RU2019103691A - Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза - Google Patents

Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза Download PDF

Info

Publication number
RU2019103691A
RU2019103691A RU2019103691A RU2019103691A RU2019103691A RU 2019103691 A RU2019103691 A RU 2019103691A RU 2019103691 A RU2019103691 A RU 2019103691A RU 2019103691 A RU2019103691 A RU 2019103691A RU 2019103691 A RU2019103691 A RU 2019103691A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
gene
nucleic acid
neovascularization
factor associated
modification
Prior art date
Application number
RU2019103691A
Other languages
English (en)
Inventor
Дзеонг Хун КИМ
Сунг Воок ПАРК
Сеокдзоонг КИМ
Донг Воо СОНГ
Original Assignee
Тулджен Инкорпорейтед
СЕУЛ НЭШНЛ ЮНИВЕРСИТИ Ар энд ДиБи ФАУНДЕЙШН
Сеул Нэшнл Юниверсити Хоспитал
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Тулджен Инкорпорейтед, СЕУЛ НЭШНЛ ЮНИВЕРСИТИ Ар энд ДиБи ФАУНДЕЙШН, Сеул Нэшнл Юниверсити Хоспитал filed Critical Тулджен Инкорпорейтед
Publication of RU2019103691A publication Critical patent/RU2019103691A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46—Hydrolases (3)
    • A61K38/465—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0048—Eye, e.g. artificial tears
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02—Ophthalmic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/515—Angiogenesic factors; Angiogenin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1136—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against growth factors, growth regulators, cytokines, lymphokines or hormones
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2227/00—Animals characterised by species
    • A01K2227/10—Mammal
    • A01K2227/105—Murine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00—Animals characterised by purpose
    • A01K2267/03—Animal model, e.g. for test or diseases
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPRs]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Vascular Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Ophthalmology & Optometry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)

Claims (54)

1. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией и выбранный из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, которые имеют модификацию в последовательности нуклеиновой кислоты.
2. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификацию последовательности нуклеиновой кислоты искусственно создают с использованием комплекса «гидовая нуклеиновая кислота - белок-редактор».
3. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где фактором, ассоциированным с неоваскуляризацией, является один или более факторов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4.
4. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где ген представляет собой фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией и искусственно модифицированный посредством комплекса «гидовая нуклеиновая кислота - белок-редактор»,
где: искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией, включает одну или более модификаций нуклеиновых кислот, которые представляют собой:
по меньшей мере одну делецию или инсерцию одного или более нуклеотидов; замену одним или более нуклеотидами, отличающимися от гена дикого типа; и инсерцию одного или более чужеродных нуклеотидов в последовательности мотива, смежного с протоспейсером (PAM), в последовательности нуклеиновой кислоты, входящей в состав фактора, ассоциированного с неоваскуляризацией, или в непрерывной последовательности из 1-50 п.о., где указанная область последовательности оснований является смежной с 5'-концом и/или 3'-концом этой последовательности, или
химическую модификацию одного или более нуклеотидов в последовательности нуклеиновой кислоты, входящей в состав фактора, ассоциированного с неоваскуляризацией.
5. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификация нуклеиновых кислот присутствует в промоторной области гена.
6. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификация нуклеиновых кислот присутствует в экзонной области гена.
7. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификация нуклеиновых кислот присутствует в интронной области гена.
8. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификация нуклеиновых кислот присутствует в энхансерной области гена.
9. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 4, где последовательность PAM представляет собой, например, одну или более из нижеследующих последовательностей (расположенных в направлении от 5' к 3'):
NGG (N представляет собой A, T, C или G);
NNNNRYAC (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой C или T);
NNAGAAW (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, а W представляет собой A или T);
NNNNGATT (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G);
NNGRR(T) (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой С или Т); и
TTN (N представляет собой A, T, C или G).
10. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 2, где белок-редактор включает один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, происходящего от Streptococcus pyogenes, белка Cas9, происходящего от Campylobacter jejuni, белка Cas9, происходящего от Streptococcus thermophilus, белка Cas9, происходящего от Streptococcus aureus, белка Cas9, происходящего от Neisseria meningitidis, и белка Cpf1.
11. Гидовая нуклеиновая кислота, способная образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 1-79 в последовательностях нуклеиновой кислоты одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, соответственно.
12. Гидовая нуклеиновая кислота по п. 11, которая включает одну или более гидовых нуклеиновых кислот, выбранных из группы, состоящей из:
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 3, 4, 7, 9, 10 и 11 в последовательности нуклеиновой кислоты гена VEGFA, соответственно;
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 14, 18, 19, 20, 26, 29 и 31 в последовательности нуклеиновой кислоты гена HIF1A, соответственно;
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 33, 34, 37, 38, 39 и 43 в последовательности нуклеиновой кислоты гена ANGPT2, соответственно;
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 47, 48, 49, 50, 53, 54 и 55 в последовательности нуклеиновой кислоты гена EPAS1, соответственно; и
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 64, 66, 67, 73, 76 и 79 в последовательности нуклеиновой кислоты гена ANGPTL4, соответственно.
13. Молекула рРНК по п. 11, где гидовой нуклеиновой кислотой является нуклеотидная последовательность из 18-23 п.о.
14. Композиция для модификации гена, включающая:
гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 1-79 в последовательностях нуклеиновой кислоты одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, соответственно, или в последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей гидовую нуклеиновую кислоту; и
белок-редактор или последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую этот белок.
15. Композиция для модификации гена по п. 14, где белок-редактор включает один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, происходящего от Streptococcus pyogenes, белка Cas9, происходящего от Campylobacter jejuni, белка Cas9, происходящего от Streptococcus thermophilus, белка Cas9, происходящего от Streptococcus aureus, белка Cas9, происходящего от Neisseria meningitidis, и белка Cpf1.
16. Композиция для модификации гена по п. 14, где модификация гена включает одну или более модификаций нуклеиновых кислот, которые представляют собой:
по меньшей мере одну делецию или инсерцию одного или более нуклеотидов; замену одним или более нуклеотидами, отличающимися от гена дикого типа; и инсерцию одного или более чужеродных нуклеотидов в последовательности мотива, смежного с протоспейсером (PAM), в последовательности нуклеиновой кислоты, входящей в состав фактора, ассоциированного с неоваскуляризацией, или в непрерывной последовательности из 1-50 п.о., где указанная область последовательности оснований является смежной с 5'-концом и/или 3'-концом этой последовательности, или
химическую модификацию одного или более нуклеотидов в последовательности нуклеиновой кислоты, входящей в состав фактора, ассоциированного с неоваскуляризацией.
17. Композиция для модификации гена по п. 16, где последовательность PAM включает одну или более из нижеследующих последовательностей (расположенных в направлении от 5' к 3'):
NGG (N представляет собой A, T, C или G);
NNNNRYAC (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой C или T);
NNAGAAW (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, а W представляет собой A или T);
NNNNGATT (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G);
NNGRR(T) (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой С или Т); и
TTN (N представляет собой A, T, C или G).
18. Композиция для модификации гена по п. 14, где указанная композиция для модификации гена образуется в системе вирусного вектора.
19. Композиция для модификации гена по п. 18, где вирусный вектор включает один или более вирусов, выбранных из группы, состоящей из ретровируса, лентивируса, аденовируса, аденоассоциированного вируса (AAV), вируса коровьей оспы, поксвируса и вируса простого герпеса.
20. Способ получения информации о последовательностях сайтов-мишеней, которые были искусственно модифицированы у индивидуума, путем анализа последовательностей одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4.
21. Способ конструирования библиотеки на основе информации, полученной способом по п. 20.
22. Набор для модификации гена, включающий:
(a) гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарные связи с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 1-79 в последовательностях нуклеиновой кислоты одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, соответственно, или в последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей эти гены; и
(b) белок-редактор, включающий один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, происходящего от Streptococcus pyogenes, белка Cas9, происходящего от Campylobacter jejuni, белка Cas9, происходящего от Streptococcus thermophilus, белка Cas9, происходящего от Streptococcus aureus, белка Cas9, происходящего от Neisseria meningitidis, и белка Cpf1, соответственно, или последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующую эти белки.
23. Композиция для лечения ангиоваскулярного расстройства, включающая:
гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарные связи с одной или более последовательностями-мишенями в последовательностях нуклеиновой кислоты одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, соответственно, или в последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей эти гены; и
белок-редактор или последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую этот белок.
24. Композиция для лечения по п. 23, где последовательность-мишень включает одну или более последовательностей-мишеней SEQ ID NO: 1-79.
25. Композиция для лечения по п. 23, где белком-редактором является белок Cas9, происходящий от Campylobacter jejuni.
26. Композиция для лечения по п. 23, где ангиоваскулярным расстройством является ишемическая ретинопатия или ретинопатия недоношенных.
RU2019103691A 2016-08-19 2017-08-21 Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза RU2019103691A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662376998P 2016-08-19 2016-08-19
US62/376,998 2016-08-19
PCT/KR2017/009078 WO2018034554A1 (ko) 2016-08-19 2017-08-21 인위적으로 조작된 신생혈관형성 조절 시스템

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2019103691A true RU2019103691A (ru) 2020-09-22

Family

ID=61196886

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019103691A RU2019103691A (ru) 2016-08-19 2017-08-21 Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза

Country Status (11)

Country Link
US (2) US20180237771A1 (ru)
EP (2) EP4012032A1 (ru)
JP (2) JP7050215B2 (ru)
KR (2) KR102145092B1 (ru)
CN (1) CN109844123A (ru)
AU (2) AU2017313616B2 (ru)
BR (1) BR112019003124A2 (ru)
CA (1) CA3033939A1 (ru)
RU (1) RU2019103691A (ru)
SG (1) SG11201901306XA (ru)
WO (1) WO2018034554A1 (ru)

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2018295992B2 (en) * 2017-07-07 2021-10-21 Toolgen Incorporated Target-specific CRISPR mutant
CN112533627A (zh) 2018-03-27 2021-03-19 G+Flas 生命科学公司 序列特异性体内细胞靶向
WO2019190198A1 (ko) 2018-03-27 2019-10-03 (주)지플러스 생명과학 가이드 rna 및 엔도뉴클레아제를 유효성분으로 포함하는 암 치료용 약학적 조성물
CN113195746B (zh) 2018-12-17 2023-10-20 日本制铁株式会社 炉内残留熔渣量的估计方法和估计装置
US11845989B2 (en) 2019-01-23 2023-12-19 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Treatment of ophthalmic conditions with angiopoietin-like 7 (ANGPTL7) inhibitors
SG11202107497XA (en) 2019-01-23 2021-08-30 Regeneron Pharma Treatment of ophthalmic conditions with angiopoietin-like 7 (angptl7) inhibitors
CN112143701A (zh) * 2019-06-26 2020-12-29 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心 基于rna定点编辑的抑制脉络膜新生血管形成的方法及试剂
WO2021243105A1 (en) * 2020-05-28 2021-12-02 University Of Southern California Composition and method for treating retinal vascular disease with vegf gene disruption
CN112662674B (zh) * 2021-01-12 2023-04-11 广州瑞风生物科技有限公司 靶向编辑VEGFA基因外显子区域的gRNA及其应用
CA3210480A1 (en) 2021-02-26 2022-09-01 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Treatment of inflammation with glucocorticoids and angiopoietin-like 7 (angptl7) inhibitors
CN114540325B (zh) * 2022-01-17 2022-12-09 广州医科大学 靶向dna去甲基化的方法、融合蛋白及其应用

Family Cites Families (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7795422B2 (en) * 2002-02-20 2010-09-14 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of hypoxia inducible factor 1 (HIF1) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
CA2559161C (en) * 2004-03-12 2013-06-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Irna agents targeting vegf
EP2126081A2 (en) * 2007-03-02 2009-12-02 MDRNA, Inc. Nucleic acid compounds for inhibiting hif1a gene expression and uses thereof
WO2008154482A2 (en) * 2007-06-08 2008-12-18 Sirnaomics, Inc. Sirna compositions and methods of use in treatment of ocular diseases
US9012622B2 (en) * 2008-12-31 2015-04-21 Patrick Y. Lu Compositions and methods using siRNA molecules and siRNA cocktails for the treatment of breast cancer
WO2012100172A2 (en) * 2011-01-22 2012-07-26 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for the specific inhibition of hif-1a by double stranded rna
US8697359B1 (en) * 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
DK3064585T3 (da) * 2012-12-12 2020-04-27 Broad Inst Inc Konstruering og optimering af forbedrede systemer, fremgangsmåder og enzymsammensætninger til sekvensmanipulation
IL289396B2 (en) * 2013-03-15 2023-12-01 The General Hospital Coporation Using tru-grnas to increase the specificity of RNA-guided genome editing
EP3004370B1 (en) * 2013-06-05 2024-08-21 Duke University Rna-guided gene editing and gene regulation
KR20160056869A (ko) * 2013-06-17 2016-05-20 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 바이러스 구성성분을 사용하여 장애 및 질환을 표적화하기 위한 crispr-cas 시스템 및 조성물의 전달, 용도 및 치료 적용
EP3019619B1 (en) * 2013-07-11 2021-08-25 ModernaTX, Inc. Compositions comprising synthetic polynucleotides encoding crispr related proteins and synthetic sgrnas and methods of use
WO2015048577A2 (en) * 2013-09-27 2015-04-02 Editas Medicine, Inc. Crispr-related methods and compositions
CA2930015A1 (en) * 2013-11-07 2015-05-14 Editas Medicine, Inc. Crispr-related methods and compositions with governing grnas
WO2015089462A1 (en) * 2013-12-12 2015-06-18 The Broad Institute Inc. Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for genome editing
CN113789317B (zh) * 2014-08-06 2024-02-23 基因工具股份有限公司 使用空肠弯曲杆菌crispr/cas系统衍生的rna引导的工程化核酸酶的基因编辑
CN111518811A (zh) * 2015-01-28 2020-08-11 先锋国际良种公司 Crispr杂合dna/rna多核苷酸及使用方法
EP3328399B1 (en) * 2015-07-31 2023-12-27 Regents of the University of Minnesota Modified cells and methods of therapy
CA2947904A1 (en) 2015-11-12 2017-05-12 Pfizer Inc. Tissue-specific genome engineering using crispr-cas9
WO2017099494A1 (ko) 2015-12-08 2017-06-15 기초과학연구원 Cpf1을 포함하는 유전체 교정용 조성물 및 그 용도
JP6875500B2 (ja) 2016-07-28 2021-05-26 インスティテュート フォー ベーシック サイエンスＩｎｓｔｉｔｕｔｅ Ｆｏｒ Ｂａｓｉｃ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｃａｓ９タンパク質およびガイドＲＮＡを含む眼疾患治療用薬学組成物
US20200405639A1 (en) * 2017-04-14 2020-12-31 The Broad Institute, Inc. Novel delivery of large payloads

Also Published As

Publication number Publication date
KR102145092B1 (ko) 2020-08-14
AU2017313616B2 (en) 2022-12-08
JP7050215B2 (ja) 2022-04-08
KR20200098441A (ko) 2020-08-20
CN109844123A (zh) 2019-06-04
AU2022204172B2 (en) 2024-08-15
SG11201901306XA (en) 2019-03-28
WO2018034554A1 (ko) 2018-02-22
US11999952B2 (en) 2024-06-04
KR20180020929A (ko) 2018-02-28
EP3502261A4 (en) 2020-07-15
JP7276422B2 (ja) 2023-05-18
JP2022058425A (ja) 2022-04-12
AU2022204172A1 (en) 2022-07-07
BR112019003124A2 (pt) 2019-10-01
US20180237771A1 (en) 2018-08-23
AU2017313616A1 (en) 2019-02-07
CA3033939A1 (en) 2018-02-22
JP2019524847A (ja) 2019-09-05
EP4012032A1 (en) 2022-06-15
KR102259006B1 (ko) 2021-05-31
US20210254054A1 (en) 2021-08-19
EP3502261A1 (en) 2019-06-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2019103691A (ru) Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза
RU2019118283A (ru) Искусственно созданная система управления функцией шк
RU2019106669A (ru) Модифицированный иммунорегуляторный элемент и изменение иммунитета посредством этого элемента
RU2014138491A (ru) Композиции и способы лечения гемоглобинопатии
Decker et al. The expression of the Ig H chain repertoire in developing bone marrow B lineage cells.
US20220127621A1 (en) Fusion proteins and fusion ribonucleic acids for tracking and manipulating cellular rna
EP4219806A2 (en) Adeno-associated virus library
WO2020191248A8 (en) Methods and compositions for editing nucleotide sequences
JP2018534950A5 (ru)
Wada et al. Antigenic variation by positional control of major surface glycoprotein gene expression in Pneumocystis carinii
RU96118426A (ru) Мутагенез днк за счет неупорядоченной фрагментации и вторичной сборки
WO2011038187A1 (en) Controlled adeno-associated virus (aav) diversification and libraries prepared therefrom
US20200255860A1 (en) A strong insulator and uses thereof in gene delivery
JPWO2021050571A5 (ru)
US20210332344A1 (en) Directed modification of rna
WO2020069339A8 (en) Mutant reverse tetracycline transactivators for expression of genes
GB2616795A (en) Compositions and methods for the targeting of BCL11A
US20110003705A1 (en) Novel method for generating and screening an antibody library
KR20220119703A (ko) 조절 핵산 서열
CN110551761A (zh) CRISPR/Sa-SepCas9基因编辑系统及其应用
JPWO2021242903A5 (ru)
JPWO2019183150A5 (ru)
GB2624791A (en) Systems and methods for regulating aberrant gene expressions
JP2023051914A5 (ru)
JPWO2019200122A5 (ru)

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20200824