JP2018506996A - 個体の免疫レパートリーの変化を測定するための方法 - Google Patents
個体の免疫レパートリーの変化を測定するための方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2018506996A JP2018506996A JP2017564771A JP2017564771A JP2018506996A JP 2018506996 A JP2018506996 A JP 2018506996A JP 2017564771 A JP2017564771 A JP 2017564771A JP 2017564771 A JP2017564771 A JP 2017564771A JP 2018506996 A JP2018506996 A JP 2018506996A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- sample
- subject
- immune
- cdr3
- frequency
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B25/00—ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/20—Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/30—Detection of binding sites or motifs
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B25/00—ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
- G16B25/10—Gene or protein expression profiling; Expression-ratio estimation or normalisation
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
- G16B40/10—Signal processing, e.g. from mass spectrometry [MS] or from PCR
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H50/00—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
- G16H50/20—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for computer-aided diagnosis, e.g. based on medical expert systems
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Artificial Intelligence (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Bioethics (AREA)
Abstract
Description
本願は、参照によって本明細書に組み入れられる「個体の免疫レパートリーの変化を測定するための方法(Method for Measuring a Change in an Individual’s Immunorepertoire)」という名称を付けられ2015年3月6日に出願された米国特許仮出願第62/129,706号に対する優先権を主張する。
本開示は、リンパ球の差次的に発現される受容体および特有CDR3配列に基づき、単一細胞レベルで個体のTリンパ球およびBリンパ球を分類するための方法、および疾患および/またはそのような疾患の処置の前、最中、および/または後の個体の免疫レパートリーの変化を決定する方法に関する。
ホメオスタシスのプロセスを通じて、免疫系は、総称して個体の「免疫レパートリー」と呼ばれる、ある特定の数およびレパートリーのTリンパ球およびBリンパ球を維持する。その一方で、個体の免疫レパートリーは、連続的細胞代謝回転の結果および抗原への曝露の結果として、常に変化する。そのような免疫レパートリーの変化には、例えば、新たな(ナイーブ)Tリンパ球およびBリンパ球の発生、活性Tリンパ球およびBリンパ球の拡大、ならびに新たなメモリーTリンパ球およびBリンパ球の形成が含まれうる。
本発明者らは、疾患に罹患している個体または疾患の処置のために治療を受けている個体の免疫レパートリーの変化を決定するための方法を開発している。該方法は、健康現象の前、最中、または後に一個体で見られる免疫細胞多様性のレベルの変化における差異を用いて、個体に対する疾患の影響または処置計画の効果を判定する。そのような健康現象には、1つの態様において、自然発生(すなわち、疾患の発症)または人工発生(すなわち、疾患処置の開始)が含まれうる。本発明の1つの局面において、免疫細胞多様性のレベルの差異はデルタインデックスと称される。デルタインデックスは、個体の最も劇的な免疫細胞の経時的な量的変化(CDR3の上方または下方制御)および質的変化(クローンの獲得または欠失)として本明細書において定義される。1つの態様において、本発明は、3番目の相補性決定領域(CDR3)、そのヌクレオチド配列がそれぞれT細胞クローンまたはB細胞クローンに特有である領域の変化を決定する。1つの態様において、個体の免疫系内の最も劇的な免疫細胞は、免疫レパートリーインパクト範囲としてとして称される。1つの態様において、インパクト範囲は、そのヌクレオチド配列の最大の変化を示すサンプル集団内の100個のCDR3クローンとして定義される。他の態様において、インパクト範囲は、他の数のクローン、例えば、最大の変化を示す1,000クローンまたは10,000クローンを含みうる。本明細書で用いられる「免疫細胞」は、Tリンパ球および/またはBリンパ球を指す。
シグナル/ノイズ=デルタインデックス(PAT1S1-PAT2S1)/デルタインデックス(PAT1S1-PAT1S2)。
図4に図示する態様において、100のインパクト範囲の選択は、最も低いシグナル対ノイズ比を生じさせ、よりノイズが少ない結果をもたらす。
2つの全血サンプルを、3ヶ月間隔で2人の健常な個体のそれぞれから収集した。各個体からのサンプルに対して2種類の次世代シーケンシング(NGS)プロトコールを実施した。平均で100万個の細胞からRNAを抽出し、アームPCRを用いてNGSライブラリを作製した。Illumina HiSeq(登録商標)機器を用いて、配列決定を行った。
2つの全血サンプルを、3ヶ月の間隔で19名の健常な個体のそれぞれから収集した。各個体からのサンプルに対して2種類のNGSプロトコールを行った。平均で100万個の細胞からRNAを抽出し、アームPCRを用いてNGSライブラリを作製した。Illumina HiSeq(登録商標)機器を用いて、配列決定を行った。各サンプルについて、平均で500万のT細胞受容体分子を配列決定した(1個体当たり1000万個の総リード数)。およそ100,000〜300,000個の特有CDR3配列が各サンプルから得られた。
ネオアジュバント処置、すなわち、手術前に腫瘍量を減少させるための手術前化学療法を受けた12人の乳がん患者から、サンプルを得た。
Claims (18)
- 同じ患者から収集した第1のサンプル中および第2のサンプル中の免疫細胞の集団または亜集団における免疫細胞のクロノタイプを定量化する工程;
各クロノタイプの頻度を同定することによって該第1のサンプルおよび該第2のサンプルについて頻度データを算出する工程;
該第1のサンプルおよび該第2のサンプルについて該頻度データを正規化する工程;
該第1のサンプル中および該第2のサンプル中に存在する各クロノタイプの頻度の絶対値差分を決定する工程;ならびに
該第1のサンプルと該第2のサンプルとに共通しており最大頻度変化を有するクロノタイプを決定する工程
を含む、対象の免疫レパートリーの変化を算出する方法。 - 免疫細胞のクロノタイプが、アームPCRおよび次世代シーケンシングを用いて定量化される、請求項1に記載の方法。
- 前記クロノタイプがCDR3クロノタイプである、請求項1に記載の方法。
- 前記第1のサンプルおよび前記第2のサンプルが同時点で収集される、請求項1に記載の方法。
- 前記第1のサンプルおよび前記第2のサンプルが、異なる時点で収集される、請求項1に記載の方法。
- 最大頻度変化を有する少なくとも100個のクロノタイプを同定する、請求項1に記載の方法。
- 各サンプルが白血球細胞を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記対象が健常である、請求項1に記載の方法。
- 前記対象が、疾患と診断されているか、または疾患を有すると疑われる、請求項1に記載の方法。
- 前記対象が免疫療法で処置される、請求項1に記載の方法。
- 前記対象が、前記第1のサンプルを収集した後に免疫療法を受ける、請求項10に記載の方法。
- 白血球細胞の少なくとも2つのサンプル集団を対象から収集する工程;
標的特異的なネステッドプライマーを含む反応混合物中で白血球細胞の各集団由来のポリヌクレオチドを別々に増幅して、第1のアンプリコンのセットを生成する工程であって、該標的特異的なネステッドプライマーの少なくとも一部が、少なくとも1つの共通プライマーに対する結合部位を該第1アンプリコンに組み込むための鋳型として増幅中に機能する追加のヌクレオチドを含む、工程;
該第1のアンプリコンを含有する各第1の反応混合物の一部を別々に、少なくとも1つの共通プライマーを含む第2の反応混合物に移す工程;
各集団について、該少なくとも1つの共通プライマーを用いて該第1のアンプリコンを増幅して、第2のアンプリコンのセットを生成する工程;
各該第2のアンプリコンを配列決定して、サンプル中に存在する特定のCDR3領域の頻度を同定する工程;
CDR3頻度データを正規化する工程;
第1のサンプルのおよび第2のサンプルの正規化した該CDR3頻度データを比較して、各CDR3配列の頻度間の絶対値差分を決定する工程;ならびに
該第1のサンプルと該第2のサンプルとに共通しており最大頻度変化を有するCDR3配列を決定する工程
を含む、対象の免疫レパートリーの変化を算出する方法。 - 前記第1のサンプルおよび前記第2のサンプルが同時点で収集される、請求項12に記載の方法。
- 前記第1のサンプルおよび前記第2のサンプルが、異なる時点で収集される、請求項12に記載の方法。
- 前記対象が健常である、請求項12に記載の方法。
- 前記対象が、疾患と診断されているか、または疾患を有すると疑われる、請求項12に記載の方法。
- 前記対象が免疫療法で処置される、請求項1に記載の方法。
- 前記対象が、前記第1のサンプルを収集した後に免疫療法を受ける、請求項10に記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201562129706P | 2015-03-06 | 2015-03-06 | |
US62/129,706 | 2015-03-06 | ||
PCT/US2016/020939 WO2016144776A1 (en) | 2015-03-06 | 2016-03-04 | Method for measuring a change in an individual's immunorepertoire |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2018506996A true JP2018506996A (ja) | 2018-03-15 |
JP6974181B2 JP6974181B2 (ja) | 2021-12-01 |
Family
ID=56849672
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017564771A Active JP6974181B2 (ja) | 2015-03-06 | 2016-03-04 | 個体の免疫レパートリーの変化を測定するための方法 |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US10529442B2 (ja) |
EP (1) | EP3265591A4 (ja) |
JP (1) | JP6974181B2 (ja) |
KR (1) | KR20170134432A (ja) |
CN (2) | CN115449542A (ja) |
AU (2) | AU2016229162A1 (ja) |
BR (1) | BR112017019148A2 (ja) |
CA (1) | CA2978751A1 (ja) |
HK (1) | HK1245848A1 (ja) |
RU (1) | RU2714752C2 (ja) |
SG (1) | SG11201707045YA (ja) |
WO (1) | WO2016144776A1 (ja) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012037524A2 (en) | 2010-09-16 | 2012-03-22 | The General Hospital Corporation | Red blood cell dynamics for diagnosis |
US11293852B2 (en) * | 2016-04-07 | 2022-04-05 | The General Hospital Corporation | White blood cell population dynamics |
US20200199650A1 (en) * | 2017-05-18 | 2020-06-25 | Geneplus-Beijing | Analysis system for peripheral blood-based non-invasive detection of lesion immune repertoire diversity and uses of system |
CN111383736A (zh) * | 2018-12-28 | 2020-07-07 | 康多富国际有限公司 | 免疫系统疾病保健食品组合确定方法及其可读取储存媒体 |
Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013036459A2 (en) * | 2011-09-09 | 2013-03-14 | Sequenta, Inc. | Sequence-based measures of immune response |
WO2014008448A1 (en) * | 2012-07-03 | 2014-01-09 | Sloan Kettering Institute For Cancer Research | Quantitative assessment of human t-cell repertoire recovery after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation |
JP2014503223A (ja) * | 2011-01-14 | 2014-02-13 | シービー バイオテクノロジーズ インコーポレイテッド | 免疫多様性の評価方法およびその使用 |
US20140065629A1 (en) * | 2012-08-29 | 2014-03-06 | Israel Barken | Methods of treating diseases |
WO2014124451A1 (en) * | 2013-02-11 | 2014-08-14 | Cb Biotechnologies, Inc. | Method for evaluating an immunorepertoire |
US20140235478A1 (en) * | 2013-02-04 | 2014-08-21 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Measurement and Comparison of Immune Diversity by High-Throughput Sequencing |
WO2014189635A1 (en) * | 2013-05-20 | 2014-11-27 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Tracking donor-reactive tcr as a biomarker in transplantation |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2009231582B2 (en) * | 2008-04-03 | 2015-02-26 | iRepertoire, Inc. | Amplicon rescue multiplex polymerase chain reaction for amplificaton of multiple targets |
US9012148B2 (en) * | 2008-04-16 | 2015-04-21 | Jian Han | Method for evaluating and comparing immunorepertoires |
US9234240B2 (en) * | 2010-05-07 | 2016-01-12 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Measurement and comparison of immune diversity by high-throughput sequencing |
WO2016086029A1 (en) * | 2014-11-25 | 2016-06-02 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Characterization of adaptive immune response to vaccination or infection using immune repertoire sequencing |
-
2016
- 2016-03-04 WO PCT/US2016/020939 patent/WO2016144776A1/en active Application Filing
- 2016-03-04 CN CN202210692616.4A patent/CN115449542A/zh active Pending
- 2016-03-04 EP EP16762225.7A patent/EP3265591A4/en active Pending
- 2016-03-04 AU AU2016229162A patent/AU2016229162A1/en not_active Abandoned
- 2016-03-04 KR KR1020177027829A patent/KR20170134432A/ko not_active Application Discontinuation
- 2016-03-04 RU RU2017132275A patent/RU2714752C2/ru active
- 2016-03-04 CA CA2978751A patent/CA2978751A1/en active Pending
- 2016-03-04 JP JP2017564771A patent/JP6974181B2/ja active Active
- 2016-03-04 BR BR112017019148A patent/BR112017019148A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2016-03-04 CN CN201680013959.6A patent/CN107429293A/zh active Pending
- 2016-03-04 SG SG11201707045YA patent/SG11201707045YA/en unknown
- 2016-03-04 US US15/060,992 patent/US10529442B2/en active Active
-
2018
- 2018-04-19 HK HK18105121.1A patent/HK1245848A1/zh unknown
-
2022
- 2022-04-19 AU AU2022202555A patent/AU2022202555A1/en active Pending
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2014503223A (ja) * | 2011-01-14 | 2014-02-13 | シービー バイオテクノロジーズ インコーポレイテッド | 免疫多様性の評価方法およびその使用 |
WO2013036459A2 (en) * | 2011-09-09 | 2013-03-14 | Sequenta, Inc. | Sequence-based measures of immune response |
WO2014008448A1 (en) * | 2012-07-03 | 2014-01-09 | Sloan Kettering Institute For Cancer Research | Quantitative assessment of human t-cell repertoire recovery after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation |
US20140065629A1 (en) * | 2012-08-29 | 2014-03-06 | Israel Barken | Methods of treating diseases |
US20140235478A1 (en) * | 2013-02-04 | 2014-08-21 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Measurement and Comparison of Immune Diversity by High-Throughput Sequencing |
WO2014124451A1 (en) * | 2013-02-11 | 2014-08-14 | Cb Biotechnologies, Inc. | Method for evaluating an immunorepertoire |
WO2014189635A1 (en) * | 2013-05-20 | 2014-11-27 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Tracking donor-reactive tcr as a biomarker in transplantation |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
ONCOIMMUNOLOGY, 2014, VOL.3, NO.12, E968467 (PP.1-12), JPN6019046900, ISSN: 0004366086 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US10529442B2 (en) | 2020-01-07 |
HK1245848A1 (zh) | 2018-08-31 |
EP3265591A1 (en) | 2018-01-10 |
WO2016144776A1 (en) | 2016-09-15 |
RU2714752C2 (ru) | 2020-02-19 |
CN115449542A (zh) | 2022-12-09 |
CA2978751A1 (en) | 2016-09-15 |
RU2017132275A3 (ja) | 2019-04-08 |
EP3265591A4 (en) | 2019-04-10 |
CN107429293A (zh) | 2017-12-01 |
US20160259884A1 (en) | 2016-09-08 |
KR20170134432A (ko) | 2017-12-06 |
AU2016229162A1 (en) | 2017-09-21 |
AU2022202555A1 (en) | 2022-05-12 |
SG11201707045YA (en) | 2017-09-28 |
JP6974181B2 (ja) | 2021-12-01 |
BR112017019148A2 (pt) | 2018-07-31 |
RU2017132275A (ru) | 2019-04-08 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2766004C1 (ru) | Способ оценки нормального состояния иммунного репертуара и его применение | |
EP2663864B1 (en) | Immunodiversity assessment method and its use | |
US9012148B2 (en) | Method for evaluating and comparing immunorepertoires | |
AU2022202555A1 (en) | Method for measuring a change in an individual's immunorepertoire | |
JP2018531044A6 (ja) | 免疫レパートリーの正常性の評価方法およびその使用 | |
JP6198736B2 (ja) | 疾患のシグネチャとしてのアイソタイププロファイルの検出 | |
JP6931125B2 (ja) | 標的遺伝子発現の数学的モデル化を使用する、jak−stat1/2細胞シグナル伝達経路活性の評価 | |
CN110004229A (zh) | 多基因作为egfr单克隆抗体类药物耐药标志物的应用 | |
US20220148690A1 (en) | Immunorepertoire wellness assessment systems and methods | |
US20050019764A1 (en) | Method for analyzing t lymphocytes with the aid of t lymphocyte receptors of an organism | |
Wu et al. | Validation of the QuantStudio5 Instrument for Use in Biocept’s TargetSelectorTM ctDNA Lung Cancer Assays |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180201 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180509 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20190110 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20191030 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20191202 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20200227 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200526 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20201014 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20210112 |
|
RD04 | Notification of resignation of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424 Effective date: 20210112 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210413 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20210906 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20211005 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20211104 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6974181 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |