JP2023502474A - Ｉｇｈｍｂｐ２遺伝子に関連する障害の治療のための材料および方法 - Google Patents

Abstract

本開示は、免疫グロブリン－μ結合タンパク質２（ＩＧＨＭＢＰ２）関連障害の治療のために設計された、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）などの遺伝子療法ベクターを提供する。一態様では、（ａ）１つ以上の調節制御要素と、（ｂ）免疫グロブリン－μ結合タンパク質２（ＩＧＨＭＢＰ２）のｃＤＮＡ配列とを含む、ポリヌクレオチドが、本明細書に記載される。いくつかの実施形態では、調節制御要素は、配列番号３に記載されるヌクレオチド配列を含むＣＢＡプロモーター、または配列番号４に記載されるヌクレオチド配列を含むＰ５４６プロモーター、もしくは調節制御またはプロモーター活性を保持するその断片である。

Description

本出願は、その全体が本明細書に組み込まれる、２０１９年１１月２２日に出願された米国仮出願第６２／９３９，２７０号の優先権を主張する。

電子的に提出された資料の参照による組み込み
本出願は、本開示の別個の部分として、参照によりその全体が本明細書に組み込まれ、サイズ：７３，１１０バイト、作成日：２０１９年１１月２３日の５４４４５＿Ｓｅｑｌｉｓｔｉｎｇ．ｔｘｔとして識別される、コンピュータ可読形態の配列表を含有する。

発明の分野
本開示は、免疫グロブリン－μ結合タンパク質２（ＩＧＨＭＢＰ２）遺伝子の変異に関連する障害の治療のために設計された、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）などの遺伝子療法ベクターを提供する。開示されたｒＡＡＶは、野生型タンパク質の発現をもたらす野生型ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡを、それを必要とする対象に提供する。

免疫グロブリン－μ結合タンパク質２（ＩＧＨＭＢＰ２）遺伝子は、ヘリカーゼスーパーファミリー１（ＳＦ１）内のＵｐｆ１様群の構成要素をコードする。このタンパク質は、ヘリカーゼドメイン、Ｒ３Ｈドメイン、ジンクフィンガードメイン、および核局在化シグナル配列を有することが公知である。ＩＧＨＭＢＰ２は、遍在的に発現され、１１０ｋＤａの遺伝子産物に対応する９９３個のアミノ酸をコードする、１５個のエクソンを含む。疾患の発症におけるＩＧＨＭＢＰ２タンパク質の正確な役割は不明である。正常なＩＧＨＭＢＰ２は、リボソームＲＮＡの成熟および翻訳、免疫グロブリンクラススイッチ、ｍＲＮＡ前駆体の成熟、およびＤＮＡ結合活性またはＴＡＴＡ結合タンパク質との相互作用のいずれかによる転写調節において役割を果たすことが公知である。ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質は、ヘリカーゼドメイン、Ｒ３Ｈドメイン、ジンクフィンガードメイン、および核局在化シグナル配列からなるヘリカーゼスーパーファミリー１（ＳＦ１）内のＵｐｆ１様群の構成要素として分類されている。ＩＧＨＭＰＢ２遺伝子の常染色体劣性変異は、呼吸困難１型（ＳＭＡＲＤ１）およびシャルコー・マリー・トゥース２Ｓ型（ＣＭＴ２Ｓ）を伴う脊髄性筋萎縮症を引き起こすことが公知である。ＩＧＨＭＰＢ２遺伝子における患者変異の大部分は、ヘリカーゼドメイン内でクラスター化し、ミスセンス変異である。

ＳＭＡＲＤ１は、近位筋力低下および呼吸不全に続く早期遠位下肢筋萎縮によって特徴付けられる、常染色体劣性運動ニューロン疾患である。ＳＭＡＲＤ１患者は、６週齢～１３カ月齢に横隔膜の麻痺を示す。患者は通常、１３カ月齢の前に換気を必要とする。ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子の機能喪失変異は、ＳＭＡＲＤ１を引き起こすことが公知である。

シャルコー・マリー・トゥース（ＣＭＴ）神経障害は、最もよく見られる遺伝性神経障害である。ＣＭＴ２は、遠位筋力低下および萎縮、軽度の感覚喪失、および正常またはほぼ正常な神経伝導速度によって特徴付けられる、軸索（非脱髄性）末梢神経障害である。ＣＭＴ２は、臨床的にＣＭＴ１に類似するが、典型的には、あまり重症ではない。患者は、上肢および下肢の筋萎縮を伴う、ゆっくり進行する遠位筋力低下を有する。ＣＭＴ２のサブタイプは、臨床的に類似し、分子遺伝学的所見によってのみ区別される。ＣＭＴ２のほとんどのサブタイプは、常染色体優性様式で遺伝性であるが、いくつかは、常染色体劣性様式で遺伝性である。ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子の劣性機能喪失変異は、現在はＣＭＴ２Ｓとして細分類されている、ＣＭＴ２を引き起こすことが公知である。

ＣＭＴ２Ｓのための現在の治療法はなく、管理は、症状を治療することを伴う。したがって、ＳＭＡＲＤ１およびＣＭＴ２Ｓを治療するための遺伝子置換療法を開発する必要がある。

一態様では、（ａ）１つ以上の調節制御要素と、（ｂ）免疫グロブリン－μ結合タンパク質２（ＩＧＨＭＢＰ２）のｃＤＮＡ配列とを含む、ポリヌクレオチドが、本明細書に記載される。いくつかの実施形態では、調節制御要素は、配列番号３に記載されるヌクレオチド配列を含むＣＢＡプロモーター、または配列番号４に記載されるヌクレオチド配列を含むＰ５４６プロモーター、もしくは調節制御またはプロモーター活性を保持するその断片である。いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号５のヌクレオチド配列を有するＳＶ４０イントロン、およびＳＶ４０イントロンの断片を含む。いくつかの実施形態では、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡは、配列番号１に記載されるポリヌクレオチド配列を含む。

一実施形態では、本開示は、機能的ＩＧＨＭＢＰ２タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、ｒＡＡＶを提供し、ヌクレオチドは、配列番号１に対して、例えば、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、または８９％、より典型的には、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、または９４％、さらにより典型的には、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有し、タンパク質は、ＩＧＨＭＢＰ２活性を保持する。例えば、機能的ＩＧＨＭＢＰ２タンパク質をコードするヌクレオチド配列は、ＩＧＨＭＢＰ２の機能に影響を及ぼす、１つ以上の塩基対置換、欠失、または挿入を含み得る。さらに、機能的ＩＧＨＭＢＰ２タンパク質をコードするヌクレオチド配列は、ＩＧＨＭＢＰ２タンパク質の発現を増加または減少させ得る、１つ以上の塩基対置換、欠失、または挿入を含み得、発現パターンのこの変化は、ＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２ＳなどのＩＧＨＭＢＰ２関連障害の治療のために所望され得る。

例えば、本開示は、機能的ＩＧＨＭＢＰ２タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、ｒＡＡＶを提供し、タンパク質は、配列番号２に対して、例えば、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、または８９％、より典型的には、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、または９４％、さらにより典型的には、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、タンパク質は、ＩＧＨＭＢＰ２活性を保持する。例えば、機能的ＩＧＨＭＢＰ２タンパク質をコードするヌクレオチド配列は、ＩＧＨＭＢＰ２タンパク質の機能に影響を及ぼす、１つ以上のアミノ酸置換、欠失、または挿入を含み得る。

核酸配列またはアミノ酸配列の文脈における「配列同一性」、「配列同一性の割合」、または「同一の割合」という用語は、最大限対応するように整合されたときに同じである、２つの配列中の残基を指す。配列同一性の比較の長さは、ゲノムの全長、遺伝子コード配列の全長であり得るか、または少なくとも約５００～５０００個のヌクレオチドの断片が所望される。しかしながら、少なくとも約９個のヌクレオチド、通常は少なくとも約２０～２４個のヌクレオチド、少なくとも約２８～３２個のヌクレオチド、少なくとも約３６個以上のヌクレオチドなど、より小さい断片間の同一性もまた所望され得る。配列の同一性の割合は、当技術分野で公知である技術によって決定されることができる。例えば、相同性は、配列情報を整合させ、ＡＬＩＧＮ、ＣｌｕｓｔａｌＷ２、およびＢＬＡＳＴなどの容易に入手可能なコンピュータプログラムを使用することにより、２つのポリペプチド分子間の配列情報の直接比較によって決定されることができる。一実施形態では、ＢＬＡＳＴが整合ツールとして使用されるとき、以下のデフォルトパラメータ、すなわち、遺伝暗号＝標準、フィルター＝なし、鎖＝両方、カットオフ＝６０、予測＝１０、マトリクッス＝ＢＬＯＳＵＭ６２、説明＝５０個の配列、並べ替え＝高得点、データベース＝非冗長、ＧｅｎＢａｎｋ＋ＥＭＢＬ＋ＤＤＢＪ＋ＰＤＢ＋ＧｅｎＢａｎｋ ＣＤＳ翻訳＋Ｓｗｉｓｓタンパク質＋Ｓｐｕｐｄａｔｅ＋ＰＩＲである。

別の態様では、本開示は、配列番号７のヌクレオチド配列を含むプラスミドに含有されるｒＡＡＶ構築物を提供する。例えば、ｓｓＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２ベクターは、配列番号７のＩＴＲ内にあり、かつそれを含み、図１３に示されるヌクレオチド配列を含む。ｒＡＡＶベクターは、５’ＩＴＲ、ＣＭＶエンハンサー、ＣＢプロモーター、修飾ＳＶ４０イントロン配列、ヒトＩＧＨＭＢＰ２遺伝子のためのコード配列、ｂＧＨポリＡ、および３’ＩＴＲを含む。一実施形態では、ベクターは、配列番号７のヌクレオチド１～４３９７を含む。ＩＴＲ内のヌクレオチドは、順方向または逆方向にあり得る。例えば、ＣＭＶエンハンサー配列、ＣＢプロモーター配列、ＳＶ４０配列、ヒトＩＧＨＭＢＰ２遺伝子配列、およびｂＧＨポリＡ配列は、順方向または逆方向にあり得る。別の実施形態では、ベクターは、配列番号７の１～４３９７のヌクレオチドに対して少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有する、ヌクレオチド配列を含む。配列番号７に記載されるプラスミドは、カナマイシン耐性およびｐＵＣ複製起点をさらに含む。

例示的実施形態では、本開示は、配列番号１８のヌクレオチド配列を含むプラスミドに含有されるｒＡＡＶ構築物を提供する。例えば、ｓｓＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２－ｃｌｉｎｉｃａｌベクターは、配列番号１８のＩＴＲ内にあり、かつそれを含み、図１８に示されるヌクレオチド配列を含む。ｒＡＡＶベクターは、配列番号１９に記載される５’ＩＴＲを含む。加えて、ｒＡＡＶベクターは、それぞれ逆方向に、ＣＭＶエンハンサー、ＣＢプロモーター、修飾ＳＶ４０イントロン配列、ヒトＩＧＨＭＢＰ２遺伝子のためのコード配列、ｂＧＨポリＡ、および配列番号１２に記載される３’ＩＴＲを含む。一実施形態では、ベクターは、配列番号１８のヌクレオチド１～４３８６を含む。ＩＴＲ内のヌクレオチドは、順方向または逆方向にあり得る。別の実施形態では、ベクターは、配列番号１８の１～４３８６のヌクレオチドに対して少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有する、ヌクレオチド配列を含む。配列番号１８に記載されるプラスミドは、カナマイシン耐性遺伝子およびｐＵＣ複製起点をさらに含む。カナマイシン耐性遺伝子は、順方向または逆方向にあり得る。

さらなる態様では、本開示は、配列番号８のヌクレオチド配列を含むプラスミドに含有されるｒＡＡＶ構築物を提供する。例えば、ｓｓＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２ベクターは、配列番号８のＩＴＲ内にあり、かつそれを含み、図１４に示されるヌクレオチド配列を含む。ｒＡＡＶベクターは、５’ＩＴＲ、Ｐ５４６プロモーター、修飾ＳＶ４０イントロン配列、ヒトＩＧＨＭＢＰ２遺伝子のためのコード配列、ｂＧＨポリＡ、および３’ＩＴＲを含む。一実施形態では、ベクターは、配列番号８のヌクレオチド１～４３７５を含む。ＩＴＲ内のヌクレオチドは、順方向または逆方向にあり得る。例えば、Ｐ５４６プロモーター配列、ＳＶ４０配列、ヒトＩＧＨＭＢＰ２遺伝子、およびｂＧＨポリＡ配列は、順方向または逆方向にあり得る。別の実施形態では、ベクターは、配列番号８の１～４３９７のヌクレオチドに対して少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有する、ヌクレオチド配列を含む。配列番号８に記載されるプラスミドは、カナマイシン耐性およびｐＵＣ複製起点をさらに含む。

例示的実施形態では、本開示は、配列番号１７のヌクレオチド配列を含むプラスミドに含有されるｒＡＡＶ構築物を提供する。例えば、ｓｓＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２－ｃｌｉｎｉｃａｌベクターは、配列番号１７のＩＴＲ内にあり、かつそれを含み、図１６に示されるヌクレオチド配列を含む。ｒＡＡＶベクターは、配列番号１９に記載される５’ＩＴＲを含む。加えて、ｒＡＡＶベクターは、それぞれ逆方向に、Ｐ５４６プロモーター配列、修飾ＳＶ４０イントロン配列、ヒトＩＧＨＭＢＰ２遺伝子のためのコード配列、およびｂＧＨポリＡ、ならびに配列番号１２に記載される３’ＩＴＲを含む。一実施形態では、ベクターは、配列番号１７のヌクレオチド１～４３６４を含む。ＩＴＲ内のヌクレオチドは、順方向または逆方向にあり得る。別の実施形態では、ベクターは、配列番号１７の１～４３６４のヌクレオチドに対して少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有する、ヌクレオチド配列を含む。配列番号１７に記載されるプラスミドは、カナマイシン耐性遺伝子およびｐＵＣ複製起点をさらに含む。カナマイシン耐性遺伝子は、順方向または逆方向にあり得る。

別の態様では、本明細書に記載のポリヌクレオチド配列を含むゲノムを有する組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）が、本明細書に記載される。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶは、血清型ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶＲＨ１０、ＡＡＶＲＨ７４、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶ１３、またはＡｎｃ８０、ＡＡＶ７ｍ８、およびそれらの誘導体のものである。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶのゲノムは、プロモーター断片と、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡとを含む。

いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶのゲノムは、ＣＢＡプロモーターと、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡとを含む。例示的なゲノムは、ＣＢＡプロモーターと、ｓｓＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２、配列番号７のヌクレオチド１～４３９７として記載されるｒＡＡＶ、または配列番号１８のヌクレオチド１～４３８６として記載されるｒＡＡＶなどのＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡとを含む。

いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶのゲノムは、Ｐ５４６プロモーターと、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡとを含む。例示的なゲノムは、Ｐ５４６プロモーターと、ｓｓＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２などのＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡと、配列番号８のヌクレオチド１～４３７５として記載されるｒＡＡＶ、または配列番号１７のヌクレオチド１～４３６４として記載されるｒＡＡＶとを含む。

いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶのゲノムは、ＣＢＡプロモーターの断片またはＰ５４６プロモーターの断片と、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡとを含み、プロモーターの断片は、プロモーター活性を保持する。

別の態様では、本明細書に記載のｒＡＡＶを含むｒＡＡＶ粒子が、本明細書に記載される。

本明細書に記載のｒＡＡＶのうちのいずれかまたは本明細書に記載のウイルス粒子のうちのいずれかを含む、組成物である。いくつかの実施形態では、組成物は、組成物の粘度および／または密度を増加させる薬剤をさらに含む。例えば、いくつかの実施形態では、その薬剤は、造影剤である。造影剤は、約２０～４０％の非イオン性低浸透圧化合物もしくは造影剤、またはイオヘキソールなどの約２５％～約３５％の非イオン性低浸透圧化合物であり得る。開示された組成物は、脳脊髄液への直接注射、脳室内送達、髄腔内送達、または静脈内送達などの任意の送達手段のために配合され得る。

いくつかの実施形態では、組成物は、組成物の粘度を約０．０５％、または約１％、または１．５％、または約２％、または約２．５％、または約３％または約４％、または約５％、または約６％、または約７％、または約８％、または約９％、または約１０％増加させる薬剤を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、組成物の粘度を約１％～約５％、または約２％～１２％、または約５％～約１０％、または約１％～約２０％、または約１０％～約２０％、または約１０％～約３０％、または約２０％～約４０％、または約２０％～約５０％、または約１０％～約５０％、または約１％～約５０％増加させる。

いくつかの実施形態では、組成物は、組成物の密度を約０．０５％、または約１％、または１．５％、または約２％、または約２．５％、または約３％、または約４％、または約５％、または約６％、または約７％、または約８％、または約９％、または約１０％増加させる薬剤を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、組成物の密度を約１％～約５％、または約２％～１２％、または約５％～約１０％、または約１％～約２０％または約１０％～約２０％、または約１０％～約３０％、または約２０％～約４０％または約２０％～約５０％、または約１０％～約５０％、または約１％～約５０％増加させる。

例えば、開示された組成物は、髄腔内送達のために配合され、患者当たり約１ｅ１３ｖｇ～患者当たり約１ｅ１５ｖｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含む。

加えて、開示された組成物は、静脈内送達のために配合され、約１ｅ１３ｖｇ／ｋｇ～約２ｅ１４ｖｇ／ｋｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含む。

本明細書に記載のｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子を投与することを含む、ＩＧＨＭＢＰ２関連障害の治療を必要とする対象においてＩＧＨＭＢＰ２関連障害を治療する方法が、特に企図される。いくつかの実施形態では、方法は、ｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の前、後、またはそれと同時に免疫抑制剤を投与することをさらに含む。ＩＧＨＭＰＢ２関連障害には、ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質の機能の喪失をもたらすか、またはＩＧＨＭＰＢ２タンパク質の発現の低減を引き起こす、変異によって引き起こされる障害または疾患が含まれる。ＩＧＨＭＰＢ２関連障害は、発現または活性の低減の原因にもかかわらず、ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質の発現または活性の低減に関連する任意の疾患または障害であり得る。本開示は、ＩＧＨＭＰＢ２遺伝子の変異についてのホモ接合体またはＩＧＨＭＰＢ２遺伝子の変異についてのヘテロ接合体である、対象におけるＩＧＨＭＰＢ２関連障害を企図する。例えば、ＩＧＨＭＢＰ２関連障害は、ＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２ＳなどのＩＧＨＭＢＰ２遺伝子における変異の存在に関連する神経学的障害である。ＩＧＨＭＢＰ２関連障害には、神経学的障害の重症度がＳＭＡＲＤ１およびＣＭＴ２Ｓに罹患している患者で観察される重症度の間であるような、患者が混合表現型を有する障害も含まれる。

方法のうちのいずれかでは、対象は、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子に変異を有する。これらの変異には、本明細書の表１もしくは２に示されるものなどの現在公知であるもの、または神経学的障害に関連する将来同定されるＩＧＨＭＢＰ２遺伝子の変異が含まれる。

本明細書で使用される場合の「対象」は、任意の動物であり得、また、患者とも称され得る。好ましくは、対象は、脊椎動物であり、より好ましくは、対象は、農場家畜（例えば、ウシ、ウマ、ブタ）またはペット（例えば、イヌ、ネコ）などの哺乳動物である。いくつかの実施形態では、対象は、ヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、小児対象である。いくつかの実施形態では、対象は、例えば、年齢が１～１０歳に及ぶ対象などの小児対象である。いくつかの実施形態では、対象は、４～１５歳である。対象は、一実施形態では、例えば、年齢が１０～１９歳の範囲に及ぶ対象などの青年対象である。他の実施形態では、対象は、成人（１８歳以上）である。開示された方法のうちのいずれかでは、ｒＡＡＶまたはウイルス粒子は、脳脊髄液への直接注射、脳室内送達、髄腔内送達、または静脈内送達によって送達される。例えば、方法のうちのいずれかでは、患者当たり約１ｅ１３ｖｇ～患者当たり約１ｅ１５ｖｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量が、髄腔内送達によって対象に投与される。加えて、開示された方法のうちのいずれかでは、約１ｅ１３ｖｇ／ｋｇ～約２ｅ１４ｖｇ／ｋｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量が、静脈内送達によって対象に投与される。

別の態様では、ＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２ＳなどのＩＧＨＭＢＰ２関連障害の治療のための薬剤の調製における本明細書に記載のｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の使用が、本明細書に記載される。例えば、開示された薬剤のうちのいずれかは、脳脊髄液への直接注射、脳室内送達、髄腔内送達、または静脈内送達のために配合される。例えば、薬剤は、患者当たり約１ｅ１３ｖｇ～患者当たり約１ｅ１５ｖｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含み、髄腔内送達によって対象に投与される。加えて、薬剤は、約１ｅ１３ｖｇ／ｋｇ～約２ｅ１４ｖｇ／ｋｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含み、静脈内送達によって対象に投与される。いくつかの実施形態では、薬剤は、免疫抑制剤の投与の前または後に、同時に投与される。

別の態様では、ＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２ＳなどのＩＧＨＭＢＰ２関連障害の治療のための本明細書に記載のｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子を含む組成物が、本明細書に記載される。例えば、開示された組成物のうちのいずれかは、脳脊髄液への直接注射、脳室内送達、髄腔内送達、または静脈内送達のために配合される。例えば、組成物は、患者当たり約１ｅ１３ｖｇ～患者当たり約１ｅ１５ｖｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含み、髄腔内送達によって対象に投与される。加えて、組成物は、約１ｅ１３ｖｇ／ｋｇ～約２ｅ１４ｖｇ／ｋｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含み、静脈内送達によって対象に投与される。いくつかの実施形態では、組成物は、免疫抑制剤の投与の前または後に、同時に投与される。別の実施形態では、組成物は、免疫抑制剤をさらに含む。

図１は、ＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２（プロモーター１＝ＣＢプロモーター）およびＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２（プロモーター２＝Ｐ５４６プロモーター）の概略図を提供する。 図２は、ｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｆｗ（配列番号７）のプラスミドマップを提供する。 図３は、ｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｆｗ（配列番号８）のプラスミドマップを提供する。このベクターは、本明細書に記載のｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎと同一である。Ｐ５４６５プロモーター（配列番号４）はまた、本明細書ではＭｅＣｐ２または５４６とも称され、これらの用語は、同義的に使用され得る。 図４は、ウイルスＡ（ＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２）、ウイルスＢ（空のＡＡＶ９カプシド）、およびウイルスＣ（ＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２）で処置されたｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの代表的な写真を提供する。すべての画像は、処置後２～３週間に撮影された。 図５は、動物が組織学のために犠牲にされた、注射後８週間までにウイルスＡ、ウイルスＢ、ウイルスＣで処置されたｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの生存分析を提供する。ウイルスＡおよびウイルスＣは、大部分がこれらのマウスの生存を回復するが、ウイルスＢ（空のウイルス粒子）には効果がない。 図６Ａ～６Ｂは、ウイルスＡ、ウイルスＢ、またはウイルスＣを用いた処置後のｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの体重増加を示すグラフを提供する。 図６Ａ～６Ｂは、ウイルスＡ、ウイルスＢ、またはウイルスＣを用いた処置後のｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの体重増加を示すグラフを提供する。 図７は、吊り下げワイヤー試験を使用したｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの強度試験を描写し、ウイルスＡ、ウイルスＢ、またはウイルスＣを用いた処置後にマウスが落下するまでワイヤーにつかまることができる時間を測定する、グラフを提供する。 図８Ａ～８Ｄは、ウイルスＡおよびウイルスＣが神経および筋肉面積に強い影響を及ぼしたことを実証する写真を提供する。 図８Ａ～８Ｄは、ウイルスＡおよびウイルスＣが神経および筋肉面積に強い影響を及ぼしたことを実証する写真を提供する。 図９Ａ～９Ｃ：図９Ａおよび９Ｂは、ウイルスＡまたはウイルスＣを用いた処置から８週間後の内側腓腹筋（ＭＧ）の完全に神経支配された、除神経された、および部分的に神経支配された神経筋接合部（ＮＭＪ）の代表的な写真を提供する。野生型マウスは、完全に神経支配されたＮＭＪを有し、未処置マウスは、生後２～３週間後にＮＭＪにほとんど神経支配を有していなかった。処置されたマウスは、処置後８週間に、完全に神経支配された、断片化された、および除神経されたＮＭＪの混合物を有していた。中央のパネルは、シナプス前神経を表すニューロフィラメントを染色し、右のパネルは、シナプス後アセチルコリン受容体を染色する。図９Ｃのグラフは、内側腓腹筋およびヒラメ筋上のＮＭＪの計数を提供する。 図９Ａ～９Ｃ：図９Ａおよび９Ｂは、ウイルスＡまたはウイルスＣを用いた処置から８週間後の内側腓腹筋（ＭＧ）の完全に神経支配された、除神経された、および部分的に神経支配された神経筋接合部（ＮＭＪ）の代表的な写真を提供する。野生型マウスは、完全に神経支配されたＮＭＪを有し、未処置マウスは、生後２～３週間後にＮＭＪにほとんど神経支配を有していなかった。処置されたマウスは、処置後８週間に、完全に神経支配された、断片化された、および除神経されたＮＭＪの混合物を有していた。中央のパネルは、シナプス前神経を表すニューロフィラメントを染色し、右のパネルは、シナプス後アセチルコリン受容体を染色する。図９Ｃのグラフは、内側腓腹筋およびヒラメ筋上のＮＭＪの計数を提供する。 図９Ａ～９Ｃ：図９Ａおよび９Ｂは、ウイルスＡまたはウイルスＣを用いた処置から８週間後の内側腓腹筋（ＭＧ）の完全に神経支配された、除神経された、および部分的に神経支配された神経筋接合部（ＮＭＪ）の代表的な写真を提供する。野生型マウスは、完全に神経支配されたＮＭＪを有し、未処置マウスは、生後２～３週間後にＮＭＪにほとんど神経支配を有していなかった。処置されたマウスは、処置後８週間に、完全に神経支配された、断片化された、および除神経されたＮＭＪの混合物を有していた。中央のパネルは、シナプス前神経を表すニューロフィラメントを染色し、右のパネルは、シナプス後アセチルコリン受容体を染色する。図９Ｃのグラフは、内側腓腹筋およびヒラメ筋上のＮＭＪの計数を提供する。 図１０は、ウイルスＡおよびウイルスＣがｎｍｄ－２Ｊマウスモデルにおいて生存を改善することを実証する、生存プロットを提供する。 図１１Ａ～１１Ｄは、電気生理学的結果、すなわち、複合筋活動電位（ＣＭＡＰ）、単一運動単位電位（ＳＭＵＰ）、および運動単位数推定（ＭＵＮＥ）のプロットを提供する。ウイルスＡおよびウイルスＣの両方でＣＭＡＰおよびＭＵＮＥ上の有意な増加がある。ウイルスＡおよびＣは、相互に異ならなかった。ＣＭＡＰ：神経支配の強度を測定する。ＭＵＮＥ：筋肉を神経支配するニューロンの数を推定する。 図１２Ａ～１２Ｃは、健康なマウスならびにウイルスＡおよびウイルスＣで処置されたＥｍ５マウスでの吊り下げワイヤー試験からの結果を提供する。図Ｂは、健康なマウス、ならびにウイルスＡおよびウイルスＣで処置されたＥｍ５マウスにおける筋肉量の増加を示し、図１２Ｃは、全体重に関連して腓腹筋の重量を提供する。 図１３は、プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｆｗ（配列番号７）の注釈付き配列を提供する。 図１３は、プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｆｗ（配列番号７）の注釈付き配列を提供する。 図１４は、プラスミドｓｓ．ＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｆｗ（配列番号８）の注釈付き配列を提供する。 図１４は、プラスミドｓｓ．ＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｆｗ（配列番号８）の注釈付き配列を提供する。 図１５は、ｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１７）のプラスミドマップを提供する。Ｐ５４６プロモーター（配列番号４）はまた、本明細書ではＭｅＣｐ２または５４６とも称され、これらの用語は、同義的に使用され得る。このプラスミドでは、Ｐ５４６プロモーター配列、ＳＶ４０イントロン配列、およびＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡ配列は、逆方向にある。 図１６は、プラスミドｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１７）の注釈付き配列を提供する。 図１６は、プラスミドｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１７）の注釈付き配列を提供する。 図１６は、プラスミドｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１７）の注釈付き配列を提供する。 図１７は、ｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１８）のプラスミドマップを提供する。このプラスミドでは、ＣＭＶエンハンサー配列、ＣＢプロモーター配列、ＳＶ４０イントロン配列、およびＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡ配列は、逆方向にある。 図１８は、プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１８）の注釈付き配列を提供する。 図１８は、プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１８）の注釈付き配列を提供する。 図１８は、プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－Ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１８）の注釈付き配列を提供する。

免疫グロブリン－μ結合タンパク質２（ＩＧＨＭＢＰ２）遺伝子は、ヘリカーゼドメイン、Ｒ３Ｈドメイン、ジンクフィンガードメイン、および核局在化シグナル配列からなるヘリカーゼスーパーファミリー１（ＳＦ１）内のＵｐｆ１様群の構成要素である、タンパク質をコードする。ＩＧＨＭＰＢ２遺伝子の変異は、呼吸困難１型（ＳＭＡＲＤ１）およびシャルコー・マリー・トゥース病２Ｓ型（ＣＭＴ２Ｓ）を伴う脊髄性筋萎縮症を引き起こすことが公知である。ＩＧＨＭＰＢ２遺伝子における患者変異の大部分は、ヘリカーゼドメイン内でクラスター化し、ミスセンス変異である。

ＩＧＨＭＰＢ２変異
ＩＧＨＭＰＢ２の野生型ｃＤＮＡ配列は、配列番号１（Ｇｅｎｂａｎｋ ＮＭ＿００２１８０．２）に記載され、ＤＮＡ結合タンパク質ＳＭＵＢ－２としても知られるＩＧＨＭＰＢ２タンパク質は、配列番号２（Ｇｅｎｂａｎｋ ＮＰ＿００２１７１．２）に記載される。野生型遺伝子産物は、７つの推定ヘリカーゼモチーフおよびＲＮＡヘリカーゼに典型的なＤＥＡＤボックス様モチーフを有する、９９３アミノ酸タンパク質である。変異は、ヘリカーゼ活性の機能不全につながり得る。ＩＧＨＭＰＢ２遺伝子は、１５個のエクソンを有することが公知である。ＩＧＨＭＰＢ２遺伝子の変異は、ＳＭＡＲＤ１およびＣＭＴ２Ｓに関連することが見出された。
ＳＭＡＲＤ１を引き起こす約２６個の既知のＩＧＨＭＰＢ２変異がある。変異には、劣性ミスセンス変異、ナンセンス変異、フレームシフト、フレーム内欠失、フレームシフト挿入、およびスプライスドナー部位変異が含まれ、ＩＧＨＭＰＢ２遺伝子の１５個のエクソンに及ぶ（Ｌｕａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｒａｉｎ ＆ Ｄｅｖ．２８：６８５－６８９，２０１６、参照により本明細書に組み込まれる）。ＳＭＡＲＤ１を引き起こすことが公知である例示的な変異が、表１で以下に要約される。開示された遺伝子療法ベクターおよび治療方法は、ＳＭＡＲＤ１を引き起こすＩＧＨＭＰＢ２の他の変異が将来識別され得るため、表１に提供される変異によって引き起こされる障害または出願時に公知であるものに限定されない。表１

ＣＭＴ２Ｓを引き起こす既知のＩＧＨＭＰＢ２変異は、軸索神経障害を引き起こす常染色体劣性変異である（Ｃｏｔｔｅｎｉｅ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ．２０１４；９５：５９０－６０１、Ｓｃｈｏｔｔｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｅｕｒｏｌｏｇｙ．２０１５；８４：５２３－３１、両方とも参照により本明細書に組み込まれる）。ＣＭＴ２Ｓを引き起こすことが公知である例示的な変異が、表２で以下に要約される。開示された遺伝子療法ベクターおよび治療方法は、ＣＭＴ２Ｓを引き起こすＩＧＨＭＰＢ２の他の変異が将来識別され得るため、表２に提供される変異によって引き起こされる障害または出願時に公知であるものに限定されない。

ＳＭＡＲＤ１の診断および進行
ＳＭＡＲＤ１はまた、常染色体劣性遠位脊髄性筋萎縮症１遠位遺伝性運動神経障害ＶＩ型（ｄＨＭＮ６もしくはＨＭＮ６）または遠位筋ジストロフィー１型（ＤＳＭＡ－１）としても公知である。この障害は、乳児ＳＭＡの変異体である。ＳＭＡＲＤ１の最も顕著な症状は、胸部Ｘ線上に示される内臓脱出症を伴う横隔膜麻痺に起因する重度の呼吸困難、３％を下回る低出生体重、離乳不能、および上肢における進行性筋力低下であり、遠位筋もまた、影響を受ける。追加の症状には、低い運動神経伝導速度、および腓腹神経生検での有髄線維のサイズの縮小が含まれる。感覚神経および自律神経もまた、一部の患者では、疼痛知覚の減少、過剰発汗、便秘、および膀胱失禁によって実証されるように影響を受けた。臨床的特徴には、子宮内胎児発育遅延、未熟児、弱い泣き声、および足の奇形が含まれる。症状は通常、１カ月齢～６カ月齢で現れる。

シャルコー・マリー・トゥース遺伝性神経障害２（ＣＭＴ２）の診断および進行
ＣＭＴ２は、進行性末梢運動および感覚神経障害であり、一般に、ｉ）正常範囲（＞４０～５０ｍ／秒）を伴うが、時として軽度に異常な範囲（＞３０～４０ｍ／秒）内である神経伝導速度（ＮＣＶ）、ｉｉ）正の波、多相性電位、または細動、ならびに誘発された運動および感覚反応の振幅の低減などの所見を伴う軸索神経障害の証拠を示すＥＭＧ検査、ｉｉｉ）複合運動活動電位（ＣＭＡＰ）の大幅な低減および／または（必ずではないが）典型的には劣性様式と一致する家族歴のうちの１つ以上を測定して診断される。

神経生検は、診断のために要求されないが、進行を監視するか、または診断を確認する方法として使用され得る。神経生検は、再生の兆候を伴う有髄線維の喪失、軸索発芽、およびニューロフィラメントを伴う萎縮性軸索、ならびに対照よりも大きな節の間隙および短い節間の長さを示し、節間形成の発達異常を示唆している。

ＣＭＴ２Ｓは、感覚系ではなく運動系の神経をより顕著に関与させるが、両方が関与する。罹患した個人は、典型的には、通常、腱反射の減弱および軽度の感覚喪失または感覚喪失なしに関連する足および／または手の遠位筋のゆっくりと進行する衰弱および萎縮を有する。罹患した個人は、通常、５歳～２５歳の間に症候性になるが、発症は、歩行の遅れを伴う乳児期から３０年後までに及ぶ。典型的な主症状は、足および足首の衰弱である。最初の身体所見は、足首における足背屈の衰弱を伴う腱反射の減弱または欠如である。

ＣＭＴ２Ｓがある成人患者は、典型的には、両側性下垂足、膝下の筋肉の対称性萎縮（コウノトリ脚外観）、および下肢の腱反射の欠如を有する。活発な腱反射および伸筋足底反応、ならびに非対称性筋萎縮もまた、罹患した個人の最大１５％で報告されている。発声または呼吸の困難をもたらす声帯または横隔神経の関与が観察されている。加えて、むずむず脚症候群および睡眠時無呼吸も観察されている。

ＡＡＶ遺伝子療法
本開示は、ＩＧＨＭＰＢ２ ｃＤＮＡを発現する遺伝子療法ベクター、例えば、ｒＡＡＶベクター、およびＩＧＨＭＰＢ２関連障害を治療する方法を提供する。ＩＧＨＭＰＢ２関連障害には、ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質の機能の喪失を引き起こすか、またはＩＧＨＭＰＢ２タンパク質の発現の低減を引き起こす、変異によって引き起こされる障害が含まれる。さらに、発現または活性の低減の原因にもかかわらず、ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質の発現または活性の低減に関連する任意の疾患または障害である。

本明細書で使用される場合、「ＡＡＶ」という用語は、アデノ随伴ウイルスの一般的な略語である。アデノ随伴ウイルスは、ある特定の機能が同時感染ヘルパーウイルスによって提供される細胞内でのみ成長する一本鎖ＤＮＡパルボウイルスである。現在、ＡＡＶの１３個の血清型が存在し、それらは、例えば、Ｃａｒｔｅｒ，１９８９，Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓｅｓ，Ｖｏｌ．１，ｐｐ．１６９－２２８、およびＢｅｒｎｓ，１９９０，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，ｐｐ．１７４３－１７６４，Ｒａｖｅｎ Ｐｒｅｓｓ，（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ）で見出され得る、ＡＡＶの一般的な情報および概説で特性評価されている。しかしながら、様々な血清型が遺伝子レベルでさえも構造的および機能的の両方で非常に密接に関連していることが周知であるため、これらの同じ原理が追加のＡＡＶ血清型に適用可能であることが十分に予想される。（例えば、Ｂｌａｃｋｌｏｗｅ，１９８８，ｐｐ．１６５－１７４ ｏｆ Ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓｅｓ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｄｉｓｅａｓｅ，Ｊ．Ｒ．Ｐａｔｔｉｓｏｎ，ｅｄ．、およびＲｏｓｅ，Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ ３：１－６１（１９７４）を参照されたい）。例えば、すべてのＡＡＶ血清型は、相同ｒｅｐ遺伝子によって媒介される非常に類似した複製特性を明らかに呈し、これらはすべて、ＡＡＶ２で発現されるもの等の３つの関連カプシドタンパク質を有する。関連性の程度は、ゲノムの長さに沿った血清型間の広範な交差ハイブリダイゼーション、および「逆位末端反復配列」（ＩＴＲ）に対応する末端における類似自己アニーリングセグメントの存在を明らかにする、ヘテロ二本鎖分析によってさらに示唆される。類似感染性パターンはまた、各血清型における複製機能が類似調節制御下にあることも示唆する。

本明細書で使用される場合の「ＡＡＶベクター」とは、ＡＡＶ末端反復配列（ＩＴＲ）に隣接している１つ以上の目的とするポリヌクレオチド（または導入遺伝子）を指す。かかるＡＡＶベクターは、ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子産物をコードおよび発現するベクターでトランスフェクトされた宿主細胞中に存在する場合に、感染性ウイルス粒子に複製およびパッケージングされ得る。

「ＡＡＶビリオン」または「ＡＡＶウイルス粒子」または「ＡＡＶベクター粒子」とは、少なくとも１つのＡＡＶカプシドタンパク質およびカプシドに包まれたポリヌクレオチドＡＡＶベクターからなるウイルス粒子を指す。粒子が異種ポリヌクレオチド（すなわち、哺乳動物細胞に送達される導入遺伝子などの野生型ＡＡＶゲノム以外のポリヌクレオチド）を含む場合、それは、典型的には、「ＡＡＶベクター粒子」または単に「ＡＡＶベクター」と称される。したがって、かかるベクターがＡＡＶベクター粒子内に含有されるため、ＡＡＶベクター粒子の産生には、必然的にＡＡＶベクターの産生が含まれる。

アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）は、複製欠損パルボウイルスであり、その一本鎖ＤＮＡゲノムは、逆位末端配列（ＩＴＲ）を含む約４．７ｋｂ長である。例示的なＩＴＲ配列は、配列番号１１、１２、および１９に記載されるＩＴＲ配列などの、長さが１３０個の塩基対または長さが１４１個の塩基対であり得る。ＡＡＶの複数の血清型がある。ＡＡＶ血清型のゲノムのヌクレオチド配列は、公知である。例えば、ＡＡＶ血清型２（ＡＡＶ２）ゲノムのヌクレオチド配列は、Ｒｕｆｆｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｇｅｎ Ｖｉｒｏｌ，７５：３３８５－３３９２（１９９４）によって修正されたＳｒｉｖａｓｔａｖａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｖｉｒｏｌ，４５：５５５－５６４（１９８３）に提示されている。他の例として、ＡＡＶ－１の完全ゲノムは、ＧｅｎＢａｎｋ受理番号ＮＣ＿００２０７７で提供されており、ＡＡＶ－３の完全ゲノムは、ＧｅｎＢａｎｋ受理番号ＮＣ＿１８２９で提供されており、ＡＡＶ－４の完全ゲノムは、ＧｅｎＢａｎｋ受理番号ＮＣ＿００１８２９で提供されており、ＡＡＶ－５ゲノムは、ＧｅｎＢａｎｋ受理番号ＡＦ０８５７１６で提供されており、ＡＡＶ－６の完全ゲノムは、ＧｅｎＢａｎｋ受理番号ＮＣ＿００１８６２で提供されており、ＡＡＶ－７およびＡＡＶ－８のゲノムの少なくとも一部は、それぞれ、ＧｅｎＢａｎｋ受理番号ＡＸ７５３２４６およびＡＸ７５３２４９で提供されており（ＡＡＶ－８に関する米国特許第７，２８２，１９９および同第７，７９０，４４９もまた参照）、ＡＡＶ－９ゲノムは、Ｇａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７８：６３８１－６３８８（２００４）で提供されており、ＡＡＶ－１０ゲノムは、Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．，１３（１）：６７－７６（２００６）に提示されており、ＡＡＶ－１１ゲノムは、Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，３３０（２）：３７５－３８３（２００４）で提供されている。ＡＡＶｒｈ．７４血清型のクローニングは、Ｒｏｄｉｎｏ－Ｋｌａｐａｃ．，ｅｔ ａｌ．Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ ｍｅｄｉｃｉｎｅ ５，４５（２００７）に記載されている。ウイルスＤＮＡ複製（ｒｅｐ）、カプシド形成／パッケージング、および宿主細胞染色体組み込みを指示するＣｉｓ作用配列は、ＩＴＲ内に含有される。３つのＡＡＶプロモーター（それらの相対マップ位置に対してｐ５、ｐ１９、およびｐ４０と名付けられる）は、ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子をコードする２つのＡＡＶ内部オープンリーディングフレームの発現を駆動する。単一のＡＡＶイントロンの差異的スプライシング（例えば、ＡＡＶ２のヌクレオチド２１０７および２２２７における）と相まって、２つのｒｅｐプロモーター（ｐ５およびｐ１９）は、ｒｅｐ遺伝子から４つのｒｅｐタンパク質（ｒｅｐ７８、ｒｅｐ６８、ｒｅｐ５２、およびｒｅｐ４０）の産生をもたらす。Ｒｅｐタンパク質は、最終的にウイルスゲノムの複製に関与する複数の酵素特性を保有する。ｃａｐ遺伝子は、ｐ４０プロモーターから発現され、３つのカプシドタンパク質ＶＰ１、ＶＰ２、およびＶＰ３をコードする。選択的スプライシングおよび非コンセンサス翻訳開始部位は、３つの関連カプシドタンパク質の産生に関与する。単一コンセンサスポリアデニル化部位は、ＡＡＶゲノムのマップ位置９５に位置する。ＡＡＶのライフサイクルおよび遺伝学は、Ｍｕｚｙｃｚｋａ，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｔｏｐｉｃｓ ｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，１５８：９７－１２９（１９９２）に概説されている。

ＡＡＶは、例えば、遺伝子療法において、外来ＤＮＡを細胞に送達するためのベクターとしてそれを魅力的にする固有の特徴を有する。培養中の細胞のＡＡＶ感染は、非細胞変性であり、ヒトおよび他の動物の自然感染は、サイレントおよび無症候性である。さらに、ＡＡＶは、多くの哺乳動物細胞を感染させ、インビボで多くの異なる組織を標的とする可能性を許容する。さらに、ＡＡＶは、ゆっくりと分裂する細胞および非分裂細胞を形質導入し、転写的に活性な核エピソーム（染色体外要素）としてそれらの細胞の寿命にわたって本質的に存続することができる。ＡＡＶプロウイルスゲノムは、組換えゲノムの構築を実現可能にするプラスミド中のクローン化ＤＮＡとして感染性である。さらに、ＡＡＶ複製、ゲノムカプシド形成および組み込みを指示するシグナルがＡＡＶゲノムのＩＴＲ内に含有されるため、ゲノムの内部約４．３ｋｂ（複製および構造カプシドタンパク質、ｒｅｐ－ｃａｐをコードする）のいくつかまたはすべては、プロモーター、目的のＤＮＡ、およびポリアデニル化シグナルを含有する遺伝子カセットなどの外来ＤＮＡと置換され得る。ｒｅｐおよびｃａｐタンパク質は、トランスで提供され得る。ＡＡＶの別の重要な特徴は、それが極めて安定した頑健なウイルスであることである。これは、アデノウイルスを不活性化するために使用される条件（５６℃～６５℃で数時間）に容易に耐え、ＡＡＶの低温保存の重要性を低くする。ＡＡＶは、凍結乾燥され得る。最後に、ＡＡＶ感染細胞は、重複感染に耐性を示さない。

複数の研究により、筋肉における長期（１．５年を超える）の組換えＡＡＶ媒介タンパク質発現が実証されている。Ｃｌａｒｋ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ，８：６５９－６６９（１９９７）、Ｋｅｓｓｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔ．Ａｃａｄ Ｓｃ．ＵＳＡ，９３：１４０８２－１４０８７（１９９６）、およびＸｉａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｖｉｒｏｌ，７０：８０９８－８１０８（１９９６）を参照されたい。また、Ｃｈａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｔｈｅｒ，２：６１９－６２３（２０００）、およびＣｈａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｔｈｅｒ，４：２１７－２２２（２００１）も参照されたい。さらに、筋肉は高度に血管化されているため、Ｈｅｒｚｏｇ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ，９４：５８０４－５８０９（１９９７）、およびＭｕｒｐｈｙ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ，９４：１３９２１－１３９２６（１９９７）に記載されているように、組換えＡＡＶ形質導入が、筋肉内注射に続いて体循環において導入遺伝子産物の出現をもたらした。さらに、Ｌｅｗｉｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｖｉｒｏｌ，７６：８７６９－８７７５（２００２）は、骨格筋線維が、正しい抗体グリコシル化、折り畳み、および分泌のための必要な細胞因子を保有することを実証し、筋肉が分泌タンパク質治療薬の安定した発現が可能であることを示した。

本開示の組換えＡＡＶゲノムは、本開示の核酸分子および核酸分子に隣接する１つ以上のＡＡＶ ＩＴＲを含む。ｒＡＡＶゲノム中のＡＡＶ ＤＮＡは、ＡＡＶ血清型（例えば、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶＲＨ１０、ＡＡＶＲＨ７４、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶ１３、またはＡｎｃ８０、ＡＡＶ７ｍ８、およびそれらの誘導体）を含むが、これらに限定されない、組換えウイルスが由来し得る任意のＡＡＶ血清型に由来し得る。偽型ｒＡＡＶの産生は、例えば、ＷＯ０１／８３６９２に開示されている。他のタイプのｒＡＡＶ変異体、例えば、カプシド変異を有するｒＡＡＶも企図される。例えば、Ｍａｒｓｉｃ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，２２（１１）：１９００－１９０９（２０１４）を参照されたい。上記の背景技術の部分に記載されたように、様々なＡＡＶ血清型のゲノムのヌクレオチド配列が、当該技術分野において既知である。

提供される組換えＡＡＶ（すなわち、感染性カプシド化ｒＡＡＶ粒子）は、ｒＡＡＶゲノムを含む。「ｒＡＡＶゲノム」という用語は、修飾されている天然のＡＡＶゲノムに由来するポリヌクレオチド配列を指す。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶゲノムは、天然のｃａｐおよびｒｅｐ遺伝子を除去するために修飾されている。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶゲノムは、内因性５’および３’逆位末端反復（ＩＴＲ）を含む。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶゲノムは、ＡＡＶゲノムが由来したＡＡＶ血清型とは異なるＡＡＶ血清型からのＩＴＲを含む。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶゲノムは、逆位末端反復（ＩＴＲ）によって５’末端および３’末端上に隣接した目的の導入遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶのゲノムは、「遺伝子カセット」を含む。例示的実施形態では、両方のｒＡＡＶのゲノムは、ＡＡＶ ｒｅｐおよびｃａｐ ＤＮＡを欠き、すなわち、ゲノムのＩＴＲの間にＡＡＶ ｒｅｐまたはｃａｐ ＤＮＡが存在しない。

本明細書に提供されるｒＡＡＶゲノムは、いくつかの実施形態では、導入遺伝子ポリヌクレオチド配列に隣接する１つ以上のＡＡＶ ＩＴＲを含む。導入遺伝子ポリヌクレオチド配列は、遺伝子カセットを形成するために標的細胞内で機能的である転写制御要素（プロモーター、エンハンサー、および／またはポリアデニル化シグナル配列を含むが、これらに限定されない）に作動可能に連結されている。プロモーターの例は、ｐＩＲＦプロモーター、配列番号３に記載されるポリヌクレオチド配列を含むニワトリβアクチンプロモーター（ＣＢＡ）、および配列番号４に記載されるポリヌクレオチド配列を含むＰ５４６プロモーターである。シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）初期プロモーター、マウス乳腺腫瘍ウイルス（ＭＭＴＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）長末端反復（ＬＴＲ）プロモーター、ＭｏＭｕＬＶプロモーター、トリ白血病ウイルスプロモーター、エプスタイン－バールウイルス最初期プロモーター、ラウス肉腫ウイルスプロモーター、ならびに、アクチンプロモーター、ミオシンプロモーター、伸長因子－１ａプロモーター、ヘモグロビンプロモーター、およびクレアチンキナーゼプロモーターなどであるが、これらに限定されないヒト遺伝子プロモーターを含むが、これらに限定されない追加のプロモーターが、本明細書で企図される。

加えて、本明細書では、ＣＢプロモーター配列、Ｐ５４６プロモーター配列、および転写促進活性を示すＣＢＡ（配列番号３）またはＰ５４６（配列番号４）配列のヌクレオチド配列に対して少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるプロモーター配列が提供される。

転写制御要素の他の例は、組織特異的制御要素、例えば、ニューロン内で特異的に、または星状細胞内での特異的に発現を可能にするプロモーターである。例としては、ニューロン特異的エノラーゼおよびグリア線維性酸性タンパク質プロモーターが挙げられる。誘導性プロモーターもまた、企図される。誘導性プロモーターの非限定的な例としては、メタロチオネインプロモーター、グルココルチコイドプロモーター、プロゲステロンプロモーター、およびテトラサイクリン調節プロモーターが挙げられるが、これらに限定されない。遺伝子カセットはまた、哺乳動物細胞中で発現されたときに導入遺伝子ＲＮＡ転写物のプロセシングを容易にするためのイントロン配列を含んでもよい。このようなイントロンの一例は、ＳＶ４０イントロンである。

本明細書で提供されるｒＡＡＶゲノムは、ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質をコードするポリヌクレオチド（配列番号１）を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるｒＡＡＶゲノムは、ＩＧＨＭＰＢ２ ｃＤＮＡ（配列番号１）によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドを含む。

本明細書で提供されるｒＡＡＶゲノムは、配列番号７のヌクレオチド１～４３９７または配列番号８のヌクレオチド１～４３７５を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるｒＡＡＶゲノムは、配列番号７のヌクレオチド１～４３９７または配列番号７配列番号７もしくは８のヌクレオチド１～４３７５に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるポリヌクレオチドを含む。

本明細書で提供されるｒＡＡＶゲノム、いくつかの実施形態では、ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質をコードし、厳しい条件下で配列番号１に記載されるポリヌクレオチド配列またはその補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド配列。

本開示のＤＮＡプラスミドは、本開示のｒＡＡＶゲノムを含む。ＤＮＡプラスミドは、ｒＡＡＶゲノムの感染性ウイルス粒子への組み立てのために、ＡＡＶのヘルパーウイルス（例えば、アデノウイルス、Ｅ１欠失アデノウイルス、またはヘルペスウイルス）の感染に許容される細胞に移される。パッケージングされるＡＡＶゲノム、ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子、ならびにヘルパーウイルス機能が細胞に提供される、ｒＡＡＶ粒子を産生する技術は、当該技術分野において標準的である。ｒＡＡＶの産生は、以下の成分、ｒＡＡＶゲノム、ｒＡＡＶゲノムから分離した（すなわち、その中に存在しない）ＡＡＶ ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子、ならびにヘルパーウイルス機能が、単一細胞（本明細書でパッケージング細胞と表される）内に存在することを必要とする。ＡＡＶ ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子は、組換えウイルスが由来し得る任意のＡＡＶ血清型に由来し得、ＡＡＶ血清型ＡＡＶ－９、ＡＡＶ－１、ＡＡＶ－２、ＡＡＶ－３、ＡＡＶ－４、ＡＡＶ－５、ＡＡＶ－６、ＡＡＶ－７、ＡＡＶｒｈ．７４、ＡＡＶ－８、ＡＡＶ－１０、ＡＡＶ－１１、ＡＡＶ－１２、およびＡＡＶ－１３を含むが、これらに限定されない、ｒＡＡＶゲノムＩＴＲとは異なるＡＡＶ血清型に由来し得る。偽型ｒＡＡＶの産生は、例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれるＷＯ０１／８３６９２に開示される。

パッケージング細胞を生成する方法は、ＡＡＶ粒子の産生のための必要なすべての成分を安定して発現する細胞株を作成することである。例えば、ＡＡＶ ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子を欠くｒＡＡＶゲノム、ｒＡＡＶゲノムから分離したＡＡＶ ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子、ならびにネオマイシン耐性遺伝子などの選択可能なマーカーを含む、プラスミド（または複数のプラスミド）が、細胞のゲノムに組み込まれる。ＡＡＶゲノムは、ＧＣテーリング（Ｓａｍｕｌｓｋｉ ｅｔ ａｌ．，１９８２，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓ６．ＵＳＡ，７９：２０７７－２０８１）、制限エンドヌクレアーゼ切断部位を含有する合成リンカーの付加（Ｌａｕｇｈｌｉｎ ｅｔ ａｌ．，１９８３，Ｇｅｎｅ，２３：６５－７３）、または直接平滑末端ライゲーション（Ｓｅｎａｐａｔｈｙ ＆ Ｃａｒｔｅｒ，１９８４，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２５９：４６６１－４６６６）などの手順により細菌プラスミドに導入されている。次いで、パッケージング細胞株は、アデノウイルスなどのヘルパーウイルスに感染させられる。この方法の利点は、細胞が選択可能であり、ｒＡＡＶの大規模産生に好適であることである。好適な方法の他の例は、ｒＡＡＶゲノムおよび／またはｒｅｐ遺伝子ならびにｃａｐ遺伝子をパッケージング細胞に導入するためのプラスミドではなく、アデノウイルスまたはバキュロウイルスを採用する。

ｒＡＡＶ生産の一般原則は、例えば、Ｃａｒｔｅｒ，１９９２，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎｓ ｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１５３３－５３９、およびＭｕｚｙｃｚｋａ，１９９２，Ｃｕｒｒ．Ｔｏｐｉｃｓ ｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ．ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５８：９７－１２９）に概説されている。様々なアプローチは、Ｒａｔｓｃｈｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．４：２０７２（１９８４）、Ｈｅｒｍｏｎａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：６４６６（１９８４）、Ｔｒａｔｓｃｈｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏ１．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．５：３２５１（１９８５）、ＭｃＬａｕｇｈｌｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６２：１９６３（１９８８）、およびＬｅｂｋｏｗｓｋｉ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．，７：３４９（１９８８）．Ｓａｍｕｌｓｋｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６３：３８２２－３８２８（１９８９）、米国特許第５，１７３，４１４号、ＷＯ９５／１３３６５、ならびに対応する米国特許第５，６５８．７７６号、ＷＯ９５／１３３９２、ＷＯ９６／１７９４７、ＰＣＴ／ＵＳ９８／１８６００、ＷＯ９７／０９４４１（ＰＣＴ／ＵＳ９６／１４４２３）、ＷＯ９７／０８２９８（ＰＣＴ／ＵＳ９６／１３８７２）、ＷＯ９７／２１８２５（ＰＣＴ／ＵＳ９６／２０７７７）、ＷＯ ９７／０６２４３（ＰＣＴ／ＦＲ９６／０１０６４）、ＷＯ９９／１１７６４、Ｐｅｒｒｉｎ ｅｔ ａｌ．Ｖａｃｃｉｎｅ １３：１２４４－１２５０（１９９５）、Ｐａｕｌ ｅｔ ａｌ．Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ４：６０９－６１５（１９９３）、Ｃｌａｒｋ ｅｔ ａｌ．Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ３：１１２４－１１３２（１９９６）、米国特許第５，７８６，２１１号、米国特許第５，８７１，９８２号、および米国特許第６，２５８，５９５号に記載されている。前述の文書は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれ、ｒＡＡＶ産生に関する文書の部分を特に強調する。

したがって、本開示は、感染性ｒＡＡＶを産生するパッケージング細胞を提供する。一実施形態では、パッケージング細胞は、ＨｅＬａ細胞、２９３細胞、およびＰｅｒＣ．６細胞（同種２９３株）などの安定して形質転換されたがん細胞であり得る。別の実施形態では、パッケージング細胞は、低継代２９３細胞（アデノウイルスのＥ１で形質転換されたヒト胎児腎細胞）、ＭＲＣ－５細胞（ヒト胎児線維芽細胞）、ＷＩ－３８細胞（ヒト胎児線維芽細胞）、ベロ細胞（サル腎細胞）、およびＦＲｈＬ－２細胞（アカゲザル胎児肺細胞）などの形質転換されたがん細胞ではない細胞である。

ｒＡＡＶは、カラムクロマトグラフィーまたは塩化セシウム勾配によってなど、当該技術分野で標準的な方法によって精製され得る。ヘルパーウイルスからｒＡＡＶベクターを精製するための方法は、当該技術分野で公知であり、例えば、Ｃｌａｒｋ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．，１０（６）：１０３１－１０３９（１９９９）、Ｓｃｈｅｎｐｐ ａｎｄ Ｃｌａｒｋ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｍｅｄ．，６９ ４２７－４４３（２００２）、米国特許第６，５６６，１１８号、およびＷＯ９８／０９６５７に開示される方法を含む。

本明細書で提供される組成物は、ｒＡＡＶと、１つまたは複数の薬学的に許容される賦形剤とを含む。許容される賦形剤は、レシピエントにとって非毒性であり、好ましくは、採用される投与量および濃度で不活性であり、リン酸塩［例えば、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）］、クエン酸塩、もしくは他の有機酸などの緩衝剤、アスコルビン酸などの抗酸化剤、低分子量ポリペプチド、血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリンなどのタンパク質、ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、もしくはリジンなどのアミノ酸、単糖類、二糖類、およびグルコース、マンノース、もしくはデキストリンを含む他の炭水化物、ＥＤＴＡなどのキレート剤、マンニトールもしくはソルビトールなどの糖アルコール、ナトリウムなどの塩形成対イオン、および／またはＴｗｅｅｎ（登録商標）、ポロキサマー１８８などのコポリマー、Ｐｌｕｒｏｎｉｃｓ（例えば、Ｐｌｕｒｏｎｉｃ Ｆ６８）、もしくはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの非イオン性界面活性剤が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で提供される組成物は、イオビトリドール、イオヘキソール、イオメプロール、イオパミドール、イオペントール、イオプロミド、イオベルソール、またはイオキシランなどの非イオン性低浸透圧化合物を含有する、薬学的に許容される水性賦形剤を含むことができ、非イオン性低浸透圧化合物を含有する水性賦形剤は、以下の特性、約１８０ｍｇＩ／ｍＬ、約３２２ｍＯｓｍ／ｋｇ水の蒸気圧浸透圧法によるオスモル濃度、約２７３ｍＯｓｍ／Ｌのオスモル濃度、２０℃で約２．３ｃｐおよび３７℃で約１．５ｃｐの絶対粘度、ならびに３７℃で約１．１６４の比重のうちの１つ以上を有することができる。

例示的な組成物は、組成物の粘度および／または密度を増加させるための薬剤を含む。例えば、組成物は、組成物の粘度および／または密度を増加させるための造影剤を含む。例示的な組成物は、約２０～４０％の非イオン性低浸透圧化合物もしくは造影剤、または約２５％～約３５％の非イオン性低浸透圧化合物を含む。例示的な組成物は、２０ｍＭのＴｒｉｓ（ｐＨ８．０）、１ｍＭのＭｇＣｌ_２、２００ｍＭのＮａＣｌ、０．００１％のポロキサマー１８８、および約２５％～約３５％の非イオン性低浸透圧化合物中に配合されたｓｃＡＡＶまたはｒＡＡＶウイルス粒子を含む。別の例示的な組成物は、１×ＰＢＳおよび０．００１％プルロニック（登録商標）Ｆ６８中に配合されたｓｃＡＡＶを含む。

本開示の方法で投与されるｒＡＡＶの投与量は、例えば、特定のｒＡＡＶ、投与モード、投与の時間、治療目標、個体、および標的とされる細胞型によって変動し、当該技術分野で標準的な方法によって決定され得る。投与量は、ウイルスゲノムの単位（ｖｇ）で表され得る。本明細書で企図される投与量は、１×１０^７、１×１０^８、１×１０^９、５×１０^９、６×１０^９、７×１０^９、８×１０^９、９×１０^９、１×１０^１０、２×１０^１０、３×１０^１０、４×１０^１０、５×１０^１０、１×１０^１１、約１×１０^１２、約１×１０^１３、約１．１×１０^１３、約１．２×１０^１３、約１．３×１０^１３、約１．５×１０^１３、約２×１０^１３、約２．５×１０^１３、約３×１０^１３、約３．５×１０^１３、約４×１０^１３、約４．５×１０^１３、約５×１０^１３、約６×１０^１３、約１×１０^１４、約２×１０^１４、約３×１０^１４、約４×１０^１４、約５×１０^１４、約１×１０^１５、約１×１０^１６まで、またはそれ以上の総ウイルスゲノムを含む。

約１×１０^９～約１×１０^１０、約５×１０^９～約５×１０^１０、約１×１０_１０～約１×１０^１１、約１×１０^１１～約１×１０^１５ｖｇ、約１×１０^１２～約１×１０^１５ｖｇ、約１×１０^１２～約１×１０^１４ｖｇ、約１×１０^１３～約６×１０^１４ｖｇ、約１×１０^１３～約１×１０^１５ｖｇ、および約６×１０^１３～約１．０×１０^１４ｖｇの投与量も企図される。本明細書で例示される１つの用量は、髄腔内送達を介して投与される１ｘ１０^１３ｖｇである。本明細書で例示される別の用量は、１．５×１０^１３ｖｇである。

投与量はまた、ｖｇ／ｋｇの単位で表され得る。本明細書で企図される投与量は、約１×１０^７ｖｇ／ｋｇ、１×１０^８ｖｇ／ｋｇ、１×１０^９ｖｇ／ｋｇ、５×１０^９ｖｇ／ｋｇ、６×１０^９ｖｇ／ｋｇ、７×１０^９ｖｇ／ｋｇ、８×１０^９ｖｇ／ｋｇ、９×１０^９ｖｇ／ｋｇ、１×１０^１０ｖｇ／ｋｇ、２ｘ１０^１０ｖｇ／ｋｇ^１０、３×１０^１０ｖｇ／ｋｇ、４×１０^１０ｖｇ／ｋｇ、５×１０^１０ｖｇ／ｋｇ、１×１０^１１ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１２ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約１．１×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約１．２×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約１．３×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約１．５×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約２×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約２．５×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約３×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約３．５×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約４×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約４．５×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約５×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約６×１０^１３ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１４ｖｇ／ｋｇ、約２×１０^１４ｖｇ／ｋｇ、約３×１０^１４ｖｇ／ｋｇ、約４×１０^１４ｖｇ／ｋｇ、約５×１０^１４ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１５ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１６ｖｇ／ｋｇまでを含む。

約１×１０^９ｖｇ／ｋｇ～約１×１０^１０ｖｇ／ｋｇ、約４５×１０^９ｖｇ／ｋｇ～約５×１０^１０ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１０ｖｇ／ｋｇ～約１×１０^１１ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１１ｖｇ／ｋｇ～約１×１０^１５ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１２ｖｇ／ｋｇ～約１×１０^１５ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１２ｖｇ／ｋｇ～約１×１０^１４ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１３ｖｇ／ｋｇ～約２×１０^１４ｖｇ／ｋｇ、約１×１０^１３ｖｇ／ｋｇ～約１×１０^１５ｖｇ／ｋｇ、および約６×１０^１３ｖｇ／ｋｇ～約１．０×１０^１４ｖｇ／ｋｇの投与量も企図される。本明細書で例示される１つの用量は、静脈内送達を介して投与される１ｘ１０^１３ｖｇ／ｇである。本明細書で例示される別の用量は、静脈内送達を介して投与される２．５×１０^１４ｖｇ／ｋｇである。

インビボまたはインビトロで、ｒＡＡＶで標的細胞を形質導入する方法が、本開示によって企図される。インビボ方法は、有効用量または有効複数回用量の本開示のｒＡＡＶを含む組成物を、それを必要とする動物（ヒトを含む）に投与するステップを含む。用量が、障害／疾患の発症前に投与される場合、投与は予防的である。用量が、障害／疾患の発症後に投与される場合、投与は治療的である。本開示の実施形態では、有効用量は、治療される障害／疾患状態に関連する少なくとも１つの症状を緩和（排除または低減）し、障害／疾患状態への進行を遅延もしくは予防し、障害／疾患状態の進行を遅延もしくは予防し、疾患の程度を軽減し、疾患の寛解（部分もしくは完全）をもたらし、および／または生存を延長する用量である。本開示の方法による予防または治療が企図される疾患の例は、ＳＭＡＲＤ１およびＣＭＴ２Ｓである。

併用療法も本開示によって企図される。本明細書で使用される組み合わせは、同時処置および逐次的処置の両方を含む。新規療法との組み合わせであるとして、本開示の方法と標準的な医療との組み合わせが特に企図される。いくつかの実施形態では、併用療法は、本明細書に開示される遺伝子療法と組み合わせて免疫抑制剤を投与することを含む。

有効用量の組成物の投与は、筋肉内、非経口、静脈内、経口、頬側、鼻、肺、頭蓋内、骨内、眼内、直腸、または膣を含むがこれらに限定されない、当該技術分野で標準的な経路によるものであり得る。本開示のｒＡＡＶのＡＡＶ成分（特に、ＡＡＶ ＩＴＲおよびカプシドタンパク質）の投与経路および血清型は、治療される感染および／または疾患状態、ならびに野生型ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質を発現する標的細胞／組織を考慮して、当業者によって選択および／または適合され得る。

本開示は、有効用量の本開示のｒＡＡＶおよび組成物の局所投与および全身投与を提供する。例えば、全身投与とは、全身が影響を受けるように循環系に投与することである。全身投与には、消化管を通した吸収などの経腸投与、および注射、注入、または移植を通した非経口投与が含まれる。

本開示のｒＡＡＶによる細胞の形質導入は、ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質の持続的発現をもたらす。本開示は、したがって、ＩＧＨＭＰＢ２タンパク質を発現するｒＡＡＶを動物、好ましくは、ヒトに投与／送達する方法を提供する。これらの方法は、本開示の１つ以上のｒＡＡＶで細胞を形質導入することを含む。

「形質導入」という用語は、レシピエント細胞によるＩＧＨＭＰＢ２の発現をもたらす、本開示の複製欠損ｒＡＡＶを介した、インビボまたはインビトロのいずれかのレシピエント細胞へのＩＧＨＭＰＢ２のコード領域の投与／送達を指すために使用される。

免疫抑制剤
免疫抑制剤は、遺伝子療法の投与後の対象におけるｒＡＡＶに対する免疫応答の開始の前または後に投与され得る。加えて、免疫抑制剤は、遺伝子療法またはタンパク質補充療法と同時に投与され得る。対象における免疫応答には、対象へのｒＡＡＶの投与に続くか、またはそれによって引き起こされる、有害な免疫応答または炎症反応が含まれる。免疫応答は、投与されたｒＡＡＶに応答した対象における抗体の産生であり得る。

例示的な免疫抑制剤には、グルココルチコステロイド、ヤヌスキナーゼ阻害剤、カルシニューリン阻害剤、ｍＴＯＲ阻害剤、プリン類似体、メトトレキサート、およびシクロホスファミドなどの細胞静止剤、イノシン一リン酸デヒドロゲナーゼ（ＩＭＤＨ）阻害剤、モノクローナル抗体または融合タンパク質およびポリペプチドなどの生物製剤、ならびにボルテゾミブなどのジペプチドボロン酸分子が含まれる。

免疫抑制剤は、炎症を減少させ、対象の免疫系を抑制または変調するステロイドである、抗炎症ステロイドであり得る。例示的な抗炎症ステロイドは、プレドニゾロン、ベタメタゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、デフラザコート、ブデソニド、またはプレドニゾンなどのグルココルチコイドである。

ヤヌスキナーゼ阻害剤は、ヤヌスキナーゼファミリーの酵素のうちの１つ以上を標的とすることによる、ＪＡＫ／ＳＴＡＴシグナル伝達経路の阻害剤である。例示的なヤヌスキナーゼ阻害剤には、トファシチニブ、バリシチニブ、ウパダシチニブ、ペフィシチニブ、およびオクラシチニブが含まれる。

カルシニューリン阻害剤は、シクロフィリンに結合し、カルシニューリンの活性を阻害する。例示的なカルシニューリン阻害剤には、シクロスポリン、タクロリムス、およびピセクロリムスが含まれる。

ｍＴＯＲ阻害剤は、セリン／スレオニン特異的タンパク質キナーゼｍＴＯＲを低減または阻害する。例示的なｍＴＯＲ阻害剤には、シロリムス、エベロリムス、およびテムシロリムスが含まれる。

免疫抑制剤には、免疫抑制マクロライドが含まれる。「免疫抑制マクロライド」という用語は、対象の免疫系を抑制または変調するマクロライド剤を指す。マクロライドは、クラジノースまたはデソアミンなどの１つ以上のデオキシ糖が付着した大きな大環状ラクトン環を含む薬剤のクラスである。ラクトン環は通常、１４、１５、または１６員である。マクロライドは、ポリケチドクラスの薬剤に属し、天然産物であり得る。免疫抑制マクロライドの例には、タクロリムス、ピメクロリムス、およびシロリムスが含まれる。

プリン類似体は、ヌクレオチド合成を阻止し、ＩＭＤＨ阻害剤を含む。例示的なプリン類似体には、アザチオプリン、ミコフェノール酸、およびレフノミドが含まれる。

例示的な免疫抑制生物製剤には、アバタセプト、アダリムマブ、アナキンラ、セルトリズマブ、エタネルセプト、ゴリムマブ、インフリキシマブ、イセキズマブ、ナタリズマブ、リツキシマブ、セクキヌマブ、トシリズマブ、ウステキネヌマブ、ベドリズマブ、バシリキシマブ、ベラタセプト、およびダクリズマブが含まれる。

特に、免疫抑制剤は、抗ＣＤ２０抗体である。抗ＣＤ２０特異的抗体という用語は、ＣＤ２０に特異的に結合するか、またはＣＤ２０の発現もしくは活性を阻害もしくは低減する抗体を指す。例示的な抗ＣＤ２０抗体には、リツキシマブ、オクレリズマブ、またはオファツムマブが含まれる。

免疫抑制抗体の追加の例には、バシリキシマブおよびダクリズマブなどの抗ＣＤ２５抗体（または抗ＩＬ２抗体もしくは抗ＴＡＣ抗体）、ならびにムロモナブ－ＣＤ３、オテリキシズマブ、テプリズマブ、およびビシリズマブなどの抗ＣＤ３抗体、アレムツズマブなどの抗ＣＤ５２抗体が含まれる。

以下の実施例は、限定ではなく例示として提供される。記載された数値範囲には、各範囲内の各整数値が含まれ、記述される整数の最小および最大が含まれる。

実施例１－ＩＧＨＭＢＰ２をコードする遺伝子療法構築物
ＩＧＨＭＢＰ２をコードするＡＡＶゲノム構築物は、遍在プロモーターの制御下にあるＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡの完全長転写産物を用いたＡＡＶ９ベクター設計を描写する、図１に記載されるように生成された。これらの構築物に含むために企図されるプロモーターは、ｉ）ｃｍｖ－エンハンサーニワトリベータアクチンプロモーター（ＣＢＡ、配列番号３）、またはＰ５４６（配列番号４）もしくは５４６と称される合成短縮メチルＣｐＧ結合タンパク質２（ＭｅＣｐ２）プロモーターのいずれかである。

ヒトＧＦＰ ｃＤＮＡクローンが、Ｏｒｉｇｅｎｅ，Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，ＭＤから入手された。ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡのみが、ｉ）Ｐ５４６プロモーターまたはｖ）ハイブリッドニワトリβ－アクチンプロモーター（ＣＢ）のいずれかのうちの１つ以上の制御下で、自己相補的ＡＡＶ９ゲノムにさらにサブクローン化された。プラスミド構築物はまた、シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）キメライントロンなどのイントロン、およびウシ成長ホルモン（ＢＧＨ）ポリアデニル化シグナル（ＢＧＨポリＡ）も含んだ。構築物は、いずれかのＡＡＶ９ゲノムにパッケージ化された。

プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ．－Ｆｗ（カナマイシン耐性遺伝子が順方向にある）のためのマップが、図２に記載され、プラスミド全体の配列が、配列番号７で提供される。ｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２ベクターは、配列番号７のＩＴＲ内にあり、かつそれを含み、図１３に示されるようなヌクレオチド配列を含む。ｒＡＡＶベクターは、５’ＡＡＶ２ ＩＴＲ、ＣＭＶエンハンサー、ＣＢＡプロモーター、修飾ＳＶ４０イントロン配列、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子のためのコード配列、ｂＧＨポリＡ、および３’ＡＡＶ２ ＩＴＲを含む。配列番号７に記載されるプラスミドは、ｐＵＣ複製起点とともにカナマイシン耐性をさらに含む。プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ．－Ｒｖ（カナマイシン耐性遺伝子が逆方向にある）は、配列番号９として提供される。

表２は、プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ．－Ｆｗ（配列番号７）の分子的特徴を示し、その範囲は、配列番号７におけるヌクレオチドを指し、

は、カナマイシン遺伝子が順方向にあることを示す。

プラスミドｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ．－Ｆｗ（カナマイシン耐性遺伝子が順方向にある）のためのマップが、図３に記載され、プラスミド全体の配列が、配列番号８で提供される。ｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２ベクターは、配列番号８のＩＴＲ内にあり、かつそれを含み、図１４に示されるようなヌクレオチド配列を含む。ｒＡＡＶベクターは、５’ＡＡＶ２ ＩＴＲ、Ｐ５４６プロモーター（本明細書ではＭｅＣｐ２プロモーターまたはＰ５４６プロモーターとしても表される）、修飾ＳＶ４０イントロン配列、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子のためのコード配列、ｂＧＨポリＡ、および３’ＡＡＶ２ ＩＴＲを含む。配列番号８に記載されるプラスミドは、ｐＵＣ複製起点とともにカナマイシン耐性をさらに含む。プラスミドｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ．－Ｒｖ（カナマイシン遺伝子が逆方向にある）は、配列番号１０として提供される。

表３は、プラスミドｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ．－Ｆｗ（配列番号８）の分子的特徴を示し、その範囲は、配列番号８におけるヌクレオチドを指し、

は、カナマイシン耐性遺伝子が順方向にあることを示す。

プラスミドｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－ｃｌｉｎｉｃａｌ（Ｐ５４６プロモーター配列、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡ配列、ＳＶ４０イントロン、およびｂＧＨポリアデニル化配列が逆方向である）のためのマップが、図１５に記載され、プラスミド全体の配列が、配列番号１７で提供される。ｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２－ｃｌｉｎｉｃａｌベクターは、ＩＴＲ内にあり、かつそれを含み、図１６に示されるようなヌクレオチド配列を含む。ｒＡＡＶベクターは、５’ＡＡＶ２ ＩＴＲ（配列番号１９）、Ｐ５４６プロモーター、修飾ＳＶ４０イントロン配列、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子のためのコード配列、ｂＧＨポリＡ、および３’ＡＡＶ２ ＩＴＲ（配列番号１２）を含む。配列番号１７に記載されるプラスミドは、ｐＵＣ複製起点とともにカナマイシン耐性をさらに含む。カナマイシン耐性遺伝子は、図１５では順方向にあるが、逆方向にカナマイシン耐性遺伝子を伴うプラスミドも企図される。

表４は、プラスミドｓｓＡＡＶ．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１７）の分子的特徴を示し、その範囲は、配列番号１７におけるヌクレオチドを指し、

は、要素が順方向にあることを示し、

は、要素が逆方向にあることを示す。

プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－ｃｌｉｎｉｃａｌ（ＣＭＶエンハンサー配列、ＣＢプロモーター配列、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡ配列、ＳＶ４０イントロン、およびｂＧＨポリアデニル化配列が逆方向にある）のためのマップが、図１７に記載され、プラスミド全体の配列が、配列番号１８で提供される。ｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２－ｃｌｉｎｉｃａｌベクターは、ＩＴＲ内にあり、かつそれを含み、図１８に示されるようなヌクレオチド配列を含む。ｒＡＡＶベクターは、５’ＡＡＶ２ ＩＴＲ（配列番号１９）、ＣＭＶエンハンサー、ＣＢプロモーター、修飾ＳＶ４０イントロン配列、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子のためのコード配列、ｂＧＨポリＡ、および３’ＡＡＶ２ ＩＴＲ（配列番号１２）を含む。配列番号１８に記載されるプラスミドは、ｐＵＣ複製起点とともにカナマイシン耐性をさらに含む。カナマイシン耐性遺伝子は、図１７では順方向にあるが、逆方向にカナマイシン耐性遺伝子を伴うプラスミドも企図される。

表５は、プラスミドｓｓＡＡＶ．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２．Ｋａｎ－ｃｌｉｎｉｃａｌ（配列番号１８）の分子的特徴を示し、その範囲は、配列番号１８におけるヌクレオチドを指し、

は、要素が順方向にあることを示し、

は、要素が逆方向にあることを示す。

実施例２－マウスにおけるＩＧＨＭＢＰ２遺伝子療法ベクターのＣＳＦ送達
ＳＭＡＲＤ１およびＣＭＴ２Ｓのマウスモデルが、ＩＧＨＭＢＰ２を発現するＡＡＶのＣＳＦ送達の効果を比較するために使用された。以下の表４は、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子療法ベクターの有効性を調査するために使用され得る、異なるマウスモデルを提供する。この研究では、疾患スペクトルの非常に重症の末端（ｅｍ３）および中程度疾患形態（ｎｍｄ－２Ｊ）を表す２つの異なるマウスモデルが、この研究に使用された。

Ｅｍ３マウスモデル
最初の研究のために、ｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスは、脳脊髄液（ＣＳＦ）への脳室内注射（ＩＣＶ）を介してＩＧＨＭＢＰ２遺伝子療法ベクターまたは対照を投与された。「ｎｍｄ」マウス変異は、脊髄運動ニューロンの進行性変性および筋萎縮を引き起こす（Ｃｏｘ ｅｔ ａｌ．，ｅｕｒｏｎ ２１：１３２７－１３３７，１９９８）。ｎｍｄ変異は、Ｓｍｂｐ２またはＣａｔｆ１として以前に説明された推定転写活性化因子およびＡＴＰａｓｅ／ＤＮＡヘリカーゼとして同定された。ｎｍｄ表現型は、マウス染色体１３上の主要な遺伝子座によって半優性様式で減衰される。

Ｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスマウスは、１×ＰＢＳおよび０．００１％Ｐｌｕｒｏｎｉｃ Ｆ６８（ＰＢＳ／Ｆ６８として表される）中に配合されたｓｓＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２（ウイルスＡ）またはｓｓＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２（ウイルスＣ）もしくは空のウイルス粒子（ウイルスＢ）のいずれかの動物当たり５ｅ１０ウイルスゲノム（ｖｇ）のいずれかの１回の脳室内注射を受けた。強度試験が、投与後３週間から開始して実施され、生存率も監視された。図３は、ウイルスＡおよびウイルスＣを用いた処置が麻痺を回復させるように思われたが、これらのマウスが対照よりも小さいままであったことを実証する。

図４は、ＡＡＶの投与後２～３週間における対照マウスの隣にｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの代表的な画像を提供する。ウイルスＡまたはウイルスＣで処置されたマウスは、クラスプの改善を示した。加えて、ウイルスＢ（空のウイルス粒子）で処置されたマウスは、ウイルスＡおよびＣで処置されたマウスと比較して、その後肢を広げることができなかった。

図５は、ｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}マウスの生存分析を提供する。ウイルスＡまたはウイルスＣを用いた処置は、マウスの生存期間を回復した（それぞれ１匹が早期に死亡した）。しかしながら、ウイルスＢ（空のウイルス粒子）は、回復するように思われない。未処置およびウイルスＢ処置では時折生存者がいたが、これらのマウスは、非常に小さく、弱かった。図６に示されるように、ウイルスＡまたはウイルスＣを用いた処置は、ｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの体重を改善したが、処置から８週間後に測定されると体重を完全には回復しなかった。

強度試験のために、処置されたマウスは、ワイヤーケージの蓋の上で最大６０秒間反転され、それらが落下したとき、または６０秒の終点に達したときの時間が留意された。３回の試行の最長時間が記録された。マウスが６０秒間持続する最初の試行に失敗した場合、最初の失敗した試行が、Ａ）故意に参加したくないこと、Ｂ）滑ったこと、またはＣ）６０秒のワイヤー吊り下げを完了することができなかったことに起因したかどうかを確認するために、再度試験された。２回目に失敗した場合、約３～５分の休憩が与えられ、再度試験された。図７のデータ／グラフ内の数字は、最長の試行を反映する。図７は、マウスがワイヤーから吊り下げられるときに落下するまでの待ち時間と対比した処置後の時間を提供する。ウイルスＡを用いた処置は、最初の改善を示し、その後に強度の低下が続き、後に、注射後８週間で野生型レベルに戻って回復した。ウイルスＣを用いた処置は、ホモ接合体マウスが正常マウス（ｎｍｄ^＋／＋）と同様であるように強度を改善した。

加えて、処置されたｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの神経が、抽出および評価された。左右両方の横隔神経、大腿運動神経、および大腿感覚神経が、抽出され、電子顕微鏡（ＥＭ）固定で一晩固定された。神経は、次いで、１×ＰＢＳ緩衝液で３回洗浄され、我々の組織学中核部に送られるまで４℃で保存された。軸索数が、ＩｍａｇｅＪの半自動化「ＷＥＫＡ訓練可能プログラム」プラグインを使用して決定された。処置されたｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの大腿神経の断面が、図８Ａに示され、軸索領域が、図８Ｂに提供される。すべての群は、コルモゴロフ－スミルノフ検定で相互と有意に異なった。ウイルスＡまたはウイルスＣを用いた処置は、軸索の面積を有意に増加させた。

処置から８週間後の処置されたｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの肋間筋の筋肉面積も調査された。処置されたマウスでは、３００本の筋線維が、各動物の個別の組織のヘマトキシリンおよびエオシン断面からＩｍａｇｅＪにおいて手動でトレースされた。測定値は、ピクセル単位で提供され、図８Ｄのグラフは、筋線維領域の範囲を示す累積度数を表す。

後肢の筋肉の断面が、図８Ｃに示される。後肢からの断面画像については、２つの切開が、膝および足首における脚の長さを定義するために膝蓋骨および踵骨に加えられた。第３の切開が、膝蓋骨および踵骨から等距離の点に加えられた。骨および筋肉の形態が、すべての動物の間で同じ領域から画像を選ぶために調べられた。ウイルスＡまたはウイルスＣで処置されたマウスは、筋肉面積の増加を示し、ウイルスＣが最高のパフォーマンスを示した。

加えて、ウイルスＡまたはウイルスＢを用いた処置は、ｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの後肢における神経筋接合部を部分的に回復した。図９Ａおよび９Ｂは、ｒＡＡＶを用いた処置から８週間後に後肢から取得されたＭＧおよびＳｏｌ筋肉の免疫細胞化学を示す代表的な写真である。ＭＧとＳｏｌ筋肉は、重量を量られ、筋肉は、４％ＰＦＡで固定された。筋肉は、シナプス前神経のためのマーカーとしてのニューロフィラメント（緑）およびシナプス後Ａｃｈ受容体のためのマーカーとしてブンガロトキシン（赤）を検出する抗体で染色された。神経筋接合部（ＮＭＪ）が、ＳＰ８ Ｌｅｉｃａ共焦点顕微鏡を介して撮影された。各タイプのＮＭＪ占有の例が、図９Ａに提供されている。占有は、完全に神経支配されている（赤色のＢＴＸアセチルコリンチャネルおよび緑色のニューロフィラメントチャネルが完全に重複する）、部分的に神経支配されている（赤色および緑色のチャネルが部分的に重複する）、または完全に除神経されている（１つのチャネルが完全に欠如している）のいずれかとして手動で決定された。未処置ｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスの後肢には神経筋接合部の神経支配がほとんどなかった。ウイルスＡおよびＣ処置ｎｍｄ^{ｅｍ３／ｅｍ３}ホモ接合体マウスでは、完全に神経支配された、断片化された、および神経支配されていないＮＭＪの混合物が見出された。グラフは、内側腓腹筋およびヒラメ筋上のＮＭＪの計数を提供し、ウイルスＡおよびウイルスＣの両方で完全に神経支配されたＮＭＪの増加を示し、ウイルスＣがより高い割合の完全に神経支配されたＮＭＪを示した。

Ｎｍｄ－２Ｊマウスモデル
加えて、ｎｍｄ－２Ｊマウスは、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子療法ベクターを投与されたか、または対照が、脳脊髄液（ＣＳＦ）への脳室内注射（ＩＣＶ）を介して投与された。ｎｍｄ－２Ｊマウスは、中程度ＳＭＡＲＤ１様麻痺を有し、約６０～１００日で死亡する傾向がある。これらのマウスは、１×ＰＢＳおよび０．００１％Ｐｌｕｒｏｎｉｃ Ｆ６８（ＰＢＳ／Ｆ６８として表される）中に配合されたｓｓＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２（ウイルスＡ）またはｓｓＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２（ウイルスＣ）もしくは空のウイルス粒子（ウイルスＢ）のいずれかの動物当たり５ｅ１０ウイルスゲノム（ｖｇ）のいずれかの１回の脳室内注射を受けた。上記に記載されるように、図１０は、ウイルスＡおよびＣがｎｍｄ－２Ｊマウスの生存を改善したことを実証する、生存プロットを提供する。

筋電図検査（ＥＭＧ）は、有効性についての潜在的な臨床バイオマーカーである。電気生理学的結果は、Ａｒｎｏｌｄ ｅｔ ａｌ，Ａｎｎａｌｓ ｏｆ ｃｌｉｎｉｃａｌ ａｎｄ ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ ｎｅｕｒｏｌｏｇｙ，１（１），３４－４４，２０１４に記載されるように坐骨神経刺激に続いて後肢筋から記録される、複合筋活動電位（ＣＭＡＰ）、単一運動単位電位（ＳＭＵＰ）、および運動単位数推定（ＭＵＮＥ）が含まれる。ＣＭＡＰは、神経支配の強度を測定し、ＭＵＮＥは、筋肉を神経支配するニューロンの数の推定値を提供する。

簡潔には、２つの細いリング電極が、電気生理学的結果を記録するために麻酔されたマウス上に配置された。活性（Ｅ１）リング電極は、膝関節において後肢の腓腹筋の近位部分上で皮膚上に配置され、参照（Ｅ２）リング電極は、足の中足骨中央部分の領域上に配置された。リング電極の下にある皮膚は、インピーダンスを低減させるためにゲルでコーティングされた。坐骨ＣＭＡＰ応答が、坐骨神経の最大上刺激（最大約１２０％）（０．１ミリ秒の持続時間および強度１～１０ｍＡの方形波パルス）を用いて取得された。平均単一運動単位電位（ＳＭＵＰ）サイズおよびＭＵＮＥは、最小限の悉無律型応答を取得するために強度を０．０２６ｍＡステップで増加させながら、１Ｈｚの周波数において０．１ミリ秒の持続時間の最大下刺激を送達することによって、増分応答を記録することにより計算された。１０の増分が、平均単一運動単位電位ＳＭＵＰ振幅を提供するために平均された。ＭＵＮＥは、以下のように計算された：ＭＵＮＥ＝ＣＭＡＰ／平均ＳＭＵＰ。ＣＭＡＰおよびＳＭＵＰの振幅については、ピーク間測定が使用された。図１１Ａ－Ｄに示されるように、ウイルスＡまたはウイルスＣで処置されたマウスではＣＭＡＰおよびＭＵＮＥ上に有意な増加があったが、ＣＭＡＰは、ウイルスＡで処置されたマウスおよびウイルスＣで処置されたマウスで異ならなかった。図１１Ａ－Ｄは、未処置マウスと比較して、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子療法ベクターで処置されたマウス間の明確な差異を実証する。

Ｅｍ５マウスモデル
ｅｍ５マウスモデルはまた、脳脊髄液（ＣＳＦ）への脳室内注射（ＩＣＶ）を介して投与されたＩＧＨＭＢＰ２遺伝子療法ベクターの効果を調査するために使用された。ｅｍ５マウスは、感覚および運動神経障害の表現型であるＣＭＴ２Ｓを有し、約１０カ月の生存期間を有する。これらのマウスは、１×ＰＢＳおよび０．００１％Ｐｌｕｒｏｎｉｃ Ｆ６８（ＰＢＳ／Ｆ６８として表される）中に配合されたｓｓＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２（ウイルスＡ）またはｓｓＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２（ウイルスＣ）もしくは空のウイルス粒子（ウイルスＢ）のいずれかの動物当たり５ｅ１０ウイルスゲノム（ｖｇ）のいずれかの１回の脳室内注射を受けた。

図１２Ａは、健康なマウスならびにウイルスＡおよびウイルスＣで処置されたＥｍ５マウスでの吊り下げワイヤー試験の結果を提供する。健康なマウスならびにウイルスＡおよびウイルスＣで処置されたマウスは、未処置ｅｍ５マウスと比較して有意に優れた握力を示した。健康なマウスとウイルスＡまたはウイルスＣで処置されたマウスとの間に有意差はなかった。図１２Ｂは、処置されたマウスおよび未処置マウスにおける内側腓腹筋（ＭＧ）の重量を示す。図１２Ｂは、未処置ｅｍ５マウスと比較して、健康なマウスならびにウイルスＡおよびウイルスＣで処置されたＥｍ５マウスにおける全体重に関連してＭＧの筋肉量の増加を示す。処置された動物と健康な動物との間に差異はなかった。

実施例３－ヒトにおける臨床試験
ｓｓＡＡＶ９．ＣＢ．ＩＧＨＭＢＰ２（ウイルスＡ）またはｓｓＡＡＶ９．Ｐ５４６．ＩＧＨＭＢＰ２（ウイルスＣ）は、ＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２ＳなどのＩＧＨＭＢＰ２関連障害に罹患しているヒト患者に髄腔内に投与される。臨床試験用のｓｃＡＡＶは、ｃＧＭＰ条件下でＨＥＫ２９３細胞の三重トランスフェクション方法を利用して産生される。

参加のために選択される患者は、遺伝子型によって決定されるようなＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２ＳなどのＩＧＨＭＢＰ２関連障害と診断された１～２０歳であろう。患者は、患者当たりｓｓＡＡＶの１回限りの遺伝子導入用量を受ける。ｓｓＡＡＶは、２０ｍＭの１ｍＭ ＭｇＣｌ_２、２００ｍＭのＮａＣｌ、０．００１％ポロキサマー１８８ Ｔｒｉｓ（ｐＨ８．０）中で配合され、髄腔内注射を通して一度だけ送達されるであろう。安全性は、臨床的根拠に基づき、かつ安全性ラベルの検討により評価される。遺伝子導入後３０日目の安全性データの精査を可能にするために、各対象の登録の間に最低３～４週間がある。疾患の進行が測定され、生活の質および長期生存の可能性に対する処置の影響が評価される。

Claims (33)

1. ポリヌクレオチドであって、
   （ａ）１つ以上の調節制御要素と、
   （ｂ）免疫グロブリン－μ結合タンパク質２（ＩＧＨＭＢＰ２）のｃＤＮＡ配列とを含む、ポリヌクレオチド。
2. 前記調節制御要素が、ＣＢＡプロモーターまたはＰ５４６プロモーター、もしくはその断片である、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
3. 前記ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡが、配列番号１に対して少なくとも９５％の配列同一性を含むポリヌクレオチド配列、または配列番号１に記載されるポリヌクレオチド配列を含む、請求項１または２に記載のポリヌクレオチド。
4. 配列番号３または４のヌクレオチド配列を含む、請求項１～３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
5. 請求項１～４のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド配列を含むゲノムを有する、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）。
6. 前記ゲノムが、Ｐ５４６プロモーターと、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡとを含む、請求項５に記載のｒＡＡＶ。
7. 前記ゲノムが、ＣＢＡプロモーターと、ＩＧＨＭＢＰ２ ｃＤＮＡとを含む、請求項５に記載のｒＡＡＶ。
8. 前記ｒＡＡＶが、血清型ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶＲＨ１０、ＡＡＶＲＨ７４、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶ１３またはＡｎｃ８０、ＡＡＶ７ｍ８、およびそれらの誘導体のものである、請求項５～７のいずれか一項に記載のｒＡＡＶ。
9. 請求項５～８のいずれか一項に記載のｒＡＡＶを含む、ｒＡＡＶ粒子。
10. 請求項５～８のいずれか一項に記載のｒＡＡＶまたは請求項９に記載のウイルス粒子を含む、組成物。
11. 前記組成物の粘度または密度を増加させる薬剤をさらに含む、請求項１０に記載の組成物。
12. 前記薬剤が、造影剤である、請求項１０に記載の組成物。
13. 前記組成物が、脳脊髄液への直接注射、脳室内送達、髄腔内送達、または静脈内送達のために配合される、請求項９～１２のいずれか一項に記載の組成物。
14. 前記組成物が、髄腔内送達のために配合され、患者当たり約１ｅ１３ｖｇ～患者当たり約１ｅ１５ｖｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含む、請求項１０～１３のいずれか一項に記載の組成物。
15. 前記組成物が、静脈内送達のために配合され、約１ｅ１３ｖｇ／ｋｇ～約２ｅ１４ｖｇ／ｋｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含む、請求項１０～１３のいずれか一項に記載の組成物。
16. 請求項５～８のいずれか一項に記載のｒＡＡＶ、請求項９に記載のｒＡＡＶ粒子、または請求項１０～１５のいずれか一項に記載の組成物を投与することを含む、ＩＧＨＭＢＰ２関連障害の治療を必要とする対象においてＩＧＨＭＢＰ２関連障害を治療する方法。
17. 前記障害が、ＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２Ｓである、請求項１６に記載の方法。
18. 前記対象が、ＩＧＨＭＢＰ２遺伝子に変異を有する、請求項１６または１７に記載の方法。
19. 前記ｒＡＡＶまたは前記ｒＡＡＶ粒子が、脳脊髄液への直接注射、脳室内送達、髄腔内送達、または静脈内送達によって投与される、請求項１６～１８のいずれか一項に記載の方法。
20. 患者当たり約１ｅ１３ｖｇ～患者当たり約１ｅ１５ｖｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量が、髄腔内送達によって前記対象に投与される、請求項１６～１９のいずれか一項に記載の方法。
21. 約１ｅ１３ｖｇ／ｋｇ～約２ｅ１４ｖｇ／ｋｇの用量のｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量が、静脈内送達によって前記対象に投与される、請求項１６～２０のいずれか一項に記載の方法。
22. 免疫抑制剤を投与するステップをさらに含む、請求項１６～２１のいずれか一項に記載の方法。
23. ＩＧＨＭＢＰ２関連障害の治療のための薬剤の調製における、請求項５～８のいずれか一項に記載のｒＡＡＶ、請求項９に記載のｒＡＡＶ粒子、または請求項１０～１５のいずれか一項に記載の組成物の使用。
24. 前記障害が、ＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２Ｓである、請求項２３に記載の使用。
25. 前記薬剤が、脳脊髄液への直接注射、脳室内送達、髄腔内送達、または静脈内送達のために配合される、請求項２３または２４に記載の使用。
26. 前記薬剤が、患者当たり約１ｅ１３ｖｇ～患者当たり約１ｅ１５ｖｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含み、前記薬剤が、前記対象への髄腔内送達のために配合される、請求項２３～２５のいずれか一項に記載の使用。
27. 前記薬剤が、約１ｅ１３ｖｇ／ｋｇ～約２ｅ１４ｖｇ／ｋｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含み、前記薬剤が、前記対象への静脈内送達のために配合される、請求項２３～２５のいずれか一項に記載の使用。
28. ＩＧＨＭＢＰ２関連障害の治療のための請求項５～８のいずれか一項に記載のｒＡＡＶ、請求項９に記載のｒＡＡＶ粒子、または請求項１０～１５のいずれか一項に記載の組成物を含む、組成物。
29. 前記障害が、ＳＭＡＲＤ１またはＣＭＴ２Ｓである、請求項２８に記載の組成物。
30. 前記組成物が、脳脊髄液への直接注射、脳室内送達、髄腔内送達または静脈内送達のために配合される、請求項２８または２９に記載の組成物。
31. 前記組成物が、患者当たり約１ｅ１３ｖｇ～患者当たり約１ｅ１５ｖｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含み、前記組成物が、髄腔内送達のために配合される、請求項２８～３０のいずれか一項に記載の組成物。
32. 前記組成物が、約１ｅ１３ｖｇ／ｋｇ～約２ｅ１４ｖｇ／ｋｇのｒＡＡＶまたはｒＡＡＶ粒子の用量を含み、前記組成物が、静脈内送達のために配合される、請求項２８～３０のいずれか一項に記載の組成物。
33. 前記組成物が、免疫抑制剤をさらに含む、請求項２８～３２のいずれか一項に記載の組成物。

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