JP2018517192A - 生物学的経路の関連性の評価を行うコンピュータ実装方法、コンピュータ・システム、およびコンピュータ・プログラム - Google Patents
生物学的経路の関連性の評価を行うコンピュータ実装方法、コンピュータ・システム、およびコンピュータ・プログラム Download PDFInfo
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Abstract
【解決手段】実施形態は、対象の病気に対する経路の関連性を評価するコンピュータ実装方法を対象にし、経路はソースおよびターゲットを含んでいる。方法は、経路に対するソースの影響を作成することを含む。方法は、経路の変更の少なくとも一部に基づいて、対象の薬品を使用して経路をターゲットにすることの価値を作成することをさらに含む。方法は、経路内のソースとターゲットの間の関係を識別することをさらに含む。方法は、経路に対するソースの影響、経路の変更の少なくとも一部に基づいて、対象の薬品を使用して経路をターゲットにすることの価値、および経路内のソースとターゲットの間の関係を結合することをさらに含み、この結合によって、対象の病気に対する経路の関連性を表す評価が得られる。
【選択図】図5
Description
Claims (25)
- 対象の病気に対する少なくとも1つの経路の関連性を評価する、コンピュータにより実装される方法であって、前記経路はソースおよびターゲットを含んでおり、前記方法が、
プロセッサによって、前記経路に対する前記ソースの影響を作成することと、
前記プロセッサによって、前記経路の変更の少なくとも一部に基づいて、対象の薬品を使用して前記経路をターゲットにすることの価値を作成することと、
前記プロセッサによって、前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の関係を識別することと、
前記経路に対する前記ソースの前記影響、
前記経路の変更の少なくとも一部に基づいて、対象の薬品を使用して前記経路をターゲットにすることの前記価値、および
前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の前記関係
を結合することと
を含み、
前記結合によって前記対象の病気に対する前記経路の前記関連性の評価が得られる、方法。 - 前記経路に対する前記ターゲットの前記影響が、前記ターゲットの加重値を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記経路の前記変更の少なくとも一部に基づいて前記経路をターゲットにすることの前記価値が、前記ターゲットの加重値を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の前記関係が、前記ソースから前記ターゲットまでの前記経路のトポロジーを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記プロセッサによって、前記評価を他の前記評価と比較してランク付けすることをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記プロセッサによって、前記評価の少なくとも一部に基づいて、前記経路の簡略化された視覚化を実行することをさらに備える、請求項1に記載の方法。
- 前記簡略化された視覚化が、
前記経路のグラフを作成することであって、前記グラフが、エッジによって接続された複数のノードを含んでいる、前記作成することと、
前記グラフの関連するパスを識別することと、
前記関連するパスから、情報を与えないノードまたは無意味なノードを削除して、第1のサブグラフを作成することと、
前記第1のサブグラフの関係および関連する属性を簡略化して、第2の簡略化されたサブグラフを作成することと
を含む、請求項6に記載の方法。 - 前記関連する属性が、前記第2の簡略化されたサブグラフの前記複数のノードまたは前記複数のエッジの特性を備える、請求項7に記載の方法。
- 対象の病気に対する少なくとも1つの経路の関連性を評価するためのコンピュータ・システムであって、前記経路はソースおよびターゲットを含んでおり、前記システムが、
前記経路に対する前記ソースの影響を作成するように構成されたプロセッサを備え、
前記プロセッサは、前記経路の変更の少なくとも一部に基づいて、対象の薬品を使用して前記経路をターゲットにすることの価値を作成するようにさらに構成され、
前記プロセッサは、前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の関係を識別するようにさらに構成され、
前記プロセッサは、
前記経路に対する前記ソースの前記影響、
前記経路の前記変更の少なくとも一部に基づいて、前記対象の薬品を使用して前記経路をターゲットにすることの前記価値、および
前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の前記関係
を結合するようにさらに構成され、
前記プロセッサによる前記結合によって前記対象の病気に対する前記経路の前記関連性の評価が得られる、コンピュータ・システム。 - 前記経路に対する前記ターゲットの前記影響が、前記ターゲットの加重値を含む、請求項9に記載のコンピュータ・システム。
- 前記経路の前記変更の少なくとも一部に基づいて前記経路をターゲットにすることの前記価値が、前記ターゲットの加重値を含む、請求項9に記載のコンピュータ・システム。
- 前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の前記関係が、前記ソースから前記ターゲットまでの前記経路のトポロジーを含む、請求項9に記載のコンピュータ・システム。
- 前記プロセッサは、前記評価を他の前記評価と比較してランク付けするようにさらに構成される、請求項9に記載のコンピュータ・システム。
- 前記プロセッサは、前記評価の少なくとも一部に基づいて、前記経路の簡略化された視覚化を実行するようにさらに構成される、請求項9に記載のコンピュータ・システム。
- 前記簡略化された視覚化が、
前記経路のグラフを作成することであって、前記グラフが、エッジによって接続された複数のノードを含んでいる、前記作成することと、
前記グラフの関連するパスを識別することと、
前記関連するパスから、情報を与えないノードまたは無意味なノードを削除して、第1のサブグラフを作成することと、
前記第1のサブグラフの関係および関連する属性を簡略化して、第2の簡略化されたサブグラフを作成することと
を含む、請求項14に記載のコンピュータ・システム。 - 前記関連する属性が、前記第2の簡略化されたサブグラフの前記複数のノードまたは前記複数のエッジの特性を備える、請求項15に記載のコンピュータ・システム。
- 対象の病気に対する少なくとも1つの経路の関連性を評価するためのコンピュータ・プログラム製品であって、前記経路はソースおよびターゲットを含んでおり、前記コンピュータ・プログラム製品が、
プログラム命令が具現化されたコンピュータ可読記憶媒体を備え、前記コンピュータ可読記憶媒体は本質的に一時的信号ではなく、プロセッサ回路によって読み取り可能な前記プログラム命令が、
前記経路に対する前記ソースの影響を作成することと、
前記経路の変更の少なくとも一部に基づいて、対象の薬品を使用して前記経路をターゲットにすることの価値を作成することと、
前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の関係を識別することと、
前記経路に対する前記ソースの前記影響、
前記経路の前記変更の少なくとも一部に基づいて、前記対象の薬品を使用して前記経路をターゲットにすることの前記価値、および
前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の前記関係
を結合することと
を含む方法を前記プロセッサ回路に実行させ、
前記結合によって前記対象の病気に対する前記経路の前記関連性の評価が得られる、コンピュータ・プログラム製品。 - 前記経路に対する前記ターゲットの前記影響が、前記ターゲットの加重値を含み、
前記経路の前記変更の少なくとも一部に基づいて、前記経路をターゲットにすることの前記価値が、前記ターゲットの加重値を含み、
前記経路内の前記ソースと前記ターゲットとの間の前記関係が、前記ソースから前記ターゲットまでの前記経路のトポロジーを含む、請求項17に記載のコンピュータ・プログラム製品。 - 前記評価を他の前記評価と比較してランク付けすることと、
前記評価の少なくとも一部に基づいて、前記経路の簡略化された視覚化を実行することとをさらに含み、
前記簡略化された視覚化が、
前記経路のグラフを作成することであって、前記グラフが、エッジによって接続された複数のノードを含んでいる、前記作成することと、
前記グラフの関連するパスを識別することと、
前記関連するパスから、情報を与えないノードまたは無意味なノードを削除して、第1のサブグラフを作成することと、
前記第1のサブグラフの関係および関連する属性を簡略化して、第2の簡略化されたサブグラフを作成することと
を含む、請求項17に記載のコンピュータ・プログラム製品。 - 少なくとも1つの経路の視覚化を簡略化する、コンピュータにより実装される方法であって、
前記経路のグラフを作成することであって、前記グラフが、エッジによって接続された複数のノードを含んでいる、前記作成することと、
前記グラフの関連するパスを識別することと、
前記関連するパスから、情報を与えないノードまたは無意味なノードを削除して、第1のサブグラフを作成することと、
前記第1のサブグラフの関係および関連する属性を簡略化して、第2の簡略化されたサブグラフを作成することと
を含む、方法。 - 前記関連する属性が、前記第2の簡略化されたサブグラフの前記複数のノードまたは前記複数のエッジの特性を備える、請求項20に記載の方法。
- 前記特性が、
人工的リンクの距離、または
スーパーセット複合体
を含む、請求項21に記載の方法。 - 少なくとも1つの経路の視覚化を簡略化するためのコンピュータ・システムであって、
前記経路のグラフを作成するように構成されたプロセッサであって、前記グラフが、エッジによって接続された複数のノードを含んでいる、前記プロセッサを備え、
前記プロセッサは、前記グラフの関連するパスを識別するようにさらに構成され、
前記プロセッサは、前記関連するパスから、情報を与えないノードまたは無意味なノードを削除して、第1のサブグラフを作成するようにさらに構成され、
前記プロセッサは、前記第1のサブグラフの関係および関連する属性を簡略化して、第2の簡略化されたサブグラフを作成するようにさらに構成された、コンピュータ・システム。 - 前記関連する属性が、前記第2の簡略化されたサブグラフの前記複数のノードまたは前記複数のエッジの特性を備える、請求項23に記載のコンピュータ・システム。
- 前記特性が、
人工的リンクの距離、または
スーパーセット複合体を含む、請求項24に記載のコンピュータ・システム。
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