JP2019505581A - 神経膠腫の治療用の薬剤の調製における化合物の使用 - Google Patents

神経膠腫の治療用の薬剤の調製における化合物の使用 Download PDF

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Abstract

本発明は、神経膠腫、特に神経膠芽腫の治療用の医薬品の調製における、式Aで表される化合物の使用を提供する。特に、特異的な融合タンパク質の発現を処置するための医薬品の調製における、式Aで表される化合物の使用を提供する。本発明の技術的解決法を用いて、神経膠芽腫の分類を実施でき、特定の患者グループに対して医薬品の投与を行うことができ、正確な処置を実施できる。【化1】

Description

本発明はバイオ医薬品の技術分野に関する。具体的には、本発明は、神経膠腫、特に神経膠芽腫の治療用の医薬品の調製における化合物の使用に関する。
神経膠芽腫は、神経膠腫の中でも最も悪性の神経膠腫である。神経膠芽腫は大脳皮質の下に増殖し、テント上大脳半球のほぼ全体で見られる。浸潤性増殖により、神経膠芽腫は通常、いくつかの葉に浸潤し、深部組織に浸潤し、そして脳梁を介して反対側の大脳半球に拡がる。神経膠芽腫は前頭葉で最も多く見られ、続いて、側頭葉及び頭頂葉で見られ、少数の症例では、後頭葉/視床、脳幹神経節等で見られる。
神経膠芽腫は増殖が速く、経過が短い。患者の70〜80%は3〜6か月の疾患経過を経験し、1年を超える疾患経過を経験するのはわずか10%である。稀な症例ではあるが、神経膠芽腫による出血は脳卒中のような症状の発現を引き起こす。神経膠芽腫は急速に増殖し、広範囲にわたる脳浮腫及び明白な頭蓋内圧亢進の明らかな症状を生じる。ほぼ全ての患者が、頭痛、嘔吐、頭痛を伴う鬱血乳頭、精神状態の変化、脚の筋力低下、意識障害及び会話困難に苦しむ。神経膠芽腫は脳組織に浸潤性の損傷を引き起こし、一連の局所症状を生じる。神経膠芽腫の患者は、様々な程度の半身不随、片側知覚不全、失語症、半盲等に苦しむ。片麻痺、脳神経傷害、片側知覚不全及び半盲は、神経学的検査によって発見できる。患者の約33%はてんかん発作に苦しみ、約20%にはアパシー、認知症、及び精神遅滞等といった精神症状を有する。
神経膠芽腫は、2つのタイプ、即ち低悪性度神経膠腫から進行する二次性神経膠芽腫と、低悪性度の前癌病変が存在しない一次性神経膠芽腫とに分類できる。
一次性神経膠芽腫は、最初に診断される場合はグレードIVの神経膠芽腫であり、これらの最も明白な分子的特徴として、EGFRの増幅、突然変異、又は過剰発現(40%)、P53の突然変異(30%)、CDKN2A/Bの欠失(30〜40%)、RB1の突然変異又は欠失、10番染色体の欠損(70%)、PTENの突然変異(30%)等が挙げられる。
対照的に、二次性神経膠芽腫は、低悪性度の神経膠腫(グレードII又はグレードIII)から進行するグレードIVの神経膠腫である。最初の臨床診断で低悪性度と診断される神経膠腫は、外科手術又は化学放射線療法後に増殖して元の状態に戻り、グレードIVの神経膠腫へと進行する。研究により、二次性神経膠芽腫の分子マーカー及び遺伝学的細胞経路が一次性神経膠芽腫のものとは異なることが分かっている。イソクエン酸デヒドロゲナーゼ(IDH)の突然変異は二次性神経膠芽腫でのみ見られるが、全ての二次性神経膠芽腫がIDH突然変異を有しているとは限らない。現在のところ、二次性神経膠芽腫の分子マーカーについての研究では、IDH1の突然変異(70%)、P53の突然変異(65%)、PDGFA及びPDGFRAの過剰発現(60%)、19番染色体長碗の欠失(50%)、並びにRB1の突然変異又は欠失(25%)に関心が集まっている。これらの分子マーカーの発見は、目的とする神経膠芽腫の治療のための重要な標的を提供する。このような分子マーカーを標的化する多くの標的薬が存在しているが、標的薬は様々な理由のために臨床応用段階に入っていない。根本原因は、ほとんどの場合、標的関係の低い特異性が不十分な治療効果及び医薬品の大きな副作用をもたらすことである。従って、このような標的薬は臨床応用には適さない。
従って、神経膠腫、特に神経膠芽腫について、より高い標的特異性を有しており、正確な治療を実現できる医薬品が、現在必要とされている。
肝細胞増殖因子受容体(HGFR、c−Metとも呼ばれる)は、met遺伝子によりコードされ、受容体型チロシンキナーゼファミリーに属する。HGFRがそのリガンドである肝細胞増殖因子と結合した後、HGFRの細胞内ドメインが自動的にリン酸化されて下流にあるシグナル伝達経路を活性化し、これにより細胞増殖、形態形成、及び運動性を調節する。多くのc−Metの異常が見つかっており、大抵は異なる腫瘍に現れている。加えて、研究により、PTPRZ1遺伝子によりコードされるホスファターゼ(受容体型チロシンキナーゼファミリー(RPRPBとも呼ばれる)に属する)が、c−Metから特異的なリン酸化部位を除去してmetシグナル伝達経路を不活化できることが分かっている。従って、タンパク質はおそらくc−Metと特定の結合関係を有しており、疾患の発症及び進行におけるc−Metの役割に影響を与えると結論づけることができる。
上記課題を目指して、本発明の目的は、高い標的特異性を有しており、神経膠腫、特に神経膠芽腫の個人に合わせた正確な治療を実現できる薬剤を提供することである。
膨大な量の研究に基づいて、本発明の発明者らは、他のc−Met阻害剤と比較して、式Aで表される化合物が、c−Met阻害剤として、神経膠腫、特に神経膠芽腫についてより明白な阻害作用を有していることを見出した。特に、上記化合物は、特異的融合タンパク質を発現し、その結果、より不良な予後につながる神経膠芽腫の亜型に対してより明白な阻害作用を有する。従って、本発明は、以下の技術的解決法を提供する。
本発明は、式Aで表される化合物の、神経膠腫の治療用の薬剤の製造における使用を提供する。
Figure 2019505581
式Aで表される化合物は、中国特許第103122000号の実施例44に記載されているステップ及びスキームにより合成できる。
好ましくは、神経膠腫は神経膠芽腫である。
より好ましくは、神経膠腫は二次性神経膠芽腫である。
一方、研究により、特異的な融合タンパク質が二次性神経膠芽腫において発現され得ることが分かった。この融合タンパク質は、c−Metのアミノ酸配列の大部分と、c−Metのアミノ酸配列のN末端に融合されたPTPRZ1のアミノ酸配列の一部分とを含む。式Aで表される化合物は、融合タンパク質を発現する神経膠芽腫の亜型の増殖及び腫瘍形成について良好な阻害作用を有する。
従って、好ましくは、本発明は、二次性神経膠芽腫の治療用の薬剤の製造における式Aで表される化合物の使用を提供する。ここで、二次性神経膠芽腫は融合タンパク質を発現する二次性神経膠芽腫の亜型であり、上記融合タンパク質(本明細書中では「ZM」とも呼ばれる)は、PTPRZ1のエキソン1、エキソン1〜2、エキソン1〜3、又はエキソン1〜8から翻訳されるタンパク質部分を、c−Metのエキソン2〜24から翻訳されるタンパク質部分に対して融合することにより形成され、ここではPTPRZ1のタンパク質部分はc−Metのタンパク質部分のN末端に配置される。
好ましくは、融合タンパク質は、配列番号1で示されるアミノ酸配列を含む。
好ましくは、融合タンパク質は、配列番号2で示されるアミノ酸配列を含む。
より好ましくは、融合タンパク質はそのN末端に、配列番号1で示されるアミノ酸配列及び配列番号2で示されるアミノ酸配列を含む。
最も好ましくは、融合タンパク質は、配列番号3、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6で示されるアミノ酸配列を含む。
本発明の特定の実施形態によれば、融合タンパク質のアミノ酸配列は、配列番号3、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6で示されるものである。本明細書中では、そのアミノ酸配列が配列番号3で示されるものである融合タンパク質は「ZM1−2」と命名され、そのアミノ酸配列が配列番号4で示されるものである融合タンパク質は「ZM2−2」と命名され、そのアミノ酸配列が配列番号5で示されるものである融合タンパク質は「ZM3−2」と命名され、そのアミノ酸配列が配列番号6で示されるものである融合タンパク質は「ZM8−2」と命名される。
上記技術的な解決法に基づいて、神経膠芽腫細胞中での本発明の上記融合タンパク質の発現は、イムノブロッティングにより抗体を用いて検出できる。検出対象のタンパク質のアミノ酸配列がわかっている場合は、そのタンパク質に対する抗体(例えば、モノクローナル抗体又はマルチクローナル抗体)が、当該分野での従来技術であるイムノブロッティングにより特異的な組織又は細胞中でのタンパク質の発現を検出するために使用される。検出は、融合タンパク質の1つの断片に関して、又は融合タンパク質全体に関して実施できる。本発明の特定の実施形態によれば、ヒトc−Metタンパク質に対する抗体を用いて、上記融合タンパク質の発現を検出できる。実際、融合タンパク質のうちのいずれが神経膠芽腫細胞中で発現されるかどうかに基づいて、神経膠芽腫を亜型に分類でき、その後、本発明により提供される式Aで表される化合物で治療できる。
一方、二次性神経膠芽腫は特異的な融合転写物を含有し得、上記融合転写物は、c−MetをコードするRNAの大部分と、c−MetをコードするRNAの部分の5’末端に融合されたPTPRZ1をコードするRNAの一部分とを含有する。式Aで表される化合物は、融合転写物を含有する神経膠芽腫の亜型の増殖及び腫瘍形成について、より良好な阻害作用を有する。
従って、好ましくは、本発明は、二次性神経膠芽腫の治療用の薬剤の製造における式Aで表される化合物の使用を提供する。ここで、二次性神経膠芽腫は、融合転写物を含有する二次性神経膠芽腫の亜型であり、融合転写物は、PTPRZ1のエキソン1、エキソン1〜2、エキソン1〜3、又はエキソン1〜8から転写される1つのRNA部分と、c−Metのエキソン2〜24から転写される1つのRNA部分とを連結することにより形成される。ここではPTPRZ1のRNA部分は、c−MetのRNA部分の5’末端に配置される。
好ましくは、融合転写物は、配列番号1で示されるアミノ酸配列をコードするRNA配列を含む。
好ましくは、融合転写物は、配列番号2で示されるアミノ酸配列をコードするRNA配列を更に含む。
より好ましくは、融合転写物はその5’末端に、配列番号1で示されるアミノ酸配列をコードする1つのRNA配列、及び配列番号2で示されるアミノ酸配列をコードする1つのRNA配列を含む。
最も好ましくは、融合転写物は、配列番号3、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6で示されるアミノ酸配列をコードする1つのRNA配列を含む。本発明の特定の実施形態によれば、融合転写物のヌクレオチド配列は、配列番号3、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6で示されるアミノ酸配列をコードする1つのRNA配列からなる。
同様に上記技術的な解決法に基づき、神経膠芽腫細胞中での本発明の上記融合タンパク質の発現はまた、上記融合転写物、即ちそのコードRNA配列に関しても検出できる。検出対象のタンパク質のアミノ酸配列がわかっている場合は、コードRNA配列の検出もまた当該分野での従来技術に属し、検出は、融合タンパク質の1つの断片に関して、又は融合タンパク質全体に関して実施してよい。例えば、全RNAを抽出して鋳型として使用できるか、又は全RNAを、鋳型として使用されるcDNAに逆転写できる。特異的プライマーを用いてPCR増幅を実施する。実際、融合転写物が神経膠芽腫細胞中に存在するかどうかに基づいて、神経膠芽腫を亜型に分類でき、その後本発明により提供される式Aで表される化合物で治療できる。
従って、本発明はまた、配列番号7、配列番号8、配列番号9、又は配列番号10でそれぞれ示される融合タンパク質ZM1−2、ZM2−2、ZM3−2、又はZM8−2のcDNA配列も提供する。
本発明により提供される技術的解決法に基づき、式Aで表される化合物は、神経膠腫、特に神経膠芽腫を治療するために臨床的に利用でき、これには、必要としている被験体に、有効量の式Aで表される化合物又は式Aで表される化合物を含有しているいずれの医薬組成物が投与できることが含まれる。用量及び投与経路は、個々の健康状態、疾患の症状及び重篤度等に依存し、特別な状況の際に医師が判断する必要がある。
具体的には、正確な治療スキームが必要な場合、治療対象の被験体の神経膠芽腫試料等の腫瘍試料を、最初に臨床的に検出して、例えば上記融合タンパク質が発現されるかどうか、若しくは上記融合転写物が神経膠芽腫試料に含有されるかどうかを検出する、並びに/又は試料中の融合タンパク質又は融合転写物の含有量を検出することができる。治療対象の被験体の試料が上記融合タンパク質若しくは融合転写物を含有する場合、又は融合タンパク質若しくは融合転写物の含有量が正常な被験体中若しくは任意の他の関連する試料中の含有量より高い場合は、式Aで表される化合物又は上記化合物を含有する医薬組成物を投与できる。このような状況では、試料中の融合タンパク質又は融合転写物の存在又は含有量が、当該分野での従来技術、例えば上記イムノブロッティング及びPCRを用いて検出できる。
臨床研究は、本発明で記載される融合タンパク質を発現する、又は本発明で記載される融合転写物を含有する神経膠芽腫が予後不良であり、それら患者の生存期間が、融合タンパク質又は融合転写物を有しない患者の生存期間より明らかに短い(248日に対して127日)ことを示す。このような神経膠芽腫の患者に関して、本発明により提供される式Aで表される化合物は、他の同様の薬剤と比較して特別な治療の利点を有する。
更に、神経膠腫、特に神経膠芽腫の治療の間には、式Aで表される化合物を、他の治療法又は治療薬と共に、同時に、連続して、又は一定の時間間隔をあけて使用できる。用量及び投与経路は、個々の健康状態、疾患の症状及び重篤度等に依存し、特別な状況の際に医師が判断する必要がある。
先行技術と比較して、本発明は以下の有益な効果を有する。
神経膠芽腫細胞株のin−vitroでの増殖及びin−vivoでの腫瘍形成についての式Aで表される化合物の実験を通して、本発明は初めて、式Aで表される化合物が他のc−Met阻害剤と比較して、神経膠芽腫の進行をより有意に阻害できることを証明する。具体的に言うと、実験は、同様の構造を有するc−Met阻害剤と比較して、式Aで表される化合物は、細胞生存性及び動物での腫瘍形成に対して、より強力な阻害作用を有することを証明する。細胞の実験及びin−vivoでの実験の両方の結果は、式Aで表される化合物の神経膠芽腫に対する阻害作用が、クリゾチニブ(crizotinib)の阻害作用に近いか、又はこれより更に高いことが証明する。特に、クリゾチニブの分子量は式Aで表される化合物の分子量より大きく、これにより、クリゾチニブが血液脳関門を通過することはより難しく、神経膠芽腫に到達できるクリゾチニブは少なく、限定的な役割しか果たすことができない。更に、クリゾチニブは二重標的医薬品である。研究は、クリゾチニブはc−Metを阻害しながらALKを阻害するため、比較的大きな副作用を有することを示している。対照的に、式Aで表される化合物はc−Metのみを標的化するため、副作用はより小さい。
特に、実験は、式Aで表される化合物が、特異的な融合タンパク質を発現する二次性神経膠芽腫についてより有意な阻害作用を有すること、及びその作用が、同様の化合物又は公知の治療用医薬品の作用をはるかに上回ることを証明する。融合タンパク質が神経膠芽腫中で発現されるかどうか、又は記載されるような融合転写物が神経膠芽腫中に存在するかどうかの検出を通して、融合タンパク質を発現するか又は融合転写物を含有する神経膠芽腫の亜型を他の神経膠芽腫と区別でき、その後式Aで表される化合物を採用して有効な治療を提供し、これによって、神経膠芽腫の患者に対する個別の正確な治療が実現され、このような特定のタイプの神経膠芽腫が引き起こす予後不良の問題が根本的に解決される。同時に、式Aで表される化合物の作用機構に基づいて、副作用を回避でき、患者の疼痛を緩和でき、この薬剤での治療がより安全かつより効果的なものとなる。最後に、疾患の治療及び予後診断についての費用対効果が改善される。
以下、本発明の実施形態を添付の図面を参照して詳細に説明する。
図1は、本発明により提供される配列番号3より示される融合タンパク質(ZM1−2)、及び配列番号4で示される融合タンパク質(ZM2−2)のcDNAの配列決定の結果を示す。 図2は、本発明により提供される融合タンパク質の構造を示す。 図3は、実施例3で本発明により提供される融合タンパク質のイムノブロッティングの結果を示している。ここでは、レーン1は融合タンパク質ZM8−2であり、レーン2は融合タンパク質ZM2−2であり、レーン3及び4はそれぞれ対照である。 図4は、レンチウイルスベクターPCDH−EF1−MCS−T2A−Puroの構造の説明であり、その中に、融合タンパク質をコードする配列の挿入位置が示されている。 図5は、実施例5のin−vivoでの腫瘍増殖に対する阻害についての実験結果を示す。 図6は、実施例5のマウスの生存実験の結果を示す。 図7は、実施例5の神経膠芽腫のin−vivoでの腫瘍形成実験についての脳の磁気共鳴撮像の結果を示す。ここでは、パネル7Aは、モデル化により得たベクターマウス(2)の脳画像を示し、パネル7Bは、モデル化により得たZM2−2マウス(2)の脳画像を示し、パネル7Cは、式Aで表される化合物の最初の投与後16日目のZM2−2マウス(2)の脳画像を示し、パネル7Dは、式Aで表される化合物の最初の投与後16日目に化合物の投与が停止されてから10日のZM2−2マウス(2)の脳画像を示す。
以下、本発明を、具体的な実施例を参照して説明する。当業者であれば、これらの実施例が本発明の範囲の何らかの限定ではなく、単に本発明を記述するために使用されることを理解できる。
特別の定めのない限りは、以下の実施例の方法は従来法である。特別の定めのない限りは、以下の実施例で使用される医薬品の原材料及び試薬の材料等は、全て市販の製品である。
実施例1
神経膠芽腫のRNA及びcDNAを得る
80個の神経膠芽腫試料を医薬品倫理委員会の基準に従った手術により収集した。各試料は、試料を提供した患者及びその患者の医師から同意書を得て収集した。試料の性別、年齢、及び疾患のタイプを表1に示す。
Figure 2019505581
Figure 2019505581
RNA抽出キット(Qiagen社から購入)を使用して、その中の説明書に従って、各神経膠芽腫試料の全mRNAを抽出した。全mRNAの完全性を分析器を用いて検出し、各試料由来の全mRNAのRIN(RNA integrity Number)が7.0超であることを確認した。
逆転写キット(RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit、K1622、Invitrogen社から購入)を用いて、その中の説明書に従って、各試料に由来する全mRNAを鋳型として20μlの反応系に逆転写を実施し、これにより各試料について二本鎖cDNAを合成した。
実施例2
神経膠芽腫中における本発明の融合タンパク質の検出
実施例1で調製した各試料の二本鎖cDNAを鋳型とし、以下のプライマー配列を使用して増幅させた。
順方向プライマー:
配列番号11 ATGCGAATCCTAAAGCGTTTCCTCG
逆方向プライマー:
配列番号12 CTATGATGTCTCCCAGAAGGAGGCT
20μlの増幅系は以下を含んでいた:10μMの順方向プライマー、1μl;10μMの逆方向プライマー、1μl;100ngの鋳型;2×Phusion Master Mix(NEB、製品番号M0531)、10μl;ヌクレアーゼフリー水、20μlになるように。
PCRプログラムの設定は以下を含んでいた:98℃で30秒間;98℃で10秒間、60℃で30秒間、72℃で1.5分間を計30サイクル;72℃で5分間;12℃で維持。
PCR産物を1%のアガロースゲル電気泳動により分析し、生じたバンドをDNAゲル回収キット(QIAquick PCR purification kit、Qiagen社から購入)により回収し、その後Tベクター(pGEM−T easy vector、Promega社から購入)にクローニングし、DNAシーケンサー(ABI Prism 3730×l DNA Sequencer、Applied Biosystems社から購入)により配列決定した。
配列決定の結果は、2つの異なるヌクレオチド配列が増幅により得られたことを示していた。これらは66個の異なるヌクレオチドを有し、それぞれ配列番号7及び配列番号8で示す。ヌクレオチド配列の配列決定結果を図1に示す。更に、特定の試料の全ゲノムDNAの配列決定により、融合タンパク質ZM3−2及び融合タンパク質ZM8−2のゲノムDNA配列を見出した。
試料の供給源に基づいて、表1に列挙したNo.60試料、No.64試料、No.77試料、No.78試料、No.80試料が、対応する融合タンパク質のcDNA又はゲノムDNAを有していたことが分かった。融合タンパク質ZM1−2はNo.60試料中で見られ、融合タンパク質ZM2−2はNo.64試料及びNo.78試料の両方で見られ、融合タンパク質ZM3−2はNo.77タンパク質中で見られ、融合タンパク質ZM8−2はNo.80試料中で見られた。結果は、本発明による融合タンパク質及びそのコードRNA又はゲノムDNAが一部の神経膠芽腫に特異的に存在しており、別の神経膠芽腫には存在せず、またほぼ全てが二次性神経膠芽腫において見られたことを示した。
このようにして、配列番号3(融合タンパク質ZM1−2)、配列番号4(融合タンパク質ZM2−2)、配列番号5(融合タンパク質ZM3−2)、配列番号6(融合タンパク質ZM8−2)に示すような、融合タンパク質のアミノ酸配列が得られる。配列のアラインメントから、これらの4つの融合タンパク質が全て、N末端からC末端の方向に、c−Metタンパク質のほぼ全体に対してPTPRZ1タンパク質の一部を融合することにより形成されていることが分かった。特に、融合タンパク質ZM1−2は、c−Metのエキソン2〜24にPTPRZ1のエキソン1を融合することにより得られ、融合タンパク質ZM2−2は、c−Metのエキソン2〜24にPTPRZ1のエキソン1〜2を融合することにより得られ、融合タンパク質ZM3−2は、c−Metのエキソン2〜24にPTPRZ1のエキソン1〜3を融合することにより得られ、融合タンパク質ZM8−2は、c−Metのエキソン2〜24にPTPRZ1のエキソン1〜8を融合することにより得られた。4つの融合タンパク質はいずれも、c−Metのプロモーター及びエキソン1(非機能エレメント)に相当する部分を含有しなかった。従って、融合遺伝子がPTPRZ1のプロモーターを用いて転写されると推測した。4つの融合遺伝子の構造の説明を図2に示す。
更に、臨床研究により、本発明で記載する融合タンパク質を有する神経膠芽腫の症例の生存期間の中央値が127日であり、報告されている神経膠芽腫の症例の生存期間の中央値(248日)より短いことが分かった。このようにして、二次性神経膠芽腫のうち、本発明で記載する融合タンパク質を発現する神経膠芽腫の亜型が予後不良であることが証明される。
実施例3
神経膠芽腫中の融合タンパク質のイムノブロッティングによる確認
実施例1で収集した80個の神経膠芽腫試料の全タンパク質を、融合タンパク質のイムノブロッティングによる確認に供した。
イムノブロッティングによる確認で使用した抗体は、ヒトc−Metタンパク質に対する抗体であった(ウサギ抗体、Abcam社から購入、製品番号ab51067)。非融合ヒトc−Metタンパク質の分子量は145kDaであるが、融合タンパク質の分子量はより大きい。イムノブロッティングの操作は、抗体の説明書及びイムノブロッティングキットの説明書に従って実施した。
イムノブロッティングの結果は、得られた免疫ブロットのバンドが実施例2の結果と一致していることを示した。免疫ブロットのバンドは、表1に列挙した試料のうち、No.60、No.64、No.77、No.78、No.80の試料で見られた(全て二次性神経膠芽腫の試料であった)。図3は、ZM8−2及びZM2−2のイムノブロッティングの結果を示している。ここでは、ZM8−2の分子量は約190kDaであり、ZM2−2の分子量は、ほぼ重なり合った免疫ブロットのバンドで示されるように、非融合体であるヒトc−Metタンパク質の分子量に近かった。
このように、本発明で記載する融合タンパク質が、一部の神経膠芽腫において特異的に発現され、別の神経膠芽腫では発現されないことを知ることができる。従って、神経膠芽腫は、融合タンパク質を発現する神経膠芽腫の亜型と、融合タンパク質を発現しない神経膠芽腫の亜型とに分類できる。
実施例4
神経膠芽腫細胞の増殖に対する式Aで表される化合物の阻害活性の決定
式Aで表される化合物及びクリゾチニブ、並びに式Aの構造と同様の構造をそれぞれ有する式B〜Hで表される化合物を使用して、神経膠芽腫細胞の増殖に対する阻害活性を試験する実験を行った。
式A〜Hで表される化合物を、中国特許第103122000号において開示されているステップ及びスキームにより合成した。
Figure 2019505581
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Figure 2019505581
クリゾチニブ(CRIZOTINIB;PF−02341066):製品番号S1068、Selleck社(米国)から購入。
最初に、レンチウイルスベクターPCDH(PCDH−EF1−MCS−T2A−Puro、SBI、製品番号CD510B−1、図4に示す構造)を使用し、配列番号7又は配列番号8で示すヌクレオチド配列をその説明書に従ってベクターにクローニングして、配列番号3及び配列番号4でそれぞれ表される融合タンパク質を発現する発現ベクターを調製した。発現ベクターをそれぞれ「PCDH−ZM1−2」及び「PCDH−ZM2−2」と命名し、印をつけた。次に、ウイルスパッケージングプラスミド(SBI、製品番号LV500A−1)を用いて、レンチウイルスを調製するためのベクターのうちの1つと共に293T細胞を同時感染させた。レンチウイルスベクターPCDHをパッケージングし、293T細胞に同時感染させるために同じ方法を実施して、ブランクベクターを有するレンチウイルスを調製した。これを「PCDH−blank」と命名した。
ヒト神経膠腫細胞株U87(これは本発明により提供される融合タンパク質をいずれも発現しなかった)をCell Bank of Chinese Academy of Medical Sciencesから購入した。U87細胞を上で調製したレンチウイルスのうちのいずれに感染させ、ピューロマイシン(スクリーニング用に0.5μg/mL、維持用に0.2μg/mL)を加えることによりスクリーニングし、融合タンパク質を安定して発現する細胞モデルを確立した。これらの細胞モデルを融合タンパク質の発現及び融合遺伝子の転写に関して、イムノブロッティング及び逆転写PCRにより確認し、融合タンパク質ZM1−2及びZM2−2をそれぞれ安定に発現した細胞株を最終的に得て、これらをそれぞれ「PCDH−ZM1−2発現細胞」及び「PCDH−ZM2−2発現細胞」と命名した。同様に、U87細胞に、ブランクベクターを有するレンチウイルスPCDH−blankを感染させて、「PCDH−blank発現細胞」をブランク対照として得た。
大きな皿で培養された、対数増殖期にあったこれらのU87細胞を、滅菌PBSで1回洗浄し、その後0.25%のトリプシンで2分間消化した。全ての細胞を消化して分離させた後、10%のウシ胎仔血清(FBS)を含有する完全DMEM培地を用いて消化を停止させた。細胞を計数し、細胞濃度を20000細胞/mlに調整した。その後、細胞をマルチチャンネルピペットを用いてCorning 96ウェルプレートに播種し(2000細胞/ウェル)に播種し、5%のCOインキュベータ中で37℃で24時間インキュベートした。試験対象の化合物(クリゾチニブ及び式A〜Hで表される化合物)をそれぞれDMSOに溶解させてストック溶液を調製し、その後ストック溶液及び完全培地を使用して、様々な薬剤濃度(0、5、10、20、40、60、80、100μΜ)の溶液を調製した。細胞を、更に72時間インキュベータでインキュベートし、その後20μlの3−(4,5−ジメチルチアゾール−2)−2,5−ジフェニルテトラゾリウムブロマイド(MTT)を各ウェルに添加した。インキュベータ中での1〜3時間の後、マイクロプレートリーダを用いて490nmでの吸光度を決定した。各濃度に対応する阻害率を計算し、IC50の値をGraphPadソフトウェアで決定した。結果を表2に示す。
Figure 2019505581
表2から、ヒト神経膠腫細胞株U87自体及びブランク対照細胞株U87において、同様の構造を有する式F〜Gで表される化合物と比較して、式Aで表される化合物が細胞生存性の阻害についてより著しく強力な作用を発揮すること、及びクリゾチニブの作用と同様であるか又はクリゾチニブの作用よりはるかに高い増殖に対する阻害作用を発揮することを知ることができる。
加えて、実験の間に、融合タンパク質ZM1−2及びZM2−2の発現を伴う神経膠芽腫が明らかに速く増殖することが分かった。細胞に共通して、細胞生存性は式Aで表される化合物によってのみ阻害され得、式B〜Hで表される化合物及びクリゾチニブの細胞生存性に対する阻害作用は、式Aで表される化合物の阻害作用に明らかに劣っていた。
実施例5
神経膠芽腫のin−vivoでの腫瘍形成に対する式Aで表される化合物の阻害活性の決定
神経膠芽腫のin−vivoでの腫瘍形成の阻害についての実験を、式Aで表される化合物及びクリゾチニブを用いて実施した。
(1)腫瘍増殖の阻害についての実験
最初に、腫瘍を保有するマウスモデルを確立した。約16〜18gの体重の6〜8週齢の、母系BALB/c(nu/nu)ヌードマウスをVital River社から購入した。実施例4で調製した「PCDH−blank発現細胞」及び「PCDH−ZM2−2発現細胞」をそれぞれPBSで10細胞/mlの懸濁液になるように調製した。75%のエタノールで消毒したヌードマウスに、右の肩甲骨領域に100μlの細胞懸濁液を皮下注射した。ここでは、PCDH−blank発現細胞を7匹のヌードマウスに注射し、PCDH−ZM2−2発現細胞を21匹のヌードマウスに注射した。皮下接種後、約2〜3日で、固形腫瘍の形成が観察され始め、約15日後に腫瘍が形成されたことが分かった。腫瘍の大きさ及びマウスの体重の変化を1週間に2回測定した。「PCDH−blank発現細胞」の注射により得た腫瘍を保有するマウスを「ベクターマウス(1)」と命名し、「PCDH−ZM2−2発現細胞」の注射により得た腫瘍を保有するマウスを「ZM2−2マウス(1)」と命名した。
腫瘍が約100mmの体積を有するまでに増殖したら、ZM2−2マウス(1)を腫瘍の大きさの平均値により以下を含む3つのグループに分けた:式Aで表される化合物を投与した7匹のマウスのグループ;クリゾチニブを投与した7匹のマウスのグループ;7匹のマウス対照グループ。前の2つのグループには、式Aで表される化合物を10mg/kg/日の用量で、又はクリゾチニブを50mg/kg/日の用量で、強制栄養により投与した。これらの2種類の薬剤はそれぞれ、通常の生理食塩水を用いて懸濁液になるように調製し、継続投与のために連続して撹拌しながら、1日に1回投与した。対照グループには、通常の生理食塩水を強制栄養により投与した。腫瘍の大きさ及びマウスの体重の変化を1週間に2回測定した。腫瘍の直径はノギスで測定した。腫瘍の体積を計算するための方程式は以下であった:腫瘍の体積=0.5*長さ*幅。腫瘍の大きさの変化を図5に示す。結果は、式Aで表される化合物がZM2−2マウス(1)において腫瘍の増殖を有意に阻害できたこと、阻害作用がクリゾチニブの阻害作用より強力であったことを示していた。
(2)マウスの生存についての実験
最初に、腫瘍を保有するマウスモデルを確立した。実施例4で調製した「PCDH−blank発現細胞」及び「PCDH−ZM2−2発現細胞」をそれぞれ、PBSで10細胞/5μlの懸濁液になるように調製した。75%のエタノールで消毒したヌードマウスに100μlの細胞懸濁液を接種した。(大泉門の右側に2mm、後ろ側に2mm離れた)細胞接種位置をマウス用の脳の定位固定装置を用いて決定した。注射の深さは3.5mmであり、その後0.6mm上昇させた。5μlの細胞溶液をそれぞれ、各マウスに注射した。注射後、マウスを更に1時間そのまま維持し、次に、従来の皮膚閉鎖を行った。頭蓋内腫瘍を観察した後、「PCDH−blank発現細胞」を用いて得た腫瘍を保有するマウスを「ベクターマウス(2)」と命名し、「PCDH−ZM2−2発現細胞」を用いて得た腫瘍を保有するマウスを「ZM2−2マウス(2)」と命名した。
マウスの脳を核磁気共鳴撮像により検出した。ベクターマウス(2)の頭蓋内腫瘍が、ZM2−2マウス(2)の頭蓋内腫瘍より明らかに小さいことが分かった。このように、本発明により提供される融合タンパク質の発現は、マウスにおける神経膠芽腫の腫瘍形成の明白な増強につながったことが証明される。結果を、パネル7A及び7Bにそれぞれ示す。
8匹のベクターマウス(2)及び8匹のZM2−2マウス(2)にそれぞれ、式Aで表される化合物を50mg/kg体重/日の用量で投与した。この化合物を強制栄養により1日に1回投与した。同時に、対照グループとして、8匹のZM2−2マウス(2)の別のグループに、通常の生理食塩水を投与した。この実験を6週間にわたり継続した。結果は、図6に示すように、通常の生理食塩水をのみを投与したZM2−2マウス(2)が20日目から徐々に死亡したが、一方で式Aで表される化合物を投与したベクターマウス(2)は全て生存しており、式Aで表される化合物の投与により、ZM2−2マウス(2)の生存期間が明らかに延びたことを示した。
式Aで表される化合物を投与したZM2−2マウス(2)の脳を、式Aで表される化合物を最初に投与した後16日目に、核磁気共鳴撮像により検出した。頭蓋内腫瘍が明らかに小さくなったことが分かった。パネル7Cを参照のこと。同様に、式Aで表される化合物が、ZM2−2マウスにおける腫瘍の増殖を明白に阻害できることが証明される。
別の8匹のZM2−2マウス(2)にもまた、式Aで表される化合物を50mg/kg体重/日の用量で投与した。この化合物を1日に1回、強制栄養により投与した。その後、最初の投与後16日目に化合物の投与を停止し、化合物の中止後10日目に核磁気共鳴撮像により脳を検出した。腫瘍が再び急速に増殖し始めたことが分かった。結果をパネル7Dに示す。
上述の実験結果によると、式Aで表される化合物が、本発明により提供される融合タンパク質を発現する神経膠芽腫の増殖を有意に阻害でき、患者の生存を延長できること、及び神経膠芽腫は上記化合物を停止した後に再発しやすいことが確認できる。式Aで表される化合物の腫瘍阻害作用は、クリゾチニブの腫瘍阻害作用よりもはるかに強力であり、従って、上記化合物をクリゾチニブの代替として使用できる。
更に、本発明の融合タンパク質を発現する神経膠芽腫の症例の生存期間の中央値が、他の報告されている神経膠芽腫の症例の生存期間の中央値よりも短いことが証明されており、これは、神経膠芽腫の中でも、融合タンパク質を発現する神経膠芽腫の症例が予後不良であることを意味する。予後不良であるこのような神経膠芽腫の亜型に関して、式Aで表される化合物は、c−Met阻害剤として機能できる他の化合物、及びクリゾチニブと比較して優れた治療効果を発揮できる。
本発明の実施形態に関する上の説明は、本発明の限定を意図したものではなく、当業者は、本発明に従って様々な変更及び変形を実施でき、これらは本発明の精神から逸脱することなく本発明の保護範囲に含まれる。

Claims (9)

  1. 式A:
    Figure 2019505581
    で表される化合物の、神経膠腫の治療用の薬剤の製造における使用。
  2. 前記神経膠腫は神経膠芽腫であることを特徴とする、請求項1に記載の使用。
  3. 前記神経膠腫は二次性神経膠芽腫であることを特徴とする、請求項1又は2に記載の使用。
  4. 前記二次性神経膠芽腫は、融合タンパク質を発現する二次性神経膠芽腫の亜型であり、
    前記融合タンパク質は、PTPRZ1のエキソン1、エキソン1〜2、エキソン1〜3、又はエキソン1〜8から翻訳されるタンパク質部分を、c−Metのエキソン2〜24から翻訳されるタンパク質部分に対して融合することにより形成され、
    PTPRZ1の前記タンパク質部分は、c−Metの前記タンパク質部分のN末端に配置される
    ことを特徴とする、請求項3に記載の使用。
  5. 前記融合タンパク質は、配列番号1で示されるアミノ酸配列を含み;
    好ましくは、前記融合タンパク質は、配列番号2で示されるアミノ酸配列を更に含み;
    より好ましくは、前記融合タンパク質はN末端に、配列番号1で示されるアミノ酸配列及び配列番号2で示されるアミノ酸配列を含む
    ことを特徴とする、請求項3又は4に記載の使用。
  6. 前記融合タンパク質は、配列番号3、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6で示されるアミノ酸配列を含み;
    好ましくは、前記融合タンパク質の前記アミノ酸配列は、配列番号3、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6で示されるものである
    ことを特徴とする、請求項3〜5のいずれか1項に記載の使用。
  7. 前記二次性神経膠芽腫は、融合転写物を含有する二次性神経膠芽腫の亜型であり、
    前記融合転写物は、PTPRZ1のエキソン1、エキソン1〜2、エキソン1〜3、又はエキソン1〜8から転写される1つのRNA部分と、c−Metのエキソン2〜24から転写される1つのRNA部分とを連結することにより形成され、
    PTPRZ1の前記RNA部分は、c−Metの前記RNA部分の5’末端に配置される
    ことを特徴とする、請求項3に記載の使用。
  8. 前記融合転写物は、配列番号1で示されるアミノ酸配列をコードするRNA配列を含み;
    好ましくは、前記融合転写物は、配列番号2で示されるアミノ酸配列をコードするRNA配列を更に含み;
    より好ましくは、前記融合転写物は5’末端に、配列番号1で示されるアミノ酸配列をコードする1つのRNA配列、及び配列番号2で示されるアミノ酸配列をコードする1つのRNA配列を含む
    ことを特徴とする、請求項7に記載の使用。
  9. 前記融合転写物は、配列番号3、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6で示されるアミノ酸配列をコードする1つのRNA配列を含み;
    好ましくは、前記融合転写物のヌクレオチド配列は、配列番号3、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6で示されるアミノ酸配列をコードする1つのRNA配列からなる
    ことを特徴とする、請求項7又は8に記載の使用。
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