JP2022519711A - ステロイドの1,2-脱水素のための微生物の生物工学的最適化 - Google Patents
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Abstract
Description
したがって本発明の第一の態様は、20β-HSDHをコードする遺伝子の発現が、対応する未改変の細菌と比較して減少しているか又は抑制されている遺伝子改変細菌に関し、ここで対応する未改変の細菌は、Δ1-デヒドロゲナーゼ活性及び20-β-デヒドロゲナーゼ活性を有する。
- 対応する未改変細菌は、Δ1-デヒドロゲナーゼ活性及び20-β-デヒドロゲナーゼ活性を有し、
- 少なくとも1つの遺伝子改変は、20-ベータ-ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ(20β-HSDH)をコードする遺伝子の減少された又は抑制された発現を誘導し、そして
- 好ましくは、上記遺伝子改変された細菌は、そのΔ1-デヒドロゲナーゼ活性を維持する。
a) Δ1-デヒドロゲナーゼ活性及び20-β-デヒドロゲナーゼ活性を有する細菌を供給すること;並びに
b) 20β-HSDHをコードする遺伝子を不活化するか又は欠失させること
を含む。
a) 1,2-脱水素されていないステロイドを供給すること;
b) 1,2-脱水素されていない該ステロイドを、本発明に従う細菌又はその抽出物と、1,2-脱水素されたステロイドを得るために十分な条件下で接触させること
を含む、1,2-脱水素されたステロイドの製造方法に関する。
- 11ベータ 17,21-トリヒドロキシプレグナ-4-エン-3,20-ジオン (ヒドロコルチゾン)であり、そして上記方法は、11ベータ,17アルファ,21-トリヒドロキシ-1,4-プレグナジエン-3,20-ジオン (プレドニゾロン)の製造のためのものである;又は
- 17アルファ,21-ジヒドロキシ-4-プレグネン-3,11,20-トリオン (コルチゾン)であり、そして上記方法は、17アルファ,21-ジヒドロキシ-1,4プレグナジエン-3,11,20-トリオン (プレドニゾン)の製造のためのものである;又は
- プレグナ-4-エン-3,20-ジオンであり、そして上記方法はプレグナ-1,4-ジエン-3,20-ジオンの製造のためのものである;又は
- 11ベータ,17アルファ,21-トリヒドロキシ-6アルファ-メチル-1,4-プレグナジエン-3,20-ジオン (6-メチルプレドニゾロン)の製造のための、11ベータ,17,21-トリヒドロキシ-6アルファ-1,4-プレグネン-3,20-ジオン (6-メチル-ヒドロコルチゾン)である;又は
- 9,11-デヒドロコルテキソロンであり、そして上記方法は1,2-9,11-デヒドロコルゲキソロンの製造のためのものである;又は
- 9,11 デヒドロコルテキソロン-17,21-ジアセテートであり、そして上記方法は1,2-9,11 デヒドロコルテキソロンの製造のためのものである;又は
- 9,11-16,17-デヒドロコルテキソロン-21-アセテートであり、そして上記方法は、1,2-9,11-16,17-デヒドロコルテキソロン-21-アセテートの製造のためのものである;又は
- 16-アルファ-メチルヒドロコルチゾンであり、そして上記方法は16-アルファ-メチルプレドニゾロンの製造のためのものである。
- 11ベータ 17,21-トリヒドロキシプレグナ-4-エン-3,20-ジオン (ヒドロコルチゾン)であり、そして11ベータ,17アルファ,21-トリヒドロキシ-1,4-プレグナジエン-3,20-ジオン (プレドニゾロン)が製造される;又は
- 17アルファ,21-ジヒドロキシ-4-プレグネン-3,11,20-トリオン (コルチゾン)であり、そして17アルファ,21-ジヒドロキシ-1,4 プレグナジエン-3,11,20-トリオン (プレドニゾン)が製造される;又は
- プレグナ-4-エン-3,20-ジオンであり、そしてプレグナ-1,4-ジエン-3,20-ジオンが製造される;又は
- 11ベータ,17,21-トリヒドロキシ-6アルファ-1,4-プレグネン-3,20-ジオン (6-メチル-ヒドロコルチゾン)であり、そして11ベータ,17アルファ,21-トリヒドロキシ-6アルファ-メチル-1,4-プレグナジエン-3,20-ジオン (6-メチルプレドニゾロン)が製造される;又は
- 9,11-デヒドロコルテキソロンであり、そして1,2-9,11-デヒドロコルテキソロンが製造される;又は
- 9,11デヒドロコルテキソロン-17,21-ジアセテートであり、そして1,2-9,11 デヒドロコルテキソロンが製造される;又は
- 9,11-16,17-デヒドロコルテキソロン-21-アセテートであり、そして1,2-9,11-16,17-デヒドロコルテキソロン-21-アセテートが製造される;又は
- 16-アルファ-メチルヒドロコルチゾンであり、そして16-アルファ-メチルプレドニゾロンが製造される。
配列番号1はN.シンプレックスのNOSIM5169の配列に相当する。
配列番号2はN.シンプレックスのNOSIM3735の配列に相当する。
配列番号3は、ミコバクテリウム アビウム亜種(Mycobacterium avium subsp.)パラ結核症MAP4の20β-HSDHの遺伝子の配列に相当する。
NOSIM5169の不活化のためのプラスミドを以下のように構築した:2.0及び1.7kbpサイズの相同なショルダーをPCRにより増幅した。一方のショルダーの増幅のために使用したプライマーはXbal及びEcoRV制限部位を含有しており、そして第二の相同ショルダーのためのプライマーを、EcoRV及びEcoRI制限部位を含有するように設計した。
このプロトコルは、アルスロバクター(Arthrobacter)について記載された手順(Zhangら、2011年)に基づく。エレクトロコンピテントセルの製造のための最適化された手順は以下のとおりであった:N.シンプレックスの細胞を、LB+Ph(LBは溶原性ブロスを表し、そしてPhはホスホマイシンを表す)20ml中に播種し、そして静止期に達するまで培養した。次いで前培養からの1%種菌を新鮮なLB培地に播種し、そして600nmで0.4~0.5の光学密度に達するまで培養した。次いでアンピシリン(Ap)及びグリシンをそれぞれ最終濃度30μg/I及び5g/Iまで添加し、そして培養を継続した。3時間後に、培養物を氷上に置き、そして遠心分離により採取した(4500rpm、6分、4℃)。氷冷エレクトロポレーション緩衝液(0.5Mソルビトール、10%グリセロール)中で3回洗浄した後、細胞を遠心分離により100倍濃縮した。最後に、懸濁液を60μlアリコートに分配し、そして氷上で保存した(このプロトコルをN.シンプレックスNOSIM5169-hygの生成のために使用した)。
第二のプラスミドを用いたN.シンプレックス株のエレクトロポレーション後に、シングルクロスオーバー形質転換体を得、そしてLB+Am+X-Gluc寒天プレートに適用した(略図については図1を参照のこと)(X-Glucは一水和物、X-GlcAを表す)。アプラマイシン上で成長する能力及びβ-グルクロニダーゼ(GUS)(例えば、Myronovskyiら、2011年)反応を行う能力は、形質転換体がシングルクロスオーバー変異体であることを裏付けた。この後、変異体をLB+Ph培地100mlに播種し、そして48時間28℃、200rpmにてインキュベートした。
次いで、培養物1mlを新鮮なLB+Ph培地中に移し、そして同じ条件でさらに48時間インキュベートした。この工程を数回繰り返した。最後のインキュベーションの後、LB+X-Gluc寒天プレートでの変異体の段階希釈を行った。
第二のプラスミドの代わりに、「第二プラスミド-hyg」を使用して形質転換を行った。抗生物質耐性遺伝子(ハイグロマイシン耐性)の存在は、ダブルクロスオーバー変異体のさらなる同定を容易にし得る。しかし、この耐性遺伝子はN.シンプレックスのゲノムにおいて不活性となる場合がある。
NOSIM3735の上流のDNA領域はPCRによるその増幅のためにアクセスできなかったので、NOSIM3735が不活化された株の構築のために以前に記載された方法を適用することができなかった。この課題を克服するために、N.シンプレックスゲノムのフラグメントを含有するコスミドライブラリーを注文し、そして配列決定した。
クローンをヒドロコルチゾンからのプレドニゾロンの製造のための古典的プロセスにおいて使用する。
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Claims (15)
- 20-ベータ-ヒドロキシステロイド脱水素酵素(20β-HSDH)をコードする遺伝子の発現が、対応する未改変の細菌と比較して減少しているか又は抑制されている遺伝子改変細菌であって、ここで対応する未改変細菌は、Δ1-デヒドロゲナーゼ活性及び20-β-デヒドロゲナーゼ活性を有する、上記遺伝子改変細菌。
- 20β-HSDHをコードする遺伝子は不活化されているか又は欠失されている、請求項1に記載の遺伝子改変細菌。
- 20β-HSDHをコードする遺伝子は変異している、請求項1又は2に記載の遺伝子改変細菌。
- 20β-HSDHをコードする遺伝子はトランケートされている、請求項1~3のいずれか1項に記載の遺伝子改変細菌。
- 細菌はノカルジオイド科由来の細菌である、請求項1~4のいずれか1項に記載の遺伝子改変細菌。
- 遺伝子改変細菌はΔ1-デヒドロゲナーゼ活性を有するが、未改変細菌と比較して減少した20-β-デヒドロゲナーゼ活性を有するか、又は20-β-デヒドロゲナーゼ活性を有していない、請求項1~5のいずれか1項に記載の遺伝子改変細菌。
- a) Δ1-デヒドロゲナーゼ活性及び20-β-デヒドロゲナーゼ活性を有する細菌を供給すること;並びに
b) 20β-HSDHをコードする遺伝子を不活化するか又は欠失させること
を含む、請求項1~6のいずれか1項に記載の遺伝子改変細菌の製造方法。 - a) 1,2-脱水素されていないステロイドを供給すること;
b) 1,2-脱水素されていない該ステロイドを、請求項1~6のいずれか1項に記載の細菌又はその抽出物と、1,2-脱水素されたステロイドを得るために十分な条件下で接触させること
を含む、1,2-脱水素されたステロイドの製造方法。 - 1,2-脱水素されていないステロイドは副腎皮質ステロイドである、請求項8に記載の方法。
- 1,2-脱水素されていないステロイドはヒドロコルチゾンであり、そして上記方法はプレドニゾロンの製造のためのものである、請求項8又は9に記載の方法。
- 上記1,2-脱水素されたステロイドを回収し、そして精製することをさらに含む、請求項8~10のいずれか1項に記載の方法。
- 20β-脱水素されたステロイドを除去する工程を含まない、請求項11に記載の方法。
- 1,2-脱水素されたステロイドを製剤化して医薬組成物にすることをさらに含む、請求項8~12のいずれか1項に記載の方法。
- 上記抽出物はΔ1-デヒドロゲナーゼ活性を有する、請求項8~13のいずれか1項に記載の方法。
- 上記抽出物は、請求項1~6のいずれか1項に記載の細菌の細胞溶解、及びΔ1-デヒドロゲナーゼ活性を濃縮するため又はΔ1-デヒドロゲナーゼ活性の精製を容易にするために、場合により細胞溶解生成物を分画することにより得られる、請求項8~13のいずれか1項に記載の方法。
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