JP2015532124A - アミロース含量が増加した高品質デュラムコムギの生成 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2012年12月12日に出願された米国仮特許出願第61/736,136号及び2012年10月23日に出願された米国仮特許出願第61/717,357号の利益を主張し、これらの出願は、参照によりそれらの全体が全ての目的のために本明細書に組み込まれている。
本明細書とともに電子的に提出されたテキストファイルの内容は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれている:配列表のコンピュータ読み取り可能フォーマットコピー(ファイル名:MONT_135_01WO_Seq_List.txt、記録日時:2013年10月10日;ファイルサイズ:136キロバイト)。
配列番号1〜配列番号24についての配列表は、本出願の一部であり、参照により本明細書に組み込まれている。配列表は、この書類の最後に示す。
本明細書で用いる場合、本記載及び特許請求の範囲において用いる「含む」との動詞並びにその活用形は、この語句の後に続く項目が含まれるが、具体的に言及していない項目が除外されないことを意味する、非限定的な意味で用いる。
ADP−グルコース+(1,4−アルファ−D−グルコシル)n
=ADP+(1,4−アルファ−D−グルコシル)n+1
を触媒できる、E.C.番号2.4.1.21を有するタンパク質のことをいう。
ATP+アルファ−D−グルコース1−リン酸
=二リン酸+ADP−グルコース
を触媒できる、E.C.番号2.7.7.27を有するタンパク質のことをいう。
2 1,4−アルファ−D−グルカン
=アルファ−1,4−D−グルカン−アルファ−1,6−(アルファ−1,4−D−グルカン)
を触媒できる、E.C.番号2.4.1.18を有するタンパク質のことをいう。
コムギは、Triticumの属に属する植物種である。コムギ種の非限定的な例は、T.aestivum(食用コムギ又はパンコムギとしても知られる、6倍体)、T.aethiopicum、T.araraticum、T.boeoticum、T.carthlicum、T.compactum、T.dicoccoides、T.dicoccum(エマーコムギとしても知られる、4倍体)、T.durum(デュラムコムギとしても知られる、4倍体)、T.ispahanicum、T.karamyschevii、T.macha、T.militinae、T.monococcum(一粒コムギ、2倍体)、T.polonicum、T.spelta(スペルトとしても知られる、6倍体)、T.sphaerococcum、T.timopheevii、T.turanicum、T.turgidum、T.urartu、T.vavilovii、T.zhukovskyi及びそれらの任意の雑種を含む。
デンプンは、植物中の主要な保留炭水化物である。デンプンは、実際上全ての型の組織:葉、果実、根、シュート、茎、花粉及び種子に存在する。穀物の穀粒では、デンプンは、貯蔵エネルギーの主要な供給源である。穀物の穀粒中に含有されるデンプンの量は、種及び発達段階に応じて変動する。
欧州及び北米では、パスタは、100%デュラム小麦粉を用いて伝統的に調製されている(Fuad及びPrabhasanker 2010)。実際に、デュラムコムギの小麦粉に固有の特性により、この小麦粉は、パスタ製造に理想的に適するものになる。なぜなら、比較的高いレベルの黄色色素による優れた色と、天然のグルテニンタンパク質に固有の良好な混合特性を与えるからである(Dexter及びMatson 1979; Fuad及びPrabhasanker 2010)。最近、繊維及びアミロース含量の増加を含む栄養特性が改善された小麦粉製品、並びにタンパク質含量が増加した小麦粉製品に向かう動きがある。
1又は複数のデンプン合成遺伝子の1又は複数の変異体対立遺伝子を有するデュラムコムギを作出して同定できる。いくつかの実施形態では、このような変異体対立遺伝子は、進化の間に自然に生じる。いくつかの実施形態では、このような変異体対立遺伝子は、突然変異誘発(例えば化学的突然変異誘発、放射線照射突然変異誘発、トランスポゾン突然変異誘発、挿入突然変異誘発、符号タグ化突然変異誘発、部位特異的突然変異誘発及び天然突然変異誘発)、アンチセンス、ノックアウト及び/又はRNA干渉のような人工的な方法により作出される。
