JP2017519985A - 血液学用デジタルホログラフィ顕微鏡検査データ分析 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2014年6月16日に出願された米国仮出願第62/012,636号の出願日遡及の特典を請求し、この出願は、参照により全体が本明細書に組み込まれる。
1520 プロセッサ
1521 システムバス
1530 システムメモリ
1534 オペレーションシステム
1535 アプリケーションプログラム
1536 他のプログラムモジュール
1537 プログラムデータ
1540 ディスクコントローラ
1541 ハードディスク
1542 着脱式メディアドライブ
1560 ユーザ入力インタフェース
1561 ポインティング装置
1562 キーボード
1565 ディスプレイコントローラ
1566 表示装置
1570 ネットワークインタフェース
1571 ネットワーク
1572 モデム
1580 リモートコンピューティング装置
Claims (20)
- 血液学用のデジタルホログラフィ顕微鏡検査(DHM)データを分析する方法であって、
デジタルホログラフィ顕微鏡検査システムを使用して獲得した複数のDHM画像を受け取る段階と、
前記複数のDHM画像のそれぞれにおける1つ以上の連結成分を識別する段階と、
前記1つ以上の連結成分から1つ以上のトレーニング白血球画像を生成する段階と、
前記1つ以上のトレーニング白血球画像を使用して複数の白血球タイプを識別するようにクラシファイアをトレーニングする段階と、
新しいDHM画像から新しい白血球画像を抽出する段階と、
前記クラシファイアを前記新しい白血球画像に適用して複数の確率値を決定する段階であって、それぞれの確率値が前記複数の白血球タイプのうちの1つに対応する段階と、
前記新しい白血球画像と前記複数の確率値をグラフィカルユーザインタフェースで提示する段階とを含む方法。 - 前記1つ以上の連結成分を識別する段階の前に、前記複数のDHM画像のそれぞれにしきい値化を適用してそれぞれのDHM画像における輝点を強調する段階を更に含む、請求項1に記載の方法。
- 前記1つ以上の連結成分が、1組の連結成分を含み、
前記1つ以上の連結成分を識別する段階の後で前記1つ以上の連結成分から1つ以上の小さい連結成分を除去する段階を更に含み、各小さい連結成分が、所定のしきい値より小さいサイズを有する、請求項2に記載の方法。 - 前記クラシファイアが、K最近接(K−NN)クラシファイアである、請求項1に記載の方法。
- 前記クラシファイアが、前記複数のDHM画像のそれぞれから抽出されたテクストンベーステクスチャ特徴を使用して前記新しいDHM画像を分類する、請求項4に記載の方法。
- 前記クラシファイアが、局所的画像特徴として階層的k平均とスケール不変特徴変換(SIFT)記述子とを使用してトレーニングされた視覚的語彙辞書である、請求項1に記載の方法。
- 前記複数のDHM画像のそれぞれから複数の稠密SIFT記述子を抽出する段階と、
前記複数のDHM画像のそれぞれから抽出された前記複数の稠密SIFT記述子に基づいて語彙辞書の構造を表す二分探索木を構築する段階と、
前記二分探索木に基づいて視覚的語彙辞書を生成する段階を更に含む、請求項6に記載の方法。 - 前記視覚的語彙辞書が、語彙ヒストグラムである、請求項7に記載の方法。
- 前記複数のDHM画像における前記複数の白血球タイプの1つ以上を識別するために1対1nラベルサポートベクトルマシン(SVM)が使用される、請求項6に記載の方法。
- 前記クラシファイアが、自動エンコーダ畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を使用してトレーニングされたディープラーニングクラシファイアである、請求項1に記載の方法。
- 光学濃度と染色プロトコルと関連付けられた着色との間のマッピングを決定する段階と、
前記新しい白血球画像と関連付けられた光学濃度情報を決定する段階と、
前記新しい白血球画像を提示する段階の前に、前記マッピングと前記光学濃度情報を使用して前記新しい白血球画像を着色する段階とを含む、請求項1に記載の方法。 - 前記複数の確率値を使用して全血球(CBC)検査を行なう段階を更に含む、請求項1に記載の方法。
- 血液学用のデジタルホログラフィ顕微鏡検査(DHM)データを分析するための製品であって、
デジタルホログラフィ顕微鏡検査システムを使用して取得された複数のDHM画像を受け取る段階と、
前記複数のDHM画像のそれぞれにおける1つ以上の連結成分を識別する段階と、
前記1つ以上の連結成分から1つ以上のトレーニング白血球画像を生成する段階と、
前記1つ以上のトレーニング白血球画像を使用して複数の白血球タイプを識別するようにクラシファイアをトレーニングする段階と、
新しいDHM画像から新しい白血球画像を抽出する段階と、
前記クラシファイアを前記新しい白血球画像に適用して複数の確率値を決定する段階であって、それぞれの確率値が前記複数の白血球タイプのうちの1つに対応する段階と、
前記新しい白血球画像と前記複数の確率値をグラフィカルユーザインタフェースで提示する段階とを含む方法を実行するためのコンピュータ実行命令を保持する非一時的有形コンピュータ可読媒体を含む製品。 - 前記1つ以上の連結成分を識別する段階の前に、前記複数のDHM画像のそれぞれにしきい値化を適用してそれぞれのDHM画像内における輝点を強調する段階を更に含む、請求項13に記載の製品。
- 前記1つ以上の連結成分が、1組の連結成分を含み、前記方法が、更に、前記1つ以上の連結成分を識別する段階の後で前記1つ以上の連結成分から前記1つ以上の小さい連結成分を除去する段階を含み、それぞれの小さい連結成分が、所定のしきい値より小さいサイズを有する、請求項14に記載の製品。
- 前記クラシファイアが、前記複数のDHM画像のそれぞれから抽出されたテクストンベーステクスチャ特徴を使用して前記新しいDHM画像を分類する、請求項13に記載の製品。
- 前記クラシファイアが、局所的画像特徴として階層的k平均とスケール不変特徴変換(SIFT)記述子とを使用してトレーニングされた視覚的語彙辞書である、請求項13に記載の製品。
- 前記クラシファイアが、自動エンコーダ畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を使用してトレーニングされたマージナルスペースラーニング(MSL)クラシファイアである、請求項1に記載の製品。
- 光学濃度と染色プロトコルと関連付けられた着色との間のマッピングを決定する段階と、
前記新しい白血球画像と関連付けられた光学濃度情報を決定する段階と、
前記新しい白血球画像を提示する段階の前に、前記マッピングと前記光学濃度情報を使用して前記新しい白血球画像を着色する段階とを含む、請求項13に記載の製品。 - 血液学用のデジタルホログラフィ顕微鏡検査(DHM)データを分析するシステムであって、
デジタルホログラフィ顕微鏡検査システムと通信して複数のトレーニングDHM画像と検査DHM画像を取得するように構成されたネットワーク構成要素であって、
前記複数のトレーニングDHM画像のそれぞれにおける1つ以上の連結成分を識別し、
前記1つ以上の連結成分から1つ以上のトレーニング白血球画像を生成し、
前記1つ以上のトレーニング白血球画像を使用して複数の白血球タイプを識別するようにクラシファイアをトレーニングし、
前記検査DHM画像から検査白血球画像を抽出し、
前記クラシファイアを前記新しい白血球画像に適用して複数の確率値を決定し、それぞれの確率値が、前記複数の白血球タイプのうちの1つに対応するように構成されたモデリングプロセッサと、
前記検査白血球画像と前記複数の確率値を提示するように構成されたグラフィカルユーザインタフェースとを含むシステム。
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