JP2016104741A - 細胞からのタンパク質抽出方法 - Google Patents
細胞からのタンパク質抽出方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2016104741A JP2016104741A JP2015237245A JP2015237245A JP2016104741A JP 2016104741 A JP2016104741 A JP 2016104741A JP 2015237245 A JP2015237245 A JP 2015237245A JP 2015237245 A JP2015237245 A JP 2015237245A JP 2016104741 A JP2016104741 A JP 2016104741A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- protein
- cells
- reagent
- hpv
- extract
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 177
- 238000000751 protein extraction Methods 0.000 title abstract description 12
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 234
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 234
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 150
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims abstract description 79
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 56
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 claims abstract description 54
- 239000002736 nonionic surfactant Substances 0.000 claims abstract description 33
- 239000003398 denaturant Substances 0.000 claims abstract description 20
- 239000000284 extract Substances 0.000 claims description 103
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 89
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 claims description 53
- 102000000470 PDZ domains Human genes 0.000 claims description 29
- 108050008994 PDZ domains Proteins 0.000 claims description 29
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 23
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 23
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 claims description 22
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 20
- 239000000834 fixative Substances 0.000 claims description 19
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 18
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 18
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 17
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 16
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- 231100000590 oncogenic Toxicity 0.000 claims description 15
- 230000002246 oncogenic effect Effects 0.000 claims description 15
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 claims description 15
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical group [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 13
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 13
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 13
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 claims description 12
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 claims description 9
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 claims description 9
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical group CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 241000725643 Respiratory syncytial virus Species 0.000 claims description 8
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 claims description 8
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 claims description 8
- -1 ion salts Chemical class 0.000 claims description 8
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 8
- 102100027240 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 1 Human genes 0.000 claims description 7
- 101710137278 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 1 Proteins 0.000 claims description 7
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 claims description 7
- 241000341655 Human papillomavirus type 16 Species 0.000 claims description 5
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 claims description 5
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 claims description 5
- 229940016590 sarkosyl Drugs 0.000 claims description 5
- 108700004121 sarkosyl Proteins 0.000 claims description 5
- KSAVQLQVUXSOCR-UHFFFAOYSA-M sodium lauroyl sarcosinate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCC(=O)N(C)CC([O-])=O KSAVQLQVUXSOCR-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 5
- 102100036221 Tax1-binding protein 3 Human genes 0.000 claims description 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 4
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 claims description 4
- GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N triton Chemical compound [3H+] GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N 0.000 claims description 4
- 101100489349 Arabidopsis thaliana PAT24 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 241001115402 Ebolavirus Species 0.000 claims description 3
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical group O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 101100315589 Homo sapiens TAX1BP3 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 241001115401 Marburgvirus Species 0.000 claims description 3
- 101100313925 Oryza sativa subsp. japonica TIP1-2 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 101100313932 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) TIP20 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 101100313921 Zea mays TIP1-1 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 claims description 3
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 claims description 3
- 239000012285 osmium tetroxide Substances 0.000 claims description 3
- 229910000489 osmium tetroxide Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 101150023068 tip1 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 claims description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 2
- WSFSSNUMVMOOMR-NJFSPNSNSA-N methanone Chemical compound O=[14CH2] WSFSSNUMVMOOMR-NJFSPNSNSA-N 0.000 claims description 2
- 239000003607 modifier Substances 0.000 claims description 2
- OXNIZHLAWKMVMX-UHFFFAOYSA-N picric acid Chemical compound OC1=C([N+]([O-])=O)C=C([N+]([O-])=O)C=C1[N+]([O-])=O OXNIZHLAWKMVMX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 2
- 241000580858 Simian-Human immunodeficiency virus Species 0.000 claims 1
- 239000013543 active substance Substances 0.000 claims 1
- 239000000463 material Substances 0.000 abstract description 4
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 abstract description 3
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 abstract description 2
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 abstract description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 abstract description 2
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 abstract 1
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 abstract 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 172
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 46
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 34
- 238000009739 binding Methods 0.000 description 23
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 22
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 18
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 18
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 18
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 18
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 15
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 14
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 13
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 13
- 102220002645 rs104894309 Human genes 0.000 description 9
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 9
- 101000805948 Mus musculus Harmonin Proteins 0.000 description 8
- 230000002380 cytological effect Effects 0.000 description 8
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 8
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 8
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 8
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 8
- 239000011536 extraction buffer Substances 0.000 description 7
- 238000002331 protein detection Methods 0.000 description 7
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 6
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 6
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 6
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 6
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 5
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 5
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 5
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 5
- 238000009595 pap smear Methods 0.000 description 5
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M sodium hydroxide Inorganic materials [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 description 4
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SEQKRHFRPICQDD-UHFFFAOYSA-N N-tris(hydroxymethyl)methylglycine Chemical compound OCC(CO)(CO)[NH2+]CC([O-])=O SEQKRHFRPICQDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 4
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000000711 cancerogenic effect Effects 0.000 description 4
- 231100000315 carcinogenic Toxicity 0.000 description 4
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 description 4
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 4
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 4
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 description 4
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 4
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 3
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 3
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 3
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 3
- 101001078087 Homo sapiens Reticulocalbin-2 Proteins 0.000 description 3
- 208000009608 Papillomavirus Infections Diseases 0.000 description 3
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 3
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 102100025337 Reticulocalbin-2 Human genes 0.000 description 3
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 3
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 3
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 3
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 3
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 3
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 3
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 3
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4,6-dichloropyrimidine-5-carbaldehyde Chemical group NC1=NC(Cl)=C(C=O)C(Cl)=N1 GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine Chemical compound CC1=C(N)C(C)=CC(C=2C=C(C)C(N)=C(C)C=2)=C1 UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L Calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 2
- 201000011001 Ebola Hemorrhagic Fever Diseases 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 208000000461 Esophageal Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 108091006027 G proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000030782 GTP binding Human genes 0.000 description 2
- 108091000058 GTP-Binding Proteins 0.000 description 2
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N Guanidine Chemical compound NC(N)=N ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000590691 Homo sapiens MAGUK p55 subfamily member 2 Proteins 0.000 description 2
- 241000701074 Human alphaherpesvirus 2 Species 0.000 description 2
- 102100032498 MAGUK p55 subfamily member 2 Human genes 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 206010030155 Oesophageal carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 2
- 102000043276 Oncogene Human genes 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UZMAPBJVXOGOFT-UHFFFAOYSA-N Syringetin Natural products COC1=C(O)C(OC)=CC(C2=C(C(=O)C3=C(O)C=C(O)C=C3O2)O)=C1 UZMAPBJVXOGOFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007997 Tricine buffer Substances 0.000 description 2
- 201000003761 Vaginal carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 206010046905 Vaginal dysplasia Diseases 0.000 description 2
- 208000004354 Vulvar Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 208000000260 Warts Diseases 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 2
- 239000006172 buffering agent Substances 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 210000003679 cervix uteri Anatomy 0.000 description 2
- 230000003196 chaotropic effect Effects 0.000 description 2
- KCFYHBSOLOXZIF-UHFFFAOYSA-N dihydrochrysin Natural products COC1=C(O)C(OC)=CC(C2OC3=CC(O)=CC(O)=C3C(=O)C2)=C1 KCFYHBSOLOXZIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 2
- 201000004101 esophageal cancer Diseases 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 2
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008240 homogeneous mixture Substances 0.000 description 2
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 2
- 210000004969 inflammatory cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000002563 ionic surfactant Substances 0.000 description 2
- AMXOYNBUYSYVKV-UHFFFAOYSA-M lithium bromide Chemical compound [Li+].[Br-] AMXOYNBUYSYVKV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- KWGKDLIKAYFUFQ-UHFFFAOYSA-M lithium chloride Chemical compound [Li+].[Cl-] KWGKDLIKAYFUFQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 229960002931 methacholine chloride Drugs 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- HEGSGKPQLMEBJL-RKQHYHRCSA-N octyl beta-D-glucopyranoside Chemical compound CCCCCCCCO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O HEGSGKPQLMEBJL-RKQHYHRCSA-N 0.000 description 2
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 2
- 201000010153 skin papilloma Diseases 0.000 description 2
- FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M sodium iodide Inorganic materials [Na+].[I-] FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- VGTPCRGMBIAPIM-UHFFFAOYSA-M sodium thiocyanate Chemical compound [Na+].[S-]C#N VGTPCRGMBIAPIM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]propane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CCCS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 0.000 description 1
- GUQQBLRVXOUDTN-XOHPMCGNSA-N 3-[dimethyl-[3-[[(4r)-4-[(3r,5s,7r,8r,9s,10s,12s,13r,14s,17r)-3,7,12-trihydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1h-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoyl]amino]propyl]azaniumyl]-2-hydroxypropane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CC(O)CS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 GUQQBLRVXOUDTN-XOHPMCGNSA-N 0.000 description 1
- XNPKNHHFCKSMRV-UHFFFAOYSA-N 4-(cyclohexylamino)butane-1-sulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCCCNC1CCCCC1 XNPKNHHFCKSMRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010068327 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase Proteins 0.000 description 1
- 102100027123 55 kDa erythrocyte membrane protein Human genes 0.000 description 1
- 102100036775 Afadin Human genes 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102100036514 Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100036440 Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100022717 Atypical chemokine receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100022005 B-lymphocyte antigen CD20 Human genes 0.000 description 1
- 206010004146 Basal cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 102100032850 Beta-1-syntrophin Human genes 0.000 description 1
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 1
- LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M Bisulfite Chemical compound OS([O-])=O LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 239000008001 CAPS buffer Substances 0.000 description 1
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100026679 Carboxypeptidase Q Human genes 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 108700019745 Disks Large Homolog 4 Proteins 0.000 description 1
- 102100024099 Disks large homolog 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100022264 Disks large homolog 4 Human genes 0.000 description 1
- 206010058314 Dysplasia Diseases 0.000 description 1
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 1
- 101150029707 ERBB2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100027623 FERM and PDZ domain-containing protein 4 Human genes 0.000 description 1
- 108010008177 Fd immunoglobulins Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 101150048348 GP41 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710170439 Glycoprotein 2a Proteins 0.000 description 1
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 description 1
- 241000711549 Hepacivirus C Species 0.000 description 1
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 1
- 208000005176 Hepatitis C Diseases 0.000 description 1
- 208000005331 Hepatitis D Diseases 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000928246 Homo sapiens Afadin Proteins 0.000 description 1
- 101000928690 Homo sapiens Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000928673 Homo sapiens Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000678879 Homo sapiens Atypical chemokine receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000897405 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD20 Proteins 0.000 description 1
- 101000868444 Homo sapiens Beta-1-syntrophin Proteins 0.000 description 1
- 101000910846 Homo sapiens Carboxypeptidase Q Proteins 0.000 description 1
- 101001053984 Homo sapiens Disks large homolog 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001053980 Homo sapiens Disks large homolog 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000951365 Homo sapiens Disks large-associated protein 5 Proteins 0.000 description 1
- 101000862373 Homo sapiens FERM and PDZ domain-containing protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000907578 Homo sapiens Forkhead box protein M1 Proteins 0.000 description 1
- 101001005128 Homo sapiens LIM domain kinase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001042360 Homo sapiens LIM domain kinase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001018294 Homo sapiens Microtubule-associated serine/threonine-protein kinase 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001018298 Homo sapiens Microtubule-associated serine/threonine-protein kinase 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000988394 Homo sapiens PDZ and LIM domain protein 5 Proteins 0.000 description 1
- 101000886818 Homo sapiens PDZ domain-containing protein GIPC1 Proteins 0.000 description 1
- 101001113469 Homo sapiens Partitioning defective 6 homolog alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000922137 Homo sapiens Peripheral plasma membrane protein CASK Proteins 0.000 description 1
- 101000942742 Homo sapiens Protein lin-7 homolog A Proteins 0.000 description 1
- 101000609959 Homo sapiens Protein piccolo Proteins 0.000 description 1
- 101000867413 Homo sapiens Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-1 Proteins 0.000 description 1
- 101100155061 Homo sapiens UBE3A gene Proteins 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 241000700588 Human alphaherpesvirus 1 Species 0.000 description 1
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 description 1
- 241000713340 Human immunodeficiency virus 2 Species 0.000 description 1
- 101100540311 Human papillomavirus type 16 E6 gene Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 102100029874 Kappa-casein Human genes 0.000 description 1
- 108050007394 Kinesin-like protein KIF20B Proteins 0.000 description 1
- 102100026023 LIM domain kinase 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100021756 LIM domain kinase 2 Human genes 0.000 description 1
- 229910013684 LiClO 4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 208000032271 Malignant tumor of penis Diseases 0.000 description 1
- 102100028328 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710137272 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 102100028327 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 101710137274 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 102100033251 Microtubule-associated serine/threonine-protein kinase 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100033252 Microtubule-associated serine/threonine-protein kinase 4 Human genes 0.000 description 1
- 101100268515 Mus musculus Serpina1b gene Proteins 0.000 description 1
- 101100155062 Mus musculus Ube3a gene Proteins 0.000 description 1
- CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N N-methyl-guanidine Natural products CNC(N)=N CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010008858 Nitric Oxide Synthase Type I Proteins 0.000 description 1
- 102100022397 Nitric oxide synthase, brain Human genes 0.000 description 1
- 206010031096 Oropharyngeal cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010057444 Oropharyngeal neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 102100029181 PDZ and LIM domain protein 5 Human genes 0.000 description 1
- 102100039983 PDZ domain-containing protein GIPC1 Human genes 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000282577 Pan troglodytes Species 0.000 description 1
- 102100024019 Pancreatic secretory granule membrane major glycoprotein GP2 Human genes 0.000 description 1
- 102100023711 Partitioning defective 6 homolog alpha Human genes 0.000 description 1
- 208000002471 Penile Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010034299 Penile cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 102100032928 Protein lin-7 homolog A Human genes 0.000 description 1
- 102100039154 Protein piccolo Human genes 0.000 description 1
- 102100035772 Regulator of G-protein signaling 12 Human genes 0.000 description 1
- 101710148337 Regulator of G-protein signaling 12 Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 102100032758 Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-1 Human genes 0.000 description 1
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 1
- 102000002154 T-Lymphoma Invasion and Metastasis-inducing Protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010001288 T-Lymphoma Invasion and Metastasis-inducing Protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101710193790 Tax1-binding protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 102100030434 Ubiquitin-protein ligase E3A Human genes 0.000 description 1
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 1
- 206010047741 Vulval cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000129 anionic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003945 anionic surfactant Substances 0.000 description 1
- 210000000436 anus Anatomy 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 230000003139 buffering effect Effects 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003093 cationic surfactant Substances 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N dimethylaminoamidine Natural products CN(C)C(N)=N SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 1
- 101150069842 dlg4 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000004043 dyeing Methods 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 1
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- 238000004299 exfoliation Methods 0.000 description 1
- 239000013020 final formulation Substances 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 1
- ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N guanidinium thiocyanate Chemical compound SC#N.NC(N)=N ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 208000005252 hepatitis A Diseases 0.000 description 1
- 201000010284 hepatitis E Diseases 0.000 description 1
- 239000008241 heterogeneous mixture Substances 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M hydroxide Chemical compound [OH-] XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 238000003365 immunocytochemistry Methods 0.000 description 1
- 230000000951 immunodiffusion Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 1
- 208000020082 intraepithelial neoplasia Diseases 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 238000000691 measurement method Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 1
- 238000007431 microscopic evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 1
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 1
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 1
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 1
- 238000007479 molecular analysis Methods 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000214 mouth Anatomy 0.000 description 1
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 1
- 210000003097 mucus Anatomy 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 230000036963 noncompetitive effect Effects 0.000 description 1
- 125000002347 octyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 201000006958 oropharynx cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 231100000255 pathogenic effect Toxicity 0.000 description 1
- 210000003899 penis Anatomy 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- 210000003800 pharynx Anatomy 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 1
- 102000016914 ras Proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000009877 rendering Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 210000002345 respiratory system Anatomy 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 1
- 238000007790 scraping Methods 0.000 description 1
- 238000004062 sedimentation Methods 0.000 description 1
- 210000000582 semen Anatomy 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 1
- 201000008261 skin carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000017520 skin disease Diseases 0.000 description 1
- 235000009518 sodium iodide Nutrition 0.000 description 1
- BAZAXWOYCMUHIX-UHFFFAOYSA-M sodium perchlorate Chemical compound [Na+].[O-]Cl(=O)(=O)=O BAZAXWOYCMUHIX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229910001488 sodium perchlorate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000008247 solid mixture Substances 0.000 description 1
- 206010041823 squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 239000012089 stop solution Substances 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 230000000153 supplemental effect Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 210000001138 tear Anatomy 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 210000001215 vagina Anatomy 0.000 description 1
- 208000013139 vaginal neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 210000003905 vulva Anatomy 0.000 description 1
- 201000005102 vulva cancer Diseases 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000002888 zwitterionic surfactant Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56983—Viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/14—Extraction; Separation; Purification
- C07K1/145—Extraction; Separation; Purification by extraction or solubilisation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/82—Translation products from oncogenes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2710/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
- C12N2710/00011—Details
- C12N2710/20011—Papillomaviridae
- C12N2710/20051—Methods of production or purification of viral material
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/005—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from viruses
- G01N2333/01—DNA viruses
- G01N2333/025—Papovaviridae, e.g. papillomavirus, polyomavirus, SV40, BK virus, JC virus
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Oncology (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
本出願は、2006年5月11日に出願された米国特許仮出願第60/747,076号の恩典を主張し、この出願は参照により本明細書に組み入れられる。
多様な診断法において、細胞を被験体から採取し、固定液を含む液体培養液中に置く。診断を提供するために、細胞を該培養液中で固定させて、細胞学的に調べる。例えば、頸部組織内の前癌性細胞または癌性細胞の検出は、日常的には頸部剥離細胞の顕微鏡評価によって実施される。この方法は、 George N. Papanicolaouによって開発され、「Pap」試験として知られており、サンプリング装置を使用して女性の子宮頸部から細胞を剥離させる工程、固定液を含む輸送液に剥離細胞を置く工程、および次にスライドに細胞を置く工程を含む。細胞を次に染色し、訓練を受けた医療関係者によって細胞の異常が光学顕微鏡で調べられる。毎年、米国内だけで5,500万例以上のPap試験が実施されている。
対象となる文献としては、米国特許第6,890,729号(特許文献1)、米国特許第6,337,189号(特許文献2)および米国特許出願公開第20050032105号(特許文献3)が挙げられる。
細胞、好ましくは固定細胞からタンパク質抽出物を生成するための方法を提供する。一般的に、方法には、細胞のpHを少なくともpH約10.0までpHを上昇させて、中間組成物を生成する工程、および次に、非イオン性界面活性剤の存在下で、中間組成物のpHを中和させて、タンパク質抽出物を生成する工程が含まれる。方法には、a)細胞を抽出試薬と接触させて、少なくともpH約10.0のpHを有する中間組成物を生成する工程;およびb)中間組成物を中和試薬と接触させて、中間組成物のpHを中和させて、タンパク質抽出物を生成する工程が含まれうる。抽出試薬および中和試薬の一方または両方は非イオン性界面活性剤を含む。特定の態様では、固定細胞は、固定された頸部剥離細胞であってもよい。
他に定義されない限り、本明細書で使用するすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。さらに、参照の明確さおよび容易さのために、特定の要素を以下に定義する。
〔1〕 a)固定細胞を抽出試薬と接触させて、少なくともpH約10.0のpHを有する中間組成物を生成する工程;および
b)中間組成物を中和試薬と接触させて中間組成物のpHを中和させ、タンパク質抽出物を生成する工程
を含む、固定細胞からタンパク質抽出物を生成するための方法であって、抽出試薬および中和試薬の一方または両方が非イオン性界面活性剤を含む、方法。
〔2〕 中間組成物のpHを中和させてタンパク質抽出物を生成するために、
a)固定細胞を抽出試薬と接触させて、少なくともpH約10.0のpHを有する中間組成物を生成する工程;および
b)中間組成物を、非イオン性界面活性剤を含む中和試薬と接触させる工程
を含む、〔1〕記載の方法。
〔3〕 中間組成物のpHを中和させてタンパク質抽出物を生成するために、
a)固定細胞を非イオン性界面活性剤が含まれる抽出試薬と接触させて、少なくともpH約10.0のpHを有する中間組成物を生成する工程;および
b)中間組成物を中和試薬と接触させる工程
を含む、〔1〕記載の方法。
〔4〕 工程a)より前に固定細胞を含む細胞試料を受け取る工程をさらに含む、〔1〕記載の方法。
〔5〕 細胞が固定頸部細胞である、〔1〕記載の方法。
〔6〕 固定細胞が、SUREPATH(商標)、CYTOLYT(商標)、またはPRESERVCYT(商標)輸送液中に存在する、〔1〕記載の方法。
〔7〕 細胞試料が離れた場所から受け取られる、〔4〕記載の方法。
〔8〕 pHがpH約11.0からpH約13.0の範囲内にある、〔1〕記載の方法。
〔9〕 抽出試薬が変性剤を含む、〔1〕記載の方法。
〔10〕 変性剤がドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、尿素、またはサルコシルである、〔9〕記載の方法。
〔11〕 非イオン性界面活性剤がTRITON(商標)またはTWEEN(商標)界面活性剤である、〔1〕記載の方法。
〔12〕 a)〔1〕記載の方法により固定細胞からタンパク質抽出物を生成する工程;および
b)タンパク質抽出物中のタンパク質の存在を検査する工程
を含む、タンパク質を検出するための方法。
〔13〕 検査に前記タンパク質の捕捉剤を用いる、〔12〕記載の方法。
〔14〕 検査が免疫アッセイを含む、〔12〕記載の方法。
〔15〕 アッセイが酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)である、〔12〕記載の方法。
〔16〕 タンパク質がヒト乳頭腫ウイルス(HPV)タンパク質である、〔12〕記載の方法。
〔17〕 タンパク質がHPV E6タンパク質である、〔12〕記載の方法。
〔18〕 固定細胞が頸部剥離細胞である、〔12〕記載の方法。
〔19〕 固定細胞が、接触工程a)より前に離れた場所から受け取られる、〔12〕記載の方法。
〔20〕 d)検査の結果を離れた場所に伝達する工程をさらに含む、〔12〕記載の方法。
〔21〕 a)固定細胞を含む細胞試料、
b)少なくともpH約10.0のpHを有する抽出試薬、および
c)中和試薬
を含む、タンパク質抽出物を生成するためのシステムであって、抽出試薬および中和試薬の一方または両方が非イオン性界面活性剤を含み、かつ抽出試薬および中和剤が、結合アッセイでの使用に適したタンパク質抽出物を生成するために〔1〕記載の方法において用いられる、システム。
〔22〕 タンパク質抽出物中のタンパク質を検出するための試薬をさらに含む、〔21〕記載のシステム。
〔23〕 a)少なくともpH約10.0のpHを有する抽出試薬、
b)中和試薬、ならびに
c)抽出試薬および中和試薬を用いて〔1〕記載の方法を実施するための使用説明書
を含む、固定細胞からタンパク質抽出物を生成するためのキットであって、抽出試薬および中和試薬の一方または両方が非イオン性界面活性剤を含む、キット。
〔24〕 タンパク質抽出物中のタンパク質を検出するための試薬をさらに含む、〔23〕記載のキット。
〔25〕 試薬が前記タンパク質の捕捉剤を含む、〔24〕記載のキット。
〔26〕 タンパク質がHPV E6タンパク質である、〔24〕記載のキット。
〔27〕 a)標的ウイルスタンパク質が存在する、または存在することが疑われる細胞を含む細胞試料を抽出試薬と接触させて、少なくともpH10.0のpHを有する中間組成物を生成する工程;および
b)中間組成物を中和試薬と接触させて中間組成物のpHを中和させ、標的ウイルスタンパク質の抽出物を生成する工程
を含む、細胞試料から標的ウイルスタンパク質を抽出するための方法。
〔28〕 抽出試薬および中和試薬の一方または両方が非イオン性界面活性剤を含む、〔27〕記載の方法。
〔29〕 細胞試料中の細胞を化学固定剤で固定する、〔27〕記載の方法。
〔30〕 化学固定剤が、アルコール、アルデヒド、ケトン、四酸化オスミウム、酢酸、ピクリン酸、重金属イオン塩、およびプロピレングリコールからなる群より選択される、〔29〕記載の方法。
〔31〕 アルコールがメタノールまたはエタノールであり、アルデヒドがグルタルアルデヒドまたはホルムアルデヒドであり、かつケトンがアセトンである、〔30〕記載の方法。
〔32〕 工程a)より前に固定細胞を含む細胞試料を受け取る工程をさらに含む、〔1〕記載の方法。
〔33〕 ウイルスタンパク質が病原ウイルスによってコードされる、〔27〕記載の方法。
〔34〕 病原ウイルスが、HIV、エボラウイルス、マールブルグウイルス、肝炎ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、単純ヘルペスウイルス(HSV)、ヒト乳頭腫ウイルス(HPV)からなる群より選択される、〔33〕記載の方法。
〔35〕 ウイルスタンパク質がHPVのE6またはE7タンパク質である、〔27〕記載の方法。
〔36〕 HPVが、HPV株4、11、20、24、28、36、48、50、16、18、31、35、30、39、45、51、52、56 、59、58、33、66、68、69、26、53、73、または82である、〔35〕記載の方法。
〔37〕 HPVが、HPV26、HPV53、HPV66、HPV73、HPV82、HPV16、HPV18、HPV31、HPV35、HPV30、HPV39、HPV45、HPV51、HPV52、HPV56、HPV59、HPV58、HPV33、HPV66、HPV68、HPV69、およびHPV82からなる群より選択される発癌性HPV株である、〔35〕記載の方法。
〔38〕 抽出液中の標的ウイルスタンパク質の存在を検出する工程をさらに含む、〔27〕記載の方法。
〔39〕 検出工程に標的ウイルスタンパク質の捕捉剤を用いる、〔38〕記載の方法。
〔40〕 ウイルスタンパク質がHPVのE6タンパク質であり、かつ捕捉剤がE6タンパク質に対する抗体である、〔39〕記載の方法。
〔41〕 ウイルスタンパク質がHPVのE6タンパク質であり、かつ捕捉剤がPDZドメインを含むポリペプチドを含む、〔39〕記載の方法。
〔42〕 PDZドメインがMAGI-1の第二ドメイン、DLGまたはTIP1のPDZドメインである、〔41〕記載の方法。
〔43〕 細胞試料が粘膜または血液をさらに含む、〔27〕記載の方法。
〔44〕 細胞試料が頸部剥離細胞を含む、〔27〕記載の方法。
本明細書で言及しているすべての出版物および特許出願は、各個別の出版物または特許出願が具体的かつ個別に参照により組み入れられるように示されたかのように、参照により本明細書に組み入れられる。
本発明の好適な態様が本明細書に示され、記載されているが、このような態様が例としてのみ提供されることは当業者には明白である。当業者であれば、本発明から逸脱することなく、多くのバリエーション、変更、および代用を思いつくであろう。本明細書に記載された本発明の態様の様々な代替物を、本発明を実施する際に用いてもよいことが理解されるはずである。添付の特許請求の範囲によって本発明の範囲が定められ、それによってこれらの特許請求の範囲およびそれらの同等物の範囲内の方法および構成物が包含されることが意図される。
上記の通り、本発明は、固定細胞からタンパク質抽出物を生成するための方法を提供する。一般的に、方法には、a)固定細胞をpH約10.0より大きいpHを有する抽出試薬と接触させて、中間組成物を生成する工程;およびb)中間組成物を中和試薬と接触させる工程の2つの工程が含まれる。抽出試薬および/または中和試薬には、非イオン性界面活性剤が含まれる。結果として得られるタンパク質抽出物には非イオン性界面活性剤が含まれ、中性pH(つまり、pH約7.0およびpH約8.0)を有する。この方法によって、一般的に、それらのタンパク質に対する捕捉剤を使用して容易に検出可能なタンパク質を含む、タンパク質抽出物が生成される。そのようなものとして、本方法によって生成されるタンパク質抽出物は、一般的に、それらのタンパク質の検出のための結合アッセイ、例えば、免疫アッセイでの使用に適している。
本発明による方法論を使用して、細胞試料から標的タンパク質または対象となるタンパク質を抽出することができる。細胞試料は、均一な細胞集団、もしくは異なる種類の細胞の不均一な混合物でありうる。細胞試料には、粘膜、血液細胞、および炎症細胞などの「混入物」も含まれる可能性があり、これらは標的タンパク質の抽出目的では対象にはならず、もしくは標的タンパク質は含まれない。
本方法において用いられる抽出試薬には、固定細胞への抽出試薬の添加時に、少なくともpH10.0であるpHを有するタンパク質抽出物を生成する十分な濃度の量で存在する成分が含まれる。したがって、抽出試薬は一般的に少なくともpH約10.0のpHを有する。
本方法において用いる中和試薬は、中間組成物との接触時に、上で考察した中間組成物のpHを中和するために十分なpHを有する。換言すれば、中和試薬には非イオン性界面活性剤が含まれており、かつ中和試薬を中間組成物と混合させた際、上で考察した中間組成物のpHを中和するために十分なpHを有する。以下でより詳細に考察している通り、中和試薬には、特定の態様では、非イオン性界面活性剤が含まれる。
上で考察した方法によって作成されたタンパク質抽出物は、タンパク質抽出物中の1つまたは複数のタンパク質の存在を評価する方法において、直接的または間接的に(つまり、さらなる試薬の添加後)用いることができる。タンパク質検出方法には、一般的に、タンパク質に特異的に結合する捕捉剤が含まれる。検出されるタンパク質の同一性は、方法を実施する時点で公知の(つまり、既定の)または未知の同一性でありうる。
さらに別の局面では、本発明は、対象となる方法を実施するため、例えば、固定細胞からタンパク質抽出物を生成するため、特定の態様では、タンパク質抽出物中のタンパク質の存在を検査するためのキットを提供する。対象となるキットには、少なくともpH約10.0のpHを有する抽出試薬および中和試薬が少なくとも含まれる。抽出試薬および/または中和試薬には非イオン性界面活性剤が含まれる。さらに、キットには、タンパク質を検出するための補足剤、ならびに、特定の態様では、捕捉剤を使用してタンパク質を検出するための試薬(例えば、緩衝剤および検出試薬)が含まれうる。上記の要素は別々の容器内に存在しうる、または1つまたは複数の要素を1つの容器内、例えば、ガラスまたはプラスチックのバイアル内に混ぜ合わせることができる。
上記の方法およびシステムは、特定の疾患または症状、またはウイルスまたは細菌などの病原菌による感染症を診断する方法を含む、様々な研究方法および診断方法に容易に用いることができる。一態様では、HPV感染細胞を検出するための診断の一部として方法が用いられる。HPVの発癌性株の存在が癌性細胞および前癌性細胞に関連するため、本方法を用いて癌性または前癌性の頸部細胞を検出できる。
スパイクされた臨床試料の抽出
HPV16 E6遺伝子(C33A+)をトランスフェクトした細胞をTHINPREP(商標)培養液で固定して、以下に記載したTHINPREP(商標)固定臨床試料の一部に添加(つまり、「スパイク」)した。細胞を5つの臨床試料ぞれぞれの半分にスパイクした(2,000万個のC33A+細胞を有する各臨床試料の半分)。
C33A(+) ThinPrep細胞/1 ml当たり2,000万個細胞
1- 1/2の臨床陰性#229 (1.0 ml抽出物)に20M C33A(+) ThinPrep細胞
2- 1/2の臨床陰性#230 (1.0 ml抽出物)に20M C33A(+) ThinPrep細胞
3- 1/2の臨床陰性#231 (1.0 ml抽出物)に20M C33A(+) ThinPrep細胞
4- 1/2の臨床陰性#232 (1.0 ml抽出物)に20M C33A(+) ThinPrep細胞
5- 1/2の臨床陰性#233 (1.0 ml抽出物)に20M C33A(+) ThinPrep細胞
6- 20M C33A(+) ThinPrep細胞(1.0 ml抽出物)
Triton X-100/ロット092K0171 - (1% = 250μl)
5M NaCl/ロット5701-53 - (0.15M = 750μl)
0.5M トリスベース/ロット5708-20 - (0.1M = 5 ml)
0.5M グリシン/ロット5708-9 - (0.1M = 5 ml)
10% SDS/ロット5708-8 - (0.05% = 125μl)
8M 尿素/ロット5678-83 - (0.25M = 781μl)
20 mlまでRO/DIを添加 - (8.1 ml)
5N NaOH/ロットA09522 - (525μl)
25 mlまでRO/DIを添加 - (4.475 ml)
最終pH - 11.48
最終調合物:0.1 M トリス/0.1 Mグリシン/0.15 M NaCl/1% Triton X-100/0.05% SDS/0.25M 尿素 pH11.48
1.50 ml遠心管に細胞懸濁液を添加する。
2.10〜15分間、3,000 rpmで回転させる。
3.静かに上清を除去する。
4.内容物を1.5 ml nunc管に移す。
5.10〜15分間、3,000 rpmで回転させる。
6.静かに上清を除去する。
7.ペレットに必要量の抽出試薬を添加する。
8.再懸濁させて細胞ペレットを分散させる。
a.添加剤(DTT 1:100)
9.pHを調べて、11.5に調整する。
10.30分間、室温(または抽出に適当な温度)で混合する。
11.10〜15分間、14,000 rpmで回転させる。
12.清澄な上清を除去する。
13.DTTを1:100で添加する。
14.5N HClでpH8.0に中和して、ELISAで検査する。
(31.0 μlの5N HCl/mlでpH8.0に中和させる。)
100 mM DTT/NR 5701-90/DOM2/7/05
1 - プレート(Nunc 439454 Maxisorp F96/ロット542043)をPBS (ロット021405)中5μg/ml GST-Magi-PDZ (ロット88.18/0.65μg/μl)でコーティングする - 100μl/ウェル。
11 ml x 5μg/ml = 55μg x 1μl/0.65μg = 84.6μl GST-Magi-PDZ
2 - 4℃で一晩インキュベートする。
3 - プレート洗浄機で3回(TBS - Tween)洗う。
4 - 250μlのブロッキング緩衝剤(ロット033005)でプレートをブロッキングする。
5 - 25℃で2時間インキュベートする。
6 - プレート洗浄機で3回(TBS - Tween)洗う。
7 - 適当なウェルに100μl MBP-E6/溶解物試料を添加する。
8 - 25℃で1時間インキュベートする。
9 - プレート洗浄機で3回(TBS - Tween)洗う。
10 - 適当なウェル中の2% BSA HNTG緩衝剤(ロット031805B)に100μlの抗E6抗体(4C6 - 2.85 mg/ml -ロット02) 5μg/mlを添加する。N-末端ペプチド(HPV16E6 ロット番号PN3952-2)を適当な試料に10μg/ml添加して、シグナルの特異性を検証する(添加前の45分間、ペプチドを事前に抗E6抗体とインキュベートする)。
11 - 25℃で2時間インキュベートする。
12 - プレート洗浄機で3回(TBS - Tween)洗う。
13 - 2% BSA/0.05% Tween 20緩衝剤(ロット040505)中でヤギ抗マウスIgG-HRP (Jackson GxM IgG-HRP /カタログ番号115-035-062 /ロット60988)の1:5,000希釈液を調製する。
10.0 ml x 1/5000 = 0.002 ml x 1,000μl/ml = 2.0μlヤギ抗マウスIgG-HRP
14 - 適当なウェルに100μlの1:5,000ヤギ抗マウスIgG-HRP希釈液を添加する。
(TMB基質を除去して、室温に置く)
15 - 25℃で1時間インキュベートさせる。
16 - プレート洗浄機で5回(TBS - Tween)洗う。
17 - 100μlのNeogen K-Blue TMB基質(ロット041018)を添加する。
18 - 25℃で30分間インキュベートする。
19 - 100μlの停止液(ロット030705)を加え、A450を読み取る。
2% BSA/0.05% Tween 緩衝剤 - (ロット040505)
2% BSAブロッカー ロット033005 (49.975 ml)
Tween 20 ロットA016759301 (0.025 ml)
Claims (42)
- a)細胞を抽出試薬と接触させて、pH10.0より大きいpHを有する中間組成物を生成する工程であって、該抽出試薬は相当量の変性剤を含まない、またはタンパク質を変性させるために典型的に用いられる変性剤の濃度よりも低い濃度で変性剤を含み、ここで、前記タンパク質を変性させるために典型的に用いられる変性剤の濃度が0.01 M〜0.05 Mもしくは0.05 M〜0.1 Mである、工程;および
b)中間組成物を中和試薬と接触させて中間組成物のpHを中和させ、タンパク質抽出物を生成する工程
を含む、細胞からタンパク質抽出物を生成するための方法であって、抽出試薬は非イオン性界面活性剤を含む、方法。 - 工程a)より前に細胞を含む細胞試料を受け取る工程をさらに含む、請求項1記載の方法。
- 細胞が頸部細胞である、請求項1記載の方法。
- 細胞が、SUREPATH(商標)、CYTOLYT(商標)、またはPRESERVCYT(商標)輸送液中に存在する、請求項1記載の方法。
- 細胞試料が離れた場所から受け取られる、請求項2記載の方法。
- pHがpH11.0からpH13.0の範囲内にある、請求項1記載の方法。
- 抽出試薬が変性剤を含む、請求項1記載の方法。
- 変性剤がドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、尿素、またはサルコシルである、請求項7記載の方法。
- 非イオン性界面活性剤がTRITON(商標)またはTWEEN(商標)界面活性剤を含む、請求項1記載の方法。
- a)請求項1記載の方法により細胞からタンパク質抽出物を生成する工程;および
b)タンパク質抽出物中のタンパク質の存在を検査する工程
を含む、タンパク質を検出するための方法。 - 検査に前記タンパク質の捕捉剤を用いる、請求項10記載の方法。
- 検査が免疫アッセイを含む、請求項10記載の方法。
- アッセイが酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)である、請求項10記載の方法。
- タンパク質がヒト乳頭腫ウイルス(HPV)タンパク質である、請求項10記載の方法。
- タンパク質がHPV E6タンパク質である、請求項10記載の方法。
- 細胞が頸部剥離細胞である、請求項10記載の方法。
- 細胞が、接触工程a)より前に離れた場所から受け取られる、請求項10記載の方法。
- d)検査の結果を離れた場所に伝達する工程をさらに含む、請求項10記載の方法。
- a)細胞を含む細胞試料、
b)pH10.0より大きいpHを有する抽出試薬であって、該抽出試薬は相当量の変性剤を含まない、またはタンパク質を変性させるために典型的に用いられる変性剤の濃度よりも低い濃度で変性剤を含み、ここで、前記タンパク質を変性させるために典型的に用いられる変性剤の濃度が0.01 M〜0.05 Mもしくは0.05 M〜0.1 Mである、抽出試薬、および
c)中和試薬
を含む、タンパク質抽出物を生成するためのシステムであって、抽出試薬は非イオン性界面活性剤を含み、かつ抽出試薬および中和剤が、結合アッセイでの使用に適したタンパク質抽出物を生成するために請求項1記載の方法において用いられうる、システム。 - タンパク質抽出物中のタンパク質を検出するための試薬をさらに含む、請求項19記載のシステム。
- a)pH10.0より大きいpHを有する抽出試薬であって、該抽出試薬は相当量の変性剤を含まない、またはタンパク質を変性させるために典型的に用いられる変性剤の濃度よりも低い濃度で変性剤を含み、ここで、前記タンパク質を変性させるために典型的に用いられる変性剤の濃度が0.01 M〜0.05 Mもしくは0.05 M〜0.1 Mである、抽出試薬、
b)中和試薬、ならびに
c)抽出試薬および中和試薬を用いて請求項1記載の方法を実施するための使用説明書
を含む、細胞からタンパク質抽出物を生成するためのキットであって、抽出試薬は非イオン性界面活性剤を含む、キット。 - タンパク質抽出物中のタンパク質を検出するための試薬をさらに含む、請求項21記載のキット。
- 試薬が前記タンパク質の捕捉剤を含む、請求項22記載のキット。
- タンパク質がHPV E6タンパク質である、請求項22記載のキット。
- a)標的ウイルスタンパク質が存在する、または存在することが疑われる細胞を含む細胞試料を抽出試薬と接触させて、pH10.0より大きいpHを有する中間組成物を生成する工程であって、該抽出試薬は相当量の変性剤を含まない、またはタンパク質を変性させるために典型的に用いられる変性剤の濃度よりも低い濃度で変性剤を含み、ここで、前記タンパク質を変性させるために典型的に用いられる変性剤の濃度が0.01 M〜0.05 Mもしくは0.05 M〜0.1 Mである、工程;および
b)中間組成物を中和試薬と接触させて中間組成物のpHを中和させ、標的ウイルスタンパク質の抽出物を生成する工程
を含む、細胞試料から標的ウイルスタンパク質を抽出するための方法。 - 抽出試薬は非イオン性界面活性剤を含む、請求項25記載の方法。
- 細胞試料中の細胞を化学固定剤で固定する、請求項25記載の方法。
- 化学固定剤が、アルコール、アルデヒド、ケトン、四酸化オスミウム、酢酸、ピクリン酸、重金属イオン塩、およびプロピレングリコールからなる群より選択される、請求項27記載の方法。
- アルコールがメタノールまたはエタノールであり、アルデヒドがグルタルアルデヒドまたはホルムアルデヒドであり、かつケトンがアセトンである、請求項28記載の方法。
- 工程a)より前に固定細胞を含む細胞試料を受け取る工程をさらに含む、請求項1記載の方法。
- ウイルスタンパク質が病原ウイルスによってコードされる、請求項25記載の方法。
- 病原ウイルスが、HIV、エボラウイルス、マールブルグウイルス、肝炎ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、単純ヘルペスウイルス(HSV)、ヒト乳頭腫ウイルス(HPV)からなる群より選択される、請求項31記載の方法。
- ウイルスタンパク質がHPVのE6またはE7タンパク質である、請求項25記載の方法。
- HPVが、HPV株4、11、20、24、28、36、48、50、16、18、31、35、30、39、45、51、52、56 、59、58、33、66、68、69、26、53、73、または82である、請求項33記載の方法。
- HPVが、HPV26、HPV53、HPV66、HPV73、HPV82、HPV16、HPV18、HPV31、HPV35、HPV30、HPV39、HPV45、HPV51、HPV52、HPV56、HPV59、HPV58、HPV33、HPV66、HPV68、HPV69、およびHPV82からなる群より選択される発癌性HPV株である、請求項33記載の方法。
- 抽出物中の標的ウイルスタンパク質の存在を検出する工程をさらに含む、請求項25記載の方法。
- 検出工程に標的ウイルスタンパク質の捕捉剤を用いる、請求項36記載の方法。
- ウイルスタンパク質がHPVのE6タンパク質であり、かつ捕捉剤がE6タンパク質に対する抗体である、請求項37記載の方法。
- ウイルスタンパク質がHPVのE6タンパク質であり、かつ捕捉剤がPDZドメインを含むポリペプチドを含む、請求項37記載の方法。
- PDZドメインがMAGI-1の第二ドメイン、DLGまたはTIP1のPDZドメインである、請求項39記載の方法。
- 細胞試料が粘膜または血液をさらに含む、請求項25記載の方法。
- 細胞試料が頸部剥離細胞を含む、請求項25記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US74707606P | 2006-05-11 | 2006-05-11 | |
US60/747,076 | 2006-05-11 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009510190A Division JP2009536958A (ja) | 2006-05-11 | 2007-05-11 | 細胞からのタンパク質抽出方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2016104741A true JP2016104741A (ja) | 2016-06-09 |
JP6877871B2 JP6877871B2 (ja) | 2021-05-26 |
Family
ID=38694244
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009510190A Withdrawn JP2009536958A (ja) | 2006-05-11 | 2007-05-11 | 細胞からのタンパク質抽出方法 |
JP2015237245A Active JP6877871B2 (ja) | 2006-05-11 | 2015-12-04 | 細胞からのタンパク質抽出方法 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009510190A Withdrawn JP2009536958A (ja) | 2006-05-11 | 2007-05-11 | 細胞からのタンパク質抽出方法 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US8962262B2 (ja) |
EP (1) | EP2024520B1 (ja) |
JP (2) | JP2009536958A (ja) |
CN (2) | CN104497098A (ja) |
AU (1) | AU2007249242B2 (ja) |
CA (1) | CA2652118C (ja) |
ES (1) | ES2462040T3 (ja) |
WO (1) | WO2007134252A1 (ja) |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7601497B2 (en) | 2000-06-15 | 2009-10-13 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Detection of nucleic acids by target-specific hybrid capture method |
JP2009536958A (ja) | 2006-05-11 | 2009-10-22 | ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー | 細胞からのタンパク質抽出方法 |
US9207240B2 (en) * | 2007-11-14 | 2015-12-08 | Arbor Vita Corporation | Method of efficient extraction of protein from cells |
US8877436B2 (en) | 2008-10-27 | 2014-11-04 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Fast results hybrid capture assay on an automated platform |
US20100216147A1 (en) * | 2009-01-28 | 2010-08-26 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Sequence-specific large volume sample preparation method and assay |
WO2010127326A1 (en) * | 2009-04-30 | 2010-11-04 | Becton, Dickinson And Company | E6 binding peptides for use in affinity purification |
WO2010127324A2 (en) * | 2009-04-30 | 2010-11-04 | Arbor Vita Corporation | Chimeric pdz domain-containing protein for viral detection |
CA2760542A1 (en) | 2009-05-01 | 2010-11-04 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | A non-target amplification method for detection of rna splice-forms in a sample |
EP2529031B1 (en) | 2010-01-29 | 2014-07-09 | QIAGEN Gaithersburg, Inc. | Method of determining and confirming the presence of hpv in a sample |
EP2528932B1 (en) * | 2010-01-29 | 2016-11-30 | QIAGEN Gaithersburg, Inc. | Methods and compositions for sequence-specific purification and multiplex analysis of nucleic acids |
CA2799200A1 (en) | 2010-05-19 | 2011-11-24 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Methods and compositions for sequence-specific purification and multiplex analysis of nucleic acids |
US9376727B2 (en) | 2010-05-25 | 2016-06-28 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Fast results hybrid capture assay and associated strategically truncated probes |
JP2014511182A (ja) | 2011-02-24 | 2014-05-15 | キアゲン ガイサーズバーグ アイエヌシー. | Hpv核酸を検出するための材料及び方法 |
US10254279B2 (en) | 2013-03-29 | 2019-04-09 | Nima Labs, Inc. | System and method for detection of target substances |
US10466236B2 (en) | 2013-03-29 | 2019-11-05 | Nima Labs, Inc. | System and method for detecting target substances |
CN105209912B (zh) | 2013-03-29 | 2018-04-17 | 第6感传感器实验室公司 | 用于有害物质的检测的便携式装置 |
CN103461320B (zh) * | 2013-08-19 | 2015-09-02 | 安徽信灵检验医学科技有限公司 | 一种用于液基薄层脱落细胞的不等张保存液 |
JP2019523863A (ja) * | 2016-05-31 | 2019-08-29 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | ウイルス抗原の血清学的検出方法 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH0343094A (ja) * | 1989-02-09 | 1991-02-25 | Eastman Kodak Co | 単純ヘルペスウイルス抗原の抽出または測定のための抽出組成物、抽出方法および診断試験キット |
WO2005063286A1 (en) * | 2003-12-23 | 2005-07-14 | Arbor Vita Corporation | Antibodies for oncogenic strains of hpv and methods of their use |
WO2005088311A1 (en) * | 2003-08-25 | 2005-09-22 | Mtm Laboratories Ag | Method for detecting neoplastic disorders in a solubilized body sample |
JP2005538360A (ja) * | 2002-09-09 | 2005-12-15 | アルボー ビータ コーポレーション | 子宮頸部癌を診断する方法 |
Family Cites Families (34)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US3546334A (en) * | 1965-05-21 | 1970-12-08 | Lerner Lab Inc | Composition for fixing and protecting a smear of body cells and method of applying same |
US3303038A (en) * | 1965-07-29 | 1967-02-07 | Ethicon Inc | Process of forming collagen articles and dispersions |
JPS5535088B2 (ja) * | 1971-09-10 | 1980-09-11 | ||
US4578282A (en) * | 1982-02-04 | 1986-03-25 | Harrison James S | Composition for diagnostic reagents |
US4766065A (en) * | 1984-08-23 | 1988-08-23 | Becton Dickinson And Company | Detection of cell membrane protein |
US4649192A (en) * | 1985-05-30 | 1987-03-10 | Smith Kline-Rit | Method for the isolation and purification of hepatitis B surface antigen using polysorbate |
US4857300A (en) * | 1987-07-27 | 1989-08-15 | Cytocorp, Inc. | Cytological and histological fixative formulation and methods for using same |
US5132205A (en) * | 1988-10-07 | 1992-07-21 | Eastman Kodak Company | High ph extraction composition and its use to determine a chlamydial, gonococcal or herpes antigen |
US5047325A (en) * | 1988-10-07 | 1991-09-10 | Eastman Kodak Company | Wash solution containing a cationic surfactant and its use in chlamydial and gonococcal determinations |
US5104640A (en) * | 1989-03-17 | 1992-04-14 | Wescor, Inc. | Fixative composition for fixing blood smears to slides |
US5256571A (en) * | 1991-05-01 | 1993-10-26 | Cytyc Corporation | Cell preservative solution |
US5196182A (en) * | 1991-05-08 | 1993-03-23 | Streck Laboratories, Inc. | Tissue fixative |
US5773277A (en) * | 1992-06-26 | 1998-06-30 | Seikagaku Kogyo Kabushiki Kaisha | Crystalline chondroitinase isolated from Proteus vulgaris ATCC 6896 |
US5432056A (en) * | 1993-11-15 | 1995-07-11 | Ventana Medical Systems, Inc. | Bisulfite-based tissue fixative |
US5658749A (en) * | 1994-04-05 | 1997-08-19 | Corning Clinical Laboratories, Inc. | Method for processing mycobacteria |
US5620869A (en) * | 1995-09-28 | 1997-04-15 | Becton, Dickinson And Company | Methods for reducing inhibition of nucleic acid amplification reactions |
US7306926B2 (en) * | 1998-07-01 | 2007-12-11 | Mtm Laboratories Ag | Method for detecting carcinomas in a solubilized cervical body sample |
US6245568B1 (en) * | 1999-03-26 | 2001-06-12 | Merck & Co., Inc. | Human papilloma virus vaccine with disassembled and reassembled virus-like particles |
US20060148711A1 (en) * | 1999-05-14 | 2006-07-06 | Arbor Vita Corporation | Molecular interactions in neurons |
US20050037969A1 (en) * | 1999-05-14 | 2005-02-17 | Arbor Vita Corporation | Molecular interactions in hematopoietic cells |
US20050019841A1 (en) * | 1999-05-14 | 2005-01-27 | Arbor Vita Corporation | Modulation of signaling pathways |
US6488671B1 (en) * | 1999-10-22 | 2002-12-03 | Corazon Technologies, Inc. | Methods for enhancing fluid flow through an obstructed vascular site, and systems and kits for use in practicing the same |
US6337189B1 (en) * | 2000-02-08 | 2002-01-08 | Streck Laboratories, Inc. | Fixative system, method and composition for biological testing |
US6436662B1 (en) * | 2000-04-04 | 2002-08-20 | Digene Corporation | Device and method for cytology slide preparation |
AU2001277986A1 (en) * | 2000-07-25 | 2002-02-05 | Axcell Biosciences Corporation | Identification and isolation of novel polypeptides having pdz domains and methods of using same |
US20030175852A1 (en) * | 2000-09-15 | 2003-09-18 | Kalra Krishan L | Ehancement of in situ hybridization |
US7312041B2 (en) * | 2001-02-16 | 2007-12-25 | Arbor Vita Corporation | Methods of diagnosing cervical cancer |
CA2449747C (en) | 2001-06-22 | 2010-04-13 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Use of fkbp chaperones as expression tool |
US20050032105A1 (en) * | 2001-10-12 | 2005-02-10 | Bair Robert Jackson | Compositions and methods for using a solid support to purify DNA |
JP2006507818A (ja) * | 2002-11-01 | 2006-03-09 | プロメガ コーポレイション | 細胞溶解のための組成物、使用方法、装置およびキット |
EP1694692B1 (en) * | 2003-12-16 | 2010-04-28 | QIAGEN North American Holdings, Inc. | Formulations and methods for denaturing proteins |
CA2562447A1 (en) | 2004-04-15 | 2005-12-15 | Allied Biotech, Inc. | Methods and apparatus for detection of viral infection |
JP2009536958A (ja) | 2006-05-11 | 2009-10-22 | ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー | 細胞からのタンパク質抽出方法 |
US9207240B2 (en) | 2007-11-14 | 2015-12-08 | Arbor Vita Corporation | Method of efficient extraction of protein from cells |
-
2007
- 2007-05-11 JP JP2009510190A patent/JP2009536958A/ja not_active Withdrawn
- 2007-05-11 CN CN201410545307.XA patent/CN104497098A/zh active Pending
- 2007-05-11 WO PCT/US2007/068809 patent/WO2007134252A1/en active Application Filing
- 2007-05-11 CN CNA2007800210313A patent/CN101460636A/zh active Pending
- 2007-05-11 AU AU2007249242A patent/AU2007249242B2/en active Active
- 2007-05-11 EP EP07797439.2A patent/EP2024520B1/en active Active
- 2007-05-11 CA CA2652118A patent/CA2652118C/en active Active
- 2007-05-11 US US11/747,830 patent/US8962262B2/en active Active
- 2007-05-11 ES ES07797439.2T patent/ES2462040T3/es active Active
-
2015
- 2015-01-15 US US14/598,148 patent/US9771398B2/en active Active
- 2015-12-04 JP JP2015237245A patent/JP6877871B2/ja active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH0343094A (ja) * | 1989-02-09 | 1991-02-25 | Eastman Kodak Co | 単純ヘルペスウイルス抗原の抽出または測定のための抽出組成物、抽出方法および診断試験キット |
JP2005538360A (ja) * | 2002-09-09 | 2005-12-15 | アルボー ビータ コーポレーション | 子宮頸部癌を診断する方法 |
WO2005088311A1 (en) * | 2003-08-25 | 2005-09-22 | Mtm Laboratories Ag | Method for detecting neoplastic disorders in a solubilized body sample |
WO2005063286A1 (en) * | 2003-12-23 | 2005-07-14 | Arbor Vita Corporation | Antibodies for oncogenic strains of hpv and methods of their use |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN101460636A (zh) | 2009-06-17 |
WO2007134252A1 (en) | 2007-11-22 |
CA2652118C (en) | 2015-07-07 |
CA2652118A1 (en) | 2007-11-22 |
EP2024520B1 (en) | 2014-03-05 |
CN104497098A (zh) | 2015-04-08 |
US8962262B2 (en) | 2015-02-24 |
AU2007249242A1 (en) | 2007-11-22 |
EP2024520A4 (en) | 2011-01-05 |
AU2007249242B2 (en) | 2014-02-27 |
US9771398B2 (en) | 2017-09-26 |
JP6877871B2 (ja) | 2021-05-26 |
JP2009536958A (ja) | 2009-10-22 |
EP2024520A1 (en) | 2009-02-18 |
ES2462040T3 (es) | 2014-05-22 |
US20150266928A1 (en) | 2015-09-24 |
US20070292899A1 (en) | 2007-12-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6877871B2 (ja) | 細胞からのタンパク質抽出方法 | |
JP5787519B2 (ja) | 細胞からの効率的なタンパク質抽出方法 | |
EP2300824B1 (en) | Detection of early stages and late stages hpv infection | |
TWI438281B (zh) | 包含重組人類乳突病毒(hpv)蛋白之組合物之製造方法及其在子宮頸癌上的用途 | |
JP5819851B2 (ja) | Hpv関連の癌の治療及びスクリーニングのための細胞に基づいた高処理能力hpv免疫アッセイ | |
US20080200344A1 (en) | Protein chips for HPV detection | |
JP2009536958A5 (ja) | ||
EP2755998A1 (en) | Antibodies against e7 protein of human papilloma virus (hpv) | |
BRPI0805220A2 (pt) | métodos para produzir um extrato de proteìna a partir de células fixas e para detectar uma proteìna, sistema e kit para produzir um extrato de proteìna, e, método para extrair uma proteìna viral alvo de uma amostra de célula |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20151208 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20161005 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20161222 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170215 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20170215 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170403 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20171002 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20171228 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180330 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20180830 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190104 |
|
C60 | Trial request (containing other claim documents, opposition documents) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C60 Effective date: 20190104 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20190104 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20190201 |
|
C21 | Notice of transfer of a case for reconsideration by examiners before appeal proceedings |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C21 Effective date: 20190204 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20190322 |
|
C211 | Notice of termination of reconsideration by examiners before appeal proceedings |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C211 Effective date: 20190327 |
|
C22 | Notice of designation (change) of administrative judge |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C22 Effective date: 20190918 |
|
C22 | Notice of designation (change) of administrative judge |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C22 Effective date: 20191007 |
|
C13 | Notice of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C13 Effective date: 20191121 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20200221 |
|
C22 | Notice of designation (change) of administrative judge |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C22 Effective date: 20200413 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200518 |
|
C22 | Notice of designation (change) of administrative judge |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C22 Effective date: 20200708 |
|
C13 | Notice of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C13 Effective date: 20200820 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20201119 |
|
RD04 | Notification of resignation of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424 Effective date: 20210115 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210219 |
|
C23 | Notice of termination of proceedings |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C23 Effective date: 20210301 |
|
C03 | Trial/appeal decision taken |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C03 Effective date: 20210401 |
|
C30A | Notification sent |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C3012 Effective date: 20210401 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20210428 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6877871 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |