JP2021524906A - 同種移植片レシピエントを分類するためのバイオマーカー - Google Patents
同種移植片レシピエントを分類するためのバイオマーカー Download PDFInfo
- Publication number
- JP2021524906A JP2021524906A JP2020555307A JP2020555307A JP2021524906A JP 2021524906 A JP2021524906 A JP 2021524906A JP 2020555307 A JP2020555307 A JP 2020555307A JP 2020555307 A JP2020555307 A JP 2020555307A JP 2021524906 A JP2021524906 A JP 2021524906A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- abmr
- protein
- sample
- recipient
- genes
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
- G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
- G01N2333/4701—Details
- G01N2333/4716—Complement proteins, e.g. anaphylatoxin, C3a, C5a
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
- G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
- G01N2333/4701—Details
- G01N2333/4728—Details alpha-Glycoproteins
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/745—Assays involving non-enzymic blood coagulation factors
- G01N2333/7454—Tissue factor (tissue thromboplastin, Factor III)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/76—Assays involving albumins other than in routine use for blocking surfaces or for anchoring haptens during immunisation
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/775—Apolipopeptides
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/81—Protease inhibitors
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/24—Immunology or allergic disorders
- G01N2800/245—Transplantation related diseases, e.g. graft versus host disease
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/60—Complex ways of combining multiple protein biomarkers for diagnosis
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
区分2: 抗体関連型変化
急性/活動性ABMR:診断のために3つ全ての特徴が提示されていなければならない。組織学的特徴を示す生検および、現在/最近の血管内皮との抗体相互作用およびDSAの両方ではないが一方の証拠が、急性/活動性のABMRの疑いがあると指定され得る。病変は、臨床的に急性またはくすぶっている(smoldering)または潜在的であり得る。なお、以下の基準に基づき病変がC4d-陽性またはC4d陰性である場合は注意されたい。
1.以下の1以上を含む、急性組織傷害の組織学的証拠
− 微小血管の炎症(再発性若しくは新生の糸球体腎炎が無くg>0、および/またはptc>0)
− 血管内膜または貫壁性の動脈炎(v>0)
− 他の原因の無い急性血栓性微小血管症
− 他に明らかな原因がない場合の急性尿細管障害
2.以下の少なくとも1つを含む、血管内皮との現在/最近の抗体相互作用の証拠
− 尿細管周囲の毛細血管におけるリニアC4d染色(凍結切片ではIFによるC4d2若しくはC4d3、またはパラフィン切片ではIHCによるC4d>0)
− 少なくとも中程度の微小血管の炎症([g + ptc]≧2)、但し、急性TCMR、境界域浸潤、または感染がある場合。 ptc≧ 2だけでは十分ではなく、g≧1でなければならない。
− 完全に検証された場合、内皮損傷を示す生検組織における遺伝子転写物の発現の増加
3. DSAの血清学的証拠(HLAまたは他の抗原)
− 基準1と2に基づいてABMRの疑いのある生検は、迅速なDSA試験が促される。
区分4:急性TCMR(グレード)
IA. 重大な間質性炎症(非硬化性皮質実質の>25%、i2またはi3)および中等症尿細管炎の病巣(t2)
