JP2023553005A - 末梢ミエリンタンパク質22の発現の阻害のための生成物及び方法 - Google Patents
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- C12N2750/00011—Details
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- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
Abstract
末梢ミエリンタンパク質22遺伝子の発現を阻害するためのRNA干渉ベースの方法及び生成物が提供される。末梢ミエリンタンパク質22遺伝子を阻害するRNA、並びにRNAをコードするDMAが提供される。組換えアデノ随伴ウイルスなどの送達ビヒクルは、末梢ミエリンタンパク質22遺伝子を阻害するRNAをコードするDMAを送達する。これらの方法は、シャルコー・マリー・トゥース病1A型(CMT1A)などのシャルコー・マリー・トゥース病を治療する。【選択図】図1
Description
末梢ミエリンタンパク質22遺伝子の発現を阻害するためのRNA干渉ベースの方法及び生成物が提供される。末梢ミエリンタンパク質22の遺伝子を阻害するRNA、並びにそのRNAをコードするDNAが提供される。組換えアデノ随伴ウイルスなどの送達ビヒクルが、末梢ミエリンタンパク質22の遺伝子を阻害するRNAをコードするDNAを送達する。これらの方法は、シャルコー・マリー・トゥース病1A型(CMT1A)などのシャルコー・マリー・トゥース病を治療する。
配列表の参照による援用
本出願は、開示の別個の部分として、コンピュータ可読形式の配列表(ファイル名:56204_SeqListing.txt;6,159,677バイト-ASCIIテキストファイル、2021年11月30日付け)を含み、参照によりその全体が本明細書に援用される。
本出願は、開示の別個の部分として、コンピュータ可読形式の配列表(ファイル名:56204_SeqListing.txt;6,159,677バイト-ASCIIテキストファイル、2021年11月30日付け)を含み、参照によりその全体が本明細書に援用される。
シャルコー・マリー・トゥース病(Charcot-Marie-Tooth disease)(CMT)は、2500人に1人が罹患する遺伝性末梢神経障害の異種群を指す。最も一般的なタイプ、CMT1型は、脱髄性末梢神経障害である。全てのCMT症例の50%以上及びCMT1型症例の約70~80%に影響を及ぼすCMT1型サブタイプは、常染色体優性の脱髄性CMT神経障害1A型である[CMT1A(MIM118220)]。
CMT1Aは、最も頻繁に、染色体17p11.2-p12上の優性遺伝の1.4Mbのタンデム染色体内重複によって引き起こされる。重複は、末梢ミエリンタンパク質22(PMP22)に翻訳されるPMP22遺伝子の3つのコピーをもたらす[非特許文献1及び非特許文献2]。場合によっては、PMP22における点変異はまた、優性CMT1Aにつながる可能性があり、一般に、最も重度の表現型で存在する[非特許文献3,非特許文献4,Timmermanら(上記非特許文献1)]。CMT1Aを有する患者は、徐々に進行性の遠位筋の脱力及び萎縮、感覚の喪失、及び反射の欠如を発症し、典型的には思春期に発症する。CMT1Aは、同じ家族内でも疾患の重症度に高いばらつきを示す。感覚応答は通常、運動神経伝導速度(MNCV)が前腕で5~35m/sの範囲で遅くなる一方で、ほとんどは、平均約20m/sであり、異なる神経で均一かつ対称的な所見を有する。MNCVは数十年にわたって有意に変化しないが、運動振幅と運動単位数はゆっくりと減少し、臨床障害と相関する軸索喪失を反映する。
PMP22タンパク質は、発生中にシュワン細胞(SC)をミエリン化することによって主に産生される22kDaの内因性4回膜貫通糖タンパク質であり、末梢神経系(PNS)コンパクトミエリンの2~5%を占める。このタンパク質は、SCの成長と分化、骨髄形成、ミエリンの厚さ、並びにPNS軸索及びミエリンの維持に不可欠である。PMP22はまた、細胞骨格アクチンと形質膜との連結に関与し、脂質ラフト(lipid raft)におけるコレステロール含有量の調節因子として機能する。PMP22 mRNAがほぼ全ての組織において発現されているという事実にもかかわらず、PMP22タンパク質は、髄鞘形成SCにおいてのみ見出され、PMP22 mRNAの組織特異的転写後調節を示唆している[非特許文献5及び非特許文献6]。
PMP22遺伝子の5’-UTRは、2つの既知のプロモーター、P1及びP2を含む。それぞれの転写産物は、それらの5’非コード領域においてのみ異なる[非特許文献7及び非特許文献8]が、組織特異的発現パターンを示す6つのスプライスバリアントをもたらす[非特許文献9]。PMP22の調節は、そのイントロン領域及びそれら内のエンハンサーエレメントによって達成される[非特許文献10、非特許文献11、及び非特許文献12]。P1プロモーターの転写産物は、SC特異的であるが、P2プロモーターの転写産物は、非PNS組織で発現される。したがって、PMP22遺伝子又はその重要な転写結合部位の重複は、スプライシングアイソフォームの比率をシフトさせ、メチル化、マイクロRNA結合、及び翻訳後修飾部位を変化させる[非特許文献13及び非特許文献14]。正常な髄鞘形成及び非髄鞘形成SCでは、新しく合成されたPMP22の約20%がグリコシル化され、一方、残りの約80%がプロテアソーム小胞体(ER)関連分解(ERAD)を標的化する。
CMT1A患者では、腓骨神経生検におけるPMP22 mRNAレベル[非特許文献15]及びタンパク質レベル[非特許文献16]が増加しているため、CMT1AはPMP22の遺伝子投与量効果に依存すると考えられている。1つの欠失した及び1つの重複したPMP22アレルの組み合わせを有する個体は、バランスの取れた遺伝子投与量を有するため、CMT1A様表現型を提示しない。いくつかのCMT1A表現型は、PMP22発現に影響を与える染色体17p上の異なるサイズ又は異なるタイプの重複からも生じ得る[Pantera(上記非特許文献12)]。1.4Mb重複を有するCMT1A患者は、皮膚生検においてPMP22レベルが異なっている場合があり、必ずしも疾患重症度と相関しない[非特許文献17及び非特許文献18]。それにもかかわらず、CMT1Aの駆動機構としてPMP22遺伝子投与効果を支持する。PMP22を過剰発現するげっ歯類モデルは、CMT1A様表現型を再現した[非特許文献19、非特許文献20、非特許文献21、非特許文献22、非特許文献23、非特許文献24、及び非特許文献25]。CMT1A様表現型は、PMP22の過剰発現を中断した後に改善された[非特許文献26、Lee(上記非特許文献14)、Perea(上記非特許文献23)、非特許文献27、非特許文献28、非特許文献29、非特許文献30、非特許文献31、非特許文献32、非特許文献33、及び非特許文献34]。
過剰発現したPMP22は、分解に対するプロテアソームの能力を飽和させ、核周囲又は細胞質でのPMP22蓄積、全体的なプロテアソーム活性の低下、及びERストレスをもたらすことが示されている。PMP22はまた、ミエリンの厚さ及び維持の決定において、ミエリン形成の初期段階に関与する。PMP22重複は、ミエリン鞘及びSCの構造、タンパク質化学量論及び機能を不安定にし、脱髄、再ミエリン形成、特徴的なオニオンバルブ形成、及びSCアポトーシスにつながる。結果として、SC軸索相互作用の障害及び機能不全のニューロフィラメント構造は、より遅い軸索輸送及びミエリン形成速度を伴うニューロフィラメントのより高いパッキング密度及びより少ないリン酸化をもたらす。
CMT1Aの現在の治療は、理学療法又は矯正手術の形態での一般的な症状管理に向けられたままである。
したがって、当技術分野では、CMT1Aの治療のための生成物及び方法の必要性が存在する。
したがって、当技術分野では、CMT1Aの治療のための生成物及び方法の必要性が存在する。
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本明細書の開示は、PMP22 mRNAを標的化する人工阻害性RNAを発現するベクターを使用して、RNA干渉(RNAi)による過剰発現されたPMP22のサイレンシングを特異的に誘導する方法を提供する。企図される人工阻害性RNAには、PMP22遺伝子の発現を阻害する、低分子干渉RNA(siRNA)(短鎖干渉RNA、低分子阻害性RNA、又は短鎖阻害性RNAとも称される)、短鎖ヘアピンRNA(shRNA)、及びmiRNAシャトル(人工miRNA)が含まれるが、これらに限定されない。人工阻害性RNAは、本明細書ではmiPMP22と称される。miPMP22は、小さな調節配列であり、例えば、PMP22 mRNAの3’UTRを逆相補的な様式で標的化することによって転写後に作用し、PMP22のmRNA及びタンパク質レベルを低下させる。本方法及び生成物の使用は、例えば、CMT1Aの予防又は治療に適応される。
PMP22阻害性RNA並びにmiPMP22のうちの1つ以上をコードするポリヌクレオチドが提供される。本開示は、配列番号1~8のうちのいずれか1つに示される配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を含むRNAをコードする鋳型ヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。
例示的なmiPMP22は、配列番号9~16のうちのいずれか1つに示される全長配列、又は配列番号9~16のうちのいずれか1つに示される配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の同一性を含むそのバリアントを含む。対応する最終的にプロセシングされたアンチセンスガイド鎖配列は、配列番号17~24にそれぞれ記載されているか、又は配列番号17~24のうちのいずれか1つに示される配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の同一性を含むそのバリアントである。プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は、RNA誘導サイレンシング複合体のRNA成分となる成熟miRNA二重鎖であり、最終的に配列特異的遺伝子サイレンシングに関与する。本開示は更に、図48に示されるアンチセンスガイド鎖を提供し、少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一である、これらのアンチセンスガイド鎖の各々のバリアントを企図する。本開示は更に、図50に示されるアンチセンスガイド鎖を提供し、少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一である、これらのアンチセンスガイド鎖の各々のバリアントを企図する。
miPMP22は、ヒトPMP22遺伝子(ヒトPMP22 cDNAである配列番号25によって表される)によってコードされるメッセンジャーRNA(mRNA)のセグメントに特異的に結合することができ、セグメントは、野生型マウスPMP22遺伝子(マウスPMP22 cDNAである配列番号27によって表される)によってコードされるmRNAと比較して保存されている。例えば、miPMP22は、配列番号25のヌクレオチド1~2423内の配列に相補的であるmRNAセグメントに特異的に結合することができる。より具体的には、miPMP22は、配列番号25のヌクレオチド1412~1433(例えば、miPMP22~868が結合するヌクレオチド)又は配列番号25の1415~1436(例えば、miPMP22~871が結合するヌクレオチド)内の配列に相補的であるmRNAセグメントに特異的に結合することができる。
miPMP22をコードするDNAの送達は、DNAをシュワン細胞に送達する送達ビヒクルを使用して達成することができる。例えば、組換えAAV(rAAV)ベクターを使用して、miPMP22をコードするDNAを送達することができる。他のベクター(例えば、レンチウイルス、アデノウイルス、レトロウイルス、ウマ随伴ウイルス、アルファウイルス、ポックスウイルス、ヘルペスウイルス、ポリオウイルス、シンドビスウイルス、及びワクシニアウイルスなどの他のウイルスベクター)を使用して、miPMP22をコードするポリヌクレオチドを送達することもできる。したがって、1つ以上のmiPMP22をコードするウイルスベクターも提供される。ウイルスベクターがrAAVである場合、rAAVは、AAVのrep及びcap遺伝子を欠く。rAAVは、自己相補型(sc)AAVであり得る。別の例として、脂質ナノ粒子などの非ウイルスベクターを送達に使用することができる。
miPMP22を各々コードするrAAVが本明細書に提供される。また、1つ以上のmiPMP22をコードするrAAVも提供される。1つ以上のmiPMP22をコードするrAAV(一本鎖ゲノム、scAAVを有する)は、1、2、3、4、5、6、7、又は8つのmiPMP22をコードすることができる。1つ以上のmiPMP22をコードするscAAVは、1、2、3、又は4つのmiPMP22をコードすることができる。
本明細書に記載の核酸又はウイルスベクターを含む組成物が提供される。
細胞におけるPMP22遺伝子の発現の防止又は阻害する方法が更に提供され、細胞を、miPMP22をコードする送達ビヒクル(例えば、rAAV)と接触させることを含み、送達ビヒクルがrAAVである場合、rAAVは、rep及びcap遺伝子を欠く。本方法において、重複及び/又は変異型PMP22アレルの発現が、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、又は100%阻害される。本方法において、野生型PMP22アレルの発現が、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、又は100%阻害される。
細胞におけるPMP22遺伝子の発現の防止又は阻害する方法が更に提供され、細胞を、miPMP22をコードする送達ビヒクル(例えば、rAAV)と接触させることを含み、送達ビヒクルがrAAVである場合、rAAVは、rep及びcap遺伝子を欠く。本方法において、重複及び/又は変異型PMP22アレルの発現が、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、又は100%阻害される。本方法において、野生型PMP22アレルの発現が、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、又は100%阻害される。
miPMP22をコードするDNAを必要とする対象にそれを送達する方法が更に提供され、miPMP22をコードするDNAを含む送達ビヒクル(例えば、rAAV)を、対象に投与することを含み、送達ビヒクルがrAAVである場合、rAAVは、rep及びcap遺伝子を欠く。miPMP22をコードするDNAを必要とする対象にそれを送達する他の方法は、1つ以上のmiPMP22をコードするDNAを含む送達ビヒクル(例えば、rAAV)を、対象に投与することを含み、送達ビヒクルがrAAVである場合、rAAVは、rep及びcap遺伝子を欠く。
CMT1Aの予防又は治療する方法も提供され、miPMP22をコードするDNAを含む送達ビヒクル(例えば、rAAV)を投与することを含む、送達ビヒクルがrAAVである場合、rAAVは、rep及びcap遺伝子を欠く。CMT1Aを予防又は治療する他の方法は、1つ以上のmiPMP22をコードするDNAを含む送達ビヒクル(例えば、rAAV)を投与することを含み、送達ビヒクルがrAAVである場合、rAAVは、rep遺伝子及びcap遺伝子を欠く。これらの方法は、発現罹患していない対象における正常なPMP22発現の少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%、又はそれ以上への、PMP22発現の回復をもたらす。
本開示は、本明細書に記載の核酸及び/又はそれらのうちのいずれか1つ以上の組み合わせを含むウイルスベクターである送達ビヒクルを提供する。提供されるウイルスベクターとしては、アデノ随伴ウイルス(AAV)、アデノウイルス、レンチウイルス、レトロウイルス、ポックスウイルス、バキュロウイルス、単純ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルス、又は合成ウイルスが挙げられるが、これらに限定されない。ウイルスベクターは、AAVであり得る。AAVは、rep遺伝子及びcap遺伝子を欠く。AAVは、組換えAAV(rAAV)又は自己相補型組換えAAV(scAAV)であり得る。AAVは、例えば、AAV-1、AAV-2、AAV-3、AAV-4、AAV-5、AAV-6、AAV-7、AAV-8、AAV-9、AAV-10、AAV-11、AAV-12、AAV-13、AAV-anc80、又はAAVrh.74である。AAVは、AAV-9であり得る。AAVは、偽型AAV、例えば、AAV2/8又はAAV2/9であり得る。
本開示は、本明細書に記載の核酸及び薬学的に許容される担体を含む組成物を提供する。本開示は、本明細書に記載の核酸を含むウイルスベクター、及び/又はそれらのうちのいずれか1つ以上と薬学的に許容される担体との組み合わせを含む組成物を提供する。
本開示は、シュワン細胞に薬剤を送達することができる送達ビヒクルと、miPMP22をコードする核酸であってを、miPMP22が、ヒトPMP22遺伝子によってコードされるmRNAのセグメント(セグメントは、CMT1Aに関連する変異を含む配列をコードするか又はコードしないかのいずれか)に結合し、セグメントが、野生型マウスPMP22遺伝子と比較して保存されている、核酸と、任意選択的に、薬学的に許容される担体とを含む組成物を提供する。ヒトPMP22遺伝子は、配列番号25の配列、又は少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%の同一性を含むそのバリアントを含むことができる。マウスPMP22遺伝子は、配列番号27の配列、又は少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%の同一性を含むそのバリアントを含むことができる。miPMP22は、例えば、配列番号25のヌクレオチド1412~1433(例えば、miPMP22~868が結合するヌクレオチド)又は配列番号25の1415~1436(例えば、miPMP22~871が結合するヌクレオチド)内の配列に相補的であるmRNAセグメントに特異的に結合する。
本開示は、ウイルスベクターである、組成物中の送達ビヒクルを提供する。組成物中のウイルスベクターは、例えば、アデノ随伴ウイルス(AAV)、アデノウイルス、レンチウイルス、レトロウイルス、ポックスウイルス、バキュロウイルス、単純ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルス、又は合成ウイルスであり得る。ウイルスベクターは、AAVであり得る。AAVは、rep遺伝子及びcap遺伝子を欠く。AAVは、組換えAAV(rAAV)又は自己相補型組換えAAV(scAAV)であり得る。AAVは、例えば、AAV-1、AAV-2、AAV-3、AAV-4、AAV-5、AAV-6、AAV-7、AAV-8、AAV-9、AAV-10、AAV-11、AAV-12、AAV-13、AAV-anc80、及びAAVrh.74から選択されるカプシド血清型であるか、又はそれを有する。AAVは、AAV-9のカプシド血清型であり得るか、又はカプシド血清型を有することができる。AAVは、AAV2/8又はAAV2/9などの偽型AAVであり得る。
