JP2021508251A - アルツハイマー病をモデル化する新しいヒト誘発多能性幹細胞株およびその使用 - Google Patents

アルツハイマー病をモデル化する新しいヒト誘発多能性幹細胞株およびその使用 Download PDF

Info

Publication number
JP2021508251A
JP2021508251A JP2020544079A JP2020544079A JP2021508251A JP 2021508251 A JP2021508251 A JP 2021508251A JP 2020544079 A JP2020544079 A JP 2020544079A JP 2020544079 A JP2020544079 A JP 2020544079A JP 2021508251 A JP2021508251 A JP 2021508251A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
gene
hipsc
promoter
vector
expression
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2020544079A
Other languages
English (en)
Inventor
▲えん▼玉波
付建
周敏
▲劉▼雨晴
江利香
▲楊▼波
▲楊▼佳▲銀▼
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shenzhen Cell Inspire Biotechnology Co Ltd
Original Assignee
Shenzhen Cell Inspire Biotechnology Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shenzhen Cell Inspire Biotechnology Co Ltd filed Critical Shenzhen Cell Inspire Biotechnology Co Ltd
Publication of JP2021508251A publication Critical patent/JP2021508251A/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602Vertebrate cells
    • C12N5/0696Artificially induced pluripotent stem cells, e.g. iPS
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602Vertebrate cells
    • C12N5/0618Cells of the nervous system
    • C12N5/0619Neurons
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5044Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics involving specific cell types
    • G01N33/5058Neurological cells
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • G01N33/6896Neurological disorders, e.g. Alzheimer's disease
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2503/00Use of cells in diagnostics
    • C12N2503/02Drug screening
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2506/00Differentiation of animal cells from one lineage to another; Differentiation of pluripotent cells
    • C12N2506/02Differentiation of animal cells from one lineage to another; Differentiation of pluripotent cells from embryonic cells
    • C12N2506/025Differentiation of animal cells from one lineage to another; Differentiation of pluripotent cells from embryonic cells from extra-embryonic cells, e.g. trophoblast, placenta
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2506/00Differentiation of animal cells from one lineage to another; Differentiation of pluripotent cells
    • C12N2506/25Differentiation of animal cells from one lineage to another; Differentiation of pluripotent cells from renal cells, from cells of the urinary tract
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2506/00Differentiation of animal cells from one lineage to another; Differentiation of pluripotent cells
    • C12N2506/45Differentiation of animal cells from one lineage to another; Differentiation of pluripotent cells from artificially induced pluripotent stem cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2510/00Genetically modified cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/10041Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2740/10043Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/46Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
    • G01N2333/47Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
    • G01N2333/4701Details
    • G01N2333/4709Amyloid plaque core protein
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/28Neurological disorders
    • G01N2800/2814Dementia; Cognitive disorders
    • G01N2800/2821Alzheimer

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Transplantation (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本発明は、hiPSCのβ−セクレターゼのレベルの増加および/またはAβ−42ペプチドの増加を誘発するように、AD関連遺伝子をhiPSCに組み込むことを含む、アルツハイマー病(AD)の細胞モデルを調製する方法に関し、また、この方法で調製されたアルツハイマー病(AD)の細胞モデルにも関する。

Description

本発明は、生物医学分野、特にアルツハイマー病(AD)のために生理学的に関連する細胞モデルを作成することに関する。具体的には、本発明は、ヒト誘発多能性幹細胞(hiPSC)を遺伝子修飾することによりAD細胞モデルを調製する方法に関する。
アルツハイマー病(AD)は慢性神経変性疾患であり、認知症の最も一般的な原因である。双子と家族の研究に基づいたレビューによれば、アルツハイマー病の遺伝的遺伝率は、49%から79%の範囲にある12。症例の約0.1%は、家族性の常染色体(非性関連)優性遺伝であり、65歳以前に発症する3。この形の疾患は、早期発症型家族性アルツハイマー病と呼ばれる。常染色体優性家族性ADのほとんどは、アミロイド前駆体タンパク質(APP)をコードする遺伝子と、プレセニリン1をコードする遺伝子と、プレセニリン2をコードする遺伝子との3つの遺伝子から選ばれる1つにおける変異に起因する可能性がある4。APPとプレセニリン遺伝子のほとんどの変異は、老人斑の主成分であるAβ42と呼ばれる小さいタンパク質の生成を増加させる5
アルツハイマー病のほとんどの症例は常染色体優性遺伝を示さず、孤発性ADと呼ばれ、環境的および遺伝的差異が危険因子であるかもしれない。最も目立つ遺伝的危険因子は、アポリポタンパク質Eのε4対立遺伝子の遺伝である(APOE)6-7。AD患者の40%〜80%は少なくとも1つのAPOEε4対立遺伝子を持っている7。APOEε4対立遺伝子は、ヘテロ接合体では3倍、ホモ接合体では15倍、疾患のリスクを増加させる3
TREM2遺伝子の変異は、アルツハイマー病を発症するリスクが3〜5倍高くなることに関連している8-9。一般に認められている作用メカニズムは、TREM2が変異すると、脳内の白血球が存在するβアミロイドの量を制御できなくなることである。
ADには2つの異なる特徴がある。1つはアミロイドβ‐タンパク質(Aβ)を含む細胞外プラークの存在であり、もう1つは細胞内神経原線維変化(NFT)である。ADの真の病理はまだ明確ではないが、何十年にわたる研究の積み重ねは、アミロイドカスケード仮説に強力な証拠を提供している。この仮説によると、ADを引き起こす重要なイベントは、アミロイド前駆体タンパク質(APP)の処理中に特定のペプチドが形成されることのようであり、アミロイドβペプチド42(Aβ42)は、容易に凝集してAβ42オリゴマーを形成し、その後にアミロイドプラークを形成する、粘着性ペプチドであり、これはADの1つの特徴である。Aβ42凝集体とアミロイドプラークの存在は、ニューロンの炎症を引き起こし、カルシウム活性化キナーゼの発現を増加させることができ、これは却ってニューロンの細胞骨格微小管を安定化するtauタンパク質の過剰なリン酸化を誘導する。tauタンパク質の過剰リン酸化は、ADの2つ目の特徴であるニューロンでの神経原線維変化の形成を引き起こし、続いてニューロン死を引き起こす10-14
α−セクレターゼと、β−セクレターゼと、γ−セクレターゼとの3つの酵素は、APPの切断に関与する。正常なプロセスでは、APPはまずα−セクレターゼまたはβ−セクレターゼによって切断され、γ−セクレターゼは、さらに切断される生成物を異なる長さのペプチドの混合物に処理する。APPがβ−セクレターゼによって切断される場合、生成物はγ−セクレターゼによってさらに切断されて可溶性の40個のアミノ酸アミロイドペプチド(Aβ40)または42個のアミノ酸のペプチド(Aβ42)を生成し、これら42個のアミノ酸のペプチドは凝集して不溶性凝集体を形成し、これによってアミロイドプラークを形成する。アミロイドカスケード仮説の強力な証拠は、家族性AD(FAD)の研究からであり、すべての家族性AD患者のAPPまたはプレセニリン(PS)遺伝子に変異があることを示している。APP遺伝子の変異は異常なAPPタンパク質を引き起こし、この異常なAPPタンパク質はβ−セクレターゼによって優先的に切断されてより多くのAβペプチドを生成する。一方、PS遺伝子の変異は、アミロイドプラークの成分であるAβ42ペプチドを優先的に生成する。もう一つの重要な観察結果は、β−セクレターゼの発現及び酵素活性が、AD患者、特にAD人口の90%以上を占める孤発性AD(SAD)患者で有意に上昇していることである。アミロイド沈着の影響を受けた脳領域では、β−セクレターゼタンパク質と活性レベルが上昇し、この上昇が維持されているが、ADにおけるニューロンとシナプスは明らかに失われている15-17
β−セクレターゼ1(BACE1)は、β−サイトアミロイド前駆体タンパク質切断酵素1、β部位APP切断酵素1、膜関連アスパラギン酸プロテアーゼ2、メマプシン−2、アスパルチルプロテアーゼ2、およびAPS2とも呼ばれ、末梢神経細胞のミエリン鞘の形成時に重要なアスパラギン酸プロテアーゼである18。ヒトでは、BACE1遺伝子によってコードされる。BACE1によるAPPの細胞外切断により、可溶性の細胞外フラグメントと、C99と呼ばれる細胞膜結合フラグメントとが生成する。γ−セクレターゼによる膜貫通ドメイン内のC99の切断により、APPの細胞内ドメインが放出され、アミロイドβが生成する。γ−セクレターゼはBACE1よりも細胞膜に近い場所でAPPを切断するため、γ−セクレターゼはアミロイド−βペプチドのフラグメントを除去する。BACE1ではなくα−セクレターゼによってAPPを初歩的に切断することは、アミロイドβの最終的な生成を防ぐことができる。
APPおよびプレセニリン(PS)タンパク質とは異なり、BACE1をコードする遺伝子には、まれな疾患である早期発症型家族性アルツハイマー病を引き起こす既知の変異はない。しかしながら、この酵素のレベルがより一般的な遅発性孤発性アルツハイマー病で増加することは示されている。BACEによるAPPおよびその他の膜貫通タンパク質の切断の生理学的目的は不明である。BACE2は、BACE1に近接した相同体であり、生体内でのAPP切断は報告されていない。
Aβ−42ペプチドの生成はアミロイドプラークの形成において主要な役割を果たすので、過去20年間のすべての創薬努力は、β−セクレターゼ活性を阻害するまたはAβ−42の凝集を阻害することによるAβ−42ペプチドの減少に集中している19-26。しかし、AD薬剤開発の主要な問題の1つは、適切なADモデルの欠如である。今まで最もよく知られているADモデルは、変異APPおよびPS1遺伝子をマウスゲノムに挿入して高齢マウスにおいてAD表現型を示す5×FADトランスジェニックマウスである27。5×FADマウスモデルは広く使用されているが、薬剤開発においてその有用性に関して2つの主な欠点がある。第1に、ヒトの中枢神経系はマウスの中枢神経系とは非常に異なるため、5×FADモデルでテストされた候補薬剤は通常、ヒトへの影響についての予測可能性が劣る。第2に、5×FADマウスが表現型を示すには6〜8か月またはそれ以上かかるため、このモデルは明らかにAD候補薬剤の早期スクリーニングには適していない。
多能性幹細胞は、無期限に増殖するだけではなく、ニューロン、心臓、膵臓細胞、肝細胞など、ヒト体内の他の細胞型を生成できるため、細胞モデルの調製において大きな発展の見込みがある。ヒト誘導多能性幹細胞(hiPSC)は、成体細胞から直接に生成できる多能性幹細胞の一種である。iPSC技術は、日本の京都にある山中伸弥氏の研究室によって開拓された。転写因子をコードする4つの特定の遺伝子の導入により、成体細胞を多能性幹細胞に転換できることを、山中氏は2006年に発表した。この画期的な技術は、体細胞のリプログラミング技術であり、これにより、研究者は、皮膚線維芽細胞などの最終分化細胞を胚性幹細胞段階に戻すことができる28-29
hiPSCは様々な疾患の患者から入手でき、無期限に増殖できるため、無制限の細胞ソースを提供できる。さらに重要なことに、これらの患者由来のhiPSCは、疾患関連の初代細胞に再分化し、細胞レベルで疾患の表現型を示すことができる30-36。これは、hiPSCベースの細胞疾患モデルを作成するための1つの一般的なストラテジーである。このストラテジーは、疾患と明確に診断された患者からhiPSCを生成し、患者由来のhiPSCを標的細胞型に分化させてインビトロで疾患の表現型を示すことである。
患者由来のhiPSCの他に、研究者らは細胞疾患モデルを確立ための別のストラテジーを実験している。研究者たちは、病気にかかっていないヒトからhiPSCを生成し、ゲノム編集技術によって致病遺伝子をhiPSCに導入する。
hiPSCから適切なAD細胞モデルを生成するには、次のいくつかの基準を満たす必要がある。それは、生理学的にヒト機能性ニューロンと同等でなければならず、比較的に短い期間でインビトロでAD表現型を示さなければならず、AD関連のヒトニューロンを一貫して大量に再現できる必要がある。何十年にもわたる研究にも関わらず、これまでこのような細胞モデルを調製するには真に成功していない。
本発明は、アルツハイマー病(AD)の細胞モデルを調製する方法を提供することにより、上述のニーズの少なくとも一部を満たし、この方法は、hiPSCを遺伝子編集して、細胞モデルが由来する同質遺伝子hiPSCと比較してより高いレベルのβ−セクレターゼとβ−42ペプチドを生成することを含む。
本発明について、本発明者らはAD関連遺伝子を非罹患hiPSCに導入して、同質遺伝子系、すなわち、同じ遺伝的背景を有する罹患細胞株と非罹患細胞株を得て、ゲノム編集技術によって導入されたAD関連遺伝子のスタッキング効果により、罹患細胞株は比較的に短い期間においてインビトロで細胞レベルでAD表現型を示す。
一態様では、本発明は、β−セクレターゼのレベルおよび/またはAβ−42ペプチドの増加を誘発するようにAD関連遺伝子をhiPSCに組み込むことを含む、アルツハイマー病(AD)の細胞モデルを調製する方法を提供する。一つの実施形態では、前記AD関連遺伝子はhiPSCにおいて構成的に過剰発現される。一つの実施形態では、前記AD関連遺伝子は、ADを引き起こす変異APPまたは変異PS遺伝子、特にPS1dE9遺伝子である。一つの実施形態では、前記AD関連遺伝子はBACE1遺伝子である。一つの実施形態では、前記AD関連遺伝子は、ADを引き起こす変異APP、PS1dE9遺伝子、およびBACE1遺伝子から選択される一つ以上である。
ある実施形態では、前記AD関連遺伝子が部位特異的な方法によりhiPSCに組み込まれる。好ましくは、前記AD関連遺伝子がAAVS1部位でhiPSCに組み込まれる。
一態様では、本発明は、上記方法により生成されたアルツハイマー病(AD)の細胞モデルを提供する。
一態様では、本発明は、AD関連遺伝子をhiPSCに導入して構成的に過剰発現させることを含む、hiPSCを修飾する方法を含む。一つの実施形態では、前記AD関連遺伝子が、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターによってhiPSCに導入され、前記ヌクレオチド配列が、哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターに機能的に連結されている。一つの実施形態では、前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである。一つの実施形態では、哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子が、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む同一の発現ベクターまたはそれぞれの発現ベクターによって前記hiPSCにさらに導入される。一つの実施形態では、前記プロモーターがPGAプロモーターまたはCAGプロモーターである。一つの実施形態では、発現ベクターがさらに、部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列を含み、好ましくは、ヒトAAVS1部位に相同なヌクレオチド配列を含む。
一態様では、本発明は、哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターに機能的に連結され、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む、発現ベクターを提供する。一つの実施形態では、前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである。一つの実施形態では、前記ベクターは、哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子をコードするヌクレオチド配列をさらに含む。一つの実施形態では、前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである。一つの実施形態では、前記ベクターは、部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列をさらに含み、好ましくは、ヒトAAVS1部位に相同なヌクレオチド配列を含む。一つの実施形態では、薬剤選択遺伝子は抗生物質耐性遺伝子であり、好ましくは、ピューロマイシン、ネオマイシン、カナマイシン、またはジェネティシン耐性遺伝子である。一つの実施形態では、レポーター遺伝子が、緑色蛍光タンパク質または赤色蛍光タンパク質をコードする遺伝子である。一つの実施形態では、ベクター内のすべてのエレメントが、前記AD関連遺伝子の発現に寄与する順序で排列している。好ましくは、ベクター内のすべてのエレメントがシス順で排列している。
一態様では、本発明は、第1のプロモーターと、前記第一のプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子と、第二のプロモーターと、前記第二のプロモーターによって制御されるレポーター遺伝子に連結されているAD関連遺伝子と、ヒトAAVS1部位に相同な配列とのコード核酸配列を含む遺伝子構築体であって、前記エレメントがシス順で排列している、遺伝子構築体を提供する。一つの実施形態では、前記第1のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記薬剤選択遺伝子が抗生物質耐性遺伝子であり、前記第二のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記AD関連遺伝子が、BACE1をコードする遺伝子であり、前記レポーター遺伝子が、緑色蛍光タンパク質または赤色蛍色タンパク質をコードする遺伝子であり、好ましくは、緑色蛍光タンパク質をコードする遺伝子である。一つの実施形態では、前記第1のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記薬剤選択遺伝子が抗生物質耐性遺伝子であり、前記第二のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記AD関連遺伝子がPS1dE9であり、前記レポーター遺伝子がGFPである。一つの実施形態では、抗生物質耐性遺伝子が、ピューロマイシン、ネオマイシン、カナマイシン、またはジェネティシン耐性遺伝子である。
一態様では、本発明は、上記発現ベクターのいずれか一つまたは上記遺伝子構築体のいずれか一つによって転換されたhiPSC細胞株を提供する。一つの実施形態では、前記hiPSC細胞株は、AD細胞モデルの生成に使用される。
一態様では、本発明は、ヒトAAVS1部位でBACE1遺伝子を組み込み、前記組み込まれたBACE1遺伝子を構成的に過剰発現する、AD細胞モデルとして使用される遺伝子修飾されたhiPSCを提供する。一つの実施形態では、前記BACE1遺伝子が組み込まれていない同質遺伝子hiPSCと比較して、修飾されたhiPSCは、増加したβ−セクレターゼ、Aβ42/Aβ−40比、および/またはAβ−42ペプチドを示す。一つの実施形態では、修飾されたhiPSCは、ヒトAAVS1部位でPS1dE9遺伝子を組み込み、前記組み込まれたPS1dE9遺伝子を構成的に過剰発現する。
一態様では、本発明は、AD治療薬のハイスループットスクリーニングのための、遺伝子修飾されたhiPSCの使用を含む。
一態様では、本発明は、
i)上記発現ベクターまたは上記遺伝子構築体をhiPSCに導入することにより、hiPSCからアルツハイマー病(AD)の細胞モデルを調製することと、
ii)細胞モデルで候補化合物を2日から2週間培養することと、
iii)前記候補化合物を添加する前後のβ−セクレターゼのレベル、Aβ−42濃度、及びAβ42/Aβ−40比を測定することと、
iv)β−セクレターゼのレベル、Aβ−42濃度、及びAβ42/Aβ−40比から選択される一つ以上の測定値の減少が、前記候補化合物がADの治療のための潜在的な治療薬であることを示すこととを含む、
AD治療薬をハイスループットスクリーニングするための方法を提供する。
一つの実施形態では、前記hiPSCがヒトドナーに由来し、好ましくは、ADを有さない正常なヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される。一つの実施形態では、前記方法は初期のAD薬スクリーニング用である。
一態様では、本発明は、
i)BACE1遺伝子またはPS1dE9遺伝子を構成的に過剰発現させることによりhiPSC細胞株を修飾することと、
ii)前記hiPSC細胞株を機能性ニューロンに再分化することと、
iii)候補化合物の存在下で前記機能性ニューロンを培養することと、
iv)β−セクレターゼのレベル、Aβ42/Aβ−40比、及び/またはAβ−42濃度を測定し、β−セクレターゼのレベル、Aβ42/Aβ−40比、及び/またはAβ−42濃度を低減できる化合物を選択することとを含む、
β−セクレターゼまたはAβ−42阻害剤をスクリーニングするための薬剤スクリーニング方法を提供する。
一つの実施形態では、前記方法は、候補薬剤化合物の存在下で前記機能性ニューロンを2日から2週間培養することを含む。一つの実施形態では、前記hiPSCがヒトドナーに由来し、好ましくは、ADを有さない正常なヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される。一つの実施形態では、上記発現ベクターまたは上記遺伝子構築体をhiPSCに導入することによって前記hiPSCを調製する。
具体的には、本発明は以下に係る。
1.hiPSCのβ−セクレターゼのレベルの増加および/またはAβ−42ペプチドの増加を誘発するようにAD関連遺伝子をhiPSCに組み込むことを含む、アルツハイマー病(AD)の細胞モデルを調製する方法。
2.前記AD関連遺伝子がhiPSCにおいて構成的に過剰発現される、項1に記載の方法。
3.前記AD関連遺伝子が、ADを引き起こす変異APP遺伝子または変異PS遺伝子である、項1または2に記載の方法。
4.前記変異PS遺伝子がPS1dE9遺伝子である、項3に記載の方法。
5.前記AD関連遺伝子がBACE1遺伝子である、項1または2に記載の方法。
6.前記AD関連遺伝子が、ADを引き起こす変異APP遺伝子、PS1dE9遺伝子、およびBACE1遺伝子から選択される、項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
7.前記AD関連遺伝子が部位特異的な方法によりhiPSCに組み込まれる、項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
8.前記AD関連遺伝子がAAVS1部位でhiPSCに組み込まれる、項7に記載の方法。
9.項1〜8のいずれか一項に記載の方法により生成されたアルツハイマー病(AD)の細胞モデル。
10.AD関連遺伝子をhiPSCに導入して構成的に過剰発現させることを含む、hiPSCを修飾する方法。
11.前記AD関連遺伝子が、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターによってhiPSCに導入され、前記ヌクレオチド配列が、哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターに機能的に連結されている、項10に記載の方法。
12.前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである、項11に記載の方法。
13.哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子が、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む同一の発現ベクターまたはそれぞれの発現ベクターによって前記hiPSCにさらに導入される、項11または12に記載の方法。
14.前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである、項13に記載の方法。
15.前記発現ベクターがさらに、部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列を含む、項10〜14のいずれか一項に記載の方法。
16.前記部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列が、ヒトAAVS1部位に相同なヌクレオチド配列である、項15に記載の方法。
17.哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターに機能的に連結され、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む、発現ベクター。
18.前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである、項17に記載のベクター。
19.哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子をコードするヌクレオチド配列をさらに含む、項17または18に記載のベクター。
20.前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである、項19に記載のベクター。
21.部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列をさらに含む、項17〜20のいずれか一項に記載のベクター。
22.前記部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列が、ヒトAAVS1部位に相同なヌクレオチド配列である、項21に記載のベクター。
23.前記薬剤選択遺伝子が抗生物質耐性遺伝子である、項17〜22のいずれか一項に記載のベクター。
24.前記レポーター遺伝子が、緑色蛍光タンパク質または赤色蛍光タンパク質をコードする遺伝子である、項17〜23のいずれか一項に記載のベクター。
25.前記ベクター内のすべてのエレメントが、前記AD関連遺伝子の発現に寄与する順序で排列している、項17〜24のいずれか一項に記載のベクター。
26.前記ベクター内のすべてのエレメントがシス順で排列している、項25に記載のベクター。
27.第1のプロモーターと、前記第一のプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子と、第二のプロモーターと、前記第二のプロモーターによって制御されるレポーター遺伝子に連結されているAD関連遺伝子と、ヒトAAVS1部位に相同な配列とのコード核酸配列を含む遺伝子構築体であって、前記エレメントがシス順で排列している、遺伝子構築体。
28.前記第1のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記薬剤選択遺伝子が抗生物質耐性遺伝子であり、前記第二のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記AD関連遺伝子が、BACE1をコードする遺伝子であり、前記レポーター遺伝子が、緑色蛍光タンパク質または赤色蛍色タンパク質をコードする遺伝子である、項27に記載の遺伝子構築体。
29.前記第1のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記薬剤選択遺伝子が抗生物質耐性遺伝子であり、前記第二のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記AD関連遺伝子が、PS1dE9をコードする遺伝子であり、前記レポーター遺伝子が、GFPをコードする遺伝子である、項27に記載の遺伝子構築体。
30.抗生物質耐性遺伝子が、ピューロマイシン、ネオマイシン、カナマイシン、またはジェネティシン耐性遺伝子である、項28または29に記載の遺伝子構築体。
31.項16〜26のいずれか一項に記載の発現ベクターまたは項27〜30のいずれか一項に記載の遺伝子構築体によって転換されたhiPSC細胞株。
32.AD細胞モデルの生成のための、項31のhiPSC細胞株の使用。
33.ヒトAAVS1部位でBACE1遺伝子が組み込まれ、前記組み込まれたBACE1遺伝子が構成的に過剰発現されている、AD細胞モデルとして使用される遺伝子修飾されたhiPSC。
34.前記BACE1遺伝子が組み込まれていない同質遺伝子hiPSCと比較して、増加したβ−セクレターゼおよび/またはAβ−42ペプチドを示す、項33に記載の遺伝子修飾されたhiPSC。
35.ヒトAAVS1部位でPS1dE9遺伝子が組み込まれ、前記組み込まれたPS1dE9遺伝子が構成的に過剰発現されている、AD細胞モデルとして使用される遺伝子修飾されたhiPSC。
36.前記PS1dE9遺伝子が組み込まれていない同質遺伝子hiPSCと比較して、増加したβ−セクレターゼおよび/またはAβ−42ペプチドを示す、項35に記載の遺伝子修飾されたhiPSC。
37.AD治療薬のハイスループットスクリーニングのための、項33〜36のいずれか一項に記載の遺伝子修飾されたhiPSCの使用。
38.i)項16〜26のいずれか一項に記載の発現ベクターまたは項27〜30のいずれか一項に記載の遺伝子構築体をhiPSCに導入することにより、hiPSCからアルツハイマー病(AD)の細胞モデルを調製することと、
ii)上記細胞モデルで候補化合物を2日から2週間培養することと、
iii)前記候補化合物を添加する前後のβ−セクレターゼのレベル、Aβ−42濃度、及びAβ42/Aβ−40比を測定することとを含み、
ここで、β−セクレターゼのレベル、Aβ−42濃度、及びAβ42/Aβ−40比から選択される一つ以上の測定値の減少は、前記候補化合物がADの治療のための潜在的な治療薬であることを示す、
AD治療薬をハイスループットスクリーニングするための方法。
39.前記hiPSCがヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される、項38に記載の方法。
40.前記hiPSCが、ADを有さない正常なヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される、項39に記載の方法。
41.初期のAD薬スクリーニング用の、項38〜40のいずれか一項に記載のハイスループットスクリーニング方法。
42.i)BACE1遺伝子またはPS1dE9遺伝子を構成的に過剰発現させることによりhiPSC細胞株を修飾することと、
ii)前記hiPSC細胞株を機能性ニューロンに再分化することと、
iii)候補化合物の存在下で前記機能性ニューロンを培養することと、
iv)β−セクレターゼのレベル、Aβ42/Aβ−40比、及び/またはAβ−42濃度を測定し、β−セクレターゼのレベル、Aβ42/Aβ−40比、及び/またはAβ−42濃度を低減できる化合物を選択することとを含む、
β−セクレターゼまたはAβ−42阻害剤をスクリーニングするための薬剤スクリーニング方法。
43.候補薬剤化合物の存在下で前記機能性ニューロンを2日から2週間培養することを含む、項42に記載の方法。
44.前記hiPSCがヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される、項42または43に記載の方法。
45.前記hiPSCが、ADを有さない正常なヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される、項44に記載の方法。
46.項16〜26のいずれか一項に記載の発現ベクターまたは項27〜30のいずれか一項に記載の遺伝子構築体をhiPSCに導入することによって前記hiPSCを調製する、項42〜45のいずれか一項に記載の方法。
本発明の実施形態のこれらおよびその他の態様と利点は、以下の説明から、及び添付の図面を参照して、より容易に理解されるであろう。
親hiPSC細胞株(UCIS3007)の生成および表現型の同定実例を示す図である。健常な非罹患ドナーからの尿細胞が単離され、4つの転写因子(Oct4、Sox2、Klf4、およびcMyc)を使用した標準リプログラミング法でhiPSC細胞に転換された。図1Aは、形態学的変化とアルカリホスホターゼ(AP)染色を示す、尿細胞のリプログラミングのプロセスを示す図である。 親hiPSC細胞株(UCIS3007)の生成および表現型の同定実例を示す図である。健常な非罹患ドナーからの尿細胞が単離され、4つの転写因子(Oct4、Sox2、Klf4、およびcMyc)を使用した標準リプログラミング法でhiPSC細胞に転換された。図1Bは、多能性幹細胞のバイオマーカーの免疫染色(Nanog、Tra−1−60、Tra−1−81、SSEA3、及びSSEA4)を示す図である。 親hiPSC細胞株(UCIS3007)の生成および表現型の同定実例を示す図である。健常な非罹患ドナーからの尿細胞が単離され、4つの転写因子(Oct4、Sox2、Klf4、およびcMyc)を使用した標準リプログラミング法でhiPSC細胞に転換された。図1Cは、その他の多能性試験(導入遺伝子サイレンシング、内因性多能性遺伝子の発現、表面マーカーのFACS分析、プロモーターの脱メチル化(demythelation)、核型分析、胚様体形成および胚葉マーカーの発現)を示す図である。 親hiPSC細胞株(UCIS3007)の生成および表現型の同定実例を示す図である。健常な非罹患ドナーからの尿細胞が単離され、4つの転写因子(Oct4、Sox2、Klf4、およびcMyc)を使用した標準リプログラミング法でhiPSC細胞に転換された。図1Dは、その他の多能性試験(導入遺伝子サイレンシング、内因性多能性遺伝子の発現、表面マーカーのFACS分析、プロモーターの脱メチル化(demythelation)、核型分析、胚様体形成および胚葉マーカーの発現)を示す図である。 親hiPSC細胞株(UCIS3007)の生成および表現型の同定実例を示す図である。健常な非罹患ドナーからの尿細胞が単離され、4つの転写因子(Oct4、Sox2、Klf4、およびcMyc)を使用した標準リプログラミング法でhiPSC細胞に転換された。図1Eは、その他の多能性試験(導入遺伝子サイレンシング、内因性多能性遺伝子の発現、表面マーカーのFACS分析、プロモーターの脱メチル化(demythelation)、核型分析、胚様体形成および胚葉マーカーの発現)を示す図である。 親hiPSC細胞株(UCIS3007)の生成および表現型の同定実例を示す図である。健常な非罹患ドナーからの尿細胞が単離され、4つの転写因子(Oct4、Sox2、Klf4、およびcMyc)を使用した標準リプログラミング法でhiPSC細胞に転換された。図1Fは、3つの胚葉が示されている、奇形腫の形成を示す図である。 親hiPSC細胞株からの神経幹細胞と神経細胞(NSC、混合ニューロン、ドーパミン作動性ニューロン、及び運動ニューロン)を示す図である。 AAVS1部位でのAD関連遺伝子の異所性発現を伴うhiPSC細胞株の生成に使用されるドナーベクターを示す図である。標的組み込みに係る核酸配列は、ヒトAAVS1部位(HA−LおよびHA−R)に相同する配列、PGK−1プロモーター、薬剤選択マーカー遺伝子、VAGプロモーター、AD関連遺伝子およびレポーター遺伝子を含み、これらはシス順で排列している。異なるAD関連遺伝子は、Xho−IおよびBglIIを使用した制限酵素消化で簡単に置き換えることができる。図3Aは、骨格ベクターCIB−PCBEBを示す図である。 AAVS1部位でのAD関連遺伝子の異所性発現を伴うhiPSC細胞株の生成に使用されるドナーベクターを示す図である。標的組み込みに係る核酸配列は、ヒトAAVS1部位(HA−LおよびHA−R)に相同する配列、PGK−1プロモーター、薬剤選択マーカー遺伝子、VAGプロモーター、AD関連遺伝子およびレポーター遺伝子を含み、これらはシス順で排列している。異なるAD関連遺伝子は、Xho−IおよびBglIIを使用した制限酵素消化で簡単に置き換えることができる。図3Bは、BACE1遺伝子の標的組み込みのためのドナーベクターを示す図である。 AAVS1部位でのAD関連遺伝子の異所性発現を伴うhiPSC細胞株の生成に使用されるドナーベクターを示す図である。標的組み込みに係る核酸配列は、ヒトAAVS1部位(HA−LおよびHA−R)に相同する配列、PGK−1プロモーター、薬剤選択マーカー遺伝子、VAGプロモーター、AD関連遺伝子およびレポーター遺伝子を含み、これらはシス順で排列している。異なるAD関連遺伝子は、Xho−IおよびBglIIを使用した制限酵素消化で簡単に置き換えることができる。図3Cは、PS1dE9遺伝子の標的組み込みのためのドナーベクターを示す図である。 BACE1遺伝子のAAVS1部位への標的組み込みを示す図である。AAVS1部位は、PPP1R12C遺伝子座のエクソン1およびエクソン2のイントロン領域にある。F1、F2、F3、R1、R2、およびR3は、ジャンクションPCRによる挿入の検証に使用されるプライマーである。図4Aは、標的組み込みストラテジーを示す図である。 BACE1遺伝子のAAVS1部位への標的組み込みを示す図である。AAVS1部位は、PPP1R12C遺伝子座のエクソン1およびエクソン2のイントロン領域にある。F1、F2、F3、R1、R2、およびR3は、ジャンクションPCRによる挿入の検証に使用されるプライマーである。図4Bは、ジャンクションPCRによる単一細胞クローンのスクリーニング(上のパネル:F1+R1プライマーを使用した5’末端ジャンクションPCR。クローン21はインサート付きのIPSN0041−21であり、クローン24はインサートのないネガティブクローンである;下のパネル:3’末端ジャンクションPCR)を示す図である。 BACE1遺伝子のAAVS1部位への標的組み込みを示す図である。AAVS1部位は、PPP1R12C遺伝子座のエクソン1およびエクソン2のイントロン領域にある。F1、F2、F3、R1、R2、およびR3は、ジャンクションPCRによる挿入の検証に使用されるプライマーである。図4Cは、IPSN0041−21のインサートの5’末端と3’末端配列を示す図である。 PS1dE9遺伝子のAAVS1部位への標的組み込みを示す図である。AAVS1部位は、PPP1R12C遺伝子座のエクソン1およびエクソン2のイントロン領域にある。F1、F2、F3、R1、R2、およびR3は、ジャンクションPCRによる挿入の検証に使用されるプライマーである。図5Aは、標的組み込みストラテジーを示す図である。 PS1dE9遺伝子のAAVS1部位への標的組み込みを示す図である。AAVS1部位は、PPP1R12C遺伝子座のエクソン1およびエクソン2のイントロン領域にある。F1、F2、F3、R1、R2、およびR3は、ジャンクションPCRによる挿入の検証に使用されるプライマーである。図5Bは、ジャンクションPCRによる単一細胞クローンのスクリーニング(上のパネル:F1+R1プライマーを使用した5’末端ジャンクションPCR。74は、更なるキャラクタライゼーションのために選択された、インサート付きのクローンであり、67はインサートのないネガティブクローンである;下のパネル:3’末端ジャンクションPCR)を示す図である。 PS1dE9遺伝子のAAVS1部位への標的組み込みを示す図である。AAVS1部位は、PPP1R12C遺伝子座のエクソン1およびエクソン2のイントロン領域にある。F1、F2、F3、R1、R2、およびR3は、ジャンクションPCRによる挿入の検証に使用されるプライマーである。図5Cは、クローン74のインサートの5’末端と3’末端配列を示す図である。 PS1dE9遺伝子のAAVS1部位への標的組み込みを示す図である。AAVS1部位は、PPP1R12C遺伝子座のエクソン1およびエクソン2のイントロン領域にある。F1、F2、F3、R1、R2、およびR3は、ジャンクションPCRによる挿入の検証に使用されるプライマーである。図5Dは、iPSC(UCI3007−74)におけるPS1dE9遺伝子の過剰発現を示す図である。 HiPSCから大量の神経細胞を調製する調製方法を示す図である。中間段階としての神経幹細胞(NSC)が測定プロセスを短縮し、変異を減らすための重要なステップであることは示されている。神経幹細胞は、NSC特異的バイオマーカーsоx−1(赤、核を染色する)とネスチン(緑、細胞質を染色する)で免疫染色される。機能性ニューロンは、ニューロン特異的バイオマーカーTujI(赤)とDapi(青)で免疫染色される。 親細胞株IPSN0041と比較して、IPSN0041−21におけるBACE1遺伝子が過剰発現し、また、親細胞株IPSN0041と比較して、IPSN0041−21におけるBACE1遺伝子がRNAおよびタンパク質での発現が有意に高いことを示す図である。A.hiPSCおよびhiPSCからのニューロンにおけるIPSN0041−21とIPSN0041の間のmRNA発現を示す図である。B.神経幹細胞およびhiPSC細胞株からのニューロンにおけるBACE1タンパク質の発現を示す図である。 IPSN0041と比較して、IPSN0041−21におけるAβ−42ペプチドの過剰発現を示す図である。図8Aは、hiPSCからのニューロンにおけるAβ−42濃度を示す図であり、IPSN0041−21からのニューロンは、IPSN0041からのニューロンより高いAβ−42濃度を有することは示されている。 IPSN0041と比較して、IPSN0041−21におけるAβ−42ペプチドの過剰発現を示す図である。図8Bは、異なる発現パターンを示す、IPSN0041−21とIPSN0041の間のAβ−42発現の経時的研究を示す図である。 IPSN0041−21を使用した薬剤スクリーニングの実施例を示す図である。以前に報告されていない2つの小分子化合物B3とB16がhiPSCからのニューロンにおけるAβ−40とAβ−42ペプチドの生成を減らすが、Aβ−42/40比には影響しないことは示されている。既知のβ−セクレターゼ阻害剤(10uM)を陽性対照として使用する。データは3つの生物学的反復からのものである。図9Aは、B3とB16がAβ−40の生成を減らすことを示す図である。 IPSN0041−21を使用した薬剤スクリーニングの実施例を示す図である。以前に報告されていない2つの小分子化合物B3とB16がhiPSCからのニューロンにおけるAβ−40とAβ−42ペプチドの生成を減らすが、Aβ−42/40比には影響しないことは示されている。既知のβ−セクレターゼ阻害剤(10uM)を陽性対照として使用する。データは3つの生物学的反復からのものである。図9Bは、B3とB16がAβ−42の生成を減らすことを示す図である。 IPSN0041−21を使用した薬剤スクリーニングの実施例を示す図である。以前に報告されていない2つの小分子化合物B3とB16がhiPSCからのニューロンにおけるAβ−40とAβ−42ペプチドの生成を減らすが、Aβ−42/40比には影響しないことは示されている。既知のβ−セクレターゼ阻害剤(10uM)を陽性対照として使用する。データは3つの生物学的反復からのものである。図9Cは、Aβ−40に対するAβ−42の比率を示す図である。
本願で使用されるすべての技術および科学用語は、別段の定義がない限り、当業者によって一般に理解されているものと同じ意味を有する。例えば、本願で提供される生物学分野の用語について、研究者は特にSambrookら、Molecular Cloning: A Laboratory Manual、第二版、Cold Spring Harbor Press,Plainsview,New York (1989);およびAusubelら、Current Protocols in Molecular Biology (Supplement 47),John Wiley & Sons,New York(1999)を参考にした。これらの用語は、当業者によって理解される範囲より狭い範囲を有すると解釈されるべきではない。
「含む」という用語は、本明細書および請求の範囲で使用されており、他の要素またはステップを除外するものではない。特に説明しない限り、単数名詞を言及する時に不定冠詞または定冠詞である「一つ」、「一種」、「これ」、「この」を使用する場合、当該名詞の複数をも含む。
「AD関連遺伝子」は、アルツハイマー病(AD)の発症に関連するいずれの遺伝子を表す。アルツハイマー病の原因はよくわかっていないが、リスクの約70%は、アミロイド前駆体タンパク質(APP)およびプレセニリン(PS)1及び2をコードする変異遺伝子のような通常の遺伝子に遺伝的な関係がある。APP遺伝子変異により、β−セクレターゼによって優先的に切断されてより多くのAβペプチドを生成する異常なAPPタンパク質が生成する。PS遺伝子変異により、アミロイドプラークの構成成分であるAβ42ペプチドが優先的に生成する。FADまたはSAD患者にはβ−セクレターゼをコードする遺伝子の変異が見つかっていないが、BACE1発現の上昇により、Aβペプチドの発現が上昇し、AD患者におけるAβ−42ペプチドのレベルを増加させることが明らかである。これらの遺伝子は、ADの発症に密接に関連することが見出されたまたは見出される他の遺伝子とともに、本発明ではまとめてAD関連遺伝子と呼ばれる。
本願における変異アミロイド前駆体タンパク質(APP)またはプレセニリン(PS)1および2遺伝子は、ADの発症を引き起こす変異のAPPまたはPS1またはPS2遺伝子を表す。これらの遺伝子の変異は、AD患者で自然に発生するか、インビトロで遺伝的に生成し得る。本発明で「BACE1遺伝子」という用語が使われる場合、自然に存在する遺伝子だけではなく、その機能的変異体も含む。機能的変異体は、アミノ酸配列に自然に存在する遺伝子とわずかに異なり得る。例えば、自然に存在するBACE1タンパク質のアミノ酸配列とは、少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、96%、97%、98%、99%の同一性を有するが、自然のBACE1タンパク質と同じ機能を持っている。
「構成的発現」とは、必要に応じてのみ転写される通性遺伝子と比較して、継続的に転写される遺伝子発現のことである。「過剰発現」とは、顕著な遺伝子関連の発現型を生成する過度に高いまたは過量のレベルの遺伝子発現をいう。本発明について言えば、hiPSCに組み込まれる前記AD関連遺伝子は、hiPSCでは構成的に過剰発現され、アミロイド前駆体タンパク質の処理過程においてAD発現型の出現をもたらす。
本発明の「AD発現型」は、アミロイド前駆体タンパク質の処理過程での発現型に関係し、前記発現型は、AD関連遺伝子の組み込み、および組み込まれたAD関連遺伝子の構成的過剰発現によって誘導されて生成し、前記AD発現型は、β−セクレターゼのレベルの増加、アミロイドタンパク質βペプチドの増加、Aβ−42濃度の増加、および/またはAβ−42/Aβ−40の増加を含むが、これらに限られていない。
本発明では、前記AD関連遺伝子は、AD関連遺伝子を構成的に過剰発現してAD発現型を生成するためにhiPSCに組み込まれる。好ましくは部位特異的な方法で組み込まれ、もっとも好ましくは、セーフハーバー部位、すなわちヒトAAVS1部位、に相同な配列を使用して組み込まれる。相同組換えを達成するには遺伝子が「相同」であることが必要であり、これによって外来遺伝子を標的部位に組み込む。公知常識に基づいて、当業者は、相同組換えの目的を達成するために標的組み込み部位での核酸配列に相同な核酸配列を設計する方法を知っている。したがって、本発明は相同な配列を言及する場合、実施例で使用されている相同な配列を含むが、これらに限られず、さらに、当業者が通常の技術を通してヒトAAVS1部位での組み込みを実現するために設計したいずれの相同な配列を含む。
ベクター
本発明のAD細胞モデルは、遺伝的組換え法を用いて生成して、AD関連遺伝子を非患者のhiPSCに導入することができる。組換えられて生成したAD細胞モデルについて、AD関連タンパク質、例えば、変異APPまたはPSタンパク質、またはBACE1酵素をコードする核酸を単離し、さらにクローニングする(DNAの増幅)または発現するために複製可能なベクターに挿入する。前記タンパク質をコードするDNAについて、本分野の従来の方法を使用して容易に単離およびシーケンシングすることができる。
本発明の目的のために、多くのベクターが、更なる改変に用いることができる。ベクターの成分は一般に、複製起点、1つ以上のマーカー遺伝子、1つ以上のレポーター遺伝子、エンハンサー要素、プロモーター、および転写終結配列から選択される1つ以上を含むが、これらに限られていない。
複製起点
発現ベクターとクローニングベクターはどちらも、ベクターが選択した宿主細胞内で複製できるようにする核酸配列を含む。
一般に、クローニングベクターにおいて、この配列は、ベクターが宿主染色体DNAとは独立して複製することを可能にするものであり、複製起点または自己複製配列を含む。この配列は、さまざまな細菌、酵母、及びウイルスでよく知られている。プラスミドpBR322の複製起点はほとんどのグラム陰性菌に適しており、2μプラスミド起点は酵母に適しており、さまざまなウイルス起点(SV40、ポリオ―マ、アデノウイルス、VSV、またはBPV)は哺乳動物細胞でのクローニングベクターに使用可能である。一般に、哺乳動物発現ベクターは複製成分起点を必要としない(初期プロモーターを含むためSV40起点を一般に使用可能である)。
選択遺伝子成分
発現ベクターとクローニングベクターは、選択性マーカーとも呼ばれる選択遺伝子を含み得る。典型的な選択遺伝子は、次のタンパク質、すなわち、(a)アンピシリン、ネオアイシン、メトトレキサートまたはテトラサイクリン、ウロマイシン、カナマイシン、及びジェネティシンなど、抗生物質または他の毒素に対する耐性を付与するタンパク質、(b)栄養要求性欠乏を補うタンパク質、または(c)バチルスのD−アラニンラセマーゼをコードする遺伝子のような、複合培地から得られない重要な栄養素を提供するタンパク質、をコードする。
選択スキームの一例は、宿主細胞の増殖を阻止する為に薬剤を利用する。異種遺伝子での形質転換に成功した細胞は、薬剤耐性を付与するタンパク質を生成し、選択スキームで生き残る。このような優性選択の例では、ネオマイシン、ウロマイシン、カナマイシン、ジェネティシン、ハイグロマイシンという薬物を使用する。
哺乳動物細胞に適した選択性マーカーの別の例は、DHFR、グルタミンシンセターゼ(GS)、チミジンキナーゼ、メタロチオネイン−Iおよび−II、好ましくは霊長類メタロチオネイン遺伝子、アデノシン20デアミナーゼ、オルニチンデカルボキシラーゼなど、コーディング核酸の抗体を吸収する能力のある細胞の同定を可能にするものである。
例えば、DHFR遺伝子で形質転換された細胞は、メトトレキセート(Mtx)、DHFRの競合的アンタゴニストを含む培地で形質転換体を培養することにより同定される。これらの条件下で、DHFR遺伝子は他の同時形質転換された核酸とともに増幅される。
あるいは、GS遺伝子で形質転換された細胞は、L−メチオニンスルホキシミン(Msx)、GS阻害剤を含む培地で形質転換体を培養することにより同定される。これらの条件下で、GS遺伝子は他の同時形質転換された核酸とともに増幅される。GS選択/増幅システムは、上記DHFR選択/増幅システムと組み合わせて使用することができる。
レポーター遺伝子成分
レポーター遺伝子(通常は単にレポーターと略称)は、研究者が生物体に関心のある別の遺伝子の調節配列に設けられた遺伝子である。一部の遺伝子をレポーターとして選択するのは、これらの遺伝子によりこれらを発現する生物体に与える特徴が容易に同定および測定でき、あるいは、これらの遺伝子が選択性マーカーであるからである。レポーター遺伝子は、ある遺伝子が細胞または生物集団に取り込まれたか、または発現されたかの指標としてよく使用される。
レポーター遺伝子を生物体に導入するために、科学者は、レポーター遺伝子と目的遺伝子を同じDNA構築体に置いて細胞または生物体に挿入する。視覚同定特徴を誘発する一般的に使用されるレポーター遺伝子は、通常、蛍光および発光タンパク質に係る。その例として、クラゲの緑色蛍光タンパク質(GFP)をコードする遺伝子、および遺伝子dsRedからの赤色蛍光タンパク質をコードする遺伝子を含み、前記クラゲの緑色蛍光タンパク質遺伝子によって、この遺伝子を発現する細胞が青色光の下で緑色に光る。
プロモーター成分
発現ベクターおよびクローニングベクターは一般に、宿主細胞によって認識し、目的のタンパク質をコードする核酸に機能的に連結されるプロ―モーターを含む。
プロモーター配列は真核生物では知られている。ほぼすべての真核生物遺伝子には、ATが豊富な領域があり、この領域は、転写開始部位のほぼ上流の塩基に位置している。多くの遺伝子の転写開始点から上流の70〜80塩基にある別の配列は、CNCAAT領域であり、Nは任意のヌクレオチド配列であってもよい。ほとんどの真核遺伝子の3’末端にはAATAAA配列があり、これは、コード配列の3’末端にポリAテールを付加するシグナルであってもよい。これらの配列は全て、真核の発現ベクターに適切に挿入される。
hiPSCのベクターからのAD致病タンパク質の転写は、次のプロモーターを介して制御することができる。すなわち、ポリオ―マウイルス、鶏痘ウイルス、アデノウイルス(アデノウイルス2など)、ウシパピローマウイルス、鳥肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、B型肺炎ウイルス、シミアンウイルス40(SV40)などのウイルスのゲノムから取得したプロモーター、またはアクチンプロモーターや免疫グロブリンプロモーターのような、異種哺乳動物プロモーターから取得したプロモーター、宿主細胞系と相容する、熱ショックプロモーターから取得したプロモーターを介して制御することができる。
SV40ウイルスの初期および後期プロモーターは、SV40ウイルスの複製起点を含むSV40制限フラグメントとして便利に取得できる。ヒトサイトメガロウイルスの即時初期プロモーターは、HindIII E制限フラグメントとして便利に取得される。米国特許第4,419,446号には、ベクターとしてウシパピローマウイルスを使用して哺乳動物宿主においてDNAを発現するシステムが開示されている。このシステムの改善は米国特許第4,601,978号に記載されている。また、Reyesら、Nature 297:598−601(1982)、単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼ5プロモーターの制御下のマウス細胞におけるヒトp−インターフェロンcDNAの発現を参照できる。あるいは、Rous肉腫ウイルスの長い末端反復をプロモーターとして使用することができる。
CAGプロモーターは、哺乳動物発現ベクターで高いレベルの遺伝子発現を駆動するためによく使用される強力な合成プロモーターである37-38。次の配列から構築される:
(C)サイトメガロウイルス(CMV)初期エンハンサーエレメント、
(A)プロモーター、第1のエクソンおよびニワトリβ−アクチン遺伝子の最初のイントロン、
(G)ウサギβ−グロビン遺伝子のスプライスアクセプター。
得られた合成エレメントはpCAGGS発現ベクターに使用される。
構築体全体は一般に「CAGプロモーター」と呼ばれるが、転写配列とイントロンの一部を含むため、厳格な意味でのプロモーターではない。CMV即時初期エンハンサーの他に、ニワトリβアクチン遺伝子のイントロンには、脊椎動物では高度に保存的なエンハンサーエレメントがさらに含まれる。プロモーターの3’部分はGC含有量が高いため、PCR増幅には適しない。
PGK−1遺伝子は、ハウスキーピング酵素、3−ホスホグリセリン酸キナーゼをコードし、広く発現している。この遺伝子は哺乳動物のX染色体上に存在し、メス体細胞またはオス生殖細胞の不活性X染色体上のほとんどの他の遺伝子と一緒にサイレンシングされる場合を除き、常に発現される。Pgk(PGK)−1プロモーターは、ヌクレオチドGおよびCが豊富な領域にある。このプロモーターは、大腸菌lacやneоなどのレポーター遺伝子の高いレベルの発現を効率的に駆動できる。転写開始部位の上流の120bpはコアプロモーターとされる。その上流は320bpの領域であり、コアプロモーターの転写を方向と位置に依存しない方法で増強する。この320bpの領域は、SV40初期領域のコアプロモーターの転写を増強しない。核タンパク質はこの320bpのフラグメントに結合するが、ゲル移動度シフト法によって結合された制限領域を証明することができ、これによって、エンハンサーの活性が複数の部位に結合している因子によって媒介できることが示され、各部位は低い親和性を有する39
エンハンサーエレメント成分
エンハンサー配列をベクターに挿入することによって、高等真核生物における、目的タンパク質をコードするDNA転写はしばしば増加する。現在、哺乳動物の遺伝子(グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α−フェトプロテイン、及びインスリン)から多くのエンハンサー配列が知られている。しかし、一般に真核細胞のウイルスからのエンハンサーが使用される。例として、複製起点の後側(100〜270bp)のSV40エンハンサー、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後側のポリオ―マエンハンサーおよびアデノウイルスエンハンサーが挙げられる。また、Yaniv,Nature297:17−18(1982)の、真核プロモーターの活性化のための強化エレメントも参照できる。エンハンサーは、抗体コード配列の5’または3’位、好ましくはプロモーターの5’部位で、ベクターにスプライシングされ結合され得る。
転写終止成分
ヒト細胞のような真核宿主細胞で使用される発現ベクターはまた、転写の終止およびmRNAの安定化に必要な配列を含む。このような配列は一般に、真核またはウイルスDNAまたはcDNAの5’、時には3’の非翻訳領域から取得できる。これらの領域には、目的タンパク質をコードするmRNAの非翻訳部分にポリアデニル化フラグメントとして転写されたヌクレオチドセグメントが含まれる。
一つの実施形態では、本発明のベクターは、アルツハイマー病(AD)関連遺伝子に関連する遺伝子をヒト多能性幹細胞(hiPSC)に高効率で標的組み込むために設計される。そのため、ベクターはまた、部位特異的組み込みのための配列を含むように設計される。
標的認識能力を持つ酵素による既知の位置への遺伝子の挿入は、ゲノム指向編集技術であり、この技術により、研究者は高効率かつ正確にゲノムレベルの任意の遺伝子またはDNA片段を削除、挿入、または修飾することができる40-42。このような技術はまた、例えば、US8697359、US8771945、US8795965に開示された最近広く使用されているCRISPRcas9遺伝子編集技術を含む。本発明の一部の実施形態では、AD関連遺伝子は、CRISPRcas9遺伝子編集技術により、セーフハーバー部位、すなわち、AAVS1部位に特異的に組み込まれる。
AAVS1部位は、ヒト19番染色体上の自然なAAV組み込み部位である。この領域(AAVS1)には、導入遺伝子の理想的な標的となる特徴がある。
本発明の一つの具体的な実施形態では、ベクターは、第1のプロモーターによって制御される薬剤選択マーカー遺伝子、第2のプロモーターによって制御されるレポーター遺伝子と連結されるAD関連遺伝子、及びヒトAAVS1部位の配列に相同な配列を含む。
本発明の一つの具体的な実施形態では、ドナーベクターの主鎖は、シス順で排列している標的組み込みのための左腕(HA−L)、PGK−1プロモーター、ピューロマイシン遺伝子、CAGプロモーター、GFPレポーター遺伝子、および標的組み込みのための右腕(HA−RL)を含む(図4A)。
本明細書で使用されているように、標的組み込みのための左腕(HA−L)は、次の配列を含む:
TGCTTTCTCTGACCAGCATTCTCTCCCCTGGGCCTGTGCCGCTTTCTGTCTGCAGCTTGTGGCCTGGGTCACCTCTACGGCTGGCCCAGATCCTTCCCTGCCGCCTCCTTCAGGTTCCGTCTTCCTCCACTCCCTCTTCCCCTTGCTCTCTGCTGTGTTGCTGCCCAAGGATGCTCTTTCCGGAGCACTTCCTTCTCGGCGCTGCACCACGTGATGTCCTCTGAGCGGATCCTCCCCGTGTCTGGGTCCTCTCCGGGCATCTCTCCTCCCTCACCCAACCCCATGCCGTCTTCACTCGCTGGGTTCCCTTTTCCTTCTCCTTCTGGGGCCTGTGCCATCTCTCGTTTCTTAGGATGGCCTTCTCCGACGGATGTCTCCCTTGCGTCCCGCCTCCCCTTCTTGTAGGCCTGCATCATCACCGTTTTTCTGGACAACCCCAAAGTACCCCGTCTCCCTGGCTTTAGCCACCTCTCCATCCTCTTGCTTTCTTTGCCTGGACACCCCGTTCTCCTGTGGATTCGGGTCACCTCTCACTCCTTTCATTTGGGCAGCTCCCCTACCCCCCTTACCTCTCTAGTCTGTGCTAGCTCTTCCAGCCCCCTGTCATGGCATCTTCCAGGGGTCCGAGAGCTCAGCTAGTCTTCTTCCTCCAACCCGGGCCCCTATGTCCACTTCAGGACAGCATGTTTGCTGCCTCCAGGGATCCTGTGTCCCCGAGCTGGGACCACCTTATATTCCCAGGGCCGGTTAATGTGGCTCTGGTTCTGGGTACTTTTATCTGTCCCCTCCACCCCACAGTGGGGC。
PGK−ピューロマイシンカセットは、次の配列を含む:
ATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATTACCGGGTAGGGGAGGCGCTTTTCCCAAGGCAGTCTGGAGCATGCGCTTTAGCAGCCCCGCTGGGCACTTGGCGCTACACAAGTGGCCTCTGGCCTCGCACACATTCCACATCCCCCGGTAGGCGCCAACCGGCTCCGTTCTTTGGTGGCCCCTTCGCGCCACCTTCTACTCCTCCCCTAGTCAGGAAGTTCCCCCCCGCCCCGCAGCTCGCGTCGTGCAGGACGTGACAAATGGAAGTAGCACGTCTCACTAGTCTCGTGCAGATGGACAGCACCGCTGAGCAATGGAAGCGGGTAGGCCTTTGGGGCAGCGGCCAATAGCAGCTTTGCTCCTTCGCTTTCTGGGCTCAGAGGCTGGGAAGGGGTGGGTCCGGGGGCGGGCTCAGGGGCGGGCTCAGGGGCGGGGCGGGCGCCCGAAGGTCCTCCGGAGGCCCGGCATTCTGCACGCTTCAAAAGCGCACGTCTGCCGCGCTGTTCTCCTCTTCCTCATCTCCGGGCCTTTCGGAATTCATGACCGAGTACAAGCCCACGGTGCGCCTCGCCACCCGCGACGACGTCCCCCGGGCCGTACGCACCCTCGCCGCCGCGTTCGCCGACTACCCCGCCACGCGCCACACCGTCGACCCGGACCGCCACATCGAGCGGGTCACCGAGCTGCAAGAACTCTTCCTCACGCGCGTCGGGCTCGACATCGGCAAGGTGTGGGTCGCGGACGACGGCGCCGCGGTGGCGGTCTGGACCACGCCGGAGAGCGTCGAAGCGGGGGCGGTGTTCGCCGAGATCGGCCCGCGCATGGCCGAGTTGAGCGGTTCCCGGCTGGCCGCGCAGCAACAGATGGAAGGCCTCCTGGCGCCGCACCGGCCCAAGGAGCCCGCGTGGTTCCTGGCCACCGTCGGCGTCTCGCCCGACCACCAGGGCAAGGGTCTGGGCAGCGCCGTCGTGCTCCCCGGAGTGGAGGCGGCCGAGCGCGCCGGGGTGCCCGCCTTCCTGGAGACCTCCGCGCCCCGCAACCTCCCCTTCTACGAGCGGCTCGGCTTCACCGTCACCGCCGACGTCGAGGTGCCCGAAGGACCGCGCACCTGGTGCATGACCCGCAAGCCCGGTGCCTGATAGAACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTATCATGTCTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTAT。
CAGプロモーターは次の配列を含む:
ATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGCGCTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTTGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTGAGGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCTCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCAGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGTCGGTCGGGCTGCAACCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTACGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGTCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGTGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGGCGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGCTGTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTCCTCGACCTCGAG。
GFPレポーター遺伝子は、次の配列を含む:
AGATCTGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTAGGTTCGAAATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCTTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCGCCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAAGGTCTATATCACCGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGACCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTGA。
標的組み込みのための右腕(HA−RL)は、次の配列を含む:
TACTAGGGACAGGATTGGTGACAGAAAAGCCCCATCCTTAGGCCTCCTCCTTCCTAGTCTCCTGATATTGGGTCTAACCCCCACCTCCTGTTAGGCAGATTCCTTATCTGGTGACACACCCCCATTTCCTGGAGCCATCTCTCTCCTTGCCAGAACCTCTAAGGTTTGCTTACGATGGAGCCAGAGAGGATCCTGGGAGGGAGAGCTTGGCAGGGGGTGGGAGGGAAGGGGGGGATGCGTGACCTGCCCGGTTCTCAGTGGCCACCCTGCGCTACCCTCTCCCAGAACCTGAGCTGCTCTGACGCGGCTGTCTGGTGCGTTTCACTGATCCTGGTGCTGCAGCTTCCTTACACTTCCCAAGAGGAGAAGCAGTTTGGAAAAACAAAATCAGAATAAGTTGGTCCTGAGTTCTAACTTTGGCTCTTCACCTTTCTAGTCCCCAATTTATATTGTTCCTCCGTGCGTCAGTTTTACCTGTGAGATAAGGCCAGTAGCCAGCCCCGTCCTGGCAGGGCTGTGGTGAGGAGGGGGGTGTCCGTGTGGAAAACTCCCTTTGTGAGAATGGTGCGTCCTAGGTGTTCACCAGGTCGTGGCCGCCTCTACTCCCTTTCTCTTTCTCCATCCTTCTTTCCTTAAAGAGTCCCCAGTGCTATCTGGGACATATTCCTCCGCCCAGAGCAGGGTCCCGCTTCCCTAAGGCCCTGCTCTGGGCTTCTGGGTTTGAGTCCTTGGCAAGCCCAGGAGAGGCGCTCAGGCTTCCCTGTCCCCCTTCCTCGTCCACCATCTCATGCCCCTGGCTCTCCTGCCCCTTCCCTACAGGGGTTCCTGGCTCTGCTCT。
別の具体的な実施形態では、ドナーベクターは、BgIIIおよびXhoI部位でベクター骨格に挿入されるBACE1遺伝子を含む(図4B)。BACE1遺伝子のcDNA配列は、遺伝子座NM_138973.3(Homo sapiensβ−セクレターゼ1、転写変異体d、mRNA)としてGenbankに開示されている。本明細書で使用されているように、「BACE1」は、BACE1遺伝子によってコードされる膜貫通プロテアーゼを表す。BACE1は、アミロイド前駆体タンパク質からのアミロイドβペプチドの形成における最初のステップを触媒する。アミロイドβペプチドは、アミロイドβプラークの主成分であり、ヒトアルツハイマー病患者の脳に蓄積している。
ドナーベクターにおけるBACE1遺伝子のDNA配列は下記通りである:
ATGGCCCAAGCCCTGCCCTGGCTCCTGCTGTGGATGGGCGCGGGAGTGCTGCCTGCCCACGGCACCCAGCACGGCATCCGGCTGCCCCTGCGCAGCGGCCTGGGGGGCGCCCCCCTGGGGCTGCGGCTGCCCCGGGAGACCGACGAAGAGCCCGAGGAGCCCGGCCGGAGGGGCAGCTTTGTGGAGATGGTGGACAACCTGAGGGGCAAGTCGGGGCAGGGCTACTACGTGGAGATGACCGTGGGCAGCCCCCCGCAGACGCTCAACATCCTGGTGGATACAGGCAGCAGTAACTTTGCAGTGGGTGCTGCCCCCCACCCCTTCCTGCATCGCTACTACCAGAGGCAGCTGTCCAGCACATACCGGGACCTCCGGAAGGGTGTGTATGTGCCCTACACCCAGGGCAAGTGGGAAGGGGAGCTGGGCACCGACCTGCTTTGTGGTGCTGGCTTCCCCCTCAACCAGTCTGAAGTGCTGGCCTCTGTCGGAGGGAGCATGATCATTGGAGGTATCGACCACTCGCTGTACACAGGCAGTCTCTGGTATACACCCATCCGGCGGGAGTGGTATTATGAGGTGATCATTGTGCGGGTGGAGATCAATGGACAGGATCTGAAAATGGACTGCAAGGAGTACAACTATGACAAGAGCATTGTGGACAGTGGCACCACCAACCTTCGTTTGCCCAAGAAAGTGTTTGAAGCTGCAGTCAAATCCATCAAGGCAGCCTCCTCCACGGAGAAGTTCCCTGATGGTTTCTGGCTAGGAGAGCAGCTGGTGTGCTGGCAAGCAGGCACCACCCCTTGGAACATTTTCCCAGTCATCTCACTCTACCTAATGGGTGAGGTTACCAACCAGTCCTTCCGCATCACCATCCTTCCGCAGCAATACCTGCGGCCAGTGGAAGATGTGGCCACGTCCCAAGACGACTGTTACAAGTTTGCCATCTCACAGTCATCCACGGGCACTGTTATGGGAGCTGTTATCATGGAGGGCTTCTACGTTGTCTTTGATCGGGCCCGAAAACGAATTGGCTTTGCTGTCAGCGCTTGCCATGTGCACGATGAGTTCAGGACGGCAGCGGTGGAAGGCCCTTTTGTCACCTTGGACATGGAAGACTGTGGCTACAACATTCCACAGACAGATGAGTCAACCCTCATGACCATAGCCTATGTCATGGCTGCCATCTGCGCCCTCTTCATGCTGCCACTCTGCCTCATGGTGTGTCAGTGGCGCTGCCTCCGCTGCCTGCGCCAGCAGCATGATGACTTTGCTGATGACATCTCCCTGCTGA。
BACE1のタンパク質配列は下記通りである:
MAQALPWLLLWMGAGVLPAHGTQHGIRLPLRSGLGGAPLGLRLPRETDEEPEEPGRRGSFVEMVDNLRGKSGQGYYVEMTVGSPPQTLNILVDTGSSNFAVGAAPHPFLHRYYQRQLSSTYRDLRKGVYVPYTQGKWEGELGTDLLCGAGFPLNQSEVLASVGGSMIIGGIDHSLYTGSLWYTPIRREWYYEVIIVRVEINGQDLKMDCKEYNYDKSIVDSGTTNLRLPKKVFEAAVKSIKAASSTEKFPDGFWLGEQLVCWQAGTTPWNIFPVISLYLMGEVTNQSFRITILPQQYLRPVEDVATSQDDCYKFAISQSSTGTVMGAVIMEGFYVVFDRARKRIGFAVSACHVHDEFRTAVEGPFVTLDMEDCGYNIPQTDESTLMTIAYVMAAICALFMLPLCLMVCQWRCLRCLRQQHDDFADDISLLK。
別の一つの具体的な実施形態では、ドナーベクターは、ベクター骨格に挿入されるBgIIIおよびXhoI部位でのPS1dE9遺伝子を含む(図5B)。PS1dE9遺伝子は、PS1遺伝子のエクソン9が欠失しているPS1遺伝子の変異体である。本明細書で使用されているように、用語「PS1」は、プレセニリン1遺伝子によってコードされるタンパク質を表す。PS1遺伝子のcDNA配列は、遺伝子座NM_000021.3(Homosapiens、プレセニリン1、転写変異体1、mRNA)としてGenbankに開示されている。プレセニリン1は、プレセニリン複合体の4つのコアタンパク質の1つであり、細胞内のγセクレターゼを含むいくつかのタンパク質のタンパク質加水分解イベントを導く。用語の「PS1dE9遺伝子」は、PS1の変異遺伝子を表し、これは、異常なγ−セクレターゼの分解を引き起こし、Aβ−42ペプチドの生成に寄与し、これによってアルツハイマー病の早期発症を引き起こす。
ドナーベクターのPS1dE9のDNA配列は下記の通りである(強調表示されているのは欠失している配列である):
PS1dE9のタンパク質配列は以下の通りである(強調表示されているのは、エクソン9が欠失していることによる翻訳ミスのある部分である):
本明細書の別の実施形態では、本発明のドナーベクターは、BACE1の任意の変異体および/またはPS1の任意の変異体を含んでもよい。変異体は、例えば、異なる個体の対立遺伝子変異体(多型など)、選択的スプライシング形態などによって引き起こされる自然に存在する変異体を含む。変異体は好ましくは、本発明による配列と実質的に相同であり、すなわち、本発明の配列とは一般に、少なくとも約80%、好ましくは少なくとも約90%、より好ましくは少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%のヌクレオチド配列同一性を示す。本発明の遺伝子の変異体はまた、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で上記で定義された配列(またはその相補鎖)にハイブリダイズする核酸配列を含む。典型的なストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、42℃を超える温度、200mM以下の塩分を含む。
hiPSC細胞株
一つの実施形態では、本発明は、本発明の方法によってセーフハーバー部位(AAVS1部位)でAD関連遺伝子を組み込むことでhiPSC細胞株を生成することに係る。本発明によって作製されたhiPSC細胞株は、組み込まれた遺伝子を構成的に過剰発現し、同質遺伝子対照のhiPSC細胞株と比較して増加したβ−セクレターゼ及び/またはAβ−42ペプチドを示す。
一つの具体的な実施形態では、本発明の方法によって調製されたhiPSC細胞株は、AAVS1部位に組み込まれた外因性核酸配列を有する。核酸配列は、PGK−1プロモーター、ピューロマイシン、CAGプロモーター、BACE1遺伝子、GFP遺伝子、および異なるセグメントをリンクする配列を含む。挿入された核酸配列は下記の通りである(下線部はBACE1遺伝子である):
ATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATTACCGGGTAGGGGAGGCGCTTTTCCCAAGGCAGTCTGGAGCATGCGCTTTAGCAGCCCCGCTGGGCACTTGGCGCTACACAAGTGGCCTCTGGCCTCGCACACATTCCACATCCCCCGGTAGGCGCCAACCGGCTCCGTTCTTTGGTGGCCCCTTCGCGCCACCTTCTACTCCTCCCCTAGTCAGGAAGTTCCCCCCCGCCCCGCAGCTCGCGTCGTGCAGGACGTGACAAATGGAAGTAGCACGTCTCACTAGTCTCGTGCAGATGGACAGCACCGCTGAGCAATGGAAGCGGGTAGGCCTTTGGGGCAGCGGCCAATAGCAGCTTTGCTCCTTCGCTTTCTGGGCTCAGAGGCTGGGAAGGGGTGGGTCCGGGGGCGGGCTCAGGGGCGGGCTCAGGGGCGGGGCGGGCGCCCGAAGGTCCTCCGGAGGCCCGGCATTCTGCACGCTTCAAAAGCGCACGTCTGCCGCGCTGTTCTCCTCTTCCTCATCTCCGGGCCTTTCGGAATTCATGACCGAGTACAAGCCCACGGTGCGCCTCGCCACCCGCGACGACGTCCCCCGGGCCGTACGCACCCTCGCCGCCGCGTTCGCCGACTACCCCGCCACGCGCCACACCGTCGACCCGGACCGCCACATCGAGCGGGTCACCGAGCTGCAAGAACTCTTCCTCACGCGCGTCGGGCTCGACATCGGCAAGGTGTGGGTCGCGGACGACGGCGCCGCGGTGGCGGTCTGGACCACGCCGGAGAGCGTCGAAGCGGGGGCGGTGTTCGCCGAGATCGGCCCGCGCATGGCCGAGTTGAGCGGTTCCCGGCTGGCCGCGCAGCAACAGATGGAAGGCCTCCTGGCGCCGCACCGGCCCAAGGAGCCCGCGTGGTTCCTGGCCACCGTCGGCGTCTCGCCCGACCACCAGGGCAAGGGTCTGGGCAGCGCCGTCGTGCTCCCCGGAGTGGAGGCGGCCGAGCGCGCCGGGGTGCCCGCCTTCCTGGAGACCTCCGCGCCCCGCAACCTCCCCTTCTACGAGCGGCTCGGCTTCACCGTCACCGCCGACGTCGAGGTGCCCGAAGGACCGCGCACCTGGTGCATGACCCGCAAGCCCGGTGCCTGATAGAACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTATCATGTCTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATGCGGCCGCAATCGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGCGCTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTTGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTGAGGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCTCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCAGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGTCGGTCGGGCTGCAACCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTACGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGTCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGTGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGGCGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGCTGTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTCCTCGACCTCGAGATGGCCCAAGCCCTGCCCTGGCTCCTGCTGTGGATGGGCGCGGGAGTGCTGCCTGCCCACGGCACCCAGCACGGCATCCGGCTGCCCCTGCGCAGCGGCCTGGGGGGCGCCCCCCTGGGGCTGCGGCTGCCCCGGGAGACCGACGAAGAGCCCGAGGAGCCCGGCCGGAGGGGCAGCTTTGTGGAGATGGTGGACAACCTGAGGGGCAAGTCGGGGCAGGGCTACTACGTGGAGATGACCGTGGGCAGCCCCCCGCAGACGCTCAACATCCTGGTGGATACAGGCAGCAGTAACTTTGCAGTGGGTGCTGCCCCCCACCCCTTCCTGCATCGCTACTACCAGAGGCAGCTGTCCAGCACATACCGGGACCTCCGGAAGGGTGTGTATGTGCCCTACACCCAGGGCAAGTGGGAAGGGGAGCTGGGCACCGACCTGCTTTGTGGTGCTGGCTTCCCCCTCAACCAGTCTGAAGTGCTGGCCTCTGTCGGAGGGAGCATGATCATTGGAGGTATCGACCACTCGCTGTACACAGGCAGTCTCTGGTATACACCCATCCGGCGGGAGTGGTATTATGAGGTGATCATTGTGCGGGTGGAGATCAATGGACAGGATCTGAAAATGGACTGCAAGGAGTACAACTATGACAAGAGCATTGTGGACAGTGGCACCACCAACCTTCGTTTGCCCAAGAAAGTGTTTGAAGCTGCAGTCAAATCCATCAAGGCAGCCTCCTCCACGGAGAAGTTCCCTGATGGTTTCTGGCTAGGAGAGCAGCTGGTGTGCTGGCAAGCAGGCACCACCCCTTGGAACATTTTCCCAGTCATCTCACTCTACCTAATGGGTGAGGTTACCAACCAGTCCTTCCGCATCACCATCCTTCCGCAGCAATACCTGCGGCCAGTGGAAGATGTGGCCACGTCCCAAGACGACTGTTACAAGTTTGCCATCTCACAGTCATCCACGGGCACTGTTATGGGAGCTGTTATCATGGAGGGCTTCTACGTTGTCTTTGATCGGGCCCGAAAACGAATTGGCTTTGCTGTCAGCGCTTGCCATGTGCACGATGAGTTCAGGACGGCAGCGGTGGAAGGCCCTTTTGTCACCTTGGACATGGAAGACTGTGGCTACAACATTCCACAGACAGATGAGTCAACCCTCATGACCATAGCCTATGTCATGGCTGCCATCTGCGCCCTCTTCATGCTGCCACTCTGCCTCATGGTGTGTCAGTGGCGCTGCCTCCGCTGCCTGCGCCAGCAGCATGATGACTTTGCTGATGACATCTCCCTGCTGAAGGTCGACAGATCTGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTAGGTTCGAAATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCTTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCGCCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAAGGTCTATATCACCGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGACCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTGAGAGCTCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCGATCG。
インサートセグメントと宿主ゲノム間の5’末端ジャンクションでの配列は、次のように表される:
ACCCCACAGTGGGGCAAGCTTGGATCCTC及びその相補的な配列。
インサートセグメントと宿主ゲノム間の3’末端ジャンクションでの配列は、次のように表される:
CGATCGGCGGCCGCTACTAGGGACAGGATT及びその相補的な配列。
一つの具体的な実施形態では、本発明の方法によって調製されたhiPSC細胞株は、AAVS1部位に組み込まれた外因性核酸配列を有する。核酸配列は、PGK−1プロモーター、ピューロマイシン、CAGプロモーター、変異体PS1遺伝子(PS1dE9)、GFP遺伝子、および異なるセグメントをリンクする配列を含む。挿入された核酸配列は下記の通りである(下線部はPS1dE9遺伝子である):
ATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATTACCGGGTAGGGGAGGCGCTTTTCCCAAGGCAGTCTGGAGCATGCGCTTTAGCAGCCCCGCTGGGCACTTGGCGCTACACAAGTGGCCTCTGGCCTCGCACACATTCCACATCCCCCGGTAGGCGCCAACCGGCTCCGTTCTTTGGTGGCCCCTTCGCGCCACCTTCTACTCCTCCCCTAGTCAGGAAGTTCCCCCCCGCCCCGCAGCTCGCGTCGTGCAGGACGTGACAAATGGAAGTAGCACGTCTCACTAGTCTCGTGCAGATGGACAGCACCGCTGAGCAATGGAAGCGGGTAGGCCTTTGGGGCAGCGGCCAATAGCAGCTTTGCTCCTTCGCTTTCTGGGCTCAGAGGCTGGGAAGGGGTGGGTCCGGGGGCGGGCTCAGGGGCGGGCTCAGGGGCGGGGCGGGCGCCCGAAGGTCCTCCGGAGGCCCGGCATTCTGCACGCTTCAAAAGCGCACGTCTGCCGCGCTGTTCTCCTCTTCCTCATCTCCGGGCCTTTCGGAATTCATGACCGAGTACAAGCCCACGGTGCGCCTCGCCACCCGCGACGACGTCCCCCGGGCCGTACGCACCCTCGCCGCCGCGTTCGCCGACTACCCCGCCACGCGCCACACCGTCGACCCGGACCGCCACATCGAGCGGGTCACCGAGCTGCAAGAACTCTTCCTCACGCGCGTCGGGCTCGACATCGGCAAGGTGTGGGTCGCGGACGACGGCGCCGCGGTGGCGGTCTGGACCACGCCGGAGAGCGTCGAAGCGGGGGCGGTGTTCGCCGAGATCGGCCCGCGCATGGCCGAGTTGAGCGGTTCCCGGCTGGCCGCGCAGCAACAGATGGAAGGCCTCCTGGCGCCGCACCGGCCCAAGGAGCCCGCGTGGTTCCTGGCCACCGTCGGCGTCTCGCCCGACCACCAGGGCAAGGGTCTGGGCAGCGCCGTCGTGCTCCCCGGAGTGGAGGCGGCCGAGCGCGCCGGGGTGCCCGCCTTCCTGGAGACCTCCGCGCCCCGCAACCTCCCCTTCTACGAGCGGCTCGGCTTCACCGTCACCGCCGACGTCGAGGTGCCCGAAGGACCGCGCACCTGGTGCATGACCCGCAAGCCCGGTGCCTGATAGAACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTATCATGTCTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATGCGGCCGCAATCGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGCGCTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTTGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTGAGGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCTCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCAGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGTCGGTCGGGCTGCAACCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTACGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGTCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGTGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGGCGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGCTGTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTCCTCGACCTCGAGATGACAGAGTTACCTGCACCGTTGTCCTACTTCCAGAATGCACAGATGTCTGAGGACAACCACCTGAGCAATACTGTACGTAGCCAGAATGACAATAGAGAACGGCAGGAGCACAACGACAGACGGAGCCTTGGCCACCCTGAGCCATTATCTAATGGACGACCCCAGGGTAACTCCCGGCAGGTGGTGGAGCAAGATGAGGAAGAAGATGAGGAGCTGACATTGAAATATGGCGCCAAGCATGTGATCATGCTCTTTGTCCCTGTGACTCTCTGCATGGTGGTGGTCGTGGCTACCATTAAGTCAGTCAGCTTTTATACCCGGAAGGATGGGCAGCTAATCTATACCCCATTCACAGAAGATACCGAGACTGTGGGCCAGAGAGCCCTGCACTCAATTCTGAATGCTGCCATCATGATCAGTGTCATTGTTGTCATGACTATCCTCCTGGTGGTTCTGTATAAATACAGGTGCTATAAGGTCATCCATGCCTGGCTTATTATATCATCTCTATTGTTGCTGTTCTTTTTTTCATTCATTTACTTGGGGGAAGTGTTTAAAACCTATAACGTTGCTGTGGACTACATTACTGTTGCACTCCTGATCTGGAATTTTGGTGTGGTGGGAATGATTTCCATTCACTGGAAAGGTCCACTTCGACTCCAGCAGGCATATCTCATTATGATTAGTGCCCTCATGGCCCTGGTGTTTATCAAGTACCTCCCTGAATGGACTGCGTGGCTCATCTTGGCTGTGATTTCAGTATATGATTTAGTGGCTGTTTTGTGTCCGAAAGGTCCACTTCGTATGCTGGTTGAAACAGCTCAGGAGAGAAATGAAACGCTTTTTCCAGCTCTCATTTACTCCTGCACAGAAAGGGAGTCACAAGACACTGTTGCAGAGAATGATGATGGCGGGTTCAGTGAGGAATGGGAAGCCCAGAGGGACAGTCATCTAGGGCCTCATCGCTCTACACCTGAGTCACGAGCTGCTGTCCAGGAACTTTCCAGCAGTATCCTCGCTGGTGAAGACCCAGAGGAAAGGGGAGTAAAACTTGGATTGGGAGATTTCATTTTCTACAGTGTTCTGGTTGGTAAAGCCTCAGCAACAGCCAGTGGAGACTGGAACACAACCATAGCCTGTTTCGTAGCCATATTAATTGGTTTGTGCCTTACATTATTACTCCTTGCCATTTTCAAGAAAGCATTGCCAGCTCTTCCAATCTCCATCACCTTTGGGCTTGTTTTCTACTTTGCCACAGATTATCTTGTACAGCCTTTTATGGACCAATTAGCATTCCATCAATTTTATATCTAGAGATCTGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTAGGTTCGAAATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCTTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCGCCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAAGGTCTATATCACCGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGACCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTGAGAGCTCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCGATCG。
インサートセグメントと宿主ゲノム間の5’末端ジャンクションでの配列は、次のように表される:
ACCCCACAGTGGGGCAAGCTTGGATCCTC及びその相補的な配列。
インサートセグメントと宿主ゲノム間の3’末端ジャンクションでの配列は、次のように表される:
CGATCGGCGGCCGCTACTAGGGACAGGATT及びその相補的な配列。
別の実施形態では、挿入された核酸配列は、BACE1の任意の変異体および/またはPS1の任意の変異体をコードする配列を含んでもよい。変異体は、例えば、異なる個体の対立遺伝子変異体(多型など)、選択的スプライシング形態などによって引き起こされる自然に存在する変異体を含む。変異体は好ましくは、本発明による配列と実質的に相同であり、すなわち、本発明の配列とは一般に、少なくとも約80%、好ましくは少なくとも約90%、より好ましくは少なくとも約95%のヌクレオチド配列同一性を示す。本発明の遺伝子の変異体はまた、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で上記で定義された配列(またはその相補鎖)にハイブリダイズする核酸配列を含む。典型的なストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、42℃を超える温度、200mM以下の塩分を含む。
薬剤スクリーニング法
一つの実施形態では、本発明は、本発明の方法によって作製されたhiPSC細胞株を使用して、ADの治療のための治療剤をスクリーニングする方法に係る。この方法は、hiPSC細胞株を機能性ニューロンに再分化するステップ、薬剤化合物をニューロン培地に投与するステップ、薬剤化合物の存在下でニューロンを一定期間培養するステップ、β−セクレターゼのレベル、Aβ−42濃度、及びAβ42/Aβ−40比などを測定するステップなど、複数のステップを含むことができる。
本発明のβ−セクレターゼのレベルは、本分野の従来の方法によってRNAレベル及びタンパク質レベルで検出できる。
一つの具体的な実施形態では、BACE1遺伝子を過剰発現するhiPSC細胞株は、大量の機能性ニューロンの生成に使用される。hiPSC細胞株由来の神経細胞を96ウェルプレートで培養する。スクリーニングされる化合物をニューロン培地に2日から2週間加える。β−セクレターゼのレベルおよび/またはAβ−42ペプチドの減少に対する化合物の効果は、並行して測定される。
別の具体的な実施形態では、PS1dE9遺伝子を過剰発現するhiPSC細胞株は、大量の機能性ニューロンの生成に使用される。hiPSC細胞株由来の神経細胞を96ウェルプレートで培養する。スクリーニングされる化合物をニューロン培地に2日から2週間加える。Aβ−42ペプチドの減少に対する化合物の効果は測定される。
別の実施形態では、AAVS1部位でBACE1遺伝子の任意の変異体および/またはPS1遺伝子の任意の変異体を過剰発現するhiPSC細胞株を使用して、大量の機能性ニューロンを生成する。変異体は、例えば、異なる個体の対立遺伝子変異体(多型など)、選択的スプライシング形態などによって引き起こされる自然に存在する変異体を含む。変異体は好ましくは、本発明による配列と実質的に相同であり、すなわち、本発明の配列とは一般に、少なくとも約80%、好ましくは少なくとも約90%、より好ましくは少なくとも約95%のヌクレオチド配列同一性を示す。本発明の遺伝子の変異体はまた、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で上記で定義された配列(またはその相補鎖)にハイブリダイズする核酸配列を含む。典型的なストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、42℃を超える温度、200mM以下の塩分を含む。
本願で添付の図面を参照して説明された実施形態は説明的、例示的であり、本発明を一般的に理解するために使用される。実施形態は、本発明を限定するものと解釈されるべきではない。同じまたは類似した要素、及び同じまたは類似した機能を有する要素は、説明全体を通して同じ図面符号で示される。また、本発明の範囲は添付の請求の範囲によってのみ限定されるため、本願で使用されている用語は、特定の実施形態を説明することのみを目的とし、限定を意図するものではないと理解されるべきである。
実施例は、説明の目的でのみ提供される。
実施例1:ゲノム編集用の親hiPSC細胞株の生成
2つのhiPSC細胞株、すなわち、UCIS3007とIPSN0041が生成され、同質遺伝子病変hiPSC細胞株を調製するために親hiPSC細胞株として使用された。UCIS3007は、非罹患女性ドナーの尿細胞に由来し、この尿細胞は、4つの転写因子(Oct4、Sox1、Klf4、およびcMyc)を使用して、レトロウイルスベクターを介したリプログラミング法により得られた。ドナー尿上皮細胞を尿上皮細胞増殖培地(CIB、カタログ番号UC−0302)で培養した。ウイルス感染の前日に、約20,000個の尿液における上皮細胞を12ウェルプレートに播種した。レトロウイルスベクターでトランスフェクトした細胞を、hiPSCリプログラミング血清培地(CIB、カタログ番号RE−0201)で培養した。6日目に、細胞をフィーダー細胞を含むT25フラスコに播種し、マイトマイシンCで処理した。約10,000個の細胞を各T25フラスコに播種し、hiPSCクローンが現れるまで約20日間リプログラミング培地で培養した。次に、クローンをマトリゲル(Corning、カタログ番号352477)で被覆されたプレートにピックアップして更なる精製および増殖に用いられた。
IPSN0041は非罹患ドナーの臍帯マトリックス細胞に由来し、この臍帯マトリックス細胞は、6つの転写因子を有するエピソームベクターを使用したフットプリントフリー(footprint−free method)によって得られた。Amaxa NucleofectorキットIIを使用して、核転移試薬(Lonza、カタログ番号VPI−1005)と混合したエピソームプラスミド(3μgpCEP4−EO2S−EN2K、2.4μgpCEP4−M2L、3.2μgpCEP4−EO2S−1)で約100万個の臍帯マトリックス細胞をエレクトロポレーション法でトランスフェクトした。トランスフェクトされた細胞を、マトリゲル(Corning、カタログ番号352477)で被覆された2つのT25フラスコに直ちに播種し、hiPSCリプログラミング培地(CIB、カタログ番号RE−0202)で培養した。トランスフェクションしてから15日目に、培地をmTeSr1に置き換え、hiPSCコロニーが現れるまでさらに7日間培養した。典型的なhiPSC形態を持つクローンを、更なる精製および増殖のために選択した。
hiPSCクローンの同定は国際標準43-44に従って行われ、外因性遺伝子サイレンシングおよび多能性マーカー発現検出、外因性遺伝子組み込みアッセイ、プロモーター脱メチル化分析、核型分析テスト、分化能テスト(胚様体形成)、奇形腫テスト、セルID(STR)テストなどを含む(図1)。また、ゲノム編集作業を行う前に、これら2つの親hiPSC細胞株の神経系統分化の可能性も検証された(図2)。
実施例2:ドナーベクターと標的ベクターの構築
最も一般的に使用されているゲノム編集技術CRISPR/Cas9システムを使用してhiPSC遺伝子工学改変が行われた。AD関連遺伝子のセーフハーバー部位(AAVS1部位)への標的組み込みについて、AAVS1部位を標的とする特異的なCRISPRsgRNAベクターが構築された。sgRNAの設計および構築は、文献に記載されている方法に従って行われた29。BpiI酵素の標的部位はベクター上にあり、認識部位は切断部分にある。そのため、目標部位スペーサー配列は、一段階の消化によってベクターにクローニングすることができる。消化後、ベクターには5’GTGG3’と5’GTTT3’粘着末端が含まれている。CACC+ターゲットスペーサー配列の粘着末端と、AAAC+逆相補配列の粘着末端とを合成することにより、sgRNAは、追加の粘着末端を持つ2本鎖オリゴ配列になり、cas9ベクターに連結することができる。CRISPR−cas9プラスミドは一般的に2ステップの方法で構築される。最初のステップは、合成されたオリゴ配列の切断部位を処理することであり、第2のステップは、処理されたオリゴ配列を制限酵素消化で処理されたCRISPR−cas9ベクターと連結することである。
ドナー構築について、まず、PGK−PURO−SV40PA、P2A−EGFP−BGHPAおよびCAGプロモーターを含む骨格ベクターとマルチクローニングサイト(MSC)が生成された。最終的なドナーを構築するために、1)T−HindIII−CAG−EcoRI、2)T−SalI−P2A−EGFP−BGHPA−NotI、3)T−Hind III−PGK−PURO−SV40PA−HindIII、4)合成されたPUC19−EcoRI−BACE1cds−SalI、及び5)PZDベクター(Sigma−Aldrich)の5つのプラスミドが生成された。最初のステップは、プラスミド1、2、4および5を消化して、HindIII−CAG−EcoRI−、−LALI−EGA−EGFP−BGHPA−NоtI−、EcoRI−BACE1cds−SalI−およびHindIII−PZDonor−HindIII−の4つのフラグメントを回収して、すべてのフラグメントを連結した。DH5α細胞へ形質転換した後、陽性クローンは、PCBEB6の中間ベクターとして同定された。HindIII消化を介して、PCBEB6とT−HindIII−PGK−PURO−SV40PA−HindIIIを連結して最終的なドナーベクターが生成された。このドナーベクターはCIB−PCBEBと呼ばれる(図3A)。AAVS1部位での過剰発現のすべての外因性遺伝子は、両端にBglIIとXhoI切断部位を持つ遺伝子配列を合成することによって完成された。目的の遺伝子は、ベクターをBglIIとXhoIで消化してベクターに挿入され、そしてインサートセグメントと前記ベクターを連結した。最終的なドナープラスミドを使用してDH5α細胞に形質転換し、そしてシーケンシングによって検証した。BACE1遺伝子とPS1dE9遺伝子の過剰発現のドナーの構築は、図3Bと3Cに示されている。
実施例3:AAVS1部位でのAD関連遺伝子の標的組み込み
AD関連遺伝子をAAVS1部位に導入するために、mTeSR1(Stemcell Technologies、カタログ番号05850)を使用して、親hiPSCを、マトリゲル(Corning、カタログ番号354277)で被覆された6ウェルプレート上に37℃、5%CO2で培養した。細胞を80%コンフルエンスで収穫し、Cas9−sgRNAプラスミドとドナープラスミドと共に、エレクトロポレーション法(Amaxa Nucleofector II、プログラムA−024)によって同時トランスフェクションした。各トランスフェクション反応の細胞数は0.5〜1×106であり、プラスミドの量は、Cas9−sgRNA2.5μg、ドナープラスミド4μgであった。トランスフェクションされた細胞を、マトリゲルで被覆された6ウェルプレートに直ちに播種し、mTeSR1および10μMY−27632(Sigma、カタログ番号Y0503)とともにインキュベーションした。48時間インキュベーションした後、薬剤選択のために、0.5μg/mlのピューロマイシン(Xiya Reagent、カタログ番号1014553)を培地に添加して24時間インキュベーションした。ピューロマイシン耐性細胞を、マトリゲルで被覆されたT25フラスコに1000細胞/mlの密度で播種し、mTeSR1および10uM Y−27632でインキュベーションすることによって、単細胞クローンを調製した。10日後に顕微鏡の下で単細胞クローンをピックアップして、マトリゲルで被覆された96ウェルプレートに移された。各クローンを2つの等しい部分に分け、2つの96ウェルプレート上に培養し、1つは増殖用、1つは同定用であった。遺伝子組み込みを検証するために、DNA溶解キット(QuickExtract TM DNA Extraction Solution 1.0、Epicenter、カタログ番号QE09050)で細胞を溶解した後、ジャンクションPCRでインサートフラグメントの存在を確認した(図4B)。ジャンクションPCRによって同定された陽性クローンは、シーケンシングによってさらに検証された(図4C)。また、選択されたクローンについて多能性測定および核型分析を行って、単細胞のクローニングプロセスによって導入された変異を排除した(図4D)。BACE1とPS1dE9遺伝子を構成的に過剰発現する2つのhiPSC細胞株は、類似したストラテジーを施用して生成された(図4Aと図5A)。
実施例4:神経細胞の大規模生成
上記のように、AD関連のヒトニューロンを一貫して重複可能に大量に生成できることは、薬剤スクリーニングのための生理学的な細胞プラットフォームを構築するために重要である。現在の技術では、hiPSCからの機能的ニューロンへの分化は長いプロセスであり、しかも培養条件の一連の変化にさらされる。したがって、96ウェルプレートにhiPSCを直接に播種してニューロンを生成すると、分化したニューロンの数と質の点で、ウェル間で大きな変異が生じる。この大きな変異は、薬剤スクリーニングには適していない。この問題を解決するために、変異を制御するための段階的なプロセス(Step−wise process)が開発された。最初のステップは、hiPSCから高質の神経幹細胞(NSC)を生成することであり、このステップにより、hiPSCから成熟したニューロンまでのプロセス全体が6〜8週間短縮された。第2のステップは、NSCを神経前駆細胞(NPC)に分化させることであり、これにより、成熟したニューロンを生成する分化時間がさらに短縮された。NSCストックの生成のために、hiPSCを神経誘導培地(Stemcell Technologies、カタログ番号05835)および10uM Y−27632(Sigma、カタログ番号Y0503)を含む12ウェルプレート上に播種した。5日後、形成された胚様体球をマトリゲルで被覆された12ウェルプレート上に広げ、37℃のCO2インキュベーターでインキュベーションし、神経誘導培地を毎日変更した。7日後、NSC様ロゼット細胞を選んで24ウェルプレートに移した。培地は、NSC増殖培地(CIB、カタログ番号NE−0603)で置き換えられた。7〜8日後、NSC様細胞を選んで48ウェルプレートに移した。NSC密度が90%コンフルエンスに達したら、更なる増殖と保管のために6ウェルプレートに移した。機能性ニューロンを生成するために、8×104/cm2のNSCを、ポリ−L−オルニチン(Sigma、Cat No.P4957)およびラミニン(Sigma、カタログ番号2020)で被覆された6ウェルプレートに移し、ニューロン誘導培地(Stemcell Technologies、カタログ番号08500)で培養した。7日後、培地をニューロン成熟培地(Stemcell Technologies、カタログ番号08510)に置き換えて2〜3週間培養を続けた。成熟ニューロンは、Tuj1などのニューロン特異的バイオマーカーの免疫染色によって検証された(図6)。
実施例5:修飾されたhiPSC細胞株におけるβ−セクレターゼの過剰発現
上記のように、本発明により作られたベクターを使用して2つのhiPSC細胞株が生成された。1つのhiPSC細胞株(IPSN0041−21)は、AAVS1部位で構成的に発現されたBACE1(β−セクレターゼ1)遺伝子を含む。この細胞株について、RNAおよびタンパク質レベルでのBACE1遺伝子の発現を、その同質遺伝子の親細胞株(IPSN0041)のRNAおよびタンパク質レベルでの発現と比較した。BACE1 mRNA発現を定量化するために、全RNAをTRIzоl(Sigma、カタログ番号T9424)で抽出した。ABITM7500システムと蛍光色素SYBR Premix EXTaqTMII(TaKaRa、カタログ番号RR820A)を使用してqPCRを行った。ハウスキーピング遺伝子β−アクチンを参照として使用し、各データポイントは3回の繰り返しの平均値であった。その結果、IPSN0041と比べて、IPSN0041−21のBACE1 mRNA発現は、iPSCとiPSC由来のニューロンではるかに高く、トランスフェクトされたBACE1遺伝子がIPSN0041−21で確かに過剰発現していることは示された(図7A)。BACE1タンパク質の発現は、ELISAキット(Thermo Fisher、カタログ番号P0013)を使用して行われた。上記方法によってNSCと成熟ニューロンが取得され、細胞はタンパク質溶解緩衝液(Biyuntian Biotechnology、カタログ番号P0013)によって溶解され、ELISAキットを使用して製造元のプロトコルに従ってBACE1タンパク質濃度は測定された。RNAの結果と同様に、IPSN0041−21におけるBACE1タンパク質(β−セクレターゼ1)レベルは、hiPSC由来のNSCおよびニューロンの親系IPSN0041のBACE1タンパク質レベルよりも有意に高いことが示された(図7B)。
実施例6:修飾されたhiPSC細胞株におけるAβ−42ペプチドの発現
Aβ−42ペプチドの検出について、成熟したニューロンをニューロン成熟培地(Stemcell Technologies、カタログ番号08510)で長くとも7週間培養した。上澄みを1週間間隔で収集した。Aβ−42ペプチドの濃度を、ヒト/ラットAβ42ELISAキット(WAKO、カタログ番号290−62601)を使用して測定した。標準化のために、毎回収集した総タンパク質をも測定した(Thermo Fisher、Pierce BCA Protein Assay Kit、カタログ番号23225)。予想通り、IPSN0041−21ニューロン培地でのAβ−42ペプチドの発現量は、IPSN0041ニューロンでのAβ−42ペプチドの発現量より高いことが観察された(図8A)。6週間の期間にわたる更なる研究により、IPSN0041−21由来のニューロンは、IPSN0041由来のニューロンと異なる発現パターンを持つことが明らかになった。IPSN0041由来のニューロン(野生型)におけるAβ−42ペプチドレベルは、ニューロン培養の最初の週で非常に低く、時間の経過とともに増加し、5週目でピークになり、6週目で減少した。これに対して、IPSN0041−21由来のニューロンにおけるAβ−42の発現は、ニューロン培養の最初の2週間で高く、時間の経過とともに減少した(図8B)。6週間のインビトロでの神経細胞培養は成熟ニューロンの老化プロセスを模擬しているため、観察した結果、野生型ニューロンの場合、Aβ−42レベルはニューロンの老化プロセス中に増加することがわかり、これは、ADの疾患メカニズムと一致している。6週目のAβ−42の低減は、培地におけるニューロンの死による可能性がある。一方、初期のIPSN0041−21ニューロンにおけるAβ−42の高レベルの発現は、BACE1導入遺伝子の過剰発現として解釈でき、3週間後のAβ−42発現の低減は、未成熟ニューロンの機能障害またはβ−セクレターゼが多すぎて前記ニューロンの死を引き起こしたことが原因である可能性がある。この観察結果は、β−セクレターゼ発現の上昇がニューロンの生存に有害であることを示した。
実施例7:修飾されたhiPSC細胞株を使用した薬剤化合物のスクリーニング
修飾されたhiPSC細胞株IPSN0041−21から大量のニューロン前駆細胞(NPC)が生成された。化合物スクリーニングアッセイを実施するために、NPCを50,000細胞/ウェルの細胞密度の96ウェルプレートに播種した。NPCをニューロン成熟培地(Stemcell Technologies、カタログ番号08510)で長くとも4週間培養した。上澄みを1週間間隔で収集した。Aβ−40とAβ−42濃度を、ヒト/ラットAβ42ELISAキット(WAKO、カタログ番号290−62601)を使用して2週目、3週目、または4週目に測定した。Aβ−40とAβ−42ペプチドの測定の1週間前に、測定される化合物をニューロン培地に加えた。図9に示すように、2つの新規化合物(B3とB16)によるAβペプチドへの影響を測定した。その結果、B3とB16が、Aβ−40とAβ−42ペプチドの生成を減少させるが、Aβ−42とAβ−40との比率には影響しないことは示された。注目されたのは、B3とB16の処理状況と比較して、Aβ−42とAβ−40との高い比率によって示されたように、陽性対照(一般的に使用されるβ−セクレターゼ阻害剤(Sigma−Aldrich、カタログ番号S4562))がAβ−42ペプチドとAβ−40ペプチドの生成を不均衡に減少させた。この結果は、BACE1遺伝子の過剰発現によってIPSN0041−21におけるAβペプチドの発現が上昇し、Aβ−40とAβ−42ペプチド測定の感度を確実に高め、異なるAβペプチドに対する潜在的な薬剤化合物の影響の区別付けを可能にすることを示した。特に、このシステムは、Aβ−42の生成を効果的に減少させる化合物をスクリーニングできる。
結論
本発明は、hiPSCにおけるAD関連遺伝子の過剰発現によって生理学的に関連するAD細胞モデルを作製することを記載しており、前記AD関連遺伝子は、例えば、BACE1とPS1およびその変異体である。ヒトゲノムのセーフハーバー部位(AAVS1)でAD関連遺伝子を効率的に標的組み込むためのいくつかのユニークなドナーベクターが生成されている。AAVS1部位でのAD関連遺伝子の標的組み込みは、安全で制御された導入遺伝子発現を提供し、未知のコピー数や内因性遺伝子への潜在的な破壊など、一般的に使用されるランダム組み込み法の欠点を克服した。これらのドナーベクターを使用して生成したhiPSC細胞株は、高いレベルのβ−セクレターゼ活性および/または高いレベルのAβ−42ペプチドを示し、前記Aβ−42ペプチドは、アミロイドプラーク形成の主成分である。本発明は、hiPSC細胞株由来の神経細胞を使用してAD関連遺伝子を過剰発現する新しい細胞アッセイプラットフォームを確立した。現在の本分野の従来技術と比較して、本発明により作製された細胞アッセイプラットフォームが、新しいβ−セクレターゼ阻害剤および/またはAβ−42ペプチド阻害剤のスクリーニングに明確な利点を提供することは、潜在的な薬剤候補化合物の予備スクリーニングによって示されている。
参考文献:
1) Heritability of different forms of memory in the Late Onset Alzheimer's Disease Family Study.. Journal of Alzheimer's Disease. 2011;23(2):249-55.
2) Role of genes and environments for explaining Alzheimer disease. Arch. Gen. Psychiatry. 2006;63(2):168-74. doi:10.1001/archpsyc.63.2.168.
3) Alzheimer's Disease. Lancet. 2006;368(9533):387-403. doi:10.1016/S0140-6736(06)69113-7.
4) Genome-wide association studies in Alzheimer disease. Archives of Neurology. 2008;65(3):329-34. doi:10.1001/archneur.65.3.329.
5) Selkoe DJ. Translating cell biology into therapeutic advances in Alzheimer's disease. Nature. 1999;399(6738 Suppl):A23-31.
6) Apolipoprotein E: high-avidity binding to beta-amyloid and increased frequency of type 4 allele in late-onset familial Alzheimer disease. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1993;90(5):1977-81.
7) Apolipoprotein E4: a causative factor and therapeutic target in neuropathology, including Alzheimer's disease. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2006;103(15):5644-51.
8) Variant of TREM2 associated with the risk of Alzheimer's disease. The New England Journal of Medicine. 2012;368(2):107-16.
9) TREM2 variants in Alzheimer's disease. The New England Journal of Medicine. 2012;368(2):117-27.
10) Tanzi, R. E. & Bertram, L. Twenty years of the Alzheimer's disease amyloid hypothesis: a genetic perspective. Cell 120: 545-555 (2005).
11) Michel, G. et al. A Century of Alzheimer's Disease. Science 314: 777-781 (2006).
12) Crews, L. & Masliah, E. Molecular mechanisms of neurodegeneration in Alzheimer's disease. Hum. Mol. Genet. 19 (R1): R12-R20 (2010).
13) Muratore, C.R. et al. The familial Alzheimer's disease APPV717I mutation alters APP processing and Tau expression in iPSC-derived neurons. Hum Mol Genet. 23 (13): 3523-3536 (2014).
14) Musiek, E.S. & Holtzman, D. M. Three Dimensions of the Amyloid Hypothesis: Time, Space, and "Wingmen". Nat Neurosci 18(6): 800-806 (2016).
15) Fukumoto, H. et al. Beta-secretase protein and activity are increased in the neocortex in Alzheimer disease. Arch Neurol 59: 1381-9 (2002).
16) Yang, L.B. et al. Elevated beta-secretase expression and enzymatic activity detected in sporadic Alzheimer disease. Nat Med. 9: 3-4 (2003).
17) Li, R. et al. Amyloid beta peptide load is correlated with increased beta-secretase activity in sporadic Alzheimer's disease patients. Proc. Natl Acad. Sci. USA 101: 3632-3637 (2004).
18) Willem M, Garratt AN, Novak B, Citron M, Kaufmann S, Rittger A, DeStrooper B, Saftig P, Birchmeier C, Haass C (Oct 2006). "Control of peripheral nerve myelination by the beta-secretase BACE1". Science. 314 (5799): 664-6.
19) Evin, G. & Hinc, C. BACE1 as a therapeutic target in Alzheimer's disease: rationale and current status. Drugs Aging 30(10): 755-64 (2013).
20) Ghosh, A.K., Brindisi, M. & Tang, J. Developing β-secretase inhibitors for treatment of Alzheimer's disease. J Neurochem 120(Suppl 1): 71-83 (2013).
21) Ghosh, A.K. & Tang, J. Prospects of β-Secretase Inhibitors for the Treatment of Alzheimer's Disease. Chem Med Chem 10(9): 1463-1466 (2015).
22) Menting, K.W. & Claassen, J.A.H.R. β-secretase inhibitor; a promising novel therapeutic drug in Alzheimer's disease. Front Aging Neurosci 6: 165 (2014).
23) Nie, Q., Du, X. G. & Geng, M. Y. Small molecule inhibitors of amyloid β peptide aggregation as a potential therapeutic strategy for Alzheimer's disease. Acta Pharmacologica Sinica 32: 545-551 (2011).
24) Habchi, J. et al. Systematic development of small molecules to inhibit specific microscopic steps of Aβ42 aggregation in Alzheimer's disease. Proc. Natl Acad. Sci. USA 114: E200-E208 (2016).
25) Crunkhorn, S. Identification of novel Aβ inhibitors. Nature Reviews Drug Discovery 16: 88 (2017).
26) Vassar, R. BACE1 inhibitor drugs in clinical trials for Alzheimer's disease. Alzheimer's Research & Therapy 6: 89 (2014).
27) Higgins, G. A. & Jacobsen, H. Transgenic mouse models of Alzheimer's disease: phenotype and application. Behavioural Pharmacology 14: 419-438 (2003).
28) Takahashi, K. & Yamanaka, S. Induction of Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic and Adult Fibroblast Cultures by Defined Factors. Cell 126 (4): 663-676 (2006).
29) Takahashi, K. et al. Induction of pluripotentstem cells from adult human fibroblasts by defined factors. Cell 131 (5): 861-872 (2007).
30) Yagi, T. et al. Modeling familial Alzheimer's disease with induced pluripotent stem cells. Hum. Mol. Genet. 20: 4530-4539 (2011).
31) Israel, M. A. et al. Probing sporadic and familial Alzheimer's disease using induced pluripotent stem cells. Nature 482: 216-220 (2012).
32) Young, J.E. & Goldstein, L.S.B. Alzheimer's disease in a dish: promises and challenges of human stem cell models. Hum. Mol. Genet. 21(R1): R82-R89 (2012).
33) Kondo, T. et al. Modeling Alzheimer's disease with iPSCs reveals stress phenotypes associated with intracellular Ab and differential drug responsiveness. Cell Stem Cell 12: 487-496 (2013).
34) Muratore, C. R. et al. The familial Alzheimer's disease APPV717I mutation alters APP processing and Tau expression in iPSC-derived neurons. Hum. Mol. Genet. 23: 3523-3536 (2014).
35) Sproul, A. A. et al. Characterization and molecular profiling of PSEN1 familial Alzheimer's disease iPSC-derived neural progenitors. PLoS ONE 9: e84547 (2014).
36) Young, J.E. et al. Elucidating molecular phenotypes caused by the SORL1 Alzheimer's disease genetic risk factor using human induced pluripotent stem cells. Cell Stem Cell 16 (4): 373-385 (2015).
37) Okabe M, Ikawa M, Kominami K, Nakanishi T, Nishimune Y. 'Green mice' as a source of ubiquitous green cells. FEBS Lett. 1997 May 5;407(3):313-9.
38) Alexopoulou AN, Couchman JR, and Whiteford JR. The CMV early enhancer/chicken beta actin (CAG) promoter can be used to drive transgene expression during the differentiation of murine embryonic stem cells into vascular progenitors. BMC Cell Biology 9: 2, 2008.
39) M W McBurney, L C Sutherland, C N Adra, B Leclair, M A Rudnicki, and K Jardine, The mouse Pgk-1 gene promoter contains an upstream activator sequence, Nucleic Acids Res. 1991 Oct 25; 19(20): 5755-5761.
40) Hsu, P.D., Lander, E.S. and Zhang, F. Development and Applications of CRISPR-Cas9 for Genome Engineering. Cell 157: 1262-1278 (2014).
41) Cong, L. et al. Multiplex Genome Engineering Using CRISPR/Cas Systems. Science 339 (6121): 819-823 (2013).
42) Ran, F. A. et al. Genome engineering using the CRISPR-Cas9system. Nature Protocols 8: 2281-2308 (2013).
43) Wang, J. et al. Generation of clinical-grade human pluripotent stem cells in Xeno-free conditions. Stem Cell Research & Therapy, (6): 223 (2015).
44) Zhou, T. et al. Generation of human induced pluripotent stem cells from urine samples. Nat Protoc. 7(12): 2080-2089 (2012).

Claims (46)

  1. hiPSCのβ−セクレターゼのレベルの増加および/またはAβ−42ペプチドの増加を誘発するようにAD関連遺伝子をhiPSCに組み込むことを含む、アルツハイマー病(AD)の細胞モデルを調製する方法。
  2. 前記AD関連遺伝子がhiPSCにおいて構成的に過剰発現される、請求項1に記載の方法。
  3. 前記AD関連遺伝子が、ADの発症を引き起こす変異APP遺伝子または変異PS遺伝子である、請求項1または2に記載の方法。
  4. 前記変異PS遺伝子がPS1dE9遺伝子である、請求項3に記載の方法。
  5. 前記AD関連遺伝子がBACE1遺伝子である、請求項1または2に記載の方法。
  6. 前記AD関連遺伝子が、ADの発症を引き起こす変異APP遺伝子、PS1dE9遺伝子、およびBACE1遺伝子から選択される、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
  7. 前記AD関連遺伝子が部位特異的な方法によりhiPSCに組み込まれる、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
  8. 前記AD関連遺伝子がAAVS1部位でhiPSCに組み込まれる、請求項7に記載の方法。
  9. 請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法により生成されたアルツハイマー病(AD)の細胞モデル。
  10. AD関連遺伝子をhiPSCに導入して構成的に過剰発現させることを含む、hiPSCを修飾する方法。
  11. 前記AD関連遺伝子が、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターによってhiPSCに導入され、前記ヌクレオチド配列が、哺乳動物発現ベクターにおおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターに機能的に連結されている、請求項10に記載の方法。
  12. 前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである、請求項11に記載の方法。
  13. 哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子が、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む同一の発現ベクターまたはそれぞれの発現ベクターによって前記hiPSCにさらに導入される、請求項11または12に記載の方法。
  14. 前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである、請求項13に記載の方法。
  15. 前記発現ベクターがさらに、部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列を含む、請求項10〜14のいずれか一項に記載の方法。
  16. 前記部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列が、ヒトAAVS1部位に相同なヌクレオチド配列である、請求項15に記載の方法。
  17. 哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターに機能的に連結され、AD関連タンパク質とレポーター分子をコードするヌクレオチド配列を含む、発現ベクター。
  18. 前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである、請求項17に記載のベクター。
  19. 哺乳動物発現ベクターにおける遺伝子の高いレベルの発現を駆動するためのプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子をコードするヌクレオチド配列をさらに含む、請求項17または18に記載のベクター。
  20. 前記プロモーターがPGK−1プロモーターまたはCAGプロモーターである、請求項19に記載のベクター。
  21. 部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列をさらに含む、請求項17〜20のいずれか一項に記載のベクター。
  22. 前記部位特異的組み込みのためのヌクレオチド配列が、ヒトAAVS1部位に相同なヌクレオチド配列である、請求項21に記載のベクター。
  23. 前記薬剤選択遺伝子が抗生物質耐性遺伝子である、請求項17〜22のいずれか一項に記載のベクター。
  24. 前記レポーター遺伝子が、緑色蛍光タンパク質または赤色蛍光タンパク質をコードする遺伝子である、請求項17〜23のいずれか一項に記載のベクター。
  25. 前記ベクター内のすべてのエレメントが、前記AD関連遺伝子の発現に寄与する順序で排列している、請求項17〜24のいずれか一項に記載のベクター。
  26. 前記ベクター内のすべてのエレメントが、シス順で排列している、請求項25に記載のベクター。
  27. 第1のプロモーターと、前記第一のプロモーターによって制御される薬剤選択遺伝子と、第二のプロモーターと、前記第二のプロモーターによって制御されるレポーター遺伝子に連結されているAD関連遺伝子と、ヒトAAVS1部位に相同な配列との核酸配列を含む遺伝子構築体であって、前記エレメントがシス順で排列している、遺伝子構築体。
  28. 前記第1のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記薬剤選択遺伝子が抗生物質耐性遺伝子であり、前記第二のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記AD関連遺伝子が、BACE1をコードする遺伝子であり、前記レポーター遺伝子が、緑色蛍光タンパク質または赤色蛍色タンパク質をコードする遺伝子である、請求項27に記載の遺伝子構築体。
  29. 前記第1のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記薬剤選択遺伝子が抗生物質耐性遺伝子であり、前記第二のプロモーターがPGK−1またはCAGプロモーターであり、前記AD関連遺伝子が、PS1dE9をコードする遺伝子であり、前記レポーター遺伝子が、GFPをコードする遺伝子である、請求項27に記載の遺伝子構築体。
  30. 抗生物質耐性遺伝子が、ピューロマイシン、ネオマイシン、カナマイシン、またはジェネティシン耐性遺伝子である、請求項28または29に記載の遺伝子構築体。
  31. 請求項16〜26のいずれか一項に記載の発現ベクターまたは請求項27〜30のいずれか一項に記載の遺伝子構築体によって転換されたhiPSC細胞株。
  32. AD細胞モデルの生成のための、請求項31のhiPSC細胞株の使用。
  33. ヒトAAVS1部位でBACE1遺伝子が組み込まれ、前記組み込まれたBACE1遺伝子が構成的に過剰発現されている、AD細胞モデルとして使用される遺伝子修飾されたhiPSC。
  34. 前記BACE1遺伝子が組み込まれていない同質遺伝子hiPSCと比較して、増加したβ−セクレターゼおよび/またはAβ−42ペプチドを示す、請求項33に記載の遺伝子修飾されたhiPSC。
  35. ヒトAAVS1部位でPS1dE9遺伝子が組み込まれ、前記組み込まれたPS1dE9遺伝子が構成的に過剰発現されている、AD細胞モデルとして使用される遺伝子修飾されたhiPSC。
  36. 前記PS1dE9遺伝子が組み込まれていない同質遺伝子hiPSCと比較して、増加したβ−セクレターゼおよび/またはAβ−42ペプチドを示す、請求項35に記載の遺伝子修飾されたhiPSC。
  37. AD治療薬のハイスループットスクリーニングのための、請求項33〜36のいずれか一項に記載の遺伝子修飾されたhiPSCの使用。
  38. i)請求項16〜26のいずれか一項に記載の発現ベクターまたは請求項27〜30のいずれか一項に記載の遺伝子構築体をhiPSCに導入することにより、hiPSCからアルツハイマー病(AD)の細胞モデルを調製することと、
    ii)上記細胞モデルで候補化合物を2日から2週間培養することと、
    iii)前記候補化合物を添加する前後のβ−セクレターゼのレベル、Aβ−42濃度、及びAβ42/Aβ−40比を測定することとを含み、
    ここで、β−セクレターゼのレベル、Aβ−42濃度、及びAβ42/Aβ−40比から選択される一つ以上の測定値の減少は、前記候補化合物がADの治療のための潜在的な治療薬であることを示す、
    AD治療薬をハイスループットスクリーニングするための方法。
  39. 前記hiPSCがヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される、請求項38に記載の方法。
  40. 前記hiPSCが、ADを有さない正常なヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される、請求項39に記載の方法。
  41. 初期のAD薬スクリーニング用の、請求項38〜40のいずれか一項に記載のハイスループットスクリーニングするための方法。
  42. i)BACE1遺伝子またはPS1dE9遺伝子を構成的に過剰発現させることによりhiPSC細胞株を修飾することと、
    ii)前記hiPSC細胞株を機能性ニューロンに再分化することと、
    iii)候補化合物の存在下で前記機能性ニューロンを培養することと、
    iv)β−セクレターゼのレベル、Aβ42/Aβ−40比、及び/またはAβ−42濃度を測定し、β−セクレターゼのレベル、Aβ42/Aβ−40比、及び/またはAβ−42濃度を低減できる化合物を選択することとを含む、
    β−セクレターゼまたはAβ−42阻害剤をスクリーニングするための薬剤スクリーニング方法。
  43. 候補薬剤化合物の存在下で前記機能性ニューロンを2日から2週間培養することを含む、請求項42に記載の方法。
  44. 前記hiPSCがヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される、請求項42または43に記載の方法。
  45. 前記hiPSCが、ADを有さない正常なヒトドナーに由来し、通常のリプログラミング法によりインビトロでhiPSCに転換される、請求項44に記載の方法。
  46. 請求項16〜26のいずれか一項に記載の発現ベクターまたは請求項27〜30のいずれか一項に記載の遺伝子構築体をhiPSCに導入することによって前記hiPSCを調製する、請求項42〜45のいずれか一項に記載の方法。
JP2020544079A 2017-11-06 2017-11-06 アルツハイマー病をモデル化する新しいヒト誘発多能性幹細胞株およびその使用 Pending JP2021508251A (ja)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CN2017/109547 WO2019084958A1 (en) 2017-11-06 2017-11-06 Novel human induced pluripotent stem cell lines for modeling alzheimer's disease and usage thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2021508251A true JP2021508251A (ja) 2021-03-04

Family

ID=66332771

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2020544079A Pending JP2021508251A (ja) 2017-11-06 2017-11-06 アルツハイマー病をモデル化する新しいヒト誘発多能性幹細胞株およびその使用

Country Status (4)

Country Link
US (1) US11834648B2 (ja)
EP (1) EP3707263A4 (ja)
JP (1) JP2021508251A (ja)
WO (1) WO2019084958A1 (ja)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2021508251A (ja) 2017-11-06 2021-03-04 深▲セン▼市三▲啓▼生物技▲術▼有限公司Shenzhen Cell Inspire Biotechnology Co., Ltd. アルツハイマー病をモデル化する新しいヒト誘発多能性幹細胞株およびその使用
EP4079852A4 (en) * 2019-12-20 2024-04-10 Riken ANIMAL MODEL OF NON-HUMAN PRIMATE ALZHEIMER'S DISEASE AND METHOD FOR PRODUCING SAME
WO2022154343A1 (ko) * 2021-01-13 2022-07-21 재단법인대구경북과학기술원 Apoe christchurch 돌연변이를 포함하는 알츠하이머 저항성 세포 모델 및 이의 제조방법

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20020157122A1 (en) * 2000-10-27 2002-10-24 Wong Philip C. Beta-secretase transgenic organisms, anti-beta-secretase antibodies, and methods of use thereof
WO2004076661A1 (ja) * 2003-02-27 2004-09-10 Renascience Co., Ltd. 高効率神経分化誘導法と疾患変異ノックインes細胞を組合わせた疾患神経細胞の確立
WO2011046189A1 (ja) * 2009-10-15 2011-04-21 国立大学法人京都大学 神経変性疾患のモデル細胞、その製造方法及びその用途
JP2012523232A (ja) * 2009-04-09 2012-10-04 サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド 幹細胞への標的組込み
JP2015516162A (ja) * 2012-05-07 2015-06-11 サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド 導入遺伝子のヌクレアーゼ媒介標的化組み込みのための方法および組成物

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2015277369B2 (en) * 2014-06-16 2021-08-19 The Johns Hopkins University Compositions and methods for the expression of CRISPR guide RNAs using the H1 promoter
CN105596349B (zh) 2014-11-21 2019-09-03 中国科学院上海生命科学研究院 减弱bace1和ps1相互作用的物质在制备治疗阿尔茨海默症的组合物中的用途
US20170035860A1 (en) * 2015-04-02 2017-02-09 Alexander C. Flynn Compositions and methods for treatment of neurogenerative diseases
JP2021508251A (ja) 2017-11-06 2021-03-04 深▲セン▼市三▲啓▼生物技▲術▼有限公司Shenzhen Cell Inspire Biotechnology Co., Ltd. アルツハイマー病をモデル化する新しいヒト誘発多能性幹細胞株およびその使用

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20020157122A1 (en) * 2000-10-27 2002-10-24 Wong Philip C. Beta-secretase transgenic organisms, anti-beta-secretase antibodies, and methods of use thereof
WO2004076661A1 (ja) * 2003-02-27 2004-09-10 Renascience Co., Ltd. 高効率神経分化誘導法と疾患変異ノックインes細胞を組合わせた疾患神経細胞の確立
JP2012523232A (ja) * 2009-04-09 2012-10-04 サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド 幹細胞への標的組込み
WO2011046189A1 (ja) * 2009-10-15 2011-04-21 国立大学法人京都大学 神経変性疾患のモデル細胞、その製造方法及びその用途
JP2015516162A (ja) * 2012-05-07 2015-06-11 サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド 導入遺伝子のヌクレアーゼ媒介標的化組み込みのための方法および組成物

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
HUMAN MOLECULAR GENETICS, vol. 13, no. 2, JPN6021037227, 2004, pages 159 - 170, ISSN: 0004754112 *
THE JOURNAL OF NEUROSCIENCE, vol. 23, no. 24, JPN6021037226, 2003, pages 8513 - 8525, ISSN: 0004754111 *
THE JOURNAL OF NEUROSCIENCE, vol. 32, no. 33, JPN6021037229, 2012, pages 11390 - 11395, ISSN: 0004754113 *

Also Published As

Publication number Publication date
US20210180029A1 (en) 2021-06-17
EP3707263A1 (en) 2020-09-16
WO2019084958A1 (en) 2019-05-09
US11834648B2 (en) 2023-12-05
EP3707263A4 (en) 2021-06-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11866733B2 (en) Human induced pluripotent stem cells for high efficiency genetic engineering
Sommer et al. Excision of reprogramming transgenes improves the differentiation potential of iPS cells generated with a single excisable vector
US9932607B2 (en) Site-specific integration of transgenes into human cells
EP2434012B1 (en) Vector material for creating pluripotent stem cells, and pluripotent stem cell creation method using said vector material
AU2013270018A1 (en) Method for expression of heterologous proteins using a recombinant negative-strand RNA virus vector
Merkl et al. Efficient generation of rat induced pluripotent stem cells using a non-viral inducible vector
Xie et al. Neurodegenerative diseases in a dish: the promise of iPSC technology in disease modeling and therapeutic discovery
US11834648B2 (en) Human induced pluripotent stem cell lines for modeling Alzheimer's disease and usage thereof
Young et al. Patient-specific induced pluripotent stem cells as a platform for disease modeling
CN114761035A (zh) 用于体内双重组酶介导的盒式交换(dRMCE)的系统和方法及其疾病模型
US20230212524A1 (en) Methods and Compositions for Rapid Generation of Single and Multiplexed Reporters in Cells
WO2021181110A1 (en) Method of generating hepatic cells
Ustyantseva et al. A platform for studying neurodegeneration mechanisms using genetically encoded biosensors
Simna et al. Prospects of non-coding elements in genomic dna based gene therapy
EA019719B1 (ru) Способ получения плюрипотентных клеток
JP2006517101A (ja) 治療用産物を送達するための、増殖性の幹細胞および前駆細胞における候補分子の持続的発現
EP3898967A1 (en) Method for the introduction of genetic information in cell by site-specific integration system
WO2021190226A1 (zh) 单碱基编辑介导的剪接修复在制备治疗脊髓性肌萎缩症中的应用
CN108118069A (zh) 新的模拟阿尔茨海默病的人诱导多潜能干细胞系及其用途
WO2016171625A1 (en) Targeting telomerase for cell therapy
US20090239305A1 (en) Gene recombination exchange system for stable gene modification in human ES cells
US8895715B2 (en) S100B mini-promoters
US11274279B2 (en) Method of generating hepatic cells
JP5671737B2 (ja) 分化細胞由来多能性幹細胞由来の二次ニューロスフェアの選択方法、その選択方法によって選択されたクローン、及びそのクローンの使用方法
JP2010161960A (ja) 人工多能性幹細胞の製造方法

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20200708

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20200508

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20200918

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20200918

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20200923

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20201216

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20201223

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20210928

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20211228

RD04 Notification of resignation of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424

Effective date: 20220216

A02 Decision of refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02

Effective date: 20220419