JP2021500852A - 共有抗原を標的にする抗原結合タンパク質 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2017年8月18日に出願された米国仮出願第62/547,146号および2017年11月3日に出願された米国仮出願第62/581,368号の利益を主張し、これらの出願は、その全体がすべての目的について参照により本明細書に組み込まれる。
本出願には配列表が含まれ、この配列表はASCII形式で出願されたものであり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。2018年8月16日作成の該ASCIIコピーの名称は、40698PCT_CRF_sequencelisting.txtであり、サイズは1,591,443バイトである。
免疫系は、体液性免疫応答および細胞性免疫応答という2種類の免疫応答を用いて、病原体からの抗原特異的な保護を提供し、これらの免疫応答には、それぞれBリンパ球およびTリンパ球を介した病原体抗原の特異的認識が関与する。
一態様では、ヒト白血球抗原(HLA)−ペプチド標的に特異的に結合する単離された抗原結合タンパク質(ABP)が本明細書で提供され、HLA−ペプチド標的は、HLAクラスI分子と複合体化したHLA拘束性ペプチドを含み、HLA拘束性ペプチドは、HLAクラスI分子のα1/α2ヘテロ二量体部分のペプチド結合溝に位置し、HLAクラスI分子はHLAサブタイプA*02:01であり、HLA拘束性ペプチドは配列LLASSILCAを含むか、HLAクラスI分子はHLAサブタイプA*01:01であり、HLA拘束性ペプチドは配列EVDPIGHLYを含むか、HLAクラスI分子はHLAサブタイプB*44:02であり、HLA拘束性ペプチドは配列GEMSSNSTALを含むか、HLAクラスI分子はHLAサブタイプA*02:01であり、HLA拘束性ペプチドは配列GVYDGEEHSVを含むか、HLAクラスI分子はHLAサブタイプ*01:01であり、HLA拘束性ペプチドは配列EVDPIGHVYを含むか、またはHLAクラスI分子はHLAサブタイプHLA−A*01:01であり、HLA拘束性ペプチドは配列NTDNNLAVYを含む。
他に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語、表記法および他の科学用語は、当業者によって一般的に理解される意味を有することを意図する。いくつかの場合では、一般的に理解されている意味を持つ用語は、明確化および/またはすぐに参照することができるように本明細書で定義されており、本明細書でそのような定義を含めることは、当該技術分野で一般的に理解されているものとの違いを表すと必ずしも解釈されるべきではない。本明細書に記載または参照される技法および手順は、例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual 4th ed.(2012)Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NYに記載される広く利用される分子クローニング方法論などの当業者による従来の方法論を利用して、一般的によく理解され、かつ通常用いられる。必要に応じて、市販のキットおよびリガンドの使用を伴う手順は、特に明記しない限り、一般的に製造業者定義のプロトコルおよび条件に従って実施される。
*CDR−H1のC末端は、Kabat番号付け規則を使用して番号付けされた場合、CDRの長さに応じてH32とH34との間で異なる。
主要組織適合性複合体(MHC)は、マウスではH−2、ヒトではHLAと総称される、連結した遺伝子座のグループによってコードされる抗原の複合体である。MHC抗原の2つの主要なクラスであるクラスIおよびクラスIIは、各々、組織型および移植適合性を決定する役割を果たす細胞表面糖タンパク質のセットを含む。移植反応では、細胞傷害性T細胞(CTL)が主にクラスI糖タンパク質に応答し、一方でヘルパーT細胞が主にクラスII糖タンパク質に応答する。
ヒトには、多くのMHCハプロタイプ(本明細書では、MHCサブタイプ、HLAサブタイプ、MHCタイプ、およびHLAタイプと互換的に称される)がある。例示的なHLAサブタイプには、単に例として、HLA−A2、HLA−A1、HLA−A3、HLA−A11、HLA−A23、HLA−A24、HLA−A25、HLA−A26、HLA−A28、HLA−A29、HLA−A30、HLA−A31、HLA−A32、HLA−A33、HLA−A34、HLA−68、HLA−B7、HLA−B8、HLA−B40、HLA−B44、HLA−B13、HLA−B15、HLA−B−18、HLA−B27、HLA−B35、HLA−B37、HLA−B38、HLA−B39、HLA−B45、HLA−B46、HLA−B49、HLA−B51、HLA−B54、HLA−B55、HLA−B56、HLA−B57、HLA−B58、HLA−C*01、HLA−C*02、HLA−C*03、HLA−C*04、HLA−C*05、HLA−C*06、HLA−C*07、HLA−C*12、HLA−C*14、HLA−C*16、HLA−Cw8、およびそれらの4桁および6桁のサブタイプすべてが挙げられる。当業者に既知であるように、上記のHLAタイプの対立遺伝子変異体があり、それらはすべて本発明に包含される。HLAクラス対立遺伝子の完全なリストは、http://hla.alleles.org/alleles/に見ることができる。例えば、HLAクラスI対立遺伝子の完全なリストは、http://hla.alleles.org/alleles/class1.htmlに見ることができる。
「拘束性ペプチド」としてのHLA拘束性ペプチド(本明細書では互換的に言及される)は、腫瘍特異的遺伝子、例えば、がん特異的遺伝子のペプチド断片であり得る。好ましくは、がん特異的遺伝子はがん試料で発現される。がん試料で異常に発現している遺伝子は、データベースを通じて同定することができる。例示的なデータベースには、単に例として、The Cancer Genome Atlas(TCGA)Research Network:http://cancergenome.nih.gov/、the International Cancer Genome Consortium:https://dcc.icgc.org/が挙げられる。いくつかの実施形態では、がん特異的遺伝子には、TCGAデータベースからの少なくとも5つの試料において少なくとも10RPKMの発現が観察される。がん特異的遺伝子は、観察可能な二峰性分布を有してもよい。
例示的なHLA−ペプチド標的は表Aに示されている。表Aの各行には、各複合体のHLA対立遺伝子および対応するHLA拘束性ペプチド配列が示されている。ペプチド配列は、表Aの各行に示されるそれぞれの配列からなり得る。あるいは、ペプチド配列は、表Aの各行に示されるそれぞれの配列を含み得る。あるいは、ペプチド配列は、表Aの各行に示されるそれぞれの配列から本質的になり得る。
HLA−ペプチド標的を含む組成物は、医薬組成物であってもよい。そのような組成物は、複数のHLA−ペプチド標的を含んでもよい。例示的な医薬組成物は本明細書に記載されている。組成物は、免疫応答を励起することができてもよい。組成物はアジュバントを含んでもよい。好適なアジュバントには、1018 ISS、ミョウバン、アルミニウム塩、Amplivax、AS15、BCG、CP−870、893、CpG7909、CyaA、dSLIM、GM−CSF、IC30、IC31、Imiquimod、ImuFact IMP321、IS Patch、ISS、ISCOMATRIX、JuvImmune、LipoVac、MF59、モノホスホリルリピドA、Montanide IMS 1312、Montanide ISA 206、Montanide ISA 50V、Montanide ISA−51、OK−432、OM−174、OM−197−MP− EC、ONTAK、PepTelベクター系、PLG微粒子、Resiquimod、SRL172、ビロソームおよび他のウイルス様粒子、YF−17D、VEGFトラップ、R848、ベータ−グルカン、Pam3Cys、サポニンに由来するAquila’s QS21 stimulon(Aquila Biotech,Worcester,Mass.,USA)、マイコバクテリア抽出物および合成細菌細胞壁模倣体、ならびにRibi’s Detox、SuperfosのQuilなどの他の専売アジュバントが挙げられるが、これらに限定されない。QuilまたはSuperfos。不完全フロイントまたはGM−CSFなどのアジュバントが有用である。樹状細胞に特異的ないくつかの免疫学的アジュバント(例えばMF59)およびそれらの調製は、これまでに説明されている(Dupuis M,et al.,Cell Immunol.1998;186(1):18−27;Allison A C;Dev Biol Stand.1998;92:3−11)。サイトカインも使用することができる。いくつかのサイトカインは、リンパ組織への樹状細胞の移動に対する影響(例えば、TNF−アルファ)、樹状細胞のTリンパ球に対する効率的な抗原提示細胞への成熟の促進(例えば、GM−CSF、IL−1、およびIL−4)(参照により全体が具体的に組み込まれる米国特許第5,849,589号)、および免疫アジュバントとしての作用(例えば、IL−12)(Gabrilovich D I,et al.,J Immunother Emphasis Tumor Immunol.1996(6):414−418)に直結している。
本明細書に開示のHLA−ペプチド標的に特異的に結合するABPも、本明細書で提供される。
ABPは、抗体またはその抗原結合断片を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるABPは単一特異性ABPである。
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるABPは、Fc領域を含む。Fc領域は、野生型またはその変異体であり得る。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるABPは、天然に存在するFc領域と比較して、1つ以上のアミノ酸置換、挿入、または欠失を有するFc領域を含む。いくつかの態様では、そのような置換、挿入、または欠失により、安定性、グリコシル化、または他の特徴が改変されたABPが得られる。いくつかの態様では、そのような置換、挿入、または欠失により、グリコシル化されたABPが得られる。
いくつかの態様において、HLA−ペプチド標的に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片を含むABPが本明細書で提供され、HLA−ペプチド標的のHLAクラスI分子は、HLAサブタイプA*02:01であり、HLA−ペプチド標的のHLA拘束性ペプチドは、配列LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)(「G7」)を含む。
A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、さらに詳述するように、1つ以上の配列を含んでもよい。
A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、1つ以上の抗体相補性決定領域(CDR)配列を含んでもよく、例えば、3つの重鎖CDR(CDR−H1、CDR−H2、CDR−H3)および3つの軽鎖CDR(CDR−L1、CDR−L2、CDR−L3)を含んでもよい。A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、特定の重鎖CDR3(CDR−H3)配列および特定の軽鎖CDR3(CDR−L3)配列を含んでもよい。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:3030であり、CDR−L3はSEQ ID NO:3048である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:3025であり、CDR−L3はSEQ ID NO:3043である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:3026であり、CDR−L3はSEQ ID NO:3044である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:3027であり、CDR−L3はSEQ ID NO:3045である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:3028であり、CDR−L3はSEQ ID NO:3046である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:3029であり、CDR−L3はSEQ ID NO:3047である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:3031であり、CDR−L3はSEQ ID NO:3049である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:3032であり、CDR−L3はSEQ ID NO:3050である。
*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、VL配列を含んでもよい。VL配列は、SEQ ID NO:3002であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:3003であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:3004であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:3005であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:3006であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:3007であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:3008であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:3009であってもよい。
*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、VH配列を含んでもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2994であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2995であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2996であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2997であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2998であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2999であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:3000であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:3001であってもよい。
A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2994であるVH配列およびSEQ ID NO:3002であるVL配列を含んでもよい。A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2995であるVH配列およびSEQ ID NO:3003であるVL配列を含んでもよい。A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2996であるVH配列およびSEQ ID NO:3004であるVL配列を含んでもよい。A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2997であるVH配列およびSEQ ID NO:3005であるVL配列を含んでもよい。A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2998であるVH配列およびSEQ ID NO:3006であるVL配列を含んでもよい。A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2999であるVH配列およびSEQ ID NO:3007であるVL配列を含んでもよい。A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、
SEQ ID NO:3000であるVH配列およびSEQ ID NO:3008であるVL配列を含んでもよい。A*02:01_LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)に特異的なABPは、SEQ ID NO:3001であるVH配列およびSEQ ID NO:3009であるVL配列を含んでもよい。
いくつかの態様において、HLA−ペプチド標的に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片を含むABPが本明細書で提供され、HLA−ペプチド標的のHLAクラスI分子は、HLAサブタイプA*01:01であり、HLA−ペプチド標的のHLA拘束性ペプチドは、配列NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)(「G2」)を含む。
A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、さらに詳述するように、1つ以上の配列を含んでもよい。
A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、1つ以上の抗体相補性決定領域(CDR)配列を含んでもよく、例えば、3つの重鎖CDR(CDR−H1、CDR−H2、CDR−H3)および3つの軽鎖CDR(CDR−L1、CDR−L2、CDR−L3)を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、特定の重鎖CDR3(CDR−H3)配列および特定の軽鎖CDR3(CDR−L3)配列を含んでもよい。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2902であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2971である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2903であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2972である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2903であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2973である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2904であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2974である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2905であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2975である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2906であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2976である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2907であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2976である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2908であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2977である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2909であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2972である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2910であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2978である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2911であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2976である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2912であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2978である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2913であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2979である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2914であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2980である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2903であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2981である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2915であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2982である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2916であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2973である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2917であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2972である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2917であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2972である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2918であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2974である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2919であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2983である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2920であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2984である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2921であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2972である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2922であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2985である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2923であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2986である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2924であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2987である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2925であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2973である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2926であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2988である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2927であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2989である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2928であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2981である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2929であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2990である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2930であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2989である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2931であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2991である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2932であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2992である。いくつかの実施形態では、CDR−H3はSEQ ID NO:2933であり、CDR−L3はSEQ ID NO:2993である。
:2872であるCDR−H1、SEQ ID NO:2882であるCDR−H2、SEQ ID NO:2925であるCDR−H3、SEQ ID NO:2952であるCDR−L1、SEQ ID NO:2969であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2973であるCDR−L3を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2873であるCDR−H1、SEQ ID NO:2882であるCDR−H2、SEQ ID NO:2926であるCDR−H3、SEQ ID NO:2943であるCDR−L1、SEQ ID NO:2958であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2988であるCDR−L3を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2852であるCDR−H1、SEQ ID NO:2882であるCDR−H2、SEQ ID NO:2927であるCDR−H3、SEQ ID NO:2935であるCDR−L1、SEQ ID NO:2958であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2989であるCDR−L3を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2874であるCDR−H1、SEQ ID NO:2896であるCDR−H2、SEQ ID NO:2928であるCDR−H3、SEQ ID NO:2938であるCDR−L1、SEQ ID NO:2958であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2981であるCDR−L3を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2875であるCDR−H1、SEQ ID NO:2897であるCDR−H2、SEQ ID NO:2929であるCDR−H3、SEQ ID NO:2953であるCDR−L1、SEQ ID NO:2961であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2990であるCDR−L3を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2876であるCDR−H1、SEQ ID NO:2898であるCDR−H2、SEQ ID NO:2930であるCDR−H3、SEQ ID NO:2941であるCDR−L1、SEQ ID NO:2962であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2989であるCDR−L3を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2877であるCDR−H1、SEQ ID NO:2899であるCDR−H2、SEQ ID NO:2931であるCDR−H3、SEQ ID NO:2946であるCDR−L1、SEQ ID NO:2964であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2991であるCDR−L3を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2878であるCDR−H1、SEQ ID NO:2900であるCDR−H2、SEQ ID NO:2932であるCDR−H3、SEQ ID NO:2946であるCDR−L1、SEQ ID NO:2958であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2992であるCDR−L3を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2879であるCDR−H1、SEQ ID NO:2901であるCDR−H2、SEQ ID NO:2933であるCDR−H3、SEQ ID NO:2954であるCDR−L1、SEQ ID NO:2970であるCDR−L2、およびSEQ ID NO:2993であるCDR−L3を含んでもよい。
A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、VL配列を含んでもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2816であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2817であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2818であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2819であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2820であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2821であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2822であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2823であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2824であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2825であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2826であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2827であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2828であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2829であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2830であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2831であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2832であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2833であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2834であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2835であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2836であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2837であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2838であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2839であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2840であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2841であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2842であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2843であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2844であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2845であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2846であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2847であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2848であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2849であってもよい。VL配列は、SEQ ID NO:2850であってもよい。
A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、VH配列を含んでもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2781であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2782であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2783であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2784であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2785であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2786であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2787であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2788であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2789であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2790であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2791であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2792であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2793であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2794であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2795であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2796であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2797であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2798であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2799であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2800であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2801であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2802であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2803であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2804であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2805であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2806であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2807であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2808であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2809であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2810であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2811であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2812であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2813であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2814であってもよい。VH配列は、SEQ ID NO:2815であってもよい。
A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2781であるVH配列およびSEQ ID NO:2816であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2782であるVH配列およびSEQ ID NO:2817であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2783であるVH配列およびSEQ ID NO:2818であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2784であるVH配列およびSEQ ID NO:2819であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2785であるVH配列およびSEQ ID NO:2820であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2786であるVH配列およびSEQ ID NO:2821であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2787であるVH配列およびSEQ ID NO:2822であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2788であるVH配列およびSEQ ID NO:2823であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2789であるVH配列およびSEQ ID NO:2824であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2790であるVH配列およびSEQ ID NO:2825であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2791であるVH配列およびSEQ ID NO:2826であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2792であるVH配列およびSEQ ID NO:2827であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2793であるVH配列およびSEQ ID NO:2828であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2794であるVH配列およびSEQ ID NO:2829であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2795であるVH配列およびSEQ ID NO:2830であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2796であるVH配列およびSEQ ID NO:2831であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2797であるVH配列およびSEQ ID NO:2832であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2798であるVH配列およびSEQ ID NO:2833であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2799であるVH配列およびSEQ ID NO:2834であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2800であるVH配列およびSEQ ID NO:2835であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2801であるVH配列およびSEQ ID NO:2836であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2802であるVH配列およびSEQ ID NO:2837であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2803であるVH配列およびSEQ ID NO:2838であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2804であるVH配列およびSEQ ID NO:2839であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2805であるVH配列およびSEQ ID NO:2840であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2806であるVH配列およびSEQ ID NO:2841であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2807であるVH配列およびSEQ ID NO:2842であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2808であるVH配列およびSEQ ID NO:2843であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2809であるVH配列およびSEQ ID NO:2844であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2810であるVH配列およびSEQ ID NO:2845であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2811であるVH配列およびSEQ ID NO:2846であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2812であるVH配列およびSEQ ID NO:2847であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2813であるVH配列およびSEQ ID NO:2848であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2814であるVH配列およびSEQ ID NO:2849であるVL配列を含んでもよい。A*01:01_NTDNNLAVY(SEQ ID NO:23)に特異的なABPは、SEQ ID NO:2815であるVH配列およびSEQ ID NO:2850であるVL配列を含んでもよい。
提供されるABP、例えば、HLA−ペプチド ABPには、受容体がある。受容体には、本明細書に開示のHLA−ペプチド標的に特異的に結合する抗原受容体および他のキメラ受容体が含まれ得る。受容体はT細胞受容体(TCR)であってもよい。受容体はキメラ抗原受容体(CAR)であってもよい。
一態様では、本明細書で提供されるABP、例えば、本明細書に開示のHLA−ペプチド標的に特異的に結合するABPには、T細胞受容体(TCR)が含まれる。TCRは、単離されても、精製されてもよい。
いくつかの態様において、HLA−ペプチド標的に特異的に結合するTCRまたはその抗原結合断片を含むABPが本明細書で提供され、HLA−ペプチド標的のHLAクラスI分子は、HLAサブタイプA*02:01であり、HLA−ペプチド標的のHLA拘束性ペプチドは、配列LLASSILCA(SEQ ID NO:2737)(「G7」)を含む。
いくつかの態様において、HLA−ペプチド標的に特異的に結合するTCRまたはその抗原結合断片を含むABPが本明細書で提供され、HLA−ペプチド標的のHLAクラスI分子は、HLAサブタイプA*01:01であり、HLA−ペプチド標的のHLA拘束性ペプチドは、配列EVDPIGHLY(SEQ ID NO:3051)を含む。
SEQ ID NO:3115であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3416であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3116であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3417であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3117であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3418であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3118であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3419であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3119であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3420であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3120であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3352であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3121であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3421であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3054であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3367であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3122であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3422であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3123であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3423であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3124であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3424であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3112であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3351であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3060であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3352であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3059であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3351であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3071であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3355であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3125であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3425であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3126であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3426であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3127であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3427であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3128であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3428であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3129であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3429であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3130であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3352であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3052であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3362であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3055であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3352であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3131であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3430であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3132であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3431であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3133であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3432であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3053であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3381であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3134であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3433であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3061であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3351であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3104であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3352であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3055であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3351であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3058であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3353であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3135であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3434であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3052であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3435であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3136であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3436であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3137であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3437であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3138であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3438であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3139であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3439であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3140であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3440であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3141であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3441であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3142であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3442であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3143であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3443であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3144であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3444であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3145であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3445であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3136であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3444であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3146であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3446であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3147であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3447であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3148であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3448であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3149であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3449であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3150であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3450であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3151であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3436であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3139であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3436であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3152であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3451であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3153であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3452であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3154であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3453であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3155であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3454であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3137であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3440であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3156であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3455であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3151であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3456であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3157であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3457であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3158であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3458であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3159であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3459であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3160であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3460であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3077であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3461であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3161であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3462であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3162であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3463であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3163であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3464であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3164であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3465であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3137であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3442であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3136であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3438であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3165であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3466であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3166であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3467であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3167であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3468であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3168であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3469であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3169であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3470であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3137であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3436であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3170であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3471であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3171であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3472であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3172であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3473であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3173であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3474であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3174であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3475であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3175であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3476であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3176であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3477であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3177であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3478であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3178であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3479であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3179であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3480であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3180であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3481であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3136であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3482であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3181であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3483であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3182であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3484であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3183であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3485であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3184であってもよく、βCD
R3はSEQ ID NO:3486であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3185であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3487であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3186であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3488であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3187であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3489であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3188であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3482であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3189であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3490であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3190であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3491であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3191であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3492であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3192であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3493であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3193であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3494であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3194であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3495であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3195であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3496であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3196であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3497であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3197であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3498であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3198であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3499であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3199であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3500であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3137であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3449であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3200であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3436であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3201であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3501であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3138であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3436であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3202であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3502であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3203であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3503であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3204であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3504であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3205であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3505であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3206であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3506であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3207であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3507であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3148であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3440であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3208であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3508であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3209であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3509であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3210であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3510であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3211であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3511であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3212であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3512であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3213であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3513であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3214であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3514であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3215であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3515であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3216であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3516であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3217であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3517であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3218であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3518であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3219であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3519であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3220であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3520であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3221であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3521であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3217であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3518であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3222であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3522であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3223であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3523であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3224であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3524であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3225であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3525であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3226であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3526であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3227であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3527であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3228であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3528であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3229であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3529であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3230であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3530であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3217であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3525であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3231であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3531であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3232であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3532であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3233であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3520であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3217であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3530であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3234であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3533であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3235であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3534であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3217であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3532であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3236であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3535であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3237であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3536であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3238であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3537であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3239であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3538であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3240であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3539であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3241であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3540であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3242であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3541であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3243であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3542であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3244であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3543であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3245であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3544であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3246であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3545であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3247であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3546であってもよい。
αCDR3はSEQ ID NO:3248であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3547であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3249であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3548であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3217であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3524であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3250であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3549であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3251であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3550であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3252であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3551であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3253であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3552であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3254であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3553であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3255であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3554であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3256であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3555であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3257であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3556であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3258であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3557であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3259であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3558であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3260であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3559であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3261であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3560であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3217であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3519であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3262であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3561であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3263であってもよく、βCDR3はSEQ ID 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よく、βCDR3はSEQ ID NO:3631であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3328であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3632であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3289であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3598であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3329であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3633であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3330であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3634であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3331であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3635であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3332であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3636であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3333であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3637であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3334であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3638であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3335であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3639であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3336であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3640であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3337であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3641であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3338であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3642であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3290であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3596であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3339であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3643であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3290であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3601であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3340であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3644であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3289であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3611であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3341であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3645であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3342であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3646であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3343であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3647であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3142であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3648であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3344であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3649であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3345であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3650であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3290であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3614であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3346であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3651であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3347であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3652であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3348であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3653であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3349であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3654であってもよい。αCDR3はSEQ ID NO:3350であってもよく、βCDR3はSEQ ID NO:3655であってもよい。
5−4、TRBD1、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−1、TRAJ3、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV20、TRAJ20、TRBV7−2、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−4、TRAJ42、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ31、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ13、TRBV20−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ4、TRBV28、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ4、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV3、TRAJ9、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−1、TRAJ42、TRBV19、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ47、TRBV19、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−1、TRAJ34、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV20−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ11、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ34、TRBV6−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ47、TRBV19、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ28、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ2−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ17、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−2DV8、TRAJ57、TRBV5−4、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ32、TRBV7−8、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ39、TRBV20−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−3、TRAJ20、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ4、TRBV20−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ9、TRBV2、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ32、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−3、TRAJ6、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ40、TRBV7−9、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV5、TRAJ37、TRBV5−6、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ3、TRBV20−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ4、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ6、TRBV10−3、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ23、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ20、TRBV11−2、TRBD2、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ15、TRBV24−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ9、TRBV5−4、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−6、TRAJ12、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV11−2、TRBD2、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ41、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV25、TRAJ28、TRBV7−2、TRBD2、およびTRBJ2−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV10−3、TRBD1、およびTRBJ1−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ49、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ34、TRBV6−6、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV24、TRAJ6、TRBV7−2、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ15、TRBV6−6、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ15、TRBV29−1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ43、TRBV12−4、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ30、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−1、TRAJ45、TRBV19、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ43、TRBV24−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV24−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ28、TRBV4−1、TRBD1、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−2、TRAJ44、TRBV27、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ36、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ9、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−3、TRAJ15、TRBV4−1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ43、TRBV24−1、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ40、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV30、TRAJ32、TRBV28、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−2DV8、TRAJ26、TRBV7−9、TRBD2、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ6、TRBV20−1、TRBD1、およびTRBJ1−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ47、TRBV5−1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−2DV8、TRAJ45、TRBV29−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ15、TRBV7−2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ29、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV3、TRAJ6、TRBV28、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ9、TRBV10−3、TRBD1、およびTRBJ1−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ15、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−6、TRAJ40、TRBV15、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−2DV8、TRAJ57、TRBV13、TRBD1、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−6、TRAJ10、TRBV7−9、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ20、TRBV5−4、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−1、TRAJ28、TRBV7−8、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ9、TRBV24−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ15、TRBV2、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV35、TRAJ26、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−2DV8、TRAJ43、TRBV5−1、TRBD2、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV5、TRAJ32、TRBV19、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−1、TRAJ21、TRBV5−1、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ45、TRBV12−4、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV12−5、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV24、TRAJ52、TRBV27、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ52、TRBV19、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV36DV7、TRAJ44、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV3、TRAJ29、TRBV11−2、TRBD1、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ15、TRBV13、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ52、TRBV11−3、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ6、TRBV19、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ13、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ43、TRBV12−3、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−3、TRAJ20、TRBV12−4、およびTRBJ2−1を含んで
もよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ52、TRBV4−1、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ23、TRBV19、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ30、TRBV13、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ43、TRBV12−4、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV24、TRAJ10、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV5、TRAJ9、TRBV4−1、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ40、TRBV7−8、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−1、TRAJ45、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ26、TRBV4−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−2、TRAJ45、TRBV19、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV22、TRAJ23、TRBV5−4、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ42、TRBV28、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ52、TRBV7−8、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ39、TRBV3−1、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ9、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ5、TRBV24−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV23DV6、TRAJ13、TRBV6−5、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−6、TRAJ12、TRBV24−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ28、TRBV27、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ34、TRBV4−1、TRBD2、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ21、TRBV28、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV9−2、TRAJ29、TRBV5−8、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV27、TRAJ40、TRBV7−6、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV7−8、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ30、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ30、TRBV20−1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ26、TRBV12−5、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ33、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−1、TRAJ50、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV40、TRAJ41、TRBV6−5、TRBD2、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ31、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV5、TRAJ43、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV24、TRAJ52、TRBV5−1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ11、TRBV7−6、TRBD1、およびTRBJ1−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ39、TRBV10−3、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ20、TRBV14、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ48、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−1、TRAJ22、TRBV29−1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV10−3、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV39、TRAJ49、TRBV24−1、TRBD1、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−1、TRAJ23、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ9、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV9、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ28、TRBV19、TRBD1、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV10、TRAJ8、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ48、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ4、TRBV7−2、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV5−1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV9、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ6、TRBV6−6、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ29、TRBV5−1、TRBD2、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV41、TRAJ41、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV5−1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ39、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ13、TRBV9、およびTRBJ1−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV5−1、TRBD2、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ57、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV5、TRAJ44、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV3、TRAJ39、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ4、TRBV11−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−2DV8、TRAJ40、TRBV7−8、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−3、TRAJ41、TRBV7−9、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV5、TRAJ4、TRBV11−2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV24、TRAJ49、TRBV6−5、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV4、TRAJ45、TRBV24−1、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ48、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−2、TRAJ44、TRBV6−1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ27、TRBV7−9、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−1、TRAJ49、TRBV7−9、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ5、TRBV7−8、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ20、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ2−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV39、TRAJ42、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ39、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ34、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV25、TRAJ34、TRBV29−1、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV39、TRAJ39、TRBV30、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ6、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−6、TRAJ30、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ18、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−3、TRAJ23、TRBV11−3、TRBD1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ47、TRBV5−6、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV22、TRAJ31、TRBV5−6、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV14、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ31、TRBV2、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ5、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV16、TRAJ28、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−1、TRAJ12、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ52、TRBV29−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV36DV7、TRAJ49、TRBV15、TRBD2、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−3、TRAJ58、TRBV12−4、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、T
RAV16、TRAJ18、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ48、TRBV27、およびTRBJ2−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV2、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV29DV5、TRAJ37、TRBV5−4、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ20、TRBV24−1、TRBD1、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ6、TRBV15、TRBD1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ42、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−1、TRAJ23、TRBV25−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−1、TRAJ28、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV2、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−6、TRAJ42、TRBV27、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV40、TRAJ32、TRBV7−6、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV5、TRAJ5、TRBV20−1、TRBD1、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ40、TRBV4−1、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ53、TRBV5−1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ48、TRBV5−6、TRBD1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−3、TRAJ15、TRBV20−1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−3、TRAJ23、TRBV13、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ9、TRBV7−3、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ45、TRBV5−1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV25、TRAJ31、TRBV29−1、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV34、TRAJ37、TRBV28、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ9、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ36、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ34、TRBV6−1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ26、TRBV11−3、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ36、TRBV5−4、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ49、TRBV4−1、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ13、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV24、TRAJ7、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ20、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ49、TRBV6−1、TRBD1、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV5−5、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ39、TRBV4−2、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−2、TRAJ30、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV20、TRAJ45、TRBV5−4、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV7−8、TRBD2、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−2DV8、TRAJ48、TRBV2、TRBD1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV25、TRAJ15、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ49、TRBV5−4、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ12、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV38−2DV8、TRAJ54、TRBV24−1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV17、TRAJ52、TRBV27、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ28、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ36、TRBV4−1、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV5−4、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ43、TRBV6−5、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ41、TRBV9、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ40、TRBV20−1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−2、TRAJ52、TRBV6−1、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−1、TRAJ57、TRBV2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ36、TRBV12−4、TRBD1、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−4、TRAJ34、TRBV7−9、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ32、TRBV7−9、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ6、TRBV3−1、TRBD2、およびTRBJ1−4を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ29、TRBV5−1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV14DV4、TRAJ26、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV35、TRAJ44、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ24、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV25、TRAJ21、TRBV28、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV3、TRAJ36、TRBV28、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−2、TRAJ52、TRBV5−6、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−6、TRAJ40、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ42、TRBV28、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ32、TRBV20−1、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV24、TRAJ24、TRBV28、TRBD2、およびTRBJ2−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ36、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ26、TRBV2、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ31、TRBV29−1、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV39、TRAJ33、TRBV6−1、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV3、TRAJ38、TRBV27、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV10、TRAJ33、TRBV30、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ20、TRBV2、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−1、TRAJ20、TRBV5−1、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV27、TRAJ45、TRBV27、TRBD1、およびTRBJ1−6を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ18、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−2、TRAJ28、TRBV27、およびTRBJ1−5を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ34、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ40、TRBV4−1、およびTRBJ1−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ34、TRBV4−2、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV13−2、TRAJ46、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ36、TRBV9、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV1−2、TRAJ20、TRBV11−3、TRBD1、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV3、TRAJ6、TRBV12−4、TRBD1、およびTRBJ2−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV25、TRAJ32、TRBV19、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ33、TRBV9、TRBD1、およびTRBJ1−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV19、TRAJ53、TRBV7−7、TRBD1、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ20、TRBV10−3、TRBD2、およびTRBJ2−3を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV12−1、TRAJ34、TRBV6−5、TRBD1、およびTRBJ2−7を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV26−2、TRAJ43、TRBV25−1、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV8−6、TRAJ20、TRBV7−9、TRBD1、およびTRBJ2−2を含
んでもよい。そのようなTCRは、TRAV3、TRAJ18、TRBV20−1、TRBD2、およびTRBJ2−1を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV21、TRAJ40、TRBV11−3、TRBD1、およびTRBJ1−2を含んでもよい。そのようなTCRは、TRAV2、TRAJ10、TRBV6−5、TRBD2、およびTRBJ2−7を含んでもよい。
はSEQ ID NO:3718であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4021である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3719であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4022である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3720であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4023である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3663であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3962である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3659であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3965である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3677であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4024である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3721であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4025である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3722であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4026である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3663であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3966である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3659であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4027である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3722であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3964である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3723であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4028である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3724であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4029である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3725であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4030である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3726であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4031である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3727であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4032である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3728であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4033である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3729であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4034である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3658であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3978である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3730であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4035である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3731であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4036である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3732であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4037である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3719であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3962である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3665であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3963である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3664であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3962である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3676であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3966である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3733であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4038である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3734であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4039である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3735であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4040である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3736であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4041である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3737であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4042である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3738であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3963である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3659であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3973である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3660であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3963である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3739であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4043である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3740であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4044である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3741であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4045である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3657であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3992である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3742であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4046である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3666であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3962である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3711であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3963である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3660であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3962である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3663であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:3964である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3743であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4047である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3744であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4048である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3745であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4049である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3746であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4050である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3747であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4051である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3748であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4052である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3749であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4053である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3750であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4054である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3751であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4055である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3752であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4056である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3753であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4057である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3754であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4058である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3755であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4057である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3756であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4059である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3757であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4060である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3758であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4061である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3759であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4062である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3760であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4063である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3761であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4049である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3748であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4049である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3762であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4064である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3763であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4065である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3764であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4066である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3765であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4067である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3746であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4053である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3766であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4068である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3761であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4069である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3767であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4070である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3768であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4071である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3769であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4072である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3770であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4073である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3771であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4074である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3772であり、ベー
