JP2023518400A - 微小ガイダンス及びナビゲーションコントロール(miniGNC)抗体様タンパク質、その製造方法及び使用方法 - Google Patents

微小ガイダンス及びナビゲーションコントロール(miniGNC)抗体様タンパク質、その製造方法及び使用方法 Download PDF

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Abstract

多重特異性抗体様タンパク質であって、第1単量体及び第2単量体を含み、第1単量体は、第1結合単量体、CH1ドメイン、第1ヒンジ、第1CH2ドメイン及び第1CH3ドメインを含み、第2単量体は、第2結合単量体、CLドメイン、第2ヒンジ、第2CH2ドメイン及び第2CH3ドメインを含み、第1結合単量体及び第2結合単量体は、二量体を形成するように構成され、第1単量体及び第2単量体は、CH1ドメインとCLドメインの間の少なくとも1つのジスルフィド結合及び第1ヒンジと第2ヒンジの間の少なくとも1つのジスルフィド結合を介して共有結合でペアとなり、第1単量体及び第2単量体は、必要に応じて第1結合ドメイン(D1)及び第2結合ドメイン(D2)、並びに第4結合ドメイン(D4)及び第5結合ドメイン(D5)を含み、多重特異性抗体様タンパク質は少なくとも二重特異性である多重特異性抗体様タンパク質。【選択図】図1

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2020年3月17日に提出された米国仮出願第62/991,042号の優先権を主張し(35U.S.C.119(e))、その開示全体は、参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、がん免疫療法に用いる多重特異性抗体の技術分野に関し、より具体的には、免疫細胞及び腫瘍細胞の両方の表面分子に対して多重結合活性を有する微小ガイダンス及びナビゲーションコントロール(miniGNC)抗体の製造及び使用方法に関する。
治療用抗体は、がん、感染症、自己免疫などの疾患の治療の主力となっている。モノクローナルである単一特異性抗体は、例えば特定のシグナル伝達経路の阻害又は活性化を介して疾患を治療するための直接的なメカニズムを提供する一方、多重特異性抗体は、より複雑な治療メカニズムを提供することができる。複数の異なる抗原又は単一抗原内の複数のエピトープを標的とすることにより、細胞の共局在化や活性化などの生物学的応答は引き出される。これによって、例えば、T細胞やその他の免疫細胞を特定の抗原発現腫瘍細胞の部位にリダイレクトすることが可能になる。このように、二重特異性及び多重特異性抗体は、免疫腫瘍学の分野で重要なプラットフォームとなっている。
多特異性抗体プラットフォームの利点により、このようなフレームワークが数多く開発されている。このようなプラットフォームの一つは、ガイダンス及びナビゲーションコントロール(GNC)として知られている。GNCタンパク質には、機能的に独立した複数の結合部分を連結して、エフェクター細胞と標的細胞の両方を結合できる単一の実体にするタンパク質が含まれる(出願人の出願WO/2019/005641、WO2019191120及びPCT/US20/59230;その全体が本明細書に組み込まれる)。一般に、これらのプラットフォームは少なくとも2つの特異性に制限されており、2つ以上の抗原への結合を必要とする複雑な治療メカニズムの探索を妨げている。2つ以上の特異性を持つ抗体プラットフォームでは、通常、結合ドメインの数を増加させるために、望ましくない物理的及び生物学的特性を有する大きな分子を形成する必要がある。分子が大きく複雑になると、凝集や溶解性の問題が発生する可能性が高くなるため、分子量の増大は発展を妨害する可能性がある。さらに、大きな高分子は、固形腫瘍に浸透する能力が、小さなサイズのタンパク質と比較して妨げられる可能性がある。したがって、モノクローナルIgG抗体よりも顕著に大きくないものの、3つ以上の特異性を有する多重特異性抗体プラットフォームが必要である。
以下の概要は単なる例示であり、決して限定することを意図するものではない。上記の例示的な態様、実施形態、及び特徴に加えて、さらなる態様、実施形態、及び特徴は、図面及び以下の詳細な説明を参照することによって明らかになるであろう。
本発明は、結合特異性を有するタンパク質(例えば、多重特異性抗体を含む多重特異性タンパク質様抗体)、これらの結合タンパク質の断片(scFvドメイン、Fab領域、Fcドメイン、VH、VL、軽鎖、重鎖、可変領域及び相補性決定領域(CDR)など)を提供する。本発明は、さらにこの抗体様タンパク質の製造方法及び使用方法を提供する。
一態様において、本発明は、多重特異性抗体様タンパク質を提供する。一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、N末端及びC末端を有し、第1単量体と第2単量体とを含む。第1単量体は、N末端からC末端まで第1結合単量体、CH1ドメイン、第1ヒンジ、第1CH2ドメイン及び第1CH3ドメインを含む。第1単量体は、必要に応じてN末端に結合した第1結合ドメイン(D1)及び/又はC末端に結合した第4結合ドメイン(D4)を含み得る。第2単量体は、N末端からC末端まで第2結合単量体、CLドメイン、第2ヒンジ、第2CH2ドメイン及び第2CH3ドメインを含む。第2単量体は、必要に応じてN末端に結合した第2結合ドメイン(D2)及び/又はC末端に結合した第5結合ドメイン(D5)を含み得る。第1結合単量体及び第2結合単量体は、二量体を形成するように構成される。第1単量体及び第2単量体は、CH1ドメインとCLドメインとの間の少なくとも1つのジスルフィド結合及び第1ヒンジと第2ヒンジとの間の少なくとも1つのジスルフィド結合を介して共有結合でペアとなる。前記多重特異性抗体様タンパク質は、少なくとも二重特異性である。
一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、三重特異性、四重特異性又は五重特異性であり得る。一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、モノクローナル抗体であり得る。一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、精製されたモノクローナル抗体であり得る。一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、ヒト化抗体であり得る。
一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、さらに第1CH3ドメインと第2CH3ドメインとの間にジスルフィド結合を含み得る。
一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、さらに第1ヒンジと第2ヒンジとの間に第2ジスルフィド結合を含み得る。
一実施形態において、接続リンカーは、様々なドメインの間に使用される。一実施形態において、前記接続リンカーは、(Gリンカーを含み得る。ここで、n、x及びyは、それぞれ独立して1から10の整数である。一実施形態において、D1、D2、D4又はD5は、リンカーを介してN又はC末端に結合される。一実施形態において、前記リンカーは、(Gリンカーを含み得る。n、x及びyは、それぞれ独立して1から10の整数であり得る。一実施形態において、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9及び10である。一実施形態において、xは、1、2、3、4、5、6、7、8、9及び10である。一実施形態において、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9及び10である。
一実施形態において、第1CH3ドメインは、ホール(hole)構造を形成するように構成され、第2CH3ドメインは、ノブ(knob)構造を形成するように構成される。第1ドメインCH2と第1CH3ドメイン、及び第2CH2ドメインと第2CH3ドメインは、ヘテロ二量体化されて相補的なFcドメインを形成するように構成される。
一実施形態において、第1CH3ドメインは、T366S、L368A又はY407Vに少なくとも1つの「ホール」変異を含み、第2CH3ドメインは、T366Wに「ノブ」変異を含み得る。
一実施形態において、Fcドメインは、H435R/Y436Fに変異を含み得る。
一実施形態において、Fcドメインは、ADCC、ADCP又はCDCから選択されるエフェクター細胞機能を排除するようにエンジニアリングされる。
一実施形態において、Fcドメインは、L234A、L235A、G237A、K322A(Euナンバリング)に少なくとも1つの変異を含み得る。一実施形態において、Fc領域は、L234A/L235A/G237A/K322Aに変異を含む。一実施形態において、Fc領域は、L234A/L235A/K322A(Euナンバリング)に変異を含む。一実施形態において、Fcドメインは、ヌル変異を含む。一実施形態において、IgG4 Fcドメインは、変異S228P(Euナンバリング)を含む。一実施形態において、IgG4 Fcドメインは、変異S228P/F234A/L234A(Euナンバリング)を含む。
一実施形態において、重鎖定常配列は、IgG1又はIgG4に由来し得る。
一実施形態において、前記Fcドメインは、配列番号313又は314と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、第1結合単量体は、VHドメインを含み、第2結合単量体は、VLドメインを含み得る。VH、CH1、VL、CLドメインは、Fab領域を第3結合ドメイン(D3)として構成する。一実施形態において、Fab領域は、VH-44CとVL 100Cとの間にジスルフィド結合を含み得る。
一実施形態において、第1結合単量体と第2結合単量体は、NKG2D受容体を第3結合ドメイン(D3)として構成する。
一実施形態において、D1、D2、D4及びD5は、それぞれ独立してscFvドメイン、VHHドメイン、受容体又はリガンドである。
一実施形態において、scFvドメインは、VLドメインに結合したVHドメインを含み得る。一実施形態において、scFvドメインは、VH-VL方向を有し得る。一実施形態において、scFvドメインは、VL-VH方向を有し得る。
一実施形態において、scFvドメインは、VLとVHの間にジスルフィド結合を含み得る。一実施形態において、前記ジスルフィド結合は、scFvドメインのVL100とVH44の間にある。一実施形態において、scFvドメインは、VHに変異R19Sを含み得る。
一実施形態において、VHHドメインは、VH又はVHHに変異R19Sを含み得る。
一実施形態において、D1、D2、D4及びD5の少なくとも1つ、2つ又は3つは、scFvであり得る。一実施形態において、D1、D2、D4及びD5は、全てscFvであり得る。
一実施形態において、D1、D2、D4及びD5の少なくとも1つ、2つ又は3つは、VHHドメインであり得る。一実施形態において、D1、D2、D4及びD5は、全てVHHドメインであり得る。
一実施形態において、D1、D2、D4及びD5の少なくとも1つ、2つ又は3つは、受容体であり得る。一実施形態において、D1、D2、D4及びD5は、全て受容体であり得る。
一実施形態において、D1、D2、D4及びD5の少なくとも1つ、2つ又は3つは、リガンドであり得る。一実施形態において、D1、D2、D4及びD5は、全てリガンドであり得る。
一実施形態において、D1、D2、D4及びD5は、それぞれ独立してT細胞活性化受容体、免疫細胞結合受容体、免疫チェックポイント分子、共刺激因子、白血球の受容体、腫瘍抗原、腫瘍関連抗原(TAA)、組織細胞の受容体、癌細胞の受容体又はそれらの組み合わせから選択される抗原に対して結合特異性を有し得る。
一実施形態において、T細胞活性化受容体の結合ドメインは、腫瘍関連抗原(TAA)の結合ドメインに隣接する。
一実施形態において、T細胞活性化受容体は、CD3を含み得る。
一実施形態において、免疫チェックポイント受容体は、PD-L1、PD-1、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、BTLA、VISTA、PD-L2、CD160、LOX-1、siglec-15、CD47、HVEM SIRPα、CSF1R、CD73、Siglec-15、CD47又はそれらの組み合わせを含み得る。
一実施形態において、共刺激受容体は、4-1BB、CD28、OX40、GITR、CD40L、CD40、ICOS、LIGHT、CD27、CD30又はそれらの組み合わせを含み得る。
一実施形態において、腫瘍関連抗原は、EGFR、HER2、HER3、EGRFVIII、CD19、BCMA、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30、ROR1、CEA、LMP1、LMP2A、メソテリン、PSMA、EpCAM、グリピカン-3、gpA33、GD2、TROP2、NKG2Dリガンド、CD39、CLDN18.2、DLL3、HLA-G、FcRH5、GPRC5D、LIV-1、MUC1、CD138、CD70、uPAR、CD38又はそれらの組み合わせを含み得る。
一実施形態において、D1、D2、D3、D4及びD5は、それぞれ独立してEGFR、HER2、HER3、EGFRvIII、ROR1、CD3、CD28、CEA、LMP1、LMP2A、メソテリン、PSMA、EpCAM、グリピカン-3、gpA33、GD2、TROP2、NKG2D、NKG2Dリガンド、BCMA、CD19、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30、PD-L1、PD1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40、CD40L、VISTA、ICOS、BTLA、LIGHT、HVEM、CSF1R、CD73、CD39、CLDN18.2、DLL3、HLA-G、FcRH5、GPRC5D、LIV-1、MUC1、CD138、CD70、CD16、uPAR、Siglec-15、CD47、CD38、NKp46、PD-L2、CD160、LOX-1、SIRPα CD27から選択される抗原に対して結合特異性を有し得る。Fcドメインは、ヒトIgG Fcドメインを含み得る。
一実施形態において、D1はCD3、CD20、CEA、HER2、EGFR又はNKG2Dリガンドに対して結合特異性を有する。一実施形態において、D2はHER3、EGFR、CD3又はCD19に対して結合特異性を有する。一実施形態において、D3はHER3、EGFR、CD3又はNKG2Dリガンドに対して結合特異性を有する。一実施形態において、D4は4-1BB又はEGFRに対して結合特異性を有する。一実施形態において、D5はPD-L1又はHER3に対して結合特異性を有する。
一実施形態において、D1はCD3に対して結合特異性を有し、D2はHER3に対して結合特異性を有し、D3はEGFRに対して結合特異性を有し、D4は4-1BBに対して結合特異性を有し、D5はPD-L1に対して結合特異性を有する。
一実施形態において、D1はEGFRに対して結合特異性を有し、D2はHER3に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有し、D4は4-1BBに対して結合特異性を有し、D5はPD-L1に対して結合特異性を有する。
一実施形態において、D1はEGFRに対して結合特異性を有し、D2はCD3に対して結合特異性を有し、D3はHER3に対して結合特異性を有し、D4は4-1BBに対して結合特異性を有し、D5はPD-L1に対して結合特異性を有する。
一実施形態において、D1はCD3又はEGFRに対して結合特異性を有し、D2はCD19に対して結合特異性を有し、D3はCD3又はEGFRに対して結合特異性を有し、D4は4-1BBに対して結合特異性を有し、D5はPD-L1に対して結合特異性を有する。
一実施形態において、D1及びD4はそれぞれEGFRに対して結合特異性を有し、D2及びD5はそれぞれHER3に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有する。
一実施形態において、D1はCD20に対して結合特異性を有し、D2はCD19に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有し、D4は4-1BBに対して結合特異性を有し、D5はPD-L1に対して結合特異性を有する。
一実施形態において、D1はNKG2Dリガンドに対して結合特異性を有し、D2はCD19に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有し、D4は4-1BBに対して結合特異性を有し、D5はPD-L1に対して結合特異性を有し得る。
一実施形態において、D1はCD3に対して結合特異性を有し、D3はNKG2D受容体を含み得る。一実施形態において、前記タンパク質は、CD19に対して結合特異性を有するD2をさらに含み得る。一実施形態において、前記タンパク質は、PD-L1に対して結合特異性を有するD5をさらに含み得る。一実施形態において、前記タンパク質は、4-1BBに対して結合特異性を有するD4をさらに含み得る。
一実施形態において、多重特異性抗体様タンパク質は二重特異性である。一実施形態において、D2はHER3に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有する。一実施形態において、D1はHER2に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有する。一実施形態において、D1はEGFRに対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有する。一実施形態において、D3はCD3に対して結合特異性を有し、D5はHER3に対して結合特異性を有する。一実施形態において、D3はCD3に対して結合特異性を有し、D4はEGFRに対して結合特異性を有する。