IB. 重大な間質性炎症(非硬化性皮質実質の>25%、i2またはi3)および激しい尿細管炎の病巣(t3)
IIA. 間質性炎症および尿細管炎を伴うまたは伴わない、軽度から中等度の血管内膜の動脈炎(v1)
IIB. 間質性炎症および尿細管炎を伴うまたは伴わない、内腔面積(v2)の>25%を含む激しい血管内膜の動脈炎(v2)
III. 経壁性動脈炎および/または動脈フィブリノイドの変化とリンパ球性炎症を伴う内側平滑筋細胞の壊死(v3)
− ヒト被検者からのタンパク質を含む試料、好ましくはヒト同種移植レシピエントからの試料を用意する工程と、
− 前記試料における、好ましくは図1のリストに記載された、TF、SERPINA1、APOA4、AFM、AZGP1、ORM1、ORM2、C3、A1BG、SERPINC1、LRG1、IGHA1、IGHG4、TFAP2C、HPX、A2M、CARD6、SERPINA7、CCDC73、CYSTM1およびAPOA1からなる群から選択される少なくとも1つまたは少なくとも2つの遺伝子、特に少なくとも2つの遺伝子についてのタンパク質レベルを測定する工程とを含む。
調査対象母集団
我々は、他施設共同の後ろ向き調査を行った。4つの欧州臨床センター(ルーヴェン大学病院、パリのネッカー、CHUリモージュおよびハノーファーメディカルスクール)において、文書にてインフォームドコンセントを行った、腎臓の同種移植片を受容した患者が含まれた。プロトコル生検(protocol biopsy)または適応生検(indication biopsy)が行われ、尿試料が収集された。このプロテオミクス研究において、尿試料のみが分析に用いられた。生検は現地または中央の病理医が読み取り、全ての試料を、正常(NL)、抗体関連型拒絶(ABMR)、T細胞関連型拒絶(TCMR)および間質性線維症および尿細管萎縮(IFTA)の4つの異なる表現型にクラス分けした。これらの表現型の組合せも可能とした。
本研究は概略的に3つの工程に分けることができる。工程1では、130人の腎臓の同種移植片レシピエントの尿試料が分析され、工程2では、133人の腎臓の同種移植片レシピエントの尿試料が分析された。工程1および2は、診断に用いるABMRバイオマーカーとしての使用のための異なって発現されるタンパク質の同定、およびトレーニング、に関連する。工程3は複数のバイオマーカーの独立した検証に関連し、当該工程では、腎臓の同種移植片レシピエントの240の試料について、バイオマーカーの診断能力が試験された。
尿試料は、上記4つの異なる臨床センターで収集された。排尿後すぐの尿試料、特に2回目の排尿を、朝、生検を採取する前に収集した。尿クレアチニン、ヘモグロビン、白血球、グルコースおよびタンパク質含有量を、現地で尿試験紙検査を用いて測定した。収集から2時間以内に、尿試料は2000g、4℃で20分間遠心分離され、細胞残屑および細胞円柱を除去した。上清は分析センターへと発送されるまで-20℃で保管された。到着後、試料は-80℃で保管された。工程を通じて、試料は24試料のバッチに無作為化され、全てのバッチに各臨床センターからの全ての異なる表現型の試料が含まれるように考慮された。
Pierce(商標)BCAプロテインアッセイキット(サーモサイエンティフィック)を用いた最初の濃度決定の後、10kDa分子量カットオフ膜(メルクミリポア)を用い、アミコン(Amicon)ウルトラ-0.5 遠心分離フィルタユニット上で2mgのタンパク質を処理した。濃縮された試料のタンパク質濃度は再度同様のBCAプロテインアッセイを用いて決定された。その後、Pierce(商標)脱アルブミンキット(サーモサイエンティフィック)のスピンカラム上に100μgのタンパク質を投入し、試料からヒトアルブミンを除去した。脱アルブミン化の後、タンパク質濃度が最後に決定された。20μgのタンパク質が0.1% ラピジェスト(RapiGest(商標)SF、ウォーターズ(Waters))中で変性された。変性後、200 mM TCEP(トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン、サーモサイエンティフィック)2 μlを加え、試料を55℃で1時間インキュベーションすることによりタンパク質の還元を行った。その後、375 mM IAA(ヨードアセトアミド、サーモサイエンティフィック)2μlを加え、暗中室温で30分間、試料のアルキル化を行った。タンパク質を沈殿させるため、予め冷却したアセトン1 mlを加え、-20℃、オーバーナイトでインキュベーションした。遠心分離工程(10000g、15分、4℃)の後、タンパク質の沈殿物を200 mM TEAB(重炭酸トリエチルアンモニウム、シグマアルドリッチ)20μlに再懸濁させた。トリプシン(トリプシンゴールド、質量分析グレード、プロメガ)1μgを加え、37℃でオーバーナイトでインキュベーションしてタンパク質を消化した。HClを最終濃度が200 mMになるように加え(30分、室温)、消化を停止させてラピジェストを加水分解した。遠心分離工程(10000g、15分、4℃)の後、沈殿物が除去され、試料は、2% アセトニトリル、0.1% ギ酸により、最終濃度が0.2μg/μlとなるように希釈した。全ての試料に4 fmol/μl GFP([Glu1]-フィブリノペプチドB,ヒト、シグマアルドリッチ)を添加した。
LCカラムに、20 fmolのGFPが添加された、総量で1 μgのペプチド混合物を投入した。トリプシンの消化で生じたペプチド混合物を、ACQUITY UPLC ペプチドBEH C18ナノACQUITYカラム(100 μm×100 mm、ウォーターズ)と連結したナノACQUITY UPLCシンメトリーC18トラップカラム(180 μm×20 mm、ウォーターズ)を用いたナノアクイティウルトラパフォーマンスLCシステム(ウォーターズ)で分析した。68分かけて移動相B(98% アセトニトリル、0.1% ギ酸、pH=2)を線形のグラジエントで5%から45%とし、その後、移動相Bを3分間で90%まで急増させた。流速は400 nl/minに設定した。ナノLCは、ナノスプレーイオン源(サーモサイエンティフィック)を介してLTQ ベロス(Velos)オービトラップ質量分析計(サーモサイエンティフィック)とオンラインで連結させた。
MS/MSの結果(生データ)と、プロテオームディスカバラー(Proteome Discoverer)の結果を品質管理(QC)分析で検査した。QC分析は、各試料について各時点での試料とMS機器の品質を保証するものであるため、系統的に行った。何らかの理由で試料が要求されるQCパラメータを満たさない場合、これらの試料はさらなるデータ分析工程から除いた。
各試料について全てのペプチドの量的データを得るため、生MS1データからピーク強度を調べるための組織内ソフトウェアを開発した。すなわち、このソフトウェアツールは、10分の保持時間ウィンドウにおいて、デルタppmが5として生MS1データにおけるm/z値を調べる。このようにして、ほぼ全ての同定されたペプチドからの量的情報を含むデータ行列が取得される。このアルゴリズムはおとり調査(decoy search)を用いることで結果として得られたデータを整頓するとともに、ピーク形状もチェックした。
工程1と工程2のデータがトレーニングデータとして使用される。工程1データは顕著に異なって発現されたタンパク質を選択するために使用した。工程2データは最初の検証データセットとして使用された。テストされた仮説はABMR対ABMR無し(no ABMR)である。ABMRケースにおいて、有意に上方調節または下方調節されたタンパク質を選択するためにANOVAを用いた。ANOVAは、工程1と工程2の試料の各タンパク質について生成されたデータに独立して適用した。最後に、ABMR0と比較してABMR1において(すなわち、ABMR対ABMR無し)、2つの工程のうち1つの工程で少なくとも0.8(log2倍の変化(fold change))(タンパク質レベルについて)上方調節された上位21タンパク質を選択した(図1)。
最後に、独立した検証データセットとなる、工程3の試料から得られた規格化された、改良されたデータに、モデルされたサポートベクターマシン(SVM)が適用される。ROCカーブが生成され、結果が検査されて個々の患者ごとにプロットされた。
ペプチド同定
全てのデータは、プロテオームディスカバラーソフトウェア(バージョン2.1、サーモサイエンティフィック)を用いて、ヒトUniprotデータベースに対してサーチを行った。MascotとSequestの両サーチエンジンを用いた。以下のサーチパラメータを用いた。プレカーサーマストレランス 10ppm、フラグメントマストレランス 0.5Da。切断酵素としてトリプシンを選び、2つの切断のミスまで許容した。カルバミドメチル化(carbamidomethylation)を、システインの固定された修飾として設定し、メチオニンの酸化、ならびに、セリン、チロシンおよびスレオニンのリン酸化を可変の修飾として設定した。結果として得たペプチド同定結果は以下の設定を用いてフィルターした。標的−おとりアプローチに基づく誤発見率(False Discovery Rate)(FDR)<5%の高信頼性のもの、および第一にランクされた(first ranked)ペプチドのみを含ませ、図1に示されたタンパク質を得た。
工程1および工程2で得られたデータに、ANOVAを適用し、結果をp値によりリストにした。上位21の選択されたタンパク質を図1に示す。標的分析においても利用できるタンパク質あたりの高信頼性同定を用いて、2つのユニークなペプチドを選択した。このようなユニークなペプチドがリスト上のタンパク質について利用可能でない場合、当該タンパク質はモデルにおいて使用しなかった。このようにして、我々の最終モデルは、6つのタンパク質からの12のペプチドを含んだ。選択されたペプチドは以下の表1に示す。生検の結果は、我々の分析において「結果変数(outcome variable)」として考慮した。12の選択されたペプチドをパラメータとして用い、工程1と工程2のデータによりサポートベクターマシンのトレーニングを行った。カットオフ点を固定した後、感度84.7%、特異度78.3%が得られた(表2参照)。
工程1および2のデータをトレーニングデータセットとして用い、SVMモデルを不変とした。こうして工程3の試料を完全に独立した検証データセットとして用いた。検証は、以前に腎臓の同種移植片を受容した独立した患者の大規模コホート(240)について行った。
トレーニングセットにおいて、60/249ケースはABMR(24.1%)を示し、検証セットにおいて、43/391(11.0%)がABMRを示した。
Claims (16)
- 抗体関連型拒絶(ABMR)の有無についての同種移植片レシピエントの分類方法であって、
− 同種移植片レシピエントからのタンパク質を含む試料における、TF、SERPINA1、APOA4、AFM、AZGP1、ORM1、ORM2、C3、A1BG、SERPINC1、LRG1、IGHA1、IGHG4、TFAP2C、HPX、A2M、CARD6、SERPINA7、CCDC73、CYSTM1、およびAPOA1からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子についてのタンパク質レベルを測定する工程と、
− 前記少なくとも2つの遺伝子についての、前記測定されたタンパク質レベルと参照タンパク質レベルとの比較を行う工程と、
− 前記測定されたタンパク質レベルと前記参照タンパク質レベルとの前記比較に基づいて、ABMRの有無について前記同種移植片レシピエントを分類する工程とを備える方法。 - 請求項1に記載の方法において、
前記方法は、ABMRの有無について前記同種移植片レシピエントの試料を分類するためのものである、方法。 - 請求項1または2に記載の方法において、
前記同種移植片レシピエントは同種腎移植片レシピエントである、方法。 - 請求項1から3までのいずれか一項に記載の方法において、
前記試料は、体液試料であり、好ましくは尿試料である、方法。 - 請求項1から4までのいずれか一項に記載の方法において、
TF、SERPINA1、APOA4、AFM、AZGP1、ORM1、ORM2、C3、A1BG、SERPINC1、LRG1、IGHA1、IGHG4、TFAP2C、HPX、A2M、CARD6、SERPINA7、CCDC73、CYSTM1、およびAPOA1からなる群から選択される少なくとも6つの遺伝子についてのタンパク質レベルが測定される、方法。 - 請求項1から4までのいずれか一項に記載の方法において、
A1BG、AFM、APOA1、APOA4、IGHA1、IGHG4、LRG1、SERPINA1、SERPINC1およびTFからなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子についてのタンパク質レベルが測定される、方法。 - 請求項6に記載の方法において、
A1BG、AFM、APOA1、APOA4、IGHA1、IGHG4、LRG1、SERPINA1、SERPINC1およびTFからなる群から選択される少なくとも6つの遺伝子についてのタンパク質レベルが測定される、方法。 - 請求項1から7までのいずれか一項に記載の方法において、
前記同種移植片レシピエントまたはその試料は、ABMRを有しない同種移植片レシピエントの参照試料における前記少なくとも2つの遺伝子についての参照タンパク質レベルと比較して前記タンパク質レベルが増加したときに、ABMRを有すると分類される、方法。 - 請求項1から8までのいずれか一項に記載の方法において、
− 前記試料におけるタンパク質をトリプシンで切断し、ペプチドの混合物を作成する工程と、
− 前記ペプチドの混合物を液体クロマトグラフィ工程に供し、ペプチドを含む溶出液を作成する工程と、
− 前記溶出液についての質量分析工程を行い、前記少なくとも2つの遺伝子についての前記タンパク質レベルを表す前記少なくとも2つのペプチドについてのペプチドレベルを測定する工程とをさらに備える、方法。 - 請求項9に記載の方法において、
前記少なくとも2つのペプチドは配列番号1−22から選択される、方法。 - 請求項1から8までのいずれか一項に記載の方法において、
前記タンパク質レベルの測定は、酵素結合免疫吸着検査法(ELISA)により行われる、方法。 - 同種移植片レシピエントのABMR群または非ABMR群への割り当て方法であって、
− 移植片拒絶反応を患っているか、患うリスクのある同種移植片レシピエントからのタンパク質を含む試料における、TF、SERPINA1、APOA4、AFM、AZGP1、ORM1、ORM2、C3、A1BG、SERPINC1、LRG1、IGHA1、IGHG4、TFAP2C、HPX、A2M、CARD6、SERPINA7、CCDC73、CYSTM1、およびAPOA1からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子についてのタンパク質レベルを測定する工程と、
− 前記少なくとも2つの遺伝子についての、前記測定されたタンパク質レベルと参照タンパク質レベルとの比較を行う工程と、
− 前記測定されたタンパク質レベルと前記参照タンパク質レベルとの前記比較に基づいて、前記同種移植片レシピエントを前記ABMR群または前記非ABMR群に割り当てる工程とを備える方法。 - 尿試料における、同種腎移植片レシピエントにおけるABMRの有無についてのマーカーとしての、TF、SERPINA1、APOA4、AFM、AZGP1、ORM1、ORM2、C3、A1BG、SERPINC1、LRG1、IGHA1、IGHG4、TFAP2C、HPX、A2M、CARD6、SERPINA7、CCDC73、CYSTM1、またはAPOA1の複数の遺伝子によりコードされた少なくとも2つのタンパク質、好ましくは前記少なくとも2つのタンパク質のタンパク質レベルの、使用。
- ABMRに関連した移植片拒絶反応を患う同種移植片レシピエントの処置に用いるための標準治療治療剤であって、
(i)請求項1から11までのいずれか一項に記載の方法により、前記レシピエント若しくはその試料がABMRを有すると分類されるか、または、
(ii)請求項12に記載の方法により、前記レシピエント若しくはその試料がABMR群に割り当てられる、標準治療治療剤。 - 請求項14に記載の標準治療治療剤において、
前記治療剤は、コルチコステロイド、リツキシマブ、静脈注射用免疫グロブリン(IVIG)製品、ボルテゾミブ、エクリズマブおよびこれらの組合せからなる群から選択され、前記治療剤は治療的に有効な投薬方式により投与するためのものである、標準治療治療剤。 - ABMRに関連する移植片拒絶反応を患う同種移植片レシピエントの処置方法であって、
− ABMRに関連する移植片拒絶反応を患う同種移植片レシピエントに治療的に有効な量の標準治療治療剤を投与する工程を備え、
(i)請求項1から11までのいずれか一項に記載の方法により、前記レシピエント若しくはその試料がABMRを有すると分類されるか、または、
(ii)請求項12に記載の方法により、前記レシピエント若しくはその試料がABMR群に割り当てられる、方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP17306944.4 | 2017-12-27 | ||
EP17306944 | 2017-12-27 | ||
PCT/EP2018/097044 WO2019129824A1 (en) | 2017-12-27 | 2018-12-27 | Biomarkers for typing allograft recipients |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2021524906A true JP2021524906A (ja) | 2021-09-16 |
JP7073528B2 JP7073528B2 (ja) | 2022-05-23 |
Family
ID=60990612
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2020555307A Active JP7073528B2 (ja) | 2017-12-27 | 2018-12-27 | 同種移植片レシピエントを分類するためのバイオマーカー |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20200400685A1 (ja) |
EP (1) | EP3732487A1 (ja) |
JP (1) | JP7073528B2 (ja) |
CN (1) | CN111971561A (ja) |
WO (1) | WO2019129824A1 (ja) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN114496279B (zh) * | 2022-01-12 | 2022-08-30 | 广州保量医疗科技有限公司 | 菌群移植配型的排序方法、系统、计算机设备及存储介质 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013150375A2 (en) * | 2012-04-04 | 2013-10-10 | Assistance Publique Hôpitaux De Paris | Endothelial cells activation biomarkers characterizing antibody mediated rejection and uses thereof |
JP2015517469A (ja) * | 2012-05-01 | 2015-06-22 | デユーク・ユニバーシテイ | 移植片拒絶のバイオマーカーとしてのヘパラン硫酸の組成物および方法 |
WO2015155199A1 (en) * | 2014-04-08 | 2015-10-15 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | A new biomarker of antibody-mediated rejection |
US20160356774A1 (en) * | 2014-03-07 | 2016-12-08 | University Of Washington - Center For Commercialization | Non-Invasive Biomarker of Antibody-Mediated Allograft Rejection |
JP2017513009A (ja) * | 2014-04-09 | 2017-05-25 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | 免疫評価および移植片拒絶の予測のためのタンパク質バイオマーカー |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7972802B2 (en) * | 2005-10-31 | 2011-07-05 | University Of Washington | Lipoprotein-associated markers for cardiovascular disease |
US20080009442A1 (en) * | 2005-12-06 | 2008-01-10 | Institute For Human Genetics And Biochemistry | Therapeutic use for alpha1 proteinase inhibitor in hematopoiesis |
CN102119224A (zh) * | 2008-05-30 | 2011-07-06 | 不列颠哥伦比亚大学 | 使用基因组或蛋白质组表达图谱诊断肾同种异体移植物的排斥的方法 |
-
2018
- 2018-12-27 US US16/958,240 patent/US20200400685A1/en active Pending
- 2018-12-27 WO PCT/EP2018/097044 patent/WO2019129824A1/en unknown
- 2018-12-27 EP EP18830860.5A patent/EP3732487A1/en active Pending
- 2018-12-27 JP JP2020555307A patent/JP7073528B2/ja active Active
- 2018-12-27 CN CN201880090304.8A patent/CN111971561A/zh active Pending
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013150375A2 (en) * | 2012-04-04 | 2013-10-10 | Assistance Publique Hôpitaux De Paris | Endothelial cells activation biomarkers characterizing antibody mediated rejection and uses thereof |
JP2015517469A (ja) * | 2012-05-01 | 2015-06-22 | デユーク・ユニバーシテイ | 移植片拒絶のバイオマーカーとしてのヘパラン硫酸の組成物および方法 |
US20160356774A1 (en) * | 2014-03-07 | 2016-12-08 | University Of Washington - Center For Commercialization | Non-Invasive Biomarker of Antibody-Mediated Allograft Rejection |
WO2015155199A1 (en) * | 2014-04-08 | 2015-10-15 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | A new biomarker of antibody-mediated rejection |
JP2017513009A (ja) * | 2014-04-09 | 2017-05-25 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | 免疫評価および移植片拒絶の予測のためのタンパク質バイオマーカー |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
HALLORAN, P. F. ET AL.: "Microarray Diagnosis of Antibody-Mediated Rejection in Kidney Transplant Biopsies: An International", AMERICAN JOURNAL OF TRANSPLANTATION, vol. 13, no. 11, JPN6021048080, November 2013 (2013-11-01), pages 2865 - 2874, XP055457647, ISSN: 0004655120, DOI: 10.1111/ajt.12465 * |
RODRIGUEZ, R. ET AL.: "Behavior of pro-inflammatory markers in short and long-term stable renal transplaneted pediatrics pa", PEDIATRIC NEPHROLOGY, vol. 31, no. 10, JPN6021048082, October 2016 (2016-10-01), pages 1951, ISSN: 0004655121 * |
XU-DUBOIS, Y. ET AL.: "Markers of Endothelial-to-Mesenchymal Transition: Evidence for Antibody-Endothelium Interaction duri", JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY OF NEPHROLOGY, vol. 27, no. 1, JPN6021048078, January 2016 (2016-01-01), pages 324 - 332, XP055455475, ISSN: 0004655118, DOI: 10.1681/ASN.2014070679 * |
野呂大輔 ほか: "血清N-glycanの質量解析による抗体関連拒絶反応予知因子の探索", 日本臨床腎移植学会雑誌, vol. 第5巻,第1号, JPN6021048079, July 2017 (2017-07-01), pages 71 - 82, ISSN: 0004655119 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2019129824A1 (en) | 2019-07-04 |
CN111971561A (zh) | 2020-11-20 |
JP7073528B2 (ja) | 2022-05-23 |
EP3732487A1 (en) | 2020-11-04 |
US20200400685A1 (en) | 2020-12-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2019035768A (ja) | 口腔癌検出用唾液バイオマーカー | |
Bakun et al. | Urine proteome of autosomal dominant polycystic kidney disease patients | |
CN105122068A (zh) | 蛋白质组学ipf标志物 | |
US20180088126A1 (en) | Method of identifying proteins in human serum indicative of pathologies of human lung tissues | |
US20210325409A1 (en) | Biomarkers and uses thereof for diagnosing the silent phase of alzheimer's disease | |
US10359433B2 (en) | BAG3 as biochemical serum and tissue marker | |
Wang et al. | Quantitative proteomic analysis of urinary exosomes in kidney stone patients | |
WO2012004276A2 (en) | Multiprotein biomarkers of amyotrophic lateral sclerosis in peripheral blood mononuclear cells, diagnostic methods and kits | |
JP6366608B2 (ja) | 癌診断における血小板バイオマーカー | |
JP7073528B2 (ja) | 同種移植片レシピエントを分類するためのバイオマーカー | |
JP2019536062A (ja) | 敗血症又は敗血症性ショック(ss)患者に由来する血漿中の循環ヒストンh3及びh2bを検出する質量分析ベースの方法 | |
CN108473529B (zh) | 检测和治疗肺高压的方法 | |
JPWO2020013097A1 (ja) | 前立腺がんに特異的な糖鎖、及びこれを用いた検査方法 | |
US20150118224A1 (en) | Endothelial cells activation biomarkers characterizing antibody mediated rejection and uses thereof | |
WO2020251024A1 (ja) | 特発性肺線維症の予後予測方法 | |
JP2015108515A (ja) | 大腸癌の診断のための検査方法 | |
WO2022091793A1 (ja) | 糞便由来タンパク質を用いた膵臓がんバイオマーカーの開発 | |
Ngo et al. | Proteomic profiling of bronchoalveolar lavage fluid uncovers protein clusters linked to survival in idiopathic forms of interstitial lung disease | |
KR101912377B1 (ko) | 폐암감별진단용 바이오마커 및 이를 이용한 폐암감별진단용 정보제공 방법 | |
JP6772489B2 (ja) | オートタキシン測定による心臓病等の検査方法および検査薬 | |
Kaushal | Development and Application of Quantitative Methods for Clinical High-Throughput Proteomics | |
AU2015201494A8 (en) | Identification of proteins in human serum indicative of pathologies of human lung tissues |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20201203 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210618 |
|
RD03 | Notification of appointment of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7423 Effective date: 20210630 |
|
RD04 | Notification of resignation of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424 Effective date: 20210812 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20211206 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20220303 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20220411 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20220511 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7073528 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |