JP2018525324A - 先天性振戦に対するペスチウイルスワクチン - Google Patents

先天性振戦に対するペスチウイルスワクチン Download PDF

Info

Publication number
JP2018525324A
JP2018525324A JP2017561377A JP2017561377A JP2018525324A JP 2018525324 A JP2018525324 A JP 2018525324A JP 2017561377 A JP2017561377 A JP 2017561377A JP 2017561377 A JP2017561377 A JP 2017561377A JP 2018525324 A JP2018525324 A JP 2018525324A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
pestivirus
composition
seq
inactivated
pestiviruses
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
JP2017561377A
Other languages
English (en)
Other versions
JP7046607B2 (ja
Inventor
ビクトリア，ジョセフ・ギルバート
パターソン，アビー・レイ
ビセク，カリー・アン
アイアー，アルン・ブイ
ホッブス，リー・アン
アルーダ，ベイリー・ローレン
アルーダ，パウロ・エンリケ・エリアス
マクシュタット，ドリュー・ロバート
シューウォーツ，ケント・ジェイ
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH
Iowa State University Research Foundation ISURF
Original Assignee
Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH
Iowa State University Research Foundation ISURF
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=56889250&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=JP2018525324(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH, Iowa State University Research Foundation ISURF filed Critical Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH
Publication of JP2018525324A publication Critical patent/JP2018525324A/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP7046607B2 publication Critical patent/JP7046607B2/ja
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/12—Viral antigens
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/08—Antiepileptics; Anticonvulsants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/525—Virus
    • A61K2039/5252—Virus inactivated (killed)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/54—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the route of administration
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/545—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the dose, timing or administration schedule
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/55—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the host/recipient, e.g. newborn with maternal antibodies
    • A61K2039/552—Veterinary vaccine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
    • C12N2770/00011—Details
    • C12N2770/24011—Flaviviridae
    • C12N2770/24311—Pestivirus, e.g. bovine viral diarrhea virus
    • C12N2770/24334—Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Abstract

本発明は、新規ペスチウイルスに関連する疾患から仔ブタを保護するためのワクチンに関する。ワクチンは、通常、ペスチウイルス抗原、および場合によりアジュバントを含む。先天性振戦を非限定的に含めたペスチウイルスに関連する疾患からブタを保護する方法、およびペスチウイルスワクチンを製造する方法もまた提供される。