一実施形態において、二重特異性抗体様タンパク質は、配列番号1及び3、5及び7、9及び11、13及び15、53及び55、57及び59、113及び115、117及び119、121及び123、125及び127、157及び159、297及び299、又は199及び201と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、三重特異性である。一実施形態において、D1はEGFRに対して結合特異性を有し、D2はHER3に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有する。一実施形態において、D1はCEAに対して結合特異性を有し、D2はEGFRに対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有する。 一実施形態において、D3はCD3に対して結合特異性を有し、D4はEGFRに対して結合特異性を有し、D5はHER3に対して結合特異性を有する。一実施形態において、前記抗体は、EGFR、HER3及びCD3に対して結合特異性を有する三重特異性抗体である。一実施形態において、三重特異性抗体様タンパク質は、配列番号41及び43、45及び47、49及び51、101及び103、105及び107、109及び111、195及び197、137及び139、又は161及び163と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、多重特異性抗体様タンパク質は四重特異性である。一実施形態において、D1はEGFRに対して結合特異性を有し、D2はHER3に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有し、D4は4-1BBに対して結合特異性を有する。一実施形態において、D1はEGFRに対して結合特異性を有し、D2はHER3に対して結合特異性を有し、D3はCD3に対して結合特異性を有し、D5はPD-L1に対して結合特異性を有する。前記抗体は、EGFR、HER3、CD3及び4-1BBに対して結合特異性を有する四重特異性である。前記抗体は、EGFR、HER3、CD3及びPD-L1に対して結合特異性を有する四重特異性である。一実施形態において、前記四重特異性抗体様タンパク質は、配列番号33及び35、37及び39、141及び143、145及び147、又は165及び167と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、前記抗体は、五重特異性である。一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、EGFR、HER3、CD3、4-1BB及びPD-L1に対して結合特異性を有し得る。一実施形態において、五重特異性抗体様タンパク質は、配列番号17及び19、21及び23、25及び27、29及び31、69及び71、73及び75、77及び79、81及び83、85及び87、89及び91、93及び95、97及び99、129及び131、133及び135、149及び151、169及び171、173及び175、又は177及び179と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
第2態様において、本発明は、相補性決定領域(CDR)の新規配列を提供する。一実施形態において、本発明は、前記CDRを含むタンパク質、抗体様タンパク質又は抗体を提供する。
一実施形態において、前記CDRは、CEAに対して親和性を有し得る。一実施形態において、前記CDRは、CEAに対して平衡解離定数(KD)を有し得る。前記KDは、0.1nM、2nM、5nM、10nM、20nM、30nM又は50nM以下である。一実施形態において、前記CDRは、配列番号301、302、303、304、305又は306と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、本発明は、CEAに対して親和性を有するタンパク質を提供する。一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号301と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR H1を有し得る。一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号302と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR H2を有し得る。一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号303と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR H3を有し得る。一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号314と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR L1を有し得る。一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号305と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR L2を有し得る。一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号306と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR L3を有し得る。一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号279、280、281又は282から選択されるアミノ酸配列と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号279、280、281又は282から選択されるアミノ酸配列と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、本発明は、可変領域を有する多重特異性抗体様タンパク質を提供する。前記可変領域は、配列番号301、302、303、304、305又は306から選択されるアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、前記CDRは、CD3に対して親和性を有し得る。一実施形態において、前記CDRは、CD3に対して平衡解離定数(KD)を有し得る。前記KDは、10nM、20nM、30nM、50nM、100nM、200nM、300nM、400nM又は500nM以下である。一実施形態において、前記CDRは、配列番号307、308、309、310、311又は312と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、CD3に対して親和性を有する前記タンパク質は、配列番号307と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR H1を有する。一実施形態において、CD3に対して親和性を有する前記タンパク質は、配列番号308と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR H2を有する。一実施形態において、CD3に対して親和性を有する前記タンパク質は、配列番号309と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR H3を有する。一実施形態において、CD3に対して親和性を有する前記タンパク質は、配列番号310と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR L1を有する。一実施形態において、CD3に対して親和性を有する前記タンパク質は、配列番号311と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR L2を有する。一実施形態において、CD3に対して親和性を有する前記タンパク質は、配列番号312と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCDR L3を有する。
一実施形態において、前記タンパク質は、配列番号227-230、231-234、235-238、239-242及び291-294から選択されるアミノ酸配列と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、配列番号227-230、231-234、235-238、239-242及び291-294から選択されるアミノ酸配列と少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
一実施形態において、前記多重特異性抗体様タンパク質は、可変領域を有し得る。前記可変領域は、配列番号307、308、309、310、311又は312から選択されるアミノ酸配列を含み得る。
別の態様において、本発明は、前記多重特異性抗体様タンパク質、断片、ドメイン及び領域をコードする単離された核酸配列を提供する。
別の態様において、本発明は、前記単離された核酸配列を含む発現ベクターを提供する。
別の態様において、本発明は、前記単離された核酸配列を含む宿主細胞を提供する。一実施形態において、前記宿主細胞は、前記発現ベクターを含む。一実施形態において、前記宿主細胞は、原核細胞又は真核細胞であり得る。
別の態様において、本発明は、前記多重特異性抗体様タンパク質の調製方法を提供する。一実施形態において、前記方法は、多重特異性抗体様タンパク質をコードするDNA配列が発現されるように宿主細胞を培養するステップと、前記多重特異性抗体を精製するステップとを含む。一実施形態において、前記方法は、前記多重特異性抗体様タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養するステップと、前記抗体様タンパク質を回収するステップとを含む。
別の態様において、本発明は、免疫複合体を提供する。一実施形態において、前記免疫複合体は、造影剤及び/又は細胞毒性剤に結合した多重特異性抗体様タンパク質を含み得る。
別の態様において、本発明は、医薬組成物を提供する。一実施形態において、前記医薬組成物は、多重特異性抗体様タンパク質及び薬学的に許容される担体を含み得る。一実施形態において、前記医薬組成物は、放射性同位体、放射性核種、毒素、治療薬、化学療法薬又はそれらの組み合わせをさらに含み得る。一実施形態において、前記医薬組成物は、前記免疫複合体、及び薬学的に許容される担体を含み得る。
別の態様において、本発明は、がん、自己免疫疾患又は感染症に罹患している対象を治療又は予防する方法を提供する。一実施形態において、前記方法は、前記対象に精製された多重特異性抗体様タンパク質を含む医薬組成物、免疫複合体又は前記医薬組成物を投与するステップを含み得る。一実施形態において、前記方法は、有効量の治療薬を共投与するステップをさらに含み得る。一実施形態において、前記治療薬は、抗体、化学療法剤、酵素又はそれらの組み合わせを含み得る。
一実施形態において、前記対象はヒトである。一実施形態において、前記対象は哺乳類である。一実施形態において、前記対象はチンパンジーである。一実施形態において、前記対象はペット動物である。
別の態様において、本発明は、有効濃度の前記多重特異性抗体様タンパク質、免疫複合体又は医薬組成物を含む溶液を提供する。一実施形態において、前記溶液は、対象の血漿である。
本明細書の開示の前述及び他の特徴は、添付の図面と併せて、以下の説明及び添付の特許請求の範囲からより完全に明らかになるであろう。図面は、本明細書の開示に従って用意されたいくつかの実施形態のみを示しており、従って、その範囲を限定するものと見なされるべきではなく、本明細書の開示は、添付の図面の使用を通じてさらなる特異性及び詳細が説明され得る。
5つの結合ドメイン(D1-D5)を有するminiGNC分子のヘテロ二量体構成を示す。ここで、2つの単量体は、鎖A(N-D1-D3/VH-CH1-CH2-CH3-D4-C)及び鎖B(N-D2-D3/VL-CL-CH2-CH3-D5-C)によってコードされる。
VH又はFcのいずれかにノックアウト変異(KO)を有するエンジニアリングされたminiGNCの鎖A及び鎖Bの二量体化を示す。(2A)プロテインA精製によるホモ二量体(a)、所望のヘテロ二量体(b)、及び鎖B単量体(c)への混合物の分画。(2B)非還元及び還元条件下で予想サイズでのプロテインA分画ホモ二量体(a)、ヘテロ二量体(b)、鎖B単量体(c)及び鎖A単量体(d)のSDS-PAGE分析。
ペンタminiGNC(SI-75P6)、テトラminiGNC(SI-75E2)、トリminiGNC(SI-75X3)、バイminiGNC(SI-75X2)及びモノminiGNC(SI-75O2)分子を用いた、BXPC3腫瘍細胞に対する多重特異性miniGNC分子媒介TDCCの比較効力を示す。
0.1から5.5pMの範囲のEC50値を有する、BXPC3腫瘍細胞株に対するminiGNC分子媒介TDCCの比較効力を示す。
比較効力を測定するTDCCアッセイの生存曲線を示す。(A)膵臓がん細胞(HPAFII)に対するステープル化ドメインを有する多重特異性miniGNC分子(ペンタminiGNC(SI-68P1)、テトラminiGNC(SI-68E2及びSI-68E1)及びトリminiGNC(SI-68x2))の殺傷効力(TDCCアッセイ)。(B)MCF-7乳がん細胞に対するSI-68X1の効力。
乳がん細胞(MDA-MB-231)に対する二量体NKG2D受容体を有する多重特異性miniGNC分子(三重特異性(SI-49R25)、四重特異性(SI-49P_X)、五重特異性(SI-49PM1及びSI-49P8)を含む)の殺傷機能(TDCCアッセイ)を示す。
以下の詳細な説明では、その一部を構成する添付の図面を参照する。図面では、文脈上別段の指示がない限り、通常、類似の記号は類似のコンポーネントを識別します。詳細な説明、図面、及び特許請求の範囲に記載されている例示的な実施形態は、限定することを意味するものではない。 本明細書に提示される主題の精神又は範囲から逸脱することなく、他の実施形態を利用することができ、他の変更を行うことができる。本明細書に記載され、図に示されているように、本開示の側面は、本明細書で明示的に検討されている様々な構成で配置、置換、結合、分離、及び設計が可能であることは、容易に理解できる。
本発明は、特に単離された抗体、この抗体の製造方法;この抗体若しくは抗原結合断片から構成される二重特異性若しくは多重特異性分子、抗体薬物複合体及び/又は免疫複合体;この抗体、二重特異性若しくは多重特異性分子、抗体薬物複合体及び/又は免疫複合体を含む医薬組成物;前記分子及び組成物を製造する方法;ならびに本発明の分子及び組成物を用いてがんを治療する方法を提供する。
本発明は、微小構成の多重特異性ガイダンス及びナビゲーションコントロール(GNC)抗体(miniGNC)を開示する。miniGNCプラットフォーム分子は、1つ、2つ、3つ又は4つの追加結合ドメインを有するFab-ヒンジ-Fc領域コア構造(D1からD5)の形成を特徴とする2つのポリペプチド鎖の組み立てられたヘテロ二量体である(図1)。この2つのポリペプチドでは、鎖A(又は鎖1):N-D1-D3(VH)-CH1-ヒンジ-CH2-CH3-D4-C、及び鎖B(又は鎖2):N-D2-D3(VL)-CL-ヒンジ-CH2-CH3-D5-Cで構成され得る。この2鎖のFcドメインは、ヘテロ二量体の形成を促進するために、「knobs-into-holes」としても知られている相補的な変異を含むようにエンジニアリングされる。miniGNCプラットフォーム分子は、可変成分を含み得る。例えば、Fab領域のVH及びVLは、結合特異性を有するか又は有さない非Fab二量体によって置換され得る。追加の結合ドメインは、scFv若しくはVHHなどの抗体フラグメント、又はリガンド若しくは受容体などの非抗体構造であり得る。miniGNCプラットフォーム抗体は、2価、3価、4価又は5価であり、最大5つの異なる特異性を有するとともに、通常の2価IgG抗体(150kDのトリminiGNC Ab)のサイズを保持するか、又はわずかに大きい(175kDのテトラminiGNC Ab及び200kDのペンタminiGNC Ab)。
本発明は、miniGNC抗体、特に五重特異性miniGNC抗体(ペンタminiGNC Ab)の製造及び使用方法に関する。通常、GNC抗体などのGNCタンパク質は、腫瘍細胞を標的としながらT細胞を活性化するなど、免疫細胞に関与するための2つの部分を含むことを特徴とする。GNC抗体と同様に、miniGNC抗体は、T細胞活性化のための抗CD3、共刺激のための抗4-1BB、免疫チェックポイントを阻害するための抗PD-L1など、免疫細胞に関与するための複数の抗原結合ドメインを保持する。がんを治療するための抗体療法の有効性を向上させるために、miniGNC抗体は、GNC抗体の2つの部分の特徴を保持しながら、構造的に安定してコンパクトになるように設計されている。この改善により、同じ又は異なる腫瘍細胞上に第2腫瘍関連抗原に対する結合特異性を追加することは可能になる。GNC抗体と比較して、miniGNCにはFcRnを介したリサイクルと半減期の延長、及び容易なプロテインAによる精製を可能にするFcドメインが含まれる。必要に応じて、Fc受容体媒介性免疫を組み込むことができる。Fcを含むminiGNC抗体は非常にコンパクトであるため、開発性を向上させ、腫瘍への浸透を促進することができる。GNC抗体は通常、抗原結合ドメイン(AgBD)の数が増加したため、IgG抗体よりも大きく、T細胞と腫瘍細胞の両方に結合するための空間的柔軟性を提供する。一方、miniGNC抗体は、ヒトIgGの150kDと比較して、ヒトIgG抗体とおおよそ同じサイズを保持し、二重特異性では110-130kD、三重特異性では120-160、四重特異性では130-190kD、五重特異性では140-220kDである。各鎖に1つ又は2つのscFvを組み込むことで、腫瘍の微小環境をナビゲートしながら、鎖ペアリングの複雑化を軽減し、安定性を向上させることができる。これらの特徴的な機能により、GNC及びminiGNC抗体は、腫瘍関連抗原を標的とする部分が同じであるため、同じがんを治療するための有効な抗体療法の代替となる可能性がある。前記腫瘍関連抗原は、EGFR、HER2、HER3、EGRFVIII、CD19、BCMA、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30、ROR1、CEA、LMP1、LMP2A、メソテリン、PSMA、EpCAM、グリピカン-3、gpA33、GD2、TROP2、NKG2Dリガンド、CD39、CLDN18.2、DLL3、HLA-G、FcRH5、GPRC5D、LIV-1、MUC1、CD138、CD70、uPAR、CD38を含むが、これらに限定されない。
「抗体」という用語は、最も広い意味で使用され、所望の生物活性を示す限り、具体的には、単一のモノクローナル抗体(アゴニスト抗体及びアンタゴニスト抗体)、ポリエピトープ特異性を有する抗体組成物、及び抗体断片(例えば、Fab、F(ab')2及びFv)をカバーする。いくつかの実施形態において、抗体は、モノクローナル、ポリクローナル、キメラ、scFv、二重特異性、二重有効、ヒト及びヒト化抗体であってもよい。既知の抗原に結合する分子の活性断片の例には、Fab、F(ab')2、scFv及びFv断片、並びにFab免疫グロブリン発現ライブラリの産物、上述したいずれかの抗体及び断片のエピトープ結合断片が含まれる。いくつかの実施形態において、抗体は、免疫グロブリン分子及び免疫グロブリン分子の免疫活性部分、即ち、抗原に免疫特異的に結合する結合部位を含む分子を含んでもよい。免疫グロブリンは、任意のタイプ(IgG、IgM、IgD、IgE、IgA及びIgY)、クラス(IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及びIgA2)又はサブクラスの免疫グロブリン分子であってもよい。一実施形態では、抗体は、完全抗体及び完全抗体に由来の任意の抗原結合断片であってもよい。典型的な抗体は、通常、2本の重(H)鎖と2本の軽(L)鎖からなるヘテロ四量体タンパク質を指す。各重鎖は、重鎖可変ドメイン(Vと略記)及び重鎖定常ドメインから構成される。各軽鎖は、軽鎖可変ドメイン(Vと略記)及び軽鎖定常ドメインから構成される。V領域及びV領域は、超可変相補性決定領域s(CDR)及びフレームワーク領域(FR)と呼ばれるより保存された領域のドメインにさらに分けられ得る。各可変ドメイン(V又はV)は、通常、アミノ末端からカルボキシ末端へFR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4の順番で配列される3つのCDR及び4つのFRから構成される。重鎖及び軽鎖の可変領域には、抗原と相互作用する結合領域がある。
本明細書で使用される「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を指す。即ち、集団を含む個々の抗体は、少量存在する可能性のある自然発生突然変異を除いて同一である。モノクローナル抗体は非常に特異的であり、単一の抗原部位に向けられる。さらに、異なる決定基(エピトープ)に対する異なる抗体を典型的に含む従来の(ポリクローナル)抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は抗原上の単一の決定基に向けられる。それらの特異性に加えて、モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ培養により合成され、他の免疫グロブリンにコンタミネーションされていないという点で有利である。修飾語「モノクローナル」は、抗体の実質的に均一な集団から得られるという抗体の特性を示し、特定の方法による抗体の生産を必要とすると解釈されない。例えば、本明細書の開示に従って使用されるモノクローナル抗体は、Kohler&Milstein,Nature,256:495(1975)によって最初に記載されたハイブリドーマ法によって作製されてもよく、又は組換えDNA法によって作製されてもよい(例えば、U.S.Pat.No.4,816,567参照)。
モノクローナル抗体は、特定の種に由来する、又は特定の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体の対応する配列と重鎖及び/又は軽鎖の一部が同一又は相同であり、一方、鎖の残りの部分は、所望の生物活性を示す限り、別の種に由来する、又は別の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体、並びにそのような抗体の断片の対応する配列と同一又は相同である「キメラ」抗体(免疫グロブリン)を含んでいてもよい(U.S.Pat.No.4,816,567、及びMorrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851-6855[1984])。
モノクローナル抗体は、マウスハイブリドーマ又はファージディスプレイ(レビューはSiegel.Transfus.Clin.Biol.9:15-22(2002)参照)を含むさまざまな方法を使用して、又は初代B細胞から直接抗体を分子クローニングすること(Tiller.New Biotechnol.28:453-7(2011)参照)で生産し得る。本発明において、抗体は、ハイブリドーマやディスプレイなどのその後の戦略と組み合わせて、ウサギ、マウス又はラマを免疫する方法によって作成された。ウサギは、親和性、多様性、特異性の高い抗体を作成することが知られている(Weber et al.Exp.Mol.Med.49:e305)。ウサギの免疫及びその後のB細胞培養に加えて、抗体の生成と発見のための他の一般的な戦略には、他の動物(マウスなど)の免疫、その後のハイブリドーマ及び/又はファージ、酵母若しくは哺乳動物細胞でのディスプレイ;或いは合成可変遺伝子ライブラリーを用いたディスプレイが含まれる。この抗体発見の一般的な方法は、Seeber et al.PLOS One.9:e86184(2014)に記載されている方法と似ている。
「抗原又はエピトープ結合部分もしくは断片」という用語は、抗原に結合することができる抗体の断片を指す。これらの断片は、インタクト抗体の抗原結合機能及び追加機能の能力を有していてもよい。結合断片の例は、合成リンカーによって単一ポリペプチド鎖に接続された抗体の単一アームのVL及びVHドメインからなる単鎖Fv断片(scFv)、又はVL、定常軽鎖(CL)、VH、及び定常重鎖1(CH1)ドメインからなる一価断片であるFab断片を含むが、これらに限定されない。抗体断片は、さらに小さなサブフラグメントであってもよく、単一のCDRドメイン、特にVL及び/又はVHドメインのいずれかからのCDR3領域と同じくらい小さいドメインで構成されてもよい(Beiboer et al.,J.Mol.Biol.296:833-49(2000))。抗体断片は、当業者に知られている従来の方法を使用して生産される。抗体断片は、インタクト抗体で使用される同じ技術を使用して、有用性に関してスクリーニングできる。
「抗原又はエピトープ結合断片」は、多くの当該技術分野で知られている技術により、本明細書の開示の抗体に由来し得る。例えば、精製モノクローナル抗体をペプシンなどの酵素で切断し、HPLCゲルろ過にかけることができる。次に、Fab断片を含む適切な画分を収集し、膜濾過などにより濃縮し得る。抗体の活性断片の単離のための一般的な技術のさらなる説明については、例えば、Khaw,B.A.et al.J.Nucl.Med.23:1011-1019(1982)、Rousseaux et al.Methods Enzymology,121:663-69,Academic Press,1986を参照。
抗体のパパイン消化は、それぞれが単一の抗原結合部位を持つ「Fab」断片と呼ばれる2つの同一の抗原結合断片と、その名前が容易に結晶化する能力を反映する残りの「Fc」断片を生成する。ペプシン処理により、2つの抗原結合部位を有し、抗原を架橋できるF(ab')断片が生成される。
Fab断片は、軽鎖の定常ドメイン及び重鎖の最初の定常ドメイン(CH1)を含んでいてもよい。Fab'断片は、抗体ヒンジ領域からの1つ以上のシステインを含む重鎖CH1ドメインのカルボキシ末端にいくつかの残基が追加されていることにより、Fab断片とは異なる。Fab'-SHは、定常ドメインのシステイン残基が遊離チオール基を有するFab'の本明細書における呼称である。F(ab')2抗体断片は元々、間にヒンジシステインを有するFab'断片のペアとして生成された。抗体断片の他の化学的結合も知られている。
「Fv」は、完全な抗原認識及び結合部位を含む最小の抗体断片である。この領域は、1つの重鎖可変ドメインと1つの軽鎖可変ドメインの二量体で構成され、非共有結合で緊密に結合している。この構成では、各可変ドメインの3つのCDRが相互作用して、VH-VL二量体の表面に抗原結合部位を規定する。集合的に、6つのCDRは抗体に抗原結合特異性を付与する。しかし、単一の可変ドメイン(または抗原に特異的な3つのCDRのみを含むFvの半分)でさえ、抗原を認識して結合する能力があるが、結合部位全体よりも親和性が低くなる。
脊椎動物種由来の抗体(免疫グロブリン)の「軽鎖」は、定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ(κ)とラムダ(λ)と呼ばれる2つの明確に異なるタイプのいずれかに割り当てることができる。
重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンを異なるクラスに割り当てることができる。免疫グロブリンには5つの主要なクラスがある。IgA、IgD、IgE、IgG、IgM、及びこれらのいくつかは、サブクラス(アイソタイプ)、例えば、IgG-1、IgG-2、IgG-3、IgG-4、IgA-1及びIgA-2にさらに分けられ得る。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、デルタ、イプシロン、γ、及びμと呼ばれる。免疫グロブリンの異なるクラスのサブユニット構造と三次元配置はよく知られている。
「ヒト化抗体」は、非ヒトドナー免疫グロブリンに由来するCDRを有し、分子の残りの免疫グロブリン由来部分が1つ(又はそれ以上)のヒト免疫グロブリンに由来する操作された抗体のタイプを指す。さらに、フレームワークサポート残基は、結合親和性を保持するために変更されてもよい。「ヒト化抗体」を得る方法は、当業者によく知られている。(例えば、Queen et al.,Proc.Natl Acad Sci USA,86:10029-10032 (1989),Hodgson et al.,Bio/Technology,9:421(1991)参照)。
本明細書で使用される「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「蛋白質」という用語は互換性があり、ペプチド結合によって連結されたアミノ酸から構成される生体分子を意味すると定義される。
本明細書で使用される「a」、「an」、及び「the」という用語は、「1つ以上」を意味すると定義され、文脈が不適切でない限り複数形を含む。
「単離された」とは、それが自然に発生する成分の少なくともいくつかを含まない生体分子を意味する。「単離された」とは、本明細書に開示の様々なポリペプチドを説明するために使用される場合、発現元の細胞又は細胞培養物から同定及び分離及び/又は回収されたポリペプチドを意味する。典型的には、単離されたポリペプチドは、少なくとも1つの精製工程により調製される。「単離された抗体」とは、異なる抗原結合特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指す。
「組換え」とは、外因性宿主細胞で組換え核酸技術を使用して抗体が生成されることを意味する。
「抗原」という用語は、生物、特に動物、より具体的にはヒトを含む哺乳動物において免疫応答を誘発することができる実体又はその断片を指す。この用語は、抗原性又は抗原決定基に関与する免疫原及びその領域を含む。
また、本明細書で使用される「免疫原性」という用語は、免疫原性剤に対する抗体、T細胞又は他の反応性免疫細胞の生産を誘発又は増強し、ヒト又は動物の免疫応答に寄与する物質を指す。個体が治療される障害を緩和又は軽減するために、本明細書の開示の投与された免疫原性組成物に対して十分な抗体、T細胞及び他の反応性免疫細胞を生産すると、免疫応答が生じる。
特定の抗原又はエピトープに対する「特異的結合」又は「特異的に結合する」又は「特異的」とは、非特異的相互作用とは明らかに異なる結合を意味する。特異的結合は、例えば、一般に結合活性を持たない同様の構造の分子である対照分子の結合と比較して、分子の結合を決定することにより測定し得る。例えば、特異的結合は、標的に類似した制御分子との競合により決定し得る。
「親和性」という用語は、抗体/抗原、受容体/リガンドなどの2つのポリペプチド間の引力の尺度を指す。2つのポリペプチド間の固有の引力は、特定の相互作用の結合親和性平衡解離定数(KD)として表すことができる。KD結合親和性定数は、例えば、バイオレイヤー干渉法によって測定することができる。ここで、KDは、kdis(解離速度定数)とkon(結合速度定数)の比、即ち、KD=kdis/konである。
特定の抗原又はエピトープに対する特異的結合は、例えば、少なくとも約10-4M、少なくとも約10-5M、少なくとも約10-6M、少なくとも約10-7M、少なくとも約10-8M、少なくとも約10-9M、少なくとも約10-10M、少なくとも約10-11M、少なくとも約10-12M、又はそれ以上の抗原又はエピトープに対するKDを有する抗体によって示され得る。ここで、KDは特定の抗体-抗原相互作用の平衡解離定数を指す。典型的には、抗原に特異的に結合する抗体は、抗原又はエピトープに対して対照分子の20~、50~、100~、500~、1000~、5000~、10000~倍、又はより大きいKDを有してもよい。
また、特定の抗原又はエピトープに対する特異的結合は、例えば、対照に対するエピトープについて少なくとも20~、50~、100~、500~、1000~、5000~、10000~倍、又はより大きい抗原又はエピトープに対するKA又はKaを有する抗体により示すことができる。ここで、KA又はKaは、特定の抗体-抗原相互作用の結合(association)速度を意味する。
2つの配列間の「相同性」は、配列の同一性によって決定される。互いに比較される2つの配列の長さが異なる場合、配列同一性は、好ましくは、より長い配列のヌクレオチド残基と同一であるより短い配列のヌクレオチド残基の割合に関する。配列同一性は、コンピュータープログラムを使用して従来通りに決定できる。所定の配列と本明細書の開示の上記の配列との比較において現れる逸脱は、例えば、追加、欠失、置換、挿入又は組換えによって引き起こされてもよい。
本明細書の開示は、本明細書に含まれる特定の実施形態及び実施例の以下の詳細な説明を参照することにより、より容易に理解されてもよい。本明細書の開示は、その特定の実施形態の特定の詳細を参照して説明されたが、そのような詳細な説明は、開示の範囲に対する限定とみなされるべきではない。
実施例
実施例1:五重特異性miniGNC抗体の構造
miniGNC抗体の設計は、鎖Aと鎖Bの間のヘテロ二量体の2本のポリペプチド鎖の共発現及び組み立てに依存する(図1)。鎖Aは、天然の重鎖(HC)であり得る一方、鎖Bは、軽鎖とHCのFcドメインとの間の組換え融合ペプチドである。この抗体のコアには、Fab領域(VH-CH1/VL-CL)があり、その後ろにヒンジ及びヒトIgG1のFc領域(CH2-CH3/CH2-CH3)である。ホモ二量体を不安定化し、ヘテロ二量体の形成を促進するために、CH3ドメインに「Knobs-into-holes」変異又は他の相補的な変異セットを導入することができる(Ridgway JB,Presta LG,Carter P.,Protein Eng 1996;9:617-21)。The鎖AのCH3ドメインにおける「ホール」変異は、T366S、L368A及びY470Vで構成され、鎖BのCH3ドメインにおける「ノブ」変異は、T366Wである。鎖B上のT366W変異によって構成される「ノブ」は、優先的に鎖A上の3つの変異によって構成される「ホール」と相互作用する。この優先的なペアリングは、ヘテロ二量体をさらに安定化することができる一方、Fabドメインコンポーネントの非共有結合ペアリング(即ち、鎖A上のVH-CH1と鎖B上のVL-Ck)は、機能的なFab領域を構成する。言い換えれば、機能的なD3結合ドメイン(例えば、機能的なFab領域又は非Fab受容体二量体)は、鎖A-鎖Bヘテロ二量体でのみ作成することができる。GNC抗体と比較して、miniGNC抗体は、依然として天然IgG(Fab,Fc)及び他の可変配列に基づく構造(例えば、scFv及びVHH)由来の抗体断片を含むが、ヘテロ二量体の形成後にFab領域-ヒンジ-Fc領域構造を優先的に構成するようにエンジニアリングされる。miniGNC抗体の特徴は、このエンジニアリングされた構造のコンパクトさである。
構造的に多様化された1つ又は複数の抗原結合ドメインをD1、D2、D4又はD5としてminiGNC分子の2つのN末端及び2つのC末端に付加することにより、最大5つの結合特異性を形成することができる。これらの付加結合ドメインのそれぞれは、scFv及びVHHなどの可変配列に基づく構造、又はリガンド及び受容体などの非可変配列に基づく構造であり得る。図1に示すように、D1及びD2は、それぞれ鎖A及び鎖BのN末端に結合した結合ドメインを指し、D4及びD5は、それぞれ鎖A及び鎖BのC末端に結合した結合ドメインを指す。従って、五重特異性miniGNC(ペンタminiGNC)抗体の2つのポリペプチドは、以下のように構成され得る。
鎖A:N-D1-D3(VH)-CH1-ヒンジ-CH2-CH3-D4-C
鎖B:N-D2-D3(VL)-CL-ヒンジ-CH2-CH3-D5-C
ここで、図1に示すように、VLはVλ又はVκであり、CLはCλ又はCκであり得る。
結合ドメインの数及びそれらの結合特異性に応じて、1つ又は複数の結合ドメインを減少させてテトラ、トリ及びバイminiGNCにすることにより図1のペンタminiGNC抗体の構造を簡略化することができる。例えば、表1は、EGFR及びHER3を標的とする効果を最適化するための抗CD3miniGNC抗体のファミリーの生成及び特徴付けを示す。この場合、各結合ドメインは、1つの結合特異性を発揮する。その5つの結合ドメインのうちの2つが抗原の同じエピトープを標的とする(即ち、同じ結合特異性を有する)場合、このペンタminiGNC抗体は、四重特異性ペンタminiGNC抗体となる。
実施例2:エンジニアリングされたminiGNC抗体のコア構造
miniGNCの構造が安定して機能的なヘテロ二量体タンパク質に変換可能であることを証明するために、簡易な非対称フォーマットを設計してminiGNC分子のヘテロ二量体形成に対する構成と変異の影響を評価した。簡単に言えば、単一のscFv(D1)は鎖AのN末端に融合され、鎖Bは追加の結合ドメインを含まない。このように、鎖Aと鎖Bの間の二量体化の各種の割合は、SDS-PAGEとSECによって区別することができる。鎖Aホモ二量体は観察されず、鎖Bホモ二量体、鎖Aヘテロ二量体及び鎖Bヘテロ二量体の予測サイズは、それぞれ100kDa、150kDa及び125kDaである(図2)。
混合物からヘテロ二量体miniGNC分子を選択的に精製するための戦略を設計するために、鎖BのCH3ドメイン(H435及びY436)における2つのアミノ酸残基を置換した。特に、ヒスチジン(H435)は、治療用抗体の精製中にプロテインA樹脂への鎖Bの結合に重要であり(Tustian et al.,2016)、このアミノ酸の置換又はProAノックアウト変異(ProAKO)は、プロテインA結合を終了させる。この戦略により、プロテインAカラムからの選択的溶出によるヘテロ二量体の分離が可能になる。プロテインAカラムは親重鎖結合部位を介してヘテロ二量体を保持するため、鎖BがプロテインA結合を欠いていることから鎖Bホモ二量体は通過する。鎖B上のProAKOの設計は、IgG3サブクラスの相同領域から取得した残基を有するプロテインA結合部位のアミノ酸置換により免疫原性を変更する可能性のある問題を最小限に抑える。ほとんどのminiGNC分子は主にIgG1サブタイプの構造及び配列を組み込むが、IgG3は、プロテインA、プロテインG及びFcRn(新生児Fc受容体)への結合においていくつかの特定の構造摂動を伴う他のIgGサブクラスと全体的に類似した構造を有する。この違いは、IgG3のR435(他のサブタイプではH435)の存在がFcとプロテインAの相互作用を排除する、以前に明らかにされたFc配列の違いに基づくものである。したがって、したがって、代表的なminiGNC分子では、miniGNC鎖B上のプロテインA結合に重要なアミノ酸(H435及びF436)が、IgG3対応配列(R435及びY436)に変異した。
鎖BのN末端に融合したscFvが追加された多重特異性miniGNC抗体のクラスでは、scFvがVH3ファミリーに由来する場合、依然としてプロテインA結合と相互作用する可能性がある。VH3にコードされた抗体は、ブドウ球菌プロテインA(SPA)と相互作用することが知られており、FR1、CDR2及びFR3における残基は、SPA結合に関与することが確認されており(Roben,et al.,1995)、構造データは、単一の関連領域を非結合免疫グロブリンからの対応領域で置換することにより、VH3にコードされた抗体によるプロテインA結合が排除されることを示している。FR1のアミノ酸R19の置換は、プロテインAへの結合に重要であることが確認され、VH4ファミリーにおける同等領域からのアミノ酸配列(S19)を用いて実施された。
ProAKOの異なる組み合わせ(H435R/Y436F(Fc)及びR19S(VH))を含む4つの異なるバージョンの鎖B変異(配列番号3、7、11及び15)を有する4セットのminiGNC抗体(配列番号1-16)を分析サイズ排除クロマトグラフィーにより精製及び分析した。両方のセットの変異を有する鎖Bを含むタンパク質のみが鎖Bの混入物を完全に除去できた(図2A)。このVH3プロテインAノックアウト変異(R19S)及び鎖B上のFcプロテインAノックアウト変異(H435R,F436Y)は、ほとんどの多重特異性抗体フォーマットに組み込まれ、バイ、トリ、テトラ及びペンタminiGNC分子の生成に使用された。
代替抗体アイソタイプを有する機能的なminiGNCタンパク質を生成する可能性を実証するために、IgG4定常領域を含む例示的なminiGNCを生成した。SI-75XM9(配列番号297-300)は、IgG1 CH1、ヒンジ及びFcがIgG4 CH1、ヒンジ及びFcに置換された以外、SI-75X5(配列番号1-4)二重特異性miniGNCの類似体である。特に、両方のタンパク質は、同じ結合ドメイン(D2の抗HER3ドメイン及びD3の抗CD3*ドメイン)を有し、同じコア構造及び変異を含む(Knobs-into-Holes Fc変異;抗HER3 scFvにおけるR19S;及びFcにおけるH435R/Y436F変異)。表8に示すように、SI-75XM9は、SI-77X5に匹敵する力価を有し、分析SECによって評価されるように、プロテインA精製後に目的タンパク質の割合が19%大幅に増加した(85.6%POI対72.2%POI)。高分子量種の減少は、IgG4の短いヒンジ長(15ではなく12個のアミノ酸)に関連する可能性があり、これにより高次オリゴマーの会合傾向が減少する可能性がある。したがって、代替抗体アイソタイプを有するminiGNCタンパク質を生成することができるとともに、凝集の減少などのより好ましい特性をもたらすこともできる。
実施例3:多重特異性miniGNC抗体の構成
第1グループの多重特異性miniGNC抗体を生成及び特徴付けするために、3つの部分1結合ドメイン(即ち、αCD3、αPD-L1及びα4-1BB)、及びEGFR及びHER3に対する2つの部分2結合ドメインを選択して比較した。表1に示すように、このグループをさらにペンタminiGNC、テトラminiGNC、トリminiGNC及びバイminiGNCグループに細分化した。各サブグループにおいて、少なくとも1つのminiGNC抗体は、D3からのCD3結合を有した。ペンタminiGNCグループは、SI-75P6(配列番号17、19;D3位置からのαEGFRを有する)、SI-75P4(配列番号21、23;D4に4-1BB受容体に対するリガンドである41BBLを有する)、SI-75P3(配列番号25、27)及びSI-75P9(配列番号29、31;D3からのαHER3を有する)を含む。α4-1BB又はαPD-L1ドメインの存在下と非存在下での効果を比較するために、テトラminiGNCグループは、2つの抗体、即ちSI-75E1(配列番号33、35)及びSI-75E2(配列番号37、39)を含む。ヘテロ二量体のN末端又はC末端上の2つの部分2結合ドメインを比較するために、トリminiGNCグループは、3つの抗体、即ち、SI-75X3(配列番号41、43)、SI-75X16(配列番号45、47)及びSI-75X18(配列番号49、51)を含む。バイminiGNCグループは、3つの抗体、即ち、SI-75X1(配列番号53、55)、SI-75X2(配列番号57、59)及びSI-75X5(配列番号1、3)を含み、それぞれが1つの部分1結合ドメイン及び1つの部分2結合ドメインを有する。
第1グループのminiGNC抗体の各メンバーをコードするDNAをベクターpTT5にクローニングし、ExpiCHO発現システムを用いて許容できる力価で9日間発現させた。5mLのMabSelectプロテインAカラムでminiGNC抗体を精製した後、Akta Avant又はPurifierシステムのいずれかで高負荷16/600 200pg分取SECカラムを用いたサイズ排除を行った。多角度光散乱(MALS、Wyattシステム)に接続されたウォーターズHPLCを用いてSEC凝集体を分析し、dn/dc計算方法により正しい分子量を特定した。
実施例4:結合親和性のOctet分析
miniGNC抗体の機能を評価するために、各ドメインの結合親和性をBiolayer Interferometry(Octet 384システム)により決定した。Octet分析により、選択したminiGNC抗体がすべての同種抗原に対する結合特異性及び親和性を保持していることを確認した。各miniGNC抗体をAHCセンサーに10ug/mlで180秒間ロードした後、60秒のベースラインステップ、100nMの市販ヒト抗原との180秒の関連付けステップ、及び360秒の解離ステップを実施した。すべてのステップのサンプルはOctet緩衝液(0.1%Tween20及び1%BSAを含むPBS)に含まれた。1:1結合モデルを用いたフィッティングを実施して親和性KD値を抽出した。表1に示すように、各結合ドメインの結合親和性は、そのKDによって測定されるように、許容範囲内で変化する。部分1結合では、aCD3ドメインのKDは、17.4から36.2nMであり、αPD-L1のKDは、1から2.72nMであり、α4-1BBのKDは、7.51から37.3nMであり得る。部分2結合では、αEGFRのKDは、5.56から11.1であり、aHER3のKDは、112.8から185nMであり得る。
実施例5:多重特異性miniGNC抗体比較効力
がん細胞の殺傷効力を測定するために、第1グループの多重特異性miniGNC抗体をT細胞依存性細胞傷害(TDCC)アッセイにかけた。このグループのminiGNC抗体は、すべての分子にαCD3結合ドメインがあるため、T細胞を利用し、T細胞媒介性細胞溶解をリダイレクトし、最終的に標的細胞を殺すことができる。
発光に基づくT細胞依存性細胞傷害(TDCC)アッセイを使用し、ルシフェラーゼの構成的発現による細胞生存率の定量化により、抗体誘導性細胞傷害の程度を測定した。ルシファー化BXPC3ヒト膵臓がん細胞株(ATCC,Manassas,VA)を37℃、5%CO2で10%熱不活化ウシ胎児血清(Invitrogen,Waltham,MA)を含むRPMI(ATCC,Manassas,VA)培地において培養した。細胞生存率をVi-CELL自動セルカウンターで監視した(Beckman Coulter,Pasadena,CA)。標的細胞の表面発現をフローサイトメトリーにより測定した。ヒト膵臓がん細胞であるBXPC3細胞をヒト汎T細胞と5:1のエフェクター/標的(E:T)比で共培養し、抗体を5倍希釈系列(0-30nM)で添加した。Multidropバルク液体ディスペンサー(BIOTEK,Winooski,VT)を用い、標的細胞を500細胞/ウェル(20μL/ウェル)、T細胞を2500細胞/ウェル(20μL/ウェル)でポリスチレンTC処理マイクロプレート(384ウェル、白色、平底)(Corning,Corning,NY)に順次接種した。抗体希釈物を添加し(10μL/ウェル)、プレートを37℃、5%CO2で72時間インキュベートした後、発光に基づく細胞生存率を定量化した。20μLのBright-Glo(Promega)をウェルに添加し、CLARIOstarプレートリーダーを用いて腫瘍細胞の生存率に対応する発光を測定した。
データをシグモイド関数にフィッテイングして計算し、比較のために表1にEC50値を示した。図3は、ペンタminiGNC(SI-75P6)、テトラminiGNC(SI-75E2)、トリminiGNC(SI-75X3)、バイminiGNC(SI-75X2)、及びモノminiGNC(SI-75O2)分子から選択されるminiGNC抗体の用量依存細胞生存率曲線を示す。すべての多重特異性miniGNC抗体は、BXPC3細胞を完全に死滅できる一方、ペンタ及びテトラminiGNC抗体の両方は、pMレベルのEC50範囲で高い効力を着実に示した。この点で、SI-75X1は非常に強力であった。このデータは、BXPC3がん細胞を標的とする場合、部分1結合ドメイン、特にαPD-L1ドメインが免疫チェックポイント阻害剤として重要な役割を果たすことを示している。
実施例6:miniGNC抗体におけるCD3結合ドメインの構成
定義により、miniGNC抗体は、それぞれその部分1及び2結合ドメインの結合を介して、少なくとも1つの免疫エフェクター細胞及び1つの標的癌細胞と相互作用することができる。miniGNC抗体構成の一般的なスキーム(図1)により、2つの部分2結合ドメインをD1とD2に割り当てる場合、有効性はそれらをD1とD4又はD2とD5に割り当てる場合と異なる可能性があり、これは、細胞表面における標的の相対位置が上下又は両側で異なるためである。そこで、第2グループのペンタminiGNC抗体を構成して表2に示した。このグループのminGNC抗体は、CD3、CD19、EGFR、4-1BB及びPD-L1 に対して同じ結合特異性を有し、D2、D4及びD5に同じ結合ドメインを有する。SI-68P13(配列番号69,71)は、αCD3 D3ドメインを有し、D2の違い(即ち、αCD19vs.αHER3)以外、第1グループのSI-75P3と同様であるとともに、αCD3ドメインの位置がD1に変更された以外、第2グループのSI-68P17(配列番号73,75)と同様である。第2グループの残りのminiGNC抗体は、D1(αCD3)及びD3(αEGFR)と同じ結合特異性を有する。SI-68P17は、CD19、4-1BB及びPD-L1のそれぞれに対して結合特異性を有する。
抗CD3抗体は、T細胞活性化に基づく免疫療法において中心的な役割を果たす。治療用抗体の開発にはヒト化抗体が望ましい。位置効果を試験するために、CD3ドメインを位置D1及びD3に組み込んで、SI-68P17(配列番号73、75)及びSI-68P13(配列番号69、71)を生成した。ヒト化フレームワークの抗CD3配列1(CD3**)、2(CD3***)、3(CD****)及び4(CD*****)を発現カセットにクローニングしてSI-68P15(配列番号77,79)、SI-68P18(配列番号81,83)、SI-68P19(配列番号85,87)及びSI-68P16(配列番号89,91)を生成した(表2)。各発現カセットを25mLのExpiCHOにトランスフェクトし、8日間発現させた後、各ペンタminiGNC抗体を回収及び精製するためにプロテインAアフィニティクロマトグラフィーを行った。抗体は良好な力価で産生された(表2)。Octetにより、異なるCD3ドメインを含むペンタminiGNC抗体がそれぞれヒトCD3に結合できることを確認した(表2)。各ペンタminiGNC抗体を、AHCセンサーを介して10μg/mlでロードし、連続希釈(最大200nM、1:2.5希釈)又は単一の100nM濃度のHisタグ付きヒトCD3に結合した。得られた1:1結合モデルに対するグローバルフィットは、ペンタGNC抗体が低ナノモル範囲の親和性でCD3に結合することを示した(表2)。
がん細胞に対するCD3媒介性T細胞指向性細胞毒性の効果を評価するために、BXPC3腫瘍細胞株を標的として使用した。抗体の段階希釈物(0~30nM;1~5希釈係数)をルシフェリア化標的細胞及び活性化T細胞(薬物の直前に接種;エフェクター:標的=5:1)を含む白色384ウェルプレートに総量50μlで添加した。さらに72時間後、20ulのBright-Glo(Promega)をウェルに添加し、ルシファー化腫瘍細胞の生存率に対応する発光を、CLARIOstarプレートリーダーを用いて決定した。データをシグモイド関数にフィッテイングしてEC50値を計算した結果、図4及び表2に示すように、0.1~5.5pMの範囲であった。このデータは、抗CD3の配置、構成及び結合親和性にある程度の柔軟性があることを示している。
実施例7:VHHを結合ドメインとして有する多重特異性miniGNC抗体
複数のscFvドメインを含むGNC及びminiGNC抗体などの多重特異性抗体プラットフォームでは、同じ分子内の複数のVH及びVLドメインによる鎖のミスペアリングに関連する潜在的な問題がある。異なるVHドメインとVLドメインは、互いに相互作用する傾向が異なる。異なる特異性の結合ドメインが優れた相互作用エネルギーを有する場合、タンパク質が集合するときに間違ったペアリングが形成される可能性がある。その結果、どの結合ドメインも標的抗原に結合しない。
VHHは、単一のIgドメインを有する「抗体」、即ち、「重鎖のみ」を指し、単一ドメイン抗体(sdAb)又はナノボディとしても知られている。第1単一ドメイン抗体は、ラクダ科動物に見られる重鎖抗体からエンジニアリングされ、VH断片(VHH)としても知られている。VHHドメインは、いくつかの好ましい特性により、抗体に基づく治療法にますます組み込まれている。VHHドメインは、より伝統的に使用されているscFvドメインと比較して、安定性と溶解性が向上した。従来の抗体可変領域のVH/VL界面は疎水性であるが、それらの表面が一時的に露出すると、著しい凝集又は沈殿が生じる可能性がある。一方、VHHドメインは本来より親水性の高い表面を有するため、優れた溶解性と安定性を有する。Fab又はscFvドメインと比較して、VHHドメインの明らかな利点は、サイズが小さいことである。Fabドメインは約50kDa、scFvドメインは約25kDaであるのに対し、VHHドメインは非常にコンパクトな12~15kDaである。ペンタminiGNC抗体は、5つの結合ドメインを含む(図1)。scFvドメインの代わりにVHHドメインを組み込むことにより、分子サイズが大幅に減少し、腫瘍への浸透が増加する。
第3グループの多重特異性miniGNC抗体は、EGFR及びHER3に対するVHH結合ドメインを有するように作成及び構成された(Gottlin et al.,2009;Eliseev et al.,2018)(表3)。五重、三重及び二重特異性単一ドメイン可変領域(VHH)が組み込まれたminiGNC分子は、合理的な力価で構築及び精製された。各多重特異性miniGNC(SI-75P5(配列番号93,95)、SI-75P8(配列番号97,99)、SI-75X4(配列番号101,103)、SI-75X17(配列番号105,107)、SI-75X19(配列番号109,111)、SI-75X9(配列番号113-115)、SI-75X11(配列番号117,119)、SI-75X15(配列番号121,123)及びSI-75X13(配列番号125,127)のドメインの結合活性は、Octetにより確定された。AHCセンサーを用いてGNC抗体を10ug/mlの濃度で180秒間捕捉した。60秒のベースラインステップの後、単一濃度の抗原を用いて180秒の結合ステップを実施した。被験抗原は、200nMのヒトEGFR(自社精製)、100nMのヒトCD3(Acro CDD-H52W1)、20nMのヒトPD-L1(Acro PD1-H5229)、400nMのヒト4-1BB(自社精製)、200nMのヒトHER3(Acro ER3-H5223)を含む。結合後、420秒の解離ステップを行った。ForteBio Data Analysisソフトウェア(バージョン11)の1対1結合モデルを用いてKD値を計算して表に示した。データは、VHHが組み込まれたminiGNCプラットフォームにおいてすべてのドメインが高い親和性を保持することを示している。
がん細胞であるBXPC3腫瘍細胞株を標的として用いてT細胞指向性細胞傷害性を評価した。抗体の段階希釈物(0~30nM;1~5希釈係数)をルシフェリア化標的細胞及び活性化T細胞(薬物の直前に接種;エフェクター:標的=5:1)を含む白色384ウェルプレートに総量50μlで添加した。さらに72時間後、20ulのBright-Glo(Promega)をウェルに添加し、ルシファー化腫瘍細胞の生存率に対応する発光を、CLARIOstarプレートリーダーを用いて決定した。EC50値を表3に示した。
実施例8:発現とタンパク質の品質を改善するためにエンジニアリングされたFab(D3)ドメイン
必要に応じて、fab領域のVH-VL界面にジスルフィドステープルを導入した(図5)。このエンジニアリングの目的は、コア-fab界面で共有ジスルフィド結合を形成することによりヘテロ二量体のペアリングを改善し、全体の構造を安定化することであった(Weatherill et al.,2012)。システインペアを任意に導入して、鎖BのVLA100及び鎖Aのfab領域の対応VHA44でジスルフィド結合を形成した。
Fabにおけるステープル化された可変領域の効果を分析するために、同一の結合特異性を有する一対のペンタminiGNC抗体(SI-38P11及びSI-76PM1)(配列番号129及び131;133及び135)を作成した。図1の命名システムによれば、この2つの抗体の鎖Aは、D1にαCD20 scFv、D3にαCD3 VH(VH Fab-CH1-Fc)、D4にα4-1BBを有する一方、鎖Bは、D2にαCD19、D3にαCD3V(VKappa Fab CL-Fc)、D5にαPD-L1 scFvを含む(表4)。SI-76PM1は、D3(VH/VL Fab-CH1/CL-Fc)にジスルフィドを追加して構築され、SI-38P11は、VH/VL Fabに追加のジスルフィドペアリングなしで構築された。
D3位にジスルフィドステープルを含むか又は含まないペンタminiGNC抗体構築物をExpiCHOシステムで発現させた。ステープル化D3を有する構築物(SI-76PM1)はSI-38P11よりも顕著に高い力価で生成された。両方のタンパク質を5mL MabSelectプロテインAカラムで精製した後、Akta Avant又はAkta Pure Purifierシステムで高負荷16/600 200pg分取SECカラムを用いてサイズ排除を行った。多角度光散乱(MALS、Wyattシステム)に接続されたウォーターズHPLCを用いてSEC凝集体を分析し、dn/dc計算方法により正しい分子量を特定した。表4に示すようにすべての分析を実施した結果、ジスルフィド結合、即ち、「D3ステープル化Fab」、ペンタminiGNC抗体は、5%高い目的タンパク質の産生を示した。両方の分子は、同等の抗原結合動態を示した(表4)。
実施例9:ステープル化scFv結合ドメインを有する多重特異性miniGNC抗体
多重特異性miniGNC分子のコア構造は、ヘテロ二量体を安定化するためのいくつかの特徴(共有結合したヒンジ、及びFc領域のCH3ドメインによる非共有的で優先的な「knobs-into-holes」の相互作用)を獲得するように設計された。安定性とコンパクトさは望ましいものであるが、D1とD2又はD3とD4がより近接することが、それらの安定性及び独立した機能に影響を与えるかどうかはまだ不明である。それぞれの追加した結合ドメインの安定性及び独立性を保持するために、各scFvドメインのVL100とVH44にジスルフィド結合を導入し、つまり、各scFvドメインをステープル化することができる。VLとVHの間のジスルフィド結合をすべてのscFvドメインに用いて構造全体を安定化することができる。或いは、選択された少なくとも1つのscFvドメインの任意の位置にジスルフィド結合を導入することができる。
EGFR及びHER3を標的とするD1及びD2を有する4つのminiGNC抗体(トリminiGNC(SI-68X2,配列番号137,139)、テトラminiGNC(SI-68E1,配列番号141,143;SI-68E2,配列番号145,147)及びペンタminiGNC(SI-68P1,配列番号149,151)分子を含む)は、膵臓がん細胞(HPAF-II)に対するTDCCの比較効力を測定するためにグループ化された。4-1BB及びPD-L1に対する部分1の結合特異性は変化であったが、CD3は多重特異性に関してグループ内のD3と同様に一定であった。これら4つのminiGNC抗体のそれぞれをコードする発現構築物は、すべてのscFvドメインがジスルフィド結合を有するように修飾された。構造体をExpiCHOシステムで個別に発現させ、各抗体を適切な力価で精製した。それぞれの抗原への結合動態をOctetにより確定した。AHCセンサーを用いてminiGNC抗体を10ug/mlの濃度で180秒間捕捉した。60秒のベースラインステップの後、単一濃度の抗原を用いて180秒の結合ステップを行った。被験抗原は、200nMのヒトEGFR(自社精製)、100nMのヒトCD3(Acro CDD-H52W1)、20nMのヒトPD-L1(Acro PD1-H5229)、400のヒト4-1BB(自社精製)、200nMのヒトHER3(Acro ER3-H5223)を含む。結合した後、420秒の解離ステップを行った。ForteBio Data Analysisソフトウェア(バージョン11)の1対1結合モデルを用いてKD値を計算して表に示した。すべてステープル化されたscFvドメインを有する各miniGNC分子の分析されたKD値(表5)をそれぞれの抗原に対するモノクローナル抗体対照のKD(表6)と比較した。結合動態データは、各ステープル化scFvドメインがそれぞれのmAb又はFc-scFv対照(SI-1C3(配列番号181,183)、SI-1C7(配列番号185)、SI-9C21(配列番号187,189)、SI-35SF11(配列番号191)、SI-3SF11(配列番号193)、SI-20C14(配列番号287及び289))と同等の結合親和性を有することを示している(表6)。これは、1つ又は複数のscFvドメインをステープル化しても、結合親和性にはほとんど影響を与えないことを示唆している。
miniGNC抗体の効力に対するステープル化scFvドメインの効果を評価するために、T細胞指向性細胞毒傷害(TDCC)アッセイを使用し、標的細胞はHPAF-II、ヒト膵臓がん細胞系であった(ATCC,Manassas,VA)。標的細胞の表面発現は、フローサイトメトリーによって検証された。抗体の段階希釈物(0~30nM;1~5希釈係数)をルシフェリア化標的細胞及び活性化T細胞(薬物の直前に接種;エフェクター:標的=5:1)を含む白色384ウェルプレートに総量50μLで添加した。さらに72時間後、20ulのBright-Glo(Promega)をウェルに添加し、ルシファー化腫瘍細胞の生存率に対応する発光を、CLARIOstarプレートリーダーを用いて決定した。データをシグモイド関数にフィッテイングしてEC50値を計算した。図6及び表5に示すように、生存曲線は、4つのminiGNC抗体の効力が全てpMの用量範囲内にあり、ペンタminiGNC抗体がテトラminiGNC及びトリminiGNC抗体よりも高いTDCC効力を発揮する傾向があることを明らかにした。この観察も、ステープル化scFvドメインの使用がほとんど影響を与えないことを示している。
実施例10:NKG2D受容体二量体を結合ドメインとして有するminiGNC
結合特異性の数の増加により、GNC抗体はT細胞だけでなく、T細胞のサブセット、ナチュラルキラー細胞、その他の免疫細胞(部分1結合ドメイン特異性として総称される)にも結合することができる(出願人の出願WO/2019/005641及びWO2019191120;その全体が本明細書に組み込まれる)。部分1の結合特異性の一部は、標的細胞に対する細胞応答又は認識に取って代わる可能性がある。例えば、NKG2Dは、形質転換細胞及び感染細胞を検出及び除去するための主な認識受容体であり、そのリガンドは、ウイルス感染又はゲノムストレス(例えば、がん)の結果として、細胞ストレス中で誘導される。ヒトでは、NKG2DはNK細胞及びCD8+T細胞で発現される。miniGNC抗体のクラスへの結合ドメイン/特異性としてのNKG2Dの追加は、単一の多機能治療薬としての抗体の細胞毒性及び有効性を改善することができる。
NK細胞では、NKG2Dは活性化受容体として機能し、それ自体が細胞毒性を引き起こすことができる一方、CD8T細胞では、NKG2Dの機能は共刺激シグナルを送ってそれらを活性化することである。NKG2Dは、ホモ二量体を形成し、その外部ドメインはリガンド結合に役立つ。この機能は、NKG2DをminiGNCフォーマットの非可変配列に基づく結合ドメインとして認定し、他の結合ドメインを追加して多重特異性NKG2D-miniGNCタンパク質のクラスを作成することができる。1つのminiGNCフォーマットにおいて、1つのminiGNCフォーマットにおいて、個々のNKG2D単量体は、鎖A及び鎖BのD3位置に組み込まれ、Fc二量体化で二量体NKG2D受容体を形成した。したがって、NKG2Dは、多重特異性miniGNC分子がそのリガンドに結合するための受容体として機能する。別のminiGNCフォーマットにおいて、NKG2Dタンデムリピートは、ホモ二量体化して機能的な二量体受容体を形成する個々のNKG2D単量体間に(GxSy)nスペーサー/リンカーを追加することによって設計された。このNKG2Dタンデム二量体構造は、D1、D2、D4又はD5に配置することができる。
表7に示すように、このクラスは、モノNKG2D-miniGNC(SI-49R26、配列番号153、155)、バイminiGNC(SI-49R27、配列番号157、159)、トリminiGNC(SI-49R25、配列番号161、163)、テトラminiGNC(SI-49P_X、配列番号165、167)、及びペンタmini-GNC分子(SI49P8、SI-49P9、配列番号169、171、177及び179)を含む。SI-49PM1(配列番号173、175)は、SI-49P8のD1(αCD3)及びD3の位置を置換することによって作成され、NKG2D又はCD3のOctet結合親和性は、この置換によって影響されなかった。他の部分1結合ドメインの結合親和性はこのクラスのNKG2D-miniGNC分子において安定したままであったが、NKG2D の結合親和性は2 倍以内であった。したがって、ペンタminiGNC分子は、NKG2Dリガンドに結合するためのNKG2D受容体の結合機能を有する。
NKG2D-miniGNC分子、トリ、テトラ及びペンタminiGNC分子のTDCCの効力を評価及び比較するために、SI-49R25、SI-49P_X、SI-49P8及びSI-49PM1を用いてMDA-MB-231乳がん細胞株を標的とした。miniGNCタンパク質の段階希釈物(0~30nM、1~5希釈係数)を、ルシフェリア化MDA-MB-231細胞を含む白色の384ウェルプレートに24時間前に添加し、37℃で増殖させた。活性化T細胞をminiGNC分子(エフェクター:標的=15:1)の直前に総量50μlで接種した。さらに72時間インキュベートした後、20ulのBright-Glo(Promega)をウェルに添加し、ルシファー化腫瘍細胞の生存率に対応する発光を、CLARIOstarプレートリーダーを用いて決定した。データをシグモイド関数にフィッテイングしてEC50値を計算した(図7)。用量生存率曲線によれば、2つのグループがあり、テトラ及びペンタminiGNC分子は、トリminiGNC分子であるSI-49R25よりも強力であった。表7に示すように、この違いは、αPD-L1の追加による可能性がある。しかし、SI-49R25のEC50値(59.3nM)は、比較的強力であると考えるべきである。乳がん細胞株MDA-MB-231にとって、汎B細胞マーカーであるCD19は非関与腫瘍抗原である。この点に関して、SI-49R25は、CD3及びNKG2Dリガンドに対する2つの結合特異性を有するとみなすことができる。したがって、このデータは、様々なminiGNC抗体形式へのNKG2D受容体の組み込みがTDCCの効力に寄与することを示している。より広い意味では、miniGNC抗体分子は複数の結合特異性に対応して、がんなどの標的細胞に対して最適化の免疫応答を調節、協力及びダイレクトすることができる。
Figure 2023518400000002
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配列表
Figure 2023518400000011
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Figure 2023518400000013
Figure 2023518400000014
Figure 2023518400000015

>Sequence ID 1: SI-75X5 Chain A Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 2: SI-75X5 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 3: SI-75X5 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 26: SI-75P3 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 27: SI-75P3 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 28: SI-75P3 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 33: SI-75E1 Chain A Amino Acid Sequence

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>Sequence ID 34: SI-75E1 Chain A Nucleotide Sequence

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>Sequence ID 48: SI-75X16 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 57: SI-75X2 Chain A Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 58: SI-75X2 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 60: SI-75X2 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 69: SI-68P13 Chain A Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 70: SI-68P13 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 71: SI-68P13 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 72: SI-68P13 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 76: SI-68P17 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 79: SI-68P15 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 80: SI-68P15 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 81: SI-68P18 Chain A Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 82: SI-68P18 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 83: SI-68P18 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 84: SI-68P18 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 86: SI-68P19 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 87: SI-68P19 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 88: SI-68P19 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 90: SI-68P16 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 92: SI-68P16 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 94: SI-75P5 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 95: SI-75P5 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 133: SI-76PM1 Chain A Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 134: SI-76PM1 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 162: SI-49R25 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 163: SI-49R25 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 164: SI-49R25 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 171: SI-49P8 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 172: SI-49P8 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 173: SI-49PM1 Chain A Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 174: SI-49PM1 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 175: SI-49PM1 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 176: SI-49PM1 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 177: SI-49P9 Chain A Amino Acid
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>Sequence ID 178: SI-49P9 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 179: SI-49P9 Chain B Amino Acid Sequence
ENVLTQSPASLSASPGERVTITCSASSSVSYMHWYQQKPGQAPKLWIYDTSKLASGVPSRFSGSGSGNDHTLTISSMEPEDFATYYCFQGSVYPFTFGQGTKLEIKGSTGSGSKPGSGEGSTKGQVTLKESGPGLVQPGQTLRLTCAFSGFSLSTSGMGVGWIRQPPGKGLEWLAHIWWDDDKRYNPALKSRLTISKDTSKNQVYLQMNSLDAEDTAVYYCARMELWSYYFDYWGQGTLVTVSTGGGGSGGGGSFLNSLFNQEVQIPLTESYCGPCPKNWICYKNNCYQFFDESKNWYESQASCMSQNASLLKVYSKEDQDLLKLVKSYHWMGLVHIPTNGSWQWEDGSILSPNLLTIIEMQKGDCALYASSFKGYIENCSTPNTYICMQRTVRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECGGDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCAVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSFSSGYDMCWVRQAPGKCLEWIACIAAGSAGITYDANWAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSAFSFDYAMDLWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQSISSHLNWYQQKPGKAPKLLIYKASTLASGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQGYSWGNVDNVFGCGTKVEIK
>Sequence ID 180: SI-49P9 Chain B Nucleotide Sequence
GAAAATGTATTGACACAGAGCCCCGCCTCCCTCAGTGCCTCACCTGGGGAAAGGGTAACTATCACTTGCTCTGCATCAAGCAGCGTCTCATACATGCATTGGTATCAACAAAAGCCTGGACAGGCCCCCAAGCTCTGGATATACGATACGAGCAAGCTGGCTTCCGGCGTACCTAGCCGCTTCAGTGGTTCCGGCTCAGGCAACGATCACACCCTTACGATTTCCAGTATGGAACCCGAAGATTTTGCAACTTATTATTGTTTCCAGGGGAGCGTGTACCCATTCACTTTCGGGCAGGGGACAAAATTGGAGATAAAGGGAAGTACTGGTTCTGGGTCTAAACCCGGTTCCGGCGAAGGTAGTACTAAAGGACAGGTCACATTGAAGGAATCTGGCCCCGGCCTTGTTCAGCCAGGACAGACCCTTAGGCTCACCTGTGCCTTCAGTGGTTTTTCTCTTAGCACTAGCGGTATGGGGGTCGGCTGGATTCGGCAGCCTCCCGGCAAAGGTCTTGAGTGGTTGGCTCACATTTGGTGGGACGACGACAAACGGTATAATCCTGCCTTGAAAAGTCGGCTGACCATTAGTAAGGATACCTCAAAAAATCAAGTGTACTTGCAAATGAATAGCCTTGACGCCGAGGATACGGCTGTATATTATTGCGCGCGGATGGAACTCTGGTCTTACTACTTTGATTATTGGGGGCAGGGGACTCTCGTCACGGTGTCGACTGGCGGTGGAGGGTCCGGCGGTGGTGGATCATTCCTAAACTCATTATTCAACCAAGAAGTTCAAATTCCCTTGACCGAAAGTTACTGTGGCCCATGTCCTAAAAACTGGATATGTTACAAAAATAACTGCTACCAATTTTTTGATGAGAGTAAAAACTGGTATGAGAGCCAGGCTTCTTGTATGTCTCAAAATGCCAGCCTTCTGAAAGTATACAGCAAAGAGGACCAGGATTTACTTAAACTGGTGAAGTCATATCATTGGATGGGACTAGTACACATTCCAACAAATGGATCTTGGCAGTGGGAAGATGGCTCCATTCTCTCACCCAACCTACTAACAATAATTGAAATGCAGAAGGGAGACTGTGCACTCTATGCCTCGAGCTTTAAAGGCTATATAGAAAACTGTTCAACTCCAAATACGTACATCTGCATGCAAAGGACTGTGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTGGAGGCGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCCGCGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCGCGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATGTCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGTGGTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTATAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTGGCGGTGGAGGGTCCGGCGGTGGTGGATCCGAGGTGCAGCTGTTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCTCCTTCAGTAGCGGGTACGACATGTGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGTGCCTGGAGTGGATCGCATGCATTGCTGCTGGTAGTGCTGGTATCACTTACGACGCGAACTGGGCGAAAGGCCGGTTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCCGTATATTACTGTGCGAGATCGGCGTTTTCGTTCGACTACGCCATGGACCTCTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCGTCTGGTGGAGGCGGTTCAGGCGGAGGTGGAAGTGGTGGTGGCGGCTCTGGAGGCGGCGGATCTGACATCCAGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGGCCAGTCAGAGCATTAGTTCCCACTTAAACTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATAAGGCATCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTTACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAACAGGGTTATAGTTGGGGTAATGTTGATAATGTTTTCGGCTGCGGGACCAAGGTGGAGATCAAATAG
>Sequence ID 181: SI-1C3 Heavy Chain Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 182: SI-1C3 Heavy Chain Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 183: SI-1C3 Light Chain Amino Acid Sequence
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYFCQHFDHLPLAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
>Sequence ID 184: SI-1C3 Light Chain Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 185: SI-1C7 Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 186: SI-1C7 Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 187: SI-9C21 Heavy Chain Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 188: SI-9C21 Heavy Chain Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 189: SI-9C21 Light Chain Amino Acid Sequence
EIVMTQSPSTLSASVGDRVIITCQASESISSWLAWYQQKPGKAPKLLIYEASKLASGVPSRFSGSGSGAEFTLTISSLQPDDFATYYCQGYFYFISRTYVNSFGQGTKLTVLRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
>Sequence ID 190: SI-9C21 Light Chain Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 191: SI-35FS11 Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 192: SI-35FS11 Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 193: SI-3FS11 Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 194: SI-3FS11 Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 195: SI-68X1 Chain A Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 196: SI-68X1 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 197: SI-68X1 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 198: SI-68X1 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 199: SI-68X3 Chain A Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 200: SI-68X3 Chain A Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 201: SI-68X3 Chain B Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 202: SI-68X3 Chain B Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 203: αEGFR VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 204: αEGFR VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 205: αEGFR VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 206: αEGFR VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 207: αEGFR* VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 208: αEGFR* VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 209: αEGFR* VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 210: αEGFR* VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 211: αEGFR* VH Stapled Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 212: αEGFR* VH Stapled Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 213: αEGFR* VL Stapled Amino Acid Sequence
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYFCQHFDHLPLAFGCGTKVEIK
>Sequence ID 214: αEGFR* VL Stapled Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 215: αCD19 VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 216: αCD19 VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 217: αCD19 VL Amino Acid Sequence
ENVLTQSPASLSASPGERVTITCSASSSVSYMHWYQQKPGQAPKLWIYDTSKLASGVPSRFSGSGSGNDHTLTISSMEPEDFATYYCFQGSVYPFTFGQGTKVTVL
>Sequence ID 218: αCD19 VL Nucleotide Sequence
GAAAATGTATTGACACAGAGCCCCGCCTCCCTCAGTGCCTCACCTGGGGAAAGGGTAACTATCACTTGCTCTGCATCAAGCAGCGTCTCATACATGCATTGGTATCAACAAAAGCCTGGACAGGCCCCCAAGCTCTGGATATACGATACGAGCAAGCTGGCTTCCGGCGTACCTAGCCGCTTCAGTGGTTCCGGCTCAGGCAACGATCACACCCTTACGATTTCCAGTATGGAACCCGAAGATTTTGCAACTTATTATTGTTTCCAGGGGAGCGTGTACCCATTCACTTTCGGGCAGGGGACAAAAGTGACCGTCCTA
>Sequence ID 219: αCD3 VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 220: αCD3 VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 221: αCD3 VL Amino Acid Sequence
DVVMTQSPSTLSASVGDRVTINCQASESISSWLAWYQQKPGKAPKLLIYEASKLASGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQGYFYFISRTYVNSFGGGTKVEIK
>Sequence ID 222: αCD3 VL Nucleotide Sequence
GACGTCGTGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCAATTGCCAAGCCAGTGAGAGCATTAGCAGTTGGTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATGAAGCATCCAAACTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAAGGCTATTTTTATTTTATTAGTCGTACTTATGTAAATTCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAA
>Sequence ID 223: αCD3 VH stapled Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 224: αCD3 VH stapled Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 225: αCD3 VL stapled Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 226: αCD3 VL stapled Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 227: αCD3* VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 228: αCD3* VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 229: αCD3* VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 230: αCD3* VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 231: αCD3** VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 232: αCD3** VH Nucleotide Sequence
GAAGTCCAATTGGTAGAAAGTGGCGGTGGTCTGGTGCAACCTGGTGGATCTCTTCGCCTCTCATGCGCCGCTAGTGGCTTTACTATTTCAACTAATGCGATGAGCTGGGTTCGCCAGGCCCCCGGCAAAGGACTTGAGTGGGTCGGCGTCATCACCGGCAGGGACATTACATACTATGCGAGTTGGGCAAAGGGCAGGTTCACGATTAGCCGCGATACTTCAAAGAATACCGTTTACCTTCAAATGAATAGCTTGAGGGCGGAAGACACAGCTGTGTATTACTGCGCGAGGGATGGAGGTAGTTCCGCCATAACTTCCAACAACATATGGGGACAAGGCACGCTGGTTACTGTCTCGAGT

>Sequence ID 233: αCD3** VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 234: αCD3** VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 235: αCD3*** VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 236: αCD3*** VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 237: αCD3*** VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 238: αCD3*** VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 239: αCD3**** VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 240: αCD3**** VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 241: αCD3**** VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 242: αCD3**** VL Nucleotide Sequence
GATGTGGTGATGACCCAGAGCCCGAGCAGCCTGAGCGCGAGCGTGGGCGATCGCGTGACCATTAGCTGCCAGGCGAGCGAAAGCATTAGCAGCTGGCTGGCGTGGTATCAGCAGAAACCGGGCCAGGCGCCGAAACTGCTGATTTATGAAGCGAGCAAACTGGCGAGCGGCGTGCCGAGCCGCTTTAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCGAATTTACCCTGACCATTAGCAGCCTGGAACCGGAAGATTTTGCGACCTATTATTGCCAGGGCTATTTTTATTTTATTAGCCGCACCTATGTGAACAGCTTTGGCGGCGGCACCAAAGTGGAAATTAAA
>Sequence ID 243: αPD-L1 VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 244: αPD-L1 VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 245: αPD-L1 VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 246: αPD-L1 VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 247: α4-1BB VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 248: α4-1BB VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 249: α4-1BB VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 250: α4-1BB VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 251: 41BBL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 252: 41BBL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 253: NKG2D dimer Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 254: NKG2D dimer Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 255: αHER3 VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 256: αHER3 VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 257: αHER3 VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 258: αHER3 VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 259: αCD20 VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 260: αCD20 VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 261: αCD20 VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 262: αCD20 VL Nucleotide Sequence
CAGATCGTGCTGAGCCAGAGCCCCGCCATCCTGAGCGCCAGCCCCGGCGAGAAGGTGACCATGACCTGCCGGGCCAGCAGCAGCGTGAGCTACATCCACTGGTTCCAGCAGAAGCCCGGCAGCAGCCCCAAGCCCTGGATCTACGCCACCAGCAACCTGGCCAGCGGCGTGCCCGTGCGGTTCAGCGGCAGCGGCAGCGGCACCAGCTACAGCCTGACCATCAGCCGGGTGGAGGCCGAGGACGCCGCCACCTACTACTGCCAGCAGTGGACCAGCAACCCCCCCACCTTCGGCGGCGGCACCAAGCTGACCGTGCTG
>Sequence ID 263: EGFR VHH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 264: EGFR VHH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 265: HER3 VHH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 266: HER3 VHH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 267: αPD-L1 Stapled VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 268: αPD-L1 Stapled VH Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 269: αPD-L1 Stapled VL Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 270: αPD-L1 Stapled VL Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 271: α4-1BB VH Stapled Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 272: α4-1BB VH Stapled Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 273: α4-1BB VL Stapled Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 274: α4-1BB VL Stapled Nucleotide Sequence
GACGTTGTGATGACCCAGTCTCCATCTTCCGTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACCTGTCAGGCCAGTCAGAACATTAGGACTTACTTATCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATGCTGCAGCCAATCTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCGACTTGGAACCTGGCGATGCTGCAACTTACTATTGTCAGTCTACCTATCTTGGTACTGATTATGTTGGCGGTGCTTTCGGCTGTGGGACCAAGGTGGAGATCAAATGA
>Sequence ID 275: αHer3 VH Stapled Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 276: αHer3 VH Stapled Nucleotide Sequence
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>Sequence ID 277: αHer3 VL Stapled Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 278: αHer3 VL Stapled Nucleotide Sequence
CAGTCTGCCCTGACTCAGCCTGCCTCCGTGTCTGGGTCTCCTGGACAGTCGATCACCATCTCCTGCACTGGAACCAGCAGTGACGTTGGTGGTTATAACTTTGTCTCCTGGTACCAACAACACCCAGGCAAAGCCCCCAAACTCATGATCTATGATGTCAGTGATCGGCCCTCAGGGGTGTCTGATCGCTTCTCCGGCTCCAAGTCTGGCAACACGGCCTCCCTGATCATCTCTGGCCTCCAGGCTGACGACGAGGCTGATTATTACTGCAGCTCATATGGGAGCAGCAGCACTCATGTGATTTTCGGCTGTGGGACCAAGGTGACCGTCCTA
>Sequence ID 279: αCEA 656E11 VH Amino Acid Sequence
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>Sequence ID 280: αCEA 656E11 VH Nucleotide Sequence
GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCTCCTTCAGTGGCACCCAGTACGTGTGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATCGGATGCATTTATGTGGATGTGGCTAACACTTACTACGCGACCTCCGTGAAGGGCAGATTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTATCTTCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCGAGTCATGATACTGTTTGTGCTGGTTGTGGTTTGGACTTGTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCGAGC
>Sequence ID 281: αCEA 656E11 VL Amino Acid Sequence
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASENIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYDASTLASGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQSTYYNNIIYGAAFGGGTKVEIK
>Sequence ID 282: αCEA 656E11 VL Nucleotide Sequence
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGGCCAGTGAGAACATTTACAGCAATTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATGATGCTTCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAATCTACTTATTATAATAATATCATTTATGGGGCTGCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAA
>Sequence ID 283: αHER2 VH Amino Acid Sequence
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVST
>Sequence ID 284: αHER2 VH Nucleotide Sequence
GAAGTACAGCTTGTTGAGAGTGGTGGTGGACTTGTCCAACCAGGGGGAAGTCTGCGGCTGTCATGCGCAGCCTCTGGCTTCAACATTAAGGACACCTACATTCACTGGGTTCGGCAAGCGCCGGGGAAGGGGCTGGAATGGGTCGCCAGGATATACCCTACCAACGGGTACACCAGGTATGCAGATAGCGTTAAGGGTAGATTCACTATTTCAGCTGACACTAGCAAGAACACCGCGTATCTCCAGATGAACTCCCTTCGCGCCGAGGATACGGCTGTGTACTACTGCTCTAGGTGGGGAGGAGATGGGTTTTACGCAATGGATTACTGGGGACAGGGAACACTCGTTACGGTGTCGACA
>Sequence ID 285: αHER2 VL Amino Acid Sequence
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIK
>Sequence ID 286: αHER2 VL Nucleotide Sequence
GACATCCAAATGACGCAGTCTCCCTCCAGTTTGAGTGCAAGTGTGGGAGACAGAGTTACGATCACATGTAGGGCAAGTCAGGACGTCAATACAGCCGTCGCATGGTACCAGCAGAAGCCTGGAAAGGCCCCGAAACTTCTGATTTACTCTGCAAGTTTCCTCTACAGTGGTGTTCCTAGTCGCTTCAGTGGGTCTCGGTCAGGCACCGATTTTACCCTGACAATTAGCAGCTTGCAACCGGAAGATTTTGCGACCTATTATTGCCAGCAACATTATACCACCCCTCCCACATTTGGACAAGGCACGAAGGTAGAGATTAAA
>Sequence ID 287: SI-20C14 (anti-CEA 656E11) Heavy Chain Amino Acid Sequence
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSFSGTQYVCWVRQAPGKGLEWIGCIYVDVANTYYATSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCASHDTVCAGCGLDLWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCAVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
>Sequence ID 288: SI-20C14 (anti-CEA 656E11) Heavy Chain Nucleotide Sequence
GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCTCCTTCAGTGGCACCCAGTACGTGTGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATCGGATGCATTTATGTGGATGTGGCTAACACTTACTACGCGACCTCCGTGAAGGGCAGATTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTATCTTCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCGAGTCATGATACTGTTTGTGCTGGTTGTGGTTTGGACTTGTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCGAGCGCTAGCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCCGCGGGGGCACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCGCGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTATAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTTAA
>Sequence ID 289: SI-20C14 (anti-CEA 656E11) Light Chain Amino Acid Sequence
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASENIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYDASTLASGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQSTYYNNIIYGAAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
>Sequence ID 290: SI-20C14 (anti-CEA 656E11) Light Chain Nucleotide Sequence
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGGCCAGTGAGAACATTTACAGCAATTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATGATGCTTCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAATCTACTTATTATAATAATATCATTTATGGGGCTGCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
>Sequence ID 291: αCD3***** VH Amino Acid Sequence
QQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGIDLSSNAIGWVRQAPGKGLEWVGVIFGSGNTYYASWAKGRFTISRSKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGYSSDIWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 292: αCD3***** VH Nucleotide Sequence
CAACAGTTGGTTGAGTCTGGTGGCGGTCTCGTTAAGCCTGGAGGGTCCCTTCGGCTTAGTTGTGCGGCCTCTGGGATCGACCTGTCTAGCAACGCTATAGGATGGGTACGGCAAGCTCCGGGCAAAGGCCTTGAGTGGGTCGGCGTTATTTTTGGGAGCGGTAATACGTACTACGCCAGCTGGGCAAAAGGTAGGTTCACTATCAGTCGATCAAAGAACACGGTATATCTTCAGATGAACAGTCTCCGGGCGGAGGACACCGCGGTTTATTATTGCGCAAGGGGGGGATACTCCTCAGACATATGGGGCCAAGGTACTTTGGTGACGGTCTCGAGC
>Sequence ID 293: αCD3***** VL Amino Acid Sequence
DPVLTQSPSSLSASVGDRVTISCQSSQSVAKNNNLAWFQQKPGQAPKLLIYSASTLAAGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSVQPEDFATYYCSARDSGNIQSFGGGTKVEIK
>Sequence ID 294: αCD3***** VL Nucleotide Sequence
GATCCAGTTCTGACACAAAGTCCATCCAGCCTGTCTGCCTCAGTCGGCGACAGAGTGACCATCAGTTGCCAGAGCTCACAGTCTGTGGCTAAGAACAACAACTTGGCGTGGTTCCAACAGAAACCTGGACAGGCTCCGAAATTGCTGATCTATTCTGCTTCCACGCTTGCTGCTGGTGTTCCTTCCCGCTTTTCAGGTAGTGGTAGCGGGACAGACTTCACTTTGACTATAAGCAGCGTGCAGCCTGAAGATTTTGCGACCTACTATTGTTCTGCTAGAGACAGTGGAAATATTCAGTCCTTTGGGGGGGGAACGAAGGTCGAAATAAAG
>Sequence ID 295: NKG2D Monomer Amino Acid Sequence
FLNSLFNQEVQIPLTESYCGPCPKNWICYKNNCYQFFDESKNWYESQASCMSQNASLLKVYSKEDQDLLKLVKSYHWMGLVHIPTNGSWQWEDGSILSPNLLTIIEMQKGDCALYASSFKGYIENCSTPNTYICMQRTV
>Sequence ID 296: NKG2D Monomer Nucleotide Sequence
TTTCTGAATAGCCTGTTCAACCAGGAGGTGCAGATCCCACTGACCGAGAGCTATTGTGGACCTTGTCCTAAGAACTGGATCTGTTACAAGAACAACTGCTACCAGTTCTTCGACGAGAGCAAGAATTGGTATGAAAGCCAGGCCAGCTGCATGAGCCAAAACGCCTCTCTGCTGAAGGTGTACTCCAAAGAAGATCAGGACCTGCTGAAGCTGGTGAAGTCCTACCACTGGATGGGCCTGGTGCACATCCCAACCAACGGCAGCTGGCAGTGGGAAGACGGCAGCATCCTGAGCCCTAACCTGCTGACAATCATTGAGATGCAGAAAGGCGACTGCGCCCTGTACGCCAGTTCTTTTAAGGGCTACATCGAAAACTGTAGCACCCCTAACACCTACATCTGCATGCAGAGAACAGTG
>Sequence ID 297: SI-75XM9 chain A amino acid sequence
QVQLQESGGRLVQPGEPLSLTCKTSGIDLSSNAIGWVRQAPGKGLEWIGVIFGSGNTYYASWAKGRFTISRSTSTVYLKMNSLRSEDTAIYYCARGGYSSDIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
>Sequence ID 298: SI-75XM9 chain A nucleotide sequence
CAAGTGCAGTTGCAAGAAAGTGGTGGTAGACTGGTTCAGCCTGGTGAACCCTTGTCACTGACGTGTAAAACAAGCGGCATTGATCTGTCCTCTAACGCCATCGGATGGGTCCGACAGGCCCCAGGAAAAGGTCTGGAGTGGATCGGAGTTATCTTCGGGAGCGGCAATACATACTACGCAAGCTGGGCAAAAGGGCGATTTACGATATCACGGAGCACCTCTACAGTTTATTTGAAAATGAACTCCCTCCGGTCCGAGGATACCGCGATATATTACTGTGCCAGAGGGGGGTACTCCTCTGATATCTGGGGGCAGGGTACACTGGTTACAGTTTCATCCGCTAGCACCAAGGGACCCTCTGTGTTTCCTCTGGCTCCTTGCTCCAGATCCACCTCCGAGTCTACAGCTGCTCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTTCCTGAGCCTGTGACCGTGTCCTGGAACTCTGGCGCTCTGACATCTGGCGTGCACACCTTTCCAGCTGTGCTGCAGTCCTCCGGCCTGTACTCTCTGTCCTCTGTCGTGACCGTGCCTTCCTCTAGCCTGGGCACCAAGACCTACACCTGTAATGTGGACCACAAGCCTTCCAACACCAAGGTGGACAAGCGCGTGGAATCTAAGTACGGCCCTCCTTGTCCTCCATGTCCTGCTCCAGAAGCTGCTGGCGGCCCATCCGTGTTTCTGTTCCCTCCAAAGCCTAAGGACACCCTGATGATCTCTCGGACCCCTGAAGTGACCTGCGTGGTGGTGGATGTGTCCCAAGAGGATCCCGAGGTGCAGTTCAATTGGTACGTGGACGGCGTGGAAGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCTAGAGAGGAACAGTTCAACTCCACCTACAGAGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGATTGGCTGAACGGCAAAGAGTACAAGTGCAAGGTGTCCAACAAGGGCCTGCCTTCCAGCATCGAAAAGACCATCTCCAAGGCCAAGGGCCAGCCTAGGGAACCCCAGGTTTACACCCTGCCTCCAAGCCAAGAGGAAATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGTCCTGCGCCGTGAAGGGCTTCTACCCTTCCGATATCGCCGTGGAATGGGAGAGCAATGGCCAGCCTGAGAACAACTACAAGACAACCCCTCCTGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTGGTGTCCCGCCTGACCGTGGACAAGTCCAGATGGCAAGAGGGCAACGTGTTCTCCTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAATCACTACACCCAGAAGTCCCTGTCTCTGTCCCTGGGATGA
>Sequence ID 299: SI-75XM9 chain B amino acid sequence
QSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNFVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSDRPSGVSDRFSGSKSGNTASLIISGLQADDEADYYCSSYGSSSTHVIFGGGTKVTVLGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGGGLVKPGGSLSLSCAASGFTFSSYWMSWVRQAPGKGLEWVANINRDGSASYYVDSVKGRFTISRDDAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGVGYFDLWGRGTLVTVSSGGGGSGGGGSDPQLTQSPSSLSATVGQRVTINCQSSQSVAKNNNLAWFQQKPGKPPKLLIYSASTLAAGVPSRFSGSGSGTQFTLTITRVQSEDFATYYCSARDSGNIQSFGGGTRVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECGGGPPCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNRFTQKSLSLSLG
>Sequence ID 300: SI-75XM9 chain B nucleotide sequence
CAGTCTGCCCTGACTCAGCCTGCCTCCGTGTCTGGGTCTCCTGGACAGTCGATCACCATCTCCTGCACTGGAACCAGCAGTGACGTTGGTGGTTATAACTTTGTCTCCTGGTACCAACAACACCCAGGCAAAGCCCCCAAACTCATGATCTATGATGTCAGTGATCGGCCCTCAGGGGTGTCTGATCGCTTCTCCGGCTCCAAGTCTGGCAACACGGCCTCCCTGATCATCTCTGGCCTCCAGGCTGACGACGAGGCTGATTATTACTGCAGCTCATATGGGAGCAGCAGCACTCATGTGATTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGACCGTCCTAGGCGGTGGCGGTAGTGGGGGAGGCGGTTCTGGCGGCGGAGGGTCCGGCGGTGGAGGATCACAGGTGCAATTGCAGGAGTCGGGGGGAGGCCTGGTCAAGCCTGGAGGGTCCCTGAGCCTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCTTTAGTAGTTATTGGATGAGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGGTGGCCAACATAAACCGCGATGGAAGTGCGAGTTACTATGTGGACTCTGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACGACGCCAAGAACTCACTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGAGCTGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCGAGAGATCGTGGGGTGGGCTACTTCGATCTCTGGGGCCGTGGCACCCTGGTCACCGTCTCGAGTGGCGGTGGAGGGTCCGGCGGTGGTGGATCAGATCCTCAATTGACCCAGTCCCCTAGTAGCCTTTCTGCAACCGTGGGCCAGAGGGTAACAATCAATTGCCAGTCAAGCCAGTCCGTAGCGAAGAATAATAATTTGGCATGGTTCCAACAAAAACCGGGTAAACCTCCTAAACTCCTTATCTACTCAGCTTCAACCCTTGCCGCGGGTGTGCCCAGCCGGTTCTCAGGCTCAGGTTCCGGGACTCAATTTACACTTACCATCACTCGCGTCCAAAGTGAGGATTTTGCAACCTACTATTGTTCTGCACGGGATTCCGGGAACATACAGTCCTTTGGGGGTGGAACTCGGGTGGAGATAAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTGGCGGCGGACCTCCTTGTCCTCCATGTCCTGCTCCAGAAGCTGCTGGCGGCCCATCCGTGTTTCTGTTCCCTCCAAAGCCTAAGGACACCCTGATGATCTCTCGGACCCCTGAAGTGACCTGCGTGGTGGTGGATGTGTCCCAAGAGGATCCCGAGGTGCAGTTCAATTGGTACGTGGACGGCGTGGAAGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCTAGAGAGGAACAGTTCAACTCCACCTACAGAGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGATTGGCTGAACGGCAAAGAGTACAAGTGCAAGGTGTCCAACAAGGGCCTGCCTTCCAGCATCGAAAAGACCATCTCCAAGGCCAAGGGCCAGCCTAGGGAACCCCAGGTTTACACCCTGCCTCCAAGCCAAGAGGAAATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGTGGTGCCTCGTGAAGGGCTTCTACCCTTCCGATATCGCCGTGGAATGGGAGAGCAATGGCCAGCCTGAGAACAACTACAAGACAACCCCTCCTGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTGTATTCCCGCCTGACCGTGGACAAGTCCAGATGGCAAGAGGGCAACGTGTTCTCCTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAATCGCTTCACCCAGAAGTCCCTGTCTCTGTCCCTGGGATGA
>Sequence ID 301: anti-CEA 656E11 CDR-H1 amino acid sequence
GTQYVC
>Sequence ID 302: anti-CEA 656E11 CDR-H2 amino acid sequence
CIYVDVANTYYATSVKG
>Sequence ID 303: anti-CEA 656E11 CDR-H3 amino acid sequence
HDTVCAGCGLDL
>Sequence ID 304: anti-CEA 656E11 CDR-L1 amino acid sequence
QASENIYSNLA
>Sequence ID 305: anti-CEA 656E11 CDR-L2 amino acid sequence
DASTLAS
>Sequence ID 306: anti-CEA 656E11 CDR-L3 amino acid sequence
QSTYYNNIIYGAA
>Sequence ID 307: anti-CD3 283E3 (BSM/FRS) CDR-H1 amino acid sequence
SNAIG
>Sequence ID 308: anti-CD3 283E3 (BSM/FRS) CDR-H2 amino acid sequence
VIFGSGNTYYASWAKG
>Sequence ID 309: anti-CD3 283E3 (BSM/FRS) CDR-H3 amino acid sequence
GGYSSDI
>Sequence ID 310: anti-CD3 283E3 (BSM/FRS) CDR-L1 amino acid sequence
QSSQSVAKNNNLA
>Sequence ID 311: anti-CD3 283E3 (BSM/FRS) CDR-L2 amino acid sequence
SASTLAA
>Sequence ID 312: anti-CD3 283E3 (BSM/FRS) CDR-L3 amino acid sequence
SARDSGNIQS
>Sequence ID 313: human IgG1 amino acid sequence
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG

>Sequence ID 314: human IgG4 amino acid sequence

ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG

Claims (30)

  1. N末端及びC末端を有する多重特異性抗体様タンパク質であって、
    第1単量体及び第2単量体を含み、
    前記第1単量体は、N末端からC末端まで第1結合単量体、CH1ドメイン、第1ヒンジ、第1CH2ドメイン、及び第1CH3ドメインを含み、前記第1単量体は、必要に応じてN末端に結合した第1結合ドメイン(D1)及び/又はC末端に結合した第4結合ドメイン(D4)を含み、
    前記第2単量体は、N末端からC末端まで第2結合単量体、CLドメイン、第2ヒンジ、第2CH2ドメイン及び第2CH3ドメインを含み、前記第2単量体は、必要に応じてN末端に結合した第2結合ドメイン(D2)及び/又はC末端に結合した第5結合ドメイン(D5)を含み、
    前記第1結合単量体及び前記第2結合単量体は、二量体を形成するように構成され、
    前記第1単量体及び前記第2単量体は、CH1ドメインとCLドメインの間の少なくとも1つのジスルフィド結合、及び第1ヒンジと第2ヒンジの間の少なくとも1つのジスルフィド結合を介して共有結合でペアとなり、
    前記多重特異性抗体様タンパク質は、少なくとも二重特異性である、多重特異性抗体様タンパク質。
  2. 前記第1結合単量体は、VHドメインを含み、前記第2結合単量体は、VLドメインを含み、前記VH、CH1、VL、CLドメインは、Fab領域を第3結合ドメイン(D3)として形成する、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  3. 前記第1結合単量体及び前記第2結合単量体は、NKG2D受容体を第3結合ドメイン(D3)として形成する、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  4. 前記第1CH3ドメインは、ホール構造を形成するように構成され、前記第2CH3ドメインは、ノブ構造を形成するように構成され、前記第1CH2ドメインと第1CH3ドメイン及び前記第2CH2ドメインと第2CH3ドメインは、ヘテロ二量体化して相補的なFcドメインを形成するように構成される、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  5. 前記D1、D2、D4及びD5は、それぞれ独立してscFvドメイン、VHHドメイン、受容体又はリガンドである、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  6. 前記D1、D2、D3、D4及びD5は、それぞれ独立してEGFR、HER2、HER3、EGFRvIII、ROR1、CD3、CD28、CEA、LMP1、LMP2A、メソテリン、PSMA、EpCAM、グリピカン-3、gpA33、GD2、TROP2、NKG2D、NKG2Dリガンド、BCMA、CD19、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30、PD-L1、PD1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40、CD40L、VISTA、ICOS、BTLA、LIGHT、HVEM、CSF1R、CD73、CD39、CLDN18.2、DLL3、HLA-G、FcRH5、GPRC5D、LIV-1、MUC1、CD138、CD70、CD16、uPAR、Siglec-15、CD47、CD38、NKp46、PD-L2、CD160、LOX-1、SIRPα、CD27から選択される抗原に対して結合特異性を有し、前記Fcドメインは、ヒトIgG Fcドメインを含む、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  7. 前記D1は、CD3、CD20、CEA、HER2、EGFR又はNKG2Dリガンドに対して結合特異性を有する、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  8. 前記D2は、HER3、EGFR、CD3又はCD19に対して結合特異性を有する、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  9. 前記D3は、HER3、EGFR、CD3又はNKG2Dリガンドに対して結合特異性を有する、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  10. 前記D4は、4-1BB又はEGFRに対して結合特異性を有する、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  11. 前記D5は、PD-L1又はHER3に対して結合特異性を有する、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  12. 前記抗体は、EGFR、HER3及びCD3に対して結合特異性を有する三重特異性抗体である、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  13. 前記抗体は、EGFR、HER3、CD3及び4-1BBに対して結合特異性を有する四重特異性抗体である、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  14. 前記抗体は、EGFR、HER3、CD3及びPD-L1に対して結合特異性を有する四重特異性抗体である、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  15. 前記抗体は、EGFR、HER3、CD3、4-1BB及びPD-L1に対して結合特異性を有する五重特異性抗体である、請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質。
  16. CEAに対して親和性を有する相補性決定領域(CDR)であって、配列番号301、302、303、304、305又は306と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、相補性決定領域。
  17. CEAに対して親和性を有するタンパク質であって、請求項16に記載のCDRを含む、タンパク質。
  18. CEAに対して結合親和性を有する多重特異性抗体様タンパク質であって、配列番号279、280、281又は282から選択されるアミノ酸配列と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、多重特異性抗体様タンパク質。
  19. CD3に対して結合親和性を有する相補性決定領域(CDR)であって、配列番号307、308、309、310、311又は312と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、相補性決定領域。
  20. CD3に対して親和性を有するタンパク質であって、請求項19に記載のCDRを含む、タンパク質。
  21. CD3に対して結合親和性を有する多重特異性抗体様タンパク質であって、配列番号227-230、231-234、235-238、239-242及び291-294から選択されるアミノ酸配列と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、多重特異性抗体様タンパク質。
  22. 請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質をコードする単離された核酸配列。
  23. 請求項22に記載の単離された核酸配列を含む発現ベクター。
  24. 請求項22に記載の単離された核酸配列を含む、宿主細胞。
  25. 請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質と、cytotoxic agentとを含む、免疫複合体。
  26. 請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
  27. 請求項25に記載の免疫複合体と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
  28. がん、自己免疫疾患又は感染症に罹患している対象を治療又は予防する方法であって、前記対象に精製された請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質を含む医薬組成物を投与する工程を含む、方法。
  29. 請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質の調製方法であって、
    請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質をコードするDNA配列が発現されるように宿主細胞を培養する工程と、
    前記多重特異性抗体様タンパク質を精製する工程と、
    を含む、方法。
  30. 有効濃度の請求項1に記載の多重特異性抗体様タンパク質を含む溶液であって、前記溶液は、対象の血漿である、溶液。
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