JP2023516016A - 誤って折り畳まれたタンパク質の眼疾患を治療するための組成物及び方法 - Google Patents
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Abstract
それを必要とする対象における、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる遺伝性眼障害を治療する方法は、誤って折り畳まれた眼タンパク質のクリアランスを促進する化合物を対象に投与することを含む。【選択図】図1A
Description
関連出願
この出願は、2020年2月26日出願の米国仮出願第62/981,819号の優先権を主張するものであり、その主題は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
この出願は、2020年2月26日出願の米国仮出願第62/981,819号の優先権を主張するものであり、その主題は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
政府の資金提供
この発明は、米国立衛生研究所によって付与された助成金P30 EY08098の下で政府支援により行われた。米国政府は、本発明に対して一定の権利を有する。
この発明は、米国立衛生研究所によって付与された助成金P30 EY08098の下で政府支援により行われた。米国政府は、本発明に対して一定の権利を有する。
背景
タンパク質のミスフォールディング及び折り畳まれていないタンパク質の応答は、世界中の百万人以上に影響を及ぼす進行性網膜変性の網膜色素変性症(RP)などの遺伝性網膜疾患の一因であることが見出されている。RPの疾患進行は広く変化するが、数十年間継続し得る。杆体視細胞の漸減により、夜盲症が生じ、その後、視野が減少し、最終的に視野狭窄になる。多くのRP患者の中心視力は、法的失明が生じたときに錐体視細胞の二次喪失が生じるまで、何年も継続し得る。RHO遺伝子中の160超の変異がRPと関連付けられており、これらの変異の約1/3はロドプシンのミスフォールディングを引き起こし、杆体視細胞に対して毒性であるドミナントネガティブ効果をもたらすと考えられている。RHO P23H変異のみは、北米における全常染色体優性(ad)RP症例の約10~12%を占めるので、この変異はadRPのモデルとして最も一般的に研究されている。他のタンパク質のミスフォールディング疾患のように、現在、RPについては有効な治療は利用可能でない。
タンパク質のミスフォールディング及び折り畳まれていないタンパク質の応答は、世界中の百万人以上に影響を及ぼす進行性網膜変性の網膜色素変性症(RP)などの遺伝性網膜疾患の一因であることが見出されている。RPの疾患進行は広く変化するが、数十年間継続し得る。杆体視細胞の漸減により、夜盲症が生じ、その後、視野が減少し、最終的に視野狭窄になる。多くのRP患者の中心視力は、法的失明が生じたときに錐体視細胞の二次喪失が生じるまで、何年も継続し得る。RHO遺伝子中の160超の変異がRPと関連付けられており、これらの変異の約1/3はロドプシンのミスフォールディングを引き起こし、杆体視細胞に対して毒性であるドミナントネガティブ効果をもたらすと考えられている。RHO P23H変異のみは、北米における全常染色体優性(ad)RP症例の約10~12%を占めるので、この変異はadRPのモデルとして最も一般的に研究されている。他のタンパク質のミスフォールディング疾患のように、現在、RPについては有効な治療は利用可能でない。
弱い光の受容体ロドプシンは、杆体視細胞の外側セグメントに存在する最も豊富なタンパク質であり、夜間に高い視覚感度を支持する。ロドプシンのホメオスタシスは、杆体外節(OS)形態及び杆体視細胞機能を維持するために必須である。杆体OSの高い存在量及び10%の毎日のリニューアル速度により、杆体OSの長さを一定に保つために、ロドプシン生合成は極めて高いレベルに維持される。そのため、RHO遺伝子変異の1つの対立遺伝子でさえ、ロドプシンタンパク質のホメオスタシスを実質的に妨害し、RPでの杆体細胞死をもたらし得る。P23H変異は、ロドプシンの網膜結合部位の頂部に着座した反平行β-プラグ足場の構造的安定性に影響を及ぼし、このβ-プラグ足場は、水性環境から疎水性リガンド結合ポケットを切除するために必須である。変異ロドプシンタンパク質は、培養細胞中の小胞体(ER)内に蓄積する。ER結合タンパク質分解経路は、RhoP23H/+ノックインマウス網膜において活性化され、90%超の変異ロドプシンタンパク質が分解を受けることは、タンパク質品質管理システムがロドプシンのホメオスタシスを維持することが困難であるという概念を支持する。それにもかかわらず、RhoP23H/+マウス網膜の杆体におけるこのロバストなタンパク質分解システムは、ロドプシンの分解の一定の高い負荷によって長期的に圧倒される。
初期又は中期のadRPにおいて誤って折り畳まれたロドプシンによって引き起こされる杆体死を防止するために、実験的取り組みは、ロドプシンの折り畳みの支持又はER結合タンパク質分解システムの促進に焦点を当ててきた。例えば、薬理学的又は化学的シャペロンは、ロドプシンの折りたたみ並びにビタミンA誘導体及び類似体の4-フェニル酪酸及びクルクミンを含むその細胞輸送を改善することが報告された。高用量のビタミンA補充は、RP患者の中で、ある程度のレベルの視覚的保護を示した。しかし、これらの患者の遺伝情報の欠如のために、ビタミンAの効力がロドプシンの薬理学的シャペロンとして11-シス-レチナールのレチナール供給の増加によるものであるかどうかは明らかではない。
誤って折り畳まれたロドプシンを減少させることは、杆体視細胞を救助するための有効な戦略として示されている。長期の網膜保護は、ロドプシンmRNAの変異対立遺伝子を特異的に切断する小リボザイムの遺伝子送達によって処置されたP23Hトランスジェニックラットで示されている。プロテアソームの調節サブユニットのトランスジェニック過剰発現による誤って折り畳まれたロドプシン分解を増強することも、ロドプシンP23Hノックインマウスにおいて網膜保護を示した。これらの研究から、誤って折り畳まれたロドプシンがRHO関連adRPにおける杆体視細胞を保存するのに十分であることが示唆される。しかし、誤って折り畳まれたロドプシンを除去し、インビボで網膜保護を示すのに有効な薬理学的ツールは利用可能でない。
本明細書に記載の実施形態は、それを必要とする対象において、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又は誤って折り畳まれた眼タンパク質によって引き起こされる遺伝性眼障害を治療する化合物及び方法に関する。誤って折り畳まれたオプシンタンパク質などの誤って折り畳まれた眼タンパク質を減少させることは、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる遺伝性眼疾患を有する対象において杆体視細胞を保存又は救助するための有効な戦略であり得ることが見出された。小分子ハイスループットスクリーニングアッセイを使用して、対応する野生型タンパク質に影響を与えることなく、誤って折り畳まれた変異眼タンパク質を選択的に減少させる化合物を特定した。これらの化合物は、誤って折り畳まれた眼タンパク質のクリアランスを促進するか、又は分解を加速させ、視覚機能を保存し、遺伝性眼疾患に関連する光受容体死を防止することが見出された。
したがって、いくつかの実施形態では、それを必要とする対象において誤って折り畳まれた眼タンパク質のクリアランスを促進し、かつ/又は誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる遺伝性眼障害を治療する方法は、
から選択される治療有効量の化合物、それらの医薬として許容し得る塩、互変異性体、若しくは溶媒和物、又はそれらの組み合わせを対象に投与することを含む。
いくつかの実施形態では、対象は、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、若しくはそれによって引き起こされる遺伝性眼障害になりやすいか、又はそれを有する。例えば、対象は、誤って折り畳まれたオプシンタンパク質に関連付けられるか、若しくはそれによって引き起こされる非症候性常染色体優性網膜色素変性症などの、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、若しくはそれによって引き起こされる非症候性網膜障害にかかりやすいか、又はそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、誤って折り畳まれた眼タンパク質は、誤って折り畳まれたオプシンである。誤って折り畳まれたオプシンタンパク質は、そのアミノ酸配列に変異を含み得る。例えば、誤って折り畳まれた変異オプシンタンパク質は、誤って折り畳まれた変異ロドプシンであり得、変異は、P23H、C110Y、D190N、T17M、P347S、又はP267Lのうちの少なくとも1つである。
いくつかの実施形態では、該化合物は、局所投与、全身投与、硝子体内注射、及び眼内送達のうちの少なくとも1つによって投与することができる。都合のよいことに、該化合物は、網膜変性の発達又は進行を停止させるために、非症候性常染色体優性網膜色素変性症の初期段階又は中間段階などの、眼障害の初期段階又は中間段階に対象に投与される。
いくつかの実施形態では、対象に投与される化合物の治療有効量は、誤って折り畳まれた眼タンパク質の分解を加速させ、眼タンパク質ホメオスタシスを改善し、視覚機能を改善若しくは保存し、光受容細胞死を阻害し、かつ/又は網膜構造を改善若しくは保存するのに有効な量である。
いくつかの実施形態では、視覚機能における改善又は保存には、明所視網膜電図(ERG)応答の改善又は保存が含まれる。他の実施形態では、網膜構造における改善又は保存は、外核層(ONL)の厚さの改善又は保存である。
詳細な説明
便宜上、本明細書、実施例、及び添付の特許請求の範囲で用いる特定の用語をここにまとめる。特に定義しない限り、本明細書で使用する全ての技術用語及び科学用語は、この出願が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。
便宜上、本明細書、実施例、及び添付の特許請求の範囲で用いる特定の用語をここにまとめる。特に定義しない限り、本明細書で使用する全ての技術用語及び科学用語は、この出願が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。
冠詞「1つ(a)」及び「1つ(an)」は、冠詞の文法目的で1つ又は2以上の(すなわち、少なくとも1つ)を指すために本明細書で使用する。例として、「要素」は、1つの要素又は2以上の要素を意味する。
用語「含む(comprise)」、「含む(comprising)」、「含む(include)」、「含む(including)」「有する(have)」、及び「有する(having)」は、包括的なオープンな意味で使用され、追加要素が含まれ得ることを意味する。本明細書で使用する用語「など」、「例えば」は、限定するものではなく、単なる例示目的のためのものである。「含む」及び「含むが、これらに限定されない」は、互換的に使用される。
本明細書で使用する用語「又は」は、文脈が特に明確に示さない限り、「及び/又は」を意味すると理解されるべきである。
本明細書で使用する用語「約」又は「おおよそ」は、基準の含量、レベル、値、数、頻度、割合、寸法、大きさ、量、重量又は長さに対して15%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%又は1%程度変化する含量、レベル、値、数、頻度、割合、寸法、大きさ、量、重量又は長さを指す。一実施形態では、用語「約」又は「おおよそ」は、基準の含量、レベル、値、数、頻度、割合、寸法、大きさ、量、重量又は長さについて、含量、レベル、値、数、頻度、割合、寸法、大きさ、量、重量又は長さ±15%、±10%、±9%、±8%、±7%、±6%、±5%、±4%、±3%、±2%、又は±1%の範囲を指す。
本願の化合物のいくつかの構造は、不斉(キラル)炭素又は硫黄原子を含むことに留意されたい。したがって、そのような不斉から生じる異性体は、特に示さない限り、本明細書に含まれることが理解されるべきである。そのような異性体は、古典的な分離技術及び立体化学的に制御された合成によって実質的に純粋な形態で取得できる。本出願の化合物は、立体異性体形態で存在してよく、そのため、個々の立体異性体として、又は混合物として生成できる。
用語「誘導体」は、共通のコア構造を有し、本明細書に記載の様々な基で置換される化合物を指す。
用語「バイオアイソスター」は、原子又は原子のグループを、別の広く類似する原子又は原子のグループと交換することから生じる化合物を指す。バイオアイソスター置換の目的は、親化合物に類似した生物学的性質を有する新しい化合物を作製することである。バイオアイソスター置換は、物理化学又は位相幾何学に基づき得る。カルボン酸のバイオアイソスターの例には、アシルスルホンイミド、テトラゾール、スルホン酸塩、及びホスホン酸塩が含まれる。例えば、Patani及びLaVoie,Chem.Rev.96,3147-3176(1996)を参照されたい。
語句「非経口投与」及び「非経口的に投与される」は、当技術分野で認められた用語であり、注射などの経腸及び局所投与以外の投与様式を含み、静脈内、筋肉内、胸膜内、血管内、心内膜、動脈内、髄腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、脊髄内及び胸骨内の注射並びに注入を含むが、これらに限定されない。
用語「治療する」は、当技術分野で認められており、対象における疾患、障害又は病態を抑制すること、例えば、その進行を遅らせること、及び疾患、障害又は病態を緩和すること、例えば、疾患、障害及び/又は病態の退行を引き起こすことを含む。疾患又は病態を治療することは、基礎をなす病態生理に影響を与えなくとも、特定の疾患又は病態の少なくとも1つの症状を寛解させることを含む。
用語「予防する」は、当技術分野で認められており、疾患、障害及び/又は病態になりやすいが、まだそれを有すると診断されていない対象において疾患、障害又は病態が生じるのを止めることを含む。疾患に関連する病態を予防することは、疾患が診断された後であるが病態が診断される前に病態が生じるのを止めることを含む。
用語「医薬組成物」は、対象への投与に適する形態で開示される化合物を含む製剤を指す。好ましい実施形態では、該医薬組成物は、バルク又は単位剤形にある。単位剤形は、例えば、カプセル、IVバッグ、錠剤、エアロゾル吸引器上の単一ポンプ、又はバイアルを含む様々な形態のいずれかである。組成物の単位用量中の有効成分(例えば、開示される化合物又はその塩の製剤)の量は、有効量であり、関与する特定の治療に従って変化する。患者の年齢及び病態に依存して投薬量を日常的に変更する必要が時々あることは、当業者なら理解するであろう。投薬量は投与経路にも依存する。経口、肺、直腸、非経口、経皮、皮下、静脈内、筋肉内、腹腔内、鼻腔内、吸入などを含む様々な経路が企図される。本明細書に記載の化合物の局所投与又は経皮投与のための剤形には、粉末、スプレー、軟膏、ペースト、クリーム、ローション、ゲル、液剤、パッチ、噴霧化合物、及び吸入剤が含まれる。好ましい実施形態では、活性化合物は、医薬として許容し得る担体と、必要とされる任意の保存剤、緩衝剤又は噴霧剤と無菌条件下で混合される。
用語「フラッシュ用量」は、剤形を迅速に分散させる化合物製剤を指す。
用語「即時放出」は、比較的短期間での、一般的には最長で約60分での、剤形からの化合物の放出として定義される。用語「改良放出」は、遅延放出、持続放出、及びパルス放出を含むと定義される。用語「パルス放出」は、剤形からの薬物の一連の放出として定義される。用語「徐放」又は「持続放出」は、長期間にわたる剤形からの化合物の連続放出として定義される。
語句「医薬として許容し得る」は、当技術分野で認められている。特定の実施形態では、この用語は、健康な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー反応、又は他の問題若しくは合併症を起こすことなく、ヒト及び動物の組織と接触させて使用するのに適し、妥当な利益/リスク比に見合う、組成物、ポリマー及び他の物質並びに/又は剤形を含む。
語句「医薬として許容し得る担体」は、当技術分野で認められており、例えば、1つの臓器若しくは身体の部分から、別の臓器若しくは身体の部分に任意の対象組成物を運搬又は輸送するのに関与する液体若しくは固体の充填剤、希釈剤、賦形剤、溶剤又は封入材料などの、医薬として許容し得る物質、組成物又はビヒクルを含む。各担体は、対象組成物の他の成分と適合し、患者に有害ではないという意味で「許容でき」なければならない。特定の実施形態では、医薬として許容し得る担体は発熱性ではない。医薬として許容し得る担体として役立ち得る物質のいくつかの例には、医薬製剤に使用される(1)ラクトース、グルコース及びスクロースなどの糖類;(2)コーンスターチ及びジャガイモデンプンなどのデンプン類;(3)カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース及び酢酸セルロースなどのセルロース及びその誘導体;(4)粉末トラガカント;(5)麦芽;(6)ゼラチン;(7)タルク;(8)ココアバター及び坐剤ワックスなどの賦形剤;(9)ピーナッツ油、綿実油、ヒマワリ油、ゴマ油、オリーブ油、コーン油及び大豆油などの油類;(10)プロピレングリコールなどのグリコール類;(11)グリセリン、ソルビトール、マンニトール及びポリエチレングリコールなどのポリオール類;(12)オレイン酸エチル及びラウリン酸エチルなどのエステル類;(13)寒天;(14)水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなどの緩衝剤;(15)アルギン酸;(16)発熱物質を含まない水;(17)等張食塩水;(18)リンゲル液;(19)エチルアルコール;(20)リン酸緩衝液;並びに(21)他の非毒性適合性物質が含まれる。
本出願の化合物は、さらに塩を形成することができる。これらの形態の全ても本明細書で企図される。
化合物の「医薬として許容し得る塩」は、医薬として許容され、親化合物の所望の薬理学的活性を有する塩を意味する。例えば、塩は酸付加塩であり得る。酸付加塩の一実施形態は塩酸塩である。医薬として許容し得る塩は、従来の化学的方法により塩基性又は酸性の部分を含む親化合物から合成することができる。一般に、そのような塩は、これらの化合物の遊離酸形態又は塩基形態と、化学量論量の適切な塩基又は酸とを、水若しくは有機溶媒若しくは2つの混合物中で反応させることによって調製することができ、一般に、エーテル、酢酸エチル、エタノール、イソプロパノール、又はアセトニトリルのような非水性媒体が好ましい。塩のリストは、レミントンの薬学(Remington’s Pharmaceutical Sciences)、第18版(Mack Publishing Company,1990)に見出される。
本明細書に記載の化合物は、エステル、例えば、医薬として許容し得るエステルとして調製することもできる。例えば、化合物中のカルボン酸官能基は、その対応するエステル、例えば、メチル、エチル、又は他のエステルに変換することができる。また、化合物中のアルコール基は、対応するエステル、例えば、アセテート、プロピオネート、又は他のエステルに変換することができる。
本明細書に記載の化合物は、プロドラッグ、例えば、医薬として許容し得るプロドラッグとして調製することもできる。用語「プロドラッグ(pro-drug)」及び「プロドラッグ(prodrug)」は、本明細書では同義的に使用され、活性のある親薬物をインビボで放出する任意の化合物を指す。プロドラッグは、薬剤の多くの望ましい品質(例えば、溶解性、バイオアベイラビリティ、製造など)を高めると知られているので、化合物をプロドラッグ形態で送達することができる。そのため、本明細書に記載の化合物は、特許請求される化合物のプロドラッグ、それを送達する方法及びそれを含む組成物を含むと意図される。「プロドラッグ」は、そのようなプロドラッグが対象に投与されるときに、活性のある親薬物をインビボで放出する任意の共有結合担体を含むと意図される。プロドラッグは、修飾物が日常的な操作又はインビボのいずれかで親化合物へと切断されるように、化合物中に存在する官能基を修飾することによって調製される。プロドラッグには、ヒドロキシ基、アミノ基、スルフヒドリル基、カルボキシ基、又はカルボニル基がインビボで開裂して、それぞれ遊離ヒドロキシル基、遊離アミノ基、遊離スルフヒドリル基、遊離カルボキシ基又は遊離カルボニル基を形成する任意の基に結合される化合物が含まれる。
プロドラッグの例には、エステル(例えば、アセテート、ジアルキルアミノアセテート、ホルメート、ホスフェート、スルフェート、及びベンゾエート誘導体)並びにヒドロキシ官能基のカルバメート(例えば、N,N-ジメチルアミノカルボニル)、カルボキシル官能基のエステル基(例えば、エチルエステル、モルホリノエタノールエステル)、N-アシル誘導体(例えば、N-アセチル)N-マンニッヒ塩基、シッフ塩基及びアミノ官能基のエナミノン、式Iの化合物中のケトン及びアルデヒド官能基のオキシム、アセタール、ケタール及びエノールエステルなどが含まれるが、これらに限定されず、Bundegaard,H.「プロドラッグの設計(Design of Prodrugs) p1-92,Elesevier,New York-Oxford(1985)を参照されたい。
さらに、本明細書に記載の化合物の塩は、水和若しくは非水和(無水)形態のいずれかで、又は他の溶媒分子との溶媒和物として存在し得る。水和物の非限定的な例には、一水和物、二水和物などが含まれる。溶媒和物の非限定的な例としては、エタノール溶媒和物、アセトン溶媒和物などが含まれる。
用語「溶媒和物」は、化学量論的又は非化学量論的な量の溶媒のいずれかを含む溶媒付加形態を意味する。いくつかの化合物は、結晶性固体状態にある固定モル比の溶媒分子を捕捉する傾向を有するため、溶媒和物を形成する。溶媒が水である場合、形成される溶媒和物は水和物であり、溶媒がアルコールである時は、形成される溶媒和物はアルコラートである。水和物は、水がH2Oとしてその分子状態を保持する物質の1つとの1以上の水分子の組み合わせによって形成され、そのような組み合わせは1以上の水和物を形成できる。
本明細書に記載の化合物、塩及びプロドラッグは、エノール及びイミン形態を含むいくつかの互変異性形態、ケト及びエナミン形態並びに幾何異性体並びにそれらの混合物で存在し得る。互変異性体は、溶液中で互変異性セットの混合物として存在する。固体形態では、通常1種類の互変異性体が優勢である。1種類の互変異性体が記載され得るが、本出願は、本発明の化合物の全ての互変異性体を含む。互変異性体は、平衡状態で存在し1種類の異性体形態から別の形態に容易に変換される2種以上の構造異性体のうちの1つである。この反応は、隣接する共役二重結合の交代を伴う水素原子の幾何学的な移動をもたらす。互変異性化が可能である溶液中では、互変異性体の化学平衡に達する。互変異性体の正確な比は、温度、溶媒、及びpHを含むいくつかの要因に依存する。互変異性化による相互変換可能な互変異性体の概念は、互変異性と呼ばれる。
用語「類似体」は、別の化合物と構造的に類似しているが、組成がわずかに異なる(1つの原子と異なる要素の原子との置換において又は特定の官能基の存在、又は1つの官能基と別の官能基との置換においてのように)化学化合物を指す。そのため、類似体は、基準化合物と機能及び外観が類似しているか又は同等であるが、構造又は起源が異なる化合物である。
本方法によって治療される「患者」、「対象」、又は「宿主」は、哺乳動物、魚、鳥、爬虫類、若しくは両生類などの、ヒト又は非ヒト動物のいずれかを意味し得る。そのため、本明細書に開示される方法の対象は、ヒト、非ヒト霊長類、馬、豚、ウサギ、犬、羊、山羊、牛、猫、モルモット又は齧歯類であり得る。この用語は、特定の年齢又は性別を示すものではない。そのため、雄又は雌に関係なく、成人及び新生児対象、並びに胎児が含まれることが意図される。一態様において、対象は哺乳動物である。患者は、疾患又は障害に罹患した対象を指す。
用語「予防的」又は「治療的」処置は、当技術分野で認められており、本組成物の1以上を宿主に投与することを含む。望ましくない病態の臨床徴候の前に投与される場合、処置は予防的であり、すなわち、それは望ましくない病態の発症に対して宿主を保護するが、望ましくない病態の徴候の後に投与される場合、処置は治療的である(すなわち、既存の望ましくない病態又はその副作用を軽減、寛解、又は安定化することが意図される)。
「減少する」又は「増加する」は、それぞれ少なくとも10%、25%、50%、75%、又は100%の負又は正の変化を意味する。
用語「治療剤」、「薬物」、「医薬品」及び「生理活性物質」は、当技術分野で認められており、疾患若しくは病態を治療するために患者又は対象において局所的又は全身的に作用する生物学的、生理学的、又は薬理学的活性のある物質である分子及び他の薬剤を含む。この用語は、限定されないが、その医薬として許容し得る塩及びプロドラッグを含む。そのような薬剤は、酸性、塩基性、又は塩であり得、それらは中性分子、極性分子、又は水素結合可能な分子錯体であり得、それらは、患者又は対象に投与される場合、生物学的に活性化されるエーテル、エステル、及びアミドなどの形態のプロドラッグであり得る。
語句「治療有効量」又は「医薬として有効な量」は、当技術分野で認められている用語である。特定の実施形態では、この用語は、何らかの医療処置に適用可能な合理的利益/リスク比でいくつかの所望の効果をもたらす、治療剤の量を指す。特定の実施形態では、この用語は、特定の治療レジメンの標的を除去、低減若しくは維持するのに必要な又は十分なその量を指す。有効量は、治療される疾患若しくは病態、投与される特定の標的化構築物、対象の大きさ又は疾患若しくは病態の重篤度などの要因に応じて変化し得る。当業者は、過度の実験を必要とせずに特定の化合物の有効量を経験的に決定し得る。特定の実施形態では、インビボ使用のための治療有効量の治療剤は、ポリマーの化学的かつ物理的特性に部分的に依存する、ポリマーマトリックスからの薬剤の放出速度;薬剤のアイデンティティ;投与様式及び投与方法;並びに薬剤に加えてポリマーマトリックスに組み込まれる任意の他の材料を含む、多数の要因に依存する可能性がある。
本明細書全体を通して、組成物が、特定の成分を有する、含む(including)、又は含む(comprising)と記載される場合、組成物はまた、列挙される成分から本質的になる、又は列挙される成分からなることが企図される。同様に、方法又はプロセスが、特定のプロセス工程を有する、含む(including)、又は含む(comprising)と記載される場合、このプロセスはまた、列挙されるプロセス工程から本質的になる、又は列挙されるプロセス工程からなる。さらに、工程の順番又は特定の行動を実行するための順番は、本明細書に記載の組成物及び方法が操作可能の状態である限り重要ではないと理解されるべきである。さらに、2以上の工程又は行動を同時に行うことができる。
用語「小分子」は、当技術分野で認められている用語である。特定の実施形態では、この用語は、約2000amu未満、又は約1000amu未満、さらに約500amu未満の分子量を有する分子を指す。
用語「野生型」又は「野生型立体構造」は、タンパク質機能が野生型タンパク質機能に対して改変されるように、タンパク質の立体構造又は形状に影響するアミノ酸配列中に存在する変異を含まないタンパク質の3次元構造又は形状を指す。オプシンについては、野生型立体構造は、P23H(P23Hオプシン)と命名された変異などの、ミスフォールディングを引き起こす変異を含まない立体構造である(例えば、Genbank登録番号NM000539及びNP000530参照)(プロリンがN末端から始まる残基23でヒスチジンに置換されていることを意味する)。「野生型立体構造」のオプシンは、レチノイド結合、視覚サイクル機能、及び光受容体膜への挿入を含むが、これらに限定されないオプシンの生物学的機能が可能である。
「誤って折り畳まれたオプシンタンパク質」とは、誤って折り畳まれたタンパク質が、野生型タンパク質に関連付けられる1以上の生物学的活性を欠いているように野生型タンパク質の立体構造と三次構造が異なるタンパク質を意味する。
「P23Hロドプシン」は、P23Hロドプシンの任意の核酸又はタンパク質を意味する。
特に示さない限り、本明細書で使用する全ての割合及び比率は、重量基準である。
本明細書に記載の実施形態は、それを必要とする対象において、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる遺伝性眼障害を治療する化合物及び方法に関する。誤って折り畳まれたオプシンタンパク質などの、誤って折り畳まれた眼タンパク質を減少させることは、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる遺伝性の眼障害を有する対象において杆体視細胞を保存又は救助するための有効な戦略であり得ることが見出された。小分子ハイスループットスクリーニングアッセイを使用して、対応する野生型タンパク質に影響を与えることなく、誤って折り畳まれた変異眼タンパク質を選択的に減少させる化合物を特定した。これらの化合物は、誤って折り畳まれた眼タンパク質のクリアランスを促進するか、又は分解を加速させ、視覚機能を保存し、かつ遺伝性眼障害に関連する光受容体死を防止することが見出された。
いくつかの実施形態では、それを必要とする対象における誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる遺伝性眼障害を治療する方法は、それを必要とする対象における誤って折り畳まれた眼タンパク質のクリアランスを促進する治療有効量の化合物を該対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、細胞中の対応する野生型眼タンパク質ではなく、誤って折り畳まれた変異眼タンパク質(例えば、誤って折り畳まれた変異オプシン又はロドプシン)の分解を促進した化合物が選択され得る。本明細書に記載のハイスループットスクリーニングアッセイを用いて、細胞中の対応する野生型眼タンパク質ではなく、誤って折り畳まれた変異眼タンパク質(例えば、誤って折り畳まれた変異オプシン又はロドプシン)の分解を促進したと特定された化合物、それらの医薬として許容し得る塩、互変異性体、若しくは溶媒和物、又はそれらの組み合わせは、
から選択される。
いくつかの実施形態では、遺伝性眼障害は、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる非症候性網膜障害である。例えば、非症候性網膜障害は、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる非症候性常染色体優性網膜色素変性症(adRP)であり得る。
都合の良いことに、該化合物は、
又は、その医薬として許容し得る塩、互変異性体、若しくは溶媒和物であり得る。この式を有する化合物は、メトトレキサートとも呼ばれる。メトトレキサートは、N-[4-[(2,4-ジアミノ-6-プテリジニル)メチル]メチルアミノ]ベンゾイル]-L-グルタミン酸としても知られている非天然の化学物質である。
特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物は、対象における網膜色素変性症(RP)又は常染色体優性網膜色素変性症(AdRP)の治療、予防、改善、又はその進行を遅延させる方法で使用することができる。本方法は、本明細書に記載の化合物を対象に投与することによって、対象における網膜色素変性症(RP)又は常染色体優性網膜色素変性症(AdRP)の治療、予防、改善、又はその進行を遅延させることを含むことができる。
他の実施形態では、本明細書に記載の化合物は、P23Hロドプシン変異対立遺伝子を有するか、又は常染色体優性網膜色素変性症(AdRP)などの網膜色素変性症(RP)を有する対象における視覚機能、視野、光受容細胞機能、ERG応答、若しくは視力を改善又は保存する方法で使用することができる。本方法は、本明細書に記載の化合物を対象に投与することを含むことができる。特定の実施形態では、P23Hロドプシン変異対立遺伝子を有するか、又は常染色体優性網膜色素変性症(AdRP)などの網膜色素変性症(RP)を有する対象における光受容細胞喪失及び/又は網膜外核層(ONL)の劣化を阻害、防止、又はその進行を遅延させる方法は、本明細書に記載の化合物を該対象に投与することを含む。
いくつかの実施形態では、誤って折り畳まれた眼タンパク質は、誤って折り畳まれたオプシンである。本方法は、インビトロ又はインビボで実施することができ、オプシンタンパク質は、緩衝液などの培地中に存在するか、又は細胞内に含まれていてもよい。このような細胞は、一般に、ヒト細胞などの哺乳動物細胞であり、選択した生化学的又は生理学的特性を有する組換え細胞又は細胞株の一部であってもよい。一実施形態では、細胞は、網膜細胞などの眼細胞である。細胞は、脊椎動物又は哺乳動物(例えば、ヒト)の光受容細胞(例えば、杆体細胞、錐体細胞)であり得る。一実施形態では、杆体細胞は、ヒトの眼などの哺乳動物の眼に存在する。
具体的な実施形態では、誤って折り畳まれたオプシンタンパク質は、そのアミノ酸配列に変異を含むことができる。例えば、誤って折り畳まれた変異オプシンタンパク質は、誤って折り畳まれた変異ロドプシンであり得、変異は、P23H、C110Y、D190N、T17M、P347S、又はP267Lのうちの少なくとも1つである。
本明細書に記載の他の実施形態は、哺乳動物の眼における光受容体機能の喪失を改善する方法であって、変異オプシンタンパク質のクリアランスを促進する本明細書に記載の治療有効量の化合物を、11-シス-レチナールに対する親和性が低下した変異オプシンタンパク質に苦しむ哺乳動物に投与することによって、前記哺乳動物の眼における光受容体機能の喪失を改善する方法に関する。一実施形態では、接触は、本明細書に記載の化合物を、光受容体機能の低下に苦しむ哺乳動物に投与することによって生じる。
いくつかの実施形態では、このような光受容体機能の喪失は、部分的な喪失又は完全な喪失であり得、部分的な喪失は、1%の喪失~99%の喪失の間の任意の程度であり得る。加えて、このような喪失は、変異がP23H変異であるような、オプシンのミスフォールディングを引き起こす変異の存在によるものであり得る。
別の実施形態では、オプシン結合剤を投与して、誤って折り畳まれたオプシンタンパク質の誤った局在化に関連する眼の病態を改善することができる。一実施形態では、誤って局在化したオプシンタンパク質を有する対象に本明細書に記載の化合物を投与すると、誤って局在化したオプシンタンパク質のクリアランスが促進される。したがって、本明細書に記載の方法及び化合物は、誤って折り畳まれたオプシンタンパク質と関連付けられるオプシンの誤った局在化に関連する眼の病態を予防又は治療するのに有用である。
任意に、本明細書に記載の化合物は、別の治療剤と共に投与することができる。例えば、本明細書に記載の化合物は、合成レチノイドと組み合わせて使用することができ(例えば、米国特許公開第2004-0242704号に開示されている)、任意に別の活性化合物(例えば、本明細書で説明される)と組み合わせて使用することができる。さらに別の実施形態では、本明細書に記載の化合物は、変異P23Hオプシンタンパク質のクリアランスを促進することができる任意の他の薬剤と組み合わせて投与することができる。
本明細書に記載の方法で使用される化合物は、例えば、眼、非経口、皮下、静脈内、関節内、髄腔内、筋肉内、腹腔内、及び皮内注射などの局所的及び全身的送達方法を含むか、又は硝子体内注射、眼内注射又は眼周囲注射による標準的送達方法を用いて対象に投与することができる。特定の対象に使用される特定の手法及び投与量は、例えば、対象の一般的な健康、体重及び年齢を含むいくつかの要因に依存する。これらなどの要因に基づいて、医療従事者は治療への適切な手法を選択することができる。
本明細書で使用する用語「治療する」又は「治療」は、症状の重篤度及び/又は頻度の低下、症状及び/又は根本原因の除去、症状の発生及び/又はそれらの根本原因の予防、並びに疾患の改善(improvement)又は改善(remediation)を指す。このような治療は、必ずしも完全に疾患を改善する必要はない。例えば、本明細書に記載の化合物の投与による網膜変性を有する対象の治療は、疾患の抑制又は疾患の退行を引き起こすことを包含することができる。さらに、このような治療は、当業者に公知の網膜変性のための他の伝統的な治療と組み合わせて使用することができる。
本明細書に記載の方法による治療は、眼障害の状態に依存して、対象において変更、停止、又は再び開始することができる。治療は、当業者が適切であると決定した間隔で実施することができる。例えば、投与は、1日に1回、2回、3回、又は4回実施することができる。いくつかの実施形態では、網膜変性の誘発が生じた後に、該化合物を投与することができる。
治療方法は、治療有効量の本明細書に記載の化合物を対象に投与することを含むことができる。例えば、本明細書に記載の方法に使用するための医薬組成物は、対象の体重1kg当たり0.01~1,000mg/kgの範囲、より好ましくは患者の体重1kg当たり約10~100mgの範囲で投与量中に治療有効量の化合物又はその塩を有することができる。
上記(及びその他)の投与様式で使用するための医薬化合物の製剤は、当技術分野において公知であり、例えば、レミントンの薬学(Remington’s Pharmaceutical Sciences)(第18版)、A.Gennaro(編),1990,Mack Publishing Company,Easton,Pa.に記載されている(例えば、M.J.Rathbone(編),経口粘膜薬物送達(Oral Mucosal Drug Delivery、Drugs and the Pharmaceutical Sciences Series,Marcel Dekker,Inc.,N.Y.,U.S.A.,1996;M.J.Rathboneら(編),改変放出薬物送達技術(Modified-Release Drug Delivery Technology), Drugs and the Pharmaceutical Sciences Series,Marcel Dekker,Inc.,N.Y.,U.S.A.,2003;Ghoshら(編),口腔への薬物送達(Drug Delivery to the Oral Cavity), Drugs and the Pharmaceutical Sciences Series,Marcel Dekker,Inc.,N.Y.,U.S.A.,2005;及びMathiowitzら(編),生体接着薬物送達システム(Bioadhesive Drug Delivery Systems),Drugs and the Pharmaceutical Sciences Series,Marcel Dekker,Inc.,N.Y.,U.S.A.,1999も参照されたい)。本発明の化合物は、医薬として許容し得る非毒性賦形剤及び担体を含む医薬組成物に製剤化することができる。賦形剤は、有効成分又は複数の有効成分以外に医薬製剤中に存在する全ての成分である。適切な賦形剤及び担体は、安全で効果的であると考えられ、望ましくない生物学的副作用、又は他の薬物との望ましくない相互作用を引き起こさずに個体に投与され得る物質で構成することができる。適切な賦形剤及び担体は、薬剤のバイオアベイラビリティ及び性能に影響を及ぼさない物質で構成されるものである。本明細書で一般的に使用されるように、「賦形剤」には、界面活性剤、乳化剤、乳化安定剤、皮膚軟化剤、緩衝剤、溶媒、染料、香味剤、結合剤、充填剤、滑剤、及び防腐剤が含まれるが、これらに限定されない。適切な賦形剤には、「医薬賦形剤のハンドブック(Handbook of Pharmaceutical Excipients)」、第4版、Pharmaceutical Press,2003などの当技術分野で一般に知られているものが含まれる。
医薬組成物は、対象への投与に悪影響を与えない限り、必要に応じて、血漿タンパク質、プロテアーゼ、及び他の生物学的物質を含む、1以上の追加のタンパク質を任意にさらに含んでよい。適切なタンパク質又は生体物質は、公知の、当業者に利用できる精製方法のいずれかによってヒト又は哺乳動物の血漿から;標準的な組換えDNA技術に従って導入されたヒト又は哺乳動物の血漿タンパク質を発現する遺伝子を含む上清、抽出物、又は組換え組織培養物の溶解物、ウイルス、酵母、細菌などから;又は流体(例えば、血液、ミルク、リンパ、尿など)若しくは標準的なトランスジェニック技術に従って導入されたヒト血漿タンパク質を発現する遺伝子を含むトランスジェニック動物から取得され得る。
医薬組成物は、約5.0~約8.0の範囲などの生理学的pHを反映する所定のレベルで製剤のpHを維持するための1以上のpH緩衝化合物を含むことができる。水性液体製剤に使用されるpH緩衝化合物は、ヒスチジンなどのアミノ酸若しくはアミノ酸の混合物又はヒスチジンとグリシンなどのアミノ酸の混合物であり得る。あるいは、pH緩衝化合物は、好ましくは、約5.0~約8.0の範囲などの所定のレベルで製剤のpHを維持するが、カルシウムイオンをキレートしない薬剤である。このようなpH緩衝化合物の例示的な例には、イミダゾール及び酢酸イオンが含まれるが、これらに限定されない。pH緩衝化合物は、製剤のpHを所定のレベルで維持するのに適する任意の量で存在し得る。
医薬組成物はまた、1以上の浸透圧調節剤、すなわち、製剤の浸透性(例えば、張力性、浸透圧(osmolality)、及び/又は浸透圧(osmotic pressure))を、レシピエント個体の血流及び血液細胞に許容し得るレベルに調節する化合物を含むことができる。浸透圧調節剤は、カルシウムイオンをキレートしない薬剤であり得る。浸透圧調節剤は、製剤の浸透性を調節する当業者に知られているか又は利用可能である任意の化合物であり得る。当業者は、本発明の製剤に使用するための所定の浸透圧調節剤の適性を経験的に決定し得る。適切な種類の浸透圧調節剤の代表的な例には、塩化ナトリウム及び酢酸ナトリウムなどの塩類;スクロース、デキストロース、及びマンニトールなどの糖類;グリシンなどのアミノ酸類;並びにこれらの薬剤及び/又はこれらの種類の薬剤の1以上の混合物が含まれるが、これらに限定されない。浸透圧調節剤(複数可)は、製剤の浸透性を調節するのに十分な任意の濃度で存在し得る。
本明細書に記載の化合物を含む組成物は、カルシウムイオン、マグネシウムイオン及び/又はマンガンイオンなどの多価金属イオンを含むことができる。組成物を安定化させ、レシピエント個体に悪影響を及ぼさない任意の多価金属イオンが使用され得る。当業者は、これらの2つの基準に基づいて、経験的に適切な金属イオンを決定することができ、そのような金属イオンの適切な供給源は公知であり、無機塩及び有機塩を含む。
他の送達系は、時間放出、遅延放出又は持続放出送達システムを含むことができる。そのようなシステムは、組成物の繰り返し投与を避けることができ、対象及び医師の利便性を高めることができる。多くの種類の放出送達システムが利用可能であり、当業者に公知である。それらには、ポリラクチドなどのポリマー塩基系(米国特許第3,773,919号;欧州特許58,481)、ポリ(ラクチド-グリコリド)、コポリオキサレートポリカプロラクトン、ポリエステルアミド、ポリオルトエステル、ポリ-D-(-)-3-ヒドロキシ酪酸(欧州特許133,988)などのポリヒドロキシ酪酸、L-グルタミン酸とガンマ-エチル-L-グルタメートのコポリマー(Sidman,K R.ら,Biopolymers 22:547-556)、ポリ(2-ヒドロキシエチルメタクリレート)又はエチレンビニルアセテート(Langer,ftら,J.Biomed.Mater.Res.15:267-277;Langer,B.Chem.Tech.12:98-105)、及びポリ無水物が含まれる。
徐放組成物の他の例には、成形品、例えば、フィルム、又はマイクロカプセルの形態の半透過性ポリマーマトリックスが含まれる。送達システムには、コレステロール、コレステロールエステル及び脂肪酸などのステロール類又はモノ-、ジ-及びトリ-グリセリドなどの中性脂肪を含む脂質類;生物学的に誘導される生体再吸収性ヒドロゲルなどのヒドロゲル放出システム(すなわち、キチンヒドロゲル又はキトサンヒドロゲル);シラスティック系;ペプチドベース系;ワックスコーティング;慣用の結合剤及び賦形剤を用いた圧縮錠剤;部分的に微細化したインプラントなどである非ポリマー系も含まれる。具体的な例には、(a)薬剤が、13.5.米国特許第4,452,775号、同第4,667,014号、同第4,748,034号及び同第5,239,660号に記載のものなどのマトリックス内の形態に含まれている浸食系、並びに(b)有効成分が、米国特許第3,832,253号及び同第3,854,480号に記載のものなどのポリマーから制御された速度で浸透する拡散システムが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書に記載の化合物を含む組成物は、網膜色素変性症などの眼疾患又は病態の治療に特に適している。
1つの手法では、該組成物は、眼の硝子体への直接注入に適する眼装置を通して投与することができる。該組成物は、例えば、米国特許第5,672,659号及び第5,595,760号に記載のものなどの徐放性組成物中に提供されてもよい。このような装置は、有害な局所的及び全身的副作用の危険性なく、眼を治療するための様々な組成物の持続制御放出を提供することが見出されている。眼への送達方法の目的は、インプラントの持続時間を延長するために、眼内デバイス又はインプラントに含まれる薬物の量を最大にしながら、その大きさを最小にすることである。例えば、米国特許第5,378,475号、同第6,375,972号、及び同第6,756,058号及び米国特許公開第20050096290号及び同第200501269448号を参照されたい。このようなインプラントは、生分解性及び/又は生体適合性インプラントであり得るか、又は非生分解性インプラントであり得る。
生分解性眼インプラントは、例えば、米国特許公開第20050048099号に記載されている。インプラントは、活性剤に対して透過性又は不透過性であり得、前部又は後部チャンバーなどの眼のチャンバー内に挿入されるか、又は強膜、経脈絡膜腔、若しくは硝子体の外側の無血管領域内に移植され得る。あるいは、本発明の組成物のデポーとして作用するコンタクトレンズが、薬物送達のために使用され得る。
いくつかの実施形態では、インプラントは、治療の所望の部位、例えば、眼内空間及び眼の斑への薬物の経強膜拡散を可能にするために、強膜上などの無血管領域上に配置され得る。さらに、経強膜拡散の部位は、好ましくは、斑に近接している。本発明の組成物の送達のためのインプラントの例には、全てが参照により本明細書に組み込まれる米国特許第3,416,530号、同第3,828,777号、同第4,014,335号、同第4,300,557号、同第4,327,725号、同第4,853,224号、同第4,946,450号、同第4,997,652号、同第5,147,647号、同第164,188号、同第5,178,635号、同第5,300,114号、同第5,322,691号、同第5,403,901号、同第5,443,505号、同第5,466,466号、同第5,476,511号、同第5,516,522号、同第5,632,984号、同第5,679,666号、同第5,710,165号、同第5,725,493号、同第5,743,274号、同第5,766,242号、同第5,766,619号、同第5,770,592号、同第5,773,019号、同第5,824,072号、同第5,824,073号、同第5,830,173号、同第5,836,935号、同第5,869,079号、同第5,902,598号、同第5,904,144号、同第5,916,584号、同第6,001,386号、同第6,074,661号、同第6,110,485号、同第6,126,687号、同第6,146.366号、同第6,251,090号、及び同第6,299,895号、並びにWO01/30323及びWO01/28474に記載の装置を含むが、これらに限定されない。
眼送達のための他の手法には、本明細書に記載の化合物を網膜色素上皮細胞及び/又はBruch膜に標的化するリポソームの使用が含まれる。例えば、該化合物は、上記の方法でリポソームと複合化され、この化合物/リポソーム複合体は、該化合物を所望の眼組織又は細胞に向かわせるために、網膜色素変性症などの眼障害を有する患者に静脈内注射を用いて注射され得る。網膜色素上皮細胞又はBruch膜の近傍にリポソーム複合体を直接注入することはまた、網膜色素変性症などのいくつかの眼障害形態に複合体の標的化を提供することができる。具体的な実施形態では、該化合物は、眼内持続送達(VITRASERT又はENVISION)を介して投与される。具体的な実施形態では、該化合物は、後部サブテノン注射によって送達される。別の具体的な実施形態では、本発明の組成物を含むマイクロエマルジョン粒子は、Bruch膜、網膜色素上皮細胞、又はその両方から脂質をとるために眼組織に送達される。
本明細書に記載の化合物を含む組成物は、局所的に送達され得る。局所送達のために、該組成物は、眼送達のために承認される任意の医薬として許容し得る賦形剤に提供される。好ましくは、該組成物は、点眼形態で眼の表面に送達される。いくつかの用途では、該組成物の送達は、角膜を通して眼の内部への化合物の拡散に依存する。
一実施例では、本明細書に記載の化合物は、対象の眼に投与することができる眼科用製剤中に提供することができる。眼科用製剤は、医薬として許容し得る溶液、懸濁液又は軟膏中に化合物を含むことができる。濃度のいくつかの変化は、使用される特定の化合物、治療される対象の状態などに依存して必然的に起こり、治療に責任のある人が、個々の対象について最も適する濃度を決定する。眼科用製剤は、所望であれば、追加の成分、例えば、防腐剤、緩衝剤、張度剤、浸透圧剤、酸化防止剤、安定剤、非イオン性湿潤剤又は清澄剤、及び増粘剤を含む滅菌水溶液の形態であり得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法で使用される組成物は、メトトレキサートを含むことができる。メトトレキサートを含む組成物は、繰り返される注射用に製剤化することができる。
いくつかの実施形態では、メトトレキサートは持続放出用に製剤化される。多くのメトトレキサートの徐放性製剤は、当技術分野で公知であり、脂質封入製剤などの生分解性インプラント、例えば、Bonettiら,Cancer Chemother Pharmacol 33:303-306(1994)に記載の「デポー/メトトレキサート(Depo/Methotrexate)及びChatelutら,J Pharm Sci.1994 March;83(3):429-32;例えば、WO2011143484に記載のメトトレキサート(MTX)の多小胞リポソーム(MVL)製剤;例えば、Vijayaragavanら,Int J Pharm Res 3(1):39-44(2011)に記載のナノ又はマイクロ粒子、例えば、α-ラクトアルブミン微粒子又はTaheriら,J Nanomaterials 2011(dx.doi.org/10.1155/2011/768201)に記載のコンジュゲートメトトレキサートーヒト血清アルブミンのナノ粒子;ポリイオン複合体(PIC)ミセル;ヒドロキシプロピルメチルセルロース(HPMC)、カルボキシメチルセルロース(CMC)及びポリアクリル酸(PAA)誘導体などの生体接着性ポリマー、並びにヒアルロン酸(HA)、例えば、可溶性ヒドロキシプロピルセルロースの眼用のインサートであるLacrisert(Aton Pharma)を含むが、これに限定されない。
あるいは、又は加えて、徐放は、例えば、Palakurthiら,Current Eye Research,35(12):1105-1115(2010)に記載の、若しくはRetisert(Bausch & Lomb)、Ozurdex(Allergan)と類似の硝子体内インプラントなどの徐放性デバイス;又は例えば、Iluvien(Alimera)若しくはVitrasert(Bausch & Lomb)インプラントと類似の非生分解性インプラント;I-vationプラットフォーム(SurModics Inc.)を使用して達成され得る。Leeら,Pharm Res.27(10):2043-53(2010);Haghjouら,J Ophthalmic Vis Res.6(4):317-329(2011);Kimら,Invest.Ophthalmol.Vis.Sci.45(8):2722-2731(2004);並びにVelez及びWhitcup,Br J Ophthalmol 83:1225-1229(1999)も参照されたい。
上記の本明細書に記載の化合物を含む組成物は、治療有効量又は有効量で投与することができる。用語「治療有効量」は、例えば、網膜変性関連疾患又は障害(例えば、網膜色素変性症)を有する対象の治療に有効な量(用量)を指す。治療有効量は、様式又は投与、治療される特定の状態及び所望の結果に依存する。それはまた、対象の病態のステージ、年齢及び身体状態、同時治療の性質、もしあれば、医療従事者に周知の同様の要因に依存し得る。治療用途では、医学的に望ましい結果を達成するのに十分な量である。
網膜色素変性症に罹患している対象に関して、有効量は、細胞中の誤って折り畳まれたオプシンタンパク質のクリアランスを促進するのに十分である。誤って折り畳まれたタンパク質に関連する疾患又は障害を有する対象に関して、有効量は、網膜色素変性症などの病理に関連付けられる症状を安定化、緩慢、又は低下させるのに十分な量である。
いくつかの実施形態では、対象に投与される治療有効量の化合物は、誤って折り畳まれた眼タンパク質の分解を加速させ、眼タンパク質ホメオスタシスを改善し、視覚機能を改善若しくは保存し、光受容細胞死を阻害し、かつ/又は網膜構造を改善若しくは保存するのに有効な量である。
いくつかの実施形態では、視覚機能における改善又は保存には、明順応網膜電図(ERG)応答の改善又は保存が含まれる。他の実施形態では、網膜構造における改善又は保存は、外核層(ONL)の厚さの改善又は保存である。
一般に、本発明の化合物の用量は、1日当たり約0.01mg/kg~1日当たり約1000mg/kg(例えば、0.01、0.05、0.1、0.25、0.5、1.0、5、10、15、20、25)である。約50~約2000mg/kgの範囲の用量(例えば、50、100、200、250、500、750、1000、1250、1500、1750、2000)が適していることが予想される。より低い用量は、静脈内投与などの特定の投与形態から生じる。対象における応答が適用される初期用量で不十分である場合には、より高い用量(又は異なる、より局所的な送達経路によって効果的により高い用量)が、患者の慣用が許容する程度まで使用され得る。本明細書に記載の化合物を含む組成物の適切な全身レベルを達成するために、1日当たり複数回の用量が企図される。
当業者は、動物モデルと比較してヒトの投与量を修正することが当技術分野で日常的であることを認識しているので、ヒトの投与量は、マウスで使用される化合物の量から推定することによって、最初に決定することができる。特定の実施形態では、投与量は、約10~1000mg(例えば、約20mg~1,000mg、30mg~1,000mg、40mg~1,000mg、50mg~1,000mg、60mg~1,000mg、70mg~1,000mg、80mg~1,000mg、90mg~1,000mg、約10~900mg、10~800mg、10~700mg、10~600mg、10~500mg、100~1000mg、100~900mg、100~800mg、100~700mg、100~600mg、100~500mg、100~400mg、100~300mg、200~1000mg、200~900mg、200~800mg、200~700mg、200~600mg、200~500mg、200~400mg、300~1000mg、300~900mg、300~800mg、300~700mg、300~600mg、300~500mg、400mg~1,000mg、500mg~1,000mg、100mg~900mg、200mg~800mg、300mg~700mg、400mg~700mg、及び500mg~600mg)の範囲の量で変化し得ることが想定される。いくつかの実施形態では、該化合物は、約10mg、50mg、100mg、150mg、200mg、250mg、300mg、350mg、400mg、450mg、500mg、550mg、600mg、650mg、700mg、750mg、800mg以上の量で存在する。いくつかの実施形態では、15-PGDH阻害剤は、約1000mg、950mg、900mg、850mg、800mg、750mg、700mg、650mg、600mg、550mg、500mg、450mg、400mg、350mg、300mg、250mg、200mg、150mg、又は100mg以下の量で存在する。
他の実施形態では、化合物の治療有効投与量は、例えば、約0.001mg/kg体重~500mg/kg体重、例えば、約0.001mg/kg体重~400mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~300mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~200mg/kg体重、約0.001mg/kg~100mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~90mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~80mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~70mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~60mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~50mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~40mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~30mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~25mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~20mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~15mg/kg体重、約0.001mg/kg体重~10mg/kg体重であり得る。
さらに他の実施形態では、治療有効投与量は、例えば、約0.0001mg/kg体重~0.1mg/kg体重、例えば、約0.0001mg/kg体重~0.09mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.08mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.07mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.06mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.05mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.04mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.03mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.02mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.019mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.018mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.017mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.016mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.015mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.014mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.013mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.012mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.011mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.01mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.009mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.008mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.007mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.006mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.005mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.004mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.003mg/kg体重、約0.0001mg/kg体重~0.002mg/kg体重であり得る。いくつかの実施形態では、治療有効用量は、0.0001mg/kg体重、0.0002mg/kg体重、0.0003mg/kg体重、0.0004mg/kg重量、0.0005mg/kg重量、0.0006mg/kg重量、0.0007mg/kg重量、0.0008mg/kg重量、0.0009mg/kg重量、0.001mg/kg重量、0.002mg/kg重量、0.003mg/kg体重、0.004mg/kg体重、0.005mg/kg体重、0.006mg/kg体重、0.007mg/kg体重、0.008mg/kg体重、0.009mg/kg体重、0.01mg/kg体重、0.02mg/kg体重、0.03mg/kg体重、0.04mg/kg体重、0.05mg/kg体重、0.06mg/kg体重、0.07mg/kg体重、0.08mg/kg体重、0.09mg/kg体重、又は0.1mg/kg体重であり得る。特定の個体の有効用量は、個体の必要性に応じて経時的に変化(例えば、増加又は減少)させることができる。
いくつかの実施形態では、治療有効投与量は、10μg/kg/日、50μg/kg/日、100μg/kg/日、250μg/kg/日、500μg/kg/日、1000μg/kg/日又はそれ以上の投与量であり得る。様々な実施形態では、15-PGDH阻害剤又はその医薬塩の量は、0.01μg/kg~10μg/kg、0.1μg/kg~5μg/kg、0.1μg/kg~1000μg/kg、0.1μg/kg~900μg/kg、0.1μg/kg~900μg/kg、0.1μg/kg~800μg/kg、0.1μg/kg~700μg/kg、0.1μg/kg~600μg/kg、0.1μg/kg~500μg/kg、又は0.1μg/kg~400μg/kgの投与量を患者に提供するのに十分である。
一態様では、有効量の化合物を含む医薬組成物は、少なくとも2回投与される。別の態様では、医薬組成物は少なくとも5回投与される。さらに別の態様では、医薬組成物は少なくとも10回投与される。当業者は、治療されている特定の疾患又は障害に基づいて組成物を投与する頻度、又は対象が従来の治療にどのように応答したかを判断することができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の化合物は、非症候性常染色体優性網膜色素変性症の初期段階又は中間段階で対象に投与することができる。網膜色素変性疾患の過程は、3段階、すなわち初期段階、中間段階、及び最終段階に都合よく分割することができる。
初期段階では、夜間の失明が主症状である。それは、人生の最初の年から存在し得るか、又は20年間又はそれ以降に出現し得る。この段階では、薄暗い光に周辺視野欠陥が存在する可能性がある。しかし、これらの欠陥は存在しないか、又は日中は最小であるため、患者は正常な生活習慣を有し、疾患は安定であると思われ得る。特に家族の病歴がない場合(症例の約半分)、この段階で診断を確立することは困難である。視力は正常であるか、又は亜正常である。骨片状色素沈着物が存在しないか、又は稀であるので、眼底検査は正常であるように思われ得る。さらに、網膜細動脈の減衰は適度であり、視神経円板は正常である。網膜電図(ERG)は重要な試験である。ほとんどの場合、それは、暗順応条件において優勢であるb波の振幅が減少していることを示す。しかし、ERGは、網膜が部分的に影響を受けた場合にのみ、最大ERG振幅が減少するにもかかわらず、正常であるように思われ得る。