Description

発明の詳細な説明
関連出願
本出願は、２０１５年８月３１日に出願された米国特許出願第６２／２１２，１２４号の利益を主張するものであり、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
背景
Ａ．技術分野
本発明は、先天性振戦（ＣＴ）すなわち先天性ミオクローヌスの臨床兆候を軽減することのできるペスチウイルスワクチンに関する。その症状は、略式には、震える仔ブタ、震え仔ブタまたは振戦する仔ブタとして知られている。
ペスチウイルスはフラビウイルス科のウイルス属である。ペスチウイルス属のウイルスは、イノシシ科のメンバー（様々な種のブタを含む）を含めた哺乳動物に感染する。
ＣＴは、新生ブタに見られる散発性疾患である。大抵は、同腹の２匹以上のブタが罹患している。振戦が大き過ぎるために仔ブタが乳首を見つけて哺乳することができない場合には、死亡率が高くなることがある。罹患した同腹仔、または群れの流行発生において、死亡率は標準値を３〜１０％上回る可能性がある。症状は、罹患した仔ブタが成長するにつれて減少する。
ＣＴは５つの型に分類される。ＡＩ型、ＡＩＩＩ型、ＡＩＶ型およびＡＶ型は、古典的なブタ熱ウイルス、遺伝形質、またはトリクロルホンへの曝露に関係している。これらの原因は既知であり、それゆえ回避されるため、ＡＩＩ型が最も一般的な原因であると仮定される。ＡＩＩ型はウイルス感染との関連があると考えられている。第２群での原因ウイルスは、全てではないにしてもほとんどのブタ集団に広まっているが、おそらく雌ブタの群れに免疫が確立されているために、ほとんどの群れでは疾患がほとんど見られない。しかし、新しい未経産の群れでは、第１回目の経産の間に全腹の多くて８０％を巻き込んだ大規模な流行発生の可能性がある。どの新しい群れでも、これは数値化不可能な危険性である。
ブタが振戦しながら生まれる原因は、脳および脊髄の低髄鞘形成または脱髄の原発病変から派生している。この症状に対する特別な処置はない。しかし、哺乳補助ならびに、冷えおよび重なり合いを回避できる環境の提供は、離乳時体重が１ｋｇ以上落ちるかもしれないものの、より多くのブタが時間とともに回復するのを可能にする。
Ｂ．関連技術分野の説明
１型および２型のブタサーコウイルスへの感染（Ｂｕｒｎｂｏｒｇら、「Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｏｆ ｍｙｏｃａｒｄｉｔｉｓ ｗｉｔｈ ｈｉｇｈ ｖｉｒａｌ ｌｏａｄ ｏｆ ｐｏｒｃｉｎｅ ｃｉｒｃｏｖｉｒｕｓ ｔｙｐｅ ２ Ｉｎ ｓｅｖｅｒａｌ ｔｉｓｓｕｅｓ ｉｎ ｃａｓｅｓ ｏｆ ｆｅｔａｌ ｄｅａｔｈ ａｎｄ ｈｉｇｈ ｍｏｒｔａｌｉｔｙ ｉｎ ｐｉｇｌｅｔｓ．Ａ ｃａｓｅ ｓｔｕｄｙ．」Ｊ Ｖｅｔ Ｄｉａｇｎ Ｉｎｖｅｓｔ．１９（４）：３６８−３７５、２００７参照）、またはアストロウイルス（Ｂｌｏｍｓｔｒｏｍら、「Ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ ａｓ ａ ｐｏｓｓｉｂｌｅ ｃａｕｓｅ ｏｆ ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ ｔｒｅｍｏｒ ｔｙｐｅ ＡＩＩ ｉｎ ｐｉｇｌｅｔｓ？」 Ａｃｔａ Ｖｅｔ Ｓｃａｎｄ．５６（１）：８２、２０１４参照）は、ＣＴの原因であることが初期に報告されていたが、以後にこれは誤りであることが証明された（Ｈａら、「Ｌａｃｋ ｏｆ ｅｖｉｄｅｎｃｅ ｏｆ ｐｏｒｃｉｎｅ ｃｉｒｃｏｖｉｒｕｓ ｔｙｐｅ １ ａｎｄ ｔｙｐｅ ２ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ｉｎ ｐｉｇｌｅｔｓ ｗｉｔｈ ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ ｔｒｅｍｏｒｓ ｉｎ Ｋｏｒｅａ」、Ｖｅｔ Ｒｅｃ．（２００５）１５６：３８３−３８４；Ｋｅｎｎｅｄｙら、「Ａｂｓｅｎｃｅ ｏｆ ｅｖｉｄｅｎｃｅ ｏｆ ｐｏｒｃｉｎｅ ｃｉｒｃｏｖｉｒｕｓ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ｉｎ ｐｉｇｌｅｔｓ ｗｉｔｈ ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ ｔｒｅｍｏｒｓ」Ｊ Ｖｅｔ Ｄｉａｇｎ Ｉｎｖｅｓｔ．２００３ Ｍａｒ；１５（２）：１５１−１５６参照）。このように、仔ブタのＡＩＩ型ＣＴの明確な病原体供給源は存在せず、それゆえ、この症状の有効な処置は存在しない。
概要
上記技術的課題の解決は、特許請求の範囲の記載およびその中で描写される実施形態によって達成される。したがって、本発明は、その様々な態様において、特許請求の範囲に従って実施される。
本発明は、当該技術分野における欠点を克服する免疫原性組成物、ワクチンおよび関連する方法を提供する。組成物および方法は、仔ブタの先天性振戦に対する処置を提供する。
一態様では、本発明の組成物は、配列番号１に対して少なくとも約９５％の同一性、例えば、少なくとも約９６％、９７％、９８％、または少なくとも約９９％、例えば１００％の同一性を有する核酸配列を含む不活化ペスチウイルスを含むことができる。別の態様では、本開示は、配列番号２に対して少なくとも約９５％の同一性、例えば、少なくとも約９６％、９７％、９８％、または少なくとも約９９％、例えば１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含む不活化ペスチウイルスを含む組成物を提供する。
本発明の組成物のいくつかの実施形態において、ペスチウイルスは、化学的に不活化されたペスチウイルス、例えば、バイナリーエチレンイミン、エチレンイミン、アセチルエチレンイミン、ベータエチレンイミン、ベータプロピオラクトン、グルタルアルデヒド、オゾンおよび／またはホルムアルデヒドなどの不活化剤による処理によって不活化されているペスチウイルスである。
いくつかの実施形態において、ペスチウイルスは、物理的に不活化されたペスチウイルス、例えば、ＵＶ照射、Ｘ線照射、ガンマ線照射、凍結融解および／または加熱による処理によって不活化されているペスチウイルスである。
別の態様では、本明細書で提供される組成物は、配列番号１に対して少なくとも約９５％の同一性、例えば、少なくとも約９６％、９７％、９８％、または少なくとも約９９％、例えば１００％の同一性を有する核酸配列を含む弱毒化ペスチウイルスを含むことができる。別の態様では、組成物は、配列番号２に対して少なくとも約９５％の同一性、例えば、少なくとも約９６％、９７％、９８％、または少なくとも約９９％、例えば１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含む弱毒化ペスチウイルスを含む組成物を含むことができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のペスチウイルスは凍結乾燥形態であることができる。一実施形態では、組成物は少なくとも約１０４個のウイルス粒子、例えば、少なくとも約１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９個、または少なくとも約１０１０個のウイルス粒子を有する。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、薬学的に許容可能なキャリアおよび／または賦形剤、例えばアジュバント、例えば水中油エマルジョン系のアジュバントを含むことができる。
いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に記載の不活化ペスチウイルスと弱毒化ペスチウイルスとの混合物を含むことができる。本開示はまた、本明細書に記載の不活化ペスチウイルスと弱毒化ペスチウイルスとベクターとの混合物を含む組成物を特徴とする。
さらに別の態様では、本開示は、配列番号３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９または２１に対して少なくとも約９５％（例えば、少なくとも約９６％、９７％、９８％または９９％）の同一性を有する少なくとも１つの核酸配列、例えば、配列番号３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９または２１に対して１００％の同一性を有する少なくとも１つの核酸配列を含むベクター、例えばバキュロウイルス発現ベクターまたはイヌアデノウイルスベクターを含む組成物を提供する。別の態様において、本開示は、配列番号４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０または２２に対して少なくとも約９５％（例えば、少なくとも約９６％、９７％、９８％または９９％）の同一性を有するアミノ酸配列をコードする少なくとも１つの配列、例えば、配列番号４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０または２２に対して１００％の同一性を有するアミノ酸配列をコードする少なくとも１つの配列を含むベクターを含む組成物を特徴とする。いくつかの実施形態では、組成物は、上記ベクターの混合物を含み得る。
ペスチウイルスに関連する疾患、例えば先天性振戦から仔ブタを保護する方法もまた提供される。方法は、妊娠中の雌ブタもしくは未経産ブタ、または繁殖前の雌ブタもしくは未経産ブタ、または新生仔ブタに、仔ブタを保護するのに十分な量の本明細書に記載のいずれかの組成物を投与することを含むことができる。
いくつかの実施形態では、方法は、雌ブタまたは未経産ブタに組成物を筋肉内、皮下、静脈内、経口、動脈内、（例えば吸入を用いるかまたは用いない）鼻腔内、心臓内、髄腔内、胸腔内、腹腔内、心室内、舌下、経皮および／または吸入により投与することを含む。一実施形態では、投与は第１の投与であり、方法は、第１の投与から１〜３週間後の第２の投与を含む。
いくつかの態様では、本開示は、本明細書に記載のいずれかの組成物、例えば、医薬としての使用または医薬の製造における使用のための不活化ペスチウイルス、弱毒化ペスチウイルスおよび／またはベクターを含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物は、ペスチウイルスに関連する疾患、例えば先天性振戦から仔ブタを保護するためのものである。
本発明は、系統発生学的に中国コウモリペスチウイルスに最も近い、本発明の不活化ペスチウイルスワクチンまたは改変生ペスチウイルスワクチンに関する。図１および図２は、本発明のペスチウイルスの系統樹を特定するものである。アミノ酸近接結合樹は、ペスチウイルス間で部分ゲノム配列と完全ゲノム配列とが重複していたＮＳ３の２１２個のアミノ酸に基づいている。多様性のレベルは新種のペスチウイルスと一致する。ペスチウイルスは、図３に示すように、識別された分離株同士ではヌクレオチドレベルで８３〜９８％保存されている。
本発明のペスチウイルスは、そのようなワクチンの製造に使用することができる。特に、本発明は、以下で識別される改良されたペスチウイルス分離株、または上記分離株のうちの１つの任意の子孫もしくは派生体を提供する。
本発明のペスチウイルスは、改変ウイルスをブタまたはＣＴに罹患しやすいその他の哺乳動物に投与した場合に、ＣＴ疾患の臨床兆候は引き起こせないがペスチウイルスの病原形に対して哺乳動物を免疫化する免疫応答を誘導することはできるように、ウイルスを細胞培養において少なくとも４回継代することによって弱毒化することができる、ということを特徴とすることができる。
本発明のペスチウイルス分離株は、試験管内で１０回より多く、好ましくは少なくとも２０回、さらにより好ましくは少なくとも３０回、さらにいっそう好ましくは少なくとも４０回、さらにより好ましくは少なくとも５０回、さらにいっそう好ましくは少なくとも５５回、さらにより好ましくは少なくとも６０回、さらにいっそう好ましくは少なくとも７０回、さらにより好ましくは少なくとも８０回、さらにいっそう好ましくは少なくとも９０回、さらにより好ましくは少なくとも９５回、最も好ましくは少なくとも１００回、細胞培養物中で継代することができる。
ワクチンは、皮内または筋肉内への適用に適したキャリアを含み得ることが企図される。いくつかの実施形態では、ワクチンは凍結乾燥形態である。特定の実施形態では、ワクチンは、少なくとも約１０４個のウイルス粒子を含む。本発明は、当該技術分野における欠点を克服する免疫原性組成物、ワクチンおよび関連する方法を提供する。本発明は、不活化ペスチウイルスまたは改変生弱毒化ペスチウイルスを含む免疫原性組成物に関する。さらなる免疫原性組成物は、組換えにより発現されるかまたはベクターの土台の一部として送達されるサブゲノム抗原を含むワクチンを含む。特に、本出願は、本発明のペスチウイルスの分離株に関連する疾患からブタ、特に仔ブタを保護するためのワクチンを提供する。
本発明の別の態様は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９または２１に示す配列に対して少なくとも約９５％、例えば、少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有する核酸配列を含むペスチウイルスに関する。
本発明の別の態様は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０または２２に示す配列に対して少なくとも約９５％の同一性、例えば、少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むペスチウイルスに関する。
本発明の別の態様は、本明細書に記載の不活化ペスチウイルスまたは弱毒化生ペスチウイルスを薬学的に許容可能なキャリアと混合することを含む、先天性振戦に対抗するための不活化ワクチンまたは弱毒化生ワクチンの調製方法に関する。
本発明の免疫原性組成物およびワクチンは、不活化ペスチウイルスまたは改変生ペスチウイルスを含み、アジュバントも含み得る。ワクチンはまた、その他の成分、例えば、（１つ以上の）保存剤、（１つ以上の）安定剤および、他のブタ病原体に対する抗原を含んでもよい。
当業者であれば、本明細書において使用される組成物には、注射可能な生理学的に許容可能な既知の滅菌溶液が組み込まれてもよいことを理解するであろう。非経口的な注射または点滴のための使用準備済溶液を調製するために、水性等張溶液、例えば生理食塩水または血漿タンパク質溶液を容易に入手できる。さらに、本発明の免疫原性組成物およびワクチン組成物は、薬学的または獣医学的に許容可能なキャリア、希釈剤、等張剤、安定化剤またはアジュバントを含むことができる。
本発明の方法はまた、本発明の組成物を獣医学的に許容可能なキャリア、アジュバント、またはそれらの組み合わせと混合することを含み得る。当業者であれば、キャリア、アジュバントまたは組み合わせの選択は、送達経路、個人的好み、そして何よりも動物種によって判断されるであろうことを理解するであろう。
本発明の別の態様は、本発明の不活化ペスチウイルスまたは弱毒化生ペスチウイルスと薬学的に許容可能なキャリアとを含む、ペスチウイルス感染からブタを保護するためのワクチンを企図する。
そのようなワクチンはさらに、非ペスチウイルスまたは、本発明のペスチウイルスとは異なるペスチウイルス、それらの弱毒化もしくは不活化された病原体、またはそれらの抗原性物質を１つ以上含むことが有益であり得る。例えば、非ペスチウイルス病原体は、仮性狂犬病ウイルス、ブタインフルエンザウイルス、ブタパルボウイルス、伝染性胃腸炎ウイルス、大腸菌、ブタ丹毒菌、気管支敗血症菌、ブタコレラ菌、ブタパラインフルエンザ菌、パスツレラ・ムルトシダ、ブタ連鎖球菌、マイコプラズマ・ハイオニューモニエ・ブタサーコウイルス、例えば、限定はしないが、２型ブタサーコウイルス（ＰＣＶ２）、ブタ繁殖・呼吸障害症候群（ＰＲＲＳ）およびアクチノバチルス・プルロニューモニアから選択され得る。
ペスチウイルスによって引き起こされる感染の処置または予防のための方法もまた開示される。方法は、有効量の本発明の免疫原性組成物を動物、具体的には妊娠中の雌ブタまたは未経産ブタに投与することを含み、それによって上記処置または予防が仔ブタに提供される、方法である。処置または予防は、ＣＴ感染の兆候を軽減すること、ＣＴ感染の臨床兆候の重症度または発症率を低減すること、ＣＴ感染による動物の死亡率を低減すること、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される。
本明細書において、適する被験体および、本発明の組成物が投与され得ることを必要とする被験体としては、例えば、ウイルス、微生物、寄生虫、原生動物、細菌または真菌に関連する感染症、疾患または症状の予防または処置のどちらかを必要とする動物が挙げられる。免疫応答が本発明の組成物または方法の使用によって刺激される動物としては、例えば家畜、例えば、ブタ、ウシ、ヤギおよびヒツジが挙げられる。好ましい動物としては、例えば、ブタ、ネズミ科、ウマ類、ウサギ類およびウシ属が挙げられる。最も好ましくは、免疫応答は、ブタ、特に、雌ブタ、未経産ブタおよび仔ブタにおいて刺激される。
本発明は、ペスチウイルス感染の臨床徴候の発生率または重症度が、本明細書によって提供される免疫原性組成物を受けていない被験体に比べて少なくとも１０％、好ましくは少なくとも２０％、さらにより好ましくは少なくとも３０％、さらにいっそう好ましくは少なくとも５０％、さらにより好ましくは少なくとも７０％、最も好ましくは少なくとも１００％低減されるように、本明細書において提供される本発明の免疫原性組成物を投与するステップを含む、ペスチウイルス感染に関連するかまたはそれによって引き起こされる１つ以上の臨床兆候の発生率または重症度を低減する方法を提供する。そのような臨床兆候には、様々な程度での全身の振戦および震えが含まれる。仔ブタは、通常は震え、振戦およびうなずきを行いながら生まれ、活発な刺激はしばしば震えを誇張させる。仔ブタが眠りにつくと震えは止まる傾向がある。加えて、仔ブタが歩き回っているときの筋振戦、神経症状、協調の欠如、「犬座り」、および死亡率の上昇があり得る。場合によっては振戦が２４〜４８時齢まで露顕しないことがある。仔ブタへの影響としては、例えば哺乳への影響が挙げられ、深刻な場合には乳首への仔ブタの物理的保持が必要とされる。流行発生の深刻さに応じて死亡率のレベルは１５〜２０％になる可能性があり、より深刻な流行発生では３０〜４０％に至る可能性がある。臨床重症度のその他の尺度としては、例えば、一日増体重平均値の低下および神経学的損傷が挙げられる。
好ましい投与経路としては、例えば、鼻腔内、経口、皮内および筋肉内が挙げられる。筋肉内または膣内への投与、最も好ましくは単回投与であることが好ましい。本発明の組成物を多数回（例えば２回以上）用量で投与してもよく、他の投与経路または複数の投与経路によって投与してもよい、ということは当業者に認識されるであろう。例えば、そのような他の経路には、皮下、皮内、静脈内、血管内、動脈内、腹腔内、クモ膜下腔内、気管内、皮内、心臓内、葉内、髄内または肺内が含まれる。治療の所望の持続期間および有効性に応じて、本発明の組成物は、１回または数回、また断続的にも投与され得、例えば、様々な用量で毎日、数日間、数週間または数ヶ月間投与され得る。
非哺乳動物細胞に対する弱毒化生ペスチウイルスを調製する方法も企図される。
本発明の新規ワクチンは、特定の種類または調製方法に限定されない。これらのワクチンは、当該技術分野において既知の標準的な方法によって調製される。ペスチウイルスワクチンの最も好ましい送達は、未経産ブタまたは妊娠中の雌ブタに悪性のペスチウイルスに対する接種を行って母系免疫を仔ブタに移行させることである。
本発明のその他の目的、特徴および利点は、以下の詳細な説明から明らかになるであろう。しかしながら、詳細な説明および特定の実施例が本発明の好ましい実施形態を示しているが、単に例示として示されているに過ぎないことは、理解されるべきであり、というのも、この詳細な説明から本発明の趣旨内および範囲内での様々な変更および改変が当業者に明らかになるであろうからである。
以下の図面は、本明細書の一部を形成し、本発明の特定の態様をさらに実証するために含まれる。本発明は、本明細書中に提示される特定の実施形態の詳細な説明と組み合わせてこれらの図面のうちの１つ以上を参照することで、よりよく理解され得る。
図１（ＦＩＧ．１）は、本発明の新規ペスチウイルスを特定する系統樹を示す。 図２（ＦＩＧ．２）は、本発明の新規ペスチウイルスを特定する系統樹を示す。 図３（ＦＩＧ．３）は、本発明のペスチウイルス配列のアミノ酸同一性（パーセント同一性）の比較である。 図４（ＦＩＧ．４）は、実施例１で試験した仔ブタにおけるウイルス血症のサイクルを示す。 図５Ａ（ＦＩＧ．５Ａ）は、ペスチウイルスの系統学的関連を示す。ＣｌｕｓｔａｌＷマルチプルアラインメントにより整列させたペスチウイルスＮＳ３アミノ酸について１，０００回のブートストラップ標本化（ＭＥＧＡ６．０）を用いて発生させた近接結合系統樹。 図５Ｂ（ＦＩＧ．５Ｂ）は、ペスチウイルスの系統学的関連を示す。ＣｌｕｓｔａｌＷマルチプルアラインメントにより整列させたペスチウイルスＮｐｒｏアミノ酸について１，０００回のブートストラップ標本化（ＭＥＧＡ６．０）を用いて発生させた近接結合系統樹。各試料のＧｅｎＢａｎｋ受託番号は名前で示されている。丸は、この研究から示される配列を指し示し、三角は、接種に使用したこの研究で示されるウイルスからの配列を指し示す。 図６（ＦＩＧ．６）は、試料の種類別での陽性パーセントおよびＲＴ−ｑＰＣＲの平均Ｃｑを示す棒グラフである。ＮＳ３遺伝子を標的とするＲＴ−ｑＰＣＲによって検出されたペスチウイルスＲＮＡ。ＰＢＳを接種された仔ブタにはウイルスＲＮＡが検出されなかった。 図７（ＦＩＧ．７）は、不活化ペスチウイルスが、ワクチン接種された仔ブタにおいてペスチウイルス特異的な血清学的応答を誘導したことを示すグラフである。
詳細な説明
本発明は、雌ブタまたは未経産ブタに投与してそれらの仔ブタの先天性振戦の臨床的影響を軽減することのできる、不活化ペスチウイルス、弱毒化ペスチウイルス、およびサブユニットワクチンまたは免疫原性組成物を提供する。さらに、投与方法、ワクチンの作製方法、検査法、および本発明のその他の態様を記載する。
好ましくは、本発明のペスチウイルスは、配列番号１に対して少なくとも約９５％の同一性、例えば、配列番号１に対して少なくとも約９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有する核酸配列を有するか、あるいは配列番号２に対して少なくとも９５％の同一性、例えば、配列番号２に対して少なくとも約９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を有する、不活化ペスチウイルスおよび／または改変生ペスチウイルスおよび／または弱毒化ペスチウイルスである。
CATAATGCTTTAATTGGCCGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATATTTATGAGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGAGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCAATGGACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCACTTCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGCGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGGCCACCATGCCCCTTTACGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTCATTAACATGGAAAAACAGATTGCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTGGTAGGAGAAAGTCATACAAAAATAACCACGCTTTCTGGAAAGACCTATCGAGGCACCTGGGAAATGGAGAAACGGCCAAATCCTTATGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCCCAACAGCTTACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGAGATGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCAAATACGAACGGGGTGTTTGTTGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCTCCATTAGGCATTTGGAAGATAAGATTGGACTATAGTGACTTGGTAAACATAAGCAGACCAACCCCCGCTAGTGGGAAAAACTCTTACCAAGTTGAGACCTGCAGTGGGGAGCTGGCTACAGTGACACTGGTACACAATAGGGTGCTCGTGGAAGATTGCAGGGGGCTATACCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATTGTGCTCTATGTGAAAACTTGTTCTGACTGGGCAGATCAGGTAGAAAAACAGGAGAAAGAAAGCCCCCCAAAACCACAGCGGCCACCAAGGCGAGACCCACGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAGACAACCTAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTCATCTACAAAGGCAGGACCAAAAACAAAAAGACCCCGGATGGAGTCTATAGATACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGACGTAGTAAAGGTCAGGAAGATGCTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTGATGTACCTGATACATATCATAACTCCAGGCCTTGCCAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAAGATGAAAACTCGACGGGGATCAACCAGATACTGTGGCAAAGACAGATCAACAGATCCTTACATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGCCACGGTATGCCCAATGAAACTATCACGGATGAGGAATTACGCAGTCTGGGAATGGTAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACCTGTTGCCAGTTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCACAAAAACAGGCGTGGATCACGAGGATAACGGCCCTACAAGCTAACCTTACCGGGCCTTATGAGGGACCTGAGTGCGCCGTCATCTGCCGATTTAACGGCAGCTACAACATCGTAAAACAGGCCAGAGATGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGCAAGGAAGGGCATCCTTTTCTATTCTCTGGTGAAAGATCCGACACCTCATGCCTAAGGCCCCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCATCAATGGCCGATGGCTTTGCCCATGGGGTTGATAAGGCGATAATACTAATCAGGAAGGGGGCATCAGGAATAATCAATTTCCTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCGGTAGCTGAAGCAACTATAGTACCATATTGTGATACTTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCATGTAAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATCTCCCCGACAATGATATATCTGGGAGAAGGAGACCCGGCCCATAATATCCAGCACTTATTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTTCTACTCGGGATTCTGGGTGAGTGGTATGGAGAATTGGCTTCCACAATATACTTACTACTAGAATACGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATTCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTCCCAGCTAGTCATACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCGTGGTGGCAGAGACCTGGCATATACTAAAAATATTGGCGTCAGCCCTGGTGAACATAGTTGCAGCGTTCGTAAACCTGGAATTGGTTTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAAGGGAACCTGATAGGTGCCATATTATGGTGCTTGTTACTGTCAGGCGCTGAAGGCTCGTGCTACAAAAGACAAGACTATTACAACACCCAACTAGTCGTCGAAGAAAAAACAGGCGTAGAAAAACGATCTATAATGGGCAAGTGGACCGTGATAACCAGGGAAGGTCGGGAGCCAAGATTAATGGAGCAAATAAATATGGTATTGAATGATAGCCTGTCAGAAACCTACTGCTATAATAGGCTAAACACCAGCACTTGGGGGCGGCAACCGGCAAGACAAAGAGGGTGTGGTCAAACCGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTAGAAGAACAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGTAACAGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGCGTATGGCTATCAAGAAAGGGTAACGTACAGTGTCAGCGTAACGGCTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAAACTGAAAGTATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACTTGTGTGTACAGCTGGGCATTCGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAACAGGAAGGATGGTTATTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAACGACTACCAGTATTGGACAAAAATGCCTACTGCCTCGTCCGCCGCAACCATGTACCGCCACTTGCTCCCCTTACTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCGGTGTGGTTTGTGGCAATGCTCCTGTCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTAGGCACTAAACAACTGGCTGTCACGCTAACCCTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTACTTTTCTATATTGTCTTGATGCTAGCCGTTAAGGAAGAACTTATAAAAAAAATTGTGACCGCTAGCCTTGTGGCCTTAAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGTTTTCTTATTGTACTCAGACTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTAGGTTTATTATTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCGGAGTTTGGAACTCCTTTCCTGATCTACCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTGTTAGTCAGCTTCTCCGCACTGAACCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGTTGTTGGCAACACATATAACAGCGCTCACATTGACTGGCTTGAGTGATTCAATCTTCTATATGATGCTTATAACAACAAATTTGTTAATAAAGACATTCATATACTTGCTGGGGGCTAGTATGAATTGGGTCGAGAGAGAAAAAAAGAAATTGCTAGTGAAGAGGAGACTAATATACAAGAAAGCCGTTACTTGCAGTCAGGATGAGAATGTATTGGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAACGCGGATTTCACCCCATGCAAGCTTGAACTTCTACAATTACTTAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTGTGTTTTTCCTACTACAAACCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCTTAACTGTAATAGTAATTGGCGTACAAGAGTACAACGTAGCCATGGCCCGCGGGCGAAGTGTGGTCCACAGGCTACTAGCCATGGCCTATTACATATACGGCCGCATACAGGGTGACATGTTCCAGCTCGCCACTATCCAGTGCCTGCTGTCGAGTCCGAGGAAAATTATGAAACACATGGTAGAGAATCCAACTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACAGAACTCTTCAACCAGGGTGTTAGTCAATCCAAGATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACACAAGGGCATGTGTGGCCTCCCAACAGTAGTGCAAAATTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAGCTGGGTTACCCCCCTGGGGATCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATCACTAACGTCGAGTCTGCTAAGATGGACTTACTCTCCAAACTTATGACCTTTCTGGGGATTGAAAGCTCGAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACAAGGAAATTATTGAAGATAGTAAGGGGCTTGGAAACAGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATAAGTAGCGCAAAACACGTTACAGGTGAAAAGAACTTAATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGAAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCTGACGAGGTAGAGTACGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCTCCCGACAATGCCTTATGCTACTGTTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAGACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACATCAGACGGCAATAAAGCCTATTATAATGTAAACAATTTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGCTGCACTCCACCGGGGCCATAGTGGGGAGGATTAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGAACTATTAGTAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGACATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATTACCCTTGGAACGGGAGCCGGGAAAACCACAGAACTGCCTAGGCAATACCTCACAACAGTAGGTGCCCATAAATCCGTGCTGGTCTTAGTCCCCTTAAAAGCACCTGCTGAAAGTGTTTGCCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTAAGAGTGGGGGAACGGAAAGAGGGAGATGTGAGCAGCGGCATCACCTACGCTACTTACGGATTTTGCTGCCAGCTAAACCTAGTCCAACTTAAAGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTTTTTTTTGATGAATATCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATTCATGCACTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCAACCCCCCCGGGTACCGTGACGACTGAAGGCAGGAAGTTTGACATTGAAGAGGTAGGGGTTGCTACCATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGCATAGCGGTCGCTGGTATGCAGGTCCCATTAGAAGACTTAACAGGAAAGAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACCAAAGAAGCCGCGGAGACGGAGGCTAAAGAACTGCGCACCAGAGGAATTAACGCCACCTACTACTATTCAGGTATAGACCCTAAGACTCTGGAACATGGGATGACCAATCAGCCATACTGTATTGTAGCTACCAATGCCATTGAATCAGGTATAACCTGTCCTGACTTGGATGTGGTCATAGACACCATGCAGAAGTACGAAAAAGTAGTGAATTTCTCGGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCATTAGTAAAGAAAAAAATCACCAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGCAGGCAAAAGAAAGGAAAATACTACTACCCCTCGGGGGTGGTACCGAATGGGTCAAAAGACCTAAGCTATTTAATCCTACAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAACAAGTCAATATAACAGAGTACTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTAGAAGTGAGAATACTTGAGAGAATGAACAAGGAAATCTTGCTACCACTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCTTGGAAAGAAGTACTCACCCGGAAAAAGTGGCACTGTTGTATAACAAATTAGTGCAGAAAAATCCTATAGTATACCCTAGAGTACAGGAAGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAATACCTATAATCTGGCCGTATATGACAAGCTAAAAGATGTCAACCCACAAGCCATTTATGTTCTAGCAGAAGAGGAGAGAGCCACAGAAATGATGGGTCTCGAGTTTGAACAAGACCCATCTGACTTACAGGATTCGGTAGTTCAGCTTTGTGAAGATATCAAGAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAACTGCTAGTAGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAAGCCTTAACCAGAAACCACGTGCCCTGGGTCAGCAAAGAGTATTGTTATGAGCTGACCGATTCACCGGATACTTACGAAAACTCATTCGCACCTTTGGACGTCGACGTCCAAAACTCCGGTGAAGGAAAACACCCAGAGCAACTGGCAGACCATCAATTGAGGCAACTACTGGAGACTGGGAGAGACAAGGCAATTGATTTCCTAAAAGGAATCCGCGAGTTCACTAGTGGGGCCATAAACAGTCCAAAGGCACTAAGTATATGGGAGAAAATATATCAGTATTTGAAGAAGCATCAGGGCGAGATCATCTCATCAGCAGCGTGGGGCAGTGCGACGGCCCTTCACGACAGTATTAAATCTAGACTAGGAGATGAGGTCGCTACTGCAGTAATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGTGAAAGAGAACTGTCTGGGCTAACTAGGCAAGTTCTAATTGACATCATAGTATATTATATAGTTAACAAGCCCCGGTTCGAAGGAGACGACTACGCAAAGAGAAAAGGAAGAAGGCTAGTCATCGAAGTCCTGATGGGGGCACTGGCGACTTATGCGGTGTCCAATTTTTGGGGTGTGTCCATTAATAAGATACTGCAACCAATTTCTGATTATCTACCCTATGCCACCGCCACTTTGGCTTTTCTTCGCCCAACCTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCTTCCTCTATCTATAGAGCTTTTCTCTCCATTAAGCATGCGGAAAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCTTCTGCCGCCCTCGAAGTCATGGGCCTGACCCCAGTATCGGCTGGCCTAGGCGTCTTGCTGGGGCTTGGGTTGTGTGTGCTCCATATGAACATTGACAAGAATGAGGAGAAAAGGACACTTATACTGAAAATGTTTGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTAGACGAGTTGGATAAACTGGAGCCAGAAAAAATAATCCTCTCATTGTTGGAGGGTATCCAAACCTGCACAAACCCGATTAGAGCAATCATGATTTTGTACAGGGTGTACTACAAGGGAGAAACTTTCACAGAAGCTTTGTCTAAGATGGCCGGCAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATAGTCGAGTTCCTGGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGAGGGTATATAGATCTTAGTGCTAATTTGCTGACCTTTCTCCTCGAGAAACTAAAAAAAATGACTAACCTCGCCATCGGGGAAGCTAGAAAGGTCTTGCTCCCCATCCCATACTTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCTGACGCCAGAATCAAGGCCCCTGAATCCTACGACCAAGTGGTAGTGGAATGCAAATGTGGCGCTTCAGCGAGGTATTCCTTCCGCGATGGAGTTCATGAGATATTGGAAGAAAAAAGGACTAATTGGTGCAAGAACTTCTTCTTATGGGGACCCAACTTCCACAATCCGGATCCAAAAAGGATGACATTCTATGAATACGGCCAAGCAAAAAAGTGTCCTGTTATCATAATTGGTGAAGACATAACCTTCGGCAAATATGGCATATATATCAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGAGGGAGGTTAATAAGGGGTACCACCCACGCTACTATCAGTAGGGAGGAATTGCTGGAAATCCTAACAGCCCCAAGCCAAGTGGCCATAGGCAAGGTCAAGCTAACCGATTACTGTAATCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAATTGGCCGTACTTGAAGGTGACAAAATACATTTTTGGAAAGCACACCGTGGATCCAAAATCACAGACCAACTCACTATTGAGAATCTGACAGATGATTTGGGGTCAGAAATCAGGGACATCACATGGGAGCTGTACACAGGTGGAACGTGCACCGTAAAAGGGGTGTCCCTTAGATCATGCGCACCAGGTCATAGAACTAAGGCTATGGTCTTGTGTGATTGCACTGATGTGCTTAGCCCCTGTTACCTAATAAACGGCAGGAGACCATCCCCATTTGACGTCGCGGAAGGTTATGAATGTCACCACCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAAGACCTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGACGAGTCCCTGTCTACGATCCTCTGTGTTTGTTTGACACTGATAGTAAACTGCTACCTCCCGACACCTACTACTTGGAAGAAGATCAAGAGGACTTTGAGTACGCATTGAGATGCTGGGGCCTCGGGGTTTATGTAGCAGACGGGCCTGTCACTTCCCCCCCGGACATAAGAATACACCATAGTTCGGTATTACTACTGCTGACACCTGGAGTAAACTCAGAGTTGCCCTTACAGTACATACGTTGTTACCCTCATCAGGCAGAGGTGGACATCTACATTAGGAGTCAGCTTTTGGAGGAGGAAGACACTGCTACGGAGGTGGAAGGCTCCCAGGAAGATGGTGATGAAGGGATGGGCGATGCGGTAATAGAGGATGAGGATACATCGTCCACAACAGAATCAATACCCCCACTAGAAGAGGAGGAAGGGGGCGAAGAGCCAATCACCTATGTGGTCATAAGGGGATTACAAGAAGAAAGATACGCCAGCCATCTTAAACTAAATGACTGGATCAGTGAAAACATTTCAGAGCCACACAGAGTCCAAATTATGCTAGATGGGACAGTGAGAGTCACAATAAAAGAGGGCAAAGTGAAACATTTGTTTGGGGTCTATAGAATAGAAAACTCCCTGGAAGCAATGTTTAAAGAGACCATAGCTGACCTCCCCGTAGCTACCCAACCGCCCCAGGGGCCAGTCTATACGGCTAAAGAGCTGGCCCAAGGGAACATCGCCCCGGTCCAACCTGCAGCGAATTATTACGGAATGATAGAGGGGAGAGGCGACCCAATGACGGCATTCGAAGCCTTATCAGTCTTGCGGTCACAAAAAGTCTTAGCCAAGGACGTGAAGGTGAACACCCGCAGGGCGCAGGTTTTTTTAAATAAAGTCAGGAGAATTGCTGAGGTCAGAGCGTCGGAACTGACATTAAAATGCTTACCGATACTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGAGAGGAAACCAACATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCAATAATGACCTCAATAGGAATTAGACTAGAAAAACTGCCAGTGGTTAGAGCAAACACTTCCGGCTCTAAGTTCAGACAGTCAATCTTAGAAAAAATGGATAAGTATGAAAATGAACAAGTCCCAGGGTTACATGAAAAGATGTGGGCAGCGTTCCTGGCAACTGCCAGGCAAGATTTAAGAAATACCTATGAGGAAGTAACTTATCTTGAATTAGAGGCCGGAATCAATCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGCTGGAAAAAAAAGAAAAAATTGACGTCACAATCCAAGAGATTGAAAAAGGCAACCACTTATACTATGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTTGATGATTGGTTGTCAGAGGATTTCGTCACTTATAAGAAACCACGTGTGATACAGTACCCTGAGGCAGTCACCCGGTTGGCCATCACCAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCTATAGTGATTCCCGGTTATGAGGGAAAAACCCCGATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTCAGTGCAGATTGGGCTCAGTTCAAAAATCCGGTAGCCGTCAGCTTCGACACCAGAGCCTGGGACACTCAAGTAACAAGAGAAGACCTCAGGCTGGTAGGGCGGATACAGAAATACTATTACAAAAAAAAATATTGGAAG
TTCATTGACAATTTGACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTAATCACTGTAGAAGGAGATATGTTCCTCAGAGTTGGACAGCGCGGATCCGGACAGCCTGATACCTCAGCAGGCAATTCCATGCTAAATGTGCTGACTATGTTGGTAGCTTTCTCTGAATCCACAAATCTGCCCATAGCGGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTCTGTGGTGACGACGGTTTCTTAATCACAGAATCGGAATTAGGGAGGAAGTTTGCTGAAAAAGGTGTTCCTCTGTTAGCTGCATTTGGCAAACCCCAAAAAATTACAGAGGGAGCGAGCCTAAAGGTAACCAGCAACTTTGACGGAATAGAGTTTTGTAGTCATACCCCTATCAGAGTCCAAACACCAAACATCAGGTGGATGCCAGCGAGACCAACAGCAACAATCCTAGGCAAAATGAGTACCAGGCTGGGTGAGGGTGCCACCAGGTCGGGAGAAGAATACGAAAAACAGGTGGCATTCGCATATCTACTGATGTACCCCTGGAACCCGCTGGTCAGGAGAATCAGCCTCCTATTGTTATCGACTACTGACCCAATGGGGAAAGAGGAAACCCCATGCTCCGATGAGGGGGTGAAGTATGTTGGGGACCCTATCGCTGCATACAGGGATGTATGGGGGCACAAATTAGAGGATGTAGGCCATGTTGATCAACCGCAGTTATCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATTTGGAAACCAAAGACAAGTCAGCGGCTAGTCGAACAGTGTTGTCGTCTGGCCGAGAAAAGCAATTGTGTGGTACGTGCTGACTCCCTGATAAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGTGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTTGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAATGTAATTGTAGAAGATGATATCTTCCTAGTCCTGTGGAAGAGATTTTCAAAGTACATTTTTCAGAAAATGAAGTTCATGCAGAGAATGTTCGCCCCTTATTAAGTGGGGGGCACTCATTTAAATTATAACCAGTATCTGGTAAGTATAAGATTTGTGTAAATAAAGTATATAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCGTATAGGCTGGGGTGATCGCCGCACCCCCCCCTTCACTAGGCGCCTCAACCCCATGTACCATGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATGAATGGAGTAATACGGGTAACAAACTTATAGGCCAGTATTGCCCCATTTGCTTTATAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCCGATCTGATATC（配列番号１）
MEKQIAYYLKKEKQRNGWTELVVGESHTKITTLSGKTYRGTWEMEKRPNPYGTYLPRPSPQQLTALHPHPVVNCKVVEYKEMDPNYGDCPNTNGVFVDEKGRRLSSPPLGIWKIRLDYSDLVNISRPTPASGKNSYQVETCSGELATVTLVHNRVLVEDCRGLYQWKPNCEGIVLYVKTCSDWADQVEKQEKESPPKPQRPPRRDPRKGLQPQVPKETEVTEKKRQPSVTLVSGGQKAQVIYKGRTKNKKTPDGVYRYPGAKEGDVVKVRKMLKNWHIALVMYLIHIITPGLAKVQWFLKDENSTGINQILWQRQINRSLHGEWPNQICHGMPNETITDEELRSLGMVDTSPRTNYTCCQLQYHEWKKHGWCNYPQKQAWITRITALQANLTGPYEGPECAVICRFNGSYNIVKQARDEVSPLTGCKEGHPFLFSGERSDTSCLRPPSTSWVRPVKMDEASMADGFAHGVDKAIILIRKGASGIINFLDTIGRWLPVAEATIVPYCDTYTVTGMYVHVKNCLPRGLPKHSKIISPTMIYLGEGDPAHNIQHLFGSGIAKWVLVLLGILGEWYGELASTIYLLLEYGSEWLEHESLVTEGLIPGINITIELPASHTVPGWVWVAGQWVCVKPDWWPTQIWIETVVAETWHILKILASALVNIVAAFVNLELVYLVIILVKISKGNLIGAILWCLLLSGAEGSCYKRQDYYNTQLVVEEKTGVEKRSIMGKWTVITREGREPRLMEQINMVLNDSLSETYCYNRLNTSTWGRQPARQRGCGQTVPYWPGDNVLEEQYYSTGYWVNVTGGCQLREGVWLSRKGNVQCQRNGSSLMLQLAIKEENDTMEIPCDPVETESMGPVAQGTCVYSWAFAPRGWYYNRKDGYWLQYIKKNDYQYWTKMPTASSAATMYRHLLPLLVACLMGGRISVWFVAMLLSLQVEASEVGTKQLAVTLTLWKMDWTELLFYIVLMLAVKEELIKKIVTASLVALKNSPVALSFLIVLRLVGGSEALPVGLLLEKMCIDQPEFGTPFLIYLWDNWKWTVLVSFSALNHEKTIKLARKLLLATHITALTLTGLSDSIFYMMLITTNLLIKTFIYLLGASMNWVEREKKKLLVKRRLIYKKAVTCSQDENVLENKFNKITVNADFTPCKLELLQLLRAFLVSLCFSYYKPLLYAETTLTVIVIGVQEYNVAMARGRSVVHRLLAMAYYIYGRIQGDMFQLATIQCLLSSPRKIMKHMVENPTLKKLWQGETELFNQGVSQSKIVNPKKIGLEELHKGMCGLPTVVQNLVIYAKKNDSLILGELGYPPGDLTSDGWEILGPGRIPKITNVESAKMDLLSKLMTFLGIESSRVPRTPVHSTRKLLKIVRGLETGWGYTHAGGISSAKHVTGEKNLMTHMEGRKGKYILQSQEHGADEVEYGVKTDQKAPDNALCYCFNPEATNIKGETGAMVFMKKIGKKWTLVTSDGNKAYYNVNNLKGWSGLPIMLHSTGAIVGRIKSAYSDENDLVEELIDSRTISKSNETNLDHLIKELADMRRGEFRSITLGTGAGKTTELPRQYLTTVGAHKSVLVLVPLKAPAESVCRFMRSKYPTINFSLRVGERKEGDVSSGITYATYGFCCQLNLVQLKEWISRYSMVFFDEYHTATPEQIAIISKIHALKVKTRIVAMSATPPGTVTTEGRKFDIEEVGVATIEKGEEPKRGRIAVAGMQVPLEDLTGKNCLVFVATKEAAETEAKELRTRGINATYYYSGIDPKTLEHGMTNQPYCIVATNAIESGITCPDLDVVIDTMQKYEKVVNFSAKMPLIVTSLVKKKITREEQGQRKGRVGRQKKGKYYYPSGVVPNGSKDLSYLILQAQEYGVLEQVNITEYFIIMNEDWGLYDVDEVEVRILERMNKEILLPLGIVEKQILERSTHPEKVALLYNKLVQKNPIVYPRVQEGEVSKEYNTYNLAVYDKLKDVNPQAIYVLAEEERATEMMGLEFEQDPSDLQDSVVQLCEDIKRYTKLSGITEKLLVGTMVGYIGYKALTRNHVPWVSKEYCYELTDSPDTYENSFAPLDVDVQNSGEGKHPEQLADHQLRQLLETGRDKAIDFLKGIREFTSGAINSPKALSIWEKIYQYLKKHQGEIISSAAWGSATALHDSIKSRLGDEVATAVIILKYLAFGERELSGLTRQVLIDIIVYYIVNKPRFEGDDYAKRKGRRLVIEVLMGALATYAVSNFWGVSINKILQPISDYLPYATATLAFLRPTFMESAVVVASSIYRAFLSIKHAENRSLVTQVASAALEVMGLTPVSAGLGVLLGLGLCVLHMNIDKNEEKRTLILKMFVKNFIDQAALDELDKLEPEKIILSLLEGIQTCTNPIRAIMILYRVYYKGETFTEALSKMAGKSLIVMVIVEFLELTGQTQGGYIDLSANLLTFLLEKLKKMTNLAIGEARKVLLPIPYLYCETWQSDARIKAPESYDQVVVECKCGASARYSFRDGVHEILEEKRTNWCKNFFLWGPNFHNPDPKRMTFYEYGQAKKCPVIIIGEDITFGKYGIYIKFGHRPDGGRLIRGTTHATISREELLEILTAPSQVAIGKVKLTDYCNQKGIIDRKLAVLEGDKIHFWKAHRGSKITDQLTIENLTDDLGSEIRDITWELYTGGTCTVKGVSLRSCAPGHRTKAMVLCDCTDVLSPCYLINGRRPSPFDVAEGYECHHRKPRATYEDLEMEEILKRRVPVYDPLCLFDTDSKLLPPDTYYLEEDQEDFEYALRCWGLGVYVADGPVTSPPDIRIHHSSVLLLLTPGVNSELPLQYIRCYPHQAEVDIYIRSQLLEEEDTATEVEGSQEDGDEGMGDAVIEDEDTSSTTESIPPLEEEEGGEEPITYVVIRGLQEERYASHLKLNDWISENISEPHRVQIMLDGTVRVTIKEGKVKHLFGVYRIENSLEAMFKETIADLPVATQPPQGPVYTAKELAQGNIAPVQPAANYYGMIEGRGDPMTAFEALSVLRSQKVLAKDVKVNTRRAQVFLNKVRRIAEVRASELTLKCLPILGKVNGRKLIREETNIPNQRLASIMTSIGIRLEKLPVVRANTSGSKFRQSILEKMDKYENEQVPGLHEKMWAAFLATARQDLRNTYEEVTYLELEAGINRKGAPGFFEKESSIGEVLEKKEKIDVTIQEIEKGNHLYYETAMPKNEKRDVLDDWLSEDFVTYKKPRVIQYPEAVTRLAITKIMYKWVKQKPIVIPGYEGKTPIFEIFEKVSADWAQFKNPVAVSFDTRAWDTQVTREDLRLVGRIQKYYYKKKYWKFIDNLTAMMEEVPVITVEGDMFLRVGQRGSGQPDTSAGNSMLNVLTMLVAFSESTNLPIAAAWKACRIHVCGDDGFLITESELGRKFAEKGVPLLAAFGKPQKITEGASLKVTSNFDGIEFCSHTPIRVQTPNIRWMPARPTATILGKMSTRLGEGATRSGEEYEKQVAFAYLLMYPWNPLVRRISLLLLSTTDPMGKEETPCSDEGVKYVGDPIAAYRDVWGHKLEDVGHVDQPQLSRMNYSMTYLGIWKPKTSQRLVEQCCRLAEKSNCVVRADSLIKKKVKITYDPGIGVAQVIRRWEELEWTRRKPELTNVIVEDDIFLVLWKRFSKYIFQKMKFMQRMFAPY（配列番号２）
本開示はまた、ペスチウイルスのＮｐｒｏ、カプシド、Ｅｒｎｓ、Ｅ１、Ｅ２、ＮＳ２−３、ヘリカーゼ、ＮＳ４Ｂ、ＮＳ５ＡまたはＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ（ＲｄＲｐ）タンパク質をコードするベクターおよび感染性分子クローンを提供する。
Ｎｐｒｏ：１８０アミノ酸からなるＮ末端プロテアーゼ（Ｎｐｒｏ）タンパク質をコードする遺伝子は、配列番号１の３７８〜９１７位に見出される。
ATGGAAAAACAGATTGCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTGGTAGGAGAAAGTCATACAAAAATAACCACGCTTTCTGGAAAGACCTATCGAGGCACCTGGGAAATGGAGAAACGGCCAAATCCTTATGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCCCAACAGCTTACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGAGATGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCAAATACGAACGGGGTGTTTGTTGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCTCCATTAGGCATTTGGAAGATAAGATTGGACTATAGTGACTTGGTAAACATAAGCAGACCAACCCCCGCTAGTGGGAAAAACTCTTACCAAGTTGAGACCTGCAGTGGGGAGCTGGCTACAGTGACACTGGTACACAATAGGGTGCTCGTGGAAGATTGCAGGGGGCTATACCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATTGTGCTCTATGTGAAAACTTGT（配列番号３）
MEKQIAYYLKKEKQRNGWTELVVGESHTKITTLSGKTYRGTWEMEKRPNPYGTYLPRPSPQQLTALHPHPVVNCKVVEYKEMDPNYGDCPNTNGVFVDEKGRRLSSPPLGIWKIRLDYSDLVNISRPTPASGKNSYQVETCSGELATVTLVHNRVLVEDCRGLYQWKPNCEGIVLYVKTC（配列番号４）
カプシド：１１１個のアミノ酸からなるカプシドタンパク質をコードする遺伝子は、配列番号１の９１８〜１２５０位に見出される。
TCTGACTGGGCAGATCAGGTAGAAAAACAGGAGAAAGAAAGCCCCCCAAAACCACAGCGGCCACCAAGGCGAGACCCACGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAGACAACCTAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTCATCTACAAAGGCAGGACCAAAAACAAAAAGACCCCGGATGGAGTCTATAGATACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGACGTAGTAAAGGTCAGGAAGATGCTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTGATGTACCTGATACATATCATAACTCCAGGC（配列番号５）
SDWADQVEKQEKESPPKPQRPPRRDPRKGLQPQVPKETEVTEKKRQPSVTLVSGGQKAQVIYKGRTKNKKTPDGVYRYPGAKEGDVVKVRKMLKNWHIALVMYLIHIITPG（配列番号６）
Ｅｒｎｓ：２０９個のアミノ酸からなるエンベロープタンパク質Ｅｒｎｓをコードする遺伝子は、配列番号１の１２５１〜１８７７位に見出される。
CTTGCCAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAAGATGAAAACTCGACGGGGATCAACCAGATACTGTGGCAAAGACAGATCAACAGATCCTTACATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGCCACGGTATGCCCAATGAAACTATCACGGATGAGGAATTACGCAGTCTGGGAATGGTAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACCTGTTGCCAGTTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCACAAAAACAGGCGTGGATCACGAGGATAACGGCCCTACAAGCTAACCTTACCGGGCCTTATGAGGGACCTGAGTGCGCCGTCATCTGCCGATTTAACGGCAGCTACAACATCGTAAAACAGGCCAGAGATGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGCAAGGAAGGGCATCCTTTTCTATTCTCTGGTGAAAGATCCGACACCTCATGCCTAAGGCCCCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCATCAATGGCCGATGGCTTTGCCCATGGGGTTGATAAGGCGATAATACTAATCAGGAAGGGGGCATCAGGAATAATCAATTTCCTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCGGTAGCTGAAGCA（配列番号７）
LAKVQWFLKDENSTGINQILWQRQINRSLHGEWPNQICHGMPNETITDEELRSLGMVDTSPRTNYTCCQLQYHEWKKHGWCNYPQKQAWITRITALQANLTGPYEGPECAVICRFNGSYNIVKQARDEVSPLTGCKEGHPFLFSGERSDTSCLRPPSTSWVRPVKMDEASMADGFAHGVDKAIILIRKGASGIINFLDTIGRWLPVAEA（配列番号８）
Ｅ１：２００アミノ酸からなるエンベロープタンパク質Ｅ１をコードする遺伝子は、配列番号１の１８７８〜２４７７位に見出される。
ACTATAGTACCATATTGTGATACTTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCATGTAAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATCTCCCCGACAATGATATATCTGGGAGAAGGAGACCCGGCCCATAATATCCAGCACTTATTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTTCTACTCGGGATTCTGGGTGAGTGGTATGGAGAATTGGCTTCCACAATATACTTACTACTAGAATACGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATTCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTCCCAGCTAGTCATACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCGTGGTGGCAGAGACCTGGCATATACTAAAAATATTGGCGTCAGCCCTGGTGAACATAGTTGCAGCGTTCGTAAACCTGGAATTGGTTTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAAGGGAACCTGATAGGTGCCATATTATGGTGCTTGTTACTGTCAGGCGCTGAAGGC（配列番号９）
TIVPYCDTYTVTGMYVHVKNCLPRGLPKHSKIISPTMIYLGEGDPAHNIQHLFGSGIAKWVLVLLGILGEWYGELASTIYLLLEYGSEWLEHESLVTEGLIPGINITIELPASHTVPGWVWVAGQWVCVKPDWWPTQIWIETVVAETWHILKILASALVNIVAAFVNLELVYLVIILVKISKGNLIGAILWCLLLSGAEG（配列番号１０）
Ｅ２：３７２個のアミノ酸からなるエンベロープタンパク質Ｅ２をコードする遺伝子は、配列番号１の２４７８〜３５９３位に見出される。
TCGTGCTACAAAAGACAAGACTATTACAACACCCAACTAGTCGTCGAAGAAAAAACAGGCGTAGAAAAACGATCTATAATGGGCAAGTGGACCGTGATAACCAGGGAAGGTCGGGAGCCAAGATTAATGGAGCAAATAAATATGGTATTGAATGATAGCCTGTCAGAAACCTACTGCTATAATAGGCTAAACACCAGCACTTGGGGGCGGCAACCGGCAAGACAAAGAGGGTGTGGTCAAACCGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTAGAAGAACAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGTAACAGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGCGTATGGCTATCAAGAAAGGGTAACGTACAGTGTCAGCGTAACGGCTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAAACTGAAAGTATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACTTGTGTGTACAGCTGGGCATTCGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAACAGGAAGGATGGTTATTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAACGACTACCAGTATTGGACAAAAATGCCTACTGCCTCGTCCGCCGCAACCATGTACCGCCACTTGCTCCCCTTACTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCGGTGTGGTTTGTGGCAATGCTCCTGTCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTAGGCACTAAACAACTGGCTGTCACGCTAACCCTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTACTTTTCTATATTGTCTTGATGCTAGCCGTTAAGGAAGAACTTATAAAAAAAATTGTGACCGCTAGCCTTGTGGCCTTAAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGTTTTCTTATTGTACTCAGACTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTAGGTTTATTATTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCGGAGTTTGGAACTCCTTTCCTGATCTACCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTGTTAGTCAGCTTCTCCGCACTGAACCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGTTGTTGGCAACACATATAACAGCGCTCACATTG（配列番号１１）
SCYKRQDYYNTQLVVEEKTGVEKRSIMGKWTVITREGREPRLMEQINMVLNDSLSETYCYNRLNTSTWGRQPARQRGCGQTVPYWPGDNVLEEQYYSTGYWVNVTGGCQLREGVWLSRKGNVQCQRNGSSLMLQLAIKEENDTMEIPCDPVETESMGPVAQGTCVYSWAFAPRGWYYNRKDGYWLQYIKKNDYQYWTKMPTASSAATMYRHLLPLLVACLMGGRISVWFVAMLLSLQVEASEVGTKQLAVTLTLWKMDWTELLFYIVLMLAVKEELIKKIVTASLVALKNSPVALSFLIVLRLVGGSEALPVGLLLEKMCIDQPEFGTPFLIYLWDNWKWTVLVSFSALNHEKTIKLARKLLLATHITALTL（配列番号１２）
ＮＳ２−３：９３４個のアミノ酸からなる非構造タンパク質ＮＳ２−３をコードする遺伝子は、配列番号１の３５９４〜６３９５位に見出される。
ACTGGCTTGAGTGATTCAATCTTCTATATGATGCTTATAACAACAAATTTGTTAATAAAGACATTCATATACTTGCTGGGGGCTAGTATGAATTGGGTCGAGAGAGAAAAAAAGAAATTGCTAGTGAAGAGGAGACTAATATACAAGAAAGCCGTTACTTGCAGTCAGGATGAGAATGTATTGGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAACGCGGATTTCACCCCATGCAAGCTTGAACTTCTACAATTACTTAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTGTGTTTTTCCTACTACAAACCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCTTAACTGTAATAGTAATTGGCGTACAAGAGTACAACGTAGCCATGGCCCGCGGGCGAAGTGTGGTCCACAGGCTACTAGCCATGGCCTATTACATATACGGCCGCATACAGGGTGACATGTTCCAGCTCGCCACTATCCAGTGCCTGCTGTCGAGTCCGAGGAAAATTATGAAACACATGGTAGAGAATCCAACTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACAGAACTCTTCAACCAGGGTGTTAGTCAATCCAAGATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACACAAGGGCATGTGTGGCCTCCCAACAGTAGTGCAAAATTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAGCTGGGTTACCCCCCTGGGGATCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATCACTAACGTCGAGTCTGCTAAGATGGACTTACTCTCCAAACTTATGACCTTTCTGGGGATTGAAAGCTCGAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACAAGGAAATTATTGAAGATAGTAAGGGGCTTGGAAACAGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATAAGTAGCGCAAAACACGTTACAGGTGAAAAGAACTTAATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGAAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCTGACGAGGTAGAGTACGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCTCCCGACAATGCCTTATGCTACTGTTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAGACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACATCAGACGGCAATAAAGCCTATTATAATGTAAACAATTTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGCTGCACTCCACCGGGGCCATAGTGGGGAGGATTAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGAACTATTAGTAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGACATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATTACCCTTGGAACGGGAGCCGGGAAAACCACAGAACTGCCTAGGCAATACCTCACAACAGTAGGTGCCCATAAATCCGTGCTGGTCTTAGTCCCCTTAAAAGCACCTGCTGAAAGTGTTTGCCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTAAGAGTGGGGGAACGGAAAGAGGGAGATGTGAGCAGCGGCATCACCTACGCTACTTACGGATTTTGCTGCCAGCTAAACCTAGTCCAACTTAAAGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTTTTTTTTGATGAATATCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATTCATGCACTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCAACCCCCCCGGGTACCGTGACGACTGAAGGCAGGAAGTTTGACATTGAAGAGGTAGGGGTTGCTACCATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGCATAGCGGTCGCTGGTATGCAGGTCCCATTAGAAGACTTAACAGGAAAGAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACCAAAGAAGCCGCGGAGACGGAGGCTAAAGAACTGCGCACCAGAGGAATTAACGCCACCTACTACTATTCAGGTATAGACCCTAAGACTCTGGAACATGGGATGACCAATCAGCCATACTGTATTGTAGCTACCAATGCCATTGAATCAGGTATAACCTGTCCTGACTTGGATGTGGTCATAGACACCATGCAGAAGTACGAAAAAGTAGTGAATTTCTCGGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCATTAGTAAAGAAAAAAATCACCAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGCAGGCAAAAGAAAGGAAAATACTACTACCCCTCGGGGGTGGTACCGAATGGGTCAAAAGACCTAAGCTATTTAATCCTACAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAACAAGTCAATATAACAGAGTACTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTAGAAGTGAGAATACTTGAGAGAATGAACAAGGAAATCTTGCTACCACTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCTTGGAAAGAAGTACTCACCCGGAAAAAGTGGCACTGTTGTATAACAAATTAGTGCAGAAAAATCCTATAGTATACCCTAGAGTACAGGAAGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAATACCTATAATCTGGCCGTATATGACAAGCTAAAAGATGTCAACCCACAAGCCATTTATGTTCTAGCAGAAGAGGAGAGAGCCACAGAAATGATGGGTCTCGAGTTTGAACAAGACCCATCTGACTTACAGGATTCGGTAGTTCAGCTTTGTGAAGATATCAAGAGGTATACAAAACTC（配列番号１３）
TGLSDSIFYMMLITTNLLIKTFIYLLGASMNWVEREKKKLLVKRRLIYKKAVTCSQDENVLENKFNKITVNADFTPCKLELLQLLRAFLVSLCFSYYKPLLYAETTLTVIVIGVQEYNVAMARGRSVVHRLLAMAYYIYGRIQGDMFQLATIQCLLSSPRKIMKHMVENPTLKKLWQGETELFNQGVSQSKIVNPKKIGLEELHKGMCGLPTVVQNLVIYAKKNDSLILGELGYPPGDLTSDGWEILGPGRIPKITNVESAKMDLLSKLMTFLGIESSRVPRTPVHSTRKLLKIVRGLETGWGYTHAGGISSAKHVTGEKNLMTHMEGRKGKYILQSQEHGADEVEYGVKTDQKAPDNALCYCFNPEATNIKGETGAMVFMKKIGKKWTLVTSDGNKAYYNVNNLKGWSGLPIMLHSTGAIVGRIKSAYSDENDLVEELIDSRTISKSNETNLDHLIKELADMRRGEFRSITLGTGAGKTTELPRQYLTTVGAHKSVLVLVPLKAPAESVCRFMRSKYPTINFSLRVGERKEGDVSSGITYATYGFCCQLNLVQLKEWISRYSMVFFDEYHTATPEQIAIISKIHALKVKTRIVAMSATPPGTVTTEGRKFDIEEVGVATIEKGEEPKRGRIAVAGMQVPLEDLTGKNCLVFVATKEAAETEAKELRTRGINATYYYSGIDPKTLEHGMTNQPYCIVATNAIESGITCPDLDVVIDTMQKYEKVVNFSAKMPLIVTSLVKKKITREEQGQRKGRVGRQKKGKYYYPSGVVPNGSKDLSYLILQAQEYGVLEQVNITEYFIIMNEDWGLYDVDEVEVRILERMNKEILLPLGIVEKQILERSTHPEKVALLYNKLVQKNPIVYPRVQEGEVSKEYNTYNLAVYDKLKDVNPQAIYVLAEEERATEMMGLEFEQDPSDLQDSVVQLCEDIKRYTKL（配列番号１４）
ヘリカーゼ：６８７個のアミノ酸からなるヘリカーゼタンパク質をコードする遺伝子は、配列番号１の４３３５〜６３９５位に見出される。
GGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATCACTAACGTCGAGTCTGCTAAGATGGACTTACTCTCCAAACTTATGACCTTTCTGGGGATTGAAAGCTCGAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACAAGGAAATTATTGAAGATAGTAAGGGGCTTGGAAACAGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATAAGTAGCGCAAAACACGTTACAGGTGAAAAGAACTTAATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGAAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCTGACGAGGTAGAGTACGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCTCCCGACAATGCCTTATGCTACTGTTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAGACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACATCAGACGGCAATAAAGCCTATTATAATGTAAACAATTTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGCTGCACTCCACCGGGGCCATAGTGGGGAGGATTAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGAACTATTAGTAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGACATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATTACCCTTGGAACGGGAGCCGGGAAAACCACAGAACTGCCTAGGCAATACCTCACAACAGTAGGTGCCCATAAATCCGTGCTGGTCTTAGTCCCCTTAAAAGCACCTGCTGAAAGTGTTTGCCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTAAGAGTGGGGGAACGGAAAGAGGGAGATGTGAGCAGCGGCATCACCTACGCTACTTACGGATTTTGCTGCCAGCTAAACCTAGTCCAACTTAAAGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTTTTTTTTGATGAATATCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATTCATGCACTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCAACCCCCCCGGGTACCGTGACGACTGAAGGCAGGAAGTTTGACATTGAAGAGGTAGGGGTTGCTACCATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGCATAGCGGTCGCTGGTATGCAGGTCCCATTAGAAGACTTAACAGGAAAGAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACCAAAGAAGCCGCGGAGACGGAGGCTAAAGAACTGCGCACCAGAGGAATTAACGCCACCTACTACTATTCAGGTATAGACCCTAAGACTCTGGAACATGGGATGACCAATCAGCCATACTGTATTGTAGCTACCAATGCCATTGAATCAGGTATAACCTGTCCTGACTTGGATGTGGTCATAGACACCATGCAGAAGTACGAAAAAGTAGTGAATTTCTCGGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCATTAGTAAAGAAAAAAATCACCAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGCAGGCAAAAGAAAGGAAAATACTACTACCCCTCGGGGGTGGTACCGAATGGGTCAAAAGACCTAAGCTATTTAATCCTACAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAACAAGTCAATATAACAGAGTACTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTAGAAGTGAGAATACTTGAGAGAATGAACAAGGAAATCTTGCTACCACTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCTTGGAAAGAAGTACTCACCCGGAAAAAGTGGCACTGTTGTATAACAAATTAGTGCAGAAAAATCCTATAGTATACCCTAGAGTACAGGAAGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAATACCTATAATCTGGCCGTATATGACAAGCTAAAAGATGTCAACCCACAAGCCATTTATGTTCTAGCAGAAGAGGAGAGAGCCACAGAAATGATGGGTCTCGAGTTTGAACAAGACCCATCTGACTTACAGGATTCGGTAGTTCAGCTTTGTGAAGATATCAAGAGGTATACAAAACTC（配列番号１５）
GPGRIPKITNVESAKMDLLSKLMTFLGIESSRVPRTPVHSTRKLLKIVRGLETGWGYTHAGGISSAKHVTGEKNLMTHMEGRKGKYILQSQEHGADEVEYGVKTDQKAPDNALCYCFNPEATNIKGETGAMVFMKKIGKKWTLVTSDGNKAYYNVNNLKGWSGLPIMLHSTGAIVGRIKSAYSDENDLVEELIDSRTISKSNETNLDHLIKELADMRRGEFRSITLGTGAGKTTELPRQYLTTVGAHKSVLVLVPLKAPAESVCRFMRSKYPTINFSLRVGERKEGDVSSGITYATYGFCCQLNLVQLKEWISRYSMVFFDEYHTATPEQIAIISKIHALKVKTRIVAMSATPPGTVTTEGRKFDIEEVGVATIEKGEEPKRGRIAVAGMQVPLEDLTGKNCLVFVATKEAAETEAKELRTRGINATYYYSGIDPKTLEHGMTNQPYCIVATNAIESGITCPDLDVVIDTMQKYEKVVNFSAKMPLIVTSLVKKKITREEQGQRKGRVGRQKKGKYYYPSGVVPNGSKDLSYLILQAQEYGVLEQVNITEYFIIMNEDWGLYDVDEVEVRILERMNKEILLPLGIVEKQILERSTHPEKVALLYNKLVQKNPIVYPRVQEGEVSKEYNTYNLAVYDKLKDVNPQAIYVLAEEERATEMMGLEFEQDPSDLQDSVVQLCEDIKRYTKL（配列番号１６）
ＮＳ４Ｂ：６７アミノ酸からなる非構造タンパク質ＮＳ４Ｂをコードする遺伝子は、配列番号１の６３９６〜６５９６位に見出される。
TCTGGGATCACTGAGAAACTGCTAGTAGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAAGCCTTAACCAGAAACCACGTGCCCTGGGTCAGCAAAGAGTATTGTTATGAGCTGACCGATTCACCGGATACTTACGAAAACTCATTCGCACCTTTGGACGTCGACGTCCAAAACTCCGGTGAAGGAAAACACCCAGAGCAACTG（配列番号１７）
SGITEKLLVGTMVGYIGYKALTRNHVPWVSKEYCYELTDSPDTYENSFAPLDVDVQNSGEGKHPEQL（配列番号１８）
ＮＳ５Ａ：８１１個のアミノ酸からなる非構造タンパク質ＮＳ５Ａをコードする遺伝子は、配列番号１の６５９７〜９０２９位に見出される。
GCAGACCATCAATTGAGGCAACTACTGGAGACTGGGAGAGACAAGGCAATTGATTTCCTAAAAGGAATCCGCGAGTTCACTAGTGGGGCCATAAACAGTCCAAAGGCACTAAGTATATGGGAGAAAATATATCAGTATTTGAAGAAGCATCAGGGCGAGATCATCTCATCAGCAGCGTGGGGCAGTGCGACGGCCCTTCACGACAGTATTAAATCTAGACTAGGAGATGAGGTCGCTACTGCAGTAATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGTGAAAGAGAACTGTCTGGGCTAACTAGGCAAGTTCTAATTGACATCATAGTATATTATATAGTTAACAAGCCCCGGTTCGAAGGAGACGACTACGCAAAGAGAAAAGGAAGAAGGCTAGTCATCGAAGTCCTGATGGGGGCACTGGCGACTTATGCGGTGTCCAATTTTTGGGGTGTGTCCATTAATAAGATACTGCAACCAATTTCTGATTATCTACCCTATGCCACCGCCACTTTGGCTTTTCTTCGCCCAACCTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCTTCCTCTATCTATAGAGCTTTTCTCTCCATTAAGCATGCGGAAAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCTTCTGCCGCCCTCGAAGTCATGGGCCTGACCCCAGTATCGGCTGGCCTAGGCGTCTTGCTGGGGCTTGGGTTGTGTGTGCTCCATATGAACATTGACAAGAATGAGGAGAAAAGGACACTTATACTGAAAATGTTTGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTAGACGAGTTGGATAAACTGGAGCCAGAAAAAATAATCCTCTCATTGTTGGAGGGTATCCAAACCTGCACAAACCCGATTAGAGCAATCATGATTTTGTACAGGGTGTACTACAAGGGAGAAACTTTCACAGAAGCTTTGTCTAAGATGGCCGGCAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATAGTCGAGTTCCTGGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGAGGGTATATAGATCTTAGTGCTAATTTGCTGACCTTTCTCCTCGAGAAACTAAAAAAAATGACTAACCTCGCCATCGGGGAAGCTAGAAAGGTCTTGCTCCCCATCCCATACTTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCTGACGCCAGAATCAAGGCCCCTGAATCCTACGACCAAGTGGTAGTGGAATGCAAATGTGGCGCTTCAGCGAGGTATTCCTTCCGCGATGGAGTTCATGAGATATTGGAAGAAAAAAGGACTAATTGGTGCAAGAACTTCTTCTTATGGGGACCCAACTTCCACAATCCGGATCCAAAAAGGATGACATTCTATGAATACGGCCAAGCAAAAAAGTGTCCTGTTATCATAATTGGTGAAGACATAACCTTCGGCAAATATGGCATATATATCAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGAGGGAGGTTAATAAGGGGTACCACCCACGCTACTATCAGTAGGGAGGAATTGCTGGAAATCCTAACAGCCCCAAGCCAAGTGGCCATAGGCAAGGTCAAGCTAACCGATTACTGTAATCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAATTGGCCGTACTTGAAGGTGACAAAATACATTTTTGGAAAGCACACCGTGGATCCAAAATCACAGACCAACTCACTATTGAGAATCTGACAGATGATTTGGGGTCAGAAATCAGGGACATCACATGGGAGCTGTACACAGGTGGAACGTGCACCGTAAAAGGGGTGTCCCTTAGATCATGCGCACCAGGTCATAGAACTAAGGCTATGGTCTTGTGTGATTGCACTGATGTGCTTAGCCCCTGTTACCTAATAAACGGCAGGAGACCATCCCCATTTGACGTCGCGGAAGGTTATGAATGTCACCACCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAAGACCTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGACGAGTCCCTGTCTACGATCCTCTGTGTTTGTTTGACACTGATAGTAAACTGCTACCTCCCGACACCTACTACTTGGAAGAAGATCAAGAGGACTTTGAGTACGCATTGAGATGCTGGGGCCTCGGGGTTTATGTAGCAGACGGGCCTGTCACTTCCCCCCCGGACATAAGAATACACCATAGTTCGGTATTACTACTGCTGACACCTGGAGTAAACTCAGAGTTGCCCTTACAGTACATACGTTGTTACCCTCATCAGGCAGAGGTGGACATCTACATTAGGAGTCAGCTTTTGGAGGAGGAAGACACTGCTACGGAGGTGGAAGGCTCCCAGGAAGATGGTGATGAAGGGATGGGCGATGCGGTAATAGAGGATGAGGATACATCGTCCACAACAGAATCAATACCCCCACTAGAAGAGGAGGAAGGGGGCGAAGAGCCAATCACCTATGTGGTCATAAGGGGATTACAAGAAGAAAGATACGCCAGCCATCTTAAACTA（配列番号１９）
ADHQLRQLLETGRDKAIDFLKGIREFTSGAINSPKALSIWEKIYQYLKKHQGEIISSAAWGSATALHDSIKSRLGDEVATAVIILKYLAFGERELSGLTRQVLIDIIVYYIVNKPRFEGDDYAKRKGRRLVIEVLMGALATYAVSNFWGVSINKILQPISDYLPYATATLAFLRPTFMESAVVVASSIYRAFLSIKHAENRSLVTQVASAALEVMGLTPVSAGLGVLLGLGLCVLHMNIDKNEEKRTLILKMFVKNFIDQAALDELDKLEPEKIILSLLEGIQTCTNPIRAIMILYRVYYKGETFTEALSKMAGKSLIVMVIVEFLELTGQTQGGYIDLSANLLTFLLEKLKKMTNLAIGEARKVLLPIPYLYCETWQSDARIKAPESYDQVVVECKCGASARYSFRDGVHEILEEKRTNWCKNFFLWGPNFHNPDPKRMTFYEYGQAKKCPVIIIGEDITFGKYGIYIKFGHRPDGGRLIRGTTHATISREELLEILTAPSQVAIGKVKLTDYCNQKGIIDRKLAVLEGDKIHFWKAHRGSKITDQLTIENLTDDLGSEIRDITWELYTGGTCTVKGVSLRSCAPGHRTKAMVLCDCTDVLSPCYLINGRRPSPFDVAEGYECHHRKPRATYEDLEMEEILKRRVPVYDPLCLFDTDSKLLPPDTYYLEEDQEDFEYALRCWGLGVYVADGPVTSPPDIRIHHSSVLLLLTPGVNSELPLQYIRCYPHQAEVDIYIRSQLLEEEDTATEVEGSQEDGDEGMGDAVIEDEDTSSTTESIPPLEEEEGGEEPITYVVIRGLQEERYASHLKL（配列番号２０）
ＲｄＲｐ：７５１個のアミノ酸からなるＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼをコードする遺伝子は、配列番号１の９０３０〜１１２８５位に見出される。
AATGACTGGATCAGTGAAAACATTTCAGAGCCACACAGAGTCCAAATTATGCTAGATGGGACAGTGAGAGTCACAATAAAAGAGGGCAAAGTGAAACATTTGTTTGGGGTCTATAGAATAGAAAACTCCCTGGAAGCAATGTTTAAAGAGACCATAGCTGACCTCCCCGTAGCTACCCAACCGCCCCAGGGGCCAGTCTATACGGCTAAAGAGCTGGCCCAAGGGAACATCGCCCCGGTCCAACCTGCAGCGAATTATTACGGAATGATAGAGGGGAGAGGCGACCCAATGACGGCATTCGAAGCCTTATCAGTCTTGCGGTCACAAAAAGTCTTAGCCAAGGACGTGAAGGTGAACACCCGCAGGGCGCAGGTTTTTTTAAATAAAGTCAGGAGAATTGCTGAGGTCAGAGCGTCGGAACTGACATTAAAATGCTTACCGATACTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGAGAGGAAACCAACATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCAATAATGACCTCAATAGGAATTAGACTAGAAAAACTGCCAGTGGTTAGAGCAAACACTTCCGGCTCTAAGTTCAGACAGTCAATCTTAGAAAAAATGGATAAGTATGAAAATGAACAAGTCCCAGGGTTACATGAAAAGATGTGGGCAGCGTTCCTGGCAACTGCCAGGCAAGATTTAAGAAATACCTATGAGGAAGTAACTTATCTTGAATTAGAGGCCGGAATCAATCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGCTGGAAAAAAAAGAAAAAATTGACGTCACAATCCAAGAGATTGAAAAAGGCAACCACTTATACTATGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTTGATGATTGGTTGTCAGAGGATTTCGTCACTTATAAGAAACCACGTGTGATACAGTACCCTGAGGCAGTCACCCGGTTGGCCATCACCAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCTATAGTGATTCCCGGTTATGAGGGAAAAACCCCGATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTCAGTGCAGATTGGGCTCAGTTCAAAAATCCGGTAGCCGTCAGCTTCGACACCAGAGCCTGGGACACTCAAGTAACAAGAGAAGACCTCAGGCTGGTAGGGCGGATACAGAAATACTATTACAAAAAAAAATATTGGAAGTTCATTGACAATTTGACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTAATCACTGTAGAAGGAGATATGTTCCTCAGAGTTGGACAGCGCGGATCCGGACAGCCTGATACCTCAGCAGGCAATTCCATGCTAAATGTGCTGACTATGTTGGTAGCTTTCTCTGAATCCACAAATCTGCCCATAGCGGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTCTGTGGTGACGACGGTTTCTTAATCACAGAATCGGAATTAGGGAGGAAGTTTGCTGAAAAAGGTGTTCCTCTGTTAGCTGCATTTGGCAAACCCCAAAAAATTACAGAGGGAGCGAGCCTAAAGGTAACCAGCAACTTTGACGGAATAGAGTTTTGTAGTCATACCCCTATCAGAGTCCAAACACCAAACATCAGGTGGATGCCAGCGAGACCAACAGCAACAATCCTAGGCAAAATGAGTACCAGGCTGGGTGAGGGTGCCACCAGGTCGGGAGAAGAATACGAAAAACAGGTGGCATTCGCATATCTACTGATGTACCCCTGGAACCCGCTGGTCAGGAGAATCAGCCTCCTATTGTTATCGACTACTGACCCAATGGGGAAAGAGGAAACCCCATGCTCCGATGAGGGGGTGAAGTATGTTGGGGACCCTATCGCTGCATACAGGGATGTATGGGGGCACAAATTAGAGGATGTAGGCCATGTTGATCAACCGCAGTTATCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATTTGGAAACCAAAGACAAGTCAGCGGCTAGTCGAACAGTGTTGTCGTCTGGCCGAGAAAAGCAATTGTGTGGTACGTGCTGACTCCCTGATAAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGTGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTTGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAATGTAATTGTAGAAGATGATATCTTCCTAGTCCTGTGGAAGAGATTTTCAAAGTACATTTTTCAGAAAATGAAGTTCATGCAGAGAATGTTCGCCCCTTATTAA（配列番号２１）
NDWISENISEPHRVQIMLDGTVRVTIKEGKVKHLFGVYRIENSLEAMFKETIADLPVATQPPQGPVYTAKELAQGNIAPVQPAANYYGMIEGRGDPMTAFEALSVLRSQKVLAKDVKVNTRRAQVFLNKVRRIAEVRASELTLKCLPILGKVNGRKLIREETNIPNQRLASIMTSIGIRLEKLPVVRANTSGSKFRQSILEKMDKYENEQVPGLHEKMWAAFLATARQDLRNTYEEVTYLELEAGINRKGAPGFFEKESSIGEVLEKKEKIDVTIQEIEKGNHLYYETAMPKNEKRDVLDDWLSEDFVTYKKPRVIQYPEAVTRLAITKIMYKWVKQKPIVIPGYEGKTPIFEIFEKVSADWAQFKNPVAVSFDTRAWDTQVTREDLRLVGRIQKYYYKKKYWKFIDNLTAMMEEVPVITVEGDMFLRVGQRGSGQPDTSAGNSMLNVLTMLVAFSESTNLPIAAAWKACRIHVCGDDGFLITESELGRKFAEKGVPLLAAFGKPQKITEGASLKVTSNFDGIEFCSHTPIRVQTPNIRWMPARPTATILGKMSTRLGEGATRSGEEYEKQVAFAYLLMYPWNPLVRRISLLLLSTTDPMGKEETPCSDEGVKYVGDPIAAYRDVWGHKLEDVGHVDQPQLSRMNYSMTYLGIWKPKTSQRLVEQCCRLAEKSNCVVRADSLIKKKVKITYDPGIGVAQVIRRWEELEWTRRKPELTNVIVEDDIFLVLWKRFSKYIFQKMKFMQRMFAPY（配列番号２２）
一実施形態では、本発明によるペスチウイルスは、ペスチウイルス突然変異体であり、特に、野生型ペスチウイルスのゲノムと比較して上記ウイルスのタンパク質をコードする遺伝子に突然変異を含むペスチウイルス突然変異体である。
好ましい実施形態では、本発明によるペスチウイルスは、上記ウイルスのＮｐｒｏ、カプシド、Ｅｒｎｓ、Ｅ１、Ｅ２、ＮＳ２−３、ヘリカーゼ、ＮＳ４Ｂ、ＮＳ５ＡまたはＲｄＲｐタンパク質をコードする遺伝子に突然変異を含む。したがって、本発明は、好ましくは、ペスチウイルスポリタンパク質をコードする遺伝子における突然変異の結果として低減されたウイルス適応性を呈するペスチウイルスに関するものであり、当該突然変異は好ましくは以下に述べる突然変異である。
本明細書に記載の突然変異は、１つ以上の点突然変異および／または１つ以上のゲノム欠失および／または１つ以上の挿入を含むかまたはそれらからなることが好ましい。
本明細書において使用する免疫原性組成物はまた、本明細書に記載のペスチウイルスポリタンパク質のいずれかを含む組成物を指す。さらなる実施形態によれば、そのような免疫原性組成物はさらに、上記ペスチウイルスポリタンパク質（特にＥ２タンパク質）を発現する（好ましくは組換えバキュロウイルスの）ウイルスベクターの少なくとも一部を含む。さらに、免疫原性組成物は、ｉ）上記のペスチウイルスタンパク質のいずれかを好ましくは上記の濃度で含むことができ、そして、ｉｉ）ポリタンパク質内でプロセシングされたタンパク質の上記ペスチウイルスポリタンパク質を発現する（好ましくは組換えバキュロウイルスの）ウイルスベクターの少なくとも一部を含むことができ、さらに、ｉｉｉ）細胞培養上清の一部を含むことができる。
さらなる実施形態によれば、本発明はまた、本明細書において記載される核酸分子のいずれかを含むベクターに関する。言い換えれば、本発明は、任意のそのようなペスチウイルスポリタンパク質またはその一部のコード配列を含むベクターに関する。好ましくは、上記ベクターは、任意のそのようなペスチウイルスポリタンパク質またはタンパク質の一部を発現することを可能にする発現ベクターである。本発明によるベクターは、試験管内または生体内での細菌細胞、酵母細胞または動物細胞のトランスフェクションまたは感染に適したベクターである。
本発明のワクチンは、典型的には、薬学的に許容可能なキャリアと共に調合された不活化または弱毒化されたペスチウイルスを含む。注射用途に適する医薬形態は、通常は、滅菌された水溶液（水溶性である場合）または分散液および、滅菌注射剤用の溶液または分散液の即時調製のための滅菌粉末を含む。製剤は、望ましくは、滅菌されており、簡単に注射できる程度に流動性であるべきである。剤形は、製造および貯蔵の条件下で安定でなければならず、典型的には細菌および真菌のような微生物の汚染作用から保護される。キャリアは、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、液体ポリエチレングリコールなど）、それらの適切な混合物、および植物油を含有している、溶媒または分散媒体とすることができる。１つの可能なキャリアは、生理学的塩溶液である。溶液の適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用、分散液の場合での必要な粒径の維持、および界面活性剤の使用によって、維持することができる。微生物の作用は、例えば、パラベン類、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサール（エチル水銀チオサリチル酸ナトリウム）、デオマイシン、ゲンタマイシンなどの様々な抗菌剤および抗真菌剤によって防止することができる。等張剤、例えば糖または塩化ナトリウムを含むことが好ましい場合が多い。所望により、吸収を遅延させる薬剤、例えばモノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを組成物中に使用することにより、注射剤組成物の持続的な吸収をもたらすことができる。
本発明のワクチンの単回用量の体積は様々であり得るが、通常は、従来のワクチンにおいて一般的に採用される範囲内とすることになる。単回用量の体積は、好ましくは、上記の複合物およびアジュバントの濃度で約０．１ｍｌ〜約３ｍｌ、好ましくは約０．２ｍｌ〜約１．５ｍｌ、より好ましくは約０．２ｍｌ〜約０．５ｍｌである。
本発明のワクチン組成物は、当該技術分野において既知の任意の簡便な手段によって、例えば、筋肉内、皮下、静脈内、経口、動脈内、（例えば吸入を用いるかまたは用いない）鼻腔内、心臓内、髄腔内、胸腔内、腹腔内、舌下、経皮および／または吸入によって投与され得る。
組成物が投与される被験体は、好ましくは動物であり、例えば、限定されないが、ブタ、ウシ、ウマ、ヒツジ、家禽（例えばニワトリ）、ヤギ、ネコ、イヌ、ハムスター、マウスおよびラットである。最も好ましくは、哺乳動物は、ブタ、より好ましくは、雌ブタ、未経産ブタまたは仔ブタである。いくつかの実施形態では、雌ブタまたは未経産ブタは妊娠しているものとすることができる。
本発明の製剤は、免疫化に有効な量の１つ以上の免疫原性組成物と、生理学的に許容可能なビヒクルとを含む。ワクチンは、免疫化に有効な量の１つ以上の免疫原性組成物と、生理学的に許容可能なビヒクルとを含む。製剤は、投与様式に適合していなければならない。
免疫原性組成物は、必要に応じて、少量の湿潤剤もしくは乳化剤、またはｐＨ緩衝剤を含有することもできる。免疫原性組成物は、液体溶液、懸濁液、エマルジョン、錠剤、丸薬、カプセル、徐放性製剤または粉末とすることができる。経口用製剤は、標準的なキャリア、例えば、医薬品グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなどを含むことができる。
好ましい投与経路としては、限定されないが、例えば、鼻腔内、経口、皮内および筋肉内が挙げられる。筋肉内または膣内への投与、最も好ましくは単回投与であることが望ましい。当業者であれば、本発明の組成物を１回、２回またはそれ以上の用量で投与してもよく、他の投与経路によって投与してもよい、ということを認識するであろう。例えば、そのような他の経路には、皮下、皮内、静脈内、血管内、動脈内、腹腔内、クモ膜下腔内、気管内、皮内、心臓内、葉内、髄内または肺内が含まれる。治療の所望の持続期間および有効性に応じて、本発明の組成物は、１回または数回、また断続的にも投与され得、例えば、様々な用量で毎日、数日間、数週間または数ヶ月間投与され得る。
本発明の実施形態はまた、妊娠中の雌ブタまたは未経産ブタに本明細書に記載の弱毒化ワクチンのいずれかを投与することを含む、ペスチウイルスに関連する疾患から仔ブタを保護する方法を含む。例えば、投与されるワクチンは、ペスチウイルスの１つ以上の抗原を含む。
したがって、一態様によれば、本発明は、妊娠中の雌ブタまたは未経産ブタに、不活化もしく弱毒化されたペスチウイルス抗原、またはペスチウイルス抗原を含む免疫原性組成物を有効量で投与するステップを含む、仔ブタの群れ内でのペスチウイルス感染の割合を低減する方法に関し、ここで、ペスチウイルス抗原は、不活化ペスチウイルス、弱毒化ペスチウイルス、またはサブユニットワクチンである。
一実施形態では、本発明のペスチウイルスは、配列番号１または２の配列によってコードされるかまたはそれを含む任意のペスチウイルスであり、ここで；当該配列が配列番号１または２と少なくとも９９％同一であり；かつ／または、当該ペスチウイルスが、配列番号１または２と少なくとも９０％同一である核酸配列によってコードされる。
別の実施形態では、方法は、配列番号１の配列によってコードされるかまたはそれを含むペスチウイルスからなる群から選択される１つ以上の免疫原性成分を含むワクチンの投与を含み、ここで；当該配列が配列番号２と少なくとも９９％同一であり；ポリタンパク質が配列番号１または２の核酸配列によってコードされ；かつ／またはペスチウイルスポリタンパク質が、配列番号１または２と少なくとも９０％同一である核酸配列によってコードされる。
本明細書に記載の化合物は、ペスチウイルス関連疾患を治療するのに治療上有効な用量で被験体に投与することができる。投与量は、ワクチンを受ける宿主ならびに、宿主の大きさ、体重および年齢などの因子によるであろう。
組成物の免疫原性は、当該技術分野で既知の任意の免疫学的検定を用いることにより、組成物による免疫後の試験被験体の免疫応答をモニタリングすることによって決定することができる。体液性（抗体）応答および／または細胞介在性免疫の発生は、免疫応答の指標として解釈され得る。試験被験体としては、例えば、ブタ、マウス、ハムスター、イヌ、ネコ、ウサギ、ウシ、ウマ、ヒツジおよび家禽（例えば、ニワトリ、アヒル、ガチョウおよびシチメンチョウ）などの動物が挙げられ得る。
試験被験体の免疫応答は、様々な手法、例えば：既知の技法、例えば、酵素結合免疫吸着検査（ＥＬＩＳＡ）、イムノブロット、免疫沈降などによって検査されるような、免疫原性複合物に対する結果として生じる免疫血清の反応性によって分析することができ；あるいは、病原体による感染からの免疫化宿主の保護によって、および／または（例えば被験体の試料を培養することにより）感染性病因物質のレベル、例えば細菌レベルを検査するための当該技術分野で既知の任意の方法もしくは当該技術分野で既知のその他の技法によって決定される、免疫化宿主における病原体による感染に起因する症候の減弱によって、分析することができる。感染性病因物質のレベルは、免疫グロブリンを指し向ける先の抗原のレベルを測定することによっても決定され得る。感染性病因物質のレベルの低下または感染性疾患の症候の改善は、その組成物が有効であることを指し示している。
本発明の治療薬は、動物またはヒトにおける生体内での使用に先立って、治療上または予防上の所望の活性について試験管内（ｉｎ ｖｉｔｒｏ）での試験をすることができる。例えば、特定の治療薬の投与が必要とされるか否かを判定するために使用され得る試験管内検査には、適切な細胞株に由来する細胞、または特定の疾患または障害を有する被験体から培養された細胞を治療薬に曝露するかさもなければ治療薬を投与して、細胞に対する治療薬の効果を観察する、という試験管内での細胞培養検査が含まれる。
あるいは、感染性病因物質による感染を受け易いが感染性病因物質に感染していない（被験体から培養された、または培養細胞株に由来する）細胞に治療薬を接触させ、細胞を感染性病因物質に曝露し、その後、治療薬と接触した細胞の感染率が、治療薬と接触していない細胞の感染率よりも低いか否かを判定することによって、治療薬を検査してもよい。感染性病因物質による細胞の感染は、当該技術分野で既知のいかなる方法によって検査してもよい。
さらに、治療薬は、療法の前、間または後の適切な時間間隔で動物モデルまたはヒト被験体において抗体を指し向ける先の分子のレベルを測定することによって評価することができる。分子の量のいかなる変化または変化の欠如も識別して被験体に対する治療の効果と相関させることができる。分子のレベルは、当該技術分野で既知の任意の方法によって決定することができる。
本発明の方法および組成物を使用してペスチウイルスワクチンまたは免疫原性組成物を動物にワクチン接種した後、当該技術分野で既知の任意の結合性検査を用いて、得られた抗体と特定の分子との間の結合を評価することができる。これらの検査は、特定の抗原に対してより高い親和性または特異性を呈する抗体を選択するために実施してもよい。
一般に、ウイルスの弱毒化は、ウイルスに対して許容性である適切な宿主細胞での反復継代培養をウイルスが所望の特性を示すまで行うことによって、病原性ウイルス分離株から生成され得る（ＷＯ９２／２１３７５、ＷＯ９３／０６２１１、ＷＯ９３／０３７６０、ＷＯ９３／０７８９８、ＷＯ９６／３６３５６、ＥＰ ０ ６７６ ４６７、ＥＰ ０ ７３２ ３４０、ＥＰ ０ ８３５ ９３０）。あるいは、それは、感染性クローン（通常は、ウイルスゲノムの完全長相補的ＤＮＡ転写物）の使用による遺伝子再編成によって生成され得る（ＷＯ９８／１８９３３、ＥＰ １ ０１８ ５５７、ＷＯ０３／０６２４０７、Ｎｉｅｌｓｅｎら、Ｊ Ｖｉｒｏｌ ２００３、７７：３７０２−３７１１）。加えて、ウイルスは、非天然の生理学的条件下、例えば、限定されないが、変更した温度、非宿主種由来の細胞、または突然変異原の存在下で継代培養され得る。
本発明は、同一または異なる形態での増殖または増幅によって菌株から派生するペスチウイルス株、特に、寄託株の本質的特徴を有する子孫にまで範囲が及ぶ。継続的に増殖させると株は突然変異を獲得することがあり、そのほとんどはこれらの株の特性を大幅に変えない。
別の態様では、本発明は、配列番号１または２のペスチウイルスの派生体または子孫の調製および分離を企図する。したがって、本発明は、同一または異なる形態での増殖または増幅によって菌株から派生するペスチウイルス株、特に、特定された株の本質的特徴を有する子孫にまで範囲が及ぶ。継続的に増殖させると株は突然変異を獲得することがあり、そのほとんどはこれらの株の特性を大幅に変えない。
本発明の分離株は、さらに望ましい特性をそれらに付与するようにさらに改変されてもよい。これは、弱毒化された表現型を拡張するための適切な宿主細胞における継続的増殖などの古典的な増殖および選択技法によって達成され得る。あるいは、適切な遺伝子工学的技法により、これらの株のゲノムの核酸配列の指向性突然変異によって分離株を遺伝子改変してもよい。
改変された配列を作製する組換え技法は当業者に周知であり、大抵はウイルスゲノムの完全長相補的ＤＮＡ複製物（感染性クローン）の構築を採用するものであり、それは後にＤＮＡ組換えおよび操作方法（例えば部位特異的変異導入法など）によって改変され得る。このように、例えばウイルスタンパク質の抗原部位または酵素特性が改変され得る。
本発明は、配列番号１または配列番号２の配列と少なくとも９５％の配列相同性を共有するペスチウイルス核酸配列を包含することが好ましい、というのも、そのようなウイルスは、そのような相同性配列を含有する弱毒化ウイルスでワクチン接種される動物に対して免疫を付与するのに有効となる可能性があるからである。配列番号１または２に示される配列は、弱毒化ペスチウイルスの完全長配列であり、約１１，５５０塩基の完全長配列を有する。
本発明のペスチウイルス株は、本発明のワクチンに適しており、当該技術分野で既知の方法により、例えば、適切な宿主細胞中で増殖させることにより、増殖および採取することができる。
本明細書において記載される場合、ワクチンは特に、生ワクチンおよび／または改変生ワクチン−弱毒化ワクチンである。本発明によるペスチウイルス株は、当該技術分野で既知の方法により、例えば、適切な宿主細胞中で増殖させることにより、増殖および採取することができる。改変生ワクチン（ＭＬＶ）は、典型的には、１用量当たり１０１〜１０７個のウイルス粒子、好ましくは１用量当たり１０３〜１０６個の粒子、より好ましくは１用量当たり１０４〜１０６個の粒子（４．０〜６．０ｌｏｇ１０ＴＣＩＤ５０）の投与を可能にするように配合される。
本発明の一実施形態は、（ａ）細胞にペスチウイルスを接種すること；（ｂ）接種した細胞をインキュベートすること；（ｃ）インキュベートした細胞からペスチウイルスを採取することを含む、ペスチウイルスワクチンを製造する方法を含む。好ましい実施形態では、方法は、配列番号１または２の配列によってコードされるかまたはそれを含む配列；配列番号１または２と少なくとも９９％同一である配列；配列番号１の核酸配列によってコードされるタンパク質；および／または配列番号２と少なくとも９０％同一である核酸配列によってコードされるポリタンパク質を含む、ペスチウイルスを含む。方法はさらに、ペスチウイルスワクチンにアジュバントを添加することを含むことができ、好ましくは当該アジュバントはＥＭＵＬＳＩＧＥＮ（登録商標）水中油エマルジョン系アジュバントである。
本発明の別の実施形態は、ペスチウイルスの１つ以上の抗原を宿主細胞において発現させること；およびペスチウイルス細胞中の１つ以上の抗原を採取することを含む、組換えワクチンを製造する方法を含む。１つのそのような実施形態では、方法は、ペスチウイルスタンパク質の抗原をコードする単離核酸を含む１つ以上の抗原（ここで、組換えペスチウイルスポリペプチドは配列番号１または２と少なくとも９０％の相同性を有する）；ａ）の単離核酸を含むベクター；ａ）の核酸によってコードされる組換えペスチウイルスタンパク質；およびそれらの任意の組み合わせを含むことができる。典型的な一実施形態において、ペスチウイルスの１つ以上の抗原は、組換えバキュロウイルスベクターによって発現される。方法は、昆虫細胞において発現されるペスチウイルスの１つ以上の抗原を含むことができる。一実施形態は、さらに、ペスチウイルスワクチンへのアジュバントの添加を含み、好ましくはアジュバントがＥＭＵＬＳＩＧＥＮ（登録商標）水中油エマルジョン系アジュバントである。
本発明のペスチウイルスペプチドの使用によって生じる抗体またはその結合部分は、試料中のペスチウイルスの存在を検出するために有用である。この検出方法は、本発明のペスチウイルスペプチドに対して惹起された単離抗体またはその結合部分を提供するステップ、ある量のペスチウイルスを含有すると思われる試料を単離抗体またはその結合部分に添加するステップ、およびペスチウイルスに結合した単離抗体またはその結合部分を含む複合体の存在を検出するステップを含む。
本発明の抗体またはその結合部分は、試料中のペスチウイルスペプチドの存在を検出するためにも有用である。この検出方法は、ペスチウイルスペプチドに対して惹起された単離抗体またはその結合部分を提供するステップ、ある量のペスチウイルスペプチドを含有すると思われる試料を単離抗体またはその結合部分に添加するステップ、およびペスチウイルスペプチドに結合した単離抗体またはその結合部分を含む複合体の存在を検出するステップを含む。
結合対の構成要素である特異的分子に結合する免疫グロブリン、特に抗体（および機能的に活性なその断片）は、本明細書に記載されているような、診断および予後予測として使用され得る。様々な実施形態において、本発明は、結合対の構成要素の測定、および臨床用途におけるそのような測定の使用を提供する。本発明の免疫グロブリンを、例えば生体試料中の抗原の検出に使用し、それにより、免疫グロブリンが結合する分子の異常レベルおよび／またはそのような分子の異常形態の存在に関して被験体を試験してもよい。「異常レベル」とは、疾患を有さない身体の一部または被験体からの類似試料に存在するレベルまたはそれを表す標準レベルに比べて上昇または低下していることを意味する。本発明の抗体はまた、診断または予後予測技法において使用するためのキットにおいて試薬として含まれてもよい。
一態様では、ペスチウイルスペプチドに免疫特異的に結合する本発明の抗体を使用してペスチウイルス感染が診断、予後予測またはスクリーニングされ得る。
別の態様では、本発明は、ペスチウイルス感染またはそれに対する免疫の存在を診断またはスクリーニングする方法であって、被験体に由来する試料に対する抗体の免疫特異的結合のレベルを被験体において測定することを含み、当該抗体がペスチウイルスペプチドに免疫特異的に結合するものであり、上記免疫特異的結合のレベルが、感染性病因物質を有さない被験体に由来する類似試料中での上記免疫特異的結合のレベルと比較して増加していることが、ペスチウイルスペプチドの存在を指し示す、方法を提供する。
ペスチウイルスペプチドまたはその拮抗物質の存在を検出するための適切な検査の例としては、限定されないが、ＥＬＩＳＡ、放射免疫検定、ゲル拡散沈降反応アッセイ、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、蛍光免疫アッセイ、プロテインＡ免疫アッセイまたは免疫電気泳動アッセイが挙げられる。
特定の分子に対する免疫学的検定は、典型的には、試料、例えば、生体液、組織抽出物、新たに採取された細胞、または培養細胞の溶解物を、検出可能に標識された抗体の存在下でインキュベートし、結合した抗体を当該技術分野で周知の数々の技法のうちのいずれかを用いることによって検出することを含む。
所与の抗体の結合活性は、周知の方法に従って決定することができる。当業者であれば、慣例的な実験を採用することによって各測定のための機能的かつ最適な検査条件を決定することができるであろう。
本発明のさらなる態様は、ペスチウイルスの検出または測定のための診断キットに関する。１つ以上の容器の中に、抗ペスチウイルスペプチド抗体を含み、かつ場合によって当該抗体に対する標識化結合相手を含む、診断用途のためのキットが提供される。あるいは、抗ペスチウイルスペプチド抗体を（検出可能なマーカー、例えば、化学発光、酵素、蛍光または放射性部分で）標識することができる。したがって、本発明は、抗ペスチウイルスペプチド抗体と対照免疫グロブリンとを含む診断キットを提供する。特定の実施形態では、容器の上記化合物のうちの１つを検出可能に標識することができる。キットは、場合によってはさらに、標準または対照として使用するための、キットの抗体によって認識される所定量のペスチウイルスペプチドを容器中に含むことができる。
本発明のさらに別の実施形態は、妊娠中の雌ブタまたは未経産ブタにワクチンを投与することができる分注器と；本明細書に記載のペスチウイルスワクチンとを含む、ペスチウイルスに関連する疾患に対するワクチンを妊娠中の雌ブタまたは未経産ブタに接種するためのキットを含む。
組成物は、必要に応じて、活性成分を含有する１つ以上の単位剤形を収容し得るパックまたは分注装置で提供され得る。パックは、例えば、ブリスターパックなどの金属製またはプラスチック製の薄片を含み得る。パックまたは分注装置には、好ましくは哺乳動物、特にブタに投与するための、投与のための指示書を添付してもよい。そのような（１つ以上の）容器には、医薬品または生物学的製品の製造、使用または販売を規制する政府機関によって規定された形式で、ヒトへの投与のための製造、使用または販売についての機関による承認を反映するものである貼り紙を付けることができる。
他に定義されない限り、本明細書中で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が出願時に属する技術分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。用語の意味と範囲は明確でなければならない。ただし、潜在的な曖昧さがある場合には、本明細書において提供される定義は、辞書または外部によるいかなる定義よりも優先される。さらに、文脈から特に要求されていない限り、単数形の用語は複数形を含み、複数形の用語は単数形を含むものとする。本明細書において、「または」の使用は、他に記載がない限り、「および／または」を意味する。さらに、「含んでいる」という用語、ならびにその他の形態、例えば「含む」および「含まれる」の使用は限定的ではない。本明細書で言及される全ての特許および刊行物は、参照により本明細書に組み込まれる。
本発明の実施は、特に明記しない限り、分子生物学、微生物学、組換えＤＮＡ技術、タンパク質化学および免疫学の従来技法を用いるものであり、それは当業者の技量の範囲内である。そのような技法は文献中で十分に説明されている。例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ、ＦｒｉｔｓｃｈおよびＭａｎｉａｔｉｓ、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、第Ｉ、ＩＩおよびＩＩＩ巻、第２版（１９８９）；ＤＮＡ Ｃｌｏｎｉｎｇ、第ＩおよびＩＩ巻（Ｄ．Ｎ．Ｇｌｏｖｅｒ編、１９８５）；Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｍ．Ｊ．Ｇａｉｔ編、１９８４）；Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ（Ｂ．Ｄ．ＨａｍｅｓおよびＳ．Ｊ．Ｈｉｇｇｉｎｓ編、１９８４）；Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ（Ｒ．Ｋ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙ編、１９８６）；Ｉｍｍｏｂｉｌｉｚｅｄ Ｃｅｌｌｓ ａｎｄ Ｅｎｚｙｍｅｓ（ＩＲＬ ｐｒｅｓｓ、１９８６）；Ｐｅｒｂａｌ，Ｂ．、Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ（１９８４）；シリーズ、Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ（Ｓ．ＣｏｌｏｗｉｃｋおよびＮ．Ｋａｐｌａｎ編、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．）；Ｐｒｏｔｅｉｎ ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｍｅｔｈｏｄｓ−ａ ｐｒａｃｔｉｃａｌ ａｐｐｒｏａｃｈ（Ｅ．Ｌ．Ｖ．ＨａｒｒｉｓおよびＳ．Ａｎｇａｌ編、ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ、Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ）；およびＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、第Ｉ−ＩＶ巻（Ｄ．Ｍ．ＷｅｉｒおよびＣ．Ｃ．Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ編、１９８６、Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ）を参照されたい。
本発明が特定のＤＮＡ、ポリペプチド配列またはプロセスパラメータに限定されないことを理解されたい、というのも、そういったものは当然のことながら変動し得るからである。また、本明細書中で使用される用語は単に本発明の特定の実施形態を説明するためのものに過ぎず、限定を意図するものではない、ということも理解されたい。本明細書および添付の特許請求の範囲で使用されているように、単数形「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」は、内容から明確に別段の規定がされない限り、複数の指示対象を含むことに留意されたい。したがって、例えば、「抗原」への言及は、２つ以上の抗原の混合物を含み、「賦形剤」への言及は、２つ以上の賦形剤の混合物などを含む。
本出願において互換的に使用される「免疫原性組成物もしくは免疫学的組成物、またはワクチン」は、組成物に対する細胞または抗体を媒介する免疫応答の宿主において免疫応答を引き出す、本発明の少なくとも１つのペスチウイルスまたはその免疫原性部分を含む物質の組成物を指す。本発明の好ましい実施形態では、免疫原性組成物は、免疫応答を誘導し、より好ましくは、ＣＴ感染の１つ以上の臨床兆候に対する保護免疫を付与する。
本明細書において使用する「免疫原性」または「抗原」は、本明細書に記載の免疫応答を引き出すポリペプチドまたはタンパク質を指す。これには、細胞性および／または体液性の免疫応答が含まれる。組成物の企図された機能に応じて、１つ以上の抗原が含まれてもよい。「免疫原性」のペスチウイルスタンパク質またはポリペプチドは、本明細書において特定されたペスチウイルスのいずれかの完全長配列、またはその類似体もしくは免疫原性断片を含む。本出願において互換的に使用される「免疫原性断片」または「免疫原性部分」という用語は、１つ以上のエピトープを含む、したがって本明細書に記載の免疫学的応答を引き出す、ペスチウイルスの断片または切断形態および／もしくは置換形態を指す。通常、そのような切断形態および／もしくは置換形態、または断片は、完全長ペスチウイルスタンパク質由来の少なくとも６個の連続したアミノ酸を含む。より好ましくは、切断形態もしくは置換形態、または断片は、全長ペスチウイルスタンパク質由来の少なくとも１０個、より好ましくは少なくとも１５個、さらにより好ましくは少なくとも１９個の連続したアミノ酸を有する。そのような断片は、当該技術分野で周知である任意の数のエピトープマッピング技法を用いて同定することができる。例えば、Ｅｐｉｔｏｐｅ Ｍａｐｐｉｎｇ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、第６６巻（Ｇｌｅｎｎ Ｅ．Ｍｏｒｒｉｓ編、１９９６）Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ、Ｔｏｔｏｗａ、Ｎｅｗ Ｊｅｒｓｅｙを参照されたい。例えば、線状エピトープは、タンパク質分子の一部に対応する固体支持体上で多数のペプチドを同時に合成し、ペプチドが支持体に結合したままでペプチドを抗体と反応させることによって、決定することができる。このような技法は当該技術分野で既知であり記載がなされており、例えば、米国特許第４，７０８，８７１号；Ｇｅｙｓｅｎら（１９８４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８１：３９９８−４００２；およびＧｅｙｓｅｎら（１９８６）Ｍｏｌｅｃ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２３：７０９−７１５を参照されたい。同様に、立体配座エピトープは、例えば、Ｘ線結晶学および二次元核磁気共鳴などでアミノ酸の空間的立体配座を決定することによって容易に同定される。上記のエピトープマッピングプロトコルを参照されたい。合成抗原、例えば、ポリエピトープ、隣接エピトープおよびその他の組換えまたは合成に由来する抗原も定義に含まれる。例えば、Ｂｅｒｇｍａｎｎら（１９９３）Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２３：２７７７−２７８１；Ｂｅｒｇｍａｎｎら（１９９６）、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５７：３２４２−３２４９；Ｓｕｈｒｂｉｅｒ，Ａ．（１９９７）、Ｉｍｍｕｎｏｌ．ａｎｄ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．７５：４０２−４０８；およびＧａｒｄｎｅｒら（１９９８）第１２回世界エイズ会議、ジュネーブ、スイス、１９９８年６月２８日〜７月３日を参照されたい。（その教示および内容は全て参照により本明細書に組み込まれる）。
本明細書中で使用される「ワクチン」という用語は、動物において免疫応答を誘導する少なくとも１つの免疫学的活性成分を含むと共に、活性成分の免疫学的活性を増強する１つ以上の追加成分を必ずではないにしても可能性として含む、医薬組成物を指す。ワクチンはさらに、医薬組成物に典型的なさらなる成分を含んでもよい。明確にするために記すが、ワクチンの免疫学的活性成分は、完全なウイルス粒子を、それらの元の形態で、またはいわゆる改変生ワクチン（ＭＬＶ）中の弱毒化粒子として、もしくはいわゆる死滅ワクチン（ＫＶ）中の適切な方法で不活化された粒子として、含み得る。別の形態では、ワクチンの免疫学的活性成分は生物の適切な要素を含み得（サブユニットワクチン）、ここで、これらの要素は、完全粒子またはそのような粒子を含有する増殖培養物を破壊し場合によりそれに続いて精製ステップを行って所望の（１つ以上の）構造体を得ることまたは、例えば細菌、昆虫、哺乳動物もしくはその他の種に基づく適切な系の使用による適切な操作と場合によりそれに続く単離および精製の手順とを含む合成プロセスを行うことまたは、適切な医薬組成物を使用して遺伝物質を直接組み込むこと（ポリヌクレオチドワクチン接種）によりワクチンを必要としている動物における合成プロセスを誘導することにより、生成するものである。ワクチンは、上記要素のうちの１つを含んでもよく、またはそのうちの２つ以上を同時に含んでもよい。本明細書において理解されるように、用語「ワクチン」は、抗原物質を含む、獣医学的使用のための改変生弱毒化ワクチンであり、ペスチウイルス感染によって引き起こされる疾患に対して特異的かつ活性な免疫を誘導する目的で投与される。不活化ペスチウイルスまたは弱毒化ペスチウイルス、特に、本明細書に記載の不活化ペスチウイルスまたは改変生弱毒化ペスチウイルスは、それが含有している免疫原に対する母系抗体（ｍａｔｅｒｎａｌ ａｎｔｉｂｏｄｙ）（時には、抗原関連生物にも対する母系抗体）によって受動的に移され得る活性免疫を付与する。
本明細書中で使用される場合、用語「不活化」または「死滅」は同義語として使用される。不活化の様々な物理的および化学的な方法が当該技術分野で知られている。「不活化」という用語は、照射され（紫外線（ＵＶ）、Ｘ線、電子線またはガンマ線）、加熱され、または化学処理されて不活化、死滅しているがその免疫原性は保持している、以前に毒性であったウイルスもしくは非毒性ウイルスまたは細菌を指す。一実施形態では、本明細書中に開示される不活化ウイルスは、不活化剤による処理によって不活化される。適する不活化剤としては、例えば、ベータプロピオラクトン、バイナリーエチレンイミンまたはベータ−エチレンイミンまたはアセチル−エチレンイミン、グルタルアルデヒド、オゾン、およびホルマリン（ホルムアルデヒド）が挙げられる。
ホルマリンまたはホルムアルデヒドによる不活化に関して、ホルムアルデヒドは典型的には水およびメチルアルコールと混合されてホルマリンを生成している。メチルアルコールの添加は、活性化プロセス中の分解または交差反応を防止する。一実施形態では、ウイルスまたは細菌を不活化するためにホルムアルデヒドの３７％溶液の約０．１〜１％が使用される。高用量による副作用が起こらない程度に材料を不活化することを確実にするためにホルマリンの量を調節することは必須である。
より好ましい不活化方法は、エチレンイミンおよび関連する誘導体、例えばバイナリーエチレンイミン（ＢＥＩ）およびアセチルエチレンイミンの使用であり、それはペスチウイルスの不活化において使用するための適切な化学的不活化剤の例である。その他の化学的不活化剤、例えば、ベータプロピオラクトン、アルデヒド（ホルムアルデヒドなど）および／または洗剤（例えば、ＴＷＥＥＮ（登録商標）洗剤、ＴＲＩＴＯＮ（登録商標）Ｘ、またはアルキルトリメチルアンモニウム塩）を使用してウイルスを不活化することもできる。不活化は、当業者に既知の標準的な方法を用いて行うことができる。定期的な時間間隔で試料を採取し、残存する生ウイルスを検査することができる。適切な細胞株に対する細胞変性効果および／または適切な特異的モノクローナルまたはポリクローナル抗体による蛍光染色をモニタリングすることを用いて、残存する生ウイルスの存在を検出することができる。あるいは、連続継代培養での定量的リアルタイムＰＣＲによってモニタリングされる増殖を利用して、残存する感染性ウイルスの存在を判定することができる。
ＢＥＩによる不活化は、ＢＥＩ原液（例えば、０．１〜０．２Ｍの２−ブロモ−エチルアミン臭化水素酸塩を０．１〜０．２ＮのＮａＯＨ水溶液に添加することにより形成される溶液）をウイルス流体と合わせてＢＥＩを約１〜５ｍＭの終濃度にすることによって達成することができる。不活化は、通常、ＢＥＩ−ウイルス混合物を３５〜４０℃（例えば、３７℃）に保持して約２４〜７２時間定常的に混合することによって行われる。ウイルス不活化は、チオ硫酸ナトリウム溶液をＢＥＩ濃度の過剰な終濃度に対して添加し（例えば、ＢＥＩの体積の１７％のチオ硫酸ナトリウムを添加して過剰なＢＥＩを中和し）、次いで混合することによって、停止させることができる。
より詳しく述べると、ウイルスとの関連において、用語「不活化された」は、ウイルスが生体内または試験管内で複製できないことを意味し、それぞれ、ウイルスとの関連において、用語「不活化された」は、ウイルスが生体内または試験管内で複製できないことを意味する。例えば、用語「不活化された」は、試験管内、例えば試験管内で増殖させ、その後に化学的または物理的手段を用いて複製がもはやできないように不活化させた、ウイルスを指す。別の例では、用語「不活化された」は、増殖させてその後に化学的または物理的手段を用いて不活化させたウイルスであって、その結果としてワクチンの成分として使用され得るウイルス、ウイルスの断片、またはウイルスの成分の懸濁液を生じる、ウイルスを指す。
「生ワクチン」という用語は、生きている、特に生きたウイルス活性成分を含むワクチンを指す。
「サブユニットワクチン」は、免疫系を最も刺激する抗原を含むことができる。場合によっては、これらのワクチンは、ペスチウイルスのＮｐｒｏ、カプシド、Ｅｒｎｓ、Ｅ１、Ｅ２、ＮＳ２−３、ヘリカーゼ、ＮＳ４Ｂ、ＮＳ５Ａおよび／もしくはＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ（ＲｄＲｐ）タンパク質、またはこれらのタンパク質からのエピトープを使用する。サブユニットワクチンは、必須抗原のみを含有し、ペスチウイルスを構成するその他全ての分子を含有しないので、ワクチンに対する有害反応の可能性が低い。
サブユニットワクチンは、１〜１０個またはそれ以上の抗原、例えば、２、３、４、５、６、７、８または９個の抗原を含有することができる。技能を有する熟練者であれば、サブユニットワクチンを作る方法を理解するであろう。例えば、組換えＤＮＡ技術を用いて抗原分子を発現させることができる。このようにして作られたワクチンは、「組換えサブユニットワクチン」と呼ばれる。
「医薬組成物」は、それが投与される生物の、またはその生物の中または上で生きている生物の生理学的、例えば免疫学的機能を改変することのできる１つ以上の成分から本質的に構成される。その用語には、制限されないが、抗生物質または抗寄生虫剤および、他の特定の目的、限定されないが例えば、処理特性、滅菌性、安定性、経腸経路または非経口経路（例えば、経口、鼻腔内、静脈内、筋肉内、皮下、皮内またはその他の適切な経路）による組成物の投与の実現可能性、投与後の寛容性、または放出特性を達成するために一般的に使用されるその他の成分が含まれる。実証目的のためだけに与えられるそのような医薬組成物の１つの非限定的な例は、以下のようにして調製することができよう：感染細胞培養物の細胞培養上清を安定剤（例えば、スペルミジンおよび／またはウシ血清アルブミン（ＢＳＡ））と混合し、混合物を凍結乾燥するかまたはその他の方法で脱水する。次いで、ワクチン接種の前に、混合物を水性溶液（例えば、生理食塩水、リン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ））または非水溶液（例えば、油エマルジョン、アルミニウム系アジュバント）で再水和させる。
本明細書において使用される場合、「薬学的または獣医学的に許容可能なキャリア」には、任意のあらゆる溶媒、分散媒体、コーティング、アジュバント、安定化剤、希釈剤、保存剤、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤、吸着遅延剤などが含まれる。いくつかの好ましい態様、特に、凍結乾燥させた免疫原性組成物を含む態様では、本発明で使用するための安定化剤は凍結乾燥または凍結乾燥のための安定化剤を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の免疫原性組成物はアジュバントを含有する。本明細書において使用される「アジュバント」としては、例えば、水酸化アルミニウムおよびリン酸アルミニウム、サポニン、例えば、Ｑｕｉｌ Ａ、ＱＳ−２１（Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ Ｉｎｃ．、Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ ＭＡ）、ＧＰＩ−０１００（Ｇａｌｅｎｉｃａ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ、Ｉｎｃ．、Ｂｉｒｍｉｎｇｈａｍ、ＡＬ）、油中水エマルジョン、水中油エマルジョン、水中油中水エマルジョンを挙げることができる。エマルジョンは、特に、軽質流動パラフィン油（Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｐｈａｒｍａｃｏｐｅａタイプ）；イソプレノイド油、例えばスクアランまたはスクアレン；アルケン、特にイソブテンまたはデセンのオリゴマー化によって生じる油；直鎖アルキル基を含有する酸またはアルコールのエステル、より詳しくは、植物油、オレイン酸エチル、ジ−（カプリル酸／カプリン酸）プロピレングリコール、トリ−（カプリル酸／カプリン酸）グリセリル、またはジオレイン酸プロピレングリコール；分岐状の脂肪酸またはアルコールのエステル、特にイソステアリン酸エステルをベースとすることができる。油は、エマルジョンを形成するために乳化剤と組み合わせて使用する。乳化剤は、好ましくは、非イオン性界面活性剤、特に、ソルビタンのエステル、マンニドのエステル（例えば、無水マンニトールオレアート）、グリコールのエステル、ポリグリセロールのエステル、プロピレングリコールのエステルおよび、（場合によってエトキシ化された）オレイン酸、イソステアリン酸、リシノレイン酸またはヒドロキシステアリン酸のエステル、およびポリオキシプロピレン−ポリオキシエチレンコポリマーブロック、特にＰｌｕｒｏｎｉｃ製品、特にＬ１２１である。Ｈｕｎｔｅｒら、Ｔｈｅ Ｔｈｅｏｒｙ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ Ａｄｊｕｖａｎｔｓ（Ｅｄ．Ｓｔｅｗａｒｔ−Ｔｕｌｌ、Ｄ．Ｅ．Ｓ．）、ＪｏｈｎＷｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ、ＮＹ、ｐｐ．５１−９４（１９９５）、およびＴｏｄｄら、Ｖａｃｃｉｎｅ １５：５６４−５７０（１９９７）を参照されたい。典型的なアジュバントは、Ｍ．ＰｏｗｅｌｌおよびＭ．Ｎｅｗｍａｎによって編集された「Ｖａｃｃｉｎｅ Ｄｅｓｉｇｎ，Ｔｈｅ Ｓｕｂｕｎｉｔ ａｎｄ Ａｄｊｕｖａｎｔ Ａｐｐｒｏａｃｈ」、Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ、１９９５の１４７頁に記載されているＳＰＴエマルジョンならびにこれと同じ書籍の１８３頁に記載されているエマルジョンＭＦ５９である。
アジュバントのさらなる例は、アクリル酸またはメタクリル酸のポリマー、および無水マレイン酸とアルケニル誘導体とのコポリマーから選択される化合物である。有益なアジュバント化合物は、架橋している、特に糖または多価アルコールのポリアルケニルエーテルと架橋している、アクリル酸またはメタクリル酸のポリマーである。これらの化合物はカルボマーという用語で知られている（Ｐｈａｍｅｕｒｏｐａ 第８巻、第２号、１９９６年６月）。当業者は米国特許第２，９０９，４６２号を参照することもでき、それは、少なくとも３個のヒドロキシル基、好ましくは８個以下のヒドロキシル基を有するポリヒドロキシル化化合物で架橋されたそのようなアクリルポリマーを記載したものであり、少なくとも３つのヒドロキシルの水素原子が、少なくとも２つの炭素原子を有する不飽和脂肪族ラジカルで置き換えられている。好ましいラジカルは、２〜４個の炭素原子を含有するもの、例えば、ビニル、アリルおよびその他のエチレン性不飽和基である。不飽和ラジカルはそれら自体がメチルなどの他の置換基を含有していてもよい。カーボポールという名称で販売されている製品；（ＢＦ Ｇｏｏｄｒｉｃｈ、オハイオ州、米国）が特に適する。それらは、アリルスクロースまたはアリルペンタエリスリトールで架橋されている。その中でも、カーボポール９７４Ｐ、９３４Ｐおよび９７１Ｐが挙げられ得る。最も好ましいのはカーボポール９７１Ｐの使用である。無水マレイン酸とアルケニル誘導体とのコポリマーの中には、コポリマーＥＭＡ（Ｍｏｎｓａｎｔｏ）があり、それは無水マレイン酸とエチレンとのコポリマーである。水中にこれらのポリマーを溶解させると、免疫原性組成物、免疫学的組成物またはワクチン組成物自体を中に組み込むことになるアジュバント溶液を得るために（好ましくは生理学的ｐＨに）中和されることになる酸性溶液をもたらす。
さらに適するアジュバントとしては、限定されないが数ある中でも例えば、ＲＩＢＩアジュバント系（Ｒｉｂｉ Ｉｎｃ．）、ブロックコポリマー（ＣｙｔＲｘ、Ａｔｌａｎｔａ ＧＡ）、ＳＡＦ−Ｍ（Ｃｈｉｒｏｎ、Ｅｍｅｒｙｖｉｌｌｅ ＣＡ）、モノホスホリルリピドＡ、アブリジン脂質アミンアジュバント、大腸菌（組換え体その他）由来の熱依存性腸毒素、コレラ毒素、ＩＭＳ１３１４もしくはムラミルジペプチドまたは、天然もしくは組換えのサイトカインもしくはそれらの類似体、または内因性サイトカイン放出の刺激剤が挙げられる。
アジュバントは、単回用量当たり約１００μｇ〜約１０ｍｇの量、好ましくは単回用量当たり約１００μｇ〜約１０ｍｇの量、より好ましくは単回用量当たり約５００μｇ〜約５ｍｇの量、よりいっそう好ましくは単回用量当たり約７５０μｇ〜約２．５ｍｇの量、最も好ましくは単回用量当たり約１ｍｇの量で添加できると期待される。あるいは、アジュバントは、最終製品の体積の約０．０１〜５０％の濃度、好ましくは約２〜３０％の濃度、より好ましくは約５〜２５％の濃度、さらにより好ましくは約７〜２２％の濃度、最も好ましくは１０〜２０％の濃度であり得る。
「希釈剤」としては、例えば、水、生理食塩水、デキストロース、エタノール、グリセロールなどを挙げることができる。等張剤としては、数ある中でも例えば、塩化ナトリウム、デキストロース、マンニトール、ソルビトールおよびラクトースを挙げることができる。安定剤としては、数ある中でも例えば、アルブミンおよび、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）のアルカリ塩が挙げられる。
「単離」されたとは、「人の手によって」その自然な状態から変化したこと、すなわち、自然界で起こる場合、それに対して本来の環境からの変更または移動またはその両方がなされたことを意味する。例えば、生体内に天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは「単離」されていないが、その天然状態の共存物質から分離された同じポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、本明細書中で使用する用語で言うところの「単離」がされている。
「弱毒化」とは、病原体の毒性を低減することを意味する。本発明において、弱毒化ウイルスは、ペスチウイルス感染の臨床兆候を引き起こさないが標的哺乳動物の免疫応答を誘導することができるように毒性が低減されたウイルスである。しかしながら弱毒化ウイルスはまた、弱毒化されていない野生型ペスチウイルスに感染しておりかつ不活化または弱毒化されたウイルスを受けていない動物の「対照グループ」と比較して、不活化または弱毒化されたペスチウイルスに感染した動物の臨床兆候が発生率または重症度において低減される、ということも意味し得る。これに関連して、用語「低減する／低減される」は、上に定義される対照グループと比較して少なくとも１０％、好ましくは２５％、さらにいっそう好ましくは５０％、さらにより好ましくは６０％、さらにいっそう好ましくは７０％、さらにより好ましくは８０％、さらにいっそう好ましくは９０％、最も好ましくは１００％の低減を意味する。したがって、不活化され、弱毒化されかつ／または無毒性であるペスチウイルス分離株は、不活化ペスチウイルスまたは改変生ペスチウイルスを含む免疫原性組成物への組み込みに適している。
「弱毒化ウイルス」は、生存能力のある（「生」）ウイルスであり、それは、例えば、特定の細胞株でのウイルスの継代培養またはウイルスゲノムの遺伝子操作によって感染因子の毒性を低減させたものである。ウイルスの弱毒化は、その毒性（病原性）に関係するが、必ずしもウイルスの複製能力に影響を及ぼすわけではない。弱毒化されたウイルスは依然として複製することができる。したがって、それは、特定の疾患を引き起こすことなく免疫応答を開始させるように病原性が低減されたウイルスの株であり得る。本発明との関連において、弱毒化ウイルスは、毒性に関与する少なくとも１つの遺伝子またはタンパク質を不活性化することによってその病原性が排除または低減されたペスチウイルスであり得る。本発明において、「弱毒化」は「無毒性」と同義である。これに関して、用語「低減する／低減された」は、対照グループと比較して病原性の少なくとも１０％、好ましくは２５％、さらにいっそう好ましくは５０％、さらにより好ましくは６０％、さらにいっそう好ましくは７０％、さらにより好ましくは８０％、さらにいっそう好ましくは９０％、最も好ましくは１００％の低減を意味する。
「改変生」とは、当該技術分野で知られているいくつかの方法のうちのいずれか、例えば、限定されないが、細胞培養における反復継代；通常の制限温度での増殖への強制適応；化学的突然変異原で処理して多数の突然変異を強制的に起こし、所望の特性を選択すること；およびｒＤＮＡ技術を用いた遺伝子の欠失または挿入などによって、ウイルスの毒性が低減されていることを意味する。「非毒性」または「無毒性」という用語は、改変生ウイルスが投与された場合に感染の臨床兆候を低く呈するかまたは全く呈さないことを意味する。
「毒性」とは、ペスチウイルス分離株がペスチウイルスに関連する疾患を引き起こす能力を指す。毒性は、動物の疾患の進行を観察することによって評価することができる。ペスチウイルスの「毒性」株の一例は、本発明において記載され使用されている抗原投与用株によって例示される株である。
「無毒性」とは、毒性が欠如しているペスチウイルスの分離株を指す。すなわち、無毒性の菌株、分離株または構築物は非病原性であり、疾患を引き起こすことができない。本明細書中で使用される場合、用語「無毒性」は、用語「非毒性」と同義的に使用される。
本明細書中で使用される場合、用語「株」または「分離株」は互換的に使用される。
本明細書中で使用される場合、用語「野生型ペスチウイルス」は、ブタ、特に仔ブタにＣＴを引き起こすことができるものである感染性病原性ペスチウイルスを特に指す。特に好ましい一実施形態では、「野生型ウイルス」という用語は、そのゲノムがＲＮＡ配列を含むかまたはＲＮＡポリヌクレオチドからなる、ペスチウイルスを指し、ここで、上記のＲＮＡ配列またはＲＮＡポリヌクレオチドは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９または２１を含むポリヌクレオチドのＲＮＡ複製物である。いくつかの実施形態では、野生型ペスチウイルスは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０または２２を含むアミノ酸配列を含む。
本明細書において、「有効用量」とは、限定されないが、抗原が投与される動物において臨床症候の軽減をもたらす免疫応答を引き出すかまたは引き出せる、抗原の量を意味する。
本明細書中で使用される場合、組成物に関して、用語「有効量」は、動物における感染または疾患発生の発生率を低減するかまたは重症度を低下させる免疫応答を誘導することができる、免疫原性組成物の量を意味する。特に、有効量は、単回用量当たりの組織培養感染量５０またはプラーク形成単位で測定された力価を指す。あるいは、療法との関連において、「有効量」という用語は、疾患もしくは障害もしくは１つ以上のそれらの症候の重症度もしくは持続期間を低減もしくは改善すること、疾患もしくは障害の進行を防止すること、疾患もしくは障害の退行を引き起こすこと、疾患もしくは障害に関連する１つ以上の症候の再発、進展、発症もしくは進行を予防すること、または別の療法もしくは治療剤の予防もしくは処置を増強もしくは改善することのために十分となる療法の量を指す。
本明細書中で使用される「ペスチウイルスに対して免疫反応性」という用語は、ペプチドまたは断片がペスチウイルスに対する免疫応答を引き出すことを意味する。
用語「配列同一性」または「パーセント同一性」は、本明細書中では交換可能に使用される。本発明の目的のために、ここでは、２つのアミノ酸配列または２つの核酸配列のパーセント同一性を決定するには配列を最適な比較目的のために整列させることが規定される（例えば、第２のアミノまたは核酸配列との最適な整列のために第１のアミノ酸または核酸の中にギャップを導入することができる）。次いで、対応するアミノ酸またはヌクレオチドの位置においてアミノ酸またはヌクレオチド残基を比較する。第１の配列中の位置が、第２の配列中の対応する位置と同じアミノ酸またはヌクレオチド残基によって占有される場合、分子はその位置において同一である。２つの配列間の同一性パーセントは、配列によって共有される同一位置の数の関数（すなわち、％同一性＝同一位置の数／位置の総数（すなわち重複する位置）×１００）である。好ましくは、２つの配列は長さが同じである。
本明細書中で使用される場合、「配列相同性」は、２つの配列の関連性を決定する方法を指す。配列相同性を決定するには、２つ以上の配列を最適に整列させ、必要に応じてギャップを導入する。しかし、「配列同一性」とは対照的に、保存性アミノ酸置換は、配列相同性を決定する際に一致としてカウントされる。言い換えれば、基準配列との９５％の配列相同性を有するポリペプチドまたはポリヌクレオチドを得るためには、基準配列中のアミノ酸残基またはヌクレオチドの８５％、好ましくは９０％、さらにいっそう好ましくは９５％が一致するかまたは別のアミノ酸またはヌクレオチドによる保存性置換を含んでいなければならず、または、基準配列中の保存性置換を含まない全てのアミノ酸残基またはヌクレオチドの１５％以下、好ましくは１０％以下、さらにいっそう好ましくは５％以下の数のアミノ酸またはヌクレオチドが、基準配列の中に挿入されていてもよい。好ましくは、相同配列は、少なくとも５０個分、さらにいっそう好ましくは１００個分、さらにいっそう好ましくは２５０個分、さらにいっそう好ましくは５００個分の長さのヌクレオチドを含む。
「保存性置換」は、全体的な機能性が著しく変化しないようにアミノ酸残基が、大きさ、疎水性などを含めた特徴または特性が類似している別のアミノ酸残基によって置換されることを指す。
当業者であれば、いくつかの異なるコンピュータプログラムを利用して２つの配列間の相同性が決定されるという事実に気付くであろう。例えば、配列の比較および２つの配列間のパーセント同一性の決定は、数学的アルゴリズムを使用して達成することができる。好ましい実施形態では、２つのアミノ酸配列間または核酸配列間のパーセント同一性は、Ａｃｃｅｌｒｙｓ ＧＣＧソフトウェアパッケージ（ｗｗｗ．ａｃｃｅｌｒｙｓ．ｃｏｍ／ｐｒｏｄｕｃｔｓ／ｇｃｇから入手可能）のＧＡＰプログラムに組み込まれているＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．（４８）：４４４−４５３（１９７０））のアルゴリズムを使用して、Ｂｌｏｓｕｍ６２行列またはＰＡＭ２５０行列、ならびに１６、１４、１２、１０、８、６または４のギャップ重みおよび１、２、３、４、５または６の長さ重みを使用して決定される。当業者であれば、これらの種々のパラメーターは全て、わずかに異なる結果を生じることになるが、異なるアルゴリズムを使用する場合に２つの配列の全体的なパーセント同一性は著しく変化しない、ということを理解するであろう。
配列比較は、比較される２つの配列の全長に亘って行われてもよく、または２つの配列の断片に亘って行われてもよい。典型的には、比較は、比較される２つの配列の全長に亘って行われる。しかし、配列同一性は、例えば２０、５０、１００またはそれ以上の連続アミノ酸残基の領域に亘って行われ得る。
当該技術分野において知られている「配列同一性」は、２つ以上のポリペプチド配列の間、または２つ以上のポリヌクレオチド配列の間、すなわち基準配列と、基準配列と比較される所与の配列との間での関係を指す。配列同一性は、そのような配列の並び同士での一致によって決定されるように、配列を最適に整列させて最も高い配列類似度を生じた後に所与の配列を基準配列と比較することによって決定される。そのような整列にあたって配列同一性は位置ごとに確認され、例えば、特定の位置でヌクレオチドまたはアミノ酸残基が同一であるならば配列はその位置で「同一」である。次いで、そのような位置同一性の総数を基準配列中のヌクレオチドまたは残基の総数で割って、％配列同一性を得る。配列同一性は、既知の方法、限定されないが例えば、Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｌｅｓｋ，Ａ．Ｎ．編、Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８８）、Ｂｉｏｃｏｍｐｕｔｉｎｇ：Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｇｅｎｏｍｅ Ｐｒｏｊｅｃｔｓ、Ｓｍｉｔｈ，Ｄ．Ｗ．編、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９９３）；Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｄａｔａ、第Ｉ部、Ｇｒｉｆｆｉｎ，Ａ．Ｍ．およびＧｒｉｆｆｉｎ，Ｈ．Ｇ．編、Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ Ｊｅｒｓｅｙ（１９９４）；Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、ｖｏｎ Ｈｅｉｎｇｅ，Ｇ．、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ（１９８７）；Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｐｒｉｍｅｒ、Ｇｒｉｂｓｋｏｖ，Ｍ．およびＤｅｖｅｒｅｕｘ，Ｊ．編、Ｍ．Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９９１）；ならびにＣａｒｉｌｌｏ，Ｈ．およびＬｉｐｍａｎ，Ｄ．、ＳＩＡＭ Ｊ．Ａｐｐｌｉｅｄ Ｍａｔｈ．、４８：１０７３（１９８８）（その教示は参照により本明細書に組み込まれる）に記載されている方法によって容易に計算することができる。配列同一性を決定するための好ましい方法は、試験される配列間で最大の一致を与えるように計画される。配列同一性を決定する方法は、所与の配列間の配列同一性を決定する公的に利用可能なコンピュータプログラムにおいて体系化されている。そのようなプログラムの例としては、限定されないが、ＧＣＧプログラムパッケージ（Ｄｅｖｅｒｅｕｘ，Ｊ．ら、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ、１２（１）：３８７（１９８４））、ＢＬＡＳＴＰ、ＢＬＡＳＴＮおよびＦＡＳＴＡ（Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｓ．Ｆ．ら、Ｊ．Ｍｏｌｅｃ．Ｂｉｏｌ．、２１５：４０３−４１０（１９９０）が挙げられる。ＢＬＡＳＴＸプログラムは、ＮＣＢＩおよびその他の提供元から公的に入手可能である（ＢＬＡＳＴ Ｍａｎｕａｌ、Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｓ．ら、ＮＣＶＩ ＮＬＭ ＮＩＨ Ｂｅｔｈｅｓｄａ、ＭＤ ２０８９４、Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｓ．Ｆ．ら、Ｊ．Ｍｏｌｅｃ．Ｂｉｏｌ．、２１５：４０３−４１０（１９９０）、その教示は参照により本明細書に組み込まれる）。これらのプログラムは、所与の配列と基準配列との間で最も高いレベルの配列同一性を生むべくデフォルトのギャップ重みを使用して配列を最適に整列させる。例として、基準ヌクレオチド配列に対して少なくとも例えば９５％、例えば少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の「配列同一性」を有するヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドが意味するところは、所与のポリヌクレオチド配列が参照ヌクレオチド配列の各１００ヌクレオチド当たり多くて５、４、３、２、１または０個の点突然変異を含み得ることを除けば所与のポリヌクレオチド配列のヌクレオチド配列が基準配列と同一である、ということである。言い換えれば、基準ヌクレオチド配列に対して少なくとも９５％、例えば少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有するヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドでは、基準配列中のヌクレオチドの多くて５％、４％、３％、２％、１％もしくは０％に欠失もしくは別のヌクレオチドによる置換がなされていてもよく、または基準配列中の全ヌクレオチドの多くて５％、４％、３％、２％、１％もしくは０％の数のヌクレオチドが基準配列の中に挿入されていてもよい。基準配列のこれらの突然変異は、基準ヌクレオチド配列の５’または３’末端位置で起こってもよく、または基準配列中のヌクレオチド間に個々に散在しているかもしくは基準配列内の１つ以上の連続したグループに散在しているそれらの末端位置間のどこで起こってもよい。同様に、基準アミノ酸配列に対して少なくとも例えば９５％、例えば少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する所与のアミノ酸配列を有するポリペプチドの意味するところは、所与のポリペプチド配列が基準アミノ酸配列の各１００アミノ酸当たり多くて５、４、３、２、１または０個のアミノ酸変化を含み得ることを除けばポリペプチドの所与のアミノ酸配列が基準配列と同一である、ということである。言い換えれば、基準アミノ酸配列と少なくとも９５％、例えば少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する所与のポリペプチド配列を得るには、基準配列中のアミノ酸残基の多くて５％、４％、３％、２％、１％もしくは０％に欠失もしくは別のアミノ酸による置換がなされていてもよく、または基準配列中のアミノ酸残基の総数の５％、４％、３％、２％、１％もしくは０％の数のアミノ酸が基準配列の中に挿入されていてもよい。基準配列のこれらの変化は、基準アミノ酸配列のアミノ末端もしくはカルボキシ末端の位置で起こってもよく、または基準配列中の残基間に個々に散在しているかもしくは基準配列内の１つ以上の連続したグループに散在しているそれらの末端位置間のどこで起こってもよい。好ましくは、同一でない残基位置は、保存性アミノ酸置換により異なっている。しかし、保存性置換は、配列同一性を決定する場合には一致として含まれない。
本発明との関連において「突然変異」という用語は、ペスチウイルスのゲノム配列、特にＲＮＡ配列における変更として理解される。遺伝物質としてＲＮＡを使用するウイルスは突然変異速度が速いため、本明細書で言及される場合の用語「突然変異」は、特に、遺伝子操作によるゲノム配列の変更を指し、例えば、クローニングによるもの、強制組換えによるもの、突然変異原の存在下での増殖によるもの、または実験的にゲノムを変化させるために用いられるその他の技法であって特に同じ条件下で増殖させたときに感染宿主においてウイルスを野生型ペスチウイルスよりも有意に低い力価に増殖させる技法によるものを指す。さらに、別の好ましい実施形態では、本明細書に記載の突然変異は、本発明のペスチウイルスの自然突然変異およびその後の単離によって引き起こさすこともでき、その場合、上記単離のなされたウイルスは本明細書に記載の突然変異を含む。
本発明のタンパク質配列または核酸配列はさらに、例えば他のファミリーメンバーまたは関連配列を同定するために、公共データベースに対する検索を実施するための「クエリ配列」として使用することができる。そのような検索は、Ａｌｔｓｃｈｕｌら（１９９０）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−１０のＢＬＡＳＴＮおよびＢＬＡＳＴＰプログラム（バージョン２．０）を用いて実施することができる。本発明のタンパク質分子と相同なアミノ酸配列を得るために、ＢＬＡＳＴＰプログラム、スコア＝５０、ワード長＝３を用いてＢＬＡＳＴタンパク質検索を行うことができる。ギャップを有する整列を比較目的のために得るには、Ａｌｔｓｃｈｕｌら（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５（１７）：３３８９−３４０２に記載されているようなＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴを利用することができる。ＢＬＡＳＴおよびＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム（例えば、ＢＬＡＳＴＰおよびＢＬＡＳＴＮ）のデフォルトパラメーターを使用することができる。国立生物工学情報センターのホームページをｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖで参照されたい。
当該技術分野において既知の用語「ベクター」は、遺伝物質を宿主細胞に送達するために使用されるポリヌクレオチド構築物、典型的にはプラスミドまたはウイルスを指す。ベクターは、例えば、ウイルス、プラスミド、コスミドまたはファージとすることができる。本明細書において使用するベクターは、ＤＮＡまたはＲＮＡのどちらかからなることができる。いくつかの実施形態では、ベクターはＤＮＡからなる。「発現ベクター」は、ベクターが適切な環境に存在しているときに、ベクターが保有する１つ以上の遺伝子によってコードされるタンパク質の発現を導くことができるベクターである。ベクターは自律的複製が可能であることが好ましい。典型的には、発現ベクターは、転写プロモーター、遺伝子、および転写ターミネーターを含む。遺伝子発現は通常はプロモーターの制御下に置かれ、遺伝子がプロモーターに「操作可能に連結されている」と言われる。
本明細書中で使用される場合、用語「操作可能に連結されている」は、調節エレメントと遺伝子またはそのコード領域との間での連結を表現するために使用される。典型的には、遺伝子発現は、１つ以上の調節エレメント、限定されないが例えば、構成性プロモーターまたは誘導性プロモーター、組織特異的調節エレメント、およびエンハンサーの制御下に置かれる。遺伝子またはコード領域は、遺伝子またはコード領域が調節エレメントによって制御または影響されるという意味で、調節エレメントに「操作可能に連結されている」または「操作的に連結されている」または「操作可能に関連付けられている」と言われる。例えば、プロモーターがコード配列の転写または発現に影響を与えるならば、プロモーターはコード配列に操作可能に連結されている。
本明細書中で使用される用語「構築物（ｃｏｎｓｔｒｕｃｔ）」は、特定の（１つ以上の）ヌクレオチド配列の発現のために生成されたかまたは他の組換えヌクレオチド配列の構築に使用されることになる、組換え核酸を指す。
発現のためのベクター（または組換え体）を作製および／または使用するためのベクターおよび方法は、とりわけＤＮＡ発現ベクターに関する米国特許第４，６０３，１１２号、第４，７６９，３３０号、第５，１７４，９９３号、第５，５０５，９４１号、第５，３３８，６８３号、第５，４９４，８０７号、第４，７２２，８４８号、第５，９４２，２３５号、第５，３６４，７７３号、第５，７６２，９３８号、第５，７７０，２１２号、第５，９４２，２３５号、第３８２，４２５号、国際公開第９４／１６７１６号パンフレット、第９６／３９４９１号パンフレット、第９５／３００１８号パンフレット；Ｐａｏｌｅｔｔｉ、「Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｐｏｘ ｖｉｒｕｓ ｖｅｃｔｏｒｓ ｔｏ ｖａｃｃｉｎａｔｉｏｎ：Ａｎ ｕｐｄａｔｅ」、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：１１３４９−１１３５３、１９９６年１０月；Ｍｏｓｓ、「Ｇｅｎｅｔｉｃａｌｌｙ ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ ｐｏｘｖｉｒｕｓｅｓ ｆｏｒ ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ｖａｃｃｉｎａｔｉｏｎ，ａｎｄ ｓａｆｅｔｙ」、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：１１３４１−１１３４８、１９９６年１０月；Ｓｍｉｔｈら、米国特許第４，７４５，０５１号（組換えバキュロウイルス）；Ｒｉｃｈａｒｄｓｏｎ，Ｃ．Ｄ．（編集者）、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ３９、「Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ」（１９９５ Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ Ｉｎｃ．）；Ｓｍｉｔｈら、「Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｈｕｍａｎ Ｂｅｔａ Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ ｉｎ Ｉｎｓｅｃｔ Ｃｅｌｌｓ Ｉｎｆｅｃｔｅｄ ｗｉｔｈ ａ Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｖｅｃｔｏｒ」、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、１９８３年１２月、第３巻、Ｎｏ．１２、２１５６−２１６５頁；Ｐｅｎｎｏｃｋら、「Ｓｔｒｏｎｇ ａｎｄ Ｒｅｇｕｌａｔｅｄ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ Ｂ−Ｇａｌａｃｔｏｓｉｄａｓｅ ｉｎ Ｉｎｆｅｃｔ Ｃｅｌｌｓ ｗｉｔｈ ａ Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ ｖｅｃｔｏｒ」、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、１９８４年３月、第４巻、Ｎｏ．３、４０６頁；ＥＰＡ０ ３７０ ５７３；１９８６年１０月１６日に出願された米国特許出願第９２０，１９７号；ＥＰ特許公報第２６５７８５号；米国特許第４，７６９，３３１号（組換えヘルペスウイルス）；Ｒｏｉｚｍａｎ、「Ｔｈｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｏｆ ｈｅｒｐｅｓ ｓｉｍｐｌｅｘ ｖｉｒｕｓ ｇｅｎｅｓ： Ａ ｐｒｉｍｅｒ ｆｏｒ ｇｅｎｅｔｉｃ ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ｏｆ ｎｏｖｅｌ ｖｅｃｔｏｒｓ」、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：１１３０７−１１３１２、１９９６年１０月；Ａｎｄｒｅａｎｓｋｙら、「Ｔｈｅ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃａｌｌｙ ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ ｈｅｒｐｅｓ ｓｉｍｐｌｅｘ ｖｉｒｕｓｅｓ ｔｏ ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ ｂｒａｉｎ ｔｕｍｏｒｓ」、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：１１３１３−１１３１８、１９９６年１０月；Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎら、「Ｅｐｓｔｅｉｎ−Ｂａｒｒ ｖｉｒｕｓ ｖｅｃｔｏｒｓ ｆｏｒ ｇｅｎｅ ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｔｏ Ｂ ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅｓ」、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：１１３３４−１１３４０、１９９６年１０月；Ｆｒｏｌｏｖら、「Ａｌｐｈａｖｉｒｕｓ−ｂａｓｅｄ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｖｅｃｔｏｒｓ： Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ａｎｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ」、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：１１３７１−１１３７７、１９９６；Ｋｉｔｓｏｎら、Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．６５、３０６８−３０７５、１９９１；米国特許第５，５９１，４３９号、第５，５５２，１４３号；国際公開第９８／００１６６号パンフレット；特許許可済の米国特許出願第０８／６７５，５５６号および第０８／６７５，５６６号（どちらも１９９６年７月３日に出願（組換えアデノウイルス））；Ｇｒｕｎｈａｕｓら、１９９２、「Ａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ ａｓ ｃｌｏｎｉｎｇ ｖｅｃｔｏｒｓ」、Ｓｅｍｉｎａｒｓ ｉｎ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ ３：２３７−５２、１９９３；Ｂａｌｌａｙら、ＥＭＢＯ Ｊｏｕｒｎａｌ ４：３８６１−６５、Ｇｒａｈａｍ、Ｔｉｂｔｅｃｈ ８：８５−８７、１９９０；Ｐｒｅｖｅｃら、Ｊ．Ｇｅｎ Ｖｉｒｏｌ．７０：４２９−３４；国際公開第９１／１１５２５号パンフレット；Ｆｅｌｇｎｅｒら（１９９４）、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６９、２５５０−２５６１、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５９：１７４５−４９、１９９３；ならびにＭｃＣｌｅｍｅｎｔｓら、「Ｉｍｍｕｎｉｚａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ＤＮＡ ｖａｃｃｉｎｅｓ ｅｎｃｏｄｉｎｇ ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｄ ｏｒ ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｂ，ａｌｏｎｅ ｏｒ ｉｎ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ，ｉｎｄｕｃｅｓ ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ ｉｍｍｕｎｉｔｙ ｉｎ ａｎｉｍａｌ ｍｏｄｅｌｓ ｏｆ ｈｅｒｐｅｓ ｓｉｍｐｌｅｘ ｖｉｒｕｓ−２ ｄｉｓｅａｓｅ」、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：１１４１４−１１４２０、１９９６；ならびに米国特許第５，５９１，６３９号、第５，５８９，４６６号および第５，５８０，８５９号ならびに国際公開第９０／１１０９２号パンフレット、第９３／１９１８３号パンフレット、第９４／２１７９７号パンフレット、第９５／１１３０７号パンフレット、第９５／２０６６０号パンフレット；Ｔａｎｇら、Ｎａｔｕｒｅ、およびＦｕｒｔｈら、Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、に開示されている方法、またはそれらに類似するものとすることができる。また、国際公開第９８／３３５１０号パンフレット；Ｊｕら、Ｄｉａｂｅｔｏｌｏｇｉａ、４１：７３６−７３９、１９９８（レンチウイルス発現系）；Ｓａｎｆｏｒｄら、米国特許第４，９４５，０５０号；Ｆｉｓｃｈｂａｃｈｅｔら（Ｉｎｔｒａｃｅｌ）；国際公開第９０／０１５４３号パンフレット；Ｒｏｂｉｎｓｏｎら、Ｓｅｍｉｎａｒｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ 第９巻、２７１−２８３頁（１９９７）、（ＤＮＡベクター系）；Ｓｚｏｋａら、米国特許第４，３９４，４４８号（生細胞にＤＮＡを挿入する方法）；ＭｃＣｏｒｍｉｃｋら、米国特許第５，６７７，１７８号（細胞変性ウイルスの使用）；および米国特許第５，９２８，９１３号（遺伝子送達のためのベクター）；ならびに本明細書中で引用されるその他の文献も参照されたい。
本明細書中で使用される場合、用語「核酸」および「ポリヌクレオチド」は相互に交換可能であり、任意の核酸を指す。用語「核酸」および「ポリヌクレオチド」には、具体的には、５つの生物学的に生じる塩基（アデニン、グアニン、チミン、シトシンおよびウラシル）以外の塩基からなる核酸も含まれる。
用語「調節エレメント」および「発現制御エレメント」は互換的に使用され、特定の宿主生物において操作可能に連結されたコード配列の発現に影響を与えることのできる核酸分子を指す。これらの用語は、プロモーター、ＲＮＡポリメラーゼと転写因子との基本的相互作用に必要なコアエレメント、上流エレメント、エンハンサーおよび応答エレメントを含めた、転写を促進または調節する全てのエレメントに広く使用されかつそれらを包含する。原核生物において典型的な調節エレメントとしては、例えば、プロモーター、オペレーター配列およびリボソーム結合部位が挙げられる。真核生物において使用される調節エレメントとしては、限定されないが例えば、転写および翻訳の制御配列、例えば、宿主細胞においてコード配列の発現および／またはコードされたポリペプチドの産生を提供および／または調節する、プロモーター、エンハンサー、スプライシングシグナル、ポリアデニル化シグナル、ターミネーター、タンパク質分解シグナル、内部リボソーム進入エレメント（ＩＲＥＳ）、２Ａ配列などを挙げることができる。
本明細書中で使用される場合、用語「プロモーター」は、ＲＮＡポリメラーゼの結合を可能にして遺伝子の転写を導くヌクレオチド配列である。通常、プロモーターは、遺伝子の転写開始部位の近位にある、遺伝子の５’非コード領域に位置する。転写の開始において機能するプロモーター内の配列エレメントは、コンセンサスヌクレオチド配列を特徴としていることが多い。プロモーターの例としては、限定されないが、細菌、酵母、植物、ウイルスおよび哺乳動物（ヒトを含む）由来のプロモーターが挙げられる。プロモーターは、誘導性、抑制性および／または構成性であることができる。誘導性プロモーターは、温度変化などの培養条件の何らかの変化に応答して、それらの制御下でＤＮＡからの転写レベルの上昇を開始する。
本明細書中で使用される場合、用語「エンハンサー」は、転写の開始部位に対するエンハンサーの距離または配向にかかわらず転写効率を高めることができる、調節エレメントの一種を指す。
ウイルスベクターの生成は、当該技術分野で周知の任意の適切な遺伝子工学技法、例えば、限定されないが、制限エンドヌクレアーゼ消化、ライゲーション、形質転換、プラスミド精製およびＤＮＡ配列決定の標準的技法、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ．Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｎ．Ｙ．（１９８９））に記載されている技法を用いて成し遂げることができる。
ウイルスベクターは、任意の既知の生物のゲノムからの配列を組み込むことができる。配列は、それらの天然の形態で組み込むことができ、または所望の活性を得るために任意の方法で改変することができる。例えば、配列は、挿入、欠失または置換を含むことができる。
ウイルスベクターは、２つ以上の対象タンパク質のコード領域を含むことができる。例えば、ウイルスベクターは、第１対象タンパク質のコード領域と、第２対象タンパク質のコード領域とを含むことができる。第１対象タンパク質および第２対象タンパク質は、同じまたは異なったものであることができる。いくつかの実施形態では、ウイルスベクターは、第３または第４の対象タンパク質の（１つ以上の）コード領域を含むことができる。第３および第４の対象タンパク質は同じまたは異なったものであることができる。１つのウイルスベクターによってコードされる２つ以上の対象タンパク質の合計長は様々であることができる。例えば、２つ以上のタンパク質の合計長は、少なくとも約４００アミノ酸、少なくとも約４５０アミノ酸、少なくとも約５００アミノ酸、少なくとも約５５０アミノ酸、少なくとも約６００アミノ酸、少なくとも約６５０アミノ酸、少なくとも約７００アミノ酸、少なくとも約７５０アミノ酸、少なくとも約８００アミノ酸、またはそれ以上の長さであることができる。
好ましいウイルスベクターとしては、例えば、バキュロウイルス、例えばＢａｃｕｌｏＧｏｌｄ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、カリフォルニア州）、特に、生産細胞が昆虫細胞であることを条件とするものが挙げられる。バキュロウイルス発現系が好ましいが、その他の発現系が本発明の目的、すなわち細胞培養上清中へのＥまたはＥｒｎｓの発現のために機能することは当業者に理解される。そのような他の発現系は、培地中へのＥまたはＥｒｎｓの発現を引き起こすためにシグナル配列の使用を必要とすることがある。
用語「属内グループ（ｇｅｎｏｇｒｏｕｐ）」は、当該技術分野で知られているように、属内の関連ウイルスを指し；それはさらに、遺伝学的集団に細分することができる。同定されているペスチウイルス属の属内グループとしては、例えば、ボーダー病ウイルス、ウシ下痢ウイルス−１（ＢＶＤ−１）、ＢＶＤ−２、古典的なブタ熱ウイルス、およびその他の未分類のペスチウイルスが挙げられる。
用語「クレード（ｃｌａｄｅ）」は、当該技術分野で知られているように、祖先およびその全ての子孫からなるグループである、系統樹における単一の「枝」を指す。祖先は、一例として、個体、母集団または種であり得る。属内グループは多数のクレードを含むことができる。
「免疫応答」または「免疫学的応答」は、限定されないが、対象となる組成物またはワクチンに対する細胞性および／または抗体媒介性の免疫応答の発達を意味する。通常、免疫応答または免疫学的応答には、限定されないが、下記作用のうちの１つ以上が含まれる：対象となる組成物またはワクチンに含まれた１つ以上の抗原に対して特異的に差し向けられる抗体、Ｂ細胞、ヘルパーＴ細胞、サプレッサーＴ細胞および／または細胞傷害性Ｔ細胞の産生または活性化。好ましくは、宿主は、新規感染に対する耐性が増強されかつ／または疾患の臨床重症度が低減されるように、治療的または保護的な免疫学的（記憶）応答のいずれかを呈することになる。そのような保護は、症候の数の減少、症候の重症度の減少、または病原体の感染に関連する症候のうちの１つ以上の欠如、ウイルス血症の発症の遅延、ウイルス持続性の低下、全体的なウイルス負荷の減少および／またはウイルス排泄の減少のいずれかによって実証されることになる。
本明細書において、「特異的に免疫反応性である」とは、ペスチウイルスまたはＣＴ感染に特徴的な抗原を認識するが厳密な抗原投与対照に特徴的な抗原とは反応しない、免疫反応性のタンパク質またはポリペプチドを指す。
「疾患に対する保護」、「保護免疫」、「機能的免疫」および同様の語句は、本発明の１つ以上の治療用組成物またはそれらの組合せの投与によって生じる疾患または症状に対する応答を意味し、それは、病気または感染に曝された非免疫化被験体で予想されるよりも少ない悪影響をもたらす。つまり、ワクチン接種された被験者では、感染の悪影響の重症度が低減される。ワクチン接種された被験者では感染が軽減され得るか、減速され得るか、または完全に防止され得る。本明細書では、感染の完全な予防を意味する場合には具体的にそう言及している。完全な予防が記載されていない場合、その用語は部分的な予防を含む。
本明細書において、「臨床兆候の発生率および／または重症度の低減」または「臨床症候の軽減」は、限定されないが、グループ内での感染した被験体の数を低減すること、臨床兆候を呈している被験体の数を低減もしくは除去すること、または１体以上の被験体内に存在する任意の臨床兆候の重症度を野生型感染の場合よりも低くすることを意味する。例えば、それは、病原体負荷の軽減、病原体排出、病原体伝染の軽減、またはＣＴに症候的な任意の臨床兆候の軽減を指すべきものである。好ましくは、本発明の治療用組成物を受けている１体以上の被験体において、これらの臨床兆候は、組成物を受けておらず感染する被験体の場合よりも少なくとも１０％低減される。より好ましくは、本発明の治療用組成物を受けている被験体において、臨床兆候は、少なくとも２０％、好ましくは少なくとも３０％、より好ましくは少なくとも４０％、さらにいっそう好ましくは少なくとも５０％低減される。
本明細書において用語「強まった保護」は、限定されないが、それぞれが感染因子による感染、好ましくはペスチウイルスが起こすＣＴに関連している１つ以上の臨床症候が、ワクチン接種グループの被験体において、非ワクチン接種対照グループの被験体よりも統計的に有意に軽減されることを意味する。「臨床症候の統計的に有意な軽減」という用語は、限定されないが、感染因子による抗原投与後に少なくとも１つの臨床症状の発生頻度が、ワクチン接種グループの被験体において、非ワクチン接種対照グループよりも少なくとも１０％、好ましくは２０％、より好ましくは３０％、さらにいっそう好ましくは５０％、さらにいっそう好ましくは７０％低いことを意味する。
「長期の保護」とは、少なくとも３週間、より好ましくは少なくとも３ヶ月間、さらにより好ましくは少なくとも６ヶ月間持続する「向上した有効性」を指すものとする。家畜の場合、長期の保護は、動物が食肉用に販売されている平均年齢まで持続することが最も好ましい。
本明細書中で使用される場合、用語「ウイルス血症」は、特に、ペスチウイルス粒子が動物、特に仔ブタの血流中で複製および循環する状態として理解される。
ペスチウイルスによって誘導される「ウイルス血症の軽減」という用語は、限定されないが、動物の血流に入るペスチウイルスが低減され、ウイルス血症レベル、すなわち血清１ｍＬ当たりのペスチウイルス複製物の数または血清１デシリットル当たりのプラーク形成コロニーの数が、本発明の組成物を受けている被験体の血清において、組成物を受けておらず感染し得る被験体よりも少なくとも５０％低減される、ということを意味する。より好ましくは、ウイルス血症レベルは、本発明の組成物を受けている被験体において少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９９．９％、より好ましくは少なくとも９９．９９％、さらにいっそう好ましくは少なくとも９９．９９９％低減される。
「安全性」とは、有害な結末、例えば、限定されないが、毒性への細菌系ワクチンの潜在的復帰、臨床上重要な副作用、例えば持続性の全身性の病気またはワクチン投与部位での許容不可能な炎症が、ワクチン接種後のワクチン接種動物には存在しないことを指す。
本明細書中で使用される場合、用語「ワクチン接種」または「ワクチンの接種」またはその変化形は、限定されないが、動物に投与されたときにペスチウイルスまたはＣＴに対する動物の免疫応答を直接または間接的に引き出すかまたは引き出せる本発明の免疫原性組成物を投与することを含むプロセスを意味する。
本発明との関連において、「死亡率」とは、ペスチウイルス感染またはＣＴによって引き起こされる死亡を指し、感染が非常に重篤であるがために苦しみを防止しかつその一生に人道的な終焉をもたらすべく動物を安楽死させる状況を含む。
以下の実施例は、本発明の好ましい実施形態を実証するために含まれる。以下の実施例において開示される技法が、本発明の実施において良好に機能するように本発明者らによって発見された技法を代表するものであり、したがってその実施のための好ましい態様を構成すると考えることができるものであることは、当業者に理解されるべきである。しかしながら、開示されている具体的実施形態に多くの変更を行ってなおも本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく同様または類似の結果を得ることができることは、本開示に鑑みて当業者に理解されるべきである。
実施例１
この研究の目的は、本発明の新規ペスチウイルスを含有する組織ホモジネートを使用して、帝王切開由来初乳未接種（ＣＤＣＤ）ブタにおいて臨床疾患を再現できるか否かを判定することであった。具体的には、目的は、新規ペスチウイルスを含有する血清による抗原投与後のＣＤＣＤ仔ブタにおけるウイルス血症および組織定着（ｑＲＴ−ＰＣＲによって検出される）を再現することである。
動物の世話
ブタは、研究期間中、アイオワ州ケンブリッジのＶＲＩの動物施設に収容された。ブタは、その地域の許容可能な畜産慣例に従って、それらの大きさ、年齢および状態に適した市販の飼料（ＵｌｔｒａＣａｒｅ Ｍｅｄｉｃａｔｅｄ、ロット＃４Ｊｕｎ１６）を給餌された（抗生物質が含まれていた）。水は自由に摂取可能であった。床と餌箱の空間は、協会で定められている「Ｇｕｉｄｅ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｃａｒｅ ａｎｄ Ｕｓｅ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ａｎｉｍａｌｓ ｉｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ｔｅａｃｈｉｎｇ」第３版、２０１０年１月の要件を満たすかまたはそれを超えるものであった。
瀕死の動物および飲食したがらない動物は、調査員の裁量により剖検日前に安楽死させた。研究期間全体を通して、死亡または安楽死させた動物は全て獣医によって剖検された。全ての動物は、研究の終了時に安楽死させ、評価し、焼却処分した。
実験計画
合計１０匹のＣＤＣＤブタをこの生物検定に使用した。ブタを無作為に２つのグループに分けた。グループ１の動物（ｎ＝６）に対して、ペスチウイルスを含有する血清を使用して３つの経路（頭蓋内、鼻腔内および静脈内）により抗原投与を行った。グループ２の動物（ｎ＝４）に対して、同様の方法で偽薬材料を接種し、陰性対照として供した。各グループの動物を別々の部屋に維持した。抗原投与の後、抗原投与の日（Ｄ０）からＤ２８の日までブタの臨床兆候を毎日モニタリングした。研究全体を通して、直腸温を週に２回測った。研究全体を通して、血清、糞便および鼻の試料を週に２回採取した。試料をペスチウイルスＲＮＡについてスクリーニングした。動物の体重をＤ０および剖検時に測り、平均一日増に対する抗原投与の影響を評価した。Ｄ１０、１４、１７、２１、２４および２８に、抗原投与グループから１匹の動物を剖検した。どの動物を剖検するかについての判断は、血清中のペスチウイルスＲＮＡの検出に基づいていた。Ｄ１７、２１、２４および２８に、偽薬グループから１匹の動物を安楽死させた。剖検時に採取した組織および末梢血清（ｔｅｒｍｉｎａｌ ｓｅｒａ）は、ペスチウイルスＲＮＡの存在についてｑＲＴ−ＰＣＲによりスクリーニングした（図４）。
ＮＡＣ＃２０１４０５３０、動物ＩＤ番号２１〜２４、ロット＃２８１５−１０５−２〜２８１５−１０５−５からの血清を３７℃で解凍し、プールした。プールした血清に０．２μｍでの濾過を行い、６ｍＬの血清を１倍濃度のリン酸緩衝生理食塩水（Ｇｉｂｃｏカタログ＃１００１０−０２３、Ｌ＃１５３５３５８）２９ｍＬに添加することによって希釈した。調製した材料にＬ＃２８１５−１７１−Ａを割り当て、使用するまで−７０℃±１０℃で保存した（ＦｒｅｅｚｅｒＷｏｒｋｓ ｉｄ＃４６６５２８）。抗原投与の日に材料を解凍し、抗原投与期間中、氷上に保持した。２ｍＬずつ３つ分取したものを保留試料として−７０℃±１０℃で保存した（ＦｒｅｅｚｅｒＷｏｒｋｓ ｉｄ＃４６６０４４）。プールした材料は保持したが、それ以上試験されなかった。
抗原投与
鼻腔内への抗原投与：ＤＰＣ０に、調査員は滅菌注射器を使用して２ｍｌの抗原投与材料を、鼻腔１つ当たり１ｍｌ投与した。これは、動物を麻酔する前に投与した。
頭蓋内への抗原投与：ＤＰＣ０に、調査員は動物をケタミン、キシラジンおよびテラゾールの混合物で麻酔した。頭蓋冠を清掃し、消毒した。生検パンチ（Ｍｉｌｔｅｘ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ Ｃｏｍｐａｎｙ、Ｉｎｃ．）を使用して、頭蓋冠から４ｍｍの皮膚切片を除去した。手持ち式のパワードリルを使用して、冠状ノコギリで頭蓋冠に穴を開けた。２０ゲージ、１．８８インチ長のカテーテル（ＢＤ ＡｎｇｉｏＣａｔｈ部品番号Ｈ３２７２）を使用して大脳に抗原投与材料を注入した。接種材料の注入後、１倍濃度のＰＢＳ ０．５ｍｌをカテーテルに挿入して、接種材料の送達を確保した。皮膚切開部を一本の縫合糸で閉じた。
静脈内への抗原投与：仔ブタが麻酔されている間に、滅菌バタフライカテーテルおよびシリンジを使用して２ｍｌの抗原投与材料を耳静脈にゆっくりと投与した。
臨床観察
抗原投与後、仔ブタを臨床兆候の有無について毎日１回モニタリングした。臨床兆候が他のブタペスチウイルス（例えば古典的ブタコレラ、ボンゴワナウイルス）と類似するか否かは不明であるため、全身感染の兆候および神経学的兆候について仔ブタをモニタリングした。
糞便試料の採取
調査員が仔ブタから糞便材料を採取した。試料は、スワブ（Ｆｉｓｈｅｒカタログ番号２３−４００−１１１）をファルコンチューブに入れたものであった。試料は床からではなく動物から採取した。採取の日に材料を移送し、試料は、配送後２４時間未満で試験する場合は２〜８℃で保持し、後日試験する場合は−７０℃±１０℃で保持した。
鼻試料の採取
調査員が仔ブタから鼻スワブを採取した。試料は、スワブ（Ｆｉｓｈｅｒカタログ番号２３−４００−１１１）をファルコンチューブに入れたものであった。試料は、両方の鼻孔を拭うことによって動物から採取された。試料を最低限の研究番号、研究日および動物ＩＤでラベリングした。採取の日に材料を移送し、試料は、配送後２４時間未満で試験する場合は２〜８℃で保持し、後日試験する場合は−７０℃±１０℃で保持した。
採血
採血日に調査員は１８〜２０ｇ×１インチ（２．５４ｃｍ）〜１．５インチ（３．８１ｃｍ）のＶＡＣＣＵＴＡＩＮＥＲ（登録商標）滅菌針、ＶＡＣＣＵＴＡＩＮＥＲ（登録商標）針ホルダーおよび、９または１３ｍＬの血清セパレーターチューブ（ＳＳＴ）を使用して、各ブタの前大静脈を介して４〜１５ｍＬの静脈全血を採取した。血清を遠心分離によって血餅から分離し、スクリューキャップの極低温バイアルの中に静かに移した。採取の日に材料を移送し、試料は、配送後２４時間未満で試験する場合は２〜８℃で保持し、後日試験する場合は−７０℃±１０℃で保持した。
剖検
全体的概観：いずれの瀕死の動物も採血し、人道的に安楽死させ、その後に獣医によって剖検された。剖検予定日前に得たウイルス血症データ（Ｃｔ値＜３０）に基づいて、剖検するブタを選択した。仔ブタは剖検時に体重を測り、巨視的病変を記録した。
末梢血の採取および処理：仔ブタは、採血前に深い麻酔をかけた。滅菌済の瓶、ボトルまたは多数のＳＳＴチューブの中に血液（体重の約５％）を採取し、室温で凝固させた。血清を遠心分離により血餅から分離し、滅菌ボトルに静かに移した。血清試料は、配送後２４時間未満で試験する場合は２〜８℃で保持し、後日試験する場合は−７０℃で保持した。
試料採取：大脳（器官の１／２）、小脳（器官の１／２）、脳幹（器官の１／２）、脊髄（６切片）、骨髄（長い骨の１切片を採取）、扁桃腺（１切片）、肺（副肺葉または病変のある領域の１切片）、心臓（２切片）、脾臓（１切片）、腎臓（１切片）、肝臓（１切片）、リンパ節（気管気管支および腸間膜）、小腸（回腸３切片）、大腸（３切片）のホルマリン固定組織試料を調査員が採取した。固定組織がホルマリンに対して１：１０の比で維持されるように、１インチ切片の肺および１〜２インチ切片の腸が推奨される。１０％の緩衝済ホルマリン溶液の入った１つの容器に全ての固定組織を入れた。各仔ブタについて、上に列挙した切片の複製試料を別々のｗｈｉｒｌ ｐａｃｋ袋の中に採取した。
組織の処理：試料を採取した日に輸送し、試料は、配送後２４時間未満で試験する場合は２〜８℃で保持し、後日試験する場合は−７０℃で保持した。固定組織を室温に維持した。
体重測定
ＤＰＣ０ 剖検の日に仔ブタの体重測定を行った。体重は較正された計器で測り、動物施設によって提供された適切な記入用紙に記録した。体重を用いて平均一日増を計算した。
試料の試験
全ての試料に対してペスチウイルスのＰＣＲを実施した。選択した試料を、エンテロウイルス、ブタカリシウイルス、伝染性胃腸炎ウイルス、大腸菌、サルモネラ属および／もしくはクロストリジウム属、またはその他の感染因子についてスクリーニングした。
実施例２
このプロジェクトの目的は、１）先天性振戦を有する仔ブタからの試料中の潜在的な（１つ以上の）病原体を検出すること、および２）疾患を再現する感染モデルを開発することであった。次世代シーケンシングを用いて、先天性振戦を有する仔ブタにおいて異系統ペスチウイルスが検出された。そのウイルスは、元々はコウモリペスチウイルスと最も密接に関連付けられていたが、現在では、異型ブタペスチウイルスと暫定的に名付けられた、最近公表された新規ブタペスチウイルスとより密接に関連付けられている。定量的リアルタイムＰＣＲにより、そのウイルスは、２つの別々の農場の先天性振戦を有する新生仔ブタの試料中に検出されたが、同じ農場の未罹患仔ブタの試料からは検出されなかった。第２の目的を達成するために、ペスチウイルスまたはＰＢＳ（対照）を含有する血清を、妊娠中の雌ブタに静脈内および鼻腔内の経路で接種し、それと同時に超音波ガイド下での外科技法により胎仔羊膜嚢に直接接種した。接種は妊娠４５日目または６２日目のどちらかで実施した。新規ペスチウイルスを接種された全ての雌ブタは、先天性振戦に罹患した仔ブタを産んだが、その一方で、ＰＢＳを接種された対照仔ブタは罹患していなかった。分娩後０、１および２日目に撮影したビデオから、各仔ブタの振戦の重症度を採点した。振戦の重症度は、大多数の仔ブタにおいて分娩後０〜２日目まで比較的一定にとどまった。ペスチウイルス接種された同腹仔における先天性振戦の有病率は５７％（罹患仔ブタ７匹のうち４匹）〜１００％（罹患仔ブタ１０匹のうち１０匹）の範囲であった。ウイルスは、先天性振戦を有する仔ブタの組織においてＰＣＲで一貫して検出されたが、対照仔ブタでは検出されなかった。試料採取された仔ブタの９０％を上回る仔ブタにおいてＰＣＲで陽性となった試料には、脳幹（４１個のうち３７個）、腸間膜リンパ節（４１個のうち３７個）、気管気管支リンパ節（４１個のうち３７個）および全血（２０個のうち１９個）が含まれていた。先天性振戦について最初に記述されたのは１９２２年であったが、こちらは、異系統ブタペスチウイルスによる実験的接種に続く先天性振戦の再現についての最初の報告である。このペスチウイルスに起因する先天性振戦の病態生理をよりよく理解するためには、疾患機序および疫学を調査する研究ならびに診断検査の開発が必要である。
次世代シーケンシング
ＣＴについての３つの診断調査から様々なブタ組織（血清、大脳、小脳、脊髄、脳脊髄液（ＣＳＦ）および／または肺）を得た：１匹の仔ブタの肺組織（ＩＤ２０１３０１０３）；６匹の仔ブタのプールされた脳組織またはプールされた肺組織のどちらか（ＩＤ２０１２０７０５）；２つの異なる農場からの６匹の異なる仔ブタのＣＳＦ（ｎ＝２；Ｂ農場）、血清（ｎ＝２；Ａ農場およびＢ農場）および肺（ｎ＝２；Ａ農場およびＢ農場）（ＩＤ２０１４０１６５７３）。試料ＩＤ２０１２０７０５の肺組織を別とすれば、試験した全ての試料は少なくとも部分的なペスチウイルスゲノム配列を呈した。血清または組織ホモジネートをハンクス平衡塩溶液（Ｃｏｒｎｉｎｇ−Ｃｅｌｌｇｒｏ）中に再懸濁させ、ウイルス粒子で保護された核酸をヌクレアーゼの合剤：ＲＮアーゼＡ（インビトロジェン）、Ｂａｓｅｌｉｎｅ Ｚｅｒｏ ＤＮａｓｅ（Ｅｐｉｃｅｎｔｒｅ）、およびＴｕｒｂｏ ＤＮａｓｅ（インビトロジェン）による消化によって濃縮した。Ｑｉａｇｅｎ Ｖｉｒａｌ ＲＮＡ血液キットを使用して、製造業者のプロトコルに従ってウイルス核酸を抽出した。抽出後、核酸をさらにＴｕｒｂｏ ＤＮａｓｅで処理して宿主ＤＮＡまたは潜在的なウイルスＤＮＡを除去し、そうしてウイルスＲＮＡをさらに濃縮した。ランダムヘキサマーによるプライミングを用い、逆転写およびクレノウ（ＮＥＢ）処理により二本鎖ｃＤＮＡを生成させた。
ビーズ標準化の代わりにカラム溶出（Ｑｉａｇｅｎ、ＭｉｎＥｌｕｔｅ）で置き換えて、ＮｅｘｔＥｒａ ＸＴライブラリー調製キット（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）を製造業者の提案するプロトコルに従って使用するライブラリー生成により、試料をＭｉＳｅｑに基づく配列決定のために処理した。５００サイクルキット（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）を使用してＭｉＳｅｑ上でライブラリーを実行し、ＮｅｘｔＧｅｎｅ（バージョン２．３．４．２）とＳｅｑｕｅｎｃｈｅｒソフトウェア（バージョン５．１）との組み合わせを用いてデータを解析した。３’末端での不適切な塩基を３つ以下とするかまたは１６未満のＱスコアを有する塩基の３連続とするカットオフを用いて切り詰められた、２５より大きい中央値Ｑスコアを含んでいる配列として、高品質の配列を選択した。Ｄｅ ｎｏｖｏで組み立てた配列を、ＢＬＡＳＴｎおよびＢＬＡＳＴｘによってＧｅｎＢａｎｋ配列との比較によって解析した。ＮＳ３遺伝子の２１５アミノ酸配列およびＮｐｒｏ遺伝子の１７０アミノ酸配列の系統発生学的解析のためにＣｌｕｓｔａｌＷアラインメントを用いた。ＭＥＧＡ６．０ソフトウェアを用いて１，０００回の反復によって近接結合系統樹を生成させた。
定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ｑＰＣＲ）
異系統ペスチウイルスのゲノムのＮ３Ｓ領域を標的とするＲＴ−ｑＰＣＲを設計した。定期的な診断試験のためにアイオワ州立大学獣医診断研究所（ＩＳＵ ＶＤＬ）に提出された生育途中のブタの組織試料（ｎ＝３６２）を使用して、この試料セットにおけるペスチウイルスの頻度を決定した。先天性振戦のある農場からも２つの試料セットを採取した。これらの試料には、血清、大脳、小脳、脳幹および脊髄が含まれた。第１のセット（Ａ農場）は、６匹の哺乳前の罹患仔ブタおよび２匹の哺乳前の未罹患仔ブタ、選択した哺乳前の仔ブタの元である５匹の雌ブタの血清、ならびに６〜１４日齢の５匹の哺乳後の罹患仔ブタおよび２匹の哺乳後の未罹患仔ブタから構成された。第２のセット（Ｂ農場：ＩＳＵＶＤＬ２０１４０１６５７３）は、哺乳状況が未知の５匹の罹患仔ブタおよび、罹患仔ブタを有する５匹の雌ブタの血清から構成された。
抽出した２μｌの全核酸、１．０μｌのプローブ（２μＭ）、１μｌの各プライマー（５μＭ）、１２．５μｌの２倍濃縮ＲＴ−ＰＣＲミックス、０．５μｌのｉＳｃｒｉｐｔ逆転写酵素および７．０μｌのＤＥＰＣ処理水を含有する、２５μｌの反応系中で、定量的ワンステップＲＴ−ＰＣＲキット（ｉＴａｑ Ｕｎｉｖｅｒｓａｌプローブ ワンステップキット；ＢｉｏＲａｄ、カタログ番号１７２−５１４１）を実行した（表２）。反応は、ＣＦＸ９６リアルタイムＰＣＲ検出システム（ＢｉｏＲａｄ）を使用して以下の条件下で行った：５０℃で１０分間の初期逆転写、続いて９５℃で３分間の初期変性、９５℃で１５秒間の変性と５７℃で３０秒間の伸長とを４０サイクル。定量的データを生成するために、各実行（Ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ ＤＮＡ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）にペスチウイルスＵｌｔｒａｍｅｒを、プライマーの標的となるＮＳ３領域を包含して含めた。陽性試料のカットオフは、３６未満のサイクル定量（Ｃｑ）値で確立された。
雌ブタ接種モデル
動物
全ての手順は、アイオワ州立大学の動物実験委員会（ログ番号：１−１４−７９０７−Ｓ２）によって承認された。個々に識別された８匹の妊娠３８日目の交配雌ブタを、ＣＴの既往歴のないことが既知である商業的供給源から得た。出荷および接種の前に、全ての雌ブタからの血清は、ＲＴ−ｑＰＣＲによりＰＣＶ２ａ、ＰＣＶ２ｂ、ＰＲＲＳＶ、ＰＰＶ１、ＰＰＶ５および新規ペスチウイルスについて陰性であった。個々の雌ブタを、別々に収容される３つのグループのうちの１つに無作為的に割当て［妊娠４５日目（ｎ＝１）および妊娠６２日目（ｎ＝１）に偽接種、妊娠４５日目にペスチウイルス接種（ｎ＝３）、および妊娠６２日目にペスチウイルス接種（ｎ＝３）］、試験期間全体を通して栄養的に完全な食餌を与えた。
動物への接種
麻酔による吐き戻しの危険性を低減するために、手術前の１２時間、雌ブタへの給餌給水を控えた。ウイルス血症のブタの末梢血清（ＩＳＵＶＤＬ２０１４０１６５７３）を３７℃で解凍した。全核酸を抽出し、ＰＣＶ２ａ、ＰＣＶ２ｂ、ＰＲＲＳＶ、ＰＰＶ１、ＰＰＶ５およびペスチウイルスの存在をＰＣＲでスクリーニングした。ペスチウイルスのみが検出された（Ｃｑ＝２７．４７）。血清に０．２μｍでの濾過を行い、６ｍＬの血清を１倍濃度のＰＢＳ（Ｇｉｂｃｏ）３５ｍＬに添加することによって希釈した。接種の日に接種材料を解凍し、接種手順の間、氷上で保持した。チレタミンとゾラゼパムとの合剤（ＴＥＬＡＺＯＬ（登録商標））、ケタミンおよびキシラジンを筋肉内注射することによって全身麻酔を導入した。麻酔導入後、各雌ブタを左側臥位に配置し、右腹部を無菌開腹手術のために準備した。手術のために腹部に覆布を掛け、２％リドカインを含む局所ラインブロックを切開前に投与した。腹腔への到達を成し遂げるために、乳房組織の約５ｃｍ横でおおよそ３０ｃｍの傍正中切開を行った。子宮を体外に出し、手持ち式の滅菌リニアアレー超音波変換器を使用して各胎仔部分を撮像し、胎仔羊膜嚢の中へ接種針を導いた。小ゲージ針（２２ｇ）（Ｓ２ＭＰ４）を使用して各嚢に０．２５ｍＬの接種材料（ＰＢＳまたはペスチウイルス血清）を接種した。サイズ２のポリグラクチン９１０縫合糸を使用して腹壁を３層に閉じた。さらに、外科手技の直後に雌ブタに接種材料を鼻腔内（２ｍＬ）および静脈内（２ｍＬ）の経路を介して直接投与した。切開孔閉鎖の直後および麻酔回復の前に、単回用量のフルニキシンメグルミン（ＢＡＮＡＭＩＮＥ−Ｓ（登録商標））およびセフチオフル結晶性遊離酸（ＥＸＣＥＤＥ（登録商標））を筋肉内に与えた。麻酔導入は、各手術日に最初の雌ブタに対して午前８時３０分であった。各手技に約１時間かかった。最後の雌ブタの麻酔導入は午前１１時３０分であった。
臨床観察、検体採取および剖検
接種後、雌ブタを毎日モニタリングし、接種後（ＤＰＩ）０日目から７日目まで直腸温を測った。糞便材料、血液および鼻スワブをＤＰＩ２、７、１０および１４に雌ブタから採取し、その後は分娩まで毎週採取した。分娩時に、仔ブタを個々に識別し、血清、鼻スワブおよび糞便スワブを採取した。仔ブタのサブセット（ｎ＝７）においては、臍帯からの血液を採取した。分娩後（ＤＰＦ）０日目から２日目まで毎日個々の仔ブタのビデオを撮った。グループに対して盲検された４人の調査員がビデオを見直し、各仔ブタに振戦重症度点数を付けた：０−なし、１−筋肉の微細な線維束性収縮、２−軽度の振戦、３−中等度の振戦、４−著しい跳ね回りを伴う重度の振戦。次いで、点数を平均して各仔ブタにＤＰＦ別の全体的振戦重症度点数を割り当てた。ＤＰＦ２に０．７５以上と採点された仔ブタは罹患していると見なした。股開きの有無についても各仔ブタを各ＤＰＦに記録した。雌ブタおよび仔ブタをそれぞれ家畜銃および注射用バルビツール酸系の過剰投与によってＤＰＦ２に安楽死させた。剖検では、仔ブタの血清、大脳、小脳、脳幹、脊髄、腎臓、腸間膜リンパ節、気管気管支リンパ節、胸腺、心臓および脾臓を採取した。仔ブタのサブセットにおいては、全血（ＥＤＴＡチューブ；ｎ＝２０）およびＣＳＦ（ｎ＝２９）を採取した。雌ブタの血清もまた剖検時に採取した。
ペスチウイルスの同定
次世代シーケンシング
中国コウモリペスチウイルスと密接に関連し、かつ現在では近年報告された仮称の異型ブタペスチウイルスとより密接に関連していることが知られているウイルスが、３つの独立した先天性振戦疾患調査により、次世代シーケンス技術を用いることによって発見された。ほぼ完全なゲノムが、３つの調査のうちの１つから得られた。ウイルス血症の動物の血清中のこのウイルスを、後に動物接種のためにこの研究で使用した。ＮＳ３およびＮｐｒｏの系統発生解析は、推定上の「異型ブタペスチウイルス」種のメンバーとして本明細書において同定されたウイルスの分類（図５）を支持し、ヌクレオチド同一性およびアミノ酸同一性がそれぞれ８８．０％および９４．６％である。ＲＴ−ｑＰＣＲによるペスチウイルスＲＮＡの遡及的分析は、ＩＳＵ ＶＤＬに提出された被験体において３６２個のうち２１個の試料（６％）が陽性であることを指し示した。これらの被験体は、様々な臨床兆候を経験している群れから定期的に提出されたものであった。
ＲＴ−ｑＰＣＲ
２つの農場、Ａ農場およびＢ農場から、先天性振戦を呈している動物および未罹患コホートから仔ブタ試料を採取した。先天性振戦と診断された動物は、ＲＴ−ｑＰＣＲによりペスチウイルスに陽性であったが、未罹患仔ブタの中枢神経組織または血清にはウイルスが検出されなかった（表３）。ウイルスは、Ａ農場からの１匹の雌ブタの血清中に検出された。
雌ブタ接種モデル
雌ブタの観察および試料
妊娠４５日目に偽接種された１匹の雌ブタは、手術後に中等度の発熱を呈し、ＤＰＩ３および４に全ての胎仔を堕胎した。妊娠４５日目に接種されるグループにおいて、１匹の雌ブタは、接種時に妊娠していないことが判明した；この雌ブタは研究から除外した。偽接種およびペスチウイルス接種された雌ブタは臨床兆候を呈さず、また、検出可能なウイルス血症の発症またはＲＴ−ｑＰＣＲで検出可能なレベルでのウイルスの排出もなかった。全ての雌ブタは自然分娩した。１匹の死産仔ブタ（雌ブタＩＤ３６６１）と１匹の衰弱胎仔（雌ブタＩＤ３５００）があった。
仔ブタの観察および試料
偽接種された仔ブタは、ＤＰＦ０、１または２においてＣＴと一致する臨床兆候を有していなかった（Ｓ４ ＭＰ４）。妊娠４５日目または６２日目に胎仔としてペスチウイルス接種された仔ブタの大多数は、ＣＴと一致する臨床兆候を有していた（Ｓ４ ＭＰ４）。ペスチウイルス接種された同腹仔における先天性振戦（Ｓ５ ＭＰ４）および股開き（Ｓ６ ＭＰ４）の有病率は、ＤＰＦ２においてそれぞれ５７〜１００％および０〜４０％の範囲であった（表４）。振戦の重症度は、同腹仔のなかで仔ブタによって様々であったが、大多数の仔ブタが２日間の観察期間に亘って比較的一定にとどまった（表５）。

ウイルス核酸を組織、血清および全血から抽出し、定量的リアルタイムＰＣＲによって分析した。偽薬接種した同腹仔はどの組織においてもペスチウイルス陽性が認められなかったが、実験的接種グループの動物のほぼ全てが少なくとも１つの組織において陽性であった。出生したペスチウイルス被接種仔ブタでは、ＲＴ−ｑＰＣＲによってペスチウイルスＲＮＡが血清（４１個のうち２６個）、鼻腔スワブ（４１個のうち１２個）、糞便（４１個のうち１４個）、末梢血清（４１個のうち３４個）、大脳（４１個のうち３０個）、小脳（４１個のうち３６個）、脳幹（４１個のうち３７個）、脊髄（４１個のうち３３個）、腎臓（４１個のうち３５個）、腸間膜リンパ節（４１個のうち３７個）、気管気管支リンパ節（４１個のうち３６個）、胸腺（４１個のうち３７個）、心臓（４１個のうち３５個）および脾臓（４１個のうち３７個）において検出されたことから（図６）、組織向性は広範であった。ＰＢＳ被接種仔ブタからの同じ試料にはウイルスＲＮＡは検出されなかった。さらに、ペスチウイルスＲＮＡは、仔ブタのサブセットの臍帯血（７匹中５匹）、全血（２０匹中１９匹）およびＣＳＦ（２９匹中２６匹）に検出された（図６）。血清、鼻スワブ、ＣＳＦ、腸間膜リンパ節、気管気管支リンパ節、脾臓および臍帯血の平均Ｃｑは２６未満であった。糞便、末梢血清、小脳、脊髄、腎臓、胸腺および心臓の平均Ｃｑは２６〜２８の範囲であった。脳、脳幹および全血は、平均Ｃｑ値が最も高かった（＞２８）。ペスチウイルスＲＮＡは、脳幹、腸間膜リンパ節、気管気管支リンパ節および全血に最も一般的に（採取した試料の９０％以上）検出され；末梢血清、小脳、脊髄、ＣＳＦ、腎臓、胸腺、心臓および脾臓での検出はあまり一般的でなく（採取した試料の８０〜９０％）；血清、鼻分泌物、糞便、大脳および臍帯血での検出は最も一般的でなかった（採取した試料の２９〜７４％）。２匹の動物（３５および９０）の血清をランダムに選択して、完全ゲノム配列決定によりゲノム安定性を評価した。どちらの動物も、親株からの同一の７ヌクレオチドの固定的変化を呈し、４つの保存性アミノ酸変化をもたらした。抗原投与材料のディープシーケンシングデータを調べると、これらの位置の各々に多型の証拠が認められた。
考察
ＣＴの症候群はほぼ１００年前に初めて文書に記録された。しかし、現代の流行発生はほとんどが未確認ウイルスに帰属されてきた。次世代シーケンシングを用いて、元々コウモリペスチウイルスと密接に関係していると識別された新規因子が、ＣＴを有する仔ブタの試料中に検出された。
多数の多様な種類の試料においてウイルスＲＮＡを検出すべく、異系統ペスチウイルスのゲノムのＮ３Ｓ部分を標的としてＲＴ−ｑＰＣＲを設計した。遡及的分析により、様々な臨床兆候を経験している群れからの試料の６％（３６２個中２１個）にペスチウイルスＲＮＡがＲＴ−ｑＰＣＲで検出され、この試料セットの組織中にウイルスが低い有病率で存在することが示唆された。接種研究からの試料を、ＣＴ臨床兆候および組織分布およびＣＳＦＶの複製部位に基づいて選択した。２つの無関係の農場のＣＴを有する仔ブタの組織試料は、血清および中枢神経系組織に一貫して検出されたウイルスＲＮＡを含んでおり、ウイルスが臨床上は中枢神経系機能に影響を及ぼすがその一方で全身に分布していることを示唆していた。これは、ペスチウイルス接種された仔ブタにおけるウイルスＲＮＡの組織分布によってさらに支持される。試験した全ての組織が同様のレベルの検出可能なペスチウイルスＲＮＡを有していたため、具体的な複製部位は判定されなかった。このことから、ウイルス複製が、全身的に起こるものであり、ＣＳＦＶに類似して末梢血単核細胞または内皮細胞を含み得る、ということが示唆され得る。
この接種モデルに使用したペスチウイルスはウイルス血症血清であった、というのも、試験管内でのウイルス培養の試みがうまくいかなかったからである。この研究において雌ブタの免疫状態は、この新たに発見されたウイルスの血清学的検査が欠如しているがために未知である。ブタの胎盤は雌親から胎仔への抗体の移入を許容しないので、雌ブタの抗ペスチウイルス抗体による妨害の可能性を回避するために胎仔羊膜嚢に直接接種した。
１匹のＰＢＳ被接種雌ブタは外科手技の結果として堕胎したが、偽接種された雌ブタとペスチウイルス接種された雌ブタとの間には臨床的差異は観察されなかった。死産仔、ミイラ化胎仔または衰弱胎仔は、ＣＴ流行発生に関してこれまでに報告されていない。ペスチウイルス接種された雌ブタから産まれた、１つの腹から産まれた１匹の死産仔および、別の腹から産まれた１匹の衰弱胎仔は、偶発的と見なされ、胎仔感染の結果ではないようであった。ＩＮおよびＩＶ接種にもかかわらず、雌ブタは検出可能なウイルス血症を発症せず、ＲＴ−ｑＰＣＲで検出可能なレベルのウイルスを排出しなかった。したがって、雌ブタが抗原投与後に感染しなかったか、または利用可能な診断試験が感染の検出には不十分であったかのどちらかである。
ＣＴが顕在化するには、仔ブタの妊娠の７０〜８０日目あたりに起こる胎仔の免疫能の発達に先立って胎仔感染が起こらなければならない可能性がある。この研究では、妊娠４５日目および６２日目の胎仔はどちらも異系統ペスチウイルスに感染し易く、感染仔ブタの大多数にＣＴを生じさせた。これらの２つの妊娠時点は、胎仔免疫の発達（妊娠４５日目）および胎仔中枢神経系の発達（妊娠６２日目）よりも前に起こるＣＳＦＶに基づくこのペスチウイルスのウイルス血症の概算に基づいて選択された。他の種では、生殖不全、先天性奇形または、持続感染した動物がそれらの一生を通してウイルスを排出し得る免疫寛容を含めて、様々な臨床転帰が、様々な妊娠時点での子宮内ペストウイルス感染によって起こる。この研究では、ペスチウイルス接種された数々の仔ブタが股開きを有して産まれた。この症状はブタではよく見られる。しかし、発病機序および病因論は現在のところ推論的である。股開き、雌ブタの生殖不全または、持続感染動物をもたらす子宮内感染の能力において、このペスチウイルスが果たす役割は、もしあるとすれば、さらなる調査を必要とする。
全体的に見れば、本明細書において再現される臨床疾患は、腹間でのＣＴの有病率および同腹仔のなかでの臨床兆候の重症度が様々である天然の流行発生を模倣している。ウイルスＲＮＡは、ＣＴを有する全ての仔ブタで検出された。しかも、出生したペスチウイルス被接種仔ブタ４２匹のうち４１匹にウイルスＲＮＡが検出された。出生したペスチウイルス被接種仔ブタのうち１１匹はＤＰＦ２またはＤＰＦ０（９５）にＣＴを有さず、ウイルスＲＮＡは、１匹を除く全てのペスチウイルス接種された未罹患仔ブタにおいて検出された（９５）。しかし、中枢神経系の機能不全の機序は、全ての感染仔ブタではないが大多数の仔ブタにおいて今のところ未知である。宿主−ウイルス相互作用の生態学および発病機序は、現在のところ不明確であるが、興味深い。ＣＴの臨床的発現において持続感染または機能不全免疫応答が果たす役割、および中枢神経系機能不全の機序を調査する必要がある。高い有病率ならびにヒト医学および獣医学におけるそのような症候学の重要性にもかかわらず、ヒトおよび動物における振戦障害の機序に関する文献は限られている。
この研究では、近年記述された異なるブタペスチウイルスが、ＣＴを有する仔ブタにおいて同定されたが、未罹患のコホートでは同定されず、また、革新的接種技法の開発によりこのウイルスを使用してＣＴが再現された。ウイルス単離技法、特異的抗体検査、現場検出技法および改良された分子ツールの開発の成功は、間違いなくこのウイルスの発病機序および疫学についてのよりよい理解につながるであろう。
実施例３
この研究の目的は、ペスチウイルスに対して未感作または血清陰性である雌親に投与した場合のペスチウイルスワクチンの有効性を評価することである。
研究計画
この実験には合計１０匹の雌親を使用した。雌親を無作為的に３つのグループに分けた。グループ１の動物（ｎ＝４）には、繁殖の直前または直後においてＤ０およびＤ１４に試作ペスチウイルスワクチンでワクチン接種した。グループ２の動物（ｎ＝４）には偽薬の試作ワクチン製剤をワクチン接種した。グループ３の動物（ｎ＝２）は未接種のままとした（厳密な対照）。各グループの動物を別々の部屋に維持した。妊娠約４２日目に、グループ１および２の雌親にペスチウイルスを静脈内、筋肉内、鼻腔内、膣内または子宮内接種などの経路により投与した。抗原投与の後、雌親は研究全体を通して臨床症状を毎日モニタリングされることになる。妊娠期間全体を通して、血清、糞便および鼻の試料および直腸温を週に２回採った。妊娠約８０日目に、全ての雌ブタに対して超音波評価を実施した。分娩時に、仔ブタを臨床兆候の存在について視覚的に評価した。ペスチウイルスの検出のために血清、臍帯血および胎盤を採取した。仔ブタを処理し、ビデオ撮影を行った。仔ブタは雌ブタの上に維持した。仔ブタが２４時齢になったときに仔ブタを臨床兆候の存在について視覚的に評価し、ビデオ記録をキャプチャした。仔ブタは４８時間後に安楽死させた。安楽死の前に、仔ブタを臨床兆候の存在について視覚的に評価した。ビデオ記録をキャプチャする。選択された組織および血液を剖検時に採取した。試料をペスチウイルスＲＮＡおよび抗ペスチウイルス抗体についてスクリーニングした。
確実に盲検的にするために、本発明のワクチンおよび対照を投与する人（投与者）は、試験動物の臨床観察および試料採取の責任者と同じではなかった。研究所での試験は実施例２に記載したものと同じであった。
実施例４
この研究の主目的は、不活化完全ウイルスワクチン投与後のペスチウイルス特異的血清反応を誘導することの実現可能性を判定することであった。具体的には、濃縮した不活化ウイルスを未感作動物に筋肉内注射し、ワクチン接種前後の血清学的ＥＬＩＳＡによって評価した。
ディープシーケンシング技術を用いて、中国コウモリペスチウイルスと最も密接に関連している新規ウイルスが多数の流行発生調査被験体から発見された。これらの被験体の臨床歴には、先天性振戦（２例）、貧血ブタ（１例）、またはＰＣＶＡＤと関連していると考えられている代替ブタ（１例）が含まれた。その知見に基づき、アイオワ州立大学獣医診断研究所（ＩＳＵ ＶＤＬ）から採取した２つの試料セットにおいてｑＰＣＲを計画し、同定されたウイルスの有病率を決定した。見かけ上の有病率は、肺ホモジネートのセットでは７．３％（８／１１０）であり、多発性漿膜炎の病歴を有する被験体からの臨床試料のセットでは５．２％（１３／２５２）であると分かった。先天性振戦の臨床歴を有する２つの農場からの追加試料を、ＩＳＵ ＶＤＬ施設の一員（Ｐａｕｌｏ Ａｒｒｕｄａ博士）との協力により採取した。これらの試料をブタの接種に使用し、高レベルのウイルスを含有する血清を生成させた（実施例１）。追跡研究では、妊娠中の雌親への血清の子宮内接種が、先天性振戦を有して生まれるブタの割合を高くする、ということが実証された（実施例２）。臨床疾患を引き起こすペスチウイルスの能力ゆえに、ワクチンの開発は興味深い。従来の不活化ワクチンをこの研究に含めた。
従来の不活化ワクチンがこの試験に含まれることになる。さらに、ウイルスベクターも本研究に含まれることになる。関連する抗原を発現させるための生ウイルスベクターの使用はＬｅａｄ２Ｇｒｏｗ戦略の重要な要素であるため、この研究はブタでのベクターの評価を提供する。この研究は、ペスチウイルスのＥ２タンパク質を発現するイヌアデノウイルスベクター（ＣＡＶ−２；Ｓｏｌｏ−Ｊｅｃ ＣＡＶ−２での使用を認可されているもの）を利用することになる。ベクターは複製能を有し、長い持続期間の広範な免疫応答を誘導すると仮定される。インフルエンザＡ ＨＡ遺伝子を発現する追加のＣＡＶ構築物を構築物対照として含めることになる。
動物を組み入れる基準
ＢＳＬ２条件下で生まれた動物で研究を行い、血清学的アッセイは現在ペスチウイルスに利用できないため、血清試料の前スクリーニングは行わなかった。ワクチン接種時に健康であったブタのみを試験に含めた。ワクチン接種時に調査員が不健康な動物に気付いた場合には、それらの動物をワクチン接種せずに人道的に安楽死させた。
動物の世話
全ての動物は、研究期間中、アイオワ州Ｓｉｏｕｘセンターの動物施設に収容された。動物は、その地域の許容可能な畜産慣例に従って、それらの大きさ、年齢および状態に適した市販の飼料を給餌された（抗生物質が含まれ得る）。水は自由に摂取可能であった。床と餌箱の空間は、協会で定められている「Ｇｕｉｄｅ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｃａｒｅ ａｎｄ Ｕｓｅ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ａｎｉｍａｌｓ ｉｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ｔｅａｃｈｉｎｇ」第３版、２０１０年１月の要件を満たすかまたはそれを超えるものであった。
試験監視員による事前の承認なしにその他の生物学的または薬学的な製品を試験動物に投与することはなかった。
組み入れ後の除外の基準
瀕死の動物は、看護している獣医／調査員の裁量で安楽死させた。瀕死の動物は、飲食したがらない動物、または重度の臨床兆候に起因して重度の脱水症状になっている動物として定義した。研究期間全体を通して、死亡または安楽死させた動物はいずれも獣医によって剖検された。剖検は、以下に記載するとおりに行った。監視員と調査員とで協議して、取り除かれた試験動物のデータをデータ解析および最終報告に含めるか否かを判断した。
研究動物の処分
全ての動物は、研究の終了時に人道的に安楽死させ、評価し、レンダリングによって処分した。全ての手続きは施設のＳＯＰに記載されているとおりに行った。
実験計画
全体的説明
この実験は、通常飼育動物における試作ペスチウイルスワクチンの血清学的応答を評価するために計画された。実験グループの説明については以下の表８を参照されたい。
離乳時に、約６週齢の合計６匹の動物をグループ１およびグループ２に無作為に分け、表８に従って２ｍＬ用量のワクチンまたは偽薬のどちらかを投与した。動物は、ランダム化して同じ部屋内の別々の檻で混ぜ合わせた。グループ３の動物は、別の部屋で混ぜ合わせた。研究全体を通して、全身の健康の所見を記録したが、有害反応は全く観察されなかった。ワクチン接種後約１４日目に血清を採取し、処理が完了するまで血清学的評価のために４℃で保持した。最初のワクチン接種の２１日後に、同一材料の追加免疫ワクチン接種を施した。追加免疫後１３日目（３４日目）に動物から血清を採取した。
血清試料は、検査が利用可能になったときに抗体陽転の証拠について検査した。Ｄ０からＤ７まで毎日、グループ３のブタから口腔、鼻および糞便スワブを採取した。生ＣＡＶの存在について試料を評価した。ワクチンの投与後最低３日間、注射部位に反応がないか観察した。動物は、試行の終わりに人道的に安楽死させた。研究活動項目の概観および具体的な手順の詳細については以下の表９を参照されたい。
ワクチン材料
感染したＳＫ６細胞からの上清を超遠心分離によって１０倍に濃縮し、５ｍＭのＢＥＩ溶液を使用して３７℃で６時間不活化させた。ワクチンに１２．５％のｅｍｕｌｓｉｇｅｎ Ｄを配合し、投与の時まで４℃で保存した。グループ２のブタは偽薬材料（リン酸緩衝生理食塩水＋１２．５％ｅｍｕｌｓｉｇｅｎ Ｄ）を受けた。適切な大きさの滅菌針およびシリンジを使用して、２ｍＬ用量の適切なワクチンを頸部の筋肉組織に投与した。
ワクチン接種
どのワクチン材料を投与する前にも、調査員または被指名者が全ての動物の全体的な健康状態および研究への組み入れについて検討した。Ｄ０およびＤ２１に適切なワクチンの２ｍＬ用量を、適切な大きさの滅菌針およびシリンジを使用して頸部の筋肉組織に投与するかまたは滅菌シリンジおよびカニューレを使用して鼻内に（鼻腔１つ当たり１ｍＬ）投与した。ＩＭ注射の場合、Ｄ０に右頸部の筋肉組織を注射に使用し、Ｄ２１に左頸部の筋肉組織を注射に使用した。ロット番号、投与量、動物識別番号およびワクチン材料の投与時期をワクチン確認記録に記録した。
臨床観察
ワクチン接種期間中、全身の健康所見の記入用紙を使用して動物を毎日評価した。ワクチン接種後最低３日間、注射部位の領域をモニタリングした。注射部位の領域に病変が存在する場合には、病変が消散するまで、または試験の終了までその領域をモニタリングした。
採血
採血日に調査員または被指名者が、前大静脈を介して３〜９ｍＬの静脈全血を採取した。１８〜２０ｇ×１インチ（２．５４ｃｍ）〜１．５インチ（３．８１ｃｍ）の滅菌ＶＡＣＣＵＴＡＩＮＥＲ（登録商標）針、ＶＡＣＣＵＴＡＩＮＥＲ（登録商標）針ホルダーおよび適切な大きさの血清分離チューブ（ＳＳＴ）を使用した。血液は、月曜日から木曜日までに採取した場合には採取日に氷上でアイオワ州エイムズのＢＩＶＩ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒ＆Ｄへ一晩で搬送した。血清を金曜日または土曜日に採取した場合には、血清を遠心分離によって血餅から分離し、少なくとも研究番号、研究日および動物ＩＤでラベリングしたスクリューキャップ極低温バイアルの中へ静かに移した。処理した血清試料を−７０℃で保存し、次の出荷日にドライアイス上でエイムズへ搬送した。ＢＩＶＩ−エイムズでは、血清試料をＦｒｅｅｚｅｒＷｏｒｋｓ電子管理システムによって追跡した。ＢＩＶＩ−エイムズの血清試料は、送達後４８時間未満で試験する場合は２〜８℃で保存し、後日試験する場合は−７０℃で保存した。試料は、この研究の完了後最低６ヶ月間保存した。
スワブ試料
材料は、氷上でアイオワ州エイムズのＢＩＶＩ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒ＆Ｄへ一晩で搬送した。週末に採取が発生した場合には試料を−７０℃で凍結させ、次の試料採取日にドライアイス上で搬送した。ＢＩＶＩ−エイムズでの試料は、送達後２４時間未満で試験する場合には２〜８℃で保存し、後日試験する場合には−７０℃で保存した。試料は、ＦｒｅｅｚｅｒＷｏｒｋｓ電子管理システムによって追跡した。試料は、この研究の完了後最低６ヶ月間保存した。
剖検
研究中に瀕死の動物があった場合は、看護している獣医師の裁量で動物を安楽死させ、剖検した。適切な試料を採取して死因を判定した。確認試験のために試料を診断研究所へ提出することがある。
試験以外の時に、施設のＳＯＰに従って動物を深く麻酔し、各動物から２５０ｍＬ遠心分離ボトル１本分の血液（非固定式に捕集）を採取した。施設のＳＯＰに従って動物を安楽死させ、注射部位を触診した。剖検時に注射部位反応が大いに触診される場合には、（新鮮な固定された）試料を採取した。研究中に動物に臨床兆候が存在するかまたは臨床疾患の形跡がある場合には、動物を剖検した。適切な試料を採取して疾患の原因を判定した。確認試験のために試料を診断研究所へ提出することがある。
部屋の消毒、入室および作業手順
試作ワクチンは、ヒトに対して感染性であるとは考えられない。動物を扱うときには手袋、マスクおよび使い捨てのＴＹＶＥＫ（登録商標）を着用した。ブーツおよび個人用保護具（ＰＰＥ）は部屋に固有のものであった。グループ３の動物で行った作業と、グループ１および２の動物で行った作業との間にはシャワーを必要とした。部屋間での補給品またはＰＰＥの移動は認めなかった。施設および設備の消毒は綿密に施され、調査員の報告書に記された。
血清学的応答
酵素結合吸光度検査（ＥＬＩＳＡ）のバックグラウンドを低減するために、遠心沈殿させた血清をブタ初期肺細胞に吸収させた。ＥＬＩＳＡプレートを３００ｎｇの濃縮不活化ペスチウイルスでコーティングした。ワクチン接種動物および偽薬動物の吸収された試験血清、ならびに未感作動物の血清を二度評価し、データを図７にまとめた。全てのグループから採取した全ての血清は、０日目においてＥＬＩＳＡで陰性であった（ＯＤ＜０．１５）。不活化ペスチウイルスの追加免疫接種後１３日目までに、４匹の動物全てが強い血清学的応答を呈したが、対応する偽薬対照はいずれも検査の０．７ＯＤ閾値を超えなかった。正確ウィルコクソン順位和検定を用いると、ワクチン接種グループ内では、偽薬と比較してＯＤの統計的に有意な増加があり（ｐ値＝０．００４）、ペスチウイルスに対する特異的血清応答を指し示していた。
実施例５
この研究の主目的は、生体外で新規ペスチウイルスを単離して生産的に複製することであった。具体的には、天然の宿主種（ブタ）に由来する細胞においてウイルス増殖を達成し、分子生物学的技法によってモニタリングした。
接種材料の調製
実施例２からの感染仔ブタの組織を採取し、個々に秤量し、ＳＡＦＣ改変最少必須培地（ＭＥＭ）をそれぞれに添加して最終的な重量：体積を１０％とした。組織を金属ビーズとの高速振盪により分散させ、微量遠心分離によって清澄化を行い、０．２μｍのフィルターで濾過した。さらに、実施例２のペスチウイルス感染仔ブタからの末梢血を個々に採取した。ｑＰＣＲを用いて組織ホモジネートおよび血清試料の各々をペスチウイルスの存在および相対濃度について検査した。最も高い力価を有する試料を、試料の末梢血清、脾臓および腎臓ホモジネートの種類に基づいてプールした。これらのプールはその後、接種材料として使用した。
ブタ初期組織の接種
上記接種材料を初期胎仔ブタ肺細胞および初期ブタ胎仔腎細胞の両培養物に対して使用して、ウイルスの増殖を試みた。初代細胞培養物は、帝王切開由来初乳未接種（ＣＤＣＤ）ブタから採取した組織から調製した。
接種材料は、等しい体積のＭＥＭで希釈し、０．８μｍ／０．２μｍのフィルターに通すことによって滅菌した。血清または宿主細胞に関連するいかなる毒性も取り除こうとして接種前に試料を１：２または１：１０のいずれかにさらに希釈した。
培養は、増殖培地（１０％の放射線照射済ウシ胎仔血清と２．５％の１Ｍ ＨＥＰＥＳとを含むＭＥＭ）中で実施した。培養７日後に材料を３サイクルの凍結／融解に供し、その後、新鮮な細胞に対する接種を、揺動させながら３７℃、５％ＣＯ２で１時間ウイルス感染させることによって行った。１時間後、接種材料を除去し、増殖培地と交換した。継代は初期肺細胞で１１回、初期腎細胞で４回続けた。初期腎細胞でのサイクル閾値は２１．３〜２２．５の範囲であり、生産的な複製を示唆していた。初期肺でのサイクル閾値もまた生産的なウイルス複製を示唆しており、それらを表１０にまとめて示す。
不死化ブタ細胞の接種
初期細胞の元の接種条件と同様に、第１１継代の（３サイクル凍結／融解した）初期肺培養物の上清を添加することによって、不死化ブタ腎細胞（ＳＫ６）に対する接種を行い、揺動させながら３７℃、５％ＣＯ２で１時間インキュベートした。３７℃、５％ＣＯ２で６日間インキュベートした後、同じ方法で新鮮なＳＫ６細胞に対して材料を継代した。１４回の継代の後に各継代から核酸を抽出し、ｑＰＣＲによりモニタリングした。連続継代するとサイクル閾値は約１７に低下し（表１０参照）、ウイルス力価がおおよそ１０倍増加したことを指し示していた。
ウイルス採取物の不活化
第１１継代のＳＫ６細胞の上清をプールし、高速遠心分離によって約１０倍に濃縮してウイルスをペレット化した。ウイルスペレットを元の体積の約１／１０の不活性緩衝液（１倍濃度のリン酸緩衝生理食塩水）中に再懸濁させた。終濃度５ｍＭの環化バイナリーエチレンイミン（ＢＥＩ）を使用して６時間３７℃で定常的に撹拌することにより、高濃度のウイルスを不活化させた。不活化の完了に際して、チオ硫酸ナトリウム溶液（１７体積％）を使用して３７℃で１５分間インキュベートすることにより、ＢＥＩを不活性化させた。不活化ペスチウイルスに終濃度１２．５％のｅｍｕｌｓｉｇｅｎ Ｄを配合し、実施例４の推定上のワクチン候補として使用した。
本明細書において開示され特許請求される組成物および方法の全ては、本開示に鑑みて必要以上の実験をすることなく実施および実行することができる。本発明の組成物および方法を好ましい実施形態の観点から記載してきたが、本発明の概念、趣旨および範囲から逸脱することなく本明細書中に記載されている組成物および方法ならびにステップまたはステップの順序に変形を適用し得ることは当業者には明らかであろう。より具体的には、化学的にも生理学的にも関連する特定の薬剤で本明細書に記載の薬剤を置き換えてもよく、それにもかかわらず同じかまたは類似の結果が達成され得る、ということは明らかであろう。当業者に明らかなそのような類似の代替物および改変は全て、添付の特許請求の範囲によって定義される本発明の趣旨、範囲および概念の範囲内であるとみなされる。

Claims (23)

  1. 配列番号１に対して少なくとも９５％の同一性を有する核酸配列を含む不活化ペスチウイルスを含む組成物。
  2. 配列番号２に対して少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む不活化ペスチウイルスを含む組成物。
  3. 前記ペスチウイルスは、化学的に不活化されたペスチウイルスであり、前記ペスチウイルスは、バイナリーエチレンイミン、エチレンイミン、アセチルエチレンイミン、ベータエチレンイミン、ベータプロピオラクトン、グルタルアルデヒド、オゾンおよびホルムアルデヒドからなる群から選択される不活化剤による処理によって不活化されている、請求項１または２に記載の組成物。
  4. 前記ペスチウイルスは、物理的に不活化されたペスチウイルスであり、前記ペスチウイルスは、ＵＶ照射、Ｘ線照射、ガンマ線照射、凍結融解および／または加熱による処理によって不活化されている、請求項１または２に記載の組成物。
  5. 薬学的に許容可能なキャリアおよび／または賦形剤をさらに含む、請求項１または２に記載の組成物。
  6. 前記薬学的に許容可能なキャリアおよび／または賦形剤は、アジュバントである、請求項５に記載の組成物。
  7. 前記アジュバントは、水中油エマルジョン系のアジュバントである、請求項６に記載の組成物。
  8. 配列番号１に対して少なくとも９５％の同一性を有する核酸配列を含む弱毒化ペスチウイルスを含む組成物。
  9. 配列番号２に対して少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む弱毒化ペスチウイルスを含む組成物。
  10. 薬学的に許容可能なキャリアおよび／または賦形剤をさらに含む、請求項８または９に記載の組成物。
  11. 前記薬学的に許容可能なキャリアおよび／または賦形剤は、アジュバントである、請求項１０に記載の組成物。
  12. 前記アジュバントは、水中油エマルジョン系のアジュバントである、請求項１１に記載の組成物。
  13. 前記ペスチウイルスは、凍結乾燥形態である、請求項８または９に記載の組成物。
  14. 前記組成物は、少なくとも約１０４個のウイルス粒子を含む、請求項８または９に記載の組成物。
  15. 配列番号３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９または２１に対して少なくとも９５％の同一性を有する核酸配列を含むベクターを含む組成物。
  16. 配列番号４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０または２２に対して少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列をコードするベクターを含む組成物。
  17. 前記ベクターは、バキュロウイルス発現ベクターまたはイヌアデノウイルスベクターである、請求項１５または１６に記載の組成物。
  18. ペスチウイルスに関連する疾患から仔ブタを保護する方法であって、妊娠中の雌ブタもしくは未経産ブタに、または繁殖前の雌ブタもしくは未経産ブタに、前記仔ブタを保護するのに十分な量の請求項１、２、８、９、１４および／または請求項１５に記載の組成物を投与することを含む、方法。
  19. 前記疾患は、先天性振戦である、請求項１８に記載の方法。
  20. 前記方法は、前記組成物を妊娠中の雌ブタまたは未経産ブタに投与することを含む、請求項１８に記載の方法。
  21. 前記方法は、繁殖前の雌ブタまたは未経産ブタに前記組成物を投与することを含む、請求項１８に記載の方法。
  22. 前記方法は、前記雌ブタまたは未経産ブタに前記組成物を筋肉内投与することを含む、請求項１８に記載の方法。
  23. 前記投与は、第１の投与であり、前記方法がさらに、前記第１の投与から１〜３週間後の第２の投与を含む、請求項１８に記載の方法。
JP2017561377A 2015-08-31 2016-08-31 先天性振戦に対するペスチウイルスワクチン Active JP7046607B2 (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562212124P 2015-08-31 2015-08-31
US62/212,124 2015-08-31
PCT/US2016/049709 WO2017040672A1 (en) 2015-08-31 2016-08-31 Pestivirus vaccines for congenital tremors

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2018525324A true JP2018525324A (ja) 2018-09-06
JP7046607B2 JP7046607B2 (ja) 2022-04-04

Family

ID=56889250

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2017561377A Active JP7046607B2 (ja) 2015-08-31 2016-08-31 先天性振戦に対するペスチウイルスワクチン

Country Status (21)

Country Link
US (2) US9920302B2 (ja)
EP (1) EP3344289B1 (ja)
JP (1) JP7046607B2 (ja)
KR (1) KR20180042167A (ja)
CN (1) CN108135993B (ja)
AU (1) AU2016315796B2 (ja)
BR (1) BR112017028224A2 (ja)
CA (1) CA2996629A1 (ja)
CL (1) CL2018000513A1 (ja)
DK (1) DK3344289T3 (ja)
EA (1) EA036116B1 (ja)
ES (1) ES2778649T3 (ja)
HK (1) HK1256205A1 (ja)
MX (1) MX2017016252A (ja)
MY (1) MY189501A (ja)
PH (1) PH12017501795B1 (ja)
PL (1) PL3344289T3 (ja)
PT (1) PT3344289T (ja)
TW (1) TWI799365B (ja)
UA (1) UA124140C2 (ja)
WO (1) WO2017040672A1 (ja)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20140170180A1 (en) 2012-12-17 2014-06-19 Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. Porcine parvovirus 5a, methods of use and vaccine
ES2778649T3 (es) * 2015-08-31 2020-08-11 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Vacunas pestivirales para temblores congénitos
CN106801109B (zh) * 2017-03-24 2021-03-05 温氏食品集团股份有限公司 一种猪非典型瘟病毒rt-pcr检测特异性引物、试剂盒及检测方法
CN109295014B (zh) * 2018-10-30 2021-08-17 华中农业大学 一种非典型猪瘟病毒e2蛋白重组杆状病毒及其制备方法和应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2016097245A1 (en) * 2014-12-19 2016-06-23 Intervet International B.V. Pestivirus
WO2016176624A2 (en) * 2015-04-30 2016-11-03 Kansas State University Research Foundation Porcine pestvirus, vaccines, and assays

Family Cites Families (51)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US382425A (en) 1888-05-08 Brandt
US2909462A (en) 1955-12-08 1959-10-20 Bristol Myers Co Acrylic acid polymer laxative compositions
US3456053A (en) * 1966-05-06 1969-07-15 Pfizer & Co C Inactivated hog cholera virus vaccine
US4394448A (en) 1978-02-24 1983-07-19 Szoka Jr Francis C Method of inserting DNA into living cells
US4769331A (en) 1981-09-16 1988-09-06 University Patents, Inc. Recombinant methods and materials
US5174993A (en) 1981-12-24 1992-12-29 Health Research Inc. Recombinant avipox virus and immunological use thereof
US5364773A (en) 1991-03-07 1994-11-15 Virogenetics Corporation Genetically engineered vaccine strain
US4603112A (en) 1981-12-24 1986-07-29 Health Research, Incorporated Modified vaccinia virus
US4769330A (en) 1981-12-24 1988-09-06 Health Research, Incorporated Modified vaccinia virus and methods for making and using the same
US5338683A (en) 1981-12-24 1994-08-16 Health Research Incorporated Vaccinia virus containing DNA sequences encoding herpesvirus glycoproteins
US4722848A (en) 1982-12-08 1988-02-02 Health Research, Incorporated Method for immunizing animals with synthetically modified vaccinia virus
US5833975A (en) 1989-03-08 1998-11-10 Virogenetics Corporation Canarypox virus expressing cytokine and/or tumor-associated antigen DNA sequence
US5505941A (en) 1981-12-24 1996-04-09 Health Research, Inc. Recombinant avipox virus and method to induce an immune response
JPS60500673A (ja) 1983-03-08 1985-05-09 コモンウエルス　セラム　ラボラトリ−ズ　コミツシヨン 抗原活性を有するアミノ酸配列
US4745051A (en) 1983-05-27 1988-05-17 The Texas A&M University System Method for producing a recombinant baculovirus expression vector
US4945050A (en) 1984-11-13 1990-07-31 Cornell Research Foundation, Inc. Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor
IE872748L (en) 1986-10-16 1988-04-16 Arjomari Europ Polypeptides derived from the evvelope gene of human¹immunodeficiency virus in recombinant baculovirus infected¹insect cells
GB8717430D0 (en) 1987-07-23 1987-08-26 Celltech Ltd Recombinant dna product
WO1990001543A1 (fr) 1988-07-29 1990-02-22 Intracel Corporation Procede d'expression genetique de proteines heterologues par des cellules transfectees in vivo
CA2003300A1 (en) 1988-11-21 1990-05-21 Franklin Volvovitz Skin test and test kit for aids
WO1990011092A1 (en) 1989-03-21 1990-10-04 Vical, Inc. Expression of exogenous polynucleotide sequences in a vertebrate
US5703055A (en) 1989-03-21 1997-12-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery
US5552143A (en) 1989-03-24 1996-09-03 The Wistar Institute Of Anatomy & Biology Recombinant cytomegalovirus vaccine
US5591439A (en) 1989-03-24 1997-01-07 The Wistar Institute Of Anatomy And Biology Recombinant cytomegalovirus vaccine
GB9001766D0 (en) 1990-01-25 1990-03-28 Univ Court Of The University O Vaccines
EP0575491B1 (en) 1991-03-07 2003-08-13 Virogenetics Corporation Genetically engineered vaccine strain
US5997878A (en) 1991-03-07 1999-12-07 Connaught Laboratories Recombinant poxvirus-cytomegalovirus, compositions and uses
DK0587780T4 (da) 1991-06-06 2008-10-13 Boehringer Ingelheim Vetmed Smitstof, som forårsager Mystery Swine Disease,vaccinepræparater og diagnostiske sæt
DE601062T1 (de) 1991-08-26 1995-05-18 James Edward Collins Vakzine gegen und diagnosemethode für das schweine-unfruchtbarkeits- und atmungs-syndrom (suas).
US6042830A (en) 1992-08-05 2000-03-28 Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. Viral agent associated with mystery swine disease
WO1993006211A1 (en) 1991-09-16 1993-04-01 Collins James E Vaccine for mystery swine disease and method for diagnosis thereof
JPH07501049A (ja) 1991-10-14 1995-02-02 アクゾ・ノベル・エヌ・ベー ブタ生殖・呼吸系症候群ワクチン及び診断方法
US5643578A (en) 1992-03-23 1997-07-01 University Of Massachusetts Medical Center Immunization by inoculation of DNA transcription unit
US5846945A (en) 1993-02-16 1998-12-08 Onyx Pharmaceuticals, Inc. Cytopathic viruses for therapy and prophylaxis of neoplasia
IL108915A0 (en) 1993-03-18 1994-06-24 Merck & Co Inc Polynucleotide vaccine against influenza virus
FR2711670B1 (fr) 1993-10-22 1996-01-12 Pasteur Institut Vecteur nucléotidique, composition le contenant et vaccin pour l'immunisation à l'encontre d'une hépatite.
WO1995020660A2 (en) 1994-01-27 1995-08-03 University Of Massachusetts Medical Center Immunization by inoculation of dna transcription unit
ATE206455T1 (de) 1994-04-11 2001-10-15 Akzo Nobel Nv Europäische vakzinstämme des fortplanzungs- atmungs-syndromsvirus des schweins
WO1995030018A2 (en) 1994-04-29 1995-11-09 Immuno Aktiengesellschaft Recombinant poxviruses with foreign polynucleotides in essential regions
ATE268783T1 (de) 1995-03-14 2004-06-15 Akzo Nobel Nv Expression in der selben zelle von polypeptide vom schweinen reproduktiven und respiratorischen syndrom
EP0871755A1 (en) 1995-03-23 1998-10-21 Cantab Pharmaceuticals Research Limited Vectors for gene delivery
AU737243B2 (en) 1996-07-03 2001-08-16 Merial, Inc. Recombinant canine adenovirus (CAV) containing exogenous DNA
ATE199022T1 (de) 1996-10-09 2001-02-15 Akzo Nobel Nv Europäische vakzinstämme des fortplanzungs- atmungs-syndromsvirus des sweins (prrsv)
EP0839912A1 (en) 1996-10-30 1998-05-06 Instituut Voor Dierhouderij En Diergezondheid (Id-Dlo) Infectious clones of RNA viruses and vaccines and diagnostic assays derived thereof
US6183752B1 (en) 1997-02-05 2001-02-06 Pasteur Merieux Serums Et Vaccins Restenosis/atherosclerosis diagnosis, prophylaxis and therapy
CA2290220C (en) 1998-12-22 2013-11-19 Pfizer Products Inc. An infectious cdna clone of north american porcine reproductive and respiratory syndrome (prrs) virus and uses thereof
DK1149901T3 (da) * 2000-04-21 2006-07-31 Akzo Nobel Nv Mutanter af pestivirus og vacciner indeholdende disse
EP1290016A2 (en) * 2000-06-15 2003-03-12 Purdue Research Foundation Vaccine for congenital tremors in pigs
US6841364B2 (en) 2002-01-22 2005-01-11 Protatek International, Inc. Infectious cDNA clones of porcine reproductive and respiratory syndrome virus and expression vectors thereof
CN104178505B (zh) * 2014-09-01 2017-03-08 华中农业大学 一种表达猪瘟病毒e2基因重组病毒及制备方法与应用
ES2778649T3 (es) * 2015-08-31 2020-08-11 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Vacunas pestivirales para temblores congénitos

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2016097245A1 (en) * 2014-12-19 2016-06-23 Intervet International B.V. Pestivirus
WO2016176624A2 (en) * 2015-04-30 2016-11-03 Kansas State University Research Foundation Porcine pestvirus, vaccines, and assays

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
J. GEN. VIROL. (2015-07-24) VOL.96, ISSUE 10, P.2994-2998, JPN6020030129, ISSN: 0004512516 *

Also Published As

Publication number Publication date
AU2016315796A1 (en) 2017-10-19
PL3344289T3 (pl) 2021-01-11
PH12017501795A1 (en) 2018-04-02
EA201792593A1 (ru) 2018-08-31
MX2017016252A (es) 2018-04-20
TWI799365B (zh) 2023-04-21
UA124140C2 (uk) 2021-07-28
WO2017040672A1 (en) 2017-03-09
JP7046607B2 (ja) 2022-04-04
DK3344289T3 (da) 2020-04-14
PH12017501795B1 (en) 2018-04-02
AU2016315796B2 (en) 2022-08-04
TW201718007A (zh) 2017-06-01
US9920302B2 (en) 2018-03-20
CA2996629A1 (en) 2017-03-09
EP3344289A1 (en) 2018-07-11
CN108135993A (zh) 2018-06-08
PT3344289T (pt) 2020-04-02
CN108135993B (zh) 2022-03-22
ES2778649T3 (es) 2020-08-11
US20180171307A1 (en) 2018-06-21
MY189501A (en) 2022-02-16
US10633637B2 (en) 2020-04-28
KR20180042167A (ko) 2018-04-25
US20170058266A1 (en) 2017-03-02
EP3344289B1 (en) 2020-01-29
BR112017028224A2 (pt) 2018-09-11
CL2018000513A1 (es) 2019-01-11
EA036116B1 (ru) 2020-09-30
HK1256205A1 (zh) 2019-09-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2577129C2 (ru) Поливалентные иммуногенные композиции pcv2 и способы получения таких композиций
US9579373B2 (en) Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, compositions, vaccine and methods of use
TW201141517A (en) Multivalent vaccine against porcine Teschovirus and other disease causing organisms in swine
CN106148287B (zh) 猪流行性腹泻病毒株及其疫苗组合物、制备方法和应用
KR20200027479A (ko) 세네카바이러스 a 면역원성 조성물 및 이의 방법
US10633637B2 (en) Pestivirus vaccines for congenital tremors
CN109922825B (zh) 抗猪细小病毒及猪生殖与呼吸道综合征病毒的疫苗及其制造方法
TW202026010A (zh) 抗豬流行性下痢之鼻內載體疫苗
US10188725B2 (en) Hybrid core feline vaccines
US20170072042A1 (en) Salmonella choleraesuis-salmonella typhimurium vaccines
RU2577127C9 (ru) Поливалентные иммунногенные композиции pcv2 и способы получения таких композиций
Srivastava et al. NEPHROTIC SYNDROME IN A SIAMESE CAT

Legal Events

Date Code Title Description
A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20190828

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20200818

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20201117

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20210112

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20210217

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20210601

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20210813

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20211026

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20220222

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20220323

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Ref document number: 7046607

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150