JP2022511591A - 緑膿菌o11血清型o抗原オリゴ糖の化学合成方法 - Google Patents
緑膿菌o11血清型o抗原オリゴ糖の化学合成方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2022511591A JP2022511591A JP2021512705A JP2021512705A JP2022511591A JP 2022511591 A JP2022511591 A JP 2022511591A JP 2021512705 A JP2021512705 A JP 2021512705A JP 2021512705 A JP2021512705 A JP 2021512705A JP 2022511591 A JP2022511591 A JP 2022511591A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- building block
- fucosamine
- compound
- glucose
- formula
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 62
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title claims abstract description 29
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title claims abstract description 16
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title claims abstract description 16
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 title claims description 27
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 title abstract description 7
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 title abstract description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 title description 13
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 58
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims abstract description 30
- TVTGZVYLUHVBAJ-GASJEMHNSA-N D-Fucosamine Chemical compound C[C@H]1OC(O)[C@H](N)[C@@H](O)[C@H]1O TVTGZVYLUHVBAJ-GASJEMHNSA-N 0.000 claims abstract description 19
- TVTGZVYLUHVBAJ-ZZWDRFIYSA-N (3s,4s,5s,6s)-3-amino-6-methyloxane-2,4,5-triol Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H]1O TVTGZVYLUHVBAJ-ZZWDRFIYSA-N 0.000 claims abstract description 16
- YTPLMLYBLZKORZ-UHFFFAOYSA-N Thiophene Chemical compound C=1C=CSC=1 YTPLMLYBLZKORZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 12
- 239000008103 glucose Substances 0.000 claims abstract description 12
- 239000012046 mixed solvent Substances 0.000 claims abstract description 11
- 229930192474 thiophene Natural products 0.000 claims abstract description 6
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 47
- 150000004043 trisaccharides Chemical class 0.000 claims description 35
- -1 chloracetyl Chemical group 0.000 claims description 33
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims description 25
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 17
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 17
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 17
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 claims description 14
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 claims description 12
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 238000010276 construction Methods 0.000 claims description 11
- 239000011669 selenium Substances 0.000 claims description 9
- 239000007858 starting material Substances 0.000 claims description 8
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 8
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 claims description 7
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 7
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 claims description 6
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 claims description 6
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 5
- YQTCQNIPQMJNTI-UHFFFAOYSA-N 2,2-dimethylpropan-1-one Chemical group CC(C)(C)[C]=O YQTCQNIPQMJNTI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 claims description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 4
- KPUWHANPEXNPJT-UHFFFAOYSA-N disiloxane Chemical group [SiH3]O[SiH3] KPUWHANPEXNPJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 claims description 4
- 125000005524 levulinyl group Chemical group 0.000 claims description 4
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 4
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 claims description 3
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 claims description 3
- 208000032536 Pseudomonas Infections Diseases 0.000 claims description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 3
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 3
- BUGBHKTXTAQXES-UHFFFAOYSA-N Selenium Chemical compound [Se] BUGBHKTXTAQXES-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 125000001033 ether group Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 claims description 2
- 230000001035 methylating effect Effects 0.000 claims description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052711 selenium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 claims 2
- 125000000600 disaccharide group Chemical group 0.000 claims 2
- 125000005336 allyloxy group Chemical group 0.000 claims 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 claims 1
- UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N phenylmethyl ester of formic acid Natural products O=COCC1=CC=CC=C1 UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 claims 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 abstract description 20
- NTBYIQWZAVDRHA-KCDKBNATSA-N (2s,3s,4r,5s)-2-amino-3,4,5-trihydroxyhexanal Chemical compound C[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](N)C=O NTBYIQWZAVDRHA-KCDKBNATSA-N 0.000 abstract 2
- WQZGKKKJIJFFOK-ZZWDRFIYSA-N L-glucose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-ZZWDRFIYSA-N 0.000 abstract 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 abstract 1
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 69
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 61
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical group ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 56
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 42
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 35
- HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N Trichloro(2H)methane Chemical compound [2H]C(Cl)(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N 0.000 description 33
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 30
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 28
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 23
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 23
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 20
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 19
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 19
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 16
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 16
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 13
- HZNVUJQVZSTENZ-UHFFFAOYSA-N 2,3-dichloro-5,6-dicyano-1,4-benzoquinone Chemical compound ClC1=C(Cl)C(=O)C(C#N)=C(C#N)C1=O HZNVUJQVZSTENZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M sodium iodide Chemical compound [Na+].[I-] FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- 150000002016 disaccharides Chemical group 0.000 description 11
- YYROPELSRYBVMQ-UHFFFAOYSA-N 4-toluenesulfonyl chloride Chemical compound CC1=CC=C(S(Cl)(=O)=O)C=C1 YYROPELSRYBVMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 10
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 10
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 10
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 9
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 8
- WQDUMFSSJAZKTM-UHFFFAOYSA-N Sodium methoxide Chemical compound [Na+].[O-]C WQDUMFSSJAZKTM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 8
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 8
- SHZGCJCMOBCMKK-SVZMEOIVSA-N D-fucopyranose Chemical group C[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-SVZMEOIVSA-N 0.000 description 7
- 239000000386 donor Substances 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 7
- FTVLMFQEYACZNP-UHFFFAOYSA-N trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate Chemical compound C[Si](C)(C)OS(=O)(=O)C(F)(F)F FTVLMFQEYACZNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 230000009471 action Effects 0.000 description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 6
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 6
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 6
- SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N (1s,2s,3s,5r)-1-(carboxymethyl)-3,5-bis[(4-phenoxyphenyl)methyl-propylcarbamoyl]cyclopentane-1,2-dicarboxylic acid Chemical compound O=C([C@@H]1[C@@H]([C@](CC(O)=O)([C@H](C(=O)N(CCC)CC=2C=CC(OC=3C=CC=CC=3)=CC=2)C1)C(O)=O)C(O)=O)N(CCC)CC(C=C1)=CC=C1OC1=CC=CC=C1 SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N 0.000 description 5
- IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N (3S,8S,10R,13S,14S,17S)-17-isoquinolin-7-yl-N,N,10,13-tetramethyl-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-amine Chemical compound CN(C)[C@H]1CC[C@]2(C)C3CC[C@@]4(C)[C@@H](CC[C@@H]4c4ccc5ccncc5c4)[C@@H]3CC=C2C1 IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N 0.000 description 5
- ONBQEOIKXPHGMB-VBSBHUPXSA-N 1-[2-[(2s,3r,4s,5r)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-4,6-dihydroxyphenyl]-3-(4-hydroxyphenyl)propan-1-one Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CC(O)=CC(O)=C1C(=O)CCC1=CC=C(O)C=C1 ONBQEOIKXPHGMB-VBSBHUPXSA-N 0.000 description 5
- UNILWMWFPHPYOR-KXEYIPSPSA-M 1-[6-[2-[3-[3-[3-[2-[2-[3-[[2-[2-[[(2r)-1-[[2-[[(2r)-1-[3-[2-[2-[3-[[2-(2-amino-2-oxoethoxy)acetyl]amino]propoxy]ethoxy]ethoxy]propylamino]-3-hydroxy-1-oxopropan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-[(2r)-2,3-di(hexadecanoyloxy)propyl]sulfanyl-1-oxopropan-2-yl Chemical compound O=C1C(SCCC(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)COCC(=O)N[C@@H](CSC[C@@H](COC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CO)C(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)COCC(N)=O)CC(=O)N1CCNC(=O)CCCCCN\1C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2CC/1=C/C=C/C=C/C1=[N+](CC)C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2C1 UNILWMWFPHPYOR-KXEYIPSPSA-M 0.000 description 5
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 5
- 0 CCC*C1C(**)OC(C)[C@@]2(*)C1C2C[C@@]1OC(C)C(C)(CO[C@]2C(*C)C(C)[C@@](*)[C@@](CC)*2)CC1**C=CC Chemical compound CCC*C1C(**)OC(C)[C@@]2(*)C1C2C[C@@]1OC(C)C(C)(CO[C@]2C(*C)C(C)[C@@](*)[C@@](CC)*2)CC1**C=CC 0.000 description 5
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 5
- 229940126543 compound 14 Drugs 0.000 description 5
- 229940126142 compound 16 Drugs 0.000 description 5
- 229940125898 compound 5 Drugs 0.000 description 5
- JGFBRKRYDCGYKD-UHFFFAOYSA-N dibutyl(oxo)tin Chemical compound CCCC[Sn](=O)CCCC JGFBRKRYDCGYKD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 5
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 5
- GHYOCDFICYLMRF-UTIIJYGPSA-N (2S,3R)-N-[(2S)-3-(cyclopenten-1-yl)-1-[(2R)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxopropan-2-yl]-3-hydroxy-3-(4-methoxyphenyl)-2-[[(2S)-2-[(2-morpholin-4-ylacetyl)amino]propanoyl]amino]propanamide Chemical compound C1(=CCCC1)C[C@@H](C(=O)[C@@]1(OC1)C)NC([C@H]([C@@H](C1=CC=C(C=C1)OC)O)NC([C@H](C)NC(CN1CCOCC1)=O)=O)=O GHYOCDFICYLMRF-UTIIJYGPSA-N 0.000 description 4
- QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N (3S)-3-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[5-[(3aS,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-[1-bis(4-chlorophenoxy)phosphorylbutylamino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound CCCC(NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CCCCC1SC[C@@H]2NC(=O)N[C@H]12)C(C)C)P(=O)(Oc1ccc(Cl)cc1)Oc1ccc(Cl)cc1 QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N 0.000 description 4
- ZWEHNKRNPOVVGH-UHFFFAOYSA-N 2-Butanone Chemical compound CCC(C)=O ZWEHNKRNPOVVGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-ZSJDYOACSA-N Heavy water Chemical compound [2H]O[2H] XLYOFNOQVPJJNP-ZSJDYOACSA-N 0.000 description 4
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000002841 Lewis acid Substances 0.000 description 4
- OPFJDXRVMFKJJO-ZHHKINOHSA-N N-{[3-(2-benzamido-4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-pyrazol-5-yl]carbonyl}-G-dR-G-dD-dD-dD-NH2 Chemical compound S1C(C=2NN=C(C=2)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CCCN=C(N)N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(N)=O)=C(C)N=C1NC(=O)C1=CC=CC=C1 OPFJDXRVMFKJJO-ZHHKINOHSA-N 0.000 description 4
- LNUFLCYMSVYYNW-ZPJMAFJPSA-N [(2r,3r,4s,5r,6r)-2-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[[(3s,5s,8r,9s,10s,13r,14s,17r)-10,13-dimethyl-17-[(2r)-6-methylheptan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1h-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-4,5-disulfo Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1C[C@@H]2CC[C@H]3[C@@H]4CC[C@@H]([C@]4(CC[C@@H]3[C@@]2(C)CC1)C)[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H]1O[C@H](COS(O)(=O)=O)[C@@H](OS(O)(=O)=O)[C@H](OS(O)(=O)=O)[C@H]1OS(O)(=O)=O LNUFLCYMSVYYNW-ZPJMAFJPSA-N 0.000 description 4
- 125000000738 acetamido group Chemical group [H]C([H])([H])C(=O)N([H])[*] 0.000 description 4
- KGNDCEVUMONOKF-UGPLYTSKSA-N benzyl n-[(2r)-1-[(2s,4r)-2-[[(2s)-6-amino-1-(1,3-benzoxazol-2-yl)-1,1-dihydroxyhexan-2-yl]carbamoyl]-4-[(4-methylphenyl)methoxy]pyrrolidin-1-yl]-1-oxo-4-phenylbutan-2-yl]carbamate Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1CO[C@H]1CN(C(=O)[C@@H](CCC=2C=CC=CC=2)NC(=O)OCC=2C=CC=CC=2)[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)(O)C=2OC3=CC=CC=C3N=2)C1 KGNDCEVUMONOKF-UGPLYTSKSA-N 0.000 description 4
- 125000000649 benzylidene group Chemical group [H]C(=[*])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 4
- 229940125773 compound 10 Drugs 0.000 description 4
- 229940125797 compound 12 Drugs 0.000 description 4
- 229940126086 compound 21 Drugs 0.000 description 4
- 229940126208 compound 22 Drugs 0.000 description 4
- 229940125833 compound 23 Drugs 0.000 description 4
- ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N jdtic Chemical compound C1([C@]2(C)CCN(C[C@@H]2C)C[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]2NCC3=CC(O)=CC=C3C2)=CC=CC(O)=C1 ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N 0.000 description 4
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 4
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 4
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000009518 sodium iodide Nutrition 0.000 description 4
- JRMUNVKIHCOMHV-UHFFFAOYSA-M tetrabutylammonium bromide Chemical compound [Br-].CCCC[N+](CCCC)(CCCC)CCCC JRMUNVKIHCOMHV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- GLGNXYJARSMNGJ-VKTIVEEGSA-N (1s,2s,3r,4r)-3-[[5-chloro-2-[(1-ethyl-6-methoxy-2-oxo-4,5-dihydro-3h-1-benzazepin-7-yl)amino]pyrimidin-4-yl]amino]bicyclo[2.2.1]hept-5-ene-2-carboxamide Chemical compound CCN1C(=O)CCCC2=C(OC)C(NC=3N=C(C(=CN=3)Cl)N[C@H]3[C@H]([C@@]4([H])C[C@@]3(C=C4)[H])C(N)=O)=CC=C21 GLGNXYJARSMNGJ-VKTIVEEGSA-N 0.000 description 3
- WWTBZEKOSBFBEM-SPWPXUSOSA-N (2s)-2-[[2-benzyl-3-[hydroxy-[(1r)-2-phenyl-1-(phenylmethoxycarbonylamino)ethyl]phosphoryl]propanoyl]amino]-3-(1h-indol-3-yl)propanoic acid Chemical compound N([C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)O)C(=O)C(CP(O)(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)OCC=1C=CC=CC=1)CC1=CC=CC=C1 WWTBZEKOSBFBEM-SPWPXUSOSA-N 0.000 description 3
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical group [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 3
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 3
- UIIMBOGNXHQVGW-DEQYMQKBSA-M Sodium bicarbonate-14C Chemical class [Na+].O[14C]([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-DEQYMQKBSA-M 0.000 description 3
- DRUIESSIVFYOMK-UHFFFAOYSA-N Trichloroacetonitrile Chemical compound ClC(Cl)(Cl)C#N DRUIESSIVFYOMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZBIKORITPGTTGI-UHFFFAOYSA-N [acetyloxy(phenyl)-$l^{3}-iodanyl] acetate Chemical compound CC(=O)OI(OC(C)=O)C1=CC=CC=C1 ZBIKORITPGTTGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 3
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 3
- 229920001429 chelating resin Polymers 0.000 description 3
- 229940125758 compound 15 Drugs 0.000 description 3
- 229940125782 compound 2 Drugs 0.000 description 3
- 229940126214 compound 3 Drugs 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 3
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 3
- 230000009916 joint effect Effects 0.000 description 3
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N sodium cyanoborohydride Chemical compound [Na+].[B-]C#N BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- AKHNMLFCWUSKQB-UHFFFAOYSA-L sodium thiosulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=S AKHNMLFCWUSKQB-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 235000019345 sodium thiosulphate Nutrition 0.000 description 3
- SEDZOYHHAIAQIW-UHFFFAOYSA-N trimethylsilyl azide Chemical compound C[Si](C)(C)N=[N+]=[N-] SEDZOYHHAIAQIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000007923 virulence factor Effects 0.000 description 3
- 239000000304 virulence factor Substances 0.000 description 3
- AOSZTAHDEDLTLQ-AZKQZHLXSA-N (1S,2S,4R,8S,9S,11S,12R,13S,19S)-6-[(3-chlorophenyl)methyl]-12,19-difluoro-11-hydroxy-8-(2-hydroxyacetyl)-9,13-dimethyl-6-azapentacyclo[10.8.0.02,9.04,8.013,18]icosa-14,17-dien-16-one Chemical compound C([C@@H]1C[C@H]2[C@H]3[C@]([C@]4(C=CC(=O)C=C4[C@@H](F)C3)C)(F)[C@@H](O)C[C@@]2([C@@]1(C1)C(=O)CO)C)N1CC1=CC=CC(Cl)=C1 AOSZTAHDEDLTLQ-AZKQZHLXSA-N 0.000 description 2
- RZJGKPNCYQZFGR-UHFFFAOYSA-N 1-(bromomethyl)naphthalene Chemical compound C1=CC=C2C(CBr)=CC=CC2=C1 RZJGKPNCYQZFGR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MOHYOXXOKFQHDC-UHFFFAOYSA-N 1-(chloromethyl)-4-methoxybenzene Chemical compound COC1=CC=C(CCl)C=C1 MOHYOXXOKFQHDC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940126657 Compound 17 Drugs 0.000 description 2
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N Hydrazine Chemical compound NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-PQMKYFCFSA-N L-Fucose Natural products C[C@H]1O[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-PQMKYFCFSA-N 0.000 description 2
- 241000209094 Oryza Species 0.000 description 2
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical class [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YFHNDHXQDJQEEE-UHFFFAOYSA-N acetic acid;hydrazine Chemical compound NN.CC(O)=O YFHNDHXQDJQEEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960004821 amikacin Drugs 0.000 description 2
- LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N amikacin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](N)C[C@H]([C@@H]([C@H]1O)O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)NC(=O)[C@@H](O)CCN)[C@H]1O[C@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N 0.000 description 2
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 2
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 2
- XRWSZZJLZRKHHD-WVWIJVSJSA-N asunaprevir Chemical compound O=C([C@@H]1C[C@H](CN1C(=O)[C@@H](NC(=O)OC(C)(C)C)C(C)(C)C)OC1=NC=C(C2=CC=C(Cl)C=C21)OC)N[C@]1(C(=O)NS(=O)(=O)C2CC2)C[C@H]1C=C XRWSZZJLZRKHHD-WVWIJVSJSA-N 0.000 description 2
- AGEZXYOZHKGVCM-UHFFFAOYSA-N benzyl bromide Chemical compound BrCC1=CC=CC=C1 AGEZXYOZHKGVCM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UORVGPXVDQYIDP-UHFFFAOYSA-N borane Chemical compound B UORVGPXVDQYIDP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940125810 compound 20 Drugs 0.000 description 2
- 229940125961 compound 24 Drugs 0.000 description 2
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- YWWZCHLUQSHMCL-UHFFFAOYSA-N diphenyl diselenide Chemical compound C=1C=CC=CC=1[Se][Se]C1=CC=CC=C1 YWWZCHLUQSHMCL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 description 2
- 229930182470 glycoside Natural products 0.000 description 2
- 125000003147 glycosyl group Chemical group 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- JAXFJECJQZDFJS-XHEPKHHKSA-N gtpl8555 Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@H](B1O[C@@]2(C)[C@H]3C[C@H](C3(C)C)C[C@H]2O1)CCC1=CC=C(F)C=C1 JAXFJECJQZDFJS-XHEPKHHKSA-N 0.000 description 2
- 239000005457 ice water Substances 0.000 description 2
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 2
- 150000007517 lewis acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- UKVIEHSSVKSQBA-UHFFFAOYSA-N methane;palladium Chemical compound C.[Pd] UKVIEHSSVKSQBA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 2
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 2
- PIBWKRNGBLPSSY-UHFFFAOYSA-L palladium(II) chloride Chemical compound Cl[Pd]Cl PIBWKRNGBLPSSY-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- KOUKXHPPRFNWPP-UHFFFAOYSA-N pyrazine-2,5-dicarboxylic acid;hydrate Chemical compound O.OC(=O)C1=CN=C(C(O)=O)C=N1 KOUKXHPPRFNWPP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 2
- NDVLTYZPCACLMA-UHFFFAOYSA-N silver oxide Chemical compound [O-2].[Ag+].[Ag+] NDVLTYZPCACLMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910000104 sodium hydride Inorganic materials 0.000 description 2
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical class O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 2
- DPKBAXPHAYBPRL-UHFFFAOYSA-M tetrabutylazanium;iodide Chemical compound [I-].CCCC[N+](CCCC)(CCCC)CCCC DPKBAXPHAYBPRL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZBQKPDHUDKSCRS-UHFFFAOYSA-N $l^{1}-oxidanyl acetate Chemical group CC(=O)O[O] ZBQKPDHUDKSCRS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VSTXCZGEEVFJES-UHFFFAOYSA-N 1-cycloundecyl-1,5-diazacycloundec-5-ene Chemical compound C1CCCCCC(CCCC1)N1CCCCCC=NCCC1 VSTXCZGEEVFJES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UPQQXPKAYZYUKO-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trichloroacetamide Chemical compound OC(=N)C(Cl)(Cl)Cl UPQQXPKAYZYUKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RUHJZSZTSCSTCC-UHFFFAOYSA-N 2-(bromomethyl)naphthalene Chemical compound C1=CC=CC2=CC(CBr)=CC=C21 RUHJZSZTSCSTCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003504 2-oxazolinyl group Chemical group O1C(=NCC1)* 0.000 description 1
- 206010010356 Congenital anomaly Diseases 0.000 description 1
- 201000003883 Cystic fibrosis Diseases 0.000 description 1
- YVECGMZCTULTIS-HSUXUTPPSA-N D-galactal Chemical compound OC[C@H]1OC=C[C@@H](O)[C@H]1O YVECGMZCTULTIS-HSUXUTPPSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 1
- 208000008745 Healthcare-Associated Pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 239000005909 Kieselgur Substances 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 108010040201 Polymyxins Proteins 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 241000801924 Sena Species 0.000 description 1
- 201000001880 Sexual dysfunction Diseases 0.000 description 1
- KEAYESYHFKHZAL-UHFFFAOYSA-N Sodium Chemical compound [Na] KEAYESYHFKHZAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical class [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- AZFNGPAYDKGCRB-XCPIVNJJSA-M [(1s,2s)-2-amino-1,2-diphenylethyl]-(4-methylphenyl)sulfonylazanide;chlororuthenium(1+);1-methyl-4-propan-2-ylbenzene Chemical compound [Ru+]Cl.CC(C)C1=CC=C(C)C=C1.C1=CC(C)=CC=C1S(=O)(=O)[N-][C@@H](C=1C=CC=CC=1)[C@@H](N)C1=CC=CC=C1 AZFNGPAYDKGCRB-XCPIVNJJSA-M 0.000 description 1
- YVBSAPDHRXHFHV-UHFFFAOYSA-N [chloro(methoxy)methyl]benzene Chemical compound COC(Cl)C1=CC=CC=C1 YVBSAPDHRXHFHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TUCNEACPLKLKNU-UHFFFAOYSA-N acetyl Chemical compound C[C]=O TUCNEACPLKLKNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007259 addition reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-DPYQTVNSSA-N aldehydo-D-fucose Chemical group C[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-DPYQTVNSSA-N 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 230000007924 bacterial virulence factor Effects 0.000 description 1
- 239000004305 biphenyl Substances 0.000 description 1
- 235000010290 biphenyl Nutrition 0.000 description 1
- 125000006267 biphenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229910000085 borane Inorganic materials 0.000 description 1
