JP2022533983A - 網膜細胞を標的とした最適化された遺伝子治療 - Google Patents

網膜細胞を標的とした最適化された遺伝子治療 Download PDF

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Abstract

本開示は、最適化された遺伝子治療ベクターを使用して網膜内の特定の細胞型を標的とする方法に関する。特に、本開示は、網膜細胞を特異的に標的とする遺伝子治療ベクター、ならびに視覚機能障害、網膜変性症、およびCLN病などの視力関連障害を治療する方法を提供する。バッテン病などの視力関連障害を治療するために眼を標的とするためのAAV遺伝子治療の最適化には、さまざまな細胞型の特定の標的化が必要である。本開示は、マウスおよび非ヒト霊長類の網膜における特定の細胞型への導入遺伝子の送達を標的とするための最適な遺伝子治療ベクターを決定するために、異なる遺伝子治療ベクター、プロモーターおよび投与経路を比較する実験データを提供する。

Description

本出願は、2017年5月17日に出願された米国仮特許出願第62/849,794号の優先権を主張し、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
電子的に提出された資料の参照による組み込み
本開示の一部である配列表を明細書と同時にテキストファイルとして提出する。配列表を含むテキストファイルの名称は、「53953_Seqlisting.txt」であり、これは2020年4月14日に作成され、サイズは15.429バイトである。配列表の内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
本開示は、最適化された遺伝子治療ベクターを使用して網膜内の特定の細胞型を標的とする方法に関する。特に、本開示は、網膜細胞を特異的に標的とする遺伝子治療ベクター、ならびに視覚機能障害、網膜変性症、およびCLN病などの視力関連障害を治療する方法を提供する。
遺伝子治療ベクターの眼への投与は、眼の解剖学的構造が明確であるため、多くの利点がある。特に、目の容易なアクセスは、迅速で進歩的な検査を可能にする。眼の比較的密閉された構造および小さなサイズは、送達のために低用量のベクターを必要とする。血液網膜関門は、体循環へのベクターの漏出を防ぎ、比較的免疫特権のある環境を維持する。特定の眼障害に主にまたは部分的に関与する個々のまたは複数の遺伝子が同定されている。
遺伝子治療ベクターの眼への投与は、いくつかの有望な結果を示している。現在、視力喪失関連疾患を対象とした臨床遺伝子治療試験が数多くあり、これらの試験は主に遺伝性網膜疾患を対象としている。例えば、臨床試験では、レーバー先天性黒内障(LCA)、レーバー遺伝性視神経症、および網膜色素変性症が試験されている。今日まで、AAVベクター、特にAAV2血清型は、眼の遺伝子治療で最も一般的に使用されてきた。Lee et al.,Progress in retinal and eye research 68:31-53,2019を参照。
神経セロイドリポフスチン症(NCL)は、まとめてバッテン病と称される一群の重度の神経変性障害である。これらの障害は神経系に影響を及ぼし、典型的には、例えば、移動、視力および思考能力に関する問題を悪化させる。異なるNCLは、それらの遺伝学的原因によって区別される。バッテン病の小児期の患者では、部分的または完全な視力の喪失がしばしば発症する。特にバッテン病を患っている人では、リポフスチンは脳および網膜などの細胞内に蓄積する。リポフスチンの蓄積は、網膜、視神経、および視力を処理する脳の領域の光受容体に損傷を与える。
現在、網膜の特定の細胞型を標的とする改善された遺伝子治療法が必要とされている。さらに、バッテン病の症状を改善することができる治療はない。したがって、バッテン病の治療に対する当該技術分野における必要性が残っている。
Lee et al.,Progress in retinal and eye research 68:31-53,2019
本開示は、網膜の特定の細胞型を標的とする最適化された遺伝子治療ベクターを提供する。これらの最適化された遺伝子治療ベクターは、特定の網膜細胞に導入遺伝子を送達するのに有用である。本開示は、局所静脈内(IV)送達、網膜下送達、硝子体内送達、脳室内送達、実質内送達または髄腔内送達を使用して最適化された遺伝子治療ベクターを投与することを含む、視力関連障害を治療する方法を提供する。特定の細胞型を標的とする遺伝子治療法は、視力喪失関連疾患の治療に利点がある。
本開示は、対象の網膜細胞に導入遺伝子を送達する方法であって、導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを対象に投与することを含み、遺伝子治療ベクターが、局所静脈内(IV)送達、網膜下送達、硝子体内送達、脳室内送達、実質内送達または髄腔内送達を使用して対象に投与される、方法を提供する。例えば、開示された方法は、双極細胞、桿体視細胞、錐体視細胞、神経節細胞、ミュラーグリア細胞、ミクログリア細胞、水平細胞および/またはアマクリン細胞を含むがこれらに限定されないすべての網膜細胞に導入遺伝子を送達することをもたらす。
本開示はまた、導入遺伝子を対象の網膜細胞に送達するための組成物であって、組成物が、導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを含み、組成物が、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、組成物を提供する。
別の実施形態では、本開示は、導入遺伝子を対象の網膜細胞に送達するための薬剤の調製のための遺伝子治療ベクターの使用であって、薬剤が、導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを含み、薬剤が、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、使用を提供する。
本開示はまた、対象の視覚機能障害、網膜変性症または視力関連障害を治療する方法であって、導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを対象に投与することを含み、遺伝子治療ベクターが、局所静脈内(IV)送達、網膜下送達、硝子体内送達、脳室内送達、実質内送達または髄腔内送達を使用して投与される、方法を提供する。
本開示はまた、対象の視覚機能障害または視力関連障害を治療するための組成物であって、組成物が対象への導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを含み、組成物が、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、組成物を提供する。
追加の実施形態では、本開示は、対象の視覚機能障害または視力関連障害を治療するための薬剤の調製のための遺伝子治療ベクターの使用であって、薬剤が導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを含み、薬剤が、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、使用を提供する。
例えば、視力関連障害は、バッテン病、先天性白内障、先天性緑内障、網膜変性症、視神経萎縮、眼の奇形、斜視、眼球のずれ、緑内障、湿性加齢性黄斑変性症、乾性加齢性黄斑変性症、網膜色素変性症、全脈絡膜萎縮、レーバー先天性黒内障、レーバー遺伝性視神経症、早期発症網膜ジストロフィー、色覚異常、x連鎖網膜分離症、アッシャー症候群1B、新生血管の加齢性黄斑変性症、シュタルガルト病の黄斑変性症、糖尿病性黄斑変性症、または糖尿病性黄斑浮腫である。特定の実施形態では、視力関連障害は、CLN1病、CLN2病、CLN3病、CLN4病、CLN5病、CLN6病またはCLN8病などのCLNバッテン病である。
目的の任意の導入遺伝子を網膜細胞に送達するための、開示された方法、組成物および使用。導入遺伝子は、目的のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列であるか、あるいはsiRNAもしくはmiRNAなどの目的の遺伝子の発現を阻害、妨害、または沈静化する核酸である。例示的な導入遺伝子は、RPE65、RPGR、ORF15、CNGA3、CMH、ND4、PDE6B、ChR2、MERTK、hRS1、hMYOJA、hABCA4、CD59、抗hVEGF抗体、エンドスタチン-アンギオスタチン、sFLT01、またはsFLT-1をコードするポリヌクレオチドである。追加の例示的な導入遺伝子には、RTP801に対するsiRNA、VEGFR-1に対するsiRNA、VEGFに対するsiRNA、またはADRB2に対するsiRNAが含まれる。一実施形態では、導入遺伝子は、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8などのCLNポリペプチドをコードする。
本開示はまた、対象のバッテン病を治療する方法であって、CLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを対象に投与することを含み、遺伝子治療ベクターが、局所静脈内(IV)送達、網膜下送達、硝子体内送達、脳室内送達、実質内送達または髄腔内送達を使用して投与される、方法を提供する。
他の実施形態では、本開示は、対象のバッテン病を治療するための組成物であって、組成物が、CLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを含み、組成物が、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、組成物を提供する。
追加の実施形態では、本開示は、対象のバッテン病を治療するための薬剤の調製のための遺伝子治療ベクターの使用であって、薬剤がCLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを含み、薬剤が、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、使用を提供する。
本開示の方法、組成物または使用のいずれかによって治療されるバッテン病は、CLN1病、CLN2病、CLN3病、CLN4病、CLN5病、CLN6病またはCLN8病である。
開示された方法、組成物または使用のいずれかにおいて、導入遺伝子は、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8などのCLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。バッテン病を治療するための方法、組成物または使用のいずれかにおいて、未治療のバッテン病患者と比較して、効果的な治療は、(a)視力の喪失、(b)脳容積の損失、(c)認知機能の喪失、および(d)言語発達遅滞、から選択されるバッテン病の1つ以上の症状を減少させるかまたは遅延させる。症状は、統一バッテン病評価尺度(UBDS)またはハンブルク運動言語尺度を使用して評価することができる。
開示された方法、組成物または使用のいずれかにおいて、遺伝子治療ベクターは、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAVRH10、AAVRH74、AAV11、AAV12、AAV13、AAVTTまたはAnc80、AAV7m8、およびそれらの誘導体である。
開示された方法、組成物または使用のいずれかにおいて、遺伝子治療ベクターは、CMVプロモーター、p546、またはCBプロモーターを含む。
さらに、開示された方法、組成物または使用のいずれかにおいて、遺伝子治療ベクターは、髄腔内送達を使用して投与され、方法は、遺伝子治療ベクターの投与後に対象をトレンデレンブルグ体位に置くことをさらに含む。
本開示で試験されたベクターの概略図を提供する。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 髄腔内投与後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 網膜下注射後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 網膜下注射後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 網膜下注射後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 網膜下送達後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 網膜下送達後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 網膜下送達後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 網膜下送達後のGFP導入遺伝子の網膜送達を示す。 2つの異なる共染色を使用して試験された4つのベクターすべてについて、網膜下送達後のすべての組織の合成を低倍率で提供する。 2つの異なる共染色を使用して試験された4つのベクターすべてについて、網膜下送達後のすべての組織の合成を低倍率で提供する。 AAV9.CB.GFPの1.2e14vgを髄腔内注射した10歳の非ヒト霊長類からのデータを提供する。網膜を、ミュラーグリア細胞マーカーであるSox2で対比染色した。注射された霊長類では、GFPおよびSox2の顕著な共局在が観察された。 硝子体内注射後の網膜におけるミュラーグリア細胞の形質導入を示す。GCは神経節細胞層、INLは内神経層、ONLは外神経層である。Sox2はミュラー細胞特異的マーカーである。 硝子体内注射後の網膜におけるミュラーグリア細胞の形質導入を示す。GCは神経節細胞層、INLは内神経層、ONLは外神経層である。Sox2はミュラー細胞特異的マーカーである。 硝子体内注射後の網膜における双極細胞の形質導入を示す。Otx2は双極細胞特異的マーカーである。 硝子体内注射後の網膜における双極細胞の形質導入を示す。Otx2は双極細胞特異的マーカーである。
バッテン病などの視力関連障害を治療するために眼を標的とするためのAAV遺伝子治療の最適化には、さまざまな細胞型の特定の標的化が必要である。本開示は、マウスおよび非ヒト霊長類の網膜における特定の細胞型への導入遺伝子の送達を標的とするための最適な遺伝子治療ベクターを決定するために、異なる遺伝子治療ベクター、プロモーターおよび投与経路を比較する実験データを提供する。
データはAAV9およびAnc80ベクターの投与に焦点を当てているが、本開示は、網膜細胞を特異的に標的とするプロモーターを含む任意の遺伝子治療ベクターの使用を企図しており、これらの最適化されたベクターは、局所静脈内(IV)送達、網膜下送達、硝子体内送達、脳室内送達、実質内送達または髄腔内送達を使用して投与される。例えば、データは、脳室内注射を介して脳脊髄液に直接注射されたAAV9が、網膜の双極細胞における導入遺伝子発現を標的とするのに効果的であることを示した。したがって、髄腔内注射は、遺伝子治療ベクターを眼に送達するために、そして特に遺伝子治療ベクターを双極細胞に送達するために使用することができる。
遺伝子治療ベクター
アデノ随伴ウイルス(AAV)は、複製欠損パルボウイルスであり、その一本鎖DNAゲノムは、2つの145個のヌクレオチドの逆方向末端反復(ITR)を含む約4.7kbの長さであり、ウイルス自体またはその誘導体を指すように使用することができる。この用語は、他に特定されない限り、すべてのサブタイプ、ならびに天然に存在する形態および組換え形態の両方を包含する。AAVの複数の血清型がある。AAVの血清型は、各々特定のクレードと関連しており、そのメンバーは血清学的および機能的類似性を共有している。したがって、AAVはまた、クレードによって称され得る。例えば、AAV9配列は、「クレードF」配列と称される(Gao et al.,J.Virol.,78:6381-6388(2004))。本開示は、特定のクレード、例えばクレードF内の任意の配列の使用を企図する。AAV血清型のゲノムのヌクレオチド配列は既知である。例えば、AAV-1の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_002077に提供されており、AAV-2の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_001401およびSrivastava et al.,J.Virol.,45:555-564(1983)に提供されており、AAV-3の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_1829に提供されており、AAV-4の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_001829に提供されており、AAV-5ゲノムは、GenBank受入番号AF085716に提供されており、AAV-6の完全なゲノムは、GenBank受入番号NC_00 1862に提供されており、AAV-7およびAAV-8ゲノムの少なくとも部分は、それぞれ、GenBank受入番号AX753246およびAX753249に提供されており、AAV-9ゲノムは、Gao et al.,J.Virol.,78:6381-6388(2004)に提供されており、AAV-10ゲノムは、Mol.Ther.,13(1):67-76(2006)に提供されており、AAV-11ゲノムは、Virology,330(2):375-383(2004)に提供されており、AAV-12ゲノムの部分は、GenBank受入番号DQ813647に提供されており、AAV-13ゲノムの部分は、GenBank受入番号EU285562に提供されている。AAV rh.74ゲノムの配列は、参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第9,434,928号に提供されている。AAV-B1ゲノムの配列は、Choudhury et al.,Mol.The.,24(7):1247-1257(2016)に提供されている。Anc80は、AAV1、AAV2、AAV8、およびAAV9のAAVベクターである。Anc80の配列は、両方とも参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Zinn et al.,Cell Reports 12:1056-1068,2015、Vandenberghe et al、PCT/US2014/060163、およびGenBank受入番号KT235804-KT235812に提供されている。
ウイルスDNA複製(rep)、キャプシド形成/パッケージング、および宿主細胞染色体組み込みを指示するCis作用配列は、ITR内に含有される。3つのAAVプロモーター(それらの相対マップ位置に対してp5、p19、およびp40と名付けられる)は、repおよびcap遺伝子をコードする2つのAAV内部オープンリーディングフレームの発現を駆動する。単一のAAVイントロンの差異的スプライシング(ヌクレオチド2107および2227における)と相まって、2つのrepプロモーター(p5およびp19)により、rep遺伝子から4つのrepタンパク質(rep78、rep68、rep52、およびrep40)が産生される。repタンパク質は、最終的にウイルスゲノムの複製に関与する複数の酵素特性を有する。cap遺伝子は、p40プロモーターから発現され、3つのキャプシドタンパク質VP1、VP2、およびVP3をコードする。選択的スプライシングおよび非コンセンサス翻訳開始部位は、3つの関連キャプシドタンパク質の産生に関与する。単一コンセンサスポリアデニル化部位は、AAVゲノムのマップ位置95に位置する。AAVのライフサイクルおよび遺伝学は、Muzyczka,Current Topics in Microbiology and Immunology,158:97-129(1992)に概説されている。
AAVは、例えば、遺伝子治療において、外来DNAを細胞に送達するためのベクターとしてそれを魅力的にする固有の特徴を有する。培養中の細胞のAAV感染は非細胞変性であり、ヒトおよび他の動物の自然感染はサイレントかつ無症候性である。さらに、AAVは、多くの哺乳動物細胞を感染させ、インビボで多くの異なる組織を標的とする可能性を可能にする。さらに、AAVは、緩徐に分裂する細胞および非分裂細胞を形質導入し、転写的に活性な核エピソーム(染色体外要素)として本質的にそれらの細胞の寿命にわたって存続し得る。天然のAAVプロウイルスゲノムは、組換えゲノムの構築を実現可能にするプラスミド中のクローン化DNAとして感染性である。さらに、AAV複製、ゲノムキャプシド形成および組み込みを指示するシグナルがAAVゲノムのITR内に含有されるので、ゲノムの内部約4.3kb(複製および構造キャプシドタンパク質、rep-capをコードする)のいくつかまたはすべては、プロモーター、目的のDNAおよびポリアデニル化シグナルを含有する遺伝子カセットのような外来DNAと置き換えられ得る。場合によっては、repおよびcapタンパク質は、トランスで提供される。AAVの別の重要な特徴は、それが極めて安定かつ頑健なウイルスであることである。これは、アデノウイルスを不活性化するために使用される条件(56℃~65℃で数時間)に容易に耐え、AAVの低温保存の重要性を低くする。AAVは、凍結乾燥され得る。最後に、AAV感染細胞は、重複感染に耐性を示さない。
本明細書で使用される「AAV」という用語は、野生型AAVウイルスまたはウイルス粒子を指す。「AAV」、「AAVウイルス」、および「AAVウイルス粒子」という用語は、本明細書では交換的に使用される。「rAAV」という用語は、組換えAAVウイルス、または組換え感染性のカプセル化ウイルス粒子を指す。「rAAV」、「rAAVウイルス」、および「rAAVウイルス粒子」という用語は、本明細書では交換的に使用される。
「rAAVゲノム」という用語は、修飾されている天然のAAVゲノムに由来するポリヌクレオチド配列を指す。いくつかの実施形態では、rAAVゲノムは、天然のcapおよびrep遺伝子を除去するために修飾されている。いくつかの実施形態では、rAAVゲノムは内因性5’および3’逆方向末端反復(ITR)を含む。いくつかの実施形態では、rAAVゲノムは、AAVゲノムが由来するAAV血清型とは異なるAAV血清型からのITRを含む。いくつかの実施形態では、rAAVゲノムは、逆方向末端反復(ITR)によって5’末端および3’末端に隣接した目的の導入遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、rAAVゲノムは、「遺伝子カセット」を含む。
「scAAV」という用語は、自己相補的ゲノムを含むrAAVウイルスまたはrAAVウイルス粒子を指す。「ssAAV」という用語は、一本鎖ゲノムを含むrAAVウイルスまたはrAAVウイルス粒子を指す。
本明細書に提供されるrAAVゲノムは、いくつかの実施形態では、導入遺伝子ポリヌクレオチド配列に隣接する1つ以上のAAV ITRを含む。導入遺伝子ポリヌクレオチド配列は、遺伝子カセットを形成するために標的細胞内で機能的である転写制御要素(プロモーター、エンハンサーおよび/またはポリアデニル化シグナル配列を含むが、これらに限定されない)に作動可能に連結されている。プロモーターの例は、CMVプロモーター、ニワトリβアクチンプロモーター(CB)およびP546プロモーターである。シミアンウイルス40(SV40)初期プロモーター、マウス乳腺腫瘍ウイルス(MMTV)、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)長い末端反復(LTR)プロモーター、MoMuLVプロモーター、トリ白血病ウイルスプロモーター、エプスタインバールウイルス最初期プロモーター、ラウス肉腫ウイルスプロモーター、ならびにヒト遺伝子プロモーター(例えば、限定されないが、アクチンプロモーター、ミオシンプロモーター、伸長因子-1aプロモーター、ヘモグロビンプロモーター、クレアチンキナーゼプロモーターなど)を含むが、これらに限定されない追加のプロモーターが、本明細書で企図される。
本明細書では、配列番号8の核酸配列、および配列番号3のヌクレオチド配列と少なくとも65%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%同一であるプロモーター配列であって、転写促進活性を有するプロモーター配列を含む、CMVプロモーター配列がさらに提供される。本明細書では、配列番号7の核酸配列、および転写促進活性を有する、配列番号7のヌクレオチド配列と少なくとも65%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%同一であるプロモーター配列を含む、CBプロモーター配列がさらに提供される。本明細書では、配列番号9の核酸配列、および転写促進活性を有する、配列番号9のヌクレオチド配列と少なくとも65%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%同一であるプロモーター配列を含むP546プロモーター配列がさらに提供される。転写制御要素の他の例は、組織特異的制御要素、例えば、ニューロン内での特異的発現を可能にするか、または星状細胞内での特異的発現を可能にするプロモーターである。例としては、ニューロン特異的エノラーゼおよびグリア線維性酸性タンパク質プロモーターが挙げられる。誘導性プロモーターもまた、企図される。誘導性プロモーターの非限定的な例としては、メタロチオネインプロモーター、グルココルチコイドプロモーター、プロゲステロンプロモーター、およびテトラサイクリン調節プロモーターが挙げられるが、これらに限定されない。遺伝子カセットはまた、哺乳動物細胞中で発現されたときに導入遺伝子RNA転写物のプロセシングを容易にするためのイントロン配列を含んでもよい。このようなイントロンの一例は、SV40イントロンである。
「パッケージング」とは、AAV粒子の組み立ておよびキャプシド形成をもたらす一連の細胞内事象を指す。「産生」という用語は、パッケージング細胞によるrAAV(感染性のカプセル化されたrAAV粒子)を産生するプロセスを指す。
AAV「rep」および「cap」遺伝子は、それぞれアデノ随伴ウイルスの複製タンパク質およびキャプシド形成タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を指す。AAV repおよびcapは、本明細書においてAAV「パッケージング遺伝子」と称される。
AAVについての「ヘルパーウイルス」は、AAV(例えば、野生型AAV)が哺乳動物細胞によって複製およびパッケージングされることを可能にするウイルスを指す。アデノウイルス、ヘルペスウイルス、およびワクシニアなどのポックスウイルスを含む、AAVに対する様々なこのようなヘルパーウイルスは、当該技術分野において既知である。アデノウイルスは、多数の異なるサブグループを包含し得るが、サブグループCのアデノウイルス5型が最も一般的に使用される。ヒト、非ヒト哺乳動物、およびトリ起源の多数のアデノウイルスが既知であり、ATCCなどの寄託機関から入手可能である。ヘルペス科のウイルスには、例えば、単純ヘルペスウイルス(HSV)およびエプスタイン-バールウイルス(EBV)、ならびにサイトメガロウイルス(CMV)および偽狂犬病ウイルス(PRV)が含まれ、これらはATCCなどの寄託機関からも入手可能である。
「ヘルパーウイルス機能」とは、(本明細書に記載の複製およびパッケージングのための他の要件と併せて)AAV複製およびパッケージングを可能にするヘルパーウイルスゲノムにコードされている機能を指す。本明細書中に記載されるように、「ヘルパーウイルス機能」は、ヘルパーウイルスを提供すること、または例えば必要な機能をコードするポリヌクレオチド配列をトランスでプロデューサー細胞に提供することによることを含む多数の方法で提供され得る。
本明細書で提供されるrAAVゲノムは、AAV repおよびcap DNAを欠く。本明細書に企図されるrAAVゲノム(例えば、ITR)内のAAV DNAは、AAV血清型Anc80、AAV-1、AAV-2、AAV-3、AAV-4、AAV-5、AAV-6、AAV-7、AAV-8、AAV-9、AAV-10、AAV-11、AAV-12、AAV-13、AAV rh.74、およびAAV-B1を含むが、これらに限定されない、組換えウイルスを導出するのに好適な任意のAAV血清型からであり得る。上記されるように、様々なAAV血清型のゲノムのヌクレオチド配列が、当該技術分野において既知である。キャプシド変異を有するrAAVもまた企図される。例えば、Marsic et al.,Molecular Therapy,22(11):1900-1909(2014)を参照されたい。本明細書中の修飾キャプシドもまた企図され、グリコシル化および脱アミド化などの種々の翻訳後修飾を有するキャプシドを含む。アスパラギンまたはグルタミン側鎖を脱アミド化してアスパラギン残基をアスパラギン酸残基またはイソアスパラギン酸残基に変換すること、およびグルタミンをグルタミン酸またはイソグルタミン酸に変換することは、本明細書に提供されるrAAVキャプシドにおいて企図される。例えば、Giles et al.Molecular Therapy,26(12):2848-2862(2018)を参照されたい。本明細書中の修飾キャプシドもまた、治療を必要とする罹患組織および臓器にrAAVを指向させる標的化配列を含むと企図される。
本明細書で提供されるDNAプラスミドは、本明細書に記載されるrAAVゲノムを含む。DNAプラスミドは、AAV9キャプシドタンパク質を用いて感染性ウイルス粒子中にrAAVゲノムを組み立てるために、AAVのヘルパーウイルス(例えば、アデノウイルス、E1欠損アデノウイルス、またはヘルペスウイルス)による感染を許容することができる細胞に導入され得る。パッケージングされるべきrAAVゲノム、repおよびcap遺伝子、およびヘルパーウイルス機能が細胞に提供されるrAAVを産生する技術は、当該技術分野において標準的である。rAAV粒子の産生は、以下の成分、rAAVゲノム、rAAVゲノムから分離した(すなわち、その中に存在しない)AAV repおよびcap遺伝子、ならびにヘルパーウイルス機能が、単一細胞(本明細書でパッケージング細胞と表される)内に存在することを必要とする。AAV repおよびcap遺伝子は、組換えウイルスが由来し得る任意のAAV血清型に由来してもよく、rAAVゲノムITRとは異なるAAV血清型に由来してもよい。偽型rAAVの産生は、例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれるWO01/83692に開示される。様々な実施形態では、AAVキャプシドタンパク質は、組換えrAAVの送達を増強するために修飾され得る。キャプシドタンパク質に対する修飾は、一般的に当該技術分野において既知である。例えば、その開示全体が参照により本明細書に組み入れられる、US2005/0053922およびUS2009/0202490を参照されたい。
パッケージング細胞を生成する方法は、rAAVの産生に必要な成分をすべて安定して発現する細胞株を作製することである。例えば、AAV repおよびcap遺伝子を欠くrAAVゲノム、rAAVゲノムから分離したAAV repおよびcap遺伝子、およびネオマイシン耐性遺伝子などの選択可能なマーカーを含むプラスミド(または複数のプラスミド)は、細胞のゲノムに組み込まれてもよい。rAAVゲノムは、GCテーリング(Samulski et al.,1982,Proc.Natl.Acad.S6.USA,79:2077-2081)、制限エンドヌクレアーゼ切断部位を含有する合成リンカーの付加(Laughlin et al.,1983,Gene,23:65-73)、または直接平滑末端ライゲーション(Senapathy&Carter,1984,J.Biol.Chem.,259:4661-4666)などの手順により細菌プラスミドに導入されてもよい。その後、パッケージング細胞株は、アデノウイルスなどのヘルパーウイルスで感染させられ得る。この方法の利点は、細胞が選択可能であり、rAAVの大規模産生に好適であることである。好適な方法の他の非限定的な例は、rAAVゲノムならびに/またはrepおよびcap遺伝子をパッケージング細胞に導入するためにプラスミドではなくアデノウイルスまたはバキュロウイルスを用いる。
rAAV粒子産生の一般的原理は、例えば、Carter,1992,Current Opinions in Biotechnology,1533-539、およびMuzyczka,1992,Curr.Topics in Microbial.and Immunol.,158:97-129)に概説されている。様々なアプローチは、Ratschin et al.,Mol.Cell.Biol.4:2072(1984)、Hermonat et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6466(1984)、Tratschin et al.,Mo1.Cell.Biol.5:3251(1985)、McLaughlin et al.,J.Virol.,62:1963(1988)、およびLebkowski et al.,1988 Mol.Cell.Biol.,7:349(1988)に記載されている。Samulski et al.(1989,J.Virol.,63:3822-3828)、米国特許第5,173,414号、WO95/13365および対応する米国特許第5,658,776号、WO95/13392、WO96/17947、PCT/US98/18600、WO97/09441(PCT/US96/14423)、WO97/08298(PCT/US96/13872)、WO97/21825(PCT/US96/20777)、WO97/06243(PCT/FR96/01064)、WO99/11764、Perrin et al.(1995)Vaccine 13:1244-1250、Paul et al.(1993)Human Gene Therapy 4:609-615、Clark et al.(1996)Gene Therapy 3:1124-1132、米国特許第5,786,211号、米国特許第5,871,982号、および米国特許第6,258,595号に記載されている。前述の文書は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれ、rAAV粒子産生に関する文書の部分を特に強調する。
感染性rAAV粒子を産生するパッケージング細胞が、本明細書でさらに提供される。一実施形態では、パッケージング細胞は、HeLa細胞、293細胞、およびPerC.6細胞(同種293株)などの安定して形質転換されたがん細胞であり得る。別の実施形態では、パッケージング細胞は、形質転換されたがん細胞ではない細胞、例えば、低継代293細胞(アデノウイルスのE1で形質転換されたヒト胎児腎細胞)、MRC-5細胞(ヒト胎児線維芽細胞)、WI-38細胞(ヒト胎児線維芽細胞)、Vero細胞(サル腎細胞)、およびFRhL-2細胞(アカゲザル胎児肺細胞)であり得る。
本開示のrAAVゲノムを含むrAAV(例えば、感染性キャプシド形成したrAAV粒子)も本明細書で提供される。rAAVのゲノムは、AAVのrepおよびcap DNAを欠いており、すなわち、rAAVのゲノムのITR間にAAVのrepまたはcap DNAが存在しない。rAAVゲノムは自己相補的(sc)ゲノムであり得る。scゲノムを有するrAAVは、本明細書中でscAAVと称される。rAAVゲノムは一本鎖(ss)ゲノムであり得る。一本鎖ゲノムを有するrAAVは、本明細書中でssAAVと称される。
rAAVは、当該技術分野で標準的な方法によって、例えば、カラムクロマトグラフィーまたは塩化セシウム勾配によって精製され得る。ヘルパーウイルスからrAAVベクターを精製するための方法は、当該技術分野で既知であり、例えば、Clark et al.,Hum.Gene Ther.,10(6):1031-1039(1999)、Schenpp and Clark,Methods Mol.Med.,69 427-443(2002)、米国特許第6,566,118号、およびWO98/09657に開示される方法を含み得る。
rAAVを含む組成物もまた提供される。組成物は、CLN6ポリペプチドをコードするrAAVを含む。組成物は、目的とする異なったポリペプチドをコードする2つ以上のrAAVを含み得る。いくつかの態様では、rAAVはscAAVまたはssAAVである。
本明細書で提供される組成物は、rAAVおよび薬学的に許容される1つ以上の賦形剤を含む。許容される賦形剤は、レシピエントにとって非毒性であり、好ましくは、用いられる投薬量および濃度で不活性であり、リン酸塩[例えば、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)]、クエン酸塩、もしくは他の有機酸などの緩衝剤;アスコルビン酸などの抗酸化剤;低分子量ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリンなどのタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニンもしくはリジンなどのアミノ酸;単糖類、二糖類、およびグルコース、マンノース、もしくはデキストリンを含む他の炭水化物;EDTAなどのキレート剤;マンニトールもしくはソルビトールなどの糖アルコール;ナトリウムなどの塩形成対イオン;および/またはTween(登録商標)などの非イオン性界面活性剤、ポロキサマー188、プルロニック(登録商標)(例えば、プルロニック(登録商標)F68)もしくはポリエチレングリコール(PEG)などのコポリマーが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で提供される組成物は、イオビトリドール、イオヘキソール、イオメプロール、イオパミドール、イオペントール、イオプロミド、イオベルソール、またはイオキシランなどの非イオン性低浸透圧性化合物を含有する薬学的に許容される水性賦形剤を含むことができ、非イオン性低浸透圧性化合物を含有する水性賦形剤は、以下の特性、約180mgI/mL、約322mOsm/kg水の蒸気圧浸透圧法によるオスモル濃度、約273mOsm/Lのオスモル濃度、20℃で約2.3cpおよび37℃で約1.5cpの絶対粘度、ならびに37℃で約1.164の比重、のうちの1つ以上を有することができる。例示的な組成物は、約20~40%の非イオン性低浸透圧性化合物、または約25%~約35%の非イオン性低浸透圧性化合物を含む。例示的な組成物は、20mMのトリス(pH8.0)、1mMのMgCl、200mMのNaCl、0.001%のポロキサマー188、および約25%~約35%の非イオン性の低浸透圧性化合物中に配合されたscAAVまたはrAAVウイルス粒子を含む。別の例示的組成物は、1×PBSおよび0.001%プルロニック(登録商標)F68中に配合されたscAAVを含む。
本開示の方法で投与されるrAAVの投薬量は、例えば、特定のrAAV、投与モード、投与の時間、治療目標、個体、および標的とされる細胞型によって変動することになり、当該技術分野における標準の方法によって決定され得る。投薬量は、ウイルスゲノム(vg)の単位で表されてもよい。本明細書で企図される投薬量は、1×10、1×10、1×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、1×1011、約1×1012、約1×1013、約1.1×1013、約1.2×1013、約1.3×1013、約1.5×1013、約2×1013、約2.5×1013、約3×1013、約3.5×1013、約4×1013、約4.5×1013、約5×1013、約6×1013、約1×1014、約2×1014、約3×1014、約4×1014、約5×1014、約1×1015、約1×1016まで、またはそれ以上の総ウイルスゲノムを含む。約1×10~約1×1010vg、約5×10~約5×1010vg、約1×1010~約1×1011vg、約1×1011~約1×1015vg、約1×1012~約1×1015vg、約1×1012~約1×1014vg、約1×1013~約6×1014vg、および約6×1013~約1.0×1014vgの投薬量も企図される。本明細書中に例示される1用量は、6×1013vgである。本明細書に例示される他の用量は、1.5×1013vgである。
rAAVによって標的網膜細胞に形質導入する方法が提供されている。網膜細胞には、双極細胞、桿体視細胞、錐体視細胞、神経節細胞、ミュラーグリア細胞、ミクログリア細胞、水平細胞またはアマクリン細胞が含まれる。
「形質導入」という用語は、レシピエント細胞による機能性ポリペプチドの発現をもたらす、本開示の複製欠損rAAVを介した、インビボまたはインビトロのいずれかでの、標的細胞へのCLN6ポリヌクレオチドの投与/送達を指すように使用される。本開示のrAAVによる細胞の形質導入は、rAAVによってコードされるポリペプチドまたはRNAの持続的発現をもたらす。したがって、本開示は、髄腔内、局所IV送達、脳室内、網膜下注射、硝子体内送達もしくは実質内送達、またはそれらの任意の組み合わせによって、導入遺伝子によってコードされるポリペプチドをコードする対象rAAVを投与/送達する方法を提供する。髄腔内送達は、脳または脊髄のくも膜の下の空間への送達を指す。いくつかの実施形態では、髄腔内投与は槽内投与による。
導入遺伝子
目的の任意の導入遺伝子を網膜細胞に送達する開示された方法。導入遺伝子は、目的のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列であるか、あるいはsiRNAもしくはmiRNAなどの目的の遺伝子の発現を阻害、妨害、または沈静化する核酸である。
例示的な導入遺伝子は、RPE65、RPGR、ORF15、CNGA3、CMH、ND4、PDE6B、ChR2、MERTK、hRS1、hMYOJA、hABCA4、CD59、抗hVEGF抗体、エンドスタチン-アンギオスタチン、sFLT01、またはsFLT-1をコードするポリヌクレオチドである。一実施形態では、導入遺伝子は、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8などのCLNポリペプチドをコードする。追加の例示的な導入遺伝子には、RTP801に対するsiRNA、VEGFR-1に対するsiRNA、VEGFに対するsiRNA、またはADRB2に対するsiRNAが含まれる。
網膜で発現されるmiRNAは、開示された最適化された遺伝子治療ベクターに含まれる導入遺伝子として企図されている。miRNAの例は、Karali et al.,Nucleic Acids Res.2016 Feb 29;44(4):1525-1540に記載され、これは参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で提供されるrAAVゲノムは、RPE65、RPGR、ORF15、CNGA3、CMH、ND4、PDE6B、ChR2、MERTK、hRS1、hMYOJA、hABCA4、CD59、PEDF、エンドスタチン-アンギオスタチン遺伝子、sFLT-1、抗hVEGF抗体をコードする遺伝子のうちのいずれか1つをコードするポリヌクレオチド配列を含む導入遺伝子をコードするポリヌクレオチドを含み得る。例えば、導入遺伝子によってコードされるポリペプチドには、導入遺伝子配列によってコードされるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドが含まれる。
本明細書で提供されるrAAVゲノムは、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6およびCLN8などのCLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。ポリペプチドは、CLNポリペプチドアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドを含み、CLN活性(例えば、リソソーム自己蛍光貯蔵物質のクリアランスの増加、ATPシンターゼサブユニットCのリソソーム蓄積の減少、ならびに例えば治療前の患者と比較して治療した場合の患者における星状細胞およびミクログリアの活性化の減少、のうちの少なくとも1つ)を有するポリペプチドをコードする。
本明細書で提供されるrAAVゲノムは、場合によっては、CLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、またはCLN活性(例えば、リソソーム自己蛍光貯蔵物質のクリアランスの増加、ATPシンターゼサブユニットCのリソソーム蓄積の減少、ならびに例えば治療前の患者と比較して治療した場合の患者における星状細胞およびミクログリアの活性化の減少、のうちの少なくとも1つ)を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と少なくとも65%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%同一であるポリヌクレオチドを含む。
本明細書に提供されるrAAVゲノムは、いくつかの実施形態では、所望の活性を有するポリペプチドをコードし、かつストリンジェントな条件下で目的の既知の導入遺伝子の核酸配列のいずれか1つまたはその相補体にハイブリダイズする、ポリヌクレオチド配列を含む導入遺伝子を含む。他の実施形態では、本明細書で提供されるrAAVゲノムは、CLN活性を有するポリペプチドをコードし、かつストリンジェントな条件下でCLNポリペプチドをコードする核酸配列のいずれか1つまたはその相補体にハイブリダイズする、ポリヌクレオチド配列を含む。
以下は、視覚的要素に重点を置いて、各バッテン病サブタイプの疾患特性の概要を示している。「主要疾患網膜細胞」カラムに含まれるデータは、マウス網膜から編集された単一細胞RNAデータに基づいて決定された。このデータの調査はまだ進行中である。
Figure 2022533983000001
「ストリンジェントな」という用語は、ストリンジェントとして当該技術分野において一般に理解される条件を指すために使用される。ハイブリダイゼーションストリンジェシーは、主に、温度、イオン強度、およびホルムアミドなどの変性剤の濃度によって決定される。ハイブリダイゼーションおよび洗浄のためのストリンジェントな条件の例は、65~68℃での0.015Mの塩化ナトリウム、0.0015Mのクエン酸ナトリウム、または42℃での0.015Mの塩化ナトリウム、0.0015Mのクエン酸ナトリウム、および50%ホルムアミドである。例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2nd Ed.,Cold Spring Harbor Laboratory,(Cold Spring Harbor,N.Y.1989)を参照されたい。
投与方法
髄腔内投与が本明細書に例示される。これらの方法は、本明細書に記載の1つ以上のrAAVで標的細胞を形質導入することを含む。いくつかの実施形態では、導入遺伝子を含むrAAVウイルス粒子は、患者の眼、脳および/または脊髄に投与もしくは送達される。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、脳に送達される。送達が企図される脳の領域としては、運動皮質、視覚野、小脳、および脳幹が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、脊髄に送達される。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、下位運動ニューロンに送達される。ポリヌクレオチドは、双極細胞、桿体視細胞、錐体視細胞、神経節細胞、ミュラーグリア細胞、ミクログリア細胞、水平細胞またはアマクリン細胞などの網膜細胞に送達され得る。
本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、患者は、rAAVの投与後(例えば、約5分間、約10分間、約15分間または約20分間)、トレンデレンベルク体位(頭低位)に保持される。例えば、患者は、頭低位で、約1度~約30度、約15~約30度、約30~約60度、約60~約90度、または約90~約180度)傾けられてもよい。
網膜下投与の場合、眼の赤道またはその後方に、30G針などの針で小さな強膜切開を行う。ウイルスまたはビヒクルは、切開部、例えば、ハミルトン注射器にチューブで取り付けられた細いガラスピペットを介して、または30G針およびハミルトン注射器を介して、網膜下に送達される。例えば、網膜下投与は、当技術分野で知られている方法を使用して、臨床的に訓練された外科医によって実施される。
脳室内注射の場合、針が頭蓋骨に挿入され、液体が脳脊髄液を含有する空洞に注射される。例えば、脳室内注射は、当技術分野で知られている方法を使用して、臨床的に訓練された外科医によって実施される。
本明細書で提供される方法は、本明細書で提供されるrAAVを含む組成物の有効用量または有効複数用量を、それを必要とする対象(例えば、ヒト患者を含むが、これに限定されない動物)に投与するステップを含む。用量が視力関連障害の症状の発症前に投与される場合、投与は予防的である。用量が視力関連障害の症状の発症後に投与される場合、投与は治療的である。有効用量は、視力関連障害に関連する少なくとも1つの症状を緩和(排除または低減)する用量であり、障害の進行を遅延させるかまたは予防する用量であり、障害の範囲を縮小する用量であり、障害の寛解(部分的または完全な)をもたらす用量であり、かつ/または生存および/もしくは視力を長引かせる用量である。治療前の対象と比較して、または未治療の対象と比較して、本明細書で提供される方法は、安定化、視力の喪失もしくは網膜変性症の進行の減少、または視力もしくは黄斑変性症の改善をもたらす。
視力関連障害がCLNバッテン病である場合、治療前の対象と比較して、または未治療の対象と比較して、本明細書で提供される方法は、CLNバッテン病の進行および/または改善を評価するために使用される尺度、例えば、統一バッテン病評価システム(UBDRS)、またはハンブルク運動言語尺度、のうちの1つ以上の安定化、進行の減少、または改善をもたらす。UBDRS評価尺度(Marshall et al.,Neurology.2005 65(2):275-279に記載される)[CLNバッテン病の進行および/または改善を評価するために使用されるUBDRS身体の1つ以上の尺度、例えば、統一バッテン病評価システム(UBDRS)、またはハンブルク運動言語尺度を含む]。UBDRS評価尺度(Marshall et al.,Neurology.2005 65(2):275-279に記載される)[UBDRS身体評価尺度、UBDRS発作評価尺度、UBDRS行動評価尺度、UBDRS能力評価尺度、UBDRS症状発症の順序、およびUBDRS臨床全般印象(CGI)を含む]、小児のQOL尺度(Pediatric Quality of Life Scale)(PEDSQOL)尺度、運動機能、言語機能、認知機能、および生存。治療前の対象と比較して、または未治療の対象と比較して、本明細書で提供される方法は、以下、自己蛍光貯蔵物質のリソソーム蓄積の減少または遅延、ATPシンターゼサブユニットCのリソソーム蓄積の減少または遅延、グリア活性化(星状細胞および/またはミクログリア)活性化の減少または遅延、星状細胞増加症の減少または遅延、およびMRIによって測定された脳容積損失の減少または遅れ、のうちの1つ以上をもたらし得る。
以下の実施例により特定の実施形態を説明するが、当業者には変形および修飾が発生するであろうことが理解される。したがって、請求項に見られるそのような制限のみが、本発明に課せられるべきである。
実施例1.scAAV9.GFPおよびAnc80.GFPの産生
ヒトGFP cDNAクローンは、Origene,Rockville,MDから入手した。GFP cDNAを、ハイブリッドニワトリβ-アクチンプロモーター(CB)、CMVエンハンサープロモーター、またはP546プロモーターの下で自己相補的AAV9ゲノムまたはAnc80ゲノムにさらにサブクローニングし、インビトロおよびインビボで試験した。AAV2 ITR間に挿入されたGFP cDNAを示すプラスミド構築物の概略図を図1に提供する。プラスミド構築物はまた、CBプロモーター、シミアンウイルス40(SV40)キメライントロンなどのイントロン、およびウシ成長ホルモン(BGH)ポリアデニル化シグナル(BGH PolyA)のうちの1つ以上を含んでいた。図1の構築物は、AAV9ゲノムまたはAnc80ゲノム(総称して「AAV」と呼ばれる)のいずれかにパッケージングされた。
実施例2.ICV送達後のマウス網膜の形質導入
scAAV9.CB.GFPは、生後0日目~2日目に1回の脳室内(ICV)注射によりマウスに投与され、2ケ月にわたってさまざまな時点で発現がモニターされた。マウスに5e10 vgのscAAV9.CB.GFPを注射した。scAAV9.CB.GFPを、1×PBSおよび0.001%プルロニック(登録商標)F68(PBS/F68と示す)中に配合した。
導入遺伝子の網膜発現を調べるために、免疫組織化学分析を行ってGFPタンパク質を視覚化した。scAAV9.CB.GFPを注射したマウスを使用した。網膜組織は、GFP(上段)、桿体双極細胞のマーカーであるPKCα(中段)、および核対比染色を提供するDraq5(下段)で染色された。図2Aに示すように、桿体双極細胞は、scAAV9.CB.GFPのICV投与後に導入遺伝子GFPを発現した。
Pax6はアマクリン/前駆細胞のマーカーである。図2Bに示すように、5e10 vgの用量でscAAV9.CB.GFPをICV投与すると、桿体双極細胞(中央の列を参照)およびアマクリン/前駆細胞(左および右の列を参照)でGFPが発現した。図2Cに示すように、5e10 vgの用量でscAAV9.CB.GFPをICV投与した後、桿体双極細胞(中央および右の列)およびアマクリン/前駆細胞(右の列)の形質導入も観察された。図2Dは、scAAV9.CB.GFPのICV投与後のすべての組織の合成を示している。
カルレチニン(Cy3)は網膜の水平細胞のマーカー(赤い染色)であり、Iba1(紫色の染色)は網膜のミクログリア細胞のマーカーである。図3Aに示すように、AAV9.CB.GFP、scAnc80.CB.GFP、scAnc80.CB.GFP、およびscAnc80.CMVのICV投与により、導入遺伝子がミクログリア細胞および水平細胞に送達された。P546プロモーターを含む遺伝子治療ベクターは、CMVおよびCBプロモーターよりも遅い速度で導入遺伝子を送達した。
Otx2はすべての双極細胞の核マーカー(緑色の染色)であり、Iba1(赤色の染色)は網膜のミクログリア細胞のマーカーである。図3Bに示すように、scAnc80.P546.GFP、AAV9.CB.GFP、scAnc80.CB.GFP、scAnc80.CMV、およびAAV9.P546.GFPのICV投与により、導入遺伝子が双極細胞およびミクログリア細胞に送達された。Otx2(赤色の双極核)およびIba1(紫色)染色の合成を図3Cに示す。
Sox2は、網膜のミュラーグリア細胞のメーカー(緑色の染色)である。これらの細胞はCLN3病に関与している。図3Dに示すように、AAV9.CB.GFP、scAnc80.CB.GFP、scAnc80.CMV.GFP、およびAAV9.P546.GFPのICV投与により、導入遺伝子がミュラーグリア細胞に送達された。Anc80ベクターを含む遺伝子治療ベクターは、AAV9ベクターよりも遅い速度で導入遺伝子を送達した。Sox2染色の合成を図3Eに示す。
この実験は、AAVのICV投与が、網膜内の桿体双極細胞およびアマクリン/前駆細胞へのGFP導入遺伝子の送達をもたらしたことを示している。ICV送達が導入遺伝子を網膜細胞に送達するのに非常に効率的であったことは驚くべきことである。
実施例3.網膜下および髄腔内送達後のマウス網膜の形質導入
標準的な手順に従って、マウスをイソフルランまたはキシラゼン/ケタミン混合物で麻酔した。トロピカミドを一滴垂らして瞳孔を拡張させた。4.0縫合糸を使用して、目の周りに繊細に巻き付けられた小さなループを形成することにより、目を前方に保持し、切開および注射方法の動きを減らした。網膜下注射の場合、30G針で赤道またはその後方に小さな強膜切開を行った。ウイルスまたはビヒクルは、ハミルトン注射器にチューブで取り付けられた細いガラスピペットを使用して切開するか、または30G針およびハミルトン注射器を介して網膜下に送達された。必要に応じて、10.0本の縫合糸を使用して縫合を行った。注射の前後に、オプテインおよびベトロポリシンを局所的に適用し、マウスを標準治療(回復のための加熱ケージ、ケージの底の食物、長いシッパーチューブ)を介して回復させ、安定するまでモニターした。
scAAV9.CMV.GFPまたはscAnc80.CMV.GFPを1回の網膜下注射によりマウス(1~5ケ月齢)に投与し、2ケ月にわたってさまざまな時点で発現をモニターした。AAVおよびAnc80を、9×10および3.2×1010vgを配合したPBS/F68の範囲の用量で投与した。
導入遺伝子の網膜発現を調べるために、免疫組織化学分析を使用してGFPタンパク質を視覚化した。scAAV9.CMV.GFPまたはscAnc80.CMV.GFPを注射したマウスを使用した。網膜組織は、GFP(上段)、マーカーまたはアマクリン/前駆細胞であるPax6(中段)、および核対比染色を提供するDAPI(下段)で染色された。図4Aに示すように、アマクリン/前駆細胞は、注射の約1週間後にscAAV9.CMV.GFPまたはscAnc80.CMV.GFPの網膜下注射後に導入遺伝子GFPを発現した。
Otx2は、すべての網膜双極細胞の核マーカーである。網膜組織は、GFP(上段)、Otx2(中段)、および核対比染色を提供するDAPI(下段)でも染色された。図4Bに示すように、双極細胞は、注射の約1週間後にscAAV9.CMV.GFPまたはscAnc80.CMV.GFPの網膜下注射後に導入遺伝子GFPを発現した。
網膜組織は、GFP(上段)、桿体双極細胞のマーカーであるPKCα(中段)、および核対比染色を提供するDAPI(下段)でも染色された。図4Cに示すように、桿体双極細胞は、注射の約1週間後に、網膜下注射またはscAAV9.CMV.GFPもしくはscAnc80.CMV.GFPの後に導入遺伝子GFPを発現した。図5A~Cは、scAAV9.CB.GFP、scAAV9.CMV.GFP、scAnc80.CB.GFP、またはscAnc80.CMV.GFPの網膜下送達後のすべての組織の合成を提供する。図5Aは、試験した4つのベクターすべての低倍率での染色を示している。図5Bは高倍率での染色を示し、図5Cは高倍率での染色を示しているが、共染色は異なっている。双極細胞における導入遺伝子の発現(OtxおよびPKCα染色)は、以下のベクター、scAAV9.CB.GFP、scAnc80CMV.GFP、scAnc80.CB.GFPまたはscAnc80.CMV.GFPの網膜下注射の4週間後に検出可能であった。図6は、2つの異なる共染色を使用して試験された4つのベクターすべてについて、低倍率で網膜下送達した後のすべての組織の合成を示している。
10歳の非ヒト霊長類に1e14 vgのAAV9.CB.GFPを髄腔内注射した。網膜は、ミュラーグリア細胞マーカーであるSox2で対比染色された。図7は、AAV9.CB.GFPを注射した霊長類におけるGFPおよびSox2の顕著な共局在を示している。
実施例4.硝子体内送達後のマウス網膜の形質導入
マウスは、上記のように硝子体内注射のために麻酔された。30Gの針で輪部と強膜との間に小さな切開を行った。ウイルスまたはビヒクルは、ハミルトン注射器にチューブで取り付けられた細いガラスピペットを使用して切開するか、または30G針およびハミルトン注射器を介して硝子体腔に送達される。注射の前後に、オプテインおよびベトロポリシンを局所的に適用し、マウスを標準治療(回復のための加熱ケージ、ケージの底の食物、長いシッパーチューブ)を介して回復させ、安定するまでモニターする。
CB(プロモーター1)またはP546(プロモーター2)の制御下にあるscAAV9.GFPまたはscANC80.GFPを1回の硝子体内注射でマウス(1~5ケ月齢)に投与し、2月のコースにわたってさまざまな時点で発現をモニターした。AAVおよびAnc80を、2×1010vpを配合したPBS/F68の用量で投与した。次の表は、この研究で使用された細胞マーカーの指針を提供する。
Figure 2022533983000002
図8に示すように、試験したベクターのうちのいずれかの硝子体内注射により、内顆粒層(INL)を標的とするGFP発現をもたらした。網膜組織は、GFP、およびINL内のミュラー細胞に特異的なマーカーであるSox2で染色された。図8Aに示すように、AAV9およびAnc80は、網膜の内層および外層を標的とするための候補ベクターである。図8Bは、GPF陽性ミュラーグリアの定量的測定を提供する(Sox2染色)。この測定は、試験されたすべてのベクターが、CBAプロモーターよりもP546プロモーターで得られたGFP陽性細胞の数が多いミュラーグリアを形質導入したことを示している。この違いは、ミュラーグリア細胞内のこれらのプロモーターの発現の違いに起因し得る。それでもなお、AAV9ベクターとAnc80ベクターとの間で同等の数の細胞が形質導入されているため、AAV9には、網膜発現だけでなくCNS発現にも利用できるという追加の利点がある。ただし、Anc80ベクターは、AAV9と比較してより多くのミュラーグリアを形質導入した。
網膜組織は、双極細胞特異的マーカーであるOtx2でも染色された。図9Aに示すように、硝子体内注射によって送達された場合、CBまたはP546のいずれかの制御下にあるAAV9.GFPおよびAnc80.GFPは双極細胞を形質導入した。定量的測定では、すべてのベクターを試験した場合、GFP陽性双極細胞の割合が低いことが示されている(図9B)。AAV9およびAnc80ベクターは、双極細胞で同様の形質導入率を示し、一方、P546プロモーターは、CBプロモーターと比較して双極細胞でより良いGFP発現を可能にした。
本明細書では本発明の好ましい実施形態を示し、記載してきたが、そのような実施形態が例としてのみ提供されていることは当業者には明らかであろう。当業者であれば、本発明から逸脱することなく、多数の変形、変更、および置換を思い付くであろう。本明細書に記載の実施形態に対する様々な代替形態を採用してもよいことを理解されたい。以下の特許請求の範囲が本発明の範囲を定義し、これらの特許請求の範囲内の方法および構造ならびにそれらの同等物がそれによって包含されることが意図される。
本出願で参照されるすべての文書は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
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CLN3ヌクレオチド配列(配列番号1)
atgggaggct gtgcaggctc gcggcggcgc ttttcggatt ccgaggggga ggagaccgtc 60
ccggagcccc ggctccctct gttggaccat cagggcgcgc attggaagaa cgcggtgggc 120
ttctggctgc tgggcctttg caacaacttc tcttatgtgg tgatgctgag tgccgcccac 180
gacatcctta gccacaagag gacatcggga aaccagagcc atgtggaccc aggcccaacg 240
ccgatccccc acaacagctc atcacgattt gactgcaact ctgtctctac ggctgctgtg 300
ctcctggcgg acatcctccc cacactcgtc atcaaattgt tggctcctct tggccttcac 360
ctgctgccct acagcccccg ggttctcgtc agtgggattt gtgctgctgg aagcttcgtc 420
ctggttgcct tttctcattc tgtggggacc agcctgtgtg gtgtggtctt cgctagcatc 480
tcatcaggcc ttggggaggt caccttcctc tccctcactg ccttctaccc cagggccgtg 540
atctcctggt ggtcctcagg gactggggga gctgggctgc tgggggccct gtcctacctg 600
ggcctcaccc aggccggcct ctcccctcag cagaccctgc tgtccatgct gggtatccct 660
gccctgctgc tggccagcta tttcttgttg ctcacatctc ctgaggccca ggaccctgga 720
ggggaagaag aagcagagag cgcagcccgg cagcccctca taagaaccga ggccccggag 780
tcgaagccag gctccagctc cagcctctcc cttcgggaaa ggtggacagt gttcaagggt 840
ctgctgtggt acattgttcc cttggtcgta gtttactttg ccgagtattt cattaaccag 900
ggactttttg aactcctctt tttctggaac acttccctga gtcacgctca gcaataccgc 960
tggtaccaga tgctgtacca ggctggcgtc tttgcctccc gctcttctct ccgctgctgt 1020
cgcatccgtt tcacctgggc cctggccctg ctgcagtgcc tcaacctggt gttcctgctg 1080
gcagacgtgt ggttcggctt tctgccaagc atctacctcg tcttcctgat cattctgtat 1140
gaggggctcc tgggaggcgc agcctacgtg aacaccttcc acaacatcgc cctggagacc 1200
agtgatgagc accgggagtt tgcaatggcg gccacctgca tctctgacac actggggatc 1260
tccctgtcgg ggctcctggc tttgcctctg catgacttcc tctgccagct ctcctga 1317
CLN3アミノ酸配列(配列番号2)
Met Gly Gly Cys Ala Gly Ser Arg Arg Arg Phe Ser Asp Ser Glu Gly
1 5 10 15
Glu Glu Thr Val Pro Glu Pro Arg Leu Pro Leu Leu Asp His Gln Gly
20 25 30
Ala His Trp Lys Asn Ala Val Gly Phe Trp Leu Leu Gly Leu Cys Asn
35 40 45
Asn Phe Ser Tyr Val Val Met Leu Ser Ala Ala His Asp Ile Leu Ser
50 55 60
His Lys Arg Thr Ser Gly Asn Gln Ser His Val Asp Pro Gly Pro Thr
65 70 75 80
Pro Ile Pro His Asn Ser Ser Ser Arg Phe Asp Cys Asn Ser Val Ser
85 90 95
Thr Ala Ala Val Leu Leu Ala Asp Ile Leu Pro Thr Leu Val Ile Lys
100 105 110
Leu Leu Ala Pro Leu Gly Leu His Leu Leu Pro Tyr Ser Pro Arg Val
115 120 125
Leu Val Ser Gly Ile Cys Ala Ala Gly Ser Phe Val Leu Val Ala Phe
130 135 140
Ser His Ser Val Gly Thr Ser Leu Cys Gly Val Val Phe Ala Ser Ile
145 150 155 160
Ser Ser Gly Leu Gly Glu Val Thr Phe Leu Ser Leu Thr Ala Phe Tyr
165 170 175
Pro Arg Ala Val Ile Ser Trp Trp Ser Ser Gly Thr Gly Gly Ala Gly
180 185 190
Leu Leu Gly Ala Leu Ser Tyr Leu Gly Leu Thr Gln Ala Gly Leu Ser
195 200 205
Pro Gln Gln Thr Leu Leu Ser Met Leu Gly Ile Pro Ala Leu Leu Leu
210 215 220
Ala Ser Tyr Phe Leu Leu Leu Thr Ser Pro Glu Ala Gln Asp Pro Gly
225 230 235 240
Gly Glu Glu Glu Ala Glu Ser Ala Ala Arg Gln Pro Leu Ile Arg Thr
245 250 255
Glu Ala Pro Glu Ser Lys Pro Gly Ser Ser Ser Ser Leu Ser Leu Arg
260 265 270
Glu Arg Trp Thr Val Phe Lys Gly Leu Leu Trp Tyr Ile Val Pro Leu
275 280 285
Val Val Val Tyr Phe Ala Glu Tyr Phe Ile Asn Gln Gly Leu Phe Glu
290 295 300
Leu Leu Phe Phe Trp Asn Thr Ser Leu Ser His Ala Gln Gln Tyr Arg
305 310 315 320
Trp Tyr Gln Met Leu Tyr Gln Ala Gly Val Phe Ala Ser Arg Ser Ser
325 330 335
Leu Arg Cys Cys Arg Ile Arg Phe Thr Trp Ala Leu Ala Leu Leu Gln
340 345 350
Cys Leu Asn Leu Val Phe Leu Leu Ala Asp Val Trp Phe Gly Phe Leu
355 360 365
Pro Ser Ile Tyr Leu Val Phe Leu Ile Ile Leu Tyr Glu Gly Leu Leu
370 375 380
Gly Gly Ala Ala Tyr Val Asn Thr Phe His Asn Ile Ala Leu Glu Thr
385 390 395 400
Ser Asp Glu His Arg Glu Phe Ala Met Ala Ala Thr Cys Ile Ser Asp
405 410 415
Thr Leu Gly Ile Ser Leu Ser Gly Leu Leu Ala Leu Pro Leu His Asp
420 425 430
Phe Leu Cys Gln Leu Ser
435
CLN6ヌクレオチド配列(配列番号3)
atggaggcga cgcggaggcg gcagcacctg ggagcgacgg gcggcccagg cgcgcagctg 60
ggcgcctcct tcctgcaggc caggcatggc tctgtgagcg ctgatgaggc tgcccgcacg 120
gctcccttcc acctcgacct ctggttctac ttcacactgc agaactgggt tctggacttt 180
gggcgtccca ttgccatgct ggtattccct ctcgagtggt ttccactcaa caagcccagt 240
gttggggact acttccacat ggcctacaac gtcatcacgc cctttctctt gctcaagctc 300
atcgagcggt ccccccgcac cctgccacgc tccatcacgt acgtgagcat catcatcttc 360
atcatgggtg ccagcatcca cctggtgggt gactctgtca accaccgcct gctcttcagt 420
ggctaccagc accacctgtc tgtccgtgag aaccccatca tcaagaatct caagccggag 480
acgctgatcg actcctttga gctgctctac tattatgatg agtacctggg tcactgcatg 540
tggtacatcc ccttcttcct catcctcttc atgtacttca gcggctgctt tactgcctct 600
aaagctgaga gcttgattcc agggcctgcc ctgctcctgg tggcacccag tggcctgtac 660
tactggtacc tggtcaccga gggccagatc ttcatcctct tcatcttcac cttcttcgcc 720
atgctggccc tcgtcctgca ccagaagcgc aagcgcctct tcctggacag caacggcctc 780
ttcctcttct cctccttcgc actgaccctc ttgcttgtgg cgctctgggt cgcctggctg 840
tggaatgacc ctgttctcag gaagaagtac ccgggtgtca tctacgtccc tgagccctgg 900
gctttctaca cccttcacgt cagcagtcgg cactga 936
CLN6アミノ酸配列(配列番号4):
Met Glu Ala Thr Arg Arg Arg Gln His Leu Gly Ala Thr Gly Gly Pro
1 5 10 15
Gly Ala Gln Leu Gly Ala Ser Phe Leu Gln Ala Arg His Gly Ser Val
20 25 30
Ser Ala Asp Glu Ala Ala Arg Thr Ala Pro Phe His Leu Asp Leu Trp
35 40 45
Phe Tyr Phe Thr Leu Gln Asn Trp Val Leu Asp Phe Gly Arg Pro Ile
50 55 60
Ala Met Leu Val Phe Pro Leu Glu Trp Phe Pro Leu Asn Lys Pro Ser
65 70 75 80
Val Gly Asp Tyr Phe His Met Ala Tyr Asn Val Ile Thr Pro Phe Leu
85 90 95
Leu Leu Lys Leu Ile Glu Arg Ser Pro Arg Thr Leu Pro Arg Ser Ile
100 105 110
Thr Tyr Val Ser Ile Ile Ile Phe Ile Met Gly Ala Ser Ile His Leu
115 120 125
Val Gly Asp Ser Val Asn His Arg Leu Leu Phe Ser Gly Tyr Gln His
130 135 140
His Leu Ser Val Arg Glu Asn Pro Ile Ile Lys Asn Leu Lys Pro Glu
145 150 155 160
Thr Leu Ile Asp Ser Phe Glu Leu Leu Tyr Tyr Tyr Asp Glu Tyr Leu
165 170 175
Gly His Cys Met Trp Tyr Ile Pro Phe Phe Leu Ile Leu Phe Met Tyr
180 185 190
Phe Ser Gly Cys Phe Thr Ala Ser Lys Ala Glu Ser Leu Ile Pro Gly
195 200 205
Pro Ala Leu Leu Leu Val Ala Pro Ser Gly Leu Tyr Tyr Trp Tyr Leu
210 215 220
Val Thr Glu Gly Gln Ile Phe Ile Leu Phe Ile Phe Thr Phe Phe Ala
225 230 235 240
Met Leu Ala Leu Val Leu His Gln Lys Arg Lys Arg Leu Phe Leu Asp
245 250 255
Ser Asn Gly Leu Phe Leu Phe Ser Ser Phe Ala Leu Thr Leu Leu Leu
260 265 270
Val Ala Leu Trp Val Ala Trp Leu Trp Asn Asp Pro Val Leu Arg Lys
275 280 285
Lys Tyr Pro Gly Val Ile Tyr Val Pro Glu Pro Trp Ala Phe Tyr Thr
290 295 300
Leu His Val Ser Ser Arg His
305 310
CLN8ヌクレオチド配列(配列番号5)
atgaatcctg cgagcgatgg gggcacatca gagagcattt ttgacctgga ctatgcatcc 60
tgggggatcc gctccacgct gatggtcgct ggctttgtct tctacttggg cgtctttgtg 120
gtctgccacc agctgtcctc ttccctgaat gccacttacc gttctttggt ggccagagag 180
aaggtcttct gggacctggc ggccacgcgt gcagtctttg gtgttcagag cacagccgca 240
ggcctgtggg ctctgctggg ggaccctgtg ctgcatgccg acaaggcgcg tggccagcag 300
aactggtgct ggtttcacat cacgacagca acgggattct tttgctttga aaatgttgca 360
gtccacctgt ccaacttgat cttccggaca tttgacttgt ttctggttat ccaccatctc 420
tttgcctttc ttgggtttct tggctgcttg gtcaatctcc aagctggcca ctatctagct 480
atgaccacgt tgctcctgga gatgagcacg ccctttacct gcgtttcctg gatgctctta 540
aaggcgggct ggtccgagtc tctgttttgg aagctcaacc agtggctgat gattcacatg 600
tttcactgcc gcatggttct aacctaccac atgtggtggg tgtgtttctg gcactgggac 660
ggcctggtca gcagcctgta tctgcctcat ttgacactgt tccttgtcgg actggctctg 720
cttacgctaa tcattaatcc atattggacc cataagaaga ctcagcagct tctcaatccg 780
gtggactgga acttcgcaca gccagaagcc aagagcaggc cagaaggcaa cgggcagctg 840
ctgcggaaga agaggccata g 861
CLN8アミノ酸配列(配列番号6)
Met Asn Pro Ala Ser Asp Gly Gly Thr Ser Glu Ser Ile Phe Asp Leu
1 5 10 15
Asp Tyr Ala Ser Trp Gly Ile Arg Ser Thr Leu Met Val Ala Gly Phe
20 25 30
Val Phe Tyr Leu Gly Val Phe Val Val Cys His Gln Leu Ser Ser Ser
35 40 45
Leu Asn Ala Thr Tyr Arg Ser Leu Val Ala Arg Glu Lys Val Phe Trp
50 55 60
Asp Leu Ala Ala Thr Arg Ala Val Phe Gly Val Gln Ser Thr Ala Ala
65 70 75 80
Gly Leu Trp Ala Leu Leu Gly Asp Pro Val Leu His Ala Asp Lys Ala
85 90 95
Arg Gly Gln Gln Asn Trp Cys Trp Phe His Ile Thr Thr Ala Thr Gly
100 105 110
Phe Phe Cys Phe Glu Asn Val Ala Val His Leu Ser Asn Leu Ile Phe
115 120 125
Arg Thr Phe Asp Leu Phe Leu Val Ile His His Leu Phe Ala Phe Leu
130 135 140
Gly Phe Leu Gly Cys Leu Val Asn Leu Gln Ala Gly His Tyr Leu Ala
145 150 155 160
Met Thr Thr Leu Leu Leu Glu Met Ser Thr Pro Phe Thr Cys Val Ser
165 170 175
Trp Met Leu Leu Lys Ala Gly Trp Ser Glu Ser Leu Phe Trp Lys Leu
180 185 190
Asn Gln Trp Leu Met Ile His Met Phe His Cys Arg Met Val Leu Thr
195 200 205
Tyr His Met Trp Trp Val Cys Phe Trp His Trp Asp Gly Leu Val Ser
210 215 220
Ser Leu Tyr Leu Pro His Leu Thr Leu Phe Leu Val Gly Leu Ala Leu
225 230 235 240
Leu Thr Leu Ile Ile Asn Pro Tyr Trp Thr His Lys Lys Thr Gln Gln
245 250 255
Leu Leu Asn Pro Val Asp Trp Asn Phe Ala Gln Pro Glu Ala Lys Ser
260 265 270
Arg Pro Glu Gly Asn Gly Gln Leu Leu Arg Lys Lys Arg Pro
275 280 285
CBプロモーター(配列番号7)
ccacgttctg cttcactctc cccatctccc ccccctcccc acccccaatt ttgtatttat
ttatttttta attattttgt gcagcgatgg gggcgggggg gggggggggg cgcgcgccag
gcggggcggg gcggggcgag gggcggggcg gggcgaggcg gagaggtgcg gcggcagcca
atcagagcgg cgcgctccga aagtttcctt ttatggcgag gcggcggcgg cggcggccct
ataaaaagcg aagcgcgcgg cgggcgggag
CMVプロモーター(配列番号8)
cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt
gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca
atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc
aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta
catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac
P546プロモーター(配列番号9)
gaacaacgccaggctcctcaacaggcaactttgctacttctacagaaaatgataataaag
aaatgctggtgaagtcaaatgcttatcacaatggtgaactactcagcagggaggctctaa
taggcgccaagagcctagacttccttaagcgccagagtccacaagggcccagttaatcct
caacattcaaatgctgcccacaaaaccagcccctctgtgccctagccgcctcttttttcc
aagtgacagtagaactccaccaatccgcagctgaatggggtccgcctcttttccctgcct
aaacagacaggaactcctgccaattgagggcgtcaccgctaaggctccgccccagcctgg
gctccacaaccaatgaagggtaatctcgacaaagagcaaggggtggggcgcgggcgcgca
ggtgcagcagcacacaggctggtcgggagggcggggcgcgacgtctgccgtgcggggtcc
cggcatcggttgcgcgcgcgctccctcctctcggagagagggctgtggtaaaacccgtcc
ggaaaa

Claims (51)

  1. 対象の網膜細胞に導入遺伝子を送達する方法であって、前記導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを投与することを含み、前記遺伝子治療ベクターが、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して前記対象に投与される、方法。
  2. 前記網膜細胞が、双極細胞、桿体視細胞、錐体視細胞、神経節細胞、ミュラーグリア細胞、ミクログリア細胞、水平細胞またはアマクリン細胞である、請求項1に記載の方法。
  3. 対象の視覚機能障害または視力関連障害を治療する方法であって、導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを前記対象に投与することを含み、前記遺伝子治療ベクターが、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して投与される、方法。
  4. 前記視力関連障害が、バッテン病、先天性白内障、先天性緑内障、網膜変性症、視神経萎縮、眼奇形、斜視、眼球のずれ、緑内障、湿性加齢性黄斑変性症、乾性加齢性黄斑変性症、網膜色素変性症、全脈絡膜萎縮、レーバー先天性黒内障、レーバー遺伝性視神経症、早期発症網膜ジストロフィー、色覚異常、x連鎖網膜分離症、アッシャー症候群1B、新生血管の加齢性黄斑変性症、シュタルガルト病の黄斑変性症、糖尿病性黄斑変性症、または糖尿病性黄斑浮腫である、請求項3に記載の方法。
  5. 前記視力関連障害がバッテン病であるか、または前記視覚機能障害がバッテン病の症状である、請求項3または4に記載の方法。
  6. 前記バッテン病が、CLN1病、CLN2病、CLN3病、CLN4病、CLN5病、CLN6病またはCLN8病である、請求項5に記載の方法。
  7. 前記導入遺伝子が、RPE65、RPGR、ORF15、CNGA3、CMH、ND4、PDE6B、ChR2、MERTK、hRS1、hMYOJA、hABCA4、CD59、抗hVEGF抗体、エンドスタチン-アンギオスタチン、sFLT01、またはsFLT-1をコードする、請求項1~6のいずれか一項に記載の方法。
  8. 前記導入遺伝子が、miRNA、RTP801に対するsiRNA、VEGFR-1に対するsiRNA、VEGFに対するsiRNA、またはADRB2に対するsiRNAである、請求項1~7のいずれか一項に記載の方法。
  9. 前記導入遺伝子がCLNポリペプチドをコードする、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
  10. 前記CLNポリペプチドが、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8である、請求項9に記載の方法。
  11. 対象のバッテン病を治療する方法であって、CLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを前記対象に投与することを含み、前記遺伝子治療ベクターが、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して投与される、方法。
  12. 前記バッテン病が、CLN1病、CLN2病、CLN3病、CLN4病、CLN5病、CLN6病またはCLN8病である、請求項11に記載の方法。
  13. 前記導入遺伝子がCLNポリペプチドをコードする、請求項11または12に記載の方法。
  14. 前記CLNポリペプチドが、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8である、請求項13に記載の方法。
  15. 前記治療が、未治療のバッテン病患者と比較して、
    (a)視力の喪失、
    (b)脳容積の損失、
    (c)認知機能の喪失、および
    (d)言語発達遅滞
    から選択されるバッテン病の1つ以上の症状を減少させるかまたは遅延させる、請求項11~14のいずれか一項に記載の方法。
  16. 前記遺伝子治療ベクターが、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAVRH10、AAVRH74、AAV11、AAV12、AAV13、AAVTT、もしくはAnc80、またはAAV7m8である、請求項1~15のいずれか一項に記載の方法。
  17. 前記AAV9またはAnc80が髄腔内送達を使用して投与され、前記方法が、前記遺伝子治療ベクターの投与後に前記対象をトレンデレンブルグ体位に置くことをさらに含む、請求項1~15のいずれか一項に記載の方法。
  18. 導入遺伝子を対象の網膜細胞に送達するための組成物であって、前記組成物が前記導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを含み、前記組成物が、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して前記遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、組成物。
  19. 前記網膜細胞が、双極細胞、桿体視細胞、錐体視細胞、神経節細胞、ミュラーグリア細胞、ミクログリア細胞、水平細胞またはアマクリン細胞である、請求項18に記載の組成物。
  20. 対象の視覚機能障害または視力関連障害を治療するための組成物であって、前記組成物が、前記対象への導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを含み、前記組成物が、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して前記遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、組成物。
  21. 前記視力関連障害が、バッテン病、先天性白内障、先天性緑内障、網膜変性症、視神経萎縮、眼奇形、斜視、眼球のずれ、緑内障、湿性加齢性黄斑変性症、乾性加齢性黄斑変性症、網膜色素変性症、全脈絡膜萎縮、レーバー先天性黒内障、レーバー遺伝性視神経症、早期発症網膜ジストロフィー、色覚異常、x連鎖網膜分離症、アッシャー症候群1B、新生血管の加齢性黄斑変性症、シュタルガルト病の黄斑変性症、糖尿病性黄斑変性症、または糖尿病性黄斑浮腫である、請求項20に記載の組成物。
  22. 前記視力関連障害がバッテン病であるか、または前記視覚機能障害がバッテン病の症状である、請求項20または21に記載の組成物。
  23. 前記バッテン病が、CLN1病、CLN2病、CLN3病、CLN4病、CLN5病、CLN6病またはCLN8病である、請求項22に記載の組成物。
  24. 前記導入遺伝子が、RPE65、RPGR、ORF15、CNGA3、CMH、ND4、PDE6B、ChR2、MERTK、hRS1、hMYOJA、hABCA4、CD59、抗hVEGF抗体、エンドスタチン-アンギオスタチン、sFLT01、またはsFLT-1をコードする、請求項18~21のいずれか一項に記載の組成物。
  25. 前記導入遺伝子が、miRNA、RTP801に対するsiRNA、VEGFR-1に対するsiRNA、VEGFに対するsiRNA、またはADRB2に対するsiRNAである、請求項18~21のいずれか一項に記載の組成物。
  26. 前記導入遺伝子がCLNポリペプチドをコードする、請求項18~23のいずれか一項に記載の組成物。
  27. 前記CLNポリペプチドが、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8である、請求項26に記載の組成物。
  28. 対象のバッテン病を治療するための組成物であって、前記組成物が、CLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを含み、前記組成物が、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して前記遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、組成物。
  29. 前記バッテン病が、CLN1病、CLN2病、CLN3病、CLN4病、CLN5病、CLN6病またはCLN8病である、請求項28に記載の組成物。
  30. 前記導入遺伝子がCLNポリペプチドをコードする、請求項28または29に記載の組成物。
  31. 前記CLNポリペプチドが、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8である、請求項30に記載の組成物。
  32. 前記治療が、未治療のバッテン病患者と比較して、
    (a)視力の喪失、
    (b)脳容積の損失、
    (c)認知機能の喪失、および
    (d)言語発達遅滞
    から選択されるバッテン病の1つ以上の症状を減少させるかまたは遅延させる、請求項28~31のいずれか一項に記載の組成物。
  33. 前記遺伝子治療ベクターが、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAVRH10、AAVRH74、AAV11、AAV12、AAV13、AAVTT、もしくはAnc80、またはAAV7m8である、請求項18~32のいずれか一項に記載の組成物。
  34. 前記遺伝子治療ベクターがAAV9またはAnc80であり、前記組成物が髄腔内送達を使用して前記遺伝子治療を投与するために配合され、前記対象が前記遺伝子治療ベクターの投与後にトレンデレンブルグ体位に置かれる、請求項18~32のいずれか一項に記載の組成物。
  35. 対象の網膜細胞に導入遺伝子を送達するための薬剤の調製のための遺伝子治療の使用であって、前記薬剤が前記導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを含み、前記薬剤が、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して前記遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、使用。
  36. 前記網膜細胞が、双極細胞、桿体視細胞、錐体視細胞、神経節細胞、ミュラーグリア細胞、ミクログリア細胞、水平細胞またはアマクリン細胞である、請求項35に記載の使用。
  37. 対象の視覚機能障害または視力関連障害を治療するための薬剤の調製のための遺伝子治療ベクターの使用であって、前記薬剤が導入遺伝子をコードする遺伝子治療ベクターを含み、前記薬剤が、局所静脈内送達、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して前記遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、使用。
  38. 前記視力関連障害が、バッテン病、先天性白内障、先天性緑内障、網膜変性症、視神経萎縮、眼奇形、斜視、眼球のずれ、緑内障、湿性加齢性黄斑変性症、乾性加齢性黄斑変性症、網膜色素変性症、全脈絡膜萎縮、レーバー先天性黒内障、レーバー遺伝性視神経症、早期発症網膜ジストロフィー、色覚異常、x連鎖網膜分離症、アッシャー症候群1B、新生血管の加齢性黄斑変性症、シュタルガルト病の黄斑変性症、糖尿病性黄斑変性症、または糖尿病性黄斑浮腫である、請求項37に記載の使用。
  39. 前記視力関連障害がバッテン病であるか、または前記視覚機能障害がバッテン病の症状である、請求項37または38に記載の使用。
  40. 前記バッテン病が、CLN1病、CLN2病、CLN3病、CLN4病、CLN5病、CLN6病またはCLN8病である、請求項39に記載の使用。
  41. 前記導入遺伝子が、RPE65、RPGR、ORF15、CNGA3、CMH、ND4、PDE6B、ChR2、MERTK、hRS1、hMYOJA、hABCA4、CD59、抗hVEGF抗体、エンドスタチン-アンギオスタチン、sFLT01、またはsFLT-1をコードする、請求項35~40のいずれか一項に記載の使用。
  42. 前記導入遺伝子が、miRNA、RTP801に対するsiRNA、VEGFR-1に対するsiRNA、VEGFに対するsiRNA、またはADRB2に対するsiRNAである、請求項35~40のいずれか一項に記載の使用。
  43. 前記導入遺伝子がCLNポリペプチドをコードする、請求項35~40のいずれか一項に記載の使用。
  44. 前記CLNポリペプチドが、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8である、請求項43に記載の使用。
  45. 対象のバッテン病を治療するための薬剤の調製のための遺伝子治療ベクターの使用であって、前記薬剤が、CLNポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを含み、前記薬剤が、網膜下送達、硝子体内送達または髄腔内送達を使用して前記遺伝子治療ベクターを投与するために配合される、使用。
  46. 前記バッテン病が、CLN1病、CLN2病、CLN3病、CLN4病、CLN5病、CLN6病またはCLN8病である、請求項45に記載の使用。
  47. 前記導入遺伝子がCLNポリペプチドをコードする、請求項45または46に記載の使用。
  48. 前記CLNポリペプチドが、CLN1、CLN2、CLN3、CLN4、CLN5、CLN6またはCLN8である、請求項47に記載の使用。
  49. 前記治療が、未治療のバッテン病患者と比較して、
    (a)視力の喪失、
    (b)脳容積の損失、
    (c)認知機能の喪失、および
    (d)言語発達遅滞
    から選択されるバッテン病の1つ以上の症状を減少させるかまたは遅延させる、請求項35~48のいずれか一項に記載の使用。
  50. 前記遺伝子治療ベクターが、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAVRH10、AAVRH74、AAV11、AAV12、AAV13、AAVTT、またはAnc80、またはAAV7m8である、請求項35~49のいずれか一項に記載の使用。
  51. 前記遺伝子治療ベクターがAAV9またはAnc80であり、前記薬剤が髄腔内送達を使用して前記遺伝子治療を投与するために配合され、前記対象が前記遺伝子治療ベクターの投与後にトレンデレンブルグ体位に置かれる、請求項35~49のいずれか一項に記載の使用。
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