JP2023514414A - プロピオニバクテリウム・アクネスの予防的かつ治療的な免疫処置 - Google Patents
プロピオニバクテリウム・アクネスの予防的かつ治療的な免疫処置 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2023514414A JP2023514414A JP2022550232A JP2022550232A JP2023514414A JP 2023514414 A JP2023514414 A JP 2023514414A JP 2022550232 A JP2022550232 A JP 2022550232A JP 2022550232 A JP2022550232 A JP 2022550232A JP 2023514414 A JP2023514414 A JP 2023514414A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- acnes
- dsa1
- dsa2
- polypeptide
- sequence
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 241000186427 Cutibacterium acnes Species 0.000 title claims abstract description 165
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 title claims description 23
- 230000003053 immunization Effects 0.000 title description 35
- 238000002649 immunization Methods 0.000 title description 34
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 title description 8
- 229940055019 propionibacterium acne Drugs 0.000 title 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 310
- 208000020154 Acnes Diseases 0.000 claims abstract description 302
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 300
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 279
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims abstract description 230
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 193
- 101000894525 Homo sapiens Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 Proteins 0.000 claims abstract description 138
- 102100021398 Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 Human genes 0.000 claims abstract description 138
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims abstract description 86
- 238000009739 binding Methods 0.000 claims abstract description 86
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims abstract description 45
- 229920000045 Dermatan sulfate Polymers 0.000 claims abstract description 24
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 24
- AVJBPWGFOQAPRH-FWMKGIEWSA-L dermatan sulfate Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H](OS([O-])(=O)=O)[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](C([O-])=O)O1 AVJBPWGFOQAPRH-FWMKGIEWSA-L 0.000 claims abstract description 23
- 229940051593 dermatan sulfate Drugs 0.000 claims abstract description 23
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 claims abstract description 12
- 101710111882 Agglutinin-like protein 2 Proteins 0.000 claims abstract description 9
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 claims abstract description 9
- 101710111884 Agglutinin-like protein 1 Proteins 0.000 claims abstract description 7
- GVUVRRPYYDHHGK-VQVTYTSYSA-N Pro-Thr Chemical group C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 GVUVRRPYYDHHGK-VQVTYTSYSA-N 0.000 claims abstract description 7
- 150000003278 haem Chemical class 0.000 claims abstract description 7
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 108091074158 neocarzinostatin family Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 266
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 266
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 266
- 208000002874 Acne Vulgaris Diseases 0.000 claims description 167
- 206010000496 acne Diseases 0.000 claims description 167
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims description 116
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 115
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 115
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 90
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims description 83
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 71
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 70
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 55
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 54
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 45
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 43
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 43
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 41
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 40
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 claims description 40
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 39
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 claims description 36
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 claims description 36
- 230000001018 virulence Effects 0.000 claims description 34
- 108040004998 NADPH:sulfur oxidoreductase activity proteins Proteins 0.000 claims description 29
- 210000001539 phagocyte Anatomy 0.000 claims description 29
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 27
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 claims description 26
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 25
- 239000002076 α-tocopherol Substances 0.000 claims description 25
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 24
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 23
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 23
- 238000009472 formulation Methods 0.000 claims description 23
- 229960002429 proline Drugs 0.000 claims description 23
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 claims description 22
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 claims description 22
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 22
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 claims description 22
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 claims description 22
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 21
- 230000009467 reduction Effects 0.000 claims description 21
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims description 19
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 claims description 19
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 18
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 15
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 15
- 238000010790 dilution Methods 0.000 claims description 15
- 239000012895 dilution Substances 0.000 claims description 15
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 claims description 15
- 230000012010 growth Effects 0.000 claims description 15
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 claims description 14
- 239000007943 implant Substances 0.000 claims description 12
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 claims description 11
- 206010014801 endophthalmitis Diseases 0.000 claims description 10
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 claims description 10
- 239000001747 Potassium fumarate Substances 0.000 claims description 9
- 206010023332 keratitis Diseases 0.000 claims description 9
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 claims description 9
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 8
- 206010064687 Device related infection Diseases 0.000 claims description 8
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 claims description 8
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 8
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 claims description 8
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 claims description 8
- 210000003780 hair follicle Anatomy 0.000 claims description 8
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 claims description 8
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 7
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 claims description 7
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 7
- 206010014665 endocarditis Diseases 0.000 claims description 7
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 claims description 7
- 229960004295 valine Drugs 0.000 claims description 7
- 239000004474 valine Substances 0.000 claims description 7
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 6
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 claims description 6
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims description 6
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 claims description 6
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 6
- 201000000306 sarcoidosis Diseases 0.000 claims description 6
- 239000002970 Calcium lactobionate Substances 0.000 claims description 5
- 208000014912 Central Nervous System Infections Diseases 0.000 claims description 5
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 5
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 5
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 5
- 108700021021 mRNA Vaccine Proteins 0.000 claims description 5
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 claims description 5
- 201000007094 prostatitis Diseases 0.000 claims description 5
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 claims description 5
- 206010001889 Alveolitis Diseases 0.000 claims description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 4
- 206010031149 Osteitis Diseases 0.000 claims description 4
- 206010031252 Osteomyelitis Diseases 0.000 claims description 4
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical group CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 claims description 4
- 206010037457 Pulmonary vasculitis Diseases 0.000 claims description 4
- 208000008765 Sciatica Diseases 0.000 claims description 4
- 230000000172 allergic effect Effects 0.000 claims description 4
- 206010003246 arthritis Diseases 0.000 claims description 4
- 208000010668 atopic eczema Diseases 0.000 claims description 4
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 claims description 4
- 208000018339 bone inflammation disease Diseases 0.000 claims description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 4
- 201000007717 corneal ulcer Diseases 0.000 claims description 4
- 201000001155 extrinsic allergic alveolitis Diseases 0.000 claims description 4
- 208000022098 hypersensitivity pneumonitis Diseases 0.000 claims description 4
- 229940126582 mRNA vaccine Drugs 0.000 claims description 4
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000013642 negative control Substances 0.000 claims description 4
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 claims description 4
- 208000011354 prosthesis-related infectious disease Diseases 0.000 claims description 4
- 206010060968 Arthritis infective Diseases 0.000 claims description 3
- 201000001320 Atherosclerosis Diseases 0.000 claims description 3
- 208000008439 Biliary Liver Cirrhosis Diseases 0.000 claims description 3
- 208000033222 Biliary cirrhosis primary Diseases 0.000 claims description 3
- 208000004020 Brain Abscess Diseases 0.000 claims description 3
- 206010009137 Chronic sinusitis Diseases 0.000 claims description 3
- 206010009900 Colitis ulcerative Diseases 0.000 claims description 3
- 206010010741 Conjunctivitis Diseases 0.000 claims description 3
- 206010020843 Hyperthermia Diseases 0.000 claims description 3
- 208000003367 Hypopigmentation Diseases 0.000 claims description 3
- 208000004575 Infectious Arthritis Diseases 0.000 claims description 3
- 208000003456 Juvenile Arthritis Diseases 0.000 claims description 3
- 206010059176 Juvenile idiopathic arthritis Diseases 0.000 claims description 3
- 208000012654 Primary biliary cholangitis Diseases 0.000 claims description 3
- 241000876474 Sapho Species 0.000 claims description 3
- 206010040868 Skin hypopigmentation Diseases 0.000 claims description 3
- 201000000002 Subdural Empyema Diseases 0.000 claims description 3
- 201000006704 Ulcerative Colitis Diseases 0.000 claims description 3
- 206010064996 Ulcerative keratitis Diseases 0.000 claims description 3
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 claims description 3
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 claims description 3
- 208000013507 chronic prostatitis Diseases 0.000 claims description 3
- 208000027157 chronic rhinosinusitis Diseases 0.000 claims description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 3
- 230000001066 destructive effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000002526 effect on cardiovascular system Effects 0.000 claims description 3
- 208000002557 hidradenitis Diseases 0.000 claims description 3
- 201000007162 hidradenitis suppurativa Diseases 0.000 claims description 3
- 230000036031 hyperthermia Effects 0.000 claims description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims description 3
- 208000021600 intervertebral disc degenerative disease Diseases 0.000 claims description 3
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 claims description 3
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000011164 ossification Effects 0.000 claims description 3
- 201000001245 periodontitis Diseases 0.000 claims description 3
- 206010034674 peritonitis Diseases 0.000 claims description 3
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 claims description 3
- 201000001223 septic arthritis Diseases 0.000 claims description 3
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 claims description 3
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 claims description 3
- 201000004595 synovitis Diseases 0.000 claims description 3
- 238000011200 topical administration Methods 0.000 claims description 3
- 108010008038 Synthetic Vaccines Proteins 0.000 claims description 2
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 238000007822 cytometric assay Methods 0.000 claims description 2
- 101000611918 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Phosphatidylinositol transfer protein PDR16 Proteins 0.000 claims 52
- 101000611917 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Phosphatidylinositol transfer protein PDR17 Proteins 0.000 claims 52
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims 1
- 208000001860 Eye Infections Diseases 0.000 claims 1
- 206010056559 Graft infection Diseases 0.000 claims 1
- 208000018650 Intervertebral disc disease Diseases 0.000 claims 1
- 102220507168 Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40_C97S_mutation Human genes 0.000 claims 1
- 206010048038 Wound infection Diseases 0.000 claims 1
- 229920006317 cationic polymer Polymers 0.000 claims 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims 1
- 208000011323 eye infectious disease Diseases 0.000 claims 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 claims 1
- 102220243786 rs187643086 Human genes 0.000 claims 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 244
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 222
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 217
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 68
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 61
- 230000007923 virulence factor Effects 0.000 description 59
- 239000000304 virulence factor Substances 0.000 description 59
- 239000000047 product Substances 0.000 description 52
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 47
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 45
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 42
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 38
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 35
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 33
- 238000011160 research Methods 0.000 description 30
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 28
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 28
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 28
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 26
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 25
- 235000005772 leucine Nutrition 0.000 description 24
- 229940125575 vaccine candidate Drugs 0.000 description 24
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 23
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 21
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 21
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 20
- 235000013930 proline Nutrition 0.000 description 19
- 230000006870 function Effects 0.000 description 18
- 238000002825 functional assay Methods 0.000 description 18
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 18
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 18
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 17
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 15
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 14
- 238000013461 design Methods 0.000 description 14
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 14
- 239000000463 material Substances 0.000 description 14
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 14
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 14
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 description 13
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 13
- 230000001024 immunotherapeutic effect Effects 0.000 description 13
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 13
- 235000008729 phenylalanine Nutrition 0.000 description 13
- 230000004044 response Effects 0.000 description 13
- 235000008521 threonine Nutrition 0.000 description 13
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 12
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 12
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 11
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 11
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 11
- 238000011161 development Methods 0.000 description 11
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 11
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 11
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 11
- 229940042743 immune sera Drugs 0.000 description 11
- 230000004224 protection Effects 0.000 description 11
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 10
- 230000036074 healthy skin Effects 0.000 description 10
- 210000004201 immune sera Anatomy 0.000 description 10
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 10
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 10
- 230000000625 opsonophagocytic effect Effects 0.000 description 10
- 230000008569 process Effects 0.000 description 10
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 10
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 10
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 10
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 9
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 9
- 240000001857 Phyllostachys elegans Species 0.000 description 9
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 9
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 9
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 9
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 9
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 9
- 238000012552 review Methods 0.000 description 9
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 8
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 8
- 241000736262 Microbiota Species 0.000 description 8
- 108010006232 Neuraminidase Proteins 0.000 description 8
- 102000005348 Neuraminidase Human genes 0.000 description 8
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 8
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 8
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 8
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 7
- 230000009471 action Effects 0.000 description 7
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 description 7
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 7
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 7
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 7
- 230000007124 immune defense Effects 0.000 description 7
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 7
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 7
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 7
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 7
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 7
- 102100026608 Aldehyde dehydrogenase family 3 member A2 Human genes 0.000 description 6
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 6
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 6
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 6
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 6
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 6
- 230000032770 biofilm formation Effects 0.000 description 6
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 6
- 230000036541 health Effects 0.000 description 6
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 6
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 6
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 6
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 6
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 6
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 6
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 6
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 6
- 230000014207 opsonization Effects 0.000 description 6
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 6
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 6
- 230000008591 skin barrier function Effects 0.000 description 6
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 6
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 6
- 101100274887 Arabidopsis thaliana CAMTA1 gene Proteins 0.000 description 5
- 101100006458 Arabidopsis thaliana CIPK7 gene Proteins 0.000 description 5
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 5
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 5
- 101100431874 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) YDR169C-A gene Proteins 0.000 description 5
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 5
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 5
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 5
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 5
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 5
- 229960002449 glycine Drugs 0.000 description 5
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 5
- 238000010820 immunofluorescence microscopy Methods 0.000 description 5
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 5
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 5
- 235000014705 isoleucine Nutrition 0.000 description 5
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 5
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 5
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 5
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 5
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 5
- 238000000575 proteomic method Methods 0.000 description 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 5
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 235000014393 valine Nutrition 0.000 description 5
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 5
- 101100274894 Arabidopsis thaliana CAMTA3 gene Proteins 0.000 description 4
- 101100496015 Arabidopsis thaliana CIPK14 gene Proteins 0.000 description 4
- 101100182490 Arabidopsis thaliana LECRK13 gene Proteins 0.000 description 4
- 101100043428 Arabidopsis thaliana SR gene Proteins 0.000 description 4
- 101100478293 Arabidopsis thaliana SR34 gene Proteins 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 4
- XUMBMVFBXHLACL-UHFFFAOYSA-N Melanin Chemical compound O=C1C(=O)C(C2=CNC3=C(C(C(=O)C4=C32)=O)C)=C2C4=CNC2=C1C XUMBMVFBXHLACL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108700001237 Nucleic Acid-Based Vaccines Proteins 0.000 description 4
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 4
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 4
- 108091008109 Pseudogenes Proteins 0.000 description 4
- 102000057361 Pseudogenes Human genes 0.000 description 4
- 101100431881 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) YDR182W-A gene Proteins 0.000 description 4
- 102000011011 Sphingosine 1-phosphate receptors Human genes 0.000 description 4
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 4
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 4
- 230000003044 adaptive effect Effects 0.000 description 4
- 230000033289 adaptive immune response Effects 0.000 description 4
- 230000003385 bacteriostatic effect Effects 0.000 description 4
- 238000007622 bioinformatic analysis Methods 0.000 description 4
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 4
- 210000004900 c-terminal fragment Anatomy 0.000 description 4
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 4
- 229940030156 cell vaccine Drugs 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 4
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 4
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 4
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 4
- 229940023146 nucleic acid vaccine Drugs 0.000 description 4
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 4
- 239000000244 polyoxyethylene sorbitan monooleate Substances 0.000 description 4
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 4
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 4
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 4
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 4
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 4
- 229940021747 therapeutic vaccine Drugs 0.000 description 4
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 4
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 4
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 4
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- 229940046168 CpG oligodeoxynucleotide Drugs 0.000 description 3
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- 108700022034 Opsonin Proteins Proteins 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010065472 Vimentin Proteins 0.000 description 3
- 102000013127 Vimentin Human genes 0.000 description 3
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 3
- -1 adhesins Proteins 0.000 description 3
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 3
- 125000003295 alanine group Chemical group N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 description 3
- 238000004873 anchoring Methods 0.000 description 3
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 3
- 230000027645 antigenic variation Effects 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 230000004709 cell invasion Effects 0.000 description 3
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 3
- 230000007123 defense Effects 0.000 description 3
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 230000003325 follicular Effects 0.000 description 3
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 3
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 3
- 108010037896 heparin-binding hemagglutinin Proteins 0.000 description 3
- 230000003054 hormonal effect Effects 0.000 description 3
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 3
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 3
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 3
- 230000015788 innate immune response Effects 0.000 description 3
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 3
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 3
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 3
- 210000004898 n-terminal fragment Anatomy 0.000 description 3
- 244000039328 opportunistic pathogen Species 0.000 description 3
- 230000000242 pagocytic effect Effects 0.000 description 3
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 3
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 3
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 3
- 239000006041 probiotic Substances 0.000 description 3
- 235000018291 probiotics Nutrition 0.000 description 3
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 3
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 3
- 210000001732 sebaceous gland Anatomy 0.000 description 3
- 210000002374 sebum Anatomy 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- 235000004400 serine Nutrition 0.000 description 3
- 229960001153 serine Drugs 0.000 description 3
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 3
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 210000005048 vimentin Anatomy 0.000 description 3
- YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N (6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene Chemical compound CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000005416 ATP-Binding Cassette Transporters Human genes 0.000 description 2
- 108010006533 ATP-Binding Cassette Transporters Proteins 0.000 description 2
- 206010000503 Acne cystic Diseases 0.000 description 2
- 208000036762 Acute promyelocytic leukaemia Diseases 0.000 description 2
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 2
- 102100037579 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase Human genes 0.000 description 2
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 101000741435 Homo sapiens Calcitonin receptor Proteins 0.000 description 2
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 description 2
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 2
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 2
- 206010061246 Intervertebral disc degeneration Diseases 0.000 description 2
- 102000008133 Iron-Binding Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010035210 Iron-Binding Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 2
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- 108010026217 Malate Dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 208000037273 Pathologic Processes Diseases 0.000 description 2
- 241000531735 Pelargonium mutans Species 0.000 description 2
- 108010022923 Peptidoglycan Glycosyltransferase Proteins 0.000 description 2
- 201000005702 Pertussis Diseases 0.000 description 2
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 2
- 206010037888 Rash pustular Diseases 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 208000031650 Surgical Wound Infection Diseases 0.000 description 2
- BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N Tetramethylsqualene Natural products CC(=C)C(C)CCC(=C)C(C)CCC(C)=CCCC=C(C)CCC(C)C(=C)CCC(C)C(C)=C BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000002689 Toll-like receptor Human genes 0.000 description 2
- 108020000411 Toll-like receptor Proteins 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 2
- 230000004721 adaptive immunity Effects 0.000 description 2
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 2
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 2
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 2
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 2
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 2
- 210000003651 basophil Anatomy 0.000 description 2
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 2
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 2
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 2
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 2
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 2
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 2
- HSJPMRKMPBAUAU-UHFFFAOYSA-N cerium(3+);trinitrate Chemical compound [Ce+3].[O-][N+]([O-])=O.[O-][N+]([O-])=O.[O-][N+]([O-])=O HSJPMRKMPBAUAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 239000012568 clinical material Substances 0.000 description 2
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 2
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 2
- 208000018180 degenerative disc disease Diseases 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 2
- 206010013023 diphtheria Diseases 0.000 description 2
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 2
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N dodecahydrosqualene Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 2
- 230000002121 endocytic effect Effects 0.000 description 2
- 108010005965 endoglycoceramidase Proteins 0.000 description 2
- 239000000147 enterotoxin Substances 0.000 description 2
- 231100000655 enterotoxin Toxicity 0.000 description 2
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 2
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 2
- 230000037406 food intake Effects 0.000 description 2
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 2
- 210000004907 gland Anatomy 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000009036 growth inhibition Effects 0.000 description 2
- 230000002949 hemolytic effect Effects 0.000 description 2
- 239000012642 immune effector Substances 0.000 description 2
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 2
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 description 2
- 230000002480 immunoprotective effect Effects 0.000 description 2
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 2
- 125000000741 isoleucyl group Chemical group [H]N([H])C(C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])[H])C(=O)O* 0.000 description 2
- 108010045069 keyhole-limpet hemocyanin Proteins 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 2
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 230000003571 opsonizing effect Effects 0.000 description 2
- 230000003950 pathogenic mechanism Effects 0.000 description 2
- 230000009054 pathological process Effects 0.000 description 2
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 2
- 108010040473 pneumococcal surface protein A Proteins 0.000 description 2
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 2
- 150000004032 porphyrins Chemical class 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 208000029561 pustule Diseases 0.000 description 2
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 2
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 2
- 244000005714 skin microbiome Species 0.000 description 2
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 2
- 229940031439 squalene Drugs 0.000 description 2
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 2
- 229940031626 subunit vaccine Drugs 0.000 description 2
- 230000003319 supportive effect Effects 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 230000000451 tissue damage Effects 0.000 description 2
- 231100000827 tissue damage Toxicity 0.000 description 2
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 2
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 2
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 2
- OEANUJAFZLQYOD-CXAZCLJRSA-N (2r,3s,4r,5r,6r)-6-[(2r,3r,4r,5r,6r)-5-acetamido-3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-methoxyoxan-4-yl]oxy-4,5-dihydroxy-3-methoxyoxane-2-carboxylic acid Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](OC)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](OC)[C@H](C(O)=O)O1 OEANUJAFZLQYOD-CXAZCLJRSA-N 0.000 description 1
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000021527 ATP binding proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091011108 ATP binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000007815 Acquired Hyperostosis Syndrome Diseases 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 241000203069 Archaea Species 0.000 description 1
- 238000011725 BALB/c mouse Methods 0.000 description 1
- 108010071023 Bacterial Outer Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000004342 Benzoyl peroxide Substances 0.000 description 1
- OMPJBNCRMGITSC-UHFFFAOYSA-N Benzoylperoxide Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(=O)OOC(=O)C1=CC=CC=C1 OMPJBNCRMGITSC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 101710168515 Cell surface glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 241000193163 Clostridioides difficile Species 0.000 description 1
- 102220627890 Coagulation factor IX_C97S_mutation Human genes 0.000 description 1
- 102100031048 Coiled-coil domain-containing protein 6 Human genes 0.000 description 1
- 208000032170 Congenital Abnormalities Diseases 0.000 description 1
- 206010010356 Congenital anomaly Diseases 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 241000759568 Corixa Species 0.000 description 1
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 description 1
- 206010011409 Cross infection Diseases 0.000 description 1
- 108010025905 Cystine-Knot Miniproteins Proteins 0.000 description 1
- 101710112752 Cytotoxin Proteins 0.000 description 1
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 1
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- 102100037840 Dehydrogenase/reductase SDR family member 2, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 108700022150 Designed Ankyrin Repeat Proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000027244 Dysbiosis Diseases 0.000 description 1
- 101710146739 Enterotoxin Proteins 0.000 description 1
- 102100039466 Eukaryotic translation initiation factor 5B Human genes 0.000 description 1
- 101710082714 Exotoxin A Proteins 0.000 description 1
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000002090 Fibronectin type III Human genes 0.000 description 1
- 108050009401 Fibronectin type III Proteins 0.000 description 1
- 206010016936 Folliculitis Diseases 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 230000005526 G1 to G0 transition Effects 0.000 description 1
- 101000812705 Gallus gallus Endoplasmin Proteins 0.000 description 1
- 229920002683 Glycosaminoglycan Polymers 0.000 description 1
- 241000606768 Haemophilus influenzae Species 0.000 description 1
- 108010006464 Hemolysin Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101001036496 Homo sapiens Eukaryotic translation initiation factor 5B Proteins 0.000 description 1
- 101001131829 Homo sapiens P protein Proteins 0.000 description 1
- 101001098523 Homo sapiens PAX-interacting protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 108091006975 Iron transporters Proteins 0.000 description 1
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 108010063045 Lactoferrin Proteins 0.000 description 1
- 102100032241 Lactotransferrin Human genes 0.000 description 1
- 102000004317 Lyases Human genes 0.000 description 1
- 108090000856 Lyases Proteins 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N Manganese Chemical compound [Mn] PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710085938 Matrix protein Proteins 0.000 description 1
- 101710127721 Membrane protein Proteins 0.000 description 1
- 102000003939 Membrane transport proteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000301 Membrane transport proteins Proteins 0.000 description 1
- NPPQSCRMBWNHMW-UHFFFAOYSA-N Meprobamate Chemical compound NC(=O)OCC(C)(CCC)COC(N)=O NPPQSCRMBWNHMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000019010 Methylmalonyl-CoA Mutase Human genes 0.000 description 1
- 108010051862 Methylmalonyl-CoA mutase Proteins 0.000 description 1
- 102100040243 Microtubule-associated protein tau Human genes 0.000 description 1
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- 108090000235 Myeloperoxidases Proteins 0.000 description 1
- 102000003896 Myeloperoxidases Human genes 0.000 description 1
- 101800000135 N-terminal protein Proteins 0.000 description 1
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 241000588650 Neisseria meningitidis Species 0.000 description 1
- 208000031662 Noncommunicable disease Diseases 0.000 description 1
- 206010029803 Nosocomial infection Diseases 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 101710116435 Outer membrane protein Proteins 0.000 description 1
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 1
- 208000012868 Overgrowth Diseases 0.000 description 1
- 101800001452 P1 proteinase Proteins 0.000 description 1
- 102100037141 PAX-interacting protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 108700020474 Penicillin-Binding Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 108090000279 Peptidyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 101710178747 Phosphatidate cytidylyltransferase 1 Proteins 0.000 description 1
- 240000000697 Pinguicula vulgaris Species 0.000 description 1
- 101710183389 Pneumolysin Proteins 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 101000606032 Pomacea maculata Perivitellin-2 31 kDa subunit Proteins 0.000 description 1
- 101000606027 Pomacea maculata Perivitellin-2 67 kDa subunit Proteins 0.000 description 1
- 102000017033 Porins Human genes 0.000 description 1
- 108010013381 Porins Proteins 0.000 description 1
- 206010036346 Posterior capsule opacification Diseases 0.000 description 1
- 206010036410 Postoperative wound infection Diseases 0.000 description 1
- 238000012356 Product development Methods 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 101710188053 Protein D Proteins 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 101710203930 RNA polymerase-associated transcription-specificity factor RAP94 Proteins 0.000 description 1
- 229940022005 RNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- 101710132893 Resolvase Proteins 0.000 description 1
- 101710099182 S-layer protein Proteins 0.000 description 1
- 201000004854 SAPHO syndrome Diseases 0.000 description 1
- 102000002255 Secretory Proteinase Inhibitory Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010000303 Secretory Proteinase Inhibitory Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000040739 Secretory proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091058545 Secretory proteins Proteins 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- 102100020814 Sequestosome-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100031075 Serine/threonine-protein kinase Chk2 Human genes 0.000 description 1
- 101710084578 Short neurotoxin 1 Proteins 0.000 description 1
- 239000000589 Siderophore Substances 0.000 description 1
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 1
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 241000193998 Streptococcus pneumoniae Species 0.000 description 1
- 241000193996 Streptococcus pyogenes Species 0.000 description 1
- 239000012505 Superdex™ Substances 0.000 description 1
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 1
- 206010043376 Tetanus Diseases 0.000 description 1
- 208000031737 Tissue Adhesions Diseases 0.000 description 1
- 101710182223 Toxin B Proteins 0.000 description 1
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 1
- 101710182532 Toxin a Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102000010912 Transferrin-Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 206010066901 Treatment failure Diseases 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 1
- 230000001464 adherent effect Effects 0.000 description 1
- 230000025845 adhesion to host Effects 0.000 description 1
- 239000003463 adsorbent Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 150000004347 all-trans-retinol derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K aluminium phosphate Chemical compound O1[Al]2OP1(=O)O2 ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229940047712 aluminum hydroxyphosphate Drugs 0.000 description 1
- 230000001668 ameliorated effect Effects 0.000 description 1
- 229940093740 amino acid and derivative Drugs 0.000 description 1
- 230000009604 anaerobic growth Effects 0.000 description 1
- 230000003255 anti-acne Effects 0.000 description 1
- 230000002421 anti-septic effect Effects 0.000 description 1
- 230000009833 antibody interaction Effects 0.000 description 1
- 230000009831 antigen interaction Effects 0.000 description 1
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 230000003078 antioxidant effect Effects 0.000 description 1
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 1
- 229940064004 antiseptic throat preparations Drugs 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N aspartic acid group Chemical group N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 238000011948 assay development Methods 0.000 description 1
- 230000001363 autoimmune Effects 0.000 description 1
- 229940037642 autologous vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000004900 autophagic degradation Effects 0.000 description 1
- 230000029586 bacterial cell surface binding Effects 0.000 description 1
- 230000008952 bacterial invasion Effects 0.000 description 1
- 235000019400 benzoyl peroxide Nutrition 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 230000007698 birth defect Effects 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 159000000007 calcium salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 1
- 230000021164 cell adhesion Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000022534 cell killing Effects 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 230000003822 cell turnover Effects 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 1
- 208000025222 central nervous system infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000012993 chemical processing Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 108010031071 cholera toxoid Proteins 0.000 description 1
- 201000010720 chronic endophthalmitis Diseases 0.000 description 1
- 238000003501 co-culture Methods 0.000 description 1
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 description 1
- 238000005345 coagulation Methods 0.000 description 1
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 1
- 230000004154 complement system Effects 0.000 description 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 210000000795 conjunctiva Anatomy 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 230000008094 contradictory effect Effects 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical class N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 239000002619 cytotoxin Substances 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000002074 deregulated effect Effects 0.000 description 1
- 230000003831 deregulation Effects 0.000 description 1
- 239000007933 dermal patch Substances 0.000 description 1
- 210000004207 dermis Anatomy 0.000 description 1
- 230000001627 detrimental effect Effects 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 239000012502 diagnostic product Substances 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 1
- 208000034653 disorder of pilosebaceous unit Diseases 0.000 description 1
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 230000002222 downregulating effect Effects 0.000 description 1
- 230000007140 dysbiosis Effects 0.000 description 1
- 210000005069 ears Anatomy 0.000 description 1
- 230000002500 effect on skin Effects 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 230000009881 electrostatic interaction Effects 0.000 description 1
- 230000029578 entry into host Effects 0.000 description 1
- 230000026502 entry into host cell Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003979 eosinophil Anatomy 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000013213 extrapolation Methods 0.000 description 1
- 230000001815 facial effect Effects 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 210000000245 forearm Anatomy 0.000 description 1
- 210000001061 forehead Anatomy 0.000 description 1
- 231100000221 frame shift mutation induction Toxicity 0.000 description 1
- 230000009454 functional inhibition Effects 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 description 1
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 229940047650 haemophilus influenzae Drugs 0.000 description 1
- 230000035876 healing Effects 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000003228 hemolysin Substances 0.000 description 1
- 239000003219 hemolytic agent Substances 0.000 description 1
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000003284 homeostatic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005745 host immune response Effects 0.000 description 1
- 230000007236 host immunity Effects 0.000 description 1
- 101150081658 htaA gene Proteins 0.000 description 1
- 102000047119 human OCA2 Human genes 0.000 description 1
- 244000005702 human microbiome Species 0.000 description 1
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 1
- 229920002674 hyaluronan Polymers 0.000 description 1
- 229960003160 hyaluronic acid Drugs 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M hydroxide Chemical compound [OH-] XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- FAHBNUUHRFUEAI-UHFFFAOYSA-M hydroxidooxidoaluminium Chemical compound O[Al]=O FAHBNUUHRFUEAI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000000521 hyperimmunizing effect Effects 0.000 description 1
- 206010020718 hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000008076 immune mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 238000010324 immunological assay Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 1
- 230000004968 inflammatory condition Effects 0.000 description 1
- 230000006749 inflammatory damage Effects 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 150000002484 inorganic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011147 inorganic material Substances 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000008611 intercellular interaction Effects 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 230000006662 intracellular pathway Effects 0.000 description 1
- 235000014413 iron hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- NCNCGGDMXMBVIA-UHFFFAOYSA-L iron(ii) hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[Fe+2] NCNCGGDMXMBVIA-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 230000000366 juvenile effect Effects 0.000 description 1
- 210000002510 keratinocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000011031 large-scale manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 125000001909 leucine group Chemical group [H]N(*)C(C(*)=O)C([H])([H])C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000003591 leukocyte elastase inhibitor Substances 0.000 description 1
- GZQKNULLWNGMCW-PWQABINMSA-N lipid A (E. coli) Chemical class O1[C@H](CO)[C@@H](OP(O)(O)=O)[C@H](OC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCC)[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](OP(O)(O)=O)O1 GZQKNULLWNGMCW-PWQABINMSA-N 0.000 description 1
- 238000011866 long-term treatment Methods 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 description 1
- 108010026228 mRNA guanylyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000007726 management method Methods 0.000 description 1
- 229910052748 manganese Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011572 manganese Substances 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 229940035032 monophosphoryl lipid a Drugs 0.000 description 1
- 210000000214 mouth Anatomy 0.000 description 1
- 210000002200 mouth mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 238000002887 multiple sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 210000001167 myeloblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000002077 nanosphere Substances 0.000 description 1
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 230000035764 nutrition Effects 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 230000001662 opsonic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 229940127234 oral contraceptive Drugs 0.000 description 1
- 239000003539 oral contraceptive agent Substances 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000011368 organic material Substances 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 229940092253 ovalbumin Drugs 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 230000003094 perturbing effect Effects 0.000 description 1
- 230000003285 pharmacodynamic effect Effects 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000001126 phototherapy Methods 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 235000020777 polyunsaturated fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 230000002980 postoperative effect Effects 0.000 description 1
- GRLPQNLYRHEGIJ-UHFFFAOYSA-J potassium aluminium sulfate Chemical compound [Al+3].[K+].[O-]S([O-])(=O)=O.[O-]S([O-])(=O)=O GRLPQNLYRHEGIJ-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- 238000011533 pre-incubation Methods 0.000 description 1
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 description 1
- 238000009117 preventive therapy Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- RVQDZELMXZRSSI-UHFFFAOYSA-N prolyl-lysine Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C1CCCN1 RVQDZELMXZRSSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 229940021993 prophylactic vaccine Drugs 0.000 description 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 1
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 1
- 229940124551 recombinant vaccine Drugs 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000007115 recruitment Effects 0.000 description 1
- 210000003289 regulatory T cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000008261 resistance mechanism Effects 0.000 description 1
- 210000002345 respiratory system Anatomy 0.000 description 1
- 230000012423 response to bacterium Effects 0.000 description 1
- 230000004043 responsiveness Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 102220094755 rs876660673 Human genes 0.000 description 1
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 1
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 1
- 235000017709 saponins Nutrition 0.000 description 1
- 210000004378 sebocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 230000018528 secretion by tissue Effects 0.000 description 1
- 125000003607 serino group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000007390 skin biopsy Methods 0.000 description 1
- 210000004927 skin cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000017520 skin disease Diseases 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 238000005063 solubilization Methods 0.000 description 1
- 230000007928 solubilization Effects 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 102000005969 steroid hormone receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010010318 streptococcal M protein Proteins 0.000 description 1
- 229940031000 streptococcus pneumoniae Drugs 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 210000004243 sweat Anatomy 0.000 description 1
- 210000000106 sweat gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010998 test method Methods 0.000 description 1
- 229960000814 tetanus toxoid Drugs 0.000 description 1
- 230000003614 tolerogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- 229960001005 tuberculin Drugs 0.000 description 1
- 201000008827 tuberculosis Diseases 0.000 description 1
- 238000000539 two dimensional gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 241001148471 unidentified anaerobic bacterium Species 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- 229960004854 viral vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 210000001835 viscera Anatomy 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012070 whole genome sequencing analysis Methods 0.000 description 1
- 238000002424 x-ray crystallography Methods 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- NWONKYPBYAMBJT-UHFFFAOYSA-L zinc sulfate Chemical compound [Zn+2].[O-]S([O-])(=O)=O NWONKYPBYAMBJT-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229960001763 zinc sulfate Drugs 0.000 description 1
- 229910000368 zinc sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/05—Actinobacteria, e.g. Actinomyces, Streptomyces, Nocardia, Bifidobacterium, Gardnerella, Corynebacterium; Propionibacterium
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
- A61K39/40—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum bacterial
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
- A61P17/02—Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
- A61P17/10—Anti-acne agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/12—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Dermatology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
グラム陽性細菌プロピオニバクテリウム・アクネス(Propionibacterium acnes(P.acnes);最近キューティバクテリウム・アクネス(Cutibacterium acnes)と再命名されることが提案された)は、皮脂の分泌に起因する固有の脂質リッチ環境を提供する、皮脂腺内に主に存在する皮膚共生生物である。P.アクネスは耐気性であるが、嫌気性成長条件を好んで、周囲の皮膚組織由来の皮脂、細胞残渣、および代謝副産物を、エネルギーおよび栄養の一次供給源として用いる。また、P.アクネスは、皮膚から離れて、ヒトおよび他の動物の結膜、気道、尿生殖器管、および消化管において見出されてきた。
I.質が良好な患者向きの証拠(すなわち、患者にとって重要である転帰:罹患率、死亡率、病徴改善、コスト低減、およびクオリティオブライフを測定する証拠)。
II.質が限られた患者向きの証拠。
III.コンセンサスガイドライン、オピニオン、ケーススタディ、または疾患向きの証拠(すなわち、患者の転帰の改善を反映していても反映していなくてもよい、中間、生理学的、またはサロゲートエンドポイントを測定する証拠)を含む他の証拠。
A.首尾一貫して質が良好な患者向きの証拠に基づく推奨。
B.質が首尾一貫しない、または限られた患者向きの証拠に基づく推奨。
C.コンセンサス、オピニオン、ケーススタディ、または疾患向きの証拠に基づく推奨。
本発明の目的は、P.アクネスワクチンについての先行技術の示唆の欠点を克服すること、P.アクネス感染およびP.アクネス関連障害を防止して、これと戦うための手段および方法の向上を実現することである。
したがって、本発明は、特許請求され、本明細書中にさらに記載される、実施形態を含む主題を提供する。本発明は、P.アクネスを免疫学的に標的とするための、実質的かつ臨床的に関連する戦略、およびこの微生物と関係する治療結果を提供する。本発明は、(ヒト)患者の免疫系に免疫学的に対処して、P.アクネス徴候の有効な予防または治療を可能にすることを意図する。本発明に従う生成物、とりわけワクチンおよび治療的かつ予防的方法により、P.アクネス徴候が、効果的に制御されるか、寛解するか、または治療される。生存ワクチン接種アプローチが示唆されておらず、ざ瘡の免疫病理学が、疾患病因の知識におけるギャップの1つとして示されている、P.アクネス徴候の処置の分野における現在の状況(とりわけ、尋常性ざ瘡について:Zaengleinら、2016年)と対照的に、本発明は、そのような障害についての適切な、かつ関連する予防処置アプローチを提供する。加えて、治験において現在試験されている薬物は、数十年前発見されたものとそれほど異ならず、期待外れの結果を示してきた。さらに、P.アクネス抗原に基づくワクチン戦略は、実現可能性に関して疑われている(Zouboulisら、2017年)。したがって、本発明は初めて、P.アクネス徴候の生存ワクチン接種アプローチを切り開く。
a)P.アクネスの表面に結合する抗原特異的抗体の誘導;ならびに/または
b)P.アクネスに対する他の同族であるか、もしくは抗原特異的な抗体の抗菌活性の機能的阻害;ならびに/または
c)P.アクネスに対するオプソニン食作用傷害活性の誘導
d)P.アクネスによるバイオフィルム形成の防止、阻害、もしくは低減
e)P.アクネスによるインプラントもしくは医学的デバイス感染の防止
f)P.アクネス感染によって引き起こされる炎症もしくは組織損傷の低減
g)ヒト細胞、細胞外マトリックス成分、もしくは組織への接着の能力の低減
h)細胞侵入および細胞内生存能力の低減
i)ヒト免疫応答を回避するか、もしくはそれと競合する能力の低減(例えば、病原性因子の機能または発現を阻害することによる)
j)ニッチ適応および生存に必要とされる栄養および無機物を吸収する能力の低減
k)P.アクネスによって誘導される組織炎症の低減
l)P.アクネスによる損傷後の組織の治癒率および回復率の増大。
P.アクネス関連病理の分野における現在の課題は、どのくらいの数の、どの抗原または抗原性エピトープが含まれるべきか、どのようにこれらを組み合わせて生成するべきか、どの抗原性エピトープに、どのP.アクネス株に対して、免疫応答が、細菌に対する免疫エフェクタ細胞の所望の効果を確実にするように導かれるべきか、生成物が、感受性宿主において最適な保護的かつ/または治療的効果を提供するように製造かつ投与されるべきかに関する設計および詳細な説明に関して、特定の予防的生成物または免疫療法生成物を定義することである。
本発明の目的で、以下の名前および略語が、本発明において言及されるP.アクネスのポリペプチドに用いられる(公開されるデータベース中の、引用文献中の注釈付き):
P002(配列番号1):CAMP因子についての例、また、Christie-Atkins-Munch-Petersen(CAMP)因子としても知られている(Liuら、2011年;Wangら2018年);
P005(配列番号2):グリセルアルデヒド-3-リン酸脱水素酵素についての例;また、Hollandら(2010)によって記述され、かつAchermannら(2015)によって潜在的ワクチン候補の中に示唆されている。
P018(配列番号3):「リプレッサ」についての例;
P022(配列番号4):「特徴のないタンパク質」についての例、また、「宿主細胞表面付着タンパク質PA25957」(Lodesら、2006年)および「デルマタン硫酸結合性接着因子/DsA1」(McDowellら、2011年)として、公開された文献において記述されている、
P027(配列番号8):「特徴のないタンパク質」についての例、また、「宿主細胞表面付着タンパク質PA5541」(Lodesら、2006年)および「デルマタン硫酸結合性接着因子/DsA2」としても知られている;
P028(配列番号13):「Fe-輸送について推定の、保存タンパク質」についての例、PA21693(Lodesら、2006年)としても知られている、
P032(配列番号21):翻訳開始因子IF-2についての例;
P035(配列番号22):Achermannら(2015年);Bek-Thomsenら(2014年)によって同定されているリンゴ酸脱水素酵素についての例、Yuら(2016年)によって50843200として同定されている。
P042(配列番号23):「TEDドメイン含有タンパク質」についての例、また、Hollandら(2010)によってPPA1715として、Yuら(2016年)によってgi 50843175として同定されている。
P046(配列番号24):「見込みがあるエンドサイトーシスペプチドグリカントランスグリコシラーゼRlpA」についての例;また、PPA2175としてHollandら(2010年)によって同定されている
P068(配列番号25):タンパク質配列データベースにおける「特徴のないタンパク質」についての例-このタンパク質はまた、Hollandら、2010年によってPPA1939と記述され;Yuら(2015年)およびYuら(2016年)によってgi 50843388と記述され、Allhornら(2016年)によってRoxPとして記述されている;
P069(配列番号26):「外膜リポタンパク質」についての例、これは、Yuら(2015年)によってgi 50843218として同定されている。
P070(配列番号27):「ABC輸送体、ATP-結合タンパク質」についての例、Achermannら(2015年)によって潜在的ワクチン候補として示唆されている。
P071(配列番号28):LodesによってPA-4687と記述されているタンパク質についての例、この出願時に、公開データベースにおいて、このタンパク質は、「HtaA様表面タンパク質」と称される;この同じ名前は、重要な病原性因子間でこのタンパク質を考慮した他の著者らによっても用いられている(Brzuszkiewiczら、2011年;McLaughlinら、2019年)。
当該分野における現在の課題は、先行技術において研究され、治療的または予防的処置を開発する際の病原性因子として、または潜在的材料として潜在的に関連していると示唆された多くの様々な候補の中でワクチン材料として最も適した抗原を選択することである。ワクチン候補としての実際の性能が分析されて、細菌に対する保護的な免疫応答を誘導する能力について互いに比較される、体系的に行われる比較に関する研究の欠如が、最終的な選択をするのを困難にしている。
- 少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含む少なくとも1つの抗原を選択することを含み、P.アクネスエピトープは、生存P.アクネス細菌によって提示される場合にヒト血清抗体に直接到達可能であるエピトープであり、ヒト免疫系によるエピトープの特異的結合は、細菌数、フィットネス、増殖、病原性、またはそれらの組合せの低減につながり、
免疫系による、特に、ヒト免疫系によるエピトープの結合は、フローサイトメトリーアッセイを使用することによって、好ましくは蛍光活性化セルソーティング(FACS)アッセイによって証明され;
細菌数、フィットネス、増殖、病原性、またはそれらの組合せの低減、とりわけ(抗体の直接的効果に起因する)細菌数の低減は、少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含む少なくとも1つの抗原に対して特異的な抗体の存在下でのオプソニン食作用傷害アッセイ(OPK)によって証明される、前記方法が提供される。
- 少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含む少なくとも1つの抗原を選択することを含み、P.アクネスエピトープは、生存P.アクネス細菌によって提示される場合にヒト血清抗体に直接到達可能であるエピトープであり、ヒト免疫系によるエピトープの特異的結合は、細菌数、フィットネス、増殖、病原性、またはそれらの組合せの低減につながり、
免疫系による、特に、ヒト免疫系によるエピトープの結合は、フローサイトメトリーアッセイを使用して、好ましくは蛍光活性化セルソーティング(FACS)アッセイによって、P.アクネス細菌に結合する抗体によって、およびフローサイトメトリーアッセイにおける生存P.アクネス細菌への抗原特異的抗体の結合によって証明され;
細菌数、フィットネス、増殖、病原性、またはそれらの組合せの低減は、オプソニン食作用傷害アッセイ(OPK)によって証明され、前記OPKアッセイは、少なくとも1/200の補体不活化血清希釈で出発して、少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含む少なくとも1つの抗原に対して特異的なポリクローナルヒト抗体、またはそのような抗体を含有するヒト血清もしくは抗原誘導ポリクローナル抗体血清の少なくとも2つの2倍階段希釈を使用する、5%CO2の存在下での37℃での少なくとも24時間またはそれより長いインキュベーション後に、K50力価判定のためのオプソニン食作用傷害アッセイにおいて使用される、少なくとも2倍高い希釈における陰性対照と比較して、反応試料中の細菌細胞数の少なくとも50%より多い低減を示す。
・フローサイトメトリー
・オプソニン貪食作用
・SPR/Biacore
(1)アッセイについての最も関連する細胞の好ましい使用:顆粒球、およびとりわけ好中球(HL60細胞は、顆粒球に区別した)。顆粒球、およびとりわけ好中球は、細菌への侵入に対する早期の宿主防御における重要な役割を果たす。感染に応じて、好中球は血流から動員されて、炎症の局所的部位に向けて移動して、そこで感染拡大を止めるか、または妨げるように局所的自然免疫防御を補助する。
(2)アッセイに用いられる細胞による食細胞殺傷の誘導における役割を調査するための、異なる抗原に対して特異的に高められた抗体の好ましい使用(例えば、好ましくはHL60細胞は、顆粒球に区別した)。
(3)食細胞殺傷は好ましくは、抗原非特異的殺傷を含まない条件下で評価され、これは、抗生物質または補体が用いられた研究において、抗体の不在下で起こり得る。これは、殺菌活性を有する抗体を誘導する、異なる抗原および抗原性エピトープの潜在性の不偏の評価を確実にする。
(4)食細胞方法は好ましくは、24時間を超える長いインキュベーション期間にわたって、細胞外P.アクネスおよびHL60食細胞の双方の最適なP.アクネス成長および生存を確実にするように最適化されている:他の方法において、殺傷相中の時間は、24時間以内であり、より長い時間が許容されるならば、抗生物質が、細胞外細菌の増殖を妨げるのに用いられ、またはアッセイ可変性が増大して、同じアッセイにおける多数の試料の系統的評価を困難にさせる。
- 抗生物質化合物の存在および/もしくはアッセイへの添加なしで、かつ/または
- 補体および/もしくは補体因子の存在ならびに/または補体および/もしくは補体因子への添加なしで;OPKアッセイにおいて殺菌に及ぼす抗生物質または補体(自然免疫系)の系統的影響のないP.アクネス細菌の有効な殺傷についての、抗原それ自体の質の不偏の分析を可能にするように、実行される。
抗原P028またはPITP(PA-21693)は、Lodesら(2006年)によって、ジフテリア菌htaAの生成物に類似し、かつP.アクネスによる鉄吸収機構に関係した2つの推定のP.アクネスタンパク質(PA-21693およびPA-4687)の1つとして記載されている。
表面アクセシビリティおよびOPK活性プロファイルによる抗原PITPは、抗原DsA1またはDsA2によって誘導される免疫応答を最もよく補完する:これは、細胞表面上で到達可能であり、P.アクネスIB型、およびより低い程度でIII型(他の2つの抗原を発現しない)を食細胞殺傷することができる抗体を誘導することができ、PITP表面発現がDsA1およびDsA2(P.アクネスIA2型およびII型)と比較してより低くなり得る株上で、他の2つの抗原によって誘導される抗体は、これを補償することができる(例えば、図1A、図1B;図4、図5)。
本発明に従う好ましい戦略の目的は、オプソニン食作用傷害アッセイにおいて、生成の単純さおよびより低いコストを目的に、全長タンパク質DsA1およびDsA2双方の組合せによって誘導される抗体に対して可能な限り匹敵し、かつ広い、表面結合および機能性を有する抗体を誘導することができるハイブリッドタンパク質を見出すことであった。
タンパク質PITPおよびDsA1/DsA2ハイブリッド分子、例えばハイブリッドH4の組合せは、尋常性ざ瘡病理に関連する全てのP.アクネス株を標的とすることを可能にする(例えば図11A~C)。PITPおよびDsA1/DsA2ハイブリッド分子、例えばハイブリッドH4を含むワクチンは、免疫応答を誘導し、これは、いずれかの単一のタンパク質単独によるワクチン接種後に誘導される免疫応答にすら勝る、交差反応性および交差型反応性に関する明らかな優位性を実証する(例えば図9、図16A~E)。
機能的アッセイの重要性は、本発明の過程において示され、かつ開発されてきた。これらの機能的アッセイは、とりわけ、病理学上関連するP.アクネス感染の危険を有するか、または当該危険に曝されているヒト個体への投与に有効な交差型反応性ワクチンを提供するために、ワクチン抗原組成を決定し(とりわけ、ワクチン候補として3つのタンパク質DsA1、DsA2、およびPITPを選択する)、ワクチン設計を最適化するのに必須であった。
本発明は、先行技術において課題を現在もたらし、かつ「どの細菌ファイロタイプが、宿主に最大の利益を提供するのに、ワクチンによって標的とされるべきか?」という問題に対する答えを提供する:
先行技術における研究は、ざ瘡病変の典型的な位置を多くの場合表さない皮膚上の単一の位置由来の分析用の材料を試料採集している。例えば、Fitz-Gibbonの研究(Fitz-Gibbonら、2013年)は、当該分野において、エキスパートらからいくつかの否定的なレビューを受けた。これは、ざ瘡によって典型的に罹患されていない、鼻を覆う皮膚上の皮膚孔からのみ材料を収集したという事実に起因し、彼らが用いた方法論が、許容可能な基準に従って考慮されなかったことが理由である(EadyおよびLayton、2013年;AlexeyevおよびZouboulis、2013年)。本発明に従う発見は、罹患された領域および非罹患領域の皮膚孔だけでなく、炎症を起こした病変もまた試料採集することが必須であることを示す。なぜなら、皮膚表面上に、または孔内に見出される株は必ずしも、炎症を起こした病変内で存続し続ける同じ株でない場合があるからである。各個体にコロニー形成する株の亜集団だけが、その特定の個体において病原性潜在性を有するので、株同一性は、様々な研究からの結果を組み合わせて、異なる多くの個体から単離された最も一般的な株を探すことによって、普遍的に推定することができない。むしろ、特定の各患者において機能する細菌特異的因子および宿主特異的因子双方の分析および比較が、その代わりとして実行される必要がある。
H4は、Dsa1およびDsA2双方の機能的に関連するエピトープを含有する。H4特異的抗体(すなわち、少なくとも1つの(関連する)DsA1および1つの(関連する)DsA2エピトープを含有するハイブリッド分子によって誘導される抗体)は、重度のざ瘡患者において、DsA1およびDsA2と比較してより豊富である傾向があるようである。これは、皮膚における患者の免疫応答が、ハイブリッド抗原、例えばH4構築体によって十分に表される双方のタンパク質の機能的に関連するエピトープに向けて駆動されることを示す(例えば図15)。
本発明を記載する文脈における(とりわけ以下の特許請求の範囲および実施形態の文脈における)用語「a」および「an」および「the」、ならびに類似した指示対象の使用は、本明細書中で特に明記されない限り、または文脈によって明らかに矛盾しない限り、単数および複数の双方をカバーすると解釈されるべきである。
MLSLLRRLLR WSDQSQQSPP PPPPQAEASS NRPRSVAQAA IATDGKGIID KDCRDAVIND AKLRAAIAGA LVKAGFSSAD AVALAPRIAK EMAKEGVLLI NHHKLKALIG AQLGLLTDAK IQRAAAAVDL GIKATLAATI IPNALHSAAF KDAVVANLVA AGVDKKLAKA TAVAIAATAL NPALGPIAKT EAIKAEIAAQ AALLVGRGVH LKKAAIEHII GRSFDAAVAT AIVSSPILNA RIVTHLVRAG IDKSLAVQIA PRIIDRLAKE PLLALNTAKL MKNITRQIVD VITADKAIKT AEQLEKELPA LDDLVKKACS CPKPTPTPTP TPTPTPKPTP TPTPKPTPTP KPKPTPAPAP TSGATSDEST SRSGGHSQGG SGTHYIHHGV APVLTHSSDL PSTGF
MIIFVRVGNR HMRKRRAVLV VAFQLVNRRL AITKFPTPRR NDASNKNHCG SCDSNCLNRL TISYHPLPAN AASNGNSSIT QSAAFSPRAT TKISEDCRKA IINDLKLRGA IVGALVKAGL SAADAAALAP RIAAEMAAEG TLTINHHRLK VLVASQLGLV ADAAVQHAAA AIDLSFKAIL GASIIPNALG SAAFKNAVIA NLVAAGIDKH LARATAVAIV ATALNPALGP IAKFELIKAE IAAQAALLIR RGVHLQKAAI EHVIGRAFDA AVATAIISSP ILSARIVTHL VRAGIDKSIA ISLAPHIVKR LAKEPLLAFN TAKLVKDIAR QIVDIRNTQE AIAVYKQLKA ELPTLDGLVQ KACTPEPTPT PTPTPTPTPT PAPTPTPAPT PTPAPTPAPT PTPAPTPTPT PTPTPTPTPT HGATTTTPIS RTTDRHNLGS HHTRIAAPAL IHAKALPATG TGA
におけるナンバリングおよびその配列に基づいて、以下のように定義される(また:例えば図12Aおよび図12C参照)NSR:A72からK92まで、CSD1、I93からL174まで、SR1、S175からS191まで、CSD2、A192からL311まで、SR2、A312からT321まで、CSD3、A322からE366まで、PTリピート領域、P367からT420まで、CTR、H421からA463まで。M1~A71のシグナルペプチド(SP)は通常、最終のポリペプチド内に(ワクチン内に)含有されない(存在してもよいN末端メチオニン以外)。したがって、SPは、成熟(機能的)配列の部分でなく、かつ抗原の部分でなく、本明細書中で開示されるワクチン製剤用の生成セットアップにおける一部でない;しかしながら、ある形態の連続発酵により生成される場合(すなわち、細胞を収穫してこじ開けない場合)、シグナルペプチドを用いた培地中への分泌は、適切なSPを用いてもよい。
- フェニルアラニン150(F150)からイソロイシン193(I193)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)からロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
-ヒスチジン218(H218)からロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
を含むか、またはこれらからなる。
(1)フェニルアラニン150(F150)からロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列(N末端にて1、2、3、もしくは4つのアミノ酸、かつ/またはC末端にて1、2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10個のアミノ酸をさらに伸長);
(2)フェニルアラニン150(F150)からロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列(N末端にて1、2、3、もしくは4つのアミノ酸、かつ/またはC末端にて少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、もしくは22個のアミノ酸をさらに伸長);
(3)ヒスチジン218(H218)からロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列(N末端にて少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、もしくは22個のアミノ酸、かつ/またはC末端にて1、2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10個のアミノ酸をさらに伸長);
(4)フェニルアラニン150(F150)からロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列(N末端にて1、2、3、もしくは4つのアミノ酸、かつ/またはC末端にて1、2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10個のアミノ酸をさらに伸長);
(5)アラニン148(F148)からロイシン271(L271)の連続ポリペプチド配列(N末端にて1、2、3、もしくは4つのアミノ酸、かつ/またはC末端にて少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、もしくは22個のアミノ酸をさらに伸長);
(6)ヒスチジン146(H146)からトレオニン277(T277)の連続ポリペプチド配列(N末端にて少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、もしくは22個のアミノ酸、かつ/またはC末端にて1、2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10個のアミノ酸をさらに伸長);
(7)ロイシン238(L238)からロイシン272(L272)の連続ポリペプチド配列(N末端にて1、2、3、もしくは4つのアミノ酸、かつ/またはC末端にて1、2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10個のアミノ酸をさらに伸長);
