JP2018516983A5 - - Google Patents

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Description

本方法は、CMVゲノム破壊を可能にし、それにより、細胞に対する細胞毒性が観察されることなく、ウイルス増殖の無能力化がもたらされる。本発明の態様は、CMVゲノム物質(DNAまたはRNA)を選択的に標的とするようにCRISPR/gRNA/Cas9複合体を設計し、CRISPR/gRNA/Cas9複合体を、CMVゲノムを含む細胞または組織に送達し、ウイルスを無力化にするためにCMVゲノムを切断することを提供する。本方法は、CMVゲノム機能が標的にされた損壊を可能にするか、または好ましい実施形態では、CMVゲノムにおけるヌクレアーゼ作用のための複数の部位を標的とすることにより引き起こされた複数の切断によってCMV核酸を消化することを可能にする。本発明の態様は、CRISPR/gRNA/Cas9複合体カクテルのトランスフェクションを提供することによって、CMV増殖を完全に抑制する。本発明のさらなる態様および利点は、以下のその詳細な説明を考慮すると明白となる。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される:
(項目1)
単純ヘルペスウイルス(HSV)感染の処置のための組成物であって、
ヌクレアーゼと、
HSV核酸に相補的であり、前記ヌクレアーゼを前記HSV核酸に向かわせることが可能な配列特異的標的指向性部分と
をコードするベクターを含む組成物。
(項目2)
前記HSV核酸が、複製開始点S(oriS)領域である、項目1に記載の組成物。
(項目3)
前記HSV核酸が、ロングユニーク領域9(UL9)またはロングリピート領域2(RL2)である、項目1に記載の組成物。
(項目4)
経皮的に投与されるように構成されている、項目1に記載の組成物。
(項目5)
局所用溶液を含む、項目1に記載の組成物。
(項目6)
前記ヌクレアーゼが、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ、およびメガヌクレアーゼからなる群から選択されるヌクレアーゼである、項目1に記載の組成物。
(項目7)
前記ヌクレアーゼが、Cas9エンドヌクレアーゼを含み、配列特異的結合モジュールが、ウイルスゲノムの部分を特異的に標的とするガイドRNAを含む、項目1に記載の組成物。
(項目8)
ヒト患者への送達用にさらにパッケージングされている、項目1に記載の組成物。
(項目9)
標的指向性の配列が、ガイドRNAであり、ヒトゲノム内で60%超の一致を有していない、項目1に記載の組成物。
(項目10)
前記ベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ポックスウイルス、アルファウイルス、ワクシニアウイルス、アデノ随伴ウイルス、プラスミド、ナノ粒子、カチオン性脂質、カチオン性ポリマー、金属ナノ粒子、ナノロッド、リポソーム、マイクロバブル、細胞透過性ペプチド、およびリポスフェアからなる群から選択されるベクターを含む、項目1に記載の組成物。
(項目11)
単純ヘルペスウイルス(HSV)感染を処置するための方法であって、
ヌクレアーゼとHSV核酸に相補的な配列特異的標的指向性部分とをコードするベクター、または前記ヌクレアーゼと前記配列特異的標的指向性部分とを含むリボ核タンパク質を宿主の細胞内に導入するステップ、
前記配列特異的標的指向性部分が、前記ヌクレアーゼを前記HSV核酸に向かわせるようにさせるステップ、および
前記ヌクレアーゼに前記HSV核酸を切断させるステップ
を含む方法。
(項目12)
前記HSV核酸が、複製開始点S(oriS)領域である、項目11に記載の方法。
(項目13)
前記HSV核酸が、ロングユニーク領域9(UL9)またはロングリピート領域2(RL2)である、項目11に記載の方法。
(項目14)
前記ベクターを前記宿主に経皮的に投与するステップをさらに含む、項目11に記載の方法。
(項目15)
さらに、前記経皮的な投与が、前記ベクターを含む局所用溶液を塗布することを含む、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記ヌクレアーゼが、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ、およびメガヌクレアーゼからなる群から選択されるベクターである、項目11に記載の方法。
(項目17)
前記ヌクレアーゼが、Cas9エンドヌクレアーゼを含み、配列特異的結合モジュールが、ウイルスゲノムの部分を特異的に標的とするガイドRNAを含む、項目11に記載の方法。
(項目18)
前記宿主が、生体ヒト対象であり、前記ステップがin vivoで実施される、項目11に記載の方法。
(項目19)
標的指向性の配列が、ガイドRNAであり、ヒトゲノム内で60%超の一致を有していない、項目11に記載の方法。
(項目20)
前記ベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ポックスウイルス、アルファウイルス、ワクシニアウイルス、アデノ随伴ウイルス、プラスミド、ナノ粒子、カチオン性脂質、カチオン性ポリマー、金属ナノ粒子、ナノロッド、リポソーム、マイクロバブル、細胞透過性ペプチド、およびリポスフェアからなる群から選択されるベクターを含む、項目11に記載の方法。
(項目21)
単純ヘルペスウイルス(HSV)感染の処置のための組成物であって、
ヌクレアーゼと、
HSV核酸に相補的であり、前記ヌクレアーゼを前記HSV核酸に向かわせることが可能な配列特異的標的指向性部分と
を含むリボ核タンパク質を含む組成物。
(項目22)
前記HSV核酸が、複製開始点S(oriS)領域である、項目21に記載の組成物。
(項目23)
前記HSV核酸が、ロングユニーク領域9(UL9)またはロングリピート領域2(RL2)である、項目21に記載の組成物。
(項目24)
経皮的に投与されるように構成されている、項目21に記載の組成物。
(項目25)
感染組織に局所塗布するための薬学的に許容される担体をさらに含む、項目21に記載の組成物。
(項目27)
前記ヌクレアーゼが、Cas9エンドヌクレアーゼを含み、配列特異的結合モジュールが、ウイルスゲノムの部分を特異的に標的とするガイドRNAを含む、項目21に記載の組成物。
(項目29)
標的指向性の配列が、ガイドRNAであり、ヒトゲノム内で60%超の一致を有していない、項目21に記載の組成物。
(項目30)
サイトメガロウイルス(CMV)感染の処置のための組成物であって、
ヌクレアーゼと、
CMV核酸に相補的であり、前記ヌクレアーゼを前記CMV核酸に向かわせることが可能な配列特異的標的指向性部分と
を含む組成物。
(項目31)
前記ヌクレアーゼが、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ、およびメガヌクレアーゼからなる群から選択されるヌクレアーゼを含む、項目30に記載の組成物。
(項目32)
前記ヌクレアーゼがCas9エンドヌクレアーゼである、項目30に記載の組成物。
(項目33)
前記ヌクレアーゼが、前記Cas9エンドヌクレアーゼを前記CMV核酸の部分へと標的化するガイドRNAをさらに含む、項目32に記載の組成物。
(項目34)
前記ヌクレアーゼが、前記CMV核酸中に少なくとも1つの二本鎖切断を引き起こす、項目30の組成物。
(項目35)
前記ヌクレアーゼが、前記CMV核酸中に少なくとも1つの挿入を引き起こす、項目30の組成物。
(項目36)
臓器のサイトメガロウイルス(CMV)感染を処置するための方法であって、
ヌクレアーゼと、CMV核酸に相補的であり、前記ヌクレアーゼを前記CMV核酸に向かわせることが可能な配列特異的標的指向性部分とを含む組成物を臓器内に導入するステップ、および
前記ヌクレアーゼに、CMV核酸を標的とし、かつ切断させるステップ
を含む方法。
(項目37)
前記臓器が移植ドナーに由来する、項目36に記載の方法。
(項目38)
前記臓器が、心臓、肝臓、腎臓、目、肺、膵臓、腸、および胸腺からなる群から選択される、項目36に記載の方法。
(項目39)
前記ヌクレアーゼが、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ、およびメガヌクレアーゼからなる群から選択されるヌクレアーゼを含む、項目36に記載の方法。
(項目40)
前記ヌクレアーゼがCas9エンドヌクレアーゼである、項目36に記載の方法。
(項目41)
前記ヌクレアーゼが、前記Cas9エンドヌクレアーゼを前記CMV核酸の部分へと標的化するガイドRNAをさらに含む、項目40に記載の方法。
(項目42)
前記導入するステップが、送達用ウイルスベクターで前記ヌクレアーゼを送達することを含む、項目36に記載の方法。
(項目43)
前記ウイルスベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ポックスウイルス、アルファウイルス、ワクシニアウイルス、およびアデノ随伴ウイルスからなる群から選択される、項目42に記載の方法。
(項目44)
前記導入するステップが、プラスミド、ナノ粒子、カチオン性脂質、カチオン性ポリマ
ー、金属ナノ粒子、ナノロッド、リポソーム、細胞透過性ペプチド、リポスフェア、およびポリエチレングリコール(PEG)からなる群から選択されるものを含むベクターで前記ヌクレアーゼを送達することを含む、項目36に記載の方法。
(項目45)
前記ヌクレアーゼが、前記CMV核酸中に少なくとも1つの二本鎖切断を引き起こす、項目36に記載の方法。
(項目46)
前記ヌクレアーゼが、前記CMV核酸中に少なくとも1つの挿入を引き起こす、項目36に記載の方法。
(項目47)
胎児のサイトメガロウイルス(CMV)感染を処置するための方法であって、
ヌクレアーゼと、CMV核酸に相補的であり、前記ヌクレアーゼを前記CMV核酸に向かわせることが可能な配列特異的標的指向性部分とを含む組成物を妊婦に導入するステップ、および
前記ヌクレアーゼに、CMV核酸を標的とし、かつ切断させるステップ
を含む方法。
(項目48)
前記ヌクレアーゼが、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ、およびメガヌクレアーゼからなる群から選択されるヌクレアーゼを含む、項目47に記載の方法。
(項目49)
前記ヌクレアーゼがCas9エンドヌクレアーゼである、項目47に記載の方法。
(項目50)
前記ヌクレアーゼが、前記Cas9エンドヌクレアーゼを前記CMV核酸の部分へと標的化するガイドRNAと会合している、項目47に記載の方法。
(項目51)
前記導入するステップが、ウイルスベクター内の前記ヌクレアーゼを送達することを含む、項目47に記載の方法。
(項目52)
前記ウイルスベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ポックスウイルス、アルファウイルス、ワクシニアウイルス、およびアデノ随伴ウイルスからなる群から選択される、項目51に記載の方法。
(項目53)
前記導入するステップが、プラスミド、ナノ粒子、カチオン性脂質、カチオン性ポリマー、金属ナノ粒子、ナノロッド、リポソーム、細胞透過性ペプチド、リポスフェア、およびポリエチレングリコール(PEG)からなる群から選択されるものを含むベクターで前記ヌクレアーゼを送達することを含む、項目47に記載の方法。
(項目54)
前記ヌクレアーゼが、前記CMV核酸中に少なくとも1つの二本鎖切断を引き起こす、項目47に記載の方法。
(項目55)
前記ヌクレアーゼが、前記CMV核酸中に少なくとも1つの挿入を引き起こす、項目47に記載の方法。

Claims (19)

  1. Cas9エンドヌクレアーゼと、
    単純ヘルペスウイルス(HSV核酸に相補的な部分を有するガイドRNAであって、前記Cas9エンドヌクレアーゼを前記HSV核酸に向かわせることが可能なガイドRNA
    をコードするベクターを含む組成物であって、
    前記HSV核酸が、複製開始点S(oriS)領域、ロングユニーク領域9(UL9)またはLATイントロン(LATi)を含む、組成物
  2. 経皮的に投与されるように構成されている、請求項1に記載の組成物。
  3. 局所用溶液を含む、請求項1に記載の組成物。
  4. ヒト患者への送達用にパッケージングされている、請求項1に記載の組成物。
  5. 前記HSV核酸に相補的な前記ガイドRNAの前記部分が、ヒトゲノム内で60%超の一致を有していない、請求項1に記載の組成物。
  6. 前記ベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ポックスウイルス、アルファウイルス、ワクシニアウイルス、アデノ随伴ウイルス、プラスミド、ナノ粒子、カチオン性脂質、カチオン性ポリマー、金属ナノ粒子、ナノロッド、リポソーム、マイクロバブル、細胞透過性ペプチド、およびリポスフェアからなる群から選択されるベクターを含む、請求項1に記載の組成物。
  7. HSV感染を処置するための方法において使用するための、請求項1〜6のいずれか一項に記載の組成物
  8. リボ核タンパク質を含む組成物であって、前記リボ核タンパク質は、
    Cas9エンドヌクレアーゼと、
    HSV核酸に相補的な部分を有するガイドRNAであって、前記Cas9エンドヌクレアーゼを前記HSV核酸に向かわせることが可能なガイドRNA
    を含み、
    前記HSV核酸が、oriS領域、RL2、UL9またはLATiを含む、組成物。
  9. 経皮的に投与されるように構成されている、請求項に記載の組成物。
  10. 感染組織に局所塗布するための薬学的に許容される担体をさらに含む、請求項に記載の組成物。
  11. 前記HSV核酸に相補的な前記ガイドRNAの前記部分が、ヒトゲノム内で60%超の一致を有していない、請求項に記載の組成物。
  12. HSV感染の処置の方法において使用するための、請求項8〜11のいずれか一項に記載の組成物。
  13. 前記リボ核タンパク質が、ナノ粒子、カチオン性脂質、カチオン性ポリマー、金属ナノ粒子、ナノロッド、リポソーム、細胞透過性ペプチド、リポスフェア、またはポリエチレングリコール(PEG)を使用して送達される、請求項12に記載の使用のための組成物。
  14. 前記リボ核タンパク質が、ナノ粒子に封入されているかまたはナノ粒子と複合体となっている、請求項12に記載の使用のための組成物。
  15. 組成物であって、
    Cas9エンドヌクレアーゼをコードするmRNAと、
    HSV核酸に相補的な部分を有するガイドRNAであって、前記Cas9エンドヌクレアーゼを前記HSV核酸に向かわせることが可能なガイドRNAと
    を含み、
    前記HSV核酸が、oriS領域、UL9、RL2またはLATiを含む、組成物。
  16. 前記mRNAおよび前記ガイドRNAが、脂質ナノ粒子に封入されているかまたはナノ粒子と複合体となっている、請求項15に記載の組成物。
  17. 前記組成物が、局所用溶液を含む、請求項15に記載の組成物。
  18. 前記HSV核酸に相補的な前記ガイドRNAの部分が、ヒトゲノム内で60%超の一致を有していない、請求項15に記載の組成物。
  19. HSV感染の処置の方法において使用するための、請求項15〜18のいずれか一項に記載の組成物。
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