JP2018194374A5 - - Google Patents
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Description
Aβはアルツハイマー病のバイオマーカーとして注目されており、質量分析により生体試料中に含まれるAβ量を定量する試みがいくつか報告されている。例えば、特許文献1では、Aβに特異的に結合する抗Aβ抗体(AβのPhe4−Gly9をエピトープとする6E10、およびAβのLeu17−Val24をエピトープとする4G8)を用いた免疫沈降(IP)と、マトリクス支援レーザー脱離イオン化質量分析(MALDI−MS)とを組み合わせた分析方法により、微量のヒト血漿から22種類のAPP切断ペプチドを検出した例が報告されている。特許文献1では、APPのプロセッシングにより生成するペプチドとして、APP669−711(配列番号5)等の、βセレクターゼによる切断部位よりもN末端側で切断されたペプチドが検出されたことが報告されている。
しかしながら、非特許文献1に記載の手法では、Aβの中間配列をサロゲートペプチドとして選択しているため、C末端の切断部位の異なるAβ(例えば、Aβ1−38(配列番号2)、Aβ1−40(配列番号3)、Aβ1−42(配列番号4)や、N末端側がβセクレターゼ切断部位(APPのMet671とAsp672の間)以外で切断されたAPP切断ペプチド(例えば、前述のAPP669−711)を個別に定量することはできない。
Aβ1−40のC末端をエピトープとする抗体bによりIPを行った場合、図1に示す3種のペプチドの中で、Aβ1−40およびAPP669−711の2種が捕捉される。抗体aを用いたIPによりAβ1−42を捕捉し、抗体aに捕捉されずに流出した溶液(洗浄液を含む)に抗体bを用いたIPを実施して、Aβ1−40およびAPP669−711を捕捉してもよい。
抗体bを用いたIPにより捕捉されたペプチドをLys−Cにより消化した試料からは、Aβ1−40の切断位置IIIのN末端側の配列「DAEFRHDSGYEVHHQK」を有するペプチド、およびAPP669−711の切断位置IIIのN末端側の配列(切断位置Iと切断位置IIIの間の配列)「MDAEFRHDSGYEVHHQK」を有するペプチドが生成する。これらのペプチドは分子量が異なるため、質量分析により判別可能である。
抗体bを用いたIPのみでは、C末端の配列が共通するAβ1−40とAPP669−711とを識別できないが、C末端側を抗体識別部位とするとするIPによりペプチドを分離し、IPで捕捉回収されたペプチドのN末端側のプロテアーゼ消化断片をトランジションとして選択することにより、N末端側の配列の相違(生体内でのAPPからの切断部位の相違)が識別可能となる。
本発明においては、上述のようにペプチドのC末端またはN末端のいずれか一方に特異的に結合する抗体を用いたIPによりペプチドを分離した後、抗体結合部位と反対側の末端のペプチド断片の分析が行われる。例えば、AβのC末端側に結合する抗体を用いたIPにより分離したペプチドは、プロテアーゼ処理後に、N末端側のプロテアーゼ消化断片が質量分析による検出対象として選択される。AβのN末端側に結合する抗体を用いたIPにより捕捉されたペプチドは、C末端側のプロテアーゼ消化断片の質量分析が行われる。図1に示す3種のペプチドは、C末端側のIPによりAβ1−42およびAβ1−40とAPP669−711とが分離され、N末端側のペプチド断片の質量分析により、Aβ1−42とAβ1−40とを識別できる。
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