(8)ロイシン145(L145)からアラニン201(A201)の連続ポリペプチド配列(N末端にて1、2、3、もしくは4つのアミノ酸、かつ/またはC末端にて少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、もしくは22個のアミノ酸をさらに伸長);および/または
(9)ロイシン145(L145)からロイシン280(L280)の連続ポリペプチド配列(N末端にて少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、もしくは22個のアミノ酸、かつ/またはC末端にて1、2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10個のアミノ酸をさらに伸長)
である。
MTTSAMRKIV ASVLGAILAL TGVLITPAAW AAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPKTPIAPS KQPSKQAAPS KQVKPSKQAG PNKQSTTPQQ KTAEHRSQTP AAHRTMTKQV CTIGASKVTS GSLTWGIRTS FTSYLRGPIA NGSWKLSGGA NWNGSAFTFP LTSGSFDPAT KSGSLKYSGS VHMTGHHGIL DMTLAEPSLQ IKGSTGHLYL DVKSSSMDGK KTNYGRVDFA
TFGVSVSGNA AIKGSPVKLT ATGAKAFAGF YRAGEPMNPL STNLTLSAEK VCHNVTVDAV TGKVIGDDSG KGAGRGLPVT GAEGPSSDEI DLGIVGGLAL TAVVSTVVVC RRYAARI
におけるナンバリングおよびその配列に基づいて、以下のように定義される(また:例えば図12D参照):ENFD、A32からR164;SR1、E165からK237、HbD、V238からL396、SR2(C末端LPXT(G)モチーフを含む(すなわち、Gを含まない、LPXTを含む))、S397からT430、およびhLAR、G431からI467。M1~A31のシグナルペプチド(SP)は通常、最終のポリペプチド内に(ワクチン内に)含有されない(存在してもよいN末端メチオニン以外)。
- ENFDのプロリン34からグルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDのプロリン94からトレオニン143、好ましくはプロリン94~グリシン147の連続ポリペプチド配列、または
- HbDのバリン238からアスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含むか、またはそれからなる。
39I-48I、40P-49T、41V-50I、42G-51S、43R-52G、44E-53K、68P-77N、69A-78S、70S-79D、71V-80K、72P-81F、73E-82Y、74F-83G、75Y-84Y、76G-85D、77N-86P、78S-87S、79D-88K、80K-89D、81F-90T、82Y-91T、83G-92E、84Y-93S、85D-94P、86P-95S、87S-96T、88K-97I、89D-98W、90T-99V、91T-100Y、92E-101T、93S-102P、94P-103S、95S-104Q、96T-105K、97I-106A、98W-107I、99V-108G、100Y-109S、101T-110R、102P-111F、103S-112A、104Q-113Q、105K-114G、106A-115R、107I-116P、108G-117M、109S-118N、110R-119N、111F-120D、112A-121G、125I-134Q、126T-135G、127M-136K、128K-137D、144K-153H、145A-154S、146H-155D、147G-156D、148V-157T、149G-158R、150K-159T、151T-160P、152D-161V、153H-162T、154S-163Y、155D-164R、156D-165E、157T-166A、158R-167T、159T-168P、160P-169A、161V-170P、162T-171T、163Y-172G、164R-173P、165E-174K、166A-175T、167T-176P、168P-177I、169A-178A、170P-179P、171T-180S、172G-181K、173P-182Q、174K-183P、175T-184S、176P-185K、177I-186Q、178A-187A、179P-188A、180S-189P、181K-190S、182Q-191K、183P-192Q、184S-193V、185K-194K、186Q-195P、187A-196S、188A-197K、189P-198Q、190S-199A、191K-200G、192Q-201P、193V-202N、194K-203K、195P-204Q、196S-205S、197K-206T、198Q-207T、199A-208P、200G-209Q、201P-210Q、202N-211K、203K-212T、204Q-213A、205S-214E、206T-215H、207T-216R、208P-217S、209Q-218Q、210Q-219T、211K-220P、212T-221A、213A-222A、214E-223H、215H-224R、216R-225T、217S-226M、218Q-227T、219T-228K、220P-229Q、221A-230V、222A-231C、223H-232T、224R-233I、225T-234G、226M-235A、227T-236S、228K-237K、229Q-238V、230V-239T、231C-240S、232T-241G、233I-242S、266L-275S、267S-276A、268G-277F、282T-291K、334S-343N、353G-362I、354V-363K、355S-364G、356V-365S、357S-366P、358G-367V、359N-368K、377F-386P、378A-387M、379G-388N、380F-389P、396L-405V、397S-406T、398A-407V、399E-408D、400K-409A、401V-410V、402C-411T、403H-412G、404N-413K、405V-414V、406T-415I、407V-416G、408D-417D、409A-418D、410V-419S、411T-420G、412G-421K、413K-422G、414V-423A、415I-424G、416G-425R、417D-426G、418D-427L、419S-428P、420G-429V、421K-430T、422G-431G、423A-432A、424G-433E、425R-434G、426G-435P、427L-436S、428P-437S、429V-438D、430T-439E、431G-440I、432A-441D、433E-442L、434G-443G、435P-444I、436S-445V、および437S-446G。
ポリペプチドは、DsA1の少なくともCSD1、CSD2、またはCSD3、およびDsA2の少なくともCSD1、CSD2、またはCSD3を含む。
DsA1およびDsA2のポリペプチドストレッチは独立して、少なくとも20アミノ酸残基長を有する。
- 表面露出されるDsA1ポリペプチドのエピトープ、または表面露出されるP.アクネスのデルマタン硫酸結合接着因子2(DsA2ポリペプチド)のエピトープを有する少なくとも1つの抗原性ポリペプチド
(DsA1またはDsA2は、N末端からC末端まで、N末端スワッピング領域(「NSR」)、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」)、および、場合により、Pro-Thrリピート含有領域(「PTリピート領域」)、およびC末端領域(「CTR」)を含む);および
- 表面露出されるPITPポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの抗原性ポリペプチド
を含むワクチンである。
(a)DsA1のCSD1の少なくともエピトープ含有断片もしくは派生体、およびDsA2のCSD2の少なくともエピトープ含有断片もしくは派生体を含み;かつ/または
(b)少なくとも30のアミノ酸残基、好ましくは少なくとも40のアミノ酸残基のDsA1のCSD1のCSD1断片または派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチ、および少なくとも30アミノ酸残基、好ましくは少なくとも40アミノ酸残基のDsA1のCSD2のCSD2断片または派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチを含み;
(c)少なくとも、DsA1の
- フェニルアラニン150(F150)からロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)からロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)からロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、およびDsA2の
- フェニルアラニン194(F194)からロイシン228(L228)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン194(F194)からロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン262(H262)からロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列
を含むポリペプチドを含むワクチンである。
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン34からグルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン94からトレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDもしくはそのPITP派生体のバリン238からアスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含む。
- 表面露出されるDsA1ポリペプチドのエピトープ、または表面露出されるDsA2ポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの合成抗原性ポリペプチド;および
- 表面露出されるP.アクネスのPITPポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの合成抗原性ポリペプチド
を含むワクチンに関する。
GenBankエントリID(DsA1):VBYU01000003.1:466799-467896(2019年5月22日)およびQJIR01000003.1:466818-467915(2019年6月3日)、QJII01000011.1:3-1160(2019年6月3日)およびVBYK01000011.1:3-1151(2019年5月22日)。
GenBankエントリID(DsA2):MVCC01000003.1:313005-313898(2017年10月17日)、BFFM01000002.1:c62117-61161(2019年5月16日)およびLKVC01000009.1:231840-232958(2019年5月16日)、LKVC01000009.1(16-10月-2017年10月16日)およびGCA_000145535.1_ASM14553v1(2010/08/16)またはGCA_000342585.1_PropiAcnFZ1_2_0_1.0 (2013/03/01)。
以下のDsA1内、DsA2内およびDsA1-DsA2内アミノ酸変動が、DsA1およびDsA2中に存在する:
DsA1のCSD1の50位(参照=D(7.6%)およびバリアント=N(79.6%))は、DsA2の94位(参照=S(81.5%)およびバリアント=D(10.9%))に対応する。DsA1のCSD1の51位(参照=K(87.2%))は、DsA2の95位(参照=E(81.5%)およびバリアント=A(10.9%))に対応する。DsA1のCSD1の53位(参照=C(85.5%)およびバリアント=Y(1.6%))は、DsA2の97位(参照=C(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の55位(参照=D(87.2%))は、DsA2の99位(参照=K(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の57位(参照=V(85.5%)およびバリアント=I(1.6%))は、DsA2の101位(参照=I(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の61位(参照=A(87.2%))は、DsA2の105位(参照=L(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の65位(参照=A(87.2%))は、DsA2の109位(参照=G(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の68位(参照=A(87.2%))は、DsA2の112位(参照=V(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の71位(参照=L(87.2%)およびバリアント=M(2.5%))は、DsA2の115位(参照=L(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の76位(参照=F(89.8%))は、DsA2の120位(参照=L(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の78位(参照=S(89.8%))は、DsA2の122位(参照=A(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の82位(参照=V(89.8%)およびバリアント=M(10.1%))は、DsA2の126位(参照=A(92.4%))に対応する。DsA1のCSD1の86位(参照=P(96.6%)およびバリアント=S(2.5%)およびバリアント=R(0.8%))は、DsA2の130位(参照=P(93.2%))に対応する。DsA1のCSD1の90位(参照=K(20.3%)およびバリアント=R(79.6%))は、DsA2の134位(参照=A(94.1%))に対応する。DsA1のCSD1の94位(参照=K((100%))は、DsA2の138位(参照=A(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の97位(参照=V(100%))は、DsA2の141位(参照=T(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の99位(参照=L(100%))は、DsA2の143位(参照=T(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の100位(参照=I(100%))は、DsA2の144位(参照=I(84.8%)およびバリアント=L(13.4%))に対応する。DsA1のCSD1の104位(参照=K(100%))は、DsA2の148位(参照=R(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の106位(参照=K(100%))は、DsA2の150位(参照=K(94.9%)およびバリアント=E(3.3%))に対応する。DsA1のCSD1の107位(参照=A(100%))は、DsA2の151位(参照=V(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の109位(参照=I(100%))は、DsA2の153位(参照=V(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の110位(参照=G(100%))は、DsA2の154位(参照=A(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の111位(参照=A(100%))は、DsA2の155位(参照=S(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の113位(参照=L(5%)およびバリアント=V(94.9%))は、DsA2の157位(参照=L(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の114位(参照=G(100%))は、DsA2の158位(参照=G(94.9%)およびバリアント=S(3.3%))に対応する。DsA1のCSD1の116位(参照=L(100%))は、DsA2の160位(参照=V(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の117位(参照=T(100%))は、DsA2の161位(参照=A(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の120位(参照=K(100%))は、DsA2の164位(参照=A(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の121位(参照=I(100%))は、DsA2の165位(参照=V(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の123位(参照=R(100%))は、DsA2の167位(参照=H(98.3%))に対応する。DsA1のCSD1の124位(参照=A(100%))は、DsA2の168位(参照=A(97.4%)およびバリアント=T(0.8%))に対応する。DsA1のCSD1の128位(参照=V(100%))は、DsA2の172位(参照=I(98.3%))に対応する。
DsA1中のD50N、D50S、K51E、K51A、C53Y、D55K、V57I、A61L、A65G、A68V、L71M、F76L、S78A、V82M、V82A、L84M、P86R、P86S、K90R、K90A、K94A、V97T、L99T、I100L、K104R、K106E、A107V、I109V、G110A、A111S、L113V、G114S、L116V、T117A、K120A、I121V、R123H、A124T、V128I、およびQ6A5P9のCSD1の観点から:以下のアミノ酸交換のうち1つまたはそれ以上の、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを有するCSD1派生体:
DsA2中のS94D、S94N、E95A、E95K、C97Y、K99D、I101V、L105A、G109A、V112A、L115M、L120F、A122S、A126M、A126V、L128M、P130R、P130S、A134K、A134R、A138K、T141V、T143L、I144L、R148K、K150E、V151A、V153I、A154G、S155A、L157V、G158S、V160L、A161T、A164K、V165I、H167R、A168T、I172V。
DsA1中のM281V、N283D、T285A、R286Q、V289A、V291I、I292R、T293N、A294T、D295K、D295Q、K296E、I298V、K299A、T300V、T300I、A301Y、301と302Dの間のギャップ、E302K、E305K、K306A、A310T、D313G、K316Q、S320T、C321-、P322L、K323D、K323EおよびQ6A5P9のCSD3の観点から:以下のアミノ酸交換のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有するCSD3派生体:
DsA2中のV325M、D327N、A329T、R330Q、V333A、I335V、R336I、N337T、T338A、Q339K、Q339D、E340K、I342V、A343K、V344T、V344I、Y345A、345と346Dの間のギャップ、K346E、K349E、A350K、T354A、G357D、Q360K、T364S、364と365Cの間のギャップ、P365L、E366D、E366K。
A301Y、G206L、G206F、A192L、G206R、G206W、G206Q、G206K、A301F、A301L、G206I、A301W、A301I、G206E、G206M、G208L、G206V、A192M、A256L、A192I、A68I、G206N、A68V、I259L、A161L、V205I、G206T、G206H、A68L、G206Y、A256I、G206A、68M、A192F、G110A、N239L、G206C、A301V、E305L、A93I、A93L、S223A、E305I、E305V、E305A、K120V、K120L、N157I、K120C、E305C、E305M、N239I、K120I、R248C、N239V、E191I、E305F、S78I、K120M、E191L、R248L、H146V、E191V、H146I、S78L、S78V、N157V、H146C、K120F、R248I、R248M、D164L、P236V、P236L、H146L、H146F、D164I、H146M、P86L、R248G、N239C、N157C、E305T、E191C、S78C、R248F、G221L、E305G、P236F、T171L、P86V、R248S、N157L、K120A、H146A、P86I、N157F、S235A、R248A、E191M、N157M、A124I、P236A、S78F、P236C、S78M、A161I、N239M、T171I、E191F、S235V、P86F、H146G、S223I、E305S、D164F、E305Y、P236M、S223L、N239F、H146Y、P236I、G221V、D164C、K120G、D164M、S235I、R248V、A124V、S235L、S223V、S147L、S235C、P86M、G208I、D164A、S147I、N239A、K120T、T117I、G110L、R248Y、P182I、A198L、A124L、A215L、A127L、A66L、P86C、G221F、R248T、T171F、P182V、S147V、P271V、T171V、G110V、P271A、E191A、A149L、K120Y、G114I、K120S、S235F、A201I、G131V、A201V、R248N、A66V、A202I、G221C、G114V、A229L、H146T、A124F、A127F、T117V、S223C、A215F、A127I、P182C、A215V、G162L、G162I、G208F、A201L、A161F、N157A、A198V、E191Y、A161V、S223F、G221M、R248W、G131C、A202V、N157T、S147F、N157Y、G114A、T171C、H146W、S78T、A149I、G250L、N239T、A149V、G208C、K120P、G250V、S235G、S223M、D164V、N239G、T171M、E191G、S78A、D164Y、P271I、G110F、G110C、D164W、P236Y、A124C、A66F、S147M、G75L、E305N、S147C、G221I、A127M、P182L、G221A、G110M、A66C、E305Q、P271F、A215M、P236W、K120W、H146P、A161C、A229I、S78G、G114M、P86A、E305W、V154L、G185V、G75I、S223Y、G75V、R248Q、T277V、E191S、A229F、T277G、G131I、N239S、P271C、V154I、A66M、D164G、G208A、P236T、R248D、D164T、A127C、A215I、A161M、P86W、A201F、C53L、T117F、G131A、T117C、A318L、F150L、G208M、P271M、A149C、G208V、G114C、G162F、S223W、A198I、N157G、A202L、P236G、G185I、A198F、A149M、P86Y、E191W、N157W、I263L、S235T、E305P、E305R、A201C、A201M、F150I、G96I、G114F、G221Y、A199L、D164S、A124M、A179I、A202F、H146S、A231L、C53I、I263V、G162M、K120Q、N239Y、G96L、G75C、N157S、T277C、T117A、A199V、G162C、P271Y、G250C、A127Y、A66I、T117L、G185C、A229C、R248P、A144I、T117M、P86T、A260L、G185A、E191Q、G131L、T277I、G250I、G131M、T277A、A127V、F150V、A318I、S78W、S147Y、A198M、P86G、A215C、A70I、S235M、A179V、A202M、A144V、A202C、G208W、T171Y、S147W、G208Y、G250F、A195L、K120H、A127W、A66Y、S223G、K120N、S78Y、E191N、A198C、P271G、V154F、A70V、H146N、A229M、A134L、P86S、S78Q、A199I、G75M、A68C、E191T、A89L、G96A、D164P、C53V、S78P、G185L、A149G、A149F、およびP182A(安定化効果を有する好ましい交換である);
D265K、D55K、K169R、H103D、H102D、H102E、H103E、D313E、D312E、K316R、K104D、K212E、D312K、K212D、K166D、K212R、K317D、K166E、K317E、K317R、K213R、D312R、H103R、K316E、K165E、H102R、D313K、K213E、D313R、A126K、K213D、K166R、A126E、K165R、K104E、H245E、K282E、N283E、A126R、S77K、P142R、H102K、H245D、K316D、A125K、S77R、A126D、A138K、P142K、K133D、S234E、H210E、P261K、P142E、D129E、H210D、A138E、A227K、A138R、H218K、D60E、D80R、およびD80K(溶媒和を増大する好ましい交換である)
を含有する。
A161L、A161I、A126I、A126V、A126L、S175G、G190H、A161T、S183T、R336I、A126F、A161F、A329L、A161V、S283L、A205L、G109A、A329I、G265F、A161W、A232I、S175W、R336L、A300I、K349I、A161M、A300L、G109L、G109I、A246L、S183M、A223L、E235V、G252L、A329M、A126W、S183L、A259L、A329V、A329F、S183I、A242L、G109F、R336V、K117I、R336C、K117C、K349V、R336A、R336F、K117L、R336M、E235I、R310A、K349L、K117V、R310V、K349C、N201I、R310I、R310C、K349F、K349M、K117M、R292C、N201V、R336G、R292L、K117F、E235C、P130L、E235A、D208L、P280L、E235L、R292M、R336T、P280V、R292I、N201L、E235M、P130I、K117A、K349A、P130V、R292G、R310F、R336S、R336Y、N201C、K117G、R310L、R310M、R310G、R336W、D208V、R292F、P130F、K349Y、K117T、R310T、P280C、R292S、N201F、R310S、T215L、N201M、S279C、R292A、S279L、P280F、D208C、S175V、A126M、P280A、S279A、P130C、S279V、E235F、P186C、P130M、K349T、A126C、K349G、N320V、K117S、N320I、S283V、A168I、N320L、S175I、E235Y、P186V、P280I、P186A、P280M、G265L、D208M、P186L、K117Y、S283I、A205I、D208F、A168L、T215I、R292V、A133L、R336P、R310Y、A168V、S279F、S183V、A164I、S279I、S175L、D208A、K349S、E235T、S175C、A122I、D208I、A126Y、A123L、K117P、N320C、R292T、S283C、E235W、G252I、T215V、R292Y、R336Q、S175A、A123I、E235G、A205V、A171V、A133V、A245I、S183C、P226V、R310P、G181I、P226I、A168C、A246I、A171L、N201A、S175M、G158I、A164L、T215C、A164C、P280W、A133C、G119I、T215F、A245V、N320M、A122V、A123V、G206L、N320A、G265V、A122L、A193L、S191V、R310W、G252F、G181V、E235S、R292N、P130W、G119V、G265C、S279M、A259V、A259F、A168F、A168M、A246V、P226C、R292W、G158V、P130Y、G206V、P186G、C97L、N201Y、A171C、G265M、G140L、K117N、G140I、D208G、A193V、G181F、K349W、S279G、A245L、A205F、G158A、A193I、K117W、A122C、R310D、G294V、P186T、S175F、S191C、N201T、K349Q、R310N、A242V、T215M、D208Y、T321C、G252C、I276L、A259M、A171F、N201G、G119F、D208T、P186M、G229V、G294L、S191I、P186S、G119C、G229I、P130A、A205C、A171M、T321V、A193C、F268L、A133M、A123F、G357A、G109V、K117Q、N320G、R310Q、T321G、S283M、P186Y、G229A、R336D、N201S、S183F、F194L、F268V、A245F、G265A、G252A、R336H、A259I、A133I、A123C、P130T、G113L、D208S、P280T、F268I、G181C、P280Y、R336E、P280G、G158C、N320Y、G140V、K349P、R292D、D208W、N320F、G265I、R336N、A164M、G206M、F268C、G158M、R292P、S191L、G158F、G252M、A245C、G229C、E235Q、G252V、A205M、G206F、R292Q、G181M、A126G、A243L、K349N、S283A、A246M、S279T、P186I、A246F、A246C、A223I、C97I、A164V、A245M、A171I、G357I、A126T、S283F、A123M、F194I、K117D、P226L、P130S、G140F、I276F、F194V、A243V、P130G、G181L、G229F、A259C、G113I、K117H、N320S、G119M、A239L、G206C、A114I、E235N、K349D、A242I、A161C、G294C、G119L、A126S、T321L、A193M、A223V、A122M、G113C、A242C、N201W、R292H、A275L、A242M、G357V、P186F、G294I、D208P、A259W、A243I、R310E、G140C、A242F、G265W、S183A、G109C、G113F、S191F、およびG265Y(安定化効果を有する好ましい交換である);
S94D、E95K、A343K、A350K、F176D、N196D、H147D、H146D、H147E、H146E、T91E、R250E、T91D、R251E、R148D、H254E、A170K、R250K、R251K、H254D、A170R、H146K、H147K、K346E、T90D、R250D、T90E、A138K、R251D、H262K、A169K、H146R、I102E、T90K、A271K、K346R、H306E、D124E、K326E、A169R、D124R(溶媒和を増大する好ましい交換である)
を含有する。
T392F、F352L、T392I、M303F、A276Y、S365I、T392L、M303W、A276L、T392W、K363T、A361V、F286Y、A361I、K363F、M303Y、T392V、A361L、S365V、A270V、A276M、S365L、K363V、M312L、T252L、M387L、Y297F、A276F、G353T、A276W、K363S、T252R、L314I、T252I、A361F、L295I、L255I、A276I、K363L、S318W、V354L、K363I、A361T、S318I、A361M、G353L、T392Y、S365A、A270I、A361W、T252M、K363A、K363W、L319I、G353D、A276V、G353N、G353F、T252V、G353S、S318V、L255V、G364I、L394V、K363M、S318F、L390I、G353I、S335Y、G364L、S365M、T252Q、S365F、L330A、T252F、S318M、K363Y、G353V、S365G、S365W、K363G、T392M、V354F、A276T、G364W、K363C、P317I、S335C、P317L、P317F、G269C、S335A、P317V、G268C、S334V、S335V、G269V、S334C、A361C、G268I、G269F、G268L、S334I、G268V、G269L、S335G、S334A、G268F、S335T、P317C、P317M、S335L、A361Y、G269I、S335I、G268Y、K363P、G268W、S335M、K363H、F286I、G268M、G269M、G269W、G268A、S334G、S334L、G268P、G268T、G293F、F286L、T252C、S335N、T392C、K363N、S334F、M303I、K363Q、A376L、G364V、W245I、G269S、Y297C、S335Q、G358V、W245L、A376I、S334M、G358L、T252A、S318C、S335H、Y297L、S365C、M312I、G373L、Y297I、G358I、S335F、G268N、M303L、G269T、Y297V、P317A、G268Q、G268H、G293L、S334T、G305C、S318L、S335D、S335P、G364C、W245V、W245F、P317Y、T392A、F286V、S335W、A376V、G358C、K363D、M312F、G269N、S335R、A378I、A378C、P317W、G268K、G268R、G268D、A376C、G373V、M312V、M303V、G353C、S318A、G364F、G241C、G268E、G379I、G269P、F286C、L330F、G284V、W245C、A378V、L330I、G293I、G373C、G379L、S318Y、G358F、L394I、L330V、G373I、F352I、A361G、S335K、G246C、M387F、A378L、G241I、V354C、M387I、G269A、G308C、F352C、A276C、G293C、G269Q、K363R、G379V、F286W、W245M、G246V、A270C、G246L、M303C、G293V、G305A、Y297A、G345I、G241V(安定化効果を有する好ましい交換である);
N388D、R248K、S336D、T372E、T249E、E316D、D348E、R382E、R382K、K265E、H327K、D338E、K333R、P386E、S336E、K341D、K341E、K341R、E385D、G268K、G268R、G268D、K340R、G268E、K333D、K368R、G353D(溶媒和を増大する好ましい交換である);
H306I+S335R、H306L+S335R、H306I+S335K、H306C+S335R、H306C+S335R、H306I+S335K、H306L+S335K、H306L+S335K、H306L+S335R、H306V+S335R、H306I+S335R、H306V+S335R、H306C+S335K、H306F+S335K、H306V+S335K、H306V+S335K、H306F+S335R、H306F+S335R、H306W+S335R、H306F+S335K、H306M+S335R、H306W+S335K、H306W+S335R、H306M+S335K、H306A+S335R、H306A+S335R、H306W+S335K、H306A+S335K、H306Y+S335R、H306Y+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306T+S335K、H306S+S335R、H306T+S335K、H306S+S335K、S334V+S335R、H306S+S335K、S334V+S335K、S334I+S335R、S334C+S335R、H306P+S335R、M312I+S335R、S334I+S335K、S334V+S335R、S334V+S335K、H306P+S335K、S334C+S335R、S334A+S335R、M312F+S335R、M312L+S335R、S334C+S335K、H306R+Y381L、M312L+S335R、S250L+S335R、H306Q+S335R、H306N+S335K、S334C+S335K、S334A+S335K、H306P+S335K、H306Q+S335R、M312V+S335R、M312I+S335K、S334I+S335K、M312I+S335R、M312L+S335K、H306N+S335R、S334L+S335R、S334A+S335K、M312L+S335K、S250I+S335R、H306N+S335R、S250V+S335R、H306N+S335K、M312F+S335K、S250V+S335R、S250A+S335R、S334M+S335R、M312V+S335R、S250A+S335K、M312F+S335K、S250A+S335K、S250L+S335R、S334G+S335R、S250C+S335R、S250C+S335R、H306Q+S335K、S334G+S335R、Y254F+S335R、S334L+S335R、S250I+S335R、I309C+S335R、S250I+S335K、Y254C+S335R、S250L+S335K、M312V+S335K、S334G+S335K、S250L+H306R、S250V+H306R、H306R+Y381I、M312V+S335K、S250I+H306R、M312C+S335R、Y254C+S335R、S250V+S335K、Y254W+S335R、S334G+S335K、S250L+H306R、S250L+S335K、Y254W+S335R、S250V+S335K、S334L+S335K、I309C+S335R、I309C+S335K、Y254F+S335R、S250A+S335R、S250C+S335K、S250I+H306R、S250A+H306R、S250C+S335K、H306Q+S335K、Y254C+S335K、S334L+S335K、S250A+H306R、I309C+S335K、Y254W+S335K、Y254C+S335K、Y254I+S335R、H306R+Y381C、S250M+S335K、M312C+S335K、M312C+S335K、S250V+H306R、S250M+S335R、Y254V+S335R、Y254I+S335K、S250W+S335R、I259C+S335R、S334M+S335R、Y254A+S335R、Y254V+S335R、S250M+S335K、F251L+S35R、Y254I+H306R、I259C+S335K、Y254I+S335R、I259C+S335K、S250Y+S335K、Y254F+S335K、S250M+S335R、Y254F+H306R、Y254V+S335K、Y254V+H306R、S334T+S335K、S334Y+S335R、Y254A+S335R、S334M+S335K、Y254I+H306R、Y254M+S335K、Y254A+S335K、S334F+S335R、S334M+S335K、F251L+H306R、S334T+S335R、Y254I+S335K、Y254A+S335K、S334T+S335K、S250Y+H306R、Y254A+H306R、Y254M+S335K、F251L+S335K、I259C+S335R、F251L+H306R、Y254M+H306R、S334P+S335R、S334P+S335R、S334P+S335K、S334F+S335R、Y254M+S335R、H306I+S335C、H306L+S335C、H306L+S335C、H306I+S335C、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306L+S335V、H306M+S335C、H306I+S335G、H306I+S335G、H306I+S335A、H306I+S335A、H306F+S335C、H306F+S335C、H306L+S335V、H306I+S335T、H306L+S335A、H306C+S335A、H306I+S335V、H306I+S335V、H306L+S334V、H306L+S335A、H306C+S335V、H306L+S334C、H306I+S335I、H306I+S334A、H306L+S334C、H306L+S334V、H306F+S334V、H306C+S335A、H306F+S335V、H306C+S334V、H306C+S334V、H306I+S335L、H306C+S335V、H306L+S334I、H306M+S335C、H306I+S334C、H306I+S335I、H306W+S335C、H306V+S335A、H306I+S334C、H306I+S334I、H306L+S335I、H306V+S335A、H306C+S334C、H306L+S335G、H306C+S334C、H306L+S335T、H306I+S334I、H306V+S334V、H306I+S335L、H306M+S335V、H306V+S335V、H306V+S335V、H306I+S335M、H306L+S335T、H306V+S335I、H306C+S335G、H306L+S335L、H306C+S334I、H306L+S335Y、H306L+S335I、H306V+S334V、H306C+S335G、H306I+S334A、H306L+S334A、H306C+S335I、H306F+S335V、H306I+S335T、H306L+S335Y、H306C+S334I、H306L+S334I、H306V+S335G、H306V+S335G、H306A+S335C、H306A+S335C、H306M+S335A、H306C+S334A、H306V+S335I、H306L+S335G、H306L+S334A、H306C+S334A、H306I+S335Y、H306I+S335Y、H306W+S335C、H306F+S335A、H306F+S335A、H306F+S335I、H306I+S335N、H306L+S335L、H306I+S335M、H306I+S335N、H306V+S334I、H306V+S334C、H306V+S335L、H306C+S335L、H306C+S335L、H306I+A376L、H306F+S335T、H306L+S335M、H306F+S334V、S334V+S335C、S335C+Y381L、S335C+A376I、S334I+S335C、S334V+S335C、M312I+S335C、M312I+S335C、S335C+A376L、S334I+S335C、S335C+A376L、S335C+A378C、S335C+A376C、S335C+A376V、S334A+S335C、S335C+A378C、S334A+S335C、S335C+A376I、S334V+S335A、S335A+A376L、S335C+A376C、S335C+A376V、S335C+A378L、S334V+S335A、S335A+A376I、S334V+A376L、S334I+S335V、S335C+A378I、M312F+S335C、M312F+S335C、S334I+S335A、S335C+A378V、S335V+A376L、S334V+S335L、S335C+A378I、S334C+S335V、S334V+A376I、S334V+A376I、S335V+A376I、M312I+S334V、S334V+S335I、S335C+Y381I、M312V+S335C、S335C+A378L、S335A+Y381L、S334C+A376C、S334V+S335I、S335C+Y381V、M312L+S335C、S335C+A378V、S335V+A376L、S334I+S335V、S335C+Y381C、S335V+A376I、S334C+A376L、S334C+Y381L、M312V+S335C、S334V+S335L、S334C+A376I、S334C+A376C、S334V+Y381L、M312L+S335C、S335V+A376V、S334I+A376I、S335V+A376V、S335V+Y381L、Y254F+S335C、L310F+S335C、S335I+A376I、S334V+A376V、M312I+S335V、S334C+S335A、S334I+A376L、M312F+S335V、S335C+Y381A、L310F+S335C、S334G+S335C、S334G+S335C、S334V+A376V、S335C+A376M、S335C+A376M、S334A+S335I、S334V+A376L、M312C+S335C、S334C+S335A、S335A+A376V、S334A+S335V、S334A+S335V、Y254F+S335C、S335A+A376L、S335A+Y381I、S335A+A376I、S334L+S335C、S335A+A376V、およびM312C+S335C(溶媒和の増大および/またはポルフィリン結合の低減を有する好ましい交換である)
を含有する。
A274Y、S26C、S26L、A274F、S26I、G119H、A274L、A274W、S26V、S26M、S212L、T108I、A134L、S26F、N130V、A229L、A274I、G194F、S26W、A291F、G181I、A229I、E278I、A175L、G181L、A152L、A274V、N130L、E278V、K46I、E278L、E278A、K46C、K46L、K93L、K93V、E164I、E278C、E164V、E278M、N130I、K46V、R221C、K93C、K46M、S51L、K93I、E278F、K93M、E164A、S51I、R221L、P209L、K46F、S51V、E164C、R221I、E164M、K93F、D137L、P209V、E164L、P59L、R221F、N130C、S51C、R221G、E278T、K46G、P59V、K46A、N130M、E278G、D137V、K46T、P209C、P59I、P209I、T144L、N130F、E164F、S51F、R221M、P209F、S51M、R221S、P209A、K93A、P209M、E164Y、D137C、R221A、P115C、P59F、S208A、K46S、P115V、A134I、P115A、S212V、N249L、E278S、D137F、D137M、P115L、S212I、R221V、N249V、D137I、E278Y、G194L、P59M、R221T、A188L、N249I、T144I、E164T、S208C、S208V、D137A、K46Y、K93G、G87I、E164G、K46P、P59C、A97V、S212C、G83L、K93T、N249C、A134V、G83V、T108V、T112L、T144V、A100L、G87V、E164W、E164S、A171L、A97L、A188F、K93W、T90I、A174I、K93Y、A111L、A97I、N130A、G48I、E278W、R221Y、G135L、T112V、F197V、T144F、K93S、G194V、G87A、A188V、T144C、K46N、P115M、A175I、N130T、S51A、G194C、G48L、G104V、A174V、G158V、T90V、R221N、A202L、A39L、A134F、D137Y、G158I、A174L、P155V、A171V、S51T、F197I、T112C、D137W、G135V、D137G、P115G、T250C、S208L、A100I、T250L、T144M、T108C、P115F、G69L、T112F、G181F、A100F、S208I、G223V、T250V、N249M、A111V、N249Y、A111F、A188M、A111I、P209Y、A175V、P155I、N130G、S120V、A111C、A100C、A97F、G194M、G69I、E278Q、S208G、G181C、G87F、G48V、A97C、I205L、G194I、D137T、S51G、F197C、G223L、N249A、S51Y、P115S、A202I、P155C、S26A、G83M、S120C、D137S、E278N、G83F、G158C、P59Y、G87C、G87M、N130S、P115I、A202F、A100M、G83C、S212M、A39V、A188I、F197L、G181M、A134C、P115T、A174F、K93P、P209W、P209G、P59A、A39C、G104I、T250G、S208F、R221Q、G181A、G104C、T90C、K46Q、P209T、K46W、A171I、G158A、A134M、G48C、G194A、T90A、T90M、N130Y、N249F、A172L、A152V、A152I、P59W、R221P、G158F、T112M、G135M、G181V、G104L、S208T、N249W、A97M、G135F、K93Q、G42L、A111M、G104A、E278P、T90L、R221D、A175C、A188C、A291L、S212A、F123L、T250I、A174C、E164Q、P155L、A174M、G158M、A172V、E164N、A168L、T90F、A39F、G42V、I205F、A39M、N249G、A175F、G135C、A171F、S212F、K46D、A100Y、G42I、P59G、G69A、E164P、G158L、G42C、A171C、T250M、T108L、K93N、A171M、G223I、A175M、T108M、A172I、S51P、A291I、A111Y、G20V、S120I、P59T、A58I、G223C、S208M、G48M、K46H、A62L、A43I、T250A、N130W、G194Y、R221H、D137P、N249S、G104F、A100V、F123I、A172C、T112I、G69F、P115Y、P59S、A100W、G104M、G69C、R221W、K93H、A204L、G20L、G223F、A168I、D28K、E275K、K77R、D17R、H76D、H75D、H76E、K77D、H75E、P294D、S293D、S293E、D286E、P294E、S292E、D285E、H76R、K77E、K289R、P295D、D285K、R179E、H75R、P295E、P294R、P294K、D286K、D285R、S293R、S293K、R180D、R180K、H183E、R179K、K289E、R180E、A98K、R179D、A99K、S292D、D286R、K290D、H75K、A99E、N256E、K290E、K290R、R239D、A199K、A200K、K255E、H183D、A99R、H235E、A98R、D102K、およびA200R
が好ましい(以下の段落では、アミノ酸番号付けは、配列番号49に従い、別の場所におけるように、Q6A5X9、Q6A5P9およびQ6A9N1に従わない)。
P.アクネスの2つの別個の表現型(IおよびII型)は、血清学的凝集試験および細胞壁糖分析によって区別できる:I型株の細胞壁は、ガラクトース、グルコースおよびマンノースを含有するのに対し、II型株は、グルコースおよびマンノースのみを含有する。追加の研究によって、これらの次亜種は、糖および糖アルコールの発酵ならびにバクテリオファージ感染に対するその感受性において相違を示すことが示されている。P.アクネスrecA遺伝子の配列分析によって、IおよびII型は系統学的に別個のクラスターまたは系統に対するということが示された。しかし、これら2つのクラスターは、16S rRNAシーケンシングに基づいてほとんど同一である。recA遺伝子の分析によってまた、P.アクネスI型内の株のサブクラスターが同定され、これは、IB型と指定されている。
Y(TAC)→H(CAC)[より高い全体的なコドン数、より高いGC含量]
I(ATC)→L(CTG)[有意に高い全体的なコドン数、より高いGC含量]
N(AAC)→D(GAC)[より高い全体的なコドン数、より高いGC含量]
M(ATG)→L(CTG)[有意に高い全体的なコドン数、より高いGC含量]
S(AGC)→A(GCC)[有意に高い全体的なコドン数、より高いGC含量]
R(AGA)→Q(CAG)[有意に高い全体的なコドン数、より高いGC含量]
・ウリジン→プソイドウリジン(記号:Ψ)
・ウリジン→N-1-メチルプソイドウリジン(m1Ψ)
・シトシン→5-メチルシトシン(5mC)
・コーディング潜在力を維持し、RNA配列中に含まれた場合にRNA依存性タンパク質キナーゼによる認識の低減を特徴とする、任意の他のウラシル(塩基)類似体(PKR)
・mRNA中に組み込まれた場合に(既存のmRNAの転写または化学的修飾によって)、mRNAのコーディング潜在力を依然として維持するが、炎症(例えば、TLR7またはTLR8による認識の低減によって)またはmRNA分解を低減する、任意の他の天然または非天然RNA塩基類似体。
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応する、前記ワクチン。
- フェニルアラニン150(F150)~イソロイシン193(I193)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態1に従うワクチン。
(1)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列;
(2)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(3)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(4)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張するフェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(5)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、アラニン148(F148)~ロイシン271(L271)の連続ポリペプチド配列;
(6)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン146(H146)~トレオニン277(T277)の連続ポリペプチド配列;
(7)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン238(L238)~ロイシン272(L272)の連続ポリペプチド配列;
(8)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン145(L145)~アラニン201(A201)の連続ポリペプチド配列;ならびに/または
(9)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン145(L145)~ロイシン280(L280)の連続ポリペプチド配列
である、実施形態1~3のいずれか1項に従うワクチン。
-少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2;または
-少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2のN末端部分ならびに異なる、少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2のC末端部分からなるアミノ酸配列であって、NおよびC末端部分からなるアミノ酸配列のアミノ酸残基の総数は、DsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2と同一である、アミノ酸配列
によって相互接続される、実施形態1~39のいずれか1項に従うワクチン。
(a)20個のアミノ酸残基の連続ポリペプチド配列、特に、DsA1のF150~L184またはDsA2のF194~L228を少なくとも含む、DsA1のA148~L267またはDsA2のA192~L311内のDsA1またはDsA2のCSD2断片、
(b)以下のアミノ酸交換:DsA1中のA149T、D152N、D152S、V155I、V163I、K166H、K166P、A168T、K169R、T171A、V173M、A176V、A183T、T190F、T190I、E191K、A192L、A192F、A198G、A199T、A202T、V205I、G206N、G206S、G206R、G206Q、K212Q、A214T、I219V、I219A、S223A、D225N、V233I、S235F、N239S、L255I、V257I、Q258S、I259L、R262H、I264V、D265KおよびDsA2中のT193A、N196D、N196S、I199V、I207V、H210K、H210P、A212T、R213K、T215A、V217M、V220A、T227A、F234T、F234I、E235K、L236A、L236F、A242G、A243T、A246T、I249V、R250G、R250S、R250N、G250Q、Q256K、A258T、V263I、V263A、A267S、D269N、I277V、S279F、S283N、I299L、I301V、S302Q、L303I、H306R、V308I、K309Dのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有する、(a)のCSD2派生体、
(c)20個のアミノ酸残基の連続ポリペプチド配列、特に、DsA1のT117~A127またはDsA2のT161~LA171を少なくとも含む、DsA1のI49~L130またはDsA2のI93~L174内のDsA1またはDsA2のCSD1断片、
(d)以下のアミノ酸交換:DsA1中のD50N、D50S、K51E、K51A、C53Y、D55K、V57I、A61L、A65G、A68V、L71M、F76L、S78A、V82M、V82A、L84M、P86R、P86S、K90R、K90A、K94A、V97T、L99T、I100L、K104R、K106E、A107V、I109V、G110A、A111S、L113V、G114S、L116V、T117A、K120A、I121V、R123H、A124T、V128IおよびDsA2中のS94D、S94N、E95A、E95K、C97Y、K99D、I101V、L105A、G109A、V112A、L115M、L120F、A122S、A126M、A126V、L128M、P130R、P130S、A134K、A134R、A138K、T141V、T143L、I144L、R148K、K150E、V151A、V153I、A154G、S155A、L157V、G158S、V160L、A161T、A164K、V165I、H167R、A168T、I172Vのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有する(c)のCSD1派生体、
(e)DsA1のR266~T277もしくはR286~K296またはDsA2のV333~Q347の連続ポリペプチド配列を少なくとも含む、DsA1のA278~K323またはDsA2のA322~E366内のDsA1またはDsA2のCSD3断片、
(f)以下のアミノ酸交換:DsA1中のM281V、N283D、T285A、R286Q、V289A、V291I、I292R、T293N、A294T、D295K、D295Q、K296E、I298V、K299A、T300V、T300I、A301Y、-301から302Dの間、E302K、E305K、K306A、A310T、D313G、K316Q、S320T、C321-、P322L、K323D、K323EおよびDsA2中のV325M、D327N、A329T、R330Q、V333A、I335V、R336I、N337T、T338A、Q339K、Q339D、E340K、I342V、A343K、V344T、V344I、Y345A、345から346Dの間のギャップ、K346E、K349E、A350K、T354A、G357D、Q360K、T364S、364から365Cの間のギャップ、P365L、E366D、E366Kのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有するCSD3派生体
を含む、ワクチンまたはP.アクネスポリペプチド。
DsA1:A301Y、G206L、G206F、A192L、G206R、G206W、G206Q、G206K、A301F、A301L、G206I、A301W、A301I、G206E、G206M、G208L、G206V、A192M、A256L、A192I、A68I、G206N、A68V、I259L、A161L、V205I、G206T、G206H、A68L、G206Y、A256I、G206A、68M、A192F、G110A、N239L、G206C、A301V、E305L、A93I、A93L、S223A、E305I、E305V、E305A、K120V、K120L、N157I、K120C、E305C、E305M、N239I、K120I、R248C、N239V、E191I、E305F、S78I、K120M、E191L、R248L、H146V、E191V、H146I、S78L、S78V、N157V、H146C、K120F、R248I、R248M、D164L、P236V、P236L、H146L、H146F、D164I、H146M、P86L、R248G、N239C、N157C、E305T、E191C、S78C、R248F、G221L、E305G、P236F、T171L、P86V、R248S、N157L、K120A、H146A、P86I、N157F、S235A、R248A、E191M、N157M、A124I、P236A、S78F、P236C、S78M、A161I、N239M、T171I、E191F、S235V、P86F、H146G、S223I、E305S、D164F、E305Y、P236M、S223L、N239F、H146Y、P236I、G221V、D164C、K120G、D164M、S235I、R248V、A124V、S235L、S223V、S147L、S235C、P86M、G208I、D164A、S147I、N239A、K120T、T117I、G110L、R248Y、P182I、A198L、A124L、A215L、A127L、A66L、P86C、G221F、R248T、T171F、P182V、S147V、P271V、T171V、G110V、P271A、E191A、A149L、K120Y、G114I、K120S、S235F、A201I、G131V、A201V、R248N、A66V、A202I、G221C、G114V、A229L、H146T、A124F、A127F、T117V、S223C、A215F、A127I、P182C、A215V、G162L、G162I、G208F、A201L、A161F、N157A、A198V、E191Y、A161V、S223F、G221M、R248W、G131C、A202V、N157T、S147F、N157Y、G114A、T171C、H146W、S78T、A149I、G250L、N239T、A149V、G208C、K120P、G250V、S235G、S223M、D164V、N239G、T171M、E191G、S78A、D164Y、P271I、G110F、G110C、D164W、P236Y、A124C、A66F、S147M、G75L、E305N、S147C、G221I、A127M、P182L、G221A、G110M、A66C、E305Q、P271F、A215M、P236W、K120W、H146P、A161C、A229I、S78G、G114M、P86A、E305W、V154L、G185V、G75I、S223Y、G75V、R248Q、T277V、E191S、A229F、T277G、G131I、N239S、P271C、V154I、A66M、D164G、G208A、P236T、R248D、D164T、A127C、A215I、A161M、P86W、A201F、C53L、T117F、G131A、T117C、A318L、F150L、G208M、P271M、A149C、G208V、G114C、G162F、S223W、A198I、N157G、A202L、P236G、G185I、A198F、A149M、P86Y、E191W、N157W、I263L、S235T、E305P、E305R、A201C、A201M、F150I、G96I、G114F、G221Y、A199L、D164S、A124M、A179I、A202F、H146S、A231L、C53I、I263V、G162M、K120Q、N239Y、G96L、G75C、N157S、T277C、T117A、A199V、G162C、P271Y、G250C、A127Y、A66I、T117L、G185C、A229C、R248P、A144I、T117M、P86T、A260L、G185A、E191Q、G131L、T277I、G250I、G131M、T277A、A127V、F150V、A318I、S78W、S147Y、A198M、P86G、A215C、A70I、S235M、A179V、A202M、A144V、A202C、G208W、T171Y、S147W、G208Y、G250F、A195L、K120H、A127W、A66Y、S223G、K120N、S78Y、E191N、A198C、P271G、V154F、A70V、H146N、A229M、A134L、P86S、S78Q、A199I、G75M、A68C、E191T、A89L、G96A、D164P、C53V、S78P、G185L、A149G、A149F、P182A;
DsA2:A161L、A161I、A126I、A126V、A126L、S175G、G190H、A161T、S183T、R336I、A126F、A161F、A329L、A161V、S283L、A205L、G109A、A329I、G265F、A161W、A232I、S175W、R336L、A300I、K349I、A161M、A300L、G109L、G109I、A246L、S183M、A223L、E235V、G252L、A329M、A126W、S183L、A259L、A329V、A329F、S183I、A242L、G109F、R336V、K117I、R336C、K117C、K349V、R336A、R336F、K117L、R336M、E235I、R310A、K349L、K117V、R310V、K349C、N201I、R310I、R310C、K349F、K349M、K117M、R292C、N201V、R336G、R292L、K117F、E235C、P130L、E235A、D208L、P280L、E235L、R292M、R336T、P280V、R292I、N201L、E235M、P130I、K117A、K349A、P130V、R292G、R310F、R336S、R336Y、N201C、K117G、R310L、R310M、R310G、R336W、D208V、R292F、P130F、K349Y、K117T、R310T、P280C、R292S、N201F、R310S、T215L、N201M、S279C、R292A、S279L、P280F、D208C、S175V、A126M、P280A、S279A、P130C、S279V、E235F、P186C、P130M、K349T、A126C、K349G、N320V、K117S、N320I、S283V、A168I、N320L、S175I、E235Y、P186V、P280I、P186A、P280M、G265L、D208M、P186L、K117Y、S283I、A205I、D208F、A168L、T215I、R292V、A133L、R336P、R310Y、A168V、S279F、S183V、A164I、S279I、S175L、D208A、K349S、E235T、S175C、A122I、D208I、A126Y、A123L、K117P、N320C、R292T、S283C、E235W、G252I、T215V、R292Y、R336Q、S175A、A123I、E235G、A205V、A171V、A133V、A245I、S183C、P226V、R310P、G181I、P226I、A168C、A246I、A171L、N201A、S175M、G158I、A164L、T215C、A164C、P280W、A133C、G119I、T215F、A245V、N320M、A122V、A123V、G206L、N320A、G265V、A122L、A193L、S191V、R310W、G252F、G181V、E235S、R292N、P130W、G119V、G265C、S279M、A259V、A259F、A168F、A168M、A246V、P226C、R292W、G158V、P130Y、G206V、P186G、C97L、N201Y、A171C、G265M、G140L、K117N、G140I、D208G、A193V、G181F、K349W、S279G、A245L、A205F、G158A、A193I、K117W、A122C、R310D、G294V、P186T、S175F、S191C、N201T、K349Q、R310N、A242V、T215M、D208Y、T321C、G252C、I276L、A259M、A171F、N201G、G119F、D208T、P186M、G229V、G294L、S191I、P186S、G119C、G229I、P130A、A205C、A171M、T321V、A193C、F268L、A133M、A123F、G357A、G109V、K117Q、N320G、R310Q、T321G、S283M、P186Y、G229A、R336D、N201S、S183F、F194L、F268V、A245F、G265A、G252A、R336H、A259I、A133I、A123C、P130T、G113L、D208S、P280T、F268I、G181C、P280Y、R336E、P280G、G158C、N320Y、G140V、K349P、R292D、D208W、N320F、G265I、R336N、A164M、G206M、F268C、G158M、R292P、S191L、G158F、G252M、A245C、G229C、E235Q、G252V、A205M、G206F、R292Q、G181M、A126G、A243L、K349N、S283A、A246M、S279T、P186I、A246F、A246C、A223I、C97I、A164V、A245M、A171I、G357I、A126T、S283F、A123M、F194I、K117D、P226L、P130S、G140F、I276F、F194V、A243V、P130G、G181L、G229F、A259C、G113I、K117H、N320S、G119M、A239L、G206C、A114I、E235N、K349D、A242I、A161C、G294C、G119L、A126S、T321L、A193M、A223V、A122M、G113C、A242C、N201W、R292H、A275L、A242M、G357V、P186F、G294I、D208P、A259W、A243I、R310E、G140C、A242F、G265W、S183A、G109C、G113F、S191F、G265Y、S94D、E95K、A343K、A350K、F176D、N196D、H147D、H146D、H147E、H146E、T91E、R250E、T91D、R251E、R148D、H254E、A170K、R250K、R251K、H254D、A170R、H146K、H147K、K346E、T90D、R250D、T90E、A138K、R251D、H262K、A169K、H146R、I102E、T90K、A271K、K346R、H306E、D124E、K326E、A169R、D124R
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含む、実施形態1~62のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはDsA1および/もしくはDsA2派生体。
T392F、F352L、T392I、M303F、A276Y、S365I、T392L、M303W、A276L、T392W、K363T、A361V、F286Y、A361I、K363F、M303Y、T392V、A361L、S365V、A270V、A276M、S365L、K363V、M312L、T252L、M387L、Y297F、A276F、G353T、A276W、K363S、T252R、L314I、T252I、A361F、L295I、L255I、A276I、K363L、S318W、V354L、K363I、A361T、S318I、A361M、G353L、T392Y、S365A、A270I、A361W、T252M、K363A、K363W、L319I、G353D、A276V、G353N、G353F、T252V、G353S、S318V、L255V、G364I、L394V、K363M、S318F、L390I、G353I、S335Y、G364L、S365M、T252Q、S365F、L330A、T252F、S318M、K363Y、G353V、S365G、S365W、K363G、T392M、V354F、A276T、G364W、K363C、P317I、S335C、P317L、P317F、G269C、S335A、P317V、G268C、S334V、S335V、G269V、S334C、A361C、G268I、G269F、G268L、S334I、G268V、G269L、S335G、S334A、G268F、S335T、P317C、P317M、S335L、A361Y、G269I、S335I、G268Y、K363P、G268W、S335M、K363H、F286I、G268M、G269M、G269W、G268A、S334G、S334L、G268P、G268T、G293F、F286L、T252C、S335N、T392C、K363N、S334F、M303I、K363Q、A376L、G364V、W245I、G269S、Y297C、S335Q、G358V、W245L、A376I、S334M、G358L、T252A、S318C、S335H、Y297L、S365C、M312I、G373L、Y297I、G358I、S335F、G268N、M303L、G269T、Y297V、P317A、G268Q、G268H、G293L、S334T、G305C、S318L、S335D、S335P、G364C、W245V、W245F、P317Y、T392A、F286V、S335W、A376V、G358C、K363D、M312F、G269N、S335R、A378I、A378C、P317W、G268K、G268R、G268D、A376C、G373V、M312V、M303V、G353C、S318A、G364F、G241C、G268E、G379I、G269P、F286C、L330F、G284V、W245C、A378V、L330I、G293I、G373C、G379L、S318Y、G358F、L394I、L330V、G373I、F352I、A361G、S335K、G246C、M387F、A378L、G241I、V354C、M387I、G269A、G308C、F352C、A276C、G293C、G269Q、K363R、G379V、F286W、W245M、G246V、A270C、G246L、M303C、G293V、G305A、Y297A、G345I、G241V;N388D、R248K、S336D、T372E、T249E、E316D、D348E、R382E、R382K、K265E、H327K、D338E、K333R、P386E、S336E、K341D、K341E、K341R、E385D、G268K、G268R、G268D、K340R、G268E、K333D、K368R、G353D;H306I+S335R、H306L+S335R、H306I+S335K、H306C+S335R、H306C+S335R、H306I+S335K、H306L+S335K、H306L+S335K、H306L+S335R、H306V+S335R、H306I+S335R、H306V+S335R、H306C+S335K、H306F+S335K、H306V+S335K、H306V+S335K、H306F+S335R、H306F+S335R、H306W+S335R、H306F+S335K、H306M+S335R、H306W+S335K、H306W+S335R、H306M+S335K、H306A+S335R、H306A+S335R、H306W+S335K、H306A+S335K、H306Y+S335R、H306Y+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306T+S335K、H306S+S335R、H306T+S335K、H306S+S335K、S334V+S335R、H306S+S335K、S334V+S335K、S334I+S335R、S334C+S335R、H306P+S335R、M312I+S335R、S334I+S335K、
S334V+S335R、S334V+S335K、H306P+S335K、S334C+S335R、S334A+S335R、M312F+S335R、M312L+S335R、S334C+S335K、H306R+Y381L、M312L+S335R、S250L+S335R、H306Q+S335R、H306N+S335K、S334C+S335K、S334A+S335K、H306P+S335K、H306Q+S335R、M312V+S335R、M312I+S335K、S334I+S335K、M312I+S335R、M312L+S335K、H306N+S335R、S334L+S335R、S334A+S335K、M312L+S335K、S250I+S335R、H306N+S335R、S250V+S335R、H306N+S335K、M312F+S335K、S250V+S335R、S250A+S335R、S334M+S335R、M312V+S335R、S250A+S335K、M312F+S335K、S250A+S335K、S250L+S335R、S334G+S335R、S250C+S335R、S250C+S335R、H306Q+S335K、S334G+S335R、Y254F+S335R、S334L+S335R、S250I+S335R、I309C+S335R、S250I+S335K、Y254C+S335R、S250L+S335K、M312V+S335K、S334G+S335K、S250L+H306R、S250V+H306R、H306R+Y381I、M312V+S335K、S250I+H306R、M312C+S335R、Y254C+S335R、S250V+S335K、Y254W+S335R、S334G+S335K、S250L+H306R、S250L+S335K、Y254W+S335R、S250V+S335K、S334L+S335K、I309C+S335R、I309C+S335K、Y254F+S335R、S250A+S335R、S250C+S335K、S250I+H306R、S250A+H306R、S250C+S335K、H306Q+S335K、Y254C+S335K、S334L+S335K、S250A+H306R、I309C+S335K、Y254W+S335K、Y254C+S335K、Y254I+S335R、H306R+Y381C、S250M+S335K、M312C+S335K、M312C+S335K、S250V+H306R、S250M+S335R、Y254V+S335R、Y254I+S335K、S250W+S335R、I259C+S335R、S334M+S335R、Y254A+S335R、Y254V+S335R、S250M+S335K、F251L+S35R、Y254I+H306R、I259C+S335K、Y254I+S335R、I259C+S335K、S250Y+S335K、Y254F+S335K、S250M+S335R、Y254F+H306R、Y254V+S335K、Y254V+H306R、S334T+S335K、S334Y+S335R、Y254A+S335R、S334M+S335K、Y254I+H306R、Y254M+S335K、Y254A+S335K、S334F+S335R、S334M+S335K、F251L+H306R、S334T+S335R、Y254I+S335K、Y254A+S335K、S334T+S335K、S250Y+H306R、Y254A+H306R、Y254M+S335K、F251L+S335K、I259C+S335R、F251L+H306R、Y254M+H306R、S334P+S335R、S334P+S335R、S334P+S335K、S334F+S335R、Y254M+S335R、H306I+S335C、H306L+S335C、H306L+S335C、H306I+S335C、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306L+S335V、H306M+S335C、H306I+S335G、H306I+S335G、H306I+S335A、H306I+S335A、H306F+S335C、H306F+S335C、H306L+S335V、H306I+S335T、H306L+S335A、H306C+S335A、H306I+S335V、H306I+S335V、H306L+S334V、H306L+S335A、H306C+S335V、H306L+S334C、H306I+S335I、H306I+S334A、H306L+S334C、H306L+S334V、H306F+S334V、H306C+S335A、H306F+S335V、H306C+S334V、H306C+S334V、H306I+S335L、H306C+S335V、H306L+S334I、H306M+S335C、H306I+S334C、H306I+S335I、H306W+S335C、H306V+S335A、H306I+S334C、H306I+S334I、H306L+S335I、H306V+S335A、H306C+S334C、H306L+S335G、H306C+S334C、H306L+S335T、H306I+S334I、H306V+S334V、H306I+S335L、H306M+S335V、H306V+S335V、H306V+S335V、H306I+S335M、H306L+S335T、H306V+S335I、H306C+S335G、H306L+S335L、H306C+S334I、H306L+S335Y、H306L+S335I、H306V+S334V、H306C+S335G、H306I+S334A、H306L+S334A、H306C+S335I、H306F+S335V、H306I+S335T、H306L+S335Y、H306C+S334I、H306L+S334I、H306V+S335G、H306V+S335G、H306A+S335C、H306A+S335C、H306M+S335A、H306C+S334A、H306V+S335I、H306L+S335G、H306L+S334A、
H306C+S334A、H306I+S335Y、H306I+S335Y、H306W+S335C、H306F+S335A、H306F+S335A、H306F+S335I、H306I+S335N、H306L+S335L、H306I+S335M、H306I+S335N、H306V+S334I、H306V+S334C、H306V+S335L、H306C+S335L、H306C+S335L、H306I+A376L、H306F+S335T、H306L+S335M、H306F+S334V、S334V+S335C、S335C+Y381L、S335C+A376I、S334I+S335C、S334V+S335C、M312I+S335C、M312I+S335C、S335C+A376L、S334I+S335C、S335C+A376L、S335C+A378C、S335C+A376C、S335C+A376V、S334A+S335C、S335C+A378C、S334A+S335C、S335C+A376I、S334V+S335A、S335A+A376L、S335C+A376C、S335C+A376V、S335C+A378L、S334V+S335A、S335A+A376I、S334V+A376L、S334I+S335V、S335C+A378I、M312F+S335C、M312F+S335C、S334I+S335A、S335C+A378V、S335V+A376L、S334V+S335L、S335C+A378I、S334C+S335V、S334V+A376I、S334V+A376I、S335V+A376I、M312I+S334V、S334V+S335I、S335C+Y381I、M312V+S335C、S335C+A378L、S335A+Y381L、S334C+A376C、S334V+S335I、S335C+Y381V、M312L+S335C、S335C+A378V、S335V+A376L、S334I+S335V、S335C+Y381C、S335V+A376I、S334C+A376L、S334C+Y381L、M312V+S335C、S334V+S335L、S334C+A376I、S334C+A376C、S334V+Y381L、M312L+S335C、S335V+A376V、S334I+A376I、S335V+A376V、S335V+Y381L、Y254F+S335C、L310F+S335C、S335I+A376I、S334V+A376V、M312I+S335V、S334C+S335A、S334I+A376L、M312F+S335V、S335C+Y381A、L310F+S335C、S334G+S335C、S334G+S335C、S334V+A376V、S335C+A376M、S335C+A376M、S334A+S335I、S334V+A376L、M312C+S335C、S334C+S335A、S335A+A376V、S334A+S335V、S334A+S335V、Y254F+S335C、S335A+A376L、S335A+Y381I、S335A+A376I、S334L+S335C、S335A+A376V、M312C+S335C、D152F、D152L、D152I、D152V、D152M、D152W、D152Y、D152S、D152A、D152T、D152G、D152N、D152Q、D152P、D152H、D152K、D152R、D152C、D155Q、D155L、D155F、D155I、D155M、D155W、D155V、D155Y、D155A、D155N、D155T、D155S、D155P、D155G、D155H、D155R、D155K、D155C、D156L、D156F、D156I、D156W、D156V、D156A、D156Y、D156M、D156G、D156S、D156T、D156Q、D156N、D156P、D156H、D156K、D156R、D156C、H146R、H146K、H153R、H153K、Y63A、H146A、H153A、F74A、L141A、F81A、P72A、K144A、T143A、Y75A、W98A、D156A、R158A、S250W、S250F、S250D、S250E、S250K、S250R、F251A、Y254A、I259W、I259F、I259D、I259E、I259R、I259K、H306A、I309W、I309F、I309E、I309D、I309R、I309K、L310W、L310F、L310D、L310E、L310R、L310K、M312W、M312F、M312D、M312E、M312R、M312K、S334W、S334F、S334D、S334E、S334R、S334K、S335W、S335F、S335D、S335E、S335K、S335R、M337W、M337F、M337D、M337E、M337K、M337R、A376W、A376F、A376E、A376D、A376R、A376K、F377、A378W、A378F、A378D、A378E、A378K、A378R、F380A、Y381A、D348I、D348L、D348M、D348F、D348V、D348Y、D348A、D348W、D348T、D348G、D348P、D348H、D348S、D348R、D348K、D348E、D348C、H306R、H306D、H306E、H306K、H307D、H307R、H307E、H307K、H327R、H327K、H327E、H327D、H302E、H302K、H302R、H302D、H215K、H215R、H215E、H215D、H223K、H223R、H223E、H223D、H403K、H403R、H403E、H403D
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含むPITP派生体をさらに含む、実施形態1~63のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはDsA1および/もしくはDsA2派生体。
A274Y、S26C、S26L、A274F、S26I、G119H、A274L、A274W、S26V、S26M、S212L、T108I、A134L、S26F、N130V、A229L、A274I、G194F、S26W、A291F、G181I、A229I、E278I、A175L、G181L、A152L、A274V、N130L、E278V、K46I、E278L、E278A、K46C、K46L、K93L、K93V、E164I、E278C、E164V、E278M、N130I、K46V、R221C、K93C、K46M、S51L、K93I、E278F、K93M、E164A、S51I、R221L、P209L、K46F、S51V、E164C、R221I、E164M、K93F、D137L、P209V、E164L、P59L、R221F、N130C、S51C、R221G、E278T、K46G、P59V、K46A、N130M、E278G、D137V、K46T、P209C、P59I、P209I、T144L、N130F、E164F、S51F、R221M、P209F、S51M、R221S、P209A、K93A、P209M、E164Y、D137C、R221A、P115C、P59F、S208A、K46S、P115V、A134I、P115A、S212V、N249L、E278S、D137F、D137M、P115L、S212I、R221V、N249V、D137I、E278Y、G194L、P59M、R221T、A188L、N249I、T144I、E164T、S208C、S208V、D137A、K46Y、K93G、G87I、E164G、K46P、P59C、A97V、S212C、G83L、K93T、N249C、A134V、G83V、T108V、T112L、T144V、A100L、G87V、E164W、E164S、A171L、A97L、A188F、K93W、T90I、A174I、K93Y、A111L、A97I、N130A、G48I、E278W、R221Y、G135L、T112V、F197V、T144F、K93S、G194V、G87A、A188V、T144C、K46N、P115M、A175I、N130T、S51A、G194C、G48L、G104V、A174V、G158V、T90V、R221N、A202L、A39L、A134F、D137Y、G158I、A174L、P155V、A171V、S51T、F197I、T112C、D137W、G135V、D137G、P115G、T250C、S208L、A100I、T250L、T144M、T108C、P115F、G69L、T112F、G181F、A100F、S208I、G223V、T250V、N249M、A111V、N249Y、A111F、A188M、A111I、P209Y、A175V、P155I、N130G、S120V、A111C、A100C、A97F、G194M、G69I、E278Q、S208G、G181C、G87F、G48V、A97C、I205L、G194I、D137T、S51G、F197C、G223L、N249A、S51Y、P115S、A202I、P155C、S26A、G83M、S120C、D137S、E278N、G83F、G158C、P59Y、G87C、G87M、N130S、P115I、A202F、A100M、G83C、S212M、A39V、A188I、F197L、G181M、A134C、P115T、A174F、K93P、P209W、P209G、P59A、A39C、G104I、T250G、S208F、R221Q、G181A、G104C、T90C、K46Q、P209T、K46W、A171I、G158A、A134M、G48C、G194A、T90A、T90M、N130Y、N249F、A172L、A152V、A152I、P59W、R221P、G158F、T112M、G135M、G181V、G104L、S208T、N249W、A97M、G135F、K93Q、G42L、A111M、G104A、E278P、T90L、R221D、A175C、A188C、A291L、S212A、F123L、T250I、A174C、E164Q、P155L、A174M、G158M、A172V、E164N、A168L、T90F、A39F、G42V、I205F、A39M、N249G、A175F、G135C、A171F、S212F、K46D、A100Y、G42I、P59G、G69A、E164P、G158L、G42C、A171C、T250M、T108L、K93N、A171M、G223I、A175M、T108M、A172I、S51P、A291I、A111Y、G20V、S120I、P59T、A58I、G223C、S208M、G48M、K46H、A62L、A43I、T250A、N130W、G194Y、R221H、D137P、N249S、G104F、A100V、F123I、A172C、T112I、G69F、P115Y、P59S、A100W、G104M、G69C、R221W、K93H、A204L、G20L、G223F、A168I、D28K、E275K、K77R、D17R、H76D、H75D、H76E、K77D、H75E、P294D、S293D、S293E、D286E、P294E、S292E、D285E、H76R、K77E、K289R、P295D、D285K、R179E、H75R、P295E、P294R、P294K、D286K、D285R、S293R、S293K、R180D、R180K、H183E、R179K、K289E、R180E、A98K、R179D、A99K、S292D、D286R、K290D、H75K、A99E、N256E、K290E、K290R、R239D、A199K、A200K、K255E、H183D、A99R、H235E、A98R、D102K、およびA200R
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含む、実施形態1~64のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはDsA1および/もしくはDsA2派生体。
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列;
ならびに/またはPITPドメインは以下のとおりに定義される:Q6A9N1の配列中のA32~R164のENFD;E165~K237のSR1、V238~L396のHbD、S397~T430のSR2(C末端LPXT(G)モチーフを含む(すなわち、LPXTを含むが、Gを含まない))およびG431~I467のhLARもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的PITP配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のPITP配列、実施形態1~63のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはDsA1および/またはDsA2派生体。
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応する、前記ワクチン。
- フェニルアラニン150(F150)~イソロイシン193(I193)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態71に従うワクチン。
(1)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列;
(2)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、および/または
(3)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
である、実施形態71~73のいずれか1項に従うワクチン。
(b)少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD1のCSD1断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチおよび少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD2のCSD2断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチを含む;
(c)少なくともDsA1の
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、および
DsA2の
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン228(L228)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン262(H262)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列を含む、
ポリペプチドを含む、
特に、ポリペプチドは、ポリペプチド中に存在する場合はDsA1のC53、C319およびC321ならびにDsA2のC97およびC363のうち1つまたはそれ以上にアミノ酸交換、好ましくは、アミノ酸交換DsA1のC53S、C319SおよびC321PならびにDsA2のC97SおよびC363Sのうち1つまたはそれ以上を含み、ならびに/またはDsA1もしくはDsA2の断片または派生体において、少なくとも5つのPTリピート、好ましくは、少なくとも10のPTリピート、特に、少なくとも15のPTリピートが、天然に存在する野生型DsA1/DsA2ポリペプチド(「天然DsA1/DsA2」)と比較して欠失しており、好ましくは、少なくとも1つの、より好ましくは少なくとも2つの、より好ましくは少なくとも3つの、いっそうより好ましくは少なくとも4つの、特に5つのPTリピートが存在する、実施形態1~91のいずれか1項に従うワクチン。
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDもしくはそのPITP派生体のバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列を含み;
特に、PITP派生体は、位置C231およびC402にアミノ酸交換を含む、請求項1~96のいずれか1項に記載のワクチン。
- ENFDのプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDのプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDのバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態1または2に従うワクチン。
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応する、実施形態1~4のいずれか1項に従うワクチン。
- ENFDまたはHbDのポルフィリン結合性ドメインまたはそのポルフィリン(prophyin)結合性派生体、
- ENFDのプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDのプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDのバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態1~6のいずれか1項に従うワクチンまたは実施形態7に従うPITPポリペプチドの断片もしくは派生体。
- 少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2;または
- 少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2のN末端部分ならびに異なる、少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2のC末端部分からなるアミノ酸配列であって、NおよびC末端部分からなるアミノ酸配列のアミノ酸残基の総数は、DsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2と同一である、アミノ酸配列
によって相互接続される、実施形態1~39のいずれか1項に従うワクチン。
DsA1:A301Y、G206L、G206F、A192L、G206R、G206W、G206Q、G206K、A301F、A301L、G206I、A301W、A301I、G206E、G206M、G208L、G206V、A192M、A256L、A192I、A68I、G206N、A68V、I259L、A161L、V205I、G206T、G206H、A68L、G206Y、A256I、G206A、68M、A192F、G110A、N239L、G206C、A301V、E305L、A93I、A93L、S223A、E305I、E305V、E305A、K120V、K120L、N157I、K120C、E305C、E305M、N239I、K120I、R248C、N239V、E191I、E305F、S78I、K120M、E191L、R248L、H146V、E191V、H146I、S78L、S78V、N157V、H146C、K120F、R248I、R248M、D164L、P236V、P236L、H146L、H146F、D164I、H146M、P86L、R248G、N239C、N157C、E305T、E191C、S78C、R248F、G221L、E305G、P236F、T171L、P86V、R248S、N157L、K120A、H146A、P86I、N157F、S235A、R248A、E191M、N157M、A124I、P236A、S78F、P236C、S78M、A161I、N239M、T171I、E191F、S235V、P86F、H146G、S223I、E305S、D164F、E305Y、P236M、S223L、N239F、H146Y、P236I、G221V、D164C、K120G、D164M、S235I、R248V、A124V、S235L、S223V、S147L、S235C、P86M、G208I、D164A、S147I、N239A、K120T、T117I、G110L、R248Y、P182I、A198L、A124L、A215L、A127L、A66L、P86C、G221F、R248T、T171F、P182V、S147V、P271V、T171V、G110V、P271A、E191A、A149L、K120Y、G114I、K120S、S235F、A201I、G131V、A201V、R248N、A66V、A202I、G221C、G114V、A229L、H146T、A124F、A127F、T117V、S223C、A215F、A127I、P182C、A215V、G162L、G162I、G208F、A201L、A161F、N157A、A198V、E191Y、A161V、S223F、G221M、R248W、G131C、A202V、N157T、S147F、N157Y、G114A、T171C、H146W、S78T、A149I、G250L、N239T、A149V、G208C、K120P、G250V、S235G、S223M、D164V、N239G、T171M、E191G、S78A、D164Y、P271I、G110F、G110C、D164W、P236Y、A124C、A66F、S147M、G75L、E305N、S147C、G221I、A127M、P182L、G221A、G110M、A66C、E305Q、P271F、A215M、P236W、K120W、H146P、A161C、A229I、S78G、G114M、P86A、E305W、V154L、G185V、G75I、S223Y、G75V、R248Q、T277V、E191S、A229F、T277G、G131I、N239S、P271C、V154I、A66M、D164G、G208A、P236T、R248D、D164T、A127C、A215I、A161M、P86W、A201F、C53L、T117F、G131A、T117C、A318L、F150L、G208M、P271M、A149C、G208V、G114C、G162F、S223W、A198I、N157G、A202L、P236G、G185I、A198F、A149M、P86Y、E191W、N157W、I263L、S235T、E305P、E305R、A201C、A201M、F150I、G96I、G114F、G221Y、A199L、D164S、A124M、A179I、A202F、H146S、A231L、C53I、I263V、G162M、K120Q、N239Y、G96L、G75C、N157S、T277C、T117A、A199V、G162C、P271Y、G250C、A127Y、A66I、T117L、G185C、A229C、R248P、A144I、T117M、P86T、A260L、G185A、E191Q、G131L、T277I、G250I、G131M、T277A、A127V、F150V、A318I、S78W、S147Y、A198M、P86G、A215C、A70I、S235M、A179V、A202M、A144V、A202C、G208W、T171Y、S147W、G208Y、G250F、A195L、K120H、A127W、A66Y、S223G、K120N、S78Y、E191N、A198C、P271G、V154F、A70V、H146N、A229M、A134L、P86S、S78Q、A199I、G75M、A68C、E191T、A89L、G96A、D164P、C53V、S78P、G185L、A149G、A149F、P182A;
DsA2:A161L、A161I、A126I、A126V、A126L、S175G、G190H、A161T、S183T、R336I、A126F、A161F、A329L、A161V、S283L、A205L、G109A、A329I、G265F、A161W、A232I、S175W、R336L、A300I、K349I、A161M、A300L、G109L、G109I、A246L、S183M、A223L、E235V、G252L、A329M、A126W、S183L、A259L、A329V、A329F、S183I、A242L、G109F、R336V、K117I、R336C、K117C、K349V、R336A、R336F、K117L、R336M、E235I、R310A、K349L、K117V、R310V、K349C、N201I、R310I、R310C、K349F、K349M、K117M、R292C、N201V、R336G、R292L、K117F、E235C、P130L、E235A、D208L、P280L、E235L、R292M、R336T、P280V、R292I、N201L、E235M、P130I、K117A、K349A、P130V、R292G、R310F、R336S、R336Y、N201C、K117G、R310L、R310M、R310G、R336W、D208V、R292F、P130F、K349Y、K117T、R310T、P280C、R292S、N201F、R310S、T215L、N201M、S279C、R292A、S279L、P280F、D208C、S175V、A126M、P280A、S279A、P130C、S279V、E235F、P186C、P130M、K349T、A126C、K349G、N320V、K117S、N320I、S283V、A168I、N320L、S175I、E235Y、P186V、P280I、P186A、P280M、G265L、D208M、P186L、K117Y、S283I、A205I、D208F、A168L、T215I、R292V、A133L、R336P、R310Y、A168V、S279F、S183V、A164I、S279I、S175L、D208A、K349S、E235T、S175C、A122I、D208I、A126Y、A123L、K117P、N320C、R292T、S283C、E235W、G252I、T215V、R292Y、R336Q、S175A、A123I、E235G、A205V、A171V、A133V、A245I、S183C、P226V、R310P、G181I、P226I、A168C、A246I、A171L、N201A、S175M、G158I、A164L、T215C、A164C、P280W、A133C、G119I、T215F、A245V、N320M、A122V、A123V、G206L、N320A、G265V、A122L、A193L、S191V、R310W、G252F、G181V、E235S、R292N、P130W、G119V、G265C、S279M、A259V、A259F、A168F、A168M、A246V、P226C、R292W、G158V、P130Y、G206V、P186G、C97L、N201Y、A171C、G265M、G140L、K117N、G140I、D208G、A193V、G181F、K349W、S279G、A245L、A205F、G158A、A193I、K117W、A122C、R310D、G294V、P186T、S175F、S191C、N201T、K349Q、R310N、A242V、T215M、D208Y、T321C、G252C、I276L、A259M、A171F、N201G、G119F、D208T、P186M、G229V、G294L、S191I、P186S、G119C、G229I、P130A、A205C、A171M、T321V、A193C、F268L、A133M、A123F、G357A、G109V、K117Q、N320G、R310Q、T321G、S283M、P186Y、G229A、R336D、N201S、S183F、F194L、F268V、A245F、G265A、G252A、R336H、A259I、A133I、A123C、P130T、G113L、D208S、P280T、F268I、G181C、P280Y、R336E、P280G、G158C、N320Y、G140V、K349P、R292D、D208W、N320F、G265I、R336N、A164M、G206M、F268C、G158M、R292P、S191L、G158F、G252M、A245C、G229C、E235Q、G252V、A205M、G206F、R292Q、G181M、A126G、A243L、K349N、S283A、A246M、S279T、P186I、A246F、A246C、A223I、C97I、A164V、A245M、A171I、G357I、A126T、S283F、A123M、F194I、K117D、P226L、P130S、G140F、I276F、F194V、A243V、P130G、G181L、G229F、A259C、G113I、K117H、N320S、G119M、A239L、G206C、A114I、E235N、K349D、A242I、A161C、G294C、G119L、A126S、T321L、A193M、A223V、A122M、G113C、A242C、N201W、R292H、A275L、A242M、G357V、P186F、G294I、D208P、A259W、A243I、R310E、G140C、A242F、G265W、S183A、G109C、G113F、S191F、G265Y、S94D、E95K、A343K、A350K、F176D、N196D、H147D、H146D、H147E、H146E、T91E、R250E、T91D、R251E、R148D、H254E、A170K、R250K、R251K、H254D、A170R、H146K、H147K、K346E、T90D、R250D、T90E、A138K、R251D、H262K、A169K、H146R、I102E、T90K、A271K、K346R、H306E、D124E、K326E、A169R、D124R
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含む、DsA1および/またはDsA2派生体をさらに含む、実施形態1~62のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはPITPポリペプチド。
T392F、F352L、T392I、M303F、A276Y、S365I、T392L、M303W、A276L、T392W、K363T、A361V、F286Y、A361I、K363F、M303Y、T392V、A361L、S365V、A270V、A276M、S365L、K363V、M312L、T252L、M387L、Y297F、A276F、G353T、A276W、K363S、T252R、L314I、T252I、A361F、L295I、L255I、A276I、K363L、S318W、V354L、K363I、A361T、S318I、A361M、G353L、T392Y、S365A、A270I、A361W、T252M、K363A、K363W、L319I、G353D、A276V、G353N、G353F、T252V、G353S、S318V、L255V、G364I、L394V、K363M、S318F、L390I、G353I、S335Y、G364L、S365M、T252Q、S365F、L330A、T252F、S318M、K363Y、G353V、S365G、S365W、K363G、T392M、V354F、A276T、G364W、K363C、P317I、S335C、P317L、P317F、G269C、S335A、P317V、G268C、S334V、S335V、G269V、S334C、A361C、G268I、G269F、G268L、S334I、G268V、G269L、S335G、S334A、G268F、S335T、P317C、P317M、S335L、A361Y、G269I、S335I、G268Y、K363P、G268W、S335M、K363H、F286I、G268M、G269M、G269W、G268A、S334G、S334L、G268P、G268T、G293F、F286L、T252C、S335N、T392C、K363N、S334F、M303I、K363Q、A376L、G364V、W245I、G269S、Y297C、S335Q、G358V、W245L、A376I、S334M、G358L、T252A、S318C、S335H、Y297L、S365C、M312I、G373L、Y297I、G358I、S335F、G268N、M303L、G269T、Y297V、P317A、G268Q、G268H、G293L、S334T、G305C、S318L、S335D、S335P、G364C、W245V、W245F、P317Y、T392A、F286V、S335W、A376V、G358C、K363D、M312F、G269N、S335R、A378I、A378C、P317W、G268K、G268R、G268D、A376C、G373V、M312V、M303V、G353C、S318A、G364F、G241C、G268E、G379I、G269P、F286C、L330F、G284V、W245C、A378V、L330I、G293I、G373C、G379L、S318Y、G358F、L394I、L330V、G373I、F352I、A361G、S335K、G246C、M387F、A378L、G241I、V354C、M387I、G269A、G308C、F352C、A276C、G293C、G269Q、K363R、G379V、F286W、W245M、G246V、A270C、G246L、M303C、G293V、G305A、Y297A、G345I、G241V;N388D、R248K、S336D、T372E、T249E、E316D、D348E、R382E、R382K、K265E、H327K、D338E、K333R、P386E、S336E、K341D、K341E、K341R、E385D、G268K、G268R、G268D、K340R、G268E、K333D、K368R、G353D;H306I+S335R、H306L+S335R、H306I+S335K、H306C+S335R、H306C+S335R、H306I+S335K、H306L+S335K、H306L+S335K、H306L+S335R、H306V+S335R、H306I+S335R、H306V+S335R、H306C+S335K、H306F+S335K、H306V+S335K、H306V+S335K、H306F+S335R、H306F+S335R、H306W+S335R、H306F+S335K、H306M+S335R、H306W+S335K、H306W+S335R、H306M+S335K、H306A+S335R、H306A+S335R、H306W+S335K、H306A+S335K、H306Y+S335R、H306Y+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306T+S335K、H306S+S335R、H306T+S335K、H306S+S335K、S334V+S335R、H306S+S335K、S334V+S335K、S334I+S335R、S334C+S335R、H306P+S335R、M312I+S335R、S334I+S335K、S334V+S335R、S334V+S335K、H306P+S335K、S334C+S335R、S334A+S335R、M312F+S335R、M312L+S335R、S334C+S335K、H306R+Y381L、M312L+S335R、S250L+S335R、H306Q+S335R、H306N+S335K、S334C+S335K、S334A+S335K、H306P+S335K、H306Q+S335R、M312V+S335R、M312I+S335K、S334I+S335K、M312I+S335R、M312L+S335K、H306N+S335R、S334L+S335R、S334A+S335K、M312L+S335K、S250I+S335R、H306N+S335R、S250V+S335R、H306N+S335K、M312F+S335K、S250V+S335R、S250A+S335R、S334M+S335R、M312V+S335R、S250A+S335K、M312F+S335K、S250A+S335K、S250L+S335R、S334G+S335R、S250C+S335R、S250C+S335R、H306Q+S335K、S334G+S335R、Y254F+S335R、S334L+S335R、S250I+S335R、I309C+S335R、S250I+S335K、Y254C+S335R、S250L+S335K、M312V+S335K、S334G+S335K、S250L+H306R、S250V+H306R、H306R+Y381I、M312V+S335K、S250I+H306R、M312C+S335R、Y254C+S335R、S250V+S335K、Y254W+S335R、S334G+S335K、S250L+H306R、S250L+S335K、Y254W+S335R、S250V+S335K、S334L+S335K、I309C+S335R、I309C+S335K、Y254F+S335R、S250A+S335R、S250C+S335K、S250I+H306R、S250A+H306R、S250C+S335K、H306Q+S335K、Y254C+S335K、S334L+S335K、S250A+H306R、I309C+S335K、Y254W+S335K、Y254C+S335K、Y254I+S335R、H306R+Y381C、S250M+S335K、M312C+S335K、M312C+S335K、S250V+H306R、S250M+S335R、Y254V+S335R、Y254I+S335K、S250W+S335R、I259C+S335R、S334M+S335R、Y254A+S335R、Y254V+S335R、S250M+S335K、F251L+S35R、Y254I+H306R、I259C+S335K、Y254I+S335R、I259C+S335K、S250Y+S335K、Y254F+S335K、S250M+S335R、Y254F+H306R、Y254V+S335K、Y254V+H306R、S334T+S335K、S334Y+S335R、Y254A+S335R、S334M+S335K、Y254I+H306R、Y254M+S335K、Y254A+S335K、S334F+S335R、S334M+S335K、F251L+H306R、S334T+S335R、Y254I+S335K、Y254A+S335K、S334T+S335K、S250Y+H306R、Y254A+H306R、Y254M+S335K、F251L+S335K、I259C+S335R、F251L+H306R、Y254M+H306R、S334P+S335R、S334P+S335R、S334P+S335K、S334F+S335R、Y254M+S335R、H306I+S335C、H306L+S335C、H306L+S335C、H306I+S335C、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306L+S335V、H306M+S335C、H306I+S335G、H306I+S335G、H306I+S335A、H306I+S335A、H306F+S335C、H306F+S335C、H306L+S335V、H306I+S335T、H306L+S335A、H306C+S335A、H306I+S335V、H306I+S335V、H306L+S334V、H306L+S335A、H306C+S335V、H306L+S334C、H306I+S335I、H306I+S334A、H306L+S334C、H306L+S334V、H306F+S334V、H306C+S335A、H306F+S335V、H306C+S334V、H306C+S334V、H306I+S335L、H306C+S335V、H306L+S334I、H306M+S335C、H306I+S334C、H306I+S335I、H306W+S335C、H306V+S335A、H306I+S334C、H306I+S334I、H306L+S335I、H306V+S335A、H306C+S334C、H306L+S335G、H306C+S334C、H306L+S335T、H306I+S334I、H306V+S334V、H306I+S335L、H306M+S335V、H306V+S335V、H306V+S335V、H306I+S335M、H306L+S335T、H306V+S335I、H306C+S335G、H306L+S335L、H306C+S334I、H306L+S335Y、H306L+S335I、H306V+S334V、H306C+S335G、H306I+S334A、H306L+S334A、H306C+S335I、H306F+S335V、H306I+S335T、H306L+S335Y、H306C+S334I、H306L+S334I、
H306V+S335G、H306V+S335G、H306A+S335C、H306A+S335C、H306M+S335A、H306C+S334A、H306V+S335I、H306L+S335G、H306L+S334A、H306C+S334A、H306I+S335Y、H306I+S335Y、H306W+S335C、H306F+S335A、H306F+S335A、H306F+S335I、H306I+S335N、H306L+S335L、H306I+S335M、H306I+S335N、H306V+S334I、H306V+S334C、H306V+S335L、H306C+S335L、H306C+S335L、H306I+A376L、H306F+S335T、H306L+S335M、H306F+S334V、S334V+S335C、S335C+Y381L、S335C+A376I、S334I+S335C、S334V+S335C、M312I+S335C、M312I+S335C、S335C+A376L、S334I+S335C、S335C+A376L、S335C+A378C、S335C+A376C、S335C+A376V、S334A+S335C、S335C+A378C、S334A+S335C、S335C+A376I、S334V+S335A、S335A+A376L、S335C+A376C、S335C+A376V、S335C+A378L、S334V+S335A、S335A+A376I、S334V+A376L、S334I+S335V、S335C+A378I、M312F+S335C、M312F+S335C、S334I+S335A、S335C+A378V、S335V+A376L、S334V+S335L、S335C+A378I、S334C+S335V、S334V+A376I、S334V+A376I、S335V+A376I、M312I+S334V、S334V+S335I、S335C+Y381I、M312V+S335C、S335C+A378L、S335A+Y381L、S334C+A376C、S334V+S335I、S335C+Y381V、M312L+S335C、S335C+A378V、S335V+A376L、S334I+S335V、S335C+Y381C、S335V+A376I、S334C+A376L、S334C+Y381L、M312V+S335C、S334V+S335L、S334C+A376I、S334C+A376C、S334V+Y381L、M312L+S335C、S335V+A376V、S334I+A376I、S335V+A376V、S335V+Y381L、Y254F+S335C、L310F+S335C、S335I+A376I、S334V+A376V、M312I+S335V、S334C+S335A、S334I+A376L、M312F+S335V、S335C+Y381A、L310F+S335C、S334G+S335C、S334G+S335C、S334V+A376V、S335C+A376M、S335C+A376M、S334A+S335I、S334V+A376L、M312C+S335C、S334C+S335A、S335A+A376V、S334A+S335V、S334A+S335V、Y254F+S335C、S335A+A376L、S335A+Y381I、S335A+A376I、S334L+S335C、S335A+A376V、M312C+S335C、D152F、D152L、D152I、D152V、D152M、D152W、D152Y、D152S、D152A、D152T、D152G、D152N、D152Q、D152P、D152H、D152K、D152R、D152C、D155Q、D155L、D155F、D155I、D155M、D155W、D155V、D155Y、D155A、D155N、D155T、D155S、D155P、D155G、D155H、D155R、D155K、D155C、D156L、D156F、D156I、D156W、D156V、D156A、D156Y、D156M、D156G、D156S、D156T、D156Q、D156N、D156P、D156H、D156K、D156R、D156C、H146R、H146K、H153R、H153K、Y63A、H146A、H153A、F74A、L141A、F81A、P72A、K144A、T143A、Y75A、W98A、D156A、R158A、S250W、S250F、S250D、S250E、S250K、S250R、F251A、Y254A、I259W、I259F、I259D、I259E、I259R、I259K、H306A、I309W、I309F、I309E、I309D、I309R、I309K、L310W、L310F、L310D、L310E、L310R、L310K、M312W、M312F、M312D、M312E、M312R、M312K、S334W、S334F、S334D、S334E、S334R、S334K、S335W、S335F、S335D、S335E、S335K、S335R、M337W、M337F、M337D、M337E、M337K、M337R、A376W、A376F、A376E、A376D、A376R、A376K、F377、A378W、A378F、A378D、A378E、A378K、A378R、F380A、Y381A、D348I、D348L、D348M、D348F、D348V、D348Y、D348A、D348W、D348T、D348G、D348P、D348H、D348S、D348R、D348K、D348E、D348C、H306R、H306D、H306E、H306K、H307D、H307R、H307E、H307K、H327R、H327K、H327E、H327D、H302E、H302K、H302R、H302D、H215K、H215R、H215E、H215D、H223K、H223R、H223E、H223D、H403K、H403R、H403E、H403D
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含む、PITP派生体をさらに含む、実施形態1~63のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはPITPポリペプチド。
A274Y、S26C、S26L、A274F、S26I、G119H、A274L、A274W、S26V、S26M、S212L、T108I、A134L、S26F、N130V、A229L、A274I、G194F、S26W、A291F、G181I、A229I、E278I、A175L、G181L、A152L、A274V、N130L、E278V、K46I、E278L、E278A、K46C、K46L、K93L、K93V、E164I、E278C、E164V、E278M、N130I、K46V、R221C、K93C、K46M、S51L、K93I、E278F、K93M、E164A、S51I、R221L、P209L、K46F、S51V、E164C、R221I、E164M、K93F、D137L、P209V、E164L、P59L、R221F、N130C、S51C、R221G、E278T、K46G、P59V、K46A、N130M、E278G、D137V、K46T、P209C、P59I、P209I、T144L、N130F、E164F、S51F、R221M、P209F、S51M、R221S、P209A、K93A、P209M、E164Y、D137C、R221A、P115C、P59F、S208A、K46S、P115V、A134I、P115A、S212V、N249L、E278S、D137F、D137M、P115L、S212I、R221V、N249V、D137I、E278Y、G194L、P59M、R221T、A188L、N249I、T144I、E164T、S208C、S208V、D137A、K46Y、K93G、G87I、E164G、K46P、P59C、A97V、S212C、G83L、K93T、N249C、A134V、G83V、T108V、T112L、T144V、A100L、G87V、E164W、E164S、A171L、A97L、A188F、K93W、T90I、A174I、K93Y、A111L、A97I、N130A、G48I、E278W、R221Y、G135L、T112V、F197V、T144F、K93S、G194V、G87A、A188V、T144C、K46N、P115M、A175I、N130T、S51A、G194C、G48L、G104V、A174V、G158V、T90V、R221N、A202L、A39L、A134F、D137Y、G158I、A174L、P155V、A171V、S51T、F197I、T112C、D137W、G135V、D137G、P115G、T250C、S208L、A100I、T250L、T144M、T108C、P115F、G69L、T112F、G181F、A100F、S208I、G223V、T250V、N249M、A111V、N249Y、A111F、A188M、A111I、P209Y、A175V、P155I、N130G、S120V、A111C、A100C、A97F、G194M、G69I、E278Q、S208G、G181C、G87F、G48V、A97C、I205L、G194I、D137T、S51G、F197C、G223L、N249A、S51Y、P115S、A202I、P155C、S26A、G83M、S120C、D137S、E278N、G83F、G158C、P59Y、G87C、G87M、N130S、P115I、A202F、A100M、G83C、S212M、A39V、A188I、F197L、G181M、A134C、P115T、A174F、K93P、P209W、P209G、P59A、A39C、G104I、T250G、S208F、R221Q、G181A、G104C、T90C、K46Q、P209T、K46W、A171I、G158A、A134M、G48C、G194A、T90A、T90M、N130Y、N249F、A172L、A152V、A152I、P59W、R221P、G158F、T112M、G135M、G181V、G104L、S208T、N249W、A97M、G135F、K93Q、G42L、A111M、G104A、E278P、T90L、R221D、A175C、A188C、A291L、S212A、F123L、T250I、A174C、E164Q、P155L、A174M、G158M、A172V、E164N、A168L、T90F、A39F、G42V、I205F、A39M、N249G、A175F、G135C、A171F、S212F、K46D、A100Y、G42I、P59G、G69A、E164P、G158L、G42C、A171C、T250M、T108L、K93N、A171M、G223I、A175M、T108M、A172I、S51P、A291I、A111Y、G20V、S120I、P59T、A58I、G223C、S208M、G48M、K46H、A62L、A43I、T250A、N130W、G194Y、R221H、D137P、N249S、G104F、A100V、F123I、A172C、T112I、G69F、P115Y、P59S、A100W、G104M、G69C、R221W、K93H、A204L、G20L、G223F、A168I、D28K、E275K、K77R、D17R、H76D、H75D、H76E、K77D、H75E、P294D、S293D、S293E、D286E、P294E、S292E、D285E、H76R、K77E、K289R、P295D、D285K、R179E、H75R、P295E、P294R、P294K、D286K、D285R、S293R、S293K、R180D、R180K、H183E、R179K、K289E、R180E、A98K、R179D、A99K、S292D、D286R、K290D、H75K、A99E、N256E、K290E、K290R、R239D、A199K、A200K、K255E、H183D、A99R、H235E、A98R、D102K、およびA200R
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを好ましくは含む、実施形態1~64のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはPITPポリペプチド。
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列;
ならびに/またはPITPドメインは以下のとおりに定義される:Q6A9N1の配列中のA32~R164のENFD;E165~K237のSR1、V238~L396のHbD、S397~T430のSR2(C末端LPXT(G)モチーフを含む(すなわち、LPXTを含むが、Gを含まない))およびG431~I467のhLARもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的PITP配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のPITP配列、実施形態1~63のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはDsA1および/またはDsA2派生体。
- ENFDのプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDのプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDのバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態71または72に従うワクチン。
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応する、実施形態71~74のいずれか1項に従うワクチン。
78.断片または派生体は、少なくとも
- ENFDのプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDのプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDのバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態77に従うPITPポリペプチドの断片または派生体。
(b)少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD1のCSD1断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチおよび少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD2のCSD2断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチを含む;
(c)少なくともDsA1の
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、および
DsA2の
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン228(L228)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン262(H262)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列を含む、
ポリペプチドを含む、
特に、ポリペプチドは、ポリペプチド中に存在する場合はDsA1のC53、C319およびC321ならびにDsA2のC97およびC363のうち1つまたはそれ以上にアミノ酸交換、好ましくは、アミノ酸交換DsA1のC53S、C319SおよびC321PならびにDsA2のC97SおよびC363Sのうち1つまたはそれ以上を含み、ならびに/またはDsA1もしくはDsA2の断片または派生体において、少なくとも5つのPTリピート、好ましくは、少なくとも10のPTリピート、特に、少なくとも15のPTリピートが、天然に存在する野生型DsA1/DsA2ポリペプチド(「天然DsA1/DsA2」)と比較して欠失しており、好ましくは、少なくとも1つの、より好ましくは少なくとも2つの、より好ましくは少なくとも3つの、いっそうより好ましくは少なくとも4つの、特に5つのPTリピートが存在する、実施形態1~91のいずれか1項に従うワクチン。
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDもしくはそのPITP派生体のバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列を含み;
特に、PITP派生体は、位置C231およびC402にアミノ酸交換を含む、請求項1~96のいずれか1項に記載のワクチン。
DsA1は、N末端からC末端に、N末端スワッピング領域(「NSR」)、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」)、Pro-Thrリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域(「CTR」)を含み、ならびに
PITPポリペプチドは、N末端からC末端に、拡大されたネオカルチノスタチンファミリードメイン(「ENFD」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、ヘム結合ドメイン(「HbD」)、C末端LPXT(G)モチーフを含む第2のスワッピング領域(「SR2」)および疎水性C末端領域(「hLAR」)を含む、前記ワクチン。
- 表面に露出しているDsA1ポリペプチドのエピトープまたは表面に露出しているP.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン2(DsA2ポリペプチド)のエピトープを有する少なくとも1つの抗原ポリペプチドであって、
DsA2は、N末端からC末端に、N末端スワッピング領域(「NSR」)、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」)、および場合により、Pro-Thrリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域(「CTR」)を含む、少なくとも1つの抗原ポリペプチド;ならびに
- 表面に露出しているPITPポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの抗原ポリペプチド
を含む、前記ワクチン。
3.ワクチンであって、
- 表面に露出しているDsA1ポリペプチドのエピトープまたは表面に露出しているDsA2ポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの合成抗原ポリペプチド;および
- 表面に露出しているP.アクネスのPITPポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの合成抗原ポリペプチド
を含む、前記ワクチン。
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応する、実施形態1~3のいずれか1項に従うワクチン。
- フェニルアラニン150(F150)~イソロイシン193(I193)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態4に従うワクチン。
(1)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列;
(2)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(3)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(4)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張するフェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(5)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、アラニン148(F148)~ロイシン271(L271)の連続ポリペプチド配列;
(6)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン146(H146)~トレオニン277(T277)の連続ポリペプチド配列;
(7)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン238(L238)~ロイシン272(L272)の連続ポリペプチド配列;
(8)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン145(L145)~アラニン201(A201)の連続ポリペプチド配列;ならびに/または
(9)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン145(L145)~ロイシン280(L280)の連続ポリペプチド配列
である、実施形態4または5のいずれか1項に従うワクチン。
- ENFDもしくはHbDのポルフィリン結合性ドメインもしくはそのポルフィリン(prophyin)結合性派生体、
- ENFDのプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDのプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDのバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態8に従うワクチン。
- 少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2;または
- 少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2のN末端部分ならびに異なる、少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2のC末端部分からなるアミノ酸配列であって、NおよびC末端部分からなるアミノ酸配列のアミノ酸残基の総数は、DsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2と同一である、アミノ酸配列
によって相互接続される、実施形態1~39のいずれか1項に従うワクチン。
(b)以下のアミノ酸交換:DsA1中のA149T、D152N、D152S、V155I、V163I、K166H、K166P、A168T、K169R、T171A、V173M、A176V、A183T、T190F、T190I、E191K、A192L、A192F、A198G、A199T、A202T、V205I、G206N、G206S、G206R、G206Q、K212Q、A214T、I219V、I219A、S223A、D225N、V233I、S235F、N239S、L255I、V257I、Q258S、I259L、R262H、I264V、D265KおよびDsA2中のT193A、N196D、N196S、I199V、I207V、H210K、H210P、A212T、R213K、T215A、V217M、V220A、T227A、F234T、F234I、E235K、L236A、L236F、A242G、A243T、A246T、I249V、R250G、R250S、R250N、G250Q、Q256K、A258T、V263I、V263A、A267S、D269N、I277V、S279F、S283N、I299L、I301V、S302Q、L303I、H306R、V308I、K309Dのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有する、(a)のCSD2派生体、
(c)20個のアミノ酸残基の連続ポリペプチド配列、特に、DsA1のT117~A127またはDsA2のT161~LA171を少なくとも含む、DsA1のI49~L130またはDsA2のI93~L174内のDsA1またはDsA2のCSD1断片、
(d)以下のアミノ酸交換:DsA1中のD50N、D50S、K51E、K51A、C53Y、D55K、V57I、A61L、A65G、A68V、L71M、F76L、S78A、V82M、V82A、L84M、P86R、P86S、K90R、K90A、K94A、V97T、L99T、I100L、K104R、K106E、A107V、I109V、G110A、A111S、L113V、G114S、L116V、T117A、K120A、I121V、R123H、A124T、V128IおよびDsA2中のS94D、S94N、E95A、E95K、C97Y、K99D、I101V、L105A、G109A、V112A、L115M、L120F、A122S、A126M、A126V、L128M、P130R、P130S、A134K、A134R、A138K、T141V、T143L、I144L、R148K、K150E、V151A、V153I、A154G、S155A、L157V、G158S、V160L、A161T、A164K、V165I、H167R、A168T、I172Vのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有する、(c)のCSD1派生体、
(e)DsA1のR266~T277もしくはR286~K296またはDsA2のV333~Q347の連続ポリペプチド配列を少なくとも含む、DsA1のA278~K323またはDsA2のA322~E366内のDsA1またはDsA2のCSD3断片、
(f)以下のアミノ酸交換:DsA1中のM281V、N283D、T285A、R286Q、V289A、V291I、I292R、T293N、A294T、D295K、D295Q、K296E、I298V、K299A、T300V、T300I、A301Y、-301から302Dの間、E302K、E305K、K306A、A310T、D313G、K316Q、S320T、C321-、P322L、K323D、K323EおよびDsA2中のV325M、D327N、A329T、R330Q、V333A、I335V、R336I、N337T、T338A、Q339K、Q339D、E340K、I342V、A343K、V344T、V344I、Y345A、K346E、K349E、A350K、T354A、G357D、Q360K、T364S、P365L、E366D、E366Kのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有する、CSD3派生体
を含むまたはからなるポリペプチドを含む、実施形態1~61のいずれか1項に従うワクチン、方法または組成物。
DsA1:A301Y、G206L、G206F、A192L、G206R、G206W、G206Q、G206K、A301F、A301L、G206I、A301W、A301I、G206E、G206M、G208L、G206V、A192M、A256L、A192I、A68I、G206N、A68V、I259L、A161L、V205I、G206T、G206H、A68L、G206Y、A256I、G206A、68M、A192F、G110A、N239L、G206C、A301V、E305L、A93I、A93L、S223A、E305I、E305V、E305A、K120V、K120L、N157I、K120C、E305C、E305M、N239I、K120I、R248C、N239V、E191I、E305F、S78I、K120M、E191L、R248L、H146V、E191V、H146I、S78L、S78V、N157V、H146C、K120F、R248I、R248M、D164L、P236V、P236L、H146L、H146F、D164I、H146M、P86L、R248G、N239C、N157C、E305T、E191C、S78C、R248F、G221L、E305G、P236F、T171L、P86V、R248S、N157L、K120A、H146A、P86I、N157F、S235A、R248A、E191M、N157M、A124I、P236A、S78F、P236C、S78M、A161I、N239M、T171I、E191F、S235V、P86F、H146G、S223I、E305S、D164F、E305Y、P236M、S223L、N239F、H146Y、P236I、G221V、D164C、K120G、D164M、S235I、R248V、A124V、S235L、S223V、S147L、S235C、P86M、G208I、D164A、S147I、N239A、K120T、T117I、G110L、R248Y、P182I、A198L、A124L、A215L、A127L、A66L、P86C、G221F、R248T、T171F、P182V、S147V、P271V、T171V、G110V、P271A、E191A、A149L、K120Y、G114I、K120S、S235F、A201I、G131V、A201V、R248N、A66V、A202I、G221C、G114V、A229L、H146T、A124F、A127F、T117V、S223C、A215F、A127I、P182C、A215V、G162L、G162I、G208F、A201L、A161F、N157A、A198V、E191Y、A161V、S223F、G221M、R248W、G131C、A202V、N157T、S147F、N157Y、G114A、T171C、H146W、S78T、A149I、G250L、N239T、A149V、G208C、K120P、G250V、S235G、S223M、D164V、N239G、T171M、E191G、S78A、D164Y、P271I、G110F、G110C、D164W、P236Y、A124C、A66F、S147M、G75L、E305N、S147C、G221I、A127M、P182L、G221A、G110M、A66C、E305Q、P271F、A215M、P236W、K120W、H146P、A161C、A229I、S78G、G114M、P86A、E305W、V154L、G185V、G75I、S223Y、G75V、R248Q、T277V、E191S、A229F、T277G、G131I、N239S、P271C、V154I、A66M、D164G、G208A、P236T、R248D、D164T、A127C、A215I、A161M、P86W、A201F、C53L、T117F、G131A、T117C、A318L、F150L、G208M、P271M、A149C、G208V、G114C、G162F、S223W、A198I、N157G、A202L、P236G、G185I、A198F、A149M、P86Y、E191W、N157W、I263L、S235T、E305P、E305R、A201C、A201M、F150I、G96I、G114F、G221Y、A199L、D164S、A124M、A179I、A202F、H146S、A231L、C53I、I263V、G162M、K120Q、N239Y、G96L、G75C、N157S、T277C、T117A、A199V、G162C、P271Y、G250C、A127Y、A66I、T117L、G185C、A229C、R248P、A144I、T117M、P86T、A260L、G185A、E191Q、G131L、T277I、G250I、G131M、T277A、A127V、F150V、A318I、S78W、S147Y、A198M、P86G、A215C、A70I、S235M、A179V、A202M、A144V、A202C、G208W、T171Y、S147W、G208Y、G250F、A195L、K120H、A127W、A66Y、S223G、K120N、S78Y、E191N、A198C、P271G、V154F、A70V、H146N、A229M、A134L、P86S、S78Q、A199I、G75M、A68C、E191T、A89L、G96A、D164P、C53V、S78P、G185L、A149G、A149F、P182A;
DsA2:A161L、A161I、A126I、A126V、A126L、S175G、G190H、A161T、S183T、R336I、A126F、A161F、A329L、A161V、S283L、A205L、G109A、A329I、G265F、A161W、A232I、S175W、R336L、A300I、K349I、A161M、A300L、G109L、G109I、A246L、S183M、A223L、E235V、G252L、A329M、A126W、S183L、A259L、A329V、A329F、S183I、A242L、G109F、R336V、K117I、R336C、K117C、K349V、R336A、R336F、K117L、R336M、E235I、R310A、K349L、K117V、R310V、K349C、N201I、R310I、R310C、K349F、K349M、K117M、R292C、N201V、R336G、R292L、K117F、E235C、P130L、E235A、D208L、P280L、E235L、R292M、R336T、P280V、R292I、N201L、E235M、P130I、K117A、K349A、P130V、R292G、R310F、R336S、R336Y、N201C、K117G、R310L、R310M、R310G、R336W、D208V、R292F、P130F、K349Y、K117T、R310T、P280C、R292S、N201F、R310S、T215L、N201M、S279C、R292A、S279L、P280F、D208C、S175V、A126M、P280A、S279A、P130C、S279V、E235F、P186C、P130M、K349T、A126C、K349G、N320V、K117S、N320I、S283V、A168I、N320L、S175I、E235Y、P186V、P280I、P186A、P280M、G265L、D208M、P186L、K117Y、S283I、A205I、D208F、A168L、T215I、R292V、A133L、R336P、R310Y、A168V、S279F、S183V、A164I、S279I、S175L、D208A、K349S、E235T、S175C、A122I、D208I、A126Y、A123L、K117P、N320C、R292T、S283C、E235W、G252I、T215V、R292Y、R336Q、S175A、A123I、E235G、A205V、A171V、A133V、A245I、S183C、P226V、R310P、G181I、P226I、A168C、A246I、A171L、N201A、S175M、G158I、A164L、T215C、A164C、P280W、A133C、G119I、T215F、A245V、N320M、A122V、A123V、G206L、N320A、G265V、A122L、A193L、S191V、R310W、G252F、G181V、E235S、R292N、P130W、G119V、G265C、S279M、A259V、A259F、A168F、A168M、A246V、P226C、R292W、G158V、P130Y、G206V、P186G、C97L、N201Y、A171C、G265M、G140L、K117N、G140I、D208G、A193V、G181F、K349W、S279G、A245L、A205F、G158A、A193I、K117W、A122C、R310D、G294V、P186T、S175F、S191C、N201T、K349Q、R310N、A242V、T215M、D208Y、T321C、G252C、I276L、A259M、A171F、N201G、G119F、D208T、P186M、G229V、G294L、S191I、P186S、G119C、G229I、P130A、A205C、A171M、T321V、A193C、F268L、A133M、A123F、G357A、G109V、K117Q、N320G、R310Q、T321G、S283M、P186Y、G229A、R336D、N201S、S183F、F194L、F268V、A245F、G265A、G252A、R336H、A259I、A133I、A123C、P130T、G113L、D208S、P280T、F268I、G181C、P280Y、R336E、P280G、G158C、N320Y、G140V、K349P、R292D、D208W、N320F、G265I、R336N、A164M、G206M、F268C、G158M、R292P、S191L、G158F、G252M、A245C、G229C、E235Q、G252V、A205M、G206F、R292Q、G181M、A126G、A243L、K349N、S283A、A246M、S279T、P186I、A246F、A246C、A223I、C97I、A164V、A245M、A171I、G357I、A126T、S283F、A123M、F194I、K117D、P226L、P130S、G140F、I276F、F194V、A243V、P130G、G181L、G229F、A259C、G113I、K117H、N320S、G119M、A239L、G206C、A114I、E235N、K349D、A242I、A161C、G294C、G119L、A126S、T321L、A193M、A223V、A122M、G113C、A242C、N201W、R292H、A275L、A242M、G357V、P186F、G294I、D208P、A259W、A243I、R310E、G140C、A242F、G265W、S183A、G109C、G113F、S191F、G265Y、S94D、E95K、A343K、A350K、F176D、N196D、H147D、H146D、H147E、H146E、T91E、R250E、T91D、R251E、R148D、H254E、A170K、R250K、R251K、H254D、A170R、H146K、H147K、K346E、T90D、R250D、T90E、A138K、R251D、H262K、A169K、H146R、I102E、T90K、A271K、K346R、H306E、D124E、K326E、A169R、D124R
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含む、実施形態1~62のいずれか1項に従うワクチン、方法または組成物。
T392F、F352L、T392I、M303F、A276Y、S365I、T392L、M303W、A276L、T392W、K363T、A361V、F286Y、A361I、K363F、M303Y、T392V、A361L、S365V、A270V、A276M、S365L、K363V、M312L、T252L、M387L、Y297F、A276F、G353T、A276W、K363S、T252R、L314I、T252I、A361F、L295I、L255I、A276I、K363L、S318W、V354L、K363I、A361T、S318I、A361M、G353L、T392Y、S365A、A270I、A361W、T252M、K363A、K363W、L319I、G353D、A276V、G353N、G353F、T252V、G353S、S318V、L255V、G364I、L394V、K363M、S318F、L390I、G353I、S335Y、G364L、S365M、T252Q、S365F、L330A、T252F、S318M、K363Y、G353V、S365G、S365W、K363G、T392M、V354F、A276T、G364W、K363C、P317I、S335C、P317L、P317F、G269C、S335A、P317V、G268C、S334V、S335V、G269V、S334C、A361C、G268I、G269F、G268L、S334I、G268V、G269L、S335G、S334A、G268F、S335T、P317C、P317M、S335L、A361Y、G269I、S335I、G268Y、K363P、G268W、S335M、K363H、F286I、G268M、G269M、G269W、G268A、S334G、S334L、G268P、G268T、G293F、F286L、T252C、S335N、T392C、K363N、S334F、M303I、K363Q、A376L、G364V、W245I、G269S、Y297C、S335Q、G358V、W245L、A376I、S334M、G358L、T252A、S318C、S335H、Y297L、S365C、M312I、G373L、Y297I、G358I、S335F、G268N、M303L、G269T、Y297V、P317A、G268Q、G268H、G293L、S334T、G305C、S318L、S335D、S335P、G364C、W245V、W245F、P317Y、T392A、F286V、S335W、A376V、G358C、K363D、M312F、G269N、S335R、A378I、A378C、P317W、G268K、G268R、G268D、A376C、G373V、M312V、M303V、G353C、S318A、G364F、G241C、G268E、G379I、G269P、F286C、L330F、G284V、W245C、A378V、L330I、G293I、G373C、G379L、S318Y、G358F、L394I、L330V、G373I、F352I、A361G、S335K、G246C、M387F、A378L、G241I、V354C、M387I、G269A、G308C、F352C、A276C、G293C、G269Q、K363R、G379V、F286W、W245M、G246V、A270C、G246L、M303C、G293V、G305A、Y297A、G345I、G241V;N388D、R248K、S336D、T372E、T249E、E316D、D348E、R382E、R382K、K265E、H327K、D338E、K333R、P386E、S336E、K341D、K341E、K341R、E385D、G268K、G268R、G268D、K340R、G268E、K333D、K368R、G353D;H306I+S335R、H306L+S335R、H306I+S335K、H306C+S335R、H306C+S335R、H306I+S335K、H306L+S335K、H306L+S335K、H306L+S335R、H306V+S335R、H306I+S335R、H306V+S335R、H306C+S335K、H306F+S335K、H306V+S335K、H306V+S335K、H306F+S335R、H306F+S335R、H306W+S335R、H306F+S335K、H306M+S335R、H306W+S335K、H306W+S335R、H306M+S335K、H306A+S335R、H306A+S335R、H306W+S335K、H306A+S335K、H306Y+S335R、H306Y+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306T+S335K、H306S+S335R、H306T+S335K、H306S+S335K、S334V+S335R、H306S+S335K、S334V+S335K、S334I+S335R、S334C+S335R、H306P+S335R、M312I+S335R、S334I+S335K、S334V+S335R、S334V+S335K、H306P+S335K、S334C+S335R、S334A+S335R、M312F+S335R、M312L+S335R、S334C+S335K、H306R+Y381L、M312L+S335R、S250L+S335R、H306Q+S335R、H306N+S335K、S334C+S335K、S334A+S335K、H306P+S335K、H306Q+S335R、M312V+S335R、M312I+S335K、S334I+S335K、M312I+S335R、M312L+S335K、H306N+S335R、S334L+S335R、S334A+S335K、M312L+S335K、S250I+S335R、H306N+S335R、S250V+S335R、H306N+S335K、M312F+S335K、S250V+S335R、S250A+S335R、S334M+S335R、M312V+S335R、S250A+S335K、M312F+S335K、S250A+S335K、S250L+S335R、S334G+S335R、S250C+S335R、S250C+S335R、H306Q+S335K、S334G+S335R、Y254F+S335R、S334L+S335R、S250I+S335R、I309C+S335R、S250I+S335K、Y254C+S335R、S250L+S335K、M312V+S335K、S334G+S335K、S250L+H306R、S250V+H306R、H306R+Y381I、M312V+S335K、S250I+H306R、M312C+S335R、Y254C+S335R、S250V+S335K、Y254W+S335R、S334G+S335K、S250L+H306R、S250L+S335K、Y254W+S335R、S250V+S335K、S334L+S335K、I309C+S335R、I309C+S335K、Y254F+S335R、S250A+S335R、S250C+S335K、S250I+H306R、S250A+H306R、S250C+S335K、H306Q+S335K、Y254C+S335K、S334L+S335K、S250A+H306R、I309C+S335K、Y254W+S335K、Y254C+S335K、Y254I+S335R、H306R+Y381C、S250M+S335K、M312C+S335K、M312C+S335K、S250V+H306R、S250M+S335R、Y254V+S335R、Y254I+S335K、S250W+S335R、I259C+S335R、S334M+S335R、Y254A+S335R、Y254V+S335R、S250M+S335K、F251L+S35R、Y254I+H306R、I259C+S335K、Y254I+S335R、I259C+S335K、S250Y+S335K、Y254F+S335K、S250M+S335R、Y254F+H306R、Y254V+S335K、Y254V+H306R、S334T+S335K、S334Y+S335R、Y254A+S335R、S334M+S335K、Y254I+H306R、Y254M+S335K、Y254A+S335K、S334F+S335R、S334M+S335K、F251L+H306R、S334T+S335R、Y254I+S335K、Y254A+S335K、S334T+S335K、S250Y+H306R、Y254A+H306R、Y254M+S335K、F251L+S335K、I259C+S335R、F251L+H306R、Y254M+H306R、S334P+S335R、S334P+S335R、S334P+S335K、S334F+S335R、Y254M+S335R、H306I+S335C、H306L+S335C、H306L+S335C、H306I+S335C、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306L+S335V、H306M+S335C、H306I+S335G、H306I+S335G、H306I+S335A、H306I+S335A、H306F+S335C、H306F+S335C、H306L+S335V、H306I+S335T、H306L+S335A、H306C+S335A、H306I+S335V、H306I+S335V、H306L+S334V、H306L+S335A、H306C+S335V、H306L+S334C、H306I+S335I、H306I+S334A、H306L+S334C、H306L+S334V、H306F+S334V、H306C+S335A、H306F+S335V、H306C+S334V、H306C+S334V、H306I+S335L、H306C+S335V、H306L+S334I、H306M+S335C、H306I+S334C、H306I+S335I、H306W+S335C、H306V+S335A、H306I+S334C、H306I+S334I、H306L+S335I、H306V+S335A、H306C+S334C、H306L+S335G、H306C+S334C、H306L+S335T、H306I+S334I、H306V+S334V、H306I+S335L、H306M+S335V、H306V+S335V、H306V+S335V、H306I+S335M、H306L+S335T、H306V+S335I、H306C+S335G、H306L+S335L、H306C+S334I、H306L+S335Y、H306L+S335I、H306V+S334V、H306C+S335G、H306I+S334A、H306L+S334A、H306C+S335I、H306F+S335V、H306I+S335T、H306L+S335Y、H306C+S334I、H306L+S334I、H306V+S335G、H306V+S335G、H306A+S335C、H306A+S335C、H306M+S335A、H306C+S334A、H306V+S335I、H306L+S335G、H306L+S334A、H306C+S334A、H306I+S335Y、H306I+S335Y、H306W+S335C、H306F+S335A、H306F+S335A、H306F+S335I、H306I+S335N、H306L+S335L、H306I+S335M、H306I+S335N、H306V+S334I、H306V+S334C、H306V+S335L、H306C+S335L、H306C+S335L、H306I+A376L、H306F+S335T、H306L+S335M、H306F+S334V、
S334V+S335C、S335C+Y381L、S335C+A376I、S334I+S335C、S334V+S335C、M312I+S335C、M312I+S335C、S335C+A376L、S334I+S335C、S335C+A376L、S335C+A378C、S335C+A376C、S335C+A376V、S334A+S335C、S335C+A378C、S334A+S335C、S335C+A376I、S334V+S335A、S335A+A376L、S335C+A376C、S335C+A376V、S335C+A378L、S334V+S335A、S335A+A376I、S334V+A376L、S334I+S335V、S335C+A378I、M312F+S335C、M312F+S335C、S334I+S335A、S335C+A378V、S335V+A376L、S334V+S335L、S335C+A378I、S334C+S335V、S334V+A376I、S334V+A376I、S335V+A376I、M312I+S334V、S334V+S335I、S335C+Y381I、M312V+S335C、S335C+A378L、S335A+Y381L、S334C+A376C、S334V+S335I、S335C+Y381V、M312L+S335C、S335C+A378V、S335V+A376L、S334I+S335V、S335C+Y381C、S335V+A376I、S334C+A376L、S334C+Y381L、M312V+S335C、S334V+S335L、S334C+A376I、S334C+A376C、S334V+Y381L、M312L+S335C、S335V+A376V、S334I+A376I、S335V+A376V、S335V+Y381L、Y254F+S335C、L310F+S335C、S335I+A376I、S334V+A376V、M312I+S335V、S334C+S335A、S334I+A376L、M312F+S335V、S335C+Y381A、L310F+S335C、S334G+S335C、S334G+S335C、S334V+A376V、S335C+A376M、S335C+A376M、S334A+S335I、S334V+A376L、M312C+S335C、S334C+S335A、S335A+A376V、S334A+S335V、S334A+S335V、Y254F+S335C、S335A+A376L、S335A+Y381I、S335A+A376I、S334L+S335C、S335A+A376V、M312C+S335C、D152F、D152L、D152I、D152V、D152M、D152W、D152Y、D152S、D152A、D152T、D152G、D152N、D152Q、D152P、D152H、D152K、D152R、D152C、D155Q、D155L、D155F、D155I、D155M、D155W、D155V、D155Y、D155A、D155N、D155T、D155S、D155P、D155G、D155H、D155R、D155K、D155C、D156L、D156F、D156I、D156W、D156V、D156A、D156Y、D156M、D156G、D156S、D156T、D156Q、D156N、D156P、D156H、D156K、D156R、D156C、H146R、H146K、H153R、H153K、Y63A、H146A、H153A、F74A、L141A、F81A、P72A、K144A、T143A、Y75A、W98A、D156A、R158A、S250W、S250F、S250D、S250E、S250K、S250R、F251A、Y254A、I259W、I259F、I259D、I259E、I259R、I259K、H306A、I309W、I309F、I309E、I309D、I309R、I309K、L310W、L310F、L310D、L310E、L310R、L310K、M312W、M312F、M312D、M312E、M312R、M312K、S334W、S334F、S334D、S334E、S334R、S334K、S335W、S335F、S335D、S335E、S335K、S335R、M337W、M337F、M337D、M337E、M337K、M337R、A376W、A376F、A376E、A376D、A376R、A376K、F377、A378W、A378F、A378D、A378E、A378K、A378R、F380A、Y381A、D348I、D348L、D348M、D348F、D348V、D348Y、D348A、D348W、D348T、D348G、D348P、D348H、D348S、D348R、D348K、D348E、D348C、H306R、H306D、H306E、H306K、H307D、H307R、H307E、H307K、H327R、H327K、H327E、H327D、H302E、H302K、H302R、H302D、H215K、H215R、H215E、H215D、H223K、H223R、H223E、H223D、H403K、H403R、H403E、H403D
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含む、実施形態1~63のいずれか1項に従うワクチン、方法または組成物。
A274Y、S26C、S26L、A274F、S26I、G119H、A274L、A274W、S26V、S26M、S212L、T108I、A134L、S26F、N130V、A229L、A274I、G194F、S26W、A291F、G181I、A229I、E278I、A175L、G181L、A152L、A274V、N130L、E278V、K46I、E278L、E278A、K46C、K46L、K93L、K93V、E164I、E278C、E164V、E278M、N130I、K46V、R221C、K93C、K46M、S51L、K93I、E278F、K93M、E164A、S51I、R221L、P209L、K46F、S51V、E164C、R221I、E164M、K93F、D137L、P209V、E164L、P59L、R221F、N130C、S51C、R221G、E278T、K46G、P59V、K46A、N130M、E278G、D137V、K46T、P209C、P59I、P209I、T144L、N130F、E164F、S51F、R221M、P209F、S51M、R221S、P209A、K93A、P209M、E164Y、D137C、R221A、P115C、P59F、S208A、K46S、P115V、A134I、P115A、S212V、N249L、E278S、D137F、D137M、P115L、S212I、R221V、N249V、D137I、E278Y、G194L、P59M、R221T、A188L、N249I、T144I、E164T、S208C、S208V、D137A、K46Y、K93G、G87I、E164G、K46P、P59C、A97V、S212C、G83L、K93T、N249C、A134V、G83V、T108V、T112L、T144V、A100L、G87V、E164W、E164S、A171L、A97L、A188F、K93W、T90I、A174I、K93Y、A111L、A97I、N130A、G48I、E278W、R221Y、G135L、T112V、F197V、T144F、K93S、G194V、G87A、A188V、T144C、K46N、P115M、A175I、N130T、S51A、G194C、G48L、G104V、A174V、G158V、T90V、R221N、A202L、A39L、A134F、D137Y、G158I、A174L、P155V、A171V、S51T、F197I、T112C、D137W、G135V、D137G、P115G、T250C、S208L、A100I、T250L、T144M、T108C、P115F、G69L、T112F、G181F、A100F、S208I、G223V、T250V、N249M、A111V、N249Y、A111F、A188M、A111I、P209Y、A175V、P155I、N130G、S120V、A111C、A100C、A97F、G194M、G69I、E278Q、S208G、G181C、G87F、G48V、A97C、I205L、G194I、D137T、S51G、F197C、G223L、N249A、S51Y、P115S、A202I、P155C、S26A、G83M、S120C、D137S、E278N、G83F、G158C、P59Y、G87C、G87M、N130S、P115I、A202F、A100M、G83C、S212M、A39V、A188I、F197L、G181M、A134C、P115T、A174F、K93P、P209W、P209G、P59A、A39C、G104I、T250G、S208F、R221Q、G181A、G104C、T90C、K46Q、P209T、K46W、A171I、G158A、A134M、G48C、G194A、T90A、T90M、N130Y、N249F、A172L、A152V、A152I、P59W、R221P、G158F、T112M、G135M、G181V、G104L、S208T、N249W、A97M、G135F、K93Q、G42L、A111M、G104A、E278P、T90L、R221D、A175C、A188C、A291L、S212A、F123L、T250I、A174C、E164Q、P155L、A174M、G158M、A172V、E164N、A168L、T90F、A39F、G42V、I205F、A39M、N249G、A175F、G135C、A171F、S212F、K46D、A100Y、G42I、P59G、G69A、E164P、G158L、G42C、A171C、T250M、T108L、K93N、A171M、G223I、A175M、T108M、A172I、S51P、A291I、A111Y、G20V、S120I、P59T、A58I、G223C、S208M、G48M、K46H、A62L、A43I、T250A、N130W、G194Y、R221H、D137P、N249S、G104F、A100V、F123I、A172C、T112I、G69F、P115Y、P59S、A100W、G104M、G69C、R221W、K93H、A204L、G20L、G223F、A168I、D28K、E275K、K77R、D17R、H76D、H75D、H76E、K77D、H75E、P294D、S293D、S293E、D286E、P294E、S292E、D285E、H76R、K77E、K289R、P295D、D285K、R179E、H75R、P295E、P294R、P294K、D286K、D285R、S293R、S293K、R180D、R180K、H183E、R179K、K289E、R180E、A98K、R179D、A99K、S292D、D286R、K290D、H75K、A99E、N256E、K290E、K290R、R239D、A199K、A200K、K255E、H183D、A99R、H235E、A98R、D102K、およびA200R
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを好ましくは含む、実施形態1~64のいずれか1項に従うワクチン、方法または組成物。
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列;
ならびに/またはPITPドメインは以下のとおりに定義される:Q6A9N1の配列中のA32~R164のENFD;E165~K237のSR1、V238~L396のHbD、S397~T430のSR2(C末端LPXT(G)モチーフを含む(すなわち、LPXTを含むが、Gを含まない))およびG431~I467のhLARもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的PITP配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のPITP配列、実施形態1~63のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはDsA1および/またはDsA2派生体。
DsA1は、N末端からC末端に、N末端スワッピング領域(「NSR」)、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」)、Pro-Thrリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域(「CTR」)を含み、ならびに
PITPポリペプチドは、N末端からC末端に、拡大されたネオカルチノスタチンファミリードメイン(「ENFD」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、ヘム結合ドメイン(「HbD」)、C末端LPXTGモチーフを含む第2のスワッピング領域(「SR2」)および疎水性C末端領域(「hLAR」)を含む、前記ワクチン。
- 表面に露出しているDsA1ポリペプチドのエピトープまたは表面に露出しているP.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン2(DsA2ポリペプチド)のエピトープを有する少なくとも1つの抗原ポリペプチドであって、
DsA2は、N末端からC末端に、N末端スワッピング領域(「NSR」)、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」)、および場合により、Pro-Thrリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域(「CTR」)を含む、少なくとも1つの抗原ポリペプチド;ならびに
- 表面に露出しているPITPポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの抗原ポリペプチド
を含む、前記ワクチン。
- 表面に露出しているDsA1ポリペプチドのエピトープまたは表面に露出しているDsA2ポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの合成抗原ポリペプチド;および
- 表面に露出しているP.アクネスのPITPポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの合成抗原ポリペプチド
を含む、前記ワクチン。
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応する、実施形態71~73のいずれか1項に従うワクチン。
- フェニルアラニン150(F150)~イソロイシン193(I193)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態74に従うワクチン。
(1)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列;
(2)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、および/または
(3)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
である、実施形態74または75のいずれか1項に従うワクチン。
- ENFDのプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDのプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDのバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態78に従うワクチン。
(b)少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD1のCSD1断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチおよび少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD2のCSD2断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチを含む;
(c)少なくともDsA1の
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、および
DsA2の
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン228(L228)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン262(H262)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列を含む、
ポリペプチドを含む、
特に、ポリペプチドは、ポリペプチド中に存在する場合はDsA1のC53、C319およびC321ならびにDsA2のC97およびC363のうち1つまたはそれ以上にアミノ酸交換、好ましくは、アミノ酸交換DsA1のC53S、C319SおよびC321PならびにDsA2のC97SおよびC363Sのうち1つまたはそれ以上を含み、ならびに/またはDsA1もしくはDsA2の断片または派生体において、少なくとも5つのPTリピート、好ましくは、少なくとも10のPTリピート、特に、少なくとも15のPTリピートが、天然に存在する野生型DsA1/DsA2ポリペプチド(「天然DsA1/DsA2」)と比較して欠失しており、好ましくは、少なくとも1つの、より好ましくは少なくとも2つの、より好ましくは少なくとも3つの、いっそうより好ましくは少なくとも4つの、特に5つのPTリピートが存在する、実施形態1~91のいずれか1項に従うワクチン。
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDもしくはそのPITP派生体のバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列を含み;
特に、PITP派生体は、位置C231およびC402にアミノ酸交換を含む、請求項1~96のいずれか1項に記載のワクチン。
ポリペプチドは、少なくともDsA1のCSD1、CSD2またはCSD3のエピトープおよび少なくともDsA2のCSD1、CSD2またはCSD3のエピトープを含み、好ましくは、ポリペプチドは、少なくともDsA1のCSD1、CSD2またはCSD3およびDsA2のCSD1、CSD2またはCSD3を含む、前記ポリペプチド。
DsA1およびDsA2のポリペプチドストレッチは、少なくとも20個のアミノ酸残基の長さを独立に有する、前記ポリペプチド。
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応する、実施形態1~5のいずれか1項に従うポリペプチド。
- フェニルアラニン150(F150)~イソロイシン193(I193)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態1~6のいずれか1項に従うポリペプチド。
(1)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列;
(2)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(3)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(4)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張するフェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(5)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、アラニン148(F148)~ロイシン271(L271)の連続ポリペプチド配列;
(6)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン146(H146)~トレオニン277(T277)の連続ポリペプチド配列;
(7)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン238(L238)~ロイシン272(L272)の連続ポリペプチド配列;
(8)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン145(L145)~アラニン201(A201)の連続ポリペプチド配列;ならびに/または
(9)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ロイシン145(L145)~ロイシン280(L280)の連続ポリペプチド配列
である、実施形態1~7のいずれか1項に従うポリペプチド。
(1)場合により、N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列;
(2)場合により、N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(3)場合により、N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であるDsA1またはDsA2の断片を含む、実施形態1~11のいずれか1項に従うポリペプチド。
- 少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2;または
- 少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2のN末端部分ならびに異なる、少なくともDsA1のCSD1、CSD2もしくはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2もしくはCSD3に隣接するDsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2のC末端部分からなるアミノ酸配列であって、NおよびC末端部分からなるアミノ酸配列のアミノ酸残基の総数は、DsA1もしくはDsA2のSR1もしくはSR2と同一である、アミノ酸配列
によって相互接続される、実施形態13~39のいずれか1項に従うワクチン。
(a)DsA1のF150~L184またはDsA2のF194~L228の連続ポリペプチド配列を少なくとも含む、DsA1のA148~L267またはDsA2のA192~L311内のDsA1またはDsA2のCSD2断片、
(b)以下のアミノ酸交換:DsA1中のA149T、D152N、D152S、V155I、V163I、K166H、K166P、A168T、K169R、T171A、V173M、A176V、A183T、T190F、T190I、E191K、A192L、A192F、A198G、A199T、A202T、V205I、G206N、G206S、G206R、G206Q、K212Q、A214T、I219V、I219A、S223A、D225N、V233I、S235F、N239S、L255I、V257I、Q258S、I259L、R262H、I264V、D265KおよびDsA2中のT193A、N196D、N196S、I199V、I207V、H210K、H210P、A212T、R213K、T215A、V217M、V220A、T227A、F234T、F234I、E235K、L236A、L236F、A242G、A243T、A246T、I249V、R250G、R250S、R250N、G250Q、Q256K、A258T、V263I、V263A、A267S、D269N、I277V、S279F、S283N、I299L、I301V、S302Q、L303I、H306R、V308I、K309Dのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有する、(a)のCSD2派生体、
(c)20個のアミノ酸残基の連続ポリペプチド配列、特に、DsA1のT117~A127またはDsA2のT161~LA171を少なくとも含む、DsA1のI49~L130またはDsA2のI93~L174内のDsA1またはDsA2のCSD1断片、
(d)以下のアミノ酸交換:DsA1中のD50N、D50S、K51E、K51A、C53Y、D55K、V57I、A61L、A65G、A68V、L71M、F76L、S78A、V82M、V82A、L84M、P86R、P86S、K90R、K90A、K94A、V97T、L99T、I100L、K104R、K106E、A107V、I109V、G110A、A111S、L113V、G114S、L116V、T117A、K120A、I121V、R123H、A124T、V128IおよびDsA2中のS94D、S94N、E95A、E95K、C97Y、K99D、I101V、L105A、G109A、V112A、L115M、L120F、A122S、A126M、A126V、L128M、P130R、P130S、A134K、A134R、A138K、T141V、T143L、I144L、R148K、K150E、V151A、V153I、A154G、S155A、L157V、G158S、V160L、A161T、A164K、V165I、H167R、A168T、I172Vのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有する、(c)のCSD1派生体、
(e)DsA1のR266~T277もしくはR286~K296またはDsA2のV333~Q347の連続ポリペプチド配列を少なくとも含む、DsA1のA278~K323またはDsA2のA322~E366内のDsA1またはDsA2のCSD3断片、
(f)以下のアミノ酸交換:DsA1中のM281V、N283D、T285A、R286Q、V289A、V291I、I292R、T293N、A294T、D295K、D295Q、K296E、I298V、K299A、T300V、T300I、A301Y、-301から302Dの間、E302K、E305K、K306A、A310T、D313G、K316Q、S320T、C321-、P322L、K323D、K323EおよびDsA2中のV325M、D327N、A329T、R330Q、V333A、I335V、R336I、N337T、T338A、Q339K、Q339D、E340K、I342V、A343K、V344T、V344I、Y345A、K346E、K349E、A350K、T354A、G357D、Q360K、T364S、P365L、E366D、E366Kのうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に1つを有する、CSD3派生体
を含む、実施形態1~61のいずれか1項に従うポリペプチド、ワクチン、方法または組成物。
DsA1:A301Y、G206L、G206F、A192L、G206R、G206W、G206Q、G206K、A301F、A301L、G206I、A301W、A301I、G206E、G206M、G208L、G206V、A192M、A256L、A192I、A68I、G206N、A68V、I259L、A161L、V205I、G206T、G206H、A68L、G206Y、A256I、G206A、68M、A192F、G110A、N239L、G206C、A301V、E305L、A93I、A93L、S223A、E305I、E305V、E305A、K120V、K120L、N157I、K120C、E305C、E305M、N239I、K120I、R248C、N239V、E191I、E305F、S78I、K120M、E191L、R248L、H146V、E191V、H146I、S78L、S78V、N157V、H146C、K120F、R248I、R248M、D164L、P236V、P236L、H146L、H146F、D164I、H146M、P86L、R248G、N239C、N157C、E305T、E191C、S78C、R248F、G221L、E305G、P236F、T171L、P86V、R248S、N157L、K120A、H146A、P86I、N157F、S235A、R248A、E191M、N157M、A124I、P236A、S78F、P236C、S78M、A161I、N239M、T171I、E191F、S235V、P86F、H146G、S223I、E305S、D164F、E305Y、P236M、S223L、N239F、H146Y、P236I、G221V、D164C、K120G、D164M、S235I、R248V、A124V、S235L、S223V、S147L、S235C、P86M、G208I、D164A、S147I、N239A、K120T、T117I、G110L、R248Y、P182I、A198L、A124L、A215L、A127L、A66L、P86C、G221F、R248T、T171F、P182V、S147V、P271V、T171V、G110V、P271A、E191A、A149L、K120Y、G114I、K120S、S235F、A201I、G131V、A201V、R248N、A66V、A202I、G221C、G114V、A229L、H146T、A124F、A127F、T117V、S223C、A215F、A127I、P182C、A215V、G162L、G162I、G208F、A201L、A161F、N157A、A198V、E191Y、A161V、S223F、G221M、R248W、G131C、A202V、N157T、S147F、N157Y、G114A、T171C、H146W、S78T、A149I、G250L、N239T、A149V、G208C、K120P、G250V、S235G、S223M、D164V、N239G、T171M、E191G、S78A、D164Y、P271I、G110F、G110C、D164W、P236Y、A124C、A66F、S147M、G75L、E305N、S147C、G221I、A127M、P182L、G221A、G110M、A66C、E305Q、P271F、A215M、P236W、K120W、H146P、A161C、A229I、S78G、G114M、P86A、E305W、V154L、G185V、G75I、S223Y、G75V、R248Q、T277V、E191S、A229F、T277G、G131I、N239S、P271C、V154I、A66M、D164G、G208A、P236T、R248D、D164T、A127C、A215I、A161M、P86W、A201F、C53L、T117F、G131A、T117C、A318L、F150L、G208M、P271M、A149C、G208V、G114C、G162F、S223W、A198I、N157G、A202L、P236G、G185I、A198F、A149M、P86Y、E191W、N157W、I263L、S235T、E305P、E305R、A201C、A201M、F150I、G96I、G114F、G221Y、A199L、D164S、A124M、A179I、A202F、H146S、A231L、C53I、I263V、G162M、K120Q、N239Y、G96L、G75C、N157S、T277C、T117A、A199V、G162C、P271Y、G250C、A127Y、A66I、T117L、G185C、A229C、R248P、A144I、T117M、P86T、A260L、G185A、E191Q、G131L、T277I、G250I、G131M、T277A、A127V、F150V、A318I、S78W、S147Y、A198M、P86G、A215C、A70I、S235M、A179V、A202M、A144V、A202C、G208W、T171Y、S147W、G208Y、G250F、A195L、K120H、A127W、A66Y、S223G、K120N、S78Y、E191N、A198C、P271G、V154F、A70V、H146N、A229M、A134L、P86S、S78Q、A199I、G75M、A68C、E191T、A89L、G96A、D164P、C53V、S78P、G185L、A149G、A149F、P182A;
DsA2:A161L、A161I、A126I、A126V、A126L、S175G、G190H、A161T、S183T、R336I、A126F、A161F、A329L、A161V、S283L、A205L、G109A、A329I、G265F、A161W、A232I、S175W、R336L、A300I、K349I、A161M、A300L、G109L、G109I、A246L、S183M、A223L、E235V、G252L、A329M、A126W、S183L、A259L、A329V、A329F、S183I、A242L、G109F、R336V、K117I、R336C、K117C、K349V、R336A、R336F、K117L、R336M、E235I、R310A、K349L、K117V、R310V、K349C、N201I、R310I、R310C、K349F、K349M、K117M、R292C、N201V、R336G、R292L、K117F、E235C、P130L、E235A、D208L、P280L、E235L、R292M、R336T、P280V、R292I、N201L、E235M、P130I、K117A、K349A、P130V、R292G、R310F、R336S、R336Y、N201C、K117G、R310L、R310M、R310G、R336W、D208V、R292F、P130F、K349Y、K117T、R310T、P280C、R292S、N201F、R310S、T215L、N201M、S279C、R292A、S279L、P280F、D208C、S175V、A126M、P280A、S279A、P130C、S279V、E235F、P186C、P130M、K349T、A126C、K349G、N320V、K117S、N320I、S283V、A168I、N320L、S175I、E235Y、P186V、P280I、P186A、P280M、G265L、D208M、P186L、K117Y、S283I、A205I、D208F、A168L、T215I、R292V、A133L、R336P、R310Y、A168V、S279F、S183V、A164I、S279I、S175L、D208A、K349S、E235T、S175C、A122I、D208I、A126Y、A123L、K117P、N320C、R292T、S283C、E235W、G252I、T215V、R292Y、R336Q、S175A、A123I、E235G、A205V、A171V、A133V、A245I、S183C、P226V、R310P、G181I、P226I、A168C、A246I、A171L、N201A、S175M、G158I、A164L、T215C、A164C、P280W、A133C、G119I、T215F、A245V、N320M、A122V、A123V、G206L、N320A、G265V、A122L、A193L、S191V、R310W、G252F、G181V、E235S、R292N、P130W、G119V、G265C、S279M、A259V、A259F、A168F、A168M、A246V、P226C、R292W、G158V、P130Y、G206V、P186G、C97L、N201Y、A171C、G265M、G140L、K117N、G140I、D208G、A193V、G181F、K349W、S279G、A245L、A205F、G158A、A193I、K117W、A122C、R310D、G294V、P186T、S175F、S191C、N201T、K349Q、R310N、A242V、T215M、D208Y、T321C、G252C、I276L、A259M、A171F、N201G、G119F、D208T、P186M、G229V、G294L、S191I、P186S、G119C、G229I、P130A、A205C、A171M、T321V、A193C、F268L、A133M、A123F、G357A、G109V、K117Q、N320G、R310Q、T321G、S283M、P186Y、G229A、R336D、N201S、S183F、F194L、F268V、A245F、G265A、G252A、R336H、A259I、A133I、A123C、P130T、G113L、D208S、P280T、F268I、G181C、P280Y、R336E、P280G、G158C、N320Y、G140V、K349P、R292D、D208W、N320F、G265I、R336N、A164M、G206M、F268C、G158M、R292P、S191L、G158F、G252M、A245C、G229C、E235Q、G252V、A205M、G206F、R292Q、G181M、A126G、A243L、K349N、S283A、A246M、S279T、P186I、A246F、A246C、A223I、C97I、A164V、A245M、A171I、G357I、A126T、S283F、A123M、F194I、K117D、P226L、P130S、G140F、I276F、F194V、A243V、P130G、G181L、G229F、A259C、G113I、K117H、N320S、G119M、A239L、G206C、A114I、E235N、K349D、A242I、A161C、G294C、G119L、A126S、T321L、A193M、A223V、A122M、G113C、A242C、N201W、R292H、A275L、A242M、G357V、P186F、G294I、D208P、A259W、A243I、R310E、G140C、A242F、G265W、S183A、G109C、G113F、S191F、G265Y、S94D、E95K、A343K、A350K、F176D、N196D、H147D、H146D、H147E、H146E、T91E、R250E、T91D、R251E、R148D、H254E、A170K、R250K、R251K、H254D、A170R、H146K、H147K、K346E、T90D、R250D、T90E、A138K、R251D、H262K、A169K、H146R、I102E、T90K、A271K、K346R、H306E、D124E、K326E、A169R、D124R
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含む、実施形態1~62のいずれか1項に従うポリペプチド、ワクチン、方法または組成物。
T392F、F352L、T392I、M303F、A276Y、S365I、T392L、M303W、A276L、T392W、K363T、A361V、F286Y、A361I、K363F、M303Y、T392V、A361L、S365V、A270V、A276M、S365L、K363V、M312L、T252L、M387L、Y297F、A276F、G353T、A276W、K363S、T252R、L314I、T252I、A361F、L295I、L255I、A276I、K363L、S318W、V354L、K363I、A361T、S318I、A361M、G353L、T392Y、S365A、A270I、A361W、T252M、K363A、K363W、L319I、G353D、A276V、G353N、G353F、T252V、G353S、S318V、L255V、G364I、L394V、K363M、S318F、L390I、G353I、S335Y、G364L、S365M、T252Q、S365F、L330A、T252F、S318M、K363Y、G353V、S365G、S365W、K363G、T392M、V354F、A276T、G364W、K363C、P317I、S335C、P317L、P317F、G269C、S335A、P317V、G268C、S334V、S335V、G269V、S334C、A361C、G268I、G269F、G268L、S334I、G268V、G269L、S335G、S334A、G268F、S335T、P317C、P317M、S335L、A361Y、G269I、S335I、G268Y、K363P、G268W、S335M、K363H、F286I、G268M、G269M、G269W、G268A、S334G、S334L、G268P、G268T、G293F、F286L、T252C、S335N、T392C、K363N、S334F、M303I、K363Q、A376L、G364V、W245I、G269S、Y297C、S335Q、G358V、W245L、A376I、S334M、G358L、T252A、S318C、S335H、Y297L、S365C、M312I、G373L、Y297I、G358I、S335F、G268N、M303L、G269T、Y297V、P317A、G268Q、G268H、G293L、S334T、G305C、S318L、S335D、S335P、G364C、W245V、W245F、P317Y、T392A、F286V、S335W、A376V、G358C、K363D、M312F、G269N、S335R、A378I、A378C、P317W、G268K、G268R、G268D、A376C、G373V、M312V、M303V、G353C、S318A、G364F、G241C、G268E、G379I、G269P、F286C、L330F、G284V、W245C、A378V、L330I、G293I、G373C、G379L、S318Y、G358F、L394I、L330V、G373I、F352I、A361G、S335K、G246C、M387F、A378L、G241I、V354C、M387I、G269A、G308C、F352C、A276C、G293C、G269Q、K363R、G379V、F286W、W245M、G246V、A270C、G246L、M303C、G293V、G305A、Y297A、G345I、G241V;N388D、R248K、S336D、T372E、T249E、E316D、D348E、R382E、R382K、K265E、H327K、D338E、K333R、P386E、S336E、K341D、K341E、K341R、E385D、G268K、G268R、G268D、
K340R、G268E、K333D、K368R、G353D;H306I+S335R、H306L+S335R、H306I+S335K、H306C+S335R、H306C+S335R、H306I+S335K、H306L+S335K、H306L+S335K、H306L+S335R、H306V+S335R、H306I+S335R、H306V+S335R、H306C+S335K、H306F+S335K、H306V+S335K、H306V+S335K、H306F+S335R、H306F+S335R、H306W+S335R、H306F+S335K、H306M+S335R、H306W+S335K、H306W+S335R、H306M+S335K、H306A+S335R、H306A+S335R、H306W+S335K、H306A+S335K、H306Y+S335R、H306Y+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306Y+S335K、H306T+S335R、H306T+S335K、H306S+S335R、H306T+S335K、H306S+S335K、S334V+S335R、H306S+S335K、S334V+S335K、S334I+S335R、S334C+S335R、H306P+S335R、M312I+S335R、S334I+S335K、S334V+S335R、S334V+S335K、H306P+S335K、S334C+S335R、S334A+S335R、M312F+S335R、M312L+S335R、S334C+S335K、H306R+Y381L、M312L+S335R、S250L+S335R、H306Q+S335R、H306N+S335K、S334C+S335K、S334A+S335K、H306P+S335K、H306Q+S335R、M312V+S335R、M312I+S335K、S334I+S335K、M312I+S335R、M312L+S335K、H306N+S335R、S334L+S335R、S334A+S335K、M312L+S335K、S250I+S335R、H306N+S335R、S250V+S335R、H306N+S335K、M312F+S335K、S250V+S335R、S250A+S335R、S334M+S335R、M312V+S335R、S250A+S335K、M312F+S335K、S250A+S335K、S250L+S335R、S334G+S335R、S250C+S335R、S250C+S335R、H306Q+S335K、S334G+S335R、Y254F+S335R、S334L+S335R、S250I+S335R、I309C+S335R、S250I+S335K、Y254C+S335R、S250L+S335K、M312V+S335K、S334G+S335K、S250L+H306R、S250V+H306R、H306R+Y381I、M312V+S335K、S250I+H306R、M312C+S335R、Y254C+S335R、S250V+S335K、Y254W+S335R、S334G+S335K、S250L+H306R、S250L+S335K、Y254W+S335R、S250V+S335K、S334L+S335K、I309C+S335R、I309C+S335K、Y254F+S335R、S250A+S335R、S250C+S335K、S250I+H306R、S250A+H306R、S250C+S335K、H306Q+S335K、Y254C+S335K、S334L+S335K、S250A+H306R、I309C+S335K、Y254W+S335K、Y254C+S335K、Y254I+S335R、H306R+Y381C、S250M+S335K、M312C+S335K、M312C+S335K、S250V+H306R、S250M+S335R、Y254V+S335R、Y254I+S335K、S250W+S335R、I259C+S335R、S334M+S335R、Y254A+S335R、Y254V+S335R、S250M+S335K、F251L+S35R、Y254I+H306R、I259C+S335K、Y254I+S335R、I259C+S335K、S250Y+S335K、Y254F+S335K、S250M+S335R、Y254F+H306R、Y254V+S335K、Y254V+H306R、S334T+S335K、S334Y+S335R、Y254A+S335R、S334M+S335K、Y254I+H306R、Y254M+S335K、Y254A+S335K、S334F+S335R、S334M+S335K、F251L+H306R、S334T+S335R、Y254I+S335K、Y254A+S335K、S334T+S335K、S250Y+H306R、Y254A+H306R、Y254M+S335K、F251L+S335K、I259C+S335R、F251L+H306R、Y254M+H306R、S334P+S335R、S334P+S335R、S334P+S335K、
S334F+S335R、Y254M+S335R、H306I+S335C、H306L+S335C、H306L+S335C、H306I+S335C、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306V+S335C、H306C+S335C、H306I+S334V、H306L+S335V、H306M+S335C、H306I+S335G、H306I+S335G、H306I+S335A、H306I+S335A、H306F+S335C、H306F+S335C、H306L+S335V、H306I+S335T、H306L+S335A、H306C+S335A、H306I+S335V、H306I+S335V、H306L+S334V、H306L+S335A、H306C+S335V、H306L+S334C、H306I+S335I、H306I+S334A、H306L+S334C、H306L+S334V、H306F+S334V、H306C+S335A、H306F+S335V、H306C+S334V、H306C+S334V、H306I+S335L、H306C+S335V、H306L+S334I、H306M+S335C、H306I+S334C、H306I+S335I、H306W+S335C、H306V+S335A、H306I+S334C、H306I+S334I、H306L+S335I、H306V+S335A、H306C+S334C、H306L+S335G、H306C+S334C、H306L+S335T、H306I+S334I、H306V+S334V、H306I+S335L、H306M+S335V、H306V+S335V、H306V+S335V、H306I+S335M、H306L+S335T、H306V+S335I、H306C+S335G、H306L+S335L、H306C+S334I、H306L+S335Y、H306L+S335I、H306V+S334V、H306C+S335G、H306I+S334A、H306L+S334A、H306C+S335I、H306F+S335V、H306I+S335T、H306L+S335Y、H306C+S334I、H306L+S334I、H306V+S335G、H306V+S335G、H306A+S335C、H306A+S335C、H306M+S335A、H306C+S334A、H306V+S335I、H306L+S335G、H306L+S334A、H306C+S334A、H306I+S335Y、H306I+S335Y、H306W+S335C、H306F+S335A、H306F+S335A、H306F+S335I、H306I+S335N、H306L+S335L、H306I+S335M、H306I+S335N、H306V+S334I、H306V+S334C、H306V+S335L、H306C+S335L、H306C+S335L、H306I+A376L、H306F+S335T、H306L+S335M、H306F+S334V、S334V+S335C、S335C+Y381L、S335C+A376I、S334I+S335C、S334V+S335C、M312I+S335C、M312I+S335C、S335C+A376L、S334I+S335C、S335C+A376L、S335C+A378C、S335C+A376C、S335C+A376V、S334A+S335C、S335C+A378C、S334A+S335C、S335C+A376I、S334V+S335A、S335A+A376L、S335C+A376C、S335C+A376V、S335C+A378L、S334V+S335A、S335A+A376I、S334V+A376L、S334I+S335V、S335C+A378I、M312F+S335C、M312F+S335C、S334I+S335A、S335C+A378V、S335V+A376L、S334V+S335L、S335C+A378I、S334C+S335V、S334V+A376I、S334V+A376I、S335V+A376I、M312I+S334V、S334V+S335I、S335C+Y381I、M312V+S335C、S335C+A378L、S335A+Y381L、S334C+A376C、S334V+S335I、S335C+Y381V、M312L+S335C、S335C+A378V、S335V+A376L、S334I+S335V、S335C+Y381C、S335V+A376I、S334C+A376L、S334C+Y381L、M312V+S335C、S334V+S335L、S334C+A376I、S334C+A376C、S334V+Y381L、M312L+S335C、S335V+A376V、S334I+A376I、S335V+A376V、S335V+Y381L、Y254F+S335C、L310F+S335C、S335I+A376I、S334V+A376V、M312I+S335V、S334C+S335A、S334I+A376L、M312F+S335V、S335C+Y381A、
L310F+S335C、S334G+S335C、S334G+S335C、S334V+A376V、S335C+A376M、S335C+A376M、S334A+S335I、S334V+A376L、M312C+S335C、S334C+S335A、S335A+A376V、S334A+S335V、S334A+S335V、Y254F+S335C、S335A+A376L、S335A+Y381I、S335A+A376I、S334L+S335C、S335A+A376V、M312C+S335C、D152F、D152L、D152I、D152V、D152M、D152W、D152Y、D152S、D152A、D152T、D152G、D152N、D152Q、D152P、D152H、D152K、D152R、D152C、D155Q、D155L、D155F、D155I、D155M、D155W、D155V、D155Y、D155A、D155N、D155T、D155S、D155P、D155G、D155H、D155R、D155K、D155C、D156L、D156F、D156I、D156W、D156V、D156A、D156Y、D156M、D156G、D156S、D156T、D156Q、D156N、D156P、D156H、D156K、D156R、D156C、H146R、H146K、H153R、H153K、Y63A、H146A、H153A、F74A、L141A、F81A、P72A、K144A、T143A、Y75A、W98A、D156A、R158A、S250W、S250F、S250D、S250E、S250K、S250R、F251A、Y254A、I259W、I259F、I259D、I259E、I259R、I259K、H306A、I309W、I309F、I309E、I309D、I309R、I309K、L310W、L310F、L310D、L310E、L310R、L310K、M312W、M312F、M312D、M312E、M312R、M312K、S334W、S334F、S334D、S334E、S334R、S334K、S335W、S335F、S335D、S335E、S335K、S335R、M337W、M337F、M337D、M337E、M337K、M337R、A376W、A376F、A376E、A376D、A376R、A376K、F377、A378W、A378F、A378D、A378E、A378K、A378R、F380A、Y381A、D348I、D348L、D348M、D348F、D348V、D348Y、D348A、D348W、D348T、D348G、D348P、D348H、D348S、D348R、D348K、D348E、D348C、H306R、H306D、H306E、H306K、H307D、H307R、H307E、H307K、H327R、H327K、H327E、H327D、H302E、H302K、H302R、H302D、H215K、H215R、H215E、H215D、H223K、H223R、H223E、H223D、H403K、H403R、H403E、H403D
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを含む、実施形態1~63のいずれか1項に従うポリペプチド、ワクチン、方法または組成物。
A274Y、S26C、S26L、A274F、S26I、G119H、A274L、A274W、S26V、S26M、S212L、T108I、A134L、S26F、N130V、A229L、A274I、G194F、S26W、A291F、G181I、A229I、E278I、A175L、G181L、A152L、A274V、N130L、E278V、K46I、E278L、E278A、K46C、K46L、K93L、K93V、E164I、E278C、E164V、E278M、N130I、K46V、R221C、K93C、K46M、S51L、K93I、E278F、K93M、E164A、S51I、R221L、P209L、K46F、S51V、E164C、R221I、E164M、K93F、D137L、P209V、E164L、P59L、R221F、N130C、S51C、R221G、E278T、K46G、P59V、K46A、N130M、E278G、D137V、K46T、P209C、P59I、P209I、T144L、N130F、E164F、S51F、R221M、P209F、S51M、R221S、P209A、K93A、P209M、E164Y、D137C、R221A、P115C、P59F、S208A、K46S、P115V、A134I、P115A、S212V、N249L、E278S、D137F、D137M、P115L、S212I、R221V、N249V、D137I、E278Y、G194L、P59M、R221T、A188L、N249I、T144I、E164T、S208C、S208V、D137A、K46Y、K93G、G87I、E164G、K46P、P59C、A97V、S212C、G83L、K93T、N249C、A134V、G83V、T108V、T112L、T144V、A100L、G87V、E164W、E164S、A171L、A97L、A188F、K93W、T90I、A174I、K93Y、A111L、A97I、N130A、G48I、E278W、R221Y、G135L、T112V、F197V、T144F、K93S、G194V、G87A、A188V、T144C、K46N、P115M、A175I、N130T、S51A、G194C、G48L、G104V、A174V、G158V、T90V、R221N、A202L、A39L、A134F、D137Y、G158I、A174L、P155V、A171V、S51T、F197I、T112C、D137W、G135V、D137G、P115G、T250C、S208L、A100I、T250L、T144M、T108C、P115F、G69L、T112F、G181F、A100F、S208I、G223V、T250V、N249M、A111V、N249Y、A111F、A188M、A111I、P209Y、A175V、P155I、N130G、S120V、A111C、A100C、A97F、G194M、G69I、E278Q、S208G、G181C、G87F、G48V、A97C、I205L、G194I、D137T、S51G、F197C、G223L、N249A、S51Y、P115S、A202I、P155C、S26A、G83M、S120C、D137S、E278N、G83F、G158C、P59Y、G87C、G87M、N130S、P115I、A202F、A100M、G83C、S212M、A39V、A188I、F197L、G181M、A134C、P115T、A174F、K93P、P209W、P209G、P59A、A39C、G104I、T250G、S208F、R221Q、G181A、G104C、T90C、K46Q、P209T、K46W、A171I、G158A、A134M、G48C、G194A、T90A、T90M、N130Y、N249F、A172L、A152V、A152I、P59W、R221P、G158F、T112M、G135M、G181V、G104L、S208T、N249W、A97M、G135F、K93Q、G42L、A111M、G104A、E278P、T90L、R221D、A175C、A188C、A291L、S212A、F123L、T250I、A174C、E164Q、P155L、A174M、G158M、A172V、E164N、A168L、T90F、A39F、G42V、I205F、A39M、N249G、A175F、G135C、A171F、S212F、K46D、A100Y、G42I、P59G、G69A、E164P、G158L、G42C、A171C、T250M、T108L、K93N、A171M、G223I、A175M、T108M、A172I、S51P、A291I、A111Y、G20V、S120I、P59T、A58I、G223C、S208M、G48M、K46H、A62L、A43I、T250A、N130W、G194Y、R221H、D137P、N249S、G104F、A100V、F123I、A172C、T112I、G69F、P115Y、P59S、A100W、G104M、G69C、R221W、K93H、A204L、G20L、G223F、A168I、D28K、E275K、K77R、D17R、H76D、H75D、H76E、K77D、H75E、P294D、S293D、S293E、D286E、P294E、S292E、D285E、H76R、K77E、K289R、P295D、D285K、R179E、H75R、P295E、P294R、P294K、D286K、D285R、S293R、S293K、R180D、R180K、H183E、R179K、K289E、R180E、A98K、R179D、A99K、S292D、D286R、K290D、H75K、A99E、N256E、K290E、K290R、R239D、A199K、A200K、K255E、H183D、A99R、H235E、A98R、D102K、およびA200R
のうち1つまたはそれ以上、好ましくは、1つ、2つまたは3つ、特に、1つを好ましくは含む、実施形態1~64のいずれか1項に従うポリペプチド、ワクチン、方法または組成物。
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列;
ならびに/またはPITPドメインは以下のとおりに定義される:Q6A9N1の配列中のA32~R164のENFD;E165~K237のSR1、V238~L396のHbD、S397~T430のSR2(C末端LPXT(G)モチーフを含む(すなわち、LPXTを含むが、Gを含まない))およびG431~I467のhLARもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的PITP配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のPITP配列、実施形態1~63のいずれか1項に従うワクチン、組成物、方法またはDsA1および/またはDsA2派生体。
ポリペプチドは、少なくともDsA1のCSD1、CSD2またはCSD3および少なくともDsA2のCSD1、CSD2またはCSD3を含む、前記ポリペプチド。
DsA1およびDsA2のポリペプチドストレッチは、少なくとも20個のアミノ酸残基の長さを独立に有する、前記ポリペプチド。
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応する、実施形態71~75のいずれか1項に従うポリペプチド。
- フェニルアラニン150(F150)~イソロイシン193(I193)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、実施形態71~76のいずれか1項に従うポリペプチド。
(1)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列;
(2)N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、および/または
(3)N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
である、実施形態71~77のいずれか1項に従うポリペプチド。
(1)場合により、N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列;
(2)場合により、N末端で1、2、3もしくは4個のアミノ酸および/またはC末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸をさらに拡張する、フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列;
(3)場合により、N末端で少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21もしくは22個のアミノ酸および/またはC末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸をさらに拡張する、ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であるDsA1またはDsA2の断片を含む、実施形態71~81のいずれか1項に従うポリペプチド。
(b)少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD1のCSD1断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチおよび少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD2のCSD2断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチを含む;
(c)少なくともDsA1の
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、および
DsA2の
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン228(L228)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン262(H262)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列を含む、
ポリペプチドを含む、
特に、ポリペプチドは、ポリペプチド中に存在する場合はDsA1のC53、C319およびC321ならびにDsA2のC97およびC363のうち1つまたはそれ以上にアミノ酸交換、好ましくは、アミノ酸交換DsA1のC53S、C319SおよびC321PならびにDsA2のC97SおよびC363Sのうち1つまたはそれ以上を含み、ならびに/またはDsA1もしくはDsA2の断片または派生体において、少なくとも5つのPTリピート、好ましくは、少なくとも10のPTリピート、特に、少なくとも15のPTリピートが、天然に存在する野生型DsA1/DsA2ポリペプチド(「天然DsA1/DsA2」)と比較して欠失しており、好ましくは、少なくとも1つの、より好ましくは少なくとも2つの、より好ましくは少なくとも3つの、いっそうより好ましくは少なくとも4つの、特に5つのPTリピートが存在する、実施形態1~91のいずれか1項に従うワクチン。
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDもしくはそのPITP派生体のバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列を含み;
特に、PITP派生体は、位置C231およびC402にアミノ酸交換を含む、請求項1~96のいずれか1項に記載のワクチン。
本発明は以下の実施例および図によってさらに説明されるが、それらに限定されるわけではない。
前述の説明は、後述の実施例を参照することにより、より完全に理解されるであろう。ただし、そのような実施例は、本発明の1つまたは複数の実施形態を実践する方法の単なる例示であり、本発明の範囲の限定として読まれるべきではない。
選択されたタンパク質の組換え発現
多量のP.アクネスタンパク質を発現させ、それを、表1(AおよびB)に示されるように、対応する遺伝子のプラスミド媒介性過剰発現において大腸菌(E.coli)株BL21(DE3)を使用して精製した。Hisタグを含むタンパク質を、Ni-NTAカラムによって精製し、Hisタグを有さないタンパク質は、連続イオン交換およびサイズ排除カラムによって精製した。タンパク質は、PBSまたは同様の緩衝系に可溶であり、-80℃で凍結乾燥製造物として貯蔵した。発現されたタンパク質は、CoAにより、>90%の純度を有し、動物免疫付与のために使用した。
タンパク質を、4℃で一晩インキュベートすることにより、100μg/mlの濃度にてアルハイドロゲル(InvivoGen、vac-alu-250)において製剤化した。
マウス(BALB/C)を、アジュバントとの組み合わせにおいて、それぞれのタンパク質によって3か月以内に5回免疫付与した。マウスを、用量あたり10μgのアルハイドロゲル(登録商標)結合抗原によって免疫付与し、2つ以上の抗原の組み合わせ物の場合には、抗原あたり10μgを使用した。ウサギを、用量あたり50μgの水中油アジュバントタンパク質によって4回免疫付与した。
合計110のP.アクネス分離株を、様々な商業的および学術的供給元から得るか、またはOrigimmの臨床調査研究の過程においてヒトから単離した(表2を参照されたい)。当該株を、この研究において相対的に分析し、同じ条件下において取り扱い、増殖させた。全ての株を、ラピッドタイピングのためのマルチプレックスタッチダウンPCRによって6つのファイロタイプIA1、IA2、IB、IC、II、およびIIIにカテゴライズするか(Barnardら 2015)、またはFitz-Gibbonら, 2013のスキームに従って特異的リボタイプへと分類した(Fitz-Gibbonら 2013)。特に明記されない限り、全ての株は、Gas PakTM EZ Anaerobic Container systemシステム(BD)を使用して嫌気的に37℃でインキュベートした。実験での使用のために、それぞれの分離株を、-80℃のストックから、Hemin and Vit K(BD(商標), Cat. Nr. 25509)によってブルセラ血液寒天プレート上に画線播種(streak)し、3~5日間インキュベートして、最大14日間、2~8℃で維持した。液体培養のために、当該プレートからの細菌コロニーを、チオグリコレートブロス(BD(商標), Cat. Nr. 221788)に再懸濁させ、適切な光学濃度までインキュベートして、個々の実験のための接種物として使用した。鉄飢餓状態を模倣するために、予備培養物を0.1のOD600まで希釈し、デフェロキサミンメシレート(DMF、Sigma)を500μMの最終濃度において補い、次いで、標準的P.アクネス増殖条件下において15~20時間のインキュベーションを行った。
中間指数関数的(Mid-exponential)P.アクネス増殖培養物を、4分間の1000xgでの遠心分離処理によってペレット化し、0.5%ウシ血清アルブミン(BSA、H2B)を補った氷冷Hanks緩衝液(HBSS、Gibco)で2回洗浄した。4×106細胞/mlの細胞密度を得るために、ブロッキング剤(2%のBSA)の存在下において、最終的なペレットをHBSSに再懸濁させた。細菌(ウェルあたり2×105cfu)を、HBSS/2%のBSAにおける1/1000の最終希釈において、熱不活性化(56℃で45分)マウスまたはウサギ血清よって、30分間インキュベートした。初期インキュベーションは、96ウェルマイクロタイタープレートにおいて100μlの量で実施した。1000xgでの遠心分離後、細菌ペレットをHBSS/0.5%BSAで洗浄し、HBSS/0.5%BSAにおいて1/500に希釈した、検出抗体を含む100μlのHBSS/0.5%BSAに再懸濁させ(それぞれ、マウスまたはウサギからの一次抗体に応じて;Alexa Fluor 48のF(ab’)2-ヤギ抗マウスIgG(H+L)交差吸着された二次抗体、ThermoFisher、Cat.Nr.A11017;ヤギ抗ウサギIgGのAlexa Fluor 48のF(ab’)2断片、ThermoFisher、Cat.Nr.A11070)、当該細胞を用いて30分間インキュベートした。その後、HBSSにおいて1/500希釈した50μlのSyto60(ThermoFisher、Cat.Nr.S11342)を当該反応物に加え、続いて、細菌細胞の可視化を支援しフローサイトメトリ分析を促進するために、15分間のインキュベーションを行った。分析の前に、細菌を遠心分離し、HBSSにおいて洗浄し、2%パラホルムアルデヒド(PFA、AlfaAesar)において10分間インキュベートした。2%PFAを遠心分離処理によって除去し、固定された細菌をHBSSに再懸濁させた。P.アクネスの表面に結合した抗P.アクネス抗体の量に相関する蛍光強度を、BD Accuri C6および96ウェルプレートローダを備えるフローサイトメトリを使用して測定した。FLOWJO(登録商標)ソフトウェアを使用してデータ分析を実施し、検出抗体の中央値蛍光強度を計算した。
ヒト前骨髄球白血病細胞系(ECACC)であるHL60を、10%熱不活性化ウシ胎仔血清(FBS、Gibco)を補ったRPMI培地1640 1×+Glutamax(Gibco)において維持した。細胞を増殖させ、0,8%ジメチルホルムアミド(DMF、Sigma)を補った増殖培地において、3日かけて貪食細胞に分化させた。OPKアッセイのために、P.アクネス液体培養を中間対数増殖期へと増殖させ、細菌細胞をHBSS/0.5%BSAにおいて2回洗浄し、HBSS/2%BSAにおいて約1.5×108細胞/mlまで希釈した。次いで、当該細菌を、6.6×106細胞/mlのDMF分化HL-60細胞を用いて、RPMI1640+10%FCS+20mMグルコースにて1:400のMOIにおいて、37℃で少なくとも24時間以上、5%CO2の存在下において、気体許容密封ホイル(Aera seal)で覆ったマイクロタイタープレートにてインキュベートした。アッセイ反応物をデュプリケートにおいて調製した。熱不活性化血清試料の段階希釈を、生きたP.アクネスを用いて、食細胞の存在下においてインキュベートした。複数の反応アリコートを、食菌作用前(T=0)および貪食細胞によるインキュベーションの終了時に播種した。インキュベーション後、反応物の1:64、1:32、または1:16希釈(細菌株に応じて)の100μlを、ヘミンおよびビタミンKを補ったブルセラ血液寒天プレート上に播種した。最低70時間の37℃での当該プレートの嫌気性インキュベーションの後、プレート上のコロニーを、Colony Counter(AES Laboratories)によってカウントした。cfu/反応値の中央値を各反応から得て、OPK活性のパーセンテージを以下のように計算した:貪食細胞を用いたインキュベーション後のcfuの数を、対応するネガティブコントロール(血清以外の全てのアッセイ成分を含む反応物および/または対応する免疫前血清を含む反応物)のcfuと比較し、下記の式において使用した:100-100×(CFU免疫/CFUコントロール)。ヒトまたは抗P.アクネス抗体を含有する抗原特異的過免疫血清のオプソニン職採用傷害活性を、K50力価として表した:すなわち、この力価は、ネガティブコントロール(抗体を加えない反応または同じ希釈で試験した対応する免疫前血清)との比較において生存可能な細菌数(コロニー形成単位、cfu)の50%超の減少を示す最も高い血清希釈に対応する。結果として得られるK50力価は、評価されたタンパク質抗原に対して作製された血清のOPK活性の直接的尺度である。これは、免疫付与において細菌性抗P.アクネス抗体の生成を誘発する抗原の効力、またはヒト免疫系との相互作用の結果としてP.アクネスによって発現された天然タンパク質抗原に対してヒト宿主において生成された抗体の効力の明確な指標である。
動物を、実施例1において説明したように「動物の免疫付与」の方法に従って、抗原P022(DsA1)、P027(DsA2)、またはP028(PITP)のみを含むワクチンによって、ならびにこれらの抗原の組み合わせ物を含むワクチンによって免疫付与した。この免疫付与によって作製された抗体を、表面結合アッセイにおいて試験した(実施例1において説明したように)。
DsA1およびDsA2の断片の分析
いくつかのP022(DsA1)およびP027(DsA2)の断片ならびにP022およびP027のハイブリッド分子を作製し(表1B、図17A、図17B、図17C)、実施例1において説明されるように、動物の免疫付与(ウサギおよびマウス)のために使用した。
P022-V4をFc2上に固定し、P027-V5をFc3上に固定し、H4-V4をFc4上に固定し、ならびに、Fc1にはタンパク質を固定せず、基準フローセルとして使用した。4つ全てのフローセルを、固定化手順の後に、遊離ビチオン(free Biotin)によってブロックした。血清試料の測定の際、チップ性能およびタンパク質の完全性を制御するために、3つ全てのタンパク質に対して特異的であるマウスモノクローナル抗体を一定の間隔で注入した。P022-V2(DsA1)、P022(F4、F5、F7、F8、F9、F11-14)の断片、P027-V3(DsA2)、P027(P027F1)の断片、ハイブリッドコンストラクト(H2-H5、H4-V1)の単一タンパク質製剤のアルハイドロゲル(登録商標)製剤ならびにネガティブコントロールとしてのアジュバントアルハイドロゲル(登録商標)(PBS)に対して作製された抗体の結合レベルをキャラクタリゼーションするために、2つのパラメータを評価した:すなわち、第1に、タンパク質特異的抗体の濃度に対する半定量的尺度である反応単位(RU)において与えられた注入の終了時(会合フェーズの終了時)での結合、および、第2に、解離フェーズの際のポリクローナル抗体の親和性を反映する、結合した抗体の相対的解離速度。結合性は、反応単位において報告され、ならびに、相対的解離速度は、1:1ラングミュア解離フィッティングモデルによる別々のKdフィッティングを使用して特定され、ならびに1秒あたり(1/s)のシグナル減少において報告される。
タンパク質モデリングおよびスワップ点の特定
フォールド認識(fold-recognition)に基づく、DsA1のための可能なテンプレートとしてのS.アウレウス細胞外マトリックス結合タンパク質ebhAの認識後、初期構造モデルを作製した。第2の実施において、100のモデルを、各15ループモデル(合計1500)に対して、コンピュータシミュレーションにおいて自動的に作製した。それらのそれぞれは、局所的(または最適な)最小値を得るための新たな試みを表している。これらの中で、10の最良を、スコアリングエネルギー関数に基づいて選択し、その後に、dsspソフトウェアを使用して、各残基に対して二次構造を得た。ヘリックスバンドルに対して、リンカ(一般的に「スワップ領域」と表される)および得られた二次構造の程度を考慮した。したがって、この方法は、二次構造要素の優先性を、または、むしろ構造化されたヘリックスへの細長いコイルの変換の程度をシミュレーションするために使用した。次いで、スワップ領域を、中央コアが構造化されない、ヘリックスへと構造化する必要のない領域として定義した。したがって、これらのスワップ領域は、構造的に定義された、おそらく機能的アドヘシンドメインの間の領域であり、DsA1からDsA2へおよびその逆の切り替えは、構造的完全性を妨害すべきではない(図7B)。
EMBL-EBIから得られるClustal Omega多重配列アラインメントソフトウェアバージョン1.2.4を使用して、アミノ酸配列をアラインメントした。図12Bの調製物に対して、公開データベースにおいて利用可能な、様々なP.アクネス株から得られるタンパク質配列を手作業で選択した。
タンパク質DsA1の3ドメイン構造(図7A)を、特定の断片の始まりおよび終わり(図7B)に関していくらかの柔軟性を提供する配列エリアに基づく免疫学的研究において調べられるように、断片およびハイブリッドの設計を最適化するためのツールとして使用した。使用される「スワップ部位」、すなわち、PROT-22(DsA1)およびPROT-27(DsA2)配列領域が切り替えられる位置(タンパク質クロスオーバーのように)は、構造要素、詳細にはαヘリックス、に干渉する可能性が最小のエリアであるスワップ領域内において選択した。スワップ領域の原理および位置も、図12Aに示される。
タンパク質DsA1およびDsA2の最も重要なエピトープをさらに調査するためにDsA1およびDsA2のいくつかのハイブリッドを設計し、DsA1およびDsA2の両方に等しく良好に特異的に結合することができる抗体を誘発するため(実施例1において説明されるように)、免疫原として使用した(実施例1において説明されるように)。DsA1のタンパク質分子の中央部分およびN末端部分(アミノ酸29~145;278~333)ならびにDsA2配列の中央部分のみ(アミノ酸190~321)にほとんど制限される機能的に最も関連する領域を含む、ハイブリッドH4による免疫付与は、ELISAアッセイにおいて両方の完全長タンパク質P022(DsA1)およびP027(DsA2)に特異的に結合する能力を有する抗体を誘発した(実施例1において説明されるように)(図8)。完全長タンパク質および他の断片およびハイブリッドバージョンによる免疫付与によって誘発される抗体とは対照的に、自身たちに対して最も特異的に結合するが、第2の相同抗原にははるかに低い程度において結合する。
安定性評価のために、タンパク質試料に対して3回の凍結/解凍サイクル(FT)のような異なるストレス要因を施し、様々な温度条件:-20℃(-20)、2~8℃(+4)、室温21~24℃(RT)、および37℃(+37)、において7日間貯蔵した。それを、新たに再構成したタンパク質バッチ(T0)と比較した。当該タンパク質を、4~12%のSDS-PAGE(Bio-Rad)によって分離した。分離後、銀染色キット(Pierce)を使用して、当該タンパク質を可視化した。このキットの使用により、タンパク質は、バンドあたり0.25ng超において検出可能である。タンパク質のサイズを、標準タンパク質ゲルラダー(Thermo Scientific、26616)およびウシ血清アルブミン(200ng/ロードしたウェル)を含む試料と比較した。染色したゲルをオフィススキャナを使用してスキャンして、プロトコルに従ってさらに文書化した。
抗原P028(PITP)のみまたはハイブリッドH4のみを含むワクチンによって、ならびにP028(PITP)およびハイブリッドH4の両方の組み合わせ物を含むワクチンによって動物を免疫付与し、実施例1において説明したように「動物の免疫付与」の方法に従って、単一ワクチンへと一緒に製剤化した。この免疫付与によって作製された抗体を、表面結合アッセイにおいて試験した(実施例1の下において説明されるように)。
ヒト臨床試料
ヒト血清試料は、オーストリア(研究参照番号323423452354および倫理委員会承認EK-13-052-041(Ethikkommission der Stadt Wien))、および米国(ClinicalTrials.gov識別子:NCT04056598)において登録されたOrigimm臨床調査研究の過程において得た。全ての血清は、内部標準作業手順(internal standard operating procedures)に従って取り扱い、-80℃において小さなアリコートにおいて貯蔵し、無菌条件下において取り扱った。
全てのヒト対象は、それらの座瘡病理およびP.アクネスとの相互作用の経歴から相互依存的に、それらの血清において検出することができるP.アクネスに対する既存の抗体を含む。ヒト対象から得られる血清試料を、実施例1において説明されるように表面結合アッセイおよびOPKアッセイにおいて試験した。これらの抗体は、生きたP.アクネスによって発現される抗原を標的とし、ならびにこれらの抗原のエピトープがP.アクネス細胞表面上においてアクセス可能である場合、それらは、細菌のオプソニン職採用傷害を誘発することができ:すなわち、抗体の表面結合の増加との関連におけるOPK K50力価の著しい増加によって証明されるように、実際に、本発明によって得られるデータにより、オプソニン職採用傷害は、表面結合抗体の最も重要な機能的活性である(図13A、13B)。オプソニン職採用傷害の効率は、P.アクネスに結合する抗体の量によってだけでなく、特定のP.アクネス株によって提供される表面アクセス可能かつ免疫原性のエピトープに対して各個人において生成される抗体が標的にする抗原性エピトープのタイプによっても影響される。これらの違いは、表面結合強度と、NCTC737(ファイロタイプIA1)(図-13A)およびKPA171202(ファイロタイプIB)に対するOPK K50力価との間の相関性の直線傾向の比較において観察することができる(図13B)。
臨床調査研究(ClinicalTrials.gov識別子:NCT04056598)における過程において、中程度から重症の座瘡(IGA>2)を有する個々の対象の顔面皮膚において識別された炎症性病変(膿疱)由来の物質を単離した。皮膚表面を滅菌し、滅菌針によって座瘡(にきび面皰)を開くことにより、当該物質を無菌スワブによって採取した。DNAを当該試料から直接抽出し、SLST特異的プライマを使用したPCRに供して、公開されている方法およびそれに関連する公開データベースに従ってファイロタイプを特定した(Scholzら 2014)。
臨床調査研究(ClinicalTrials.gov識別子:NCT04056598)における過程において、中程度から重症の座瘡(IGA>2)を有する個々の対象の皮膚細孔の上部からの物質を単離した。2つの異なる場所を、各個人の顔においてサンプリングした(前頭および頬領域)。皮膚細孔試料のDNA収量を増加させるため、当該物質を、酸素の不在下において+37℃で4日間、または酸素の存在下において室温で3日間、プレート上で増殖させた。当該プレートをインキュベーションの際に解体した。総試料からDNAを抽出し、SLST特異的プライマを使用したPCRに供して、公開されている方法および関連する公開データベースに従って、ファイロタイプを特定した(Scholzら 2014)。
臨床調査研究の過程において、中程度から重症の座瘡(IGA>2)を有する対象からの血清を採取し、抗原P028(PITP)、P027(DsA2)、P022(DsA1)、およびハイブリッドタンパク質H4に対する抗体の存在について試験した。
DsA1およびDsA2の断片の分析
いくつかのP028(PITP)の断片および派生体を作製し(表1Aおよび1C)、実施例1において説明されるように動物の免疫付与(マウス)のために使用した。
H4ならびにP028(PITP)(表1C、図20B)の2つの異なる断片:P028C12(H4+P028F1)およびP028C13(H4+P028F2)を含む2つのハイブリッドを設計した。P028断片F1またはF2を、H4のC末端に融合させた。当該2つのハイブリッドに対して作製したマウス血清抗体を、免疫関連(機能的)抗体反応の誘発におけるそれらのそれぞれの交差反応性および効力を特定するために、表面結合アッセイ、OPK、およびELISAにおいて試験した。6つ全てのMLSTファイロタイプへの表面結合におけるはるかに高いレベルは、P028C13と比較して、P028C12に対して作製された血清抗体によって達成された(図21C、21D)。加えて、P028C12血清抗体の交差反応性は、表面結合の増加ならびに6つのMLSTファイロタイプに対するオプソニン食作用活性において証明されるように、P028-V7(PITP)またはH4-V3のいずれかと比較して、はるかに良好であった(図21C、22A、22B)。P028C12血清抗体における増加した交差反応性および機能性(増加したOPK活性)は、MLSTタイプIA1、IA2、IC、およびIIの株に対するP028-V7(PITP)と比較して、とりわけ重要であるが(図21C、22A、22B)、その一方で、ファイロタイプIBおよびIIIからの株に関して、P028C12は、P028-V7(PITP)に匹敵した(図21D、22A)。しかしながら、P028C13によって誘発されるマウス血清抗体は、H4-V3融合パートナと比較して、OPK活性の誘発において劣っており、それは、株IA2およびICに対してとりわけ明白であり(図22A、22B)、ならびに、表面結合において検出可能なその交差反応性の大部分は、このハイブリッドのH4部分によって誘発され(図21C)、あるいは、ハイブリッド配列の追加部分によって誘発された抗体は、PITP融合パートナのみと比較して、表面結合(図21C、21D)またはOPK活性(図22B)のいずれかにおける著しい増加をもたらし;これは、とりわけ、DsA1およびDsA2を発現しないファイロタイプIBおよびIIIに関して観察することができる(図21D、22A)。
座瘡の病因は、いくつかの要因の相互作用によって引き起こされ:皮脂分泌を増加させ、ならびに皮膚環境を変更してP.アクネス病原性に対してより貢献的にさせる、遺伝的特徴およびホルモン活性は、宿主の免疫反応の品質によって相殺されることを必要とする。局所的皮膚環境、免疫系、および、P.アクネ株のコロニー形成は、各ヒト宿主に対して独特であり、P.アクネスに対する有効なワクチンは、様々な株によってコロニー形成される宿主を保護することができるように広い交差反応性の免疫反応を誘発すること、およびP.アクネスを認識し結合することができるだけでなく、貪食細胞が細菌細胞を効率的に殺しその数を減少させるのに貢献することができるような抗体の高レベルを誘発することを必要とし、それにより、宿主細胞を損傷し炎症または感染症を永続させるためのP.アクネスの適合性および能力を減少させる。
ワクチン抗原、抗原派生体、および断片に対して作製された血清抗体によって標的にされる免疫関連エピトープを含有する配列をさらに検証および確認するために、異なる抗体およびコントロールを使用した。これらは、ポリクローナルマウス、ウサギ、およびヒト抗体あるいはアフィニティ精製された抗体試料を含んだ。P022-V3、P027-V4、またはP028-V1に対して免疫付与されたマウスからモノクローナル抗体を開発し、追加のコントロールとして使用した。
モノクローナル抗体作製のために、BALB/cマウスを、P022-V3、P027-V4、またはP028-V1によって4回免疫付与した。脾臓を無菌切除し、プールして、ホモジナイズした。脾臓細胞およびSP2/0-Ag14骨髄細胞を融合させ、ハイブリドーマの抗体分泌を、免疫付与抗原および宿主細胞タンパク質に対してELISAにおいて評価した。第2のクローニング工程の後、モノクローナル抗体を発現する安定なハイブリドーマを、さらなるキャラクタリゼーションおよびエピトープマッピング実験のために選択した。
Origimmが試料を調製し、Pepperprint社が、1つまたはそれ以上の抗原をオーバーラップペプチドへと翻訳することによる抗体および血清の高解像度エピトープマッピングのために、PEPperCHIP(登録商標) Peptide Microarrayを使用して分析を行った。抗体または血清試料ならびに適合した二次抗体を用いた、当該結果として得られるペプチドマイクロアレイのインキュベーションは、所定の試料のエピトープと相関するスポットパターンをもたらす。したがって、関心対象のタンパク質(P028-V2、P027-V4、P022-V3)は、14aaにおいて前のペプチドと重なる15aa長ペプチドへと分割され、それらの全てをチップ上にスポットし、ポジティブ(HA)およびネガティブ(ポリオ)コントロールペプチドもチップ上にスポットした。当該抗体および血清試料を用いた当該ペプチドマイクロアレイのインキュベーションを、異なる抗体濃度において、あるいは1:1000、1:100、および1:10の血清希釈において実施し、その後に、蛍光検出のために、ヤギ抗ヒトIgG(H+L) DyLight680、ヒツジ抗ウサギIgG(H+L) DyLight680、およびヤギ抗マウスIgG(H+L) DyLight680ならびにコントロール抗体(マウスモノクローナル抗HA(12CA5)DyLight800)を用いてインキュベーションを行った。結合した抗体の蛍光シグナルを、LI-COR Odyssey Imaging Systemによって読み出した。スポット強度の定量化およびペプチドアノテーションを、PepSlide(登録商標) Analyzerによって行った。様々な二次抗体およびコントロール抗体を用いるペプチドマイクロアレイコピーの事前染色を、主なアッセイを妨げる得る線形ペプチドのバックグラウンド相互作用が存在しないことを検証するための追加のコントロールとして実施した。
マウスモノクローナルおよびポリクローナル抗体、ヒトおよびウサギ血清試料のPEPperMAP(登録商標)配座エピトープマッピングを、9および13のアミノ酸のペプチド長ならびに8および12のアミノ酸のペプチド-ペプチドオーバーラップを有する環状拘束ペプチドへと翻訳された、P022-V4断片(L115-T333)、P027-V4断片(V161-E351)およびP028-V2に対して実施した。加えて、ポジティブ(HA)およびネガティブ(ポリオ)コントロールペプチドもチップ上にスポットした。配座ペプチドマイクロアレイを、0.05%Tween20および10%ロックランドブロッキング緩衝液(MB-070)を伴うインキュベーションバッファPBS(pH7.4)において、1:1000、1:500、1:200、1:100、および1:50の濃度および希釈において、抗体および血清試料と共にインキュベートし、続いて、蛍光検出のために、ヤギ抗ヒトIgG(H+L)DyLight680、ヒツジ抗ウサギIgG(H+L)DyLight680、およびヤギ抗マウスIgG(H+L)DyLight680二次抗体、ならびにコントロール抗体(マウスモノクローナル抗HA(12CA5)DyLight800)によって染色した。結合した抗体の蛍光シグナルを、LI-COR Odyssey Imaging Systemによって読み出した。スポット強度の定量化およびペプチドアノテーションを、PepSlide(登録商標)Analyzerによって行った。二次抗体およびコントロール抗体による各ペプチドマイクロアレイの2つの配座ペプチドの事前染色を、主なアッセイを妨げる得る環状拘束ペプチドとのバックグラウンド相互作用が存在しないことを検証するための追加のコントロールとして実施した。
架橋質量分析アプローチ(XL-MS)の場合、P022モノクローナル抗体が結合したエピトープの分析のために、成熟全長野生型タンパク質P22-V3を選択した。当該抗原に結合した抗体の複合体を、質量標識された化学架橋剤によって安定化した。次に、当該複合体の存在を、高質量MALDI検出を使用して確認した。架橋化学の後、Ab/Ag複合体は非常に安定であるため、多くの異なるオーバーラップペプチドを提供するために、複数の酵素(並行して利用した5つ)および分解条件を当該複合体に適用した。高解像度Orbitrap(商標)質量分析およびMS/MS技術を使用して、これらのペプチドの同定を実施した。架橋試薬に結合した質量タグを使用して、架橋ペプチドの同定を特定した。MS/MS断片化および特定の相互作用ソフトウェアを使用したデータ分析の後、同じ実験においてエピトープおよびパラトープの両方が特定される。
96ウェルマイクロタイタープレート(Nunc-Immuno、マキシソルブ)を、最適な信号対雑音比を達成するために予備実験において各抗原に対して最適化した、PBS中において0.5μg/mlから2μg/mlの間の濃度の70μlの組換えタンパク質、断片、およびハイブリッド(P022-V3、P027-V4、P022F2-F14、P027-F1およびH2-H5)によって、4℃で18±2時間かけてコーティングした。各プレートを洗浄緩衝液(0.1%のTween-20を補ったPBS)で洗浄した後、100μlのブロッキング緩衝液(2%のBSAおよび0.1%のTween-20を伴うPBS)を加え、非特異的結合を防ぐためにオービタルシェーカにおいて最低30分間インキュベートした。抗原特異的抗体力価の特定のために、熱不活性化(56℃で45分)ウサギまたはマウス血清の5倍希釈シリーズの50μlを当該コーティングされブロックされたプレートに適用し、オービタルシェーカにおいて1時間インキュベートした。次いで、当該一次抗体溶液を除去し、その後に洗浄工程を行い、その後に50μlの1/20,000希釈したホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)連結二次抗体(ペルオキシダーゼAffiniPureヤギ抗ウサギIgG、Fc断片特異的、Jackson Immuno ResearchペルオキシダーゼAffiniPureヤギ抗マウスIgG、Fc断片特異的、Jackson Immuno Research)を用いたインキュベーションを行った。プレートを洗浄した後、10分間のインキュベーションのために100μlのテトラメチルベンジジン基質(TMB、Thermo Fisher)を加えることによって、HRP活性を検出し、青い色(Amax=370nmおよび652nm)を得たが、それは、50μlの3Nの硫酸(Sigma)停止溶液を加えることで黄色(Amax=450nm)に変わる。反応を、マイクロタイタープレート光度計(Tecan Sunrise)を使用して定量化した。バックグラウンド値は、一次抗体を欠く反応を読むことによって特定した。各試験試料のIgGの量を、デュプリケートにおいて希釈シリーズによって測定し、GraphPadソフトウェアを使用することによるこれらの測定値のS字状曲線フィッティングから、EC50値を計算した。
5のアミノ酸オーバーラップを有する15量体として、P022F11配列に基づいて、13のペプチドを合成した。当該オーバーラップペプチドと、ポジティブコントロールとして使用した完全長P022F11を、ニトロセルロース膜上にスポットし、2%BSA緩衝液によってブロックし、続いて、二次ペルオキシダーゼ標識AffiniPureヤギ抗マウスIgG(H+L)(Jackson Immuno Research)によって染色し、ChemiDoc ImagerにおいてECL基質によって検出した。
上記において説明されるこれらの方法およびツールは、最も多くの免疫関連配列領域およびエピトープの確認をもたらし、それらは、本発明における定義に従って、P.アクネスの表面においてアクセス可能であり、オプソニン食作用活性を誘発する抗体によって結合され、食細胞、とりわけ、本発明において説明されるオプソニン職採用傷害アッセイに関して使用されるような顆粒球タイプ(好中球)の、より効率的な死滅能力によるP.アクネス細胞数の減少をもたらす。これらの方法は、交差反応性および交差タイプ反応性エピトープの識別も容易にし、それらは、本発明に従って、少なくとも2つ以上のファイロタイプの表面上において、ならびに同じファイロタイプ内の少なくとも2つ以上の株においてアクセス可能であり、したがって、これらのエピトープは、交差タイプ反応性P.アクネスワクチンへの封入にとって、さらに重要である。
R32~I41(最小)、M28~D44(好ましい);
T43~K51(最小)、M1[del2~27]S28~K51(好ましい)、c;
R87~K90(最小)、P86~A93(好ましい)、P86~G96(好ましい)、c;
T117~A125(最小)、T117~I132(好ましい)、c;
A144~N157(最小)、H146~A160(最小)、l/c;
A156~A170(最小);
K166~L180(最小);
A176~T190(最小);
N181~E191(最小)、c;
P186~A198(最小);
I216~F224(最小)、I216~D225(好ましい)、c;
A226~A240(最小);
P236~G250(最小)、S234~G250(好ましい)、l/c;
L246~A260(好ましい);[
I251~I263(最小)、I251~L267(好ましい)、l/c;
I264~P271(最小)、c;
R266~T277(最小);
A268~L280(最小)、l/c;
T285~D290(最小)、c;
R286~D290(最小)、c;
V289~K296(最小)、R286~K296(好ましい)、c;
V291~T300(最小)、c;
A301~E307(最小)、c;
A310~D313(最小);
A291~D313(好ましい)、c。
pH安定性は、例えば、示差走査蛍光分析(実施例のセクションを参照されたい)を使用して、プロメテウス技術(非特許文献1;非特許文献2;非特許文献3)によって特定される。示差走査蛍光分析は、熱傾斜の際または化学的変性剤の存在下においてタンパク質内部蛍光における変化を検出することによる天然および無標識条件下での熱的変性または化学変性の測定を可能にする。熱的変性の場合、折り畳み状態から非折畳み状態への転移の温度が特定される。より高い転移温度は、より高い熱的安定性に対応する。
Achermann et al., Clin. Microbiol. Rev. 27 (2014), 419-440
Achermann Y, Tran B, Kang M et al. Immunoproteomic identification of in vivo-produced Propionibacterium acnes proteins in a rabbit biofilm infection model. Clin Vaccine Immunol 2015;22:467-76.
Alexeyev OA, Zouboulis CC. Shooting at skin Propionibacterium acnes: To be or not to be on target. J Invest Dermatol 2013;133:2292-4.
Allhorn M, Arve S, Bruggemann H et al. A novel enzyme with antioxidant capacity produced by the ubiquitous skin colonizer Propionibacterium acnes. Nat Publ Gr2016:1-12; Sci. Rep. 6 (2016): 36412.
Athey et al., BMC Bioinformatics 18 (2017), 391.
Barnard E, Liu J, Yankova E et al. Strains of the Propionibacterium acnes type III lineage are associated with the skin condition progressive macular hypomelanosis. Sci Rep 2016;6:1-9.
Barnard E, Nagy I, Hunyadku rti J et al. Multiplex touchdown PCR for rapid typing of the opportunistic pathogen Propionibacterium acnes. J Clin Microbiol 2015;53:1149-55.
Bek-Thomsen M, Lomholt HB, Scavenius C et al. Proteome analysis of human sebaceous follicle infundibula extracted from healthy and acne-affected skin. PLoS One 2014;9:e107908.
Borelli et al., Acta Derm. Venerol. 86 (2006), 316-319
Bruggemann H, Henne A, Hoster F et al. The complete genome sequence of Propionibacterium acnes, a commensal of human skin. Science (80- ) 2004;305:671-3.
Bruggemann, Skin: Acne and P. acnes Genomics, in Timmis (ed.), "Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology", DOI 10.1007/978-3-540-77587-4_244; Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2010, pages 3215 to 3225
Bruggemann H. Skin: Cutibacterium (formerly Propionibacterium) acnes and Acne Vulgaris. Heal Consequences Microb Interact with Hydrocarb Oils, Lipids 2019:1-20.
Brzuszkiewicz E, Weiner J, Wollherr A et al. Comparative genomics and transcriptomics of propionibacterium acnes. PLoS One 2011;6:e21581.
Burkhart CG, Burkhart CN. Expanding the microcomedone theory and acne therapeutics: Propionibacterium acnes biofilm produces biological glue that holds corneocytes together to form plug. J Am Acad Dermatol 2007;57:722-4.
Cao et al., J. Chem. Inf. Model. 59 (2019), 1508-1514
Capoor et al., Eur. Spine J. 28 (2019), 2952-2971
Chen et al., Comput. Biol. 16 (2020), e1008543
Coenye T, Peeters E, Nelis HJ. Biofilm formation by Propionibacterium acnes is associated with increased resistance to antimicrobial agents and increased production of putative virulence factors. Res Microbiol 2007;158:386-92.
Colussi et al., Nat. 519 (2015), 110-113.
Cong et al., Arch. Dermatol. Res. 311 (2019), 337-349
Contassot E. Vaccinating against Acne: Benefits and Potential Pitfalls. 2018:1-3.
Crommelin et al., J. Phar. Sci. 110 (2021), 627-634,
Dagnelie MA, Khammari A, Dreno B et al. Cutibacterium acnes molecular typing: time to standardize the method. Clin Microbiol Infect 2018;24:1149-55.
Dekio I, Rajendram D, Morita E et al. Genetic diversity of Propionibacterium acnes strains isolated from human skin in Japan and comparison with their distribution in Europe. J Med Microbiol 2012;61:622-30.
Douglas HC, Gunter SE. The taxonomic position of Corynebacterium acnes. J Bacteriol 1946;52:15-23.
Dutra et al., Front. Pharmacol. 5 (2014), Art. 115
Eady EA, Layton AM. A distinct acne microbiome: Fact or fiction? J Invest Dermatol 2013;133:2294-5.
Engelke L, Winter G, Hook S et al. Recent insights into cutaneous immunization: How to vaccinate via the skin. Vaccine 2015;33:4663-74.
Fischer N, Mak TN, Shinohara DB et al. Deciphering the Intracellular Fate of Propionibacterium acnes in Macrophages. Biomed Res Int 2013;2013:1-11.
Fischetti VA. Streptococcal M protein: Molecular design and biological behavior. Clin Microbiol Rev 1989;2:285-314.
Fitz-Gibbon S, Tomida S, Chiu BH et al. Propionibacterium acnes strain populations in the human skin microbiome associated with acne. J Invest Dermatol 2013;133:2152-60.
Forster et al., PLoS Med 17 (2020), pmed.1003024
Gilchrist T. A bacteriological and microscopical study of over three hundred vesicular and pustular lesions of the skin, with a research upon the etiology of Acne vulgaris. Johns Hopkins Hosp Rep 1900;9:409-30.
Giuliani MM, Adu-Bobie J, Comanducci M et al. A universal vaccine for serogroup B meningococcus. Proc Natl Acad Sci U S A2006;103:10834-9.
Gordon S. Phagocytosis: An Immunobiologic Process. Immunity 2016;44:463-75.
Grange PA, Raingeaud J, Morelle W et al. Characterization of a Propionibacterium acnes Surface Protein as a Fibrinogen-Binding Protein. Sci Rep 2017;7:1-14.
Holland C, Mak TN, Zimny-Arndt U et al. Proteomic identification of secreted proteins of Propionibacterium acnes. BMC Microbiol 2010;10:230.
Holmberg A, Lood R, Morgelin M et al. Biofilm formation by Propionibacterium acnes is a characteristic of invasive isolates. Clin Microbiol Infect 2009;15:787-95.
Holtkamp et al., Blood 108 (2006), 4009-4017.
Horstick et al., NAR 43 (2015), e48.
Horwath et al., J Bacteriol. 194 (2012): 202-203.
Jahns AC, Lundskog B, Ganceviciene R et al. An increased incidence of Propionibacterium acnes biofilms in acne vulgaris: A case-control study. Br J Dermatol 2012;167:50-8.
Jalkanen et al., Semin. Cell Dev. Biol. 0 (2014), 24-32.
Keshari S, Kumar M, Balasubramaniam A et al. Prospects of acne vaccines targeting secreted virulence factors of Cutibacterium acnes. Expert Rev Vaccines 2019;18:433-7.
Kim et al., Nat. Struct. Mol. Biol. 27 (2020), 581-588.
Knittelfelder R, Riemer AB, Jensen-Jarolim E. Mimotope vaccination - From allergy to cancer. Expert Opin Biol Ther 2009;9:493-506.
Kuehnast T, Cakar F, Weinhaupl T et al. Comparative analyses of biofilm formation among different Cutibacterium acnes isolates. Int J Med Microbiol 2018;308:1027-35.
Lee, Byun, Kim. Potential Role of the Microbiome in Acne: A Comprehensive Review. J Clin Med 2019;8:987.
Liu J, Cheng A, Bangayan NJ et al. Draft genome sequences of Propionibacterium acnes type strain ATCC6919 and antibiotic-resistant strain HL411PA1. Genome Announc 2014;2:e00740-14.
Liu PF, Nakatsuji T, Zhu W et al. Passive immunoprotection targeting a secreted CAMP factor of Propionibacterium acnes as a novel immunotherapeutic for acne vulgaris. Vaccine2011;29:3230-8.
Lodes MJ, Secrist H, Benson DR et al. Variable expression of immunoreactive surface proteins of Propionibacterium acnes. Microbiology 2006;152:3667-81.
Lomholt HB, Kilian M. Population genetic analysis of Propionibacterium acnes identifies a subpopulation and epidemic clones associated with acne. PLoS One2010;5:e12277.
Loveckova Y, Havlikova I. A microbiological approach to acne vulgaris. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub 2002;146:29-32.
Macdougall IC, Rossert J, Casadevall N et al. A peptide-based erythropoietin-receptor agonist for pure red-cell aplasia. N Engl J Med 2009;361:1848-55.
Malonis et al., Chem. Rev. 120 (2020), 3210-3229
Mauger et al., PNAS 116 (2019), 24075-24083.
Mayslich et al., Microorg. 9 (2021), 303
McDowell et al., J. Clin. Microbiol. 43 (2005), 326-334
McDowell A, Barnard E, Nagy I et al. An expanded multilocus sequence typing scheme for propionibacterium acnes: Investigation of "pathogenic", "commensal" and antibiotic resistant strains. PLoS One 2012;7:e41480.
McDowell A, Gao A, Barnard E et al. A novel multilocus sequence typing scheme for the opportunistic pathogen propionibacterium acnes and characterization of type I cell surfaceassociated antigens. Microbiology 2011;157:1990-2003.
McDowell et al., BioMed Res. Int. 2015, ID 493564.
McLaughlin J, Watterson S, Layton AM et al. Propionibacterium acnes and Acne Vulgaris: New Insights from the Integration of Population Genetic, Multi-Omic, Biochemical and Host-Microbe Studies. Microorganisms2019;7:128.
Miah, Biotechnol. 1 (2002), 21-27.
Morris GE. Epitope mapping. Methods Mol Biol 2005;295:255-68.
Myszka et al., Biophys. J. 75 (1998), 583-594
Nakatsuji T, Liu YT, Huang CP et al. Vaccination targeting a surface sialidase of P. acnes: Implication for new treatment of acne vulgaris. PLoS One 2008;3:e1551.
Nicholson et al., Tr. Cell Biol. 29 (2019), 191-200.
O’Neill AM, Gallo RL. Host-microbiome interactions and recent progress into understanding the biology of acne vulgaris. Microbiome2018;6:1-16.
Pardi et al., NRDD 17 (2018), 261-279
Petronelli, Dermatology Times Feb. 2021, 22;: "Next-Gen Therapies Advance Acne Treatment".
Portillo et al., BioMed Res. Int. 2013, ID 804391.
Prausitz et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol. 333 (2009), 369-393
Sadhasivam S, Sinha M, Saini S et al. Heterogeneity and antibiotic resistance in Propionibacterium acnes isolates and its therapeutic implications: blurring the lines between commensal and pathogenic phylotypes. Dermatol Ther 2016;29:451-4.
Sayanjali et al., Int. J. Med. Microbiol. 306 (2016), 517-528
Sasaki et al., PNAS 97 (2000), 1512-1515.
Schaller et al., Br. J. Dermatol. 153 (2005), 66-71
Scholz CFP, Jensen A, Lomholt HB et al. A novel high-resolution single locus sequence typing scheme for mixed populations of Propionibacterium acnes in vivo. PLoS One 2014;9:e104199.
Shu et al., Curr. Med. Chem. 20 (2013), 562-568.
Schupp et al., BMC Pulm. Med. 15 (2015), 75
Smith GP, Petrenko VA. Phage display. Chem Rev 1997;97:391-410.
Taylor PW. Bactericidal and bacteriolytic activity of serum against gram-negative bacteria. Microbiol Rev 1983;47:46-83.
Theodorou et al., JBC 295 (2020), 5519-5532
Thess et al., Mol. Ther. 23 (2015), 1456-1464.
Tomida S, Nguyen L, Chiu B et al. Pan-Genome and Comparative Genome Analyses of. Am Soc Microbiol 2013;4:1-11.
VanBlargan LA, Goo L, Pierson TC. Deconstructing the Antiviral Neutralizing-Antibody Response: Implications for Vaccine Development and Immunity. Microbiol Mol Biol Rev 2016;80:989-1010.
Verma et al., Nat. Commun. (2019), 10-5774-s41467_019_Article_13810
Voros A, Horvath B, Hunyadkurti J et al. Complete genome sequences of three propionibacterium acnes isolates from the type ia 2 cluster. J Bacteriol 2012;194:1621-2.
Wang Y, Hata TR, Tong YL et al. The Anti-Inflammatory Activities of Propionibacterium acnes CAMP Factor-Targeted Acne Vaccines. J Invest Dermatol 2018:1-10.
Webster GF, Leyden JJ, Musson RA et al. Susceptibility of Propionibacterium acnes to killing and degradation by human neutrophils and monocytes in vitro. Infect Immun 1985;49:116-21.
Wingfield, Curr. Protoc. Protein Sci. 88 (2018), 6.14.1-6.14.3
van Westen E, Rodenburg GD, van Gils EJM et al. Levels and functionality of antibodies after pneumococcal conjugate vaccine in schedules with different timing of the booster dose. Vaccine2013;31:5834-42.
Xiao et al, Biochemistry 49 (2010), 5588-5599.
Yang et al., J. Mol. Cell Biol. 11 (2019), 911-919.
Yu Y, Champer J, Agak GW et al. Different Propionibacterium acnes Phylotypes Induce Distinct Immune Responses and Express Unique Surface and Secreted Proteomes. J Invest Dermatol2016;136:2221-8.
Yu Y, Champer J, Kim J. Analysis of the surface, secreted, and intracellular proteome of Propionibacterium acnes. EuPA Open Proteomics 2015;9:1-7.
Zaenglein AL, Pathy AL, Schlosser BJ et al. Guidelines of care for the management of acne vulgaris. J Am Acad Dermatol 2016;74:945-73.e33.
Zaluga E. Skin reactions to antigens of propionibacterium acnes in patients with acne vulgaris treated with autovaccine. Ann Acad Medicae Stetin (Ann Acad Med Stetin) 1998;44:65-85.
Zhang et al., Front. Immunol. 10 (2019), 594.
Zouboulis CC, Dessinioti C, Tsatsou F et al. Anti-acne drugs in phase 1 and 2 clinical trials. Expert Opin Investig Drugs 2017;26:813-23.
Uniprot Q6A5X9(配列番号64)
MLSLLRRLLR WSDQSQQSPP PPPPQAEASS NRPRSVAQAA IATDGKGIID KDCRDAVIND AKLRAAIAGA LVKAGFSSAD AVALAPRIAK EMAKEGVLLI NHHKLKALIG AQLGLLTDAK IQRAAAAVDL GIKATLAATI IPNALHSAAF KDAVVANLVA AGVDKKLAKA TAVAIAATAL NPALGPIAKT EAIKAEIAAQ AALLVGRGVH LKKAAIEHII GRSFDAAVAT AIVSSPILNA RIVTHLVRAG IDKSLAVQIA PRIIDRLAKE PLLALNTAKL MKNITRQIVD VITADKAIKT AEQLEKELPA LDDLVKKACS CPKPTPTPTP TPTPTPKPTP TPTPKPTPTP KPKPTPAPAP TSGATSDEST SRSGGHSQGG SGTHYIHHGV APVLTHSSDL PSTGF
Uniprot Q6A5P9(配列番号65)
MIIFVRVGNR HMRKRRAVLV VAFQLVNRRL AITKFPTPRR NDASNKNHCG SCDSNCLNRL TISYHPLPAN AASNGNSSIT QSAAFSPRAT TKISEDCRKA IINDLKLRGA IVGALVKAGL SAADAAALAP RIAAEMAAEG TLTINHHRLK VLVASQLGLV ADAAVQHAAA AIDLSFKAIL GASIIPNALG SAAFKNAVIA NLVAAGIDKH LARATAVAIV ATALNPALGP IAKFELIKAE IAAQAALLIR RGVHLQKAAI EHVIGRAFDA AVATAIISSP ILSARIVTHL VRAGIDKSIA ISLAPHIVKR LAKEPLLAFN TAKLVKDIAR QIVDIRNTQE AIAVYKQLKA ELPTLDGLVQ KACTPEPTPT PTPTPTPTPT PAPTPTPAPT PTPAPTPAPT PTPAPTPTPT PTPTPTPTPT HGATTTTPIS RTTDRHNLGS HHTRIAAPAL IHAKALPATG TGA
Uniprot Q6A9N1(配列番号66)
MTTSAMRKIV ASVLGAILAL TGVLITPAAW AAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPKTPIAPS KQPSKQAAPS KQVKPSKQAG PNKQSTTPQQ KTAEHRSQTP AAHRTMTKQV CTIGASKVTS GSLTWGIRTS FTSYLRGPIA NGSWKLSGGA NWNGSAFTFP LTSGSFDPAT KSGSLKYSGS VHMTGHHGIL DMTLAEPSLQ IKGSTGHLYL DVKSSSMDGK KTNYGRVDFA TFGVSVSGNA AIKGSPVKLT ATGAKAFAGF YRAGEPMNPL STNLTLSAEK VCHNVTVDAV TGKVIGDDSG KGAGRGLPVT GAEGPSSDEI DLGIVGGLAL TAVVSTVVVC RRYAARI
P002(配列番号1)
MHAVEPTTTI SATSTHELSA SDARNSIQLL NAHIATLQSV QKSVPGSDYS DQIRDLLKAA
FDLRGLIETL AHGGIPFYDP STIMPRIKLV ATTIDTIHTA TTTLQNKVRP AHVELGLEVT
KAVLLTANPA STAKELDAEG AALKARLEKV SQYPDLTPND VATVYVRTNF SKTIWQVRAN
RDRYILGHKS AAVYKTLNHA ITKAVGVRLN PKTTVGNIQA ARTELLAAYQ TAFNSPDVKK
AAHHHHHH
P005(配列番号2)
MTVKVGINGF GRIGRNFFRA LAEQGADLEV VAVNDLTDTK TLAHLLKYDS IMGRFSGEVS
YDDDSITVDG KTIKVLAERN PADLPWKELG AEIVVESTGL FTDGEKAKAH FEAGAKKVII
SAPGKNVDGT FVMGVNDGDY DNAKHNIISN ASCTTNCLAP LAKVLNDAFG IERGIMTTVH
AYTGDQRLQD APHKDLRRAR AAALNMIPTK TGAAQAVALV LPELKGKFDG LAVRVPTPTG
SLTDLTFQTS KETTVEEVQA AVKKAAEGPL KGILAYTEDP IVSKDIEGDP HSSIFDATET
KAIGNLVKVL SWYDNEWGYS NRLVDLTKLV ASKLAHHHHH H
P018(配列番号3)
MSSELVDTTE MYLRTFYELL EEGVELRRAR IVERLHQSGP TVSQTVARME RDGLVVVESD
RSISLTQEGH DVAQTVMRKH RLAECLLTQI IGLRPDLVHD EACRWEHVIS GEVEKRLTGL
LENPDVSPYG CPLPPEQAGC RPDGSARFRD DSKPLDEVIA ETGCPVSVTV TRLSEFFQAT
EGNLADVYAA GLLPGKSVEV DDDADGIRLT GPSGSIVVDP EILSGLFVAQ NSHHHHHH
P022(配列番号4)
MHHHHHHLSL LRRLLRWSDQ SQQSPPPPPP QAEASSNRPR SVAQAAIATD GKGIIDKDCR
DAVINDAKLR AAIAGALVKA GFSSADAVAL APRIAKEMAK EGVLLINHHK LKALIGAQLG
LLTDAKIQRA AAAVDLGIKA TLAATIIPNA LHSAAFKDAV VANLVAAGVD KKLAKATAVA
IAATALNPAL GPIAKTEAIK AEIAAQAALL VGRGVHLKKA AIEHIIGRSF DAAVATAIVS
SPILNARIVT HLVRAGIDKS LAVQIAPRII DRLAKEPLLA LNTAKLMKNI TRQIVDVITA
DKAIKTAEQL EKELPALDDL VKKACSCPKP TPTPTPTPTP TPKPTPTPTP KPTPTPKPKP
TPAPAPTSGA TSDESTSRSG GHSQGGSGTH YIHHGVAPVL THSSDLPSTG F
P022-V1(配列番号5)
MHHHHHHDSQ IRGEAMRRSR IAVAAATATA LVGSIAAITP SPQAEASSNR PRSVAQAAIA
TDGKGIINKD CRDAVINDAK LRAAIAGALV KAGFSSADAV ALAPRIAREM AKEGVLLINH
HKLKALIGAQ VGLLTDAKIQ RAAAAVDLGI KATLAATIIP NALHSAAFKD AVVANLVAAG
VDKKLAKATA VAIAATALNP ALGPIAKTEA IKAEIGAQAA LLVSRGVHLK KAAIEHIIGR
SFDAAVATAI VSSPILNARI VTHLVRAGID KSLAVQIAPR IIDRLAKEPL LALNTAKLMK
NITRQIVDVI TADKAIKTAE QLEKELPALD DLVKKACSCP KPTPTPTPTP TPTPTPKPTP
TPTPTPTPTP KPKPTPAPAP TSGATSDEST SRSGGHSQGG SGTHYIHHGV APVLTHSSDL
PSTGF
P022-V2(配列番号6)
MHHHHHHSSN RPRSVAQAAI ATDGKGIIDK DCRDAVINDA KLRAAIAGAL VKAGFSSADA
VALAPRIAKE MAKEGVLLIN HHKLKALIGA QLGLLTDAKI QRAAAAVDLG IKATLAATII
PNALHSAAFK DAVVANLVAA GVDKKLAKAT AVAIAATALN PALGPIAKTE AIKAEIAAQA
ALLVGRGVHL KKAAIEHIIG RSFDAAVATA IVSSPILNAR IVTHLVRAGI DKSLAVQIAP
RIIDRLAKEP LLALNTAKLM KNITRQIVDV ITADKAIKTA EQLEKELPAL DDLVKKACSC
PKPTPTPTPT PTPTPKPTPT PTPKPTPTPK PKPTPAPAPT SGATSDESTS RSGGHSQGGS
GTHYIHHGVA PVLTHSSDLP STGF
P022-V3(配列番号7)
MSSNRPRSVA QAAIATDGKG IIDKDCRDAV INDAKLRAAI AGALVKAGFS SADAVALAPR
IAKEMAKEGV LLINHHKLKA LIGAQLGLLT DAKIQRAAAA VDLGIKATLA ATIIPNALHS
AAFKDAVVAN LVAAGVDKKL AKATAVAIAA TALNPALGPI AKTEAIKAEI AAQAALLVGR
GVHLKKAAIE HIIGRSFDAA VATAIVSSPI LNARIVTHLV RAGIDKSLAV QIAPRIIDRL
AKEPLLALNT AKLMKNITRQ IVDVITADKA IKTAEQLEKE LPALDDLVKK ACSCPKPTPT
PTPTPTPTPK PTPTPTPKPT PTPKPKPTPA PAPTSGATSD ESTSRSGGHS QGGSGTHYIH
HGVAPVLTHS SDLPSTGF
P027(配列番号8)
MITKFPTPRR NDASNKNHCG SCDSNCLNRL TISYHPLPAN AASNGNSSIT QSAAFSPRAT
TKISEDCRKA IINDLKLRGA IVGALVKAGL SAADAAALAP RIAAEMAAEG TLTINHHRLK
VLVASQLGLV ADAAVQHAAA AIDLSFKAIL GASIIPNALG SAAFKNAVIA NLVAAGIDKH
LARATAVAIV ATALNPALGP IAKFELIKAE IAAQAALLIR RGVHLQKAAI EHVIGRAFDA
AVATAIISSP ILSARIVTHL VRAGIDKSIA ISLAPHIVKR LAKEPLLAFN TAKLVKDIAR
QIVDIRNTQE AIAVYKQLKA ELPTLDGLVQ KACTPEPTPT PTPTPTPTPT PAPTPTPAPT
PTPAPTPAPT PTPAPTPTPT PTPTPTPTPT HGATTTTPIS RTTDRHNLGS HHTRIAAPAL
IHAKALPATG TGAHHHHHH
P027-V1(配列番号9)
MIIFVRVGNR HMRKRRAVLV VAFQLVNRRL AITKFPTPRR NDASNKNHCG SCDSNCLNRL
TISYHPLPAN AASNGNSSIT QSAAFSPRAT TKISEDCRKA IINDLKLRGA IVGALVKAGL
SAADAAALAP RIAAEMAAEG TLTINHHRLK VLVASQLGLV ADAAVQHAAA AIDLSFKAIL
GASIIPNALG SAAFKNAVIA NLVAAGIDKH LARATAVAIV ATALNPALGP IAKFELIKAE
IAAQAALLIR RGVHLQKAAI EHVIGRAFDA AVATAIISSP ILSARIVTHL VRAGIDKSIA
ISLAPHIVKR LAKEPLLAFN TAKLVKDIAR QIVDIRNTQE AIAVYKQLKA ELPTLDGLVQ
KACTPEPTPT PTPTPTPTPT PAPTPTPAPT PTPAPTPAPT PTPAPTPTPT PTPTPTPTPT
HGATTTTPIS RTTDRHNLGS HHTRIAAPAL IHAKALPATG TGAHHHHHH
P027-V2(配列番号10)
MHHHHHHLSP SFQPLGETMR RTRITVAAVT ATALIGSLSA ITPLPANAAS NGNSSITQSA
AFSPRATTKI SEDCRKAIIN DLKLRGAIVG ALVKAGLSAA DAAALAPRIA AEMAAEGTLT
INHHRLKVLV ASQLGLVADA AVQHAAAAID LSFKAILGAS IIPNALGSAA FKNAVIANLV
AAGIDKHLAR ATAVAIVATA LNPALGPIAK FELIKAEIAA QAALLIRRGV HLQKAAIEHV
IGRAFDAAVA TAIISSPILS ARIVTHLVRA GIDKSIAISL APHIVKRLAK EPLLAFNTAK
LVKDIARQIV DIRNTQEAIA VYKQLKAELP TLDGLVQKAC TPEPTPTPTP TPTPTPTPTP
TPTPTPTPTP TPTPTPAPTP APTPAPTPTP TPTPAPTPTP TPTPTPTPTP TPTPTPTPTH
GATTTTPISR TTDRHNLGSH HTRIAAPALI HAKALPATGT GA
P027-V3(配列番号11)
MHHHHHHASN GNSSITQSAA FSPRATTKIS EDCRKAIIND LKLRGAIVGA LVKAGLSAAD
AAALAPRIAA EMAAEGTLTI NHHRLKVLVA SQLGLVADAA VQHAAAAIDL SFKAILGASI
IPNALGSAAF KNAVIANLVA AGIDKHLARA TAVAIVATAL NPALGPIAKF ELIKAEIAAQ
AALLIRRGVH LQKAAIEHVI GRAFDAAVAT AIISSPILSA RIVTHLVRAG IDKSIAISLA
PHIVKRLAKE PLLAFNTAKL VKDIARQIVD IRNTQEAIAV YKQLKAELPT LDGLVQKACT
PEPTPTPTPT PTPTPTPAPT PTPAPTPTPA PTPAPTPTPA PTPTPTPTPT PTPTPTHGAT
TTTPISRTTD RHNLGSHHTR IAAPALIHAK ALPATGTGA
P027-V4(配列番号12)
MASNGNSSIT QSAAFSPRAT TKISEDCRKA IINDLKLRGA IVGALVKAGL SAADAAALAP
RIAAEMAAEG TLTINHHRLK VLVASQLGLV ADAAVQHAAA AIDLSFKAIL GASIIPNALG
SAAFKNAVIA NLVAAGIDKH LARATAVAIV ATALNPALGP IAKFELIKAE IAAQAALLIR
RGVHLQKAAI EHVIGRAFDA AVATAIISSP ILSARIVTHL VRAGIDKSIA ISLAPHIVKR
LAKEPLLAFN TAKLVKDIAR QIVDIRNTQE AIAVYKQLKA ELPTLDGLVQ KACTPEPTPT
PTPTPTPTPT PAPTPTPAPT PTPAPTPAPT PTPAPTPTPT PTPTPTPTPT HGATTTTPIS
RTTDRHNLGS HHTRIAAPAL IHAKALPATG TGA
P028(配列番号13)
MHHHHHHAGP TVTVIPVGRE GGDITISGKG FSTTGFGVYV AVAPASVPEF YGNSDKFYGY
DPSKDTTESP STIWVYTPSQ KAIGSRFAQG RPMNNDGSFT ITMKAPPFEQ GKDFVVLTTK
AHGVGKTDHS DDTRTPVTYR EATPAPTGPK TPIAPSKQPS KQAAPSKQVK PSKQAGPNKQ
STTPQQKTAE HRSQTPAAHR TMTKQVCTIG ASKVTSGSLT WGIRTSFTSY LRGPIANGSW
KLSGGANWNG SAFTFPLTSG SFDPATKSGS LKYSGSVHMT GHHGILDMTL AEPSLQIKGS
TGHLYLDVKS SSMDGKKTNY GRVDFATFGV SVSGNAAIKG SPVKLTATGA KAFAGFYRAG
EPMNPLSTNL TLSAEKVCHN VTVDAVTGKV IGDDSGKGAG RGLPVTGAEG PSSDEIDLGI
VGGLALTAVV STVVVCRRYA ARI
P028-V1(配列番号14)
MAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT
TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK
TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPKTPIAPS KQPSKQAAPS KQVKPSKQAG PNKQSTTPQQ
KTAEHRSQTP AAHRTMTKQV CTIGASKVTS GSLTWGIRTS FTSYLRGPIA NGSWKLSGGA
NWNGSAFTFP LTSGSFDPAT KSGSLKYSGS VHMTGHHGIL DMTLAEPSLQ IKGSTGHLYL
DVKSSSMDGK KTNYGRVDFA TFGVSVSGNA AIKGSPVKLT ATGAKAFAGF YRAGEPMNPL
STNLTLSAEK VCHNVTVDAV TGKVIGDDSG KGAGRGLPVT
P028-V2(配列番号15)
MAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT
TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK
TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPKTPIAPS KQPSKQAAPS KQVKPSKQAG PNKQSTTPQQ
KTAEHRSQTP AAHRTMTKQV CTIGASKVTS GSLTWGIRTS FTSYLRGPIA NGSWKLSGGA
NWNGSAFTFP LTSGSFDPAT KSGSLKYSGS VHMTGHHGIL DMTLAEPSLQ IKGSTGHLYL
DVKSSSMDGK KTNYGRVDFA TFGVSVSGNA AIKGSPVKLT ATGAKAFAGF YRAGEPMNPL
STNLTLSAEK VCHNVTVDAV TGKVIGDDSG KGAGRGLPVT GAEGPSSDEI DLGIVGGLAL
TAVVSTVVVC RRYAARI
P028-V3(配列番号16)
MAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT
TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK
TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPSGSLTWG IRTSFTSYLR GPIANGSWKL SGGANWNGSA
FTFPLTSGSF DPATKSGSLK YSGSVHMTGH HGILDMTLAE PSLQIKGSTG HLYLDVKSSS MDGKKTNYGR VDFATFGVSV SGNAAIKGSP VKLTATGAKA FAGFYRAGEP MNPLS
P028-V4(配列番号17)
MAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT
TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK
TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPKTPIAPS KQPSKQAAPS KQVKPSKQAG PNKQSTTPQQ
KTAEHRSQTP AAHRTMTKQV CTIGASKVTS GSLTWGIRTS FTSYLRGPIA NGSWKLSGGA NWNGSAFTFP LTSGSFDPAT KSGSLKYSGS VHMTGHHGIL DMTLAEPSLQ IKGSTGHLYL DVKSSSMDGK KTNYGRVDFA TFGVSVSGNA AIKGSPVKLT ATGAKAFAGF YRAGEPMNPL
S
P028-V5(配列番号18)
MAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPKTPIAPS KQPSKQAAPS KQVKPSKQAG PNKQSTTPQQ KTAEHRSQTP AAHRTMTKQV STIGASKVTS GSLTWGIRTS FTSYLRGPIA NGSWKLSGGA NWNGSAFTFP LTSGSFDPAT KSGSLKYSGS VHMTGHHGIL DMTLAEPSLQ IKGSTGHLYL DVKSSSMDGK KTNYGRVDFA TFGVSVSGNA AIKGSPVKLT ATGAKAFAGF YRAGEPMNPL STNLTLSAEK VCHNVTVDAV TGKVIGDDSG KGAGRGLPVT
P028-V6(配列番号19)
MAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPKTPIAPS KQPSKQAAPS KQVKPSKQAG PNKQSTTPQQ KTAEHRSQTP AAHRTMTKQV CTIGASKVTS GSLTWGIRTS FTSYLRGPIA NGSWKLSGGA NWNGSAFTFP LTSGSFDPAT KSGSLKYSGS VHMTGHHGIL DMTLAEPSLQ IKGSTGHLYL DVKSSSMDGK KTNYGRVDFA TFGVSVSGNA AIKGSPVKLT ATGAKAFAGF YRAGEPMNPL STNLTLSAEK VSHNVTVDAV TGKVIGDDSG KGAGRGLPVT
P028-V7(配列番号20)
MAGPTVTVIP VGREGGDITI SGKGFSTTGF GVYVAVAPAS VPEFYGNSDK FYGYDPSKDT TESPSTIWVY TPSQKAIGSR FAQGRPMNND GSFTITMKAP PFEQGKDFVV LTTKAHGVGK TDHSDDTRTP VTYREATPAP TGPKTPIAPS KQPSKQAAPS KQVKPSKQAG PNKQSTTPQQ KTAEHRSQTP AAHRTMTKQV STIGASKVTS GSLTWGIRTS FTSYLRGPIA NGSWKLSGGA NWNGSAFTFP LTSGSFDPAT KSGSLKYSGS VHMTGHHGIL DMTLAEPSLQ IKGSTGHLYL DVKSSSMDGK KTNYGRVDFA TFGVSVSGNA AIKGSPVKLT ATGAKAFAGF YRAGEPMNPL STNLTLSAEK VSHNVTVDAV TGKVIGDDSG KGAGRGLPVT
P032(配列番号21)
MAKVRVYELA KELGLSSKQL LGKLNDMGEF VRSASSTIEA PVVRRLRDQI GSAEPADDAK
AAKPAARKSQ TSSKKTSKET TTAKPAPGPK PGPGPKPTPG PRPGSSSGPK PGRSSAARTS
ATPRPGLIKS SGASSQQEPP AAKPESKPTP KPGQNVPKPH APAPKPKPGA PSKSPKPGAR
PGPRPGGSAG LPSAARPGPR PGAGRRTGAP RPGNNPFASS QGMGQSRHRS EGGQRSGGSR
SGQGERMPRP GGSQGSRGGS GMPRPNPAMM PKHQSSQIGQ ATTGRGGRGG GRGRGGSRGS
GFGGGFGGGP RGPIGGGRGG RGGRGTQGAF GRGGGGRRGR KSRKQRRQEF DEMQAPLVGG
VRVRKGNGET VRLRRGASLT DLAEKINAEP AQLVQVLFNL GEMVTATQSV SDDTLEILGG
ELNYQIQVVS PEDEDRELLE SFDLEFGEDE GDDSDLVARP PVVTVMGHVD HGKTKLLDAL
RHTDVVKGEA GGITQAIGAY QVQTEVDDAE RAITFIDTPG HEAFTAMRAR GAQSTDIAVL
VVAADDGVMP QTVEALNHAK AADVPIVVAV NKIDKPEADP DKVRGQLTEY GLVPEEYGGD
TMFVNVSART HEGLDDLLEA IVLTADAALD LRANPDMAAQ GVAIEAHLDK GRGPVATALI
QRGTLHIGDS IVAGSSYGRV RAMINDQGES VDEAAPATPV QVLGLTSVPG AGDNFLVVDD
DRKARQIAEK REARMRAAQQ ARSSRRKTLD QLFEQLEKGE TEELLLILKG DGAGSVEALE
DALAKIDVGD EVDLRVIDRG VGAITETNVS LAAASNAVIV GFNVRPTAHA QRMADEENVD
IRYYSVIYDA IDEIEAALRG MLKPIYEEKA MGTAEIRQIF RSSKVGTIAG CMITDGTIRR
HAKARLVRDG VVVQETEINT LQREKDAVTE VREGYECGLT LTNYSDIHVG DEVQCYEMVE
KPRDHHHHHH
P035(配列番号22)
MTQTPVKIAV TGAAGQICYS LLFRIASGSL LGDTPIELRL LEITPALKAL EGVVMELDDC
AFGNLVNIEI GDDPKKVFDG VNAAFLVGAM PRKAGMERSD LLTKNGAIFA AQGKALNDVA
ADDVRVLVTG NPANTNALIA ATNAVDIPNN HFAALTRLDH NRAKTQLARK TGKTVNDVRH
MTIWGNHSST QYPDVFHAEV AGQKATNLVN EAWIENEFIP TVAKRGAAII DARGASSAAS
AANATVECMR DWMGSTPEGD WVSMAIPSDG SYGVPEGLIS SFPVTITNGK VEIVQGLDID
DFSRAKIDAS AKELADERDA VKELGLIHHH HHH
P042(配列番号23)
MHHHHHHDAV NEIHAKAGDQ ASVSLTAYAD SPFYKKLPSY VSDSLRDGLF YYTGYYLEDG
AAAGLANLTA LHPTDTQDNS HTLDGDPVLA YCIEKNSLQE RYHQDTGTLT KWSELKPHYN
DNLTNALPKI GWIAKNGYPS KALDELEKQA NAANGNDDAT GSDHRDAVTA TQAAIWHFSD
DFTLKSDDIT EYENGRLISV PDSAKKHISS LYNYLIKKAV PVSDPLDSTS DARGTSDFAG
AALSFEAGQR GHQDRIIVPI QPISPAPTPT PTPTPTPTPT PTPTPTPTPT PTPTPTPTPT
VDVKVTTTAD QTAEVGKPFG DTAHITGTVP EGAHITFKLS HKGLLPNMCG DSVITTKPVA
VPAGNHIQPI DIASPKVTVG QAGTYYWVET LTDSNGKVLA QGKCGEHAET TTVTAPVVPT
PTPTMIPVGP SHPGLMPHTG V
P046(配列番号24)
MHHHHHHTNT STNAGTTLKR TVALAAAASL AVMGTIAEEA HAAPAGNLGA HAEKAPTQHT
KKAPAEQAKR ATTYTARFAL TRVHLNVRSG HSTEYRRYGL LRPGDKLLII GEDVRGWTPV
NYRGKTAWVA TRYITKMNRP VGIYAQRGDH NARSKAVQRD LSTLNYFPAK WVGLPYGPIT
TNAVKVFQRA NALKQTGVTD AVTLGLLKSK ADYQRAAAAE KSSTYKHAEH HSEHSSSTSR
STARPARNTS PDVSTSGIAG SCQASFYDDS QTASGESFSS SALTAASKTY SFGTRLKVTN
KANGQSVVVR VNDRGPYVSG RCLDLSSAAF SRISSLSAGV ADVTYAKVS
P068(配列番号25)
MHHHHHHATP IDESQLPVGP QVSVTDSAQH TGPFAASSPL TITVKPGAPC VRADGYQESM
VTRVLDDKGH QVWTGTFDES KLIGGTGLGT ATFHVGSPAA AFNFHGSERT TYRTLSYCAY
PHYVNGTRER LSQVSVKTFM VDPALN
P069(配列番号26)
MHHHHHHKNT GRDSAADGKT TVKIGTTEAA NDYWNVIKKK AAAEGINIDV VSFNDYTQPN
VALSQGQIDL NAFQHLLFLA DYDVKNNDNI TALAATYVVP LNIYSKKYQR LSQLPAGATI
AIPNDATNQG RALLVLQEAG LLKLRGNGSA LSTPADVIAN QSKVKVKAID AAQTAASLEG
VDGAVVNNNF ATDAGLDRNK VLYHDDATGK SADPYLNIIA VKDADKDNPT YQKVAQLWSD
PDVTKAIIKQ SGGTAKIVSG HSKADLDKIL SGLTTDIKKS NS
P070(配列番号27)
MHHHHHHSAS VTAATTMTSR TASAVRTLDL TKTYGSGTTL VRALRSVTLD IPSGRFTAIM
GASGSGKSTL LHCITGLDSS TSGRVWIGDT EITHLDDDAL TKLRRQHVGF VFQSFNLMPT
LSAADNITLP LRLSHTKVDK EWFDHITGML GITERLGHKP SQMSGGQQQR VAVARALVTR
PDVIVADEPT GALDSEASGD LLTFLRHCVD DLGQTVVMVT HDHDAAARAD DIVTVTDGQV
STARSQEALA
P071(配列番号28)
MHHHHHHDQP DADQSQRQVA LGAMQWTINS HFLNALKMMM HGSWSTSSGA SWNGKAFSFP
VSKGSLSSTA QKADVKYSGS VHFTGVGGRM DLTLADPEIV VNNGDDHVIM SVKSKTMVGQ
SVDYGRITFV DMTGSITQGQ NDAAQVVGTN VKLNSQAVDA FAGFYQAGKP MDDIDSSLKL
GPQSSRPEPT VTPKPSVTPK PSVKPKPTVA PKPSVKPKPR VSPKPSAKPK PTVAPKPDQS
TIMAPQSDAA TEAAAGEAPS AGAHKIIRKQ VCTVVPGASR ATSPTSTPAK VGKGSMNWGV
STSFVNALKG PMQGKWTMSG GASADGTRFN FPFSGGNYDR ATKTGNLNFS GGVHFTGVHG
LLDLSLSDPS LSLKNGKGVM KLTLNAGGMA PFKGRVDFAN VSVVPSGSGF TATSVVLTGN
GVQVWNGFYK KGHSMDNFSV SLGDKSDSAS AAKQNSASLV KKSAASPTKR ECHDVLVDAK
TGQIISGSNG SLPNTGV
P022F1(配列番号29)
MHHHHHHLSL LRRLLRWSDQ SQQSPPPPPP QAEASSNRPR SVAQAAIATD GKGIIDKDCR
DAVINDAKLR AAIAGALVKA GFSSADAVAL APRIAKEMAK EGVLLINHHK LKALIGAQLG
LLTDAKIQRA AAAVDLGIKA TLAATIIP
P022F2(配列番号30)
MHHHHHHGVL LINHHKLKAL IGAQLGLLTD AKIQRAAAAV DLGIKATLAA TIIPNALHSA
AFKDAVVANL VAAGVDKKLA KATAVAIAAT ALNPALGPIA KTEAIKAEIA AQAALLVGRG
VHLKKAAIEH IIGRSFDAAV ATAIVSSP
P022F3(配列番号31)
MHHHHHHGVH LKKAAIEHII GRSFDAAVAT AIVSSPILNA RIVTHLVRAG IDKSLAVQIA
PRIIDRLAKE PLLALNTAKL MKNITRQIVD VITADKAIKT AEQLEKELPA LDDLVKKACS
CPKPTPTPTP TPTPTPKPTP TPTPKPTPTP KPKPTPAPAP TSG
P022F4(配列番号32)
MHHHHHHPLL ALNTAKLMKN ITRQIVDVIT ADKAIKTAEQ LEKELPALDD LVKKACSCPK
PTPTPTPTPT PTPKPTPTPT PKPTPTPKPK PTPAPAPTSG ATSDESTSRS GGHSQGGSGT
HYIHHGVAPV LTHSSDLPST GF
P022F5(配列番号33)
MHHHHHHLSL LRRLLRWSDQ SQQSPPPPPP QAEASSNRPR SVAQAAIATD GKGIIDKDCR
DAVINDAKLR AAIAGALVKA GFSSADAVAL APRIAKEMAK EGVLLINHHK LKALIGAQLG
LLTDAKIQRA AAAVDLGIKA TLAATIIPNA LHSAAFKDAV VANLVAAGVD KKLAKATAVA
IAATALNPAL GPIAKTEAIK AEIAAQAALL VGRGVHLKKA AIEHIIGRSF DAAVATAIVS
SP
P022F6(配列番号34)
MHHHHHHLSL LRRLLRWSDQ SQQSPPPPPP QAEASSNRPR SVAQAAIATD GKGIIDKDCR
DAVINDAKLR AAIAGALVKA GFSSADAVAL APRIAKEMAK EGVLLINHHK LKALIGAQLG
LLTDAKIQRA AAAVDLGIKA TLAATIIPNA LHSAAFKDAV VANLVAAGVD KKLAKATAVA
IAATALNPAL GPIAKTEAIK AEIAAQAALL VGRGVHLKKA AIEHIIGRSF DAAVATAIVS
SPILNARIVT HLVRAGIDKS LAVQIAPRII DRLAKEPLLA LNTAKLMKNI TRQIVDVITA
DKAIKTAEQL EKELPALDDL VKKACSCPKP TPTPTPTPTP TPKPTPTPTP KPTPTPKPKP
TPAPAPTSG
P022F7(配列番号35)
MHHHHHHGVL LINHHKLKAL IGAQLGLLTD AKIQRAAAAV DLGIKATLAA TIIPNALHSA
AFKDAVVANL VAAGVDKKLA KATAVAIAAT ALNPALGPIA KTEAIKAEIA AQAALLVGRG
VHLKKAAIEH IIGRSFDAAV ATAIVSSPIL NARIVTHLVR AGIDKSLAVQ IAPRIIDRLA
KEPLLALNTA KLMKNITRQI VDVITADKAI KTAEQLEKEL PALDDLVKKA CSCPKPTPTP
TPTPTPTPKP TPTPTPKPTP TPKPKPTPAP APTSGATSDE STSRSGGHSQ GGSGTHYIHH
GVAPVLTHSS DLPSTGF
P022F8(配列番号36)
MHHHHHHPPQ AEASSNRPRS VAQAAIATDG KGIIDKDCRD AVINDAKLRA AIAGALVKAG
FSSADAVALA PRIAKEMAKE GVLLINHHKL KALIGAQLGL LTDAKIQRAA AAVDLGIKAT
LAATIIPNAL HSAAFKDAVV ANLVAAGVDK KLAKATAVAI AATALNPALG PIAKTEAIKA
EIAAQAALLV GRGVHLKKAA IEHIIGRSFD AAVATAIVSS PILNARIVTH LVRAGIDKSL
AVQIAPRIID RLAKEPLLAL NTAKLMKNIT RQIVDVITAD KAIKTAEQLE KELPALDDLV
KKACS
P022F9(配列番号37)
MHHHHHHSSN RPRSVAQAAI ATDGKGIIDK DCRDAVINDA KLRAAIAGAL VKAGFSSADA
VALAPRIAKE MAKEGVLLIN HHKLKALIGA QLGLLTDAKI QRAAAAVDLG IKATLAATII
PNALHSAAFK DAVVANLVAA GVDKKLAKAT AVAIAATALN PALGPIAKTE AIKAEIAAQA
ALLVGRGVHL KKAAIEHIIG RSFDAAVATA IVSSPILNAR IVTHLVRAGI DKSLAVQIAP
RIIDRLAKEP LLALNTAKLM KNITRQIVDV ITADKAIKTA EQLEKELPAL DDLVKKACSC
PKPTPTPTPT PT
P022F10(配列番号38)
MHHHHHHSSN RPRSVAQAAI ATDGKGIIDK DCRDAVINDA KLRAAIAGAL VKAGFSSADA
VALAPRIAKE MAKEGVLLIN HHKLKALIGA QLGLLTDAKI QRAAAAVDLG IKATLAATII
PNAL
P022F11(配列番号39)
MHHHHHHSAA FKDAVVANLV AAGVDKKLAK ATAVAIAATA LNPALGPIAK TEAIKAEIAA
QAALLVGRGV HLKKAAIEHI IGRSFDAAVA TAIVSSPILN ARIVTHLVRA GIDKSLAVQI
APRIIDRLAK EPLLALNT
P022F12(配列番号40)
MHHHHHHKAE IAAQAALLVG RGVHLKKAAI EHIIGRSFDA AVATAIVSSP ILNARIVTHL
VRAGIDKSLA VQIAPRIIDR LAKEPLLALN TAKLMKNITR QIVDVITADK AIKTAEQLEK
ELPALDDLVK KACSCPKPTP TPTPTPTPTP KPTPTPTPKP TPTPKPKPTP APAPTSG
P022F13(配列番号41)
MHHHHHHKAE IAAQAALLVG RGVHLKKAAI EHIIGRSFDA AVATAIVSSP ILNARIVTHL
VRAGIDKSLA VQIAPRIIDR LAKEPLLALN TAKLMKNITR QIVDVITADK AIKTAEQLEK
ELPALDDLVK KACSCPKPTP TPTPTPTPTP KPTPTPTPKP TPTPKPKPTP APAPTSGATS
DESTSRSGGH SQGGSGTHYI HHGVAPVLTH SSDLPSTGF
P022F14(配列番号42)
MHHHHHHSSN RPRSVAQAAI ATDGKGIIDK DCRDAVINDA KLRAAIAGAL VKAGFSSADA
VALAPRIAKE MAKEGVLLIN HHKLKALIGA QLGLLTDAKI QRAAAAVDLG IKATLAATII
PNALHSAAFK DAVVANLVAA GVDKKLAKAT AVAIAATALN PALGPIAKTE AIKAEIAAQA
ALLVGRGVHL KKAAIEHIIG RSFDAAVATA IVSSPILNAR IVTHLVRAGI DKSLAVQIAP
RIIDRLAKEP LLALNTAKLM KNITRQIVDV ITADKAIKTA EQLEKELPAL DDLVKKACS
P027F1(配列番号43)
MHHHHHHGSA AFKNAVIANL VAAGIDKHLA RATAVAIVAT ALNPALGPIA KFELIKAEIA
AQAALLIRRG VHLQKAAIEH VIGRAFDAAV ATAIISSPIL SARIVTHLVR AGIDKSIAIS
LAPHIVKRLA KEPLLAFNT
H2(配列番号44)
MHHHHHHSAA FKDAVVANLV AAGVDKKLAK ATAVAIAATA LNPALGPIAK TEAIKAEIAA
QAALLVGRGV HLKKAAIEHI IGRSFDAAVA TAIVSSPILN ARIVTHLVRA GIDKSLAVQI
APRIIDRLAK EPLLALNTNA LGSAAFKNAV IANLVAAGID KHLARATAVA IVATALNPAL
GPIAKFELIK AEIAAQAALL IRRGVHLQKA AIEHVIGRAF DAAVATAIIS SPILSARIVT
HLVRAGIDKS IAISLAPHIV KRLAKEPLLA FNT
H3(配列番号45)
MHHHHHHSSN RPRSVAQAAI ATDGKGIIDK DCRDAVINDA KLRAAIAGAL VKAGFSSADA
VALAPRIAKE MAKEGVLLIN HHKLKALIGA QLGLLTDAKI QRAAAAVDLG IKATLAATII
PNALASNGNS SITQSAAFSP RATTKISEDC RKAIINDLKL RGAIVGALVK AGLSAADAAA
LAPRIAAEMA AEGTLTINHH RLKVLVASQL GLVADAAVQH AAAAIDLSFK AILGASIIPN
AL
H4(配列番号46)
MHHHHHHSSN RPRSVAQAAI ATDGKGIIDK DCRDAVINDA KLRAAIAGAL VKAGFSSADA
VALAPRIAKE MAKEGVLLIN HHKLKALIGA QLGLLTDAKI QRAAAAVDLG IKATLAATII
PNALGSAAFK NAVIANLVAA GIDKHLARAT AVAIVATALN PALGPIAKFE LIKAEIAAQA
ALLIRRGVHL QKAAIEHVIG RAFDAAVATA IISSPILSAR IVTHLVRAGI DKSIAISLAP
HIVKRLAKEP LLAFNTAKLM KNITRQIVDV ITADKAIKTA EQLEKELPAL DDLVKKACSC
PKPTPTPTPT PT
H4-V1(配列番号47)
MSSNRPRSVA QAAIATDGKG IIDKDCRDAV INDAKLRAAI AGALVKAGFS SADAVALAPR
IAKEMAKEGV LLINHHKLKA LIGAQLGLLT DAKIQRAAAA VDLGIKATLA ATIIPNALGS
AAFKNAVIAN LVAAGIDKHL ARATAVAIVA TALNPALGPI AKFELIKAEI AAQAALLIRR
GVHLQKAAIE HVIGRAFDAA VATAIISSPI LSARIVTHLV RAGIDKSIAI SLAPHIVKRL
AKEPLLAFNT AKLMKNITRQ IVDVITADKA IKTAEQLEKE LPALDDLVKK ACSCPKPTPT
PTPTPT
H4-V2(配列番号48)
MSSNRPRSVA QAAIATDGKG IIDKDSRDAV INDAKLRAAI AGALVKAGFS SADAVALAPR IAKEMAKEGV LLINHHKLKA LIGAQLGLLT DAKIQRAAAA VDLGIKATLA ATIIPNALGS AAFKNAVIAN LVAAGIDKHL ARATAVAIVA TALNPALGPI AKFELIKAEI AAQAALLIRR GVHLQKAAIE HVIGRAFDAA VATAIISSPI LSARIVTHLV RAGIDKSIAI SLAPHIVKRL AKEPLLAFNT AKLMKNITRQ IVDVITADKA IKTAEQLEKE LPALDDLVKK ACSCPKPTPT
PTPTPT
H4-V3(配列番号49)
MSSNRPRSVA QAAIATDGKG IIDKDSRDAV INDAKLRAAI AGALVKAGFS SADAVALAPR IAKEMAKEGV LLINHHKLKA LIGAQLGLLT DAKIQRAAAA VDLGIKATLA ATIIPNALGS AAFKNAVIAN LVAAGIDKHL ARATAVAIVA TALNPALGPI AKFELIKAEI AAQAALLIRR GVHLQKAAIE HVIGRAFDAA VATAIISSPI LSARIVTHLV RAGIDKSIAI SLAPHIVKRL AKEPLLAFNT AKLMKNITRQ IVDVITADKA IKTAEQLEKE LPALDDLVKK ASSPPKPTPT
PTPTPT
H5(配列番号50)
MHHHHHHGSA AFKNAVIANL VAAGIDKHLA RATAVAIVAT ALNPALGPIA KFELIKAEIA
AQAALLIRRG VHLQKAAIEH VIGRAFDAAV ATAIISSPIL SARIVTHLVR AGIDKSIAIS
LAPHIVKRLA KEPLLAFNTA KLMKNITRQI VDVITADKAI KTAEQLEKEL PALDDLVKKA
CSCPKPTPTP TPTPT
PRO-H4-V3ヒトコドンバイアス(配列番号67)
ATGAGCAGCAACAGACCCAGAAGCGTGGCCCAGGCCGCCATCGCCACCGACGGCAAGGGC
ATCATCGACAAGGACAGCAGAGACGCCGTGATCAACGACGCCAAGCTGAGAGCCGCCATC
GCCGGCGCCCTGGTGAAGGCCGGCTTCAGCAGCGCCGACGCCGTGGCCCTGGCCCCCAGA
ATCGCCAAGGAGATGGCCAAGGAGGGCGTGCTGCTGATCAACCACCACAAGCTGAAGGCC
CTGATCGGCGCCCAGCTGGGCCTGCTGACCGACGCCAAGATCCAGAGAGCCGCCGCCGCC
GTGGACCTGGGCATCAAGGCCACCCTGGCCGCCACCATCATCCCCAACGCCCTGGGCAGC
GCCGCCTTCAAGAACGCCGTGATCGCCAACCTGGTGGCCGCCGGCATCGACAAGCACCTG
GCCAGAGCCACCGCCGTGGCCATCGTGGCCACCGCCCTGAACCCCGCCCTGGGCCCCATC
GCCAAGTTCGAGCTGATCAAGGCCGAGATCGCCGCCCAGGCCGCCCTGCTGATCAGAAGA
GGCGTGCACCTGCAGAAGGCCGCCATCGAGCACGTGATCGGCAGAGCCTTCGACGCCGCC
GTGGCCACCGCCATCATCAGCAGCCCCATCCTGAGCGCCAGAATCGTGACCCACCTGGTG
AGAGCCGGCATCGACAAGAGCATCGCCATCAGCCTGGCCCCCCACATCGTGAAGAGACTG
GCCAAGGAGCCCCTGCTGGCCTTCAACACCGCCAAGCTGATGAAGAACATCACCAGACAG
ATCGTGGACGTGATCACCGCCGACAAGGCCATCAAGACCGCCGAGCAGCTGGAGAAGGAG
CTGCCCGCCCTGGACGACCTGGTGAAGAAGGCCAGCAGCCCCCCCAAGCCCACCCCCACC
CCCACCCCCACCCCCACC
PRO-H4-V3高-GC+ヒトコドンバイアス(配列番号68)
ATGAGCAGCAACCGGCCCCGGAGCGTGGCCCAGGCCGCCATCGCCACCGACGGCAAGGGC
ATCATCGACAAGGACAGCCGGGACGCCGTGATCAACGACGCCAAGCTGCGGGCCGCCATC
GCCGGCGCCCTGGTGAAGGCCGGCTTCAGCAGCGCCGACGCCGTGGCCCTGGCCCCCCGG
ATCGCCAAGGAGATGGCCAAGGAGGGCGTGCTGCTGATCAACCACCACAAGCTGAAGGCC
CTGATCGGCGCCCAGCTGGGCCTGCTGACCGACGCCAAGATCCAGCGGGCCGCCGCCGCC
GTGGACCTGGGCATCAAGGCCACCCTGGCCGCCACCATCATCCCCAACGCCCTGGGCAGC
GCCGCCTTCAAGAACGCCGTGATCGCCAACCTGGTGGCCGCCGGCATCGACAAGCACCTG
GCCCGGGCCACCGCCGTGGCCATCGTGGCCACCGCCCTGAACCCCGCCCTGGGCCCCATC
GCCAAGTTCGAGCTGATCAAGGCCGAGATCGCCGCCCAGGCCGCCCTGCTGATCCGGCGG
GGCGTGCACCTGCAGAAGGCCGCCATCGAGCACGTGATCGGCCGGGCCTTCGACGCCGCC
GTGGCCACCGCCATCATCAGCAGCCCCATCCTGAGCGCCCGGATCGTGACCCACCTGGTG
CGGGCCGGCATCGACAAGAGCATCGCCATCAGCCTGGCCCCCCACATCGTGAAGCGGCTG
GCCAAGGAGCCCCTGCTGGCCTTCAACACCGCCAAGCTGATGAAGAACATCACCCGGCAG
ATCGTGGACGTGATCACCGCCGACAAGGCCATCAAGACCGCCGAGCAGCTGGAGAAGGAG
CTGCCCGCCCTGGACGACCTGGTGAAGAAGGCCAGCAGCCCCCCCAAGCCCACCCCCACC
CCCACCCCCACCCCCACC
PRO-028-V7ヒトコドンバイアス(配列番号69)
ATGGCCGGCCCCACCGTGACCGTGATCCCCGTGGGCAGAGAGGGCGGCGACATCACCATC
AGCGGCAAGGGCTTCAGCACCACCGGCTTCGGCGTGTACGTGGCCGTGGCCCCCGCCAGC
GTGCCCGAGTTCTACGGCAACAGCGACAAGTTCTACGGCTACGACCCCAGCAAGGACACC
ACCGAGAGCCCCAGCACCATCTGGGTGTACACCCCCAGCCAGAAGGCCATCGGCAGCAGA
TTCGCCCAGGGCAGACCCATGAACAACGACGGCAGCTTCACCATCACCATGAAGGCCCCC
CCCTTCGAGCAGGGCAAGGACTTCGTGGTGCTGACCACCAAGGCCCACGGCGTGGGCAAG
ACCGACCACAGCGACGACACCAGAACCCCCGTGACCTACAGAGAGGCCACCCCCGCCCCC
ACCGGCCCCAAGACCCCCATCGCCCCCAGCAAGCAGCCCAGCAAGCAGGCCGCCCCCAGC
AAGCAGGTGAAGCCCAGCAAGCAGGCCGGCCCCAACAAGCAGAGCACCACCCCCCAGCAG
AAGACCGCCGAGCACAGAAGCCAGACCCCCGCCGCCCACAGAACCATGACCAAGCAGGTG
AGCACCATCGGCGCCAGCAAGGTGACCAGCGGCAGCCTGACCTGGGGCATCAGAACCAGC
TTCACCAGCTACCTGAGAGGCCCCATCGCCAACGGCAGCTGGAAGCTGAGCGGCGGCGCC
AACTGGAACGGCAGCGCCTTCACCTTCCCCCTGACCAGCGGCAGCTTCGACCCCGCCACC
AAGAGCGGCAGCCTGAAGTACAGCGGCAGCGTGCACATGACCGGCCACCACGGCATCCTG
GACATGACCCTGGCCGAGCCCAGCCTGCAGATCAAGGGCAGCACCGGCCACCTGTACCTG
GACGTGAAGAGCAGCAGCATGGACGGCAAGAAGACCAACTACGGCAGAGTGGACTTCGCC
ACCTTCGGCGTGAGCGTGAGCGGCAACGCCGCCATCAAGGGCAGCCCCGTGAAGCTGACC
GCCACCGGCGCCAAGGCCTTCGCCGGCTTCTACAGAGCCGGCGAGCCCATGAACCCCCTG
AGCACCAACCTGACCCTGAGCGCCGAGAAGGTGAGCCACAACGTGACCGTGGACGCCGTG
ACCGGCAAGGTGATCGGCGACGACAGCGGCAAGGGCGCCGGCAGAGGCCTGCCCGTGACC
PRO-028-V7高-GC+ヒトコドンバイアス(配列番号70)
ATGGCCGGCCCCACCGTGACCGTGATCCCCGTGGGCCGGGAGGGCGGCGACATCACCATC
AGCGGCAAGGGCTTCAGCACCACCGGCTTCGGCGTGTACGTGGCCGTGGCCCCCGCCAGC
GTGCCCGAGTTCTACGGCAACAGCGACAAGTTCTACGGCTACGACCCCAGCAAGGACACC
ACCGAGAGCCCCAGCACCATCTGGGTGTACACCCCCAGCCAGAAGGCCATCGGCAGCCGG
TTCGCCCAGGGCCGGCCCATGAACAACGACGGCAGCTTCACCATCACCATGAAGGCCCCC
CCCTTCGAGCAGGGCAAGGACTTCGTGGTGCTGACCACCAAGGCCCACGGCGTGGGCAAG
ACCGACCACAGCGACGACACCCGGACCCCCGTGACCTACCGGGAGGCCACCCCCGCCCCC
ACCGGCCCCAAGACCCCCATCGCCCCCAGCAAGCAGCCCAGCAAGCAGGCCGCCCCCAGC
AAGCAGGTGAAGCCCAGCAAGCAGGCCGGCCCCAACAAGCAGAGCACCACCCCCCAGCAG
AAGACCGCCGAGCACCGGAGCCAGACCCCCGCCGCCCACCGGACCATGACCAAGCAGGTG
AGCACCATCGGCGCCAGCAAGGTGACCAGCGGCAGCCTGACCTGGGGCATCCGGACCAGC
TTCACCAGCTACCTGCGGGGCCCCATCGCCAACGGCAGCTGGAAGCTGAGCGGCGGCGCC
AACTGGAACGGCAGCGCCTTCACCTTCCCCCTGACCAGCGGCAGCTTCGACCCCGCCACC
AAGAGCGGCAGCCTGAAGTACAGCGGCAGCGTGCACATGACCGGCCACCACGGCATCCTG
GACATGACCCTGGCCGAGCCCAGCCTGCAGATCAAGGGCAGCACCGGCCACCTGTACCTG
GACGTGAAGAGCAGCAGCATGGACGGCAAGAAGACCAACTACGGCCGGGTGGACTTCGCC
ACCTTCGGCGTGAGCGTGAGCGGCAACGCCGCCATCAAGGGCAGCCCCGTGAAGCTGACC
GCCACCGGCGCCAAGGCCTTCGCCGGCTTCTACCGGGCCGGCGAGCCCATGAACCCCCTG
AGCACCAACCTGACCCTGAGCGCCGAGAAGGTGAGCCACAACGTGACCGTGGACGCCGTG
ACCGGCAAGGTGATCGGCGACGACAGCGGCAAGGGCGCCGGCCGGGGCCTGCCCGTGACC
PRO-H4-V3 ORI000137ランク_頻度(配列番号71)
ATGAGCAGCAACCGGCCCCGGAGCGTGGCCCAGGCCGCCATCGCCACCGACGGCAAGGGC
ATCATCGACAAGGACAGCCGGGACGCCGTGATCAACGACGCCAAGCTGCGGGCCGCCATC
GCCGGCGCCCTGGTGAAGGCCGGCTTCAGCAGCGCCGACGCCGTGGCCCTGGCCCCCCGG
ATCGCCAAGGAGATGGCCAAGGAGGGCGTGCTGCTGATCAACCACCACAAGCTGAAGGCC
CTGATCGGCGCCCAGCTGGGCCTGCTGACCGACGCCAAGATCCAGCGGGCCGCCGCCGCC
GTGGACCTGGGCATCAAGGCCACCCTGGCCGCCACCATCATCCCCAACGCCCTGGGCAGC
GCCGCCTTCAAGAACGCCGTGATCGCCAACCTGGTGGCCGCCGGCATCGACAAGCACCTG
GCCCGGGCCACCGCCGTGGCCATCGTGGCCACCGCCCTGAACCCCGCCCTGGGCCCCATC
GCCAAGTTCGAGCTGATCAAGGCCGAGATCGCCGCCCAGGCCGCCCTGCTGATCCGGCGG
GGCGTGCACCTGCAGAAGGCCGCCATCGAGCACGTGATCGGCCGGGCCTTCGACGCCGCC
GTGGCCACCGCCATCATCAGCAGCCCCATCCTGAGCGCCCGGATCGTGACCCACCTGGTG
CGGGCCGGCATCGACAAGAGCATCGCCATCAGCCTGGCCCCCCACATCGTGAAGCGGCTG
GCCAAGGAGCCCCTGCTGGCCTTCAACACCGCCAAGCTGATGAAGAACATCACCCGGCAG
ATCGTGGACGTGATCACCGCCGACAAGGCCATCAAGACCGCCGAGCAGCTGGAGAAGGAG
CTGCCCGCCCTGGACGACCTGGTGAAGAAGGCCAGCAGCCCCCCCAAGCCCACCCCCACC
CCCACCCCCACCCCCACC
PRO-028-V7 ORI000135ランク_頻度(配列番号72)
ATGGCCGGCCCCACCGTGACCGTGATCCCCGTGGGCCGGGAGGGCGGCGACATCACCATC
AGCGGCAAGGGCTTCAGCACCACCGGCTTCGGCGTGTACGTGGCCGTGGCCCCCGCCAGC
GTGCCCGAGTTCTACGGCAACAGCGACAAGTTCTACGGCTACGACCCCAGCAAGGACACC
ACCGAGAGCCCCAGCACCATCTGGGTGTACACCCCCAGCCAGAAGGCCATCGGCAGCCGG
TTCGCCCAGGGCCGGCCCATGAACAACGACGGCAGCTTCACCATCACCATGAAGGCCCCC
CCCTTCGAGCAGGGCAAGGACTTCGTGGTGCTGACCACCAAGGCCCACGGCGTGGGCAAG
ACCGACCACAGCGACGACACCCGGACCCCCGTGACCTACCGGGAGGCCACCCCCGCCCCC
ACCGGCCCCAAGACCCCCATCGCCCCCAGCAAGCAGCCCAGCAAGCAGGCCGCCCCCAGC
AAGCAGGTGAAGCCCAGCAAGCAGGCCGGCCCCAACAAGCAGAGCACCACCCCCCAGCAG
AAGACCGCCGAGCACCGGAGCCAGACCCCCGCCGCCCACCGGACCATGACCAAGCAGGTG
AGCACCATCGGCGCCAGCAAGGTGACCAGCGGCAGCCTGACCTGGGGCATCCGGACCAGC
TTCACCAGCTACCTGCGGGGCCCCATCGCCAACGGCAGCTGGAAGCTGAGCGGCGGCGCC
AACTGGAACGGCAGCGCCTTCACCTTCCCCCTGACCAGCGGCAGCTTCGACCCCGCCACC
AAGAGCGGCAGCCTGAAGTACAGCGGCAGCGTGCACATGACCGGCCACCACGGCATCCTG
GACATGACCCTGGCCGAGCCCAGCCTGCAGATCAAGGGCAGCACCGGCCACCTGTACCTG
GACGTGAAGAGCAGCAGCATGGACGGCAAGAAGACCAACTACGGCCGGGTGGACTTCGCC
ACCTTCGGCGTGAGCGTGAGCGGCAACGCCGCCATCAAGGGCAGCCCCGTGAAGCTGACC
GCCACCGGCGCCAAGGCCTTCGCCGGCTTCTACCGGGCCGGCGAGCCCATGAACCCCCTG
AGCACCAACCTGACCCTGAGCGCCGAGAAGGTGAGCCACAACGTGACCGTGGACGCCGTG
ACCGGCAAGGTGATCGGCGACGACAGCGGCAAGGGCGCCGGCCGGGGCCTGCCCGTGACC
PRO-H4-V3 ORI000137二コドン(bicodon)_最適化(配列番号73)
ATGAGCAGCAACCGGCCCCGCTCTGTGGCCCAGGCCGCCATCGCCACAGATGGCAAGGGC
ATCATCGACAAGGACAGCAGAGATGCTGTGATCAATGATGCCAAGCTGCGGGCTGCCATC
GCCGGGGCCCTGGTGAAGGCCGGCTTCAGCTCTGCTGATGCTGTGGCCCTGGCCCCCCGC
ATCGCCAAGGAGATGGCCAAGGAGGGCGTGCTGCTCATCAACCACCACAAGCTGAAGGCC
CTGATTGGGGCCCAGCTGGGCCTGCTGACAGATGCCAAGATCCAGCGGGCTGCTGCTGCT
GTGGACCTGGGCATCAAGGCCACCCTGGCCGCCACCATCATCCCCAATGCCCTGGGCTCT
GCTGCCTTCAAGAATGCCGTCATCGCCAACCTGGTGGCCGCCGGCATCGACAAGCACCTG
GCCCGGGCCACAGCTGTGGCCATCGTGGCCACCGCCCTGAACCCTGCCCTGGGCCCCATC
GCCAAGTTTGAGCTGATCAAGGCCGAGATTGCTGCCCAGGCCGCCCTGCTCATCCGCCGG
GGCGTGCACCTGCAGAAGGCTGCCATCGAGCACGTGATTGGCCGGGCCTTTGATGCTGCT
GTGGCCACCGCCATCATCAGCAGCCCCATCCTGTCTGCCCGCATCGTGACCCACCTGGTG
CGGGCCGGCATCGACAAGAGCATCGCCATCAGCCTGGCCCCCCACATCGTGAAGCGGCTG
GCCAAGGAGCCCCTGCTGGCCTTCAACACAGCCAAGCTGATGAAGAACATCACCCGGCAG
ATCGTGGATGTGATCACCGCTGACAAGGCCATCAAGACAGCTGAGCAGCTGGAGAAGGAG
CTGCCTGCCCTGGATGACCTGGTGAAGAAGGCCAGCAGCCCCCCCAAGCCCACCCCCACC
CCCACCCCCACCCCCACC
PRO-028-V7 ORI000135二コドン_最適化(配列番号74)
ATGGCCGGCCCCACTGTGACTGTCATCCCTGTGGGCCGGGAGGGCGGGGACATCACCATC
AGCGGCAAGGGCTTCAGCACCACCGGCTTTGGCGTGTATGTGGCTGTGGCCCCAGCCAGC
GTGCCTGAGTTCTACGGCAACAGTGACAAGTTCTACGGCTATGACCCCAGCAAGGACACC
ACCGAGAGCCCCAGCACCATCTGGGTGTACACCCCCAGCCAGAAGGCCATCGGCAGCCGC
TTTGCCCAGGGCCGGCCCATGAACAATGATGGCTCCTTCACCATCACCATGAAGGCCCCC
CCATTTGAGCAGGGCAAGGACTTCGTGGTGCTGACCACCAAGGCCCACGGCGTGGGCAAG
ACAGACCACAGTGATGACACCCGCACCCCTGTGACCTACCGGGAGGCCACCCCAGCCCCC
ACTGGCCCCAAGACCCCCATCGCCCCCAGCAAGCAGCCCAGCAAGCAGGCCGCCCCCAGC
AAGCAGGTGAAGCCCAGCAAGCAGGCCGGCCCCAACAAGCAGAGCACCACCCCCCAGCAG
AAGACAGCTGAGCACCGCAGCCAGACCCCAGCTGCCCACCGCACCATGACCAAGCAGGTG
TCCACCATCGGGGCCAGCAAGGTGACCAGCGGCAGCCTGACCTGGGGCATCCGCACCTCC
TTCACCAGCTACCTGCGGGGCCCCATCGCCAACGGCTCCTGGAAGCTGTCTGGAGGGGCC
AACTGGAATGGCAGCGCCTTCACCTTCCCCCTGACCAGCGGCAGCTTTGACCCAGCCACC
AAGAGCGGCAGCCTGAAGTACAGCGGCTCTGTGCACATGACTGGCCACCACGGCATCCTG
GACATGACCCTGGCCGAGCCCAGCCTGCAGATCAAGGGCAGCACCGGCCACCTGTACCTG
GATGTGAAGAGCAGCTCCATGGATGGCAAGAAGACCAACTACGGCCGGGTGGACTTTGCC
ACCTTCGGGGTGTCTGTGTCTGGAAATGCCGCCATCAAGGGCAGCCCTGTGAAGCTGACA
GCCACCGGGGCCAAGGCCTTTGCTGGCTTCTACAGAGCTGGGGAGCCCATGAACCCCCTG
AGCACCAACCTGACCCTGTCTGCTGAGAAGGTGTCCCACAACGTGACTGTGGATGCTGTG
ACTGGCAAGGTGATTGGAGATGATTCTGGCAAGGGGGCCGGCCGGGGCCTGCCTGTGACC
PRO-H4-V3 ORI000137二コドン_最適化ハイブリッドモデル(配列番号75)
ATGAGCTCCAACCGCCCCCGCTCCGTGGCCCAGGCCGCCATCGCCACAGATGGCAAGGGC
ATCATCGACAAGGACAGCAGAGATGCTGTGATCAATGATGCCAAGCTGCGGGCTGCCATC
GCCGGGGCCCTGGTGAAGGCCGGCTTCAGCTCTGCTGATGCTGTGGCCCTGGCCCCCCGC
ATCGCCAAGGAGATGGCCAAGGAGGGCGTGCTGCTCATCAACCACCACAAGCTGAAGGCC
CTGATTGGGGCCCAGCTGGGCCTGCTGACAGATGCCAAGATCCAGCGGGCTGCTGCTGCT
GTGGACCTGGGCATCAAGGCCACCCTGGCCGCCACCATCATCCCCAATGCCCTGGGCTCT
GCTGCCTTCAAGAATGCCGTCATCGCCAACCTGGTGGCCGCCGGCATCGACAAGCACCTG
GCCCGGGCCACAGCTGTGGCCATCGTGGCCACCGCCCTGAACCCTGCCCTGGGCCCCATC
GCCAAGTTTGAGCTGATCAAGGCCGAGATTGCTGCCCAGGCCGCCCTGCTCATCCGCCGG
GGCGTGCACCTGCAGAAGGCTGCCATCGAGCACGTGATTGGCCGGGCCTTTGATGCTGCT
GTGGCCACCGCCATCATCAGCAGCCCCATCCTGTCTGCCCGCATCGTGACCCACCTGGTG
CGGGCCGGCATCGACAAGAGCATCGCCATCAGCCTGGCCCCCCACATCGTGAAGCGGCTG
GCCAAGGAGCCCCTGCTGGCCTTCAACACAGCCAAGCTGATGAAGAACATCACCCGGCAG
ATCGTGGATGTGATCACCGCTGACAAGGCCATCAAGACAGCTGAGCAGCTGGAGAAGGAG
CTGCCTGCCCTGGATGACCTGGTGAAGAAGGCCAGCAGCCCCCCCAAGCCCACCCCCACC
CCCACCCCCACCCCCACC
PRO-028-V7 ORI000135二コドン_最適化ハイブリッドモデル(配列番号76)
ATGGCCGGGCCCACCGTGACCGTGATCCCAGTGGGCCGGGAGGGCGGCGACATCACCATC
AGCGGCAAGGGCTTCAGCACCACCGGCTTTGGCGTGTATGTGGCTGTGGCCCCAGCCAGC
GTGCCTGAGTTCTACGGCAACAGTGACAAGTTCTACGGCTATGACCCCAGCAAGGACACC
ACCGAGAGCCCCAGCACCATCTGGGTGTACACCCCCAGCCAGAAGGCCATCGGCAGCCGC
TTTGCCCAGGGCCGGCCCATGAACAATGATGGCTCCTTCACCATCACCATGAAGGCCCCC
CCATTTGAGCAGGGCAAGGACTTCGTGGTGCTGACCACCAAGGCCCACGGCGTGGGCAAG
ACAGACCACAGTGATGACACCCGCACCCCTGTGACCTACCGGGAGGCCACCCCAGCCCCC
ACTGGCCCCAAGACCCCCATCGCCCCCAGCAAGCAGCCCAGCAAGCAGGCCGCCCCCAGC
AAGCAGGTGAAGCCCAGCAAGCAGGCCGGCCCCAACAAGCAGAGCACCACCCCCCAGCAG
AAGACAGCTGAGCACCGCAGCCAGACCCCAGCTGCCCACCGCACCATGACCAAGCAGGTG
TCCACCATCGGGGCCAGCAAGGTGACCAGCGGCAGCCTGACCTGGGGCATCCGCACCTCC
TTCACCAGCTACCTGCGGGGCCCCATCGCCAACGGCTCCTGGAAGCTGTCTGGAGGGGCC
AACTGGAATGGCAGCGCCTTCACCTTCCCCCTGACCAGCGGCAGCTTTGACCCAGCCACC
AAGAGCGGCAGCCTGAAGTACAGCGGCTCTGTGCACATGACTGGCCACCACGGCATCCTG
GACATGACCCTGGCCGAGCCCAGCCTGCAGATCAAGGGCAGCACCGGCCACCTGTACCTG
GATGTGAAGAGCAGCTCCATGGATGGCAAGAAGACCAACTACGGCCGGGTGGACTTTGCC
ACCTTCGGGGTGTCTGTGTCTGGAAATGCCGCCATCAAGGGCAGCCCTGTGAAGCTGACA
GCCACCGGGGCCAAGGCCTTTGCTGGCTTCTACAGAGCTGGGGAGCCCATGAACCCCCTG
AGCACCAACCTGACCCTGTCTGCTGAGAAGGTGTCCCACAACGTGACTGTGGATGCTGTG
ACTGGCAAGGTGATTGGAGATGATTCTGGCAAGGGGGCCGGCCGGGGCCTGCCTGTGACC
Claims (32)
- P.アクネス(P.acnes)関連感染症の処置または防止において使用するためのワクチンを生成する方法であって、
-少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含む少なくとも1つの抗原を選択することを含み、P.アクネスエピトープは、生存P.アクネス細菌によって提示される場合にヒト血清抗体に直接到達可能であるエピトープであり、ヒト免疫系によるエピトープの特異的結合は、細菌数、フィットネス、増殖、病原性またはそれらの組合せの低減、特に、細菌数の低減につながり、
免疫系による、特に、ヒト免疫系によるエピトープの結合は、フローサイトメトリーアッセイを使用することによって、好ましくは蛍光活性化セルソーティング(FACS)アッセイによって証明され;
細菌数、フィットネス、増殖、病原性またはそれらの組合せの低減は、少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含む少なくとも1つの抗原に対して特異的な抗体の存在下でのオプソニン食作用傷害アッセイ(OPK)によって証明される、前記方法。 - P.アクネス関連感染症の処置または防止において使用するためのワクチンを生成する方法であって、
-少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含む少なくとも1つの抗原を選択することを含み、P.アクネスエピトープは、生存P.アクネス細菌によって提示される場合にヒト血清抗体に直接到達可能であるエピトープであり、ヒト免疫系によるエピトープの特異的結合は、細菌数、フィットネス、増殖、病原性またはそれらの組合せの低減、特に、細菌数の低減につながり、
免疫系による、特に、ヒト免疫系によるエピトープの結合は、フローサイトメトリーアッセイを使用して、好ましくは蛍光活性化セルソーティング(FACS)アッセイによって、P.アクネス細菌への抗体結合によって、およびフローサイトメトリーアッセイにおける生存P.アクネス細菌への抗原特異的抗体の結合によって証明され;
細菌数、フィットネス、増殖、病原性またはそれらの組合せの低減は、オプソニン食作用傷害アッセイ(OPK)によって証明され、前記OPKアッセイは、少なくとも1/200の補体不活化血清希釈で出発して、少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含む少なくとも1つの抗原に対して特異的なポリクローナルヒト抗体、またはこのような抗体を含有するヒト血清もしくは抗原誘導ポリクローナル抗体血清の少なくとも2つの連続2倍希釈を使用する、5%CO2の存在下での37℃での少なくとも24時間またはそれより長いインキュベーション後に、K50力価決定のためのオプソニン食作用傷害アッセイにおいて使用される、少なくとも2倍高い希釈における陰性対照と比較して、反応試料における細菌細胞数の少なくとも50%より多い低減を示す、前記方法。 - OPKアッセイが、
- 抗生物質化合物の存在および/もしくは添加なしに、ならびに/または
- 補体および/もしくは補体因子の存在および/もしくは添加なしに、
実行される、請求項1または2に記載の方法。 - OPKアッセイが、貪食細胞、好ましくは、好中球、顆粒球、マクロファージ、単球および/またはP.アクネス細菌を取り込み死滅させることが可能な他の細胞、特に、好中球または顆粒球を使用して実行される、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
- P.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン1(DsA1ポリペプチド)および/またはP.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン2(DsA2ポリペプチド)および/またはDsA1もしくはDsA2の断片および/または派生体を含むワクチンであって、DsA1およびDsA2は、N末端からC末端に、N末端スワッピング領域(「NSR」)、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」)、Pro-Thrリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域(「CTR」)を含み、断片および/または派生体は、少なくともCSD2断片を含むまたはからなり、CSD2断片は、好ましくは、断片または派生体はNSRおよびCTRを含まないという条件で、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、
- ロイシン238(L238)~ロイシン272(L272)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
であり、アミノ酸番号付けは、UniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A5X9に対応し、
DsA1ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5X9の配列中のNSR:S29~I48、I49~L130のCSD1、G131~S147のSR1、A148~L267のCSD2、A268~T277のSR2、A278~K323のCSD3、P324~T361のPTリピート領域およびS362~F405のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA1配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA1配列;
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義される:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列、前記ワクチン。 - 断片または派生体は、少なくとも
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、好ましくは、フェニルアラニン150(F150)~イソロイシン193(I193)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、
- ロイシン238(L238)~ロイシン272(L272)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列
を含むまたはからなる、請求項5に記載のワクチン。 - P.アクネスの推定鉄輸送タンパク質(PITPポリペプチド)および/またはPITPの断片および/または派生体を含むワクチンであって、PITPは、N末端からC末端に、拡大されたネオカルチノスタチンファミリードメイン(「ENFD」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、ヘム結合ドメイン(「HbD」)、C末端LPXT(G)モチーフを含む第2のスワッピング領域(「SR2」)および疎水性C末端領域(「hLAR」)を含み、断片および/または派生体は、少なくともPITPエピトープを含むまたはからなり、PITPドメインは以下のとおりに定義される:Q6A9N1の配列中のA32~R164のENFD;E165~K237のSR1、V238~L396のHbD、S397~T430のSR2(C末端LPXT(G)モチーフを含む(すなわち、LPXTを含むが、Gを含まない))およびG431~I467のhLARまたはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的PITP配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のPITP配列、前記ワクチン。
- 断片および/または派生体は、hLARが欠失している、親水性C末端領域によって置き換えられている、または部分欠失しており、部分欠失が、hLARのN末端の12個のアミノ酸を除く、好ましくは、hLARのN末端の11個のアミノ酸を除く、特に、hLARのN末端の10個のアミノ酸を除くhLARの喪失をもたらす、PITPポリペプチドである;あるいは少なくともUniProtデータベース中のアミノ酸配列Q6A9N1中のENFDのプロリン34~グルタミン酸73もしくはプロリン94~トレオニン143HbDのバリン238~アスパラギン393に対応するアミノ酸を含むその断片もしくは派生体である、請求項7に記載のワクチン。
- PITP断片および/または派生体は、hLARが欠失しているPITPポリペプチドである、請求項7または8に記載のワクチン。
- PITP派生体は、位置Y63、H146、H153、F74、L141、F81、P72、K144、T143、Y75、W98、D156およびR158にアミノ酸交換を含む、請求項7~9のいずれか1項に記載のワクチン。
- PITP派生体は、位置C231およびC402にアミノ酸交換を含む、請求項7から10のいずれか1項に記載のワクチン。
- 表面に露出しているP.アクネスのエピトープを有する少なくとも2つの抗原ポリペプチドを含むワクチンであって、好ましくは、少なくとも1つのエピトープは、表面に露出しているP.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン1(DsA1ポリペプチド)のエピトープまたは表面に露出しているP.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン2(DsA1ポリペプチド)のエピトープまたは表面に露出しているP.アクネスの推定鉄輸送タンパク質(PITPポリペプチド)のエピトープであり、
DsA1またはDsA2は、N末端からC末端に、N末端スワッピング領域(「NSR」)、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」)、Pro-Thrリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域(「CTR」)を含み、ならびに
PITPポリペプチドは、N末端からC末端に、拡大されたネオカルチノスタチンファミリードメイン(「ENFD」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、ヘム結合ドメイン(「HbD」)、C末端LPXT(G)モチーフを含む第2のスワッピング領域(「SR2」)および疎水性C末端領域(「hLAR」)を含み、
DsA1ドメインは以下のとおりに定義される:Q6A5X9の配列中のNSR:S29~I48、I49からL130のCSD1、G131~S147のSR1、A148からL267のCSD2、A268~T277のSR2、A278~K323のCSD3、P324~T361のPTリピート領域およびS362~F405のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA1配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA1配列、
ならびに/またはDsA2ドメインは、以下のとおりに定義され:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列;
ならびに/またはPITPドメインは、以下のとおりに定義される:Q6A9N1の配列中のA32~R164のENFD;E165~K237のSR1、V238~L396のHbD、S397~T430のSR2(C末端LPXT(G)モチーフを含む(すなわち、LPXTを含むが、Gを含まない))およびG431~I467のhLARもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的PITP配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のPITP配列、前記ワクチン。 - ワクチンであって、
- 表面に露出しているDsA1ポリペプチドのエピトープまたは表面に露出しているP.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン2(DsA2ポリペプチド)のエピトープを有する少なくとも1つの抗原ポリペプチドであって、
DsA1またはDsA2は、N末端からC末端に、N末端スワッピング領域(「NSR」)、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」)および場合により、Pro-Thrリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域(「CTR」)を含む、前記少なくとも1つの抗原ポリペプチド;ならびに
- 表面に露出しているPITPポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの抗原ポリペプチドであって、
DsA1ドメインは、以下のとおりに定義される:Q6A5X9の配列中のNSR:S29~I48、I49~L130のCSD1、G131~S147のSR1、A148~L267のCSD2、A268~T277のSR2、A278~K323のCSD3、P324~T361のPTリピート領域およびS362~F405のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA1配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA1配列;
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列、前記少なくとも1つの抗原ポリペプチド
を含む、前記ワクチン。 - (a)少なくともDsA1のCSD1の断片もしくは派生体を含有するエピトープおよび少なくともDsA2のCSD2の断片もしくは派生体を含有するエピトープを含む、ならびに/または
(b)少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD1のCSD1断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチおよび少なくとも30個のアミノ酸残基、好ましくは、少なくとも40個のアミノ酸残基のDsA1のCSD2のCSD2断片もしくは派生体を含む少なくともポリペプチドストレッチを含む;
(c)少なくともDsA1の
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン184(L184)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン150(F150)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン218(H218)~ロイシン267(L267)の連続ポリペプチド配列、および
DsA2の
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン228(L228)の連続ポリペプチド配列、
- フェニルアラニン194(F194)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列、または
- ヒスチジン262(H262)~ロイシン311(L311)の連続ポリペプチド配列を含む、ポリペプチドを含む、請求項5~13のいずれか1項に記載のワクチン。 - ポリペプチドは、ポリペプチド中に存在する場合はDsA1のC53、C319およびC321ならびにDsA2のC97およびC363のうち1つまたはそれ以上にアミノ酸交換、好ましくは、DsA1のアミノ酸交換C53S、C319SおよびC321PならびにDsA2のC97SおよびC363Sのうち1つまたはそれ以上を含む、請求項5~14のいずれか1項に記載のワクチン。
- 断片または派生体において、少なくとも5つのPTリピート、好ましくは、少なくとも10のPTリピート、特に、少なくとも15のPTリピートが、天然に存在する野生型DsA1/DsA2ポリペプチド(「天然DsA1/DsA2」)と比較して欠失しており、好ましくは、少なくとも1つの、より好ましくは少なくとも2つの、より好ましくは少なくとも3つの、いっそうより好ましくは少なくとも4つの、特に5つのPTリピートが存在する、請求項5~15のいずれか1項に記載のワクチン。
- ポリペプチドは、PITPポリペプチドまたは少なくともPITPのエピトープを含む少なくとも30個のアミノ酸残基のポリペプチドストレッチを含むPITPの断片または派生体をさらに含む、好ましくは、PITPポリペプチドまたはPITPの断片または派生体は、少なくとも
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン34~グルタミン酸73の連続ポリペプチド配列、
- ENFDもしくはそのPITP派生体のプロリン94~トレオニン143の連続ポリペプチド配列、または
- HbDもしくはそのPITP派生体のバリン238~アスパラギン393の連続ポリペプチド配列
を含む、請求項5~16のいずれか1項に記載のワクチン。 - PITP派生体は、位置C231およびC402にアミノ酸交換を含む、請求項17に記載のワクチン。
- ワクチンであって、
- 表面に露出しているDsA1ポリペプチドのエピトープまたは表面に露出しているDsA2ポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの合成抗原ポリペプチド;および
- 表面に露出しているP.アクネスのPITPポリペプチドのエピトープを有する少なくとも1つの合成抗原ポリペプチド
を含む、前記ワクチン。 - P.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン1(DsA1)の少なくとも1つのポリペプチドストレッチおよびP.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン2(DsA2)の少なくとも1つのポリペプチドストレッチを含むポリペプチドであって、前記DsA1およびDsA2は、N末端からC末端に、N末端領域、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」);および場合により、Pro-Leuリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域を含み;
ポリペプチドは、少なくともDsA1のCSD1、CSD2またはCSD3のエピトープおよび少なくともDsA2のCSD1、CSD2またはCSD3のエピトープを含み、好ましくは、ポリペプチドは、少なくともDsA1のCSD1、CSD2またはCSD3およびDsA2のCSD1、CSD2またはCSD3を含み、
DsA1ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5X9の配列中のNSR:S29~I48、I49~L130のCSD1、G131~S147のSR1、A148~L267のCSD2、A268~T277のSR2、A278~K323のCSD3、P324~T361のPTリピート領域およびS362~F405のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA1配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA1配列;
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義される:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列、前記ポリペプチド。 - P.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン1(DsA1)の少なくとも1つのポリペプチドストレッチおよびP.アクネスのデルマタン硫酸結合アドヘシン2(DsA2)の少なくとも1つのポリペプチドストレッチを含むポリペプチドであって、前記DsA1およびDsA2は、N末端からC末端に、N末端領域、第1の保存されたサブドメイン(「CSD1」)、第1のスワッピング領域(「SR1」)、第2の保存されたサブドメイン(「CSD2」)、第2のスワッピング領域(「SR2」)、第3の保存されたサブドメイン(「CSD3」);および場合により、Pro-Leuリピート含有領域(「PTリピート領域」)およびC末端領域を含み;
DsA1およびDsA2のポリペプチドストレッチは、少なくとも20個のアミノ酸残基の長さを独立に有し、
DsA1ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5X9の配列中のNSR:S29~I48、I49~L130のCSD1、G131~S147のSR1、A148~L267のCSD2、A268~T277のSR2、A278~K323のCSD3、P324~T361のPTリピート領域およびS362~F405のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA1配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA1配列;
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義される:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列、前記ポリペプチド。 - P.アクネス関連感染症の処置または防止において使用するためのワクチンであって、DsA1および/またはDsA2および/またはPITPのエピトープを含むポリペプチドを含み、エピトープは、DsA1のR32-I41、Q38-K51、R32-K51、T43-K51、Q38-K51、R87-K90+T43-K51、R87-K90+T117-I132およびR87-K90+S234-G250、R87-K90+L246-A260、R87-K90+A256-E270、R87-K90+R266-T277、T117-I132、T117-A127、V128-I132、A144-N157、H146-A160、A148-N157、A156-A170、K166-L180、A176-T190、P186-A198、N181-E191、I216-F224、I216-D225、A226-A240、S234-G250、I251-I263、I251-L267、I264-P271、P236-G250、L246-A260、A256-E270、S234-G250、I251-L267、A268-L280、R266-T277、T285-R286+I216-F224、T285-R286+I264-P271、T285-R286+V289-K296、T285-R286+V289-K296、T285-R286+A144-N157、A310-D313+T285-R286、T285-D290、T285-D290+V291-T300、T285-D290+A301-E307、V291-T300、A301-E307、T285-T300、A301-E307、R286-D290+V291-T300、R286-D290+A301-E307、V289-K296、A310-D313+I216-F224、A310-D313+I264-P271、A310-D313+T285-R286、A310-D313+R286-D290、A310-D313+V289-K296、A310-D313+V289-K296、A310-D313+T285-T300、A310-D313+A144-N157、A310-D313+T285-R286、A310-D313+T285-D290、A310-D313+T293-E307、T285-D290、V291-T300、T293-E307、A301-E307;DsA2のL152-Q166、G190-P230、I199-D208、A218-I237、P230-Q244、I231-A270、H254-A270、A271-S279、A271-R310、L311-T321、L311-K323、V333-Q347、A218-P230、I231-I237、H254-H262、Q256-H262、E261-D269、D269-S279、K313-K323;PITPのD79-T90、E73-D85、R43-I50、P68-Y75、P86-E92、I39-G45、Y84-D89、F81-D89、D79-D89、T37-E44、E73-W98、E73-F81、D79-T90、P72-F81、A129-F138、D120-Q134、F111-D120、F132-G147、D152-E165、R115-F123、D120-K128、P131-F138、N181-E191、T143-T159、P116-T124、P131-D137、P131-D137、T175-C231、Q198-K203、P179-K185、G200-Q210、K174-A188、K174-K185、P201-Q209、P183-P201、P183-K191、K185-P195、R164-S180、E165-S180、K185-S190、V193-N202、V193-G200、K203-P208、R216-T225、R216-R224、P173-K191、K197-K203、P168-T175、K185-K203、R164-K174、T175-V193、S250-N261、D287-S300、K340-V347、D338-F352、D338-D348、S285-P288+G305-L314、S285-P288+H306-L314、S285-P288+T342-T351、S285-P288+D338-D348、D287-S300、T342-T351、D338-D348、H306-L314、G305-L314、G364-K375、R382-E399、V367-G373、A383-L390、T342-T351、M387-T395、E385-T392、V401-V410、N404-A409、G416-L427、L396-V410、T406-I415、D417-G424、V407-D418、V407-V414、K421-V429、S419-T430、D408-I415、T406-V414からなる群から選択され、好ましくは、エピトープは、DsA1、DsA2またはPITP配列のN末端またはC末端に少なくとも1つの追加のアミノ酸残基を含み、特に、エピトープは、DsA1、DsA2またはPITP配列のN末端またはC末端に少なくとも2個の追加のアミノ酸残基を含み;ポリペプチドは、好ましくは、担体分子に共有結合的に連結され、または足場分子、特に、担体ポリペプチド中に埋め込まれ、
DsA1ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5X9の配列中のNSR:S29からI48、I49~L130のCSD1、G131~S147のSR1、A148~L267のCSD2、A268~T277のSR2、A278~K323のCSD3、P324~T361のPTリピート領域およびS362~F405のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA1配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA1配列;
ならびに/またはDsA2ドメインは以下のとおりに定義され:Q6A5P9の配列中のNSR:A72~K92、I93~L174のCSD1、S175~S191のSR1、A192~L311のCSD2、A312~T321のSR2、A322~E366のCSD3、P367~T420のPTリピート領域およびH421~A463のCTRもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的DsA2配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のDsA2配列;
ならびに/またはPITPドメインは以下のとおりに定義される:Q6A9N1の配列中のA32~R164のENFD;E165~K237のSR1、V238~L396のHbD、S397~T430のSR2(C末端LPXT(G)モチーフを含む(すなわち、LPXTを含むが、Gを含まない))およびG431~I467のhLARもしくはこれらのドメイン全てを含む任意の他の機能的PITP配列、特に、これらのドメイン全てを含む図12のPITP配列、前記ワクチン。 - エピトープは、DsA1のR32-I41、Q38-K51、T43-K51、Q38-K51、R87-K90+S234-G250、R87-K90+L246-A260、R87-K90+A256-E270、R87-K90+R266-T277、T117-I132、T117-A127、A144-N157、H146-A160、A148-N157、A156-A170、K166-L180、A176-T190、P186-A198、N181-E191、I216-F224、A226-A240、S234-G250、I251-I267、I264-P271、P236-G250、L246-A260、A256-E270、S234-G250、I251-L267、A268-L280、R266-T277、T285-D290、T285-D290+V291-T300、T285-D290+A301-E307、V291-T300、A301-E307、T285-T300、R286-D290+V291-T300、R286-D290+A301-E307、R286-T300、V289-K296、A310-D313+V289-K296、A310-D313+V289-K296、A310-D313+T285-T300、A310-D313+A144-N157、A310-D313+T285-R286、A310-D313+T285-D290、A310-D313+T293-E307、T285-D290、V291-T300、T293-E307、A301-E307;DsA2のL152-Q166、G190-P230、I199- D208、P230-Q244、L311-T321、L311-K323、H254-H262、Q256-H262、E261-D269、D269-S279、K313-K323;PITPのD79-T90、E73-D85、P86-E92、F81-D89、E73-W98、E73-F81、P72-F81、A129-F138、D120-Q134、P116-T124、P131-D137、Q198-K203、K174-A188、K174-K185、P183-P201、P183-K191、K185-P195、R216-T225、K197-K203、P168-T175、R164-K174、S285-P288+G305-L314、S285-P288+H306-L314、S285-P288+T342-T351、S285-P288+D338-D348、D287-S300、T342-T351、D338-D348、H306-L314、T406-I415からなる群から選択され、好ましくは、エピトープは、DsA1、DsA2またはPITP配列のN末端またはC末端に少なくとも1つの追加のアミノ酸残基を含み、特に、エピトープは、DsA1、DsA2またはPITP配列のN末端またはC末端に少なくとも2つの追加のアミノ酸残基を含み;ポリペプチドは、好ましくは、担体または足場分子、特に、担体ポリペプチドに共有結合的に連結される、請求項22に記載の使用のためのワクチン。
- N末端メチオニンアミノ酸残基を含む、場合により、ワクチンまたは医薬製剤中に含有される、請求項5~23のいずれか1項に記載のDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPならびに/またはDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPの断片および/もしくは派生体。
- 治療的処置において使用するための、好ましくは、特に、尋常性ざ瘡、角膜炎、滑膜炎ざ瘡膿疱症骨化症骨炎(SAPHO)症候群、心内膜炎、人工関節感染症、手術創感染症、移植血管感染症、嫌気性菌関節炎、人工弁心内膜炎のような心血管デバイス関連感染症;眼用感染症、乳房インプラントの疾病、坐骨神経痛、結膜炎、シャント関連および/または脊髄ハードウェア中枢神経系感染症、シャント関連中枢神経系感染症、サルコイドーシス、眼内炎骨髄炎、アレルギー性肺胞炎、関節リウマチ、感染性関節炎、慢性若年性関節炎、慢性破壊性少関節炎、変形性椎間板疾患、歯性感染症、潰瘍性大腸炎異常高熱症、脳膿瘍、硬膜下蓄膿、腹膜炎、歯周炎、歯内感染症、眼内炎、角膜炎、慢性副鼻腔炎、毛包炎、角膜炎、角膜潰瘍、眼内炎、前立腺炎症、慢性前立腺炎、原発性胆汁性肝硬変、化膿性汗腺炎、肺血管炎、反対型ざ瘡、進行性の斑状メラニン減少症、集簇性ざ瘡、アテローム性動脈硬化症、前立腺がんおよびP.アクネスによる医療用インプラントバイオフィルム感染症からなる群から選択されるP.アクネス関連感染症の処置または防止において使用するための、請求項5~24のいずれか1項に記載のDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPならびに/またはDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPの断片および/もしくは派生体。
- P.アクネス関連感染症およびI、IIまたはIII型P.アクネスのいずれか、またはP.アクネスのI、IIおよびIII型のうち少なくとも2つのファイロタイプの、もしくは少なくとも2つのリボタイプの組合せと関連する病状を患っているヒト患者におけるP.アクネス関連感染症の処置または防止において使用するための、好ましくは、P.アクネスに対する交差反応性ワクチン、特に、交差型反応性ワクチンとして使用するための、特に、P.アクネス関連感染症およびP.アクネスのIBおよびIII型と関連する病状を患っているヒト患者における感染症の処置または防止のための、請求項5~24のいずれか1項に記載のDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPならびに/またはDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPの断片および/もしくは派生体。
- 請求項5~26のいずれか1項に記載のワクチンまたはポリペプチドであって、DsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPならびに/またはDsA1もしくはDsA2もしくはPITPの断片もしくは派生体は、抗原またはその断片もしくは派生体を含有するエピトープをコードするDNAまたはRNAとして、好ましくは、mRNAワクチン、特に、カチオン性ポリマーを用いて製剤化され、mRNA分子は以下の構造:5’UTR-シグナルペプチドによってコードされた抗原またはエピトープ-3’UTRを有するmRNAワクチンとして;または特に、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、水泡性口内炎ウイルスベクター、ニューカッスル病ウイルスベクター、アルファウイルスベクター、バキュロウイルスベクターもしくはレトロウイルスベクターを用いるベクターベースのワクチンとして提供され;および/またはDNAレベルでコード配列は、最初のコードDNA配列ATGGTGを有し;特に、mRNAは、配列番号67~76から転写されるような配列を含む、前記ワクチンまたはポリペプチド。
- 請求項5~27のいずれか1項に記載のワクチンまたはポリペプチドを含む医薬製剤であって、これらの請求項のいずれか1項に記載のポリペプチド、すなわち、請求項1~27のいずれか1項に記載のDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPならびに/またはDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPの断片および/もしくは派生体またはそれらの混合物と、医薬上許容される賦形剤または担体とを含む、前記医薬製剤。
- P.アクネス関連感染症およびI、IIまたはIII型P.アクネスのいずれか、またはP.アクネスのI、IIおよびIII型のうち少なくとも2つのファイロタイプの、もしくは少なくとも2つのリボタイプの組合せと関連する病状を患っているヒト患者におけるP.アクネス関連感染症の処置または防止の、好ましくは、P.アクネスに対する交差反応性ワクチン、特に、交差型反応性ワクチンとして使用するための、特に、P.アクネス関連感染症およびP.アクネスのIBおよびIII型と関連する病状を患っているヒト患者における感染症の処置または防止のための方法であって、請求項5~27のいずれか1項に記載のDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPならびに/またはDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPの断片および/もしくは派生体の有効量または有効量のそれらの混合物のそれを必要とする患者への投与を含む、前記方法。
- 投与が、皮内、皮下(s.c.)、非経口、筋肉内(i.m.)、粘膜、経皮または局所投与によって、好ましくは、皮内または筋肉内投与によって、特に、シリンジによって、またはマイクロニードリングデバイスによって実行される、請求項29に記載の方法。
- 請求項5~28のいずれか1項に記載のポリペプチド、ワクチンおよび製剤の生成方法であって、これらの請求項に記載の少なくとも1つのP.アクネスエピトープを含むポリペプチドが、宿主細胞において発現され、これらの宿主細胞から抽出され、精製され、場合により、ヒト患者におけるP.アクネス関連感染症の処置または防止において使用するための医薬製剤、特に、ワクチンに製剤化され、仕上げられる、前記方法。
- P.アクネス関連感染症およびI、IIまたはIII型P.アクネスのいずれか、またはP.アクネスのI、IIおよびIII型のうち少なくとも2つのファイロタイプの、もしくは少なくとも2つのリボタイプの組合せと関連する病状を患っているヒト患者におけるP.アクネス関連感染症の処置または防止のための医薬の製造のための、好ましくは、P.アクネスに対する交差反応性ワクチン、特に、交差型反応性ワクチンとして使用するための、特に、P.アクネス関連感染症およびP.アクネスのIBおよびIII型と関連する病状を患っているヒト患者における感染症の処置または防止のための、請求項5~27のいずれか1項に記載のDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPならびに/またはDsA1および/もしくはDsA2および/もしくはPITPの断片および/もしくは派生体またはそれらの混合物の使用。
Applications Claiming Priority (9)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP20158656.7 | 2020-02-21 | ||
EP20158661.7 | 2020-02-21 | ||
EP20158662.5 | 2020-02-21 | ||
EP20158656 | 2020-02-21 | ||
EP20158659.1 | 2020-02-21 | ||
EP20158659 | 2020-02-21 | ||
EP20158661 | 2020-02-21 | ||
EP20158662 | 2020-02-21 | ||
PCT/EP2021/054346 WO2021165543A1 (en) | 2020-02-21 | 2021-02-22 | Propionibacterium acnes prophylactic and therapeutic immune treatment |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2023514414A true JP2023514414A (ja) | 2023-04-05 |
JPWO2021165543A5 JPWO2021165543A5 (ja) | 2024-03-01 |
Family
ID=74666738
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2022550232A Pending JP2023514414A (ja) | 2020-02-21 | 2021-02-22 | プロピオニバクテリウム・アクネスの予防的かつ治療的な免疫処置 |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20240139302A1 (ja) |
EP (1) | EP4106803A1 (ja) |
JP (1) | JP2023514414A (ja) |
KR (1) | KR20230005127A (ja) |
CN (2) | CN118561970A (ja) |
AU (1) | AU2021223787A1 (ja) |
BR (1) | BR112022016555A2 (ja) |
CA (1) | CA3171831A1 (ja) |
MX (1) | MX2022010203A (ja) |
WO (1) | WO2021165543A1 (ja) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11771652B2 (en) * | 2020-11-06 | 2023-10-03 | Sanofi | Lipid nanoparticles for delivering mRNA vaccines |
CN114209808B (zh) * | 2021-12-24 | 2023-08-18 | 成都佩德生物医药有限公司 | 一种多肽rk12用于制备治疗痤疮药物的应用 |
CN115925829B (zh) * | 2022-07-22 | 2024-04-23 | 东北农业大学 | rHtaA-c蛋白在制备用于预防化脓隐秘杆菌的疫苗中的应用 |
GB2623078A (en) * | 2022-10-03 | 2024-04-10 | Univ Brunel | Prevention and/or treatment of wound infection |
WO2024188165A1 (zh) * | 2023-03-10 | 2024-09-19 | 成都威斯克生物医药有限公司 | 抗痤疮的重组蛋白疫苗及制备方法和应用 |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0138854B1 (en) | 1983-03-08 | 1992-11-04 | Chiron Mimotopes Pty. Ltd. | Antigenically active amino acid sequences |
JP2004520803A (ja) | 2000-04-21 | 2004-07-15 | コリクサ コーポレイション | 尋常性挫瘡の治療および診断のための組成物および方法 |
WO2003033515A1 (en) | 2001-10-15 | 2003-04-24 | Corixa Corporation | Compositions and methods for the therapy and diagnosis of acne vulgaris |
EP2381920A4 (en) | 2008-12-05 | 2013-04-17 | Univ California | METHOD AND COMPOSITIONS FOR TREATING P.ACNES |
DE11786796T8 (de) | 2010-05-27 | 2013-04-25 | Hasumi Kenichiro | Antigenpeptid und verwendung davon |
GB201014715D0 (en) | 2010-09-06 | 2010-10-20 | Vib Vzw | Nanobodies stabilizing functional conformational states of GPCRS |
EP3728310A1 (en) | 2017-12-18 | 2020-10-28 | VIIV Healthcare UK (No.5) Limited | Antigen binding polypeptides |
-
2021
- 2021-02-22 KR KR1020227032571A patent/KR20230005127A/ko unknown
- 2021-02-22 AU AU2021223787A patent/AU2021223787A1/en active Pending
- 2021-02-22 WO PCT/EP2021/054346 patent/WO2021165543A1/en active Application Filing
- 2021-02-22 CA CA3171831A patent/CA3171831A1/en active Pending
- 2021-02-22 MX MX2022010203A patent/MX2022010203A/es unknown
- 2021-02-22 CN CN202410581926.8A patent/CN118561970A/zh active Pending
- 2021-02-22 US US17/801,099 patent/US20240139302A1/en active Pending
- 2021-02-22 JP JP2022550232A patent/JP2023514414A/ja active Pending
- 2021-02-22 BR BR112022016555A patent/BR112022016555A2/pt unknown
- 2021-02-22 EP EP21706289.2A patent/EP4106803A1/en active Pending
- 2021-02-22 CN CN202180028384.6A patent/CN115996754A/zh active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA3171831A1 (en) | 2021-08-26 |
EP4106803A1 (en) | 2022-12-28 |
CN115996754A (zh) | 2023-04-21 |
US20240139302A1 (en) | 2024-05-02 |
MX2022010203A (es) | 2022-11-07 |
KR20230005127A (ko) | 2023-01-09 |
BR112022016555A2 (pt) | 2022-11-16 |
WO2021165543A1 (en) | 2021-08-26 |
AU2021223787A1 (en) | 2022-10-13 |
CN118561970A (zh) | 2024-08-30 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2023514414A (ja) | プロピオニバクテリウム・アクネスの予防的かつ治療的な免疫処置 | |
Bartolini et al. | Recombinant outer membrane vesicles carrying Chlamydia muridarum HtrA induce antibodies that neutralize chlamydial infection in vitro | |
US20030021795A1 (en) | Use of coiled-coil structural scaffold to generate structure-specific peptides | |
JP2009544279A (ja) | 歯周病の予防に有用なポルフィロモナス・ジンジバリスポリペプチド | |
US10420828B2 (en) | Targets of acinetobacter baumannii | |
JP6505110B2 (ja) | OspAの突然変異体断片、並びにそれに関する方法および使用 | |
JP2014507142A (ja) | α溶血素オリゴペプチドを含む免疫原性組成物 | |
Cachia et al. | Synthetic peptide vaccine and antibody therapeutic development: prevention and treatment of Pseudomonas aeruginosa | |
US9267947B2 (en) | Compositions and methods for preventing or treating Burkholderia infection | |
Wan et al. | Flagella hook protein FlgE is a novel vaccine candidate of Pseudomonas aeruginosa identified by a genomic approach | |
SA98180918A (ar) | تسلسلات حامض نووي وحامض أميني تتعلق ببكتيريا h.pylori " وتركيبات لقاحية منها " | |
US20130243779A1 (en) | Peptides protective against e. faecalis, methods and uses relating thereto | |
EP3077512B1 (en) | Immunogenic compositions and vaccines derived from bacterial surface receptor proteins | |
TWI605056B (zh) | 用於治療艱難梭狀芽孢桿菌(Clostridium difficile)相關疾病之組成物及方法 | |
Prasad et al. | Leptospiral protein LIC11334 display an immunogenic peptide KNSMP01 | |
CN115151559A (zh) | 葡萄球菌肽和使用方法 | |
Fegan et al. | Rational selection of TbpB variants elucidates a bivalent vaccine formulation with broad spectrum coverage against Neisseria gonorrhoeae | |
Bidmos et al. | Reverse vaccinology | |
US20220238183A1 (en) | Novel methods for rapid detection of immunogenic epitopes in biothreat agents and emerging pathogens for peptide vaccines and therapeutics | |
EP2004222A2 (en) | Vaccine | |
JP2013520193A (ja) | クロストリジウム遺伝子 | |
CN111647569A (zh) | AT-CoaR6融合蛋白及在制备抗金葡菌感染的双组分疫苗中的应用 | |
RU2013108881A (ru) | РЕКОМБИНАНТНЫЕ ПОРИНОВЫЕ БЕЛКИ Por A Neisseria meningitidis |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A711 | Notification of change in applicant |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711 Effective date: 20231228 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20231228 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20240221 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20240221 |
|
A711 | Notification of change in applicant |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711 Effective date: 20240628 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20240628 |