タV(D)J配列はSEQ ID NO:4075である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3773であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4076である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3774であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4077である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3775であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4078である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3746であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4055である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3745であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4051である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3776であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4079である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3777であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4080である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3778であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4081である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3779であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4082である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3780であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4083である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3746であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4049である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3781であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4084である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3782であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4085である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3783であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4086である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3784であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4087である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3785であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4088である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3786であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4089である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3787であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4090である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3788であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4091である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3789であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4092である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3790であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4093である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3791であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4094である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3755であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4095である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3792であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4096である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3793であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4097である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3794であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4098である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3795であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4099である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3796であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4100である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3797であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4101である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3798であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4102である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3799であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4095である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3800であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4103である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3801であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4104である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3802であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4105である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3803であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4106である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3804であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4107である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3805であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4108である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3806であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4109である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3807であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4110である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3808であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4111である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3809であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4112である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3810であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4113である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3746であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4062である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3811であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4049である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3812であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4114である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3747であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4049である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3813であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4115である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3814であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4116である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3815であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4117である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3816であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4118である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3817であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4119である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3818であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4120である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3758であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4053である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3819であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4121である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3820であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4122である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3821であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4123である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3822であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4124である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3823であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4125である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3824であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4126である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3825であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4127である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3826であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4128である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3827であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4129である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4130である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3829であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4131である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3830であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4132である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3831であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4133である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3832であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4134である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4131である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3833であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4135である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3834であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4136である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3835であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4137である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3836であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4138である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3837であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4139である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3838であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4140である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3839であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:41
41である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3840であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4142である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3841であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4143である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4138である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3842であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4144である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3843であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4145である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3844であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4133である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4143である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3845であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4146である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3846であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4147である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4145である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3847であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4148である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3848であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4149である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3849であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4150である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3850であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4151である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3851であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4152である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3852であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4153である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3853であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4154である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3854であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4155である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3855であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4156である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3831であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4157である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3856であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4158である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3857であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4159である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3858であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4160である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3859であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4161である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4137である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3860であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4162である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3861であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4163である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3862であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4164である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3863であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4165である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3864であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4166である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3865であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4167である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3866であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4168である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3867であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4169である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3868であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4170である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3869であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4171である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3870であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4172である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3871であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4173である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4132である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3872であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4174である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3873であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4175である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4176である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3874であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4177である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3875であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4178である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3876であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4179である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3877であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4180である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3878であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4181である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3879であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4182である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4141である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3880であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4183である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4184である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3881であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4185である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3830であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4135である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3882であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4186である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3883であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4187である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3884であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4188である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3885であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4189である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4190である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3841であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4130である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3886であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4191である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3887であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4192である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3888であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4193である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3889であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4194である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3890であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4195である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3891であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4196である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3892であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4197である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3893であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4198である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3894であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4199である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3895であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4200である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3896であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4201である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3897であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4202である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3898であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4203である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3899であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4204である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3900であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4205である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3901であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4206である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3902であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4207である。いくつかの実施形態では、アルフ
ァVJ配列はSEQ ID NO:3903であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4208である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3904であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4209である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3905であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4210である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3830であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4211である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3906であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4212である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3828であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4213である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3907であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4214である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3908であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4215である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3909であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4216である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3910であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4217である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3911であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4218である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3912であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4219である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3913であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4220である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3914であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4221である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3915であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4222である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3916であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4223である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3917であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4224である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3899であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4208である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3918であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4225である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3919であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4226である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3920であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4227である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3921であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4228である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3922であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4229である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3923であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4230である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3924であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4231である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3899であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4232である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3925であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4233である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3926であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4234である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3927であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4235である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3928であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4236である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3929であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4237である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3930であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4238である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3931であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4239である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3932であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4240である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3933であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4241である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3934であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4242である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3935であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4215である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3936であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4243である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3937であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4244である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3938であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4245である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3899であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4211である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3939であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4246である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3940であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4247である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3941であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4248である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3942であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4249である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3943であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4250である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3944であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4251である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3945であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4252である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3946であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4253である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3947であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4254である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3948であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4255である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3900であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4209である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3949であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4256である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3900であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4214である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3950であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4257である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3899であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4224である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3951であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4258である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3952であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4259である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3953であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4260である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3751であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4261である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3954であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4262である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3955であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4263である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3956であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4264である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3957であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4265である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3958であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4266である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3959であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4267である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3960であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4268である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:3961であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4269である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:4302であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4317である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:4303であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4318である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:4304であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4319である。いくつかの実施形態では、アルファVJ配列はSEQ ID NO:4305であり、ベータV(D)J配列はSEQ ID NO:4320である。
いくつかの態様において、HLA−ペプチド標的に特異的に結合するTCRまたはその抗原結合断片を含むABPが本明細書で提供され、HLA−ペプチド標的のHLAクラスI分子は、HLAサブタイプB*44:02であり、HLA−ペプチド標的のHLA拘束性ペプチドは、配列GEMSSNSTAL(SEQ ID NO:4272)を含む。
いくつかの態様において、HLA−ペプチド標的に特異的に結合するTCRまたはその抗原結合断片を含むABPが本明細書で提供され、HLA−ペプチド標的のHLAクラスI分子は、HLAサブタイプA*02:01であり、HLA−ペプチド標的のHLA拘束性ペプチドは、配列GVYDGEEHSV(SEQ ID NO:4271)を含む。
抗原受容体を含む細胞、例えば、本明細書に記載の抗HLA−ペプチド ABP(例えば、CARまたはTCR)を含む細胞外ドメインを含む細胞も提供される。そのような細胞の集団、およびそのような細胞を含む組成物も提供される。いくつかの実施形態では、組成物または集団は、HLA−ペプチド ABPを発現する細胞が、組成物中の全細胞あるいはT細胞またはCD8+もしくはCD4+細胞などのある特異定の種類の細胞の少なくとも1、5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または99パーセント超を構成するように、そのような細胞が富化されている。いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に開示の抗原受容体を含む少なくとも1つの細胞を含む。組成物の中には、養子細胞療法などの投与のための医薬組成物および製剤がある。細胞および組成物を、対象、例えば患者に投与するための治療方法も提供される。
HLA−ペプチド ABPをコードする単離された核酸、核酸を含むベクター、およびベクターと核酸とを含む宿主細胞、ならびにABPの産生のための組換え技術も提供される。
Saccharomyces cerevisiae、または一般的なパン酵母は、一般に使用される下等真核生物宿主微生物である。しかし、いくつかの他の属、種、および株、例えば、Schizosaccharomyces pombe、Kluyveromyces(K.lactis、K.fragilis、K.bulgaricus K.wickeramii、K.waltii、K.drosophilarum、K.thermotolerans、およびK.marxianus)、Yarrowia、Pichia pastoris、Candida(C.albicans)、Trichoderma reesia、Neurospora crassa、Schwanniomyces(S.occidentalis)、ならびに例えば、Penicillium、Tolypocladium、およびAspergillus(A.nidulansおよびA.niger)などの糸状菌も利用可能かつ有用である。
HLA−ペプチド抗原の調製
本明細書で提供されるABPの単離または創出に使用されるHLA−ペプチド抗原は、無傷のHLA−ペプチドまたはHLA−ペプチドの断片であってもよい。HLA−ペプチド抗原は、例えば、単離されたタンパク質または細胞の表面に発現したタンパク質の形態であってもよい。
HLA−ペプチドに結合するABPは、当技術分野で既知の任意の方法、例えば、対象のファージディスプレイまたは免疫化を使用して同定することができる。
モノクローナルABPは、例えば、Kohler et al.,Nature,1975,256:495−497(参照によりその全体が組み込まれる)によって最初に記載されたハイブリドーマ法、および/または組み換えDNA法(例えば、参照によりその全体が組み込まれる米国特許第4,816,567号を参照されたい)を使用して得てもよい。モノクローナルABPはまた、例えば、ファージまたは酵母ベースのライブラリーを使用して得てもよい。例えば、各々参照により全体が組み込まれる米国特許第8,258,082号および同第8,691,730号を参照されたい。
キメラABPを作製する例示的な方法は、例えば、各々参照により全体が組み込まれる、米国特許第4,816,567号、およびMorrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1984,81:6851−6855に記載されている。いくつかの実施形態では、キメラABPは、組換え技法を使用して、非ヒト可変領域(例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、またはサルなどの非ヒト霊長類に由来する可変領域)をヒトの定常領域と組み合わせることによって作製される。
ヒト化ABPは、非ヒトモノクローナルABPの構造部分の大部分またはすべてを対応するヒトABP配列で代置することにより生成させてもよい。結果として、抗原特異的可変またはCDRのみが非ヒト配列で構成されるハイブリッド分子が生成される。ヒト化ABPを得るための方法には、例えば、各々参照により全体が組み込まれる、Winter and Milstein,Nature,1991,349:293−299、Rader et al.,Proc.Nat.Acad.Sci.U.S.A.,1998,95:8910−8915、Steinberger et al.,J.Biol.Chem.,2000,275:36073−36078、Queen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,1989,86:10029−10033、ならびに米国特許第5,585,089号、同第5,693,761号、同第5,693,762号、および同第6,180,370号に記載されているものが含まれる。
ヒトABPは、例えば、トランスジェニック動物(例えば、ヒト化マウス)を使用することにより、当該技術分野で既知の様々な技法により生成することができる。例えば、各々参照により全体が組み込まれる、Jakobovits et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,1993,90:2551、Jakobovits et al.,Nature,1993,362:255−258、Bruggermann et al.,Year in Immuno.,1993,7:33、ならびに米国特許第5,591,669号、同第5,589,369号、および同第5,545,807号を参照されたい。ヒトABPはまた、ファージディスプレイライブラリーに由来し得る(例えば、各々参照により全体が組み込まれる、Hoogenboom et al.,J.Mol.Biol.,1991,227:381−388、Marks et al.,J.Mol.Biol.,1991,222:581−597、ならびに米国特許第5,565,332号および同第5,573,905号を参照されたい)。ヒトABPはまた、インビトロで活性化されたB細胞によって生成してもよい(例えば、各々参照により全体が組み込まれる、米国特許第5,567,610号および同第5,229,275号を参照されたい)。ヒトABPはまた、酵母ベースのライブラリーに由来してもよい(例えば、参照により全体が組み込まれる米国特許第8,691,730号を参照されたい)。
本明細書で提供されるABP断片は、本明細書に記載の例示的な方法または当技術分野で既知の方法を含む、任意の好適な方法により作製され得る。好適な方法としては、組み換え技法およびABP全体のタンパク質分解が挙げられる。ABP断片を作製する例示的な方法は、例えば、参照により全体が組み込まれる、Hudson et al.,Nat.Med.,2003,9:129−134に記載されている。scFv ABPを作製する方法は、例えば、各々参照により全体が組み込まれる、Pluckthun,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg and Moore eds.,Springer−Verlag,New York,pp.269−315(1994)、WO93/16185、ならびに米国特許番号5,571,894および同第5,587,458号に記載されている。
本明細書で提供される代替の足場は、本明細書に記載の例示的方法または当技術分野で既知の方法を含む、任意の好適な方法により作製され得る。例えば、Adnectins(商標)を調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Emanuel et al.,mAbs,2011,3:38−48に記載されている。iMabを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、米国特許公開第2003/0215914号に記載されている。Anticalins(登録商標)を調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Vogt and Skerra,Chem.Biochem.,2004,5:191−199に記載されている。クニッツドメインを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Wagner et al.,Biochem.&Biophys.Res.Comm.,1992,186:118−1145に記載されている。チオレドキシンペプチドアプタマーを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Geyer and Brent,Meth.Enzymol.,2000,328:171−208で提供されている。アフィボディを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Fernandez,Curr.Opinion in Biotech.,2004,15:364−373で提供されている。DARPinを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Zahnd et al.,J.Mol.Biol.,2007,369:1015−1028で提供されている。アフィリンを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Ebersbach et al.,J.Mol.Biol.,2007,372:172−185で提供されている。テトラネクチンを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Graversen et al.,J.Biol.Chem.,2000,275:37390−37396で提供されている。アビマーを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Silverman et al.,Nature Biotech.,2005,23:1556−1561で提供されている。フィノマーを調製する方法は、参照により全体が組み込まれる、Silacci et al.,J.Biol.Chem.,2014,289:14392−14398で提供されている。代替の足場に関するさらなる情報は、各々参照により全体が組み込まれる、Binz et al.,Nat.Biotechnol.,2005 23:1257− 1268、およびSkerra,Current Opin.in Biotech.,2007 18:295−304で提供されている。
本明細書で提供される多重特異性ABPは、本明細書に記載の例示的方法または当技術分野で既知の方法を含む、任意の好適な方法により作製され得る。一般的な軽鎖ABPを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるMerchant et al.,Nature Biotechnol.,1998,16:677−681に記載されている。四価二重特異性ABPを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるColoma and Morrison,Nature Biotechnol.,1997,15:159−163に記載されている。ハイブリッド免疫グロブリンを作製する方法は、その各々は参照により全体が組み込まれる、Milstein and Cuello,Nature,1983,305:537−540、およびStaerz and Bevan,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1986,83:1453−1457に記載されている。ノブ・イン・ホール修飾を備えた免疫グロブリンを作製する方法は、参照によりその全体が組み込まれる米国特許第5,731,168号に記載されている。静電的修飾を伴う免疫グロブリンを作製する方法は、参照によりその全体が組み込まれるWO2009/089004に提供されている。二重特異性単鎖ABPを作製する方法は、その各々は参照によりその全体が組み込まれる、Traunecker et al.,EMBO J.,1991,10:3655−3659、およびGruber et al.,J.Immunol.,1994,152:5368−5374に記載されている。リンカーの長さが変化し得る一本鎖ABPを作製する方法は、その各々は参照によりその全体が組み込まれる、米国特許第4,946,778号および同第5,132,405号に記載されている。ダイアボディを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるHollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1993,90:6444−6448に記載されている。トリアボディおよびテトラボディを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるTodorovska et al.,J.Immunol.Methods,2001,248:47−66に記載されている。三重特異性F(ab’)3誘導体を作製する方法は、参照により全体が組み込まれるTutt et al.J.Immunol.,1991,147:60−69に記載されている。架橋ABPを作製する方法は、各々参照により全体が組み込まれる、米国特許第4,676,980号、Brennan et al.,Science,1985,229:81−83、Staerz,et al.Nature,1985,314:628−631、およびEP0453082に記載されている。ロイシンジッパーによって組み立てられた抗原結合ドメインを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるKostelny et al.,J.Immunol.,1992,148:1547−1553に記載されている。DNLアプローチを介してABPを作製する方法は、各々参照により全体が組み込まれる、米国特許第7,521,056号、同第7,550,143号、同第7,534,866号、および同第7,527,787号に記載されている。ABPおよび非ABP分子のハイブリッドを作製する方法は、そのようなABPの例について、参照により全体が組み込まれるWO93/08829に記載されている。DAF ABPを作製する方法は、参照によりその全体が組み込まれる米国特許公開第2008/0069820号に記載されている。還元および酸化を介してABPを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるCarlring et al.,PLoS One,2011,6:e22533に記載されている。DVD−Igs(商標)を作製する方法は、参照により全体が組み込まれる米国特許第7,612,181号に記載されている。DARTs(商標)を作製する方法は、参照により全体が組み込まれるMoore et al.,Blood,2011,117:454−451に記載されている。DuoBodies(登録商標)を製造する方法は、各々参照により全体が組み込まれる、Labrijn et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,2013,110:5145−5150、Gramer et al.,mAbs,2013,5:962−972、およびLabrijn et al.,Nature Protocols,2014,9:2450−2463に記載されている。IgGからCH3のC末端に融合されたscFvを含むABPを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるColoma and Morrison,Nature Biotechnol.,1997,15:159−163に記載されている。Fab分子が免疫グロブリンの定常領域に付着しているABPを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるMiler et al.,J.Immunol.,2003,170:4854−4861に記載されている。CovX−ボディを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるDoppalapudi et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,2010,107:22611−22616に記載されている。Fcab ABPを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるWozniak−Knopp et al.,Protein Eng.Des.Sel.,2010,23:289−297に記載されている。TandAb(登録商標)ABPを作製する方法は、各々参照により全体が組み込まれる、Kipriyanov et al.,J.Mol.Biol.,1999,293:41−56およびZhukovsky et al.,Blood,2013,122:5116に記載されている。タンデムFabを作製する方法は、参照により全体が組み込まれるWO2015/103072に記載されている。Zybodies(商標)を作製する方法は、参照により全体が組み込まれるLaFleur et al.,mAbs,2013,5:208−218に記載されている。
任意の好適な方法を使用して、エラーを起こしやすいPCR、チェーンシャッフリング、およびトリヌクレオチド特異性突然変異誘発(TRIM)などのオリゴヌクレオチド特異的突然変異誘発を含む、ABPをコード化するポリヌクレオチド配列(複数可)に変動性を導入することができる。いくつかの態様では、いくつかのCDR残基(例えば、一度に4〜6残基)が無作為化される。抗原結合に関与するCDR残基は、例えば、アラニンスキャニング突然変異誘発またはモデリングを使用して、特異的に同定されてもよい。特にCDR−H3およびCDR−L3は、多くの場合、突然変異の標的になる。
抗体、CAR、およびTCRを含む受容体を含むABPを発現させるため、ならびにそのようなABPを発現する遺伝子操作された細胞を産生させるための方法、核酸、組成物、およびキットも提供される。遺伝子操作には、一般に、レトロウイルス形質導入、トランスフェクション、または形質転換などによる、組み換えられたまたは操作された成分をコードする核酸を細胞に導入することが伴う。
102(2):497−505に記載されている。
いくつかの実施形態では、操作された細胞の調製には、1つ以上の培養および/または調製ステップが含まれる。HLA−ペプチド−ABP、例えば、TCRまたはCARの導入のための細胞は、生体試料、例えば、対象から得られたまたは対象に由来する試料などの試料から単離することができる。いくつかの実施形態では、細胞が単離される対象は、疾患もしくは状態を有するか、細胞療法を必要とするか、または細胞療法が施される対象である。いくつかの実施形態における対象は、細胞が単離、処理、および/または操作される養子細胞療法などの特定の治療的介入を必要とするヒトである。
当該技術分野で既知の様々なアッセイを使用して、本明細書中に提供されるHLA−ペプチド ABPを同定および特徴付けてもよい。
本明細書で提供されるABPの特異性抗原結合活性は、本開示の他の箇所で説明されるように、SPR、BLI、RIAおよびMSD−SETを使用することを含む任意の好適な方法によって評価し得る。さらに、抗原結合活性は、フローサイトメトリーを使用するELISAアッセイ、および/またはウエスタンブロットアッセイによって評価してもよい。
本明細書で提供されるABPおよび/または細胞による治療後のエフェクタ機能は、各々参照により全体が組み込まれる、Ravetch and Kinet,Annu.Rev.Immunol.,1991,9:457−492、米国特許第5,500,362号、同第5,821,337号、Hellstrom et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA,1986,83:7059−7063、Hellstrom et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA,1985,82:1499−1502、Bruggemann et al.,J.Exp.Med.,1987,166:1351−1361、Clynes et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA,1998,95:652−656、WO2006/029879、WO2005/100402、Gazzano−Santoro et al.,J.Immunol.Methods,1996,202:163−171、Cragg et al.,Blood,2003,101:1045−1052、Cragg et al.Blood,2004,103:2738−2743、およびPetkova et al.,Int’l.Immunol.,2006,18:1759−1769に記載されているものを含む、当技術分野で既知の様々なインビトロおよびインビボアッセイを使用して評価することができる。
本明細書で提供されるABP、細胞、またはHLA−ペプチド標的は、任意の適切な医薬組成物に製剤化され、任意の好適な投与経路によって投与され得る。好適な投与経路としては、動脈内、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内、経鼻、非経口、肺、および皮下経路が挙げられるが、これらに限定されない。
治療用途の場合、ABPおよび/または細胞は、当技術分野で既知のものおよび上記で考察したものなどの薬学的に許容可能な剤形で哺乳動物、一般的にはヒトに投与される。例えば、ABPおよび/または細胞は、筋肉内、腹腔内、脳脊髄内、皮下、関節内、滑液嚢内、髄腔内、または腫瘍内経路によって、ボーラスとして、または一定期間の連続注入によって、ヒトに静脈内投与されてもよい。ABPはまた、局所的および全身的治療効果を発揮するために、腫瘍周囲、病変内、または病変周辺経路によって好適に投与される。腹腔内経路は、例えば、卵巣腫瘍の治療では特に有用であり得る。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるABPおよび/または細胞は、少なくとも1つの追加の治療薬とともに投与される。本明細書で提供されるABPおよび/または細胞とともに、任意の好適な追加の治療薬を投与してもよい。追加の治療薬をABPに融合させることができる。いくつかの態様では、追加の治療薬は、放射線、細胞毒性薬、毒素、化学療法薬、細胞増殖抑制薬、抗ホルモン薬、EGFR阻害薬、免疫調節薬、抗血管新生薬、およびそれらの組み合わせから選択される。いくつかの実施形態では、追加の治療薬はABPである。
対象に由来する細胞上の所定のHLA−ペプチドの存在を予測および/または検出する方法も提供される。そのような方法は、例えば、本明細書で提供されるABPおよび/または細胞による治療に対する応答性を予測および評価するために使用されてもよい。
本明細書で提供されるABPおよび/または細胞を含むキットも提供される。キットは、本明細書に記載されているように、疾患または障害の治療、予防、および/または診断に使用されてもよい。
3つの計算ステップを使用して、がん特異的なHLA−ペプチド標的を同定した。まず、Genotype−Tissue Expression(GTEx)Project[1]をとおして利用可能なデータを使用して、大部分の正常な組織で一般に発現しない遺伝子を同定した。次に、The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network(http://cancergenome.nih.gov/)からのデータを使用して、これらの遺伝子のどれががん試料で異常に発現しているのかを同定した。これらの遺伝子中、すべての目的で参照により全体が本明細書に組み込まれる国際特許出願第PCT/US2016/067159に記載されているように、MS/MSによって配列決定されたHLA提示ペプチドでトレーニングされたディープラーニングモデルを使用して、MHCクラスIタンパク質によって細胞表面抗原として提示される可能性が高いペプチドを同定した。
上記のアプローチから生じる予測HLA−ペプチド標的を検証するための初期評定として、HLA結合親和性測定、HLAペプチド質量分析、およびT細胞応答の測定を含む様々なアッセイ技法によって以前に同定されている標的の報告について、公開データベースおよび選定した文献を審査した。IEDB(Vitaら、2015)およびTantigen(Olsenら、2017)という、HLA−ペプチド対のアッセイ結果注釈を含む2つの包括的なデータベースを使用した。コンピューターで予測された標的のうち19個(遺伝子全体で15個が固有)がデータベースで以前に報告されており、その多くが、長年がん免疫学の研究対象となっている遺伝子(例えば、がん精巣抗原)であった。表Bを参照されたい。
次に、7個の遺伝子のタンパク質からのHLA−ペプチド標的AFP、KKLC−1、MAGE−A4、MAGE−A10、MART−1、NY−ESO−1、およびWT1を同定した。
表AのHLA−ペプチド複合体からのペプチドの存在を、それぞれのHLA−ペプチド複合体からの所与のHLA対立遺伝子各々について陽性であることが分かっている腫瘍試料に対する質量分析(MS)を使用して決定した。
概要
次の例は、腫瘍特異的HLA拘束性ペプチドを認識する抗体(Ab)を特定できることを示している。そのようなAbによって認識される全体的なエピトープは、一般に、ペプチドとその特定のペプチドを提示するHLAタンパク質との両方の複合表面を含む。HLA複合体をペプチド特異的に認識するAbは、T細胞受容体(TCR)様AbまたはTCR模倣Abと称されることが多い。抗体発見のために選択されたHLA−ペプチド標的抗原は、HLA−A*01:01_NTDNNLAVY(「G2」と指定される、表Aの標的X)およびHLA−A*02:01_LLASSILCA(「G7」と指定される、表Aの標的X)である。これらのHLA−ペプチド抗原の細胞表面提示は、実施例4に記載されているように、腫瘍試料から得られたHLA複合体の質量分析により確認した。
HLA−ペプチド標的であるG2およびG7、ならびにカウンタースクリーン陰性対照ペプチド−HLAを、確立された方法を使用して、HLA分子の条件付きリガンドを使用して、組換えにより産生させた。合計で、G2およびG7標的の各々について、18個のカウンタースクリーンHLA−ペプチドを生成した。
Distributed Bio Incの極めて多様なSuperHuman 2.0合成未感作scFvライブラリー(超安定かつ多様なVH/VL足場上の全多様性7.6e10)をファージディスプレイに使用した。ファージライブラリーは、18個のプールされた陰性pHLA複合体(「完全プール」)で最初に枯渇し、続いて、確立されたプロトコルを使用して標的pHLA複合体によりビーズベースのファージパニングを3〜4回行って、HLA−ペプチド標的であるそれぞれG2およびG7に対するscFvバインダーを同定した。ファージ力価をパニングの各ラウンドで決定して、非結合ファージの除去を確立した。ファージELISAの結果を図14Aおよび14Bに示す。G2およびG7標的の各々について、後のラウンドのパニングにおいて結合ファージの富化があった。出力ファージ上清も、ELISAによって標的結合について試験した。
様々なヒト白血球抗原(HLA)のαおよびβ2ミクログロブリン鎖は、確立された手順(Garboczi、Hung、およびWiley、1992)を使用してBL21適格大腸菌細胞(New England Biolabs)中で別々に発現した。自動誘導後、細胞を、Bugbuster(登録商標)中の超音波処理およびベンゾナーゼタンパク質抽出試薬(Novagen)を介して溶解させた。得られた封入体を、0.5%Triton X−100(50mMのトリス、100mMのNaCl、1mMのEDTA)を含む洗浄緩衝液または含まない洗浄緩衝液中で洗浄および超音波処理した。最後の遠心分離後、封入体ペレットを、尿素溶液(8Mの尿素、25mMのMES、10mMのEDTA、0.1mMのDTT、pH6.0)に溶解させた。Bradfordアッセイ(Biorad)を使用して濃度を定量し、封入体を−80℃で保存した。
HLA−ペプチドの安定性を、条件付きリガンドペプチド交換および安定性ELISAアッセイにより評定した。簡単に言うと、条件付きリガンド−HLA複合体を、カウンタースクリーンまたは試験ペプチドの存在下または非存在下で±条件刺激に供した。条件刺激への露出により、条件付きリガンドがHLA複合体から切断され、その結果、HLA複合体が解離する。カウンタースクリーンまたは試験ペプチドは、HLA複合体のα1/α2溝に安定して結合する場合、HLA複合体を解離から「救助」する。
ファージライブラリのスクリーニングを、上記の全体的なスクリーニング設計に従って実行した。各ペプチド−HLA複合体へのscFvバインダーを同定するために、3〜4ラウンドのビーズベースのパニングを行った。パニングの各ラウンドについて、開始ファージのアリコートを入力力価測定のために取っておき、残りのファージをDynabead M−280ストレプトアビジンビーズ(Life Technologies)に対して3回枯渇させた後、100ピコモルのプールされた陰性ペプチド−HLA複合体と事前に結合させたストレプトアビジンに対して枯渇させた。パニングの最初のラウンドでは、ストレプトアビジンビーズに結合した100ピコモルのペプチド−HLA複合体を、枯渇させたファージとともに2時間室温で回転させながらインキュベートした。1倍PBST(PBS+0.05%Tween−20)中0.5%BSAでの5分間の洗浄を3回、続いて1倍PBS中0.5%BSAでの5分間の洗浄を3回用いて、ペプチド−HLA複合体結合ビーズに結合していないファージを除去した。洗浄したビーズから結合したファージを溶出させるために、1mlの0.1M TEAを添加し、回転させながら室温で10分間インキュベートした。溶出したファージをビーズから収集し、pH7.5、0.5mlの1Mトリス−HClで中和した。次に、中和したファージを使用して対数増殖TG−1細胞を感染させ(OD600=0.5)、37℃で1時間感染させた後、後続のパニングラウンドのための出力力価および細菌成長用に、細胞を、100μg/mlのカルベニシリンおよび2%グルコース(2YTCG)寒天を含む2YT培地にプレーティングした。後続ラウンドのパニングでは、表1に示すように、選択抗原濃度が低下した一方、洗浄は、量および洗浄時間の長さが増加した。
パニングの最終ラウンドで得られ、大腸菌で発現されたファージからクローニングされた個々のscFvを、以下のようにscFv PPE ELISAに供した。
選択したクローンを、次のように、Fab、scFv、またはIgG形式に再フォーマットした。
選択したG2およびG7 Fabの構築物を、哺乳動物発現に対して最適化したベクターにクローニングした。各DNA構築物をトランスフェクション用に規模拡大し、配列を確認した。100mLの一時的な生産を、各HEK293細胞(Tuna293(商標)Process)において完了した。タンパク質を、抗CH1精製により精製した後、HiLoad 16/600 Superdex 200を介したSEC研磨により精製した。SEC研磨に使用した移動相は、20mMのトリス、50mMのNaCl、pH7であった。最終確認CE−SDS分析を行った。
発現プラスミドをBL21(DE3)株に形質転換し、400mLの大腸菌培養中で周辺シャペロンとともに共発現させた。細胞ペレットを再構成した:10ml/1gのバイオマス(25mMのHEPES、pH7.4、0.3MのNaCl、10mMのMgCl2、10%グリセロール、0.75%CHAPS、1mMのDTT)およびリゾチーム、ならびにベンゾナーゼおよびLake Pharmaプロテアーゼ阻害剤カクテル。細胞懸濁液を振盪台で室温で30分間インキュベートした。溶解物を、4℃、13,000×rpmで15分間遠心分離することにより澄ませた。澄ませた溶解物を、IMAC緩衝液A(20mMのトリス−HCl、Ph7.5、300mMのNaCl/10%グリセロール/1mMのDTT)で事前に平衡化した5mlのNi NTA樹脂にロードした。樹脂を、10CVの緩衝液Aにより(または安定したベースラインに達するまで)、続いて10CVの8%IMAC緩衝液B(20mMのトリス−HCl、Ph7.5;300mMのNaCl/10%グリセロール/1mMのDTT/250mMのイミダゾール)により洗浄した。標的タンパク質を、100%IMAC緩衝液Bまでの20CV勾配で溶出させた。5CVの100%IMAC Bでカラムを洗浄して、タンパク質の完全な除去を確実にした。溶出画分をSDS−PAGEおよびウェスタンブロット(抗His)で分析し、適宜プールした。プールを最終製剤緩衝液(20mMのトリス−HCl、Ph7.5、300mMのNaCl/10%グリセロール/1mMのDTT)に対して透析し、最終タンパク質濃度が0.3mg/ml超になるまで濃縮し、1mLバイアルに分取して、液体窒素中で瞬間凍結させた。最終QCステップには、SDS−PAGEおよびA280の測定を含めた。
Gシリーズ抗体の発現構築物を、哺乳動物発現に対して最適化したベクターにクローニングした。各DNA構築物をトランスフェクション用に規模拡大し、配列を確認した。10mLの一時的な産生を、各HEK293細胞(Tuna293(商標)Process)において完了した。タンパク質をタンパク質A精製により精製し、最終CE−SDS分析を行った。
Octet Qke(ForteBio)で親和性測定を行った。1倍動力学緩衝液中のビオチン化pHLA複合体を、使用した最高濃度の各Fabに最適なnmシフト応答(約0.6nm)を与える濃度で、ストレプトアビジンセンサーにロードした。pHLA複合体を300秒間ロードし、その後、リガンドをロードした先端部を120秒間動力学緩衝液中で平衡化した。次に、リガンドをロードしたバイオセンサーを、2倍希釈に滴定したFab溶液に200秒間浸漬した。開始Fab濃度は100nM〜2uMの範囲であり、その後はFabのKD値に基づいて最適化した。動力学緩衝液の解離ステップを200秒間測定した。データを、1:1結合モデルを使用するForteBioデータ分析ソフトウェアを使用して分析した。
選択したFabクローンの接触点として作用するアミノ酸残基を決定するために、G2およびG7拘束性ペプチドの位置スキャンを実行した。
scFvクローンG2−P1H11およびG7−EpからのIgGを、実施例7に記載のように創出した。
Phoenix−AMPHO細胞(ATCC(登録商標)、CRL−3213(商標))を、6ウェルプレートに5×105細胞/ウェルでプレーティングし、一晩37℃でインキュベートした。
内因性MHCを欠くK562細胞に、それぞれG2またはG7のHLAサブタイプを導入するためにレトロウイルスを形質導入した。HLA形質導入K562細胞を、前夜に、6ウェルプレートにおいて、1%FBSを含有するIDMEM中、50μMの標的または陰性対照ペプチド(Genscript)でパルスし、標準的な組織培養条件下でインキュベートした。細胞を採集し、PBSで洗浄し、eBioscience Fixable Viability Dye eFluor 450を用いて15分間室温で染色した。PBS+1%FBSでさらに洗浄した後、さまざまな濃度の試験IgG(G2−P1H11またはG7R4−B5−P2E9)とともに細胞を再懸濁した。細胞を抗体とともに1時間4℃でインキュベートした。さらに洗浄した後、PEコンジュゲートヤギ抗ヒトIgG二次抗体(Jackson ImmunoResearch)を、30分間4℃で、1:200で添加した。PBS+1%FBSで洗浄した後、細胞をPBS+1%FBSに再懸濁し、フローサイトメトリーで分析した。フローサイトメトリー分析は、Attune NxT Softwareを使用するAttune NxT Flow Cytometer(ThermoFisher)で行った。FlowJoを使用して、データを分析した。
リード抗体またはCAR−T構築物をインビボで評価して、ヒト化マウス腫瘍モデルにおける指向腫瘍殺滅を実証する。リード抗体またはCAR−T構築物を、ヒト腫瘍およびPBMCを移植した異種移植腫瘍モデルにおいて評価する。抗腫瘍活性を測定し、対照構築物と比較して、標的特異的な腫瘍殺滅を実証する。
水素/重水素交換
20μMのHLA−ペプチドを3倍モル過剰のscFvまたはFabフォーマット化ABPとともに20分間室温(20〜25℃)でインキュベートして、交換実験用の複合体を生成した。Apo対照については、HLA−ペプチドを、ABPなしで、等量の50mMのNaCl、20mMのトリス、pH 8.0とともにインキュベートした。その後のすべての反応ステップは、Chronos 4.8.0ソフトウェア(Leap Technologies,Morrisville,NC)によって制御される自動HDX PALシステムによって4℃で行った。重水素交換は、30秒〜3時間の範囲で二連で実行した。5μlのタンパク質複合体を、H2O(0分の対照時点)または指定時間のD2Oへと10倍に希釈した後、0.8Mの塩酸グアニジン、0.4%酢酸(v/v)、および75mMのトリス(2−カルボキシエチル)ホスフィン中で3分間クエンチングした。統合されたライン上でのタンパク質消化のために、約50ピコモルのクエンチしたタンパク質複合体を固定化Protein XIII/Pepsinカラム(NovaBioAssays,Woburn,MA)に移した。
ペプチドのクロマトグラフィー分離を、トラップC18カラム(粒径5μMおよび直径2.1mm)および分析用C18カラム(粒径1.9μMおよび直径1mm)を含むUltiMate 3000 Basic Manual UHPLC System(ThermoFisher Scientific,Waltham,MA)を使用して実行した。試料を、10%アセトニトリル、0.5%ギ酸を用いて、40μl/分の流速で2分間脱塩し、ペプチドを、95%アセトニトリル、0.5%ギ酸の濃度を漸増させながら40μl/分の流速で溶出させた。質量分析は、Orbitrap Fusion Lumos質量分析計(ThermoFisher,Waltham,MA)で行い、ESIソースは3700Vの陽イオン電圧に設定した。水素−重水素交換実験を行う前に、各HLA−ペプチド複合体のペプチド断片を、データ依存性LC/MS/MSにより分析し、データを、ペプチド前駆体の質量許容値10ppm、断片イオンの質量許容値0.1Daで、PEAKS Studio(Bioinformatics Solutions Inc.,Waterloo,ON,Canada)を使用して検索した。HLA、β2M、およびペプチドの配列を検索し、おとりデータベース戦略を使用して誤検出率を同定した。水素−重水素実験からのペプチドをLC/MSにより検出し、保持時間枠サイズ0.22分、7.0 ppmのエラーで、HDX Workbench(Omics Informatics,Honolulu,HI)により分析した。重水素(D)交換試料では、次に、ペプチドを溶出時間枠内で同定し、質量の差を決定した。Dは分子量がHよりも1大きいため、質量はペプチド骨格で交換された各Dについて1増加する。質量および同位体イオンの強度の差により、各ペプチドのD%の値が生成された。Pymol(Schrodinger,Cambridge,MA)を使用して、重水素取り込みの差を関連するタンパク質結晶構造にマッピングした。Apo対照とABPと間のD交換の減少を計算し、アミノ酸によりプロットした。GraphPad Prism 7.0(La Jolla,CA)を使用して、統計分析およびグラフ表示を行った。
図25は、HLA−ペプチド標的に特異的に結合するTCRを単離した実験的ワークフローを示す。簡単に言うと、HLA−ペプチド標的に結合する未感作CD8+T細胞をフローサイトメトリーにより単離し、ポリクローナルに拡大させた。拡大後、HLA−ペプチド標的複合体に対する細胞の特異性をフローサイトメトリーにより試験した。拡張させた集団の大部分(75%超)がHLA−ペプチド標的に特異的であった場合、集団全体を全体として配列決定して、TCRを同定した。あるいは、HLA−ペプチド標的に特異的に結合した細胞を再選別し、再選別後に単離した細胞のみを配列決定した。TCR配列を発現ベクターにクローニングし、組換えTCRとしてレシピエントT細胞に導入した。評価したTCRの発現およびTCR組換えT細胞による同種HLA−ペプチド標的複合体の結合を評価した。
健康なドナーからの末梢血単核細胞(PBMC)を、以下のように未感作CD8+T細胞について磁気的に富化した。健康なドナーからの白血球アフェレーシス試料を処理することにより、PBMCを得た。凍結PBMCを解凍し、ビオチン化CD45RO、CD14、CD15、CD16、CD19、CD25、CD34、CD36、CD57、CD123、抗HLA−DR、CD235a(グリコホリンA)、CD244、およびCD4抗体のカクテルとともにインキュベートし、その後、PBMC集団からの除去のために、抗ビオチンマイクロビーズで磁気標識した。富化した未感作CD8 T細胞を、標的ペプチドおよび適切なHLA分子を含む四量体で標識し、生/死および系統マーカーで染色し、図26に示すゲーティング手順に従ってフローサイトメトリーにより選別した。HLA−ペプチド四量体に結合した細胞を単離した。ポリクローナル拡大の後、拡大させたCD8+T細胞の特異性を、HLA−ペプチドまたは四量体なしの対照で標識することにより再評定した。例示的なHLA−ペプチド標的であるB*44:02_GEMSSNSTALおよびA*01:01_EVDPIGHLYのフローサイトメトリーの結果を図27に示す。HLA−ペプチド標的A*03:01_GVHGGILNKのフローサイトメトリーの結果は図28に示す。
T細胞の配列決定の基準
拡張させた集団の大部分(75%超)がHLA−ペプチド標的に特異的であった場合、集団全体を全体として配列決定して、TCRを同定した。次に、集団から選択したTCR配列を発現ベクターにクローニングし、特異性を確認するためにレシピエントT細胞にトランスフェクトした。あるいは、HLA−ペプチド標的に特異的に結合した細胞を再選別し、再選別後に単離した細胞のみを配列決定した。
図26に記載するように単離し拡大させたT細胞は、10x Genomicsの単一細胞分解能対合免疫TCRプロファイリングアプローチを使用して配列決定した。具体的には、後の単一細胞cDNA生成および全長TCRプロファイリングのために、2〜8000個の生T細胞を単一細胞エマルジョン中に分割した(定常領域をとおして5’UTR、アルファ鎖およびベータ鎖の対合を確保する)。1つのアプローチでは、転写産物の5’末端で分子バーコード化テンプレートスイッチングオリゴを利用し、第2のアプローチでは、3’末端で分子バーコード化定常領域オリゴを利用し、第3のアプローチは、RNAポリメラーゼプロモーターをTCRの5’末端または3’末端のいずれかに結合させる。これらのアプローチはすべて、単一細胞レベルでのアルファおよびベータTCRペアの同定およびデコンボリューションを可能にするものである。得られたバーコード化cDNA転写産物は、最適化された酵素およびライブラリー構築ワークフローを経て、バイアスを減らし、細胞プール内のクローン型の正確な表現を保証する。ライブラリーは、IlluminaのMiSeqまたはHiSeq4000機器(ペアードエンド150サイクル)上、細胞あたり約5〜50000リードの標的配列決定深度で配列決定した。
再選別した細胞からの、A*0101_EVDPHIGHLYに特異的なTCRクローン型の注釈付き可変、多様性、接合、および定常領域を、表9で以下に示す。
Jurkat TIB−152 T細胞株培養物を、Nucleofector 4D電気穿孔機を使用して、ヒトCD8を発現するプラスミドと、GFPレポーター遺伝子を有するTCR αおよびβ鎖を発現するプラスミドとで同時トランスフェクトした。トランスフェクションに使用したプラスミドを図4および5に記載する。トランスフェクションの24〜48時間後、Jurkat T細胞を目的のTCRの発現について分析した。フローサイトメトリーを使用して、HLA−ペプチド複合体および対照の感染症ベースのペプチド四量体への結合について、細胞を評定した。HLA−ペプチド標的四量体の結合を評価する前に、全集団を単一GFP発現生細胞でゲーティングした。図31は、それぞれのHLA−ペプチド標的に結合するが、対照ペプチド四量体には結合しない、A*0201_LLASSILCA−、A*0201_GVYDGEEHSV−、B*4402_GEMSSNSTAL−、およびA*0101_EVDPIGHLY特異的TCRを発現しているJurkat細胞の例を示す。
レンチウイルスベクターを、HLA−ペプチド標的であるHLA−A*0201_LLASSILCAに特異的なTCRのために生成した。モデルベクターシステムとして、System Biosciences,Palo Alto,CAから市販されている第3世代レンチウイルスベース発現ベクターシステムを使用した。図33を参照されたい。
T細胞を、患者の血液、リンパ節、または腫瘍から単離する。患者は、SATとHLA適合しており、標的を担持するタンパク質の発現に基づいて選択する。次に、例えば、SAT−MHC四量体結合細胞を選別することにより、またはT細胞とSATパルス抗原提示細胞とのインビトロの共培養において刺激した活性化細胞を選別することにより、T細胞を、SAT特異的T細胞について富化する。
TCRアルファおよびベータ鎖配列を、適切な構築物にクローニングする。TCR自己または異種バルクT細胞を構築物を形質導入して、操作されたTCR T細胞を産生する。これらのT細胞を、後の実験で使用するために、抗CD3抗体およびIL−2サイトカインの存在下で拡大させる。ある特定の場合には、天然TCRを欠失させるか、または挿入したTCRを修飾して、適当な多量体化を増加させる。
まず、適切なMHCを発現し、適切な標的(複数可)でパルスした抗原提示細胞を使用して、操作されたTCRを保有するT細胞を標的認識についてスクリーニングする。
目的の腫瘍抗原を提示するヒトクラスI MHC分子を標的とする強力かつ選択的なmAbを同定する。ヒト腫瘍抗原を提示する可溶性ヒトpMHC分子を、複数のマウスまたはウサギの免疫化に利用し、その後、免疫した動物に由来するB細胞をスクリーニングして、標的のクラスI MHC分子に結合するmAbを発現するB細胞を同定する。マウスまたはウサギのスクリーニングから同定したmAbをコードする配列は、単離したB細胞からクローニングすることになる。次に、回収したmAbを無関係のpMHCのパネルに対して評価して、標的pMHCに選択的に結合するリードmAbを同定する。リードmAbは、標的結合親和性および選択性を決定するために十分に特徴付ける。強力かつ選択的な結合を示すリードmAbをヒト化して、全長ヒトIgGモノクローナル抗体(mAb)構築物を生成する。加えて、リードmAbを、CAR T細胞の生成に使用できる、二重特異性mAb構築物およびキメラ抗原受容体(CAR)構築物に組み込む。全長二重特異性構築物またはscFVベースの二重特異性構築物を構築することができる。
免疫組織化学技術を利用して、標的pMHC分子を発現するヒト腫瘍細胞へのリード抗体の特異的結合を実証する。CAR−T構築物でトランスフェクトしたT細胞株をヒト腫瘍細胞とともにインキュベートして、インビトロでのi腫瘍細胞の殺滅を実証する。あるいは、標的を発現する腫瘍細胞を二重特異性構築物(ABPおよびエフェクタードメインをコードするもの)およびPBMCまたはT細胞とともにインキュベートする。
リード抗体またはCAR−T構築物をインビボで評価して、ヒト化マウス腫瘍モデルにおける指向腫瘍殺滅を実証する。リード抗体またはCAR−T構築物を、ヒトPBMCを移植した異種移植腫瘍モデルにおいて評価する。抗腫瘍活性を測定し、対照構築物と比較して、標的依存性の腫瘍殺滅を実証する。
Claims (178)
- ヒト白血球抗原(HLA)−ペプチド標的に特異的に結合する単離された抗原結合タンパク質(ABP)であって、前記HLA−ペプチド標的が、HLAクラスI分子と複合体化したHLA拘束性ペプチドを含み、前記HLA拘束性ペプチドが、前記HLAクラスI分子のα1/α2ヘテロ二量体部分のペプチド結合溝に位置し、
a.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*02:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列LLASSILCAからなる、
b.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列EVDPIGHLYからなる、
c.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプB*44:02であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列GEMSSNSTALからなる、
d.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*02:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列GVYDGEEHSVからなる、
e.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプ*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列EVDPIGHVYからなる、または、
f.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプHLA−A*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列NTDNNLAVYからなる、
単離されたABP。 - 前記HLA拘束性ペプチドが、約5〜15アミノ酸長である、請求項1に記載の単離されたABP。
- 前記HLA拘束性ペプチドが、約8〜12アミノ酸長である、請求項2に記載の単離されたABP。
- 抗体またはその抗原結合断片を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*02:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列LLASSILCAを含む、請求項4に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:3025〜3032のいずれか1つに示される配列を含むCDR−H3を含む、請求項5に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:3043〜3050のいずれか1つに示される配列を含むCDR−L3を含む、請求項5または6に記載の単離されたABP。
- G7R3−P1C6、G7R3−P1G10、1−G7R3−P1B4、2−G7R4−P2C2、3−G7R4−P1A3、4−G7R4−B5−P2E9、5−G7R4−B10−P1F8、またはB7(G7R3−P3A9)と指定されるscFvからのCDR−H3およびCDR−L3を含む、請求項5〜7のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- G7R3−P1C6、G7R3−P1G10、1−G7R3−P1B4、2−G7R4−P2C2、3−G7R4−P1A3、4−G7R4−B5−P2E9、5−G7R4−B10−P1F8、またはB7(G7R3−P3A9)と指定されるscFvからの3つすべての重鎖CDRおよび3つすべての軽鎖CDRを含む、請求項5〜8のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:2994〜3001から選択されるVH配列を含む、請求項5〜9のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 3002〜3009から選択されるVL配列を含む、請求項5〜10のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- G7R3−P1C6、G7R3−P1G10、1−G7R3−P1B4、2−G7R4−P2C2、3−G7R4−P1A3、4−G7R4−B5−P2E9、5−G7R4−B10−P1F8、またはB7(G7R3−P3A9)と指定されるscFvからのVH配列およびVL配列を含む、請求項5〜11のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記拘束性ペプチドLLASSILCAの残基1〜5のうちのいずれか1つ以上を介して前記HLA−ペプチド標的に結合する、請求項5〜12のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプHLA−A*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列NTDNNLAVYを含む、請求項4に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:2902〜2933のいずれか1つに示される配列を含むCDR−H3を含む、請求項14に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:2971〜2993のいずれか1つに示される配列を含むCDR−L3を含む、請求項14または15に記載の単離されたABP。
- G2−P2E07、G2−P2E03、G2−P2A11、G2−P2C06、G2−P1G01、G2−P1C02、G2−P1H01、G2−P1B12、G2−P1B06、G2−P2H10、G2−P1H10、G2−P2C11、G2−P1C09、G2−P1A10、G2−P1B10、G2−P1D07、G2−P1E05、G2−P1D03、G2−P1G12、G2−P2H11、G2−P1C03、G2−P1G07、G2−P1F12、G2−P1G03、G2−P2B08、G2−P2A10、G2−P2D04、G2−P1C06、G2−P2A09、G2−P1B08、G2−P1E03、G2−P2A03、G2−P2F01、G2−P1H11、またはG2−P1D06と指定されるscFvからのCDR−H3およびCDR−L3を含む、請求項14〜16のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- G2−P2E07、G2−P2E03、G2−P2A11、G2−P2C06、G2−P1G01、G2−P1C02、G2−P1H01、G2−P1B12、G2−P1B06、G2−P2H10、G2−P1H10、G2−P2C11、G2−P1C09、G2−P1A10、G2−P1B10、G2−P1D07、G2−P1E05、G2−P1D03、G2−P1G12、G2−P2H11、G2−P1C03、G2−P1G07、G2−P1F12、G2−P1G03、G2−P2B08、G2−P2A10、G2−P2D04、G2−P1C06、G2−P2A09、G2−P1B08、G2−P1E03、G2−P2A03、G2−P2F01、G2−P1H11、またはG2−P1D06と指定されるscFvからの3つすべての重鎖CDRおよび3つすべての軽鎖CDRを含む、請求項14〜17のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 2781〜2815から選択されるVH配列を含む、請求項14〜18のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 2816〜2850から選択されるVL配列を含む、請求項14〜19のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- G2−P2E07、G2−P2E03、G2−P2A11、G2−P2C06、G2−P1G01、G2−P1C02、G2−P1H01、G2−P1B12、G2−P1B06、G2−P2H10、G2−P1H10、G2−P2C11、G2−P1C09、G2−P1A10、G2−P1B10、G2−P1D07、G2−P1E05、G2−P1D03、G2−P1G12、G2−P2H11、G2−P1C03、G2−P1G07、G2−P1F12、G2−P1G03、G2−P2B08、G2−P2A10、G2−P2D04、G2−P1C06、G2−P2A09、G2−P1B08、G2−P1E03、G2−P2A03、G2−P2F01、G2−P1H11、またはG2−P1D06と指定されるscFvからのVH配列およびVL配列を含む、請求項14〜20のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記拘束性ペプチドNTDNNLAVYの残基6〜9を介しておよび前記HLAサブタイプ対立遺伝子A*0101の残基157〜160を介して前記HLA−ペプチド標的に結合する、請求項14〜21のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記拘束性ペプチドNTDNNLAVYの残基3〜8を介して前記HLA−ペプチド標的に結合する、請求項14〜22のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- T細胞受容体(TCR)またはその抗原結合部分を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記TCRまたはその抗原結合部分が、TCR可変領域を含む、請求項24に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記TCRまたはその抗原結合部分が、1つ以上のTCR相補性決定領域(CDR)を含む、請求項24または25に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記TCRが、アルファ鎖およびベータ鎖を含む、請求項24〜26のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記TCRが、ガンマ鎖およびデルタ鎖を含む、請求項24〜27のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 抗原結合タンパク質を含む細胞外部分と細胞内シグナル伝達ドメインとを含むキメラ抗原受容体(CAR)の一部である、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記抗原結合タンパク質がscFvを含み、前記細胞内シグナル伝達ドメインがITAMを含む、請求項29に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3−ゼータ(CD3)鎖のゼータ鎖シグナル伝達ドメインを含む、請求項29または30に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記細胞外ドメインと前記細胞内シグナル伝達ドメインとを連結する膜貫通ドメインをさらに含む、請求項29〜31のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記膜貫通ドメインが、CD28の膜貫通部分を含む、請求項32に記載の抗原結合タンパク質。
- T細胞共刺激分子の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項29〜33のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記T細胞共刺激分子が、CD28、4−1BB、OX−40、ICOS、またはそれらの任意の組み合わせである、請求項34に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*02:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列LLASSILCAを含む、請求項24〜35のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4277、4278、4279、4280、または4281であるTCRアルファCDR3配列を含む、請求項36に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4291〜4295のうちのいずれか1つであるTCRベータCDR3配列を含む、請求項36または37に記載の単離されたABP。
- TCRクローン型ID番号:TCR19、TCR21、TCR22、TCR18、またはTCR23のうちのいずれか1つからのアルファCDR3およびベータCDR3配列を含む、請求項36〜38のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRアルファ可変(TRAV)アミノ酸配列、TCRアルファ接合(TRAJ)アミノ酸配列、TCRベータ可変(TRBV)アミノ酸配列、TCRベータ多様性(TRBD)アミノ酸配列、およびTCRベータ接合(TRBJ)アミノ酸配列を含み、
前記TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD、およびTRBJアミノ酸配列の各々が、TCRクローン型ID番号:TCR19、TCR21、TCR22、TCR18、およびTCR23から選択されるTCRクローン型のうちのいずれか1つについての対応するTRAV、TRAJ、TRBV、TRBD、およびTRBJアミノ酸配列と、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である、
請求項36〜39のいずれか一項に記載の単離されたABP。 - TCRアルファ定常(TRAC)アミノ酸配列を含む、請求項36〜40のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRベータ定常(TRBC)アミノ酸配列を含む、請求項36〜41のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4306〜4310のうちのいずれか1つに対して、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するTCRアルファVJ配列を含む、請求項36〜42のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4321〜4325のうちのいずれか1つに対して、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するTCRベータV(D)J配列を含む、請求項36〜43のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRアルファVJアミノ酸配列およびTCRベータV(D)Jアミノ酸配列を含み、
前記TCRアルファVJおよび前記TCRベータV(D)Jアミノ酸配列の各々が、TCRクローン型ID番号:TCR19、TCR21、TCR22、TCR18、およびTCR23から選択されるTCRクローン型のうちのいずれか1つについての対応するTCRアルファVJおよびTCRベータV(D)Jアミノ酸配列と、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である、
請求項36〜44のいずれか一項に記載の単離されたABP。 - 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列EVDPIGHLYを含む、請求項24〜35のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4273〜4276または3052〜3350のうちのいずれか1つであるTCRアルファCDR3配列を含む、請求項46に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4287〜4290または3351〜3655のうちのいずれか1つであるTCRベータCDR3配列を含む、請求項46または47に記載の単離されたABP。
- TCR ID番号:TCR101〜TCR469、TCR2、TCR4、TCR53、TCR54、またはTCR101〜TCR469のうちのいずれか1つからのアルファCDR3およびベータCDR3配列を含む、請求項46〜48のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRアルファ可変(TRAV)アミノ酸配列、TCRアルファ接合(TRAJ)アミノ酸配列、TCRベータ可変(TRBV)アミノ酸配列、TCRベータ多様性(TRBD)アミノ酸配列、およびTCRベータ接合(TRBJ)アミノ酸配列を含み、
前記TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD、およびTRBJアミノ酸配列の各々が、TCR ID番号:TCR101〜TCR469、TCR2、TCR4、TCR53、TCR54、またはTCR101〜TCR469から選択されるTCRクローン型のうちのいずれか1つについての対応するTRAV、TRAJ、TRBV、TRBD、およびTRBJアミノ酸配列と、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である、
請求項46〜49のいずれか一項に記載の単離されたABP。 - TCRアルファ定常(TRAC)アミノ酸配列を含む、請求項46〜50のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRベータ定常(TRBC)アミノ酸配列を含む、請求項46〜50のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:3656〜3961または4302〜4305のうちのいずれか1つに対して、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するTCRアルファVJ配列を含む、請求項46〜52のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:3962〜4269または4317〜4320のうちのいずれか1つに対して、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するTCRベータV(D)J配列を含む、請求項46〜53のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRアルファVJアミノ酸配列およびTCRベータV(D)Jアミノ酸配列を含み、
前記TCRアルファVJおよび前記TCRベータV(D)Jアミノ酸配列の各々が、TCR ID番号:TCR101〜TCR469、TCR2、TCR4、TCR53、およびTCR54から選択されるTCRクローン型のうちのいずれか1つについての対応するTCRアルファVJおよびTCRベータV(D)Jアミノ酸配列と、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、および100%同一である、
請求項46〜54のいずれか一項に記載の単離されたABP。 - 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプB*44:02であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列GEMSSNSTALを含む、請求項24〜35のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4284〜4286または3138のうちのいずれか1つであるTCRアルファCDR3配列を含む、請求項56に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4298〜4301のうちのいずれか1つであるTCRベータCDR3配列を含む、請求項56または57に記載の単離されたABP。
- TCR ID番号:TCR29、TCR30、TCR32、またはTCR33のうちのいずれか1つからのアルファCDR3およびベータCDR3配列を含む、請求項56〜58のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRアルファ可変(TRAV)アミノ酸配列、TCRアルファ接合(TRAJ)アミノ酸配列、TCRベータ可変(TRBV)アミノ酸配列、TCRベータ多様性(TRBD)アミノ酸配列、およびTCRベータ接合(TRBJ)アミノ酸配列を含み、
前記TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD、およびTRBJアミノ酸配列の各々が、TCR ID番号:TCR29、TCR30、TCR32、またはTCR33から選択されるTCRクローン型のうちのいずれか1つについての対応するTRAV、TRAJ、TRBV、TRBD、およびTRBJアミノ酸配列と、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である、
請求項56〜59のいずれか一項に記載の単離されたABP。 - TCRアルファ定常(TRAC)アミノ酸配列を含む、請求項56〜60のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRベータ定常(TRBC)アミノ酸配列を含む、請求項56〜61のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4313〜4316のうちのいずれか1つに対して、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するTCRアルファVJ配列を含む、請求項56〜62のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4328〜4331のうちのいずれか1つに対して、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するTCRベータV(D)J配列を含む、請求項56〜63のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRアルファVJアミノ酸配列およびTCRベータV(D)Jアミノ酸配列を含み、
前記TCRアルファVJおよび前記TCRベータV(D)Jアミノ酸配列の各々が、TCR ID番号:TCR29、TCR30、TCR32、またはTCR33から選択されるTCRクローン型のうちのいずれか1つについての対応するTCRアルファVJおよびTCRベータV(D)Jアミノ酸配列と、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である、
請求項56〜64のいずれか一項に記載の単離されたABP。 - 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*02:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列GVYDGEEHSVを含む、請求項24〜35のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4282または4283であるTCRアルファCDR3配列を含む、請求項66に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4296または4297であるTCRベータCDR3配列を含む、請求項66または67に記載の単離されたABP。
- TCRクローン型ID番号:TCR26またはTCR28からのアルファCDR3およびベータCDR3配列を含む、請求項66〜68のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRアルファ可変(TRAV)アミノ酸配列、TCRアルファ接合(TRAJ)アミノ酸配列、TCRベータ可変(TRBV)アミノ酸配列、TCRベータ多様性(TRBD)アミノ酸配列、およびTCRベータ接合(TRBJ)アミノ酸配列を含み、
前記TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD、およびTRBJアミノ酸配列の各々が、TCR ID番号:TCR26またはTCR28についての対応するTRAV、TRAJ、TRBV、TRBD、およびTRBJアミノ酸配列と、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である、
請求項66〜68のいずれか一項に記載の単離されたABP。 - TCRアルファ定常(TRAC)アミノ酸配列を含む、請求項66〜70のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRベータ定常(TRBC)アミノ酸配列を含む、請求項66〜71のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4311または4312に対して、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するTCRアルファVJ配列を含む、請求項66〜72のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- SEQ ID NO:4326または4327に対して、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するTCRベータV(D)J配列を含む、請求項66〜73のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- TCRアルファVJアミノ酸配列およびTCRベータV(D)Jアミノ酸配列を含み、
前記TCRアルファVJおよび前記TCRベータV(D)Jアミノ酸配列の各々が、TCR ID番号:TCR26またはTCR28についての対応するTCRアルファVJおよびTCRベータV(D)Jアミノ酸配列と、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である、
請求項66〜74のいずれか一項に記載の単離されたABP。 - 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプHLA−A*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列NTDNNLAVYを含む、請求項24〜35のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプHLA−A*03:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列GVHGGILNKを含む、請求項24〜35のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプHLA−A*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列EVDPIGHVYを含む、請求項24〜35のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- ヒト白血球抗原(HLA)−ペプチド標的に特異的に結合する単離された抗原結合タンパク質(ABP)であって、前記HLA−ペプチド標的が、HLAクラスI分子と複合体化したHLA拘束性ペプチドを含み、前記HLA拘束性ペプチドが、前記HLAクラスI分子のα1/α2ヘテロ二量体部分のペプチド結合溝に位置し、前記HLA−ペプチド標的が、表Aから選択される、単離されたABP。
- 前記HLA拘束性ペプチドが、WT1またはMART1から選択される遺伝子に由来しない、請求項79に記載の単離されたABP。
- 前記HLA拘束性ペプチドが、約5〜15アミノ酸長である、請求項79または80に記載の単離されたABP。
- 前記HLA拘束性ペプチドが、約8〜12アミノ酸長である、請求項81に記載の単離されたABP。
- 抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項79〜82のいずれか一項に記載の単離されたABP。
- 前記抗原結合タンパク質が足場に連結し、任意選択で、前記足場が血清アルブミンまたはFcを含み、任意選択で、Fcが、ヒトFcであり、IgG(IgG1、IgG2、IgG3、IgG4)、IgA(IgA1、IgA2)、IgD、IgE、またはIgMである、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記抗原結合タンパク質が、リンカーを介して足場に連結し、任意選択で、前記リンカーがペプチドリンカーであり、任意選択で、前記ペプチドリンカーがヒト抗体のヒンジ領域である、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- Fv断片、Fab断片、F(ab’)2断片、Fab’断片、scFv断片、scFv−Fc断片、および/または単一ドメイン抗体もしくはその抗原結合断片を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- scFv断片を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 1つ以上の抗体相補性決定領域(CDR)、任意選択で6つの抗体CDRを含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 抗体を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- モノクローナル抗体である、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- ヒト化抗体、ヒト抗体、またはキメラ抗体である、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 多重特異性であり、任意選択で二重特異性である、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 1つ超の抗原または単一抗原上の1つ超のエピトープに結合する、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- IgG、IgA、IgD、IgE、およびIgMから選択されるクラスの重鎖定常領域を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記ヒトIgGクラスであり、IgG1、IgG4、IgG2、およびIgG3から選択されるサブクラスである重鎖定常領域を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記抗原結合タンパク質が修飾Fcを含み、任意選択で、前記修飾Fcが、半減期を延長する1つ以上の突然変異を含み、任意選択で、前記半減期を延長する1つ以上の突然変異がYTEである、請求項に記載の抗原結合タンパク質。
- 単離されたHLA−ペプチド標的であって、前記HLA−ペプチド標的が、HLAクラスI分子と複合体化したHLA拘束性ペプチドを含み、前記HLA拘束性ペプチドが、前記HLAクラスI分子のα1/α2ヘテロ二量体部分のペプチド結合溝に位置し、前記HLA−ペプチド標的が、表Aから選択され、但し、前記単離されたHLA−ペプチド標的が、標的番号6364〜6369、6386〜6389、6500、6521〜6524、または6578のうちのいずれでもなく、表Bまたは表Cに見られるHLA−ペプチド標的ではない、単離されたHLA−ペプチド標的。
- a.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*02:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列LLASSILCAを含む、
b.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列EVDPIGHLYを含む、
c.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプB*44:02であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列GEMSSNSTALを含む、
d.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプA*02:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列GVYDGEEHSVを含む、
e.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプ*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列EVDPIGHVYを含む、または、
f.前記HLAクラスI分子が、HLAサブタイプHLA−A*01:01であり、前記HLA拘束性ペプチドが、配列NTDNNLAVYを含む、
請求項97に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。 - 配列LLASSILCAからなるかまたはそれから本質的になる拘束性ペプチドと複合体化したHLAサブタイプA*02:01を含む、請求項98に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記HLA拘束性ペプチドが、約5〜15アミノ酸長である、請求項97〜99のいずれか一項に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記HLA拘束性ペプチドが、約8〜12アミノ酸長である、請求項97〜100のいずれか一項に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記ABPが、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項97〜101のいずれか一項に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記HLAサブタイプと前記拘束性ペプチドとの会合により、前記HLAサブタイプのβ2−ミクログロビンサブユニットと前記HLAサブタイプのα−サブユニットとの、共有結合によらない会合が安定する、請求項97〜102のいずれか一項に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記HLAサブタイプの前記β2−ミクログロビンサブユニットと前記HLAサブタイプの前記α−サブユニットとの前記安定した会合が、条件付きペプチド交換により示される、請求項103に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 親和性標識をさらに含む、前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記親和性標識がビオチン標識である、請求項105に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 検出可能な標識と複合体化している、前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記検出可能な標識が、β2−ミクログロビン結合分子を含む、請求項107に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記β2−ミクログロビン結合分子が、標識抗体である、請求項108に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 前記標識抗体が、蛍光色素標識抗体である、請求項109に記載の単離されたHLA−ペプチド標的。
- 固体支持体に付着した前記請求項のいずれか一項に記載のHLA−ペプチド標的を含む、組成物。
- 前記固体支持体が、ビーズ、ウェル、膜、チューブ、カラム、プレート、セファロース、磁気ビーズ、またはチップを含む、請求項111に記載の組成物。
- 前記HLA−ペプチド標的が、親和性結合対の第1の成員を含み、前記固体支持体が、前記親和性結合対の第2の成員を含む、請求項111または112に記載の組成物。
- 前記第1の成員がストレプトアビジンであり、前記第2の成員がビオチンである、請求項113に記載の組成物。
- a.表Aに記載されているHLAサブタイプの、単離および精製されたα−サブユニットと、
a.前記HLAサブタイプの、単離および精製されたβ2−ミクログロビンサブユニットと、
b.表Aに記載されている、単離および精製された拘束性ペプチドと、
c.反応緩衝剤と
を含む、反応混合物。 - a.前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたHLA−ペプチド標的と、
b.ヒト対象から単離された複数のT細胞と
を含む、反応混合物。 - 前記T細胞がCD8+T細胞である、請求項116に記載の反応混合物。
- プロモーターに作動可能に連結した、請求項97または98に定義のHLA拘束性ペプチドをコードする第1の核酸配列と、
請求項97または98に定義のHLAサブタイプをコードする第2の核酸配列と
を含む、単離されたポリヌクレオチドであって、
前記第2の核酸が、前記第1の核酸配列と同じまたは異なるプロモーターに作動可能に連結し、
前記コードされたペプチドおよびコードされたHLAサブタイプが、請求項97または98に定義のHLA/ペプチド複合体を形成する、
単離されたポリヌクレオチド。 - プロモーターに作動可能に連結した、請求項97または98に定義のHLA拘束性ペプチドをコードする第1の核酸配列を含む第1の構築物と、
安定なHLA−ペプチド複合体の発現における使用のための説明書と
を含む、請求項に記載の安定なHLA−ペプチド標的を発現させるためのキット。 - 前記第1の構築物が、請求項97または98に定義のHLAサブタイプをコードする第2の核酸配列をさらに含む、請求項119に記載のキット。
- 前記第2の核酸配列が、同じまたは異なるプロモーターに作動可能に連結する、請求項120に記載のキット。
- 請求項97または98に定義のHLAサブタイプをコードする第2の核酸配列を含む第2の構築物をさらに含む、請求項119に記載のキット。
- 前記第1および第2の構築物の一方または両方が、レンチウイルスベクター構築物である、請求項119〜122のいずれか一項に記載のキット。
- 請求項97または98に記載の異種HLA−ペプチド標的を含む、宿主細胞。
- 表Aに記載のHLA拘束性ペプチドをコードするポリヌクレオチド、例えば、請求項97または98に記載のHLA拘束性ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、宿主細胞。
- 内因性MHCを含まない、請求項125に記載の宿主細胞。
- 外因性HLAを含む、請求項126に記載の宿主細胞。
- K562細胞である、請求項127に記載の宿主細胞。
- a.請求項128に記載の宿主細胞と、
b.表Aに記載の拘束性ペプチドを含む細胞培養培地と
を含む、細胞培養システム。 - 腫瘍細胞株由来の培養細胞である、請求項124に記載の宿主細胞。
- 前記腫瘍細胞株が、HCC−1599、NCI−H510A、A375、LN229、NCI−H358、ZR−75−1、MS751、OE19、MOR、BV173、MCF−7、NCI−H82、およびNCI−H146からなる群から選択される、請求項130に記載の宿主細胞。
- 前記抗原結合タンパク質が、前記HLAクラスI分子との接触点および前記HLA−ペプチド標的の前記HLA拘束性ペプチドとの接触点を通して、前記HLA−ペプチド標的に結合する、前記請求項のいずれか一項に記載のABP。
- 医薬として使用するための前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- がんの治療に使用するためのものであり、任意選択で、前記がんが、前記HLA−ペプチド標的を発現するかまたは発現すると予測される、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 固形腫瘍および血液系腫瘍から選択されるがんの治療に使用するための前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
- 前記請求項のいずれか一項に記載のABPの保存的に修飾された変異体である、ABP。
- 前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質と結合について競合する、抗原結合タンパク質(ABP)。
- 前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質が結合するものと同じHLA−ペプチドエピトープに結合する、抗原結合タンパク質(ABP)。
- 前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を含む受容体を発現する、操作された細胞。
- T細胞、任意選択で細胞傷害性T細胞(CTL)である、請求項139に記載の操作された細胞。
- 前記抗原結合タンパク質が、異種プロモーターから発現される、請求項139または140に記載の操作された細胞。
- 前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質またはその抗原結合部分をコードする、単離されたポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドのセット。
- 前記請求項のいずれか一項に記載のHLA/ペプチド標的をコードする、単離されたポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドのセット。
- 請求項142または143に記載のポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドのセットを含む、ベクターまたはベクターのセット。
- 任意選択でCHOもしくはHEK293であるか、または任意選択でT細胞である、前記請求項のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチドのセットまたは請求項144に記載のベクターもしくはベクターのセットを含む宿主細胞。
- 請求項145に記載の宿主細胞を用いて前記抗原結合タンパク質を発現させることと、
前記発現した抗原結合タンパク質を単離することと
を含む、抗原結合タンパク質を産生させる方法。 - 前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質と、薬学的に許容される賦形剤と、を含む、医薬組成物。
- 対象におけるがんを治療する方法であって、有効量の前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質または請求項147に記載の医薬組成物を前記対象に投与することを含み、任意選択で、前記がんが固形腫瘍および血液系腫瘍から選択される、方法。
- 前記がんが、前記HLA−ペプチド標的を発現するかまたは発現すると予測される、請求項148に記載の方法。
- 前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質または請求項147に記載の医薬組成物と、
使用説明書と
を含む、キット。 - 請求項97に記載の少なくとも1つのHLA−ペプチド標的と、
アジュバントと
を含む、組成物。 - 請求項97に記載の少なくとも1つのHLA−ペプチド標的と、
薬学的に許容される賦形剤と
を含む、組成物。 - 表Aに開示の少なくとも1つのHLA−ペプチド標的のポリペプチドを含むアミノ酸配列を含む組成物であって、任意選択で、前記アミノ酸配列が、前記ポリペプチドから本質的になるかまたはそれからなる、組成物。
- 前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドのセットを含む、ウイルス。
- 繊維状ファージである、請求項154に記載のウイルス。
- 前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドのセットを含む、酵母細胞。
- 表Aに列挙された少なくとも1つのHLA−ペプチド標的を提供することと、
前記少なくとも1つの標的を前記抗原結合タンパク質と結合させ、それにより前記抗原結合タンパク質を同定することと
を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を同定する方法。 - 前記抗原結合タンパク質が、複数の別個の抗原結合タンパク質を含むファージディスプレイライブラリーに存在する、請求項157に記載の方法。
- 前記ファージディスプレイライブラリーが、前記HLA−ペプチド標的のHLAに非特異的に結合する抗原結合タンパク質を実質的に含まない、請求項158に記載の方法。
- 前記抗原結合タンパク質が、複数の別個のTCRまたはその抗原結合断片を含むTCRライブラリーに存在する、請求項157に記載の方法。
- 前記結合ステップが、1回超、任意選択で少なくとも3回実行される、請求項157〜160のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗原結合タンパク質が前記HLA−ペプチド標的に選択的に結合するかどうかを決定するために、前記抗原結合タンパク質を前記HLA−ペプチド標的とは異なる1つ以上のペプチド−HLA複合体と接触させることをさらに含み、
任意選択で、可溶性標的HLA−ペプチド複合体への前記抗原結合タンパク質の結合親和性を、標的複合体とは異なる可溶性HLA−ペプチド複合体への結合親和性に対して測定することにより、選択性が決定され、
任意選択で、1つ以上の細胞の表面で発現される標的HLA−ペプチド複合体への前記抗原結合タンパク質の結合親和性を、1つ以上の細胞の表面で発現される標的複合体とは異なるHLA−ペプチド複合体に対して測定することにより、選択性が決定される、
請求項157〜161のいずれか一項に記載の方法。 - 表Aに列挙された少なくとも1つのHLA−ペプチド標的を得ることと、
前記HLA−ペプチド標的を、任意選択でアジュバントと組み合わせて、対象に投与することと、
前記抗原結合タンパク質を前記対象から単離することと
を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を同定する方法。 - 前記抗原結合タンパク質を単離することが、前記抗原結合タンパク質を同定するために、前記対象の血清をスクリーニングすることを含む、請求項163に記載の方法。
- 前記抗原結合タンパク質が前記HLA−ペプチド標的に選択的に結合するかどうかを決定するために、前記抗原結合タンパク質を前記HLA−ペプチド標的とは異なる1つ以上のペプチド−HLA複合体と接触させることをさらに含み、
任意選択で、可溶性標的HLA−ペプチド複合体への前記抗原結合タンパク質の結合親和性を、標的複合体とは異なる可溶性HLA−ペプチド複合体への結合親和性に対して測定することにより、選択性が決定され、
任意選択で、1つ以上の細胞の表面で発現される標的HLA−ペプチド複合体への前記抗原結合タンパク質の結合親和性を、1つ以上の細胞の表面で発現される標的複合体とは異なるHLA−ペプチド複合体に対して測定することにより、選択性が決定される、
請求項163に記載の方法。 - 前記対象が、マウス、ウサギ、またはラマである、請求項163に記載の方法。
- 前記抗原結合タンパク質を単離することが、前記抗原結合タンパク質を発現する前記対象からB細胞を単離することと、任意選択で、前記単離されたB細胞から前記抗原結合タンパク質をコードする配列を直接クローニングすることと、を含む、請求項163に記載の方法。
- 前記B細胞を使用してハイブリドーマを創出することをさらに含む、請求項167に記載の方法。
- 前記B細胞からCDRをクローニングすることをさらに含む、請求項167に記載の方法。
- 任意選択でEBV形質転換を介して、前記B細胞を不死化することをさらに含む、請求項167に記載の方法。
- 前記B細胞の前記抗原結合タンパク質を含むライブラリーを創出することをさらに含み、任意選択で、前記ライブラリーがファージディスプレイまたは酵母ディスプレイである、請求項167に記載の方法。
- 前記抗原結合タンパク質をヒト化することをさらに含む、請求項163に記載の方法。
- 前記抗原結合タンパク質を含む細胞を得ることと、
表Aに列挙された少なくとも1つのHLA−ペプチド標的を含むHLA多量体と前記細胞を接触させることと、
前記HLA多量体と前記抗原結合タンパク質との間の結合を介して前記抗原結合タンパク質を同定することと
を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を同定する方法。 - 前記抗原結合タンパク質を含む1つ以上の細胞を得ることと、
天然または人工の抗原提示細胞(APC)上に提示された、表Aに列挙された少なくとも1つのHLA−ペプチド標的を用いて、前記1つ以上の細胞を活性化することと、
表Aに列挙された少なくとも1つのHLA−ペプチド標的との相互作用により活性化された1つ以上の細胞の選択を介して、前記抗原結合タンパク質を同定することと
を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を同定する方法。 - 前記細胞が、T細胞、任意選択でCTLである、請求項173または174に記載の方法。
- フローサイトメトリー、磁気分離、または単一細胞分離を任意選択で使用して、前記細胞を単離することをさらに含む、請求項173または174に記載の方法。
- 前記抗原結合タンパク質を配列決定することをさらに含む、請求項176に記載の方法。
- 表Aに列挙された少なくとも1つのHLA−ペプチド標的を提供することと、
前記標的を使用して前記抗原結合タンパク質を同定することと
を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を同定する方法。
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