JP2022522405A - Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド及びその使用方法 - Google Patents
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Abstract
本開示は、単鎖抗原提示ポリペプチド及び多量体抗原提示ポリペプチドを含む、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドを提供する。本開示は、本開示のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸、及び当該核酸で遺伝子改変された細胞を提供する。本開示のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法を提供する。【選択図】図１
Description
相互参照
本出願は、２０１９年３月６日に出願された米国仮特許出願第６２／８１４，７２１号の利益を主張するものであり、当該出願は、その全体が参照により本明細書に援用される。
本出願は、２０１９年３月６日に出願された米国仮特許出願第６２／８１４，７２１号の利益を主張するものであり、当該出願は、その全体が参照により本明細書に援用される。
緒言
哺乳類の免疫系の適切な機能の中核をなすのは、２つの特殊な細胞種である抗原提示細胞（「ＡＰＣ」）とＴ細胞との間における活動とコミュニケーションの連携である。ＡＰＣは、外来生物由来のタンパク質、または異常なタンパク質（例えば、がん細胞における遺伝子突然変異によるもの）を捕捉し、それを、Ｔ細胞を含むより大きな免疫系による精査のためのシグナルに適した小さな断片に分解する役割を持つ。特に、ＡＰＣは、タンパク質を小さなペプチド断片に分解し、次に、それが主要組織適合遺伝子複合体（「ＭＨＣ」）のタンパク質と対になり、細胞表面に提示される。Ｔ細胞エピトープとしても知られる、ペプチド断片を含むＭＨＣの細胞表面の提示は、Ｔ細胞による監視の基本的な足がかりを提供し、これにより、Ｔ細胞は、特異的な認識が可能になる。ペプチド断片は、病原体由来、腫瘍由来、または天然宿主タンパク質（自己タンパク質）由来であり得る。更に、ＡＰＣは、その存在が脅威レベルの激化を意味する、細菌毒素、ウイルスタンパク質、ウイルスＤＮＡ、ウイルスＲＮＡなどの他の外来成分を認識することができる。ＡＰＣは、より効果的な応答をもたらすために、更なる共刺激シグナルを介して、この情報をＴ細胞に中継する。
哺乳類の免疫系の適切な機能の中核をなすのは、２つの特殊な細胞種である抗原提示細胞（「ＡＰＣ」）とＴ細胞との間における活動とコミュニケーションの連携である。ＡＰＣは、外来生物由来のタンパク質、または異常なタンパク質（例えば、がん細胞における遺伝子突然変異によるもの）を捕捉し、それを、Ｔ細胞を含むより大きな免疫系による精査のためのシグナルに適した小さな断片に分解する役割を持つ。特に、ＡＰＣは、タンパク質を小さなペプチド断片に分解し、次に、それが主要組織適合遺伝子複合体（「ＭＨＣ」）のタンパク質と対になり、細胞表面に提示される。Ｔ細胞エピトープとしても知られる、ペプチド断片を含むＭＨＣの細胞表面の提示は、Ｔ細胞による監視の基本的な足がかりを提供し、これにより、Ｔ細胞は、特異的な認識が可能になる。ペプチド断片は、病原体由来、腫瘍由来、または天然宿主タンパク質（自己タンパク質）由来であり得る。更に、ＡＰＣは、その存在が脅威レベルの激化を意味する、細菌毒素、ウイルスタンパク質、ウイルスＤＮＡ、ウイルスＲＮＡなどの他の外来成分を認識することができる。ＡＰＣは、より効果的な応答をもたらすために、更なる共刺激シグナルを介して、この情報をＴ細胞に中継する。
Ｔ細胞は、特殊な細胞表面受容体であるＴ細胞受容体（「ＴＣＲ」）を介して、ペプチド－主要組織適合遺伝子複合体（「ｐＭＨＣ」）複合体を認識する。ＴＣＲは、各Ｔ細胞に固有のものであり、その結果、各Ｔ細胞は、特定のｐＭＨＣ標的に極めて特異的である。潜在的脅威にあふれた世界に適切に対処するために、人体内には、明確に異なるＴＣＲを有する別個のＴ細胞が多数（約１０，０００，０００）存在する。更に、特定のＴ細胞ペプチドに特異的である任意の所与のＴ細胞は、最初は、全Ｔ細胞集団のごく小さな部分でしかない。通常は、休眠状態で、数も限られているが、特定のＴＣＲを持つＴ細胞は、ＡＰＣによって容易に活性化及び増幅され、何百万ものＴ細胞が関与する極めて強力なＴ細胞応答をもたらすことができる。このように活性化されたＴ細胞応答は、以下に例示するように、ウイルス感染、細菌感染、及び腫瘍を含む他の細胞脅威を攻撃し、除去することが可能である。逆に、自己抗原または共通抗原に対する、過活性のＴ細胞応答の広範な非特異的活性化は、健康な組織または細胞を不適切に攻撃及び破壊するＴ細胞を発生させることがある。
ＭＨＣタンパク質は、ヒトの場合、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）と称される。ＨＬＡクラスＩＩ遺伝子座には、ＨＬＡ－ＤＭ（ＨＬＡ－ＤＭ α鎖及びＨＬＡ－ＤＭ β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ－ＤＭＡ及びＨＬＡ－ＤＭＢ）、ＨＬＡ－ＤＯ（ＨＬＡ－ＤＯ α鎖及びＨＬＡ－ＤＯ β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ－ＤＯＡ及びＨＬＡ－ＤＯＢ），ＨＬＡ－ＤＰ（ＨＬＡ－ＤＰ α鎖及びＨＬＡ－ＤＰ β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ－ＤＰＡ及びＨＬＡ－ＤＰＢ）、ＨＬＡ－ＤＱ（ＨＬＡ－ＤＱ α鎖及びＨＬＡ－ＤＱ β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ－ＤＱＡ及びＨＬＡ－ＤＱＢ）、及びＨＬＡ－ＤＲ（ＨＬＡ－ＤＲ α鎖及びＨＬＡ－ＤＲ β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ－ＤＲＡ及びＨＬＡ－ＤＲＢ）が含まれる。
概要
本開示は、単鎖抗原提示ポリペプチド及び多量体抗原提示ポリペプチドを含む、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドを提供する。本開示は、本開示のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸、及び当該核酸で遺伝子改変された細胞を提供する。本開示のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法を提供する。
本開示は、単鎖抗原提示ポリペプチド及び多量体抗原提示ポリペプチドを含む、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドを提供する。本開示は、本開示のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸、及び当該核酸で遺伝子改変された細胞を提供する。本開示のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法を提供する。
定義
「ポリヌクレオチド」及び「核酸」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドのいずれかである、任意の長さのヌクレオチドの重合形態を指す。したがって、本用語は、限定するものではないが、一本鎖、二本鎖もしくは多本鎖のＤＮＡもしくはＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ－ＲＮＡハイブリッド、またはプリン及びピリミジン塩基もしくは他の天然、化学的もしくは生化学的修飾、非天然もしくは誘導体化ヌクレオチド塩基を含む重合体を含む。
「ポリヌクレオチド」及び「核酸」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドのいずれかである、任意の長さのヌクレオチドの重合形態を指す。したがって、本用語は、限定するものではないが、一本鎖、二本鎖もしくは多本鎖のＤＮＡもしくはＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ－ＲＮＡハイブリッド、またはプリン及びピリミジン塩基もしくは他の天然、化学的もしくは生化学的修飾、非天然もしくは誘導体化ヌクレオチド塩基を含む重合体を含む。
「ペプチド」、「ポリペプチド」及び「タンパク質」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、任意の長さのアミノ酸の重合形態を指し、これらには、コードアミノ酸及び非コードアミノ酸、化学的もしくは生化学的に修飾されたアミノ酸、または誘導体化されたアミノ酸、ならびに修飾されたペプチド骨格を有するポリペプチドが含まれ得る。
ポリヌクレオチドまたはポリペプチドが別のポリヌクレオチドまたはポリペプチドに対して、あるパーセントの「配列同一性」を有するということは、整列させ、２つの配列を比較したとき、当該パーセンテージの塩基またはアミノ酸が同じであり、同じ相対位置にあることを意味する。配列同一性は、多数の異なる方法で決定することができる。配列同一性を決定するには、様々な簡便な方法及びコンピュータープログラム（例えば、ＢＬＡＳＴ、Ｔ－ＣＯＦＦＥＥ、ＭＵＳＣＬＥ、ＭＡＦＦＴなど）を使用して配列を整列させることができ、こうした方法及びコンピュータープログラムは、ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｌｉ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴ、ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｍｓａ／ｔｃｏｆｆｅｅ／、ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｍｓａ／ｍｕｓｃｌｅ／、ｍａｆｆｔ．ｃｂｒｃ．ｊｐ／ａｌｉｇｎｍｅｎｔ／ｓｏｆｔｗａｒｅ／を含むワールドワイドウェブ上のサイトを通じて利用可能である。例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．（１９９０），Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｉ．２１５：４０３－１０を参照されたい。
「保存的アミノ酸置換」という用語は、類似の側鎖を有するアミノ酸残基のタンパク質の互換性を指す。例えば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、及びイソロイシンからなる脂肪族側鎖を有するアミノ酸の群；セリン及びトレオニンからなる脂肪族ヒドロキシル側鎖を有するアミノ酸の群；アスパラギン及びグルタミンからなるアミド含有側鎖を有するアミノ酸の群；フェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファンからなる芳香族側鎖を有するアミノ酸の群；リシン、アルギニン、及びヒスチジンからなる塩基性側鎖を有するアミノ酸の群；グルタミン酸及びアスパラギン酸からなる酸性側鎖を有するアミノ酸の群；ならびにシステイン及びメチオニンからなる硫黄含有側鎖を有するアミノ酸の群。例示的な保存的アミノ酸置換基は、バリン－ロイシン－イソロイシン、フェニルアラニン－チロシン、リシン－アルギニン、アラニン－バリン－グリシン、及びアスパラギン－グルタミンである。
本明細書で（例えば、Ｔ細胞上のポリペプチド（例えば、Ｔ細胞受容体）に対するＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドの結合に関して）使用される「結合」という用語は、２つの分子間の非共有結合的な相互作用を指す。非共有結合は、例えば、静電的、疎水性、イオン性及び／または水素結合相互作用（塩橋及び水橋などの相互作用を含む）による２つの分子間の直接的会合を指す。非共有結合性相互作用は、一般に、１０－６Ｍ未満、１０－７Ｍ未満、１０－８Ｍ未満、１０－９Ｍ未満、１０－１０Ｍ未満、１０－１１Ｍ未満、１０－１２Ｍ未満、１０－１３Ｍ未満、１０－１４Ｍ未満、または１０－１５Ｍ未満の解離定数（ＫＤ）を特徴とする。「親和性」は、非共有結合の強さを指し、結合親和性の増大は、ＫＤの低下と相関する。「特異的結合」は、一般に、少なくとも約１０－７Ｍ以上、例えば、５×１０－７Ｍ、１０－８Ｍ、５×１０－８Ｍ、１０－９Ｍ以上の親和性を有する結合を指す。「非特異的結合」は、一般に、約１０－７Ｍ未満の親和性を有する結合（例えば、１０－６Ｍ、１０－５Ｍ、１０－４Ｍの親和性を有する結合）（例えば、その指定の結合部位または受容体以外の部分に対するリガンドの結合）を指す。しかしながら、いくつかの文脈において、例えば、ＴＣＲとペプチド／ＭＨＣ複合体との間の結合である「特異的結合」は、１μＭ～１００μＭ、または１００μＭ～１ｍＭの範囲であり得る。「共有結合（ｃｏｖａｌｅｎｔ ｂｉｎｄｉｎｇ）」または「共有結合（ｃｏｖａｌｅｎｔ ｂｏｎｄ）」は、本明細書で使用されるとき、２つの異なる分子間での１つ以上の共有化学結合の形成を指す。
本明細書で使用される「免疫学的シナプス」または「免疫シナプス」という用語は、一般に、適応免疫応答において相互作用する２つの免疫細胞の間の天然の界面を指し、例えば、抗原提示細胞（ＡＰＣ）または標的細胞と、エフェクター細胞、例えば、リンパ球、エフェクターＴ細胞、ナチュラルキラー細胞などとの間の界面が含まれる。ＡＰＣとＴ細胞との間の免疫学的シナプスは、例えば、Ｂｒｏｍｌｅｙ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００１；１９：３７５－９６（当該文献の開示は、その全体が参照により本明細書に援用される）に記載されているように、一般に、Ｔ細胞抗原受容体と主要組織適合遺伝子複合体分子との相互作用によって開始される。
「Ｔ細胞」は、ヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋細胞）、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＤ８＋細胞）、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）、及びＮＫ－Ｔ細胞を含む、ＣＤ３を発現する全てのタイプの免疫細胞を含む。
「免疫調節ポリペプチド」（「共刺激ポリペプチド」とも称される）という用語は、本明細書で使用されるとき、Ｔ細胞上の同種の免疫共調節ポリペプチドに特異的に結合することによって、一次シグナル（例えば、ＴＣＲ／ＣＤ３複合体と、ペプチドをロードした主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドとの結合によってもたらされるもの）に加えて、Ｔ細胞応答（限定するものではないが、増殖、活性化、分化などを含む）を媒介するシグナルをもたらす、抗原提示細胞（ＡＰＣ）（例えば、樹状細胞、Ｂ細胞など）上のポリペプチド、またはＡＰＣ上のポリペプチドの一部を含む。免疫調節ポリペプチドには、限定するものではないが、ＣＤ７、Ｂ７－１（ＣＤ８０）、Ｂ７－２（ＣＤ８６）、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、４－１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ－Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ－Ｇ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、ＨＶＥＭ、Ｔｏｌｌリガンド受容体に結合するアゴニストまたは抗体、及びＢ７－Ｈ３と特異的に結合するリガンドが含まれ得る。また、共刺激ポリペプチドは、とりわけ、Ｔ細胞上に存在する同種の共刺激分子、限定するものではないが、ＩＬ－２、ＣＤ２７、ＣＤ２８、４－１ＢＢ、ＯＸ４０、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＰＤ－１、ＩＣＯＳ、リンパ球機能関連抗原－１（ＬＦＡ－１）、ＣＤ２、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、Ｂ７－Ｈ３、及びＣＤ８３に特異的に結合するリガンドなどと特異的に結合する抗体も包含する。
上記のとおり、「免疫調節ポリペプチド」（本明細書において「ＭＯＤ」とも称される）は、Ｔ細胞上の同種の免疫共調節ポリペプチドに特異的に結合する。
本開示のＴＭＡＰＰの「免疫調節ドメイン」（「ＭＯＤ」）は、標的Ｔ細胞上に存在し得る同種の免疫共調節ポリペプチドに結合する。
「異種」とは、本明細書で使用されるとき、未変性の核酸またはタンパク質にはみられないヌクレオチドまたはポリペプチドをそれぞれ意味する。
「組み換え」とは、本明細書で使用されるとき、特定の核酸（ＤＮＡまたはＲＮＡ）が、天然系でみられる内因性核酸とは区別可能な構造的なコード配列または非コード配列を有するコンストラクトをもたらす、クローニング、制限、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）及び／またはライゲーションの各工程の様々な組み合わせの産物であることを意味する。ポリペプチドをコードするＤＮＡ配列は、ｃＤＮＡ断片または一連の合成オリゴヌクレオチドからアセンブリし、細胞または無細胞転写翻訳系に含有される組み換え転写単位から発現可能な合成核酸を提供することができる。
「組み換え発現ベクター」または「ＤＮＡコンストラクト」という用語は、ベクター及び少なくとも１つのインサートを含むＤＮＡ分子を指すために本明細書中で区別なく使用される。組み換え発現ベクターは、通常、インサート（複数可）の発現及び／または伝播のために、あるいは、他の組み換えヌクレオチド配列の構築のために作製される。インサート（複数可）は、プロモーター配列に作動可能に連結されても連結されなくてもよく、ＤＮＡ制御配列に作動可能に連結されても連結されなくてもよい。
本明細書で使用されるとき、「親和性」という用語は、２つの作用物質（例えば、抗体及び抗原）の可逆的結合の平衡定数を指し、解離定数（ＫＤ）で表される。親和性は、無関係のアミノ酸配列に対する抗体の親和性よりも、少なくとも１倍超、少なくとも２倍超、少なくとも３倍超、少なくとも４倍超、少なくとも５倍超、少なくとも６倍超、少なくとも７倍超、少なくとも８倍超、少なくとも９倍超、少なくとも１０倍超、少なくとも２０倍超、少なくとも３０倍超、少なくとも４０倍超、少なくとも５０倍超、少なくとも６０倍超、少なくとも７０倍超、少なくとも８０倍超、少なくとも９０倍超、少なくとも１００倍超、もしくは少なくとも１，０００倍超、またはそれ以上であり得る。抗体の標的タンパク質に対する親和性は、例えば、約１００ナノモル（ｎＭ）～約０．１ｎＭ、約１００ｎＭ～約１ピコモル（ｐＭ）、または約１００ｎＭ～約１フェムトモル（ｆＭ）以上であり得る。本明細書で使用されるとき、「アビディティ」という用語は、希釈後における２つ以上の作用物質の複合体の解離抵抗性を指す。
「結合」という用語は、例えば、共有結合性、静電性、疎水性、ならびにイオン性及び／または水素結合の相互作用（塩橋及び水橋などの相互作用を含む）による２つの分子間の直接的会合を指す。「特異的結合」は、少なくとも約１０－７Ｍ以上、例えば、５×１０－７Ｍ、１０－８Ｍ、５×１０－８Ｍを超える親和性を有する結合を指す。「非特異的結合」は、約１０－７Ｍ未満の親和性を有する結合、例えば、１０－６Ｍ、１０－５Ｍ、１０－４Ｍなどの親和性を有する結合を指す。
「治療」、「治療すること」などの用語は、一般に、所望の薬理学的作用及び／または生理学的作用を得ることを意味するために本明細書で使用される。作用は、疾患もしくはその症状を完全もしくは部分的に防ぐという点で予防的であり得、及び／または疾患及び／または当該疾患に起因し得る有害作用を部分的もしくは完全に治すという点で治療的であり得る。本明細書で使用される「治療」は、哺乳動物における疾患または症状のあらゆる治療を包含し、（ａ）疾患もしくは症状に罹患する素因があり得るが、まだ罹患の診断を受けていない対象における疾患もしくは症状の発症予防、（ｂ）疾患もしくは症状の阻害、すなわち、その発生の阻止、及び／または（ｃ）疾患の緩和、すなわち、疾患の退行の誘起を含む。治療薬は、疾患または損傷の発生前、発生中、または発生後に投与され得る。進行中の疾患の治療が特に対象となるが、この場合、治療は、患者の望ましくない臨床症状を安定化または軽減させるものである。そのような治療は、望ましくは、患部組織における機能が完全に失われる前に実施される。主題の治療法は、望ましくは、疾患の症候期中、いくつかの場合においては、疾患の症候期後に投与される。
「個体」、「対象」、「宿主」及び「患者」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、診断、治療、または治療法が望まれるあらゆる哺乳類対象を指す。哺乳類は、例えば、ヒト、非ヒト霊長類、げっ歯類（例えば、ラット、マウス）、ウサギ類（例えば、ウサギ）、有蹄類（例えば、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ヤギなど）などを含む。
本発明を更に説明する前に、本発明が、記載される特定の実施形態に限定されず、当然のことながら、それ自体多様であり得ることを理解されたい。また、本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を説明することのみを目的にしており、本発明の範囲が添付の特許請求の範囲によってのみ限定されるため、限定を意図するものではないことも理解されたい。
値の範囲が記載される場合、その範囲の上限値と下限値との間にある、別途明確な記載がない限りはその下限値の単位の１０分の１までの各値、及びその指定範囲内の任意の他の指定値または間にある値は、本発明内に包含されることが理解される。これらのより狭い範囲の上限値及び下限値は、指定範囲内の任意の特定の限界値が除外される場合には、より狭い範囲に独立して含まれ得、また本発明内に包含される。指定範囲が限界値の一方または両方を含む場合、当該含まれる限界値の一方または両方を除いた範囲もまた本明細書に含まれる。
別途の定義がない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されている意味と同一の意味を有する。本明細書に記載のものと同様または同等の任意の方法及び材料を本発明の実施または検証に使用することができるが、好ましい方法及び材料を以下に記載する。本明細書で言及される全ての公開物は、当該公開物に関連して引用される方法及び／または材料を開示及び記載するために、参照により本明細書に援用される。
本明細書及び添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、別途明記されない限り、複数の指示物を含むことに留意すべきである。したがって、例えば、「Ｔｒｅｇ」への言及は、複数の当該Ｔｒｅｇを含み、「ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖」への言及は、１つ以上のＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖及び当業者に知られているその同等物を含むなどとなる。更に、特許請求の範囲は、何らかの任意選択の要素を除外するように作成される場合があることにも留意されたい。したがって、本記述は、請求項の要素の詳述に関連した「だけ」、「のみ」などの排他的用語の使用、または「否定による」限定の使用に対する前提として働くことが意図される。
明確を期すために、本発明のいくつかの特徴が別個の実施形態の文脈で記載されるが、１つの実施形態で組み合わせて提供され得ることも認識される。逆に、煩雑になるのを避けるために、本発明の様々な特徴が１つの実施形態の文脈で記載されるが、これもまた別個に提供されてもよいし、任意の好適な部分的組み合わせで提供されてもよい。本発明に関する実施形態の全ての組み合わせが本発明に明確に包含され、ありとあらゆる組み合わせが個別にかつ明確に開示された場合と同様に本明細書に開示される。加えて、様々な実施形態及びその要素の全ての部分的組み合わせもまた本発明に明確に包含され、ありとあらゆるそのような部分的組み合わせが個別にかつ明確に本明細書に開示された場合と同様に本明細書に開示される。
本明細書で考察される公開物は、本出願の出願日以前の開示についてのみ記載される。本明細書におけるいかなる記載も、本発明が先行発明に基づいてかかる公開物に先行する権利がないという自認を構成するものではない。更に、記載される公開日は、実際の公開日とは異なる場合があり、これは個別に確認する必要がある場合がある。
詳細な説明
本開示は、（ａ）第１のポリペプチドであって、（ｉ）ペプチドエピトープ、及び（ｉｉ）第１のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、（ｂ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み、第１及び／または第２のポリペプチドは、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド（ＴＭＡＰＰ）を提供する。本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸、及び当該核酸で遺伝子改変された細胞を提供する。本開示のＴＭＡＰＰは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法を提供する。
本開示は、（ａ）第１のポリペプチドであって、（ｉ）ペプチドエピトープ、及び（ｉｉ）第１のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、（ｂ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み、第１及び／または第２のポリペプチドは、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド（ＴＭＡＰＰ）を提供する。本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸、及び当該核酸で遺伝子改変された細胞を提供する。本開示のＴＭＡＰＰは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法を提供する。
本開示は、抗原提示ポリペプチド（ＡＰＰ）を提供し、ここで、本開示のＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドを含まない。本開示のＡＰＰは、単鎖ポリペプチドまたは多重鎖（多量体）ポリペプチドであり得る。本開示のＡＰＰは、診断用途及び治療用途に有用である。
Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド
本開示は、単鎖ＴＭＡＰＰ及び多重体ＴＭＡＰＰを含む、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド（ＴＭＡＰＰ）を提供する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２つのポリペプチド鎖を含み、本明細書において、「多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド」と称される場合もある。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。本開示のＴＭＡＰＰは、「ｓｙｎＴａｃポリペプチド」とも称される。
本開示は、単鎖ＴＭＡＰＰ及び多重体ＴＭＡＰＰを含む、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド（ＴＭＡＰＰ）を提供する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２つのポリペプチド鎖を含み、本明細書において、「多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド」と称される場合もある。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。本開示のＴＭＡＰＰは、「ｓｙｎＴａｃポリペプチド」とも称される。
本開示のＴＭＡＰＰは、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２つ以上の免疫調節ポリペプチド（例えば、２、３、４、または５つの免疫調節ポリペプチド）を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを含む場合、２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、第１のポリペプチド鎖中にのみ存在する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを含む場合、２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、第２のポリペプチド鎖中にのみ存在する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを含む場合、２つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、第１のポリペプチド鎖中に存在し、２つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、第２のポリペプチド鎖に存在する。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する。すなわち、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を持たず、例えば、２つの免疫調節ポリペプチドのうちの１つは、第１のアミノ酸配列を含み、２つの免疫調節ポリペプチドのうちの２つ目は、第２のアミノ酸配列を含み、ここで、第１及び第２のアミノ酸配列は同一でない。いくつかの場合において、第１及び第２のアミノ酸配列は、アミノ酸配列が１アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～２５アミノ酸、または２５アミノ酸を超えて、互いに異なる。いくつかの場合において、第１及び第２のアミノ酸配列は、９８％未満、９５％未満、９０％未満、８５％未満、８０％未満、７５％未満、または７０％未満のアミノ酸配列同一性を互いに共有する。
本開示のＴＭＡＰＰは、Ｔ細胞の活性を調節する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、自己反応性Ｔ細胞及び／または自己反応性Ｂ細胞の活性を低下させる。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）の数及び／または活性を増大させ、これにより、自己反応性Ｔ細胞及び／または自己反応性Ｂ細胞の活性の低下をもたらす。
本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドには、ＩＬ－２、トランスフォーミング増殖因子ベータ（ＴＧＦβ）、ＪＡＧ１、ＣＤ７、Ｂ７－１（ＣＤ８０）、Ｂ７－２（ＣＤ８６）、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、４－１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ－Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ－Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、及びＩＬＴ４が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドは、野生型または天然の免疫調節ポリペプチドと比較して、１～１０のアミノ酸置換を含み、かつその同種の免疫共調節ポリペプチド（例えば、Ｔ細胞の表面上に存在する免疫共調節ポリペプチド）に対して、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する野生型または天然の免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、親和性の低下を呈する、バリアントである。
多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド
本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ペプチドエピトープ（ＴＣＲが認識及び結合するペプチド）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド、及びｉｖ）免疫調節ポリペプチド（本明細書において「ＭＯＤポリペプチド」または「ＭＯＤドメイン」とも称される）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、２つのポリペプチド鎖を含み、そのようなＴＭＡＰＰは、本明細書において、多量体ＴＭＡＰＰと称される。本開示のＴＭＡＰＰは、二量体化ポリペプチド、及び免疫グロブリン骨格（例えば、Ｉｇ Ｆｃポリペプチド）または非免疫グロブリン骨格のうちの一方または両方を更に含み得る。本開示の多量体ＴＭＡＰＰの非限定的な例は、図１Ａ～１Ｅ、図２Ａ～２Ｄ、及び図３Ａ～３Ｃに模式的に示されている。
本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ペプチドエピトープ（ＴＣＲが認識及び結合するペプチド）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド、及びｉｖ）免疫調節ポリペプチド（本明細書において「ＭＯＤポリペプチド」または「ＭＯＤドメイン」とも称される）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、２つのポリペプチド鎖を含み、そのようなＴＭＡＰＰは、本明細書において、多量体ＴＭＡＰＰと称される。本開示のＴＭＡＰＰは、二量体化ポリペプチド、及び免疫グロブリン骨格（例えば、Ｉｇ Ｆｃポリペプチド）または非免疫グロブリン骨格のうちの一方または両方を更に含み得る。本開示の多量体ＴＭＡＰＰの非限定的な例は、図１Ａ～１Ｅ、図２Ａ～２Ｄ、及び図３Ａ～３Ｃに模式的に示されている。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。本開示のＴＭＡＰＰが２または３コピーの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、その２または３コピーは、タンデムに並んでいる。本開示のＴＭＡＰＰが２または３コピーの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、その２または３コピーは、リンカーによって互いに分離されている。
本開示のＴＭＡＰＰは、１つ以上のリンカーを含み得、ここで、当該１つ以上のリンカーは、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間（かかるリンカーは、本明細書において「Ｌ１」と称される）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩポリペプチドとの間（かかるリンカーは、本明細書において「Ｌ２」と称される）、ｉｉｉ）第１の免疫調節ポリペプチドと第２の免疫調節ポリペプチドとの間（かかるリンカーは、本明細書において「Ｌ３」と称される）、ｉｖ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩＩポリペプチドとの間、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドと二量体化ポリペプチド（例えば、二量体化ペアの第１または第２のメンバー）との間、及びｖｉ）二量体化ポリペプチド（例えば、二量体化ペアの第１または第２のメンバー）とＩｇＦｃポリペプチドとの間のうちの１つ以上の間にある。いくつかの場合において、Ｌ１リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、Ｌ２リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、Ｌ３リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。免疫調節ポリペプチド、ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びＩｇ Ｆｃポリペプチドの配列（Ｎ末端からＣ末端の順）は、変わり得る。可能な配列の一例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。この配列は、図１Ａに模式的に示される。可能な配列の別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。この配列は、図１Ｂに模式的に示される。可能な配列の別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。この配列は、図１Ｃに模式的に示される。免疫調節ポリペプチド（複数可）は、図１Ａ～１Ｃに模式的に例示されるように、ＭＨＣクラスＩＩ α１及びα２ポリペプチドと同じポリペプチド鎖上にあり得る。あるいは、ペプチド抗原（「エピトープ」）は、図１Ｄ及び１Ｅに模式的に例示されるように、ＭＨＣクラスＩＩ β１及びβ２ポリペプチドと同じポリペプチド鎖上にあり得る。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。この配列は、図１Ｄに模式的に示される。別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。この配列は、図１Ｅに模式的に示される。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、第１の免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３」リンカー）、例えば、約２アミノ酸長～５０アミノ酸長のリンカーによって第２の免疫調節ポリペプチドに連結される。好適なＬ３リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
本開示のＴＭＡＰＰの２つのポリペプチド鎖は、例えば、ジスルフィド結合を介して、共有結合され得る。本開示のＴＭＡＰＰの２つのポリペプチド鎖はまた、互いに非共有結合的に会合し得る。本開示のＴＭＡＰＰの２つのポリペプチド鎖は、第１のポリペプチド中に存在する第１の二量化ドメインと、第２のポリペプチド中に存在する第２の二量体化ドメインとの間の相互作用を介して、連結され得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチド鎖は、第１の二量体化ドメインとして、Ｉｇ ＣＨ１ポリペプチドを含み得、本開示のＴＭＡＰＰの第２のポリペプチド鎖は、第２の二量体化ドメインとして、免疫グロブリンκ鎖の定常領域を含み得る。
好適なＩｇ ＣＨ１ポリペプチドは、約９０アミノ酸～約１２０アミノ酸（例えば、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、または約１１０アミノ酸～約１２０アミノ酸）の長さを有し、次のＣＨ１アミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
好適なＩｇ κ鎖定常領域ポリペプチドは、約９０アミノ酸～約１２０アミノ酸（例えば、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、または約１１０アミノ酸～約１２０アミノ酸）の長さを有し、次のκ鎖定常領域アミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）ＣＨ１ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｖ）ＣＨ１ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｖ）ＣＨ１ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。そのようなＴＭＡＰＰの例は、図２Ａに模式的に示される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｖ）ＣＨ１ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。そのようなＴＭＡＰＰの例は、図２Ｂに模式的に示される。可能な配列の別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ κ定常領域ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）ＣＨ１ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。この配列は、図２Ｃに模式的に示される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）ＣＨ１ポリペプチド、ｉｖ Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。そのようなＴＭＡＰＰの例は、図２Ｄに模式的に示される。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、第１の免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３」リンカー）、例えば、約２アミノ酸長～５０アミノ酸長のリンカーによって第２の免疫調節ポリペプチドに連結される。好適なＬ３リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＣＨ１ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）ＣＨ１ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。一例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）ＣＨ１ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。そのようなＴＭＡＰＰは、図３Ａに模式的に示される。別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）ＣＨ１ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。そのようなＴＭＡＰＰは、図３Ｂに模式的に示される。別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）Ｉｇ κ鎖定常領域ポリペプチド、及びｖ）免疫調節ポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）ＣＨ１ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。そのようなＴＭＡＰＰは、図３Ｃに模式的に示される。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、第１の免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３」リンカー）、例えば、約２アミノ酸長～５０アミノ酸長のリンカーによって第２の免疫調節ポリペプチドに連結される。好適なＬ３リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む。いくつかの場合において、第１及び第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む。別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、第１及び第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、第１及び第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、第１及び第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む。本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、第１の免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３」リンカー）、例えば、約２アミノ酸長～５０アミノ酸長のリンカーによって第２の免疫調節ポリペプチドに連結される。好適なＬ３リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ
３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチド、及びｖ）二量体化ペアの第１のメンバー（例えば、第１のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバー（例えば、第２のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチド、及びｖ）及びｖ）二量体化ペアの第１のメンバー（例えば、第１のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバー（例えば、第２のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ペアの第１のメンバー（例えば、第１のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチド、及びｖ）二量体化ペアの第２のメンバー（例えば、第２のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ペアの第１のメンバー（例えば、第１のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチド、及びｖ）二量体化ペアの第２のメンバー（例えば、第２のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、及びｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、及びｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｖ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単鎖（単一ポリペプチド鎖）ＴＭＡＰＰである。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰはまた、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得る。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み得、ここで、２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列または異なるアミノ酸配列を有し得る。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰの構成要素の配列は、免疫調節ポリペプチドの配置を含め、変わり得る。非限定的な例は、図４Ａ～４Ｃに示される。例えば、いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得、ここで、単鎖ＴＭＡＰＰの免疫調節ポリペプチドは、ｉ）Ｎ末端（ペプチド抗原のＮ末端）、ｉｉ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、及びｖ）Ｉｇ ＦｃポリペプチドのＣ末端のうちの１つ以上に位置する。そのような配列は、図４Ａに模式的に示される。別の例として、いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得、ここで、単鎖ＴＭＡＰＰの免疫調節ポリペプチドは、ｉ）Ｎ末端（ペプチド抗原のＮ末端）、ｉｉ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとの間、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、及びｖ）Ｉｇ ＦｃポリペプチドのＣ末端のうちの１つ以上に位置する。そのような配列は、図４Ｂに模式的に示される。別の例として、いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得、ここで、単鎖ＴＭＡＰＰの免疫調節ポリペプチドは、ｉ）Ｎ末端（ペプチド抗原のＮ末端）、ｉｉ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドとの間、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、及びｖ）ｖ）Ｉｇ ＦｃポリペプチドのＣ末端のうちの１つ以上に位置する。そのような配列は、図４Ｃに模式的に示される。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単鎖（単一ポリペプチド鎖）ＴＭＡＰＰである。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰはまた、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得る。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み得、ここで、２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列または異なるアミノ酸配列を有し得る。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰの構成要素の配列は、免疫調節ポリペプチドの配置を含め、変わり得る。非限定的な例は、図４Ａ～４Ｃに示される。例えば、いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得、ここで、単鎖ＴＭＡＰＰの免疫調節ポリペプチドは、ｉ）Ｎ末端（ペプチド抗原のＮ末端）、ｉｉ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、及びｖ）Ｉｇ ＦｃポリペプチドのＣ末端のうちの１つ以上に位置する。そのような配列は、図４Ａに模式的に示される。別の例として、いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得、ここで、単鎖ＴＭＡＰＰの免疫調節ポリペプチドは、ｉ）Ｎ末端（ペプチド抗原のＮ末端）、ｉｉ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとの間、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、及びｖ）Ｉｇ ＦｃポリペプチドのＣ末端のうちの１つ以上に位置する。そのような配列は、図４Ｂに模式的に示される。別の例として、いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得、ここで、単鎖ＴＭＡＰＰの免疫調節ポリペプチドは、ｉ）Ｎ末端（ペプチド抗原のＮ末端）、ｉｉ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドとの間、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、及びｖ）ｖ）Ｉｇ ＦｃポリペプチドのＣ末端のうちの１つ以上に位置する。そのような配列は、図４Ｃに模式的に示される。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰの任意の２つの構成要素間のリンカーは、アミノ酸配列ＧＧＳＡＡＡＧＧ（配列番号２）を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃは、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。上記の実施形態のいずれかにおいて、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープ（自身の抗原のエピトープ）である。
クラスＩＩ ＭＨＣポリペプチド
上記のとおり、本開示のＴＭＡＰＰは、クラスＩＩ ＭＨＣポリペプチドを含む。
上記のとおり、本開示のＴＭＡＰＰは、クラスＩＩ ＭＨＣポリペプチドを含む。
天然に生じるクラスＩＩ ＭＨＣポリペプチドは、α鎖及びβ鎖を含む。「クラスＩＩ ＭＨＣポリペプチド」は、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）のα鎖及びβ鎖を含む。ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドには、ＭＣＨクラスＩＩ ＤＰ α及びβポリペプチド、ＤＭ α及びβポリペプチド、ＤＯＡ α及びβポリペプチド、ＤＯＢ α及びβポリペプチド、ＤＱ α及びβポリペプチド、ならびにＤＲ α及びβポリペプチドが含まれる。本明細書で使用されるとき、「クラスＩＩ ＭＨＣポリペプチド」は、クラスＩＩ ＭＨＣ α鎖ポリペプチド、クラスＩＩ ＭＨＣ β鎖ポリペプチド、またはクラスＩＩ ＭＨＣ αもしくはβ鎖ポリペプチドの一部のみを含み得る。例えば、「クラスＩＩ ＭＨＣポリペプチド」は、ｉ）クラスＩＩＭＨＣ α鎖ポリペプチドのα１ドメインのみ、ｉｉ）クラスＩＩＭＨＣ α鎖のα２ドメインのみ、ｉｉｉ）クラスＩＩＭＨＣ α鎖のα１ドメイン及びα２ドメインのみ、ｉｖ）クラスＩＩＭＨＣ β鎖のβ１ドメインのみ、ｖ）クラスＩＩＭＨＣ β鎖のβ２ドメインのみ、ｖｉ）クラスＩＩＭＨＣ β鎖のβ１ドメイン及びβ２ドメインのみ、ｖｉｉ）クラスＩＩＭＨＣ α鎖のα１ドメイン、クラスＩＩＭＨＣ β鎖のβ１ドメイン、及びクラスＩＩ ＭＨＣのβ２ドメインなどを含む、ポリペプチドであり得る。
クラスＩＩ ＭＨＣポリペプチドは、アレル型を含む。ＨＬＡ遺伝子座は、本質的に、高度に多型である。Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ ｆｏｒ Ｆａｃｔｏｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ＨＬＡ Ｓｙｓｔｅｍ ２０００（Ｈｕｍ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．；６２（４）：４１９－６８，２００１）に開示されているように、２２１のＨＬＡ－ＤＲＢ１アレル、１９のＤＲＢ３アレル、８９のＤＲＢ４アレル、１４のＤＲＢ５アレル、１９のＤＱＡ１アレル及び３９のＤＱＢ１アレルがあり、新しいアレルが絶えず発見されている。ＷＨＯ ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ ｆｏｒ Ｆａｃｔｏｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ＨＬＡ Ｓｙｓｔｅｍ（ｗｗｗ．ａｎｔｈｏｎｙｎｏｌａｎ．ｃｏｍ／ＨＩＧ／）の２００７年改訂版では、３つのＤＲＡアレル、４９４のＤＲＢ１アレル、１つのＤＲＢ２アレル、４４のＤＲＢ３アレル、１３のＤＲＢ４アレル、１８のＤＲＢ５アレル、３つのＤＲＢ６アレル、２つのＤＲＢ７アレル、１０のＤＲＢ８アレル、１つのＤＲＢ９アレル、３４のＤＱＡ１アレル、８３のＤＱＢ１アレル、２３のＤＰＡ１、１２６のＤＰＢ１アレル、４つのＤＭＡアレル、７つのＤＭＢアレル、１２のＤＯＡアレル及び９つのＤＯＢアレルがあることが示された。本明細書で使用されるとき、「クラスＩＩ ＭＨＣポリペプチド」という用語は、任意の既知のクラスＩＩ ＭＨＣポリペプチドのアレル型を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、天然クラスＩＩ ＭＨＣ α鎖中に存在し得るリーダー部分、膜貫通部分、及び細胞内部分（例えば、細胞質尾部）を含まない、クラスＩＩ ＭＨＣ α鎖を含む。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、クラスＩＩ ＭＨＣ α鎖のα１及びα２部分のみを含み、天然クラスＩＩ ＭＨＣ α鎖中に存在し得るリーダー部分、膜貫通部分、及び細胞内部分（例えば、細胞質尾部）を含まない。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、天然クラスＩＩ ＭＨＣ β鎖中に存在し得るリーダー部分、膜貫通部分、及び細胞内部分（例えば、細胞質尾部）を含まない、クラスＩＩ ＭＨＣ β鎖を含む。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、クラスＩＩ ＭＨＣ β鎖のβ１及びβ２部分のみを含み、天然クラスＩＩ ＭＨＣ β鎖中に存在し得るリーダー部分、膜貫通部分、及び細胞内部分（例えば、細胞質尾部）を含まない。
ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖
ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、α１ドメイン及びα２ドメインを含む。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するα１ドメイン及びα２ドメインは、同じＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドに由来する。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するα１ドメイン及びα２ドメインは、２つの異なるＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドに由来する。
ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、α１ドメイン及びα２ドメインを含む。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するα１ドメイン及びα２ドメインは、同じＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドに由来する。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するα１ドメイン及びα２ドメインは、２つの異なるＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドに由来する。
本開示のＴＭＡＰＰ（例えば、多量体ＴＭＡＰＰ、単鎖ＴＭＡＰＰ）に含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、シグナルペプチドが欠如している。本開示の多量体ポリペプチドに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、約６０アミノ酸～約１９０アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、約６０アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１８０アミノ酸、または約１８０アミノ酸～約２００アミノ酸の長さを有し得る。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ α１ドメインは、約３０アミノ酸～約９５アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ α１ドメインは、約３０アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約９０アミノ酸、または約９０アミノ酸～約９５アミノ酸の長さを有し得る。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ α２ドメインは、約３０アミノ酸～約９５アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ α２ドメインは、約３０アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約９０アミノ酸、または約９０アミノ酸～約９５アミノ酸の長さを有し得る。
ＤＲＡ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＲＡポリペプチドである。ＤＲＡポリペプチドは、図６に示されるＤＲＡアミノ酸配列のアミノ酸２６～２０３と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＡポリペプチドは、約１７８アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、または１８０アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＲＡポリペプチドである。ＤＲＡポリペプチドは、図６に示されるＤＲＡアミノ酸配列のアミノ酸２６～２０３と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＡポリペプチドは、約１７８アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、または１８０アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＲＡポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＡポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（配列番号５、ＤＲＡ＊０１：０２：０１のアミノ酸２６～２０３、図６参照）、またはそのアレルバリアントを含む。いくつかの場合において、アレルバリアントは、図６中の配列の位置２４２にあるロイシンの代わりにバリンを有することにより、ＤＲＡ＊０１：０２：０１とは異なるＤＲＡ＊０１：０１：０１：０１アレルバリアントである。
好適なＤＲＡ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８４アミノ酸（例えば、８０、８１、８２、８３、８４、８５、または８６アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＡ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＲＡ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。
ＤＭＡ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＭＡポリペプチドである。ＤＭＡポリペプチドは、図１１に示されるＤＭＡアミノ酸配列のアミノ酸２７～２１７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＭＡポリペプチドは、約１９１アミノ酸（例えば、１８８、１８９、１９０、１９１、１９２、または１９３アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＭＡポリペプチドである。ＤＭＡポリペプチドは、図１１に示されるＤＭＡアミノ酸配列のアミノ酸２７～２１７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＭＡポリペプチドは、約１９１アミノ酸（例えば、１８８、１８９、１９０、１９１、１９２、または１９３アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＭＡＡポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＭＡＡポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（配列番号８ ＤＭＡ＊０１：０１：０１のアミノ酸２７～２１７、図１１参照）、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＭＡ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９８アミノ酸（例えば、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、または１０１アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＭＡ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＭＡ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９３アミノ酸（例えば、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＭＡ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＯＡ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＯＡポリペプチドである。ＤＯＡポリペプチドは、図１３に示されるＤＯＡアミノ酸配列のアミノ酸２６～２０４と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＯＡポリペプチドは、約１７９アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、または１８２アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＯＡポリペプチドである。ＤＯＡポリペプチドは、図１３に示されるＤＯＡアミノ酸配列のアミノ酸２６～２０４と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＯＡポリペプチドは、約１７９アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、または１８２アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＯＡポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＯＡポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（配列番号１１；ＤＯＡ＊０１：０１：０１：０１のアミノ酸２６～２０４、図１３参照）、またはそのアレルバリアントを含む。いくつかの場合において、アレルバリアントは、ＤＯＡ＊０１：０１：０１：０１と比較して、位置８０にあるシステインの代わりにアルギニン（Ｒ８０Ｃ）を有することによるＤＯＡ＊０１：０２または位置７４にあるロイシンの代わりにバリン（Ｌ７４Ｖ）を有することによるＤＯＡ＊０１：０３バリアントであり得る。