- XTEOJPUYZWEXFI-UHFFFAOYSA-N butyl n-[3-[4-(imidazol-1-ylmethyl)phenyl]-5-(2-methylpropyl)thiophen-2-yl]sulfonylcarbamate Chemical compound S1C(CC(C)C)=CC(C=2C=CC(CN3C=NC=C3)=CC=2)=C1S(=O)(=O)NC(=O)OCCCC XTEOJPUYZWEXFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 229940041011 carbapenems Drugs 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- GCFBRXLSHGKWDP-XCGNWRKASA-N cefoperazone Chemical compound O=C1C(=O)N(CC)CCN1C(=O)N[C@H](C=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2C(C(O)=O)=C(CSC=3N(N=NN=3)C)CS[C@@H]21 GCFBRXLSHGKWDP-XCGNWRKASA-N 0.000 description 1
- 229960004682 cefoperazone Drugs 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 229910001873 dinitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002170 ethers Chemical class 0.000 description 1
- 210000003495 flagella Anatomy 0.000 description 1
- 229940124307 fluoroquinolone Drugs 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 238000005858 glycosidation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000002338 glycosides Chemical group 0.000 description 1
- 239000000348 glycosyl donor Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000004896 high resolution mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- XELZGAJCZANUQH-UHFFFAOYSA-N methyl 1-acetylthieno[3,2-c]pyrazole-5-carboxylate Chemical compound CC(=O)N1N=CC2=C1C=C(C(=O)OC)S2 XELZGAJCZANUQH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 244000039328 opportunistic pathogen Species 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N phenol group Chemical group C1(=CC=CC=C1)O ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N phenylbenzene Natural products C1=CC=CC=C1C1=CC=CC=C1 ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 230000002980 postoperative effect Effects 0.000 description 1
- 239000004304 potassium nitrite Substances 0.000 description 1
- 235000010289 potassium nitrite Nutrition 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003223 protective agent Substances 0.000 description 1
- 238000007342 radical addition reaction Methods 0.000 description 1
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000010992 reflux Methods 0.000 description 1
- 238000012827 research and development Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 229910001923 silver oxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000012312 sodium hydride Substances 0.000 description 1
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002277 temperature effect Effects 0.000 description 1
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001889 triflyl group Chemical group FC(F)(F)S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- PQDJYEQOELDLCP-UHFFFAOYSA-N trimethylsilane Chemical compound C[SiH](C)C PQDJYEQOELDLCP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000019206 urinary tract infection Diseases 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H15/00—Compounds containing hydrocarbon or substituted hydrocarbon radicals directly attached to hetero atoms of saccharide radicals
- C07H15/02—Acyclic radicals, not substituted by cyclic structures
- C07H15/04—Acyclic radicals, not substituted by cyclic structures attached to an oxygen atom of the saccharide radical
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/104—Pseudomonadales, e.g. Pseudomonas
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/715—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
- A61K31/738—Cross-linked polysaccharides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H1/00—Processes for the preparation of sugar derivatives
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H3/00—Compounds containing only hydrogen atoms and saccharide radicals having only carbon, hydrogen, and oxygen atoms
- C07H3/06—Oligosaccharides, i.e. having three to five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2/00—Peptides of undefined number of amino acids; Derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
Abstract
Description
式中、リンカーは、-(CH2)n-N-Y1Y2、またはO-(CH2)n-SY1(Y2)、またはO-(CH2)n-N3を含み、n=1~10であり、Y1は水素(H)またはベンジル(Bn)であり、Y2は水素(H)またはベンジルオキシカルボニル(ベンジルメトキシカルボニル)(Cbz)である;R1は、水素(H)、エステル、アセチル(Ac)、ベンゾイル(Bz)、ピバロイル(Piv)、クロルアセチル(ClAc)、レブリニル(Lev、Levulinyl)、及びアリルオキシカルボニル(Alloc)を含むが、これらに限られていない;R2、R3、及びR4は、水素(H)またはエステル、エーテルであり、アセチル(Ac)、ベンゾイル(Bz)、ピバロイル(Piv)、クロルアセチル(ClAc)、レブリニル(Lev)、アリルオキシカルボニル(Alloc)およびベンジル(Bn)、p-メトキシベンジル(pMBn)、アリル(All)、トリチル(Tr)、モノメトキシトリチル(Mmt)、及びシリルエーテル基を含むが、これらに限られていない;R5およびR6は、水素(H)、エーテル基、ベンジル(Bn)、p-メトキシベンジル(pMBn)、アリル(All)、トリチル(Tr)、モノメトキシトリチル(Mmt)、及びシリルエーテル基を含むが、これらに限られていない;R7、R8、R9、およびR10は、水素(H)、窒素(N)またはアセチル(Ac)を含む。
式中、Rは-(CH2)n-NH2、またはO-(CH2)n-SHであり、n=1~10である。
(式中、Rは-(CH2)n-NH2、またはO-(CH2)n-SHであり、n=1~10である)
に示される化学構造を有するO抗原三糖前駆体を予め合成し、還元によりO抗原三糖を得ることを含む。
アミノ連結アームが組み立てられた、緑膿菌のO11血清型O抗原三糖の構造は下記通りである:
式中、Rは-(CH2)n-NH2であり、n=1~10である。
糖ビルディングブロック3(D-グルコースビルディングブロック)の合成(図1参照)
図1に示されるように、ペルアセチル化グルコース1を出発原料として使用し、乾燥したN,N-ジメチルホルムアミド中で酢酸ヒドラジン(NH2-NH2-AcOH)によって選択的に加水分解したことにより1位のアセチルを除去した。得られた1-OHグルコース2を使用して、トリクロロアセトニトリル(Cl3CN)と1,8-ジアザビシクロウンデク-7-エン(DBU)を使用して、無水ジクロロメタン中でグルコシルトリクロロアセトイミデート3を生成した。
具体的な試験操作とステップ:
化合物2:ペルアセチル化グルコース1(5.0g、12.8mmоl)を無水DMF(65ml)に溶解し、酢酸ヒドラジン(1.45g、15.6mmоl)を加えた。反応物を40℃で6時間撹拌し、反応物の消失をTLCによってモニタリングした。反応液を室温まで冷却し、飽和NaCl溶液で洗浄し、有機相を分離し、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、2:1)で精製して、化合物2(3.9g、11.2mmоl)を得た。この化合物の同定データは、関連文献で報告されている。
化合物3:化合物2(1.1g、3.16mmоl)を無水DCM(30ml)に溶解し、0℃に冷却した。Cl3CN(3.2ml、31.6mmоl)およびDBU(0.45ml、0.3mmоl)を反応液に順次加え、反応物を氷浴中で4時間撹拌し、反応原料の消失をTLCでモニタリングした。反応液を室温に戻し、飽和NaHCO3で抽出し、有機相を分離し、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、4:1)で精製して、化合物3(1.3g、2.8mmоl)を得た。この化合物の同定データは、関連文献で報告されている。
糖ビルディングブロック7(L-フコースビルディングブロック)の合成ルート(図2参照)
図2に示されるように、アリル-2-デオキシ-2-アジド-L-フコシド4を出発原料として使用し、3位と4位のアセチルをメトキシドナトリウムを含むアルカリ性環境下で除去し、得られたジヒドロキシ化合物を、ジブチルスズオキシドとブロモメチルナフタレンの作用下で4位でNap基で選択的に保護することにより化合物5を取得し、3-Nap化合物5のヒドロキシルをベンジルで保護して化合物6を生成した。最後に、化合物6のNap基をDDQで除去して3-OH化合物7を得た。
具体的な試験操作とステップ:
化合物5:アリル-2-デオキシ-2-アジド-L-フコシド4(500mg、2.2mmоl)を無水トルエン(22ml)に溶解し、次にジブチルスズオキシド(814mg、3.3mmol)を加えた。反応液を110℃に加熱し、1時間撹拌した後、反応液を40℃に冷却し、ブロモメチルナフタレン(814mg、3.3mmol)および臭化テトラブチルアンモニウム(1.05mg、3.3mmol)を加えて反応を20時間継続した。反応が完了した後、酢酸エチル(30ml)を加えて希釈し、飽和食塩水で洗浄した。有機相を分離し、濃縮後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、5:1)で精製して化合物5(527mg、1.7mmоl、79%)を得た。[α]D 20= 34.0°( c = 1.00, CHCl3); 1H NMR (400 MHz, Chloroform-d ) δ 7.85 (dt, J = 10.5, 7.7 Hz, 4H, Ar-H), 7.59 - 7.45 (m, 3H, Ar-H), 5.94 (ddt, J = 16.8, 10.9, 5.6 Hz, 1H, Ally-H), 5.33 (dd, J = 17.2, 1.7 Hz, 1H, Ally-CH2a), 5.21 (dd, J = 10.5, 1.5 Hz, 1H, Ally-CH2b), 4.88 (s, 2H, 2Nap-H), 4.12 (dd, J = 12.9, 6.2 Hz, 1H, Ally-H), 4.23 (d, J = 8.1 Hz, 1H, 1-H), 4.12 (dd, J= 12.9, 6.2 Hz, 1H, Ally-OCH2b), 3.74 (d, J = 3.3 Hz, 1H, 4-H), 3.66 (dd, J= 10.0, 8.0 Hz, 1H, 2-H), 3.47 (q, J = 6.5 Hz, 1H, 5-H), 3.35 (dd, J = 10.0, 3.3 Hz, 1H, 3-H), 2.32 (s, 1H, 4-OH), 1.34 (d, J = 6.4 Hz, 6-CH3). 13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 134.65, 133.65, 133.20, 128.55, 127.93, 127.77, 126.98, 126.33, 126.22, 125.75, 117.61, 100.75, 79.41, 77.33, 77.22, 77.01, 76.70, 72.19, 70.19, 69.97, 68.34, 62.57, 16.33. HRMS(ESI)m/z calcd for C20H23N3O4Na[M+Na]+ 391.1581, found 391.1564。
化合物6:化合物5(527mg、1.7mmоl)を無水DMF(17ml)に溶解し、0℃に冷却し、30分間氷浴した。NaH(140mg、3.4mmоl)を反応フラスコに加え、0℃で30分間撹拌し続け、臭化ベンジル(0.5ml、3.4mmоl)を加えた。反応液を室温に戻し、3時間撹拌を続け、反応原料がすべて消失した後、DCM(20ml)を加えて希釈し、氷水で反応をクエンチした。飽和NaHCO3で3回洗浄し、有機相を合わせ、濃縮後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、25:1)で精製し、化合物6(531mg、1.2mmоl、68%)を得た。[α]D 20 = 50.3°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.90 - 7.77 (m, 4H, Ar-H), 7.57 - 7.45 (m, 3H, Ar-H), 7.38 - 7.21 (m, 6H, Ar-H), 5.94 (dddd, J = 16.9, 10.8, 6.1, 5.0 Hz, 1H, Ally-H), 5.32 (dt, J= 17.2, 1.7 Hz, 1H, Ally-H), 5.19 (dq, J= 10.5, 1.5 Hz, 1H, Ally-H), 4.97 (d, J= 11.7 Hz, 1H, PhCH), 4.87 (s, 2H, 2Nap-H) 4.71 (d, J = 11.7 Hz, 1H, PhCH-H), 4.39 (ddt, J = 12.9, 5.0, 1.6 Hz, 1H, Ally-H), 4.22 (d, J = 8.0 Hz, 1H, 1-H), 4.10 (ddt, J = 12.9, 6.1, 1.4 Hz, 1H, Ally-H), 3.87 (dd, J = 10.4, 8.0 Hz, 1H, 2-H ), 3.55 (d, J = 2.8 Hz, 1H, 4-H), 3.42 - 3.38 (m, 1H, 5-H ), 3.36 (dd, J = 10.4, 2.8 Hz, 1H, 3-H), 1.20 (d, J = 6.4 Hz, 3H, 6-CH3)
13C NMR (101 MHz, Chloroform-d) δ 138.38 , 135.34 , 133.93 , 133.38 , 133.23 , 128.55 , 128.48 , 128.36 , 128.07 , 127.89 , 127.83 , 126.79 , 126.38 , 126.21 , 125.90 , 117.58 , 101.11 , 81.07(C-1) , 75.17 , 74.85 , 72.87 , 70.74 , 70.07 , 63.31 , 17.02 . HRMS(ESI)m/z calcd for C27H29N3O4Na[M+Na]+ 482.2050, found 482.2041。
化合物7:化合物6(531mg、1.16mmоl)をジクロロメタン(50ml)と水(5ml)の混合溶媒に溶解し、反応液を0℃に冷却し、DDQ(540mg、2.32mmоl)を加えた。反応液を室温で2時間撹拌し、すべての原料が完全に反応したことをTLCでモニタリングした後、反応液を10%Na2S2O3で洗浄し、有機相を分離し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させて濃縮し、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、3:1)で精製して化合物7(325mg、0.96mmоl、85%)を得た。[α]D 20 = -3.6°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.42 - 7.28 (m, 5H, Ar-H), 5.94 (dddd, J= 16.7, 10.4, 6.1, 5.1 Hz, 1H, Ally-H), 5.33 (dq, J = 17.2, 1.6 Hz, 1H, Ally-H), 5.21 (dq, J = 10.5, 1.4 Hz, 1H, Ally-H), 4.81 (d, J = 11.6 Hz, 1H, Bn-H), 4.72 (d, J = 11.6 Hz, 1H, Bn-H), 4.41 (ddt, J = 12.9, 5.1, 1.6 Hz, 1H, Ally-H), 4.26 (d, J = 7.7 Hz, 1H, 1-H), 4.11 (ddt, J = 12.9, 6.1, 1.4 Hz, 1H, Ally-H), 3.58 - 3.49 (m, 3H, 2-H,4-H, 5-H), 3.45 (dd, J = 10.4, 3.3 Hz, 1H, 3-H), 2.14 (s, 1H, -OH), 1.31 (d, J = 6.5 Hz, 3H, 6-Me)。13C NMR (101 MHz, Chloroform-d) δ 138.02 , 133.75 , 128.68 , 128.30 , 128.18 , 117.63 , 101.11 , 78.60 , 76.04 , 73.12 , 70.95 , 70.17 , 64.73 , 17.01 。HRMS(ESI)m/z calcd for C16H21N3O4Na[M+Na]+ 342.1424, found 342.1430。
糖ビルディングブロック17の合成ルート(図3参照)
図3に示されるように、3,4,6-トリ-O-アセチル-マンノセン8を出発原料として、ヨードベンゼンジアセテート(PhI(OAc)2)、アジドトリメチルシラン(TMS-N3)、およびジフェニルジセレニド(Ph2Se2)と付加反応して、1-セレノフェニル-2-アジド化合物9を取得した。化合物9の3つのアセチルをメタノールとメトキシドナトリウムで除去し、6位のヒドロキシルを4-トルエンスルホニルクロリド(TsCl)で選択的に保護し化合物10を得た。次に、6-Tsグルコース10のTs基をヨウ化ナトリウムによってヨウ素化し、そして6位をシアノ水素化ホウ素ナトリウム(NaCNBH3)でメチルに還元してD-フコース化合物11を得た。D-フコース化合物の3位をp-メトキシベンジルクロリド(PMBCI)とジブチルスズオキシド(Bu2SnO)で選択的に保護して化合物12を得てから、4位のヒドロキシルをベンジルで保護して化合物13を得た。化合物13の4位NapをDDQで除去し、アセチルで保護して化合物14を得た。化合物14の1位のセレノフェニルを臭化テトラブチルアンモニウム(NBS)によって加水分解し、そして1-OHフコースをCl3CNとDBUによってグリコシルトリクロロアセトイミデートドナー15にした。次に、化合物15を、トリフルオロメタンスルホン酸トリメチルシリルの促進下で3炭素連結アームと反応させて、結合アームが組み立てられたフコース化合物16を得た。最後に、化合物16のアセチルをメタノールおよびナトリウムメトキシドのアルカリ性環境で除去して、糖ビルディングブロック17を得た。
具体的な試験操作とステップ:
化合物9:ガラクタール化合物8(2.0g、7.35mmоl)を無水ジクロロメタン(35ml)に溶解し、次に-30℃に冷却した。アルゴンガスの保護下で、ヨードベンゼンジアセテート(2.4g、7.35mmоl)とアジドトリメチルシラン(1.8ml、14.7mmоl)を加え、-30℃で0.5時間撹拌し続け、その後ゆっくりと室温に戻し、3時間撹拌を続けた後、原料が完全に反応したことをTLCでモニタリングした。反応液を飽和NaHCO3(20ml)で3回洗浄し、有機相を分離し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させてろ過し、濾液をスピン乾燥した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、6:1)で精製して化合物9(2.4g、5.15mmоl、70%)を得た。[α]D 20= 931.7°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.78 - 7.11 (m, 5H, Ar-H), 6.01 (d, J = 5.4 Hz, 1H, H-1), 5.47 (dd, J = 3.4, 1.4 Hz, 1H, 4-H), 5.12 (dd, J = 10.9, 3.3 Hz, 1H, 3-H), 4.67 (ddd, J = 7.1, 5.8, 1.3 Hz, 1H, 5-H), 4.26 (dd, J = 10.9, 5.4 Hz, 1H, 2-H), 4.08 (dd, J = 11.5, 5.9 Hz, 1H, 6a-H), 4.02 (dd, J = 11.4, 7.1 Hz, 1H, 6b-H), 2.15 (s, 3H, COCH3), 2.07 (s, 3H, COCH3), 1.98 (s, 3H, COCH3).13C NMR (101 MHz, Chloroform-d): δ 169.93 , 137.08 , 135.12 , 129.91 , 129.19 , 128.56 , 128.23 , 128.04 , 127.97 , 84.44 , 77.22 , 75.34 , 73.68 , 73.44 , 70.09 , 67.05 , 58.99 , 21.67 , 20.83。HRMS(ESI)m/z calcd for C18H21N3NaO7Se[M+Na]+494.0442。
化合物10:化合物9(0.5g、1.1mmоl)をメタノール(2.2ml)に溶解し、ナトリウムメトキシド(29mg、0.5mmоl)を加えた。反応液を室温で2時間撹拌し、TLC検出により、原料が完全に反応したことが示された。反応液を水素型Amberlite IR120樹脂で約7に中和した。樹脂をろ過し、溶剤をスピン乾燥した。
前のステップの粗生成物を無水ピリジン(8ml)に溶解し、アルゴンガスの保護下でTsCl(253mg、1.3mmоl)を加えた。反応液を室温で12時間撹拌し、原料の完全な反応をTLCにより検出した。反応液をDCMで希釈し、1M塩酸で洗浄した後、飽和重炭酸ナトリウムで抽出した。有機相を合わせ、無水ナトリウムで乾燥して濃縮した後、シリカゲルカラム(ジクロロメタン/メタノール、200:1)で精製して化合物10(384mg、077mmоl、70%)を得た。[α]D 20 = 133.6°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.72 (d, J = 8.3 Hz, 2H, Ar-H), 7.58 (dt, J = 6.7, 1.6 Hz, 2H, Ar-H), 7.36 - 7.23 (m, 6H, Ar-H), 5.86 (d, J = 5.3 Hz, 1H, H-1), 4.57 - 4.50 (m, 1H, 5-H), 4.29 (dd, J= 10.6, 6.0 Hz, 1H, 6a ), 4.10 - 3.93 (m, 3H, H-2, H-4, 6b-H), 3.78 (ddd, J = 9.8, 6.0, 3.3 Hz, 1H, H-3), 2.68 (dd, J = 6.5, 4.8 Hz, 2H, 3-OH, 4-OH), 2.44 (s, 3H, PhCH3)。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 145.20, 135.04, 132.36, 132.11, 132.01, 129.94, 129.24, 128.78, 128.66, 128.24, 128.00, 127.67, 84.62, 77.34, 77.22, 77.02, 76.70, 70.62, 69.97, 67.87, 67.55, 61.57, 21.68。HRMS(ESI)m/z calcd for C19H21N3NaO5SSe[M+Na]+506.0265。
化合物11:アルゴンガスの保護下で、化合物10(380mg、0.76mmоl)を2-ブタノン(9.6ml)に溶解し、ヨウ化ナトリウム(568mg、3.8mmоl)を加えた。反応液を80℃で12時間撹拌し、原料が完全に反応したことをTLCで検出した。反応液を室温に戻し、酢酸エチル(10ml)を加えて希釈し、10%チオ硫酸ナトリウムで2回洗浄し、水で2回洗浄し、有機相を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。濃縮後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、4:1)で精製して新しい化合物(259mg、0.57mmоl、75%)を得た。[α]D 20 = 317.6°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.61 - 7.43 (m, 4H, Ar-H), 7.39 - 7.12 (m, 6H, Ar-H), 5.96 (d, J = 5.3 Hz, 1H, 1-H), 4.44 - 4.33 (m, 1H, 5-H), 4.22 (d, J = 3.7 Hz, 1H, 4-H), 4.09 (dd, J = 10.2, 5.3 Hz, 1H, 2-H), 3.79 (ddd, J = 9.9, 6.1, 3.3 Hz, 1H, 3-H), 3.17 (dd, J= 12.7, 8.2 Hz, 1H, 6-Ha), 3.06 (dd, J = 12.7, 6.0 Hz, 1H, 6-Hb), 2.75 (d, J = 6.2 Hz, 1H, 3-OH), 2.45 (d, J = 3.9 Hz, 1H, 4-OH)。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 134.58, 132.92, 132.87, 132.81, 129.49, 129.32, 129.28, 129.18, 128.19, 127.97, 127.46, 85.04, 84.62, 77.36, 77.25, 77.04, 76.73, 72.32, 71.32, 68.93, 61.71, 26.94。HRMS(ESI)m/z calcd for C12H14IN3NaO3Se [M+Na]+ 477.9143。
アルゴンガスの保護下で、新しい化合物をDMF(2ml)に溶解し、シアノ水素化ホウ素ナトリウム(48mg、0.75mmоl)を加えた。反応液を95℃で12時間撹拌し、原料が完全に反応したことをTLCで検出した。反応液を室温に戻し、反応液を水と酢酸エチルで洗浄し、有機相を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。濃縮後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、2:1)で精製して化合物11(35mg、0.1mmоl、70%)を得た。[α]D 20 =259.4°( c = 1.00, CHCl3)。1HNMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.73 - 7.45 (m, 2H, Ar-H), 7.40 - 6.93 (m, 3H, Ar-H), 5.92 (d, J = 5.3 Hz, 1H, H-1), 4.39 (dt, J = 7.4, 6.0 Hz, 1H, 5-H), 4.05 (dd, J = 10.0, 5.3 Hz, 1H, 2-H), 3.91 - 3.74 (m, 2H, H-3. 4-H), 2.60 (d, J = 6.3 Hz, 1H, 3-OH), 2.26 (d, J = 4.0 Hz, 1H, 4-OH), 1.27 (d, J = 6.6 Hz, 3H, 6-CH3). 13C NMR (101 MHz, Chloroform-d) δ 134.48 , 129.15 , 127.90 , 85.00 , 77.22 , 71.46 , 71.29 , 68.69 , 61.88 , 15.98。HRMS(ESI)m/z calcd for C12H15N3NaO3Se [M+Na]+346.0230, found 346.0226。
化合物12:化合物11(3.0g、9.1mmоl)を無水トルエン(54ml)に溶解し、アルゴンガスの保護下で、Bu2SnO(3.5g、13.7mmоl)を加えた。反応液を118℃に加熱し、撹拌しながら1.5時間還流した。そして、反応液を60℃に冷却し、PMBCl(1.9ml、13.7mmоl)とTBAI(5.1g、13.7mmоl)を加え、2時間撹拌し続けた。反応液を室温に冷却して、酢酸エチル(80ml)を加えて希釈し、水(100ml)で2回洗浄し、有機相を分離し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。濾液を濃縮した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、6:1)で精製して化合物12(2.7g、6mmоl、66%)を得た。[α]D 20= 137.9°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.26 (s, 11H,Ar-H), 5.88 (d, J = 5.4 Hz, 1H,H-1), 4.70 (d, J = 11.0 Hz, 1H, Bn-H),4.63 (d, J = 11.0 Hz, 1H, Bn-H), 4.36 - 4.24 (m, 1H, 5-H), 4.15 (dd, J = 10.2, 5.3Hz, 1H, 2-H), 3.86 (dt, J = 3.2, 1.5 Hz, 1H, 4-H), 3.82 (s, 3H, Me-H), 3.69 (dd, J = 10.2, 3.2 Hz, 1H, 3-H), 2.35 (t, J = 1.6 Hz, 1H, 4-OH), 1.26 (d, J = 6.6 Hz, 3H, 6-Me). 13C NMR (101 MHz, Chloroform-d) δ 159.74 , 134.40 , 129.75 , 129.10 , 129.08 , 127.75 , 114.14 , 85.28 , 78.85 , 71.84 , 68.61 , 68.55 , 60.18 , 55.31 , 16.05 。HRMS(ESI)m/z calcd for C20H23N3O4SeNa[M+Na]+472.0751, found 472.0725。
化合物13:化合物12(2.2g、4.9mmоl)をDMF(30ml)に溶解し、0℃で30分間撹拌し、水素化ナトリウム(396mg、9.8mmоl)をアルゴンガスの保護下でゆっくりと加えた。氷浴中で30分間撹拌を続け、臭化ベンジル(1.2ml、9.8mmоl)を反応液に滴加した。2時間撹拌して反応させ、すべての原料が完全に反応したことをTLCで検出した後、氷水を加えることによって反応をクエンチし、反応液をDCMで希釈し、抽出後に無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。濃縮液をシリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、30:1)で精製して化合物13(1.9g、3.6mmоl、74%)を得た。[α]D 20 = 71.5°( c = 1.00, CHCl3)。1HNMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.57 - 7.55 (m , 2H, Ar-H), 7.36 - 7.25 (m , 10H, Ar-H), 6.94 - 6.91 (m , 2H, Ar-H), 5.92 (d, J = 5.3 Hz, 1H, H-1), 4.94 (d, J = 11.4 Hz, 1H , PhCH), 4.77 - 4.66 (m, 2H, PhCH2), 4.60 (d, J = 11.5 Hz, 1H, PhCH ), 4.33 (dd, J = 10.2, 5.3 Hz, 1H, H-2), 4.21 (q, J = 6.5 Hz, 1H, H-5), 3.83 (s, 3H, OCH3), 3.71 (dd, J = 10.3, 2.7 Hz, 1H, H-3), 3.68 (dd, J = 2.8, 1.1 Hz, 1H, H-4), 1.12 (d, J = 6.4 Hz, 3H, 6-CH3)。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 159.63, 138.33, 134.48, 129.72, 129.16, 128.90, 128.44, 128.32, 127.90, 127.77, 114.14, 85.79, 80.47, 77.16, 76.01, 75.13, 72.40, 69.56, 61.03, 55.46, 16.69。HRMS(ESI)m/z calcd for C27H29N3NaO4Se [M+Na]+562.1221, found 562.1209。
化合物14:化合物13(900mg、1.67mmоl)をDCM(84ml)に溶解し、2,3-ジクロロ-5,6-ジシアノ-1,4-ベンゾキノン(564mg、2.5mmоl)および水(4.2ml)をアルゴンガスの保護下で加えた。室温で7時間撹拌して反応させ、完全に反応したことをTLCで検出した。DCM(50ml)を加えて希釈し、反応液を10%チオ硫酸ナトリウム(100ml)で2回洗浄した。有機相を分離し、無水硫酸ナトリウムで濃縮した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、10:1)で精製して新しい生成物(573mg、1.4mmоl、82%)を得た。新しい生成物を乾燥したピリジン(3.2ml)に溶解し、0℃に冷却し、30分間後に無水酢酸(0.5ml、5.12mmоl)をゆっくりと加え、反応液を室温に戻して5時間撹拌し続け、原料が完全に反応したことをTLCで検出した。反応液を1M塩酸で洗浄した後、飽和重炭酸ナトリウムと飽和食塩水で抽出した。有機相を分離して濃縮した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、20:1)で精製して化合物14(598mg、1.3mmоl、quant)を得た。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.68 - 7.21 (m, 9H, Ar - H), 5.91 (d, J = 5.3 Hz, 1H,H-1), 5.46 (dd, J = 3.3, 1.2 Hz, 1H, H-4), 4.75 (d, J = 10.7 Hz, 1H,PhCH2), 4.53 (d, J = 10.7 Hz, 1H, PhCH), 4.48 - 4.37 (m, 1H, H-5), 4.12 (dd, J = 10.3, 5.4 Hz, 1H, H-2), 3.78 (dd, J = 10.4, 3.3 Hz, 1H, H-3), 2.15 (s, 3H,COCH3), 1.12 (d, J = 6.5 Hz, 3H,6-CH3)。13C NMR (101 MHz, Chloroform-d) δ 170.52 , 136.90 , 134.53 , 129.12 , 128.50 , 128.34 , 128.07 , 127.88 , 85.08 , 71.68 , 68.89 , 67.77 , 60.36 , 20.76 , 16.07 。HRMS(ESI)m/z calcd for C21H23N3NaO4Se [M+Na]+ 484.0751, found 484.0749。
化合物15:化合物14(580mg/1.3mmоl)をテトラヒドロフラン(6ml)と水(6ml)の混合溶液に溶解し、0℃に冷却した。臭化テトラブチルアンモニウム(3mmоl)を加え、反応液を室温に戻し、5時間撹拌を続け、原料が完全に反応したことをTLCで検出した。反応液を10%チオ硫酸ナトリウムで洗浄し、DCMと水で抽出し、有機相を分離し、無水硫酸ナトリウムで乾燥して濃縮した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、4:1)で精製して新しい化合物(417mg、1.3mmоl、quant)を得た。[α]D 20 = 54.9°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.43 - 7.30 (m, 8H, Ar-H), 5.47 (dd, J = 3.3, 1.3 Hz, 1H, 1a-H), 5.34 (dd, J = 3.4, 1.1 Hz, 0.8H, 4b-H), 5.32 (d, J = 3.6 Hz, 1H, 4a-H), 4.77 (d, J = 10.8 Hz, 1H, PhCH), 4.75 (d, J = 11.1 Hz, 0.8H, PhCH), 4.54 (d, J = 7.9 Hz, 1H, 1b-H), 4.53 (d, J = 10.8 Hz, 1H, PhCH), 4.53 (d, J = 11.1 Hz, 0.8H, PhCH), 4.32 (qd, J = 6.6, 1.3 Hz, 1H, 5-H ), 4.03 (dd, J = 10.5, 3.2 Hz, 1H, 2a-H), 3.74 (dd, J = 10.5, 3.5 Hz, 1H, 3a-H), 3.69 (td, J = 6.4, 1.1 Hz, 0.8H, 5b-H), 3.58 (dd, J = 10.2, 7.9 Hz, 0.8H, 2b-H), 3.45 (dd, J = 10.3, 3.4 Hz, 0.8H, 3b-H), 2.19 (s, 2.4H, COCH3), 2.18 (s, 3H, COCH3), 1.25 (d, J = 6.5 Hz, 2.4H, 6b-CH3), 1.19 (d, J = 6.5 Hz, 3H, 6a-CH3).。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 170.90, 170.88, 137.15, 137.04, 128.63, 128.52, 128.40, 128.22, 128.17, 96.20, 92.46, 77.91, 77.48, 77.36, 77.16, 77.16, 76.84, 74.36, 71.91, 71.67, 69.69, 69.46, 68.39, 65.21, 64.03, 59.82, 20.95, 20.93, 16.55, 16.42。HRMS(ESI)m/z calcd for C15H19N3O5Na[M+Na]+344.1217, found 344.1208。
新しい化合物(417mmоl、1.3mmоl)を無水ジクロロメタン(14ml)に溶解し、0℃に冷却した。トリクロロアセトニトリル(0.4ml、3.78mmоl)およびDBU(23μL、0.13mmоl)を順次に加え、反応液を5時間撹拌し続け、原料が完全に反応したことをTLCで検出した。反応液を室温で直接濃縮し、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、10:1)で精製して化合物15(518mg、1.1mmоl、88%)を得た。
化合物16:グリコシルトリクロロアセトイミデート15(518mg、1.1mmоl)および窒素-ベンジル-窒素-ベンジルホルメート-プロパノール(500mg、1.7mmоl)を無水DCMに溶解し、4Åモレキュラーシーブを加え、室温で30分間撹拌した。そして、反応液を-40℃に冷却し、アルゴンガスの保護下で、TMSOTf(0.3ml、1.3mmоl)をゆっくりと加えた。反応液を-40℃で4時間撹拌し続け、原料が完全に反応したことをTLCで検出し、トリエチルアミン(1ml)で反応をクエンチした。反応液を飽和NaHCO3で抽出し、有機相を分離し、無水Na2SO4で乾燥した後、シリカゲルカラムで精製して化合物16(396mg、0.44mmоl、60%)を得た。[α]D 20 = -10.8°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.45 - 7.16 (m, 15H, Ar-H), 5.23 - 5.12 (m, 2H, PhCH), 4.74 - 4.59 (m, 3H, 3-H, 2PhCH), 4.61 - 4.38 (m, 2H, 2NPhCH), 4.21 (dd, J = 33.3, 8.0 Hz, 1H, 1-H), 4.02 - 3.87 (m, 1H, linker-OCH), 3.79 (t, J = 9.5 Hz, 1H 2-H), 3.67 (d, J = 3.0 Hz, 1H, 4-H), 3.63 - 3.27 (m, 4H, 5-H linker-OCH, linker-NCH2), 2.07 (s,3H, COCH3), 2.01 - 1.76 (m, 2H, linker-CH2), 1.24 (d, J = 6.4 Hz, 3H, 6-CH3).13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 170.38, 137.95, 137.70, 128.52, 128.46, 128.40, 128.32, 127.97, 127.92, 127.87, 127.27, 101.99, 77.37, 77.25, 77.05, 76.74, 76.19, 75.59, 74.23, 70.48, 67.40, 67.19, 61.11, 50.90, 44.67, 43.62, 28.48, 28.03, 20.89, 16.57. HRMS(ESI)m/z calcd for C33H38N4O7Na[M+Na]+625.2633, found 625.2650。
化合物17:化合物16(262mg、0.42mmоl)をメタノール(4ml)に溶解し、ナトリウムメトキシド(40mg)を加えた。反応液を室温で2時間撹拌し、すべての原料が完全に反応した後、反応液をメタノールで希釈し、水素型Amberlite IR120樹脂で反応液を約pH7に中和した。樹脂をろ過し、濾液を濃縮した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、3:1)で精製して化合物17(244mg、0.42mmоl、quant)を得た。[α]D 20 = -24.1°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.76 - 6.87 (m, 15H, Ar-H), 5.22 (d, J= 9.4 Hz, 2H, PhCH), 4.83 (d, J = 11.6 Hz, 1H, PhCH), 4.78 (d, J = 11.6 Hz, 1H, PhCH), 4.58 (d, J = 14.0 Hz, 2H, PhCH), 4.25 - 4.08 (m, 1H, 1-H), 4.05 - 3.86 (m, 1H, linker-OCH), 3.62 - 3.34 (m, 7H, 2-H, 3-H, 4-H, 5-H, linker-OCH, linker-NCH2), 2.46 (s, 1H, -OH), 2.02 - 1.80 (m, 2H, linker-CH2), 1.31 (d, J = 6.4 Hz, 3H, 6-CH3).13C NMR (101 MHz, Chloroform-d) δ 138.00 , 128.58 , 128.56 , 128.50 , 128.26 , 128.08 , 127.95 , 127.89 , 102.12 (1-C) , 78.48 , 77.36 , 75.94 , 72.96 , 70.84 , 67.24 , 64.70 , 50.94 , 43.74 , 28.58 , 16.91。HRMS(ESI)m/z calcd for C31H36N4NaO6[M+Na]+ 583.2527, found 583.2531。
方法一:
従来の文献に報告されている類似した化合物の合成方法から、D-フコースビルディングブロックを合成する方法1をまとめたものを、図4に示す。ガラクタールS1を出発原料として使用し、ジフェニルジセレニド、トリメチルシリルアジドおよびジアセチルヨードベンゼンの共同作用下で、セレノフェニルおよびアジドをそれぞれ1位および2位に導入し、重要な中間体S2を得た。メタノール、ナトリウムメトキシドの作用下で、3、4、6位のアセチルを除去して化合物S3を得、次にベンジリデン基を4位と6位に導入して化合物S4を得、そして3位をアセチルで一時的に保護して化合物S5を得、トリメチルシリルトリフルオロメタンスルホン酸とボランの共同作用下で、ベンジリデン基を選択的に開き、ベンジルを4位に導入して化合物S6を得た。次に、p-トルエンスルホニルクロリドとピリジンの作用下でp-トルエンスルホニルを、露出した6位に導入して化合物S7を得たが、6位のp-トルエンスルホニルをヨウ素原子で置換すると、反応がスムーズに進まなかった。
発明者は、アセトニトリルおよびTBAIをそれぞれ100℃および80℃で反応し、及び、ブタノンおよびヨウ化ナトリウムを80℃で反応することを含む、異なる条件を試したが、対応する生成物S8を得るために6位にヨウ素を導入することができなかったため、さらに目標のD-フコースビルディングブロックをルートに沿って合成することができなかった。
方法二:
方法一を改善し、改善した合成ルートを図5に示す。ペルアセチルグルカールS9を出発原料とし、フリーラジカル付加反応を用い、セレノフェニルとアジドをそれぞれ1位と2位に導入して化合物S10を得てから、アセチルを除去して化合物S11を得、次に4、6位をベンジリデン基で同時に保護して化合物S12を得、そして3位をアセチルで一時的に保護して化合物S13を得、ベンジリデン基を80%酢酸溶液で開いて化合物S14を得、p-トルエンスルホン酸とピリジンの条件下でp-トルエンスルホニルを6位に導入して化合物S15を得た。そして、2-ブタノンの還流溶液中で、ヨウ化ナトリウムと反応し、ヨウ素を6位に導入して化合物S16を得た。化合物S16の6位のヒドロキシルをシアノボロヒドリドナトリウムによる還元法によりメチルに還元して化合物S17を得、次にトリフルオロメチルスルホニルをまず4位に導入して化合物S18を得、次に亜硝酸カリウムによって還元して4位に垂直なヒドロキシルを有する化合物S19を得、すなわち、4位に水平なヒドロキシルを垂直に結合したヒドロキシルに首尾よく変換し、これによって、D-フコース構造に変換し、そして酸化銀の中性条件下で、ベンジルを4位のヒドロキシルに導入して化合物S20を得た。
この方法では、必要な化合物S20を得ることができるが、実用性は高くない。これは主にルートステップが長すぎて、合計11の反応モジュールがあり、特に4-OH転位、およびAg2Oを使用してOBn基を作る最後のステップの二つのステップの反応収率の両方とも50%未満であるため、このルートの合計収率は2%未満である。
二糖20の合成ルート(図6参照) 図6に示されるように、二糖18の合成は、図1に示されるルートによって前に合成されたグルコース化合物3および図2に示されるルートによって合成されたL-フコース化合物7を使用してルイス酸TMSOTfの触媒作用下で完成された。次に、二糖18還元末端のアリルをメタノール溶液中で塩化パラジウムによって加水分解して除去したことにより1-OH二糖化合物19を得た。最後に、化合物19を、2,2,2-トリフルオロ-N-フェニルアセトイミドイルクロリドを使用してN-フェニル-トリフルオロアセトイミデートを含む二糖供与体20にした。
具体的な試験操作とステップ:
化合物18:単糖供与体3(500mg、1.0mmоl)およびグリコシル受容体7(165mg、0.52mmоl)を窒素ガスの保護下で無水DCM(10ml)に溶解し、4Åモレキュラーシーブを加えた。反応液を室温で30分間撹拌した後、0℃に冷却し、TMSOTf(36μL、0.2mmоl)を加えた。反応液をゆっくりと室温に戻し、5時間撹拌を続け、原料が完全に反応したことをTLCで検出した。反応液をトリエチルアミンでクエンチし、飽和重炭酸ナトリウムで抽出し、濃縮液をシリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、2:1)で精製して化合物18(300mg、0.46mmоl、88%)を得た。[α]D 20= 2.3°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.52 - 6.73 (m, 6H,Ar-H), 5.84 (ddt, J = 16.4, 10.8, 5.6 Hz, 1H,Ally-H), 5.23 (d, J = 17.3 Hz, 1H, Ally-H), 5.17 - 5.05 (m, 3H, Ally-H, 3’-H, 4’-H), 5.03 (t, J = 8.2 Hz, 1H, 2’-H), 4.80 (d, J = 11.3 Hz, 1H, Bn-H), 4.77 (d, J = 7.7 Hz, 1H, 1’-H), 4.46 (d, J = 11.4 Hz, 1H, Bn-H), 4.29 (dd, J = 13.0, 5.0 Hz, 1H, Ally-H), 4.20 (dd, J = 12.3, 4.4 Hz, 1H, 6’-Ha), 4.17 - 4.08 (m, 2H, 6’-Hb, 1-H), 4.00 (dd, J = 13.0, 6.2 Hz, 1H, Ally-H), 3.66 (qd, J = 10.3, 4.9 Hz, 3H, 5’-H, 2-H, 3-H), 3.43 (d, J = 2.5 Hz, 1H, 4-H), 3.35 (d, J = 6.4 Hz, 1H, 5-H), 1.99 (s, 3H, CH3CO), 1.95 (s, 3H, CH3CO), 1.92 (s, 3H, CH3CO), 1.79 (s, 3H, CH3CO), 1.10 (d, J = 6.3 Hz, 3H, 6-CH3)。13C NMR (101 MHz, Chloroform-d) δ 170.38 , 170.08 , 169.04 , 168.88 , 137.76 , 133.47 , 128.04 , 127.91 , 127.52 , 117.24 , 100.54 , 98.46 , 79.37 , 77.03 , 75.44 , 74.68 , 72.99 , 71.87 , 71.34 , 70.06 , 69.76 , 68.00 , 61.87 , 61.62 , 20.46 , 20.32 , 16.50。HRMS(ESI)m/z calcd for C30H39N3NaO13 [M+Na]+672.2375, found 672.2377。
化合物19:化合物18(300mg、0.46mmоl)を無水メタノール(23ml)に溶解し、次に反応液を40℃に加熱した。塩化パラジウム(16mg)を加え、1時間撹拌し続け、原料が完全に反応したことをTLCで検出した。反応液をDCMで希釈して飽和重炭酸ナトリウムで抽出し、有機相を分離して濃縮した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、1:1)で精製して化合物19(256mg、0.40mmоl、88%)を得た。[α]D 20= -7.1°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d)。 -anomer δ 7.35 - 7.22 (m, 5H, Ar-H), 5.23 (d, J = 3.5 Hz, 1H, 1-H), 5.22 - 5.00 (m, 3H, 2’-H, 3’-H, 4’-H), 4.86 - 4.72 (m, 2H, 1’-H, Bn-H), 4.43 (d, J = 11.0 Hz, 1H, Bn-H), 4.38 (d, J = 7.8 Hz, 1H, 1’-H), 4.28 (dd, J = 10.6, 2.7 Hz, 1H, 3-H), 4.25 - 4.11 (m, 2H, 6’-Hab), 4.11 - 4.02 (m, 1H, 5-H), 3.75 - 3.65 (m, 2H, 2-H, 5’-H), 3.61 (d, J = 2.8 Hz, 1H, 4-H), 2.01 (s, 3H, OAc-Me), 1.97 (s, 3H, OAc-Me), 1.93 (s, 3H, OAc-Me), 1.72 (s, 3H, OAc-Me), 1.10 (d, J = 6.4 Hz, 3H, 6-Me)。 -anomer δ 7.35 - 7.22 (m, 5H, Ar-H), 5.22 - 5.00 (m, 3H, 2’-H, 3’-H, 4’-H), 4.80 ( d, J= 11.5 Hz, 1H, Bn-H), 4.47 (d, J = 11.3 Hz, 1H, Bn-H), 4.38 (d, J= 7.8 Hz, 1H, 1’-H), 4.22 - 4.03 (m, 4H, 6ab -H, 1’-H, 3-H), 3.74 - 3.58 (m, 3H, 2-H, 4-H, 5’-H), 3.51 - 3.41 (m, 1H, 5-H), 2.01 (s, 3H, OAc-Me), 1.97 ( s, 3H, OAc-Me), 1.94 (s, 3H, OAc-Me), 1.72 (s, 3H, OAc-Me), 1.10 (d, J = 6.4 Hz, 3H, 6-Me)。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 170.79, 170.69, 170.43, 170.38, 169.33, 169.29, 169.15, 169.05, 137.87, 128.44, 128.39, 128.36, 128.32, 128.24, 128.14, 128.12, 128.00, 127.93, 102.18, 101.52, 98.74, 98.67, 98.65, 96.22, 92.72, 79.54, 79.42, 79.37, 77.37, 77.25, 77.14, 77.05, 76.87, 76.73, 76.48, 75.73, 75.52, 75.17, 75.03, 75.00, 74.96, 74.06, 73.33, 73.23, 73.20, 72.13, 72.10, 71.97, 71.82, 71.56, 70.69, 70.62, 70.40, 68.25, 68.20, 66.62, 63.71, 63.53, 62.05, 61.99, 61.78, 58.93, 43.75, 29.68, 20.71, 20.69, 20.66, 20.58, 20.56, 20.54, 16.78, 16.67, 16.61, 16.57。HRMS(ESI)m/z calcd for C27H35N3NaO13 [M+Na]+632.2062, found 632.2039。
化合物20:化合物19(86mg、0.14mmоl)を無水DCMに溶解して0℃に冷却した。アルゴンガスの保護下で2,2,2-トリフルオロ-N-フェニルアセトイミドイルクロリド(0.1ml)およびDBU(30μL)を加えた。反応液を室温に戻して20時間撹拌し続けた。室温で濃縮した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、2.5:1)で精製して化合物20(67mg)を得た。
三糖24の合成ルート(図7参照)
図7に示されるように、二糖供与体20と単糖受容体17を、ジクロロメタン、ジエチルエーテルおよびチオフェンなどの溶媒の共同作用下で、ルイス酸TMSOTfによって触媒して1,2-シス結合三糖21を得た。三糖21のアジドを、チオ酢酸およびピリジンによって0℃でアセチルアミノ化合物22に還元した。化合物22のグルコース基の4つのアセチルをアルカリ性条件下で除去して化合物23を得た。最後に、すべての芳香族基をパラジウム炭素および水素によって除去して、アミノ連結アームが組み立てられた緑膿菌O11血清型O抗原三糖を得た。
具体的な試験操作とステップ:
化合物21:二糖供与体20(35mg)および単糖受容体17(45mg)を、アルゴンガスの保護下で無水DCM(0.9ml)、ジエチルエーテル(0.9ml)、及びチオフェン(0.9ml)の混合溶媒に溶解し、4Åモレキュラーシーブを加え、室温で30分間撹拌してから0℃に冷却した。TMSOTfを加えて8時間撹拌し続け、グリコシル供与体が完全に反応したことをTLCで検出した。反応をトリエチルアミンでクエンチし、飽和重炭酸ナトリウムで抽出し、有機相を濃縮した後、シリカゲルカラム(石油エーテル/酢酸エチル、3:1)およびSephadex LH-20ゲルカラム(DCM/MeOH、1:1)で精製して化合物21(37mg)を得た。[α]D 20= -44.5°( c = 1.00, CHCl3)。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.41 - 7.19 (m, 20H, Ar-H), 5.30 - 5.04 (m, 6H, 2PhCH, 1’-H, 2”-H, 3”-H, 4”-H ), 4.83 (d, J = 11.1 Hz, 1H, PhCH), 4.77- 4.75 (m, 3H, 2PhCH, 1”-H), 4.55 - 4.50 (m, 2H, NPhCH), 4.42 (d, J = 11.0 Hz, 1H, PhCH), 4.33 - 4.21 (m, 1H, 6”-H), 4.18 (d, J= 7.0 Hz, 1H, 1-H), 4.07 (m, 2H, 3’-H, 6”-H), 4.00 - 3.88 (m, 1H, linker-OCH), 3.81 (t, J = 9.0 Hz, 1H, 2-H), 3.79 - 3.67 (m, 2H, 5’-H, 5”-H), 3.62 (dd, J= 10.7, 3.7 Hz, 1H, 2’-H), 3.53 - 3.26 (m ,6H, linker-OCH, linker-NCH2, 3-H, 4H, 4’-H), 2.04 (s, 1H, COCH3), 2.00 (s, 1H, COCH3), 1.96 - 1.81 (m, 2H, linker-CH2), 1.80 (s, 1H, COCH3), 1.30 (d, J = 6.7, 3H, 6-CH3), 1.10 (d, J = 6.4 Hz, 3H, 6’-CH3)。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 170.70, 170.41, 169.22, 168.95, 138.47, 137.94, 137.78, 128.50, 128.44, 128.38, 127.99, 127.96, 127.89, 127.86, 127.77, 127.62, 127.25, 102.44, 100.52, 99.60, 79.20, 79.11, 77.34, 77.22, 77.02, 76.70, 75.31, 75.26, 73.29, 72.29, 71.96, 70.71, 68.03, 67.50, 67.18, 63.61, 61.76, 58.26, 50.90, 49.78, 44.76, 43.68, 29.69, 28.52, 28.09, 23.42, 20.66, 20.59, 16.95, 16.54。HRMS(ESI)m/z calcd for C58H69N7NaO18[M+Na]+1174.4591, found 1174.4626。
化合物22:化合物21(30mg)を乾燥ピリジン(0.5ml)およびチオ酢酸(0.5ml)に溶解し、0℃で12時間撹拌し、原料が完全に反応したことをTLCで検出した後、トルエンを使用して反応液と3回共沸し、シリカゲルカラム(ジクロロメタン/メタノール、50:1)で精製して化合物21(30mg)を得た。[α]D 20= 49.5°( c = 1.00, CHCl3). 1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.80 - 6.90 (m, 20H, Ar-H), 6.83 (d, J = 8.1 Hz, 1H, NHAc-H), 6.18 (d, J = 9.2 Hz, 1H, NHAc-H), 5.27 - 5.13 (m, 3H, 3’’-H, 2Cbz-H), 5.10 - 4.99 (m, 2H, 1’-H, 4’’-H ), 4.96 (t, J = 8.7 Hz, 1H, 2’’-H), 4.88 (d, J = 11.1 Hz, 1H, Bn-H), 4.84 - 4.79 (m, 1H, Bn-H), 4.74 (d, J = 15.5 Hz, 2H, Bn-H), 4.63 (d, J = 8.0 Hz, 3H, 1’’-H, 3-H, 2’-H), 4.41 (d, J = 10.9 Hz, 1H, Bn-H), 4.34 - 4.25 (m, 2H, 6’’-H, 1-H), 4.25 - 4.13 (m, 1H,2-H), 4.09 (t, J = 9.0 Hz, 1H, 6’’-H), 3.86 (dtt, J = 34.7, 10.8, 6.0 Hz, 3H, 5’-H, 4-H, 3’-H), 3.66 (dd, J = 9.7, 6.0 Hz, 1H, 5’’-H), 3.60 - 3.52 (m, 1H, 3-H), 3.44 (d, J = 7.3 Hz, 2H, 5-H, 4’-H), 3.34 - 3.08 (m, 1H, linker-OCH2-H), 2.87 (dt, J = 14.3, 5.0 Hz, 1H, linker-NH2-H), 2.14 (s, 3H, OAc-Me), 2.09 (s, 3H, NHAc-Me), 2.06 (s, 3H, OAc-Me), 2.00 (s, 3H, OAc-Me), 1.89 (s, 3H, NHAc-Me), 1.80 (s, 3H, OAc-Me), 1.68 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 1.32 (d, J = 6.3 Hz, 3H, 6’-Me), 1.17 (d, J = 6.5 Hz, 3H, 6-Me).13C NMR (101 MHz, Chloroform-d) δ 171.62, 171.05, 170.77, 170.42, 169.28, 168.83, 156.56, 138.81, 138.17, 137.98, 137.35, 136.86, 128.66, 128.55, 128.51, 128.47, 128.36, 128.17, 128.09, 127.96, 127.91, 127.80, 127.76, 127.71, 127.65, 127.50, 127.28, 127.19, 126.35, 101.24, 100.77, 99.67, 80.00, 79.66, 78.94, 77.83, 77.23, 75.05 (d, J = 13.2 Hz), 73.18, 72.20, 72.07, 70.73, 68.21, 67.52, 67.33, 65.76, 61.95, 52.22, 49.70, 47.60, 42.47, 31.92, 29.69, 26.87, 23.33, 20.84, 20.58, 20.56, 17.24, 16.73。
化合物23:化合物22(22mg)をメタノール(5ml)に溶解し、ナトリウムメトキシド(10mg)を加えた。反応液を室温で2時間撹拌し、原料が完全に反応したことをTLCで検出した後、水素型Amberlite IR120樹脂で反応液を約7に中和した。樹脂をろ過し、反応液を濃縮した後、シリカゲルカラム(ジクロロメタン/メタノール、10:1)で精製して化合物23(18mg)を得た。[α]D 20 = -16.3°。1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 7.60 - 7.13 (m, 20H), 7.12 (d, J = 7.3 Hz, 1H, NHAc-H), 6.69 (d, J = 9.8 Hz, 1H, NHAc-H), 5.23 (d, J = 12.6 Hz, 1H, Cbz-H), 5.15 (d, J = 12.4 Hz, 1H, Bn-H), 5.05 (d, J = 12.3 Hz, 1H, Cbz-H), 4.96 - 4.83 (m, 2H, 1’-H, Bn-H), 4.79 (d, J = 15.7 Hz, 1H, Bn-H), 4.72 (d, J = 12.2 Hz, 1H, Bn-H), 4.66 - 4.49 (m, 2H, Bn-H, 2’-H), 4.36 (s, 1H,OH-H),4.28 (d, J = 9.5 Hz, 1H, 2A-H), 4.22 (d, J = 16.0 Hz, 1H, Bn-H), 4.03 (d, J = 7.3 Hz, 2H,1’’-H, NCH2-H), 4.00 - 3.84 (m, 4H, 3’-H, 1-H, 6’’-H, OCH2-H), 3.72 (dd, J = 12.5, 6.1 Hz, 1H, 6’’-H), 3.64 (q, J = 6.7 Hz, 1H, 5-H), 3.42 (ddd, J = 26.0, 12.9, 5.7 Hz, 4H, 5-H, 2’’-H,3’’-H,4’’-C), 3.33 (d, J = 4.6 Hz, 1H, 3-H), 3.31 - 3.19 (m, 2H, 4’-H, 5’’-C), 3.15 (td, J = 9.7, 4.0 Hz, 1H, OCH2-H), 2.88 - 2.74 (m, 2H, NH2-H), 2.09 (s, 3 H, NHAc-Me), 1.96 (s, 3H, NHAc-Me), 1.72 - 1.57 (m, 2H, linker-CH2),1.32 (s, J = 6.4, 3H, 6-Me), 1.03 (s, J = 6.3, 3H, 6-Me)。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 172.97, 172.65, 156.77, 138.85, 138.64, 137.11, 136.82, 128.75, 128.60, 128.38, 128.14, 128.05, 127.64, 127.50, 127.34, 127.26, 127.07, 101.41, 99.87, 82.13, 79.54, 77.36, 77.04, 76.72, 76.31, 75.31, 74.62, 74.34, 74.14, 72.82, 71.70, 70.92, 67.67, 67.56, 65.55, 62.61, 52.00, 49.50, 48.11, 42.01, 29.72, 26.65, 23.53, 17.50, 16.75。HRMS(ESI)m/z calcd for C62H77N3NaO20 [M+Na]+1038.4570, found 1038.4538。
化合物24:化合物23(12mg)をメタノール(3ml)、ジクロロメタン(1ml)および水(1ml)の混合溶媒に溶解し、氷酢酸を2滴加えてから、パラジウム炭素(10mg)を加えた。反応は、水素圧0.4MPa、反応時間12時間で、BLT-2000中圧水素化装置で行われた。反応後、反応液を珪藻土でろ過し、濃縮後、CHROMAFIX C18 ecで精製して化合物24(7mg)を得た。1H NMR (400 MHz, Deuterium Oxide) δ 5.03 (s, 1H, 1’-H), 4.51 (d, J = 7.9 Hz, 1H, 1’’-H), 4.37 (d, J = 8.4 Hz, 1H, 1-H), 4.17 (s, 1H, 2’-H), 4.07 (q, J = 6.6 Hz, 1H, 5’-H ), 4.02 (s, 1H, 3’-H), 3.99 - 3.86 (m, 4H, 2-H,4’-H, 6”-H, OCH2-H), 3.80 - 3.75 (m, 1H, 5-H), 3.67 (ddt, J = 16.6, 10.9, 6.0 Hz, 3H, 3-H, 6”-H, OCH2-H), 3.46 (m, 2H, 3”-H, 5”-H), 3.34 (t, J = 9.3 Hz, 1H, 4”-H), 3.26 (t, J = 8.6 Hz, 1H, 2”-H), 3.05 (t, J = 6.9 Hz, 2H, NCH2-H), 2.00 (s, 3H, NHAc-Me), 1.98 (s, 3H, NHAc-Me), 1.91 (t, J = 6.4 Hz, 2H, CH2-H), 1.23 (d, J =6.9 Hz, 3H, 6-Me), 1.21 (d, J =6.8 Hz, 3H, 6’-Me)。13C NMR (101 MHz, Deuterium Oxide) δ 174.35 , 101.49 , 100.22 , 98.89 , 76.54 , 76.00 , 75.46 , 74.78 , 72.81 , 71.31 , 70.63 , 70.33 , 69.63 , 69.60 , 68.39 , 67.88 , 66.88 , 60.84 , 51.31 , 47.88 , 37.60 , 26.64 , , 22.20 , 22.17 , 15.39 , 15.29 。HRMS(ESI)m/z calcd for C25H45N3NaO14[M+Na]+ 634.2794, found 634.2789。
糖環のC-2位のアシルの補助下での隣接基関与効果を利用して1,2-トランスグリコシド結合を効率よく構築することは、糖化学において比較的に成熟した方法となっている。2位のアセチルは、糖化学保護戦略において最も簡単に入手でき、最も効果的な保護剤として、例えば、本特許の化合物18の合成など、一般的に優先的に考慮される。しかしながら、1,2-シス反応については、成熟した方法はまだない。実施例6を参照すると、他の条件を変えずに溶媒成分を変え、生成物の構造の結果を表1に示す。
表1から分かるように、1,2-シスグリコシド結合の構築は溶媒の影響を大きく受け、中でも、無水ジクロロメタン/ジエチルエーテル/チオフェンの混合溶媒が最も効果的であり、均一なα型生成物を実現でき、反応の立体選択性は100%に達することができる。
アセチルアミノを単糖段階でそれぞれ組み立て、アセチルアミノ二糖供与体S21とアセチルアミノ受容体S22を得た。これに基づいて、グリコシル化反応では成功しなかった目標の三糖S23の合成を行い、その理由を分析した結果、供与体二糖の還元末端の2位のアセチルアミノが活性化されて安定なオキサゾリン環中間体を形成したため、グリコシル化反応を制限した。上記の結果は、アセチルアミノの前駆体として非関与アジドを使用すると、目標のオリゴ糖合成の反応性および立体選択性を改善するのに役立つことを示している。
Claims (10)
- D-グルコースビルディングブロック、L-フコサミンビルディングブロック、及びD-フコサミンビルディングブロックを使用してO抗原三糖を構築することを含む、緑膿菌O11血清型O抗原三糖を合成する方法であって、D-グルコースビルディングブロックまたはL-フコサミンビルディングブロックは、1,2-α-シス-グリコシド結合を介してD-フコサミンビルディングブロックと接続し、D-グルコースビルディングブロックは、1,2-β-トランス-グリコシド結合を介してL-フコサミンビルディングブロックと接続し、前記1,2-α-シス-グリコシド結合の構築は、混合溶媒で行われ、前記混合溶媒は、ジクロロメタン、ジエチルエーテル、及びチオフェンのうちの2つ以上を含むことを特徴とする、方法。
- D-グルコースビルディングブロックの化学構造は式IIに示され、L-フコサミンビルディングブロックの化学構造は式IIIに示され、D-フコサミンビルディングブロックの化学構造は式IVに示され、
式中、リンカーは、-(CH2)n-N-Y1Y2、またはO-(CH2)n-SY1(Y2)、またはO-(CH2)n-N3を含み、n=1~10であり、Y1は水素(H)またはベンジル(Bn)であり、Y2は水素(H)またはベンジルオキシカルボニル(Cbz)である;
R1は、水素(H)、エステル、アセチル(Ac)、ベンゾイル(Bz)、ピバロイル(Piv)、クロルアセチル(ClAc)、レブリニル(Lev)、及びアリルオキシカルボニル(Alloc)を含むが、これらに限られていない;
R2、R3、及びR4は、水素(H)またはエステル、エーテルであり、アセチル(Ac)、ベンゾイル(Bz)、ピバロイル(Piv)、クロルアセチル(ClAc)、レブリニル(Lev)、アリルオキシカルボニル(Alloc)およびベンジル(Bn)、p-メトキシベンジル(pMBn)、アリル(All)、トリチル(Tr)、モノメトキシトリチル(Mmt)、及びシリルエーテル基を含むが、これらに限られていない;
R5およびR6は、水素(H)、エーテル基、ベンジル(Bn)、p-メトキシベンジル(pMBn)、アリル(All)、トリチル(Tr)、モノメトキシトリチル(Mmt)、及びシリルエーテル基を含むが、これらに限られていない;
R7、R8、R9、およびR10は、水素(H)、窒素(N)またはアセチル(Ac)を含むことを特徴とする、請求項1に記載の方法。 - D-フコサミンは、グルコースを使用して合成され、前記方法は、3,4,6-トリ-O-アセチル-マンノセンを原料として、アジドおよびセレン試薬を介して1-セレノフェニル-2-アジドグルコースを取得し、アセチル基を除去し、6-Cをメチル化し、最後にD-フコサミン化合物を取得することを含むことを特徴とする、請求項1~5のいずれか一項に記載の方法。
- 緑膿菌O11血清型O抗原三糖を含む、糖-タンパク質複合体の調製方法であって、前記緑膿菌O11血清型O抗原三糖の調製方法は、請求項1~6のいずれか一項に記載の方法であることを特徴とする、糖-タンパク質複合体の調製方法。
- 緑膿菌ワクチンまたは緑膿菌感染によって引き起こされる疾患のための薬品の開発または調製における、請求項1~6のいずれか一項に記載の合成方法の使用。
- 緑膿菌ワクチンまたは緑膿菌感染によって引き起こされる疾患のための薬品の開発または調製における、請求項7に記載の化合物または請求項8に記載の糖-タンパク質複合体の調製方法の使用。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201811551666.0 | 2018-12-18 | ||
CN201811551666.0A CN109627270B (zh) | 2018-12-18 | 2018-12-18 | 一种绿脓假单胞菌o11血清型o抗原寡糖的化学合成方法 |
PCT/CN2019/119584 WO2020125307A1 (zh) | 2018-12-18 | 2019-11-20 | 一种绿脓假单胞菌o11血清型o抗原寡糖的化学合成方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2022511591A true JP2022511591A (ja) | 2022-02-01 |
JP7209815B2 JP7209815B2 (ja) | 2023-01-20 |
Family
ID=66075319
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021512705A Active JP7209815B2 (ja) | 2018-12-18 | 2019-11-20 | 緑膿菌o11血清型o抗原オリゴ糖の化学合成方法 |
Country Status (4)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20200405840A1 (ja) |
JP (1) | JP7209815B2 (ja) |
CN (1) | CN109627270B (ja) |
WO (1) | WO2020125307A1 (ja) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN109627270B (zh) * | 2018-12-18 | 2020-12-29 | 江南大学 | 一种绿脓假单胞菌o11血清型o抗原寡糖的化学合成方法 |
CN115677800B (zh) * | 2022-10-28 | 2023-08-08 | 山东大学 | 一种铜绿假单胞菌o10血清型o-抗原三糖及其合成方法 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2019144508A1 (zh) * | 2018-01-29 | 2019-08-01 | 江南大学 | 类志贺邻单胞菌o51血清型o抗原寡糖化学合成方法 |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US10596272B2 (en) * | 2015-06-08 | 2020-03-24 | MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Vaccines against Streptococcus pneumoniae serotype 5 |
CN108329362B (zh) * | 2018-03-20 | 2020-10-09 | 江南大学 | 一种革兰氏阳性菌表面荚膜多糖结构衍生物的制备方法 |
CN109627270B (zh) * | 2018-12-18 | 2020-12-29 | 江南大学 | 一种绿脓假单胞菌o11血清型o抗原寡糖的化学合成方法 |
-
2018
- 2018-12-18 CN CN201811551666.0A patent/CN109627270B/zh active Active
-
2019
- 2019-11-20 WO PCT/CN2019/119584 patent/WO2020125307A1/zh active Application Filing
- 2019-11-20 JP JP2021512705A patent/JP7209815B2/ja active Active
-
2020
- 2020-09-11 US US17/017,896 patent/US20200405840A1/en active Pending
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2019144508A1 (zh) * | 2018-01-29 | 2019-08-01 | 江南大学 | 类志贺邻单胞菌o51血清型o抗原寡糖化学合成方法 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
CARBOHYDR. RES., vol. 251, JPN6022022924, 1994, pages 127 - 144, ISSN: 0004948196 * |
J. AM. CHEM. SOC., vol. 140, JPN6022022926, 2018, pages 3120 - 3127, ISSN: 0004948197 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2020125307A1 (zh) | 2020-06-25 |
US20200405840A1 (en) | 2020-12-31 |
CN109627270B (zh) | 2020-12-29 |
CN109627270A (zh) | 2019-04-16 |
JP7209815B2 (ja) | 2023-01-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7085631B2 (ja) | プレシオモナス・シゲロイデスo51血清型o-抗原オリゴ糖の化学合成方法 | |
Emmadi et al. | Expeditious synthesis of bacterial, rare sugar building blocks to access the prokaryotic glycome | |
Gening et al. | Synthesis of β-(1→ 6)-linked glucosamine oligosaccharides corresponding to fragments of the bacterial surface polysaccharide poly-N-acetylglucosamine | |
JP7208995B2 (ja) | ヘリコバクタ‐・ピロリリポ多糖の外部コアの八炭糖の調製方法 | |
JP7209815B2 (ja) | 緑膿菌o11血清型o抗原オリゴ糖の化学合成方法 | |
US11566040B2 (en) | Synthesis of O-antigen oligosaccharide compounds of Helicobacter pylori serotype O2 | |
Yi et al. | Synthesis of 4, 5-disubstituted-3-deoxy-d-manno-octulosonic acid (Kdo) derivatives | |
CN114874345B (zh) | 一种幽门螺旋杆菌核心脂多糖寡糖抗原糖链的化学合成方法 | |
Périon et al. | A new synthesis of the oligosaccharide domain of acarbose | |
CN114085255B (zh) | 一种苏黎世克罗诺杆菌5型脂多糖o-抗原寡糖片段及其制备方法与应用 | |
JP2540400B2 (ja) | L−タロピラノシド誘導体の製造方法 | |
Boutet et al. | Synthesis of branched tri-to pentasaccharides representative of fragments of Shigella flexneri serotypes 3a and/or X O-antigens | |
Mulard et al. | Synthesis of a tri-and tetrasaccharide fragment specific for the Shigella flexneri serotype 5a O-antigen. A reinvestigation | |
JPH0616692A (ja) | 新規糖誘導体 | |
US10669353B2 (en) | Preparation method of outer core octasaccharide of Helicobacter pylori lipopolysaccharide | |
Zong et al. | Facile syntheses of the disaccharide repeating unit of the O-antigenic polysaccharide of Burkholderia pseudomallei strain 304b and its dimer and trimer | |
CN115677800B (zh) | 一种铜绿假单胞菌o10血清型o-抗原三糖及其合成方法 | |
Mukherjee et al. | Towards the complete synthetic O-antigen of Vibrio cholerae O1, serotype inaba: improved synthesis of the conjugation-ready upstream terminal hexasaccharide determinant | |
Chaudhury et al. | A target oriented expeditious approach towards synthesis of certain bacterial rare sugar derivatives | |
Du et al. | A simple access to 3, 6-branched oligosaccharides: Synthesis of a glycopeptide derivative that relates to Lycium barbarum L. | |
Yun et al. | Synthesis of 2′-Azidoethyl Trisaccharide, α-D-Gal-(1→ 2)-6d-α-D-Altro-Hepp-(1→ 3)-(β-D-GlcNAc, an o-antigenic repeating unit of C. jejuni 0: 23 and 0: 36 | |
Moutel et al. | Synthesis of novel analogues of the calicheamicin γ 1 I and esperamicin A 1B oligosaccharides | |
Petráková et al. | Syntheses of specifically deoxygenated methyl α-isomaltotriosides | |
JP6198207B2 (ja) | 新規糖供与体及びそれを用いた糖鎖の合成方法 | |
WO1998030572A1 (en) | PROCESSES FOR THE PREPARATION OF αGal(1→4)βGal(1→4)Glc-OR |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20210507 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20220614 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20220914 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20221220 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20230110 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7209815 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |