JP2019524847A - 人工的に操作された血管新生調節系 - Google Patents
人工的に操作された血管新生調節系 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2019524847A JP2019524847A JP2019510289A JP2019510289A JP2019524847A JP 2019524847 A JP2019524847 A JP 2019524847A JP 2019510289 A JP2019510289 A JP 2019510289A JP 2019510289 A JP2019510289 A JP 2019510289A JP 2019524847 A JP2019524847 A JP 2019524847A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- nucleic acid
- gene
- sequence
- domain
- complementary
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 title claims abstract description 54
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 title description 10
- 206010029113 Neovascularisation Diseases 0.000 claims abstract description 249
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 87
- 101150054149 ANGPTL4 gene Proteins 0.000 claims abstract description 73
- 108700042530 Angiopoietin-Like Protein 4 Proteins 0.000 claims abstract description 3
- 102000045205 Angiopoietin-Like Protein 4 Human genes 0.000 claims abstract description 3
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims description 651
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 622
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 556
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 382
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 382
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 255
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 claims description 238
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 220
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 147
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 140
- 108020005004 Guide RNA Proteins 0.000 claims description 138
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 97
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 97
- 101150030763 Vegfa gene Proteins 0.000 claims description 86
- 101150064607 HIF1A gene Proteins 0.000 claims description 79
- 101150040698 ANGPT2 gene Proteins 0.000 claims description 72
- 101150023500 EPAS1 gene Proteins 0.000 claims description 71
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 claims description 44
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 38
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 38
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 38
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 36
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 claims description 36
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 33
- 241000589875 Campylobacter jejuni Species 0.000 claims description 32
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 27
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 27
- 241000193996 Streptococcus pyogenes Species 0.000 claims description 25
- 241000194020 Streptococcus thermophilus Species 0.000 claims description 25
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 claims description 14
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 13
- 230000004075 alteration Effects 0.000 claims description 12
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 claims description 11
- 241000588650 Neisseria meningitidis Species 0.000 claims description 10
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 claims description 9
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 claims description 6
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 claims description 3
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 claims description 3
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 claims description 3
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 claims description 3
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 claims description 3
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 claims description 3
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 claims description 3
- 208000017442 Retinal disease Diseases 0.000 claims description 2
- 206010038923 Retinopathy Diseases 0.000 claims description 2
- 206010038933 Retinopathy of prematurity Diseases 0.000 claims description 2
- 230000000302 ischemic effect Effects 0.000 claims description 2
- 208000019553 vascular disease Diseases 0.000 claims 3
- 206010059245 Angiopathy Diseases 0.000 claims 2
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 abstract description 48
- 102100039037 Vascular endothelial growth factor A Human genes 0.000 abstract description 32
- 101001046870 Homo sapiens Hypoxia-inducible factor 1-alpha Proteins 0.000 abstract description 22
- 102100022875 Hypoxia-inducible factor 1-alpha Human genes 0.000 abstract description 20
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 abstract description 20
- 102100036448 Endothelial PAS domain-containing protein 1 Human genes 0.000 abstract description 18
- 108010018033 endothelial PAS domain-containing protein 1 Proteins 0.000 abstract description 17
- 102100034608 Angiopoietin-2 Human genes 0.000 abstract description 14
- 101000924533 Homo sapiens Angiopoietin-2 Proteins 0.000 abstract description 5
- 101000808011 Homo sapiens Vascular endothelial growth factor A Proteins 0.000 abstract description 3
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 232
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 89
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 77
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 76
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 75
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 75
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 73
- 108010008532 Deoxyribonuclease I Proteins 0.000 description 66
- 102000007260 Deoxyribonuclease I Human genes 0.000 description 66
- 230000006870 function Effects 0.000 description 64
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 61
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 61
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 60
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 57
- 241000894007 species Species 0.000 description 54
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 description 48
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 43
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 39
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 37
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 36
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 36
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 36
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 35
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 34
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 33
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 33
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 32
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 description 31
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 31
- 230000006780 non-homologous end joining Effects 0.000 description 30
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 27
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 27
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 25
- 101000819111 Homo sapiens Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3 Proteins 0.000 description 24
- 102100021386 Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3 Human genes 0.000 description 24
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 21
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 19
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 19
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 19
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 18
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 18
- 102100025674 Angiopoietin-related protein 4 Human genes 0.000 description 17
- 101000693076 Homo sapiens Angiopoietin-related protein 4 Proteins 0.000 description 17
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 17
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 17
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 16
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 16
- -1 ACAT Proteins 0.000 description 15
- 101100372758 Danio rerio vegfaa gene Proteins 0.000 description 14
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 14
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 14
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 14
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 13
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 13
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 13
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 13
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 13
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 13
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 13
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 12
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 12
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 12
- 238000003197 gene knockdown Methods 0.000 description 12
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 12
- 108010048036 Angiopoietin-2 Proteins 0.000 description 11
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 11
- 108091028113 Trans-activating crRNA Proteins 0.000 description 10
- 208000005590 Choroidal Neovascularization Diseases 0.000 description 9
- 206010060823 Choroidal neovascularisation Diseases 0.000 description 9
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 9
- 241000605894 Porphyromonas Species 0.000 description 9
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 9
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 230000005782 double-strand break Effects 0.000 description 9
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 9
- 108091092724 Noncoding DNA Proteins 0.000 description 8
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 8
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 8
- 208000002780 macular degeneration Diseases 0.000 description 8
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 8
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 8
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 8
- 108020005345 3' Untranslated Regions Proteins 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 7
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 210000001525 retina Anatomy 0.000 description 7
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 7
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 7
- 210000003556 vascular endothelial cell Anatomy 0.000 description 7
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 6
- 206010012689 Diabetic retinopathy Diseases 0.000 description 6
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 6
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 6
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 6
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 description 6
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 6
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 6
- 108010053099 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Proteins 0.000 description 6
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 6
- 206010064930 age-related macular degeneration Diseases 0.000 description 6
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 6
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 6
- 229940039696 lactobacillus Drugs 0.000 description 6
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 description 6
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 6
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 6
- 230000005783 single-strand break Effects 0.000 description 6
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 5
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 5
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 5
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 5
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 5
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 5
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 5
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 5
- 101100166147 Streptococcus thermophilus cas9 gene Proteins 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 5
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 5
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 5
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 5
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 5
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 5
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 5
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 5
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 5
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 5
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000008569 process Effects 0.000 description 5
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 5
- 230000001603 reducing effect Effects 0.000 description 5
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 5
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 4
- 241001502303 Candidatus Methanoplasma Species 0.000 description 4
- 108010035563 Chloramphenicol O-acetyltransferase Proteins 0.000 description 4
- 102100034157 DNA mismatch repair protein Msh2 Human genes 0.000 description 4
- 241000186394 Eubacterium Species 0.000 description 4
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 4
- 241000589601 Francisella Species 0.000 description 4
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 4
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 4
- 102100031561 Hamartin Human genes 0.000 description 4
- 101001134036 Homo sapiens DNA mismatch repair protein Msh2 Proteins 0.000 description 4
- 101000851937 Homo sapiens Endothelial PAS domain-containing protein 1 Proteins 0.000 description 4
- 101000795643 Homo sapiens Hamartin Proteins 0.000 description 4
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 4
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 4
- 229910015837 MSH2 Inorganic materials 0.000 description 4
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 4
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 4
- 241000605861 Prevotella Species 0.000 description 4
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 4
- 229920006978 SSBR Polymers 0.000 description 4
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 4
- 241000203587 Streptosporangium roseum Species 0.000 description 4
- 102100036407 Thioredoxin Human genes 0.000 description 4
- 102100033177 Vascular endothelial growth factor receptor 2 Human genes 0.000 description 4
- 241001531273 [Eubacterium] eligens Species 0.000 description 4
- 108091005948 blue fluorescent proteins Proteins 0.000 description 4
- 108010082025 cyan fluorescent protein Proteins 0.000 description 4
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 4
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 4
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 4
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 4
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 4
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 description 4
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 description 4
- 238000001543 one-way ANOVA Methods 0.000 description 4
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 4
- 210000003583 retinal pigment epithelium Anatomy 0.000 description 4
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 4
- 108060008226 thioredoxin Proteins 0.000 description 4
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 4
- 108091005957 yellow fluorescent proteins Proteins 0.000 description 4
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 3
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 3
- 201000004569 Blindness Diseases 0.000 description 3
- 241000223282 Candidatus Peregrinibacteria Species 0.000 description 3
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 3
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 3
- 108090000379 Fibroblast growth factor 2 Proteins 0.000 description 3
- 102000003974 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 3
- 241000589599 Francisella tularensis subsp. novicida Species 0.000 description 3
- 108090000320 Hyaluronan Synthases Proteins 0.000 description 3
- 241000589902 Leptospira Species 0.000 description 3
- 102000004137 Lysophosphatidic Acid Receptors Human genes 0.000 description 3
- 108090000642 Lysophosphatidic Acid Receptors Proteins 0.000 description 3
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 3
- 241000588621 Moraxella Species 0.000 description 3
- 108010085220 Multiprotein Complexes Proteins 0.000 description 3
- 102000007474 Multiprotein Complexes Human genes 0.000 description 3
- 108090000772 Neuropilin-1 Proteins 0.000 description 3
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 3
- 108010038512 Platelet-Derived Growth Factor Proteins 0.000 description 3
- 102000010780 Platelet-Derived Growth Factor Human genes 0.000 description 3
- 108700005075 Regulator Genes Proteins 0.000 description 3
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 3
- 241000187191 Streptomyces viridochromogenes Species 0.000 description 3
- 102000018679 Tacrolimus Binding Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010027179 Tacrolimus Binding Proteins Proteins 0.000 description 3
- 239000002870 angiogenesis inducing agent Substances 0.000 description 3
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 3
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 3
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 3
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 3
- 206010003246 arthritis Diseases 0.000 description 3
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 description 3
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 3
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 3
- 230000034431 double-strand break repair via homologous recombination Effects 0.000 description 3
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 3
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 3
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 3
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 3
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 3
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 3
- 102000049131 human HIF1A Human genes 0.000 description 3
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 3
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 3
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 3
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 3
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 3
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 230000002207 retinal effect Effects 0.000 description 3
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 3
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 3
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 3
- FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 4',6-Diamino-2-phenylindol Chemical compound C1=CC(C(=N)N)=CC=C1C1=CC2=CC=C(C(N)=N)C=C2N1 FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005730 ADP ribosylation Effects 0.000 description 2
- 241000093740 Acidaminococcus sp. Species 0.000 description 2
- 241000266272 Acidithiobacillus Species 0.000 description 2
- 241001464929 Acidithiobacillus caldus Species 0.000 description 2
- 241001147780 Alicyclobacillus Species 0.000 description 2
- 241000906059 Bacillus pseudomycoides Species 0.000 description 2
- 108091032955 Bacterial small RNA Proteins 0.000 description 2
- 206010061692 Benign muscle neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 2
- 241001040999 Candidatus Methanoplasma termitum Species 0.000 description 2
- 102100031437 Cell cycle checkpoint protein RAD1 Human genes 0.000 description 2
- 102100025064 Cellular tumor antigen p53 Human genes 0.000 description 2
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 2
- 241000193163 Clostridioides difficile Species 0.000 description 2
- 241000193155 Clostridium botulinum Species 0.000 description 2
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 2
- 206010055665 Corneal neovascularisation Diseases 0.000 description 2
- 102100026846 Cytidine deaminase Human genes 0.000 description 2
- 108010031325 Cytidine deaminase Proteins 0.000 description 2
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 2
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 2
- 102100033934 DNA repair protein RAD51 homolog 2 Human genes 0.000 description 2
- 206010012646 Diabetic blindness Diseases 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 2
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 description 2
- 108090000368 Fibroblast growth factor 8 Proteins 0.000 description 2
- 108010060309 Glucuronidase Proteins 0.000 description 2
- 102000053187 Glucuronidase Human genes 0.000 description 2
- HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N HA peptide Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N 0.000 description 2
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 description 2
- 108090000100 Hepatocyte Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 102100021866 Hepatocyte growth factor Human genes 0.000 description 2
- 101001023784 Heteractis crispa GFP-like non-fluorescent chromoprotein Proteins 0.000 description 2
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101001130384 Homo sapiens Cell cycle checkpoint protein RAD1 Proteins 0.000 description 2
- 101000721661 Homo sapiens Cellular tumor antigen p53 Proteins 0.000 description 2
- 101001132307 Homo sapiens DNA repair protein RAD51 homolog 2 Proteins 0.000 description 2
- 101000615488 Homo sapiens Methyl-CpG-binding domain protein 2 Proteins 0.000 description 2
- 101000955962 Homo sapiens Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog Proteins 0.000 description 2
- 102000003918 Hyaluronan Synthases Human genes 0.000 description 2
- 108050009527 Hypoxia-inducible factor-1 alpha Proteins 0.000 description 2
- 208000022559 Inflammatory bowel disease Diseases 0.000 description 2
- 241000186869 Lactobacillus salivarius Species 0.000 description 2
- 102000016267 Leptin Human genes 0.000 description 2
- 108010092277 Leptin Proteins 0.000 description 2
- 241001148627 Leptospira inadai Species 0.000 description 2
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 2
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 2
- 241000282553 Macaca Species 0.000 description 2
- 102000002274 Matrix Metalloproteinases Human genes 0.000 description 2
- 108010000684 Matrix Metalloproteinases Proteins 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 102100021299 Methyl-CpG-binding domain protein 2 Human genes 0.000 description 2
- 241000179980 Microcoleus Species 0.000 description 2
- 241000542065 Moraxella bovoculi Species 0.000 description 2
- 201000004458 Myoma Diseases 0.000 description 2
- 241000588653 Neisseria Species 0.000 description 2
- 102100028762 Neuropilin-1 Human genes 0.000 description 2
- DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N Nicotinamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CN=C1 DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001515112 Nitrosococcus watsonii Species 0.000 description 2
- 102000002488 Nucleoplasmin Human genes 0.000 description 2
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 description 2
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 description 2
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 2
- 241000512220 Polaromonas Species 0.000 description 2
- 108010064218 Poly (ADP-Ribose) Polymerase-1 Proteins 0.000 description 2
- 102100023712 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 Human genes 0.000 description 2
- 241000878522 Porphyromonas crevioricanis Species 0.000 description 2
- 241001135241 Porphyromonas macacae Species 0.000 description 2
- 241001135219 Prevotella disiens Species 0.000 description 2
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 2
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 description 2
- 238000012228 RNA interference-mediated gene silencing Methods 0.000 description 2
- 230000007022 RNA scission Effects 0.000 description 2
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 2
- 108091081062 Repeated sequence (DNA) Proteins 0.000 description 2
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 2
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 2
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 2
- 201000009594 Systemic Scleroderma Diseases 0.000 description 2
- 206010042953 Systemic sclerosis Diseases 0.000 description 2
- 241000206213 Thermosipho africanus Species 0.000 description 2
- 102100031372 Thymidine phosphorylase Human genes 0.000 description 2
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 2
- 108010009583 Transforming Growth Factors Proteins 0.000 description 2
- 102000009618 Transforming Growth Factors Human genes 0.000 description 2
- 102100033019 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 Human genes 0.000 description 2
- 206010046851 Uveitis Diseases 0.000 description 2
- 108010053096 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-1 Proteins 0.000 description 2
- 102000016549 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Human genes 0.000 description 2
- 108010053100 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-3 Proteins 0.000 description 2
- 102100033178 Vascular endothelial growth factor receptor 1 Human genes 0.000 description 2
- 102100033179 Vascular endothelial growth factor receptor 3 Human genes 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-N arachidonic acid Chemical compound CCCCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCC(O)=O YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-N 0.000 description 2
- 241000385736 bacterium B Species 0.000 description 2
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 2
- 230000012292 cell migration Effects 0.000 description 2
- 210000003161 choroid Anatomy 0.000 description 2
- 201000000159 corneal neovascularization Diseases 0.000 description 2
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 2
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 description 2
- 208000030533 eye disease Diseases 0.000 description 2
- 108010021843 fluorescent protein 583 Proteins 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 238000003209 gene knockout Methods 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 description 2
- 102000047825 human ANGPT2 Human genes 0.000 description 2
- 102000055659 human ANGPTL4 Human genes 0.000 description 2
- 102000058223 human VEGFA Human genes 0.000 description 2
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 2
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 2
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 description 2
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 2
- 229940039781 leptin Drugs 0.000 description 2
- NRYBAZVQPHGZNS-ZSOCWYAHSA-N leptin Chemical compound O=C([C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CCSC)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O NRYBAZVQPHGZNS-ZSOCWYAHSA-N 0.000 description 2
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 2
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 description 2
- 125000000018 nitroso group Chemical group N(=O)* 0.000 description 2
- 230000030147 nuclear export Effects 0.000 description 2
- 230000005937 nuclear translocation Effects 0.000 description 2
- 108060005597 nucleoplasmin Proteins 0.000 description 2
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 2
- 210000000608 photoreceptor cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000000770 proinflammatory effect Effects 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 230000008263 repair mechanism Effects 0.000 description 2
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 2
- DUYSYHSSBDVJSM-KRWOKUGFSA-N sphingosine 1-phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCC\C=C\[C@@H](O)[C@@H](N)COP(O)(O)=O DUYSYHSSBDVJSM-KRWOKUGFSA-N 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 201000000596 systemic lupus erythematosus Diseases 0.000 description 2
- 101150003509 tag gene Proteins 0.000 description 2
- 229940094937 thioredoxin Drugs 0.000 description 2
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 2
- 230000034512 ubiquitination Effects 0.000 description 2
- 238000010798 ubiquitination Methods 0.000 description 2
- 230000008728 vascular permeability Effects 0.000 description 2
- BJHCYTJNPVGSBZ-YXSASFKJSA-N 1-[4-[6-amino-5-[(Z)-methoxyiminomethyl]pyrimidin-4-yl]oxy-2-chlorophenyl]-3-ethylurea Chemical compound CCNC(=O)Nc1ccc(Oc2ncnc(N)c2\C=N/OC)cc1Cl BJHCYTJNPVGSBZ-YXSASFKJSA-N 0.000 description 1
- 102100026152 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase epsilon Human genes 0.000 description 1
- 102100030390 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100036506 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1 Human genes 0.000 description 1
- ZNHVWPKMFKADKW-UHFFFAOYSA-N 12-HETE Chemical compound CCCCCC=CCC(O)C=CC=CCC=CCCCC(O)=O ZNHVWPKMFKADKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZNHVWPKMFKADKW-ZYBDYUKJSA-N 12-HETE Natural products CCCCC\C=C/C[C@@H](O)\C=C\C=C/C\C=C/CCCC(O)=O ZNHVWPKMFKADKW-ZYBDYUKJSA-N 0.000 description 1
- LLMLGZUZTFMXSA-UHFFFAOYSA-N 2,3,4,5,6-pentachlorobenzenethiol Chemical compound SC1=C(Cl)C(Cl)=C(Cl)C(Cl)=C1Cl LLMLGZUZTFMXSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100039377 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein Human genes 0.000 description 1
- 101710176122 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein Proteins 0.000 description 1
- 102100034254 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100036009 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2 Human genes 0.000 description 1
- UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 5,8-dihydroxy-2-methoxy-6-methyl-7-(2-oxopropyl)naphthalene-1,4-dione Chemical compound CC1=C(CC(C)=O)C(O)=C2C(=O)C(OC)=CC(=O)C2=C1O UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100036512 7-dehydrocholesterol reductase Human genes 0.000 description 1
- 102100026802 72 kDa type IV collagenase Human genes 0.000 description 1
- 102100032296 A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 12 Human genes 0.000 description 1
- 102100031901 A-kinase anchor protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 239000013607 AAV vector Substances 0.000 description 1
- 101150092476 ABCA1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108091005671 ADAMTS12 Proteins 0.000 description 1
- 102000017919 ADRB2 Human genes 0.000 description 1
- 108700005241 ATP Binding Cassette Transporter 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100021407 ATP-dependent RNA helicase DDX18 Human genes 0.000 description 1
- 108091006112 ATPases Proteins 0.000 description 1
- 241000007910 Acaryochloris marina Species 0.000 description 1
- 241001135192 Acetohalobium arabaticum Species 0.000 description 1
- 241000604451 Acidaminococcus Species 0.000 description 1
- 241000605222 Acidithiobacillus ferrooxidans Species 0.000 description 1
- 102100022714 Acyl-coenzyme A thioesterase 13 Human genes 0.000 description 1
- 101710169767 Acyl-coenzyme A thioesterase 13 Proteins 0.000 description 1
- 102000057290 Adenosine Triphosphatases Human genes 0.000 description 1
- 102100039675 Adenylate cyclase type 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100032599 Adhesion G protein-coupled receptor B3 Human genes 0.000 description 1
- 102100031786 Adiponectin Human genes 0.000 description 1
- 102100033497 Adiponectin receptor protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100032358 Adiponectin receptor protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 108010003133 Aldo-Keto Reductase Family 1 Member C2 Proteins 0.000 description 1
- 102100024089 Aldo-keto reductase family 1 member C2 Human genes 0.000 description 1
- 241000190857 Allochromatium vinosum Species 0.000 description 1
- 102100030461 Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO Human genes 0.000 description 1
- 241000147155 Ammonifex degensii Species 0.000 description 1
- 241000192542 Anabaena Species 0.000 description 1
- 102100022987 Angiogenin Human genes 0.000 description 1
- 101710085845 Angiopoietin-related protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 102000009840 Angiopoietins Human genes 0.000 description 1
- 108010009906 Angiopoietins Proteins 0.000 description 1
- 102100040006 Annexin A1 Human genes 0.000 description 1
- 102100033715 Apolipoprotein A-I Human genes 0.000 description 1
- 101710095342 Apolipoprotein B Proteins 0.000 description 1
- 102100040202 Apolipoprotein B-100 Human genes 0.000 description 1
- 241001495180 Arthrospira Species 0.000 description 1
- 241000620196 Arthrospira maxima Species 0.000 description 1
- 240000002900 Arthrospira platensis Species 0.000 description 1
- 235000016425 Arthrospira platensis Nutrition 0.000 description 1
- 241001495183 Arthrospira sp. Species 0.000 description 1
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 1
- 241000589941 Azospirillum Species 0.000 description 1
- 101150071434 BAR1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000605059 Bacteroidetes Species 0.000 description 1
- 102100021334 Bcl-2-related protein A1 Human genes 0.000 description 1
- 102100021738 Beta-adrenergic receptor kinase 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100024504 Bone morphogenetic protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 241000555281 Brevibacillus Species 0.000 description 1
- 241001453380 Burkholderia Species 0.000 description 1
- 241000168061 Butyrivibrio proteoclasticus Species 0.000 description 1
- 102000049320 CD36 Human genes 0.000 description 1
- 108010045374 CD36 Antigens Proteins 0.000 description 1
- 102100032912 CD44 antigen Human genes 0.000 description 1
- 102100024154 Cadherin-13 Human genes 0.000 description 1
- 101001039256 Caenorhabditis elegans Low-density lipoprotein receptor-related protein Proteins 0.000 description 1
- 101100381481 Caenorhabditis elegans baz-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100031077 Calcineurin B homologous protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 101710147325 Calcineurin B homologous protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 102100024316 Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A Human genes 0.000 description 1
- 102100021534 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100033088 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D Human genes 0.000 description 1
- 241000589876 Campylobacter Species 0.000 description 1
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 1
- 102100032566 Carbonic anhydrase-related protein 10 Human genes 0.000 description 1
- 241000206594 Carnobacterium Species 0.000 description 1
- 102000011068 Cdc42 Human genes 0.000 description 1
- 102000020313 Cell-Penetrating Peptides Human genes 0.000 description 1
- 108010051109 Cell-Penetrating Peptides Proteins 0.000 description 1
- 101150054987 ChAT gene Proteins 0.000 description 1
- 241000606161 Chlamydia Species 0.000 description 1
- 102100023460 Choline O-acetyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 108091060290 Chromatid Proteins 0.000 description 1
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 description 1
- 102100031615 Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 241000193403 Clostridium Species 0.000 description 1
- 102100033781 Collagen alpha-2(IV) chain Human genes 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 208000027205 Congenital disease Diseases 0.000 description 1
- 241000065719 Crocosphaera Species 0.000 description 1
- 108010037462 Cyclooxygenase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101150081028 Cysltr1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150016994 Cysltr2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100038496 Cysteinyl leukotriene receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100033539 Cysteinyl leukotriene receptor 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100036952 Cytoplasmic protein NCK2 Human genes 0.000 description 1
- 102100029813 D(1B) dopamine receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100020756 D(2) dopamine receptor Human genes 0.000 description 1
- 230000007035 DNA breakage Effects 0.000 description 1
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 description 1
- 101100481408 Danio rerio tie2 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010011878 Deafness Diseases 0.000 description 1
- 241000605716 Desulfovibrio Species 0.000 description 1
- 208000002249 Diabetes Complications Diseases 0.000 description 1
- 206010012655 Diabetic complications Diseases 0.000 description 1
- 102100022732 Diacylglycerol kinase beta Human genes 0.000 description 1
- 102100030215 Diacylglycerol kinase eta Human genes 0.000 description 1
- 102100030220 Diacylglycerol kinase zeta Human genes 0.000 description 1
- 101000876610 Dictyostelium discoideum Extracellular signal-regulated kinase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101100189582 Dictyostelium discoideum pdeD gene Proteins 0.000 description 1
- 102100024746 Dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- 102100036367 Dual 3',5'-cyclic-AMP and -GMP phosphodiesterase 11A Human genes 0.000 description 1
- 102100033334 E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog Human genes 0.000 description 1
- 102000017914 EDNRA Human genes 0.000 description 1
- 102100021977 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 Human genes 0.000 description 1
- 108050004000 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 Proteins 0.000 description 1
- 102100030695 Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 102100021579 Enhancer of filamentation 1 Human genes 0.000 description 1
- 241000588914 Enterobacter Species 0.000 description 1
- 102100031855 Estrogen-related receptor gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000272186 Falco columbarius Species 0.000 description 1
- 102100035111 Farnesyl pyrophosphate synthase Human genes 0.000 description 1
- 102000009123 Fibrin Human genes 0.000 description 1
- 108010073385 Fibrin Proteins 0.000 description 1
- BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N Fibrin monomer Chemical compound CNC(=O)CNC(=O)CN BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100026561 Filamin-A Human genes 0.000 description 1
- 241000192016 Finegoldia magna Species 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 241000223218 Fusarium Species 0.000 description 1
- 102100023685 G protein-coupled receptor kinase 5 Human genes 0.000 description 1
- 230000010190 G1 phase Effects 0.000 description 1
- 230000010337 G2 phase Effects 0.000 description 1
- 102100027541 GTP-binding protein Rheb Human genes 0.000 description 1
- 102100035924 Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 Human genes 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 241000032681 Gluconacetobacter Species 0.000 description 1
- 102100036076 Glycerophosphocholine cholinephosphodiesterase ENPP6 Human genes 0.000 description 1
- 102100036733 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-12 Human genes 0.000 description 1
- 102100036703 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 Human genes 0.000 description 1
- 102000000310 HNH endonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108050008753 HNH endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 101100340443 Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) infB gene Proteins 0.000 description 1
- 102100031573 Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Human genes 0.000 description 1
- 241000724709 Hepatitis delta virus Species 0.000 description 1
- 208000009889 Herpes Simplex Diseases 0.000 description 1
- 208000007514 Herpes zoster Diseases 0.000 description 1
- 101000691569 Homo sapiens 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase epsilon Proteins 0.000 description 1
- 101000583063 Homo sapiens 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000928753 Homo sapiens 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000640855 Homo sapiens 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000694288 Homo sapiens 40S ribosomal protein SA Proteins 0.000 description 1
- 101000783681 Homo sapiens 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000928720 Homo sapiens 7-dehydrocholesterol reductase Proteins 0.000 description 1
- 101000627872 Homo sapiens 72 kDa type IV collagenase Proteins 0.000 description 1
- 101000774738 Homo sapiens A-kinase anchor protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000677540 Homo sapiens Acetyl-CoA carboxylase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000798882 Homo sapiens Actin-like protein 6A Proteins 0.000 description 1
- 101000959347 Homo sapiens Adenylate cyclase type 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000796801 Homo sapiens Adhesion G protein-coupled receptor B3 Proteins 0.000 description 1
- 101000775469 Homo sapiens Adiponectin Proteins 0.000 description 1
- 101001135206 Homo sapiens Adiponectin receptor protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000589401 Homo sapiens Adiponectin receptor protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001062620 Homo sapiens Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO Proteins 0.000 description 1
- 101000959738 Homo sapiens Annexin A1 Proteins 0.000 description 1
- 101000733802 Homo sapiens Apolipoprotein A-I Proteins 0.000 description 1
- 101100218947 Homo sapiens BMP3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000894929 Homo sapiens Bcl-2-related protein A1 Proteins 0.000 description 1
- 101000959437 Homo sapiens Beta-2 adrenergic receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000751445 Homo sapiens Beta-adrenergic receptor kinase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000868273 Homo sapiens CD44 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000762243 Homo sapiens Cadherin-13 Proteins 0.000 description 1
- 101001117044 Homo sapiens Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A Proteins 0.000 description 1
- 101000971617 Homo sapiens Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000944258 Homo sapiens Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D Proteins 0.000 description 1
- 101000867836 Homo sapiens Carbonic anhydrase-related protein 10 Proteins 0.000 description 1
- 101000969553 Homo sapiens Cell surface glycoprotein CD200 receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000993348 Homo sapiens Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000710876 Homo sapiens Collagen alpha-2(IV) chain Proteins 0.000 description 1
- 101001024712 Homo sapiens Cytoplasmic protein NCK2 Proteins 0.000 description 1
- 101000865210 Homo sapiens D(1B) dopamine receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000931901 Homo sapiens D(2) dopamine receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001044814 Homo sapiens Diacylglycerol kinase beta Proteins 0.000 description 1
- 101000864599 Homo sapiens Diacylglycerol kinase eta Proteins 0.000 description 1
- 101000864576 Homo sapiens Diacylglycerol kinase zeta Proteins 0.000 description 1
- 101001072029 Homo sapiens Dual 3',5'-cyclic-AMP and -GMP phosphodiesterase 11A Proteins 0.000 description 1
- 101000997630 Homo sapiens E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog Proteins 0.000 description 1
- 101001010541 Homo sapiens Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 101000967336 Homo sapiens Endothelin-1 receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000898310 Homo sapiens Enhancer of filamentation 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000920831 Homo sapiens Estrogen-related receptor gamma Proteins 0.000 description 1
- 101001023007 Homo sapiens Farnesyl pyrophosphate synthase Proteins 0.000 description 1
- 101000913549 Homo sapiens Filamin-A Proteins 0.000 description 1
- 101000829476 Homo sapiens G protein-coupled receptor kinase 5 Proteins 0.000 description 1
- 101001000703 Homo sapiens Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001040875 Homo sapiens Glucosidase 2 subunit beta Proteins 0.000 description 1
- 101000876254 Homo sapiens Glycerophosphocholine cholinephosphodiesterase ENPP6 Proteins 0.000 description 1
- 101001072398 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-12 Proteins 0.000 description 1
- 101001072481 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 Proteins 0.000 description 1
- 101000777663 Homo sapiens Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Proteins 0.000 description 1
- 101001079904 Homo sapiens Hyaluronan and proteoglycan link protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000962530 Homo sapiens Hyaluronidase-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000962526 Homo sapiens Hyaluronidase-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000972489 Homo sapiens Laminin subunit alpha-1 Proteins 0.000 description 1
- 101001054649 Homo sapiens Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001054646 Homo sapiens Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001042362 Homo sapiens Leukemia inhibitory factor receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001064301 Homo sapiens Lipase member K Proteins 0.000 description 1
- 101001051093 Homo sapiens Low-density lipoprotein receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001030069 Homo sapiens Major vault protein Proteins 0.000 description 1
- 101000990902 Homo sapiens Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 description 1
- 101001032845 Homo sapiens Metabotropic glutamate receptor 5 Proteins 0.000 description 1
- 101000645296 Homo sapiens Metalloproteinase inhibitor 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001013648 Homo sapiens Methionine synthase Proteins 0.000 description 1
- 101000936433 Homo sapiens Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 101000628796 Homo sapiens Microsomal glutathione S-transferase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000615613 Homo sapiens Mineralocorticoid receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001052493 Homo sapiens Mitogen-activated protein kinase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000970561 Homo sapiens Myc box-dependent-interacting protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000998158 Homo sapiens NF-kappa-B inhibitor beta Proteins 0.000 description 1
- 101001128156 Homo sapiens Nanos homolog 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001124309 Homo sapiens Nitric oxide synthase, endothelial Proteins 0.000 description 1
- 101001124991 Homo sapiens Nitric oxide synthase, inducible Proteins 0.000 description 1
- 101000979342 Homo sapiens Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit Proteins 0.000 description 1
- 101001098357 Homo sapiens Orexin receptor type 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001098232 Homo sapiens P2Y purinoceptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001120086 Homo sapiens P2Y purinoceptor 12 Proteins 0.000 description 1
- 101000735213 Homo sapiens Palladin Proteins 0.000 description 1
- 101000741788 Homo sapiens Peroxisome proliferator-activated receptor alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000741790 Homo sapiens Peroxisome proliferator-activated receptor gamma Proteins 0.000 description 1
- 101001123325 Homo sapiens Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta Proteins 0.000 description 1
- 101000620897 Homo sapiens Phosphatidylcholine transfer protein Proteins 0.000 description 1
- 101000605666 Homo sapiens Phospholipase A1 member A Proteins 0.000 description 1
- 101000730665 Homo sapiens Phospholipase D1 Proteins 0.000 description 1
- 101000730670 Homo sapiens Phospholipase D2 Proteins 0.000 description 1
- 101000905839 Homo sapiens Phospholipid-transporting ATPase VA Proteins 0.000 description 1
- 101000605403 Homo sapiens Plasminogen Proteins 0.000 description 1
- 101000609255 Homo sapiens Plasminogen activator inhibitor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000609261 Homo sapiens Plasminogen activator inhibitor 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001126417 Homo sapiens Platelet-derived growth factor receptor alpha Proteins 0.000 description 1
- 101001113440 Homo sapiens Poly [ADP-ribose] polymerase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001043564 Homo sapiens Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001021281 Homo sapiens Protein HEXIM1 Proteins 0.000 description 1
- 101000878540 Homo sapiens Protein-tyrosine kinase 2-beta Proteins 0.000 description 1
- 101001098529 Homo sapiens Proteinase-activated receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000738769 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000581173 Homo sapiens Rho GTPase-activating protein 17 Proteins 0.000 description 1
- 101000669917 Homo sapiens Rho-associated protein kinase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000669921 Homo sapiens Rho-associated protein kinase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000944909 Homo sapiens Ribosomal protein S6 kinase alpha-1 Proteins 0.000 description 1
- 101001051714 Homo sapiens Ribosomal protein S6 kinase beta-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000983111 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase PAK 6 Proteins 0.000 description 1
- 101000713169 Homo sapiens Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000629638 Homo sapiens Sorbin and SH3 domain-containing protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000693265 Homo sapiens Sphingosine 1-phosphate receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000693269 Homo sapiens Sphingosine 1-phosphate receptor 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000653757 Homo sapiens Sphingosine 1-phosphate receptor 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000653759 Homo sapiens Sphingosine 1-phosphate receptor 5 Proteins 0.000 description 1
- 101000629597 Homo sapiens Sterol regulatory element-binding protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000629605 Homo sapiens Sterol regulatory element-binding protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000800055 Homo sapiens Testican-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000659879 Homo sapiens Thrombospondin-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000633605 Homo sapiens Thrombospondin-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000712600 Homo sapiens Thyroid hormone receptor beta Proteins 0.000 description 1
- 101000801481 Homo sapiens Tissue-type plasminogen activator Proteins 0.000 description 1
- 101000637850 Homo sapiens Tolloid-like protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001087416 Homo sapiens Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 Proteins 0.000 description 1
- 101000638886 Homo sapiens Urokinase-type plasminogen activator Proteins 0.000 description 1
- 101000988419 Homo sapiens cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D Proteins 0.000 description 1
- 101001046426 Homo sapiens cGMP-dependent protein kinase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001098818 Homo sapiens cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A Proteins 0.000 description 1
- 102100028084 Hyaluronan and proteoglycan link protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100039283 Hyaluronidase-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100039285 Hyaluronidase-2 Human genes 0.000 description 1
- 206010021143 Hypoxia Diseases 0.000 description 1
- 208000019468 Iatrogenic Disease Diseases 0.000 description 1
- 102100026236 Interleukin-8 Human genes 0.000 description 1
- 108090001007 Interleukin-8 Proteins 0.000 description 1
- 206010065630 Iris neovascularisation Diseases 0.000 description 1
- 241001430080 Ktedonobacter racemifer Species 0.000 description 1
- 241001134638 Lachnospira Species 0.000 description 1
- 241000186673 Lactobacillus delbrueckii Species 0.000 description 1
- 102100022746 Laminin subunit alpha-1 Human genes 0.000 description 1
- 101710128836 Large T antigen Proteins 0.000 description 1
- 102100027017 Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- 241000589248 Legionella Species 0.000 description 1
- 208000007764 Legionnaires' Disease Diseases 0.000 description 1
- 102100029825 Leptin receptor gene-related protein Human genes 0.000 description 1
- 102100021747 Leukemia inhibitory factor receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100030653 Lipase member K Human genes 0.000 description 1
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 1
- 108010015372 Low Density Lipoprotein Receptor-Related Protein-2 Proteins 0.000 description 1
- 102100024640 Low-density lipoprotein receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100021922 Low-density lipoprotein receptor-related protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 101000761444 Loxosceles laeta Dermonecrotic toxin Proteins 0.000 description 1
- 101000964266 Loxosceles laeta Dermonecrotic toxin Proteins 0.000 description 1
- 241001134698 Lyngbya Species 0.000 description 1
- 108040008097 MAP kinase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000019149 MAP kinase activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000206589 Marinobacter Species 0.000 description 1
- 241000501784 Marinobacter sp. Species 0.000 description 1
- 102100027754 Mast/stem cell growth factor receptor Kit Human genes 0.000 description 1
- 102100030412 Matrix metalloproteinase-9 Human genes 0.000 description 1
- 102100025169 Max-binding protein MNT Human genes 0.000 description 1
- 108050004622 Membrane metallo-endopeptidase-like 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100038357 Metabotropic glutamate receptor 5 Human genes 0.000 description 1
- 102100026262 Metalloproteinase inhibitor 2 Human genes 0.000 description 1
- 241000204637 Methanohalobium evestigatum Species 0.000 description 1
- 102100031551 Methionine synthase Human genes 0.000 description 1
- 102100027392 Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 102100026723 Microsomal glutathione S-transferase 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100021316 Mineralocorticoid receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100024193 Mitogen-activated protein kinase 1 Human genes 0.000 description 1
- 101150097381 Mtor gene Proteins 0.000 description 1
- 101100078999 Mus musculus Mx1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100481410 Mus musculus Tek gene Proteins 0.000 description 1
- 102100021970 Myc box-dependent-interacting protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 1
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 1
- 208000031888 Mycoses Diseases 0.000 description 1
- 102100033457 NF-kappa-B inhibitor beta Human genes 0.000 description 1
- 102100031893 Nanos homolog 3 Human genes 0.000 description 1
- 241000167285 Natranaerobius thermophilus Species 0.000 description 1
- 102000048238 Neuregulin-1 Human genes 0.000 description 1
- 108090000556 Neuregulin-1 Proteins 0.000 description 1
- 102000004207 Neuropilin-1 Human genes 0.000 description 1
- 101100355599 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) mus-11 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000135938 Nitratifractor Species 0.000 description 1
- 102100029438 Nitric oxide synthase, inducible Human genes 0.000 description 1
- 241000192147 Nitrosococcus Species 0.000 description 1
- 241000919925 Nitrosococcus halophilus Species 0.000 description 1
- 241000203622 Nocardiopsis Species 0.000 description 1
- 108020004485 Nonsense Codon Proteins 0.000 description 1
- XOJVVFBFDXDTEG-UHFFFAOYSA-N Norphytane Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C XOJVVFBFDXDTEG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000192673 Nostoc sp. Species 0.000 description 1
- 102100023050 Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit Human genes 0.000 description 1
- 102100038494 Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 Human genes 0.000 description 1
- 206010069385 Ocular ischaemic syndrome Diseases 0.000 description 1
- 206010030113 Oedema Diseases 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 241000243981 Onchocerca Species 0.000 description 1
- 102100037588 Orexin receptor type 2 Human genes 0.000 description 1
- 101100378536 Ovis aries ADRB1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100037600 P2Y purinoceptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100026171 P2Y purinoceptor 12 Human genes 0.000 description 1
- 101700056750 PAK1 Proteins 0.000 description 1
- 101150098694 PDE5A gene Proteins 0.000 description 1
- 102100035031 Palladin Human genes 0.000 description 1
- 206010073286 Pathologic myopia Diseases 0.000 description 1
- 102000018546 Paxillin Human genes 0.000 description 1
- ACNHBCIZLNNLRS-UHFFFAOYSA-N Paxilline 1 Natural products N1C2=CC=CC=C2C2=C1C1(C)C3(C)CCC4OC(C(C)(O)C)C(=O)C=C4C3(O)CCC1C2 ACNHBCIZLNNLRS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010034277 Pemphigoid Diseases 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102100038831 Peroxisome proliferator-activated receptor alpha Human genes 0.000 description 1
- 102100038825 Peroxisome proliferator-activated receptor gamma Human genes 0.000 description 1
- 102100028961 Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta Human genes 0.000 description 1
- 241000983938 Petrotoga mobilis Species 0.000 description 1
- 102100022906 Phosphatidylcholine transfer protein Human genes 0.000 description 1
- 102100038331 Phospholipase A1 member A Human genes 0.000 description 1
- 102100026918 Phospholipase A2 Human genes 0.000 description 1
- 101710096328 Phospholipase A2 Proteins 0.000 description 1
- 102100032967 Phospholipase D1 Human genes 0.000 description 1
- 102100032983 Phospholipase D2 Human genes 0.000 description 1
- 102100033616 Phospholipid-transporting ATPase ABCA1 Human genes 0.000 description 1
- 102100023496 Phospholipid-transporting ATPase VA Human genes 0.000 description 1
- 108010082093 Placenta Growth Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100035194 Placenta growth factor Human genes 0.000 description 1
- 102100038124 Plasminogen Human genes 0.000 description 1
- 102100039418 Plasminogen activator inhibitor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100039419 Plasminogen activator inhibitor 2 Human genes 0.000 description 1
- 108010051742 Platelet-Derived Growth Factor beta Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100030485 Platelet-derived growth factor receptor alpha Human genes 0.000 description 1
- 102100026547 Platelet-derived growth factor receptor beta Human genes 0.000 description 1
- 102100037596 Platelet-derived growth factor subunit A Human genes 0.000 description 1
- 102100040990 Platelet-derived growth factor subunit B Human genes 0.000 description 1
- 102100039277 Pleiotrophin Human genes 0.000 description 1
- 241001599925 Polaromonas naphthalenivorans Species 0.000 description 1
- 241001472610 Polaromonas sp. Species 0.000 description 1
- 102100023652 Poly [ADP-ribose] polymerase 2 Human genes 0.000 description 1
- 108010061844 Poly(ADP-ribose) Polymerases Proteins 0.000 description 1
- 102000012338 Poly(ADP-ribose) Polymerases Human genes 0.000 description 1
- 229920000776 Poly(Adenosine diphosphate-ribose) polymerase Polymers 0.000 description 1
- 108010001511 Pregnane X Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100021923 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100040120 Prominin-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100038280 Prostaglandin G/H synthase 2 Human genes 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 102100037787 Protein-tyrosine kinase 2-beta Human genes 0.000 description 1
- 102100037136 Proteinase-activated receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010019674 Proto-Oncogene Proteins c-sis Proteins 0.000 description 1
- 241000590028 Pseudoalteromonas haloplanktis Species 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 101000947436 Psychotria longipes Cyclopsychotride-A Proteins 0.000 description 1
- 101710132082 Pyrimidine/purine nucleoside phosphorylase Proteins 0.000 description 1
- 101150006234 RAD52 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150040459 RAS gene Proteins 0.000 description 1
- 101150076031 RAS1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150020518 RHEB gene Proteins 0.000 description 1
- 101150111584 RHOA gene Proteins 0.000 description 1
- 102000053062 Rad52 DNA Repair and Recombination Human genes 0.000 description 1
- 108700031762 Rad52 DNA Repair and Recombination Proteins 0.000 description 1
- 102100022122 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 Human genes 0.000 description 1
- 101100372762 Rattus norvegicus Flt1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100029981 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4 Human genes 0.000 description 1
- 101710100963 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4 Proteins 0.000 description 1
- 208000001647 Renal Insufficiency Diseases 0.000 description 1
- 206010038848 Retinal detachment Diseases 0.000 description 1
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 1
- 101001030849 Rhinella marina Mesotocin receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100027656 Rho GTPase-activating protein 17 Human genes 0.000 description 1
- 102100039313 Rho-associated protein kinase 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100039314 Rho-associated protein kinase 2 Human genes 0.000 description 1
- 241000191025 Rhodobacter Species 0.000 description 1
- 102100033536 Ribosomal protein S6 kinase alpha-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100024917 Ribosomal protein S6 kinase beta-2 Human genes 0.000 description 1
- 241000605947 Roseburia Species 0.000 description 1
- 108091005487 SCARB1 Proteins 0.000 description 1
- 108010017324 STAT3 Transcription Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100037118 Scavenger receptor class B member 1 Human genes 0.000 description 1
- 101100450707 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) hif2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100031206 Serine/threonine-protein kinase N1 Human genes 0.000 description 1
- 102100026840 Serine/threonine-protein kinase PAK 6 Human genes 0.000 description 1
- 102100026715 Serine/threonine-protein kinase STK11 Human genes 0.000 description 1
- 101710181599 Serine/threonine-protein kinase STK11 Proteins 0.000 description 1
- 102100023085 Serine/threonine-protein kinase mTOR Human genes 0.000 description 1
- 102100024040 Signal transducer and activator of transcription 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100026901 Sorbin and SH3 domain-containing protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 241000949716 Sphaerochaeta Species 0.000 description 1
- 102100025750 Sphingosine 1-phosphate receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100025747 Sphingosine 1-phosphate receptor 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100029803 Sphingosine 1-phosphate receptor 4 Human genes 0.000 description 1
- 102100029802 Sphingosine 1-phosphate receptor 5 Human genes 0.000 description 1
- 102000011011 Sphingosine 1-phosphate receptors Human genes 0.000 description 1
- 108050001083 Sphingosine 1-phosphate receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100026839 Sterol regulatory element-binding protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100026841 Sterol regulatory element-binding protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 241000194019 Streptococcus mutans Species 0.000 description 1
- 101000745670 Streptomyces venezuelae (strain ATCC 10712 / CBS 650.69 / DSM 40230 / JCM 4526 / NBRC 13096 / PD 04745) Chloramphenicol 3-O phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 108091027544 Subgenomic mRNA Proteins 0.000 description 1
- 241000192560 Synechococcus sp. Species 0.000 description 1
- 102000002154 T-Lymphoma Invasion and Metastasis-inducing Protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010001288 T-Lymphoma Invasion and Metastasis-inducing Protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100033456 TGF-beta receptor type-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100033390 Testican-1 Human genes 0.000 description 1
- 108700031954 Tgfb1i1/Leupaxin/TGFB1I1 Proteins 0.000 description 1
- 102100036034 Thrombospondin-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100029529 Thrombospondin-2 Human genes 0.000 description 1
- 108700023160 Thymidine phosphorylases Proteins 0.000 description 1
- 102100033451 Thyroid hormone receptor beta Human genes 0.000 description 1
- 102100033571 Tissue-type plasminogen activator Human genes 0.000 description 1
- 102100031997 Tolloid-like protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 1
- 108010011702 Transforming Growth Factor-beta Type I Receptor Proteins 0.000 description 1
- 108010082684 Transforming Growth Factor-beta Type II Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000004060 Transforming Growth Factor-beta Type II Receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100033663 Transforming growth factor beta receptor type 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100022387 Transforming protein RhoA Human genes 0.000 description 1
- 102100031358 Urokinase-type plasminogen activator Human genes 0.000 description 1
- 208000002495 Uterine Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 108091008605 VEGF receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000009484 Vascular Endothelial Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 208000014070 Vestibular schwannoma Diseases 0.000 description 1
- 208000000208 Wet Macular Degeneration Diseases 0.000 description 1
- 102000002258 X-ray Repair Cross Complementing Protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010000443 X-ray Repair Cross Complementing Protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 108010017070 Zinc Finger Nucleases Proteins 0.000 description 1
- VRGWBRLULZUWAJ-XFFXIZSCSA-N [(2s)-2-[(1r,3z,5s,8z,12z,15s)-5,17-dihydroxy-4,8,12,15-tetramethyl-16-oxo-18-bicyclo[13.3.0]octadeca-3,8,12,17-tetraenyl]propyl] acetate Chemical compound C1\C=C(C)/CC\C=C(C)/CC[C@H](O)\C(C)=C/C[C@@H]2C([C@@H](COC(C)=O)C)=C(O)C(=O)[C@]21C VRGWBRLULZUWAJ-XFFXIZSCSA-N 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000007488 abnormal function Effects 0.000 description 1
- 208000004064 acoustic neuroma Diseases 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005600 alkyl phosphonate group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 description 1
- 208000002205 allergic conjunctivitis Diseases 0.000 description 1
- 102000009899 alpha Karyopherins Human genes 0.000 description 1
- 108010077099 alpha Karyopherins Proteins 0.000 description 1
- 230000001668 ameliorated effect Effects 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 239000004037 angiogenesis inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000002491 angiogenic effect Effects 0.000 description 1
- 108010072788 angiogenin Proteins 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 229940114079 arachidonic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000021342 arachidonic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940011019 arthrospira platensis Drugs 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 208000024998 atopic conjunctivitis Diseases 0.000 description 1
- 241000496058 bacterium ND2006 Species 0.000 description 1
- 108010079292 betaglycan Proteins 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 210000001775 bruch membrane Anatomy 0.000 description 1
- 210000005252 bulbus oculi Anatomy 0.000 description 1
- 102100029170 cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D Human genes 0.000 description 1
- 102100022422 cGMP-dependent protein kinase 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100037093 cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A Human genes 0.000 description 1
- 102100029175 cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase Human genes 0.000 description 1
- 230000005907 cancer growth Effects 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 210000000845 cartilage Anatomy 0.000 description 1
- 108010051348 cdc42 GTP-Binding Protein Proteins 0.000 description 1
- 230000034303 cell budding Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 201000005667 central retinal vein occlusion Diseases 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 230000007073 chemical hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 210000004756 chromatid Anatomy 0.000 description 1
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 208000037976 chronic inflammation Diseases 0.000 description 1
- 230000006020 chronic inflammation Effects 0.000 description 1
- 239000012792 core layer Substances 0.000 description 1
- 208000029078 coronary artery disease Diseases 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 1
- 238000002716 delivery method Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 108020001096 dihydrofolate reductase Proteins 0.000 description 1
- 230000010339 dilation Effects 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 230000010595 endothelial cell migration Effects 0.000 description 1
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 1
- 230000007071 enzymatic hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006047 enzymatic hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 1
- 230000004438 eyesight Effects 0.000 description 1
- 201000006802 familial erythrocytosis 4 Diseases 0.000 description 1
- 238000000249 far-infrared magnetic resonance spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 229950003499 fibrin Drugs 0.000 description 1
- 125000001153 fluoro group Chemical group F* 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- VRGWBRLULZUWAJ-UHFFFAOYSA-N fusaproliferin Natural products C1C=C(C)CCC=C(C)CCC(O)C(C)=CCC2C(C(COC(C)=O)C)=C(O)C(=O)C21C VRGWBRLULZUWAJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 125000001475 halogen functional group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 1
- 230000010370 hearing loss Effects 0.000 description 1
- 231100000888 hearing loss Toxicity 0.000 description 1
- 208000016354 hearing loss disease Diseases 0.000 description 1
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 1
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 125000001165 hydrophobic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000007954 hypoxia Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 239000000976 ink Substances 0.000 description 1
- 230000017730 intein-mediated protein splicing Effects 0.000 description 1
- 230000035990 intercellular signaling Effects 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 201000006370 kidney failure Diseases 0.000 description 1
- 108010019813 leptin receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 210000002418 meninge Anatomy 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 230000033607 mismatch repair Effects 0.000 description 1
- 125000004573 morpholin-4-yl group Chemical group N1(CCOCC1)* 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 208000001491 myopia Diseases 0.000 description 1
- 230000004379 myopia Effects 0.000 description 1
- JTSLALYXYSRPGW-UHFFFAOYSA-N n-[5-(4-cyanophenyl)-1h-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]pyridine-3-carboxamide Chemical compound C=1C=CN=CC=1C(=O)NC(C1=C2)=CNC1=NC=C2C1=CC=C(C#N)C=C1 JTSLALYXYSRPGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 1
- 230000009826 neoplastic cell growth Effects 0.000 description 1
- 208000015122 neurodegenerative disease Diseases 0.000 description 1
- 229960003966 nicotinamide Drugs 0.000 description 1
- 235000005152 nicotinamide Nutrition 0.000 description 1
- 239000011570 nicotinamide Substances 0.000 description 1
- 230000037434 nonsense mutation Effects 0.000 description 1
- 230000020520 nucleotide-excision repair Effects 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 230000009437 off-target effect Effects 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- 230000003071 parasitic effect Effects 0.000 description 1
- ACNHBCIZLNNLRS-UBGQALKQSA-N paxilline Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C2=C1[C@]1(C)[C@@]3(C)CC[C@@H]4O[C@H](C(C)(O)C)C(=O)C=C4[C@]3(O)CC[C@H]1C2 ACNHBCIZLNNLRS-UBGQALKQSA-N 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 210000003668 pericyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 150000004713 phosphodiesters Chemical group 0.000 description 1
- PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N phosphoramidic acid Chemical group NP(O)(O)=O PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BRWWKYJBIHJVNQ-UYXJWNHNSA-N phosphoric acid;(3s,4r)-3,4,5-trihydroxypentanal Chemical group OP(O)(O)=O.OC[C@@H](O)[C@@H](O)CC=O BRWWKYJBIHJVNQ-UYXJWNHNSA-N 0.000 description 1
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 1
- 230000010118 platelet activation Effects 0.000 description 1
- 108010017843 platelet-derived growth factor A Proteins 0.000 description 1
- 102000005162 pleiotrophin Human genes 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000001023 pro-angiogenic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 229930185346 proliferin Natural products 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 235000004252 protein component Nutrition 0.000 description 1
- 238000001814 protein method Methods 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 230000007398 protein translocation Effects 0.000 description 1
- 208000020016 psychiatric disease Diseases 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 108010062302 rac1 GTP Binding Protein Proteins 0.000 description 1
- ZAHRKKWIAAJSAO-UHFFFAOYSA-N rapamycin Natural products COCC(O)C(=C/C(C)C(=O)CC(OC(=O)C1CCCCN1C(=O)C(=O)C2(O)OC(CC(OC)C(=CC=CC=CC(C)CC(C)C(=O)C)C)CCC2C)C(C)CC3CCC(O)C(C3)OC)C ZAHRKKWIAAJSAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000016914 ras Proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000754 repressing effect Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000004264 retinal detachment Effects 0.000 description 1
- 208000004644 retinal vein occlusion Diseases 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 230000033443 single strand break repair Effects 0.000 description 1
- 229960002930 sirolimus Drugs 0.000 description 1
- QFJCIRLUMZQUOT-HPLJOQBZSA-N sirolimus Chemical compound C1C[C@@H](O)[C@H](OC)C[C@@H]1C[C@@H](C)[C@H]1OC(=O)[C@@H]2CCCCN2C(=O)C(=O)[C@](O)(O2)[C@H](C)CC[C@H]2C[C@H](OC)/C(C)=C/C=C/C=C/[C@@H](C)C[C@@H](C)C(=O)[C@H](OC)[C@H](O)/C(C)=C/[C@@H](C)C(=O)C1 QFJCIRLUMZQUOT-HPLJOQBZSA-N 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 108020003113 steroid hormone receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000005969 steroid hormone receptors Human genes 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000005062 synaptic transmission Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 1
- 208000006379 syphilis Diseases 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 108091006107 transcriptional repressors Proteins 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 230000000472 traumatic effect Effects 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 description 1
- 206010046766 uterine cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000005167 vascular cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 235000019156 vitamin B Nutrition 0.000 description 1
- 239000011720 vitamin B Substances 0.000 description 1
- 229940046001 vitamin b complex Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/86—Viral vectors
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/465—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
- A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
- A61K9/0048—Eye, e.g. artificial tears
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
- A61P27/02—Ophthalmic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
- C07K14/515—Angiogenesic factors; Angiogenin
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
- C12N15/1136—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against growth factors, growth regulators, cytokines, lymphokines or hormones
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
- C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
- C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
- C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2227/00—Animals characterised by species
- A01K2227/10—Mammal
- A01K2227/105—Murine
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2267/00—Animals characterised by purpose
- A01K2267/03—Animal model, e.g. for test or diseases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPRs]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Vascular Medicine (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Virology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Ophthalmology & Optometry (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Cardiology (AREA)
Abstract
Description
該人工的に操作された新生血管形成関連因子は、核酸の1または複数の改変を含み、その改変は、
新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内のプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列かまたはPAM配列の5'末端および/または3'末端に隣接する連続した1bp〜50bpの塩基配列領域内の、1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入、野性型遺伝子とは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換、および1または複数の外来ヌクレオチドの挿入の少なくとも1つであるか、
あるいは
新生血管形成関連因子を構成する核酸配列の1または複数のヌクレオチドの化学修飾である。
VEGFA遺伝子の核酸配列内の配列番号3、4、7、9、10および11の標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
HIF1A遺伝子の核酸配列内の配列番号14、18、19、20、26、29および31の標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
ANGPT2遺伝子の核酸配列内の配列番号33、34、37、38、39および43の標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
EPAS1遺伝子の核酸配列内の配列番号47、48、49、50、53、54および55の標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、ならびに
ANGPTL4遺伝子の核酸配列内の配列番号64、66、67、73、76および79の標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸。
(a)VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の配列番号1〜1522、例えば、配列番号1〜79の標的配列の各々に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、またはガイド核酸をコードする核酸配列、
(b)化膿性連鎖球菌由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群から選択される1または複数のタンパク質を含む編集タンパク質または編集タンパク質をコードする核酸配列
が含まれてよい。
(b)化膿性連鎖球菌由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群からそれぞれ選択される1または複数のタンパク質を含む編集タンパク質または編集タンパク質をコードする核酸配列を、細胞に導入することが含まれる。
(a)VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の配列番号1〜1522、例えば、配列番号1〜79の標的配列に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸またはガイド核酸をコードする核酸配列、ならびに
(b)化膿性連鎖球菌由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群からそれぞれ選択される1または複数のタンパク質を含む編集タンパク質または編集タンパク質をコードする核酸配列が含まれる。
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の1または複数の標的配列と相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、またはガイド核酸をコードする核酸配列と、
編集タンパク質または編集タンパク質をコードする核酸配列
が含まれる。
本発明の例示的な実施形態は、新生血管形成に関連する系の改善および改変に関する。
[新生血管形成関連因子] 本発明の一実施形態は、人工的に操作されたかまたは改変された新生血管形成関連因子に関する。
新生血管形成関連因子、つまり、操作される遺伝子(以降、標的遺伝子と呼ぶ)の全部または一部の欠失、例えば、標的遺伝子の1bpまたはそれ以上のヌクレオチド、例えば、1〜30、1〜27、1〜25、1〜23、1〜20、1〜15、1〜10、1〜5、1〜3、または1ヌクレオチドの欠失、
野性型とは異なるヌクレオチドを有する標的遺伝子の1bpまたはそれ以上のヌクレオチド、例えば、1〜30、1〜27、1〜25、1〜23、1〜20、1〜15、1〜10、1〜5、1〜3、または1ヌクレオチドの置換、および
1または複数のヌクレオチド、例えば、1〜30、1〜27、1〜25、1〜23、1〜20、1〜15、1〜10、1〜5、1〜3、または1ヌクレオチド(各々独立にA、T、CおよびGから選択される)標的遺伝子の特定の位置への挿入。
[新生血管形成調節系] 本発明の一態様では、新生血管形成関連因子を人工的に操作することによって新生血管形成を調節するための新生血管形成調節系が提供される。
プロモーター配列中、
エンハンサー配列中、
特定のイントロン配列中、または
特定のエクソン配列中であり得る。
新生血管形成の調節に影響を及ぼす新生血管形成関連因子、例えばVEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子、またはANGPTL4遺伝子を、操作対象として標的化することができる。
本発明の新生血管形成調節系には、ガイド核酸−編集タンパク質複合体が新生血管形成関連因子を操作するための組成物として含まれてよい。
用語「ガイド核酸−編集タンパク質複合体」とは、ガイド核酸と編集タンパク質の間の相互作用によって形成された複合体をさし、核酸−タンパク質複合体にはガイド核酸および編集タンパク質が含まれる。
ガイド核酸は、標的核酸、遺伝子、染色体またはタンパク質を認識する能力があり、ガイド核酸−タンパク質複合体を形成する核酸である。
用語「ガイドドメイン」は、標的遺伝子または核酸上の標的配列と相補的結合を形成することができ、標的遺伝子または核酸と特異的に相互作用する働きをする相補ガイド配列を有するドメインである。
用語「第1の相補的ドメイン」は、第2の相補的ドメインに相補的な核酸配列を含む核酸配列であり、第2の相補的ドメインと二本鎖を形成するのに十分な相補性を有する。
用語「リンカードメイン」は、2またはそれ以上の同一または異なるドメインである2またはそれ以上のドメインを連結する核酸配列である。リンカードメインは、共有結合または非共有結合によって2またはそれ以上のドメインと連結されるか、または共有結合または非共有結合によって2またはそれ以上のドメインを連結することができる。
用語「第2の相補的ドメイン」は、第1の相補的ドメインに相補的な核酸配列を含む核酸配列であり、第1の相補的ドメインと二本鎖を形成するのに十分な相補性を有する。
用語「近位ドメイン」は、第2の相補的ドメインに隣接して位置する核酸配列である。
用語「テールドメイン」は、ガイド核酸の両端の一方または両方の端部に位置する核酸配列である。
用語「gRNA」とは、標的遺伝子または核酸に対して、gRNA−CRISPR酵素複合体、すなわちCRISPR複合体を特異的に標的化する能力がある核酸をさす。さらに、gRNAは、CRISPR酵素と結合し、CRISPR酵素を標的遺伝子または核酸に導くことができる、核酸特異的RNAである。gRNAには、複数のドメインが含まれてよい。
ガイドドメインには、標的遺伝子または核酸上の標的配列と相補的結合を形成する能力がある相補ガイド配列が含まれる。ガイド配列は、標的遺伝子または核酸上の標的配列と相補性、例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%または95%またはそれ以上の相補性または完全な相補性を有する核酸配列であり得る。ガイドドメインは、gRNA−Cas複合体、すなわちCRISPR複合体が標的遺伝子または核酸と特異的に相互作用することを可能にすると考えられる。
第1の相補的ドメインには、第2の相補的ドメインに相補的な核酸配列が含まれ、そしてそれが第2の相補的ドメインと二本鎖を形成することが可能なように十分な相補性を有する。
別の実施形態では、第1の相補的ドメインには、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25塩基の配列が含まれてよい。
例えば、第1の相補的ドメインが化膿性連鎖球菌の第1の相補的ドメインまたはそれに由来する第1の相補的ドメインである場合、第1の相補的ドメインは、5'−GUUUUAGAGCUA−3'であるか、あるいは5'−GUUUUAGAGCUA−3'と部分的な、すなわち少なくとも50%またはそれ以上の、または完全な相同性を有する塩基配列であり得る。ここで、第1の相補的ドメインは、(X)nをさらに含み、5'−GUUUUAGAGCUA(X)n−3'となり得る。Xは、塩基A、T、UおよびGからなる群から選択され得、nは、5〜15の整数である塩基の数を表し得る。ここで、(X)nは、同じ塩基のn回の繰り返しであるか、またはn個の塩基A、T、UおよびGの混合物であり得る。
リンカードメインは、2またはそれ以上のドメインを連結する核酸配列であり、2またはそれ以上の同一または異なるドメインを連結する。リンカードメインは、共有結合または非共有結合によって、2またはそれ以上のドメインと連結されるか、あるいは2またはそれ以上のドメインを連結することができる。
リンカードメインは、天然の配列、例えば、tracrRNAの部分配列と相同性を有し得るか、またはそれに由来し得る。
例えば、第2の相補的ドメインが、化膿性連鎖球菌の第2の相補的ドメインまたはそれに由来する第2の相補的ドメインである場合、第2の相補的ドメインは、5'−UAGCAAGUUAAAAU−3'であるか、または5'−UAGCAAGUUAAAAU−3'(第1の相補的ドメインと二本鎖を形成する塩基配列に下線を引く)と部分的な、すなわち少なくとも50%またはそれ以上の相同性を有する塩基配列であり得る。ここで、第2の相補的ドメインは、(X)nおよび/または(X)mをさらに含み、5'−(X)n UAGCAAGUUAAAAU(X)m−3'となり得る。Xは、塩基A、T、UおよびGからなる群から選択することができ、nおよびmの各々は、nが1〜15の整数であってよく、mが1〜6の整数であってよい塩基の数を表すことができる。ここで、(X)nは、同じ塩基のn回の繰り返し、またはn個の塩基A、T、UおよびGの混合物を表し得る。さらに、(X)mは、同じ塩基のm回の繰り返し、またはm個の塩基A、T、UおよびGの混合物を表し得る。
さらに、近位ドメインは、天然の近位ドメインと相同性を有してもよく、または天然の近位ドメインに由来してもよい。さらに、近位ドメインは、天然に存在する種に応じて、塩基配列に相違を有し得るか、天然に存在する種に含まれる近位ドメインに由来し得るか、または天然に存在する種に含まれる近位ドメインと部分的もしくは完全な相同性を有し得る。
二本鎖gRNAは、第1の鎖および第2の鎖からなる。
5'−[ガイドドメイン]−[第1の相補的ドメイン]−3'からなってよく、
第2の鎖は、
5'−[第2の相補的ドメイン]−[近位ドメイン]−3'または
5'−[第2の相補的ドメイン]−[近位ドメイン]−[テールドメイン]−3'からなってよい。
第1の鎖において、ガイドドメインには、標的遺伝子または核酸上の標的配列と相補的結合を形成することができる相補ガイド配列が含まれる。ガイド配列は、標的遺伝子または核酸上の標的配列に相補的な核酸配列であり、これは例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%または95%またはそれ以上の相補性または完全な相補性を有する。ガイドドメインは、gRNA−Cas複合体、すなわちCRISPR複合体が標的遺伝子または核酸と特異的に相互作用することを可能にすると考えられる。
第1の相補的ドメインは、第2の鎖の第2の相補的ドメインに相補的な核酸配列を含み、第2の相補的ドメインと二本鎖を形成するのに十分な相補性を有するドメインである。
5'−(Ntarget)−(Q)m−3'、または
5'−(X)a−(Ntarget)−(X)b−(Q)m−(X)c−3'
であり得る。
第2の鎖は、第2の相補的ドメインおよび近位ドメインからなり、選択的にテールドメインを含み得る。
第2の鎖において、第2の相補的ドメインは、第1の鎖の第1の相補的ドメインに相補的な核酸配列を含み、第1の相補的ドメインと二本鎖を形成するのに十分な相補性を有する。第2の相補的ドメインは、第1の相補的ドメインと相補的な塩基配列、および第1の相補的ドメインに相補的でない塩基配列、例えば、第1の相補的ドメインと二本鎖を形成しない塩基配列を含み得、かつ、第1の相補的ドメインよりも長い塩基配列を有し得る。
第2の鎖において、近位ドメインは、1〜20塩基の配列であり、第2の相補的ドメインの3'末端方向に位置するドメインである。例えば、近位ドメインは、5、6、7、8、8、9、10、11、12、13、14または15塩基の配列であるか、またはそれらを含み得る。
選択的に、第2の鎖において、テールドメインは、第2の鎖の3'末端に選択的に付加されたドメインであり得、テールドメインは、1〜50塩基の配列であるか、またはそれらを含み得る。例えば、テールドメインは、1〜5、5〜10、10〜15、15〜20、20〜25、25〜30、30〜35、35〜40、40〜45または45〜50塩基の配列であるか、またはそれらを含み得る。
一本鎖gRNAは、2つの種類に分類され得る。
まず、二本鎖gRNAの第1の鎖または第2の鎖がリンカードメインによって連結されている一本鎖gRNAがあり、ここで一本鎖gRNAは、5'−[第1の鎖]−[リンカードメイン]−[第2の鎖]−3'からなる。
5'−[ガイドドメイン]−[第1の相補的ドメイン]−[リンカードメイン]−[第2の相補的ドメイン]−[近位ドメイン]−3'または
5'−[ガイドドメイン]−[第1の相補的ドメイン]−[リンカードメイン]−[第2の相補的ドメイン]−[近位ドメイン]−[テールドメイン]−3'
からなり得る。
一本鎖gRNAにおいて、リンカードメインは、第1の鎖および第2の鎖を連結するドメインであり、具体的には、第1の相補的ドメインと第2の相補的ドメインを連結して一本鎖gRNAを生成する核酸配列である。ここで、リンカードメインは、共有結合または非共有結合によって第1の相補的ドメインおよび第2の相補的ドメインと連結されるか、または第1の相補的ドメインを第2の相補的ドメインと連結し得る。
5'−(Ntarget)−(Q)m−(L)j−(Z)h−(P)k−3'、または
5'−(Ntarget)−(Q)m−(L)j−(Z)h−(P)k−(F)i−3'
であり得る。
5'−(X)a−(Ntarget)−(X)b−(Q)m−(X)c−(L)j−(X)d−(Z)h−(X)e−(P)k−(X)f−3'、または
5'−(X)a−(Ntarget)−(X)b−(Q)m−(X)c−(L)j−(X)d−(Z)h−(X)e−(P)k−(X)f−(F)i−3'であり得る。
第2に、一本鎖gRNAは、ガイドドメイン、第1の相補的ドメインおよび第2の相補的ドメインからなる一本鎖gRNAであり得、ここで、一本鎖gRNAは、
5'−[第2の相補的ドメイン]−[第1の相補的ドメイン]−[ガイドドメイン]−3'または
5'−[第2の相補的ドメイン]−[リンカードメイン]−[第1の相補的ドメイン]−[ガイドドメイン]−3'からなり得る。
一本鎖gRNAにおいて、ガイドドメインには、標的遺伝子または核酸上の標的配列と相補的結合を形成する能力がある相補ガイド配列が含まれる。ガイド配列は、標的遺伝子または核酸上の標的配列と相補性を有する核酸配列であり得、これは例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%または95%またはそれ以上の相補性または完全な相補性を有する。ガイドドメインは、gRNA−Cas複合体、すなわちCRISPR複合体が標的遺伝子または核酸と特異的に相互作用することを可能にすると考えられる。
第1の相補的ドメインは、第2の相補的ドメインに相補的な核酸配列を含み、第2の相補的ドメインと二本鎖を形成するのに十分な相補性を有するドメインである。
第2の相補的ドメインは、第1の相補的ドメインに相補的な核酸配列を含み、第1の相補的ドメインと二本鎖を形成するように十分な相補性を有する。第2の相補的ドメインは、第1の相補的ドメインと相補的な塩基配列、および第1の相補的ドメインと相補性を有さない塩基配列、例えば、第1の相補的ドメインと二本鎖を形成しない塩基配列を含み得、かつ、第1の相補的ドメインよりも長い塩基配列を有し得る。
選択的に、リンカードメインは、第1の相補的ドメインと第2の相補的ドメインを連結して一本鎖gRNAを生成する核酸配列である。ここで、リンカードメインは、共有結合または非共有結合によって第1の相補的ドメインおよび第2の相補的ドメインと連結されるか、または第1を第2の相補的ドメインと連結し得る。
5'−(Z)h−(Q)m−(Ntarget)−3'または
5'−(X)a−(Z)h−(X)b−(Q)m−(X)c−(Ntarget)−3'
であり得る。
5'−(Z)h−(L)j−(Q)m−(Ntarget)−3'または
5'−(X)a−(Z)h−(L)j−(Q)m−(X)c−(Ntarget)−3'
であり得る。
編集タンパク質とは、核酸と直接結合することができるか、または直接結合せずに相互作用することができる、ペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質をさす。
用語「CRISPR酵素」は、CRISPR−Cas系の主なタンパク質成分であり、gRNAと複合体を形成して、CRISPR−Cas系となる。
V型CRISPR酵素は、II型CRISPR酵素のRuvCドメインに対応する類似のRuvCドメインを含み、II型CRISPR酵素のHNHドメインの代わりのNucドメイン、標的を認識するRECおよびWEDドメイン、およびPAMを認識するPIドメインからなり得る。V型CRISPR酵素の具体的な構造的特徴については、Takashi Yamano et al.(2016)Cell 165:949−962が参照され得る。
CRISPR酵素は、標的遺伝子または核酸の二本鎖または一本鎖を切断し、二本鎖または一本鎖の切断または除去を引き起こすヌクレアーゼ活性を有する。一般に、野性型II型CRISPR酵素またはV型CRISPR酵素は、標的遺伝子または核酸の二本鎖を切断する。
酵素活性を変更し、それによって不完全なまたは部分的な活性を示すように改変されたCRISPR酵素はニッカーゼと呼ばれる。
酵素活性を完全に不活性にするように改変されたCRISPR酵素は、不活性CRISPR酵素と呼ばれる。
CRISPR酵素は、上記のヌクレアーゼ活性に加えて、エンドヌクレアーゼ活性、エキソヌクレアーゼ活性またはヘリカーゼ活性、すなわち二本鎖核酸のヘリックス構造をアニールする能力を有し得る。
CRISPR酵素は、gRNAと相互作用し、それによってgRNA−CRISPR酵素複合体、すなわちCRISPR複合体を形成し得、ガイド配列がgRNAと協働してPAM配列を含む標的配列に接近することを導く。ここで、CRISPR酵素が標的遺伝子または核酸と相互作用する能力は、PAM配列に依存する。
SpCas9の例では、PAM配列は、5'−NGG−3'、5'−NAG−3'および/または5'−NGA−3'であり得、
StCas9の例では、PAM配列は、5'−NGGNG−3'および/または5'−NNAGAAW−3'(W=AまたはTである)であり得、
NmCas9の例では、PAM配列は、5'−NNNNGATT−3'および/または5'−NNNGCTT−3'であり得、
CjCas9の例では、PAM配列は、5'−NNNVRYAC−3'(V=G、CまたはAであり、R=AまたはGであり、Y=CまたはTである)であり得、
ストレプトコッカス・ミュータンス(Streptococcus mutans)Cas9(SmCas9)の例では、PAM配列は、5'−NGG−3'および/または5'−NAAR−3'(R=AまたはG)であり得、そして
黄色ブドウ球菌Cas9(SaCas9)の例では、PAM配列は、5'−NNGRR−3'、5'−NNGRRT−3'および/または5'−NNGRRV−3'(R=AまたはGであり、V=G、CまたはAである)であり得る。
Cpf1の例では、PAM配列は、5'−TTN−3'であり得る。
CRISPR酵素は、ヌクレアーゼ活性、ヘリカーゼ活性、gRNAと相互作用する能力、および標的遺伝子または核酸に接近する能力、例えばCRISPR酵素のPAM認識能力などの様々な特徴を改善または阻害するように修飾され得る。
改変は、天然に存在するCRISPR酵素に存在する正電荷を有するアミノ酸からなる領域に位置する1または2またはそれ以上のアミノ酸の改変であり得る。
改変は、CRISPR酵素のRuvCドメインに存在するアミノ酸の1または2またはそれ以上の改変であり得る。ここで、RuvCドメインは、RuvCI、RuvCIIまたはRuvCIIIドメインであり得る。
改変は、CRISPR酵素のヌクレアーゼ活性に関与するアミノ酸の1または2またはそれ以上の改変であり得る。
用語「標的配列」は、標的遺伝子または核酸中に存在する塩基配列であり、ガイド核酸のガイドドメインに含まれるガイド配列に相補性を有する。標的配列は、標的遺伝子または核酸、すなわち遺伝子操作または修正の対象に従って変動し得る塩基配列であり、標的遺伝子または核酸に応じて様々な形態に設計され得る。
標的配列は、VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子、およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択される1または複数の遺伝子の部分核酸配列であり得る。
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子、および/またはANGPTL4遺伝子の各々の2またはそれ以上の領域を標的化することができ、かつ
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子、および/またはANGPTL4遺伝子の二本鎖および/または一本鎖の切断を独立して誘導することができるか、あるいは
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子、および/またはANGPTL4遺伝子の切断部位への1つの外来ヌクレオチドの挿入を誘導することができる。
(a)本明細書に記載されるVEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子、および/またはANGPTL4遺伝子の標的配列に相補的なガイドドメインを含むガイド核酸をコードする配列、および
(b)編集タンパク質をコードする配列
が含まれ得る。
本発明のガイド核酸−編集タンパク質複合体の使用のための一実施形態における、gRNA−CRISPR酵素複合体を使用する標的DNA、RNA、遺伝子または染色体の操作または改変を下に説明する。
標的遺伝子または核酸は、上記のgRNA−CRISPR酵素複合体、すなわちCRISPR複合体を使用して操作または修正され得る。ここで、標的遺伝子または核酸の操作または修正には、i)標的遺伝子または核酸を切断および損傷すること、およびii)損傷した標的遺伝子または核酸を修復することの全ての段階が含まれる。
i)標的遺伝子または核酸の切断および損傷は、CRISPR複合体を用いる標的遺伝子または核酸の切断および損傷、特に、標的遺伝子または核酸中の標的配列切断または損傷であり得る。
CRISPR複合体によって切断または損傷した標的遺伝子または核酸は、NHEJおよび相同組換え修復(HDR)によって修復または回復され得る。
NHEJは、切断された二本鎖または一本鎖の両端を一緒に連結することにより、DNAの二本鎖切断を回復または修復する方法であり、一般に、二本鎖の破壊(例えば、切断)により形成された2つの適合する端部が互いに頻繁に接触して2つの端部を完全に結合する場合、破壊された二本鎖は回復される。NHEJは全細胞周期で使用されることのできる回復方法であり、通常、G1期のように細胞内で鋳型として使用される相同ゲノムが存在しない場合に行われる。
HDRは、損傷した遺伝子または核酸を修復するまたは回復するための、一般に破壊されたDNAを修復するまたは回復するための、すなわち細胞の生得的な情報を回復するための鋳型として相同配列を使用する、誤りのない修正方法であり、破壊されたDNAは、改変されていない相補的な塩基配列の情報または姉妹染色分体の情報を用いて修復される。HDRの最も一般的な種類は、相同組換え(HR)である。HDRは、活発に分裂する細胞のSまたはG2/M期に通常行われる修復または回復方法である。
SSAは、標的核酸中に存在する2つの反復配列間の二本鎖切断を修復する一方法であり、一般に30塩基超の反復配列を使用する。反復配列は、破壊された末端の各々で標的核酸の二本鎖に対して一本鎖を有するように(粘着末端を有するように)切断され、切断後、反復配列を含む一本鎖オーバーハングをRPAタンパク質でコーティングして、反復配列が互いに不適切にアニーリングされることのないようにする。RAD52は、オーバーハング上の各反復配列に結合し、相補的な反復配列をアニーリングする能力がある配列が配置される。アニーリング後、オーバーハングの一本鎖フラップが切断され、新しいDNAの合成が特定のギャップを埋めてDNA二本鎖を回復させる。この修復の結果として、2つの反復間のDNA配列が除去され、欠失長さは、本明細書において使用される2つの反復の位置、および切断の経路または進行の程度を含む様々な因子に依存し得る。
ゲノム内の一本鎖切断は、上記の修復機構とは別個の機構である、SSBRによって修復される。一本鎖DNA切断の場合は、PARP1および/またはPARP2が切断を認識し、修復機構を動員する。DNA切断に関するPARP1の結合および活性は一時的であり、SSBRは損傷領域でのSSBRタンパク質複合体の安定性を促進することによって促進される。SSBR複合体において最も重要なタンパク質はXRCC1であり、これはDNAの3'および5'末端プロセシングを促進するタンパク質と相互作用して、DNAを安定化させる。末端プロセシングは、通常、損傷した3'末端をヒドロキシル化状態に、および/または損傷した5'末端をリン酸部分に修復することに関与し、末端がプロセシングされた後に、DNAギャップ充填が起こる。DNAギャップ充填には2つの方法、すなわち短いパッチ修復と長いパッチ修復があり、短いパッチ修復は単一塩基の挿入を伴う。DNAギャップ充填の後、DNAリガーゼが末端結合を促進する。
MMRは、ミスマッチしたDNA塩基で働く。MSH2/6またはMSH2/3複合体の各々は、ATPアーゼ活性を有するので、ミスマッチの認識および修復の開始において重要な役割を果たし、MSH2/6は主に塩基−塩基ミスマッチを認識し、1または2の塩基ミスマッチを識別するが、MSH2/3は主にそれよりも大きいミスマッチを認識する。
BERは、全細胞周期を通して活性であり、小さい非ヘリックス歪み塩基(non−helix−distorting base)損傷領域をゲノムから除去するために使用される修復方法である。損傷したDNAでは、損傷した塩基は、塩基とリン酸塩−デオキシリボース骨格を連結しているN−グリコシド結合を切断することによって除去され、その後ホスホジエステル骨格が切断され、それにより一本鎖DNAの切断が生じる。それにより形成された破壊された一本鎖末端を除去し、除去された一本鎖によって生じたギャップを新しい一本鎖相補的な塩基で充填し、その後新たに充填された相補的な塩基の末端をDNAリガーゼによって骨格と連結され、その結果損傷したDNAが修復される。
NERは、大きなヘリックス歪み損傷をDNAから除去するために重要な切除機構であり、損傷が認識されると、損傷領域を含有する短い一本鎖DNAセグメントが除去され、22〜30塩基の一本鎖ギャップが生じる。生じたギャップは新しい相補的な塩基で充填され、新たに充填された相補的な塩基の末端をDNAリガーゼによって骨格と連結され、その結果損傷したDNAが修復される。
用語「ノックアウト」とは、標的遺伝子または核酸の不活性化をさし、および「標的遺伝子または核酸の不活性化」とは、標的遺伝子または核酸の転写および/または翻訳が起こらない状態をさす。疾患の原因となる遺伝子または異常な機能を有する遺伝子の転写および翻訳は、ノックアウトによって阻害され得、その結果、タンパク質発現が阻止される。
用語「ノックダウン」とは、標的遺伝子または核酸の転写および/または翻訳あるいは標的タンパク質の発現の低下をさす。ノックダウンによって遺伝子またはタンパク質の過剰発現を調節することによって、疾患の発症が予防され得るか、または疾患が治療され得る。
用語「ノックイン」とは、標的遺伝子または核酸への特定の核酸または遺伝子の挿入をさし、ここで、「特定の核酸」とは、挿入または発現させる目的の遺伝子または核酸をさす。疾患を誘発する変異遺伝子は、ノックインによって正常な遺伝子の発現を誘導するための、正常への修正または正常な遺伝子の挿入によって疾患治療に利用され得る。
gRNA−CRISPR酵素複合体によって人工的に操作された新生血管形成関連因子の構成には、
新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内のPAM配列中に位置するか、またはその5'末端および/または3'末端に隣接する、塩基配列中の連続した1bp〜50bp、1bp〜40bpまたは1bp〜30bp、好ましくは、3bp〜25bpの領域における
1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入、
野性型遺伝子とは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換、および
1または複数の外来ヌクレオチドの挿入
の中の1または複数の核酸の改変が含まれてよい。
特定のタンパク質が発現され得、その活性は、人工的に操作された新生血管形成関連因子によって刺激され得る。
a)5'−NGG−3'(NはA、T、CまたはGである)配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの欠失、
b)野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なるヌクレオチドを含む5'−NGG−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの置換、
c)5'−NGG−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域への1または複数のヌクレオチドの挿入、あるいは
d)a)からc)から選択される2またはそれ以上の組合せ
によって調製される。
a')5'−NNNNRYAC−3'(各々のNは独立にA、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの欠失、
b')野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なるヌクレオチドを含む5'−NNNNRYAC−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの置換、
c')5'−NNNNRYAC−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域への1または複数のヌクレオチドの挿入、あるいは
d')a')からc')から選択される2またはそれ以上の組合せ
によって調製される。
a'')5'−NNAGAAW−3'(各々のNは独立にA、T、CまたはGであり、およびWはAまたはTである)の5'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの欠失、
b'')野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なるヌクレオチドを含む5'−NNAGAAW−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの置換、
c'')5'−NNAGAAW−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域への1または複数のヌクレオチドの挿入、あるいは
d'')a'')からc'')から選択される2またはそれ以上の組合せ
によって調製される。
a''')5'−NNNNGATT−3'(各々のNは独立にA、T、CまたはGである)の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの欠失、
b''')野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なるヌクレオチドを含む5'−NNNNGATT−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの置換、
c''')5'−NNNNGATT−3'配列に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域への1または複数のヌクレオチドの挿入、あるいは
d''')a''')からc''')から選択される2またはそれ以上の組合せ
によって調製される。
a'''')5'−NNGRR(T)−3'配列(各々のNは独立にA、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、(T)は無作為に付加可能な配列である)の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの欠失、
b'''')野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なるヌクレオチドを含む5'−NNGRR(T)−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域の1または複数のヌクレオチドの置換、
c'''')5'−NNGRR(T)−3'配列に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜25bp、例えば、17bp〜23bpの領域への1または複数のヌクレオチドの挿入、あるいは
d'''')a'''')からc'''')から選択される2またはそれ以上の組合せ
によって調製される。
a''''')5'−TTN−3'配列(NはA、T、CまたはGである)の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した10bp〜30bp、例えば、15bp〜26bpの領域の1または複数のヌクレオチドの欠失、
b''''')野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なるヌクレオチドを含む5'−TTN−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した10bp〜30bp、例えば、15bp〜26bpの領域の1または複数のヌクレオチドの置換、
c''''')5'−TTN−3'配列の5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した10bp〜30bp、例えば、15bp〜26bpの領域の1または複数のヌクレオチドの挿入、あるいは
d''''')a''''')からc''''')から選択される2またはそれ以上の組合せ
によって調製される。
新生血管形成関連因子の核酸配列内のPAM配列中のまたはその5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜50bp、1bp〜40bp、1bp〜30bp、および好ましくは3bp〜25bp領域の1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入による発現量の低下または増加、
野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換による発現量の低下または増加、
1または複数の外来ヌクレオチドの挿入による発現量、融合タンパク質の発現または特定のタンパク質の独立した発現の低下または増加、ならびに
上記タンパク質の発現特性に影響される第3のタンパク質の発現量の低下または増加
を有することがある。
新生血管形成関連因子の核酸配列内のPAM配列中のまたはその5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜50bp、1bp〜40bp、1bp〜30bp、および好ましくは3bp〜25bp領域の1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入によるコドン、アミノ酸および三次元構造の変更、
野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換によるコドン、アミノ酸および三次元構造の変更、
1または複数の外来ヌクレオチドの挿入による、コドン、アミノ酸および三次元構造、または特定のタンパク質との融合構造または特定のタンパク質が分離されている独立構造の変更、ならびに
構造特性の変更された上記のタンパク質に影響される第3のタンパク質のコドン、アミノ酸および三次元構造の変更
を有することがある。
新生血管形成関連因子の核酸配列内のPAM配列中のまたはその5'末端および/または3'末端に隣接する塩基配列中の連続した1bp〜50bp、1bp〜40bp、1bp〜30bp、および好ましくは3bp〜25bp領域の1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入に起因するタンパク質の改変による特定の機能の活性化または不活性化あるいは新しい新生血管形成機能の導入、
野性型遺伝子のヌクレオチドとは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換に起因するタンパク質の改変による特定の機能の活性化または不活性化あるいは新しい機能の導入、
1または複数の外来ヌクレオチドの挿入に起因するタンパク質の改変による特定の機能の活性化または不活性化あるいは新しい機能の導入、特に、特定のタンパク質の融合または独立した発現による既存の機能への第3の機能の導入、ならびに
機能特性の変更された上記のタンパク質に影響される第3のタンパク質の機能の変更
を有することがある。
ガイド核酸−編集タンパク質複合体の効率を高めるため、または損傷した遺伝子もしくは核酸の修復効率を高めるために、さらなる成分が選択的に添加され得る。
ガイド核酸−編集タンパク質複合体の標的核酸、遺伝子または染色体の切断効率を高めるために、さらなる成分が活性化因子として使用され得る。
さらなる成分をアシスターとして使用して、損傷した遺伝子または核酸の修復効率を高めることができ得る。
用語「対象」とは、ガイド核酸、編集タンパク質またはガイド核酸−編集タンパク質複合体が導入される生物、ガイド核酸、編集タンパク質またはガイド核酸−編集タンパク質複合体が動作する生物、あるいは生物から得た標本または試料をさす。
ガイド核酸、編集タンパク質またはガイド核酸−編集タンパク質複合体は、様々な送達方法および様々な形態によって対象に送達または導入され得る。
ガイド核酸および/または編集タンパク質をコードするDNA、RNAまたはその混合物の形態は、当技術分野で公知の方法によって対象に送達または導入され得る。
ガイド核酸および/または編集タンパク質をコードする核酸配列は、ベクターによって対象に送達または導入され得る。
一実施形態では、治療される疾患は、新生血管形成関連疾患であり得る。
虚血性網膜症、視神経乳頭血管新生、虹彩血管新生、網膜血管新生、脈絡膜血管新生、角膜血管新生、硝子体血管新生、緑内障、パヌス(panus)、翼状片、黄斑浮腫、糖尿病性網膜症、増殖性糖尿病性網膜症、糖尿病性黄斑浮腫、血管性網膜症、網膜変性症、ブドウ膜炎、網膜の炎症性疾患、および増殖性硝子体網膜症が含まれ得る。
糖尿病性網膜症は、1型糖尿病または2型糖尿病のいずれかと診断された患者の約40〜45%に起こる糖尿病性合併症である。
黄斑変性症は、黄斑変性症は、視覚障害が黄斑変性によって引き起こされる疾患をさし、加齢黄斑変性症(AMD)とも呼ばれる。
本発明の例示的な一実施形態は、人工的に操作された新生血管形成関連因子を使用する疾患の治療で使用される組成物に関する。
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択される1または複数の遺伝子の核酸配列、またはそれをコードする核酸配列内の1または複数の標的配列の各々と相補的結合を形成する能力があるガイド核酸と、
編集タンパク質またはそれをコードする核酸配列を含む、血管障害を治療するための組成物、
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択される1または複数の遺伝子の核酸配列、またはそれをコードする核酸配列の配列番号1〜1522、例えば、配列番号1〜79の標的配列の各々と相補的結合を形成する能力があるガイド核酸と、
編集タンパク質またはそれをコードする核酸配列を含む、血管障害を治療するための組成物、および
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択される1または複数の遺伝子の核酸配列またはそれをコードする核酸配列の配列番号1〜1522、例えば、配列番号1〜79の標的配列の各々と相補的結合を形成する能力があるガイド核酸と、編集タンパク質から形成される複合体を含む血管障害を治療するための組成物。
本発明の別の例示的な実施形態では、上記の組成物を製造し、有効量の組成物をそれを必要とする患者に投与することを含む、患者において疾患を治療するための方法が提供される。
生物の遺伝子を操作することによって新生血管形成を調節するための治療方法が、使用され得る。そのような治療方法は、生物の遺伝子を操作するために遺伝子を操作するための組成物を生物に直接注入することによって達成され得る。
特定の実施形態では、本発明は、AMDまたは糖尿病性網膜症を治療するための組成物を調製するためのキットを提供することができる。
1.sgRNAの設計 ヒトVEGFA遺伝子(NCBI受託番号NM_001025366.2)、HIF1A遺伝子(NCBI受託番号NM_001243084.1)、ANGPT2遺伝子(NCBI受託番号NM_001118887.1)、EPAS1遺伝子(NCBI受託番号NM_001430.4)およびANGPTL4遺伝子(NCBI受託番号NM_001039667.2)のCRISPR/Cas9標的領域を、CRISPR RGEN Tools(Institute for Basic Science、韓国)を用いて選択した。遺伝子の標的領域は、CRISPR酵素の種類に応じて異なり得る。CjCas9のための遺伝子の標的配列を、上記の表1〜5と表6〜9にまとめ、SpCas9のための遺伝子の標的配列を表10〜14にまとめる。
[表6]
VEGFA遺伝子の標的配列
HIF1A遺伝子の標的配列
EPAS1遺伝子の標的配列
ANGPT2遺伝子の標的配列
SpCas9のためのVEGFA遺伝子の標的配列
SpCas9のためのHIF1A遺伝子の標的配列
SpCas9のためのEPAS1遺伝子の標的配列
SpCas9のためのANGPT2遺伝子の標的配列
SpCas9のためのANGPTL4遺伝子の標的配列
ヒトコドン最適化CjCas9(カンピロバクター・ジェジュニ亜種ジェジュニNCTC11168由来)をコードする配列を、C末端に核移行シグナル(NLS)およびHAエピトープを有するように合成し(GeneArtTM Gene Synthesis,Thermo Fisher Scientific)、合成された核酸配列を以前の研究に記載されるp3sプラスミドを用いて複製した(Cho,S.W.,Kim,S.,Kim,J.M.&Kim,J.S.Targeted genome engineering in human cells with the Cas9 RNA−guided endonuclease.Nature Biotechnology 31,230−232(2013))。
Xの位置にランダム配列を含む可変性PAM配列(5'−NNNNXCAC−3'、5'−NNNNAXAC−3'、5'−NNNNACXC−3'、および5'−NNNNACAX−3')を有するAAVS1標的部位(AAVS1−TS1)を合成した(Macrogen,Inc.)、合成された核酸配列は、RFPおよびGFPをコードする代替レポータープラスミドを用いて複製され得る。
HEK293(ATCC、CRL−1573)細胞およびマウスNIH 3T3(ATCC、CRL−1658)細胞を、100単位/mLペニシリン、100mg/mLストレプトマイシン、および10%ウシ胎児血清(FBS)を添加したダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で培養した。
sgRNA配列と、C末端にNLSおよびHAタグを有するCjCas9遺伝子とを含有するAAV逆方向末端反復配列(ITR)に基づくベクタープラスミドを構築した。sgRNA転写をU6プロモーターによって誘導し、C57BL/6マウスのC2C12筋芽細胞のEFSプロモーターによるか、またはTA筋肉のSpc512プロモーターによってCjCas9発現を調節した。
AAVベクターを産生するために、AAVDJまたはAAV9キャプシッドのシュードタイプを使用した。HEK293T細胞を、pAAV−ITR−CjCas9−sgRNA、pAAVED2/9、およびへルパープラスミドとともにトランスフェクトした。HEK293T細胞は、2%FBS含有DMEM中で培養した。HEK293T細胞においてポリプラストランスフェクション(PEIpro)、トリプルトランスフェクションおよびプラスミドを1:1:1のモル比で混合することによるPEI共沈を用いて、組換えAAVベクターストックを作製した。72時間の培養の後、細胞を溶解し、粒子を単離し、ステップ勾配超遠心分離によってイオジキサノール(Sigma−Aldrich)で精製した。ベクターゲノムの数を定量的PCRによって定量した。
マウス筋芽細胞を様々なウイルス量のAAVDJ−CjCas9(感染多重度(MOI)1、5、10、50、および100(定量的PCRにより決定))で感染させ、2%FBS含有DMEM中で培養した。標的ディープシークエンシングのために、細胞を異なる時点で入手した。MOI1は、定量的PCRによって決定される、合計100個のウイルス粒子のうちの1個のウイルス粒子による感染とみなされる。
本研究で使用された全ての動物の管理、使用および処置は、ソウル大学校動物実験委員会、眼科学および安全研究によって提供されるガイダンス、ならびに獣医学における動物使用に関するARVOの声明に従う厳格な合意の下で実施された。本研究において、特定の雄病原体フリー(SPF)−6週齢C57BL/6Jマウスを使用した。マウスを12時間の明/暗サイクルで維持した。
マウスを、ストレプトゾトシン(STZ、Sigma−Aldrich、米国ミズーリ州セントルイス)を1回腹腔内に注射することによって誘導した。対照として、クエン酸緩衝液を注射した。STZ注射の4日後、マウスの血糖値が300mg/dlまたはそれ以上になった場合、糖尿病が誘発されたと考えられた。
チレタミンおよびゾラゼパムの1:1(各2.25mg/kg(体重))の比の混合物、および0.7mg/kg(体重)の塩酸キシラジンを、6週齢のマウスの硝子体に麻酔のために注射した。手術用顕微鏡(Leica Microsystems Ltd.)下、33Gブラントニードルを有するNanofilシリンジ(World Precision Instruments Inc.)を用いて2μl(2×1010ウイルスゲノム)のAAV9−CjCas9を硝子体に注射した。
注射の42日後、試料をホルマリンで固定し、パラフィンに包埋した(n=4)。試料を包埋したパラフィンを横に切って得た試料を抗HA抗体(Roche、3F10、1:1000)、抗オプシン抗体(Millipore、AB5405、1:1000)、およびAlexa Fluor 488または594抗体(Thermo Fisher Scientific、1:500)で免疫染色した。Image J ソフトウェア(1.47v、NIH)を使用してHAタグをつけたCjCas9を発現しているRPE細胞においてオプシン陽性部位を検出した。共焦点顕微鏡(LSM 710、Carl Zeiss)を使用して、CjCas9およびeGFPの分布をRPEフラットマウント上で視覚化した。
DNAをRPEおよび網膜から抽出するために、RPEおよび網膜フラットマウントの画像を得た後、組織試料をPBSで洗浄した。溶解バッファー(NucleoSpin Tissue、Macherey−Nagel)中で30秒間ボルテックスすることによって、RPE細胞を脈絡膜/強膜から分離した。ゲノムDNAを分析して、残っている脈絡膜/強膜組織からのRPE細胞の完全な単離を同定した。ゲノムDNAは標的ディープシークエンシングによって分析された。
注射の42日後、全RPE混合物を神経網膜組織から単離し、2種類の組織をその後の分析のために凍結した。試料組織を120μlの細胞溶解バッファー(CST#9803)に溶解し、Vegfaタンパク質の量をマウスVEGF Quantikine ELISAキット(MMV00、R&D Systems)を用いて測定した。
マウスの麻酔後、0.5%フェニレフリンおよび0.5%トロピカミドを含有する点眼薬を注入して瞳孔を拡張させた。レーザー光凝固を、間接的ヘッドセットデリバリーシステム(Iridex)およびレーザーシステム(Ilooda)を用いて実施した。レーザーのパラメータは、532nmの波長、200μmのスポットサイズ、800mWの出力および70msの露光時間である。レーザーによる熱傷が視神経の近くで3〜4回誘発された。硝子体から出血することなく泡が発生する火傷は研究にのみ使用された。7日後、眼球を4%パラホルムアルデヒドで室温で1時間固定した。イソレクチン−B4(Thermo Fisher Scientific、カタログ番号I21413、1:100)および抗GFP抗体(Abcam、ab6556、1:100)を用いて、RPE混合物(RPE/脈絡膜/強膜)を4℃で一晩免疫染色した。RPE混合物をフラットマウントし、蛍光顕微鏡(Eclipse 90i、Nikon)または共焦点顕微鏡(LSM 710、Carl Zeiss)を100倍の倍率で使用して可視化した。CNV部位は、Image J ソフトウェア(1.47v、NIH)を用いて検出した。1個の眼球あたり平均3〜4個のCNV部位を分析した。各群は、17〜18個の眼球からなる。
血管漏出を検出するため、STZ誘発性糖尿病マウスモデルを使用した。PBSに溶解した200μlのエバンスブルー染料(20mg/ml)を麻酔下のマウスに静脈注射した。灌流の2時間後、眼球を摘出して4%パラホルムアルデヒドで1時間固定した。網膜を2×PBS中で切除し、フラットマウントし、網膜の画像を蛍光顕微鏡(Eclipse 90i、Nikon)を用いて40倍および100倍の倍率で得た。
インビトロまたはインビボで試料サイズを事前に決定するために、統計的方法は使用しなかった。統計解析のために、一元配置分散分析およびチューキー事後検定を使用した。
984アミノ酸からなるCjCas9はSpCas9よりも相当にサイズが小さいので(2.95kbp)、CjCas9遺伝子とsgRNAの両方を1つのAAVベクターにパッケージすることが可能である。そのため、この実施例では、AMDを治療するための方法としてCjCas9を使用する遺伝子操作の可能性を確認するために、CjCas9発現AAVを使用した。
CNVを誘導するために眼球にAAVを注射し、6週間後にレーザー治療に付し、それに続いてレーザー治療の1週間後にCNV部位を検出した(図1のF)。AAV−CjCas9:VegfaおよびAAV−CjCas9:Hif1aをそれぞれの眼球に注射した場合、AAVを含まない陰性対照と比較して、CNV部位がそれぞれ24±4%および20±4%減少したことが確認された(図1のFおよび図1のG)。その他の陰性対照、すなわちRosa26特異的CjCas9の場合も、治療効果は確認されなかった。
錐体機能不全はマウスRPE細胞内のVegfa遺伝子のコンディショナルノックアウトに引き起こされるので、RPE細胞におけるAAV誘導性遺伝子ノックアウトによる副作用の原因を調査した。この目的のために、網膜の錐体機能関連オプシン陽性部位のサイズを測定した。結果として、Vegfa特異的CjCas9は、AAVを含まない対照の約30±10%サイズが減少した(図3)。しかし、予想したように、Hif1aまたはRosa26特異的CjCas9は錐体機能不全を誘発しなかった。そのような結果は、AMDの治療のためのHifla不活性化が新生血管形成を阻害して錐体機能不全を引き起こさないことを示唆し得る。
糖尿病性網膜症(DR)、未熟児網膜症、等などの網膜疾患への適用を拡大するため、構築したウイルスを硝子体への注射によって眼球に注射し、6週間後、網膜組織におけるインデル頻度により引き起こされるインビボゲノム編集効果を標的ディープシークエンシングによって観察し、それに続いてVegfaタンパク質の発現量をELISAによって確認した(図1のB)。網膜組織において、CjCas9によって誘導されたインデルを網膜細胞のRosa26、Vegfa、およびHif1a標的部位で認め、それぞれ44±8%、20±2%、および58±5%のインデル頻度を確認した(図4のA、図4のB、および図4のC)。予想したように、Vegfaタンパク質の発現量は、網膜細胞において、Vegfa−またはHif1a特異的CjCas9をコードするAAV(AAV−CjCas9:VegfaまたはHif1a)で処理した場合に低下したが、Rosa26特異的CjCas9(AAV−CjCas9:Rosa26)をコードするAAVで処理した場合には低下しなかった(図4のD)。
糖尿病性網膜症は、血管漏出および血液漏出の症状を特徴とする。そのため、この実施例では、血管漏出または血液漏出症状をSTZを用いる糖尿病誘導マウスを用いて確認し、CjCas9によって引き起こされる改善または治療効果を確認した。結果として、血管漏出および破裂によって引き起こされる血液漏出が、Vegfa特異的CjCas9(AAV−CjCas9:Vegfa)を注射した網膜において減少したことを確認した。Rosa26特異的CjCas9(AAV−CjCas9:Rosa26)注入マウスと比較して、Vegfa特異的CjCas9(AAV−CjCas9:Vegfa)注入マウスの血管漏出および血液漏出は減少し、したがって同年齢の正常マウスと同様のレベルに回復した。そのような結果は、STZを注射した実験、つまり、AAV−CjCas9を7週間後に注射し、6週間後に観察を行った実験(図5)と、STZを注射した実験、つまりAAV−CjCas9を14週間後に注射し、7週間後に観察を行った実験(図6)の両方において同様に示された。上の結果によれば、Vegfa特異的CjCas9(AAV−CjCas9:Vegfa)が血管漏出および血液漏出を減少させる効果を有することが確認された、したがってVegfa特異的CjCas9(AAV−CjCas9:Vegfa)は糖尿病性網膜症を効果的に治療することができると期待される。
前述の実施例の適用を拡大するため、ヒトVEGFA(図7)およびヒトHIF1A(図8のA)に加えて、ヒトANGPT2(図9)、ヒトEPAS1(図10)およびヒトANGPTL4(図11)を、AMDおよびDR治療のためのゲノム編集の可能性のある標的として選択して、CjCas9系を用いてヒト細胞で効果的に編集される能力のある各遺伝子の標的部位をスクリーニングした。特に、マウスHif1a遺伝子のCjCas9標的部位は、ヒトまたは異なる哺乳動物において完全に保存された(図8のB)。さらに、保存された標的部位の高い編集効率がヒト細胞において観察された(図8のA、sgRNA #7)。そのため、この研究で示唆されたHiflaのAAVまたはその変異体は将来のヒト患者の治療に使用できると予想される。
[項目1]
人工的に操作された新生血管形成関連因子であって、VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択され、核酸配列が改変されている、人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目2]
前述核酸配列における前述改変が、ガイド核酸−編集タンパク質複合体によって人工的に引き起こされる、項目1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目3]
前述新生血管形成関連因子が、VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択される1または複数である、項目1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目4]
前述遺伝子が、ガイド核酸−編集タンパク質複合体によって人工的に操作された新生血管形成関連因子であり、
前述人工的に操作された新生血管形成関連因子が、核酸の1または複数の改変を含み、前述改変が、
前述新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内のプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列かまたは前述PAM配列の5'末端および/または3'末端に隣接する連続した1bp〜50bpの塩基配列領域内の、1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入、野性型遺伝子とは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換、および1または複数の外来ヌクレオチドの挿入の少なくとも1つであるか、
あるいは
前述新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内の1または複数のヌクレオチドの化学修飾である、
項目1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目5]
前述核酸の改変が、前述遺伝子のプロモーター領域で起こる、項目1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目6]
前述核酸の改変が、前述遺伝子のエクソン領域で起こる、項目1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目7]
前述核酸の改変が、前述遺伝子のイントロン領域で起こる、項目1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目8]
前述核酸の改変が、前述遺伝子のエンハンサー領域で起こる、項目1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目9]
前述PAM配列が、例えば、次の配列(5'から3'方向に記載)
NGG(NはA、T、CまたはGである)、
NNNNRYAC(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)、
NNAGAAW(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、WはAまたはTである)、
NNNNGATT(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGである)、
NNGRR(T)(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)、および
TTN(NはA、T、CまたはGである)
のうち1または複数である、項目4に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目10]
前述編集タンパク質が、化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni)由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス(Streptococcus thermophilus)由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群から選択される1または複数を含む、項目2に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
[項目11]
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の配列番号1〜79の標的配列に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸。
[項目12]
前述VEGFA遺伝子の前述核酸配列内の配列番号3、4、7、9、10および11の前述標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
前述HIF1A遺伝子の前述核酸配列内の配列番号14、18、19、20、26、29および31の前述標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
前述ANGPT2遺伝子の前述核酸配列内の配列番号33、34、37、38、39および43の前述標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
前述EPAS1遺伝子の前述核酸配列内の配列番号47、48、49、50、53、54および55の前述標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、ならびに
前述ANGPTL4遺伝子の前述核酸配列内の配列番号64、66、67、73、76および79の前述標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
からなる群から選択される1または複数のガイド核酸を含む、項目11に記載のガイド核酸。
[項目13]
前述ガイド核酸が、18〜23bpのヌクレオチドである、項目11に記載のgRNA分子。
[項目14]
遺伝子操作のための組成物であって、
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の配列番号1〜79の標的配列に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、あるいは前述ガイド核酸をコードする核酸配列と、
編集タンパク質または前述編集タンパク質をコードする核酸配列と
を含む、遺伝子操作のための組成物。
[項目15]
前述編集タンパク質が、化膿性連鎖球菌由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群から選択される1または複数のタンパク質を含む、項目14に記載の遺伝子操作のための組成物。
[項目16]
前述遺伝子操作が、
新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内のプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列かまたは前述PAM配列の5'末端および/または3'末端に隣接する連続した1bp〜50bpの塩基配列領域内の、1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入、野性型遺伝子とは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換、および1または複数の外来ヌクレオチドの挿入の少なくとも1つであるか、
あるいは
前述新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内の1または複数のヌクレオチドの化学修飾である、
核酸の1または複数の改変を含む、項目14に記載の遺伝子操作のための組成物。
[項目17]
前述PAM配列が、次の配列(5'から3'方向に記載)
NGG(NはA、T、CまたはGである)、
NNNNRYAC(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)、
NNAGAAW(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、WはAまたはTである)、
NNNNGATT(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGである)、
NNGRR(T)(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)、および
TTN(NはA、T、CまたはGである)
のうち1または複数を含む、項目16に記載の遺伝子操作のための組成物。
[項目18]
前述遺伝子操作のための組成物が、ウイルスベクター系で形成される、項目14に記載の遺伝子操作のための組成物。
[項目19]
前述ウイルスベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、ワクシニアウイルス、ポックスウイルスおよび単純ヘルペスウイルスから選択される1または複数を含む、項目18に記載の遺伝子操作のための組成物。
[項目20]
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択される1または複数の遺伝子の配列を分析することによって、被験体における人工的に操作可能な標的部位の配列に関する情報を提供するための方法。
[項目21]
項目20に記載の方法によって提供される前述情報を用いてライブラリーを構築するための方法。
[項目22]
遺伝子操作のためのキットであって、
(a)VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の配列番号1〜79の標的配列の各々に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、または前述ガイド核酸をコードする核酸配列と、
(b)それぞれ、化膿性連鎖球菌由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群から選択される1または複数のタンパク質を含む編集タンパク質、または前述編集タンパク質をコードする核酸配列と
を含む、遺伝子操作のためのキット。
[項目23]
血管障害を治療するための組成物であって、
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の1または複数の標的配列の各々に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、または前述ガイド核酸をコードする核酸配列と、
編集タンパク質または前述編集タンパク質をコードする核酸配列と
を含む、血管障害を治療するための組成物。
[項目24]
前述標的配列が、配列番号1〜79の標的配列のうち1または複数を含む、項目23に記載の治療用組成物。
[項目25]
前述編集タンパク質が、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質である、項目23に記載の治療用組成物。
[項目26]
前述血管障害が、虚血性網膜症または未熟児網膜症である、項目23に記載の治療用組成物。
Claims (26)
- 人工的に操作された新生血管形成関連因子であって、VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択され、核酸配列が改変されている、人工的に操作された新生血管形成関連因子。
- 前記核酸配列における前記改変が、ガイド核酸−編集タンパク質複合体によって人工的に引き起こされる、請求項1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
- 前記新生血管形成関連因子が、VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択される1または複数である、請求項1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
- 前記遺伝子が、ガイド核酸−編集タンパク質複合体によって人工的に操作された新生血管形成関連因子であり、
前記人工的に操作された新生血管形成関連因子が、核酸の1または複数の改変を含み、前記改変が、
前記新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内のプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列かまたは前記PAM配列の5'末端および/または3'末端に隣接する連続した1bp〜50bpの塩基配列領域内の、1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入、野性型遺伝子とは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換、および1または複数の外来ヌクレオチドの挿入の少なくとも1つであるか、
あるいは
前記新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内の1または複数のヌクレオチドの化学修飾である、
請求項1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。 - 前記核酸の改変が、前記遺伝子のプロモーター領域で起こる、請求項1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
- 前記核酸の改変が、前記遺伝子のエクソン領域で起こる、請求項1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
- 前記核酸の改変が、前記遺伝子のイントロン領域で起こる、請求項1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
- 前記核酸の改変が、前記遺伝子のエンハンサー領域で起こる、請求項1に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
- 前記PAM配列が、例えば、次の配列(5'から3'方向に記載)
NGG(NはA、T、CまたはGである)、
NNNNRYAC(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)、
NNAGAAW(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、WはAまたはTである)、
NNNNGATT(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGである)、
NNGRR(T)(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)、および
TTN(NはA、T、CまたはGである)
のうち1または複数である、請求項4に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。 - 前記編集タンパク質が、化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni)由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス(Streptococcus thermophilus)由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群から選択される1または複数を含む、請求項2に記載の人工的に操作された新生血管形成関連因子。
- VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の配列番号1〜79の標的配列に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸。
- 前記VEGFA遺伝子の前記核酸配列内の配列番号3、4、7、9、10および11の前記標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
前記HIF1A遺伝子の前記核酸配列内の配列番号14、18、19、20、26、29および31の前記標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
前記ANGPT2遺伝子の前記核酸配列内の配列番号33、34、37、38、39および43の前記標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
前記EPAS1遺伝子の前記核酸配列内の配列番号47、48、49、50、53、54および55の前記標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、ならびに
前記ANGPTL4遺伝子の前記核酸配列内の配列番号64、66、67、73、76および79の前記標的配列に対してそれぞれ相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、
からなる群から選択される1または複数のガイド核酸を含む、請求項11に記載のガイド核酸。 - 前記ガイド核酸が、18〜23bpのヌクレオチドである、請求項11に記載のgRNA分子。
- 遺伝子操作のための組成物であって、
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の配列番号1〜79の標的配列に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、あるいは前記ガイド核酸をコードする核酸配列と、
編集タンパク質または前記編集タンパク質をコードする核酸配列と
を含む、遺伝子操作のための組成物。 - 前記編集タンパク質が、化膿性連鎖球菌由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群から選択される1または複数のタンパク質を含む、請求項14に記載の遺伝子操作のための組成物。
- 前記遺伝子操作が、
新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内のプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列かまたは前記PAM配列の5'末端および/または3'末端に隣接する連続した1bp〜50bpの塩基配列領域内の、1または複数のヌクレオチドの欠失または挿入、野性型遺伝子とは異なる1または複数のヌクレオチドによる置換、および1または複数の外来ヌクレオチドの挿入の少なくとも1つであるか、
あるいは
前記新生血管形成関連因子を構成する核酸配列内の1または複数のヌクレオチドの化学修飾である、
核酸の1または複数の改変を含む、請求項14に記載の遺伝子操作のための組成物。 - 前記PAM配列が、次の配列(5'から3'方向に記載)
NGG(NはA、T、CまたはGである)、
NNNNRYAC(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)、
NNAGAAW(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、WはAまたはTである)、
NNNNGATT(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGである)、
NNGRR(T)(各々のNは、独立に、A、T、CまたはGであり、RはAまたはGであり、YはCまたはTである)、および
TTN(NはA、T、CまたはGである)
のうち1または複数を含む、請求項16に記載の遺伝子操作のための組成物。 - 前記遺伝子操作のための組成物が、ウイルスベクター系で形成される、請求項14に記載の遺伝子操作のための組成物。
- 前記ウイルスベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、ワクシニアウイルス、ポックスウイルスおよび単純ヘルペスウイルスから選択される1または複数を含む、請求項18に記載の遺伝子操作のための組成物。
- VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群から選択される1または複数の遺伝子の配列を分析することによって、被験体における人工的に操作可能な標的部位の配列に関する情報を提供するための方法。
- 請求項20に記載の方法によって提供される前記情報を用いてライブラリーを構築するための方法。
- 遺伝子操作のためのキットであって、
(a)VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の配列番号1〜79の標的配列の各々に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、または前記ガイド核酸をコードする核酸配列と、
(b)それぞれ、化膿性連鎖球菌由来Cas9タンパク質、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質、ストレプトコッカス・サーモフィルス由来Cas9タンパク質、ストレプトクックス・アウレウス(Streptocuccus aureus)由来Cas9タンパク質、髄膜炎菌由来Cas9タンパク質、およびCpf1タンパク質からなる群から選択される1または複数のタンパク質を含む編集タンパク質、または前記編集タンパク質をコードする核酸配列と
を含む、遺伝子操作のためのキット。 - 血管障害を治療するための組成物であって、
VEGFA遺伝子、HIF1A遺伝子、ANGPT2遺伝子、EPAS1遺伝子およびANGPTL4遺伝子からなる群からそれぞれ選択される1または複数の遺伝子の核酸配列内の1または複数の標的配列の各々に対して相補的結合を形成する能力があるガイド核酸、または前記ガイド核酸をコードする核酸配列と、
編集タンパク質または前記編集タンパク質をコードする核酸配列と
を含む、血管障害を治療するための組成物。 - 前記標的配列が、配列番号1〜79の標的配列のうち1または複数を含む、請求項23に記載の治療用組成物。
- 前記編集タンパク質が、カンピロバクター・ジェジュニ由来Cas9タンパク質である、請求項23に記載の治療用組成物。
- 前記血管障害が、虚血性網膜症または未熟児網膜症である、請求項23に記載の治療用組成物。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2021212083A JP7276422B2 (ja) | 2016-08-19 | 2021-12-27 | 人工的に操作された血管新生調節系 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201662376998P | 2016-08-19 | 2016-08-19 | |
US62/376,998 | 2016-08-19 | ||
PCT/KR2017/009078 WO2018034554A1 (ko) | 2016-08-19 | 2017-08-21 | 인위적으로 조작된 신생혈관형성 조절 시스템 |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021212083A Division JP7276422B2 (ja) | 2016-08-19 | 2021-12-27 | 人工的に操作された血管新生調節系 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2019524847A true JP2019524847A (ja) | 2019-09-05 |
JP7050215B2 JP7050215B2 (ja) | 2022-04-08 |
Family
ID=61196886
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019510289A Active JP7050215B2 (ja) | 2016-08-19 | 2017-08-21 | 人工的に操作された血管新生調節系 |
JP2021212083A Active JP7276422B2 (ja) | 2016-08-19 | 2021-12-27 | 人工的に操作された血管新生調節系 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021212083A Active JP7276422B2 (ja) | 2016-08-19 | 2021-12-27 | 人工的に操作された血管新生調節系 |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20180237771A1 (ja) |
EP (2) | EP3502261A4 (ja) |
JP (2) | JP7050215B2 (ja) |
KR (2) | KR102145092B1 (ja) |
CN (1) | CN109844123A (ja) |
AU (2) | AU2017313616B2 (ja) |
BR (1) | BR112019003124A2 (ja) |
CA (1) | CA3033939A1 (ja) |
RU (1) | RU2019103691A (ja) |
SG (1) | SG11201901306XA (ja) |
WO (1) | WO2018034554A1 (ja) |
Families Citing this family (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20190005801A (ko) * | 2017-07-07 | 2019-01-16 | 주식회사 툴젠 | 표적 특이적 crispr 변이체 |
US11865164B2 (en) | 2018-03-27 | 2024-01-09 | G+Flas Life Sciences | Pharmaceutical composition for treating cancer, containing guide RNA and endonuclease as active ingredients |
EP3781196B1 (en) | 2018-03-27 | 2024-03-06 | G+Flas Life Sciences | Sequence-specific in vivo cell targeting |
KR102463279B1 (ko) | 2018-12-17 | 2022-11-07 | 닛폰세이테츠 가부시키가이샤 | 로 내 잔류 슬래그양의 추정 방법 및 추정 장치 |
US11845989B2 (en) | 2019-01-23 | 2023-12-19 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Treatment of ophthalmic conditions with angiopoietin-like 7 (ANGPTL7) inhibitors |
US11767526B2 (en) | 2019-01-23 | 2023-09-26 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Treatment of ophthalmic conditions with angiopoietin-like 7 (ANGPTL7) inhibitors |
CN112143701A (zh) * | 2019-06-26 | 2020-12-29 | 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心 | 基于rna定点编辑的抑制脉络膜新生血管形成的方法及试剂 |
WO2021243105A1 (en) * | 2020-05-28 | 2021-12-02 | University Of Southern California | Composition and method for treating retinal vascular disease with vegf gene disruption |
CN112662674B (zh) * | 2021-01-12 | 2023-04-11 | 广州瑞风生物科技有限公司 | 靶向编辑VEGFA基因外显子区域的gRNA及其应用 |
WO2022182768A1 (en) | 2021-02-26 | 2022-09-01 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Treatment of inflammation with glucocorticoids and angiopoietin-like 7 (angptl7) inhibitors |
CN114540325B (zh) * | 2022-01-17 | 2022-12-09 | 广州医科大学 | 靶向dna去甲基化的方法、融合蛋白及其应用 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2015048577A2 (en) * | 2013-09-27 | 2015-04-02 | Editas Medicine, Inc. | Crispr-related methods and compositions |
WO2015070083A1 (en) * | 2013-11-07 | 2015-05-14 | Editas Medicine,Inc. | CRISPR-RELATED METHODS AND COMPOSITIONS WITH GOVERNING gRNAS |
JP2016521555A (ja) * | 2013-06-05 | 2016-07-25 | デューク ユニバーシティ | Rnaガイド遺伝子編集及び遺伝子調節 |
JP2016523564A (ja) * | 2013-07-11 | 2016-08-12 | モデルナ セラピューティクス インコーポレイテッドModerna Therapeutics,Inc. | CRISPR関連タンパク質をコードする合成ポリヌクレオチドおよび合成sgRNAを含む組成物ならびに使用方法 |
Family Cites Families (16)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7795422B2 (en) * | 2002-02-20 | 2010-09-14 | Sirna Therapeutics, Inc. | RNA interference mediated inhibition of hypoxia inducible factor 1 (HIF1) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA) |
AU2005222902B2 (en) * | 2004-03-12 | 2010-06-10 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | iRNA agents targeting VEGF |
EP2126081A2 (en) * | 2007-03-02 | 2009-12-02 | MDRNA, Inc. | Nucleic acid compounds for inhibiting hif1a gene expression and uses thereof |
WO2008154482A2 (en) * | 2007-06-08 | 2008-12-18 | Sirnaomics, Inc. | Sirna compositions and methods of use in treatment of ocular diseases |
WO2010078517A2 (en) * | 2008-12-31 | 2010-07-08 | Sirnaomics, Inc. | Compositions and methods using sirna molecules and sirna cocktails for the treatment of breast cancer |
WO2012100172A2 (en) * | 2011-01-22 | 2012-07-26 | Dicerna Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions for the specific inhibition of hif-1a by double stranded rna |
US8697359B1 (en) * | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
CN113355357A (zh) * | 2012-12-12 | 2021-09-07 | 布罗德研究所有限公司 | 对用于序列操纵的改进的系统、方法和酶组合物进行的工程化和优化 |
US10119133B2 (en) * | 2013-03-15 | 2018-11-06 | The General Hospital Corporation | Using truncated guide RNAs (tru-gRNAs) to increase specificity for RNA-guided genome editing |
EP3011034B1 (en) * | 2013-06-17 | 2019-08-07 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components |
CN111206032A (zh) * | 2013-12-12 | 2020-05-29 | 布罗德研究所有限公司 | 用于基因组编辑的crispr-cas系统和组合物的递送、用途和治疗应用 |
CN113789317B (zh) * | 2014-08-06 | 2024-02-23 | 基因工具股份有限公司 | 使用空肠弯曲杆菌crispr/cas系统衍生的rna引导的工程化核酸酶的基因编辑 |
NZ733702A (en) * | 2015-01-28 | 2022-04-29 | Caribou Biosciences Inc | Crispr hybrid dna/rna polynucleotides and methods of use |
US10166255B2 (en) * | 2015-07-31 | 2019-01-01 | Regents Of The University Of Minnesota | Intracellular genomic transplant and methods of therapy |
WO2017099494A1 (ko) * | 2015-12-08 | 2017-06-15 | 기초과학연구원 | Cpf1을 포함하는 유전체 교정용 조성물 및 그 용도 |
US20200405639A1 (en) * | 2017-04-14 | 2020-12-31 | The Broad Institute, Inc. | Novel delivery of large payloads |
-
2017
- 2017-08-21 EP EP17841736.6A patent/EP3502261A4/en active Pending
- 2017-08-21 KR KR1020170105303A patent/KR102145092B1/ko active IP Right Grant
- 2017-08-21 CA CA3033939A patent/CA3033939A1/en not_active Abandoned
- 2017-08-21 JP JP2019510289A patent/JP7050215B2/ja active Active
- 2017-08-21 RU RU2019103691A patent/RU2019103691A/ru not_active Application Discontinuation
- 2017-08-21 SG SG11201901306XA patent/SG11201901306XA/en unknown
- 2017-08-21 EP EP21210792.4A patent/EP4012032A1/en active Pending
- 2017-08-21 BR BR112019003124A patent/BR112019003124A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2017-08-21 WO PCT/KR2017/009078 patent/WO2018034554A1/ko unknown
- 2017-08-21 CN CN201780064951.7A patent/CN109844123A/zh active Pending
- 2017-08-21 AU AU2017313616A patent/AU2017313616B2/en active Active
-
2018
- 2018-04-13 US US15/953,141 patent/US20180237771A1/en not_active Abandoned
-
2020
- 2020-07-22 KR KR1020200090852A patent/KR102259006B1/ko active IP Right Grant
-
2021
- 2021-04-21 US US17/236,660 patent/US20210254054A1/en active Pending
- 2021-12-27 JP JP2021212083A patent/JP7276422B2/ja active Active
-
2022
- 2022-06-15 AU AU2022204172A patent/AU2022204172A1/en active Pending
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2016521555A (ja) * | 2013-06-05 | 2016-07-25 | デューク ユニバーシティ | Rnaガイド遺伝子編集及び遺伝子調節 |
JP2016523564A (ja) * | 2013-07-11 | 2016-08-12 | モデルナ セラピューティクス インコーポレイテッドModerna Therapeutics,Inc. | CRISPR関連タンパク質をコードする合成ポリヌクレオチドおよび合成sgRNAを含む組成物ならびに使用方法 |
WO2015048577A2 (en) * | 2013-09-27 | 2015-04-02 | Editas Medicine, Inc. | Crispr-related methods and compositions |
WO2015070083A1 (en) * | 2013-11-07 | 2015-05-14 | Editas Medicine,Inc. | CRISPR-RELATED METHODS AND COMPOSITIONS WITH GOVERNING gRNAS |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
ARVO ANNUAL MEETING ABSTRACT, (2016.05.01), ABSTRACT NO.1159, JPN6020002243, ISSN: 0004531084 * |
NATURE BIOTECHNOLOGY, vol. 34, JPN6020043940, 2016, pages 184 - 191, ISSN: 0004531085 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU2022204172A1 (en) | 2022-07-07 |
KR20200098441A (ko) | 2020-08-20 |
RU2019103691A (ru) | 2020-09-22 |
CN109844123A (zh) | 2019-06-04 |
CA3033939A1 (en) | 2018-02-22 |
KR20180020929A (ko) | 2018-02-28 |
JP7276422B2 (ja) | 2023-05-18 |
JP7050215B2 (ja) | 2022-04-08 |
KR102145092B1 (ko) | 2020-08-14 |
AU2017313616B2 (en) | 2022-12-08 |
AU2017313616A1 (en) | 2019-02-07 |
SG11201901306XA (en) | 2019-03-28 |
JP2022058425A (ja) | 2022-04-12 |
BR112019003124A2 (pt) | 2019-10-01 |
EP3502261A4 (en) | 2020-07-15 |
US20180237771A1 (en) | 2018-08-23 |
WO2018034554A1 (ko) | 2018-02-22 |
EP3502261A1 (en) | 2019-06-26 |
KR102259006B1 (ko) | 2021-05-31 |
EP4012032A1 (en) | 2022-06-15 |
US20210254054A1 (en) | 2021-08-19 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7276422B2 (ja) | 人工的に操作された血管新生調節系 | |
CN106061510B (zh) | 用于基因组编辑的crispr-cas系统和组合物的递送、用途和治疗应用 | |
JP2020508659A (ja) | プロタンパク質転換酵素サブチリシン/ケキシン9型(pcsk9)関連障害の処置のための組成物および方法 | |
US11827877B2 (en) | Compositions and methods for genomic editing by insertion of donor polynucleotides | |
JP2020508056A (ja) | 遺伝子編集のための組成物および方法 | |
TW201802242A (zh) | Crispr/cas組分之脂質奈米粒子調配物 | |
JP7440043B2 (ja) | 遺伝子発現調節のための人為的なゲノム操作 | |
JP2020524993A (ja) | クロンを含む組成物及びその使用 | |
KR102621539B1 (ko) | 인위적으로 조작된 sc 기능 조절 시스템 | |
EP3640334A1 (en) | Genome editing system for repeat expansion mutation | |
Yeh | In Vivo Delivery and Therapeutic Applications of Base Editors | |
Young | Development of a Therapeutic CRISPR/Cas9 Platform for Duchenne Muscular Dystrophy | |
TW202323522A (zh) | 用於調節基因體的方法及組合物 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190417 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20190417 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20200310 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200609 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20201117 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210216 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20210622 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210916 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20211102 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20211126 |
|
A711 | Notification of change in applicant |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711 Effective date: 20211224 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20211227 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20211224 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7050215 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |