JP2020178562A - 心房細動及び/又は心室細動のリスクを判定する方法 - Google Patents
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Abstract
Description
rs2494938:複数のがん(肺がん、胃がん、および食道がん)に関するSNP(非特許文献 1)
rs2619539:記憶力に関するSNP(非特許文献 2)
rs11066280:収縮期血圧に関するSNP(非特許文献 3)
rs11066280:拡張期血圧に関するSNP(非特許文献 4)
rs11175194:上皮性卵巣がんに関するSNP(非特許文献 5)
rs3093059:血液中のC反応性タンパク濃度に関するSNP(非特許文献 6)
rs10508372:喘息に関するSNP(非特許文献 7)
rs2857595:喉頭がんに関するSNP(非特許文献 8)
rs4680:喫煙量に関するSNP(非特許文献 9)
rs4680:痛みの感じやすさに関するSNP(非特許文献 10)
rs4680:調和性(男性向け)に関するSNP(非特許文献 11)
rs4680:外向性(女性向け)に関するSNP(非特許文献 12)
rs4680:損害回避(男性向け)に関するSNP(非特許文献 13)
rs4680:損害回避(女性向け)に関するSNP(非特許文献 14)
rs4680:支配欲に関するSNP(非特許文献 15)
rs4680:失敗を避ける傾向に関するSNP(非特許文献 16)
rs4680:短期的利益を求める傾向に関するSNP(非特許文献 17)
rs4680:悲しみの表情の認識力に関するSNP(非特許文献 18)
rs4680:怒りの表情の認識力に関するSNP(非特許文献 19)
rs4351:血液中のアスパルチルフェニルアラニン濃度に関するSNP(非特許文献 20)
rs2858942:平均赤血球ヘモグロビン量に関するSNP(非特許文献 21)
染色体番号 6
染色体上の位置 40536128
塩基配列 TGGTATATTGGAAATTGAGACAGCA[A/G]CTTCTCTGCATCAAGGAGACTCTTA(配列番号1)
染色体番号 6
染色体上の位置 15620855
塩基配列 TGACATGGTCTTAAAATGTATAAAA[C/G]ACTATCATAGCTAATAGGATTATTT(配列番号2)
染色体番号 12
染色体上の位置 112817783
塩基配列 AGAGGTTCTTTCCTTTGAAAACCAT[A/T]CTTCTGTGGAAATAGCTGACAAATT(配列番号3)
染色体番号 12
染色体上の位置 64264837
塩基配列 AGGCCCCCAGATTTGCATTTGTAAC[A/G]AGTTACCAGGTGAGACTGATGCTGT(配列番号4)
染色体番号 1
染色体上の位置 159685136
塩基配列 AGAGTTCTTAATAAGTGTACTCAAT[T/C]GGCTGAGAAAATGTGTCCATGCAAA(配列番号5)
染色体番号 10
染色体上の位置 8972018
塩基配列 CGTCCCAAGGCCTTGGAATGTTGGC[A/G]TAACAGGAAAAAGGGTGTGGAGTGG(配列番号6)
染色体番号 6
染色体上の位置 31568469
塩基配列 GATAAGACTTGGCCAGAGAAGTCAC[T/C]CAATCTCACCCCTGCCAGCACGTAG(配列番号7)
染色体番号 22
染色体上の位置 19951271
塩基配列 CCAGCGGATGGTGGATTTCGCTGGC[A/G]TGAAGGACAAGGTGTGCATGCCTGA(配列番号8)
染色体番号 17
染色体上の位置 61569732
塩基配列 AAGTCCCTCCCACTTGGGAGAAGTG[A/G]CAAAGACCATCTGTCACAGCTGAAG(配列番号9)
染色体番号 16
染色体上の位置 225653
塩基配列 GGAAGCCCTCAGACTAACCCTGGTC[A/C]CCTTGAATGCCTCGTCCACACCTCC(配列番号10)
本SNPセットを用いた判定方法の精度について説明する。上記データベースから、テスト用に、利用者の遺伝子型情報と罹患情報とを対応付けたデータセットを作成した。データセットにおける各利用者の本SNPセットの各SNPの遺伝子型を、ホモ接合型(AA,BB)と、ヘテロ接合型(AB)に分類し、分類した各遺伝子型が図2に示す網掛けをした遺伝子型と一致する場合には、xiの値を1と評価し、一致しない場合には0と評価して、x1〜xNを特徴量として算出した。
本SNPセットを用いる判定モデルが、各比較SNPセットを用いる比較判定モデルよりも有意に優れたモデルであることを確かめるために、ノンパラメトリック検定の一種であるウィルコクソンの順位和検定を行った。具体的には、本SNPセットを用いる判定モデルのAUCと、各比較SNPセットを用いる比較判定モデルのAUCとに差が無いという帰無仮説を設定し、有意水準を0.01としてウィルコクソンの順位和検定を行った。
Claims (1)
- rs2494938、rs2619539、rs11066280、rs11175194、rs3093059、rs10508372、rs2857595、rs4680、rs4351、及びrs2858942を少なくとも含む一塩基多型セットの遺伝子型情報に基づいて、心房細動及び/又は心室細動のリスクを判定する、方法。
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Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2022092119A1 (ja) | 2020-10-26 | 2022-05-05 | 日本製鉄株式会社 | 巻鉄心、巻鉄心の製造方法及び巻鉄心製造装置 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2007014244A (ja) * | 2005-07-06 | 2007-01-25 | Japan Health Science Foundation | 心室伝導障害または心室細動の遺伝的素因を検査する方法、およびそのための試薬 |
JP2010511404A (ja) * | 2006-12-05 | 2010-04-15 | デコード・ジェネティクス・イーエイチエフ | 心臓不整脈のリスクマネージメント用の遺伝マーカー |
WO2011053134A2 (en) * | 2009-10-26 | 2011-05-05 | Academisch Medisch Centrum Bij De Universiteit Van Amsterdam | Determination of genetic risk for ventricular fibrillation |
US20120065075A1 (en) * | 2010-07-02 | 2012-03-15 | Prognomix Inc. | Method of determining a predisposition to atrial fibrillation (af) in a subject |
JP2018143178A (ja) * | 2017-03-06 | 2018-09-20 | 国立大学法人三重大学 | 循環器疾患の遺伝的リスク検出法 |
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2019
- 2019-04-23 JP JP2019081982A patent/JP7165100B2/ja active Active
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2007014244A (ja) * | 2005-07-06 | 2007-01-25 | Japan Health Science Foundation | 心室伝導障害または心室細動の遺伝的素因を検査する方法、およびそのための試薬 |
JP2010511404A (ja) * | 2006-12-05 | 2010-04-15 | デコード・ジェネティクス・イーエイチエフ | 心臓不整脈のリスクマネージメント用の遺伝マーカー |
WO2011053134A2 (en) * | 2009-10-26 | 2011-05-05 | Academisch Medisch Centrum Bij De Universiteit Van Amsterdam | Determination of genetic risk for ventricular fibrillation |
US20120065075A1 (en) * | 2010-07-02 | 2012-03-15 | Prognomix Inc. | Method of determining a predisposition to atrial fibrillation (af) in a subject |
JP2018143178A (ja) * | 2017-03-06 | 2018-09-20 | 国立大学法人三重大学 | 循環器疾患の遺伝的リスク検出法 |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2022092119A1 (ja) | 2020-10-26 | 2022-05-05 | 日本製鉄株式会社 | 巻鉄心、巻鉄心の製造方法及び巻鉄心製造装置 |
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