好適なＤＯＡ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８５アミノ酸（例えば、８３、８４、８５、８６、８７、または８８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なα１ドメイン配列は、ＤＯＡ＊０１：０２及びＤＯＡ＊０１：０３に見出されるＬ７４Ｖ及び／またはＲ８０Ｃ置換を組み込むことができる（Ｌ７４及びＲ８０に対応するアミノ酸が斜体及び太字で示されている）。好適なＤＯＡ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＯＡ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＯＡ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＰＡ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＰＡ１ポリペプチドである。ＤＰＡ１ポリペプチドは、図１５に示されるＤＰＡ１アミノ酸配列のアミノ酸２９～２０９と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＰＡ１ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、１８３、または１８４アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＰＡ１ポリペプチドである。ＤＰＡ１ポリペプチドは、図１５に示されるＤＰＡ１アミノ酸配列のアミノ酸２９～２０９と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＰＡ１ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、１８３、または１８４アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＰＡ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＰＡ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（配列番号１４、ＤＰＡ１＊０１：０３：０１：０１のアミノ酸２９～２０９、図１５参照）、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＰＡ１ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約８７アミノ酸（例えば、８４、８５、８６、８７、８８、または８９アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＰＡ１ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＰＡ１ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約９７アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＰＡ１ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
他のＤＰＡ１ポリペプチドは、配列：
（配列番号１７；ＤＰＡ１＊０２：０１：０１：０１のアミノ酸２９～２０９、図１５参照）、または少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、もしくは１００％のアミノ酸配列同一性を有するそのバリアントを含む。
好適なＤＰＡ１ α１ドメインは、ＤＰＡ１＊０２：０１：０１：０１、配列番号１７のアミノ酸２９～１１５に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約８７アミノ酸（例えば、８４、８５、８６、８７、８８、または８９アミノ酸の長さを有し得る。好適なＤＰＡ１ α２ドメインは、ＤＰＡ１＊０２：０１：０１：０１、配列番号１７のアミノ酸１１６～２０９に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約９７アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。
ＤＱＡ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＱＡ１ポリペプチドである。ＤＱＡ１ポリペプチドは、図１７に示されるＤＱＡ１アミノ酸配列のいずれかのアミノ酸２４～２０４と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＡ１ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、または１８３アミノ酸）の長さを有する。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ（「ＩＭＧＴ」）／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６０１のＤＱＡ１＊０１：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６０３、ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００２１１３のＤＱＡ１＊０１：０２ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６０７のＤＱＡ１＊０２：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６０９のＤＱＡ１＊０３：０１：α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６１２のＤＱＡ１＊０４：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６１３のＤＱＡ１＊０５：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６２０のＤＱＡ１＊０６：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＱＡ１ポリペプチドである。ＤＱＡ１ポリペプチドは、図１７に示されるＤＱＡ１アミノ酸配列のいずれかのアミノ酸２４～２０４と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＡ１ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、または１８３アミノ酸）の長さを有する。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ（「ＩＭＧＴ」）／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６０１のＤＱＡ１＊０１：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６０３、ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００２１１３のＤＱＡ１＊０１：０２ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６０７のＤＱＡ１＊０２：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６０９のＤＱＡ１＊０３：０１：α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６１２のＤＱＡ１＊０４：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６１３のＤＱＡ１＊０５：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＱＡ１ α鎖ポリペプチドは、図１７中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００６２０のＤＱＡ１＊０６：０１ α鎖アミノ酸のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。
「ＤＱＡ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＱＡ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＱＡ１ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８７アミノ酸（例えば、８４、８５、８６、８７、８８、または８９アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＡ１ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＱＡ１ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＡ１ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＱＡ２
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＱＡ２ポリペプチドである。ＤＱＡ２ポリペプチドは、図１８に示されるＤＱＡ２アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＡ２ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、または１８３アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドは、ＤＱＡ２ポリペプチドである。ＤＱＡ２ポリペプチドは、図１８に示されるＤＱＡ２アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＡ２ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、または１８３アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＱＡ２ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＱＡ２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＱＡ２ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８７アミノ酸（例えば、８４、８５、８６、８７、８８、または８９アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＡ２ α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＱＡ２ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＡ２ α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖
ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、β１ドメイン及びβ２ドメインを含む。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するβ１ドメイン及びβ２ドメインは、同じＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドに由来する。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するβ１ドメイン及びβ２ドメインは、２つの異なるＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドに由来する。
ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、β１ドメイン及びβ２ドメインを含む。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するβ１ドメイン及びβ２ドメインは、同じＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドに由来する。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するβ１ドメイン及びβ２ドメインは、２つの異なるＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドに由来する。
本開示のＴＭＡＰＰ（例えば、多量体ＴＭＡＰＰ、単鎖ＴＭＡＰＰ）に含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、シグナルペプチドが欠如している。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、約６０アミノ酸～約２１０アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、約６０アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸～約２００アミノ酸、または約２００アミノ酸～約２１０アミノ酸の長さを有し得る。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ β１ドメインは、約３０アミノ酸～約１０５アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ β１ドメインは、約３０アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、または約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸の長さを有し得る。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ β２ドメインは、約３０アミノ酸～約１０５アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ β２ドメインは、約３０アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、または約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸の長さを有し得る。
ＤＲＢ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。一実施形態において、ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７に示される任意のＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得、図７は、ＤＲＢ１前駆体タンパク質を示し、アミノ酸１～２９はシグナル配列（下線）であり、３０～１２４はβ１領域（太字）を形成し、１２５～２２７はβ２領域（太字及び下線）であり、２２８～２５０は膜貫通領域である。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。一実施形態において、ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７に示される任意のＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得、図７は、ＤＲＢ１前駆体タンパク質を示し、アミノ酸１～２９はシグナル配列（下線）であり、３０～１２４はβ１領域（太字）を形成し、１２５～２２７はβ２領域（太字及び下線）であり、２２８～２５０は膜貫通領域である。
一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－１（ＤＲＢ１＊０１：０１）ベータ鎖アミノ酸配列Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ／ＵｎｉＰｒｏｔ参照配列（「ｓｐ」）Ｐ０４２２９．２のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－３（ＤＲＢ１＊０３：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｐ０１９１２．２のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－４（ＤＲＢ１＊０４：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｐ１３７６０．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－７（ＤＲＢ１＊０７：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｐ１３７６１．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－８（ＤＲＢ１＊０８：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｑ３０１３４．２のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－９（ＤＲＢ１＊０９：０１）ベータ鎖アミノ酸配列 ｓｐＱ９ＴＱＥ０．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－１０（ＤＲＢ１＊１０：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｑ３０１６７．２のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－１１（ＤＲＢ１＊１１：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｐ２００３９．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－１２（ＤＲＢ１＊１２：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｑ９５ＩＥ３．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－１３（ＤＲＢ１＊１３：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｑ５Ｙ７Ａ７．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－１４（ＤＲＢ１＊１４：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｑ９ＧＩＹ３．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－１５（ＤＲＢ１＊１５：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｐ０１９１１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、図７中のＤＲＢ１－１６（ＤＲＢ１＊１６：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ｓｐ Ｑ２９９７４．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ１ β鎖ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＲＢ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＢ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（ＤＲＢ１－４のアミノ酸３１～２２７、図７Ａ参照）、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＲＢ１ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ１ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＲＢ１ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約１０３アミノ酸（例えば、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、または１０６アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ１ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＲＢ３
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ３ポリペプチドである。一実施形態において、ＤＲＢ３ポリペプチドは、図８に示される任意のＤＲＢ３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得、図８は、ＤＲＢ３前駆体タンパク質を示し、アミノ酸１～２９はシグナル配列（下線）であり、３０～１２４はβ１領域（太字で示される）を形成し、１２５～２２７はβ２領域であり、２２８～２５０は膜貫通領域である。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図８中のＤＲＢ１－３（ＤＲＢ３＊０１：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿０７２０４９．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図８中のＧｅｎＢａｎｋアクセッションＥＡＸ０３６３２．１のＤＲＢ１－３ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図８中のＤＲＢ１－３（ＤＲＢ３＊０２：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ＧｅｎＢａｎｋ ＣＡＡ２３７８１．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図８中のＤＲＢ１－３（ＤＲＢ３＊０３：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＮ１５２０５．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ３ポリペプチドである。一実施形態において、ＤＲＢ３ポリペプチドは、図８に示される任意のＤＲＢ３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得、図８は、ＤＲＢ３前駆体タンパク質を示し、アミノ酸１～２９はシグナル配列（下線）であり、３０～１２４はβ１領域（太字で示される）を形成し、１２５～２２７はβ２領域であり、２２８～２５０は膜貫通領域である。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図８中のＤＲＢ１－３（ＤＲＢ３＊０１：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿０７２０４９．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図８中のＧｅｎＢａｎｋアクセッションＥＡＸ０３６３２．１のＤＲＢ１－３ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図８中のＤＲＢ１－３（ＤＲＢ３＊０２：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ＧｅｎＢａｎｋ ＣＡＡ２３７８１．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図８中のＤＲＢ１－３（ＤＲＢ３＊０３：０１）ベータ鎖アミノ酸配列ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＮ１５２０５．１のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。
「ＤＲＢ３ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＢ３ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＲＢ３ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ３ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＲＢ３ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約１０３アミノ酸（例えば、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、または１０５アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ３ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＲＢ４
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ４ポリペプチドである。ＤＲＢ４ポリペプチドは、図９に示されるＤＲＢ４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ４ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ４ポリペプチドである。ＤＲＢ４ポリペプチドは、図９に示されるＤＲＢ４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ４ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＲＢ４ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＢ４ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＲＢ４ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ４ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＲＢ４ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約１０３アミノ酸（例えば、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、または１０５アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ４ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＲＢ５
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ５ポリペプチドである。ＤＲＢ５ポリペプチドは、図１０に示されるＤＲＢ５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ５ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ５ポリペプチドである。ＤＲＢ５ポリペプチドは、図１０に示されるＤＲＢ５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ５ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＲＢ５ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＢ５ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＲＢ５ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ５ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＲＢ５ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約１０３アミノ酸（例えば、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、または１０５アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ５ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＭＢ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＭＢポリペプチドである。ＤＭＢポリペプチドは、図１２に示されるＤＭＢアミノ酸配列のアミノ酸１９～２０７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＭＢポリペプチドは、約１８９アミノ酸（例えば、１８７、１８８、１８９、１９０、または１９１アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＭＢポリペプチドである。ＤＭＢポリペプチドは、図１２に示されるＤＭＢアミノ酸配列のアミノ酸１９～２０７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＭＢポリペプチドは、約１８９アミノ酸（例えば、１８７、１８８、１８９、１９０、または１９１アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＭＢポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＭＢポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、または そのアレルバリアントを含む。
好適なＤＭＢ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＭＢ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＭＢ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＭＢ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＯＢ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＯＢポリペプチドである。ＤＯＢポリペプチドは、図１４に示されるＤＯＢアミノ酸配列のアミノ酸２７～２１４と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＯＢポリペプチドは、約１８８アミノ酸（例えば、１８６、１８７、１８８、１８９、または１９０アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＯＢポリペプチドである。ＤＯＢポリペプチドは、図１４に示されるＤＯＢアミノ酸配列のアミノ酸２７～２１４と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＯＢポリペプチドは、約１８８アミノ酸（例えば、１８６、１８７、１８８、１８９、または１９０アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＯＢポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＯＢポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＯＢ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＯＢ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＯＢ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＯＢ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＰＢ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＰＢ１ポリペプチドである。ＤＰＢ１ポリペプチドは、図１６に示されるＤＰＢ１アミノ酸配列のいずれかのアミノ酸３０～２１５と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＰＢ１ポリペプチドは、約１８６アミノ酸（例えば、１８４、１８５、１８６、１８７、または１８８アミノ酸）の長さを有する。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡＡｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５１４のＤＰＢ１＊０１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５１７のＤＰＢ１＊０１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５２０のＤＰＢ１＊０３：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５２１、ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００２１１２．３のＤＰＢ１＊０４：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５２４のＤＰＢ１０６：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５２８のＤＰＢ１＊１１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５９０のＤＰＢ１＊７１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ０２０４６のＤＰＢ１＊１０４：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ１０３６４のＤＰＢ１＊１４１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＰＢ１ポリペプチドである。ＤＰＢ１ポリペプチドは、図１６に示されるＤＰＢ１アミノ酸配列のいずれかのアミノ酸３０～２１５と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＰＢ１ポリペプチドは、約１８６アミノ酸（例えば、１８４、１８５、１８６、１８７、または１８８アミノ酸）の長さを有する。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡＡｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５１４のＤＰＢ１＊０１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５１７のＤＰＢ１＊０１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５２０のＤＰＢ１＊０３：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５２１、ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００２１１２．３のＤＰＢ１＊０４：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５２４のＤＰＢ１０６：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５２８のＤＰＢ１＊１１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ００５９０のＤＰＢ１＊７１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ０２０４６のＤＰＢ１＊１０４：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。一実施形態において、ＤＲＢ３ β鎖ポリペプチドは、図１６中のＩＭＧＴ／ＨＬＡ Ａｃｃ Ｎｏ：ＨＬＡ１０３６４のＤＰＢ１＊１４１：０１ベータ鎖アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。
「ＤＰＢ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＰＢ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＰＢ１ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９２アミノ酸（例えば、９０、９１、９２、９３、または９４アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＰＢ１ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＰＢ１ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＰＢ１ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＱＢ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＱＢ１ポリペプチドである。ＤＱＢ１ポリペプチドは、図１９Ａまたは図１９Ｂまたは図１９Ｃに示されるＤＱＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＢ１ポリペプチドは、約１８８アミノ酸（例えば、１８６、１８７、１８８、１９０、１９１、または１９２アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＱＢ１ポリペプチドである。ＤＱＢ１ポリペプチドは、図１９Ａまたは図１９Ｂまたは図１９Ｃに示されるＤＱＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＢ１ポリペプチドは、約１８８アミノ酸（例えば、１８６、１８７、１８８、１９０、１９１、または１９２アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＱＢ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＱＢ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＱＢ１ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、または９６アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＢ１ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＱＢ１ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、または９６アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＢ１ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
ＤＱＢ２
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＱＢ２ポリペプチドである。ＤＱＢ２ポリペプチドは、図２０Ａまたは図２０に示されるＤＱＢ２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２１５と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＢ２ポリペプチドは、約１８２アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、または１８２アミノ酸）の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、ＤＱＢ２ポリペプチドである。ＤＱＢ２ポリペプチドは、図２０Ａまたは図２０に示されるＤＱＢ２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２１５と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＢ２ポリペプチドは、約１８２アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、または１８２アミノ酸）の長さを有する。
「ＤＱＢ２ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＱＢ２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
、またはそのアレルバリアントを含む。
好適なＤＱＢ２ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％、のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＢ２ β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
、または天然アレルバリアントを含み得る。
好適なＤＱＢ２ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２ ９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＢ２ β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
、その天然アレルバリアントを含み得る。
疾患リスクに関連したアレル及びハプロタイプ
ＭＨＣクラスＩＩのある特定のアレル及びハプロタイプは、疾患に関連しており、例えば、特定の疾患を発症するリスクが高まる。例えば、Ｅｒｌｉｃｈ ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｄｉａｂｅｔｅｓ ５７：１０８４；Ｇｏｕｇｈ ａｎｄ Ｓｉｍｍｏｎｄｓ（２００７）Ｃｕｒｒ．Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ８：４５３；Ｍｉｔｃｈｅｌｌ ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｒｏｂｂｉｎｓ Ｂａｓｉｃ Ｐａｔｈｏｌｏｇｙ Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ：Ｓａｕｎｄｅｒｓ，８ｔｈ ｅｄ．；Ｍａｒｇａｒｉｔｔｅ－Ｊｅａｎｎｉｎ ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｔｉｓｓｕｅ Ａｎｔｉｇｅｎｓ ６３：５６２；及びＫｕｒｋｏ ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｃｌｉｎ．Ｒｅｖ．Ａｌｌｅｒｇｙ Ｉｍｍｕｎｏｌ．４５：１７０を参照されたい。
ＭＨＣクラスＩＩのある特定のアレル及びハプロタイプは、疾患に関連しており、例えば、特定の疾患を発症するリスクが高まる。例えば、Ｅｒｌｉｃｈ ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｄｉａｂｅｔｅｓ ５７：１０８４；Ｇｏｕｇｈ ａｎｄ Ｓｉｍｍｏｎｄｓ（２００７）Ｃｕｒｒ．Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ８：４５３；Ｍｉｔｃｈｅｌｌ ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｒｏｂｂｉｎｓ Ｂａｓｉｃ Ｐａｔｈｏｌｏｇｙ Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ：Ｓａｕｎｄｅｒｓ，８ｔｈ ｅｄ．；Ｍａｒｇａｒｉｔｔｅ－Ｊｅａｎｎｉｎ ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｔｉｓｓｕｅ Ａｎｔｉｇｅｎｓ ６３：５６２；及びＫｕｒｋｏ ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｃｌｉｎ．Ｒｅｖ．Ａｌｌｅｒｇｙ Ｉｍｍｕｎｏｌ．４５：１７０を参照されたい。
ＨＬＡと自己免疫疾患の関連性及び自己抗原に関する更なる情報は、例えば、以下に見出すことができる：１）Ｆｅｒｎａｎｄｏ，ｅｔ ａｌ．，ＰＬｏＳ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｖｏｌｕｍｅ ４（４）ｅ１００００２４（２００８）、２）Ｊｏｎｅｓ，ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，６：２７１－２８２（２００６）、３）Ｇｏｕｇｈ，ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，２００７，８，４５３－４６５（２００７）、４）Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｉｔｙ ｆｒｏｍ Ｂｅｎｃｈ ｔｏ Ｂｅｄｓｉｄｅ，Ａｎａｙａ ｅｔ ａｌ．Ｅｄｓ．Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｅ Ｄｉｓｅａｓｅｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，ＣＲＥＡ Ｔｅｘｔｓ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ，Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ａｎｄ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｅｌ Ｒｏｓａｒｉｏ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ（２０１３）；例えば、Ｃｒｕｚ－Ｔａｐｉａｓ ｅｔ ａｌ．の第１７章ＨＬＡ Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｅ Ｄｉｓｅａｓｅｓ及び免疫原については第８章参照、５）Ｚａｎｅｌｌｉ，ｅｔ ａｌ．，Ｒｈｅｕｍａｔｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌｕｍｅ ３９，Ｉｓｓｕｅ １０，１ Ｏｃｔｏｂｅｒ ２０００，ｐａｇｅｓ １０６０－１０６６、６）Ｓａｎｔｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｅｘｐｅｒｔ Ｏｐｉｎ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ；１０（３）：２６９－２９２（２０１５）、７）Ｃｏｎｇｈｕａ，ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，９７（３２）：ｅ１１７９０（２０１８）、８）Ｆａｌｌａｔａｈ ｅｔ ａｌ．，Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｅ Ｄｉｓ．２０１２；３１２８１７（２０１２）、９）Ｂａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｉｔｙ，５，２０３－２０８（２００４）、１０）Ｍｅｎｃｏｎｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｉｔｙ，３５（１），４５－５１（２０１０）、１１）Ｓｉｎｋｏｖｉｔｓ ｅｔ ａｌ．，Ｆｒｏｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，９：１６４６（２０１８）、１２）Ｇｌａｄｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｒｈｅｕｍａｔｏｌｏｇｙ，３２（８）１４８１－１４８７（２００５）、１３）Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．，ＰｌｏｓＯｎｅ ９（１），ｅ８７３６３（２０１４）、１４）Ｚｈｏｕ，ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｐａｔｈｏｌ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．，２６（３）：７４７－７５１（２０１３）、１５）Ｋｅｍｐ ｅｔ ａｌ．Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｉｔｙ ｉｎ ｖｉｔｉｌｉｇｏ ｉｎ Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｅ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ－Ｐａｔｈｏｇｅｎｅｔｉｃ Ａｓｐｅｃｔｓ，Ｅｄ．Ｃ．Ｐ．Ｍａｖｒａｇａｎｉ，ｉｎ ＩｎＴｅｃｈ Ｐｒｅｓｓ：Ｒｉｊｅｋａ，Ｃｒｏａｔｉａ（２０１１）、１６）Ｓｉｍｍｏｎｄｓ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．７６：１５７－１６３，（２００５）、１７）Ｍａ ＆ Ｑｉｕ，Ｊ．Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ，７（５）：７１８－７２１（２００１）、１８）Ｏｋａ ｅｔ ａｌ．，ＰＬｏＳ Ｏｎｅ，１２（１０）：ｅ０１８７３２５（２０１７）、１９）Ｍｉｌｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ Ｉｍｍｕｎ．１６（７）：４７０－４８０（２０１５）、２０）Ｔｅｎｎｅｂｏ ｅｔ ａｌ．，Ｒｈｅｕｍａｔｏｌｏｇｙ ５４：５２８－５３５（２０１５）、２１）Ｇｒｅｉｄｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８０：８４４４－８４５４（２００８）、２２）Ｈｏｌｌｅｎｂａｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｕｔｏｉｍｍｕｎ．６５：１３－２５（２０１５）及びその中で引用されている参考文献、２３）Ｆｏｇｄｅｌｌ，ｅｔ ａｌ．，Ｔｉｓｓｕｅ Ａｎｔｉｇｅｎｓ １９９５：４６：３３３－３３６、２４）Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｃｌｉｎ Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ．Ｍｅｔａｂ．，８４：３１８２－３１８６（１９９９）、２５）Ｓｕｌｚｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，５４６：６５６－６６３（２０１７）、２６）Ｓｏｍｍａ ｅｔ ａｌ．，Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ Ｒｅｓ Ｐｒａｃｔ．２０１３：６８３８２４（２０１３）、２７）Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｍｅｄ Ｒｅｐ．；１７（５）：６５３３－６５４１（２０１８）、２８）Ｂｏｄｉｓ，ｅｔ ａｌ．，Ｒｈｅｕｍａｔｏｌ Ｔｈｅｒ．，５（１）：５－２０（２０１８）、２９）Ｏｏｉ，ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ；５４５（７６５３）：２４３－２４７（２０１７）、３０）Ｙａｍａｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｄｅｒｍａｔｏｌ．，３８（７）７１１－７１６（２０１１）、３１）Ｈａｍｍｅｒｓ ＆ Ｓｔａｎｌｅｙ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｐａｔｈｏｌ．，１１：１７５－１９７（２０１６）。
そのようなＨＬＡハプロタイプ及び／またはアレルを発現する個体が所定の自己免疫疾患を発症するリスクの増加と関連しているＨＬＡハプロタイプ及びアレルは、図３９に提供される表中に示される。本開示のＴＭＡＰＰは、図３９に記載される表に示されるＨＬＡハプロタイプ及び／またはアレルのいずれかを含み得る。図３９に記載される表はまた、特定の自己免疫疾患に関連する自己抗原の例も提供する。本開示のＴＭＡＰＰは、表に示される自己抗原のいずれかのペプチドエピトープ（例えば、４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のペプチドエピトープ）を含み得る。
以下は、図３９に提供される表の注意書きである。１）ＡＨ８．１（ＨＬＡ Ａ１－Ｂ８－ＤＲ３－ＤＱ２ハプロタイプ）、２）ＤＱ３アレルは、ＤＱＢ１＊０３：０１～ＤＱＢ１＊０３：０５タンパク質などのＤＱＢ１＊０３アレルを含む、３）ＤＱ５アレルは、ＤＱＢ１＊０５：０１～ＤＱＢ１＊０５：０４などのＤＱＢ１＊０５アレルを含み、ＤＱＡ１＊０１：０１と関連し得る、４）ＤＲ２アレルは、ＤＲＢ１＊１５：０１～１５：０４及びＤＲＢ１＊１６：０１～１６：０６を含む、５）ＤＲ３ハプロタイプは、ＤＲＢ１＊０３：０１、ＤＲＢ１＊０３：０２、ＤＲＢ１＊０３：０３、及びＤＲＢ１＊０３：０４を含む、６）ＤＲ４ハプロタイプは、ＤＲＢ１＊０４：０１～ＤＲＢ１＊０４：１３を含む、７）ＡＨ＝祖先ハプロタイプ；７）Ｓｉｍｍｏｎｄｓ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．７６：１５７－１６３（２００５）、表１参照、オッズ比が１．５より大きいＨＬＡには次のＤＲＢ１、ＤＡＢ１アレル及びＤＱＡ１アレル：ＤＲＢ１＊－０３：０１～０５、－１０：０１、－０８：０１～１１、－１６：０１～６、－１１：０１～２１、－０１：０１～０４、－０４：０１～２２、及び－１５：０１～０５；ＤＱＢ１＊－０２、－０４、－０３：０１、０３：０４、－０５、－０６：０１～０９、及び－０３：０２；ならびにＨＬＡ－ＤＱＡ１＊－０５：０１～０２、－０６：０１、－０４：０１、－０１：０１、－０１：０４、－０１：０２、－０１：０３、－０３：１１、及び－０３：１２が含まれる、８）Ｌｉ ｅｔ ａｌ．、Ｍｏｌ Ｍｅｄ Ｒｅｐ．；１７（５）：６５３３－６５４１（２０１８）は、自己抗原に由来するエピトープには、ＳＭＤ１（ＮＣＢＩアクセッション番号ＣＡＥ１１８９７．１）、ＳＭＤ２（ＮＣＢＩアクセッション番号ＡＡＣ１３７７６．１）、ＳＭＤ３（ＮＣＢＩアクセッション番号ＡＡＡ５７０３４．１）、増殖細胞核抗原（ＰＣＮＡ）（ＮＣＢＩアクセッション番号ＮＰ＿８７２５９０．１）、酸性リボソームリンタンパク質（Ｐ１）（ＮＣＢＩアクセッション番号ＡＡＡ３６４７１．１）、酸性リボソームリンタンパク質（Ｐ２）（ＮＣＢＩアクセッション番号ＡＡＡ３６４７２．１）、ｓｎＲＮＰ－Ｂ／Ｂ’（ＮＣＢＩアクセッション番号Ｐ１４６７８．２）、Ｕ１－ｓｎＲＮＰ－Ｃ（ＮＣＢＩアクセッション番号ＮＰ＿００３０８４．１）、Ｕ１－ｓｎＲＮＰ－Ａ（ＮＣＢＩアクセッション番号ＮＰ＿００４５８７．１）、ヌクレオリン（ＮＣＢＩアクセッション番号ＡＡＡ５９９５４．１）、酸性リボソームリンタンパク質（Ｐ０）（ＮＣＢＩアクセッション番号ＡＡＡ３６４７０．１）、ＤＮＡトポイソメラーゼ１（短縮型）（ＮＣＢＩアクセッション番号ＮＰ＿００３２７７．１）、ＤＮＡトポイソメラーゼ１（全長）（ＮＣＢＩアクセッション番号ＮＰ＿００３２７７．１）、及びＵ１－ＳｎＲＮＰ６８／７０ＫＤａ（ＮＣＢＩアクセッション番号Ｐ０８６２１．２）が含まれることを記している。
ＤＲＢ１
ＨＬＡ－ＤＲ３血清型は、早期発症重症筋無力症、橋本甲状腺炎、自己免疫性肝炎、一次性シェーグレン症候群、及びＳＬＥと関連している。ある特定のＤＲＢ１アレルは、そのようなアレルを発現する個体が特定の自己免疫疾患または複数の自己免疫疾患を発症するリスクの増加と関連している。
ＨＬＡ－ＤＲ３血清型は、早期発症重症筋無力症、橋本甲状腺炎、自己免疫性肝炎、一次性シェーグレン症候群、及びＳＬＥと関連している。ある特定のＤＲＢ１アレルは、そのようなアレルを発現する個体が特定の自己免疫疾患または複数の自己免疫疾患を発症するリスクの増加と関連している。
ＤＲＢ１＊０１：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０１：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０２ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０１：０３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０３ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０１：０３ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０３：０１
ＤＲＢ１＊０３０１（図７の「ＤＲＢ１＊０３：０１」）は、早期発症グレーヴス病及び／または１型自己免疫性肝炎の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０３０１（図７の「ＤＲＢ１＊０３：０１」）は、早期発症グレーヴス病及び／または１型自己免疫性肝炎の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０３：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０３０４
ＤＲＢ１＊０３０４は、グレーヴス病と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０３０４は、グレーヴス病と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０１
ＤＲＢ１＊０４：０１は、多発性硬化症及び／またはリウマチ様関節炎の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０１は、多発性硬化症及び／またはリウマチ様関節炎の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０２
ＤＲＢ１＊０４：０２は、特発性尋常性天疱瘡、及び／またはＳＬＥ（例えば、ＳＬＥ関連抗カルジオリピン、ＳＬＥ関連抗β２糖タンパク質Ｉ）の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０２は、特発性尋常性天疱瘡、及び／またはＳＬＥ（例えば、ＳＬＥ関連抗カルジオリピン、ＳＬＥ関連抗β２糖タンパク質Ｉ）の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０３
ＤＲＢ１＊０４０３は、ＳＬＥの発症リスクの増加（例えば、ＳＬＥ関連抗カルジオリピン抗体及び／またはＳＬＥ関連抗β２糖タンパク質Ｉ抗体の発症リスクの増加）と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０３ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４０３は、ＳＬＥの発症リスクの増加（例えば、ＳＬＥ関連抗カルジオリピン抗体及び／またはＳＬＥ関連抗β２糖タンパク質Ｉ抗体の発症リスクの増加）と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０３ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０４
ＤＲＢ１＊０４：０４は、リウマチ様関節炎（例えば、循環する抗環状シトルリン化ペプチド抗体の力価が高くなるリスクの増加）及び／または自己免疫性肝炎の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０４アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０４ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０４は、リウマチ様関節炎（例えば、循環する抗環状シトルリン化ペプチド抗体の力価が高くなるリスクの増加）及び／または自己免疫性肝炎の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０４アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０４ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０５
ＤＲＢ１＊０４：０５は、リウマチ様関節炎及び／または自己免疫性肝炎の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０５アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０５ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０５は、リウマチ様関節炎及び／または自己免疫性肝炎の発症リスクの増加と関連している。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０５アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０５ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０６
ＤＲＢ１＊０４：０６は、抗カスパーゼ－８自己抗体の発生リスクの増加と関連している（例えば、珪肺症－全身性強皮症（ＳＳｃ）－全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０６アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０６ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０６は、抗カスパーゼ－８自己抗体の発生リスクの増加と関連している（例えば、珪肺症－全身性強皮症（ＳＳｃ）－全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）。したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０６アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０６ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０４：０８
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０８アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０８ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０８アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０８ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０８アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０８ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０８アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０８ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０８アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０８ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０４：０８アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０４：０８ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０８：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０８：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０２ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０８：０３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０３ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０８：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０８：０３ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊０９：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１０：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１０：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１０：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１０：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１０：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１０：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１０：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１０：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１０：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１０：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１０：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１０：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１０：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１１：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１１：０３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０３ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０３ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１１：０４
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０４アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０４ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１１：０４アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１１：０４ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１３：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１３：０３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０３ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１３：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１３：０３ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１４：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１４：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０２ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１４：０５
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０５アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０５ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０５アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０５ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１４：０６
ＤＲＢ１＊１４：０６：
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０６アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０６ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１４：０６：
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１４：０６アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１４：０６ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＲＢ１＊１５０２、及びＤＲＢ１＊１５０３
ＤＲ２血清型は、ＳＬＥ及び／またはＭＳのリスク増加と関連している。ＳＬＥ及び／またはＭＳのリスク増加と関連しているＨＬＡアレルには、ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＲＢ１＊１５０２、及びＤＲＢ１＊１５０３が含まれる。
ＤＲ２血清型は、ＳＬＥ及び／またはＭＳのリスク増加と関連している。ＳＬＥ及び／またはＭＳのリスク増加と関連しているＨＬＡアレルには、ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＲＢ１＊１５０２、及びＤＲＢ１＊１５０３が含まれる。
したがって、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊１５０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊１５０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図７に示されるＤＲＢ１＊１５０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０２アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０２アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０３アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０３アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０３ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１５：０４
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０４アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０４ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０４アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５０４アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５０４ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１５：０５
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０５アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０５ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０５アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０５ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０５アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０５ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１５：０６
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０６アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０６ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０６アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０６ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０６アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０６ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ１＊１５：０７
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０７アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０７ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０７アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０７ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０７アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０７ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０７アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０７ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０７アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０７ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ１＊１５：０７アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ１＊１５：０７ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＢ３アレルのＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＢ３アレルのＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ３＊０１：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０１：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０１：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ３＊０３：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０３：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ３＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０３：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ４
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＢ４アレルのＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＢ４アレルのＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドを含む。
例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ４＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ４＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ４＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ４＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ４＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ３＊０３：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ５
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＢ５アレルのＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＢ５アレルのＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドを含む。
ＤＲＢ５＊０１：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ５＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ５＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ５＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ５＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ５＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＢ５＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２５～２２７に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１
ある特定のＤＱＢ１アレルは、そのようなアレルを発現する個体が多発性硬化症などの自己免疫疾患を発症するリスクの増加と関連している。例えば、ＤＱＢ１＊０３０１、及びＤＱＢ１＊０６０２は、ＭＳ及び／またはより重症のＭＳ表現型（例えば、より重症の炎症性及び神経変性損傷）の発症リスクの増加と関連している。
ある特定のＤＱＢ１アレルは、そのようなアレルを発現する個体が多発性硬化症などの自己免疫疾患を発症するリスクの増加と関連している。例えば、ＤＱＢ１＊０３０１、及びＤＱＢ１＊０６０２は、ＭＳ及び／またはより重症のＭＳ表現型（例えば、より重症の炎症性及び神経変性損傷）の発症リスクの増加と関連している。
ＤＱＢ１＊０２：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０２：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０２：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０２：０２ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０３：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０３：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０２アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３０２アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３０２ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０３：０３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０３アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０３アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０３アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０３アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０３：０４
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０３：０４アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０３：０４ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０４：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０４：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０４：０２アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０５：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０５：０３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０３アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０３アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０３ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０３アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０３アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０５：０３アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０５：０３ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０６：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＢ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＢ１＊０６：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図１９Ａに示されるＤＱＢ１＊０６０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図１９Ａに示されるＤＱＢ１＊０６０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図１９Ａに示されるＤＱＢ１＊０６０２アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図１９Ａに示されるＤＱＢ１＊０６０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図１９Ａに示されるＤＱＢ１＊０６０２アミノ酸配列のアミノ酸３３～１２６に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、図１９Ａに示されるＤＱＢ１＊０６０２アミノ酸配列のアミノ酸１２７～２２０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＢ１＊０６０２ポリペプチドを含む。
ＤＰＢ１
本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＰＢ１アレルのＭＨＣクラスＩＩ β鎖を含み得る。
本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＰＢ１アレルのＭＨＣクラスＩＩ β鎖を含み得る。
ＤＰＢ１＊０３：０１
例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２１に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２２～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。
例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２１に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２２～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。
ＤＰＢ１＊０９：０１
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２１に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２２～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２１に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊０９：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２２～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊０９：０１ポリペプチドを含む。
ＤＰＢ１＊１３：０１
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２１に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２２～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２１に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊１３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２２～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊１３：０１ポリペプチドを含む。
ＤＰＢ１＊３５：０１
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊３５：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊３５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊３５：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２１に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊３５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊３５：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２２～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊３５：０１ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊３５：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊３５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊３５：０１アミノ酸配列のアミノ酸３０～１２１に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊３５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＰＢ１＊３５：０１アミノ酸配列のアミノ酸１２２～２１５に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＰＢ１＊３５：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＱＡ１アレルのＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＱＡ１アレルのＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０１：０１
例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。
例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０１：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０２ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０２アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０２ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０１：０３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０３ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０３ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０３アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０３ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０１：０４
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０４アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０４アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０４アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０４ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０４アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０１：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０４アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０４ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ＊０１：０４アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ＊０１：０４ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０３：０１
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０３：０２
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０３：０２アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０４：０１
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０４：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０５：０１
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０５：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０５：０１ポリペプチドを含む。
ＤＱＡ１＊０６：０１
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。
別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸２４～１１０に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＱＡ１＊０６：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１１～２０４に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＱＡ１＊０６：０１ポリペプチドを含む。
ＤＲＡ１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＡ１アレルのＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドを含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＡ１アレルのＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドを含む。
ＤＲＡ１＊０１：０１
例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸２６～２０３に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＡ１＊０１：０１（「ＤＲＡ＊０１：０１」とも呼ぶ；図３９では「ＤＲＡ１＊０１：０１と称される）ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸２６～１０９に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１０～２０３に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。
例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸２６～２０３に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＡ１＊０１：０１（「ＤＲＡ＊０１：０１」とも呼ぶ；図３９では「ＤＲＡ１＊０１：０１と称される）ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸２６～１０９に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、以下に記載されるＤＲＡ１＊０１：０１アミノ酸配列のアミノ酸１１０～２０３に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドを含む。
組み合わせ（ハプロタイプ）
本開示のＴＭＡＰＰは、ＭＨＣ α鎖とＭＨＣ β鎖の任意の組み合わせを含み得、例えば、α鎖がＤＲＡ α鎖で、β鎖がＤＲＢ β鎖であり、α鎖がＤＱＡ α鎖で、β鎖がＤＱＢ β鎖である場合などである。以下は、可能な組み合わせ（ハプロタイプ）の例である。
本開示のＴＭＡＰＰは、ＭＨＣ α鎖とＭＨＣ β鎖の任意の組み合わせを含み得、例えば、α鎖がＤＲＡ α鎖で、β鎖がＤＲＢ β鎖であり、α鎖がＤＱＡ α鎖で、β鎖がＤＱＢ β鎖である場合などである。以下は、可能な組み合わせ（ハプロタイプ）の例である。
ＤＱＡ１＊０１：０１とＤＱＢ１＊０５：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０５：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０５：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０５：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０５：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＲＡ１＊０１：０１とＤＲＢ１＊０４：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊０４：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊０４：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊０４：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊０４：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＲＡ１＊０１：０１（ＤＲＡ＊０１：０１）とＤＲＢ５＊０１：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ５＊０１：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ５＊０１：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ５＊０１：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ５＊０１：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＲＡ１＊０１：０１とＤＲＢ１＊１５：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊１５：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊１５：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊１５：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊１５：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＱＡ１＊０１：０２とＤＱＢ１＊０６：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０２ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０６：０２ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０２ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０６：０２ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０２ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０６：０２ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０２ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０６：０２ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＱＡ１＊０３：０１とＤＱＢ１＊０３：０３
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０３：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０３：０２ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０３：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０３：０２ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０３：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０３：０２ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０３：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０３：０２ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＱＡ１＊０１：０４とＤＱＢ１＊０５：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０４ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０５：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０４ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０５：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０４ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０５：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０４ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０５：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＲＡ１＊０１：０１とＤＲＢ１＊０１：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊０１：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊０１：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊０１：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＲＢ１＊０１：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＱＡ１＊０４：０１とＤＱＢ１＊０４：０２
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０４：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０４：０２ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０４：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０４：０２ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０４：０１ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０４：０２ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０４：０１ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０４：０２ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＱＡ１＊０３：０２とＤＱＢ１＊０３：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０３：０２ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０３：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０３：０２ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０３：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０３：０２ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０３：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０３：０２ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０３：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
ＤＱＡ１＊０１：０３とＤＱＢ１＊０６：０１
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０３ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０６：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０３ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０６：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０３ α鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０６：０１ β鎖ポリペプチドの約７０アミノ酸～約２００アミノ酸（例えば、約７０ａａ～約１００ａａ、または約１００ａａ～約１５０ａａ、または約１５０ａａ～約２００ａａ）の連続するストレッチに対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＨＣ β鎖ポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＤＱＡ１＊０１：０３ α鎖ポリペプチドと、ｉｉ）ＤＱＢ１＊０６：０１ β鎖ポリペプチドと、を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、疾患の発症リスクの増加と関連しているＭＨＣクラスＩＩ α及び／またはβ鎖アレルを含み、例えば、ＴＭＡＰＰで治療される個体は、ＭＨＣクラスＩＩ α鎖及び／またはβ鎖アレルを発現する。
骨格ポリペプチド
本開示のＴＭＡＰＰは、多量体であれ単量体であれ、免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格を含み得る。本開示のＴＭＡＰＰポリペプチドは、多量体であれ単量体であれ、Ｆｃポリペプチドを含み得るか、別の好適な骨格ポリペプチドを含み得る。
本開示のＴＭＡＰＰは、多量体であれ単量体であれ、免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格を含み得る。本開示のＴＭＡＰＰポリペプチドは、多量体であれ単量体であれ、Ｆｃポリペプチドを含み得るか、別の好適な骨格ポリペプチドを含み得る。
好適な骨格ポリペプチドには、抗体ベースの骨格ポリペプチド及び非抗体ベースの骨格が含まれる。非抗体ベースの骨格には、例えば、アルブミン、ＸＴＥＮ（延長組み換え）ポリペプチド、トランスフェリン、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド（例えば、Ｈａｓｓｏｕｎｅｈ ｅｔ ａｌ．（２０１２）Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．５０２：２１５参照；例えば、（Ｖａｌ－Ｐｒｏ－Ｇｌｙ－Ｘ－Ｇｌｙ；配列番号５９）（配列中、Ｘは、プロリン以外の任意のアミノ酸である）のペンタペプチド反復単位を含むポリペプチド）、アルブミン結合ポリペプチド、シルク様ポリペプチド（例えば、Ｖａｌｌｕｚｚｉ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｐｈｉｌｏｓ Ｔｒａｎｓ Ｒ Ｓｏｃ Ｌｏｎｄ Ｂ Ｂｉｏｌ Ｓｃｉ．３５７：１６５参照）、シルクエラスチン様ポリペプチド（ＳＥＬＰ；例えば、Ｍｅｇｅｅｄ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ａｄｖ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ Ｒｅｖ．５４：１０７５参照）などが含まれる。好適なＸＴＥＮポリペプチドには、例えば、ＷＯ２００９／０２３２７０、ＷＯ２０１０／０９１１２２、ＷＯ２００７／１０３５１５、ＵＳ２０１０／０１８９６８２、及びＵＳ２００９／００９２５８２に開示されているものが含まれる。Ｓｃｈｅｌｌｅｎｂｅｒｇｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００９）Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２７：１１８６）も参照されたい。好適なアルブミンポリペプチドには、例えば、ヒト血清アルブミンが含まれる。
好適な骨格ポリペプチドは、いくつかの場合において、半減期延長ポリペプチドである。したがって、いくつかの場合において、好適な骨格ポリペプチドは、骨格ポリペプチドを持たない対照多量体ポリペプチドと比較して、多量体ポリペプチドのｉｎ ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を増大させる。例えば、いくつかの場合において、骨格ポリペプチドは、骨格ポリペプチドを持たない対照多量体ポリペプチドと比較して、多量体ポリペプチドのｉｎ ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、または１００倍を超えて増大させる。一例として、いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、Ｆｃポリペプチドを持たない対照多量体ポリペプチドと比較して、多量体ポリペプチドのｉｎ ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、または１００倍を超えて増大させる。
Ｆｃポリペプチド
いくつかの場合において、本開示のＴＭＭＰの第１及び／または第２のポリペプチド鎖は、Ｆｃポリペプチドを含む。本開示のＴＭＭＰのＦｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ２ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ３ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃなどであり得る。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａ～２１Ｇに示されるＦｃ領域のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃ領域は、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃ領域は、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、Ｎ７７の置換を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、Ｎ７７Ａの置換を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸９９～３２５に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１９～２４６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１～２７６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１～２３４に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＭＰの第１及び／または第２のポリペプチド鎖は、Ｆｃポリペプチドを含む。本開示のＴＭＭＰのＦｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ２ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ３ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃなどであり得る。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａ～２１Ｇに示されるＦｃ領域のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃ領域は、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃ領域は、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、Ｎ７７の置換を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、Ｎ７７Ａの置換を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸９９～３２５に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１９～２４６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１～２７６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１～２３４に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１００～３２７に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合において、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。
いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｎ２９７（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＮ７７）のアスパラギン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるアミノ酸配列を含む（図２１Ａに示されるアミノ酸配列ではＮ７７であるＮ２９７Ａの置換を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４）のロイシン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３５（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１５）のロイシン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。
いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｅに示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｆに示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｇに示されるアミノ酸配列を含む（図２１Ｇに示されるアミノ酸配列では位置１４及び１５に対応するＬ２３４Ａの置換及びＬ２３５Ａの置換を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｐ３３１（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＰ１１１）のプロリン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含み、いくつかの場合において、置換は、Ｐ３３１Ｓの置換である。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４及びＬ２３５（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５）のロイシン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４及びＬ２３５（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５）のロイシン以外のアミノ酸による置換、ならびにＰ３３１（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＰ１１１）のプロリン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｅに示されるアミノ酸配列（（図２１Ｅに示されるアミノ酸配列ではアミノ酸位置１４、１５、及び１１１に対応するＬ２３４Ｆ、Ｌ２３５Ｅ、及びＰ３３１Ｓの置換を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＭＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｇに示されるようにＬ２３４Ａ及びＬ２３５Ａの置換（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５のＡｌａによる置換）を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。
リンカー
上記のとおり、本開示のＴＭＡＰＰは、例えば、エピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、第１のＭＨＣポリペプチドと第２のＭＨＣポリペプチドとの間などに挿入されたリンカーペプチドを含み得る。
上記のとおり、本開示のＴＭＡＰＰは、例えば、エピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、第１のＭＨＣポリペプチドと第２のＭＨＣポリペプチドとの間などに挿入されたリンカーペプチドを含み得る。
好適なリンカー（「スペーサー」とも称される）は、容易に選択することができ、１アミノ酸～２５アミノ酸、３アミノ酸～２０アミノ酸、２アミノ酸～１５アミノ酸、３アミノ酸～１２アミノ酸など、また４アミノ酸～１０アミノ酸、５アミノ酸～９アミノ酸、６アミノ酸～８アミノ酸、または７アミノ酸～８アミノ酸を含む、多くの好適な長さのいずれかであってよい。好適なリンカーは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、２５～３５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、または３５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、３５～４５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、または４５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、４５～５０アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、４５、４６、４７、４８、４９、または５０アミノ酸長であり得る。
例示的なリンカーとしては、グリシンポリマー（Ｇ）ｎ、グリシン－セリンポリマー（例えば、（ＧＳ）ｎ、（ＧＳＧＧＳ）ｎ（配列番号６１）及び（ＧＧＧＳ）ｎ（配列番号６２）（ここで、ｎは、少なくとも１つの整数である）を含む）、グリシン－アラニンポリマー、アラニン－セリンポリマー、及び当該技術分野において知られている他の柔軟性のあるリンカーが挙げられる。グリシン及びグリシン－セリンポリマーが使用され得、ＧｌｙとＳｅｒはいずれも比較的非構造的であることから、構成成分間の中間テザーとして機能することができる。グリシンポリマーは、グリシンが更にアラニンよりも極めて多くのΦ－Ψ空間を利用でき、長い側鎖を持つ残基よりも制限が少ないため、使用され得る（Ｓｃｈｅｒａｇａ，Ｒｅｖ．Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｃｈｅｍ．１１１７３－１４２（１９９２）参照）。例示的なリンカーは、限定するものではないが、ＧＧＳＧ（配列番号６３）、ＧＧＳＧＧ（配列番号６４）、ＧＳＧＳＧ（配列番号６５）、ＧＳＧＧＧ（配列番号６６）、ＧＧＧＳＧ（配列番号６７）、ＧＳＳＳＧ（配列番号６８）などを含む、アミノ酸配列を含み得る。例示的なリンカーは、例えば、Ｇｌｙ（Ｓｅｒ４）ｎ、（配列番号６９）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である）を含み得る。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＳＳＳＳ）ｎ（配列番号６９）（ここで、ｎは、４である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＳＳＳＳ）ｎ（配列番号６９）（ここで、ｎは、５である）を含む。例示的なリンカーは、例えば、（ＧｌｙＧｌｙＧｌｙＧｌｙＳｅｒ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である）を含み得る。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、２である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、３である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、４である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、５である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、６である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、７である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、８である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、９である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１）（ここで、ｎは、１０である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列ＡＡＡＧＧ（配列番号７０）を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するリンカーポリペプチドは、ＴＭＡＰＰの第２のポリペプチド中に存在するシステイン残基とジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を含む。いくつかの場合において、例えば、好適なリンカーは、アミノ酸配列
を含む。
エピトープ提示ペプチド
本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するペプチドエピトープ（本明細書において「ペプチド抗原」または「エピトープ提示ペプチド」または「エピトープ」とも称される）は、Ｔ細胞の表面上のＴＣＲに対するエピトープを表す。エピトープ提示ペプチドは、約４アミノ酸～約２５アミノ酸の長さを有し得、例えば、エピトープは、４アミノ酸（ａａ）～１０ａａ、１０ａａ～１５ａａ、１５ａａ～２０ａａ、または２０ａａ～２５ａａの長さを有し得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープは、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７、ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａの長さを有し得る。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープ提示ペプチドは、５アミノ酸～１０アミノ酸、例えば、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、または１０ａａの長さを有する。
本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するペプチドエピトープ（本明細書において「ペプチド抗原」または「エピトープ提示ペプチド」または「エピトープ」とも称される）は、Ｔ細胞の表面上のＴＣＲに対するエピトープを表す。エピトープ提示ペプチドは、約４アミノ酸～約２５アミノ酸の長さを有し得、例えば、エピトープは、４アミノ酸（ａａ）～１０ａａ、１０ａａ～１５ａａ、１５ａａ～２０ａａ、または２０ａａ～２５ａａの長さを有し得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープは、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７、ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａの長さを有し得る。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープ提示ペプチドは、５アミノ酸～１０アミノ酸、例えば、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、または１０ａａの長さを有する。
本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープ提示ペプチドは、Ｔ細胞によって特異的に結合され、すなわち、エピトープは、エピトープ特異的Ｔ細胞によって特異的に結合される。エピトープ特異的Ｔ細胞は、参照アミノ酸配列を有するエピトープ提示ペプチドに結合するが、参照アミノ酸配列と異なるエピトープには実質的に結合しない。例えば、エピトープ特異的Ｔ細胞は、参照アミノ酸配列を有するエピトープ提示ペプチドに結合し、参照アミノ酸配列と異なるエピトープには、結合したとしても、１０－６Ｍ未満、１０－５Ｍ未満、または１０－４Ｍ未満の親和性で結合する。エピトープ特異的Ｔ細胞は、少なくとも１０－７Ｍ、少なくとも１０－８Ｍ、少なくとも１０－９Ｍ、または少なくとも１０－１０Ｍの親和性で、特異的なエピトープ提示ペプチドに結合することができる。
がんエピトープ
好適なエピトープ提示ペプチドには、がん関連抗原中に存在するエピトープ提示ペプチドが含まれるが、これらに限定されない。がん関連抗原には、葉酸受容体α、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＣＡＩＸ）、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ４４ｖ７／８、がん胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮糖タンパク質－２（ＥＧＰ－２）、上皮糖タンパク質－４０（ＥＧＰ－４０）、葉酸結合タンパク質（ＦＢＰ）、胎児型アセチルコリン受容体、ガングリオシド抗原ＧＤ２、Ｈｅｒ２／ｎｅｕ、ＩＬ－１３Ｒ－ａ２、カッパ軽鎖、ＬｅＹ、Ｌ１細胞接着分子、黒色腫関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＭＡＧＥ－Ａ１、メソテリン、ＭＵＣ１、ＮＫＧ２Ｄリガンド、腫瘍胎児抗原（ｈ５Ｔ４）、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、腫瘍関連糖タンパク質－７２（ＴＡＧ－７２）、及び血管内皮細胞増殖因子受容体－２（ＶＥＧＦ－Ｒ２）が含まれるが、これらに限定されない。例えば、Ｖｉｇｎｅｒｏｎ ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｉｔｙ １３：１５、及びＶｉｇｎｅｒｏｎ（２０１５）ＢｉｏＭｅｄ Ｒｅｓ．Ｉｎｔ’ｌ Ａｒｔｉｃｌｅ ＩＤ ９４８５０１を参照されたい。いくつかの場合において、エピトープは、ヒトパピローマウイルスＥ７抗原エピトープであり、例えば、Ｒａｍｏｓ ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．３６：６６を参照されたい。
好適なエピトープ提示ペプチドには、がん関連抗原中に存在するエピトープ提示ペプチドが含まれるが、これらに限定されない。がん関連抗原には、葉酸受容体α、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＣＡＩＸ）、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ４４ｖ７／８、がん胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮糖タンパク質－２（ＥＧＰ－２）、上皮糖タンパク質－４０（ＥＧＰ－４０）、葉酸結合タンパク質（ＦＢＰ）、胎児型アセチルコリン受容体、ガングリオシド抗原ＧＤ２、Ｈｅｒ２／ｎｅｕ、ＩＬ－１３Ｒ－ａ２、カッパ軽鎖、ＬｅＹ、Ｌ１細胞接着分子、黒色腫関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＭＡＧＥ－Ａ１、メソテリン、ＭＵＣ１、ＮＫＧ２Ｄリガンド、腫瘍胎児抗原（ｈ５Ｔ４）、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、腫瘍関連糖タンパク質－７２（ＴＡＧ－７２）、及び血管内皮細胞増殖因子受容体－２（ＶＥＧＦ－Ｒ２）が含まれるが、これらに限定されない。例えば、Ｖｉｇｎｅｒｏｎ ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｉｔｙ １３：１５、及びＶｉｇｎｅｒｏｎ（２０１５）ＢｉｏＭｅｄ Ｒｅｓ．Ｉｎｔ’ｌ Ａｒｔｉｃｌｅ ＩＤ ９４８５０１を参照されたい。いくつかの場合において、エピトープは、ヒトパピローマウイルスＥ７抗原エピトープであり、例えば、Ｒａｍｏｓ ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．３６：６６を参照されたい。
いくつかの場合において、好適なペプチドエピトープは、ＭＵＣ１ポリペプチド、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）Ｅ６ポリペプチド、ＬＭＰ２ポリペプチド、ＨＰＶ Ｅ７ポリペプチド、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）ｖＩＩＩポリペプチド、ＨＥＲ－２／ｎｅｕポリペプチド、黒色腫抗原ファミリーＡ３（ＭＡＧＥＡ３）ポリペプチド、ｐ５３ポリペプチド、変異型ｐ５３ポリペプチド、ＮＹ－ＥＳＯ－１ポリペプチド、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原；ＰＳＭＡ）ポリペプチド、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）ポリペプチド、Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原（ｍｅｌａｎＡ／ＭＡＲＴ１）ポリペプチド、Ｒａｓポリペプチド、ｇｐ１００ポリペプチド、プロテアーゼ３（ＰＲ１）ポリペプチド、ｂｃｒ－ａｂｌポリペプチド、チロシナーゼポリペプチド、サバイビンポリペプチド、前立腺特異的抗原（ＰＳＡ）ポリペプチド、ｈＴＥＲＴポリペプチド、肉腫転座切断点ポリペプチド、滑膜肉腫Ｘ（ＳＳＸ）切断点ポリペプチド、ＥｐｈＡ２ポリペプチド、前立腺性酸性ホスファターゼ（ＰＡＰ）ポリペプチド、黒色腫アポトーシス阻害（ＭＬ－ＩＡＰ）ポリペプチド、アルファ－フェトプロテイン（ＡＦＰ）ポリペプチド、上皮細胞接着分子（ＥｐＣＡＭ）ポリペプチド、ＥＲＧ（ＴＭＰＲＳＳ２ ＥＴＳ融合体）ポリペプチド、ＮＡ１７ポリペプチド、ペアードボックス－３（ＰＡＸ３）ポリペプチド、未分化リンパ腫キナーゼ（ＡＬＫ）ポリペプチド、アンドロゲン受容体ポリペプチド、サイクリンＢ１ポリペプチド、Ｎ－ｍｙｃがん原遺伝子（ＭＹＣＮ）ポリペプチド、Ｒａｓホモログ遺伝子ファミリーメンバーＣ（ＲｈｏＣ）ポリペプチド、チロシナーゼ関連タンパク質－２（ＴＲＰ－２）ポリペプチド、メソテリンポリペプチド、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）ポリペプチド、黒色腫関連抗原－１（ＭＡＧＥ Ａ１）ポリペプチド、シトクロムＰ４５０ １Ｂ１（ＣＹＰ１Ｂ１）ポリペプチド、胎盤特異的タンパク質１（ＰＬＡＣ１）ポリペプチド、ＢＯＲＩＳポリペプチド（ＣＣＣＴＣ結合因子またはＣＴＣＦとしても知られる）、ＥＴＶ６－ＡＭＬポリペプチド、乳癌抗原ＮＹ－ＢＲ－１ポリペプチド（アンキリンリピートドメイン含有タンパク質３０Ａとも称される）、Ｇタンパク質シグナル伝達調節因子（ＲＧＳ５）ポリペプチド、Ｔ細胞によって認識される扁平上皮癌抗原（ＳＡＲＴ３）ポリペプチド、炭酸脱水酵素ＩＸポリペプチド、ペアードボックス－５（ＰＡＸ５）ポリペプチド、ＯＹ－ＴＥＳ１（精巣抗原；アクロシン結合タンパク質としても知られる）ポリペプチド、精子タンパク質１７ポリペプチド、リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ（ＬＣＫ）ポリペプチド、高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷ－ＭＡＡ）、Ａキナーゼアンカータンパク質－４（ＡＫＡＰ－４）、滑膜肉腫Ｘ切断点２（ＳＳＸ２）ポリペプチド、Ｘ抗原ファミリーメンバー１（ＸＡＧＥ１）ポリペプチド、Ｂ７ホモログ３（Ｂ７Ｈ３；ＣＤ２７６としても知られる）ポリペプチド、レグマインポリペプチド（ＬＧＭＮ１；アスパラギニルエンドペプチダーゼとしても知られる）、Ｉｇ及びＥＧＦ相同性ドメイン－２を含むチロシンキナーゼ（Ｔｉｅ－２；アンジオポエチン－１受容体としても知られる）ポリペプチド、Ｐ抗原ファミリーメンバー４（ＰＡＧＥ４）ポリペプチド、血管内皮細胞増殖因子受容体２（ＶＥＧＦ２）ポリペプチド、ＭＡＤ－ＣＴ－１ポリペプチド、線維芽細胞活性化タンパク質（ＦＡＰ）ポリペプチド、血小板由来成長因子受容体ベータ（ＰＤＧＦβ）ポリペプチド、ＭＡＤ－ＣＴ－２ポリペプチド、Ｆｏｓ関連抗原－１（ＦＯＳＬ）ポリペプチド、ならびにウィルムス腫瘍－１（ＷＴ１）ポリペプチドの約４アミノ酸長～約２０アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、または２０ａａ）のペプチド断片である。
がん関連抗原のアミノ酸配列は、当該技術分野において知られており、例えば、ＭＵＣ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＣＡＡ５６７３４）、ＬＭＰ２（ＧｅｎＢａｎｋ ＣＡＡ４７０２４）、ＨＰＶ Ｅ６（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＤ３３２５２）、ＨＰＶ Ｅ７（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＨＧ９９４８０）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１３３３８７０）、ＨＥＲ－２／ｎｅｕ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＩ６７１４７）、ＭＡＧＥ－Ａ３（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＨ１１７４４）、ｐ５３（ＧｅｎＢａｎｋ ＢＡＣ１６７９９）、ＮＹ－ＥＳＯ－１（ＧｅｎＢａｎｋ ＣＡＡ０５９０８）、ＰＳＭＡ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＨ２５６７２）、ＣＥＡ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＡ５１９６７）、ｍｅｌａｎ／ＭＡＲＴ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００５５０２）、Ｒａｓ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１１２３９１４）、ｇｐ１００（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＣ６０６３４）、ｂｃｒ－ａｂｌ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＢ６０３８８）、チロシナーゼ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＢ６０３１９）、サバイビン（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＣ５１６６０）、ＰＳＡ（ＧｅｎＢａｎｋ ＣＡＤ５４６１７）、ｈＴＥＲＴ（ＧｅｎＢａｎｋ ＢＡＣ１１０１０）、ＳＳＸ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１２６５６２０）、Ｅｐｈ２Ａ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００４４２２）、ＰＡＰ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＨ１６３４４）、ＭＬ－ＩＡＰ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＨ１４４７５）、ＡＦＰ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１１２５）、ＥｐＣＡＭ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００２３４５）、ＥＲＧ（ＴＭＰＲＳＳ２ ＥＴＳ融合体）（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＣＡ８１３８５）、ＰＡＸ３（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＩ０１３０１）、ＡＬＫ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００４２９５）、アンドロゲン受容体（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００００３５）、サイクリンＢ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＣＡＯ９９２７３）、ＭＹＣＮ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１２８０１５７）、ＲｈｏＣ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＨ５２８０８）、ＴＲＰ－２（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＣ６０６２７）、メソテリン（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＨ０９２７２）、ＰＳＣＡ（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＨ６５１８３）、ＭＡＧＥ Ａ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００４９７９）、ＣＹＰ１Ｂ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＭ５０５１２）、ＰＬＡＣ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＧ２２５９６）、ＢＯＲＩＳ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１２５５９６９）、ＥＴＶ６（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１９７８）、ＮＹ－ＢＲ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿４４３７２３）、ＳＡＲＴ３（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿０５５５２１）、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＧｅｎＢａｎｋ ＥＡＷ５８３５９）、ＰＡＸ５（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿０５７９５３）、ＯＹ－ＴＥＳ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿１１５８７８）、精子タンパク質１７（ＧｅｎＢａｎｋ ＡＡＫ２０８７８）、ＬＣＫ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１０３６２３６）、ＨＭＷ－ＭＡＡ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１８８８）、ＡＫＡＰ－４（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００３８７７）、ＳＳＸ２（ＧｅｎＢａｎｋ ＣＡＡ６０１１１）、ＸＡＧＥ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１０９１０７３、ＸＰ＿００１１２５８３４、ＸＰ＿００１１２５８５６、及びＸＰ＿００１１２５８７２）、Ｂ７Ｈ３（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１０１９９０７、ＸＰ＿９４７３６８、ＸＰ＿９５０９５８、ＸＰ＿９５０９６０、ＸＰ＿９５０９６２、ＸＰ＿９５０９６３、ＸＰ＿９５０９６５、及びＸＰ＿９５０９６７）、ＬＧＭＮ１（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１００８５３０）、ＴＩＥ－２（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿０００４５０）、ＰＡＧＥ４（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１３０５８０６）、ＶＥＧＦＲ２（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００２２４４）、ＭＡＤ－ＣＴ－１（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００５８９３ ＮＰ＿０５６２１５）、ＦＡＰ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００４４５１）、ＰＤＧＦβ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００２６００）、ＭＡＤ－ＣＴ－２（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００１１３８５７４）、ＦＯＳＬ（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００５４２９）、及びＷＴ－１（ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿０００３６９）を参照されたい。これらのポリペプチドはまた、例えば、Ｃｈｅｅｖｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００９）Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．１５：５３２３、及び当該文献中で引用されている参考文献；Ｗａｇｎｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｓｃｉ．１１６：１６５３；Ｍａｔｓｕｉ ｅｔ ａｌ．（１９９０）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ５：２４９；Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ ３８３：１６８でも考察されている。
いくつかの場合において、エピトープは、ＨＰＶ１６Ｅ７／８２－９０（ＬＬＭＧＴＬＧＩＶ；配列番号４０４）である。いくつかの場合において、エピトープは、ＨＰＶ１６Ｅ７／８６－９３（ＴＬＧＩＶＣＰＩ；配列番号４０５）である。いくつかの場合において、エピトープは、ＨＰＶ１６Ｅ７／１１－２０（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴＴ；配列番号４０６）である。いくつかの場合において、エピトープは、ＨＰＶ１６Ｅ７／１１－１９（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴ；配列番号４０７）である。追加の好適なＨＰＶエピトープについては、例えば、Ｒｅｓｓｉｎｇ ｅｔ ａｌ．（（１９９５）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５４：５９３４）を参照されたい。
自身のエピトープ
いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、「自身の」抗原（自己抗原）に関連するか、当該抗原中に存在するエピトープである。自己免疫疾患に関連する抗原は、アジソン病（自己免疫性副腎炎、Ｍｏｒｂｕｓ Ａｄｄｉｓｏｎ）、円形脱毛症、アジソン貧血（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂｉｅｒｍｅｒ）、自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）、寒冷型の自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）（寒冷赤血球凝集素症、寒冷自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）（寒冷凝集素症）、（ＣＨＡＤ））、温式型の自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）（温式ＡＩＨＡ，温式自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ））、自己免疫性ドナート・ランドシュタイナー溶血性貧血（発作性寒冷ヘモグロビン尿症）、抗リン脂質症候群（ＡＰＳ）、アテローム性動脈硬化症、自己免疫性関節炎、側頭動脈炎、高安動脈炎（高安病、大動脈弓疾患）、側頭動脈炎／巨細胞性動脈炎、自己免疫性慢性胃炎、自己免疫性不妊症、自己免疫性内耳疾患（ＡＩＥＤ）、バセドウ病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂａｓｅｄｏｗ）、ベヒテレフ病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂｅｃｈｔｅｒｅｗ、強直性脊椎炎（ａｎｋｙｌｏｓｉｎｇ ｓｐｏｎｄｙｌｉｔｉｓ、ｓｐｏｎｄｙｌｉｔｉｓ ａｎｋｙｌｏｓａｎｓ）、ベーチェット症候群（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂｅｈｃｅｔ）、自己免疫性炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎（Ｍｏｒｂｕｓ Ｃｒｏｈｎ、クローン病を含む）を含む腸疾患、自己免疫性心筋症、特発性拡張型心筋症（ＤＣＭ）、慢性疲労免疫不全症候群（ＣＦＩＤＳ）、慢性炎症性脱髄性多発神経障害（ＣＩＤＰ）、慢性多発性関節炎、チャーグ・ストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、コーガン症候群、ＣＲＥＳＴ症候群（石灰沈着、レイノー症状、食道の運動障害、肢端硬化症及び毛細血管拡張症を伴う症候群）、クローン病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｃｒｏｈｎ、潰瘍性大腸炎）、デューリング疱疹状皮膚炎、自己免疫性皮膚疾患、皮膚筋炎、特発性混合クリオグロブリン血症、特発性混合クリオグロブリン血症、線維筋痛症、線維筋炎、グッドパスチャー症候群（抗ＧＢＭ媒介性糸球体腎炎）、移植片対宿主病、ギラン・バレー症候群（ＧＢＭ、多発性根神経炎）、自己免疫性血液疾患、橋本甲状腺炎、血友病、後天性血友病、自己免疫性肝炎、特発性肺線維症（ＩＰＦ）、特発性血小板減少性紫斑病、免疫血小板減少性紫斑病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｗｅｒｌｈｏｆ、ＩＴＰ）、ＩｇＡネフロパシー、自己免疫性不妊症、若年性リウマチ様関節炎（Ｍｏｒｂｕｓ Ｓｔｉｌｌ、スティル症候群）、ランバート・イートン症候群、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、エリテマトーデス（円板状）、ライム関節炎（ライム病、ボレリア関節炎）、メニエール病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｍｅｎｉｅｒｅ）；混合性結合組織病（ＭＣＴＤ）、多発性硬化症（ＭＳ、播種性脳脊髄炎、シャルコー病）、重症筋無力症（筋無力症、ＭＧ）、筋炎、多発性筋炎、神経系自己免疫疾患、尋常性天疱瘡、水疱性類天疱瘡、多腺性（自己免疫）症候群（ＰＧＡ症候群、シュミット症候群）、リウマチ性多発筋痛症、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性自己免疫性胆管炎、全身性進行性硬化症（ＰＳＳ）、リウマチ様関節炎（ＲＡ、慢性多発性関節炎、関節のリウマチ性疾患、リウマチ熱）、サルコイドーシス（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂｏｅｃｋ、ベスニエー・ベック・シャウマン病）、スティフマン症候群、硬皮症、強皮症、シェーグレン症候群、自己免疫性ぶどう膜炎、及びウェグナー病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｗｅｇｎｅｒ、ウェグナー肉芽腫症）などの自己免疫疾患に関連する自己抗原であり得る。
いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、「自身の」抗原（自己抗原）に関連するか、当該抗原中に存在するエピトープである。自己免疫疾患に関連する抗原は、アジソン病（自己免疫性副腎炎、Ｍｏｒｂｕｓ Ａｄｄｉｓｏｎ）、円形脱毛症、アジソン貧血（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂｉｅｒｍｅｒ）、自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）、寒冷型の自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）（寒冷赤血球凝集素症、寒冷自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）（寒冷凝集素症）、（ＣＨＡＤ））、温式型の自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）（温式ＡＩＨＡ，温式自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ））、自己免疫性ドナート・ランドシュタイナー溶血性貧血（発作性寒冷ヘモグロビン尿症）、抗リン脂質症候群（ＡＰＳ）、アテローム性動脈硬化症、自己免疫性関節炎、側頭動脈炎、高安動脈炎（高安病、大動脈弓疾患）、側頭動脈炎／巨細胞性動脈炎、自己免疫性慢性胃炎、自己免疫性不妊症、自己免疫性内耳疾患（ＡＩＥＤ）、バセドウ病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂａｓｅｄｏｗ）、ベヒテレフ病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂｅｃｈｔｅｒｅｗ、強直性脊椎炎（ａｎｋｙｌｏｓｉｎｇ ｓｐｏｎｄｙｌｉｔｉｓ、ｓｐｏｎｄｙｌｉｔｉｓ ａｎｋｙｌｏｓａｎｓ）、ベーチェット症候群（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂｅｈｃｅｔ）、自己免疫性炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎（Ｍｏｒｂｕｓ Ｃｒｏｈｎ、クローン病を含む）を含む腸疾患、自己免疫性心筋症、特発性拡張型心筋症（ＤＣＭ）、慢性疲労免疫不全症候群（ＣＦＩＤＳ）、慢性炎症性脱髄性多発神経障害（ＣＩＤＰ）、慢性多発性関節炎、チャーグ・ストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、コーガン症候群、ＣＲＥＳＴ症候群（石灰沈着、レイノー症状、食道の運動障害、肢端硬化症及び毛細血管拡張症を伴う症候群）、クローン病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｃｒｏｈｎ、潰瘍性大腸炎）、デューリング疱疹状皮膚炎、自己免疫性皮膚疾患、皮膚筋炎、特発性混合クリオグロブリン血症、特発性混合クリオグロブリン血症、線維筋痛症、線維筋炎、グッドパスチャー症候群（抗ＧＢＭ媒介性糸球体腎炎）、移植片対宿主病、ギラン・バレー症候群（ＧＢＭ、多発性根神経炎）、自己免疫性血液疾患、橋本甲状腺炎、血友病、後天性血友病、自己免疫性肝炎、特発性肺線維症（ＩＰＦ）、特発性血小板減少性紫斑病、免疫血小板減少性紫斑病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｗｅｒｌｈｏｆ、ＩＴＰ）、ＩｇＡネフロパシー、自己免疫性不妊症、若年性リウマチ様関節炎（Ｍｏｒｂｕｓ Ｓｔｉｌｌ、スティル症候群）、ランバート・イートン症候群、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、エリテマトーデス（円板状）、ライム関節炎（ライム病、ボレリア関節炎）、メニエール病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｍｅｎｉｅｒｅ）；混合性結合組織病（ＭＣＴＤ）、多発性硬化症（ＭＳ、播種性脳脊髄炎、シャルコー病）、重症筋無力症（筋無力症、ＭＧ）、筋炎、多発性筋炎、神経系自己免疫疾患、尋常性天疱瘡、水疱性類天疱瘡、多腺性（自己免疫）症候群（ＰＧＡ症候群、シュミット症候群）、リウマチ性多発筋痛症、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性自己免疫性胆管炎、全身性進行性硬化症（ＰＳＳ）、リウマチ様関節炎（ＲＡ、慢性多発性関節炎、関節のリウマチ性疾患、リウマチ熱）、サルコイドーシス（Ｍｏｒｂｕｓ Ｂｏｅｃｋ、ベスニエー・ベック・シャウマン病）、スティフマン症候群、硬皮症、強皮症、シェーグレン症候群、自己免疫性ぶどう膜炎、及びウェグナー病（Ｍｏｒｂｕｓ Ｗｅｇｎｅｒ、ウェグナー肉芽腫症）などの自己免疫疾患に関連する自己抗原であり得る。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＭＰ中に存在するペプチドエピトープは、アジソン病、円形脱毛症、強直性脊椎炎、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫関連不妊症、自己免疫性血小板減少性紫斑病、水疱性類天疱瘡、クローン病、グッドパスチャー症候群、糸球体腎炎（例えば、半月体形成性糸球体腎炎、増殖性糸球体腎炎）、グレーヴス病、橋本甲状腺炎、混合性結合組織病、多発性硬化症、重症筋無力症（ＭＧ）、天疱瘡（例えば、尋常性天疱瘡）、悪性貧血、多発性筋炎、乾癬、乾癬性関節炎、リウマチ様関節炎、強皮症、シェーグレン症候群、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、血管炎、または白斑に関連するペプチドである。
自己抗原には、例えば、アグリカン、アラニル－ｔＲＮＡシンテターゼ（ＰＬ－１２）、アルファベータクリスタリン、アルファフォドリン（Ｓｐｔａｎ１）、アルファ－アクチニン、α１アンチキモトリプシン、α１アンチトリプシン、α１ミクログロブリン、アルドラーゼ、アミノアシル－ｔＲＮＡシンテターゼ、アミロイド、アネキシン、アポリポタンパク質、アクアポリン、殺菌性／透過性増強タンパク質（ＢＰＩ）、β－グロビン前駆体ＢＰ１、β－アクチン、β－ラクトグロブリンＡ、β－２－糖タンパク質Ｉ、β２－ミクログロブリン、血液型抗原、Ｃ反応性タンパク質（ＣＲＰ）、カルモジュリン、カルレチクリン、カルジオリピン、カタラーゼ、カテプシンＢ、セントロメアタンパク質、コンドロイチン硫酸、クロマチン、コラーゲン、補体成分、シトクロムＣ、シトクロムＰ４５０２Ｄ６、サイトケラチン、デコリン、デルマタン硫酸、ＤＮＡトポイソメラーゼＩ、エラスチン、エプスタインバー核抗原１（ＥＢＮＡ１）、エラスチン、エンタクチン、抽出可能な核抗原、第Ｉ因子、第Ｐ因子、第Ｂ因子、第Ｄ因子、第Ｈ因子、第Ｘ因子、フィブリノゲン、フィブロネクチン、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＬＣ－１）、ｇｐ２１０核エンベロープタンパク質、ＧＰ２（主要チモーゲン顆粒膜糖タンパク質）、グルテニン、糖タンパク質ｇｐＩＩｂ／ＩＩＩａ、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、グリコアルブミン、グリセルアルデヒド３－リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）、ハプトグロビンＡ２、熱ショックタンパク質、ヘモシアニン、ヘパリン、ヒストン、ヒスチジル－ｔＲＮＡシンテターゼ（Ｊｏ－１）、ホルデイン、ヒアルロニダーゼ、免疫グロブリン、インテグリン、間質性レチノール結合タンパク質３、内因子、Ｋｕ（ｐ７０／ｐ８０）、乳酸脱水素酵素、ラミニン、肝臓サイトゾル抗原タイプ１（ＬＣ１）、肝臓／腎臓ミクロソーム抗原１（ＬＫＭ１）、リゾチーム、黒色腫分化関連タンパク質５（ＭＤＡＳ）、Ｍｉ－２（クロモドメインヘリカーゼＤＮＡ結合タンパク質４）、ミトコンドリアタンパク質、ムスカリン受容体、ミエリン関連糖タンパク質、ミオシン、ミエリン塩基性タンパク質、ミエリンプロテオリピドタンパク質、ミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質、ミエロペルオキシダーゼ（ＭＰＯ）、リウマチ因子（ＩｇＭ抗ＩｇＧ）、ニューロン特異的エノラーゼ、ニコチン性アセチルコリン受容体Ａ鎖、ヌクレオリン、ヌクレオポリン、ヌクレオソーム抗原、ＰＭ／Ｓｃｌ１００、ＰＭ／Ｓｃｌ７５、膵臓β細胞抗原、ペプシノーゲン、ペルオキシレドキシン１、ホスホグルコースイソメラーゼ、リン脂質、ホスファチジルイノシトール、血小板由来成長因子、ポリメラーゼベータ（ＰＯＬＢ）、カリウムチャネルＫＩＲ４．１、増殖細胞核抗原（ＰＣＮＡ）、プロテアーゼ－３、プロテオリピドタンパク質、プロテオグリカン、プロトロンビン、リカバリン、ロドプシン、リボヌクレアーゼ、リボ核タンパク質、リボソーム、リボソームリンタンパク質、ＲＮＡ、Ｓｍタンパク質、Ｓｐ１００核タンパク質、ＳＲＰ５４（シグナル認識粒子５４ｋＤａ）、セレクチン、平滑筋タンパク質、スフィンゴミエリン、連鎖球菌抗原、スーパーオキシドジスムターゼ、滑膜性関節タンパク質、Ｔ１Ｆ１ガンマコラーゲン、スレオニル－ｔＲＮＡシンテターゼ（ＰＬ－７）、組織型トランスグルタミナーゼ、甲状腺ペルオキシダーゼ、サイログロブリン、甲状腺刺激ホルモン受容体、トランスフェリン、トリオースリン酸イソメラーゼ、チューブリン、腫瘍壊死因子アルファ、トポイソメラーゼ、Ｕ１－ｄｎＲＮＰ６８／７０ｋＤａ、Ｕ１－ｓｎＲＮＰＡ、Ｕ１－ｓｎＲＮＰＣ、Ｕ－ｓｎＲＮＰＢ／Ｂ’、ユビキチン、血管内皮細胞増殖因子、ビメンチン、ならびにビトロネクチンが含まれる。
本開示のＴＭＡＰＰに含まれる抗原／エピトープは、Ｔ１Ｄ及びセリアック病以外の（またはそれらに加えて）自己免疫疾患を治療するのに有用なものである。したがって、本開示は、セリアック病またはＴ１Ｄ以外の（またはそれらに加えて）自己免疫疾患を治療するのに有用な抗原／エピトープを含むタンパク質コンストラクト（例えば、ＴＭＡＰＰ）及びタンパク質コンストラクト（例えば、ＴＭＡＰＰ）（ならびにそのようなタンパク質コンストラクトを含む組成物）を調製する方法のみを包含する。同様に、本開示は、Ｔ１Ｄまたはセリアック病以外の（またはそれらに加えて）自己免疫疾患を治療する方法及び治療のみを包含する。明確を期すために、Ｔ１Ｄ及び／またはセリアック病以外の自己免疫疾患を治療するのに有用な抗原／エピトープを含むＴＭＡＰＰは、Ｔ１Ｄ及び／またはセリアック病の治療にも何らかの治療上の利益を提供し得る場合、本開示の範囲から除外されない。同様に、Ｔ１Ｄ及び／またはセリアック病以外の自己免疫疾患を治療する方法、または治療は、Ｔ１Ｄまたはセリアック病を治療する方法または治療としての用途も有し得る場合、本開示の範囲から除外されない。
円形脱毛症（自己免疫性脱毛症）に関連する自己抗原には、例えば、毛嚢ケラチノサイトポリペプチド、メラニン形成関連自己抗原、及びメラノサイトポリペプチドが含まれる。メラノサイト自己抗原の一例は、チロシナーゼである。自己免疫性脱毛症に関連する自己抗原にはまた、トリコヒアリン（Ｌｅｕｎｇ ｅｔ ａｌ．（２０１０）Ｊ．Ｐｒｏｔｅｏｍｅ Ｒｅｓ．９：５１５３）及びケラチン１６が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、毛嚢ケラチノサイトポリペプチド、メラノサイトポリペプチド、メラニン形成関連ポリペプチド、チロシナーゼ、トリコヒアリン、またはケラチン１６の４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
アジソン病に関連する自己抗原には、例えば、２１－ヒドロキシラーゼが含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、２１－ヒドロキシラーゼの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
自己免疫性甲状腺炎（橋本甲状腺炎）に関連する自己抗原には、例えば、サイログロブリン、甲状腺ペルオキシダーゼ、甲状腺刺激ホルモン受容体（ＴＳＨ受容体）、甲状腺ヨードトランスポーターＮａ＋／Ｉ－共輸送体（ＮＩＳ）、ペンドリンなどが含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述した橋本甲状腺炎関連ポリペプチドのいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
クローン病に関連する自己抗原には、例えば、膵臓分泌顆粒膜糖タンパク質－２（ＧＰ２）が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、ＧＰ２の４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
グッドパスチャー病に関連する自己抗原には、例えば、ＩＶ型コラーゲンのα３鎖、例えば、ＩＶ型コラーゲンのα３鎖のアミノ酸１３５～１４５が含まれる。Ｐｅｎａｄｅｓ ｅｔ ａｌ．（１９９５） Ｅｕｒ． Ｊ． Ｂｉｏｃｈｅｍ． ２２９：７５４；Ｋａｌｌｕｒｉ ｅｔ ａｌ．（１９９４） Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ９１：６２０１．本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、ＩＶ型コラーゲンのα３鎖の４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
グレーヴス病に関連する自己抗原には、例えば、サイログロブリン、甲状腺ペルオキシダーゼ、及びサイロトロピン受容体（ＴＳＨ－Ｒ）が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したグレーヴス病関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
混合性結合組織病に関連する自己抗原には、例えば、Ｕ１リボ核タンパク質（Ｕ１－ＲＮＰ）ポリペプチド（ｓｎＲＮＰ７０としても知られる）が含まれる。Ｓａｔｏ ｅｔ ａｌ．（２０１０）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１０６：５５．本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、Ｕ１－ＲＮＰポリペプチドの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
多発性硬化症に関連する自己抗原には、例えば、ミエリン塩基性タンパク質、ミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質、及びミエリンプロテオリピドタンパク質が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述した多発性硬化症関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。非限定的な一例として、ペプチドエピトープは、アミノ酸配列
を含み得る。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＤＲＢ１＊１５：０１ＭＨＣクラスＩＩ β鎖と、アミノ酸配列
のペプチドエピトープと、を含む。
重症筋無力症に関連する自己抗原には、例えば、アセチルコリン受容体（ＡｃｈＲ；例えば、Ｌｉｎｄｓｔｒｏｍ（２０００）Ｍｕｓｃｌｅ＆Ｎｅｒｖｅ ２３：４５３参照）、筋特異的チロシンキナーゼ、及び低密度リポタンパク質受容体関連タンパク質－４が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述した重症筋無力症関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、ＡｃｈＲの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドである。
パーキンソン病に関連する自己抗原には、例えば、α－シヌクレインが含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、α－シヌクレインの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、次のいずれか１つの５アミノ酸長～全長のペプチドを含む：
（
はホスホセリンを示す）。
天疱瘡（例えば、尋常性天疱瘡、落葉状天疱瘡、水疱性類天疱瘡）に関連する自己抗原には、デスモソーマルカドヘリンデスモグレイン３（Ｄｓｇ３）などの尋常性天疱瘡免疫原；Ｄｓｇ１などの落葉状天疱瘡免疫原；ＢＰ２３０抗原、ＧＰＡＧ１ａ、及びＢＰＡＧ１ｂを含むヘミデスモソームペプチドなどの水疱性類天疱瘡免疫原が含まれる。例えば、Ｃｉｒｉｌｌｏ ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ １２１：３７７を参照されたい。水疱性類天疱瘡に関連する自己抗原には、水疱性類天疱瘡抗原１（ＢＰＡＧ１；ＢＰ２３０またはジストニンとも知られる）、水疱性類天疱瘡抗原２（ＢＰＡＧ２；ＢＰ１８０またはＸＶＩＩ型コラーゲンとしても知られる）、ならびにヒトインテグリンα－５及びβ－４のサブユニットが含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、前述した天疱瘡関連抗原のいずれかの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
筋炎（例えば、多発性筋炎、皮膚筋炎）に関連する自己抗原には、例えば、ヒスチジルｔＲＮＡシンテターゼが含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、ヒスチジルｔＲＮＡシンテターゼの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
リウマチ様関節炎に関連する自己抗原には、例えば、コラーゲン、ビメンチン、アグレガン、フィブリノゲン、環状シトルリン化ペプチド、α－エノラーゼ、ヒストンポリペプチド、ラクトフェリン、カタラーゼ、アクチニン、及びアクチン（細胞質１及び２（β／γ）が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したリウマチ様関節炎関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
強皮症に関連する自己抗原には、核抗原が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、強皮症に関連する核抗原の４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
シェーグレン症候群に関連する自己抗原には、例えば、Ｒｏ／Ｌａリボ核タンパク質（ＲＮＰ）複合体、アルファ－ベータ－フォドリン、島細胞自己抗原、ポリ（ＡＤＰ）リボースポリメラーゼ（ＰＡＲＰ）、核有糸分裂装置（ＮｕＭＡ）、ＮＯＲ－９０、Ｒｏ６０ｋＤ自己抗原、Ｒｏ５２抗原、Ｌａ抗原（例えば、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＰ＿００１２８１０７４．１参照）、及びｐ２７抗原が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したシェーグレン症候群関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）に関連する自己抗原には、例えば、Ｒｏ６０自己抗原、低密度リポタンパク質、Ｕ－１小核リボ核タンパク質複合体（Ｂ／Ｂ’、Ｄ１、Ｄ２、Ｄ３、Ｅ、Ｆ、Ｇ）のＳｍ抗原、α－アクチン１、α－アクチン４、アネキシンＡＩ、Ｃ１ｑ／腫瘍壊死因子関連タンパク質、カタラーゼ、デフェンシン、クロマチン、ヒストンタンパク質、トランスケトラーゼ、ｈＣＡＰ１８／ＬＬ３７、及びリボ核タンパク質（ＲＮＰ）が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したＳＬＥ関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
血小板減少性紫斑病に関連する自己抗原には、ＡＤＡＭＴＳ１３（トロンボスポンジン１型モチーフメンバー１３を含むディスインテグリン及びメタロプロテアーゼ）、及びフォン・ヴィレブランド因子切断プロテアーゼ（ＶＷＦＣＰ）が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、ＡＤＡＭＴＳ１３ポリペプチドまたはＶＷＦＣＰポリペプチドの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
血管炎に関連する自己抗原には、プロテアーゼ－３、リゾチームＣ、ラクトフェリン、白血球エラスターゼ、カテプシンＧ、及びアズロシジンが含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、前述した血管炎関連抗原のいずれかの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
白斑に関連する自己抗原には、ＳＯＸ９、ＳＯＸ１０、ＰＭＥＬ（プレメラノソームタンパク質）、チロシナーゼ、ＴＹＲＰ１（チロシン関連タンパク質１）、ＤＤＴ（Ｄ－ドーパクロムタウトメラーゼ）、Ｒａｂ３８、及びＭＣＨＲ１（メラニン凝集受容体が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述した白斑関連ポリペプチドのいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
自己免疫ぶどう膜炎に関連する自己抗原には、例えば、光受容体間レチノイド結合タンパク質（ＩＲＢＰ）が含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、ＩＲＢＰの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述した抗原のいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
自己免疫性多内分泌腺症候群に関連する自己抗原には、例えば、１７－アルファヒドロキシラーゼ、ヒスチジンデカルボキシラーゼ、トリプトファンヒドロキシラーゼ、及びチロシンヒドロキシラーゼが含まれる。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述した自己免疫性多内分泌腺症候群関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
乾癬に関連する自己抗原には、ＡＤＡＭＴＳ１５が含まれる。例えば、Ｐｒｉｎｚ（２０１７）Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｉｔｙ Ｒｅｖｉｅｗｓ １６：９７０を参照されたい。本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、ＡＤＡＭＴＳ１５ポリペプチドの４アミノ酸長～約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
免疫調節ポリペプチド（「ＭＯＤ」）
本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドには、ＩＬ－２、ＣＤ７、Ｂ７－１（ＣＤ８０）、Ｂ７－２（ＣＤ８６）、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、４－１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ－Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ－Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、及びＩＬＴ４が含まれるが、これらに限定されない。
本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドには、ＩＬ－２、ＣＤ７、Ｂ７－１（ＣＤ８０）、Ｂ７－２（ＣＤ８６）、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、４－１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ－Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ－Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、及びＩＬＴ４が含まれるが、これらに限定されない。
本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチド（ＭＯＤ）、及びその同種の共刺激受容体（本明細書において「共免疫調節ポリペプチド」または「ｃｏＭＯＤ」とも呼ばれる）の例は、以下が挙げられる：
ａ）４－１ＢＢＬ（ＭＯＤ）と４－１ＢＢ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｂ）ＰＤ－Ｌ１（ＭＯＤ）とＰＤ１（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｃ）ＩＬ－２（ＭＯＤ）とＩＬ－２受容体（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｄ）ＣＤ８０（ＭＯＤ）とＣＤ２８（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｅ）ＣＤ８６（ＭＯＤ）とＣＤ２８（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｆ）ＯＸ４０Ｌ（ＣＤ２５２）（ＭＯＤ）とＯＸ４０（ＣＤ１３４）（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｇ）Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）（ＭＯＤ）とＦａｓ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｈ）ＩＣＯＳ－Ｌ（ＭＯＤ）とＩＣＯＳ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｉ）ＩＣＡＭ（ＭＯＤ）とＬＦＡ－１（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｊ）ＣＤ３０Ｌ（ＭＯＤ）とＣＤ３０（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｋ）ＣＤ４０（ＭＯＤ）とＣＤ４０Ｌ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｌ）ＣＤ８３（ＭＯＤ）とＣＤ８３Ｌ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｍ）ＨＶＥＭ（ＣＤ２７０）（ＭＯＤ）とＣＤ１６０（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｎ）ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）（ＭＯＤ）とＮｏｔｃｈ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｏ）ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）（ＭＯＤ）とＣＤ４６（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｐ）ＣＤ７０（ＭＯＤ）とＣＤ２７（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｑ）ＣＤ８０（ＭＯＤ）とＣＴＬＡ４（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｒ）ＣＤ８６（ＭＯＤ）とＣＴＬＡ４（Ｃｏ－ＭＯＤ）、ならびに
ｓ）ＴＧＦ－β１、ＴＧＦ－β２、及び／またはＴＧＦ－β３（ＭＯＤ）とＴＧＦ－β受容体（例えば、ＴＧＦＢＲ１及び／またはＴＧＦＢＲ２）（Ｃｏ－ＭＯＤ）。
ａ）４－１ＢＢＬ（ＭＯＤ）と４－１ＢＢ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｂ）ＰＤ－Ｌ１（ＭＯＤ）とＰＤ１（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｃ）ＩＬ－２（ＭＯＤ）とＩＬ－２受容体（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｄ）ＣＤ８０（ＭＯＤ）とＣＤ２８（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｅ）ＣＤ８６（ＭＯＤ）とＣＤ２８（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｆ）ＯＸ４０Ｌ（ＣＤ２５２）（ＭＯＤ）とＯＸ４０（ＣＤ１３４）（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｇ）Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）（ＭＯＤ）とＦａｓ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｈ）ＩＣＯＳ－Ｌ（ＭＯＤ）とＩＣＯＳ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｉ）ＩＣＡＭ（ＭＯＤ）とＬＦＡ－１（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｊ）ＣＤ３０Ｌ（ＭＯＤ）とＣＤ３０（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｋ）ＣＤ４０（ＭＯＤ）とＣＤ４０Ｌ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｌ）ＣＤ８３（ＭＯＤ）とＣＤ８３Ｌ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｍ）ＨＶＥＭ（ＣＤ２７０）（ＭＯＤ）とＣＤ１６０（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｎ）ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）（ＭＯＤ）とＮｏｔｃｈ（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｏ）ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）（ＭＯＤ）とＣＤ４６（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｐ）ＣＤ７０（ＭＯＤ）とＣＤ２７（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｑ）ＣＤ８０（ＭＯＤ）とＣＴＬＡ４（Ｃｏ－ＭＯＤ）、
ｒ）ＣＤ８６（ＭＯＤ）とＣＴＬＡ４（Ｃｏ－ＭＯＤ）、ならびに
ｓ）ＴＧＦ－β１、ＴＧＦ－β２、及び／またはＴＧＦ－β３（ＭＯＤ）とＴＧＦ－β受容体（例えば、ＴＧＦＢＲ１及び／またはＴＧＦＢＲ２）（Ｃｏ－ＭＯＤ）。
いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、４－１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７－１ポリペプチド、Ｂ７－２ポリペプチド、ＩＣＯＳ－Ｌポリペプチド、ＯＸ－４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、ＴＧＦβポリペプチド、及びＰＤ－Ｌ２ポリペプチドから選択される。免疫調節ポリペプチドは、完全長の免疫調節ポリペプチドの細胞外部分のみを含み得る。したがって、例えば、免疫調節ポリペプチドは、いくつかの場合において、天然の免疫調節ポリペプチドに通常みられる、シグナルペプチド、膜貫通ドメイン及び細胞内ドメインのうちの１つ以上を除外することができる。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドは、天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列の全てまたは一部（例えば、細胞外部分）を含む。他の場合において、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドは、天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、少なくとも１つのアミノ酸置換を含むバリアント免疫調節ポリペプチドである。いくつかの場合において、バリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する天然の免疫調節ポリペプチド（例えば、バリアントに存在するアミノ酸置換（複数可）を含まない免疫調節ポリペプチド）の免疫共調節ポリペプチドに対する親和性よりも、免疫共調節ポリペプチドに対して低い結合親和性を呈する。
低親和性バリアント免疫調節ポリペプチド
免疫共調節ドメインに対して親和性の低下を呈する好適な免疫調節ドメインは、野生型免疫調節ドメインと１アミノ酸（ａａ）～２０ａａの違いを有し得る。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、アミノ酸配列が、対応する野生型免疫調節ポリペプチドと１ａａ、２ａａ、３ａａ、４ａａ、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、または１０ａａ異なる。別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、アミノ酸配列が、対応する野生型免疫調節ポリペプチドと１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、または２０ａａ異なる。一例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０のアミノ酸置換を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、単一のアミノ酸置換を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、２つのアミノ酸置換（例えば、２以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、３つのアミノ酸置換（例えば、３以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、４つのアミノ酸置換（例えば、４以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、５つのアミノ酸置換（例えば、５以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、６つのアミノ酸置換（例えば、６以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、７つのアミノ酸置換（例えば、７以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、８つのアミノ酸置換（例えば、８以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、９つのアミノ酸置換（例えば、９以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１０のアミノ酸置換（例えば、１０以下のアミノ酸置換）を含む。
免疫共調節ドメインに対して親和性の低下を呈する好適な免疫調節ドメインは、野生型免疫調節ドメインと１アミノ酸（ａａ）～２０ａａの違いを有し得る。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、アミノ酸配列が、対応する野生型免疫調節ポリペプチドと１ａａ、２ａａ、３ａａ、４ａａ、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、または１０ａａ異なる。別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、アミノ酸配列が、対応する野生型免疫調節ポリペプチドと１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、または２０ａａ異なる。一例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０のアミノ酸置換を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、単一のアミノ酸置換を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、２つのアミノ酸置換（例えば、２以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、３つのアミノ酸置換（例えば、３以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、４つのアミノ酸置換（例えば、４以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、５つのアミノ酸置換（例えば、５以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、６つのアミノ酸置換（例えば、６以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、７つのアミノ酸置換（例えば、７以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、８つのアミノ酸置換（例えば、８以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、９つのアミノ酸置換（例えば、９以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１０のアミノ酸置換（例えば、１０以下のアミノ酸置換）を含む。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１１のアミノ酸置換（例えば、１１以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１２のアミノ酸置換（例えば、１２以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１３のアミノ酸置換（例えば、１３以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１４のアミノ酸置換（例えば、１４以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１５のアミノ酸置換（例えば、１５以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１６のアミノ酸置換（例えば、１６以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１７のアミノ酸置換（例えば、１７以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１８のアミノ酸置換（例えば、１８以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１９のアミノ酸置換（例えば、１９以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、２０のアミノ酸置換（例えば、２０以下のアミノ酸置換）を含む。
上述のとおり、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、対応する野生型免疫調節ポリペプチドの同種の免疫共調節ポリペプチドに対する親和性と比較して、親和性の低下を呈する。
免疫調節ポリペプチドと同種の免疫共調節ポリペプチドの例示的なペアとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
ａ）４－１ＢＢＬ（免疫調節ポリペプチド）と４－１ＢＢ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｂ）ＰＤ－Ｌ１（免疫調節ポリペプチド）とＰＤ１（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｃ）ＩＬ－２（免疫調節ポリペプチド）とＩＬ－２受容体（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｄ）ＣＤ８０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２８（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｅ）ＣＤ８６（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２８（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｆ）ＯＸ４０Ｌ（ＣＤ２５２）（免疫調節ポリペプチド）とＯＸ４０（ＣＤ１３４）（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｇ）Ｆａｓリガンド（免疫調節ポリペプチド）とＦａｓ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｈ）ＩＣＯＳ－Ｌ（免疫調節ポリペプチド）とＩＣＯＳ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｉ）ＩＣＡＭ（免疫調節ポリペプチド）とＬＦＡ－１（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｊ）ＣＤ３０Ｌ（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ３０（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｋ）ＣＤ４０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ４０Ｌ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｌ）ＣＤ８３（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ８３Ｌ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｍ）ＨＶＥＭ（ＣＤ２７０）（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ１６０（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｎ）ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）（免疫調節ポリペプチド）とＮｏｔｃｈ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｏ）ＪＡＧ１（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ４６（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｐ）ＣＤ８０（免疫調節ポリペプチド）とＣＴＬＡ４（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｑ）ＣＤ８６（免疫調節ポリペプチド）とＣＴＬＡ４（同種の免疫共調節ポリペプチド）、及び
ｒ）ＣＤ７０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２７（同種の免疫共調節ポリペプチド）。
ａ）４－１ＢＢＬ（免疫調節ポリペプチド）と４－１ＢＢ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｂ）ＰＤ－Ｌ１（免疫調節ポリペプチド）とＰＤ１（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｃ）ＩＬ－２（免疫調節ポリペプチド）とＩＬ－２受容体（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｄ）ＣＤ８０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２８（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｅ）ＣＤ８６（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２８（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｆ）ＯＸ４０Ｌ（ＣＤ２５２）（免疫調節ポリペプチド）とＯＸ４０（ＣＤ１３４）（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｇ）Ｆａｓリガンド（免疫調節ポリペプチド）とＦａｓ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｈ）ＩＣＯＳ－Ｌ（免疫調節ポリペプチド）とＩＣＯＳ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｉ）ＩＣＡＭ（免疫調節ポリペプチド）とＬＦＡ－１（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｊ）ＣＤ３０Ｌ（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ３０（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｋ）ＣＤ４０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ４０Ｌ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｌ）ＣＤ８３（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ８３Ｌ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｍ）ＨＶＥＭ（ＣＤ２７０）（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ１６０（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｎ）ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）（免疫調節ポリペプチド）とＮｏｔｃｈ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｏ）ＪＡＧ１（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ４６（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｐ）ＣＤ８０（免疫調節ポリペプチド）とＣＴＬＡ４（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
ｑ）ＣＤ８６（免疫調節ポリペプチド）とＣＴＬＡ４（同種の免疫共調節ポリペプチド）、及び
ｒ）ＣＤ７０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２７（同種の免疫共調節ポリペプチド）。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
結合親和性の決定
免疫調節ポリペプチドとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の結合親和性は、バイオレイヤー干渉法（ＢＬＩ）により、精製された免疫調節ポリペプチド及び精製された同種の免疫共調節ポリペプチドを使用して決定することができる。ＴＭＡＰＰとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の結合親和性もまた、ＢＬＩにより、精製されたＴＭＡＰＰ及び同種の免疫共調節ポリペプチドを使用して決定することができる。ＢＬＩ法は、当業者によく知られている。例えば、Ｌａｄ ｅｔ ａｌ．（２０１５）Ｊ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｓｃｒｅｅｎ．２０（４）：４９８－５０７；及びＳｈａｈ ａｎｄ Ｄｕｎｃａｎ（２０１４）Ｊ．Ｖｉｓ．Ｅｘｐ．１８：ｅ５１３８３を参照されたい。本開示中に記載される、免疫調節ポリペプチドとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間、またはｓｙｎＴａｃとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の特異的及び相対的結合親和性は、以下の手順を使用して決定することができる。
免疫調節ポリペプチドとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の結合親和性は、バイオレイヤー干渉法（ＢＬＩ）により、精製された免疫調節ポリペプチド及び精製された同種の免疫共調節ポリペプチドを使用して決定することができる。ＴＭＡＰＰとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の結合親和性もまた、ＢＬＩにより、精製されたＴＭＡＰＰ及び同種の免疫共調節ポリペプチドを使用して決定することができる。ＢＬＩ法は、当業者によく知られている。例えば、Ｌａｄ ｅｔ ａｌ．（２０１５）Ｊ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｓｃｒｅｅｎ．２０（４）：４９８－５０７；及びＳｈａｈ ａｎｄ Ｄｕｎｃａｎ（２０１４）Ｊ．Ｖｉｓ．Ｅｘｐ．１８：ｅ５１３８３を参照されたい。本開示中に記載される、免疫調節ポリペプチドとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間、またはｓｙｎＴａｃとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の特異的及び相対的結合親和性は、以下の手順を使用して決定することができる。
ＴＭＡＰＰとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の結合親和性を決定するために、Ｏｃｔｅｔ ＲＥＤ ９６（Ｐａｌ ＦｏｒｔｅＢｉｏ）機器または同様の機器を使用して、ＢＬＩアッセイを以下のように実施することができる。ＴＭＡＰＰ（例えば、本開示のＴＭＡＰＰ；対照ＴＭＡＰＰ（対照ＴＭＡＰＰは、野生型免疫調節ポリペプチドを含む））を不溶性支持体（「バイオセンサー」）上に固定する。固定化されたＴＭＡＰＰが「標的」である。固定化は、捕捉抗体を不溶性支持体上に固定化することによって行うことができ、捕捉抗体は、ＴＭＡＰＰを固定化する。例えば、固定化は、抗Ｆｃ（例えば、抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ）抗体を不溶性支持体上に固定化することによって行うことができ、固定化された抗Ｆｃ抗体は、ＴＭＡＰＰ（ＴＭＡＰＰは、ＩｇＦｃポリペプチドを含む）に結合し、これを固定化する。固定化されたＴＭＡＰＰに免疫共調節ポリペプチドをいくつかの異なる濃度でアプライして、機器の応答を記録する。アッセイは、２５ｍＭ ＨＥＰＥＳ（ｐＨ６．８）、５％ポリ（エチレングリコール）６０００、５０ｍＭ ＫＣｌ、０．１％ウシ血清アルブミン、及び０．０２％ Ｔｗｅｅｎ ２０非イオン性界面活性剤を含む液体媒体中で実施される。固定化されたＴＭＡＰＰに対する免疫共調節ポリペプチドへの結合は、３０℃で実施される。結合親和性の陽性対照として、抗ＭＨＣクラスＩＩモノクローナル抗体を使用することができる。例えば、１６－２３抗体（Ｓｉｇｍａ；「１６．２３」とも称される；例えば、Ｐｉｏｕｓ ｅｔ ａｌ．（１９８５）Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６２：１１９３；Ｍｅｌｌｉｎｓ ｅｔ ａｌ．（１９９１）Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７４：１６０７参照；ＥＣＡＣＣハイブリドーマコレクション１６－２３、ＥＣＡＣＣ９９０４３００１）などの抗ＨＬＤ－ＤＲ３モノクローナル抗体を、結合親和性の陽性対照として使用することができる。別の例として、ＨＫＢ１抗体（Ｉｍｍｕｎｏｔｏｏｌｓ；Ｈｏｌｔｅ ｅｔ ａｌ．（１９８９）Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１９：１２２１）などのｐａｎ－ＨＬＡクラスＩＩ抗体を、結合親和性の陽性対照として使用することができる。抗ＭＨＣクラスＩＩモノクローナル抗体の連続希釈物を使用して、標準曲線を作成する。免疫共調節ポリペプチドまたは抗ＭＨＣクラスＩＩ ｍＡｂが「アナライト」である。ＢＬＩは、ｉ）固定化されたポリペプチド（「標的」）と、ｉｉ）内部リファレンスレイヤーの２つの表面から反射される白色光の干渉波を解析する。バイオセンサーチップに結合する分子（「アナライト」；例えば、免疫共調節ポリペプチド、抗ＨＬＡ抗体）の数の変化によって、干渉波にシフトが生じ、この干渉波のシフトをリアルタイムに測定することができる。標的／アナライト相互作用の親和性を記述する２つの動力学的用語は、結合定数（ｋａ）と解離定数（ｋｄ）である。これらの２つの用語の比（ｋｄ／ａ）が親和性定数ＫＤを与える。
上記のとおり、免疫調節ポリペプチド（例えば、ＩＬ－２またはＩＬ－２バリアント）とその同種の免疫共調節ポリペプチド（例えば、ＩＬ－２Ｒ）との間の結合親和性の決定もまた、ＢＬＩによって決定することができる。アッセイは、ＴＭＡＰＰについて上に記載したものと同様である。Ｏｃｔｅｔ ＲＥＤ ９６（Ｐａｌ ＦｏｒｔｅＢｉｏ）機器または同様の機器を使用して、ＢＬＩアッセイを以下のように実施することができる。本開示のＴＭＡＰＰの構成成分である免疫調節ポリペプチド（例えば、本開示のバリアントＩＬ－２ポリペプチド）及び対照免疫調節ポリペプチド（対照免疫調節ポリペプチドは、野生型免疫調節ポリペプチド、例えば、野生型ＩＬ－２を含む））を不溶性支持体（「バイオセンサー」）上に固定する。免疫調節ポリペプチドが「標的」である。固定化は、捕捉抗体を不溶性支持体上に固定化することによって行うことができ、捕捉抗体は、免疫調節ポリペプチドを固定化する。例えば、標的が免疫親和性タグ（例えば、ＦＬＡＧ、ヒトＩｇＧ Ｆｃ）に融合されている場合、固定化は、免疫親和性タグ（例えば、抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ）に対する適切な抗体を不溶性支持体上に固定化することによって行うことができ、固定化された抗体は、免疫調節ポリペプチド（免疫調節ポリペプチドは、ＩｇＦｃポリペプチドを含む）に結合し、これを固定化する。固定化された免疫調節ポリペプチドに免疫共調節ポリペプチド（または複数のポリペプチド）をいくつかの異なる濃度でアプライして、機器の応答を記録する。あるいは、免疫共調節ポリペプチド（または複数のポリペプチド）をバイオセンサーに固定化し（例えば、ＩＬ－２受容体ヘテロ三量体、例えば、単量体サブユニット、ヘテロ二量体サブ複合体、または完全なヘテロ三量体に対して）、固定化された免疫共調節ポリペプチド（複数可）に免疫調節ポリペプチドをいくつかの異なる濃度でアプライして、機器の応答を記録する。アッセイは、２５ｍＭ ＨＥＰＥＳ（ｐＨ６．８）、５％ポリ（エチレングリコール）６０００、５０ｍＭ ＫＣｌ、０．１％ウシ血清アルブミン、及び０．０２％ Ｔｗｅｅｎ ２０非イオン性界面活性剤を含む液体媒体中で実施される。固定化された免疫調節ポリペプチドに対する免疫共調節ポリペプチドへの結合は、３０℃で実施される。ＢＬＩは、ｉ）固定化されたポリペプチド（「標的」）と、ｉｉ）内部リファレンスレイヤーの２つの表面から反射される白色光の干渉波を解析する。バイオセンサーチップに結合する分子（「アナライト」；例えば、免疫共調節ポリペプチド）の数の変化によって、干渉波にシフトが生じ、この干渉波のシフトをリアルタイムに測定することができる。標的／アナライト相互作用の親和性を記述する２つの動力学的用語は、結合定数（ｋａ）と解離定数（ｋｄ）である。これらの２つの用語の比（ｋｄ／ａ）が親和性定数ＫＤを与える。したがって、野生型免疫調節ポリペプチド（例えば、ＩＬ－２）のその受容体（例えば、ＩＬ－２Ｒ）に対する結合親和性と、バリアント免疫調節ポリペプチド（例えば、本明細書で開示されるＩＬ－２バリアント）のその同種の免疫共調節ポリペプチド（例えば、その受容体）（例えば、ＩＬ－２Ｒ）に対する結合親和性の両方を決定することにより、野生型免疫共調節ポリペプチドと比較した、同種の免疫共調節ポリペプチドに対するバリアント免疫共調節ポリペプチドの相対結合親和性を決定することが可能となる。すなわち、バリアント免疫調節ポリペプチドのその受容体（その同種の免疫共調節ポリペプチド）に対する結合親和性が、野生型免疫調節ポリペプチドの同じ同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性と比較して減少するかどうかを決定することができ、もしそうであれば、その結合親和性は、野生型免疫共調節ポリペプチドの結合親和性からパーセンテージが小さくなる。
ＢＬＩアッセイは、マルチウェルプレートで実施される。アッセイを実施するには、プレートのレイアウトを決め、アッセイのステップを決め、バイオセンサーをＯｃｔｅｔ Ｄａｔａ Ａｃｑｕｉｓｉｔｉｏｎソフトウエアに割り当てる。バイオセンサーアセンブリを水和する。水和したバイオセンサーアセンブリ及びアッセイプレートをＯｃｔｅｔ機器で１０分間平衡化する。データを取得したら、その取得データをＯｃｔｅｔ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓソフトウエアに読み込ませる。処理ウインドウで、リファレンスの差し引き、ｙ軸の位置合わせ、ステップ間補正、及びＳａｖｉｔｚｋｙ－Ｇｏｌａｙフィルターの方法を指定することによって、データ処理を行う。解析ウインドウで、解析するステップ（結合及び解離）を指定し、カーブフィッティングモデル（１：１）、フィッティング方法（グローバル）、及び目的のウインドウ（秒単位）を指定することによって、データ解析を行う。フィッティングの質を評価する。各データのトレース（アナライト濃度）のＫＤ値は、３倍の範囲内であれば、平均化することができる。ＫＤエラー値は、親和性定数値の１０倍以内でなければならず、Ｒ２値は、０．９５を超えるものとする。例えば、Ａｂｄｉｃｈｅ ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｊ．Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．３７７：２０９を参照されたい。
いくつかの場合において、ｉ）対照ＴＭＡＰＰ（ここで、対照ＴＭＡＰＰは、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性と、ｉｉ）野生型免疫調節ポリペプチドのバリアントを含む本開示のＴＭＡＰＰの、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性との比は、ＢＬＩによって（上記のとおり）測定したとき、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。いくつかの場合において、ｉ）対照ＴＭＡＰＰ（ここで、対照ＴＭＡＰＰは、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性と、ｉｉ）野生型免疫調節ポリペプチドのバリアントを含む本開示のＴＭＡＰＰの、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定したとき、１．５：１～１０６：１、例えば、１．５：１～１０：１、１０：１～５０：１、５０：１～１０２：１、１０２：１～１０３：１、１０３：１～１０４：１、１０４：１～１０５：１、または１０５：１～１０６：１の範囲内である。
本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープは、少なくとも１００μＭ（例えば、少なくとも１０μＭ、少なくとも１μＭ、少なくとも１００ｎＭ、少なくとも１０ｎＭ、または少なくとも１ｎＭ）の親和性で、Ｔ細胞上のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）に結合する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープは、約１０－４Ｍ～約５×１０－４Ｍ、約５×１０－４Ｍ～約１０－５Ｍ、約１０－５Ｍ～５×１０－５Ｍ、約５×１０－５Ｍ～１０－６Ｍ、約１０－６Ｍ～約５×１０－６Ｍ、約５×１０－６Ｍ～約１０－７Ｍ、約１０－７Ｍ～約５×１０－７Ｍ、約５×１０－７Ｍ～約１０－８Ｍ、または約１０－８Ｍ～約１０－９Ｍの親和性で、Ｔ細胞上のＴＣＲに結合する。別の方法で表現すると、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープは、約１ｎＭ～約５ｎＭ、約５ｎＭ～約１０ｎＭ、約１０ｎＭ～約５０ｎＭ、約５０ｎＭ～約１００ｎＭ、約０．１μＭ～約０．５μＭ、約０．５μＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、約７５μＭ～約１００μＭの親和性で、Ｔ細胞上のＴＣＲに結合する。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、１ｎＭ～１００ｎＭ、または１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、約１ｎＭ～約５ｎＭ、約５ｎＭ～約１０ｎＭ、約１０ｎＭ～約５０ｎＭ、約５０ｎＭ～約１００ｎＭの結合親和性を有する。
ＰＤ－Ｌ１バリアント
１つの非限定的な例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。野生型ＰＤ－Ｌ１は、ＰＤ１に結合する。
１つの非限定的な例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。野生型ＰＤ－Ｌ１は、ＰＤ１に結合する。
野生型ヒトＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み得る。
野生型ヒトＰＤ－Ｌ１エクトドメインは、次のアミノ酸配列：
を含み得る。
野生型ＰＤ－１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み得る。
いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ－１（例えば、配列番号１０５に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ－１ポリペプチド）に対して、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ－Ｌ１ポリペプチドの結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、本開示のバリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ－Ｌ１ポリペプチドの結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、ＰＤ－１（例えば、配列番号１０５に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ－１ポリペプチド）に結合する。
いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ－１に対して、１ｎＭ～１ｍＭの結合親和性を有する。いくつかの場合において、本開示のバリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ－１に対して、１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ１（例えば、配列番号１０５に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ１ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１０３または配列番号１０４に記載されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適なＰＤ－Ｌ１バリアントは、以下のアミノ酸配列：
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｒｇである。
好適なＰＤ－Ｌ１バリアントは、以下のアミノ酸配列：
（ここで、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である）に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｓｐである。
好適なＰＤ－Ｌ１バリアントは、以下のアミノ酸配列：
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｒｇである。
ＣＤ８０バリアント
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＣＤ８０ポリペプチドである。野生型ＣＤ８０は、ＣＤ２８に結合する。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＣＤ８０ポリペプチドである。野生型ＣＤ８０は、ＣＤ２８に結合する。
ヒトＣＤ８０のエクトドメインの野生型アミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して、配列番号１０９に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ８０ポリペプチドのＣＤ２８に対する結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ８０ポリペプチドの、ＣＤ２８（例えば、配列番号１１０、１１１、または１１２のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対する結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、ＣＤ２８に結合する。
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して、１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、本開示のバリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８（例えば、配列番号１１０、配列番号１１１、または配列番号１１２に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号１０９に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適なＣＤ８０バリアントは、以下のアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
（ここで、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｍｅｔ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである。
ＣＤ８６バリアント
いくつかの場合において、本開示のＴ ＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＣＤ８６ポリペプチドである。野生型ＣＤ８６は、ＣＤ２８に結合する。
いくつかの場合において、本開示のＴ ＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＣＤ８６ポリペプチドである。野生型ＣＤ８６は、ＣＤ２８に結合する。
野生型ヒトＣＤ８６の完全エクトドメインのアミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
野生型ヒトＣＤ８６のＩｇＶドメインのアミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して、配列番号１３０または配列番号１３１に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ８６ポリペプチドのＣＤ２８に対する結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０または配列番号１３１に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ８６ポリペプチドの、ＣＤ２８（例えば、配列番号１１０、１１１、または１１２のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対する結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、ＣＤ２８に結合する。
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して、１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、本開示のバリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８（例えば、配列番号１１０、１１１、または１１２のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３０に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号１３１に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適なＣＤ８６バリアントは、以下のアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
（ここで、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、１番目のＸはＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、２番目のＸはＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、１番目及び２番目のＸは、両方ともＡｌａである；
（ここで、１番目のＸはＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、２番目のＸはＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、１番目及び２番目のＸは、両方ともＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａである；
（ここで、１番目のＸはＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、２番目のＸはＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、１番目及び２番目のＸは、両方ともＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである；及び
（ここで、Ｘ１はＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである。
４－１ＢＢＬバリアント
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドである。野生型４－１ＢＢＬは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）に結合する。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドである。野生型４－１ＢＢＬは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）に結合する。
野生型４－１ＢＢＬアミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、ヒト４－１ＢＢＬの腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）相同性ドメイン（ＴＨＤ）のバリアントである。
ヒト４－１ＢＢＬのＴＨＤの野生型アミノ酸配列は、例えば、以下の配列番号１５７～１５９のうちの１つであり得る：
。
野生型４－１ＢＢアミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、４－１ＢＢに対して、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含む４－１ＢＢＬポリペプチドの結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、本開示のバリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、同一条件下にてアッセイしたとき、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含む４－１ＢＢＬポリペプチドの、４－１ＢＢポリペプチド（例えば、配列番号１６０に記載されるアミノ酸配列を含む４－１ＢＢポリペプチド）に対する結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、４－１ＢＢに結合する。
いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、４－１ＢＢに対して、１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、４－１ＢＢ（例えば、配列番号１６０に記載されるアミノ酸配列を含む４－１ＢＢポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１５６～１５９のうちの１つに記載される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適な４－１ＢＢＬバリアントは、以下のアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
（ここで、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｍｅｔ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；及び
（ここで、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである。
ＩＬ－２バリアント
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＩＬ－２ポリペプチドである。野生型ＩＬ－２は、ＩＬ－２受容体（ＩＬ－２Ｒ）に結合する。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＩＬ－２ポリペプチドである。野生型ＩＬ－２は、ＩＬ－２受容体（ＩＬ－２Ｒ）に結合する。
野生型ＩＬ－２アミノ酸配列は、次のとおりであり得る：
。
野生型ＩＬ２は、細胞の表面上のＩＬ２受容体（ＩＬ２Ｒ）に結合する。ＩＬ２受容体は、いくつかの場合において、アルファ鎖（ＩＬ－２Ｒα；ＣＤ２５とも称される）、ベータ鎖（ＩＬ－２Ｒβ；ＣＤ１２２とも称される、及びガンマ鎖（ＩＬ－２Ｒγ；ＣＤ１３２とも称される）を含む、ヘテロ三量体ポリペプチドである。ヒトＩＬ－２Ｒα、ＩＬ２Ｒβ、及びＩＬ－２Ｒγのアミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰがバリアントＩＬ－２ポリペプチドを含む場合、「同種の免疫共調節ポリペプチド」は、配列番号２４６、２４７、及び２４８のアミノ酸配列に含まれるポリペプチドを含む、ＩＬ－２Ｒである。
いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、ＩＬ－２Ｒに対して、配列番号２４５に記載されるアミノ酸配列を含むＩＬ－２ポリペプチドの結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、同一条件下にてアッセイしたとき、配列番号２４５に記載されるアミノ酸配列を含むＩＬ－２ポリペプチドの、ＩＬ－２Ｒ（例えば、配列番号２４６～２４８に記載されるアミノ酸配列を含むポリペプチドを含むＩＬ－２Ｒ）に対する結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、ＩＬ－２Ｒに結合する。
いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、ＩＬ－２Ｒに対して、１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、ＩＬ－２Ｒ（例えば、配列番号２４６～２４８に記載されるアミノ酸配列を含むポリペプチドを含むＩＬ－２Ｒ）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号２４５に記載されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適なＩＬ－２バリアントは、以下のアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｒｇである。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｓｎである。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｓｐである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｃｙｓである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｇｌｕである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｇｌｎである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｇｌｙである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｉｌｅである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｌｙｓである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｌｅｕである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｍｅｔである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｐｈｅである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｐｒｏである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｓｅｒである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｔｈｒである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｔｙｒである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｔｒｐである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｖａｌである；
（ここで、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである；
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＴｈｒであり、Ｘ２はＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＧｌｕ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外のアミノ酸であり、Ｘ３はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外のアミノ酸であり、Ｘ３はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外のアミノ酸であり、Ｘ３はＧｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外のアミノ酸であり、Ｘ３はＴｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４はＴｙｒ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ４は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａであり、Ｘ４はＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外のアミノ酸であり、Ｘ３はＴｙｒ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４はＧｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ４は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａであり、Ｘ４はＡｌａである；
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４はＴｙｒ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ５はＧｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ４は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ５は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａであり、Ｘ４はＡｌａであり、Ｘ５はＡｌａである；及び
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外のアミノ酸であり、Ｘ３はＧｌｎ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである。
ＴＧＦ－β
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在する免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。ＴＧＦ－βポリペプチドのアミノ酸配列は、当該技術分野において知られている。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在する免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－β１ポリペプチドである。本開示のＴＭＡＰＰ中に存在する免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－β２ポリペプチドである。本開示のＴＭＡＰＰ中に存在する免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－β３ポリペプチドである。好適なＴＧＦ－βポリペプチドは、ヒトＴＧＦ－β１ポリペプチド、ヒトＴＧＦ－β２ポリペプチド、またはヒトＴＧＦ－β３ポリペプチドの成熟形態に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。好適なＴＧＦ－βポリペプチドは、約１００アミノ酸～約１２５アミノ酸の長さを有し得、例えば、好適なＴＧＦ－βポリペプチドは、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、または約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸の長さを有し得る。
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在する免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－βポリペプチドである。ＴＧＦ－βポリペプチドのアミノ酸配列は、当該技術分野において知られている。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在する免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－β１ポリペプチドである。本開示のＴＭＡＰＰ中に存在する免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－β２ポリペプチドである。本開示のＴＭＡＰＰ中に存在する免疫調節ポリペプチドは、ＴＧＦ－β３ポリペプチドである。好適なＴＧＦ－βポリペプチドは、ヒトＴＧＦ－β１ポリペプチド、ヒトＴＧＦ－β２ポリペプチド、またはヒトＴＧＦ－β３ポリペプチドの成熟形態に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。好適なＴＧＦ－βポリペプチドは、約１００アミノ酸～約１２５アミノ酸の長さを有し得、例えば、好適なＴＧＦ－βポリペプチドは、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、または約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸の長さを有し得る。
好適なＴＧＦ－β１ポリペプチドは、次のＴＧＦ－β１アミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、ここで、ＴＧＦ－β１ポリペプチドは、約１１２アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＴＧＦ－β１ポリペプチドは、Ｃ７７Ｓの置換を含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＴＧＦ－β１ポリペプチドは、次のＴＧＦ－β１アミノ酸配列：
（ここで、アミノ酸７７は、Ｓｅｒである）に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
好適なＴＧＦ－β２ポリペプチドは、次のＴＧＦ－β２アミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、ここで、ＴＧＦ－β２ポリペプチドは、約１１２アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＴＧＦ－β２ポリペプチドは、Ｃ７７Ｓの置換を含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＴＧＦ－β２ポリペプチドは、次のＴＧＦ－β２アミノ酸配列：
（ここで、アミノ酸７７はＳｅｒである）に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
好適なＴＧＦ－β３ポリペプチドは、次のＴＧＦ－β３アミノ酸配列：
に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、ここで、ＴＧＦ－β３ポリペプチドは、約１１２アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、好適なＴＧＦ－β３ポリペプチドは、Ｃ７７Ｓの置換を含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＴＧＦ－β３ポリペプチドは、次のＴＧＦ－β３アミノ酸配列：
（ここで、アミノ酸７７はＳｅｒである）に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
二量体化ペア
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示の抗原提示ポリペプチド（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、ポリペプチドの二量体化ペアを含む。例えば、本開示の抗原提示ポリペプチド（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、少なくとも第１及び第２のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドであり、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、二量体化ペアの第１のメンバーを含み、第２のポリペプチドは、二量体化ペアの第２のメンバーを含む。
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示の抗原提示ポリペプチド（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、ポリペプチドの二量体化ペアを含む。例えば、本開示の抗原提示ポリペプチド（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、少なくとも第１及び第２のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドであり、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、二量体化ペアの第１のメンバーを含み、第２のポリペプチドは、二量体化ペアの第２のメンバーを含む。
二量体化ペプチドは、当該技術分野において知られており、任意の既知の二量体化ペプチドが使用に好適である。二量体化ペプチドは、コラーゲンリピートＧｌｙ－Ｘａａ－Ｘａａからなるコラーゲンドメインを含む、コレクチンファミリー（例えば、ＡＣＲＰ３０またはＡＣＲＰ３０様タンパク質）のポリペプチドを含む。他の二量体化ペプチドは、コイルドコイルドメイン及びロイシンジッパードメインを含む。コラーゲンドメインは、（Ｇｌｙ－Ｘａａ－Ｘａａ）ｎを含み得、ここで、Ｘａａは、任意のアミノ酸であり、ｎは、１０～４０の整数である。いくつかの場合において、コラーゲンドメインは、（Ｇｌｙ－Ｘａａ－Ｐｒｏ）ｎを含み、ここで、Ｘａａは、任意のアミノ酸であり、ｎは、１０～４０の整数である。二量体化ペプチドは、当該技術分野においてよく知られており、例えば、米国特許出願公開第２００３／０１３８４４０号を参照されたい。
いくつかの場合において、二量体化ペアは、互いに結合する２つのロイシンジッパーポリペプチドを含む。ロイシンジッパーポリペプチドの非限定的な例としては、例えば、次のアミノ酸配列のいずれか１つのペプチドを含む：
。
いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。
更なるロイシンジッパーポリペプチドは、当該技術分野において知られており、そのいずれも本開示の抗原提示ポリペプチドの使用に好適である。
コラーゲンオリゴマー化ペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み得る。
コイルドコイル二量体化ペプチドは、当該技術分野において知られている。例えば、コイルドコイル二量体化ペプチドは、次のアミノ酸配列のいずれか１つのペプチドを含み得る：
。
いくつかの場合において、二量体化ペプチドは、少なくとも１つのシステイン残基を含む。例としては、例えば、
が挙げられる。
図５Ａ及び図５Ｂに示されるものなどのＩｇ ＣＨ１ドメイン及びＩｇ κ鎖定常領域は、二量体化ペプチドとしても機能する。
追加のポリペプチド
本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、上記のものに加えて、１つ以上のポリペプチドを含み得る。好適な追加のポリペプチドには、エピトープタグ及び親和性ドメインが含まれる。１つ以上の追加のポリペプチドは、本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖のＮ末端、本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖のＣ末端、または本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖の内部に含まれ得る。
本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、上記のものに加えて、１つ以上のポリペプチドを含み得る。好適な追加のポリペプチドには、エピトープタグ及び親和性ドメインが含まれる。１つ以上の追加のポリペプチドは、本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖のＮ末端、本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖のＣ末端、または本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖の内部に含まれ得る。
エピトープタグ
好適なエピトープタグには、ヘマグルチニン
などが含まれるが、これらに限定されない。
好適なエピトープタグには、ヘマグルチニン
親和性ドメイン
親和性ドメインは、結合パートナー（例えば、同定または精製に有用な固体支持体上に固定されたものなど）と相互作用することができるペプチド配列を含む。発現タンパク質に融合されたヒスチジンなどの複数の連続する単一アミノ酸をコードするＤＮＡ配列を、ニッケルセファロースなどの樹脂カラムへの高親和性結合による組み換えタンパク質のワンステップ精製に使用することができる。例示的な親和性ドメインとしては、Ｈｉｓ５（ＨＨＨＨＨ）（配列番号２９１）、ＨｉｓＸ６（ＨＨＨＨＨＨ）（配列番号２９２）、Ｃ－ｍｙｃ（ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ）（配列番号２９０）、Ｆｌａｇ（ＤＹＫＤＤＤＤＫ）（配列番号２８９）、ＳｔｒｅｐＴａｇ（ＷＳＨＰＱＦＥＫ）（配列番号２９３）、ヘマグルチニン、例えば、ＨＡタグ（ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ）（配列番号２８８）、グルタチオン－Ｓ－トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、チオレドキシン、セルロース結合ドメイン、ＲＹＩＲＳ（配列番号２９４）、Ｐｈｅ－Ｈｉｓ－Ｈｉｓ－Ｔｈｒ（配列番号２９５）、キチン結合ドメイン、Ｓ－ペプチド、Ｔ７ペプチド、ＳＨ２ドメイン、Ｃ末端ＲＮＡタグ、ＷＥＡＡＡＲＥＡＣＣＲＥＣＣＡＲＡ（配列番号２９６）、金属結合ドメイン、例えば、亜鉛結合ドメインまたはカルシウム結合ドメイン、例えば、カルシウム結合タンパク質、例えば、カルモジュリン、トロポニンＣ、カルシニューリンＢ、ミオシン軽鎖、リカバリン、Ｓ－モジュリン、ビジニン、ＶＩＬＩＰ、ニューロカルシン、ヒポカルシン、フリクエニン、カルトラクチン、カルパイン大サブユニット、Ｓ１００タンパク質、パルブアルブミン、カルビンジンＤ９Ｋ、カルビンジンＤ２８Ｋ及びカルレチニンに由来するものなど、インテイン、ビオチン、ストレプトアビジン、ＭｙｏＤ、Ｉｄ、ロイシンジッパー配列、ならびにマルトース結合タンパク質が挙げられる。
親和性ドメインは、結合パートナー（例えば、同定または精製に有用な固体支持体上に固定されたものなど）と相互作用することができるペプチド配列を含む。発現タンパク質に融合されたヒスチジンなどの複数の連続する単一アミノ酸をコードするＤＮＡ配列を、ニッケルセファロースなどの樹脂カラムへの高親和性結合による組み換えタンパク質のワンステップ精製に使用することができる。例示的な親和性ドメインとしては、Ｈｉｓ５（ＨＨＨＨＨ）（配列番号２９１）、ＨｉｓＸ６（ＨＨＨＨＨＨ）（配列番号２９２）、Ｃ－ｍｙｃ（ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ）（配列番号２９０）、Ｆｌａｇ（ＤＹＫＤＤＤＤＫ）（配列番号２８９）、ＳｔｒｅｐＴａｇ（ＷＳＨＰＱＦＥＫ）（配列番号２９３）、ヘマグルチニン、例えば、ＨＡタグ（ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ）（配列番号２８８）、グルタチオン－Ｓ－トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、チオレドキシン、セルロース結合ドメイン、ＲＹＩＲＳ（配列番号２９４）、Ｐｈｅ－Ｈｉｓ－Ｈｉｓ－Ｔｈｒ（配列番号２９５）、キチン結合ドメイン、Ｓ－ペプチド、Ｔ７ペプチド、ＳＨ２ドメイン、Ｃ末端ＲＮＡタグ、ＷＥＡＡＡＲＥＡＣＣＲＥＣＣＡＲＡ（配列番号２９６）、金属結合ドメイン、例えば、亜鉛結合ドメインまたはカルシウム結合ドメイン、例えば、カルシウム結合タンパク質、例えば、カルモジュリン、トロポニンＣ、カルシニューリンＢ、ミオシン軽鎖、リカバリン、Ｓ－モジュリン、ビジニン、ＶＩＬＩＰ、ニューロカルシン、ヒポカルシン、フリクエニン、カルトラクチン、カルパイン大サブユニット、Ｓ１００タンパク質、パルブアルブミン、カルビンジンＤ９Ｋ、カルビンジンＤ２８Ｋ及びカルレチニンに由来するものなど、インテイン、ビオチン、ストレプトアビジン、ＭｙｏＤ、Ｉｄ、ロイシンジッパー配列、ならびにマルトース結合タンパク質が挙げられる。
薬物コンジュゲート
本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖は、ポリペプチド鎖に連結した（例えば、共有結合的に会合した）小分子薬物を含み得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、当該Ｆｃポリペプチドは、共有結合的に連結した小分子薬物を含み得る。いくつかの場合において、小分子薬物は、自己免疫疾患を治療する薬剤、または自己免疫疾患の症状を緩和する薬剤である。本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖は、ポリペプチド鎖に連結した（例えば、共有結合的に会合した）薬剤を含み得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、Ｆｃポリペプチドは、共有結合的に連結した薬剤を含み得る。
本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖は、ポリペプチド鎖に連結した（例えば、共有結合的に会合した）小分子薬物を含み得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、当該Ｆｃポリペプチドは、共有結合的に連結した小分子薬物を含み得る。いくつかの場合において、小分子薬物は、自己免疫疾患を治療する薬剤、または自己免疫疾患の症状を緩和する薬剤である。本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖は、ポリペプチド鎖に連結した（例えば、共有結合的に会合した）薬剤を含み得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、Ｆｃポリペプチドは、共有結合的に連結した薬剤を含み得る。
薬物は、本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖に直接的にまたは間接的に連結され得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、薬物は、Ｆｃポリペプチドに直接的にまたは間接的に連結され得る。直接的な連結は、アミノ酸側鎖への直接的な連結を伴い得る。間接的な連結は、リンカーを介した連結であり得る。薬物は、チオエーテル結合、アミド結合、カルバメート結合、ジスルフィド結合、またはエーテル結合を介して、本開示のＴＭＡＰＰのポリペプチド鎖（例えば、Ｆｃポリペプチド）に連結され得る。
リンカーには、切断可能なリンカー及び切断不可能なリンカーが含まれる。いくつかの場合において、リンカーは、プロテアーゼで切断可能なリンカーである。好適なリンカーには、例えば、ペプチド（例えば、２～１０アミノ酸長、例えば、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０アミノ酸長）、アルキル鎖、ポリ（エチレングリコール）、ジスルフィド基、チオエーテル基、酸分解性基、光分解性基、ペプチダーゼ分解性基、及びエステラーゼ分解性基が含まれる。好適なリンカーの非限定的な例は、ｉ）Ｎ－スクシンイミジル－［（Ｎ－マレイミドプロピオンアミド）－テトラエチレングリコール］エステル（ＮＨＳ－ＰＥＧ４－マレイミド）、ｉｉ）Ｎ－スクシンイミジル４－（２－ピリジルジチオ）ブタノエート（ＳＰＤＢ）、Ｎ－スクシンイミジル４－（２－ピリジルジチオ）２－スルホブタノエート（スルホ－ＳＰＤＢ）、Ｎ－スクシンイミジル４－（２－ピリジルジチオ）ペンタノエート（ＳＰＰ）、Ｎ－スクシンイミジル－４－（Ｎ－マレイミドメチル）－シクロヘキサン－１－カルボキシ－（６－アミドカプロエート）（ＬＣ－ＳＭＣＣ）、κ－マレイミドウンデカン酸Ｎ－スクシンイミジルエステル（ＫＭＵＡ）、γ－マレイミド酪酸Ｎ－スクシンイミジルエステル（ＧＭＢＳ）、ε－マレイミドカプロン酸Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＥＭＣＳ）、ｍ－マレイミドベンゾイル－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＭＢＳ）、Ｎ－（α－マレイミドアセトキシ）－スクシンイミドエステル（ＡＭＡＳ）、スクシンイミジル－６－（β－マレイミドプロピオンアミド）ヘキサノエート（ＳＭＰＨ）、Ｎ－スクシンイミジル４－（ｐ－マレイミドフェニル）ブチレート（ＳＭＰＢ）、Ｎ－（ｐ－マレイミドフェニル）イソシアネート（ＰＭＰＩ）、Ｎ－スクシンイミジル４（２－ピリジルチオ）ペンタノエート（ＳＰＰ）、Ｎ－スクシンイミジル（４－ヨード－アセチル）アミノベンゾエート（ＳＩＡＢ）、６－マレイミドカプロイル（ＭＣ）、マレイミドプロパノイル（ＭＰ）、ｐ－アミノベンジルオキシカルボニル（ＰＡＢ）、Ｎ－スクシンイミジル４－（マレイミドメチル）シクロヘキサンカルボキシレート（ＳＭＣＣ）、ＳＭＣＣの「長鎖」アナログ（ＬＣ－ＳＭＣＣ）であるＮ－スクシンイミジル－４－（Ｎ－マレイミドメチル）－シクロヘキサン－１－カルボキシ－（６－アミドカプロエート）、３－マレイミドプロパン酸Ｎ－スクシンイミジルエステル（ＢＭＰＳ）、Ｎ－スクシンイミジルヨードアセテート（ＳＩＡ）、Ｎ－スクシンイミジルブロモアセテート（ＳＢＡ）、及びＮ－スクシンイミジル３－（ブロモアセトアミド）プロピオネート（ＳＢＡＰ）である。
ポリペプチド（例えば、Ｆｃポリペプチド）は、文献に記載されるように、スクシンイミジル４－（Ｎ－マレイミドメチル）－シクロヘキサン－１－カルボキシレート（ＳＭＣＣ）、スルホ－ＳＭＣＣ、マレイミドベンゾイル－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＭＢＳ）、スルホ－ＭＢＳまたはスクシンイミジル－ヨードアセテートなどの架橋剤で修飾して、１～１０個の反応性基を導入することができる。次いで、修飾されたＦｃポリペプチドをチオール含有剤と反応させることで、コンジュゲートを生成する。
例えば、本開示のＴＭＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、Ｆｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖は、式（Ａ）－（Ｌ）－（Ｃ）のものであり、ここで、（Ａ）は、Ｆｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖であり、（Ｌ）は、存在する場合、リンカーであり、（Ｃ）は、薬剤である。（Ｌ）は、存在する場合、（Ａ）を（Ｃ）に連結する。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖は、２つ以上の薬剤（例えば、２、３、４、もしくは５つ、または５つを超える薬剤）を含み得る。
好適な薬物には、例えば、スルファサラジン、アザチオプリン、シクロホスファミド、抗マラリア薬、Ｄ－ペニシラミン、シクロスポリンが含まれる。好適な薬物には、非ステロイド性抗炎症薬、糖質コルチコイド、レフルノミド、メトトレキサートなどが含まれる。
例示的なＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド
以下は、本開示の多重体ＴＭＡＰＰの非限定的な例である。
以下は、本開示の多重体ＴＭＡＰＰの非限定的な例である。
１）いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲに結合することが可能なエピトープを提示するペプチド（例えば、「自身の」エピトープ」）、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２０アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ＨＬＡ α１及びＨＬＡ α２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１８９アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ１４Ａ及びＬ１５Ａの置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドであり、例えば、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２６アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、多発性硬化症に関連する自己抗原である。いくつかの場合において、ＨＬＡ β１及びβ２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１９９アミノ酸の長さを有する。好適なリンカーは、
であり得る。
２）いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）リンカー、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、ｖ）リンカー、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲに結合することが可能なエピトープを提示するペプチド（例えば、「自身の」エピトープ）、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２０アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ＨＬＡ α１及びＨＬＡ α２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１８９アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ１４Ａ及びＬ１５Ａの置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドであり、例えば、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２６アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、自身のペプチドである。例えば、いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、リウマチ様関節炎に関連する自己抗原である。いくつかの場合において、ＨＬＡ β１及びβ２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１９９アミノ酸の長さを有する。好適なリンカーは、
であり得る。
３）いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）リンカー、ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲに結合することが可能なエピトープを提示するペプチド（例えば、「自身の」エピトープ）、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２０アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ＨＬＡ α１及びＨＬＡ α２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１８９アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ１４Ａ及びＬ１５Ａの置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドであり、例えば、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２６アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、自身のペプチドである。例えば、いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、ＳＬＥに関連する。いくつかの場合において、ＨＬＡ β１及びβ２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１９９アミノ酸の長さを有する。好適なリンカーは、
であり得る。
４）いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）リンカー、及びｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＴＣＲに結合することが可能なエピトープを提示するペプチド（例えば、「自身の」エピトープ）、ｉｖ）リンカー、ｖ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、及びｖｉ）ＨＬＡ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２０アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ＨＬＡ α１及びＨＬＡ α２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１８９アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ１４Ａ及びＬ１５Ａの置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドであり、例えば、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２６アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、自身のペプチドである。例えば、いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、シェーグレン症候群に関連する。いくつかの場合において、ＨＬＡ β１及びβ２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１９９アミノ酸の長さを有する。好適なリンカーは、
であり得る。
５）いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｉｉｉ）リンカー、及びｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲに結合することが可能なエピトープを提示するペプチド（例えば、「自身の」エピトープ）、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ β２ポリペプチド、及びｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２０アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ＨＬＡ α１及びＨＬＡ α２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１８９アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ１４Ａ及びＬ１５Ａの置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドであり、例えば、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含み、２２６アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、自身のペプチドである。例えば、いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、グレーヴス病に関連する。いくつかの場合において、ＨＬＡ β１及びβ２ポリペプチドは、ともに次のアミノ酸配列：
を含み、１９９アミノ酸の長さを有する。好適なリンカーは、
であり得る。
追加の例示的な多量体ＴＭＡＰＰ
以下は、次のポリペプチドペアを採用した本開示の多量体ＴＭＡＰＰの非限定的な例である：１）図２６Ａに示される１４５２ポリペプチドと図３４Ａに示される１６６１ポリペプチド、２）図３３Ａに示される１６５９ポリペプチドと図３５Ａに示される１６６４ポリペプチド、３）図に示される１６３７ポリペプチドと図２５Ａに示される１４０８ポリペプチド、及び図３１Ａに示される「ＤＲＡ－ＤＲＢ－エピトープコンストラクト」ポリペプチドと図３２Ａに示される１６４０ポリペプチド。ＴＭＡＰＰを必要とする個体に投与されるＴＭＡＰＰは、一般に、上述の図に示されるようなリーダー配列またはヒスチジンタグを含まない。
以下は、次のポリペプチドペアを採用した本開示の多量体ＴＭＡＰＰの非限定的な例である：１）図２６Ａに示される１４５２ポリペプチドと図３４Ａに示される１６６１ポリペプチド、２）図３３Ａに示される１６５９ポリペプチドと図３５Ａに示される１６６４ポリペプチド、３）図に示される１６３７ポリペプチドと図２５Ａに示される１４０８ポリペプチド、及び図３１Ａに示される「ＤＲＡ－ＤＲＢ－エピトープコンストラクト」ポリペプチドと図３２Ａに示される１６４０ポリペプチド。ＴＭＡＰＰを必要とする個体に投与されるＴＭＡＰＰは、一般に、上述の図に示されるようなリーダー配列またはヒスチジンタグを含まない。
１）１４５２＋１６６１。いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｖｉ）二量体化ポリペプチド、及びｖｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ β２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチド、ｖｉ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチド、及びｖｉｉ）ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ β２ポリペプチド、及びｉｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ、例えば、ＰＫＹＶＫＱＮＴＬＫＬＡＴ（配列番号３０３）である。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ－ＤＲＢ１ β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパー二量体化ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図２６Ａに示される１４５２アミノ酸配列を、リーダー配列なし、かつＣ末端リンカー及びヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図２６Ａに示される１４５２アミノ酸配列のアミノ酸２１～６２８を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３４Ａに示される１６６１アミノ酸配列を、リーダー配列なしで含む。例えば、いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３４Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１～４９１を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドのエピトープは、
ではなく、代わりに、異なるエピトープで置換される。