中間段階では、臨床像が完成する。夜間の失明は明らかであり、夜間の運転が困難であり、夕方及び暗い階段で歩行することが困難である。患者は、常同的な状況を通して日中の光の状態で周辺視野内の喪失を認識するようになる。運転中には、歩行者又は側方から近づく車に気づかず、握手の際に手を握れず、頻繁に様々な物体にぶつかる。その結果、患者は、不慣れな場所での夜間の運転及び循環を回避することによって自分自身を適合させる。淡い色(特に青色及び黄色の色相)に対する色弱が存在する場合が多い。加えて、患者は、特に、拡散光(白色の曇った天候)の下では明順応性になる。このことは、不十分な光と明るすぎる光との間の狭い窓で、読むことが困難になる。読むことができないのは、黄斑の関与(黄斑浮腫又は軽度の中心窩黄斑の萎縮)及び皮質下後方の白内障のせいで、部分的に視力が低下するためである。眼底検査によって、網膜の萎縮と共に、中央周辺部に骨片状色素沈着物の存在が明らかになっている。網膜血管の狭窄は明らかであり、視神経円板は適度に薄い。これとは対照的に、軽度の黄斑の関与は頻繁であるが、極端な周囲及び黄斑領域は比較的不十分に見える。ERGは、通常、暗順応条件(杆体)では記録不可能であり、錐体応答(30HZフリッカー、明るい光)は顕著に低下している。
最終段階では、患者は、周囲の視力喪失(古典的なトンネル視覚)の結果として自律的に移動することができず、固定点の周りの残りの視野の程度は少ない。読むことは困難であり、拡大眼鏡が必要である。羞明は強烈である。眼底検査によって、黄斑領域に到達する広範囲の色素沈着物が明らかになっている。血管は薄く、視神経円板は蝋様蒼白を有する。蛍光眼底造影は、周囲及び中心窩黄斑領域にも網脈絡膜萎縮を検出する。ERGは記録不可能である。
一実施形態では、対象が網膜色素変性症の症状(視覚障害、夜間の失明、光感度、トンネル視覚、及び周辺視覚の喪失から視覚の全喪失など)を有すると診断されると、開示される化合物が投与される。別の実施形態では、対象が網膜色素変性症を発症するリスクがある(リスク要因は、家族の病歴を含むか、又はロドプシン変異についての試験結果が陽性であり得る)と特定される場合があると、開示される化合物が投与される。さらに別の実施形態では、対象が網膜色素変性症を有すると診断され得ると、開示される化合物が投与される。別の実施形態では、病因として、対象の光受容細胞中のロドプシン変異(例えば、P23H杆体オプシン変異)が関与する網膜変性の他の形態の症状を有すると対象が診断されると、該化合物が投与される。別の実施形態では、対象の光受容細胞中のロドプシン変異が病因である網膜変性の他の形態を発症する危険性であると対象が特定されると、開示される化合物が投与される。いくつかの実施形態では、化合物を予防的に投与される。いくつかの実施形態では、網膜損傷が明らかになる前に、対象は疾患を有すると診断されている。いくつかの実施形態では、ヒト対象は、彼又は彼女が網膜生成治療又は予防を必要としていることを知り得る。
いくつかの実施形態では、対象は、網膜変性の程度を監視され得る。対象は、眼の検査、散瞳検査、眼底検査、視力検査、及び/又は生検などの様々な方法で監視され得る。監視は、様々な時間で行うことができる。例えば、対象は、化合物が投与された後に監視され得る。監視は、例えば、化合物の最初の投与後1日、1週間、2週間、1ヶ月、2ヶ月、6ヶ月、1年、2年、5年、又は任意の他の時点で起こり得る。対象は、繰り返し監視され得る。いくつかの実施形態では、化合物の用量は、監視に応答して変更され得る。
網膜変性を患っている対象を治療するための別の方法は、本明細書に記載の治療有効量の化合物を、ロドプシンのシャペロン及び/又は抗網膜変性剤若しくは療法として作用する治療有効量の追加の化合物と共に投与することである。抗網膜変性剤又は療法の例には、ビタミンA、DHA、及びルテインなどのサプリメント、並びに光学プロステーシス装置、遺伝子治療メカニズム及び網膜シート移植が含まれるが、これらに限定されない。
当業者なら、網膜色素変性症を治療するために本発明の化合物のいずれかを使用するための最良の治療レジメンを直接決定できることを認識する。これは実験の問題ではなく、むしろ医療技術において日常的に実施される最適化の1つである。ヌードマウスにおけるインビボ研究が、投与量及び送達の投与計画の最適化を開始する開始点を提供する場合が多い。注射の頻度は、最初に、いくつかのマウスの研究において行われているように、週に1回である。しかし、この頻度は、最初の臨床試験の前に得られた結果及び特定の患者の必要性に応じて、1日から2週毎に、2週毎から毎月に最適に調節され得る。
実施例
この実施例では、本発明者らは、破壊される最初の細胞事象であり、杆体のストレス及び死を引き起こすRHO関連adPRの予防的治療のために、小分子による変異ロドプシンを発現する杆体細胞におけるロドプシンのホメオスタシスを標的とする。本発明者らは、リソソーム活性を介してP23Hロドプシン分解を選択的に加速させる細胞ベースのアッセイを用いるハイスループットスクリーニング(HTS)による承認された薬物メトトレキサート(MTX)を特定した。重要なことに、MTXは、RhoP23H/+ノックインマウスにおいて単回硝子体内注射(IVI)によってロドプシンのホメオスタシスを改善し、視覚機能を高めた。さらに、週に複数回MTXをIVIすると、ビヒクル対照と比較して、RhoP23H/+ノックインマウスの上網膜上の光受容細胞の数がより多くなった。誤って折り畳まれたロドプシンのクリアランスを誘導する際のMTXの活性は、タンパク質のミスフォールディングによって引き起こされる遺伝性網膜変性症の治療における可能性を示唆する。
この実施例では、本発明者らは、破壊される最初の細胞事象であり、杆体のストレス及び死を引き起こすRHO関連adPRの予防的治療のために、小分子による変異ロドプシンを発現する杆体細胞におけるロドプシンのホメオスタシスを標的とする。本発明者らは、リソソーム活性を介してP23Hロドプシン分解を選択的に加速させる細胞ベースのアッセイを用いるハイスループットスクリーニング(HTS)による承認された薬物メトトレキサート(MTX)を特定した。重要なことに、MTXは、RhoP23H/+ノックインマウスにおいて単回硝子体内注射(IVI)によってロドプシンのホメオスタシスを改善し、視覚機能を高めた。さらに、週に複数回MTXをIVIすると、ビヒクル対照と比較して、RhoP23H/+ノックインマウスの上網膜上の光受容細胞の数がより多くなった。誤って折り畳まれたロドプシンのクリアランスを誘導する際のMTXの活性は、タンパク質のミスフォールディングによって引き起こされる遺伝性網膜変性症の治療における可能性を示唆する。
材料及び方法
安定細胞株
前述したようにルシフェラーゼレポーターアッセイのためのウミシイタケルシフェラーゼ(Rluc)と各々融合したWT及びP23H変異マウスロドプシンを安定的に発現する2つのHek293安定細胞株のHek293(RhoWT-Rluc)及びHek293(RHOP23H-Rluc)細胞を作製した。簡単に説明すると、Hek293細胞(ATCC,Manassas,VA,USA)を、Rluc 8(オーガスタ大学、Augusta,GA USAのNavine Lambert博士からの贈与)と融合したマウスWT又はP23HロドプシンのcDNAを含むpcDNA3.1 Zeoでトランスフェクトし、トランスフェクト細胞を、10%ウシ胎児血(FBS,Gibco Laboratories,Gaithersburg,MD USA)を補充したダルベッコ改変イーグル培地(DMEM,Genesee Scientific,El Cajon,CA USA)中で48時間インキュベートし、陽性クローン選択のために、400μg/mLのゼオシン(InvivoGen,San Diego,CA USA)を添加した。1週間のゼオシン選択から生き残った細胞のコロニーを収集し、WT及びP23Hロドプシンの発現を、ルシフェラーゼアッセイ及びロドプシンのイムノブロッティングにより確認し、モノマーの陽性バンドは約70kDであった(図8)。WTとP23Hのロドプシンタンパク質間の分子量の差は、WT及びP23Hロドプシンタンパク質を発現するNIH3T3細胞においても見られるグリコシル化の違いによるものである。
安定細胞株
前述したようにルシフェラーゼレポーターアッセイのためのウミシイタケルシフェラーゼ(Rluc)と各々融合したWT及びP23H変異マウスロドプシンを安定的に発現する2つのHek293安定細胞株のHek293(RhoWT-Rluc)及びHek293(RHOP23H-Rluc)細胞を作製した。簡単に説明すると、Hek293細胞(ATCC,Manassas,VA,USA)を、Rluc 8(オーガスタ大学、Augusta,GA USAのNavine Lambert博士からの贈与)と融合したマウスWT又はP23HロドプシンのcDNAを含むpcDNA3.1 Zeoでトランスフェクトし、トランスフェクト細胞を、10%ウシ胎児血(FBS,Gibco Laboratories,Gaithersburg,MD USA)を補充したダルベッコ改変イーグル培地(DMEM,Genesee Scientific,El Cajon,CA USA)中で48時間インキュベートし、陽性クローン選択のために、400μg/mLのゼオシン(InvivoGen,San Diego,CA USA)を添加した。1週間のゼオシン選択から生き残った細胞のコロニーを収集し、WT及びP23Hロドプシンの発現を、ルシフェラーゼアッセイ及びロドプシンのイムノブロッティングにより確認し、モノマーの陽性バンドは約70kDであった(図8)。WTとP23Hのロドプシンタンパク質間の分子量の差は、WT及びP23Hロドプシンタンパク質を発現するNIH3T3細胞においても見られるグリコシル化の違いによるものである。
2つのNIH3T3安定細胞株のNIH3T3(RHOWT/GFP)及びNIH3T3(RHOP23H/GFP)を、それぞれウイルス形質導入(24、33)を介してNIH3T3細胞にpMiLRO 23及びpMiLRO DNAコンストラクトを組み込むことによって作製したKrzysztof Palczewski博士の研究室と分け合った。陽性クローン選択のために、GFPをロドプシンと共発現させた。WT及びP23Hロドプシンタンパク質の発現をイムノブロット及び免疫染色によって確認した。
ビーナス蛍光タンパク質と融合したWTのマウスロドプシン及び6つ変異マウスロドプシン(T4R、P23H、P53R、C110Y、D190N、P267L)を別々に発現する7種のU2OS安定細胞株を作製した。簡単に説明すると、U2OS細胞(ATCC,Manassas,VA,USA)を、ビーナスマウスと融合したWT又はT4R、P23H、P53R、C110Y、D190N、P267LロドプシンのcDNAを含むpcDNA3.1 Zeoでトランスフェクトし、トランスフェクト細胞を、10% FBSを有するDMEM中で48時間インキュベートし、陽性クローン選択のために、400μg/mLのゼオシを添加した。1週間のゼオシン選択から生き残った細胞のコロニーを収集し、WT及び6つの変異ロドシンの発現を、ビーナスの蛍光及びロドプシンのイムノブロッティングにより確認した。
細胞の培養及び培地
細胞を、10%FBS及び5μg/mLのプラスモシン(InvivoGen,San Diego,CA USA)を有するDMEMを含む完全培地中で、37℃、5%CO2及び>95%の湿度で培養し、ATCC動物細胞培養ガイド(www.atcc.org)で指示されるように継代培養した。
細胞を、10%FBS及び5μg/mLのプラスモシン(InvivoGen,San Diego,CA USA)を有するDMEMを含む完全培地中で、37℃、5%CO2及び>95%の湿度で培養し、ATCC動物細胞培養ガイド(www.atcc.org)で指示されるように継代培養した。
化学薬品及び試薬
ViviRenをPromega(Madison,WI,USA)から購入し、60mMのストックアリコートとしてジメチルスルホキシド(DMSO)に溶解し、琥珀色のチューブ内で、-80℃で保存した。UC 10kダイバーシティセットは、384ウェルフォーマットで、化合物当たり10mMでシンシナティ大学創薬センター(UCDDC,Cincinnati,OH USA)によって提供され、スペクトラムコレクション(MicroSource,Gaylordsville,CT USA)及びLife Chemicals 50Kダイバーシティセット(Life Chemicals USA,Woodbridge,CT USA)を、384ウェルフォーマットで、化合物当たり10mMでKrzysztof Palczewski博士によって提供され、米国食品医薬品局(FDA)承認薬、薬理学的に活性のある化合物のライブラリー(LOPAC,Millipore Sigma,St.Louis,MO USA)及びメカニズム照会プラットE(MIPE)コレクションは、1536ウェルフォーマットで各化合物について7又は11用量シリーズでNCATSによって提供された。これらの化合物ライブラリー中の全ての化合物をDMSOに溶解し、-80℃で保存し、接着箔フィルムでシールした。ヒット化合物を粉末中の化合物ストックから厳選するか、又は3連の用量応答試験並びに確認及びカウンタースクリーニングのために化学ベンダーから注文した。CL-001(Pubchem CID:11715767)、CL-006(CID:11338033)、CL-007(CID:5330790)、及びCL-008(CID:16747683)をSelleckchem(Houston,TX USA)から購入し;CL-002(CID:6224422)、CL-003(CID:4438424)、及びCL-004(CID:6624030)をLife Chemicalsから注文し、CL-005(CID:10091681)はUCDDCによって提供され、CL-009/MTX(CID:126941)は、Cayman Chemical(Ann Arbor,MI USA)から購入した。DMSO及びL-メチオニンは、MilliporeSigma(St.Louis,MO USA)社製であった。抗ロドプシン抗体1D4及びB630は、Krzysztof Palczewski博士の研究室と共有した。抗微小管関連タンパク質軽鎖3(LC3)抗体は、Cell Signaling Technology(4108S,Danvers,MA USA)から購入した。抗セクエストソーム1(SQSTM1/p62)抗体を、Novus Biologicals(NBP1-42821,Centennial,CO USA)から購入した。Cy3コンジュゲートヤギ抗マウスIgG(A10521)、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)コンジュゲートヤギ抗マウスIgG(32230)、HRPコンジュゲートヤギ抗ウサギIgG(32260)、HRP-ストレプトアビジン(SA)(434323)、L-アジドホモアラニン(AHA,C10102)、ビオチン(BTN)-sDIBO(C20023)、及びダイナビーズ(商標)プロテインG(10004D)、BCAタンパク質アッセイ(23225)、パラホルムアルデヒド(28908)、ヘキスト33342(H3570)、及びスーパーシグナル(商標)West Pico PLUS化学発光基質(34580)は、ThermoFisher(Waltham,MA USA)から取得した。
ViviRenをPromega(Madison,WI,USA)から購入し、60mMのストックアリコートとしてジメチルスルホキシド(DMSO)に溶解し、琥珀色のチューブ内で、-80℃で保存した。UC 10kダイバーシティセットは、384ウェルフォーマットで、化合物当たり10mMでシンシナティ大学創薬センター(UCDDC,Cincinnati,OH USA)によって提供され、スペクトラムコレクション(MicroSource,Gaylordsville,CT USA)及びLife Chemicals 50Kダイバーシティセット(Life Chemicals USA,Woodbridge,CT USA)を、384ウェルフォーマットで、化合物当たり10mMでKrzysztof Palczewski博士によって提供され、米国食品医薬品局(FDA)承認薬、薬理学的に活性のある化合物のライブラリー(LOPAC,Millipore Sigma,St.Louis,MO USA)及びメカニズム照会プラットE(MIPE)コレクションは、1536ウェルフォーマットで各化合物について7又は11用量シリーズでNCATSによって提供された。これらの化合物ライブラリー中の全ての化合物をDMSOに溶解し、-80℃で保存し、接着箔フィルムでシールした。ヒット化合物を粉末中の化合物ストックから厳選するか、又は3連の用量応答試験並びに確認及びカウンタースクリーニングのために化学ベンダーから注文した。CL-001(Pubchem CID:11715767)、CL-006(CID:11338033)、CL-007(CID:5330790)、及びCL-008(CID:16747683)をSelleckchem(Houston,TX USA)から購入し;CL-002(CID:6224422)、CL-003(CID:4438424)、及びCL-004(CID:6624030)をLife Chemicalsから注文し、CL-005(CID:10091681)はUCDDCによって提供され、CL-009/MTX(CID:126941)は、Cayman Chemical(Ann Arbor,MI USA)から購入した。DMSO及びL-メチオニンは、MilliporeSigma(St.Louis,MO USA)社製であった。抗ロドプシン抗体1D4及びB630は、Krzysztof Palczewski博士の研究室と共有した。抗微小管関連タンパク質軽鎖3(LC3)抗体は、Cell Signaling Technology(4108S,Danvers,MA USA)から購入した。抗セクエストソーム1(SQSTM1/p62)抗体を、Novus Biologicals(NBP1-42821,Centennial,CO USA)から購入した。Cy3コンジュゲートヤギ抗マウスIgG(A10521)、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)コンジュゲートヤギ抗マウスIgG(32230)、HRPコンジュゲートヤギ抗ウサギIgG(32260)、HRP-ストレプトアビジン(SA)(434323)、L-アジドホモアラニン(AHA,C10102)、ビオチン(BTN)-sDIBO(C20023)、及びダイナビーズ(商標)プロテインG(10004D)、BCAタンパク質アッセイ(23225)、パラホルムアルデヒド(28908)、ヘキスト33342(H3570)、及びスーパーシグナル(商標)West Pico PLUS化学発光基質(34580)は、ThermoFisher(Waltham,MA USA)から取得した。
HTS及びカウンタースクリーニングの手順
HTSは、シンシナティ大学(UC)、ケース・ウェスタン・リザーブ大学、及び国立トランスレーショナルサイエンス推進センター(NCATS)を含む3つの施設で実施され、合計6種の化合物コレクションを試験した。これらの化合物コレクションには、1)UC 10kダイバーシティセット(10,011化合物)、2)Life Chemicals 50Kコレクション(50,560)、3)スペクトルコレクション(2,400化合物)、4)LOPACコレクション(1,280化合物)、5)FDAコレクション(2,816化合物)及び6)NCATS MIPEコレクション(1,912化合物)が含まれる。HTSアッセイ及び確認アッセイの手順は、品質管理パラメータ(信号対ノイズ比及びZ’因子)にもかかわらず、異なる施設での設備に適合させるためにわずかに異なり(表4)、これらのアッセイが堅牢であることを実証する(表1)。化合物コレクション1)、2)及び3)については、最初に、1回の単一用量(9.93~16.13μM)でP23Hロドプシンルシフェラーゼレポーターアッセイを用いて、384ウェルフォーマットで各化合物を試験し、平均-2SDでカットオフよりも低い活性スコアを有する2072個の化合物を特定した。活性スコアは、0%対照としてDMSO処理細胞及び約100%対照として1mMのエバンスブルー処理細胞を用いて正規化した。これらのヒット化合物から、本発明者らは、ルシフェラーゼ阻害活性を有すると報告されたものを除外し、ヒットの確認のために残りを厳選した。3連でルシフェラーゼレポーターアッセイにより再びHek293(RHOP23H-Rluc)細胞中10μMで各ヒットを試験し、次いで、約50%より低い活性スコアを有する確認されたヒットを、組換えRluc活性アッセイによるRluc活性に対する効果、及びHek293(RHOWT-Rluc)細胞における3連で10μMでのルシフェラーゼレポーターアッセイによるWTロドプシンレベルに対する効果についてそれぞれカウンタースクリーニングをした。本発明者らは、Rluc活性又はWTロドプシン-Rlucレポーター活性(約50%より高い活性スコア)に顕著に影響しない52個の化合物を特定した。次に、本発明者らは、Hek293(RHOP23H-Rluc)細胞とHek293(RHOWT-Rluc)細胞の両方においてこれらの確認されたヒットの用量応答を試験し、用量依存的にWTロドプシンよりP23Hのクリアランスを選択的に優先した化合物を特定した(表4)。化合物コレクション4)~6)については、本発明者らは、1536ウェルフォーマットでHek293(RHOP23H-Rluc)細胞におけるルシフェラーゼレポーターアッセイを用いて、7又は11用量で各化合物を直接試験し、約50%より小さい効力を有し、EC50<20μMである128個の化合物を特定した。次に、本発明者らは、これらの128個の化合物を厳選し、Hek293(RHOP23H-Rluc)とHek293(RhoWT-Rluc)細胞の両方において3連で、7又は11用量でルシフェラーゼレポーターアッセイによりそれらを試験し、WTロドプシンよりP23Hのクリアランスに対してより高い効力を示した34個の化合物を選択した。
