JP2022510856A - Vsvキメラベクター - Google Patents

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Abstract

本発明は、ベクターが、ダンデノングウイルス(DANDV)又はモペイアウイルス(MOPV)の糖タンパク質GPをコードしている遺伝子を含み、且つVSVのエンベロープタンパク質Gをコードしている機能性遺伝子を欠いていることを特徴とする、VSVキメラベクターに関する。本発明はまた、VSVキメラベクターシステムも提供する。加えて本発明は、固形腫瘍の治療におけるなど、医薬における使用を含む、本発明のVSVキメラベクター及びシステムの使用に関する。【選択図】なし

Description

本発明は、ベクターが、ダンデノングウイルス(Dandenong virus)(DANDV)又はモペイアウイルス(Mopeia virus)(MOPV)の糖タンパク質GPをコードしている遺伝子を含み、且つVSVのエンベロープタンパク質Gをコードしている機能性遺伝子を欠いていることを特徴とする、VSVキメラベクターに関する。本発明はまた、VSVキメラベクターシステムも提供する。加えて、本発明は、固形腫瘍の治療におけるなど、医薬における使用を含む、本発明のVSVキメラベクター及びシステムの使用に関する。
先行技術の説明
癌療法におけるウイルスの使用は、過去10年間に集中的に研究されている。腫瘍溶解性ウイルス(OV)は、癌治療における重要な薬剤であると考えられる。腫瘍溶解性ウイルスは、免疫刺激と腫瘍-特異性細胞溶解の魅力的な治療の組合せをもたらす。更に、OVは、腫瘍選択性の最適化及び増強された免疫刺激のために遺伝的に改変されることができ、且つチェックポイント阻害抗体分子などの他の薬剤及び他の免疫療法と容易に組合せることができる。OVの有効性は、多くの前臨床試験において、最近はヒトにおいて明らかにされており、腫瘍溶解性ヘルペスウイルスであるタリモジェンラヘルパレペベクが米食品医薬品局(FDA)により承認された[1, 2]。
今日まで、多様な特性を持つ広範なウイルスが、前臨床研究及び臨床研究下にある。腫瘍溶解性ウイルスは、サイズ及び複雑性において、大型の二本鎖DNAウイルス、例えばワクシニアウイルス(190kb)[3]及び1型単純ヘルペスウイルス(152kb)[4]などから、小型の一本鎖RNAウイルス、例えば、ゲノムサイズが11~16kbである、水疱性口内炎ウイルス(VSV)[5,6]、麻疹ウイルス(MV)[7]又はニューカッスル病ウイルス(NDV)[8]などにまで幅がある。しかし、全ての腫瘍溶解性ウイルスのプラットフォームは、利点と欠点を有する。明らかに、腫瘍溶解の有望なアプローチは、それらの複製に関して天然に許容状態である腫瘍型と様々なウイルスをマッチさせることである。他方で、例えばワクシニア-及び水疱性口内炎ウイルス-ベースのベクターなど、一部のプラットフォームの広範な天然の受容体トロピズムは、多くの異なる種類の癌への適用を可能にする。
VSV-ベースのベクタープラットフォームは、その広範な受容体トロピズムに起因するのみではなく、許容細胞において複製するその非常に大きい能力及び感染した腫瘍組織内での免疫応答を開始する局所炎症を引き起こす強力なCPEを誘導するその能力を理由とすることによっても、非常に有望なウイルス療法(virotherapy)と考えられる。しかし、腫瘍溶解性ウイルス療法において野生型VSVを使用することでいくつかの欠点が存在する。第一に、野生型VSV株(stains)は、神経毒であると考えられる。野生型VSVは、これらのウイルスが血液脳関門を誤って通過し、且つ治療を受ける個体の脳内に広がる場合には、死亡に繋がる重度の脳炎を引き起こし得る。第二に、VSV感染した個体は、主に核タンパク質及び糖タンパク質に対する高い抗体力価を伴う強力な液性反応を迅速に開始し得る。核タンパク質内に位置したエピトープに特異性があるCD8+細胞との強力なCTL反応に加え、VSVのエンベロープ糖タンパク質Gへ結合する中和抗体は、VSV感染症の制御に重要であると考えられる。VSVの糖タンパク質Gを標的化する中和抗体は、ウイルスの蔓延を限定することができ、且つこれらは、VSV再感染からの個体の保護を媒介することができる。しかし、ベクター中和は、癌患者への腫瘍溶解性の薬剤の反復適用を制限する。
VSV野生型のこれらの欠点を除くために、VSV-GPと称する組換えVSVベクターが、WO2010/040526において説明されている。VSV-GPにおいて、神経毒性及びベクター中和の主要な決定基であると考えられる内在性糖タンパク質VSV-Gのコード領域は、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)のWE-HPI株のエンベロープ糖タンパク質GPにより置き換えられた。VSVウイルスエンベロープタンパク質GのLCMV-GP(WE-HPI)による置き換えによりもたらされる利点は、(i)VSV-G媒介した神経毒性の喪失[9]、及び(ii)マウスモデルのみにおける抗体によるベクター中和の欠如[10,11]である。しかし、中和抗体の誘導の低下、その結果としての療法における使用に関する改善された安定性を伴うベクターの必要性は、依然存在する。
従って、本発明により解決される技術的問題点は、改善されたVSVキメラベクターの提供、並びに対応する使用及び方法である。この技術的問題点は、本明細書において提供される実施態様により及び請求項として解決される。
発明の概要
本発明は、ベクターが、ダンデノングウイルス(DANDV)又はモペイアウイルス(MOPV)の糖タンパク質GPをコードしている遺伝子又はそれらの機能性断片もしくはバリアントを含み、且つVSVのエンベロープタンパク質Gをコードしている機能性遺伝子を欠いていることを特徴とする、VSVキメラベクターを提供する。本発明において、VSVのエンベロープタンパク質Gが、DANDVもしくはMOPVのGP又はそれらの機能性断片もしくはバリアントにより置き換えられることは好ましい。代わりの本発明の実施態様において、ベクターが、イッピイウイルス(IPPYV)、ラティーノウイルス(LATV)もしくはオリベロウイルス(OLIVV)の糖タンパク質GPをコードしている遺伝子又はそれらの機能性断片もしくはバリアントを含み、且つVSVのエンベロープタンパク質Gをコードしている機能性遺伝子を欠いていることを特徴とする、VSVキメラベクターが、提供される。
当該技術分野においてVSV-ベースのOVを改善する試みにおいて、本発明者らは、驚くべきことに、VSVベクター中のDANDV又はMOPVの表面タンパク質GPは、中和抗体の力価を示さないか又は低い力価を示し、且つ腫瘍細胞において基礎をなすVSVベクターの複製能を維持するキメラベクターにつながることを発見した。加えて、VSV-GPベクターのトロピズム及び神経毒性の欠如の両方は、保存されている。
本発明者らはその結果、驚くべきことに、アレナウイルス、特にDANDV及びMOPVのエンベロープタンパク質GPをVSVのフレームワークにおいて使用した場合、これらは、マウスにおける頭蓋内適用後に神経毒性を示さない組換えベクターにつながることを発見した。同時に、このキメラVSVベクターは、驚くべきことに、先行技術のVSVベクターの細胞トロピズムを維持している。本発明者らの驚きの大半は、LCMVのGPを伴うVSVと比べ、ウイルス誘導した細胞変性効果(CPE)に起因した、選択されたヒト腫瘍細胞株の死滅の改善が示されたことである。この効果は、インビボにおいて確認され、特にヒト肺癌異種移植モデルにおけるVSV-G(x)-DANDV及びVSV-G(x)-MOPVの有効性は、VSV-LCMV-GPと比べ、予想以上に改善された。加えてVSV-G(x)-DANDV及びVSV-G(x)-MOPVは、静脈内免疫処置後のウサギモデルにおけるベクター-中和抗体の有意に遅延された誘導を示した。
従って一実施態様において、本発明は、ベクターが、ダンデノングウイルス(DANDV)又はモペイアウイルス(MOPV)の糖タンパク質GPをコードしている遺伝子を含み、且つVSVのエンベロープタンパク質Gをコードしている機能性遺伝子を欠いていることを特徴とする、VSVキメラベクターに関し、ここでこれらのベクターは、同一条件下で、LCMVのGPによりシュードタイプ化(pseudotyped)されたVSVベクターと比べ、中和抗体の減少した誘導を示す。本発明の更なる実施態様において、このベクターは、イッピイ、オリベロ又はラティーノウイルスの糖タンパク質GPをコードしている遺伝子を含む。「中和抗体」は、抗原に結合し、これにより抗原により授けられた生物学的作用を防止する抗体である。宿主に対し異物である多くの抗原は、中和抗体の産生を含む、宿主の免疫系の反応を誘導する。しかし本発明のVSVキメラベクターは、中和抗体の低下した誘導のみに繋がる点で、既知のキメラVSVベクターよりも改善されており、且つ結果的に宿主の標的化された細胞に対する改善された生物学的作用を示し得る。当業者は、中和抗体が誘導されるかどうか及びどの程度誘導されるかを決定する手段及び方法を良く知っている。従って当業者は、本発明のVSVキメラベクターは、中和抗体を誘導するかどうか、及びその誘導は、LCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVキメラベクターと比べて減少されるかどうかを、容易に決定することができる。そのようなアッセイは、定量的又は定性的結果を提供してよい。例えば、アッセイは、中和抗体誘導能の絶対測定値を提供してよく、その後これはLCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVキメラベクターについて予め決定された数値と比較されてよい。加えて又は代わりに、アッセイは、中和抗体を誘導する相対能力を定量的に提供してよい。本発明において利用され得る例示的アッセイは、実施例5に提供されている。図9に示したように、これらの結果は、驚くべきことに予想を超えて、本発明のベクターは中和抗体の有意に減少された誘導を示すことを示している。従って例示的アッセイは、免疫処置後の異なる時点由来の血清試料に添加される中和抗体の存在の決定におけるp-ニトロフェニルリン酸(pNPP)の使用を含んでよい。nAbが存在しない場合、表面タンパク質の代わりに分泌型胚性アルカリホスファターゼ(SEAP)の遺伝子を収容しているGP-シュードタイプ化されたウイルス(各々、LCMV-GP、DANDV-GP又はMOPV-GP)は、BHK21Cl.13細胞に感染し、SEAPの発現を生じることができる。対照的に、このウイルスが、血清中の抗体により中和される場合、ウイルスは、この細胞を感染することができず、これによりSEAPは発現されない。従って、nAb活性は、SEAP活性の関数として決定され得る。非線形曲線のフィッティングにより、EC50値は計算することができる。
本発明の一実施態様において、改善された生物学的作用は、同一条件下でLCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVベクターと比べた、腫瘍細胞の死滅の増加であることができる。従って本発明は一実施態様において、ベクターが、ダンデノングウイルス(DANDV)又はモペイアウイルス(MOPV)の糖タンパク質GPをコードしている遺伝子を含み、且つVSVのエンベロープタンパク質Gをコードしている機能性遺伝子を欠いていることを特徴とする、VSVキメラベクターに関し、ここでこのベクターは、同一条件下で、LCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVベクターと比べ、腫瘍細胞の増加した死滅を示す。当業者は、腫瘍細胞が死滅されるかどうか及びどの程度死滅されるかを決定する手段及び方法を良く知っている。従って当業者は、本発明のVSVキメラベクターは、腫瘍細胞を死滅させるかどうか、及びその死滅は、LCMVのGPを発現するVSVキメラベクターと比べて増加されるかどうかを、容易に決定することができる。そのようなアッセイは、定量的又は定性的結果を提供することができる。例えば、アッセイは、腫瘍細胞を死滅させる能力の絶対測定値を提供することができ、その後これはLCMVのGPを発現するVSVキメラベクターについて予め決定された数値と比較されてよい。加えて又は代わりに、アッセイは、腫瘍細胞を死滅させる相対能力を定量的に提供してよい。例示的アッセイは、実施例4に提供される。そのようなアッセイは、IFNにより感染された細胞のプレインキュベーション、及び引き続きの本発明のVSVキメラベクター及び/又はLCMVのVSV-GPによる感染を含んでよい。例えば3日間などのインキュベーション後、細胞は、MTT(3-(4,5-ジメチルチアゾール-2-イル)-2,5-ジフェニルテトラゾリウムブロミド)-ベースのインビトロ細胞毒性アッセイを、製造業者の推奨に従い用い、生存度について分析されてよい。その後試料は、常用のマイクロプレートリーダーにおいて、550nmで測定され得る。値は、インターフェロン(IFN)による前処置をしなかった偽感染した細胞に対し規準化され、生存細胞の割合(%)として表され得る。
ダンデノングウイルス(DANDV)は、旧世界アレナウイルスである[12]。今日まで、糖タンパク質GPを含み、且つ本発明のVSVキメラベクターに含まれるGPのドナーとして本発明において利用され得る当業者に公知であるただ1種の株が存在する。本発明のVSVキメラベクター中に含まれるDANDV GPは、6個以上のグリコシル化部位;特に7個のグリコシル化部位を有する。好ましいGPの例は、Genbank寄託番号EU136038でアクセス可能なDANDVに含まれるものである。従って、一実施態様において、DANDVのGPをコードしている遺伝子は、配列番号1に示された核酸配列、又は配列番号1の核酸配列と少なくとも80、85、90、95、96、97、98、99もしくは100%の配列同一性を有する配列を有する一方で、配列番号1において示された核酸配列によりコードされたGPを含むキメラVSVベクターの機能特性は維持される。
モペイアウイルス(MOPV)は、旧世界アレナウイルスである[13]。糖タンパク質GPを含み、且つ本発明のVSVキメラベクターに含まれるGPのドナーとして本発明において利用され得る当業者に公知である数種の株が存在する。本発明のVSVキメラベクター中に含まれるMOPV GPは、6個以上のグリコシル化部位;特に7個のグリコシル化部位を有する。好ましいGPの例は、Genbank寄託番号AY772170でアクセス可能なモペイアウイルスに含まれるものである。従って、一実施態様において、MOPVのGPをコードしている遺伝子は、配列番号3に示された核酸配列、又は配列番号3の核酸配列と少なくとも60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99もしくは100%の配列同一性を有する配列を有する一方で、配列番号3において示された核酸配列によりコードされたGPを含むキメラVSVベクターの機能特性は維持される。
イッピイウイルス(Ippy virus)(IPPYV)は、野生で捕獲された齧歯類であるナイルサバンナネズミ(Arvicanthis sp.)から最初に単離された旧世界アレナウイルスである[14]。糖タンパク質GPを含み、且つ本発明のVSVキメラベクターに含まれるGPのドナーとして本発明において利用され得る当業者に公知である数種の株が存在する。本発明のVSVキメラベクター中に含まれるIPPYV GPは、6個以上のグリコシル化部位、好ましくは8個以上のグリコシル化部位、特に10個のグリコシル化部位を有する。好ましいGPの例は、Genbank寄託番号DQ328877でアクセス可能なIPPYVに含まれるものである。従って、一実施態様において、イッピイウイルスのGPをコードしている遺伝子は、配列番号5に示された核酸配列、又は配列番号5の核酸配列と少なくとも60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99もしくは100%の配列同一性を有する配列を有する一方で、配列番号5において示された核酸配列によりコードされたGPを含むキメラVSVベクターの機能特性は維持される。
ラティーノウイルス(Latino virus)(LATV)は、成体の妊娠した雌のブラジルヨルマウス(Calomys callosus)から最初に単離された旧世界アレナウイルスである[15]。糖タンパク質GPを含み、且つ本発明のVSVキメラベクターに含まれるGPのドナーとして本発明において利用され得る当業者に公知である数種の株が存在する。本発明のVSVキメラベクター中に含まれるLATV GPは、6個以上のグリコシル化部位、好ましくは8個以上のグリコシル化部位、特に10個のグリコシル化部位を有する。好ましいGPの例は、Genbank寄託番号AF485259でアクセス可能なLATVに含まれるものである。従って、一実施態様において、LATVのGPをコードしている遺伝子は、配列番号7に示された核酸配列、又は配列番号7の核酸配列と少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99もしくは100%の配列同一性を有する配列を有する一方で、配列番号7において示された核酸配列によりコードされたGPを含むキメラVSVベクターの機能特性は維持される。
オリベロウイルス(Olivero virus)(OLIVV)は、齧歯類ボロモス・オブセキュア(Bolomys obscures)から最初に単離された新世界アレナウイルスである[16]。糖タンパク質GPを含み、且つ本発明のVSVキメラベクターに含まれるGPのドナーとして本発明において利用され得る当業者に公知である数種の株が存在する。本発明のVSVキメラベクター中に含まれるOLIVV GPは、6個以上のグリコシル化部位、好ましくは8個以上のグリコシル化部位、特に9個のグリコシル化部位を有する。好ましいGPの例は、Genbank寄託番号U34248でアクセス可能なOLIVVに含まれるものである。従って、一実施態様において、OLIVVのGPをコードしている遺伝子は、配列番号9に示された核酸配列、又は配列番号9の核酸配列と少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99もしくは100%の配列同一性を有する配列を有する一方で、配列番号9において示された核酸配列によりコードされたGPを含むキメラVSVベクターの機能特性は維持される。
先に説明され且つ添付された実施例において示された本発明のVSVキメラベクターの驚くべき予想外の技術的利点の観点において、医学的用途のための本発明のベクター、従ってそのような用途に適していると具体的に指定されたベクターを提供することは、本発明の範囲内である。従って、本発明の一実施態様において、少なくとも1つの導入遺伝子を含む本発明のベクターが、提供される。「導入遺伝子」は、1つの生体から単離され、且つ異なる生体に導入される、遺伝子配列を含むDNAのセグメントである。本発明において、本発明のベクターに含まれる単数又は複数の導入遺伝子は、任意の起源であってよく、且つ標的化された細胞に何らかの生物学的作用を有してよい。
更なる実施態様において、本発明は、システムが少なくとも2種の補完的複製(complementary replicating)するVSVベクターを含むことを特徴とする、VSVキメラベクターシステムに関し、ここでこのシステムは、VSVのタンパク質N、L、P及びMをコードしている遺伝子n、l、p及びm、ダンデノング-GP又はモペイア-GPをコードしている遺伝子gpを含み、且つVSVのGタンパク質をコードしている機能性遺伝子を欠いており、ここでこのシステムの各ベクターは、遺伝子n、l、p、m及びgpの一つを欠いており、且つここでこの欠けている遺伝子は、このシステムの任意の他のベクター上に存在する。本発明のVSVキメラベクターシステムに含まれる各GP遺伝子は、先に説明された本発明のVSVキメラベクターに含まれるGPタンパク質をコードしている遺伝子の一つである。
本発明は、更なる実施態様において、ビリオンが、エンベロープタンパク質として、ダンデノングウイルス又はモペイアウイルスのGPタンパク質を含むことを特徴とする、キメラVSVビリオンに関する。更なる実施態様において、このビリオンは、エンベロープタンパク質として、イッピイウイルス、ラティーノウイルス、又はオリベロウイルスのGPを含んでよい。従って本発明はまた、エンベロープタンパク質として、先に説明されたGP遺伝子のいずれかの産物を含むウイルス粒子である、ビリオンも提供する。この点において、当業者は、ビリオンのエンベロープタンパク質は、宿主の細胞膜上の受容体部位を同定し且つ結合するために役立つことを知っている。従って本発明のビリオンは、エンベロープタンパク質としてそれらの表面上にキメラGPタンパク質、すなわちVSVのGPタンパク質とは異なるGPタンパク質を含む。しかし、これらのビリオン核酸配列内容物の組成は、特に限定されない。すなわち、例えばキメラVSVビリオンは、VSVのGPをコードしている非機能性遺伝子を含んでよい。これらのキメラVSVビリオンはまた、VSVのGPをコードしている遺伝子を欠いてよい。本発明のキメラVSVビリオンの表面上に発現されたGPは、更に先に説明されたような、ダンデノングウイルス又はモペイアウイルスのGPタンパク質をコードしている遺伝子の遺伝子産物である。更なる実施態様において、本発明のキメラVSVビリオンの表面上に発現されたGPは、更に先に説明されたような、イッピイウイルス、ラティーノウイルス、又はオリベロウイルスのGPをコードしている遺伝子の遺伝子産物であってよい。従って、このGPタンパク質は、配列番号2、又は4のいずれか一つに示されるアミノ酸配列を含んでよい。或いはこのGPタンパク質は、配列番号6、8又は10のいずれか一つに示されるアミノ酸配列を含んでよい。本発明のキメラVSVビリオンはまた、エンベロープタンパク質として、配列番号2と60、65、70、75、80、85、90もしくは95%の配列同一性、又は配列番号4と45、50、55、60、65、70、75、80、85、90もしくは95%の配列同一性、又は配列番号6と45、50、55、60、65、70、75、80、85、90もしくは95%の配列同一性、又は配列番号8と92、93、94、95、96、97、98もしくは99%の配列同一性、又は配列番号10と60、65、70、75、80、85、90もしくは95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質を含んでよく、ここでこれらのエンベロープタンパク質は、エンベロープタンパク質として、配列番号2、4、6、8又は10のいずれか一つに示されたアミノ酸配列を含むGPを含むキメラVSVビリオンの細胞トロピズム及び機能性を維持している。
本発明はまた、細胞が、本発明のキメラVSVビリオンを産生することを特徴とする、ウイルス産生細胞も提供する。この細胞は、任意の起源であってよく、且つ単離された細胞として、又は細胞集団に含まれる細胞として存在してよい。本発明のシュードタイプ化されたVSVビリオンを産生する細胞は、哺乳動物細胞であることは、好ましい。より好ましい実施態様において、本発明のウイルス産生細胞は、哺乳動物細胞は、多能性成体前駆細胞(MAPC)、神経幹細胞(NSC)、間葉系幹細胞(MSC)、HeLa細胞、任意のHEK293細胞、Vero細胞又は骨髄由来の腫瘍浸潤細胞(BM-TIC)であることを特徴としている。或いは、このウイルス産生細胞は、ヒト細胞、サル細胞、マウス細胞又はハムスター細胞であってよい。当業者は、所与の細胞が、ウイルスを産生するかどうか、従って特定の細胞が本発明の範囲内に収まるかどうかを試験する際に使用するのに適した方法を知っている。この点において、本発明の細胞により産生されたウイルスの量は、特に限定されない。好ましいウイルス力価は、更なる下流の処理を伴わない感染後の所定の細胞培養物の粗上清中、≧1×107TCID50/ml、又は≧1×108ゲノムコピー/mlである。
特定の実施態様において、本発明のウイルス産生細胞は、細胞がVSVのタンパク質N、L、P及びMをコードしている遺伝子n、l、p及びm、並びにダンデノング-GP又はモペイア-GP糖タンパク質をコードしている遺伝子gpからなる群から選択される少なくとも1種の遺伝子の発現のための1又は複数の発現カセットを含むことを特徴としている。
本発明のウイルス産生細胞は、例えば遺伝子治療において使用されてよい。そのような目的のために、この細胞はダンデノング又はモペイアウイルスのGPによりシュードタイプ化されたVSVビリオンへのパッケージングのための遺伝子導入ベクターを含み、ここでこの遺伝子導入ベクターが、導入遺伝子を含むことを特徴とするウイルス産生細胞が提供される。この点において、導入遺伝子は、宿主の特定の必要性に対処する遺伝子であってよい。
本発明の意図内の導入遺伝子は、本明細書に提供される手段を使用し、細胞へ導入されてよい。従って一実施態様において、本発明は、細胞が、本発明のキメラビリオンにより形質導入され、ここでビリオンが、導入遺伝子を含むことを特徴とする、インビトロ又はインビボにおいて細胞へ導入遺伝子を導入する方法に関連している。導入遺伝子はまた、本発明のウイルス産生細胞を使用し導入されてよい。従って更なる実施態様において、細胞を、本発明のウイルス産生細胞と接触させることを特徴とする、インビトロにおいて細胞へ導入遺伝子を導入する方法が、提供される。それへ導入遺伝子が導入される細胞は、腫瘍細胞であることが、好ましい。
更なる実施態様において、本発明は、本明細書に提供される任意の手段を含む医薬組成物に関する。従ってこの医薬組成物は、組成物が、本発明のVSVキメラベクター、本発明のVSVキメラベクターシステム、本発明のキメラVSVビリオン、又は本発明のウイルス産生細胞を含むことを特徴とすることができる。
更なる実施態様において、本明細書に提供される手段、特に本発明のVSVキメラベクター、本発明のVSVキメラベクターシステム、本発明のキメラVSVビリオン、本発明のウイルス産生細胞、又は本発明の医薬組成物は、医薬品として使用するために提供される。
本発明は更に、癌の治療において使用するための、本発明のVSVキメラベクター、本発明のVSVキメラベクターシステム、本発明のキメラVSVビリオン、本発明のウイルス産生細胞、又は本発明の医薬組成物に関する。好ましい実施態様において、癌は、固形癌である。より好ましい実施態様において、固形癌は、脳癌、結腸直腸癌、中咽頭扁平上皮癌、胃癌、胃食道接合部腺癌、食道癌、肝細胞癌、膵臓腺癌、胆管癌、膀胱尿路上皮癌、転移性黒色腫、前立腺癌、乳癌、膠芽細胞腫、非小細胞肺癌、脳腫瘍又は小細胞肺癌であることができる。
本発明の更なる実施態様において、本発明のVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物が提供され、ここでVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物は、PD-1又はPD-L1アンタゴニストと組合せられる。そのような組合せは、投与前に行われてよく、すなわち、本発明のVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物は、それを必要とする患者へ投与する前に、PD-1又はPD-L1アンタゴニストと組合せられ、併用製剤を形成することができる。或いは、本発明のVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物は、個別に投与され、併用治療を形成することができる。従って本発明はまた、本明細書に提供される使用のための、本発明のVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物と、PD-1又はPD-L1アンタゴニストを含有する医薬組成物にも関する。更に本発明は、本発明のVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物の投与、並びにPD-1又はPD-L1アンタゴニストの投与を含む、治療方法に関する。
本発明内において、当業者、特に医師は、本発明のVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物の適切な投与経路を選択することができる。特定の実施態様において、本発明のVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物が提供され、ここでVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物は、腫瘍内又は静脈内に投与される。別の実施態様において、本発明に従い使用するためのVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物が提供され、ここでVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物は、腫瘍内に、続いて静脈内に投与される。すなわち、本発明のVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物は、静脈内又は腫瘍内投与に好適に製剤化されてよい。
本発明はまた、対象、特にヒト対象を治療する方法も提供し、ここで対象は、癌、特に固形腫瘍を有し、この方法は、本発明のVSVキメラベクター、本発明のVSVキメラベクターシステム、本発明のキメラVSVビリオン、本発明のウイルス産生細胞、又は本発明の医薬組成物の治療的有効量を投与することを含む。特定の実施態様において、固形癌は、脳癌、結腸直腸癌、中咽頭扁平上皮癌、胃癌、胃食道接合部腺癌、食道癌、肝細胞癌、膵臓腺癌、胆管癌、膀胱尿路上皮癌、転移性黒色腫、前立腺癌、乳癌、膠芽細胞腫、非小細胞肺癌、脳腫瘍又は小細胞肺癌である。
本発明は更に、本明細書に提供される手段を備えるキットに関連している。
図1は、表(表1):旧世界アレナウイルス(A)及び新世界アレナウイルスクレードC(B)のGPC配列の比較である。配列は、NCBIから入手した。N-連結したグリコシル化シグナルNxT又はNxSの数は、翻訳されたヌクレオチド配列から推定され、且つ6(LCMV)~10(IPPV、OLIVV)シグナルの範囲であった。与えられたアミノ酸位置は、翻訳開始のメチオニンから出発する個々の配列の配列位置に対応する。GPC配列は、ペアワイズMUSCLEアラインメントによりLCMV-GP WE HPIと比較した[17]。相対配列同一性(% Seq Id.)、絶対同一性(n)及び配列類似性が、示されている。aa:アミノ酸、nt:ヌクレオチド。 図2:アレナウイルス糖タンパク質の複数の配列アラインメント。LCMV-GP WE HPI、DANVD GP、IPPYV GP、MOPV GP、OLIVV GP及びLATV GPのアミノ酸配列は、MUSCLEを用いて整列させた[17]。黒色矢印は、シグナルペプチダーゼの切断部位、並びに前駆体糖タンパク質GPCを、SSP、GP1及びGP2へ切断する細胞サブチリシンケキシンアイソザイム1(SKI-1)/サイト1プロテアーゼ(S1P)の切断部位を示した。アレナウイルスGPのGP1ペプチド内の推定されたN-連結したグリコシル化シグナル配列NxT又はNxSは、破線によりボックスで囲んだ。 図2:アレナウイルス糖タンパク質の複数の配列アラインメント。LCMV-GP WE HPI、DANVD GP、IPPYV GP、MOPV GP、OLIVV GP及びLATV GPのアミノ酸配列は、MUSCLEを用いて整列させた[17]。黒色矢印は、シグナルペプチダーゼの切断部位、並びに前駆体糖タンパク質GPCを、SSP、GP1及びGP2へ切断する細胞サブチリシンケキシンアイソザイム1(SKI-1)/サイト1プロテアーゼ(S1P)の切断部位を示した。アレナウイルスGPのGP1ペプチド内の推定されたN-連結したグリコシル化シグナル配列NxT又はNxSは、破線によりボックスで囲んだ。 図2:アレナウイルス糖タンパク質の複数の配列アラインメント。LCMV-GP WE HPI、DANVD GP、IPPYV GP、MOPV GP、OLIVV GP及びLATV GPのアミノ酸配列は、MUSCLEを用いて整列させた[17]。黒色矢印は、シグナルペプチダーゼの切断部位、並びに前駆体糖タンパク質GPCを、SSP、GP1及びGP2へ切断する細胞サブチリシンケキシンアイソザイム1(SKI-1)/サイト1プロテアーゼ(S1P)の切断部位を示した。アレナウイルスGPのGP1ペプチド内の推定されたN-連結したグリコシル化シグナル配列NxT又はNxSは、破線によりボックスで囲んだ。 図3は、表(表2):選択された旧世界及び新世界クレードCアレナウイルスの中のGPC領域におけるヌクレオチド及びアミノ酸の配列同一性である。 図4:trans-補完された(trans-complemented)VSV*MQΔGウイルスにより感染されたBHK21Cl.13細胞におけるGFP発現。VSVマトリックスタンパク質内に変異M33A、M51R、V221F及びS226Rを保有し、且つeGFP配列によるGタンパク質の全コード配列の置き換えを伴う、非細胞壊死性VSV*MQΔGウイルス[18]は、BHK21Cl.13細胞においてtrans-補完された。VSV*MQΔGによる感染効率(MOI)3での感染の24時間前に、BHK21Cl.13は、その細胞においてアレナウイルスGPを発現するように、発現プラスミドpCAG-DANDV-GP、pCAG-IPPYV-GP、pCAG-LATV-GP、pCAG-MOPV-GP又はpCAG-OLIVV-GPにより一過性にトランスフェクトした。対照について、細胞を、偽トランスフェクションした。trans-補完されたウイルスを含む上清を、感染後24時間で収集し、且つ希釈せずに(無希釈)又は1:10から1:1000の範囲で連続10倍希釈して、BHK21Cl.13細胞(A)又はBHK-556細胞(B)のいずれかの上で、継代した。LCMV-GPを安定して発現しているBHK-566細胞において、DANDV-GP、LATV-GP、MOPV-GP又はOLIVV-GPによりtrans-補完されたVSVΔG GFPウイルスは、高い希釈であっても、細胞培養物中に拡散することができ、このことは感染の48時間後の偏在性のGFP発現につながった。IPPY-GPは、VSV*MQΔGウイルスをtrans-補完せず、従って、BHK-566細胞は、偽対照よりもより高いレベルでGFPを発現しなかった。GFP蛍光は、感染の48時間後に、Leica DM2500蛍光顕微鏡上で同一露光時間で撮像した。 図5は、表(表3):VSV*McpΔGのtrans-補完されたウイルスの細胞変性効果である。VSV*McpΔGウイルス[18]は、BHK21Cl.13細胞においてtrans-補完された。VSV*McpΔGによるMOI=3での感染の24時間前に、BHK21Cl.13は、発現プラスミドpCAG-DANDV-GP、pCAG-IPPYV-GP、pCAG-LATV-GP、pCAG-MOPV-GP又はpCAG-OLIVV-GPにより一過性にトランスフェクトした。対照について、細胞を、偽トランスフェクションした。trans-補完されたウイルスを含む上清を、感染後24時間で(24hpi)収集し、且つ希釈せずに(無希釈)又は1:10から1:1000の範囲で連続10倍希釈して、BHK21Cl.13細胞(A)又はBHK-556細胞(B)のいずれかの上で、継代した。LCMV-GPを安定して発現しているBHK-566細胞において、DANDV-GP、LATV-GP、MOPV-GP又はOLIVV-GPによりtrans-補完されたVSV*McpΔGウイルスは、高い希釈であっても、細胞培養物中に拡散することができた。細胞変性効果(CPE)は、明視野顕微鏡下で感染の48時間後にモニタリングした。CPEの分類は、強CPE(++++)から目視できるCPEなし(-)の範囲である。 図6:VSV-G(x)DANDV及びMOPV複製動態。Vero細胞を、T75細胞培養フラスコ中に感染のために、密度4×104個細胞/cm2で播種し、対照としてのVSV-GP及び2種のバリアントVSV-G(x)DANDV及びVSV-G(x)MOPVを指定されたMOI(感染効率、0.05又は0.0005)で、24時間後に感染させた。試料を、24、30及び42時間で採取し、且つ感染力価(infectious titer)を、TCID50(A)により決定し、並びにゲノム力価(B)を、qPCRにより決定した。 図7:I型インターフェロン(IFN)は、ヒト腫瘍細胞株におけるVSV-G(x)複製を制限した。ヒトCalu6細胞(A)及び22Rv1細胞(B)を、指定された量のIFNと共に、16時間プレインキュベーションした。引き続き、細胞を、VSV-GP、VSV-G(x)DANDV、VSV-G(x)MOPV又はVSV-G(x)OLIVVにより、MOIの0.1、1、又は10で、4つ組で感染させるか、又は陰性対照として未感染で放置した。感染の3日後、細胞を、MTTアッセイを用い、生存度について分析した。グラフは、平均±SEMで示し、IFNにより前処理しなかった非感染細胞の生存度を100%に規準化している。 図8:I型インターフェロン(IFN)は、マウス腫瘍細胞株におけるVSV-G(x)複製を制限した。マウスのSCCVII細胞(A)、Ct26Cl.25細胞(B)又はLLC1細胞(C)を、指定された量のIFNと共に、16時間プレインキュベーションした。引き続き、細胞を、VSV-GP、VSV-G(x)DANDV、VSV-G(x)MOPV又はVSV-G(x)OLIVVにより、MOIの0.1、1、又は10で、4つ組で感染させるか、又は陰性対照として未感染で放置した。感染の3日後、細胞を、MTTアッセイを用い、生存度について分析した。グラフは、平均±SEMで示し、IFNにより前処理しなかった非感染細胞の生存度を100%に規準化している。 図9:ウサギの処置及びモニタリングのスケジュール。このスケジュールは、3つの中の1つの処置のデザインを示している。処置の全てのサイクルは、同一であり、且つVSV-GP又はVSV-G(x)ウイルスのi.v.注射により、D0、D14及びD28に開始した。ウサギが操作される時点は、矢印で示した。nAb、中和抗体;BW、体重;BT、体温;WBC、白血球カウント。 図10:LCMV-GP、DANDV-GP及びMOPV-GP組換えVSVベクターで免疫処置したウサギにおける中和抗体の誘導。各ウイルス処置(プライム、初回ブースト、第2回目ブースト)後-4日目、10日目並びに実験終了時に収集した血清を、自己アレナウイルス糖タンパク質に対する中和抗体について分析した。血清を、方法セクションにおいて詳細に説明したLCMV-GP WE-HPI、DANDV-GP又はMOPV-GPのいずれかでシュードタイプ化したVSVΔG SEAPを用いて、それらの中和能について試験した。(A)感染率[%]は、非血清対照に対し規準化し、1:10から1:31.250までの範囲での血清希釈に対しプロットした。プライム免疫処置(白四角)後、どのウサギも、LCMV、DANDV又はMOPVのアレナウイルスGPに対するnAbを示さなかった。初回ブースト後、VSV-G(x)、DANDV及びMOPVで免疫処置したウサギの血清は、VSV-GPで免疫処置したウサギの血清と比べ、自己VSVΔG SEAPウイルスの部分的中和のみを示し、従って対応するEC50値の計算は、適応不能であった(n.a.)。EC50値は、非線形曲線フィット後に計算した(B)。LCMV-GP中和抗体KL25によるVSV-ΔG SEAP-GPの中和は、アッセイ間の対照として使用した(C)。 図11:肺癌異種移植マウスモデルにおける様々なアレナウイルス糖タンパク質GP組換えVSVベクターによる腫瘍内処置の有効性。5×106個Calu6肺癌細胞を、8週齢のNMRIヌードマウスの右側腹部に皮下注射した。腫瘍の平均サイズが容積0.05~0.07cm3に到達した時点で、処置を開始した。マウスを、腫瘍内PBS(n=8)マウス(A)、又は1×107TCID50のVSV-GP(B)、VSV-G(x)DANDVもしくはVSV-G(x)MOPV(D)のいずれかで、4日間間をあけて3回処置した。動物は、処置の開始後、2~3日毎に、腫瘍増殖についてモニタリングし、腫瘍容積が0.8cm3に到達するか又は腫瘍が潰瘍化した時点で、屠殺した。カプラン-マイヤー生存曲線(E)。点線は、ウイルス注射の時点を指摘している。 図12は、表(表4):ウイルス誘導した神経毒性の評価に関するスコアである。感染したマウスの神経毒性スコアは、全般的外見、臨床所見、身体状態、誘発された行動、運動性、及び呼吸などの様々なカテゴリーを基にした。異なるカテゴリーのスコアは、0~3の範囲である。図12に示した累積毒性スコアは、各カテゴリーのスコアを足し算して計算した。 図13:SwissCD1マウスにおける神経毒性。SwissCD-1マウスは、右線条体への定位固定注射により、1×106TCID50を含有する3μlの単回頭蓋内注射を受け取った。PBSを、対照群においてi.c.投与した。動物を、42日間、図12に従い、神経毒性の徴候及び一般的健康について、毎日モニタリングした。(A)PBS(菱形)、VSV-G DsRed(四角)、VSV-GP(点)、VSV-GP(x)ダンデノング(三角)及びVSV-GP(x)モペイア(逆三角)の実験群のマウス生存は、カプラン-マイヤー曲線としてプロットした。カプラン-マイヤー解析は、試験したウイルスバリアントは、マウスにおいて神経毒性を示さなかったことを指摘している。(B)図12に従い計算した累積毒性スコアは、これらの群内で観察された神経毒性は存在しないことを指摘している。ビリオン表面に野生型VSV糖タンパク質を含むVSV-G DsRed対照群のみ、神経学的徴候を発症し、これはi.c.感染後第一週目での安楽死につながった。
詳細な説明
先に説明したように、本発明は、概して、キメラVSVベクターの提供に関し、ここでこのVSVベクターは、VSVのエンベロープタンパク質GPをコードしている機能性遺伝子を欠き、且つ代わりに、アレナウイルス、特にダンデノングウイルス又はモペイアウイルス(MOPV)の糖タンパク質GPをコードしている遺伝子を含む。或いはこれらのベクターは、イッピイウイルス、ラティーノウイルス又はオリベロウイルスのGPを含んでよい。当業者が公知のように、糖タンパク質GPは、ビリオンの表面上に存在するエンベロープタンパク質であり、これはビリオンと宿主生物の細胞の間の結合に寄与している。従って、このエンベロープタンパク質は、ビリオンのトロピズムを決定する。VSVのトロピズムを変更することにより、医薬における使用に適しているキメラVSVベクターを調製することができる。そのようなキメラベクター/ビリオンは、先行技術において、例えばWO2010/040526において、提供されている。しかし、更により効率的な治療選択肢及び医薬用途に関して更により良い適性を提供する更に改善されたキメラベクターの必要性が存在する。この必要性は、本発明により満たされる。
別に定義されない限りは、本明細書において使用される技術用語及び科学用語は、本発明が属する分野の業者により通常理解される意味、並びに本出願中で使用される多くの用語に対する一般的指針を当業者に提供する刊行された文献を参照した意味と、同じ意味を有する。以下の定義は、単に明確化のために提供され、請求された本発明の範囲を限定することは意図していない。
用語「ある(a又はan)」は、1又は複数を指し、例えば「ある遺伝子」は、1又は複数のそのような遺伝子を表すと理解される。従って、用語「ある(a又はan)」、「1又は複数」、及び「少なくとも1」は、本明細書において互換的に使用される。本明細書において使用される用語「約」は、別に特定されない限りは、所与の言及から10%の変動であることを意味する。
以下の説明に関して、本明細書記載の各組成物は、別の実施態様において、本発明の方法において有用であることが意図されている。加えて、本方法において有用と本明細書記載の各組成物は、別の実施態様において、本発明の実施態様それ自身であることも意図されている。本明細書の様々な実施態様が語句「含んでなる」を用いて表される場合、他の状況下において、関連した実施態様はまた、語句「からなる」又は「から本質的になる」を用いて解釈及び説明されることも意図される。
この点において、本発明のベクターは、水疱性口内炎のウイルスを基にし、且つレトロウイルスベクターにまさる少なくとも以下の全般的利点を有する:
(i) VSVベクターは、腫瘍溶解性であり、且つ他の腫瘍溶解性ウイルスベクターと比べ、特に高い腫瘍溶解性活性を有する。
(ii) VSVベクターは、腫瘍細胞において優先的に複製し、且つ他の腫瘍溶解性ウイルスベクターと比べ、特に高い複製能を有する。
(iii) VSVベクターは、活発な分裂細胞に加え、静止細胞に感染する。
(iv) VSVベクターは、強力な先天性の体液性及び細胞性免疫応答を誘導する。
(v) VSVベクターは、純粋に細胞質性で、すなわちRNAウイルスとして、複製し、これらは、宿主細胞ゲノムへ組込むか、又は複製-コンピテントなウイルスを組換えることができない。
(vi) VSVベクターは、容易にパッケージングされる。
(vii) VSV糖タンパク質は、外来エンベロープタンパク質と互換性がある。先にVSVエンベロープへ取り込まれている糖タンパク質の例は:HIVgp160[19]、HCVE1/E2[20]、SARS S[21]、Lassa GP[22]、又はLCMVのGPである。しかし本発明のベクターは、先行技術、及び特にLCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVにまさる追加の利点を有する。
具体的には、本発明のベクターは驚くべきことに、同一条件下で、LCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVベクターと比べ、中和抗体の減少された誘導を示す。当業者は、中和抗体の誘導を決定するために利用され得るアッセイを知っている。
実施例5に説明されたアッセイを使用することにより、本発明者らは、驚くべきことに、中和抗体の誘導が減少されることを発見した。そのような作用は、当業者により当然のようには予測されていなかった。更に、この作用の意義は、本明細書に提供されるベクター及び更なる手段は、明らかな利点を提供することを証明している。この点において、本明細書に提供されるベクター/ビリオンによる中和抗体の誘導は、LCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVベクターと比べ、減少されることが好ましい。
本発明のベクター/ビリオンは、中和抗体を減少することを証明したのみではなく、同じ条件下でLCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVベクターと比べ、腫瘍細胞の死滅の増大も追加的に示す。当業者は、腫瘍細胞の死滅を決定/定量するために利用することができるアッセイを知っている。本発明のベクター/ビリオンによる腫瘍細胞の死滅は、LCMVのGPによりシュードタイプ化されたVSVベクターと比べ、増加されることは、好ましい。
先に説明された驚くべき作用を達成するために、VSVのGPは、非機能性であるが、ダンデノングウイルスもしくはモペイア(MOPV)ウイルスのGPは、取り込まれるか、又はVSVのGPは、ダンデノングウイルスもしくはモペイア(MOPV)ウイルスのGPにより置き換えられる。或いはVSVのGPは、非機能性であるが、イッピイウイルス、ラティーノウイルスもしくはオリベロウイルスのGPは、取り込まれるか、又はVSVのGPは、イッピイウイルス、ラティーノウイルスもしくはオリベロウイルスのGPにより置き換えられる。どのようにVSVベクターが、先のGPのいずれかによりシュードタイプ化され得るかについては、様々な可能性が存在する。従って本発明のベクターの正確な核酸配列は、VSVのGPが、ビリオンの表面に本質的に存在しない一方で、先の任意のウイルスのGPが、ビリオンの表面に発現される限りは、変動してよい。本発明内において、好ましいベクターの例は、配列番号1又は3、5、7又は9を含む核酸配列、或いは配列番号1、3、5、7又は9のいずれか一つと少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99もしくは100%の同一性の核酸配列を含む核酸配列を含む。この点において、配列番号1は、ダンデノングウイルスのGPをコードしている好ましい核酸配列に対応し、配列番号3は、モペイアウイルスのGPをコードしている好ましい核酸配列に対応し、配列番号5は、イッピイウイルスのGPをコードしている好ましい核酸配列に対応し、配列番号7は、ラティーノウイルスのGPをコードしている好ましい核酸配列に対応し、及び配列番号9は、オリベロウイルスのGPをコードしている好ましい核酸配列に対応している。
参照核酸配列に関する「核酸配列同一性の割合(%)」は、参照配列のヌクレオチドと同一である候補配列中のヌクレオチドの割合として定義される。同一ヌクレオチドの割合を決定する方法は、当業者に公知である。本発明内で、BLASTなどのコンピュータソフトウェアを使用することは好ましい。パラメータは、当業者により用意に決定することができる。
VSVをシュードタイプ化するために使用される任意のGP遺伝子をコードしている核酸配列は、変動してよいが、先に提供された好ましい遺伝子配列によりコードされたGPにより付与される機能性は、維持されることは重要である。維持される機能性パラメータは、好ましくは、中和抗体の誘導、腫瘍細胞の死滅及び/又はトロピズムである。この点において、先に提供されたアッセイを、利用することができる。更に、当業者は、ウイルス粒子/ビリオンのトロピズムを決定するために利用することができるアッセイを知っている。
当業者が理解するように、核酸配列は、コードされたポリペプチドの一次配列の変化を伴うか又は伴わずに変動され得る。本発明内で、シュードタイプ化に使用される遺伝子によりコードされたポリペプチド配列は、各々、配列番号1、3、5、7又は9によりコードされたGPタンパク質に関して変更されないままであることは好ましい。すなわち、本発明のビリオンに含まれるGPタンパク質は、ダンデノング又はモペイアウイルスのGPタンパク質に対応することは、好ましい。より特定すると、本発明のビリオンは、配列番号2、4、6、8又は10に示されたアミノ酸配列のいずれか一つを含むGPタンパク質を含むことは、好ましい。しかし、当業者は、ポリペプチドのアミノ酸配列は、その機能性に影響を及ぼすことなく変更され得ることを知っている。従って、代替配列を含むポリペプチドもまた、前記アミノ酸配列のいずれか一つの機能性が本質的に維持される限りは、本発明に包含される。
従っていくつかの実施態様において、本明細書に提供されるGPタンパク質のアミノ酸配列バリアントを含むビリオンが、企図される。アミノ酸配列バリアントは、それぞれのGPをコードしているヌクレオチド配列へ好適な修飾を導入することによるか、又はペプチド合成により、調製され得る。そのような修飾は、例えば、GPのアミノ酸配列内の残基の欠失、及び/又は挿入、及び/又は置換を含む。最終構築体が、例えば中和抗体の導入、腫瘍細胞の死滅及び/又はトロピズムなどの、所望の特徴を有することを条件として、欠失、挿入及び置換の任意の組合せを、最終構築体に至るように作製することができる。
いくつかの実施態様において、1又は複数のアミノ酸置換を有するバリアントが提供される。保存的置換は、「好ましい置換」の見出しで、表5に示されている。より実質的変化は、「例示的置換」の見出しで表5に提供されており、且つアミノ酸側鎖クラスに関して以下に更に説明されている。アミノ酸置換は、関心対象のGPへ導入されてよく、生成物/ビリオンは、所望の活性についてスクリーニングされる。
アミノ酸は、共通の側鎖特性に従いグループ化されてよい:
(1) 疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2) 中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3) 酸性:Asp、Glu;
(4) 塩基性:His、Lys、Arg;
(5) 鎖配向に影響を及ぼす残基:Gly、Pro;
(6) 芳香族:Trp、Tyr、Phe。
Figure 2022510856000001
非保存的置換は、これらのクラスの一つのメンバーを、別のクラスに交換することを必然的に伴うであろう。本発明の範囲内で、本発明のビリオンに含まれるバリアントGPタンパク質は、各々、ダンデノングウイルス、モペイアウイルス、イッピイウイルス、ラティーノウイルス又はオリベロウイルスの変更されないGPタンパク質によりビリオンにもたらされる機能性を維持する。そのようなバリアントGPタンパク質は、配列番号2と60、65、70、75、80、85、90又は95%の配列同一性を、或いは配列番号4と45、50、55、60、65、70、75、80、85、90又は95%の配列同一性を、或いは配列番号6と45、50、55、60、65、70、75、80、85、90又は95%の配列同一性を、或いは配列番号8と92、93、94、95、96、97、98又は99%の配列同一性を、或いは配列番号10と60、65、70、75、80、85、90又は95%の配列同一性を有してよく、ここでこのエンベロープタンパク質は、細胞トロピズム、及び配列番号2、4、6、8又は10のいずれか一つに示されたアミノ酸配列を含むエンベロープタンパク質としてのGPを含むキメラVSVビリオンの機能性を維持する。
参照アミノ酸配列に関して「アミノ酸配列同一性の割合(%)」は、必要ならば最大パーセント配列同一性を達するように、配列を整列し且つギャップを導入した後に、配列同一性の一部として保存的置換は考慮せずに、参照ポリペプチド配列中のアミノ酸と同一である候補配列中のアミノ酸の百分率として定義される。アミノ酸配列同一性の割合(%)を目的とするアラインメントは、例えば、BLAST、BLAST-2、ALIGN又はMegalign(DNASTAR)ソフトウェアなどの、公に入手可能なコンピュータソフトウェアを使用し、当該技術分野内にある様々な方法で達成することができる。当業者は、比較される配列の完全長にわたり最大アラインメントを達成するために必要とされる任意のアルゴリズムを含む、配列を整列するための好適なパラメータを決定することができる。
更なる実施態様において、本発明は、ダンデノングもしくはモペイアGPタンパク質、又はイッピイ、ラティーノもしくはオリベロGPのいずれか一つの機能性を有するバリアントGP配列に関し、ここでこのバリアントGPタンパク質は、20、15、10、5の、又は好ましくは4、3、2もしくは1の変更(複数可)を含む。
VSVキメラベクター又はそれらを基にした及び本明細書に提供されるベクターシステムは、それらの固有の腫瘍溶解性特性に加え、少なくとも1種の導入遺伝子を更に導入することにより改善され得る。当業者は、そのような導入遺伝子を本発明のベクターへ導入するために利用することができる技術、並びにそれらを導入する場所を知っている。アプローチの一例は、制限及びライゲーション又はPCR及びGibsonアセンブリの工程を含む。本発明内で利用することができる導入遺伝子は、特定の必要性が、導入遺伝子の送達により対処される限りは、特に限定されない。非限定的であるが好ましい例は、自殺タンパク質、サイトカイン/ケモカイン、免疫関連受容体に結合する抗体又は抗体断片、ワクチンの目的のために働くタンパク質、ウイルス融合タンパク質、マーカータンパク質又はそれらの融合体をコードしている導入遺伝子を含む。
治療用途において複製可能なウイルスの使用時の安全性を増加するために、VSVウイルスの複製、腫瘍溶解性及び生成は、少なくとも2種の複製-欠損を相互に補完するベクターにより感染された細胞においてのみ生じる事を確実にするベクターシステムが、提供される。
従って本発明は、一実施態様において、システムが、少なくとも2種の補完的複製するVSVベクターを含むことを特徴とする、VSVキメラベクターシステムに関し、ここでこのシステムは、VSVのタンパク質N、L、P及びMをコードしている遺伝子n、l、p及びm、ダンデノング-GPもしくはモペイア-GP、又はイッピイ-GP、ラティーノ-GPもしくはオリベロ-GPをコードしている遺伝子gpを含み、且つVSVのGタンパク質をコードしている機能性遺伝子を欠いており、ここで本システムの各ベクターは、遺伝子n、l、p、m及びgpの一つを欠いており、且つここでその欠けている遺伝子は、本システムの任意の他のベクターに存在する。そのような補完的複製する(cr)VSVベクターは、標的化された細胞、例えば腫瘍細胞内に、限定された程度で拡散することができ、このことは遺伝子導入及び腫瘍溶解性の効率を増大する。従って、本発明のベクターシステムは、標的化された細胞、特に腫瘍細胞において導入遺伝子に関して限定された再生能を伴う腫瘍溶解性VSVキメラベクターの調製を可能にする。LCMV-GPをコードしている遺伝子gp、並びに治療遺伝子及び/又はマーカー遺伝子などの可能性のある追加の遺伝子は、本システムの任意のベクター上に存在することができる。
本発明のベクターシステムの様々なバリアントが、可能である。例えば、このベクターシステムは、2種のベクター又は3種以上のベクターからなることができる。ベクターシステムが2種のベクターからなる場合、第一のベクターは、VSVのGPの代わりに、ダンデノングウイルスもしくはモペイアウイルスのGP、又はイッピイウイルス、ラティーノウイルスもしくはオリベロウイルスのGP、並びにPタンパク質をコードしている遺伝子pの欠失を含んでよい。同じく第二のベクターは、VSV-Gを含まないが、VSVのPタンパク質を発現してよい。各ベクターは、VSVの核タンパク質(N)及びポリメラーゼ(L)、並びにより少ないMタンパク質の細胞変性バリアント(Mncp)を発現してよい。第一のベクターは、加えて、マーカー遺伝子rfpを保有してよいのに対し、第二のベクターは、導入遺伝子を保有してよい。
本発明はまた、2種のベクターを含むベクターシステムも提供し、ここで1種のベクターは、本明細書において定義されたように、ダンデノングウイルスもしくはモペイアウイルスのGP、又はイッピイウイルス、ラティーノウイルスもしくはオリベロウイルスのGPを含み、且つ第二のベクターは、LCMVのGPを含む。LCMVのGPを含む第二のベクターは、WO2010/040526に説明されたようなベクターであってよい。
本発明は更に、本発明のキメラビリオンを産生する細胞に関する。本発明の意味におけるウイルス産生細胞は、複製不可能なベクターからのビリオンの産生のため古典的パッケージング細胞、並びに再生可能なベクターからのビリオンを産生するためのプロデューサー細胞を含む。パッケージング細胞は通常、パッケージされる各ベクターにおいて欠損され及び/又はビリオンの産生に必要である必須遺伝子の発現のための1又は複数のプラスミドを含む。そのような細胞は、哺乳動物細胞、特にヒト細胞、サル細胞、マウス細胞又はハムスター細胞、より特定するとHEK293細胞、HeLa細胞、又はVero細胞であることができる。そのような細胞は、所望の目的に適した好適な細胞株を選択することができる当業者には公知である。
先行する研究において、パッケージング細胞は、ウイルスベクターの導入に使用されたが;しかし、これは、腫瘍内で遊走しない線維芽細胞に主に関連した(Shortら、1990、Culverら、1992)。対照的に、成体幹細胞、特に神経幹細胞(NSC)、多能性成体前駆細胞(MAPC)及び間葉系幹細胞(MSC)は、高い遊走能を有する。これらは、腫瘍組織へ拘束されつづけ、これにより、腫瘍組織への非常に効率的であるが特異的でもある遺伝子導入が達成される。しかし、これらの幹細胞は、インビトロにおいて限定された継代能を有する。
成体間葉系幹細胞、いわゆるBM-TIC(骨髄由来腫瘍浸潤細胞)の亜集団は、実験的に誘導された神経膠腫への注入後、腫瘍全体に浸潤し、加えて、その腫瘍塊から離れた個々の腫瘍細胞を追跡する(track)[23]。BM-TICは、成体骨髄から単離され、高い増殖能を有し、且つMLVベクター[24]及びVSVベクターのための遊走するプロデューサー細胞として使用することができる。
従って本発明の主題は、本発明のVSVキメラベクターを産生するウイルス産生細胞である。特に、これらは、腫瘍内でのそれらの遊走時に該ベクターを放出する、腫瘍-浸潤性プロデューサー細胞である。好ましい細胞は、成体幹細胞、特に神経幹細胞(NSC)及び間葉系幹細胞(MSC)である。特に好ましい細胞は、MSCから誘導されたBM-TIC細胞である。
本発明のウイルス産生細胞、従って同じく該細胞から産生されたVSVキメラベクターもまた、変異されたMタンパク質をコードしている遺伝子を含んでよい。このベクターバリアントは、腫瘍細胞について選択的に腫瘍溶解性であるのに対し、これは健常細胞については毒性はない。Mタンパク質の37PSAP40領域にアミノ酸交換を伴うか、又はMタンパク質のPSAP領域の外側に単独(M51R)もしくは複数(V221F及びS226R;M33A及びM51A)の変異を伴うMバリアントが、好ましい。変異M33A、M51R、V22F及びS226Rを伴うMタンパク質が、特に好ましい。パッケージング細胞における効率的ウイルス産生を確実にするために、Mバリアントは、ウイルスインターフェロンアンタゴニストと共に安定してトランスフェクトされ得る。
一実施態様において、このウイルス産生は、細胞は、VSVのタンパク質N、L、P及びMをコードしている遺伝子n、l、p及びm、並びにダンデノング-GPもしくはモペイア-GP糖タンパク質、又はイッピイ-GP、ラティーノ-GP又はオリベロ-GPをコードしている遺伝子gpからなる群から選択される遺伝子の少なくとも1つの発現のために、1又は複数の発現カセットを含むことで特徴付けられる。この細胞は更に、ダンデノング又はモペイアウイルス、或いはイッピイ、ラティーノ又はオリベロウイルスのGPによりシュードタイプ化されたVSVビリオンへのパッケージングのための遺伝子導入ベクターを更に含み、ここでこの遺伝子導入ベクターは、導入遺伝子を含む。
加えて、本発明の主題は、遺伝子導入のインビトロにおける方法であり、ここで導入遺伝子を含む本発明のVSVキメラベクター又は本発明のVSVキメラベクターシステムは、直接的に、又は本発明のウイルス産生細胞(パッケージング細胞)によるかのいずれかで、細胞へ導入される。少なくとも2種のベクターを伴うcrベクターシステムが使用される場合、少なくとも2種のパッケージング細胞が使用され、ここでこれらの細胞の各々は、(複製能がないcrベクターの1種を産生する。VSVウイルスの産生は、crベクターシステムの全てのベクターで感染された細胞においてのみ生じ、従って全ての必須ウイルス遺伝子を含む。
加えて本発明は、治療的方法における薬物としての本発明のベクター及びウイルス産生細胞の使用に関する。特に、本発明のベクター及びウイルス産生細胞は、固形癌の治療のために使用される。その治療効果は、理論により結びつけられるものではないが、これらの組換えベクター及びウイルスの腫瘍溶解性の特性により、並びに治療的遺伝子の使用により、引き起こされる。
固形癌は、脳癌、結腸直腸癌、中咽頭扁平上皮癌、胃癌、胃食道接合部腺癌、食道癌、肝細胞癌、膵臓腺癌、胆管癌、膀胱尿路上皮癌、転移性黒色腫、前立腺癌、乳癌、膠芽細胞腫、非小細胞肺癌、脳腫瘍又は小細胞肺癌であることができる。
本発明の主題は、更に、本発明のベクター、ビリオン、又はウイルス産生細胞、並びに任意に薬学的に許容される担体及び補助物質などの添加剤を含有する医薬組成物である。
ウイルス腫瘍溶解性及び治療的遺伝子の導入効率を増加するために、連続してベクターを放出する腫瘍-浸潤ウイルス産生細胞は、腫瘍への直接移植のために製剤化されてよい。従って本明細書に提供される手段は、腫瘍内投与又は静脈内投与のために製剤化されてよい。
用語「医薬製剤」又は「医薬組成物」は、そのような形状において、その中に含まれる活性成分の生物活性を有効にし、並びに製剤が投与される対象にとって予想外の毒性がある追加成分を含有しない、調製品を指す。
「薬学的に許容される担体」は、対象に対し無毒である、活性成分以外の、医薬製剤中の成分を指す。薬学的に許容される担体は、緩衝液、賦形剤、安定化剤、又は保存剤を含むが、これらに限定されるものではない。
本明細書において使用される「治療」(並びに「治療する」又は「治療している」などのその文法上の変形)は、治療される個体の天然の経過の変更を試みる臨床的介入を指し、且つ予防のため又は臨床病理の経過時のいずれかに実行され得る。治療の望ましい効果は、疾患の発生又は再発の防止、症状の軽減、何らかの直接又は間接の疾患の病理的帰結の縮小、転移の防止、疾患進行速度の減少、疾患状態の改善又は緩和、並びに寛解又は改善された予後を含むが、これらに限定されるものではない。一部の実施態様において、本発明の抗体は、疾患の発症を遅延するため又は疾患の進行を遅らせるために使用される。
本明細書記載のベクター、ビリオン又は細胞の医薬製剤は、所望の純度を有するそのようなベクター、ビリオン又は細胞を、1又は複数任意の薬学的に許容される担体[25]と、凍結乾燥製剤又は水溶液の形状で、混合することにより調製される。薬学的に許容される担体は、一般に、利用される用量及び濃度で、レシピエントに対し無毒であり、且つ以下を含むが、これらに限定されるものではない:リン酸、クエン酸、及び他の有機酸などの、緩衝液;アスコルビン酸及びメチオニンを含む、抗酸化剤;保存剤(オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチルもしくはベンジルアルコール;メチルもしくはプロピルパラベンなどの、アルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;及び、m-クレゾール);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリンなどの、タンパク質;ポリビニルピロリドンなどの、親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、又はリジンなどの、アミノ酸;グルコース、マンノース、又はデキストリンを含む、単糖、二糖、及び他の炭水化物;EDTAなどの、キレート剤;ショ糖、マンニトール、トレハロース又はソルビトールなどの、糖類;ナトリウムなどの、塩を形成する対オイン;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体);並びに/又は、ポリエチレングリコール(PEG)などの、非イオン性界面活性剤。本明細書における薬学的に許容される担体の例は、更に、可溶性中性-活性ヒアルロニダーゼ糖タンパク質(sHASEGP)などの侵入型(interstitial)薬物分散剤、例えば、rHuPH20(ハイレネックス(HYLENEX)(登録商標)、Baxter International, Inc.)などのヒト可溶性PH-20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質を含む。rHuPH20を含む、特定の例示的sHASEGP及び使用方法は、米国特許公開第2005/0260186号及び第2006/0104968号に説明されている。一つの態様において、sHASEGPは、コンドロイチナーゼなどの、1又は複数の追加のグリコサミノグリカナーゼと組合せられる。
本明細書の製剤はまた、治療される特定の適応症について必要ならば、好ましくは互いに有害に作用しない相補的活性を伴うものである、2種以上の活性成分を含んでもよい。
活性成分は、例として、各々、例えばヒドロキシメチルセルロース又はゼラチン-マイクロカプセル及びポリ-(メチルメタクリレート)マイクロカプセルである、コアセルベーション技術によるか又は界面重合により、調製されるマイクロカプセル中にか、コロイド状薬物送達システム(例えば、リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子及びナノカプセル)において又はマクロエマルションにおいて、封入されてよい。そのような技術は、文献[25]において明らかにされている。徐放性調製品が、調製されてよい。徐放性調製品の好適な例は、抗体又は免疫複合体を含有する固形疎水性ポリマーの半透性マトリクスを含み、このマトリクスは、例えばフィルムなど成形された製品の形状、又はマイクロカプセルである。インビボ投与に使用される製剤は、一般に無菌である。無菌状態は、例えば無菌の濾過膜を通す濾過により、容易に達成され得る。
一つの態様において、医薬品として使用するための本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物が、提供される。更なる態様において、治療方法において使用するための本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物が提供される。いくつかの実施態様において、癌の治療において使用するための本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物が提供される。いくつかの実施態様において、本発明は、癌を有する個体の治療方法、ベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の有効量を個体へ投与することを含む方法において使用するための本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物を提供する。一つのそのような実施態様において、本方法は、例えば以下に説明したような、少なくとも1種の追加の治療薬の有効量を、個体へ投与することを更に含む。
更なる態様において、本発明は、医薬品の製造又は調製における、本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の使用を提供する。一実施態様において、本医薬品は、癌、特に固形腫瘍の治療に関してである。更なる実施態様において、本医薬品は、癌、特に固形癌の治療方法において使用するためであり、この方法は、癌、特に固形癌を有する個体に、本医薬品の有効量を投与することを含む。一つのそのような実施態様において、本方法は、更に少なくとも1種の追加の治療薬、例えばPD-1又はPD-L1のアンタゴニストである治療薬の有効量を、個体へ投与することを含む。
更なる態様において、本発明は、癌、特に固形癌を治療する方法を提供する。一実施態様において、本方法は、本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の有効量を、癌を有する個体へ投与することを含む。一つのそのような実施態様において、本方法は更に、以下に説明したような、少なくとも1種の追加の治療薬の有効量を、個体へ投与することを含む。
先の実施態様のいずれかの「個体」は、ヒトであってよい。しかし、特にヒトを含む、治療又は予防のこれらの方法を必要とする任意の哺乳動物が、含まれる。そのような治療又は予防を必要とする他の哺乳動物は、イヌ、ネコ、又は他の愛玩動物、ウマ、家畜、非ヒト霊長類を含む、実験動物などを含む。この対象は、雄又は雌であってよい。一実施態様において、この対象は、癌、より特定すると固形腫瘍を有するか、又はそれを発症するリスクがある。
先に説明したように、本発明は、例えば先の治療的方法のいずれかにおいて使用するために、本明細書に提供されるベクター、ビリオン又は細胞のいずれかを含有する医薬組成物を提供する。一実施態様において、医薬製剤は、本明細書に提供されるベクター、ビリオン、又は細胞のいずれか、及び薬学的に許容される担体を含有する。別の実施態様において、医薬製剤は、本明細書に提供されるベクター、ビリオン、又は細胞のいずれか、及び例えば、以下に説明されたような少なくとも1種の追加の治療薬を含有する。
本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物は、療法において、単独で、又は他の薬剤と組合せてのいずれかで使用することができる。例えば、本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物は、少なくとも1種の追加の治療薬と同時投与されてよい。
本発明の意味内の「治療薬」は、非限定的に、ポリペプチド、ペプチド、糖タンパク質、核酸、合成及び天然の薬物、ペプチド、ポリエン、大環状分子(macrocyles)、配糖体、テルペン、テルペノイド、脂肪族及び芳香族化合物、並びにそれらの誘導体を含む、分子である。好ましい実施態様において、治療薬は、PD-1又はPD-L1のアンタゴニストである。別の好ましい実施態様において、治療薬は、チェックポイント阻害抗体又は個体の免疫応答を刺激する任意の他の免疫療法薬である。更に別の実施態様において、治療薬は、化学療法薬である。化学療法薬は、実質的に、個体において腫瘍細胞に対し腫瘍溶解作用を発揮し、且つ本発明の腫瘍溶解性ウイルスの腫瘍溶解作用を阻害又は低下しない任意の薬剤であってよい。この薬剤は、既知の又はその後発見された化学療法薬のいずれかであってよい。例として、既知の種類の化学療法薬は、例えば、アントラサイクリン、アルキル化剤、スルホン酸アルキル、アジリジン、エチレンイミン、メチルメラミン、ナイトロジェンマスタード、ニトロソ尿素、抗生物質、代謝拮抗薬、葉酸アナログ、プリンアナログ、ピリミジンアナログ、酵素、ポドフィロトキシン、白金-含有剤、インターフェロン、及びインターロイキンを含む。
好適な治療薬は、Goodman and Oilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics(例えば、第9版)、又はThe Merck Index(例えば第12版)に示されたものを含むが、これらに限定されるものではない。治療薬の部類(genera)は、炎症反応に影響を及ぼす薬物、体液の組成に影響を及ぼす薬物、電解質代謝に影響を及ぼす薬物、化学療法薬(例えば、高増殖性疾患、特に癌について、寄生虫感染症について、及び微生物疾患について)、抗新生物薬、血液及び造血器官に影響を及ぼす薬物、ホルモン及びホルモンアンタゴニスト、ビタミン及び栄養素、ワクチン、オリゴヌクレオチド及び遺伝子療法を含むが、これらに限定されるものではない。2種の薬物など、2種以上の活性物質の組合せ、例えば混合物又は配合物を含有する組成物もまた、本発明により包含されることは理解されるであろう。
先に注記されたそのような組合せ療法は、組合せ投与(この場合2種以上の治療薬は、同じ又は異なる製剤中に含まれる)、並びに個別の投与であって、この場合本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の投与は、追加の治療薬及び/又はアジュバントの投与の前に、同時に、及び/又は続けて行われ得るものを包含している。本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物はまた、放射線治療と組合せて使用されることもできる。
本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物(及び任意の追加の治療薬)は、非経口、肺内、及び鼻腔内、並びに局所治療が望ましい場合、病巣内、子宮内又は膀胱内の投与を含む、任意の好適な手段により、投与されることができる。非経口注入は、筋肉内、静脈内、動脈内、腹腔内、又は皮下の投与を含む。同じく直接の腫瘍内投与も構想される。好ましいのは、静脈内又は腫瘍内投与である。投薬は、一部、投与が短期又は長期であるかに応じて、任意の好適な経路、例えば静脈内又は皮下注射などの注射によることができる。非限定的に、様々な時点での単回又は複数回投与、ボーラス投与、及びパルス注入を含む、様々な投薬スケジュールが、本明細書において企図される。
腫瘍内注射、又は腫瘍血管系への直接注射は、個別の、固形の、アクセス可能な腫瘍のために、特別に企図されている。局所的、局部的又は全身的投与もまた、適し得る。例えば、>4cmの腫瘍に関して、投与されるべき容積は、約4~10mL(好適には10mL)であるのに対し、<4cmの腫瘍に関して、約1~3mLの容積が使用されてよい(好適には3ml)。一部の実施態様において、投与される薬剤の容積は、腫瘍容積の最大25%又は最大33%であることができる。単回投与量として送達された複数回注射は、容積約0.1~約0.5mLを含む。このウイルス粒子は、有利なことに、およそ1cm間隔で間をあけて、腫瘍への複数回注射を投与することにより、接触されてよい。外科的介入の場合において、手術不可能な腫瘍対象を切除するために、本組成物は、術前に使用されてよい。連続投与もまた、例えば、カテーテルの腫瘍への又は腫瘍血管系への移植によるなど、適切ならば、適用されてよい。そのような連続灌流は、治療開始後、約1~2時間から、約2~6時間まで、約6~12時間まで、約12~24時間まで、約1~2日まで、約1~2週間より長くまでの期間行われてよい。一般に、連続灌流による治療的組成物の投与量は、その間灌流が行われる期間にわたり調節され、単回又は複数回注射により与えられるものと、同等であろう。特に黒色腫及び肉腫の治療において、四肢灌流が、治療的組成物を投与するために使用されることも、更に企図される。
本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物は、良好な医療業務と一致する様式で、製剤化され、投薬され、且つ投与されるであろう。この状況を考慮する上での要因は、治療される特定の障害、治療される特定の哺乳動物、個々の患者の臨床状態、その障害の原因、薬剤の送達部位、投与方法、投与スケジュール、及び医療実践者に公知の他の要因を含む。このベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物は、問題の障害を予防又は治療するために現在使用されている1又は複数の薬剤と共に製剤化されることは必ずしもではないが、任意に必要とされる。そのような他の薬剤の有効量は、製剤中に存在するベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の量、障害又は治療の種類、及び先に考察した他の要因によって左右される。これらは一般に、本明細書に記載したものと同じ用量で及び投与経路により、又は本明細書記載の用量の約1~99%で、又は適していることが実験的に/臨床的に決定された任意の用量及び任意の経路で、使用される。
疾患の予防又は治療のために、本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の好適な用量(単独で、又は1又は複数の他の追加の治療薬と組合せて使用される場合)は、治療される疾患の種類、ベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の種類、疾患の重症度及び経過、ベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物が予防的又は治療的目的のために投与されるかどうか、先行する療法、患者の既往歴及びベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物に対する反応、並びに担当医の裁量により左右されるであろう。このベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物は、好適には、患者へ、一度に又は一連の治療にわたって投与される。疾患の種類及び重症度に応じて、例えば、1又は複数回の個別投与によるか、又は連続注入によるかに関わらず、ベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の約1μg/kg~15mg/kg(例えば、0.1mg/kg~10mg/kg)が、患者への投与のための候補初回量であることができる。一つの代表的1日量は、先に言及した要因に応じて、約1μg/kg~100mg/kg又はそれ以上の範囲である。数日間又はそれ以上に及ぶ反復投与に関して、状態に応じて、治療は、一般に、疾患症状の所望の抑制が生じるまで、持続されるであろう。ベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の用量の一つの例は、約0.05mg/kg~約10mg/kgの範囲であろう。従って、約0.5mg/kg、2.0mg/kg、4.0mg/kg又は10mg/kgの1又は複数の投与量(又はそれらの任意の組合せ)が、患者へ投与されてよい。そのような投与量は、間欠的に、例えば1週間おき又は3週間おきに投与されてよい(例えば、その結果患者は、ベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物の約2~約20回の、又は例えば約6回の投与量を受け取る)。最初のより高い負荷投与量、それに続く1又は複数回のより低い投与量が、投与されてよい。しかし、他の投薬計画が、有用であり得る。この療法の進行は、通常の技術及びアッセイにより、容易にモニタリングされる。
或いは、本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物は、治療される領域のサイズ、使用されるウイルス力価、投与経路、及び本方法の所望の効果に応じて、その範囲内の全ての数値を含む、約50μL~約10mLの容積で送達されてよい。一実施態様において、容積は、約50μLである。別の実施態様において、容積は、約70μLである。別の実施態様において、容積は、約100μlである。別の実施態様において、容積は、約125μLである。別の実施態様において、容積は、約150μLである。別の実施態様において、容積は、約175μLである。更に別の実施態様において、容積は、約200μLである。別の実施態様において、容積は、約250μlである。別の実施態様において、容積は、約300μLである。別の実施態様において、容積は、約450μLである。別の実施態様において、容積は、約500μLである。別の実施態様において、容積は、約600μLである。別の実施態様において、容積は、約750μLである。別の実施態様において、容積は、約850μLである。別の実施態様において、容積は、約1000μLである。別の実施態様において、容積は、約2000μLである。別の実施態様において、容積は、約3000μLである。別の実施態様において、容積は、約4000μLである。別の実施態様において、容積は、約5000μLである。別の実施態様において、容積は、約6000μLである。別の実施態様において、容積は、約7000μLである。別の実施態様において、容積は、約8000μLである。別の実施態様において、容積は、約9000μLである。別の実施態様において、容積は、約10000μLである。細胞-特異的プロモーター配列の制御下で、所望の導入遺伝子をコードしている核酸配列を保有しているビリオンの有効濃度は、約108~1013個ベクターゲノム/ミリリットル(vg/mL)の範囲が望ましい。感染単位は、S.K. McLaughlinらの文献[26]に説明されたように測定されてよい。好ましくは、その濃度は、約1.5×109vg/mL~約1.5×1012vg/mL、より好ましくは約1.5×109vg/mL~約1.5×1011vg/mLである。一実施態様において、有効濃度は、約1.5×1010vg/mLである。別の実施態様において、有効濃度は、約1.5×1011vg/mLである。別の実施態様において、有効濃度は、約2.8×1011vg/mLである。更に別の実施態様において、有効濃度は、約1.5×1012vg/mLである。別の実施態様において、有効濃度は、約1.5×1013vg/mLである。望ましくない作用のリスクを軽減するために、最小有効濃度が利用されることが、望ましい。更にこれらの範囲内の更に他の用量は、治療される対象、好ましくはヒトの生理的状態、対象の年齢、癌の特定の種類及び癌が進行性である場合発達した程度を考慮し、担当医により、選択されてよい。
前記製剤又は治療方法は、本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物のいずれか一つを使用し、実行され得ることは理解される。
別の本発明の態様において、先に説明された障害の治療、予防及び/又は診断に有用な物質を含む製品が、提供される。この製品は、容器、及び容器の上又はこれに関連づけられたラベル又は添付文書を含む。好適な容器は、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV点滴バッグなどを含む。これらの容器は、ガラス又はプラスチックなどの、様々な材料から形成されてよい。この容器は、それ自身で、又は障害の治療、予防及び/又は診断に有効な別の組成物と組み合わせて、組成物を保持し、且つ滅菌したアクセスポートを有してよい(例えば、容器は、皮下注射針により穿刺可能な栓を有する静脈内点滴バッグ又はバイアルであってよい)。この組成物中の少なくとも1種の活性物質は、本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物である。ラベル又は添付文書は、この組成物は、選択された状態を治療するために使用されることを指摘している。更にこの製品は、(a)それに含まれた組成物を伴う第一の容器、ここでこの組成物は、本発明のベクター、ビリオン、細胞又は医薬組成物を含有する;並びに、(b)それに含まれた組成物を伴う第二の容器、ここでこの組成物は、更なる細胞毒性物質又は他の治療薬を含有する:を含んでよい。本発明のこの実施態様の製品は、この組成物は、特定の状態、特に癌を治療するために使用することができることを指摘する添付文書を更に含んでよい。或いは、又は加えて、この製品は、薬学的に許容される緩衝液、例えば注射用静菌水(BWFI)、リン酸-緩衝食塩水、リンゲル液又はデキストロース液を含む、第二(又は第三)の容器を更に含んでよい。これは、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針及びシリンジを含む、商業的及び使用者の観点から望ましい他の物質を更に含んでよい。
実施例
実施例1:アレナウイルスGP配列アラインメント
SセグメントのアレナウイルスRNA配列を、以下の遺伝子バンクフラットファイルフォーマットにおけるNCBIヌクレオチドライブラリーから検索した:LCMV-GP WE-HPI(寄託番号:AJ297484)、MOPV-GP(寄託番号:JN561684)、DANDV-GP(寄託番号:EU136038)、IPPYV-GP(寄託番号:DQ328877)、OLIVV-GP(寄託番号:U34248)及びLATV(寄託番号:AF485259)。GPC糖タンパク質配列は、SセグメントによりコードされたGPCオープンリーディングフレームの翻訳により得た。旧世界及び新世界クレードCアレナウイルスGPC配列は、ヌクレオチド及びタンパク質のレベルで、Geneiousソフトウェアパッケージバージョン11.0.5(Biomatters Ltd.)を使用し、比較した。
糖タンパク質GPのGP1ペプチド中のN-連結したグリコシル化シグナルを、グリコシル化シグナル配列NxS又はNxTにより同定した。グリコシル化シグナル部位の番号付けは、ATGメチオニン翻訳開始コドンで始まる親の配列に対応している(図1)。
絶対及び相対配列同一性(% Seq Id)は、ヌクレオチド配列又は対応するGPCアミノ酸配列の複数のアラインメント(図2及び3)後に、計算した。配列は、MUSCLE[17]を用いて、k-mer及びpctidクラスタリングによる距離マトリクスを用いる8反復(iterations)の最大数で、整列させた。引き続き、配列を、UPMGA法を用いてクラスタリングした。各アレナウイルスGPCタンパク質のLCMV WE-HPIと比較した配列類似性を、閾値≧1によるblosum62マトリクスを用い、ペアワイズアラインメントから計算した。
実施例2:アレナウイルスGPはVSV-Gを補完することができる
DANDV、MOPV、並びにLATV及びOLIVVのGP糖タンパク質は、VSV*MQΔGウイルスをtrans-補完(trans-complement)することができた。得られるVSVシュードタイプは、後続の継代においてBHK21Cl.13細胞を感染することができ、且つ偽対照と比べた場合、異なる希釈で、増大したGFPシグナルを示した(図4A)。IPPYV-GP-補完したVSV*MQΔGウイルスの上清により感染されたBHK21Cl.13細胞において認めることができたGFPグナルは、偽対照及び投入したVSV*MQΔGウイルスの結果と同等であった。これらの結果を確認するために、LCMV-GPを安定して発現するBHK-566細胞を、シュードタイプ化されたVSV*MQΔGウイルスにより感染させた。DANDV-GP、LATV-GP、MOPV-GP又はOLIVV-GPによりtrans-補完されたウイルスは、高い希釈であっても、細胞培養物内で拡散することができ、これは感染48時間後の遍在性のGFP発現につながった(図4B)。DANDV、MOPVV、IPPYV、OLIVV及びLATVのGPによりtrans-補完されたVSV*McpΔGウイルスの細胞変性効果(CPE)は、対応するVSV*MQΔGシュードタイプにより得られた結果を確認し、且つ図5にまとめた。
trans-補完に関して、0.8~1×106個BHK21Cl.13細胞を、トランスフェクションの前日に、6-ウェルプレートに1日間播種した。翌日、BHK21Cl.13を、TransIT-LT1トランスフェクション試薬(Mirus Bio LCC, Madison, Wisconsin USA)を、製造業者の推奨に従い用い、2,5μgのpCAG-DANDV-GP、pCAG-IPPYV-GP、pCAG-LATV-GP、pCAG-MOPV-GP又はpCAG-OLIVV-GPによりトランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、一過性にトランスフェクトされたBHK21Cl.13細胞を、MOIが3で、VSVマトリクスタンパク質内に変異M33A、M51R、V221F及びS226Rを保有する、VSV*McpΔG又はVSV*MQΔGにより感染した[9]。感染の1時間後、細胞を、cGMEM(10%FCS、2%グルタミン及び1%Tryptoseリン酸ブロスを含有)により2回洗浄し、更に24時間インキュベーションした。上清を収集し、且つ細胞デブリを、卓上遠心分離機で8000rpmで5分間の遠心分離により除去した。その後上清を、連続10倍希釈で、24-ウェルプレートにおいて、新鮮なBHK21Cl.13細胞又はBHK-566細胞へ移し、これらはレンチウイルスの形質導入後LCMV-GP WE-HPIを安定して発現している。ベクターからのGFP発現又は細胞変性効果を、Leica DM2500蛍光顕微鏡において、24時間及び48時間後にモニタリングした。写真を、同じ露光時間で撮像した。
実施例3-複製動態
WO2010/040526に説明されたようなVSVベクター骨格並びにDANDV、MOPV、OLIVV及びLATVのGPを含むVSV-キメラベクターを、クローニングした。得られたキメラVSV-G(x)-DANDV、-MOPV、-OLIVV及びLATVベクターのGPを、残りのVSVベクター骨格にはいかなる変化も伴わずに、LCMVのGPと置き換えた。VSV-G(x)-DANDV及び-MOPVの複製動態にはわずかな差異が存在したが(VSV-G(x)-LATV及び-OLIVVは試験しなかった)、両方のウイルスは、30hpi後に、1×107TCID50/ml(図6A)又は1×109ゲノムコピー/ml(図6B)よりも高い力価まで複製した。それらの複製能力に関して、VSV-G(x)-DANDV及び-MOPVは、特にOV癌療法に適しているであろう。
複製動態の比較のために、T75細胞培養フラスコ中のVero細胞単層を、VSV-GP、VSV-G(x)DANDV又はVSV-G(x)MOPVにより、MOIの0.05又は0.0005で、感染させた。感染した細胞の上清500μlを、指定された時点で収集した。上清を、卓上遠心分離機においておよそ2000rpmで5分間遠心分離し、細胞デブリを除去し、且つ更なる処理まで、-80℃で貯蔵した。TCID50アッセイによるウイルス力価[27]及びqPCRによるウイルスゲノム[28]の分析を、別所記載のように行った。
実施例4-VSV-G(x)バリアントの腫瘍細胞死滅(図7)
細胞株
ヒトCalu6肺癌細胞は、Dr. Edith Lorenz, OncoTyrol (Department of Internal Medicine, Hematology and Oncology, AG Zwierzina, Innsbruck)から得た。細胞を、10%ウシ胎仔血清、2mM L-グルタミン及び1%ペニシリン/ストレプトマイシン(Pen/Strep)を含むDMEM培地において増殖した。これらの細胞を、EDTA-トリプシン0.05%を用い2~3日毎に継代培養し、その時これらは、集密度80%に達していた。ヒト前立腺癌由来の22Rv1細胞は、Prof. Z. Culig (Department of Urology, Medical University of Innsbruck)のご厚意により提供された。細胞を、10%FCS、2mMグルタミン、10mM HEPES、1mMピルビン酸ナトリウム及び1%Pen/Strepを含有するRPMI1640中で、1週間に2回継代培養した。接着性のマウス扁平上皮癌細胞(SCCVII)は、Dr. Lukas Mach (Department of Applied Genetics and Cell Biology, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna)から得た。細胞を、10%FCS、2mMグルタミン、0.1mM非必須アミノ酸(NEAA)、1mMピルビン酸ナトリウム及び1%Pen/Strepを含有するDMEMにおいて増殖させた。SCCVII細胞は、EDTA-トリプシン0.05%を使用し、1:10の比で、1週間に3回継代培養した。IFN-I抗ウイルス反応を破壊するLacZカセットが安定して形質導入されたBalb/c由来のCT26Cl.25マウス結腸癌細胞は、ATCCから入手した(#CRL-2639)。細胞を、10%FCS、2%グルタミン、10mM HEPES、0.1mM NEAA、1mMピルビン酸ナトリウム、1%P/S及び400μg/ml G418を含有するRPMI1640中、1:10の比で、1週間に2回継代培養した。LLC1細胞は、原発性Lewis肺癌の移植後に、肺腫瘍を有するC57BL/6マウスから、確立した。これらの細胞は、ATCCから入手し(#CRL-1642)、且つ10%FCS、4mMグルタミン及び1%P/Sを含有するDMEM中で培養した。集密な細胞培養物を、緩く接着した細胞の再浮遊により、3~4日毎に、1:6~1:10で継代培養した。
VSV殺傷アッセイ
細胞を、96-ウェルプレートに播種し、10、100、500及び1000単位のユニバーサルタイプ-1 IFN(PBL, Piscataway, NJ, USA)と共に、容積100μl/ウェルで、一晩プレインキュベーションした。翌朝、細胞を、MOIが0.1、1、又は10のVSV-GP、VSV-G(x)DANDV、VSV-G(x)MOPV又はVSV-G(x)OLIVVにより、最終容積120μl/ウェルで、感染させた。各条件に関して、4つ組試料で行った。陽性として、死滅対照細胞を、最終濃度6.67mMのH22と共にインキュベーションした。感染の3日後、細胞を、製造業者の推奨に従い、MTT(3-(4,5-ジメチルチアゾール-2-イル)-2,5-ジフェニルテトラゾリウムブロミド)-ベースのインビトロ細胞毒性アッセイ(Sigma-Aldrich, Saint Louis, MI, USA)を用いて、生存度について分析した。プレートを、常用のマイクロプレートリーダーにおいて、550nmで測定し、細胞を含まないウェルのブランク値を減算した。値は、インターフェロン(IFN)で前処理しなかった偽感染した細胞に対し規準化し、生存細胞の割合(%)として表した。
実施例5:NZWウサギのi.v.処置後の中和抗体
本試験は、VSV G(x)バリアントは、健康な無腫瘍のニュージーランドホワイト(NZW)ウサギにおける3回静脈内(i.v.)投与後に、のVSV-GPと比べ、中和抗体(nAb)を誘導しないか、又はnAbをより低いレベルで誘導するかどうかを評価することを試みた。NZWウサギは、VSV-GP又は様々なVSV-G(x)候補の1×109TCID50により、14日間間を開けて3回i.v.処置した。nAb誘導、並びに体重及び体温、ウイルス血症、全血球カウント及び血液化学を、図9に図示したように処置後一定の間隔でモニタリングした。この試験の主要目的は、各投与後10日間、nAbレベルを測定することにより、nAb誘導をモニタリングすることであった。nAbアッセイは、先にKakuら[29]、J. Virol Methods (2012) 179(1):226-32に公開された研究を基にしている。このnAbアッセイにおいて使用したVSVΔG SEAPウイルスは、エンベロープ糖タンパク質Gの代わりに分泌型胚性アルカリホスファターゼ(SEAP)を発現する。このウイルスは、LCMV-GP、又はこのプロデューサー細胞の細胞表面上に異所性に発現された他のアレナウイルス糖タンパク質の各々により、補完された。これらのtrans-補完されたウイルスは次に、収集したウサギによる中和について試験した(図10)。
体重(BW)及び体温(BT)、白血球(WBC)カウント、血液化学(任意)及びウイルス血症(血漿/血液中のTCID50及びN-特異的qPCR)を含む、動物の健康状態などの安全性パラメータは、副次的目的であった。
ウサギの処理及び飼育:Crl:KBL(NZW)ウサギは、Charles River Laboratories(仏国)から購入した。動物施設への到着時に、ウサギはおよそ7週齢であった。これらの動物は、ウサギ用檻(R-Suite Enriched Rabbit Housing, Techniplast)内で2匹の群で飼育した。個体は、耳の刺青により同定した。ウサギの飼育は毎日管理し、且つ全般的健康状態をモニタリングした。食物は自在摂取させ、及び飲料水の毎日の交換は、実験期間中は保証された。ウサギは、最低4日間馴化させ、その後ウサギは、処理に適合された。ウイルス処置は、ウサギが少なくとも1週間の馴化及び処理された後、開始した。
ウイルス及びNZWウサギの処置:ウイルスの希釈を、PBSにより行った。VSV-GP又はVSV-G(x)溶液の最終濃度は、1×109TCID50/mlであった。ウイルス希釈物は、注射直前まで氷上に保持した。ウサギは、綿タオル中に動物を包み込み固定した。刺青した左耳の注射部位を、適宜剃毛し、その後無菌アルコールスワブを使用し清潔にした。1ml PBS中の1×109TCID50ウイルスを、1mlシリンジに装着した29ゲージ針により、左耳静脈へゆっくり注射した。
ウサギのモニタリング:体重及び体温を、図9に示したスケジュールに従い定期的に測定した。体温は、デジタル体温計により直腸で測定した。体重は、Ultra MBSCバランスを使用し、記録した。
血液採取及び処置:血液は、23Gマイクロ針(Sarstedt、独国)を使用し、耳動脈から採取した。動脈穿刺前に、耳は、適宜剃毛し、且つアルコールパッドを用いて消毒した。最低2mlの血液を、50μlヘパリン(5000IE/ml)の入った15mlチューブに採取した。100μlヘパリン血を、qPCRによるウイルス力価の分析のために、-80℃で貯蔵し、残りの血液は、TCID50決定又は臨床化学(300μl)のために、ヘパリン血漿(200μl)に処理した。初回処置前-4日目及び各処置サイクル後10日目に、追加の2~3ml血液を、血清調製のために、15ml Falcon中に収集した。加えて、およそ500μl血液を、2個のEDTAでプレ-コートされたマイクロベット(microvettes)(Microvette(登録商標) CB 300 K2E, Sarstedt, 独国)中に収集した。EDTA血を、全血球カウントに使用し、最小100μlを、アーカイブとし且つqPCRに使用した。EDTA血漿を、第二のマイクロベットから調製し、使用時まで-80℃で貯蔵した。
TCID 50 によるウイルス血症及びVSV-N特異的qPCR:ウイルス血症は、各処置サイクルのウイルス適用後8時間及び連続する3日間、血漿のTCID50アッセイにより測定した(Urbiolaらの文献[27]に記載されたように)。VSV-N特異的qPCRについて、qPCRのために凍結した及び-80℃で貯蔵したEDTA血及びヘパリン血の100μlを、使用した。RNAは、市販の血液試料用RNA分離キットを用いて分離した。qPCRによるウイルス力価の決定は、例えばJenksら[28]により説明されたように行った。
白血球カウント:EDTA血を使用する白血球カウントは、ScilVet ABC血液カウンターを用いて測定した。およそ10~20μlの新鮮なEDTA血が、このアッセイに必要であった。測定は、製造業者に従い行った。
屠殺:ウサギは、FELASA及びGV SOLASの推奨に従い、ケタミン/キシラジンにより麻酔をかけた。麻酔後、右耳の耳静脈に、カテーテル挿管し、ウサギを、心臓穿刺により終末放血(terminal bleed)した。抗凝固薬を含まない血液及びヘパリン血を、収集した。ウサギは、FELASA及びGV SOLASの推奨に従い静脈カテーテルを通じたペントバルビタールの致死量により麻酔から解放した。ウサギを屠殺した後、脾臓を摘出し、任意の下流の分析(例えば、VSV-N特異的T細胞反応)のために、脾細胞を標準手順により分離した。血液を、血清又は血漿に処理し、アリコートを使用時まで-80℃で貯蔵した。
中和抗体(nAb)アッセイ:-4日目に初回処置前に収集した免疫前血清及び各処置サイクル後10日目に採取した血清試料を、VSV-ΔG SEAP GPウイルス又は異なる糖タンパク質バリアントによりシュードタイプ化したウイルスに対するnAbの存在について分析した。感染したBHK21Cl.13細胞の上清中のSEAP活性を、p-ニトロ-フェニルリン酸(pNPP)の、ウイルスコードされたSEAPにより溶液中黄色を有するp-ニトロフェニルへの酵素転換により測定した。この呈色反応は、常用のマイクロプレートリーダーにおいて、405nmで測定し、SEAP発現ウイルスによる感染率の間接的測定値として用いた。血清及び無血清-処置した対照試料を比較し、このnAbアッセイは、血清試料は、中和抗体を含むかどうかを、示した。nAbが存在しない場合、ウイルスは中和されず、且つBHK21Cl.13細胞を感染することができ、結果的にSEAPを発現する。対照的に、このウイルスが血清中の抗体により中和された場合、ウイルスは細胞を感染することができず、従ってSEAPは発現されなかった。
ウイルス中和の1日前に、BHK21Cl.13細胞を、マルチ-チャンネル分注ピペットを使用し、96-ウェル細胞培養プレートに、1ウェルにつき100μlのcGMEM中密度1×104個細胞で播種した。低いアッセイ間変動を保証するために、細胞を、Luna細胞カウンター(Logos Biosystems)を用いてカウントした。細胞数の写真分析を基にしている任意の他の細胞カウンティング装置(例えば、Tecanリーダー)を、使用することができる。CASYカウンター(OLS OMNI Life Science)又はKovar Glassticスライドによる細胞カウンティングは、推奨されない。細胞は、37℃、6%CO2、湿度95%で一晩インキュベーションした。細胞培養プレートを、加湿チャンバー内に保持し、プレート境界でのウェルの蒸発を防いだ。
翌日、最低希釈1:5で始まる連続1:5血清希釈物を、最初に調製した。簡単に述べると、1ウェルにつき200μlのcGMEMを、マルチ-チャンネル分注ピペットを用いて、96-ウェルプレートへ添加した。濃度100μg/mlのKL25モノクローナルΔLCMV GP抗体50μl(アッセイ間対照)又は熱で失活した(1h、56℃)血清試料を、96-ウェルプレートのC列のウェルに200μl GMEMへ添加し、数回上下にピペッティングすることにより混合した。96ウェルプレートのC列で開始しH列までの5倍連続希釈を、マルチチャンネルピペットを用いて行った:C列のウェルからの50μlを、次の列のウェルに移し、数回上下にピペッティングすることにより混合した。次にD列のウェルからの50μlを、次の列のウェルに添加するなど、H列で終了するまで続けた。各ウェルの血清希釈物175μlを、マルチチャンネルピペットを用いて、清潔な96-ウェルプレートへ移した。血清希釈物は、氷上に保持した。96-ウェルプレートのA列及びB列は、非感染対照(A列)又は無血清対照(B列)として利用した。
シュードタイプ化されたVSVΔG SEAPウイルスの希釈物を、1×104 BHK21Cl.13細胞が播種される1日前に、各々、1ウェル当たり1×103又は1×104感染粒子に相当する、MOIの0.1又は1で、cGMEM中に調製した。nAbアッセイにおいて各3つ組に必要とされるウイルスの量は、下記式により計算した:

必要とされるウイルスストックの容積[μl]=3.5×104感染粒子(MOI=1)/ウイルスストック力価[TCID50/ml]×ウェル数
及び
cGMEMの容積[μl]=(175μl×ウェル数)-必要とされるウイルスストックの容積[μl]
次にウイルス溶液175μlを、連続血清希釈物175μlが入ったB-H列の各ウェルに添加し、350μl血清/ウイルス試料を作製した。ウイルス/血清試料を、マルチチャネルピペットを用い、数回上下にピペッティングすることにより混合した。175μlのcGMEMを、A列(非感染対照)のウェルへ添加した。血清/ウイルス混合物を、氷上で1時間インキュベーションした。
インキュベーション後、100μlの血清/ウイルス試料を、1日前に96ウェルプレートに播種したBHK21Cl.13細胞へ、3つ組で添加した。細胞は、集密度80~90%でなければならない。BHK21Cl.13を、37℃、6%CO2及び湿度95%で更に24時間インキュベーションした。
翌日、nAb活性を、SEAP活性の関数として測定した。簡単に述べると、p-ニトロ-フェニルリン酸(pNPP)基質溶液(SIGMA-FAST, Sigma Aldrich)を、製造業者の推奨に従い調製した。各96-ウェル細胞培養物に関して、pNPP基質溶液を、21mlの滅菌H2O中に1個の緩衝液錠剤及び1個のpNPP基質錠剤を溶解することにより調製した。1日前に感染した細胞由来の細胞培養物上清40μlを、マルチチャンネルピペットを用いて、新たな96ウェルプレートへ移した。その後pNNP基質溶液の200μlを、マルチチャンネル分注ピペットを用いて、細胞培養物上清へ添加した。プレートを、室温で、暗所において、少なくとも1時間インキュベーションした。ウェルのODを、常用のマイクロプレートリーダーにより405nmで測定した。無血清対照のOD405が、1.0よりも低い場合、インキュベーション時間を追加の時間又は最大4時間まで延長し、その後OD測定を繰り返した。測定したOD値は、血清希釈に対してプロットした。非線形曲線へのフィティングにより、EC50値は、GraphPad Prism 5ソフトウェアバージョン5.03(GraphPad, San Diego, California USA)を用いて計算した。
実施例6:Calu6肺腫瘍異種移植モデルの処置(図11)
レシピエントマウス:8週齢の雌のNMRI-ヌードマウスを、Janvier(仏国)から購入した。動物を、8匹の動物群で、換気した檻中で、個別に飼育した。同定を目的に、マウスの耳にクリップを付けた。腫瘍生着(engraftment)前に、マウスは、少なくとも1週間馴化させた。
腫瘍細胞:Calu6肺癌細胞株は、Dr. Edith Lorenz, OncoTyrol (Department of Internal Medicine, Hematology and Oncology, AG Zwierzina, Innsbruck)から得た。細胞を、10%ウシ胎仔血清、2mM L-グルタミン及び1%ペニシリン/ストレプトマイシンを含む、DMEM培地において増殖した。細胞を、EDTA-トリプシン0.05%を使用し、2~3日毎に継代培養し、この時集密度80%に到達した。細胞を、少ない細胞数で播種した。NRMIヌードマウスへの移植前24時間に、細胞を収集し、プールし、その後T175フラスコ内に比1:2で継代した。
生着の日、細胞を、EDTA-トリプシン0.05%を用いて剥離させ、完全培地を添加し、KOVA Glassticスライド(FisherScientific)において、細胞をカウントした。細胞数を決定するために、10μlの細胞浮遊液を、96-ウェルプレートにおいて反復ピペッティングすることにより、90μlトリパンブルー溶液と混合した。カウント用の混合物20μlを、KOVA Glassticスライドに移し、上部及び右側のグリッド線を含む3つの正方形(a、b、c)中の細胞を、青色に標識された死滅細胞を除いて、カウントした。1ml当たりの細胞数を、下記式により決定した:((カウント(a)+カウント(b)+カウント(c)))/3)×104×10=細胞/ml。動物1匹当たり5×106個細胞を、50mlのFalconチューブに移し、PBSで洗浄した。これらの細胞を、PBS中に再浮遊させ、最終濃度1×108個細胞/mlを得た。引き続き、この細胞浮遊液を、1mlアリコートに分け、注射前に氷上で最大30分間留めた。
Calu6細胞のNMRI-ヌードレシピエントマウスへの生着:Calu6細胞を、先に説明したように調製し、チューブを優しく軽く叩くことにより再浮遊させた。マウスに、イソフルラン吸入により麻酔をかけ、注射部位を、無菌アルコールスワブを用いて清潔にした。27G針を備えた0.5mlシリンジを用い、50μl中5×106個細胞を、右側腹部に皮下投与(s.c.)した。腫瘍細胞の注射後、動物を、触知可能な病巣について2週間毎にチェックした。病巣を検出した後、その動物を秤量し、腫瘍サイズを測定した。腫瘍は、キャリパーを用いて測定し、腫瘍の長さ(cm)及び幅(cm)の値を用いて、下記式を使って、およその腫瘍容積(cm3)を計算した:容積=長さ×(幅)2×0.4。長さは、より長い寸法であるとして、動物軸の方向とは関わりなく規定した。
組換えVSVベクターによる処置:腫瘍の平均サイズが、容積0.05~0.07cm3に到達した時点で、腫瘍を処置した。8匹マウスの1つの檻を、1群に割当てた。檻の割当ては、異なる群間で同様の腫瘍サイズの平均及び分布を得るように行った。陰性対照群に関して、30μlのPBSを、i.t.注射した。その他の3つの処置群に関して、VSV-GP、VSV-GP(x)DANDV及びVSV-GP(x)MOPVの最終濃度は、3.3×108TCID50/mlであった。ウイルスの希釈は、PBSにより行った。注射前に、マウスには、イソフルラン吸入により麻酔をかけ、注射部位を、無菌アルコールスワブを用いて清潔にした。29G針を備えた0.1mlシリンジを用い、1つの腫瘍及び1匹の動物につき30μlの1×107TCID50のVSV-GP、VSV-GP(x)DANDV又はVSV-GP(x)MOPVを、i.t.注射した。処置は、4日間を開けて2回繰り返した。
腫瘍増殖のモニタリング:処置後、最大4日間隔で、1週間に少なくとも2回動物を試験し、腫瘍サイズを測定した。腫瘍は、先に説明したように測定した。1匹の動物の腫瘍サイズが、倫理的理由(例えば、屠殺直前など)のためにその間で測定された場合には、その群の少なくとも全ての動物を測定した。マウスの体重は、1週間に1回測定した。以下のエンドポイント基準を、安楽死のために必要とした:(i)腫瘍容積が0.8cm3を超える、(ii)マウスが>20%の体重減少を示す、又は(iii)腫瘍潰瘍。屠殺の日付は、カプラン-マイヤー生存曲線を計算するために使用した。
実施例7:VSV-G(x)-DANDV及び-MOPVの神経毒性
野生型VSV感染症は、そのウイルスが脳へのアクセスを獲得した場合に、神経症状を引き起こし得る。これらの神経学的合併症は、感染した対象の死亡に繋がり得る重度の脳炎を含む。キメラVSV-GPを使用する利点は、神経学的感染症は、ほぼ完全に存在しないことが示され、VSV-骨格を安全な腫瘍溶解性薬剤とすることである。弱毒化された表現型の理由は、ウイルスエンベロープ糖タンパク質を介して促進された変更されたウイルストロピズムのためであると考えられる。GP糖タンパク質の変更又は修飾は、VSV-GPのトロピズムプロファイルに影響を及ぼし、その結果VSV-G(x)DANV及びVSV-G(x)MOPVの神経毒性評価が行われた。VSV-G(x)DANDV及びVSV-G(x)MOPVの両方は、Swiss CD1マウスの頭蓋内への直接注射後に、VSV-LCMV-GPについて示されたような、神経毒性のいかなる徴候も示さなかった(図13)。VSV-G DsRedを受け取った全ての対照マウスは、感染後最初の1週間以内に死亡した。
マウス
8週齢の雌のSwiss CD-1マウスを、Janvier(仏国)から購入した。動物を、5匹の動物群で、換気した檻中で、個別に飼育した。同定を目的に、マウスの耳にクリップを付けた。動物は、実験開始前に、少なくとも1週間馴化させた。
ウイルス
各実験群に関して、指定されたウイルスストックを、氷上で解凍した。これらのウイルスを、PBS中1×106TCID50/3μlに希釈した。全体の容積は、100μlであった。ウイルス浮遊液80μlを、マウスの1群(n=5)の定位注射に使用した。残存する20μlは、標準手順に従い力価決定に使用した。この試料の連続1/2対数希釈は、1×105~1×1010TCID50/mlの範囲をカバーしていた。ウイルス力価決定は、定位注射のためのウイルス希釈液の調製後、1時間以内に行った。
定位注射:マウスを秤量し、適量のケタミン及びキシラジン(体重10g当たり100μl)を、i.p.注射した。麻酔開始した後、目線と後頭部の間の頭蓋部を、適宜剃毛し、且つ目を軟膏(bepanthenクリーム)により保護した。このマウスを、耳棒(ear bars)を外耳道へ両側で固定し、且つ上顎を顎棒により包み込む(enclose)ことにより、定位固定枠に配置した。皮膚を、エタノール中のベータヨウ素(betaiodine)により無菌的に清潔にし、その後前方-後方軸に沿った正中線上に線状の皮膚切開を行った。帽状腱膜(galea-periosteum)を、正中線から遠心性の運きによりかき寄せ(scrape)、骨を、同じ運きにより綿スワブで乾かした。ブレグマの同定後、定位固定枠に固定したHamiltonシリンジの針先端を、ブレグマを直接覆うように調節した。その後針を、ブレグマの0.4mm吻側及び2mm右側方の目標位置に動かし、その位置に、手術用チップにより印を付け、且つ針を再度取り除いた。電気ドリルを使用し、標的位置に穿頭孔を作製し、骨片及び細粉を、PBSで湿らせた綿スワブにより、病巣から取り除いた。
シリンジを、自動インジェクターの高速反転モードを使用し、調製したウイルス溶液で充填した。液体が針の先端で小さい液滴を形成するまでシリンジプランジャーを素早く前向きに押した後、これを湿らせた綿スワブにより清潔にした。針の先端が、ブレグマの0.4mm吻側及び2mm右側方の穿頭孔に配置された後、針を、深さ3mmの所望の座標にまで下側に下げた。その後自動注射手順を、開始した。注射が終了した後、針を1分間その位置に放置し、針の軌跡を通る逆流を防いだ。その後針を、脳及び頭蓋部からゆっくり引き抜いた。Vetbond 3Mを用い創傷を閉鎖する前に、病巣を、PBSにより清潔にした。その後創傷を、感染を防ぐためにベータヨウ素により拭い、この動物を、低体温症を防ぐためのヒーティングパッドを備えた回復用檻に移した。
齧歯類における術後鎮痛に関するFELASA必要要件に従い、術後の鎮痛を提供した。簡単に述べると、イブプロフェン30mg/kg/日を、飲料水中で、72時間かけて、経口供給した。これらの動物を、手術完了時から横になり、完全な可動性が達成されるまで、モニタリングした。動物は、創傷部位の開口、分泌、発赤又は感染の他の可能性のある徴候について、初日に数回、その後毎日モニタリングした。
神経毒性の評価
処置後、1週間又は全てのVSV-G動物が屠殺されるまで、動物を、1日2回試験した。その後、処置後40日まで、動物を毎日モニタリングした。スコア化したパラメータは、体重、運動性、外観及び身体状態、並びに神経毒性の臨床的及び誘発された行動徴候を含む(図12)。累積毒性スコアは、特定のスコアの足し算により計算した。安楽死は、規定されたエンドポイント基準に従い適用された。
配列表
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Figure 2022510856000010
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Claims (22)

  1. VSVキメラベクターであって、前記ベクターが、ダンデノングウイルス(Dandenong virus)又はモペイアウイルス(Mopeia virus)の糖タンパク質GPをコードしている遺伝子を含み、且つVSVのエンベロープタンパク質Gをコードしている機能性遺伝子を欠いていることを特徴とする、VSVキメラベクター。
  2. 前記ベクターが、同一条件下で、LCMVのGPによりシュードタイプ化(pseudotyped)されたVSVベクターと比べ、腫瘍細胞の増大した死滅及び中和抗体の減少した誘導を示す、請求項1に記載のベクター。
  3. 前記VSVのエンベロープタンパク質Gが、ダンデノングウイルス又はモペイアウイルスのGPにより置き換えられることを特徴とする、請求項1又は2に記載のベクター。
  4. 前記ベクターが更に、少なくとも1つの導入遺伝子を含むことを特徴とする、請求項1~3のいずれか一項に記載のベクター。
  5. システムが、少なくとも2つの補完的複製(complementary replicating)するVSVベクターを含むことを特徴とする、VSVキメラベクターシステムであって、ここで該システムが、VSVのタンパク質N、L、P及びMをコードしている遺伝子n、l、p及びm、ダンデノング-GP又はモペイア-GPをコードしている遺伝子gpを含み、且つVSVのGタンパク質をコードしている機能性遺伝子を欠いており、ここで該システムの各ベクターが、遺伝子n、l、p、m及びgpの一つを欠いており、並びにここでこの欠けている遺伝子が、該システムの任意の他のベクター上に存在する、VSVキメラベクターシステム。
  6. キメラVSVビリオンであって、前記ビリオンが、エンベロープタンパク質としてダンデノング又はモペイアウイルスのGPタンパク質を含むことを特徴とする、キメラVSVビリオン。
  7. ウイルス産生細胞であって、前記細胞が、請求項6に記載のキメラVSVビリオンを産生することを特徴とする、ウイルス産生細胞。
  8. 前記細胞が、哺乳動物細胞であることを特徴とする、請求項7に記載のウイルス産生細胞。
  9. 前記哺乳動物細胞が、多能性成体前駆細胞(MAPC)、神経幹細胞(NSC)、間葉系幹細胞(MSC)、HeLa細胞、任意のHEK293細胞、Vero細胞又は骨髄由来の腫瘍浸潤細胞(BM-TIC)であることを特徴とする、請求項8に記載のウイルス産生細胞。
  10. 前記細胞が、VSVのタンパク質N、L、P及びMをコードしている遺伝子n、l、p及びm、並びにダンデノング又はモペイアGP糖タンパク質をコードしている遺伝子gpからなる群から選択される少なくとも1種の遺伝子の発現のための1又は複数の発現カセットを含むことを特徴とする、請求項7~9のいずれか一項に記載のウイルス産生細胞。
  11. 前記細胞が、ダンデノング又はモペイアウイルスのGPによりシュードタイプ化されたVSVビリオンへのパッケージングのための遺伝子導入ベクターを含み、ここで該遺伝子導入ベクターが、導入遺伝子を含むことを特徴とする、請求項7~10のいずれか一項に記載のウイルス産生細胞。
  12. インビトロにおいて細胞へ導入遺伝子を導入する方法であって、前記細胞が、請求項6に記載のキメラビリオンにより形質導入され、ここで該ビリオンが、導入遺伝子を含むことを特徴とする、方法。
  13. インビトロにおいて細胞へ導入遺伝子を導入する方法であって、前記細胞が、請求項7~11のいずれか一項に記載のウイルス産生細胞と接触させられることを特徴とする、方法。
  14. 前記細胞が、腫瘍細胞であることを特徴とする、請求項12又は13に記載の方法。
  15. 請求項1~4のいずれか一項に記載のVSVキメラベクター、請求項5に記載のVSVキメラベクターシステム、請求項6に記載のキメラVSVビリオン、又は請求項7~11のいずれか一項に記載のウイルス産生細胞を含有することを特徴とする、医薬組成物。
  16. 医薬品として使用するための、請求項1~4のいずれか一項に記載のVSVキメラベクター、請求項5に記載のVSVキメラベクターシステム、請求項6に記載のキメラVSVビリオン、請求項7~11のいずれか一項に記載のウイルス産生細胞、又は請求項15に記載の医薬組成物。
  17. 癌の治療に使用するための、請求項1~4のいずれか一項に記載のVSVキメラベクター、請求項5に記載のVSVキメラベクターシステム、請求項6に記載のシュードタイプ化されたVSVビリオン、請求項7~11のいずれか一項に記載のウイルス産生細胞、又は請求項15に記載の医薬組成物。
  18. 前記癌が、固形癌である、請求項17に記載の使用のためのVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物。
  19. 前記固形癌が、脳癌、結腸直腸癌、中咽頭扁平上皮癌、胃癌、胃食道接合部腺癌、食道癌、肝細胞癌、膵臓腺癌、胆管癌、膀胱尿路上皮癌、転移性黒色腫、前立腺癌、乳癌、膠芽細胞腫、非小細胞肺癌、脳腫瘍又は小細胞肺癌であることを特徴とする、請求項18に記載の使用のためのVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物。
  20. 前記VSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物が、PD-1又はPD-L1アンタゴニストと組合せられている、請求項16~19のいずれか一項に記載の使用のためのVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物。
  21. 前記VSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物が、腫瘍内又は静脈内に投与されることになる、請求項16~20のいずれか一項に記載の使用のためのVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物。
  22. 前記VSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物が、腫瘍内に、続いて静脈内に投与される、請求項21に記載の使用のためのVSVキメラベクター、VSVキメラベクターシステム、キメラVSVビリオン、ウイルス産生細胞又は医薬組成物。
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