JP2018532384A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2018532384A5 JP2018532384A5 JP2018511420A JP2018511420A JP2018532384A5 JP 2018532384 A5 JP2018532384 A5 JP 2018532384A5 JP 2018511420 A JP2018511420 A JP 2018511420A JP 2018511420 A JP2018511420 A JP 2018511420A JP 2018532384 A5 JP2018532384 A5 JP 2018532384A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- lsp
- compound
- assay system
- enzyme
- surfactant
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims 20
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 14
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 14
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 claims 12
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims 12
- 230000001580 bacterial Effects 0.000 claims 8
- 230000003197 catalytic Effects 0.000 claims 8
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims 8
- 230000024881 catalytic activity Effects 0.000 claims 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 7
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 claims 7
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 claims 5
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 4
- NLEBIOOXCVAHBD-QKMCSOCLSA-N dodecyl β-D-maltoside Chemical group O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](OCCCCCCCCCCCC)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 NLEBIOOXCVAHBD-QKMCSOCLSA-N 0.000 claims 4
- 102000037240 fusion proteins Human genes 0.000 claims 4
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims 4
- 108090000233 Signal peptidase II Proteins 0.000 claims 3
- 101700061446 TTC8 Proteins 0.000 claims 3
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims 2
- 238000002825 functional assay Methods 0.000 claims 2
- 101700022040 his-42 Proteins 0.000 claims 2
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 claims 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims 2
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 2
- 206010060945 Bacterial infection Diseases 0.000 claims 1
- 230000036499 Half live Effects 0.000 claims 1
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 claims 1
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 claims 1
- 210000002966 Serum Anatomy 0.000 claims 1
- 230000000844 anti-bacterial Effects 0.000 claims 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 claims 1
- 201000009910 diseases by infectious agent Diseases 0.000 claims 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 1
- 150000002611 lead compounds Chemical class 0.000 claims 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 claims 1
- 108010003574 phosphatidylglycerol glyceryl transferase Proteins 0.000 claims 1
- 230000002194 synthesizing Effects 0.000 claims 1
Claims (39)
- リポタンパク質シグナルペプチダーゼ(Lsp)の触媒活性を測定するためのアッセイ系であって、(a)組換え発現され、可溶性の、精製されたLsp酵素および(b)Lsp基質を含む、アッセイ系。
- 前記Lspが、細菌Lspである、請求項1に記載のアッセイ系。
- 前記Lspが、大腸菌Lspである、請求項2に記載のアッセイ系。
- 前記Lspが、Hisタグ付き融合タンパク質として発現する、請求項1に記載のアッセイ系。
- 前記Hisタグ付き融合タンパク質がN末端His6タグを含む、請求項4に記載のアッセイ系。
- 前記Lspが、界面活性剤によって可溶化されている、請求項1に記載のアッセイ系。
- 前記界面活性剤が、n−ドデシルβ−D−マルトシド(DDM)である、請求項6に記載のアッセイ系。
- 前記基質が、ペプチド、ペプチド模倣物、または、脂質修飾システイン残基を含有するタンパク質である、請求項1に記載のアッセイ系。
- 前記基質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)ドナー−アクセプター対で標識されている、請求項1に記載のアッセイ系。
- リポタンパク質シグナルペプチダーゼ(Lsp)を阻害する作用剤を同定する方法であって、(a)組換え産生され、精製されたLspとLsp基質とを被験化合物の存在下で接触させる工程、および(b)1または複数の前記被験化合物による前記基質のLsp切断の阻害を検出し、それにより、前記リポタンパク質シグナルペプチダーゼ(Lsp)を阻害する作用剤を同定する工程を含む、方法。
- 前記Lspが、細菌Lspである、請求項10に記載の方法。
- 前記Lspが、大腸菌Lspである、請求項11に記載の方法。
- 前記Lspが、Hisタグ付き融合タンパク質である、請求項10に記載の方法。
- 前記Hisタグ付き融合タンパク質がN末端His6タグを含む、請求項14に記載の方法
- 前記Lspが、界面活性剤によって可溶化される、請求項10に記載の方法。
- 前記界面活性剤が、n−ドデシルβ−D−マルトシド(DDM)である、請求項16に記載の方法。
- 前記基質が、ペプチド、ペプチド模倣物、または、脂質修飾システイン残基を含有するタンパク質である、請求項10に記載の方法。
- 前記基質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)ドナー−アクセプター対で標識されている、請求項10に記載の方法。
- Lsp触媒活性が蛍光共鳴エネルギー移動によって検出される、請求項10に記載の方法。
- ハイスループット形式で実施される、請求項10に記載の方法。
- 前記被験化合物が小さい有機化合物である、請求項10に記載の方法。
- 前記同定された作用剤を殺菌活性について調べることをさらに含む、請求項10に記載の方法。
- 前記同定された作用剤を、細菌リポタンパク質ジアシルグリセリルトランスフェラーゼ(Lgt)を阻害する能力について調べることをさらに含む、請求項10に記載の方法。
- 細菌細胞においてLsp触媒活性を阻害するための方法であって、前記細胞に存在するLspを化合物に阻害させる条件下で、前記細菌細胞をLsp阻害化合物と接触させる工程を含み、前記Lsp阻害化合物が、Compound SR−010000270728−1、Compound BBS−8またはCompound BBS−20、またはそれらの機能性変異体である、方法、但し、ヒト対象の内部に存在している細菌細胞内のLsp触媒活性を阻害するための方法は除く。
- 前記細菌細胞が、非ヒト対象の内部に存在している、請求項24に記載の方法。
- 前記非ヒト対象が、前記細菌細胞による感染症に罹患している、請求項25に記載の方法。
- 前記対象が、治療上有効な量の前記Lsp阻害化合物を投与される、請求項25に記載の方法。
- Compound SR−010000270728−1、Compound BBS−8またはCompound BBS−20、またはそれらの機能性変異体を含む、対象体内において細菌感染症を治療するための医薬組成物。
- 前記対象がヒトである、請求項28に記載の医薬組成物。
- アッセイ系の触媒活性を測定することの可能な、活性界面活性剤で可溶化された膜貫通酵素を生成する方法であって、(a)前記活性膜貫通酵素を発現することの可能な発現ベクターを構築する工程;(b)前記活性膜貫通酵素を前記ベクターから発現させる工程;
および(c)界面活性剤に基づく系において前記活性膜貫通酵素を可溶化し精製し、それにより、アッセイ系の触媒比活性を測定することの可能な、活性膜貫通界面活性剤で可溶化された酵素を生成する工程を含む、方法。 - 前記膜貫通酵素がLspである、請求項30に記載の方法。
- 前記酵素の触媒活性を測定するためのアッセイにおける請求項30に従って生成された
前記膜貫通酵素の使用。 - 前記膜貫通酵素の特異的阻害剤を同定するためのハイスループットスクリーニングにお
ける、請求項30に従って生成された前記膜貫通酵素の使用。 - 前記膜貫通酵素がLspである、請求項33に従って生成された前記膜貫通酵素の使用。
- 改良された特性を備えるLsp阻害化合物を同定するための方法であって、(a)リードLsp阻害化合物の1または複数の構造類似体を合成する工程;(b)機能アッセイを前記類似体に実施して、前記リード化合物のものと比較して改良された生物学的または薬学的特性を有する類似体を同定し、それにより、改良された特性を備えるLsp阻害化合物を同定する工程を含む、方法。
- 前記リードLsp阻害化合物が、Compound SR−010000270728−1、Compound BBS−8、Compound BBS−20、またはそれらの機能性変異体である、請求項35に記載の方法。
- 前記改良された生物学的または薬学的特性が、Lsp触媒活性の阻害の向上である、請求項35に記載の方法。
- 前記機能アッセイが、精製され、界面活性剤で可溶化されたLsp酵素を用いる、請求項37に記載の方法。
- 前記改良された生物学的または薬学的特性が、安定性または血清半減期の増加である、請求項35に記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201562214695P | 2015-09-04 | 2015-09-04 | |
US62/214,695 | 2015-09-04 | ||
PCT/US2016/049869 WO2017040762A2 (en) | 2015-09-04 | 2016-09-01 | Methods for identifying novel antibiotics and related compositions |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2018532384A JP2018532384A (ja) | 2018-11-08 |
JP2018532384A5 true JP2018532384A5 (ja) | 2019-10-03 |
Family
ID=58189060
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018511420A Pending JP2018532384A (ja) | 2015-09-04 | 2016-09-01 | 新規な抗生物質を同定するための方法および関連組成物 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20190144912A1 (ja) |
EP (1) | EP3344043A4 (ja) |
JP (1) | JP2018532384A (ja) |
CN (1) | CN108135181A (ja) |
CA (1) | CA2997530A1 (ja) |
WO (1) | WO2017040762A2 (ja) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2019010165A1 (en) * | 2017-07-05 | 2019-01-10 | The Scripps Research Institute | BENZAMIDE-TYPE INHIBITORS OF PEPTIDE PEPTIDE SIGNAL OF BACTERIAL LIPOPROTEINS |
EP3587382A1 (en) | 2018-06-28 | 2020-01-01 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Click-mass spectrometry of alkyne-labeled compounds |
Family Cites Families (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS62236494A (ja) * | 1986-04-08 | 1987-10-16 | Sumitomo Chem Co Ltd | シグナルペプチダ−ゼに対するモノクロ−ナル抗体、およびそれを産生するハイブリド−マ |
CA2032914A1 (en) * | 1989-12-26 | 1991-06-27 | Peter C.K. Lau | Use of bacterial lipoprotein amino terminus in fusion plasmids for in vivo expression of lipid modified polypeptides |
US7888005B2 (en) * | 2003-02-12 | 2011-02-15 | The Curators Of The University Of Missouri | Inhibitors of macromolecular activity |
FR2890446B1 (fr) * | 2005-09-05 | 2008-04-18 | Cis Bio Internat Sa | Methode de detection d'interaction intracellulaire entre bio-molecules |
JP5431339B2 (ja) * | 2007-10-10 | 2014-03-05 | ジボダン エス エー | 酵素学的方法および酵素 |
WO2011034622A2 (en) * | 2009-09-21 | 2011-03-24 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Inducible self-cleaving protease tag and method of purifying recombinant proteins using the same |
WO2012033831A2 (en) * | 2010-09-07 | 2012-03-15 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | Methods and compositions for gamma-secretase assay |
GB201222833D0 (en) * | 2012-12-18 | 2013-01-30 | Isis Innovation | Detection of membrane proteins |
US20140287447A1 (en) * | 2013-03-14 | 2014-09-25 | Ronald R. Fiscus | Ultrasensitive methodology for quantifying the kinase catalytic activity of any protein kinase in biological/clinical samples or recombinant/purified proteins using near-infrared-fluorescence (NIRF)-labeled, kinase-selective peptide substrates and a combination of kinase-selective inhibitors to define individual kinase activity |
-
2016
- 2016-09-01 JP JP2018511420A patent/JP2018532384A/ja active Pending
- 2016-09-01 WO PCT/US2016/049869 patent/WO2017040762A2/en active Application Filing
- 2016-09-01 CA CA2997530A patent/CA2997530A1/en not_active Abandoned
- 2016-09-01 EP EP16842970.2A patent/EP3344043A4/en not_active Withdrawn
- 2016-09-01 CN CN201680058081.8A patent/CN108135181A/zh active Pending
- 2016-09-01 US US15/756,741 patent/US20190144912A1/en not_active Abandoned
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Kitamura et al. | Expedited approach toward the rational design of noncovalent SARS-CoV-2 main protease inhibitors | |
Mensa et al. | Comparative mechanistic studies of brilacidin, daptomycin, and the antimicrobial peptide LL16 | |
Bogyo et al. | Selective targeting of lysosomal cysteine proteases with radiolabeled electrophilic substrate analogs | |
Behnam et al. | Discovery of nanomolar dengue and West Nile virus protease inhibitors containing a 4-benzyloxyphenylglycine residue | |
Ogilvie et al. | Peptidomimetic inhibitors of the human cytomegalovirus protease | |
Weigel et al. | Phenylalanine and phenylglycine analogues as arginine mimetics in dengue protease inhibitors | |
Breuning et al. | Michael acceptor based antiplasmodial and antitrypanosomal cysteine protease inhibitors with unusual amino acids | |
Ghosh et al. | Structure-based design, synthesis, and biological evaluation of a series of novel and reversible inhibitors for the severe acute respiratory syndrome− coronavirus papain-like protease | |
Loregian et al. | Selective anti-cytomegalovirus compounds discovered by screening for inhibitors of subunit interactions of the viral polymerase | |
Bastos et al. | Prolyl oligopeptidase of Trypanosoma brucei hydrolyzes native collagen, peptide hormones and is active in the plasma of infected mice | |
Behnam et al. | C-terminal residue optimization and fragment merging: discovery of a potent peptide-hybrid inhibitor of dengue protease | |
Tausch et al. | Identification of human cathepsin G as a functional target of boswellic acids from the anti-inflammatory remedy frankincense | |
US20160297851A1 (en) | Broad spectrum antibiotic arylomycin analogs | |
MD Bastos et al. | Parasite prolyl oligopeptidases and the challenge of designing chemotherapeuticals for Chagas disease, leishmaniasis and African trypanosomiasis | |
Torres et al. | Asparagine deprivation mediated by Salmonella asparaginase causes suppression of activation-induced T cell metabolic reprogramming | |
US20130281360A1 (en) | Broad spectrum antibiotic arylomycin analogs | |
JP2010506166A (ja) | デング熱の診断及び治療 | |
US20240083885A1 (en) | Compositions and methods for inhibiting m pro protease activity and for preventing and treating sars-cov-2 infection | |
US8187874B2 (en) | Drug discovery method | |
Kühl et al. | A new class of dengue and West Nile virus protease inhibitors with submicromolar activity in reporter gene DENV-2 protease and viral replication assays | |
Osman et al. | Why all the fury over furin? | |
Weisshaar et al. | Identification and characterization of influenza virus entry inhibitors through dual myxovirus high-throughput screening | |
JP2018532384A5 (ja) | ||
Ortega-Pierres et al. | Giardia duodenalis: Role of secreted molecules as virulent factors in the cytotoxic effect on epithelial cells | |
Xu et al. | A commensal dipeptidyl aminopeptidase with specificity for N-terminal glycine degrades human-produced antimicrobial peptides in vitro |