２）１６５９＋１６６４。いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、及びｉｉｉ）ＨＬＡ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチド、及びｖ）ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、及びｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ、例えば、
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＤＲＡ α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＤＲＡ α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ１ β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３３Ａに示される１６５９アミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカー及びヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３３Ａに示される１６５９アミノ酸配列のアミノ酸２１～５９１を含む。いくつかの場合において、エピトープは、ＰＫＹＶＫＱＮＴＬＫＬＡＴ（配列番号３０３）ではなく、代わりに、異なるエピトープで置換される。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３５Ａに示される１６６４アミノ酸配列を、リーダー配列なしで含む。例えば、いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３５Ａに示される１６６４アミノ酸配列のアミノ酸２１～４２９を含む。
３）１６３７－１４０８。いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｖ）二量体化ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ β２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチド、ｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチド、及びｖｉ）ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β２ポリペプチド、及びｉｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）ｐｐ６５エピトープ
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ１ β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３０Ａに示される１６３７アミノ酸配列を、リーダー配列なし、かつＣ末端リンカー及びヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３０Ａに示される１６３７アミノ酸配列のアミノ酸２１～６２９を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、エピトープ
を含まず、代わりに、エピトープは、異なるエピトープで置換される。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図２５Ａに示されるアミノ酸配列を含むが、リーダーペプチドを含まない。したがって、例えば、いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図２５Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１～４９３を含む。
４）「ＤＲＡ－ＤＲＢ－エピトープ」＋１６４０。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｖ）二量体化ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）独立して選択される第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ β２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１－４ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチド、ｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチド、及びｖｉ）ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、ｉｉ）独立して選択される第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１－４ β２ポリペプチド、及びｉｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ、例えば、
である。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンペプチドではなく、代わりに、エピトープは、異なるエピトープで置換される。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ１－４ β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ１－４ β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。第１のポリペプチドのアミノ酸配列は、図３１Ａに示されるＤＲＡ－ＤＲＢ－エピトープコンストラクトのアミノ酸２１～６２９と同様の形式、例えば、リーダー配列なし、かつＣ末端リンカー及びヒスチジンタグなし）で構成され得る。第２のポリペプチドのアミノ酸配列は、図３２Ａに示されるタンパク質／ポリペプチドコンストラクト１６４０のアミノ酸２１～４９３と同様の形式（リーダー配列なし）で構成され得る。
単鎖ＴＭＡＰＰ
以下は、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰの非限定的な例である。例えば、図２８Ａ（１５９９ポリペプチド）及び図２９Ａ（１６０１ポリペプチド）を参照されたい。ＴＭＡＰＰを必要とする個体に投与されるＴＭＡＰＰは、一般に、上述の図に示されるようなリーダー配列またはヒスチジンタグを含まない。
以下は、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰの非限定的な例である。例えば、図２８Ａ（１５９９ポリペプチド）及び図２９Ａ（１６０１ポリペプチド）を参照されたい。ＴＭＡＰＰを必要とする個体に投与されるＴＭＡＰＰは、一般に、上述の図に示されるようなリーダー配列またはヒスチジンタグを含まない。
１）１５９９。いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ β２ポリペプチド、ｖｉ）免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、及びｖｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。１つの非限定的な例として、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ ＤＲＢ β２ポリペプチド、ｖｉ）免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、及びｖｉｉ）ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２８Ａに示されるアミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカー及びヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２８Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１～９８１を含む。いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、ヘマグルチニンエピトープ
を含まず、代わりに、エピトープは、異なるエピトープで置換される。
２）１６０１。いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｖ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｖｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、及びｖｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。１つの非限定的な例として、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチド、ｖ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、ｖｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ－２ポリペプチド）、及びｖｉｉ）ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ－２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
（Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２９Ａに示されるアミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカー及びヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２９Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１～８７６を含む。
抗原提示ポリペプチド
本開示は、免疫調節ポリペプチドを含まない抗原提示ポリペプチド（ＡＰＰ）を提供する。本開示のＡＰＰは、単鎖ポリペプチドまたは多重鎖（多量体）ポリペプチドであり得る。本開示のＡＰＰは、診断用途及び治療用途に有用である。
本開示は、免疫調節ポリペプチドを含まない抗原提示ポリペプチド（ＡＰＰ）を提供する。本開示のＡＰＰは、単鎖ポリペプチドまたは多重鎖（多量体）ポリペプチドであり得る。本開示のＡＰＰは、診断用途及び治療用途に有用である。
多量体抗原提示ポリペプチド
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、２つのポリペプチド鎖を含む。いくつかの場合において、２つのポリペプチド鎖は、例えば、ジスルフィド結合を介して、互いに共有結合されている。他の場合において、２つのポリペプチド鎖は、互いに共有結合されていない。いくつかの場合において、２つのポリペプチド鎖は、互いに共有結合されておらず、これらの場合のいくつかにおいて、２つのポリペプチド鎖のそれぞれは、二量体化ペアのメンバーを含む。本開示の多量体ＡＰＰの例は、図３７Ａ及び図３７Ｂに模式的に示されている。
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、２つのポリペプチド鎖を含む。いくつかの場合において、２つのポリペプチド鎖は、例えば、ジスルフィド結合を介して、互いに共有結合されている。他の場合において、２つのポリペプチド鎖は、互いに共有結合されていない。いくつかの場合において、２つのポリペプチド鎖は、互いに共有結合されておらず、これらの場合のいくつかにおいて、２つのポリペプチド鎖のそれぞれは、二量体化ペアのメンバーを含む。本開示の多量体ＡＰＰの例は、図３７Ａ及び図３７Ｂに模式的に示されている。
いくつかの場合において、本開示の抗原提示多量体ポリペプチド（多量体ＡＰＰ）は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）によって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及びｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）によって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）によって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドと免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドとの間にリンカーを含む。
いくつかの場合において、本開示の抗原提示多量体ポリペプチド（多量体ＡＰＰ）は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。二量体化ペアの第１のメンバーと第２のメンバーは、互いに、非共有結合的に結合する。いくつかの場合において、二量体化ペアの第１のメンバーと第２のメンバーは、二量体化剤を必要とすることなく、互いに、非共有結合的に結合する。いくつかの場合において、二量体化ペアの第１のメンバーと第２のメンバーは、二量体化剤の存在下で、互いに、非共有結合的に結合する。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバー、及びｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバー、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｉｉｉ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）第２のロイシンジッパーポリペプチド、及びｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドと二量体化ペアの第２のメンバーとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドと二量体化ペアの第１のメンバーとの間にリンカーを含む。
いくつかの場合において、本開示の抗原提示多量体ポリペプチド（多量体ＡＰＰ）は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）二量体化ペアの第１のメンバー、ｖｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）二量体化ペアの第１のメンバー、ｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチド、ｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドと二量体化ペアの第１のメンバーとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドと二量体化ペアの第２のメンバーとの間にリンカーを含む。
単量体抗原提示ポリペプチド
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖である。例を図３７Ｃ及び図３８Ａに模式的に示す。
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖である。例を図３７Ｃ及び図３８Ａに模式的に示す。
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ（例えば、単鎖ＡＰＰ）は、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及びｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドと免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格との間にリンカーを含む。
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及びｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｖｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識及び結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドとＩｇまたは非Ｉｇ骨格との間にリンカーを含む。
いくつかの場合において、本開示の単鎖ＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ α２ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ β２ポリペプチド、及びｖｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。１つの非限定的な例として、本開示の単鎖ＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＡ α２ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ ＤＲＢ β２ポリペプチド、及びｖｉ）ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ
である。他の場合において、エピトープは、
ではなく、代わりに、異なるエピトープで置換される。いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２７Ａに示される１５５９アミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカー及びヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２７Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１～７００を含む。
ＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
上記のとおり、本開示のＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩポリペプチド、すなわち、ＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチド及びＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドを含む。好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチド及びＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、上に記載されている。
上記のとおり、本開示のＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩポリペプチド、すなわち、ＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチド及びＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドを含む。好適なＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチド及びＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチドは、上に記載されている。
Ｆｃポリペプチド
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得る。例えば、ＡＰＰが多量体ポリペプチドである場合、いくつかの場合において、多量体ポリペプチドの第１及び／または第２のポリペプチド鎖は、Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、単量体ポリペプチドであり、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ２ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ３ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃなどであり得る。
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み得る。例えば、ＡＰＰが多量体ポリペプチドである場合、いくつかの場合において、多量体ポリペプチドの第１及び／または第２のポリペプチド鎖は、Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、単量体ポリペプチドであり、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ２ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ３ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃなどであり得る。
いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａ～２１Ｇに示されるＦｃ領域のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃ領域は、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃ領域は、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、Ｎ７７の置換を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、Ｎ７７Ａの置換を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸９９～３２５に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１９～２４６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１～２７６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１～２３４に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１００～３２７に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合において、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
を含む。
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｎ２９７（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＮ７７）のアスパラギン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるアミノ酸配列を含む（図２１Ａに示されるアミノ酸配列ではＮ７７であるＮ２９７Ａの置換を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４）のロイシン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３５（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１５）のロイシン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｅに示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｆに示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｇに示されるアミノ酸配列を含む（図２１Ｇに示されるアミノ酸配列では位置１４及び１５に対応するＬ２３４Ａの置換及びＬ２３５Ａの置換を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｐ３３１（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＰ１１１）のプロリン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含み、いくつかの場合において、置換は、Ｐ３３１Ｓの置換である。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４及びＬ２３５（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５）のロイシン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４及びＬ２３５（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５）のロイシン以外のアミノ酸による置換、ならびにＰ３３１（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＰ１１１）のプロリン以外のアミノ酸による置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｅに示されるアミノ酸配列（（図２１Ｅに示されるアミノ酸配列ではアミノ酸位置１４、１５、及び１１１に対応するＬ２３４Ｆ、Ｌ２３５Ｅ、及びＰ３３１Ｓの置換を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｇに示されるようにＬ２３４Ａ及びＬ２３５Ａの置換（図２１Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５のＡｌａによる置換）を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。
核酸
本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、核酸は、組み換え発現ベクターであり、したがって、本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターを提供する。本開示は、本開示のＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、核酸は、組み換え発現ベクターであり、したがって、本開示は、本開示のＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターを提供する。以下の核酸に関する議論は、本開示のＴＭＡＰＰをコードする核酸を指すが、その議論は、本開示のＡＰＰをコードする核酸にも同様に適用される。
本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、核酸は、組み換え発現ベクターであり、したがって、本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターを提供する。本開示は、本開示のＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、核酸は、組み換え発現ベクターであり、したがって、本開示は、本開示のＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターを提供する。以下の核酸に関する議論は、本開示のＴＭＡＰＰをコードする核酸を指すが、その議論は、本開示のＡＰＰをコードする核酸にも同様に適用される。
本開示の単鎖抗原提示ポリペプチドをコードする核酸
上記のように、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。したがって、本開示は、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列は、転写制御要素（複数可）、例えば、プロモーターに作動可能に連結され得る。
上記のように、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。したがって、本開示は、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列は、転写制御要素（複数可）、例えば、プロモーターに作動可能に連結され得る。
本開示の多量体ポリペプチドをコードする核酸（複数可）
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、少なくとも２つの別個のポリペプチド鎖を含む。本開示は、本開示の多量体ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、開示の多量体ＴＭＡＰＰの個々のポリペプチド鎖は、別個の核酸にコードされる。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドの全てのポリペプチド鎖は、単一の核酸にコードされる。いくつかの場合において、第１の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第２の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、単一の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチド及び本開示の多量体ポリペプチドの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、少なくとも２つの別個のポリペプチド鎖を含む。本開示は、本開示の多量体ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、開示の多量体ＴＭＡＰＰの個々のポリペプチド鎖は、別個の核酸にコードされる。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドの全てのポリペプチド鎖は、単一の核酸にコードされる。いくつかの場合において、第１の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第２の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、単一の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチド及び本開示の多量体ポリペプチドの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。
多量体ＴＭＡＰＰの個々のポリペプチド鎖をコードする別個の核酸
本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。上記のとおり、いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰの個々のポリペプチド鎖は、別個の核酸にコードされる。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの別個のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素、例えば、プロモーター（真核細胞において機能するプロモーターなど）に作動可能に連結され、ここで、プロモーターは、構成性プロモーターまたは誘導性プロモーターであり得る。
本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。上記のとおり、いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰの個々のポリペプチド鎖は、別個の核酸にコードされる。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの別個のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素、例えば、プロモーター（真核細胞において機能するプロモーターなど）に作動可能に連結され、ここで、プロモーターは、構成性プロモーターまたは誘導性プロモーターであり得る。
例えば、本開示は、第１の核酸及び第２の核酸を提供し、ここで、当該第１の核酸は、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、当該第２の核酸は、当該ＴＭＡＰＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、第１及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素に作動可能に連結される。いくつかの場合において、転写制御要素は、真核細胞において機能するプロモーターである。いくつかの場合において、核酸は、別個の発現ベクター中に存在する。
いくつかの場合において、第１及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素に作動可能に連結される。いくつかの場合において、転写制御要素は、真核細胞において機能するプロモーターである。いくつかの場合において、核酸は、別個の発現ベクター中に存在する。
ＴＭＡＰＰ中に存在する２つ以上のポリペプチドをコードする核酸
本開示は、本開示のＴＭＡＰＰの少なくとも第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが第１、第２、及び第３のポリペプチドを含む場合、核酸は、当該第１、第２、及び第３のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、タンパク質分解により切断可能なリンカーを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、リボソームスキッピングシグナル（またはシス作用性加水分解酵素要素、ＣＨＹＳＥＬ）を含む。本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間にタンパク質分解により切断可能なリンカーが提供される核酸の例は、以下に記載され、これらの実施形態のいずれにおいても、タンパク質分解により切断可能なリンカーをコードするヌクレオチド配列の代わりに、ＩＲＥＳまたはリボソームスキッピングシグナルを使用することができる。
本開示は、本開示のＴＭＡＰＰの少なくとも第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが第１、第２、及び第３のポリペプチドを含む場合、核酸は、当該第１、第２、及び第３のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、タンパク質分解により切断可能なリンカーを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、リボソームスキッピングシグナル（またはシス作用性加水分解酵素要素、ＣＨＹＳＥＬ）を含む。本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間にタンパク質分解により切断可能なリンカーが提供される核酸の例は、以下に記載され、これらの実施形態のいずれにおいても、タンパク質分解により切断可能なリンカーをコードするヌクレオチド配列の代わりに、ＩＲＥＳまたはリボソームスキッピングシグナルを使用することができる。
いくつかの場合において、第１の核酸（例えば、組み換え発現ベクター、ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡなど）は、本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、第２の核酸（例えば、組み換え発現ベクター、ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡなど）は、本開示のＴＭＡＰＰの第２のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、及び第２のポリペプチドをコードする第２のヌクレオチド配列は、転写制御要素、例えば、プロモーター（真核細胞において機能するプロモーターなど）に作動可能に連結され、ここで、プロモーターは、構成性プロモーターまたは誘導性プロモーターであり得る。
組み換え発現ベクター
本開示は、本開示の核酸を含む、組み換え発現ベクターを提供する。いくつかの場合において、組み換え発現ベクターは、非ウイルスベクターである。いくつかの場合において、組み換え発現ベクターは、ウイルスコンストラクト、例えば、組み換えアデノ随伴ウイルスコンストラクト（例えば、米国特許第７，０７８，３８７参照）、組み換えアデノウイルスコンストラクト、組み換えレンチウイルスコンストラクト、組み換えレトロウイルスコンストラクト、非組み込み型ウイルスベクターなどである。
本開示は、本開示の核酸を含む、組み換え発現ベクターを提供する。いくつかの場合において、組み換え発現ベクターは、非ウイルスベクターである。いくつかの場合において、組み換え発現ベクターは、ウイルスコンストラクト、例えば、組み換えアデノ随伴ウイルスコンストラクト（例えば、米国特許第７，０７８，３８７参照）、組み換えアデノウイルスコンストラクト、組み換えレンチウイルスコンストラクト、組み換えレトロウイルスコンストラクト、非組み込み型ウイルスベクターなどである。
好適な発現ベクターには、ウイルスベクター（例えば、ワクシニアウイルス、ポリオウイルス、アデノウイルスをベースにするウイルスベクター（例えば、Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３５：２５４３ ２５４９，１９９４；Ｂｏｒｒａｓ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ６：５１５ ５２４，１９９９；Ｌｉ ａｎｄ Ｄａｖｉｄｓｏｎ，ＰＮＡＳ ９２：７７００ ７７０４，１９９５；Ｓａｋａｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｈ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ５：１０８８ １０９７，１９９９；ＷＯ９４／１２６４９、ＷＯ９３／０３７６９、ＷＯ９３／１９１９１、ＷＯ９４／２８９３８、ＷＯ９５／１１９８４及びＷＯ９５／００６５５参照）、アデノ随伴ウイルス（例えば、Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ９：８１ ８６，１９９８、Ｆｌａｎｎｅｒｙ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ９４：６９１６ ６９２１，１９９７；Ｂｅｎｎｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３８：２８５７ ２８６３，１９９７；Ｊｏｍａｒｙ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ４：６８３ ６９０，１９９７、Ｒｏｌｌｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ １０：６４１ ６４８，１９９９；Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｍｏｌ Ｇｅｎｅｔ ５：５９１ ５９４，１９９６；Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ＷＯ９３／０９２３９、Ｓａｍｕｌｓｋｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒ．（１９８９）６３：３８２２－３８２８；Ｍｅｎｄｅｌｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｖｉｒｏｌ．（１９８８）１６６：１５４－１６５；及びＦｌｏｔｔｅ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ（１９９３）９０：１０６１３－１０６１７参照）、ＳＶ４０、単純ヘルペスウイルス、ヒト免疫不全ウイルス（例えば、Ｍｉｙｏｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ９４：１０３１９ ２３，１９９７；Ｔａｋａｈａｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｖｉｒｏｌ ７３：７８１２ ７８１６，１９９９参照）、レトロウイルスベクター（例えば、マウス白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、ならびにラウス肉腫ウイルス、Ｈａｒｖｅｙ肉腫ウイルス、トリ白血病ウイルス、レンチウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、骨髄増殖性肉腫ウイルス及び乳腺腫瘍ウイルスなどのレトロウイルスに由来するベクター）などが含まれるが、これらに限定されない。多数の好適な発現ベクターが当業者に知られており、多くが市販されている。
使用される宿主／ベクター系に応じて、構成性及び誘導性プロモーター、転写エンハンサー要素、転写ターミネーターなどを含む多数の好適な転写及び翻訳制御要素のいずれかを発現ベクターに使用することができる（例えば、Ｂｉｔｔｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９８７）Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１５３：５１６－５４４参照）。
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰをコードするヌクレオチド配列は、制御要素、例えば、プロモーターなどの転写制御要素に作動可能に連結される。転写制御要素は、真核細胞（例えば、哺乳類細胞）または原核細胞（例えば、細菌または古細菌細胞）のいずれかで機能的であり得る。いくつかの場合において、ＤＮＡ標的ＲＮＡ及び／または部位特異的改変ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、ＤＮＡ標的ＲＮＡ及び／または部位特異的改変ポリペプチドをコードする当該ヌクレオチド配列を原核生物及び真核細胞の両方で発現させることが可能な複数の制御要素に作動可能に連結される。
好適な真核生物プロモーター（真核細胞で機能するプロモーター）の非限定的な例としては、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）前初期単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）チミジンキナーゼ、前期及び後期ＳＶ４０、レトロウイルス由来の長い末端反復（ＬＴＲ）、ならびにマウスメタロチオネイン－Ｉに由来するものが挙げられる。適切なベクター及びプロモーターの選択は、十分に当業者の技術レベルの範囲内である。発現ベクターはまた、翻訳開始のためのリボソーム結合部位及び転写ターミネーターを含有する。発現ベクターはまた、発現の増幅に適切な配列を含み得る。
遺伝子改変された宿主細胞
本開示は、遺伝子改変された宿主細胞を提供し、当該宿主細胞は、本開示の核酸（複数可）で遺伝子改変されている。
本開示は、遺伝子改変された宿主細胞を提供し、当該宿主細胞は、本開示の核酸（複数可）で遺伝子改変されている。
好適な宿主細胞には、酵母細胞、昆虫細胞、及び哺乳類細胞などの真核細胞が含まれる。いくつかの場合において、宿主細胞は、哺乳類細胞株の細胞である。好適な哺乳類細胞株には、ヒト細胞株、非ヒト霊長類細胞株、げっ歯類（例えば、マウス、ラット）細胞株などが含まれる。好適な哺乳類細胞株には、ＨｅＬａ細胞（例えば、米国培養細胞系統保存機関（ＡＴＣＣ）番号ＣＣＬ－２）、ＣＨＯ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ９６１８、ＣＣＬ６１、ＣＲＬ９０９６）、２９３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ－１５７３）、Ｖｅｒｏ細胞、ＮＩＨ ３Ｔ３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ－１６５８）、Ｈｕｈ－７細胞、ＢＨＫ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＣＬ１０）、ＰＣ１２細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１７２１）、ＣＯＳ細胞、ＣＯＳ－７細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１６５１）、ＲＡＴ１細胞、マウスＬ細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＣＬＩ．３）、ヒト胎児腎細胞（ＨＥＫ）細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１５７３）、ＨＬＨｅｐＧ２細胞などが含まれるが、これらに限定されない。
遺伝子改変された宿主細胞を使用して、本開示のＴＭＡＰＰを産生することができる。例えば、遺伝子改変された宿主細胞を使用して、本開示の多量体ＴＭＡＰＰ、または本開示の単鎖ＴＭＡＰＰを産生することができる。ポリペプチド（複数可）をコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクター（複数可）を宿主細胞に導入して、遺伝子改変された宿主細胞を生成し、その遺伝子改変された宿主細胞がポリペプチド（複数可）を産生する。
組成物
本開示は、本開示のＴＭＡＰＰまたはＡＰＰを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。本開示は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。以下の組成物に関する議論は、本開示のＴＭＡＰＰを含む組成物を指すが、その議論は、本開示のＡＰＰにも等しく適用される。
本開示は、本開示のＴＭＡＰＰまたはＡＰＰを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。本開示は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。以下の組成物に関する議論は、本開示のＴＭＡＰＰを含む組成物を指すが、その議論は、本開示のＡＰＰにも等しく適用される。
ＴＭＡＰＰを含む組成物
本開示の組成物は、本開示のＴＭＡＰＰに加えて、塩、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４など；緩衝剤、例えば、Ｔｒｉｓ緩衝液、Ｎ－（２－ヒドロキシエチル）ピペラジン－Ｎ’－（２－エタンスルホン酸）（ＨＥＰＥＳ）、２－（Ｎ－モルホリノ）エタンスルホン酸（ＭＥＳ）、２－（Ｎ－モルホリノ）エタンスルホン酸ナトリウム塩（ＭＥＳ）、３－（Ｎ－モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、Ｎ－トリス［ヒドロキシメチル］メチル－３－アミノプロパンスルホン酸（ＴＡＰＳ）など；可溶化剤；界面活性剤、例えば、Ｔｗｅｅｎ－２０などの非イオン性界面活性剤；プロテアーゼ阻害薬；グリセロールなどのうちの１つ以上を含み得る。
本開示の組成物は、本開示のＴＭＡＰＰに加えて、塩、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４など；緩衝剤、例えば、Ｔｒｉｓ緩衝液、Ｎ－（２－ヒドロキシエチル）ピペラジン－Ｎ’－（２－エタンスルホン酸）（ＨＥＰＥＳ）、２－（Ｎ－モルホリノ）エタンスルホン酸（ＭＥＳ）、２－（Ｎ－モルホリノ）エタンスルホン酸ナトリウム塩（ＭＥＳ）、３－（Ｎ－モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、Ｎ－トリス［ヒドロキシメチル］メチル－３－アミノプロパンスルホン酸（ＴＡＰＳ）など；可溶化剤；界面活性剤、例えば、Ｔｗｅｅｎ－２０などの非イオン性界面活性剤；プロテアーゼ阻害薬；グリセロールなどのうちの１つ以上を含み得る。
組成物は、薬学的に許容される賦形剤を含み得、賦形剤については、様々なものが当該技術分野において知られており、本明細書で詳細に論じる必要はない。薬学的に許容される賦形剤は、例えば、“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ”，１９ｔｈ Ｅｄ．（１９９５）または最新版、Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ；Ａ．Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ”，２０ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ；Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ（１９９９）Ｈ．Ｃ．Ａｎｓｅｌ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ ７ｔｈ ｅｄ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ；及びＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ（２０００）Ａ．Ｈ．Ｋｉｂｂｅ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，３ｒｄ ｅｄ．Ａｍｅｒ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ａｓｓｏｃ．を含む、様々な公開物中に十分記載されている。
医薬組成物は、ｉ）本開示のＴＭＡＰＰ、及びｉｉ）薬学的に許容される賦形剤を含み得る。いくつかの場合において、主題の医薬組成物は、対象への投与に好適なものであり、例えば、無菌である。例えば、いくつかの実施形態において、主題の医薬組成物は、ヒト対象への投与に好適なものであり、例えば、組成物が無菌であり、検出可能な発熱物質及び／または他の毒素を含まない。
タンパク質組成物は、他の成分、例えば、医薬品等級のマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、タルカム、セルロース、グルコース、スクロース、マグネシウム、カーボネートなどを含み得る。組成物は、生理学的条件に近づけるために必要とされる薬学的に許容される補助物質、例えば、ｐＨ調整剤及び緩衝剤、毒性調整剤など、例えば、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、乳酸ナトリウム、塩酸塩、硫酸塩、溶媒和物（例えば、混合イオン性塩、水、有機物質）、水和物（例えば、水）などを含み得る。
例えば、組成物は、水溶液、粉末形態、顆粒剤、錠剤、丸剤、坐剤、カプセル剤、懸濁剤、スプレーなどを含み得る。組成物は、以下に記載される様々な投与経路に応じて製剤化され得る。
本開示のＴＭＡＰＰが注射剤として組織に直接投与される場合（例えば、皮下、腹腔内、筋肉内、リンパ管内、及び／または静脈内投与）、製剤は、即時使用可能な剤形として、または非水性形態（例えば、再構成可能な貯蔵安定性粉末）もしくは薬学的に許容される担体及び賦形剤で構成される液剤などの水性形態として、提供することができる。タンパク質含有製剤はまた、投与後の主題タンパク質の血清半減期を延長するように提供することもできる。例えば、タンパク質は、コロイドとして調製されたリポソーム製剤、または血清半減期を延長する他の従来技術で提供され得る。リポソームの調製には、例えば、Ｓｚｏｋａ ｅｔ ａｌ．１９８０ Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｂｉｏｅｎｇ．９：４６７、米国特許第４，２３５，８７１号，同第４，５０１，７２８号及び同第４，８３７，０２８号に記載されるような様々な方法が利用可能である。調製物はまた、制御放出形態または徐放性形態で提供されてもよい。
いくつかの場合において、本開示の組成物は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰと、ｂ）生理食塩水（例えば、０．９％ＮａＣｌ）と、を含む。いくつかの場合において、組成物は、無菌である。いくつかの場合において、組成物は、ヒト対象への投与に好適なものであり、例えば、組成物は、無菌であり、検出可能な発熱物質及び／または他の毒素を含まない。したがって、本開示は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰと、ｂ）生理食塩水（例えば、０．９％ＮａＣｌ）と、を含む組成物を提供し、当該組成物は、無菌であり、検出可能な発熱物質及び／または他の毒素を含まない。
非経口投与に好適な製剤の他の例としては、等張無菌注射用液剤、抗酸化剤、静菌剤、及び製剤を対象のレシピエントの血液と等張にする溶質、懸濁化剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤、及び保存剤が挙げられる。例えば、主題の医薬組成物は、容器、例えば、無菌容器、例えば、シリンジ中に存在し得る。製剤は、アンプル及びバイアルなどの単位用量または複数回用量の密封容器で提供することができ、使用直前に注射剤用の無菌液状賦形剤、例えば、水の添加のみを要するフリーズドライ（凍結乾燥）状態で保存することができる。即時注射用液剤及び懸濁剤は、滅菌された散剤、顆粒剤及び錠剤から調製することができる。
製剤中における本開示のＴＭＡＰＰの濃度は、大きく変えることができ（例えば、約０．１％未満（通常、約２％または少なくとも約２％）から２０重量％～５０重量％までまたはそれ以上）、選択された特定の投与様式及び患者の必要性に従って、主に、液量、粘度、及び患者による因子に基づいて通常選択される。
本開示は、本開示の組成物、例えば、液体組成物を含む、容器を提供する。容器は、例えば、シリンジ、アンプルなどであってよい。いくつかの場合において、容器は、無菌である。いくつかの場合において、容器も組成物も無菌である。
核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物
本開示は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物、例えば、医薬組成物を提供する。薬学的に許容される賦形剤は、多種多様なものが当該技術分野において知られており、本明細書で詳細に論じる必要はない。薬学的に許容される賦形剤は、例えば、Ａ．Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ”，２０ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ；Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ（１９９９）Ｈ．Ｃ．Ａｎｓｅｌ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ ７ｔｈ ｅｄ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ；及びＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ（２０００）Ａ．Ｈ．Ｋｉｂｂｅ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，３ｒｄ ｅｄ．Ａｍｅｒ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ａｓｓｏｃ．を含む、様々な公開物中に十分記載されている。
本開示は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物、例えば、医薬組成物を提供する。薬学的に許容される賦形剤は、多種多様なものが当該技術分野において知られており、本明細書で詳細に論じる必要はない。薬学的に許容される賦形剤は、例えば、Ａ．Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ”，２０ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ；Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ（１９９９）Ｈ．Ｃ．Ａｎｓｅｌ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ ７ｔｈ ｅｄ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ；及びＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ（２０００）Ａ．Ｈ．Ｋｉｂｂｅ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，３ｒｄ ｅｄ．Ａｍｅｒ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ａｓｓｏｃ．を含む、様々な公開物中に十分記載されている。
本開示の組成物は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸または１つ以上の組み換え発現ベクターと、ｂ）緩衝液、界面活性剤、抗酸化剤、親水性ポリマー、デキストリン、キレート化剤、懸濁化剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤、静菌剤、湿潤剤、及び保存剤のうちの１つ以上と、を含み得る。好適な緩衝液には、（例えば、Ｎ，Ｎ－ビス（２－ヒドロキシエチル）－２－アミノエタンスルホン酸（ＢＥＳ）、ビス（２－ヒドロキシエチル）アミノ－トリス（ヒドロキシメチル）メタン（ＢＩＳ－Ｔｒｉｓ）、Ｎ－（２－ヒドロキシエチル）ピペラジン－Ｎ’３－プロパンスルホン酸（ＥＰＰＳまたはＨＥＰＰＳ）、グリシルグリシン、Ｎ－２－ヒドロキシエチルピペラジン－Ｎ’－２－エタンスルホン酸（ＨＥＰＥＳ）、３－（Ｎ－モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、ピペラジン－Ｎ，Ｎ’－ビス（２－エタン－スルホン酸）（ＰＩＰＥＳ）、炭酸水素ナトリウム、３－（Ｎ－トリス（ヒドロキシメチル）－メチル－アミノ）－２－ヒドロキシ－プロパンスルホン酸）ＴＡＰＳＯ、（Ｎ－トリス（ヒドロキシメチル）メチル－２－アミノエタンスルホン酸（ＴＥＳ）、Ｎ－トリス（ヒドロキシメチル）メチル－グリシン（トリシン）、トリス（ヒドロキシメチル）－アミノメタン（Ｔｒｉｓ）など）が含まれるが、これらに限定されない。好適な塩には、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４などが含まれる。
本開示の医薬製剤は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを、約０．００１％～約９０％（ｗ／ｗ）の量で含み得る。製剤の以下の記載において、「主題の核酸または組み換え発現ベクター」は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含むことが理解される。例えば、いくつかの場合において、主題の製剤は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む。
主題の核酸または組み換え発現ベクターは、他の化合物または化合物の混合物との混合、カプセル化、コンジュゲート、または別の方法による会合が可能であり、かかる化合物には、例えば、リポソームまたは受容体標的分子が含まれ得る。主題の核酸または組み換え発現ベクターは、取り込み、分布及び／または吸収を助ける１つ以上の成分と組み合わせて製剤にすることができる。
主題の核酸または組み換え発現ベクター組成物は、限定するものではないが、錠剤、カプセル剤、ゲルカプセル剤、液状シロップ剤、軟質ゲル剤、坐剤、及び浣腸剤などの多くの可能な剤形のうちのいずれかに製剤化することができる。主題の核酸または組み換え発現ベクター組成物はまた、水性、非水性または混合媒体中の懸濁剤として製剤化することもできる。水性懸濁剤は、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトール及び／またはデキストランを含む、懸濁剤の粘度を高める物質を更に含有し得る。懸濁剤は、安定剤も含有し得る。
主題の核酸または組み換え発現ベクターを含む製剤は、リポソーム製剤であり得る。本明細書で使用されるとき、「リポソーム」という用語は、球状の二重層（複数可）に配置された両親媒性脂質から構成される小胞を意味する。リポソームは、親油性材料から形成される膜と、送達される組成物を含有する水性内部と、を有する、単層または多層の小胞である。カチオン性リポソームは、正に荷電したリポソームであり、負に荷電したＤＮＡ分子と相互作用して安定な複合体を形成することができる。ｐＨ感受性または負に荷電したリポソームは、ＤＮＡと複合体を形成するのではなく、ＤＮＡを捕捉すると考えられる。カチオン性及び非カチオン性のいずれのリポソームも、主題の核酸または組み換え発現ベクターを送達するために使用することができる。
リポソームにはまた、「立体的に安定化された」リポソームも含まれ、この用語は、本明細書で使用されるとき、１つ以上の特殊な脂質を含むリポソームを指し、この特殊な脂質は、リポソームに組み込まれると、そのような特殊な脂質を欠くリポソームと比較して循環寿命を向上させる。立体的に安定化されたリポソームの例は、リポソームの小胞形成脂質部分の一部が１つ以上の糖脂質を含むもの、またはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）部分などの１つ以上の親水性ポリマーにより誘導体化されているものである。リポソーム及びその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されており、その全体が参照により本明細書に援用される。
本開示の製剤及び組成物はまた、界面活性剤を含み得る。薬物製品、製剤及び乳剤における界面活性剤の使用は、当該技術分野においてよく知られている。界面活性剤及びその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されている。
一実施形態において、核酸の効率的な送達をもたらすために、様々な浸透促進剤が含まれる。非脂溶性薬物が細胞膜を超えて拡散することを助けるのに加えて、浸透促進剤は、脂溶性薬物の透過性も向上させる。浸透促進剤は、５つの広い分類、すなわち、界面活性剤、脂肪酸、胆汁酸塩、キレート化剤、及び非キレート化非界面活性剤のうちの１つに属するように分類され得る。浸透促進剤及びその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されており、その全体が参照により本明細書に援用される。
経口投与用の組成物及び製剤には、散剤または顆粒剤、微粒子、ナノ粒子、水もしくは非水性媒体中の懸濁剤もしくは液剤、カプセル剤、ゲルカプセル剤、サシェ剤、錠剤、またはミニ錠剤が含まれる。粘稠剤、矯味剤、希釈剤、乳化剤、分散助剤または結合剤が望ましい場合がある。好適な経口製剤には、主題のアンチセンス核酸が、１つ以上の浸透促進剤、界面活性剤及びキレート剤とともに投与されるものが含まれる。好適な界面活性剤には、脂肪酸及び／またはそのエステルもしくは塩、胆汁酸及び／またはその塩が含まれるが、これらに限定されない。好適な胆汁酸／塩及び脂肪酸ならびにその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されている。また、浸透促進剤の組み合わせ、例えば、胆汁酸／塩と組み合わせた脂肪酸／塩も好適である。例示的な好適な組み合わせは、ラウリン酸、カプリン酸及びＵＤＣＡのナトリウム塩である。更なる浸透促進剤には、ポリオキシエチレン－９－ラウリルエーテル、及びポリオキシエチレン－２０－セチルエーテルが含まれるが、これらに限定されない。好適な浸透促進剤にはまた、プロピレングリコール、ジメチルスルホキシド、トリエタノールアミン、Ｎ，Ｎ－ジメチルアセトアミド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド、２－ピロリドン及びその誘導体、テトラヒドロフルフリルアルコール、ならびにＡＺＯＮＥ（商標）が含まれる。
方法
本開示のＴＭＡＰＰは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法であって、一般に、標的Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることを伴う、方法を提供する。
本開示のＴＭＡＰＰは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法であって、一般に、標的Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることを伴う、方法を提供する。
本開示のＡＰＰは、様々な研究、治療、及び診断目的に有用である。例えば、本開示のＡＰＰは、抗原特異的Ｔ細胞を直接的にまたは間接的に標識するために使用され得る。
Ｔ細胞活性を調節する方法
本開示は、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることを含み、Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることにより、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法を提供する。いくつかの場合において、接触は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで生じる。いくつかの場合において、接触は、ｉｎ ｖｉｖｏで生じる。いくつかの場合において、接触は、ｅｘ ｖｉｖｏで生じる。
本開示は、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることを含み、Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることにより、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法を提供する。いくつかの場合において、接触は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで生じる。いくつかの場合において、接触は、ｉｎ ｖｉｖｏで生じる。いくつかの場合において、接触は、ｅｘ ｖｉｖｏで生じる。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、自己反応性Ｔ細胞及び／または自己反応性Ｂ細胞の活性を低下させる。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）の数及び／または活性を増大させ、これにより、自己反応性Ｔ細胞及び／または自己反応性Ｂ細胞の活性の低下をもたらす。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰに接触させるＴ細胞は、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である。Ｔｒｅｇは、ＣＤ４＋、ＦＯＸＰ３＋、及びＣＤ２５＋である。Ｔｒｅｇは、自己反応性Ｔ細胞を抑制することができる。いくつかの場合において、本開示の方法は、Ｔｒｅｇを活性化し、それにより、自己反応性Ｔ細胞の活性を低下させる。
本開示は、Ｔｒｅｇの増殖を増加させる方法であって、Ｔｒｅｇを本開示のＴＭＡＰＰに接触させることを含み、当該接触させることにより、Ｔｒｅｇの増殖を増加させる、方法を提供する。本開示は、個体におけるＴｒｅｇの数を増加させる方法であって、個体に本開示のＴＭＡＰＰを投与することを含み、当該投与することにより、個体におけるＴｒｅｇの数の増加をもたらす、方法を提供する。例えば、Ｔｒｅｇの数は、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも２倍、少なくとも２．５倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、または１０倍を超えて増加し得る。
いくつかの場合において、接触させる細胞は、ヘルパーＴ細胞であり、ヘルパーＴ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることにより、ヘルパーＴ細胞の活性化をもたらす。いくつかの場合において、ヘルパーＴ細胞の活性化は、ＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞、例えば、自己反応性細胞を標的とし、殺傷するＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の活性化及び／または数の増加をもたらす。
いくつかの場合において（例えば、本開示のＴＭＡＰＰががんエピトープを含む場合）、本開示のＴＭＡＰＰは、がん細胞に対するＣＤ８＋Ｔ細胞応答、例えば、ＣＤ８＋Ｔ細胞応答を活性化させる。
抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法
本開示は、抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法を提供する。方法は、Ｔ細胞を本開示のＡＰＰと接触させることと、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合を検出することと、を含む。
本開示は、抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法を提供する。方法は、Ｔ細胞を本開示のＡＰＰと接触させることと、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合を検出することと、を含む。
本開示は、抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法であって、Ｔ細胞を本開示のＡＰＰと接触させることを含み、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合は、Ｔ細胞がＡＰＰに存在するエピトープに特異的であることを示す、方法を提供する。
いくつかの場合において、ＡＰＰは、検出可能な標識を含む。好適な検出可能な標識には、放射性同位体、蛍光ポリペプチド、または蛍光産物を生成する酵素及び有色産物を生成する酵素が含まれるが、これらに限定されない。ＡＰＰが検出可能な標識を含む場合、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合は、当該検出可能な標識を検出することによって検出される。
好適な蛍光タンパク質には、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）またはそのバリアント、ＧＦＰの青色蛍光バリアント（ＢＦＰ）、ＧＦＰのシアン蛍光バリアント（ＣＦＰ）、ＧＦＰの黄色蛍光バリアント（ＹＦＰ）、改良型ＧＦＰ（ＥＧＦＰ）、改良型ＣＦＰ（ＥＣＦＰ）、改良型ＹＦＰ（ＥＹＦＰ）、ＧＦＰＳ６５Ｔ、Ｅｍｅｒａｌｄ、Ｔｏｐａｚ（ＴＹＦＰ）、Ｖｅｎｕｓ、Ｃｉｔｒｉｎｅ、ｍＣｉｔｒｉｎｅ、ＧＦＰｕｖ、不安定化ＥＧＦＰ（ｄＥＧＦＰ）、不安定化ＥＣＦＰ（ｄＥＣＦＰ）、不安定化ＥＹＦＰ（ｄＥＹＦＰ）、ｍＣＦＰｍ、Ｃｅｒｕｌｅａｎ、Ｔ－Ｓａｐｐｈｉｒｅ、ＣｙＰｅｔ、ＹＰｅｔ、ｍＫＯ、ＨｃＲｅｄ、ｔ－ＨｃＲｅｄ、ＤｓＲｅｄ、ＤｓＲｅｄ２、ＤｓＲｅｄモノマー、Ｊ－Ｒｅｄ、ダイマー２、ｔ－ダイマー２（１２）、ｍＲＦＰ１、ポシロポリン、Ｒｅｎｉｌｌａ ＧＦＰ、Ｍｏｎｓｔｅｒ ＧＦＰ、ｐａＧＦＰ、Ｋａｅｄｅタンパク質及びＫｉｎｄｌｉｎｇタンパク質、フィコビリタンパク質及びフィコビリタンパク質結合体（Ｂ－フィコエリトリン、Ｒ－フィコエリトリン及びアロフィコシアニンを含む）が含まれるが、これらに限定されない。蛍光タンパク質の他の例としては、ｍＨｏｎｅｙｄｅｗ、ｍＢａｎａｎａ、ｍＯｒａｎｇｅ、ｄＴｏｍａｔｏ、ｔｄＴｏｍａｔｏ、ｍＴａｎｇｅｒｉｎｅ、ｍＳｔｒａｗｂｅｒｒｙ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ｍＧｒａｐｅ１、ｍＲａｓｐｂｅｒｒｙ、ｍＧｒａｐｅ２、ｍＰｌｕｍ（Ｓｈａｎｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｎａｔ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２：９０５－９０９）などが挙げられる。花虫類種に由来する種々の蛍光及び有色タンパク質のいずれか、例えば、Ｍａｔｚ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１７：９６９－９７３に記載されているものなども使用に適している。
好適な酵素には、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β－ガラクトシダーゼ（ＧＡＬ）、グルコース－６－リン酸デヒドロゲナーゼ、β－Ｎ－アセチルグルコサミニダーゼ、β－グルクロニダーゼ、インベルターゼ、キサンチンオキシダーゼ、ホタルルシフェラーゼ、グルコースオキシダーゼ（ＧＯ）などが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの場合において、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合は、検出可能に標識された、ＡＰＰに特異的な抗体を使用して検出される。ＡＰＰに特異的な抗体は、放射性同位体、蛍光ポリペプチド、または蛍光産物を生成する酵素、または有色産物を生成する酵素などの検出可能な標識を含み得る。
いくつかの場合において、検出されるＴ細胞は、複数のＴ細胞を含むサンプル中に存在する。例えば、検出されるＴ細胞は、１０～１０９個のＴ細胞、例えば、１０～１０２、１０２～１０４、１０４～１０６、１０６～１０７、１０７～１０８、または１０８～１０９、または１０９個を超えるＴ細胞を含むサンプル中に存在し得る。
治療法
本開示は、治療方法であって、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節し、個体を治療するのに有効な量の本開示のＴＭＡＰＰ、または当該ＴＭＡＰＰをコードする１つ以上の核酸もしくは発現ベクターを個体に投与することを含む、治療方法を提供する。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の組み換え発現ベクターを投与すること含む。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上のｍＲＮＡ分子を投与することを含む。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰを投与することを含む。治療することができる状態には、Ｔ１Ｄ及び／またはセリアック病以外の自己免疫障害が含まれる。
本開示は、治療方法であって、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節し、個体を治療するのに有効な量の本開示のＴＭＡＰＰ、または当該ＴＭＡＰＰをコードする１つ以上の核酸もしくは発現ベクターを個体に投与することを含む、治療方法を提供する。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の組み換え発現ベクターを投与すること含む。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上のｍＲＮＡ分子を投与することを含む。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰを投与することを含む。治療することができる状態には、Ｔ１Ｄ及び／またはセリアック病以外の自己免疫障害が含まれる。
本開示は、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、個体に、有効量の本開示のＴＭＡＰＰ、またはＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸（例えば、発現ベクター、ｍＲＮＡなど）を投与することを含み、ＴＭＡＰＰは、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法を提供する。エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節することは、個体の疾患または障害を治療することができる。したがって、本開示は、治療方法であって、それを必要とする個体に、有効量の本開示のＴＭＡＰＰ（例えば、本開示の多量体ＴＭＡＰＰ、または本開示の単鎖ＴＭＡＰＰ）を投与すること含む、治療方法を提供する。疾患または障害は、Ｔ１Ｄまたはセリアック病以外の自己免疫疾患または障害である。
いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、阻害性ポリペプチドであり、本開示のＴ ＴＭＡＰＰは、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を阻害する。いくつかの場合において、エピトープは、自身のエピトープであり、本開示のＴＭＡＰＰは、自身のエピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に阻害する。
本開示は、個体の自己免疫障害を治療する方法であって、個体に、有効量の本開示のＴＭＡＰＰ、または当該ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸を投与することを含み、当該ＴＭＡＰＰ（例えば、本開示のＴＭＡＰＰまたは本開示の単鎖ＴＭＡＰＰ）は、自身のエピトープであるＴ細胞エピトープを含み、当該ＴＭＡＰＰは、阻害性免疫調節ポリペプチドを含む、方法を提供する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、自己反応性Ｔ細胞の数が、ＴＭＡＰＰの投与前、またはＴＭＡＰＰによる投与のない状態の個体における自己反応性Ｔ細胞の数と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少する量である。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体におけるＴｈ２サイトカインの産生が減少する量である。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体の自己免疫疾患に関連する１つ以上の症状を改善する量である。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＣＤ４＋自己反応性Ｔ細胞の数を減少させ、それにより、ＣＤ８＋自己反応性Ｔ細胞が減少する。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＣＤ４＋Ｔｒｅｇの数を増加させ、それにより、ＣＤ４＋自己反応性Ｔ細胞及び／またはＣＤ８＋Ｔ自己反応性Ｔ細胞の数が減少する。
本開示は、個体のアレルギーを治療する方法であって、個体に、有効量の本開示のＴＭＡＰＰ、または当該ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸を投与することを含み、当該ＴＭＡＰＰ（例えば、本開示のＴＭＡＰＰまたは本開示の単鎖ＴＭＡＰＰ）は、アレルゲン関連ペプチドエピトープであるＴ細胞エピトープを含み、当該ＴＭＡＰＰは、阻害性免疫調節ポリペプチドを含む、方法を提供する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、アレルゲン特異的ＣＤ４＋Ｔ細胞の数及び／または活性が、ＴＭＡＰＰの投与前、またはＴＭＡＰＰによる投与のない状態の個体におけるアレルゲン特異的ＣＤ４＋Ｔ細胞の数及び／または活性と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少する量である。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、アレルゲン特異的ＣＤ４＋Ｔ細胞によって産生されるサイトカインの量が減少する量である。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体におけるＩｇＥのレベルが、ＴＭＡＰＰの投与前、またはＴＭＡＰＰによる投与のない状態の個体におけるＩｇＥのレベルと比較して減少する量である。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体のアレルギー性疾患に関連する１つ以上の症状を改善する量である。
「アレルゲン」は、対象において望ましくない（例えば、１型過敏症の）免疫応答（すなわち、アレルギー応答または反応）を引き起こし得る任意の物質である。アレルゲンには、植物アレルゲン（例えば、花粉、ブタクサアレルゲン）、昆虫アレルゲン、昆虫刺傷アレルゲン（例えば、ハチ刺傷アレルゲン）、動物アレルゲン（例えば、動物鱗屑またはネコＦｅｌ ｄ １抗原などのペットアレルゲン）、ラテックスアレルゲン、カビアレルゲン、真菌アレルゲン、化粧品アレルゲン、薬物アレルゲン、食物アレルゲン、ダスト、昆虫毒液、ウイルス、細菌などが含まれるが、これらに限定されない。食物アレルゲンには、牛乳アレルゲン、卵アレルゲン、ナッツアレルゲン（例えば、ピーナッツまたは木堅果アレルゲンなど（例えば、クルミ、カシューナッツなど））、魚アレルゲン、甲殻類アレルゲン、大豆アレルゲン、豆果アレルゲン、種子アレルゲン及び小麦アレルゲンが含まれるが、これらに限定されない。昆虫刺傷アレルゲンには、ハチ刺傷、カリバチ刺傷、アシナガバチ刺傷、スズメバチ刺傷などであるアレルゲンまたはそれらに関連するアレルゲンが含まれる。昆虫アレルゲンにはまたチリダニアレルゲン（例えば、Ｄｅｒ Ｐ１抗原）及びゴキブリアレルゲンが含まれる。薬物アレルゲンには、抗生物質、非ステロイド性抗炎症薬（ＮＳＡＩＤ）、麻酔剤などであるアレルゲンまたはそれらに関連するアレルゲンが含まれる。花粉アレルゲンには、草アレルゲン、木アレルゲン、雑草アレルゲン、花アレルゲンなどが含まれる。
アレルゲンの非限定的な例としては、Ｐｈｌ ｐ １、Ｐｈｌ ｐ ５、Ｐｈｌ ｐ ６、Ｐｏａ ｐ １、Ｐｏａ ｐ ５、Ｄａｃ ｇ １、Ｆｅｓ ｐ １、Ｌｏｌ ｐ １及びＬｏｌ ｐ ５などの草花粉アレルゲン；Ｄｅｒ ｆ １、Ｄｅｒ ｆ ２、Ｄｅｒ ｐ １及びＤｅｒ ｐ ２などのチリダニアレルゲン；Ａｐｉ ｍ １、Ａｐｉ ｍ ２、Ｖｅｓ ｖ １、Ｖｅｓ ｖ ２、Ｖｅｓ ｖ ５、Ｄｏｌ ｍ １、Ｄｏｌ ｍ ２、Ｄｏｌ ｍ ５、Ｄｏｌ ａ ５、Ｐｏｌ ａ １、Ｐｏｌ ａ ２、及びＰｏｌ ａ ５などの毒液アレルゲン；Ａｍｂ ａ １、Ａｍｂ ａ ２、Ｐａｒ ｊ １、Ｐａｒ ｏ １及びＰａｒ ｍ １などの雑草アレルゲン；Ｂｅｔ ｖ １などのカバノキアレルゲン；Ｃｒｙ ｊ １及びＣｒｙ ｊ ２などの日本スギアレルゲン；Ｐｅｒ ａ １などのゴキブリアレルゲン；Ｏｌｅ ｅ １などのオリーブ花粉アレルゲン；Ｆｅｌ ｄ １などのネコアレルゲン；Ｃａｎ ｆ １及びＣａｎ ｆ ２などのイヌアレルゲン；Ｅｑｕ ｃ １及びＥｑｕ ｃ ２などのウマアレルゲン；Ａｒｔ ｖ １、Ａｒｔ ｖ ２、Ａｒｔ ｖ ３などのヨモギアレルゲン；Ａｌｔ ａ １、Ａｌｔ ａ ３、Ａｌｔ ａ ４、Ａｌｔ ａ ５、Ａｌｔ ａ ６、Ｃｌａ ｈ １、Ｃｌａ ｈ ２及びＣｌａ ｈ ６などのカビアレルゲン；ならびにＳｏｌ ｉ ２、Ｓｏｌ ｉ ３及びＳｏｌ ｉ ４などのヒアリアレルゲンが挙げられるが、これらに限定されない。
上記のとおり、いくつかの場合において、主題の治療方法の実施にあたり、本開示のＴＭＡＰＰは、それを必要とする個体に、ポリペプチドそのものとして投与される。他の場合において、主題の治療方法の実施にあたり、ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸が、それを必要とする個体に投与される。したがって、他の場合において、本開示の１つ以上の核酸、例えば、本開示の１つ以上の組み換え発現ベクターが、それを必要とする個体に投与される。
製剤
好適な製剤は、上記のとおりであり、好適な製剤は、薬学的に許容される賦形剤を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸と、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含み、いくつかの場合、核酸は、ｍＲＮＡである。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第１の核酸と、ｂ）本開示のＴＭＡＰＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第２の核酸と、ｃ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第１の組み換え発現ベクターと、ｂ）本開示のＴＭＡＰＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第２の組み換え発現ベクターと、ｃ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。
好適な製剤は、上記のとおりであり、好適な製剤は、薬学的に許容される賦形剤を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸と、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含み、いくつかの場合、核酸は、ｍＲＮＡである。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第１の核酸と、ｂ）本開示のＴＭＡＰＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第２の核酸と、ｃ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第１の組み換え発現ベクターと、ｂ）本開示のＴＭＡＰＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第２の組み換え発現ベクターと、ｃ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。
好適な薬学的に許容される賦形剤は、上記のとおりである。
用量
好適な用量は、様々な臨床学的因子に基づき、主治医または他の有資格医療関係者によって決定され得る。医療分野においてよく知られているように、任意のある患者に対する用量は、患者の体格、体表面積、年齢、投与される特定のポリペプチドまたは核酸、患者の性別、投与の時間及び経路、全般的な健康状態、ならびに同時に投与される他の薬物を含む、多くの因子に依存する。本開示の多量体ポリペプチドまたは単鎖ポリペプチド（例えば、多量体ＴＭＡＰＰまたは単鎖ＴＭＡＰＰ）は、１用量当たり１ｎｇ／ｋｇ体重～２０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ体重～１０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．５ｍｇ／ｋｇ体重～５ｍｇ／ｋｇ体重の量で投与され得るが、前述の因子を特に考慮した上で、この例示的範囲を下回る用量または上回る用量が想定される。レジメンが連続注入である場合、１μｇ～１０ｍｇ／ｋｇ体重／分の範囲内であってもよい。本開示のＴＭＡＰＰは、約１ｍｇ／ｋｇ体重～５０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、約１ｍｇ／ｋｇ体重～約５ｍｇ／ｋｇ体重、約５ｍｇ／ｋｇ体重～約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約１０ｍｇ／ｋｇ体重～約１５ｍｇ／ｋｇ体重、約１５ｍｇ／ｋｇ体重～約２０ｍｇ／ｋｇ体重、約２０ｍｇ／ｋｇ体重～約２５ｍｇ／ｋｇ体重、約２５ｍｇ／ｋｇ体重～約３０ｍｇ／ｋｇ体重、約３０ｍｇ／ｋｇ体重～約３５ｍｇ／ｋｇ体重、約３５ｍｇ／ｋｇ体重～約４０ｍｇ／ｋｇ体重、または約４０ｍｇ／ｋｇ体重～約５０ｍｇ／ｋｇ体重の量で投与され得る。
好適な用量は、様々な臨床学的因子に基づき、主治医または他の有資格医療関係者によって決定され得る。医療分野においてよく知られているように、任意のある患者に対する用量は、患者の体格、体表面積、年齢、投与される特定のポリペプチドまたは核酸、患者の性別、投与の時間及び経路、全般的な健康状態、ならびに同時に投与される他の薬物を含む、多くの因子に依存する。本開示の多量体ポリペプチドまたは単鎖ポリペプチド（例えば、多量体ＴＭＡＰＰまたは単鎖ＴＭＡＰＰ）は、１用量当たり１ｎｇ／ｋｇ体重～２０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ体重～１０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．５ｍｇ／ｋｇ体重～５ｍｇ／ｋｇ体重の量で投与され得るが、前述の因子を特に考慮した上で、この例示的範囲を下回る用量または上回る用量が想定される。レジメンが連続注入である場合、１μｇ～１０ｍｇ／ｋｇ体重／分の範囲内であってもよい。本開示のＴＭＡＰＰは、約１ｍｇ／ｋｇ体重～５０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、約１ｍｇ／ｋｇ体重～約５ｍｇ／ｋｇ体重、約５ｍｇ／ｋｇ体重～約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約１０ｍｇ／ｋｇ体重～約１５ｍｇ／ｋｇ体重、約１５ｍｇ／ｋｇ体重～約２０ｍｇ／ｋｇ体重、約２０ｍｇ／ｋｇ体重～約２５ｍｇ／ｋｇ体重、約２５ｍｇ／ｋｇ体重～約３０ｍｇ／ｋｇ体重、約３０ｍｇ／ｋｇ体重～約３５ｍｇ／ｋｇ体重、約３５ｍｇ／ｋｇ体重～約４０ｍｇ／ｋｇ体重、または約４０ｍｇ／ｋｇ体重～約５０ｍｇ／ｋｇ体重の量で投与され得る。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの好適な用量は、０．０１μｇ～１００ｇ／ｋｇ体重、０．１μｇ～１０ｇ／ｋｇ体重、１μｇ～１ｇ／ｋｇ体重、１０μｇ～１００ｍｇ／ｋｇ体重、１００μｇ～１０ｍｇ／ｋｇ体重、または１００μｇ～１ｍｇ／ｋｇ体重である。当業者であれば、体液または組織において測定された投与薬剤の滞留時間及び濃度に基づいて、反復投与頻度を容易に推定することができる。治療が成功した後、疾患状態の再発を予防するために、患者に維持療法を受けさせることが望ましい場合もあり、この場合、本開示の多量体ポリペプチドまたは単鎖ポリペプチド（例えば、多量体ＴＭＡＰＰまたは単鎖ＴＭＡＰＰ）は、０．０１μｇ～１００ｇ／ｋｇ体重、０．１μｇ～１０ｇ／ｋｇ体重、１μｇ～１ｇ／ｋｇ体重、１０μｇ～１００ｍｇ／ｋｇ体重、１００μｇ～１０ｍｇ／ｋｇ体重、または１００μｇ～１ｍｇ／ｋｇ体重の範囲の維持用量で投与される。
当業者であれば、特定の多量体ポリペプチドまたは単鎖ポリペプチド（多量体ＴＭＡＰＰまたは単鎖ＴＭＡＰＰ）、症状の重症度及び副作用に対する対象の感受性に応じて、用量レベルが変わり得ることを容易に理解するであろう。所与の化合物に好ましい用量は、様々な手段により、当業者によって容易に決定される。
いくつかの場合において、複数回用量の本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターが投与される。本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの投与頻度は、様々な因子のいずれか、例えば、症状の重症度などに応じて変わり得る。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、月１回、月２回、月３回、隔週（ｑｏｗ）、週１回（ｑｗ）、週２回（ｂｉｗ）、週３回（ｔｉｗ）、週４回、週５回、週６回、隔日（ｑｏｄ）、１日１回（ｑｄ）、１日２回（ｑｉｄ）、または１日３回（ｔｉｄ）投与される。
本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの投与継続期間、例えば、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターが投与される期間は、様々な因子のいずれか、例えば、患者の応答などに応じて変わり得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、約１日～約１週間、約２週間～約４週間、約１ヶ月～約２ヶ月、約２ヶ月～約４ヶ月、約４ヶ月～約６ヶ月、約６ヶ月～約８ヶ月、約８ヶ月～約１年、約１年～約２年、もしくは約２年～約４年またはそれ以上に及ぶ期間にわたって投与され得る。
投与経路
活性剤（本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクター）は、ｉｎ ｖｉｖｏ法及びｅｘ ｖｉｖｏ法、ならびに全身及び局所投与経路を含む、薬物送達に好適な任意の利用可能な方法及び経路を使用して個体に投与される。
活性剤（本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクター）は、ｉｎ ｖｉｖｏ法及びｅｘ ｖｉｖｏ法、ならびに全身及び局所投与経路を含む、薬物送達に好適な任意の利用可能な方法及び経路を使用して個体に投与される。
従来の薬学的に許容される投与経路には、腫瘍内、腫瘍近傍、筋肉内、気管内、リンパ管内、頭蓋内、皮下、皮内、局所適用、静脈内、動脈内、経直腸、経鼻、経口、ならびに他の経腸及び非経口の投与経路が含まれる。投与経路は、ＴＭＡＰＰ及び／または所望の効果に応じて、組み合わされてもよいし、所望により調節されてもよい。本開示のＴＭＡＰＰ、または本開示の核酸もしくは組み換え発現ベクターは、単回投与または複数回投与で投与され得る。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、静脈内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、筋肉内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、リンパ管内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、局所投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、腫瘍内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、腫瘍近傍に投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、頭蓋内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、皮下投与される。
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、静脈内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、筋肉内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、局所投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、腫瘍内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、腫瘍近傍に投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、頭蓋内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、皮下投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、リンパ管内投与される。
本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、全身または局所経路を含む、従来の薬物の送達に好適な任意の利用可能な従来の方法及び経路を使用して宿主に投与することができる。一般に、本開示の方法での使用が企図される投与経路には、経腸、非経口及び吸入経路が含まれるが、必ずしもこれらに限定されない。
吸入投与以外の非経口投与経路には、局所、経皮、皮下、筋肉内、眼窩内、嚢内、脊髄内、胸骨内、腫瘍内、リンパ管内、腫瘍近傍及び静脈内経路、すなわち、消化管経路以外の任意の投与経路が含まれるが、必ずしもこれらに限定されない。非経口投与は、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの全身送達または局所送達をもたらすために実施することができる。全身送達が所望される場合、投与は、典型的に、医薬品の浸潤性または全身吸収による局所投与または粘膜投与を伴う。
治療に好適な対象
本開示の方法による治療に好適な対象には、自己免疫疾患を有する個体が含まれ、これには、自己免疫疾患であると診断された個体、及び自己免疫疾患に対する治療を受けたが、当該治療に応答しなかった個体が含まれる。本開示の方法により治療され得る自己免疫疾患には、アジソン病、円形脱毛症、強直性脊椎炎、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫関連不妊症、自己免疫性血小板減少性紫斑病、水疱性類天疱瘡、クローン病、グッドパスチャー症候群、糸球体腎炎（例えば、半月体形成性糸球体腎炎、増殖性糸球体腎炎）、グレーヴス病、橋本甲状腺炎、混合性結合組織病、多発性硬化症、重症筋無力症（ＭＧ）、天疱瘡（例えば、尋常性天疱瘡）、悪性貧血、多発性筋炎、乾癬、乾癬性関節炎、リウマチ様関節炎、強皮症、シェーグレン症候群、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、血管炎、及び白斑が含まれるが、これらに限定されない。
本開示の方法による治療に好適な対象には、自己免疫疾患を有する個体が含まれ、これには、自己免疫疾患であると診断された個体、及び自己免疫疾患に対する治療を受けたが、当該治療に応答しなかった個体が含まれる。本開示の方法により治療され得る自己免疫疾患には、アジソン病、円形脱毛症、強直性脊椎炎、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫関連不妊症、自己免疫性血小板減少性紫斑病、水疱性類天疱瘡、クローン病、グッドパスチャー症候群、糸球体腎炎（例えば、半月体形成性糸球体腎炎、増殖性糸球体腎炎）、グレーヴス病、橋本甲状腺炎、混合性結合組織病、多発性硬化症、重症筋無力症（ＭＧ）、天疱瘡（例えば、尋常性天疱瘡）、悪性貧血、多発性筋炎、乾癬、乾癬性関節炎、リウマチ様関節炎、強皮症、シェーグレン症候群、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、血管炎、及び白斑が含まれるが、これらに限定されない。
共刺激ポリペプチドを選択的に送達する方法
本開示は、ＰＤ－Ｌ１などの共刺激ポリペプチド、または本明細書で開示されるＰＤ－Ｌ１バリアントなどの天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアントを、例えば、所与のエピトープに特異的なＴＣＲを標的とするように、選択されたＴ細胞または選択されたＴ細胞集団に送達する方法を提供する。本開示は、ＰＤ－Ｌ１などの共刺激ポリペプチド、または本明細書で開示されるＰＤ－Ｌ１バリアントなどの天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアントを、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープに特異的なＴＣＲを持つ標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法を提供する。方法は、Ｔ細胞の集団を本開示のＴＭＡＰＰと接触させることを含む。Ｔ細胞の集団は、ｉ）標的Ｔ細胞と、ｉｉ）エピトープに特異的でない非標的Ｔ細胞（例えば、エピトープ特異的Ｔ細胞が結合するエピトープ以外のエピトープ（複数可）に特異的なＴ細胞）とを含む、混合集団であり得る。エピトープ特異的Ｔ細胞は、ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープ提示ペプチドに特異的であり、ＴＭＡＰＰによって提供されるペプチドＨＬＡ複合体またはペプチドＭＨＣ複合体に結合する。Ｔ細胞の集団をＴＭＡＰＰに接触させると、ＴＭＡＰＰ中に存在する共刺激ポリペプチド（例えば、ＰＤ－Ｌ１または低親和性ＰＤ－Ｌ１バリアント）が、ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープに特異的なＴ細胞（複数可）に選択的に送達される。
本開示は、ＰＤ－Ｌ１などの共刺激ポリペプチド、または本明細書で開示されるＰＤ－Ｌ１バリアントなどの天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアントを、例えば、所与のエピトープに特異的なＴＣＲを標的とするように、選択されたＴ細胞または選択されたＴ細胞集団に送達する方法を提供する。本開示は、ＰＤ－Ｌ１などの共刺激ポリペプチド、または本明細書で開示されるＰＤ－Ｌ１バリアントなどの天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアントを、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープに特異的なＴＣＲを持つ標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法を提供する。方法は、Ｔ細胞の集団を本開示のＴＭＡＰＰと接触させることを含む。Ｔ細胞の集団は、ｉ）標的Ｔ細胞と、ｉｉ）エピトープに特異的でない非標的Ｔ細胞（例えば、エピトープ特異的Ｔ細胞が結合するエピトープ以外のエピトープ（複数可）に特異的なＴ細胞）とを含む、混合集団であり得る。エピトープ特異的Ｔ細胞は、ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープ提示ペプチドに特異的であり、ＴＭＡＰＰによって提供されるペプチドＨＬＡ複合体またはペプチドＭＨＣ複合体に結合する。Ｔ細胞の集団をＴＭＡＰＰに接触させると、ＴＭＡＰＰ中に存在する共刺激ポリペプチド（例えば、ＰＤ－Ｌ１または低親和性ＰＤ－Ｌ１バリアント）が、ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープに特異的なＴ細胞（複数可）に選択的に送達される。
したがって、本開示は、ＰＤ－Ｌ１などの共刺激ポリペプチド、もしくは本明細書で開示されるＰＤ－Ｌ１バリアントなどの天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアント、または両方の組み合わせを、標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法であって、Ｔ細胞の混合集団を本開示のＴＭＡＰＰと接触させることを含む、方法を提供する。Ｔ細胞の混合集団は、標的Ｔ細胞と、非標的Ｔ細胞と、を含む。標的Ｔ細胞は、ＴＭＡＰＰ内に存在するエピトープに特異的である。Ｔ細胞の混合集団を本開示のＴＭＡＰＰに接触させると、ＴＭＡＰＰ内に存在する共刺激ポリペプチド（複数可）が、標的Ｔ細胞に送達される。
例えば、本開示のＴＭＡＰＰを、ｉ）ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープに特異的な標的Ｔ細胞（複数可）と、ｉｉ）非標的Ｔ細胞（複数可）、例えば、ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープではない第２のエピトープ（複数可）に特異的なＴ細胞（複数可）とを含む、Ｔ細胞の集団に接触させる。当該集団に接触させると、ＴＭＡＰＰ中に存在する共刺激ポリペプチド（複数可）（例えば、天然共刺激ポリペプチド（例えば、天然ＰＤ－Ｌ１）または天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアント（例えば、本明細書で開示されるＰＤ－Ｌ１バリアント））の選択的送達が標的Ｔ細胞にもたらされる。したがって、例えば、ＴＭＡＰＰに結合するのは、非標的Ｔ細胞の５０％未満、４０％未満、３０％未満、２５％未満、２０％未満、１５％未満、１０％未満、５％未満、または４％未満、３％未満、２％未満または１％未満であり、結果として、共刺激ポリペプチド（例えば、ＰＤ－Ｌ１またはＰＤ－Ｌ１バリアント）は、非標的Ｔ細胞には送達されない。
いくつかの場合において、Ｔ細胞の集団は、ｉｎ ｖｉｔｒｏのものである。いくつかの場合において、Ｔ細胞の集団は、ｉｎ ｖｉｔｒｏのものであり、本開示のＴＭＡＰＰに対する標的Ｔ細胞集団の生物学的応答（例えば、Ｔ細胞の活性化及び／または増大及び／または表現型分化）は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ培養の環境で惹起される。例えば、Ｔ細胞の混合集団は、個体から取得することができ、ｉｎ ｖｉｔｒｏでＴＭＡＰＰと接触させることができる。かかる接触は、定められた用量（複数可）及び／または曝露スケジュール（複数可）での単回または複数回のＴ細胞の集団の曝露を含み得る。いくつかの場合において、当該接触により、Ｔ細胞の集団内の標的Ｔ細胞の選択的な結合／活性化及び／または拡大が生じ、活性化及び／または拡大された標的Ｔ細胞の集団が生成される。一例として、Ｔ細胞の混合集団は、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）であり得る。例えば、患者由来のＰＢＭＣは、標準的な採血及びＰＢＭＣ濃縮技術によって取得することができ、その後、標準的なリンパ球培養条件下で０．１～１０００ｎＭの本開示のＴＭＡＰＰに曝露される。ｉｎ ｖｉｔｒｏ培養物中の標的Ｔ細胞の存在量は、定められた用量及びスケジュールでのＴ細胞混合集団の曝露前、曝露中、及び曝露後の時点で、特定のペプチド－ＭＨＣ多量体及び／または表現型マーカー及び／または機能活性（例えば、サイトカインＥＬＩＳｐｏｔアッセイ）によってモニタリングすることができる。いくつかの場合において、抗原特異的細胞の最適な存在量及び／または表現型がｉｎ ｖｉｔｒｏで達成されたら、活性化及び／または拡大された標的Ｔ細胞の集団の全てまたは一部が個体（Ｔ細胞の混合集団が取得された個体）に投与される。
いくつかの場合において、Ｔ細胞の集団は、ｉｎ ｖｉｔｒｏのものである。例えば、Ｔ細胞の混合集団は、個体から取得され、ｉｎ ｖｉｔｒｏで本開示のＴＭＡＰＰと接触させる。かかる接触は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ細胞培養の環境における、定められた用量（複数可）及び／または曝露スケジュール（複数可）での単回または複数回のＴ細胞の曝露を含み得、これを使用して、当該Ｔ細胞の混合集団が、ＴＭＡＰＰによって提示されるエピトープに特異的であるＴ細胞を含むかどうかを決定することができる。ＴＭＡＰＰのエピトープに特異的なＴ細胞の存在は、Ｔ細胞の混合集団を含むサンプルを評価することによって決定することができ、Ｔ細胞の集団は、エピトープに特異的でないＴ細胞（非標的Ｔ細胞）を含み、エピトープに特異的なＴ細胞（標的Ｔ細胞）を含み得る。既知のアッセイを使用して、標的Ｔ細胞の活性化及び／または増殖を検出することができ、これにより、特定のＴＭＡＰＰが、個体内に存在するＴ細胞に結合するエピトープを保有しているかどうか、ひいては、当該ＴＭＡＰＰが、その個体にとって、治療用組成物としての利用可能性を有するかどうかを決定することができる、ｅｘ ｖｉｖｏアッセイが提供される。標的Ｔ細胞の活性化及び／または増殖を検出するのに好適な既知のアッセイには、例えば、Ｔ細胞の表現型及び／または抗原特異性及び／または増殖についてのフローサイトメトリーによる特性評価が含まれる。エピトープ特異的Ｔ細胞の存在を検出するそのようなアッセイ、例えば、コンパニオン診断には、ＴＭＡＰＰが標的Ｔ細胞の選択的な結合／活性化及び／または拡大をもたらすかどうかを決定するための追加のアッセイ（例えば、エフェクターサイトカインＥＬＩＳｐｏｔアッセイ）及び／または適切な対照（例えば、抗原特異的及び抗原非特異的な多量体ペプチド－ＨＬＡ染色試薬）が更に含まれ得る。したがって、例えば、本開示は、個体から取得されたＴ細胞の混合集団において、目的のエピトープに結合する標的Ｔ細胞の存在を検出する方法であって、ａ）Ｔ細胞の混合集団を本開示のＴＭＡＰＰとｉｎ ｖｉｔｒｏで接触させることであって、多量体ポリペプチドは、目的のエピトープを含む、接触させることと、ｂ）当該接触に応じたＴ細胞の活性化及び／または増殖を検出することであって、活性化及び／または増殖されたＴ細胞は、標的Ｔ細胞の存在を示す、検出することとを含む、方法を提供する。代替的及び／または付加的に、ＴＭＡＰＰを使用して所望のＴ細胞集団の活性化及び／または拡大（増殖）が得られた場合、活性化／拡大されたＴ細胞を含むＴ細胞の集団の全てまたは一部が、治療として、当該個体に投与され得る。
いくつかの場合において、Ｔ細胞の集団は、個体におけるｉｎ ｖｉｖｏのものである。そのような場合、共刺激ポリペプチド（例えば、ＰＤ－Ｌ１または低親和性ＰＤ－Ｌ１）をエピトープ特異的Ｔ細胞に選択的に送達するための本開示の方法は、ＴＭＡＰＰを個体に投与することを含む。
共刺激ポリペプチド（例えば、ＩＬ－２または低親和性ＰＤ－Ｌ１）が選択的に送達されるエピトープ特異的Ｔ細胞はまた、本明細書中、「標的Ｔ細胞」とも称される。いくつかの場合において、標的Ｔ細胞は、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である。いくつかの場合において、Ｔｒｅｇは、自己反応性Ｔ細胞の活性を阻害または抑制する。
本開示の非限定的態様の例
上に記載される本主題の実施形態を含む態様は、単独でも、または１つ以上の他の態様もしくは実施形態との組み合わせでも有益であり得る。
上に記載される本主題の実施形態を含む態様は、単独でも、または１つ以上の他の態様もしくは実施形態との組み合わせでも有益であり得る。
態様セットＡ
態様１．多量体抗原提示ポリペプチドであって、
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド、及び
ｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、当該第２のポリペプチドと
を含み、
当該多量体ポリペプチドが、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープを含み、当該エピトープが、Ａ）第１のポリペプチドのＮ末端、またはＢ）第２のポリペプチドのＮ末端にある、
当該多量体抗原提示ポリペプチド。
態様１．多量体抗原提示ポリペプチドであって、
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド、及び
ｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、当該第２のポリペプチドと
を含み、
当該多量体ポリペプチドが、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープを含み、当該エピトープが、Ａ）第１のポリペプチドのＮ末端、またはＢ）第２のポリペプチドのＮ末端にある、
当該多量体抗原提示ポリペプチド。
態様２．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含む、
態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含む、
態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様３．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、
態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、
態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様４．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含む、
態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含む、
態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様５．第１のポリペプチドがＣ末端にＩｇ Ｆｃポリペプチドを含む、態様１～４のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様６．
ａ）第１のポリペプチドが第１の二量体化ポリペプチドを含み、
ｂ）第２のポリペプチドが第２の二量体化ポリペプチドを含む、
態様１～５のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが第１の二量体化ポリペプチドを含み、
ｂ）第２のポリペプチドが第２の二量体化ポリペプチドを含む、
態様１～５のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様７．第１及び第２の二量体化ポリペプチドが、ロイシンジッパーポリペプチド、コラーゲン二量体化ポリペプチド、またはコイルドコイルポリペプチドである、態様６に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様８．ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、及び１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２～６のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様９．ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、及び１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２～６のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様１０．ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドが、図７Ａ～７Ｊ、図８Ａ～８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ～１９Ｂ、及び図２０Ａ～２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２～６のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様１１．ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドが、図７Ａ～７Ｊ、図８Ａ～８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ～１９Ｂ、及び図２０Ａ～２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２～６のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
態様１２．
ｉ）主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ α２ポリペプチド、
ｉｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ β１ポリペプチド、
ｉｖ）クラスＩＩ ＭＨＣ β２ポリペプチド、
ｖ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、及び
ｖｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、単鎖抗原提示ポリペプチド。
ｉ）主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ α２ポリペプチド、
ｉｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ β１ポリペプチド、
ｉｖ）クラスＩＩ ＭＨＣ β２ポリペプチド、
ｖ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、及び
ｖｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様１３．ポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ β１ポリペプチド、ｉｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ α１ポリペプチド、ｉｖ）クラスＩＩ ＭＨＣ α２ポリペプチド、及びｖ）クラスＩＩ ＭＨＣ β２ポリペプチドを含む、態様１２に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様１４．Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ β２ポリペプチド、
ｉｖ）クラスＩＩ ＭＨＣ α１ポリペプチド、及び
ｖ）クラスＩＩ ＭＨＣ α２ポリペプチド
を含む、態様１２に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）クラスＩＩ ＭＨＣ β２ポリペプチド、
ｉｖ）クラスＩＩ ＭＨＣ α１ポリペプチド、及び
ｖ）クラスＩＩ ＭＨＣ α２ポリペプチド
を含む、態様１２に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様１５．Ｃ末端に免疫グロブリンＦｃポリペプチドを含む、態様１３または態様１４に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様１６．リンカーを含む、態様１３に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様１７．リンカーが、エピトープとクラスＩＩ ＭＨＣ β１ポリペプチドとの間にある、態様１６に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様１８．リンカーを含む、態様１４に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様１９．リンカーが、エピトープとクラスＩＩ ＭＨＣ β１ポリペプチドとの間にある、態様１８に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様２０．ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、及び１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１２～１９のいずれか１つに記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様２１．ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、及び１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１２～１９のいずれか１つに記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様２２．ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドが、図７Ａ～７Ｊ、図８Ａ～８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ～１９Ｂ、及び図２０Ａ～２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１２～１９のいずれか１つに記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様２３．ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドが、図７Ａ～７Ｊ、図８Ａ～８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ～１９Ｂ、及び図２０Ａ～２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１２～１９のいずれか１つに記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
態様２４．多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドであって、
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、
ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第２のポリペプチドと
を含み、
当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、
当該多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、
ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第２のポリペプチドと
を含み、
当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、
当該多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様２５．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）免疫調節ドメイン
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）免疫調節ドメイン
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様２６．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）免疫調節ドメイン
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）免疫調節ドメイン
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様２７．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｉｖ）免疫調節ドメイン、及び
ｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｉｖ）免疫調節ドメイン、及び
ｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様２８．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様２９．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３０．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｖ）第２の二量体化ポリペプチドを含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｖ）第２の二量体化ポリペプチドを含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３１．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、及び
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、及び
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３２．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３３．
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチド
を含む、
態様２４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３４．リンカーを含む、態様２４～３３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３５．ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、及び１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２４～３３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３６．ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、及び１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２４～３３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３７．ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドが、図７Ａ～７Ｊ、図８Ａ～８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ～１９Ｂ、及び図２０Ａ～２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２４～３３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３８．ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドが、図７Ａ～７Ｊ、図８Ａ～８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ～１９Ｂ、及び図２０Ａ～２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２４～３３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３９．免疫調節ポリペプチドが、天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列を含む、態様２４～３８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４０．免疫調節ポリペプチドが、ＩＬ－２、４－１ＢＢＬ、ＰＤ－Ｌ１、ＣＤ８０、ＣＤ８６、Ｂ７－１、ＩＣＯＳ－Ｌ、ＯＸ－４０Ｌ、ＦａｓＬ、ＴＧＦβ、ＪＡＧ１、及びＰＤ－Ｌ２からなる群から選択される、態様３９に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４１．免疫調節ポリペプチドが、天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１～１０のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、バリアント免疫調節ポリペプチドであり、当該バリアント免疫調節ポリペプチドが、免疫共調節ポリペプチドに対する天然の免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、当該免疫共調節ポリペプチドに対して低下した親和性を有する、態様２４～３８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４２．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドである、態様４１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４３．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＣＤ８０ポリペプチドである、態様４１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４４．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＩＬ－２ポリペプチドである、態様４１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４５．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＣＤ８６ポリペプチドである、態様４１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４６．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである、態様４１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４７．多量体ポリペプチドが、２つの免疫調節ポリペプチドを含む、態様２４～４６のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４８．２つの免疫調節ポリペプチドが、同じポリペプチド鎖上にある、態様４７に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４９．２つの免疫調節ポリペプチドが、別個のポリペプチド鎖上にある、態様４７に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５０．２つの免疫調節ポリペプチドが、同じアミノ酸配列を含む、態様４７～４９のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５１．多量体ポリペプチドが、ａ）エピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、ｂ）任意の２つの隣接するＭＨＣポリペプチドの間、ｃ）ＭＨＣポリペプチドとＦｃポリペプチドとの間、及びｄ）２つの隣接する免疫調節ポリペプチドの間のうちの１つ以上にペプチドリンカーを含む、態様２４～５０のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５２．リンカーが２０アミノ酸～４０アミノ酸の長さを有する、態様５１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５３．リンカーが、式（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）のペプチドである、５１または５２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５４．
ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、
ｉｉ）主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｖｉ）免疫調節ポリペプチド、及び
ｖｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、
ｉｉ）主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｖｉ）免疫調節ポリペプチド、及び
ｖｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５５．Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｖｉ）免疫調節ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｖｉ）免疫調節ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５６．Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｖｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド
を含み、
第１及び第２の免疫調節ポリペプチドが、同じアミノ酸配列を含む、
態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｖｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド
を含み、
第１及び第２の免疫調節ポリペプチドが、同じアミノ酸配列を含む、
態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５７．Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）エピトープ、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ｉ）免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）エピトープ、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５８．Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｖｉ）免疫調節ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｖｉ）免疫調節ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５９．Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６０．Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）エピトープ、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ｉ）免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）エピトープ、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、
ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、及び
ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド
を含む、態様５４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６１．ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、及び１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様５４～６０のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６２．ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、及び１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様５４～６０のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６３．ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドが、図７Ａ～７Ｊ、図８Ａ～８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ～１９Ｂ、及び図２０Ａ～２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様５４～６０のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６４．ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドが、図７Ａ～７Ｊ、図８Ａ～８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ～１９Ｂ、及び図２０Ａ～２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様５４～６０のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６５．免疫調節ポリペプチドが、天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列を含む、態様５４～６４のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６６．免疫調節ポリペプチドが、ＩＬ－２、４－１ＢＢＬ、ＰＤ－Ｌ１、ＣＤ８０、ＣＤ８６、Ｂ７－１、ＩＣＯＳ－Ｌ、ＯＸ－４０Ｌ、ＦａｓＬ、ＪＡＧ１、ＴＧＦβ、及びＰＤ－Ｌ２からなる群から選択される、態様６５に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６７．免疫調節ポリペプチドが、天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１～１０のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、バリアント免疫調節ポリペプチドであり、当該バリアント免疫調節ポリペプチドが、免疫共調節ポリペプチドに対する天然の免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、当該免疫共調節ポリペプチドに対して低下した親和性を有する、態様５４～６４のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６８．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアント４－１ＢＢＬポリペプチドである、態様６７に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６９．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＣＤ８０ポリペプチドである、態様６７に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７０．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＩＬ－２ポリペプチドである、態様６７に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７１．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＣＤ８６ポリペプチドである、態様６７に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７２．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである、態様６７に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７３．ポリペプチドが、２つの免疫調節ポリペプチドを含む、態様５４～７２のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７４．２つの免疫調節ポリペプチドが、同じアミノ酸配列を含む、態様７３に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７５．多量体ポリペプチドが、
ａ）エピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、
ｂ）任意の２つの隣接するＭＨＣポリペプチドの間、
ｃ）ＭＨＣポリペプチドとＦｃポリペプチドとの間、及び
ｄ）２つの隣接する免疫調節ポリペプチドの間
のうちの１つ以上にペプチドリンカーを含む、態様５４～７４のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）エピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、
ｂ）任意の２つの隣接するＭＨＣポリペプチドの間、
ｃ）ＭＨＣポリペプチドとＦｃポリペプチドとの間、及び
ｄ）２つの隣接する免疫調節ポリペプチドの間
のうちの１つ以上にペプチドリンカーを含む、態様５４～７４のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７６．リンカーが２０アミノ酸～４０アミノ酸の長さを有する、態様７５に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７７．リンカーが、式（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ここで、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）のペプチドである、態様７５または７６に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７８．Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである、態様２４～５３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド、または態様５４～７７のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７９．薬物がＩｇ Ｆｃポリペプチドにコンジュゲートされる、態様７８に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様８０．エピトープが、がんエピトープである、態様２４～５３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド、または態様５４～７７のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様８１．エピトープが、自己エピトープである、態様２４～５３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド、または態様５４～７７のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様８２．第１及び第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドが、
ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ１＊０１：０１、ＤＲＢ１＊０１：０２、ＤＲＢ１＊０１：０３、ＤＲＢ１＊０３０１、ＤＲＢ１＊０３：０２、ＤＲＢ１＊０３０４、ＤＲＢ１＊０４：０１、ＤＲＢ１＊０４：０２、ＤＲＢ１＊０４０３、ＤＲＢ１＊０４：０４、ＤＲＢ１＊０４：０５、ＤＲＢ１＊０４：０６、ＤＲＢ１＊０４：０８、ＤＲＢ１＊０８：０３、ＤＲＢ１＊０９：０１、ＤＲＢ１＊１０：０１、ＤＲＢ１＊１１：０４、ＤＲＢ１＊１３：０１、ＤＲＢ１＊１４：０２、ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＲＢ１＊１５０２、及びＤＲＢ１＊１５０３のうちの１つのＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ ＤＲＢ１鎖ポリペプチド；または
ｉｉｉ）次のアレル：ＤＱＡ１＊０１：０１、ＤＱＡ＊０１：０２、ＤＱＡ１＊０１：０４、ＤＱＡ１＊０３：０１、ＤＱＡ１＊０３：０２、ＤＱＡ１＊０４：０１、ＤＱＡ１＊０５：０１のうちの１つのＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｖ）ＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＱＢ１＊０２：０１、ＤＱＢ１＊０３：０１、ＤＱＢ１＊０３：０３、ＤＱＢ１＊０４：０１、ＤＱＢ１＊０４：０２、ＤＱＢ１＊０５：０１、ＤＱＢ１＊０５：０３、ＤＱＢ１＊０６：０１、及びＤＱＢ１＊０６０２のうちの１つのＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖ）ＤＲＡ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ３＊０１：０１及びＤＲＢ３＊０３：０１のうちの１つのＤＲＢ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉ）ＤＲＡ４ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ４＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉｉ）ＤＰＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＰＢ１＊０３：０１、ＤＰＢ１＊０９：０１、及びＤＰＢ１＊１３：０１のうちの１つのＤＰＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド
を含む、態様２４～５３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド、または態様５４～７７のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ１＊０１：０１、ＤＲＢ１＊０１：０２、ＤＲＢ１＊０１：０３、ＤＲＢ１＊０３０１、ＤＲＢ１＊０３：０２、ＤＲＢ１＊０３０４、ＤＲＢ１＊０４：０１、ＤＲＢ１＊０４：０２、ＤＲＢ１＊０４０３、ＤＲＢ１＊０４：０４、ＤＲＢ１＊０４：０５、ＤＲＢ１＊０４：０６、ＤＲＢ１＊０４：０８、ＤＲＢ１＊０８：０３、ＤＲＢ１＊０９：０１、ＤＲＢ１＊１０：０１、ＤＲＢ１＊１１：０４、ＤＲＢ１＊１３：０１、ＤＲＢ１＊１４：０２、ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＲＢ１＊１５０２、及びＤＲＢ１＊１５０３のうちの１つのＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ ＤＲＢ１鎖ポリペプチド；または
ｉｉｉ）次のアレル：ＤＱＡ１＊０１：０１、ＤＱＡ＊０１：０２、ＤＱＡ１＊０１：０４、ＤＱＡ１＊０３：０１、ＤＱＡ１＊０３：０２、ＤＱＡ１＊０４：０１、ＤＱＡ１＊０５：０１のうちの１つのＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｖ）ＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＱＢ１＊０２：０１、ＤＱＢ１＊０３：０１、ＤＱＢ１＊０３：０３、ＤＱＢ１＊０４：０１、ＤＱＢ１＊０４：０２、ＤＱＢ１＊０５：０１、ＤＱＢ１＊０５：０３、ＤＱＢ１＊０６：０１、及びＤＱＢ１＊０６０２のうちの１つのＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖ）ＤＲＡ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ３＊０１：０１及びＤＲＢ３＊０３：０１のうちの１つのＤＲＢ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉ）ＤＲＡ４ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ４＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉｉ）ＤＰＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＰＢ１＊０３：０１、ＤＰＢ１＊０９：０１、及びＤＰＢ１＊１３：０１のうちの１つのＤＰＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド
を含む、態様２４～５３のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド、または態様５４～７７のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様８３．
ａ）態様１～８２のいずれか１つに記載の抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）バッファーと
を含む、組成物。
ａ）態様１～８２のいずれか１つに記載の抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）バッファーと
を含む、組成物。
態様８４．
ａ）態様２４～７７及び８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）薬学的に許容される賦形剤と
を含む、組成物。
ａ）態様２４～７７及び８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）薬学的に許容される賦形剤と
を含む、組成物。
態様８５．
ａ）態様２４～７７及び８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）生理食塩水と
を含む、組成物。
ａ）態様２４～７７及び８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）生理食塩水と
を含む、組成物。
態様８６．生理食塩水が０．９％ＮａＣｌである、態様８５に記載の組成物。
態様８７．無菌である、態様８５または態様８６に記載の組成物。
態様８８．態様１～２３のいずれか１つに記載の抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、１つ以上の核酸。
態様８９．態様８８に記載の１つ以上の核酸を含む、１つ以上の組み換え発現ベクター。
態様９０．態様８８に記載の１つ以上の核酸または態様８９に記載の１つ以上の組み換え発現ベクターにより遺伝子改変された、宿主細胞。
態様９１．真核細胞である、態様９０に記載の宿主細胞。
態様９２．態様２４～７７のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、１つ以上の核酸。
態様９３．態様９２に記載の１つ以上の核酸を含む、１つ以上の組み換え発現ベクター。
態様９４．態様９１に記載の１つ以上の核酸または態様９３に記載の１つ以上の組み換え発現ベクターにより遺伝子改変された、宿主細胞。
態様９５．真核細胞である、態様９３に記載の宿主細胞。
態様９６．抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法であって、Ｔ細胞を態様１～２３のいずれか１つに記載の抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、Ｔ細胞に対する抗原提示ポリペプチドの結合は、Ｔ細胞が抗原提示ポリペプチドに存在するエピトープに特異的であることを示す、当該方法。
態様９７．抗原提示ポリペプチドが、検出可能な標識を含む、態様９６に記載の方法。
態様９８．検出可能な標識が、放射性同位体、蛍光ポリペプチド、または蛍光産物を生成する酵素、有色産物を生成する酵素である、態様９７に記載の方法。
態様９９．Ｔ細胞に対する抗原提示ポリペプチドの結合が、検出可能に標識された、抗原提示ポリペプチドに特異的な抗体を使用して検出される、態様９６に記載の方法。
態様１００．Ｔ細胞は、複数のＴ細胞を含むサンプル中に存在する、態様９６～９９のいずれか１つに記載の方法。
態様１０１．エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、Ｔ細胞を態様２４～７７及び８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、当該接触させることが、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、当該方法。
態様１０２．当該接触させることが、ｉｎ ｖｉｔｒｏで行われる、態様１０１に記載の方法。
態様１０３．当該接触させることが、ｉｎ ｖｉｖｏで行われる、態様１０１に記載の方法。
態様１０４．Ｔ細胞が制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である、態様１０１～１０３のいずれか１つに記載の方法。
態様１０５．当該接触させることが、Ｔｒｅｇを活性化し、自己反応性Ｔ細胞の活性を低下させる、態様１０４に記載の方法。
態様１０６．Ｔ細胞がＣＤ４＋Ｔヘルパー細胞であり、当該接触させることがＣＤ４＋Ｔ細胞を活性化する、態様１０１～１０５のいずれか１つに記載の方法。
態様１０７．当該活性化したＣＤ４＋Ｔ細胞が、ＣＤ８＋Ｔ細胞を活性化する、態様１０６に記載の方法。
態様１０８．ＣＤ８＋Ｔ細胞が、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドによって提示されるがんエピトープに特異的である、態様１０７の方法。
態様１０９．Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドをそれを必要とする個体に投与することを含む、態様１０１及び１０３～１０８のいずれか１つに記載の方法。
態様１１０．当該投与することが全身投与である、態様１０９に記載の方法。
態様１１１．当該投与することが局所投与である、態様１０９に記載の方法。
態様１１２．当該投与することが腫瘍近傍の投与である、態様１０９に記載の方法。
態様１１３．当該投与することが静脈内投与によるものである、態様１０９に記載の方法。
態様１１４．当該個体がヒトである、態様１０１～１１３のいずれか１つに記載の方法。
態様１１５．当該個体が自己免疫疾患を有する、態様１１４に記載の方法。
態様１１６．当該個体ががんを有する、態様１１４に記載の方法。
態様１１７．治療方法であって、それを必要とする個体に、有効量の態様２４～７７及び８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドを投与することを含み、当該投与することが、個体を治療する、当該治療方法。
態様１１８．個体ががんを有し、当該投与することががんを治療する、態様１１７に記載の方法。
態様１１９．個体が自己免疫障害を有し、当該投与することが自己免疫障害を治療する、態様１１７に記載の方法。
態様１２０．当該投与することが静脈内投与によるものである、態様１１７～１１９のいずれか１つに記載の方法。
態様１２１．当該投与することが局所投与によるものである、態様１１７～１１９のいずれか１つに記載の方法。
態様１２２．当該投与することが全身投与によるものである、態様１１７～１１９のいずれか１つに記載の方法。
態様セットＢ
前述の説明を限定することなく、１～２３の番号を付した本開示のいくつかの非限定的な態様を以下に記載する。本開示を読めば当業者には明らかであるように、個々に番号が付された態様のそれぞれは、個々に番号が付された先行の態様または後述の態様のいずれかとともに使用または組み合わせられてもよい。これは、全てのそのような態様の組み合わせに対する支持を提供することを意図しており、以下に明示的に記載される態様の組み合わせに限定されるものではない。
前述の説明を限定することなく、１～２３の番号を付した本開示のいくつかの非限定的な態様を以下に記載する。本開示を読めば当業者には明らかであるように、個々に番号が付された態様のそれぞれは、個々に番号が付された先行の態様または後述の態様のいずれかとともに使用または組み合わせられてもよい。これは、全てのそのような態様の組み合わせに対する支持を提供することを意図しており、以下に明示的に記載される態様の組み合わせに限定されるものではない。
態様１．多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドであって、
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）１型糖尿病もしくはセリアック病以外のまたはそれに加えた自己免疫疾患を治療するのに有用な自己免疫疾患関連エピトープを提示するペプチドであって、当該エピトープが、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）に結合されることが可能である、当該ペプチド、
ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第２のポリペプチドと
を含み、
当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、
当該第１及び第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドが、
ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ１＊０１：０１、ＤＲＢ１＊０１：０２、ＤＲＢ１＊０１：０３、ＤＲＢ１＊０３０１、ＤＲＢ１＊０３：０２、ＤＲＢ１＊０３０４、ＤＲＢ１＊０４：０１、ＤＲＢ１＊０４：０２、ＤＲＢ１＊０４０３、ＤＲＢ１＊０４：０４、ＤＲＢ１＊０４：０５、ＤＲＢ１＊０４：０６、ＤＲＢ１＊０４：０８、ＤＲＢ１＊０８：０３、ＤＲＢ１＊０９：０１、ＤＲＢ１＊１０：０１、ＤＲＢ１＊１１：０４、ＤＲＢ１＊１３：０１、ＤＲＢ１＊１４：０２、ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＲＢ１＊１５０２、及びＤＲＢ１＊１５０３のうちの１つのＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ ＤＲＢ１鎖ポリペプチド；または
ｉｉｉ）次のアレル：ＤＱＡ１＊０１：０１、ＤＱＡ＊０１：０２、ＤＱＡ１＊０１：０４、ＤＱＡ１＊０３：０１、ＤＱＡ１＊０３：０２、ＤＱＡ１＊０４：０１、ＤＱＡ１＊０５：０１のうちの１つのＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｖ）ＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＱＢ１＊０２：０１、ＤＱＢ１＊０３：０１、ＤＱＢ１＊０３：０３、ＤＱＢ１＊０４：０１、ＤＱＢ１＊０４：０２、ＤＱＢ１＊０５：０１、ＤＱＢ１＊０５：０３、ＤＱＢ１＊０６：０１、及びＤＱＢ１＊０６０２のうちの１つのＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖ）ＤＲＡ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ３＊０１：０１及びＤＲＢ３＊０３：０１のうちの１つのＤＲＢ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉ）ＤＲＡ４ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ４＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉｉ）ＤＰＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＰＢ１＊０３：０１、ＤＰＢ１＊０９：０１、及びＤＰＢ１＊１３：０１のうちの１つのＤＰＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド
を含み、
当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、
当該多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）１型糖尿病もしくはセリアック病以外のまたはそれに加えた自己免疫疾患を治療するのに有用な自己免疫疾患関連エピトープを提示するペプチドであって、当該エピトープが、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）に結合されることが可能である、当該ペプチド、
ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
を含む、当該第２のポリペプチドと
を含み、
当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、
当該第１及び第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドが、
ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ１＊０１：０１、ＤＲＢ１＊０１：０２、ＤＲＢ１＊０１：０３、ＤＲＢ１＊０３０１、ＤＲＢ１＊０３：０２、ＤＲＢ１＊０３０４、ＤＲＢ１＊０４：０１、ＤＲＢ１＊０４：０２、ＤＲＢ１＊０４０３、ＤＲＢ１＊０４：０４、ＤＲＢ１＊０４：０５、ＤＲＢ１＊０４：０６、ＤＲＢ１＊０４：０８、ＤＲＢ１＊０８：０３、ＤＲＢ１＊０９：０１、ＤＲＢ１＊１０：０１、ＤＲＢ１＊１１：０４、ＤＲＢ１＊１３：０１、ＤＲＢ１＊１４：０２、ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＲＢ１＊１５０２、及びＤＲＢ１＊１５０３のうちの１つのＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ ＤＲＢ１鎖ポリペプチド；または
ｉｉｉ）次のアレル：ＤＱＡ１＊０１：０１、ＤＱＡ＊０１：０２、ＤＱＡ１＊０１：０４、ＤＱＡ１＊０３：０１、ＤＱＡ１＊０３：０２、ＤＱＡ１＊０４：０１、ＤＱＡ１＊０５：０１のうちの１つのＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｖ）ＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＱＢ１＊０２：０１、ＤＱＢ１＊０３：０１、ＤＱＢ１＊０３：０３、ＤＱＢ１＊０４：０１、ＤＱＢ１＊０４：０２、ＤＱＢ１＊０５：０１、ＤＱＢ１＊０５：０３、ＤＱＢ１＊０６：０１、及びＤＱＢ１＊０６０２のうちの１つのＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖ）ＤＲＡ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ３＊０１：０１及びＤＲＢ３＊０３：０１のうちの１つのＤＲＢ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉ）ＤＲＡ４ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ４＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉｉ）ＤＰＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＰＢ１＊０３：０１、ＤＰＢ１＊０９：０１、及びＤＰＢ１＊１３：０１のうちの１つのＤＰＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド
を含み、
当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、
当該多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様２．
ａ１）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ１）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
ａ２）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ２）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及び
ｉｖ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド
を含むか、または
ａ３）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ３）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｉｉｉ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド、及び
ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
ａ４）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含み、かつ
ｂ４）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含むか、または
ａ５）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含み、かつ
ｂ５）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド
を含む、
態様１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ１）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ１）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
ａ２）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ２）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及び
ｉｖ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド
を含むか、または
ａ３）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ３）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｉｉｉ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド、及び
ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
ａ４）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含み、かつ
ｂ４）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含むか、または
ａ５）当該第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含み、かつ
ｂ５）当該第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）当該ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）当該１つ以上の免疫調節ポリペプチド
を含む、
態様１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様３．
ａ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｂ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｃ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｄ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０６：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｅ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｆ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０４ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｇ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｈ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０３：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、
態様１または態様２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｂ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｃ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｄ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０６：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｅ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｆ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０４ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｇ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｈ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０３：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、
態様１または態様２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様４．当該免疫調節ポリペプチドが、
ａ）天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列を含むか、または
ｂ）当該天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１～１０のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、バリアント免疫調節ポリペプチドであり、当該バリアント免疫調節ポリペプチドが、免疫共調節ポリペプチドに対する当該天然の免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、当該免疫共調節ポリペプチドに対して低下した親和性を有する、
態様１～３のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
ａ）天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列を含むか、または
ｂ）当該天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１～１０のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、バリアント免疫調節ポリペプチドであり、当該バリアント免疫調節ポリペプチドが、免疫共調節ポリペプチドに対する当該天然の免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、当該免疫共調節ポリペプチドに対して低下した親和性を有する、
態様１～３のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様５．当該免疫調節ポリペプチドが、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、またはＴＧＦ－βポリペプチドである、態様１～４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様６．当該免疫調節ポリペプチドが、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである、態様１～４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様７．自己免疫疾患関連ペプチドが、約４アミノ酸～約２５アミノ酸の長さを有する、態様１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様８．当該ペプチドが、多発性硬化症関連ペプチドである、態様１～７のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様９．当該ペプチドが、リウマチ様関節炎関連ペプチドである、態様１～７のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様１０．当該ペプチドが、全身性エリテマトーデス関連ペプチドである、態様１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様１１．当該ペプチドが、アジソン病関連ペプチドである、態様１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様１２．当該ペプチドが、重症筋無力症関連ペプチドである、態様１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様１３．当該ペプチドが、シェーグレン症候群関連ペプチドである、態様１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様１４．当該ペプチドが、乾癬関連ペプチドである、態様１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
態様１５．
ａ）態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）薬学的に許容される賦形剤と
を含む、組成物。
ａ）態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）薬学的に許容される賦形剤と
を含む、組成物。
態様１６．態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、１つ以上の核酸。
態様１７．態様１６に記載の１つ以上の核酸を含む、１つ以上の発現ベクター。
態様１８．態様１６に記載の１つ以上の核酸または態様１７に記載の１つ以上の発現ベクターにより遺伝子改変された、宿主細胞。
態様１９．個体の自己免疫疾患に特異的なＣＤ４＋Ｔ細胞の数及び／または活性を減少させる方法であって、当該ＣＤ４＋Ｔ細胞を態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、当該接触させることが、当該ＣＤ４＋Ｔ細胞の数及び／または活性を減少させ、当該自己免疫疾患が、Ｔ１Ｄまたはセリアック病以外である、当該方法。
態様２０．個体の自己免疫疾患を治療する方法であって、それを必要とする個体に、有効量の態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドを投与することを含み、当該投与することが、当該個体の自己免疫疾患を治療し、当該自己免疫疾患が、Ｔ１Ｄまたはセリアック病以外である、当該方法。
態様２１．当該自己免疫疾患が、アジソン病、円形脱毛症、強直性脊椎炎、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫関連不妊症、自己免疫性血小板減少性紫斑病、水疱性類天疱瘡、クローン病、グッドパスチャー症候群、糸球体腎炎（例えば、半月体形成性糸球体腎炎、増殖性糸球体腎炎）、グレーヴス病、橋本甲状腺炎、混合性結合組織病、多発性硬化症、重症筋無力症（ＭＧ）、天疱瘡（例えば、尋常性天疱瘡）、悪性貧血、多発性筋炎、乾癬、乾癬性関節炎、リウマチ様関節炎、強皮症、シェーグレン症候群、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、血管炎、または白斑である、態様２０に記載の方法。
態様２２．個体の自己免疫疾患に特異的な病原性ＣＤ４＋及び／またはＣＤ８＋自己反応性Ｔ細胞の数及び／または活性を減少させる方法であって、ＣＤ４＋Ｔ細胞を態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、当該接触させることが、病原性ＣＤ４＋及び／またはＣＤ８＋Ｔ細胞の数及び／または活性を減少させ、当該自己免疫疾患が、Ｔ１Ｄまたはセリアック病以外である、当該方法。
態様２３．個体の自己免疫疾患に特異的なＣＤ４＋Ｔ細胞及び／またはＣＤ８＋自己反応性Ｔ細胞の数及び／または活性を減少させる方法であって、ＣＤ４＋Ｔ細胞を態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、当該接触させることが、ＣＤ４＋Ｔｒｅｇ細胞の数を増加させ、それにより、病原性ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／またはＣＤ８＋Ｔ細胞の数及び／または活性が減少し、当該自己免疫疾患が、Ｔ１Ｄまたはセリアック病以外である、当該方法。
以下の実施例は、本発明の実施法及び使用法に関する完全な開示と説明を当業者に提供するために記載されるものであり、発明者らが発明とみなすものの範囲を限定するものでも、以下の実験が行われた実験の全てであることまたは以下の実験のみが行われたことを示すものではない。使用される数（例えば量、温度など）に関しては、正確さを確保するように努めたが、多少の実験誤差及び偏差を考慮されたい。別途指定のない限り、部は重量部であり、分子量は重量平均分子量であり、温度は摂氏度であり、圧力は大気圧または略大気圧である。標準的な略語、例えば、ｂｐ：塩基対、ｋｂ：キロベース、ｐｌ：ピコリットル、ｓまたはｓｅｃ：秒、ｍｉｎ：分、ｈまたはｈｒ：時間、ａａ：アミノ酸、ｋｂ：キロベース、ｂｐ：塩基対、ｎｔ：ヌクレオチド、ｉ．ｍ．：筋肉内、ｉ．ｐ．：腹腔内、ｓ．ｃ．：皮下などが使用され得る。
実施例１：抗原提示ポリペプチドの産生
安定したインタクトなＭＨＣクラスＩＩ抗原提示ポリペプチドの産生を最適化するために、ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む、様々な構造配置の抗原提示ポリペプチドを合成し、発現させ、プロテインＡアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製した。ＭＨＣクラスＩＩ ｓｙｎＴａｃｓの設計にあたり、ばらつきのあったパラメーターには、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖及びベータ鎖の向き、Ｆｃの配置、ＩＬ２（ＭＯＤ）の配置、ならびに各種リンカーの長さ及び内容が含まれた。示されるバリアントは、単鎖型及び二本鎖型を含み、そのそれぞれは、図２４に模式的に示されるように、α－１ドメインのＮ末端に連結されたＭＨＣクラスＩＩ β－１ドメインと、α－２のＣ末端または別個の鎖上にあるβ－２と、を含む。β－２ドメインまたはＩＬ２融合あり及びなしの単鎖バリアントが示されており、また、ｂＺＩＰ二量体化ドメインあり及びなしの２本鎖型も示されている。
安定したインタクトなＭＨＣクラスＩＩ抗原提示ポリペプチドの産生を最適化するために、ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む、様々な構造配置の抗原提示ポリペプチドを合成し、発現させ、プロテインＡアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製した。ＭＨＣクラスＩＩ ｓｙｎＴａｃｓの設計にあたり、ばらつきのあったパラメーターには、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖及びベータ鎖の向き、Ｆｃの配置、ＩＬ２（ＭＯＤ）の配置、ならびに各種リンカーの長さ及び内容が含まれた。示されるバリアントは、単鎖型及び二本鎖型を含み、そのそれぞれは、図２４に模式的に示されるように、α－１ドメインのＮ末端に連結されたＭＨＣクラスＩＩ β－１ドメインと、α－２のＣ末端または別個の鎖上にあるβ－２と、を含む。β－２ドメインまたはＩＬ２融合あり及びなしの単鎖バリアントが示されており、また、ｂＺＩＰ二量体化ドメインあり及びなしの２本鎖型も示されている。
免疫調節ポリペプチドありまたはなしの抗原提示ポリペプチドを生成した。抗原提示ポリペプチドのアミノ酸配列、及び当該ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を図２５～３５に記載する。ポリペプチドには、単鎖ポリペプチド及び多量体ポリペプチドが含まれた。抗原提示ポリペプチドを以下に示す：
１）１５９９－これは、バリアントＩＬ－２免疫調節ポリペプチドを含む単鎖ポリペプチドである。１５９９ポリペプチドは、ＨＬＡ β２ポリペプチドも含む。１５９９ポリペプチドは、ｉ）エピトープ（ヘマグルチニンエピトープ）、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１及びα２、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β２、ｖ）バリアントＩＬ－２免疫調節ポリペプチド、ならびにｖ）ＩｇＧ１ Ｆｃを含む。
２）１５５９－これは、ＨＬＡ β２ポリペプチドを含む単鎖ポリペプチドである。１５５９ポリペプチドは、免疫調節ポリペプチドを含まない。１５５９ポリペプチドは、ｉ）エピトープ（ヘマグルチニン（ＨＡ）エピトープ）、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１及びα２、ｉｖ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β２、ならびにｖ）ＩｇＧ１ Ｆｃを含む。
３）１６０１－これは、単鎖ポリペプチドのバリアントＩＬ－２免疫調節ポリペプチドである。１６０１ポリペプチドは、ＨＬＡ β２ポリペプチドを含まない。１６０１ポリペプチドは、ｉ）エピトープ（ヘマグルチニンエピトープ）、ｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＢ１ β１、ｉｉｉ）ＨＬＡ ＤＲＡ α１及びα２、ｉｖ）２コピーのバリアントＩＬ－２免疫調節ポリペプチド、ならびにｖ）ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む。
４）１４５２＋１６６１－これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。エピトープは、ヘマグルチニンエピトープである。ＨＬＡ ＤＲＢ１及びＤＲＡ ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む。両ポリペプチド鎖は、ロイシンジッパー二量体化ペプチドを含む。１４５２ポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む。
５）１６５９＋１６６４－これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。ＨＬＡ ＤＲＢ１及びＤＲＡ ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む。エピトープは、ヘマグルチニンエピトープである。１６６４ポリペプチドは、２コピーのバリアントＩＬ－２免疫調節ポリペプチドを含む。両ポリペプチド鎖は、ロイシンジッパー二量体化ペプチドを含まない。１６５９ポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む。
６）１６３７＋１４０８－これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。ＨＬＡ ＤＲＢ１及びＤＲＡ ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む。エピトープは、ＣＭＶエピトープである。１４０８ポリペプチドは、２コピーのバリアントＩＬ－２免疫調節ポリペプチドを含む。両鎖は、ロイシンジッパー（ｂＺＩＰ）を含む。１６３７ポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む。
７）「ＤＲＡ－ＤＲＢ－エピトープ」＋１６４０－これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。ＨＬＡ ＤＲＢ１－４及びＤＲＡ ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む。エピトープは、ヘマグルチニンエピトープである。両鎖は、ロイシンジッパー（ｂＺＩＰ）を含む。ＤＲＡ－ＤＲＢ－エピトープポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む。
上記のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む発現コンストラクトを哺乳類細胞株に導入した。産生されたポリペプチドを還元ポリアクリルアミドゲルにロードした。図２４の左パネルに示されるように、全てのポリペプチドが検出可能な量で産生された。各種コンストラクトを図２４の右パネルに模式的に示す。
β－２ドメインを含まない単鎖型（ＩＬ２を含む）は、プロテインＡ精製をすると、ロバストな発現レベルを示し、均一でインタクトな産物であった（レーン３）。解析ゲルで観察される顕著な分解産物によって示されるように、β－２ドメインの追加により、分子の発現低下及び不安定化が生じた（レーン１）。ＩＬ２を除去すると（β－２は保持したまま）、更に発現が低下したが、分解産物は最小であった（レーン２）。
β－２ドメインが別個の鎖上にある場合、ｂＺＩＰロイシンジッパー二量体化ドメインの組み込みにより、ロバストな組み立てが観察された（レーン５）。ｂＺＩＰドメインを含まない場合、インタクトなＦｃ含有鎖の中程度の発現と産生が観察され、β－２鎖が組み込まれた（レーン４）。二本鎖ｂＺＩＰモデルのＨＡペプチドをＣＭＶペプチドに変更すると、インタクト産物の発現は、極めてロバストであった（レーン６）。
したがって、安定したインタクトなＭＨＣクラスＩＩ抗原提示ポリペプチドが合成され、発現し、精製された。これらは、単鎖系または二本鎖系のいずれかを組み込んだ設計モデルを表した。二本鎖系を使用する場合、β－２ドメイン及び二量体化ドメインの両方の組み込みは、ロバストな発現をもたらした。ＭＨＣへの結合のために選択されたペプチドは、安定化を提供することができた。更に、２つの異なるＭＨＣアレルのＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを用いると、安定したインタクトなＭＨＣクラスＩＩ抗原提示ポリペプチドが生成された。
本発明について、その具体的な実地形態を参照しながら説明してきたが、当業者であれば、本発明の本来の趣旨及び範囲から逸脱することなく、種々の変更を行うことができ、等価物を代わりに使用できることが理解されよう。更に、特定の状況、材料、物質の組成、プロセス、１つまたは複数のプロセスステップを本発明の目的、趣旨及び範囲に適合させるように、多くの改変を行ってもよい。こうした改変は全て、本明細書に添付される特許請求の範囲に含まれるものとする。
Claims (21)
- 多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドであって、
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）１型糖尿病（Ｔ１Ｄ）もしくはセリアック病以外のまたはそれに加えた自己免疫疾患を治療するのに有用な自己免疫疾患関連エピトープを提示するペプチドであって、前記エピトープが、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）に結合されることが可能である、前記ペプチド、
ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、前記第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
を含む、前記第２のポリペプチドと
を含み、
前記多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、
前記第１及び前記第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドが、
ｉ）ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ１＊０１：０１、ＤＲＢ１＊０１：０２、ＤＲＢ１＊０１：０３、ＤＲＢ１＊０３０１、ＤＲＢ１＊０３：０２、ＤＲＢ１＊０３０４、ＤＲＢ１＊０４：０１、ＤＲＢ１＊０４：０２、ＤＲＢ１＊０４０３、ＤＲＢ１＊０４：０４、ＤＲＢ１＊０４：０５、ＤＲＢ１＊０４：０６、ＤＲＢ１＊０４：０８、ＤＲＢ１＊０８：０３、ＤＲＢ１＊０９：０１、ＤＲＢ１＊１０：０１、ＤＲＢ１＊１１：０４、ＤＲＢ１＊１３：０１、ＤＲＢ１＊１４：０２、ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＲＢ１＊１５０２、及びＤＲＢ１＊１５０３のうちの１つのＤＲＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ ＤＲＢ１鎖ポリペプチド；または
ｉｉｉ）次のアレル：ＤＱＡ１＊０１：０１、ＤＱＡ＊０１：０２、ＤＱＡ１＊０１：０４、ＤＱＡ１＊０３：０１、ＤＱＡ１＊０３：０２、ＤＱＡ１＊０４：０１、ＤＱＡ１＊０５：０１のうちの１つのＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｉｖ）ＤＱＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＱＢ１＊０２：０１、ＤＱＢ１＊０３：０１、ＤＱＢ１＊０３：０３、ＤＱＢ１＊０４：０１、ＤＱＢ１＊０４：０２、ＤＱＢ１＊０５：０１、ＤＱＢ１＊０５：０３、ＤＱＢ１＊０６：０１、及びＤＱＢ１＊０６０２のうちの１つのＤＱＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖ）ＤＲＡ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＲＢ３＊０１：０１及びＤＲＢ３＊０３：０１のうちの１つのＤＲＢ３ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉ）ＤＲＡ４ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ４＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉ）ＤＲＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、ＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド；または
ｖｉｉｉ）ＤＰＡ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ α鎖ポリペプチドと、次のアレル：ＤＰＢ１＊０３：０１、ＤＰＢ１＊０９：０１、及びＤＰＢ１＊１３：０１のうちの１つのＤＰＢ１ポリペプチドに対して少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するＭＨＣクラスＩＩ β鎖ポリペプチド
を含み、
前記多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドが、任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、
前記多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。 - ａ１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
ａ２）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ２）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及び
ｉｖ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド
を含むか、または
ａ３）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含み、かつ
ｂ３）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、
ｉｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、及び
ｉｖ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
ａ４）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含み、かつ
ｂ４）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）前記ペプチドエピトープ、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、及び
ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド
を含むか、または
ａ５）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α１ポリペプチド、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ α２ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含み、かつ
ｂ５）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、
ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β１ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ β２ポリペプチド、及び
ｉｖ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド
を含む、
請求項１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。 - ａ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｂ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ１＊０４：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｃ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ５＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｄ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０６：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｅ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０３：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０３：０３ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｆ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０１：０４ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０５：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｇ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＲＡ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＲＢ１＊０１：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｈ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０４：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０４：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、または
ｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ αポリペプチドが、ＤＱＡ１＊０３：０２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記ＭＨＣクラスＩＩ βポリペプチドが、ＤＱＢ１＊０３：０１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、
請求項１または請求項２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。 - 前記免疫調節ポリペプチドが、
ａ）天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列を含むか、または
ｂ）前記天然の免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１～１０のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、バリアント免疫調節ポリペプチドであり、前記バリアント免疫調節ポリペプチドが、免疫共調節ポリペプチドに対する前記天然の免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、前記免疫共調節ポリペプチドに対して低下した親和性を有する、
請求項１～３のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。 - 前記免疫調節ポリペプチドが、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、またはＴＧＦ－βポリペプチドである、請求項１～４のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 前記免疫調節ポリペプチドが、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである、請求項１～４のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 自己免疫疾患関連ペプチドが、約４アミノ酸～約２５アミノ酸の長さを有する、請求項１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 前記ペプチドが、多発性硬化症関連ペプチドである、請求項１～７のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 前記ペプチドが、リウマチ様関節炎関連ペプチドである、請求項１～７のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 前記ペプチドが、全身性エリテマトーデス関連ペプチドである、請求項１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 前記ペプチドが、アジソン病関連ペプチドである、請求項１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 前記ペプチドが、重症筋無力症関連ペプチドである、請求項１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 前記ペプチドが、シェーグレン症候群関連ペプチドである、請求項１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- 前記ペプチドが、乾癬関連ペプチドである、請求項１に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
- ａ）請求項１～１４のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、
ｂ）薬学的に許容される賦形剤と
を含む、組成物。 - 請求項１～１４のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、１つ以上の核酸。
- 請求項１６に記載の１つ以上の核酸を含む、１つ以上の発現ベクター。
- 請求項１６に記載の１つ以上の核酸または請求項１７に記載の１つ以上の発現ベクターにより遺伝子改変された、宿主細胞。
- 個体の自己免疫疾患に特異的なＣＤ４＋Ｔ細胞の数及び／または活性を減少させる方法であって、前記ＣＤ４＋Ｔ細胞を請求項１～１４のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、前記接触させることが、前記ＣＤ４＋Ｔ細胞の数及び／または活性を減少させ、前記自己免疫疾患が、Ｔ１Ｄまたはセリアック病以外である、前記方法。
- 個体の自己免疫疾患を治療する方法であって、それを必要とする個体に、有効量の請求項１～１４のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドを投与することを含み、前記投与することが、前記個体の前記自己免疫疾患を治療し、前記自己免疫疾患が、Ｔ１Ｄまたはセリアック病以外である、前記方法。
- 前記自己免疫疾患が、アジソン病、円形脱毛症、強直性脊椎炎、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫関連不妊症、自己免疫性血小板減少性紫斑病、水疱性類天疱瘡、クローン病、グッドパスチャー症候群、糸球体腎炎（例えば、半月体形成性糸球体腎炎、増殖性糸球体腎炎）、グレーヴス病、橋本甲状腺炎、混合性結合組織病、多発性硬化症、重症筋無力症（ＭＧ）、天疱瘡（例えば、尋常性天疱瘡）、悪性貧血、多発性筋炎、乾癬、乾癬性関節炎、リウマチ様関節炎、強皮症、シェーグレン症候群、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、血管炎、または白斑である、請求項２０に記載の方法。
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