本開示は、重複及び/又は変異型PMP22遺伝子を含むシュワン細胞に、(a)配列番号1~8のうちのいずれか1つに示されるポリヌクレオチド配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、若しくは100%の同一性を含むmiPMP22をコードする鋳型核酸を含む核酸、配列番号9~16のうちのいずれか1つに示される全長miPMP22配列をコードする核酸、又は配列番号9~16のうちのいずれか1つに示される配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の同一性を含むそのバリアント、配列番号17~24のうちのいずれか1つに示されるポリヌクレオチド配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、若しくは100%の同一性を含むmiPMP22のプロセシングされたアンチセンスガイド鎖をコードする核酸、図48に示される1つ以上のアンチセンスガイド鎖をコードする核酸、又は少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一である図48におけるアンチセンスガイド鎖のバリアント、あるいは図50に示される1つ以上のアンチセンスガイド鎖をコードする核酸、又は少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一である図50におけるアンチセンスガイド鎖のバリアント、(b)本明細書に記載の核酸のうちのいずれか1つ以上を含むベクター、あるいは(c)本明細書に記載の核酸又はベクターのうちのいずれか1つ以上を含む組成物を送達する方法を提供する。
本開示は、重複及び/又は変異型PMP22遺伝子に罹患している対象を治療する方法を提供し、本方法は、対象に(a)配列番号1~8のうちのいずれか1つに示されるポリヌクレオチド配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、若しくは100%の同一性を含むmiPMP22をコードする鋳型核酸を含む核酸、配列番号9~16のうちのいずれか1つに示される全長miPMP22配列をコードする核酸、又は配列番号9~16のうちのいずれか1つに示される配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の同一性を含むそのバリアント、配列番号17~24のうちのいずれか1つに示されるポリヌクレオチド配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、若しくは100%の同一性を含むmiPMP22のプロセシングされたアンチセンスガイド鎖をコードする核酸、図48に示される1つ以上のアンチセンスガイド鎖をコードする核酸、又は少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一である図48におけるアンチセンスガイド鎖のバリアント、あるいは図50に示される1つ以上のアンチセンスガイド鎖をコードする核酸、又は少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一である図50におけるアンチセンスガイド鎖のバリアント、(b)本明細書に記載の核酸のうちのいずれか1つ以上を含むベクター、あるいは(c)本明細書に記載の核酸又はベクターのうちのいずれか1つ以上を含む組成物を投与することを含む。
本開示は、CMT1Aに罹患している、本明細書の方法によって治療される対象を企図する。本開示はまた、PMP22遺伝子の重複又は変異によりCMT1Aのリスクがある対象の治療を企図する。対象は、哺乳動物であり得る。対象は、ヒト対象であり得る。
本開示はまた、重複及び/又は変異型PMP22遺伝子に罹患している対象を治療するための医薬品の製造又はその対象の治療における、本明細書に記載される少なくとも1つの核酸、本明細書に記載される少なくとも1つのウイルスベクター、又は本明細書に記載される組成物の使用を提供する。
本開示はまた、CMT1Aを治療するための医薬品の製造又はCMT1Aの治療を必要とする対象における治療において、本明細書に記載される少なくとも1つの核酸、本明細書に記載される少なくとも1つのウイルスベクター、又は本明細書に記載される組成物の使用を提供する。
本開示の他の特徴及び利点は、以下の図面の説明及び詳細な説明から明らかであろう。しかしながら、図面、詳細な説明、及び実施例は、開示された主題の実施形態を示しているが、本開示の趣旨及び範囲内の様々な変更及び修正が、図面、詳細な説明、及び実施例から明らかになるため、単に例示として与えられることを理解されたい。
この特許又は出願ファイルには、少なくとも1つのカラーで作成された図面が含まれている。このカラー図面を含む特許又は特許出願公開のコピーは、請求により、必要な費用の支払いに応じて、米国特許商標庁によって提供される。
本明細書に記載の生成物及び方法は、重複及び/又は変異型PMP22遺伝子に関連する疾患の治療に使用される。PMP22に関連する疾患としては、例えば、CMT1Aが挙げられる。
ヒトPMP22をコードする核酸は、配列番号25に示されている。本開示の様々な生成物及び方法は、配列番号25に示されるヒトPMP22ヌクレオチド配列のバリアントを標的化することができる。バリアントは、配列番号25に示されるヌクレオチド配列と99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、90%、89%、88%、87%、86%、85%、84%、83%、82%、81%、80%、79%、78%、77%、76%、75%、74%、73%、72%、71%、及び70%の同一性を示すことができる。
マウスPMP22をコードする核酸は、配列番号27に示されている。本開示の様々な生成物及び方法は、配列番号27に示されるヌクレオチド配列のバリアントを標的化することができる。バリアントは、配列番号27に示されるヌクレオチド配列と99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、90%、89%、88%、87%、86%、85%、84%、83%、82%、81%、80%、79%、78%、77%、76%、75%、74%、73%、72%、71%、及び70%の同一性を示すことができる。
本開示には、PMP22の過剰発現に起因する疾患又は障害を有する対象を改善及び/又は治療するために、PMP22の発現を阻害又は妨害するためのRNA干渉の使用が含まれる。RNA干渉(RNAi)は、真核細胞における遺伝子調節のメカニズムであり、様々な疾患の治療のために考慮されている。RNAiは、阻害性RNAによって媒介される遺伝子発現の転写後制御を指す。阻害性RNAは、小さい(長さ21~25ヌクレオチド)、同族メッセンジャーRNA(mRNA)と配列相同性及び塩基対を共有する非コードRNAである。阻害性RNAとmRNAとの間の相互作用は、mRNAの翻訳を防止するために細胞遺伝子サイレンシング機構を指示する。RNAi経路は、Duan(Ed.),Section 7.3 of Chapter 7 in Muscle Gene Therapy,Springer Science+Business Media,LLC(2010)に要約されている。
天然のRNAi経路の理解が進むにつれて、研究者は、疾患を治療するために、標的遺伝子の発現の調節に使用するための人工阻害性RNAを設計した。いくつかのクラスの低分子RNAは、哺乳類細胞でRNAiプロセスを誘発することが知られている[Davidson et al.,Nat.Rev.Genet.,12:329-40(2011)、Harper,Arch.Neurol.,66:933-938(2009)]。プラスミド又はウイルスベースのベクターからインビボで発現される人工阻害性RNA及びは、ベクターが標的細胞核内に存在し、駆動するプロモーターが活性である限り、単回投与で長期の遺伝子サイレンシングを達成することができる[Davidson et al.,Methods Enzymol.,392:145-73,(2005)]。重要なことに、このベクター発現アプローチは、筋肉遺伝子療法の分野で既に数十年にわたって行われてきた進歩を活用しているが、タンパク質をコードする遺伝子を発現させる代わりに、RNAi療法戦略におけるベクターカーゴは、目的の疾患遺伝子を標的化する人工阻害性RNAである。
PMP22の発現(例えば、発現のノックダウン又は阻害)に影響を与えるshRNAを含む生成物及び方法が本明細書に提供される。shRNAは、RNA干渉(RNAi)を介して標的遺伝子の発現をサイレンシングするために使用することができるタイトなヘアピンターンを有する人工RNA分子である。shRNAは、それが分解及び代謝回転の速度が比較的低いという点でRNAiの有利なメディエーターであるが、それは発現ベクターの使用を必要とする。ベクターが宿主ゲノムに形質導入されると、shRNAは、プロモーターの選択に応じて、ポリメラーゼII又はポリメラーゼIIIによって核内で転写される。この生成物は、プリマイクロRNA(pri-miRNA)を模倣し、Droshaによってプロセシングされる。得られたpre-shRNAは、エキスポーチン5によって核から輸送される。次いで、この生成物がDicerによってプロセシングされ、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)に装填される。センス(パッセンジャー)鎖が分解される。アンチセンス(ガイド)鎖は、相補的配列を有するmRNAにRISCを誘導する。完全に相補的である場合、RISCはmRNAを切断する。不完全に相補的である場合、RISCはmRNAの翻訳を抑制する。これらの両方の場合において、shRNAは、標的遺伝子のサイレンシングをもたらす。本開示は、shRNAを介してPMP22アンチセンス配列を発現するウイルスベクターの産生及び投与を含む。shRNAの発現は、様々なプロモーターを使用することによって調節される。本開示は、U6及びH1プロモーターなどのポリメラーゼIIIプロモーター、又はポリメラーゼIIプロモーターの使用を企図する。U6 shRNAが例示される。
本明細書に提供される生成物及び方法は、PMP22の発現を修飾する(例えば、発現をノックダウン又は阻害する)ためのmiRNAシャトルを含むことができる。shRNAと同様に、miRNAシャトルは、DNA導入遺伝子から細胞内で発現する。miRNAシャトルは、典型的には、正しいプロセシングを誘導するために必要な天然のmiRNA配列を含むが、ステム内の天然の成熟したmiRNA二重鎖は、(例えば、図1に示されるように)意図された標的転写産物に特異的な配列によって置き換えられる。発現後、人工miRNAは、Drosha及びDicerによって切断されて、埋め込まれたsiRNA様領域を遊離する。U6及びH1プロモーターなどのポリメラーゼIIIプロモーター、並びにポリメラーゼIIプロモーターも、miRNAシャトルの発現を駆動するために使用される。
本開示は、PMP22遺伝子の発現を阻害するために、miPMP22をコードする核酸を提供する。本開示は、miPMP22をコードする核酸を提供し、核酸は、配列番号1~8のうちのいずれか1つに示されるポリヌクレオチド配列と少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を含む。本開示は、miPMP22のプロセシングされたアンチセンスガイド鎖をコードする核酸を提供し、これは、配列番号17~24のうちのいずれか1つに示されるmiPMP22のプロセシングされたアンチセンスガイド鎖と少なくとも約70%、75、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を含む。
例示的なmiPMP22は、配列番号9~16のうちのいずれか1つ以上に示されるRNA配列、又は配列番号9~16のうちのいずれか1つと少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、若しくは99%の同一性を含むそのバリアントを含む。配列番号9~16に対応する最終的にプロセシングされたガイド鎖配列は、それぞれ配列番号17~24に示される。本開示は更に、図48に示されるアンチセンスガイド鎖を提供し、少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一である、これらのアンチセンスガイド鎖の各々のバリアントを企図する。本開示は更に、図50に示されるアンチセンスガイド鎖を提供し、少なくとも約70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一である、これらのアンチセンスガイド鎖の各々のバリアントを企図する。
本開示は、これらの配列のうちの1つ以上のコピーをコードするポリヌクレオチドが、ベクターなどの単一の送達ビヒクルに組み合わされることを企図する。したがって、本開示は、本開示の核酸又は本開示の核酸の組み合わせを含むベクターを含む。本明細書に開示される核酸を送達するためのウイルスベクター(例えば、アデノ随伴ウイルス(AAV)、アデノウイルス、レトロウイルス、レンチウイルス、ウマ随伴ウイルス、アルファウイルス、ポックスウイルス、ヘルペスウイルス、単純ヘルペスウイルス、ポリオウイルス、シンドビスウイルス、ワクシニアウイルス、若しくは合成ウイルス(例えば、キメラウイルス、モザイクウイルス、若しくは偽型ウイルス)、及び/又は外来タンパク質、合成ポリマー、ナノ粒子、若しくは小分子を含有するウイルス)が提供される。AAVベクターが例示される。非ウイルス送達ビヒクルもまた、企図される。
アデノ随伴ウイルス(AAV)は、複製欠陥パルボウイルスであり、その一本鎖DNAゲノムは、約4.7kb長であり、145ヌクレオチドの逆位末端反復(ITR)を含む。AAVには複数の血清型がある。AAV血清型のゲノムのヌクレオチド配列は既知である。例えば、AAV-1の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_002077に提供されている。AAV-2の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_001401及びSrivastava et al.,J.Virol.,45:555-564(1983)に提供されている。AAV-3の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_1829に提供されている。AAV-4の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_001829に提供されている。AAV-5のゲノムは、GenBank受入番号AF085716に提供されている。AAV-6の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_001862に提供されている。AAV-7及びAAV-8のゲノムの少なくとも一部分は、それぞれGenBank受入番号AX753246及びAX753249に提供されている。AAV-9のゲノムは、Gao et al.,J.Virol.,78:6381-6388(2004)に提供されている。AAV-10のゲノムは、Mol.Ther.,13(1):67-76(2006)に提供されている。AAV-11のゲノムは、Virology,330(2):375-383(2004)に提供されている。AAV-12のゲノムの部分は、Genbank受入番号DQ813647に提供されている。AAV-13のゲノムの部分は、Genbank受入番号EU285562に提供されている。AAVrh.74のゲノムの配列は、米国特許第9,434,928号に提供されている(参照により本明細書に援用される)。AAV-B1のゲノムの配列は、Choudhury et al.,Mol.Ther.,24(7):1247-1257(2016)に提供されている。ウイルスのDNA複製(rep)、カプシド形成/パッケージング、及び宿主細胞染色体への組込みを誘導するシス作用性配列は、AAV ITR内に含まれる。3つのAAVプロモーター(それらの相対マップ位置にちなんでp5、p19、及びp40と名付けられている)は、rep遺伝子及びcap遺伝子をコードする2つのAAV内部のオープンリーディングフレームの発現を駆動する。単一のAAVイントロンの差次的スプライシング(ヌクレオチド2107及び2227における)と共役した、2つのrepプロモーター(p5及びp19)は、rep遺伝子から4つのrepタンパク質(rep78、rep68、rep52、及びrep40)の産生をもたらす。repタンパク質は、最終的にウイルスゲノムの複製に関与する複数の酵素特性を保有する。cap遺伝子は、p40プロモーターから発現され、3つのカプシドタンパク質(VP1、VP2、及びVP3)をコードする。選択的スプライシング及び非コンセンサス翻訳開始部位は、3つの関連するカプシドタンパク質の産生に関与する。単一コンセンサスポリアデニル化部位は、AAVゲノムのマップ位置95に位置する。AAVのライフサイクル及び遺伝学は、Muzyczka,Current Topics in Microbiology and Immunology,158:97-129(1992)に概説されている。
AAVは、例えば、遺伝子療法において、外来DNAを細胞に送達するためのベクターとして魅力的にする固有の特徴を有する。培養中の細胞のAAV感染は、非細胞傷害性であり、ヒト及び他の動物の自然感染は、無症状及び無症候性である。更に、AAVは、多くの哺乳動物細胞に感染し、インビボで多くの異なる組織を標的化する可能性を与える。更に、AAVは、ゆっくりと分裂する細胞及び非分裂細胞を形質導入し、転写的に活性な核エピソーム(染色体外エレメント)として本質的にそれらの細胞の生涯にわたって存続し得る。AAVプロウイルスゲノムは、組換えゲノムの構築を実現可能にするプラスミド中のクローン化DNAとして感染性である。更に、AAV複製、ゲノムカプシド形成、及び組み込みを誘導するシグナルが、AAVゲノムのITR内に含まれているため、内部の約4.3kbのゲノム(複製及び構造カプシドタンパク質をコードする、rep-cap)の一部又は全てを、外来DNAで置き換えることができる。rep及びcapタンパク質は、トランスで提供され得る。AAVの別の重要な特徴は、それが極めて安定した頑健なウイルスであることである。これは、アデノウイルスを不活性化するために使用される条件(56℃~65℃で数時間)に容易に耐え、AAVの低温保存の重要性が低くなる。AAVは、凍結乾燥することもできる。最後に、AAV感染細胞は、重複感染に耐性がない。
本明細書に例示されるように、AAVベクターは、rep遺伝子及びcap遺伝子を欠く。AAVは、組換えAAV(rAAV)又は自己相補型組換えAAV(scAAV)であり得る。AAVは、例えば、AAV-1、AAV-2、AAV-3、AAV-4、AAV-5、AAV-6、AAV-7、AAV-8、AAV-9、AAV-10、AAV-11、AAV-12、AAV-13、AAV-anc80、AAVrh.74、AAVrh.8、又はAAVrh.10に由来し得るカプシド血清型を有する。
提供されるウイルスベクターとしては、例えば、AAV1(すなわち、AAV1逆末端反復(ITR)及びAAV1カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV2(すなわち、AAV2 ITR及びAAV2カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV3(すなわち、AAV3 ITR及びAAV3カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV4(すなわち、AAV4 ITR及びAAV4カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV5(すなわち、AAV5 ITR及びAAV5カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV6(すなわち、AAV6 ITR及びAAV6カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV7(すなわち、AAV7 ITR及びAAV7カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV8(すなわち、AAV8 ITR及びAAV8カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV9(すなわち、AAV9 ITR及びAAV9カプシドタンパク質を含むAAV)、AAVrh74(すなわち、AAVrh74 ITR及びAAVrh74カプシドタンパク質を含むAAV)、AAVrh.8(すなわち、AAVrh.8 ITR及びAAVrh.8カプシドタンパク質を含むAAV)、AAVrh.10(すなわち、AAVrh.10 ITR及びAAVrh.10カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV11(すなわち、AAV11 ITR及びAAV11カプシドタンパク質を含むAAV)、AAV12(すなわち、AAV12 ITR及びAAV12カプシドタンパク質を含むAAV)、又はAAV13(すなわち、AAV13 ITR及びAAV13カプシドタンパク質を含むAAV)が挙げられる。
本開示のDNAプラスミドは、本開示の組換えAAV(rAAV)ゲノムを含む。DNAプラスミドは、rAAVゲノムを感染性ウイルス粒子に組み立てるために、AAVのヘルパーウイルス(例えば、アデノウイルス、E1欠失アデノウイルス、又はヘルペスウイルス)の感染が許容される細胞に導入される。パッケージングされるAAVゲノム、rep遺伝子及びcap遺伝子、並びにヘルパーウイルス機能を細胞に提供するrAAV粒子を生成する技術は、当該技術分野において標準である。rAAVの産生は、以下の成分、rAAVゲノム、rAAVゲノムから分離した(すなわち、その中に存在しない)AAV rep遺伝子及びcap遺伝子、並びにヘルパーウイルス機能が、単一細胞(本明細書でパッケージング細胞と表される)内に存在することを必要とする。AAV rep遺伝子は、組換えウイルスが誘導され得る任意のAAV血清型(AAV血清型AAV-1、AAV-2、AAV-3、AAV-4、AAV-5、AAV-6、AAV-7、AAV-8、AAV-9、AAV-10、AAV-11、AAV-12、AAV-13、AAV-anc80、及びAAVrh.74が含まれるが、これらに限定されない)に由来してもよく、rAAVゲノムITRとは異なるAAV血清型に由来してもよい。rAAVゲノム中のIAAV DNAは、組換えウイルスが誘導され得る任意のAAV血清型(AAV血清型AAV-1、AAV-2、AAV-3、AAV-4、AAV-5、AAV-6、AAV-7、AAV-8、AAV-9、AAV-10、AAV-11、AAV-12、AAV-13、AAV-anc80、及びAAVrh.74が含まれるが、これらに限定されない)に由来することができる。他のタイプのrAAVバリアント、例えば、カプシド変異を有するrAAVも、本開示に含まれる。例えば、Marsic et al.,Molecular Therapy 22(11):1900-1909(2014)を参照されたい。上述のとおり、様々なAAV血清型のゲノムのヌクレオチド配列が、当該技術分野において既知である。同族成分の使用が具体的に企図される。偽型rAAVの産生は、例えば、WO01/83692に開示されている(その全体が参照により本明細書に援用される)。
AAVベクターは、擬AAVであり得、1つのAAV血清型からのITRと、異なるAAV血清型からのカプシドタンパク質と、を含む。偽型AAVは、AAV2/9(すなわち、AAV2 ITR及びAAV9カプシドタンパク質を含むAAV)であり得る。擬似型のAAVは、AAV2/8(すなわち、AAV2 ITR及びAAV8カプシドタンパク質を含むAAV)であり得る。擬似型のAAVは、AAV2/1(すなわち、AAV2 ITR及びAAV1カプシドタンパク質を含むAAV)であり得る。
AAVベクターは、組換えカプシドタンパク質(例えば、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAVrh74、AAVrh.8、若しくはAAVrh.10、AAV10、AAV11、AAV12、又はAAV13からのカプシドタンパク質のうちの1つ以上のキメラを含むカプシドタンパク質)を含むことができる。他のタイプのrAAVバリアント、例えば、カプシド変異を有するrAAV、も企図される。例えば、Marsic et al.,Molecular Therapy,22(11):1900-1909(2014)を参照されたい。上述のとおり、様々なAAV血清型のゲノムのヌクレオチド配列が、当該技術分野において既知である。
本開示は、PMP22 mRNAを標的化してPMP22発現を阻害するmiPMP22を送達するためのAAVを提供する。AAVは、RNAポリメラーゼIII(PolIII)ベースのプロモーターの制御下でmiPMP22を送達するために使用することができる。AAVは、U6プロモーターの制御下でmiPMP22を送達するために使用される。AAVは、H1プロモーターの制御下でmiPMP22を送達するために使用される。AAVは、RNAポリメラーゼII(PolII)ベースのプロモーターの制御下でmiPMP22を送達するために使用される。AAVは、U7プロモーターの制御下でmiPMP22を送達するために使用される。AAVは、シュワン細胞特異的プロモーターの制御下でmiPMP22を送達するために使用される。AAVは、MPZプロモーターの制御下でmiPMP22を送達するために使用される。AAVは、PMP22プロモーターの制御下でmiPMP22を送達するために使用される。
本質的に、U6プロモーターは、U6RNAの発現を制御する。U6RNAは、スプライシングに関与する核内低分子RNA(snRNA)であり、これらは十分に特徴付けられている[Kunkel et al.,Nature,322(6074):73-77(1986)、Kunkel et al.,Genes Dev.2(2):196-204(1988)、Paule et al.,Nuc.Acids Res.,28(6):1283-1298(2000)]。U6プロモーターは、哺乳類細胞におけるベクターベースの発現を制御するために使用されている[Paddison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,99(3):1443-1448(2002)、Paul et al.,Nat.Biotechnol.,20(5):505-518(2002)]。それは、(1)プロモーターがRNAポリメラーゼIII(polyIII)によって認識され、RNAの高レベルな構成的発現を制御し、(2)プロモーターがほとんどの哺乳類細胞型において活性であるためである。本開示は、マウス及びヒトの両方のU6プロモーターの使用を含む。
本明細書におけるAAVベクターは、rep遺伝子及びcap遺伝子を欠く。AAVは、組換えAAV、組換え一本鎖AAV(ssAAV)、又は組換え自己相補型AAV(組換えscAAV)であり得る。
本開示のrAAVゲノムは、例えば、1つ以上のmiPMP22をコードするポリヌクレオチドに隣接する1つ以上のAAV ITRを含む。商業プロバイダー、例えば、Ambion Inc.(Austin,TX)、Darmacon Inc.(Lafayette,CO)、InvivoGen(San Diego,CA)、及びMolecular Research Laboratories,LLC(Herndon,VA)は、カスタム阻害性RNA分子を生成している。加えて、市販のキットは、SILENCER(商標)siRNA構築キット(Ambion Inc.,Austin,TX)又はpsiRNAシステム(InvivoGen,San Diego,CA)などのカスタムsiRNA分子を産生するために利用可能である。
パッケージング細胞を生成する方法は、AAV粒子の産生に必要な全ての成分を安定して発現する細胞株を作製することである。例えば、AAV rep及びcap遺伝子を欠くrAAVゲノム、rAAVゲノムから分離されたAAV rep及びcap遺伝子、並びに選択マーカー(例えば、ネオマイシン耐性遺伝子)を含む、プラスミド(又は複数のプラスミド)が、細胞のゲノムに組み込まれる。AAVゲノムは、GCテーリング[Samulski et al.,Proc.Natl.Acad.S6.USA,79:2077-2081(1982)]、制限エンドヌクレアーゼ切断部位を含む合成リンカーの付加[Laughlin et al.,Gene,23:65-73(1983)]、又は直接平滑末端ライゲーション[Senapathy & Carter,J.Biol.Chem.,259:4661-4666(1984)]などの手順によって細菌プラスミドに導入されている。次いで、パッケージング細胞株を、アデノウイルスなどのヘルパーウイルスに感染させる。この方法の利点は、細胞が選択可能であり、rAAVの大規模産生に好適であることである。好適な方法の他の例は、rAAVゲノム並びに/又はrep遺伝子及びcap遺伝子をパッケージング細胞に導入するためのプラスミドではなく、アデノウイルス又はバキュロウイルスを使用する。
rAAVの生産の一般原理は、例えば、Carter,Current Opinions in Biotechnology,1533-1539(1992)及びMuzyczka,Curr.Topics in Microbiol.and Immunol.,158:97-129(1992)に概説されている。様々なアプローチが以下に記載されている:Ratschin et al.,Mol.Cell.Biol.4:2072(1984)、Hermonat et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6466(1984)、Tratschin et al.,Mol.Cell.Biol.5:3251(1985)、McLaughlin et al.,J.Virol.,62:1963(1988)、及びLebkowski et al.,Mol.Cell.Biol.,7:349(1988)、Samulski et al.,J.Virol.,63:3822-3828(1989)、米国特許第5,173,414号、WO95/13365、及び対応する米国特許第5,658.776号、WO95/13392、WO96/17947、PCT/US98/18600、WO97/09441(PCT/US96/14423)、WO97/08298(PCT/US96/13872)、WO97/21825(PCT/US96/20777)、WO97/06243(PCT/FR96/01064)、WO99/11764、Perrin et al.,Vaccine,13:1244-1250(1995)、Paul et al.,Hum.Gene Ther.,4:609-615(1993)、Clark et al.,Gene Ther.,3:1124-1132(1996)、米国特許第5,786,211号、米国特許第5,871,982号、米国特許第6,258,595号、及びMcCarty,Mol.Ther.,16(10):1648-1656(2008)。前述の文書は、それらの全体が参照により本明細書に援用され、特に、rAAV産生に関する文書のセクションに重点を置く。自己相補型(sc)rAAVの産生及び使用は、具体的に企図され、例示される。
本開示は、AAVベクターを産生するパッケージング細胞を更に提供する。パッケージング細胞は、HeLa細胞、293細胞、及びPerC.6細胞(同種293株)などの安定して形質転換されたがん細胞であり得る。別の実施形態では、パッケージング細胞は、形質転換されたがん細胞ではない細胞、例えば、低継代数の293細胞(アデノウイルスのE1で形質転換されたヒト胎児腎細胞)、MRC-5細胞(ヒト胎児線維芽細胞)、WI-38細胞(ヒト胎児線維芽細胞)、Vero細胞(サル腎臓細胞)、及びFRhL-2細胞(アカゲザル胎児肺細胞)である。
したがって、組換えAAV(rAAV)(すなわち、感染性カプシド化rAAV粒子)が本明細書に提供される。rAAVのゲノムは、AAVのrep及びcapのDNAを欠き、すなわち、rAAVのゲノムのITR間にAAVのrep又はcapのDNAが存在しない。
rAAVは、当該技術分野で標準的な方法によって(例えば、カラムクロマトグラフィー又は塩化セシウム勾配などによって)精製され得る。ヘルパーウイルスからrAAVベクターを精製するための方法は、当該技術分野で既知であり、例えば、Clark et al.,Hum.Gene Ther.,10(6):1031-1039(1999)、Schenpp and Clark,Methods Mol.Med.,69:427-443(2002)、米国特許第6,566,118号、及びWO98/09657に開示されている方法を含む。
本開示の核酸及びウイルスベクターを含む組成物が提供される。本明細書に記載の送達ビヒクル(例えば、rAAV)を含む組成物が提供される。かかる組成物は、薬学的に許容される担体も含む。本組成物は、希釈剤及びアジュバントなどの他の成分も含み得る。許容される担体、希釈剤、及びアジュバントは、レシピエントに対して非毒性であり、好ましくは、用いられる投薬量及び濃度で不活性であり、緩衝剤(例えば、リン酸塩、クエン酸塩、若しくは他の有機酸)、抗酸化剤(例えば、アスコルビン酸)、低分子量ポリペプチド、タンパク質(例えば、血清アルブミン、ゼラチン、若しくは免疫グロブリン)、親水性ポリマー(例えば、ポリビニルピロリドン)、アミノ酸(例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、若しくはリジン)、単糖類、二糖類、及び他の炭水化物(グルコース、マンノース、若しくはデキストリンを含む)、キレート剤(例えば、EDTA)、糖アルコール(例えば、マンニトール若しくはソルビトール)、塩形成カウンターイオン(例えば、ナトリウム)、並びに/又は非イオン性界面活性剤(例えば、Tween、プルロニック(登録商標)、ポリエチレングリコール(PEG))が含まれる。
本発明の方法で投与されるrAAVの力価は、例えば、特定のrAAV、投与方法、治療目標、個体、及び標的化される細胞型に応じて異なり、当該技術分野における標準的な方法によって決定され得る。rAAVの力価は、1ml当たり約1×106、約1×107、約1×108、約1×109、約1×1010、約1×1011、約1×1012、約1×1013、約1×1014、約1×1016、又はそれ以上のDNase耐性粒子(DRP)[又はウイルスゲノム(vg)]の範囲であり得る。
インビボ又はインビトロで、標的細胞に送達ビヒクル(例えば、rAAV)を形質導入する方法が企図される。インビボ方法は、有効用量又は有効な複数回用量の送達ビヒクル(例えば、rAAV)を含む組成物を、それを必要とする対象(ヒト患者を含む)に投与するステップを含む。用量が、障害/疾患の発症前に投与される場合、投与は予防的である。用量が、障害/疾患の発症後に投与される場合、投与は治療的である。有効用量は、治療される障害/疾患状態に関連する少なくとも1つの症状を緩和(排除若しくは低減)する用量であり、障害/疾患状態への進行を遅延若しくは予防する用量であり、障害/疾患状態の進行を遅延若しくは予防する用量であり、疾患の程度を軽減する用量であり、疾患の寛解(部分若しくは完全)をもたらす用量であり、並びに/又は生存を延長する用量である。本発明の方法による予防又は治療が企図される疾患の例はCMT1Aである。病理学的PMP22遺伝子重複又は変異を保有することが知られている家族において、本方法は、疾患の発症前に実行することができる。他の患者では、本方法は診断後に行われる。
分子的、生化学的、組織学的、及び機能的な転帰の尺度は、本方法の治療有効性を実証する。転帰の尺度は、例えば、Chapters 32,35 and 43 of Dyck and Thomas,Peripheral Neuropathy,Elsevier Saunders,Philadelphia,PA,4th Edition,Volume 1(2005)及びBurgess et al.,Methods Mol.Biol.,602:347-393(2010)に記載されている。転帰の尺度としては、罹患した組織における変異型PMP22 mRNA若しくはタンパク質の減少又は除去、PMP22遺伝子のノックダウン、体重増加、及び筋力の改善のうちの1つ以上が挙げられるが、これらに限定されない。他には、神経組織学(軸索数、軸索サイズ、及びミエリン形成)、神経筋接合部の分析、並びに筋肉重量及び/又は筋肉組織学が含まれるが、これらに限定されない。他のものとしては、神経伝導速度ncv、筋電図emg、及びシナプス生理学が挙げられるが、これらに限定されない。
本開示の方法では、対象におけるPMP22の発現は、治療前の対象における発現と比較して、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、又は100%阻害される。
併用療法も本発明により企図される。本明細書で使用される組み合わせは、同時治療及び逐次治療の両方を含む。本明細書に記載の方法と標準的な医学的治療及び支持療法との組み合わせは特に企図される。
有効用量の本開示の核酸、ウイルスベクター、又は組成物の投与は、当該技術分野で標準的な経路によるものであり得、筋肉内、非経口、血管内、静脈内、経口、頬側、経鼻、経肺、頭蓋内、脳室内、髄腔内、骨内、眼内、経直腸、又は膣内が含まれるが、これらに限定されない。有効用量は、経路の組み合わせによって送達され得る。例えば、有効用量は、静脈内及び筋肉内、又は静脈内及び脳室内などで送達される。有効用量は、連続して又は逐次送達され得る。有効用量は、同時に送達され得る。本発明のrAAVのAAV成分(具体的には、AAV ITR及びカプシドタンパク質)の投与経路及び血清型は、治療される感染症及び/又は疾患状態、並びにmiRNAを発現させる標的細胞/組織を考慮して、当業者によって選択及び/又は適合される。
特に、送達ビヒクル(例えば、rAAV)の実際の投与は、送達ビヒクル(例えば、rAAV)を対象の標的細胞に輸送する任意の物理的方法を使用することによって達成され得る。投与としては、筋肉への注射、血流への注入、及び/又は神経系若しくは肝臓への直接注射が挙げられるが、これらに限定されない。リン酸緩衝生理食塩水中にrAAVを単に再懸濁させることが、筋肉組織発現に有用なビヒクルを提供するのに十分であることが実証されており、rAAVと同時投与され得る担体又は他の成分に対する既知の制限はない(しかし、DNAを分解する組成物は、rAAVを用いる通常の方法において避ける必要がある)。rAAVのカプシドタンパク質は、rAAVがグリア細胞(例えば、シュワン細胞)などの目的の特定の標的組織に標的化されるように修飾され得る。例えば、WO02/053703を参照されたい(その開示は、参照により本明細書に援用される)。薬学的組成物は、注射用製剤として、又は経皮輸送により筋肉に送達される局所製剤として調製することができる。筋肉内注射及び経皮輸送の両方のための多数の製剤がこれまで開発されてきており、本発明の実施において使用することができる。送達ビヒクル(例えば、rAAV)は、投与及び取り扱いを容易にするために、任意の薬学的に許容される担体とともに使用することができる。
送達ビヒクル(例えば、rAAV)の分散液はまた、グリセロール、ソルビトール、液体ポリエチレングリコール、及びそれらの混合物中で、並びに油中で調製することができる。通常の保存及び使用の条件下で、これらの調製物は、微生物の増殖を防止するために保存剤を含む。これに関連して、用いられる滅菌水性媒体は全て、当業者に周知の標準的な技術によって容易に入手可能である。
