JP2020072741A - 個人の喫煙ステータスを予測するためのシステムおよび方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、合衆国法典第35編米国特許法第119条の下で、2013年12月16日出願の「Systems and Methods for Predicting a Smoking Status of an Individual」と題する米国仮特許出願第61/916,443号の優先権を主張するものであり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は、例えば、以下を提供する。
(項目1)
被験者から取得したサンプルを評価するためのコンピュータ実装された方法であって、
受け取る回路によって前記サンプルに関連付けられたデータセットを受け取ることであって、前記データセットがLRRN3、CDKN1C、PALLD、SASH1、RGL1、およびTNFRSF17に対する定量的な発現データを含むことと、
プロセッサによって前記受け取ったデータセットに基づいてスコアを発生することであって、前記スコアが前記被験者の予測される喫煙ステータスを示すことと、を含む、コンピュータ実装された方法。
(項目2)
前記データセットが、IGJ、RRM2、SERPING1、FUCA1、およびID3に対する定量的な発現データを更に含む、項目1に記載のコンピュータ実装された方法。
(項目3)
前記スコアが前記データセットに適用される分類スキームの結果であって、前記分類スキームが前記データセット内の前記定量的な発現データに基づいて決定される、項目1または2のいずれか1項に記載のコンピュータ実装された方法。
(項目4)
LRRN3、CDKN1C、PALLD、SASH1、RGL1、およびTNFRSF17の各々に対してフォールド変化値を演算することを更に含む、項目1〜3のいずれか1項に記載のコンピュータ実装された方法。
(項目5)
各演算されたフォールド変化値のそれぞれが少なくとも2つの独立した母集団データセットに対する所定の閾値を超えることを要する少なくとも1つの基準を、各フォールド変化値が満たすことを決定することを更に含む、項目4に記載のコンピュータ実装された方法。
(項目6)
個人の喫煙者ステータスを予測するためのキットであって、
試験サンプル内のLRRN3、CDKN1C、PALLD、SASH1、RGL1、およびTNFRSF17を含む遺伝子シグネチャ内の前記遺伝子の発現レベルを検出する一組の試薬と、
前記個人の喫煙者ステータスを予測するための前記キットを使用するための説明書と、を備えるキット。
(項目7)
喫煙製品の代替品の個人に対する効果を評価するために前記キットが使用される、項目6に記載のキット。
(項目8)
前記喫煙製品の前記代替品が加熱式たばこ製品である、項目7に記載のキット。
(項目9)
前記個人による前記加熱式たばこ製品の使用開始後0〜5日の間にLRRN3発現の減少が検出される、項目8に記載のキット。
(項目10)
前記代替品の前記個人に対する前記効果が、前記個人を非喫煙者として分類するものである、項目7〜9のいずれか1項に記載のキット。
(項目11)
前記遺伝子シグネチャが、IGJ、RRM2、SERPING1、FUCA1、およびID3のうちの少なくとも1つを更に含む、項目6〜10のいずれか1項に記載のキット。
(項目12)
個人の喫煙者ステータスを予測するためのキットであって、
試験サンプル中のLRRN3、CDKN1C、PALLD、SASH1、RGL1、TNFRSF17、IGJ、RRM2、SERPING1、FUCA1、およびID3から成る群から選択される少なくとも5つのマーカーを含む遺伝子シグネチャ内の前記遺伝子の発現レベルを検出する一組の試薬と、
前記個人の喫煙者ステータスを予測するための前記キットを使用するための説明書と、を備えるキット。
(項目13)
喫煙製品の代替品の個人に対する効果を評価するために使用されるキットであって、前記喫煙製品の前記代替品が加熱式たばこ製品である、項目12に記載のキット。
(項目14)
前記個人による前記加熱式たばこ製品の使用開始後0〜5日の間にLRRN3発現の減少が検出される、項目13に記載のキット。
(項目15)
コンピュータ可読指示を含むコンピュータプログラム製品であって、少なくとも1つのプロセッサを備えるコンピュータ化したシステムで実行した時、項目1〜5のいずれか1項に記載の前記方法の1つ以上の工程を前記プロセッサに実施させる、コンピュータプログラム製品。
個人の喫煙者ステータスを予測するために使用することができるロバストな血液に基づく遺伝子シグネチャを特定するための演算システムおよび方法を本明細書に記述する。特に、本明細書に記述する遺伝子シグネチャは、現在喫煙している被験者を喫煙したことがない被験者または喫煙をやめた被験者特別する能力を有する。
Claims (1)
- 本明細書に記載の発明。
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