JP2018504123A5

JP2018504123A5 -

Info

Publication number: JP2018504123A5
Application number: JP2017539370A
Authority: JP
Filing date: 2016-01-20
Publication date: 2019-02-28

Claims

配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３および１４を含んでなる群から選択されるリボヌクレオチド配列を有するプローブセットを有してなる２つ以上のｍｉＲＮＡプローブのコレクション。
前記コレクションが、生体試料に存在するｍｉＲＮＡに対する１４個のｍｉＲＮＡプローブの相対比率が１以上であることを含んでなる、請求項１に記載のコレクション。
固体支持体および
固体支持体に付着した請求項１に記載のコレクション
を含んでなる、ｍｉＲＮＡマイクロアレイ。
対象が自閉症スペクトル障害を有するか否かの診断を補助する方法であって、
自閉症スペクトル障害を有する可能性のある対象から生体試料を得ること；
配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３および１４を含んでなる群から選択されるリボヌクレオチド配列を有するプローブセットを有してなる１つ以上のｍｉＲＮＡプローブのコレクションを提供すること；
該プローブを、生体試料に存在している場合の相補的核酸分子にハイブリダイゼーションさせるために効果的な条件下で、対象からの生体試料を該コレクションと接触させること；
該接触の結果として任意のハイブリダイゼーションを検出すること；および
該検出に基づき対象が自閉症スペクトル障害を有するか否か同定すること
を含んでなる、方法。
前記検出が、マイクロアレイ、Ｌｕｍｉｎｅｘ系磁気ビーズまたはＬｕｍｉｎｅｘ系非磁気ビーズ、ノーザンブロット、ＲＮａｓｅプロテクションアッセイ、ｉｎｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＩＳＨ）、ＲＮＡ−ＳｃｏｐｅおよびＳＭＡＲＴＦｌａｒｅを含む定量的ハイブリダイゼーション系アッセイによって実行される、請求項４に記載の方法。
前記検出によってｍｉＲＮＡ発現レベルが測定される、請求項４に記載の方法。
前記検出が、オリゴヌクレオチドプローブ、ＳｙｂｒＧｒｅｅｎまたは類似の染料でのリアルタイム定量的ＰＣＲ、放射性ヌクレオチド系定量化、およびデジタルドロップレットＰＣＲを含むポリメラーゼ連鎖反応アッセイによって実行される、請求項４に記載の方法。
対象が自閉症スペクトル障害を有するか否かの診断を補助する方法であって、
自閉症スペクトル障害を有する可能性のある対象から生体試料を得ること；
生体試料をダイレクトシークエンシング法にかけて生体試料中の核酸分子のヌクレオチド配列情報を提供すること；
生体試料中の核酸分子のヌクレオチド配列情報と、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３および１４を含んでなるプローブセットから選択される１つ以上のｍｉＲＮＡプローブのコレクションのヌクレオチド配列とを比較すること；
１つ以上のｍｉＲＮＡプローブまたはそれらの相補体の任意のコレクションが、生体試料中に存在しているか測定し、かつそれらの発現レベルおよび該比較に基づき互いに対しての発現の相対レベルを測定すること；および
該測定に基づき対象が自閉症スペクトル障害を有するか否か同定すること
を含んでなる、方法。
前記同定に基づき治療指針を実行することをさらに含んでなり、
前記治療指針が、次の１つ以上：
追加診断試験の実行、薬物療法の処方、対象の自閉症スペクトル障害のモニタリング頻度の増加、行動療法およびライフスタイル選択の推奨もしくはそれらの組み合わせ、
または
前記治療指針が、ライフスタイルの選択の推奨を含み、かつ次の１つ以上：行動療法の導入、時間管理および課題整理、環境的変化の導入、食生活の変更、運動の変更もしくはそれらの組み合わせ
を含んでいてもよい、請求項４または８に記載の方法。
前記コレクションが、生体試料に存在する他のｍｉＲＮＡに対する１４個のｍｉＲＮＡプローブの相対比率が１以上であることを含んでなる、請求項４または８に記載の方法。
前記生体試料が、唾液、尿、便、血清、脳組織または脳脊髄液である、請求項４または８に記載の方法。
対象が自閉症スペクトル障害を有するか否か測定するための好適なキットであって、
配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３および１４を含んでなる群から選択されるリボヌクレオチド配列を有するプローブセットを有してなる２つ以上のｍｉＲＮＡプローブを含んでなるキット。
前記２つ以上のｍｉＲＮＡプローブに付着した固体支持体をさらに含んでなる、請求項１２に記載のキット。
（ａ）陰性対照として用いる、１つのランダムに生成した配列；（ｂ）全ＲＮＡ分解のための標準化対照として用いる、ハウスキーピング遺伝子に由来する、少なくとも１つのオリゴヌクレオチド配列；または（ｃ）陽性対照として用いる、少なくとも１つのランダムに生成した配列
の少なくとも１つをさらに含んでなる、請求項１２に記載のキット。
前記固体支持体が、スワブ、唾液コレクションバイアルおよび／またはＰＣＲアレイプレートを含んでなる、請求項３に記載のマイクロアレイ。
前記固体支持体が、スワブ、唾液コレクションバイアルおよび／またはＰＣＲアレイプレートを含んでなる、請求項１３に記載のキット。
前記相対比が、１．５：１〜２．５：１である、請求項２に記載のコレクション。
前記相対比が、１．５：１〜２．５：１である、請求項１０に記載の方法。