HTSは、シンシナティ大学(UC)、ケース・ウェスタン・リザーブ大学、及び国立トランスレーショナルサイエンス推進センター(NCATS)を含む3つの施設で実施され、合計6種の化合物コレクションを試験した。これらの化合物コレクションには、1)UC 10kダイバーシティセット(10,011化合物)、2)Life Chemicals 50Kコレクション(50,560)、3)スペクトルコレクション(2,400化合物)、4)LOPACコレクション(1,280化合物)、5)FDAコレクション(2,816化合物)及び6)NCATS MIPEコレクション(1,912化合物)が含まれる。HTSアッセイ及び確認アッセイの手順は、品質管理パラメータ(信号対ノイズ比及びZ’因子)にもかかわらず、異なる施設での設備に適合させるためにわずかに異なり(表4)、これらのアッセイが堅牢であることを実証する(表1)。化合物コレクション1)、2)及び3)については、最初に、1回の単一用量(9.93~16.13μM)でP23Hロドプシンルシフェラーゼレポーターアッセイを用いて、384ウェルフォーマットで各化合物を試験し、平均-2SDでカットオフよりも低い活性スコアを有する2072個の化合物を特定した。活性スコアは、0%対照としてDMSO処理細胞及び約100%対照として1mMのエバンスブルー処理細胞を用いて正規化した。これらのヒット化合物から、本発明者らは、ルシフェラーゼ阻害活性を有すると報告されたものを除外し、ヒットの確認のために残りを厳選した。3連でルシフェラーゼレポーターアッセイにより再びHek293(RHOP23H-Rluc)細胞中10μMで各ヒットを試験し、次いで、約50%より低い活性スコアを有する確認されたヒットを、組換えRluc活性アッセイによるRluc活性に対する効果、及びHek293(RHOWT-Rluc)細胞における3連で10μMでのルシフェラーゼレポーターアッセイによるWTロドプシンレベルに対する効果についてそれぞれカウンタースクリーニングをした。本発明者らは、Rluc活性又はWTロドプシン-Rlucレポーター活性(約50%より高い活性スコア)に顕著に影響しない52個の化合物を特定した。次に、本発明者らは、Hek293(RHOP23H-Rluc)細胞とHek293(RHOWT-Rluc)細胞の両方においてこれらの確認されたヒットの用量応答を試験し、用量依存的にWTロドプシンよりP23Hのクリアランスを選択的に優先した化合物を特定した(表4)。化合物コレクション4)~6)については、本発明者らは、1536ウェルフォーマットでHek293(RHOP23H-Rluc)細胞におけるルシフェラーゼレポーターアッセイを用いて、7又は11用量で各化合物を直接試験し、約50%より小さい効力を有し、EC50<20μMである128個の化合物を特定した。次に、本発明者らは、これらの128個の化合物を厳選し、Hek293(RHOP23H-Rluc)とHek293(RhoWT-Rluc)細胞の両方において3連で、7又は11用量でルシフェラーゼレポーターアッセイによりそれらを試験し、WTロドプシンよりP23Hのクリアランスに対してより高い効力を示した34個の化合物を選択した。
Rlucレポーターアッセイ
Rlucレポーターアッセイについては以前に説明されている。HTSを、UC 10Kダイバーシティセット、スペクトルコレクション及びLife Chemicals 50Kダイバーシティセットには384ウェルフォーマットで、FDA、LOPAC、及びMIPEコレクションには1536ウェルフォーマットで行った。一例として384ウェルフォーマットを使用して、3×105/mLのHek(RHOP23H-Rluc)細胞を、8チャンネルMultiflo液体ディスペンサー(Bioteck,Winooski,VT USA)により384ウェル白色壁透明底プレート(アッセイプレート)のウェル当たり40μL播種した。アッセイプレートを300×gで30秒間遠心分離し、37℃で、5%CO2で一晩培養した。翌日、化合物を、384ウェル化合物プレートから培養細胞を含む384ウェルアッセイプレートに、JANUS MDT自動ワークステーション(PerkinElmer,Waltham,MA USA)によって操作される50nLの384ピンツールによって移した。50μL/ウェルの化合物溶液を含む化合物プレートを、カラム3~22中のDMSOに溶解した。対照を、それぞれ50μLのDMEM、DMSO、DMSO、及びエバンスブルー(DMSO中606mM)を含む対照プレート中のカラム1、2、23、及び24にローディングした。化合物プレートからアッセイプレートに50nLのピンツールを用いて対照を移した。再使用する前に、ピンツールを、100mLのDMSO、洗浄水、及び100mLのエタノールを含む洗浄ウェルに順次浸漬することによって十分に洗浄し、30秒間空気乾燥した。処理したアッセイプレートを300×gで30秒間遠心分離し、37℃、5%CO2で24時間インキュベートした。3日目に、5μL/ウェルの2%のn-ドデシル-β-D-マルトピラノシド(DDM)をアッセイプレートに添加し、続いて5秒間振盪を行った。アッセイプレートを室温で5分間インキュベートし、リン酸緩衝化生理食塩水(PBS)で希釈した50μMのViviREN溶液5μL/ウェルを添加し、続いて5秒間振盪した。アッセイプレートを、室温で、薄暗い光の中で1時間インキュベートした。各ウェルの発光を、0.1秒の積分時間でEnspireプレートリーダー(PerkinElmer)によって読み取った。HTSアッセイの1536ウェルフォーマットについては、細胞を白色壁透明底の1536ウェルプレートのウェル当たり5μLの3000個の細胞/ウェルで播種し;化合物を23nLの1536ピンツールを用いて移し、0.5μL/ウェルのDDM及び1μL/ウェルの30μMのViviREN溶液をアッセイプレートに順次添加したことの違いを除いて、手順は384ウェルアッセイと同じである。カウンタースクリーニングアッセイのために、Hek293(RhoWT-Rluc)細胞を用いてHTSアッセイとしてアッセイを繰り返した。活性スコア(%)=(RLU化合物-RLUDMSO)/(RLUDMSO-RLUエバンスブルー)×100。RLU、相対発光単位。
Rlucレポーターアッセイについては以前に説明されている。HTSを、UC 10Kダイバーシティセット、スペクトルコレクション及びLife Chemicals 50Kダイバーシティセットには384ウェルフォーマットで、FDA、LOPAC、及びMIPEコレクションには1536ウェルフォーマットで行った。一例として384ウェルフォーマットを使用して、3×105/mLのHek(RHOP23H-Rluc)細胞を、8チャンネルMultiflo液体ディスペンサー(Bioteck,Winooski,VT USA)により384ウェル白色壁透明底プレート(アッセイプレート)のウェル当たり40μL播種した。アッセイプレートを300×gで30秒間遠心分離し、37℃で、5%CO2で一晩培養した。翌日、化合物を、384ウェル化合物プレートから培養細胞を含む384ウェルアッセイプレートに、JANUS MDT自動ワークステーション(PerkinElmer,Waltham,MA USA)によって操作される50nLの384ピンツールによって移した。50μL/ウェルの化合物溶液を含む化合物プレートを、カラム3~22中のDMSOに溶解した。対照を、それぞれ50μLのDMEM、DMSO、DMSO、及びエバンスブルー(DMSO中606mM)を含む対照プレート中のカラム1、2、23、及び24にローディングした。化合物プレートからアッセイプレートに50nLのピンツールを用いて対照を移した。再使用する前に、ピンツールを、100mLのDMSO、洗浄水、及び100mLのエタノールを含む洗浄ウェルに順次浸漬することによって十分に洗浄し、30秒間空気乾燥した。処理したアッセイプレートを300×gで30秒間遠心分離し、37℃、5%CO2で24時間インキュベートした。3日目に、5μL/ウェルの2%のn-ドデシル-β-D-マルトピラノシド(DDM)をアッセイプレートに添加し、続いて5秒間振盪を行った。アッセイプレートを室温で5分間インキュベートし、リン酸緩衝化生理食塩水(PBS)で希釈した50μMのViviREN溶液5μL/ウェルを添加し、続いて5秒間振盪した。アッセイプレートを、室温で、薄暗い光の中で1時間インキュベートした。各ウェルの発光を、0.1秒の積分時間でEnspireプレートリーダー(PerkinElmer)によって読み取った。HTSアッセイの1536ウェルフォーマットについては、細胞を白色壁透明底の1536ウェルプレートのウェル当たり5μLの3000個の細胞/ウェルで播種し;化合物を23nLの1536ピンツールを用いて移し、0.5μL/ウェルのDDM及び1μL/ウェルの30μMのViviREN溶液をアッセイプレートに順次添加したことの違いを除いて、手順は384ウェルアッセイと同じである。カウンタースクリーニングアッセイのために、Hek293(RhoWT-Rluc)細胞を用いてHTSアッセイとしてアッセイを繰り返した。活性スコア(%)=(RLU化合物-RLUDMSO)/(RLUDMSO-RLUエバンスブルー)×100。RLU、相対発光単位。
組換えRluc活性アッセイ
組換えRluc(RayBiotech,Peachtree Corners,GA USA)をPBSに溶解し、0.3μg/mLに希釈した。各化合物を、化合物作業溶液としてのPBSで10×最終濃度に希釈した。384ウェルプレートで、希釈したRluc16μL/ウェルを化合物作業溶液4μL/ウェルと混合した。MolecularDevices SpectraMax XLマイクロプレートリーダーを用いて、各ウェル内の発光を、5μMのセレンテラジンh基質(Nanolight Technologies, Pinetop,AZ USA)をウェル当たり20μL注入した後に2.5秒読み取った。各化合物を10μMの最終濃度で試験し、3回繰り返した。ルシフェラーゼ活性を、DMSO及び1mMのエバンスブルーによってそれぞれ0%及び約100%の対照として正規化した。
組換えRluc(RayBiotech,Peachtree Corners,GA USA)をPBSに溶解し、0.3μg/mLに希釈した。各化合物を、化合物作業溶液としてのPBSで10×最終濃度に希釈した。384ウェルプレートで、希釈したRluc16μL/ウェルを化合物作業溶液4μL/ウェルと混合した。MolecularDevices SpectraMax XLマイクロプレートリーダーを用いて、各ウェル内の発光を、5μMのセレンテラジンh基質(Nanolight Technologies, Pinetop,AZ USA)をウェル当たり20μL注入した後に2.5秒読み取った。各化合物を10μMの最終濃度で試験し、3回繰り返した。ルシフェラーゼ活性を、DMSO及び1mMのエバンスブルーによってそれぞれ0%及び約100%の対照として正規化した。
ドットブロット
NIH3T3(RHOP23H/GFP)又はNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞を、96ウェルプレート中の100μL/ウェルの完全培地に2.5×104細胞/ウェルで播種し、37℃、5%CO2で4時間培養した。次いで、細胞を、2×最終濃度の試験化合物を含む100μL/ウェルの完全培地で処理した。37℃、5%CO2でさらに24時間インキュベーションした後、培地を吸引し、細胞をPBSで1回洗浄した。放射線免疫沈降アッセイ(RIPA)緩衝液及び完全プロテアーゼ阻害剤カクテル(Roche Diagnostics,Basel,Switzerland)を含む細胞溶解緩衝液を、200μL/ウェルで細胞に添加した後、6秒間超音波処理した。RHOWTの細胞タンパク質レベルはRHOP23Hよりも高かったので、1ウェルのNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞試料の5%及び1ウェルのNIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞試料の90%をニトロセルロース膜にロードし、空気乾燥させた。オプシンタンパク質を0.1μg/mLのHRPコンジュゲート1D4抗ロドプシン抗体で免疫染色した。バンドのデンシトメトリーを、ImageJソフトウェアによって測定し、DMSO処理対照に正規化した。
NIH3T3(RHOP23H/GFP)又はNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞を、96ウェルプレート中の100μL/ウェルの完全培地に2.5×104細胞/ウェルで播種し、37℃、5%CO2で4時間培養した。次いで、細胞を、2×最終濃度の試験化合物を含む100μL/ウェルの完全培地で処理した。37℃、5%CO2でさらに24時間インキュベーションした後、培地を吸引し、細胞をPBSで1回洗浄した。放射線免疫沈降アッセイ(RIPA)緩衝液及び完全プロテアーゼ阻害剤カクテル(Roche Diagnostics,Basel,Switzerland)を含む細胞溶解緩衝液を、200μL/ウェルで細胞に添加した後、6秒間超音波処理した。RHOWTの細胞タンパク質レベルはRHOP23Hよりも高かったので、1ウェルのNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞試料の5%及び1ウェルのNIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞試料の90%をニトロセルロース膜にロードし、空気乾燥させた。オプシンタンパク質を0.1μg/mLのHRPコンジュゲート1D4抗ロドプシン抗体で免疫染色した。バンドのデンシトメトリーを、ImageJソフトウェアによって測定し、DMSO処理対照に正規化した。
ウェスタンブロット
細胞を5×105細胞/ウェルの密度で6ウェルプレートに播種し、37℃、5%CO2で17時間培養した。対応する濃度の化合物を含む新鮮な培地で培地交換した。24時間処理した後、細胞を収集し、氷上で12秒超音波処理しながら、0.1%SDS及び完全プロテアーゼ阻害剤カクテルを含む150μLのPBSに溶解した。氷上での24秒間の超音波処理を行いながら、0.1%SDSと完全プロテアーゼ阻害剤カクテルを含むPBSの300μL/網膜に網膜試料を溶解した。タンパク質濃度を、Nanodrop分光計を用いてOD280nmの測定により決定した。ロドプシンをイムノブロットするために、NIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞については1ウェル当たり100μgの全タンパク質、又はNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞については20μgの全タンパク質を、SDS-PAGEゲル上にロードした。他のタンパク質を検出するために、1ウェル当たり50μgの全タンパク質をロードした。10%及び16%のSDS-PAGEゲルでの電気泳動により分離した後、タンパク質を、湿潤膜電気転写カセットを用いてニトロセルロース膜に移し、続いて0.05%のTween 20を含むPBS中5%ウシ血清アルブミンで1時間ブロッキングした。膜を4℃で一次抗体と一晩インキュベートした後、室温で1時間、適切な二次抗体とインキュベートした。ブロットをSuperSignal(商標)West Pico PLUS化学発光基質を用いて可視化し、BioRadゲルイメージャによりスキャンした。
細胞を5×105細胞/ウェルの密度で6ウェルプレートに播種し、37℃、5%CO2で17時間培養した。対応する濃度の化合物を含む新鮮な培地で培地交換した。24時間処理した後、細胞を収集し、氷上で12秒超音波処理しながら、0.1%SDS及び完全プロテアーゼ阻害剤カクテルを含む150μLのPBSに溶解した。氷上での24秒間の超音波処理を行いながら、0.1%SDSと完全プロテアーゼ阻害剤カクテルを含むPBSの300μL/網膜に網膜試料を溶解した。タンパク質濃度を、Nanodrop分光計を用いてOD280nmの測定により決定した。ロドプシンをイムノブロットするために、NIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞については1ウェル当たり100μgの全タンパク質、又はNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞については20μgの全タンパク質を、SDS-PAGEゲル上にロードした。他のタンパク質を検出するために、1ウェル当たり50μgの全タンパク質をロードした。10%及び16%のSDS-PAGEゲルでの電気泳動により分離した後、タンパク質を、湿潤膜電気転写カセットを用いてニトロセルロース膜に移し、続いて0.05%のTween 20を含むPBS中5%ウシ血清アルブミンで1時間ブロッキングした。膜を4℃で一次抗体と一晩インキュベートした後、室温で1時間、適切な二次抗体とインキュベートした。ブロットをSuperSignal(商標)West Pico PLUS化学発光基質を用いて可視化し、BioRadゲルイメージャによりスキャンした。
ハイコンテントイメージング
哺乳動物細胞におけるP23Hロドプシンクリアランスに対する活性化合物の効果を評価するために、先に記載したように、NIH3T3(RHOWT/GFP)及びNIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞を用いてイメージベースアッセイを行った。簡単に説明すると、細胞を、384ウェルプレートにウェル当たり5000個の細胞を播種し、細胞がプレートの底部に付着するまで、37℃、5%CO2で4時間インキュベートした。付着した細胞を24時間化合物で処理した。アッセイ培地を吸引し、細胞を室温で20分間、ウェル当たり20μLの4%パラホルムアルデヒドで固定した。細胞膜を0.1%Triton X-100(PBST)を含むPBSで透過処理し、次いで、15μL/ウェルで、50μg/mLの1D4抗ロドプシン抗体と室温で1時間インキュベートした。50μL/ウェルのPBSTで3回洗浄した後、細胞を15μL/ウェルのCy3コンジュゲートヤギ抗マウスIgG抗体と室温で1時間インキュベートした。50μL/ウェルのPBSTで3回洗浄した後、細胞を、2μg/mLのヘキスト33342を含むPBS50μL/ウェル中でインキュベートし、核を染色した。最後に、免疫染色した細胞を、ImageExpressハイコンテントイメージングシステム(MolecularDevices)により画像化した。ロドプシンの免疫蛍光を、ウェル当たり600~1000個の無傷細胞を含む5つのフィールドから取得したウェル当たり、細胞当たりのCy3チャネルの全蛍光の平均を用いて、MetaXpressソフトウェアによって測定した。0%としてのDMSO処理細胞及び約100%としての二次抗体のみで免疫染色した細胞にロドプシンの蛍光強度を正規化した後に、各化合物についての用量応答曲線をプロットし、Originソフトウェアを用いて改変ヒル関数によりフィッティングした。ヒット確認のためのハイコンテントイメージング実験をCWRU創薬研究所で実施し、BafA1及びMG-132によるMTX同時処理のためのハイコンテントイメージング分析をピッツバーグ大学創薬研究所で行った。そのため、実験的変動による小さな差異が、CL-009/MTX活性について見られた。
哺乳動物細胞におけるP23Hロドプシンクリアランスに対する活性化合物の効果を評価するために、先に記載したように、NIH3T3(RHOWT/GFP)及びNIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞を用いてイメージベースアッセイを行った。簡単に説明すると、細胞を、384ウェルプレートにウェル当たり5000個の細胞を播種し、細胞がプレートの底部に付着するまで、37℃、5%CO2で4時間インキュベートした。付着した細胞を24時間化合物で処理した。アッセイ培地を吸引し、細胞を室温で20分間、ウェル当たり20μLの4%パラホルムアルデヒドで固定した。細胞膜を0.1%Triton X-100(PBST)を含むPBSで透過処理し、次いで、15μL/ウェルで、50μg/mLの1D4抗ロドプシン抗体と室温で1時間インキュベートした。50μL/ウェルのPBSTで3回洗浄した後、細胞を15μL/ウェルのCy3コンジュゲートヤギ抗マウスIgG抗体と室温で1時間インキュベートした。50μL/ウェルのPBSTで3回洗浄した後、細胞を、2μg/mLのヘキスト33342を含むPBS50μL/ウェル中でインキュベートし、核を染色した。最後に、免疫染色した細胞を、ImageExpressハイコンテントイメージングシステム(MolecularDevices)により画像化した。ロドプシンの免疫蛍光を、ウェル当たり600~1000個の無傷細胞を含む5つのフィールドから取得したウェル当たり、細胞当たりのCy3チャネルの全蛍光の平均を用いて、MetaXpressソフトウェアによって測定した。0%としてのDMSO処理細胞及び約100%としての二次抗体のみで免疫染色した細胞にロドプシンの蛍光強度を正規化した後に、各化合物についての用量応答曲線をプロットし、Originソフトウェアを用いて改変ヒル関数によりフィッティングした。ヒット確認のためのハイコンテントイメージング実験をCWRU創薬研究所で実施し、BafA1及びMG-132によるMTX同時処理のためのハイコンテントイメージング分析をピッツバーグ大学創薬研究所で行った。そのため、実験的変動による小さな差異が、CL-009/MTX活性について見られた。
qPCR
