静脈内注射する。8週目において、マウスを安楽死させ、組織(心臓、肺、脾臓、肝臓、腎臓、精巣/卵巣、骨格筋、および脳)を、組織学的および分子研究のために回収するであろう。凍結切片を、GFP発現について分析する。心臓の試料を、RNAscope in situハイブリダイゼーションにより分析し、AAV-CTDPにより形質導入された心筋細胞の割合を直接的に測定する。分子研究は、GFPまたはCTDPのRNA発現、および宿主ゲノムあたりのウイルスゲノムコピーを測定する。
10%、30%、および50%の心筋細胞形質導入を生じるウイルス用量を確立し、次に用量-応答研究を行う。2つの異なるマウスCPVTモデル、RYR2-R176Q/+およびRYR2-R4650I/+を用いる。これらのCPVT変異は、タンパク質の反対の末端における異なる変異ホットスポット領域において生じる。両方の遺伝子型の使用は、複数の異なるCPVTにより引き起こされるRYR2変異に対する処置が有効であることを示すために役立つ。CPVTモデルおよび同腹仔対照マウスの両方を研究する。マウスを、4週齢において、これら3つの用量のAAV-CTDPで、または心筋細胞のうちの50%を形質導入する用量におけるAAV-GFPで処置する。4週間後、マウスに、心エコー図検査、次いで電気生理学研究を行う。電気生理学研究は、右経動脈を通して右心室中への8極ペーシング/記録カテーテルの挿入を含む。マウスは、アドレナリン作動性刺激(イソプロテレノールに加えてエピネフリン)で、および最近記載されたようなプログラムされた心室刺激で21処置する。電気生理学研究の後で、マウスを安楽死させ、組織を組織学的および分子アッセイのために保存する。これらの研究は、遺伝子型および処置群に対して盲検化で行う。3つの遺伝子型、および3つの用量に加えて、1つの用量の対照ベクターについて、1群あたり10個体の動物が存在する。本研究は、120個体のマウスの投薬および電気生理学研究を要求する。
次に、ウサギCPVTモデルにおける有効性を試験する。マウスの心臓生理学は、ヒトとは著しく異なる。例えば、マウスの心拍はヒトよりも10倍速く、心臓の質量は2000倍小さい。対照的に、ウサギの心臓生理学は、ヒトとより類似する-ウサギの心拍はヒトよりも2倍速く、質量は約10倍低い。心拍およびサイズは、心臓のイオンチャネルの発現について、および不整脈に対する感受性について、重要な意味を有する。ウサギとヒトとの心臓の電気生理学の間のより近いアラインメントは、ウサギモデルにおける有効性および安全性の実証が、治療戦略のリスクを著しく低下させるであろうことを示す。ウサギモデルは、ウサギの飼育および収容、ならびに十分なAAVの生成の両方に関して高価である。したがって、最初の用量を見出す研究は、記載されるようにマウスモデルにおいて行い、次いで、ウサギモデルにおいて検証する。
ウサギCPVTモデル(R4650I/+)は、開発中である。対照の、および処置されたCPVTウサギを、カテコールアミン刺激に対する、またはプログラムされた心室刺激に対する不整脈応答について比較する。
AAV-GFPを用いての、最初の用量を見出す、および体内分布の研究において、マウスのための上のタスク2において記載されるように、治療用ベクターのいくつかの用量を試験し、心臓および他の組織の形質導入を測定する。若齢のウサギ(8週齢)を、静脈内でAAV-GFPで処置する。4週間後に、心臓、肺、脾臓、肝臓、腎臓、精巣/卵巣、骨格筋、および脳における形質導入および発現を測定する。RNAscope in situハイブリダイゼーションを用いて同等の心臓の形質導入効率を確認するために、ウサギを、比較可能な用量においてAAV-CTDPで処置する。
AAV-GFPを用いての、最初の用量を見出す、および体内分布の研究において、マウスのための上のタスク2において記載されるように、治療用ベクターのいくつかの用量を試験し、心臓および他の組織の形質導入を測定する。若齢のウサギ(8週齢)を、静脈内でAAV-GFPで処置する。4週間後に、心臓、肺、脾臓、肝臓、腎臓、精巣/卵巣、骨格筋、および脳における形質導入および発現を測定する。RNAscope in situハイブリダイゼーションを用いて同等の心臓の形質導入効率を確認するために、ウサギを、比較可能な用量においてAAV-CTDPで処置する。
CPVTおよび同腹仔対照ウサギを、タスク2において記載されるようにマウスにおいて有効であると見出されるレベルまでの、心筋細胞を形質導入するウイルスの用量で処置する。CPVTラビットの第3のコホートは、処置内。処置の4週間後、ウサギに、心エコー図検査、次いで電気生理学研究を行う。電気生理学研究は、アドレナリン作動性ストレス(イソプロテレノールに加えてエピネフリン)およびプログラムされた心室刺激の間の表面EKGおよび心臓内記録からなる。1群あたり合計で10個体のウサギが存在し、3群において合計30個体のウサギが存在する。
次いで、ある範囲のCPVTの遺伝子型にわたるヒトiPSC-CMにおける有効性を試験する。4つのCPVT変異ホットスポット領域のうちの各々にマッピングするいくつかの異なるCPVT遺伝子型を有する患者からのiPSC-CMに対して、AAV-CTDPを試験する。AAV2キャプシドは、培養細胞に遺伝子導入するために用いることができる。Ca2+スパーク頻度を一次読み出しとして用いて、治療剤候補の有効性を、遺伝子型の間で測定する。
参考文献
均等物および範囲
当業者は、本明細書において記載される態様の多くの均等物を認識するか、または慣用的な実験のみをもちいてこれを確認することができるであろう。本開示の範囲は、上の記載に対して限定されることを意図されず、むしろ、添付の請求の範囲において記載されるとおりである。
当業者は、本明細書において記載される態様の多くの均等物を認識するか、または慣用的な実験のみをもちいてこれを確認することができるであろう。本開示の範囲は、上の記載に対して限定されることを意図されず、むしろ、添付の請求の範囲において記載されるとおりである。
「a」、「an」、および「the」などの冠詞は、文脈から逆であることが示されるか別段に明白でない限り、1つまたは1つより多くを意味し得る。群の2つ以上のメンバーの間に「または(or)」を含む請求項または記載は、文脈から逆であることが示されるか別段に明白でない限り、群のメンバーのうちの1つ、1つより多く、または全てが存在する場合に、満たされると考えられる。2つ以上の群のメンバーの間に「または」を含む群の開示は、群のうちの正確に1つのメンバーが存在する態様、群のうちの1つより多くのメンバーが存在する態様、および群のメンバーの全てが存在する態様を提供する。簡潔さの目的のために、これらの態様は、本明細書においては個々にはっきりと詳細に説明はされていないが、これらの態様の各々は、本明細書において提供され、特に請求されても、または放棄されてもよいことが、理解されるであろう。
本開示は、請求項のうちの1つ以上から、または説明の1つ以上の関連する部分からの、1つ以上の限定、要素、節、または説明的用語が、別の請求項中に導入される、全てのバリエーション、組み合わせおよび順列を包含することが、理解されるべきである。例えば、別の請求項に従属する請求項は、同じ基礎請求項に従属する任意の他の請求項において見いだされる限定のうちの1つ以上を含むように改変することができる。さらに、別段に示されない限り、または矛盾もしくは不一致が生じるであろうことが当業者に明らかでない限り、請求項が組成物を記述する場合、本明細書において開示される製造または使用する方法のうちのいずれかにより、または存在する場合には当該分野において公知の方法により、組成物を製造または使用する方法が含まれることが、理解されるべきである。
要素がリストとして、例えばマーカッシュ群形式において存在する場合、要素の全ての可能なサブグループもまた開示されること、および任意の要素または要素のサブグループを、群から取り除くことができることが、理解されるべきである。用語「含むこと(comprising)」は、オープンであることを意図され、追加の要素またはステップの包含を許容することもまた、記述される。一般に、態様、生成物、または方法が、特定の要素、特徴、またはステップを含むものとして言及される場合、かかる要素、特徴、またはステップからなるか、またはこれらから本質的になる態様、生成物、または方法もまた提供されることが、理解されるべきである。簡潔さの目的のために、これらの態様は、これらの態様の各々は、本明細書において提供され、特に請求されても、または放棄されてもよいことが、理解されるであろう。
範囲が示される場合、エンドポイントが含まれる。さらに、別段に示されるか、文脈および/または当業者の理解から別段に明らかでない限り、範囲として表される値は、文脈が明らかに異なることを指示しない限り、いくつかの態様において記述された値の中の任意の特定の値を、当該範囲の下限の単位の10分の1まで、想定することができることが、理解されるべきである。簡潔さの目的のために、各々の範囲の中の値は、本明細書においては個々にはっきりと詳細に説明はされていないが、これらの値の各々は、本明細書において提供され、特に請求されても、または放棄されてもよいことが、理解されるであろう。また、別段に示されるか、文脈および/または当業者の理解から別段に明らかでない限り、範囲として表される値は、示される範囲の中の任意の部分範囲を想定することができ、ここで、部分範囲のエンドポイントは、当該範囲の下限の単位の10分の1と同じ程度の正確さまで、表されることが、理解されるべきである。
ウェブサイトが提供される場合、URLアドレスは、対応するウェブアドレスの区切りを丸括弧内に入れて、非ブラウザ実行可能コード(non-browser-executable code)として提供される。実際のウェブアドレスは、丸括弧を含まない。
加えて、本開示の任意の特定の態様は、請求項のうちのいずれか1つ以上から明示的に除外することができることが、理解されるべきである。範囲が示される場合、当該範囲内の任意の値は、請求項のうちのいずれか1つ以上から明示的に除外することができる。本開示の組成物および/または方法の任意の態様、要素、特徴、適用、または側面は、任意の1つ以上の請求項から除外することができる。簡潔さの目的のために、1つ以上の要素、特徴、目的、または側面が除外される態様の全ては、本明細書において明示的に記載されない。
Claims (39)
- 異常なリアノジン受容体2型(RYR2)機能に関連する障害を処置する方法であって、必要とする対象に心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドの有効量を投与することを含む、前記方法。
- 異常なリアノジン受容体2型(RYR2)機能に関連する障害を処置する方法であって、必要とする対象に心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸の有効量を投与することを含む、前記方法。
- 異常なRYR2機能が、RYR2における1つ以上の変異により引き起こされる、請求項1または請求項2に記載の方法。
- RYR2における変異が、対象における心筋細胞において過剰な拡張期Ca2+放出を引き起こす、請求項3に記載の方法。
- ポリペプチドが、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つに対して少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項1~4のいずれか一項に記載の方法。
- ポリペプチドが、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項5に記載の方法。
- ヌクレオチド配列が、プロモーターに作動可能に連結されている、請求項2~6のいずれか一項に記載の方法。
- 核酸が、ベクターである、請求項2~7のいずれか一項に記載の方法。
- ベクターが、発現ベクターである、請求項8に記載の方法。
- 発現ベクターが、ウイルスベクターである、請求項9に記載の方法。
- ウイルスベクターが、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、または組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクターから選択される、請求項10に記載の方法。
- ウイルスベクターが、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列およびプロモーターに隣接する2つのAAV逆位末端反復配列(ITRs)をさらに含む、rAAVベクターである、請求項11に記載の方法。
- rAAVベクターが、rAAV粒子中にパッケージングされる、請求項11に記載の方法。
- rAAV粒子が、キャプシドタンパク質をさらに含む、請求項13に記載の方法。
- キャプシドタンパク質が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV6.2、AAV7、AAV8、AAV9、AAV.rh8、AAV.rh10、AAV.rh39、AAV.43、AAV2/2-66、AAV2/2-84、およびAAV2/2-125、またはそれらのバリアントから選択される血清型のものである、請求項14に記載の方法。
- キャプシドタンパク質が、血清型AAV9のものである、請求項15に記載の方法。
- rAAVが、自己相補的AAV(scAAV)である、請求項11~16のいずれか一項に記載の方法。
- ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、コドン最適化されている、請求項2~12のいずれか一項に記載の方法。
- 核酸が、メッセンジャーRNA(mRNA)である、請求項2~6のいずれか一項に記載の方法。
- mRNAが、修飾されたmRNAである、請求項19に記載の方法。
- ポリペプチドまたは核酸が、対象における心筋細胞に送達される、請求項1~20のいずれか一項に記載の方法。
- 障害が、不整脈である、請求項1~21のいずれか一項に記載の方法。
- 不整脈が、遺伝性または後天性である、請求項22に記載の方法。
- 遺伝性不整脈が、カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍(CPVT)である、請求項23に記載の方法。
- 不整脈が、心室性不整脈または上室性不整脈である、請求項23に記載の方法。
- 心室性不整脈が、心室頻拍、心室細動、または心室性期外収縮である、請求項25に記載の方法。
- 上室性不整脈が、心房細動、心房粗動、心房頻拍、心房性期外収縮、または発作性上室性頻拍である、請求項25に記載の方法。
- 障害が、心不全である、請求項1~21のいずれか一項に記載の方法。
- ポリペプチドまたは核酸を投与することが、対象における心筋細胞における過剰な拡張期Ca2+放出を減少させる、請求項25に記載の方法。
- 対象が、ヒトである、請求項1~29のいずれか一項に記載の方法。
- 投与することが、注射を介するものである、請求項1~30のいずれか一項に記載の方法。
- 不整脈を処置する方法であって、必要とする対象に組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)の有効量を投与することを含み、ここで、rAAVが、血清型AAV9のキャプシドタンパク質および心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、前記方法。
- ポリペプチドが、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つに対して少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項32に記載の方法。
- ポリペプチドが、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項32または請求項33に記載の方法。
- ポリペプチドが、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列からなる、請求項32に記載の方法。
- キャプシドタンパク質および心筋ミオシン結合タンパク質C(MYBPC3)のC末端ドメインを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、組み換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)。
- ポリペプチドが、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項33に記載のrAAV。
- ポリペプチドが、配列番号1~16または53~64のうちのいずれか1つのアミノ酸配列からなる、請求項33に記載のrAAV。
- 異常なリアノジン受容体2型(RYR2)機能に関連する障害を処置することにおける、請求項33または請求項34に記載のrAAVの使用。
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