JP2022191233A - インスリンアナログ - Google Patents

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Abstract

【課題】インスリンアナログ、特に短縮型B鎖を有するインスリンアナログを提供する。【解決手段】A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを含むインスリンアナログであって、前記B鎖は、ヒトインスリンのB鎖の特定の位置で芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基を含み、および/またはヒトインスリンのB鎖の別の特定の位置で芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基を含み、前記アナログは、ヒトインスリン中に見出される少なくとも1個のアミノ酸を含むがコヌス・ジオグラフス(Conus geographus)毒液インスリンの対応する位置では欠いており、前記A鎖ペプチドおよび前記B鎖ペプチドは少なくとも1対のシステイン残基を介して互いに結合している、インスリンアナログを提供する。【選択図】なし

Description

本出願は、2016年7月22日に出願された豪国仮特許出願第2016902883号明細書からの優先権を主張し、この明細書はその全体が参照により組み込まれる。本出願はまた、2017年4月4日に出願された米国仮特許出願第62/483,118号明細書からの優先権も主張し、この明細書はその全体が参照により組み込まれる。
連邦政府による資金提供を受けた研究に関する陳述
本発明はその一部がNational Institutes of Healthにより付与されたGM 48677の下で政府の支援を受けてなされた。政府は本発明において一定の権利を有する。
本発明の分野
本発明は概してインスリンアナログに関する。より具体的には、本発明は、短縮型B鎖を有する即時作用性インスリンアナログに関する。本発明はまた、イモガイの毒液由来のインスリンの結晶構造、ならびにこの結晶および関連する構造情報を使用して、インスリンレセプターと相互作用するまたはインスリンレセプターを調節するインスリンアナログをスクリーニングするおよび設計する方法にも関する。
インスリンは、グルコース代謝、生殖および認知の制御において中心的役割を果たすポリペプチドホルモンである。ヒトインスリン単量体は、2個のジスルフィド架橋(CysA7-CysB7およびCysA19-B20)で共有結合的に連結された2本のポリペプチド鎖(A鎖およびB鎖)からなる。A鎖は21個のアミノ酸からなり、B鎖は30個のアミノ酸からなる。A鎖内には3番目のジスルフィド架橋が位置する(CysA6-CysA11)。身体内では、インスリンは単量体、二量体および六量体として存在する。この六量体は、2個の中心亜鉛イオンにより互いに保持された3個のインスリン二量体からなる。ヒトインスリンは六量体として膵臓β-細胞中に貯蔵されている。インスリンレセプターに結合する生物学的に活性な形態は単量体である。インスリンの六量体-単量体変換は、このインスリンの生物学的利用能にとって極めて重要である。
インスリン制御の妨害は、重篤な臨床症状(例えば糖尿病性脊髄炎(diabetes myelitis)、高血糖および他の類似の状態)と関連することが多い。真性糖尿病(糖尿病と呼ばれる)は、長期間にわたる高血糖レベルを特徴とする一群の障害である。膵臓がインスリンを十分に産生しない場合には、または身体がインスリンに適切に反応しない場合には、糖尿病が生じる可能性がある。インスリンまたはインスリンアナログの投与は、糖尿病等の状態を処置する最も有効な方法であり続けている。糖尿病の処置は、ホルモンの基礎レベルを維持するための、即時作用性の食前インスリンと長時間作用性インスリンとの組み合わせの投与を伴うことが多い。
即時作用性インスリンアナログは活性が速やかに発現される。典型的には、この即時作用性インスリンアナログは単量体である、または罹患した個体への注射時に単量体型へと迅速に解離する。構造的には、このインスリンアナログは、インスリン多量体化に有害であるB鎖C末端領域(残基B26~B30)内で改変を有することによって通常のヒトインスリンとは異なる。しかしながら、自己会合を消失させるためのB鎖のさらなるC末端トランケーションにより活性がほぼ完全に消失しており、なぜならばおそらく活性にはPheB24が重要だからである。例えば、デス-オクタペプチド(des-octapeptide)[B23-B30]インスリン(DOI)(単量体アナログ)は、0.1%未満の生物活性を保持する(Bao at al.,1997)。PheB24は、残基GlyB20-GluB21-ArgB22-GlyB23により形成された1型β-ターンのすぐC末端に隣接し、トリプレット(triplet)PheB24-PheB25-TyrB26および1型β-ターンの両方が脊椎動物インスリンで高度に保存されている。
単量体であり、即時作用性であり且つヒトインスリンレセプターシグナル伝達活性を保持する新規のインスリンアナログおよびそのようなアナログを設計する方法が必要とされている。
本発明者らは、コヌス・ジオグラフス(Conus geographus)の毒液由来の新たに同定されたインスリンCon-Ins G1の特徴を明らかにしており、このインスリンは単量体ではあるが依然としてヒトインスリンレセプターに結合してシグナル伝達活性を保持することを示す。本発明者らはさらにCon-Ins G1の結晶の作製に成功しており、X線結晶構造解析を使用してこの結晶の三次元構造を解明した。本明細書で提示された構造データは、ヒトインスリンの芳香族トリプレットPheB24-PheB25-TyrB26を欠いているにもかかわらずCon-Ins G1がその活性を保持することを可能にする重要なアミノ酸位置および相互作用の同定を初めて可能にしている。
一態様では、本発明は、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを含むインスリンアナログであって、このB鎖は、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置で芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基を含み、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置で芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基を含み、このアナログは、ヒトインスリン中に見出される少なくとも1個のアミノ酸を含むがコヌス・ジオグラフス(Conus geographus)毒液インスリンの対応する位置では欠いており、これらA鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは少なくとも1対のシステイン残基を介して互いに結合している、インスリンアナログを提供する。
いくつかの実施形態では、この芳香族残基は、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジンおよび4-メチルフェニルアラニンからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、この大きい脂肪族残基は、イソロイシン、シクロヘキシルアラニン、シクロペンチルアラニンおよびメチオニンからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置での芳香族残基または大きい脂肪族残基は、チロシン、フェニルアラニン、4-メチルフェニルアラニン、ヒスチジン、トリプトファン、メチオニン、シクロペンチルアラニンおよびシクロヘキシルアラニンからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置での芳香族残基または大きい脂肪族残基は、チロシン、フェニルアラニン、4-メチルフェニルアラニン、ヒスチジン、トリプトファン、メチオニン、シクロペンチルアラニンおよびシクロヘキシルアラニンからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、このB鎖は、ヒトインスリンと比較した場合にC末端でトランケートされている。いくつかの実施形態では、このB鎖は、ヒトインスリンの9個のC末端アミノ酸のうちの1個または複数個または全てを欠いている。いくつかの実施形態では、このB鎖はヒトインスリンのPheB24を少なくとも欠いている。いくつかの実施形態では、このB鎖はヒトB鎖の芳香族トリプレット(ヒトインスリンのアミノ酸PheB24-PheB25-TyrB26)を少なくとも欠いている。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-XA2-XA3-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-XA12-XA13-XA14-XA15-XA16-XA17-XA18-XA19-CysA20-XA21-XA22-XA23-XA24-XA25-XA26-XA27-XA28-XA29-XA30-XA31-XA32-XA33-XA34(この配列中、XA2=ValまたはIle;XA3=ValまたはAla;XA4=Glu、Asp、Cysまたはガンマカルボキシグルタメート;XA5=Gln、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、HisまたはVal;CysA6、CysA7およびCysA11は独立してCysまたはセレノシステインであり;XA8=Thr、His、Asp、Gln、Tyr、Lys、AlaまたはVal;XA9=Ser、Arg、Asn、Gly、HisまたはLys;XA10=Ile、Pro、Tyr、Ala、Ser、Val、Phe、HisまたはThr;XA12=SerまたはThr;XA13=Leu、Asn、Val、ArgまたはAsp;XA14=Tyr、Ala、Gln、His、AspまたはGlu;XA15=Gln、GluまたはThr;XA16=Phe、LeuまたはAla;XA17=Glu、Gln、Lys、Arg、Ile、Met、ThrまたはSer;XA18=Lys、Ser、Thr、Asn、GlnまたはGlu;XA19=TyrまたはPhe;CysA20=Cys、セレノシステイン、アミド化Cysまたはアミド化セレノシステイン;XA21=Asn、Pro、His、Ser、Gly、Alaまたは存在せず;XA22=Pro、Asn、Thr、Leu、Serまたは存在せず;XA23=Thr、Leu、Val、Serまたは存在せず;XA24=Arg、Thr、Met、Gln、Leuまたは存在せず;XA25=Glu、Glyまたは存在せず;XA26=Ser、Leuまたは存在せず;XA27~XA31は独立してSerであり、または存在せず;XA32=Ala、Serまたは存在せず;XA33=Ala、Valまたは存在せず;ならびにXA34=Alaまたは存在しない)(配列番号1)を含むA鎖ペプチドと、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Ala、Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Ala、Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Lys、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Thr、Tyr、ArgまたはGly;XB17=Thr、Tyr、Pro、LeuまたはGly;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、Arg、SerまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Val、Tyr、Phe、His、Gly、Gln、Leu、アミド化His、アミド化Valまたは存在せず;XB23=Glu、Asp、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Ile、Leu、Ser、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Ala、Asp、Ser、Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号2)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このB鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号3)を含む。
いくつかの実施形態では、このB鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;ならびにXB24、XB25、XB26、XB27、XB28、XB29、XB30、XB31、XB32、XB33、XB34、XB35、XB36、XB37、XB38およびXB39は存在しない)(配列番号4)を含む。
いくつかの実施形態では、このB鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号5)を含む。
いくつかの実施形態では、このB鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=HisまたはTyr;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=ValまたはLeu;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号6)を含む。
いくつかの実施形態では、このB鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thr、Asnまたは存在せず;XB2=Phe、Serまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、AsnまたはGln;XB7=HisまたはTyr;XB8=Arg、IleまたはLeu;XB12=His、Asp、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB13=Val、IleまたはLeu;XB14=Thr、Ala、ProまたはVal;XB15=Glu、Val、AsnまたはAsp;XB16=Ser、Gln、TyrまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Asp、MetまたはVal;XB19=Leu、Asp、GlnまたはLys;XB20=LeuまたはVal;CysB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=TyrまたはGly;およびXB23=Glu、Arg、Glyまたは存在しない)(配列番号7)を含む。
いくつかの実施形態では、このB鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu、XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;XB22=Tyr;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号8)を含む。
いくつかの実施形態では、XB17およびXB22はTyrである。いくつかの実施形態では、XB22はTyrである。いくつかの実施形態では、XB17はTyrである。
いくつかの実施形態では、このA鎖ペプチドは、配列Gly-XA2-XA3-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-XA12-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-XA19-CysA20-XA21-XA22-XA23-XA24-XA25-XA26-XA27-XA28-XA29-XA30-XA31-XA32-XA33-XA34(この配列中、XA2=ValまたはIle;XA3=ValまたはAla;XA4=Glu、ガンマカルボキシグルタメートまたはCys;XA5=Gln、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、HisまたはVal;CysA6、CysA7およびCysA11は独立してCysまたはセレノシステインであり;XA8=Thr、His、Asp、Gln、Tyr、LysまたはVal;XA9=Ser、Arg、Asn、HisまたはLys;XA10=Ile、Pro、Tyr、Ala、Ser、Phe、HisまたはThr;XA12=SerまたはThr;XA13=Leu、Asn、ValまたはAsp;XA14=Tyr、Ala、Gln、AspまたはGlu;XA15=Gln、GluまたはThr;またはAla;XA17=Glu、Lys、Arg、Ile、Met、ThrまたはSer;XA18=Lys、Thr、Asn、GlnまたはGlu;XA19=TyrまたはPhe;CysA20=Cys、セレノシステイン、アミド化Cysまたはアミド化セレノシステイン;XA21=Asn、Pro、His、Ser、Gly、Alaまたは存在せず;XA22=Pro、Asn、Thr、Leu、Serまたは存在せず;XA23=Thr、Leu、Val、Serまたは存在せず;XA24=Arg、Thr、Met、Gln、Leuまたは存在せず;XA25=Glu、Glyまたは存在せず;XA26=Ser、Leuまたは存在せず;XA27~XA31は独立してSerであり、または存在せず;XA32=Ala、Serまたは存在せず;XA33=Ala、Valまたは存在せず;ならびにXA34=Alaまたは存在しない)(配列番号9)を含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-XA2-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-XA16-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA2はValまたはIleであり、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA16はPheまたはLeuであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号10)を含むA鎖ペプチドと、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;XB22=GlyまたはTyr;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号11)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-XA2-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA2はValまたはIleであり、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号12)を含むA鎖ペプチドと、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-Tyr-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号13)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Val-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号14)を含むA鎖ペプチドと、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-Arg-CysB9-Gly-Ser-XB12-Ile-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-Leu-CysB21-Tyr-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、およびXB23=GluまたはArg)(配列番号15)を含むB鎖ペプチドとを含む。
一実施形態では、このインスリンアナログは、C末端でのトランケート型B鎖ならびにこのB鎖のアミノ酸番号15および/または20での芳香族残基または大きい脂肪族残基を除いてヒトインスリンと同一である。例として、Xaaが芳香族残基または大きい脂肪族残基である下記の3つの実施形態が提供されるがこれらに限定されない。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn(配列番号16)を含むA鎖ペプチドと、配列Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Xaa-Tyr-Leu-Val-Cys-Gly-Glu(この配列中、Xaaは芳香族残基または大きい脂肪族残基である)(配列番号17)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn(配列番号18)を含むA鎖ペプチドと、配列Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tyr-Leu-Val-Cys-Xaa-Glu(この配列中、Xaaは芳香族残基または大きい脂肪族残基である)(配列番号19)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn(配列番号20)を含むA鎖ペプチドと、配列Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Xaa-Tyr-Leu-Val-Cys-Xaa-Glu(配列番号21)(この配列中、Xaaは芳香族残基または大きい脂肪族残基である)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは多くの改変アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、下記:
i)XA4はガンマカルボキシグルタメートである、
ii)XB5=ヒドロキシプロリン、および
iii)XB12=ガンマカルボキシグルタメート
のうちの1つまたは複数または全てを含む。
いくつかの実施形態では、B鎖ペプチドのCysB9はA鎖ペプチドのCysA6に結合している。いくつかの実施形態では、B鎖ペプチドのCysB21はA鎖ペプチドのCysA20に結合している。いくつかの実施形態では、CysA7はCysA11に結合している。
いくつかの実施形態では、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは一対のそれらの各末端で互いに連結されている。いくつかの実施形態では、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは両方の末端で互いに連結されている。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログはヒトIR-Bレセプターに対するIC50が10-6Mよりも低い。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログはヒトIGF-IRに結合しない、またはIGF-IRに弱く結合する。いくつかの実施形態では、このアナログはヒトIGF-IRに対する親和性(K)が100nMよりも弱い。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは主に単量体である。いくつかの実施形態では、このアナログの少なくとも75%は溶液中で単量体である。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンと比較した場合に、ヒトに投与された際に生物学的利用能が増加している。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトへの投与から0.5~3時間以内に生物学的利用能がピークになる。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは投与から10分以内に活性を発現する。
さらなる態様では、本発明は、本明細書で定義されたインスリンアナログまたはその薬学的に許容される塩と、1種または複数種の薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物を提供する。
さらなる態様では、本発明は、インスリンに関連する状態を処置するおよび/または予防する方法であって、必要とする対象に、本明細書で定義されたインスリンアナログの治療上有効な量を投与することを含む方法を提供する。いくつかの実施形態では、このインスリンに関連する状態は高血糖、インスリン抵抗性、1型糖尿病、妊娠糖尿病または2型糖尿病である。
さらなる態様では、本発明は、血糖値を低減させる方法であって、必要とする対象に、本明細書で定義されたインスリンアナログの治療上有効な量を投与することを含む方法を提供する。
さらなる態様では、本発明は、対象のインスリンに関連する状態を処置するためのおよび/または予防するための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用を提供する。さらなる態様では、本発明は、対象の血糖値を低減させるための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用を提供する。
さらなる態様では、本発明は、対象のインスリンに関連する状態の処置および/または予防での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログを提供する。さらなる態様では、本発明は、対象の血糖値の低減での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログを提供する。
さらなる態様では、本発明は、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであって、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、ペプチドを提供する。いくつかの実例では、このアミノ酸20での置換はG20Y、G20FまたはG20Pである。いくつかの実例では、このアミノ酸10での置換はH10E、H10DまたはH10Qである。
いくつかの実施形態では、このペプチドはインスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含み、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含み、このA鎖ペプチド中に少なくとも1個の置換をさらに含む。いくつかの実例では、このA鎖ペプチド中の少なくとも1個の置換はT8H、T8Y、T8KまたはS9Rである。
いくつかの実施形態では、このペプチドはインスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含み、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含み、このA鎖ペプチド中に少なくとも2個の置換をさらに含む。いくつかの実例では、このA鎖ペプチド中の少なくとも2個の置換は、T8H、T8Y、T8KおよびS9Rから選択される置換のうちの2つである。
いくつかの実施形態では、このペプチドはデス-オクタペプチドインスリンである。いくつかの実例では、B鎖ペプチドはFVNQHLCGSELVEALYLVCYER(配列番号30)の配列を含む。いくつかの実例では、このA鎖はGIVEQCCHRICSLYQLENYCN(配列番号39)の配列を含む。
いくつかの実施形態では、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは少なくとも1個のジスルフィド結合を介して結合している。いくつかの実施形態では、このペプチドは単量体である。
いくつかの実施形態では、このインスリンA鎖ペプチドは野生型ヒトインスリンA鎖ペプチドと少なくとも70%同一である。
さらに別の態様では、本発明は、本明細書で定義されたインスリンアナログ、ペプチドまたは化合物を含む医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであって、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、ペプチドと、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物を提供する。
さらに別の態様では、本発明は、対象中でインスリンレセプター活性化を増加させる方法であって、本明細書で定義されたインスリンアナログ、ペプチドまたは化合物の治療上有効な量を投与することを含む方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、対象中でインスリンレセプター活性化を増加させる方法であって、必要とする対象に、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであり、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、ペプチドの治療上有効な量を投与することを含む方法を提供する。
さらに別の態様では、本発明は、対象の血糖を低下させる方法であって、本明細書で定義されたインスリンアナログ、ペプチドまたは化合物の治療上有効な量を投与することを含む方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、対象の血糖を低下させる方法であって、必要な対象に、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであり、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、ペプチドの治療上有効な量を投与することを含む方法を提供する。
さらに別の態様では、本発明は、対象の1型糖尿病を処置する方法であって、本明細書で定義されたインスリンアナログ、ペプチドまたは化合物の治療上有効な量を投与することを含む方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、対象の1型糖尿病を処置する方法であって、必要とする対象に、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであり、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、ペプチドの治療上有効な量を投与することを含む方法を提供する。いくつかの実例では、この対象は、このペプチドの投与の前に1型糖尿病と診断されている。
さらなる態様では、少なくとも1個のジスルフィド結合を介してB鎖ペプチドに結合しているA鎖ペプチドを有する治療用タンパク質であって、このA鎖はGIVEQCCHRICSLYQLENYCN(配列番号39)の配列を含み、このB鎖ペプチドはFVNQHLCGSELVEALYLVCYER(配列番号30)の配列を含む、治療用タンパク質が提供される。
さらなる態様では、本発明は、インスリンレセプター(IR)に結合することが知られているポリペプチドを再設計するまたは改変する方法であって、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造の、構造に基づく評価を実施すること、およびこの評価の結果としてポリペプチドを再設計するまたは化学的に改変することを含む方法を提供する。いくつかの実施形態では、この構造に基づく評価は、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造とインスリンの原子座標またはそのサブセットとの比較を含む。いくつかの実施形態では、この構造に基づく評価は、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造とインスリンレセプターの原子座標またはそのサブセットとの間に形成される複合体の分子モデリングをさらに含む。いくつかの実施形態では、この方法は、再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドを合成するまたは得ること、およびこのポリペプチドのIRに結合する能力を試験することをさらに含む。いくつかの実施形態では、この方法は、再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドを合成するまたは得ること、および再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドのIR活性化を調節する能力を決定することをさらに含む。いくつかの実施形態では、この方法は、再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドを合成するまたは得ること、および再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドの血糖値を低下させる能力を決定することをさらに含む。いくつかの実施形態では、IRに結合することが知られているポリペプチドはインスリンである。いくつかの実施形態では、このインスリンはヒトインスリンである。別の態様では、本明細書で定義された方法により再設計されているまたは改変されているポリペプチドも提供される。いくつかの実施形態では、このポリペプチドは単量体である。
別の態様では、本発明は、IRアゴニストである単離分子であって、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義されるCon-Ins G1の3D構造に基づいて同定されているおよび/または設計されている分子を提供する。いくつかの実施形態では、この分子はペプチド、ポリペプチドまたはペプチド模倣物である。いくつかの実施形態では、この分子は単量体である。いくつかの実施形態では、この分子はヒトIR-Bレセプターに対するIC50が10-6Mよりも低い。
別の態様では、本発明は、IRに結合する化合物を同定する方法であって、
i)下記:
a)付録Iの原子座標もしくはそのサブセットにより定義される構造、または
b)a)の対応する主鎖原子上で重ねた場合に約2.0Å未満の平均二乗偏差を有する構造
を有するポリペプチドの三次元構造モデルを作成すること、および
ii)このIRに潜在的に結合する化合物を設計するまたはスクリーニングすること
を含む方法を提供する。
いくつかの実施形態では、三次元構造モデルを作成することは、IRまたはその領域に結合したポリペプチドのモデルを作成することを含む。いくつかの実施形態では、この方法は、IRに潜在的に結合する化合物を合成することをさらに含む。いくつかの実施形態では、この化合物はIRの少なくとも1種の生物学的活性を調節する。いくつかの実施形態では、この化合物は単量体である。いくつかの実施形態では、この方法は、血糖値を調節する能力に関して、ii)で設計されたまたはスクリーニングされた化合物を試験することをさらに含む。いくつかの実施形態では、工程i)およびii)をインシリコで実施する。
別の態様では、本発明は、インスリン活性を模倣する化合物を同定するコンピュータベースの方法であって、
i)下記:
a)付録Iの原子座標もしくはそのサブセットにより定義される構造、または
b)a)の対応する主鎖原子上で重ねた場合に約2.0Å未満の平均二乗偏差を有する構造
を有するポリペプチドの三次元構造モデルを作成すること、および
ii)インスリン活性を模倣する化合物を設計するまたはスクリーニングすること
を含む方法を提供する。
いくつかの実施形態では、三次元構造モデルを作成することは、IRまたはその領域に結合するポリペプチドのモデルを作成することを含む。いくつかの実施形態では、この方法は、IRに潜在的に結合する化合物を合成することをさらに含む。いくつかの実施形態では、この化合物はIRの少なくとも1種の生物学的活性を調節する。いくつかの実施形態では、この化合物は単量体である。いくつかの実施形態では、この方法は、血糖値を調節する能力に関して、ii)で設計されたまたはスクリーニングされた化合物を試験することをさらに含む。いくつかの実施形態では、工程i)およびii)をインシリコで実施する。
さらなる態様では、本発明は、本明細書で定義された方法を使用して同定された化合物を提供する。
さらなる態様では、本発明は、あらゆる格子寸法において変動が最大約2%であるa=b=c=74.91Åの単位格子寸法を有する空間群P432を有するCon-Ins G1ポリペプチドの結晶を提供する。
さらなる態様では、本発明は、付録Iの原子座標により定義されるCon-Ins G1ポリペプチドの構造を提供する。
さらなる態様では、本発明は、構造モデルとしての、付録Iの原子座標により定義されるCon-Ins G1ポリペプチドの構造の使用を提供する。いくつかの実施形態では、この構造モデルをインスリンアナログの同定に使用する。本発明はまた、本明細書で定義された使用により同定されたインスリンアナログも提供する。
さらに別の態様では、本発明は、本明細書で定義されたインスリンアナログ、ポリペプチド分子および/または化合物を含む医薬組成物を提供する。
本明細書中の任意の実施形態は、別途具体的に述べられていない限り、必要な変更を加えて任意の他の実施形態に適用されると解釈するものとする。例として、当業者が理解するように、本発明の方法に関して本明細書で概説されたインスリンアナログ、ペプチドおよび健康状態の例は、本発明の使用および医薬組成物にも同様に当てはまる。薬剤の製造における本化合物の医薬組成物への組込み等の製造工程を本発明の実施形態が含むことも意図されている。
本明細書全体にわたり、別途具体的に述べられていない限り、または文脈が要求しない限り、単一の工程、組成物、工程群または組成物群への言及は、これらの工程、組成物、工程群または組成物群のうちの1つおよび複数(即ち1つまたは複数)を包含すると解釈するものとする。
本開示の方法および組成物のさらなる利点は、下記の説明において一部が記載され且つこの説明から一部が理解され、または本開示の方法および組成物の実施により習得され得る。本開示の方法および組成物の利点は、添付の特許請求の範囲で特に指摘された要素および組み合わせにより実現され且つ達成される。
下記の非限定的な実施例により且つ添付の図面を参照して本発明を下記に説明する。本発明は、例示のみを目的として意図されている本明細書で説明された特定の実施形態により範囲が限定されるべきではない。本明細書で説明されているように、機能的に等価な製品、組成物および方法は明らかに本発明の範囲内である。
本明細書に組み込まれており且つ本明細書の一部を構成する添付の図面は、本開示の方法および組成物のいくつかの実施形態を図示しており、本明細書と一緒に、本開示の方法および組成物の原理を説明するのに役立つ。
ヒトインスリンとの配列比較を示す図である。Con-Ins G1の配列およびヒトインスリンとの比較。保存されたシステイン残基および芳香族トリプレットに灰色の網掛けをしている。ジスルフィド結合を、2個のシステイン残基を結ぶ実線で示す。γ:γ-カルボキシル化グルタメート(γ-carboxylated-glutamate);O:ヒドロキシプロリン;:C末端アミド化。 Con-Ins G1のキャラクタリゼーションを示すグラフである。Con-Ins G1(n=9)、PTM-フリー sCon-Ins G1(n=9)およびヒトインスリン(n=21)のヒトIR(アイソフォームB)への競合結合分析。エラーバーはSEMを表す(存在しない場合、エラーバーはマーカーサイズと比べて小さい)。sCon-Ins G1:SecA6とSecA10との間にジセレニド結合を有するCon-Ins G1。 Aktリン酸化分析により測定したインスリンシグナル伝達を示すグラフである。sCon-Ins G1、PTM-フリー sCon-Ins G1およびhInsのAktリン酸化分析(n=4)。エラーバーはSEMを表す(存在しない場合、エラーバーはマーカーサイズと比べて小さい)。 図4aは、Con-Ins G1のx線結晶構造を示す図である。Con-Ins G1およびhInsの重ね合わせ(PDBエントリー1MSO)。Con-Ins G1のB鎖およびA鎖の主鎖は灰色であり、hInsのB鎖およびA鎖の主鎖は(それぞれ)黒色および白色である。 図4bは、Con-Ins G1の疎水性コアを示す図である。hInsのコア構造と比較したCon-Ins G1のコア構造。Con-Ins G1のB鎖およびA鎖の主鎖は灰色であり、hInsのB鎖およびA鎖の主鎖は(それぞれ)黒色および白色である。 図4c-eは、Con-Ins G1の翻訳後改変を示す図である。GlaA4、GlaB10およびHypB3の側鎖相互作用(それぞれ、hIns GluA4のものと比較したGlaA4のものとの側鎖相互作用)。Con-Ins G1のB鎖およびA鎖の主鎖は灰色であり、hInsのB鎖およびA鎖の主鎖は(それぞれ)黒色および白色である。 Con-Ins G1のx線結晶構造を示す図である。結晶学的4回転軸の周りのCon-Ins G1単量体の結晶内の配置を示す立体画像。4個の硫酸塩分子(中心)を、非拘束座標とそれぞれ0.25の有効占有率とにより、4回転軸上の差電子密度の比較的特徴がない小塊へとモデル化している。硫酸イオンは、各Con-Ins G1単量体からのGlyA1のアミノ末端基およびGlaA4の側鎖カルボキシレートを含む電荷補償クラスタの一部を形成する。 hIRに結合するCon-ins G1を示す図である。ヒトインスリンレセプターの一次インスリン結合部位に関連したCon-Ins G1の分子モデル。hIns残基B22~B27(PDBエントリー4OGAからのそれぞれのhIR結合形態)を黒色で重ねる。この図は、Con-Ins G1 TyrB15の側鎖は、そのレセプターフリーの立体配座から回転すると、Con-Ins G1 / hIR複合体の形成においてhIns PheB24の側鎖の代わりとしてCon-Ins G1 TyrB20の側鎖と一緒にどのようにして作用し得るかを示す。明確にするために、Con-Ins G1のA鎖(前景)は透明である。 TyrB15およびTyrB20を示す図である。1.5σレベルで輪郭を描いた、Con-Ins G1残基TyrB15およびTyrB20の近傍における(2mFobs-DFcalc)差電子密度の等値面表示(isosurface representation)。これらの両方の残基の側鎖は、隣接する残基の側鎖(例えばTyrA19の側鎖)と比較して乱れているように見える。 Con-Ins G1のGlaA4を示す図である。Con-Ins G1とhIRの一次結合部位との複合体の分子モデル内で観測した、Con-Ins G1 PTM残基GlaA4の側鎖とhIR αCT残基Asn711の側鎖との相互作用を示す概略図である。分子表面はhIR L1ドメインの分子表面である。 Aktリン酸化分析により測定したインスリンシグナル伝達を示すグラフである。hIns、hIns[DOI]およびhIns[TyrB15,TyrB20,DOI]のAktリン酸化分析。 Con-Ins G1のキャラクタリゼーションを示すグラフである。見掛け上のMW 5380±55g/molの単一種に対する最良フィット(線)による、30,000rpm(黒色点)および45,000rpm(灰色点)でのCon-Ins G1の沈降平衡分析。 Fv83-7.IR310.TおよびIR-A704-719との共複合体中のCon-InsG1を示す図である。Fv83-7.IR310.TおよびIR-A704-719との共複合体中のCon-InsG1の複合体の結晶構造の非対称単位における2個のコピーの重ね合わせの2つの直交図。各パネル内では、一方のコピーを比較的厚い連結を有する灰色のCαトレースとして示し、他方を比較的薄い連結を有する黒色のCαトレースとして示す。この重ね合わせはIR310.T部分内の共通の残基に基づく。明確にするために、CRドメインおよびこのCRドメインの付着したFv83-7を省略する。 Fv83-7.IR310.TおよびIR-A704-719との共複合体中のCon-InsG1を示す図である。Fv83-7.IR310.TおよびIR-A704-719との共複合体中のCon-InsG1の結晶構造と、Fab83-7.IR310.TおよびIR-A704-719との共複合体中のhInsの結晶構造との重ね合わせ(PDBエントリー4OGA)。このCon-InsG1複合体を薄い灰色のCαトレース(および太線)で示し、hIns複合体を黒色のCαトレース(および細線、太い黒色で示す残基B22~B30を除く)で示す。この重ね合わせはIR310.T部分内の共通の残基に基づく。明確にするためにIR310.Tのシステインリッチドメインおよびこのドメインの付着した抗体断片を省略する。 TyrB15およびTyrB20を示す図である。IR310.Tの共通ドメインL1に基づく、Fab83-7、IR310.TおよびIR-A704-719との複合体(PDAエントリー4OGA;標識付)中のhInsと、Fv83-7、IR310.TおよびIR-A704-719との複合体(下線付き標識)中のCon-Ins G1との重ね合わせ。IR310.TのL1ドメインを漫画のリボン表現で示し、hIns、Con-Ins G1およびIR-A704-719をCαトレース表現で示す。明確にするために、IR310.TのCRドメインを省略する。hIR Phe714、hIns LeuB15およびPhe B24およびCon-Ins G1 TyrB15の側鎖およびCα原子をボールスティック表現(ball-and-stick representation)で示す。hIns PheB24およびCon-InsG1 TyrB15の側鎖の空間的対応は明白である。Con-Ins G1 TyrB20に関しては解釈可能な電子密度は存在しない。明確にするために、Con-Ins G1およびhInsのそれぞれのA鎖を省略する。 hIRの一次結合部位(部位1)を含む構成成分に結合したhIns[DOI]の分子モデリングを示す図である。IR L1ドメイン(残基Gly5~Cys155)およびIR-A704-719セグメント(IR-Aアイソフォームの残基Phe705~Ser719)と複合体化したhIns[DOI]の分子モデル。IR-A704-719セグメントを漫画のリボン表現で示し且つ濃い灰色に着色する。hIns[DOI]A鎖およびB鎖を漫画のリボン表現で示し且つ標識を付す。透明な分子表面はhIR L1ドメインの分子表面である。hIR L1ドメインを、Tyr67の側鎖を示した漫画のリボン表現で示す。 hIRの一次結合部位(部位1)を含む構成成分に結合したhIns[TyrB15,DOI]の分子モデリングを示す図である。IR L1ドメイン(残基Gly5~Cys155)およびIR-AセグメントPhe705~Ser719(IR-A704-719)と複合体化したhIns[TyrB15,DOI]の分子モデル。IR-A704-719セグメントを漫画のリボン表現で示し且つ濃い灰色に着色する。hIns[TyrB15,DOI]A鎖およびB鎖を漫画のリボン表現で示し且つ標識を付す。分子表面はhIR L1ドメインの分子表面である。この図は、TyrB15の側鎖が、そうでなければhIns LeuB15に占められる空間を占めるDOI-(IR-A704-719)-L1界面の疎水性コアへとどのようにして突出するかを示す。 hIRの一次結合部位(部位1)を含む構成成分に結合したhIns[DOI,TyrB20]の分子モデリングを示す図である。IR L1ドメイン(残基Gly5~Cys155)およびIR-A704-719と複合体化したhIns[TyrB20,DOI]の分子モデル。この図は、TyrB20の側鎖がどのようにしてhIns PheB24結合部位中に留まり、レセプターとの全ての他の相互作用が天然様に見えるかを示す。IR-A704-719セグメントを漫画のリボン表示で示し且つ濃い灰色に着色する。hIns[TyrB20,DOI]A鎖およびB鎖を漫画のリボン表現で示し且つ標識を付す。透明な分子表面はhIR L1ドメインの分子表面である。hIR L1ドメインを、Tyr67の側鎖を示した漫画のリボン表現で示す。 hIns[DOI]の位置走査を示す表である。hIns[DOI]の各部位での結果としての変異ΔΔG(kcal/mol)寄与。 hIns[TyrB15,DOI]の位置走査を示す表である。hIns[TyrB15,DOI]の各部位での結果としての変異ΔΔG(kcal/mol)寄与。 hIns[TyrB20,DOI]の位置走査を示す表である。hIns[TyrB20,DOI]の各部位での結果としての変異ΔΔG(kcal/mol)寄与。 インスリン多量体平衡の概要を示す図である。この図は、インスリン単量体化により吸収速度が遅くなることを示す。 ヒトDOIインスリンの化学全合成を示す図である。この図は、ヒトDOIインスリの化学全合成を示す。Thr-Serイソペプチド(赤枠)を使用して、インスリンA鎖の溶解性を増加させた。 例示したインスリンアナログによるインスリンシグナル伝達活性化を示す図である。この図は、hIR活性化へのB15 TyrおよびB20 Tyrの効果を示す。使用した各ペプチドの配列も示す。 例示したインスリンアナログによるインスリンシグナル伝達活性化を示す図である。この図は、hIR活性化へのB10 Glu、B20 Tyrの効果を示す。使用した各ペプチドの配列も示す。 例示したインスリンアナログによるインスリンシグナル伝達活性化を示す図である。図24Aおよび図24Bはそれぞれ、ペプチド配列/インスリンシグナル伝達の活性化におけるB20残基および改変アミノ酸の効果を示す。 例示したインスリンアナログによるインスリンシグナル伝達活性化を示す図である。この図は、hIR活性化へのA8 His、A9 Argの効果を示す。使用した各ペプチドの配列も示す。 例示したインスリンアナログによるインスリンシグナル伝達活性化を示す図である。この図は、hIR活性化へのA8、A9、B10およびB20の個々の効果を示す。 毒液インスリンによるインスリンシグナル伝達活性化を示す図である。この図は、Con-Ins G1と同様の効力を有するいくつかの毒液インスリンのインスリンシグナル活性化を示す(上方のパネル)。これらの毒液インスリンの配列アラインメント(下方のパネル)。A鎖の9位および10位とB鎖の10位および20位での残基を強調して表す。γおよびは翻訳後改変(それぞれガンマ-カルボキシグルタメートおよびC末端アミド化)を表す。
配列表への手掛かり
配列番号1~41:本開示の実施形態に係るインスリンアナログ、ペプチドおよび/または化合物。
全体的な技術および定義
別途具体的に定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、当業(例えば、分子遺伝学、薬理学、タンパク質結晶学、タンパク質化学、生化学および同類のもの)者により一般に理解されるのと同じ意味を有すると解釈されるべきである。
別途指示されない限り、本発明で利用される技術は当業者に公知の標準的な手順である。そのような技術は、下記等の出典における文献全体を通して記載されて説明されている:J.Perbal,A Practical Guide to Molecular Cloning,John Wiley and Sons(1984)、J.Sambrook et al.Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbour Laboratory Press(1989)、T.A.Brown(編集者),Essential Molecular Biology:A Practical Approach,Volumes 1 and 2,IRL Press(1991)、D.M.Glover and B.D.Hames(編集者),DNA Cloning:A Practical Approach,Volumes 1-4,IRL Press(1995および1996)、ならびにF.M.Ausubel et al.(編集者),Current Protocols in Molecular Biology,Greene Pub.Associates and Wiley-Interscience(1988、現在までに全ての改訂を含む)、Ed Harlow and David Lane(編集者)Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbour Laboratory,(1988)、ならびにJ.E.Coligan et al.(編集者)Current Protocols in Immunology,John Wiley&Sons(現在までの全ての改訂を含む)。
本明細書全体を通して、単語「含む(comprise)」または変形(例えば「含む(comprises)」もしくは「含む(comprising)」は、述べられた要素、整数もしくは工程または要素、整数もしくは工程の群の包含を暗示するが、あらゆる他の要素、整数もしくは工程または要素、整数もしくは工程の群の排除は暗示しないと理解される。
用語「および/または」(例えば「Xおよび/またはY」)は「XおよびY」または「XまたはY」のいずれかを意味すると理解されるものとし、且つ両方の意味またはいずれかの意味を明示的に支持すると解釈されるものとする。加えて、冠詞「a」および「an」は、本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、別途明示されない限り、または文脈から単数形を対象とすることが明らかでない限り、「1つまたは複数」を意味すると概して解釈され得る。
用語「インスリン」は、ヒトインスリン、ブタインスリン、モルモットインスリン、ニワトリインスリン、マウスインスリン、ウシインスリンまたは毒液インスリンを意味する。いくつかの実施形態では、インスリンはヒトインスリンを意味する。用語「毒液インスリン」はイモガイの毒液インスリンを意味する。好ましくは、毒液インスリンはCon-Ins G1を意味する。
用語「インスリンアナログ」は、本明細書で使用される場合、インスリンの活性を模倣し得るあらゆる薬剤を指す。いくつかの実施形態では、インスリンアナログは少なくともインスリンレセプターアゴニストである。いくつかの実施形態では、インスリンアナログはインスリンレセプターに結合する。好ましくは、インスリンアナログは、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質またはペプチド模倣物であり得る。いくつかの実施形態では、インスリンアナログはペプチドである。当業者が理解するように、別途文脈が示さない限り、用語「インスリンアナログ」、「ペプチド」および「インスリンペプチド」は互換的に使用される。インスリンアナログとして、本明細書で開示された方法により同定されたIRアゴニスト、分子、化合物および同類のものも挙げられる。
用語「ペプチド」は、本明細書で使用される場合、2~約50個のアミノ酸(例えば、4個、6個、8個、10個、12個、15個、20個、25個、30個、35個、40個または45個のアミノ酸の長さ)の範囲のアミノ酸のポリマーを指す。用語ペプチドは、非改変ペプチド、改変ペプチドおよび他の方法で化学的に誘導体化されたペプチド(例えばリン酸化、硫酸化、アミド化および同類のもの)の両方を包含する。いくつかの実施形態では、ペプチドは、Sadowsky et al.(2005)およびSadowsky et al.(2007)で説明されたもの等の非天然ペプチドオリゴマーであり得る。用語「ポリペプチド」または「タンパク質」は、本明細書で互換的に使用される場合、約50個のアミノ酸の全長と比べて概して大きい且つ安定した特徴的な二次構造および三次構造を典型的には有するアミノ酸のポリマーを指す。用語「ポリペプチド」または「タンパク質」はまた、非共有結合的なまたは共有結合的な会合のいずれかを介して生じる安定した三次四次構造と会合するそのようなポリマー(例えば2種以上)の組み合わせも含み得る。
いくつかの実施形態では、ペプチド、タンパク質またはポリペプチドは、処置する対象中に天然に存在するアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ペプチドまたはポリペプチドは、1種または複数種の非天然アミノ酸、改変アミノ酸または合成アミノ酸アナログを含む。そのようなアミノ酸として下記が挙げられるがこれらに限定されない:一般的なアミノ酸のD-異性体、2,4-ジアミノ酪酸、α-アミノイソ酪酸、4-アミノ酪酸、2-アミノ酪酸、6-アミノヘキサン酸、2-アミノイソ酪酸、3-アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリン、システイン酸、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、シクロペンチルアラニン、β-アラニン、フルオロ-アミノ酸、デザイナーアミノ酸、例えばβ-メチルアミノ酸、Cα-メチルアミノ酸、Nα-メチルアミノ酸および一般のアミノ酸アナログ。同様にこの範囲に含まれるのは、例えばビオチン化、ベンジル化、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、既知の保護(protecting)/保護(blocking)基による誘導体化、タンパク質分解性開裂、抗体分子または他の細胞リガンドへの連結等により合成の最中にまたは合成後に差次的に改変されるペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質である。これらの改変は、ペプチド、タンパク質またはポリペプチドの安定性および/または生物活性を増加させるのに役立ち得る。
用語アミノ酸「改変」は、アミノ酸の置換またはアミノ酸への/アミノ酸からの化学基の付加および/もしくは除去によるアミノ酸の誘導を指し、ヒトタンパク質中に一般に見出される20種のアミノ酸のいずれかおよび非定型のまたは天然には存在しないアミノ酸による置換を含む。非定型アミノ酸の商業的供給源として、Sigma-Aldrich(Milwaukee,Wis.)、ChemPep Inc.(Miami,Fla.)およびGenzyme Pharmaceuticals(Cambridge,Mass.)が挙げられる。非定型アミノ酸を商業的供給業者から購入し得る、新規に合成し得る、または天然に存在するアミノ酸から化学的に改変し得る、もしくは誘導体化し得る。
本明細書で使用される場合、アミノ酸「置換」は、あるアミノ酸残基の異なるアミノ酸残基への置き換えを指す。置換アミノ酸は、ヒトタンパク質中で一般に見出される20種のアミノ酸のいずれか、ならびに非定型のまたは天然には存在しないアミノ酸であり得る。
用語「A鎖ペプチド」および「B鎖ペプチド」は、「インスリンA鎖ペプチド」および「インスリンB鎖ペプチド」と互換性がある。
本明細書で使用される場合、「その誘導体」である化合物への言及は、祖先の化合物から適合されており、または改変されており、祖先の化合物と類似するが新規の構造を有し且つ類似する生物学的活性を有する化合物を指す。いくつかの実施形態では、この祖先の化合物は、本明細書で説明された小分子、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質またはインスリンアナログである。いくつかの実施形態では、この祖先の化合物は、任意の化学的改変を含むように改変され得るペプチド、ポリペプチド、タンパク質またはインスリンアナログであり、この化学的改変は、このタンパク質またはペプチドと関連する任意の分子(例えば炭水化物、脂質および/またはタンパク質もしくはペプチド)の単一または複数の置換、欠失および/または付加を含む。一実施形態では、タンパク質、ポリペプチドまたはペプチドの「誘導体」として、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、パラミトイル化、ミリストイル化、イソプレニル化、脂質化、アルキル化、誘導体化、保護(protective)/保護(blocking)基の導入、タンパク質分解開裂、または抗体もしくは別の細胞リガンドへの結合から得られる改変アナログが挙げられる。
本出願全体を通して、文字および数字による特定のアミノ酸位置(例えばA5位またはB5位)への全ての言及は、コヌス・ジオグラフス(Conus geographus)由来の毒液インスリンCon-G1 InsのそれぞれのA鎖中におけるもしくはB鎖中におけるA鎖(例えばA5位)もしくはB鎖(例えばB5位)のいずれかの位置でのまたはその任意のアナログ中の対応するアミノ酸位置でのアミノ酸を指す。例えば、さらなる詳述が全くない本明細書での「B17位」への言及は、Con-Ins G1が2個の追加のN末端のB鎖残基を有することから、ヒトインスリンのB鎖の対応するB15位を意味するだろう。
本明細書で使用される場合、語句「アミノ酸番号に対応する位置で」は、定義されたアミノ酸配列に関して周囲のアミノ酸と比較したアミノ酸の相対位置を指す。例として、いくつかの実施形態では、ヒトインスリンと比較した場合(図1を参照されたい)、本発明のインスリンアナログのB鎖は、例えばCon-Ins G1中に存在する1個または2個の追加のN末端アミノ酸を有し得る。一例では、タンパク質アラインメントを実施すると、当業者は、天然に存在するヒトインスリンのB鎖のロイシン(15番目のアミノ酸)がB鎖Con-Ins G1の17番目のアミノ酸に対応することを容易に理解するだろう(図1を参照されたい)。本発明の好ましい実施形態では、天然に存在するヒトインスリンのB鎖の15番目のアミノ酸は芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基である、および/または天然に存在するヒトインスリンのB鎖の20番目のアミノ酸は芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基である。
用語「単量体インスリン」は、ヒトインスリンと比べて高次の種(例えば二量体、四量体、六量体等)を形成しにくいインスリンおよびインスリンアナログを指す。好ましくは、インスリンまたはインスリンアナログは完全にまたは実質的に単量体であり、例えば少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%または100%単量体である。
当業者に理解されるように、用語「治療的」は、疾患もしくは状態を処置し得るまたは疾患もしくは状態と関連する1種もしくは複数種の症状を寛解させ得る処置、治療または薬物を指す。本明細書で使用される場合、治療薬は、タンパク質、ペプチド、核酸(例えばCpGオリゴヌクレオチド)、小分子、ワクチン、アレルギー性抽出物、抗体、遺伝子治療薬、他の生物製剤または小分子が挙げられるがこれらに限定されない治療用化合物を指し得る。
本明細書で使用される場合、用語「対象」は、インスリン関連障害にかかりやすいあらゆる生物を指す。当業者に理解されるように、用語「対象」および「患者」は互換的に使用され得る。例えば、この対象は、哺乳動物、鳥類、節足動物、脊索動物、両生類または爬虫類であり得る。例示的な対象として下記が挙げられるがこれらに限定されない:ヒト、霊長類、家畜(例えばヒツジ、ウシ、ニワトリ、ウマ、ロバ、ブタ)、コンパニオン動物(例えばイヌ、ネコ)、実験室試験用動物(例えばマウス、ウサギ、ラット、モルモット、ハムスター)、捕獲した野生動物(例えばキツネ、シカ)。一例では、対象は哺乳動物である。一例では、対象はヒトである。
用語「処置する」は、本明細書で使用される場合、特定の障害もしくは状態の予防、または特定の障害もしくは状態と関連する症状の軽減、および/または前記症状の予防もしくは排除を含む。例えば、本明細書で使用される場合、用語「糖尿病を処置する」は概して、血糖値を許容レベル内で維持することを指し、所与の状況に応じて血糖値を増加させるまたは低減させることを含み得る。
当業者が理解するように、インスリンアナログは治療上有効な量で投与されるだろう。用語「有効な量」または「治療上有効な量」は、本明細書で使用される場合、処置される疾患または状態の症状のうちの1つまたは複数をある程度まで軽減するのに十分に投与されるインスリンアナログの量を指す。この結果は、疾患の徴候、症状または原因の低減および/もしくは軽減、または生物学的システムの任意の他の所望の変更であり得る。例えば、1つの症状は高血糖の予防または処置であるだろう。インスリンアナログの「有効な量」は、過度に有害な副作用なしに所望の薬理学的効果または治療上の改善を達成するのに十分な量である。ほんの一例として、治療上有効な量は、用量漸増臨床試験が挙げられるがこれに限定されない日常的な実験により決定され得る。用語「治療上有効な量」として、例えば予防上有効な量が挙げられる。「有効な量」または「治療上有効な量」は、対象の年齢、体重、全身状態のいずれかによる化合物の代謝の変動、処置される状態、処置される状態の重症度、および処方医師の判断に起因して、対象毎に変動し得ることが理解される。そのため、正確な「有効な量」を特定することは必ずしも可能であるとは限らない。しかしながら、任意の個々の場合における適切な「有効な」量は、日常的な実験を使用して当業者により決定され得る。複数種の治療薬を組み合わせて使用する場合、各治療薬の「治療上有効な量」は、単独で使用した場合に治療上有効であるだろう治療薬の量を指し得る、または1種もしくは複数種の追加の治療薬との組み合わせにより治療上有効である低減量を指し得る。
活性の用語「発現」は、本明細書で使用される場合、インスリンが血流に到達して血糖値を下げ始める前の時間の長さを指し、「ピーク」はインスリンアナログが血糖値を最も低下させる期間を指し、「持続時間」は、インスリンが作用し続ける(即ち血糖値を下げ続ける)期間がどれくらいかを指す。当業者は、インスリンアナログの発現、ピークおよび持続期間が因子(例えば患者、患者の状態、および投与経路)に応じて変動し得ることを気付いているだろう。
用語「IR」は、本明細書で使用される場合、野生型IRおよびそのバリアント(例えば対立遺伝子バリアント)、ならびに天然に存在する変異および遺伝子操作されたバリアントを含む。IRが本明細書で具体的に開示されていない他の種に由来し得ることは当業者に容易に明らかであるだろう。さらに、原始的生物から哺乳動物およびヒトまでのIR配列の既知の保存を前提として、当業者は、そのような他の適切なIRの同定に困難を伴わないであろう。
毒液インスリン結晶
一態様では、本発明は、毒液インスリンを含む結晶を提供する。本明細書で使用する場合、用語「結晶」は、平面が一定の角度で交差し且つ構成する化学種の規則的な構造(例えば内部構造)が存在する構造(例えば三次元(3D)固体凝集体)を意味する。用語「結晶」は、実験的に調製された結晶等の固体の物理的結晶形態を特に指す。
本発明に係る結晶を、コヌス・ジオグラフス(Conus geographus)およびコヌス・トゥリパ(Conus tulipa)等のコヌス(Conus)属の生物由来の毒液インスリンを使用して調製し得る。いくつかの実施形態は、コヌス・ジオグラフス(Conus geographus)の毒液由来のインスリンに関する。しかしながら、この毒液インスリンは他の種にも由来し得る。典型的には、このインスリンは、20個のアミノ酸のA鎖と23個のアミノ酸のBとを含むが、これらA鎖およびB鎖の長さは変動し得る。A鎖およびB鎖のアミノ酸は翻訳後改変されてもよく、翻訳後改変の例として下記が挙げられるがこれらに限定されない:グルタミン酸がγ-カルボキシル化グルタミン酸(コンジュゲート塩基ガンマカルボキシグルタメートとも称される)に置き換えられ得ること、プロリンがヒドロキシプロリンに置き換えられ得ること、C末端がアミド化され得ること、システインがセレノシステインに置き換えられ得ること。当業者は他の翻訳後改変が可能であることを認識するだろう。
好ましい実施形態では、この毒液インスリンはCon-Ins G1であり且つ下記に示す配列を有し:
A鎖:GVVyHCCHRPCSNAEFKKYC(配列番号22)
B鎖:TFDTOKHRCGSyITNSYMDLCYR(配列番号23)
これらの配列中、yはγ-カルボキシル化グルタミン酸であり、Oはヒドロキシプロリンであり、A鎖のC末端はアミド化されている。しかしながら、このインスリンポリペプチドはまた、他の種から得られてもよいし非天然の設計された配列であってもよい。
結晶を野生型配列またはそのバリアント(例えば、天然に存在する変異および遺伝子操作されたバリアント)で構築し得る。典型的には、バリアントは、対応する野生型毒液インスリンと少なくとも90、95または98%の配列同一性を有する。
毒液インスリンを含む結晶の作製を下記に説明する。
好ましい実施形態では、本発明は、あらゆる格子寸法において変動が最大約2%であるa=b=c=74.91Åの単位格子寸法を有する空間群P432を有するCon-Ins G1の結晶を提供する。
好ましい実施形態では、毒液インスリンを含む結晶は付録Iに記載した原子座標を有する。本明細書で使用する場合、用語「原子座標」は、軸系を参照して1個または複数個の原子の位置を定義する一連の値を指す。原子座標を、これから導き出されるモデルの正確さに大きく影響を及ぼすことなく変化させ得ることを当業者は理解し、そのため、本発明は好ましい原子構造の非常に正確な定義を提供するが、小さい変化が想定され、特許請求の範囲はそのような変化を包含することを意図されていることが理解されるだろう。水素以外の全ての主鎖原子に関するx座標、y座標およびz座標の平均二乗偏差(RMSD)が付録Iに記載の座標と比較して2.0Å未満(好ましくは1.5Å、1.3Å、1Å、0.7Å未満または0.3Å未満)であるバリアントが好ましい。原子座標の3D剛体回転および/または並進は関連する分子の構造を変更しないことが当業者に容易に認識されるだろう。
毒液インスリンの結晶構造
さらなる態様では、毒液インスリンまたはその領域の結晶構造も提供される。いくつかの実施形態では、この毒液インスリンはCon-Ins G1である。いくつかの実施形態では、毒液インスリンの結晶構造は、付録Iの原子座標で定義されるCon-Ins G1の構造である。
毒液インスリンに関して実験的に得られた原子座標を付録Iに示す。しかしながら、当業者は、X線結晶学により決定された一連の原子座標に標準誤差がないわけではないことを認識するだろう。従って、付録Iで列挙された原子座標上で(主鎖原子を使用して)重ねた場合に0.75Å未満のタンパク質主鎖原子の平均二乗偏差を有する毒液インスリンに関する任意の組の構造座標は同一と見なすものとする。
本発明はまた、付録Iで列挙された原子座標に実質的に一致する毒液インスリンの原子座標も含む。所与の組の原子座標に「実質的に一致する」構造は、そのような構造の少なくとも約50%が各ドメイン中の二次構造要素の主鎖原子に関して約2.0Å未満のRMSDを有する構造であり、好ましくは各ドメイン中の二次構造要素の主鎖原子に関して約1.5Å未満のRMSDを有する構造であり、より好ましくは各ドメイン中の二次構造要素の主鎖原子に関して約1.3Å未満(好ましさがより高くなると約1.0Å未満、約0.7Å未満、約0.5Å未満)のRMSDを有する構造であり、最も好ましくは各ドメイン中の二次構造要素の主鎖原子に関して約0.3Å未満のRMSDを有する構造である。
より好ましい実施形態では、所与の組の原子座標に実質的に一致する構造は、そのような構造の少なくとも約75%が列挙のRMSD値を有する構造であり、より好ましくはそのような構造の少なくとも約90%が列挙のRMSD値を有する構造であり、最も好ましくはそのような構造の約100%が列挙のRMSD値を有する構造である。
さらにより好ましい実施形態では、「実質的に一致する」の上記の定義を、アミノ酸側鎖の原子を含むように拡張し得る。本明細書で使用される場合、語句「共通のアミノ酸側鎖」は、所与の組の原子座標に実質的に一致する構造とそのような原子座標により実際に表される構造との両方に共通するアミノ酸側鎖を指す。
ポリペプチドに関する一組の原子座標は三次元での形状を定義する点の相対的な組であることが認識されるだろう。そのため、全く異なる組の座標が類似のまたは同一の形状を定義する可能性があり得る。さらに、個々の座標のわずかな変動は全体形状にほとんど影響を及ぼさないだろう。
座標の変動は構造座標の数学的操作に起因して生じる場合がある。例えば、付録Iに記載された構造座標を、この構造座標の結晶学的並べ替え、この構造座標の細分化、この構造座標の組への整数の加算もしくは減算、この構造座標の反転またはこれらの任意の組み合わせにより操作する可能性がある。
あるいは、アミノ酸の変異、付加、置換および/もしくは欠失、または結晶を構成する構成要素のうちのいずれかの他の変化に起因する結晶構造の改変が構造座標の変動を説明する可能性もある。
様々なコンピュータ解析を使用して、分子複合体またはその一部が上記で説明した毒液インスリンの構造の全てまたは一部と十分に類似するかどうかを決定する。そのような解析を、当業者に既知のソフトウェア(例えばPDBeFOLD(Krissinel and Henrick,2004)、DALI(Holm and Rosenstroem,2010)、LSQMAN(Kleywegt and Jones,1994)およびCHIMERA(Pettersen et al.2004)を使用して実行し得る。
比較は概して、指定の対の等価原子全体にわたるフィットの平均二乗偏差が絶対最小値であるように必要とされる最適な並進および回転の算出を含む。この数はオングストロームで付与される。従って、本発明の範囲内の毒液インスリンの構造座標は、全身の並進および/または回転により付録Iに列挙された原子座標に関連する構造座標を含む。従って、上記で列挙されたRMSD値は、少なくとも構造の主鎖原子が最適に重ねられていると仮定し、RMSD値を算出するのに必要とされる最適なフィットを達成するために並進および/または回転を必要とする場合がある。
いくつかの実施形態では、付録Iで列挙された前記原子座標のサブセットおよびこのサブセットに実質的に一致するサブセットも提供される。好ましいサブセットは、毒液インスリンの1つまたは複数の領域(例えば、(i)A鎖、(ii)B鎖、(iii)疎水性コア(例えばCon-Ins G1では、この疎水性コアは残基ValA2、CysA6、CysA11、PheA16、TyrA19、ArgB6、IleB11、TyrB15およびLeuB18の側鎖を含む)、(iv)PTMおよびこのPTMと相互作用する残基、(v)レセプター結合表面(例えばCon-Ins G1のIR結合表面);(vi)TyrB15およびTyrB15と相互作用する残基;(vii)TyrB20およびTyrB20と相互作用する残基;(viii)PheA16およびPheA16と相互作用する残基、(ix)それぞれのA鎖末端のすぐ近くの残基のサブセット)を画定する。
例えば下記のデータに由来する情報を使用して、Insight II Homologyソフトウェアパッケージ(Insight II(97.0),MSI,San Diego)により実行されるように、特定の組の原子座標に実質的に一致する毒液インスリンまたはその領域の三次元構造を適切なモデリングコンピュータプログラム(例えばMODELER(Sali and Blundell,1993))によりモデル化し得る:(1)この毒液インスリンのアミノ酸配列;(2)三次元立体配置を有する特定の組の原子座標により表されるタンパク質の関連部分のアミノ酸配列、および(3)特定の三次元立体配置の原子座標。特定の組の原子座標に実質的に一致する毒液インスリンの三次元構造を分子の置き換え等の方法によっても算出し得、この方法を下記で詳細に説明する。
構造座標/原子座標を概して、後続のコンピュータ操作のために機械可読媒体にロードする。そのため、モデルおよび/または原子座標は機械可読媒体(例えば、磁気媒体または光学媒体、およびランダムアクセスメモリまたはリードオンリーメモリ、例えばテープ、ディスケット、ハードディスク、CD-ROMおよびDVD、フラッシュメモリーカードまたはチップ、サーバーおよびインターネット)に有利に保存される。この機械は概してコンピュータである。本発明はまた、Con-Ins G1のモデルおよび/または原子座標を表すデータが記録されているコンピュータ可読媒体も提供する。同様に提供されるのは、付録Iに係る座標データまたはいずれかのそのサブセットが記録されているコンピュータ可読媒体であって、前記座標データはCon-Ins G1またはCon-Ins G1の領域の三次元構造を定義する、コンピュータ記録媒体である。
本発明はまた、付録Iで示される一連の原子座標またはいずれかのそのサブセットであって、前記座標は毒液インスリンの三次元構造を定義する、一連の原子座標またはいずれかのそのサブセットも提供する。構造座標/原子座標をコンピュータで使用して、コンピュータにより示され得るおよび/または電子ファイル中に表され得るイモガイインスリン結晶の三次元構造の画像(例えばイメージ)を作成し得る。
構造座標/原子座標およびそれらに由来するモデルを様々な目的(例えば、創薬、生物学的試薬(結合タンパク質)の選択および他のタンパク質結晶のX線結晶学的解析)にも使用し得る。一態様では、構造モデルとしてのCon-Ins G1の構造の使用が提供される。いくつかの実施形態では、この構造モデルはインスリンアナログの同定に使用され得る。本発明はまた、構造モデルとしてCon-Ins G1の構造を使用して同定したインスリンアナログも包含する。
Con-Ins G1またはその領域の三次元構造を使用して、薬物設計にならびにIRと相互作用するおよび/またはIRを調節する候補化合物のインシリコでのスクリーニングに有用なモデルを開発し得る。このモデルの開発では他の物理化学的特徴(例えば結合、静電気等)も使用し得る。
一般に、用語「インシリコ」はコンピュータメモリ中での作成を指し、即ち、シリコン上でのまたは他の同様のチップ上での作成を指す。別途述べない限り、「インシリコ」は「仮想的」を意味する。本明細書で使用される場合、用語「インシリコ」は、インビトロまたはインビボでの実験よりはむしろコンピュータモデルの使用に基づくスクリーニング方法を指すことを意図されている。
分子の置き換え
本明細書で提供されるCon-Ins G1の結晶構造を使用して、分子の置き換えを使用して新規の結晶の構造もモデル化/解明し得る。
いくつかの態様では、本発明はまた、構造モデルとしての毒液インスリンの構造またはそのサブセットの使用も提供する。
いくつかの実施形態では、付録Iに記載されたもの等の毒液インスリンの原子座標または毒液インスリンの領域の原子座標を使用して、毒液インスリンに類似する少なくともいくつかの構造的特徴を含む分子複合体の三次元構造の少なくとも一部を決定し得る。具体的には、別の結晶化毒液インスリンまたはインスリンアナログについての構造情報を得ることができる。このことを、分子の置き換え等の多くの公知の技術のいずれかにより達成し得る。
分子の置き換えの方法(例えばPHASER(McCoy et al.2007))は概して当業者に既知である。分子の置き換えの方法は概して、Brunger,1997;Navaza and Saludjian,1997;Tong and Rossmann,1997;Bentley,1997;Lattman,1985;Rossmann,1972で説明されている。
一般に、X線回折データは、結晶化した標的構造の結晶から収集される。このX線回折データを変換してPatterson関数を算出する。この結晶化した標的構造のPatterson関数を、既知の構造(本明細書では検索構造と称される)から算出されたPatterson関数と比較する。この結晶化した標的構造のPatterson関数を検索構造のPatterson関数に対して回転させて、結晶中の結晶化した標的構造の正しい配向を決定する。次に、並進関数を算出して、結晶軸に対する標的構造の位置を決定する。この結晶化した標的構造が単位格子内に正しく配置されると、実験データの初期位相を算出し得る。この位相は、構造の差違を観測し得る電子密度マップの算出および構造の精密化に必要である。好ましくは、検索分子の構造的特徴(例えばアミノ酸配列、保存されたジスルフィド結合、およびベータ-ストランドまたはベータ-シート)は、この結晶化した標的構造に関連している。
次に、この電子密度マップを、未知の結晶化した分子複合体の最終的で正確な構造を生成するために、任意の公知のモデル構築および構造精密化技術に供し得る(例えばJones et al.1991;Brunger et al.1998を参照されたい)。
分子の置き換え以外の方法により位相の正確な値を得ることは、近似および精密化の反復サイクルを含む時間のかかるプロセスであり、結晶構造の解明を大きく妨げる。しかしながら、少なくとも相同部分を含むタンパク質の結晶構造が解明されると、既知の構造からの位相は、未知の構造に関する位相の満足のいく推定を可能にする。分子の置き換えを使用することにより、本明細書で提供された(および付録Iで記載された)毒液インスリンの構造座標の全てまたは一部を使用して、最初からそのような情報を決定しようとする試みと比べて迅速且つ効率的に、構造が未知である結晶化した分子/分子複合体の構造を決定し得る。
この方法により、毒液インスリンの任意の部分と十分に相同である任意の結晶化した分子/分子複合体の任意の部分の構造を解明し得る。この方法は、本明細書で説明された方法を使用して設計されたインスリンアナログの構造の決定で特に有用である。
本明細書で言及された分子/分子複合体の全ては公知のX線回折技術を使用して研究され得、1.5~3.5Åの分解能のX線データに対してコンピュータソフトウェア(例えば、X-PLOR(Yale University,Molecular Simulations,Inc.により配布されている;Bruenger,1996を参照されたい)、REFMAC(Murshudov et al.1997)、PHENIX(Adams et al.2010)およびBUSTER(Global Phasing Ltdにより配布されている、Bricogne et al.2011))を使用して約0.25以下のR値に精密化され得る。そのため、この情報を使用して既知のインスリンアナログを最適化し得、より重要なことに、新規のまたは改善されたインスリンアナログを設計し得る。
毒液インスリンを結晶化する方法
本発明はまた、毒液インスリンを含む結晶を作製する方法も提供する。本明細書で開示された毒液インスリンの結晶形を下記の結晶化方法により得ることができる。
一態様では、本発明は、毒液インスリンを結晶化する方法であって、
(a)毒液インスリンの水溶液を準備する工程、
(b)任意選択で、工程(a)の溶液を濃縮する工程、および
(c)この毒液インスリンの最終濃度が0.5mg/mL~10mg/mLの範囲であるように工程(a)または工程(b)の溶液を沈殿剤溶液で希釈する工程
を含む方法を提供する。
工程(a)で準備される毒液インスリンの水溶液は緩衝化されていてもよいし緩衝化されていなくてもよい。当業者に既知の任意の適切な緩衝液を使用し得る。毒液インスリン溶液用の非限定的な例として、Tris-HCl、リン酸ナトリウムおよびトリエタノールアミノ緩衝液が挙げられる。所望のpH値が得られない場合、塩基または酸(例えば、塩化アンモニウム、酢酸ナトリウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウムまたは塩酸)の添加によるpHの調整を実施し得る。好ましくは、工程(a)の溶液は10mM HClを含む。
任意選択で、次いでこの溶液を任意選択的に濃縮し得る。いくつかの実施形態では、この溶液を遠心ろ過により濃縮する。しかしながら、当業者に既知の任意の適切な技術を使用し得る。濃縮工程(b)の後、毒液インスリンの濃度は1.0mg/mL~20mg/mLの範囲であるべきである。好ましくは、この毒液インスリンの濃度は約4.0mg/mLである。これは、工程(c)の緩衝化沈殿剤溶液による希釈前の工程(b)の最後での毒液インスリンの濃度である。工程(b)の濃縮溶液中のまたは工程(b)の濃縮の最中のまたは工程(b)の濃縮後の毒液インスリンの濃度を、例えばBradfordタンパク質アッセイによりまたはUV吸光度分光法等の他の常法により決定する可能性がある。
工程(c)では、工程(b)の溶液に沈殿剤溶液を添加する。好ましくは、工程(b)の溶液を1:4~4:1(工程(b)の溶液:緩衝化沈殿剤溶液)の比で沈殿剤溶液により希釈し、より好ましくは1:1の比で沈殿剤溶液により希釈する。
この沈殿剤溶液は、少なくとも1種の小さい有機両親媒性分子および/または少なくとも1種の無機塩を含み得る。いくつかの実施形態では、この小さい有機両親媒性分子は、下記を含むまたは下記からなる群から選択され得る:グリセロール、エチレングリコール、ブチルエーテル、ベンズアミジン、ジオキサン、エタノール、イソプロパノール、ブタノール、ペンタノール、メチルペンタンジオール、ペンタンジオール、ヘキサンジオール、ヘプタントリオール、ジチオスレイトール、MES、Tris、Tris-HCI、Bis-Tris、イミダゾール、ビシン、トリメチルアミンN-オキシド、コハク酸、DL-マレート、CHES、CAPS、グリシン、CAPSO、ADA、MOPS、Bis-Trisプロパン、SPG、MIB、PCB、MMT、N-[2-ヒドロキシエチル]ピペラジン-N’-[2-エタンスルホン酸](HEPES)、TRIS、スクロースおよびこれらの組み合わせ。好ましい実施形態では、この小さい有機両親媒性分子はDL-マレート、TRISおよびMESを含む。いくつかの実施形態では、この小さい有機両親媒性分子は緩衝液として作用し得る。いくつかの実施形態では、溶液中のこの小さい有機両親媒性分子のpHを約2.0~約11.0に調整し得、例えば2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5、10.0、10.5および11.0の間の任意のpHに調整し得る。いくつかの実施形態では、このpHは約8.0~約10.0である。好ましい実施形態では、このpHは9.0である。
いくつかの実施形態では、この沈殿剤溶液中の全ての小さい有機両親媒性分子の量は、この緩衝化沈殿剤溶液の総重量に対して1重量/体積%~50重量/体積%の小さい有機両親媒性分子であり、好ましくは5重量/体積%~20重量/体積%の小さい有機両親媒性分子であり、より好ましくは8重量/体積%~12重量/体積%の小さい有機両親媒性分子である。好ましい実施形態では、この緩衝化沈殿剤溶液は10重量/体積%の小さい有機両親媒性分子を含む。
用語「少なくとも1種の小さい有機両親媒性分子」は、前述の小さい有機両親媒性分子の混合物を使用し得ることを意味する。小さい有機両親媒性分子の混合物を使用する場合、使用される量は、合わせた全ての小さい有機両親媒性分子の総量を指す。
この沈殿剤溶液は無機塩も含み得る。いくつかの実施形態では、この無機塩は、下記を含むまたは下記からなる群から選択される:塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、酢酸アンモニウム、フッ化アンモニウム、臭化アンモニウム、ヨウ化アンモニウム、窒化アンモニウム、塩化カドミウム、硫酸カドミウム、塩化カルシウム、酢酸カルシウム、塩化セシウム、硫酸セシウム、塩化コバルト、塩化鉄、酢酸リチウム、塩化リチウム、硝酸リチウム、硫酸リチウム、酢酸マグネシウム、ギ酸マグネシウム、硝酸マグネシウム、塩化ニッケル、酢酸カリウム、臭化カリウム、フッ化カリウム、ギ酸カリウム、ヨウ化カリウム、硝酸カリウム、チオシアン酸カリウム、酒石酸カリウム/ナトリウム、酢酸ナトリウム、臭化ナトリウム、フッ化ナトリウム、ヨウ化ナトリウム、硝酸ナトリウム、リン酸ナトリウム、硫酸ナトリウム、チオシアン酸ナトリウム、塩化亜鉛、硫酸亜鉛、酢酸亜鉛、塩化マグネシウム、塩化ナトリウム、カコジル酸ナトリウム、水酸化ナトリウム、塩化カリウム、水酸化カリウム、硫酸カリウム、酢酸ナトリウム、酒石酸ナトリウム、ギ酸アンモニウム、酒石酸二アンモニウム、マロン酸ナトリウム、酒石酸二ナトリウム、コハク酸ナトリウムおよびコハク酸ナトリウムならびにこれらの組み合わせ。好ましい実施形態では、この無機塩は硫酸アンモニウムである。
いくつかの実施形態では、この沈殿剤溶液中の少なくとも1種の無機塩の量は約50mM~約4000mMであり、約1000mM~約3000mMであり、約1500mM~約2500mMまたは約2000mMである。複数種の無機塩が使用される場合、前述の濃度は、合わせた全ての無機塩の濃度を指し、無機塩の混合物で使用される各単一の塩の濃度を指すものではない。
いくつかの実施形態では、この沈殿剤溶液を緩衝化し得る。人に知られているあらゆる緩衝液を使用し得る。いくつかの実施形態では、この緩衝液は、クエン酸、酢酸ナトリウム、クエン酸ナトリウム、カコジル酸ナトリウム、HEPESナトリウム、TRIS HCl、CAPSO、CAPS、リンゴ酸ナトリウム、MESナトリウムおよび同類のものならびにこれらの組み合わせを含む、またはからなる。いくつかの実施形態では、この沈殿剤溶液はpHが約2.0~約11.0であり得、例えば2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5、10.0、10.5および11.0の間の任意のpHであり得る。いくつかの実施形態では、この沈殿剤溶液はpHが約8.0~約10.0であり得る。好ましい実施形態では、この沈殿剤溶液はpHが9.0であり得る。
いくつかの実施形態では、この緩衝化沈殿剤溶液は、1M超の少なくとも1種の無機塩および/または5重量%~20重量%の少なくとも1種の小さい有機両親媒性分子を含む。好ましい実施形態では、この沈殿剤溶液は2.0M硫酸アンモニウムおよび10% DL-リンゴ酸塩-MES-Tris(pH9.0)を含む。
理論上、工程(c)の希釈溶液中の少なくとも1種の沈殿剤は水に関してタンパク質分子と競合し、そのため、このタンパク質が過飽和となる。結晶は通常、過飽和状態からのみ成長するため、沈殿物から結晶が成長し得る。塩、ポリマーおよび有機溶媒は適切な沈殿剤である。上記で列挙した緩衝化沈殿剤溶液の成分に加えて、工程(c)の溶液はさらなる沈殿剤を含み得る。
いくつかの実施形態では、結晶化に懸滴法(hanging drop method)または座滴法(sitting drop method)を使用する。「懸滴蒸気拡散」技術は高分子の結晶化にとって最も一般的な方法である。この方法より、試料および試薬の混合物で構成された液滴を試薬の液体リザーバーにより蒸気平衡に置く。典型的には、この液滴はこのリザーバーと比べて低い試薬濃度を含む。平衡を達成するために、この液滴から水蒸気が離れ、最終的にはリザーバーに入る。この液滴から水が離れるにつれて、試料は相対的な過飽和の増加を受ける。水が液滴からリザーバーへと離れるにつれて、試料および試薬の両方は濃度が増加する。液滴中の試薬濃度がリザーバー中の試薬濃度とほぼ同一である場合に平衡に達する。
インスリンアナログ
野生型インスリンはA鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを含む。野生型ヒトインスリンA鎖は配列GIVEQCCTSICSLYQLENYCN(配列番号24)で表される。野生型ヒトインスリンB鎖は配列FVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKT(配列番号25)で表される。
本発明者らは、ヒトインスリンの芳香族トリプレットPheB24-PheB25-TyrB26に相当するものを欠く単量体インスリンであるCon-G1 Insの三次元構造を決定している。理論に拘束されることを望まないが、TyrB15の側鎖はIR会合に関して重要なヒトインスリンPheB24の欠如を補償し得ると考えられる。Con-Ins G1 TyrB20の側鎖がヒトインスリンPheB24に相当するものの欠如の補償に関与し得るとも考えられる。これらの残基の潜在的重要性を、配列分析に基づいて予測し得なかった。本明細書に記載されている構造上の発見は、本質的に単量体であり且つ即時作用性である新規クラスの治療用ヒトインスリンアナログの設計のためのプラットフォームを提供する。
一態様では、本発明は、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを含むインスリンアナログであって、このB鎖は、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置で芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基を含み、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置で芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基を含み、このアナログは、ヒトインスリン中に見出される少なくとも1個のアミノ酸を含むがコヌス・ジオグラフス(Conus geographus)インスリンの対応する位置では欠いており、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは少なくとも1対のシステイン残基を介して互いに結合している、インスリンアナログを提供する。いくつかの実施形態では、この芳香族残基または大きい脂肪族残基は天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり得る。
インスリン-IR複合体の共結晶構造から、PheB24の側鎖が、IRおよびインスリンB鎖により定義される無極性ポケット(B24関連結合ポケットと称される)内の「アンカー」として独自の役割を果たすことが明らかになった(Menting et al.2014)。理論に拘束されることを望まないが、本発明は、ヒトインスリンのB鎖の15位および/または20位での大きい脂肪族置換または芳香族置換が、B24関連結合ポケット中での挿入によりPheB24の欠如を補償し得ることを想定する。大きい脂肪族残基または芳香族残基の側鎖はB24関連結合ポケットと物理的におよび化学的に適合し得ると考えられる。
いくつかの実施形態では、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置での芳香族残基または大きい脂肪族残基は、チロシン、フェニルアラニン、4-メチルフェニルアラニン、ヒスチジン、トリプトファン、メチオニン、シクロペンチルアラニンおよびシクロヘキシルアラニンからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置での芳香族残基または大きい脂肪族残基は、チロシン、フェニルアラニン、4-メチルフェニルアラニン、ヒスチジン、トリプトファン、メチオニン、シクロペンチルアラニンおよびシクロヘキシルアラニンからなる群から選択される。この芳香族残基または大きい脂肪族は天然アミノ酸であってもよいし非天然アミノ酸であってもよい。
いくつかの実施形態では、このB鎖は、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置で芳香族残基を含む、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置で芳香族残基を含む。この芳香族残基は天然アミノ酸であってもよいし非天然アミノ酸であってもよい。例えば、この芳香族アミノ酸は、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン、4-アセチルフェニルアラニンおよび同類のものであり得る。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置でチロシンを有する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置でチロシンを有する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置でチロシンを有する、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置でチロシンを有する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置でフェニルアラニンを有する、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置でフェニルアラニンを有する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置でトリプトファンを有する、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置でトリプトファンを有する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置で4-アセチルフェニルアラニンを有する、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置で4-アセチルフェニルアラニンを有する。
いくつかの実施形態では、このB鎖は、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置で大きい脂肪族残基を含む、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置で大きい脂肪族残基を含む。本明細書で使用される場合「大きい脂肪族」残基は、ロイシン(15位および20位にてヒトインスリン中で天然に存在する)側鎖と比べて大きい側鎖を有する。例えば、いくつかの実施形態では、大きい脂肪族残基の側鎖は、ロイシンと比較して同数のまたはより多くの非水素原子を有し得る。いくつかの実施形態では、大きい脂肪族残基の側鎖はロイシンと比較した場合に大きい側鎖体積を有する。いくつかの実施形態では、大きい脂肪族残基の側鎖はロイシンと比較した場合に分子量が大きい。いくつかの実施形態では、大きい脂肪族残基の側鎖はロイシンと比較した場合に立体配座の柔軟性が高い。「大きい脂肪族」残基は天然アミノ酸であってもよいし非天然アミノ酸であってもよい。例えば、大きい脂肪族残基は、メチオニン、イソロイシン、シクロペンチルアラニンまたはシクロヘキシルアラニンおよび同類のものであり得る。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置でメチオニンを有する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置でメチオニンを有する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置でシクロヘキシルアラニンを有する、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置でシクロヘキシルアラニンを有する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置でシクロペンチルアラニンを有する、および/またはヒトインスリンのB鎖の20位に対応する位置でシクロペンチルアラニンを有する。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、IR結合に必須であると考えられる芳香族トリプレットPheB24-PheB25-TyrB26を欠く改変B鎖を有し、且つほとんどの場合ではヒトインスリンと比較して短いB鎖を有する。いくつかの実施形態では、このB鎖は、ヒトインスリンと比較した場合にC末端でトランケートされている。いくつかの実施形態では、このB鎖は、ヒトインスリンの9個のC末端アミノ酸のうちの1個または複数個を欠いており、例えば、このB鎖は、ヒトインスリンの1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個または9個のC末端アミノ酸を欠いている。いくつかの実施形態では、このB鎖は、ヒトインスリンのPheB24を少なくとも欠いている。いくつかの実施形態では、このB鎖はヒトB鎖芳香族トリプレット(ヒトインスリンのアミノ酸PheB24-PheB25-TyrB26)を少なくとも欠いている。これらの残基は存在しなくてもよいし、ヒトインスリンのB酸のアミノ酸番号24、25および/または26に対応する位置でのアミノ酸がそれぞれフェニルアラニン、フェニルアラニンまたはチロシンではないように置換されていてもよい。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-XA2-XA3-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-XA12-XA13-XA14-XA15-XA16-XA17-XA18-XA19-CysA20-XA21-XA22-XA23-XA24-XA25-XA26-XA27-XA28-XA29-XA30-XA31-XA32-XA33-XA34(この配列中、XA2=ValまたはIle;XA3=ValまたはAla;XA4=Glu、Asp、ガンマカルボキシグルタメートまたはCys;XA5=Gln、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、HisまたはVal;CysA6、CysA7およびCysA11は独立してCysまたはセレノシステインであり;XA8=Thr、His、Asp、Gln、Tyr、Lys、AlaまたはVal;XA9=Ser、Arg、Asn、Gly、HisまたはLys;XA10=Ile、Pro、Tyr、Ala、Ser、Val、Phe、HisまたはThr;XA12=SerまたはThr;XA13=Leu、Asn、Val、ArgまたはAsp;XA14=Tyr、Ala、Gln、His、AspまたはGlu;XA15=Gln、GluまたはThr;XA16=Phe、LeuまたはAla;XA17=Glu、Gln、Lys、Arg、Ile、Met、ThrまたはSer;XA18=Lys、Ser、Thr、Asn、GlnまたはGlu;XA19=TyrまたはPhe;CysA20=Cys、セレノシステイン、アミド化Cysまたはアミド化セレノシステイン;XA21=Asn、Pro、His、Ser、Gly、Alaまたは存在せず;XA22=Pro、Asn、Thr、Leu、Serまたは存在せず;XA23=Thr、Leu、Val、Serまたは存在せず;XA24=Arg、Thr、Met、Gln、Leuまたは存在せず;XA25=Glu、Glyまたは存在せず;XA26=Ser、Leuまたは存在せず;XA27~XA31は独立してSerであり、または存在せず;XA32=Ala、Serまたは存在せず;XA33=Ala、Valまたは存在せず;ならびにXA34=Alaまたは存在しない)(配列番号1)を含むA鎖ペプチドと、
配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39
(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Ala、Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Ala、Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Lys、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Thr、Tyr、ArgまたはGly;XB17=Thr、Tyr、Pro、LeuまたはGly;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、Arg、SerまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Val、Tyr、Phe、His、Gly、Gln、Leu、アミド化His、アミド化Valまたは存在せず;XB23=Glu、Asp、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Ile、Leu、Ser、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Ala、Asp、Ser、Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号2)
を含むB鎖ペプチドと
を含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号3)を含むB鎖ペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;ならびにXB24、XB25、XB26、XB27、XB28、XB29、XB30、XB31、XB32、XB33、XB34、XB35、XB36、XB37、XB38およびXB39は存在しない)(配列番号4)を含むB鎖ペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号5)を含むB鎖ペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39(この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=HisまたはTyr;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=ValまたはLeu;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号6)を含むB鎖ペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thr、Asnまたは存在せず;XB2=Phe、Serまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、AsnまたはGln;XB7=HisまたはTyr;XB8=Arg、IleまたはLeu;XB12=His、Asp、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB13=Val、IleまたはLeu;XB14=Thr、Ala、ProまたはVal;XB15=Glu、Val、AsnまたはAsp;XB16=Ser、Gln、TyrまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Asp、MetまたはVal;XB19=Leu、Asp、GlnまたはLys;XB20=LeuまたはVal;CysB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=TyrまたはGly;およびXB23=Glu、Arg、Glyまたは存在しない)(配列番号7)を含むB鎖ペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu、XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;XB22=Tyr;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号8)を含むB鎖ペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、XB17位およびXB22位での残基はチロシンである。いくつかの実施形態では、XB22はTyrである。いくつかの実施形態ではXB17はTyrである。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-XA2-XA3-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-XA12-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-XA19-CysA20-XA21-XA22-XA23-XA24-XA25-XA26-XA27-XA28-XA29-XA30-XA31-XA32-XA33-XA34(この配列中、XA2=ValまたはIle;XA3=ValまたはAla;XA4=Glu、ガンマカルボキシグルタメートまたはCys;XA5=Gln、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、HisまたはVal;CysA6、CysA7およびCysA11は独立してCysまたはセレノシステインであり;XA8=Thr、His、Asp、Gln、Tyr、LysまたはVal;XA9=Ser、Arg、Asn、HisまたはLys;XA10=Ile、Pro、Tyr、Ala、Ser、Phe、HisまたはThr;XA12=SerまたはThr;XA13=Leu、Asn、ValまたはAsp;XA14=Tyr、Ala、Gln、AspまたはGlu;XA15=Gln、GluまたはThr;またはAla;XA17=Glu、Lys、Arg、Ile、Met、ThrまたはSer;XA18=Lys、Thr、Asn、GlnまたはGlu;XA19=TyrまたはPhe;CysA20=Cys、セレノシステイン、アミド化Cysまたはアミド化セレノシステイン;XA21=Asn、Pro、His、Ser、Gly、Alaまたは存在せず;XA22=Pro、Asn、Thr、Leu、Serまたは存在せず;XA23=Thr、Leu、Val、Serまたは存在せず;XA24=Arg、Thr、Met、Gln、Leuまたは存在せず;XA25=Glu、Glyまたは存在せず;XA26=Ser、Leuまたは存在せず;XA27~XA31は独立してSerであり、または存在せず;XA32=Ala、Serまたは存在せず;XA33=Ala、Valまたは存在せず;ならびにXA34=Alaまたは存在しない)(配列番号9)を含むA鎖ペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-XA2-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-XA16-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA2はValまたはIleであり、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA16はPheまたはLeuであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号10)を含むA鎖ペプチドと、
配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;XB22=GlyまたはTyr;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号11)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-XA2-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA2はValまたはIleであり、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号12)を含むA鎖ペプチドと、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-Tyr-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号13)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Val-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号14)を含むA鎖ペプチドと、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-Arg-CysB9-Gly-Ser-XB12-Ile-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-Leu-CysB21-Tyr-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、およびXB23=GluまたはArg)(配列番号15)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-XA2-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA2はValまたはIleであり、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号26)を含むA鎖ペプチドと、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-Tyr-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;XB22=GlyまたはTyr;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号27)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Val-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号28)を含むA鎖ペプチドと、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-Arg-CysB9-Gly-Ser-XB12-Ile-XB14-XB15-XB16-Tyr-XB18-XB19-Leu-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB22=GlyまたはTyr;およびXB23=GluまたはArg(配列番号29)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn(配列番号16)を含むA鎖ペプチドと、配列Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Xaa-Tyr-Leu-Val-Cys-Gly-Glu(この配列中、Xaaは芳香族残基または大きい脂肪族残基である)(配列番号17)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn(配列番号18)を含むA鎖ペプチドと、配列Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tyr-Leu-Val-Cys-Xaa-Glu(この配列中、Xaaは芳香族残基または大きい脂肪族残基である)(配列番号19)を含むB鎖ペプチドとを含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、配列Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn(配列番号20)を含むA鎖ペプチドと、配列Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Xaa-Tyr-Leu-Val-Cys-Xaa-Glu(この配列中、Xaaは芳香族残基または大きい脂肪族残基である)(配列番号21)を含むB鎖ペプチドとを含む。
IRに対するこのアナログの親和性を増加させるヒトインスリンの多くの改変が既に同定されている。例えば、ヒトインスリンのThrA8をヒスチジンに置き換えることにより、IRに対する親和性が3倍増加する(Glendorf et al.(2011)。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、ヒトインスリンのThrA8に対応する位置でヒスチジン残基を有する。
このインスリンアナログは、1個または複数個の非天然アミノ酸、改変アミノ酸または合成アミノ酸アナログを含み得、これらのうちのいくつかを本明細書中に配列で示す。例えば、そのようなアミノ酸として下記が挙げられるがこれらに限定されない:
一般的なアミノ酸のD-異性体、2,4-ジアミノ酪酸、α-アミノイソ酪酸、4-アミノ酪酸、2-アミノ酪酸、6-アミノヘキサン酸、2-アミノイソ酪酸、3-アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ガンマカルボキシグルタメート、ヒドロキシプロリン、ホモシトルリン、システイン酸、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、シクロペンチルアラニン、セレノシステイン、アミド化システイン、アミド化セレノシステイン、β-アラニン、フルオロ-アミノ酸、デザイナーアミノ酸、例えばβ-メチルアミノ酸、Cα-メチルアミノ酸、Nα-メチルアミノ酸および一般のアミノ酸アナログ。同様にこの範囲に含まれるのは、例えばビオチン化、ベンジル化、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、既知の保護(protecting)/保護(blocking)基による誘導体化、タンパク質分解性開裂、抗体分子または他の細胞リガンドへの連結等により合成の最中にまたは合成後に差次的に改変されるペプチドである。
本明細書で開示されているように、PTMを含むCon-Ins G1の合成アナログは、PTMフリーのアナログと比べてヒトIR-Bに対する活性が4倍高かった(実施例を参照されたい)。いくつかの実施形態では、例えば様々なA鎖のXA4またはXA5 Glu位で、またはいくつかのB鎖のXB12 Glu位で、1個または複数個のGlu残基をガンマ-カルボキシグルタメート(Gla)に置き換え得る。いくつかの実施形態では、例えばある特定のB鎖のXB5 Pro位で1個または複数個のPro残基をヒドロキシプロリン(Hyp)に置き換え得る。いくつかの実施形態では、C末端をアミド化し得、例えば、数ある中でも様々なA鎖の末端でCys()をアミド化し得る。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは、下記のうちの1つまたは複数を含む:(i)XA4はガンマカルボキシグルタメートである、ii)XB5=ヒドロキシプロリン、およびiii)XB12=ガンマカルボキシグルタメート。本発明者らは、これらのPTMのうちの少なくともいくつかがIRへのCon-Ins G1の結合に寄与することを発見している。
このインスリンアナログは、少なくとも1対のシステイン残基を介して互いに結合しているA鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを有する。いくつかの実施形態では、B鎖ペプチドのCysB9はA鎖ペプチドのCysA6に結合しており、B鎖ペプチドのCysB21はA鎖ペプチドのCysA20に結合している、および/またはCysA7はCysA11に結合している。
いくつかの実施形態では、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは1つまたは複数の末端で互いに連結され得る。いくつかの実施形態では、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは、ある末端で互いに連結されている。例えば、A鎖ペプチドのN末端はB鎖ペプチドのN末端もしくはC末端に連結され得る、A鎖ペプチドのC末端はB鎖ペプチドのN末端もしくはC末端に連結され得る、A鎖ペプチドのC末端はA鎖ペプチドのN末端に連結され得る、またはB鎖ペプチドのC末端はB鎖ペプチドのN末端に連結され得る。いくつかの実施形態では、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは両方の末端で互いに連結されている。そのため、いくつかの実施形態ではこのインスリンアナログは非環式ではあるが、他の場合では、このインスリンアナログは、説明されたCys結合パターンを保持しつつ環式であり得る。そのような実施形態では、このインスリンアナログは環化主鎖を有し、その結果、A鎖およびB鎖は遊離N末端または遊離C末端を有しない(この実施形態の場合、それにより両方の末端が連結されている)。1つまたは複数の末端での連結は、A鎖ペプチド主鎖のアミノ酸とB鎖ペプチド主鎖のアミノ酸との間で直接的であり得る、またはそれらの間で結合した1個もしくは複数個のアミノ酸のリンカーまたは他のリンカー分子であり得る。
いくつかの実施形態では、安定性を改善することが当業者に知られている化学基、残基または残基の基をC末端および/またはN末端に付加し得る。いくつかの実施形態では、生物学的利用能を改善することが当業者に知られている化学基、残基または残基の基をC末端および/またはN末端に付加し得る。いくつかの実施形態では、N末端に付加され得るそのような残基または基で、このインスリンアナログ内のGlyも置き換え得る。いくつかの実施形態では、C末端またはN末端のいずれかに蛍光タグを付着させ得る。
本明細書で開示されたインスリンアナログペプチドを当業者に既知の任意の技術または方法で作製し得、そのような技術または方法のいずれも本範囲内であると見なされる。例えば、技術として、化学合成、固相ペプチド合成、組換え発現、ペプチド合成および組換え発現の組み合わせならびに同類のものが挙げられるがこれらに限定されない。例示的な技術を実施例セクションでさらに説明する。このインスリンアナログを、様々な形態(例えば天然型、融合型、グリコシル化型、脂質化型等)で調製し得る。
このインスリンアナログを好ましくは実質的に純粋な形態(即ち、宿主細胞タンパク質または他の混入物を実質的に含まない形態)で調製する。典型的には、このインスリンアナログは、存在する総タンパク質の少なくとも60重量%である場合に実質的に純粋である。例えば、このインスリンアナログは、存在する総タンパク質の少なくとも75重量%であり、少なくとも約80重量%であり、少なくとも約85重量%であり、少なくとも約90重量%であり、少なくとも約91重量%であり、少なくとも約92重量%であり、少なくとも約93重量%であり、少なくとも約94重量%であり、少なくとも約95重量%であり、少なくとも約96重量%であり、少なくとも約97重量%であり、少なくとも約98重量%であり、少なくとも約99重量%であり、より好ましくは少なくとも90重量%である。
本開示はまた、このインスリンアナログの塩または誘導体も提供する。用語「塩」は、本明細書で使用される場合、無機または有機の酸および/または塩基と形成される酸性および/または塩基性の塩を示し、好ましくは塩基性塩を示す。特にこのインスリンアナログを薬剤として用いる場合には、薬学的に許容される塩が概して好ましいが、他の塩は、例えばこの化合物の処理においてまたは非薬剤型の用途が企図される場合に有用性を見出す。この化合物の塩を当業者に既知の任意の技術により調製し得る。
用語「薬学的に許容される塩」は、本明細書で使用される場合、親化合物の生物学的活性を保持し且つ生物学的にまたは他の形で望ましくないものではない化合物の塩を指す。本明細書で開示された化合物の多くは、アミノ基および/もしくはカルボキシル基またはこれらに類似の基の存在により酸性および/または塩基性の塩を形成し得る。薬学的に許容される塩基付加塩を無機塩基および有機塩基から調製し得る。無機塩基から誘導される塩として、ほんの一例としてナトリウム塩、カリウム塩、リチウム塩、アンモニウム塩、カルシウム塩およびマグネシウム塩が挙げられる。有機塩基から誘導される塩として、第一級アミン、第二級アミンおよび第三級アミンの塩が挙げられるがこれらに限定されない。薬学的に許容される酸付加塩を無機酸および有機酸から調製し得る。無機酸から誘導される塩として、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸および同類のものが挙げられる。有機酸から誘導される塩として、酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、ピルビン酸、シュウ酸、リンゴ酸、マロン酸、コハク酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸、サリチル酸および同類のものが挙げられる。
用語「誘導体」は、本明細書で使用される場合、天然に存在するアルファ-アミノ酸中に見出される1個または複数個の側基が改変されているアルファアミノ酸を含む。そのため、例えば、天然に存在するアミノ酸を、様々なコードされていないまたは改変されたアミノ酸(例えば、対応するD-アミノ酸またはNメチルアミノ酸)に置き換え得る。他の改変は当業者に既知であり、化学的に類似の基によるヒドロキシル官能基、チオール官能基、アミノ官能基およびカルボキシル官能基の置換(例えば、システイン中における-SeHによる-SHの置換)を含む。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログ、その塩または誘導体はIRに結合し得る。好ましくは、このIRはヒトIR-Bレセプターである。いくつかの実施形態では、ヒトIR-Bレセプターに対するIC50または親和性(K)は、10-4M、10-5M、10-6M、10-7M、10-8M、10-9Mまたは10-10Mよりも低い。好ましくは、ヒトIR-Bレセプターに対するIC50は、10-6Mよりも低い。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログ、その塩または誘導体はIGF-IRに結合しない、またはIGF-IRに弱く結合する。本明細書で使用される場合、「弱く」は、IGF-IRに十分な親和性で結合してIGF-IRを活性化しないおよび/またはIGF-IRを介したシグナル伝達を引き起こさないインスリンアナログを指す。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログはIGF-IRに対するIC50またはkが10-9M、10-8M、10-7M、10-6M、10-5Mまたは10-4Mよりも弱く、好ましくは、このインスリンアナログはIGF-IRに対する親和性(K)が100nMよりも弱い。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログ、その塩または誘導体は溶液中で主に単量体である。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログの少なくとも50%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも60%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも70%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも75%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも80%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも85%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも90%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも95%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも98%が単量体である、このインスリンアナログの少なくとも99%が単量体である、またはこのインスリンアナログの約100%が単量体である。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは単量体である。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは少なくとも部分的に単量体であり得、対象への投与時に単量体型へと解離し得る。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログは単量体である、または対象の血流中で単量体型へと解離する。
いくつかの実施形態では、このインスリンアナログ、その塩または誘導体は即時作用性インスリンアナログである。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログ、その塩または誘導体は、ヒトインスリンと比較した場合にヒトに投与した場合に生物学的利用能が増加している。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログ、その塩または誘導体は、ヒトへの投与から10分~6時間以内に生物学的利用能がピークになる。いくつかの実施形態では、投与後のこのインスリンアナログの最大血漿濃度は、投与後のヒトインスリンの最大血漿濃度と比べて早く起こる。例えば、このインスリンアナログ、その塩または誘導体のピーク利用能は、投与から10分~4時間以内、投与から15分~3時間以内、投与から30分~1時間以内または投与から40~55分以内に起こる。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログ、その塩または誘導体は、投与から2分、5分、10分、15分、20分または30分以内に活性が発現する。好ましくは、活性の発現は投与から10~30分以内である。
本発明のインスリンアナログはまた、本発明の方法を使用して設計されたまたは同定されたものおよび標的結合部位を認識して結合し得るものも含む。
標的結合部位として、IR等のインスリンの生理学的結合パートナーならびに生理学的結合パートナーの領域が挙げられる。例えば、標的結合部位は、エピトープ(例えば、標的結合部位として下記で同定するループ構造に対応する)を規定する短いポリペプチド、またはループ構造を模倣する模倣物(例えばペプチド模倣物)であり得る。
いくつかの実施形態では、この標的結合部位はインスリンレセプターであり、好ましくはヒトインスリンレセプターである。いくつかの実施形態では、この標的結合部位は、IRにおいてレセプターへのインスリンドッキングに関与する領域である。いくつかの実施形態では、IRの領域は、下記のうちの1つまたは複数を含む低親和性標的結合部位を含む:L1ドメイン、CTペプチドおよびIR外部ドメインのCRドメイン。L1ドメインに関して、この標的結合部位は、L1の中心β-シートの分子表面の部分、およびL1の4番目のLRR環中にPhe39もしくはループまたは好ましくは両方を含む2番目のLRRの分子表面の部分を好ましくは含む。CRドメインに関して、この標的結合部位はCRドメインのモジュール6を好ましくは含む。
いくつかの実施形態では、この低親和性標的結合部位は、下記のアミノ酸配列のうちの1つまたは複数からの1個または複数個のアミノ酸を含み得る:(i)アミノ酸1~156;(ii)アミノ酸704~719;および(iii)アミノ酸157~310。
アミノ酸1~156に関して、この標的結合部位は、アミノ酸配列1~68から、好ましくは1~55から、より好ましくはアミノ酸配列27~55から少なくとも1個のアミノ酸を好ましくは含む。この標的結合部位は、Arg14、Asn15、Gln34、Leu36、Leu37、Phe39、Pro43~Phe46、Phe64、Leu87、Phe88、Asn90およびPhe89から選択される少なくとも1個のアミノ酸を好ましくは含み、より好ましくはArg14、Asn15、Gln34、Leu37、Phe39、Pro43~Phe46、Phe64から選択される少なくとも1個のアミノ酸を含み、さらにより好ましくはPhe39およびPro43~Phe46から選択される少なくとも1個のアミノ酸を含み、最も好ましくは少なくともPhe39を含む。
アミノ酸157~310に関して、この標的結合部位は、アミノ酸配列192~310から少なくとも1個のアミノ酸を好ましくは含み、より好ましくは配列227~303から少なくとも1個のアミノ酸を含み、さらにより好ましくは配列259~284から選択される少なくとも1個のアミノ酸を含む。
別の態様では、本発明はまた、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであって、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、ペプチドも提供する。開示されているのは、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを含むペプチドであって、このB鎖ペプチドは野生型ヒトインスリンと比較してアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、ペプチドである。いくつかの実例では、任意の保存的アミノ酸置換が10位、20位または両方の位置で存在し得る。例えば、別の親水性アミノ酸、極性アミノ酸または脂肪族アミノ酸を一方または両方の位置で置換する可能性がある。
本開示のペプチドのいくつかの実例では、B鎖ペプチドのアミノ酸20での置換はG20Y、G20FまたはG20Pであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸20での置換はG20Yである。いくつかの実例では、アミノ酸20での置換はG20Pであり得、このペプチドはアミノ酸21で置換をさらに含み、アミノ酸21での置換はG21Hであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸置換はグリシンからの任意の保存的置換であり得る。
本開示のペプチドのいくつかの実例では、B鎖ペプチドのアミノ酸10での置換はH10E、H10DまたはH10Qであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸10での置換はH10Eである。いくつかの実例では、このアミノ酸置換はヒスチジンからの任意の保存的置換であり得る。
いくつかの実例では、インスリンA鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドの両方は野生型インスリンと比較して置換を含み得る。開示されているのは、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであって、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含み、A鎖ペプチド中で少なくとも1個の置換をさらに含むペプチドである。いくつかの実例では、この少なくとも1個の置換を8位または9位置で見出し得る。いくつかの実例では、このA鎖ペプチド中での少なくとも1個の置換はT8H、T8Y、T8KまたはS9Rであり得る。いくつかの実例では、任意の保存的アミノ酸置換が8位もしくは9位または両方の位置で存在し得る。例えば、別の親水性アミノ酸が置換される可能性がある、または他の極性アミノ酸が置換される可能性がある。
開示されているのは、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであって、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含み、A鎖ペプチド中に少なくとも2個の置換をさらに含むペプチドである。いくつかの実例では、この少なくとも2個の置換を8位および9位で見出し得る。いくつかの実例では、このA鎖ペプチド中の少なくとも2個の置換は、T8H、T8Y、T8KおよびS9Rから選択され得る。いくつかの実例では、任意の保存的アミノ酸置換が8位もしくは9位または両方の位置で存在し得る。例えば、一方のまたは両方の位置で、別の親水性アミノ酸が置換される可能性がある、または他の極性アミノ酸が置換される可能性がある。
いくつかの実例では、このB鎖ペプチドは、野生型と比較してC末端アミノ酸の1個または複数個(最大8個)を欠いている。そのため、本開示のペプチドはデス-オクタペプチドインスリンペプチド(ヒトインスリンB鎖のC末端の最後の8個のアミノ酸を欠いている)であり得る。例えば、いくつかの実例では、本開示のペプチドは、下記:
FVNQHLCGSELVEALYLVCYER(配列番号30)、
FVNQHLCGSELVEALYLVCFER(配列番号31)、
FVNQHLCGSELVEALYLVCPER(配列番号32)、
FVNQHLCGSDLVEALYLVCYER(配列番号33)、
FVNQHLCGSDLVEALYLVCFER(配列番号34)、
FVNQHLCGSDLVEALYLVCPER(配列番号35)、
FVNQHLCGSQLVEALYLVCYER(配列番号36)、
FVNQHLCGSQLVEALYLVCFER(配列番号37)、または
FVNQHLCGSQLVEALYLVCPER(配列番号38)
の配列を含むB鎖ペプチドを有し得る。
いくつかの実例では、本開示のペプチドは、GIVEQCCHRICSLYQLENYCN(配列番号39)、GIVEQCCYRICSLYQLENYCN(配列番号40)またはGIVEQCCKRICSLYQLENYCN(配列番号41)の配列を含むA鎖を有し得る。
本開示のペプチドのいくつかの実例では、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを、少なくとも1個のジスルフィド結合を介して結合し得る。いくつかの実例では、A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを、少なくとも2個のジスルフィド結合を介して結合し得る。
いくつかの実例では、本開示のペプチドは単量体である。換言すると、いくつかの実例では、本開示のペプチドは二量体、四量体、六量体等を形成する可能性が低い。
本開示のペプチドのいくつかの実例では、このインスリンA鎖ペプチドは、野生型ヒトインスリンA鎖ペプチドと少なくとも70%同一であり得る。いくつかの実例では、このインスリンA鎖ペプチドは、野生型ヒトインスリンA鎖ペプチドと少なくとも60、65、70、75、80、85、90、95、99%同一であり得る。いくつかの実例では、このパーセント同一性を、本開示のペプチドのN末端またはC末端からの1個または複数個のアミノ酸の欠失により達成し得る。
本開示のペプチドのいくつかの実例では、このインスリンB鎖ペプチドは、野生型ヒトインスリンB鎖ペプチドと少なくとも70%同一であり得る。いくつかの実例では、このインスリンB鎖ペプチドは、野生型ヒトインスリンB鎖ペプチドと少なくとも60、65、70、75、80、85、90、95、99%同一であり得る。いくつかの実例では、このパーセント同一性を、本開示のペプチドのN末端またはC末端からの1個または複数個のアミノ酸の欠失により達成し得る。
いくつかの実例では、本開示のペプチドは、1個または複数個の非天然アミノ酸、改変アミノ酸または合成アミノ酸アナログを含み得る。そのようなアミノ酸として下記が挙げられるがこれらに限定されない:一般的なアミノ酸のD-異性体、2,4-ジアミノ酪酸、α-アミノイソ酪酸、4-アミノ酪酸、2-アミノ酪酸、6-アミノヘキサン酸、2-アミノイソ酪酸、3-アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリン、システイン酸、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、シクロペンチルアラニン、β-アラニン、フルオロ-アミノ酸、デザイナーアミノ酸、例えばβ-メチルアミノ酸、Cα-メチルアミノ酸、Nα-メチルアミノ酸および一般のアミノ酸アナログ。同様にこの範囲に含まれるのは、例えばビオチン化、ベンジル化、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、既知の保護(protecting)/保護(blocking)基による誘導体化、タンパク質分解性開裂、抗体分子または他の細胞リガンドへの連結等により合成の最中にまたは合成後に差次的に改変されるペプチドである。これらの改変は、このペプチドの安定性および/または生物活性を増加させるのに役立ち得る。
本開示のペプチドのさらなる実例では、提供されるのは、少なくとも1個のジスルフィド結合を介してB鎖ペプチドに結合したA鎖ペプチドを有する治療用タンパク質であって、このA鎖はGIVEQCCHRICSLYQLENYCN(配列番号39)の配列を含み、このB鎖ペプチドはFVNQHLCGSELVEALYLVCYER(配列番号30)の配列を含む、治療用タンパク質である。
本開示の治療用タンパク質を医薬組成物中で用い得ること、および糖尿病等の障害の処置と関連して使用し得ることが認識される。
インスリンアナログの設計方法
本発明により提供される毒液インスリンの三次元構造を使用して、インスリンアナログ(本明細書ではIRアゴニスト、分子および化合物とも称される)を設計し得、特に即時作用性インスリンアナログを設計し得る。一態様では、構造モデルとしての、付録Iの原子座標により定義されるCon-Ins G1の構造の使用が提供される。いくつかの実施形態では、この構造モデルをインスリンアナログの同定に使用する。
いくつかの実施形態では、IRと潜在的に相互作用し得る化合物を同定する、設計するまたはスクリーニングする方法が提供される。この方法は、化合物の、Con-Ins G1の三次元構造またはそのサブセットにより定義されるIR構造との相互作用に基づいて、この化合物の、構造に基づく同定、設計またはスクリーニングを実施することを含む。
本発明はまた、既知のIR結合分子の特性の改善にも有用である。例えば、既知のIR結合分子を、付録Iの原子座標またはその一部により定義されるCon-Ins G1の3D構造ならびに自己会合する能力およびIRと相互作用する可能性の評価に対してスクリーニングし得る。この評価を考慮して、既知のIR結合分子を、下記の特性のうちの1つまたは複数を付与するように再設計する(即ち化学的に改変する)可能性がある:(i)自己会合を低減させる、(ii)IRの低親和性結合部位(即ち、選択性を支配する結合部位)に対する親和性を改善する、(iii)IRに対する高親和性結合部位(即ち、シグナル伝達を支配する結合部位)に対する親和性を改善する、および(iv)IGF-1Rへの結合に対する親和性を低下させる。
いくつかの実施形態では、IRまたはIRの領域に結合することが知られているポリペプチドを再設計するまたは改変する方法が提供される。この方法は、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造の、構造に基づく評価を実施すること、およびこの評価の結果としてポリペプチドを再設計するまたは化学的に改変することを含む。いくつかの実施形態では、構造に基づく評価は、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造とインスリンの原子座標またはそのサブセットとの比較を含む。いくつかの実施形態では、構造に基づく評価は、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造とインスリンレセプターの原子座標またはそのサブセットとの間に形成される複合体の分子モデリングをさらに含む。いくつかの実施形態では、このモデルは付録IIの原子座標またはそのサブセットにより定義される。
いくつかの実施形態では、この方法は、再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドを合成するまたは得ること、およびこのポリペプチドのIRに結合する能力を試験することをさらに含む。いくつかの実施形態では、この再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドがIR活性化を調節する能力を決定する。いくつかの実施形態では、この再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドの血糖値を低下させる能力を決定し得る。
いくつかの実施形態では、IRに結合することが知られているポリペプチドはインスリン様成長因子(IGF)である。適切なIGFとして、ヒト、ブタ、ウシ、トリ、マウスおよび同類のものに由来するものが挙げられる。いくつかの実施形態では、このIGFはヒトのIGF-IまたはIGF-IIである。
好ましい実施形態では、IRに結合することが知られているポリペプチドはインスリンである。適切なインスリンとして、ヒトインスリン、ブタインスリン、ウシインスリン、ヒツジインスリン、マウスインスリン、モルモットインスリンおよび同類のものが挙げられる。いくつかの実施形態では、このインスリンはヒトインスリンである。
本明細書で使用される場合、用語「モデリング」は、原子構造情報および相互作用モデルに基づく分子構造および/または機能の定量的分析および定性的分析を含む。用語「モデリング」は、従来の数値に基づく分子動力学およびエネルギー最小化モデル、双方向コンピュータグラフィックモデル、改変分子力学モデル、距離幾何学および他の構造に基づく制約モデルを含む。
分子モデリング技術をCon-Ins G1またはその領域の原子座標に適用して、様々な3Dモデルを導き出してIRおよび他のタンパク質標的の結合部位等の結合部位の構造を調べ得る。
本明細書で言及されるCon-Ins G1の領域は、単一アミノ酸(またはその側鎖)により、連続アミノ酸配列により、または2個以上の別々のアミノ酸および/またはアミノ酸のストレッチにより定義され得る。そのような別々のアミノ酸および/またはアミノ酸のストレッチは、三次元構造中で互いに密接に空間的に近接して存在し得る、または例えば適切なリガンドの結合時に密接に空間的に近接する可能性を有し得る。適切には、Con-Ins G1の領域は、IRの結合(IR二量体中の他の単量体への最初の選択的低親和性結合およびその後の高親和性結合の両方)に関与するアミノ酸配列を含む。
これらの技術を使用して、IRに結合してIRの活性を調節し得る小さい化学物質および大きい化学物質もスクリーニングし得る、または設計し得る。このスクリーニングは、立体3Dスクリーニングシステムまたはコンピュータスクリニングシステムを用い得る。
いくつかの実施形態では、そのようなモデリング方法は、IRの特定の領域に対して立体化学的な相補性を有する化学物質(例えばポリペプチド、ペプチド、ペプチド模倣物、化合物および同類のもの)を設計する、または選択する。「立体化学的な相補性」は、化合物またはその一部が、レセプターへの結合時に自由エネルギーの正味の減少を有するように、このレセプターとの十分な数のエネルギー的に望ましい接触を行うことを意味する。
IR外部ドメインと自然に相互作用する分子または複合体の結合を阻害するために化学物質とレセプター部位との間の相補性がレセプター部位の全ての残基にわたって広がる必要がないことが認識されるだろう。
IRの領域に対して立体相補性を有する化学物質を同定するために多くの方法を使用し得る。例として、このプロセスは、機械可読記憶媒体から生成された付録I中のCon-Ins G1またはその領域の原子座標に基づく、コンピュータスクリーン上でのCon-Ins G1構造の目視検査により開始し得る。いくつかの実施形態では、このプロセスは、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造とインスリンレセプターの原子座標またはそのサブセットとの間に形成される複合体の分子モデリングにより開始し得る。当分野で公知であり且つ入手可能であるモデリングソフトウェア(例えばMODELLER(v9.15)(Webb and Sali,(2014))を使用し得る。このモデリング工程の後に、標準的な分子力学力場(例えばCHARMM(Guvench et al.2011;Best et al.2012))によるエネルギー最小化が続いてもよい。モデリングおよびエネルギー最小化の後に、当分野で既知のソフトウェアを使用した分子動力学シミュレーション(例えばNAMD(Phillips et al.2005))が続いてもよい。加えて、本発明の結合部分を選択するプロセスを補助するための、多くのより特殊化されたコンピュータプログラムが存在する。
本明細書で定義されるポリペプチドを再設計するまたは改変する方法により再設計されているまたは改変されているポリペプチドまたはその塩もしくはアナログも提供される。好ましくは、この再設計されたまたは改変されたポリペプチドは単量体である、または対象に投与した場合に単量体に解離する。
IRの好ましい領域は特異性を支配するものであり、例えば上記で標的結合部位として説明されているものである。
別の態様では、IRアゴニストである単離分子であって、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義されるCon-Ins G1の3D構造に基づいて同定されているおよび/または設計されている分子が提供される。適切な分子として、ペプチド、ポリペプチドまたはペプチド模倣物が挙げられる。
用語「ペプチド模倣物」は、本明細書で使用される場合、ペプチドの生物学的活性を模倣するが化学的性質においてはもはや完全にはペプチド性ではない分子である。厳密な定義により、ペプチド模倣物は、もはやいかなるペプチド結合(即ち、アミノ酸間のアミド結合)を含まない分子である。しかしながら、用語ペプチド模倣物を、天然ではもはや完全にはペプチド性ではない分子(例えば偽ペプチド、半ペプチドおよびペプトイド)を説明するために使用し得る。完全に非ペプチドか部分的に非ペプチドかにかかわらず、本発明のペプチド模倣物は、このペプチド模倣物が基づくペプチド中の活性基の三次元配置に非常に似ている反応性化学部分の空間配置をもたらす。この類似の活性部位の幾何学の結果として、このペプチド模倣物は、ペプチドの生物学的活性と類似の生物学的システムに影響を及ぼす。
毒液インスリンに基づく適切なペプチド模倣物を、本明細書で説明された容易に利用可能な技術および/または方法を使用して開発し得る。そのため、例えばペプチド結合を、ペプチド模倣物が元々のペプチドと類似の構造(従って生物学的活性)を採用するのを可能にする非ペプチド結合に置き換え得る。アミノ酸の化学基を同様の構造の他の化学基に置き換えることにより、さらなる改変も行い得る。毒液インスリンに由来するペプチド模倣物の開発を、付録Iに記載されたこれらの残基の三次元構造またはそのサブセットを参照することにより促進し得る。MACCS-3DおよびISIS/3D(Molecular Design Ltd.,San Leandro,CA)、ChemDBS-3D(Chemical Design Ltd.,Oxford,U.K.)ならびにSybyl/3DB Unity(Tripos Associates,St.Louis,MO)等のプログラムを使用し、この構造情報を使用して、三次元データベースを検索して類似の構造を有する分子を同定し得る。
当業者は、ペプチド模倣物の設計が、本発明の方法を使用して設計されたまたは同定された化学構造のわずかな構造の変更または調整を必要とする場合があることを認識するだろう。一般に、本発明の方法を使用して同定されたまたは設計された模倣物を化学的に合成し、次いで本明細書で説明された方法のいずれかを使用してインスリンレセプター活性を調節する能力に関して試験し得る。本発明の方法は特に有用であり、なぜならば、本発明の方法を使用して、インスリンレセプター活性を調節する能力に関してスクリーニングされなければならない潜在的な模倣物の数を大幅に減少させ得るからである。
いくつかの実施形態では、本単離分子はIRに結合し得る。好ましくは、このIRはヒトIR-Bレセプターである。いくつかの実施形態では、このヒトIR-Bレセプターに対するIC50またはKは、10-4M、10-5M、10-6M、10-7M、10-8M、10-9Mまたは10-10Mよりも強い。好ましくは、このヒトIR-Bレセプターに対するIC50またはKは10-6Mよりも強い。いくつかの実施形態では、この単離分子はIGF-IRに結合しない、またはIGF-IRに弱く結合する。好ましくは、この単離分子はIGF-IRに対する親和性(K)が100nMよりも弱い。
いくつかの実施形態では、この単離分子は溶液中で主に単量体である。いくつかの実施形態では、この単離分子の少なくとも50%が単量体である、この単離分子の少なくとも60%が単量体である、この単離分子の少なくとも70%が単量体である、この単離分子の少なくとも75%が単量体である、この単離分子の少なくとも80%が単量体である、この単離分子の少なくとも85%が単量体である、この単離分子の少なくとも90%が単量体である、この単離分子の少なくとも95%が単量体である、この単離分子の少なくとも98%が単量体である、この単離分子の少なくとも99%が単量体である、またはこの単離分子の約100%が単量体である。いくつかの実施形態では、この単離分子は少なくとも部分的に単量体であり得、対象への投与時に単量体型へと解離し得る。いくつかの実施形態では、この単離分子は単量体である、または対象の血流中で単量体型へと解離する。
本発明はまた、IGF-IRに結合しないまたはIGF-IRに弱く結合するだけであるインスリンアナログの同定および/または設計でも有用である。例えば、本発明の方法を使用して同定されたインスリンアナログを、IGF-IRに結合する能力に関してインシリコ、インビトロおよび/またはインビボでスクリーニングし得る。IGR-IRに結合することが発見されたまたは疑われる任意のインスリンアナログを、IRに関してより選択的であるように再設計し得る。
いくつかの実施形態では、本明細書の方法により同定されたインスリンアナログ(単離された分子、化合物またはIRアゴニストを含む)はIGF-IRに結合しない、またはIGF-IRに弱く結合する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログはIGF-IRに対するIC50またはKが10-9M、10-8M、10-7M、10-6M、10-5Mまたは10-4Mよりも弱く、好ましくは、このインスリンアナログはIGF-IRに対する親和性(K)が100nMよりも弱い。
本開示はまた、IRに結合する化合物を同定する方法であって、
i)下記:
a)付録Iの原子座標もしくはそのサブセットにより定義される構造、または
b)a)の対応する主鎖原子上で重ねた場合に約2.0Å未満の平均二乗偏差を有する構造
を有するポリペプチドの三次元構造モデルを作成すること、および
ii)IRに潜在的に結合する化合物を設計するまたはスクリーニングすること
を含む方法も提供する。
いくつかの実施形態では、三次元構造モデルを作成することは、IRまたはその領域に結合するポリペプチドのモデルを作成することを含む。IRの好ましい領域は特異性を支配するものであり、例えば上記で標的結合部位として説明されているものである。いくつかの実施形態では、このモデルは、付録IIの原子座標またはそのサブセットにより定義される。
このモデルは、例えば側鎖または主鎖の小さな動きにより候補化合物とタンパク質との間の適合度を改善するためのわずかな表面変化を可能にするという意味で適応性があり得る。
いくつかの実施形態では、この方法は、IRと潜在的に結合する化合物を合成することをさらに含む。いくつかの実施形態では、化合物はIRの少なくとも1種の生物学的活性を調節する。いくつかの実施形態では、この方法は、ii)で設計されたまたはスクリーニングされた化合物を、IRの少なくとも1種の生物学的活性を調節する能力に関して試験することをさらに含み得る。例えば、この方法は、ii)で設計されたまたはスクリーニングされた化合物を、血糖値を調節する能力に関して試験することをさらに含み得る。いくつかの実施形態では工程i)およびii)をインシリコで実施する。
本発明はまた、インスリン活性を模倣する化合物を同定するコンピュータベースの方法であって、
i)下記:
a)付録Iの原子座標もしくはそのサブセットにより定義される構造、または
b)a)の対応する主鎖原子上で重ねた場合に約2.0Å未満の平均二乗偏差を有する構造
を有するポリペプチドの三次元構造モデルを作成すること、および
ii)インスリン活性を模倣する化合物を設計するまたはスクリーニングすること
を含む方法も提供する。
いくつかの実施形態では、三次元構造モデルを作成することは、IRまたはその領域に結合したポリペプチドのモデルを作成することを含む。いくつかの実施形態では、このモデルは、付録IIの原子座標またはそのサブセットにより定義される。IRの好ましい領域は特異性を支配するものであり、例えば上記で標的結合部位として説明されているものである。
いくつかの実施形態では、この方法は、IRに潜在的に結合する化合物を合成することをさらに含む。いくつかの実施形態では、化合物はIRの少なくとも1種の生物学的活性を調節する。いくつかの実施形態では、この方法は、ii)で設計されたまたはスクリーニングされた化合物を、IRの少なくとも1種の生物学的活性を調節する能力に関して試験することをさらに含み得る。例えば、この方法は、ii)で設計されたまたはスクリーニングされた化合物を、血糖値を調節する能力に関して試験することをさらに含み得る。いくつかの実施形態では、工程i)およびii)をインシリコで実施する。
いくつかの実施形態では、本発明の方法により同定された化合物はIRに結合し得る。好ましくは、このIRはヒトIR-Bレセプターである。いくつかの実施形態では、このヒトIR-Bレセプターに対するIC50は10-4M、10-5M、10-6M、10-7M、10-8M、10-9Mまたは10-10Mよりも低い。好ましくは、このヒトIR-Bレセプターに対するIC50は10-6Mよりも低い。
いくつかの実施形態では、本発明の方法により同定された化合物はIGF-IRに結合しない、またはIGF-IRに弱く結合する。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログはIGF-IRに対するIC50またはKが10-9M、10-8M、10-7M、10-6M、10-5Mまたは10-4Mよりも弱く、好ましくは、このインスリンアナログはIGF-IRに対する親和性(K)が100nMよりも弱い。
いくつかの実施形態では、本発明の方法により同定された化合物は溶液中で主に単量体である。いくつかの実施形態では、この化合物の少なくとも50%が単量体である、この化合物の少なくとも60%が単量体である、この化合物の少なくとも70%が単量体である、この化合物の少なくとも75%が単量体である、この化合物の少なくとも80%が単量体である、この化合物の少なくとも85%が単量体である、この化合物の少なくとも90%が単量体である、この化合物の少なくとも95%が単量体である、この化合物の少なくとも98%が単量体である、この化合物の少なくとも99%が単量体である、またはこの化合物の約100%が単量体である。いくつかの実施形態では、この化合物は少なくとも部分的に単量体であり得、対象への投与時に単量体型へと解離し得る。いくつかの実施形態では、この化合物は単量体である、または対象の血流中で単量体型へと解離する。
当業者に容易に理解されるように、本発明の方法は、インスリンレセプターと相互作用するインスリンアナログタンパク質を設計するためのおよび選択するための合理的方法を提供する。いくつかの場合では、このタンパク質は、活性を増大させるためにさらなる開発を必要とする場合がある。そのようなさらなる開発は当分野では日常的であり、本出願で提供される構造情報により支援されるだろう。特定の実施形態では、本発明の方法はそのようなさらなる開発工程を含むことを意図されている。
インスリンアナログを上記の方法により設計すると、または選択すると、このインスリンアナログがIR等の標的に結合し得る効率を、コンピュータ評価により試験して最適化し得る。例えば、IRに結合するように設計されているまたは選択されているインスリンアナログはまた、好ましくは、天然IRに結合する場合に結合部位に占められるものと重複しない体積を横切らなければならない。IRに結合するように設計されたまたは選択されたインスリンアナログを、その結合状態で標的タンパク質との反発的な静電気的相互作用を好ましくは欠くように、コンピュータによりさらに最適化し得る。そのような非相補的(例えば静電気的)相互作用として、反発的な電荷-電荷相互作用、双極子-双極子相互作用および電荷-双極子相互作用が挙げられる。具体的には、インスリンアナログがIRに結合した場合の化合物とインスリンアナログとの間の全ての静電気的相互作用の合計は、好ましくは結合のエンタルピーに対して中立的である、または有利な寄与を行う。
上記で説明したようにインスリンアナログを最適に選択すると、または設計すると、このインスリンアナログの結合特性を改善するためにまたは変更するために、このインスリンアナログの原子または側基のうちのいくつかで置換を行ってもよい。一般に、最初の置換は保存的であり、即ち置換基は元々の基とほぼ同一のサイズ、形状、疎水性および電荷を有するだろう。当然のことながら、立体配座を変更することが当分野で知られている構成要素を避けるべきであることを理解すべきである。次いで、そのような置換インスリンアナログを、上記で詳細に説明した同一のコンピュータ方法によりIRへの適合の効率について分析し得る。
当分野では、複合の変形エネルギーおよび静電気的相互作用を評価するために特定のコンピュータソフトウェアが利用可能である。そのような使用のために設計されたプログラムの例として、Gaussian 92,リビジョンC(Frisch,Gaussian,Inc.,Pittsburgh,PA);AMBER,バージョン4.0(Kollman,University of California at San Francisco);QUANTA/CHARMM(Molecular Simulations,Inc.,Burlington,MA)およびInsight II/Discover(Biosysm Technologies Inc.,San Diego,CA)が挙げられる。
本発明は、本明細書で説明された方法を使用して同定されたインスリンアナログ(IRアゴニスト、分子、化合物および同類のものを含む)を包含する。いくつかの実施形態ではまた、本明細書で説明された方法を使用して同定されたインスリンアナログ(IRアゴニスト、分子、化合物および同類のものを含む)を含む医薬組成物にも関する。
結合および生物学的活性のスクリーニングアッセイおよび確認
本発明のインスリンアナログ(本開示の方法を使用して同定された化合物および分子を含む)を好ましくは、IRおよび/またはIGF-1R機能の多くのインビトロおよびインビボでのアッセイにより評価して、IRおよび/またはIGF-1R活性と相互作用するおよび調節する能力を確認する。例えば、化合物を、IRおよび/もしくはIGF-1Rに結合する能力に関して試験し得る、ならびに/またはIRおよび/もしくはIGF-1Rのシグナル伝達を調節する(例えば活性化するもしくは破壊する)能力に関して試験し得る。
スクリーニングアッセイが結合アッセイである場合、IRまたはIGF-1Rを標識に結合させ得、この標識は検出可能なシグナルを直接的にまたは間接的に提供し得る。様々な標識として、放射性同位体、蛍光分子、化学発光分子、酵素、特異的結合分子、粒子、例えば磁気粒子、および同類のものが挙げられる。特異的結合分子として、例えばビオチンおよびストレプトアビジン、ジゴキシンおよび抗ジゴキシン等のペアが挙げられる。特異的結合メンバーに関して、相補的メンバーは通常、既知の手順に従って、検出される分子で標識されるだろう。
このスクリーニングアッセイに様々な他の試薬を含め得る。これらとして、例えば最適なタンパク質-タンパク質結合を容易にするためにおよび/または非特異的なもしくはバックグラウンドの相互作用を低減させるために使用される、塩、中性タンパク質、例えばアルブミン、界面活性剤のような試薬が挙げられる。アッセイの効率を改善する試薬(例えばプロテアーゼインヒビター、ヌクレアーゼインヒビター、抗微生物剤等)を使用し得る。成分を、必要な結合を生じさせる任意の順序で添加する。最適な活性を促進する任意の温度(概して4~40℃)でインキュベーションを実施する。
IRまたはIGF-1Rへの化合物の直接的結合を、表面プラズモン共鳴(BIAcore)によっても行い得る(Morton and Myszka,1998で概説されている)。ここで、アミンもしくはチオール-ジスルフィド交換カップリングを使用する直接化学カップリングにより(Nice and Catimel,1999)、または適切に誘導体化されたセンサー表面へのFc融合タンパク質としてのレセプター外部ドメインの捕捉により(Morten and Myszka,1998)、レセプターをCM5上でまたは他のセンサーチップ上で固定する。潜在的なインスリンアナログ(分析物と呼ばれる)は、適切な流速および濃度範囲でセンサー表面上を通過する。古典的な分析方法は、広範囲の分析物濃度に対する応答を集めることである。濃度範囲は反応に関する十分な情報を提供し、CLAMP(Morton and Myszka,1998を参照されたい)等のフィッティングアルゴリズムを使用することにより速度定数を決定し得る(Morton and Myszka,1998;Nice and Catimel, 1999)。通常、リガンド表面は各分析物の結合サイクルの最後に再生される。表面再生により、各サイクルの開始時に同数のリガンド結合部位が分析物にアクセス可能であることが確実になる。
インキュベーション期間は最適な活性のために選択されるが、迅速なハイスループットスクリーニングを容易にするために最適化もされ得る。通常、0.1~1時間が十分であるだろう。一般に、複数のアッセイ混合物を様々な試験薬濃度と並行して実行し、これらの濃度に対する様々な応答を得る。典型的には、これらの濃度のうちの1つは陰性コントールとして(即ちゼロ濃度または検出レベル未満で)作用する。
天然インスリンのインスリンアナログ置き換えのための異種スクリーニングの基礎としてのインビトロでの競合レセプター結合アッセイの基本フォーマットは下記のとおりであり得る:IRまたはIGF-1Rの活性部位の占有を、Denley et al(2004)により説明されたように時間分解された蛍光検出(TRFD)により定量化する。RIR-A細胞、RIR-B細胞およびP6細胞をそれぞれIR-A、IR-BおよびIGF-1Rの供給源として使用する。細胞を、4℃で1時間にわたり溶解緩衝液(20mM HEPES、150mM NaCl、1.5mM MgCl、10%(体積/体積)グリセロール、1%(体積/体積)Triton X-100、1mM EDTA pH7.5)で溶解させる。溶解物を3500rpmで10分にわたり遠心分離し、次いで抗インスリンレセプター抗体83-7または抗IGF-1R抗体24-31で予めコーティングした白色Greiner Lumitrac 600プレートに1ウェル当たり100μlを添加する。いずれの捕捉抗体も、インスリン、IGF-IまたはIGF-IIによるレセプター結合を妨げない。約100,000蛍光カウントのユーロピウム標識インスリンまたはユーロピウム標識IGF-Iを様々な量の非標識競合インスリンアナログと一緒に各ウェルに添加し、4℃で16時間にわたりインキュベートする。ウェルを20mM Tris、150mM NaCl、0.05%(体積/体積)Tween 20(TBST)で洗浄し、DELFIA増強溶液(100μl/ウェル)を添加する。BMG Lab Technologies Polarstar(商標)Fluorimeterまたはa Wallac Victor II(EG&G Wallac,Inc.)により、340nm励起フィルタおよび612nm発光フィルタを使用して、時間分解された蛍光を測定する。
IRに対する化合物の結合および生物学的活性を評価するために採用され得る他の適切なアッセイの例は当分野で公知である。例えば、適切なアッセイを国際公開第03/027246号パンフレット中に見出し得る。適切なアッセイの例として下記が挙げられる:
(i)(Denley et al.(2004)により説明されているような)レセプター自己リン酸化。RIR-A細胞、RIR-B細胞またはP6細胞を2.5×10個の細胞/ウェルでFalcon 96ウェル平底プレートに蒔き、37℃、5%COで一晩増殖させる。細胞を血清フリー培地で4時間にわたり洗浄した後、37℃、5%COで10分にわたり、1%BSAを含むDMEM 100μl中のインスリン、IGF-IまたはIGF-IIのいずれかのうちの1つで処理する。2mM NaVOおよび1mg/ml NaFを含む溶解緩衝液を細胞に添加し、溶解物からのレセプターを抗体83-7または24-31で予めコーティングした96ウェルプレート上で捕捉し、1×TBST/0.5%BSAでブロックする。4℃での一晩のインキュベーションの後、このプレートを1×TBSTで洗浄する。リン酸化レセプターをユーロピウム標識抗ホスホチロシン抗体PY20(130ng/ウェル、室温、2時間)で検出する。上記で説明したように、DELFIA増強溶液(100μl/ウェル)を添加して時間分解された蛍光を測定する。
(ii)(Olefsky,1978により説明されているような)2-デオキシ[U-14C]グルコースを使用するグルコース取り込み。24ウェルプレート中での分化後8~12日の脂肪細胞を、1%(重量/体積)RIAグレードBSAおよび2mMピルビン酸ナトリウムが補充されたKrebs-Ringer Bicarbonate Buffer(130mM NaCl、5mM KCl、KHPO、1.3mM MgSO.7HO、25mM NaHCOおよび1.15mM CaClを含む25mM Hepes、pH7.4)で2回洗浄する。脂肪細胞を、インスリンの添加前に37℃で90分にわたりまたはアゴニストもしくはアンタゴニストの添加前に30分にわたり平衡化する。インスリン(Actrapid,Novogen)を、37℃で30分にわたり0.7~70nMの濃度範囲にわたり添加する。脂肪細胞にアゴニストまたはアンタゴニスト(0~500mM)を90分にわたり添加し、続いてアンタゴニストの場合には天然インスリンを添加する。1ウェル当たり50mM 2-デオキシグルコースおよび0.5mCi 2-デオキシ-[U-14C]グルコース(NEN,PerkinElmer Life Sciences)の取り込みを、シンチレーション計数によるアゴニスト刺激の最後の10分にわたり測定する。
(iii)(Robinson and James(1992)およびMarsh et al.(1995)により説明されているような)原形質膜ローン(plasma membrane lawn)を使用したグルコース輸送体GLUT4トランスロケーション。
(iv)(Marsh et al.1995により説明されているような)原形質膜ローンを使用したGLUT4トランスロケーション。3T3-L1繊維芽細胞を6ウェルプレート中にてカバーガラス上で増殖させ、脂肪細胞に分化させる。分化の8~12日後、脂肪細胞を、0.5%FBSを含むDMEM中で18時間にわたり血清飢餓状態にする。細胞をKrebs-Ringer Bicarbonate Buffer、pH7.4で2回洗浄し、37℃で90分にわたり平衡化した後にインスリン(100nM)を添加する、または30分にわたり平衡化した後に化合物(100μM)を添加する。処理後、脂肪細胞をPBS中の0.5mg/mlポリ-L-リシンで洗浄し、氷上で1:3(体積/体積)膜緩衝液(membrane buffer)(70mM KCl、5mM MgCl、3mM EGTAならびに新たに添加した1mM DTTおよび2mM PMSFを含む30mM Hepes、pH7.2)で3回洗浄して低浸透圧ショックを与える。次いで、洗浄した細胞を、氷上で1:1(体積/体積)膜緩衝液中にて設定0でプローブソニケータ(Microson)を使用して超音波処理して、カバーガラスに付着したままである原形質膜断片のローンを生成する。この断片を、22℃で20分にわたり膜緩衝液中の2%(重量/体積)パラホルムアルデヒドで固定し、この固定剤をPBS中の100mMグリシンによりクエンチする。次いで、この原形質膜断片を22℃で60分にわたり膜緩衝液中の1%(重量/体積)Blottoでブロックし、インハウスのウサギアフィニティ精製抗GLUT4ポリクローナル抗体(クローンR10、GLUT4のC末端の19個のアミノ酸を包含するペプチドに対して生成する)およびAlexa 488ヤギ抗ウサギ二次抗体(分子プローブ、1:200)で免疫標識する。カバーガラスを、FluoroSave試薬(Calbiochem)を使用してスライド上にマウントし、OptiScan共焦点レーザー走査免疫蛍光顕微鏡(Optiscan,VIC.,Australia)を使用して撮像する。ImageJ(NIH)イメージングソフトウェアを使用してデータを分析する。各条件に関して各実験内で少なくとも6つの視野を調べ、実験期間にわたる共焦点顕微鏡ゲイン設定を維持して実験間の変動を最小限に抑える。
インスリンアナログ活性を、脂肪細胞アッセイを使用して決定し得る。インスリンは、Hグルコースの脂肪細胞への取り込みおよびこのグルコースの脂質への変換を増加させる。脂質相へのHの取り込みを、水溶性H生成物を排除するシンチラント(scintillant)混合物への脂質相の分配により決定する。最大未満のインスリン用量でのHグルコースの取り込みへのインスリンアナログの効果を決定する。この方法の出典はMoody et al.(1974)である。マウス精巣上体脂肪パッドを解剖し、消化緩衝液(Krebs-Ringer 25mM HEPES、4%HSA、1.1mMグルコース、0.4mg/ml 1型コラゲナーゼ、pH7.4)へと細かく刻み、36.5℃で最大1.5時間にわたり消化する。ろ過、洗浄(Krebs-Ringer HEPES、1%HSA)およびアッセイ緩衝液(Krebs-Ringer HEPES、1%HSA)への再懸濁の後、遊離脂肪細胞を、試験溶液が入った96ウェルピコプレートにピペットで入れる。
このアッセイを、0.45mMグルコースの最終濃度でのHグルコース(例えばex.Amersham TRK 239)の添加により開始させる。このアッセイを、Labshakerインキュベーションタワー、400rpm中で36.5℃にて2時間にわたりインキュベートし、次いで、Permablend/Tolueneシンチラント(または等価物)の添加により停止させ、このプレートを密封した後に少なくとも1時間にわたり静置し、Packard Top Counterまたは等価物で検出する。完全天然インスリン標準曲線(8用量)を各プレートへのコントロールとして実行する。
データを、天然インスリンの反応と比較したデータと共に、Hグルコース取り込みへのインスリンアナログの効果としてグラフで示す。このアッセイを基礎インスリン濃度または最大インスリン濃度でも実行し得る。
インスリンアナログのインビボ活性を試験するために、静脈内血糖試験を下記のとおりにWistarラットで実行し得る。体重約300gの雄Mol:Wistarラットを2群に分ける。血糖濃度の測定のために尾静脈から血液サンプル10μlを採取する。次いで、このラットをt=30分で(例えばHypnorm/Dormicumにより)麻酔し、t=-20分およびt=0分で血糖を再び測定する。t=0サンプルを採取した後、1ml/kgの注射体積に相当する濃度にて等張水性緩衝液中のビヒクルまたは試験物質をラットの尾静脈に注射する。血糖を時間5、10、20、30、40、60、80、120および180分で測定する。麻酔薬投与を20分間隔で繰り返す。
本発明の方法に従って設計されたまたは選択されたインスリンアナログ、化合物および/または分子を、多くの生物物理学的方法によっても評価し得る。適切な方法として、x線結晶構造解析、分析的超遠心分離、サイズ排除クロマトグラフィー、等温熱量測定および同類のものが挙げられる。例えば、インスリンアナログ(本開示の方法を使用して同定された化合物および分子を含む)を、本明細書で説明したように、このアナログの結晶化および構造決定によるさらなる確認に供し得る。例えば、溶液中の多量体化状態を分析的超遠心分離により決定し得る。分析的超遠心分離を、12mm路長セルでBeckman XLI分析的遠心分離機を使用して20℃で実行する。化合物を含む試料を、100μg/mLの最終濃度まで10mM HClで10mM Tris、50mM NaCl、pH7.4に希釈する。当業者は、他の緩衝液、塩および同類のものを使用し得ることを認識するだろう。例えば、0.2mM ZnCl、2mM CaCl、1mMリン酸ナトリウム(pH7.4)または0.1M硫酸アンモニウムを含む試料も調製し得る。等体積の10mM NaOHを添加して任意のpH変化を中和する。100μLの総試料体積を使用する。
放射状の濃度分布を220nmでの吸光度により測定する。1時間間隔での連続吸光度走査により評価した場合、30,000rpmおよび45,000rpmで沈降平衡を確立した。両方の速度でのデータを、SEDNTERP(Laue et al.1992)を使用して組成から推定される溶液密度および溶媒部分比体積の値を使用して、SEDPHAT(Houtman et al.2007)における単一の理想的な沈降物種に一緒にフィットさせる。ジスルフィドを除いて、全ての翻訳後改変を化合物部分比体積の推定において無視する。
臨床適応症、投与経路、投与量および医薬組成物
本開示が関係するインスリンアナログ、化合物および分子は、IRの活性化および/または調節に反応する状態の処置で価値がある。この状態として、グルコース代謝および/または血糖値の調節を必要とするものが挙げられる。
IRの活性化および/または調節に反応する状態として、糖尿病脊髄炎(例えば1型糖尿病、2型糖尿病、妊娠糖尿病)、高血糖、インスリン抵抗性、耐糖能障害および同類のものが挙げられるがこれらに限定されない。いくつかの実施形態では、この状態はインスリン関連状態である。インスリン関連状態として、高血糖、インスリン抵抗性、1型糖尿病、妊娠糖尿病または2型糖尿病が挙げられるがこれらに限定されない。
本発明のインスリンアナログは、グルコース代謝を調節するための対象(例えばヒト等の哺乳動物)中での使用に適している。従って、グルクース代謝を調節する方法が提供される。いくつかの実施形態は、そのようなインスリンアナログの治療上有効な量の、必要とする対象への投与によりグルコース代謝を調節する方法に関する。いくつかの実施形態は、インスリン関連状態を処置する方法であって、必要とする対象に本明細書で定義したインスリンアナログの治療上有効な量を投与することを含む方法に関する。いくつかの実施形態は、インスリンアナログの治療上有効な量の必要とする対象への投与により糖尿病を処置する方法に関する。糖尿病として、1型糖尿病、2型糖尿病または妊娠糖尿病が挙げられるがこれらに限定されない。いくつかの実施形態は、そのようなインスリンアナログの治療上有効な量の必要とする対象への投与により高血糖を処置する方法に関する。いくつかの実施形態は、そのようなインスリンアナログの治療上有効な量の必要とする対象への投与によりインスリン抵抗性を処置する方法に関する。いくつかの実施形態は、そのようなインスリンアナログの治療上有効な量の必要とする対象への投与により耐糖能障害を処置する方法に関する。いくつかの実施形態は、そのようなインスリンアナログの治療上有効な量の必要とする対象への投与により対象の血糖値を低減させる方法に関する。
例えば、開示されているのは、対象の1型糖尿病を処置する方法であって、必要とする対象に、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドの治療上有効な量を投与することであり、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、投与することを含む方法である。いくつかの実例では、B鎖ペプチドのアミノ酸20での置換はG20Y、G20FまたはG20Pであり得る。本開示のペプチドのいくつかの実例では、B鎖ペプチドのアミノ酸10での置換はH10E、H10DまたはH10Qであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸10および20でのB鎖置換の任意の組み合わせが存在し得る。いくつかの実例では、投与されるペプチドのA鎖は少なくとも1個の置換も含み得る。例えば、いくつかの実例では、A鎖ペプチド中の少なくとも1個の置換はT8H、T8Y、T8KまたはS9Rであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸置換は8位もしくは9位または両方の位置で存在し得る。そのため、いくつかの実例では、本開示のB鎖ペプチド置換およびA鎖ペプチド置換の任意の組み合わせが存在し得る。同様に本明細書で開示されているのは、対象の1型糖尿病を処置する方法であって、本明細書で定義されたインスリンアナログの治療上有効な量を投与することを含む方法である。いくつかの実例では、この対象は、このペプチドの投与前に1型糖尿病と診断されている。いくつかの実例では、この対象は、このペプチドの投与前に1型糖尿病を発症するリスクがあると診断されている。
薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログ、化合物または分子の使用も提供される。いくつかの実施形態は、対象中でのグルコース代謝を調節するための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用に関する。いくつかの実施形態は、対象のインスリン関連状態の処置および/または予防のための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用に関する。いくつかの実施形態は、対象の糖尿病の処置および/または予防のための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用に関する。いくつかの実施形態は、対象の高血糖の処置および/または予防のための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用に関する。いくつかの実施形態は、対象のインスリン抵抗性の処置および/または予防のための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用に関する。いくつかの実施形態は、対象の耐糖能障害の処置および/または予防のための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用に関する。いくつかの実施形態は、対象の血糖値を低減させるための薬剤の製造における本明細書で定義されたインスリンアナログの使用に関する。
いくつかの実施形態はまた、対象中でのグルコース代謝の調節での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログにも関する。いくつかの実施形態は、対象のインスリン関連状態の処置および/または予防での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログに関する。いくつかの実施形態は、対象の糖尿病の処置および/または予防での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログに関する。いくつかの実施形態は、対象の高血糖の処置および/または予防での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログに関する。いくつかの実施形態は、対象のインスリン抵抗性の処置および/または予防での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログに関する。いくつかの実施形態は、対象の耐糖能障害の処置および/または予防での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログに関する。いくつかの実施形態は、対象の血糖値の低減での使用のための本明細書で定義されたインスリンアナログに関する。
いくつかの実施形態では、本インスリンアナログの投与により血糖値が低減される。好ましくは、このインスリンアナログは即時作用性インスリンアナログであり、その結果、このインスリンアナログの投与により、投与から60分以内に血糖値が低減される。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログの投与により、投与から50分、40分、30分、20分、10分または5分以内に血糖値が低減される。いくつかの実施形態では、このインスリンアナログの投与により、1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、11時間または12時間にわたり血糖値が低減される。本明細書で開示された方法のいずれかでは、本明細書で詳細に論じられている好ましい化合物を投与する可能性がある。血糖値を、当業者に既知の任意の手段により測定し得る。
インスリンレセプター活性化を増加させる方法
開示されているのは、対象中でのインスリンレセプター活性化を増加させる方法であって、必要とする対象に本開示のインスリンアナログ、ペプチド、化合物、分子または医薬組成物のいずれか1つの治療上有効な量を投与することを含む方法である。いくつかの実例では、必要とする対象は、標準的な活性化レベルと比較してインスリンレセプター活性化が低減されていることが分かっている対象であり得る。いくつかの実例では、インスリンレセプター活性化の標準的な活性化レベルは、健康な個体で確立されたレベルに基づき得る。いくつかの実例では、インスリンレセプター活性化の標準的な活性化レベルは、インスリンレセプター活性化の増加の必要性の決定前に処置される対象で確立されたレベルに基づき得る。
例えば、開示されているのは、対象中でのインスリンレセプター活性化を増加させる方法であって、必要とする対象に、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドの治療上有効な量を投与することであり、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、投与することを含む方法である。いくつかの実例では、B鎖ペプチドのアミノ酸20での置換はG20Y、G20FまたはG20Pであり得る。本開示のペプチドのいくつかの実例では、B鎖ペプチドのアミノ酸10での置換はH10E、H10DまたはH10Qであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸10および20でのB鎖置換の任意の組み合わせが存在し得る。いくつかの実例では、投与されるペプチドのA鎖は少なくとも1個の置換も含み得る。例えば、いくつかの実例では、A鎖ペプチド中の少なくとも1個の置換はT8H、T8Y、T8KまたはS9Rであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸置換は8位もしくは9位または両方の位置で存在し得る。そのため、いくつかの実例では、本開示のB鎖ペプチド置換およびA鎖ペプチド置換の任意の組み合わせが存在し得る。同様に開示されているのは、対象中でのインスリンレセプター活性化を増加させる方法であって、本明細書で定義されたインスリンアナログの治療上有効な量を投与することを含む方法である。
血糖を低下させる方法
開示されているのは、対象の血糖を低下させる方法であって、必要とする対象に本開示のインスリンアナログ、ペプチド、化合物または医薬組成物のいずれか1つの治療上有効な量を投与することを含む方法である。
いくつかの実例では、必要な対象は、標準的な血糖値と比較して血糖が増加していることが分かっている対象であり得る。いくつかの実例では、インスリンレセプター活性化の標準的な活性化レベルは、健康な個体で確立されたレベルに基づき得る。いくつかの実例では、インスリンレセプター活性化の標準的な活性化レベルは、インスリンレセプター活性化の増加の必要性の決定前に処置される対象で確立されたレベルに基づき得る。
例えば、開示されているのは、対象の血糖を低下させる方法であって、必要とする対象に、インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドの治療上有効な量を投与することであり、このB鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、投与することを含む方法である。いくつかの実例では、B鎖ペプチドのアミノ酸20での置換はG20Y、G20FまたはG20Pであり得る。本開示のペプチドのいくつかの実例では、B鎖ペプチドのアミノ酸10での置換はH10E、H10DまたはH10Qであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸10および20でのB鎖置換の任意の組み合わせが存在し得る。いくつかの実例では、投与されるペプチドのA鎖は少なくとも1個の置換も含み得る。例えば、いくつかの実例では、A鎖ペプチド中の少なくとも1個の置換はT8H、T8Y、T8KまたはS9Rであり得る。いくつかの実例では、アミノ酸置換は8位もしくは9位または両方の位置で存在し得る。そのため、いくつかの実例では、本開示のB鎖ペプチド置換およびA鎖ペプチド置換の任意の組み合わせが存在し得る。同様に開示されているのは、対象の血糖を低下させる方法であって、本明細書で定義されたインスリンアナログの治療上有効な量を投与することを含む方法である。
投与および投与量
説明されている投与経路および投与量は単なる目安として意図されている。当業者は、本明細書に記載された本開示に基づいて、本明細書に包含された組成物、製剤、方法および使用のための具体的な投与レジメンを臨床のおよび/または薬物動態の実験を通して経験的に決定し得ること、ならびにそのような投与量を予め指定された有効性および/または毒性の基準に従って調整し得ることを理解するだろう。任意の特定の患者に対する具体的な投与量および処置レジメンは様々な因子(例えば、用いられる具体的な化合物の活性および濃度、患者の特性、例えば年齢、体重および特定の患者の反応、活性の組み合わせ、処置を行う医師の判断、ならびに処置される状態の性質および重症度)に依存することも理解されるだろう。下記の投与量は平均的な場合の例である。当然のことながら、より高いまたはより低い投与量範囲に価値がある個々の実例が存在し得、そのようなものは本発明の範囲内である。
本明細書で説明された方法および使用に従って、対象に、1回または複数回の用量でインスリンアナログの治療上有効な量を投与し得る。投与される実際の量ならびに投与の経路および時間経過は、投与経路、必要とされる利益の性質、処置される状態の性質および重症度、処置される対象の状態により変動し、最終的には付き添いの獣医または医療従事者の裁量であるだろう。処置の指示(例えば、投与量、時期等に関する決定)は付き添いの獣医または医療従事者の責任の範囲内であり、典型的には障害の性質、個々の患者の状態、送達の部位、投与の方法および専門家に既知の他の因子を考慮する。
当業者は、1種または複数種のアナログを一緒にまたは別々に任意の適切なスケジュール(例えば1日当たり1回または複数回から1週当たり1回または複数回)で投与し得、例えば1日おきに、任意の日数または週数にわたりまたはその任意の変動にわたり投与し得ることを理解するだろう。通常、このインスリンアナログを1日に1回、2回、3回、4回またはより多くの回数で投与する。しかしなら、このインスリンアナログを必要に応じても投与し得、例えば血糖値が正常範囲を超えている場合または血糖値を低減させる必要がある場合にも投与し得る。一般に、本発明の化合物または組成物を食事の摂取と共に、食事の摂取前にまたは食事の摂取後に投与する。好ましくは、このインスリンアナログを全ての食事(例えば朝食、昼食および夕食)の前に投与する。いくつかの実施形態では、この化合物または組成物を食事の摂取の5分、10分、20分、30分、40分、50分または60分前に投与する。いくつかの実施形態では、この化合物または組成物を食事の摂取直前に投与する。
本明細書で説明されたインスリンアナログおよび医薬組成物を当業者に既知の任意の経路で投与し得、非経口が最も重要である。従って、本発明の一実施形態では、このインスリンアナログを非経口経路(例えば注射または注入)により投与する。他の適切な投与経路(例えば経腸(例えば経口投与)は本発明の範囲内である。具体的な実施形態では、非経口経路が好ましく、この非経口経路として、静脈内、関節内、腹腔内、皮下、筋肉内、基質内(intrastemal)の注射および注入、ならびに舌下、経皮、局所、鼻経路等の経粘膜によるまたは例えば肺吸入等の吸入による投与が挙げられる。
このインスリンアナログを適切なビヒクルで投与し得る、またはこのインスリンアナログを適切な医薬組成物の形態で投与し得る。そのような組成物も本発明の範囲内である。下記では適切な医薬組成物が説明されている。
医薬組成物
本明細書で説明されたインスリンアナログが医薬組成物に製剤化され得ることを当業者は認識するだろう。そのような組成物は、このインスリンアナログと1種または複数種の薬学的に許容される担体とを含み得る。
本明細書で使用される場合、用語「薬学的に許容される担体」として、医薬品投与に適合するありとあらゆる固体または溶媒(例えばリン酸緩衝生理食塩水緩衝液、水、生理食塩水)分散媒、コーティング、抗微生物剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤ならびに同類のものが挙げられる。薬学的に許容される担体は、本組成物の他の成分に適合し且つそのレシピエントに有害ではないという意味で「許容され」なければならない。適切な医薬用担体は、“Remington’s Pharmaceutical Sciences”by E.W.Martin(Mack Publishing Co.,Easton,Pa.);Gennaro,A.R.,Remington:The Science and Practice of Pharmacy,20th Edition,(Lippincott,Williams and Wilkins),2000;Liberman,et al.Eds.,Pharmaceutical Dosage Forms,Marcel Decker,New York,N.Y.,1980;およびKibbe,et al.Eds.,Handbook of Pharmaceutical Excipients(3rd Ed.),American Pharmaceutical Association,Washington,1999で説明されている。一般に、適切な薬学的に許容される担体は当分野で既知であり、最終用途に基づいて選択される。例えば、本発明で使用され得る薬学的に許容される担体として、注射可能なまたは注入用の組成物に適したものが挙げられるがこれに限定されない。この組成物には補充的な活性化合物も組み込まれ得る。薬学的に活性な物質のためのそのような媒体および薬剤の使用は当分野で公知である。医薬組成物は、当業者に公知であり且つ容易に利用可能である多くの出典(例えばRemington’s Pharmaceutical Sciences(Martin E.W.,Easton Pa.,Mack Publishing Company,19th ed.,1995))で説明されている。
薬学的に許容される担体の量は、化合物および当業者が担体とは異なると分類するであろうあらゆる他の任意選択の成分(例えば他の活性剤)のレベルに依存するだろう。本発明の製剤は例えば、この組成物の重量で約5%~99.99%または25%~約99.9%または30%~90%の薬学的に許容される担体を含み得る。薬学的に許容される担体は、他の補助剤の非存在下で、この組成物の残余を形成し得る。
任意選択で、本開示の医薬組成物は、他の追加の成分、例えば治療成分および/または予防成分をさらに含む。そのため、本発明は、さらなる態様において、本発明の化合物、1種または複数種の薬学的に許容される担体を1種または複数種の他の活性剤と一緒に含む医薬組成物に関する。一般に、この医薬組成物中に存在する他の活性剤の量は、単独でまたはこの組成物中の他の成分との組み合わせでさらなる利益をもたらすのに十分である。
これらの任意選択の成分は、それらの治療上のもしくは美観上の利益またはそれらの仮定された作用様式により分類され得ることを当業者は理解するだろう。しかしながら、これらの任意選択の成分は、いくつかの実例では複数種の治療上のもしくは美観上の利益をもたらし得るまたは複数種の作用様式を介して機能し得ることも理解される。従って、本明細書での分類は便宜のために行われており、成分を特定の用途または列挙された用途に限定することを意図されてはいない。同様に、適用可能である場合には、成分の薬学的に許容される塩は本明細書において有用である。
本発明の医薬製剤中に他の活性剤が存在する場合には、この化合物の用量は、他の追加の成分が存在しない場合に用いられるものと同一であってもよいし異なっていてもよい。適切な用量は当業者に容易に認識されるだろう。
医薬組成物は、その意図された投与経路(例えば局所または全身)に適合するように製剤化される。投与経路の例として、非経口投与、例えば静脈内投与、皮内投与、皮下投与、経口投与、経鼻投与、局所投与、経皮投与、経粘膜投与および直腸投与が挙げられる。経口投与および経鼻投与は吸入による投与を含む。非経口適用、皮内適用または皮下適用に使用される溶液または懸濁液は下記の成分を含み得る:無菌希釈剤、例えば注射用の水、生理食塩水、固定油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒;抗微生物剤、例えばベンジルアルコールまたはメチルパラベン;酸化防止剤、例えばアスコルビン酸または亜硫酸水素ナトリウム;キレート剤、例えばエチレンジアミン四作酸;緩衝液、例えばアセテート、シトレートまたはホスフェート、および塩化ナトリウムまたはデキストロース等の浸透圧の調整剤。pHを塩酸または水酸化ナトリウム等の酸または塩基で調整し得る。非経口用調製物を、ガラス製またはプラスチック製のアンプル、使い捨てシリンジまたは複数回用量バイアルに封入し得る。
注射用途に適した医薬組成物として、無菌の水溶液(水溶性の場合)または分散液、非水溶液、および無菌注射溶液または分散液の即時調製用の無菌粉末が挙げられる。静脈内投与の場合、適切な担体として、生理食塩水、静菌水、Cremophor EL(BASF,Parsippany,N.J.)またはリン酸緩衝生理食塩水(PBS)が挙げられる。全ての場合において、この組成物は無菌でなければならず、容易な注射可能性が存在する程度に流動性であるべきである。この組成物は製造および貯蔵の条件下で安定であるべきであり、細菌および真菌等の微生物の汚染作用に対して保護されるべきである。担体は、例えば水、エタノール、ポリオール(例えばグリセロール、プロピレングリコールおよび液体ポリエチレングリコールならびに同類のもの)ならびにそれらの適切な混合物を含む溶媒または分散媒であり得る。適切な流動性は、例えばレシチン等のコーティングの使用により、分散液の場合には必要な粒径の維持により、および界面活性剤の使用により維持され得る。微生物の作用の予防を、様々な抗微生物剤および抗菌剤、例えばパラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールおよび同類のものにより達成し得る。等張剤、例えば糖、多価アルコール、例えばマンニトール、ソルビトール、塩化ナトリウムもこの組成物に含まれ得る。この組成物に、モノステアリン酸アルミニウムまたはゼラチン等の吸収を遅延させる薬剤を含めることにより、注射用組成物の持続的吸収をもたらし得る。
必要に応じて上記に列挙した成分のうちの1つまたは組み合わせと共に適切な溶媒に必要量で活性化合物を組込み、続いて無菌ろ過することにより、無菌注射用溶液を調製し得る。一般に、塩基性分散媒および上記で列挙されたものからの必要な他の成分を含む無菌ビヒクルにポリヌクレオチドを組み込むことにより分散液を調製する。無菌注射用溶液の調製のための無菌粉末の場合には、適切な調製方法として真空乾燥および凍結乾燥が挙げられ、これらにより活性成分および無菌注射用溶液の予め無菌ろ過した溶液からの任意の追加の所望の成分の粉末が得られる。
経口組成物は概して、不活性希釈剤または食用担体を含む。経口治療投与の目的のために、本活性化合物に添加剤を組み込み、錠剤、トローチ剤またはカプセル剤(例えばゼラチンカプセル剤)の形態で使用し得る。経口組成物を、口腔洗浄薬としての使用のための流体担体を使用しても調製し得る。薬学的に適合性がある結合剤および/またはアジュバント材料を、この組成物の一部として含め得る。錠剤、丸剤、カプセル剤、トローチ剤および同類のものは、下記の成分または類似の性質の化合物のいずれかを含み得る:結合剤、例えば微結晶セルロース、タラカントガムもしくはゼラチン;添加剤、例えばデンプンもしくはラクトース、崩壊剤、例えばアルギン酸、PRIMOGELもしくはコーンスターチ;潤滑剤、例えばステアリン酸マグネシウムもしくはステローテ(sterotes);滑剤、例えばコロイド状二酸化ケイ素;甘味料、例えばスクロースもしくはサッカリン;または香味料、例えばペパーミント、サリチル酸メチルもしくはオレンジ香味料。
経鼻吸入による投与に適した製剤は、担体が固体である場合には例えば約20~約500ミクロンの範囲の粒径を有する粗粉末を含み、この粗粉末を、嗅ぎ薬を服用する方法で投与し、即ち、鼻のかなり近くで保持される粉末の容器から鼻腔を経由した急速の吸入により投与する。担体が噴霧器による投与のための液体である適切な製剤は、薬剤の水性または油性の溶液を含む。吸入による投与のために、薬剤を、適切な噴霧剤(例えば二酸化炭素等のガス)を含む加圧容器もしくはディスペンサまたは噴霧器からの液滴またはエアロゾールスプレーの形態でも送達し得る。そのような方法として、米国特許第6,468,798号明細書で説明されたものが挙げられる。
全身投与はまた、経粘膜的手段または経皮的手段によるものでもあり得る。経粘膜的投与または経皮的投与の場合、浸透させる障壁に適した浸透剤をこの製剤で使用する。そのような浸透剤は概して当分野で既知であり、この浸透剤として例えば、経粘膜投与の場合には、界面活性剤、胆汁塩およびフシジン酸誘導体が挙げられる。経粘膜投与を、経鼻スプレー剤、点滴剤または座薬の使用により達成し得る。経皮投与の場合、本活性化合物(例えば本発明のポリヌクレオチド)を、当分野で一般に知られているように軟膏、膏薬、ゲルまたはクリームに製剤化する。
本医薬組成物を、医薬製剤の当業者に公知の方法のいずれかにより調製し得る。一般に、この組成物を、インスリンアナログ、分子または化合物を液体担体もしくは微粉化固体担体または両方と均一にかつ密接に接触させることにより調製する。次いで、必要に応じて生成物を所望の製剤へと成形する。非経口投与の場合、一実施形態では、本発明のインスリンアナログ、化合物または分子を、単位投与注射形態(溶液、懸濁液または乳濁液)で所望の純度にて薬学的に許容される担体と混合することにより製剤化し得る。
いくつかの実施形態では、本医薬組成物は、本発明に係るインスリンアナログ、ペプチド、化合物または分子の治療上有効な量を含む。本発明の医薬組成物中の本発明のインスリンアナログ、ペプチド、化合物または分子の含有量は例えば、この医薬組成物の約0.1~約100重量/重量%である。
キット
上記で説明した材料および他の材料を、本開示の方法の実施にまたは本開示の方法の実施の補助に有用なキットとして任意の適切な組み合わせで一緒に包装し得る。所与のキット中のキット構成要素が本開示の方法での一緒の使用のために設計されていて且つ適合されている場合には有用である。開示されているのは、本開示のインスリンアナログのうちの1つまたは複数を含むキットである。例えば、開示されているのは、本開示のインスリンアナログ、ペプチド、化合物または医薬組成物のうちの1つまたは複数を含むキットである。
これより下記の実施例を参照して本発明のさらに説明するが、この実施例は一例にすぎず限定するものではない。この実施例は図面を参照する。
実施例1-Con-Ins G1のペプチド合成
Con-Ins G1の鎖Aおよび鎖Bの固相ペプチド合成
Con-Ins G1のA鎖およびB鎖の両方を、CEM Liberty 1自動マイクロ波ペプチド合成機(CEM Corporation,Matthews,NC)によりFmoc(9-フルオレンメチルオキシカルボニル)化学で合成した。A鎖の合成の場合には、予め充填したFmoc-Cys(Trt)-Rink Amide MBHA樹脂(0.21mmol/g)(Peptides International,Louisville,KY)を使用し、B鎖の合成の場合には、予め充填したFmoc-Arg(Pbf)-Wang樹脂(0.4mmol/g)(AnaSpec,EGT.,Freemont,CA)を使用した。側鎖保護を有するFmoc-Nα-保護アミノ酸は下記の商業的供給源由来であった:Bachem Inc.(Torrance,CA)、Chem-Impex International(Wood Dale,IL)、Genzyme(Cambridge,MA)、Novabiochem(San Diego,CA)、P3 Biosystem(Louisville、KY)およびReanal(Budapest、Hungary)。Fmoc-γ-カルボキシ-L-グルタミン酸γ,γ-ジ-t-ブチルエステル(Fmoc-Gla(OtBu)-OH)をインハウスで合成した(Rivier et al.1987)。このアミノ酸の側鎖保護は下記のとおりであった:Lys、tert-ブチルオキシカルボニル(Boc);Hyp、Ser、ThrおよびTyr、tert-ブチルエーテル(tBu);Asn、CysおよびHis トリチル(Trt);Arg 2,2,4,6,7-ペンタメチル-ジヒドロキシベンゾフラン-5-スルホニル(Pbf);Glu、GlaおよびAsp tert-ブチルエステル(OtBu);Cys、アセトアミドメチル(Acm);Cys、4-メトキシトリチル(Mmt);Cys、S-tert-ブチルチオニル(S-t-Bu)。
正確な分子内ジスルフィド結合および分子間ジスルフィド結合の作成を可能にするために、CysA7およびCysB7の側鎖保護基はAcmであり、CysA20およびCysB19の側鎖保護基はTrtであり、CysA11の側鎖をMmtで保護し、CysA6の側鎖をS-t-Buで保護した。両方の鎖を0.1mmolスケールで合成した。2分にわたり0Wにて、次いで10分にわたり60℃の最高温度で35WにてHATU[2-(1H-9-(アザベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチル-アミニウムヘキサフルオロホスフェート]:DIEA[N,N-ジイソプロピルエチルアミン]:AA[保護アミノ酸](0.9:2:1)により活性化し、DMFに溶解させた5倍モル過剰のFmoc-保護アミノ酸の存在下で、この樹脂に対してカップリング反応を実施した(NMP中のHisを除く)。Argを常に、25分にわたり室温で、次いで12分にわたり50℃の最高温度で15Wにて二重にカップリングさせた。Cys、HisおよびGlaを、6分にわたり50℃の最高温度で40Wにてカップリングさせた。2段階(各回で新鮮な試薬を使用する)でDMF中の0.1M HOBtを含む20%ピペリジンによりFmoc基の脱保護(35Wでの2分の最初の脱保護、続いて60℃の最高温度で35Wでの5分の脱保護)を実施した。
Con-Ins G1の鎖A:分子内ジスルフィド結合の形成、開裂および精製。
CysA6とCysA11との間の分子内ジスルフィド架橋を、非酸化的方法を使用してこの樹脂上に形成した(Galande et al.2005)。最初の工程では、室温で一晩、ジメチルホルムアミド(DMF)8mL中の20%メルカプトエタノール(ME)(Fluka)および1%N-メチルモルホリン(NMM)で樹脂(760mg)を処理することにより、遊離チオールを遊離させる還元によりCysA6のS-t-Buを除去した。この樹脂をDMFで洗浄し、次いで乾燥させた。次いで、この樹脂を1時間にわたりジクロロメタン(DCM)8mL中の10倍過剰の2,2’-ジチオビス(5-ニトロピリジン)(DTNB)約1mmol(Sigma-Aldrich,St Louis,MO)と反応させて、S-5-ニトロピリジン-スフェニル(5-Npys)保護CysA6を形成した。過剰の試薬をDCMで洗い流した後、この樹脂を20分にわたり捕捉剤としてのトリイソプロピルシラン(TIS)2μLの存在下でジクロロメタン(DCM)8mL中の1%トリフルオロ酢酸(TFA)で処理して、CysA11(Mm)を脱保護し、同時にCysA6とCysA11との間にジスルフィド架橋を形成した。
この樹脂を2時間にわたり(TFA/水/TIS:95:2.5:2.5)を含む試薬10mLと共に撹拌することにより、この樹脂(720mg)からの開裂および鎖Aの同時の脱保護を実施した。これに続いて、氷冷無水エチルエーテルを使用してペプチドを沈殿させ、次いで0.1%TFA/40%水/60%アセトニトリルで抽出して凍結乾燥させた。このペプチドを、流速20mL/分での60分にわたる5%~65%の溶媒Bの範囲の直線勾配による、溶媒系A:0.1%TFA/水、B:0.1%TFA/40%水/60%ACN中のBondapak C18(15-20μm粒径、300Å)を充填したWaters PrepPakカートリッジ(2.5×10cm)での分取Waters HPLC(Milford,MA)により精製した。鎖A 18.7mg(7.7μmol)を得た。このペプチドの質量を、ThermoScientific LTQ Orbitrap XL(Waltham,MA)機器で測定したエレクトロスプレーイオン化(ESI)-MSにより確認した(算出したモノアイソトピックMH+1:2422.03Da;測定したモノアイソトピックMH+1値2422.01Da)。
Com-Ins G1の鎖B:開裂および精製。
樹脂500mgを2時間にわたり(TFA/チオアニソール/3,6-ジオキサ-1,8-オクタンジチオール(3,6-Dioxa-1,8-octanedithol)(DODT,TCI America,Portland,OR)/水:87.5/5/2.5/5)を含む試薬10mLと共に撹拌することにより、この樹脂からの開裂および鎖Bの同時の脱保護を実施し、続いて氷冷無水エチルエーテルを使用してペプチドを沈殿させ、次いで0.1%TFA/40%水/60%ACNで抽出して凍結乾燥させた。このペプチドを分取HPLC(60分における20~80%の溶媒Bの範囲の勾配を除いて鎖Aの精製に関して説明したもの)で精製して、鎖B 25.9mg(9μmol)を得た。このペプチドの質量をESI-MSにより確認した(算出したモノアイソトピックMH+1値2868.24Da;測定したモノアイソトピックMH+1値2868.22Da)。
部分的に折り畳まれたCon-Ins G1(1個のジスルフィド結合を含む)を形成するための、DMSOに補助された鎖Aおよび鎖Bのライゲーション。
鎖Aおよび鎖B(それぞれ7μmol)を0.1%TFA/水溶液(7.1mL)に一緒に溶解させ、DMSO 14.5mL、水14.25mL、2mM EDTAを含む0.2M Tris、pH7.5 35.6mLの混合物に添加した。分析HPLCで酸化をモニタリングした。室温での25時間後、この反応を8%ギ酸(1mL)でクエンチし、225mLの総体積まで0.1%TFAで希釈し、60分における15~75%Bの範囲の勾配で分取HPLCにより精製した。ヘテロ二量体4.5mg(0.85μmol、7μmolの出発量に基づく12.1%収率)を得た。このペプチドの同一性をESI-MSにより確認した(算出したモノアイソトピックMH+1:5287.25Da;測定したモノアイソトピックMH+1:5287.19Da)。
完全酸化Con-Ins G1を形成するための、Iにより補助された酸化。
Con-Ins G1(部分的に折り畳まれている)4.5mg(0.85μmol)を2.5%TFA/水溶液6.2mLに溶解させ、I溶液55μL(MeOH 5mL中にI 50mg)を添加して60分にわたり撹拌した。この溶液の黄色が透明になるまで1Mアスコルビン酸溶液の添加によりクエンチした。この反応物を水60mLで希釈し、分取RP-HPLCカラムに充填した。完全酸化Con-Ins G1 1.5mg(0.29μmol)を得た(1個の鎖間ジスルフィド結合を含む部分的に折り畳まれた生成物の出発量に基づいて収率35%、および精製済鎖Aの出発量に基づいて4%)。このペプチドの同一性をThermoScientific LTQ Orbitrap XL(Waltham,MA)質量分析計でのESI-MSにより確認した(算出したモノアイソトピックMH+1:5143.16Da;測定したモノアイソトピックMH+1:5143.16Da)。
このペプチドの純度をRP-HPLCおよびキャピラリ電気泳動で評価した。GE Healthcare AKTApurifier 10(Pittsburgh,PA)およびPhenomenex(Torrance,CA)Kinetex XB-C18カラム(4.6×100mm、5.0μm粒径、100Å孔径)を使用して定量的RP-HPLCを実施した。溶媒系は、溶媒A=水中の0.1%TFAおよび溶媒B=60%ACN、40%Aを含んだ。勾配を、1.0mL/分の流速で30分にわたる20から80%へのBで実施した。検出は214nmおよび280nmであった。このペプチドの純度は89%であると決定した。Groton Biosystems GPA 100機器(Boxborough,MA)を使用してキャピラリ電気泳動(CE)を実施した。電気泳動緩衝液は0.1Mリン酸ナトリウム(15%アセトニトリル)、pH2.5であった。キャピラリ(0.75μm×100cm)への20kVの印加により分離を達成した。検出は214nmであった。評価したペプチドの純度は80%であった。
sCon-Ins G1の合成および精製。
A鎖中にCysA6、A11~SecA6、A11改変を含むCon-Ins G1(sCon-Ins G1と称する;Sec=セレノシステイン)をSafavi-Hemami et al.(2015)で説明されているように化学的に合成し、精製し、そして酸化したが、B鎖(2,980M-1・cm-1)および完全酸化sCon-Ins-G1(4,470M-1・cm-1)の定量に補正吸光係数(corrected extinction coefficient)を使用した。sCon-Ins G1に関して説明されているように(Safavi-Hemami et al.(2015))、sCon-Ins G1[GluA4,ProB3,GluB10]の合成を実施した。sCon-Ins G1[GluA4,ProB3,GluB10]のジスルフィド結合の段階的形成を下記で詳細に説明する。
sCon-Ins G1[GluA4]の鎖A:開裂、DTT還元および精製。
濃縮試薬K(TFA/水/フェノール/チオアニソール/1,2-エタンジチオール、体積で82.5/5.0/5.0/2.5)1mLを使用して1.5時間にわたり樹脂125mgからペプチドを開裂させ、この濃縮試薬Kを、TFA(Fisher Scientific,Fair Lawn,NJ)2mL、HO 66μL、2,2-ジチオビス(5-ニトロピリジン)(DTNP:Aldrich;Saint Louis,MO)12mgおよびフェノール150mgを使用して調製し、続いてチオアニソール25μLを添加した。この開裂混合物をろ過し、冷メチル-tert-ブチルエーテル(MTBE;Fisher Scientific,Fair Lawn,NJ)10mLで沈殿させた。粗ペプチドを6分にわたる7,000×gでの遠心分離により沈殿させ、冷MTBE 10mLで一回洗浄した。分子内ジセレニド結合形成(SecA6~SecA10)を誘導するために、洗浄したペプチドペレットを水中の50%ACN(Fisher Scientific;Fair Lawn,NJ)(体積/体積)および2mM EDTA(Mallinckrodt,St. Louis,MO)を含む0.2M Tris・HCl(Sigma,St Louis,MO)、pH7.5 1mL中の100mMジチオトレイトール(DTT、EMD Chemicals,Gibbstown,NJ)2mLに溶解させ、水1mLを添加し、緩やかにボルテックスし、この反応を2時間にわたり進行させた。次いで、この反応物を8%ギ酸(体積/体積)(Fisher Scientific,Fair Lawn,NJ)でクエンチし、水中の0.1%TFA(体積/体積)で希釈し、流速4mL/分で30分にわたる10~40%の溶媒Bの範囲の直線勾配で溶出させるセミ分取C18Vydacカラム(218TP510、250×10mm、5-μm粒径;Grace,Columbia,MD)を使用する逆相(RP)HPLCで精製した。HPLC溶媒は、水中の0.1%(体積/体積)TFA(溶媒A)および90%水性ACN(体積/体積)中の0.1%TFA(体積/体積)(溶媒B)であった。UV吸光度を220nmおよび280nmで測定して溶出液をモニタリングした。ペプチドの純度を、流速1mL/分による30分にわたる10~40%の溶媒Bの範囲の直線勾配を使用するC18 Vydacカラム(218TP54、250×4.6mm、5μm粒径、Grace,Columbia,MD)での分析RP-HPLCにより評価した。このペプチドを、1,490M-1・cm-1の吸光係数(ε)を使用して280nmでのUV吸光度により定量した。樹脂135mgから鎖A 3.8mgを得た。このペプチドの質量をエレクトロスプレーイオン化(ESI)-MSにより確認した(算出したモノアイソトピックMH+1:2,473.674;測定したモノアイソトピックMH+1 2,472.924)。ProteinProspector(バージョン5.12.1)を使用して分子量を算出した。
sCon-Ins G1[ProB3,GluB10]の鎖B:開裂および精製。
上記で説明したように、試薬K 1mLによる3時間の処理によって樹脂94mgからペプチドを開裂させ、続いてろ過し、沈殿させて洗浄した。洗浄したペプチドペレットを、勾配が15~45%の溶媒Bの範囲であることを除いて上記で説明したように精製した。同一の勾配を使用して上記で説明したように線状ペプチドの純度を評価し、ペプチド定量を、2,980M-1・cm-1のε値を使用して実行した。開裂樹脂94mgから鎖B 2.37mgを得た。このペプチドの質量をESI-MSで確認した(算出したモノアイソトピックMH+1:2,808.24、測定したモノアイソトピックMH+1:2,808.25)。
sCon-Ins G1[GluA4,ProB3,GluB10]を形成するための、銅により補助された鎖Aおよび鎖Bのライゲーション。
各鎖の合計100nmolを組み合わせ、SpeedVacを使用して乾燥させた。このペプチド混合物を0.1%TFA(体積/体積)100μLに溶解させ、CuCl・HO(J.T.Baker,Phillipsburg,NJ)800μL、10nM EDTAを含む1M Tris・HCl、pH7.5 100μLの混合物に添加した。最終ペプチド濃度は100μMであった。この反応物を室温で24時間放置し、次いで8%ギ酸(体積/体積)でクエンチし、0.1%TFAで希釈し、流速4mL/分で30分にわたる15~45%の溶媒Bの範囲の直線勾配で溶出させる分取C18 Vydacカラムを使用するRP-HPLCにより精製した。sCon-Ins G1の純度を、流速1mL/分でセミ分取精製の場合と同一の勾配を使用する分析RP-HPLCにより評価した。sCon-Ins G1[GluA4,ProB3,GluB10]を、4,470M-1・cm-1のε値を使用して280nmで定量した。反応収率は28%であった。鎖Aおよび鎖Bの1:1混合物900nmolから所望の生成物1.36mgを得た。ペプチドの同一性をESI-MSで確認した(算出したモノアイソトピックMH+1:5,278.15;測定したモノアイソトピックMH+1:5278.15)。
完全に折り畳まれたsCon-Ins G1[GluA4,ProB3,GluB10]のヨウ素(I)により補助された形成。
(Acros Organics,Geel,Belgium)の溶液を下記のように調製した:I 10mgをACN 5mLに添加した。20分の撹拌後、Iを完全に溶解させ、水15mLおよびTFA 600μLを添加した。このI混合物の合計300μLを、それぞれ0.1%TFA 300μLに溶解させた、部分的に折り畳まれたsCon-Ins G1[GluA4,Cys(Acm)7,ProB3,C(Acm)B7,GluB10]149nmol(90%純度)および106nmol(72%純度)に添加した。反応物を5分にわたりインキュベートし、1M L-アスコルビン酸(Sigma,St.Louis,MO)10μLでクエンチし、4.5mLの総体積まで水中の0.1%TFAで希釈し、部分的に折り畳まれたsCon-Ins G1[GluA4,ProB3,GluB10]に関して説明したように精製した。最終生成物(完全に折り畳まれたsCon-Ins G1[GluA4,ProB3,GluB10])の純度を、流速1mL/分でセミ分取精製の場合と同一の勾配を使用するC18 Vydacカラム(218TP54、250×4.6mm、5μm粒径)での分析RP-HPLCにより評価し、97%であると決定した。sCon-Ins G1[GluA4,ProB3,GluB10]を、部分的に折り畳まれた生成物に関して説明したように定量した。この反応の収率は14%であり、所望の生成物0.18mgを得た。このペプチドの同一性をESI-MSで確認した(算出したモノアイソトピックMH+1:5,134.84;測定したモノアイソトピックMH+1:5,134.07)。
hIns[DOI]およびhIns[TyrB15,TyrB20,DOI]の合成および精製
hIns[DOI]は、ヒトインスリンのB鎖の残基23~30を欠く単量体アナログである。hIns[DOI]およびhIns[TyrB15,TyrB20,DOI]を標準的な手順に従って化学的に合成し、精製し、そして酸化させた。
実施例2-Con-Ins G1ヒトインスリンレセプター結合およびシグナル伝達活性化
インスリンレセプター結合。
Con-Ins G1がヒトインスリンレセプター(hIR)に結合する能力を結合競合アッセイにより測定した。既に説明されているように(Denley et al.2004)、ユーロピウム標識ヒトインスリンおよび漸増濃度の毒液インスリンを含む可溶化免疫捕捉ヒトIR(アイソフォームB)を使用して競合結合アッセイを実施した。時間分解された蛍光を、Polarstar Fluorimeter(BMGLab Technologies,Mornington,Australia)により、340nm励起フィルタおよび612nm発光フィルタを使用して測定した。非線形回帰(1サイト)(one-site)分析による曲線の当てはめにより、Prism 6を使用してIC50値を算出した。1つのデータポイント当たり3回の反復で少なくとも3つのアッセイを実施した。
C.ジオグラフス(C.geographus)毒液インスリンsCon-Ins G1は、hInsのArgB23~ThrB30に相当するものをいずれも欠いているにもかかわらず、hInsと比べてヒトIR-Bレセプターに対して活性が30倍低いだけであることが分かった(sCon-Ins G1:log[IC50(nM)]=1.24±0.06;hIns:log[IC50(nM)]=-0.26±0.02)(図1および図2)。
インスリンシグナル伝達活性化アッセイ.
Con-Ins G1がインスリンシグナル伝達を誘導する能力をAktリン酸化分析により評価した。簡潔に言うと、ヒトIR-Bを過剰発現するマウス線維芽細胞株NIH 3T3でpAkt Ser473レベルを測定した。この細胞株を、10%ウシ胎仔血清(FBS)、100U/mLペニシリン-ストレプトマイシンおよび2μg/mLピューロマイシンを含むDMEM中で培養した。このアッセイのために、1ウェル当たり40,000個の細胞を、1%FBSを含む培養培地が入った96ウェルプレートに蒔いた。24時間後、元々の培地の除去後に各ウェルにインスリン溶液50μLをピペットで入れた。30分の処理後、このインスリン溶液を除去し、HTRF pAkt Ser473キット(Cisbio,Massachusetts,USA)を使用してpAkt Ser473の細胞内レベルを測定した。簡潔に言うと、この細胞を穏やかに振盪しつつ1時間にわたり細胞溶解緩衝液(1ウェル当たり50μL)で最初に処理した。次いで、細胞溶解物16μLを白色384ウェルプレート中の検出試薬4μLに添加した。4時間のインキュベーション後、このプレートをSynergy Neoプレートリーダー(BioTek,Vermont,USA)で読み取り、製造業者のプロトコルに従ってデータを処理した。このアッセイを合計で4回繰り返した。非線形回帰(1サイト)分析による曲線の当てはめにより(Prism 6を使用して)EC50値を算出した。
Aktリン酸化アッセイではCon-Ins G1がhInsと比べて活性が約10倍低いだけであることが分かった(sCon-Ins G1:log[EC50(nM)]=0.90±0.05;Con-Ins G1:log[EC50(nM)]=0.78±0.15;hIns:log[EC50(nM)]=-0.20±0.20;図3)。本発明者らの結果は、毒液タンパク質が基準の芳香族トリプレットまたは全体としてのB鎖C末端セグメントのいずれかに相当するものを欠いているにもかかわらず、強力な活性を可能にする構造モチーフのCon-Ins G1内での存在を強調する。
実施例3-Con-Ins G1の結晶構造
結晶化およびデータ収集。
Con-Ins G1を上記で説明したように合成した。Con-Ins G1を、4mg/mLの濃度での10mM HCl中における結晶化のために調製した。
最初の結晶化試験は、CSIRO Collaborative Crystallisation Centre(Parkville,Australia)で実行するロボット192条件低密度マトリックス懸滴スクリーン(robotic 192-condition sparse-matrix hanging-drop screen)を用いた。2,0M硫酸アンモニウムおよび10%DL-リンゴ酸塩-MES-Tris(pH9.0)を含む条件から単結晶を抽出し、次いでAustralian SynchrotronでのMX2ビームライン
Figure 2022191233000001

による100Kでの回折データ収集のために低温ループ(cryo-loop)で直接マウントした(低温保護剤(cryo-protective agent)なし)。XDSを使用してデータを1.95Åの分解能に処理した(Kabsch(2010))。空間群は、単位格子寸法a=b=c=74.91ÅであるP432である。1個の単量体当たり5143Daの見掛け上の分子量および非対称単位当たり1分子から、溶媒含有量は64%と推定される。
構造の解明および精密化
開始モデルとしてPDBエントリー3I3Zからのインスリン単量体を使用し且つPHASERソフトウェアを使用して、分子置き換えにより構造を解明した(McCoy et al,2007)。結晶学的精密化は、COOT(Emsley and Cowtan,2004)内でのモデル構築で反復されるPHENIX(Adams et al.2010)を用いた。4回転軸付近で観測した単一の硫酸イオンを、この硫酸イオンの配向または位置を制限することなくモデル化し、この硫酸イオンの占有率を0.25ではなく1に設定することによりPHENIXでもたらされた。データ処理および精密化統計を表1に示す。最終モデルは0.208/0.217のRwork/Rfreeを有した。この最終モデルでの全ての残基はRamachandranプロットの好ましい領域にある。
Figure 2022191233000002
実施例4-Con-Ins G1の構造
この構造から、Con-Ins G1全体の二次構造はhInsの二次構造と類似していることが明らかとなり、B鎖のN末端残基は古典的なT状態のhInsのN末端残基と類似の伸長経路をたどる(図4a)(このT状態は、伸長した立体配座中である残基B1~B8を特徴とし、A鎖のらせん状集合体に対して折り返されている)。hIns B22~B30に相当する残基が存在しないことから予測されるように、結晶学的単位格子内にはhIns二量体界面に類似する界面が存在しない。結晶内の全ての単量体-単量体界面はまばらであり、4回転軸の周りに充填されたCon-Ins G1単量体の間に形成されたものを除いて、それぞれが分子表面の約440Åを埋める。4個の単量体は4回転軸付近にある見掛け上の硫酸イオンを配位させ、この硫酸イオンはGlyA1のアミドおよび各GlaA4の単一の側鎖カルボキシレート基と荷電補償クラスタの一部を形成する(図5)。下記の沈降平衡データに基づいて、本発明者らは、この会合は結晶化のアーチファクトであるとの結論を下す。
Con-Ins G1の疎水性コアは残基ValA2、CysA6、CysA11、PheA16、TyrA19、ArgB6、IleB11、TyrB15およびLeuB18の側鎖を含む(図4b)。これらのうち、3つはヒトインスリンで同一であり(CysA6、CysA11およびTyrA19)、3つは控えめに異なり(ValA2→Ile、IleB11→LeuおよびLeuB18→Val)、3つは著しく異なる(ArgB6→Leu、PheA16→LeuおよびTyrB15→Leu)。hInsでは、Con-Ins G1中のTyrB15に相当するLeuB15はコアに対して部分的に且つhIns PheB24の側鎖に対して部分的に入り、Tyr残基による置換により、hIns PheB24に相当するものの非存在下でCon-Ins G1単量体の露出した疎水性表面が若干減少する。(hIns LeuA16の側鎖と比較して)Cons-Ins G1 PheA16の嵩高い側鎖はTyrB15での変化と関連しているように思われ、TyrB15の側鎖はそのhIns対応物と比較してタンパク質のコアからさらに離れており、(より大きい)PheA16芳香環は充填の観点からこれを補う(図4b)。
実施例5-相同性モデリングおよび分子動力学
重要なレセプター結合残基hIns PheB24に相当するものの非存在下での脊椎動物インスリンレセプターに対するCon-Ins G1活性を可能にする構造原理への洞察を得るために、本発明者らは、ホルモンへの主要な結合部位を形成するヒトインスリンレセプター(hIR)の要素に結合したCon-Ins G1のモデルを作成した。IR L1-CRモジュール(残基Gly5~Lys310)およびIR αCTセグメント(IR-Aアイソフォームの残基Phe705~Ser719)と複合体化したCon-Ins G1のモデルをMODELLER(v9.15)(Webb and Sali,(2014))を使用して作成し、テンプレートは、Con-Ins G1の上記の結晶構造、hInsと複合体化したIR部位1構成成分の結晶構造(PDBエントリー4OGA;Menting et al.2014)およびインスリンのA鎖のNMR構造(PDBエントリー2HIU;Hua et al.1995)であった。全てのモデルは、Con-Ins G1の翻訳後改変ならびにIR残基Asn16、Asn25、Asn111、Asn215およびAsn255のそれぞれでの単一のN連結N-アセチル-D-グルコサミン残基を含んだ(Sparrow et al.2008)。
分子動力学(MD)シミュレーションは、CHARMM36力場(Guvench et al.2011;Best et al.2012)を有するGROMACS(v5.0.4)(Pronk et al.2013)を用い、モデラー目的関数が最も低いCon-Ins G1/IR複合体のモデルでこのシミュレーションを開始した。カルボキシグルタミン酸等のイオン化可能残基はその荷電状態にあると仮定した。各系を、全原子を超えて10Å延びる立体ボックス中でTIP3P水モデルを使用して溶媒和した。ナトリウムイオンおよび塩化物イオンを添加して、系を中和して0.1Mの最終イオン強度を付与した。タンパク質および溶媒(イオンを含む)を、0.1psのカップリング時間を適用した300Kで熱浴に速度再スケーリング(velocity rescaling)しつつ別々にカップリングした。全てのシミュレーションを、10Åの単一非結合カットオフにより、および25ステップ(50fs)の近傍リスト更新頻度のVerlet近傍探索カットオフスキーム(Verlet neighbour searching cut-off scheme)を適用して実施し、全てのシミュレーションで使用する時間ステップは2fsであった。
1.2Åのグリッド幅および6次スプライン補間を適用して、長距離静電学を説明するために使用した粒子メッシュEwald法と共に周期的境界条件を使用した。P-LINCSアルゴリズムを使用して全ての結合長を制限した。シミュレーションは、最初の最小化およびその後の全てのタンパク質原子が拘束された50psのMDからなった。位置が拘束されたMDに続いて、MDシミュレーションを、αCTのC末端残基(残基Val715~Ser719)を除いてIRのCα原子に位置の拘束を適用してさらに10nsにわたり継続した。Cα原子が拘束されたMDに続いて、このシミュレーションをさらに50nsにわたり拘束することなく継続した。最終モデルの座標を付録IIに示す。
TyrB15
このモデルから現れる顕著な特徴は、hIR αCT残基Phe714との立体衝突を回避するために、本発明者らの結晶構造においてCon-Ins G1 TyrB15の側鎖がこのTyrB15の立体配座に関して回転していることである。この回転は、Con-Ins G1 TyrB15の側鎖をレセプター複合体中においてhIns PheB24に占められているポケットへと方向付け、そのためCon-Ins G1 TyrB15はレセプター結合に関してhIns PheB24の代わりであることが示唆される(図6)。TyrB15側鎖のそのような回転はまた、重要なhIR αCT残基Phe714が毒液タンパク質コアと結合することも可能にする(図6)。対照的に、脊椎動物のインスリンはB15位でロイシンを有し、このロイシンは厳密に保存されている。
TyrB20
Con-Ins G1 TyrB20の側鎖はCon-Ins G1 TyrB15の側鎖に隣接しており、hInsPheB24に相当するものの欠如の補償にも関与し得る。本発明者らは、TyrB15側鎖と関連する結晶学的に異なる電子密度はいくらか不十分に定義されており、そのような可動性に対応することに留意する(図7)。対照的に、脊椎動物のインスリンはB20位でグリシンを有し、このグリシンは厳密に保存されている。
PTM
Con-Ins G1は下記の4種の翻訳後改変(PTM)を含む:残基A4およびB10は、hIns中のGluおよびHisとは(それぞれ)対照的にγ-カルボキシグルタメート(Gla)であり、残基B3はhIns中のAsnとは対照的にヒドロキシプロリン(Hyp)であり、A鎖C末端残基CysA20はアミド化されており(図1)、Con-Ins G1B鎖のナンバリングは、hInsとの比較を可能にするために-1で始まることに留意されたい。そのような改変はコノトキシンで一般に観測されるが、インスリンではこれまで検出されていない(Safavi-Hemami et al.2015)。PTMを含むCon-Ins G1の合成アナログはPTMフリーのアナログと比べてヒトIR-Bに対して活性が4倍高く(図2)、PTMフリーのアナログと比べて8倍高い効率でAktリン酸化を誘導した(図3)。
Con-Ins構造内の4種のPTMの調査により、CysA20のアミド化を除いて全てがCon-Ins G1の構造の安定化で役割を果たす可能性があることが明らかになる。GlaA4の両方の側鎖のカルボキシレートは、hIns GluA4の単一の側鎖のカルボキシレートと同様にGlyA1のN末端アミノ基と極性相互作用している(図4c)。Con-Ins G1におけるこれらのさらなる相互作用は、短いA鎖N末端ヘリックスの安定化を補助し得る。GlaB10の一方の側鎖のカルボキシレート基はCysB7の主鎖アミドへの水素結合を形成し、B鎖N末端領域の安定化で役割を果たし得、hIns内に同等の相互作用は存在せず、hIns HisB10は六量体形成に関与している(図4d)。HypB3の側鎖ヒドロキシル基はhIns AsnB3の側鎖アミド酸素に同等に位置し、SerA12の主鎖アミドへの(長い)H結合を形成し得る(図4e)。CysA20のC末端アミドは毒液タンパク質の残部と相互作用しない。
実施例5で示されたモデル内で、レセプターと相互作用する唯一のPTM残基はGlaB4であり、その相互作用はhIns GluB4およびαCT Asn711の間のものと同等である(図8)。
実施例6-hIns G1 DOI L15Y.G20Yシグナル伝達活性化
上記で説明したように、hIns[DOI]およびhIns[TyrB15,TyrB20,DOI]のインスリンシグナル伝達を誘導する能力をAktリン酸化分析により評価した。簡潔に言うと、ヒトIR-Bを過剰発現するマウス線維芽細胞株NIH 3T3でpAkt Ser473レベルを測定した。この細胞株を、10%ウシ胎仔血清(FBS)、100U/mLペニシリン-ストレプトマイシンおよび2μg/mLピューロマイシンを含むDMEM中で培養した。このアッセイのために、1ウェル当たり40,000個の細胞を、1%FBSを含む培養培地が入った96ウェルプレートに蒔いた。24時間後、元々の培地の除去後に各ウェルにインスリン溶液50μLをピペットで入れた。30分の処理後、このインスリン溶液を除去し、HTRF pAkt Ser473キット(Cisbio,Massachusetts,USA)を使用してpAkt Ser473の細胞内レベルを測定した。簡潔に言うと、この細胞を穏やかに振盪しつつ1時間にわたり細胞溶解緩衝液(1ウェル当たり50μL)で最初に処理した。次いで、細胞溶解物16μLを白色384ウェルプレート中の検出試薬4μLに添加した。4時間のインキュベーション後、このプレートをSynergy Neoプレートリーダー(BioTek,Vermont,USA)で読み取り、製造業者のプロトコルに従ってデータを処理した。このアッセイを合計で4回繰り返した。非線形回帰(1サイト)分析による曲線の当てはめにより(Prism 6を使用して)IC50値を算出した。
Aktリン酸化アッセイではhIns[TyrB15,TyrB20,DOI]がhIns[DOI]と比べて活性が約5倍高いことが分かった(図9)。本発明者らの結果は、ヒトインスリンB鎖の15位および20位での変異の8個のC末端残基の欠如を少なくとも部分的に補償する能力を強調する。
実施例7-Con-Ins G1の溶液特性
沈降平衡分析を使用して、100μg/mLでの溶液中におけるCon-Ins G1の自己会合状態を分析した。簡潔に言うと、分析的超遠心分離を、12mm路長セルでBeckman XLI分析的遠心分離機を使用して20℃で実行した。Con-Ins G1を、10mg/mLストックから、100μg/mLの最終濃度まで10mM HClで10mM Tris、50mM NaCl、pH7.4に希釈した。等体積の10mM NaOHを添加して任意のpH変化を中和した。100μLの総試料体積を使用した。0.2mM ZnCl、2mM CaCl、1mMリン酸ナトリウム(pH7.4)または0.1M硫酸アンモニウムを含む同一の試料も調製した。放射状の濃度分布を220nmでの吸光度により測定した。1時間間隔での連続吸光度走査により評価した場合、30,000rpmおよび45,000rpmで沈降平衡を確立した。両方の速度でのデータを、SEDNTERP(Laue et al.1992)を使用して組成から推定される溶液密度および溶媒部分比体積の値を使用して、SEDPHAT(Houtman et al.2007)における単一の理想的な沈降物種に一緒にフィットさせた。ジスルフィドを除いて、全ての翻訳後改変をCon-Ins G1部分比体積の推定において無視した。報告した誤差は0.68信頼水準でのフィットの精度を説明し、この誤差を、SEDPHATで実行されるようにMonte Carloシミュレーションから推定した。
データ(30,000rpmおよび45,000rpmで得た)は、見掛け上のMW 5380±55g/molの単一の沈降種であるCon-Ins G1により十分に説明される(図10)。フィットは良好であるが(減少(reduced)X=0.95)、最良フィット質量は予想よりもわずかに高い。このことは、存在する翻訳後改変を無視して本発明者らがアミノ酸組成から決定したタンパク質部分比体積の不正確な推定を反映すると思われる。しかしながら、予測した質量のこの増加は、存在する少量のより高い分子量種の結果である可能性がある。最大でも、これは5%の二量体Con-Ins G1の存在に相当するだろう。5143の算出した理論質量に基づいて、本発明者らは、Con-Ins G1が溶液中で主に単量体であるとの結論を下す。従って、Con-Ins G1の単量体の性質は、この単量体にはインスリンのオリゴマー化に重要であることが示されているヒトインスリン鎖BのC末端部分(アミノ酸B22~B30)に相当するものが欠如していることと一致している。
本発明者らはまた、Zn2+、Ca2+、SO 2-またはPO 3-がCon-Ins G1の凝集状態を変更するかどうかも試験し、具体的には、Zn2+の場合には、このイオンがhInsの場合と同様にCon-Ins G1の多量体化を媒介し得るかどうかを試験し、SO 2-の場合には、このイオンが、結晶中に観測される四量体配置の媒介に関与し得るかどうかを試験した。これらのそれぞれのイオンの存在下で同様の沈降平衡プロファイルを観測し、単一の沈降種により同様に十分に説明され、見掛け上のMWの有意な変化を伴わない(データを示さない)。従って、本発明者らは、少なくとも最大100μg/mLの濃度でこれらのイオンのそれぞれの存在下にてCon-Ins G1は主に単量体のままであるとの結論を下す。
実施例8-レセプターの一次ホルモン結合部位を再構成するヒトインスリンレセプター断片と複合体化したCon-Ins G1の結晶構造
結晶化およびデータ収集。
ヒトインスリンレセプター(hIR)の一次インスリン結合部位(「部位1」)を、最小化され且つインスリンまたはインスリンアナログと部位1との相互作用の結晶学的分析に適したドメインに再作成し得る(Menting et al.2013)(Lawrence et al.2016)。このプロセスに不可欠なのは、結晶化を補助するためのモノクローナル抗体83-7(Soos et al.1986)の断片のレセプター断片のCRドメインへのさらなる付着である。この技術を使用して、hIR部位1を再作成する元素と共複合体化したCon-Ins G1の結晶を生成した。
実施例1で説明したようにCon-Ing G1を合成した。Con-Ins G1を10mM HClに再懸濁させた。
hIR構築物IR310.T(即ち、hIRの残基1~310および続いてトロンビン開裂部位のN末端残遺物Leu-Val-Pro-Argおよび集合バリアント(population variant)Tyr144Hisの包含)を、Menting et al.2013で説明されているように製造して精製し、モノクローナル抗体83-7(Soos et al.1986)の可変ドメインモジュールであるFv83-7を(Lawrence et al.2016)で説明されているように製造して精製した。次いで、IR310.TをFv83-7と複合体化させ、この複合体をLawrence et al.2016で説明されているように精製した。次いで、このFv83-7.IR310.T複合体を、Lawrence et al.2016で説明されているようにエンドグリコシダーゼH処理に供した。
Genscript(USA)との契約の下でhIRのAアイソフォームのペプチドIR-A704-719を合成した。
レセプターの一次ホルモン結合部位を再構成するヒトインスリンレセプター断片と複合体化したCon-Ins G1を、表2に示すEndoH-処理Fv83.7.IR310.T、IR-A704-719およびCon-Ins G1を組み合わせることにより調製した。
Figure 2022191233000003
最初の結晶化試験は、CSIRO Collaborative Crystallisation Centre(Parkville,Australia)で実行するロボット576条件低密度マトリックス座滴スクリーン(robotic 576-condition sparse-matrix sitting-drop screen)を用いた。各滴は1:1 ウェル:複合体体積比を含んだ。結晶の成長を、1.8~2.0M 硫酸アンモニウムまたは1.8~2.0M 硫酸アンモニウムと、0.1M Tris-HCl、pH7.5;MOPS-NaOH pH7.0およびMES-NaOH、pH6.5のいずれか1つとを使用して観察した。
結晶化条件を最適化し、同一のタンパク質:ペプチド:Con-Ins G1混合物の単結晶を、Linbro 24プレート中で懸滴フォーマットを使用して、ならびに1.8~2.0M 硫酸アンモニウム、または1.8~2.0M 硫酸アンモニウム、0.1M Tris-HCl、pH7.5からなるリザーバー緩衝液を使用して成長させた。他の緩衝液(例えば、MOPS-NaOH pH7.0およびMES-NaOH、pH6.5)も試験し、同様に回折結晶が生成された。1.7M 硫酸アンモニウム、50mM MOPS-NaOH pH7.0の溶液中で成長させた単結晶から最良の回折データを得た。
IR-A704-719およびEndoH-処理Fv83.7.IR310.T複合体と共複合体化したCon-Ins G1の単結晶を、リザーバー緩衝液および30%グリセロールからなる溶液に移して低温ループに抽出することにより低温保護した。次いで、このループを液体窒素浴に直接投入した。3.25Å分化能までの回折データを、Australian Synchrotron(Melbourne,Australia)でビームラインMX2にて収集した。XDSパッケージ(Kabsch,2010)を使用してデータを統合して結合し、データ処理統計を表3に示す。空間群は、単位格子寸法a=106.16、b=227.12およびc=228.70ÅのI222である。1個の複合体当たり63440Daの見掛け上の分子量および非対称単位当たり2個の複合体から、溶媒含有量は77%と推定される。
構造の解明および精密化
PHASER(McCoy et al.2007)を使用する分子置き換えにより構造を解明し、探索モデルとしてPDBエントリー40GAの単一Fv83-7.IR310.T成分を用いた(Menting et al.2014)。非対称単位中には2個のコピーがあった。Con-InsG1の2個のコピー(IRの2個のそれぞれのL1+IR-A704-709断片に別々に結合している)に対応する電子密度が差電子密度マップ中に現れた。次いで、Con-Ins G1の残基をこの電子密度に客観的に組み込んだ。X線結晶学的精密化はPHENIX(Adams et al.2010)を用いた。精密化の最終段階は、TLS精密化、個々のB因子精密化の制限、およびねじれNCS制限を含んだ。最終の精密化統計を表3に示す。最終モデルは、表4で詳述する残基を含んだ。
Figure 2022191233000004
Figure 2022191233000005
実施例9-ヒトインスリンレセプター断片と複合体化したCon-Ins G1
結晶学的非対称単位内のこの複合体の2個のコピーは全体構造においてほんのわずかな差違しか示さず(図11)、そのため、ここでの説明は複合体1に限定されるだろう。
Con-InsG1複合体の結晶構造と、Fab83-7.IR310.TおよびIR-A704-719(PDBエントリー4OGA;Menting et al.2014)との共複合体中のhInsの結晶構造との重ね合わせを図12に示す。ヒトインスリンレセプター断片と複合体化したCon-Ins G1の全体構造は、IR310.T、IR-A704-719およびFab83-7と複合体化したhInsの構造内の同等の部分構造の全体構造と類似している。顕著な差違は、Con-InsG1複合体の場合に、解釈可能な電子密度がCon-Ins G1 B7に対してN末端の3個の残基について明らかであった。そのため、最終モデルはCon-Ins G1残基B4、B5およびB6を含む。対照的に、ヒトインスリン共複合体構造では、hInsのB鎖は、C末端方向で前方の残基B7からのみモデル化される可能性がある。
図13は、ここで決定されたCon-Ins G1複合体の構造と、IR310.T、IR-A704-719およびFab 83-7と複合体化したヒトインスリンの構造との重ね合わせを示し、Con-Ins G1の残基TyrB15に焦点を合わせる。明らかなように、TyrB15の側鎖は、そのレセプターフリーの位置から回転して、ヒトインスリン複合体中においてhIns PheB24の側鎖に占められている同じ位置に配置される。この複合体構造は、TyrB15がPheB24の欠如の補償に役立つという実施例5の結論を支持する。Con-Ins G1 TyrB20に関しては、解釈可能な電子密度は存在しない。
実施例10-ヒトインスリンレセプターの一次結合部位(部位1)を含む構成成分によるhIns[DOI]、hIns[TyrB15,DOI]およびhIns[TyrB20,DOI]の分子モデリング
IR L1ドメイン(残基Gly5~Cys155)およびIR-A705-714と複合体化したデス-オクタ-インスリン(hIns[DOI]:B鎖の8個のC末端残基を欠くヒトインスリン)のモデルを、ヒトインスリン(hIns)と複合体化したIR部位1構成成分の結晶構造(PDBエントリー4OGA;Menting et al.2014)およびインスリンのA鎖のNMR構造(PDBエントリー2KJJ)を使用してMODELLER(v9.16)(Webb&Sali,2014)により作成した。全てのモデルは、IR残基Asn16、Asn25およびAsn111のそれぞれで単一のそれぞれのN-連結N-アセチル-D-グルコサミン残基の翻訳後改変を含んだ。
GROMACS(v5.1.2)(Abraham et al.2015)プログラム一式、およびMODELLER目的関数が最も低いhIns[DOI]-IR複合体のモデルで開始されるCHARMM36(Guvench et al.2011;Best et al.2012)力場の修正バージョンを使用して、分子動力学(MD)シミュレーションを行った。周期的境界条件を全ての軸に沿って使用して、各系を、全原子を超えて10Å延びるTIP3P単一点水モデル溶媒和立体ボックスに入れた。イオン化可能残基はその荷電状態にあると思われ、系を中和して十分なナトリウムイオンおよび塩化物イオンを添加することにより0.1Mの最終イオン強度を得た。速度再スケーリング(Bussi et al.2007)、300Kでのサーモスタットに独立してカップリングさせたタンパク質および溶媒を用いて2つの群で温度カップリングを行い、両方の群は0.1psの時間定数を用いた。1バールの参照圧力および0.5psの時間定数を使用してBerendsen(Berendsen et al.1984)技術により等方圧カップリングを実施した。全てのシミュレーションを、1.0Åのグリッド幅および6次スプライン補間で粒子メッシュEwald法(Essmann et al.1995)を使用するために説明される長距離静電学により、普遍的な12Å非結合相互作用カットオフで実施した。Verlet近傍探索カットオフスキームに25ステップ(50fs)の近傍リスト更新頻度を適用し、全てのシミュレーションで使用する時間ステップは2fsであった。P-LINCSアルゴリズム(Hess,2008)により全ての結合長を制限した。シミュレーションは最初の最急降下最小化およびその後の全てのタンパク質原子が拘束された50psのMDを経験した。位置的に拘束されたMDに続いて、MDシミュレーションをさらに100nsにわたり継続した。
100ns MD後にFoldXプロブラム一式(Schymkowitz,et al.2005)を使用してインスリンアナログとレセプターとの相互作用の分析を行った。FoldX RepairPDBユーティリティを使用して構造に不合理なねじれ角やファンデルワールス衝突がないことを確実にした後に位置走査を実行し、hIns[DOI]の各部位での得られた変異ΔΔGの寄与を示す。
デス-オクタ-インスリン(hIns[DOI])
hIns[DOI]により生じる相互作用は、天然hInsとレセプターとのX線結晶構造(PDBエントリー4OGA)で観測されるインスリンとレセプターとの間の界面での類似の相互作用(特に、Bドメイン残基ValB12、LeuB15およびレセプター残基Asn15、Leu37、Phe39およびPhe714により作成される疎水性ポケット内で生じた相互作用)を保つ。B鎖C末端残基の非存在により、B鎖ヘリックスはもはや巻き戻さず、その結果、ArgB22とGluA17との間に一時的な塩架橋が生じる。このことはまた、B鎖ヘリックスがシフトしてIR-L1にさらに近づくことも可能にし、その結果、TyrB16とIR-L1 Tyr67との間にπ-π平行置き換えスタッキング(parallel displaced stacking)が生じる。この最終モデルを図14に示す。
デス-オクタ-インスリン-TyrB15(hIns[TyrB15,DOI])
100nsの期間にわたりhIns[TyrB15,DOI]により観測される相互作用は、hIns[DOI]により生じた相互作用と類似している。B鎖ヘリックスは、TyrB16とIR-L1 Tyr67との間で同様のπ-πスタッキングを有するIR L1ドメインにより近いシフトを反映する。C末端B鎖残基の柔軟性は同様に、ArgB22とGluA17との間の一時的な塩架橋を可能にする。B15位でのTyrの存在は、そうでなければhIns LeuB15に占められる空間を占めるDOI-(IR-A704-719)-L1界面の疎水性コアへと突出する。最終モデルを図15に示す。
デス-オクタ-インスリン-TyrB20(hIns[TyrB20,DOI])
最初の比較モデルは、TyrB20がhIns PheB24結合部位を確実に占有するための制限を含んだ。100nsのMDの後、TyrB20はhIns PheB24結合部位中に残り、レセプターとの他の全ての相互作用は天然様に見えた。hIns[DOI]とは異なり、TyrB16とIR L1 Phe39との間の天然のπ-π平行置き換えスタッキングは維持されたが、ArgB22とGluA17との間でB鎖C末端残基の欠如により引き起こされる塩架橋はhIns[DOI]で観測したものと同じであった。最終モデルを図16に示す。
FoldX変異位置走査分析
FoldX位置走査ユーティリティは、変異に適応し得るhIns[DOI]内の位置および適応し得ない位置に関する定性的解釈を提供する(図17、図18および図19)。hIns[DOI]内およびhIns[TyrB20,DOI]内では、A鎖内の溶媒露出残基(特に残基GluA4、GlnA5およびThrA8)は、ほとんどの変異に対して少しの正味の正または負の効果を示す。このことは、代わりにこれらの残基の変異に対して正の影響を提示したhIns[TyrB15,DOI]アナログとは異なる。相互作用面にて疎水性コア内で起こる変異は当然のことながら、全てのモデルによってより大きな効果を示唆するように見え、全てのモデルは、ジスルフィ結合したシステインが有意なΔΔGアドバンテージを受け得ることを示唆したが、ジスルフィド相互作用がこのアナログの全体構造に対して重要であることから、このデータを除いた。残基TyrA14、AsnA18、HisB5およびGluB21での変異は、DOI-TyrB20アナログにおいてこれらの位置での変異が有利であることを示し、これらの変異にはDOIアナログには存在せず、より好ましい相互作用を示す。しかしながら、DOI-TyrB15アナログはDOIおよびDOI-TyrB20の結果の混合と類似の結果を示し、HisB15を除いて全ての部位でほんのわずかな差違を示唆する。AsnB3位およびGlnB4位での変異は逆を示したが、これはおそらく、このフレームでのB鎖ヘリックスに近接したB鎖の配向に起因しており、従って、サンプリング技術のアーチファクトである。
結論
IR L1ドメイン及びIR-A705-719と複合体化したhInsアナログ、hIns[DOI]、hIns[TyrB15,DOI]およびhIns[TyrB20,DOI]のMDシミュレーションならびにその後の変異分析は、重要なレセプター結合残基(特にPheB24)の欠如にかかわらずhIns[DOI]が結合するという本方法に関する洞察を提供する。このシミュレーションは、位置B20でのチロシン置換がhIns中のPheB24の代わりとして作用し得、ほぼ同じ位置を占め、シミュレートした時間にわたり安定であることを示す。インスリンレセプター断片と相互作用するhIns[DOI](PheB24、およびB15またはB20での変異によりPheB24を置き換えるあらゆる試みを欠く)のシミュレーションは、これらの結合は、IR L1およびIR-A705-719とのhInsの結合と全体的に類似することを示すが、IR L1ドメインとアナログB鎖との間の部位で僅かな差違がある。IR L1ドメインへのB鎖のシフトは、起こるであろう立体衝突に起因してhIns[TyrB20,DOI]複合体中では観測されないがhIns[TyrB15,DOI]では観測され、このことは、B20での置換の影響はB15での置換の影響とは異なることを示唆する。変異FoldX算出は、同様に好ましい変異がB20変異の際に生じる結合ポーズの変化による影響を受けない部位で存在することを示唆し、これらの差違は疎水性コアの遠位に局在した。
実施例11-単量体ヒトインスリンアナログの開発
新規インスリンアナログの研究戦略
本明細書で説明したように、捕食性カタツムリの毒液中の単量体インスリンバリアント(Con-Ins-G1)の近年の発見は本開示のペプチドの背後の研究の推進を助けている。方法が開発され、どのようにしてCon-Ins G1が二量体化を回避し、レセプター結合およびインスリンシグナル伝達を維持し、それにより非常に迅速に作用するかを説明するデータが得られている。さらに、基礎となる発見からの洞察を使用して、4箇所のアミノ酸位置でヒトインスリンの配列と異なるだけであり、単量体であり、即時作用性であり且つ本物のヒトインスリンの効力に匹敵する効力を示すタンパク質を開発している。
Con-Ins-G1の研究から得られた洞察を使用して、ヒト「短縮型」タンパク質から4種のアミノ酸置換のみを示す単量体ヒトインスリンを開発した。
ヒトインスリンの構造の制約を回避するために自然から解決策を得、魚を狩るイモガイであるコヌス・ジオグラフス(Conus geographus)は、数秒以内に魚に麻痺性低血糖ショックを誘発する毒液から特殊なインスリンの使用を進化させている。毒液インスリンCon-Ins-G1の配列を、ゲノム配列決定および質量分析の組み合わせを使用して解明した(図1)。特に、下記の4種の翻訳後改変を観測した:A4 GluおよびB10 Gluからガンマカルボキシグルタミン酸、Glaへ;B3 Proから2-ヒドロキシプロリンへ、ならびにA鎖上のC末端アミド。この毒液インスリンの低い存在量に起因して、この毒液インスリンを動物からは単離し得ない。代わりに、合成を容易にするためにジセレン結合がA鎖中の分子内ジスルフィド結合を置き換えた合成アナログ(sCon-Ins-G1)を得た。sCon-Ins-G1は、魚に注射すると低血糖ショックを誘発し、水中に存在すると魚の運動性を遅らせる。魚へのこの効果以外に、Con-Ins-G1の最も特別な特徴は、Con-Ins-G1は「短縮型」B鎖により今日まで報告されている最も短いインスリン分子であるということである。短縮型ヒトインスリン(デス-オクタペプチドインスリン、DOI)は単量体であることから、Con-Ins-G1は単量体であり且つUFI(超即時作用性インスリン)として使用され得ることが示された。Con-Ins-G1は、ヒトインスリンにおいてヒトインスリンレセプター(hIR)との結合に関与する下記の2種のセグメントを欠く:第1に、ヒトインスリンのA21 AsnはhIR結合部位1と接触し、その除去により結合親和性が100倍低下する。第2に、芳香族トリプレット(B24~B26)は、ヒトインスリンがhIR結合部位での接触を介してhIR結合部位1に結合するための一要素である。これらの残基の除去により、親和性が1,000倍低下する。
これらの懸念にもかかわらず、Con-Ins-G1(セレンアナログの代わり)を化学的に合成し、このCon-Ins-G1はヒトインスリンと比べてわずか30倍低い親和性でhIRに結合することを発見した。この驚くべき結果は下記の重要な問題を提起した:Con-Ins-G1はヒトインスリンにより使用される重要な芳香族残基なしでどのようにしてhIRに結合するのか?Con-Ins-G1の構造はヒトインスリンとほぼ同一の主鎖を示すことが分かった。Con-Ins-G1の構造を、公開されているヒトインスリン-hIR共構造にフィットさせることにより、Con-Ins-G1 B15 Tyr およびB20 Tyr(ヒトインスリン中のLeuおよびGly)はヒトIRと相互作用して、ヒトB24 Pheが果たす役割の代わりとなると推察した。これらの強力な結果は、カタツムリインスリン構造に基づいてヒト単量体UFIを開発するための合理的根拠を提供する。
治療リード(therapeutic leads)としてのヒト単量体インスリンアナログの開発
超即時作用性インスリン(UFI)の開発は、インスリンアナログ開発における次の大きな進歩を表す。ヒトインスリンの再設計における基本的な課題は、レセプター結合に関与する同一の残基が二量体形成も媒介することである。そのため、毒液インスリンCon-Ins-G1の発見は、単量体であり超即時作用性のインスリンの生成における重要な前進を表しており、なぜならば、このCon-Ins-G1はこれらの残基を欠いている(そのため二量体化しない)が、インスリンレセプターに結合して活性化する能力を保持しているからである。しかしながら、特に糖尿病が毎日のインスリン注射を必要とする慢性疾患であることを考慮すると、Con-Ins-G1とヒトインスリンとの間の低い配列同一性は免疫応答を引き起こす可能性があることが懸念される。従って、毒液インスリンに基づいてUFIを開発する代わりに、ヒトDOI(デス-オクタペプチド(B23~30)ヒトインスリン)の足場から始めることができ、なぜならば、このヒトDOIは単量体であり、2個または3個の変異を示すインスリンアナログの現在の臨床的使用により示されるように、トランケート型ヒトインスリンの近いアナログはヒト免疫系に許容される可能性があるからである。しかしながら、DOIはほぼ不活性である(ヒトインスリンと比べて1,000倍弱い)ことが課題である。データは、Con-Ins-G1がB15 Tyrおよび/またはB20 Tyrを使用してB24 Pheの欠失を補償することを示し、Con-Ins-G1の親和性を増強するさらなる改変をさらに示す。これらの洞察を利用して、DOIを、糖尿病処置のための治療リードとして活性なUFIアナログへと開発し得る。
ヒトDOIの生理活性単量体インスリンへの開発
伝統的に、DOIはヒトインスリンのトリプシン開裂により酵素的に合成されたが、これはアナログ合成には適していない。従って、DOIにアクセスするためのモジュラー合成経路が開発されている。ヒトインスリンの合成の主な課題は、A鎖の疎水性特性である。A8-A9 Thr-Ser上でイソアシルペプチド対を使用することにより、余分な荷電残基(アミン)をA鎖に導入して溶解性を高めた(図21)。ジスルフィド結合の形成後、イソアシルペプチドはpH8でOからNへのアシルシフトを受けてDOI配列が得られる。この合成DOIは、酵素的に合成されたDOIと同一の分子量(MALDIから)およびhIR活性化活性を有し、このことは本開発の方法の信頼性を証明する。
Con-Ins-G1のB15およびB20上の2個のTyrはhIR活性化に重要であることが実証されている。これら2箇所の部位の変異がhIR活性化の効力を増加させるであろうという仮説を検証するために、B15 Leuおよび/またはB20 GlyがTyrに変異した3種のDOIアナログを合成した。図22に示すように、B20 Tyrを有する2種のアナログはhIR活性化において効力が5倍増加しているが、B15 Tyr DOIアナログはDOIに類似している。このことは、おそらくB24 Pheの欠失の補償に起因してB20 TyrのみがDOIの効力を増加させ得ることを実証している。効力をさらに増加させるために、B10 Gluをさらに提示するDOIアナログを合成し、これは、最も強力なhIR結合を付与するB10置換である。これによりB20 Tyr単独と比較して効力がさらに5倍増加し、Con-Ins-G1と同様の効力がもたらされる(図23)。このことは、毒液インスリンからの変異をヒトDOIに移植して生理活性アナログを開発し得ることを実証している。
Con-Ins-G1の結晶構造およびヒトインスリンレセプターの部位1断片と複合体化したConIns G1の結晶構造はB20残基について明確な電子密度を欠いており、これはB20残基が柔軟であり得ることを示す。この位置でのチロシン置換基の側鎖がインスリンレセプターに最適に結合し得ない可能性もある。従って、Tyr以外の置換が効力をさらに増加させ得るという仮説を、Xが芳香族アミノ酸である一連のB10Eアナログ、B20X DOIアナログを合成することにより検証した(図24A)。興味深いことに、インドール(Tro)およびジフェニル基等の大きい置換基は、hIR活性化においてより高い効力をもたらす(図24B)。このビフェニルアナログはヒトインスリンの効力の10%である(N10E、B20Y DOIと比べて3倍高い)。このことは、タンパク質工学および構造生物学の両方を使用する学際的なアプローチの力を実証している。DOIの効力は、2箇所の位置を変異させることに100倍増加している。B20上のハロゲン置換ナフチルおよびジフェニル基を使用して、DOIアナログの効力をさらに最適化し得る。
A8位置はhIR結合部位2との相互作用に重要であることから、A8 His変異を現在のリードアナログ(lead analogue)に導入してhIR活性化についてアッセイし得る。A8 HisおよびA9 Arg(Con-Ins-G1上の元々の残基)の両方を、リードアナログであるB10 GluおよびB20 Tyrを有するDOIアナログに導入した(図23)。この四重DOI変異体は、ヒトインスリンの効力に匹敵するhIR活性化に対する効力を有する(図25)。Con-Ins-G1上の変異はIR部位2への結合を促進する。X線結晶学を使用してインスリンと結合部位2との間の相互作用を研究し得る。タンパク質工学の努力を、B20への研究と同様の医薬化学アプローチを使用することにより、hIR結合部位2との相互作用をさらに最適化するためにA8~A10トリプレットに拡大し得る。現在、最良のDOIアナログはわずか4個の残基で親ヒトインスリン配列とは異なり、そのため、単量体DOIアナログの免疫原性は臨床的使用中のFAD承認インスリンアナログの免疫原性と同様であると思われる。
A8、A9、B10およびB20での各変異はhIR活性化に影響を及ぼすことにおいて個々の効果を有することが実証された(図26)。
STZで処置した糖尿病マウスモデルにおける単量体インスリンリードの評価
強力な単量体インスリンアナログを同定した後、インビボ特性を評価し得る。STZ処置マウスでインスリン耐性試験を実施して、インビボでのグルコース低下能を確認し得る。UFIアナログの2つの重要な機能は早い発現および短い作用持続期間である。皮下注射後に糖尿病マウスにおいて質量分析(LC/MS/MS)と組み合わせたHPLCを使用してUFIアナログ血清レベルを測定し、UFIアナログの吸収速度を測定する(コントロールとしてインスリンシルプロを使用する)。単量体インスリンの場合、二量体インスリンリスプロと比較して早い吸収速度が見られ得る。さらに、血糖クランプ実験を使用して、標的グルコースレベルを維持するのに必要なグルコース注入量を決定することにより、インビボでのUFIアナログの発現および持続時間を定量化し得る。グルコースクランプ試験は、UFIアナログが、皮下組織におけるそれらのデポー効果の低下に起因して作用のより短い発現および持続時間を有することを示し得る。これらの特性の組み合わせは、低血糖のリスクを大幅に低減し得る。
広く説明されている本発明の趣旨または範囲から逸脱することなく、特定の実施形態で示されているように本発明に対して多数の変形および/または改変が行われ得ることを当業者は認識するだろう。従って、本実施形態は、あらゆる点で例示的であり限定的ではないと見なされるべきである。当業者は、本明細書で説明された方法および組成物の特定の実施形態に対する多くの等価物を認識するだろう、または日常的な実験だけを使用して確認し得る。そのような等価物は下記の特許請求に包含されることを意図されている。
本明細書で論じられたおよび/または参照された全ての刊行物は、その全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書に含まれている文書、行為、材料、装置、物品等のいかなる議論も、単に本発明の背景を提供することを目的としている。本出願の各請求項の優先日前に存在したからといって、これらの事項のいずれかまたは全てが先行技術のベースの一部を形成するとまたは本発明に関連する分野における共通の一般的知識であったと認めると受け取るできではない。
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Claims (94)

  1. A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドを含むインスリンアナログであって、前記B鎖は、ヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号20に対応する位置で芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基を含み、および/またはヒトインスリンのB鎖のアミノ酸番号15に対応する位置で芳香族残基もしくは大きい脂肪族残基を含み、前記アナログは、ヒトインスリン中に見出される少なくとも1個のアミノ酸を含むがコヌス・ジオグラフス(Conus geographus)毒液インスリンの対応する位置では欠いており、前記A鎖ペプチドおよび前記B鎖ペプチドは少なくとも1対のシステイン残基を介して互いに結合している、インスリンアナログ。
  2. ヒトインスリンの前記B鎖のアミノ酸番号20に対応する位置での前記芳香族残基または大きい脂肪族残基は、チロシン、フェニルアラニン、4-メチルフェニルアラニン、ヒスチジン、トリプトファン、メチオニン、シクロペンチルアラニンおよびシクロヘキシルアラニンからなる群から選択される、請求項1に記載のインスリンアナログ。
  3. 前記B鎖は、ヒトインスリンと比較した場合にC末端でトランケートされている、請求項1または2に記載のインスリンアナログ。
  4. 前記B鎖はヒトインスリンの9個のC末端アミノ酸のうちの1個または複数個または全てを欠いている、請求項3に記載のインスリンアナログ。
  5. 前記B鎖はヒトインスリンのPheB24を少なくとも欠いている、請求項3または4に記載のインスリンアナログ。
  6. 前記B鎖は前記ヒトB鎖の芳香族トリプレット(アミノ酸PheB24-PheB25-TyrB26)を少なくとも欠いている、請求項1~5のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  7. 配列Gly-XA2-XA3-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-XA12-XA13-XA14-XA15-XA16-XA17-XA18-XA19-CysA20-XA21-XA22-XA23-XA24-XA25-XA26-XA27-XA28-XA29-XA30-XA31-XA32-XA33-XA34
    (この配列中、XA2=ValまたはIle;XA3=ValまたはAla;XA4=Glu、Asp、Cysまたはガンマカルボキシグルタメート;XA5=Gln、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、HisまたはVal;CysA6、CysA7およびCysA11は独立してCysまたはセレノシステインであり;XA8=Thr、His、Asp、Gln、Tyr、Lys、AlaまたはVal;XA9=Ser、Arg、Asn、Gly、HisまたはLys;XA10=Ile、Pro、Tyr、Ala、Ser、Val、Phe、HisまたはThr;XA12=SerまたはThr;XA13=Leu、Asn、Val、ArgまたはAsp;XA14=Tyr、Ala、Gln、His、AspまたはGlu;XA15=Gln、GluまたはThr;XA16=Phe、LeuまたはAla;XA17=Glu、Gln、Lys、Arg、Ile、Met、ThrまたはSer;XA18=Lys、Ser、Thr、Asn、GlnまたはGlu;XA19=TyrまたはPhe;CysA20=Cys、セレノシステイン、アミド化Cysまたはアミド化セレノシステイン;XA21=Asn、Pro、His、Ser、Gly、Alaまたは存在せず;XA22=Pro、Asn、Thr、Leu、Serまたは存在せず;XA23=Thr、Leu、Val、Serまたは存在せず;XA24=Arg、Thr、Met、Gln、Leuまたは存在せず;XA25=Glu、Glyまたは存在せず;XA26=Ser、Leuまたは存在せず;XA27~XA31は独立してSerであり、または存在せず;XA32=Ala、Serまたは存在せず;XA33=Ala、Valまたは存在せず;ならびにXA34=Alaまたは存在しない)(配列番号1)
    を含むA鎖ペプチドと、
    配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39
    (この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Ala、Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Ala、Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Lys、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Thr、Tyr、ArgまたはGly;XB17=Thr、Tyr、Pro、LeuまたはGly;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、Arg、SerまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Val、Tyr、Phe、His、Gly、Gln、Leu、アミド化His、アミド化Valまたは存在せず;XB23=Glu、Asp、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Ile、Leu、Ser、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Ala、Asp、Ser、Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号2)
    を含むB鎖ペプチドと
    を含む請求項1~6のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  8. 前記B鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39
    (この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号3)
    を含む、請求項7に記載のインスリンアナログ。
  9. 前記B鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-XB10-XB11-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39
    (この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB10=Gly、GlnまたはAsp;XB11=Ser、Leu、GlyまたはPro;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;ならびにXB24、XB25、XB26、XB27、XB28、XB29、XB30、XB31、XB32、XB33、XB34、XB35、XB36、XB37、XB38およびXB39は存在しない)(配列番号4)
    を含む、請求項7または8に記載のインスリンアナログ。
  10. 前記B鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39
    (この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=His、Tyr、ArgまたはIle;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=Val、LeuまたはLys;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号5)
    を含む、請求項7または8に記載のインスリンアナログ。
  11. 前記B鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23-XB24-XB25-XB26-XB27-XB28-XB29-XB30-XB31-XB32-XB33-XB34-XB35-XB36-XB37-XB38-XB39
    (この配列中、XB1=Thr、Asn、Serまたは存在せず;XB2=Phe、Ser、Asn、Thr、Glnまたは存在せず;XB3=Asp、Gly、Pro、Leu、PheまたはHis;XB4=Thr、Pro、Asp、ValまたはGly;XB5=Asn、Pro、His、Thr、Arg、Serまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、Glu、Asn、Asp、Arg、GlnまたはGly;XB7=HisまたはTyr;XB8=Arg、Thr、Ile、Ser、Leu、TyrまたはLys;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB12=His、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、AspまたはAsn;XB13=Ile、Leu、Asp、ValまたはAla;XB14=Thr、Ala、Pro、ValまたはArg;XB15=Asn、Asp、Ala、Val、Thr、ProまたはGlu;XB16=Ala、Ser、Gln、His、Tyr、ArgまたはGly;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Met、Val、Gln、Ile、Asp、Gly、AsnまたはLeu;XB19=Leu、Asp、Gln、Gly、Lys、Glu、ArgまたはThr;XB20=ValまたはLeu;CB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=Tyr、PheまたはHis;XB23=Glu、Arg、Ser、Glyまたは存在せず;XB24=Arg、Asp、Valまたは存在せず;XB25=Gly、Leu、Valまたは存在せず;XB26=Phe、Val、Ileまたは存在せず;XB27=Phe、Asn、Pro、Gluまたは存在せず;XB28=Tyr、Cys、Hisまたは存在せず;XB29=Thr、His、Leu、Tyrまたは存在せず;XB30=Pro、Glu、Leu、Ile、Argまたは存在せず;XB31=Ile、Lysまたは存在せず;XB32=Thr、Lys、Leu、Glnまたは存在せず;XB33=Cysまたは存在せず;XB34=Glu、Pro、Valまたは存在せず;XB35=Glu、Glyまたは存在せず;XB36=Glu、Glyまたは存在せず;XB37=Glu、Valまたは存在せず;XB38=Ala、Aspまたは存在せず;およびXB39=Alaまたは存在しない)(配列番号6)
    を含む、請求項7または8に記載のインスリンアナログ。
  12. 前記B鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-XB7-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thr、Asnまたは存在せず;XB2=Phe、Serまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=Lys、AsnまたはGln;XB7=HisまたはTyr;XB8=Arg、IleまたはLeu;CysB9=Cysまたはセレノシステイン;XB12=His、Asp、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=Val、IleまたはLeu;XB14=Thr、Ala、ProまたはVal;XB15=Glu、Val、AsnまたはAsp;XB16=Ser、Gln、TyrまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=Tyr、Asp、MetまたはVal;XB19=Leu、Asp、GlnまたはLys;XB20=LeuまたはVal;CysB21=Cys、アミド化Cys、セレノシステインまたはアミド化セレノシステイン;XB22=TyrまたはGly;およびXB23=Glu、Arg、Glyまたは存在しない)(配列番号7)を含む、請求項7に記載のインスリンアナログ。
  13. 前記B鎖ペプチドは、配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu、XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;XB22=Tyr;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号8)を含む、請求項12に記載のインスリンアナログ。
  14. B22はTyrである、請求項7~12のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  15. 前記A鎖ペプチドは、配列Gly-XA2-XA3-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-XA12-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-XA19-CysA20-XA21-XA22-XA23-XA24-XA25-XA26-XA27-XA28-XA29-XA30-XA31-XA32-XA33-XA34
    (この配列中、XA2=ValまたはIle;XA3=ValまたはAla;XA4=Glu、ガンマカルボキシグルタメートまたはCys;XA5=Gln、Glu、ガンマカルボキシグルタメート、HisまたはVal;CysA6、CysA7およびCysA11は独立してCysまたはセレノシステインであり;XA8=Thr、His、Asp、Gln、Tyr、LysまたはVal;XA9=Ser、Arg、Asn、HisまたはLys;XA10=Ile、Pro、Tyr、Ala、Ser、Phe、HisまたはThr;XA12=SerまたはThr;XA13=Leu、Asn、ValまたはAsp;XA14=Tyr、Ala、Gln、AspまたはGlu;XA15=Gln、GluまたはThr;またはAla;XA17=Glu、Lys、Arg、Ile、Met、ThrまたはSer;XA18=Lys、Thr、Asn、GlnまたはGlu;XA19=TyrまたはPhe;CysA20=Cys、セレノシステイン、アミド化Cysまたはアミド化セレノシステイン;XA21=Asn、Pro、His、Ser、Gly、Alaまたは存在せず;XA22=Pro、Asn、Thr、Leu、Serまたは存在せず;XA23=Thr、Leu、Val、Serまたは存在せず;XA24=Arg、Thr、Met、Gln、Leuまたは存在せず;XA25=Glu、Glyまたは存在せず;XA26=Ser、Leuまたは存在せず;XA27~XA31は独立してSerであり、または存在せず;XA32=Ala、Serまたは存在せず;XA33=Ala、Valまたは存在せず;ならびにXA34=Alaまたは存在しない)(配列番号9)を含む、請求項1~14のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  16. 配列Gly-XA2-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-XA16-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA2はValまたはIleであり、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA16はPheまたはLeuであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号10)を含むA鎖ペプチドと、
    配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-XB22-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;XB22=GlyまたはTyr;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号11)を含むB鎖ペプチドと
    を含む請求項1~6のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  17. 配列Gly-XA2-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA2はValまたはIleであり、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号12)を含むA鎖ペプチドと、
    配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-XB8-CysB9-Gly-Ser-XB12-XB13-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-XB20-CysB21-Tyr-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB8=ArgまたはLeu;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB13=IleまたはLeu;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、XB20=LeuまたはVal;およびXB23=GluまたはArg)(配列番号13)を含むB鎖ペプチドと
    を含む請求項15または16に記載のインスリンアナログ。
  18. 配列Gly-Val-Val-XA4-XA5-CysA6-CysA7-XA8-XA9-XA10-CysA11-Ser-XA13-XA14-XA15-Phe-XA17-XA18-Tyr-CysA20-XA21(この配列中、XA4はGluまたはガンマカルボキシグルタメートであり、XA5はHisまたはGlnであり、XA8はHisまたはThrであり、XA9はArgまたはSerであり、XA10はProまたはIleであり、XA13はAsnまたはLeuであり、XA14はAlaまたはTyrであり、XA15はGluまたはGlnであり、XA17はLysまたはGluであり、XA18はLysまたはAsnであり、およびXA21はAsnである、または存在しない)(配列番号14)を含むA鎖ペプチドと、
    配列XB1-XB2-XB3-XB4-XB5-XB6-His-Arg-CysB9-Gly-Ser-XB12-Ile-XB14-XB15-XB16-XB17-XB18-XB19-Leu-CysB21-Tyr-XB23(この配列中、XB1=Thrまたは存在せず;XB2=Pheまたは存在せず;XB3=PheまたはAsp;XB4=ThrまたはVal;XB5=Pro、Asnまたはヒドロキシプロリン;XB6=LysまたはGln;XB12=His、Gluまたはガンマカルボキシグルタメート;XB14=ThrまたはVal;XB15=GluまたはAsn;XB16=SerまたはAla;XB17=TyrまたはLeu;XB18=TyrまたはMet;XB19=LeuまたはAsp、およびXB23=GluまたはArg)(配列番号15)を含むB鎖ペプチドと
    を含む請求項15~17のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  19. 下記:
    i)XA4はガンマカルボキシグルタメートである、
    ii)XB5はヒドロキシプロリンである、および
    iii)XB12はガンマカルボキシグルタメートである、
    のうちの1つまたは複数または全てが当てはまる請求項1~18のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  20. 配列Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn(配列番号16)を含むA鎖ペプチドと、
    配列Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Xaa-Tyr-Leu-Val-Cys-Gly-Glu(この配列中、Xaaは芳香族残基または大きい脂肪族残基である)(配列番号17)を含むB鎖ペプチドと
    を含む請求項1~19のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  21. 配列Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn(配列番号18)を含むA鎖ペプチドと、
    配列Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tyr-Leu-Val-Cys-Xaa-Glu(この配列中、Xaaは芳香族残基または大きい脂肪族残基である)(配列番号19)を含むB鎖ペプチドと
    を含む請求項1~19のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  22. 前記B鎖ペプチドのCysB9は前記A鎖ペプチドのCysA6に結合している、請求項1~21のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  23. 前記B鎖ペプチドのCysB21は前記A鎖ペプチドのCysA20に結合している、請求項1~22のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  24. CysA7はCysA11に結合している、請求項1~23のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  25. 前記A鎖ペプチドおよび前記B鎖ペプチドは一対のそれらの各末端で互いに連結されている、請求項1~24のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  26. 前記A鎖ペプチドおよび前記B鎖ペプチドは両方の末端で互いに連結されている、請求項1~25のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  27. ヒトIR-Bレセプターに対するIC50が10-6Mよりも低い、請求項1~26のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  28. 前記アナログの少なくとも75%は溶液中で単量体である、請求項1~27のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  29. ヒトインスリンと比較した場合に、ヒトに投与された際に生物学的利用能が増加している、請求項1~28のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  30. ヒトへの投与から0.5~3時間以内に生物学的利用能がピークになる、請求項29に記載のインスリンアナログ。
  31. 投与から10分以内に活性を発現する請求項29または30に記載のインスリンアナログ。
  32. 前記アナログはヒトIGF-IRに結合しない、またはヒトIGF-IRに弱く結合する、請求項1~31のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  33. 前記アナログはヒトIGF-IRに対する親和性(K)が100nMよりも弱い、請求項32に記載のインスリンアナログ。
    (請求項32)
    請求項1~31のいずれか一項に記載のインスリンアナログまたはその薬学的に許容される塩と、1種または複数種の薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
    (請求項33)
    インスリンに関連する状態を処置するおよび/または予防する方法であって、必要とする対象に、請求項1~32のいずれか一項に記載のインスリンアナログの治療上有効な量を投与することを含む方法。
  34. 前記インスリンに関連する状態は高血糖、インスリン抵抗性、1型糖尿病、妊娠糖尿病または2型糖尿病である、請求項33に記載の方法。
  35. 血糖値を低減させる方法であって、必要とする対象に、請求項1~32のいずれか一項に記載のインスリンアナログの治療上有効な量を投与することを含む方法。
  36. 対象のインスリンに関連する状態を処置するためのおよび/または予防するための薬剤の製造における請求項1~32のいずれか一項に記載のインスリンアナログの使用。
  37. 対象の血糖値を低減させるための薬剤の製造における請求項1~32のいずれか一項に記載のインスリンアナログの使用。
  38. 対象のインスリンに関連する状態の処置および/または予防での使用のための請求項1~32のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  39. 対象の血糖値の低減での使用のための請求項1~32のいずれか一項に記載のインスリンアナログ。
  40. インスリンレセプター(IR)に結合することが知られているポリペプチドを再設計するまたは改変する方法であって、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造の、構造に基づく評価を実施すること、および前記評価の結果として前記ポリペプチドを再設計するまたは化学的に改変することを含む方法。
  41. 構造に基づく評価は、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造とインスリンの原子座標またはそのサブセットとの比較を含む、請求項40に記載の方法。
  42. 構造に基づく評価は、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義される構造とインスリンレセプターの原子座標またはそのサブセットとの間に形成される複合体の分子モデリングをさらに含む、請求項40または41に記載の方法。
  43. 前記再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドを合成するまたは得ること、および前記ポリペプチドのIRに結合する能力を試験することをさらに含む請求項40~42のいずれか一項に記載の方法。
  44. 前記再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドを合成するまたは得ること、および前記再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドのIR活性化を調節する能力を決定することをさらに含む請求項40~42のいずれか一項に記載の方法。
  45. 前記再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドを合成するまたは得ること、および前記再設計されたまたは化学的に改変されたポリペプチドの血糖値を低下させる能力を決定することをさらに含む請求項40~42のいずれか一項に記載の方法。
  46. 前記IRに結合することが知られているポリペプチドはインスリンである、請求項40~45のいずれか一項に記載の方法。
  47. 前記インスリンはヒトインスリンである、請求項46に記載の方法。
  48. 請求項40~47のいずれか一項に記載の方法により再設計されているまたは改変されているポリペプチド。
  49. 単量体である請求項48に記載のポリペプチド。
  50. IRアゴニストである単離分子であって、付録Iの原子座標またはそのサブセットにより定義されるCon-Ins G1の3D構造に基づいて同定されているおよび/または設計されている分子。
  51. 前記分子はペプチド、ポリペプチドまたはペプチド模倣物である、請求項50に記載の分子。
  52. 単量体である請求項50または51に記載の分子。
  53. ヒトIR-Bレセプターに対するIC50が10-6Mよりも低い、請求項50~52のいずれか一項に記載の分子。
  54. IRに結合する化合物を同定する方法であって、
    i)下記:
    a)付録Iの原子座標もしくはそのサブセットにより定義される構造、または
    b)a)の対応する主鎖原子上で重ねた場合に約2.0Å未満の平均二乗偏差を有する構造
    を有するポリペプチドの三次元構造モデルを作成すること、および
    ii)前記IRに潜在的に結合する化合物を設計するまたはスクリーニングすること
    を含む方法。
  55. 三次元構造モデルを作成することは、IRまたはその領域に結合する前記ポリペプチドのモデルを作成することを含む、請求項54に記載の方法。
  56. 前記IRに潜在的に結合する化合物を合成することをさらに含む請求項54または55に記載の方法。
  57. 前記化合物はIRの少なくとも1種の生物学的活性を調節する、請求項54~56のいずれか一項に記載の方法。
  58. 前記化合物は単量体である、請求項54~57のいずれか一項に記載の方法。
  59. 血糖値を調節する能力に関して、前記ii)で設計されたまたはスクリーニングされた化合物を試験することをさらに含む請求項54~58のいずれか一項に記載の方法。
  60. i)およびii)をインシリコで実施する、請求項54~59のいずれか一項に記載の方法。
  61. インスリン活性を模倣する化合物を同定するコンピュータベースの方法であって、
    i)下記:
    a)付録Iの原子座標もしくはそのサブセットにより定義される構造、または
    b)a)の対応する主鎖原子上で重ねた場合に約2.0Å未満の平均二乗偏差を有する構造
    を有するポリペプチドの三次元構造モデルを作成すること、および
    ii)インスリン活性を模倣する化合物を設計するまたはスクリーニングすること
    を含む方法。
  62. 三次元構造モデルを作成することはIRまたはその領域に結合する前記ポリペプチドのモデルを作成することを含む、請求項61に記載の方法。
  63. 前記IRに潜在的に結合する化合物を合成することをさらに含む請求項61または62に記載の方法。
  64. 前記化合物はIRの少なくとも1種の生物学的活性を調節する、請求項61~63のいずれか一項に記載の方法。
  65. 前記化合物は単量体である、請求項61~64のいずれか一項に記載の方法。
  66. 血糖値を調節する能力に関して、前記ii)で設計されたまたはスクリーニングされた化合物を試験することをさらに含む請求項61~65のいずれか一項に記載の方法。
  67. i)およびii)をインシリコで実施する、請求項61~66のいずれか一項に記載の方法。
  68. 請求項54~67のいずれか一項に記載の方法を使用して同定された化合物。
  69. あらゆる格子寸法において変動が最大約2%であるa=b=c=74.91Åの単位格子寸法を有する空間群P432を有するCon-Ins G1ポリペプチドの結晶。
  70. 付録Iの原子座標により定義されるCon-Ins G1ポリペプチドの構造。
  71. 構造モデルとしての請求項70記載の構造の使用。
  72. インスリンアナログの同定のための請求項71に記載の構造モデルの使用。
  73. 請求項72の使用により同定されたインスリンアナログ。
  74. 請求項48もしくは49に記載のポリペプチド、請求項50~53のいずれか一項に記載の分子、請求項68に記載の化合物または請求項72に記載のインスリンアナログを含む医薬組成物。
  75. インスリンA鎖ペプチドおよびインスリンB鎖ペプチドを含むペプチドであって、前記B鎖ペプチドはアミノ酸10およびアミノ酸20で置換を含む、ペプチド。
  76. 前記アミノ酸20での置換はG20Y、G20FまたはG20Pである、請求項75に記載のペプチド。
  77. 前記アミノ酸20での置換はG20Pであり、前記ペプチドはアミノ酸21での置換をさらに含み、前記アミノ酸21での置換はG21Hである、請求項76に記載のペプチド。
  78. 前記アミノ酸10での置換はH10E、H10DまたはH10Qである、請求項75~77のいずれか一項に記載のペプチド。
  79. 前記A鎖ペプチド中に少なくとも1個の置換をさらに含む請求項75~78のいずれか一項に記載のペプチド。
  80. 前記A鎖ペプチド中の前記少なくとも1個の置換はT8H、T8Y、T8KまたはS9Rである、請求項79に記載のペプチド。
  81. 前記A鎖ペプチド中に少なくとも2個の置換をさらに含む請求項80に記載のペプチド。
  82. 前記A鎖ペプチド中の前記少なくとも2個の置換は、T8H、T8Y、T8KおよびS9Rから選択される置換のうちの2つである、請求項79に記載のペプチド。
  83. 前記ペプチドはデス-オクタペプチドインスリンである、請求項75~82のいずれか一項にペプチド。
  84. 前記B鎖ペプチドはFVNQHLCGSELVEALYLVCYER(配列番号30)の配列を含む、請求項75~83のいずれか一項に記載のペプチド。
  85. 前記A鎖はGIVEQCCHRICSLYQLENYCN(配列番号39)の配列を含む、請求項75~84のいずれか一項に記載のペプチド。
  86. 前記A鎖ペプチドおよびB鎖ペプチドは少なくとも1個のジスルフィド結合を介して結合している、請求項75~85のいずれか一項に記載のペプチド。
  87. 前記ペプチドは単量体である、請求項75~86のいずれか一項に記載のペプチド。
  88. 前記インスリンA鎖ペプチドは野生型ヒトインスリンA鎖ペプチドと少なくとも70%同一である、請求項75~87のいずれか一項に記載のペプチド。
  89. 請求項75~88のいずれか一項に記載のペプチドと、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
  90. 対象中でインスリンレセプター活性化を増加させる方法であって、必要とする対象に、請求項75~88のいずれか一項に記載のペプチドのいずれか1つの治療上有効な量を投与することを含む方法。
  91. 対象の血糖を低下させる方法であって、必要とする対象に、請求項75~88のいずれか一項に記載のペプチドのいずれか1つの治療上有効な量を投与することを含む方法。
  92. 対象の1型糖尿病を処置する方法であって、必要とする対象に、請求項75~88のいずれか一項に記載のペプチドのいずれか1つの治療上有効な量を投与することを含む方法。
  93. 前記対象は前記ペプチドの投与の前に1型糖尿病と診断されている、請求項92に記載の方法。
  94. 少なくとも1個のジスルフィド結合を介してB鎖ペプチドに結合しているA鎖ペプチドを有する治療用タンパク質であって、前記A鎖はGIVEQCCHRICSLYQLENYCN(配列番号39)の配列を含み、前記B鎖ペプチドはFVNQHLCGSELVEALYLVCYER(配列番号30)の配列を含む、治療用タンパク質。
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