JP2020500007A - ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合する抗体およびその使用 - Google Patents

ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合する抗体およびその使用 Download PDF

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Abstract

ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合する単離されたモノクローナル抗体ならびに関連の抗体ベースの組成物および分子が開示される。抗体を使用する治療および診断方法も開示される。上記抗体は、ジカウイルス表面の構造的分析および結合性ネットワークによって評価される、より有利な接触に寄与したCDRおよび/またはフレームワーク領域における突然変異を同定して得られ得る。得られた抗体は、対象におけるジカウイルス感染を処置および予防すること、ならびに妊娠した対象における垂直感染および胎児死亡率を予防し得る。

Description

関連出願
本出願は、2016年10月13日に出願された米国仮出願番号第62/408,020号の優先日の利益を主張している。この仮出願の内容は、その全体が参考として本明細書によって援用される。
背景
ジカウイルス(ZIKV)は、Aedes aegypti蚊によって伝播される媒介動物媒介性のアルボウイルスである。ZIKV感染は、典型的には、発熱、発疹、関節痛、および/または結膜炎を含む軽度の症状を引き起こす。しかし、最近の研究は、成人における感染とギラン・バレー症候群との間の関連と共に、新生児における感染と小頭症との間の関連を示している。ZIKVに対する承認されたワクチンまたは療法がないことから、有効な対抗手段への緊急的な必要性がある。
ZIKVのウイルス、構造、または生物学については、ほとんど知られていない。ZIKVは、デング(DV)、ウエストナイル、日本脳炎、ダニ媒介脳炎(Tick-born Encephalitis)、および黄熱病ウイルスを含むFlaviviridaeウイルス科のメンバーである。フラビウイルスのエンベロープ(E)タンパク質は、宿主細胞侵入および免疫回避を媒介する。Eタンパク質は、3つの構造的および機能的ドメインからなる。Eタンパク質ドメインIII(E−DIII)に対する抗体は、DVに感染した動物モデルにおいて予防効果および治療効果を示している(Robinson, L.ら、Cell 162巻:493〜504頁、2015年)。それゆえに、ZIKVエンベロープタンパク質に対する抗体ベースの薬剤が、ヒトにおけるZIKVの大発生と戦うための有望な選択肢となる。
Robinson, L.ら、Cell 162巻:493〜504頁、2015年
要旨
本発明の開示は、ジカウイルスエンベロープタンパク質(EP)に対する抗体に関する。残基原子間相互作用ネットワーク(またはSIN)によってガイドされるジカウイルス表面の体系的分析は、構造的に制約されているとして、融合ループエピトープ近位(FLEP)領域の同定をもたらした。構造ベースの計算的アプローチは、FLEP領域と相互作用する可能性を有する有望な足場のセットに至った。これに従い、抗TDRD3(Tudorドメイン含有3)抗体を、FLEP領域と相互作用するその能力に起因して調査した。抗原−抗体境界面の相互作用するアミノ酸対間の残基間原子相互作用を計算するための枠組みを利用し、相互作用を、2Dグラフ形式でレンダリングして、結合性ネットワークを分析した。構造的分析および結合性ネットワークによって評価される、より有利な接触に寄与したCDRおよび/またはフレームワーク領域における突然変異を同定し、新たなまたは改善された接触を潜在的に媒介する様々なアミノ酸残基を分析して、ジカウイルスEPへの結合を生じるCDRおよび/またはフレームワーク突然変異を同定した。同定された抗体は、対象におけるジカウイルス感染を処置および予防すること、ならびに妊娠した対象における垂直感染および胎児死亡率を予防することが見出された。
それゆえに、本発明の開示は、ジカウイルスEPに結合する抗体に関する。これらの抗体を用いてジカウイルスを処置するための宿主細胞および方法も本明細書で提供される。
一部の態様では、ジカウイルスエンベロープタンパク質に特異的に結合する単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、重鎖CDRおよび軽鎖CDRを含み、
(i)重鎖CDR1はGFXFSTYを含み、式中、Xは、存在してもしなくてもよく、存在する場合には極性アミノ酸残基であり;
(ii)重鎖CDR2はXGEGDSを含み、式中、Xは極性アミノ酸残基であり;
(iii)重鎖CDR3はGYXNFYYYYTMDXを含み、式中、Xは極性アミノ酸残基であり、Xは非極性アミノ酸残基であり;
(iv)軽鎖CDR1はRAXQSIXTFLAを含み、式中、Xは極性アミノ酸残基であり、Xは、極性アミノ酸残基または疎水性アミノ酸残基であり;
(v)軽鎖CDR2はDASTXAXを含み、式中、XおよびXは極性アミノ酸であり;
(vi)軽鎖CDR3はQQRYNWPPYXを含み、式中、Xは極性アミノ酸である。
他の態様では、重鎖CDRおよび軽鎖CDRを含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、
(i)重鎖CDR1がGFXFSTYを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され;
(ii)重鎖CDR2がXGEGDSを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され;
(iii)重鎖CDR3がGYXNFYYYYTMDXを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され、Xは、AおよびVから選択され;
(iv)軽鎖CDR1がRAXQSIXTFLAを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され、Xは、SおよびVから選択され;
(v)軽鎖CDR2がDASTXAXを含み、式中、Xは、RおよびNから選択され、Xは、SおよびTから選択され;
(vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYXを含み、式中、Xは、SおよびTから選択される、
単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分が本明細書で提供される。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFXFSTYを含む重鎖CDR1であって、式中、Xは存在しない、重鎖CDR1;
(ii)XGEGDSを含む重鎖CDR2であって、式中、Xは、SおよびTから選択される、重鎖CDR2;
(iii)GYXNFYYYYTMDXを含む重鎖CDR3であって、式中、Xは、SおよびTから選択され、Xは、AおよびVから選択される、重鎖CDR3;
(iv)RAXQSIXTFLAを含む軽鎖CDR1であって、式中、Xは、SおよびTから選択され、Xは、SおよびVから選択される、軽鎖CDR1;
(v)DASTXAXを含む軽鎖CDR2であって、式中、Xは、RおよびNから選択され、Xは、SおよびTから選択される、軽鎖CDR2;および
(vi)QQRYNWPPYXを含む軽鎖CDR3であって、式中、Xは、SおよびTから選択される、軽鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFSFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)SGEGDSを含む重鎖CDR2;および
(iii)GYSNFYYYYTMDAを含む重鎖CDR3
を含む。
他の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFSFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)TGEGDSを含む重鎖CDR2;および
(iii)GYSNFYYYYTMDAを含む重鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFTFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)TGEGDSを含む重鎖CDR2;および
(iii)GYSNFYYYYTMDVを含む重鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)TGEGDSを含む重鎖CDR2;および
(iii)GYTNFYYYYTMDAを含む重鎖CDR3
を含む。
他の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFSFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)TGEGDSを含む重鎖CDR2;および
(iii)GYTNFYYYYTMDAを含む重鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(iv)RATQSISTFLAを含む軽鎖CDR1;
(v)DASTRASを含む軽鎖CDR2;および
(vi)QQRYNWPPYSを含む軽鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(iv)RASQSISTFLAを含む軽鎖CDR1;
(v)DASTRATを含む軽鎖CDR2;および
(vi)QQRYNWPPYTを含む軽鎖CDR3
を含む。
他の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(iv)RATQSIVTFLAを含む軽鎖CDR1;
(v)DASTNASを含む軽鎖CDR2;および
(vi)QQRYNWPPYSを含む軽鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFSFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)SGEGDSを含む重鎖CDR2;
(iii)GYSNFYYYYTMDAを含む重鎖CDR3;
(iv)RATQSISTFLAを含む軽鎖CDR1;
(v)DASTRASを含む軽鎖CDR2;および
(vi)QQRYNWPPYSを含む軽鎖CDR3
を含む。
他の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFSFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)SGEGDSを含む重鎖CDR2;
(iii)GYSNFYYYYTMDAを含む重鎖CDR3;
(iv)RATQSIVTFLAを含む軽鎖CDR1;
(v)DASTNASを含む軽鎖CDR2;および
(vi)QQRYNWPPYSを含む軽鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFSFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)TGEGDSを含む重鎖CDR2;
(iii)GYSNFYYYYTMDAを含む重鎖CDR3;
(iv)RATQSISTFLAを含む軽鎖CDR1;
(v)DASTRASを含む軽鎖CDR2;および
(vi)QQRYNWPPYSを含む軽鎖CDR3
を含む。
他の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)GFTFSTYを含む重鎖CDR1;
(ii)TGEGDSを含む重鎖CDR2;
(iii)GYSNFYYYYTMDVを含む重鎖CDR3;
(iv)RASQSISTFLAを含む軽鎖CDR1;
(v)DASTRATを含む軽鎖CDR2;および
(vi)QQRYNWPPYTを含む軽鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、本開示は、配列番号4に記載の重鎖可変領域を含む、ジカウイルスエンベロープタンパク質に特異的に結合する単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、
(i)重鎖CDR1が、N28におけるアミノ酸置換または欠失、およびL29、S31、S32におけるアミノ酸置換を含み;
(ii)重鎖CDR2が、S52、S52A、S53、Y54、G55におけるアミノ酸置換を含み;
(iii)重鎖CDR3が、S99におけるアミノ酸欠失、ならびにK100、K100A、P100B、Y100C、F100D、S100E、G100F、W100G、A100H、およびY102におけるアミノ酸置換を含み;
重鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、R94、ならびにCDR3残基T95、V96、およびR97、ならびにそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸欠失を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分を提供する。一部の態様では、重鎖可変領域は、Chothiaによる番号付けで、V5、Y33、A49、S50、T57、A71、T73、A78、S82B、L82C、A93、L108およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む。一部の態様では、重鎖可変領域は、Chothiaによる番号付けで、T68におけるアミノ酸置換をさらに含む。一部の態様では、重鎖可変領域は、Chothiaによる番号付けで、A23、W47、Y58、L80、Q81、A84、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む。一部の態様では、重鎖可変領域は、Chothiaによる番号付けで、E1、A23、R38、W47、Y58、L80、Q81、A84、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む。一部の態様では、重鎖可変領域は、Chothiaによる番号付けで、E1、A23、R38、W47、Y58、T68、L80、Q81、A84、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む。
上述の態様のいずれかでは、配列番号4に記載の重鎖可変領域を含む、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)N28SまたはN28T、L29F、S31T、S32Yを含む重鎖CDR1;
(ii)S52T、S52AG、S53E、Y54G、G55Dを含む重鎖CDR2;
(iii)K100Y、K100ASまたはK100AT、P100BN、Y100CF、F100DY、S100EY、G100FY、W100GY、A100HT、およびY102AまたはY102Vを含む重鎖CDR3
を含む。
一部の態様では、重鎖可変領域は、Chothiaによる番号付けで、R94、ならびにCDR3残基T95、V96、およびR97におけるアミノ酸欠失を含む。
上述の態様のいずれかでは、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、配列番号5に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含み、
(i)軽鎖CDR1は、S26、V29、S31、A32、およびV33におけるアミノ酸置換を含み;
(ii)軽鎖CDR2は、S50、S53、L54、Y55および任意選択でS56におけるアミノ酸置換を含み;
(iii)軽鎖CDR3は、H91、P93、F94、Y95、L95B、F96、およびT97におけるアミノ酸置換、ならびにG92におけるアミノ酸欠失を含む。
上述の態様のいずれかでは、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(i)S26T、V29I、S31V、A32F、およびV33Lを含む軽鎖CDR1;
(ii)S50D、S53T、L54RまたはL54N、Y55A、および任意選択でS56Tを含む軽鎖CDR2;ならびに
(ii)H91R、P93Y、F94N、Y95W、L95BP、F96Y、およびT97Sにおけるアミノ酸置換を含む軽鎖CDR3
を含む。
上述の態様のいずれかでは、軽鎖可変領域は、Chothiaによる番号付けで、D1、Q3、M4、S9、A13、V15、D17、V19、I21、Y22、Q38、K42、K45、S60、Q79、T85、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む。一部の態様では、軽鎖可変領域は、Chothiaによる番号付けで、S10、V58、S76、S77、V104、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む。
一部の態様では、本開示は、ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合し、重鎖および軽鎖可変領域を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、重鎖および軽鎖アミノ酸配列が、
(a)それぞれ配列番号4および14;
(b)それぞれ配列番号4および15;
(c)それぞれ配列番号9および16;
(d)それぞれ配列番号4および16;
(e)それぞれ配列番号4および17;
(f)それぞれ配列番号8および14;
(g)それぞれ配列番号7および17;
(h)それぞれ配列番号6および15;
(i)それぞれ配列番号6および5;
(j)それぞれ配列番号7および5;
(k)それぞれ配列番号8および5;
(l)それぞれ配列番号9および5;
(m)それぞれ配列番号10および5;
(n)それぞれ配列番号11および5;
(o)それぞれ配列番号6および14;
(p)それぞれ配列番号6および16;
(q)それぞれ配列番号6および17;
(r)それぞれ配列番号7および14;
(s)それぞれ配列番号7および15;
(t)それぞれ配列番号7および16;
(u)それぞれ配列番号8および15;
(v)それぞれ配列番号8および16;
(w)それぞれ配列番号8および17;
(x)それぞれ配列番号9および14;
(y)それぞれ配列番号9および15;
(z)それぞれ配列番号9および17;
(aa)それぞれ配列番号10および14;
(bb)それぞれ配列番号10および15;
(cc)それぞれ配列番号10および16;
(dd)それぞれ配列番号10および17;
(ee)それぞれ配列番号11および14;
(ff)それぞれ配列番号11および15;
(gg)それぞれ配列番号11および16;ならびに
(hh)それぞれ配列番号11および17
からなる群から選択される、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分を提供する。
他の態様では、本開示は、ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合する単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、
(a)それぞれ配列番号20、26および31に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(b)それぞれ配列番号22、28および33に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(c)それぞれ配列番号20、26および31に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(d)それぞれ配列番号20、26および31に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(e)それぞれ配列番号21、28および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(f)それぞれ配列番号21、27および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(g)それぞれ配列番号21、27および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(h)それぞれ配列番号21、27および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(i)それぞれ配列番号21、28および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(j)それぞれ配列番号22、28および33に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(k)それぞれ配列番号23、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(l)それぞれ配列番号21、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(m)それぞれ配列番号21、27および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(n)それぞれ配列番号21、28および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(o)それぞれ配列番号21、28および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(p)それぞれ配列番号22、28および33に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(q)それぞれ配列番号22、28および33に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(r)それぞれ配列番号23、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(s)それぞれ配列番号23、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(t)それぞれ配列番号23、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(u)それぞれ配列番号21、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
(v)それぞれ配列番号21、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;ならびに
(w)それぞれ配列番号21、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列
からなる群から選択される重鎖CDRおよび軽鎖CDRを含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分を提供する。
一部の態様では、本開示は、ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合し、重鎖および軽鎖可変領域を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、重鎖可変領域が、配列番号4、6、7、8、9、10および11からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含み;軽鎖可変領域が、配列番号5、14、15、16、および17からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含み、ただし、モノクローナル抗体は、配列番号4および5を含まない、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分を提供する。
一部の態様では、本明細書に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分は、
(a)それぞれ配列番号4および14;
(b)それぞれ配列番号4および15;
(c)それぞれ配列番号9および16;
(d)それぞれ配列番号4および16;
(e)それぞれ配列番号4および17;
(f)それぞれ配列番号8および14;
(g)それぞれ配列番号7および17;
(h)それぞれ配列番号6および15;
(i)それぞれ配列番号6および5;
(j)それぞれ配列番号7および5;
(k)それぞれ配列番号8および5;
(l)それぞれ配列番号9および5;
(m)それぞれ配列番号10および5;
(n)それぞれ配列番号11および5;
(o)それぞれ配列番号6および14;
(p)それぞれ配列番号6および16;
(q)それぞれ配列番号6および17;
(r)それぞれ配列番号7および14;
(s)それぞれ配列番号7および15;
(t)それぞれ配列番号7および16;
(u)それぞれ配列番号8および15;
(v)それぞれ配列番号8および16;
(w)それぞれ配列番号8および17;
(x)それぞれ配列番号9および14;
(y)それぞれ配列番号9および15;
(z)それぞれ配列番号9および17;
(aa)それぞれ配列番号10および14;
(bb)それぞれ配列番号10および15;
(cc)それぞれ配列番号10および16;
(dd)それぞれ配列番号10および17;
(ee)それぞれ配列番号11および14;
(ff)それぞれ配列番号11および15;
(gg)それぞれ配列番号11および16;ならびに
(hh)それぞれ配列番号11および17
からなる群から選択される重鎖および軽鎖アミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有する重鎖および軽鎖配列を含む。
本開示の一部の態様は、抗体がヒト化抗体である、前記単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分のいずれかに関する。
本開示の他の態様は、抗体がジカウイルスに対する中和活性を有する、前記単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分のいずれかに関する。
本開示の一部の態様は、抗体が、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgE抗体からなる群から選択される、前記単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分のいずれかに関する。本開示の一部の態様では、前記単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分のいずれかは、IgG1抗体である。
本開示の他の態様は、前記単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物に関する。
本開示の別の態様は、それを必要とする対象におけるジカウイルス感染を処置するための方法であって、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。
本開示の別の態様は、対象におけるジカウイルス感染を予防するための方法であって、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。
他の態様では、本開示は、妊娠した対象における胎児への垂直感染を処置または予防するための方法であって、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。一部の態様では、本開示は、妊娠した対象における胎児への垂直感染を低減するまたはそのリスクを低減するための方法であって、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。
別の態様では、本開示は、胎児ジカウイルス感染を処置または予防するための方法であって、それを必要とする妊娠した対象に、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。一部の態様では、本開示は、胎児ジカウイルス感染を低減するまたはそのリスクを低減するための方法であって、妊娠した対象に、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。
本開示の別の態様は、妊娠した対象における胎児死亡率を処置または予防するための方法であって、対象に、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。一部の態様では、本開示は、妊娠した対象における胎児死亡率を低減するまたはそのリスクを低減するための方法であって、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。
他の態様では、本開示は、胎盤ジカウイルス感染を処置または予防するための方法であって、それを必要とする妊娠した対象に、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。一部の態様では、本開示は、胎盤ジカウイルス感染を低減するまたはそのリスクを低減するための方法であって、妊娠した対象に、有効量の、前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、または前記単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分のいずれか、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法に関する。
前述の方法のいずれかでは、妊娠した対象は、ジカウイルスに感染している。一部の態様では、妊娠した対象は、ジカウイルスに感染するリスクがある。
本開示の一部の態様は、前記単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分のいずれかの軽鎖、重鎖、または軽鎖および重鎖の両方をコードするヌクレオチド配列を含む核酸に関する。一部の態様では、本開示は、核酸を含む発現ベクターに関する。さらなる態様では、本開示は、発現ベクターで形質転換した細胞に関する。
図1Aは、抗TDRD3抗体の重鎖配列(上)および生成された抗ジカ抗体の重鎖配列(下)を示す。改変は太字と下線で示される。
図1Bは、抗TDRD3抗体の軽鎖配列(上)および生成された抗ジカ抗体の軽鎖配列(下)を示す。改変は太字と下線で示される。
図2は、サンドイッチELISAによって測定した、異なる株のジカウイルスへの抗ジカ抗体の結合データを示す。 図2は、サンドイッチELISAによって測定した、異なる株のジカウイルスへの抗ジカ抗体の結合データを示す。
図3Aおよび3Bは、ジカウイルスILM株(Brazil Paraiba 2015年)(3A)またはH/PF/2013株(3B)を使用するプラーク減少中和試験において決定した、抗ジカ抗体によるパーセント中和を示すグラフである。
図4A〜4Dは、抗ジカ抗体で予防的(4Aおよび4C)または治療的(4Bおよび4D)のいずれかで処置した、ジカウイルス感染(H/PF/2013株)を有するマウスにおける長期にわたる体重(4Aおよび4B)および長期にわたる生存(4Cおよび4D)を示すグラフである。
図5は、抗ジカ抗体で予防的(上)または治療的(下)のいずれかで処置した、ジカウイルス感染(H/PF/2013株)を有するマウスにおける長期にわたるウイルス負荷を示すグラフである。
図6Aは、ジカウイルス感染(H/PF/2013株)の1日後に投与した様々な用量のmAb8で処置したマウスの長期にわたる体重をグラムで示す折れ線グラフである。図6Bは、ジカウイルス感染(H/PF/2013株)の1日後に投与した様々な用量のmAb8で処置したマウスにおける長期にわたるウイルス負荷を示す折れ線グラフである。図6Cは、ジカウイルス感染(H/PF/2013株)の1日後に投与した様々な用量のmAb8で処置したマウスの生存を示すカプラン・マイヤーグラフである。
図7Aは、ジカウイルス(H/PF/2013株)に感染したTHP−1細胞における様々な抗体の抗体依存性感染増強活性を示すグラフである。異なる濃度の抗体によるオプソニン化から生じるプラークタイターが示される。図7Bは、示された様々な抗体から生じるピーク感染増強タイター(観察された最大の感染増強の点におけるウイルスタイター)の比較を提供する。<0.05(ノンパラメトリック、両側スチューデントT検定)。
図8Aは、ジカウイルス(H/PF/2013株)に感染した妊娠したA129マウスにおける垂直感染および胎児死亡率を評価するための研究設計を提供する模式図である。
図8B〜8Fは、図8Aに記載される研究の結果を示すグラフを提供する。具体的には、2日目(8B)または7日目(8C)での母親におけるウイルスRNAのレベル、パーセント致死率によって測定したパーセント胎児生存(8D)、ならびにアイソタイプ対照IgGまたはmAb8で処置したマウス由来の胎児(8E)または胎盤(8F)におけるウイルスRNAが示される。
図8B〜8Fは、図8Aに記載される研究の結果を示すグラフを提供する。具体的には、2日目(8B)または7日目(8C)での母親におけるウイルスRNAのレベル、パーセント致死率によって測定したパーセント胎児生存(8D)、ならびにアイソタイプ対照IgGまたはmAb8で処置したマウス由来の胎児(8E)または胎盤(8F)におけるウイルスRNAが示される。
図8B〜8Fは、図8Aに記載される研究の結果を示すグラフを提供する。具体的には、2日目(8B)または7日目(8C)での母親におけるウイルスRNAのレベル、パーセント致死率によって測定したパーセント胎児生存(8D)、ならびにアイソタイプ対照IgGまたはmAb8で処置したマウス由来の胎児(8E)または胎盤(8F)におけるウイルスRNAが示される。
定義
特許請求の範囲および明細書で使用される用語は、特に他の規定がない限り、以下に記載された通りに定義される。
用語「ジカウイルス」は、Flaviviridae科のメンバーを指し、発熱、発疹、関節痛または結膜炎を含む軽度の症状と通常関連するが、母子感染による新生児における小頭症、およびギラン・バレー症候群と最近関連付けられている。ジカウイルスのゲノムは、およそ11kb長のプラス鎖RNAの一本鎖からなる。ジカビリオンは、他のフラビウイルスのビリオンと同様、ウイルス粒子中に取り込まれる3つの構造タンパク質を含む、10個の機能的に別個のタンパク質を含有する。
用語「ジカウイルスエンベロープタンパク質(「E」または「EP」)」は、ウイルス侵入およびビリオン出芽を担うタンパク質を指す。これは、3つの別個のドメインから構成される。EドメインI(E−DI)は、Eタンパク質構造全体を組織化する中心的ドメインである。EドメインII(E−DII)は、E−DIから突出する2つの伸長したループから形成され、E−DIおよびEドメインIII(E−DIII)におけるポケット中にある。E−DIIIは、他の点では平滑な球状成熟ウイルス粒子の表面上に小さい突出を形成する免疫グロブリン様ドメインであり、標的細胞上の細胞受容体と相互作用すると考えられている。E−DIIの遠位端は、「融合ループ」と呼ばれる、グリシンリッチな疎水性配列である。融合ループは、残基98〜110を包含し、フラビウイルス間で高度に保存されている。ある特定の実施形態では、「ジカウイルスエンベロープタンパク質」は、融合ループを指す。ある特定の実施形態では、融合ループは、配列番号3に記載のアミノ酸配列を有する。
用語「抗体」は、本明細書で言及される場合、抗体全体およびあらゆる抗原結合性断片(すなわち、「抗原結合性部分」)またはそれらの単鎖を含む。「抗体」は、ある特定の実施形態では、ジスルフィド結合によって相互連結された少なくとも2つの重(H)鎖および2つの軽(L)鎖を含む糖タンパク質、またはその抗原結合性部分を指す。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細書ではVと略記される)および重鎖定常領域で構成される。重鎖定常領域は、3つのドメイン、CH1、CH2およびCH3で構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細書ではVと略記される)および軽鎖定常領域で構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメイン、CLで構成される。VおよびV領域は、フレームワーク領域(FR)と呼ばれるより高度に保存された領域中に散在する相補性決定領域(CDR)と呼ばれる超可変性を有する領域にさらに細かく分類できる。各VおよびVは、アミノ末端からカルボキシ末端に向かって以下の順番:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4で配列される3つのCDRおよび4つのFRで構成される。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含有する。抗体の定常領域は、免疫系の様々な細胞(例えば、エフェクター細胞)および古典的な補体系の第1の要素(Clq)を含む宿主組織または因子への免疫グロブリンの結合を媒介することができる。
抗体の「抗原結合性部分」(または単に「抗体部分」)という用語は、本明細書で使用される場合、抗原(例えば、ジカウイルスEP)に特異的に結合する能力を保持する抗体の1つまたは複数の断片を指す。このような「断片」は、例えば約8から約1500アミノ酸長、好適には約8から約745アミノ酸長、好適には約8から約300、例えば約8から約200アミノ酸、または約10から約50または100アミノ酸長である。抗体の抗原結合機能は、全長抗体の断片により実行が可能であることが示されている。抗体の「抗原結合性部分」という用語に包含される結合断片の例としては、(i)Fab断片、V、V、CLおよびCH1ドメインからなる1価断片;(ii)F(ab’)断片、ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結された2つのFab断片を含む2価断片;(iii)VおよびCH1ドメインからなるFd断片;(iv)抗体の単一のアームのVおよびVドメインからなるFv断片、(v)VドメインからなるdAb断片(Wardら、(1989年)Nature 341巻:544〜546頁);ならびに(vi)単離された相補性決定領域(CDR)、または(vii)任意選択で合成リンカーで合体されていてもよい、2つまたはそれより多くの単離されたCDRの組合せが挙げられる。さらに、Fv断片の2つのドメイン、VおよびVが別々の遺伝子にコードされているにもかかわらず、これらは、VおよびV領域が対合して1価分子を形成する単一のタンパク質鎖(単鎖Fv(scFv)として公知;例えば、Birdら(1988年)Science 242巻:423〜426頁;およびHustonら(1988年)Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85巻:5879〜5883頁を参照)のようにすることが可能な合成リンカーによる組換え方法を使用して、合体させることができる。またこのような単鎖抗体は、抗体の「抗原結合性部分」という用語に包含されることも意図される。これらの抗体断片は、当業者に公知の従来技術を使用して得られ、断片は、それが無傷抗体である場合と同じ方式で、有用性に関してスクリーニングされる。抗原結合性部分は、組換えDNA技術によって、または無傷の免疫グロブリンの酵素的もしくは化学的切断によって産生することができる。
用語「モノクローナル抗体」は、本明細書で使用される場合、特定のエピトープに対する単一の結合特異性および親和性を提示する抗体を指す。したがって、用語「ヒトモノクローナル抗体」は、単一の結合特異性を提示し、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列由来の可変および任意選択の定常領域を有する抗体を指す。一実施形態では、ヒトモノクローナル抗体は、トランスジェニック非ヒト動物、例えば、不死化細胞に融合したヒト重鎖導入遺伝子および軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有するトランスジェニックマウスから得られたB細胞を含むハイブリドーマによって産生される。
用語「組換えヒト抗体」は、本明細書で使用される場合、組換え手段によって調製される、発現される、作製される、または単離される全てのヒト抗体を含み、例えば、(a)ヒト免疫グロブリン遺伝子またはそれから調製されたハイブリドーマに関してトランスジェニックであるかまたは染色体導入されている動物(例えば、マウス)から単離された抗体、(b)抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から、例えばトランスフェクトーマから単離された抗体、(c)組換えのコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体、および(d)ヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のDNA配列へのスプライシングを含む他のあらゆる手段によって調製された、発現された、作製された、または単離された抗体である。このような組換えヒト抗体は、生殖細胞系遺伝子によってコードされる特定のヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列を利用する可変および定常領域を含むが、それに続いて、例えば抗体成熟中に生じる再配列および突然変異を含む。当業界で公知のように(例えば、Lonberg(2005年)Nature Biotech. 23巻(9号):1117〜1125頁を参照)、可変領域は抗原結合性ドメインを含有し、これは、再配列されて外来抗原に特異的な抗体を形成する様々な遺伝子によってコードされる。再配列に加えて、可変領域は、外来抗原への抗体の親和性を増加させるための複数の単一のアミノ酸変化(体細胞変異または超突然変異と称される)によってさらに改変される可能性がある。定常領域は、抗原へのさらなる応答(すなわち、アイソタイプスイッチ)において変化すると予想される。それゆえに、抗原に応答して、再配列され体細胞突然変異した、軽鎖および重鎖免疫グロブリンポリペプチドをコードする核酸分子は、元の核酸分子と配列同一性を有さない可能性があるが、その代わりに実質的に同一または類似である(すなわち、少なくとも80%の同一性を有する)と予想される。
用語「ヒト抗体」は、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列の可変および定常領域(存在する場合)を有する抗体を含む。本開示のヒト抗体は、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列によってコードされていないアミノ酸残基(例えば、in vitroでのランダムもしくは部位特異的突然変異誘発またはin vivoでの体細胞変異によって導入された突然変異)を含んでいてもよい(Lonberg, N.ら(1994年)Nature 368巻(6474号):856〜859頁);Lonberg, N.(1994年)Handbook of Experimental Pharmacology 113巻:49〜101頁;Lonberg, N.およびHuszar, D.(1995年)Intern. Rev. Immunol. 13巻:65〜93頁、およびHarding, F.およびLonberg, N.(1995年)Ann. N.Y. Acad. Sci 764巻:536〜546頁を参照)。しかしながら、用語「ヒト抗体」は、別の哺乳動物種、例えばマウスの生殖細胞系由来のCDR配列がヒトフレームワーク配列にグラフト化されている抗体(すなわち、ヒト化抗体)を含まない。
「異種抗体」は、本明細書で使用される場合、このような抗体を産生するトランスジェニック非ヒト生物に関して定義される。この用語は、トランスジェニック非ヒト動物で構成されていない生物に見出されるものに相当し、全体的にトランスジェニック非ヒト動物のもの以外の種に由来するアミノ酸配列またはコード核酸配列を有する抗体を指す。
「中和抗体」は、本明細書で使用される場合、形成されたウイルス粒子を崩壊させること、またはウイルス粒子のフォーマット化を阻害すること、またはウイルス粒子による哺乳動物細胞への結合もしくは感染を予防することが可能な抗体、例えばモノクローナル抗体を指す。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ジカウイルスを中和する。
本明細書で使用される場合、「診断用抗体」または「検出抗体(detection antibody)」または「検出抗体(detecting antibody)」は、試料中の抗原性標的の存在を検出することが可能な抗体、例えばモノクローナル抗体を指す。当業者には認識されるように、このような診断用抗体は、好ましくはそれらの抗原性標的に高い特異性を有する。
用語「ヒト化免疫グロブリン」または「ヒト化抗体」は、少なくとも1つのヒト化免疫グロブリンまたは抗体鎖(すなわち、少なくとも1つのヒト化軽鎖または重鎖)を含む免疫グロブリンまたは抗体を指す。用語「ヒト化免疫グロブリン鎖」または「ヒト化抗体鎖」(すなわち、「ヒト化免疫グロブリン軽鎖」または「ヒト化免疫グロブリン重鎖」)は、実質的にヒト免疫グロブリンまたは抗体由来の可変フレームワーク領域、および実質的に非ヒト免疫グロブリンまたは抗体由来の相補性決定領域(CDR)(例えば、少なくとも1つのCDR、好ましくは2つのCDR、より好ましくは3つのCDR)を含み、定常領域(例えば、軽鎖の場合、少なくとも1つの定常領域またはその部分、重鎖の場合、好ましくは3つの定常領域)をさらに含む可変領域を有する、免疫グロブリンまたは抗体鎖(すなわち、それぞれ軽鎖または重鎖)を指す。用語「ヒト化可変領域」(例えば、「ヒト化軽鎖可変領域」または「ヒト化重鎖可変領域」)は、実質的にヒト免疫グロブリンまたは抗体由来の可変フレームワーク領域、および実質的に非ヒト免疫グロブリンまたは抗体由来の相補性決定領域(CDR)を含む可変領域を指す。
成句「実質的にヒト免疫グロブリンまたは抗体由来の」または「実質的にヒト」は、比較目的でヒト免疫グロブリンまたは抗体アミノ酸配列にアラインされる場合、領域が、ヒトフレームワークまたは定常領域配列と、少なくとも80〜90%、好ましくは少なくとも90〜95%、より好ましくは少なくとも95〜99%の同一性(すなわち、局所的な配列同一性)を有しており、例えば、保存的置換、コンセンサス配列置換、生殖細胞系置換、復帰突然変異などが許容されることを意味する。保存的置換、コンセンサス配列置換、生殖細胞系置換、復帰突然変異などの導入はしばしばヒト化抗体または鎖の「最適化」と称される。成句「実質的に非ヒト免疫グロブリンまたは抗体由来の」または「実質的に非ヒト」は、非ヒト生物、例えば、非ヒト哺乳動物の配列と、少なくとも80〜95%、好ましくは少なくとも90〜95%、より好ましくは、96%、97%、98%、または99%同一な、免疫グロブリンまたは抗体配列を有することを意味する。
アミノ酸に関する十分に認識された命名法に関して、任意のアミノ酸残基を示すためのコード「Xaa」または「X」を含む、3文字コードまたは1文字コードが使用される。したがって、XaaまたはXは、20種の天然に存在するアミノ酸のいずれかを典型的には示し得る。
好ましくは、同一ではない残基の位置は、保存的アミノ酸置換のために異なっている。アミノ酸置換を保存的または非保存的として分類する目的で、アミノ酸は、以下:I群(疎水性側鎖):leu、met、ala、val、leu、ile;II群(中性親水性側鎖):cys、ser、thr;III群(酸性側鎖):asp、glu;IV群(塩基性側鎖):asn、gln、his、lys、arg;V群(鎖の配向に影響を与える残基):gly、pro;およびVI群(芳香族側鎖):trp、tyr、pheのように群分けされる。保存的置換は、同じクラス内でのアミノ酸間の置換を含む。非保存的置換は、これらのクラスの1つのメンバーを別のクラスのメンバーと交換することとみなされる。
突然変異(例えば、復帰突然変異)が、鎖を含む無傷の免疫グロブリンまたは抗体(またはそれらの抗原結合性断片)の結合親和性に、前記突然変異が欠失した等価な鎖を含む抗体(またはそれらの抗原結合性断片)の能力と比較して少なくとも一桁の規模で影響を与える(例えば、減少させる)場合、その突然変異は抗原結合を指示する重鎖または軽鎖の能力に実質的に影響を与えると言われる。突然変異が、鎖を含む無傷の免疫グロブリンまたは抗体(またはそれらの抗原結合性断片)の結合親和性に、前記突然変異が欠失した等価な鎖を含む抗体(またはそれらの抗原結合性断片)の能力の2、3、または4倍しか影響を与えない(例えば、減少させない)場合、その突然変異は「抗原結合を指示する鎖の能力に実質的に影響を与えない(例えば、減少させない)」。
ある特定の実施形態では、ヒト化免疫グロブリンまたは抗体は、対応する非ヒト化抗体の親和性の3倍、4倍、または5倍以内の親和性で抗原に結合する。例えば、非ヒト化抗体が10−1の結合親和性を有する場合、ヒト化抗体は、少なくとも3×10−1、4×10−1または10−1の結合親和性を有すると予想される。免疫グロブリンまたは抗体鎖の結合特性を説明する場合、鎖は、「抗原(例えば、ジカウイルスEP)結合を指示する」その能力に基づいて説明され得る。鎖が、無傷の免疫グロブリンまたは抗体(またはその抗原結合性断片)に特異的な結合特性または結合親和性を付与する場合、その鎖は「抗原結合を指示する」と言われる。
用語「キメラ免疫グロブリン」または抗体は、その可変領域が第1の種に由来し、その定常領域が第2の種に由来する免疫グロブリンまたは抗体を指す。キメラ免疫グロブリンまたは抗体は、例えば異なる種に属する免疫グロブリンの遺伝子セグメントから遺伝子工学によって構築されてもよい。用語「ヒト化免疫グロブリン」または「ヒト化抗体」は、以下で定義されるようなキメラ免疫グロブリンまたは抗体を包含することは意図されない。ヒト化免疫グロブリンまたは抗体は、それらの構築においてキメラであるが(すなわち、1つより多くのタンパク質種由来の領域を含む)、それらは、本明細書で定義されるようなキメラ免疫グロブリンまたは抗体に存在しない追加の特徴(すなわち、ドナーのCDR残基およびアクセプターのフレームワーク残基を含む可変領域)を含む。
「単離された抗体」は、本明細書で用いられる場合、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指すことが意図される(例えば、ジカウイルスEPに特異的に結合する単離された抗体は、ジカウイルスEP以外の抗原に特異的に結合する抗体を実質的に含まない)。単離された抗体は、典型的には、他の細胞性物質および/または化学物質を実質的に含まない。本開示のある特定の実施形態では、異なるジカウイルスEP特異性を有する「単離された」抗体の組合せは、明確な組成で組み合わされる。
用語「エピトープ」または「抗原決定基」は、免疫グロブリンまたは抗体が特異的に結合する抗原上の部位を指す。エピトープは、隣接するアミノ酸またはタンパク質の3次フォールディングによって並列させた隣接していないアミノ酸の両方から形成される可能性がある。隣接するアミノ酸から形成されたエピトープは、典型的には変性溶媒に露出した状態で保持され、それに対して3次フォールディングによって形成されたエピトープは、典型的には、変性溶媒での処置で失われる。エピトープは、典型的には、固有の空間的なコンフォメーションで、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15アミノ酸を含む。どのエピトープが所与の抗体と結合するかを決定するための方法(すなわち、エピトープマッピング)は当業界において周知であり、そのようなものとしては、例えば、免疫ブロッティングおよび免疫沈降アッセイが挙げられ、それらにおいて、ジカウイルスEP由来のオーバーラップまたは隣接するペプチドが、所与の抗EP抗体との反応性に関して試験される。エピトープの空間的なコンフォメーションを決定する方法としては、当業界における技術および本明細書に記載の技術、例えば、X線結晶学および2次元核磁気共鳴が挙げられる(例えば、Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology、66巻、G. E. Morris編(1996年)を参照)。
同じエピトープを認識する抗体は、ある抗体の別の抗体の標的抗原への結合をブロックする能力を示す簡単なイムノアッセイ、すなわち、競合結合アッセイで同定することができる。競合結合は、試験を受ける免疫グロブリンが参照抗体の共通の抗原への特異的な結合を阻害するアッセイで決定される。多数のタイプの競合結合アッセイが公知であり、例えば、固相の直接的または間接的なラジオイムノアッセイ(RIA)、固相の直接的または間接的な酵素免疫検査法(EIA)、サンドイッチ競合アッセイ(Stahliら、Methods in Enzymology 9巻:242頁(1983年)を参照);固相の直接的なビオチン−アビジンEIA(Kirklandら、J. Immunol. 137巻:3614頁(1986年)を参照);固相の直接的な標識アッセイ、固相の直接的な標識サンドイッチアッセイ(HarlowおよびLane、Antibodies:A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Press(1988年)を参照);1−125標識を使用する固相の直接的な標識RIA(Morelら、Mol. Immunol. 25巻(1号):7頁(1988年)を参照);固相の直接的なビオチン−アビジンEIA(Cheungら、Virology 176巻:546頁(1990年));および直接的な標識RIA(Moldenhauerら、Scand. J. Immunol. 32巻:77頁(1990年))である。典型的には、このようなアッセイは、固体表面に結合した精製された抗原またはこれらのいずれかを有する細胞、非標識の試験用免疫グロブリンおよび標識された参照免疫グロブリンの使用を含む。競合阻害は、試験用免疫グロブリンの存在下で固体表面または細胞に結合した標識の量を決定することによって測定される。通常、試験用免疫グロブリンは、過量で存在する。通常、競合抗体が過量で存在する場合、競合抗体は、参照抗体の共通の抗原への特異的な結合を、少なくとも50〜55%、55〜60%、60〜65%、65〜70% 70〜75%またはそれより多く阻害すると予想される。
用語「エピトープマッピング」は、抗体−抗原認識のための分子決定基を同定するプロセスを指す。エピトープマッピングに関する多数の方法が当業界において公知であり、例えば、X線分析、プロテアーゼマッピング、水素/重水素交換質量分析(HDX−MS)、2D核磁気共鳴、アラニンスキャニング、およびディープ突然変異スキャニング(deep mutational scanning)である。
ジカウイルスエンベロープタンパク質(EP)を標的化する抗体の操作を容易にするために、エピトープホットスポットを、境界面残基の埋もれた表面積のパーセントを分析することによって決定した。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルス抗体は、残基D98、R99およびW101を含む融合ループ(配列番号3)上のエピトープに結合する。
「結合親和性」は一般に、分子(例えば、抗体)の単一の結合部位とその結合パートナー(例えば、抗原)との間の非共有結合相互作用の合計の強さを指す。特記しない限り、本明細書で使用される場合、「結合親和性」は、結合対のメンバー(例えば、抗体および抗原)間での1:1の相互作用を反映する固有の結合親和性を指す。そのパートナーYに対する分子Xの親和性は、解離定数(Kd)によって一般に示すことができる。例えば、Kdは、約200nM、150nM、100nM、60nM、50nM、40nM、30nM、20nM、10nM、8nM、6nM、4nM、2nM、1nM、またはそれよりも強くてもよい。親和性は、本明細書に記載の方法を含む、当業界で公知の一般的な方法によって測定することができる。低親和性抗体は一般に、抗原にゆっくりと結合し、容易に解離する傾向があるが、高親和性抗体は一般に、抗原により速く結合し、より長い時間結合したままである傾向がある。結合親和性を測定する様々な方法は、当業界で公知であり、本発明の開示の目的のためにそれらのいずれかを使用することもできる。
用語「特異的な結合」、「選択的な結合」、「選択的に結合する」、および「特異的に結合する」は、本明細書で使用される場合、予め決定された抗原上のエピトープへの抗体結合を指す。典型的には、抗体は、分析物として組換えジカウイルスEPおよびリガンドとして抗体を使用するBIACORE2000機器での表面プラズモン共鳴(SPR)技術によって決定した場合、およそ10−7M未満、例えばおよそ10−8M、10−9Mもしくは10−10M未満の、またはそれよりさらに低い平衡解離定数(K)で結合し、予め決定された抗原または近縁の抗原以外の非特異的な抗原(例えば、BSA、カゼイン)への結合に関するその親和性の少なくとも2倍の親和性で、予め決定された抗原に結合する。成句「抗原を認識する抗体」および「抗原に特異的な抗体」は、本明細書において、用語「抗原に特異的に結合する抗体」と同義的に使用される。
用語「K」は、本明細書で用いられる場合、特定の抗体−抗原相互作用の解離平衡定数を指すことが意図される。
用語「kd」は、本明細書で用いられる場合、抗体/抗原複合体からの抗体の解離に関するオフレート定数を指すことが意図される。
用語「ka」は、本明細書で用いられる場合、抗体と抗原との会合に関するオンレート定数を指すことが意図される。
用語「EC50」は、本明細書で使用される場合、in vitroまたはin vivoのいずれかのアッセイにおいて応答を誘導する、抗体またはその抗原結合性部分の濃度を指し、その濃度は、最大反応の50%、すなわち最大反応とベースラインとの中間である。
本明細書で使用される場合、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域の遺伝子によってコードされる抗体のクラス(例えば、IgMまたはIgGl)を指す。一実施形態では、本開示のヒトモノクローナル抗体は、IgG1アイソタイプに属する。ある特定の実施形態では、ヒトIgG1は、配列番号1に記載の重鎖定常ドメイン配列および配列番号2に記載の軽鎖定常ドメイン配列を有する。
用語「ジカウイルスEPに結合する」は、本明細書に記載の抗体の、例えば細胞表面上に発現された、または固体支持体に付着しているジカウイルスEPに結合する能力を指す。
用語「核酸分子」は、本明細書で用いられる場合、DNA分子およびRNA分子を含むことが意図される。核酸分子は、一本鎖または二本鎖であってもよいが、好ましくは二本鎖DNAである。
本発明の開示はまた、配列番号4〜53に記載の配列の「保存的配列改変」、すなわち、アミノ酸配列の改変であって、そのヌクレオチド配列によってコードされるかまたはそのアミノ酸配列を含有する抗体の抗原への結合をなくさない改変も包含する。このような保存的配列改変は、保存的ヌクレオチドおよびアミノ酸の置換、加えてヌクレオチドおよびアミノ酸の付加および欠失を含む。例えば、改変は、当業界において公知の標準的な技術、例えば部位特異的変異誘発およびPCR媒介変異誘発によって、配列番号4〜53に導入することができる。保存的アミノ酸置換は、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置き換えられる置換を含む。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当業界において定義されている。これらのファミリーは、塩基性側鎖を有するアミノ酸(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖を有するアミノ酸(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電性極性側鎖を有するアミノ酸(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン、トリプトファン)、非極性側鎖を有するアミノ酸(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン)、ベータ分岐側鎖を有するアミノ酸(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖を有するアミノ酸(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を含む。したがって、ヒト抗EP抗体における予測の非必須アミノ酸残基は、好ましくは、同じ側鎖ファミリーからの別のアミノ酸残基で置き換えられる。抗原結合をなくさないヌクレオチドおよびアミノ酸の保存的置換を同定する方法は、当業界において周知である(例えば、Brummellら、Biochem. 32巻:1180〜1187頁(1993年);Kobayashiら Protein Eng. 12巻(10号):879〜884頁(1999年);およびBurksら Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94巻:412〜417頁(1997年)を参照)。
代替として、ある特定の実施形態では、突然変異は、抗EP抗体のコード配列の全部または一部に沿って、例えば飽和突然変異誘発によってランダムに導入することができ、結果得られた改変された抗EP抗体は、結合活性に関してスクリーニングすることができる。
核酸の場合、用語「実質的な相同性」は、2つの核酸またはそれらの指定された配列が、最適にアラインされ比較される場合、適切なヌクレオチド挿入または欠失を含んで、ヌクレオチドの少なくとも約80%、一般的にはヌクレオチドの少なくとも約90%から95%、より好ましくは少なくとも約98%から99.5%同一であることを示す。あるいは、セグメントが、選択的なハイブリダイゼーション条件下で鎖の相補体とハイブリダイズすると予想される場合、実質的な相同性が存在する。
2つの配列間のパーセント同一性は、2つの配列の最適なアライメントのために導入する必要があるギャップの数および各ギャップの長さを考慮に入れた、配列が共有する同一な位置の数の関数である(すなわち、%相同性=同一な位置の数/位置の総数×100)。2つの配列間の配列の比較およびパーセント同一性の決定は、以下の非限定的な例で説明されるような数学的なアルゴリズムを使用して達成することができる。
2つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、GCGソフトウェアパッケージ中のGAPプログラム(http://www.gcg.comで利用可能)を使用して、NWSgapdna.CMPマトリックスおよび40、50、60、70、または80のギャップウェイトおよび1、2、3、4、5、または6のレングスウェイトを使用して、決定することができる。2つのヌクレオチドまたはアミノ酸配列間のパーセント同一性はまた、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれたE. MeyersおよびW. Millerのアルゴリズム(CABIOS、4巻:11〜17頁(1989年))を使用して、PAM120重量残基表、12のギャップの伸長ペナルティーおよび4のギャップペナルティーを使用して、決定することもできる。加えて、2つのアミノ酸配列間のパーセント同一性は、GCGソフトウェアパッケージ中のGAPプログラム(http://www.gcg.comで利用可能)に組み込まれたNeedlemanおよびWunsch(J. Mol. Biol.(48巻):444〜453頁(1970年))のアルゴリズムを使用して、Blossum62マトリックスまたはPAM250マトリックスのいずれか、ならびに16、14、12、10、8、6、または4のギャップウェイトおよび1、2、3、4、5、または6のレングスウェイトを使用して、決定することができる。
本発明の開示の核酸およびタンパク質の配列はさらに、公開データベースへの検索を実行して、例えば関連の配列を同定するための「クエリー配列」としてとして使用することができる。このような検索は、Altschulら(1990年)J. Mol. Biol. 215巻:403〜10頁のNBLASTおよびXBLASTプログラム(バージョン2.0)を使用して実行することができる。BLASTヌクレオチド検索は、本開示の核酸分子に相同なヌクレオチド配列を得るために、NBLASTプログラム、スコア=100、語長=12を用いて実行することができる。BLASTタンパク質検索は、本開示のタンパク質分子に相同なアミノ酸配列を得るために、XBLASTプログラム、スコア=50、語長=3を用いて実行することができる。比較目的でギャップ有りアライメントを得るために、ギャップ有りBLASTは、Altschulら、(1997年)Nucleic Acids Res. 25巻(17号):3389〜3402頁で説明されるようにして利用することができる。BLASTおよびギャップ有りBLASTプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム(例えば、XBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメーターを使用することができる。http://www.ncbi.nlm.nih.govを参照されたい。
核酸は、全細胞中、細胞溶解産物中、または一部精製したまたは実質的に純粋な形態中に存在し得る。核酸は、アルカリ/SDS処理、CsClバンディング、カラムクロマトグラフィー、アガロースゲル電気泳動および当業界において周知の他のものなどの標準的な技術によって、他の細胞成分または他の汚染物質、例えば、他の細胞核酸またはタンパク質から精製される場合、「単離される」かまたは「実質的に純粋にされる」。F. Ausubelら編 Current Protocols in Molecular Biology、Greene Publishing and Wiley Interscience、New York(1987年)を参照されたい。
アミノ酸配列が与えられたら、当分野を熟知するものは、遺伝子コードにおける冗長性を考慮して、アミノ酸配列を変更することなくそれをコードするヌクレオチド配列に保存的置換をなすことができる。核酸の組成は、cDNA、ゲノムまたはそれらの混合物のいずれか由来の自然の配列(ただし改変された制限部位などを除く)における場合が多いが、遺伝子配列を提供するための標準的な技術に従って突然変異させることができる。コード配列の場合、これらの突然変異は、要求に応じてアミノ酸配列に影響を与えることができる。特定には、自然のV、D、J、定常、スイッチおよび本明細書に記載の他のこのような配列に実質的に相同であるかまたはそれら由来のDNA配列が予期される(この場合、「誘導された」は、配列が、別の配列と同一であるかまたはそれから改変されていることを示す)。
用語「ベクター」は、本明細書で用いられる場合、連結させた別の核酸を輸送することが可能な核酸分子を指すことが意図される。ベクターの1つのタイプは「プラスミド」であり、これは、追加のDNAセグメントをライゲートさせることができる環状の二本鎖DNAループを指す。ベクターの別のタイプはウイルスベクターであり、この場合、追加のDNAセグメントをウイルスゲノムにライゲートさせることができる。ある特定のベクターは、それらが導入される宿主細胞中で自律複製が可能である(例えば、細菌の複製起点を有する細菌ベクターおよびエピソームの哺乳動物ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム性哺乳動物ベクター)は、宿主細胞に導入されたときに宿主細胞のゲノムに統合させることができ、それによって宿主ゲノムと共に複製される。さらに、ある特定のベクターは、それらが作動可能に連結している遺伝子の発現を指示することが可能である。このようなベクターは、本明細書では、「組換え発現ベクター」(または単に「発現ベクター」)と称される。一般的に、組換えDNA技術において有用性を有する発現ベクターは、プラスミドの形態であることが多い。本明細書において、プラスミドはベクターの最も一般的に使用される形態であるため、「プラスミド」および「ベクター」は、同義的に使用することができる。しかしながら、本開示は、例えば等価な機能を果たすウイルスベクター(例えば、複製欠損型レトロウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス)などの発現ベクターの他の形態も含むことが意図される。
用語「組換え宿主細胞」(または単に「宿主細胞」)は、本明細書で用いられる場合、組換え発現ベクターが導入された細胞を指すことが意図される。このような用語は、特定の対象細胞だけではなくこのような細胞の後代も指すことが意図されることが理解されるものとする。後の世代で突然変異または環境の影響のいずれかに起因するある種の改変が起こる可能性があるため、このような後代は、実際には親細胞と同一ではない可能性があるが、それでもなお本明細書で使用される用語「宿主細胞」の範囲内に含まれる。
用語「処置する」、「処置すること」、および「処置」は、本明細書で使用される場合、本明細書に記載の治療的または予防的措置を指す。「処置」方法は、障害もしくは再発する障害の1つまたは複数の症状を、予防する、治癒させる、遅延させる、その重症度を低減させる、もしくは緩和するために、またはこのような処置の非存在下で予測される寿命より長く対象の寿命を延長するために、このような処置が必要な対象、例えば、特定の抗原(例えば、ジカウイルス)に対する強化された免疫応答が必要な対象、または最終的にこのような障害を受ける可能性がある対象に、本発明の開示のヒト抗体を投与することを採用する。
用語「有効量」または「有効投薬量」は、所望の作用を達成するかまたは少なくとも部分的に達成するのに十分な量と定義される。用語「治療有効用量」は、すでに疾患に罹った患者における疾患およびその合併症を治癒させるかまたは少なくとも部分的に抑えるのに十分な量と定義される。この使用のために有効な量は、処置されている障害の重症度および患者自身の免疫系の全身状態によって決まると予想される。
用語「患者」は、防止的または治療的処置のいずれかを受けるヒトおよび他の哺乳動物対象を含む。
本明細書で使用される場合、用語「対象」は、あらゆるヒトまたは非ヒト動物を含む。例えば、本発明の開示の方法および組成物は、免疫障害を有する対象を処置するのに使用することができる。用語「非ヒト動物」は、全ての脊椎動物、例えば、哺乳動物および非哺乳動物、例えば非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ニワトリ、両生類、爬虫類などを含む。一部の実施形態では、対象は妊娠している。
本明細書で使用される場合、用語「垂直感染」は、病原体(例えば、ジカウイルス)の母子感染を指す。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体は、妊娠した対象における垂直感染を予防する。
本開示の様々な態様は、以下のサブセクションでさらに詳細に説明される。
ジカウイルスエンベロープタンパク質に対する抗体の産生
本発明の開示は、ジカウイルスEPと結合する抗体を包含する。一部の実施形態では、ジカウイルスEPと結合する抗体は、抗TDRD3(Tudorドメイン含有3)ヒトモノクローナル抗体をベースとしたCDRまたは最適化されたCDRを含む、最適化されたモノクローナル抗体である。以下を含む(表2および3にさらに記載される)重鎖および軽鎖可変領域配列を含む単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分が本明細書で提供される:
(a)それぞれ配列番号20、26および31に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(b)それぞれ配列番号22、28および33に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(c)それぞれ配列番号20、26および31に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(d)それぞれ配列番号20、26および31に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(e)それぞれ配列番号21、28および32に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(f)それぞれ配列番号21、27および32に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(g)それぞれ配列番号21、27および32に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(h)それぞれ配列番号21、27および32に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(i)それぞれ配列番号21、28および32に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(j)それぞれ配列番号22、28および33に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(k)それぞれ配列番号23、28および34に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(l)それぞれ配列番号21、28および34に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(m)それぞれ配列番号21、27および32に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(n)それぞれ配列番号21、28および32に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(o)それぞれ配列番号21、28および32に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(p)それぞれ配列番号22、28および33に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(q)それぞれ配列番号22、28および33に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(r)それぞれ配列番号23、28および34に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(s)それぞれ配列番号23、28および34に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(t)それぞれ配列番号23、28および34に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(u)それぞれ配列番号21、28および34に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;
(v)それぞれ配列番号21、28および34に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖;ならびに
(w)それぞれ配列番号21、28および34に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖。
一部の実施形態では、ジカウイルスEPに結合する抗体は、抗TDRD3ヒトモノクローナル抗体をベースとした、重鎖および/もしくは軽鎖可変領域または最適化された重鎖および/もしくは軽鎖可変領域を含む、最適化されたモノクローナル抗体である。以下を含む重鎖および軽鎖可変配列を含む単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分も本明細書で提供される:
(a)それぞれ配列番号4および14;
(b)それぞれ配列番号4および15;
(c)それぞれ配列番号9および16;
(d)それぞれ配列番号4および16;
(e)それぞれ配列番号4および17;
(f)それぞれ配列番号8および14;
(g)それぞれ配列番号7および17;
(h)それぞれ配列番号6および15;
(i)それぞれ配列番号6および5;
(j)それぞれ配列番号7および5;
(k)それぞれ配列番号8および5;
(l)それぞれ配列番号9および5;
(m)それぞれ配列番号10および5;
(n)それぞれ配列番号11および5;
(o)それぞれ配列番号6および14;
(p)それぞれ配列番号6および16;
(q)それぞれ配列番号6および17;
(r)それぞれ配列番号7および14;
(s)それぞれ配列番号7および15;
(t)それぞれ配列番号7および16;
(u)それぞれ配列番号8および15;
(v)それぞれ配列番号8および16;
(w)それぞれ配列番号8および17;
(x)それぞれ配列番号9および14;
(y)それぞれ配列番号9および15;
(z)それぞれ配列番号9および17;
(aa)それぞれ配列番号10および14;
(bb)それぞれ配列番号10および15;
(cc)それぞれ配列番号10および16;
(dd)それぞれ配列番号10および17;
(ee)それぞれ配列番号11および14;
(ff)それぞれ配列番号11および15;
(gg)それぞれ配列番号11および16;ならびに
(hh)それぞれ配列番号11および17。
本明細書に記載のモノクローナル抗体は、様々な公知の技術、例えばKohlerおよびMilstein、Nature 256巻:495頁(1975年)によって説明されている標準的な体細胞ハイブリダイゼーション技術を使用して産生することができる。体細胞ハイブリダイゼーション手順が好ましいが、原則的に、モノクローナル抗体を産生するための他の技術、例えば、Bリンパ球のウイルスまたは腫瘍形成性形質転換、ヒト抗体遺伝子のライブラリーを使用するファージディスプレイ技術も採用することができる。
したがって、ある特定の実施形態では、ジカウイルスEPと結合する抗体を産生するために、ハイブリドーマ方法が使用される。この方法において、マウスまたは他の適切な宿主動物は、免疫化に使用される抗原に特異的に結合すると予想される抗体を産生するかまたは産生することが可能なリンパ球を発生させるのに好適な抗原で免疫化することができる。代替として、リンパ球は、in vitroで免疫化されてもよい。次いでリンパ球をポリエチレングリコールなどの好適な融合剤を使用して骨髄腫細胞と融合させて、ハイブリドーマ細胞を形成することができる(Goding、Monoclonal Antibodies:Principles and Practice、59〜103頁(Academic Press、1986年))。ハイブリドーマ細胞が成長している培養培地は、抗原に対するモノクローナル抗体の産生に関してアッセイされる。所望の特異性、親和性、および/または活性を有する抗体を産生するハイブリドーマ細胞が同定された後、クローンを限界希釈法によってサブクローニングして、標準的な方法によって成長させてもよい(Goding、Monoclonal Antibodies:Principles and Practice、59〜103頁(Academic Press、1986年))。この目的に好適な培養培地としては、例えば、D−MEMまたはRPMI−1640培地が挙げられる。加えて、ハイブリドーマ細胞は、動物における腹水腫瘍としてin vivoで成長させてもよい。サブクローンによって分泌されたモノクローナル抗体は、例えば、プロテインA−セファロース、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、またはアフィニティークロマトグラフィーなどの従来の免疫グロブリン精製手順によって、培養培地、腹水、または血清から分離することができる。
ある特定の実施形態では、ジカウイルスEPと結合する抗体および抗体部分は、例えば、McCaffertyら、Nature、348巻:552〜554頁(1990年)Clacksonら、Nature、352巻:624〜628頁(1991年)、Marksら、J. Mol. Biol.、222巻:581〜597頁(1991年)およびHoetら(2005年)Nature Biotechnology 23巻、344〜348頁;Ladnerらの米国特許第5,223,409号;同第5,403,484号;および同第5,571,698号;Dowerらの米国特許第5,427,908号および同第5,580,717号;McCaffertyらの米国特許第5,969,108号および同第6,172,197号;およびGriffithsらの米国特許第5,885,793号;同第6,521,404号;同第6,544,731号;同第6,555,313号;同第6,582,915号および同第6,593,081号で説明されている技術を使用して生成した抗体ファージライブラリーから単離することができる。加えて、チェーンシャッフリングによる高親和性(nM範囲の)ヒト抗体の産生(Marksら、Bio/Technology、10巻:779〜783頁(1992年))だけでなく、非常に多くのファージライブラリーを構築するための戦略として組合せ感染(combinatorial infection)およびin vivoでの組換え(Waterhouseら、Nuc. Acids. Res.、21巻:2265〜2266頁(1993年))も、使用することができる。
ある特定の実施形態では、ジカウイルスEPと結合する抗体は、上記のHoetらによって説明されているファージディスプレイ技術を使用して産生される。この技術は、ヒトドナーから単離された免疫グロブリン配列の固有な組合せを有し、重鎖CDRにおいて合成の多様性を有するヒトFabライブラリーの生成を含む。次いでライブラリーを、ジカウイルスEPに結合するFabに関してスクリーニングする。
本開示の抗体を産生するハイブリドーマを生成するための好ましい動物系は、マウス系である。マウスにおけるハイブリドーマ産生は当業界において周知であり、免疫化された脾細胞を単離して融合させるための免疫化プロトコールおよび技術などが挙げられる。
ある特定の実施形態では、ジカウイルスEPに対する抗体は、マウス系ではなくヒト免疫系の一部を有するトランスジェニックまたは染色体導入されたマウスを使用して生成される。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、本明細書では「HuMAbマウス」と称されるトランスジェニックマウスを使用して生成され、このマウスは、再配列されていないヒト重鎖(μおよびγ)およびκ軽鎖免疫グロブリン配列を、内因性μおよびκ鎖遺伝子座を不活性化する標的化された突然変異と共にコードするヒト免疫グロブリン遺伝子のミニ遺伝子座(miniloci)を含有する(Lonberg, N.ら(1994年)Nature 368巻(6474号):856〜859頁)。したがって、マウスは、マウスIgMまたはκの発現の低減を表し、免疫化に応答して、導入されたヒト重鎖および軽鎖導入遺伝子はクラススイッチおよび体細胞変異を受けて、高親和性ヒトIgGκモノクローナル抗体を生成する(Lonberg, N.ら(1994年)、上記;Lonberg, N.(1994年)Handbook of Experimental Pharmacology 113巻:49〜101頁;Lonberg, N.およびHuszar, D.(1995年)Intern. Rev. Immunol. 13巻:65〜93頁、ならびにHarding, F.およびLonberg, N.(1995年)Ann. N.Y. Acad. Sci 764巻:536〜546頁に総論されている)。HuMAbマウスの調製は、以下で、さらに、Taylor, L.ら(1992年)Nucleic Acids Research 20巻:6287〜6295頁;Chen, J.ら(1993年)International Immunology 5巻:647〜656頁;Tuaillonら(1993年)Proc. Natl. Acad. Sci USA 90巻:3720〜3724頁;Choiら(1993年)Nature Genetics 4巻:117〜123頁;Chen, J.ら(1993年)EMBO J. 12巻:821〜830頁; Tuaillonら(1994年)J. Immunol. 152巻:2912〜2920頁;Lonbergら、(1994年)Nature 368巻(6474号):856〜859頁;Lonberg, N.(1994年)Handbook of Experimental Pharmacology 113巻:49〜101頁;Taylor, L.ら(1994年)International Immunology 6巻:579〜591頁;Lonberg, N.およびHuszar, D.(1995年)Intern. Rev. Immunol. 13巻:65〜93頁;Harding, F.およびLonberg, N.(1995年)Ann. N.Y. Acad. Sci 764巻:536〜546頁;Fishwild, D.ら(1996年)Nature Biotechnology 14巻:845〜851頁で詳細に説明されている。さらに、全てLonbergおよびKayならびにGenPharm Internationalの、米国特許第5,545,806号;同第5,569,825号;同第5,625,126号;同第5,633,425号;同第5,789,650号;同第5,877,397号;同第5,661,016号;同第5,814,318号;同第5,874,299号;および同第5,770,429号;Suraniらの米国特許第5,545,807号;1998年6月11日に公開された国際公開WO98/24884号;1994年11月10日に公開されたWO94/25585号;1993年6月24日に公開されたWO93/1227号;1992年12月23日に公開されたWO92/22645号;1992年3月19日に公開されたWO92/03918号を参照されたい。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、導入遺伝子および導入染色体(transchomosome)にヒト免疫グロブリン配列を有するマウス、例えばヒト重鎖導入遺伝子およびヒト軽鎖導入染色体を有するマウスを使用して発生させることができる。このようなマウスは、当業界では「KMマウス」と称され、IshidaらのPCT公報WO02/43478号で詳細に説明されている。
さらにその上、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現する代替のトランスジェニック動物系が当業界において利用可能であり、本開示の抗ジカウイルスEP抗体を発生させるのに使用することができる。例えば、Xenomouse(Abgenix,Inc.)と称される代替のトランスジェニック系を使用することができ、このようなマウスは、例えば、Kucherlapatiらの米国特許第5,939,598号;同第6,075,181号;同第6,114,598号;同第6,150,584号および同第6,162,963号で説明されている。
さらに、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現する代替の導入染色体動物系が当業界において利用可能であり、本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体を発生させるのに使用することができる。例えば、ヒト重鎖導入染色体とヒト軽鎖導入染色体(tranchromosome)の両方を有するマウスは、当業界では「TCマウス」と称され、使用が可能であり、このようなマウスは、Tomizukaら(2000年)Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97巻:722〜727頁で説明されている。さらに、ヒト重鎖および軽鎖導入染色体を有するウシが当業界において説明されており(Kuroiwaら(2002年)Nature Biotechnology 20巻:889〜894頁)、本開示の抗ジカウイルスEP抗体を発生させるのに使用することができる。
当業界で説明されるヒト抗体を発生させるための追加のマウス系、これらに限定されないが、(i)マウスにおいてキメラ抗体(ヒトV/マウスC)を発生させ、それに続き標準的な組換えDNA技術を使用して完全ヒト抗体に変換されるように、内因性マウス重鎖および軽鎖可変領域が、内因性マウス定常領域に作動可能に連結されたヒト重鎖および軽鎖可変領域と相同組換えにより置き換えられている、VelocImmune(登録商標)マウス(Regeneron Pharmaceuticals,Inc.);および(ii)再配列されていないヒト重鎖可変領域を含有するが単一の再配列されたヒトに共通の軽鎖可変領域を含有しないマウスである、MeMo(登録商標)マウス(Merus Biopharmaceuticals,Inc.)なども、本開示の抗ジカウイルスEP抗体を発生させるのに適用することができる。このようなマウス、および抗体を発生させるためのその使用は、例えば、WO2009/15777、US2010/0069614、WO2011/072204、WO2011/097603、WO2011/163311、WO2011/163314、WO2012/148873、US2012/0070861およびUS2012/0073004で説明されている。
本明細書に記載のヒトモノクローナル抗体は、免疫化されたときにヒト抗体反応が生成できるようにヒト免疫細胞が再構築されたSCIDマウスを使用して調製することもできる。このようなマウスは、例えば、Wilsonらの米国特許第5,476,996号および同第5,698,767号で説明されている。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のmAbは、参照により本明細書に組み入れられるOlingerら、PNAS 2012年;109巻、18030〜18035頁で説明されるような分解されたウイルスベクターを使用して植物で産生することができる。ある特定の実施形態では、mAbは、タバコ植物で産生される。
ある特定の実施形態では、キメラ抗体は、本明細書に記載のマウスモノクローナル抗体の配列をベースとして調製することができる。キメラ抗体は、軽鎖および重鎖遺伝子が典型的には異なる種に属する免疫グロブリンの遺伝子セグメントから遺伝子工学によって構築されている抗体を指す。例えば、マウスモノクローナル抗体由来の遺伝子の可変(V)セグメントは、ヒト定常(C)セグメント、例えばIgG1およびIgG4に合体させてもよい。ヒトアイソタイプIgG1が好ましい。したがって典型的なキメラ抗体は、マウス抗体由来のVまたは抗原−結合ドメインおよびヒト抗体由来のCまたはエフェクタードメインからなるハイブリッドタンパク質である。
ヒト化抗体の産生
用語「ヒト化抗体」は、実質的にヒト抗体鎖(アクセプター免疫グロブリンまたは抗体と称される)由来の可変領域のフレームワーク残基を含む少なくとも1つの鎖および実質的にマウス抗体(ドナー免疫グロブリンまたは抗体と称される)由来の少なくとも1つの相補性決定領域を含む抗体を指す。Queenら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86巻:10029〜10033頁(1989年)、米国特許第5,530,101号、米国特許第5,585,089号、米国特許第5,693,761号、米国特許第5,693,762号、Selickら、WO90/07861、およびWinter、米国特許第5,225,539号(あらゆる目的のために参照によりそれら全体が開示に組み入れられる)を参照されたい。定常領域も、存在する場合、実質的にまたは全体的にヒト免疫グロブリン由来である。
マウスCDRのヒト可変ドメインフレームワークへの置換は、ヒト可変ドメインフレームワークがCDRの起源となるマウス可変フレームワークと同じまたは類似のコンフォメーションをとる場合、その正しい空間的な方向の保持をもたらす可能性が最も高い。これは、フレームワーク配列が、CDRが誘導されたマウス可変フレームワークドメインと高度な配列同一性を表すヒト抗体由来のヒト可変ドメインを得ることによって達成される。重鎖および軽鎖可変フレームワーク領域は、同一または異なるヒト抗体配列から誘導することができる。ヒト抗体配列は、天然に存在するヒト抗体の配列であってもよいし、または数種のヒト抗体のコンセンサス配列であってもよい。Kettleboroughら、Protein Engineering 4巻:773頁(1991年);Kolbingerら、Protein Engineering 6巻:971頁(1993年)およびCarterら、WO92/22653を参照されたい。
マウスドナー免疫グロブリンおよび適切なヒトアクセプター免疫グロブリンの相補性決定領域が同定されたら、次のステップは、結果得られるヒト化抗体の特性を最適化するために、もしあるとすればこれらの要素由来のどの残基が置換されるべきかを決定することである。一般的に、マウス残基の導入は、ヒトにおいてヒト抗マウス抗体(HAMA)応答を惹起する抗体のリスクを増加させるため、ヒトアミノ酸残基のマウスのものでの置換は最小化されるべきである。特定の患者における、または治験中のHAMA応答をモニターするために、当業界で認識されている免疫応答の決定方法を実行することができる。ヒト化抗体が投与された患者は、前記療法の投与開始時とその間中、免疫原性評価を受けることができる。HAMA応答は、例えば、表面プラズモン共鳴技術(BIACORE)および/または固相ELISA分析などの当業者公知の方法を使用して、患者からの血清試料中でヒト化された治療試薬に対する抗体を検出することによって測定される。
ヒト可変領域のフレームワーク残基由来のある特定のアミノ酸は、CDRコンフォメーションおよび/または抗原への結合へのその起こり得る影響に基づく置換のために選択される。マウスCDR領域とヒト可変フレームワーク領域との天然にはない並置が、天然にはないコンフォメーションの制約を引き起こす可能性があり、このような制約は、ある特定のアミノ酸残基の置換によって修正されない限り、結合親和性の損失をもたらす。
置換のためのアミノ酸残基の選択は、コンピューターモデリングによって部分的に決定される。免疫グロブリン分子の3次元画像を作成するためのコンピューターのハードウェアおよびソフトウェアが、本明細書に記載される。一般的に、分子モデルは、免疫グロブリン鎖またはそのドメインの解像済みの構造から開始して作成される。モデル化しようとする鎖は、アミノ酸配列の類似性に関して、解像済みの3次元構造の鎖またはドメインと比較され、最大の配列類似性を示す鎖またはドメインが、分子モデル構築の開始点として選択される。少なくとも50%の配列同一性を有する鎖またはドメインが、モデリングのために選択され、好ましくは、少なくとも60%、70%、80%、90%またはそれより高い配列同一性を有するものがモデリングのために選択される。解像済みの開始構造は、モデル化される免疫グロブリン鎖またはドメイン中の実際のアミノ酸と開始構造中のアミノ酸との差を考慮に入れるように改変される。次いで改変された構造は、複合免疫グロブリンに組み立てられる。最終的に、エネルギーの最小化によって、さらに、全ての原子が互いに適切な距離内であること、および結合距離と角度が化学的に許容できる限界内であることを検証することによって、モデルを洗練させる。
置換のためのアミノ酸残基の選択はまた、特定の配置におけるアミノ酸の特徴の調査、または特定のアミノ酸の置換もしくは変異誘発の作用の実験的な観察によって部分的に決定することもできる。例えば、マウス可変領域のフレームワーク残基と選択されたヒト可変領域のフレームワーク残基とでアミノ酸が異なる場合、ヒトフレームワークのアミノ酸は通常、マウス抗体由来の等価なフレームワークのアミノ酸が:
(1)抗原と直接非共有結合するか、
(2)CDR領域と隣接するか、
(3)別の方法でCDR領域と相互作用するか(例えば、コンピューターモデリングによって決定した場合、CDR領域の約3〜6オングストローム以内である)、または
(4)VL−VHの境界面に関与している
と合理的に予測される場合、そのアミノ酸で置換されると予想される。
「抗原と直接非共有結合する」残基としては、確立された化学的な力に従って、例えば水素結合、ファンデルワールス力、疎水性相互作用などによって抗原上のアミノ酸と直接相互作用する優れた見込みを有する、フレームワーク領域中の位置にあるアミノ酸が挙げられる。
CDRおよびフレームワーク領域は、上記のKabatらまたはChothiaらで定義された通りである。上記のKabatらで定義されるフレームワーク残基が、上記のChothiaらで定義される構造的なループ残基を構成する場合、マウス抗体に存在するアミノ酸は、ヒト化抗体への置換のために選択することが可能である。「CDR領域に隣接する」残基としては、ヒト化免疫グロブリン鎖の一次配列中のCDRの1つまたは複数に直接隣接する位置にあるアミノ酸残基、例えば、Kabatで定義されるCDRまたはChothiaで定義されるCDRに直接隣接する位置にあるアミノ酸残基が挙げられる(例えば、ChothiaおよびLesk J M B 196巻:901頁(1987年)を参照)。これらのアミノ酸は特に、CDR中のアミノ酸と相互作用する可能性が高く、アクセプターから選択される場合、ドナーCDRを歪ませて親和性を低下させる可能性が高い。さらに、隣接するアミノ酸は、抗原と直接相互作用する可能性があり(Amitら、Science、233巻:747頁(1986年)、参照により本明細書に組み入れられる)、ドナーからこれらのアミノ酸を選択することが、元の抗体において親和性を提供する抗原の接触を全て維持するために望ましい場合がある。
「別の方法でCDR領域と相互作用する」残基としては、二次構造分析によってCDR領域に影響を与えるのに十分な空間的な方向にあることが決定されるものが挙げられる。ある特定の実施形態では、「別の方法でCDR領域と相互作用する」残基は、ドナー免疫グロブリンの3次元モデル(例えば、コンピューター生成モデル)を分析することによって同定される。典型的には元のドナー抗体の3次元モデルは、CDRの外側におけるある特定のアミノ酸がCDRに近接しており、水素結合、ファンデルワールス力、疎水性相互作用などによってCDR中のアミノ酸と相互作用する優れた見込みを有することを示す。そのアミノ酸位置において、アクセプター免疫グロブリンのアミノ酸ではなくドナー免疫グロブリンのアミノ酸が選択され得る。この基準によるアミノ酸は、一般的に、CDR中のいくつかの原子の約3オングストローム単位(A)以内に側鎖原子を有すると予想され、例えば上記で列挙したものなどの確立された化学的な力によってCDR原子と相互作用できる原子を含有するはずである。
水素結合を形成する可能性がある原子のケースでは、それらの核の間で3オングストロームが測定されるが、結合を形成しない原子の場合は、それらのファンデルワールス表面間で3オングストロームが測定される。したがって、後者のケースでは、核は、相互作用が可能であるとみなされる原子に対して約6オングストローム(3オングストローム+ファンデルワールス半径の合計)以内でなければならない。多くのケースにおいて、核は、4または5から6オングストローム離れていると予想される。アミノ酸がCDRと相互作用できるかどうかの決定において、重鎖CDR2の最後の8アミノ酸をCDRの一部とみなさないことが好ましく、これはなぜなら、構造の観点から、これらの8アミノ酸はよりフレームワークの一部としての挙動を示すためである。
CDR中のアミノ酸と相互作用することが可能なアミノ酸は、さらに別の方法でも同定することができる。各フレームワークのアミノ酸の溶媒接触表面積は、2つの方法で、すなわち(1)無傷抗体において、および(2)そのCDRが除去された抗体からなる仮定の分子において計算される。これらの数値間の有意差が約10平方オングストロームまたはそれより高いことは、フレームワークのアミノ酸の溶媒へのアクセスが、CDRによって少なくとも部分的にブロックされており、それゆえにアミノ酸がCDRと接触していることを示す。アミノ酸の溶媒接触表面積は、当業界において公知のアルゴリズムを使用して抗体の3次元モデルに基づいて計算することができる(例えば、Connolly, J. Appl. Cryst. 16巻:548頁(1983年)ならびにLeeおよびRichards、J. Mol. Biol. 55巻:379頁(1971年)、これらの両方は、参照により本明細書に組み入れられる)。フレームワークのアミノ酸もまた、場合により、次にCDRと接触する別のフレームワークのアミノ酸のコンフォメーションに影響を及ぼすことによって、CDRと間接的に相互作用する場合がある。
フレームワーク中の数々の位置におけるアミノ酸が、多くの抗体においてCDRと相互作用が可能なことが公知である(ChothiaおよびLesk、上記、Chothiaら、上記ならびにTramontanoら、J. Mol. Biol. 215巻:175頁(1990年)、これらの全ては、参照により本明細書に組み入れられる)。とりわけ、軽鎖の2、48、64および71位ならびに重鎖の26〜30、71および94位におけるアミノ酸(Kabatによる番号付け)は、多くの抗体においてCDRと相互作用することが可能なことが公知である。軽鎖の35位ならびに重鎖の93および103位におけるアミノ酸も、CDRと相互作用する可能性が高い。全てのこれらの番号付けされた位置において、ヒト化免疫グロブリン中にあるべきものとしてアクセプターアミノ酸ではなくドナーアミノ酸を選択すること(それらが異なる場合)が好ましい。一方で、CDR領域と相互作用することが可能なある特定の残基、例えば軽鎖の最初の5アミノ酸は、時には、ヒト化免疫グロブリンにおける親和性を損なわずにアクセプター免疫グロブリンから選択されてもよい。
「VL−VHの境界面に関与する」残基または「充填残基」としては、例えば、NovotnyおよびHaber、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、82巻:4592〜66頁(1985年)または上記のChothiaらによって定義されるような、VLとVHとの境界面における残基が挙げられる。一般的に、異例な充填残基は、それらがヒトフレームワーク中のものとは異なる場合、ヒト化抗体中に保持されると予想される。
一般的に、上記の基準を満たすアミノ酸の1つまたは複数が置換されている。一部の実施形態では、上記の基準を満たす全てまたはほとんどのアミノ酸が置換されている。場合によっては、特定のアミノ酸が上記の基準を満たすかどうかについて多少の曖昧さがあることから、代替のバリアント免疫グロブリンが産生され、そのうちの1つはその特定の置換を有するが、その他のものは有さない。このようにして産生された代替のバリアント免疫グロブリンを、所望の活性に関して本明細書に記載のアッセイのいずれかで試験して、好ましい免疫グロブリンを選択することができる。
通常、ヒト化抗体におけるCDR領域は、実質的に同一であり、より一般的には、ドナー抗体の対応するCDR領域に同一である。通常望ましくないが、結果得られたヒト化免疫グロブリンの結合親和性に目立った影響を与えずに、CDR残基の1つまたは複数の保存的アミノ酸置換をなすことも時には考えられる。保存的置換としては、gly、ala;val、ile、leu;asp、glu;asn、gln;ser、thr;lys、arg;およびphe、tyrなどの組合せが意図される。
置換のための追加の候補は、その位置においてヒト免疫グロブリンにとって異例であるかまたは「まれな」アクセプターヒトフレームワークのアミノ酸である。これらのアミノ酸は、マウスドナー抗体の等価な位置からの、またはより典型的なヒト免疫グロブリンの等価な位置からのアミノ酸で置換することができる。例えば、アクセプター免疫グロブリンのヒトフレームワーク領域中のアミノ酸が、その位置にとってまれであり、ドナー免疫グロブリン中の対応するアミノ酸が、ヒト免疫グロブリン配列におけるその位置において共通している場合;またはアクセプター免疫グロブリン中のアミノ酸が、その位置にとってまれであり、ドナー免疫グロブリン中の対応するアミノ酸も、他のヒト配列に対してまれである場合、置換が望ましい可能性がある。これらの基準は、ヒトフレームワーク中の不規則なアミノ酸が抗体構造を確実に崩壊させないことの助けになる。さらに、異例なヒトアクセプターのアミノ酸を、ヒト抗体にとって偶然にも典型的なドナー抗体由来のアミノ酸で置き換えることによって、ヒト化抗体の免疫原性をより低くすることができる。
用語「まれな」は、本明細書で使用される場合、その位置において、代表的な配列サンプル中の配列の約20%未満、ただし通常は約10%未満で生じるアミノ酸を示し、用語「共通の」は、本明細書で使用される場合、代表的なサンプル中の配列の約25%超、ただし通常は約50%超で生じるアミノ酸を示す。例えば、全てのヒト軽鎖および重鎖可変領域配列は、互いに特に相同であり、ある特定の重要な位置に同じアミノ酸を有する配列の「下位群」にそれぞれ群分けされる(Kabatら、上記)。ヒトアクセプター配列中のアミノ酸が、ヒト配列のなかで「まれ」かまたは「共通」かを決定する場合、アクセプター配列として同じ下位群中のヒト配列のみを考察することがしばしば好ましいと予想される。
置換のための追加の候補は、上記のChothiaらによって提唱されている代替の定義に基づきCDR領域の一部として同定されると予想されるアクセプターのヒトフレームワークのアミノ酸である。置換のための追加の候補は、AbMおよび/または接触の定義に基づきCDR領域の一部として同定されると予想されるアクセプターのヒトフレームワークのアミノ酸である。
置換のための追加の候補は、まれなまたは異例なドナーのフレームワーク残基に相当するアクセプターのフレームワーク残基である。まれなまたは異例なドナーのフレームワーク残基は、その位置でマウス抗体にとってまれかまたは異例なもの(本明細書で定義される通り)である。マウス抗体の場合、下位群をKabatに従って決定して、コンセンサスとは異なる残基の位置を同定することができる。これらのドナーの特異的な差は、活性を強化するマウス配列における体細胞変異を指摘している可能性がある。結合に影響を与えることが予測される異例な残基は保持され、それに対して結合にとって重要ではないと予測される残基は置換され得る。
置換のための追加の候補は、アクセプターのフレームワーク領域中に生じる非生殖細胞系の残基である。例えば、アクセプター抗体鎖(すなわち、ドナー抗体鎖と有意な配列同一性を有するヒト抗体鎖)が、生殖細胞系の抗体鎖(同様にドナー鎖と有意な配列同一性を有する)にアラインされる場合、アクセプター鎖のフレームワークと生殖細胞系の鎖のフレームワークとで一致しない残基は、生殖細胞系の配列由来の対応する残基で置換することができる。
上記で論じられた特異的なアミノ酸置換以外に、ヒト化免疫グロブリンのフレームワーク領域は、通常、実質的に同一であり、より一般的には、それらが誘導されたヒト抗体のフレームワーク領域に同一である。当然ながら、フレームワーク領域中のアミノ酸の多くは、抗体の特異性または親和性にほとんど直接寄与しない。したがって、フレームワーク残基の多くの個々の保存的置換が、結果得られたヒト化免疫グロブリンの特異性または親和性を明らかに変化させることなく許容され得る。したがって、一実施形態では、ヒト化免疫グロブリンの可変フレームワーク領域は、ヒト可変フレームワーク領域配列またはこのような配列のコンセンサスに少なくとも85%の配列同一性を有する。別の実施形態では、ヒト化免疫グロブリンの可変フレームワーク領域は、ヒト可変フレームワーク領域配列またはこのような配列のコンセンサスに、少なくとも90%、好ましくは95%、より好ましくは96%、97%、98%または99%の配列同一性を有する。しかしながら、一般的に、このような置換は望ましくない。
ヒト化抗体は、好ましくは、少なくとも10、10、10または1010−1の抗原への特異的な結合親和性を表す。通常、抗原へのヒト化抗体の結合親和性の上限は、ドナー免疫グロブリンの結合親和性の3倍、4倍または5倍以内である。多くの場合、結合親和性の下限も、ドナー免疫グロブリンの結合親和性の3倍、4倍または5倍以内である。代替として、結合親和性は、置換がないヒト化抗体(例えば、ドナーCDRおよびアクセプターFRを有するがFR置換がない抗体)の結合親和性と比較することができる。このような例において、最適化された抗体(置換を有する)の結合は、非置換の抗体の結合より、好ましくは少なくとも2倍から3倍大きいか、または3倍から4倍大きい。比較するために、様々な抗体の活性は、例えば、BIACORE(すなわち、非標識の試薬を使用する表面プラズモン共鳴)または競合結合アッセイによって決定することができる。
改変された配列を有する抗体の生成
ある特定の実施形態では、抗TDRD3モノクローナル抗体由来の重鎖および軽鎖可変領域CDR(それぞれ配列番号4および5)を含む抗体であって、抗体がジカウイルスEPに結合するように、少なくとも1つのCDRがアミノ酸置換を含む、抗体が本明細書で提供される。ある特定の実施形態では、重鎖可変領域CDRは、Chothiaによる番号付けで、28、29、31、32、52、52A、53、54、55、100、100A、100B、100C、100D、100E、100F、100G、100H、102位、またはそれらの組合せにおけるアミノ酸置換を有する。ある特定の実施形態では、28位におけるアミノ酸置換は、セリンである。ある特定の実施形態では、28位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。ある特定の実施形態では、28位におけるアミノ酸は、欠失される。ある特定の実施形態では、29位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニンである。ある特定の実施形態では、31位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。ある特定の実施形態では、32位におけるアミノ酸置換は、チロシンである。ある特定の実施形態では、52位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。ある特定の実施形態では、52A位におけるアミノ酸置換は、グリシンである。ある特定の実施形態では、53位におけるアミノ酸置換は、グルタミン酸である。ある特定の実施形態では、54位におけるアミノ酸置換は、グリシンである。ある特定の実施形態では、55位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸である。ある特定の実施形態では、99位におけるアミノ酸は、欠失される。ある特定の実施形態では、100位におけるアミノ酸置換は、セリンチロシンである。ある特定の実施形態では、100A位におけるアミノ酸置換は、セリンである。ある特定の実施形態では、100A位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。ある特定の実施形態では、100B位におけるアミノ酸置換は、アスパラギンである。ある特定の実施形態では、100C位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニンである。ある特定の実施形態では、100D位におけるアミノ酸置換は、チロシンである。ある特定の実施形態では、100E位におけるアミノ酸置換は、チロシンである。ある特定の実施形態では、100F位におけるアミノ酸置換は、チロシンである。ある特定の実施形態では、100G位におけるアミノ酸置換は、チロシンである。ある特定の実施形態では、100H位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。ある特定の実施形態では、102位におけるアミノ酸置換は、アラニンである。ある特定の実施形態では、102位におけるアミノ酸置換は、バリンである。
ある特定の実施形態では、軽鎖可変領域CDRは、Chothiaによる番号付けで、26、29、31、32、33、50、53、54、55、56、91、93、94、95、95B、96、97位、またはそれらの組合せにおけるアミノ酸置換を有する。ある特定の実施形態では、26位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。ある特定の実施形態では、29位におけるアミノ酸置換は、イソロイシンである。ある特定の実施形態では、31位におけるアミノ酸置換は、バリンである。ある特定の実施形態では、32位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニンである。ある特定の実施形態では、33位におけるアミノ酸置換は、ロイシンである。ある特定の実施形態では、50位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸である。ある特定の実施形態では、53位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。ある特定の実施形態では、54位におけるアミノ酸置換は、アルギニンである。ある特定の実施形態では、54位におけるアミノ酸置換は、アスパラギンである。ある特定の実施形態では、55位におけるアミノ酸置換は、アラニンである。ある特定の実施形態では、56位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。ある特定の実施形態では、91位におけるアミノ酸置換は、アルギニンである。ある特定の実施形態では、93位におけるアミノ酸置換は、チロシンである。ある特定の実施形態では、94位におけるアミノ酸置換は、アスパラギンである。ある特定の実施形態では、95位におけるアミノ酸置換は、トリプトファンである。ある特定の実施形態では、95B位におけるアミノ酸置換は、プロリンである。ある特定の実施形態では、96位におけるアミノ酸置換は、チロシンである。ある特定の実施形態では、97位におけるアミノ酸置換は、セリンである。ある特定の実施形態では、プロリンが、95B位のアミノ酸と96位のアミノ酸との間に付加される。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、重鎖および軽鎖可変領域CDRを含み、重鎖可変領域CDR1は、アミノ酸配列GFXFSTY(配列番号54)を有し、式中、Xは、存在してもしなくてもよく、セリンおよびスレオニンから選択され;重鎖可変領域CDR2は、アミノ酸配列XGEGDS(配列番号55)を有し、式中、Xは、セリンおよびスレオニンから選択され;重鎖可変領域CDR3は、アミノ酸配列GYXNFYYYTMDX(配列番号56)を有し、式中、Xは、セリンおよびスレオニンから選択され、Xは、アラニンおよびバリンから選択される。
ある特定の実施形態では、重鎖CDR1は、アミノ酸配列GFSFSTY(配列番号21)を有する。ある特定の実施形態では、重鎖CDR1は、アミノ酸配列GFTGSTY(配列番号22)を有する。ある特定の実施形態では、重鎖CDR1は、アミノ酸配列GFFSTY(配列番号23)を有する。ある特定の実施形態では、重鎖CDR2は、アミノ酸配列TGEGDS(配列番号28)を有する。ある特定の実施形態では、重鎖CDR2は、アミノ酸配列SGEGDS(配列番号27)を有する。ある特定の実施形態では、重鎖CDR3は、アミノ酸配列GYSNFYYYYTMDA(配列番号32)を有する。ある特定の実施形態では、重鎖CDR3は、アミノ酸配列GYSNFYYYYTMDV(配列番号33)を有する。ある特定の実施形態では、重鎖CDR3は、アミノ酸配列GYTNFYYYTMDA(配列番号34)を有する。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、重鎖および軽鎖可変領域CDRを含み、軽鎖可変領域CDR1は、アミノ酸配列RAXQSIXTFLA(配列番号57)を有し、式中、Xは、セリンおよびスレオニンから選択され、Xは、セリンおよびバリンから選択され;軽鎖可変領域CDR2は、アミノ酸配列DASTXAX(配列番号56)を有し、式中、Xは、アルギニンおよびアスパラギンから選択され、Xは、セリンおよびスレオニンから選択され;軽鎖可変領域CDR3は、アミノ酸配列QQRYNWPPYX(配列番号56)を有し、式中、Xは、セリンおよびスレオニンから選択される。
ある特定の実施形態では、軽鎖CDR1は、アミノ酸配列RATQSISTFLA(配列番号38)を有する。ある特定の実施形態では、軽鎖CDR1は、アミノ酸配列RASQSISTFLA(配列番号39)を有する。ある特定の実施形態では、軽鎖CDR1は、アミノ酸配列RATQSIVTFLA(配列番号40)を有する。ある特定の実施形態では、軽鎖CDR2は、アミノ酸配列DASTRAS(配列番号44)を有する。ある特定の実施形態では、軽鎖CDR2は、アミノ酸配列DASTRAT(配列番号45)を有する。ある特定の実施形態では、軽鎖CDR2は、アミノ酸配列DASTNAS(配列番号46)を有する。ある特定の実施形態では、軽鎖CDR3は、アミノ酸配列QQRYNWPPYS(配列番号50)を有する。ある特定の実施形態では、軽鎖CDR3は、アミノ酸配列QQRYNWPPYT(配列番号51)を有する。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体は、可変領域配列中にフレームワーク突然変異を含有する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、重鎖および軽鎖可変領域配列を含み、重鎖可変領域配列は、Chothiaによる番号付けで、1、5、23、33、38、47、49、50、57、58、68、71、73、78、80、81、82B、82C、84、93、108位、またはそれらの組合せにおけるアミノ酸置換を含む。ある特定の実施形態では、1位におけるアミノ酸置換は、グルタミンである。一部の実施形態では、5位におけるアミノ酸置換は、ロイシンである。一部の実施形態では、23位におけるアミノ酸置換は、セリンである。一部の実施形態では、33位におけるアミノ酸置換は、セリンである。一部の実施形態では、38位におけるアミノ酸置換は、リシンである。一部の実施形態では、47位におけるアミノ酸置換は、チロシンである。一部の実施形態では、49位におけるアミノ酸置換は、セリンである。一部の実施形態では、50位におけるアミノ酸置換は、アラニンである。一部の実施形態では、57位におけるアミノ酸置換は、アラニンである。一部の実施形態では、58位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニンである。一部の実施形態では、68位におけるアミノ酸置換は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、71位におけるアミノ酸置換は、アルギニンである。一部の実施形態では、73位におけるアミノ酸置換は、アスパラギンである。一部の実施形態では、78位におけるアミノ酸置換は、ロイシンである。一部の実施形態では、80位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニンである。一部の実施形態では、81位におけるアミノ酸置換は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、82(B)位におけるアミノ酸置換は、リシンである。一部の実施形態では、82(C)位におけるアミノ酸置換は、バリンである。一部の実施形態では、84位におけるアミノ酸置換は、プロリンである。一部の実施形態では、93位におけるアミノ酸置換は、バリンである。一部の実施形態では、108位におけるアミノ酸置換は、セリンである。一部の実施形態では、108位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。一部の実施形態では、108位におけるアミノ酸置換は、メチオニンである。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体は、可変領域配列中にフレームワーク突然変異を含有する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、重鎖および軽鎖可変領域配列を含み、軽鎖可変領域配列は、Chothiaによる番号付けで、1、3、4、9、10、13、15、17、19、21、22、38、42、45、58、60、76、77、79、85、104位、またはそれらの組合せにおけるアミノ酸置換を含む。一部の実施形態では、1位におけるアミノ酸置換は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、3位におけるアミノ酸置換は、バリンである。一部の実施形態では、4位におけるアミノ酸置換は、ロイシンである。一部の実施形態では、9位におけるアミノ酸置換は、アラニンである。一部の実施形態では、10位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。一部の実施形態では、13位におけるアミノ酸置換は、ロイシンである。一部の実施形態では、15位におけるアミノ酸置換は、プロリンである。一部の実施形態では、17位におけるアミノ酸置換は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、19位におけるアミノ酸置換は、アラニンである。一部の実施形態では、21位におけるアミノ酸置換は、ロイシンである。一部の実施形態では、22位におけるアミノ酸置換は、セリンである。一部の実施形態では、38位におけるアミノ酸置換は、ヒスチジンである。一部の実施形態では、42位におけるアミノ酸置換は、グルタミンである。一部の実施形態では、45位におけるアミノ酸置換は、アルギニンである。一部の実施形態では、58位におけるアミノ酸置換は、イソロイシンである。一部の実施形態では、60位におけるアミノ酸置換は、アラニンである。一部の実施形態では、76位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。一部の実施形態では、77位におけるアミノ酸置換は、アルギニンである。一部の実施形態では、77位におけるアミノ酸置換は、スレオニンである。一部の実施形態では、79位におけるアミノ酸置換は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、85位におけるアミノ酸置換は、バリンである。一部の実施形態では、104位におけるアミノ酸置換は、ロイシンである。
別の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体の可変領域配列またはその部分は、結合(すなわち、改変されていない抗体と同じエピトープへの)を保持する構造的に関連する抗ジカウイルスEP抗体が作製されるように改変される。
したがって、本開示の一態様において、上述した操作された抗体のCDR1、2、および/または3の領域は、本明細書で開示された抗体のアミノ酸配列のような正確なアミノ酸配列を含んでいてもよい。しかしながら、本開示の他の態様において、抗体は、本明細書で開示された抗体の正確なCDR配列由来の誘導体を含み、それでもなおジカウイルスEPと効果的に結合する能力を保持する。このような配列改変は、1つまたは複数のアミノ酸の付加、欠失、または置換、例えば、上述したような保存的配列改変を含んでいてもよい。また配列改変は、本明細書で開示された抗体の特定のCDR1、CDR2、およびCDR3配列について上述したコンセンサス配列に基づいていてもよい。
したがって、別の実施形態では、操作された抗体は、例えば、本明細書で開示された抗体の1つまたは複数のCDRに90%、95%、98%または99.5%同一な1つまたは複数のCDRで構成されていてもよい。上記で列挙された値の間の範囲、例えば、上記の配列の1つまたは複数に90〜95%、95〜98%、または98〜100%同一なCDRも、本発明の開示に包含されることが意図される。
別の実施形態では、理想的な結合定数が達成されるように、より好ましい結合のオンレート、より好ましい結合のオフレート、または両方を達成するために、CDRの1つまたは複数の残基を変更して、結合を改変してもよい。この戦略を使用して、例えば1010−1またはそれを超える極めて高い結合親和性を有する抗体を獲得することができる。CDR領域を変更し、それに続いて結果生じる結合分子を所望の結合の変化に関してスクリーニングするのに、当業界において周知の親和性成熟技術および本明細書に記載の技術を使用することができる。したがって、CDRが変更される場合、最もよい組合せの結合および低い免疫原性に関して最適化された抗体が獲得されるように、結合親和性の変化に加えて免疫原性をモニターしてスコア付けすることができる。
したがって、VHおよび/またはVLのCDR1、CDR2および/またはCDR3領域内の可変領域の改変のために、部位特異的変異誘発またはPCR媒介変異誘発を実行して突然変異を導入することができ、抗体結合に対する作用または目的とする他の機能特性は、in vitroまたはin vivoのアッセイで評価することができる。好ましくは、保存的改変(本明細書で論じられるように)が導入される。突然変異は、アミノ酸の置換、付加または欠失であり得るが、好ましくは置換である。さらに、典型的には、CDR領域内の1、2、3、4または5つのみの残基が変更される。
一般的に、抗体のフレームワーク領域は、それらが誘導されたヒト生殖細胞系の配列のフレームワーク領域に、通常実質的に同一であり、より一般的には同一である。当然ながら、フレームワーク領域中のアミノ酸の多くは、抗体の特異性または親和性にほとんど直接寄与しない。したがって、フレームワーク残基の多くの個々の保存的置換は、結果得られた免疫グロブリンの特異性または親和性の明らかな変化がなければ、許容することができる。したがって、一実施形態では、抗体の可変フレームワーク領域は、ヒト生殖細胞系の可変フレームワーク領域配列またはこのような配列のコンセンサスに、少なくとも85%の配列同一性を有する。別の実施形態では、抗体の可変フレームワーク領域は、ヒト生殖細胞系の可変フレームワーク領域配列またはこのような配列のコンセンサスに、少なくとも90%、95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性を有する。
フレームワーク改変はまた、例えばUS2003/0153043でCarrらによって説明されるようにして、抗体の免疫原性を低減するか、またはその中に存在するT細胞エピトープを低減もしくは除去するようになすこともできる。
本開示の操作された抗体としては、例えば抗体の特性を改善するためにVおよび/またはV内のフレームワーク残基に改変がなされたものが挙げられる。典型的には、このようなフレームワーク改変は、抗体の免疫原性を減少させるためになされる。例えば、1つのアプローチは、1つまたは複数のフレームワーク残基を対応する生殖細胞系の配列に「復帰突然変異」させることである。より具体的には、体細胞変異を受けた抗体は、抗体が誘導される生殖細胞系の配列とは異なるフレームワーク残基を含有する可能性がある。このような残基は、抗体のフレームワーク配列を抗体が誘導される生殖細胞系の配列と比較することによって同定することができる。
別のタイプのフレームワーク改変は、T細胞エピトープを除去することによって抗体の起こり得る免疫原性を低下させるために、フレームワーク領域内の1つもしくは複数の残基を突然変異させること、または1つもしくは複数のCDR領域内の1つもしくは複数の残基でさえも突然変異させることを含む。このアプローチは「脱免疫化(deimmunization)」とも称され、米国特許公開第20030153043号でさらに詳細に説明されている。
無傷抗体を発現させるための部分的な抗体配列の使用
抗体は、6つの重鎖および軽鎖相補性決定領域(CDR)中に配置されたアミノ酸残基を介して優勢に標的抗原と相互作用する。この理由のために、CDR内のアミノ酸配列は、個々の抗体間で、CDRの外側の配列より多様である。CDR配列はほとんどの抗体−抗原相互作用に関与するため、異なる特性を有する異なる抗体由来のフレームワーク配列上にグラフト化された、特異的な天然に存在する抗体由来のCDR配列を含む発現ベクターを構築することによって、特異的な天然に存在する抗体の特性を模倣する組換え抗体を発現させることが可能である(例えば、Riechmann, L.ら、1998年、Nature 332巻:323〜327頁;Jones, P.ら、1986年、Nature 321巻:522〜525頁;およびQueen, C.ら、1989年、Proc. Natl. Acad.を参照、U.S.A. 86巻:10029〜10033頁を参照)。このようなフレームワーク配列は、生殖細胞系の抗体の遺伝子配列を含む公共のDNAデータベースから得ることができる。これらの生殖細胞系の配列は、B細胞の成熟中のV(D)Jの合体によって形成される完全に組み立てられた可変遺伝子を含まないと予想されることから、成熟抗体の遺伝子配列とは異なると予想される。生殖細胞系の遺伝子配列はまた、個体における高親和性二次レパートリー抗体の配列とも、可変領域全体にわたりむらなく異なっていると予想される。例えば、体細胞変異は、フレームワーク領域のアミノ末端部分において比較的低頻度である。例えば、体細胞変異は、フレームワーク領域1のアミノ末端部分およびフレームワーク領域4のカルボキシ末端部分において比較的低頻度である。さらに、多くの体細胞変異は、抗体の結合特性を有意に変更しない。この理由のために、元の抗体の結合特性に類似した結合特性を有する無傷の組換え抗体を再度作製するために特定の抗体のDNA配列全体を得ることは、必ずしも必要ではない(1999年3月12日付けで出願されたPCT/US99/05535を参照)。この目的のためには、典型的にはCDR領域にわたる部分的な重鎖および軽鎖配列で十分である。部分的な配列は、どの生殖細胞系の可変および合体する遺伝子セグメントが組み換えられた抗体可変遺伝子に寄与するのかを決定するのに使用される。次いで生殖細胞系の配列は、可変領域の失われた部分を満たすのに使用される。重鎖および軽鎖リーダー配列は、タンパク質成熟中に切断され、最終的な抗体の特性に寄与しない。失われた配列を付加するために、クローニングされたcDNA配列は、ライゲーションまたはPCR増幅によって合成オリゴヌクレオチドと組み合わせることができる。代替として、短いオーバーラップするオリゴヌクレオチドのセットとして可変領域全体を合成して、PCR増幅によって組み合わせることにより、全体的に合成の可変領域クローンを作製することもできる。このプロセスは、特定の制限部位の除去もしくは包含、または特定のコドンの最適化などの一定の利点を有する。
ハイブリドーマからの重鎖および軽鎖転写物のヌクレオチド配列は、天然配列と同一なアミノ酸をコードする能力を有する合成V配列を作製するために、合成オリゴヌクレオチドのオーバーラップするセットを設計するのに使用される。合成重鎖およびカッパ鎖配列は、以下の3つの方法:オリゴヌクレオチド合成およびPCR増幅を促進するために、一続きの繰り返されたヌクレオチド塩基を中断させる方法;コザックのルール(Kozak、1991年、J. Biol. Chem. 266巻:19867〜19870頁)に従って最適な翻訳開始部位を取り入れる方法;および翻訳開始部位の上流でHindIII部位を操作する方法で、天然配列と異なるようにすることができる。
重鎖および軽鎖可変領域の両方に関して、最適化されたコードおよび対応する非コード鎖配列は、対応する非コードオリゴヌクレオチドのおよそ中間点である30〜50ヌクレオチドに分解される。したがって、各鎖につき、オリゴヌクレオチドは、150〜400ヌクレオチドのセグメントにわたるオーバーラップする二本鎖のセットに組み立てることができる。次いでそのプールは、150〜400ヌクレオチドのPCR増幅産物を産生するための鋳型として使用される。典型的には、単一の可変領域オリゴヌクレオチドのセットは、2つのプールに分解されると予想され、これらは別々に増幅されて、2種のオーバーラップするPCR産物を生成する。次いでこれらのオーバーラップする産物はPCR増幅によって組み合わされて、完全な可変領域を形成する。発現ベクター構築物に容易にクローニングすることができる断片を生成するために、PCR増幅において重鎖または軽鎖定常領域のオーバーラップする断片(カッパ軽鎖のBbsI部位、またはガンマ重鎖の場合はAgeI部位を含む)を含むことも望ましい場合がある。
次いで再構築された重鎖および軽鎖可変領域は、発現ベクター構築物を形成するために、クローニングされたプロモーター、リーダー配列、翻訳開始、リーダー配列、定常領域、3’非翻訳、ポリアデニル化、および転写終結配列と組み合わされる。重鎖および軽鎖発現構築物は、単一のベクターに組み合わされて、宿主細胞に共にトランスフェクトされるか、連続的にトランスフェクトされるか、または別々にトランスフェクトされてもよく、次いでこれを融合して、両方の鎖を発現する宿主細胞を形成する。
発現ベクターの構築で使用するためのプラスミドを、PCRで増幅したV重鎖およびVカッパ軽鎖のcDNA配列が、完全な重鎖および軽鎖のミニ遺伝子を再構築するのに使用できるように構築した。これらのプラスミドは、完全ヒトIgGκまたはIgGκ抗体を発現させるのに使用することができる。
本明細書に記載の完全ヒト、ヒト化、およびキメラ抗体はまた、IgG2、IgG3、IgE、IgA、IgM、およびIgD抗体も含む。他の重鎖アイソタイプの発現のために、またはラムダ軽鎖を含む抗体の発現のために、類似のプラスミドを構築することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号20、26および31に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号38、44および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号22、28および33に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号39、45および51に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号20、26および31に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号39、45および51に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号20、26および31に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号40、46および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、28および32に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号38、44および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、27および32に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号40、46および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、27および32に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号38、44および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、27および32に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号37、43および49に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、28および32に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号37、43および49に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号22、28および33に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号37、43および49に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号23、28および34に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号37、43および49に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、28および34に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号37、43および49に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、27および32に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号39、45および51に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、28および32に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号39、45および51に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、28および32に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号40、46および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号22、28および33に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号38、44および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号22、28および33に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号40、46および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号23、28および34に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号38、44および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号23、28および34に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号40、46および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、28および34に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号38、44および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、28および34に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号39、45および51に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
ある特定の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体を調製するための方法であって、(1)重鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号21、28および34に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域および重鎖CDR;ならびに(2)軽鎖CDRの少なくとも1つが、配列番号40、46および50に示されるCDRのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域および軽鎖CDRを含む抗体を調製することを含み、抗体は、ジカウイルスEPに結合する、方法が提供される。ジカウイルスEPと結合する抗体の能力は、標準的な結合アッセイ(例えば、ELISAまたはFLISA)を使用して決定することができる。
追加の抗体の改変
本発明の開示の抗体は、軽鎖または重鎖可変領域のいずれかにおいて1つまたは複数の糖付加部位を含有していてもよい。このような糖付加部位は、抗体の免疫原性の増加または変更された抗原結合に起因する抗体のpKの変更を引き起こす可能性がある(Marshallら(1972年)Annu Rev Biochem 41巻:673〜702頁;GalaおよびMorrison(2004年)J Immunol 172巻:5489〜94頁;Wallickら(1988年)J Exp Med 168巻:1099〜109頁;Spiro(2002年)Glycobiology 12巻:43R〜56R;Parekhら(1985年)Nature 316巻:452〜7頁;Mimuraら(2000年)Mol Immunol 37巻:697〜706頁)。糖付加は、N−X−S/T配列を含有するモチーフで起こることがすでに公知である。一部の場合において、可変領域の糖付加を含有しない抗ジカウイルス抗体を有することが好ましい。これは、可変領域に糖付加モチーフを含有しない抗体を選択すること、または糖付加領域内の残基を突然変異させることのいずれかによって達成することができる。
例えば、ある特定の実施形態では、抗体の糖付加が改変され、例えば、可変領域が、可変領域に存在する1つまたは複数の糖付加部位がなくなるように変更される。より特定には、本発明の抗体の配列において糖付加を受けやすい部位をなくすことが望ましい。これは、親の可変領域に生じる1つまたは複数のN−X−(S/T)配列(式中、Xはあらゆるアミノ酸残基である)の出現を、特にN残基および/またはSもしくはT残基を置換することによって変更することにより達成される。一実施形態では、T95は、K95に突然変異されている。別の実施形態では、N47は、R47に突然変異されている。
例えば、非グリコシル化(すなわち、糖付加がない)抗体を作製することができる。糖付加は、例えば、抗原への抗体の親和性を増加させるように変更することができる。このような炭水化物の改変は、例えば、抗体配列内の1つまたは複数の糖付加部位を変更することによって達成することができる。例えば、1つまたは複数の可変領域のフレームワークの糖付加部位を排除することによって、その部位における糖付加をなくす1つまたは複数のアミノ酸置換をなすことができる。このような非グリコシル化は、抗原への抗体の親和性を増加させる可能性がある。例えば、米国特許第5,714,350号および同号6,350,861号を参照されたい。
加えて、または代替として、抗体は、フコシル残基の量が低減された低フコシル化(hypofucosylated)抗体またはバイセクト型GlcNac構造が増加した抗体などの、糖付加が変更されたタイプを有し得る。このような変更された糖付加パターンは、抗体のADCC能力を増加させることが実証されてきた。このような炭水化物の改変は、例えば、糖付加機構が変更された宿主細胞で抗体を発現することによって達成することができる。糖付加機構が変更された細胞は当業界で説明されており、これらは、本明細書に記載の組換え抗体を発現させることによって糖付加が変更された抗体を産生するための宿主細胞として使用することができる。例えば、Ms704、Ms705、およびMs709細胞株で発現される抗体がそれらの炭水化物上におけるフコースを欠失するように、細胞株Ms704、Ms705、およびMs709は、フコシルトランスフェラーゼの遺伝子、FUT8(α(1,6)−フコシルトランスフェラーゼ)を欠失している。2つの置換ベクターを使用したCHO/DG44細胞におけるFUT8遺伝子の標的化された崩壊によって、Ms704、Ms705、およびMs709FUT8−/−細胞株が作製された(米国特許公開第20040110704号およびYamane-Ohnukiら(2004年)Biotechnol Bioeng 87巻:614〜22頁を参照)。別の例として、EP1,176,195は、機能的に崩壊したFUT8遺伝子を有する細胞株であって、このような細胞株で発現される抗体が、α−1,6結合に関連する酵素を低減するかまたはなくすることによって低フコシル化を表すようにフコシルトランスフェラーゼをコードしている、細胞株を説明している。またEP1,176,195は、抗体のFc領域に結合するN−アセチルグルコサミンへのフコースの付加に関して低い酵素活性を有するかまたは酵素活性を有さない細胞株、例えばラット骨髄腫細胞株YB2/0(ATCC CRL 1662)も説明している。PCT公開公報WO03/035835は、Asn(297)が連結した炭水化物にフコースを付着させる能力が低減され、その結果としてその宿主細胞で発現される抗体の低フコシル化も引き起こされる、バリアントCHO細胞株、Lec13細胞を説明している(Shieldsら(2002年)J. Biol. Chem. 277巻:26733〜26740頁も参照)。改変された糖付加プロファイルを有する抗体はまた、PCT公開公報WO06/089231で説明されるようにニワトリの卵で産生させることもできる。代替として、改変された糖付加プロファイルを有する抗体は、植物細胞、例えばLemnaで産生させることもできる。植物系で抗体を産生するための方法は、2006年8月11日に出願されたAlston&Bird LLP代理人の整理番号040989/314911に対応する米国特許出願で開示されている。PCT公開公報WO99/54342は、操作された細胞株で発現される抗体が、抗体のADCC活性の増加をもたらすバイセクト型GlcNac構造の増加を表すように、糖タンパク質を改変するグリコシルトランスフェラーゼ(例えば、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnTIII))を発現するように操作された細胞株を説明している(Umanaら(1999年)Nat. Biotech. 17巻:176〜180頁も参照)。代替として、抗体のフコース残基を、フコシダーゼ酵素を使用して切断して除去することができ、例えば、α−L−フコシダーゼは、抗体からフコシル残基を除去する(Tarentinoら(1975年)Biochem. 14巻:5516〜23頁)。
上記で説明したように産生された抗体の可変性のセグメント(例えば、キメラまたはヒト化抗体の重鎖および軽鎖可変領域)は、典型的には、免疫グロブリン定常領域(Fc領域)の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンの少なくとも一部に連結される。ヒト定常領域のDNA配列は、様々なヒト細胞から、ただし好ましくは不死化B細胞から、周知の手順に従って単離することができる(Kabatら、上記、およびLiuら、WO87/02671を参照)(これらのそれぞれは、あらゆる目的のために参照によりその全体が開示に組み入れられる)。通常は、抗体は、軽鎖および重鎖定常領域の両方を含有すると予想される。重鎖定常領域は通常、CH1、ヒンジ、CH2、CH3、およびCH4領域を含む。本明細書に記載の抗体は、IgM、IgG、IgD、IgAおよびIgEなどの全てのタイプの定常領域、ならびにIgG1、IgG2、IgG3およびIgG4などのあらゆるアイソタイプを有する抗体を含む。抗体(例えば、ヒト化抗体)は、細胞傷害活性を表すことが望ましい場合、定常ドメインは通常、補体結合性の定常ドメインであり、クラスは、典型的にはIgG1である。ヒトアイソタイプIgG1が好ましい。軽鎖定常領域は、ラムダまたはカッパであってもよい。ヒト化抗体は、1つより多くのクラスまたはアイソタイプからの配列を含んでいてもよい。抗体は、2つの軽鎖と2つの重鎖とを含有する四量体として、別々の重鎖、軽鎖として、Fab、Fab’F(ab’)2、およびFvとして、または重鎖および軽鎖可変ドメインがスペーサーを介して連結されている単鎖抗体として発現させてもよい。
ある特定の実施形態では、抗体は、抗体の物理的安定性が改善されるように突然変異されている可変領域を含む。一実施形態では、抗体は、重鎖定常領域のヒンジ領域における228位に対応する位置にセリンからプロリンへの突然変異(S228P;EUインデックス)を含むIgG4アイソタイプ抗体である。この突然変異は、ヒンジ領域において重鎖間のジスルフィド架橋の不均一をなくすことが報告されている(Angalら 上記;241位は、Kabatの番号付けシステムに基づく)。例えば、ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体は、上記のAngalらで説明されるように、241位に対応する位置におけるセリンがプロリンに突然変異したヒトIgG4の定常領域に連結した、本明細書に記載の抗体のいずれかの重鎖可変領域を含んでいてもよい。したがって、ヒトIgG4の定常領域に連結した重鎖可変領域の場合、この突然変異は、EUインデックスによればS228P突然変異に相当する。
ある特定の実施形態では、CH1のヒンジ領域は、ヒンジ領域中のシステイン残基の数が変更される、例えば増加するかまたは減少するように改変される。このアプローチは、米国特許第5,677,425号でさらに説明されている。CH1のヒンジ領域中のシステイン残基の数は、例えば、軽鎖および重鎖のアセンブリを容易にするために、または抗体の安定性を増加もしくは減少させるために変更される。
加えて、抗体は、例えば、抗体の生物学的(例えば、血清)半減期を増加させるために、ペグ化することができる。抗体をペグ化するために、典型的には、1つまたは複数のPEG基が抗体または抗体断片に付着した状態になる条件下で、抗体またはその断片を、ポリエチレングリコール(PEG)、例えばPEGの反応性エステルまたはアルデヒド誘導体と反応させる。好ましくは、ペグ化は、反応性PEG分子(または類似の反応性水溶性ポリマー)とのアシル化反応またはアルキル化反応を介して行われる。用語「ポリエチレングリコール」は、本明細書で使用される場合、他のタンパク質を誘導体化するのに使用されてきたPEGの形態のいずれか、例えば、モノ(C1〜C10)アルコキシ−もしくはアリールオキシ−ポリエチレングリコール、またはポリエチレングリコール−マレイミドを包含することが意図される。ある特定の実施形態では、ペグ化される抗体は、非グリコシル化抗体である。タンパク質をペグ化するための方法は当業界において公知であり、本明細書に記載のの抗体に適用することができる。例えば、EP0154316およびEP0401384を参照されたい。
免疫化
ジカウイルスEPに対する完全ヒト抗体を生成するために、ヒト免疫グロブリン遺伝子を含有するトランスジェニックまたは染色体導入されたマウス(例えば、HCo12、HCo7またはKMマウス)は、例えば、Lonbergら(1994年)Nature 368巻(6474号):856〜859頁;Fishwildら(1996年)Nature Biotechnology 14巻:845〜851頁およびWO98/24884で説明されるようにして、ジカウイルスEP抗原および/またはジカウイルスEPを発現する細胞の精製または高濃度化した調製物で免疫化することができる。本明細書で説明されるように、HuMAbマウスは、免疫原として組換えジカウイルスEPタンパク質またはジカウイルスEPを発現する細胞株のいずれかで免疫化される。代替として、マウスは、ジカウイルスEPをコードするDNAで免疫化することができる。好ましくは、マウスは、最初の注入のとき6〜16週齢であると予想される。例えば、組換えジカウイルスEP抗原の精製または高濃度化した調製物(5〜50μg)は、腹腔内によりHuMAbマウスを免疫化するのに使用することができる。
様々な抗原での累積的な経験から、最初に完全フロイントアジュバント中の抗原で腹腔内(IP)または皮下(SC)により免疫化し、それに続いて隔週で不完全フロイントアジュバント中の抗原でIP/SCにより免疫化する(合計10回まで)場合に、HuMAbトランスジェニックマウスは、最もよく応答することが示されている。免疫応答は、眼窩後方の採血により得られる血漿試料での免疫化プロトコールの経過にわたりモニターすることができる。血漿は、ELISA(後述する通り)によってスクリーニングすることができ、抗ジカウイルスEPヒト免疫グロブリンの十分なタイターを有するマウスが、融合に使用される可能性がある。マウスは、屠殺しておよび脾臓を取り出す3日前に静脈内に抗原でブーストされてもよい。
ジカウイルスEPに対するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマの生成
ジカウイルスEPに対するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを生成するために、免疫化されたマウス由来の脾細胞およびリンパ節細胞を単離して、マウス骨髄腫細胞株などの適切な不死化細胞株に融合させることができる。次いで結果得られたハイブリドーマは、抗原特異的な抗体の産生に関してスクリーニングすることができる。例えば、免疫化されたマウス由来の脾臓リンパ球の単一細胞の懸濁液は、50%PEG(w/v)と共にSP2/0−Ag8.653非分泌性マウス骨髄腫細胞(ATCC、CRL1580)に融合させることができる。細胞を平底のマイクロタイタープレートでおよそ1×10個で平板培養して、それに続いて通常の試薬の他にも10%胎仔クローン血清、5〜10%のオリゲンハイブリドーマクローニングファクター(IGEN)および1×HAT(Sigma)を含有する選択培地中で2週間インキュベートすることができる。およそ2週間後、細胞は、HATがHTで置き換えられた培地中で培養することができる。次いで個々のウェルは、ELISAによってヒト抗ジカウイルスEPモノクローナルIgMおよびIgG抗体に関してスクリーニングすることができる。大規模なハイブリドーマ成長が一旦起これば、培地は、通常10〜14日後に観察してもよい。ハイブリドーマを分泌する抗体は、再度平板培養して再度スクリーニングすることができ、それでもなおIgG陽性の場合、抗ジカウイルスEPモノクローナル抗体を限界希釈によって少なくとも2回サブクローニングすることができる。次いで安定なサブクローンをin vitroで培養して、特徴付けのために組織培養培地中で抗体を生成させることができる。
ジカウイルスEPに対するモノクローナル抗体を産生するトランスフェクトーマの生成
本明細書に記載の抗体はまた、例えば、当業界において周知のようにして組換えDNA技術と遺伝子トランスフェクション方法との組合せを使用して、宿主細胞のトランスフェクトーマで産生することもできる(Morrison, S.(1985年)Science 229巻:1202頁)。
例えば、ある特定の実施形態では、目的の遺伝子、例えばヒト抗体遺伝子は、発現ベクターに、例えば、WO87/04462、WO89/01036およびEP338841で開示されたGS遺伝子発現系によって使用されるような真核性発現プラスミド、または当業界において周知の他の発現系にライゲートすることができる。クローニングされた抗体遺伝子を有する精製されたプラスミドは、CHO細胞もしくはNSO細胞などの真核宿主細胞、または代替として植物由来の細胞、菌類もしくは酵母細胞のような他の真核細胞に導入することができる。これらの遺伝子を導入するのに使用される方法は、エレクトロポレーション、リポフェクチン、リポフェクトアミンまたはその他のものなどの当業界で説明されている方法であり得る。宿主細胞にこれらの抗体遺伝子を導入した後、抗体を発現する細胞を同定し、選択することができる。これらの細胞は、代表的なトランスフェクトーマであり、これらを次いでその発現レベルに応じて増幅して、抗体を産生するためにアップスケールすることができる。これらの培養上清および/または細胞から、組換え抗体を単離および精製することができる。
代替として、これらのクローニングされた抗体遺伝子は、E.coliなどの他の発現系または生物の完全体で発現させることもでき、または合成的に発現させることもできる。
組換え抗体の発現
キメラおよびヒト化抗体は、典型的には、組換え発現によって産生される。任意選択で定常領域に連結された、軽鎖および重鎖可変領域をコードする核酸を発現ベクターに挿入する。軽鎖および重鎖は、同一または異なる発現ベクターでクローニングすることができる。免疫グロブリン鎖をコードするDNAセグメントは、免疫グロブリンポリペプチドの発現を確実にする発現ベクター中の制御配列に作動可能に連結している。発現制御配列としては、これらに限定されないが、プロモーター(例えば、天然において関連するまたは異種プロモーター)、シグナル配列、エンハンサーエレメント、および転写終結配列が挙げられる。真核宿主細胞を形質転換またはトランスフェクトすることが可能なベクターにおいて、発現制御配列は、好ましくは真核生物プロモーター系である。ベクターが適切な宿主に一旦取り込まれたなら、宿主は、高レベルのヌクレオチド配列発現、ならびに交差反応抗体の収集および精製に好適な条件下で維持される。
これらの発現ベクターは、典型的には、宿主生物においてエピソームまたは宿主染色体のDNAの統合部分のいずれかとして複製可能である。一般的に、発現ベクターは、所望のDNA配列で形質転換した細胞の検出が可能になるように、選択マーカー(例えば、アンピシリン耐性、ハイグロマイシン耐性、テトラサイクリン耐性、カナマイシン耐性またはネオマイシン耐性)を含有する(例えば、Itakuraら、米国特許第4,704,362号を参照)。
E.coliは、本明細書に記載のポリヌクレオチド(例えば、DNA配列)をクローニングするのに特に有用な原核宿主の1つである。使用に好適な他の微生物宿主としては、Bacillus subtilisなどの杆菌、ならびにSalmonella、Serratia、および様々なPseudomonas種などの他の腸内細菌科が挙げられる。これらの原核宿主において、典型的には、宿主細胞に適合する発現制御配列(例えば、複製起点)を含有すると予想される発現ベクターを作製することもできる。加えて、ラクトースプロモーター系、トリプトファン(trp)プロモーター系、ベータ−ラクタマーゼプロモーター系、またはファージラムダ由来のプロモーター系などの多数の様々な周知のプロモーターも存在すると予想される。プロモーターは、典型的には、任意選択でオペレーター配列と共に発現を制御し、転写および翻訳を開始および完了させるためのリボソーム結合部位配列などを有すると予想される。酵母などの他の微生物も、発現に有用である。
Saccharomycesは、要求に応じて発現制御配列(例えば、プロモーター)、複製起点、終結配列などを有する好適なベクターが用いられる好ましい酵母宿主である。典型的なプロモーターとしては、3−ホスホグリセリン酸キナーゼおよび他の糖分解酵素が挙げられる。誘導性酵母プロモーターとしては、なかでも、アルコールデヒドロゲナーゼ由来のプロモーター、イソチトクロムC、ならびにマルトースおよびガラクトース利用に関与する酵素が挙げられる。
微生物に加えて、哺乳動物組織の細胞培養物も、本明細書に記載のポリペプチド(例えば、免疫グロブリンまたはその断片をコードするポリヌクレオチド)を発現および産生するのに使用することができる。Winnacker、From Genes to Clones、VCH Publishers、N.Y.、N.Y.(1987年)を参照されたい。異種タンパク質(例えば、無傷の免疫グロブリン)を分泌することが可能な多数の好適な宿主細胞株が当業界において開発されていることから、実際には真核細胞が好ましく、そのようなものとしては、CHO細胞株、様々なCos細胞株、HeLa細胞、好ましくは、骨髄腫細胞株、または形質転換したB細胞もしくはハイブリドーマが挙げられる。好ましくは、細胞は、非ヒトである。これらの細胞のための発現ベクターは、発現制御配列、例えば複製起点、プロモーター、およびエンハンサー(Queenら、Immunol. Rev. 89巻:49頁(1986年))、ならびに必要なプロセシング情報の部位、例えばリボソーム結合部位、RNAスプライス部位、ポリアデニル化部位、および転写ターミネーター配列を含んでいてもよい。好ましい発現制御配列は、免疫グロブリン遺伝子、SV40、アデノウイルス、ウシパピローマウイルス、サイトメガロウイルス由来のプロモーターなどである。Coら、J. Immunol. 148巻:1149頁(1992年)を参照されたい。
代替として、トランスジェニック動物のゲノムへの導入とそれに続くトランスジェニック動物の乳汁での発現のために、抗体−コード配列を導入遺伝子に取り込むことができる(例えば、Deboerら、米国特許第5,741,957号、Rosen、米国特許第5,304,489号、およびMeadeら、米国特許第5,849,992号を参照)。好適な導入遺伝子は、カゼインまたはベータラクトグロブリンなどの乳腺特異的遺伝子由来のプロモーターおよびエンハンサーと作動可能に連結されている軽鎖および/または重鎖のコード配列を含む。
目的のポリヌクレオチド配列(例えば、重鎖および軽鎖をコードする配列および発現制御配列)を含有するベクターは、細胞宿主のタイプに応じて様々な周知の方法によって宿主細胞に移入させることができる。例えば、原核細胞には、塩化カルシウムトランスフェクションが広く利用されており、それに対して他の細胞宿主には、リン酸カルシウム処理、エレクトロポレーション、リポフェクション、遺伝子銃またはウイルスベースのトランスフェクションが使用され得る。(一般的に、Sambrookら、Molecular Cloning:A Laboratory Manual(Cold Spring Harbor Press、第2版、1989年)を参照(あらゆる目的のためにその全体が参照により組み入れられる)。哺乳動物細胞を形質転換するのに使用される他の方法としては、ポリブレン、プロトプラスト融合、リポソーム、エレクトロポレーション、およびマイクロインジェクションの使用が挙げられる(一般的に、Sambrookら、上記を参照)。トランスジェニック動物の産生のために、導入遺伝子を受精した卵母細胞にマイクロインジェクションしてもよいし、または胚性幹細胞のゲノムに取り込ませてもよく、このような細胞の核を除核した卵母細胞に移入させてもよい。
重鎖および軽鎖が別々の発現ベクターでクローニングされる場合、ベクターは、無傷の免疫グロブリンの発現およびアセンブリを達成するために共にトランスフェクトされる。本発明の開示の抗体全体、その二量体、個々の軽鎖および重鎖、または他の免疫グロブリンの形態は、一旦発現されたら、硫酸アンモニウム沈殿、アフィニティーカラム、カラムクロマトグラフィー、HPLC精製、ゲル電気泳動などの当業界の標準的手順に従って精製することができる(一般的にScopes、Protein Purification(Springer-Verlag、N.Y.、(1982年)を参照)。少なくとも約90から95%の均一性を有する実質的に純粋な免疫グロブリンが好ましく、医薬品用途の場合は98から99%またはそれより高い均一性が最も好ましい。
抗体断片
また抗体断片も、本開示の範囲内であると予期される。一実施形態では、非ヒトおよび/またはキメラ抗体の断片が提供される。別の実施形態では、ヒト化抗体の断片が提供される。典型的には、これらの断片は、少なくとも10、より典型的には10または10−1の親和性での抗原への特異的な結合を表す。ヒト化抗体断片は、別々の重鎖、軽鎖、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fabc、およびFvを含む。断片は、組換えDNA技術によって、または無傷の免疫グロブリンの酵素または化学的分離によって産生される。
抗体を特徴付けるためのアッセイ
本明細書に記載の抗体は、ジカウイルスエンベロープタンパク質(EP)への結合に関して、例えば標準的なELISAによって試験することができる。簡単に言えば、ジカウイルスエンベロープタンパク質またはジカウイルス自体の連続希釈液を、本明細書に記載の抗体と混合する。これらの混合物を、室温で一晩インキュベートして、平衡に到達させる。間接的ELISAを使用して、未結合の抗体および単独で結合した抗体の濃度を測定する。代替として、マイクロタイタープレートを、精製されたジカウイルスでコーティングし、次いでPBS中の5%乾燥脱脂乳でブロックする。洗浄後、精製された本明細書に記載の抗体を、抗原を含有するウェルに添加し、室温で2時間インキュベートする。ホースラディッシュペルオキシダーゼコンジュゲート抗マウスIgG二次抗体およびABTS基質(Kirkegaard and Perry Laboratories)を使用して、結合した抗体を検出する。
一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ELISAによって決定される、3μg/mLと25μg/mLとの間のKd値でジカウイルスEPに結合する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ELISAによって決定される、少なくとも3μg/mLのKd値でジカウイルスEPに結合する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ELISAによって決定される、少なくとも5μg/mLのKd値でジカウイルスEPに結合する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ELISAによって決定される、少なくとも10μg/mLのKd値でジカウイルスEPに結合する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ELISAによって決定される、少なくとも15μg/mLのKd値でジカウイルスEPに結合する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ELISAによって決定される、少なくとも20μg/mLのKd値でジカウイルスEPに結合する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ELISAによって決定される、少なくとも25μg/mLのKd値でジカウイルスEPに結合する。
上述したようなELISAアッセイは、抗体、したがってジカウイルスEPとの陽性の反応性を示す抗体を産生するハイブリドーマに関してスクリーニングするのに使用することができる。次いで、ジカウイルスEPに好ましくは高親和性で結合する抗体を産生するハイブリドーマをサブクローニングして、さらに特徴付けることができる。次いで、親細胞の反応性を保持する(ELISAにより)各ハイブリドーマからの1つのクローンを、細胞バンクを作製するため、および抗体精製のために、選択することができる。
フレームワークの突然変異が本明細書で開示された抗EP抗体のEPに結合する能力に影響を与えないことを確認するために、上述したELISAアッセイも使用することができる。
抗ジカウイルスEP抗体を精製するために、選択されたハイブリドーマは、モノクローナル抗体精製のための2リットルのスピナーフラスコで成長させることができる。プロテインA−セファロース(Pharmacia、Piscataway、NJ)を用いたアフィニティークロマトグラフィーの前に、上清を濾過して濃縮してもよい。溶出したIgGをゲル電気泳動および高速液体クロマトグラフィーでチェックして、純度を確認することができる。緩衝溶液をPBSに交換してもよく、濃度は、1.43の吸光係数を使用してOD280により決定してもよい。モノクローナル抗体をアリコートにして、−80℃で貯蔵することができる。
選択された抗ジカウイルスEPモノクローナル抗体が固有のエピトープに結合するかどうかを決定するために、市販の試薬(Pierce、Rockford、IL)を使用して各抗体をビオチン化することができる。ビオチン化MAbの結合は、ストレプトアビジン標識プローブで検出することができる。非標識モノクローナル抗体およびビオチン化モノクローナル抗体を使用した競合研究は、上述したようにしてジカウイルスEPがコーティングされたELISAプレートを使用して実行することができる。
精製された抗体のアイソタイプを決定するために、アイソタイプELISAは、特定のアイソタイプの抗体に特異的な試薬を使用して実行することができる。例えば、プレートを抗IgG、IgA、またはIgM重鎖に特異的な抗体(100ng/ウェル)でコーティングして、ハイブリドーマ培養上清と共にインキュベートする。mAbのサブタイプは、アルカリホスファターゼにコンジュゲートした、抗IgG1、IgG2a、IgG2b、IgG3、IgM、またはIgA重鎖に特異的な抗体を使用することによって検出される。
抗ジカウイルスEP抗体は、ジカウイルスEP抗原との反応性についてウェスタンブロッティングによってさらに試験することができる。簡単に言えば、非標識のジカウイルスEPを10%SDS−ポリアクリルアミド(polyacrylaminde)ゲル上で分解し、PVDF膜に移す。0.02%Tween−20を含有するPBS中の乾燥脱脂乳を使用して非特異的な結合部位をブロックした後、精製されたmAb(10ug/ml)を室温で1時間かけて膜に添加する。次いで膜をホースラディッシュペルオキシダーゼコンジュゲートヤギ抗マウスIgA+IgG+IgM二次抗体と共に1時間インキュベートして、ECL化学発光キット(Amersham)を使用して展開する。
様々な抗ジカウイルスEP抗体の結合親和性、交差反応性、および結合速度論を分析するための方法としては、当業界において公知の標準的なアッセイ、例えば、Biacore(商標)2000SPR機器(Biacore AB、Uppsala、Sweden)を使用するBiacore(商標)表面プラズモン共鳴(SPR)分析が挙げられる。
本明細書に記載の抗体の中和を決定するために、in vitroでのプラーク減少中和(PRNT)アッセイを実行することができる。簡単に言えば、プラークアッセイは、密集化したBHK−21細胞を使用してなされる。本明細書に記載の抗体の2倍連続希釈液を、50PFUのジカウイルスと37℃で1時間混合する。混合物を細胞単層に適用し、4〜7日間インキュベートする。感染を、4G2免疫染色とその後のTMBペルオキシダーゼ基質(KPL)によって定量し、吸光度をプレートリーダーで測定する。100%感染は、抗体に曝露されていないウェルにおける平均OD600と対応する。一部の実施形態では、PRNTアッセイのアウトプットは、PRNT50(プラーク形成を50%減少させる抗体の濃度)である。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、少なくとも0.03μg/mLのPRNT50値を有する。
一部の実施形態では、抗ジカウイルスEP抗体は、感染の抗体依存性感染増強(ADE)を低減する。ADEは、感染が、既存の感染増強性抗体の背景において生じる場合、増加した疾患重症度を媒介すると提唱されている現象である。機構的に、感染増強性抗体が成熟および未成熟ウイルス粒子に結合し、宿主細胞上に存在するFcγ受容体の抗体係合を介してウイルス侵入を媒介する場合に、これが生じる。4G2、E53、およびE−二量体エピトープ(EDE)に対するmAbを含む、数種のFLEに対する抗体が、文献中で説明されている(Dejnirattisai Wら、2015年)。数々の研究により、DENVを、Fcγ受容体によって貪食される抗体レベルでオプソニン化した場合、ファゴソーム膜とのウイルス融合を阻害できる抗体のみが感染を予防し、したがってADEを予防することが示されている(Chan KRら、2011年、Wu Rら、2012年)。それゆえに、一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体の、E−二量体境界面においてジカウイルスFLEエピトープを係合する能力は、融合阻害によりADE活性の低減を生じる。
一部の実施形態では、ADEの低減を、白血球免疫グロブリン様受容体B1(LILRB1)を発現し、したがってADEに対して高度に感受性である細胞を使用することによって試験する。そのような細胞の非限定的な例は、THP1.2S単球である。細胞を、感染前に本明細書に記載の抗ジカウイルス抗体と共にインキュベートする。次いでウイルス複製を、ウイルス感染に対して感受性の細胞を使用するプラークアッセイによって測定する。そのような細胞の非限定的な例は、BHK21細胞である。次いでプラークタイターを測定し、対照と比較したプラークタイターにおける低減は、試験した抗ジカウイルスEP抗体がADEを低減するのに有効であることを示す。ADEを測定する他の方法は、当業界で公知であり、ADEに対する本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体の影響を決定するために使用できる。
抗体の競合結合
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ジカウイルスEPへの結合に関して、本明細書に記載の特定の抗ジカウイルスEP抗体と競合する(例えば、交差競合する)。このような競合する抗体は、標準的なジカウイルスEP結合アッセイにおいて本明細書に記載のmAbの1つまたは複数のジカウイルスEPへの結合を競合的に阻害するその能力に基づいて同定することができる。例えば、標準的なELISAアッセイを使用することができ、このようなアッセイにおいて、組換えジカウイルスEPがプレート上に固定され、抗体の1つが蛍光標識され、標識された抗体の結合を競合的に分離する(compete off)非標識抗体の能力が評価される。加えて、または代替として、交差競合する抗体の能力を評価するために、BIAcore分析を使用することができる。試験抗体が本明細書に記載の抗EP抗体のジカウイルスEPへの結合を阻害する能力を有するということは、試験抗体がジカウイルスEPへの結合に関して抗体と競合できることを実証する。
ある特定の実施形態では、競合する抗体は、本明細書に記載の特定の抗EPモノクローナル抗体と同じジカウイルスEP上のエピトープに結合する抗体である。抗体が参照抗体と同じエピトープに結合するかどうかを決定するために、標準的なエピトープマッピング技術、例えばX線結晶学および2次元核磁気共鳴を使用することができる(例えば、Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology、66巻、G. E. Morris編(1996年)を参照)。
ある特定の実施形態では、ジカウイルスEPへの結合に関して競合する、および/またはジカウイルスEP上の同じエピトープに結合する抗体は、ヒト化抗体である。
一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルス抗体は、残基D98、R99およびW101を含む融合ループ(配列番号3)上のエピトープに結合する。一部の実施形態では、ジカウイルスEPへの結合に関して競合する抗体は、残基D98、R99およびW101を含む融合ループ(配列番号3)上のエピトープに結合する。
本明細書に記載の所望の特性を有する単一の原型の抗EP mAbが単離されたら、当業界公知の方法を使用することによって、類似の特性を有する、例えば同じエピトープを有する他のmAbを生成することが簡単である。例えば、本明細書に記載されるジカウイルスでマウスを免疫化し、ハイブリドーマを産生し、結果得られたmAbを、ジカウイルスEPへの結合に関して原型のmAbと競合する能力についてスクリーニングしてもよい。またマウスは、原型のmAbが結合するエピトープを含有するより小さいジカウイルスEPの断片で免疫化してもよい。例えば、ジカウイルスEPにわたる一連のオーバーラップするペプチドへの結合に関してスクリーニングすることによって、エピトープを局所化することができる。代替として、原型のmAbと同じエピトープ、それゆえにそれと類似の特性を有するmAbの選択をガイドするために、Jespersら、Biotechnology 12巻:899号、1994年の方法を使用してもよい。ファージディスプレイを使用して、まず原型の抗体の重鎖を(好ましくはヒト)軽鎖のレパートリーと対合させ、ジカウイルスEPと結合するmAbを選択し、次いで新しい軽鎖を(好ましくはヒト)重鎖のレパートリーと対合させ、原型のmAbと同じエピトープを有する(好ましくはヒト)ジカウイルスEPと結合するmAbを選択する。代替として、原型のmAbのバリアントは、抗体の重鎖および軽鎖をコードするcDNAの変異誘発により得ることができる。
エピトープマッピングは、例えば、Champeら(1995年)J. Biol. Chem. 270巻:1388〜1394頁で説明されるように、抗体が目的のエピトープと結合するかどうかを決定するために実行することができる。CunninghamおよびWells(1989年)Science 244巻:1081〜1085頁によって説明されるような「アラニンスキャニング変異誘発」、またはヒトジカウイルスEPにおけるアミノ酸残基の点変異誘発の一部の他の形態も、本明細書に記載の抗EP抗体の機能的なエピトープを決定するために使用することができる。しかしながら、変異誘発研究はまた、ジカウイルスEPの全体的な3次元構造にとって重要であるが抗体−抗原の接触に直接関与しないアミノ酸残基を解明する可能性もあるため、この方法を使用して決定された機能的なエピトープを確認するために、他の方法が必要になるある場合がある。
また特異的な抗体と結合するエピトープは、ジカウイルスEPの断片を含むペプチドへの抗体の結合を評価することによって決定してもよい。ジカウイルスEPの配列を包含する一連のオーバーラップするペプチドを合成し、例えば直接ELISA、競合ELISA(この場合、マイクロタイタープレートのウェルに結合したジカウイルスEPへの抗体の結合を予防するその能力に関して、ペプチドが評価される)で、またはチップ上で、結合に関してスクリーニングすることができる。このようなペプチドスクリーニング方法は、一部の不連続の機能的なエピトープ、すなわちジカウイルスEPポリペプチド鎖の一次配列に沿って隣接していないアミノ酸残基を含む機能的なエピトープを検出することができない場合がある。
また本明細書に記載の抗体と結合するエピトープは、構造的な方法、例えばX線結晶構造決定(例えば、WO2005/044853)、分子モデリングおよび核磁気共鳴(NMR)分光法、例えば遊離の場合、および目的の抗体との複合体において結合している場合のジカウイルスEP中の不安定なアミド水素のH−D交換速度のNMR決定などによって決定してもよい(Zinn-Justinら(1992年)Biochemistry 31巻、11335〜11347頁;Zinn-Justinら(1993年)Biochemistry 32巻、6884〜6891頁)。
X線結晶学に関して、結晶化は、当業界において公知の方法(例えばGiegeら(1994年)Acta Crystallogr. D50巻:339〜350頁;McPherson(1990年)Eur. J. Biochem. 189巻:1〜23頁)のいずれか、例えば、マイクロバッチ(例えばChayen(1997年)Structure 5巻:1269〜1274頁)、ハンギングドロップ蒸気拡散(例えばMcPherson(1976年)J. Biol. Chem. 251巻:6300〜6303頁)、シーディングおよび透析などを使用して達成することができる。少なくとも約1mg/mL、好ましくは約10mg/mLから約20mg/mLの濃度を有するタンパク質調製物を使用することが望ましい。結晶化は、ポリエチレングリコール1000〜20,000(PEG;平均分子量は約1000から約20,000Daの範囲)、好ましくは約5000から約7000Da、より好ましくは約6000Daを約10%から約30%(w/v)の範囲の濃度で含有する沈殿剤溶液中で最もよく達成することができる。また、タンパク質安定化剤、例えばグリセロールを約0.5%から約20%の範囲の濃度で含むことも望ましい場合がある。塩化ナトリウム、塩化リチウムまたはクエン酸ナトリウムなどの好適な塩も、沈殿剤溶液中において、好ましくは約1mMから約1000mMの範囲の濃度で、望ましい場合がある。沈殿剤は、好ましくは約3.0から約5.0、好ましくは約4.0のpHに緩衝化される。沈殿剤溶液中で有用な特定の緩衝液は変更してもよく、当業界において周知である(Scopes、Protein Purification:Principles and Practice、第3版、(1994年)Springer-Verlag、New York)。有用な緩衝液の例としては、これらに限定されないが、HEPES、トリス、MESおよび酢酸塩が挙げられる。結晶は、2℃、4℃、8℃および26℃などの様々な温度で成長させることができる。
抗体:抗原の結晶は、周知のX線回折技術を使用して研究することができ、これらの開示が参照によりそれらの全体が本明細書に組み入れられる、X−PLOR(Yale University、1992年、Molecular Simulations,Inc.により配信;例えばBlundellおよびJohnson(1985年)Meth. Enzymol. 114巻および115巻、H. W. Wyckoffら編、Academic Press);米国特許出願公開第2004/0014194号を参照)、およびBUSTER(Bricogne(1993年)Acta Cryst. D49巻:37〜60頁;Bricogne(1997年)Meth. Enzymol. 276A巻:361〜423頁、CarterおよびSweet編;Roversiら(2000年)Acta Cryst. D56巻:1313〜1323頁)などのコンピューターソフトウェアを使用して精製することができる。
抗体競合アッセイは、本明細書に記載される場合、抗体が別の抗体と「同じエピトープに結合する」かどうかを決定するために使用することができる。典型的には、エピトープと相互作用することが公知の抗体が、第2の抗体と、第2の抗体が過量であり第1の抗体が全ての部位を飽和させる条件下で、50%またはそれより多く、60%またはそれより多く、70%またはそれより多く、例えば70%、71%、72%、73%、74%、75%、80%、85%、90%、95%またはそれより多く競合することが、抗体が「同じエピトープに結合する」ことを示す。2つの抗体間の競合のレベルを評価するために、例えば、ラジオイムノアッセイまたは抗体のための他の標識を使用するアッセイを使用することができる。例えば、ジカウイルスEP抗原は、標識された化合物(例えば、H、125I、ビオチン、またはルビジウム)にコンジュゲートした飽和量の第1の抗EP抗体またはその抗原結合性断片と、同じ量の第2の非標識抗EP抗体の存在下でインキュベートすることができる。次いで非標識ブロッキング抗体の存在下で抗原に結合する標識された抗体の量を評価し、非標識ブロッキング抗体の非存在下における結合と比較する。競合は、ブロッキング抗体の非存在と比較した、非標識ブロッキング抗体の存在下における結合シグナルのパーセンテージの変化によって決定される。したがって、ブロッキング抗体の非存在下における結合と比較してブロッキング抗体の存在下において標識された抗体の結合の50%の阻害がある場合、2つの抗体間の50%の競合がある。したがって、50%またはそれより多く、60%またはそれより多く、70%またはそれより多く、例えば70%、71%、72%、73%、74%、75%、80%、85%、90%、95%またはそれより多くの第1および第2の抗体間の競合という言及は、第1の抗体が抗原への第2の抗体の結合を、50%、60%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、80%、85%、90%、95%またはそれより多く(第1の抗体の非存在下における第2の抗体による抗原の結合と比較して)阻害する(または逆もまた同様)ことを意味する。したがって、50%、60%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、80%、85%、90%、95%またはそれより多くの、第2の抗体による抗原への第1の抗体の結合の阻害は、2つの抗体が同じエピトープに結合することを示す。
動物モデルでの治療効能に関する抗体の試験
動物モデルは、ジカウイルスEPに対する抗体の治療効能を試験するのに効果的である。ある特定の実施形態では、ジカ感染にげっ歯類(すなわち、マウス)を使用することができる。簡単に言えば、成体マウスの50%致死量のおよそ300倍を腹膜内に接種することにより、マウス適合化ジカウイルス株(例えば、H/PF/2013(French Polynesia 2013年))でマウスを攻撃する。ある特定の実施形態では、ジカ感染にモルモットを使用することができる。モルモットは、モルモット適合化ウイルスで攻撃される。加えて、ある特定の実施形態では、非ヒト霊長類を、感染の動物モデルとして使用する。全ての動物モデルにおいて、治療効能に関して試験するために、抗体は、感染の24または48時間後に投与することができる。一部の実施形態では、予防効能に関して試験するために、抗体は、感染の24または48時間前に投与する。
ジカウイルスを予防または処置する抗体の効能を、動物の死亡率、ウイルス負荷、および/または体重を長期にわたり分析することによって決定する。一部の実施形態では、ジカウイルスに感染した未処置の動物は、感染後10〜11日以内に死亡する。一部の実施形態では、ジカウイルス感染の前または後に本明細書に記載の抗ジカ抗体で処置した動物は、未処置の動物と比較して、有意に長く生存する。一部の実施形態では、ジカウイルス感染の前または後に本明細書に記載の抗ジカ抗体で処置した動物は、最大で22日間生存する。一部の実施形態では、ジカウイルス感染の前または後に本明細書に記載の抗ジカ抗体で処置した動物は、未処置の動物と比較して、長期にわたり体重を維持する。一部の実施形態では、ジカウイルス感染の前または後に本明細書に記載の抗ジカ抗体で処置した動物は、未処置の動物と比較して、低減されたウイルス負荷を有する。
一部の実施形態では、動物モデル(例えば、マウス)を使用して、妊娠中の垂直感染および胎児死亡率を処置または予防することにおける抗ジカウイルスEP抗体の効能を決定する。一部の実施形態では、動物モデルを使用して、妊娠中の垂直感染および胎児死亡率を低減するまたはそのリスクを低減することにおける抗ジカウイルスEP抗体の効能を決定する。一部の実施形態では、妊娠した動物に、適合化ジカウイルス(例えば、マウスに関してH/PF/2013)を静脈内で感染させる。本明細書に記載の抗ジカウイルスEP抗体を、感染の前または後に投与して、それぞれ治療効能または予防効能に関して試験する。一部の実施形態では、抗体の効能を、胎児生存率を決定すると共に、母親、胎児および胎盤におけるウイルス負荷を測定することによって決定する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカ抗体で処置した母親は、低減されたウイルス負荷を有する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカ抗体で処置した母親由来の胎児は、より高い生存率および低減されたウイルス負荷を有する。一部の実施形態では、胎児のより高い生存率は、パーセント致死率における低減として測定される。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカ抗体で処置した母親由来の胎盤は、低減されたウイルス負荷を有する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルス抗体で処置した母親由来の胎児は、正常な胚発生を有する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ジカウイルス抗体で処置した母親由来の胎児は、未処置の母親と比較して、正常な胚発生を有する。一部の実施形態では、未処置の母親由来の胎児は死亡する(すなわち、100%の致死率)。
免疫毒素、イムノコンジュゲートおよび抗体誘導体
別の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、細胞毒素、薬物または放射線同位体などの治療成分に連結される。細胞毒素にコンジュゲートされる場合、これらの抗体コンジュゲートは「免疫毒素」と称される。細胞毒素または細胞傷害性物質としては、細胞に有害な(例えば、細胞を殺す)あらゆる薬剤が挙げられる。
このような治療成分を抗体にコンジュゲートするための技術は当業界において周知である。
免疫毒素の毒素要素は、例えば、化学療法剤、細菌、真菌、植物または動物起源の酵素的に活性な毒素などの毒素、またはそれらの断片、または小分子毒素であり得る。
使用することができる追加の毒素およびその断片としては、ジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の非結合性の活性断片、コレラ毒素、ボツリヌス毒素、外毒素A鎖(Pseudomonas aeruginosa由来)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデシンA鎖、アルファ−サルシン、Aleurites fordiiタンパク質、ダイアンシン(dianthin)タンパク質、phytolaca Americanaタンパク質(PAPI、PAPII、およびPAP−S)、Momordica charantia阻害剤、クルシン、クロチン、Saponaria officinalis阻害剤、ゲロニン、サポリン、ミトゲリン(mitogellin)、レストリクトシン、フェノマイシン(phenomycin)、エノマイシン(enomycin)、およびトリコテシン(tricothcene)が挙げられる。小分子毒素としては、例えば、カリケアマイシン、メイタンシノイド、パリトキシンおよびCC1065が挙げられる。
また本明細書に記載の抗体は、試料の試験およびin vivoでのイメージングなどの診断目的で使用することもでき、この目的のために、抗体(またはその結合断片)を適切な検出可能な薬剤にコンジュゲートさせて、イムノコンジュゲートを形成することができる。診断目的で、適切な薬剤は、全身イメージングのためには放射性同位体を含む検出可能な標識であり、試料の試験のためには放射性同位体、酵素、蛍光標識および他の好適な抗体タグである。
ジカウイルスEP検出のために、検出可能な標識は、in vitroの診断法の分野において現在使用される様々なタイプのいずれであってもよく、このようなものとしては、コロイド金などの金属ゾルなどの微粒子標識、N、NSまたはNタイプのペプチドキレート剤と共に提供されるI125またはTc99などの同位体、蛍光マーカー、発光マーカー、リン光性マーカーなどの発色団、加えて、所与の基質を検出可能なマーカーに変換する酵素標識、および例えばポリメラーゼ連鎖反応による増幅後に顕示化されるポリヌクレオチドタグが挙げられる。好適な酵素標識としては、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼなどが挙げられる。例えば、標識は、酵素アルカリホスファターゼであってもよく、これは、1,2ジオキセタン基質、例えばアダマンチルメトキシホスホリルオキシフェニルジオキセタン(AMPPD)、3−(4−(メトキシスピロ{1,2−ジオキセタン−3,2’−(5’−クロロ)トリシクロ{3.3.1.1 3,7}デカン}−4−イル)フェニルリン酸二ナトリウム(CSPD)、加えてCDPおよびCDP−star(登録商標)、または当業者に周知の他の発光基質、例えばテルビウム(III)およびユーロピウム(III)などの好適なランタニドのキレートの変換後に化学発光の存在または形成を測定することによって検出される。検出手段は、選択された標識によって決定される。標識またはその反応生成物の発生は、標識が微粒子であり適切なレベルに累積するようなケースでは肉眼を使用して達成してもよいし、または分光光度計、ルミノメーター、蛍光分光計など機器を全て標準的な実施に従って使用して達成してもよい。
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体は、当業界において公知であり容易に入手可能な追加の非タンパク質様成分を含有するようにさらに改変されていてもよい。抗体の誘導体化に好適な成分としては、これらに限定されないが、水溶性ポリマーが挙げられる。水溶性ポリマーの非限定的な例としては、これらに限定されないが、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ−1,3−ジオキソラン、ポリ−1,3,6−トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれか)、およびデキストランまたはポリ(n−ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロピレン(propropylene)グリコールホモポリマー、プロピレン(prolypropylene)オキシド/エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば、グリセロール)、ポリビニルアルコール、ならびにそれらの混合物が挙げられる。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、その水中での安定性のために製造において利点を有し得る。ポリマーは、あらゆる分子量を有していてもよく、分岐状または非分岐状であり得る。抗体に付着したポリマーの数は様々であってもよく、1つより多くのポリマーが付着している場合、それらは同一または異なる分子であり得る。一般的に、誘導体化に使用されるポリマーの数および/またはタイプは、これらに限定されないが、改善しようとする抗体の特定の特性または機能、抗体誘導体が規定の条件下での療法に使用されるのかどうかなどの考察に基づいて決定することができる。
組成物
ある特定の実施形態では、組成物、例えば、担体(例えば、薬学的に許容される担体)と共に製剤化された、1つまたは複数の本明細書に記載のモノクローナル抗体を含有する組成物が提供される。一部の実施形態では、組成物は、複数の(例えば、2またはそれより多くの)本明細書に記載の単離された抗体の組合せを含む。好ましくは、組成物の抗体のそれぞれは、ジカウイルスEPの別個の予め選択されたエピトープに結合する。
また本明細書に記載の医薬組成物は、併用療法で、すなわち他の薬剤と組み合わせて投与することもできる。例えば、併用療法は、少なくとも1つまたは複数の追加の治療剤と共に本明細書に記載の組成物を含んでいてもよい。また他の抗体との共投与も、本開示に包含される。
本明細書で使用される場合、用語「担体」および「薬学的に許容される担体」は、生理学的に適合するありとあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張および吸収遅延剤などを含む。好ましくは、担体は、静脈内、筋肉内、皮下、非経口、脊髄または表皮投与(例えば、注射または注入による)に好適である。投与経路に応じて、活性化合物、例えば抗体は、化合物を不活性化する可能性がある酸および他の天然条件の作用から化合物を保護するための材料でコーティングされていてもよい。
「薬学的に許容される塩」は、親化合物の所望の生物活性を保持し、いかなる望ましくない毒物学的作用も付与しない塩を指す(例えば、Berge, S.M.ら(1977年)J. Pharm. Sci. 66巻:1〜19頁を参照)。このような塩の例としては、酸付加塩および塩基付加塩が挙げられる。酸付加塩としては、塩酸、硝酸、リン酸、硫酸、臭化水素酸、ヨウ化水素酸、亜リン酸などの非毒性の無機酸由来のもの、加えて脂肪族モノおよびジカルボン酸、フェニル置換アルカン酸、ヒドロキシアルカン酸、芳香族酸、脂肪族および芳香族スルホン酸などの非毒性の有機酸由来のものが挙げられる。塩基付加塩としては、ナトリウム、カリウム、マグネシウム、カルシウムなどのアルカリ土類金属由来のもの、加えてN,N’−ジベンジルエチレンジアミン、N−メチルグルカミン、クロロプロカイン、コリン、ジエタノールアミン、エチレンジアミン、プロカインなどの非毒性の有機アミン由来のものが挙げられる。
本明細書に記載の組成物は、当業界において公知の様々な方法によって投与することができる。当業者であれば認識していると予想されるように、投与の経路および/または様式は、所望の結果に応じて変更されると予想される。活性化合物は、急速な放出から化合物を保護すると予想される担体、例えばインプラント、経皮パッチ、およびマイクロカプセル化された送達系などの放出制御製剤を用いて調製することができる。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸などの生分解性の生体適合性ポリマーを使用することができる。このような調合物を調製するための多くの方法が特許化されているかまたは一般的に当業者公知である。例えば、Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems、J.R. Robinson編、Marcel Dekker, Inc.、New York、1978年を参照されたい。
ある特定の投与経路によって本明細書に記載の化合物を投与するために、その不活性化を予防する材料で化合物をコーティングするか、または化合物をそのような材料と共に投与することが必要になる場合がある。例えば、化合物は、適切な担体、例えばリポソームまたは希釈剤中で対象に投与されてもよい。許容できる希釈剤としては、塩類溶液および水性緩衝溶液が挙げられる。リポソームとしては、水中油中水型CGFエマルジョンに加えて従来のリポソームが挙げられる(Strejanら(1984年)J. Neuroimmunol. 7巻:27号)。
担体としては、滅菌注射用溶液または分散液を即時調製するための、滅菌水溶液または分散液および滅菌粉末が挙げられる。医薬活性物質のためのこのような媒体および薬剤の使用は、当業界において公知である。どのような従来の媒体または薬剤でも活性化合物に適合する限りは、本明細書に記載の医薬組成物におけるそれらの使用が予期される。補助的な活性化合物も、組成物に取り込むことができる。
治療用組成物は、典型的には、製造および貯蔵条件下で滅菌されており、安定でなければならない。組成物は、溶液、マイクロエマルジョン、リポソーム、または高い薬物濃度に好適な他の規則正しい構造として製剤化することができる。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど)、およびそれらの好適な混合物を含有する溶媒または分散媒であり得る。適した流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用、分散液のケースでは必要な粒度の維持、および界面活性剤の使用によって維持することができる。多くのケースにおいて、組成物中に、等張剤、例えば糖、マンニトール、ソルビトールなどの多価アルコール、または塩化ナトリウムを含むことが好ましいと予想される。注射用組成物の持効性吸収は、組成物中に吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸塩およびゼラチンを含ませることによって達成することができる。
滅菌注射用溶液は、適切な溶媒中に、必要に応じて上記で列挙された成分の1つまたは組合せと共に活性化合物を必要な量で取り込ませ、それに続いて滅菌精密濾過することによって調製することができる。一般的に、分散液は、ベースの分散媒および上記で列挙されたものからの必要な他の成分を含有する滅菌ビヒクルに活性化合物を取り込むことによって調製される。滅菌注射用溶液を調製するための滅菌粉末のケースでは、好ましい調製方法は、活性成分に加えてあらゆる追加の所望の成分の粉末を前もって滅菌濾過したそれらの溶液から生産する真空乾燥およびフリーズドライ(凍結乾燥)である。
投薬レジメンは、最適な所望の応答(例えば、治療応答)が提供されるように調整される。例えば、単回のボーラスが投与されてもよいし、数回分の分割用量が長期にわたり投与されてもよいし、または治療状況の緊急性により必要に応じて用量を比例的に低減または増加させてもよい。例えば、本明細書に記載の抗体は、皮下もしくは筋肉内注射によって週1回もしくは2回、または皮下もしくは筋肉内注射によって1月1回もしくは2回投与されてもよい。
投与のしやすさおよび投薬量の均一性のために、非経口用組成物を投薬単位形態で製剤化することが特に有利である。投薬単位形態は、本明細書で使用される場合、処置される対象への一体的な投薬として適した物理的に別々の単位を指し、各単位は、必要な医薬担体を併用して所望の治療作用が生じるように計算された、予め決定された量の活性化合物を含有する。本明細書に記載の投薬量単位形態に関する詳細は、(a)活性化合物の固有の特徴および達成しようとする特定の治療作用、ならびに(b)個体における感受性の処置に関してこのような活性化合物を調合する分野における固有の制限によって決定され、これらに直接依存する。
