JP2022549971A - クリプトフィシン抗がん剤の生体触媒合成 - Google Patents

クリプトフィシン抗がん剤の生体触媒合成 Download PDF

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Abstract

本開示は、がんの治療に有用なクリプトフィシン中間体、クリプトフィシン類似体、およびクリプトフィシンキメラ分子、ならびにこれらの化合物を生成する方法およびがんを治療する方法を提供する。【選択図】図9

Description

本開示は、一般に、大腸がんなどのがんの治療、そのリスクの低減、またはその症状の改善の方法などにおける、天然発生型化合物の類似体およびその使用に関する。
政府の利益に関する陳述
本発明は、米国国立衛生研究所によって授与されたGM076477およびGM118101の下で政府の支援を受けてなされた。政府は、本発明においてある特定の権利を有する。
ポリケチドシンターゼ(PKS)、非リボソームペプチドシンテターゼ(NRPS)、およびそれらのハイブリッド(PKS/NRPS)は、無数の複雑な天然生成物を生成するモジュラータンパク質である。これらのタンパク質は、比較的単純な化学的ビルディングブロック(マロン酸塩、マロン酸塩誘導体、および/またはアミノ酸)のグループを選択し、幅広い生物学的活性を持つ多様な足場を構築する。1~2これらの天然生成物の大きなクラスであるマクロサイクルは、それらの生物学的に活性な立体配座に固定され、かつペプチド結合を分解から保護することができる拘束された環構造を含む。これらの重要な分子の生合成は、典型的には、チオエステラーゼ(TE)ドメイン、セリン、ヒスチジン、アスパラギン酸触媒トライアドを利用するα,β-ヒドロラーゼによって終了され、位置および立体特異的環化をもたらす。4~5これらの酵素が選択性を支配し、かつ加水分解よりも生産的な大環状化のための線状基質を組織化する分子メカニズムは、十分に理解されておらず、それは広範囲の生体触媒として使用するためにこれらの酵素を予測し、最終的に調整する能力を制限してきた。これらの別個の酵素を利用することは、医薬品化学の探索のための既存の合成ツールボックスを拡張するための方法論の継続的な追求において比類のない資産となるであろう。6~8
構造研究およびインビトロ生化学的分析の両方で構成されるPKSおよびNRPS TEに関する先駆的な研究により、環化を媒介する複雑な触媒メカニズムに関する重要な洞察が得られた。NRPS由来のチロシジンおよびダプトマイシンTE系では、固相ペプチド合成を利用して、様々な生物活性を有する新規の大環状類似体を提供する一連の非天然鎖伸長中間体を配合した。9~11この基質耐性は、基質の事前組織化を可能にする水素結合ネットワークに起因している。したがって、TEは、生産的な触媒作用に重要であると思われる分子内求核試薬として用いられているアミノ酸を除いて、最小限の影響を及ぼすと仮定された。12これは、サーファクチンおよびフェンギシン生合成経路からのNRPS TEの構造研究によってさらに裏付けられる。各々が、主に非極性および芳香族アミノ酸で構成される大きなお椀型の活性部位を有し、特定の相互作用は主に線状NRPS基質のヒドロキシル含有C末端で発生する。13~14
エリスロマイシン(DEBS)およびピクロマイシン(Pik)経路のPKS TEに関する研究もまた、構造的および生化学的検査から利益を得ている。この研究は、特定の官能基相互作用およびよりチャネル型の活性部位に見られる疎水性パッキングの両方の複雑な相互作用が、生産的な環化に必要であることを示している。15~17DEBSおよびPikTEの両方にいくつかの必要な拘束があるにもかかわらず、新しい大環状生成物を配合することができたドッキングおよび合成基質の組み合わせによって示されるように、非必須元素にはある程度の柔軟性が観察された。16、18~19合理的なエンジニアリングを利用して、PikTEの基礎となる触媒メカニズムを変更する単一の活性部位変異が生成され、以前はアクセスできなかった12員マクロラクトンの生産的な大環状化が促進された。20これらの説得力のある研究は、様々な系における大環状化の複雑さを浮き彫りにし続けている。大規模での大環状化を支配する要因の理解を深めるには、PKS、NRPS、およびPKS/NRPSハイブリッドTEのさらなる調査が必要である。この知識を利用することで、TE基質の柔軟性を拡大したタンパク質エンジニアリングの取り組みがすでに促進されており、これらの方針に沿った継続的な取り組みは、より活性な薬理学的に関連性のある小分子ライブラリの生成が促進されることが期待される。
クリプトフィシンは、混合PKS/NRPS生合成系によって生成されるデプシペプチド天然生成物のクラスである。21~22それらは、Nostoc sp.ATCC 53789で強力な抗真菌剤として最初に同定され23、その後、Nostoc sp.GSV 224で最も強力な抗増殖性微小管結合剤の1つとして再発見された。24最初の医薬品化学スクリーニングの取り組みは、β-エポキシド官能基が最大活性に必要であり、かつほとんどの修飾が効力に有害であることを示した。ユニットCにジェミナル-ジメチル官能基を含んだ、合成類似体であるクリプトフィシン52(図1)を、プラチナ抵抗性卵巣がんの治療のための臨床試験に導入した。25~27重大な疾患の安定化および全体的な陽性結果を示したにもかかわらず、用量を制限する末梢神経障害および広範なインビボ有効性の欠如により、試験は中止された。25、28クリプトフィシン52の臨床試験は終了したが、このクラスの代謝物は、治療が困難な薬剤抵抗性のがんに特に効果的であるため、さらなるリード最適化のための説得力のある足場となり続けている。29最近、クリプトフィシンは、これがこれらの化合物で観察される全身毒性を回避し得るため、抗体薬物コンジュゲート(ならびにRGDペプチド30および葉酸31とのコンジュゲート化を含む他の直接標的化剤)の潜在的なペイロードとして広く調査されている。32~36抗がん剤としてのクリプトフィシンには依然として大きな関心があるが、リード最適化における課題、ならびにそれらの製造のための費用のかかる合成の取り組みは、探査を妨げてきた。CrpTEの強力な機能の以前の兆候に基づいて21、特にクリプトフィシン足場の未踏の領域で、継続的な類似体生成および生物学的評価のための化学酵素的アプローチを拡大することに動機付けられた。
クリプトフィシン生合成の最終ステップは、CrpTEを介した鎖伸長中間体の大環状化である。21切除されたCrpTEは、天然および修飾基質の容易な環化を様々な程度で触媒して、クリプトフィシン3、51(図1)、および元々はEli LillyでLY404291として合成されたユニットAに末端オレフィンを含む非天然クリプトフィシンを配合することができることを示した。37さらに、CrpTEは、クリプトフィシン24および51の生成において、上流のNRPSモジュールであるCrpD-M2とトランスでさらに操作することにより、有用性も示した。22これらの研究は、医学的に重要な新規クリプトフィシン類似体の生成のための、CrpTEの独自の固有の柔軟性および多用途の生体触媒としてのその可能性を示した。その目的に向けて、CrpTE基質耐性をプローブするように設計された一連の新規のクリプトフィシン鎖伸長中間体を生成し、臨床試験で同定された制限(末梢神経障害および広範なインビボ有効性を制限する用量)に対処し得る類似体を生成する取り組みに着手した。25、28
前述の観察を考慮すると、大腸がんなどのがんの治療、その発症のリスクの低減、またはそれに関連する症状の改善における、クリプトフィシン類似体などの化合物類似体を合成および使用することにおいて有用である方法および基質の必要性が当該技術分野で存在し続けていることが明らかである。
本開示は、式Iの化合物を提供し、
Figure 2022549971000002
式中、Arは、N、O、およびSから選択される1~3個の環ヘテロ原子を有する5~7員複素環式アリール基であり、任意選択で、C1-5アルキルおよびL-Rから独立して選択される1~3個の置換基で置換されており、Rは、塩素、臭素、もしくはヨウ素であり、Rは、OHもしくはOC(O)CHNHRであり、またはRおよびRは一緒に、(1)それらが結合している炭素間の二重結合を示すか、もしくは(2)それらが結合している炭素とβ-エポキシド環を形成し、RおよびRの各々は独立して、H、C1-6アルキル、C0-6アルキレン-OH、もしくはC0-6アルキレン-NH(R)であり、またはRおよびRは、それらが結合している炭素原子と一緒に、スピロC3-5シクロアルキルもしくは1個の窒素環原子を有するスピロ3~5員ヘテロシクロアルキルを形成し、
は、C1-6アルキル、C0-6アルキレン-OH、またはC0-6アルキレン-NH(R)であり、Rは、H、C1-6アルキル、またはL-Rであり、Lは、リンカーであり、Rは、反応性化学基であり、Xは、O、NH、もしくはNMeであり、但し、化合物または塩が0または1 L-Rを含むことを条件とする。
いくつかの実施形態では、Arは、任意選択で、メチルおよびイソプロピルから選択される1~3個の置換基で置換されている、ピリジル、ピラジニル、イミダゾリル、またはオキサゾリルを含む。
様々な実施形態では、(1)Arは、
Figure 2022549971000003
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、(2)Arは、
Figure 2022549971000004
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(3)Arは、
Figure 2022549971000005
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(4)Arは、
Figure 2022549971000006
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、(5)Arは、
Figure 2022549971000007
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、(6d)Arは、
Figure 2022549971000008
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、(7)Arは、
Figure 2022549971000009
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(8)Arは、
Figure 2022549971000010
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(9)Arは、
Figure 2022549971000011
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、または(10)Arは、
Figure 2022549971000012
であり、Rは、CHであり、Rは、Hである。
本明細書に記載される化合物および塩を生成する方法が本明細書にさらに提供され、化合物または塩を形成するための大環状化に好適な条件下で、セコクリプトフィシン中間体をクリプトフィシンチオエステラーゼと接触させることを含む。
本明細書に記載される化合物もしくは塩、およびペプチド、タンパク質、または抗体を含むコンジュゲートもまた本明細書に提供される。いくつかの場合では、抗体および化合物または塩は、化合物または塩の反応性化学基および抗体上の相補的反応性基を介して共有結合されている。
本開示の他の態様は、本明細書に開示される化合物を含む薬学的組成物、対象におけるがんを治療または予防するための医薬品の調製に使用するための本明細書に開示される化合物、および対象においてがんを治療する方法における本明細書に開示される化合物の使用を含む。
本開示の他の特徴および利点は、図面を含む以下の詳細な説明から明らかになるであろう。しかしながら、詳細な説明および特定の例は、本開示の好ましい実施形態を示すが、本開示の趣旨および範囲内である様々な変更および修正はこの詳細な説明から当業者には明らかになるため、単に例示としてのみ与えられることを理解されたい。
選択されたクリプトフィシン類似体の構造を表す。 出発物質のピークが黒色、生成物のピークが青色、および加水分解副生成物が緑色である、類似体23 a~mの分析スケールCrpTE環化反応のTOF-LCMS分析。 出発物質のピークが黒色、生成物のピークが青色、および加水分解副生成物が緑色である、類似体23 a~mの分析スケールCrpTE環化反応のTOF-LCMS分析。 A)ユニットA断片の合成の概略図。B)ユニット2段階の合成反応を模式的に示す。 ユニットB断片の合成の概略図。 ユニットAB断片の合成の概略図。 A)ユニットCD断片の合成の概略図。B)ユニットCD合成反応を模式的に示す。 セコクリプトフィシン中間体の精緻化の概略図。 Crp TE反応の加水分解分析に対する変換パーセント、単離収率、および環化。 Crp TE反応の加水分解分析に対する変換パーセント、単離収率、および環化。 Crp TE反応の加水分解分析に対する変換パーセント、単離収率、および環化。 HCT-116ヒト大腸がんにおけるクリプトフィシン類似体のIC50値。
クリプトフィシンは、治療が困難な薬剤抵抗性のがんに対して非常に強力な抗増殖活性を示す大環状デプシペプチドのファミリーである。最近、これらの分子は、抗体薬物コンジュゲートの潜在的なペイロードとして注目を集め続けており、これらのチューブリン結合剤の適切な生体分子への結合を促進するための代替合成戦略ならびに類似体の継続的な必要性を強調している。この複雑な分子グループの合成および誘導体化に直面している特有の課題により、より有望な類似体にアクセスするように設計された化学酵素的合成を調査することになった。
クリプトフィシンチオエステラーゼ(CrpTE)は、20を超える天然クリプトフィシン代謝物の大環状化を触媒する用途の広い酵素であり、非天然誘導体の生成のための類を見ない生体触媒としてのその使用を含む医薬品開発戦略を構想することを可能にする。この目的のために、天然ユニットAのベンジル基の代替として複素環式芳香族基を含む12個の新しいユニットA-B-C-D線状鎖伸長中間体の拡張可能な合成を開発した。各中間体のN-アセチルシステアミン活性化形態は、野生型の切除されたCrpTEを使用して大環状生成物へのターンオーバーについて評価され、それはこの酵素の並外れた柔軟性を示した。セミ分取スケール反応を実施して、単離、構造の特性評価、およびさらなる生物学的評価を行い、ピコモル効力の低いdes β-エポキシ類似体を明らかにした。
本明細書に開示される研究は、スチレン官能基を含み、かつ低いpM効力を達成するためのエポキシド基の必要性を排除する、これまでに生成された最も強力なクリプトフィシン類似体のうちの1つの同定および生物学的評価を可能にした。この研究からの非天然基質に対するCrpTEの選択性および特異性に関する貴重な洞察は、CrpTEを、類を見ない状況および生物学的に活性な分子の生成のためのより大きな酵素カスケードの一部としての両方で用いられ得る強力でより広い範囲の触媒として確立する。
より具体的には、最新技術に基づいて、非天然基質に対するCrpTEの選択性を調査した。37天然鎖伸長中間体と末端オレフィンを含む基質との間に観察された環化対加水分解の比率は、最適な環化にはアリール環が必要であることを示した。しかしながら、様々なサイズおよび官能基置換のアリール環が十分に許容されるかどうかは不明なままであった。37この部位は、それがクリプトフィシンの構造-活性相関研究(SAR)で未踏の領域を表し、かつ水溶性を増加させ得る戦術的な生物学的等価体の使用に有利な位置であるために、操作のために選択され、より良好なインビボ有効性ならびに潜在的に減少した毒性がもたらされる。26、28CrpTEを利用してこれらの新規クリプトフィシンを配合すると、重要な新しい類似体の生成が可能になり、また非天然スターターユニットの組み込みのための酵素の柔軟性に関する独自の洞察も得られる。これらの酵素の選択性に採用されている認識因子をよりよく理解することで、創薬プロセスを支援する生体触媒プラットフォームで使用するための調整可能な基質耐性を有するTEを設計する能力がさらに拡大される。
化合物、およびがんを治療することにおけるこれらの化合物の使用が本明細書に開示される。本開示の一態様は、一般に、対象における結腸、乳房、白血病、前立腺、卵巣、中枢神経系、または非小細胞肺がんなどのがんを治療するための、本明細書に記載される化合物もしくは薬学的に許容される塩、またはそのような化合物もしくはその薬学的に許容される塩を含む薬学的に許容される組成物の使用に関連する。
本開示の化合物
本開示は、式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供し、
Figure 2022549971000013
式中、
Arは、N、O、およびSから選択される1~3個の環ヘテロ原子を有する5~7員複素環式アリール基であり、任意選択で、C1-5アルキルおよびL-Rから独立して選択される1~3個の置換基で置換されており、
は、塩素、臭素、もしくはヨウ素であり、
は、OHもしくはOC(O)CHNHRであり、または
およびRは一緒に、(1)それらが結合している炭素間の二重結合を示すか、もしくは(2)それらが結合している炭素とβ-エポキシド環を形成し、
およびRの各々は独立して、H、C1-6アルキル、C0-6アルキレン-OH、もしくはC0-6アルキレン-NH(R)であり、または
およびRは、それらが結合している炭素原子と一緒に、スピロC3-5シクロアルキルもしくは1個の窒素環原子を有するスピロ3~5員ヘテロシクロアルキルを形成し、
は、C1-6アルキル、C0-6アルキレン-OH、またはC0-6アルキレン-NH(R)であり、
Rは、H、C1-6アルキル、またはL-Rであり、
Lは、リンカーであり、
は、反応性化学基であり、
Xは、O、NH、もしくはNMeであり、
但し、化合物または塩が0または1 L-Rを含むことを条件とする。
Arは、N、O、およびSから選択される1~3個の環ヘテロ原子を有する5~7員複素環式アリール基であり、任意選択で、C1-5アルキルおよびL-Rから独立して選択される1~3個の置換基で置換されている。本明細書で使用される場合、「複素環式アリール」という用語は、合計5~7個の環原子を有し、かつ芳香環中の窒素、酸素、および硫黄原子から選択される1~3個のヘテロ原子を含む、単環式芳香環を指す。別途指示されない限り、複素環式アリール基は、非置換であり得るか、または1個以上、特に、1~3個の置換基で置換され得る。いくつかの場合では、複素環式アリール基は、本明細書で議論されるように、C1-5アルキルまたはL-R部分で置換されている。複素環式アリール基の例としては、チエニル、フリル、ピリジル、ピロリル、オキサゾリル、トリアジニル、トリアゾリル、イソチアゾリル、イソオキサゾリル、イミダゾリル、ピラジニル、ピリミジニル、チアゾリル、およびチアジアゾリルが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの場合では、複素環式アリール(Ar)は、任意選択で、メチルおよびイソプロピルから選択される1~3個の置換基で置換されている、ピリジル、ピラジニル、イミダゾリル、またはオキサゾリルを含む。いくつかの場合では、Arは、L-Rで置換されている。
本明細書で使用される場合、「アルキル」という用語は、1~30個の炭素原子、例えば、1~20個の炭素原子、または1~10個の炭素原子を含有する直鎖および分岐の飽和炭化水素基を指す。Cという用語は、アルキル基が「n」個の炭素原子を有することを意味している。例えば、Cアルキルは、4個の炭素原子を有するアルキル基を指す。C-Cアルキルは、全範囲(例えば、1~6個の炭素原子)、ならびにすべてのサブグループ(例えば、1~6、2~5、1~5、3~6、1、2、3、4、5、および6個の炭素原子)を包含する炭素原子数を有するアルキル基を指す。アルキル基の非限定的な例としては、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、sec-ブチル(2-メチルプロピル)、t-ブチル(1,1-ジメチルエチル)、3,3-ジメチルペンチル、および2-エチルヘキシルが挙げられる。別途指示されない限り、アルキル基は、非置換アルキル基または置換アルキル基であり得る。
本明細書で使用される「アルキレン」という用語は、置換基を有するアルキル基を指す。例えば、「アルキレン-OH」という用語は、ヒドロキシ基で置換されているアルキル基を指す。例えば、アルキレン基は、-CHCH-または-CH-であり得る。Cという用語は、アルキレン基が「n」個の炭素原子を有することを意味する。例えば、C1-6アルキレンは、全範囲ならびにすべてのサブグループを包含する炭素原子数を有するアルキレン基を指す。Cという用語、直接結合を示し、-Cアルキレン-OHは、OH置換基を示す。別途指示されない限り、アルキレン基は、非置換アルキレン基または置換アルキレン基であり得る。
本明細書で使用される場合、「シクロアルキル」という用語は、3~12個の炭素原子(例えば、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12個の炭素原子)を含む脂肪族環式炭化水素基を指す。Cという用語は、シクロアルキル基が「n」個の炭素原子を有することを意味する。例えば、Cシクロアルキルとは、環に5個の炭素原子を有するシクロアルキル基を指す。C-Cシクロアルキルとは、全範囲(例えば、3~5個の炭素原子)、ならびにすべてのサブグループ(例えば、3~4、4~5、2、4、および5個の炭素原子)を包含する炭素原子数を有するシクロアルキル基を指す。シクロアルキル基の非限定的な例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、およびシクロオクチルが挙げられる。別途指示されない限り、シクロアルキル基は、非置換シクロアルキル基または置換シクロアルキル基であり得る。本明細書に記載されるシクロアルキル基は、単離され得るか、スピロ環である得るか、または別のシクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基、および/もしくはヘテロアリール基に融合され得る。別途指示されない限り、シクロアルキル基が、別のシクロアルキル基に融合されている場合、シクロアルキル基の各々は、3~12個の炭素原子を含み得る。別途指示されない限り、シクロアルキル基は、非置換または置換であり得る。
本明細書で使用される場合、「ヘテロシクロアルキル」という用語は、環が、独立して、酸素、窒素、および硫黄から選択される1~3個のヘテロ原子を含むことを除いて、シクロアルキルと同様に定義される。特に、「ヘテロシクロアルキル」という用語は、合計3~10個の原子(例えば、3~5個、または5~10個)を含む環を指し、そのうちの1、2、3、または3個の原子は、独立して、酸素、窒素、および硫黄からなる群から選択されるヘテロ原子であり、環の残りの原子は炭素原子である。いくつかの場合では、ヘテロシクロアルキルは、1個の窒素環原子を有するスピロ3~5員環である。ヘテロシクロアルキル基の非限定的な例には、アゼチジン、アジリジン、ピロリジン、ピペリジン、ピラゾリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ジヒドロフラン、モルホリンなどが挙げられる。いくつかの場合では、ヘテロシクロアルキルは、アゼチジン、アジリジン、またはピロリジンを含む。ヘテロシクロアルキルは、置換または非置換であり得る。
本明細書で使用される場合、「置換」という用語は、化学官能基を修飾するために使用されるとき、官能基上の少なくとも1個の水素ラジカルを置換基で置き換えることを指す。置換基には、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヒドロキシル、オキシ、アルコキシ、ヘテロアルコキシ、エステル、チオエステル、カルボキシ、シアノ、ニトロ、アミノ、アミド、アセトアミド、およびハロ(例えば、フルオロ、クロロ、ブロモ、またはヨード)が含まれ得るが、これらに限定されない。化学官能基が複数の置換基を含むとき、その置換基は、同じ炭素原子または2個以上の異なる炭素原子に結合することができる。
本明細書で使用される場合、「リンカー」という用語は、分子(例えば、本明細書に記載される化合物およびその塩)の2つの部分を結合する部分を指す。リンカーの非限定的な例には、1~10個のアミノ酸を有するペプチド、1~15個のエチレングリコールモノマーを有するポリエチレングリコール、およびβ-グルクロン酸が挙げられる。いくつかの場合では、Lは、1~10個のアミノ酸を有するペプチドを含む。いくつかの場合では、アミノ酸は、アラニン(Ala)、シトルリン(Cit)、グルタミン(Gln)、グリシン(Gly)、リジン(Lys)、アセチル-リジン(AcLys)、プロリン(Pro)、フェニルアラニン(Phe)、およびバリン(Val)からなる群から選択される。いくつかの場合では、Lは、1~15個(例えば、5~15、3~10、3~15、5~10個)のエチレングリコールモノマーを有するポリエチレングリコールを含む。いくつかの場合では、Lは、β-グルクロン酸を含む。いくつかの場合では、β-グルクロン酸は、フラノースを含む。いくつかの場合では、β-グルクロン酸は、ピラノースを含む。
いくつかの場合では、Lは、構造
Figure 2022549971000014
を有する。
いくつかの場合では、Lは、単(すなわち、直接共有)結合、エステル結合、アミド結合、スルフィド結合、ジスルフィド結合、パラ-アミノベンジル(PAB)基を介して、またはパラ-アミノベンジルオキシカルボニル(PABC)基を介して式(I)の化合物に結合される。いくつかの場合では、Lは、単結合を介して結合される。いくつかの場合では、Lは、エステル結合を介して結合される。いくつかの場合では、Lは、アミド結合を介して結合される。いくつかの場合では、Lは、パラ-アミノベンジル(PAB)基を介して結合される。
本明細書で使用される場合、「反応性化学基」という用語は、別の相補的な官能基と反応して共有結合を形成することができる化学官能基を指す。反応性基は、相補的官能基(例えば、カルボン酸、塩化アシルなど)の存在下で、アミド官能基が形成され得るようなアミンであり得る。反応性化学基のいくつかの特定の非限定的な例は、マレイミド基、マレイミドカプロイル基、マレイミドPEG基、ブロモアセトアミド基、N-ヒドロキシスクシンイミドエステル、およびO-アルキルヒドロキシルアミンである。いくつかの場合では、Rは、マレイミド基を含む。いくつかの場合では、Rは、マレイミドカプロイル基を含む。いくつかの場合では、Rは、マレイミドPEG基を含む。いくつかの場合では、Rは、N-ヒドロキシスクシンイミドエステルを含む。いくつかの場合では、Rは、O-アルキルヒドロキシルアミンを含む。
いくつかの場合では、(1)Arは、
Figure 2022549971000015
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、(2)Arは、
Figure 2022549971000016
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(3)Arは、
Figure 2022549971000017
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(4)Arは、
Figure 2022549971000018
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、(5)Arは、
Figure 2022549971000019
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、(6)Arは、
Figure 2022549971000020
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、(7)Arは、
Figure 2022549971000021
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(8)Arは、
Figure 2022549971000022
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(9)Arは、
Figure 2022549971000023
であり、Rは、CHであり、Rは、Hであり、または(10)Arは、
Figure 2022549971000024
であり、Rは、CHであり、Rは、Hである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000025
であり、Rは、CHであり、Rは、Hである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000026
であり、Rは、CHであり、Rは、HまたはCHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000027
であり、Rは、CHであり、Rは、HまたはCHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000028
であり、Rは、CHであり、Rは、Hである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000029
であり、Rは、CHであり、Rは、Hである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000030
であり、Rは、CHであり、Rは、Hである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000031
であり、Rは、CHであり、Rは、HまたはCHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000032
であり、Rは、CHであり、Rは、HまたはCHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000033
であり、Rは、CHであり、Rは、Hである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000034
であり、Rは、CHであり、Rは、Hである。
いくつかの場合では、RおよびRは一緒に、それらが結合している炭素間の二重結合を示す。いくつかの場合では、RおよびRは一緒に、それらが結合している炭素とともにβ-エポキシド環を形成する。いくつかの場合では、Rは、Clであり、Rは、OHである。いくつかの場合では、Rは、Clであり、Rは、OC(O)CHNHである。
いくつかの場合では、(1)Arは、
Figure 2022549971000035
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、Rは、CH(CHであり、(2)Arは、
Figure 2022549971000036
であり、Rは、CHでありは、HもしくはCHであり、Rは、CH(CHであり、または(3)Arは
Figure 2022549971000037
であり、Rは、CHであり、Rは、HまたはCHでありは、CH(CHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000038
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、Rは、CH(CHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000039
であり、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、Rは、CH(CHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000040
であり、Rは、CHであり、Rは、HまたはCHであり、Rは、CH(CHである。
いくつかの場合では、Rは、NH、NHMe、CH-NH、またはCH-NHMeである。いくつかの場合では、Rは、NHである。いくつかの場合では、Rは、NHMeである。いくつかの場合では、Rは、CH-NHである。いくつかの場合では、Rは、CH-NHMeである。いくつかの場合では、Rは、OHまたはCH-OHである。いくつかの場合では、Rは、OHである。いくつかの場合では、Rは、CH-OHである。
いくつかの場合では、Rは、NH、NHMe、(CH)CHNH、または(CH)CHNHMeである。いくつかの場合では、Rは、NHである。いくつかの場合では、Rは、NHMeである。いくつかの場合では、Rは、(CH)CHNHである。いくつかの場合では、Rは、(CH)CHNHMeである。
いくつかの場合では、Xは、Oである。いくつかの場合では、Xは、NHまたはNMeである。いくつかの場合では、Xは、NHである。いくつかの場合では、Xは、NMeである。
いくつかの場合では、化合物は、以下からなる群から選択される。
Figure 2022549971000041
いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000042
である。いくつかの場合では、Rは、OC(O)CHNHL(R)であり、Rは、Clである。
いくつかの場合では、Rは、NH-LRであり、Rは、Hである。いくつかの場合では、(1)Arは、
Figure 2022549971000043
であり、RおよびRは一緒に、二重結合またはβ-エポキシドを示し、Rは、CH(CHであり、(2)Arは、
Figure 2022549971000044
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CH(CHであり、または(3)Arは、
Figure 2022549971000045
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CH(CH、CH(CHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000046
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CH(CHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000047
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CH(CHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000048
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CH(CH、CH(CHである。
いくつかの場合では、Rは、NH-LRである。いくつかの場合では、(1)Arは、
Figure 2022549971000049
であり、RおよびRは一緒に、二重結合またはβ-エポキシドを示し、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、(2)Arは、
Figure 2022549971000050
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHであり、または(3)Arは、
Figure 2022549971000051
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000052
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000053
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHである。いくつかの場合では、Arは、
Figure 2022549971000054
であり、RおよびRは一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rは、CHであり、Rは、HもしくはCHである。
本明細書に開示される化合物は、薬学的に許容される塩の形態であり得る。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される塩」という用語は、正しい医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー反応等を伴うことなく、ヒトおよび下等動物の組織との接触での使用に好適であり、妥当な利益/リスク比に相応する塩を指す。薬学的に許容される塩は、当該技術分野で周知である。例えば、S.M.Bergeらは、参照によって本明細書に組み込まれるJ.Pharmaceutical Sciences,1977,66,1-19において、薬学的に許容される塩を詳細に記載している。本発明の化合物の薬学的に許容される塩には、好適な無機および有機酸および塩基に由来するものが含まれる。薬学的に許容される非毒性酸付加塩の例は、塩酸、臭化水素酸、リン酸、硫酸、および過塩素酸などの無機酸、または酢酸、トリフルオロ酢酸、シュウ酸、マレイン酸、酒石酸、クエン酸、コハク酸、もしくはマロン酸などの有機酸で形成されるか、またはイオン交換などの当該技術分野で使用される他の方法を使用することによって形成されるアミノ基の塩である。他の薬学的に許容される塩には、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩(camphorate)、樟脳スルホン酸塩(camphorsulfonate)、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、グルコン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシ-エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩(pectinate)、過硫酸塩、3-フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが含まれる。カルボン酸または他の酸性官能基を含む化合物の塩は、好適な塩基と反応させることによって調製され得る。かかる塩には、アルカリ金属、アルカリ土類金属、アルミニウム塩、アンモニウム、N(C1-4アルキル)塩、および有機塩基の塩、例えば、トリメチルアミン、トリエチルアミン、モルホリン、ピリジン、ピペリジン、ピコリン、ジシクロヘキシルアミン、N,N’-ジベンジルエチレンジアミン、2-ヒドロキシエチルアミン、ビス-(2-ヒドロキシエチル)アミン、トリ-(2-ヒドロキシエチル)アミン、プロカイン、ジベンジルピペリジン、デヒドロアビエチルアミン、N,N’-ビスデヒドロアビエチルアミン、グルカミン、N-メチルグルカミン、コリジン、キニン、キノリン、ならびにリジンおよびアルギニンなどの塩基性アミノ酸が含まれるが、これらに限定されない。本発明は、本明細書に開示される化合物の任意の塩基性窒素含有基の四級化も企図する。水溶性もしくは油溶性または分散性産生物は、かかる四級化によって得られ得る。代表的なアルカリまたはアルカリ土類金属塩には、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなどが含まれる。さらなる薬学的に許容される塩には、適切な場合、非毒性のアンモニウム、四級アンモニウム、および対イオンを使用して形成されるアミンカチオン、例えば、ハロゲン化物、水酸化物、カルボン酸塩、硫酸塩、リン酸塩、硝酸塩、低級アルキルスルホン酸塩、およびアリールスルホン酸塩などが含まれる。
本明細書に記載される化合物もしくは塩、およびペプチド、タンパク質、または抗体を含むコンジュゲートもまた本明細書に提供される。いくつかの場合では、コンジュゲートは、本明細書に記載される化合物または塩および抗体を含む。いくつかの場合では、抗体および化合物または塩は、化合物または塩の反応性化学基および抗体上の相補的反応性基を介して共有結合されている。いくつかの場合では、抗体上の相補的反応性基は、アミンを含む。いくつかの場合では、アミンは、抗体上のリジンのε-アミンである。
いくつかの場合では、抗体は、モノクローナル抗体またはナノボディである。いくつかの場合では、抗体は、モノクローナル抗体である。いくつかの場合では、抗体は、ナノボディである。いくつかの場合では、モノクローナル抗体は、ブレンツキシマブ、セツキシマブ、ゲムツズマブ、パニツムマブ、オファツムマブ、リツキシマブ、またはトラスツズマブである。いくつかの場合では、ナノボディは、単一ドメイン抗体またはラクダ科動物抗体である。
本開示の化合物の合成
本明細書に開示される化合物は、市販の出発物質、文献で知られている化合物を使用して、または容易に調製された中間体から、当業者に既知のまたは本明細書の教示に照らした標準的な合成方法および手順を採用することによって、様々な方法で調製することができる。有機分子の調製ならびに官能基の変換および操作のための標準的な合成方法ならびに手順は、関連する科学文献または当分野の標準的な教科書から得ることができる。いずれか1つまたはいくつかの情報源に限定されることはないが、Smith,M.B.,March,J.,March’s Advanced Organic Chemistry:Reactions,Mechanisms,and Structure,5th edition,John Wiley&Sons:New York,2001、およびGreene,T.W.,Wuts,P.G.M.,Protective Groups in Organic Synthesis,3rd edition,John Wiley&Sons:New York,1999などの定評のある著作は、当業者に既知である、有用で認知された有機合成の参考教科書である。例えば、本明細書に開示される化合物は、Merrifield,J.Am.Chem.Soc.1963;85:2149、Davis et al.,Biochem.Intl.1985;10:394-414、Larsen et al.,J.Am.Chem.Soc.1993;115:6247、Smith et al.,J.Peptide Protein Res.1994;44:183、O’Donnell et al.,J.Am.Chem.Soc.1996;118:6070、Stewart and Young,Solid Phase Peptide Synthesis,Freeman(1969)、Finn et al.,The Proteins,3rd ed.,vol.2,pp.105-253(1976)、およびErickson et al.,The Proteins,3rd ed.,vol.2,pp.257-527(1976)に記載されているものを含む固相合成技術によって合成され得る。合成方法の以下の説明は、本開示の化合物の調製のための一般的な手順を示すことを意図するもので、限定するためのものではない。
本明細書に開示される合成プロセスは、多種多様な官能基を許容することができ、したがって、様々な代替出発物質を使用することができる。本プロセスは、一般に、プロセス全体の最後またはその近くで所望の最終化合物を提供するが、特定の場合では、化合物をその薬学的に許容される塩、エステル、またはプロドラッグにさらに変換することが望ましいことがある。
本明細書に記載される化合物または塩を生成する方法もまた提供され、化合物または塩を形成するための大環状化に好適な条件下で、セコクリプトフィシン中間体をクリプトフィシンチオエステラーゼと接触させることを含む。いくつかの場合では、大環状化は、大環状ラクトン化である。
いくつかの場合では、クリプトフィシンチオエステラーゼは、ポリケチドシンターゼタンパク質複合体、非リボソームタンパク質シンテターゼタンパク質複合体、またはハイブリッドポリケチドシンターゼ/非リボソームペプチドシンテターゼタンパク質複合体に由来する。いくつかの場合では、クリプトフィシンチオエステラーゼは、ハイブリッドポリケチドシンターゼ/非リボソームペプチドシンテターゼタンパク質複合体に由来する。
いくつかの場合では、方法は、セコクリプトフィシンをクリプトフィシンP450と接触させて、R、R、およびそれらが結合している炭素の間にβエポキシド環を形成することをさらに含む。いくつかの場合では、クリプトフィシンP450は、クリプトフィシンエポキシダーゼである。
薬学的組成物、投薬、および投与経路
本明細書に記載される化合物(例えば、式Iの化合物またはその化合物の薬学的に許容される塩)と、薬学的に許容される賦形剤とを含む薬学的組成物(時に、本明細書で互換的に製剤と称される)がさらに提供される。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される」という用語は、本開示の化合物などの参照物質、または化合物もしくは特定の賦形剤を含む組成物が、患者または対象への投与に安全で好適であることを意味する。「薬学的に許容される賦形剤」という用語は、活性成分(複数可)の生物学的活性の有効性を妨げず、それが投与される宿主に対して毒性がない媒体を指す。賦形剤は、活性医薬成分(API)以外の、任意の薬学的に許容される添加剤、担体、希釈剤、アジュバント、または他の成分であり得る。
本明細書に記載される化合物は、治療有効量(例えば、がんの症状を予防または緩和するのに十分な量)で対象に投与され得る。化合物は、単独で、または薬学的に許容される組成物もしくは製剤の一部として、投与され得る。加えて、化合物は、一度に投与されても、複数回投与されても、またはある期間にわたって実質的に一様に送達されてもよい。化合物の用量が、経時的に変化し得ることにも留意されたい。
特定の対象に対する特定の投与レジメンは、化合物、投与される化合物の量、投与経路、ならびに任意の副作用の原因および程度に部分的に依存するであろう。本開示による対象(例えば、ヒトなどの哺乳動物)に投与される化合物の量は、妥当な時間枠にわたって所望の応答をもたらすのに十分でなければならない。「治療有効量」という用語は、特定の疾患または状態(例えば、がん)の1つ以上の症状を改善、減弱、または排除するか、あるいは特定の疾患または状態の1つ以上の症状の発症を予防または遅延する化合物または治療的活性化合物の組み合わせの量を意味する。投与量は、典型的には、投与の経路、タイミング、および頻度に依存する。したがって、臨床医は、投与量の力価を定め、最適な治療効果を得るために投与経路を修正し、従来の範囲探索の技術は、当業者に既知である。
単に例として、この方法は、上記の要因に応じて、例えば、約0.1mg/kg~最大約100mg/kgの化合物またはそれ以上を投与することを含む。他の実施形態では、投与量は、1mg/kg~最大約100mg/kg、または5mg/kg~最大約100mg/kg、または10mg/kg~最大約100mg/kgの範囲である。ある状況では、長期の治療を必要とし、より低い用量の化合物を、複数回にわたって投与することを伴う場合もあるか、または伴わない場合もある。所望の場合、化合物の用量は、1日を通して適切な間隔で別個に、任意に単位剤形で投与される2、3、4、5、6、またはそれ以上の下位用量として投与される。治療期間は、患者の特定の状態および疾患の種類に依存し、1日~数ヶ月間続き得る。
本明細書に開示される化合物(例えば、式Iの化合物)を含む薬学的組成物などの生理学的に許容される組成物を投与する好適な方法は、当該技術分野で周知である。2つ以上の経路を使用して化合物を投与することができるが、特定の経路は別の経路よりも迅速かつ効果的な反応を提供し得る。状況に応じて、化合物を含む薬学的組成物は、体腔に適用または滴下注入され、皮膚もしくは粘膜を通じて吸収され、摂取され、吸入され、かつ/または循環血液中に導入される。例えば、ある特定の状況では、薬剤を含む薬学的組成物を、経口で、静脈内、腹腔内、脳内(実質内)、脳室内、筋肉内、眼内、動脈内、門脈内、病巣内、髄内、髄腔内、心室内、経皮、皮下、腹腔内、鼻腔内、腸内、局所、舌下、尿道、膣内、もしくは直腸手段による注射によって、徐放系によって、または埋め込みデバイスによって送達することが望ましい。所望の場合、化合物は、目的とする領域に供給する、髄腔内投与、脳内(実質内)投与、脳室内投与、または動脈内もしくは静脈内投与によって局所投与される。あるいは、組成物は、所望の化合物が吸収またはカプセル化された膜、スポンジ、または別の適切な材料の埋め込みによって局所投与される。埋め込みデバイスが使用される場合、このデバイスは、一態様では、任意の好適な組織または臓器に埋め込まれ、所望の化合物の送達は、例えば、拡散、徐放性ボーラス、または連続投与を介する。
投与を容易にするために、化合物は、様々な態様では、担体(例えば、ビヒクル、アジュバント、または希釈剤)を含む生理学的に許容される組成物に製剤化される。採用される特定の担体は、溶解度および化合物との反応性の欠如などの化学物理的考慮事項、ならびに投与経路のみによって制限される。生理学的に許容される担体は、当該技術分野で周知である。注射可能物の使用に好適な例示的薬学的形態には、滅菌水溶液または分散液、および注射可能な滅菌溶液または分散液の即時調製用の滅菌粉末が含まれる(例えば、米国特許第5,466,468号を参照されたい)。注射可能な製剤は、例えば、Pharmaceutics and Pharmacy Practice,J.B.Lippincott Co.,Philadelphia.Pa.,Banker and Chalmers,eds.,pages 238-250(1982)、およびASHP Handbook on Injectable Drugs,Toissel,4th ed.,pages 622-630(1986))にさらに記載されている。化合物を含む薬学的組成物は、一態様では、かかる薬学的組成物の使用に関する指示を提供するパッケージング材料とともに、容器内に配置される。一般に、かかる指示には、試薬濃度、ならびにある特定の実施形態では、薬学的組成物を再構成するのに必要であり得る賦形剤成分または希釈剤(例えば、水、生理食塩水、またはPBS)の相対量を説明する具体的な表現が含まれる。
非経口注射に好適な組成物は、生理学的に許容される滅菌水性もしくは非水性溶液、分散液、懸濁液、または乳濁液、および注射可能な滅菌溶液または分散液に再構成するための滅菌粉末を含み得る。好適な水性および非水性担体、希釈剤、溶媒、またはビヒクルの例としては、水、エタノール、ポリオール(プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、グリセロールなど)、それらの好適な混合物、植物油(オリーブ油など)、およびオレイン酸エチルなどの注射可能な有機エステルが挙げられる。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング剤の使用によって、分散液の場合には必要な粒径の維持によって、かつ界面活性剤の使用によって維持され得る。
これらの組成物は、保存剤、湿潤剤、乳化剤、および分散剤などのアジュバントも含み得る。微生物汚染は、様々な抗菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸などを添加することによって防止され得る。また、等張剤、例えば、糖、塩化ナトリウムなどを含むことが望ましい場合もある。注射可能な薬学的組成物の長期吸収は、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンの使用によってもたらされ得る。
経口投与用の固体剤形には、カプセル剤、錠剤、粉剤、および顆粒剤が含まれる。かかる固体剤形では、活性化合物は、クエン酸ナトリウムまたはリン酸二カルシウムなどの少なくとも1つの通例の不活性賦形剤(もしくは担体)、または(a)充填剤または増量剤、例えば、デンプン、ラクトース、スクロース、マンニトール、およびケイ酸、(b)結合剤、例えば、カルボキシメチルセルロース、アルギン酸塩、ゼラチン、ポリビニルピロリドン、スクロース、およびアカシア、(c)保湿剤、例えば、グリセロール、(d)崩壊剤、例えば、寒天、炭酸カルシウム、ジャガイモもしくはタピオカデンプン、アルギン酸、ある特定の複合ケイ酸塩、および炭酸ナトリウム、(a)溶解遅延剤、例えば、パラフィン、(f)吸収促進剤、例えば、四級アンモニウム化合物、(g)湿潤剤、例えば、セチルアルコールおよびモノステアリン酸グリセロール、(h)吸着剤、例えば、カオリンおよびベントナイト、(i)滑沢剤、例えば、タルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固体ポリエチレングリコール、ラウリル硫酸ナトリウム、またはそれらの混合物と混合される。カプセル剤および錠剤の場合、剤形は、緩衝剤も含み得る。同様のタイプの固体組成物を、賦形剤、例えば、ラクトースまたは乳糖、ならびに高分子量ポリエチレングリコールなどを使用して、軟および硬充填ゼラチンカプセル剤中の充填剤として使用することもできる。
錠剤、糖衣錠、カプセル剤、丸剤、および顆粒剤などの固体剤形は、コーティングおよびシェル、例えば、腸溶性コーティングおよび当該技術分野で周知の他のものを用いて調製され得る。固体剤形は、乳白剤も含み得る。さらに、固体剤形は、それらが活性化合物(複数可)を腸管のある特定の部分に遅延様式で放出するように、包埋組成物であり得る。使用され得る包埋組成物の例は、ポリマー物質およびワックスである。活性化合物は、任意選択で、1つ以上の賦形剤を含むマイクロカプセル化形態でもあり得る。
経口投与用の液体剤形には、薬学的に許容される乳濁液、溶剤、懸濁液、シロップ剤、およびエリキシル剤が含まれる。活性化合物に加えて、液体剤形は、当該技術分野で一般に使用される不活性希釈剤、例えば、水または他の溶媒、可溶化剤および乳化剤、例えば、エチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、1,3-ブチレングリコール、ジメチルホルムアミド、油(特に、綿実油、ラッカセイ油、トウモロコシ胚芽油、オリーブ油、ヒマシ油、およびゴマ油)、グリセロール、テトラヒドロフルフリルアルコール、ソルビタンのポリエチレングリコールおよび脂肪酸エステル、またはこれらの物質の混合物などを含み得る。
かかる不活性希釈剤に加えて、組成物は、アジュバント、例えば、湿潤剤、乳化剤、および懸濁化剤、甘味剤、香味剤、ならびに芳香剤も含み得る。懸濁液は、活性化合物に加えて、懸濁剤、例えば、エトキシル化イソステアリルアルコール、ポリオキシエチレンソルビトール、およびソルビタンエステル、微結晶性セルロース、メタ水酸化アルミニウム、ベントナイト、寒天、ならびにトラガカント、またはこれらの物質の混合物などを含み得る。
直腸投与用の組成物は、好ましくは、坐薬であり、これは、本開示の化合物を、通常の室温では固体であるが体温で液体になり、それ故に直腸または膣腔内で溶解して本活性化合物を放出する好適な非刺激性賦形剤または担体、例えば、カカオバター、ポリエチレングリコール、または坐薬ワックスなどと混合することによって調製され得る。
本発明の方法で使用される組成物は、ミセルまたはリポソームで製剤化され得る。かかる製剤には、立体的に安定化されたミセルまたはリポソームおよび立体的に安定化された混合ミセルまたはリポソームが含まれる。リポソームおよびミセルの脂質二重層は細胞の原形質膜と縮合し、閉じ込められた内容物を細胞内区画に送達することが知られているため、そのような製剤は細胞内送達を促進することができる。
製剤化されると、溶液は、投与製剤に適合する方法で、治療的に有効な量で投与される。製剤は、注射液、薬物放出カプセルなどの様々な剤形で容易に投与される。例えば、水溶液での非経口投与の場合、必要に応じて溶液を好適に緩衝し、液体希釈剤を十分な生理食塩水またはグルコースで最初に等張にする必要がある。これらの特定の水溶液は、静脈内、筋肉内、皮下、および腹腔内投与に特に好適である。
投与の頻度は、薬剤の薬物動態パラメーターと投与経路に依存する。最適な薬学的製剤は、投与経路および所望の投与量に応じて、当業者によって決定されるであろう。例えば、参照によって本明細書に組み込まれる、Remington’s Pharmaceutical Sciences,18th Ed.(1990)Mack Publishing Co.,Easton,PA,pages 1435-1712を参照されたい。そのような製剤は、投与された薬剤の物理的状態、安定性、インビボ放出の速度およびインビボクリアランスの速度に影響を与える可能性がある。投与経路に応じて、体重、体表面積または臓器の大きさに応じて適切な用量が計算される。適切な治療用量を決定するために必要な計算のさらなる改良は、特に本明細書に開示される投与量情報およびアッセイ、ならびに動物またはヒトでの臨床試験で観察された薬物動態データに照らして、過度の実験なしに当業者によって日常的に行われる。
採用される正確な用量は、宿主、獣医学またはヒト医学のいずれであるか、状態の性質および重症度、例えば治療される疾患または障害、投与様式、および使用される特定の活性物質を含むいくつかの要因に依存する。化合物は、任意の従来の経路によって、特に経腸的に、そして一態様では、錠剤またはカプセルの形態で経口的に投与され得る。投与される化合物は、医薬的な使用のため、特に目的の疾患の予防的または治療的治療で使用する上で適切なように遊離形態または薬学的に許容される塩の形態であり得る。これらの手段は、疾患状態の進行速度を遅くし、自然な方法で身体がプロセスの方向を逆転させるのを助ける。
本発明の薬学的組成物および治療方法は、ヒト医学および獣医学の分野で有用であることが理解されよう。したがって、治療される対象は、一態様では哺乳動物である。代表的な態様では、哺乳動物は、ヒトである。
人体に対して実施される方法の特許を禁止する管轄区域においては、組成物のヒト対象への「投与」の意味は、ヒト対象が任意の手法(例えば、経口、吸入、局所適用、注射、挿入など)で自己投与するであろう制御された物質を処方することに限定されるものとする。特許可能な主題を定義する法律または規制に則った最も広い合理的な解釈が意図されている。人体に対して実施される方法の特許を禁止しない管轄区域では、組成物の「投与」は、人体に対して実施される方法と前述の活動の両方を含む。
使用方法
本明細書に記載される化合物(例えば、式Iの化合物およびそれらのコンジュゲート)は、がんの治療に使用され得る。本明細書で使用される場合、「治療すること」、「治療する」、または「治療」などの用語は、予防的(preventative)(例えば、予防的(prophylactic))および緩和的な治療を含む。本明細書に開示される化合物は、治療が困難なまたは薬剤抵抗性のがんの治療に特に有利である。本明細書に記載される化合物が治療に有用であるがんの非限定的な例には、結腸、乳房、白血病、前立腺、卵巣、中枢神経系、または非小細胞肺がんが挙げられる。
いくつかの場合では、がんは、結腸がんである。いくつかの場合では、がんは、乳がんである。いくつかの場合では、がんは、白血病である。いくつかの場合では、がんは、前立腺がんである。いくつかの場合では、がんは、卵巣がんである。いくつかの場合では、がんは、中枢神経系がんである。いくつかの場合では、がんは、脳がんである。いくつかの場合では、がんは、肺がんである。いくつかの場合では、がんは、非小細胞肺がんである。
本明細書に記載される化合物は、例えば、卵巣がんを有するヒト対象のがんを減少または予防するために使用され得る。特定の例では、化合物または混合物は、蒸留水と混合することなどによって経口投与される。別の例では、試験化合物または混合物は、生理食塩水または蒸留水などで静脈内投与される。いくつかの例では、試験化合物による治療は、単回用量または反復用量であり得る。試験化合物は、約6時間毎、約12時間毎、約24時間毎(毎日)、約48時間毎、約72時間毎、または約毎週投与され得る。反復用量による治療は、ある期間の間、例えば、約1週間~12ヶ月、例えば、約1週間~約6ヶ月、または約2週間~約3ヶ月、または約1~2ヶ月の間継続し得る。化合物の投与も無期限に継続し得る。試験化合物の用量は、約0.1mg/kg~約400mg/kg、例えば、約1mg/kg~約300mg/kg、約2mg/kg~200mg/kg、約10mg/kg~約100mg/kg、約20mg/kg~約75mg/kg、または約25mg/kg~約50mg/kgである。
細胞、適切な動物モデル、または罹患した対象におけるそのような疾患を治療するための試験化合物の有効性を評価するための方法は、当業者に既知である。本明細書で使用される場合、「患者」および「対象」という用語は、互換的に使用され、イヌ、ネコ、ウシ、ウマ、およびヒツジ(例えば、非ヒト動物)およびヒトなどの動物を意味する。特定の患者または対象は、哺乳動物(例えば、ヒト)である。患者と対象という用語には、男性および女性が含まれる。
がんを治療するための医薬品の調製における本明細書に開示される化合物の使用もまた、本明細書に提供される。
本明細書の開示は、以下の実施例を参照することによって、より容易に理解されるであろう。
実施例1
材料および方法
特に明記されていない限り、化学試薬および溶媒は、EMD Millipore、Sigma-Aldrich、Oakwood、Combi blocks、Chem impex、およびThermo-Fisher Scientificから購入した。カナマイシン硫酸塩およびイソプロピル-β-D-チオガラクトピラノシド(IPTG)は、Gold Biotechnologyから入手した。リゾチームは、RPIから購入した。イミダゾールは、AK Scientificから購入した。タンパク質濃縮に使用されるAmicon Ultra遠心式フィルターは、GE Healthcareから購入した。
脱イオン水を、Q-Gard 2/Quantum Ex Ultrapure organexカートリッジを使用してMilli-Qシステム(EMD Milipore)から入手した。E.coli増殖用の培地構成成分は、EMD Milipore、Sigma-Aldrich、およびThermo-Fisher Scientificから購入した。グリセロールを、BDHからVWRを介して購入した。LBブロスおよびLB寒天培地(Miller)を、EMD Milliporeから事前に作製された顆粒形態で購入した。TBブロスを、個別に購入した構成成分から作製し、4%v/vグリセロールで構成された。培地および溶液を、使用前にオートクレーブまたは滅菌濾過した。すべての溶液について、製造業者の仕様に従って校正されたVWR symphony SB70P pHメーターを使用してpHをモニタリングした。
化学的コンピテントのE.coli Bl21(DE3)を、タンパク質の過剰発現に使用した。これらの細胞を、Zymo Researchから購入したMixandGo緩衝液キットに付属の説明書に従って調製した。光学密度(OD600)を、Eppendorf BioPhotometerを使用して測定した。
特に明記されていない限り、すべての反応は、乾燥窒素雰囲気下で、火炎乾燥ガラス器具で行った。高温で実行される反応は、IKA RET control visc(モデルRS 232 C)によって制御され、反応は約21~23℃の室温(rt)で実行され、室温よりも低温で実行される反応は、氷浴(0℃)、ドライアイス/アセトン(-78℃)、またはイソプロパノール/ThermoNESLAB(モデルCC100)中で、長時間および/または他の温度で実行された。特に明記されていない限り、市販の出発物質および試薬を受け取ったまま使用した。ジクロロメタンを、FisherからHPLCグレードとして購入し、直接使用した。テトラヒドロフラン、N,Nジメチルホルムアミド、およびピリジンを、無水の不安定な形態で購入した(EMD MilliporeDriSolv)。反応物で使用する前に、アセトンをNaSOで乾燥させた。ジイソプロピルアミンおよびトリメチルアミンを、使用直前に水素化カルシウムから蒸留した。
H NMRスペクトルを、Varian 600 NMR System(600MHz)またはVarian 400-MR(400MHz)分光計のいずれかで記録した。化学シフトは、溶媒共鳴を内部標準(CDCl 7.26およびCDOD 3.31ppm)として使用して、百万分率(ppm)で報告されている。データを次のように報告する:化学シフト、多重度(s=シングレット、d=ダブレット、t=トリプレット、q=カルテット、p=ペンテット、h=ヘクステット)、結合定数(Hz)、および積分値。プロトンデカップリングされた13C NMRスペクトルを、Varian 600 NMR System(150MHz)またはVarian 400-MR(100MHz)分光計で記録した。化学シフトは、残留溶媒ピーク(CDCl、77.0ppmまたはCDOD 49.0)に対して使用するppmで報告されている。高分解能質量スペクトルを、Agilent Technologies 6500または6545 Q-TOF LC/MSで入手した。分析反応を、6230 TOF LC/MSに接続されたAgilent 1290 infinity II HPLCモジュール(254nMでモニタリング)によって評価した。
分析薄層クロマトグラフィーを、EMD Millipore 0.25mmシリカゲルF254プレートで行った。可視化は、254nmのUVランプと、過マンガン酸カリウム(KMNO)、セリウムモリブデン酸アンモニウム(CAM)、またはp-アニスアルデヒドのいずれかとの組み合わせによって達成された。精製を、EMD Millipore Silica Gel 60(40~63um)またはBiotage Isolera one-flash精製システムを使用した強制空気フラッシュクロマトグラフィーによって行った。Biotage Isolera one精製システムで使用されるカラムには、Biotage SNAP Ultra、SiliaSep、SiliaSepHP、およびSiliaSepアミンカートリッジが含まれる。
実施例2
化学合成
1.ユニットA合成
化合物2を、図3Bに示されるように、市販のS1から2つのステップにわたって合成した。すべてのスペクトルは、以前の文献レポートに従った。1、2
(R)-4-ベンジル-3-((2R,3S)-3-ヒドロキシ-5-((4-メトキシベンジル)オキシ)-2ビニルペンタノイル)オキサゾリジン-2-オン(S3)。
内部温度プローブを備えた3つ口フラスコに、CHCl(305mL、0.1M)中の1(7.502g、30.58mmol、1当量)の溶液を添加し、-78℃まで冷却した。これをジブチルボロントリフルオロメタンスルホネート(DCM中1M、33.64mL、33.64mmol、1.1当量)、およびEtN(6.02mL、42.8mmol、1.4当量)で処理した。-78℃で1時間後、反応物を0℃まで温め、30分間撹拌した。溶液を-78℃まで再冷却し、CHCl(25mL)中のアルデヒド2(8.31g、42.81mmol、1.4当量)の溶液で処理し、1時間撹拌し、0℃まで温めた。0℃で1時間後、リン酸ナトリウム緩衝液(pH7、500mM、30mL)、続いてメタノール(30mL)を添加した。20分後、温度を10℃未満に保ちながら、30%H(30mL)を添加し、混合物を0℃で1時間撹拌した。有機物を減圧下で除去し、残りの水層を酢酸エチル(EtOAc)(3×100mL)で抽出した。合わせた有機物を1N HCl、5%NaHCO水溶液、ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物を、フラッシュクロマトグラフィー(33%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、3(11.98g、収率89%)を透明で無色の油として得た:R=0.2(33%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDCl) δ 7.31(ddd、J=7.4、6.4、1.3Hz、2H)、7.28-7.25(m、2H)、7.24-7.21(m、2H)、7.20-7.15(m、2H)、6.04(dddd、J=17.6、10.0、9.0、1.1Hz、1H)、5.39-5.36(m、1H)、5.36-5.34(m、1H)、4.68(ddt、J=11.4、6.3、3.0Hz、1H)、4.58-4.51(m、1H)、4.42(s、2H)、4.25-4.19(m、1H)、4.18-4.11(m、2H)、3.78(d、J=1.1Hz、3H)、3.69-3.64(m、1H)、3.64-3.56(m、1H)、3.28-3.17(m、1H)、2.74(dd、J=13.4、9.5Hz、1H)、1.93-1.78(m、1H)、1.74(dt、J=14.5、7.0Hz、1H)、1.55(s、2H);13C NMR(150MHz、CDCl) δ 173.46、159.19、152.90、135.04、131.67、130.14、129.42、129.30、128.91、127.35、121.00、113.78、72.87、70.54、67.74、65.95、55.25、55.17、52.53、37.58、33.87;HRMS(ES)計算値C2529NO[M+Na]462.1887、実測値462.1885
(R)-4-ベンジル-3-((2R,3S)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-5-((4-メトキシベンジル)オキシ)-2-ビニルペンタノイル)オキサゾリジン-2-オン(3)。
CHCl(135mL、0.3M)中のS3(17.56g、39.95mmol、1当量)および2,6-ルチジン(46.28mL、79.91mmol、2当量)の溶液に、tert-ブチルシリルトリフルオロメタンスルホネート(11.6mL、59.9mmol、1.5当量)を添加し、撹拌した。室温で18時間後、HO(100mL)を添加し、30分間撹拌し、有機層を分離し、水層をCHCl(2×100mL)で抽出した。合わせた有機物を1N HCl、飽和NaHCO水溶液、ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物を、フラッシュクロマトグラフィー(20%EtOAC/ヘキサン)によって精製して、3(18.08g、収率84%)を淡い黄色の油として得た:R=0.6(33%EtOAc/ヘキサン);H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.33-7.26(m、3H)、7.25(d、J=8.8Hz、2H)、7.18(d、J=6.9Hz、2H)、6.85(d、J=8.6Hz、2H)、6.00(ddd、J=9、9.3、18.2Hz、1H)、5.27(d、J=10.2Hz、1H)、5.26(d、J=18.1Hz、1H)、4.58(dd、J=6.6Hz、8.8Hz、1H)、4.56-4.52(m、1H)、4.41(d、J=11.4Hz、1H)、4.36(d、J=11.5Hz、1H)、4.21(td、J=5.2Hz、6.4Hz、1H)、4.05(dd、J=2Hz、9.2Hz、1H)、3.86(t、J=8.2Hz、1H)、3.78(s、3H)、3.59(td、J=6.5、9.2Hz、1H)、3.48(dt、J=6.2、9.4Hz、1H)、3.23(dd、J=3.0、13.4Hz、1H)、2.70(dd、J=9.7、13.4Hz、1H)、1.95-1.85(m、2H)、0.86(s、9H)、0.02(s、3H)、0.01(s、3H);13C NMR(100MHz、CDCl) δ 172.62、159.24、153.02、135.58、134.24、130.86、129.68、129.49、129.10、127.48、119.70、113.86、72.77、71.29、66.03、65.94、55.66、55.48、53.39、37.73、35.47、26.02、18.22、-4.23、-4.38;HRMS(ES)計算値C3143NOSi[M+Na]576.2752、実測値576.2767。
(2S,3S)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-5-((4-メトキシベンジル)オキシ)-2-ビニルペンタン-1-オール(4)。
0℃に冷却したテトラヒドロフラン(THF)(625mL、0.05M)中の3(17.22g、31.14mmol、1当量)の溶液に、HO(240mL)中のNaBH(5.891g、155.7mmol、5当量)の溶液を添加した。0℃で10分後、溶液を室温まで温め、5時間撹拌した。反応物を飽和NHCl水溶液(200mL)を添加することによってクエンチし、混合物を室温で1時間撹拌した。THFを減圧下で除去し、水層をEtOAc(3×75mL)で抽出し、有機物を合わせ、ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物を、フラッシュクロマトグラフィー(18%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、4(10.04g、収率85%)を無色の油として得た:R=0.25(20%EtOAc/ヘキサン);H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.25(d、J=8.8Hz、2H)、6.88(d、J=8.6Hz、2H)、5.71(ddd、J=17.3、10.4、8.6Hz、1H)、5.17(d、J=10.4Hz、1H)、5.10(d、J=17.4Hz、1H)、4.43(d、J=11.5Hz、1H)、4.38(d、J=11.5Hz、1H)、4.04-3.94(m、1H)、3.80(s、3H)、3.75(dt、J=10.8、6.6Hz、1H)、3.61(ddd、J=11.0、7.0、5.0Hz、1H)、3.46(t、J=6.3Hz、2H)、2.43(qd、J=7.6、2.7Hz、1H)、2.15(t、J=5.7Hz、1H)、1.88-1.68(m、2H)、0.88(s、9H)、0.09(s、3H)、0.06(s、3H)。13C NMR(100MHz、CDCl) δ 159.28、135.60、130.61、129.41、118.67、113.89、72.72、71.06、66.63、63.67、55.43、51.34、34.11、25.98、18.14、-4.41、-4.42;HRMS(ES)計算値C2136Si[M+Na]403.2275、実測値403.2271。
(5S,6S)-5-(2-((4-メトキシベンジル)オキシ)エチル)-2,2,3,3,9,9,10,10-オクタメチル-6-ビニル-4,8-ジオキサ-3,9-ジシラウンデカン(5)。3、4
0℃に冷却した乾燥ピリジン(250mL、0.1M)中の4(9.81g、25.8mmol、1当量)の撹拌溶液に、p-トルエンスルホニルクロリド(7.372g、38.66mmol、1.5当量)を添加した。混合物を30分間撹拌し、室温まで温めた。4時間後、混合物を0℃まで再冷却し、0.5N HCl(300mL)をゆっくりと添加した。水層をジエチルエーテル(3×200mL)で抽出し、有機物を合わせ、1M HCl、ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物を、クロマトグラフプラグ(18%EtOAc/ヘキサン)を使用して精製して、5(11.67g、収率84%)を無色の油として得た:R=0.4(20%EtOAc/ヘキサン);H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.75(d、J=8.4Hz、2H)、7.30(d、J=8.4Hz、2H)、7.21(d、J=8.4Hz、2H)、6.86(d、J=8.4Hz、2H)、5.58(ddd、J=8.7、10.3、17.3Hz、1H)、5.12(dd、J=1.2、9.2Hz、1H)、5.04(d、J=17.2Hz、1H)、4.39(d、J=11.6Hz、1H)、4.33(d、J=11.6Hz、1H)、4.08(dd、J=6.6、9.4Hz、1H)、3.94(dd、J=7.4、9.4Hz、1H)、3.93-3.89(m、1H)、3.79(s、3H)、3.35(t、J=6.4Hz、2H)、2.46-2.42(m、1H)、2.42(s、3H)、1.74-1.57(m、2H)、0.78(s、9H)、-0.01(s、3H)、-0.05(s、3H);13C NMR(100MHz、CDCl) δ 159.30、144.80、133.44、133.15、130.53、129.91、129.39、128.14、119.79、113.92、72.73、70.54、68.83、66.36、55.43、48.61、34.64、25.91、21.77、18.11、-4.25、-4.69;HRMS(ES)計算値C2842SSi[M+Na]557.2364、実測値557.2370。
tert-ブチル(((3S,4R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-4-メチルヘキサ-5-エン-3-イル)オキシ)ジメチルシラン(6)。
0℃に冷却した乾燥THF(70mL、0.1M)中の5(3.72g、6.96mmol、1当量)の溶液に、水素化トリエチルホウ素リチウム(THF中1M、17.39mL、17.39mmol、2.5当量)を10分間にわたって添加した。反応物を0℃で撹拌し、室温まで温め、さらに2時間撹拌した。反応物を0℃まで冷却し、水(15mL)、3N NaOH(15mL)、30%H(15mL)をゆっくりと添加しながらクエンチし、30分間撹拌した。有機物を減圧下で除去し、水層をEtOAc(3×50mL)で抽出した。合わせた有機物をブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物を、フラッシュクロマトグラフィー(10%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、6(1.87g、収率74%)を透明で無色の油として得た:R=0.5(10%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDCl) δ 7.25(d、J=8.3Hz、2H)、6.87(d、J=8.2Hz、2H)、5.76(ddd、J=17.4、10.1、7.3Hz、1H)、4.99(d、J=9.8Hz、1H)、4.98(d、J=18.1Hz、1H)、4.43(d、J=11.5Hz、1H)、4.38(d、J=11.5Hz、1H)、3.80(s、3H)、3.76(dt、J=8.0、4.2Hz、1H)、3.52-3.42(m、2H)、2.29(td、J=7.1、3.9Hz、1H)、1.74-1.60(m、2H)、0.99(d、J=6.9Hz、3H)、0.88(s、9H)、0.05(s、3H)、0.03(s、3H)。13C NMR(100MHz、CDCl) δ 159.23、140.84、130.85、129.39、114.67、113.87、72.68、72.65、67.24、55.43、43.58、33.36、26.05、18.27、14.68、-4.26、-4.39;HRMS(ES)計算値C2136Si[M+H]364.2434、実測値364.2439。
(tert-ブチル(((3S,4R,E)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-4-メチル-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ヘキサ-5-エン-3-イル)オキシ)ジメチルシラン(7)。
乾燥CHCl(15mL、0.2M)中のHoveyda Grubbs II(0.10g、0.16mmol、0.05当量)の溶液を、N下で、還流コンデンサを備えた2つ口フラスコに添加した。これにオレフィン6(1.15g、3.15mmol、1当量)を添加し、続いてビニルボロン酸ピナコールエステル(1.07mL、6.31mmol、3当量、溶出液として10%EtOAc/ヘキサンを使用してSiOのプラグに通し、使用直前に安定剤を除去)を添加し、反応物を18時間還流で加熱した。残留物を冷却し、濃縮し、フラッシュクロマトグラフィー(5%EtOAc/ヘキサン)によって直接精製して、7(1.10g、収率74%)を淡い黄色の油として得た:R=0.35(5%EtOAc/ヘキサン);H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.25(d、J=8.1Hz、2H)、6.87(d、J=8.0Hz、2H)、6.56(dd、J=18.1、6.6Hz、1H)、5.43(d、J=18.1Hz、1H)、4.41(d、J=18.0Hz、1H)、4.38(d、J=17.9Hz、1H)、3.87-3.75(m、1H)、3.80(d、J=0.8Hz、3H)、3.55-3.38(m、2H)、2.40(q、J=6.2Hz、1H)、1.66(q、J=6.7Hz、2H)、1.26(s、12H)、1.00(d、J=6.9Hz、3H)、0.87(d、J=0.8Hz、9H)、0.03(s、3H)、0.02(s、3H);13C NMR(100MHz、CDCl) δ 159.31、156.21、130.88、129.52、113.96、83.26、72.77、72.45、67.42、55.50、45.53、32.93、26.12、25.06、24.96、18.32、13.32、-4.20、-4.42;HRMS(ES)計算値C2747BOSi[M+H]491.3359、実測値491.3350。
(3S,4R,E)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-4-メチル-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ヘキサ-5-エン-1-オール(S4)。
室温でのCHCl(25mL、0.15M)および水(1.49mL)中の7(1.90g、3.87mmol、1当量)の溶液に、DDQ(1.32g、5.81mmol、1.5当量)を添加し、混合物を1時間撹拌した。反応物を、飽和NaHCOでクエンチし、10分間撹拌し、水で希釈した。有機層を分離し、水層をCHCl(2×50mL)で抽出し、有機物を合わせ、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物を、フラッシュクロマトグラフィー(12%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、S4(1.21g、収率83%)を無色の油として得た:R=0.15(10%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDCl) δ 6.54(dd、J=18.1、6.6Hz、1H)、5.46(dd、J=18.1、1.5Hz、1H)、3.87(ddd、J=7.9、5.0、3.8Hz、1H)、3.77-3.67(m、2H)、2.49(pdd、J=6.8、5.0、1.5Hz、1H)、2.03(t、J=5.4Hz、1H)、1.71-1.63(m、2H)、1.26(d、J=1.7Hz、12H)、1.01(d、J=6.8Hz、3H)、0.89(s、9H)、0.08(s、3H)、0.07(s、3H);13C NMR(150MHz、CDCl) δ 155.72、83.07、74.24、60.63、44.92、34.15、25.84、24.80、24.71、17.98、12.81、-4.41、-4.69;HRMS(ES)計算値C1939BOSi[M+H]371.2783、実測値371.2778。
(3S,4R,E)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-4-メチル-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ヘキサ-5-エナル(8)。
開いた丸底フラスコに、CHCl(41mL、0.1M)中のアルコールS4(1.00g、4.09mmol、1当量)を添加し、NaHCO(1.72g、20.45mmol、5当量)およびデスマーチンペルヨージナン(2.08g、4.91mmol、1.2当量)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌し、10%Na溶液(50mL)でクエンチし、両方の層が透明になるまで撹拌した。有機物を分離し、水層をCHCl(2×50mL)で抽出した。合わせた有機物をブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物を、フラッシュクロマトグラフィー(10%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、8(0.768g、収率77%)を無色の油として得た:R=0.5(10%EtOAc/ヘキサン);H NMR(400MHz、CDCl) δ 9.75(dd、J=2.1、1.1Hz、1H)、6.50(dd、J=18.1、6.6Hz、1H)、5.46(d、J=18.0Hz、1H)、4.22(dt、J=8.1、4.2Hz、1H)、2.54-2.42(m、2H)、2.41-2.33(m、1H)、1.25(s、12H)、1.01(dd、J=6.9、0.9Hz、3H)、0.85(d、J=0.8Hz、9H)、0.05(s、3H)、0.02(s、3H);13C NMR(100MHz、CDCl) δ 202.47、154.68、83.36、70.89、47.17、45.54、29.86、25.92、24.98、24.88、18.16、13.03、-4.33、-4.56;HRMS(ES)計算値C1937BOSi[M+H]368.2554、実測値368.2550。
2.ユニットB合成
S5は、図4に示されるように、および以前に報告されたように、市販の9から3つのステップで合成した。
メチル(R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-(2-(ジエトキシホスホリル)アセトアミド)プロパノエート(12)。
開いたフラスコに、S5(1.10g、3.20mmol、1当量)および4M HCl/ジオキサン(20mL)を添加した。混合物を30分間激しく撹拌し、減圧下で濃縮した。得られた白色の固体10を直接使用した。
化合物10をDMF(32mL、0.1M)中に懸濁し、2-(ジエトキシホスホリル)酢酸11(0.692g、3.52mmol、1.1当量)、EDC・HCl(0.731g、3.84mmol、1.2当量)、HOBt水和物(0.591g、3.84mmol、1.2当量)、およびDIPEA(1.03g、1.40mL、8.00mmol、2.5当量)で処理し、室温で18時間撹拌した。反応物を半飽和NHCl水溶液(30mL)でクエンチし、水層をDCMで抽出(3×30mL)し、有機物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物を、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~7%メタノール/DCM)で精製して、12(0.90mg、収率67%)を透明で無色油として得た:R=0.2(2.5%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDCl) δ 7.16(d、J=2.2Hz、1H)、7.09(bd、J=7.5Hz、1H)、7.04(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.84(d、J=8.4Hz、1H)、4.78(td、J=7.1、5.4Hz、1H)、4.13(dt、J=14.9、7.2Hz、1H)、4.06(dq、J=8.2、7.1Hz、2H)、3.85(s、3H)、3.70(s、3H)、3.08(dd、J=14.2、5.4Hz、1H)、2.97(dd、J=14.2、6.8Hz、1H)、2.85(d、J=10.7Hz、1H)、2.81(d、J=10.5Hz、1H)、1.31(t、J=7.1Hz、3H)、1.27(t、J=7.1Hz、3H);13C NMR(150MHz、CDCl) δ 171.45、163.95、163.93、154.24、131.09、129.15、128.72、122.48、112.22、77.37、77.16、76.95、62.95(d、J=15.3Hz)、62.91(d、J=15.3)、56.25、53.94、52.52、36.88、35.70、34.83、16.48、16.43、16.39;HRMS(ES)計算値C1725ClNOP[M+H]421.1057、実測値421.1053。
3.ユニットA/B類似体の合成および特性評価
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(13)。
乾燥THF(15mL、0.1M)中の12(0.63g、1.49mmol、1当量)の懸濁液を0℃まで冷却し、NaH(油中60%懸濁液、0.055g、1.64mmol、1.1当量)で処理した。THF(5mL)中のアルデヒド8(0.55g、1.49mmol、1当量)を滴下で添加する前に、反応物を30分間撹拌した。反応物を0℃で1時間撹拌させ、半飽和NHCl(10mL)でクエンチした。有機物を減圧下で除去し、残りの水層をDCM(3×50mL)で抽出し、有機物を合わせ、ブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物を、フラッシュクロマトグラフィーシステム(6~45%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、13(0.545g、収率57.4%)を透明で無色の油として得た:R=0.25(25%EtOAc/ヘキサン);H NMR:(400MHz、CDOD) δ 7.21(d、J=2.2Hz、1H)、7.10(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.75(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.57(dd、J=18.0、7.7Hz、1H)、5.96(d、J=15.3Hz、1H)、5.38(d、J=18.3Hz、1H)、4.68(dd、J=8.9、5.5Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.73(q、J=5.4Hz、1H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.0、5.6Hz、1H)、2.90(dd、J=14.0、9.0Hz、1H)、2.41-2.25(m、3H)、1.26(s、12H)、1.01(d、J=6.8Hz、3H)、0.89(s、9H)、0.06(s、3H)、0.03(s、3H);13C NMR:(100MHz、CDOD) δ 173.28、167.98、157.33、155.42、143.28、131.82、131.33、129.70、126.29、123.20、113.34、84.41、76.09、56.55、55.19、52.72、46.48、38.38、37.30、26.47、25.14、25.10、19.00、15.81、-3.99、-4.30;HRMS(ESI)計算値C3251BClNOSi[M+H]635.3216、実測値635.3215。
4.一般的な鈴木カップリング手順
TLC(2~12時間)で評価される通り、長いチューブに、13(1当量)、KPO(2.5当量)、ヨウ化アリール(2当量)、およびPd(dba)(0.05当量)を添加し、1,2ジクロロエタンおよび水(4:1、0.1M)の混合物中に懸濁し、完了するまで激しく撹拌した。反応物を0.5M HClおよびEtOAcで希釈し、水層をEtOAc(3×20mL)で抽出した。有機物を合わせ、NaSOで乾燥させ、濾過し、本明細書に示されるようにフラッシュクロマトグラフィーシステムによって精製した。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-フェニルオクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14a)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィーシステム(SiO、20~50%EtOAc/ヘキサン)を使用して精製して、14a(0.086g、収率93%)を淡い黄色の油として得た:R=0.35(25%EtOAc/ヘキサン);H NMR(400MHz、CDOD) δ 7.33(d、J=7.5Hz、2H)、7.27(t、J=7.6Hz、2H)、7.21(d、J=2.2Hz、1H)、7.18(t、J=7.2Hz、1H)、7.10(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.4Hz、1H)、6.78(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.38(d、J=16.0Hz、1H)、6.19(dd、J=16.0、8.2Hz、1H)、5.96(d、J=15.4Hz、1H)、4.69(dd、J=8.9、5.6Hz、1H)、3.83(s、3H)、3.80(q、1H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.0、5.6Hz、1H)、2.90(dd、J=14.0、9.0Hz、1H)、2.44(q、J=6.5Hz、1H)、2.37(t、J=6.9Hz、2H)、1.11(d、J=6.9Hz、3H)、0.90(s、9H)、0.06(s、3H)、0.05(s、3H);13C NMR(100MHz、CDOD) 173.28、168.03、155.41、143.50、139.03、133.10、131.82、131.73、131.33、129.67、129.50、128.04、127.06、126.17、123.18、113.33、76.54、56.53、55.15、52.72、44.11、38.62、37.27、26.44、18.98、16.80、-4.01、-4.32.;HRMS(ES)計算値C3244ClNOSi[M+H]586.2750、実測値586.2754。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-(ピリジン-2-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14b)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィー(Si-NH、20~50%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14b(0.078g、収率45%)を淡い黄色の油として得た:R=0.15(50%EtOAc/ヘキサン);H NMR(400MHz、CDOD) δ 8.44(d、J=4.0Hz、1H)、7.76(td、J=7.8、1.8Hz、1H)、7.46(d、J=8.0Hz、1H)、7.24(dd、J=7.8、5.2Hz、1H)、7.21(d、J=2.1Hz、1H)、7.10(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.3Hz、1H)、6.77(dt、J=15.3、7.4Hz、1H)、6.64(dd、J=16.0、8.2Hz、1H)、6.49(d、J=16.0Hz、1H)、5.98(d、J=15.4Hz、1H)、4.70(dd、J=9.0、5.5Hz、1H)、3.87-3.84(m、1H)、3.83(m、3H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.0、5.5Hz、1H)、2.90(dd、J=14.0、9.0Hz、1H)、2.51(h、J=6.8Hz、1H)、2.38(t、J=6.8Hz、2H)、1.14(d、J=6.8Hz、3H)、0.90(s、9H)、0.06(s、3H)、0.05(s、3H)。13C NMR(100MHz、CDOD) δ 173.27、167.95、157.17、155.41、149.74、143.24、139.05、138.66、131.83、131.34、131.12、129.70、126.38、123.38、123.17、122.34、113.34、76.26、56.53、55.15、52.73、44.06、38.62、37.31、26.43、18.97、16.47、-4.04、-4.34.HRMS(ES)計算値C3143ClNSi[M+H]587.2703、実測値587.2705。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-(ピリジン-3-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14c)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィーシステム(Si-NH、16~60%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14c(0.049g、収率72%)を淡い黄色の油として得た:R=0.15(50%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.49(d、J=2.1Hz、1H)、8.35(dd、J=4.9、1.5Hz、1H)、7.85(d、J=8.0Hz、1H)、7.37(dd、J=8.0、4.8Hz、1H)、7.21(d、J=2.1Hz、1H)、7.10(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.5Hz、1H)、6.78(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.43(d、J=16.1Hz、1H)、6.36(dd、J=16.1、7.9Hz、1H)、5.97(dt、J=15.3、1.4Hz、1H)、4.70(dd、J=8.9、5.6Hz、1H)、3.85-3.79(m、1H)、3.83(s、3H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.0、5.6Hz、1H)、2.91(dd、J=14.0、9.0Hz、1H)、2.49(td、J=7.2、4.7Hz、1H)、2.38(ddd、J=7.4、5.8、1.4Hz、2H)、1.13(d、J=6.9Hz、3H)、0.90(s、9H)、0.06(s、3H)、0.05(s、3H);13C NMR(150MHz、CDOD) δ 173.27、167.97、155.43、148.28、148.13、143.21、136.88、135.48、134.71、131.82、131.35、129.68、127.66、126.31、125.28、123.20、113.39、76.32、56.56、55.15、52.72、44.24、38.69、37.29、26.42、18.96、16.65、-4.00、-4.34;HRMS(ES)計算値C3143ClNSi[M+H]587.2703、実測値587.2702。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-(ピリジン-4-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14d)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィーシステム(Si-NH、15~55%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14d(0.062g、収率71%)を淡い黄色の油として得た:R=0.25(50%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDOD) δ δ 8.42(d、J=5.9Hz、2H)、7.37(d、J=6.3Hz、2H)、7.21(d、J=2.1Hz、1H)、7.10(dd、J=8.5、2.1Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.78(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.56(dd、J=16.0、8.2Hz、1H)、6.41(d、J=16.0Hz、1H)、5.97(d、J=15.3Hz、1H)、4.69(dd、J=9.0、5.5Hz、1H)、3.86-3.81(m、1H)、3.83(s、3H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.1、5.6Hz、1H)、2.91(dd、J=14.1、9.0Hz、1H)、2.51(td、J=13.3、6.5Hz、1H)、2.38(t、J=6.9Hz、2H)、1.13(d、J=6.8Hz、3H)、0.90(s、9H)、0.06(s、3H)、0.06(s、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) 13C NMR(150MHz、CDOD) δ 173.28、167.96、155.44、150.23、147.68、143.05、139.96、131.83、131.36、129.67、129.19、126.37、123.20、122.32、113.40、76.19、56.56、55.14、52.73、44.24、38.75、37.28、26.41、18.96、16.56、-4.02、-4.36;HRMS(ES)計算値C3143ClNSi[M+H]587.2703、実測値587.2699。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-(ピラジン-2-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14e)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィーシステム(Si-NH、20~55%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14e(0.115g、収率65%)を淡い黄色の油として得た:R=0.2(50%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.57(d、J=1.5Hz、1H)、8.51(s、1H)、8.39(d、J=2.6Hz、1H)、7.21(d、J=2.2Hz、1H)、7.10(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.5Hz、1H)、6.90(dd、J=15.9、8.3Hz、1H)、6.78(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.54(d、J=16.0Hz、1H)、5.98(d、J=15.4Hz、1H)、4.70(dd、J=8.9、5.5Hz、1H)、3.86-3.84(m、1H)、3.83(s、3H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.0、5.6Hz、1H)、2.91(dd、J=14.0、9.0Hz、1H)、2.55(q、J=6.9Hz、1H)、2.41-2.33(m、2H)、1.15(d、J=6.8Hz、3H)、0.89(s、9H)、0.06(s、3H)、0.05(s、3H);13C NMR(150MHz、CDOD) δ 173.27、167.93、155.42、152.99、145.49、143.89、143.49、143.07、141.77、131.82、131.34、129.69、127.88、126.41、123.19、113.38、76.20、56.56、55.15、52.73、44.13、38.74、37.30、26.42、18.97、16.46、-4.01、-4.36;HRMS(ES)計算値C3042ClNSi[M+H]588.2655、実測値588.2659。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-(1-メチル-1H-ピロゾール-5-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14f)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィーシステム(Si-NH、20~70%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14f(0.044g、収率63%)を淡い黄色の油として得た:R=0.1(50%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.34(d、J=2.0Hz、1H)、7.20(d、J=2.2Hz、1H)、7.10(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.4Hz、1H)、6.78(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.38(d、J=15.9Hz、1H)、6.33(d、J=2.1Hz、1H)、6.21(dd、J=15.9、8.3Hz、1H)、5.97(dt、J=15.4、1.3Hz、1H)、4.69(dd、J=8.9、5.6Hz、1H)、3.82(s、3H)、3.81-3.79(m、1H)、3.80(s、3H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.0、5.6Hz、1H)、2.91(dd、J=14.0、8.9Hz、1H)、2.48(h、J=6.9Hz、1H)、2.38(t、J=6.5Hz、2H)、1.12(d、J=6.9Hz、3H)、0.89(s、9H)、0.06(s、3H)、0.05(s、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 173.28、167.98、155.44、143.09、142.83、139.14、138.52、131.81、131.36、129.67、126.33、123.21、118.11、113.41、103.42、76.23、56.57、55.17、52.72、44.20、38.79、37.28、36.45、26.42、18.97、16.77、-3.99、-4.36;HRMS(ES)計算値C3044ClNSi[M+H]590.2812、実測値590.2811。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-(1-メチル-1H-ピロゾール-3-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14g)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィー(Si-NH、16~55%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14g(0.065g、収率71%)を淡い黄色の油として得た:R=0.25(50%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.46(d、J=2.3Hz、1H)、7.21(d、J=2.2Hz、1H)、7.10(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.4Hz、1H)、6.75(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.30(d、J=2.3Hz、1H)、6.17(dd、J=16.2、8.1Hz、1H)、5.96(d、J=15.4Hz、1H)、4.69(dd、J=9.0、5.6Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.83(s、3H)、3.78(q、J=5.6Hz、1H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.1、5.6Hz、1H)、2.91(dd、J=14.0、9.0Hz、1H)、2.42(p、J=6.7Hz、1H)、2.38-2.30(m、2H)、1.09(d、J=6.8Hz、3H)、0.90(s、9H)、0.06(s、3H)、0.04(s、3H);13C NMR(150MHz、CDOD) δ 173.29、167.99、155.43、152.12、143.43、134.95、133.03、131.82、131.37、129.71、126.28、123.29、123.22、113.38、103.22、76.44、56.55、55.16、52.71、43.95、38.60、38.52、37.33、26.44、18.98、16.48、-4.04、-4.32;HRMS(ES)計算値C3044ClNSi[M+H]590.2812、実測値590.2809。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-6-メチル-8-(1-メチル-1H-ピロゾール-4-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14h)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィーシステム(Si-NH、16~60%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14h(0.085g、収率92%)を淡い黄色の油として得た:R=0.2(50%EtOAc/ヘキサン);H NMR(400MHz、CDOD) δ 7.53(s、1H)、7.47(s、1H)、7.21(d、J=2.2Hz、1H)、7.10(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.4Hz、1H)、6.77(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.18(d、J=16.0Hz、1H)、5.95(d、J=15.4Hz、1H)、5.89(dd、J=16.1、8.2Hz、1H)、4.69(dd、J=8.9、5.6Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.83(s、3H)、3.75(q、J=5.5Hz、1H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.0、5.6Hz、1H)、2.90(dd、J=14.0、9.0Hz、1H)、2.41-2.27(m、3H)、1.06(d、J=6.8Hz、3H)、0.89(s、9H)、0.05(s、3H)、0.03(s、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ173.29、168.03、155.42、143.67、137.61、131.83、131.58、131.35、129.68、129.33、126.10、123.18、122.45、121.24、113.36、76.60、56.55、55.15、52.72、44.16、38.72、38.32、37.28、26.44、18.98、16.45、-4.05、-4.31;HRMS(ES)計算値C3044ClNSi[M+H]590.2812、実測値590.2813。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-8-(1-イソプロピル-1H-ピロゾール-4-イル)-6-メチルオクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14i)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィー(アミンカラム、20~50%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14i(0.056g、収率83%)を淡い黄色の油として得た:R=0.35(50%EtOAc/ヘキサン);H NMR(600MHz、CDOD) δ H NMR(400MHz、メタノール-d) δ 7.61(s、1H)、7.48(s、1H)、7.21(d、J=2.2Hz、1H)、7.10(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.4Hz、1H)、6.77(dt、J=15.2、7.5Hz、1H)、6.20(d、J=16.1Hz、1H)、5.95(d、J=15.3Hz、1H)、5.90(dd、J=16.1、8.1Hz、1H)、4.69(dd、J=8.9、5.6Hz、1H)、4.46(hept、J=7.0Hz、1H)、3.83(s、3H)、3.75(q、J=5.4Hz、1H)、3.70(s、3H)、3.11(dd、J=14.0、5.6Hz、1H)、2.91(dd、J=14.0、8.9Hz、1H)、2.46-2.29(m、3H)、1.46(d、J=6.7Hz、6H)、1.07(d、J=6.9Hz、3H)、0.90(s、9H)、0.06(s、3H)、0.03(s、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 13C NMR(101MHz、cdod) δ 173.29、168.04、155.42、143.72、137.18、131.83、131.35、129.68、126.09、123.19、121.88、121.43、113.36、76.65、56.55、55.16、54.99、52.72、44.16、38.27、37.28、26.44、23.07、18.99、16.38、-4.04、-4.32;HRMS(ES)計算値C3248ClNSi[M+H]618.3125、実測値618.3129。
メチル(R)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-8-(3,5-ジメチルイソオキサゾール-4-イル)-6-メチルオクタ-2,7-ジエンアミド)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)プロパノエート(14j)。
一般的な鈴木手順に従って反応を行い、フラッシュクロマトグラフィー(アミンカラム、10~50%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、14j(0.057g、収率85%)を淡い黄色の油として得た:R=0.35(33%EtOAc/ヘキサン);H NMR:(400MHz、CDOD) δ 7.20(d、J=2.2Hz、1H)、7.10(dd、J=8.3、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.4Hz、1H)、6.76(dt、J=15.2、7.6Hz、1H)、6.11(d、J=16.3Hz、1H)、5.96(d、J=15.4Hz、1H)、5.90(dd、J=16.4、8.5Hz、1H)、4.68(dd、J=9.0、5.5Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.83-3.77(m、1H)、3.70(s、3H)、3.12(dd、J=14.0、5.5Hz、1H)、2.90(dd、J=14.0、9.0Hz、1H)、2.46-2.33(m、3H)、2.38(s、3H) 2.26(s、3H)、1.11(d、J=6.9Hz、3H)、0.90(s、9H)、0.07(s、3H)、0.06(s、3H)。13C NMR:(100MHz、CDOD) δ 173.27、167.98、166.46、159.59、155.42、143.21、135.80、131.81、131.33、129.67、126.21、123.17、119.01、114.23、113.36、76.35、56.54、55.17、52.73、44.65、39.15、37.26、26.42、18.97、17.68、11.50、11.40、-3.95、-4.38;HRMS(ES)計算値C3145ClNSi[M+H]605.2808、実測値605.2801。
5.ユニットC/Dの特性評価
Figure 2022549971000055
図6Bに示されるように、19および20を市販の15から合成した。すべてのスペクトルは、公開された文献に従った。8~11
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-2-メチルプロパノエート(21)。
DMF(0.1M)中の19の溶液に、EDC HCl(1.5当量)およびHOBt(1.2当量)を添加し、反応物を30分間撹拌した。触媒DMAP(0.05当量)を添加する前に、NAcを添加し、10分間撹拌した。反応物を12時間撹拌し、水およびEtOAcで希釈し、水層を抽出し(2×40mL)、有機物を合わせ、飽和NHCl(2×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。有機物を減圧下で除去し、残りの残留物をフラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)で精製して、21を白色の固体として得た。スペクトルは、公開された文献に従った。12
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル 3-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-2,2-ジメチルプロパノエート(22)。
DMF(0.1M)中の20の溶液に、EDC HCl(1.5当量)およびHOBt(1.2当量)を添加し、反応物を30分間撹拌した。触媒DMAP(0.05当量)を添加する前に、NAcを添加し、10分間撹拌した。反応物を12時間撹拌し、水およびEtOAcで希釈し、水層を抽出し(2×40mL)、有機物を合わせ、飽和NHCl(2×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。有機物を減圧下で除去し、残りの残留物を本明細書に開示されるフラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)で精製して、22を白色の固体として得た。スペクトルは、公開された文献に従った。12
6.セコクリプトフィシン合成および類似体の特性評価
一般的なペプチドカップリング手順
14a~m(1当量)を、1,2ジクロロエタン(0.2M)中に懸濁し、水酸化トリメチルスズ(4当量)で処理し、80℃で4時間加熱した。反応物を冷却し、DCMで希釈し、1N HCl(2回)で洗浄した。粗酸を直接使用した。
同時に、21または22(1.1当量)を4M HCl/ジオキサン(5mL)中に懸濁し、室温で1時間撹拌し、濃縮して、直接使用した。
14a~mの酸をDCM中に懸濁し、0℃まで冷却し、HATU(1.1当量)で処理した。21または22アミン塩をDCM中に懸濁し、DIPEA(2.5当量)で処理し、0℃まで冷却し、混合物に添加した。反応物を一晩撹拌させ、室温まで温めた。混合物を半飽和重炭酸ナトリウムで希釈し、水層をDCM(3×10mL)で抽出し、有機物を合わせ、ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮し、本明細書で指定されるように精製した。解析的分析に利用される場合は、HydroRP C18(250×10.0mm、4ミクロン)で脱保護する前に、20~80%水/アセトニトリル勾配を3mL/分の流量で使用して、カップリング手順中に生成された任意のジアステレオマー除去するためにさらにHPLC精製を行った。本明細書に開示されるフラッシュクロマトグラフィーシステムで精製した直後に、中間体を使用して半分取反応を行った。
一般的な脱保護手順.
粗カップリング生成物を、開いたポリプロピレンバイアル中のアセトニトリル(0.1M)中に懸濁した。TLCによってモニタリングされるように、これを33%HF水溶液(2当量)で処理し、反応が完了するまで撹拌させた。反応物をDCMで希釈し、水層は塩基性になるまで飽和NaHCOをゆっくりと添加することによってクエンチした。次いで、水層をDCM(3×10mL)で抽出し、有機物を合わせ、ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮し、本明細書で指定されるように精製した。ジアステレオマー比(dr)を、NMRによって見られる通りに報告する。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-フェニルオクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23a)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)で精製した=0.5(5%メタノール/DCM)。次に、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~14%メタノール/DCM)によって精製して、23a(0.051g、3つのステップにわたって収率42%、10:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.35(10%メタノール/DCM)。H NMR:(600MHz、CDOD) δ 7.37(d、J=7.0Hz、2H)、7.27(t、J=7.9Hz、2H)、7.25(d、J=2.2Hz、1H)、7.18(t、J=7.3Hz、1H)、7.14(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.81(dt、J=15.1、7.3Hz、1H)、6.41(d、J=15.9Hz、1H)、6.23(dd、J=15.9、8.5Hz、1H)、6.01(d、J=15.4Hz、1H)、5.21(dd、J=9.6、4.0Hz、1H)、4.58(dd、J=8.1、7.0Hz、1H)、3.83(s、3H)、3.65(dt、J=8.7、4.6Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.34-3.27(m、2H)、3.19(dd、J=13.5、7.0Hz、1H)、3.06-2.97(m、3H)、2.85(dd、J=13.7、8.1Hz、1H)、2.70(h、J=7.0Hz、1H)、2.44-2.35(m、2H)、2.35-2.28(m、1H)、1.91(s、3H)、1.80-1.74(m、1H)、1.74-1.69(m、1H)、1.66-1.59(m、1H)、1.15(d、J=6.9Hz、3H)、1.10(d、J=7.1Hz、3H)、0.94(d、J=6.5Hz、3H)、0.91(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR:(150MHz、CDOD) 200.34、175.06、173.49、173.42、168.07、155.40、143.51、139.05、132.50、132.09、131.91、131.50、129.84、129.48、128.05、127.14、126.08、123.20、113.35、78.63、75.34、56.57、56.24、44.21、42.73、41.95、40.57、39.85、38.82、38.07、28.58、25.74、23.48、22.54、21.97、17.53、14.87;HRMS(ES)計算値C3952ClNS[M+H]758.3236、実測値758.3238。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(ピリジン-2-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23b)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、23b(0.025g、3つのステップにわたって収率38%、7:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR:(600MHz、CDOD) δ 8.44(d、J=4.1Hz、1H)、7.76(td、J=7.7、1.9Hz、1H)、7.51(d、J=8.1Hz、1H)、7.26(d、J=2.3Hz、1H)、7.25-7.22(m、1H)、7.14(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.81(dt、J=15.0、7.3Hz、1H)、6.67(dd、J=16.0、8.4Hz、1H)、6.52(d、J=16.0Hz、1H)、6.02(d、J=15.4Hz、1H)、5.21(dd、J=9.5、4.0Hz、1H)、4.58(dd、J=8.1、6.9Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.68(dt、J=8.7、4.7Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.33-3.30(s、2H)、3.21(dd、J=13.5、7.0Hz、1H)、3.05-2.99(m、3H)、2.85(dd、J=13.8、8.1Hz、1H)、2.71(h、J=7.0Hz、1H)、2.51-2.44(m、1H)、2.44-2.37(m、1H)、2.37-2.29(m、1H)、1.91(s、3H)、1.81-1.69(m、2H)、1.67-1.59(m、1H)、1.18(d、J=6.9Hz、3H)、1.11(d、J=7.2Hz、3H)、0.95(d、J=6.5Hz、3H)、0.92(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.34、175.09、173.49、173.42、168.05、157.30、155.43、149.71、143.29、138.74、138.61、131.92、131.56、131.35、129.85、126.27、123.36、122.32、113.42、111.43、78.67、75.12、56.61、56.25、44.08、42.75、41.97、40.60、39.87、38.75、38.09、28.61、25.76、23.46、22.54、21.99、17.10、14.86;HRMS(ES)計算値C3851ClNS[M+H]759.3189、実測値759.3184。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(ピリジン-3-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23c)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23c(0.037g、3つのステップにわたって収率51%、7:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.52(d、J=2.2Hz、1H)、8.36(dd、J=4.9、1.6Hz、1H)、7.89(dt、J=8.1、1.9Hz、1H)、7.37(ddd、J=8.0、4.9、0.9Hz、1H)、7.26(d、J=2.2Hz、1H)、7.14(dd、J=8.4、2.3Hz、1H)、6.97(d、J=8.5Hz、1H)、6.81(dt、J=15.2、7.3Hz、1H)、6.46(d、J=16.1Hz、1H)、6.41(dd、J=16.0、7.9Hz、1H)、6.02(d、J=15.4Hz、1H)、5.21(dd、J=9.5、4.0Hz、1H)、4.59(dd、J=8.0、6.8Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.67(dt、J=8.0、4.6Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.33-3.30(m、2H) 3.20(dd、J=13.5、6.9Hz、1H)、3.04-3.00(m、3H) 2.85(dd、J=13.7、8.1Hz、1H) 2.70(h、J=7.0Hz、1H)、2.51-2.36(m、2H)、2.36-2.28(m、1H)、1.91(s、3H)、1.83-1.68(m、2H)、1.65-1.61(m、1H)、1.17(d、J=6.9Hz、3H)、1.10(d、J=7.1Hz、3H)、0.95(d、J=6.5Hz、3H)、0.92(d、J=6.5Hz、3H);13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.34、175.08、173.48、173.42、168.04、155.42、148.27、148.22、143.30、136.34、135.52、134.79、131.91、131.53、129.85、127.95、126.19、125.24、123.23、113.41、78.66、75.16、56.60、56.24、44.33、42.75、41.97、40.59、39.86、38.87、38.08、28.60、25.76、23.47、22.54、21.99、17.34、14.86;HRMS(ES)計算値C3851ClNS[M+H]759.3189、実測値759.3192。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(ピリジン-4-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23e)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23e(0.048g、3つのステップにわたって収率49%、11:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.42(d、J=6.3Hz、1H)、7.40(d、J=6.3Hz、1H)、7.25(d、J=2.2Hz、1H)、7.14(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.80(dt、J=15.0、7.3Hz、1H)、6.61(dd、J=16.0、8.5Hz、1H)、6.44(d、J=15.9Hz、1H)、6.01(d、J=15.4Hz、1H)、5.21(dd、J=9.5、4.0Hz、1H)、4.58(dd、J=8.1、6.9Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.67(dt、J=7.9、4.7Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.33-3.30(m、2H) 3.20(dd、J=13.5、7.0Hz、1H)、3.04-3.00(m、3H)、2.85(dd、J=13.8、8.1Hz、1H)、2.70(h、J=6.9Hz、1H)、2.51-2.42(m、1H)、2.42-2.25(m、2H)、1.91(s、3H)、1.82-1.68(m、2H)、1.63(ddd、J=13.1、8.1、4.0Hz、1H)、1.17(d、J=6.8Hz、3H)、1.10(d、J=7.1Hz、3H)、0.94(d、J=6.5Hz、3H)、0.92(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.34、175.08、173.48、173.42、168.02、155.43、150.20、147.73、143.18、139.50、131.92、131.53、129.84、129.42、126.25、123.24、122.39、113.42、78.67、75.03、56.61、56.23、44.30、42.75、41.97、40.60、39.87、38.90、38.09、28.61、25.76、23.46、22.54、21.99、17.19、14.86.;HRMS(ES)計算値C3851ClNS[M+H]759.3189、実測値759.3187。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(ピラジン-2-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23g)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23g(0.021g、3つのステップにわたって収率25%、9:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(400MHz、CDOD) δ 8.62(s、1H)、8.51(s、1H)、8.39(d、J=2.6Hz、1H)、7.26(d、J=2.0Hz、1H)、7.14(dd、J=8.5、2.1Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.93(dd、J=15.9、8.5Hz、1H)、6.81(dt、J=14.9、7.3Hz、1H)、6.57(d、J=16.0Hz、1H)、6.02(d、J=15.4Hz、1H)、5.21(dd、J=9.4、3.9Hz、1H)、4.58(t、J=7.5Hz、1H)、3.69(dt、J=9.0、4.7Hz、1H)、3.48(dd、J=13.4、6.6Hz、1H)、3.37-3.24(m、2H)、3.20(dd、J=13.5、7.1Hz、1H)、3.07-2.97(m、1H)、3.03(t、J=6.8Hz、2H)、2.85(dd、J=13.7、8.2Hz、1H)、2.70(h、J=6.9Hz、1H)、2.56-2.42(m、1H)、2.41-2.25(m、2H) 1.91(s、3H)、1.82-1.68(m、2H)、1.62(ddd、J=13.1、8.1、3.9Hz、1H)、1.19(d、J=6.8Hz、3H)、1.10(d、J=7.0Hz、3H)、0.95(d、J=6.3Hz、3H)、0.92(d、J=6.3Hz、3H)。13C NMR(151MHz、CDOD) δ 200.34、175.08、173.47、173.42、168.03、155.42、153.09、145.39、143.89、143.46、143.20、141.38、131.91、131.54、129.86、128.22、126.28、123.24、113.42、78.67、75.01、56.62、56.24、44.21、42.75、41.97、40.60、39.86、38.80、38.09、28.61、25.76、23.46、22.54、21.99、16.99、14.86.HRMS(ES)計算値C3750ClNS[M+H]760.3141、実測値760.3143。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(1-メチル-1H-ピロゾール-5-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23h)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23h(0.022、3つのステップにわたって収率29%、9:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.34(d、J=2.2Hz、1H)、7.25(d、J=2.2Hz、1H)、7.14(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.5Hz、1H)、6.81(dt、J=15.0、7.3Hz、1H)、6.42(d、J=15.9Hz、1H)、6.38(d、J=2.1Hz、1H)、6.25(dd、J=15.9、8.6Hz、1H)、6.01(dd、J=15.4、1.5Hz、1H)、5.21(dd、J=9.5、3.9Hz、1H)、4.58(dd、J=8.1、7.0Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.82(s、3H)、3.65(dt、J=8.0、4.6Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.33-3.30(m、2H) 3.20(dd、J=13.5、7.0Hz、1H)、3.03(td、J=6.6、1.8Hz、2H)、3.03-3.00(m、1H) 2.85(dd、J=13.8、8.1Hz、1H)、2.70(h、J=6.9Hz、1H)、2.50-2.36(m、2H)、2.36-2.28(m、1H)、1.91(s、3H)、1.82-1.68(m、2H)、1.63(ddd、J=13.2、8.1、3.9Hz、1H)、1.15(d、J=6.9Hz、3H)、1.10(d、J=7.1Hz、3H)、0.95(d、J=6.4Hz、3H)、0.92(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR:(150MHz、CDOD) δ 200.34、175.07、173.47、173.41、168.03、155.41、143.25、142.84、139.10、137.95、131.90、131.51、129.84、126.20、123.21、118.41、113.40、103.56、78.66、75.00、56.60、56.24、44.34、42.74、41.96、40.59、39.86、38.86、38.09、28.60、25.75、23.47、22.54、21.99、17.31、14.87;HRMS(ES)計算値C3752ClNS[M+H]762.3298、実測値762.3295。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(1-メチル-1H-ピロゾール-3-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23i)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィー(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィー(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23i(0.019、3つのステップにわたって収率34%、11:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.46(d、J=2.3Hz、1H)、7.26(d、J=2.1Hz、1H)、7.14(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.79(dt、J=15.1、7.3Hz、1H)、6.34(d、J=2.4Hz、1H)、6.32(d、J=16.6Hz、1H)、6.21(dd、J=16.1、8.4Hz、1H)、6.01(d、J=15.4Hz、1H)、5.21(dd、J=9.5、4.0Hz、1H)、4.58(dd、J=8.1、7.0Hz、1H)、3.84(s、6H)、3.63(dt、J=8.7、4.6Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.33-3.29(m、2H)、3.20(dd、J=13.5、7.0Hz、1H)、3.05-2.99(m、3H)、2.85(dd、J=13.7、8.1Hz、1H)、2.70(h、J=7.0Hz、1H)、2.41-2.33(m、2H)、2.30(dt、J=15.4、7.8Hz、1H)、1.91(s、3H)、1.82-1.68(m、2H)、1.63(ddd、J=13.2、8.1、3.9Hz、1H)、1.13(d、J=6.9Hz、3H)、1.10(d、J=7.2Hz、3H)、0.95(d、J=6.5Hz、3H)、0.92(d、J=6.4Hz、3H)。13C NMR:(150MHz、CDOD) δ 200.35、175.08、173.50、173.43、168.07、155.42、152.17、143.44、134.45、133.02、131.91、131.54、129.87、126.17、123.62、123.23、113.39、103.27、78.65、75.19、56.59、56.27、44.02、42.75、41.97、40.59、39.86、38.72、38.60、38.09、28.59、25.76、23.47、22.54、21.98、17.24、14.86.HRMS(ES)計算値C3752ClNS[M+H]762.3298、実測値762.3295。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(1-メチル-1H-ピロゾール-4-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23j)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23j(0.065g、3つのステップにわたって収率48%11:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.54(s、1H)、7.50(s、1H)、7.25(d、J=2.1Hz、1H)、7.13(dd、J=8.2、2.1Hz、1H)、6.97(d、J=8.3Hz、1H)、6.80(dt、J=15.0、7.3Hz、1H)、6.22(d、J=16.0Hz、1H)、6.00(d、J=16.1、1H)、5.94(dd、J=16.0、8.4Hz、1H)、5.21(dd、J=9.5、4.0Hz、1H)、4.58(t、J=7.5Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.84(s、3H)、3.60(dt、J=8.5、4.5Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.33-3.30(m、2H)、3.20(dd、J=13.5、6.9Hz、1H)、3.03(t、J=5.8Hz、2H)、3.03-3.00(m、1H)、2.85(dd、J=13.7、8.2Hz、1H)、2.70(h、J=7.0Hz、1H)、2.40-2.23(m、3H)、1.91(s、3H)、1.81-1.68(m、2H)、1.63(td、J=9.2、8.6、4.4Hz、1H)、1.10(d、J=7.0Hz、6H)、0.95(d、J=6.3Hz、3H)、0.92(d、J=6.3Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.35、175.08、173.49、173.42、168.10、155.43、143.57、137.72、131.92、131.54、130.89、129.84、129.39、126.05、123.24、122.47、121.60、113.42、78.67、75.39、56.61、56.24、44.14、42.75、41.97、40.60、39.86、38.71、38.65、38.08、28.60、25.76、23.46、22.54、21.99、17.38、14.86.HRMS(ES)計算値C3752ClNS[M+H]762.3298、実測値762.3294。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-8-(1-イソプロピル-1H-ピロゾール-4-イル)-6-メチルオクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23l)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィー(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィー(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23l(0.025、3つのステップにわたって収率38%、9:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.64(s、1H)、7.51(s、1H)、7.25(d、J=2.2Hz、1H)、7.14(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.80(dt、J=15.0、7.3Hz、1H)、6.23(d、J=16.0Hz、1H)、6.00(d、J=15.4Hz、1H)、5.94(dd、J=16.0、8.5Hz、1H)、5.21(dd、J=9.5、4.0Hz、1H)、4.58(t、J=7.5Hz、1H)、4.46(hept、J=6.6Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.61(dt、J=8.6、4.5Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.33-3.30(m、2H)、3.20(dd、J=13.5、7.0Hz、1H)、3.03(t、J=6.6Hz、2H)、3.03-3.00(m、1H)、2.85(dd、J=13.8、8.1Hz、1H)、2.70(h、J=6.9Hz、1H)、2.43-2.23(m、3H)、1.91(s、3H)、1.82-1.69(m、2H)、1.63(ddd、J=13.2、8.1、3.9Hz、1H)、1.47(d、J=6.7Hz、6H)、1.11(d、J=6.9Hz、3H)、1.10(d、J=7.1Hz、3H)、0.95(d、J=6.4Hz、3H)、0.92(d、J=6.4Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.36、175.08、173.49、173.44、168.11、155.42、143.59、137.30、131.92、131.52、130.64、129.85、126.04(2)、123.22、121.90、121.82、113.39、78.65、75.41、56.59、56.24、54.99、44.15、42.74、41.97、40.59、39.86、38.67、38.07、28.59、25.76、23.48、23.08、22.54、21.97、17.44、14.86.HRMS(ESI)計算値C3956ClNS[M+H]790.3611、実測値790.3608。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル(R)-3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-8-(3,5-ジメチルイソオキサゾール-4-イル)-5-ヒドロキシ-6-メチルオクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2-メチルプロパノエート(23m)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィー(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィー(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23m(0.015g、3つのステップにわたって収率43%、8:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.25(d、J=2.1Hz、1H)、7.14(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.4Hz、1H)、6.81(dt、J=15.0、7.3Hz、1H)、6.14(d、J=16.3Hz、1H)、6.01(d、J=15.4Hz、1H)、5.93(dd、J=16.3、8.5Hz、1H)、5.21(dd、J=9.5、4.0Hz、1H)、4.57(t、J=7.5Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.63(dt、J=8.5、4.7Hz、1H)、3.48(dd、J=13.5、6.6Hz、1H)、3.33-3.30(m、2H) 3.20(dd、J=13.5、7.0Hz、1H)、3.03(t、J=6.8Hz、2H)、3.02-2.99(m、1H) 2.85(dd、J=13.7、8.1Hz、1H)、2.70(h、J=7.0Hz、1H)、2.39(s、3H)、2.38-2.30(m、3H)、2.28(s、3H)、1.91(s、3H)、1.82-1.67(m、2H)、1.63(ddd、J=12.6、8.2、3.9Hz、1H)、1.14(d、J=6.8Hz、3H)、1.10(d、J=7.1Hz、3H)、0.95(d、J=6.4Hz、3H)、0.92(d、J=6.4Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.36、175.08、173.49、173.44、168.04、166.54、159.73、155.42、143.35、135.53、131.90、131.50、129.85、126.13、123.22、119.18、114.25、113.38、78.65、75.09、56.59、56.26、44.85、42.74、41.97、40.59、39.86、38.94、38.09、28.59、25.76、23.48、22.53、21.97、17.69、14.86、11.47、11.29.HRMS(ES)計算値C3853ClNS[M+H]777.3295、実測値777.3293。
7.ジェムジメチルセコクリプトフィシン
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル 3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(ピリジン-3-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2,2-ジメチルプロパノエート(23d)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23d(0.019g、3つのステップにわたって収率51%、10:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.52(d、J=2.3Hz、1H)、8.35(dd、J=4.8、1.6Hz、1H)、7.89(dt、J=8.0、2.0Hz、1H)、7.37(dd、J=8.0、4.9Hz、1H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.15(dd、J=8.4、2.3Hz、1H)、6.96(d、J=8.5Hz、1H)、6.80(dt、J=15.0、7.3Hz、1H)、6.46(d、J=16.1Hz、1H)、6.40(dd、J=16.0、7.9Hz、1H)、6.01(d、J=15.4Hz、1H)、5.20(dd、J=9.5、3.8Hz、1H)、4.65(dd、J=8.5、6.5Hz、1H)、3.92(p、J=6.2Hz、2H)、3.83(s、3H)、3.66(dt、J=8.7、4.6Hz、1H)、3.44-3.36(m、2H)、3.33-3.29(m、2H)、3.11-3.00(m、3H)、2.85(dd、J=13.9、8.5Hz、1H)、2.44(td、J=7.2、4.3Hz、1H)、2.39(dt、J=13.0、6.4Hz、1H)、2.32(dt、J=14.9、7.6Hz、1H)、1.91(s、3H)、1.83-1.69(m、2H)、1.64(ddd、J=13.4、8.4、3.9Hz、1H)、1.14(s、3H) 1.14(d、3H)、1.13(d、3H)、0.95(d、J=6.5Hz、3H)、0.92(d、J=6.4Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.53、176.86、173.76、173.42、168.17、155.38、148.26、148.21、143.36、136.35、135.52、134.80、131.89、131.69、129.82、127.96、126.16、125.25、123.23、113.41、78.81、75.15、64.74、56.61、56.39、47.89、44.69、44.31、41.94、39.86、38.88、37.86、28.73、25.87、25.26、23.49、23.26、23.18、22.59、21.95、17.35.HRMS(ES)計算値C3953ClNS[M+H]773.3345、実測値773.3353。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル 3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(ピリジン-4-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2,2-ジメチルプロパノエート(23f)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23f(0.039g、3つのステップにわたって収率45%、12:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.41(d、J=6.1Hz、1H)、7.40(d、J=6.1Hz、1H)、7.27(d、J=1.9Hz、1H)、7.15(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.96(dd、J=8.5、1.0Hz、1H)、6.79(dt、J=14.5、7.1Hz、1H)、6.61(dd、J=16.0、8.5Hz、1H)、6.43(d、J=16.0Hz、1H)、6.00(d、J=15.4Hz、1H)、5.20(dd、J=9.5、3.8Hz、1H)、4.65(dd、J=8.4、6.6Hz、1H)、3.83(s、3H)、3.66(dt、J=8.5、4.4Hz、1H)、3.40(d、J=13.6Hz、1H)、3.36(d、J=12.9Hz、1H)、3.32-3.29(m、2H)、3.12-2.99(m、3H)、2.85(dd、J=14.0、8.5Hz、1H)、2.51-2.42(m、1H)、2.41-2.34(m、1H)、2.35-2.27(m、1H)、1.90(s、3H)、1.81-1.68(m、2H)、1.68-1.60(m、1H)、1.16(s、6H)、1.15(d、J=5.1Hz、3H)、0.95(d、J=6.5Hz、3H)、0.92(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.53、176.86、173.67、173.42、168.14、155.38、150.15、147.78、143.23、139.54、131.90、131.68、129.81、129.42、126.21、123.24、122.41、113.43、78.81、75.01、56.61、56.33、47.78、44.69、44.28、41.94、39.86、38.92、37.86、28.73、25.87、23.49、23.26、23.18、22.59、21.95、17.20.;HRMS(ES)計算値C3953ClNS[M+H]773.3345、実測値773.3353。
(S)-1-((2-アセトアミドエチル)チオ)-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル 3-((R)-3-(3-クロロ-4-メトキシフェニル)-2-((2E,5S,6R,7E)-5-ヒドロキシ-6-メチル-8-(1-メチル-1H-ピロゾール-4-イル)オクタ-2,7-ジエンアミド)プロパンアミド)-2,2-ジメチルプロパノエート(23k)。
一般的なカップリング手順に従って反応を実行し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(1~10%メタノール/DCM)によって精製した=0.65(10%メタノール/DCM)。次いで、これを、一般的な脱保護手順に従って脱保護し、フラッシュクロマトグラフィーシステム(2~15%メタノール/DCM)によって精製して、最終生成物23k(0.060、3つのステップにわたって収率41%、10:1 dr)を透明で無色の油として得た:R=0.25(10%メタノール/DCM);H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.55(s、1H)、7.50(s、1H)、7.28(d、J=2.1Hz、1H)、7.15(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.5Hz、1H)、6.79(dt、J=14.9、7.3Hz、1H)、6.21(d、J=16.1Hz、1H)、5.99(d、J=15.4Hz、1H)、5.93(dd、J=16.0、8.4Hz、1H)、5.20(dd、J=9.6、3.9Hz、1H)、4.65(dd、J=8.6、6.5Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.83(s、3H)、3.60(dt、J=8.8、4.6Hz、1H)、3.40(d、J=13.5Hz、1H)、3.35(d、J=13.9Hz、1H)、3.33-3.29(m、2H)、3.12-2.98(m、3H)、2.85(dd、J=13.9、8.6Hz、1H)、2.32(m、3H)、1.91(s、3H)、1.83-1.68(m、2H)、1.64(ddd、J=12.8、8.4、3.8Hz、1H)、1.16(s、6H)、1.10(d、J=6.9Hz、3H)、0.96(d、J=6.5Hz、3H)、0.92(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 200.54、176.85、173.68、173.44、168.22、155.38、143.62、137.71、131.90、131.68、130.86、129.81、129.39、126.00、123.23、122.47、121.60、113.40、78.80、75.37、56.60、56.35、47.77、44.68、44.12、41.94、39.86、38.72、38.67、37.85、28.73、25.87、23.49、23.25、23.17、22.59、21.94、17.40.HRMS(ES)計算値C3854ClNS[M+H]776.3454、実測値776.3457。
8.生体触媒クリプトフィシン合成および類似体の特性評価
一般的な手順分析スケール反応.
1.5mLのエッペンドルフチューブに、DMSO中に懸濁したリン酸緩衝液(pH=7.2、100mM、300μL)、DMSO(5%)、およびセコ基質(50μM)を添加した。次いで、これを、CrpTE酵素(リン酸緩衝液中、pH=7.2 100mM、0.5μM)で処理し、30℃で12時間振盪した。反応が完了すると、水層を0.300mLの酢酸エチルで抽出し、150μLを取り出し、HPLCバイアルに直接乾燥させ、70μLのメタノール中に再懸濁した。これを、TOF-MSでの分析に使用した。
一般的な手順半分取スケール反応.
250mLのエルレンマイヤーフラスコにDMSO(5%)を添加し、基質(75μM)をDMSO中に懸濁した。CrpTE酵素(0.5μM)で処理する前に、これをリン酸緩衝液(pH=7.2、100mM)で希釈し、30℃で20分間温めた。アセトンで1:1v/vに希釈する前に、反応物を100RPMで、30℃で12時間振盪し、冷凍庫で-20℃まで冷却した。沈殿したタンパク質をセライトを通して濾過し、アセトンで洗浄し、有機物を減圧下で除去し、残りの水層をDCM 3×20mLで抽出した。有機物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。反応物を、3mL/分の流量で20~80%水/アセトニトリル勾配を使用するHydroRP C18(250×10.0mm、4ミクロン)を使用して精製した。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6-メチル-16-((R,E)-4-(ピリジン-2-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25b)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.46(dd、J=5.0、0.9Hz、1H)、7.78(td、J=7.7、1.8Hz、1H)、7.48(d、J=7.9Hz、1H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.26(ddd、J=7.5、5.0、1.1Hz、1H)、7.17(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.5Hz、1H)、6.71(ddd、J=15.1、11.1、3.9Hz、1H)、6.61-6.57(m、2H)、5.93(dd、J=15.1、1.9Hz、1H)、5.09(ddd、J=11.3、6.9、1.9Hz、1H)、4.93(dd、J=9.9、3.6Hz、1H)、4.52(dd、J=11.3、3.9Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.58(dd、J=13.8、3.3Hz、1H)、3.27(dd、J=13.8、3.0Hz、1H)、3.18(dd、J=14.5、3.9Hz、1H)、2.80-2.73(m、2H)、2.73-2.65(m、2H)、2.39(dt、J=14.5、11.2Hz、1H)、1.69-1.52(m、2H)、1.34(ddd、J=14.1、8.8、3.6Hz、1H)、1.18(d、J=7.1Hz、6H)、0.74(d、J=6.5Hz、3H)、0.71(d、J=6.6Hz、3H)。13C NMR(151MHz、CDOD) δ 177.53、174.04、172.22、168.33、156.60、155.36、149.99、143.41、138.74、137.58、132.23、132.10、131.49、129.28、125.62、123.71、123.27、122.82、113.50、78.48、72.86、57.35、56.60、43.46、41.19、40.88、38.98、37.99、36.36、5.62、23.20、21.66、17.53、15.06.HRMS(ES)計算値C3442ClN[M+H]640.2784、実測値640.2788。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6-メチル-16-((R,E)-4-(ピリジン-3-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25c)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.53(d、J=2.2Hz、1H)、8.38(dd、J=4.8、1.6Hz、1H)、7.92(d、J=8.0Hz、1H)、7.40(dd、J=8.0、4.9Hz、1H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.17(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.4Hz、1H)、6.71(ddd、J=15.1、11.2、3.9Hz、1H)、6.53(d、J=15.9Hz、1H)、6.30(dd、J=15.9、8.9Hz、1H)、5.93(dd、J=15.2、1.9Hz、1H)、5.08(ddd、J=11.2、7.2、1.9Hz、1H)、4.93(dd、J=9.9、3.7Hz、1H)、4.52(dd、J=11.2、3.9Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.58(dd、J=13.8、3.3Hz、1H)、3.27(dd、J=13.8、3.0Hz、1H)、3.18(dd、J=14.5、3.9Hz、1H)、2.80-2.63(m、4H)、2.37(dt、J=14.4、11.1Hz、1H)、1.69-1.55(m、2H)、1.31(ddd、J=14.1、8.9、3.7Hz、1H)、1.19(d、J=3.5Hz、3H)、1.18(d、J=2.9Hz、3H)、0.74(d、J=6.5Hz、3H)、0.70(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 180.30、177.53、174.03、172.21、168.33、155.36、148.71、148.40、143.42、135.55、134.96、134.86、132.21、131.49、129.28、128.77、125.62、125.40、113.49、78.47、72.80、57.36、56.60、43.75、41.18、40.94、38.97、37.88、36.35、25.60、23.18、21.69、17.50、15.06.HRMS(ES)計算値C3442ClN[M+H]640.2784、実測値640.2789
(3S,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6,6-ジメチル-16-((R,E)-4-(ピリジン-3-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25d)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.53(s、1H)、8.38(d、J=4.7Hz、1H)、7.92(dt、J=8.0、1.9Hz、1H)、7.40(dd、J=8.0、4.8Hz、1H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.17(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.4Hz、1H)、6.72(ddd、J=15.2、11.2、3.9Hz、1H)、6.53(d、J=15.9Hz、1H)、6.30(dd、J=16.0、8.9Hz、1H)、5.92(dd、J=15.1、1.9Hz、1H)、5.07(ddd、J=11.1、7.2、1.8Hz、2H)、4.96(dd、J=9.9、3.4Hz、1H)、4.51(dd、J=11.3、3.8Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.46(d、J=13.6Hz、1H)、3.18(dd、J=14.5、3.8Hz、1H)、3.08(d、J=13.7Hz、1H)、2.74(dd、J=14.5、11.4Hz、1H)、2.74-2.62(m、2H)、2.36(dt、J=14.4、11.2Hz、1H)、1.66-1.55(m、2H)、1.37-1.26(m、3H)、1.20(s、3H)、1.18(d、J=6.9Hz、3H)、1.16(s、3H)、0.74(d、J=6.4Hz、3H)、0.70(d、J=6.4Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 180.03、178.94、173.68、172.01、168.22、155.37、148.71、148.40、143.63、135.55、134.85、132.17、131.46、129.26、128.78、125.43、123.28、113.50、78.43、72.58、57.48、56.60、47.39、44.02、43.75、40.92、37.92、36.48、31.64、25.85、23.32、23.29、23.22、21.65、17.49.HRMS(ES)計算値C3544ClN[M+H]654.2941、実測値654.2940。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6-メチル-16-((R,E)-4-(ピリジン-4-イル)ブタン-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25e)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.43(d、J=6.2Hz、2H)、7.42(d、J=6.3Hz、2H)、7.27(d、J=2.1Hz、1H)、7.15(dd、J=8.5、2.1Hz、1H)、6.96(d、J=8.4Hz、1H)、6.69(ddd、J=15.1、11.1、3.9Hz、1H)、6.50-6.47(m、2H)、5.91(dd、J=15.2、1.8Hz、1H)、5.08(dd、J=10.7、8.3Hz、1H)、4.90(dd、J=9.9、3.6Hz、1H)、4.51(dd、J=11.2、3.9Hz、1H)、3.82(s、3H)、3.56(dd、J=13.8、3.3Hz、1H)、3.25(dd、J=13.8、2.9Hz、1H)、3.16(dd、J=14.5、3.9Hz、1H)、2.77-2.62(m、4H)、2.34(dt、J=14.7、11.2Hz、1H)、1.67-1.51(m、2H)、1.28(ddd、J=12.9、8.7、3.5Hz、1H)、1.17(d、J=2.6Hz、3H)、1.16(d、J=2.0Hz、3H)、0.72(d、J=6.4Hz、3H)、0.68(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 177.55、174.02、172.17、168.31、155.36、150.42、147.12、143.33、138.63、132.21、131.49、130.23、129.28、125.66、123.27、122.49、113.49、78.35、72.78、57.36、56.60、43.67、41.17、40.91、38.96、37.88、36.35、25.60、23.15、21.66、17.35、15.06.HRMS(ES)計算値C3442ClN[M+H]640.2784、実測値640.2787。
(3S,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6,6-ジメチル-16-((R,E)-4-(ピリジン-4-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25f)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.45(d、J=5.7Hz、2H)、7.44(d、J=6.3Hz、2H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.17(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.5Hz、1H)、6.72(ddd、J=15.1、11.2、3.9Hz、1H)、6.51(s、1H)、6.50(d、J=4.6Hz、1H)、5.92(dd、J=15.1、1.9Hz、1H)、5.09(ddd、J=11.3、7.2、1.9Hz、1H)、4.95(dd、J=9.9、3.3Hz、1H)、4.51(dd、J=11.3、3.7Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.46(d、J=13.6Hz、1H)、3.18(dd、J=14.6、3.8Hz、1H)、3.08(d、J=13.6Hz、1H)、2.74(dd、J=14.5、11.3Hz、1H)、2.74-2.66(m、2H)、2.35(dt、J=14.5、11.2Hz、1H)、1.67-1.54(m、2H)、1.37-1.24(m、1H)、1.19(s、3H)、1.18(d、J=6.9Hz、3H)、1.16(s、3H)、0.74(d、J=6.3Hz、3H)、0.71(d、J=6.4Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 177.59、174.05、172.32、168.36、155.34、143.63、137.86、132.21、131.48、130.26、129.63、129.28、125.50、123.24、122.46、121.98、113.46、78.68、72.91、57.37、56.58、43.68、41.18、40.87、38.95、38.75、37.84、36.36、25.64、23.18、21.67、17.75、15.07.HRMS(ES)計算値C3544ClN[M+H]654.2941、実測値654.2947。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6-メチル-16-((R,E)-4-(ピラジン-2-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25g)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 8.61(d、J=1.5Hz、1H)、8.54(dd、J=2.6、1.5Hz、1H)、8.42(d、J=2.6Hz 1H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.17(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.5Hz、1H)、6.84(dd、J=15.7、8.9Hz、1H)、6.71(ddd、J=15.2、11.2、3.9Hz、1H)、6.64(d、J=15.7Hz、1H)、5.93(dd、J=15.1、1.9Hz、1H)、5.11(ddd、J=11.3、6.8、2.0Hz、1H)、4.94(dd、J=9.7、3.7Hz、1H)、4.53(dd、J=11.2、3.9Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.58(dd、J=13.8、3.4Hz、1H)、3.27(dd、J=13.7、3.0Hz、1H)、3.18(dd、J=14.5、3.9Hz、1H)、2.81-2.72(m、3H)、2.69(ddt、J=14.2、3.7、1.9Hz、1H)、2.38(dt、J=14.6、11.2Hz、1H)、1.70-1.57(m、2H)、1.36(ddd、J=14.1、8.7、3.7Hz、1H)、1.19(d、J=6.9Hz、3H)、1.19(d、J=7.5Hz、3H)、0.76(d、J=6.5Hz、3H)、0.73(d、J=6.5Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 177.53、174.03、172.18、168.32、155.36、152.52、145.69、144.15、143.92、143.33、140.15、132.22、131.48、129.28、128.83、125.65、123.27、113.50、78.45、72.83、57.35、56.60、43.37、41.19、40.91、38.98、38.03、36.35、25.65、23.23、21.74、17.37、15.07.HRMS(ES)計算値[M+H]641.2737、実測値641.2742。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6-メチル-16-((R,E)-4-(1-メチル-1H-ピロゾール-5-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25h)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.36(d、J=2.1Hz、1H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.17(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.4Hz、1H)、6.71(ddd、J=15.1、11.2、3.9Hz、1H)、6.52(d、J=15.8Hz、1H)、6.42(d、J=2.1Hz、1H)、6.14(dd、J=15.8、9.0Hz、1H)、5.93(dd、J=15.1、1.9Hz、1H)、5.07(ddd、J=11.3、6.9、1.9Hz、1H)、4.93(dd、J=9.8、3.6Hz、1H)、4.52(dd、J=11.3、3.9Hz、1H)、3.84(s、6H)、3.59(dd、J=13.8、3.3Hz、1H)、3.27(dd、J=13.8、3.0Hz、1H)、3.18(dd、J=14.5、3.9Hz、1H)、2.79-2.73(m、2H)、2.73-2.62(m、2H)、2.35(dt、J=14.6、11.2Hz、1H)、1.71-1.57(m、2H)、1.35(ddd、J=14.0、8.6、3.5Hz、1H)、1.19(d、J=7.4Hz、3H)、1.17(d、J=6.9Hz、3H)、0.77(d、J=6.4Hz、6H)。13C NMR:(150MHz、CDOD) δ 177.58、174.04、172.22、168.32、155.35、143.40、142.29、139.27、136.81、132.20、131.48、129.28、125.61、123.24、119.18、113.46、103.68、78.39、72.84、57.39、56.58、43.68、41.16、40.96、38.96、37.96、36.51、36.36、25.69、23.25、21.76、17.53、15.08.HRMS(ES)計算値C3343ClN[M+H]643.2893、実測値643.2890。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6-メチル-16-((R,E)-4-(1-メチル-1H-ピロゾール-3-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25i)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.47(d、J=2.3Hz、1H)、7.26(d、J=2.2Hz、1H)、7.15(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.96(d、J=8.5Hz、1H)、6.68(ddd、J=15.1、11.1、3.9Hz、1H)、6.36(d、J=16.0Hz、1H)、6.33(d、J=2.3Hz、1H)、6.05(dd、J=16.0、9.0Hz、1H)、5.90(dd、J=15.2、1.9Hz、1H)、5.00(ddd、J=11.3、7.1、2.0Hz、1H)、4.90(dd、J=10.0、3.6Hz、1H)、4.50(dd、J=11.2、3.9Hz、1H)、3.56(dd、J=13.8、3.3Hz、1H)、3.25(dd、J=13.8、3.0Hz、1H)、3.16(dd、J=14.5、3.9Hz、1H)、2.77-2.71(m、2H)、2.65(ddt、J=14.5、4.1、2.1Hz、1H)、2.61-2.51(m、1H)、2.34(dt、J=14.6、11.2Hz、1H)、1.68-1.61(m、1H)、1.57(ddd、J=14.8、10.0、5.0Hz、1H)、1.35(ddd、J=14.2、9.0、3.6Hz、1H)、1.17(d、J=7.4Hz、3H)、1.12(d、J=6.8Hz、3H)、0.76(d、J=6.5Hz、3H)、0.74(d、J=6.6Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 177.56、174.05、172.28、168.35、155.35、151.52、143.52、133.58、133.15、132.23、131.49、129.28、125.57、124.52、123.26、113.49、103.64、78.52、72.93、57.36、56.60、43.57、41.19、40.83、38.97、38.65、37.89、36.36、25.68、23.16、21.62、17.61、15.06.HRMS(ES)計算値C3547ClN[M+H]671.3206、実測値671.3025。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6-メチル-16-((R,E)-4-(1-メチル-1H-ピロゾール-4-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25j)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.61(s、1H)、7.51(s、1H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.17(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.4Hz、1H)、6.70(ddd、J=15.2、11.2、3.9Hz、1H)、6.27(d、J=15.9Hz、1H)、5.92(dd、J=15.2、1.9Hz、1H)、5.80(dd、J=15.9、8.9Hz、1H)、4.99(ddd、J=11.3、7.1、1.9Hz、1H)、4.92(dd、J=10.0、3.6Hz、1H)、4.52(dd、J=11.3、3.8Hz、1H)、3.84(d、J=1.8Hz、6H)、3.58(dd、J=13.8、3.3Hz、1H)、3.27(dd、J=13.8、2.9Hz、1H)、3.18(dd、J=14.5、3.8Hz、1H)、2.81-2.70(m、2H)、2.69-2.60(m、1H)、2.50(p、J=7.1Hz、1H)、2.33(dt、J=14.5、11.2Hz、1H)、1.71-1.56(m、2H)、1.38(ddd、J=13.2、9.0、3.6Hz、1H)、1.18(d、J=7.5Hz、3H)、1.11(d、J=6.8Hz、3H)、0.78(d、J=6.5Hz、3H)、0.76(d、J=6.6Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 177.59、174.05、172.32、168.36、155.34、143.63、137.86、132.21、131.48、130.26、129.63、129.28、125.50、123.24、122.46、121.98、113.46、78.68、72.91、57.37、56.58、43.68、41.18、40.87、38.95、38.75、37.84、36.36、25.64、23.18、21.67、17.75、15.07.HRMS(ES)計算値C3343ClN[M+H]643.2893、実測値643.2890。
(3S,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-6,6-ジメチル-16-((R,E)-4-(1-メチル-1H-ピロゾール-4-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) 7.60(s、1H)、7.51(s、1H)、7.27(d、J=2.1Hz、1H)、7.16(dd、J=8.5、2.2Hz、1H)、6.97(d、J=8.5Hz、1H)、6.70(ddd、J=15.2、11.2、3.9Hz、1H)、6.27(d、J=15.9Hz、1H)、5.90(dd、J=15.1、1.9Hz、1H)、5.79(dd、J=15.9、8.9Hz、1H)、4.97(ddd、J=11.3、7.1、1.6Hz、1H)、4.94(dd、J=9.9、3.4Hz、1H)、4.50(dd、J=11.4、3.7Hz、1H)、3.83(s、3H)、3.83(s、3H)、3.45(d、J=13.6Hz、1H)、3.17(dd、J=14.5、3.7Hz、1H)、3.07(d、J=13.6Hz、1H)、2.73(dd、J=14.5、11.4Hz、1H)、2.65(dt、J=14.7、2.4Hz、1H)、2.50(h、J=7.2Hz、1H)、2.32(dt、J=14.4、11.2Hz、1H)、1.68-1.57(m、2H)、1.43-1.36(m、1H)、1.19(s、3H)、1.15(s、3H)、1.11(d、J=6.9Hz、3H)、0.77(t、J=6.7Hz、6H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 178.97、173.70、172.12、168.25、155.37、143.83、137.86、132.17、131.46、130.26、129.63、129.26、125.33、123.27、122.48、121.98、113.49、78.65、72.69、57.47、56.59、47.40、44.01、43.68、40.85、38.75、37.88、36.49、25.90、23.32、23.28、23.20、21.64、17.74.HRMS(ES)計算値C3445ClN[M+H]656.2977、実測値656.2973。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-3-イソブチル-16-((R,E)-4-(1-イソプロピル-1H-ピロゾール-4-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-6-メチル-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25l)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.70(s、1H)、7.53(s、1H)、7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.17(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.5Hz、1H)、6.70(ddd、J=15.1、11.2、3.9Hz、1H)、6.28(d、J=15.8Hz、1H)、5.92(dd、J=15.2、1.9Hz、1H)、5.79(dd、J=15.9、8.9Hz、1H)、4.98(ddd、J=11.2、7.5、2.0Hz、1H)、4.91(dd、J=10.0、3.5Hz、1H)、4.52(dd、J=11.2、3.8Hz、1H)、4.47(p、J=6.7Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.58(dd、J=13.8、3.3Hz、1H)、3.27(dd、J=13.7、3.0Hz、1H)、3.18(dd、J=14.5、3.8Hz、1H)、2.79-2.71(m、2H)、2.71-2.63(m、1H)、2.50(h、J=7.2Hz、1H)、2.33(dt、J=14.5、11.2Hz、1H)、1.72-1.54(m、2H)、1.46(d、J=6.7Hz、6H)、1.37(ddd、J=14.2、9.0、3.6Hz、1H)、1.18(d、J=7.4Hz、3H)、1.12(d、J=6.9Hz、3H)、0.77(d、J=6.5Hz、3H)、0.74(d、J=6.6Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 177.60、174.05、172.33、168.37、155.35、143.64、137.40、132.21、131.48、130.12、129.28、126.34、125.51、123.25、122.67、121.38、113.46、78.67、72.93、57.38、56.59、55.07、43.80、41.18、40.87、38.96、37.85、36.37、25.64、23.31、23.09、21.70、17.79、15.07.HRMS(ES)計算値C3547ClN[M+H]671.3206、実測値671.3025。
(3S,6R,10R,16S,E)-10-(3-クロロ-4-メトキシベンジル)-16-((R,E)-4-(3,5-ジメチルイソオキサゾール-4-イル)ブタ-3-エン-2-イル)-3-イソブチル-6-メチル-1,4-ジオキサ-8,11-ジアザシクロヘキサデック-13-エン-2,5,9,12-テトラオン(25m)。
セミ分取スケール反応の一般的な手順に従って、反応を実行し、精製した。H NMR(600MHz、CDOD) δ 7.28(d、J=2.2Hz、1H)、7.17(dd、J=8.4、2.2Hz、1H)、6.98(d、J=8.4Hz、1H)、6.69(ddd、J=15.1、11.1、3.9Hz、1H)、6.23(d、J=16.2Hz、1H)、5.93(dd、J=15.1、1.9Hz、1H)、5.80(dd、J=16.2、8.9Hz、1H)、5.06(ddd、J=11.3、6.7、1.9Hz、1H)、4.93(dd、J=9.7、3.8Hz、1H)、4.51(dd、J=11.2、3.9Hz、1H)、3.84(s、3H)、3.57(dd、J=13.7、3.3Hz、1H)、3.27(dd、J=13.8、3.0Hz、1H)、3.17(dd、J=14.5、3.9Hz、1H)、2.80-2.71(m、2H)、2.67(ddt、J=14.6、4.0、2.0Hz、1H)、2.58(dt、J=8.8、6.6Hz、1H)、2.40(s、3H)、2.35(dt、J=14.5、11.4Hz、1H)、2.28(s、3H)、1.70-1.53(m、2H)、1.33(ddd、J=14.1、8.7、3.8Hz、1H)、1.18(d、J=7.4Hz、3H)、1.15(d、J=6.9Hz、3H)、0.79(d、J=3.7Hz、3H)、0.78(d、J=3.8Hz、3H)。13C NMR(150MHz、CDOD) δ 177.53、174.04、172.23、168.34、166.95、159.53、155.35、143.40、134.36、132.19、131.48、129.29、125.65、123.24、120.19、113.78、113.46、78.53、72.77、57.40、56.58、44.22、41.16、41.02、38.95、37.87、36.35、25.62、23.20、21.77、17.83、15.07、11.55、11.45.HRMS(ES)計算値C3444ClN[M+H]658.2890、実測値658.2893。
一般的なタンパク質発現および精製手順
タンパク質は、変更されたプロトコルを使用して成長および精製された。12pET-28 b(+)-CrpTE構築物をBL21(DE3)に形質転換し、50μg/mLカナマイシンを補充したLB寒天プレート上で、37℃で一晩増殖させた。コロニーを採取し、50μg/mLカナマイシンを補充した25mL LBブロスで、37℃で一晩増殖させた。50μg/mLのカナマイシンを含む6リットルのTB発現培地にそれぞれ、4mLの一晩培養物を接種し、OD600が1.2に達するまで約5時間インキュベートした(37℃、200rpm)。フラスコを振盪機から取り出し、氷浴で15分間冷却した(温度約20℃)。フラスコを振盪に戻し、100μMのIPTGを添加してタンパク質発現を開始し、20℃で18時間進行させた。6,000xgで30分間遠心分離して細胞を採取した。
次いで、細胞ペレットを溶解緩衝液(10mL/g細胞ペレット、100mMリン酸ナトリウム、20mMイミダゾール、300mM NaCl、pH8)中に再懸濁し、1mg Dnase(Sigma)で処理した。溶液を氷上に置き、超音波処理(50秒休止で12×10秒)に晒した。次いで、懸濁液を4℃で30分間、50,000×gで遠心分離した。上清を回収し、0.45μmフィルターを通した後、10mL NiNTAレジンカラムに充填した。カラムを10カラム容量の洗浄緩衝液(100mMリン酸ナトリウム緩衝液、50mMイミダゾール、300mM NaCl、pH8)で洗浄し、タンパク質を15mL溶出緩衝液(100mMリン酸ナトリウム、300mMイミダゾール、300mM NaCl、pH8)を使用して溶出した。次いで、溶出液を2.5mLに濃縮し、PD-10緩衝液交換/脱塩カラム(ストレージバッファー、100mMリン酸ナトリウム、150mM NaCl、pH7.2で事前に平衡化)に晒し、液体窒素で瞬間冷凍し、保存のために-80℃に置いた。試料をNuPAGE4~12%ビス-トリスタンパク質ゲルで実行し、純度を確認した。
実施例2の参照
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実施例3
セコクリプトフィシン鎖伸長中間体の合成.
CrpTEの基質範囲を試験し、ならびに新規のクリプトフィシンマクロラクトンを生成するために、ユニットAのアリール基の後期多様化に適したNAc活性化セコ鎖伸長中間体の拡張可能な合成を開発した。類似体は、ユニットABおよびユニットCD-NAcを含む2つの主要な中間体を使用して収束的に合成した。ユニットABの製剤化は、以前に報告された鈴木カップリング戦略と同様にキラル補助化学を利用した。38最後のホーナー・ワズワース・エモンスオレフィン化(HWE)を用いて、ユニットAとBの間に重要な接合部を形成した。NAc認識要素を含むユニットCDは、商業的かつ容易に操作されたアミノ酸誘導体のペプチドカップリングによって生成した。
そのために、ユニットAを、N-クロトニルオキサゾリジノン1およびアルデヒド2を含むエバンス不斉アルドールを使用して合成し(図3)、それにより、高いdr(>20:1)で優れた収率が得られ、所望の(2R,3S)付加物が得られた。その後のTBSトリフルオロメタンスルホネートでシリル化して3を生成し、キラル補助剤で還元的開裂によりアルコール4を生成した。39トシル化により5を生成し、水素化トリエチルホウ素リチウムでの連続還元的脱酸素により、所望の中間体6を得た。40この段階で、ビニルボロン酸ピナコールエステルを、Hoveyda-Grubbsクロスメタセシスを介して導入し、将来の多様化のために所望の鈴木ハンドルで7を得た。382,3-ジクロロ-5,6-ジシアノ-1,4-ベンゾキノン(DDQ)によるp-メトキシベンジル(PMB)保護基の除去と、それに続く8へのデスマーチンペルヨージナン(DMP)酸化により、HWEオレフィン化に必要なユニットAアルデヒド断片が得られた。41
ホスホネートパートナー12(図5)を、市販のD-チロシンメチルエステル塩酸塩9で開始して合成し、それは以前に記載されるように4つのステップで10に変換された。42その後のジエチルホスホノ酢酸(11)でのペプチドカップリングにより、所望のホスホネート12が得られた。ここから、HWEオレフィン化条件を探究し、THF中の水素化ナトリウムを使用して最適な条件を得ると、これにより、正しい異性体(全体収率70%、約5:1のE:Z生成物比)の57%の収率で多様化可能なユニットAB断片10が得られた。
ユニットCD-NAcを、市販のロイシン酸15から容易に合成した(図6)。酸官能基の最初のベンジル保護により16が生成され、続いてβ-アミノ酸17または18とカップリングして所望のエステルが生成された。これらのエステルは、H/Pd水素化分解を介して容易に脱保護され、酸19または20を得た。43これらの酸をN-アセチルシステアミンとカップリングさせて、所望のユニットCD断片21または22を得た。
多様化可能な基質13を手に、21または22とのカップリングおよび連続的な鈴木多様化を調査した。不安定な官能基およびラセミ化により、最終的なペプチドカップリングの前に鈴木多様化は不可能であった。基質13の鈴木条件をスクリーニングすると、Pd(dba)およびKPOを利用して、検出可能なラセミ化のない良好から優れた収率で、一連の新規のユニットABクリプトフィシン類似体14a~m(図5)を生成する手順が得られた。
最終的なセコクリプトフィシン鎖伸長中間体の精緻化は、ユニットABとユニットCDとのカップリングを介して達成された(図7)。メチルエステル14a~mの鹸化は、ラセミ化の影響を受けやすいことが証明され、様々な加水分解手順のスクリーニングにより、水酸化トリメチルスズが得られ、これにより、対応する酸が検出可能なラセミ化なしで、良好な収率で提供された(図7)。444M HCl/ジオキサンによる21または22の同時Boc脱保護、およびその後の0℃での1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート、ヘキサフルオロホスフェートアザベンゾトリアゾールテトラメチルウロニウム(HATU)とのペプチドカップリングにより、最小限のラセミ化で、良好な収率で、TBS保護中間体が生成された(7:1~12:1 dr、図7)。ジアステレオマーを、TBS基を除去する前に逆相HPLCを使用して分解した。最後に、アセトニトリル中のHF水溶液を使用したシリル基の脱保護により、所望のセコクリプトフィシンNAc類似体が得られた(図7、23a~m)。
実施例4
ユニットA複素環を有するCrpTEの分析的基質変換アッセイ.
多様化可能な合成を携えて、新しく生成されたユニットA鎖伸長中間体に対するCrpTEの柔軟性の調査を開始した(図2、23a~m)。CrpTE類似体の初期セットには、天然ベンゼン環の代わりに6員環複素環が含まれていた(図2、23b~g)。初期の分析スケール反応は、天然ベンジル基質と比較して、生成物への顕著なターンオーバーを明らかにした。ここでは、天然ベンジル基質(23a)が、9:1の環化:加水分解比で68%の全体的な変換を示した。対照的に、2-、3-、4-およびピラジン基質は、出発物質の完全なターンオーバーと、ほとんど検出不可能なレベルの加水分解副産物を示した(図2、23b、23c、23e、23g)。これは、図8で見られる変換%ならびに環化対加水分解の比率(24b、24c、24e、および24g)に反映され、これらはすべて、天然基質24aと比較した場合、大幅により大きかった(91~96%の変換、>10:1の環化:加水分解比率)。
非天然ユニットA類似体のセットは、様々なアルキル鎖を有する5員環芳香族複素環を含むように拡大された。2-、3-、および4-メチルピラゾール誘導体(23h~j)を合成し、ベンジル基質23aを対照として利用して、同じ分析アッセイで試験した。2-メチルピラゾールおよび3-メチルピラゾール基は、85%および84%で以前の6員環複素環よりもわずかに低い変換%を示した(図8、24hおよび24i)。これらの基質は6員環類似体よりも効率的に処理されていないにもかかわらず、それらは、野生型CrpTEによって触媒される、天然基質よりも対応するデプシペプチドクリプトフィシン類似体へのより高い変換%を保持する。興味深いことに、4-メチルピラゾール環(23j)を組み込むと、測定可能な出発物質または加水分解副生成物を含まない、生成物へのほぼ完全な変換が示された。
より大きなアルキル鎖を組み込むことにより、4-イソプロピルピラゾール基(図2、23i)は、CrpTE結合ポケットの潜在的なサイズ制限に関する重要な洞察を提供した。加水分解生成物は観察されなかったが、反応終了後の出発物質の不完全な消費は、生成物へのほぼ定量的な変換を示したそのメチル対応物と比較して低い変換%(83%)をもたらした。このより大きなアルキル置換基は、この類似体で見られる全体的な変換の低下につながる酵素内の立体的制約を示し得る。最後に、ジメチルイソオキサゾール基質23mを調べた。この化合物は、天然基質と比較して同様の変換%を示し(図8、24m)、かなりの量の出発物質が残っていた。
実施例5
ユニットAクリプトフィシン類似体の単離および特性評価
反応生成物の単離された収率、完全な構造特性、および生物学的評価を得るために、すべての反応は、分析反応と同じ条件を使用して、10mgの半分取スケールで実施した。これらの結果は、分析反応で観察された変換パーセントと密接に対応していた。6員複素環24b、c、e、およびfは、62~66%の良好な収率で単離された(図8)。5員環24h~24j、24i、および24mもまた10mgスケールで実行され、55%~69%で変動する収率で単離された(図8)。これらの化学酵素反応から生成されたすべての新規のクリプトフィシン類似体は、HRMS、HNMR、および13CNMRによって確認され、その後、生物学的活性について試験した。
実施例6
新規のスチレンクリプトフィシン類似体の生物学的評価.
クリプトフィシン類似体の各々は、様々な細胞株にわたる効力の相対比較としてゾーンアッセイを使用して評価され(表1を参照されたい)、各類似体のIC50は、HCT-116ヒト大腸がん細胞株で決定された。初期のモノメチルユニットC類似体の効力は、存在する複素環式環に応じて、活性に有意な変動を示した(図9)。6員環複素環の場合、IC50値は、類似体のピリジルセット内でも広範囲にわたり、2-ピリジル類似体は、3-ピリジル-(24c)および4-ピリジル-(24e)含有類似体(0.860nMおよび0.51nM、図9)よりも3桁少ない、102nMのIC50を示した。5員環は、ほぼ6桁にわたって、IC50値にさらに大きな差を示した。イソオキサゾール環(24m)を含めると、活性が大幅に低下し、IC50値は1.4μMであった。しかしながら、4-メチルピラゾール環(24j)の導入により、低ピコモルの類似体が提供され、これまでに観察された中で最も強力なクリプトフィシン類似体の1つとなった。
Figure 2022549971000056
Figure 2022549971000057
実施例7
Gem-ジメチル類似体の製剤化および生物学的評価.
CrpTE生体触媒で試験するための類似体の本設計をガイドするために本明細書に開示されたデータを利用して、ジェミナルジメチルユニットC類似体を、上位3つの類似体:末端3-ピリジル-、4-ピリジルl-、または4-メチル-ピラゾールを有するユニットAについて本明細書に記載される化学を利用して合成した。ユニットCおよびDの間のエステル結合は、代謝的に不安定であることが知られており、この不安定な位置に隣接する2番目のメチル基の付加は、薬物の半減期を改善することが知られている。45~46ベンジル含有ユニットAにgem-ジメチル(ユニットC)を含めると、加水分解副産物の増加があったことを示した(10:1に対して6:1の環化対加水分解)。37新しい類似体20d、f、およびkは、最初に、加水分解対環化の比率、ならびにそれらのモノメチル対応物への変換%を直接比較するための分析スケールで試験された。3つすべてが、CrpTEとインキュベートしたときに加水分解活性の増加(図2および8)、ならびに未反応の出発物質のより高いパーセンテージを示し、これは、以前の初見と一致している。マクロサイクルへの全体的な変換が低いにもかかわらず、対応する鎖伸長中間体は、天然基質とほぼ同じ効率で処理され、分子のPKSおよびNRPS由来部分の両方に非天然官能基を含む基質に対するCrpTEの顕著な柔軟性をさらに示す。
これらの類似体をまた、ゾーンアッセイおよびHCT-116のIC50の両方で試験した。ジェムジメチル部分を組み込むと、この細胞株の3つの類似体すべての効力の減少がもたらされ、この部位での代謝をブロックする代替的な方法が、より大きな効力の類似体をもたらすという予想をもたらした。
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本明細書の本開示から、本開示の特定の実施形態は、例示の目的で本明細書に記載されているが、本開示の趣旨および範囲から逸脱することなく、様々な修正がなされ得ることが理解されるであろう。

Claims (44)

  1. 式Iの構造を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩であって、
    Figure 2022549971000058
    式中、
    Arが、N、O、およびSから選択される1~3個の環ヘテロ原子を有する5~7員複素環式アリール基であり、任意選択で、C1-5アルキルおよびL-Rから独立して選択される1~3個の置換基で置換されており、
    が、塩素、臭素、もしくはヨウ素であり、
    が、OHもしくはOC(O)CHNHRであり、または
    およびRが一緒に、(1)それらが結合している炭素間の二重結合を示すか、もしくは(2)それらが結合している炭素とβ-エポキシド環を形成し、
    およびRの各々が独立して、H、C1-6アルキル、C0-6アルキレン-OH、もしくはC0-6アルキレン-NH(R)であり、または
    およびRが、それらが結合している炭素原子と一緒に、スピロC3-5シクロアルキルもしくは1個の窒素環原子を有するスピロ3~5員ヘテロシクロアルキルを形成し、
    が、C1-6アルキル、C0-6アルキレン-OH、またはC0-6アルキレン-NH(R)であり、
    Rが、H、C1-6アルキル、またはL-Rであり、
    Lが、リンカーであり、
    が、反応性化学基であり、
    Xが、O、NH、もしくはNMeであり、
    但し、前記化合物または塩が0または1 L-Rを含むことを条件とする、式Iの構造を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  2. Arが、任意選択で、メチルおよびイソプロピルから選択される1~3個の置換基で置換されている、ピリジル、ピラジニル、イミダゾリル、またはオキサゾリルを含む、請求項1に記載の化合物または塩。
  3. (1)Arが、
    Figure 2022549971000059
    であり、Rが、CHであり、Rが、Hであり、
    (2)Arが、
    Figure 2022549971000060
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、
    (3)Arが、
    Figure 2022549971000061
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、
    (4)Arが、
    Figure 2022549971000062
    であり、Rが、CHであり、Rが、Hであり、
    (5)Arが、
    Figure 2022549971000063
    であり、Rが、CHであり、Rが、Hであり、
    (6)Arが、
    Figure 2022549971000064
    であり、Rが、CHであり、Rが、Hであり、
    (7)Arが、
    Figure 2022549971000065
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、
    (8)Arが、
    Figure 2022549971000066
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、
    (9)Arが、
    Figure 2022549971000067
    であり、Rが、CHであり、Rが、Hであり、または
    (10)Arが、
    Figure 2022549971000068
    であり、Rが、CHであり、Rが、Hである、請求項1に記載の化合物または塩。
  4. およびRが一緒に、それらが結合している炭素間の二重結合を示す、請求項1、2、または3に記載の化合物または塩。
  5. (1)Arが、
    Figure 2022549971000069
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、
    (2)Arが、
    Figure 2022549971000070
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、または
    (3)Arが、
    Figure 2022549971000071
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHである、請求項4に記載の化合物または塩。
  6. およびRが一緒に、それらが結合している炭素間にβ-エポキシド環を形成する、請求項1、2、または3に記載の化合物または塩。
  7. (1)Arが、
    Figure 2022549971000072
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、
    (2)Arが、
    Figure 2022549971000073
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、または
    (3)Arが、
    Figure 2022549971000074
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHである、請求項6に記載の化合物または塩。
  8. が、Clであり、Rが、OHである、請求項1、2、または3に記載の化合物または塩。
  9. (1)Arが、
    Figure 2022549971000075
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、
    (2)Arが、
    Figure 2022549971000076
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、または
    (3)Arが、
    Figure 2022549971000077
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHである、請求項8に記載の化合物または塩。
  10. が、Clであり、Rが、OC(O)CHNHである、請求項1、2、または3に記載の化合物または塩。
  11. (1)Arが、
    Figure 2022549971000078
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、
    (2)Arが、
    Figure 2022549971000079
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、または
    (3)Arが、
    Figure 2022549971000080
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHである、請求項10に記載の化合物または塩。
  12. が、NH、NHMe、CH-NH、またはCH-NHMeである、請求項1、2、4、6、8、および10のいずれか一項に記載の化合物または塩。
  13. が、OHまたはCH-OHである、請求項1、2、4、6、8、および10のいずれか一項に記載の化合物または塩。
  14. が、NH、NHMe、(CH)CHNH、または(CH)CHNHMeである、請求項1、2、4、6、8、10、12、および13のいずれか一項に記載の化合物または塩。
  15. Xが、Oである、請求項1~14のいずれか一項に記載の化合物または塩。
  16. Xが、NHまたはNMeである、請求項1~14のいずれか一項に記載の化合物または塩。
  17. 前記構造が、以下からなる群から選択される、請求項1に記載の化合物または塩。
    Figure 2022549971000081
  18. Arが、
    Figure 2022549971000082
    である、請求項1に記載の化合物または塩。
  19. が、OC(O)CHNHL(R)であり、Rが、Clである、請求項1に記載の化合物または塩。
  20. (1)Arが、
    Figure 2022549971000083
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、
    (2)Arが、
    Figure 2022549971000084
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHであり、または
    (3)Arが、
    Figure 2022549971000085
    であり、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、Rが、CH(CHである、請求項19に記載の化合物または塩。
  21. が、NH-LRであり、Rが、Hである、請求項1に記載の化合物または塩。
  22. (1)Arが、
    Figure 2022549971000086
    であり、RおよびRが一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rが、CH(CHであり、
    (2)Arが、
    Figure 2022549971000087
    であり、RおよびRが一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rが、CH(CHであり、または
    (3)Arが、
    Figure 2022549971000088
    であり、RおよびRが一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rが、CH(CH、CH(CHである、請求項21に記載の化合物または塩。
  23. が、NH-LRである、請求項1に記載の化合物または塩。
  24. (1)Arが、
    Figure 2022549971000089
    であり、RおよびRが一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、
    (2)Arが、
    Figure 2022549971000090
    であり、RおよびRが一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHであり、または
    (3)Arが、
    Figure 2022549971000091
    であり、RおよびRが一緒に、二重結合もしくはβ-エポキシドを示し、Rが、CHであり、Rが、HもしくはCHである、請求項23に記載の化合物または塩。
  25. Lが、(a)1~10個のアミノ酸を有するペプチド、(b)1~15個のエチレングリコールモノマーを有するポリエチレングリコール、もしくは(c)β-グルクロン酸、または上記の任意の組み合わせを含む、請求項18~24のいずれか一項に記載の化合物または塩。
  26. 前記アミノ酸が、アラニン(Ala)、シトルリン(Cit)、グルタミン(Gln)、グリシン(Gly)、リジン(Lys)、アセチル-リジン(AcLys)、プロリン(Pro)、フェニルアラニン(Phe)、およびバリン(Val)からなる群から選択される、請求項25に記載の化合物または塩。
  27. Lが、単結合、エステル結合、アミド結合、スルフィド結合、ジスルフィド結合、パラ-アミノベンジル(PAB)基を介して、またはパラ-アミノベンジルオキシカルボニル(PABC)基を介して結合される、請求項18~26のいずれか一項に記載の化合物または塩。
  28. が、マレイミド基、マレイミドカプロイル基、マレイミドPEG基、ブロモアセトアミド基、N-ヒドロキシスクシンイミドエステル、O-アルキルヒドロキシルアミン、またはそれらの組み合わせを含む、請求項16~27のいずれか一項に記載の化合物または塩。
  29. 請求項1~28のいずれか一項に記載の化合物または塩を生成する方法であって、前記化合物または塩を形成するための大環状化に好適な条件下で、セコクリプトフィシン中間体をクリプトフィシンチオエステラーゼと接触させることを含む、方法。
  30. 前記大環状化が、大環状ラクトン化である、請求項29に記載の方法。
  31. 前記クリプトフィシンチオエステラーゼが、ポリケチドシンターゼタンパク質複合体、非リボソームタンパク質シンテターゼタンパク質複合体、またはハイブリッドポリケチドシンターゼ/非リボソームペプチドシンテターゼタンパク質複合体に由来する、請求項30に記載の方法。
  32. 前記クリプトフィシンチオエステラーゼが、ハイブリッドポリケチドシンターゼ/非リボソームペプチドシンテターゼタンパク質複合体に由来する、請求項31に記載の方法。
  33. 前記セコクリプトフィシンをクリプトフィシンP450と接触させて、R、R、およびそれらが結合している炭素の間にβエポキシド環を形成することをさらに含む、請求項29に記載の方法。
  34. 前記クリプトフィシンP450が、クリプトフィシンエポキシダーゼである、請求項33に記載の方法。
  35. 請求項1~28のいずれか一項に記載の化合物または塩、および薬学的に許容される賦形剤を含む、薬学的組成物。
  36. 請求項18~28のいずれか一項に記載の化合物もしくは塩、およびペプチド、タンパク質、または抗体を含む、コンジュゲート。
  37. 前記抗体および前記化合物または塩が、前記化合物または塩の前記反応性化学基および前記抗体上の相補的反応性基を介して共有結合されている、請求項36に記載のコンジュゲート。
  38. 前記抗体上の前記相補的反応性基が、アミンを含む、請求項37に記載のコンジュゲート。
  39. 前記アミンが、前記抗体上のリジンのε-アミンである、請求項38に記載のコンジュゲート。
  40. 前記抗体が、モノクローナル抗体またはナノボディである、請求項36~39のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
  41. 前記ナノボディが、単一ドメイン抗体またはラクダ科動物抗体である、請求項40に記載のコンジュゲート。
  42. 前記モノクローナル抗体が、ブレンツキシマブ、セツキシマブ、ゲムツズマブ、パニツムマブ、オファツムマブ、リツキシマブ、またはトラスツズマブである、請求項40に記載のコンジュゲート。
  43. がんの治療における、請求項1~28のいずれか一項に記載の化合物もしくは塩、または請求項37~42のいずれか一項に記載のコンジュゲートの使用。
  44. 前記がんが、結腸、乳房、白血病、前立腺、卵巣、中枢神経系、または非小細胞肺がんである、請求項43に記載の使用。
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