JP2020195344A - オイル高蓄積有用藻類株の育種方法、藻類のオイル高蓄積変異株及びそれを用いた油脂の製造方法 - Google Patents
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Abstract
Description
[2]12h明期/12h暗期の昼夜周期条件におけるデンプン含有率が20重量%以下である、[1]に記載のオイル高蓄積変異株。
[3]12h明期/12h暗期の昼夜周期条件における油脂生産速度が150g/m3/日以上である、[1]又は[2]に記載のオイル高蓄積変異株。
[4]上記藻類が、クラミドモナス・スピーシーズである、[1]から[3]のいずれかに記載のオイル高蓄積変異株。
[5]上記クラミドモナス・スピーシーズが、配列番号1〜625で表されるDNA配列とそれぞれ80%以上の相同性を有するDNA配列を有する、[4]に記載のオイル高蓄積変異株。
[6]配列番号1〜625で表されるDNA配列を有する、[4]又は[5]に記載のオイル高蓄積変異株。
[7]配列番号1〜625で表されるDNA配列を有する、藻類のオイル高蓄積変異株。[8][1]から[7]のいずれかに記載のオイル高蓄積変異株を培養する工程、及び生産された油脂を回収する工程を含む、油脂の製造方法。
本発明の藻類のオイル高蓄積変異株は、昼夜ある条件で培養を行っても、十分な油脂蓄積速度を示し、高い油脂生産効率を示す株である。
藻類とは、水中生活をする同化色素を有する植物の総称であり、ミドリムシ植物、黄色植物(珪藻類を含む)、黄褐色植物、藍藻植物、褐藻植物、緑藻植物(車軸藻類を含む)及び紅藻植物が含まれる。油脂成分を高い効率で産生するという観点から、本発明においては、緑藻植物に属するクラミドモナス(Chlamydomonas)属の藻類が好ましい。
本発明における藻類のオイル高蓄積変異株は、従来の藻類に対してイオンビーム照射によるランダムな突然変異誘発と、フローサイトメトリ―による高速スクリーニングを組合せた選抜育種を実施して得られた株である。このような藻類としては、上述したとおり、緑藻植物に属するクラミドモナス(Chlamydomonas)属の藻類が好ましく、クラミドモナスの中でも、特に油脂成分を高い効率で産生するクラミドモナス・スピーシーズJSC4株(Chlamydomonas sp. JSC4:本明細書中、単に「JSC4株」ともいう)が好ましい。
ここで、クラミドモナス・スピーシーズJSC4株は以下の手順により得られた株である。即ち、台湾中西部の海岸で採取した汽水試料から、常法により1細胞だけを単離し、無菌化した。これを、HSM寒天培地を用いて、20℃、8〜15μmol photons/m2/s、12時間明期12時間暗期の光条件で培養し、2週間に1度植え継ぐことで藻株を確立し、形態観察その他よりクラミドモナス属の緑藻と同定して、JSC4株と名づけられた。このJSC4株は、2014年3月5日付で独立行政法人製品評価技術基盤機構特許生物寄託センター(千葉県木更津市かずさ鎌足2−5−8)にプタベスト条約の規定下で受託番号FERM BP−22266として、国際寄託されている。JSC4株のクラミドモナス・スピーシーズJSC4株の藻類学的性質は以下の通りである。
(1)栄養型細胞は、楕円形であり、大きさは、約10μmである。栄養型細胞において、細胞長の約等倍の鞭毛を2本有する。栄養型細胞は、運動性を有する。
(2)栄養型細胞は外囲を細胞壁に囲まれ、内部に核、葉緑体が一個存在し、その他、ミトコンドリア、ゴルジ体、液胞、デンプン粒、油滴等が認められる。葉緑体内の基底部にピレノイドを有する。
生殖様式
(1)内生胞子は栄養細胞内に二〜八個形成され、細胞内に均等に分布する。内生胞子はその細胞内に核、葉緑体を一個有する。
(2)二分裂による増殖も行う。
生理学・生化学性状
(1)培養液:海産や汽水産及び海水塩を含む培養液中で生育できる。
(2)光合成能:光合成による光独立栄養生育ができる。
(3)含有色素:クロロフィルa、クロロフィルb、及び他のカロテノイド類
(4)同化貯蔵物質:デンプン
(5)生育温度域:15℃〜35℃(至適温度25℃)
(6)生育pH域:pH6.0〜10.0(至適pHは7.0)
本発明のオイル高蓄積変異株は、屋外のような昼夜のある条件でも油脂蓄積速度が速く、昼夜条件における油脂生産速度が150g/m3/日以上である。
(1)突然変異の導入
昼夜条件におけるオイル高蓄積株(KOR)の育種は、従来の藻株を親株として実施することができ、親株は特に限定されないが、より効率的にオイル高蓄積変異株が得られるという観点から、上述のクラミドモナス・スピーシーズJSC4株(Chlamydomonas sp. JSC4)を親株とすることが好ましい。突然変異の導入は、細胞集団に対して、イオンビームを照射することで実施することができる。イオンビームは細胞核を通過するときに、DNA二本鎖をランダムに切断する。細胞は自らが持つ修復機能によりDNA鎖をつなぎ直すが、その際にDNA欠失など様々な突然変異が発生するとされる。照射するイオンビームとしては、突然変異を導入可能なものであれば特に限定されないが、例えば、炭素(C)、ヘリウム(He)、ネオン(Ne)あるいはアルゴン(Ar)等が挙げられ、藻類への変異導入の効率の観点から、12C5+が好ましい。クラミドモナス属に属する藻類に12C5+イオンビームを照射する場合、線量の範囲は、10〜250Gyが好ましく、20〜75Gyがより好ましい。イオンビーム照射後は、数日間の回復培養後、得られた細胞集団を変異体ライブラリとし、後述するスクリーニングを行うことができる。なお、上記回復培養は、適切な光強度の昼白色蛍光灯等の条件下で3日間以上静置することにより行われる。
昼夜条件におけるオイル高蓄積株の一次スクリーニングは蛍光活性セルソーター(fluorescence activated cell sorter,FACS)を用いて行うことができる。昼夜条件で培養した細胞の細胞内油滴を蛍光色素BODIPY、ナイルレッド等で染色し、蛍光強度の強い細胞をFACSにて分取する。個々の細胞のBODIPY蛍光、ナイルレッド蛍光等の細胞内油滴の染色に由来する蛍光及びクロロフィルの自家蛍光(細胞サイズの指標として利用)の強度をFACSで解析し、クロロフィル自家蛍光あたりのBODIPY蛍光、ナイルレッド蛍光等の細胞内油滴の染色に由来する蛍光が高い細胞(上位1〜0.5%)を分取することができる。また、上記のような昼夜条件での培養とFACSによる分取を複数回繰り返し実施することで、標的とする細胞を濃縮することも可能である。
(1)培養
変異育種により獲得した各オイル高蓄積株は、1%〜5%CO2条件、好ましくは1.5%〜2.5%CO2条件、より好ましくは2%CO2条件で、15℃〜40℃、好ましくは20℃〜35℃、より好ましくは25℃〜30℃の条件で、フラスコ等の培養器中、後述する培地に懸濁し、光合成が可能な光条件下で、2〜7日間、好ましくは3〜5日間、より好ましくは4日間程度の前培養を行い、順調に生育し、細胞数が十分となったところで、拡大培養を行い、10〜20日間、好ましくは12〜16日間、より好ましくは14日間程度、上記同様光合成が可能な光条件下にて本培養を行う。
本発明において、バイオマス量は、細胞の乾燥重量を指標として算出することができる。バイオマス量の測定は、当業者に公知の方法により行うことができ、その方法は限定されないが、例えば以下のように行うことができる。即ち、上記培養によって得られたオイル高蓄積株の細胞を秤量済みマイクロチューブに必要量回収し、蒸留水で洗浄してから終夜凍結乾燥する。乾燥後、再度マイクロチューブの重量を測定し、空のマイクロチューブ重量を減算することで回収した乾燥藻体の乾燥重量(mg)を求める。さらにこれを測定に使用した培養液量で除算することで培養液中に含まれるバイオマス量(g/L)を算出することができる。秤量後、乾燥藻体は後述するデンプン、油脂、色素類の測定に用いる。本発明のオイル高蓄積株のバイオマス量は、昼夜条件での培養によっても、十分な量となる。
本発明のオイル高蓄積株は、デンプン量が少ないことが特徴であり、12h明期/12h暗期の昼夜周期条件におけるデンプン含有率が20重量%以下である。本発明において、デンプン(炭水化物)の測定は、当業者に公知の方法により行うことができ、その方法は限定されないが、例えば以下のように行うことができる。なお、デンプンの測定には、上記バイオマスの測定実験で準備した乾燥藻体を用いる。この乾燥藻体をガラスバイアルに秤量し、4%(w/v)硫酸を加える。120℃で30分処理し、温度が十分下がったら22%(w/v)炭酸ナトリウムを添加して中和する。中和液をマイクロチューブに移し、遠心操作により固形物を除去する。上清100μLをフィルター濾過し、高速液体クロマトグラフィー(high performance liquid chromatography、HPLC)によりグルコース含有量を測定する。同様の処理を可溶性デンプンについても実施することで検量線を作成し、それをもとに乾燥藻体中に含まれるデンプン含有率(重量%)を算出することができる。
本発明のオイル高蓄積株は、油脂含有率が高いことが特徴であり、12h明期/12h暗期の昼夜周期条件における油脂含有率が通常20重量%以上であり、30重量%以上であることが好ましく、40重量%以上であることがより好ましい。また、本発明のオイル高蓄積株は、油脂生産速度が速いことも特徴であり、12h明期/12h暗期の昼夜周期条件における油脂生産速度が120g/m3/日以上であり、150g/m3/日以上であることが好ましく、180g/m3/日以上であることがより好ましい。
本発明のオイル高蓄積株は、各種色素類を含み、特にルテイン及びβカロテンの含有量が多いことが特徴である。本発明において、色素類の測定は、当業者に公知の方法により行うことができ、その方法は限定されないが、例えば以下のように行うことができる。上記バイオマスの測定実験で準備した乾燥藻体を破砕専用マイクロチューブに秤量し、マルチビーズショッカー等を用いて破砕する。具体的には、例えば、ガラスビーズ300μL分とアセトン:メタノール=1:1混合液500μLを添加し、2,700rpm,4℃,60sec ON+60sec OFF条件で30回程度処理することにより行う。破砕液を遠心分離(10,000×g,1min,4℃)し、上清を新しいマイクロチューブに回収する。破砕専用マイクロチューブに残った沈殿物にアセトン:メタノール=1:1混合溶液を加え、もう一度遠心分離操作(10,000×g,1min,4℃)により上清を回収する。この抽出操作を数回行い、破砕液上清を回収する。破砕液上清のうちの一部を新しいマイクロチューブに移し、遠心エバポレーターを用いて終夜乾固する。乾固物をクロロホルムに再溶解し、クロロホルム:アセトニトリル=2:8混合液及び20μM トランス−β−アポ−8’−カロテナール(内部標準として使用)を添加し、これを専用ガラスバイアルに100μL移し、超高速高分離液体クロマトグラフィー/フォトダイオードアレイ検出器(ultra−performance liquid chromatography/photo−diode−array、UPLC/PDA)による定量分析を行う。濃度既知の標準品を同条件で分析し、保持時間、波長445nmにおける吸収スペクトル、ピークエリア値を指標として同定と定量を行う。各種色素(ルテイン、βカロテン、クロロフィルa、クロロフィルb)の解析を行うことができる。
本発明は、上述の本発明のオイル高蓄積株を用いた油脂の製造方法も含む。本発明の油脂の製造方法は、本発明のオイル高蓄積変異株を培養する工程、及び生産された油脂を回収する工程を含むことを特徴とする。
本工程については、上述のオイル高蓄積変異株の項の培養の説明を参照されたい。
上記培養工程で得られたオイル高蓄積株から油脂成分を抽出する方法としては、通常の油脂の抽出方法を用いることができ、特に、Folch法やBligh−Dyer法に代表されるクロロホルム/メタノール系等の有機溶媒による一般的な抽出方法を用いることが可能であるが、これらに限らない。
本発明は、オイル高蓄積有用藻類株の育種方法も含む。即ち、本発明のオイル高蓄積有用藻類株の育種方法は、クラミドモナス属に属する藻類にイオンビームを照射してランダムな突然変異を導入する工程、及び得られた変異細胞集団から油脂含有率が高い変異株、好ましくは20重量%以上、より好ましくは30重量%以上である変異株を分離する工程を有することを特徴とする。本発明の方法によると、油脂含有率が高く、油脂の生産効率の高い有用なクラミドモナス属に属する藻類株を得ることができる。
本工程においては、クラミドモナス属に属する藻類の細胞集団に対して、イオンビームを照射する。照射するイオンビームとしては、突然変異を導入可能なものであれば特に限定されないが、例えば、炭素(C)、ヘリウム(He)、ネオン(Ne)あるいはアルゴン(Ar)等が挙げられ、藻類への変異導入の効率の観点から、12C5+が好ましい。クラミドモナス属に属する藻類に12C5+イオンビームを照射する場合、線量の範囲は、10〜250Gyが好ましく、20〜75Gyがより好ましい。イオンビーム照射後は、数日間の回復培養後、得られた細胞集団を変異体ライブラリとし、後述するスクリーニングを行うことができる。なお、上記回復培養は、例えば、適切な光強度の昼白色蛍光灯等の条件下で3日間以上静置することにより行われる。
本工程においては、上記工程で得られた変異細胞集団から、油脂含有率が高い変異株、好ましくは20重量%以上、より好ましくは30重量%以上である変異株を分離する。具体的な分離方法としては、オイル高蓄積株を蛍光活性セルソーター(fluorescence activated cell sorter,FACS)を用いて分離することができる。目的とする条件、例えば昼夜条件で培養した変異細胞集団の細胞内油滴を蛍光色素BODIPY、ナイルレッド等で染色し、蛍光強度の強い細胞をFACSにて分取する。個々の細胞のBODIPY蛍光、ナイルレッド蛍光等の細胞内油滴の染色に由来する蛍光及びクロロフィルの自家蛍光(細胞サイズの指標として利用)の強度をFACSで解析し、クロロフィル自家蛍光あたりのBODIPY蛍光、ナイルレッド蛍光等の細胞内油滴の染色に由来する蛍光が高い細胞(上位1〜0.5%)を分取することができる。また、上記のような条件での培養とFACSによる分取を複数回繰り返し実施することで、目的とする細胞を濃縮することも可能である。
(1)突然変異の導入
昼夜条件におけるオイル高蓄積株(KOR)の育種は、クラミドモナス・スピーシーズJSC4株(Chlamydomonas sp. JSC4)を親株として実施した。突然変異の導入は国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構高崎量子応用研究所のイオン照射研究施設(TIARA: Takasaki Ion accelerators for Advanced Radiation Application)にてJSC4細胞集団にイオンビームを照射することで実施した。
2段式フラスコを使用
培地:70mL mTAP
CO2:2%CO2
光:100μmol photons/m2/s蛍光灯
温度:30℃
撹拌:100rpm
昼夜条件におけるオイル高蓄積株の一次スクリーニングは蛍光活性セルソーター(fluorescence activated cell sorter,FACS)を用いて実施した。昼夜条件で培養した細胞の細胞内油滴を蛍光色素BODIPYで染色し、蛍光強度の強い細胞をFACSにて分取した。
2段式フラスコを使用
培地:70mL MB6N+2%sea salt
CO2:2%CO2
光:250 μmol photons/m2/s 蛍光灯(12h明期+12h暗期の昼夜周期条件)
温度:30℃
撹拌:100rpm
BODIPY蛍光:励起:488nmレーザー
蛍光:PEフィルター(570nm〜630nm)
クロロフィル蛍光:励起:488nmレーザー
蛍光:PerCP−Cy5.5フィルター(690nm〜750nm)
マイクロウェルプレートで候補株を培養し、細胞から油脂を蓄積してガスクロマトグラフィー質量分析(gas chromatography−mass spectrometry,GC−MS)で解析することで、昼夜条件におけるオイル高蓄積株の二次スクリーニングを実施した。
12ウェルプレートを使用した。
培地:前培養:3mL MB6N+2%sea salt
本培養1:3mL MB6N+2%sea salt
本培養2:3mL MB0N+2%sea salt
CO2:2%CO2
光:100μmol photons/m2/s 白色LED(12h明期+12h暗期の昼夜周期条件)
温度:30℃
撹拌:100rpm
(1)オイル高蓄積株の評価に向けた培養
変異育種により獲得した各オイル高蓄積株(KOR1〜4)は、本項に示す共通の培養条件にて培養し、下記の方法により評価した。
2段式フラスコを使用した。
培地:MB6N+2% sea salt
CO2:2%CO2
光:250μmol photons/m2/s 昼白色蛍光灯(12h明期+12h暗期の昼夜周期条件)
温度:30℃
撹拌:100rpm
油脂蓄積期の細胞における油滴及びデンプン粒の観察には、化学固定法と樹脂包埋超薄切片法を組み合わせた電子顕微鏡解析を利用した。解析には上記手順(1)で準備した培養10.5日目のJSC4及びKOR1細胞を用いた。培養後の細胞を固定液 (2% パラホルムアルデヒド、2% グルタルアルデヒド、50 mMカコジル酸バッファーpH=7.4)に懸濁し、4℃に終夜置くことで固定した。JSC4及びKOR1細胞の電子顕微鏡写真を図1に示す。
上記オイル高蓄積株の評価に向けた培養実験で使用したMB6N+2%sea salt培地に含まれる窒素源は硝酸ナトリウムNaNO3のみである。NaNO3は波長220nmの光をよく吸収するため、培地中に含まれるNaNO3量の測定では波長220nmにおける光学密度(OD220)を指標とした。遠心分離操作によって細胞を除去することで培養液上清を準備した。培養液上清を蒸留水で適度に希釈し、OD220を測定した。濃度既知のNaNO3を含むMB6Nを用いて検量線を作成し、これをもとに培養液上清中に含まれるNaNO3濃度を算出した。結果を図2に示す。
バイオマス量は細胞の乾燥重量を指標とした。上記オイル高蓄積株の評価に向けた培養実験にて培養した細胞を秤量済みマイクロチューブに必要量回収し、蒸留水で1回洗浄してから終夜凍結乾燥した。乾燥後、再度マイクロチューブの重量を測定し、空のマイクロチューブ重量を減算することで回収した細胞の乾燥重量(mg)を求めた。さらにこれを測定に使用した培養液量で除算することで培養液中に含まれるバイオマス量(g/L)を求めた。結果を図3に示す。なお、秤量後、乾燥藻体は後述するデンプン、油脂、色素類の測定に供した。
デンプン(厳密には炭水化物)の測定には上記バイオマスの測定実験で準備した乾燥藻体を用いた。約3mgの乾燥藻体を5mL容ガラスバイアルに秤量し、1mLの4%(w/v)硫酸を加えた。120℃で30分処理し、温度が十分下がったら22%(w/v)炭酸ナトリウムを1mL添加して中和した。中和液1mLを新しいチューブに移し、遠心操作により固形物を除去した。上清100μLをフィルター濾過し、高速液体クロマトグラフィー(High Performance Liquid Chromatography、HPLC)によりグルコース含有量を測定した。同様の処理を可溶性デンプンについても実施することで検量線を作成し、それをもとに乾燥藻体中に含まれるデンプン含有率を算出した。結果を図4に示す。
油脂の測定には上記バイオマスの測定実験で準備した乾燥藻体を用いた。約3mgの乾燥藻体を破砕専用マイクロチューブに秤量して測定に供した。0.5mm径ガラスビーズをマイクロチューブに加えてマルチビーズショッカー装置により細胞を破砕した。細胞中の油脂を脂肪酸メチル化キット(ナカライテスク社製)を用いてメチル化し、それによって生成した脂肪酸メチルエステルをガスクロマトグラフ質量分析(GC−MS)により定量した。乾燥藻体当たりの油脂含有率の結果を図5に示す。また、培養液当たりの油脂(オイル)生産量(mg/L)及び油脂(オイル)生産速度(mg/L/day(日))の経時変化を図6及び7に示す。
色素類の測定には上記バイオマスの測定実験で準備した乾燥藻体を用いた。約5mgの乾燥藻体を破砕専用マイクロチューブに秤量し、ガラスビーズ300μL分とアセトン:メタノール=1:1混合液500μLを添加した。細胞の破砕はマルチビーズショッカーを用いて次の条件にて実施した(2,700rpm,4℃,60sec ON+60sec OFF条件で30回処理)。破砕液を遠心分離(10,000×g,1min,4℃)し、上清を新しいマイクロチューブに回収した。破砕専用マイクロチューブに残った沈殿物にアセトン:メタノール=1:1混合溶液500μLを加え、もう一度遠心分離操作(10,000×g,1min,4℃)により上清を回収した。この抽出操作を計4回行い、計2mLの破砕液上清を回収した。破砕液上清のうち330μLを新しいマイクロチューブに移し、遠心エバポレーターを用いて終夜乾固した。乾固物を50μLのクロロホルムに再溶解し、425μLのクロロホルム:アセトニトリル=2:8混合液及び25μLの20μM トランス−β−アポ−8’−カロテナール(内部標準として使用)を添加した。これを専用ガラスバイアルに100μL移し、UPLC/PDAによる定量分析に供した。分析条件は下記の通りである。濃度既知の標準品を同条件で分析し、保持時間、波長445nmにおける吸収スペクトル、ピークエリア値を指標として同定と定量を行なった。
UPLC/PDA
Mobile phase
A: MeOH:H2O=1:1(v/v)
B: AcCN
Gradient
Time (min) %A %B
0 50 50
9 0 100
Column
BEH shield RP18(1.7μm,2.1mm×100mm)
Flow rate 0.6mL/min
Column temp. 30℃
Detector PDA(445nm)
Claims (9)
- 12h明期/12h暗期の昼夜周期条件における油脂含有率が30重量%以上である、藻類のオイル高蓄積変異株。
- 12h明期/12h暗期の昼夜周期条件におけるデンプン含有率が20重量%以下である、請求項1に記載のオイル高蓄積変異株。
- 12h明期/12h暗期の昼夜周期条件における油脂生産速度が150g/m3/日以上である、請求項1又は2に記載のオイル高蓄積変異株。
- 上記藻類が、クラミドモナス・スピーシーズである、請求項1から3のいずれか1項に記載のオイル高蓄積変異株。
- 上記クラミドモナス・スピーシーズが、配列番号1〜625で表されるDNA配列とそれぞれ80%以上の相同性を有するDNA配列を有する、請求項4に記載のオイル高蓄積変異株。
- 上記クラミドモナス・スピーシーズが、配列番号1〜625で表されるDNA配列を有する、請求項4又は5に記載のオイル高蓄積変異株。
- 配列番号1〜625で表されるDNA配列を有する、藻類のオイル高蓄積変異株。
- 請求項1から7のいずれか1項に記載のオイル高蓄積変異株を培養する工程、及び生産された油脂を回収する工程を含む、油脂の製造方法。
- クラミドモナス属に属する藻類にイオンビームを照射してランダムな突然変異を導入する工程、及び得られた変異細胞集団から油脂含有率が30重量%以上である変異株を分離する工程
を含む、オイル高蓄積有用藻類株の育種方法。
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