JP2021521789A - Ifnと抗pd−l1抗体の融合タンパク質およびその使用 - Google Patents

Ifnと抗pd−l1抗体の融合タンパク質およびその使用 Download PDF

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Abstract

本発明は、IFN−anti−PD−L1融合タンパク質、融合タンパク質を含む医薬組成物およびキット、ならびに腫瘍治療における融合タンパク質の適用に関する。本発明の融合タンパク質は、PD−L1およびIFN受容体を同時に標的とすることができ、腫瘍微小環境におけるIFNシグナルの活性化は、より強力なT細胞活性化を誘導することにより、腫瘍のPD−1/PD−L1治療を強化することができる。また、抗PD-L1抗体は、免疫調節分子を腫瘍組織に特異的に送達するために使用されることができる。融合タンパク質の作用により、複数のフィードフォワード応答が生成される。これにより、ターゲティング効果が高まり、毒性が低下するだけでなく、IFN療法への応答が強化され、抗腫瘍効果を最大化する。
【選択図】図10

Description

本発明は、遺伝子工学と生物医学医療の技術分野に属し、具体的に、IFNと抗PD−L1抗体の融合タンパク質、融合タンパク質を含む薬物組成物と試薬キット、融合タンパク質の腫瘍疾病の治療における使用に関する。
プログラムされた細胞死タンパク質1(PD−1)は、T細胞のTCRシグナル活性化を阻害し、それによって免疫応答の強度と持続時間を短縮できる重要な免疫チェックポイント分子である。そのリガンドPD−L1は一般に腫瘍細胞でアップレギュレートされ、腫瘍が免疫応答を回避するメカニズムの1つになっている。 PD−1 / PD−L1ブロッキング療法(PD療法と略称)は、さまざまな癌患者の腫瘍細胞に対して長期的な免疫応答を誘発する可能性がある。しかし、実際には、客観的かつ効果的な免疫反応は、PD療法を受けている少数の患者でのみ観察される。さらに、後天性PD療法における薬剤耐性もますます注目されており、そのメカニズムはまだ不明である。したがって、特定の腫瘍がPD療法に反応できない、または薬剤耐性を発現できない理由の研究と分析は、PD療法関連の研究の最優先事項になっている。
一部の学者は、T細胞が免疫抑制シグナルを放出するため、PD療法が腫瘍を効果的に制御できると提案している。報告によると、PD療法の優れた効果は、十分な数の腫瘍浸潤リンパ球(TILs)に関連している。ただし、リンパ球浸潤が多数存在する場合でも、PD療法だけでは腫瘍特異的T細胞の(再)活性化には効果がない場合がある。これらの場合、T細胞の(再)活性化を誘導するために、他の負の相乗的阻害剤を遮断または刺激信号をアップレギュレートする必要があるかもしれない。しかし、T細胞免疫を効果的に促進することができるシグナル分子についてはまだ多くの論争がある。
I型インターフェロンにはIFNαとIFNβが含まれており、樹状細胞(DC)の成熟を促進し、抗原を処理および提示することでT細胞を活性化し、自然免疫と適応免疫の間の架け橋として機能する。初期の研究では、I型インターフェロンは腫瘍細胞の増殖を抑制し、アポトーシスを促進する効果があることがわかったため、リンパ腫、黒色腫、腎細胞腫瘍などの臨床的に特異的な腫瘍の治療に承認されている。最近の研究では、I型インターフェロンシグナル伝達経路によって媒介されるAPCおよびT細胞の活性化が、腫瘍の放射線療法および化学療法において重要な役割を果たすことが示されている。ただし、腫瘍組織におけるI型インターフェロンの発現は非常に低いである。外因性I型インターフェロン療法は、腫瘍の増殖と生存を阻害するだけでなく、抗腫瘍免疫応答を活性化することができるため、重要な研究対象となっている。
臨床的には、高用量のI型インターフェロン治療はより良い腫瘍制御効果をもたらす。ただし、IFNAR受容体は正常組織で広く発現しているため、高用量のI型インターフェロンは、インフルエンザ様症状(発熱、頭痛など)、嘔吐、白血球減少症、貧血、血小板減少症などの症状を含む重篤な副作用を患者に引き起こす可能性がある。さらに、I型インターフェロンは免疫抑制分子PD−L1の発現をアップレギュレートすることができ、これにより抗腫瘍免疫応答が阻害され、治療効果が低下する。 I型インターフェロンによって引き起こされる全身毒性と免疫抑制をどのように克服するかは、解決すべき重要な問題である。
[発明が解決しようとする課題]
腫瘍浸潤リンパ球の存在にもかかわらず、ほとんどの患者は依然として集中的なPD−1 / PD−L1療法に反応しない。 本発明者らは、生来の免疫抗原提示細胞の不完全な活性化が、PD−1 / PD−L1遮断後の腫瘍特異的T細胞の完全な活性化を制限する可能性があると考えている。 I型インターフェロン(IFN)の局所送達は、抗原提示を回復するが、PD−L1をアップレギュレートし、そしてT細胞の活性化を阻害する。
[課題を解決するための手段]
従来技術の上記の制限および欠陥を克服するために、本発明は、PD−L1およびIFN受容体を同時に標的とすることができるIFN−anti−PD−L1抗体(IFN−anti−PD−L1)融合タンパク質を提供する。 実験では、IFN−anti−PD−L1融合タンパク質が腫瘍組織に蓄積し、抗原のクロスサブミッションを大幅に増加させ、PD−L1を介した免疫抑制を克服できることが観察された。 IFN−anti−PD−L1融合タンパク質は、免疫抑制シグナルを同時に放出し、共刺激シグナルを提供してT細胞を(再)活性化し、腫瘍疾患の治療のための新世代の抗PD−L1抗体として使用できる。
本発明の目的は以下の技術案により実現される。
本発明は、融合タンパク質を提供し、前記融合タンパク質はインターフェロン(IFN)とPD−L1結合タンパク質を融合接続させてなるIFN−anti−PD−L1であり、前記融合タンパク質はホモダイマータンパク質或いはヘテロダイマータンパク質である。
本発明の前記ホモダイマータンパク質は、第一ペプチドと第二ペプチドを含み、前記第一ペプチドと第二ペプチドが同様であり、前記第一ペプチドと第二ペプチドはN端からC端までの順でIFN、PD−L1結合タンパク質、と免疫グロブリンFc区を含む。
本発明の前記ヘテロダイマータンパク質は、第一ペプチドと第二ペプチドを含み、前記第一ペプチドは第二ペプチドと異なり、前記第一ペプチドはPD−L1結合タンパク質を含み、前記第二ペプチドはIFNと免疫グロブリンFc区を含み、IFNはFc区のN端に位置しており、前記第一ペプチドに含まれるFc区と第二ペプチドに含まれるFc区は同様な、または異なるサブタイプを有する免疫グロブリンに由来する。
本発明に記載のインターフェロン(IFN)は、I型インターフェロン、I型インターフェロン変異体、II型インターフェロンおよび/またはIII型インターフェロンから選択され、例えばIFN−α、IFN−β、IFN−γ、IFN−λ1(IL−29)、IFN−λ2(IL−28a)、IFN−λ(IL−28b)とIFN−ωなどがあり、好ましくはI型インターフェロンであり、好ましくはIFN−α4であり、さらに好ましくはIFN−α4変異体であり、前記IFNはヒトソース或いはマウスソースに由来し、好ましくはIFN−α4(SEQ ID NO.13)であり、さらに好ましくはIFN−α4変異体であり、さらに好ましくは変異体mIFN−α4(L30A)(SEQ ID NO.25)、mIFN−α4(R144A)(SEQ ID NO.27)、mIFN−α4(A145G)(SEQ ID NO.29)、mIFN−α4(R149A)(SEQ ID NO.31)、mIFN−α4(S152A)(SEQ ID NO.33)、hIFN−α2(Q124R)(SEQ ID NO.35)である。
本発明に記載の免疫グロブリンFc区は、IgG1、IgG2、IgG3および/またはIgG4の定常領域アミノ酸配列から選択されることができ、好ましくはIgG1である。そのうちの、IgG1はADCCおよびCDC効果を誘発する強力な能力と長い血清半減期を持っており、抗体薬の最も一般的な抗体サブタイプである。IgG2、IgG4は、ADCCおよびCDC効果を誘発する能力が弱いであるが、血清半減期は長くなる。
本発明に記載のPD−L1結合タンパク質は、抗PD−L1抗体(完整抗体)、一本鎖抗体(ScFv)、Fab断片、F(ab’)2断片から選択することができ、前記抗PD−L1抗体はTecentriq、Bavencio、Imfinzi、KN035、CS1001、KL−A167、SHR−1316および/またはYW243.55.S70から選択されることは好ましい。さらに好ましくは、PD−L1が結合された一本鎖抗体(ScFv)であり、さらに好ましくはYW243.55.S70である。
本発明に記載のホモダイマータンパク質の第一ペプチドと第二ペプチドはSEQ ID NO.3に示すアミノ酸配列を含むことが好ましい。前記ヘテロダイマータンパク質の第一ペプチドはSEQ ID NO.1に示すアミノ酸配列を含むことが好ましく、前記第二ペプチドはSEQ ID NO.2、37、39、41、43、45、47に示すアミノ酸配列を含む。
本発明は、さらに、融合タンパク質の使用を提供しており、IFN−anti−PD−L1を腫瘍細胞に投与することで、腫瘍細胞の成長および/または移動を抑制できる。
本発明は、IFN−anti−PD−L1融合タンパク質の腫瘍疾病の治療における使用、および、IFN−anti−PD−L1融合タンパク質の薬物または試薬キットの製造における使用を提供する。前記腫瘍は、単独でPD−1/PD−L1の遮断に無効となる腫瘍または後期腫瘍であることは好ましく、抗PD−1/PD−L1抗体の単独の治療に対して耐性がある、または無効になる腫瘍は好ましく、好ましくは、上記腫瘍がB細胞リンパ腫、結腸癌とメラノーマである。
本発明は、薬物製剤または薬物組成物を提供しており、前記薬物製剤の活性成分は本発明に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1を含む。
本発明は、試薬キットを提供しており、前記試薬キットは本発明に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1を含む。
本発明は、核酸分子を提供しており、前記核酸分子は、本発明に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1をコードする。
前記核酸分子については、1)コード前記ホモダイマータンパク質をコードする核酸分子は、好ましくはSEQ ID NO.6に示すヌクレオチド配列であり、
2)前記ヘテロダイマータンパク質をコードする核酸分子は、SEQ ID NO.4、5、7、8、9、10、38、40、42、44、46、48に示すヌクレオチド配列から選択することは好ましく、SEQ ID NO.4とSEQ ID NO.5,SEQ ID NO.4とSEQ ID NO.40、あるいはSEQ ID NO.4とSEQ ID NO.42であることは好ましい。
本発明は、ベクターを提供しており、前記ベクターは上記核酸分子を含む。
本発明は、細胞を提供しており、前記細胞は、本発明に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1あるいは融合タンパク質をコードする核酸分子を含み、融合タンパク質の生産に用いられる。前記細胞は、人以外の哺乳類動物の細胞から選択され、CHOとHEK293細胞は好ましい。
本発明は、腫瘍を治療する方法を提供しており、癌症患者へ有効量の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1の投与を含む。前記腫瘍は、PD−1/PD−L1遮断での単独治療に無効となる腫瘍である。
本発明は、PD−1/PD−L1の遮断での単独治療に无效となる腫瘍、または後期腫瘍を治療する方法を提供し、患者へ有效量のIFN−αと抗PD−L1抗体を投与することを含む。また、本発明は、IFN−αと抗PD−L1抗体を同時に薬物組成物、薬物製剤または試薬キットの製造における用途を提供する。本発明は、さらに、IFN−αと抗PD−L1抗体を含む薬物組成物、薬物製剤或試薬キットを提供しており、そのうち、上記のIFN−αは腫瘍内に投与される必要がある。
これを基に、本発明は、抗PD−1/PD−L1抗体とIFN−anti−PD−L1の併用療法、抗PD−1/PD−L1抗体とIFN−anti−PD−L1融合タンパク質の薬物組成物或いは試薬キットを提供する。前記療法は、患者へ有效量の抗PD−1/PD−L1抗体とIFN−anti−PD−L1を投与することを含み、前記投与は、順序に投与または同時に投与である。前記腫瘍は、PD−1/PD−L1の遮断での単独治療に耐性がある腫瘍、無効となる腫瘍、或いは後期腫瘍である。抗PD−1/PD−L1抗体の単独治療に耐性がある腫瘍、無効となる腫瘍は好ましい。或いは、前記腫瘍患者は、末梢リンパ球輸送欠陥/障碍に関する疾病があり、前記患者の末梢リンパ球は、腫瘍組織に移動できない。
本発明は、融合タンパク質IFN−anti−PD−L1と抗PD−1/PD−L1抗体を同時に、腫瘍を治療する薬物組成物または試薬キットの製造における用途を提供する。前記腫瘍は、PD−1/PD−L1の遮断での単独治療に無効となる腫瘍、或いは後期腫瘍である。PD−1/PD−L1の遮断で単独の治療耐性がある腫瘍、無効となる腫瘍、或いは後期腫瘍である。抗PD−1/PD−L1抗体の単独治療に耐性がある腫瘍、無効となる腫瘍は好ましい。或いは、前記腫瘍患者は、末梢リンパ球輸送欠陥/障碍に関する疾病があり、前記患者の末梢リンパ球は、腫瘍組織に移動できない。
本発明は、IFN−αと抗PD−L1抗体を同時にPD−1/PD−L1の遮断での単独治療に无效となる腫瘍、あるいは後期腫瘍を治療する薬物組成物、薬物製剤或いは、試薬キットの製造における用途を提供し、前記IFN−αは腫瘍内に投与する必要がある。
本発明は、IFN−αと抗PD−L1抗体を含む薬物組成物、薬物製剤或いは試薬キットを提供し、前記IFN−αは腫瘍内に投与する必要がある。
本発明は、融合タンパク質IFN−anti−PD−L1の白血球のIFN受容体発現をアップレギュレートする用途を提供し、前記白血球は、CD45+細胞であることは好ましく、前記IFN受容体はIFNARであることは好ましい。また、融合タンパク質IFN−anti−PD−L1の白血球のIFN受容体発現をアップレギュレートする組成物の製造における用途を提供する。
本発明は、融合タンパク質IFN−anti−PD−L1のDC細胞あるいはTIL細胞の活性化における用途を提供する。また、融合タンパク質IFN−anti−PD−L1の調整活性化DC細胞またはTIL細胞の組成物の製造における用途を提供する。
本発明は、融合タンパク質IFN−anti−PD−L1の腫瘍常駐T細胞の活性化における用途を提供する。また、融合タンパク質IFN−anti−PD−L1の腫瘍常駐T細胞の活性化の組成物の製造における用途を提供する。
上記の「用途」は、治療を目的とする用途、および、治療を目的としない用途とを両方指すことができる。
本発明は、IFN−α4変異体を提供し、前記変異体は受容体との親和性が低下した突然変異であり、mIFN−α4(L30A) (SEQ ID NO.25)、mIFN−α4(R144A) (SEQ ID NO.27)、mIFN−α4(A145G) (SEQ ID NO.29)、mIFN−α4(R149A) (SEQ ID NO.31)、mIFN−α4(S152A) (SEQ ID NO.33)、および/またはhIFN−α2(Q124R) (SEQ ID NO.35)を含む。
本発明は、上記IFN−α4変異体をコードする単離された核酸分子を提供しており、前記核酸分子のヌクレオチド配列は、SEQ ID NO.26、28、30、32、34、36に示す通りである。
本発明は、IFN−α4変異体の、治療腫瘍を治療する融合タンパク質或いは薬物の製造における用途を提供する。
用語と定義
特別に説明しない限り、本願に用いられる用語と定義はいずれも当分野における通常の意味であって、また、当業者に了解されている。
本願に使用されている通り、「腫瘍部位」という用語は、腫瘍細胞を含むか、または含むことが疑われるIn vivoまたはIn vitroの位置を指す。前記腫瘍部位には、固形腫瘍と、腫瘍が成長する場所に近いまたは隣接する場所が含まれる。
本願に使用されている通り、「投与」という用語は、全身および/または局所への投与を指す。「全身投与」という用語は、非局所投与を指し、その結果、投与された物質は、全身のいくつかの器官または組織に影響を及ぼし、或いは、投与された物質は、全身のいくつかの器官または組織を横断して、標的部位に到達し得る。例えば、受験者の循環系への投与の原因で、治療産物を、投与されたベクターによって複数の組織または器官で発現させることができ、または治療産物を、投与されたベクターによって特定の部位で発現させることができる。これは、例えば、自然の向性によるか、組織固有のプロモーター要素に動作可能にリンクされているためである。当業者は、全身投与が様々な形態の投与を包含することを理解し、非経口投与、静脈内投与、筋肉内投与、皮下投与、経皮投与、腫瘍内投与、経口投与などを含むがこれらに限定されない。
「局所投与」という用語は、特定の部位またはその周辺での投与を指す。当業者は局所投与が、特定の部位への直接注射またはその周囲への注射(例えば、腫瘍内投与)などの様々な形態の投与を包含することを理解できる。
本明細書で使用されるとおり、「治療有効量」という用語は、疾患または状態(例えば、腫瘍退縮または腫瘍のサイズの縮小のための腫瘍/癌)の治療の目的を達成するために必要とされる本発明のインターフェロン、或いは、本発明のキット中の成分の量を指す。有効量は、特定の目的のために、実践および従来の方法で決定することができる。特に、治療有効量は、以下の目的を達成するために必要な量であり得る。癌細胞の数を減らす、腫瘍サイズを減らす、末梢器官への癌細胞の浸潤を阻害する(すなわち、減速または停止する)、腫瘍の転移を阻害する(すなわち、減速または停止する)、腫瘍の成長を阻害する、および/または癌に関連する1つまたは複数の症状を緩和する。
「抗体」という用語は、例えば、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、一本鎖抗体、抗体断片(所望の生物学的または免疫学的活性を示す)を含む。本願では、「免疫グロブリン」(Ig)という用語と抗体は同じ意味で使用される。抗体は、EGFR、CD4、CD8、Neuなどのような表面腫瘍抗原などの腫瘍抗原を特異的に標的とすることができる。
本発明の「腫瘍」は、B細胞リンパ腫、肺癌、気管支癌、結腸直腸癌、前立腺癌、乳癌、膵臓癌、胃癌、卵巣癌、膀胱癌、脳または中枢神経系癌、末梢神経系癌、食道癌、子宮頸癌、黒色腫、子宮または子宮内膜癌、口腔または喉の癌、肝臓癌、腎臓癌、胆管癌、小腸癌または虫垂癌、唾液腺癌、胸腺癌、副腎癌、骨肉腫、軟骨肉腫、脂肪腫、精巣癌、および悪性線維性組織球腫から選択することができる。
本発明の「腫瘍細胞」は、B細胞リンパ腫、肺癌、気管支癌、結腸直腸癌、前立腺癌、乳癌、膵臓癌、胃癌、卵巣癌、膀胱癌、脳または中枢神経系癌、末梢神経系癌、食道癌、子宮頸癌、メラノーマ、子宮癌または子宮内膜癌、口腔癌または喉癌、肝癌、腎臓癌、胆管癌、小腸癌または虫垂癌、唾液腺癌、胸腺癌、副腎癌、骨肉腫、軟骨肉腫、脂肪腫、精巣癌、および悪性線維性組織球腫の癌に由来する細胞から選択することができる。
本発明における「用途」または「使用」は、疾患治療または科学的研究などの非治療目的のための用途を意味することができる。
本発明の優れた效果:
1.本発明によって提供されるIFN−anti−PD−L1融合タンパク質は、PD−L1およびIFN受容体の両方を標的とする。データからわかるように、TMEにおけるIFNシグナルの活性化が、より強いT細胞活性化を誘導することによって進行腫瘍のPD −1 / PD−L1治療を増強できる。
2.本発明によって提供されるIFN−anti−PD−L1融合タンパク質によれば、データからわかるように、抗PD−L1抗体(PD−L1結合タンパク質)は、最小限の毒性で腫瘍組織に免疫調節分子を特異的に送達できる。本発明は、腫瘍標的治療のための新しい抗PD−L1抗体の発明の基礎を築く。
3.本発明によって提供されるIFN−anti−PD−L1融合タンパク質は、腫瘍微小環境におけるPD−L1遮断およびIFN−α受容体(IFNAR)活性化を標的とする複数のフィードフォワード応答を生成することができる。標的効果を高めるだけでなく、IFN療法への反応を高め、抗PD−L1とIFNの相乗効果を実現し、PD−1/PD−L1療法とIFN耐性を克服する。実験データは、IFN−anti−PD−L1が腫瘍組織の標的、抗原提示細胞の活性化、またPD−L1阻害シグナルの遮断を同時に実験ぢ、新世代の抗PD−L1抗体として腫瘍疾患への治療に使用できる。
4.本発明により提供されるIFN−anti−PD−L1融合タンパク質をPD−1/PD−L1遮断と併用て使用する場合、IFN−anti−PD−L1はPD−1/PD−L1耐性腫瘍のほとんどを完全に排除するとともに、記憶T細胞免疫応答を誘発する。
5.本発明によって提供される融合タンパク質は、ホモダイマーおよびヘテロダイマーの2つの構造を有し、それぞれIn vivoおよびIn vitroで高いIFN受容体結合親和性、より効果的な抗ウイルス活性、および優れた腫瘍標的性、血清半減期およびIn vivoでの腫瘍制御性を有する。
6.本発明によって提供される融合タンパク質は、親和性が低下した変異体IFNαを含み、より特異的な標的細胞結合能力を有し、IFNの末梢オフ標的効果を回避する。
I型IFNの局所投与は、PD−1/PD−L1遮断に対する進行腫瘍の耐性を克服した。(a)Balb/cマウス(n=3)に3x10個のA20細胞を皮下接種し、初期腫瘍(<50mm)を有するマウスを11日目と15日目に200μgの抗PD−L1抗体で腹腔内投与した(intraperitoneally(ip))。(b)進行したA20腫瘍(>100mm)(n=4)を有するマウスは、15日目と19日目に200μgの抗PD−L1抗体で治療された。腫瘍の成長は週に2回測定された。(c)(a)および(b)に従ってマウスを治療した。3日間の治療後、排液リンパ節の細胞を分離し、照射の有無にかかわらず2日間A20細胞と共培養した。IFNγELISPOT測定を実行した。(d)A20担癌マウス(n=5)は、11日目と15日目に200μgの抗PD−L1抗体で治療され(ip)、および/または11日目に25μgのIFNα−Fcで治療された(腫瘍内注射intratumorally (i.t.))。(e)C57BL / 6マウスに5×10のMC38細胞を接種した(n=5)。9、12、15日目に200μgの抗PD−L1抗体で治療(i.p.)、および/または9日目に25μgのIFNα−Fcで治療した。生存曲線が表示された。(f)A20担癌マウス(n=5)は、11日目に25μgのIFNα−Fc(i.t。または静脈注射(i.v.))で治療された。黒い矢印はIFNα−Fcによる治療を示している。データは平均±SEMを表し、少なくとも2つの独立した実験を表した。 *、p <0.05; **、p <0.01; n.s.、有意ではない。 IFN−anti−PD−L1融合タンパク質の構造と特性を示す。 (a)IFN−anti−PD−L1融合タンパク質のホモダイマーまたはヘテロダイマーの概略図、scFv、一本鎖可変領域断片を示す。 (b〜c)IFNAR1−/−A20細胞(b)およびPD−L1−/−A20細胞(c)に示されるタンパク質の結合を示すフローサイトメトリーである。数字は平均蛍光強度(MFI)を示している。 (d)抗ウイルス感染バイオアッセイによってIFN−anti−PD−L1タンパク質の生物学的活性を測定した。 VSV−GFPウイルスに感染する前に、L929細胞を各タンパク質とともに一晩培養した。さらに30時間培養した後、ウイルスに感染した細胞の割合をフローサイトメトリーで測定した。(e〜f)Balb / cマウスに3×10個のA20細胞を接種した(n = 5)。腫瘍が確立した後、20μgの対応するタンパク質を腫瘍内注射(e、18日目と22日目の治療)または静脈内注射(f、11日目と15日目)し、腫瘍サイズを週に2回測定した。 (g)C57BL / 6マウスに5×10のMC38細胞を接種した(n = 4〜8)。 14日目と18日目に、25μgのコントロールまたは融合タンパク質を静脈内注射した。 (h〜i)マウスに25μgの示されたタンパク質を静脈内注射した。 ELISAにより、さまざまな時点で腫瘍組織(h)または血清(i)のタンパク質濃度を測定した。データは平均±SEMを表し、少なくとも2つの独立した実験を表した。 *、p <0.05; **、p <0.01。 IFN−anti−PD−L1融合タンパク質は、副作用が少なく、In vivoでの抗腫瘍効果が良好である。 (a〜b)100μgのIFN−anti−PD−L1ヘテロダイマーまたはIFN−anti−HBsタンパク質を、0日目と4日目に担癌マウスに静脈内注射した。図は、マウスの生存曲線(a)と体重の変化(b)を示している。 (c)100μgのIFN−anti−PD−L1ヘテロダイマーまたはIFN−anti−HBsタンパク質をMC38担癌マウスに静脈内注射した。注射後6時間または24時間で血清を採取した。サイトカインミクロスフェア検出技術(CBA)によって、血清サイトカインレベルを測定した。(d)11日目と15日目に、IFNα−Fc(12.5μg)、抗PD−L1抗体(12.5μg)、IFNα−Fcと抗PD−L1抗体の混合物(12.5μg+12.5μg)、またはIFN−anti−PD−L1融合タンパク質ヘテロダイマー(25μg)を静脈内注射して、A20担癌マウス(n = 5)を治療した。腫瘍サイズは週に2回測定された。 (e)MC38担癌マウスを25μgのコントロールタンパク質またはIFN−anti−PD−L1ヘテロダイマーで処理した。 2日後、腫瘍組織を収集し、PD−L1レベルをフローサイトメトリーで測定した。 FMO、蛍光マイナス1。 (f)マウスを(e)のように扱った。 2日後に腫瘍組織を採取した。 CD45陰性およびCD45陽性細胞におけるIFNARのレベルは、フローサイトメトリーによって測定された。データは平均±SEMを表し、少なくとも2つの独立した実験を表した。 *、p <0.05; **、p <0.01; ***、p <0.001; n.d.、検出不可; n.s.、有意ではない。 宿主または腫瘍細胞で発現したPD−L1は、IFN−ANTI−PD−L1融合タンパク質の抗腫瘍効果を効果的に媒介することができる。(a)フローサイトメトリーにより、WT A20、PD−L1−/−A20、WT MC38、およびPD−L1−/−MC38細胞におけるPD−L1発現を測定した。 (b)30μgのIFN−ANTI−PD−L1ヘテロダイマーをWTまたはPD−L1−/−担癌マウスに静脈内注射した。腫瘍組織は、注射後の異なる時点で収集された。融合タンパク質の濃度はELISAによって測定された。 (c)11日目および15日目のコントロールIgまたはIFN−ANTI−PD−L1によりWTまたはPD−L1− / −A20担癌マウスを処理した(n=4〜5)。腫瘍の成長は週に2回測定された。 (d)8日目と12日目に、WTまたはPD−L−/−MC38担癌マウスをコントロールIgまたはIFN−ANTI−PD−L1で処理した(n = 5〜6)。 (e)MC38担癌マウスをIFN−ANTI−PD−L1で処理した。 2日後、腫瘍組織が収集された。 CD45陰性およびCD45陽性細胞のPD−L1レベルは、フローサイトメトリーによって評価された。 (f)PD−L1−/−マウスにMC38細胞を接種する(n=4〜5)。14日目と18日目にマウスを25μgのコントロールIgまたはIFN−anti−PD−L1で処理した。腫瘍の成長は週に2回測定された。データは平均±SEMを表し、少なくとも2つの独立した実験を表した。*、p<0.05;**、p<0.01;***、p<0.001;n.s.、有意ではない。 宿主細胞によって発現されるIFNARは、腫瘍の制御に不可欠である。(a)11日目でIFN−anti−PD−L1によりA20担癌マウスを処理した(n=5)。IFNARシグナル伝達経路を遮断するために、11日目と14日目にマウスを100 μgの抗IFNAR遮断抗体腫瘍内注射(i.t.)で処理した。 (b)フローサイトメトリーにより、invivoの(B220 +)WTまたはIFNAR−/−A20腫瘍細胞におけるIFNARの発現を評価した。(c)16日目および19日目のIFN−anti−PD−L1によりIFNAR−/−A20担癌マウスを治療した(n=6)。腫瘍の成長は週に2回測定された。(d)5×10個のMC38細胞にWTまたはIFNAR1−/−マウスを接種した。10日目と13日目にマウスを25μgのIFN−anti−PD−L1で処理した(n=4〜5)。(e)11日目と14日目のIFN−anti−PD−L1により担癌マウスを治療した(n=5〜6)。抗CD8欠失抗体は9、12、16日目に投与された。(f)IFN−ANTI−PD−L1治療の2日後、MC38腫瘍組織が分離された。腫瘍浸潤性DCにおけるCD86(CD11c + MHCII +)の発現は、フローサイトメトリーによって測定された。左の写真は代表的なパターンで、右の写真はMFIを示した。データは平均±SEMで表され、少なくとも2つの独立した実験を表した。 *、p <0.05; **、p <0.01; ***、p <0.001; n.s.、有意ではない。 PD−1の遮断により、IFN−anti−PD−L1がフィードフォワード抗腫瘍反応の誘発がさらに確保される。(a)A20担癌Balb/cマウスを15日目に20μgのIFN−anti−PD−L1および/または14日目と17日目に100μgの抗PD−1抗体で処理した(n=4〜5)。腫瘍の成長は週に2回測定された。(b)11日目と14日目に25μgのIFN−ANTI−PD−L1、および/または12日目と15日目に100μgの抗PD−1抗体によりB16担癌C57BL /6マウスを治療した(n=3〜5)。(c)(a)併用療法後に腫瘍が完全に解消したマウス(n=4)では、2.5×10A20細胞に腫瘍を再接種した。 A20細胞を接種したナイーブマウスを対照として使用した。 (d)(a)で同じIFN−anti−PD−L1およびanti−PD−1でマウスを治療した(n=4)。細胞を枯渇させるために、抗PD−1抗体治療の前日からマウスに200μgの抗CD8抗体を注射した。 (e)(a)に記載されているように、マウスをIFN−anti−PD−L1および/またはanti−PD−1で処理した。治療の12日後、腫瘍排出リンパ節を分離し、単一細胞懸濁液を調製した。細胞は、照射または非照射のA20と共培養された。 IFNγELISPOT測定を実行した。(f)A20担癌マウスから腫瘍浸潤性DC(CD11c +)およびT(CD8 +)細胞を分離し、照射されたA20細胞の存在下で共培養した。 IFNαまたは抗PD−L1抗体を培地に添加した。3日後、上清を回収し、IFNγレベルをCBAで測定した。(g)(a)に記載されているように、A20担癌マウスをIFN−ANTI−PD−L1および/または抗PD−1で処理する(n=5〜6)。FTY720は14日目から1日おきに投与された。腫瘍内のCD8+T細胞を除去するために、14日目と17日目に30μgの抗CD8抗体を腫瘍に注射した。黒と青の矢印は、それぞれ抗PD−1による治療、IFN−anti−PD−L1による治療を示す。データは平均±SEMを表し、少なくとも2つの独立した実験を表した。 *、p <0.05; **、p <0.01; ***、p <0.001。 IFN−anti−PD−L1ヘテロダイマーは、腫瘍組織を特異的に標的とし、毒性が弱い。(a)30μgのIFN−anti−PD−L1をMC38担癌マウスに静脈内注射した。注射の1、3、5日後に組織を採取した。融合タンパク質濃度はELISAによって測定された。(b)図3cに示すようにMC38担癌マウスを処理し、注射の6時間後または24時間後に血清を収集した。血清中のサイトカインレベルはCBAによって測定された。データは平均±SEMを示し、2つの重複した実験を表した。 IFN−anti−PD−L1は、腫瘍浸潤性DCにおけるCD80の発現をアップレギュレートする。IFN−anti−PD−L1治療の2日後、MC38腫瘍組織が分離された。フローサイトメトリーを使用して、腫瘍浸潤性DC(CD11c + MHCII +)におけるCD80の発現を検出した。 NKおよびCD4+T細胞は、抗PD−1抗体とIFN−anti−PD−L1の併用によって媒介される抗腫瘍反応において有意な役割を果たしていなかった。図6aに示すように、A20担癌マウスを処理した(n = 4〜5)。 (a)NK細胞を除去するために、20μgの抗シアル酸GM1抗体を13日目から週2回腹腔内注射した。 (b)CD4 + T細胞を除去するために、200μgの抗CD4抗体を13日目から週2回腹腔内注射した。腫瘍の成長は週に2回測定された。データは平均±SEMを表し、2つの重複した実験を表した。黒と青の矢印は、それぞれ抗PD−1とIFN−anti−PD−L1による処理を示した。 (c)図6eに従ってマウスを処理し、脾臓を分離して、単一細胞懸濁液を調製した。細胞は、照射または非照射のA20と共培養された。 IFNγELISPOT測定を実行した。 IFN−anti−PD−L1抗体(IFN−anti−PD−L1)によって媒介される抗腫瘍効果の概略モデルである。抗PD−L1は特異的にIFNを腫瘍組織に運んだ(1)。インターフェロンで介されたPD−L1のアップレギュレーションは、腫瘍特異的なターゲティングを強化した(2および3)。この抗体は、PD−L1 / PD−1シグナル伝達経路を遮断して、免疫ブレーキシグナルを放出した(3)。さらに、IFN−anti−PD−L1はIFNARの発現をアップレギュレートし(4)、これで腫瘍は治療に対してより敏感になった(5)。要するに、これらの要因はT細胞応答を(再)活性化することで腫瘍の成長を制御した(6)。 IFNα親和性が低下した変異体を構築した。 I型インターフェロンと受容体の間の相互作用の重要な部位に対して単一の部位特異的選択的変異を作った。 IFNα−Fc変異体の活性を検出した。IFNα−Fc変異体の生物学的活性は、抗ウイルス感染バイオアッセイによって測定された。 VSV−GFPウイルスに感染する前に、L929細胞を各タンパク質とともに一晩培養した。さらに30時間培養した後、フローサイトメトリーによってウイルス感染細胞の割合を測定し、異なる濃度のタンパク質の細胞感染への阻害率とEC50値を計算した。2つの変異体R144AとA145Gは活性が弱く、潜在的に好ましい標的であった。 変異体IFN−anti−PD−L1のinvitroターゲティングテストである。WT PD−L1 A20細胞と、前もって実験室でCRISPR−Cas9テクノロジーでノックアウトされたPD−L1−/−A20細胞を使用し、異なる濃度の二重特異性タンパク質を追加して72時間インキュベートし、CCK8キットによって異なる濃度のタンパク質の処理下の細胞の増殖結果を検出した。PD−L1−A20細胞とPD−L1 + A20細胞のEC50の比率は、この二重特異性タンパク質のターゲティングを反映できた。wt−mIFNa4−Fcのデータで比率を正規化した後、R144AとA145Gはターゲティングの優れた二種類の突然変異であった。
本発明については、以下の例でさらに詳しく説明するが、本発明は以下の内容に限定されないことを理解されたい。
材料と方法:
マウス:
雌(6〜8週齢)のBALB / cマウスとC57BL / 6マウスは、Weitong Lihua(北京、中国)から購入した。 すべてのマウスは、SPFフリーの条件下で生物物理学研究所の動物室に保管される。 動物の世話と実験は、中国科学院生物物理学研究所のガイドラインに従って行われ、IACUC(Institutional Laboration Animal Care and UseCommittee)によって承認されたプロトコルに従った。 PD−L1−/−およびIFNAR1−/−マウスは、UTの南西医療センターでSPF条件下で飼育された。 動物プロトコルはNIHガイドラインに準拠する。 この研究は、UTサウスウエスタンメディカルセンターの動物管理使用委員会によって承認された。
細胞株および試薬:
293F細胞は、Xu Ting博士(Kang Ning Jerry、蘇州市、江蘇省、中国)から提供され、SMM 293−TI培地(M293TI、Sino Biological)で培養された。A20、MC38、およびL929セルラインは、ATCC(Manassas、VA)から購入した。抗PD−1遮断抗体(4H2)は、Bristol−Myers Squibb(Redwood City、CA)から入手した。抗PD−L1抗体(10F.9G2)および抗IFNAR1抗体(MAR1−5A3)は、BioXCell(West Lebanon、NH)から購入した。抗CD8(TIB210)および抗CD4欠失抗体(GK1.5)は実験室で調製された。抗シアル酸GM1抗体は、Biolegend(San Diego、CA)から購入した。
IFN−anti−PD−L1融合タンパク質の構築:
ヘテロダイマー:特許(特許番号:US8217149B2)によると、PD−L1結合タンパク質(YW243.55.S70)配列の軽鎖および重鎖可変領域が合成された。軽鎖と重鎖の配列をGGGGSGGGGGGSGGGGSリンカーを介して接続し、ヒトIgG1Fc(SEQ ID NO.15)を重鎖のC末端に挿入して、ScFv(PD−L1)−Fc(SEQ ID NO.1)と命名し、ヘテロダイマーの第一ポリペプチドを取得した。次に、ScFv(PD−L1)−Fcのコーディング核酸配列(SEQ ID NO.4)をpEE12.4ベクター(Lonza)にクローン化した。マウスIFN−α4(SEQ ID NO.13)のcDNA配列(SEQ ID NO.14)をクローン化し、(G4S)リンカーを介してヒトIgG1 FcのN末端に挿入し、ヘテロダイマーの第二ポリペプチドmIFNα4−Fc(SEQ ID NO.2)を発現させて取得した。mIFNα4−Fcをコードするヌクレオチド配列(SEQ ID NO.5)をpEE6.4ベクター(Lonza)にクローン化した。 PD−L1結合タンパク質とIFNαのヘテロ二量体化は、以前に報告されたノブツーホール(knob−to−holes)技術を使用して生成された。プラスミドを293F細胞に1:2の比率で一過性にトランスフェクトした。トランスフェクション後7日目に上清を回収した。取扱説明書(Repligen)に従ってプロテインA−セファロースカラムを使用して融合タンパク質を精製した。
ヘテロダイマーの調製中に、異なるI型インターフェロンを使用して、第二ポリペプチドmIFNb−Fc(SEQ ID NO.7に示す核酸をコードする)、hIFNα2−Fc(コーディング核酸はSEQ ID NO.8に示す通り)、hIFNb−Fc(コーディング核酸はSEQ ID NO.9に示す通り)、mIFNγ−Fc(コーディング核酸はSEQ ID NO.10に示す通り)も使用した。生成されたヘテロダイマーは、腫瘍細胞増殖の阻害という良好な効果があった。上記のヘテロダイマー融合タンパク質の中で、IFNα−Fcが特に効果的であり、mIFNα4−FcとAnti−PD−L1から構成されるヘテロダイマー融合タンパク質が最も効果的である。関連する詳細な比較データはここには示されていない。
ホモダイマー:マウスIFN−α4のC末端をScFv(PD−L1)−FcのN末端に接続して、ホモダイマー融合タンパク質の第1および第2ポリペプチド(SEQ ID NO.3)を取得した。ヌクレオチド配列(SEQ ID NO.6)をpEE12.4ベクターにクローン化し、トランスフェクション後、Fc二量体化によりホモダイマータンパク質を自発的に形成した。
フローサイトメトリー
PE−anti−human IgG Fc(eBioscience)を使用して、融合タンパク質の結合を検出した。特異的抗体:抗PD−L1抗体(10F.9G2)、抗IFNAR1抗体(MAR1−5A3)、抗CD45抗体(30−F11)、抗CD80抗体(16−10A1)、抗CD86抗体(GL1) BioLegendまたはeBioscienceに由来した。細胞をFACSバッファー(1%ウシ血清アルブミンおよび0.05%NaN)に懸濁し、抗CD16/32抗体(抗FcγIII/II受容体、クローン2.4G2)で30分間ブロッキングし、次に特異的抗体で氷上で30分間染色した。サンプルは、FACSCaliburまたはFortessa flowcytometer(BDBiosciences)で分析された。FlowJoソフトウェア(TreeStar)を使用してデータを分析した。
IFNα抗ウイルス活性
VSV感染に敏感なL929マウス線維芽細胞を使用して、IFNの生物学的活性を定量化した。細胞を段階希釈したIFNα−FcまたはIFN−anti−PD−L1とともに37℃で一晩インキュベートした。翌日、細胞をMOI=5のVSV−GFPに感染させ、さらに30時間培養した。次に、細胞を収集し、4%PFAで固定した。 FACSFotassaフローサイトメーター(BD Biosciences)を使用してデータを取得し、FlowJoソフトウェア(TreeStar)を使用してデータを分析した。 GFP陽性細胞はウイルス感染細胞として定義された。
In vivoでのタンパク質分布の定量定量化研究
Balb / cマウスの右側にA20細胞(3×10)を皮下(s.c.)注射した。15日目に、マウスに30μgのIFNα−FcまたはIFN−anti−PD−L1を静脈注射した。 3日目の灌流後、異なるマウス組織を収集し、異なる器官のホモジネート抽出物中のヒトFcのレベルをELISAによって測定した。
腫瘍の成長と治療
Balb/cマウスの右側にA20細胞(3×10)を皮下注射した。 20μgのIFN−anti−PD−L1を静脈内注射した。PD−1シグナル伝達を遮断するために、IFN−anti−PD−L1治療の1日前に2週間に1回、マウスに100μgの抗PD−1抗体(4H2)を静脈内投与した。 CD8+T細胞を除去するために、200μgの抗CD8抗体(TIB210)をIFN−anti−PD−L1治療の1日前に腹腔内注射した。I型IFNシグナル伝達を遮断するために、100μgの抗IFNAR1抗体(MAR1−5A3)をIFN−anti−PD−L1治療の1日前に注射した。C57BL/6マウスの右側に5×10のMC38細胞を皮下注射した。マウスに25μgのIFN−anti−PD−L1を2回静脈内注射した。腫瘍体積は週に2回測定され、(長さ×幅×高さ/2)として計算された。リンパ球の輸送を遮断するために、マウスに25μgのFTY720を腹腔内注射し、遮断を維持するために20μgのFTY720を1日おきに投与した。
ELISPOTは腫瘍抗原特異的なT細胞を検出した。
リンパ節(LN)または脾臓を担癌マウスから分離して、単一細胞懸濁液を調製した。60Gysの単回投与(10Gys /分、6分)を使用して、A20腫瘍細胞を照射した。脾細胞またはLN細胞と照射された腫瘍細胞を4:1の比率で48時間共培養した。製造元のプロトコル(BD Biosciences)に従って、IFN−γの生成はIFN−γELISPOTアッセイキットを使用して測定された。イムノスポットアナライザー(CTL)でサイトカインスポットを計算した。
In vitro培養および機能分析
腫瘍組織を収集し、小片に切断し、消化バッファー(1mg/mlコラゲナーゼIVおよび100μg/mlDNase Iを含むRPMI−1640培地)に再懸濁した。 37°Cで45分間消化した後、70μmセルストレーナーで単細胞懸濁液を作成し、CD8+T細胞とDC(MHCII+CD11c+)をFACSで選別した。T細胞、DC、および照射された腫瘍細胞は、IFNα(2ng / ml)または抗PD−L1抗体(10μg/ ml)の条件下で10:1:2.5の比率で培養された。 3日後、上清を回収し、IFN−γレベルをCBAで測定した。
統計分析
データは平均±SEMとして示された。対になっていないstudent’sの両側t検定を使用して、統計分析を比較した。分析にはGraphPadPrismバージョン5.0(GraphPad Software)を使用した。 *、**、および***で、それぞれp<0.05、p<0.01、およびp<0.001の統計的に有意な差を示した。
実施例1:I型IFNの局所投薬は、PD−1/PD−L1遮断療法に対する腫瘍抵耐性を克服した。
最近の研究では、免疫チェックポイント遮断で治療された患者の臨床反応は、T細胞の活性化状態と腫瘍量に関連していることが示された。これと一致して、本発明は、抗PD−L1抗体が小さなA20腫瘍(<50mm)において効果的な腫瘍制御を示すことを見出した(図1a)。逆に、腫瘍が大きくなると(>100mm)、抗腫瘍効果は大幅に低下した(図1b)。後期腫瘍は、抗腫瘍免疫応答を阻害するためのさまざまなメカニズムを形成している可能性があった。実際、小さな腫瘍と大きな腫瘍のT細胞活性化を比較すると、PD−L1遮断は小さな腫瘍の強いT細胞活性化を誘発するが、同じ治療は後期腫瘍のT細胞に限定的な影響しか及ぼさないことが観察された(図1c)。このデータは、T細胞の活性化の不十分が、後期腫瘍が免疫チェックポイント遮断療法に効果的に反応できない理由である可能性があることを示唆した。
この仮説をテストするために、I型IFN(細胞毒性T細胞へのクロスサブミッションを強化する強力なサイトカイン)を提供することでPD−1/PD−L1遮断療法を改善できるかどうかを調査するための実験が設計された。後期腫瘍は、PD−L1遮断とIFNα併用療法で治療された。抗PD−L1抗体もIFNα(IFNα4)も単独では腫瘍を制御できず、すべての腫瘍が最終的に進行した(図1d)。印象的なことに、併用療法はより強力な抗腫瘍効果を誘発し、すべての治療されたマウスは、腫瘍の完全な根絶をもたらした(図1d)。同様の相乗効果が別の腫瘍モデルMC38でも見られた(図1e)。I型IFNシグナル伝達は、IFNαの腫瘍内送達が腫瘍の成長を効果的に制御するため、腫瘍微小環境(TME)で局所的に作用した(図1f)。反対的に、IFNが全身的に配信されると、これらの影響は完全になくなった。
要約すると、上記のデータは、I型IFNとPD−1/PD−L1遮断療法が相乗効果を持ち、後期腫瘍を制御できることを示した。これは、最適な抗腫瘍効果を達成するために、インターフェロンをTMEに標的とさせる必要があることも示した。
実施例2:腫瘍組織へのIFNの特異的送達のためのIFN−anti−PD−L1融合タンパク質の構築
ほとんどの患者は、インターフェロンによる、腫瘍への局所薬投与が実施されることができない。さらに、I型IFNの全身送達は、通常、有限的な抗腫瘍活性と重篤な副作用がある。サイトカインを含む標的抗体は、免疫調節分子の局所送達のための効果的な戦略であることが証明されている。ただし、治療標的となる腫瘍特異的分子を特定することは非常に困難である。PD−L1は腫瘍組織で高度に発現していることが報告されている。最近の研究では、抗PD−L1抗体がPD−L1陽性腫瘍組織に特異的に蓄積することが示されている。また、IFNは、その抗腫瘍機能に加えて、PD−L1の発現を強力に誘導し、腫瘍に対するT細胞の反応を阻害する可能性がある。この中和効果を克服し、TMEにおける免疫(再)活性化の相互促進を実現するために、本発明は、IFNおよび抗PD−L1抗体を使用して融合タンパク質IFN−anti−PD−L1を構築することで、腫瘍組織におけるPD−L1の発現をさらにアップレギュレートすることができ、これにより、抗体の蓄積が増加することを提案する。
この仮説を検証するために、本発明は、ホモダイマーまたはヘテロダイマーの形態として抗PD−L1抗体一本鎖可変領域フラグメント[scFv(PD−L1)]およびIFNαを含む融合タンパク質を生成した(図2a)。得られたIFN−anti−PD−L1融合タンパク質(IFN−α4を使用)を評価するために、PD−L1またはIFN−α受容体1(IFNAR1)との親和性を試験した。A20細胞は、PD−L1受容体とIFN受容体の両方も陽性である。したがって、A20細胞の1つの受容体をノックアウトし、融合タンパク質と別の受容体の結合をテストした。PD−L1を発現するIFNAR1−/−A20細胞では、融合タンパク質は抗PD−L1抗体と同様の親和性を示した(図2b)。IFNARを発現するPD−L1−/−A20細胞では、IFN−Fcまたはホモダイマーと比較して、ヘテロダイマーの結合が減少した(図2c)。
Figure 2021521789
注記:「+」は結合強度を意味し、「−」は結合なしを意味し、空白は実験なしを意味した。
融合タンパク質は、L929細胞が小胞性口内炎ウイルス(VSV)により感染されることを効果的に避け、IFNの抗ウイルス活性が変化しないことを示した(図2d)。
要約すると、これらのデータは、IFN−anti−PD−L1のホモダイマーおよびヘテロダイマー融合タンパク質が、効果的なIFN生物学的活性を維持しながらPD−L1に結合できることを示した。
実施例3:後期腫瘍を制御するための抗PD−L1を介したIFNの標的送達
In vitroでのIFN−anti−PD−L1(IFN−α4)融合タンパク質の強力な活性を考慮して、我々は、それがIn vivoで腫瘍増殖を制御できるかどうかをさらに研究した。進行したA20腫瘍のマウスを融合タンパク質(i.t.)で治療した。抗PD−L1抗体は腫瘍の成長を制御できませんでしたが、IFN−anti−PD−L1融合タンパク質のヘテロダイマーとホモダイマーはほとんどの治療マウスで抗PD−L1耐性を克服して、完全な腫瘍退縮を誘発した(2e)。
融合タンパク質の標的効果を試験するために、A20担癌マウスを融合タンパク質で体系的に治療した。驚くべきことに、ホモダイマーはIFN受容体への結合親和性が高く、in vitroでより効果的な抗ウイルス活性を示したが(図2cおよび2d)、in vivoで送達した場合、ホモダイマーではなくヘテロダイマーのみは、腫瘍の成長を効果的に抑制することができた(図2f)。MC38モデルでも同様の効果が観察された(図2g)。この違いがin vivoでの異なるダイナミクスによるものかどうかを知りたかった。さらなる実験結果は、ホモダイマーと比較して、腫瘍組織におけるヘテロダイマーの蓄積レベルがはるかに高いことを示した(図2h)。さらに、ヘテロダイマーの血清半減期は大幅に増加した(図2i)。これらのデータはまた、ヘテロダイマーがより 優れた抗腫瘍効果を有することを示唆しており、ヘテロダイマーがIn vivo研究のより優れた候補であることを示した。
要約すると、これらのデータは、抗PD−L1抗体によるIFNの標的送達が効果的な抗腫瘍効果を誘発し、腫瘍制御の改善につながることを示した。
実施例4:腫瘍を標的としたIFN−anti−PD−L1は、毒性が低く、強い抗腫瘍活性を示した
I型IFNの使用は、システム配信中の深刻な副作用のために制限されている。IFN(IFN−α4)を有する抗PD−L1抗体のin vivo毒性をテストするために、高用量のヘテロダイマー(IFN−anti−PD−L1)または非標的コントロールIFN−anti−HBs(anti−B肝炎ウイルス表面タンパク質)融合タンパク質を使用した。IFN−anti−HBsの2回目の注射後、担癌マウスは重度の体重減少、活動低下、毛皮のひだとの症状が現れ、すべてのマウスは1日以内に死亡した(図3a)。反対的に、IFN−anti−PD−L1で処理されたマウスはいずれも、死亡しておらず、軽度の体重減少後に回復した(図3aおよび3b)。IFN−anti−PD−L1融合タンパク質は腫瘍に蓄積したが、正常組織には蓄積しなかった(図7a)。
副作用をよりよく評価するために、最初の注射後に血清サイトカインレベルを測定した。印象的なのは、非標的IFN−anti−HBsが炎症性サイトカインTNF、IFN、MCP−1、IL−6およびIL−10の高度な発達を誘発した(図3cおよび図7b)。
IFN−FCと抗PD−L1抗体の単純な混合物は、IFN−anti−PD−L1融合タンパク質のような相乗効果を生み出さなかったため、腫瘍特異的ターゲティングは融合タンパク質の抗腫瘍効果に不可欠であった(図3d)。
要約すると、これらのデータは、IFN−anti−PD−L1が腫瘍組織を標的にして腫瘍の成長を阻害でき、毒性の副作用が少ないことを示した。
実施例5:IFN−anti−PD−L1アップレギュレートTMEにおけるPD−L1とIFNAR受容体
I型IFNはPD−L1発現を誘導するための最も効果的なサイトカインであるため、TMEのPD−L1レベルは、IFN−anti−PD−L1(IFN−α4ヘテロダイマー)による全身治療後に測定された。IFN−anti−PD−L1は、腫瘍組織におけるPD−L1の発現を有意に増加させた(図3e)。PD−L1発現の増加は、融合タンパク質の腫瘍特異的蓄積を促進する可能性がある。興味深いことに、CD45 +細胞(白血球)のIFN受容体のレベルも増加し(図3f)、細胞がIFN処理に対して感じやすくなった。要約すると、データは、IFN−anti−PD−L1が複数のフィードフォワード応答を生成したが、これにより、腫瘍のターゲティングと抗腫瘍効果がさらに強化される可能性があることを示した。
実施例6:インターフェロン融合タンパク質の抗腫瘍作用に対して腫瘍細胞におけるPD−L1のは必要でない
多くの腫瘍細胞は、免疫応答を回避するための戦略としてPD−L1を過剰発現する。PD−L1は、腫瘍外の多くの細胞で炎症性サイトカインによってさらに誘発される可能性がある。PD−1/PD−L1遮断療法が腫瘍細胞に作用するのか、或いは非腫瘍細胞に発現されるPD−L1に作用するのかは、まだ結論付けられていない。腫瘍細胞中のPD−L1がIFNを有する抗PD−L1抗体に必要かどうかを確定するために、本発明は、CRISPR/Cas9技術を使用して腫瘍細胞中のPD−L1をノックアウトした。PD−L1の発現は、ノックアウト後のA20およびMC38腫瘍細胞で完全に排除された(図4a)。IFNsはPD−L1の発現を誘発する可能性がある。IFNαによって刺激された場合、野生型(WT)細胞はPD−L1をアップレギュレートしたが、ノックアウト細胞は依然としてPD−L1を発現しなかった(データは示していない)。
腫瘍細胞上のPD−L1がターゲティングに必要かどうかをテストするために、融合タンパク質IFN−anti−PD−L1(IFN−α4ヘテロダイマー)を使用してWTまたはPD−L1ノックアウト(PD−L1−/−)の担癌マウスを処理した。腫瘍組織のタンパク質レベルを測定した。驚いたことに、腫瘍細胞がPD−L1を発現しているかどうかに関係なく、融合タンパク質は腫瘍組織に蓄積した(図4b)。IFN−anti−PD−L1を使用して腫瘍を治療するとき、PD−L1ノックアウト腫瘍とWT腫瘍の両方を効果的に制御できた(図4cおよび4d)。これらのデータは、腫瘍細胞のPD−L1が抗腫瘍効果に必要ではないことを示した。
前のデータは、IFN−anti−PD−L1がTMEでのPD−L1の発現をアップレギュレートするようフィードフォワードループを作成することを示した(図3e)。腫瘍細胞と間質細胞の両方がPD−L1を発現できるため、腫瘍組織の異なる細胞サブグループでPD−L1の発現レベルをテストした。IFN−anti−PD−L1治療は、腫瘍および間質細胞におけるPD−L1発現を有意にアップレギュレートした(図4e)。腫瘍細胞のPD−L1は必要ないので、宿主細胞にPD−L1が必要かどうかを知りたかった。興味深いことに、IFN−anti−PD−L1は、PD−L1欠損マウスの腫瘍増殖をうまく制御した(図4f)。要約すると、これらのデータは、宿主細胞または腫瘍細胞で発現されたPD−L1が、融合タンパク質の腫瘍標的化および抗腫瘍効果を媒介するのに十分であることを示した。
実施例7:IFN−anti−PD−L1融合タンパク質はTMEにおけるAPCとT細胞の活化促進
次に、I型IFNシグナル伝達が抗腫瘍効果に必要かどうかを調査した。IFN−anti−PD−L1融合タンパク質(ヘテロダイマー)での治療中に、マウスを抗IFNAR遮断抗体で処理した。抗IFNAR抗体は、融合タンパク質の抗腫瘍効果を完全に排除し、I型IFNシグナル伝達の重要な役割を示唆した(図5a)。
IFNARは腫瘍と宿主細胞で発現した。腫瘍細胞のIFN受容体が必要かどうかをテストするために、腫瘍細胞のIFNAR1をノックアウトした(図5b)。興味深いことに、IFN−anti−PD−L1は、A20.IFNAR1−/−腫瘍を有するマウスの腫瘍増殖を効果的に抑制した(図5c)。
腫瘍細胞のIFN受容体は必要ないため、宿主細胞に発現する受容体が必要かどうかを調べた。MC38腫瘍をWTまたはIFNAR−/−マウスに接種し、融合タンパク質で処理した。実験において、抗腫瘍効果が欠損マウスで消失したことが観察され、インターフェロン受容体が宿主においてより重要な役割を果たすことを示唆した(図5d)。
CD8+T細胞は抗腫瘍効果に必要である。CD8+T細胞が抗CD8抗体で遮断されると、抗腫瘍効果は完全に排除された(図5e)。以前の研究では、I型IFNがTMEでのDCクロスプレゼンテーションを強化し、T細胞の活性化を改善することが示された。実際、IFN−anti−PD−L1処理により、DC活性化のマーカー分子CD86およびCD80の発現が増加した(図5fおよび図8)。コントロールとして、IFN−Fcで処理した腫瘍ではDCの有意な活性化は観察されず、腫瘍特異的ターゲティングの重要な役割を示した。
要約すると、これらのデータは、IFN融合タンパク質が主に宿主細胞におけるIFNシグナル伝達を介してその抗腫瘍効果を媒介することを示した。
実施例8:PD−L1抗体によるIFNの標的送達はPD−1遮断療法への腫瘍耐性を克服した
後期腫瘍は、一般的にPD−1/PD−L1遮断療法に耐性がある。実際、抗PD−1抗体も抗PD−L1抗体治療も、後期A20腫瘍の成長を制御することはできない(図6a)。PD−1/PD−L1遮断と比較して、IFN−anti−PD−L1融合タンパク質(IFN−α4ヘテロダイマー)はより優れた抗腫瘍効果を示した。ただし、一部の腫瘍は、初期制御後に最終的に再発した(図2f−2g)。免疫療法後のPD−L1の過剰発現は、T細胞を介した腫瘍制御をさらに制限する可能性がある。したがって、抗PD−1抗体とIFN−anti−PD−L1の併用療法は、IFNまたはPD−1/PD−L1遮断療法に対する腫瘍の抵耐性を克服できると仮定した。実際、併用療法はより良い腫瘍制御をもたらし、後期腫瘍はほぼ完全に解消した(図6a)。
B16F10メラノーマは、PD−1 / PD−L1遮断療法に耐性のあるよく知られたマウス腫瘍モデルである。以前の報告と一致して、PD−1 / PD−L1遮断は、B16F10モデルの腫瘍増殖に影響を与えなかった(図6b)。IFN−anti−PD−L1治療は、一部の腫瘍だけを制御した。興味深いことに、IFN−anti−PD−L1とPD−1遮断の併用療法は、抗腫瘍効果を大幅に改善した。
IFN−anti−PD−L1によって媒介される抗腫瘍反応が長期の防御T細胞免疫につながるかどうかをテストするために、併用療法後に腫瘍が完全な解消したマウスに致死量のA20細胞を再度接種した。すべてのマウスは再攻撃された腫瘍に抵抗し、融合タンパク質が記憶適応免疫応答を誘導したことを確認した(図6c)。
併用療法に必要な細胞集団を決定するために、併用療法を受けたマウスを抗NK、CD4+、またはCD8+T細胞欠失抗体で治療した。CD8 + T細胞がない場合、抗腫瘍効果は完全に消失した(図6d)。反対的に、NKまたはCD4 + T細胞の削除では制限がある効果がある(図9a−9b)。治療後に腫瘍特異的T細胞が産生されるかどうかを検出するために、細胞をリンパ節または脾臓組織から分離し、照射されたA20腫瘍細胞と共培養した。腫瘍特異的T細胞応答を評価するためにIFN−αELISPOTアッセイを実施した。PD−1/PD−L1の遮断だけでは、T細胞の活性化に限定的な影響があった(図6eおよび図9c)。反対的に、IFN−anti−PD−L1(IFN−α4ヘテロダイマー)は、より良い応答を誘導した。重要なことに、IFN−anti−PD−L1とPD−1遮断治療の併用により、腫瘍特異的T細胞の数が大幅に増加した(図6eおよび図9c)。
明確なinvitroシステムでIFN、PD−L1および腫瘍細胞の効果をテストするために、TMEをよりよく再現し、invivoで確立された腫瘍からDCおよびT細胞を分離した。細胞は、IFN、抗PD−L1抗体、またはその2つの併用の存在下で3日間共培養された。単剤療法の効果はこんなに高くなかったが、IFNと抗PD−L1抗体の併用療法は、T細胞のIFNγ産生を有意に増加させた(図6f)。
要約すると、これらのデータは、インターフェロンとPD−1/PD−L1遮断療法の併用が、強力な腫瘍特異的T細胞応答を協調的に誘導し、後期腫瘍免疫チェックポイント遮断に対する腫瘍抵耐性を克服できることを示した。
実施例9:IFNの標的送達により腫瘍常駐T細胞を活性化させ、腫瘍抑制に用いられた
データは、腫瘍特異的T細胞が抗腫瘍免疫応答において重要な役割を果たすことを示した。これらのT細胞は、2つの主要な供給源に由来する可能性があった。すでに腫瘍組織にあるT細胞と、末梢から腫瘍組織に移動した新たに活性化されたT細胞であった。IFNは、DCを刺激してTILを活性化するだけでなく、T細胞を引き付けるケモカインを増加させることもできた。どのT細胞集団が必要かをテストするために、FTY720を使用して末梢リンパ球の腫瘍組織への輸送を遮断した。興味深いことに、リンパ球の輸送が遮断された場合でも、コントロール群と同様に、IFNとPD−1/PD−L1遮断の併用も腫瘍を制御できた(図6g)。これらのデータは、IFN−anti−PD−L1(IFN−α4ヘテロダイマー)による既存のT細胞の再活性化が腫瘍制御に十分であることを示した。一致するように、CD8 T細胞の局所的な欠失は、すべての抗腫瘍効果を減少させた(図6g)。要約すると、これらのデータは、PD−L1遮断がT細胞枯渇の状態を逆転させることができ、IFNが腫瘍制御のために部分的に回収された常在T細胞を効果的に再活性化することを示した。
実施例10:IFNαに対する親和性が低減した変異体の構築
受容体IFNARに結合するIFNαの既知の重要なアミノ酸部位については、部位特異的変異が行われた。特定の変異部位については、図11を参照する。親和性が低下したIFNα変異体をスクリーニングする。 IFNα変異体のアミノ酸配列およびこれをコーデイング核酸配列については、本明細書の配列表のSEQ ID NO.25〜36を参照する。
Figure 2021521789
実施例11:IFNα−Fc変異体の活性検測
IFNα−Fc変異体の生物学的活性は、抗ウイルス感染バイオアッセイによって測定された。VSV−GFPウイルスに感染する前に、L929細胞を各タンパク質と混合し、一晩培養した。30時間の培養後、フローサイトメトリーによってウイルス感染細胞の割合を測定し、異なる濃度のタンパク質の細胞感染に対する阻害率とEC50値を計算した(図12)。結果は、構築された変異体はすべてある程度の活性の低減があることを示した。その中で、2つの変異体R144AとA145Gは最も弱い活性を持ち、潜在的な好ましいターゲットであった。
実施例12:変異型IFN−anti−PD−L1のIn vitroターゲティング試験
WT PD−L1 + A20細胞とPD−L1−/−A20細胞を使用して、異なる濃度のタンパク質で処理された細胞の増殖結果がCCK8キットによって検出された。結果は、変異体IFN−anti−PD−L1は、野生型融合タンパク質と比較して、ターゲティング欠失を伴うPD−L1−/−A20細胞の増殖を阻害するためのEC50値が低いことを示した。ターゲティングが存在しているPD−L1+/+A20細胞では、細胞増殖阻害に対する変異型IFN−anti−PD−L1と野生型融合タンパク質のEC50値に有意差はなかった(図13)。変異型IFN−anti−PD−L1融合タンパク質の第一のポリペプチドAnti−PD−L1(ScFv(PD−L1)−Fc)のアミノ酸配列はSEQ ID NO.1に示され、第二ポリペプチド変異型mIFNa4 −Fcのアミノ酸配列を下表に示す。
Figure 2021521789
PD−L1−/−A20細胞とPD−L1+/+A20細胞のEC50の比率は、この二重特異性タンパク質のターゲティングを反映できる。比率を正規化し、wt−mIFNa4−Fcのデータと比較した後、R144AとA145Gが2つの最もターゲティングがよい変異であることがわかり、これら2つの変異融合タンパク質が、PD−L1陽性標的細胞を特異的に標的化できるとともに、他の細胞でのIFNARシグナル伝達経路の活性化を回避できる、ことを示唆した。
活性が低下したIFNα変異体と標的タンパク質の融合後、標的細胞でのみIFNAR活性化を誘導することができる。IFNを使用する場合の周辺のオフターゲットを避けた。本発明によって構築された変異体IFN−anti−PD−L1は、腫瘍の治療には大きな可能性がある。
上記の説明は、本発明の好ましい実施形態にすぎず、本発明を限定することを意図するものではない。本発明の精神および原理の範囲内で行われる修正、同等の置換、改良などは、本発明の保護の範囲内に含まれるものとする。

Claims (22)

  1. 融合タンパク質であって、
    インターフェロン(IFN)とPD−L1結合タンパク質を融合接続させてなるIFN−anti−PD−L1であり、前記融合タンパク質はホモダイマータンパク質或いはヘテロダイマータンパク質であり、
    好ましくは、前記ホモダイマータンパク質は、第一ペプチドと第二ペプチドを含み、前記第一ペプチドと第二ペプチドが同様であり、前記第一ペプチドと第二ペプチドはN端からC端までの順でIFN、PD−L1結合タンパク質、と免疫グロブリンFc区を含み、
    好ましくは、前記ヘテロダイマータンパク質は、第一ペプチドと第二ペプチドを含み、前記第一ペプチドは第二ペプチドと異なり、前記第一ペプチドはPD−L1結合タンパク質を含み、前記第二ペプチドはIFNと免疫グロブリンFc区を含み、IFNはFc区のN端に位置しており、前記第一ペプチドに含まれるFc区と第二ペプチドに含まれるFc区は同様なサブタイプを有する免疫グロブリンに由来する、
    ことを特徴とする融合タンパク質。
  2. 前記インターフェロン(IFN)は、IFN−α、IFN−β、IFN−γ、IFN−λ1(IL−29)、IFN−λ2(IL−28a)、IFN−λ(IL−28b)およびIFN−ωのようなI型インターフェロン、I型インターフェロン変異体、II型インターフェロンおよび/またはIII型インターフェロンから選択させ、
    前記IFNはヒトソースあるいはマウスソースに由来でき、
    I型インターフェロンは、好ましくIFN−α4(SEQ ID NO.13)であり、さらに好ましくIFN−α4変異体であり、さらに好ましく変異体mIFN−α4(L30A)(SEQ ID NO.25)、−α4(R144A)(SEQ ID NO.27)、mIFN−α4(A145G)(SEQ ID NO.29)、mIFN−α4(R149A)(SEQ ID NO.31)、mIFN−α4(S152A)(SEQ ID NO.33)、hIFN−α2(Q124R)(SEQ ID NO.35)である、
    ことを特徴とする請求項1に記載の融合タンパク質。
  3. 前記免疫グロブリンFc区は、IgG1、IgG2、IgG3および/またはIgG4の定常領域アミノ酸配列から選択され、好ましくはIgG1である、
    ことを特徴とする請求項1に記載の融合タンパク質。
  4. 前記PD−L1結合タンパク質は抗PD−L1抗体、一本鎖抗体(ScFv)、Fab断片、F(ab’)2断片から選択され、前記抗PD−L1抗体はTecentriq、Bavencio、Imfinzi、KN035、CS1001、KL−A167、SHR−1316および/またはYW243.55.S70から選択すれば好ましく、さらに好ましくは一本鎖抗体(ScFv)であり、さらに好ましくはYW243.55.S70である、
    ことを特徴とする請求項1に記載の融合タンパク質。
  5. 1)前記ホモダイマータンパク質の第一ペプチドと第二ペプチドはSEQ ID NO.3に示すアミノ酸配列であり、
    2)前記ヘテロダイマータンパク質第一ペプチドはSEQ ID NO.1に示すアミノ酸配列を含み、第二ペプチドはSEQ ID NO.2、37、39、41、43、45、47に示すアミノ酸配列を含む、
    ことを特徴とする請求項1に記載の融合タンパク質。
  6. 請求項1〜5に記載の融合タンパク質をコードする単離された核酸分子であって、
    1)前記ホモダイマータンパク質をコードする核酸分子は、SEQ ID NO.6に示すヌクレオチド配列であり、
    2)前記ヘテロダイマータンパク質をコードする核酸分子は、SEQ ID NO.4、5、7、8、9、10、38、40、42、44、46、48に示すヌクレオチド配列から選択され、SEQ ID NO.4とSEQ ID NO.5、SEQ ID NO.4とSEQ ID NO.40、或いはSEQ ID NO.4とSEQ ID NO.42は好ましい、
    ことを特徴とする核酸分子。
  7. 請求項6に記載の核酸分子を含むことを特徴とするベクター。
  8. 請求項1〜5のいずれかに記載の融合タンパク質および/または請求項6に記載の核酸分子の薬物組成物または試薬キットの製造における使用であって、
    好ましくは、前記薬物組成物は、腫瘍を治療する薬物組成物であり、
    好ましくは、前記腫瘍は、単独でPD−1/PD−L1の遮断に無効となる腫瘍または後期腫瘍であり、好ましくは、前記薬物組成物は、B細胞リンパ腫、メラノーマ和結腸癌を治療する薬物組成物である、前記使用。
  9. 請求項1〜5のいずれか一項に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1を含む、
    ことを特徴とする薬物製剤、薬物組成物あるいは試薬キット。
  10. 請求項1〜5のいずれか一項に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1、あるいは、前記融合タンパク質をコードする核酸分子を含み、生産融合タンパク質を生産する細胞であって、
    前記細胞は人以外の哺乳類動物の細胞であり、好ましくは、CHOとHEK293細胞である、
    ことを特徴とする細胞。
  11. 請求項1〜5のいずれか一項に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1と抗PD−1/PD−L1抗体の併用の、腫瘍を治療する薬物組成物あるいは試薬キットの製造における用途。
  12. 前記腫瘍はPD−1/PD−L1遮断の単独治療に対して無効になる腫瘍あるいは後期腫瘍であり、
    好ましくは、抗PD−1/PD−L1抗体の単独の治療に対して耐性がある、または無効になる腫瘍である、
    ことを特徴とする請求項11に記載の用途。
  13. 前記腫瘍の患者は、末梢リンパ球輸送欠陥/障碍に関する疾病があり、前記患者の末梢リンパ球は、腫瘍組織に移動できない、
    ことを特徴とする請求項11に記載の用途。
  14. IFN−αと抗PD−L1抗体の併用の、治療腫瘍を治療する薬物組成物、薬物製剤あるいは試薬キットの製造における用途であって、
    前記IFN−αは腫瘍内に投与される、
    ことを特徴とする用途。
  15. 請求項14に記載の用途であって、
    前記腫瘍は、PD−1/PD−L1の遮断の単独治療に無効となる腫瘍であり、
    IFNの単独治療に無効となる腫瘍、あるいは後期腫瘍であり、
    好ましくは、抗PD−1/PD−L1抗体の単独治療に対して耐性がある腫瘍である、
    ことを特徴とする用途。
  16. IFN−αと抗PD−L1抗体を含む薬物組成物、薬物製剤あるいは試薬キットであって、前記IFN−αは腫瘍内に投与される必要がある、
    ことを特徴とする薬物組成物、薬物製剤あるいは試薬キット。
  17. 請求項1〜5のいずれか一項に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1の白血球におけるIFN受容体発現をアップレギュレートする用途であって、
    好ましくは、前記白血球は、CD45+細胞であり、
    好ましくは、前記IFN受容体はIFNARである、
    ことを特徴とする薬物組成物、薬物製剤あるいは試薬キット。
  18. 請求項1〜5のいずれか一項に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1のDC細胞あるいはTIL細胞の活性化における用途。
  19. 請求項1〜5のいずれか一項に記載の融合タンパク質IFN−anti−PD−L1の腫瘍常駐T細胞の活性化における用途。
  20. IFN−α4変異体であって、
    前記変異体は、受容体との親和性が低下した突然変異であり、mIFN−α4(L30A)(SEQ ID NO.25)、mIFN−α4(R144A)(SEQ ID NO.27)、mIFN−α4(A145G)(SEQ ID NO.29)、mIFN−α4(R149A)(SEQ ID NO.31)、mIFN−α4(S152A)(SEQ ID NO.33)、および/またはhIFN−α2(Q124R)(SEQ ID NO.35)を含む、
    ことを特徴とする変異体。
  21. 請求項20に記載の変異体をコードする単離された核酸分子であって、
    前記核酸分子のヌクレオチド配列はSEQ ID NO.26、28、30、32、34、36に示す配列である、
    ことを特徴とする核酸分子。
  22. 請求項20に記載のIFN−α4変異体の、治療腫瘍を治療する融合タンパク質或いは薬物の製造における用途。
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