JP2023524010A - 高効率遺伝子送達系 - Google Patents
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Abstract
本開示は、ウイルスベクター送達系が投与される対象における疾患または障害の治療における使用のためのウイルスベクター送達系、そしてウイルスベクター送達系を作製及び使用する方法を提供する。
Description
関連出願
本出願は、2020年4月28日に出願された米国仮出願第63/016,968号の利益を主張する。上記の出願の全体の教示は、参照することによって本明細書に援用される。
本出願は、2020年4月28日に出願された米国仮出願第63/016,968号の利益を主張する。上記の出願の全体の教示は、参照することによって本明細書に援用される。
加齢の分野は、過去数十年で大きな進歩を遂げた。その調節が健康でいる期間及び寿命を増加させる多くの経路及び遺伝子、ならびに加齢を標的とする第1の治療物質が出現し始めている。しかしながら、加齢の研究からの大部分の解明は、適切な小分子薬物の欠如に起因して、重度の早期加齢疾患であっても臨床へと応用され得ない。さらに、マウス及び他の哺乳動物を使用する加齢の遺伝学についての研究は、当該研究が遺伝子導入動物の大きなコホートの生成、繁殖、及び加齢を要求するので、遅くそして費用のかかるままであった。
応用可能性の欠如ならびに研究の時間及び費用は、今日加齢の分野で見られる主な問題である。これらの問題は、従来の方法を使用して解決することができない。しかしながら、高度な遺伝子療法を使用して、加齢した動物において遺伝子を直接乱し患者の中へ老化保護遺伝子を送達することを介して、当該問題を解決することができる可能性がある。しかしながら、これは、遺伝子送達技術の現在の限定に起因して達成されない。
遺伝子(例えば老化保護遺伝子)を発現または過剰発現するための高効率アデノ随伴ウイルス(AAV)ベースの体全体の遺伝子療法の方法が本明細書において記載される。系は、全身性発現(例えば均一な全身性発現)のためのAAV発現系、例えば均一な全身性発現のための単一または複数のAAV発現系(DAEUS)である。DAEUSが加齢した野生型マウスにおいて複数の老化保護遺伝子の過剰発現を達成し得ることが、本明細書において示される。DAEUSが、II型ウォルフラム症候群マウスにおいてCisd2発現を完全にレスキューし、そしてこれらのマウスにおいて主要な早老性罹患率を遅らせ、好転させ得ることが、本明細書においてさらに示される。DAEUSは、他の使用の中でも、加齢の基礎生物学、早老症の治療、及び健康でいる期間及び/または寿命を延長するための老化保護遺伝子の過剰発現についての研究を加速させることを可能にする遺伝子療法プラットフォームである。
ウイルスベクター送達系が、本明細書において開示される。ウイルスベクター送達系は、単一遺伝子の送達のために操作された2つ以上のウイルス血清型を含む(すなわち同じ遺伝子は、2つ以上のウイルス血清型の各々によって送達される)。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、単一遺伝子を送達するために無限の数のウイルス血清型を含む。例えば、ウイルスベクター送達系は、少なくとも5、10、25、50、75、または100のウイルス血清型を含み得るか、または2~20または5~10のウイルス血清型を含み得る。
いくつかの実施形態において、ウイルス血清型はアデノ随伴ウイルス血清型である(例えばAAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、AAVrh10、AAV-DJ、AAV-DJ/8、AAV-PHP.B、AAV-PHP.S、AAV-PHP.eB、AAV.CAP-B10、AAV.CAP-B22、及びAAVMYOなど)。いくつかの実施形態において、2つ以上のウイルス血清型の各々は、異なる細胞タイプまたは組織タイプについて指向性(trophic)である(すなわち第1のウイルス血清型は第1の細胞タイプまたは組織タイプについて指向性であり、第2のウイルス血清型は第2の細胞タイプまたは組織タイプについて指向性である)。いくつかの実施形態において、少なくとも1つのウイルス血清型はAAV9である。いくつかの実施形態において、少なくとも1つのウイルス血清型はPHP.eBである。ある特定の実施形態において、第1のウイルス血清型はAAV9であり、第2のウイルス血清型はPHP.eBである。いくつかの実施形態において、ウイルス血清型は表1から選択される。
ウイルスベクター送達系は、miRNA標的部位をさらに含み得る。いくつかの実施形態において、miRNA標的部位は、組織標的(例えば大動脈、内皮、心筋骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、もしくは筋肉衛星細胞、またはより特異的には心臓、肝臓、筋肉、もしくは脳の組織)に基づいて選択される。いくつかの実施形態において、miRNA標的部位は、miRNA-1、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-124、miRNA-128、miRNA-133、miRNA-144、miRNA-148a、miRNA-208a、miRNA-208b、miRNA-223、及びmiRNA-499からなる群から選択される。例えば、標的組織は心臓組織であり得、miRNA標的部位は、miRNA-1、miRNA-133、miRNA-208a、miRNA-208b、またはmiRNA-499であり得る。いくつかの実施形態において、標的組織は肝臓組織であり、miRNA標的部位は、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-144、miRNA-148a、及びmiRNA-223からなる群から選択される。いくつかの実施形態において、標的組織は筋肉組織であり、miRNA標的部位は、miRNA-1またはmiRNA-133である。いくつかの実施形態において、標的組織は脳組織であり、miRNA標的部位は、miRNA-124またはmiRNA-128である。
ウイルスベクター送達系は、非サイレンシングプロモーターをさらに含み得る。いくつかの実施形態において、非サイレンシングプロモーターは、CMVプロモーター発現の少なくとも30%、任意選択で少なくとも50%のRNA発現を導く。いくつかの実施形態において、プロモーターは、Cbh、CAG、CB7、及びCBAからなる群から選択される。ある特定の実施形態において、プロモーターはCbhである。
いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、任意選択で自己相補的ベクター骨格をさらに含む。
いくつかの実施形態において、送達される遺伝子は表2から選択される。ある特定の実施形態において、遺伝子は、Cisd2、Atg5、及びPTENからなる群から選択される。いくつかの実施形態において、遺伝子は老化保護遺伝子である。いくつかの実施形態において、遺伝子は、対象において治療を必要とする疾患または障害と関連する遺伝子(例えばその発現が、治療される疾患または障害において不在まであるかまたは低減された遺伝子)である。
本明細書において開示されるウイルスベクター送達系を含む医薬組成物も、本明細書において開示される。本明細書において開示される医薬組成物またはウイルスベクター送達系を投与することを含む対象における疾患または障害を治療または予防する方法も、本明細書において開示される。
同じ遺伝子を対象の複数の(2つ以上)細胞タイプまたは組織タイプへ比較的同時に送達及び発現する方法、そして疾患または障害を治療または予防する方法が、本明細書において開示される。方法は、単一遺伝子の送達のために操作された少なくとも1つのウイルス血清型、少なくとも2つのウイルス血清型、少なくとも3つのウイルス血清型、少なくとも4つのウイルス血清型、または少なくとも5つのウイルス血清型を含むウイルスベクター送達系を対象へ投与することを含む。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、単一遺伝子を送達するために無限の数のウイルス血清型を含む。
いくつかの実施形態において、疾患または障害は、加齢関連の疾患または障害(例えば早老症、ウォルフラム症候群、神経変性障害、神経血管障害、骨格筋病態、カウデン症候群、バナヤン・ライリー・ルバルカバ症候群、プロテウス症候群、プロテウス様症候群、及び他のPTEN病(PTEN-opathy)、ウェルナー症候群、ブルーム症候群、ロスムンド・トムソン症候群、コケイン症候群、色素性乾皮症、硫黄欠乏性毛髪発育異常症、色素性乾皮症・コケイン症候群の合併型、拘束性皮膚障害、糖尿病、肥満、心血管性疾患、がん、眼の変性、肝不全、ならびに加齢黄斑変性症)である。いくつかの実施形態において、疾患または障害は、2つ以上の組織標的への遺伝子の投与から利益を得るであろう。ある特定の実施形態において、疾患または障害は、II型ウォルフラム症候群である。
いくつかの実施形態において、遺伝子は、対象中の2つ以上の組織において発現される。遺伝子は、対象中の2つ以上の組織にわたって均一に発現または過剰発現され得る。いくつかの実施形態において、遺伝子は対象中の組織のうちの少なくとも50%へ送達され、いくつかの実施形態において、対象中で少なくとも4か月間発現される。
単一遺伝子の送達のために操作された2つ以上のAAV血清型、非サイレンシングプロモーター、少なくとも1つのmiRNA標的部位、遺伝子、及び任意選択で自己相補的骨格を含むウイルスベクター送達系も、本明細書において開示される。
いくつかの実施形態において、AAV血清型は、AAV9及びPHP.eBである。いくつかの実施形態において、遺伝子は、Cisd2、Atg5、及びPTENからなる群から選択され、好ましくはCisd2である。
本明細書において開示されるウイルスベクター送達系を対象へ投与することを含む、疾患または障害(例えばII型ウォルフラム症候群)を治療する方法を、本明細書において開示する。
対象の寿命を延長する方法も、本明細書において開示される。例えば、寿命は、本明細書において記載されるウイルスベクター送達系、または本明細書において記載されるウイルスベクター送達系を含む医薬組成物(例えば単一遺伝子の送達のために操作された少なくとも1、少なくとも2、少なくとも3、少なくとも4、またはそれ以上のウイルス血清型を含むウイルスベクター送達系)を投与することによって延長され得る。
有効量のCisd2をII型ウォルフラム症候群を患う対象へ投与することを含むII型ウォルフラム症候群を治療する方法が、本明細書においてさらに記載される。
いくつかの実施形態において、Cisd2は、遺伝子療法を介して(例えばウイルスベクター送達系または当業者に公知の他の遺伝子療法を介して)対象へ投与される。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、少なくとも1つのウイルス血清型、少なくとも2つのウイルス血清型、少なくとも3つのウイルス血清型、少なくとも4つのウイルス血清型、少なくとも5つのウイルス血清型を含む。
対象へ投与されたベクターの量と1つまたは複数の標的組織中のもたらされた遺伝子導入レベルとの間の関係性を特徴づける用量-応答曲線を得ることと;対象へ投与されたベクターの量と1つまたは複数の標的組織中のもたらされた遺伝子導入レベルとの間の関係性を特徴づける線形方程式または非線形方程式を得ることと;遺伝子送達系の要求する用量を内挿または外挿して、1つまたは複数の標的組織において定義されたレベルの遺伝子導入を達成することと、を含む、対象の1つまたは複数の標的組織における遺伝子導入の前決定されたレベルを同定する方法も、本明細書において記載される。
対象へ投与されたベクターの量と1つまたは複数の標的組織中のもたらされた導入遺伝子発現レベルとの間の関係性を特徴づける用量-応答曲線を得ることと;対象へ投与されたベクターの量と1つまたは複数の標的組織中のもたらされた導入遺伝子発現レベルとの間の関係性を特徴づける線形方程式または非線形方程式を得ることと;遺伝子送達系の要求する用量を内挿または外挿して、1つまたは複数の標的組織において定義されたレベルの導入遺伝子発現を達成することと、を含む、対象の1つまたは複数の標的組織における導入遺伝子発現の前決定されたレベルを同定する方法が、本明細書においてさらに記載される。
いくつかの実施形態において、遺伝子送達系は、少なくとも1つのウイルス血清型、少なくとも2つのウイルス血清型、少なくとも3つのウイルス血清型、少なくとも4つのウイルス血清型、少なくとも5つのウイルス血清型を含む。いくつかの実施形態において、ウイルス血清型はアデノ随伴ウイルス血清型である(例えばAAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、AAVrh10、AAV-DJ、AAV-DJ/8、AAV-PHP.B、AAV-PHP.S、AAV-PHP.eB、AAV.CAP-B10、AAV.CAP-B22、AAVMYOなど)。いくつかの実施形態において、ウイルス血清型は表1から選択される。いくつかの実施形態において、1つまたは複数の標的組織は、単一組織または2つ以上の組織を含む。いくつかの実施形態において、1つまたは複数の標的組織は、大動脈、内皮、心筋、骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、ならびに筋肉衛星細胞からなる群から選択される。
本特許または出願ファイルは、カラーで作成された少なくとも1つの図面を含有する。カラー図面を含めた本特許または特許出願公開のコピーは、請求及び必要な料金の支払いに応じて官庁によって提供されるだろう。
長期的で効率的且つ体全体の遺伝子発現を可能にする遺伝子療法の方法が、本明細書において開示される。1つまたは複数の遺伝子の送達のためのウイルスベクター送達系も、本明細書において開示される。本明細書において記載されるウイルスベクター送達系は、対象内の大多数の組織の中へ遺伝子を送達し、これらの組織にわたって均一な遺伝子発現を提供し、長期的且つ安定的な遺伝子発現を提供し、野生型レベルを超える過剰発現を達成するように遺伝子の強く効率的な発現を提供し、個別の細胞間で一様に分布する遺伝子発現を提供する。遺伝子療法(例えばウイルスベクター送達系)を利用して、対象の1つまたは複数の組織へ遺伝子(例えばCisd2、Atg5、またはPTEN)を送達することによって、1つまたは複数の疾患(例えばII型ウォルフラム症候群)を治療もしくは予防するか、または対象の寿命を延長する方法も、本明細書において開示される。
別段定義されない限り、本明細書において使用されるすべての技術用語及び科学用語は、当業者によって共通して理解される意味を有する。以下の参照文献は、本明細書において使用される多くの用語の一般的な定義を当業者に提供する。Singleton et al.,Dictionary of Microbiology and Molecular Biology(2nd ed.1994);The Cambridge Dictionary of Science and Technology(Walker ed.,1988);The Glossary of Genetics,5th Ed.,R.Rieger et al.(eds.),Springer Verlag(1991);及びHale & Marham,The Harper Collins Dictionary of Biology(1991)。
標準的な技法は、組み換えDNA、オリゴヌクレオチド合成、組織培養及び形質転換、タンパク質精製などのために使用され得る。酵素反応及び精製技法は、製造者の仕様書に従って、または当該技術分野において一般的に行われるようにもしくは本明細書において記載されるように、遂行され得る。以下の手順及び技法は、概して、当技術分野において周知の従来の方法に従って、ならびに本明細書を通して引用され論じられる様々な一般的な参照文献及びより具体的な参照文献中で記載されるように、遂行され得る。例えばSambrook et al.,2001,Molecular Cloning:A Laboratory Manuel,3.sup.rd ed.,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.(それは、任意の目的のために参照することによって本明細書に援用される)を参照されたい。具体的な定義が提供されない限り、本明細書において記載される分析化学、有機化学、ならびに医用化学及び医薬品化学に関連して使用される命名法、ならびにそれらの実験室での手順及び技法は、当技術分野において周知であり一般に使用されるものである。標準的な技法は、化学合成、化学分析、医薬品調製、製剤化、及び送達、ならびに患者の治療のために使用され得る。
本出願は、ウイルスベクター送達系により形質導入された対象において、標的環境(例えば細胞、細胞の集団、組織、器官、またはその組み合わせ)へ遺伝子を送達することが可能なウイルスベクター送達系を提供する。例えば、ウイルスベクター送達系は、対象の大動脈、内皮、心筋、骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、ならびに筋肉衛星細胞への遺伝子の送達に使用され得る。ある特定の態様において、ウイルスベクター送達系は、対象の脳、心臓、肝臓、及び/または筋肉(例えば腹横筋または大腿四頭筋)への遺伝子の送達に使用され得る。対象における標的環境(例えば脳、心臓、肝臓、筋肉、またはその組み合わせ)へウイルスベクターを向けることが可能なペプチド、ペプチドを含むウイルスベクターカプシドタンパク質、ペプチドを含むカプシドタンパク質を有するウイルスベクターを含む組成物(例えば医薬組成物)、及びペプチド及びウイルスベクターのカプシドタンパク質をコードする核酸配列も、本明細書において開示される。加えて、ウイルスベクターを作製及び使用する方法を開示する。いくつかの実施形態において、ウイルスベクターは、1つまたは複数の疾患及び障害(例えば加齢に関連する疾患及び障害)の予防及び/または治療に使用される。
ベクター送達系(例えばウイルスベクター送達系)が、本明細書において開示される。ウイルスベクター送達系は、単一遺伝子を送達するための1つまたは複数のウイルス血清型を含み得、ある特定の態様において、単一遺伝子を送達するための2つ以上のウイルス血清型を含み得る。ウイルスベクター送達系は、単一導入遺伝子を対象へ送達するために無限の数のウイルス血清型を含み得る。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、少なくとも1、2、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、または100のウイルス血清型を含む。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10のウイルス血清型を含む。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、1~10、2~8、5~10、または5~8のウイルス血清型を含む。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、1つのウイルス血清型を含む。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、2つのウイルス血清型を含む。いくつかの実施形態において、第1のウイルス血清型は、第1の標的組織へ遺伝子を送達する。第2のウイルス血清型は、第1の標的組織へ及び/または第2の標的組織へ同じ遺伝子を送達する。いくつかの態様において、第3、第4、第5、第6、第7、第8、第9、及び/または第10のウイルス血清型は、1つまたは複数の組織へ遺伝子を送達する。いくつかの実施形態において、ウイルス血清型は、同時に、近接して、または逐次的に投与される。
本明細書において記載されるウイルスベクター送達系における使用に好適なウイルスとしては、例えばアデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レトロウイルス(例えばレンチウイルス)、ワクシニアウイルス及び他のポックスウイルス、ヘルペスウイルス(例えば単純ヘルペスウイルス)、ならびに他のものが挙げられる。ウイルスは、宿主細胞の中へ導入された場合に、感染性ウイルスの産生のために十分なウイルス遺伝子情報を含有していても含有していなくてもよく、すなわち、ウイルスベクターは複製可能または複製欠損性であり得る。
いくつかの実施形態において、ウイルスはアデノ随伴ウイルスである。アデノ随伴ウイルス(AAV)は、小さな(20nm)複製欠損性の非エンベロープウイルスである。AAVゲノムは、約4.7キロベース長の一本鎖DNA(ssDNA)である。ゲノムは、DNA鎖の両末端で逆方向末端反復(ITR)、ならびに2つのオープンリーディングフレーム(ORF):rep及びcapを含む。AAVゲノムは、19番染色体上の特定の部位の中へ最も頻繁に組み込まれる。ゲノムの中へのランダム取り込みは、ごくわずかな頻度で起こる。組み込み能力は、ベクターから少なくともrep ORFの一部分を除去することによって取り除かれ、エピソームのままで、少なくとも非分裂細胞において持続発現を提供するベクターをもたらし得る。AAVを遺伝子導入ベクターとして使用するために、所望されるタンパク質またはRNAをコードする(例えばプロモーターへ作動可能に連結されたポリペプチドまたはRNAをコードする)核酸配列を含む核酸は、AAVゲノムの逆方向末端反復(ITR)の間に挿入される。アデノ随伴ウイルス(AAV)、及び例えば遺伝子療法のためのベクターとしての使用は、Snyder,RO and Moullier,P.,Adeno-Associated Virus Methods and Protocols,Methods in Molecular Biology,Vol.807.Humana Press,2011中でも考察される。
いくつかの実施形態において、ウイルスは、AAV血清型1、2、3、3B、4、5、6、7、8、9、10、11、Anc80、またはPHP.eBである(米国特許出願第2017/0166926号中で開示され、参照することによって本明細書に援用される)。任意のAAV血清型または修飾されたAAV血清型が適宜使用され得、限定されない。
別の好適なAAVは、例えばAnc80(すなわちAnc80L65)(国際公開第2015054653)またはrhlO(国際公開第2003/042397号)であり得る。さらに他のAAV供給源としては、例えばPHP.B、PHP.S、hu37(例えば米国特許出願第7,906,111号;米国特許出願第2011/0236353号を参照)、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV6.2、AAV7、AAV8(米国特許出願第7,790,449号;米国特許出願第7,282,199号)、AAV9(米国特許出願第7,906,111号;米国特許出願第2011/0236353号)、AAVrh10、AAV-DJ、AAV-DJ/8、AAV.CAP-B10、AAV.CAP-B22、AAVMYO、及び他のものが挙げられ得る。これら及び他の好適なAAVの配列、そしてAAVベクターを生成する方法については、例えば国際公開第2003/042397号;国際公開第2005/033321号、国際公開第2006/110689号;米国特許出願第7,790,449号;米国特許出願第7,282,199号;米国特許出願第7,588,772号を参照されたい。AAVの他の例としては、表1中でリストされるものが挙げられる。さらに他のAAVは、選択されたAAVカプシドの組織優先性を任意選択で考慮に入れて選択され得る。ある特定の実施形態において、ウイルスベクター送達系は、ウイルス血清型AAV9及びPHP.eBを含む。
組み換えAAVベクター(AAVウィルス粒子)は、AAVカプシド内にパッケージングされた、5’AAV ITR、本明細書において記載される発現カセット、及び3’AAV ITRを含有する核酸分子を含み得る。本明細書において記載される時、発現カセットは各々の発現カセット内のオープンリーディングフレーム(複数可)のための調節エレメントを含有し、核酸分子は任意選択で追加の調節エレメントを含有し得る。
AAVベクターは、全長AAV 5’逆方向末端反復(ITR)及び全長3’ITRを含有し得る。AITRと称される5’ITRの短縮バージョンは記載され、それはD-配列及び末端分離部位(trs)が欠失される。「sc」という略語は、自己相補的であることを指す。「自己相補的AAV」は、組み換えAAV核酸配列によって保有されるコード領域が、分子内二本鎖DNA鋳型を形成するようにデザインされたコンストラクトを指す。感染に際して、第2鎖の細胞媒介性合成を待機するのではなく、scAAVの2つの相補的な半分は会合して、即時の複製及び転写についての準備ができている1つの二本鎖DNA(dsDNA)単位を形成するだろう。例えばD M McCarty et al,“Self-complementary recombinant adeno-associated virus(scAAV)vectors promote efficient transduction independently of DNA synthesis”,Gene Therapy,(August 2001),Vol 8,Number 16,Pages 1248-1254を参照されたい。自己相補的AAVは、例えば米国特許出願第6,596,535号;同第7,125,717号;及び同7,456,683号(その各々は、参照することによってその全体が本明細書に援用される)中で記載される。
シュードタイプAAVが産生される場合、ITRは、カプシドのAAV供給源とは異なる供給源から選択される。例えば、AAV2 ITRは、選択された細胞受容体、標的組織、またはウイルス標的についての特定の効率を有するAAVカプシドと共に使用するために選択され得る。一実施形態において、AAV2からのITR配列、またはその欠失バージョン(AITR)は、便宜上、そして規制認可を加速するために使用される。しかしながら、他のAAV供給源からのITRが選択されてもよい。ITRの供給源がAAV2からであり、AAVカプシドが別のAAV供給源からである場合、もたらされたベクターはシュードタイプであると称され得る。しかしながら、AAV ITRの他の供給源が利用されてもよい。
対象への送達に好適なAAVウイルスベクターを生成及び単離する方法は、当技術分野において公知である。例えば米国特許出願第7790449号;米国特許7282199;国際公開第2003/042397号;国際公開第2005/033321号、国際公開第2006/110689号;及び米国特許第7588772B2号を参照されたい。1つの系において、産生細胞株は、ITRが隣接する導入遺伝子をコードするコンストラクト、ならびにrep及びcapをコードするコンストラクト(複数可)により一過性にトランスフェクションされる。第2の系において、安定的にrep及びcapを供給するパッケージング細胞株は、ITRが隣接する導入遺伝子をコードするコンストラクトにより(一過性にまたは安定的に)トランスフェクションされる。これらの系の各々において、AAVビリオンは、ヘルパーアデノウイルスまたはヘルペスウイルスによる感染に応答して産生され、rAAVを混入ウイルスから分離することが要求される。より最近では、AAVを回収するためにヘルパーウイルスによる感染を要求しない系が開発されており、要求されるヘルパー機能(すなわちアデノウイルスEl、E2a、VA、E4、ヘルペスウイルスUL5、UL8、UL52、UL29、及びヘルペスウイルスポリメラーゼ)は、系によってもトランスで供給される。これらのより新しい系において、要求されるヘルパー機能をコードするコンストラクトにより細胞を一過性にトランスフェクションすることによってヘルパー機能は供給され得るか、または細胞はヘルパー機能をコードする遺伝子を安定的に含有するように操作され得、その発現は転写時にまたは転写後のレベルで制御され得る。さらに別の系において、ITRが隣接する導入遺伝子及びrep/cap遺伝子は、バキュロウイルスベースのベクターによる感染によって昆虫細胞の中へ導入される。これらの産生系の総説については、一般的には例えばZhang et al,2009,“Adenovirus- adeno-associated virus hybrid for large-scale recombinant adeno-associated virus production,”Human Gene Therapy 20:922-929(その各々の内容は、参照することによってその全体が本明細書に援用される)を参照されたい。これら及び他のAAV産生系を作製及び使用する方法は、以下の米国特許(それらの内容は、参照することによってその全体が本明細書に援用される):米国特許出願第5,139,941号;同第5,741,683号;同第6,057,152号;同第6,204,059号;同第6,268,213号;同第6,491,907号;同第6,660,514号;同第6,951,753号;同第7,094,604号;同第7,172,893号;同第7,201,898号;同第7,229,823号;及び同第7,439,065号中でも記載される。
別の実施形態において、他のウイルスベクターは使用され得、組み込み型ウイルス(例えばヘルペスウイルスまたはレンチウイルス)が挙げられるが、他のウイルスは選択され得る。好適には、これらの他のベクターのうちの1つが生成される場合、それは複製欠損ウイルスベクターとして産生される。「複製欠損ウイルス」または「ウイルスベクター」は、関心のある遺伝子を含有する発現カセットがウイルスカプシドまたはエンベロープ中にパッケージングされた合成または人工のウイルス粒子を指し、ウイルスカプシドまたはエンベロープ内にさらにパッケージングされた任意のウイルスゲノム配列は、複製欠損性であり;すなわち、それらは子孫ビリオンを生成し得ないが、標的細胞を感染させる能力を保持し得る。一実施形態において、ウイルスベクターのゲノムは、複製に要求される酵素をコードする遺伝子を含まない(ゲノムは、人工ゲノムの増幅及びパッケージングのために要求されるシグナルが隣接する関心のある導入遺伝子のみを含有する「ガットレス」であるように操作され得る)が、これらの遺伝子は産生の間に供給され得る。
1つまたは複数のウイルスは、哺乳動物細胞における発現を指令することが可能なプロモーター(哺乳動物細胞に感染する例えばサイトメガロウイルス(CMV)、レトロウイルス、シミアンウイルス(例えばSV40)、パピローマウイルス、ヘルペスウイルス、もしくは他のウイルスからの好適なウイルスプロモーター、または例えばEF1alpha、ユビキチン(例えばユビキチンBまたはC)、グロビン、アクチン、ホスホグリセレートキナーゼ(PGK)など等の遺伝子からの哺乳動物プロモーター、またはCAGプロモーター(CMV早期エンハンサーエレメント及びニワトリβアクチンプロモーターの組み合わせ)等の複合プロモーター等)を含有し得る。いくつかの実施形態において、ヒトプロモーターが使用され得る。いくつかの実施形態において、プロモーターは、特定の細胞タイプ(例えば標的とされる細胞の集団)における発現を指令する。いくつかの実施形態において、プロモーターは、本明細書において記載される任意の細胞の集団における発現を選択的に指令する。いくつかの実施形態において、プロモーターは、非サイレンシングプロモーターである。いくつかの実施形態において、プロモーターは、ニワトリβ-アクチンハイブリッド(Cbh)、CAG、CB7、及びCBAからなる群から選択される。ある特定の実施形態において、非サイレンシングプロモーターは、Cbhである。いくつかの実施形態において、非サイレンシングプロモーターは、細胞にわたって高度で長期的で均一な発現を指令する。例えば、非サイレンシングプロモーター(例えばCbh)は、CMVの少なくとも30%、40%、50%、60%、または70%で、少なくとも1、2、3、4、5、6、または7か月について継続的な発現を指令し得る。
いくつかの実施形態において、ウイルスベクターは、マイクロRNA(miRNA)標的部位を含む。いくつかの実施形態において、miRNA標的部位は、選択された組織における導入遺伝子の発現を低減またはサイレンシングさせることによって特定の組織を脱標的化するためにベクターの中へ操作されている。例えば、肝臓毒性は、ウイルスベクター内に肝臓特異的miRNA122標的部位を含むことによって低減され得る。いくつかの実施形態において、miRNA標的部位は、発現がサイレンシングまたは低減されるべき特定の組織に基づいて選択される。いくつかの実施形態において、ウイルスベクターは、肝臓特異的miRNA(例えばmiRNA-33、miRNA-223、miRNA-30c、miRNA-144、miRNA-148a、miRNA-24、miRNA-29、及びmiRNA-122)(例えばWilleit,et al.,Eur Heart J 37,3260-3266(2016)を参照)、筋肉特異的miRNA(例えばmiRNA-1及びmiRNA-133)(例えばXu et al.,J.Cell Sci.120,3045-3052(2007)を参照)、心臓特異的miRNA(例えばmiRNA-1、miRNA-133、miRNA-208a、miRNA-208b、及びmiRNA-499)(例えばXu et al.,J.Cell Sci.120,3045-3052(2007)、Chistiakov,et al.,J.Mol.Cell.Cardiol.94,107-121(2016)を参照)、及び/または脳特異的miRNA(例えばmiRNA-124及びmiRNA-128)(例えばCao,et al.,Genes Dev.21,531-536(2007);Adlakha,et al.,Molecular Cancer 13,33(2014)を参照)を含む。いくつかの実施形態において、ウイルスベクターは、miRNA-1、miRNA-24及びmiRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-124、miRNA-128、miRNA-133、miRNA-144、miRNA-148a、miRNA-208a、miRNA-208b、miRNA -223、及びmiRNA-499の群から選択されるmiRNA標的部位を含む。miRNA標的部位の追加の例は、mirbase.orgで利用可能である。Kozomara A,et al.Nucleic Acids Res 2019 47:D155-D162を参照されたい。いくつかの実施形態において、miRNA標的部位は、特異性(例えば特異的組織において他の組織よりも少なくとも10倍高く発現する)、及び/または高度に(例えば標的組織においてすべてのmiRNAの平均レベルよりも少なくとも5倍高いレベルで存在する)発現されるmiRNAである。例えば、miRNAは、FANTOM(De Rie,et al.,Nat.Biotechnol.35,872-878(2017)を参照)または当業者に公知の他のデータベースを使用して同定され得る。
いくつかの実施形態において、ウイルスベクターは、自己相補的(self comp)ベクター骨格を含む。例えば、ウイルスベクターは、コドン最適化遺伝子コーディング配列を含み得る。いくつかの態様において、自己相補的骨格を含むウイルスベクターは、発現の増加(例えば少なくとも2倍、5倍、10倍、15倍高い発現)を示す。
いくつかの実施形態において、遺伝子は、組織へ送達される任意の遺伝子である。いくつかの実施形態において、遺伝子は、単一遺伝子の疾患または障害と関連する。いくつかの実施形態において、遺伝子は、加齢関連遺伝子または老化保護遺伝子である。例えば、遺伝子は、表2中でリストされた任意の遺伝子であり得る。いくつかの実施形態において、遺伝子は、神経学的障害、腫瘍学的障害、網膜障害、筋骨格障害、血液学的障害/血液障害、感染性疾患、免疫障害などと関連する。遺伝子は、omim.orgで利用可能なOMIMデータベースを利用して同定され得る。いくつかの実施形態において、遺伝子は、Cisd2、Atg5、及びPTENからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、Cisd2遺伝子を対象へ送達するためにAAV9血清型及び/またはPHP.eB血清型を含む。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、miRNA標的部位(例えばmiRNA-122標的部位)を含む。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、非サイレンシングプロモーター(例えばCbh)を含み、任意選択で自己相補的骨格をさらに含む。
ウイルスベクター送達系は、標的組織において(例えば除脂肪、除血液体重のうちの少なくとも70%において)、野生型レベルの少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、または75%までのネイティブな遺伝子の過剰発現をもたらし得る。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、標的組織において、野生型レベルの少なくとも100%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1000%、1500%、2000%、2500%、5000%、7500%、10000%、50000%、100000%までのネイティブな遺伝子の過剰発現をもたらし得る。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、組織において、野生型レベルの約10%~90%、20%~80%、30%~70%、または40%~60%までのネイティブな遺伝子の過剰発現をもたらすネイティブな遺伝子を送達する。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、野生型レベルの少なくとも30%、または約2~50%までのネイティブな遺伝子の過剰発現をもたらす。ウイルスベクター送達系は、標的組織において(例えば除脂肪、除血液体重のうちの少なくとも70%において)、非ネイティブな遺伝子の検出可能な発現(例えば極微量発現を超える)をもたらし得る。いくつかの実施形態において、送達された遺伝子の発現は安定的で長期的である(例えば発現は、少なくとも1か月、2か月、3か月、4か月、5か月、6か月、7か月、8か月、9か月、10か月、11か月、12か月、15か月、18か月、21か月、24か月、3年、4年、5年、10年、15年、20年、30年、40年、50年、60年、70年、80年、90年間維持される)。
いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、関心のある遺伝子を、関心のある組織(例えば大動脈、内皮、心筋、骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、及び/または筋肉衛星細胞)へ送達する。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、関心のある遺伝子を、対象における関心のある複数の組織へ送達する。例えば、ウイルスベクター送達系は、関心のある遺伝子を、対象における組織のうちの少なくとも20%、30%、40%、50%または60%、70%、80%、または90%へ送達し得る。いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、遺伝子を、対象における組織のうちの約10%~90%、20%~80%、30%~70%、または40%~60%へ送達する。ウイルスベクター送達系は、対象内の複数の組織にわたって、遺伝子の均一または限定された変動の送達を提供し得る。
本発明のいくつかの実施形態は、有効量の本明細書において記載されるウイルスベクター送達系を含む医薬組成物の送達によって疾患または病態(加齢関連の疾患または障害等)の治療または予防の方法に関する。医薬組成物の有効量は、組成物が投与される対象における疾患または障害を、予防、遅延、阻害、または寛解するのに十分な量である。いくつかの実施形態において、有効量の本明細書において記載されるウイルスベクター送達系を含む医薬組成物の送達は、対象の平均余命または寿命を延長する。
いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、対象へ投与される。ウイルスベクター送達系は、遺伝子を、対象へ(例えば対象の1つまたは複数の組織へ)送達し得る。いくつかの実施形態において、対象が家族歴または遺伝子解析に基づいて疾患または障害を患うことが期待されるが、対象は現在疾患または障害を患っていない。いくつかの実施形態において、対象は、疾患または障害を患っている。いくつかの実施形態において、対象は、有効量の活性のあるCisd2を欠如する。例えば、Cisd2遺伝子は、対象において突然変異され得るかまたはそうでなければ不活性され得る。遺伝子は、対象における疾患または障害を治療または寛解するために、ウイルスベクター送達系を使用して送達され得る。
本明細書において使用される時、「対象」は、ヒトまたは動物を意味する。通常、動物は、脊椎動物(霊長動物、齧歯動物、飼育動物、または競技動物等)である。霊長動物としては、チンパンジー、カニクイザル、クモザル、及びマカク(例えばアカゲザル)が挙げられる。齧歯動物としては、マウス、ラット、ヤマネズミ、フェレット、ウサギ、及びハムスターが挙げられる。飼育動物及びゲーム動物としては、ウシ、ウマ、ブタ、シカ、バイソン、バッファロー、ネコ科の種(例えばイエネコ)、イヌ科の種(例えばイヌ、キツネ、オオカミ)、トリの種(例えばニワトリ、エミュー、ダチョウ)、及び魚類(例えばマス、ナマズ、及びサケ)が挙げられる。患者または対象としては、上記のもののうちの任意のサブセット(例えば上記のもののすべてであるが、1つまたは複数の群または種(ヒト、霊長動物、または齧歯動物等)を除外する)が挙げられる。ある特定の実施形態において、対象は、哺乳動物(例えば霊長動物、例えばヒト)である。「患者」、「個体」、及び「対象」という用語は、本明細書において互換的に使用される。好ましくは、対象は哺乳動物である。哺乳動物は、ヒト、非ヒト霊長動物、マウス、ラット、イヌ、ネコ、ウマ、またはウシであり得るが、これらの例に限定されない。加えて、本明細書において記載される方法は、飼育動物及び/またはペットを治療するために使用され得る。対象は、オスまたはメスであり得る。対象は、治療を必要とする病態またはかかる病態に関連する1つもしくは複数の合併症を患うかまたは有すると以前に診断されたかまたは同定されたものであり得、任意選択あるが、病態または病態に関連する1つもしくは複数の合併症のための治療を既に受けている必要はない。代替的に、対象は、治療を必要とする病態またはかかる病態に関連する1つもしくは複数の合併症を有していると以前に診断されていないものでもあり得る。むしろ、対象としては、病態または病態へ関連する1つもしくは複数の合併症についての1つまたは複数のリスク因子を示すものが挙げられ得る。特定の病態のための治療を「必要とする対象」は、その病態を有するか、その条件を有すると診断されたか、または与えられた参照集団に比べてその病態を発症するリスクが増加した対象であり得る。
本明細書において使用される時、「治療する」、「治療」、「治療すること」、または「寛解」は、疾患、障害、または医学的病態を参照して使用される場合に、病態についての治療処置を指し、目的は、症状または病態の進行または重症度を、予防、好転、軽減、寛解、阻害、遅延、または停止することである。「治療すること」という用語は、病態の少なくとも1つの有害作用または症状を低減または軽減することを包含する。1つまたは複数の症状または臨床マーカーが低減したならば、治療は一般的に「有効」である。代替的に、病態の進行が低減または停止されるならば、治療は「有効」である。すなわち、「治療」は、症状またはマーカーの改善だけでなく、また治療の非存在下において期待される症状の中断または少なくとも進行もしくは悪化の遅延も包含する。有益なまたは所望される臨床結果としては、治療の非存在において期待されるものに比較して、1つまたは複数の症状(複数可)の軽減、欠陥の程度の縮小、安定化された(すなわち悪化しない)状態が挙げられるがこれらに限定されない。
いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系は、免疫学的目的のために(例えばワクチン接種または耐性誘導のために)投与される。
障害または疾患についての所与の治療の有効性は、熟練した臨床医によって決定され得る。しかしながら、治療は、当該用語が本明細書において使用される時、本明細書において記載される薬剤または組成物による治療に続いて、障害の徴候または症状のうちの任意の1つまたはすべてが有益な様式で変更されるか、他の臨床的に許容される症状が例えば少なくとも10%改善または寛解されるならば、「有効な治療」であると判断される。有効性は、個体の入院によって査定されるように悪化しないこと、または医療介入を必要としない(すなわち、疾患の進行は停止する)ことによっても測定され得る。これらの指標を測定する方法は、当業者に公知である、及び/または本明細書において記載される。
本発明の方法によれば、治療は、1つまたは複数の組織を本発明に記載の組成物と接触させることを含む。投与経路は変動し、例えば皮内、経皮、非経口、静脈内、筋肉内、鼻腔内、皮下、局所的、経皮、気管内、腹腔内、動脈内、膀胱内、眼内、腫瘍内、吸入、灌流、洗浄、及び経口的な投与及び製剤が挙げられるだろう。治療レジメンは同様に変動し、多くの場合、疾患タイプ、疾患所在位置、疾患進行、及び患者の健康及び年齢に依存し得る。
治療は、所定の量の治療組成物を含有しているとして定義された様々な「単位用量」を包含し得る。投与される量、ならびに特定の経路及び製剤は、臨床技術分野の当業者の技能内である。単位用量を単回注射として投与する必要がないが、規定された期間にわたる連続注入を含み得る。薬剤のための投薬量範囲は効力に依存し、所望される効果を産生するのに十分多い量である。投薬量は、許容できない有害な副作用を引き起こすほど多くするべきでない。
障害または疾患についての所与の治療の有効性は、熟練した臨床医によって決定され得る。しかしながら、治療は、当該用語が本明細書において使用される時、本明細書において記載される薬剤または組成物による治療に続いて、障害の徴候または症状のうちの任意の1つまたはすべてが有益な様式で変更されるか、他の臨床的に許容される症状が例えば少なくとも10%改善または寛解されるならば、「有効な治療」であると判断される。有効性は、個体の入院によって査定されるように悪化しないこと、または医療介入を必要としない(すなわち、疾患の進行は停止する)ことによっても測定され得る。これらの指標を測定する方法は、当業者に公知である、及び/または本明細書において記載される。
本明細書において開示される医薬組成物は、米国特許出願第5,543,158号;同第5,641,515号、及び同第5,399,363号中で記載されるように、腫瘍内、非経口的、静脈内、皮内、筋肉内、経皮的、または腹腔内でさえ投与され得る。
ウイルスベクター送達系の注射は、発現コンストラクトが注射のために要求される針の特定のゲージを介して通過することができ、投薬量が要求されるレベルの精度により投与され得る限り、シリンジまたは溶液の注射のために使用される他の方法によって送達され得る。
水溶液中の非経口投与のために、例えば溶液は必要であるならば好適に緩衝され、液体希釈物質は最初に十分な食塩水またはグルコースにより等張にされるべきである。これらの特定の水溶液は、静脈内、筋肉内、皮下、腫瘍内、及び腹腔内の投与に特に好適である。これに関連して、用いられ得る滅菌済み水性溶媒は、本開示に照らして当業者に公知であろう。例えば、1つの投薬量は1mlのNaCl等張溶液中で溶解され、1000mlの皮下注入液へ添加されるか、または点滴の提案された部位で注射されるかのいずれかである(例えば“Remington’s Pharmaceutical Sciences”第15版、ページ1035-1038及び1570-1580を参照)。投薬量のいくらかの変動が、治療されている対象の病態に依存して必然的に起こるだろう。投与のための担当者は、どんな場合も、個別の対象のために適切な用量を決定するだろう。さらにヒト投与のために、調製物は、FDA Office of Biologics基準によって要求される、滅菌性、発熱性、一般的な安全性、及び純度基準を満たすべきである。
「薬学的に許容される」または「薬理学的に許容される」という語句は、対象へ投与された場合に、アレルギー性反応または類似する有害反応を産生しない分子的実体及び組成物を指す。本明細書において使用される時、「担体」としては、任意の及びすべての溶媒、分散媒質、ビヒクル、コーティング、希釈物質、抗菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤、バッファー、担体溶液、懸濁物、コロイド、ならびに同種のものが挙げられる。薬学的に活性のある物質のためのかかる媒質及び薬剤の使用は、当技術分野において周知である。任意の従来の媒質または薬剤がウイルス剤と適合性がない場合を除いて、治療組成物中での使用が企図される。補足の活性成分も組成物の中へ取り込まれ得る。
いくつかの実施形態において、方法は、本明細書において記載される医薬組成物を、有益な1つまたは複数の追加の薬剤、生物製剤、薬物、または治療と共に、障害または疾患を患う対象へ投与することをさらに含む。
いくつかの実施形態において、ウイルスベクター送達系、またはウイルスベクター送達系を含む医薬組成物は、疾患または病態を治療するために対象へ投与される。疾患または病態は、加齢関連の疾患または病態であり得る。いくつかの実施形態において、疾患または病態は、早老症候群(例えばハッチンソン・ギルフォード早老症候群(HGPS)、ウォルフラム症候群(例えばIまたはII型ウォルフラム症候群)、ウェルナー症候群、コケイン症候群、1型筋緊張性ジストロフィー、MDPL症候群、先天性角化異常症障害など)、結合組織異常(例えばマルファン症候群、ロイス・ディーツ症候群、エーラス・ダンロス症候群、骨形成不全症など)、代謝障害(例えばメチルマロン酸血、ウィルソン病など)、腫瘍抑制因子及びDNA複製の欠損障害(例えばPTEN病(カウデン症候群、プロテウス様症候群)、ブルーム症候群、RAS病(ヌーナン症候群、コステロ症候群))、神経変性障害(例えばアルツハイマー病、認知症、軽度の認知機能の減退など)、神経血管障害(例えば脳卒中)、骨格筋病態(例えばサルコペニア、フレイル)、カウデン症候群、バナヤン・ライリー・ルバルカバ症候群、プロテウス症候群、プロテウス様症候群、及び他のPTEN病、ウェルナー症候群、ブルーム症候群、ロスムンド・トムソン症候群、コケイン症候群、色素性乾皮症、硫黄欠乏性毛髪発育異常症、色素性乾皮症・コケイン症候群の合併型、拘束性皮膚障害、糖尿病、肥満、心血管性疾患、がん、眼の変性、肝不全、ならびに加齢黄斑変性症である。Schnabel,F.,et al.,Premature aging disorders:A clinical and genetic compendium.Clinical Genetics 99,3-28(2020);Rigoli,L,.et al.,Wolfram syndrome 1 and Wolfram syndrome 2.Curr.Opin.Pediatr.24,1(2012);Keane,M.G.,et al.,Medical management of marfan syndrome.Circulation 117,2802-2813(2008);MacCarrick,G.et al.,Loeys-Dietz syndrome:A primer for diagnosis and management.Genet.Med.16,576-587(2014);Mao,J.R.et al.,The Ehlers-Danlos syndrome:On beyond collagens.Journal of Clinical Investigation 107,1063-1069(2001);van Dijk,F.S.et al.,Osteogenesis Imperfecta:A Review with Clinical Examples.Mol.Syndromol.2,1-20(2011);Yehia,L.,et al.,PTEN-opathies:from biological insights to evidence-based precision medicine.J.Clin.Invest.129,452-464(2019);Cunniff,C.,et al.,Bloom’s Syndrome:Clinical Spectrum,Molecular Pathogenesis,and Cancer Predisposition.Mol.Syndromol.8,4-23(2017);及びRauen,K.A.The RASopathies.Annu.Rev.Genomics Hum.Genet.14,355-369(2013)を参照されたい。対象は、2つ以上のタイプの組織への遺伝子の投与から利益を得る任意の疾患または病態を患い得る。
いくつかの実施形態において、神経変性障害は、ポリグルタミン伸長障害(例えばHD、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮、ケネディ病(球脊髄性筋萎縮症とも称される)、脊髄小脳性運動失調(例えば1型、2型、3型(マシャド・ジョセフ病とも称される)、6型、7型、及び17型))、他のトリヌクレオチド反復伸長障害(例えば脆弱X症候群、脆弱XE精神遅滞、フリードライヒ運動失調症、筋緊張性ジストロフィー、8型脊髄小脳性運動失調、及び12型脊髄小脳性運動失調)、アレキサンダー病、アルパー病(Alper’s disease)、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、毛細血管拡張性運動失調症、バッテン病(シュピールマイアー・フォークト・シェーグレン・バッテン病をとも称される)、カナバン病、コケイン症候群、大脳皮質基底核変性症、クロイツフェルト・ヤコブ病、ギラン・バレー症候群、虚血脳卒中、クラッベ病、クールー、レビー小体型認知症、多発性硬化症、多系統萎縮症、非ハンチントン様型の舞踏病(non-Huntingtonian type of Chorea)、パーキンソン病、ペリツェウス・メルツバッハー病、ピック病、原発性側索硬化、進行性核上性麻痺、レフサム病、サンドホフ病、シルダー病、脊髄損傷、脊髄筋萎縮症(SMA)、スティール・リチャードソン・オルゼウスキー病、及び脊髄癆のうちの1つである。
いくつかの実施形態において、神経血管障害は、脳アテローム血栓症、脳動脈瘤、脳動静脈奇形、脳塞栓症、脳虚血(例えばアテローム血栓症、塞栓症、または血行動態的異常によって引き起こされる)、心停止、頸動脈狭窄症、脳血管攣縮、頭痛、頭蓋内出血、虚血性脳卒中、痙攣、脊髄血管奇形、反射性交感性ジストロフィー(RND)、神経血管圧迫障害(片側顔面痙攣等)、響鳴、三叉神経痛、舌咽神経痛、脳卒中、一過性脳虚血発作、及び血管炎からなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、骨格筋病態は、萎縮、筋肉消耗または衰弱と関連する骨折、悪液質、除神経、糖尿病、ジストロフィー、運動誘発性骨格筋疲労、疲労、フレイル、炎症性筋炎、メタボリック症候群、神経筋疾患、肥満、外科手術後筋肉衰弱、外傷後筋肉衰弱、サルコペニア、毒素曝露、消耗、及び衰弱からなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、ベクター送達系、またはベクター送達系を含む医薬組成物は、対象へ投与される(例えば静脈内に)。ベクター送達系は、突然変異したCisd2と関連する疾患または病態(例えばII型ウォルフラム症候群、または関連する病態、すなわち視覚の喪失または白内障、糖尿病、聴覚障害、腎不全など)を治療するために、遺伝子(例えばCisd2)を対象へ送達し得る。
本開示の実施形態の記載は、網羅的であるとか、または開示された正確な形態へ本開示を限定するとは意図されない。本開示の具体的な実施形態及び例は、例示の目的のために本明細書において記載されるが、当業者が認識するように、様々な同等の修飾は本開示の範囲内で可能である。例えば、方法の工程または機能は所与の順において提示されているが、代替の実施形態は異なる順序で機能を実行することができるか、または機能を実質的に同時に実行することができる。本明細書において提供される本開示の教示は、他の手順または方法へ適宜適用され得る。本明細書において記載される様々な実施形態を組み合わせて、さらなる実施形態が提供され得る。本開示の態様は、上記の参照文献及び出願の組成物、機能、及び概念を用いるために、必要であるならば修飾されて、本開示のなおさらなる実施形態を提供することができる。これら及び他の変化は、発明を実施するための形態に照らして本開示へ行われ得る。
前述の実施形態の任意の具体的な要素は、組み合わせられ得るか、または他の実施形態における要素を置換し得る。さらに、本開示のある特定の実施形態と関連する利点が、これらの実施形態の文脈中で記載されているが、他の実施形態もかかる利点を示してもよく、すべての実施形態は必ずしも本開示の範囲以内に入るように、かかる利点を示す必要があるとは限らない。
すべての特許及び同定された他の出版物は、例えば本発明と関連して使用され得るかかる出版物中で記載される方法論を記載及び開示する目的のために参照することによって、明示的に本明細書に援用される。これらの出版物は、本出願の出願日の前のそれらの開示のためのみに提供される。この点に関して、本発明者らが、先行発明もしくは先行出版物のおかげでまたは他の理由で、かかる開示に先行する権利がないことの承認として解釈されるべきではない。これらの文書の日付についてのすべての記述または内容についての描写は、本出願人に利用可能な情報に基づいているが、これらの文書の日付または内容の正確さについての承認を構成しない。
当業者は、本発明が、目的を実行し、言及された結果及び利点、そして本発明に固有のものを得るために良く適合することを容易に認識する。本明細書における記載の詳細及び実施例は、ある特定の実施形態を代表し、例示的であり、本発明の範囲に対する限定として意図されない。本明細書における修飾及び他の使用は、当業者に思い浮かぶだろう。これらの修飾は、本発明の趣旨内に網羅される。本発明の範囲及び趣旨から逸脱せずに、本明細書において開示される本発明へ変動する置換及び修飾が行われ得ることは、当業者に容易に明らかであろう。
「a」及び「an」という冠詞は、本明細書において使用される時、明細書及び特許請求の範囲中で、相反することが明確に指摘されない限り、複数の指示物を包含するように理解されるべきである。群の1つまたは複数のメンバーの間に「または」を含む請求項または記載は、相反することが指摘されない限り、またはそうでなければ文脈から明白ではない限り、群のメンバーのうちの1つ、1つを超える、またはすべてが、所与の産物またはプロセスにおいて存在するか、用いられるか、またはさもなければ関連しているならば、満たされていると判断される。本発明は、群の正確に1つのメンバーが、所与の産物またはプロセスにおいて存在するか、用いられるか、またはさもなければ関連している実施形態を包含する。本発明は、群の1つを超える、またはすべてのメンバーが、所与の産物またはプロセスにおいて存在するか、用いられるか、またはさもなければ関連している実施形態も包含する。さらに、本発明は、すべての変動、組み合わせ、及び順列を提供することを理解すべきであり、ここで、リストされた請求項のうちの1つまたは複数からの1つまたは複数の限定、要素、条項、記述用語などは、別段指摘されない限り、または矛盾もしくは不一致が生じるであろうことが当業者に明白でない限り、同じ基本請求項(または関連すれば、任意の他の請求項)に依存して、別の請求項の中へ導入される。本明細書において記載されるすべての実施形態は、適切な場合、本発明のすべての異なる態様へ適用可能であることが企図される。実施形態または態様のうちの任意のものは、適切な場合は常に、1つまたは複数の他のかかる実施形態または態様と自由に組み合わせられ得ることも企図される。要素が、例えばマーカッシュ群または類似のフォーマットでリストとして提示される場合、要素の各々の亜群も開示され、任意の要素(複数可)は群から除去され得ることが理解されるべきである。概して、本発明、または本発明の態様が、特定の要素、特色などを含むとして言及される場合、本発明のある特定の実施形態または本発明の態様は、かかる要素、特色などからなるか、または本質的になることが理解されるべきである。単純性の目的のために、これらの実施形態は、すべての事例において、本明細書において非常に多くの言葉で具体的には説明されてこなかった。特定の除外が明細書において列挙されるかどうかにかかわらず、本発明の任意の実施形態または態様は、特許請求の範囲から明示的に除外され得ることも理解されるべきである。例えば、任意の1つまたは複数の活性剤、添加物、成分、任意選択の薬剤、生物体のタイプ、障害、対象、またはそれらの組み合わせが除外され得る。
請求項または記載が物質の組成物に関する場合、別段指摘されない限り、または矛盾もしくは不一致が生じるであろうことが当業者に明白でない限り、本明細書において開示される方法のうちの任意のものに従って主題の組成物を作製または使用する方法、及び本明細書において開示される目的のうちの任意のもののために主題の組成物を使用する方法は、本発明の態様であることが理解されるべきである。請求項または記載が方法に関する場合、別段指摘されない限り、または矛盾もしくは不一致が生じるであろうことが当業者に明白でない限り、例えば方法の遂行のために有用な組成物を作製する方法、及び方法に従って産生された産物は、本発明の態様であることが理解されるべきである。
範囲が本明細書において与えられる場合、本発明は、エンドポイントが含まれる実施形態、両方のエンドポイントが除外される実施形態、及び1つのエンドポイントが含まれ、他のエンドポイントが除外される実施形態を包含する。別段指摘されない限り、両方のエンドポイントが含まれていることが想定されるべきである。さらに、別段指摘されない限り、またはそうでなければ文脈及び当業者の理解から明白でない限り、範囲として表現される値は、別段文脈が明確に定めない限り、範囲の下限の単位の10分の1まで、本発明の異なる実施形態において述べられた範囲内の任意の特定の値または部分範囲をとり得ることが理解されるべきである。1シリーズの数値が本明細書において述べられる場合、本発明は、任意の間に入る値、または当該シリーズ中の任意の2つの値によって定義された範囲に相似して関連する実施形態を含み、最小値は最小と見なされ得、最大値は最大として見なされ得ることも理解される。数値は、本明細書において使用される時、パーセンテージとして表現される値を含む。数値が「約」または「およそ」によって前置きされる本発明の任意の実施形態について、本発明は、正確な値が列挙される実施形態を包含する。数値が「約」または「およそ」によって前置きされない本発明の任意の実施形態について、本発明は、値が「約」または「およそ」によって前置きされる実施形態を包含する。
「およそ」または「約」は、概して、別段述べられない限り、またはそうでなければ文脈から明白でない限り(かかる数が、可能な値の100%を許容されないほど越える場合を除いて)、いずれかの方向(その数を超えるかまたはそれ未満)において、1%の範囲内、またはいくつかの実施形態において、数の5%の範囲内、またはいくつかの実施形態において、数の10%の範囲内に入る数を包含する。相反することが明確に指摘されない限り、2つ以上の行為を含む本明細書において請求される任意の方法において、方法の行為の順序は、必ずしも方法の行為が列挙される順序へ限定されないが、本発明は、順序がそのように限定された実施形態を包含することが理解されるべきである。別段指摘されない限り、または文脈から明白でない限り、本明細書において記載される任意の産物または組成物は、「単離された」と判断され得ることも理解されるべきである。
実施例1:加齢は、今日最も厄介な疾患における単一の最大の因子である。現在のヘルスケアシステムの主な関心事は、糖尿病、肥満、心血管性疾患、がん、フレイル、加齢黄斑変性症、及び神経変性疾患である。それらのすべては、共通且つ最大のリスク因子として高齢を共有する[1]。現在医学における支配的なパラダイムは、これらの疾患が現われた後に個別に治療し、複数の治療形式を介して症状を管理し続けることである。しかしながら、ほとんどの加齢した患者は決して回復せず、その代りに高齢に伴ってさらなる罹患率を生じ、そのすべては慣性的な治療を要求するので、これは悪化する戦いである。現在平均的な患者は、数十年間複数の慢性疾患について治療されており、多くの場合その患者の医療システムへの生涯の貢献よりもかなり高い費用である[2]。これは持続可能ではない。
加齢の生物学の基礎的研究から、マウスにおいて寿命に影響を及ぼす50を上回る遺伝子が同定された[3]。これらの知見に基づいて、保存された加齢経路(例えばタンパク質恒常性、オートファジー、インスリン-IGFシグナリング、ミトコンドリア代謝、及び他の経路)を、全身性レベルで標的化する、新しいクラスの薬物用語老化保護物質(geroprotector)が浮上してきた。過去5年にわたって数及び投資が爆発的に成長し、現在200を上回る異なる薬物が存在する[4]。
これらの薬物は、それらの源で加齢関連疾患を予防することに向けた重要な第1のステップであり、今後もおそらく大きな患者集団を抱えるだろう。しかしながら、小分子薬物は、基本的に3つの態様に起因して老化保護物質としては限定されている。第一に、これらは副作用を有する。副作用は、標的の摂動が望まれない組織における標的外の効果及び本来の標的の効果によって引き起こされる。他の薬物についての副作用は忍容されるが、これらの薬物は健康な人々を治療することが期待され、したがってそれらの使用を正当化するには、非常に軽度の副作用(たとえあったとしても)でなければならないだろう。第二に、それらは継続的で生涯にわたる投与を要求する。これは安い薬物(メトホルミン等)にとっては可能であり得るが、他に多くのものについては、これは法外に経費がかかるか、または扱いにくい(例えば注射を要求する薬物で)。最後に、これらの薬物は、標的の機能を遺伝子による方法を介して可能な限り完全には乱すことができないので、限定された有効性しか達成し得ない。
したがって、加齢関連疾患の予防を目的とする成功した治療法は、長時間作用し、組織特異的であり、細胞内ネットワークを正確に完全に乱すことが可能であることが必要である。これは、小分子薬物または生物製剤により達成可能ではないが、遺伝子療法により達成可能である。実際、遺伝子療法は、これらの要求性を満たす長期的に実行可能な唯一の方法であるように思われる。
遺伝子療法は、早老症の治療のための主な候補でもある。1つのかかる疾患の例はII型ウォルフラム症候群であり、糖尿病、聴覚障害、白内障、視覚及び聴覚の喪失、視神経の萎縮、腎臓及び胃腸の不全、ならびに多数の他の健康問題を特徴とする早老症であり、約30年の平均寿命である[5、6]。II型ウォルフラム症候群は、Cisd2(ミトコンドリア膜及び小胞体(ER)中で活性のある小さなタンパク質)におけるホモ接合の機能喪失突然変異によって引き起こされることが見出された[7、8]。マウスにおけるCisd2喪失は寿命の減少を導き、大部分のヒトのII型ウォルフラム症候群の症状の表現型をコピーする(図1A~1B)[9]。Cisd2のレベルはマウスにおいて加齢とともに減少する[9]が、Cisd2の過剰発現は、マウス(図1A)[10]及びおそらくヒト[7、11]において、健康及び寿命を増加させる。それゆえ、Cisd2遺伝子療法は、II型ウォルフラム症候群の可能性のある治療及び母集団全体の健康でいる期間を増加させる老化保護物質の両方である。
要約すると、老化保護物質としての小分子薬物の限界、早老症の治療についての必要性、ならびに加齢関連疾患の負担の増加、加齢の生物学の知識及び投資の増加、及びアデノ随伴ウイルス(AAV)の効率及び費用対有効性の増加についての現在の主な傾向を考慮して、AAVベースの老化保護遺伝子療法は、医療の主要な部分になる予定である。
DAEUS、及び現在の遺伝子療法の方法の欠点
様々な遺伝子療法の方法から、アデノ随伴ウイルス(AAV)は非常に有効であり、一般的に使用されるベクターである。AAVからの、研究及び新規臨床試験の両方において最も一般的に使用されるベクターのうちの1つは、一本鎖AAV9ベースのベクター(ssAAV9)である。これは、ssAAV9が高力価で産生され得、身体の様々な組織に形質導入され得るからであり、肝臓においてある最も高く、脳において最も低く(約100~1000倍)発現される。現在新しく操作され見出されたAAV血清型が相次いでいるが、新しいベクターは、産生することがより困難である(Anc80)か、または特異的組織のみに有効である(PHP.B)のいずれかであるので、ssAAV9は依然として選択される方法であった。AAV9に類似して、他の現在存在するAAV血清型は、様々な組織間で高度に変動する遺伝子導入レベルをもたらす。ssAAV9がいくつかの適用のためには十分であるが、それらを組織の幅広いセットへの遺伝子送達を要求する老化の研究のために使用する試みは、それらがこの目的のために好適でないことを直ちに示す。経験的には、複数の老化保護遺伝子について、最適化されたssAAV9ベクターでさえ(図2A)、加齢したマウスにおいて、全く過剰発現しないかまたは中等度の過剰発現しかもたらさず、組織間変動性が高い(図2B~2D)ことが見出された。この観察そして組織間の変動性の高さは、複数の他の人々によって報告されている(図3~4)[12、13]。このことは、加齢研究及び治療物質においてAAVを使用することへの重大な障害を示し、その結果として、AAVを加齢研究のために使用する3つの論文のみがこれまでに出版されたようであり、そのすべては、長期発現を要求しない遺伝子、または分泌され得る遺伝子、または限られた組織において研究された遺伝子に限定された。
様々な遺伝子療法の方法から、アデノ随伴ウイルス(AAV)は非常に有効であり、一般的に使用されるベクターである。AAVからの、研究及び新規臨床試験の両方において最も一般的に使用されるベクターのうちの1つは、一本鎖AAV9ベースのベクター(ssAAV9)である。これは、ssAAV9が高力価で産生され得、身体の様々な組織に形質導入され得るからであり、肝臓においてある最も高く、脳において最も低く(約100~1000倍)発現される。現在新しく操作され見出されたAAV血清型が相次いでいるが、新しいベクターは、産生することがより困難である(Anc80)か、または特異的組織のみに有効である(PHP.B)のいずれかであるので、ssAAV9は依然として選択される方法であった。AAV9に類似して、他の現在存在するAAV血清型は、様々な組織間で高度に変動する遺伝子導入レベルをもたらす。ssAAV9がいくつかの適用のためには十分であるが、それらを組織の幅広いセットへの遺伝子送達を要求する老化の研究のために使用する試みは、それらがこの目的のために好適でないことを直ちに示す。経験的には、複数の老化保護遺伝子について、最適化されたssAAV9ベクターでさえ(図2A)、加齢したマウスにおいて、全く過剰発現しないかまたは中等度の過剰発現しかもたらさず、組織間変動性が高い(図2B~2D)ことが見出された。この観察そして組織間の変動性の高さは、複数の他の人々によって報告されている(図3~4)[12、13]。このことは、加齢研究及び治療物質においてAAVを使用することへの重大な障害を示し、その結果として、AAVを加齢研究のために使用する3つの論文のみがこれまでに出版されたようであり、そのすべては、長期発現を要求しない遺伝子、または分泌され得る遺伝子、または限られた組織において研究された遺伝子に限定された。
加齢に関与する大部分の遺伝子を効果的に送達するためにAAVの使用を一般化するには、多数の技術の進歩が必要であった。第一に、加齢は全身に影響するので、単一または少数の組織ではなく、身体の大部分の組織の中へ遺伝子を送達できることが必要である。第二に、遺伝子発現は、数桁の規模の変動ではなく、これらの組織にわたって均一でなくてはならない。第三に、遺伝子発現は、長期的且つ安定的でなくてはならない。第四に、発現は、野生型レベルを超える過剰発現を達成するために強力且つ効率的でなくてはならない(大部分の遺伝子療法は、発現を野生型レベルのほんの一部のみまで回復させる)。最後に、遺伝子発現は、個別の細胞間で一様に分布しなければならない(ssAAV9ベクターによるように高い細胞間変動を有しているのではなく)。
5年にわたる試験及び開発を複数回繰り返し、2つの研究室からの資料を組み合わせた後に、これらの要求性を満たす系:DAEUS(均一な全身性の発現のための異なるAAV発現系)が開発された。これを達成するために、DAEUSは、自己相補的ベクター骨格、2つ以上のAAV血清型、1つまたは複数のマイクロRNA標的部位、及び強力な非サイレンシングプロモーターを使用して、新たにデザインされたベクターアーキテクチャを用いる。具体的には、一実施例において、DAEUSは、高く長期的且つ細胞にわたって均一な発現を提供するためのニワトリβ-アクチンハイブリッド(Cbh)プロモーター、肝臓における発現を正規化するための肝臓特異的マイクロRNA 122標的配列、発現をさらに増加させるためのコドン最適化遺伝子コーディング配列、及び身体の大部分の組織へ遺伝子を同時に送達するための2つのウイルス血清型(AAV9及びPHP.eB)を使用する(図5A)。もたらされたDAEUS系は、それらの構成要素AAV9及びPHP.eB単独とは異なり、身体の主要な組織にわたって均一な遺伝子導入及び遺伝子発現を提供した(図5B~5C)。miRNA標的部位は、望まれない組織における高すぎる発現を弱めるために含まれる。特に、弱められていないssAAV9ベクターによる実験では、アラニントランスアミナーゼ(ALT)レベル上昇から明らかな肝臓毒性が実証されたので、肝臓特異的miRNA122標的部位を含めた(図6A)。miR-122標的部位の添加は、より強力なベクターの使用にもかかわらず毒性を減少させた(図6B)。さらに、Cbhプロモーター及びmiR122標的部位を含有する最適化された自己相補的骨格でさえ、単一の血清型単独を使用する実験は、非常に不均等または不十分な発現を示したので、少なくとも2つの血清型(AAV9及びPHP.eB)を含めた(図5B~5C、図7~9)。これとは対照的に、DAEUSを使用すると、加齢した野生型マウスにおける複数の老化保護遺伝子のかなり均一な高レベル且つ長期的な過剰発現が実証された(図7~9)。
DAEUSを使用する、定義されたレベルの遺伝子導入及び導入遺伝子発現の達成
最適な治療有効性を達成するために、多くの場合、様々な組織にわたる定義されたレベルの導入遺伝子発現が要求される。本明細書において記載される方法は、DAEUS(場合によってはベクターゲノム上のmiRNA標的部位(miR122標的部位、miR182標的部位など等)と併用して、単一のカクテル中の複数の異なるAAV血清型(AAV9、PHP.eB、AAV8、AAV2など等)からなる)を用いて、身体の複数の組織にわたる遺伝子導入及び発現の標的レベルを達成する。
最適な治療有効性を達成するために、多くの場合、様々な組織にわたる定義されたレベルの導入遺伝子発現が要求される。本明細書において記載される方法は、DAEUS(場合によってはベクターゲノム上のmiRNA標的部位(miR122標的部位、miR182標的部位など等)と併用して、単一のカクテル中の複数の異なるAAV血清型(AAV9、PHP.eB、AAV8、AAV2など等)からなる)を用いて、身体の複数の組織にわたる遺伝子導入及び発現の標的レベルを達成する。
標的種の対象において定義されたパターンの遺伝子導入及び遺伝子発現を達成するために、特異的AAV血清型の注射された用量と、RNA及び/またはタンパク質のレベルでのもたらされた遺伝子導入レベル及び遺伝子発現との間の関係性の第1の基準の曲線を生成する。これを達成するために、標的種の個体に、1kgあたり1e10~1e18のAAVベクターゲノムコピー(GC)の間の範囲の用量で特異的AAV血清型を注射し、RNA及び/またはタンパク質のレベルでのもたらされた遺伝子導入及び遺伝子発現を測定する。このプロセスを、AAVカクテル中で使用されるすべての血清型について単独で反復する。このプロセスを、使用されたすべてのmiRNA標的部位についても反復する。追加で、このプロセスを、使用された各々のペアのAAV血清型について反復して、可能な相互作用効果を推定する。
本明細書において、遺伝子導入は、標的組織中の宿主細胞核ゲノムDNAあたりのAAVベクターゲノムDNAとして定義される。RNA発現は、次世代シーケンシングに基づいて100万あたりの導入遺伝子RNAカウントとして、または標的組織における逆定量PCRもしくは他の定量的RNAアッセイによって決定される宿主のハウスキーピング遺伝子レベルに対して正規化された導入遺伝子RNAレベルとして、定義される。タンパク質発現は、ウエスタンブロット、シンプルウエスタン、ELISA、または標的組織における他の定量的タンパク質発現アッセイによってアッセイされるような、インプットした組織の重量、全タンパク質、またはハウスキーピング遺伝子のタンパク質レベルへの正規化された導入遺伝子タンパク質発現のレベルとして定義される。
これらのデータから、線形回帰法または非線形回帰法を各々の標的組織について使用して、AAV用量vs遺伝子導入及び遺伝子発現の基準の用量応答曲線を推定する。最終的に、各々の標的組織について、回帰から導出された等式は、使用されたすべてのAAV血清型及びmiRNA標的部位について、相互作用項を含んで合計され、1セットの等式からなるモデルが提供され、そのことにより、カクテル中で使用されるAAV血清型の個別の用量の予測が、遺伝子導入及び遺伝子発現パターンの標的レベルを達成することを可能にする。任意の標的種、標的組織、AAV血清型、及びmiRNA標的部位が、この方法で任意選択で使用され得る。
上で記載される方法に基づいて、ハツカネズミ(Mus musculus)の脳、前脛骨筋、心臓、肝臓、ならびに他の器官及び組織における遺伝子導入の標的レベルを達成するためのプロトタイプ装置を設計した。この目的のために、血清型AAV9及びPHP.eBならびにmiR122標的部位を用いるDAEUS系の一実施形態を使用した。
5週齢のオスのC57BL6-Jマウスに、以下の血清型及び組み合わせ:
1)scAAV9-Cbh-GFP-miR122、
2)scAAV9-Cbh-GFP-miRScr(配列中、miRNA標的部位をスクランブル化して、その機能を除去した);
3)scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122;
4)scAAV9-Cbh-GFP-miRScrと一緒にscPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
を、1群あたりN=3のマウスで、およそ1kgあたり5e12、2e13、5e13、及び2e14のAAVベクターゲノムの用量で注射した。
1)scAAV9-Cbh-GFP-miR122、
2)scAAV9-Cbh-GFP-miRScr(配列中、miRNA標的部位をスクランブル化して、その機能を除去した);
3)scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122;
4)scAAV9-Cbh-GFP-miRScrと一緒にscPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
を、1群あたりN=3のマウスで、およそ1kgあたり5e12、2e13、5e13、及び2e14のAAVベクターゲノムの用量で注射した。
これから、脳、心臓、肝臓、及び前脛骨筋についてのAAV遺伝子導入に対するAAV用量の用量-応答曲線の等式を線形回帰を使用して推定した(図10)。各々の血清型及び各々の組織についての特定の等式を図10にリストする。
相互作用効果を、すべての組織についての群1及び3において個別に観察された遺伝子導入レベルを合計し、次いでそれらを群4において観察された遺伝子導入レベルに比較することによって推定した。相互作用がAAV9とPHP.eBとの間に存在しないならば、すべての組織についての群1及び3からの遺伝子導入の合計(期待された)は、それぞれのすべての組織についての群4における遺伝子導入レベル(観察された)と厳密に一致するはずである。期待された遺伝子導入レベルvs観察された遺伝子導入レベルの回帰分析は、期待値が観察値に一致し、高度に相関することを示した(r2=0.9~0.999)(図11)。相互作用の二元配置ANOVA分析は、期待値と観察値との間に有意な相互作用がないことを示した(図11)。これらのデータから、試験した用量でAAV9とPHP.eBとの間の相互作用効果が非常に小さいかまたは存在しないことが示される。
次いで関心のある5つの異なる遺伝子導入レベルを達成することが求められた。遺伝子発現パターンを、AAV9及びPHP.eBの用量の5つの異なる組み合わせの上記のモデルを使用して予測し、5週齢のオスのC57BL6-Jマウスの5つの群に、以下のカクテル:
1)1.4e14 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+1.9e13 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
2)1.9e14 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+4.8e12 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
3)4.8e13 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+1.9e14 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
4)2.4e13 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+9.5e12 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
5)4.8e12 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+4.8e13 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
を、1群あたりN=3マウスで後眼窩注射した。
1)1.4e14 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+1.9e13 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
2)1.9e14 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+4.8e12 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
3)4.8e13 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+1.9e14 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
4)2.4e13 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+9.5e12 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
5)4.8e12 GC/kg scAAV9-Cbh-GFP-miR122+4.8e13 GC/kg scPHP.eB-Cbh-GFP-miR122
を、1群あたりN=3マウスで後眼窩注射した。
結果から、予測された遺伝子導入パターン(予測)と観察された遺伝子導入パターン(観察)との間の高い一致が指摘された(図12)。結果から、線形回帰を使用する、予測された遺伝子導入レベルと観察された遺伝子導入レベルの高い相関性も指摘された(図13)。これは、上で記載された様式で用いられたDAEUS系が、所定のレベルの遺伝子導入を正確に達成することを可能にすることを示す。
II型ウォルフラム症候群を治療するためのDAEUSの使用
早老症の治療のためのDAEUSの有効性を試験するために、Cisd2ノックアウトマウスの系統をインハウスで確立した(図14)。これらは、CRISPRを介して生成されたので、存在する唯一の非遺伝子導入Cisd2ノックアウトモデルである(他のモデルの挿入突然変異誘発とは対照的に)。このモデルは選ばれたのは、上述したように、Cisd2の喪失はII型ウォルフラム症候群を引き起こす一方で、Cisd2の過剰発現がマウス及びおそらくヒトにおいて健康でいる期間及び寿命を増加させるからである[2]。したがって、Cisd2遺伝子療法は、潜在的に、II型ウォルフラム症候群(WSII)のための治療及び母集団全体のための老化保護遺伝子療法の両方である。均一なレベルのCisd2発現を回復させることを目標として、Cisd2ノックアウトマウスを、疾患の様々なステージにわたって、2e13ベクターゲノム/kgの合計用量でDAEUS-Cisd2により処理した。この用量でのDAEUS-Cisd2によるマウスの処理は、実際、Cisd2遺伝子導入の均一な回復(図15A)及び複数の組織にわたる生理的レベルへのCisd2タンパク質発現(図15B)をもたらした。これにより、試験したすべての年齢群(例えば2~4か月、または7か月で、)新生児として注射したマウス)にわたって、罹病率及び死亡率が有意に減少した(図15~16)。
早老症の治療のためのDAEUSの有効性を試験するために、Cisd2ノックアウトマウスの系統をインハウスで確立した(図14)。これらは、CRISPRを介して生成されたので、存在する唯一の非遺伝子導入Cisd2ノックアウトモデルである(他のモデルの挿入突然変異誘発とは対照的に)。このモデルは選ばれたのは、上述したように、Cisd2の喪失はII型ウォルフラム症候群を引き起こす一方で、Cisd2の過剰発現がマウス及びおそらくヒトにおいて健康でいる期間及び寿命を増加させるからである[2]。したがって、Cisd2遺伝子療法は、潜在的に、II型ウォルフラム症候群(WSII)のための治療及び母集団全体のための老化保護遺伝子療法の両方である。均一なレベルのCisd2発現を回復させることを目標として、Cisd2ノックアウトマウスを、疾患の様々なステージにわたって、2e13ベクターゲノム/kgの合計用量でDAEUS-Cisd2により処理した。この用量でのDAEUS-Cisd2によるマウスの処理は、実際、Cisd2遺伝子導入の均一な回復(図15A)及び複数の組織にわたる生理的レベルへのCisd2タンパク質発現(図15B)をもたらした。これにより、試験したすべての年齢群(例えば2~4か月、または7か月で、)新生児として注射したマウス)にわたって、罹病率及び死亡率が有意に減少した(図15~16)。
新生児として注射したマウスにおいて、フレイル、体重減少、活動度、及び視力(ルーミングスポットとしてアッセイされた)は、無処理のCisd2ノックアウトマウス(これらの機能のすべてにおける罹患率の増加が観察された)に比較して、DAEUS-Cis2処理によって野生型レベルで維持された(図17)。追加で、DAEUS-Cisd2処理マウスの寿命は、無処理対照に比較しておよそ2倍延長された(図17)。2~4か齢月で処理したマウスにおいて、フレイル、体重減少、筋肉強度(グリッドハンドとしてアッセイした)、及び協調運動(ビーム横断への挑戦としてアッセイした)は、無処理対照に比較して改善された(図18)。加えて、寿命は約2倍増加した(図18)。驚くべきことに、疾患が進行したマウスにおいて、DAEUS-Cisd2処理は、体重減少、脱毛、脊柱後弯症、及び他の罹患率を好転させ、寿命を3倍延長させた(図19)。このデータから、DAEUS-Cisd2が、II型ウォルフラム症候群の予防及び治療のための非常に有効な療法であることが実証される。
野生型マウスの寿命を延長するためのDAEUSの使用
次に、処理されたマウスの寿命を延長する目標により、野生型(早老性ではない)マウスにおいて、老化保護遺伝子Cisd2、Atg5、及びPTENを過剰発現するように、DAEUS系を操作した。この目的のために、野生型マウスにおいて、野生型のレベルを超えるCisd2、Atg5、及びPTENを過剰発現する能力を、18か月齢の野生型マウスの中への最適化された用量でDAEUS-Atg5、DAEUS-PTEN、及びDAEUS-Cisd2を送達し、注射の1か月後にもたらされたタンパク質発現の測定によって、検証した。2セットの実験において、身体の複数の主要な組織にわたって、DAEUSの最適化された用量を使用するすべての3つの遺伝子の過剰発現が、実証された(図20)。次いで野生型C57BL6/Jマウスの寿命に対するDAEUS-Cisd2及びDAEUS-PTEN処理の効果を試験した。この目的のために、24か月齢の等しい数のオス及びメスのマウスに、2e12vg/マウスのDAEUS-Cisd2、1e12vg/マウスのDAEUS-PTEN、もしくは1e12vg/マウスのDAEUS-GFP、または対照としてビヒクル(FFB)で、後眼窩注射した。次いで処理群の寿命を測定し、結果から、DAEUS-Cisd2処理マウス及びDAEUS-PTEN処理マウスは、DAEUS-GFP処理マウスまたはビヒクル処理マウスに比較して、より長い寿命を示すことが指摘された(DAEUS-Cisd2:全体的な中央寿命の7%の増加及び注射後の寿命の38%の増加;DAEUS-PTEN:全体的な中央寿命の7%の増加及び注射後の寿命の37%の増加)(図21)。結果から、本明細書において記載されるDAEUS系を使用して、老化保護遺伝子を過剰発現させ、処理した対象の寿命を延長し得ることが実証された。
次に、処理されたマウスの寿命を延長する目標により、野生型(早老性ではない)マウスにおいて、老化保護遺伝子Cisd2、Atg5、及びPTENを過剰発現するように、DAEUS系を操作した。この目的のために、野生型マウスにおいて、野生型のレベルを超えるCisd2、Atg5、及びPTENを過剰発現する能力を、18か月齢の野生型マウスの中への最適化された用量でDAEUS-Atg5、DAEUS-PTEN、及びDAEUS-Cisd2を送達し、注射の1か月後にもたらされたタンパク質発現の測定によって、検証した。2セットの実験において、身体の複数の主要な組織にわたって、DAEUSの最適化された用量を使用するすべての3つの遺伝子の過剰発現が、実証された(図20)。次いで野生型C57BL6/Jマウスの寿命に対するDAEUS-Cisd2及びDAEUS-PTEN処理の効果を試験した。この目的のために、24か月齢の等しい数のオス及びメスのマウスに、2e12vg/マウスのDAEUS-Cisd2、1e12vg/マウスのDAEUS-PTEN、もしくは1e12vg/マウスのDAEUS-GFP、または対照としてビヒクル(FFB)で、後眼窩注射した。次いで処理群の寿命を測定し、結果から、DAEUS-Cisd2処理マウス及びDAEUS-PTEN処理マウスは、DAEUS-GFP処理マウスまたはビヒクル処理マウスに比較して、より長い寿命を示すことが指摘された(DAEUS-Cisd2:全体的な中央寿命の7%の増加及び注射後の寿命の38%の増加;DAEUS-PTEN:全体的な中央寿命の7%の増加及び注射後の寿命の37%の増加)(図21)。結果から、本明細書において記載されるDAEUS系を使用して、老化保護遺伝子を過剰発現させ、処理した対象の寿命を延長し得ることが実証された。
材料及び方法
プラスミドの構築及びプラスミド配列
ssAAV9ベクター及びDAEUSベクターを、DNA合成によって構築しクローニングした。DAEUSベクターのITRからITRへの配列を完全に合成し、標準的な分子クローニングを使用して、pAAV\SC\CMV\EGFP\WPRE\bGH-2骨格(Vandenberghe研究室から受理した)の中へクローニングした。ssAAV9ベクターを部分的に合成し、AAV pCAG-FLEX2-tTA2-WPRE-bGHpA骨格(Addgene)の中へクローニングした。ssAAV9ベクターについては、ネイティブなMus musculusコーディング配列を使用した。DAEUSベクターについては、Atg5及びPTENのコーディング配列はコドンを最適化した。
プラスミドの構築及びプラスミド配列
ssAAV9ベクター及びDAEUSベクターを、DNA合成によって構築しクローニングした。DAEUSベクターのITRからITRへの配列を完全に合成し、標準的な分子クローニングを使用して、pAAV\SC\CMV\EGFP\WPRE\bGH-2骨格(Vandenberghe研究室から受理した)の中へクローニングした。ssAAV9ベクターを部分的に合成し、AAV pCAG-FLEX2-tTA2-WPRE-bGHpA骨格(Addgene)の中へクローニングした。ssAAV9ベクターについては、ネイティブなMus musculusコーディング配列を使用した。DAEUSベクターについては、Atg5及びPTENのコーディング配列はコドンを最適化した。
AAVの産生及び精製
4つの15cmのディッシュからの80%のコンフルエンシーのHEK293細胞を、ハイパーフラスコへ播種し、80%のコンフルエンシーまで増殖させ、AAVベクター、AAV8またはAAV9についてのRep/Cap(Addgene 112864及び112865)、及びpAdΔF6によりそれぞれ、1つのハイパーフラスコあたり130ug:130ug:260ugで、三重トランスフェクションした。トランスフェクションの4日後、ハイパーフラスコからの上清を1Lのフラスコの中へデカントし、3mlのTriton-X 100(8787-100ML Millipore Sigma)、1mg/mlの濃度での2.5mgのRNAse A(10109142001 Millipore Sigma)、25U/mLのターボヌクレアーゼ(Turbonuclease)(ACGC80007 VitaScientific)、及び56μlの10%のプルロニック(登録商標)F68(24040032 Thermo Fisher)を、上清へ添加した。次いで上清を混合し、ハイパーフラスコの中へ注いで戻し、旋回シェーカー上で37℃で1時間150rpmで振盪して細胞を溶解し、プラスミドDNAを取り出した。次いで溶解物をハイパーフラスコからデカントし、ハイパーフラスコを140mLのDPBS(10010072 Life Tech)により洗浄し、それを溶解物の残りへ添加した。次いで全溶解物を4℃30分間4000gで遠心分離し、上清を、0.45μmのPESボトルトップフィルター(295-4545 Thermo Fisher)を介して濾過してから、HPLC上にロードした。
4つの15cmのディッシュからの80%のコンフルエンシーのHEK293細胞を、ハイパーフラスコへ播種し、80%のコンフルエンシーまで増殖させ、AAVベクター、AAV8またはAAV9についてのRep/Cap(Addgene 112864及び112865)、及びpAdΔF6によりそれぞれ、1つのハイパーフラスコあたり130ug:130ug:260ugで、三重トランスフェクションした。トランスフェクションの4日後、ハイパーフラスコからの上清を1Lのフラスコの中へデカントし、3mlのTriton-X 100(8787-100ML Millipore Sigma)、1mg/mlの濃度での2.5mgのRNAse A(10109142001 Millipore Sigma)、25U/mLのターボヌクレアーゼ(Turbonuclease)(ACGC80007 VitaScientific)、及び56μlの10%のプルロニック(登録商標)F68(24040032 Thermo Fisher)を、上清へ添加した。次いで上清を混合し、ハイパーフラスコの中へ注いで戻し、旋回シェーカー上で37℃で1時間150rpmで振盪して細胞を溶解し、プラスミドDNAを取り出した。次いで溶解物をハイパーフラスコからデカントし、ハイパーフラスコを140mLのDPBS(10010072 Life Tech)により洗浄し、それを溶解物の残りへ添加した。次いで全溶解物を4℃30分間4000gで遠心分離し、上清を、0.45μmのPESボトルトップフィルター(295-4545 Thermo Fisher)を介して濾過してから、HPLC上にロードした。
補助サンプルポンプ(GE LifeSciences)を含有するAkta Pure HPLCシステムにおける6.6mm×100mmのカラム(ガラス、Omnifit、kinesis-USA)による、AAVX POROS CaptureSelect(ThermoFisher Scientific)樹脂を使用して、AAV精製を遂行した。機械を室温でセットアップし、すべての精製を室温(およそ21℃)で遂行した。各々の精製のためのカラム体積[CV]は1mLであった。クロマトグラフィーカラムを、10[CV]のトリス緩衝洗浄バッファー1×生理食塩水(1×TBS)(Boston Bioproducts)により前平衡化してから、AAV溶解物を適用した。カラムの平衡及びすべての後続する洗浄を2ml/分の速度で遂行した。
AAVビリオンを含有する清澄にした/濾過した溶解物を1mL/分の速度でAAVX POROSカラムの上へロードし、全ローディング時間は、小規模調製のために30分からハイパーフラスコのための700分(一晩)までの範囲であった。後の精製において1.5mL/分のロード速度も使用してランタイムの合計を減少させ、精製効率の減少は観察されなかった。次いで結合したAAVを含有するカラムを10[CV]の1×TBSにより洗浄し、5[CV]の2×TBSの洗浄、10[CV]の20%のEtOH、及び10[CV]の1×TBSの洗浄が続いた。結合したAAVを、1ml/分の速度で1×TBS中の0.2Mのグリシンの低pH(pH2.5~2.9)のバッファーを使用して、溶出させた。溶出画分は、1画分あたり0.25~1mLの体積とした。溶出させたウイルス溶液を、溶出の前に画分収集チューブの中へ画分体積の1/10の1Mのトリス-HCL(pH8.0)を直接添加することによって中和した。UV(280nm)吸収グラフに基づいてピーク画分を収集し、最終的な製剤バッファー(FFB:1× PBS、172mMのNaCl、0.001%のプルロニック(登録商標)F68)中でバッファー交換し、50kDaの分子量カットオフのAmiconのフィルター(UFC905008 EMD Millipore)を使用して濃縮してから、ウイルス力価を測定した。
簡潔には、ウイルス力価及びゲノム力価を、定量的PCR(TaqMan、Life Technologies)によって決定した。BghpA標的化プライマー-プローブ(GCCAGCCATCTGTTGT(配列番号1)、GGAGTGGCACCTTCCA(配列番号2)、6FAM-TCCCCCGTGCCTTCCTTGACC-TAMRA(配列番号3))による、リアルタイムqPCR(7500 Real-Time PCR System;Applied Biosystems、Foster City、CA、USA)を使用した。直線化CBA-EGFP DNAを、既知の濃度の1シリーズの希釈で基準として使用した。10秒間の95℃の保持ステージ後に、2ステップのPCRサイクルステージを、95℃5秒間続いて60℃で5秒間の40サイクルで遂行した。ゲノムベクター力価を基準から内挿し、1ミリリットルあたりのベクターゲノムとして表現した。
DNA及びタンパク質の定量
1mLのDNA及びRNA用のRLT+バッファー、ならびに1mLのタンパク質用の1×Haltプロテアーゼ及び脱リン酸化酵素のインヒビター(78444 Thermo Fisher Sci)を含有するRIPAバッファー中での30mgの組織の破壊によって、組織をホモジナイズした。破壊のために、サンプル、バッファー、及び1mmのジルコニア/シリカビーズ(11079110z Biospec)を、XXTuffバイアル(330TX BioSpec)の中へロードし、Mini Beadbeater 24(112011 BioSpec)を最大スピードで3分間使用して破壊した。次いでバイアルをRNAのために2~5分間タンパク質のために1時間氷の上に置き、3分間10,000gで遠心分離し、上清をさらなる手順のために使用した。
1mLのDNA及びRNA用のRLT+バッファー、ならびに1mLのタンパク質用の1×Haltプロテアーゼ及び脱リン酸化酵素のインヒビター(78444 Thermo Fisher Sci)を含有するRIPAバッファー中での30mgの組織の破壊によって、組織をホモジナイズした。破壊のために、サンプル、バッファー、及び1mmのジルコニア/シリカビーズ(11079110z Biospec)を、XXTuffバイアル(330TX BioSpec)の中へロードし、Mini Beadbeater 24(112011 BioSpec)を最大スピードで3分間使用して破壊した。次いでバイアルをRNAのために2~5分間タンパク質のために1時間氷の上に置き、3分間10,000gで遠心分離し、上清をさらなる手順のために使用した。
DNA/RNAのために、700μLの上清をAllPrep DNAミニスピンカラムの上へロードし、大腿四頭筋のためにAllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit(80224 Qiagen)ならびに脳及び肝臓のためにAllprep DNA/RNA mini kit(80204 Qiagen)を使用して精製した。精製をQiacube Connect(9002864 Qiagen)上で遂行した。
全AAVコピー数を、AAVコピー数のための基準としてBghpAプライマー及び直線化CBA-GFPプラスミド希釈系列を使用して査定した(GCCAGCCATCTGTTGT(配列番号1)、GGAGTGGCACCTTCCA(配列番号2)、6FAM-TCCCCCGTGCCTTCCTTGACC-TAMRA(配列番号3))。全ゲノムコピー数を、既知の濃度のgDNA希釈系列の基準と共に、RPIIプライマー-プローブ(GTTTTCATCACTGTTCATGATGC(配列番号4)、TCATGGGCATTACTATTCCTAC(配列番号5)、プローブ:VIC-AGGACCAGCTTCTCTGCATTATCATCGTTGAAGAT-3IABkFQ(配列番号6))を使用して推定した。次いで2倍体ゲノムあたりのAAVコピー数を、
として計算した。
両方のプライマー-プローブセットのための増幅の効率及び特異性は以前に確立され、製造業者によって推奨される熱サイクル条件でLuna Universal Probe qPCR Master Mix(M3004L NEB)を使用して、増幅を遂行した。
タンパク質発現の定量のために、タンパク質溶解物を最初に新鮮なRIPA+Haltインヒビターバッファー中で5倍に2回希釈し、すべての希釈物を、Pierce(商標)BCA Protein Assay Kit(23225 Thermo Fisher)を使用して、全タンパク質含有量についてアッセイした。各々の組織タイプごとに、次いで溶解物を、直線範囲の下端の濃度までRIPA+Haltインヒビターバッファー中で希釈した。GFPについては、抗GFP抗体ab290(ab290 Abcam)を使用した。Cisd2、PTEN、及びAtg5については、抗Cisd2抗体(13318-1-AP Proteintech)、抗Atg5抗体(NB110-53818 Novus)、及び抗PTEN D4.3抗体(Cell Signaling)をそれぞれ使用した。タンパク質定量のための直線範囲は、ab290によるWes上の12~230kDa Jess or Wes Separation Module(SM-W004 Protein Simple)を、各々の組織について、3μg/μl~0.03μg/μlの範囲の希釈物のために別々に使用して、各々のタンパク質をアッセイすることによって以前に決定された。全タンパク質のための直線範囲も、Total Protein Detection Module(DM-TP01 Protein Simple)を使用して、4μg/μl~0.1μg/μlの範囲で全タンパク質をアッセイすることによって以前に決定された(直線範囲:試験されたすべての組織について<1μg/μl)。次いでGFP、Atg5、Cisd2、及びPTENを、全タンパク質レベルと同様にアッセイし、GFP及び全タンパク質をCompass for SW 4.1(Protein Simple)を使用して定量した。最終的に、GFPを全タンパク質に対して正規化して、最終値とした。
動物実験
マウスを、1ケージあたり5匹のマウスの最高密度で標準的な換気ラック中で収容した。室温をで22℃で維持し、湿度は30%~70%であった。マウスを12時間の明/暗サイクルで維持し、食品及び水を自由裁量で提供した。ブリーダーマウスを照射したPicoLab Mouse Diet 20 5058(LabDiet、St.Louis、MO)上で維持し、非ブリーダーマウスを照射したLabDiet Prolab Isopro RMH 3000 5P75(LabDiet、St.Louis、MO)上で維持した。ケージを1/4インチのAndersonのBed o Cob bedding(The Andersons,Inc.、Maumee、OH)により満たし、すべてのケージは、3つのネストレット(nestlet)(2 3 2”の正方形の圧縮綿、Ancare、Bellmore、NY)及び1つの赤色のマウス小屋(保証付きのポリカーボネート;3 3/4”の幅×1 7/8”の高さ×3”の長さ、BioServ、Flemington、NJ)を含有した。ケージ交換を、少なくとも14日毎に、そして必要であるならばより頻繁に遂行した。動物健康監視を、指標動物及びラックプレナムからのスワブを介してのPCR試験によって四半期毎に遂行した。テキスト及び図中で記載されるように、AAVを様々な全用量で1匹のマウスあたり体積150μlで、イソフルオラン麻酔下で後眼窩注射した。テキスト及び図中で記載されるように、AAV9及びPHP.eBを、DAEUS-Atg5、DAEUS-Cisd2、DAEUS-GFP、及びDAEUS-PTENの注射のために1:1比で使用し、8週齢または18か月齢の野生型C57BL/6Jマウスを使用した。テキスト及び図中で別段指摘される場合を除いて、マウスを注射の28日後にCO2で安楽死させ、分析のために組織及び血清を収集した。血清ALTレベルは、UMass Mouse Metabolic Phenotyping Centerによって定量された。
マウスを、1ケージあたり5匹のマウスの最高密度で標準的な換気ラック中で収容した。室温をで22℃で維持し、湿度は30%~70%であった。マウスを12時間の明/暗サイクルで維持し、食品及び水を自由裁量で提供した。ブリーダーマウスを照射したPicoLab Mouse Diet 20 5058(LabDiet、St.Louis、MO)上で維持し、非ブリーダーマウスを照射したLabDiet Prolab Isopro RMH 3000 5P75(LabDiet、St.Louis、MO)上で維持した。ケージを1/4インチのAndersonのBed o Cob bedding(The Andersons,Inc.、Maumee、OH)により満たし、すべてのケージは、3つのネストレット(nestlet)(2 3 2”の正方形の圧縮綿、Ancare、Bellmore、NY)及び1つの赤色のマウス小屋(保証付きのポリカーボネート;3 3/4”の幅×1 7/8”の高さ×3”の長さ、BioServ、Flemington、NJ)を含有した。ケージ交換を、少なくとも14日毎に、そして必要であるならばより頻繁に遂行した。動物健康監視を、指標動物及びラックプレナムからのスワブを介してのPCR試験によって四半期毎に遂行した。テキスト及び図中で記載されるように、AAVを様々な全用量で1匹のマウスあたり体積150μlで、イソフルオラン麻酔下で後眼窩注射した。テキスト及び図中で記載されるように、AAV9及びPHP.eBを、DAEUS-Atg5、DAEUS-Cisd2、DAEUS-GFP、及びDAEUS-PTENの注射のために1:1比で使用し、8週齢または18か月齢の野生型C57BL/6Jマウスを使用した。テキスト及び図中で別段指摘される場合を除いて、マウスを注射の28日後にCO2で安楽死させ、分析のために組織及び血清を収集した。血清ALTレベルは、UMass Mouse Metabolic Phenotyping Centerによって定量された。
Cisd2ノックアウトマウスの生成及びフレイル測定
Cisd2ノックアウトマウスを、SpCas9タンパク質及びCisd2のエクソン2を標的化する3つのガイドRNA(AGCGCAAGTACCCCGAGGAA(配列番号7)、CCCCGAGGAAGGGCAGTAGG(配列番号8)、TGCTGTGTTCAGTTTCAGAC(配列番号9))によるC57BL6/J受精卵母細胞の顕微注射を介して生成した。次いでファウンダーの遺伝子型を決定し、サンガー法でシークエンシングし(プライマーAGCCCTAAGTTTCTCCGAGTTC(配列番号10)、GTGACATGTGGTGCTGTAGAAC(配列番号11))、機能喪失突然変異のファウンダーを野生型C57BL6/Jへ交配した。次いで仔マウスを、野生型C57BL6/Jマウスへさらに戻し交配した。次いでこの戻し交配のヘテロ接合体仔マウスを交配して、ホモ接合体Cisd2ノックアウトマウスに達した。2系統をさらに交配した(系統6:780bpの欠失、エクソン2全体の欠失、及び系統14:261bpの欠失、エクソン2の大部分の欠失に起因するフレームシフト、エクソン2の3’で4bp残る)。Cisd2発現の喪失をSimple Wesを介して確認した(図示せず)。次いでマウスを間隔を置いて体重測定し、注射の4か月後にフレイルを査定した。フレイルを、Whitehead et al.[14]中で記載されるように、31の罹患率関連測定値の加重和として盲検化して査定し、ただし、有益でない測定値(すべてのマウスにわたって0または1だった測定値)を、最終分析から除外した。
Cisd2ノックアウトマウスを、SpCas9タンパク質及びCisd2のエクソン2を標的化する3つのガイドRNA(AGCGCAAGTACCCCGAGGAA(配列番号7)、CCCCGAGGAAGGGCAGTAGG(配列番号8)、TGCTGTGTTCAGTTTCAGAC(配列番号9))によるC57BL6/J受精卵母細胞の顕微注射を介して生成した。次いでファウンダーの遺伝子型を決定し、サンガー法でシークエンシングし(プライマーAGCCCTAAGTTTCTCCGAGTTC(配列番号10)、GTGACATGTGGTGCTGTAGAAC(配列番号11))、機能喪失突然変異のファウンダーを野生型C57BL6/Jへ交配した。次いで仔マウスを、野生型C57BL6/Jマウスへさらに戻し交配した。次いでこの戻し交配のヘテロ接合体仔マウスを交配して、ホモ接合体Cisd2ノックアウトマウスに達した。2系統をさらに交配した(系統6:780bpの欠失、エクソン2全体の欠失、及び系統14:261bpの欠失、エクソン2の大部分の欠失に起因するフレームシフト、エクソン2の3’で4bp残る)。Cisd2発現の喪失をSimple Wesを介して確認した(図示せず)。次いでマウスを間隔を置いて体重測定し、注射の4か月後にフレイルを査定した。フレイルを、Whitehead et al.[14]中で記載されるように、31の罹患率関連測定値の加重和として盲検化して査定し、ただし、有益でない測定値(すべてのマウスにわたって0または1だった測定値)を、最終分析から除外した。
統計分析
データをすべて可視化し、統計分析をGraphPad Prism(GraphPad)で遂行した。使用した具体的な統計的検定を各々の試験について図の説明文中でリストし、すべての試験を別段の定めのない限りデフォルト設定により遂行した。
データをすべて可視化し、統計分析をGraphPad Prism(GraphPad)で遂行した。使用した具体的な統計的検定を各々の試験について図の説明文中でリストし、すべての試験を別段の定めのない限りデフォルト設定により遂行した。
例示的なウイルスベクター
LOCUS scAAV-CbhM-Atg5(GS)-miR 5237 bp ds-DNA環状
DEFINITION .
FEATURES Location/Qualifiers
CDS 3937..4797
/label=“Amp-R”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 1089..1109
/label=“CAG3 F”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 2568..2575
/label=“シード領域”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 2583..2829
/label=“正確なWPRE3”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
misc_feature 1609..1700
/label=“Cbh 3’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 1701..1701
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
repeat_region 767..872
/label=“5’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 1682..1700
/label=“ハイブリッドイントロンの3’端部”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2547..2576
/label=“mIR122標的部位m8”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 1701..1706
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 889..1700
/label=“Cbh”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 1180..1201
/label=“CAG3 R”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 2304..2321
/label=“野生型と共有する領域”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2442..2467
/label=“野生型と共有する領域”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 1472..1700
/label=“ハイブリッドイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 3045..3068
/label=“5’ITRを欠失”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
polyA_signal 2830..3044
/label=“BGH\pA”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1713..2540
/label=“Atg5 CO Genscript”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2717..2741
/label=“oMF80”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
enhancer 889..1192
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 883..887
/label=“Cbh 5’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 1707..1712
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
repeat_region complement(3045..3174)
/label=“3’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
promoter 1194..1471
/label=“ニワトリβ-アクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
LOCUS scAAV-CbhM-Atg5(GS)-miR 5237 bp ds-DNA環状
DEFINITION .
FEATURES Location/Qualifiers
CDS 3937..4797
/label=“Amp-R”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 1089..1109
/label=“CAG3 F”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 2568..2575
/label=“シード領域”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 2583..2829
/label=“正確なWPRE3”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
misc_feature 1609..1700
/label=“Cbh 3’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 1701..1701
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
repeat_region 767..872
/label=“5’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 1682..1700
/label=“ハイブリッドイントロンの3’端部”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2547..2576
/label=“mIR122標的部位m8”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 1701..1706
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 889..1700
/label=“Cbh”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 1180..1201
/label=“CAG3 R”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 2304..2321
/label=“野生型と共有する領域”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2442..2467
/label=“野生型と共有する領域”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 1472..1700
/label=“ハイブリッドイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 3045..3068
/label=“5’ITRを欠失”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
polyA_signal 2830..3044
/label=“BGH\pA”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1713..2540
/label=“Atg5 CO Genscript”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2717..2741
/label=“oMF80”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
enhancer 889..1192
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 883..887
/label=“Cbh 5’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 1707..1712
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
repeat_region complement(3045..3174)
/label=“3’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
promoter 1194..1471
/label=“ニワトリβ-アクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
ORIGIN
1 gttggactca agacgatagt taccggataa ggcgcagcgg tcgggctgaa cggggggttc
61 gtgcacacag cccagcttgg agcgaacgac ctacaccgaa ctgagatacc tacagcgtga
121 gctatgagaa agcgccacgc ttcccgaagg gagaaaggcg gacaggtatc cggtaagcgg
181 cagggtcgga acaggagagc gcacgaggga gcttccaggg ggaaacgcct ggtatcttta
241 tagtcctgtc gggtttcgcc acctctgact tgagcgtcga tttttgtgat gctcgtcagg
301 ggggcggagc ctatggaaaa acgccagcaa cgcggccttt ttacggttcc tggccttttg
361 ctgGCCtttt gctcacatgt tctttcctgc gttatcccct gattctgtgg ataaccgtat
421 taccgccttt gagtgagctg ataccgctcg ccgcagccga acgaccgagc gcagcgagtc
481 agtgagcgag gaagcggaag agcgcccaat acgcaaaccg cctctccccg cgcgttggcc
541 gattcattaa tgcagctggc acgacaggtt tcccgactgg aaagcgggca gtgagcgcaa
601 cgcaattaat gtgagttagc tcactcatta ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc
661 ggctcgtatg ttgtgtggaa ttgtgagcgg ataacaattt cacacaggaa acagctatga
721 ccatgattac gccagattta attaagggat ctgggccact ccctctctgc gcgctcgctc
781 gctcactgag gccgggcgac caaaggtcgc ccgacgcccg ggctttgccc gggcggcctc
841 agtgagcgag cgagcgcgca gagagggagt ggttaagCTA GCggtacccg ttacataact
901 tacggtaaat ggcccgcctg gctgaccgcc caacgacccc cgcccattga cgtcaataat
961 gacgtatgtt cccatagtaa cgccaatagg gactttccat tgacgtcaat gggtggagta
1021 tttacggtaa actgcccact tggcagtaca tcaagtgtat catatgccaa gtacgccccc
1081 tattgacgtc aatgacggta aatggcccgc ctggcattat gcccagtaca tgaccttatg
1141 ggactttcct acttggcagt acatctacgt attagtcatc gctattacca tggtcgaggt
1201 gagccccacg ttctgcttca ctctccccat ctcccccccc tccccacccc caattttgta
1261 tttatttatt ttttaattat tttgtgcagc gatgggggcg gggggggggg gggggcgcgc
1321 gccaggcggg gcggggcggg gcgaggggcg gggcggggcg aggcggagag gtgcggcggc
1381 agccaatcag agcggcgcgc tccgaaagtt tccttttatg gcgaggcggc ggcggcggcg
1441 gccctataaa aagcgaagcg cgcggcgggc gggagtcgct gcgacgctgc cttcgccccg
1501 tgccccgctc cgccgccgcc tcgcgccgcc cgccccggct ctgactgacc gcgttactcc
1561 cacaggtgag cgggcgggac ggcccttctc ctccgggctg taattagctg agcaagaggt
1621 aagggtttaa gggatggttg gttggtgggg tattaatgtt taattacctg gagcacctgc
1681 ctgaaatcac tttttttcag acgcgtgcca ccatgacgga tgataaagat gttctgagag
1741 atgtctggtt cggacgcatt cctacctgct tcacgctgta ccaagatgag attacggaga
1801 gggaggctga accctactac ctgctgctgc caagagtcag ctacctgact ctggtgaccg
1861 acaaggtcaa gaagcacttc cagaaggtca tgaggcagga ggacgtgtct gaaatctggt
1921 tcgagtacga aggaactcct ctgaagtggc actaccccat cggtctgctg ttcgacctgc
1981 tggcttccag ctctgccctg ccttggaaca tcaccgtcca cttcaagagc ttcccagaga
2041 aggacctgct gcactgccct tcaaaggacg ctgtggaggc ccacttcatg tcctgcatga
2101 aggaagctga cgccctgaag cacaagtccc aggtcatcaa cgaaatgcag aagaaggacc
2161 acaagcagct gtggatgggt ctgcaaaacg accgcttcga ccagttctgg gctatcaacc
2221 gtaagctgat ggagtaccct cctgaggaaa acggcttccg ctacatcccc ttccgtatct
2281 accagaccac taccgaaagg cccttcatcc agaagctgtt cagaccagtg gctgccgacg
2341 gtcagctgca cactctgggc gacctgctga gggaggtctg cccatcagct gtggctcctg
2401 aggacggaga aaagaggagc caggtcatga tccacggaat cgagccaatg ctggaaaccc
2461 ctctgcaatg gctgtccgaa cacctctcct acccagacaa cttcctccac atttccattg
2521 tcccccaacc tacggactaa aagcttatcg cgaacaaaca ccattgtcac actccaacta
2581 gtataatcaa cctctggatt acaaaatttg tgaaagattg actggtattc ttaactatgt
2641 tgctcctttt acgctatgtg gatacgctgc tttaatgcct ttgtatcatg ctattgcttc
2701 ccgtatggct ttcattttct cctccttgta taaatcctgg ttagttcttg ccacggcgga
2761 actcatcgcc gcctgccttg cccgctgctg gacaggggct cggctgttgg gcactgacaa
2821 ttccgtggtg cctcgactgt gccttctagt tgccagccat ctgttgtttg cccctccccc
2881 gtgccttcct tgaccctgga aggtgccact cccactgtcc tttcctaata aaatgaggaa
2941 attgcatcgc attgtctgag taggtgtcat tctattctgg ggggtggggt ggggcaggac
3001 agcaaggggg aggattggga agacaatagc aggcatgctg gggaaggaac ccctagtgat
3061 ggagttggcc actccctctc tgcgcgctcg ctcgctcact gaggccgggc gaccaaaggt
3121 cgcccgacgc ccgggctttg cccgggcggc ctcagtgagc gagcgagcgc gcagccttaa
3181 ttaacctaat tcactggccg tcgttttaca acgtcgtgac tgggaaaacc ctggcgttac
3241 ccaacttaat cgccttgcag cacatccccc tttcgccagc tggcgtaata gcgaagaggc
3301 ccgcaccgat cgcccttccc aacagttgcg cagcctgaat ggcgaatggg acgcgccctg
3361 tagcggcgca ttaagcgcgg cgggtgtggt ggttacgcgc agcgtgaccg ctacacttgc
3421 cagcgcccta gcgcccgctc ctttcgcttt cttcccttcc tttctcgcca cgttcgccgg
3481 ctttccccgt caagctctaa atcgggggct ccctttaggg ttccgattta gtgctttacg
3541 gcacctcgac cccaaaaaac ttgattaggg tgatggttca cgtagtgggc catcgccctg
3601 atagacggtt tttcgccctt tgacgttgga gtccacgttc tttaatagtg gactcttgtt
3661 ccaaactgga acaacactca accctatctc ggtctattct tttgatttat aagggatttt
3721 gccgatttcg gcctattggt taaaaaatga gctgatttaa caaaaattta acgcgaattt
3781 taacaaaata ttaacgctta caatttaggt ggcacttttc ggggaaatgt gcgcggaacc
3841 cctatttgtt tatttttcta aatacattca aatatgtatc cgctcatgag acaataaccc
3901 tgataaatgc ttcaataata ttgaaaaagg aagagtatga gtattcaaca tttccgtgtc
3961 gcccttattc ccttttttgc ggcattttgc cttcctgttt ttgctcaccc agaaacgctg
4021 gtgaaagtaa aagatgctga agatcagttg ggtgcacgag tgggttacat cgaactggat
4081 ctcaaCAGCg gtaagatcct tgagagtttt cgccccgaag aacgttttcc aatgatgagc
4141 acttttaaag ttctgctatg tggcgcggta ttatcccgta ttgacgccgg gcaagagcaa
4201 ctcggtcgcc gcatacacta ttctcagaat gacttggttg agtactcacc agtcacagaa
4261 aagcatctta cggatggcat gacagtaaga gaattatgca gtgctgccat aaccatgagt
4321 gataacactg cggccaactt acttctgaca acgatcggag gaccgaagga gctaaccgct
4381 tttttgcaca acatggggga tcatgtaact cgccttgatc gttgggaacc ggagctgaat
4441 gaagccatac caaacgacga gcgtgacacc acgatgcctg tagcaatggc aacaacgttg
4501 cgcaaactat taactggcga actacttact ctagcttccc ggcaacaatt aatagactgg
4561 atggaggcgg ataaagttgc aggaccactt ctgcgctcgg cccttccggc tggctggttt
4621 attgctgata aatctggagc cggtgagcgt gggtctcgcg gtatcattgc agcactgggg
4681 ccagatggta agccctcccg tatcgtagtt atctacacga cggggagtca ggcaactatg
4741 gatgaacgaa atagacagat cgctgagata ggtgcctcac tgattaagca ttggtaactg
4801 tcagaccaag tttactcata tatactttag attgatttaa aacttcattt ttaatttaaa
4861 aggatctagg tgaagatcct ttttgataat ctcatgacca aaatccctta acgtgagttt
4921 tcgttccact gagcgtcaga ccccgtagaa aagatcaaag gatcttcttg agatcctttt
4981 tttctgcgcg taatctgctg cttgcaaaca aaaaaaccac cgctaccagc ggtggtttgt
5041 ttgccggatc aagagctacc aactcttttt ccgaaggtaa ctggcttcag cagagcgcag
5101 ataccaaata ctgtTcttct agtgtagccg tagttaggcc accacttcaa gaactctgta
5161 gcaccgccta catacctcgc tctgctaatc ctgttaccag tggctgctgc cagtggcgat
5221 aagtcgtgtc ttaccgg(配列番号12)
1 gttggactca agacgatagt taccggataa ggcgcagcgg tcgggctgaa cggggggttc
61 gtgcacacag cccagcttgg agcgaacgac ctacaccgaa ctgagatacc tacagcgtga
121 gctatgagaa agcgccacgc ttcccgaagg gagaaaggcg gacaggtatc cggtaagcgg
181 cagggtcgga acaggagagc gcacgaggga gcttccaggg ggaaacgcct ggtatcttta
241 tagtcctgtc gggtttcgcc acctctgact tgagcgtcga tttttgtgat gctcgtcagg
301 ggggcggagc ctatggaaaa acgccagcaa cgcggccttt ttacggttcc tggccttttg
361 ctgGCCtttt gctcacatgt tctttcctgc gttatcccct gattctgtgg ataaccgtat
421 taccgccttt gagtgagctg ataccgctcg ccgcagccga acgaccgagc gcagcgagtc
481 agtgagcgag gaagcggaag agcgcccaat acgcaaaccg cctctccccg cgcgttggcc
541 gattcattaa tgcagctggc acgacaggtt tcccgactgg aaagcgggca gtgagcgcaa
601 cgcaattaat gtgagttagc tcactcatta ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc
661 ggctcgtatg ttgtgtggaa ttgtgagcgg ataacaattt cacacaggaa acagctatga
721 ccatgattac gccagattta attaagggat ctgggccact ccctctctgc gcgctcgctc
781 gctcactgag gccgggcgac caaaggtcgc ccgacgcccg ggctttgccc gggcggcctc
841 agtgagcgag cgagcgcgca gagagggagt ggttaagCTA GCggtacccg ttacataact
901 tacggtaaat ggcccgcctg gctgaccgcc caacgacccc cgcccattga cgtcaataat
961 gacgtatgtt cccatagtaa cgccaatagg gactttccat tgacgtcaat gggtggagta
1021 tttacggtaa actgcccact tggcagtaca tcaagtgtat catatgccaa gtacgccccc
1081 tattgacgtc aatgacggta aatggcccgc ctggcattat gcccagtaca tgaccttatg
1141 ggactttcct acttggcagt acatctacgt attagtcatc gctattacca tggtcgaggt
1201 gagccccacg ttctgcttca ctctccccat ctcccccccc tccccacccc caattttgta
1261 tttatttatt ttttaattat tttgtgcagc gatgggggcg gggggggggg gggggcgcgc
1321 gccaggcggg gcggggcggg gcgaggggcg gggcggggcg aggcggagag gtgcggcggc
1381 agccaatcag agcggcgcgc tccgaaagtt tccttttatg gcgaggcggc ggcggcggcg
1441 gccctataaa aagcgaagcg cgcggcgggc gggagtcgct gcgacgctgc cttcgccccg
1501 tgccccgctc cgccgccgcc tcgcgccgcc cgccccggct ctgactgacc gcgttactcc
1561 cacaggtgag cgggcgggac ggcccttctc ctccgggctg taattagctg agcaagaggt
1621 aagggtttaa gggatggttg gttggtgggg tattaatgtt taattacctg gagcacctgc
1681 ctgaaatcac tttttttcag acgcgtgcca ccatgacgga tgataaagat gttctgagag
1741 atgtctggtt cggacgcatt cctacctgct tcacgctgta ccaagatgag attacggaga
1801 gggaggctga accctactac ctgctgctgc caagagtcag ctacctgact ctggtgaccg
1861 acaaggtcaa gaagcacttc cagaaggtca tgaggcagga ggacgtgtct gaaatctggt
1921 tcgagtacga aggaactcct ctgaagtggc actaccccat cggtctgctg ttcgacctgc
1981 tggcttccag ctctgccctg ccttggaaca tcaccgtcca cttcaagagc ttcccagaga
2041 aggacctgct gcactgccct tcaaaggacg ctgtggaggc ccacttcatg tcctgcatga
2101 aggaagctga cgccctgaag cacaagtccc aggtcatcaa cgaaatgcag aagaaggacc
2161 acaagcagct gtggatgggt ctgcaaaacg accgcttcga ccagttctgg gctatcaacc
2221 gtaagctgat ggagtaccct cctgaggaaa acggcttccg ctacatcccc ttccgtatct
2281 accagaccac taccgaaagg cccttcatcc agaagctgtt cagaccagtg gctgccgacg
2341 gtcagctgca cactctgggc gacctgctga gggaggtctg cccatcagct gtggctcctg
2401 aggacggaga aaagaggagc caggtcatga tccacggaat cgagccaatg ctggaaaccc
2461 ctctgcaatg gctgtccgaa cacctctcct acccagacaa cttcctccac atttccattg
2521 tcccccaacc tacggactaa aagcttatcg cgaacaaaca ccattgtcac actccaacta
2581 gtataatcaa cctctggatt acaaaatttg tgaaagattg actggtattc ttaactatgt
2641 tgctcctttt acgctatgtg gatacgctgc tttaatgcct ttgtatcatg ctattgcttc
2701 ccgtatggct ttcattttct cctccttgta taaatcctgg ttagttcttg ccacggcgga
2761 actcatcgcc gcctgccttg cccgctgctg gacaggggct cggctgttgg gcactgacaa
2821 ttccgtggtg cctcgactgt gccttctagt tgccagccat ctgttgtttg cccctccccc
2881 gtgccttcct tgaccctgga aggtgccact cccactgtcc tttcctaata aaatgaggaa
2941 attgcatcgc attgtctgag taggtgtcat tctattctgg ggggtggggt ggggcaggac
3001 agcaaggggg aggattggga agacaatagc aggcatgctg gggaaggaac ccctagtgat
3061 ggagttggcc actccctctc tgcgcgctcg ctcgctcact gaggccgggc gaccaaaggt
3121 cgcccgacgc ccgggctttg cccgggcggc ctcagtgagc gagcgagcgc gcagccttaa
3181 ttaacctaat tcactggccg tcgttttaca acgtcgtgac tgggaaaacc ctggcgttac
3241 ccaacttaat cgccttgcag cacatccccc tttcgccagc tggcgtaata gcgaagaggc
3301 ccgcaccgat cgcccttccc aacagttgcg cagcctgaat ggcgaatggg acgcgccctg
3361 tagcggcgca ttaagcgcgg cgggtgtggt ggttacgcgc agcgtgaccg ctacacttgc
3421 cagcgcccta gcgcccgctc ctttcgcttt cttcccttcc tttctcgcca cgttcgccgg
3481 ctttccccgt caagctctaa atcgggggct ccctttaggg ttccgattta gtgctttacg
3541 gcacctcgac cccaaaaaac ttgattaggg tgatggttca cgtagtgggc catcgccctg
3601 atagacggtt tttcgccctt tgacgttgga gtccacgttc tttaatagtg gactcttgtt
3661 ccaaactgga acaacactca accctatctc ggtctattct tttgatttat aagggatttt
3721 gccgatttcg gcctattggt taaaaaatga gctgatttaa caaaaattta acgcgaattt
3781 taacaaaata ttaacgctta caatttaggt ggcacttttc ggggaaatgt gcgcggaacc
3841 cctatttgtt tatttttcta aatacattca aatatgtatc cgctcatgag acaataaccc
3901 tgataaatgc ttcaataata ttgaaaaagg aagagtatga gtattcaaca tttccgtgtc
3961 gcccttattc ccttttttgc ggcattttgc cttcctgttt ttgctcaccc agaaacgctg
4021 gtgaaagtaa aagatgctga agatcagttg ggtgcacgag tgggttacat cgaactggat
4081 ctcaaCAGCg gtaagatcct tgagagtttt cgccccgaag aacgttttcc aatgatgagc
4141 acttttaaag ttctgctatg tggcgcggta ttatcccgta ttgacgccgg gcaagagcaa
4201 ctcggtcgcc gcatacacta ttctcagaat gacttggttg agtactcacc agtcacagaa
4261 aagcatctta cggatggcat gacagtaaga gaattatgca gtgctgccat aaccatgagt
4321 gataacactg cggccaactt acttctgaca acgatcggag gaccgaagga gctaaccgct
4381 tttttgcaca acatggggga tcatgtaact cgccttgatc gttgggaacc ggagctgaat
4441 gaagccatac caaacgacga gcgtgacacc acgatgcctg tagcaatggc aacaacgttg
4501 cgcaaactat taactggcga actacttact ctagcttccc ggcaacaatt aatagactgg
4561 atggaggcgg ataaagttgc aggaccactt ctgcgctcgg cccttccggc tggctggttt
4621 attgctgata aatctggagc cggtgagcgt gggtctcgcg gtatcattgc agcactgggg
4681 ccagatggta agccctcccg tatcgtagtt atctacacga cggggagtca ggcaactatg
4741 gatgaacgaa atagacagat cgctgagata ggtgcctcac tgattaagca ttggtaactg
4801 tcagaccaag tttactcata tatactttag attgatttaa aacttcattt ttaatttaaa
4861 aggatctagg tgaagatcct ttttgataat ctcatgacca aaatccctta acgtgagttt
4921 tcgttccact gagcgtcaga ccccgtagaa aagatcaaag gatcttcttg agatcctttt
4981 tttctgcgcg taatctgctg cttgcaaaca aaaaaaccac cgctaccagc ggtggtttgt
5041 ttgccggatc aagagctacc aactcttttt ccgaaggtaa ctggcttcag cagagcgcag
5101 ataccaaata ctgtTcttct agtgtagccg tagttaggcc accacttcaa gaactctgta
5161 gcaccgccta catacctcgc tctgctaatc ctgttaccag tggctgctgc cagtggcgat
5221 aagtcgtgtc ttaccgg(配列番号12)
LOCUS scAAV-CbhM-Cisd2-miR122 4817 bp ds-DNA環状
DEFINITION .
FEATURES Location/Qualifiers
STS 1294..1354
/label=“Cisd2 STS”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 941..946
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
polyA_signal 1644..1858
/label=“BGH\pA”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1261..1283
/label=“oMF155リバース”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
CDS 2751..3611
/label=“Amp-R”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 800..932
/label=“ステムループ”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
/ApEinfo_fwdcolor=#84b0dc
misc_feature 652..760
/label=“ステムループ”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 1666..1681
/label=“bGhpA”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1124..1148
/label=“oMF67”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 722..736
/label=“oMF184_2”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 935..935
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1481..1508
/label=“WPRE F”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
repeat_region 1..106
/label=“5’-ITR”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 1823..1846
/label=“ITR配列のためのoMF253 F”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
promoter 428..705
/label=“ニワトリβ-アクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 843..934
/label=“Cbh 3’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 735..755
/label=“oMF203”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 916..934
/label=“ハイブリッドイントロンの3’端部”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
exon 1050..1264
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
CDS 947..1354
/label=“Cisd2 CDS(CDGSH鉄-硫黄ドメイン含有タンパク質2)”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1258..1281
/label=“フォワードoMF152”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
misc_feature 935..940
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 1058..1126
/label=“Cisd2 misc_feature”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
enhancer 123..426
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 1711..1726
/label=“BhjPa R”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 706..934
/label=“ハイブリッドイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 230..328
/label=“ステムループ”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 1219..1243
/label=“oMF68”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
misc_feature 117..121
/label=“Cbh 5’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
repeat_region complement(1859..1988)
/label=“3’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 719..733
/label=“oMF186_2”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 1531..1555
/label=“oMF80”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1171..1195
/label=“oMF154-フォワード”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
exon 947..1049
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 1859..1880
/label=“Dループ(McCarty 2004に基づく末端分離部位)”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1397..1643
/label=“正確なWPRE3”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
misc_feature 123..934
/label=“Cbh”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
exon 1265..1354
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1859..1882
/label=“5’ITRを欠失”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 1382..1389
/label=“シード領域”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1361..1390
/label=“mIR122標的部位m8”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
DEFINITION .
FEATURES Location/Qualifiers
STS 1294..1354
/label=“Cisd2 STS”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 941..946
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
polyA_signal 1644..1858
/label=“BGH\pA”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1261..1283
/label=“oMF155リバース”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
CDS 2751..3611
/label=“Amp-R”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 800..932
/label=“ステムループ”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
/ApEinfo_fwdcolor=#84b0dc
misc_feature 652..760
/label=“ステムループ”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 1666..1681
/label=“bGhpA”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1124..1148
/label=“oMF67”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 722..736
/label=“oMF184_2”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 935..935
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1481..1508
/label=“WPRE F”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
repeat_region 1..106
/label=“5’-ITR”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 1823..1846
/label=“ITR配列のためのoMF253 F”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
promoter 428..705
/label=“ニワトリβ-アクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 843..934
/label=“Cbh 3’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 735..755
/label=“oMF203”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 916..934
/label=“ハイブリッドイントロンの3’端部”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
exon 1050..1264
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
CDS 947..1354
/label=“Cisd2 CDS(CDGSH鉄-硫黄ドメイン含有タンパク質2)”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1258..1281
/label=“フォワードoMF152”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
misc_feature 935..940
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 1058..1126
/label=“Cisd2 misc_feature”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
enhancer 123..426
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 1711..1726
/label=“BhjPa R”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 706..934
/label=“ハイブリッドイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 230..328
/label=“ステムループ”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 1219..1243
/label=“oMF68”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
misc_feature 117..121
/label=“Cbh 5’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
repeat_region complement(1859..1988)
/label=“3’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 719..733
/label=“oMF186_2”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 1531..1555
/label=“oMF80”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1171..1195
/label=“oMF154-フォワード”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
exon 947..1049
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 1859..1880
/label=“Dループ(McCarty 2004に基づく末端分離部位)”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1397..1643
/label=“正確なWPRE3”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
misc_feature 123..934
/label=“Cbh”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
exon 1265..1354
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1859..1882
/label=“5’ITRを欠失”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 1382..1389
/label=“シード領域”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 1361..1390
/label=“mIR122標的部位m8”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
ORIGIN
1 ctgcgcgctc gctcgctcac tgaggccggg cgaccaaagg tcgcccgacg cccgggcttt
61 gcccgggcgg cctcagtgag cgagcgagcg cgcagagagg gagtggttaa gctagcggta
121 cccgttacat aacttacggt aaatggcccg cctggctgac cgcccaacga cccccgccca
181 ttgacgtcaa taatgacgta tgttcccata gtaacgccaa tagggacttt ccattgacgt
241 caatgggtgg agtatttacg gtaaactgcc cacttggcag tacatcaagt gtatcatatg
301 ccaagtacgc cccctattga cgtcaatgac ggtaaatggc ccgcctggca ttatgcccag
361 tacatgacct tatgggactt tcctacttgg cagtacatct acgtattagt catcgctatt
421 accatggtcg aggtgagccc cacgttctgc ttcactctcc ccatctcccc cccctcccca
481 cccccaattt tgtatttatt tattttttaa ttattttgtg cagcgatggg ggcggggggg
541 gggggggggc gcgcgccagg cggggcgggg cggggcgagg ggcggggcgg ggcgaggcgg
601 agaggtgcgg cggcagccaa tcagagcggc gcgctccgaa agtttccttt tatggcgagg
661 cggcggcggc ggcggcccta taaaaagcga agcgcgcggc gggcgggagt cgctgcgacg
721 ctgccttcgc cccgtgcccc gctccgccgc cgcctcgcgc cgcccgcccc ggctctgact
781 gaccgcgtta ctcccacagg tgagcgggcg ggacggccct tctcctccgg gctgtaatta
841 gctgagcaag aggtaagggt ttaagggatg gttggttggt ggggtattaa tgtttaatta
901 cctggagcac ctgcctgaaa tcactttttt tcagacgcgt gccaccatgg tcctggacag
961 cgtggcccgc atcgtgaagg tgcagctgcc cgcctacctc aagcagctcc cggtccccga
1021 cagcatcacc gggttcgccc gcctcacagt ttcagactgg ctccgcctac tgcccttcct
1081 cggggtactt gcgcttctgg gctacctcgc agtgcgccca ttcttcccaa agaagaagca
1141 acagaaggat agcttgatca atcttaagat acaaaaggaa aatcccaagg tggtgaatga
1201 gataaacatt gaagatctgt gtctcaccaa agcagcttat tgtaggtgct ggcggtccaa
1261 gacgtttcct gcctgtgatg gatcccataa taagcataat gaattgacag gcgataacgt
1321 gggtcctctc atcctgaaga agaaagaagt atagaagctt atcgcgaaca aacaccattg
1381 tcacactcca actagtataa tcaacctctg gattacaaaa tttgtgaaag attgactggt
1441 attcttaact atgttgctcc ttttacgcta tgtggatacg ctgctttaat gcctttgtat
1501 catgctattg cttcccgtat ggctttcatt ttctcctcct tgtataaatc ctggttagtt
1561 cttgccacgg cggaactcat cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg
1621 ttgggcactg acaattccgt ggtgcctcga ctgtgccttc tagttgccag ccatctgttg
1681 tttgcccctc ccccgtgcct tccttgaccc tggaaggtgc cactcccact gtcctttcct
1741 aataaaatga ggaaattgca tcgcattgtc tgagtaggtg tcattctatt ctggggggtg
1801 gggtggggca ggacagcaag ggggaggatt gggaagacaa tagcaggcat gctggggaag
1861 gaacccctag tgatggagtt ggccactccc tctctgcgcg ctcgctcgct cactgaggcc
1921 gggcgaccaa aggtcgcccg acgcccgggc tttgcccggg cggcctcagt gagcgagcga
1981 gcgcgcagcc ttaattaacc taattcactg gccgtcgttt tacaacgtcg tgactgggaa
2041 aaccctggcg ttacccaact taatcgcctt gcagcacatc cccctttcgc cagctggcgt
2101 aatagcgaag aggcccgcac cgatcgccct tcccaacagt tgcgcagcct gaatggcgaa
2161 tgggacgcgc cctgtagcgg cgcattaagc gcggcgggtg tggtggttac gcgcagcgtg
2221 accgctacac ttgccagcgc cctagcgccc gctcctttcg ctttcttccc ttcctttctc
2281 gccacgttcg ccggctttcc ccgtcaagct ctaaatcggg ggctcccttt agggttccga
2341 tttagtgctt tacggcacct cgaccccaaa aaacttgatt agggtgatgg ttcacgtagt
2401 gggccatcgc cctgatagac ggtttttcgc cctttgacgt tggagtccac gttctttaat
2461 agtggactct tgttccaaac tggaacaaca ctcaacccta tctcggtcta ttcttttgat
2521 ttataaggga ttttgccgat ttcggcctat tggttaaaaa atgagctgat ttaacaaaaa
2581 tttaacgcga attttaacaa aatattaacg cttacaattt aggtggcact tttcggggaa
2641 atgtgcgcgg aacccctatt tgtttatttt tctaaataca ttcaaatatg tatccgctca
2701 tgagacaata accctgataa atgcttcaat aatattgaaa aaggaagagt atgagtattc
2761 aacatttccg tgtcgccctt attccctttt ttgcggcatt ttgccttcct gtttttgctc
2821 acccagaaac gctggtgaaa gtaaaagatg ctgaagatca gttgggtgca cgagtgggtt
2881 acatcgaact ggatctcaac agcggtaaga tccttgagag ttttcgcccc gaagaacgtt
2941 ttccaatgat gagcactttt aaagttctgc tatgtggcgc ggtattatcc cgtattgacg
3001 ccgggcaaga gcaactcggt cgccgcatac actattctca gaatgacttg gttgagtact
3061 caccagtcac agaaaagcat cttacggatg gcatgacagt aagagaatta tgcagtgctg
3121 ccataaccat gagtgataac actgcggcca acttacttct gacaacgatc ggaggaccga
3181 aggagctaac cgcttttttg cacaacatgg gggatcatgt aactcgcctt gatcgttggg
3241 aaccggagct gaatgaagcc ataccaaacg acgagcgtga caccacgatg cctgtagcaa
3301 tggcaacaac gttgcgcaaa ctattaactg gcgaactact tactctagct tcccggcaac
3361 aattaataga ctggatggag gcggataaag ttgcaggacc acttctgcgc tcggcccttc
3421 cggctggctg gtttattgct gataaatctg gagccggtga gcgtgggtct cgcggtatca
3481 ttgcagcact ggggccagat ggtaagccct cccgtatcgt agttatctac acgacgggga
3541 gtcaggcaac tatggatgaa cgaaatagac agatcgctga gataggtgcc tcactgatta
3601 agcattggta actgtcagac caagtttact catatatact ttagattgat ttaaaacttc
3661 atttttaatt taaaaggatc taggtgaaga tcctttttga taatctcatg accaaaatcc
3721 cttaacgtga gttttcgttc cactgagcgt cagaccccgt agaaaagatc aaaggatctt
3781 cttgagatcc tttttttctg cgcgtaatct gctgcttgca aacaaaaaaa ccaccgctac
3841 cagcggtggt ttgtttgccg gatcaagagc taccaactct ttttccgaag gtaactggct
3901 tcagcagagc gcagatacca aatactgttc ttctagtgta gccgtagtta ggccaccact
3961 tcaagaactc tgtagcaccg cctacatacc tcgctctgct aatcctgtta ccagtggctg
4021 ctgccagtgg cgataagtcg tgtcttaccg ggttggactc aagacgatag ttaccggata
4081 aggcgcagcg gtcgggctga acggggggtt cgtgcacaca gcccagcttg gagcgaacga
4141 cctacaccga actgagatac ctacagcgtg agctatgaga aagcgccacg cttcccgaag
4201 ggagaaaggc ggacaggtat ccggtaagcg gcagggtcgg aacaggagag cgcacgaggg
4261 agcttccagg gggaaacgcc tggtatcttt atagtcctgt cgggtttcgc cacctctgac
4321 ttgagcgtcg atttttgtga tgctcgtcag gggggcggag cctatggaaa aacgccagca
4381 acgcggcctt tttacggttc ctggcctttt gctggccttt tgctcacatg ttctttcctg
4441 cgttatcccc tgattctgtg gataaccgta ttaccgcctt tgagtgagct gataccgctc
4501 gccgcagccg aacgaccgag cgcagcgagt cagtgagcga ggaagcggaa gagcgcccaa
4561 tacgcaaacc gcctctcccc gcgcgttggc cgattcatta atgcagctgg cacgacaggt
4621 ttcccgactg gaaagcgggc agtgagcgca acgcaattaa tgtgagttag ctcactcatt
4681 aggcacccca ggctttacac tttatgcttc cggctcgtat gttgtgtgga attgtgagcg
4741 gataacaatt tcacacagga aacagctatg accatgatta cgccagattt aattaaggga
4801 tctgggccac tccctct(配列番号13)
1 ctgcgcgctc gctcgctcac tgaggccggg cgaccaaagg tcgcccgacg cccgggcttt
61 gcccgggcgg cctcagtgag cgagcgagcg cgcagagagg gagtggttaa gctagcggta
121 cccgttacat aacttacggt aaatggcccg cctggctgac cgcccaacga cccccgccca
181 ttgacgtcaa taatgacgta tgttcccata gtaacgccaa tagggacttt ccattgacgt
241 caatgggtgg agtatttacg gtaaactgcc cacttggcag tacatcaagt gtatcatatg
301 ccaagtacgc cccctattga cgtcaatgac ggtaaatggc ccgcctggca ttatgcccag
361 tacatgacct tatgggactt tcctacttgg cagtacatct acgtattagt catcgctatt
421 accatggtcg aggtgagccc cacgttctgc ttcactctcc ccatctcccc cccctcccca
481 cccccaattt tgtatttatt tattttttaa ttattttgtg cagcgatggg ggcggggggg
541 gggggggggc gcgcgccagg cggggcgggg cggggcgagg ggcggggcgg ggcgaggcgg
601 agaggtgcgg cggcagccaa tcagagcggc gcgctccgaa agtttccttt tatggcgagg
661 cggcggcggc ggcggcccta taaaaagcga agcgcgcggc gggcgggagt cgctgcgacg
721 ctgccttcgc cccgtgcccc gctccgccgc cgcctcgcgc cgcccgcccc ggctctgact
781 gaccgcgtta ctcccacagg tgagcgggcg ggacggccct tctcctccgg gctgtaatta
841 gctgagcaag aggtaagggt ttaagggatg gttggttggt ggggtattaa tgtttaatta
901 cctggagcac ctgcctgaaa tcactttttt tcagacgcgt gccaccatgg tcctggacag
961 cgtggcccgc atcgtgaagg tgcagctgcc cgcctacctc aagcagctcc cggtccccga
1021 cagcatcacc gggttcgccc gcctcacagt ttcagactgg ctccgcctac tgcccttcct
1081 cggggtactt gcgcttctgg gctacctcgc agtgcgccca ttcttcccaa agaagaagca
1141 acagaaggat agcttgatca atcttaagat acaaaaggaa aatcccaagg tggtgaatga
1201 gataaacatt gaagatctgt gtctcaccaa agcagcttat tgtaggtgct ggcggtccaa
1261 gacgtttcct gcctgtgatg gatcccataa taagcataat gaattgacag gcgataacgt
1321 gggtcctctc atcctgaaga agaaagaagt atagaagctt atcgcgaaca aacaccattg
1381 tcacactcca actagtataa tcaacctctg gattacaaaa tttgtgaaag attgactggt
1441 attcttaact atgttgctcc ttttacgcta tgtggatacg ctgctttaat gcctttgtat
1501 catgctattg cttcccgtat ggctttcatt ttctcctcct tgtataaatc ctggttagtt
1561 cttgccacgg cggaactcat cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg
1621 ttgggcactg acaattccgt ggtgcctcga ctgtgccttc tagttgccag ccatctgttg
1681 tttgcccctc ccccgtgcct tccttgaccc tggaaggtgc cactcccact gtcctttcct
1741 aataaaatga ggaaattgca tcgcattgtc tgagtaggtg tcattctatt ctggggggtg
1801 gggtggggca ggacagcaag ggggaggatt gggaagacaa tagcaggcat gctggggaag
1861 gaacccctag tgatggagtt ggccactccc tctctgcgcg ctcgctcgct cactgaggcc
1921 gggcgaccaa aggtcgcccg acgcccgggc tttgcccggg cggcctcagt gagcgagcga
1981 gcgcgcagcc ttaattaacc taattcactg gccgtcgttt tacaacgtcg tgactgggaa
2041 aaccctggcg ttacccaact taatcgcctt gcagcacatc cccctttcgc cagctggcgt
2101 aatagcgaag aggcccgcac cgatcgccct tcccaacagt tgcgcagcct gaatggcgaa
2161 tgggacgcgc cctgtagcgg cgcattaagc gcggcgggtg tggtggttac gcgcagcgtg
2221 accgctacac ttgccagcgc cctagcgccc gctcctttcg ctttcttccc ttcctttctc
2281 gccacgttcg ccggctttcc ccgtcaagct ctaaatcggg ggctcccttt agggttccga
2341 tttagtgctt tacggcacct cgaccccaaa aaacttgatt agggtgatgg ttcacgtagt
2401 gggccatcgc cctgatagac ggtttttcgc cctttgacgt tggagtccac gttctttaat
2461 agtggactct tgttccaaac tggaacaaca ctcaacccta tctcggtcta ttcttttgat
2521 ttataaggga ttttgccgat ttcggcctat tggttaaaaa atgagctgat ttaacaaaaa
2581 tttaacgcga attttaacaa aatattaacg cttacaattt aggtggcact tttcggggaa
2641 atgtgcgcgg aacccctatt tgtttatttt tctaaataca ttcaaatatg tatccgctca
2701 tgagacaata accctgataa atgcttcaat aatattgaaa aaggaagagt atgagtattc
2761 aacatttccg tgtcgccctt attccctttt ttgcggcatt ttgccttcct gtttttgctc
2821 acccagaaac gctggtgaaa gtaaaagatg ctgaagatca gttgggtgca cgagtgggtt
2881 acatcgaact ggatctcaac agcggtaaga tccttgagag ttttcgcccc gaagaacgtt
2941 ttccaatgat gagcactttt aaagttctgc tatgtggcgc ggtattatcc cgtattgacg
3001 ccgggcaaga gcaactcggt cgccgcatac actattctca gaatgacttg gttgagtact
3061 caccagtcac agaaaagcat cttacggatg gcatgacagt aagagaatta tgcagtgctg
3121 ccataaccat gagtgataac actgcggcca acttacttct gacaacgatc ggaggaccga
3181 aggagctaac cgcttttttg cacaacatgg gggatcatgt aactcgcctt gatcgttggg
3241 aaccggagct gaatgaagcc ataccaaacg acgagcgtga caccacgatg cctgtagcaa
3301 tggcaacaac gttgcgcaaa ctattaactg gcgaactact tactctagct tcccggcaac
3361 aattaataga ctggatggag gcggataaag ttgcaggacc acttctgcgc tcggcccttc
3421 cggctggctg gtttattgct gataaatctg gagccggtga gcgtgggtct cgcggtatca
3481 ttgcagcact ggggccagat ggtaagccct cccgtatcgt agttatctac acgacgggga
3541 gtcaggcaac tatggatgaa cgaaatagac agatcgctga gataggtgcc tcactgatta
3601 agcattggta actgtcagac caagtttact catatatact ttagattgat ttaaaacttc
3661 atttttaatt taaaaggatc taggtgaaga tcctttttga taatctcatg accaaaatcc
3721 cttaacgtga gttttcgttc cactgagcgt cagaccccgt agaaaagatc aaaggatctt
3781 cttgagatcc tttttttctg cgcgtaatct gctgcttgca aacaaaaaaa ccaccgctac
3841 cagcggtggt ttgtttgccg gatcaagagc taccaactct ttttccgaag gtaactggct
3901 tcagcagagc gcagatacca aatactgttc ttctagtgta gccgtagtta ggccaccact
3961 tcaagaactc tgtagcaccg cctacatacc tcgctctgct aatcctgtta ccagtggctg
4021 ctgccagtgg cgataagtcg tgtcttaccg ggttggactc aagacgatag ttaccggata
4081 aggcgcagcg gtcgggctga acggggggtt cgtgcacaca gcccagcttg gagcgaacga
4141 cctacaccga actgagatac ctacagcgtg agctatgaga aagcgccacg cttcccgaag
4201 ggagaaaggc ggacaggtat ccggtaagcg gcagggtcgg aacaggagag cgcacgaggg
4261 agcttccagg gggaaacgcc tggtatcttt atagtcctgt cgggtttcgc cacctctgac
4321 ttgagcgtcg atttttgtga tgctcgtcag gggggcggag cctatggaaa aacgccagca
4381 acgcggcctt tttacggttc ctggcctttt gctggccttt tgctcacatg ttctttcctg
4441 cgttatcccc tgattctgtg gataaccgta ttaccgcctt tgagtgagct gataccgctc
4501 gccgcagccg aacgaccgag cgcagcgagt cagtgagcga ggaagcggaa gagcgcccaa
4561 tacgcaaacc gcctctcccc gcgcgttggc cgattcatta atgcagctgg cacgacaggt
4621 ttcccgactg gaaagcgggc agtgagcgca acgcaattaa tgtgagttag ctcactcatt
4681 aggcacccca ggctttacac tttatgcttc cggctcgtat gttgtgtgga attgtgagcg
4741 gataacaatt tcacacagga aacagctatg accatgatta cgccagattt aattaaggga
4801 tctgggccac tccctct(配列番号13)
LOCUS scAAV-CbhM-GFP-miR122-8 5129 bp ds-DNA環状
DEFINITION
FEATURES Location/Qualifiers
CDS 3829..4689
/label=“Amp-R”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 2460..2467
/label=“シード領域”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
promoter 1194..1471
/label=“ニワトリβ-アクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 1707..1712
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1682..1700
/label=“ハイブリッドイントロンの3’端部”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 883..887
/label=“Cbh 5’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 1609..1700
/label=“Cbh 3’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 2937..2960
/label=“5’ITRを欠失”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 2439..2468
/label=“mIR122標的部位m8”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
polyA_signal 2722..2936
/label=“BGH\pA”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 2475..2721
/label=“正確なWPRE3”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
misc_feature 2609..2633
/label=“oMF80”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
enhancer 889..1192
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
repeat_region complement(2937..3066)
/label=“3’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 1701..1706
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
CDS 1713..2429
/label=“eGFP”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 1701..1701
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1472..1700
/label=“ハイブリッドイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 889..1700
/label=“Cbh”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
/ApEinfo_fwdcolor=#84b0dc
repeat_region 767..872
/label=“5’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
DEFINITION
FEATURES Location/Qualifiers
CDS 3829..4689
/label=“Amp-R”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 2460..2467
/label=“シード領域”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
promoter 1194..1471
/label=“ニワトリβ-アクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 1707..1712
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1682..1700
/label=“ハイブリッドイントロンの3’端部”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 883..887
/label=“Cbh 5’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 1609..1700
/label=“Cbh 3’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
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/label=“5’ITRを欠失”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 2439..2468
/label=“mIR122標的部位m8”
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/label=“BGH\pA”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 2475..2721
/label=“正確なWPRE3”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
misc_feature 2609..2633
/label=“oMF80”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
enhancer 889..1192
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
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/label=“3’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
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/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
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/label=“eGFP”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
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/label=“クローニングスカー”
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/label=“ハイブリッドイントロン”
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/label=“Cbh”
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/label=“5’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
ORIGIN
1 gttggactca agacgatagt taccggataa ggcgcagcgg tcgggctgaa cggggggttc
61 gtgcacacag cccagcttgg agcgaacgac ctacaccgaa ctgagatacc tacagcgtga
121 gctatgagaa agcgccacgc ttcccgaagg gagaaaggcg gacaggtatc cggtaagcgg
181 cagggtcgga acaggagagc gcacgaggga gcttccaggg ggaaacgcct ggtatcttta
241 tagtcctgtc gggtttcgcc acctctgact tgagcgtcga tttttgtgat gctcgtcagg
301 ggggcggagc ctatggaaaa acgccagcaa cgcggccttt ttacggttcc tggccttttg
361 ctggcctttt gctcacatgt tctttcctgc gttatcccct gattctgtgg ataaccgtat
421 taccgccttt gagtgagctg ataccgctcg ccgcagccga acgaccgagc gcagcgagtc
481 agtgagcgag gaagcggaag agcgcccaat acgcaaaccg cctctccccg cgcgttggcc
541 gattcattaa tgcagctggc acgacaggtt tcccgactgg aaagcgggca gtgagcgcaa
601 cgcaattaat gtgagttagc tcactcatta ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc
661 ggctcgtatg ttgtgtggaa ttgtgagcgg ataacaattt cacacaggaa acagctatga
721 ccatgattac gccagattta attaagggat ctgggccact ccctctctgc gcgctcgctc
781 gctcactgag gccgggcgac caaaggtcgc ccgacgcccg ggctttgccc gggcggcctc
841 agtgagcgag cgagcgcgca gagagggagt ggttaagcta gcggtacccg ttacataact
901 tacggtaaat ggcccgcctg gctgaccgcc caacgacccc cgcccattga cgtcaataat
961 gacgtatgtt cccatagtaa cgccaatagg gactttccat tgacgtcaat gggtggagta
1021 tttacggtaa actgcccact tggcagtaca tcaagtgtat catatgccaa gtacgccccc
1081 tattgacgtc aatgacggta aatggcccgc ctggcattat gcccagtaca tgaccttatg
1141 ggactttcct acttggcagt acatctacgt attagtcatc gctattacca tggtcgaggt
1201 gagccccacg ttctgcttca ctctccccat ctcccccccc tccccacccc caattttgta
1261 tttatttatt ttttaattat tttgtgcagc gatgggggcg gggggggggg gggggcgcgc
1321 gccaggcggg gcggggcggg gcgaggggcg gggcggggcg aggcggagag gtgcggcggc
1381 agccaatcag agcggcgcgc tccgaaagtt tccttttatg gcgaggcggc ggcggcggcg
1441 gccctataaa aagcgaagcg cgcggcgggc gggagtcgct gcgacgctgc cttcgccccg
1501 tgccccgctc cgccgccgcc tcgcgccgcc cgccccggct ctgactgacc gcgttactcc
1561 cacaggtgag cgggcgggac ggcccttctc ctccgggctg taattagctg agcaagaggt
1621 aagggtttaa gggatggttg gttggtgggg tattaatgtt taattacctg gagcacctgc
1681 ctgaaatcac tttttttcag acgcgtgcca ccatggtgag caagggcgag gagctgttca
1741 ccggggtggt gcccatcctg gtcgagctgg acggcgacgt aaacggccac aagttcagcg
1801 tgtccggcga gggcgagggc gatgccacct acggcaagct gaccctgaag ttcatctgca
1861 ccaccggcaa gctgcccgtg ccctggccca ccctcgtgac caccctgacc tacggcgtgc
1921 agtgcttcag ccgctacccc gaccacatga agcagcacga cttcttcaag tccgccatgc
1981 ccgaaggcta cgtccaggag cgcaccatct tcttcaagga cgacggcaac tacaagaccc
2041 gcgccgaggt gaagttcgag ggcgacaccc tggtgaaccg catcgagctg aagggcatcg
2101 acttcaagga ggacggcaac atcctggggc acaagctgga gtacaactac aacagccaca
2161 acgtctatat catggccgac aagcagaaga acggcatcaa ggtgaacttc aagatccgcc
2221 acaacatcga ggacggcagc gtgcagctcg ccgaccacta ccagcagaac acccccatcg
2281 gcgacggccc cgtgctgctg cccgacaacc actacctgag cacccagtcc gccctgagca
2341 aagaccccaa cgagaagcgc gatcacatgg tcctgctgga gttcgtgacc gccgccggga
2401 tcactctcgg catggacgag ctgtacaagt aaaagcttat cgcgaacaaa caccattgtc
2461 acactccaac tagtataatc aacctctgga ttacaaaatt tgtgaaagat tgactggtat
2521 tcttaactat gttgctcctt ttacgctatg tggatacgct gctttaatgc ctttgtatca
2581 tgctattgct tcccgtatgg ctttcatttt ctcctccttg tataaatcct ggttagttct
2641 tgccacggcg gaactcatcg ccgcctgcct tgcccgctgc tggacagggg ctcggctgtt
2701 gggcactgac aattccgtgg tgcctcgact gtgccttcta gttgccagcc atctgttgtt
2761 tgcccctccc ccgtgccttc cttgaccctg gaaggtgcca ctcccactgt cctttcctaa
2821 taaaatgagg aaattgcatc gcattgtctg agtaggtgtc attctattct ggggggtggg
2881 gtggggcagg acagcaaggg ggaggattgg gaagacaata gcaggcatgc tggggaagga
2941 acccctagtg atggagttgg ccactccctc tctgcgcgct cgctcgctca ctgaggccgg
3001 gcgaccaaag gtcgcccgac gcccgggctt tgcccgggcg gcctcagtga gcgagcgagc
3061 gcgcagcctt aattaaccta attcactggc cgtcgtttta caacgtcgtg actgggaaaa
3121 ccctggcgtt acccaactta atcgccttgc agcacatccc cctttcgcca gctggcgtaa
3181 tagcgaagag gcccgcaccg atcgcccttc ccaacagttg cgcagcctga atggcgaatg
3241 ggacgcgccc tgtagcggcg cattaagcgc ggcgggtgtg gtggttacgc gcagcgtgac
3301 cgctacactt gccagcgccc tagcgcccgc tcctttcgct ttcttccctt cctttctcgc
3361 cacgttcgcc ggctttcccc gtcaagctct aaatcggggg ctccctttag ggttccgatt
3421 tagtgcttta cggcacctcg accccaaaaa acttgattag ggtgatggtt cacgtagtgg
3481 gccatcgccc tgatagacgg tttttcgccc tttgacgttg gagtccacgt tctttaatag
3541 tggactcttg ttccaaactg gaacaacact caaccctatc tcggtctatt cttttgattt
3601 ataagggatt ttgccgattt cggcctattg gttaaaaaat gagctgattt aacaaaaatt
3661 taacgcgaat tttaacaaaa tattaacgct tacaatttag gtggcacttt tcggggaaat
3721 gtgcgcggaa cccctatttg tttatttttc taaatacatt caaatatgta tccgctcatg
3781 agacaataac cctgataaat gcttcaataa tattgaaaaa ggaagagtat gagtattcaa
3841 catttccgtg tcgcccttat tccctttttt gcggcatttt gccttcctgt ttttgctcac
3901 ccagaaacgc tggtgaaagt aaaagatgct gaagatcagt tgggtgcacg agtgggttac
3961 atcgaactgg atctcaacag cggtaagatc cttgagagtt ttcgccccga agaacgtttt
4021 ccaatgatga gcacttttaa agttctgcta tgtggcgcgg tattatcccg tattgacgcc
4081 gggcaagagc aactcggtcg ccgcatacac tattctcaga atgacttggt tgagtactca
4141 ccagtcacag aaaagcatct tacggatggc atgacagtaa gagaattatg cagtgctgcc
4201 ataaccatga gtgataacac tgcggccaac ttacttctga caacgatcgg aggaccgaag
4261 gagctaaccg cttttttgca caacatgggg gatcatgtaa ctcgccttga tcgttgggaa
4321 ccggagctga atgaagccat accaaacgac gagcgtgaca ccacgatgcc tgtagcaatg
4381 gcaacaacgt tgcgcaaact attaactggc gaactactta ctctagcttc ccggcaacaa
4441 ttaatagact ggatggaggc ggataaagtt gcaggaccac ttctgcgctc ggcccttccg
4501 gctggctggt ttattgctga taaatctgga gccggtgagc gtgggtctcg cggtatcatt
4561 gcagcactgg ggccagatgg taagccctcc cgtatcgtag ttatctacac gacggggagt
4621 caggcaacta tggatgaacg aaatagacag atcgctgaga taggtgcctc actgattaag
4681 cattggtaac tgtcagacca agtttactca tatatacttt agattgattt aaaacttcat
4741 ttttaattta aaaggatcta ggtgaagatc ctttttgata atctcatgac caaaatccct
4801 taacgtgagt tttcgttcca ctgagcgtca gaccccgtag aaaagatcaa aggatcttct
4861 tgagatcctt tttttctgcg cgtaatctgc tgcttgcaaa caaaaaaacc accgctacca
4921 gcggtggttt gtttgccgga tcaagagcta ccaactcttt ttccgaaggt aactggcttc
4981 agcagagcgc agataccaaa tactgttctt ctagtgtagc cgtagttagg ccaccacttc
5041 aagaactctg tagcaccgcc tacatacctc gctctgctaa tcctgttacc agtggctgct
5101 gccagtggcg ataagtcgtg tcttaccgg(配列番号14)
1 gttggactca agacgatagt taccggataa ggcgcagcgg tcgggctgaa cggggggttc
61 gtgcacacag cccagcttgg agcgaacgac ctacaccgaa ctgagatacc tacagcgtga
121 gctatgagaa agcgccacgc ttcccgaagg gagaaaggcg gacaggtatc cggtaagcgg
181 cagggtcgga acaggagagc gcacgaggga gcttccaggg ggaaacgcct ggtatcttta
241 tagtcctgtc gggtttcgcc acctctgact tgagcgtcga tttttgtgat gctcgtcagg
301 ggggcggagc ctatggaaaa acgccagcaa cgcggccttt ttacggttcc tggccttttg
361 ctggcctttt gctcacatgt tctttcctgc gttatcccct gattctgtgg ataaccgtat
421 taccgccttt gagtgagctg ataccgctcg ccgcagccga acgaccgagc gcagcgagtc
481 agtgagcgag gaagcggaag agcgcccaat acgcaaaccg cctctccccg cgcgttggcc
541 gattcattaa tgcagctggc acgacaggtt tcccgactgg aaagcgggca gtgagcgcaa
601 cgcaattaat gtgagttagc tcactcatta ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc
661 ggctcgtatg ttgtgtggaa ttgtgagcgg ataacaattt cacacaggaa acagctatga
721 ccatgattac gccagattta attaagggat ctgggccact ccctctctgc gcgctcgctc
781 gctcactgag gccgggcgac caaaggtcgc ccgacgcccg ggctttgccc gggcggcctc
841 agtgagcgag cgagcgcgca gagagggagt ggttaagcta gcggtacccg ttacataact
901 tacggtaaat ggcccgcctg gctgaccgcc caacgacccc cgcccattga cgtcaataat
961 gacgtatgtt cccatagtaa cgccaatagg gactttccat tgacgtcaat gggtggagta
1021 tttacggtaa actgcccact tggcagtaca tcaagtgtat catatgccaa gtacgccccc
1081 tattgacgtc aatgacggta aatggcccgc ctggcattat gcccagtaca tgaccttatg
1141 ggactttcct acttggcagt acatctacgt attagtcatc gctattacca tggtcgaggt
1201 gagccccacg ttctgcttca ctctccccat ctcccccccc tccccacccc caattttgta
1261 tttatttatt ttttaattat tttgtgcagc gatgggggcg gggggggggg gggggcgcgc
1321 gccaggcggg gcggggcggg gcgaggggcg gggcggggcg aggcggagag gtgcggcggc
1381 agccaatcag agcggcgcgc tccgaaagtt tccttttatg gcgaggcggc ggcggcggcg
1441 gccctataaa aagcgaagcg cgcggcgggc gggagtcgct gcgacgctgc cttcgccccg
1501 tgccccgctc cgccgccgcc tcgcgccgcc cgccccggct ctgactgacc gcgttactcc
1561 cacaggtgag cgggcgggac ggcccttctc ctccgggctg taattagctg agcaagaggt
1621 aagggtttaa gggatggttg gttggtgggg tattaatgtt taattacctg gagcacctgc
1681 ctgaaatcac tttttttcag acgcgtgcca ccatggtgag caagggcgag gagctgttca
1741 ccggggtggt gcccatcctg gtcgagctgg acggcgacgt aaacggccac aagttcagcg
1801 tgtccggcga gggcgagggc gatgccacct acggcaagct gaccctgaag ttcatctgca
1861 ccaccggcaa gctgcccgtg ccctggccca ccctcgtgac caccctgacc tacggcgtgc
1921 agtgcttcag ccgctacccc gaccacatga agcagcacga cttcttcaag tccgccatgc
1981 ccgaaggcta cgtccaggag cgcaccatct tcttcaagga cgacggcaac tacaagaccc
2041 gcgccgaggt gaagttcgag ggcgacaccc tggtgaaccg catcgagctg aagggcatcg
2101 acttcaagga ggacggcaac atcctggggc acaagctgga gtacaactac aacagccaca
2161 acgtctatat catggccgac aagcagaaga acggcatcaa ggtgaacttc aagatccgcc
2221 acaacatcga ggacggcagc gtgcagctcg ccgaccacta ccagcagaac acccccatcg
2281 gcgacggccc cgtgctgctg cccgacaacc actacctgag cacccagtcc gccctgagca
2341 aagaccccaa cgagaagcgc gatcacatgg tcctgctgga gttcgtgacc gccgccggga
2401 tcactctcgg catggacgag ctgtacaagt aaaagcttat cgcgaacaaa caccattgtc
2461 acactccaac tagtataatc aacctctgga ttacaaaatt tgtgaaagat tgactggtat
2521 tcttaactat gttgctcctt ttacgctatg tggatacgct gctttaatgc ctttgtatca
2581 tgctattgct tcccgtatgg ctttcatttt ctcctccttg tataaatcct ggttagttct
2641 tgccacggcg gaactcatcg ccgcctgcct tgcccgctgc tggacagggg ctcggctgtt
2701 gggcactgac aattccgtgg tgcctcgact gtgccttcta gttgccagcc atctgttgtt
2761 tgcccctccc ccgtgccttc cttgaccctg gaaggtgcca ctcccactgt cctttcctaa
2821 taaaatgagg aaattgcatc gcattgtctg agtaggtgtc attctattct ggggggtggg
2881 gtggggcagg acagcaaggg ggaggattgg gaagacaata gcaggcatgc tggggaagga
2941 acccctagtg atggagttgg ccactccctc tctgcgcgct cgctcgctca ctgaggccgg
3001 gcgaccaaag gtcgcccgac gcccgggctt tgcccgggcg gcctcagtga gcgagcgagc
3061 gcgcagcctt aattaaccta attcactggc cgtcgtttta caacgtcgtg actgggaaaa
3121 ccctggcgtt acccaactta atcgccttgc agcacatccc cctttcgcca gctggcgtaa
3181 tagcgaagag gcccgcaccg atcgcccttc ccaacagttg cgcagcctga atggcgaatg
3241 ggacgcgccc tgtagcggcg cattaagcgc ggcgggtgtg gtggttacgc gcagcgtgac
3301 cgctacactt gccagcgccc tagcgcccgc tcctttcgct ttcttccctt cctttctcgc
3361 cacgttcgcc ggctttcccc gtcaagctct aaatcggggg ctccctttag ggttccgatt
3421 tagtgcttta cggcacctcg accccaaaaa acttgattag ggtgatggtt cacgtagtgg
3481 gccatcgccc tgatagacgg tttttcgccc tttgacgttg gagtccacgt tctttaatag
3541 tggactcttg ttccaaactg gaacaacact caaccctatc tcggtctatt cttttgattt
3601 ataagggatt ttgccgattt cggcctattg gttaaaaaat gagctgattt aacaaaaatt
3661 taacgcgaat tttaacaaaa tattaacgct tacaatttag gtggcacttt tcggggaaat
3721 gtgcgcggaa cccctatttg tttatttttc taaatacatt caaatatgta tccgctcatg
3781 agacaataac cctgataaat gcttcaataa tattgaaaaa ggaagagtat gagtattcaa
3841 catttccgtg tcgcccttat tccctttttt gcggcatttt gccttcctgt ttttgctcac
3901 ccagaaacgc tggtgaaagt aaaagatgct gaagatcagt tgggtgcacg agtgggttac
3961 atcgaactgg atctcaacag cggtaagatc cttgagagtt ttcgccccga agaacgtttt
4021 ccaatgatga gcacttttaa agttctgcta tgtggcgcgg tattatcccg tattgacgcc
4081 gggcaagagc aactcggtcg ccgcatacac tattctcaga atgacttggt tgagtactca
4141 ccagtcacag aaaagcatct tacggatggc atgacagtaa gagaattatg cagtgctgcc
4201 ataaccatga gtgataacac tgcggccaac ttacttctga caacgatcgg aggaccgaag
4261 gagctaaccg cttttttgca caacatgggg gatcatgtaa ctcgccttga tcgttgggaa
4321 ccggagctga atgaagccat accaaacgac gagcgtgaca ccacgatgcc tgtagcaatg
4381 gcaacaacgt tgcgcaaact attaactggc gaactactta ctctagcttc ccggcaacaa
4441 ttaatagact ggatggaggc ggataaagtt gcaggaccac ttctgcgctc ggcccttccg
4501 gctggctggt ttattgctga taaatctgga gccggtgagc gtgggtctcg cggtatcatt
4561 gcagcactgg ggccagatgg taagccctcc cgtatcgtag ttatctacac gacggggagt
4621 caggcaacta tggatgaacg aaatagacag atcgctgaga taggtgcctc actgattaag
4681 cattggtaac tgtcagacca agtttactca tatatacttt agattgattt aaaacttcat
4741 ttttaattta aaaggatcta ggtgaagatc ctttttgata atctcatgac caaaatccct
4801 taacgtgagt tttcgttcca ctgagcgtca gaccccgtag aaaagatcaa aggatcttct
4861 tgagatcctt tttttctgcg cgtaatctgc tgcttgcaaa caaaaaaacc accgctacca
4921 gcggtggttt gtttgccgga tcaagagcta ccaactcttt ttccgaaggt aactggcttc
4981 agcagagcgc agataccaaa tactgttctt ctagtgtagc cgtagttagg ccaccacttc
5041 aagaactctg tagcaccgcc tacatacctc gctctgctaa tcctgttacc agtggctgct
5101 gccagtggcg ataagtcgtg tcttaccgg(配列番号14)
LOCUS scAAV-CbhM-PTEN-miR122- 5283 bp ds-DNA環状
DEFINITION
FEATURES Location/Qualifiers
misc_feature 1701..1706
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 1713..2924
/label=“mPTEN”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 1682..1700
/label=“ハイブリッドイントロンの3’端部”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 1609..1700
/label=“Cbh 3’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
CDS 3983..4843
/label=“Amp-R”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 2934..2963
/label=“mIR122標的部位m8”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 1472..1700
/label=“ハイブリッドイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
promoter 1194..1471
/label=“ニワトリβ-アクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
repeat_region 767..872
/label=“5’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
enhancer 889..1192
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 1701..1701
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1707..1712
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 2970..3090
/label=“SV40pA”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 3091..3114
/label=“5’ITRを欠失”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
repeat_region complement(3091..3220)
/label=“3’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 889..1700
/label=“Cbh”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
/ApEinfo_fwdcolor=#84b0dc
misc_feature 883..887
/label=“Cbh 5’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 2955..2962
/label=“シード領域”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
DEFINITION
FEATURES Location/Qualifiers
misc_feature 1701..1706
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 1713..2924
/label=“mPTEN”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 1682..1700
/label=“ハイブリッドイントロンの3’端部”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 1609..1700
/label=“Cbh 3’クローニング部位”
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/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
CDS 3983..4843
/label=“Amp-R”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 2934..2963
/label=“mIR122標的部位m8”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 1472..1700
/label=“ハイブリッドイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
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promoter 1194..1471
/label=“ニワトリβ-アクチンプロモーター”
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/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
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/label=“5’ITR”
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/label=“CMVエンハンサー”
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misc_feature 1701..1701
/label=“クローニングスカー”
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/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
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/label=“SV40pA”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
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misc_feature 3091..3114
/label=“5’ITRを欠失”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
repeat_region complement(3091..3220)
/label=“3’ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 889..1700
/label=“Cbh”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
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/label=“Cbh 5’クローニング部位”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 2955..2962
/label=“シード領域”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
ORIGIN
1 gttggactca agacgatagt taccggataa ggcgcagcgg tcgggctgaa cggggggttc
61 gtgcacacag cccagcttgg agcgaacgac ctacaccgaa ctgagatacc tacagcgtga
121 gctatgagaa agcgccacgc ttcccgaagg gagaaaggcg gacaggtatc cggtaagcgg
181 cagggtcgga acaggagagc gcacgaggga gcttccaggg ggaaacgcct ggtatcttta
241 tagtcctgtc gggtttcgcc acctctgact tgagcgtcga tttttgtgat gctcgtcagg
301 ggggcggagc ctatggaaaa acgccagcaa cgcggccttt ttacggttcc tggccttttg
361 ctggcctttt gctcacatgt tctttcctgc gttatcccct gattctgtgg ataaccgtat
421 taccgccttt gagtgagctg ataccgctcg ccgcagccga acgaccgagc gcagcgagtc
481 agtgagcgag gaagcggaag agcgcccaat acgcaaaccg cctctccccg cgcgttggcc
541 gattcattaa tgcagctggc acgacaggtt tcccgactgg aaagcgggca gtgagcgcaa
601 cgcaattaat gtgagttagc tcactcatta ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc
661 ggctcgtatg ttgtgtggaa ttgtgagcgg ataacaattt cacacaggaa acagctatga
721 ccatgattac gccagattta attaagggat ctgggccact ccctctctgc gcgctcgctc
781 gctcactgag gccgggcgac caaaggtcgc ccgacgcccg ggctttgccc gggcggcctc
841 agtgagcgag cgagcgcgca gagagggagt ggttaagcta gcggtacccg ttacataact
901 tacggtaaat ggcccgcctg gctgaccgcc caacgacccc cgcccattga cgtcaataat
961 gacgtatgtt cccatagtaa cgccaatagg gactttccat tgacgtcaat gggtggagta
1021 tttacggtaa actgcccact tggcagtaca tcaagtgtat catatgccaa gtacgccccc
1081 tattgacgtc aatgacggta aatggcccgc ctggcattat gcccagtaca tgaccttatg
1141 ggactttcct acttggcagt acatctacgt attagtcatc gctattacca tggtcgaggt
1201 gagccccacg ttctgcttca ctctccccat ctcccccccc tccccacccc caattttgta
1261 tttatttatt ttttaattat tttgtgcagc gatgggggcg gggggggggg gggggcgcgc
1321 gccaggcggg gcggggcggg gcgaggggcg gggcggggcg aggcggagag gtgcggcggc
1381 agccaatcag agcggcgcgc tccgaaagtt tccttttatg gcgaggcggc ggcggcggcg
1441 gccctataaa aagcgaagcg cgcggcgggc gggagtcgct gcgacgctgc cttcgccccg
1501 tgccccgctc cgccgccgcc tcgcgccgcc cgccccggct ctgactgacc gcgttactcc
1561 cacaggtgag cgggcgggac ggcccttctc ctccgggctg taattagctg agcaagaggt
1621 aagggtttaa gggatggttg gttggtgggg tattaatgtt taattacctg gagcacctgc
1681 ctgaaatcac tttttttcag acgcgtgcca ccatgacagc catcatcaaa gagatcgtta
1741 gcagaaacaa aaggagatat caagaggatg gattcgactt agacttgacc tatatttatc
1801 caaatattat tgctatggga tttcctgcag aaagacttga aggtgtatac aggaacaata
1861 ttgatgatgt agtaaggttt ttggattcaa agcataaaaa ccattacaag atatacaatc
1921 tatgtgctga gagacattat gacaccgcca aatttaactg cagagttgca cagtatcctt
1981 ttgaagacca taacccacca cagctagaac ttatcaaacc cttctgtgaa gatcttgacc
2041 aatggctaag tgaagatgac aatcatgttg cagcaattca ctgtaaagct ggaaagggac
2101 ggactggtgt aatgatttgt gcatatttat tgcatcgggg caaattttta aaggcacaag
2161 aggccctaga tttttatggg gaagtaagga ccagagacaa aaagggagtc acaattccca
2221 gtcagaggcg ctatgtatat tattatagct acctgctaaa aaatcacctg gattacagac
2281 ccgtggcact gctgtttcac aagatgatgt ttgaaactat tccaatgttc agtggcggaa
2341 cttgcaatcc tcagtttgtg gtctgccagc taaaggtgaa gatatattcc tccaattcag
2401 gacccacgcg gcgggaggac aagttcatgt actttgagtt ccctcagcca ttgcctgtgt
2461 gtggtgatat caaagtagag ttcttccaca aacagaacaa gatgctcaaa aaggacaaaa
2521 tgtttcactt ttgggtaaat acgttcttca taccaggacc agaggaaacc tcagaaaaag
2581 tggaaaatgg aagtctttgt gatcaggaaa tcgatagcat ttgcagtata gagcgtgcag
2641 ataatgacaa ggagtatctt gtactcaccc taacaaaaaa cgatcttgac aaagcaaaca
2701 aagacaaggc caaccgatac ttctctccaa attttaaggt gaaactatac tttacaaaaa
2761 cagtagagga gccatcaaat ccagaggcta gcagttcaac ttctgtgact ccagatgtta
2821 gtgacaatga acctgatcat tatagatatt ctgacaccac tgactctgat ccagagaatg
2881 aaccttttga tgaagatcag cattcacaaa ttacaaaagt ctgataaaag cttatcgcga
2941 acaaacacca ttgtcacact ccaactagtt aagatacatt gatgagtttg gacaaaccac
3001 aactagaatg cagtgaaaaa aatgctttat ttgtgaaatt tgtgatgcta ttgctttatt
3061 tgtaaccatt ataagctgca ataaacaagt aggaacccct agtgatggag ttggccactc
3121 cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgggcgacc aaaggtcgcc cgacgcccgg
3181 gctttgcccg ggcggcctca gtgagcgagc gagcgcgcag ccttaattaa cctaattcac
3241 tggccgtcgt tttacaacgt cgtgactggg aaaaccctgg cgttacccaa cttaatcgcc
3301 ttgcagcaca tccccctttc gccagctggc gtaatagcga agaggcccgc accgatcgcc
3361 cttcccaaca gttgcgcagc ctgaatggcg aatgggacgc gccctgtagc ggcgcattaa
3421 gcgcggcggg tgtggtggtt acgcgcagcg tgaccgctac acttgccagc gccctagcgc
3481 ccgctccttt cgctttcttc ccttcctttc tcgccacgtt cgccggcttt ccccgtcaag
3541 ctctaaatcg ggggctccct ttagggttcc gatttagtgc tttacggcac ctcgacccca
3601 aaaaacttga ttagggtgat ggttcacgta gtgggccatc gccctgatag acggtttttc
3661 gccctttgac gttggagtcc acgttcttta atagtggact cttgttccaa actggaacaa
3721 cactcaaccc tatctcggtc tattcttttg atttataagg gattttgccg atttcggcct
3781 attggttaaa aaatgagctg atttaacaaa aatttaacgc gaattttaac aaaatattaa
3841 cgcttacaat ttaggtggca cttttcgggg aaatgtgcgc ggaaccccta tttgtttatt
3901 tttctaaata cattcaaata tgtatccgct catgagacaa taaccctgat aaatgcttca
3961 ataatattga aaaaggaaga gtatgagtat tcaacatttc cgtgtcgccc ttattccctt
4021 ttttgcggca ttttgccttc ctgtttttgc tcacccagaa acgctggtga aagtaaaaga
4081 tgctgaagat cagttgggtg cacgagtggg ttacatcgaa ctggatctca acagcggtaa
4141 gatccttgag agttttcgcc ccgaagaacg ttttccaatg atgagcactt ttaaagttct
4201 gctatgtggc gcggtattat cccgtattga cgccgggcaa gagcaactcg gtcgccgcat
4261 acactattct cagaatgact tggttgagta ctcaccagtc acagaaaagc atcttacgga
4321 tggcatgaca gtaagagaat tatgcagtgc tgccataacc atgagtgata acactgcggc
4381 caacttactt ctgacaacga tcggaggacc gaaggagcta accgcttttt tgcacaacat
4441 gggggatcat gtaactcgcc ttgatcgttg ggaaccggag ctgaatgaag ccataccaaa
4501 cgacgagcgt gacaccacga tgcctgtagc aatggcaaca acgttgcgca aactattaac
4561 tggcgaacta cttactctag cttcccggca acaattaata gactggatgg aggcggataa
4621 agttgcagga ccacttctgc gctcggccct tccggctggc tggtttattg ctgataaatc
4681 tggagccggt gagcgtgggt ctcgcggtat cattgcagca ctggggccag atggtaagcc
4741 ctcccgtatc gtagttatct acacgacggg gagtcaggca actatggatg aacgaaatag
4801 acagatcgct gagataggtg cctcactgat taagcattgg taactgtcag accaagttta
4861 ctcatatata ctttagattg atttaaaact tcatttttaa tttaaaagga tctaggtgaa
4921 gatccttttt gataatctca tgaccaaaat cccttaacgt gagttttcgt tccactgagc
4981 gtcagacccc gtagaaaaga tcaaaggatc ttcttgagat cctttttttc tgcgcgtaat
5041 ctgctgcttg caaacaaaaa aaccaccgct accagcggtg gtttgtttgc cggatcaaga
5101 gctaccaact ctttttccga aggtaactgg cttcagcaga gcgcagatac caaatactgt
5161 tcttctagtg tagccgtagt taggccacca cttcaagaac tctgtagcac cgcctacata
5221 cctcgctctg ctaatcctgt taccagtggc tgctgccagt ggcgataagt cgtgtcttac
5281 cgg(配列番号15)
1 gttggactca agacgatagt taccggataa ggcgcagcgg tcgggctgaa cggggggttc
61 gtgcacacag cccagcttgg agcgaacgac ctacaccgaa ctgagatacc tacagcgtga
121 gctatgagaa agcgccacgc ttcccgaagg gagaaaggcg gacaggtatc cggtaagcgg
181 cagggtcgga acaggagagc gcacgaggga gcttccaggg ggaaacgcct ggtatcttta
241 tagtcctgtc gggtttcgcc acctctgact tgagcgtcga tttttgtgat gctcgtcagg
301 ggggcggagc ctatggaaaa acgccagcaa cgcggccttt ttacggttcc tggccttttg
361 ctggcctttt gctcacatgt tctttcctgc gttatcccct gattctgtgg ataaccgtat
421 taccgccttt gagtgagctg ataccgctcg ccgcagccga acgaccgagc gcagcgagtc
481 agtgagcgag gaagcggaag agcgcccaat acgcaaaccg cctctccccg cgcgttggcc
541 gattcattaa tgcagctggc acgacaggtt tcccgactgg aaagcgggca gtgagcgcaa
601 cgcaattaat gtgagttagc tcactcatta ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc
661 ggctcgtatg ttgtgtggaa ttgtgagcgg ataacaattt cacacaggaa acagctatga
721 ccatgattac gccagattta attaagggat ctgggccact ccctctctgc gcgctcgctc
781 gctcactgag gccgggcgac caaaggtcgc ccgacgcccg ggctttgccc gggcggcctc
841 agtgagcgag cgagcgcgca gagagggagt ggttaagcta gcggtacccg ttacataact
901 tacggtaaat ggcccgcctg gctgaccgcc caacgacccc cgcccattga cgtcaataat
961 gacgtatgtt cccatagtaa cgccaatagg gactttccat tgacgtcaat gggtggagta
1021 tttacggtaa actgcccact tggcagtaca tcaagtgtat catatgccaa gtacgccccc
1081 tattgacgtc aatgacggta aatggcccgc ctggcattat gcccagtaca tgaccttatg
1141 ggactttcct acttggcagt acatctacgt attagtcatc gctattacca tggtcgaggt
1201 gagccccacg ttctgcttca ctctccccat ctcccccccc tccccacccc caattttgta
1261 tttatttatt ttttaattat tttgtgcagc gatgggggcg gggggggggg gggggcgcgc
1321 gccaggcggg gcggggcggg gcgaggggcg gggcggggcg aggcggagag gtgcggcggc
1381 agccaatcag agcggcgcgc tccgaaagtt tccttttatg gcgaggcggc ggcggcggcg
1441 gccctataaa aagcgaagcg cgcggcgggc gggagtcgct gcgacgctgc cttcgccccg
1501 tgccccgctc cgccgccgcc tcgcgccgcc cgccccggct ctgactgacc gcgttactcc
1561 cacaggtgag cgggcgggac ggcccttctc ctccgggctg taattagctg agcaagaggt
1621 aagggtttaa gggatggttg gttggtgggg tattaatgtt taattacctg gagcacctgc
1681 ctgaaatcac tttttttcag acgcgtgcca ccatgacagc catcatcaaa gagatcgtta
1741 gcagaaacaa aaggagatat caagaggatg gattcgactt agacttgacc tatatttatc
1801 caaatattat tgctatggga tttcctgcag aaagacttga aggtgtatac aggaacaata
1861 ttgatgatgt agtaaggttt ttggattcaa agcataaaaa ccattacaag atatacaatc
1921 tatgtgctga gagacattat gacaccgcca aatttaactg cagagttgca cagtatcctt
1981 ttgaagacca taacccacca cagctagaac ttatcaaacc cttctgtgaa gatcttgacc
2041 aatggctaag tgaagatgac aatcatgttg cagcaattca ctgtaaagct ggaaagggac
2101 ggactggtgt aatgatttgt gcatatttat tgcatcgggg caaattttta aaggcacaag
2161 aggccctaga tttttatggg gaagtaagga ccagagacaa aaagggagtc acaattccca
2221 gtcagaggcg ctatgtatat tattatagct acctgctaaa aaatcacctg gattacagac
2281 ccgtggcact gctgtttcac aagatgatgt ttgaaactat tccaatgttc agtggcggaa
2341 cttgcaatcc tcagtttgtg gtctgccagc taaaggtgaa gatatattcc tccaattcag
2401 gacccacgcg gcgggaggac aagttcatgt actttgagtt ccctcagcca ttgcctgtgt
2461 gtggtgatat caaagtagag ttcttccaca aacagaacaa gatgctcaaa aaggacaaaa
2521 tgtttcactt ttgggtaaat acgttcttca taccaggacc agaggaaacc tcagaaaaag
2581 tggaaaatgg aagtctttgt gatcaggaaa tcgatagcat ttgcagtata gagcgtgcag
2641 ataatgacaa ggagtatctt gtactcaccc taacaaaaaa cgatcttgac aaagcaaaca
2701 aagacaaggc caaccgatac ttctctccaa attttaaggt gaaactatac tttacaaaaa
2761 cagtagagga gccatcaaat ccagaggcta gcagttcaac ttctgtgact ccagatgtta
2821 gtgacaatga acctgatcat tatagatatt ctgacaccac tgactctgat ccagagaatg
2881 aaccttttga tgaagatcag cattcacaaa ttacaaaagt ctgataaaag cttatcgcga
2941 acaaacacca ttgtcacact ccaactagtt aagatacatt gatgagtttg gacaaaccac
3001 aactagaatg cagtgaaaaa aatgctttat ttgtgaaatt tgtgatgcta ttgctttatt
3061 tgtaaccatt ataagctgca ataaacaagt aggaacccct agtgatggag ttggccactc
3121 cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgggcgacc aaaggtcgcc cgacgcccgg
3181 gctttgcccg ggcggcctca gtgagcgagc gagcgcgcag ccttaattaa cctaattcac
3241 tggccgtcgt tttacaacgt cgtgactggg aaaaccctgg cgttacccaa cttaatcgcc
3301 ttgcagcaca tccccctttc gccagctggc gtaatagcga agaggcccgc accgatcgcc
3361 cttcccaaca gttgcgcagc ctgaatggcg aatgggacgc gccctgtagc ggcgcattaa
3421 gcgcggcggg tgtggtggtt acgcgcagcg tgaccgctac acttgccagc gccctagcgc
3481 ccgctccttt cgctttcttc ccttcctttc tcgccacgtt cgccggcttt ccccgtcaag
3541 ctctaaatcg ggggctccct ttagggttcc gatttagtgc tttacggcac ctcgacccca
3601 aaaaacttga ttagggtgat ggttcacgta gtgggccatc gccctgatag acggtttttc
3661 gccctttgac gttggagtcc acgttcttta atagtggact cttgttccaa actggaacaa
3721 cactcaaccc tatctcggtc tattcttttg atttataagg gattttgccg atttcggcct
3781 attggttaaa aaatgagctg atttaacaaa aatttaacgc gaattttaac aaaatattaa
3841 cgcttacaat ttaggtggca cttttcgggg aaatgtgcgc ggaaccccta tttgtttatt
3901 tttctaaata cattcaaata tgtatccgct catgagacaa taaccctgat aaatgcttca
3961 ataatattga aaaaggaaga gtatgagtat tcaacatttc cgtgtcgccc ttattccctt
4021 ttttgcggca ttttgccttc ctgtttttgc tcacccagaa acgctggtga aagtaaaaga
4081 tgctgaagat cagttgggtg cacgagtggg ttacatcgaa ctggatctca acagcggtaa
4141 gatccttgag agttttcgcc ccgaagaacg ttttccaatg atgagcactt ttaaagttct
4201 gctatgtggc gcggtattat cccgtattga cgccgggcaa gagcaactcg gtcgccgcat
4261 acactattct cagaatgact tggttgagta ctcaccagtc acagaaaagc atcttacgga
4321 tggcatgaca gtaagagaat tatgcagtgc tgccataacc atgagtgata acactgcggc
4381 caacttactt ctgacaacga tcggaggacc gaaggagcta accgcttttt tgcacaacat
4441 gggggatcat gtaactcgcc ttgatcgttg ggaaccggag ctgaatgaag ccataccaaa
4501 cgacgagcgt gacaccacga tgcctgtagc aatggcaaca acgttgcgca aactattaac
4561 tggcgaacta cttactctag cttcccggca acaattaata gactggatgg aggcggataa
4621 agttgcagga ccacttctgc gctcggccct tccggctggc tggtttattg ctgataaatc
4681 tggagccggt gagcgtgggt ctcgcggtat cattgcagca ctggggccag atggtaagcc
4741 ctcccgtatc gtagttatct acacgacggg gagtcaggca actatggatg aacgaaatag
4801 acagatcgct gagataggtg cctcactgat taagcattgg taactgtcag accaagttta
4861 ctcatatata ctttagattg atttaaaact tcatttttaa tttaaaagga tctaggtgaa
4921 gatccttttt gataatctca tgaccaaaat cccttaacgt gagttttcgt tccactgagc
4981 gtcagacccc gtagaaaaga tcaaaggatc ttcttgagat cctttttttc tgcgcgtaat
5041 ctgctgcttg caaacaaaaa aaccaccgct accagcggtg gtttgtttgc cggatcaaga
5101 gctaccaact ctttttccga aggtaactgg cttcagcaga gcgcagatac caaatactgt
5161 tcttctagtg tagccgtagt taggccacca cttcaagaac tctgtagcac cgcctacata
5221 cctcgctctg ctaatcctgt taccagtggc tgctgccagt ggcgataagt cgtgtcttac
5281 cgg(配列番号15)
LOCUS AAV_pCAG-Atg5-WPRE-bGHp 6325 bp ds-DNA環状
DEFINITION
KEYWORDS“アクセッション:addgene_65455_110978”FEATURES Location/Qualifiers
misc_feature 2957..3050
/label=“ニワトリβアクチンエクソン1全長”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 2622..2643
/label=“o2MF1プライマー結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 2930..2956
/label=“oMF209”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 4064..4088
/label=“oMF65”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
misc_feature 1267..1295
/label=“AmpRプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 2958..4027
/label=“ニワトリβアクチンエクソン-イントロン-ウサギβグロビンイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
STS 4415..4532
/label=“Atg5 STS”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 2970..2984
/label=“oMF186 CAGex1_2F”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 4040..4042
/label=“Atg5 misc_feature”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 4819..4852
/label=“oMF81”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 3148..3163
/label=“oMF207”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 2680..2956
/label=“ニワトリβアクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 3934..4027
/label=“ウサギβ-グロビン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
exon 4518..4612
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 4034..4039
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
feature 4882..5469
/label=“WPRE”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
exon 4613..4730
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
primer complement(5503..5520)
/label=“BGH_リバース_プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 1744..2050
/label=“F1起点”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 5739..5869
/label=“AAV2 ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
STS 4754..4867
/label=“Atg5 STS”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
/ApEinfo_fwdcolor=#84b0dc
misc_feature 4040..4061
/label=“oMF210-213”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
exon 4040..4147
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 3926..3933
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
exon 4276..4354
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 1425..1476
/label=“オリジナルのpCAG骨格中で欠損する配列”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
misc_feature 3027..3045
/label=“oMF187-CAGex1_2R”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 4772..4799
/label=“oMF 159プローブ?”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
CDS 4040..4867
/label=“Atg5 CDS(オートファジータンパク質5アイソフォーム1)”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 4804..4823
/label=“oMF 158リバース”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 365..1225
/label=“アンピシリン”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 4001..4027
/label=“o2MF2 R結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
misc_feature 5093..5112
/label=“o2MF14 WPREリバースプライマー”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 4745..4764
/label=“oMF157”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 4001..4027
/label=“o2MF2 R結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
misc_feature join(5916..6325,1..210)
/label=“pBR322起点”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
primer 3982..4001
/label=“pCAG_F_プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 4180..4204
/label=“oMF150”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 3051..3925
/label=“ニワトリβアクチンイントロン1の5’(ENSEMBLに比較していくつかのSNP)”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature join(5870..6325,1..2141)
/label=“AAV-CRE逆向き骨格”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 3772..3789
/label=“o2MF13プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
exon 4355..4517
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2968..2982
/label=“oMF204-206”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
regulatory 2379..2666
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 2674..2692
/label=“208”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 4161..4185
/label=“oMF149”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 4070..4093
/label=“oMF214”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
/ApEinfo_fwdcolor=#84b0dc
misc_feature complement(2142..2282)
/label=“AAV2 ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 4028..4033
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
terminator 5506..5709
/label=“bGH_PA_ターミネーター”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 4145..4169
/label=“oMF66”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
exon 4731..4867
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
exon 4148..4275
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
DEFINITION
KEYWORDS“アクセッション:addgene_65455_110978”FEATURES Location/Qualifiers
misc_feature 2957..3050
/label=“ニワトリβアクチンエクソン1全長”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 2622..2643
/label=“o2MF1プライマー結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 2930..2956
/label=“oMF209”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 4064..4088
/label=“oMF65”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
misc_feature 1267..1295
/label=“AmpRプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 2958..4027
/label=“ニワトリβアクチンエクソン-イントロン-ウサギβグロビンイントロン”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
STS 4415..4532
/label=“Atg5 STS”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 2970..2984
/label=“oMF186 CAGex1_2F”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 4040..4042
/label=“Atg5 misc_feature”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 4819..4852
/label=“oMF81”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 3148..3163
/label=“oMF207”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 2680..2956
/label=“ニワトリβアクチンプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 3934..4027
/label=“ウサギβ-グロビン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
exon 4518..4612
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#c6c9d1
/ApEinfo_fwdcolor=#c6c9d1
misc_feature 4034..4039
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
feature 4882..5469
/label=“WPRE”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
exon 4613..4730
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
primer complement(5503..5520)
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/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 1744..2050
/label=“F1起点”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 5739..5869
/label=“AAV2 ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
STS 4754..4867
/label=“Atg5 STS”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
/ApEinfo_fwdcolor=#84b0dc
misc_feature 4040..4061
/label=“oMF210-213”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
exon 4040..4147
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 3926..3933
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
exon 4276..4354
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
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/label=“オリジナルのpCAG骨格中で欠損する配列”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
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/label=“oMF187-CAGex1_2R”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 4772..4799
/label=“oMF 159プローブ?”
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/label=“Atg5 CDS(オートファジータンパク質5アイソフォーム1)”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
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/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
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misc_feature 365..1225
/label=“アンピシリン”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
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/label=“o2MF2 R結合部位”
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/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
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/label=“o2MF14 WPREリバースプライマー”
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/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 4745..4764
/label=“oMF157”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
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/label=“o2MF2 R結合部位”
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/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
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/label=“pBR322起点”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
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primer 3982..4001
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/label=“oMF150”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 3051..3925
/label=“ニワトリβアクチンイントロン1の5’(ENSEMBLに比較していくつかのSNP)”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
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/label=“AAV-CRE逆向き骨格”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 3772..3789
/label=“o2MF13プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
exon 4355..4517
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2968..2982
/label=“oMF204-206”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
regulatory 2379..2666
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 2674..2692
/label=“208”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 4161..4185
/label=“oMF149”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 4070..4093
/label=“oMF214”
/ApEinfo_revcolor=#84b0dc
/ApEinfo_fwdcolor=#84b0dc
misc_feature complement(2142..2282)
/label=“AAV2 ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 4028..4033
/label=“クローニングスカー”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
terminator 5506..5709
/label=“bGH_PA_ターミネーター”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 4145..4169
/label=“oMF66”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
exon 4731..4867
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
exon 4148..4275
/label=“Atg5エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
ORIGIN
1 ctacagagtt cttgaagtgg tggcctaact acggctacac tagaagaaca gtatttggta
61 tctgcgctct gctgaagcca gttaccttcg gaaaaagagt tggtagctct tgatccggca
121 aacaaaccac cgctggtagc ggtggttttt ttgtttgcaa gcagcagatt acgcgcagaa
181 aaaaaggatc tcaagaagat cctttgatct tttctacggg gtctgacgct cagtggaacg
241 aaaactcacg ttaagggatt ttggtcatga gattatcaaa aaggatcttc acctagatcc
301 ttttaaatta aaaatgaagt tttaaatcaa tctaaagtat atatgagtaa acttggtctg
361 acagttacca atgcttaatc agtgaggcac ctatctcagc gatctgtcta tttcgttcat
421 ccatagttgc ctgactcccc gtcgtgtaga taactacgat acgggagggc ttaccatctg
481 gccccagtgc tgcaatgata ccgcgagacc cacgctcacc ggctccagat ttatcagcaa
541 taaaccagcc agccggaagg gccgagcgca gaagtggtcc tgcaacttta tccgcctcca
601 tccagtctat taattgttgc cgggaagcta gagtaagtag ttcgccagtt aatagtttgc
661 gcaacgttgt tgccattgct acaggcatcg tggtgtcacg ctcgtcgttt ggtatggctt
721 cattcagctc cggttcccaa cgatcaaggc gagttacatg atcccccatg ttgtgcaaaa
781 aagcggttag ctccttcggt cctccgatcg ttgtcagaag taagttggcc gcagtgttat
841 cactcatggt tatggcagca ctgcataatt ctcttactgt catgccatcc gtaagatgct
901 tttctgtgac tggtgagtac tcaaccaagt cattctgaga atagtgtatg cggcgaccga
961 gttgctcttg cccggcgtca atacgggata ataccgcgcc acatagcaga actttaaaag
1021 tgctcatcat tggaaaacgt tcttcggggc gaaaactctc aaggatctta ccgctgttga
1081 gatccagttc gatgtaaccc actcgtgcac ccaactgatc ttcagcatct tttactttca
1141 ccagcgtttc tgggtgagca aaaacaggaa ggcaaaatgc cgcaaaaaag ggaataaggg
1201 cgacacggaa atgttgaata ctcatactct tcctttttca atattattga agcatttatc
1261 agggttattg tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat ttagaaaaat aaacaaatag
1321 gggttccgcg cacatttccc cgaaaagtgc cacctgacgt ctaagaaacc attattatca
1381 tgacattaac ctataaaaat aggcgtatca cgaggccctt tcgtctcgcg cgtttcggtg
1441 atgacggtga aaacctctga cacatgcagc tcccggagac ggtcacagct tgtctgtaag
1501 cggatgccgg gagcagacaa gcccgtcagg gcgcgtcagc gggtgttggc gggtgtcggg
1561 gctggcttaa ctatgcggca tcagagcaga ttgtactgag agtgcaccat aaaattgtaa
1621 acgttaatat tttgttaaaa ttcgcgttaa atttttgtta aatcagctca ttttttaacc
1681 aatagaccga aatcggcaaa atcccttata aatcaaaaga atagcccgag atagagttga
1741 gtgttgttcc agtttggaac aagagtccac tattaaagaa cgtggactcc aacgtcaaag
1801 ggcgaaaaac cgtctatcag ggcgatggcc cactacgtga accatcaccc aaatcaagtt
1861 ttttggggtc gaggtgccgt aaagcactaa atcggaaccc taaagggagc ccccgattta
1921 gagcttgacg gggaaagccg gcgaacgtgg cgagaaagga agggaagaaa gcgaaaggag
1981 cgggcgctaa ggcgctggca agtgtagcgg tcacgctgcg cgtaaccacc acacccgccg
2041 cgcttaatgc gccgctacag ggcgcgtact atggttgctt tgacgtatgc ggtgtgaaat
2101 accgcacaga tgcgtaagga gaaaataccg catcaggcgc ccctgcaggc agctgcgcgc
2161 tcgctcgctc actgaggccg cccgggcaaa gcccgggcgt cgggcgacct ttggtcgccc
2221 ggcctcagtg agcgagcgag cgcgcagaga gggagtggcc aactccatca ctaggggttc
2281 ctgcggccgc acgcgaaaca attctgcagg aatctagtta ttaatagtaa tcaattacgg
2341 ggtcattagt tcatagccca tatatggagt tccgcgttac ataacttacg gtaaatggcc
2401 cgcctggctg accgcccaac gacccccgcc cattgacgtc aataatgacg tatgttccca
2461 tagtaacgcc aatagggact ttccattgac gtcaatgggt ggagtattta cggtaaactg
2521 cccacttggc agtacatcaa gtgtatcata tgccaagtac gccccctatt gacgtcaatg
2581 acggtaaatg gcccgcctgg cattatgccc agtacatgac cttatgggac tttcctactt
2641 ggcagtacat ctacgtatta gtcatcgcta ttaccatggt cgaggtgagc cccacgttct
2701 gcttcactct ccccatctcc cccccctccc cacccccaat tttgtattta tttatttttt
2761 aattattttg tgcagcgatg ggggcggggg gggggggggg gcgcgcgcca ggcggggcgg
2821 ggcggggcga ggggcggggc ggggcgaggc ggagaggtgc ggcggcagcc aatcagagcg
2881 gcgcgctccg aaagtttcct tttatggcga ggcggcggcg gcggcggccc tataaaaagc
2941 gaagcgcgcg gcgggcggga gtcgctgcgc gctgccttcg ccccgtgccc cgctccgccg
3001 ccgcctcgcg ccgcccgccc cggctctgac tgaccgcgtt actcccacag gtgagcgggc
3061 gggacggccc ttctcctccg ggctgtaatt agcgcttggt ttaatgacgg cttgtttctt
3121 ttctgtggct gcgtgaaagc cttgaggggc tccgggaggg ccctttgtgc ggggggagcg
3181 gctcgggggg tgcgtgcgtg tgtgtgtgcg tggggagcgc cgcgtgcggc tccgcgctgc
3241 ccggcggctg tgagcgctgc gggcgcggcg cggggctttg tgcgctccgc agtgtgcgcg
3301 aggggagcgc ggccgggggc ggtgccccgc ggtgcggggg gggctgcgag gggaacaaag
3361 gctgcgtgcg gggtgtgtgc gtgggggggt gagcaggggg tgtgggcgcg tcggtcgggc
3421 tgcaaccccc cctgcacccc cctccccgag ttgctgagca cggcccggct tcgggtgcgg
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3541 gggtgccggg cggggcgggg ccgcctcggg ccggggaggg ctcgggggag gggcgcggcg
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3661 aatcgtgcga gagggcgcag ggacttcctt tgtcccaaat ctgtgcggag ccgaaatctg
3721 ggaggcgccg ccgcaccccc tctagcgggc gcggggcgaa gcggtgcggc gccggcagga
3781 aggaaatggg cggggagggc cttcgtgcgt cgccgcgccg ccgtcccctt ctccctctcc
3841 agcctcgggg ctgtccgcgg ggggacggct gccttcgggg gggacggggc agggcggggt
3901 tcggcttctg gcgtgtgacc ggcggctcta gagcctctgc taaccatgtt catgccttct
3961 tctttttcct acagctcctg ggcaacgtgc tggttattgt gctgtctcat cattttggca
4021 aagaattacg cgtgccacca tgacagatga caaagatgtg cttcgagatg tgtggtttgg
4081 acgaattcca acttgcttta ctctctatca ggatgagata actgaaagag aagcagaacc
4141 atactatttg cttttgccaa gagtcagcta tttgacgttg gtaactgaca aagtgaaaaa
4201 gcactttcag aaggttatga gacaagaaga tgttagtgag atatggtttg aatatgaagg
4261 cacacccctg aaatggcatt atccaattgg tttactattt gatcttcttg catcaagttc
4321 agctcttcct tggaacatca cagtacattt caagagtttt ccagaaaagg accttctaca
4381 ctgtccatcc aaggatgcgg ttgaggctca ctttatgtcg tgtatgaaag aagctgatgc
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4501 gatgggactg cagaatgaca gatttgacca gttttgggcc atcaaccgga aactcatgga
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4621 ggagcggcct ttcatccaga agctgttccg gcctgtggcc gcagatggac agctgcacac
4681 acttggagat ctcctcagag aagtctgtcc ttccgcagtc gcccctgaag atggagagaa
4741 gaggagccag gtgatgattc acgggataga gccaatgctg gaaacccctc tgcagtggct
4801 gagcgagcat ctgagctacc cagataactt tcttcatatt agcattgtcc cccagccaac
4861 agattgaaag cttatcgata atcaacctct ggattacaaa atttgtgaaa gattgactgg
4921 tattcttaac tatgttgctc cttttacgct atgtggatac gctgctttaa tgcctttgta
4981 tcatgctatt gcttcccgta tggctttcat tttctcctcc ttgtataaat cctggttgct
5041 gtctctttat gaggagttgt ggcccgttgt caggcaacgt ggcgtggtgt gcactgtgtt
5101 tgctgacgca acccccactg gttggggcat tgccaccacc tgtcagctcc tttccgggac
5161 tttcgctttc cccctcccta ttgccacggc ggaactcatc gccgcctgcc ttgcccgctg
5221 ctggacaggg gctcggctgt tgggcactga caattccgtg gtgttgtcgg ggaaatcatc
5281 gtcctttcct tggctgctcg cctatgttgc cacctggatt ctgcgcggga cgtccttctg
5341 ctacgtccct tcggccctca atccagcgga ccttccttcc cgcggcctgc tgccggctct
5401 gcggcctctt ccgcgtcttc gccttcgccc tcagacgagt cggatctccc tttgggccgc
5461 ctccccgcat cgataccgag cgctgctcga gagatcgatc tgcctcgact gtgccttcta
5521 gttgccagcc atctgttgtt tgcccctccc ccgtgccttc cttgaccctg gaaggtgcca
5581 ctcccactgt cctttcctaa taaaatgagg aaattgcatc gcattgtctg agtaggtgtc
5641 attctattct ggggggtggg gtggggcagg acagcaaggg ggaggattgg gaagacaata
5701 gcaggcatgc tggggacacg tgcggaccga gcggccgcag gaacccctag tgatggagtt
5761 ggccactccc tctctgcgcg ctcgctcgct cactgaggcc gggcgaccaa aggtcgcccg
5821 acgcccgggc tttgcccggg cggcctcagt gagcgagcga gcgcgcagca catgtgagca
5881 aaaggccagc aaaaggccag gaaccgtaaa aaggccgcgt tgctggcgtt tttccatagg
5941 ctccgccccc ctgacgagca tcacaaaaat cgacgctcaa gtcagaggtg gcgaaacccg
6001 acaggactat aaagatacca ggcgtttccc cctggaagct ccctcgtgcg ctctcctgtt
6061 ccgaccctgc cgcttaccgg atacctgtcc gcctttctcc cttcgggaag cgtggcgctt
6121 tctcatagct cacgctgtag gtatctcagt tcggtgtagg tcgttcgctc caagctgggc
6181 tgtgtgcacg aaccccccgt tcagcccgac cgctgcgcct tatccggtaa ctatcgtctt
6241 gagtccaacc cggtaagaca cgacttatcg ccactggcag cagccactgg taacaggatt
6301 agcagagcga ggtatgtagg cggtg(配列番号16)
1 ctacagagtt cttgaagtgg tggcctaact acggctacac tagaagaaca gtatttggta
61 tctgcgctct gctgaagcca gttaccttcg gaaaaagagt tggtagctct tgatccggca
121 aacaaaccac cgctggtagc ggtggttttt ttgtttgcaa gcagcagatt acgcgcagaa
181 aaaaaggatc tcaagaagat cctttgatct tttctacggg gtctgacgct cagtggaacg
241 aaaactcacg ttaagggatt ttggtcatga gattatcaaa aaggatcttc acctagatcc
301 ttttaaatta aaaatgaagt tttaaatcaa tctaaagtat atatgagtaa acttggtctg
361 acagttacca atgcttaatc agtgaggcac ctatctcagc gatctgtcta tttcgttcat
421 ccatagttgc ctgactcccc gtcgtgtaga taactacgat acgggagggc ttaccatctg
481 gccccagtgc tgcaatgata ccgcgagacc cacgctcacc ggctccagat ttatcagcaa
541 taaaccagcc agccggaagg gccgagcgca gaagtggtcc tgcaacttta tccgcctcca
601 tccagtctat taattgttgc cgggaagcta gagtaagtag ttcgccagtt aatagtttgc
661 gcaacgttgt tgccattgct acaggcatcg tggtgtcacg ctcgtcgttt ggtatggctt
721 cattcagctc cggttcccaa cgatcaaggc gagttacatg atcccccatg ttgtgcaaaa
781 aagcggttag ctccttcggt cctccgatcg ttgtcagaag taagttggcc gcagtgttat
841 cactcatggt tatggcagca ctgcataatt ctcttactgt catgccatcc gtaagatgct
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961 gttgctcttg cccggcgtca atacgggata ataccgcgcc acatagcaga actttaaaag
1021 tgctcatcat tggaaaacgt tcttcggggc gaaaactctc aaggatctta ccgctgttga
1081 gatccagttc gatgtaaccc actcgtgcac ccaactgatc ttcagcatct tttactttca
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1201 cgacacggaa atgttgaata ctcatactct tcctttttca atattattga agcatttatc
1261 agggttattg tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat ttagaaaaat aaacaaatag
1321 gggttccgcg cacatttccc cgaaaagtgc cacctgacgt ctaagaaacc attattatca
1381 tgacattaac ctataaaaat aggcgtatca cgaggccctt tcgtctcgcg cgtttcggtg
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1501 cggatgccgg gagcagacaa gcccgtcagg gcgcgtcagc gggtgttggc gggtgtcggg
1561 gctggcttaa ctatgcggca tcagagcaga ttgtactgag agtgcaccat aaaattgtaa
1621 acgttaatat tttgttaaaa ttcgcgttaa atttttgtta aatcagctca ttttttaacc
1681 aatagaccga aatcggcaaa atcccttata aatcaaaaga atagcccgag atagagttga
1741 gtgttgttcc agtttggaac aagagtccac tattaaagaa cgtggactcc aacgtcaaag
1801 ggcgaaaaac cgtctatcag ggcgatggcc cactacgtga accatcaccc aaatcaagtt
1861 ttttggggtc gaggtgccgt aaagcactaa atcggaaccc taaagggagc ccccgattta
1921 gagcttgacg gggaaagccg gcgaacgtgg cgagaaagga agggaagaaa gcgaaaggag
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2341 ggtcattagt tcatagccca tatatggagt tccgcgttac ataacttacg gtaaatggcc
2401 cgcctggctg accgcccaac gacccccgcc cattgacgtc aataatgacg tatgttccca
2461 tagtaacgcc aatagggact ttccattgac gtcaatgggt ggagtattta cggtaaactg
2521 cccacttggc agtacatcaa gtgtatcata tgccaagtac gccccctatt gacgtcaatg
2581 acggtaaatg gcccgcctgg cattatgccc agtacatgac cttatgggac tttcctactt
2641 ggcagtacat ctacgtatta gtcatcgcta ttaccatggt cgaggtgagc cccacgttct
2701 gcttcactct ccccatctcc cccccctccc cacccccaat tttgtattta tttatttttt
2761 aattattttg tgcagcgatg ggggcggggg gggggggggg gcgcgcgcca ggcggggcgg
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3361 gctgcgtgcg gggtgtgtgc gtgggggggt gagcaggggg tgtgggcgcg tcggtcgggc
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3481 ggctccgtac ggggcgtggc gcggggctcg ccgtgccggg cggggggtgg cggcaggtgg
3541 gggtgccggg cggggcgggg ccgcctcggg ccggggaggg ctcgggggag gggcgcggcg
3601 gcccccggag cgccggcggc tgtcgaggcg cggcgagccg cagccattgc cttttatggt
3661 aatcgtgcga gagggcgcag ggacttcctt tgtcccaaat ctgtgcggag ccgaaatctg
3721 ggaggcgccg ccgcaccccc tctagcgggc gcggggcgaa gcggtgcggc gccggcagga
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3901 tcggcttctg gcgtgtgacc ggcggctcta gagcctctgc taaccatgtt catgccttct
3961 tctttttcct acagctcctg ggcaacgtgc tggttattgt gctgtctcat cattttggca
4021 aagaattacg cgtgccacca tgacagatga caaagatgtg cttcgagatg tgtggtttgg
4081 acgaattcca acttgcttta ctctctatca ggatgagata actgaaagag aagcagaacc
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4201 gcactttcag aaggttatga gacaagaaga tgttagtgag atatggtttg aatatgaagg
4261 cacacccctg aaatggcatt atccaattgg tttactattt gatcttcttg catcaagttc
4321 agctcttcct tggaacatca cagtacattt caagagtttt ccagaaaagg accttctaca
4381 ctgtccatcc aaggatgcgg ttgaggctca ctttatgtcg tgtatgaaag aagctgatgc
4441 tttaaagcat aaaagtcaag tgatcaacga aatgcagaaa aaagaccaca agcagctctg
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4741 gaggagccag gtgatgattc acgggataga gccaatgctg gaaacccctc tgcagtggct
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4981 tcatgctatt gcttcccgta tggctttcat tttctcctcc ttgtataaat cctggttgct
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5281 gtcctttcct tggctgctcg cctatgttgc cacctggatt ctgcgcggga cgtccttctg
5341 ctacgtccct tcggccctca atccagcgga ccttccttcc cgcggcctgc tgccggctct
5401 gcggcctctt ccgcgtcttc gccttcgccc tcagacgagt cggatctccc tttgggccgc
5461 ctccccgcat cgataccgag cgctgctcga gagatcgatc tgcctcgact gtgccttcta
5521 gttgccagcc atctgttgtt tgcccctccc ccgtgccttc cttgaccctg gaaggtgcca
5581 ctcccactgt cctttcctaa taaaatgagg aaattgcatc gcattgtctg agtaggtgtc
5641 attctattct ggggggtggg gtggggcagg acagcaaggg ggaggattgg gaagacaata
5701 gcaggcatgc tggggacacg tgcggaccga gcggccgcag gaacccctag tgatggagtt
5761 ggccactccc tctctgcgcg ctcgctcgct cactgaggcc gggcgaccaa aggtcgcccg
5821 acgcccgggc tttgcccggg cggcctcagt gagcgagcga gcgcgcagca catgtgagca
5881 aaaggccagc aaaaggccag gaaccgtaaa aaggccgcgt tgctggcgtt tttccatagg
5941 ctccgccccc ctgacgagca tcacaaaaat cgacgctcaa gtcagaggtg gcgaaacccg
6001 acaggactat aaagatacca ggcgtttccc cctggaagct ccctcgtgcg ctctcctgtt
6061 ccgaccctgc cgcttaccgg atacctgtcc gcctttctcc cttcgggaag cgtggcgctt
6121 tctcatagct cacgctgtag gtatctcagt tcggtgtagg tcgttcgctc caagctgggc
6181 tgtgtgcacg aaccccccgt tcagcccgac cgctgcgcct tatccggtaa ctatcgtctt
6241 gagtccaacc cggtaagaca cgacttatcg ccactggcag cagccactgg taacaggatt
6301 agcagagcga ggtatgtagg cggtg(配列番号16)
LOCUS AAV_pCAG-Cisd2-WPRE-bGH 5915 bp ds-DNA環状
DEFINITION
KEYWORDS“アクセッション:addgene_65455_110978”FEATURES Location/Qualifiers
misc_feature 5041..5069
/label=“AmpRプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 1631..1648
/label=“o2MF13プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 617..639
/label=“oMF140”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 2213..2235
/label=“oMF155リバース”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 2532..2551
/label=“o2MF14 WPREリバースプライマー”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 817..1886
/label=“キメライントロン”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 550..568
/label=“oMF139”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 243..268
/label=“21bp反復エレメント”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 3319..5915
/label=“AAV-CRE逆向き骨格”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 2210..2233
/label=“フォワードoMF152”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
misc_feature 525..546
/label=“CAG3 R”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 474..503
/label=“oMF174プローブCAG3”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 4139..4999
/label=“アンピシリン”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
primer complement(2942..2959)
/label=“BGH_リバース_プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 3178..3318
/label=“AAV2 ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 757..774
/label=“oMF142”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature complement(1..141)
/label=“AAV2 ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
terminator 2945..3148
/label=“bGH_PA_ターミネーター”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 1860..1886
/label=“o2MF2 R結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
exon 1899..2001
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2171..2195
/label=“oMF68”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
exon 2002..2216
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 434..454
/label=“CAG3 F”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
feature 2321..2908
/label=“WPRE”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
misc_feature 2123..2147
/label=“oMF154-フォワード”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 411..431
/label=“CAG4リバース”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 623..642
/label=“oMF141\”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 2353..2387
/label=“WPRE R2”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 5199..5250
/label=“オリジナルのpCAG骨格中で欠損する配列”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
misc_feature 3365..3984
/label=“pBR322起点”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 507..535
/label=“CMVフォワード”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 2076..2100
/label=“oMF67”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 539..815
/label=“CBAプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 173..537
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 481..502
/label=“o2MF1プライマー結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 349..371
/label=“フォワードCAG4”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 5518..5824
/label=“F1起点”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
primer 1841..1860
/label=“pCAG_F_プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
CDS 1899..2306
/label=“Cisd2 CDS(CDGSH鉄-硫黄ドメイン含有タンパク質2)”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 2010..2078
/label=“Cisd2 misc_feature”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
misc_feature 380..408
/label=“oMF175 CAG4プローブ”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 1893..1898
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1860..1886
/label=“o2MF2 R結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
DEFINITION
KEYWORDS“アクセッション:addgene_65455_110978”FEATURES Location/Qualifiers
misc_feature 5041..5069
/label=“AmpRプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
misc_feature 1631..1648
/label=“o2MF13プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 617..639
/label=“oMF140”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 2213..2235
/label=“oMF155リバース”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 2532..2551
/label=“o2MF14 WPREリバースプライマー”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 817..1886
/label=“キメライントロン”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 550..568
/label=“oMF139”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 243..268
/label=“21bp反復エレメント”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 3319..5915
/label=“AAV-CRE逆向き骨格”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 2210..2233
/label=“フォワードoMF152”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
misc_feature 525..546
/label=“CAG3 R”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 474..503
/label=“oMF174プローブCAG3”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 4139..4999
/label=“アンピシリン”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
primer complement(2942..2959)
/label=“BGH_リバース_プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 3178..3318
/label=“AAV2 ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 757..774
/label=“oMF142”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature complement(1..141)
/label=“AAV2 ITR”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
terminator 2945..3148
/label=“bGH_PA_ターミネーター”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 1860..1886
/label=“o2MF2 R結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
exon 1899..2001
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 2171..2195
/label=“oMF68”
/ApEinfo_revcolor=#d6b295
/ApEinfo_fwdcolor=#d6b295
exon 2002..2216
/label=“Cisd2エクソン”
/ApEinfo_revcolor=#b7e6d7
/ApEinfo_fwdcolor=#b7e6d7
misc_feature 434..454
/label=“CAG3 F”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
feature 2321..2908
/label=“WPRE”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
misc_feature 2123..2147
/label=“oMF154-フォワード”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 411..431
/label=“CAG4リバース”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 623..642
/label=“oMF141\”
/ApEinfo_revcolor=#ffef86
/ApEinfo_fwdcolor=#ffef86
misc_feature 2353..2387
/label=“WPRE R2”
/ApEinfo_revcolor=#d59687
/ApEinfo_fwdcolor=#d59687
misc_feature 5199..5250
/label=“オリジナルのpCAG骨格中で欠損する配列”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
misc_feature 3365..3984
/label=“pBR322起点”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 507..535
/label=“CMVフォワード”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 2076..2100
/label=“oMF67”
/ApEinfo_revcolor=#f58a5e
/ApEinfo_fwdcolor=#f58a5e
misc_feature 539..815
/label=“CBAプロモーター”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 173..537
/label=“CMVエンハンサー”
/ApEinfo_revcolor=#c7b0e3
/ApEinfo_fwdcolor=#c7b0e3
misc_feature 481..502
/label=“o2MF1プライマー結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#75c6a9
/ApEinfo_fwdcolor=#75c6a9
misc_feature 349..371
/label=“フォワードCAG4”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
misc_feature 5518..5824
/label=“F1起点”
/ApEinfo_revcolor=#85dae9
/ApEinfo_fwdcolor=#85dae9
primer 1841..1860
/label=“pCAG_F_プライマー”
/ApEinfo_revcolor=#b4abac
/ApEinfo_fwdcolor=#b4abac
CDS 1899..2306
/label=“Cisd2 CDS(CDGSH鉄-硫黄ドメイン含有タンパク質2)”
/ApEinfo_revcolor=#faac61
/ApEinfo_fwdcolor=#faac61
misc_feature 2010..2078
/label=“Cisd2 misc_feature”
/ApEinfo_revcolor=#b1ff67
/ApEinfo_fwdcolor=#b1ff67
misc_feature 380..408
/label=“oMF175 CAG4プローブ”
/ApEinfo_revcolor=#9eafd2
/ApEinfo_fwdcolor=#9eafd2
misc_feature 1893..1898
/label=“Kozak”
/ApEinfo_revcolor=#ff9ccd
/ApEinfo_fwdcolor=#ff9ccd
misc_feature 1860..1886
/label=“o2MF2 R結合部位”
/ApEinfo_revcolor=#f8d3a9
/ApEinfo_fwdcolor=#f8d3a9
ORIGIN
1 cctgcaggca gctgcgcgct cgctcgctca ctgaggccgc ccgggcaaag cccgggcgtc
61 gggcgacctt tggtcgcccg gcctcagtga gcgagcgagc gcgcagagag ggagtggcca
121 actccatcac taggggttcc tgcggccgca cgcgaaacaa ttctgcagga atctagttat
181 taatagtaat caattacggg gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca
241 taacttacgg taaatggccc gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca
301 ataatgacgt atgttcccat agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg
361 gagtatttac ggtaaactgc ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtacg
421 ccccctattg acgtcaatga cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc
481 ttatgggact ttcctacttg gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtc
541 gaggtgagcc ccacgttctg cttcactctc cccatctccc ccccctcccc acccccaatt
601 ttgtatttat ttatttttta attattttgt gcagcgatgg gggcgggggg gggggggggg
661 cgcgcgccag gcggggcggg gcggggcgag gggcggggcg gggcgaggcg gagaggtgcg
721 gcggcagcca atcagagcgg cgcgctccga aagtttcctt ttatggcgag gcggcggcgg
781 cggcggccct ataaaaagcg aagcgcgcgg cgggcgggag tcgctgcgcg ctgccttcgc
841 cccgtgcccc gctccgccgc cgcctcgcgc cgcccgcccc ggctctgact gaccgcgtta
901 ctcccacagg tgagcgggcg ggacggccct tctcctccgg gctgtaatta gcgcttggtt
961 taatgacggc ttgtttcttt tctgtggctg cgtgaaagcc ttgaggggct ccgggagggc
1021 cctttgtgcg gggggagcgg ctcggggggt gcgtgcgtgt gtgtgtgcgt ggggagcgcc
1081 gcgtgcggct ccgcgctgcc cggcggctgt gagcgctgcg ggcgcggcgc ggggctttgt
1141 gcgctccgca gtgtgcgcga ggggagcgcg gccgggggcg gtgccccgcg gtgcgggggg
1201 ggctgcgagg ggaacaaagg ctgcgtgcgg ggtgtgtgcg tgggggggtg agcagggggt
1261 gtgggcgcgt cggtcgggct gcaacccccc ctgcaccccc ctccccgagt tgctgagcac
1321 ggcccggctt cgggtgcggg gctccgtacg gggcgtggcg cggggctcgc cgtgccgggc
1381 ggggggtggc ggcaggtggg ggtgccgggc ggggcggggc cgcctcgggc cggggagggc
1441 tcgggggagg ggcgcggcgg cccccggagc gccggcggct gtcgaggcgc ggcgagccgc
1501 agccattgcc ttttatggta atcgtgcgag agggcgcagg gacttccttt gtcccaaatc
1561 tgtgcggagc cgaaatctgg gaggcgccgc cgcaccccct ctagcgggcg cggggcgaag
1621 cggtgcggcg ccggcaggaa ggaaatgggc ggggagggcc ttcgtgcgtc gccgcgccgc
1681 cgtccccttc tccctctcca gcctcggggc tgtccgcggg gggacggctg ccttcggggg
1741 ggacggggca gggcggggtt cggcttctgg cgtgtgaccg gcggctctag agcctctgct
1801 aaccatgttc atgccttctt ctttttccta cagctcctgg gcaacgtgct ggttattgtg
1861 ctgtctcatc attttggcaa agaattacgc gtgccaccat ggtcctggac agcgtggccc
1921 gcatcgtgaa ggtgcagctg cccgcctacc tcaagcagct cccggtcccc gacagcatca
1981 ccgggttcgc ccgcctcaca gtttcagact ggctccgcct actgcccttc ctcggggtac
2041 ttgcgcttct gggctacctc gcagtgcgcc cattcttccc aaagaagaag caacagaagg
2101 atagcttgat caatcttaag atacaaaagg aaaatcccaa ggtggtgaat gagataaaca
2161 ttgaagatct gtgtctcacc aaagcagctt attgtaggtg ctggcggtcc aagacgtttc
2221 ctgcctgtga tggatcccat aataagcata atgaattgac aggcgataac gtgggtcctc
2281 tcatcctgaa gaagaaagaa gtatagaagc ttatcgataa tcaacctctg gattacaaaa
2341 tttgtgaaag attgactggt attcttaact atgttgctcc ttttacgcta tgtggatacg
2401 ctgctttaat gcctttgtat catgctattg cttcccgtat ggctttcatt ttctcctcct
2461 tgtataaatc ctggttgctg tctctttatg aggagttgtg gcccgttgtc aggcaacgtg
2521 gcgtggtgtg cactgtgttt gctgacgcaa cccccactgg ttggggcatt gccaccacct
2581 gtcagctcct ttccgggact ttcgctttcc ccctccctat tgccacggcg gaactcatcg
2641 ccgcctgcct tgcccgctgc tggacagggg ctcggctgtt gggcactgac aattccgtgg
2701 tgttgtcggg gaaatcatcg tcctttcctt ggctgctcgc ctatgttgcc acctggattc
2761 tgcgcgggac gtccttctgc tacgtccctt cggccctcaa tccagcggac cttccttccc
2821 gcggcctgct gccggctctg cggcctcttc cgcgtcttcg ccttcgccct cagacgagtc
2881 ggatctccct ttgggccgcc tccccgcatc gataccgagc gctgctcgag agatcgatct
2941 gcctcgactg tgccttctag ttgccagcca tctgttgttt gcccctcccc cgtgccttcc
3001 ttgaccctgg aaggtgccac tcccactgtc ctttcctaat aaaatgagga aattgcatcg
3061 cattgtctga gtaggtgtca ttctattctg gggggtgggg tggggcagga cagcaagggg
3121 gaggattggg aagacaatag caggcatgct ggggacacgt gcggaccgag cggccgcagg
3181 aacccctagt gatggagttg gccactccct ctctgcgcgc tcgctcgctc actgaggccg
3241 ggcgaccaaa ggtcgcccga cgcccgggct ttgcccgggc ggcctcagtg agcgagcgag
3301 cgcgcagctg cctgcaggac atgtgagcaa aaggccagca aaaggccagg aaccgtaaaa
3361 aggccgcgtt gctggcgttt ttccataggc tccgcccccc tgacgagcat cacaaaaatc
3421 gacgctcaag tcagaggtgg cgaaacccga caggactata aagataccag gcgtttcccc
3481 ctggaagctc cctcgtgcgc tctcctgttc cgaccctgcc gcttaccgga tacctgtccg
3541 cctttctccc ttcgggaagc gtggcgcttt ctcatagctc acgctgtagg tatctcagtt
3601 cggtgtaggt cgttcgctcc aagctgggct gtgtgcacga accccccgtt cagcccgacc
3661 gctgcgcctt atccggtaac tatcgtcttg agtccaaccc ggtaagacac gacttatcgc
3721 cactggcagc agccactggt aacaggatta gcagagcgag gtatgtaggc ggtgctacag
3781 agttcttgaa gtggtggcct aactacggct acactagaag aacagtattt ggtatctgcg
3841 ctctgctgaa gccagttacc ttcggaaaaa gagttggtag ctcttgatcc ggcaaacaaa
3901 ccaccgctgg tagcggtggt ttttttgttt gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag
3961 gatctcaaga agatcctttg atcttttcta cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact
4021 cacgttaagg gattttggtc atgagattat caaaaaggat cttcacctag atccttttaa
4081 attaaaaatg aagttttaaa tcaatctaaa gtatatatga gtaaacttgg tctgacagtt
4141 accaatgctt aatcagtgag gcacctatct cagcgatctg tctatttcgt tcatccatag
4201 ttgcctgact ccccgtcgtg tagataacta cgatacggga gggcttacca tctggcccca
4261 gtgctgcaat gataccgcga gacccacgct caccggctcc agatttatca gcaataaacc
4321 agccagccgg aagggccgag cgcagaagtg gtcctgcaac tttatccgcc tccatccagt
4381 ctattaattg ttgccgggaa gctagagtaa gtagttcgcc agttaatagt ttgcgcaacg
4441 ttgttgccat tgctacaggc atcgtggtgt cacgctcgtc gtttggtatg gcttcattca
4501 gctccggttc ccaacgatca aggcgagtta catgatcccc catgttgtgc aaaaaagcgg
4561 ttagctcctt cggtcctccg atcgttgtca gaagtaagtt ggccgcagtg ttatcactca
4621 tggttatggc agcactgcat aattctctta ctgtcatgcc atccgtaaga tgcttttctg
4681 tgactggtga gtactcaacc aagtcattct gagaatagtg tatgcggcga ccgagttgct
4741 cttgcccggc gtcaatacgg gataataccg cgccacatag cagaacttta aaagtgctca
4801 tcattggaaa acgttcttcg gggcgaaaac tctcaaggat cttaccgctg ttgagatcca
4861 gttcgatgta acccactcgt gcacccaact gatcttcagc atcttttact ttcaccagcg
4921 tttctgggtg agcaaaaaca ggaaggcaaa atgccgcaaa aaagggaata agggcgacac
4981 ggaaatgttg aatactcata ctcttccttt ttcaatatta ttgaagcatt tatcagggtt
5041 attgtctcat gagcggatac atatttgaat gtatttagaa aaataaacaa ataggggttc
5101 cgcgcacatt tccccgaaaa gtgccacctg acgtctaaga aaccattatt atcatgacat
5161 taacctataa aaataggcgt atcacgaggc cctttcgtct cgcgcgtttc ggtgatgacg
5221 gtgaaaacct ctgacacatg cagctcccgg agacggtcac agcttgtctg taagcggatg
5281 ccgggagcag acaagcccgt cagggcgcgt cagcgggtgt tggcgggtgt cggggctggc
5341 ttaactatgc ggcatcagag cagattgtac tgagagtgca ccataaaatt gtaaacgtta
5401 atattttgtt aaaattcgcg ttaaattttt gttaaatcag ctcatttttt aaccaataga
5461 ccgaaatcgg caaaatccct tataaatcaa aagaatagcc cgagatagag ttgagtgttg
5521 ttccagtttg gaacaagagt ccactattaa agaacgtgga ctccaacgtc aaagggcgaa
5581 aaaccgtcta tcagggcgat ggcccactac gtgaaccatc acccaaatca agttttttgg
5641 ggtcgaggtg ccgtaaagca ctaaatcgga accctaaagg gagcccccga tttagagctt
5701 gacggggaaa gccggcgaac gtggcgagaa aggaagggaa gaaagcgaaa ggagcgggcg
5761 ctaaggcgct ggcaagtgta gcggtcacgc tgcgcgtaac caccacaccc gccgcgctta
5821 atgcgccgct acagggcgcg tactatggtt gctttgacgt atgcggtgtg aaataccgca
5881 cagatgcgta aggagaaaat accgcatcag gcgcc(配列番号17)
1 cctgcaggca gctgcgcgct cgctcgctca ctgaggccgc ccgggcaaag cccgggcgtc
61 gggcgacctt tggtcgcccg gcctcagtga gcgagcgagc gcgcagagag ggagtggcca
121 actccatcac taggggttcc tgcggccgca cgcgaaacaa ttctgcagga atctagttat
181 taatagtaat caattacggg gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca
241 taacttacgg taaatggccc gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca
301 ataatgacgt atgttcccat agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg
361 gagtatttac ggtaaactgc ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtacg
421 ccccctattg acgtcaatga cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc
481 ttatgggact ttcctacttg gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtc
541 gaggtgagcc ccacgttctg cttcactctc cccatctccc ccccctcccc acccccaatt
601 ttgtatttat ttatttttta attattttgt gcagcgatgg gggcgggggg gggggggggg
661 cgcgcgccag gcggggcggg gcggggcgag gggcggggcg gggcgaggcg gagaggtgcg
721 gcggcagcca atcagagcgg cgcgctccga aagtttcctt ttatggcgag gcggcggcgg
781 cggcggccct ataaaaagcg aagcgcgcgg cgggcgggag tcgctgcgcg ctgccttcgc
841 cccgtgcccc gctccgccgc cgcctcgcgc cgcccgcccc ggctctgact gaccgcgtta
901 ctcccacagg tgagcgggcg ggacggccct tctcctccgg gctgtaatta gcgcttggtt
961 taatgacggc ttgtttcttt tctgtggctg cgtgaaagcc ttgaggggct ccgggagggc
1021 cctttgtgcg gggggagcgg ctcggggggt gcgtgcgtgt gtgtgtgcgt ggggagcgcc
1081 gcgtgcggct ccgcgctgcc cggcggctgt gagcgctgcg ggcgcggcgc ggggctttgt
1141 gcgctccgca gtgtgcgcga ggggagcgcg gccgggggcg gtgccccgcg gtgcgggggg
1201 ggctgcgagg ggaacaaagg ctgcgtgcgg ggtgtgtgcg tgggggggtg agcagggggt
1261 gtgggcgcgt cggtcgggct gcaacccccc ctgcaccccc ctccccgagt tgctgagcac
1321 ggcccggctt cgggtgcggg gctccgtacg gggcgtggcg cggggctcgc cgtgccgggc
1381 ggggggtggc ggcaggtggg ggtgccgggc ggggcggggc cgcctcgggc cggggagggc
1441 tcgggggagg ggcgcggcgg cccccggagc gccggcggct gtcgaggcgc ggcgagccgc
1501 agccattgcc ttttatggta atcgtgcgag agggcgcagg gacttccttt gtcccaaatc
1561 tgtgcggagc cgaaatctgg gaggcgccgc cgcaccccct ctagcgggcg cggggcgaag
1621 cggtgcggcg ccggcaggaa ggaaatgggc ggggagggcc ttcgtgcgtc gccgcgccgc
1681 cgtccccttc tccctctcca gcctcggggc tgtccgcggg gggacggctg ccttcggggg
1741 ggacggggca gggcggggtt cggcttctgg cgtgtgaccg gcggctctag agcctctgct
1801 aaccatgttc atgccttctt ctttttccta cagctcctgg gcaacgtgct ggttattgtg
1861 ctgtctcatc attttggcaa agaattacgc gtgccaccat ggtcctggac agcgtggccc
1921 gcatcgtgaa ggtgcagctg cccgcctacc tcaagcagct cccggtcccc gacagcatca
1981 ccgggttcgc ccgcctcaca gtttcagact ggctccgcct actgcccttc ctcggggtac
2041 ttgcgcttct gggctacctc gcagtgcgcc cattcttccc aaagaagaag caacagaagg
2101 atagcttgat caatcttaag atacaaaagg aaaatcccaa ggtggtgaat gagataaaca
2161 ttgaagatct gtgtctcacc aaagcagctt attgtaggtg ctggcggtcc aagacgtttc
2221 ctgcctgtga tggatcccat aataagcata atgaattgac aggcgataac gtgggtcctc
2281 tcatcctgaa gaagaaagaa gtatagaagc ttatcgataa tcaacctctg gattacaaaa
2341 tttgtgaaag attgactggt attcttaact atgttgctcc ttttacgcta tgtggatacg
2401 ctgctttaat gcctttgtat catgctattg cttcccgtat ggctttcatt ttctcctcct
2461 tgtataaatc ctggttgctg tctctttatg aggagttgtg gcccgttgtc aggcaacgtg
2521 gcgtggtgtg cactgtgttt gctgacgcaa cccccactgg ttggggcatt gccaccacct
2581 gtcagctcct ttccgggact ttcgctttcc ccctccctat tgccacggcg gaactcatcg
2641 ccgcctgcct tgcccgctgc tggacagggg ctcggctgtt gggcactgac aattccgtgg
2701 tgttgtcggg gaaatcatcg tcctttcctt ggctgctcgc ctatgttgcc acctggattc
2761 tgcgcgggac gtccttctgc tacgtccctt cggccctcaa tccagcggac cttccttccc
2821 gcggcctgct gccggctctg cggcctcttc cgcgtcttcg ccttcgccct cagacgagtc
2881 ggatctccct ttgggccgcc tccccgcatc gataccgagc gctgctcgag agatcgatct
2941 gcctcgactg tgccttctag ttgccagcca tctgttgttt gcccctcccc cgtgccttcc
3001 ttgaccctgg aaggtgccac tcccactgtc ctttcctaat aaaatgagga aattgcatcg
3061 cattgtctga gtaggtgtca ttctattctg gggggtgggg tggggcagga cagcaagggg
3121 gaggattggg aagacaatag caggcatgct ggggacacgt gcggaccgag cggccgcagg
3181 aacccctagt gatggagttg gccactccct ctctgcgcgc tcgctcgctc actgaggccg
3241 ggcgaccaaa ggtcgcccga cgcccgggct ttgcccgggc ggcctcagtg agcgagcgag
3301 cgcgcagctg cctgcaggac atgtgagcaa aaggccagca aaaggccagg aaccgtaaaa
3361 aggccgcgtt gctggcgttt ttccataggc tccgcccccc tgacgagcat cacaaaaatc
3421 gacgctcaag tcagaggtgg cgaaacccga caggactata aagataccag gcgtttcccc
3481 ctggaagctc cctcgtgcgc tctcctgttc cgaccctgcc gcttaccgga tacctgtccg
3541 cctttctccc ttcgggaagc gtggcgcttt ctcatagctc acgctgtagg tatctcagtt
3601 cggtgtaggt cgttcgctcc aagctgggct gtgtgcacga accccccgtt cagcccgacc
3661 gctgcgcctt atccggtaac tatcgtcttg agtccaaccc ggtaagacac gacttatcgc
3721 cactggcagc agccactggt aacaggatta gcagagcgag gtatgtaggc ggtgctacag
3781 agttcttgaa gtggtggcct aactacggct acactagaag aacagtattt ggtatctgcg
3841 ctctgctgaa gccagttacc ttcggaaaaa gagttggtag ctcttgatcc ggcaaacaaa
3901 ccaccgctgg tagcggtggt ttttttgttt gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag
3961 gatctcaaga agatcctttg atcttttcta cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact
4021 cacgttaagg gattttggtc atgagattat caaaaaggat cttcacctag atccttttaa
4081 attaaaaatg aagttttaaa tcaatctaaa gtatatatga gtaaacttgg tctgacagtt
4141 accaatgctt aatcagtgag gcacctatct cagcgatctg tctatttcgt tcatccatag
4201 ttgcctgact ccccgtcgtg tagataacta cgatacggga gggcttacca tctggcccca
4261 gtgctgcaat gataccgcga gacccacgct caccggctcc agatttatca gcaataaacc
4321 agccagccgg aagggccgag cgcagaagtg gtcctgcaac tttatccgcc tccatccagt
4381 ctattaattg ttgccgggaa gctagagtaa gtagttcgcc agttaatagt ttgcgcaacg
4441 ttgttgccat tgctacaggc atcgtggtgt cacgctcgtc gtttggtatg gcttcattca
4501 gctccggttc ccaacgatca aggcgagtta catgatcccc catgttgtgc aaaaaagcgg
4561 ttagctcctt cggtcctccg atcgttgtca gaagtaagtt ggccgcagtg ttatcactca
4621 tggttatggc agcactgcat aattctctta ctgtcatgcc atccgtaaga tgcttttctg
4681 tgactggtga gtactcaacc aagtcattct gagaatagtg tatgcggcga ccgagttgct
4741 cttgcccggc gtcaatacgg gataataccg cgccacatag cagaacttta aaagtgctca
4801 tcattggaaa acgttcttcg gggcgaaaac tctcaaggat cttaccgctg ttgagatcca
4861 gttcgatgta acccactcgt gcacccaact gatcttcagc atcttttact ttcaccagcg
4921 tttctgggtg agcaaaaaca ggaaggcaaa atgccgcaaa aaagggaata agggcgacac
4981 ggaaatgttg aatactcata ctcttccttt ttcaatatta ttgaagcatt tatcagggtt
5041 attgtctcat gagcggatac atatttgaat gtatttagaa aaataaacaa ataggggttc
5101 cgcgcacatt tccccgaaaa gtgccacctg acgtctaaga aaccattatt atcatgacat
5161 taacctataa aaataggcgt atcacgaggc cctttcgtct cgcgcgtttc ggtgatgacg
5221 gtgaaaacct ctgacacatg cagctcccgg agacggtcac agcttgtctg taagcggatg
5281 ccgggagcag acaagcccgt cagggcgcgt cagcgggtgt tggcgggtgt cggggctggc
5341 ttaactatgc ggcatcagag cagattgtac tgagagtgca ccataaaatt gtaaacgtta
5401 atattttgtt aaaattcgcg ttaaattttt gttaaatcag ctcatttttt aaccaataga
5461 ccgaaatcgg caaaatccct tataaatcaa aagaatagcc cgagatagag ttgagtgttg
5521 ttccagtttg gaacaagagt ccactattaa agaacgtgga ctccaacgtc aaagggcgaa
5581 aaaccgtcta tcagggcgat ggcccactac gtgaaccatc acccaaatca agttttttgg
5641 ggtcgaggtg ccgtaaagca ctaaatcgga accctaaagg gagcccccga tttagagctt
5701 gacggggaaa gccggcgaac gtggcgagaa aggaagggaa gaaagcgaaa ggagcgggcg
5761 ctaaggcgct ggcaagtgta gcggtcacgc tgcgcgtaac caccacaccc gccgcgctta
5821 atgcgccgct acagggcgcg tactatggtt gctttgacgt atgcggtgtg aaataccgca
5881 cagatgcgta aggagaaaat accgcatcag gcgcc(配列番号17)
参照文献
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Claims (135)
- 単一遺伝子の送達のために操作された2つ以上のウイルス血清型を含む、ウイルスベクター送達系。
- 前記遺伝子を送達するために5~10のウイルス血清型を含む、請求項1に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記2つ以上のウイルス血清型がアデノ随伴ウイルス血清型である、請求項1に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記2つ以上のウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、AAVrh10、AAV-DJ、AAV-DJ/8、AAV-PHP.B、AAV-PHP.S、AAV-PHP.eB、AAV.CAP-B10、AAV.CAP-B22、及びAAVMYOからなる群から選択される、請求項1に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記2つ以上のウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、及びPHP.eBからなる群から選択される、請求項1に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記2つ以上のウイルス血清型が表1から選択される、請求項1に記載のウイルスベクター送達系。
- 少なくとも1つのウイルス血清型がAAV9である、請求項1に記載のウイルスベクター送達系。
- 少なくとも1つのウイルス血清型がPHP.eBである、請求項1に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記2つ以上のウイルス血清型がAAV9及びPHP.eBを含む、請求項1に記載のウイルスベクター送達系。
- miRNA標的部位をさらに含む、請求項1~9のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記miRNA標的部位が組織標的に基づいて選択される、請求項10に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記組織標的が、大動脈、内皮、心筋、骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、ならびに筋肉衛星細胞からなる群から選択される、請求項11に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記組織標的が、心臓、肝臓、筋肉、及び脳からなる群から選択される、請求項11に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記miRNA標的部位が、miRNA-1、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-124、miRNA-128、miRNA-133、miRNA-144、miRNA-148a、miRNA-208a、miRNA-208b、miRNA-223、及びmiRNA-499からなる群から選択される、請求項10~13のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 標的組織が心臓組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-1、miRNA-133、miRNA-208a、miRNA-208b、及びmiRNA-499からなる群から選択される、請求項10~14のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 標的組織が肝臓組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-144、miRNA-148a、及びmiRNA-223からなる群から選択される、請求項10~14のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 標的組織が筋肉組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-1またはmiRNA-133である、請求項10~14のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 標的組織が脳組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-124またはmiRNA-128である、請求項10~14のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 非サイレンシングプロモーターをさらに含む、請求項1~18のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記非サイレンシングプロモーターが、CMVプロモーター発現の少なくとも30%のRNA発現を導く、請求項19に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記非サイレンシングプロモーターが、CMVプロモーター発現の少なくとも50%のRNA発現を導く、請求項19または請求項20に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記プロモーターが、Cbh、CAG、CB7、及びCBAからなる群から選択される、請求項19~21のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 自己相補的ベクター骨格をさらに含む、請求項1~22のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記遺伝子が表2から選択される、請求項1~23のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記遺伝子が、Cisd2、Atg5、及びPTENからなる群から選択される、請求項1~24のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 請求項1~25のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系を含む、医薬組成物。
- 請求項26に記載の医薬組成物を対象へ投与することを含む、前記対象における疾患または障害を治療する方法。
- 請求項26に記載の医薬組成物を対象へ投与することを含む、前記対象の寿命を延長する方法。
- 単一遺伝子の送達のために操作された少なくとも2つのウイルス血清型を含むウイルスベクター送達系を対象へ投与することを含む、疾患または障害を治療または予防する方法。
- 前記ウイルスベクター送達系が、前記遺伝子を送達するために5~10のウイルス血清型を含む、請求項29に記載の方法。
- 前記2つ以上のウイルス血清型がアデノ随伴ウイルス血清型である、請求項29に記載の方法。
- 前記2つ以上のウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、AAVrh10、AAV-DJ、AAV-DJ/8、AAV-PHP.B、AAV-PHP.S、AAV-PHP.eB、AAV.CAP-B10、AAV.CAP-B22、及びAAVMYOからなる群から選択される、請求項29に記載の方法。
- 前記2つ以上のウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、及びPHP.eBからなる群から選択される、請求項29に記載の方法。
- 前記2つ以上のウイルス血清型が表1から選択される、請求項29に記載の方法。
- 少なくとも1つのウイルス血清型がAAV9である、請求項29に記載の方法。
- 少なくとも1つのウイルス血清型がPHP.eBである、請求項29に記載の方法。
- 前記2つ以上のウイルス血清型がAAV9及びPHP.eBを含む、請求項29に記載の方法。
- 前記ウイルスベクター送達系がmiRNA標的部位をさらに含む、請求項29~37のいずれか1項に記載の方法。
- 前記miRNA標的部位が組織標的に基づいて選択される、請求項38に記載の方法。
- 前記組織標的が、大動脈、内皮、心筋、骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、ならびに筋肉衛星細胞からなる群から選択される、請求項39に記載の方法。
- 前記組織標的が、心臓、肝臓、筋肉、及び脳からなる群から選択される、請求項39に記載の方法。
- 前記miRNA標的部位が、miRNA-1、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-124、miRNA-128、miRNA-133、miRNA-144、miRNA-148a、miRNA-208a、miRNA-208b、miRNA-223、及びmiRNA-499からなる群から選択される、請求項38~41のいずれか1項に記載の方法。
- 標的組織が心臓組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-1、miRNA-133、miRNA-208a、miRNA-208b、及びmiRNA-499からなる群から選択される、請求項38~42のいずれか1項に記載の方法。
- 標的組織が肝臓組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-144、miRNA-148a、及びmiRNA-223からなる群から選択される、請求項38~42のいずれか1項に記載の方法。
- 標的組織が筋肉組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-1またはmiRNA-133である、請求項38~42のいずれか1項に記載の方法。
- 標的組織が脳組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-124またはmiRNA-128である、請求項38~42のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ウイルスベクター送達系が、非サイレンシングプロモーターをさらに含む、請求項29~46のいずれか1項に記載の方法。
- 前記非サイレンシングプロモーターが、CMVプロモーター発現の少なくとも30%のRNA発現を導く、請求項47に記載の方法。
- 前記非サイレンシングプロモーターが、CMVプロモーター発現の少なくとも50%のRNA発現を導く、請求項47または請求項48に記載の方法。
- 前記プロモーターが、Cbh、CAG、CB7、及びCBAからなる群から選択される、請求項47~49のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ウイルスベクター送達系が、自己相補的ベクター骨格をさらに含む、請求項29~50のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が表2から選択される、請求項29~51のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が、Cisd2、Atg5、及びPTENからなる群から選択される、請求項29~52のいずれか1項に記載の方法。
- 前記疾患または前記障害が、加齢関連の疾患または障害である、請求項29~53のいずれか1項に記載の方法。
- 前記疾患または前記障害が、早老症、ウォルフラム症候群、神経変性障害、神経血管障害、骨格筋条件、カウデン症候群、バナヤン・ライリー・ルバルカバ症候群、プロテウス症候群、プロテウス様症候群、及び他のPTEN病、ウェルナー症候群、ブルーム症候群、ロスムンド・トムソン症候群、コケイン症候群、色素性乾皮症、硫黄欠乏性毛髪発育異常症、色素性乾皮症・コケイン症候群の合併型、ハッチンソン・ギルフォード早老症候群、拘束性皮膚障害、糖尿病、肥満、心血管性疾患、がん、眼の変性、肝不全、ならびに加齢黄斑変性症からなる群から選択される、請求項29~54のいずれか1項に記載の方法。
- 前記疾患または前記障害が、2つ以上の組織標的への前記遺伝子の投与から利益を得るであろう、請求項29~54のいずれか1項に記載の方法。
- 前記疾患または前記障害が、II型ウォルフラム症候群である、請求項29~54のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が、前記対象中の2つ以上の組織において発現される、請求項29~57のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が、前記対象中の2つ以上の組織にわたって均一に発現される、請求項29~58のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が、前記対象中の2つ以上の組織にわたって均一に過剰発現される、請求項29~58のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が、前記対象中の組織のうちの少なくとも50%へ送達される、請求項29~58のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が、前記対象中で少なくとも4か月間発現される、請求項29~61のいずれか1項に記載の方法。
- 単一遺伝子の送達のために操作された2つ以上のAAV血清型、非サイレンシングプロモーター、少なくとも1つのmiRNA標的部位、前記遺伝子、及び任意選択で自己相補的骨格を含む、ウイルスベクター送達系。
- 前記AAV血清型がAAV9及びPHP.eBである、請求項63に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記遺伝子が、Cisd2、Atg5、及びPTENからなる群から選択される、請求項63または請求項64に記載のウイルスベクター送達系。
- 請求項63~65のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系を対象へ投与することを含む、疾患または障害を治療する方法。
- 前記疾患または前記障害が、II型ウォルフラム症候群である、請求項66に記載の方法。
- Cisd2、Atg5、及びPTENからなる群から選択される単一遺伝子の送達のために操作された少なくとも1つのウイルス血清型を含む、ウイルスベクター送達系。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、AAVrh10、AAV-DJ、AAV-DJ/8、AAV-PHP.B、AAV-PHP.S、AAV-PHP.eB、AAV.CAP-B10、AAV.CAP-B22、及びAAVMYOからなる群から選択される、請求項68に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、及びPHP.eBからなる群から選択される、請求項68に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型が表1から選択される、請求項68に記載のウイルスベクター送達系。
- 少なくとも1つのウイルス血清型がAAV9である、請求項68に記載のウイルスベクター送達系。
- 少なくとも1つのウイルス血清型がPHP.eBである、請求項68に記載のウイルスベクター送達系。
- miRNA標的部位をさらに含む、請求項68~73のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記miRNA標的部位が組織標的に基づいて選択される、請求項74に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記組織標的が、大動脈、内皮、心筋、骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、ならびに筋肉衛星細胞からなる群から選択される、請求項75に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記組織標的が、心臓、肝臓、筋肉、及び脳からなる群から選択される、請求項75に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記miRNA標的部位が、miRNA-1、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-124、miRNA-128、miRNA-133、miRNA-144、miRNA-148a、miRNA-208a、miRNA-208b、miRNA-223、及びmiRNA-499からなる群から選択される、請求項74~77のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 標的組織が心臓組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-1、miRNA-133、miRNA-208a、miRNA-208b、及びmiRNA-499からなる群から選択される、請求項74~78のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 標的組織が肝臓組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-144、miRNA-148a、及びmiRNA-223からなる群から選択される、請求項74~78のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 標的組織が筋肉組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-1またはmiRNA-133である、請求項74~78のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 標的組織が脳組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-124またはmiRNA-128である、請求項74~78のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 非サイレンシングプロモーターをさらに含む、請求項68~82のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記非サイレンシングプロモーターが、CMVプロモーター発現の少なくとも30%のRNA発現を導く、請求項83に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記非サイレンシングプロモーターが、CMVプロモーター発現の少なくとも50%のRNA発現を導く、請求項83または請求項84に記載のウイルスベクター送達系。
- 前記プロモーターが、Cbh、CAG、CB7、及びCBAからなる群から選択される、請求項83~85のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 自己相補的ベクター骨格をさらに含む、請求項68~86のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系。
- 請求項68~87に記載のいずれか1項に記載のウイルスベクター送達系を含む、医薬組成物。
- 請求項88に記載の医薬組成物を対象へ投与することを含む、前記対象における疾患または障害を治療する方法。
- 前記疾患が、II型ウォルフラム症候群である、請求項89に記載の方法。
- 請求項88に記載の医薬組成物を対象へ投与することを含む、前記対象の寿命を延長する方法。
- 単一遺伝子の送達のために操作された少なくとも1つのウイルス血清型を含むウイルスベクター送達系を対象へ投与することを含む、対象の寿命を延長する方法。
- 単一遺伝子の送達のために操作された少なくとも1つのウイルス血清型を含むウイルスベクター送達系を対象へ投与することを含む、疾患または障害を治療または予防する方法。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型がアデノ随伴ウイルス血清型である、請求項92または請求項93に記載の方法。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、AAVrh10、AAV-DJ、AAV-DJ/8、AAV-PHP.B、AAV-PHP.S、AAV-PHP.eB、AAV.CAP-B10、AAV.CAP-B22、及びAAVMYOからなる群から選択される、請求項92または請求項93に記載の方法。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、及びPHP.eBからなる群から選択される、請求項92または請求項93に記載の方法。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型が表1から選択される、請求項92または請求項93に記載の方法。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型がAAV9である、請求項92または請求項93に記載の方法。
- 前記少なくとも1つのウイルス血清型がPHP.eBである、請求項92または請求項93に記載の方法。
- 前記ウイルスベクター送達系がmiRNA標的部位をさらに含む、請求項92~99のいずれか1項に記載の方法。
- 前記miRNA標的部位が組織標的に基づいて選択される、請求項100に記載の方法。
- 前記組織標的が、大動脈、内皮、心筋、骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、ならびに筋肉衛星細胞からなる群から選択される、請求項101に記載の方法。
- 前記組織標的が、心臓、肝臓、筋肉、及び脳からなる群から選択される、請求項101に記載の方法。
- 前記miRNA標的部位が、miRNA-1、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-124、miRNA-128、miRNA-133、miRNA-144、miRNA-148a、miRNA-208a、miRNA-208b、miRNA-223、及びmiRNA-499からなる群から選択される、請求項100~103のいずれか1項に記載の方法。
- 標的組織が心臓組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-1、miRNA-133、miRNA-208a、miRNA-208b、及びmiRNA-499からなる群から選択される、請求項100~104のいずれか1項に記載の方法。
- 標的組織が肝臓組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-24、miRNA-29、miRNA-30c、miRNA-33、miRNA-122、miRNA-144、miRNA-148a、及びmiRNA-223からなる群から選択される、請求項100~104のいずれか1項に記載の方法。
- 標的組織が筋肉組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-1またはmiRNA-133である、請求項100~104のいずれか1項に記載の方法。
- 標的組織が脳組織であり、前記miRNA標的部位が、miRNA-124またはmiRNA-128である、請求項100~104のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ウイルスベクター送達系が、非サイレンシングプロモーターをさらに含む、請求項92~108のいずれか1項に記載の方法。
- 前記非サイレンシングプロモーターが、CMVプロモーター発現の少なくとも30%のRNA発現を導く、請求項109に記載の方法。
- 前記非サイレンシングプロモーターが、CMVプロモーター発現の少なくとも50%のRNA発現を導く、請求項109または請求項110に記載の方法。
- 前記プロモーターが、Cbh、CAG、CB7、及びCBAからなる群から選択される、請求項109~111のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ウイルスベクター送達系が、自己相補的ベクター骨格をさらに含む、請求項92~112のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が表2から選択される、請求項92~113のいずれか1項に記載の方法。
- 前記遺伝子が、Cisd2、Atg5、及びPTENからなる群から選択される、請求項92~114のいずれか1項に記載の方法。
- 前記疾患または前記障害が、加齢関連の疾患または障害である、請求項93~115のいずれか1項に記載の方法。
- 前記疾患または前記障害が、早老症、ウォルフラム症候群、神経変性障害、神経血管障害、骨格筋条件、カウデン症候群、バナヤン・ライリー・ルバルカバ症候群、プロテウス症候群、プロテウス様症候群、及び他のPTEN病、ウェルナー症候群、ブルーム症候群、ロスムンド・トムソン症候群、コケイン症候群、色素性乾皮症、硫黄欠乏性毛髪発育異常症、色素性乾皮症・コケイン症候群の合併型、ハッチンソン・ギルフォード早老症候群、拘束性皮膚障害、糖尿病、肥満、心血管性疾患、がん、眼の変性、肝不全、ならびに加齢黄斑変性症からなる群から選択される、請求項93~116のいずれか1項に記載の方法。
- 前記疾患または前記障害が、II型ウォルフラム症候群である、請求項93~117のいずれか1項に記載の方法。
- 有効量のCisd2をII型ウォルフラム症候群を患う対象へ投与することを含む、II型ウォルフラム症候群を治療する方法。
- Cisd2が、遺伝子療法を介して前記対象へ投与される、請求項119に記載の方法。
- Cisd2が、ウイルスベクター送達系を介して前記対象へ投与される、請求項119または請求項120に記載の方法。
- 前記ウイルスベクター送達系が、少なくとも1つのウイルス血清型を含む、請求項121に記載の方法。
- 前記ウイルスベクター送達系が、2つ以上のウイルス血清型を含む、請求項121に記載の方法。
- 対象の1つまたは複数の標的組織における遺伝子導入の前決定されたレベルを同定する方法であって、
前記対象へ投与されたベクターの量と前記1つまたは複数の標的組織中のもたらされた遺伝子導入レベルとの間の関係性を特徴づける用量-応答曲線を得ることと;
前記対象へ投与された前記ベクターの量と前記1つまたは複数の標的組織中の前記もたらされた遺伝子導入レベルとの間の関係性を特徴づける線形方程式または非線形方程式を得ることと;
遺伝子送達系の要求する用量を内挿または外挿して、前記1つまたは複数の標的組織において定義されたレベルの遺伝子導入を達成することと、
を含む、前記方法。 - 対象の1つまたは複数の標的組織における導入遺伝子発現の前決定されたレベルを同定する方法であって、
前記対象へ投与されたベクターの量と前記1つまたは複数の標的組織中のもたらされた導入遺伝子発現レベルとの間の関係性を特徴づける用量-応答曲線を得ることと;
前記対象へ投与された前記ベクターの量と前記1つまたは複数の標的組織中の前記もたらされた導入遺伝子発現レベルとの間の関係性を特徴づける線形方程式または非線形方程式を得ることと;
遺伝子送達系の要求する用量を内挿または外挿して、前記1つまたは複数の標的組織において定義されたレベルの導入遺伝子発現を達成することと、
を含む、前記方法。 - 前記遺伝子送達系が、少なくとも1つのウイルス血清型を含む、請求項124または請求項125に記載の方法。
- 前記遺伝子送達系が、2つ以上のウイルス血清型を含む、請求項124または請求項125に記載の方法。
- 前記ウイルス血清型がアデノ随伴ウイルス血清型である、請求項126または請求項127に記載の方法。
- 前記ウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、AAVrh10、AAV-DJ、AAV-DJ/8、AAV-PHP.B、AAV-PHP.S、AAV-PHP.eB、AAV.CAP-B10、AAV.CAP-B22、及びAAVMYOからなる群から選択される、請求項126~128のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ウイルス血清型が、AAV1、AAV2、AAV3、AAV3B、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、Anc80、及びPHP.eBからなる群から選択される、請求項126~128のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ウイルス血清型が表1から選択される、請求項126~128のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の標的組織が、単一組織を含む、請求項124~131のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の標的組織が、2つ以上の組織を含む、請求項124~131のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の標的組織が、大動脈、内皮、心筋、骨格筋、舌、食道、胃、小腸、大腸、横隔膜、眼、視神経、内耳、聴神経、褐色脂肪、白色脂肪、中枢神経系、末梢神経系、腎臓、脾臓、肝臓、肺、心臓、脳、胸腺、卵巣、精巣、皮膚、膵臓、骨髄細胞、骨芽細胞及び破骨細胞、血液細胞、造血幹細胞、ならびに筋肉衛星細胞からなる群から選択される、請求項124~133のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の標的組織が、心臓、肝臓、筋肉、及び脳からなる群から選択される、請求項124~133のいずれか1項に記載の方法。
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