JP2022537359A - Mage-a4 t細胞受容体およびその使用方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2019年6月18日に出願された米国仮特許出願第62/862,726号、および2019年7月9日に出願された米国仮特許出願第62/871,793号の優先権を主張する。前述の出願の各々の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、ASCII形式で電子的に提出されている配列表を含み、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。2020年6月15日に作成された当該ASCIIコピーは、118003_00320_SL.txtと名付けられ、サイズは344,832バイトである。
MAGE-A4抗原に特異的に結合するT細胞受容体に基づく新規標的化剤、ならびにかかる薬剤を治療および診断の設定において製造および使用するための方法に関して当技術分野で満たされていない要求がある。
N1-N2-N3-N4-N5-N6-N7-N8-N9-N10-N11-N12-N13-N14-N15(式I)
のアミノ酸配列を含み、
式中、N1は、非極性アミノ酸であり、
N2は、Valであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N3は、Tyr、Gly、Leu、Val、Glu、Met、Ala、またはPheであり、
N4は、Arg、Glu、Ser、Asn、Gln、Lys、Asp、Gly、またはMetであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N5は、Ser、Arg、Glu、Leu、Ala、Asp、Pro、Met、Gly、またはLysであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N6は、Ala、Asp、Gly、Ser、Val、Pro、Leu、Tyr、またはThrであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N7は、Thr、Pro、Ser、Glu、Asp、Trp、Arg、Asn、Ile、Gln、またはLeuであり、
N8は、His、Trp、Thr、Lys、Tyr、またはAlaであり、
N9は、Asn、Gly、Lys、Ile、Ser、またはArgであり、
N10は、Gln、Lys、Gly、Thr、Leu、Asp、またはSerであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N11は、Phe、Asn、Thr、Tyr、Ala、Leu、Met、またはGluであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N12は、Lys、Phe、Tyr、またはAspであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N13は、LysまたはGlyであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N14は、Thr、Leu、またはTyrであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N15は、Tyr、Gln、Ile、Thr、Val、またはArgである。
N1-N2-N3-N4-N5-N6-N7-N8-N9-N10-N11-N12-N13-N14-N15-N16-N17-N18(式II)
のアミノ酸配列を含み、
式中、N1は、AlaまたはSerであり、
N2は、Ala、Ser、またはThrであり、
N3は、Ser、Gly、またはTrpであり、
N4は、Leu、Tyr、Trp、Asp、Phe、Gly、Pro、またはHisであり、
N5は、GlyまたはAspであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N6は、PheまたはArgであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N7は、Trp、Phe、Asp、Pro、Tyr、Gly、Thr、Ser、またはValであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N8は、Pro、Arg、Asp、Tyr、Gln、Asn、またはGlyであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N9は、Aspであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N10は、Argであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N11は、Gly、Ala、またはThrであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N12は、Ser、Trp、Thr、Gly、Val、Leu、Arg、Met、Tyr、またはGlnであり、
N13は、Glyであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N14は、Asn、Asp、Gly、Thr、Pro、Gln、またはHisであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N15は、Thr、Ser、Glu、Asn、Tyr、Gln、Asp、またはProであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N16は、Glu、Pro、Lys、Thr、Ala、Gly、またはGlnであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N17は、Ala、Leu、Ile、Tyr、またはGlnであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N18は、Phe、His、Tyr、またはThrである。
本発明がより容易に理解され得るようにするため、特定の用語が最初に定義される。さらに、パラメータの値または値の範囲が列挙されるときはいつでも、列挙された値の中間の値および範囲も本発明の一部であることが意図されることに留意されたい。
T細胞は、他の免疫細胞型(多形核、好酸球、好塩基球、肥満細胞、B細胞、NK細胞)とともに、免疫系の細胞成分を構成する細胞のサブグループである。生理的条件下では、T細胞は、免疫監視および外来抗原の排除において機能する。しかし、病理学的条件下では、T細胞が疾患の原因および伝播に大きな役割を果たすという説得力のある証拠がある。これらの障害では、中枢性または末梢性のいずれかのT細胞免疫寛容の破壊が、自己免疫疾患の原因における基本的なプロセスである。
5、331、347、363、379、395、411、427、443、459、475、491、507、523、539、555、571、587、および603からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR3、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するその実質的に類似の配列と、を含む特徴、(x)配列番号7/15、23/31、39/47、55/63、71/79、87/95、103/111、119/127、135/143、151/159、167/175、183/191、199/207、215/223、231/239、247/255、263/271、279/287、295/303、311/319、327/335、343/351、359/367、375/383、391/399、407/415、423/431、439/447、455/463、471/479、487/495、503/511、519/527、535/543、551/559、567/575、583/591、599/607からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するその実質的に類似の配列を含む特徴、(xi)配列番号87/31、23/95、231/607、231/223、231/591、231/255、231/271、231/79、231/47、231/399、599/239、599/223、599/591、599/255、599/271、599/79、599/47、599/399、215/239、215/607、215/591、215/255、215/271、215/79、215/47、215/399、583/239、583/607、583/223、583/255、583/271、583/79、583/47、583/399、247/239、247/607、247/223、247/591、247/271、247/79、247/47、247/399、263/239、263/607、263/223、263/591、263/255、263/79、263/47、263/399、71/239、71/607、71/223、71/591、71/255、71/271、71/47、71/399、39/239、39/607、39/223、39/591、39/255、39/271、39/79、39/399、391/239、391/607、391/223、391/591、391/255、391/271、391/79、391/47、439/127、439/319、439/287、439/15、439/111、439/383、439/191、439/511、439/527、439/559、439/207、119/447、119/319、119/287、119/15、119/111、119/383、119/191、119/511、119/527、119/559、119/207、311/447、311/127、311/287、311/15、311/111、311/383、311/191、311/511、311/527、311/559、311/207、279/447、279/127、279/319、279/15、279/111、279/383、279/191、279/511、279/527、279/559、279/207、7/447、7/127、7/319、7/287、7/111、7/383、7/191、7/511、7/527、7/559、7/207、103/447、103/127、103/319、103/287、103/15、103/383、103/191、103/511、103/527、103/559、103/207、375/447、375/127、375/319、375/287、375/15、375/111、375/191、375/511、375/527、375/559、375/207、183/447、183/127、183/319、183/287、183/15、183/111、183/383、183/511、183/527、183/559、183/207、503/447、503/127、503/319、503/287、503/15、503/111、503/383、503/191、503/527、503/559、503/207、519/447、519/127、519/319、519/287、519/15、519/111、519/383、519/191、519/511、510/559、519/207、551/447、551/127、551/319、551/287、551/15、551/111、551/383、551/191、551/511、551/527、551/207、199/447、199/127、199/319、199/287、199/15、199/111、199/383、199/191、199/511、199/527、および199/559からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するその実質的に類似の配列を含む特徴、ならびに/あるいは(xii)予測されるオフターゲットペプチドを発現する細胞に結合しない特徴、のうちの1つ以上を示す。
836、860/852、および860/868からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するその実質的に類似の配列を含む特徴、ならびに/あるいは(xii)予測されるオフターゲットペプチドを発現する細胞に結合しない特徴、のうちの1つ以上を示す。
本発明は、本発明のMAGE-A4 TCR、または本発明のMAGE-A4 TCRを含む免疫エフェクター細胞を含む、治療用組成物を提供する。本発明による治療用組成物は、好適な担体と、賦形剤と、改善された移送、送達、耐性などをもたらすために製剤に組み込まれる他の薬剤と、ともに投与される。多くの適切な製剤は、すべての製薬化学者に知られている処方集であるRemington’s Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Company,Easton,PAに認めることができる。これらの製剤には、例えば、粉末、ペースト、軟膏、ゼリー、ワックス、油、脂質、ベシクル含有脂質(カチオン性またはアニオン性)(LIPOFECTIN(商標)など)、DNAコンジュゲート、無水吸収ペースト、水中油および油中水エマルション、エマルションカーボワックス(種々の分子量のポリエチレングリコール)、半固体ゲル、ならびにカーボワックス含有半固体混合物が含まれる。Powell et al.”Compendium of excipients for parenteral formulations”PDA(1998)J Pharm Sci Technol 52:238-311も参照されたい。
本明細書に記載の方法、または当該技術分野で既知の他の方法を使用して、本明細書に記載のT細胞を発現するTCRを投与することによって対象で誘導される抗腫瘍免疫応答は、感染細胞を殺傷することができる細胞傷害性T細胞、制御性T細胞、およびヘルパーT細胞応答によって媒介される細胞免疫応答を含み得る。B細胞を活性化し、したがって抗体産生をもたらすことができるヘルパーT細胞によって主に媒介される体液性免疫応答も誘導され得る。様々な技術が本発明の組成物によって誘導される免疫応答のタイプを分析するために使用され得、それらは当該技術分野において十分に説明されており、例えば、Current Protocols in Immunology,Edited by:John E.Coligan,Ada M.Kruisbeek,David H.Margulies,Ethan M.Shevach,Warren Strober(2001)John Wiley&Sons,NY,N.Y.が挙げられる。
細胞免疫系構成要素についてヒト化されたマウスであるVeloci-T(登録商標)マウス(例えば、参照によりその全内容が本明細書に組み込まれるPCT公開WO2016/164492を参照)を、PBSで希釈し、アジュバント、例えば、完全フロイントアジュバント(CFA、Chondrex,Inc.)と等体積で混合した、ヒトHLA-A2によって特異的に提示されるMAGE-A4(286~294)ペプチド(KVLEHVVRV、配列番号609)で免疫した。免疫したマウスから脾臓懸濁液を得て、解離させた。赤血球をACK溶解緩衝液(Life Technologies)に溶解し、脾細胞をRPMI完全培地に懸濁させた。単離された脾細胞を選別し、MHCとの関連でMAGE-A4(286~294)ペプチドに結合する単一T細胞を、蛍光活性化細胞選別(FACS)によって単離した。単離されたT細胞を単一ウェルプレートに播種し、TCRアルファおよびベータ可変領域特異的PCRプライマーと混合した。各単一T細胞におけるcDNAを、逆転写酵素(RT)反応を介して合成した。次いで、得られた各RT生成物を分割し、その後のTCRベータおよびアルファPCRのために2つの対応するウェルに移した。得られたRT生成物の1つのセットを、最初に、TCRベータ可変領域リーダー配列に特異的な5’縮重プライマー、またはTCRアルファ鎖可変領域リーダー配列に特異的な5’縮重プライマー、およびTCR定常領域に特異的な3’プライマーを使用してPCRによって増幅し、アンプリコンを生成した。次に、TCRベータ可変領域フレームワーク1に特異的な5’縮重プライマー、またはTCRアルファ鎖可変領域フレームワーク1に特異的な5’縮重プライマー、およびTCR定常領域に特異的な3’プライマーを使用してPCRによって再度増幅し、クローニングのためのアンプリコンを生成した。TCRベータおよびアルファ由来のPCR産物を、それぞれベータ定常領域およびアルファ定常領域を含む発現ベクターにクローニングした。全長ベータおよびアルファ鎖対を発現する発現ベクターをCHO細胞にトランスフェクトし、市販のMAGE-A4/HLA四量体試薬(HLA-A02:01MAGE-A4四量体、MBL International Corporation)との結合について試験した。CHO細胞を、可溶性HLA-A2(KVLEHVVRV)(配列番号609)四量体およびマウスTCR定常領域に特異的な抗体(クローンH57-597)(Biolegend、San Diego,CA)とともにインキュベートした。次いで、試料をLSRFortessa X-20(BD Biosciences、San Jose,CA)で分析した。四量体陽性細胞の割合を計算するために、抗原陽性(Ag+)ゲーティングを、FlowJo(LLC、Ashland,OR)を使用して、HLA-A2(KVLEHVVRV)(配列番号609)四量体に結合しない陰性対照TCRに基づいて設定した。すべてのAg+ TCRは、平均蛍光強度(MFI)>250によるAg+ゲーティングで、細胞の≧1%のFlowJo基準を有した。Ag+ TCRを、次世代配列決定によって決定し、同一のTCRアルファおよびベータヌクレオチド配列を発現するTCRの全数を、以下の表1に示す。
細胞免疫系構成要素についてヒト化されたマウスであるVeloci-T(登録商標)マウス(例えば、参照によりその全内容が本明細書に組み込まれるPCT公開WO2016/164492を参照)を、PBSで希釈し、アジュバント、例えば、完全フロイントアジュバント(CFA、Chondrex,Inc.)と等体積で混合した、ヒトHLA-A2によって特異的に提示されるMAGE-A4(230~239)ペプチド(GVYDGREHTV、配列番号612)で免疫した。免疫したマウスから脾臓懸濁液を得て、解離させた。赤血球をACK溶解緩衝液(Life Technologies)に溶解し、脾細胞をRPMI完全培地に懸濁させた。単離された脾細胞を選別し、MHCとの関連でMAGE-A4(230~239)ペプチドに結合する単一T細胞を、蛍光活性化細胞選別(FACS)によって単離した。単離されたT細胞を単一ウェルプレートに播種し、TCRアルファおよびベータ可変領域特異的PCRプライマーと混合した。各単一T細胞におけるcDNAを、逆転写酵素(RT)反応を介して合成した。次いで、得られた各RT生成物を分割し、その後のTCRベータおよびアルファPCRのために2つの対応するウェルに移した。得られたRT生成物の1つのセットを、最初に、TCRベータ可変領域リーダー配列に特異的な5’縮重プライマー、またはTCRアルファ鎖可変領域リーダー配列に特異的な5’縮重プライマー、およびTCR定常領域に特異的な3’プライマーを使用してPCRによって増幅し、アンプリコンを生成した。次に、TCRベータ可変領域フレームワーク1に特異的な5’縮重プライマー、またはTCRアルファ鎖可変領域フレームワーク1に特異的な5’縮重プライマー、およびTCR定常領域に特異的な3’プライマーを使用してPCRによって再度増幅し、クローニングのためのアンプリコンを生成した。TCRベータおよびアルファ由来のPCR産物を、それぞれベータ定常領域およびアルファ定常領域を含む発現ベクターにクローニングした。全長ベータおよびアルファ鎖対を発現する発現ベクターをCHO細胞にトランスフェクトし、市販のMAGE-A4/HLA四量体試薬(HLA-A02:01MAGE-A4四量体、MBL International Corporation)または市販のMAGE-A8/HLA四量体試薬(HLA-A02:01MAGE-A8四量体、MBL International Corporation)との結合について試験した。CHO細胞を、マウスTCR定常領域に特異的な抗体(クローンH57-597)(Biolegend、San Diego,CA)、および可溶性HLA-A2 MAGE-A4(GVYDGREHTV)(配列番号612)四量体または可溶性HLA-A2 MAGE-A8(GLYDGREHSV)(配列番号613)のいずれかとともにインキュベートした。次いで、試料をLSRFortessa X-20(BD Biosciences、San Jose,CA)で分析した。MAGE-A4(230~239)について四量体陽性細胞の割合を計算するために、抗原陽性(Ag+)ゲーティングを、HLA-A2(GVYDGREHTV)(配列番号612)四量体に結合しない陰性対照TCRに基づいて設定した。MAGE-A8について四量体陽性細胞の割合を計算するために、FlowJo(LLC、Ashland,OR)を使用して、抗原陽性(Ag+)ゲーティングを、HLA-A2(GLYDGREHSV)(配列番号613)四量体に結合しない陰性対照TCRに基づいて設定した。すべてのAg+ TCRは、平均蛍光強度(MFI)>250によるAg+ゲーティングで細胞の≧1%のFlowJo基準を有した。しかし、3%などのより厳密なカットオフを使用して、結合アッセイにおいてより優れた挙動を示すAg+ TCRを分離することができた。Ag+ TCRは、次世代配列決定によって決定された。表5は、同一のTCRアルファおよびベータヌクレオチド配列を発現するTCRの全数、Ag+ゲーティングにおける四量体%(MAGE-A4(230~239))、Ag+ゲーティングにおける四量体%(MAGE-A8(232~241))、ならびに後者2つの数値の比(Ag+ゲーティングにおける四量体%(MAGE-A4(230~239))をAg+ゲーティングにおける四量体%(MAGE-A8(232~241))によって除した)である。この比は、MAGE-A4(230~239)結合の特異性の指標である。
本実施例は、本発明の特定のMage-A4 TCRが、A375黒色腫細胞を選択的に死滅させる能力を説明する。
T細胞操作
Pan T細胞を、EasySepヒトT細胞単離キット(StemCell Technologies 17951)を使用して、ヒト末梢血単球細胞(PBMC)から陰性選択によって精製し、次いで凍結保存した。実験0日目に、T細胞を解凍し、200U/mlヒトIL-2および抗CD3/抗CD28活性化ビーズを、1:1のビーズ:細胞比(Life Technologies 111.32D)で含有する培地(10mg/mlゲンタマイシン、4mMのL-グルタミンを補充したCTS OpTmizer培地[Life Technologies A1048501])中に、細胞1×106個/mlで播種した。3日目に、活性化ビーズを除去し、Nucleofector IIbデバイスおよびヒトT細胞ヌクレオフェクションキット(Lonza VVPA-1002)を使用して、TRACおよびTRBC遺伝子座を標的とするsgRNAと複合体化した20mgのCas9タンパク質(Life Technologies A36499)によって細胞5×106個をトランスフェクトした。ヌクレオフェクション後、細胞を、TCRaおよびTCRb発現カセットがヒトTRAC遺伝子座を標的にするように操作されたアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターによって形質導入した。2~3日毎に、細胞を、約1×106個/mlに新鮮な補充培地中に再播種した。TCR構築物の形質導入後の様々な時点で、細胞を表面マーカーおよびペプチド-MHC四量体試薬に対する抗体で染色し、次いでフローサイトメトリーによって分析して形質導入効率を定量化した。
抗原特異的な細胞傷害性T細胞機能を、カルセイン放出アッセイによって評価した。標的腫瘍細胞を、8mMカルセインAM色素(Life Technologies C1430)の存在下で、37℃で30分間標識し、次いで培地で洗浄した。1×104個の標的細胞を、96ウェルプレート中のアッセイウェル毎に、形質導入T細胞または非形質導入(UTD)対照の様々な希釈を用いて一緒に播種した。2時間後、放出された蛍光色素を培養上清中で測定した。自発放出(SR)が、標識された標的細胞を含むがT細胞を含まないウェルで測定され、最大放出(MR)が、0.5%Triton X-100の存在下で、標識された標的細胞を有するウェルで測定された。特異的細胞傷害性のパーセントは、100X(試験放出-SR)/(MR-SR)として決定された。
初代ヒトT細胞を操作して、2つのHLA-A2制限ペプチド(MAGE-A4 286~294(KVLEHVVRV、配列番号609)およびMAGE-A4 230~239(GVYDGREHTV、配列番号294))、またはウイルスタンパク質に由来する無関連なHLA-A2制限ペプチド(HPV)に対するMAGE-A4特異的TCRを発現させた。図1に示すように、ペプチドMHC四量体試薬を使用したフローサイトメトリー分析によって、形質導入されたTCRの発現および予測される抗原特異性が確証された。
本実施例は、ジャーカット細胞におけるTCRシグナル伝達を活性化する本発明の選択されたMage-A4 TCRの能力を説明する。
ジャーカット細胞株生成
内因性TCRαおよびTCRβ発現を欠くジャーカット細胞株を、それらの遺伝子のノックアウトによって生成し、次いで、トランスジェニックTCR構築物の単一コピーCreリコンビナーゼ媒介性挿入を可能にするように操作した。次いで、AP1応答エレメント駆動型ルシフェラーゼレポーターをこの親バイオアッセイ株に組み込んだ。カスタマイズされたTCRα/β発現構築物のCre媒介性挿入によって、TCRバイオアッセイ株を生成した。
TCR構築物を発現するジャーカットバイオアッセイ株を、均一性のためにFACS選別し、次いでペプチド-MHC刺激アッセイで試験した。293T細胞(HLA-A2*01)を、抗原(MAGE-A4 286~294(KVLE))または無関連なペプチド(MAGE-A4 230~239(GVY))の様々な希釈とともにアッセイウェルに播種した。2時間のインキュベーション後、操作されたジャーカット細胞を、3:1のジャーカット細胞:293T細胞比でウェルに添加し、さらに5時間インキュベーションした。ルシフェラーゼレポーター活性は、アッセイ細胞における発光出力を測定することによって決定した。
AP1応答エレメント駆動型ルシフェラーゼ導入遺伝子を有し、MAGE-A4特異的TCR、または無関連な抗原に対するTCR(NY-ESO-1)を発現するように操作されたジャーカットバイオアッセイ株を、ペプチド刺激アッセイで試験した。図4Aおよび図4Bに示すように、HLA-A2*01制限MAGE-A4(286~294(KVLE))に特異的なTCRは、同族(KVLE)ペプチドに対してのみ反応性であったが、無関連なMAGE-A4(230~239(GVY))ペプチドに対して反応性ではなかった。親TCR陰性(TCR-)細胞および無関連なTCR(NY ESOに対する)を発現する細胞は、反応性を示さなかった。加えて、図4Aおよび図4Bは、MAGE-A4特異的TCRによって誘導されるAP1レポーター活性化が用量依存的であったことを示す。
本実施例は、T細胞におけるTCRシグナル伝達を活性化する本発明の選択されたMage-A4 TCRの能力を説明する。
当業者は、日常的な実験のみを使用して、本明細書に記載の本発明の特定の実施形態との多くの均等物を認識するか、または確認することができ、かかる均等物は、以下の特許請求の範囲に包含されることが意図される。本出願全体を通して引用されるすべての参考文献、特許、および公開された特許出願の内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
Claims (90)
- KVLEHVVRV(配列番号609)(MAGE-A4 286~294)のアミノ酸配列を含む、HLA-A2提示がん精巣抗原黒色腫関連抗原4(MAGE-A4)ペプチドに特異的に結合するT細胞受容体(TCR)であって、前記TCRが、相補的決定領域(CDR)3を含むアルファ鎖可変ドメインを含み、前記CDR3が、式I:
N1-N2-N3-N4-N5-N6-N7-N8-N9-N10-N11-N12-N13-N14-N15(式I)
のアミノ酸配列を含み、
式中、N1は、非極性アミノ酸であり、
N2は、Valであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N3は、Tyr、Gly、Leu、Val、Glu、Met、Ala、またはPheであり、
N4は、Arg、Glu、Ser、Asn、Gln、Lys、Asp、Gly、またはMetであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N5は、Ser、Arg、Glu、Leu、Ala、Asp、Pro、Met、Gly、またはLysであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N6は、Ala、Asp、Gly、Ser、Val、Pro、Leu、Tyr、またはThrであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N7は、Thr、Pro、Ser、Glu、Asp、Trp、Arg、Asn、Ile、Gln、またはLeuであり、
N8は、His、Trp、Thr、Lys、Tyr、またはAlaであり、
N9は、Asn、Gly、Lys、Ile、Ser、またはArgであり、
N10は、Gln、Lys、Gly、Thr、Leu、Asp、またはSerであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N11は、Phe、Asn、Thr、Tyr、Ala、Leu、Met、またはGluであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N12は、Lys、Phe、Tyr、またはAspであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N13は、LysまたはGlyであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N14は、Thr、Leu、またはTyrであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N15は、Tyr、Gln、Ile、Thr、Val、またはArgである、T細胞受容体(TCR)。 - N1が、Ala、Ile、またはGlyである、請求項1に記載のTCR。
- KVLEHVVRV(配列番号609)(MAGE-A4 286~294)のアミノ酸配列を含む、HLA-A2提示がん精巣抗原黒色腫関連抗原4(MAGE-A4)ペプチドに特異的に結合するT細胞受容体(TCR)であって、前記TCRが、相補的決定領域(CDR)3を含むベータ鎖可変ドメインを含み、前記CDR3が、式II:
N1-N2-N3-N4-N5-N6-N7-N8-N9-N10-N11-N12-N13-N14-N15-N16-N17-N18(式II)
のアミノ酸配列を含み、
式中、N1は、AlaまたはSerであり、
N2は、Ala、Ser、またはThrであり、
N3は、Ser、Gly、またはTrpであり、
N4は、Leu、Tyr、Trp、Asp、Phe、Gly、Pro、またはHisであり、
N5は、GlyまたはAspであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N6は、PheまたはArgであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N7は、Trp、Phe、Asp、Pro、Tyr、Gly、Thr、Ser、またはValであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N8は、Pro、Arg、Asp、Tyr、Gln、Asn、またはGlyであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N9は、Aspであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N10は、Argであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N11は、Gly、Ala、またはThrであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N12は、Ser、Trp、Thr、Gly、Val、Leu、Arg、Met、Tyr、またはGlnであり、
N13は、Glyであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N14は、Asn、Asp、Gly、Thr、Pro、Gln、またはHisであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N15は、Thr、Ser、Glu、Asn、Tyr、Gln、Asp、またはProであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N16は、Glu、Pro、Lys、Thr、Ala、Gly、またはGlnであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N17は、Ala、Leu、Ile、Tyr、またはGlnであるが、存在しても存在しなくてもよく、
N18は、Phe、His、Tyr、またはThrである、T細胞受容体(TCR)。 - 前記アルファ鎖可変ドメインが、CDR1およびCDR2をさらに含み、前記CDR1が、表2に示されるアルファ鎖可変ドメインCDR1アミノ酸配列のうちのいずれか1つを含み、前記CDR2が、独立して、表2に示されるアルファ鎖可変ドメインCDR2アミノ酸配列のうちのいずれか1つを含む、請求項1または2に記載のTCR。
- 前記ベータ鎖可変ドメインが、CDR1およびCDR2をさらに含み、前記CDR1が、表2に示されるベータ鎖可変CDR1アミノ酸配列のうちのいずれか1つを含み、前記CDR2が、独立して、表2に示されるベータ鎖可変ドメインCDR2アミノ酸配列のうちのいずれか1つを含む、請求項3に記載のTCR。
- 前記TCRが、少なくとも1つのTCRアルファ鎖可変ドメインおよび/または少なくとも1つのベータ鎖可変ドメインを含む、請求項1~5のいずれか一項に記載のTCR。
- 前記TCRが、TCRアルファ鎖可変ドメインおよびTCRベータ鎖可変ドメインを含む、請求項6に記載のTCR。
- 表4に列挙されるアルファ鎖可変ドメイン配列のうちのいずれか1つ内に含まれるアルファ鎖可変ドメインCDR1、CDR2、およびCDR3と、表4に列挙されるベータ鎖可変ドメイン配列のうちのいずれか1つ内に含まれるベータ鎖可変ドメインCDR1、CDR2、およびCDR3と、を含む、請求項3~7のいずれか一項に記載のTCR。
- 表4に列挙されるアルファ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインを含む、請求項1~8のいずれか一項に記載のTCR。
- 表4に列挙されるベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインを含む、請求項1~9のいずれか一項に記載のTCR。
- (a)表4に列挙されるアルファ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインと、(b)表4に列挙されるベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインと、を含む、請求項1~10のいずれか一項に記載のTCR。
- (a)配列番号1、17、33、49、65、81、97、113、129、145、161、177、193、209、225、241、257、273、289、305、321、337、353、369、385、401、417、433、449、465、481、497、513、529、545、561、577、および593からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR1ドメインと、
(b)配列番号2、18、34、50、66、82、98、114、130、146、162、178、194、210、226、242、258、274、290、306、322、338、354、370、386、402、418、434、450、466、482、498、514、530、546、562、578、および594からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR2ドメインと、
(c)配列番号3、19、35、51、67、83、99、115、131、147、163、179、195、211、227、243、259、275、291、307、323、339、355、371、387、403、419、435、451、467、483、499、515、531、547、563、579、および595からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR3ドメインと、
(d)配列番号9、25、41、57、73、89、105、121、137、153、169、185、201、217、233、249、265、281、297、313、329、345、361、377、393、409、425、441、457、473、489、505、521、537、553、569、585、および601からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR1と、
(e)配列番号10、26、42、58、74、90、106、122、138、154、170、186、202、218、234、250、266、282、298、314、330、346、362、378、394、410、426、442、458、474、490、506、522、538、554、570、586、および602からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR2と、
(f)配列番号11、27、43、59、75、91、107、123、139、155、171、187、203、219、235、251、267、283、299、315、331、347、363、379、395、411、427、443、459、475、491、507、523、539、555、571、587、および603からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR3と、を含む、請求項3~11のいずれか一項に記載のTCR。 - 配列番号7/15、23/31、39/47、55/63、71/79、87/95、103/111、119/127、135/143、151/159、167/175、183/191、199/207、215/223、231/239、247/255、263/271、279/287、295/303、311/319、327/335、343/351、359/367、375/383、391/399、407/415、423/431、439/447、455/463、471/479、487/495、503/511、519/527、535/543、551/559、567/575、583/591、および599/607からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対を含む、請求項12に記載のTCR。
- 配列番号87/31、23/95、231/607、231/223、231/591、231/255、231/271、231/79、231/47、231/399、599/239、599/223、599/591、599/255、599/271、599/79、599/47、599/399、215/239、215/607、215/591、215/255、215/271、215/79、215/47、215/399、583/239、583/607、583/223、583/255、583/271、583/79、583/47、583/399、247/239、247/607、247/223、247/591、247/271、247/79、247/47、247/399、263/239、263/607、263/223、263/591、263/255、263/79、263/47、263/399、71/239、71/607、71/223、71/591、71/255、71/271、71/47、71/399、39/239、39/607、39/223、39/591、39/255、39/271、39/79、39/399、391/239、391/607、391/223、391/591、391/255、391/271、391/79、391/47、439/127、439/319、439/287、439/15、439/111、439/383、439/191、439/511、439/527、439/559、439/207、119/447、119/319、119/287、119/15、119/111、119/383、119/191、119/511、119/527、119/559、119/207、311/447、311/127、311/287、311/15、311/111、311/383、311/191、311/511、311/527、311/559、311/207、279/447、279/127、279/319、279/15、279/111、279/383、279/191、279/511、279/527、279/559、279/207、7/447、7/127、7/319、7/287、7/111、7/383、7/191、7/511、7/527、7/559、7/207、103/447、103/127、103/319、103/287、103/15、103/383、103/191、103/511、103/527、103/559、103/207、375/447、375/127、375/319、375/287、375/15、375/111、375/191、375/511、375/527、375/559、375/207、183/447、183/127、183/319、183/287、183/15、183/111、183/383、183/511、183/527、183/559、183/207、503/447、503/127、503/319、503/287、503/15、503/111、503/383、503/191、503/527、503/559、503/207、519/447、519/127、519/319、519/287、519/15、519/111、519/383、519/191、519/511、519/559、519/207、551/447、551/127、551/319、551/287、551/15、551/111、551/383、551/191、551/511、551/527、551/207、199/447、199/127、199/319、199/287、199/15、199/111、199/383、199/191、199/511、199/527、および199/559からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対を含む、請求項12に記載のTCR。
- 請求項1~14のいずれか一項に記載のTCRに対して結合において競合する、TCR。
- 検出可能部分をさらに含む、請求項1~15のいずれか一項に記載のTCR。
- 請求項1~16のいずれか一項に記載のTCRと、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
- 請求項1~16のいずれか一項に記載のTCRを提示する、単離された細胞。
- 請求項1~16のいずれか一項に記載のTCRのアルファ鎖可変ドメインをコードするポリヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
- 請求項1~16のいずれか一項に記載のTCRのベータ鎖可変ドメインをコードするポリヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
- 請求項19または20に記載のポリヌクレオチド分子を含む、ベクター。
- 請求項21に記載のベクターを発現する、単離された細胞。
- MAGE-A4関連疾患または障害を有する対象を治療する方法であって、前記対象に、治療有効量の請求項1~16のいずれか一項に記載のTCR、請求項17に記載の医薬組成物、または請求項18に記載の複数の単離された細胞を投与することを含み、それによって前記対象を治療する、方法。
- 前記MAGE-A4関連疾患または障害が、MAGE-A4関連がんである、請求項23に記載の方法。
- 前記MAGE-A4関連がんが、脂肪肉腫、神経芽細胞腫、骨髄腫、黒色腫、転移性黒色腫、滑膜肉腫、膀胱がん、食道がん、食道扁平上皮がん、肝細胞がん、頭頸部がん、非小細胞肺がん、卵巣がん、卵巣上皮がん、前立腺がん、乳がん、星状細胞腫瘍、多形性膠芽腫、未分化星状細胞腫、脳腫瘍、卵管がん、原発性腹腔がん、進行性固形腫瘍、軟組織肉腫、肉腫、骨髄異形成症候群、急性骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキン病、多発性骨髄腫、転移性固形腫瘍、結腸がん、胃がん(stomach cancer)、胃がん(gastric cancer)、横紋筋肉腫、粘液様円形細胞脂肪肉腫、または再発性非小細胞肺がんである、請求項24に記載の方法。
- 前記TCR、前記医薬組成物、または前記複数の細胞が、前記対象に、第2の治療剤と組み合わせて投与される、請求項23~25のいずれか一項に記載の方法。
- 前記TCR、前記医薬組成物、または前記複数の細胞が、前記対象に皮下、静脈内、皮内、腹腔内、経口、筋肉内、または頭蓋内投与される、請求項23~26のいずれか一項に記載の方法。
- T細胞受容体(TCR)をコードするポリヌクレオチド分子であって、前記TCRが、KVLEHVVRV(配列番号609)(MAGE-A4 286~294)のアミノ酸配列を含むHLA-A2提示がん精巣抗原黒色腫関連抗原4(MAGE-A4)ペプチドに特異的に結合し、前記TCRが、(a)発光アッセイによって決定されるときに、予測されるオフターゲットペプチドを発現する細胞に結合しない特性と、(b)TCR媒介性T細胞シグナル伝達発光バイオアッセイによって決定されるときに、T細胞応答を、患者由来MAGE-A4特異的TCRよりも約2倍大きく活性化する特性と、(c)TCR媒介性T細胞シグナル伝達発光バイオアッセイによって決定されるときに、T細胞応答を、親和性成熟した(例えば、ファージディスプレイによる)MAGE-A4特異的TCRよりも約2倍大きく活性化する特性と、からなる群から選択される特性を有する、ポリヌクレオチド分子。
- 少なくとも1つのTCRアルファ鎖可変ドメインおよび/または少なくとも1つのベータ鎖可変ドメインをコードする、請求項28に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、表4に列挙されるアルファ鎖可変ドメイン配列のうちのいずれか1つ内に含まれるアルファ鎖可変ドメイン相補的決定領域(CDR)1、CDR2、およびCDR3と、表4に列挙されるベータ鎖可変ドメイン配列のうちのいずれか1つ内に含まれるベータ鎖可変ドメインCDR1、CDR2、およびCDR3と、を含む、請求項28に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、表4に列挙されるアルファ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインを含む、請求項29または30に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、表4に列挙されるベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインを含む、請求項28~31のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、(a)表4に列挙されるアルファ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインと、(b)表4に列挙されるベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインと、を含む、請求項28~32のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、
(a)配列番号1、17、33、49、65、81、97、113、129、145、161、177、193、209、225、241、257、273、289、305、321、337、353、369、385、401、417、433、449、465、481、497、513、529、545、561、577、および593からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR1ドメインと、
(b)配列番号2、18、34、50、66、82、98、114、130、146、162、178、194、210、226、242、258、274、290、306、322、338、354、370、386、402、418、434、450、466、482、498、514、530、546、562、578、および594からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、アルファ鎖可変ドメインCDR2ドメインと、
(c)配列番号3、19、35、51、67、83、99、115、131、147、163、179、195、211、227、243、259、275、291、307、323、339、355、371、387、403、419、435、451、467、483、499、515、531、547、563、579、および595からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR3ドメインと、
(d)配列番号9、25、41、57、73、89、105、121、137、153、169、185、201、217、233、249、265、281、297、313、329、345、361、377、393、409、425、441、457、473、489、505、521、537、553、569、585、および601からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR1と、
(e)配列番号10、26、42、58、74、90、106、122、138、154、170、186、202、218、234、250、266、282、298、314、330、346、362、378、394、410、426、442、458、474、490、506、522、538、554、570、586、および602からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR2と、
(f)配列番号11、27、43、59、75、91、107、123、139、155、171、187、203、219、235、251、267、283、299、315、331、347、363、379、395、411、427、443、459、475、491、507、523、539、555、571、587、および603からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR3と、を含む、請求項28~33のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド分子。 - 前記TCRが、配列番号7/15、23/31、39/47、55/63、71/79、87/95、103/111、119/127、135/143、151/159、167/175、183/191、199/207、215/223、231/239、247/255、263/271、279/287、295/303、311/319、327/335、343/351、359/367、375/383、391/399、407/415、423/431、439/447、455/463、471/479、487/495、503/511、519/527、535/543、551/559、567/575、583/591、および599/607からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対を含む、請求項34に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、配列番号87/31、23/95、231/607、231/223、231/591、231/255、231/271、231/79、231/47、231/399、599/239、599/223、599/591、599/255、599/271、599/79、599/47、599/399、215/239、215/607、215/591、215/255、215/271、215/79、215/47、215/399、583/239、583/607、583/223、583/255、583/271、583/79、583/47、583/399、247/239、247/607、247/223、247/591、247/271、247/79、247/47、247/399、263/239、263/607、263/223、263/591、263/255、263/79、263/47、263/399、71/239、71/607、71/223、71/591、71/255、71/271、71/47、71/399、39/239、39/607、39/223、39/591、39/255、39/271、39/79、39/399、391/239、391/607、391/223、391/591、391/255、391/271、391/79、391/47、439/127、439/319、439/287、439/15、439/111、439/383、439/191、439/511、439/527、439/559、439/207、119/447、119/319、119/287、119/15、119/111、119/383、119/191、119/511、119/527、119/559、119/207、311/447、311/127、311/287、311/15、311/111、311/383、311/191、311/511、311/527、311/559、311/207、279/447、279/127、279/319、279/15、279/111、279/383、279/191、279/511、279/527、279/559、279/207、7/447、7/127、7/319、7/287、7/111、7/383、7/191、7/511、7/527、7/559、7/207、103/447、103/127、103/319、103/287、103/15、103/383、103/191、103/511、103/527、103/559、103/207、375/447、375/127、375/319、375/287、375/15、375/111、375/191、375/511、375/527、375/559、375/207、183/447、183/127、183/319、183/287、183/15、183/111、183/383、183/511、183/527、183/559、183/207、503/447、503/127、503/319、503/287、503/15、503/111、503/383、503/191、503/527、503/559、503/207、519/447、519/127、519/319、519/287、519/15、519/111、519/383、519/191、519/511、510/559、519/207、551/447、551/127、551/319、551/287、551/15、551/111、551/383、551/191、551/511、551/527、551/207、199/447、199/127、199/319、199/287、199/15、199/111、199/383、199/191、199/511、199/527、および199/559からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対を含む、請求項34に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、
(a)配列番号4、20、36、52、68、84、100、116、132、148、164、180、196、212、228、244、260、276、292、308、324、340、356、372、388、404、420、436、452、468、484、500、516、532、548、564、580、および596からなる群から選択される核酸配列によってコードされるアルファ鎖可変ドメインCDR1と、
(b)配列番号5、21、37、53、69、85、101、117、133、149、165、181、197、213、229、245、261、277、293、309、325、341、357、373、389、405、421、437、453、469、485、501、517、533、549、565、581、および597からなる群から選択される核酸配列によってコードされるアルファ鎖可変ドメインCDR2と、
(c)配列番号6、22、38、54、70、86、102、118、134、150、166、182、198、214、230、246、262、278、294、310、326、342、358、374、390、406、422、438、454、470、486、502、518、534、550、566、582、および598からなる群から選択される核酸配列によってコードされるアルファ鎖可変ドメインCDR3と、
(d)配列番号12、28、44、60、76、92、108、124、140、156、172、188、204、220、236、252、268、284、300、316、332、348、364、380、396、412、428、444、460、476、492、508、524、540、556、572、588、および604からなる群から選択される核酸配列によってコードされるベータ鎖可変ドメインCDR1と、
(e)配列番号13、29、45、61、77、93、109、125、141、157、173、189、205、221、237、253、269、285、301、317、333、349、365、381、397、413、429、445、461、477、493、509、525、541、557、573、589、および605からなる群から選択される核酸配列によってコードされるベータ鎖可変ドメインCDR2と、
(f)配列番号14、30、46、62、78、94、110、126、142、158、174、190、206、222、238、254、270、286、302、318、334、350、366、382、398、414、430、446、462、478、494、510、526、542、558、574、590、および606からなる群から選択される核酸配列によってコードされるベータ鎖可変ドメインCDR3と、を含む、請求項33に記載のポリヌクレオチド分子。 - 前記TCRが、配列番号8/16、24/32、40/48、56/64、72/80、88/96、104/112、120/128、136/144、152/160、168/176、184/192、200/208、216/224、232/240、248/256、264/272、280/288、296/304、312/320、328/336、344/352、360/368、376/384、392/400、408/416、424/432、440/448、456/464、472/480、488/496、504/512、520/528、536/544、552/560、568/576、584/592、600/608からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメイン核酸配列対を含む、請求項37に記載のポリヌクレオチド分子。
- 請求項28~38のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド分子を含む、ベクター。
- 請求項39に記載のベクターを含む、単離された細胞。
- MAGE-A4関連疾患または障害を有する対象を治療する方法であって、前記対象に、請求項40に記載の複数の細胞を投与することを含み、それによって前記対象を治療する、方法。
- 前記MAGE-A4関連疾患または障害が、MAGE-A4関連がんである、請求項41に記載の方法。
- 前記MAGE-A4関連がんが、脂肪肉腫、神経芽細胞腫、骨髄腫、黒色腫、転移性黒色腫、滑膜肉腫、膀胱がん、食道がん、食道扁平上皮がん、肝細胞がん、頭頸部がん、非小細胞肺がん、卵巣がん、卵巣上皮がん、前立腺がん、乳がん、星状細胞腫瘍、多形性膠芽腫、未分化星状細胞腫、脳腫瘍、卵管がん、原発性腹腔がん、進行性固形腫瘍、軟組織肉腫、肉腫、骨髄異形成症候群、急性骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキン病、多発性骨髄腫、転移性固形腫瘍、結腸がん、胃がん(stomach cancer)、胃がん(gastric cancer)、横紋筋肉腫、粘液様円形細胞脂肪肉腫、または再発性非小細胞肺がんである、請求項43に記載の方法。
- 前記複数の細胞が、前記対象に、第2の治療剤と組み合わせて投与される、請求項41~43のいずれか一項に記載の方法。
- GVYDGREHTV(配列番号612)(MAGE-A4 230~239)のアミノ酸配列を含む、HLA-A2提示がん精巣抗原黒色腫関連抗原4(MAGE-A4)ペプチドに特異的に結合するT細胞受容体(TCR)であって、前記TCRが、配列番号620、636、652、668、684、700、716、732、748、764、780、796、812、828、844、および860のうちのいずれか1つのアルファ鎖可変ドメインとともに含まれる相補的決定領域3(CDR3)を含む、T細胞受容体(TCR)。
- GVYDGREHTV(配列番号612)(MAGE-A4 230~239)のアミノ酸配列を含む、HLA-A2提示がん精巣抗原黒色腫関連抗原4(MAGE-A4)ペプチドに特異的に結合するT細胞受容体(TCR)であって、配列番号628、644、660、676、692、708、724、740、756、772、788、804、820、836、852、および868のうちのいずれか1つのベータ鎖可変ドメイン内に含まれる相補的決定領域3(CDR3)を含む、T細胞受容体(TCR)。
- 前記アルファ鎖可変ドメインが、CDR1およびCDR2をさらに含み、前記CDR1が、表6に示されるアルファ鎖可変ドメインCDR1アミノ酸配列のうちのいずれか1つを含み、前記CDR2が、独立して、表6に示されるアルファ鎖可変ドメインCDR2アミノ酸配列のうちのいずれか1つを含む、請求項45に記載のTCR。
- 前記ベータ鎖可変ドメインが、CDR1およびCDR2をさらに含み、前記CDR1が、表6に示されるベータ鎖可変CDR1アミノ酸配列のうちのいずれか1つを含み、前記CDR2が、独立して、表6に示されるベータ鎖可変ドメインCDR2アミノ酸配列のうちのいずれか1つを含む、請求項46に記載のTCR。
- 前記TCRが、少なくとも1つのTCRアルファ鎖可変ドメインおよび/または少なくとも1つのベータ鎖可変ドメインを含む、請求項45~48のいずれか一項に記載のTCR。
- 前記TCRが、TCRアルファ鎖可変ドメインおよびTCRベータ鎖可変ドメインを含む、請求項49に記載のTCR。
- 表8に列挙されるアルファ鎖可変ドメイン配列のうちのいずれか1つ内に含まれるアルファ鎖可変ドメインCDR1、CDR2、およびCDR3と、表8に列挙されるベータ鎖可変ドメイン配列のうちのいずれか1つ内に含まれるベータ鎖可変ドメインCDR1、CDR2、およびCDR3と、を含む、請求項46~50のいずれか一項に記載のTCR。
- 表8に列挙されるアルファ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインを含む、請求項45~51のいずれか一項に記載のTCR。
- 表8に列挙されるベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインを含む、請求項45~52のいずれか一項に記載のTCR。
- (a)表8に列挙されるアルファ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインと、(b)表8に列挙されるベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインと、を含む、請求項45~53のいずれか一項に記載のTCR。
- (a)配列番号614、630、646、662、678、694、710、726、742、758、774、790、806、822、838、および854からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR1ドメインと、
(b)配列番号615、631、647、663、679、695、711、727、743、759、775、791、807、823、839、および855からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR2ドメインと、
(c)配列番号616、632、648、664、680、696、712、728、744、760、776、792、808、824、840、および856からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR3ドメインと、
(d)配列番号622、638、654、670、686、702、718、734、750、766、782、798、814、830、846、および862からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR1と、
(e)配列番号623、639、655、671、687、703、719、735、751、767、783、799、815、831、847、および863からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR2と、
(f)配列番号624、640、656、672、688、704、720、736、752、768、784、800、816、832、848、および864からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR3と、を含む、請求項46~54のいずれか一項に記載のTCR。 - 配列番号620/628、636/644、652/660、668/676、684/692、700/708、716/724、732/740、748/756、764/772、780/788、796/804、812/820、828/836、844/852、および860/868からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対を含む、請求項55に記載のTCR。
- 配列番号620/628、620/644、620/660、620/676、620/692、620/708、620/724、620/740、620/756、620/772、620/788、620/804、620/820、620/836、620/852、620/868、636/628、636/644、636/660、636/676、636/692、636/708、636/724、636/740、636/756、636/772、636/788、636/804、636/820、636/836、636/852、636/868、652/628、652/644、652/660、652/676、652/692、652/708、652/724、652/740、652/756、652/772、652/788、652/804、652/820、652/836、652/852、652/868、668/628、668/644、668/660、668/676、668/692、668/708、668/724、668/740、668/756、668/772、668/788、668/804、668/820、668/836、668/852、668/868、684/628、684/644、684/660、684/676、684/692、684/708、684/724、684/740、684/756、684/772、684/788、684/804、684/820、684/836、684/852、684/868、700/628、700/644、700/660、700/676、700/692、700/708、700/724、700/740、700/756、700/772、700/788、700/804、700/820、700/836、700/852、700/868、716/628、716/644、716/660、716/676、716/692、716/708、716/724、716/740、716/756、716/772、716/788、716/804、716/820、716/836、716/852、716/868、732/628、732/644、732/660、732/676、732/692、732/708、732/724、732/740、732/756、732/772、732/788、732/804、732/820、732/836、732/852、732/868、748/628、748/644、748/660、748/676、748/692、748/708、748/724、748/740、748/756、748/772、748/788、748/804、748/820、748/836、748/852、748/868、764/628、764/644、764/660、764/676、764/692、764/708、764/724、764/740、764/756、764/772、764/788、764/804、764/820、764/836、764/852、764/868、780/628、780/644、780/660、780/676、780/692、780/708、780/724、780/740、780/756、780/772、780/788、780/804、780/820、780/836、780/852、780/868、796/628、796/644、796/660、796/676、796/692、796/708、796/724、796/740、796/756、796/772、796/788、796/804、796/820、796/836、796/852、796/868、812/628、812/644、812/660、812/676、812/692、812/708、812/724、812/740、812/756、812/772、812/788、812/804、812/820、812/836、812/852、812/868、828/628、828/644、828/660、828/676、828/692、828/708、828/724、828/740、828/756、828/772、828/788、828/804、828/820、828/836、828/852、828/868、844/628、844/644、844/660、844/676、844/692、844/708、844/724、844/740、844/756、844/772、844/788、844/804、844/820、844/836、844/852、844/868、860/628、860/644、860/660、860/676、860/692、860/708、860/724、860/740、860/756、860/772、860/788、860/804、860/820、860/836、860/852、および860/868からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対を含む、請求項55に記載のTCR。
- 検出可能部分をさらに含む、請求項45~57のいずれか一項に記載のTCR。
- 前記単離されたTCRが、5超、10超、15超、20超、50超、100超、200超、300超、400超、500超、600超、700超、800超、900超、または1000超のオンターゲット結合/オフターゲット結合値を有する、請求項45~57のいずれか一項に記載のTCR。
- 前記単離されたTCRが、10超のオンターゲット結合/オフターゲット結合値を有する、請求項61に記載のTCR。
- 前記単離されたTCRが、500超のオンターゲット結合/オフターゲット結合値を有する、請求項61に記載のTCR。
- 請求項45~61のいずれか一項に記載の単離されたTCRに対して結合において競合する、TCR。
- 請求項45~61のいずれか一項に記載のTCRと、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
- 請求項45~61のいずれか一項に記載のTCRを提示する、単離された細胞。
- 請求項45、47、および49~61のいずれか一項に記載のTCRのアルファ鎖可変ドメインをコードするポリヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド分子。
- 請求項46、48、および49~61のいずれか一項に記載のTCRのベータ鎖可変ドメインをコードするポリヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
- 請求項65または66に記載のポリヌクレオチド配列を含む、ベクター。
- 請求項67に記載のベクターを発現する、単離された細胞。
- MAGE-A4関連疾患または障害を有する対象を治療する方法であって、前記対象に、治療有効量の請求項45~61のいずれか一項に記載のTCR、請求項63に記載の医薬組成物、または請求項64に記載の単離された細胞を投与することを含み、それによって前記対象を治療する、方法。
- 前記MAGE-A4関連疾患または障害が、MAGE-A4関連がんである、請求項69に記載の方法。
- 前記MAGE-A4関連がんが、脂肪肉腫、神経芽細胞腫、骨髄腫、黒色腫、転移性黒色腫、滑膜肉腫、膀胱がん、食道がん、食道扁平上皮がん、肝細胞がん、頭頸部がん、非小細胞肺がん、卵巣がん、卵巣上皮がん、前立腺がん、乳がん、星状細胞腫瘍、多形性膠芽腫、未分化星状細胞腫、脳腫瘍、卵管がん、原発性腹腔がん、進行性固形腫瘍、軟組織肉腫、肉腫、骨髄異形成症候群、急性骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキン病、多発性骨髄腫、転移性固形腫瘍、結腸がん、胃がん(stomach cancer)、胃がん(gastric cancer)、横紋筋肉腫、粘液様円形細胞脂肪肉腫、または再発性非小細胞肺がんである、請求項70に記載の方法。
- 前記TCR、前記医薬組成物、または前記細胞が、前記対象に、第2の治療剤と組み合わせて投与される、請求項69~71のいずれか一項に記載の方法。
- 前記投与することが、非経口的である、請求項69~71のいずれか一項に記載の方法。
- T細胞受容体(TCR)をコードするポリヌクレオチド分子であって、前記TCRが、GVYDGREHTV(配列番号612)(MAGE-A4 230~239)のアミノ酸配列を含むHLA-A2提示がん精巣抗原黒色腫関連抗原4(MAGE-A4)ペプチドに特異的に結合し、前記TCRが、(a)発光アッセイによって決定されるときに、予測されるオフターゲットペプチドを発現する細胞に結合しない特性と、(b)フローサイトメトリーアッセイによって決定されるときに、予測されるオフターゲットペプチドを発現する細胞に結合しない特性と、(c)TCR媒介性T細胞シグナル伝達発光バイオアッセイによって決定されるときに、T細胞応答を、患者由来MAGE-A4特異的TCRよりも約2倍大きく活性化する特性と、(d)TCR媒介性T細胞シグナル伝達発光バイオアッセイによって決定されるときに、T細胞応答を、親和性成熟した(例えば、ファージディスプレイによる)MAGE-A4特異的TCRよりも約2倍大きく活性化する特性と、からなる群から選択される特性を有する、ポリヌクレオチド分子。
- 少なくとも1つのTCRアルファ鎖可変ドメインおよび/または少なくとも1つのベータ鎖可変ドメインをコードする、請求項74に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、表8に列挙されるアルファ鎖可変ドメイン配列のうちのいずれか1つ内に含まれるアルファ鎖可変ドメイン相補的決定領域(CDR)1、CDR2、およびCDR3と、表8に列挙されるベータ鎖可変ドメイン配列のうちのいずれか1つ内に含まれるベータ鎖可変ドメインCDR1、CDR2、およびCDR3と、を含む、請求項74に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、表8に列挙されるアルファ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインを含む、請求項75または76に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、表8に列挙されるベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインを含む、請求項74~77のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、(a)表8に列挙されるアルファ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインと、(b)表8に列挙される前記ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列のアミノ酸配列のうちのいずれか1つの全アミノ酸配列に対して少なくとも85%のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインと、を含む、請求項74~78のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、
(a)配列番号614、630、646、662、678、694、710、726、742、758、774、790、806、822、838、および854からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR1ドメインと、
(b)配列番号615、631、647、663、679、695、711、727、743、759、775、791、807、823、839、および855からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR2ドメインと、
(c)配列番号616、632、648、664、680、696、712、728、744、760、776、792、808、824、840、および856からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するアルファ鎖可変ドメインCDR3ドメインと、
(d)配列番号622、638、654、670、686、702、718、734、750、766、782、798、814、830、846、および862からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR1と、
(e)配列番号623、639、655、671、687、703、719、735、751、767、783、799、815、831、847、および863からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR2と、
(f)配列番号624、640、656、672、688、704、720、736、752、768、784、800、816、832、848、および864からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するベータ鎖可変ドメインCDR3と、を含む、請求項74~79のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド分子。 - 前記TCRが、配列番号620/628、636/644、652/660、668/676、684/692、700/708、716/724、732/740、748/756、764/772、780/788、796/804、812/820、828/836、844/852、および860/868からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対を含む、請求項80に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、配列番号620/628、620/644、620/660、620/676、620/692、620/708、620/724、620/740、620/756、620/772、620/788、620/804、620/820、620/836、620/852、620/868、636/628、636/644、636/660、636/676、636/692、636/708、636/724、636/740、636/756、636/772、636/788、636/804、636/820、636/836、636/852、636/868、652/628、652/644、652/660、652/676、652/692、652/708、652/724、652/740、652/756、652/772、652/788、652/804、652/820、652/836、652/852、652/868、668/628、668/644、668/660、668/676、668/692、668/708、668/724、668/740、668/756、668/772、668/788、668/804、668/820、668/836、668/852、668/868、684/628、684/644、684/660、684/676、684/692、684/708、684/724、684/740、684/756、684/772、684/788、684/804、684/820、684/836、684/852、684/868、700/628、700/644、700/660、700/676、700/692、700/708、700/724、700/740、700/756、700/772、700/788、700/804、700/820、700/836、700/852、700/868、716/628、716/644、716/660、716/676、716/692、716/708、716/724、716/740、716/756、716/772、716/788、716/804、716/820、716/836、716/852、716/868、732/628、732/644、732/660、732/676、732/692、732/708、732/724、732/740、732/756、732/772、732/788、732/804、732/820、732/836、732/852、732/868、748/628、748/644、748/660、748/676、748/692、748/708、748/724、748/740、748/756、748/772、748/788、748/804、748/820、748/836、748/852、748/868、764/628、764/644、764/660、764/676、764/692、764/708、764/724、764/740、764/756、764/772、764/788、764/804、764/820、764/836、764/852、764/868、780/628、780/644、780/660、780/676、780/692、780/708、780/724、780/740、780/756、780/772、780/788、780/804、780/820、780/836、780/852、780/868、796/628、796/644、796/660、796/676、796/692、796/708、796/724、796/740、796/756、796/772、796/788、796/804、796/820、796/836、796/852、796/868、812/628、812/644、812/660、812/676、812/692、812/708、812/724、812/740、812/756、812/772、812/788、812/804、812/820、812/836、812/852、812/868、828/628、828/644、828/660、828/676、828/692、828/708、828/724、828/740、828/756、828/772、828/788、828/804、828/820、828/836、828/852、828/868、844/628、844/644、844/660、844/676、844/692、844/708、844/724、844/740、844/756、844/772、844/788、844/804、844/820、844/836、844/852、844/868、860/628、860/644、860/660、860/676、860/692、860/708、860/724、860/740、860/756、860/772、860/788、860/804、860/820、860/836、860/852、および860/868からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメインアミノ酸配列対を含む、請求項80に記載のポリヌクレオチド分子。
- 前記TCRが、
(a)配列番号617、633、649、665、681、697、713、729、745、761、777、793、809、825、841、および857からなる群から選択される核酸配列によってコードされるアルファ鎖可変ドメインCDR1と、
(b)配列番号618、634、650、666、682、698、714、730、746、762、778、794、810、826、842、および858からなる群から選択される核酸配列によってコードされるアルファ鎖可変ドメインCDR2と、
(c)配列番号619、635、651、667、683、699、715、731、747、763、779、795、811、827、843、および859からなる群から選択される核酸配列によってコードされるアルファ鎖可変ドメインCDR3と、
(d)配列番号625、641、657、673、689、705、721、737、753、769、785、801、817、833、849、および865からなる群から選択される核酸配列によってコードされるベータ鎖可変ドメインCDR1と、
(e)配列番号626、642、658、674、690、706、722、738、754、770、786、802、818、834、850、および866からなる群から選択される核酸配列によってコードされるベータ鎖可変ドメインCDR2と、
(f)配列番号627、643、659、675、691、707、723、739、755、771、787、803、819、835、851、および867からなる群から選択される核酸配列によってコードされるベータ鎖可変ドメインCDR3と、を含む、請求項33に記載のポリヌクレオチド分子。 - 前記TCRが、配列番号621/629、637/645、653/661、669/677、685/693、701/709、717/725、733/741、749/757、765/773、781/789、797/805、813/821、829/837、845/853、および861/869からなる群から選択されるアルファ鎖可変ドメイン/ベータ鎖可変ドメイン核酸配列対を含む、請求項83に記載の単離された核酸分子。
- 請求項74~84のいずれか一項に記載の単離された核酸分子のポリヌクレオチド配列を含む、ベクター。
- 請求項85に記載のベクターを含む、単離された細胞。
- MAGE-A4関連疾患または障害を有する対象を治療する方法であって、前記対象に、請求項86に記載の細胞を投与することを含み、それによって前記対象を治療する、方法。
- 前記MAGE-A4関連疾患または障害が、MAGE-A4関連がんである、請求項87に記載の方法。
- 前記MAGE-A4関連がんが、脂肪肉腫、神経芽細胞腫、骨髄腫、黒色腫、転移性黒色腫、滑膜肉腫、膀胱がん、食道がん、食道扁平上皮がん、肝細胞がん、頭頸部がん、非小細胞肺がん、卵巣がん、卵巣上皮がん、前立腺がん、乳がん、星状細胞腫瘍、多形性膠芽腫、未分化星状細胞腫、脳腫瘍、卵管がん、原発性腹腔がん、進行性固形腫瘍、軟組織肉腫、肉腫、骨髄異形成症候群、急性骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキン病、多発性骨髄腫、転移性固形腫瘍、結腸がん、胃がん(stomach cancer)、胃がん(gastric cancer)、横紋筋肉腫、粘液様円形細胞脂肪肉腫、または再発性非小細胞肺がんである、請求項88に記載の方法。
- 前記細胞が、前記対象に、第2の治療剤と組み合わせて投与される、請求項87~89のいずれか一項に記載の方法。
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