JP2017506912A5 - - Google Patents
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Description
さらに、ｎは１から３０（または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０）、または２から２０（または２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０）、または５から１８（または５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７または１８）、または１０から１６（または１０、１１、１２、１３、１４、１５または１６）の数であってよい。好ましくは、ｎは１６である。好ましくは、Ｃ−５修飾ピリミジンは、ＮａｐｄＵまたはＢｎｄＵである。より好ましくは、Ｃ−５修飾ピリミジンＢｎｄＵである。
Claims (17)
- サンプル中の微生物を検出する方法であって
ａ）蛍光標識を含むオフレートの遅い修飾アプタマー（SOMAmer）と共にサンプルをインキュベートするステップ、
ｂ）任意にサンプルを洗浄するステップ、
ｃ）蛍光ベースの検出方法によってサンプルを分析するステップ
を含む、前記方法。 - 微生物が、Staphylococcus aureusであることを特徴とする、請求項１に記載の方法。
- 蛍光ベースの検出方法が、フローサイトメトリー、固相サイトメトリー、蛍光ベースの分析方法および蛍光イメージングシステムからなる群から選択されることを特徴とする、請求項１または２に記載の方法。
- サンプルが、臨床サンプル、食品または飼料サンプル、飲料サンプル、医薬品サンプル、パーソナルケアまたは化粧品サンプルおよび／または水サンプルであることを特徴とする、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
- SOMAmerが、Staphylococcus aureusに特異的なヌクレオチド配列を含むことを特徴とする、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
- SOMAmerが、配列番号１５および配列番号１６からなる群から選択されるヌクレオチド配列、またはその断片またはそれに少なくとも８０％同一である配列、またはストリンジェントな条件下でそれにハイブリダイズする配列を含むことを特徴とする、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
- SOMAmerが、配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその断片またはそれに少なくとも８０％同一である配列、またはストリンジェントな条件下でそれにハイブリダイズする配列を含むことを特徴とする、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
- SOMAmerが、配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含むことを特徴とする、請求項１〜５および７のいずれか一項に記載の方法。
- SOMAmerが、配列番号１または配列番号３のヌクレオチド配列を含むことを特徴とする、請求項７に記載の方法。
- 蛍光標識が、フルオレセイン色素、ローダミン色素、シアニン色素、ペリジニンクロロフィル（ＰｅｒＣＰ）、Ｒ−フィコエリトリン、クマリン色素および量子ドットからなる群から選択されることを特徴とする、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
- 蛍光標識を含むオフレートの遅い修飾アプタマー（SOMAmer）であって、Staphylococcus aureusに特異的なヌクレオチド配列を含む、前記SOMAmer。
- 配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその断片またはそれに少なくとも８０％同一である配列、またはストリンジェントな条件下でそれにハイブリダイズする配列を含むことを特徴とする、請求項１１に記載のSOMAmer。
- 配列番号１５および配列番号１６からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその断片またはそれに少なくとも８０％同一である配列、またはストリンジェントな条件下でそれにハイブリダイズする配列を含むことを特徴とする、請求項１１に記載のSOMAmer。
- 配列番号１または配列番号３のヌクレオチド配列を含むことを特徴とする、請求項１１に記載のSOMAmer。
- サンプル中のStaphylococcus aureus細胞を検出するための、請求項１１から１４のいずれか一項に記載の蛍光標識を含むSOMAmerの使用。
- 請求項１１〜１４のいずれか一項に記載の蛍光標識を含むSOMAmerの少なくとも１つを含むマイクロアレイまたはバイオセンサー。
- 請求項１１〜１４のいずれか一項に記載の蛍光標識を含むSOMAmerを少なくとも１つ含むキット。
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