JP2020188813A - 多能性幹細胞の選択的な阻害のための方法 - Google Patents

多能性幹細胞の選択的な阻害のための方法 Download PDF

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レベッカ エル. ガンドレー
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ケニス アール. ボーラー
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Abstract

【課題】未分化多能性幹細胞を低減するか、または除去する方法を提供する。【解決手段】有効量の化合物を、異種細胞集団または、分化した細胞種及び未分化多能性幹細胞を含むか含むことが疑われるサンプルに接触することを含むことにより、前記化合物が、前記細胞集団またはサンプルからの未分化幹細胞を、選択的に低減または除去する方法。前記化合物は、STF−31、FK866またはニコチンアミド・ホスホリボシルトランスフェラーゼ(NAMPT)の他の阻害剤である。有効量は、約0.1μΜから約100μΜの間である。【選択図】図1A

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2014年1月21日に出願された米国仮出願第61/929,659号(
これは、すべての目的のために参照により組み込まれる)の優先権を主張する。
連邦政府支援研究に関する声明
本発明は、米国国立心臓・肺・血液研究所と米国国立衛生研究所によって認められた補
助金番号4R00HL094708−03の下で米国政府の支援によってなされた。米国
政府は、本発明において一定の権利を有する。
多能性幹細胞は人工多能性幹細胞(iPSCs)と胚幹細胞(ESCs)を含み、自己
再生する能力と体内でどのような機能性細胞にも分化する能力によって特徴づけられる。
従って多能性幹細胞は、研究と臨床応用のための分化体細胞種の貴重な原料である。定義
済み転写制御因子の外生の発現によって体細胞に由来するヒトiPSCs(hiPSCs
)の出現は、ヒトのESCs(hESCs)と関連した倫理問題を解決し、患者から抽出
されたとき、免疫学的合併症を防ぐかもしれない。前途有望ではあるものの、hiPSC
sの治療的な使用にはかなりの制限が未解決のままである。これらは、一貫性のない転写
制御因子発現と特異的DNAメチル化から、インビトロでの分化、腫瘍形成性と潜在的臨
床応用に影響を及ぼす散発的な点変異と染色体欠損にわたっている(Leeら、Natu
re Med.19(8):p.998−1004(2013);Robinton及び
Daley,Nature 481 :295−305(2012);Fengら、St
em Cells 28:704−712(2010);Goreら、Nature 4
71:63−67(2011))。さらに、hiPSCs有効性に関する現在の試験は、
広範囲なインビトロでの分化テスト、齧歯動物における、または生物情報科学(bioinfor
matic)の生体内奇形腫分析(Robinton及びDaley,Nature 481
295−305(2012);Maherali及びHochedlinger,Cel
l Stem Cell 3:595−605(2008))、及び遺伝子発現分析(B
ockら、Cell 144:439−452(2011);Mullerら、Nat.
Methods 8:315−317(2011))に依存しており、インターライン変
動(interline variability)を限定するためのハイスループットhiPSCs株発生の
実用的な手段とはなり得ない。
一の態様において、本発明は未分化多能性幹細胞を低減するか、または除去する方法を
提供する。ある実施態様において、この方法は、有効量の化合物と異質な細胞集団あるい
は分化細胞株と、未分化多能性肝細胞を含んでいるか含んでいるであろうサンプルと接触
することから成り、それに従ってその接触は選択的に細胞集団またはサンプルからの未分
化多能性細胞を低減するか、除去する。化合物は、STF−31、FK866またはニコ
チンアミド・ホスホリボシルトランスフェラーゼ(NAMPT)の他の阻害剤である。有
効量は、約0.1μΜから約100μΜの間である。
さらなる態様において、本発明は、未分化多能性幹細胞をほぼ含まない幹細胞由来の細
胞種の集団を得る方法を提供する。一の実施態様において、この方法は(a)未分化多能
性幹細胞を、一つ以上の幹細胞由来の細胞種へと分化または部分的に分化するために誘導
すること;(b)それにより、細胞集団から未分化多能性細胞を選択的に低減するか除去
するように、有効量の化合物を誘導した細胞集団と接触すること;そして、(c)一つ以
上の幹細胞由来の細胞種の未分化多能性幹細胞をほぼ含まない集団を得るために、接触し
た細胞を単離すること、を含む。前記化合物はSTF−31である。有効量は、約0.1
μΜから約100μΜの間である。いくつかのケースにおいて、有効量は2.5μΜであ
る。一つ以上の幹細胞由来の細胞種は、心筋細胞、神経前駆細胞、ニューロン、網膜色素
性上皮細胞、肝細胞または間葉系幹細胞である。
いくつかの実施態様では、単細胞クローンとして単離した幹細胞由来の細胞種を更に含
んでもよい。
他の態様において、本発明は、本明細書で提供される方法によって得られる未分化多能
性幹細胞をほぼ含まない、幹細胞由来の細胞種の集団を提供する。
本発明の、これらの及び他の特性、態様及び長所は、続く記載からより詳しく理解され
よう。本記載において、添付の図面を参照するが、これは、本明細書の一部を形成し、限
定ではなく説明のために本発明の実施態様が示される。好ましい実施態様の記載は、本発
明を限定するものではなく、全ての変更、同等物及び代替物を包含するものとする。した
がって、本発明の範囲を解釈するために本明細書中で記載される特許請求の範囲を参照す
べきである。
図1Aは、低分子で処理したヒト多能性幹細胞(hPSCs)のために収集されたデータを提示する。2.5μΜのSTF−31、30μΜのWZB117、20μΜのPluriSInで24時間から72時間処理した、コンフルエントなヒト人工多能性幹細胞(hiPSCs)(DF6−9−9T)の典型的な明視野像。スケールバーは50μmである。 20μΜのPluriSIn、30μΜのWZB117、2.5μΜのSTF−31で処理したhiPSCsのSYTOXgreenアッセイにより測定した細胞生存率(N=3)。 20μΜのPluriSIn、30μΜのWZB117、2.5μΜのSTF−31で処理したhiPSCsの典型的な生(カルセインAM−green)/死(エチジウムホモダイマー1−red)画像。スケールバーは100μm。 ニュートラルレッドアッセイによるコンフルエントhiPSCの24時間から72時間におけるSTF−31による滴定。 20μΜのPluriSIn、30μΜのWZB117、2.5μΜのSTF−31で処理した様々な密度のhiPSCのニュートラルレッドアッセイによる細胞生存率(N=3)。細胞形態学の典型的なイメージとプレート後24時間と96時間における密度は、それぞれの棒グラフと対になっている。スケールバーは200μm。 プレート後、24時間から72時間の細胞周期の各段階における生存hiPSCsの割合(N=3)。棒グラフはそれぞれの処理スキームのプレート毎のコロニー数の平均を示す(N=3)。データは平均±SEMとして表される。DMSOコントロールに対して、***p<0.05、**p<0.01、*p<0.001である。 細胞形成アッセイの概略図及び結果。アルカリホスファターゼ染色前の6日間培養の前に継代した(passaged)もの。矢印は個々のコロニーを示している。 細胞形成アッセイの概略図及び結果。アルカリホスファターゼ染色前の6日間培養の前に洗浄したもの。 図2は、hiPSCのインビトロでの選択的な除去のために24時間のパルス処理で得られたデータを提示する。滴定(A)とコンフルエントな、及びサブコンフルエントなhiPSC(DF6−9−9T)、線維芽細胞、DF6−9−9ThiPSC由来心筋細胞、のSTF−31(0.01〜100μΜ)、30μΜのWZB117、20μΜのPluriSIn処理から24時間後の低分子の比較(B)。平均生存率は処理開始72時間後ニュートラルレッドアッセイで測定した(N=3)。 滴定(A)とコンフルエントな、及びサブコンフルエントなhiPSC(DF6−9−9T)、線維芽細胞、DF6−9−9ThiPSC由来心筋細胞、のSTF−31(0.01〜100μΜ)、30μΜのWZB117、20μΜのPluriSIn処理から24時間後の低分子の比較(B)。平均生存率は処理開始72時間後ニュートラルレッドアッセイで測定した(N=3)。 5μΜのSTF−31で24時間処理後72時間における心筋細胞でのTNNI3とIRX4の発生量の典型的なフローサイトメトリーヒストグラム(C)(N=3)。 分化10日目に5μΜのSTF−31で24時間処理後15日目の心筋細胞TNNT2の免疫蛍光検出の典型的なイメージ(D)。上部のパネルは40倍で画像化される細胞集塊を示し、下部のパネルは100倍で画像化される構造組織を示している。上部のスケールバーは50μm、下部のスケールバーは20μmである(N=3)。 10日目心筋細胞に5μΜのSTF−31でパルス処理開始後24時間から72時間でのTNNI3、TNNT2、NKX2.5のqPCRの棒グラフ(E)。データは平均±SEMとして表される。DMSOコントロールに対して、**p<0.01である。 10日目心筋細胞との共培養におけるDF6−9−9T hiPSCコロニー検出アルカリホスファターゼ染色の典型的イメージ。 10日目ヒト繊維芽細胞との共培養におけるDF6−9−9T hiPSCコロニー検出アルカリホスファターゼ染色の典型的イメージ。 図3はSTF−31がNAD+サルベージ経路を阻害するデータを示している。図3Aはサブコンフルエント細胞とコンフルエント細胞での、ニュートラルレッド法で測定したhiPSC(DF6−9−9T)生存率におけるグルコース欠乏の影響(N=3)。 2.5μΜのSTF−31、30μΜのWZB117で処理した後のhiPSCにおけるECARとOCR(N=3)。 E8培地中で2.5μΜのSTF−31、30μΜのWZB117、20μΜのサイトカラシンBで1、15、18、24時間処理したhiPSCの溶媒対照群のパーセンテージとしてグルコース取込みを示す棒グラフ(N=3)。 グルコース欠乏、30μΜのWZB117、あるいは2.5μΜのSTF−31で処理されたサブコンフルエントなhiPSCの、完全な及び切断型カスパーゼ9、切断型カスパーゼ3、GAPDHの典型的なイムノブロット。イムノブロッティングのポジティブコントロールとして、hiPSCを1μΜカンプトテシンで3時間処理した。 20mMの2−DGで24時間、あるいは2.5μΜのSTF−31で3〜24時間処理した後のhiPSCにおけるヌクレオチド濃度(N=3)。 STF−31単独または、1または10μΜニコチン酸の存在下で処理した細胞におけるニュートラルレッド法で測定したhiPSC生存率(N=3)。各々のバーの上部は、それぞれの条件48時間処理された、細胞密度と形態を示す典型的な明視野画像である。データは平均±SEMとして表される。DMSOコントロールに対して、*p<0.05、**p<0.001である。 図4AはhPSCsのSTF−31処理における処理時間の影響を示す図である。 図4BはhPSCsの解糖阻害処理における処理時間の影響を示す図である。 図5は、STF−31がヒト胚性幹細胞(hESCs)に対して、細胞線維芽細胞の存在下で培養した時、有毒であることを示すデータを提示している。2.5μΜのSTF−31で96時間連続処理後の、有糸分裂不活性化ヒト線維芽細胞フィーダー上でのH1hESCコロニー生育の(A)アルカリホスファターゼ染色(上のパネル)と明視野画像(中央のパネル)の典型的なイメ−ジ。H1コロニーのアルカリホスファターゼ活性の染色の典型的なイメージ画像。継代後72時間で、溶媒対照群あるいは、2.5μΜのSTF−31で96時間処理(N=3)。 プレート後24から96時間の不連続的に増殖しているhiPSCにおける、BrDU取込みと7−AADの共染色の典型的な密度プロット。DMSOコントロ−ルに対して、*p<0.05、**p<0.001である。 10日目の心筋細胞との共培養におけるDF6−9−9T hiPSCコロニーを検出するアルカリホスファターゼ染色の典型的な画像。DF6−9−9Tは1e2から1e4細胞数の間でプレートされ、プレート後24時間で、5μΜのSTF−31により24時間処理した(N=2)。 図6は、PluriSInとSTF−31に仲介される毒性において、培地、タイミング、濃度の効果を示す。20〜40μΜのPluriSInと2.5μΜのSTF−31で処理後24から96時間におけるE8培地でのコンフルエントhiPSC(DF6−9−9T;a)のニュートラルレッドアッセイで測定された細胞生存能を表す棒グラフ(N=3)。DMSOコントロールに対して、*p<0.05、**p<0.01、***p<0.001である。 20〜40μΜのPluriSInと2.5μΜのSTF−31で処理後24から96時間におけるE8培地でのhESC(H1;b)のニュートラルレッドアッセイで測定された細胞生存能を表す棒グラフ(N=3)。DMSOコントロールに対して、*p<0.05、**p<0.01、***p<0.001である。 20μΜのPluriSInと2.5μΜのSTF−31で処理後24から96時間におけるTeSR培地でのコンフルエントhiPSCsのニュートラルレッドアッセイで測定した細胞生存能を表す棒グラフ(N=3)。DMSOコントロールに対して、*p<0.05、**p<0.01、***p<0.001である。 20μΜのPluriSInと2.5μΜのSTF−31で処理後24から96時間におけるTeSR培地でのhESCsのニュートラルレッドアッセイで測定された細胞生存能を表す棒グラフ(N=3)。DMSOコントロールに対して、*p<0.05、**p<0.01、***p<0.001である。 図7は代謝フラックスとアポトーシスマーカーの発現においての、グルコース欠乏、STF−31、WZB117の影響を示す。図7Aは20mMの2−デオキシ−d−グルコース(2−DG)で処理したhiPSC(DF6−9−9T)のECARとOCR。 2.5μΜのSTF−31、30μΜのWZB117、グルコース欠乏で6〜36時間処理されたサブコンフルエントなhiPSCのp−AMPKとAMPKレベルの典型的なイムノブロット(N=3)。 2.5μΜのSTF−31、30μΜのWZB117、グルコース欠乏で6から24時間処理されたサブコンフルエントなhiPSCのカスパーゼ3/7活性を表す、蛍光ベースのカスパーゼ3/7活性により測定された棒グラフ。DMSOコントロ−ルに対して、*p<0.05、***p<0.001である。 サブコンフルエントな細胞でのp−AMPK、切断型カスパーゼ3、切断型カスパーゼ9の、図3Dに対応しているイムノブロットのデンシトメトリー。hiPSCの6から36時間グルコース欠乏におけるデンシトメトリー(N=3)。 サブコンフルエントな細胞でのp−AMPK、切断型カスパーゼ3、切断型カスパーゼ9の、図3Dに対応しているイムノブロットのデンシトメトリー。hiPSCの2.5μΜのSTF−31と30μΜのWZB117の6から36時間処理におけるデンシトメトリー(N=3)。 図8はSTF−31が多能性幹細胞に有毒なことを証明するが、hiPSCs由来の子孫と最終的に分化した細胞はSTF−31の毒性に抵抗する。図8AはSTF−31処理(72時間、2.5μΜ)したhESCs、hiPSCs、及び分化した細胞の段階的なコントラスト・イメージ。 ヒトiPSC由来心筋細胞を、分化10日目に2.5μΜのSTF−31で処理し、心筋細胞マーカーのタンパク質とmRNA濃度は、72時間後にフローサイトメトリー(上部)、免疫蛍光(中央)で、24から72時間後にqRT−PCR(下部)により評価した。 ヒトiPSC由来神経前駆細胞は72時間、2.5μΜで処理し、MTTアッセイ(上部、10日目と12日目の前駆細胞)と免疫蛍光(下部、12日目前駆細胞を示す)で評価した。いずれの場合にも、STF−31で処理した心筋細胞と前駆細胞はコントロールとの区別がつかなかった。 図9Aは、STF−31の化学構造を示す。 図9Bは、FK866(NAMPTの非拮抗阻害剤)の化学構造を示す。 図10は、ヒト多能性幹細胞のFK866毒性に関するデータを提示する。棒グラフはFK866がヒト多能性幹細胞に対して有毒であることを示している。最大72時間FK866で処理したhiPSCsの細胞生存率のデータが示された。このNAMPT阻害剤による細胞死のタイミングは、STF−31で観察されたものと類似していて、濃度に依存していなかった。 ヒト多能性幹細胞FK866処理開始72時間後の細胞生存率。細胞は、連続的または24時間間隔で1nMから10μΜの濃度範囲で扱われた。 図11は、成人網膜色素上皮細胞(ARPE)とPAX6陽性神経前駆細胞がSTF−31処理に抵抗することを示しているデータを提示する。図11Aは、2.5μΜのSTF−31で最大72時間処理したヒト胚幹細胞(hESC)、ヒト人工多能性幹細胞(hiPCS)及びARP19の明視野画像。ARPE細胞において、形態学または生存能力に対する逆効果は示さなかった。5μΜSTF−31で同様の効果が示された(図示せず)。 2.5μΜのSTF−31で24時間処理したH7hESC、神経前駆細胞(分化10、12、14日目)、APRE19の細胞生存率。データは平均+S.D.(n=4);*p<0.05、**p<0.01、***p<0.001として表示する。 STF−31、及びニコチン酸(NA)で72時間処理したPAX6陽性神経前駆細胞の細胞生存率。データは72時間連続のSTF−31処理で観察された神経前駆細胞の細胞死を外因のNAの追加で救われることを示す。そして、多能性幹細胞で観察されるNAMPT阻害のメカニズムと一致している。データは平均+S.D.(n=4);*p<0.05、**p<0.01、***p<0.001として表示する。要するに、これらのデータは神経前駆細胞とARPE細胞における短期処理(24時間)が重要な毒性ではないことを示している。
本願で言及される刊行物、特許及び特許出願は全て、それぞれ個々の刊行物、特許及び
特許出願が具体的に及び個々に参照により組み込まれることが示されるかのように、それ
らの全体において参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書に記述される発明は、多能性幹細胞が、分化多能性幹細胞と未分化多能性幹細
胞の混合集団から選択的に除去されることができるという発明者の発見に、少なくとも一
部は、基づく。最終分化した成人細胞と部分的に分化したESCsとiPSCsは、一般
的に細胞代謝と成長を酸化的リン酸化に依存しているのに対し、未分化ESCsとiPS
Csは、糖分解依存的であり、グルコース取込みを仲介するための種々のグルコース輸送
体蛋白質をコードするいくつかの遺伝子を発現する。マイクロアレイとプロテオミクスを
用いて、本発明者らは、転写のいくつかのグルコース輸送体蛋白質の細胞表面局在化との
間の相関関係の不一致を確認した(例えば、GLUTl、GLUT3、及びGLUT4)
。WZB117がGLUTlの阻害を通して、本発明者らは、これまでGLUTl阻害剤
であると考えられていたSTF−31は、このようには機能せず。その代わりに、ニコチ
ンアミドアデニンジヌクレオチド(NAD+)サルベージ経路の阻害を通してhPSCを
取り除くことを発見した。これらの発見は、後に続く二つの報告と一致し、支持されてい
る。Adamsら、ACS Chem.Biol.9(10):2247−2254(2
014);Dragovichら、Bioorg Med Chem Lett 24:
954−962(2014)。これらの発見に基づいて、我々は、分化した子孫を助ける
(spares)プロセスの培養条件の範囲内で効果的にヒト多能性幹細胞を除去するためにS
TF−31を使用する新しい戦略を開発した。これらの結果は、臨床的に安全なhPSC
由来の子孫に基づくヒト幹細胞治療法の開発に向けての重要な進歩を提供する。
よって本発明は、分化した細胞の様々な細胞集団から多能性幹細胞を除去する方法を提
供する。第1の態様において、本発明の未分化多能性細胞を欠く細胞集団を得るための方
法を提供する。特に、本明細書に記載される発明は、多能性幹細胞から分化した、分化細
胞と潜在的発癌性多能性幹細胞を含まない、あるいは実質的に含まない細胞集団を得るた
めの方法を提供する。本発明の方法は、分化及び未分化細胞種を含む細胞集団からそのよ
うな未分化多能性幹細胞を低減する、あるいは除去する方法を含む。本明細書において、
細胞集団について「含まない(free)」と「実質的に含まない(substantially free)」
という語は、得られた細胞集団と比較して、単位体積当たり、約5%未満、好ましくは約
1%未満、より好ましくは約0.1%未満(例えば、5%、4%、3%、2%、1%、0
.5%、0.1%、0.05%、0.001%、0%)の未分化多能性幹細胞を含むこと
を示す。本明細書で提供される方法によって得られる細胞集団は、例えば、目視試験(例
えば、接触細胞集団における未分化多能性細胞を視覚的に識別すること)、リアルタイム
定量ポリメラーゼ連鎖反応(qRT−PCR)(例えば、多能性マ−カ−の遺伝子発現の
不在または減少を観測すること)、またはフローサイトメトリー(例えば、多能性マーカ
ー蛋白質レベルの不在または減少を観測すること)を用いて、未分化多能性幹細胞を含ま
ないあるいは実質的に含まないと、評価及び同定されうる。本明細書において、「実質的
に分化した」細胞集団という語は、少なくとも約50%、好ましくは少なくとも約60%
、70%、または80%、及びさらに好ましくは少なくとも約90%の、一または二以上
の幹細胞由来細胞種を示す分化細胞を含む細胞集団を意味する。
概して本発明の方法は、本発明の化学物質またな化合物と共に、細胞、細胞集団、ある
いはサンプルと接触することによって達成される。より詳しくは、本発明の方法は、有効
量の化学物質または化合物を、未分化多能性幹細胞または多能性幹細胞から誘導される分
化した細胞種及びを含む異種細胞集団に接触させることを含み、それによって、その接触
は、前記細胞集団またはサンプルからの未分化多能性幹細胞を選択的に低減または除去す
る。本発明が提供する方法で用いるために適当な化学物質と化合物は、他の(例えば、分
化した)細胞種に損傷を与えずに、多能性幹細胞を阻害することまたは除去することにお
いて選択性を示す。「選択的に」未分化多能性幹細胞を阻害するあるいは除去する化学物
質または化合物は、未分化多能性幹細胞の、生存能力を阻害または細胞死を促進する化学
物質または化合物であるが、実質的に分化細胞種の生存能力を阻害せず、あるいはその細
胞死を促進しない。本明細書において、「阻害する(inhibits)」、「阻害(inhibition
)」または「阻害すること(inhibiting)」という語は、任意の数値の10%と90%の
間、任意の整数値の30%と60%の間、または100%以上の減少、あるいは、1倍、
2倍、5倍、10倍もしくはそれ以上の減少を示す。本明細書において、「促進」または
「促進すること」という語は、任意の数値の10%と90%の間、任意の整数値の30%
と60%の間、または100%以上の増加、あるいは、1倍、2倍、5倍、10倍もしく
はそれ以上の増加を示す。
任意の適切な化学物質または化合物は、本明細書に記載の方法により使用することがで
きる。いくつかの態様において、本明細書に記載の方法での使用に適した化学物質または
化合物は、多くの生理的に重要なプロセスにおいて重要な役割を果たしている補酵素であ
るNAD+(ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド)(Ziegkel,Eur.J.
Biochem.267:1550−1564(2000))の活性または発現を抑制す
ることができる。NAD+合成は、ニコチンアミドをニコチンアミド・モノヌクレオチド
に変える酵素であり、哺乳類の生合成経路でニコチンアミド・モノヌクレオチド・アデニ
リルトランスフェラーゼによってニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(NAD+)に
変換されるNAMPT(ニコチンアミド・ホスホリボシルトランスフェラ−ゼ)によって
仲介される。NAMPTはNAD+生合成の速度制限因子であるので、NAMPT阻害剤
は細胞内NAD+レベルを激減する。低分子NAMPT阻害剤は、特に限定されないが、
STF−31(Chanら、Sci Transl Med.3:94ra70(201
1));FK866(別名APO866);GNE−617(N−{[4−(3 5−ジ
フルオロベンゼンサルフォニル)フェニル]メチル}イミダゾ[1,2−a]ピリジン−
6−カルボキサミド);GNE−618(N−(4−((3−(トリフルオロメチル)フ
ェニル)−スルホニル)ベンジル)−1H−ピラゾロ[3,4−b]ピリジン−5−カル
ボキサミド)、及びGMX−1778(別名CHS828)を含む。
FK866は、選択的に活性化T細胞の増殖をブロックしアポトーシスを誘導すること
が示されている(Bussoら、Plos One 3:e2267(2008))。S
TF−31(別名4−[[[[4−(l,l−ジメチルエチル)フェニル]スルフホニル
]アミノ]メチル]−N−3−ピリジニル−ベンズアミド)は、実験式C232533
で示され、DMSOに可溶であり、Tocris、EMD Millipore(Mer
ck KGaA)などの卸売業者から市販されている。GNE−617は、前にZhen
gらによって、J Med Chem.56:6413−6433(2013)に記載さ
れた。GNE−617に構造的に関連しているGNE−618は、前にZhengらによ
ってBioorg Med Chem Lett.23:5488−5497(2013
)に記載された。GMX−1778はNAD+生合成酵素NAMPTの強力かつ特異的な
阻害剤として記載されている(Watsonら、Molecular and Cell
ular Biol.29(21):5872−5888(2009))。von He
idemanら、Cancer Chemother.Pharmacol.65(6)
:1165−72(2010)も参照のこと。本明細書に記載される方法のための適切な
他のNAMPT阻害剤は、特に限定されないが、STF−31(PCT/US2012/
022113参照)に類似の構造を有する化合物、またはDragovichら、Bio
org Med Chem Lett.24(3):954−62(2014);Zhe
ngら、J Med Chem,56(16):6413−33(2013);Zhen
gら、Bioorg Med Chem Lett,23(20):5488−97(2
013)に記載されているようなGNE−617/618(参照)を含む。例えば、本明
細書に記載される方法のための適切なSTF−31に類似の構造を有する化合物は、特に
限定されないが、4−(フェニルスルフォンアミドメチル)−N−(キノリン−5−イル
)ベンズアミド(Vitas,STK647082);4−tert−ブチル−N−(4
−(ピリジン−3−イルカルバモイル)ベンジル)ベンズアミド(Otava Chem
icals,6360023);及び4−((4−メトキシフェニルスルフォンアミド)
メチル)−N−(ピリジン−3−イル)ベンズアミド(Vitas,STK643640
)を含む。
本明細書に記載の方法に適用可能な化学物質または化合物の有効量は、約1ナノモル(
nM)から約100マイクロモル(μΜ)の間の濃度(例えば、約0.5nM、1nM、
5nM、10nM、15nM、20nM、25nM、30nM、50nM、75nM、9
0nM、0.1μΜ、0.5μΜ、1μΜ、1.5μΜ、2μΜ、2.5μΜ、3μΜ、
3.5μΜ、4μΜ、4.5μΜ、5μΜ、10μΜ、15μΜ、20μΜ、30μΜ、
40μΜ、50μΜ、60μΜ、70μΜ、80μΜ、90μΜ、100μΜ)である。
ある態様においては、本明細書に記載の方法に適用可能な化学物質または化合物の有効量
は、約1μΜから約2.5μΜの間の濃度(例えば、約1、約1.5、約2、約2.5μ
Μ)である。本明細書において、有効量は、多能性幹細胞(例えば、hPSCs)を除去
することが可能な化学物質または化合物の量である。半数効果濃度は、EC50値と表現す
ることができる。STF−31の有効量は約2.5μΜであり、塩化ベンゼトニウム及び
塩化メチルベンゼトニウムのいずれの有効量よりも実質的に少ない(例えば、1μΜのS
TF−31と比較すると5μΜより多い)。FK866の有効量は、約1.0nΜから約
25nΜ(例えば、0.5nΜ、1nΜ、5nΜ、10nΜ、15nΜ、20nΜ、25
nΜ)である。20μΜのPluriSin#1への暴露に続いて、多能性幹細胞の選択
的阻害が説明されている(Ben−Davidら、Cell Stem Cell 12
(2):167−179(2013))。
本明細書に記載の方法に適用可能な化学物質及び化合物は、細胞、細胞集団、あるいは
サンプルと、任意に適切な時間接触させることができる。例えば、多能性幹細胞を排除す
る有効量の化学物質または化合物は、細胞、細胞集団、またはサンプルから、全ての多能
性幹細胞の除去を確実にするために十分な時間接触させることができる。ある実施態様に
おいては、十分な時間の長さは少なくとも1時間、2時間、6時間、12時間、24時間
、48時間、60時間、72時間、または96時間である。例えば、細胞は、STF−3
1またはFK866のような化学物質あるいは化合物に、24時間おきに新しい培養液中
に化合物を補給されながら72時間暴露することができる。化学物質または化合物の有効
量と、多能性幹細胞を選択的に除去するために必要な時間の長さは、反比例の関係にある
。言い換えると、暴露の長さは、例えば化合物(例えば、STF−31、FK866)の
有効量を増やせば、短縮することが可能である。
細胞集団から未分化多能性幹細胞を除去する化学物質や化合物の有効性は、未分化多能
性幹細胞の存在の有無を検出すること、区別された細胞種に特有のマーカーの発現を評価
すること、あるいは、未分化多能性幹細胞を選択的に除去または阻害する化学物質あるい
は化合物への接触もしくは露出後の細胞生存率の決定によって、確認する(定性的または
定量的)ことができる。RNAやタンパク質は細胞から抽出され、所望の表現型を示すマ
ーカーの存在の分析することができる(ノーザンハイブリダイゼーション、RT−PCR
法、ウエスタンブロット分析などを介して)。例えば、多能性幹細胞はSSEA−3、T
ra−1−60、Tra−1−81を含むさまざまな細胞表面マーカーで検出した。SS
EA−3+細胞は、その特定の抗原に選択性がある発色団抱合型抗体を使って見つけるこ
とができる。いくつかのケースでは、1つ以上の細胞表面マーカーは未分化の状態(例え
ば、SSEA−3、Tra−1−60、Tra−1−81)、ならびに、多能性幹細胞転
写因子Oct−4と相関しており、検出することができる。また、未分化多能性幹細胞は
典型的な幹細胞の形態を有しており、それらは文献に記載されている。
心筋細胞などの分化した細胞種はNKX2.5またはTNNT2などの心臓マーカーの
発現を検出するためのqRT−PCRを用いて識別することができる。成人多能性幹細胞
は、アルデヒド脱水素酵素(ALDH)の高発現レベルに基づいて識別することができる
。もちろん、細胞は免疫組織化学的に分析することができるか、組織特異染色を使用して
染色することができる。他のケースでは、テロメアの長さを分化の指標として用いること
ができる。一般的には、未分化幹細胞は分化した細胞よりも長いテロメアを持っているの
で、細胞はテロメラーゼ活性のレベルで評価することができる。
細胞生存能は、STF−31などの化合物を1回以上露出させた後の生存細胞のパーセ
ンテージを測定して評価することができる。細胞生存能は、種々の方法により示されるこ
とができ、トリパンブルーまたは7−アミノ−アクチノマイシンD(7−AAD)のよう
な生体染色の排除、ニュートラルレッド(3−アミノ−7−ジメチルアミノ−2−メチル
フェナジンハイドロクロライド)の吸収の減少、またはテトラゾリウム染料MTT3−(
4,5−ジメチルチアゾール−2−イル)−2,5−ジフェニルテトラゾリウムのホルマ
ザンへの還元を含むがこれに制限されない。
いくつかの態様において、本明細書で提供される方法によって得られる細胞集団は、未
分化多能性幹細胞が欠けているか、実質上欠けている幹細胞由来の細胞集団である。多能
性幹細胞は、人工多能性幹(iPS)細胞と胚幹(ES)細胞を含み、その両方は研究と
臨床応用のための分化した体細胞種の貴重なソースである。本明細書で提供され方法によ
って得られる細胞集団は、例えば多能性、オリゴ能性(oligopotent)、単能性、または
最終分化細胞種である。本明細書において、「多能性細胞」は細胞とその子孫を含み、多
能性細胞に由来する成熟した、あるいは部分的に成熟した細胞は特定の組織、器官あるい
は器官システムの細胞に制限されることを除き、多能性、オリゴ能性(oligopotent)、
及び単能性細胞に分化するか、またはそれを引き起こしうる。多能性幹細胞は、造血幹細
胞、神経幹細胞、骨髄幹細胞を含むがこれに限定されない。オリゴ能性(oligopotent)
幹細胞は腸幹細胞、乳腺幹細胞、骨髄あるいはリンパ球前駆細胞、羊水由来の細胞、間葉
系前駆細胞/多能性間質細胞/間葉系幹細胞(MSCs)、グリア限定前駆細胞、胎児肝
臓からの二分化能前駆細胞、末梢血単核細胞、肥満細胞前駆細胞、衛星細胞、皮膚幹細胞
、毛包幹細胞、基底幹細胞、造血細胞、骨髄前駆細胞、間葉系前駆細胞、グリア限定前駆
細胞、胎児肝臓からの二分化能前駆細胞、臍帯血細胞、末梢血幹細胞、羊水由来の細胞、
骨髄幹細胞、肥満細胞前駆細胞を含むがこれに限定されない。
いくつかの態様において、本明細書に提供される方法によって得られる細胞集団は、本
質的に均一で、基本的に1つの幹細胞由来の細胞種(例えば、心筋細胞、神経細胞、肝細
胞、神経幹細胞、造血幹細胞)を含む。本明細書で提供される方法により得られた細胞集
団から未分化多能性細胞の存在を検出するために、いかなる適切な方法も適用可能である
。例えば、細胞集団またはサブセットがすべての3つの胚葉(例えば、奇形腫、胚葉性奇
形腫、あるいは他の胚細胞腫瘍)に由来する細胞を含む腫瘍を作る可能性を評価するため
に、分析を行うことができる。いくつかの態様において、奇形腫分析は、1e3〜5e6
個のヒト細胞を動物の組織または器官、腎臓、精巣、筋肉内または皮下に注射することを
含む。いくつかの奇形腫分析プロトコルに従って、継代または一旦腫瘍直径が定義済みの
エンドポイントに達した後の6〜12週後に、注射により生じている腫瘍は公認病理学者
によって評価される。参考(Wesselschmidt,R.L.,Methods
Mol Biol.767:231−41(2011);Zhangら、Teratom
a formation:A tool for monitoring plurip
otency in stem cell research,in Stem Boo
k 2008:Cambridge(MA))。
本発明の細胞集団のための適切な分化細胞種は、3つの胚葉、内胚葉、中胚葉、及び外
胚葉のうちの分化した細胞種のいずれかを含む。いくつかの態様では、分化した細胞とし
ては、特に限定されないが、幹細胞由来心筋細胞、神経前駆細胞、神経細胞、血管平滑筋
細胞(複数の系統から得られる)、内皮細胞、神経細胞、網膜色素上皮細胞、肝細胞、及
び間葉系幹細胞が挙げられる。
他の態様において、本発明は、本明細書に記載の方法によって得られた幹細胞由来の孤
立した個体群を提供する。未分化多能性幹細胞を含まない、あるいは実質的に含まない幹
細胞由来の細胞腫の集団は、組織工学を含む研究と臨床応用のために有用である。
さらなる態様において、本発明は、細胞集団から選択的に未分化多能性幹細胞を低減ま
たは除去する1つ以上の化合物を含む治療製剤を提供する。好ましくは、本明細書におけ
る治療製剤は、良い医療行為と一致した方法で処方、服用、及び投与される。ここで考慮
される諸要因としては、治療されている特定の障害、扱われている特定の哺乳類(例えば
ヒト)、個々の患者の臨床症状、障害の原因、薬剤の送達部位、投与方法、投与のスケジ
ューリング、及び医師が認識している他の要因が挙げられる。化合物(例えば、NAMP
T阻害剤)は、そうである必要はないが、癌を防止するか治療する、あるいはもう1つの
臨床疾患または障害を治療するか防止するために一般に用いられている1つ以上の薬品と
ともに任意に処方される。好ましくは、本明細書で提供される治療製剤は、細胞集団から
選択的に未分化多能性細胞を低減するあるいは除去する1以上の化合物を生理的に許容で
きるキャリアー、賦形剤、あるいは安定剤と混合することにより調製される。代表的な態
様においては、治療製剤は凍結乾燥製剤または水溶液の形で調製される。
本明細書は、必要に応じて、対象に化合物あるいは治療製剤の治療的有効量を投与する
ことを含む方法も提供する。本明細書において、投与される化合物または治療製剤の「治
療的有効量」は、複合的な混合物から、実質的にすべての多能性細胞を消滅させるのに必
要な量であるか、対象の奇形腫細胞の数を減少させるのに必要な量である。代表的な態様
において、本発明の化学物質、化合物、及び製剤は、インビトロ及びインビボで、本明細
書において提供される幹細胞由来の細胞集団の投与において奇形腫形成の予防を含む、多
能性幹細胞の除去のために有用である。
許容できる担体、賦形剤、または安定剤は、その投与量と濃度において受容者に対して
非毒性であり、リン酸塩、クエン酸塩、及びその他の有機酸等の緩衝剤;アスコルビン酸
、及びメチオニンを含む酸化防止剤;防腐剤(オクタデシジメチルベンジル塩化アンモニ
ウム、塩化ヘキサメトニウム、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム;フェノール
、ブチル、ベンジルアルコール;メチルまたはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン
類;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3−ペンタノール;及びm−ク
レゾール);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、ま
たは免疫グロブリンの様なタンパク質;ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー;グリ
シン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニンまたはリジンなどのアミノ酸
;グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む単糖類、二糖類と他の炭水化物;
EDTA等のキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロース、またはソルビトー
ル等の糖;ナトリウム等の塩形成反イオン;金属錯体(例えば亜鉛蛋白質複合体);及び
/またはTWEEN(TM)、PLURONICS(TM)、またはポリエチレングリコ
ール(PEG)等の非イオン界面活性剤を含む。インビボ投与のために用いられる製剤は
、無菌である必要がある。これは無菌ろ過膜を通したろ過により容易に達成される。
治療量は、少なくとも約0.01μg/体重kg、少なくとも約0.05g/体重kg
、少なくとも約0.1g/体重kg、少なくとも約0.5g/体重kg、少なくとも約1
μg/kg体重、少なくとも約2.5g/体重kg、少なくとも約5μg/kg体重とす
ることができ、約100μg/kg体重を超えることはない。当業者であれば、このよう
な基準で有効成分の分子量を調整することを理解しうる。投与量もまた、局所投与、例え
ば全身投与、例えば筋肉内投与、腹腔内投与、経静脈投与などにより調整しうる。
他の態様において、本明細書は、対象に投与された細胞の腫瘍形成性を抑える方法を提
供する。本明細書において、「腫瘍形成性」と「腫瘍形成の性質」という語は、腫瘍を引
き起こす(cause)、作り出す(produce)、または発達させる(develop)能力(ability
)、傾向(tendency)または潜在能力(capability)を示す。腫瘍は、良性腫瘍(癌では
ない)、悪性の可能性がある腫瘍、潜在的な悪性腫瘍(前癌性腫瘍)、または悪性腫瘍で
ある場合がある。本明細書において、良性腫瘍、悪性の可能性がある腫瘍、潜在的な悪性
腫瘍としては、特に限定されないが、腺腫、ポリープ、及び奇形腫を挙げることができる
。腫瘍形成性を抑制する、あるいは低減することは、細胞の1つ以上の腫瘍形成の特性を
低減するか、予防することを含む。好ましくは、腫瘍形成性を抑える方法は、必要に応じ
て対象に、未分化多能性幹細胞あるいは部分的に分化した多能性幹細胞由来の子孫を、選
択的に低減させるか除去する有効量の化合物(例えば、NAMPT阻害剤)に接触させた
、多能性幹細胞を含む細胞組成物を投与することを含む。化合物との接触は、投与した細
胞組成物の腫瘍形成性(例えば、奇形腫形成への可能性)を抑えるために、対象への細胞
組成物の投与前、投与時、あるいは投与後に起こりうる。細胞組成物の対象への投与時ま
たは投与後に、化合物を細胞に接触させるための、化合物の有効量は、約0.1から0.
126mg/m2/時間の間とすることができる。好ましくは、対象はヒトである。細胞
組成物の細胞は、対象に対して同種異系または自源性とすることができる。好ましくは、
腫瘍形成性を抑制または低減することは、細胞組成物の中の任意の細胞の1つ以上の腫瘍
形成性あるいは潜在的腫瘍形成の特性を低減するか、弱めるか、予防することを含む。例
えば本発明の方法は、本明細書で提供される方法による細胞集団の処理と同時に行えば、
細胞組成物の腫瘍形成性の特性を阻害、抑制、または低減するために有効であり、細胞組
成物は、同種の非腫瘍形成性の細胞を含む細胞組成物の特性に、より類似した特性を示す
さらなる態様において、本発明は、対象への移植(transplantation)のための腫瘍形
成性が低減された細胞組成物を得るための方法を提供する。代表的な態様において、この
方法は、多能性幹細胞由来の集団を提供すること;集団と未分化多能性幹細胞あるいは部
分的に分化した多能性幹細胞由来の子孫を選択的に低減するかまたは除去する化合物(例
えば、NAMPT阻害剤)の有効量を接触させることを含み、それによって、接触させた
集団は、対象への移植のための細胞集団として用いられ、化合物と接触させていない多能
性幹細胞と比較して腫瘍形成性を減少させた。好ましくは、この対象はヒトである。細胞
組成物の細胞は、対象にとって同種異系または自源性であり得る。
製品
本発明の他の態様においては、インビトロまたはインビボで未分化多能性幹細胞を選択
的に除去または低減の方法に役立つ材料を含む製品を提供する。製品は、容器とラベルを
備えている。適当な容器として例えば、ボトル、ガラス瓶、注射器、及び試験管を挙げる
ことができる。いくつかの態様において、容器は、ガラスやプラスチックなどの様々な材
料で形成することができる。いくつかの態様において、容器は本明細書で提供される治療
的製剤を保持し、無菌のアクセスポートを有してもよい(例えば、容器は、静注液バッグ
または皮下注射針による突き刺しストッパーを有するバイアルでもよい)。組成物中の活
性成分は、選択的に未分化多能性幹細胞を低減するかまたは除去する化学物質または化合
物、またはその化合物の2つ以上の混合物である。容器に付した、または容器と関連する
ラベルは、その組成物が、本明細書に記載のインビトロまたはインビボ投与のために使わ
れることを示す。製品は、さらにリン酸緩衝生理食塩水、リンガー溶液、及びデキストロ
ースなどの薬学的に許容されるバッファを含む第2の容器を含んでもよい。さらに、他の
緩衝剤、希釈剤、フィルタ、針、注射器、及び使用のための指示を記載した添付文書等の
材料を含んでも良い。
本発明が様々な変更及び代替的な形態を受け入れる余地がある一方で、その具体的な実
施態様が図面において例として示されており、本明細書中で詳述する。しかし、具体的な
実施態様の本明細書中の記載は、開示される特定の形態に本発明を限定するものではない
が、それどころか、添付の特許請求の範囲により定められるような本発明の精神及び範囲
内に入る全ての変更、同等物及び代替物を包含することを理解されたい。
本発明は、次の非限定的な実施例を考慮するとより詳細に理解される。
[実施例1]NAD+サルベージ経路の阻害はヒト多能性幹細胞への効率的かつ選択的
な毒性を提供する
ヒト胚性幹細胞(hESC)と人工多能性幹細胞(hiPSC)は、ヒト多能性幹細胞
(hPSC)と呼ばれ、ほぼすべてのヒトの細胞種に分化することができる。薬物毒性テ
ストとヒトの病気モデリング[1−4]に有用な子孫に対する、hPSCの分化への効果
的な戦略の開発は目覚ましい進歩を遂げたが、依然として未解決の安全性に関する問題に
より、ヒトへの汎用が妨げられている。細胞異質性、純度、及び移植の方法は技術的な問
題を含むが、移植部位での潜在的な奇形腫形成は、臨床応用のための重大な障害である。
奇形腫形成は、少ない回数のマウスとヒトのPSC[5、6]の移植後、及びhPSC由
来細胞の注射の後[7−10]の動物モデルで報告されている。Geron試験のhES
C由来の神経前駆細胞の前臨床試験も、マウスの脊柱で嚢胞形成に終わり、ヒト対象にお
けるhESC製品の移植のためのさらなる限界を提した[11]。したがって、hPSC
に基づく治療法が広く利用されるようになる前に、移植前の潜在的な腫瘍形成性多能性幹
細胞の除去が必要とされる。
ここでは、我々はSTF−31(図9(A)に示す化学構造)が、分化した子孫を助け
るプロセスによって、培養条件の範囲内で、これらの潜在的腫瘍形成性細胞を効果的に除
去することを証明しているデータを提示する。これらの結果は、ヒト幹細胞治療法のため
の、臨床的に安全なヒト幹細胞に基づく治療のためのhPSC由来の子孫の開発に向けて
重要な進歩を提供する。
STF−31とWZB117が仲介するhPSCでの毒性を、以前報告されたhPSC
除去のための低分子であるPluriSInと直接比較した。STF−31による処理は
、24時間培養後のhiPSCの形態を変更しなかった(図1A)。しかしながら、消失
した断片、非接着細胞、及び全体の細胞数の減少が、48時間処理後に観察された(図1
A)。72時間の曝露後、STF−31は限られた数の残存細胞と共に、高毒性であった
。STF−31とは対照的に、細胞腫脹などの形態学的変化を引き起こすために、WZB
117による処理に72時間を要した、と同時にPluriSIn処理細胞の形態におい
て、最小限の変化が認められた。これらの形態的な変化は、細胞生存能力の生化学分析と
一致している。STF−31は、72時間の処理の後、SYTOX(登録商標)グリーン
核酸着色(図1B)による測定による細胞生存能力を10%に低減した。これに対して、
PluriSInまたはWZB117で処理した細胞の生存能力には有意な縮小はなかっ
た。SYTOX(登録商標)分析は死んだ細胞の存在に依存するので、カルセインAMと
エチジウムホモダイマー1による生細胞/死細胞染色も行った(図1C)。48時間のS
TF−31処理の後、生細胞の小さな断片(patches)が残った。これらの生細胞は72
時間処理の後は目視で確認出来なかった。対照的に、WZB117及びPluriSIn
はコンフルエントhPSCに対して有毒ではなかった。STF−31がこれらの状況の下
で培養されるhPSCの除去のために最も強い低分子であるように見えたので、継続的処
理の48時間後のSTF−31のhiPSCに対する50%致死量(LD50)は182n
Mであると決定した(図1D)。STF−31濃度を100μΜに増加させることは、ニ
ュートラルレッド分析で観察された有意な毒性が観察される時間を早めなかった(図1D
;図5A)。
我々はヒト多能性幹細胞で、以前報告されたPluriSInの毒性効果を完全に再現
することができなかったので、代わりの培養条件をテストした。サブコンフルエント及び
コンフルエントな細胞は、同じ密度でプレートし、異なる長さの時間(24時間、96時
間)生育させることによっても、2つの異なる密度(1.5e5、7.5e5細胞/cm
)でプレートし24時間生育させることによっても生成した(図1E)。それぞれの細
胞密度条件において、細胞をSTF−31、WZB117、またはPluriSInで7
2時間処理した。これらの比較において、STF−31による毒性を検出するのに必要な
時間は、コンフルエント及びサブコンフルエントな細胞の両方で類似しており、処理開始
後72時間での残細胞は2%足らずであった。対照的に、WZB117とPluriSI
nの毒性は、状況により異なった(図1E)。WZB117は、プレート後24時間処理
されたサブコンフルエント細胞及びコンフルエント細胞に毒性があったが、それはプレー
ト後96時間処理されたコンフルエント細胞に対するより有意に低い毒性であった。Pl
uriSInはサブコンフルエント細胞にのみ効果があり、コンフルエント細胞では有意
な毒性を引き起こさなかった。また、PluriSInの濃度を上げることは、コンフル
エント細胞においては細胞死を起こさなかった(図6)。重要なことに、3つのhESC
(HI、H7、H9)(データなし)と2つのhiPSC(KB3、DF6−9−9T)
株(図1;いくつかはデータなし)の間で、ならびにE8あるいはmTesR培地組成物
(図6)で培養されたhPSCの間で、化合物の各々に応じての細胞死は、類似していた
。その上、STF−31は、ヒト繊維芽細胞フィーダー細胞上で生育しているhESCコ
ロニーに、48〜72時間の間に起こっている毒性によって有毒であった。96時間処理
の後、毒性は明視野顕微鏡検査及びアルカリホスファターゼ染色で評価された。コロニー
は、アルカリホスファターゼ染色では見つけられなかった。陽性染色は非接着性細胞と無
細胞破片から成っている(図5A、上のパネル)。明視野顕微鏡検査は減らされた形態に
より非接着細胞でのコロニーの欠如を確認した(図5A、真ん中のパネル)。hESCの
除去を確認するために、コロニーは処理開始96時間後に継代され、加えて、72時間培
養された。コロニーの生育、もしくは、アルカリホスファターゼ活性は継代された細胞で
は検出されず、hESCの除去が示された(図5A、下のパネル)。
細胞密度は、hPSCから組織特異的後継者を生み出すために利用される多くのインビ
トロの分化プロトコルのための重要な変数である(例えば神経細胞、肝細胞、心筋細胞[
19、22、24、34])。さらに、細胞増殖率は、共通のhPSC培養条件とhPS
C株の間で変化させることもできる。STF−31がいろいろな細胞増殖率で有毒なこと
を確かめるために、hiPSCはプレート後24〜96時間、5−ブロモ−2−デオキシ
ウリジン(BrdU)(10μΜ)とともにインキュベートされ、そして、細胞周期は調
べられた(図1F;図5B)。プレート後24時間(低密度)ではG0/G1期の細胞は
8%で、プレート後96時間(高密度)ではG0/G1期の細胞は47%であった。した
がって、ここでテストされる除去のすべての方法が、急速に増殖しているhPSCに有毒
であると同時に、STF−31は、hPSCの幅広い密度範囲と増殖率でhPSCに有毒
なただ一つの薬剤だった。よってSTF−31による毒性は、hPSCが増殖率を変えた
であろうコンフルエントな培養系で有利な可能性がある。
hPSC自己再生と腫瘍形成性の防止のためのSTF−31の効果は、コロニー形成ア
ッセイにより、WZB117及びPluriSIn処理ともにインビトロで評価した。我
々は、24時間がhPSCの完全な毒性を成し遂げるSTF−31による最小の処理時間
であると決定した(図示せず)。24時間のパルス処理スキームを使って、STF−31
がコンフルエントhiPSCからのアルカリホスファターゼ陽性のコロニー形成を妨げる
ことを見出したが、PluriSIn及びWZB117は、コロニー成長(図1G)を防
げなかった。hiPSCの除去のためのSTF−31の効果のより厳しい評価として、細
胞の分離と再プレートの間のストレスに起因する誇張された細胞死を排除するために、細
胞の継代なしにコロニー構造分析を実行した(図1H)。この戦略では、STF−31、
WZB117、及びPluriSInを、コンフルエントなhiPSCに24時間適用し
、培地を6日間毎日交換した。DMSO、WZB117、及びPluriSInで処理し
たhiPSCにおいて、同様のレベルのアルカリホスファターゼ陽性細胞が観察された。
対照的に、2.5μΜのSTF−31で処理したhiPSCでは、限られた数のコロニー
が観察され、5μΜのSTF−31で処理したhiPSCではコロニーは観察されなかっ
た。これらの知見は、コンフルエントなhiPSCでは、STF−31での24時間の処
理はアルカリホスファターゼ陽性細胞の再形成を防止するが、WZB117及びPlur
iSInはコンフルエントな単層hPSCに対して効果がないことを証明する。
さらにSTF−31の有用性を評価するために、我々は分化細胞だけでなく、サブコン
フルエン及びコンフルエントhiPSC上でSTF−31の24時間のパルス処理の効果
を調べた。サブコンフルエント及びコンフルエント細胞でのSTF−31処理のLD50
、それぞれ1.35μΜ及び1.78μΜであると決定された(図2A)。図1中のデー
タと一致して、WZB117とPluriSInによる24時間の処理は、サブコンフル
エントhiPSCを除去したが、コンフルエントhiPSCを除去しなかった(図2B)
。STF−31による24時間の処理は、100μΜの濃度では線維芽細胞の生存能力を
30%低減するだけだったので、ヒト線維芽細胞に毒性を示さなかった。これらの24時
間処理のデータは、連続的に72時間線維芽細胞をSTF−31にさらした我々の前のレ
ポート[19]と一致している。この24時間のパルス処理を用いたhiPSC由来の心
筋細胞培養物に対するSTF−31のLD50は40μΜであり、hiPSCに対するLD
50より22倍高濃度であった(図2A)。処理時間を72時間まで延長することは、完全
にコミットした網膜色素上皮細胞(ARPE−19株;データ表示なし)あるいは繊維芽
細胞の細胞生存能力を減少させなかった[19]。
hPSC除去のために確立された条件を使用し、STF−31(24時間、5μΜ)の
10日目心筋細胞の機能及びマーカーに対する効果を調べた。STF−31処理は、心筋
細胞の自然発生的な収縮性(データ表示なし)に影響を及ぼさなかった。フローサイトメ
トリーで測定されるように(図2C)、STF−31によるパルス処理は、心臓マーカー
TNNI3とIRX4に影響を及ぼさず、そして処理された心筋細胞は、処理開始72時
間後に、心臓筋節で見られるTNNT2の同じ規模の構造組織を維持した(図2D)。q
−PCRで測定される心臓遺伝子の発現は、STF−31処理開始の後、有意に変化しな
った(図2E)。
分化細胞の存在下での選択的毒性を確認するために、10日目心筋細胞(図2F)また
はヒト線維芽細胞(図2G)とともにhiPSCの量を滴定することで、コロニー形成ア
ッセイを実行した。まず最初に、24時間のパルス処理を使用し、10日目心筋細胞から
大多数のhiPSCコロニーを除去する結果となったが、若干のコロニーが処理後に残っ
た(図5C)。5μΜのSTF−31による48時間のパルス処理が、完全にhiPSC
を除去することが確認された。処理後に線維芽細胞及び心筋細胞が残存しており、アルカ
リホスファターゼ染色の時点(データ表示なし)、及び処理開始後10日目までの間(デ
ータ表示なし)に、心筋細胞で自然収縮が観察された。結局、これらの発見は、STF−
31によるパルス処理が、広範囲な子孫で、残存するhPSCの選択的な除去のための効
果的な戦略であることを示す。
癌細胞において、STF−31は当初、壊死を誘発するGLUT1阻害剤だと言われて
いた[35]。しかし、STF−31とWZB117(不可逆的GLUT1阻害剤)の間
で観察するタイミング及び有効性の違いにより、hPSCにおけるSTF−31の動作メ
カニズムをさらなる調査に乗り出した。これらの研究において、hPSC除去のための方
法として以前に報告されたように、グルコース欠乏を比較のために使用した[16]。W
ZB117で観察される結果と同様に、グルコース欠乏はサブコンフルエント細胞に対し
て毒性を示したが、毒性は、コンフルエント細胞では後発性であり減少した(図3A)。
細胞外フラックス解析を使って、糖分解の情報を提供するため細胞外酸性化率(ECAR
)を測定し、ミトコンドリア呼吸を精査するために酸素の消費率(OCR)をモニターし
た。GLUT1阻害剤WZB117によるhiPSCの処理は、糖代謝の阻害剤(図7A
)である、2−デオキシグルコース(2−DG)による処理で観察されたのと同様に最初
の測定時までECARの減少をもたらした(図3B)。対照的に、STF−31処理に続
くECARの減少は、グルコース酸化の阻害剤と比較して最高15時間、有意に遅延した
(図3B)。STF−31処理されたhiPSCは、OCRの縮小が観察されるまでに1
5時間を要したので、OCRの結果はECARと類似する。この発見は、WZB117の
影響と対照的であり、それは最初の測定時点(8時間)でOCRを減少させていた(図3
B)。
糖代謝に対する影響と一致して、STF−31は、1時間の処理の後hiPSCでのグ
ルコース取込みに変化させなかった、これに対しWZB117による1時間の処理では2
0%の取り込みの減少という結果であった(図3C)。STF−31がグルコース取込み
において減少を引き起こした最初の時点は処理の後の18時間だった、そしてそれはEC
ARの減少の3時間後だった。このように、以前癌で報告されている結果[35]と一致
するグルコース取込みの有意な減少は、糖分解とミトコンドリア酸化性代謝のSTF−3
1による阻害後に起きた。グルコース取込みにおけるSTF−31遅延効果は、グルコー
ス輸送あるいはGLUT1生合成に影響する阻害剤にとっては予想外であり、GLUT1
阻害剤として報告されたSTF−31の作用メカニズムと一致していない。
WZB117とSTF−31はそれぞれ、24〜48時間と24〜72時間のアネキシ
ン染色処理で癌細胞での壊死を誘発することが報告されが、他のレポートはアポトーシス
でのグルコース飢餓によるATPの減少を関連づけた[36−38]。WZB117とS
TF−31がどのようにhiPSC死を促進するかを決定するために、サブコンフルエン
ト細胞でAMP活性化プロテインキナーゼ(p−AMPK)のリン酸化を測定することに
よって、エネルギー検知経路に対する影響が調べられた。WZB117処理とグルコース
欠乏に対応して、p−AMPKは処理後12時間という早い時期に見つけられ、そして、
AMPKの総レベルはhiPSCでのWZB117の処理後、24時間で減少した(図7
B)。STF−31処理に応じて、p−AMPKが24時間後、ECARとOCRの減少
の約8時間後に増加した。AMPK起動のタイミングは、STF−31及びグルコース欠
乏及びWZB117処理の両方の間でまったく別であるということを証明した。さらに、
WZB117処理及びグルコース欠乏細胞において、切断型カスパーゼ−3及びカスパー
ゼ−9は、12時間で観察され、36時間まで上がったままだった、そしてその時に、切
断型カスパーゼ−3及びカスパーゼ−9レベルの減少が観察される(図3D)。カスパー
ゼ3/7活性の誘導も、12時間と同様の時期に観察された(図7C)。これとは対照的
に、STF−31はかなり後でカスパーゼ3と−9の切断を引き起こし(図3D)、そし
て、これは処理の開始の後24時間のカスパーゼ3/7活性と同時だった(図7C)。こ
のように、カスパーゼによる細胞死経路の活性化を通して、WZB117とSTF−31
はhiPSCに作用するように見える。
代謝、グルコース取込み、及びカスパーゼ活性化の中の時間的な不一致は、我々にアデ
ニン及びピリジン・ヌクレオチド・レベルを測定することを促した(図4)、なぜならそ
れらは、解糖及び酸化的代謝、及び細胞生存能に作用することが知られているからである
[33]。これらの分析は、STF−31による処理で、NAD+レベルが3時間で50
%まで、18時間で1%以下まで減少することを明らかにした。ATPレベルは18時間
まで減少しない(図3E)。これらのデータは、STF−31が、NAD+新規(de novo
)合成またはサルベージ経路の阻害を導くことを示唆する。どのNAD+経路がターゲッ
トとされているかを調査するために、STF−31の存在下で、加えられる代謝物質を使
って救出実験を行った。1及び10μΜのニコチン酸の追加により、hPSCの生存能は
、それぞれ78%及び97%に回復した(図3F)。ニコチン酸は、hPSCの培養条件
中には存在せず、三つのNADサルベージ経路のうちの一つにおいて、ニコチン酸ホス
ホリボシルトランスフェラーゼ(NAPRT)により利用されうる。その代わりに、10
及び100μΜニコチンアミド(ニコチンアミド・ホスホリボシルトランスフェラーゼ(
NAMPT)の基質)の追加は、STF−31による毒性を救うことができなかった(デ
ータ表示なし)。要するに、これらのデータは、STF−31がNAMPT依存的なNA
+サルベージ経路を妨げることを示唆する。
hiPSC由来の子孫と最終分化細胞に対するSTF−31の毒性を評価するために、
STF−31の存在下で、間葉系幹細胞、線維芽細胞、網膜色素上皮細胞、hiPSC由
来心筋細胞、指定された肝内胚葉細胞、及び神経前駆細胞を培養した。これらの細胞種の
どれもが、STF−31処理で、形態または明らかな細胞死において目に見える変化を示
さなかった(図8A)。生存能測定は、これらの目視観察と一致していた。心筋細胞、神
経前駆細胞及び線維芽細胞については、図8B−Cのデータを参照のこと。重要なことに
、STF−31で処理した心筋細胞は、分化の5日目(前駆体)及び10日目(コミット
した(committed);最終分化ではない)において、自然周期的な縮小、心筋細胞マーカ
ーのタンパク質及びmRNAのレベル、及びコントロールと見分けがつかない構造的特徴
を示す(図8Bに10日目処理細胞のデータを示す)。Bohelerら、Stem C
ell Reports 3,185−203(2014)を参照のこと。要するに、こ
れらの調査結果はSTF−31が広範囲にわたるhPSC派生物にふさわしいことを示唆
する。
この研究は、hPSCの選択的毒性に対する効果的な戦略を確立し、定義する。多能性
幹細胞代謝は、酸素を使う糖分解によって特徴づけられ、ミトコンドリア膜電位を減少さ
せ、かつ同化作用プロセスに対する依存を増やした[39]。前述のように、GLUTl
の強化された発現、及び解糖代謝に対する依存は、グルコース欠乏[16]あるいはhP
SCの選択的な除去に対する戦略を裏付けるGLUTlの阻害を構成する。Bohele
rら、Stem Cell Reports 3,185−203(2014)を参照の
こと。しかし、我々の培養システムでは、グルコース欠乏、WZB117h、及びPlu
riSInは、コンフルエントな単層hPSCに毒性を示さず、5種のhPSC種及び2
つの異なる培地組成物の間で矛盾が無かった。したがって、これらの戦略は、細胞がコン
フルエントな単層を必要とするアプリケーションに理想的でない場合があるか、あるいは
hPSC由来細胞、例えば心筋細胞、肝細胞及び神経細胞の培養[19、22、24、3
4]の増殖率を変えた。
我々はhPSCがSTF−31を使って選択的にターゲットとしうることを示す。そし
て、STF−31は、分化のために細胞のコンフルエントな単層を必要とし、あるいは分
化細胞のコンフルエント単層を生じる培養系に対して、理想的な毒性特徴を提供する。組
織、足場あるいは他の立体的な細胞プロダクトを必要とする再生医療戦略は、ゆえに、こ
れらの調査結果から利益を得られるだろう。STF−31は、24または48時間のパル
ス処理の後、継続した毒性を示し、現在のアプローチに勝る利点を提供する。この毒性は
細胞密度に依存せず、コンフルエントhPSCとhPSC由来心筋細胞のLD50の間に、
22倍の違いを提供する。さらに、心筋細胞とhiPSCによる共培養の処理は、心筋細
胞を助けながら、hPSCの選択的な除去を提供した。最後に、5μΜのSTF−31は
、インビトロでhPSCコロニー自己再生及び7日間の再生を防ぐのに十分であった;し
かし、hPSCの分離と再プレートを含む従来のコロニー形成アッセイ法は、低濃度のS
TF−31が効果的な場合もあることを示す。
STF−31は、癌細胞でGLUTlを阻害することが報告され[35]、現在GLU
Tl阻害剤として上市されている。しかし、我々のSTF−31が媒介する毒性と、代謝
フラックスでの影響に対するデータは、このアクションのメカニズムをサポートしない。
むしろ、これらのデータは、解糖代謝に対する影響は、NAD+の減少によることを示す
。STF−31が媒介する代謝(糖分解と酸化的リン酸化)における時間的効果は、グル
コース欠乏及びWZB117によるものとは異なる。さらに、解糖フラックスの阻害の前
にグルコース取込みのブロックに失敗することは、hPSCでのSTF−31が媒介する
毒性はGLUTl阻害によらないことを示す。これら調査の結果、我々はSTF−31の
動作のメカニズムを定義しようと試みた。我々のデータは、STF−31が、NAD+
ルベージ経路の一つにおけるNAD+のニコチンアミドへの変換において、律速段階を触
媒する酵素である、NAMPTをターゲットとすることを明らかにする。このメカニズム
のさらなるサポートは、我々の原稿が準備される間に発表された別の研究で明らかになる
。Dragovichらは、組織的に67の異なる3−アミノピリジン由来のアミドを合
成して、それらにNAMPTを妨げる能力の検査をした[40]。このスクリ−ンから、
STF−31と同じ化学構造を持つ、化合物51が、精製された酵素分析において直接N
AMPTを妨げるとわかった(IC50=19nM)。X線結晶学によって、STF−31
は、NAMPTのポケットを結びつけているリガンドで結合することが示された。これら
のデータはSTF−31によって媒介される毒性がNAMPTをターゲットとすることに
よってNAD+サルベージ経路の阻害に起因することを確認した。さらに我々の研究は、
hPSCにおいてSTF−31によってもたらされる毒性作用がNAD+(グルコース輸
送の阻害でない)の減少に起因しうるという証拠を提供する。この発見は、多能性の基礎
代謝のプロファイルに対する基本的な洞察を提供する、なぜならこれらの細胞は、分化し
た子孫よりNAD+サルベージ経路の損失を補償することができないからである。本明細
書が示すNAD+サルベージ経路に対する信頼性は、十分なNAD+濃度は、再プログラミ
ングの間、多能性を確立・維持するために必要とされることを示した、NAMPTを阻害
する化合物FK866を用いた最近の報告と一致する[41]。しかし、Sonらによる
レポートは、試験済の条件で、hPSCの完全な細胞死を示さなかった。今後、より強力
で水溶性のNAMPT阻害剤が、hPSCに由来する臨床的に関連した細胞と組織の製造
のための重要な試薬になるであろう。
要約するとこの研究は、NAMPTによって媒介されるNAD+サルベージ経路をター
ゲットとすることが、選択的なhPSC毒性に対する効果的で効率的な戦略であることを
立証する。細胞代謝イベントの我々の詳細な分析は、培養においてhPSCの除去のため
にグルコース飢餓あるいはGLUT1阻害に関するNAMPT阻害剤の使用を、さらにサ
ポートする。24または48時間のパルス処理スキームで、NAMPTを阻害するために
STF−31を使用すると、hPSCの除去は多くの培養条件において、最終分化細胞及
びhPSC由来の子孫に対する細胞毒性効果なしに達成可能である。
材料及び実験的手法
細胞培養と試薬:hiPSC(DF6−9−9T、KB3[19、20])とhESC
(HI、H7、H9[21])は、前述のとおり[6、19]、E8またはmTeSR培
地でマトリゲルの上で単層培養において培養した。すべての実験において、hPSCは特
に明記しない限り、2cm2表面被覆につき1.5e5細胞でプレートし、連日の継代の
間の明確な数の細胞は、実験を通して再生産性を強化し、多能性細胞の高品質な単層培養
組織を維持する。低分子阻害剤での処理は、プレート後24から96時間の間で始めた。
これらの時点は、細胞が典型的に15−20%及び100%コンフルエントである辞典を
示した。hiPSC由来の心筋細胞は分化し、前述のとおり[22]、維持された。フィ
ーダー細胞層の上で大きくなったhESCコロニーのために、HIコロニーを、E8培地
で有糸分裂的に不活性ヒト線維芽細胞フィーダー上で培養し、コロニーはコラゲナーゼI
Vとともに37℃で40分間、継代した[23]。前述[24]のように、PAX6陽性
ニューロンが分化した。ヒト線維芽細胞は、じ前述[19]のとおり培養した。低分子S
TF−31(4−[[[[4−(l,l−ジメチルエチル)フェニル]スルホニル]アミ
ノ]メチル]−N−3−ピリジニル−ベンズアミド、Tocris)、WZB117(E
MD Millipore)、PluriSIn(Sigma−Aldrich)、ニコ
チン酸(Sigma−Aldrich)、及びニコチンアミド(Sigma−Aldri
ch)は、細胞を処理するために用いた。グルコース剥奪のために、グルコースを含まな
いDMEM F−12(US Biological)を用いる変更条件により、前述[
19]のとおりE8培地を調製した。グルコース剥奪培地をコントロールするため、17
.5mMのグルコース(Sigma−Aldrich)を、グルコースを含まないE8培
地に加えた。
インビトロ毒性分析:低分子またはグルコース剥奪による処理は、プレート後24時間
及び96時間で、hESCあるいはhiPSCで開始し、インビトロの毒性分析は、処理
開始の24〜96時間後に指定された処理の終点で実行した。パルス処理のために、hi
PSCは24時間STF−31で処理し、D−PBSで2回洗浄して、さらに48時間、
培地中で培養した。細胞生存能のためのニュートラルレッド分析は、前述[25]のとお
り実行した。インビトロでの細胞死は、SYTOX(登録商標)グリーン核酸着色(Li
fe Technologes)を使って決定した。細胞は、5%のCO2で湿らされた
細胞インキュベーター内で、37℃で30分間5μΜのSYTOX(登録商標)グリーン
中でインキュベートした。細胞生存率を、120μΜジギトニン(Sigma−Aldr
ich)、及び5μΜのSYTOX(登録商標)グリーンと共にインキュベートした細胞
の複製のため統一して決定した。細胞生存能の画像化は、Live/Dead(登録商標
)、哺乳動物細胞のための生存能/細胞毒性キット(Life Technologes
)を用いて行った。細胞を、生細胞検出のためには4μΜのCalcein AMで、損
なわれた膜により細胞を検出するためには2μΜのEthidium Homodime
r 1で、室温で20分の間染色した。細胞形態学の変更の典型的なイメージは、処理開
始の24から72時間後に、コンフルエントhPSCの上で得られた。画像化は、倒立顕
微鏡Nikon Ti−Uで行った。
BrdU取込み、及びフローサイトメトリー:細胞を9.6cm2あたり7.5e5個
でプレートし、10μΜの5−ブロモ−2−デオキシウリジン(BrdU)はプレート後
24から96時間のhiPSCに、5%のCO2で湿らされた細胞インキュベーター内で
37℃で1時間、取り込んだ。取込みの後、細胞は、メーカーのガイドライン(BD B
iosciences)に従い、FITC BrdUフロー・キットを用いて集め、染色
した。細胞生存能は、Fixable Viability Dye ekFluor(
登録商標)450(eBiosciences)により決定した。BD LSRIIフロ
ーサイトメーター(BD Biosciences)で得られる30,000の事象につ
いて、FCSExpress V3(DeNovo Software)を用いて分析を
行った。細胞周期の各段階の細胞の割合は、生細胞集団の各段階にある集団をゲーティン
グすることにより測定した。
コロニー形成アッセイ:コロニー形成アッセイは、コンフルエントhiPSC上で、3
つの異なるバリエーションで行い、コンフルエントhiPSCは、2.5及び5μΜのS
TF−31、30μΜのWZB117、20μΜのPluriSInで24時間処理した
。最初の反復は、前述の方法[26]が適用され、24時間の処理後、hiPSCはアク
ターゼ(StemCell Technologies)で剥離し、E8で再懸濁し、1
2×75mm細胞ストレーナー・キャップ(Falcon)付きのチューブを経て、そし
て2cm2あたり5e4細胞でプレートした。培地を48時間おきに交換し細胞を6日間
培養した、この際、アルカリホスファターゼ染色は、白血球アルカリホスファターゼ・キ
ット(Sigma−Aldrich)により、[27]に記述のように行い、プレート上
のホスファターゼ陽性のコロニーを目視で調査した。この戦略は、コロニー形成アッセイ
で最も一般的な方法である。しかし、継代の際に通常生じる細胞死に関する懸念により、
さらに厳しい評価のために別のアプローチへと駆り立てられた。二つ目のアッセイ(seco
nd iteration)において、細胞を24時間処理し、0.5mLのD−PBSで2度洗浄し
、培地をE8に交換した。その後、培地を6日間毎日交換し、その時点でアルカリホスフ
ァターゼ活性のための染色を行った。このアッセイにおいて、細胞は継代のストレス、す
なわち化合物の直接的な結果でない誤った低い生存能を引き起こしうるストレスにさらさ
れない;よって、この変更されたアッセイは、最初のアッセイより厳しいhPSC除去の
評価と考えられる。分化細胞との共培養によるhiPSCの除去は、ヒト線維芽細胞及び
hiPSC由来の10日目の心筋細胞により行った。hiPSC(DF6−9−9T)を
、ウェルあたり100〜10,000生細胞の濃度範囲で、ヒト繊維芽細胞(1.75e
5細胞個)、または10日目の分化した心筋細胞(3.75e5細胞個)とともに、E8
培地、及び9.6cm2あたりY−27632にプレートした。24時間後に、24また
は48時間5μΜのSTF−31で処理し、2回洗浄した、培地は毎日E8に入れ替えた
。プレートの6日後に、アルカリホスファターゼ活性の染色を行った。有糸分裂的に不活
性なヒト線維芽細胞フィーダー上で生育したhESCコロニーを除去するため、コロニー
を、細胞が明視野顕微鏡検査で画像化されてアルカリホスファターゼ活性の染色を行った
時点で96時間2.5μΜSTF−31で処理、あるいはコロニーを、コラゲナーゼIV
(2mg/mLで37℃、40分間)で継代し、さらに72時間培養してアルカリホスフ
ァターゼ活性の染色をした。ウェルの画像化はSony Cyber−shot DSC
−TX30で、個々のコロニーの画像化はニコン立体鏡により行った。
心筋細胞の特性化:すべての実験で、hiPSC(DF6−9−9T)由来の10日目
の心筋細胞分化培養物に、5μΜのSTF−31による24時間のパルス処理を行った。
フローサイトメトリーは、前述のとおり、STF−31処理開始の72時間後にTrop
onin Iタイプ3(TNNI3)とイロコイ−クラス・ホメオドメイン・タンパク質
(IRX4)に対して行った[19]。TNNI3、Troponin T2(TNNT
2)、及びHomeoboxタンパク質Nkx−2.5(NKX2−5)の定量リアルタ
イムPCRは、STF−31処理開始の24〜72時間後にTaqman(登録商標)A
ssays (Life Technologies)を使って、前述のとおり実行した
[19]。TNNT2の免疫蛍光法検出のために、心筋細胞はSTF−31処理開始の7
2時間後にカバーグラスに継代し、さらに48時間培養した。続いて細胞を、4%のパラ
ホルムアルデヒドで固定、0.2%Triton−Xで透過処理し、TroponinT
(TNNT2)の一次抗体(Abcam:ab8295)中で、4℃で一晩インキュベー
トした。さらに、細胞を二次抗体ヤギ抗マウスIgGl−Alexa 568(Life
Tech:A−21124)でインキュベートし、核をHoechst33342(L
ife Tech:H21492)により検出した。細胞は、倒立顕微鏡Nikon T
i−U、共焦点顕微鏡Nikon Eclipse90iで画像化した。
細胞外フラックス解析:hiPSCを、前述[28]のとおり、いくつかの例外と共に
、特殊なマイクロプレート(Seahorse Bioscience)上で、ウェルに
つき6e4細胞でプレートした。細胞外フラックス分析はSeahorse Biosc
ience XF24 Analyzerを使用して、プレート後48時間のhiPSC
に対して行った。細胞を、2.5μΜのSTF−31、30μΜのWZB117、20m
Mの2−デオキシグルコース(2−DG;Sigma−Aldrich)、溶媒対照、ま
たは培地対照で5.5時間処理し、750μLの分析培地で2回洗浄し、適切な処理液を
含む750μLの分析培地に放置した。
マイクロプレートを、1.5時間の非CO2インキュベーターで平衡化し、Seahor
se Bioscience XF24 Analyzerで16時間、分析した。分析
媒体は、以下の例外を除きE8試薬を含む:フェノールレッド不含有・基本DMEM F
−12(Gibco)、重炭酸ナトリウム不含有・2.5mM GlutaMAXTM・基
本DMEM F−12(Gibco)、及び15mM Hepes・基本DMEM F−
12(Gibco)。分析培地は、使用前に37℃、pH7.4に合わせた。細胞外酸性
化率(ECAR)、及び基礎酸素消費率(OCR)は、ほぼ60分おきに収集した。処理
はベースライン・培地コントロール値まで統一化し、生物学的複製の平均として示す。
グルコース取込みアッセイ:サブコンフルエントhiPSC(プレート後24時間)を
、2.5μΜのSTF−31、30μΜのWZB117、20μΜのCytochala
sin B(Sigma−Aldrich)、及び溶媒対照群で、1、15、18、及び
24時間処理した。1時間の処理のために、細胞を、5%のCO2で湿らされた37℃の
細胞インキュベーター内のKrebs−Ringer Hepes(KRH)含有処理液
(treatment)中に放置した。15、18、及び24時間の処理のために、細胞は、それ
ぞれ14、17、及び23時間E8培地で処理した、そしてその時点で、1時間にわたり
、培地をKRHバッファ含有特異的処理液(treatment)に変更した。特定の処理時間経
過後、グルコース取込みを、前述のとおり、37℃で5分間、0.5μCi[3H]2−
デオキシグルコースで行った[29]。取込みデータは、ラウリー法で測定されるタンパ
ク質濃度に統一された。
免疫ブロット分析:非接着細胞を遠心分離によって収集し、接着細胞はd−PBSとと
もに一度洗浄して、Laemmliバッファで溶解し、非接着細胞ペレットと合わせて9
5℃で5分間加熱した。タンパク質濃度を、Qubitタンパク質分析(Life Te
chnologies)で測定した。全タンパク質の25μgは、SDS−PAGEで分
離し、ニトロセルロース膜(GE Healthcare Life Sciences
)に転写して、メーカーの指示に従いブロックした。膜は、一次抗体の以下の希釈液で、
4℃で一晩中インキュベートした:Cell Signaling Technolog
y製のウサギ抗切断型裂カスパーゼ3(1:500)、ウサギ抗カスパーゼ9(1:10
00)、ウサギ抗リン酸AMPK(1:1000)、ウサギ抗AMPK(1:1,000
)、及びLife Technologies製のマウス抗GAPDH(1:10,00
0)。次に、膜は以下の濃度で45分間、二次抗体でインキュベートした:Jackso
n Immunoresearch Laboratories,Inc.製のロバ抗マ
ウス−ホースラディッシュペルオキシダーゼ(1:5,000)及びロバ抗−ウサギ−ホ
ースラディッシュペルオキシダーゼ(1:7,000)、続いて、効果が増強された化学
ルミネセンス(enhanced chemiluminescence)[30]を用いて検出した。
切断型カスパーゼ3/7蛍光ベースの分析:2.5μΜのSTF−31、30μΜのW
ZB117またはグルコース剥奪による処理を、サブコンフルエントhiPSC(プレー
ト後24時間)で開始し、6、12、18、24時間の時点で、切断型カスパーゼ3/7
活性を、細胞を500μLのE8培地で培養し、終点で培地に250μLの3×カスパー
ゼ・バッファを加えたこと以外は前述[31、32]のとおり測定した。
ヌクレオチド・プール測定:前に発表された方法[33]に従って、ATP、ADP、
AMP及びNAD+は過塩素酸降水を使用して抽出されて、HPLCを用いて分析された
。ATP、ADP、AMP及びNAD+のピークは、各々のサンプルについて測られて標
準と比較しタンパク質レベルに統一された。
統計的解析:すべての実験は3つの生物学的複製の最小で行われた。データ複製のため
の生物学的平均値の標準誤差を平均として表される。統計的解析は、TUKEYポストホ
ックテストによる一元分散分析を用いて行った。
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[実施例2]ヒト多能性幹細胞へのFK866毒性
図10は、FK866(図9B)で最大72時間の処理をしたhiPSCsの細胞生存
率のデータを示す。このNAMPT阻害剤による多能性幹細胞死のタイミングは、STF
−31で観察されたものと同様であった。FK866はSTF−31より低い濃度で、ヒ
ト多能性幹細胞対して毒性を有することが観察された。これらのデータは、STF−31
とFK866が臨床的に関連すること、及びSTF−31が、培養において分化した子孫
には影響を及ぼさないという我々の発見と一致している。したがって、多能性幹細胞の選
択的除去するための効果的な戦略は、NAMPT阻害剤を用いてNAD+濃度を激減する
ことである。また、これらのデータは、NAMPT阻害が、培地組成、細胞密度、及び細
胞系に依存せずに作用する、迅速、測定可能、かつ安価な方法を提供する、これまでの報
告よりもさらに一般的に適用可能な戦略である、ことを示す。重要なことに、STF−3
1とFK866が、インビボで腫瘍集団を低減することができるので、これらの研究は、
それらの抗腫瘍特性が多能性細胞に限られていないことを示唆する。このように、これら
の化合物は、継代のために用意された細胞における腫瘍細胞を選択的に除去するために有
用であり、分化培養における奇形腫を引き起こす細胞が、多能性か、一以上の分化した表
現型をどうかには依存しない。
[実施例3]STF−31はヒト多能性幹細胞由来の子孫と最終分化細胞を助ける(sp
ares)
間葉系幹細胞、線維芽細胞、網膜色素上皮細胞、ヒト多能性幹細胞由来の心筋細胞、指
定された肝内胚葉細胞、神経前駆細胞は、STF−31処理による形態や明らかな細胞死
に見える変化を示さず(図8A)、生存率の測定はこれらの観測と一致している(図5A
、5B)。STF−31処理されたヒト多能性幹細胞由来の心筋細胞と神経前駆細胞はコ
ントロールと区別がつかないマーカーと構造的機能のタンパク質とmRNAレベルを示す
(図8B−C)。図11に示すように、成人網膜色素上皮細胞(ARPE)及びPAX6
陽性神経前駆細胞はまた、STF−31処理に耐性を示す。72時間連続STF−31処
理した神経前駆細胞で観察された細胞死は、外因性NAの添加で救出することができ、多
能性幹細胞で観察されたNAMPT阻害のメカニズムと一致している。要するに、STF
−31が広範囲にわたるhPSC派生物にふさわしいこと、そして神経前駆細胞とARP
E細胞の短期処理(24時間)が重要な毒性ではないことをこれらのデータは証明する。
[実施例4]インビトロ及びインビボでの腫瘍形成性多能性幹細胞由来の子孫の除去
腫瘍は、もはや多能性幹細胞の典型的機能の定義に合わない細胞から生じ得る。例えば
、部分的に分化したあるいは前駆細胞が、自己再生し腫瘍化されうるが、3つ全ての胚葉
から細胞を生じない可能性がある(よって、真の多能性細胞の機能的定義にフィットする
のを妨げる)。この実施例では、多能性幹細胞由来の腫瘍性の子孫は、以下を含む:未熟
な前駆細胞、部分的に分化した子孫、胎児のような子孫、最終分化していない子孫、なら
びに遺伝子の不安定性または発癌性経路の活性化を通して、多能性腫瘍形成性の調整経路
及び/または腫瘍形成性の特徴を保持するか、再活性化する子孫。ここで、前記化合物は
、多能性幹細胞由来の子孫の哺乳類への投与と同時に、多能性幹細胞由来の腫瘍形成性の
子孫から開始される腫瘍形成を排除するために用いられる(例えば、ヒトへのヒト多能性
幹細胞由来の心筋細胞の移植)。前記化合物は、前記細胞または組織製品が送達されるの
と同時、または細胞の送達の後に投与される(例えば、細胞の送達の1日から30日後)
。前記化合物は、STF−31、FK866、他のNAMPT阻害剤、またはNAMPT
阻害剤の組み合わせを含んでもよい。例えば、哺乳動物へ送達された細胞または組織プロ
ダクトからの、腫瘍のインビボ形成を妨げるために、化合物は0.126mg/m2/h
の推薦された適用量で、または、0から0.126mg/m2/hの範囲内で、96時間
の持続性点滴として、28日おきに投与される。ヒトへのFK866の無毒投与量は、H
olenら、Invest New Drugs 26(l):45−51(2008)
に記載されている。哺乳動物に送達される子孫は任意の多能性幹細胞派生物を含んでもよ
い(例えば、心筋細胞、神経細胞、肝細胞、網膜色素上皮細胞)。
他の実施態様において使用される化合物は、インビトロ及びインビボでの下流処理の前
に、インビトロで、多能性幹細胞由来の腫瘍形成性子孫(上記に定める)からの腫瘍形成
性細胞の数を除去または低減するために用いられる。この方法では、化合物は、細胞培養
物または組織製品に、24〜96時間、STF−31の濃度0.1〜50μΜの範囲で、
FK866濃度0.001〜10μΜの範囲で、適用される。腫瘍形成性集団の除去に必
要な時間の処理の後、前記化合物は化合物を含まない適切な培地(例えば、3〜5倍の量
の培養培地)での複数の洗浄によって取り除かれ、そして細胞は、下流の適用での利用ま
で培養される。

Claims (1)

  1. 未分化多能性細胞を低減または除去する方法であって、有効量の化合物を、異種細胞集
    団または、分化した細胞種及び未分化多能性幹細胞を含むか含むことが疑われるサンプル
    に接触することを含むことにより、前記化合物が、前記細胞集団またはサンプルからの未
    分化幹細胞を、選択的に低減または除去する方法。
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