薬学的に許容される抗酸化剤の例としては、(1)水溶性抗酸化剤、例えばアスコルビン酸、塩酸システイン、硫酸水素ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、亜硫酸ナトリウムなど;(2)油溶性抗酸化剤、例えばパルミチン酸アスコルビル、ブチル化ヒドロキシアニソール(BHA)、ブチル化ヒドロキシトルエン(BHT)、レシチン、没食子酸プロピル、アルファ−トコフェロールなど;および(3)金属キレート剤、例えばクエン酸、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ソルビトール、酒石酸、リン酸などが挙げられる。
治療用組成物の場合、本明細書に記載の調合物としては、経口、経鼻、局所(頬側および舌下など)、直腸、経膣および/または非経口投与に好適なものが挙げられる。調合物は、都合のよい形態としては単位剤形で提供してもよく、薬学分野において公知のあらゆる方法によって調製されてもよい。単一の剤形を生産するために担体材料と組み合わせることができる活性成分の量は、処置される対象および特定の投与様式に応じて変更されると予想される。単一の剤形を生産するために担体材料と組み合わせることができる活性成分の量は、一般的に、治療作用をもたらす組成物の量と予想される。一般的に、この量は、100パーセントのうち、約0.001パーセントから約90パーセントの活性成分、好ましくは約0.005パーセントから約70パーセント、最も好ましくは約0.01パーセントから約30パーセントの範囲であると予想される。
膣内投与に好適な本明細書に記載の調合物としては、適切であることが当業界において公知の担体を含有する、ペッサリー、タンポン、クリーム剤、ゲル剤、ペースト剤、フォームまたはスプレー調合物も挙げられる。本明細書に記載の組成物の局所または経皮投与のための剤形としては、粉末剤、スプレー剤、軟膏、ペースト剤、クリーム剤、ローション剤、ゲル剤、液剤、パッチおよび吸入剤が挙げられる。活性化合物は、滅菌条件下で、薬学的に許容される担体と共に、さらに必要な可能性があるあらゆる保存剤、緩衝液、または噴射剤と共に混合されてもよい。
成句「非経口投与」および「非経口投与される」は、本明細書で使用される場合、通常注射による、経腸および局所投与以外の投与様式を意味し、このようなものとしては、これらに限定されないが、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹膜内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、脊髄内、硬膜外および胸骨内注射および注入が挙げられる。
本明細書に記載の医薬組成物で採用される可能性がある好適な水性および非水性担体の例としては、水、エタノール、ポリオール(例えばグリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど)、およびそれらの好適な混合物、植物油、例えばオリーブ油、ならびに注射可能な有機エステル、例えばオレイン酸エチルが挙げられる。適した流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング材料の使用、分散液のケースでは必要な粒度の維持、および界面活性剤の使用によって維持することができる。
これらの組成物はまた、保存剤、湿潤剤、乳化剤および分散剤などのアジュバントを含有していてもよい。微生物の存在の予防は、上記の滅菌手順と、様々な抗菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノールソルビン酸などの包含との両方によって確実にすることができる。糖、塩化ナトリウムなどの等張剤を組成物に含ませることも望ましい場合がある。加えて、注射可能な医薬形態の持効性吸収は、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンなどの吸収を遅延させる薬剤を含ませることによって達成することができる。
本明細書に記載の化合物がヒトおよび動物に医薬品として投与される場合、これらは、単独で、または薬学的に許容される担体と組み合わせて、例えば0.001から90%(より好ましくは、0.005から70%、例えば0.01から30%)の活性成分を含有する医薬組成物として与えることができる。
選択された投与経路に関係なく、好適な水和物の形態で使用することができる本明細書に記載の化合物、および/または本明細書に記載の医薬組成物は、当業者公知の従来の方法によって薬学的に許容される剤形に製剤化される。
本明細書に記載の医薬組成物中の活性成分の実際の投薬レベルは、患者にとって毒性にならずに、特定の患者、組成物、および投与様式ごとに所望の治療応答を達成するのに効果的な活性成分の量が達成されるように変更することができる。選択された投薬レベルは、採用される本明細書に記載の特定の組成物またはそのエステル、塩もしくはアミドの活性、投与経路、投与時間、採用される特定の化合物の排出の頻度、処置の持続時間などの様々な薬物動態学的な要因、採用される特定の組成物と組み合わせて使用される他の薬物、化合物および/または材料、処置される患者の年齢、性別、体重、状態、全身の健康状態およびそれまでの病歴、ならびに医療分野において周知の類似の要因に依存すると予想される。当業界における通常の技術を有する医師または獣医師は、必要な有効量の医薬組成物を容易に決定して、処方することができる。例えば、医師または獣医師は、所望の治療作用を達成するために必要なレベルより低いレベルで医薬組成物で用いられる本明細書に記載の化合物の投与を開始して、所望の作用が達成されるまで投薬量を徐々に増加させることができる。一般的に、本明細書に記載の組成物の好適な1日用量は、治療作用をもたらすのに有効な最も低い用量である化合物量と予想される。このような有効量は、一般的に、上述した要因によって決まると予想される。投与は、好ましくは静脈内、筋肉内、腹膜内、または皮下であり、好ましくは標的部位の近位に投与される。必要に応じて、治療用組成物の有効な1日用量は、一日中適切なインターバルで、任意選択で単位剤形により別々に投与される2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはそれより多くの下位用量(sub−dose)として投与されてもよい。本明細書に記載の化合物は単独で投与することが可能であるが、化合物を医薬製剤(組成物)として投与することが好ましい。
治療用組成物は、当業界において公知の医療用デバイスを用いて投与することができる。例えば、ある特定の実施形態では、本明細書に記載の治療用組成物は、無針の皮下注射デバイス、例えば米国特許第5,399,163号、同第5,383,851号、同第5,312,335号、同第5,064,413号、同第4,941,880号、同第4,790,824号、または同第4,596,556号で開示されたデバイスを用いて投与することができる。本発明の開示において有用な周知のインプラントおよびモジュールの例としては、制御された速度で治療薬物を投薬するための埋め込み型マイクロ注入ポンプを開示する米国特許第4,487,603号;皮膚を介して医薬を投与するための治療デバイスを開示する米国特許第4,486,194号;正確な注入速度で治療薬物を送達するための治療薬物用の注入ポンプを開示する米国特許第4,447,233号;連続的な薬物送達のための可変流量埋め込み型注入装置を開示する米国特許第4,447,224号;マルチチャンバー区画を有する浸透圧薬物送達システムを開示する米国特許第4,439,196号;および浸透圧薬物送達システムを開示する米国特許第4,475,196号が挙げられる。他の多くのこのようなインプラント、送達システム、およびモジュールは、当業者公知である。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、in vivoで適した分配が確実に達成されるように製剤化することができる。例えば、血液脳関門(BBB)は、多くの高度に親水性の化合物を排除する。本明細書に記載の治療化合物が確実にBBBを超えるように(必要に応じて)、それらを例えばリポソーム中に製剤化することができる。リポソームを製造する方法に関して、例えば、米国特許第4,522,811号;同第5,374,548号;および同第5,399,331号を参照されたい。リポソームは、特定の細胞または臓器に選択的に輸送される1つまたは複数の成分を含み、したがって標的化された薬物送達を強化することができる(例えば、V.V. Ranade(1989年)J. Clin. Pharmacol. 29巻:685頁を参照)。例示的な標的部分としては、葉酸塩またはビオチン(例えば、Lowらの米国特許第5,416,016号を参照);マンノシド(Umezawaら、(1988年)Biochem. Biophys. Res. Commun. 153巻:1038頁);抗体(P.G. Bloemanら(1995年)FEBS Lett. 357巻:140頁;M. Owaisら(1995年)Antimicrob. Agents Chemother. 39巻:180頁);界面活性プロテインA受容体(Briscoeら(1995年)Am. J. Physiol. 1233巻:134頁)であって、その様々な種が、本明細書に記載の調合物に加えて発明された分子の成分を含み得る、受容体;p120(Schreierら(1994年)J. Biol. Chem. 269巻:9090頁)が挙げられ、さらに、K. Keinanen;M.L. Laukkanen(1994年)FEBS Lett. 346巻:123頁;J.J. Killion;I.J. Fidler (1994年)Immunomethods 4巻:273頁も参照されたい。一実施形態では、本明細書に記載の治療化合物は、リポソーム中に製剤化され、ある特定の実施形態では、リポソームは、標的部分を含む。ある特定の実施形態では、リポソーム中の治療化合物は、腫瘍または感染の近位の部位にボーラス注射によって送達される。組成物は、容易なシリンジ操作性(syringability)が存在する程度に流体でなければならない。これは、製造および貯蔵条件下で安定でなければならず、細菌および菌類などの微生物の汚染作用から保護されなければならない。
組成物は、滅菌されており、シリンジによって組成物を送達できる程度に流体でなければならない。水に加えて、担体は、等張緩衝塩類溶液、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレン(polyetheylene)グリコールなど)、およびそれらの好適な混合物であり得る。適した流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用、分散液のケースでは必要な粒度の維持、および界面活性剤の使用によって維持することができる。多くのケースにおいて、組成物中に、等張剤、例えば糖、マンニトールまたはソルビトールなどの多価アルコール、および塩化ナトリウムを含むことが好ましい。注射用組成物の長期吸収は、組成物中に吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウムまたはゼラチンを含ませることによって達成することができる。
活性化合物が好適に保護される場合、上述したように、化合物は、例えば、不活性希釈剤または同化可能な食用担体と共に経口投与されてもよい。
使用および方法
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗体、二重特異性分子、および組成物は、対象においてジカウイルス感染を処置および/または予防する(例えば、それに対して免疫化する)のに使用することができる。本明細書に記載の抗体の、エンベロープタンパク質のドメインII内の融合ループに結合する能力は、フラビウイルス科内での交差反応性を示唆している。それゆえに、一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体、二重特異性分子および組成物は、フラビウイルス科の任意のメンバーを処置および/または予防する(例えば、それに対して免疫化する)のに使用することができる。
療法で使用するために、本明細書に記載の抗体は、単独かまたは免疫促進剤などの他の療法と共にのいずれかで、直接(すなわち、in vivoで)対象に投与できる。全てのケースにおいて、抗体、組成物、ならびに免疫促進剤および他の療法は、それらの所望の治療作用を発揮する有効量で投与される。用語「有効量」は、所望の生物学的な作用を実現するのに必要または十分な量を指す。当業者は、過度の実験を要せずに、経験的に特定の分子の有効量を決定することができる。
ワクチンの好ましい投与経路としては、例えば、注射(例えば、皮下、静脈内、非経口、腹膜内、髄腔内)が挙げられる。注射は、ボーラスまたは連続的な注入の形態であってもよい。他の投与経路としては、経口投与が挙げられる。
本明細書に記載の抗体はまた、アジュバントおよび他の治療剤と共投与することもできる。用語「共投与される」は、本明細書で使用される場合、用量レジメンの一部としての投与を含む、本明細書に記載の抗体およびコンジュゲートとアジュバントおよび他の薬剤との同時の、別々の、または逐次的な投与のいずれかまたは全部を含むことが理解されよう。抗体は、典型的には、単独で、またはこのような薬剤と組み合わせて担体中に製剤化される。このような担体の例としては、溶液、溶媒、分散媒、遅延剤、エマルジョンなどが挙げられる。このような医薬活性物質のための媒体の使用は当業界において周知である。分子との使用に好適な他のあらゆる従来の担体が本開示の範囲内に含まれる。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、予防適用のために利用できる。ある特定の実施形態では、予防適用は、ジカウイルス感染に対して感受性のおよび/またはジカウイルス感染の症状を示す個体におけるジカウイルス感染および/または任意の他のジカウイルス関連状態を予防する、その進行を阻害する、および/またはその発症を遅延させるための、システムおよび方法を含む。ある特定の実施形態では、予防適用は、ジカウイルス感染を有する母親の新生児における小頭症を予防する、その進行を阻害する、および/またはその発達を遅延させるための、システムおよび方法を含む。
一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、妊娠した対象におけるジカウイルス感染の垂直伝播を処置または予防するために利用される。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、妊娠した対象におけるジカウイルス感染の垂直伝播を低減するまたはそのリスクを低減するために利用される。一部の実施形態では、抗体は、ジカウイルスに感染した妊娠した対象に投与される。一部の実施形態では、抗体は、ジカウイルスに感染するリスクがある妊娠した対象に投与される。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ジカウイルスに感染したまたはジカウイルスに感染するリスクがある妊娠した対象における胎児死亡率を処置または予防するために利用される。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ジカウイルスに感染したまたはジカウイルスに感染するリスクがある妊娠した対象における胎児死亡率を低減するまたはそのリスクを低減するために利用される。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、妊娠した対象、胎児および/または胎盤におけるウイルス負荷を低減するために利用され、妊娠した対象は、ジカウイルスに感染している。ウイルス負荷は、本明細書に記載のように測定することができる。
ジカウイルスエンベロープタンパク質(EP)エピトープに基づくペプチドおよび組成物
上述した抗体は、ワクチン組成物に製剤化される。これらのワクチン組成物は、高度な抗ジカ性を有する抗体の免疫応答を惹起するために、対象を免疫化するのに採用することができる。ワクチン組成物はまた、それを必要とする対象に投与して、防御免疫応答を誘導するのにも有用である。このようなワクチン組成物は当業界において周知であり、例えば、生理学的に適合する緩衝液、保存剤、および塩類溶液など、加えてアジュバントを含む。
「アジュバント」は、特定の抗原に対する免疫応答を非特異的に増加させる薬剤であり、したがって、あらゆる所与のワクチンにおいて必要な抗原の量、および/または目的の抗原に対する十分な免疫応答をもたらすために必要な注射頻度を低減する。動物のワクチン接種に好適なアジュバントとしては、これらに限定されないが、アジュバント65(落花生油、モノオレイン酸マンニトール(mannide monooleate)およびモノステアリン酸アルミニウムを含有する);フロイント完全または不完全アジュバント;ミネラルゲル、例えば水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウムおよびアラム;界面活性剤、例えばヘキサデシルアミン、オクタデシルアミン、リゾレシチン、ジメチルジオクタデシルアンモニウムブロミド、N,N−ジオクタデシル−N’,N’−ビス(2−ヒドロキシメチル)プロパンジアミン、メトキシヘキサデシルグリセロールおよびプルロニックポリオール;ポリアニオン、例えばピラン、硫酸デキストラン、ポリIC、ポリアクリル酸およびカーボポール;ペプチド、例えばムラミールジペプチド、ジメチルグリシンおよびタフトシン;ならびに油乳濁液が挙げられる。タンパク質またはペプチドはまた、リポソームまたは他のマイクロキャリアーに取り込ませた後に投与してもよい。アジュバントおよびイムノアッセイの様々な態様に関する情報は、例えば、参照により本明細書に組み入れられるP. Tijssen、Practice and Theory of Enzyme Immunoassays、第3版、1987年、Elsevier、N.Y.によるシリーズで開示されている。
ワクチン組成物は、免疫応答を惹起するのに十分な量の所望の免疫原、例えば本開示のペプチドを含む。投与される量は、動物の質量に対して約0.0001g/kgから約1.0g/kgの範囲であってもよい。ポリクローナル抗血清を得るために、あらゆる好適な脊椎動物が容易に採用できる。動物は、好ましくは哺乳動物であり、これらに限定されないが、げっ歯類、例えばマウス、ラット、ウサギ、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、例えばヤギおよびヒツジ、霊長類、例えばサル、大型類人猿およびヒトなどが挙げられる。
ワクチン組成物は、静脈内、筋肉内、皮下、腹腔内、および/または経口などのあらゆる標準的な経路によって容易に投与される。ワクチン組成物は、好ましくは、各タイプのレシピエント動物および投与経路に適切なように製剤化されることを、技術者は理解しているものと予想される。
本開示の他の態様は、それを必要とする対象に本開示に係るワクチンの有効量を投与することによってジカウイルス感染を処置または予防する方法に関する。
本発明の開示は、以下の実施例によってさらに例示されるが、これらは、さらなる限定として解釈されないものとする。配列リスト、図面、ならびに本出願にわたり引用された全ての参考文献、特許および公開された特許出願の内容は、明示的に参照により本明細書に組み入れられる。
(実施例1)
抗ジカウイルスEP抗体の生成
抗ジカウイルスエンベロープタンパク質(EP)抗体を生成するために、エンベロープタンパク質の外部ドメインII(E−DII)中に位置するFLEP領域を調査した。どの足場を採用するかを決定するために、RCSB Protein Data Bank(PDB)を利用し、500を超える抗原−抗体の構造的複合体を、境界面形成に関して分析した。抗TDRD3(Tudorドメイン含有3)ヒト抗体が、ジカウイルスのFLEP領域と相互作用する有望な可能性を有する足場として同定された。それゆえに、この抗体を最適化のために選択して、ジカウイルスEPを標的化する抗体を生成した。抗TDRD3の重鎖および軽鎖可変領域は、それぞれ配列番号4および5に示される。
ジカウイルスEPを標的化する抗体を、Robinson, L.ら、Cell、162巻:493〜504頁(2015年)に説明されるように、エピトープ−パラトープ結合性ネットワークを計算することによって設計した。これらの抗体を、融合ループ内の残基D98、R99およびW101を標的化するように設計した。簡潔に述べると、FLEPとの複合体中の抗TDRD3抗体の結晶構造を使用して、抗原−抗体境界面にわたる様々な残基間原子間接触を決定した。CDR残基とその隣接エピトープ残基との間の相互作用を、2Dネットワークグラフでレンダリングして、結合性ネットワークを分析した。構造的分析および結合性ネットワークによって評価される、より有利な接触に寄与したCDRおよび/またはフレームワーク領域における突然変異を同定し、新たなまたは改善された接触を潜在的に媒介する様々なアミノ酸残基を分析した。生成された可変領域およびCDRは、表2および3ならびに図1Aおよび1Bに示される。
次いでこれらの抗体を、ポリエチレンイミン(PEI)を用いた一時的トランスフェクションによってFreestyle 293細胞において発現させ、プロテインAクロマトグラフィーによって精製した。精製された抗体を、IgG ELISAによって定量した。簡単に言えば、96ウェルプレートを、適切な抗原で4℃で一晩コーティングした。プレートを洗浄し、1%blott(Santa Cruz Biotechnologies)でブロックした。抗体の連続希釈液をプレートに添加し、室温で2時間インキュベートした。抗原結合したIgGを、RbαHu IgG HRPコンジュゲート二次抗体(Jackson ImmunoResearch)とその後のTMB基質(KPL)添加を使用して検出した。
(実施例2)
ジカウイルスEP抗体の結合親和性
生成された抗体がジカウイルスに結合することが可能かどうかを決定するために、サンドイッチELISAを使用した。具体的には、表2に示されるmAb3、6、7、および8を試験した。加えて、融合ループ標的化汎フラビウイルス抗体(4G2)およびHIV−1中和抗体(PGT124)を利用した。4G2の重鎖および軽鎖可変領域配列は、それぞれ配列番号12および18に記載される。PGT124の重鎖および軽鎖可変領域配列は、それぞれ配列番号13および19に記載される。PGT124抗体は、ジカウイルスの融合ループエピトープ領域の近傍に存在するN−グリカンを標的化する。
マイクロタイタープレートを、炭酸緩衝液(pH9.6)中0.05μgの精製されたマウス4G2で4℃で一晩コーティングし、10%BSAで室温で2時間ブロックした。その後、5×10pfuのジカウイルスを添加した。具体的には、株H/PF/2013(French Polynesia 2013年)、ILM(Brazil Paraiba 2015年)、またはMR766−NIID(Uganda 1947年)を利用した。室温で1時間のインキュベーション後、抗体の2倍連続希釈液を1時間添加し、その後、ヤギ抗ヒトIgG Fc交差吸着HRPコンジュゲート抗ヒトIgGを45分間添加した。抗体結合を、3,3’,5,5’−テトラメチルベンジジン(3,3',5,5'-tetramethylbenzidene)基質を添加することによって可視化し、10分後に反応を硫酸で停止させた。異なるステップ間で、プレートをPBST(PBS+0.05%Tween)で2回洗浄した。吸光度を、プレートリーダーを使用して450nmで読み取った。結果は、図2および以下の表1に示される。
これらの結果は、実施例1で生成された抗体が、様々なジカウイルス株に結合することが可能であったことを示した。
(実施例3)
ジカウイルスエンベロープタンパク質抗体の中和
抗ジカウイルス抗体がin vitroでジカウイルスを中和できるかどうかを決定するために、精製されたmAbを、ジカウイルスによるプラーク形成を阻害するそれらの能力に関して評価した。プラーク中和試験(PRNT)を、以前に説明されたように(Robinson, L.ら、Cell、162巻:493〜504頁、2015年)実施した。簡単に言えば、PRNTを、BHK−21細胞に対して実施した。RPMI維持培地(MM)中の、mAb6および8を含有する血清の2倍連続希釈液を、等しい体積中の50pfuのジカウイルス(ILM株またはH/PF/2013株)と共に1時間インキュベートし、その後BHK−21に添加した。37℃で1時間のインキュベーション後、培地を吸引し、細胞を、MM中1%のメチルセルロースで覆った。37℃で5日間の後、細胞を20%ホルムアルデヒドで固定し、1%クリスタルバイオレットで染色した。PRNT50値を、シグモイド用量応答曲線フィットを使用して決定し、逆数値として報告した。
図3Aおよび3Bに示されるように、mAb6および8は、ジカウイルスを中和することが可能であった。ILM株に関して、mAb8のPRNT50は5.122μg/mLであったが、mAb6のPRNT50は0.0597μg/mLであった。mAb8のPRNT50は、H/PF/2013株に関して5.092μg/mLであった。これらの結果は、ジカウイルスに対して生成された抗体が、ウイルスに結合しそれを中和できたことを示した。
(実施例4)
in vivoの予防および治療研究
in vitroでジカウイルスに結合しそれを中和することが可能な抗体が、in vivoで保護効能および治療効能を有するかどうかを決定するために、mAb6および8を、成体A129マウス(8〜11週齢)において試験した。A129マウスに、10pfuのH/PF/2013株(French Polynesia)を腹腔内(ip)感染させた。mAbの保護効能または予防効能を評価するために、マウスに、感染の1日前にmAb(50μg)をip注射した。治療効能を評価するために、マウスに、感染の1日後にmAb(50μg)をip注射した。mAbの効能を、死亡率、体重減少およびウイルス血症の低減を評価することによってモニターした。簡潔に言うと、マウス血液を、感染後1〜8日目に顔面静脈から収集して、リアルタイムPCRによって血清ウイルス血症レベルを測定した。マウスが感染に屈するまで、体重を毎日モニターした。マウス生存を、感染の20日後までモニターした。
図4Cおよび4Dに示されるように、ウイルス感染は、感染後10日目までに100%の死亡率を引き起こした。加えて、マウスは、神経関連疾患の症状を有した(麻痺;データ示さず)。mAb6または8による処置は、予防モデルおよび処置モデルの両方において、死亡率および体重減少を有意に低減した(図4A〜4D)。加えて、図5は、mAb6および8が、予防的または治療的のいずれかで抗体を投与したマウスにおいて、ウイルス血症を低減することができたことを示している。具体的には、ウイルス負荷は、約2〜3log低減され、ピークウイルス血症が遅延された。
これらの結果は、生成された抗ジカウイルス抗体が、予防効果および治療効果の両方を有したことを示した。
(実施例5)
in vivoの投薬量および抗体依存性感染増強研究
体重減少、ウイルス血症および生存に対する抗ジカウイルス抗体の投薬の影響を評価した。A129マウスに、ジカウイルス(株H/PF/2013)による感染の1日後に、様々な用量のmAb8(10mg/kg、2mg/kgまたは0.2mg/kg)を投与した。図6A〜6Cは、2mg/kg(約60μg)において、mAb8がウイルス血症を低減し、体重減少および生存に対する完全な保護を提供したことを示している。注目すべきことに、顕著に低い用量(0.2mg/kg(約6μg))のmAb8を投与した場合であっても、ウイルス血症または加速された死亡において、観察可能な差異は存在しなかった。これらの結果は、mAb8が、疾患の進行と関連するウイルス血症の増加を伴わずに、顕著に低い濃度であっても、部分的な保護を提供する可能性を有することを示した。
加えて、抗ジカウイルスmAb8の抗体依存性感染増強(ADE)活性を分析した。ADEは、感染が、既存の感染増強性抗体の背景において生じる場合、増加した疾患重症度を媒介すると提唱されている現象である。機構的に、感染増強性抗体が成熟および未成熟ウイルス粒子に結合し、宿主細胞上に存在するFcγ受容体の抗体係合を介してウイルス侵入を媒介する場合に、これが生じる。4G2、E53、およびE−二量体エピトープ(EDE)に対するmAbを含む、数種のFLEに対する抗体が、文献中で説明されている(Dejnirattisai Wら、2015年)。数々の研究により、DENVを、Fcγ受容体によって貪食される抗体レベルでオプソニン化した場合、ファゴソーム膜とのウイルス融合を阻害できる抗体のみが感染を予防し、したがってADEを予防することが示されている(Chan KRら、2011年、Wu Rら、2012年)。それゆえに、E−二量体境界面においてジカウイルスFLEエピトープのmAb8との係合の、融合阻害によりそのADE活性を低減する能力を試験した。
具体的には、LILRB1を発現し、したがってADEに対して高度に感受性であることが公知のTHP1.2S単球細胞を利用した。ZIKV H/PF/2013株の非常に弱い結合および中和(Kd=50.85ug/ml;PRNT50>500ug/ml)を示したmAb8の初期設計バリアントを対照として使用した(「mAb対照」)。異なる濃度の抗体を、THP1.2S単球に感染させる前に、ZIKV(株H/PF/2013)と共に1時間インキュベートした。70時間後、培養上清におけるウイルス複製を、BHK21細胞に対するプラークアッセイによって測定した。図7Aに示されるように、試験した全てのmAbは、THP1.2S細胞においてADEを示したが、mAb13は、高い抗体濃度にもかかわらず、いずれのZIKV中和活性も有さずに、高いADE活性を示した。対照的に、mAb8は、別の融合ループ抗体であるがZIKVに対する中和活性を有さない4G2と匹敵する、ピーク感染増強における少なくとも3分の1低いウイルスタイターのADEを示した(図7B)。これらの結果は、実施例1で生成された抗ジカウイルスEP抗体がADEを低減することが可能であったことを示した。
(実施例6)
母児移入(maternal transfer)に対する効能
胎盤および胎児感染が、胎児死亡率と共に、ZIKVに感染した妊娠したA129マウスにおいて観察されている。それゆえに、妊娠したA129マウスにおける垂直感染および胎児死亡率を予防するmAb8の可能性を評価した。全体的研究設計は図8Aに提供される。具体的には、4日間にわたって雄性マウスと交配させた(0日目の夕方に開始し、4日目の朝に別々にした)18匹の妊娠したA129マウスに、10PFUのジカウイルス(アジア系統のH/PF/2013株)を、10日目(7〜10日目の胚、すなわちE7〜E10に対応する)に静脈内感染させた。次いでマウスを、50μgのmAb8(n=9)またはアイソタイプ対照IgG(n=9)で、感染後24時間(E8〜E11)にわたって処置した。マウスを、17日目(E14〜E17)に屠殺し、ウイルスRNAレベルを、12日目(血液)および17日目(血液、胎盤および胎児区画)に分析した。
この研究の結果は、図8B〜8Hに提供される。アイソタイプ対照IgG処置マウスと比較した場合、mAb8処置マウスは、12日目(p値<0.0001;両側t検定)および17日目(p値=0.018;両側t検定)に、血液中にかなり低いレベルのウイルスRNAを有する(図8Bおよび8C)。有意なことに、mAb8処置は、胎盤(p値<0.0001;両側t検定)および胎児(p値<0.0001;両側t検定)感染を低減し、胎児死亡率に対する保護を提供した。対照的に、対照群から回収した胎児は、胎児および胎盤区画における顕著なウイルス血症と共に、100%の致死率を有した(図8D〜8F)。mAb8で処置したマウスから回収した胎児は、いずれの発生上の障害も伴わずに、正常な胚発生の徴候を示した。対照的に、アイソタイプ対照IgG処置マウス由来の胎児は、回収前に死亡し、これは、正常胎児と比較した明確な形態学的差異を明らかにしている(データ示さず)。これらの結果は、本明細書に記載の抗ジカウイルス抗体が、妊娠したマウスにおける垂直感染および胎児死亡率を予防することが可能であることを示した。
(実施例7)
in vivoにおける非ヒト霊長類の研究
マカク属のカニクイザルを使用して、抗EP mAbが、高用量のZIKV感染後に投与された場合、生存を改善できるかどうか、およびそれがどの程度効果的かを試験する。
ジカウイルス(ZIKV)は、完全最小必須培地(cMEM)、2%FBS、および1%ペニシリン/ストレプトマイシン(stretopmycin)中、Vero細胞で産生される。
マカクを、処置レジメンに基づく群、加えて感染の陽性対照としてPBSのみを与えた群にランダム化する。各対象を、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中の1000PFU(筋肉内の2つの部位に各1mL)のZIKVで感染させる。群の半分は、感染後24時間で処置を開始し、群の他の半分は、感染後48時間で処置を開始する。対象を、本明細書で開示されたZIKV−EP特異的な中和抗体の1つ、mAb(25mg/kg)で、伏在静脈中の5mLの徐放性ボーラス(slow bolus)として静脈内処置する。対象を毎日モニターして、内部スコア付けプロトコールで疾患進行に関してスコア付けする。スコア付けにより、対象の状態/活動、態度、活動レベル、便/尿排出量、食物/水の摂取、体重、体温、呼吸の変化、およびスコア付けされる疾患の兆候、例えば目に見える発疹、出血、チアノーゼ、または皮膚の紅潮を等級付けする。動物がmAbを受ける前に、24時間の群では感染後1、4、7、14、21、および28日目、または48時間の群では感染の2、5、8、14、21、および28日後に、体重、体温、血液、ならびに口腔咽頭、鼻、および直腸スワブの試験を行う。
(実施例8)
ヒトの研究
ジカウイルスに感染したヒトに、本明細書で開示された単一の抗EP抗体を与える。理想的には、抗体は、感染の24または48時間後に与えられる。対象を、疾患の兆候、例えば目に見える発疹、発熱、または関節痛に関してモニターする。加えて、本明細書で開示された抗EP抗体を受けている妊娠した女性からの新生児を、小頭症に関してモニターする。ウイルスタイターもまたモニターする。
等価体
当業者は、慣例的な実験のみを使用することで、本明細書に記載の本開示の具体的な実施形態の多くの等価体を認識するか、または確認できると予想される。このような等価体は、以下の特許請求の範囲に包含されることが意図される。

Claims (64)

  1. 重鎖CDRおよび軽鎖CDRを含む、ジカウイルスエンベロープタンパク質に特異的に結合する単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、
    (i)重鎖CDR1がGFXFSTYを含み、式中、Xは、存在してもしなくてもよく、存在する場合には極性アミノ酸残基であり;
    (ii)重鎖CDR2がXGEGDSを含み、式中、Xは極性アミノ酸残基であり;
    (iii)重鎖CDR3がGYXNFYYYYTMDXを含み、式中、Xは極性アミノ酸残基であり、Xは非極性アミノ酸残基であり;
    (iv)軽鎖CDR1がRAXQSIXTFLAを含み、式中、Xは極性アミノ酸残基であり、Xは、極性アミノ酸残基または疎水性アミノ酸残基であり;
    (v)軽鎖CDR2がDASTXAXを含み、式中、XおよびXは極性アミノ酸であり;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYXを含み、式中、Xは極性アミノ酸である、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  2. (i)重鎖CDR1がGFXFSTYを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され;
    (ii)重鎖CDR2がXGEGDSを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され;
    (iii)重鎖CDR3がGYXNFYYYYTMDXを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され、Xは、AおよびVから選択され;
    (iv)軽鎖CDR1がRAXQSIXTFLAを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され、Xは、SおよびVから選択され;
    (v)軽鎖CDR2がDASTXAXを含み、式中、Xは、RおよびNから選択され、Xは、SおよびTから選択され;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYXを含み、式中、Xは、SおよびTから選択される、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  3. (i)重鎖CDR1がGFXFSTYを含み、式中、Xは存在せず;
    (ii)重鎖CDR2がXGEGDSを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され;
    (iii)重鎖CDR3がGYXNFYYYYTMDXを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され、Xは、AおよびVから選択され;
    (iv)軽鎖CDR1がRAXQSIXTFLAを含み、式中、Xは、SおよびTから選択され、Xは、SおよびVから選択され;
    (v)軽鎖CDR2がDASTXAXを含み、式中、Xは、RおよびNから選択され、Xは、SおよびTから選択され;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYXを含み、式中、Xは、SおよびTから選択される、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  4. (i)重鎖CDR1がGFSFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がSGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYSNFYYYYTMDAを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  5. (i)重鎖CDR1がGFSFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がTGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYSNFYYYYTMDAを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  6. (i)重鎖CDR1がGFTFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がTGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYSNFYYYYTMDVを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  7. (i)重鎖CDR1がGFFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がTGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYTNFYYYYTMDAを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  8. (i)重鎖CDR1がGFSFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がTGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYTNFYYYYTMDAを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  9. (iv)軽鎖CDR1がRATQSISTFLAを含み;
    (v)軽鎖CDR2がDASTRASを含み;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYSを含む、請求項1から8のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  10. (iv)軽鎖CDR1がRASQSISTFLAを含み;
    (v)軽鎖CDR2がDASTRATを含み;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYTを含む、請求項1から8のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  11. (iv)軽鎖CDR1がRATQSIVTFLAを含み;
    (v)軽鎖CDR2がDASTNASを含み;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYSを含む、請求項1から8のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  12. (i)重鎖CDR1がGFSFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がSGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYSNFYYYYTMDAを含み;
    (iv)軽鎖CDR1がRATQSISTFLAを含み;
    (v)軽鎖CDR2がDASTRASを含み;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYSを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  13. (i)重鎖CDR1がGFSFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がSGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYSNFYYYYTMDAを含み;
    (iv)軽鎖CDR1がRATQSIVTFLAを含み;
    (v)軽鎖CDR2がDASTNASを含み;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYSを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  14. (i)重鎖CDR1がGFSFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がTGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYSNFYYYYTMDAを含み;
    (iv)軽鎖CDR1がRATQSISTFLAを含み;
    (v)軽鎖CDR2がDASTRASを含み;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYSを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  15. (i)重鎖CDR1がGFTFSTYを含み;
    (ii)重鎖CDR2がTGEGDSを含み;
    (iii)重鎖CDR3がGYSNFYYYYTMDVを含み;
    (iv)軽鎖CDR1がRASQSISTFLAを含み;
    (v)軽鎖CDR2がDASTRATを含み;
    (vi)軽鎖CDR3がQQRYNWPPYTを含む、請求項1に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  16. 配列番号4に記載の重鎖可変領域を含む、ジカウイルスエンベロープタンパク質に特異的に結合する単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、
    (i)重鎖CDR1が、N28におけるアミノ酸置換または欠失、およびL29、S31、S32におけるアミノ酸置換を含み;
    (ii)重鎖CDR2が、S52、S52A、S53、Y54、G55におけるアミノ酸置換を含み;
    (iii)重鎖CDR3が、S99におけるアミノ酸欠失、ならびにK100、K100A、P100B、Y100C、F100D、S100E、G100F、W100G、A100H、およびY102におけるアミノ酸置換を含み;
    前記重鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、R94、ならびにCDR3残基T95、V96、およびR97、ならびにそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸欠失を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  17. 前記重鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、V5、Y33、A49、S50、T57、A71、T73、A78、S82B、L82C、A93、L108およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む、請求項16に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  18. 前記重鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、T68におけるアミノ酸置換をさらに含む、請求項16または17に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  19. 前記重鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、A23、W47、Y58、L80、Q81、A84、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む、請求項16または17に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  20. 前記重鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、E1、A23、R38、W47、Y58、L80、Q81、A84、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む、請求項16または17に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  21. 前記重鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、E1、A23、R38、W47、Y58、T68、L80、Q81、A84、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む、請求項16または17に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  22. (i)重鎖CDR1が、N28SまたはN28T、L29F、S31T、S32Yを含み;
    (ii)重鎖CDR2が、S52T、S52AG、S53E、Y54G、G55Dを含み;
    (iii)重鎖CDR3が、K100Y、K100ASまたはK100AT、P100BN、Y100CF、F100DY、S100EY、G100FY、W100GY、A100HT、およびY102AまたはY102Vを含む、請求項16から21のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  23. 前記重鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、R94、ならびにCDR3残基T95、V96、およびR97におけるアミノ酸欠失を含む、請求項16から22のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  24. 前記軽鎖可変領域が、配列番号5に記載のアミノ酸配列を含み、
    (i)軽鎖CDR1が、S26、V29、S31、A32、およびV33におけるアミノ酸置換を含み;
    (ii)軽鎖CDR2が、S50、S53、L54、Y55および任意選択でS56におけるアミノ酸置換を含み;
    (iii)軽鎖CDR3が、H91、P93、F94、Y95、L95B、F96、およびT97におけるアミノ酸置換、ならびにG92におけるアミノ酸欠失を含む、請求項16から23のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  25. (i)軽鎖CDR1が、S26T、V29I、S31V、A32F、およびV33Lを含み;
    (ii)軽鎖CDR2が、S50D、S53T、L54RまたはL54N、Y55A、および任意選択でS56Tを含み;
    (iii)軽鎖CDR3が、H91R、P93Y、F94N、Y95W、L95BP、F96Y、およびT97Sにおけるアミノ酸置換を含む、請求項24に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  26. 軽鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、D1、Q3、M4、S9、A13、V15、D17、V19、I21、Y22、Q38、K42、K45、S60、Q79、T85、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む、請求項16から25のいずれかに記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  27. 前記軽鎖可変領域が、Chothiaによる番号付けで、S10、V58、S76、S77、V104、およびそれらの組合せにおける少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含む、請求項26に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  28. ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合し、重鎖および軽鎖可変領域を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、重鎖および軽鎖アミノ酸配列が、
    (a)それぞれ配列番号4および14;
    (b)それぞれ配列番号4および15;
    (c)それぞれ配列番号9および16;
    (d)それぞれ配列番号4および16;
    (e)それぞれ配列番号4および17;
    (f)それぞれ配列番号8および14;
    (g)それぞれ配列番号7および17;
    (h)それぞれ配列番号6および15;
    (i)それぞれ配列番号6および5;
    (j)それぞれ配列番号7および5;
    (k)それぞれ配列番号8および5;
    (l)それぞれ配列番号9および5;
    (m)それぞれ配列番号10および5;
    (n)それぞれ配列番号11および5;
    (o)それぞれ配列番号6および14;
    (p)それぞれ配列番号6および16;
    (q)それぞれ配列番号6および17;
    (r)それぞれ配列番号7および14;
    (s)それぞれ配列番号7および15;
    (t)それぞれ配列番号7および16;
    (u)それぞれ配列番号8および15;
    (v)それぞれ配列番号8および16;
    (w)それぞれ配列番号8および17;
    (x)それぞれ配列番号9および14;
    (y)それぞれ配列番号9および15;
    (z)それぞれ配列番号9および17;
    (aa)それぞれ配列番号10および14;
    (bb)それぞれ配列番号10および15;
    (cc)それぞれ配列番号10および16;
    (dd)それぞれ配列番号10および17;
    (ee)それぞれ配列番号11および14;
    (ff)それぞれ配列番号11および15;
    (gg)それぞれ配列番号11および16;ならびに
    (hh)それぞれ配列番号11および17
    からなる群から選択される、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  29. ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合する単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、
    (a)それぞれ配列番号20、26および31に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (b)それぞれ配列番号22、28および33に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (c)それぞれ配列番号20、26および31に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (d)それぞれ配列番号20、26および31に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (e)それぞれ配列番号21、28および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (f)それぞれ配列番号21、27および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (g)それぞれ配列番号21、27および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (h)それぞれ配列番号21、27および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (i)それぞれ配列番号21、28および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (j)それぞれ配列番号22、28および33に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (k)それぞれ配列番号23、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (l)それぞれ配列番号21、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号37、43および49に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (m)それぞれ配列番号21、27および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (n)それぞれ配列番号21、28および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (o)それぞれ配列番号21、28および32に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (p)それぞれ配列番号22、28および33に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (q)それぞれ配列番号22、28および33に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (r)それぞれ配列番号23、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (s)それぞれ配列番号23、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (t)それぞれ配列番号23、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (u)それぞれ配列番号21、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号38、44および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;
    (v)それぞれ配列番号21、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号39、45および51に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列;ならびに
    (w)それぞれ配列番号21、28および34に記載の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列、ならびにそれぞれ配列番号40、46および50に記載の軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列
    からなる群から選択される重鎖CDRおよび軽鎖CDRを含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  30. ジカウイルスエンベロープタンパク質に結合し、重鎖および軽鎖可変領域を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分であって、前記重鎖可変領域が、配列番号4、6、7、8、9、10および11からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含み;前記軽鎖可変領域が、配列番号5、14、15、16、および17からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含み、ただし、前記モノクローナル抗体は、配列番号4および5を含まない、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  31. (a)それぞれ配列番号4および14;
    (b)それぞれ配列番号4および15;
    (c)それぞれ配列番号9および16;
    (d)それぞれ配列番号4および16;
    (e)それぞれ配列番号4および17;
    (f)それぞれ配列番号8および14;
    (g)それぞれ配列番号7および17;
    (h)それぞれ配列番号6および15;
    (i)それぞれ配列番号6および5;
    (j)それぞれ配列番号7および5;
    (k)それぞれ配列番号8および5;
    (l)それぞれ配列番号9および5;
    (m)それぞれ配列番号10および5;
    (n)それぞれ配列番号11および5;
    (o)それぞれ配列番号6および14;
    (p)それぞれ配列番号6および16;
    (q)それぞれ配列番号6および17;
    (r)それぞれ配列番号7および14;
    (s)それぞれ配列番号7および15;
    (t)それぞれ配列番号7および16;
    (u)それぞれ配列番号8および15;
    (v)それぞれ配列番号8および16;
    (w)それぞれ配列番号8および17;
    (x)それぞれ配列番号9および14;
    (y)それぞれ配列番号9および15;
    (z)それぞれ配列番号9および17;
    (aa)それぞれ配列番号10および14;
    (bb)それぞれ配列番号10および15;
    (cc)それぞれ配列番号10および16;
    (dd)それぞれ配列番号10および17;
    (ee)それぞれ配列番号11および14;
    (ff)それぞれ配列番号11および15;
    (gg)それぞれ配列番号11および16;ならびに
    (hh)それぞれ配列番号11および17
    からなる群から選択される重鎖および軽鎖アミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有する重鎖および軽鎖配列を含む、請求項30に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  32. ジカウイルスに対する中和活性を有する、前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  33. 前記抗体が、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgE抗体からなる群から選択される、前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  34. 前記抗体が、IgG1抗体である、請求項33に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
  35. 前記請求項のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
  36. ジカウイルス感染を処置するための方法であって、それを必要とする対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  37. 請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分の軽鎖、重鎖、または軽鎖および重鎖の両方をコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
  38. 請求項37の核酸を含む発現ベクター。
  39. 請求項38に記載の発現ベクターで形質転換した細胞。
  40. 対象におけるジカウイルス感染を予防するための方法であって、それを必要とする対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  41. 妊娠した対象における胎児へのジカウイルスの垂直感染を処置または予防するための方法であって、前記対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  42. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染している、請求項41に記載の方法。
  43. 前記妊娠した対象が、ジカウイルス感染のリスクがある、請求項41に記載の方法。
  44. 胎児ジカウイルス感染を処置または予防するための方法であって、それを必要とする妊娠した対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  45. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染している、請求項44に記載の方法。
  46. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染するリスクがある、請求項44に記載の方法。
  47. 妊娠した対象における胎児死亡率を処置または予防するための方法であって、前記対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  48. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染している、請求項47に記載の方法。
  49. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染するリスクがある、請求項47に記載の方法。
  50. 胎盤ジカウイルス感染を処置または予防するための方法であって、それを必要とする妊娠した対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  51. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染している、請求項50に記載の方法。
  52. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染するリスクがある、請求項50に記載の方法。
  53. 妊娠した対象における胎児死亡率を低減するまたはそのリスクを低減するための方法であって、前記対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  54. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染している、請求項53に記載の方法。
  55. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染するリスクがある、請求項53に記載の方法。
  56. 胎児ジカウイルス感染を低減するまたはそのリスクを低減するための方法であって、それを必要とする妊娠した対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  57. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染している、請求項56に記載の方法。
  58. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染するリスクがある、請求項56に記載の方法。
  59. 胎盤ジカウイルス感染を低減するまたはそのリスクを低減するための方法であって、それを必要とする妊娠した対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  60. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染している、請求項59に記載の方法。
  61. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染するリスクがある、請求項59に記載の方法。
  62. 妊娠した対象における胎児へのジカウイルスの垂直感染を低減するまたはそのリスクを低減するための方法であって、前記対象に、有効量の、請求項1から34のいずれか一項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性部分または請求項35に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  63. 前記妊娠した対象が、ジカウイルスに感染している、請求項62に記載の方法。
  64. 前記妊娠した対象が、ジカウイルス感染のリスクがある、請求項62に記載の方法。
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