注射用途に好適な薬学的形態には、滅菌水溶液又は分散液、及び滅菌注射用溶液又は分散液を即時調製するための滅菌粉末が含まれる。全ての場合において、形態は無菌でなければならず、容易な通針性(syringeability)が存在する程度に流動性でなければならない。製造及び保管の条件下で安定していなければならず、細菌及び真菌などの微生物の汚染作用に対して保護されなければならない。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、液体ポリエチレングリコール、ソルビトールなど)、それらの好適な混合物、及び植物油を含む溶媒又は分散媒体であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング剤を使用することによって、分散液の場合には、必要な粒径を維持することによって、及び界面活性剤を使用することによって維持することができる。微生物の作用の防止は、様々な抗菌剤及び抗真菌剤(例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールなど)によってもたらされ得る。多くの場合、等張剤(例えば、糖類又は塩化ナトリウム)を含めることが好ましいであろう。注射用組成物の持続的吸収は、吸収を遅延させる薬剤(例えば、モノステアリン酸アルミニウム及びゼラチン)を使用することによってもたらされ得る。
滅菌注射用溶液は、必要な量のrAAVを適切な溶媒に、必要に応じて、上に列挙した他の様々な成分とともに組み込み、その後濾過滅菌することによって調製される。一般的に、分散液は、滅菌した活性成分を、基本分散媒及び上に列挙したものからの必要な他の成分を含む滅菌ビヒクルに組み込むことによって調製される。滅菌注射用溶液の調製のための滅菌粉末の場合、調製の好ましい方法は、真空乾燥及び凍結乾燥技術であり、それは、活性成分に加えて予め滅菌濾過したそれらの溶液からの任意の追加の所望の成分の粉末をもたらす。
本明細書に提供されるrAAVによるシュワン細胞などの細胞の形質導入は、PMP22 miRNAの持続発現をもたらす。したがって、本発明は、PMP22 miRNAを発現するrAAVを、対象(好ましくは、ヒト)に投与/送達する方法を提供する。これらの方法には、本明細書に記載の1つ以上のrAAVを細胞及び組織(シュワン細胞などのグリア細胞、末梢運動ニューロン、感覚運動ニューロン、筋肉などの組織、並びに肝臓及び脳などの臓器を含むが、これらに限定されない)に形質導入することが含まれる。形質導入は、細胞特異的制御エレメントを含む遺伝子カセットを用いて行うことができる。
「形質導入」という用語は、一例として、本明細書に記載の複製欠陥rAAVを介したインビボ又はインビトロのいずれかでの標的細胞へのmiPMP22の投与/送達を指すために使用され、標的細胞(例えば、シュワン細胞)によるmiPMP22の発現をもたらす。
したがって、有効用量の本明細書に記載のrAAV(又は本質的に同時に投与される用量若しくは一定間隔で与えられる用量)を、それを必要とする対象に投与する方法が提供される。
その他の用語
単数形「a」、「and」、及び「the」には、文脈上特に明記されていない限り、複数形の指示対象が含まれる。したがって、例えば、「抗体」への言及は、複数の抗体を含む。
その他の用語
単数形「a」、「and」、及び「the」には、文脈上特に明記されていない限り、複数形の指示対象が含まれる。したがって、例えば、「抗体」への言及は、複数の抗体を含む。
本明細書で使用される場合、全ての数値又は数値範囲は、文脈上特に明記されていない限り、かかる範囲内の又はかかる範囲を包含する全ての整数、及び値又はその範囲内の又はその範囲を包含する整数の分数を含む。したがって、例えば、90~100%の範囲への言及には、91%、92%、93%、94%、95%、95%、97%など、並びに91.1%、91.2%、91.3%、91.4%、91.5%など、92.1%、92.2%、92.3%、92.4%、92.5%などが含まれる。別の例では、1~5,000倍の範囲への言及には、1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、11倍、12倍、13倍、14倍、15倍、16倍、17倍、18倍、19倍、又は20倍など、並びに1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、又は1.5倍など、2.1倍、2.2倍、2.3倍、2.4倍、又は2.5倍などが含まれる。
本明細書で使用される場合、「約」数値は、その数を含む範囲を指し、その数値より10%低い値から、その数値より10%高い値までの範囲を指す。「約」範囲とは、範囲の下限より10%低い値から、範囲の上限より10%高い値までの範囲を指す。
本明細書で使用される場合、「することができる」又は「であり得る」とは、提供される対象の一部として機能的かつ利用可能である、本発明者らによって企図されるものを示す。
本発明の態様及び例示的な実施形態は、以下の実施例によって示される。
実施例1
PMP22を標的化するmiPMP22の設計とインビトロ試験
人工miRNAは、天然のmir-30に基づいており、正常なmiRNAの生合成に必要な重要な構造エレメント及び配列エレメントを維持しているが、成熟mir-30配列が、PMP22遺伝子に相補的な22ntで置き換えられる。例示的な一般的なmiRNAシャトル構造を示す図1を参照されたい。
実施例1
PMP22を標的化するmiPMP22の設計とインビトロ試験
人工miRNAは、天然のmir-30に基づいており、正常なmiRNAの生合成に必要な重要な構造エレメント及び配列エレメントを維持しているが、成熟mir-30配列が、PMP22遺伝子に相補的な22ntで置き換えられる。例示的な一般的なmiRNAシャトル構造を示す図1を参照されたい。
PMP22人工miRNA(miPMP22)は、マウスPMP22遺伝子とヒトPMP22遺伝子との間の保存領域を標的化するように設計された。ヒトの全長PMP22 cDNA配列を図2に示し、翻訳を図3に示す。一方、マウスのPMP22 cDNAを図4に示す。全てのmiPMP22は、エキソン5の3’UTRの保存領域に結合する。図5は、ヒトPMP22 cDNA内の6つのmiRNAの結合部位を示し、本明細書においてmiPMP22-868、miPMP22-871、miPMP22-1706、miPMP22-1740、miPMP22-1741、及びmiPMP22-1834と称される。
miPMP22-868DNA鋳型配列は、5’CTCGAGTGAGCGAGTGGGGGTTGCTGTTGATTGACTGTAAAGCCACAGATGGGTCAATCAACAGCAATCCCCACCTGCCTACTAGT3’(配列番号1)であり、これは、全長RNA配列5’CUCGAGUGAGCGAGUGGGGGUUGCUGUUGAUUGACUGUAAAGCCACAGAUGGGUCAAUCAACAGCAAUCCCCACCUGCCUACUAGU3’(配列番号9)をコードする。図6は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-868は、以下のとおりである。
一方、プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は、
である。
アンチセンスガイド鎖の15番目のヌクレオチドを「U」に変えると、二重鎖のその位置での従来のワトソン-クリック塩基対(C:G)の代わりに、この塩基対は、2つの主な理由により、ゆらいだ(wobble)U:G塩基対になる。図7を参照されたい。まず、マウス及びヒトのPMP22遺伝子は、この結合部位に配列多型を有する。ヒトでは、ヌクレオチドはGであるが、マウスではAである。RNA分子は、G:U塩基対(2つの水素結合)並びにG:C塩基対(3つの水素結合)を形成することができる。DNAと同様に、RNAはG:A塩基対を形成することができない。したがって、ヌクレオチドをUに変えると、この位置でのマウス及びヒトのPMP22転写産物の両方と塩基対を形成することができる。第二に、この塩基を変えると、miRNA二重鎖のG:C含有量を、約55%から50%に減少させた。アンチセンス分子の3’末端に5つの連続したG:C塩基対の長いストレッチは、二重鎖の巻き戻しを阻害し、サイレンシングを低減する可能性がある。G:U塩基対は2つの水素結合しか有さないが、GC塩基対は3つの水素結合を有しているため、この位置にUを挿入すると、依然として、miRNAのアンチセンス及びセンス鎖の塩基対形成を可能にするが、相互作用はわずかに弱い。
アンチセンスガイド鎖の15番目のヌクレオチドを「U」に変えると、二重鎖のその位置での従来のワトソン-クリック塩基対(C:G)の代わりに、この塩基対は、2つの主な理由により、ゆらいだ(wobble)U:G塩基対になる。図7を参照されたい。まず、マウス及びヒトのPMP22遺伝子は、この結合部位に配列多型を有する。ヒトでは、ヌクレオチドはGであるが、マウスではAである。RNA分子は、G:U塩基対(2つの水素結合)並びにG:C塩基対(3つの水素結合)を形成することができる。DNAと同様に、RNAはG:A塩基対を形成することができない。したがって、ヌクレオチドをUに変えると、この位置でのマウス及びヒトのPMP22転写産物の両方と塩基対を形成することができる。第二に、この塩基を変えると、miRNA二重鎖のG:C含有量を、約55%から50%に減少させた。アンチセンス分子の3’末端に5つの連続したG:C塩基対の長いストレッチは、二重鎖の巻き戻しを阻害し、サイレンシングを低減する可能性がある。G:U塩基対は2つの水素結合しか有さないが、GC塩基対は3つの水素結合を有しているため、この位置にUを挿入すると、依然として、miRNAのアンチセンス及びセンス鎖の塩基対形成を可能にするが、相互作用はわずかに弱い。
miPMP22-871DNA鋳型配列は、5’CTCGAGTGAGCGAGGGGTTGCTGTTGATTGAAGACTGTAAAGCCACAGATGGGTCTTCAATCAACAGCAATCCCCTGCCTACTAGT3’(配列番号2)であり、これは、全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGAGGGGUUGCUGUUGAUUGAAGACUGUAAAGCCACAGAUGGGUCUUCAAUCAACAGCAAUCCCCUGCCUACUAGU3’(配列番号10)をコードする。図8は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-871は、以下のとおりである。
5’CUCGAGUGAGCGAGGGGUUGCUGUUGAUUGAAGACUGUAAAGCCACAGAUGGGUCUUCAAUCAACAGCAAUCCCCUGCCUACUAGU3’(配列番号10)をコードする。図8は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-871は、以下のとおりである。
一方、プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は、
である。
miPMP22-868と同様の様式で、miPMP22-871アンチセンスガイド鎖の18番目のヌクレオチドを「U」に変えた。図7を参照されたい。
miPMP22-868と同様の様式で、miPMP22-871アンチセンスガイド鎖の18番目のヌクレオチドを「U」に変えた。図7を参照されたい。
miPMP22-869DNA鋳型配列は、
5’CTCGAGTGAGCGATGGGGGTTGCTGTTGATTGAACTGTAAAGCCACAGATGGGTTCAATCAACAGCAATCCCCACTGCCTACTAGT3’(配列番号3)であり、これは、全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGAUGGGGGUUGCUGUUGAUUGAACUGUAAAGCCACAGAUGGGUUCAAUCAACAGCAAUCCCCACUGCCUACUAGU3’(配列番号11)をコードする。図9は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-869は、以下のとおりである。
5’CTCGAGTGAGCGATGGGGGTTGCTGTTGATTGAACTGTAAAGCCACAGATGGGTTCAATCAACAGCAATCCCCACTGCCTACTAGT3’(配列番号3)であり、これは、全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGAUGGGGGUUGCUGUUGAUUGAACUGUAAAGCCACAGAUGGGUUCAAUCAACAGCAAUCCCCACUGCCUACUAGU3’(配列番号11)をコードする。図9は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-869は、以下のとおりである。
一方、プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は、
である。miPMP22-868と同様の様式で、miPMP22-869アンチセンスガイド鎖の16番目のヌクレオチドを「U」に変えた。
miPMP22-872DNA鋳型配列は5’CTCGAGTGAGCGAGGGTTGCTGTTGATTGAAGATCTGTAAAGCCACAGATGGGATCTTCAATCAACAGCAATCCCTGCCTACTAGT3’(配列番号4)であり、これは全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGAGGGUUGCUGUUGAUUGAAGAUCUGUAAAGCCACAGAUGGGAUCUUCAAUCAACAGCAAUCCCUGCCUACUAGU3’(配列番号12)をコードする。図10は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-872は、以下のとおりである。
miPMP22-872DNA鋳型配列は5’CTCGAGTGAGCGAGGGTTGCTGTTGATTGAAGATCTGTAAAGCCACAGATGGGATCTTCAATCAACAGCAATCCCTGCCTACTAGT3’(配列番号4)であり、これは全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGAGGGUUGCUGUUGAUUGAAGAUCUGUAAAGCCACAGAUGGGAUCUUCAAUCAACAGCAAUCCCUGCCUACUAGU3’(配列番号12)をコードする。図10は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-872は、以下のとおりである。
一方、プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は、
である。miPMP22-868と同様の様式で、miPMP22-869アンチセンスガイド鎖の19番目のヌクレオチドを「U」に変えた。
miPMP22-1706DNA鋳型配列は、5’CTCGAGTGAGCGACTCCAAGGACTGTCTGGCAATCTGTAAAGCCACAGATGGGATTGCCAGACAGTCCTTGGAGGTGCCTACTAGT3’(配列番号5)であり、これは、全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGACUCCAAGGACUGUCUGGCAAUCUGUAAAGCCACAGAUGGGAUUGCCAGACAGUCCUUGGAGGUGCCUACUAGU3’(配列番号13)をコードする。図11は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-1706は、以下のとおりである。
miPMP22-1706DNA鋳型配列は、5’CTCGAGTGAGCGACTCCAAGGACTGTCTGGCAATCTGTAAAGCCACAGATGGGATTGCCAGACAGTCCTTGGAGGTGCCTACTAGT3’(配列番号5)であり、これは、全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGACUCCAAGGACUGUCUGGCAAUCUGUAAAGCCACAGAUGGGAUUGCCAGACAGUCCUUGGAGGUGCCUACUAGU3’(配列番号13)をコードする。図11は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-1706は、以下のとおりである。
一方、プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は、5’AUUGCCAGACAGUCCUUGGAGG3’(配列番号21)である。miPMP22-1706のマウスPMP22への結合は、以下に示されるように、G:U塩基対(2つの水素結合を有する)を含む。
miPMP22-1740DNA鋳型配列は、5’CTCGAGTGAGCGACACCAACTGTAGATGTATATACTGTAAAGCCACAGATGGGTATATACATCTACAGTTGGTGGTGCCTACTAGT3’(配列番号6)であり、これは、全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGACACCAACUGUAGAUGUAUAUACUGUAAAGCCACAGAUGGGUAUAUACAUCUACAGUUGGUGGUGCCUACUAGU3’(配列番号14)をコードする。図12は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-1740は、以下のとおりである。
5’CUCGAGUGAGCGACACCAACUGUAGAUGUAUAUACUGUAAAGCCACAGAUGGGUAUAUACAUCUACAGUUGGUGGUGCCUACUAGU3’(配列番号14)をコードする。図12は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-1740は、以下のとおりである。
一方、プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は、5’UAUAUACAUCUACAGUUGGUGG3’(配列番号22)である。ヒト及びマウスのPMP22へのmiPMP22-1740の結合を、以下に示す。
miPMP22-1741DNA鋳型配列は、5’CTCGAGTGAGCGAACCAACTGTAGATGTATATATCTGTAAAGCCACAGATGGGATATATACATCTACAGTTGGTGTGCCTACTAGT3’(配列番号7)であり、これは、全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGAACCAACUGUAGAUGUAUAUAUCUGUAAAGCCACAGAUGGGAUAUAUACAUCUACAGUUGGUGUGCCUACUAGU3’(配列番号15)をコードする。図13は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-1741は、以下のとおりである。
5’CUCGAGUGAGCGAACCAACUGUAGAUGUAUAUAUCUGUAAAGCCACAGAUGGGAUAUAUACAUCUACAGUUGGUGUGCCUACUAGU3’(配列番号15)をコードする。図13は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-1741は、以下のとおりである。
一方、プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は5’AUAUAUACAUCUACAGUUGGUG3’(配列番号23)である。ヒト及びマウスのPMP22へのmiPMP22-1741の結合を、以下に示す。
miPMP22-1834DNA鋳型配列は、5’CTCGAGTGAGCGATGGACTAAGATGCATTAAAATCTGTAAAGCCACAGATGGGATTTTGATGCATCTTAGTCCACTGCCTACTAGT3’(配列番号8)であり、これは、全長RNA配列
5’CUCGAGUGAGCGAUGGACUAAGAUGCAUUAAAAUCUGUAAAGCCACAGAUGGGAUUUUGAUGCAUCUUAGUCCACUGCCUACUAGU3’(配列番号16)をコードする。図14は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-1834は、以下のとおりである。
5’CUCGAGUGAGCGAUGGACUAAGAUGCAUUAAAAUCUGUAAAGCCACAGAUGGGAUUUUGAUGCAUCUUAGUCCACUGCCUACUAGU3’(配列番号16)をコードする。図14は、Unafoldを使用して生成されたフォールディングした全長RNA配列を示す。プロセシングされた成熟二本鎖miPMP22-1834は、以下のとおりである。
一方、プロセシングされたアンチセンスガイド鎖は、5’AUUUUGAUGCAUCUUAGUCCAC3’(配列番号24)である。ヒト及びマウスのPMP22へのmiPMP22-1834の結合を、以下に示す。
それ以外の場合、miPMP22配列は、概して、Boudreau et al.,Chapter 2 of Harper(Ed.),RNA Interference Techniques,Neuromethods,Vol.58,Springer Science+Business Media,LLC(2011)に従って設計された。
この設計戦略には、以下の2つの大きな利点がある:(1)非アレル特異的PMP22遺伝子サイレンシング、及び(2)ヒトにおいて直接翻訳可能なマウスにおける有効性の試験。
実施例2
miPMP22のインビトロ試験
miPMP22鋳型配列を、U6T6発現ベクター[Boudreau et al.,pages 19-37 in RNA Interference Methods,Harper(Ed.),Humana Springer Press(2011)]にクローニングした。miRNA発現カセットのサイズは、約500bpである。次いで、miPMP22を、4:1のmiR:標的モル比を使用して、HEK293T細胞中のヒトPMP22(pCDNA3.1発現ベクターにおいてGenscriptによって合成された)と共発現させた。細胞を、Lipofectamine2000を使用してトランスフェクトし、24時間インキュベートした。全RNAをTrizol(Invitrogen)を使用して回収し、ランダムプライミングされたcDNAを合成し(高容量cDNA RTキット、ThermoFisher)、ヒト及びマウスのPMP22に対するTaqmanプローブを使用してqRT-PCRによってPMP22のノックダウンを評価した(Hs00165556_m1、Mm01333393_m1、ThermoFisher)。
miPMP22のインビトロ試験
miPMP22鋳型配列を、U6T6発現ベクター[Boudreau et al.,pages 19-37 in RNA Interference Methods,Harper(Ed.),Humana Springer Press(2011)]にクローニングした。miRNA発現カセットのサイズは、約500bpである。次いで、miPMP22を、4:1のmiR:標的モル比を使用して、HEK293T細胞中のヒトPMP22(pCDNA3.1発現ベクターにおいてGenscriptによって合成された)と共発現させた。細胞を、Lipofectamine2000を使用してトランスフェクトし、24時間インキュベートした。全RNAをTrizol(Invitrogen)を使用して回収し、ランダムプライミングされたcDNAを合成し(高容量cDNA RTキット、ThermoFisher)、ヒト及びマウスのPMP22に対するTaqmanプローブを使用してqRT-PCRによってPMP22のノックダウンを評価した(Hs00165556_m1、Mm01333393_m1、ThermoFisher)。
qRT-PCRによるノックダウン試験では、miPMP22-868、miMPM22-871、及びmiPMP22-872の3つのリード候補が同定された。これらの3つのmiPMP22は、未処理の(「miRなし」)状態と比較して、ヒトPMP22転写産物のレベルを有意に低下させることができた(図15)。結果は、3つの独立した実験の平均値である。
2つの最強のmiPMP22(868及び871)をコードする鋳型配列を、以下に記載するように、インビボ送達のためにscAAV9にクローニングした。
実施例3
miPMP22をコードするscAAV9の産生
miPMP22-868及びmiPMP22-871鋳型配列を、インビボ送達のために、scAAV9構築物(一般的に「scAAV-NP.U6.miPMP22.CMV.eGFP」と名付けられた)にクローニングした。scAAV9はまた、CMVプロモーター駆動型eGFPレポーター遺伝子も含んだ。scAAV9は、自己相補型AAVゲノムのパッケージングを可能にする変異型AAV2逆位末端反復(ITR)及び野生型AAV2 ITRを含む。得られたscAAV9は、「AAV9-miR868」(scAAV9構築物scAAV-NP.U6.miPMP22-868.CMV.eGFPの)及び「AAV9-miR871」(scAAV9構築物scAAV-NP.U6.miPMP22-871.CMV.eGFPの略)と称される。非標的化scAAVは、「AAV9-miRLacZ」(scAAV構築物scAAV-NP.U6.miRlacZ.CMV.eGFPの略)と称される。
実施例3
miPMP22をコードするscAAV9の産生
miPMP22-868及びmiPMP22-871鋳型配列を、インビボ送達のために、scAAV9構築物(一般的に「scAAV-NP.U6.miPMP22.CMV.eGFP」と名付けられた)にクローニングした。scAAV9はまた、CMVプロモーター駆動型eGFPレポーター遺伝子も含んだ。scAAV9は、自己相補型AAVゲノムのパッケージングを可能にする変異型AAV2逆位末端反復(ITR)及び野生型AAV2 ITRを含む。得られたscAAV9は、「AAV9-miR868」(scAAV9構築物scAAV-NP.U6.miPMP22-868.CMV.eGFPの)及び「AAV9-miR871」(scAAV9構築物scAAV-NP.U6.miPMP22-871.CMV.eGFPの略)と称される。非標的化scAAVは、「AAV9-miRLacZ」(scAAV構築物scAAV-NP.U6.miRlacZ.CMV.eGFPの略)と称される。
scAAV9は、以前に記載されているように[Gao et al.,J.Virol.,78:6381-6388(2004)]、アデノウイルスヘルパープラスミドpHelper(Stratagene,Santa Clara,CA)とともに、Rep2Cap9配列をコードするプラスミドを有する二本鎖AAV2-ITRベースのベクターを使用して、一過性トランスフェクション手順によって、293細胞において産生された。実験のためにscAAV9を3つの別々のバッチで産生し、2つの塩化セシウム密度勾配精製ステップによって精製し、PBSに対して透析し、ウイルス凝集を防止するために0.001%Pluronic-F68を用いて製剤化し、4℃で保存した。全てのベクター調製物を、Taq-Man技術を使用して、定量的PCRによって滴定した。ベクターの純度を、4~12%のドデシル硫酸ナトリウム-アクリルアミドゲル電気泳動及び銀染色(Invitrogen,Carlsbad,CA)によって評価した。scAAV9ウイルスを生成し、滴定した(Viral Vector Core at The Research Institute at Nationwide Children’s Hospital)。
実施例4
動物モデル
C61-Hetマウスのコロニーを、R.Martini教授(University Hospital of Wurzburg)によって寄贈された2つの繁殖ペアから始めて確立した。このモデルは、内因性野生型マウスPMP22と比較した場合、ヒトPMP22導入遺伝子の2倍の過剰発現をもたらす内因性マウス遺伝子に加えて、ヒトPMP22遺伝子の4つのコピーを発現することが知られている[Huxley et al.,(1996)上記、Huxley et al.,(1998)上記、及びSereda et al.,NeuroMolecular Med.,8(1-2):205-216(2006)]。全ての実験手順は、EUガイドライン(EC Directive 86/609/EEC)と調和した国内法に従って、キプロス政府の獣医主任によって承認されたアニマルケアプロトコル(プロジェクトライセンスCY/EXP/PR.L2/2012)に従って実施した。
動物モデル
C61-Hetマウスのコロニーを、R.Martini教授(University Hospital of Wurzburg)によって寄贈された2つの繁殖ペアから始めて確立した。このモデルは、内因性野生型マウスPMP22と比較した場合、ヒトPMP22導入遺伝子の2倍の過剰発現をもたらす内因性マウス遺伝子に加えて、ヒトPMP22遺伝子の4つのコピーを発現することが知られている[Huxley et al.,(1996)上記、Huxley et al.,(1998)上記、及びSereda et al.,NeuroMolecular Med.,8(1-2):205-216(2006)]。全ての実験手順は、EUガイドライン(EC Directive 86/609/EEC)と調和した国内法に従って、キプロス政府の獣医主任によって承認されたアニマルケアプロトコル(プロジェクトライセンスCY/EXP/PR.L2/2012)に従って実施した。
実施例5
髄腔内ベクター送達
AAV9-miR871ウイルス(標的化)、AAV9-miR868ウイルス(標的化)、及びAAV9-miRLacZウイルス(非標的化対照)を、ヒト/マウスPMP22及び他のミエリン関連タンパク質に対するそれらの効果を調べるために、2ヶ月又は2ヶ月齢のC61 Hetマウスに髄腔内注射した。髄腔内送達の場合、26ゲージの針に接続された50μLハミルトンシリンジを使用して、推定量のAAV9-miRLacZ:1.66×1013DRP/ml、AAV9-miR871:3.0×1013DRP/ml、又はAAV9-miR868:2.7×1013DRP/mlのベクターを含む20μlのAAV9ストックを、麻酔したマウスのL5~L6髄腔内空間に、5μl/分の遅い速度で注射した。以前に記載されているように、尾のフリック(flick)によって、正しい注射を検証した[Kagiava et al.,P.N.A.S.USA,113(17):E2421-E2429(2016)、Kagiava et al.,Hum.Mol.Genet.,27(8):1460-1473(2018)、Kagiava et al.,Methods in Molecular Biology,1791:277-285(2018)、及びSchiza et al.,Brain,142(5):1227-1241(2019)]。
髄腔内ベクター送達
AAV9-miR871ウイルス(標的化)、AAV9-miR868ウイルス(標的化)、及びAAV9-miRLacZウイルス(非標的化対照)を、ヒト/マウスPMP22及び他のミエリン関連タンパク質に対するそれらの効果を調べるために、2ヶ月又は2ヶ月齢のC61 Hetマウスに髄腔内注射した。髄腔内送達の場合、26ゲージの針に接続された50μLハミルトンシリンジを使用して、推定量のAAV9-miRLacZ:1.66×1013DRP/ml、AAV9-miR871:3.0×1013DRP/ml、又はAAV9-miR868:2.7×1013DRP/mlのベクターを含む20μlのAAV9ストックを、麻酔したマウスのL5~L6髄腔内空間に、5μl/分の遅い速度で注射した。以前に記載されているように、尾のフリック(flick)によって、正しい注射を検証した[Kagiava et al.,P.N.A.S.USA,113(17):E2421-E2429(2016)、Kagiava et al.,Hum.Mol.Genet.,27(8):1460-1473(2018)、Kagiava et al.,Methods in Molecular Biology,1791:277-285(2018)、及びSchiza et al.,Brain,142(5):1227-1241(2019)]。
実施例6
生体内分布及び発現
AAV9miR871(標的化)及びmiRLacZウイルス(非標的化対照)を、上記のように、2ヶ月齢のC61 Hetマウスに髄腔内に注射して、ヒト/マウスPMP22及び他のミエリン関連タンパク質に対するそれらの効果を調べた。注射の4週間及び8週間後、マウスを、eGFPレポーター遺伝子の発現について免疫染色で分析した。並びに、注射の6週間後、PMP22発現のリアルタイムPCR又は免疫ブロットによって分析した。PNS組織におけるAAV9ベクターの生体内分布も、ベクターゲノムコピー数(VGCN)分析によって評価した。
生体内分布及び発現
AAV9miR871(標的化)及びmiRLacZウイルス(非標的化対照)を、上記のように、2ヶ月齢のC61 Hetマウスに髄腔内に注射して、ヒト/マウスPMP22及び他のミエリン関連タンパク質に対するそれらの効果を調べた。注射の4週間及び8週間後、マウスを、eGFPレポーター遺伝子の発現について免疫染色で分析した。並びに、注射の6週間後、PMP22発現のリアルタイムPCR又は免疫ブロットによって分析した。PNS組織におけるAAV9ベクターの生体内分布も、ベクターゲノムコピー数(VGCN)分析によって評価した。
免疫組織化学の場合、マウスを麻酔し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)、続いて、新鮮な4%パラホルムアルデヒドを経心灌流した。脊髄神経根を含む腰髄、並びに坐骨神経及び大腿神経を切開し、凍結切片用に凍結させた。坐骨神経及び大腿神経の一部は、立体鏡下で線維にときほぐした。切片及び線維を、冷たいアセトン中で透過させ、0.5%Triton-Xを含有する5%BSAのブロッキング溶液で、室温で1時間インキュベートした。スライドを、ブロッキング溶液に希釈されたeGFP(1:2,000;Invitrogen)に対するウサギ抗血清である一次抗体と、4℃で一晩インキュベートした。次いで、スライドを、PBS中で洗浄し、ウサギの交差親和性精製二次抗体(Jackson ImmunoResearch、1:500希釈)と、室温で1時間インキュベートした。細胞核をDAPIで視覚化した。スライドを、蛍光封入剤で封入し、蛍光顕微鏡下でNIS-elements software(Nikon)を使用して、デジタルカメラで撮影した。eGFPはまた、抗eGFP抗体を用いずに、自家蛍光シグナルとして可視化した。腰髄神経根、坐骨神経、及び大腿神経のeGFP+SCの割合(%)は、最近記載されているようにカウントした[Kagiava et al.,Hum.Mol.Genet.,28(21):3528-3616(2019)]。
免疫ブロット分析の場合、新鮮な腰髄神経根、坐骨神経、及び大腿神経を、2ヶ月齢でAAV9-miR871又はAAV9-miRLacZベクターを髄腔内注射し、注射後4週間及び8週間(生体内分布実験)又は注射後6週目(サイレンシング実験)のいずれかで犠牲にしたC61 Hetマウスの群から採取し、プロテアーゼ阻害剤の混合物(Roche)を含む氷冷RIPA緩衝液(10mMリン酸ナトリウム、pH7.0、150mM NaCl、2mM EDTA、50mMフッ化ナトリウム、1%ノニデット(登録商標)P-40、1%デオキシコール酸ナトリウム、及び0.1%SDS)中で溶解した。溶解物からのタンパク質(150μg)を、12%SDS/PAGEによって分画し、次いで、セミドライ転写ユニットを使用して、PVDF膜(GE Healthcare Life Sciences)に転写した。膜上の非特異的部位を、室温でTween20(PBST)を含むPBS中の5%脱脂乳で1時間ブロッキングした。免疫ブロットを、抗huPMP22抗体(1:500 Abcam)、抗eGFP抗体(1:1000 Abcom)、及び抗msTubulin抗体(1:3000;Developmental Studies Hybridoma Bank,負荷対照用)と、4℃で一晩インキュベートした。PBSTで洗浄した後、5%ミルクPBST中のHRPコンジュゲート二次抗血清(Jackson ImmunoResearch、1:3000希釈)で1時間、免疫ブロットをインキュベートした。ブロットを、PBSTで再び洗浄し、結合した抗体を強化型化学発光システム(GE Healthcare Life Sciences)によって可視化した。
リアルタイムPCR分析の場合、RNAを、2ヶ月齢でAAV9-miR871、AAV9-miR868又はAAV9-miRLacZベクターを髄腔内注射し、注射後6週目で犠牲にしたC61 Hetマウスの群からのスナップ凍結された腰髄神経根、坐骨神経、及び大腿神経から、製造業者のプロトコルに従ってQiagen RNeasy(登録商標)脂質組織ミニキットを使用して単離した。DNase処理後、RNAを分光光度測定によって定量化し、0.3μgのRNAを使用して、TaqMan(商標)逆転写試薬を用いてcDNAを合成した。次いで、Taqman遺伝子発現アッセイ(Applied Biosystems)及び内因性対照としてmuGAPDHアッセイを使用して、huPMP22、muPMP22、muMPZ、muCNP、muGldn、及びmuGJB1のmRNAのレベルを定量化した。AAV9-miR871及びAAV9-miR868処置マウスにおけるhuPMP22、muPMP22、muMPZ、muCNP、muGldn、及びmuGJB1の発現レベルを、AAV9-miRLacZ処置同腹仔の類似の発現レベルと比較した。
ベクターゲノムコピー数(VGCN)分析の場合、製造業者の説明書に従ってMeslo MagPurix組織DNA抽出キットを使用して、腰髄神経根及び坐骨神経からDNAを抽出した。抽出したDNAにおけるベクターゲノムの検出及び定量化の場合、eGFP(レポーター遺伝子)及びTRFC(負荷対照)に対するプローブを使用して、ドロップレットデジタルPCR分析を実施した。1細胞あたりの平均VGCNを、総VGCNを総細胞数で割って計算した。
免疫染色(eGFP発現細胞の割合)及び免疫ブロット(正規化した光学密度の比)データを、GraphPad Prism5ソフトウェアの対応のないStudentのt検定を使用して比較した。全ての比較における有意水準、P<0.05。各統計解析の更なる詳細が、各結果とともに示される。
成体マウスの腰髄神経根では、発現率分析により、総PNS細胞の45.96%及び56.82%が、それぞれ注射後4週間及び8週間でeGFP陽性であったことが示された(図16)。坐骨神経では、発現率分析により、総細胞の42.06%及び45.74%が、それぞれ注射後4週間及び8週間でeGFP陽性であったことが示された(図17)。大腿神経では、発現率分析により、細胞の31.06%及び41.09%が、それぞれ注射後4週間及び8週間でeGFP陽性であったことが示された(図18)。ユビキタスプロモーターによって発現が駆動されたという事実から予想されるように、脊髄、並びに腰髄神経根、坐骨神経、及び大腿神経の両方で、軸索に沿ったeGFPシグナルが検出された。
成体マウスにおけるeGFPの発現は、AAV9-U6-miRLacZ-CMV-eGFPを髄腔内注射した2ヶ月齢マウス群から得られた腰髄神経根及び坐骨神経溶解物における抗eGFP抗体を使用した免疫ブロット分析によっても実証された。この目的のために、新鮮な腰髄神経根及び坐骨神経を、注射後4週間及び8週間で採取し、氷冷RIPA緩衝液中で溶解した。予測された30kDaのeGFPタンパク質バンドは、陰性対照と比較して、調べたAAV9-miLacZ処置マウスの腰髄神経根(神経根eGFP/チューブリン比の平均:4週間:0.96、8週間:1.01)並びに坐骨神経(坐骨神経eGFP/チューブリン比の平均:4週間:0.46、8週間:1.03)で検出可能であったが、同じレベルではなかった、(図19A、B、D、E)。
更に、注射後4週間及び8週間のマウスの腰髄神経根(平均神経根VGCN:4週間:3.25、8週間:1.9)及び坐骨神経(平均坐骨神経VGCN:4週間:0.41、8週間:0.38)から抽出されたゲノムDNAに対して行ったVGCN分析により、動物間に変動があるものの、全体的に十分かつ安定した経時的な生体内分布が示された(図19C、F)。
実施例7
PMP22のインビボAAV媒介性遺伝子サイレンシング
PNS組織における対照AAV9-miRLacZベクターの適切な生体内分布及び発現を確認した後、C61-Hetマウスの選択された転写産物におけるAAV9-miR871及びAAV9-miR868の効果を評価した。
PMP22のインビボAAV媒介性遺伝子サイレンシング
PNS組織における対照AAV9-miRLacZベクターの適切な生体内分布及び発現を確認した後、C61-Hetマウスの選択された転写産物におけるAAV9-miR871及びAAV9-miR868の効果を評価した。
AAV9-miR871で処置されたC61-Hetマウスの腰髄神経根は、ヒト及びマウスのPMP22 mRNAレベルが、それぞれ0.29倍及び0.25倍低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ0.72倍、0.54倍、0.36倍、及び0.61倍増加したことを示した(図20)。それと一致して、AAV9-miR871で処置されたマウスの坐骨神経は、ヒト及びマウスのPMP22 mRNAレベルが、それぞれ0.46及び0.49倍低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ0.32、0.16、9.16及び5.06倍増加したことを示した(図21)。AAV9-miR871処置マウスの大腿神経は、ヒト及びマウスのPMP22 mRNAレベルが、それぞれ0.54及び0.53倍低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ2.49、2.3、2.12及び1.96倍増加したことを示した(図22)。
AAV9-miR868で処置されたC61-Hetマウスの腰髄神経根は、ヒト及びマウスのPMP22 mRNAレベルが、それぞれ0.27倍及び0.01倍低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ-0.6倍、0.21倍、-0.24倍、及び0.78倍変化したことを示した(図23)。AAV9-miR868で処置されたマウスの坐骨神経は、ヒト及びマウスのPMP22 mRNAレベルが、それぞれ0.49及び0.38倍低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ0.56、0.55、0.50及び0.49倍増加したことを示した(図24)。AAV9-miR868処置マウスの大腿神経は、ヒト及びマウスのPMP22 mRNAレベルが、それぞれ0.39及び0.40倍低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ1.44、1.54、2.28及び2.30倍増加したことを示した(図25)。
AAV9-miR871で処置されたWTマウスの腰髄神経根は、マウスPMP22 mRNAレベルが、0.36倍低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ1.02、1.31、0.85、及び1.31倍増加したことを示した(図51及び52)。それと一致して、AAV9-miR871で処置されたWTマウスの坐骨神経は、マウスPMP22 mRNAレベルが、0.52倍低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ2.09、1.47、0.79、及び1.01倍増加したことを示した(図51及び52)。WT AAV9-miR871処置マウスの大腿神経は、マウスPMP22 mRNAレベルが、0.87低下し、一方、GJB1、MPZ、CNP、及びGldnを含む他のミエリン関連タンパク質のmRNAレベルが、それぞれ4.06、2.29、5.03、及び2.86倍増加したことを示した(図51及び52)。
これらの結果に基づいて、AAV9-miR871は、他のミエリンタンパク質の増強された転写をもたらしながら、hu/msのPMP22 mRNAをサイレンシングするのに最も有望なものとして選択された。したがって、腰髄神経根、坐骨神経、及び大腿神経のヒトPMP22タンパク質レベルに対するその効果を、免疫ブロット分析を使用して評価した。
PMP22タンパク質バンドは、チューブリン免疫ブロットのバンド又はミエリンタンパク質ゼロ(MPZ)SDSゲルのバンドのいずれかを使用して正規化し(図26)、両方のシナリオにおいて、HuPMP22タンパク質レベルは、miRLacZ処置マウスと比較した場合、miR871処理後に60%超有意に低下することが示された(HuPMP22/Tub:67%サイレンシング、HuPMP22/MPZ:64%サイレンシング)。チューブリンに対して正規化した場合、MPZタンパク質の発現は、miRLacZ処置マウスと比較した場合、24%増加することが示された。同様に、坐骨神経のHuPMP22タンパク質は、miRLacZ処置マウスと比較した場合、85%超有意に減少し(HuPMP22/Tub:87%サイレンシング、HuPMP22/MPZ:85%サイレンシング)、一方、MPZタンパク質の発現は、不変のままであった(MPZ/Tub:0.008%サイレンシング)(図27)。大腿神経では、HuPMP22タンパク質レベルは、miRLacZ処置マウスと比較した場合、60%超有意に減少し(HuPMP22/Tub:64%サイレンシング、HuPMP22/MPZ:72%サイレンシング)、一方、MPZタンパク質の発現は、34%有意に増加した(図28)。
同様に、WTマウスにおけるAAV9-miR871の注射は、MPZレベルを変化させずに、腰髄神経根におけるマウスPMP22のレベルを66%低下させた(図53)。WT坐骨神経では、AAV9-miR871の注射は、マウスPMP22を69%減少させ、MPZタンパク質レベルを54%増加させた(図54)。WTの大腿神経は、WTの腰髄神経根と同様に応答し、AAV9-miR871の注射は、MPZタンパク質レベルを変化させずに、マウスPMP22タンパク質レベルを99%低下させた(図55)。統計:GraphPad Prism5ソフトウェアのStudentのt検定を使用して、免疫ブロット(光学密度の比)データを比較した。全ての比較における有意水準、P<0.05。
実施例8
CMT1Aのマウスモデルを回復させるためのAAV9-miR871ベクターを用いた治療試験
既に進行した末梢神経病理を有する成体C61 HetマウスにおいてAAV9-miR871ベクターの十分なサイレンシング効果を確認した後、図29に示される試験設計に従って、早期及び後期治療試験を実施した。無作為化非標的化ベクター対照治療試験を、CMT1AのC61 Hetマウスモデルにおいて、2ヶ月齢(早期処置)又は6ヶ月齢(後期処置)でAAV9-miR871又はAAV9-miRLacZのいずれかを注射した群を使用して実施した。
CMT1Aのマウスモデルを回復させるためのAAV9-miR871ベクターを用いた治療試験
既に進行した末梢神経病理を有する成体C61 HetマウスにおいてAAV9-miR871ベクターの十分なサイレンシング効果を確認した後、図29に示される試験設計に従って、早期及び後期治療試験を実施した。無作為化非標的化ベクター対照治療試験を、CMT1AのC61 Hetマウスモデルにおいて、2ヶ月齢(早期処置)又は6ヶ月齢(後期処置)でAAV9-miR871又はAAV9-miRLacZのいずれかを注射した群を使用して実施した。
C61-Hetマウスを、それらの年齢及び受けた処置、AAV9-miR871又はAAV9-miRLacZに従って、4つの群に無作為化した。転帰分析は、両方の処置時点について、注射の4ヶ月後に実施され、運動行動能力、運動神経伝導試験、並びに形態計測分析を含み、オニオンバルブ形成の総数とともに、薄くミエリン化した軸索及び脱ミエリン化した軸索の割合を測定することによって脱ミエリン化の程度を決定した。転帰分析には、C61 Het-AAV9-miR871初期及び後期処置マウス群のNflレベルの血漿定量、並びにCD20、CD45、CD3、及びCD68マーカーの免疫応答も含まれた。
各年齢群の同腹仔マウスを、標的化ベクター(AAV9-miR871;処置群)又は非標的化ベクター(AAV9-miRLacZ;対照群)のいずれかに無作為化した。無作為化は、テーリング後の動物の付番に基づいた(奇数のマウスが処置に、偶数のマウスが対照処置に無作為化される)。マウスを、早期処置の場合は6ヶ月齢で、及び後期処置の場合は10ヶ月齢で、臨床試験、続いて、電気生理学的試験、Nfl分析のための血漿採取、並びに灌流及び定量的形態計測及び免疫応答分析によって評価した。一次評価項目は、腰髄神経根及び大腿運動神経の病理学的変化の回復(rescue)とみなした。二次評価項目は、坐骨神経運動伝導速度の有意な改善、臨床運動行動能力の改善、腰髄神経根、大腿運動神経、及び肝臓、並びに血漿Nflレベルにおける免疫反応の改善であった。
統計:miRLacZ早期又は後期処置マウス、miR871早期又は後期処置マウスの行動分析、電気生理学的分析、及び形態学的分析のデータを、GraphPad Prism5ソフトウェアのMann-Whitney検定を使用して比較した。全ての比較における有意水準、P<0.05。各統計解析の更なる詳細は、各結果に示されている。
実施例9
行動試験
[Kagiava(2016),上記、Schiza,上記]に記載されているように、処置動物及び対照処置動物における強度及び協調性を比較した。試験官は、動物の処置状況(処置又は対照ベクター処置)に対して盲検化された。運動能力(motor performance)は、2ヶ月齢(早期処置)又は6ヶ月齢(後期処置)での注射前、及び再度、注射の2ヶ月後及び4ヶ月後にロータロッド(5rpm及び17.5rpm)、フットグリップ、及びハング試験で評価した。
行動試験
[Kagiava(2016),上記、Schiza,上記]に記載されているように、処置動物及び対照処置動物における強度及び協調性を比較した。試験官は、動物の処置状況(処置又は対照ベクター処置)に対して盲検化された。運動能力(motor performance)は、2ヶ月齢(早期処置)又は6ヶ月齢(後期処置)での注射前、及び再度、注射の2ヶ月後及び4ヶ月後にロータロッド(5rpm及び17.5rpm)、フットグリップ、及びハング試験で評価した。
ロータロッド試験:運動のバランス及び協調は、加速ロータロッド装置(Ugo Basile,Italy)を使用して、記載されたプロトコル[Kagiava,Hum.Mol.Genet.(2018),上記、Savvaki,上記]に従って決定した。動物の訓練は、連続3日間の1日当たり3回の試験で構成され、試験の間に15分間の休息を含んだ。マウスをロッド上に配置し、速度を2.5rpmから25rpmに徐々に増加させた。トライアルは、マウスがロッドから落ちた場合、ミスステップした場合、又は600秒間ロッド上に滞在し場合に終了する。試験は、4日目に、5rpm及び17.5rpmの2つの異なる速度を使用して実施した。落下するまでの時間が、速度ごとに計算される。
グリップ強度試験:グリップ強度を測定するために、マウスを尾部で保持し、後肢でグリッドをつかむまで装置(UgoBasile)に向かって下げ、次いで、グリッドを離すまで穏やかに引き戻した。各セッションは、6回の連続した試験からなる。g単位での力の測定値は、装置に示されていた。
ワイヤーハング試験:ワイヤーハング試験は、運動機能及びグリップ強度を評価することを目的としている。試験は、動物を高架のワイヤーに吊るすことで開始する。動物をワイヤーの上に置き、次いで、それを反転させ、動物が落下するまでの時間を記録した。この試験は、連続3日間、1日1回実施し、次いで、平均的な能力を計算した。
早期処置群について、ロータロッド、フットグリップ、ハング試験により、2ヶ月齢での注射前、及び再度、注射後2ヶ月、注射後4ヶ月での運動能力を評価した(図30~33)。2ヶ月齢のWTマウス及び非注射C61 Hetマウスを上記の試験と比較すると、CMT1Aモデルの運動能力が著しく障害されることが証明される。これら2群間で有意差を示さなかった唯一の試験は、CMT1Aモデルにおける2ヶ月齢時の5rpmでのロータロッドであったが、時間の経過とともに進行性の悪化を示し、これは、処置によって回復した(図30)。運動能力を評価するために用いた他の全ての試験は、4ヶ月齢及び6ヶ月齢のWTマウスが、それらの年齢適合AAV9-miRLacZ処置マウスと著しく異なることを示した(図30~33)。
早期処置試験群について、2ヶ月齢のC61 Hetマウスを、各処置(miR871又はmiRLacZ)に無作為に割り当てた。予想どおり、AAV9-miR871又はAAV9-miRLacZのいずれかで処置された2ヶ月齢のC61 Hetマウスは、処置を開始する前のベースラインで有意差を示さなかった。重要なことに、4ヶ月齢及び6ヶ月齢、処置後2ヶ月及び4ヶ月での全ての運動能力試験(5rpm及び17.5rpmのロータロッド、グリップ強度、ワイヤーハング試験)は、AAV9-miLacZ処置対照同腹仔と比較した場合、AAV9-miR871処置マウスの有意な改善を示した(図30~33)。
後期処置群について、ロータロッド、フットグリップ、ハング試験により、6ヶ月齢での注射前、及び再度、注射後2ヶ月、注射後4ヶ月での運動能力を評価した(図34~37)。6ヶ月齢のWTマウス及び非注射C61 Hetマウスを上記の試験と比較すると、モデルの運動能力が著しく障害されることが証明される。運動能力を評価するために用いた他の全ての試験は、6ヶ月齢及び8ヶ月齢のWTマウスが、それらの年齢適合AAV9-miRLacZ処置マウスと著しく異なることを示した(図34~37)。
後期処置試験群について、6ヶ月齢のC61 Hetマウスを、各処置(miR871又はmiRLacZ)に無作為に割り当てた。予想どおり、AAV9-miR871又はAAV9-miRLacZのいずれかで処置された6ヶ月齢のC61 Hetマウスは、処置を開始する前のベースラインで有意差を示さなかった。重要なことに、6ヶ月齢及び8ヶ月齢、処置後2ヶ月及び4ヶ月での全ての運動能力試験(5rpm及び17.5rpmのロータロッド、グリップ強度、ワイヤーハング試験)は、AAV9-miLacZ処置対照同腹仔と比較した場合、AAV9-miR871処置マウスの有意な改善を示した(図34~37)。
WT注射群について、2ヶ月のWTマウスを各処置(miR871又はmiRLacZ)に無作為に割り当てた。予想どおり、AAV9-miR871又はAAV9-miRLacZのいずれかで処置された2ヶ月齢のWTマウスの全ての運動能力試験について、注射前のベースラインで有意差を示さなかった。WT注射群について、ロータロッド、フットグリップ、ハング試験により、2ヶ月齢での注射前、及び再度、注射後2ヶ月、注射後4ヶ月での運動能力を評価した(図56~59)。
WT注射群の5rpm及び17.5rpmでのロータロッド分析は、WTマウスにおけるAAV9-miR871の注射が、注射後2ヶ月での運動能力に悪影響を及ぼすことを示した(図56~57)。この表現型は、注射後4ヶ月では観察されず、注射WTマウス及び非注射WTマウスは同様の能力を示した(図44~45)。注射後2ヶ月及び4ヶ月のグリップ強度分析は、年齢適合非注射マウス及びモック注射WTマウスと比較した場合、AAV9-miR871を注射したWTマウスの有意な障害を示した(図58)。ハング試験分析は、WTマウスにおけるAAV9-miR871の注射が、注射後4ヶ月の時点で、マウスの能力に悪影響を及ぼすことを示した。他の全ての時点で、ベースラインのWTマウス及び注射したWTマウスのハング試験の成績は、統計的有意差を示さなかった(図59)。
実施例10
運動神経伝導速度(MNCV)、複合筋活動電位(CMAP)の坐骨神経振幅、及び後肢クラスプ観察
C61 Hetマウスは、2ヶ月齢で約28m/s、6ヶ月齢及び10ヶ月齢で22m/sの坐骨神経のMNCVを示す[Huxley(1998),上記、Kohl et al.,American Journal of Pathology,176(3):1390-1399(2010)]。坐骨神経のMNCV特性を、上記のように処置群で比較した[Huxley(1998),上記、Kohl,上記、Zielasek et al.,Muscle&Nerve,19(8):946-952(1996)]。MNCV及びCMAPの場合、左右の坐骨神経を、麻酔した動物で、0.05msの最大上矩形波パルス(5V)を用いて、双極電極を介して、坐骨切痕及び遠位に足首で刺激した。MNCVは、刺激電極と記録電極との間の距離を、遠位潜時を近位潜時から差し引いた結果で割ることによって計算した。CMAPの潜時は、後肢の第2指と第3指の間に挿入された双極電極によって記録され、刺激アーチファクトから負のM波のふれが開始するまで測定された。各マウスにおける足首から肢までの距離の変動から生じる誤差を回避するために、遠位刺激部位と記録部位との間の固定距離を使用して、遠位潜時を計算した。処置マウス群及び対照マウス群の機能的特性を評価するために、坐骨神経のMNCV及びCMAPを、早期処置群では6ヶ月齢で、後期処置群では10ヶ月齢で、及びWT注射群では6ヶ月齢で測定した(全ての時点は処置後4ヶ月であった)。
運動神経伝導速度(MNCV)、複合筋活動電位(CMAP)の坐骨神経振幅、及び後肢クラスプ観察
C61 Hetマウスは、2ヶ月齢で約28m/s、6ヶ月齢及び10ヶ月齢で22m/sの坐骨神経のMNCVを示す[Huxley(1998),上記、Kohl et al.,American Journal of Pathology,176(3):1390-1399(2010)]。坐骨神経のMNCV特性を、上記のように処置群で比較した[Huxley(1998),上記、Kohl,上記、Zielasek et al.,Muscle&Nerve,19(8):946-952(1996)]。MNCV及びCMAPの場合、左右の坐骨神経を、麻酔した動物で、0.05msの最大上矩形波パルス(5V)を用いて、双極電極を介して、坐骨切痕及び遠位に足首で刺激した。MNCVは、刺激電極と記録電極との間の距離を、遠位潜時を近位潜時から差し引いた結果で割ることによって計算した。CMAPの潜時は、後肢の第2指と第3指の間に挿入された双極電極によって記録され、刺激アーチファクトから負のM波のふれが開始するまで測定された。各マウスにおける足首から肢までの距離の変動から生じる誤差を回避するために、遠位刺激部位と記録部位との間の固定距離を使用して、遠位潜時を計算した。処置マウス群及び対照マウス群の機能的特性を評価するために、坐骨神経のMNCV及びCMAPを、早期処置群では6ヶ月齢で、後期処置群では10ヶ月齢で、及びWT注射群では6ヶ月齢で測定した(全ての時点は処置後4ヶ月であった)。
統計:GraphPad Prism5ソフトウェアの一元配置ANOVAとTukeyの多重比較検定を使用して、MNCV及びCMAPを比較した。全ての比較における有意水準、P<0.05。
miR871処置群及びmiRLacZ処置群における機能的特性を評価するために、早期処置マウス坐骨神経のMNCVを、処置後4ヶ月、6ヶ月齢で測定した。miR871処置群では、MNCV及びCMAP値が有意に改善し、それぞれ平均36.88m/s及び3.51mV(n=8)に達し、一方、miRLacZ群(n=8)では、MNCV及びCMAP値が、それぞれ平均25.9m/s及び1.44mVであった(図38A;p<0.0001、及び図60)。miR871処置群のMNCV値は、WTマウスのMNCV値に近く、平均41.61m/s(n=6;p>0.05)であった。しかしながら、miR871群のCMAP値は、WTレベルに達しなかった(WTCMAPスコア:6.9mV)。早期処置C61-Hetマウスにおける運動能力の改善は、電気生理学的特性の改善と相関していた。
早期処置群と同様に、miR871群及びmiRLacZ群の機能的特性を評価するために、処置後4ヶ月、10ヶ月齢で、後期処置坐骨神経のMNCV及びCMAPを測定した。miR871処置群では、MNCV値が有意に改善し、平均が37.69m/s(n=6)に達し、一方、miRLacZ群(n=5)では、速度が平均24.12m/sであった(図39A;p=0.0040、及び図61)。しかしながら、miR871後期処置群のMNCV値は、平均43.38m/sを有するWTマウスの値に到達することができなかった(n=4;p=0.0333)。10ヶ月齢のWTマウス及びmiRLacZマウスのCMAP値は有意に異なり、それらの平均は、それぞれ5.33及び2.4mVである。この表現型は、AAV9-miR871による後期処置後に改善されず、miR871マウス群の平均CMAPスコアは、2.98mVであった。早期処置群と同様に、早期処置C61-Hetマウスにおける運動能力の改善は、電気生理学的特性の改善と相関していた。
miR871群及びmiRLacZ群の機能的特性を評価するために、AAV9-miRLacZ又はAAV9-miR871を注射したWTマウスのMNCV及びCMAPを、処置後4ヶ月、6ヶ月齢で測定した。WT、miRLacZ、及びmiR871処置群のMNCV値には差異がなく、平均スコアが、それぞれ41.61、42.09、及び40.07m/sであった(図62A~B)。6ヶ月齢のWTマウス及びmiRLacZマウスのCMAP値には有意差がなく、平均が、それぞれ6.89及び7.03m/Vであった。miR871群は、CMAPスコアの低下を示し、平均が、4.62m/Vであった。
後肢クラスピングは、末梢神経障害の多くのマウスモデルにおける疾患進行のマーカーである[Arnaud et al.,P.N.A.S.USA,106(41):17528-17533(2009)]。後肢クラスピングの表現型がC61 Hetマウスで観察され、1ヶ月齢から始まり、10ヶ月齢まで進行した。この観察の間、マウスを、尾で懸垂させ、末梢神経系欠損の徴候としてのつま先の異常な握り締め及びクラスピングを監視した。
統計:GraphPad Prism5ソフトウェアの一元配置ANOVA及びTukeyの多重比較検定を使用して、後肢開脚角度のデータを比較した。全ての比較における有意水準、P<0.05。
2ヶ月齢でAAV9-miRLacZ(モック)を注射した6ヶ月齢のC61 Hetマウスは、尾による懸垂時に、つま先の異常な握り締め及び後肢表現型のクラスピングを示し、末梢神経系欠陥の存在を示唆した。2ヶ月齢でAAV9-miR871を注射した6ヶ月齢のC61 Hetマウスでは、この表現型が完全に回復し、後肢のクラスピングがなく、正常な握り締めを示した(図38B)。
6ヶ月齢でAAV9-miRLacZ(モック)を注射した10ヶ月齢のC61 Hetマウスは、尾による懸垂時に、つま先の異常な握り締め及び後肢表現型のクラスピングを示し、末梢神経系PNS欠陥の存在を示唆した。早期処置群と同様に、6ヶ月齢でAAV9-miR871を注射した10ヶ月齢のC61 Hetマウスでは、この表現型が完全に回復し、後肢のクラスピングがなく、正常な握り締めを示した(図39B)。
非注射WT及びAAV9-miRLacZ又はAAV9-miR871のいずれかを注射したWTは、それらの後肢クラスピング表現型において統計的有意差を示さなかった(図63)。平均の後肢開脚は、それぞれ73.19、70.54、59.09度であった。
実施例11
形態計測分析
6ヶ月齢又は10ヶ月齢のAAV9-miR871及びAAV9-miRLacZ処置C61 Hetマウスの腰髄運動神経根及び大腿運動神経を得て、上記のように、2.5%グルタルアルデヒドによる灌流、オスミウム酸染色(osmication)、脱水、及びアラルダイト樹脂(全て、Agar Scientific,Essex,UKから購入)への包埋後、ミエリン形成の定量分析を行った[Kagiava(2019),上記]。神経根が付着した腰髄脊髄及び大腿運動神経の中央部分の横断準超薄切片(1μm)を得、アルカリ性トルイジンブルー(Sigma-Aldrich、Munich,Germany)で染色した。切片を使用して、両群における異常なミエリン形成の程度を調べた。簡潔に、全ての脱ミエリン化した軸索、薄くミエリン化した軸索、及び正常にミエリン化した軸索は、以下の基準を使用してカウントした:ミエリン鞘を含まない1μmより大きい軸索は、脱ミエリン化した軸索とみなした;ミエリン鞘が軸索径の10%未満の軸索は、薄くミエリン化した軸索とみなした;円周方向に配置されたシュワン細胞のプロセス及び細胞外マトリックスによって囲まれた軸索は、「オニオンバルブ」とみなした;他の全てのミエリン化した軸索は、脱ミエリン化した軸索とみなした。全ての病理学的分析は、各マウスの処置条件に対して盲検で実施した。形態学的分析は、複数の運動神経根及び両側の大腿運動神経で実施し、結果をマウスごとに平均化した。脱ミエリン化した線維及び薄くミエリン化した線維を含む異常にミエリン化した線維の数をカウントし、各カテゴリにおける線維の割合を計算した。オニオンバルブの形成の場合、マウス当たりのバルブの総数をカウントし、そのように提示した。
形態計測分析
6ヶ月齢又は10ヶ月齢のAAV9-miR871及びAAV9-miRLacZ処置C61 Hetマウスの腰髄運動神経根及び大腿運動神経を得て、上記のように、2.5%グルタルアルデヒドによる灌流、オスミウム酸染色(osmication)、脱水、及びアラルダイト樹脂(全て、Agar Scientific,Essex,UKから購入)への包埋後、ミエリン形成の定量分析を行った[Kagiava(2019),上記]。神経根が付着した腰髄脊髄及び大腿運動神経の中央部分の横断準超薄切片(1μm)を得、アルカリ性トルイジンブルー(Sigma-Aldrich、Munich,Germany)で染色した。切片を使用して、両群における異常なミエリン形成の程度を調べた。簡潔に、全ての脱ミエリン化した軸索、薄くミエリン化した軸索、及び正常にミエリン化した軸索は、以下の基準を使用してカウントした:ミエリン鞘を含まない1μmより大きい軸索は、脱ミエリン化した軸索とみなした;ミエリン鞘が軸索径の10%未満の軸索は、薄くミエリン化した軸索とみなした;円周方向に配置されたシュワン細胞のプロセス及び細胞外マトリックスによって囲まれた軸索は、「オニオンバルブ」とみなした;他の全てのミエリン化した軸索は、脱ミエリン化した軸索とみなした。全ての病理学的分析は、各マウスの処置条件に対して盲検で実施した。形態学的分析は、複数の運動神経根及び両側の大腿運動神経で実施し、結果をマウスごとに平均化した。脱ミエリン化した線維及び薄くミエリン化した線維を含む異常にミエリン化した線維の数をカウントし、各カテゴリにおける線維の割合を計算した。オニオンバルブの形成の場合、マウス当たりのバルブの総数をカウントし、そのように提示した。
形態学的分析により、AAV9-miR871による早期処置C61-Hetマウスの調べた全てのPNS組織(神経根及び大腿神経)において、異常にミエリン化した線維の減少が示した(図40~43)。AAV9-miR871処置マウスの前腰髄運動神経根において、異常にミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ群と比較して減少した(図40~41)。詳細には、AAV9-miR871処置マウス(n=16)における薄くミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ処置マウス(n=16)における15.35%と比較して、11.74%であった(p=0.0261、Mann-Whitney検定)。詳細には、AAV9-miR871処置マウス(n=16)における脱ミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ処置マウス(n=16)における49.74%と比較して、25.36%であった(p=0.0001、Mannn-Whitney検定)。また、AAV9-miR871による処置後のオニオンバルブの形成(1切片当たり平均0.69のオニオンバルブの形成、n=16)も、AAV9-miRLacZ処置(平均8.06のオニオンバルブの形成/切片、n=16)と比較して減少した(p<0.0001、Mann-Whitney検定)。
同様に、AAV9-miR871早期処置マウスの大腿運動神経では、異常にミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ群と比較して低下した(図42~43)。AAV9-miR871処置マウス(n=16)では、薄くミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ処置マウス(n=16)における19.36%と比較して、6.83%であり(p<0.0001,Mann-Whitney検定)、一方、脱ミエリン化した線維の割合は、AAV9-miR871処置マウス(n=16)では、AAV9-miRLacZ処置マウス(n=16)における2.33%と比較して、1.09%であった(p=0.0004,Mann-Whitney検定)。早期処置群のmiRLacZ大腿運動神経において、十分なオニオンバルブの形成が観察されず、miR871処置後のこの形成における有意な交代をもたらさなかった(miRLacZ:0.69%,miR871:0.25%)。
早期処置群と同様に、10ヶ月齢のAAV9-miR871又はAAV9-miRLacZ処置C61 Hetマウスの腰髄運動神経根及び大腿運動神経を得て、マウス群からのミエリン形成の定量分析を行った。形態学的分析により、AAV9-miR871による後期処置C61-Hetマウスの調べた全てのPNS組織(神経根及び大腿神経)において、異常にミエリン化した線維の減少が示された(図44~47)。AAV9-miR871処置マウスの前腰髄運動神経根において、異常にミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ群と比較して減少した(図44~45)。詳細には、AAV9-miR871処置マウス(n=7)における薄くミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ処置マウス(n=7)における19.39 %と比較して、14.62 %であった(p=0.0364、Mann-Whitney検定)。詳細には、AAV9-miR871処置マウス(n=7)における脱ミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ処置マウス(n=7)における52.25 %と比較して、32.65 %であった(p=0.0035、Mann-Whitney検定)。また、AAV9-miR871による処置後のオニオンバルブの形成(1切片当たり平均38.86のオニオンバルブの形成、n=7)も、AAV9-miRLacZ処置(平均2.71のオニオンバルブの形成/切片、n=7)と比較して減少した(p<0.0010、Mann-Whitney検定)。
同様に、AAV9-miR871後期処置マウスの大腿運動神経では、異常にミエリン化された線維の割合は、AAV9-miRLacZ群と比較して低下した(図46~47)。AAV9-miR871処置マウス(n=10)では、薄くミエリン化した線維の割合は、AAV9-miRLacZ処置マウス(n=7)における21.95%と比較して、11.31%であった(p=0.0004、Mann-Whitney検定)。しかしながら、後期処置は、AAV9-miRLacZ(n=7)処置マウスと比較した場合、AAV9-miR871(n=10)処置マウスにおける脱ミエリン化した線維の割合を有意に減少させることができなかった(AAV9-miR871:1.37%,miRLacZ:2.08%;p=0.0544、Mann-Whitney検定)。早期処置群のmiRLacZ大腿運動神経において、十分なオニオンバルブの形成が観察されず、AAV9-miR871処置後のこの形成における有意な交代をもたらさなかった(miRLacZ:0.57%,miR871:0.20%)。
統計:GraphPad Prism5ソフトウェアのMann-Whitney検定を使用して、形態計測分析のデータを比較した。全ての比較における有意水準、P<0.05。
実施例12
PMP22スプライス形態
PMP22は、いくつかのスプライスバリアントを有する。3つの異なる研究において、6つの選択的スプライス形態が経験的に同定された。[Visigalli et al.,supra;Suter et al.,上記、及びHuehne and Rautenstrauss,Int.J.Mol.Med.,7(6):669-675(2001)]。加えて、Ensembl.orgは、26種類の異なるヒトPMP22スプライス形態を示し、そのほとんどはシリコで予測される。これらのスプライス形態のうち3つは、ナンセンス媒介性分解(NMD)を受け、したがって、タンパク質をコードしていない可能性が高い。加えて、この遺伝子座から生じ得る他の4つの切断型非コードのプロセシングされた転写産物が存在する(Ensembl転写産物205、206、227、229)。したがって、Ensemblは、PMP22遺伝子座から生じる23の可能なタンパク質コード転写産物を予測し、8つの可能なタンパク質アイソフォームを産生する。
PMP22スプライス形態
PMP22は、いくつかのスプライスバリアントを有する。3つの異なる研究において、6つの選択的スプライス形態が経験的に同定された。[Visigalli et al.,supra;Suter et al.,上記、及びHuehne and Rautenstrauss,Int.J.Mol.Med.,7(6):669-675(2001)]。加えて、Ensembl.orgは、26種類の異なるヒトPMP22スプライス形態を示し、そのほとんどはシリコで予測される。これらのスプライス形態のうち3つは、ナンセンス媒介性分解(NMD)を受け、したがって、タンパク質をコードしていない可能性が高い。加えて、この遺伝子座から生じ得る他の4つの切断型非コードのプロセシングされた転写産物が存在する(Ensembl転写産物205、206、227、229)。したがって、Ensemblは、PMP22遺伝子座から生じる23の可能なタンパク質コード転写産物を予測し、8つの可能なタンパク質アイソフォームを産生する。
2つの最も長いEnsembl転写産物は、PMP22-215(2,423bp)及びPMP22-204(4,161bp)である。PMP22-215は、全長160アミノ酸のPMP22タンパク質をコードし、PMP22-204は、より短い125アミノ酸アイソフォームを産生する。図49は、PMP22-204 cDNA配列を示す。
上に記載したmiPMP22-868及びmiPMP22-871は、23種類の可能なタンパク質コードPMP22転写産物のうちの22種類における結合部位を標的とする(図50)。1つの転写産物の例外は、PMP22-204であり、これは、エキソン4の末端に保持されたイントロンを含み、それによって、選択的な3’非翻訳領域(3’UTR)を産生する。
実施例13
C61 HetマウスにおけるAAV9-miRLacZ髄腔内注射の6週間後の免疫応答分析
2ヶ月齢のC61 HetマウスにAAV9-miRLacZを髄腔内注射し、次いで、注射後6週間(3.5ヶ月齢)又は注射後4ヶ月(6ヶ月齢)のいずれかで犠牲にした。上記の実施例6に記載のように、免疫組織化学分析用の組織を採取した。腰髄神経根、坐骨神経、及び肝臓の切片を、CD20(1:100 Santa Cruz)、CD45(1:100 Abcam)、CD68(1:50 Biorad)、及びCD3(1:100 Abcam)に対して染色した。細胞核をDAPIで視覚化した。総細胞数に対するCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞の割合を計算した。
C61 HetマウスにおけるAAV9-miRLacZ髄腔内注射の6週間後の免疫応答分析
2ヶ月齢のC61 HetマウスにAAV9-miRLacZを髄腔内注射し、次いで、注射後6週間(3.5ヶ月齢)又は注射後4ヶ月(6ヶ月齢)のいずれかで犠牲にした。上記の実施例6に記載のように、免疫組織化学分析用の組織を採取した。腰髄神経根、坐骨神経、及び肝臓の切片を、CD20(1:100 Santa Cruz)、CD45(1:100 Abcam)、CD68(1:50 Biorad)、及びCD3(1:100 Abcam)に対して染色した。細胞核をDAPIで視覚化した。総細胞数に対するCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞の割合を計算した。
注射後6週間又は4ヶ月のいずれかで、2ヶ月齢のC61 HetマウスへのAAV9-miRLacZの髄腔内送達に対する、腰髄神経根(図64)、坐骨神経(図65)、及び肝臓(図66)での免疫学的応答を、B細胞マーカーCD20、白血球マーカーCD45、マクロファージマーカーCD68、及びT細胞マーカーCD3を定量することによって分析した。AAV9-miRLacz注射C61 Hetマウスを、年齢適合非注射C61 Hetマウス及びWTマウス(正常レベルのマウスPMP22のみを発現する)と比較した。
腰髄神経根のCD20、CD45、CD3、及びCD68マーカーの免疫応答分析(図64)は、6週間の時点で、WT、C61 Het、及びC61 Het-AAV9-miRLacZのCD20レベルに有意差がないことを示した。非注射C61 HetのCD20レベルは、6ヶ月齢の値である3.5と比較した場合、有意に増加した。非注射マウス及びAAV9-miRLacZ注射C61 Hetマウスは、年齢適合WTマウスと比較した場合、注射後4ヶ月(マウスは6ヶ月齢)でCD20レベルの増加を示した。C61 HetマウスにおけるAAV9-miRLacZの注射は、非注射C61 Hetマウスと比較した場合、CD20レベルに影響を及ぼさなかった。両方の時点で、腰髄神経根のCD45、CD68、及びCD3レベルは、年齢適合非注射WTマウスと比較した場合、非注射マウス及びAAV9-miRLacZ C61 Hetマウスにおいて上昇していることが示された。非注射C61 HetマウスのCD68及びCD3レベルは、動物が加齢するにつれて増加した。C61 HetマウスにおけるAAV9-miRlacZの注射は、非注射C61 Hetマウスと比較した場合、CDマーカーのレベルに影響を及ぼさなかった。
坐骨神経のCD20、CD45、CD3、及びCD68マーカーの免疫応答分析(図65)は、WT、C61 Het、及びC61 Het-AAV9-miRLacZの6週間の時点におけるCD20レベルに有意差がなかったことを示した。非注射C61 HetのCD20レベルは、3.5ヶ月齢及び6ヶ月齢の値を比較した場合、有意に増加した。非注射マウス及びAAV9-miRLacZ注射C61 Hetマウスは、年齢適合WTマウスと比較した場合、注射後4ヶ月(マウスは6ヶ月齢)でCD20レベルの増加を示した。C61 HetマウスにおけるAAV9-miRLacZの注射は、非注射C61 Hetマウスと比較した場合、CD20レベルに影響を及ぼさなかった。両方の時点で、坐骨神経のCD45、CD68、及びCD3レベルは、年齢適合非注射WTマウスと比較した場合、非注射マウス及びAAV9-miRLacZ C61 Hetマウスにおいて上昇していることが示された。ベースラインのC61 HetマウスのCD68レベルは、動物が加齢するにつれて増加した。C61 HetマウスにおけるAAV9-miRLacZの注射は、非注射C61 Hetマウスと比較した場合、CDマーカーのレベルに影響を及ぼさなかった。
肝臓のCD20、CD45、CD3、及びCD68マーカー免疫応答分析(図66)は、非注射WT及びC61 Hetが、同様の数の免疫応答マーカーを発現することを示した。6週間の時点でのC61 Het-AAV9-miRLacZマウスのCD20及びCD3レベルは、非注射WT及びC61 Hetと比較した場合、増加した。この増加は、4ヶ月の時点でベースラインレベルに戻りバランスが取れた。
これらのデータによれば、非注射C61 Hetマウスは、年齢適合WT対照と比較した場合、腰髄神経根及び坐骨神経の切片において免疫応答マーカーの上昇を示し、年齢とともに増加した。この表現型は、AAV9-miRLacZの注射の影響を受けなかった。3.5ヶ月齢及び6ヶ月齢の非注射C61 Hetマウスは、年齢適合対照と比較した場合、それらの肝臓において正常なレベルの免疫応答マーカーを示した。注射時点から4週間後、C61 Het-AAV9-miRLacZ注射マウスは、肝臓のCD20及びCD3陽性細胞のレベルの増加を示し、AAV9注射に対する全身的な免疫応答を示した。この表現型は、注射後の時間が進行するにつれて改善され、AAV9-miRLacZを注射したC61 Hetマウスにおいて、注射の4ヶ月後、炎症反応が検出されなかった。
統計:免疫染色のデータ(CD陽性細胞の割合)を、GraphPad Prism5ソフトウェアの一元配置ANOVAとTukeyの多重比較検定を使用して、免疫染色のデータ(CD陽性細胞の割合)を比較した。全ての比較における有意水準、P<0.05。
実施例14
ニューロフィラメント軽鎖(Nfl)の血漿中レベル
本発明者らは、処置の有効性を更に評価するために、早期処置及び後期処置終了時点で、ベースラインのWT、C61 Het、AAV9-miRLacZを注射したC61 Het、及びAAV9-miR871を注射したC61 Hetに対して血液試料からのNflバイオマーカーの分析を行った。Nfl濃度は、軸索損傷の動的尺度であり、CMT疾患の重症度のバイオマーカーとして機能する。動物を犠牲にする前に、標準的な方法を使用して血液を採取した[Parasuraman,et al.,Journal of pharmacology & pharmacotherapeutics,1,(2):87-93(2010)]。
ニューロフィラメント軽鎖(Nfl)の血漿中レベル
本発明者らは、処置の有効性を更に評価するために、早期処置及び後期処置終了時点で、ベースラインのWT、C61 Het、AAV9-miRLacZを注射したC61 Het、及びAAV9-miR871を注射したC61 Hetに対して血液試料からのNflバイオマーカーの分析を行った。Nfl濃度は、軸索損傷の動的尺度であり、CMT疾患の重症度のバイオマーカーとして機能する。動物を犠牲にする前に、標準的な方法を使用して血液を採取した[Parasuraman,et al.,Journal of pharmacology & pharmacotherapeutics,1,(2):87-93(2010)]。
以前に記載されているように、血液試料を採取し、1時間以内に処理した[Kagiava et al.,Gene therapy,Online ahead of print(2021)]。血液試料を、EDTA含有チューブに採取し、20℃で、3500rpmで10分間遠心分離した。遠心分離により、血液試料を2相に分離し、上層の血漿を回収し、試験するまで-80℃で保存した。血漿中Nfl濃度を、単一分子アレイ(SIMOA)HD-1装置(Quanterix,Billerica,MA)で、市販のNF-Lightキットを使用して、University College London(UCL)において測定した[Rohrer et al.,Neurology,87(13):1329-1336(2016)、Sandelius et al.,Neurology,90(6):e518-e524(2018)]。
6ヶ月齢の非注射C61 HetマウスのNfl濃度(n=4、418.07pg/ml)は、年齢適合非注射WT対照マウスと比較して(n=4、131.10pg/ml)上昇していた(図67)。AAV9-miR971による早期処置C61 Hetマウス(n=6)は、AAV9-miRLacZ群(n=6、540.65pg/ml)と比較して、より低いNfl濃度(321.37pg/ml)を示し、AAV9-miR971のスコアが、WTレベル(131.10pg/ml)に近かった(図62)。AAV9-miRLacZの注射は、非注射C61 Hetマウスと比較した場合、血漿中Nflレベルへのいかなる代替ももたらさなかった(図67)。
10ヶ月齢の非注射C61 HetマウスのNfl濃度(n=4、539.66pg/ml)は、年齢適合非注射WT対照マウスと比較して(n=4、88.07pg/ml)上昇していた(図68)。AAV9-miR971による後期処置C61 Hetマウスは、AAV9-miRLacZを注射した年齢適合非注射C61 Het又はC61 Hetと比較した場合、血漿中Nflレベルの改善を示さなかった(図68)。非注射C61 Hetマウス、並びにAAV9-miRLacZ及びAAV9-miR871注射C61 Hetマウスは、同様のレベルのNflを示した(C61 Het AAV9-miRLacZ:471.99pg/ml、C61 Het AAV9-miR871:559.28pg/ml)(図68)。
6ヶ月齢の注射(miRLacZ:n=5、miR871:n=5)及び非注射(n=4)WTマウスのNfl濃度は、類似のスコアであり、それらの間に統計的有意差はなかった(6ヶ月齢WT:131.10pg/ml、WT AAV9-miRLacZ:128.93pg/ml、WT AAV9-miR871:104.92pg/ml)(図69)。
統計:GraphPad Prism5ソフトウェアの一元配置ANOVAとTukeyの多重比較検定を使用して、Nfl濃度のデータを比較した。全ての比較における有意水準、P<0.05。
実施例15
C61 HetマウスにおけるAAV9-miR871髄腔内注射の4ヶ月後の免疫応答分析
C61 Hetマウスに、2ヶ月齢(早期処置)又は6ヶ月齢(後期処置)のいずれかでAAV9-miR871を髄腔内注射し、次いで、注射の4ヶ月後(それぞれ6ヶ月齢又は10ヶ月齢)に犠牲にした。「実施例6」で前述したように、免疫組織化学分析用の組織を採取した。腰髄神経根、坐骨神経、及び肝臓の切片を、CD20(1:100 Santa Cruz)、CD45(1:100 Abcam)、CD68(1:50 Biorad)、及びCD3(1:100 Abcam)に対して染色した。細胞核をDAPIで視覚化した。総細胞数に対するCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞の割合を計算した。
C61 HetマウスにおけるAAV9-miR871髄腔内注射の4ヶ月後の免疫応答分析
C61 Hetマウスに、2ヶ月齢(早期処置)又は6ヶ月齢(後期処置)のいずれかでAAV9-miR871を髄腔内注射し、次いで、注射の4ヶ月後(それぞれ6ヶ月齢又は10ヶ月齢)に犠牲にした。「実施例6」で前述したように、免疫組織化学分析用の組織を採取した。腰髄神経根、坐骨神経、及び肝臓の切片を、CD20(1:100 Santa Cruz)、CD45(1:100 Abcam)、CD68(1:50 Biorad)、及びCD3(1:100 Abcam)に対して染色した。細胞核をDAPIで視覚化した。総細胞数に対するCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞の割合を計算した。
6ヶ月齢の非注射C61 Hetマウスの腰髄神経根及び坐骨神経の切片は、年齢適合非注射WTマウスと比較して、より高いレベルのCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞を示した(図70~71)。AAV9-miR871を注射した早期処置C61 Hetマウスの腰髄神経根及び坐骨神経は、低下したレベルのCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞を示し、これらのスコアがWTレベルに達した(図70~71)。これらのデータによれば、6ヶ月齢のC61 Hetマウスの腰髄神経根及び坐骨神経は、免疫応答マーカーのスコアの上昇を示し、AAV9-miR871による早期処置後、低下してWTレベルに戻った。
6ヶ月の非注射WTマウス、及びC61 Hetマウス、並びにAAV9-miR871を注射したC61 Hetマウスの肝臓切片は、類似のスコアのCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞を示した(図72)。これらのデータによれば、6ヶ月齢のC61 Hetマウスの肝臓は、ベースライン時又はAAV9-miR871の注射後4ヶ月で過剰な炎症応答を発現しない。
10ヶ月齢の非注射C61 Hetマウスの腰髄神経根及び坐骨神経の切片は、年齢適合非注射WTマウスと比較して、より高いレベルのCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞を示した(図73~74)。AAV9-miR871を注射した後期処置C61 Hetマウスの腰髄神経根及び坐骨神経は、低下したレベルのCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞を示した(図73~74)。C61 Het-AA9-miR871のスコアは、腰髄神経根のCD45のスコアを唯一の例外として、WTレベルに達した(図73~74)。これらのデータによれば、10ヶ月齢のC61 Hetマウスの腰髄神経根及び坐骨神経は、免疫応答マーカーのスコアの上昇を示し、AAV9-miR871による早期処置後、腰髄神経根のCD45マーカーを唯一の例外として、WTレベルに低下した。
10ヶ月の非注射WTマウス、及びC61 Hetマウス、並びにAAV9-miR871を注射したC61 Hetマウスの肝臓切片は、類似のスコアのCD20、CD45、CD68、及びCD3陽性細胞を示した(図75)。これらのデータによれば、6ヶ月齢のC61 Hetマウスの肝臓は、ベースライン時又はAAV9-miR871の注射後4ヶ月で過剰な炎症応答を発現しない。
実施例16
注射の4ヶ月後の早期処置群及び後期処置群のPNS及び非PNS組織のVGCN分析
C61 Hetマウスに、2ヶ月齢(早期処置)又は6ヶ月齢(後期処置)のいずれかで(マウスがそれぞれ6ヶ月齢又は10ヶ月齢であるときに)、AAV9-miR871を注射し、注射の4ヶ月後に犠牲にした。PNS(腰髄神経根、坐骨神経、及び大腿神経)並びに非PNS(脳、肝臓、腎臓、肺、四頭筋、心臓、胃、及び眼)試料を採取し、”実施例6”に記載されるように、VGCN分析用に処理した。AAV9ウイルスベクター粒子は、両方の処置群の注射の4ヶ月後、調べた全ての組織において、有意に多量に検出することができた(図76~77)。両方の処置群において、肝臓が最も高いVGCNスコアを有する組織であり、胃が最も低いVCGNスコアを有する組織であった(図76~77)。
注射の4ヶ月後の早期処置群及び後期処置群のPNS及び非PNS組織のVGCN分析
C61 Hetマウスに、2ヶ月齢(早期処置)又は6ヶ月齢(後期処置)のいずれかで(マウスがそれぞれ6ヶ月齢又は10ヶ月齢であるときに)、AAV9-miR871を注射し、注射の4ヶ月後に犠牲にした。PNS(腰髄神経根、坐骨神経、及び大腿神経)並びに非PNS(脳、肝臓、腎臓、肺、四頭筋、心臓、胃、及び眼)試料を採取し、”実施例6”に記載されるように、VGCN分析用に処理した。AAV9ウイルスベクター粒子は、両方の処置群の注射の4ヶ月後、調べた全ての組織において、有意に多量に検出することができた(図76~77)。両方の処置群において、肝臓が最も高いVGCNスコアを有する組織であり、胃が最も低いVCGNスコアを有する組織であった(図76~77)。
本発明を特定の実施形態に関して説明してきたが、当業者には、その変更及び修正が想起されることが理解される。したがって、特許請求の範囲に見られるようなかかる限定のみが本発明に課されるべきである。
本出願で参照される全ての文書は、それらの全体が参照により本明細書に援用される。
Claims (31)
- 核酸であって、
(a)配列番号1~8のうちのいずれか1つに示される鋳型核酸、
(b)配列番号9~16のうちのいずれか1つに示されるポリヌクレオチド配列と少なくとも70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、若しくは99%同一のPMP22人工阻害性RNAをコードする核酸、
(c)配列番号9~16のうちのいずれか1つに示されるPMP22人工阻害性RNAをコードする核酸、
(d)配列番号17~24のうちのいずれか1つに示されるポリヌクレオチド配列と少なくとも70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、若しくは99%同一のPMP22アンチセンスガイド鎖をコードする核酸、又は
(e)配列番号17~24のうちのいずれか1つに示されるPMP22アンチセンスガイド鎖をコードする核酸、を含む、核酸。 - 請求項1に記載の核酸、又はそれらのうちのいずれか1つ以上の組み合わせを含む、ウイルスベクター。
- 前記ウイルスベクターが、アデノ随伴ウイルス(AAV)、アデノウイルス、レンチウイルス、レトロウイルス、ポックスウイルス、バキュロウイルス、単純ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルス、又は合成ウイルスである、請求項2に記載のウイルスベクター。
- 前記ウイルスベクターが、AAVである、請求項3に記載のウイルスベクター。
- 前記AAVが、rep遺伝子及びcap遺伝子を欠く、請求項4に記載のウイルスベクター。
- 前記AAVが、組換えAAV(rAAV)又は自己相補型組換えAAV(scAAV)である、請求項4又は5に記載のウイルスベクター。
- 前記AAVが、AAV-1、AAV-2、AAV-3、AAV-4、AAV-5、AAV-6、AAV-7、AAV-8、AAV-9、AAV-10、AAV-11、AAV-12、AAV-13、AAV-anc80、又はAAVrh.74のカプシド血清型を有する、請求項4~6のいずれか一項に記載のウイルスベクター。
- 前記AAVが、AAV-9のカプシド血清型を有する、請求項4~7のいずれか一項に記載のウイルスベクター。
- 前記AAVが、偽型AAVである、請求項4~8のいずれか一項に記載のウイルスベクター。
- 前記AAVが、AAV2/8又はAAV2/9である、請求項9に記載のウイルスベクター。
- 前記PMP22人工阻害性RNAをコードする前記核酸の発現が、U6プロモーターの制御下にある、請求項4~10のいずれか一項に記載のウイルスベクター。
- 請求項1に記載の核酸と、薬学的に許容される担体と、を含む、組成物。
- 請求項2~11のいずれか一項に記載のウイルスベクターと、薬学的に許容される担体と、を含む、組成物。
- シュワン細胞に薬剤を送達することができる送達ビヒクルと、人工阻害性RNAをコードする核酸であって、前記人工阻害性RNAが、ヒト末梢ミエリンタンパク質22(PMP22)遺伝子によってコードされるメッセンジャーRNA(mRNA)のセグメントに結合する、核酸と、任意選択的に、薬学的に許容される担体と、を含む、組成物。
- 前記ヒトPMP22遺伝子が、配列番号25の配列、又は配列番号25の配列と少なくとも70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、若しくは99%同一のそのバリアントを含む、請求項14に記載の組成物。
- 前記mRNAセグメントが、配列番号25のヌクレオチド1~2423内の配列に相補的である、請求項14又は15に記載の組成物。
- 前記mRNAセグメントが、配列番号25のヌクレオチド1412~1433又は1415~1436内の配列に相補的である、請求項16に記載の組成物。
- 前記送達ビヒクルが、ウイルスベクターである、請求項14~17のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記ウイルスベクターが、アデノ随伴ウイルス(AAV)、アデノウイルス、レンチウイルス、レトロウイルス、ポックスウイルス、バキュロウイルス、単純ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルス、又は合成ウイルスである、請求項18に記載の組成物。
- 前記ウイルスベクターが、AAVである、請求項19に記載の組成物。
- 前記AAVが、rep遺伝子及びcap遺伝子を欠く、請求項20に記載の組成物。
- 前記AAVが、組換えAAV(rAAV)、組換え一本鎖AAV(ssAAV)、又は自己相補型組換えAAV(scAAV)である、請求項20又は21に記載の組成物。
- 前記AAVが、AAV-1、AAV-2、AAV-3、AAV-4、AAV-5、AAV-6、AAV-7、AAV-8、AAV-9、AAV-10、AAV-11、AAV-12、AAV-13、AAV-anc80、及びAAVrh.74からなる群から選択されるカプシド血清型を有する、請求項20~22のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記AAVが、AAV-9のカプシド血清型を有する、請求項20~23のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記AAVが、偽型AAVである、請求項20~24のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記AAVが、AAV2/8又はAAV2/9である、請求項25に記載の組成物。
- 前記PMP22人工阻害性RNAをコードする前記核酸の発現が、U6プロモーターの制御下にある、請求項12~26のいずれか一項に記載の組成物。
- 重複した末梢ミエリンタンパク質22(PMP22)遺伝子を有するシュワン細胞への送達方法であって、前記シュワン細胞を有する対象に、
(a)請求項1に記載の核酸、
(b)請求項2~11のいずれか一項に記載のベクター、又は
(c)請求項12~27のいずれか一項に記載の組成物を投与することを含む、方法。 - 末梢ミエリンタンパク質22(PMP22)遺伝子の過剰発現に罹患している対象を治療する方法であって、前記対象に、
(a)請求項1に記載の核酸、
(b)請求項2~11のいずれか一項に記載のベクター、又は
(c)請求項12~27のいずれか一項に記載の組成物を投与することを含む、方法。 - 前記対象が、シャルコー・マリー・トゥース病1A型(CMT1A)に罹患している、請求項29に記載の方法。
- 前記対象が、ヒト対象である、請求項29又は30に記載の方法。
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