NIH3T3(RHOWT/GFP)及びNIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞を、24ウェルプレートに、2.5×105個の細胞/ウェルの密度で播種し、37℃、5%CO2で一晩培養した。次いで、細胞を、化合物を含む培地で24時間インキュベートした。培地を吸引した後、細胞を収集し、300μL/ウェルのTRIzol(ThermoFisher,15596026,Waltham,MA USA)に5分間溶解した。試料を60μLのクロロホルムと30秒間激しく混合し、次いで、12,000×gで15分間、4℃で遠心分離した。RNAを含む上部水性相を取り出し、激しく振盪することにより150μLのイソプロパノールと混合した。10分間鎮静後、試料を12,000×gで、10分間4℃で遠心分離した。ペレットを300μLの75%エタノールで洗浄し、4℃で5分間、7,500×gで遠心分離した。RNAペレットを15分間空気乾燥させ、30μLのヌクレアーゼを含まない水(FisherScientific,BP2484-100,Houston,TX USA)に溶解した。RNAの収率及び純度をNanoDrop分光計により評価した。cDNAを、High-Capacity RNA-to-cDNAキット(ThermoFisher,4387406,Waltham,MA USA)を用いて1μgのRNAから作製した。cDNA鋳型及びプライマーと共に、PowerUp SYBR Greenマスターミックス(ThermoFisher,A25741,Waltham,MA USA)を用いてqPCR増幅を行い、反応を、QuantStudio3サーモサイクラー(ThermoFisher, Waltham, MA USA)によって制御した。プライマー配列は以下の通りである:RHO、フォワード5’-CCCTTCTCCAACGTCACAGG-3’(配列番号1)、リバース5’-TGAGGAAGTTGATGGGGAAGC-3’(配列番号2);βアクチン、フォワード5’-ACCTTCTACAATGAGCTGCG-3’(配列番号3)、リバース5’-CTGGATGGCTACGTACATGG-3’(配列番号4)。
NIH3T3(RHOWT/GFP)及びNIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞を、24ウェルプレートに、2.5×105個の細胞/ウェルの密度で播種し、37℃、5%CO2で一晩培養した。次いで、細胞を、化合物を含む培地で24時間インキュベートした。培地を吸引した後、細胞を収集し、300μL/ウェルのTRIzol(ThermoFisher,15596026,Waltham,MA USA)に5分間溶解した。試料を60μLのクロロホルムと30秒間激しく混合し、次いで、12,000×gで15分間、4℃で遠心分離した。RNAを含む上部水性相を取り出し、激しく振盪することにより150μLのイソプロパノールと混合した。10分間鎮静後、試料を12,000×gで、10分間4℃で遠心分離した。ペレットを300μLの75%エタノールで洗浄し、4℃で5分間、7,500×gで遠心分離した。RNAペレットを15分間空気乾燥させ、30μLのヌクレアーゼを含まない水(FisherScientific,BP2484-100,Houston,TX USA)に溶解した。RNAの収率及び純度をNanoDrop分光計により評価した。cDNAを、High-Capacity RNA-to-cDNAキット(ThermoFisher,4387406,Waltham,MA USA)を用いて1μgのRNAから作製した。cDNA鋳型及びプライマーと共に、PowerUp SYBR Greenマスターミックス(ThermoFisher,A25741,Waltham,MA USA)を用いてqPCR増幅を行い、反応を、QuantStudio3サーモサイクラー(ThermoFisher, Waltham, MA USA)によって制御した。プライマー配列は以下の通りである:RHO、フォワード5’-CCCTTCTCCAACGTCACAGG-3’(配列番号1)、リバース5’-TGAGGAAGTTGATGGGGAAGC-3’(配列番号2);βアクチン、フォワード5’-ACCTTCTACAATGAGCTGCG-3’(配列番号3)、リバース5’-CTGGATGGCTACGTACATGG-3’(配列番号4)。
パルスチェイスアッセイ
ロドプシンの分解を定量するために、非放射性パルスチェイスアッセイに「クリック」反応を使用した。簡単に説明すると、NIH3T3(RHOP23H/GFP)又はNIH3T3(RhoWT/GFP)細胞を、24ウェルプレート中の10%FBSを含む完全培地中3×105細胞/ウェルで培養した。一晩培養した後、培地を吸引し、細胞を1mL/ウェルのPBSで1回穏やかに洗浄した。細胞をL-メチオニンを含まないDMEM(Gibco,21013-024,Gaithersburg,MD USA)で1時間インキュベートし、細胞内メチオニンを排出した。次いで、細胞を最終濃度50μMでL-AHAで4時間パルスした。一方、50μMのL-メチオニンで処理した細胞を陰性対照として使用した。標識後、細胞を、様々なチェイス時間中、活性化合物の存在下又は非存在下で、2mMのL-メチオニンを有する完全なDMEM培地と置換した。次いで、0.1%SDS、1%DDM及び完全プロテアーゼ阻害剤カクテルを含むPBSで細胞を溶解した。全タンパク質濃度をBCAアッセイにより測定した。200μgの全タンパク質を含む細胞溶解物を、5μMのBTN-sDIBOと混合し、37℃で1時間「クリック」反応させた。1D4の抗ロドプシン抗体と結合したDynabeads(商標)プロテインGと試料を室温で15分間インキュベートし、続いて0.02%のTween 20を含むPBSで3回洗浄した。pH2.8の50mMのグリシンでタンパク質を室温で10分間溶出し、次いで、ニトロセルロース膜上にロードした。空気乾燥後、膜を5%ミルクでブロッキングし、0.25μg/mLのHRPコンジュゲートSAでイムノブロットした。
ロドプシンの分解を定量するために、非放射性パルスチェイスアッセイに「クリック」反応を使用した。簡単に説明すると、NIH3T3(RHOP23H/GFP)又はNIH3T3(RhoWT/GFP)細胞を、24ウェルプレート中の10%FBSを含む完全培地中3×105細胞/ウェルで培養した。一晩培養した後、培地を吸引し、細胞を1mL/ウェルのPBSで1回穏やかに洗浄した。細胞をL-メチオニンを含まないDMEM(Gibco,21013-024,Gaithersburg,MD USA)で1時間インキュベートし、細胞内メチオニンを排出した。次いで、細胞を最終濃度50μMでL-AHAで4時間パルスした。一方、50μMのL-メチオニンで処理した細胞を陰性対照として使用した。標識後、細胞を、様々なチェイス時間中、活性化合物の存在下又は非存在下で、2mMのL-メチオニンを有する完全なDMEM培地と置換した。次いで、0.1%SDS、1%DDM及び完全プロテアーゼ阻害剤カクテルを含むPBSで細胞を溶解した。全タンパク質濃度をBCAアッセイにより測定した。200μgの全タンパク質を含む細胞溶解物を、5μMのBTN-sDIBOと混合し、37℃で1時間「クリック」反応させた。1D4の抗ロドプシン抗体と結合したDynabeads(商標)プロテインGと試料を室温で15分間インキュベートし、続いて0.02%のTween 20を含むPBSで3回洗浄した。pH2.8の50mMのグリシンでタンパク質を室温で10分間溶出し、次いで、ニトロセルロース膜上にロードした。空気乾燥後、膜を5%ミルクでブロッキングし、0.25μg/mLのHRPコンジュゲートSAでイムノブロットした。
プロテアソーム活性アッセイ
NIH3T3(RHOP23H/GFP)、NIH3T3(RHOWT/GFP)及びNIH3T3細胞を、20μLの完全培地中2500細胞/ウェルの白色壁透明底384ウェルプレートに播種した。3時間のインキュベーションの後、MTXを含む完全培地5μL/ウェルを細胞に添加して、細胞を最終濃度0.0195~10μMで24時間処理した。0.1%のDMSOを含む完全培地で処理した細胞を100%対照として使用し、5μMのMG-132で8時間処理した細胞を0%対照として使用した。終点プロテアソーム活性測定のために、各ウェルに、Suc-LLVY-Glo(商標)基質(Promega,G8660,Madison,WI USA)を含むプロテアソーム-Glo(商標)試薬25μLを加えた。384ウェルプレートを2分間振盪し、溶液を混合し、続いて室温で24分間インキュベートした。各ウェルの発光を、SpectraMax I3Xマイクロプレートリーダー(Molecular Devices)によって検出した。キモトリプシン様プロテアソーム活性を、それぞれ100%及び0%対照によって正規化した。
NIH3T3(RHOP23H/GFP)、NIH3T3(RHOWT/GFP)及びNIH3T3細胞を、20μLの完全培地中2500細胞/ウェルの白色壁透明底384ウェルプレートに播種した。3時間のインキュベーションの後、MTXを含む完全培地5μL/ウェルを細胞に添加して、細胞を最終濃度0.0195~10μMで24時間処理した。0.1%のDMSOを含む完全培地で処理した細胞を100%対照として使用し、5μMのMG-132で8時間処理した細胞を0%対照として使用した。終点プロテアソーム活性測定のために、各ウェルに、Suc-LLVY-Glo(商標)基質(Promega,G8660,Madison,WI USA)を含むプロテアソーム-Glo(商標)試薬25μLを加えた。384ウェルプレートを2分間振盪し、溶液を混合し、続いて室温で24分間インキュベートした。各ウェルの発光を、SpectraMax I3Xマイクロプレートリーダー(Molecular Devices)によって検出した。キモトリプシン様プロテアソーム活性を、それぞれ100%及び0%対照によって正規化した。
動物
Krzysztof Palczewski博士の実験室によって作製されたC57BL/6J(Rho+/+)マウス及びRhoP23H/P23Hマウスを、Jackson Laboratory(ストック番号017628)から購入した。RhoP23H/P23Hマウスを野生型C57BL/6Jマウスと交配させ、P23Hヘテロ接合体マウスを作製した。全ての系統の遺伝子型決定は、それぞれフォワード及びリバースプライマー:1)GGTAGCACTGTTGGGCATCT(配列番号5);及び2)GACCCCACAGAGACAAGCTC(配列番号6)を用いて指示通り行った。573及び399bpのPCR産物は、それぞれP23Hノックアウト変異体及びRHO遺伝子のWT対立遺伝子を示した。マウスを育種し、ピッツバーグ大学動物施設で、標準的な12時間明るい/12時間暗い条件下に収容した。全ての動物実験は、動物愛護法及び規則のためのガイドに従って、ピッツバーグ大学施設内動物管理使用委員会(IACUC)によって承認された。
Krzysztof Palczewski博士の実験室によって作製されたC57BL/6J(Rho+/+)マウス及びRhoP23H/P23Hマウスを、Jackson Laboratory(ストック番号017628)から購入した。RhoP23H/P23Hマウスを野生型C57BL/6Jマウスと交配させ、P23Hヘテロ接合体マウスを作製した。全ての系統の遺伝子型決定は、それぞれフォワード及びリバースプライマー:1)GGTAGCACTGTTGGGCATCT(配列番号5);及び2)GACCCCACAGAGACAAGCTC(配列番号6)を用いて指示通り行った。573及び399bpのPCR産物は、それぞれP23Hノックアウト変異体及びRHO遺伝子のWT対立遺伝子を示した。マウスを育種し、ピッツバーグ大学動物施設で、標準的な12時間明るい/12時間暗い条件下に収容した。全ての動物実験は、動物愛護法及び規則のためのガイドに従って、ピッツバーグ大学施設内動物管理使用委員会(IACUC)によって承認された。
硝子体内注射(IVI)
インビボで網膜に対する化合物の効果を決定するために、本発明者らは化合物を硝子体空間に直接投与した。簡単に説明すると、マウスを1%トロピカミド点眼液(Akorn,Lake Forest,IL USA)で処置して、瞳孔を広げ、次いで、80mg/kg体重(bw)のケタミン(Henry Schein,Dublin,OH USA)及び7mg/kg bwのキシラジン(Bimeda,Le Sueur,MN USA)の腹腔内注射で麻酔した。注射前の局所麻酔薬として、0.5%の塩酸テトラカイン(TCI、東京、日本)1滴をマウスの眼に適用した。注射の間に、眼用の0.3%ヒプロメロースゲル(Alcon,Fort Worth,TX USA)によって眼を潤滑化した。体温を維持するために加熱パッドを使用した。マウスを位置付けて、眼の強膜を露出させた。30ゲージの針(Medline,Northfield,IL USA)を用いて、45°の角度で角膜の後方の強膜を通して穴をあけた。33ゲージの鈍端針(Hamilton,Reno,NV USA)を使用して穴に挿入し、合計0.5μLの滅菌PBS又はPBS中のMTXをゆっくりと後部チャンバーに注入し、針をその場に約30秒間保持し、針をゆっくりと取り除いた。少量のトリ抗生物質軟膏(Medline,Northfield,IL USA)を注射部位にアプライして、感染を防止した。生後日(PND)15に、各RhoP23H/+マウスの一方の眼に25又は100pmolのMTXを単回IVI投与し、PBSをビヒクル対照として他方の眼に注射した。本発明者らはまた、PND15、22、29及び36に、RhoP23H/+マウスの第2のグループにMTX又はPBSのIVIを週4回行った。
インビボで網膜に対する化合物の効果を決定するために、本発明者らは化合物を硝子体空間に直接投与した。簡単に説明すると、マウスを1%トロピカミド点眼液(Akorn,Lake Forest,IL USA)で処置して、瞳孔を広げ、次いで、80mg/kg体重(bw)のケタミン(Henry Schein,Dublin,OH USA)及び7mg/kg bwのキシラジン(Bimeda,Le Sueur,MN USA)の腹腔内注射で麻酔した。注射前の局所麻酔薬として、0.5%の塩酸テトラカイン(TCI、東京、日本)1滴をマウスの眼に適用した。注射の間に、眼用の0.3%ヒプロメロースゲル(Alcon,Fort Worth,TX USA)によって眼を潤滑化した。体温を維持するために加熱パッドを使用した。マウスを位置付けて、眼の強膜を露出させた。30ゲージの針(Medline,Northfield,IL USA)を用いて、45°の角度で角膜の後方の強膜を通して穴をあけた。33ゲージの鈍端針(Hamilton,Reno,NV USA)を使用して穴に挿入し、合計0.5μLの滅菌PBS又はPBS中のMTXをゆっくりと後部チャンバーに注入し、針をその場に約30秒間保持し、針をゆっくりと取り除いた。少量のトリ抗生物質軟膏(Medline,Northfield,IL USA)を注射部位にアプライして、感染を防止した。生後日(PND)15に、各RhoP23H/+マウスの一方の眼に25又は100pmolのMTXを単回IVI投与し、PBSをビヒクル対照として他方の眼に注射した。本発明者らはまた、PND15、22、29及び36に、RhoP23H/+マウスの第2のグループにMTX又はPBSのIVIを週4回行った。
網膜電図(ERG)
ERGは、先に記載したように、Celerisシステム(Diagnosys,Lowell,MA, USA)を用いて実施した。各試験の前に、マウスを暗闇に一晩おいた。1%トロピカミド点眼液(Akorn,Lake Forest,IL USA)で瞳孔を広げた。80mg/kg bwのケタミン及び7mg/kg bwのキシラジンの腹腔内注射でマウスに麻酔した。眼用の0.3%ヒプロメロースゲル(Alcon,Fort Worth,TX USA)によって眼を潤滑化した。体温を37℃で維持するために加熱パッドを用いた。0.01cd・s/m2~30cd・s/m2の10回のフラッシュに対する暗さに適合させた眼の暗順応ERG応答を記録し、10~30秒のスイープ間隔でフラッシュ強度あたり3回のスイープから平均化した。5分の10cd/m2照明ヘの曝露後、10cd/m2のバックグラウンド光に加えて、0.01cd・s/m2~30cd・s/m2のフラッシュに応答して光に適合させた眼から明順応ERG応答を記録した。MTX処置群及びビヒクル(PBS)群における応答振幅間の統計的有意性を決定するために、2元配置ANOVAによってP値を計算した。要因1、治療条件;及び要因2は、フラッシュ強度。
ERGは、先に記載したように、Celerisシステム(Diagnosys,Lowell,MA, USA)を用いて実施した。各試験の前に、マウスを暗闇に一晩おいた。1%トロピカミド点眼液(Akorn,Lake Forest,IL USA)で瞳孔を広げた。80mg/kg bwのケタミン及び7mg/kg bwのキシラジンの腹腔内注射でマウスに麻酔した。眼用の0.3%ヒプロメロースゲル(Alcon,Fort Worth,TX USA)によって眼を潤滑化した。体温を37℃で維持するために加熱パッドを用いた。0.01cd・s/m2~30cd・s/m2の10回のフラッシュに対する暗さに適合させた眼の暗順応ERG応答を記録し、10~30秒のスイープ間隔でフラッシュ強度あたり3回のスイープから平均化した。5分の10cd/m2照明ヘの曝露後、10cd/m2のバックグラウンド光に加えて、0.01cd・s/m2~30cd・s/m2のフラッシュに応答して光に適合させた眼から明順応ERG応答を記録した。MTX処置群及びビヒクル(PBS)群における応答振幅間の統計的有意性を決定するために、2元配置ANOVAによってP値を計算した。要因1、治療条件;及び要因2は、フラッシュ強度。
組織収集及び免疫組織化学(IHC)
マウスを安楽死させ、各目の上側を焼灼ペンによって作製される燃焼マークで標識した。1対の湾曲した先端鉗子によって眼の除核を行い、新たに調製した4%パラホルムアルデヒドで2時間固定した。固定した眼を、PBS中5、10、20及び40%のスクロース溶液で各々、室温で30分間連続的に脱水した。最後に、4℃で一晩、1:1の体積比で、PBS及びO.C.T化合物(FisherScientific,Houston,TX USA)中40%スクロースの混合物中で眼をインキュベートした後、それらを同じ混合溶液中に配向特異的に包埋し、液体窒素浴イソブテン中で凍結させた。12ミクロンの網膜断面を、-16℃でミクロトームによって作製し、視神経頭を含むものをSuperFrostガラススライド(FisherScientific,Houston,TX USA)上にアプライした。次いで、これらのスライドをIHCに使用した。PBST中で15分間再水和及び透過処理をした後、網膜切片を5%ヤギ血清中で30分間インキュベートし、次いで、マウス1D4抗ロドプシン抗体(20μg/mL)を含むPBSと加湿チャンバー内で、室温で2時間インキュベートした。網膜切片をPBSTで4回洗浄し、Cy3コンジュゲートヤギ抗マウス抗体(5μg/mL)と室温で1時間インキュベートした。ヘキスト33342(1:10000希釈)をアプライし、5分間核を染色した。切片をProlongGoldマウンティング溶液(ThermoFisher,Waltham,MA USA)でマウントした。次いで、免疫蛍光画像を、低倍率画像については蛍光顕微鏡及び高倍率画像については共焦点顕微鏡により撮影した。全6つの高倍率画像を、光学神経ヘッド(ONH)から0.6、1.0及び1.4mm近接して、網膜凍結切片当たり油を用いて、60×対物レンズを用いて取得した。マジックワンドを用いて対応する層を選択し、選択した領域内の蛍光強度を測定することにより、OS中のロドプシンの免疫蛍光強度及び外核層(ONL)を、ImageJを用いて測定した。ONLにおける核の数を、網膜に沿って200μmに及ぶ各高倍率画像においてONL中のヘキスト33343陽性物体を計数することによって計算した。
マウスを安楽死させ、各目の上側を焼灼ペンによって作製される燃焼マークで標識した。1対の湾曲した先端鉗子によって眼の除核を行い、新たに調製した4%パラホルムアルデヒドで2時間固定した。固定した眼を、PBS中5、10、20及び40%のスクロース溶液で各々、室温で30分間連続的に脱水した。最後に、4℃で一晩、1:1の体積比で、PBS及びO.C.T化合物(FisherScientific,Houston,TX USA)中40%スクロースの混合物中で眼をインキュベートした後、それらを同じ混合溶液中に配向特異的に包埋し、液体窒素浴イソブテン中で凍結させた。12ミクロンの網膜断面を、-16℃でミクロトームによって作製し、視神経頭を含むものをSuperFrostガラススライド(FisherScientific,Houston,TX USA)上にアプライした。次いで、これらのスライドをIHCに使用した。PBST中で15分間再水和及び透過処理をした後、網膜切片を5%ヤギ血清中で30分間インキュベートし、次いで、マウス1D4抗ロドプシン抗体(20μg/mL)を含むPBSと加湿チャンバー内で、室温で2時間インキュベートした。網膜切片をPBSTで4回洗浄し、Cy3コンジュゲートヤギ抗マウス抗体(5μg/mL)と室温で1時間インキュベートした。ヘキスト33342(1:10000希釈)をアプライし、5分間核を染色した。切片をProlongGoldマウンティング溶液(ThermoFisher,Waltham,MA USA)でマウントした。次いで、免疫蛍光画像を、低倍率画像については蛍光顕微鏡及び高倍率画像については共焦点顕微鏡により撮影した。全6つの高倍率画像を、光学神経ヘッド(ONH)から0.6、1.0及び1.4mm近接して、網膜凍結切片当たり油を用いて、60×対物レンズを用いて取得した。マジックワンドを用いて対応する層を選択し、選択した領域内の蛍光強度を測定することにより、OS中のロドプシンの免疫蛍光強度及び外核層(ONL)を、ImageJを用いて測定した。ONLにおける核の数を、網膜に沿って200μmに及ぶ各高倍率画像においてONL中のヘキスト33343陽性物体を計数することによって計算した。
統計的分析
HTS及びハイコンテントイメージングアッセイを、0%と約100%の対照の16の反復を含む各アッセイプレートを用いて実施し、Z’をプレートごとに計算し、各プレートの結果が対照により適切に計算された堅牢な活性スコアであることを示す、HTSについてはZ’>0.5及びハイコンテントイメージングアッセイについてはZ’>0を確実にした。Z’=1-3×(SD0%対照+SD約100%対照)/(平均0%対照-平均約100%対照)。
HTS及びハイコンテントイメージングアッセイを、0%と約100%の対照の16の反復を含む各アッセイプレートを用いて実施し、Z’をプレートごとに計算し、各プレートの結果が対照により適切に計算された堅牢な活性スコアであることを示す、HTSについてはZ’>0.5及びハイコンテントイメージングアッセイについてはZ’>0を確実にした。Z’=1-3×(SD0%対照+SD約100%対照)/(平均0%対照-平均約100%対照)。
ERG応答は2つの要因の化合物処理(要因1)とフラッシュ強度(要因2)の影響を受け得るので、ERG記録を二元配置分散分析(ANOVA)により分析した。p1及びp2は、化合物処理及びフラッシュ強度がそれぞれERG応答に顕著に影響するかどうかを決定する一方で、p1-2は、2つの要因が互いに相互作用するかどうかを決定した。他のアッセイを、対応のない両側スチューデントのt検定によって分析した。有意性についての基準は、有意ではないがp>0.05;*p<00.5)、**p<00.1)、***p<0.001;****p<0.0001。試料サイズを、関数:1)
及び2)
(式中、
σはSDであり、φは標準的な正規分布関数であり、αは0.05に設定したタイプIエラー又はP値であり、τは行われる比較の数であり、βはタイプIIエラーであり、1-βは0.90に設定したパワーである)
を用いるパワー解析に基づいて選択した(39)。雄と雌の両方を、動物研究の各試料群にランダムに含めた。
σはSDであり、φは標準的な正規分布関数であり、αは0.05に設定したタイプIエラー又はP値であり、τは行われる比較の数であり、βはタイプIIエラーであり、1-βは0.90に設定したパワーである)
を用いるパワー解析に基づいて選択した(39)。雄と雌の両方を、動物研究の各試料群にランダムに含めた。
結果
HTSはP23Hロドプシンを選択的に減少させる46個の化合物を特定した
誤って折り畳まれたP23Hロドプシン変異タンパク質を明らかにする小分子を特定するために、本発明者らは、P23Hロドプシンと融合したレポーターとして明るいRlucを安定に発現するHek293細胞株(Hek293(RHOP23H-Rluc)、図1A及び図8)を用いて、細胞ベースのHTSアッセイを開発した。光受容細胞株は培養には利用できないので、本発明者らは、HTSに最も一般的に使用されているHek293細胞のうちの1つを選択した。このルシフェラーゼレポーターアッセイを用いて、24時間の化合物処理に応答するP23Hロドプシンを定量するために、本発明者らは、合計6つの化合物コレクション中に68,979個の小分子のHTSを実施した(図1B、表4)。1つの用量(9.96~16.13μM)で試験した平均-2SD(表1)におけるカットオフよりも低い活性スコアを有する2072個の化合物を3つの化合物コレクションから特定し、7~11用量で試験したEC50<20μMである128個のヒットを他の3つの化合物コレクションから特定した。ヒット選択プロセスにおいて、本発明者らは、組換えRluc活性を阻害する化合物を除外し、10μMの化合物濃度で野生型(WT)ロドプシンを発現するHek293(RHOWT-Rluc)細胞上で発光を減少させない化合物のみを選択するためにカウンタースクリーニングを実施し、これらの選択した化合物が変異ロドプシンのクリアランスを選択的に好むことを示唆している。次いで、本発明者らは、ルシフェラーゼレポーターアッセイにより、Hek293(RHOP23H-Rluc)及びHek293(RHOWT-Rluc)細胞におけるこれらの化合物の用量応答効果を試験し、P23Hロドプシンを選択的に減少させるこれらの化合物の効力及び有効性を測定した(図1C)。一緒、変異ロドプシン選択性を有する46個の化合物を、この68,979個の化合物のHTSから確認した。
HTSはP23Hロドプシンを選択的に減少させる46個の化合物を特定した
誤って折り畳まれたP23Hロドプシン変異タンパク質を明らかにする小分子を特定するために、本発明者らは、P23Hロドプシンと融合したレポーターとして明るいRlucを安定に発現するHek293細胞株(Hek293(RHOP23H-Rluc)、図1A及び図8)を用いて、細胞ベースのHTSアッセイを開発した。光受容細胞株は培養には利用できないので、本発明者らは、HTSに最も一般的に使用されているHek293細胞のうちの1つを選択した。このルシフェラーゼレポーターアッセイを用いて、24時間の化合物処理に応答するP23Hロドプシンを定量するために、本発明者らは、合計6つの化合物コレクション中に68,979個の小分子のHTSを実施した(図1B、表4)。1つの用量(9.96~16.13μM)で試験した平均-2SD(表1)におけるカットオフよりも低い活性スコアを有する2072個の化合物を3つの化合物コレクションから特定し、7~11用量で試験したEC50<20μMである128個のヒットを他の3つの化合物コレクションから特定した。ヒット選択プロセスにおいて、本発明者らは、組換えRluc活性を阻害する化合物を除外し、10μMの化合物濃度で野生型(WT)ロドプシンを発現するHek293(RHOWT-Rluc)細胞上で発光を減少させない化合物のみを選択するためにカウンタースクリーニングを実施し、これらの選択した化合物が変異ロドプシンのクリアランスを選択的に好むことを示唆している。次いで、本発明者らは、ルシフェラーゼレポーターアッセイにより、Hek293(RHOP23H-Rluc)及びHek293(RHOWT-Rluc)細胞におけるこれらの化合物の用量応答効果を試験し、P23Hロドプシンを選択的に減少させるこれらの化合物の効力及び有効性を測定した(図1C)。一緒、変異ロドプシン選択性を有する46個の化合物を、この68,979個の化合物のHTSから確認した。
ヒットバリデーションは9個のヒットを確認した
細胞株又はRluc融合に関連する偽陽性を排除し、WTロドプシンを上回るP23Hのクリアランスに対する46個のヒットの選択的活性を確認するために、本発明者らは、それぞれP23Hロドプシン(NIH3T3(RHOP23H/GFP))及びWTロドプシン(NIH3T3(RHOWT/GFP))を安定的に発現する2つのNIH3T3細胞株においてこれらの化合物を試験した。HTSに使用したHek293由来の異なる細胞株を用いて、細胞型特異的でない活性を有する化合物を選択した。本発明者らはまた、WTロドプシンと比較してP23Hの選択的低下を示した各化合物10μMで処理したNIH3T3(RHOP23H/GFP)及びNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞からの細胞溶解物のドットブロットを用いてロドプシンレベルを決定した(図1D~G及び図9)。本発明者らは、これらの化合物で24時間処理した後に、これらの細胞中のP23H及びWTロドプシンを定量するために、ロドプシン免疫蛍光のハイコンテントイメージング分析を使用した(図1H及び2)。結果として、本発明者らは、哺乳動物細胞中で誤って折り畳まれたP23Hロドプシンを選択的に除去する9個の化合物を検証した(図1H及び表2)。
細胞株又はRluc融合に関連する偽陽性を排除し、WTロドプシンを上回るP23Hのクリアランスに対する46個のヒットの選択的活性を確認するために、本発明者らは、それぞれP23Hロドプシン(NIH3T3(RHOP23H/GFP))及びWTロドプシン(NIH3T3(RHOWT/GFP))を安定的に発現する2つのNIH3T3細胞株においてこれらの化合物を試験した。HTSに使用したHek293由来の異なる細胞株を用いて、細胞型特異的でない活性を有する化合物を選択した。本発明者らはまた、WTロドプシンと比較してP23Hの選択的低下を示した各化合物10μMで処理したNIH3T3(RHOP23H/GFP)及びNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞からの細胞溶解物のドットブロットを用いてロドプシンレベルを決定した(図1D~G及び図9)。本発明者らは、これらの化合物で24時間処理した後に、これらの細胞中のP23H及びWTロドプシンを定量するために、ロドプシン免疫蛍光のハイコンテントイメージング分析を使用した(図1H及び2)。結果として、本発明者らは、哺乳動物細胞中で誤って折り畳まれたP23Hロドプシンを選択的に除去する9個の化合物を検証した(図1H及び表2)。
9つの変異体ロドプシン選択的ヒットのケモインフォマティクス
9つのヒットの中で、2つの化合物(CL-002及びCL-004)のみが、以前に知られた薬理学的活性を有していない。それらのうちの4つ(CL-001、CL-006、CL-007、及びCL-008)は、汎サイクリン依存性キナーゼ阻害剤であった(図1H)。CL-003は、1(NOD1)、NOD2、ハンチンチン、腫瘍壊死要因α、グリコーゲンシンターゼキナーゼ3などを含むヌクレオチド結合オリゴマー化ドメインを含む異なるタンパク質を標的とする多数のアッセイにおいて活性が証明されており、多くの標的と非選択的に相互作用する汎アッセイ干渉化合物であり得る。CL-005は、プロリルヒドロキシラーゼの阻害剤、及び熱ショック誘導因子1αの安定化剤であり、低酸素応答の誘導において活性が示唆されている。CL-009、MTXは、癌及び関節リウマチの治療のための承認薬である。しかし、これらの化合物がP23Hロドプシンクリアランスを媒介する分子の作用メカニズムは、さらなる調査を必要とする。
9つのヒットの中で、2つの化合物(CL-002及びCL-004)のみが、以前に知られた薬理学的活性を有していない。それらのうちの4つ(CL-001、CL-006、CL-007、及びCL-008)は、汎サイクリン依存性キナーゼ阻害剤であった(図1H)。CL-003は、1(NOD1)、NOD2、ハンチンチン、腫瘍壊死要因α、グリコーゲンシンターゼキナーゼ3などを含むヌクレオチド結合オリゴマー化ドメインを含む異なるタンパク質を標的とする多数のアッセイにおいて活性が証明されており、多くの標的と非選択的に相互作用する汎アッセイ干渉化合物であり得る。CL-005は、プロリルヒドロキシラーゼの阻害剤、及び熱ショック誘導因子1αの安定化剤であり、低酸素応答の誘導において活性が示唆されている。CL-009、MTXは、癌及び関節リウマチの治療のための承認薬である。しかし、これらの化合物がP23Hロドプシンクリアランスを媒介する分子の作用メカニズムは、さらなる調査を必要とする。
ロドプシン転写及び生分解に対する9つの確認済み化合物の効果
本発明者らは、P23Hロドプシンの選択的クリアランスの効果が、ロドプシンの生合成の低下又は分解の増強のいずれかによるものであるかを決定するために、24時間、各ヒット化合物で処理した、又は処理していないNIH3T3(RHOP23H/GFP)及びNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞でqPCR及び非放射性パルスチェイスアッセイを行った。qPCRは、WTとP23Hロドプシン転写物の両方が、DMSO対照と比較してCL-001、CL-002、CL-003、CL-004、CL-006、CL-007及びCL-008により非選択的に低下したことを示した(図3A)。驚くべきことに、CL-005は、DMSO対照と比較してNIH3T3(RHOP23H/GFP)とNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞の両方においてロドプシン転写物を2倍増加させる一方で、CL-009/MTXは、WTとP23Hロドプシンの両方の転写に影響を及ぼさなかった。
本発明者らは、P23Hロドプシンの選択的クリアランスの効果が、ロドプシンの生合成の低下又は分解の増強のいずれかによるものであるかを決定するために、24時間、各ヒット化合物で処理した、又は処理していないNIH3T3(RHOP23H/GFP)及びNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞でqPCR及び非放射性パルスチェイスアッセイを行った。qPCRは、WTとP23Hロドプシン転写物の両方が、DMSO対照と比較してCL-001、CL-002、CL-003、CL-004、CL-006、CL-007及びCL-008により非選択的に低下したことを示した(図3A)。驚くべきことに、CL-005は、DMSO対照と比較してNIH3T3(RHOP23H/GFP)とNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞の両方においてロドプシン転写物を2倍増加させる一方で、CL-009/MTXは、WTとP23Hロドプシンの両方の転写に影響を及ぼさなかった。
非放射性パルスチェイスアッセイにおいて、本発明者らは、NIH3T3(RHOWT/GFP)及びNIH3T3(RHOP23H/GFP)細胞の培地中でメチオニン(Met)をAHAに、Metの類似体を側鎖中のアジド基に置換し、その後、培地にMetを添加し、24時間チェイスすることにより、一時的に新生タンパク質を4時間標識した。「クリック」反応を介してAHA組み込みタンパク質にBTNを付着させ、細胞溶解物を1D4抗ロドプシン抗体で免疫沈降させ、SAでドットブロットすることにより、残りのAHA標識ロドプシンを測定した(図3B)。本発明者らは、BTN-AHA標識P23Hロドプシンが、DMSO対照と比較して、10μMのCL-001、CL-002、CL-005、CL-007及びCL-009(MTX)での処理による24時間のチェイスで顕著に低下したことを見出した(図3C及び図10)。全P23Hロドプシンのプルダウンレベルが試験した全9個のヒットによって減少し、以前に検証された活性が確認された(図10F)。この結果は、これら5つの化合物(CL-001、CL-002、CL-005、CL-007及びCL-009/MTX)のみが、誤って折り畳まれたロドプシンの分解を加速させたことを示唆する。一緒に、ロドプシンドットブロット、qPCR及びパルスチェイスアッセイの結果は、(表3)ヒット化合物が、1)ロドプシン転写のみ低下させる(CL-003、CL-004、CL-006、及びCL-008)、2)分解のみ増加させる(CL-005及びCL-009)、又は3)転写の減少とP23Hロドプシンの分解の増加の両方(CL-001、CL-002、及びCL-007)によってP23Hロドプシンを低下させることを示した。安定細胞におけるロドプシンの転写は、ロドプシンプロモーターではなく、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーターによって促進されるため、グループ1)化合物は、インビボでP23Hロドプシンレベルに影響を与えない可能性があるので、この研究のさらなる調査に含めなかった。5個の化合物(CL-001、CL-002、CL-005、CL-007、及びCL-009)のみが、さらなる研究のために残った。
他の誤って折り畳まれたロドプシン変異体のクリアランスに対する5個の化合物の活性
これらの5個の確認済み化合物がインビトロで他のRPを引き起こすロドプシン変異体のクリアランスに影響を及ぼすかどうかを決定するために、本発明者らは、これらの化合物で処理した場合に、U2OS細胞で安定に発現し、adRPを引き起こす6つのロドプシン変異体(T4R、P23H、P53R、C110Y、D190N及びP237L、図8)のタンパク質レベルを測定した。これらのクラスII変異体は、ロドプシンのミスフォールディングを引き起こすと以前に報告された(www.hgmd.cf.ac.uk)。本明細書で使用するU2OS細胞は、ロドプシン輸送をレスキューする際の小分子シャペロンの効果を定量するために以前に使用した。ロドプシンのレベルを定量するために、免疫蛍光及びハイコンテントイメージングを用いて、本発明者らは、5つの化合物のいずれもロドプシン変異体の細胞局在化に影響を及ぼさなかったが、これらのロドプシン変異体の免疫蛍光強度は、CL-001、CL-002、CL-005、及びCL-007(図3D及び図11)によって低下したことを見出した。CL-009(MTX)処理単独では、P23H、C110Y、D190N及びP267L変異体を発現する細胞において用量依存的低下を示したが、T4R及びP53R変異体では示さなかった。NIH3T3(図2A)及びU2OS細胞(図3D)におけるP23Hロドプシンクリアランスに対するこれらの化合物のわずかに異なる薬理学的活性は、2つの安定な細胞株におけるP23Hロドプシンの細胞型及び発現レベルの差によるものである。次いで、本発明者らは、CL-009(MTX)が、転写に影響を及ぼすことなく変異ロドプシン分解を加速させる唯一の化合物であるので、その作用メカニズム及びインビボでの効力研究のためにCL-009(MTX)に焦点を合わせた。
これらの5個の確認済み化合物がインビトロで他のRPを引き起こすロドプシン変異体のクリアランスに影響を及ぼすかどうかを決定するために、本発明者らは、これらの化合物で処理した場合に、U2OS細胞で安定に発現し、adRPを引き起こす6つのロドプシン変異体(T4R、P23H、P53R、C110Y、D190N及びP237L、図8)のタンパク質レベルを測定した。これらのクラスII変異体は、ロドプシンのミスフォールディングを引き起こすと以前に報告された(www.hgmd.cf.ac.uk)。本明細書で使用するU2OS細胞は、ロドプシン輸送をレスキューする際の小分子シャペロンの効果を定量するために以前に使用した。ロドプシンのレベルを定量するために、免疫蛍光及びハイコンテントイメージングを用いて、本発明者らは、5つの化合物のいずれもロドプシン変異体の細胞局在化に影響を及ぼさなかったが、これらのロドプシン変異体の免疫蛍光強度は、CL-001、CL-002、CL-005、及びCL-007(図3D及び図11)によって低下したことを見出した。CL-009(MTX)処理単独では、P23H、C110Y、D190N及びP267L変異体を発現する細胞において用量依存的低下を示したが、T4R及びP53R変異体では示さなかった。NIH3T3(図2A)及びU2OS細胞(図3D)におけるP23Hロドプシンクリアランスに対するこれらの化合物のわずかに異なる薬理学的活性は、2つの安定な細胞株におけるP23Hロドプシンの細胞型及び発現レベルの差によるものである。次いで、本発明者らは、CL-009(MTX)が、転写に影響を及ぼすことなく変異ロドプシン分解を加速させる唯一の化合物であるので、その作用メカニズム及びインビボでの効力研究のためにCL-009(MTX)に焦点を合わせた。
プロテアソーム経路ではなく、リソソーム経路を介するMTX媒介P23Hロドプシンクリアランス
ロドプシンは、プロテアソームとリソソームの経路の両方を介して分解される。どのタンパク質分解経路がMTX媒介性P23Hロドプシンクリアランスに関与しているかを決定するために、本発明者らは、MTXに加えて、リソソームの酸性化及び活性を防止するATPase阻害剤のバフィロマイシンA1(BafA1)、又はプロテアソーム阻害剤であるMG-132のいずれかを用いて、NIH3T3(RHOP23H/GFP)及びNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞を処理し、イムノブロットによってこれらの細胞中のP23H又はWTロドプシンレベルを定量した。本発明者らは、MG-132処理ではなく、BafA1処理のみがMTX誘導性P23Hロドプシンクリアランスを廃止したことを見出し、プロテアソーム経路よりむしろリソソーム経路がMTX媒介性P23Hロドプシンクリアランスに関与することを示唆した(図4A&B及び図12)。BafA1及びMTXの同時処理はWTロドプシンの蓄積ももたらす一方で、MG-132+MTXはもたらさなかったことから(図4A&B)、WTとP23Hロドプシンの両方が、これらのNIH3T3安定細胞中のリソソーム経路を介して主に分解されることが示唆された。
ロドプシンは、プロテアソームとリソソームの経路の両方を介して分解される。どのタンパク質分解経路がMTX媒介性P23Hロドプシンクリアランスに関与しているかを決定するために、本発明者らは、MTXに加えて、リソソームの酸性化及び活性を防止するATPase阻害剤のバフィロマイシンA1(BafA1)、又はプロテアソーム阻害剤であるMG-132のいずれかを用いて、NIH3T3(RHOP23H/GFP)及びNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞を処理し、イムノブロットによってこれらの細胞中のP23H又はWTロドプシンレベルを定量した。本発明者らは、MG-132処理ではなく、BafA1処理のみがMTX誘導性P23Hロドプシンクリアランスを廃止したことを見出し、プロテアソーム経路よりむしろリソソーム経路がMTX媒介性P23Hロドプシンクリアランスに関与することを示唆した(図4A&B及び図12)。BafA1及びMTXの同時処理はWTロドプシンの蓄積ももたらす一方で、MG-132+MTXはもたらさなかったことから(図4A&B)、WTとP23Hロドプシンの両方が、これらのNIH3T3安定細胞中のリソソーム経路を介して主に分解されることが示唆された。
本発明者らは、これらの処理を繰り返し、免疫蛍光及びハイコンテントイメージングによりロドプシンレベルを定量した(図4C&D)。本発明者らは、細胞当たりのP23Hロドプシン免疫染色の平均強度が、MTX用量依存的に低下し、MG-132の添加によって影響されないが、BafA1との同時処理によって完全に消失したことを見出した。この結果は、MTXがリソソーム経路を介してP23Hロドプシンの分解を選択的に改善した上記のイムノブロットデータを確認した。
発明者らは、さらに、MTX処理が、NIH3T3(RHOP23H/GFP)及びNIH3T3(RHOWT/GFP)細胞におけるキモトリプシン様プロテアソーム活性に影響を及ぼさないことを見出し(図4E~G)、MTXがプロテアソーム経路に影響を及ぼさないという結論を確認した。
MTXはインビボでオートファジーフラックスを増加させた
オートファジーは、リソソーム活性を介してタンパク質凝集体のクリアランスを調節することが知られているので、MTX処置が、RPの一般的に使用されている動物モデルであるRhoP23H/+ノックインマウスにおいてオートファジーに影響を及ぼすかどうかを調べた。PND15に、IVIによる25pmolのMTXを一方の眼に、ビヒクル対照として等容量のPBSを他方の眼に投与した。オートファジーフラックスがMTXによって影響を受けたかどうかを決定するために、治療の48時間後に網膜中のLC3及びSQSTM1/p62をイムノブロットした(図5)。LC3-IIは、オートファゴソームに組み込まれるLC3の脂質化形態であり、SQSTM1/p62はオートファジーフラックスの既知のカーゴである。PBS対照と比較して、MTX処置は、SQSTM1/p62レベルの減少(図5B)及びLC3-IIの増加(図5C)をもたらし、MTXがインビボでオートファジーフラックスを増加させたことが示唆された。
オートファジーは、リソソーム活性を介してタンパク質凝集体のクリアランスを調節することが知られているので、MTX処置が、RPの一般的に使用されている動物モデルであるRhoP23H/+ノックインマウスにおいてオートファジーに影響を及ぼすかどうかを調べた。PND15に、IVIによる25pmolのMTXを一方の眼に、ビヒクル対照として等容量のPBSを他方の眼に投与した。オートファジーフラックスがMTXによって影響を受けたかどうかを決定するために、治療の48時間後に網膜中のLC3及びSQSTM1/p62をイムノブロットした(図5)。LC3-IIは、オートファゴソームに組み込まれるLC3の脂質化形態であり、SQSTM1/p62はオートファジーフラックスの既知のカーゴである。PBS対照と比較して、MTX処置は、SQSTM1/p62レベルの減少(図5B)及びLC3-IIの増加(図5C)をもたらし、MTXがインビボでオートファジーフラックスを増加させたことが示唆された。
MTXの1回のIVIは、Rho P23H/+ マウスにおいてERG応答及び網膜ロドプシンレベルを増加させた
RhoP23H/+マウスの光受容体は、PND15から1ヶ月齢までの急速な変性期間を受け、その後、より遅い速度で死亡する。本発明者らは、RhoP23H/+マウスにおける網膜変性の速い段階に、網膜の機能及び構造に対するMTX処置の効果を試験した。PND15に、これらのマウスの一方の眼に25又は100pmolのMTXを、他方の眼にビヒクル対照としての等量のPBSをIVI投与し、PND32にこれらのマウスの暗順応及び明順応全視野ERGを記録した。これらの2つの用量を、マウスの眼球の体積、及びインビトロでのMTXの有効濃度に基づいて推定した。10cd・s/m2での代表的な暗順応ERG応答は、25pmolのMTXで処置したRhoP23H/+マウスの眼のa波及びb波がPBS及び未処置群よりも高いことを示した(図6A)。マルチフラッシュ暗順応ERG測定により、25pmolのMTXで処置したRhoP23H/+の眼のa波とb波の両方はPBS又は未処置眼よりも顕著に高いが、100pmolのMTXで処置した眼は効果を示さなかったことが確認された(図6B&C)。25pmolのMTXで処置したRhoP23H/+眼はまた、PBSで処置した又は未処置の目よりも高い明順応ERG応答を示した(図6D)が、100pmolのMTXはいずれの効果も示さなかった。暗順応及び明順応のa波に対するb波の振幅の比は、MTX処置によって影響されず、25pmolのMTXによるb波の機能的増加は主に光受容体機能の増加によるものであるが、独立して増加した双極細胞応答ではないことが示唆された(図13A~B)。PBS処置群は、非処置群に対する暗順応又は明順応応答に差がなく、単回IVIが安全であり、視覚機能に影響を及ぼさないことが示唆された。
RhoP23H/+マウスの光受容体は、PND15から1ヶ月齢までの急速な変性期間を受け、その後、より遅い速度で死亡する。本発明者らは、RhoP23H/+マウスにおける網膜変性の速い段階に、網膜の機能及び構造に対するMTX処置の効果を試験した。PND15に、これらのマウスの一方の眼に25又は100pmolのMTXを、他方の眼にビヒクル対照としての等量のPBSをIVI投与し、PND32にこれらのマウスの暗順応及び明順応全視野ERGを記録した。これらの2つの用量を、マウスの眼球の体積、及びインビトロでのMTXの有効濃度に基づいて推定した。10cd・s/m2での代表的な暗順応ERG応答は、25pmolのMTXで処置したRhoP23H/+マウスの眼のa波及びb波がPBS及び未処置群よりも高いことを示した(図6A)。マルチフラッシュ暗順応ERG測定により、25pmolのMTXで処置したRhoP23H/+の眼のa波とb波の両方はPBS又は未処置眼よりも顕著に高いが、100pmolのMTXで処置した眼は効果を示さなかったことが確認された(図6B&C)。25pmolのMTXで処置したRhoP23H/+眼はまた、PBSで処置した又は未処置の目よりも高い明順応ERG応答を示した(図6D)が、100pmolのMTXはいずれの効果も示さなかった。暗順応及び明順応のa波に対するb波の振幅の比は、MTX処置によって影響されず、25pmolのMTXによるb波の機能的増加は主に光受容体機能の増加によるものであるが、独立して増加した双極細胞応答ではないことが示唆された(図13A~B)。PBS処置群は、非処置群に対する暗順応又は明順応応答に差がなく、単回IVIが安全であり、視覚機能に影響を及ぼさないことが示唆された。
網膜構造及びロドプシンのホメオスタシスを調べるために、本発明者らは、これらの処置マウス(PND33に安楽死させた)からの網膜凍結切片を、OSを標識する抗ロドプシン抗体及び核染色のためのヘキスト33342で免疫染色した。以前に報告されているように、PND33に未処置RhoP23H/+網膜は、Rho+/+網膜と比較して、顕著により短いOS層を示し、ONLにおけるロドプシンレベルが低下し、核数が約半分になり、ロドプシンのホメオスタシスが破壊され、網膜変性が1ヶ月齢でRhoP23H/+マウスに生じたことを支持した(図6E~J&Q-R及び図13C~D&14)。25pmolのMTX処置RhoP23H/+網膜は、下側ではなく上側のPBS対照と比較して、全ロドプシンレベルとOS中のロドプシンにおいて有意な増加を示した。(図6K~Q、及び図13C~D&14)。MTXの処置により、RhoP23H/+網膜のいずれの側にもONL核数の変化は見られず(図6R)、25pmolのMTXの1回のIVIは、網膜変性の速い期間からRhoP23H/+マウスを保護するのに十分ではない可能性が示唆される。PBSで処置した網膜は、未処置のRhoP23H/+網膜と比較して、全ロドプシンのレベル又は局在化にも、ONL核数にも差を示さず、1回のIVI自体が安全で、網膜の形態を変化させないことが確認された(図6H~M&Q~R及び図13C~D)。ERGとIHCの結果を組み合わせると、杆体視細胞の数の増加のせいではない網膜の上側の機能的ロドプシンレベルの増加によって、RhoP23H/+眼における25pmolのMTXの単回IVIがERG応答を改善したと結論付けられる。
MTXの複数回IVIは、Rho P23H/+ マウスにおいてERG応答及びロドプシンレベル並びに光受容細胞数を増加させた
次いで、本発明者らは、ロドプシンホメオスタシスを回復させ、RhoP23H/+マウスにおいて光受容体を保存する際に、MTXの複数回投与が効力を改善したかどうかを調べた(図7)。そのため、本発明者らは、PND15から始めるRhoP23H/+マウスの眼にMTXの週4回のIVIを行った後、PND44にERGを記録し、IHCのためにPND46に動物を安楽死させた。MTXで処置した眼のマルチフラッシュ暗順応及び明順応b波は、PBS対照群(図7A~D)と比較して顕著に増加した。100pmolのMTXで処置したRhoP23H/+眼の明順応b波も、25pmolのMTX群ほど高くないにしても、より高いフラッシュ強度でPBS群よりも高かった(図7D)。ERG記録は、MTXの複数回IVIがビヒクル対照と比較して視覚機能を改善したことを示した。しかし、ビヒクルの毎週のIVIは、未処置対照と比較して、暗順応応答と明順応応答の両方の低下を示し(図7A~D)、毎週のIVIがRhoP23H/+マウスの視覚的機能を損なうことを示唆した。
次いで、本発明者らは、ロドプシンホメオスタシスを回復させ、RhoP23H/+マウスにおいて光受容体を保存する際に、MTXの複数回投与が効力を改善したかどうかを調べた(図7)。そのため、本発明者らは、PND15から始めるRhoP23H/+マウスの眼にMTXの週4回のIVIを行った後、PND44にERGを記録し、IHCのためにPND46に動物を安楽死させた。MTXで処置した眼のマルチフラッシュ暗順応及び明順応b波は、PBS対照群(図7A~D)と比較して顕著に増加した。100pmolのMTXで処置したRhoP23H/+眼の明順応b波も、25pmolのMTX群ほど高くないにしても、より高いフラッシュ強度でPBS群よりも高かった(図7D)。ERG記録は、MTXの複数回IVIがビヒクル対照と比較して視覚機能を改善したことを示した。しかし、ビヒクルの毎週のIVIは、未処置対照と比較して、暗順応応答と明順応応答の両方の低下を示し(図7A~D)、毎週のIVIがRhoP23H/+マウスの視覚的機能を損なうことを示唆した。
25pmolのMTXの4回のIVIで処置したRhoP23H/+網膜のIHCは、PBS群と比較して、下側ではないが、上側においてOS中のロドプシンの顕著により高いレベル、ONL中のロドプシンのより低いレベル、及びONL中のより高い核数を示した(図7E~O及び図13E~F&15D)。結果から、25pmolのMTXの4回のIVIが、変異体とWTロドプシンを区別することができなくとも、網膜の上側においてOS中の折り畳まれたロドプシンを増加させ、ONL中の誤って局在化したロドプシンを減少させたことが示唆された。25pmolのMTXの1回の注射と比較して、MTXの週4回のIVIは網膜保護により高い効力を示し、PBS群と比較して上側でより多くのONL核数を保存したが、1回のMTX注射では保存されなかった。しかし、PBSの週4回のIVIは、未処置対照と比較して、RhoP23H/+網膜のONL中の総ロドプシンレベルの低下及びより低い核数を示し、ERG応答にも見られる週に複数回のIVIによる副作用が確認された(図7E~J及びN~O)。VI間隔の将来の最適化又は処置経路の変更が、長期間のMTX処置に必要である。
異なる段階でのRPの治療戦略は、介入時に生存している光受容体の数に依存して異なる。後期RPの視覚を回復するために、ほとんどの光受容体が無くなった網膜において視覚的応答を再構築するための幹細胞療法、光遺伝学、及び網膜プロステーシスの開発を含む様々な技術に対して多くの努力がなされてきた。網膜構造がまだ大部分が維持されている場合に、遺伝的変異により失われる機能性遺伝子の局所送達により、主に常染色体劣性失明を治療するための遺伝子治療が実質的にブレークスルーとなった。あるいは、毛様体神経栄養因子及び錐体杆体由来神経栄養因子などのアデノ随伴ウイルスによる神経栄養因子の遺伝子送達は、RPの動物モデルにおいて杆体及び錐体の死を遅らせる保護効果をそれぞれ示した。遺伝子治療の補完において、網膜の構造及び機能を保存することができ、視覚がRPの初期又は中間段階で維持できるように、本発明者らは、それらが死ぬ前に杆体内の早期事象を標的とする薬理学的介入を探している。具体的には、本発明者らは、杆体死が遺伝子の機能不全のせいではなく、むしろRHOなどの変異遺伝子のドミナントネガティブ効果のせいであるadRPを標的としている。そのため、この研究の目的は、誤って折り畳まれたロドプシンによって引き起こされるadRPの初期及び中間段階を標的とする予防療法を開発することである。重要なことに、本発明者らは、RPの動物モデルにおいて網膜変性の早い時期から誤って折り畳まれたロドプシンの分解を上方制御し、視覚機能を改善し、網膜構造を保存するFDA認可薬のMTXの新規活性を発見した。潜在的に、MTXによって上方制御されたこの誤って折り畳まれたタンパク質分解経路は、ロドプシン単独のクリアランスに制限されない可能性があり、ミオシリン関連の原発性開放隅角緑内障などの他の誤って折り畳まれたタンパク質関連失明に適用できる。
Gタンパク質共役受容体のタンパク質ホメオスタシスを調節する分子経路はよく理解されていない。新規小分子化合物と薬理学的に活性のある小分子化合物の両方をスクリーニングすることにより、本発明者らは、化学遺伝学を探求し、ロドプシンのホメオスタシスを調節する最も関連する分子経路を見出すことができた。本明細書で、本発明者らは、68,979個の小分子のHTSキャンペーンで、誤って折り畳まれたロドプシンの分解を高める5個の化合物を特定した:CL-001及びCL-007は汎サイクリン依存性キナーゼ阻害剤であり;CL-005はHIF1αの安定剤であり;CL-009(MTX)は葉酸代謝の阻害剤であり;かつCL-002のみは薬理学的活性が報告されていない未知の化学物質である。この研究は、作用メカニズム及びインビボ効果についてMTXにのみ焦点を合わせたが、誤って折り畳まれたロドプシンの分解を媒介することにおけるCKD又は他のキナーゼの潜在的な役割、及びMIF1αの調節要因を探索することは、エキサイティングな将来を導き、膜タンパク質の分解のよりよい理解につながり得る。
MTXは水溶性であり、網膜ブドウ膜炎などの炎症性眼疾患のためのオフタグ治療として硝子体内投与されている。そのため、P23Hロドプシンの選択的クリアランスにおけるMTXの新規活性と、RhoP23H/+マウスにおけるその網膜保護効果があるために、治療可能性を有するこの薬物は、RHO関連adRP治療にも利用できる。
MTXは、P23Hロドプシンの選択的クリアランスにおいて明らかなインビトロ活性を示した。そのため、MTXの単回又は複数回のIVIの後に、RhoP23H/+マウス網膜の上側のロドプシンレベルの増加を観察することは反直感的である。ロドプシン免疫染色のほとんどは、MTX処置したRhoP23H/+マウス網膜のOS上であり(図6及び7)、MTXによるロドプシンの増加は、適切に折り畳まれ、標的部位に輸送されることを示唆している。本明細書で試験したノックインマウスのヘテロ接合性の背景と、抗ロドプシン抗体がWTロドプシンとP23Hロドプシンを区別することができないことを考慮すると、OSにおける折り畳まれたロドプシンレベルの増加におけるMTXの活性は、インビボでP23Hロドプシンの選択的クリアランスのためであり得る。実際に、本発明者らは、RhoP23H/+マウスにおけるMTXのIVI後に、増大したオートファジーフラックスを観察し、MTXが、オートファジーの誘導を介して、誤って折り畳まれたロドプシン分解を増強し得ることが示唆される。この推論を試験するために、本発明者らは、PND15に25pmolのMTXのIVIによるRhoP23H/P23HマウスにおいてP23Hロドプシンレベルに対するMTX処置の効果を決定し、続いて処置後24、48及び72時間の時点で網膜イムノブロットを行った。しかし、RhoP23H/P23HマウスにおけるP23Hロドプシンのタンパク質レベルが低いこと(Rho+/+網膜と比較して約1/200のロドプシン)、及び個々の動物間での変動が高いため、PBS対照と比較して、MTXの処置によりP23Hロドプシンの一貫して統計的に有意な差異は見られなかった(図示せず)。
網膜変性における空間的差異は、RP動物モデル及びRP患者において知られているが、RPにおいて網膜の下側が上側よりも速く変性する理由は明らかではない。興味深いことに、本発明者らは、上側でのみRhoP23H/+網膜へのMTX処置の反復的非対称効力を観察した。薬物処置への応答のこの空間的差異は、RPの齧歯類モデルに対する神経栄養因子のIVIにも見られている。上側と下側の網膜の間の差次的遺伝子発現又は光暴露は、MTX処置の空間感度に寄与し得る。
MTXが100pmolより25pmolでより良好な網膜保護を示した理由は、さらなる調査を必要とする。1つの可能性のある説明としては、誤って折り畳まれたロドプシンを除去することによってその保護効果と共に反作用し得るMTXのより高い用量での細胞傷害性であり得る。1.76μモルのMTX(ウサギの硝子体腔が約1.5mLであることを考慮して、硝子体中約1mMの最終濃度)の硝子体内注射によりウサギにおいて網膜損傷が観察された。マウスの硝子体容積は約5.3μLであるため、100pmolのMTXは18.9μMの初期硝子体濃度をもたらす一方で、25pmolのMTX投与は約4.7μMの硝子体濃度であった(MTXのEC50はインビトロでは約3.3μMである)。100pmolのMTXによって引き起こされる明らかな網膜変性は見られなかったが、この結果は、本発明者らの将来の研究に、MTXの完全な毒性研究が必要であることを示す。RNA-seqによるトランスクリプトーム分析も、MTXによって変更した分子経路を理解するのに重要な将来の方向性である。
本発明者らの結果は、未処置対照と比較して、RhoP23H/+マウスにおける週4回の滅菌PBSのIVIが網膜変性を加速させたことを実証しているので、複数回のIVIには注意を払わなければならない。しかし、4回用量のMTXで処置した網膜は、PBS対照と比較して増加した光受容体数を示したが、MTXの1回の注射はこの効果を有さず、1回の注射はRPにおける長期の網膜保護に十分ではないことが示唆された。IVIによる副作用を回避するためのMTXでの長期処置に、最適化したIVI間隔又は徐放製剤の開発が将来必要になる。
本発明の上記の説明から、当業者は、改良、変更及び修正を認識するであろう。当業者の範囲内のそのような改良、変更及び修正は、添付の特許請求の範囲に包含されることが意図される。本明細書で引用される全ての参考文献、刊行物、及び特許は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
Claims (25)
- 前記対象が、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、若しくはそれによって引き起こされる遺伝性眼障害になりやすいか、又はそれを有する、請求項1又は2のいずれかに記載の方法。
- 前記対象が、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、若しくはそれによって引き起こされる非症候性網膜障害にかかりやすいか、又はそれを有する、請求項1~3のいずれかに記載の方法。
- 前記対象が、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる非症候性常染色体優性網膜色素変性症を有する、請求項1~4のいずれかに記載の方法。
- 前記化合物が、非症候性常染色体優性網膜色素変性症の初期段階又は中間段階で前記対象に投与される、請求項5に記載の方法。
- 前記誤って折り畳まれた眼タンパク質が、誤って折り畳まれたオプシンである、請求項1~6のいずれかに記載の方法。
- 前記誤って折り畳まれた眼タンパク質が、そのアミノ酸配列に変異を含む誤って折り畳まれたオプシンタンパク質である、請求項1~6のいずれかに記載の方法。
- 前記変異が、P23H、C110Y、D190N、T17M、P347S、又はP267Lのうちの少なくとも1つである、請求項8に記載の方法。
- 前記治療有効量は、誤って折り畳まれた眼タンパク質の分解を加速させ、眼タンパク質ホメオスタシスを改善し、視覚機能を改善若しくは保存し、光受容細胞死を阻害し、かつ/又は網膜構造を改善若しくは保存するのに有効な量である、請求項1~9のいずれかに記載の方法。
- 前記視覚機能における改善又は保存には、明順応網膜電図(ERG)応答の改善又は保存が含まれる、請求項10に記載の方法。
- 前記網膜構造における改善又は保存は、外核層(ONL)の厚さの改善又は保存である、請求項10に記載の方法。
- 前記化合物が、局所投与、全身投与、硝子体内注射、及び眼内送達のうちの少なくとも1つによって投与される、請求項1~12のいずれかに記載の方法。
- 前記対象が、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、若しくはそれによって引き起こされる非症候性網膜障害になりやすいか、又はそれを有する、請求項14又は15のいずれかに記載の方法。
- 前記対象が、誤って折り畳まれた眼タンパク質に関連付けられるか、又はそれによって引き起こされる非症候性常染色体優性網膜色素変性症を有する、請求項14~16のいずれかに記載の方法。
- 前記化合物が、非症候性常染色体優性網膜色素変性症の初期段階又は中間段階に前記対象に投与される、請求項17に記載の方法。
- 前記誤って折り畳まれた眼タンパク質が、誤って折り畳まれたオプシンである、請求項14~18のいずれかに記載の方法。
- 前記誤って折り畳まれた眼タンパク質が、そのアミノ酸配列に変異を含む誤って折り畳まれたオプシンタンパク質である、請求項14~19のいずれかに記載の方法。
- 前記変異が、P23H、C110Y、D190N、T17M、P347S、又はP267Lのうちの少なくとも1つである、請求項20に記載の方法。
- 前記治療有効量が、誤って折り畳まれた眼タンパク質の分解を加速させ、眼タンパク質ホメオスタシスを改善し、視覚機能を改善若しくは保存し、光受容細胞死を阻害し、かつ/又は網膜構造を改善若しくは保存するのに有効な量である、請求項14~20のいずれかに記載の方法。
- 前記視覚機能における改善又は保存には、明順応網膜電図(ERG)応答の改善又は保存が含まれる、請求項22に記載の方法。
- 前記網膜構造における改善又は保存は、外核層(ONL)の厚さの改善又は保存である、請求項22に記載の方法。
- 前記化合物が、局所投与、全身投与、硝子体内注射、及び眼内送達のうちの少なくとも1つによって投与される、請求項14~24のいずれかに記載の方法。
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