本発明は、デュラム表現型を改変/変更/改善する方法をさらに提供する。本明細書で用いる場合、「改変する」又は「変更する」との用語は、参照品種と比較した表現型の任意の変化、例えばデンプン特性と関連する変化のことをいう。「改善する」との用語は、工業的又は栄養的な用途のために1又は複数の質がよりよいデュラムコムギを作製する任意の変化のことをいう。このような改善は、限定されないが、粗びき粉としての質の改善、広範囲の最終生成物を製造するための原材料としての質の改善を含む。
・繊維強化:難消化性デンプンは、良好又は優れた繊維供給源である。米国農務省及びその他の国での健康機関は、食物繊維の良好又は優れた供給源を何が構成するかについての基準を設定している。
・低カロリーへの貢献:このデンプンは、約10kcal/g、5kcal/g、1kcal/g又は0.5kcal/g未満を有することができ、これは、典型的なデンプンと比べて約90%のカロリー低減をもたらす。
・低い血糖/インスリン応答
・良好な小麦粉代替物、なぜならこれは、(1)最小限の処方の変化を必要として又は変化を必要とせずに処方中に容易に組み込まれ、(2)コムギベースの製品に自然に適合し、(3)老化及び劣化を低減する能力があるからである。劣化は、パン及びその他の食品においておいしさを低減する化学的及び物理的プロセスである。
・低水結合能:このデンプンは、その他のタイプの難消化性デンプンを含むほとんどのその他の繊維供給源よりも低い水保持能を有する。これは、サクサクした感触を目標とするために理想的である、処方中の水を低減し、微生物活性及び老化に関して有効期限を改善する。
・加工抵抗性:このデンプンは、押し出し、圧力調理などのようなエネルギー集約型手順に対して安定性がある。
・官能特性:例えばスムーズでざらつきがないテクスチャ、白色、「見えない」繊維源、そして自然な風味。
i)本発明の変異体デュラムコムギと第2のコムギ種との間の交雑種を作製して、F1植物を作製することと、
ii)F1植物を第2のコムギ種に戻し交配することと、
iii)変異が第2のコムギ種のゲノムに組み込まれるまで、戻し交配工程を反復することとを含む。任意選択により、このような方法は、分子マーカーにより促進できる。
i)本発明のコムギ変異体とデュラムコムギに近い種との間の交雑種を作製して、F1植物を作製することと、
ii)F1植物をデュラムコムギに近い種に戻し交配することと、
iii)変異がデュラムコムギに近い種のゲノムに組み込まれるまで、戻し交配工程を反復することとを含む。デュラムコムギからの遺伝子を別の種及び/又は属にうまく移入するために、特別の技術(例えば体細胞雑種形成)が必要になることがある。任意選択により、このような方法は、分子マーカーにより促進できる。
本発明は、1又は複数の改変デンプン合成遺伝子を有するトランスジェニックコムギ植物を提供する。改変は、破壊又は過剰発現のいずれかであることができる。
本発明の1又は複数の変異体を、本発明のトランスジェニック植物との交配に適合性である他の植物品種又は他の近縁種に導入するために、伝統的な育種法を本発明に含めることができる。
示差走査熱量分析又はDSCは、試料及び参照の温度を増加させるために必要な熱の量の差を温度の関数として測定する熱分析技術である。試料及び参照はともに、実験中、同じ温度付近に維持される。一般的に、DSC分析についての温度プログラムは、試料ホルダ温度が時間の関数として直線的に増加するように設計される。参照試料は、走査する範囲の温度にわたって明確に規定された熱容量を有するべきである。DSCは、熱相変化、熱ガラス転移温度(Tg)、結晶融解温度、吸熱効果、発熱効果、熱安定性、熱組成安定性、酸化安定性研究、遷移現象、固体状態構造及び様々な範囲の材料を分析するために用いることができる。DSCサーモグラムは、Tgガラス転移温度、Tm融点、ΔHm吸収エネルギー(ジュール/グラム)、Tc結晶点、及びΔHc放出エネルギー(ジュール/グラム)を決定するために用いることができる。
Cp=dH/dt×dt/dT
(式中、dH/dtは、サーモグラムのベースラインのシフトであり、dt/dTは、加熱速度の逆数である)から算出される。熱流量の単位は、mW又はmcal/秒であり、加熱速度の単位は、℃/分又は℃/秒である。いくつかの実施形態では、10℃/分の加熱速度にて、DSCにより測定して、本出願のデュラムコムギから作られるデンプンの熱容量は、野生型デュラムコムギから作られるデンプンのものと比較して約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、79%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、100%、110%、120%、130%、140%、150%、160%、170%、180%、190%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1000%以上改変(例えば増加又は減少)される。
デュラムコムギの麺の質に対するSSII−Aヌル対立遺伝子の影響
材料及び方法
200のデュラムコムギ受託物の標本を、National Small Grains Collection、Aberdeen、IDから、及び55のデュラムコムギ受託物を、International Center for Agricultural Research in the Dry Areas(ICARDA)から得た。これらの受託物をスクリーニングして、SGP−A1及び/又はSGP−B1についてヌル表現型を示す受託物を、デンプン粒結合タンパク質のSDS−PAGEを用いて同定した。
単一遺伝子型からの種子を、Braunコーヒーミル(Proctor Gamble、Cincinnati、OH)中で10秒間粉砕し、次いで、2mlの微量遠心管に、6.5mmのイットリア安定化ジルコニアセラミックボール2つ(Stanford Materials、Irvine、CA)とともに入れ、これらを次いで30秒間、ミニ−ビーズビーター−96(Biospec Products、Bartlesville、OK)中で、振動距離3.2cm及び振とう速度36回の振動/秒で撹拌した。ジルコニアボールを遠心管から取り除き、0.1M NaCl 1.0mlを全穀粒小麦粉に加え、これを次いで放置して室温にて30分間浸した。30分後に、プラスチックのKontesペレットペッスル(Kimble Chase、Vineland、NJ)を用いて湿潤小麦粉を混合することにより生地のボールを作り、デンプンを圧搾した後にこのグルテンボールを試料から取り除いた。液体デンプン懸濁物を、次いで、予め秤量した新しい2.0mlチューブに移し、ddH2O 0.5mlを最初のチューブ中の残存デンプンペレットに加えた。最初のチューブをボルテックスし、1分間放置して落ち着かせ、液体デンプン懸濁物を第2のチューブに移した。デンプン懸濁物含有チューブを5,000gにて遠心分離し、液体を吸引して除いた。デンプンペレットに、SDS抽出緩衝液(55 mM Tris-Cl pH 6.8、2.3% SDS、5% BME、10%グリセロール)0.5mlを加え、懸濁されるまで試料をボルテックスし、次いで5,000gで遠心分離した。SDS緩衝液を吸引して除き、SDS緩衝液抽出をもう1度繰り返した。次に、80%CsCl 0.5mlをデンプンペレットに加え、懸濁されるまで試料をボルテックスし、次いで7,500gで遠心分離した。CsClを吸引して除き、10,000gの遠心分離速度を用いてddH2O 0.5mlで2回及びアセトンで1回デンプンペレットを洗浄した。アセトンを吸引して除いた後に、ペレットを1晩、ドラフト中で放置して乾燥させた。
デンプンを精製するために、SDSローディング緩衝液(SDS抽出緩衝液とブロモフェノールブルー)7.5μlをデンプン1ミリグラムあたり加えた。試料を15分間、70℃にて加熱し、10,000gにて1分間遠心分離し、次いで、30%アクリルアミド/0.8%ピペラジンジアクリルアミドw/vストック溶液を用いて調製した10%(w/v)アクリルアミドゲルに試料40μlをロードした。ゲルは、30%アクリルアミド/0.8%ピペラジンジアクリルアミドw/vストック溶液を用いて調製した標準的な4%w/vアクリルアミドスタッキングゲルを有した。ゲル(mAが適切になるように、ゲルの長さ幅及び高さが必要であり、アンディの論文にもそれが欠落していた)を泳動し(25mA/ゲルで45分、次いで35mA/ゲルで3時間)、標準的な手順に従って銀染色し、デジタルカメラを用いてライトボックス上で写真撮影した。SGP−A1及び/又はSGP−B1タンパク質の存在又は非存在について、各系統の遺伝子型を決定した。
2つの受託物、すなわちNSGCからのPI330546及びICARDAからのIG86304は、SGP−A1タンパク質を欠いていた。これらをともに、適応されたデュラムコムギ栽培変種「Mountrail」(PVP 990266)(Elias及びMiller、2000)と交配させた。個体群を、単粒系統法によりF5世代に進めた。全ての系統は、上記のSDS−PAGE法を用いてSGP−A1タンパク質の存在又は非存在について遺伝子型を決定した(図1)。種子増加が生じた後に、系統と親を、2つの反復を用いる乱塊分割区画法において評価した。個体群は主区画であり、各個体群内の系統は副区画であった。各区画は、30cmの間隔の4本の3m列であった。区画は、区画コンバインを用いて収穫した。試験は、Bozeman、MTの近くのArthur H.Post Field Research Laboratoryにて、2009年及び2010年に、別々の隣接した天水及び灌漑実験で成長させた。
小麦粉膨潤度(FSP)は、2009年の4つの反復(2つは天水環境から、2つは灌漑環境から)及び2010年の1つの反復からの圃場成長区画からの種子を用いて測定した。種子を、Braunコーヒーミル(Proctor Gamble、Cincinnati、OH)中で10秒間粉砕し、次いで、2mlのチューブに、6.5mmのジルコニアボール2つとともに入れ、次いで30秒間、ミニ−ビーズビーター−96(Biospec Products、Bartlesville、OK)中で、振動距離3.2cm及び振とう速度36回の振動/秒で撹拌した。次いで、全粒小麦粉30mgを2mlのチューブ中に秤量し、ddH2O 1.5mlを加えた。試料をThermomixer(登録商標)(Eppendorf、Hamburg、Germany)で、800rpmで連続的に混合しながら30分間、92℃にて加熱した。試料を次いでベンチで2分間冷却した後に、4℃、1,000gにて10分間の遠心分離を行い、その後、水を吸引して除いた。チューブを次いで再秤量し、小麦粉膨潤度を、最終小麦粉重量を初期小麦粉重量で除すことにより算出した。
どちらの年も十分に雨が降ったので、天水試験及び灌漑試験は非常に類似していた。よって、環境(天水及び灌漑)×ブロックの組み合わせを、各年についてのブロックとして処理した。両年にわたって組み合わせた分散分析を、全ての測定した形質について、個体群が主区画であり個体群内の系統が副区画である、年をまたいで組み合わせた乱塊分割区画についてのモデルを用いて行った。各系統についての最小二乗平均を得た。副区画及び副区画×個体群のソースを、SSIIa−Aクラス、SSIIa−Aクラス内の系統及びこれらのソースと年との全ての可能な相互作用に分割した。ブロック及びSSIIa−Aクラス内の系統は、無作為とみなし、全てのその他の因子は固定された効果とみなした。分析は、SAS Sytem for Windows(登録商標)(SAS Institute Inc.、Cary、NC)のSAS/STATソフトウェアバージョン9.3でPROC MIXEDプロシージャを用いて行った。各個体群についてのSSII−Aクラス平均間の差は、ESTIMATEステートメントを用いて見積もった。唯一の例外は、小麦粉膨潤度であり、ここでは、年効果をモデルに含めなかった。SAS/STATソフトウェアでPROC CORRプロシージャを用いて、選択した形質の間で線形の相関が系統平均を用いて得られた。変数の特定の対についてSSIIa−A対立遺伝子クラス間の関係(傾き)の不均質性は、Littellら240頁(2002)に概説される方法を用いて試験した。
SGP−A1タンパク質を欠く2つの遺伝子型を同定した。これらのヌル遺伝子型は、SSIIa−Abと称し、野生型はSSIIa−Aaと称した。ヌル遺伝子型をMountrailと交配させて、分離型個体群を作出した。これらの分離型個体群を、2年にわたる反復試験において評価した。平均穀粒タンパク質は、1年目及び2年目について14.1%及び15.0%であった。年との相互作用は、一般的に重要でなく、データは、2年にわたる平均として示す。SSIIa−Abクラスは、SSIIa−A1aクラスよりも低いFSPを有した(表I)。この差は、IG86304交雑種よりもPI330546交雑種について大きかった。SSIIa−Abクラスは、両方の交雑種について、より固い仁(P<0.05)を有した。仁重量は、IG86304交雑種について、SSIIa−Aaクラスと比較してSSIIa−Abクラスについて、より低かった。しかし、仁重量のこの差は、PI330546交雑種について観察されなかった。
デンプン合成酵素IIの突然変異誘発による高アミロースデュラムコムギの作出
穀類種子におけるデンプンの型は、様々なデンプン合成酵素により制御される。顆粒結合型デンプン合成酵素I「モチ様」は、アミロース生合成を制御し、多数の可溶性デンプン合成酵素は、アミロペクチン生合成に関与する。1又は複数の顆粒非結合型又は「可溶性」デンプン合成酵素における変異は、アミロペクチンの減少及びアミロース含量の増加を導く。アミロースの増加は、次いで、重要である。なぜなら、これは、グリセミック指数を低くし、デュラム(Triticum durum)パスタの質を、硬さを増加することにより増加できるからである。ここで、我々は、デュラムデンプンに対するデンプン合成酵素IIa(SSIIa又はSGP-1)変異の影響を決定することを計画した。実施例1に記載したように、デュラム受託物のスクリーニングにより、SGP−1のAゲノムコピーであるSGP−A1を欠く2つの系統が同定された。これら2つの系統は、同じSGP−A1変異、すなわち29bpの欠失を第1エキソン中に保有すると決定された。SGP−A1ヌルをそれぞれ、デュラム品種「Mountrail」と交配させ、F5由来SGP−A1ヌル後代系統をEMSで処理した。各EMS個体群から、ミスセンス変異をそれぞれ有する1つのSGP−B1ヌル変異を回収した。SGP−1 2重ヌルのそれぞれは、アミロース含量が大きく増加し、SGP−2及びSGP−3とデンプン粒内部との結合が低減することが見出された。RNA−Seqを用いて、SGP−1の喪失が他のデンプン生合成遺伝子に与える影響を調べた。いくつかのデンプン生合成遺伝子の転写産物レベルの著しい増加が、Mountrailと比較してSGP−1 2重ヌルにおいて観察された。結果として得られた高アミロースデュラムは、硬さが増加しグリセミック指数が低減するという付加価値のあるパスタの作出において有用であると見出される可能性がある。
突然変異デュラムコムギ個体群の作出及びスクリーニング
USDA National Small Grains Collection(NSGC、Aberdeen、ID)及びICARDAから得たデュラムコムギ受託物を、SGP−A1及び/又はSGP−B1についてヌルのものについて、デンプン粒結合タンパク質のSDS−PAGE(以下を参照されたい)を用いてスクリーニングした。スクリーニングした200のNSGC Triticum durumコア収集受託物からは、1つの系統、すなわちPI−330546がSGP−A1を欠き、SGP−B1を欠くものはなかった。スクリーニングした55のICARDA Triticum durum受託物からは、1つの系統、すなわちIG−86304がSGP−A1を欠き、SGP−B1を欠くものはなかった。これら2つの系統を、栽培変種「Mountrail」(PVP 9900266)と独立して交配させ(Elias及びMiller、2000)、単粒系統法によりF5世代に進めた。各交雑種からのMountrailと同様の種子及び植物の特徴を有するSGP−A1ヌル形質についてホモ接合性の系統を、次いで、EMS 0.5%を用い、植物をM1:M2世代まで温室中で2世代進めた以外はFeizら(2009)に記載されるようにしてエチルメタンスルホン酸(EMS)で処理した。294のMountrail/PI−330546 M1系統及び196のMountrail/IG−86304 M1系統からの種子を、可能性のあるSSIIa−B変異について、小麦粉膨潤度試験を用いて予備スクリーニングした。各系統について、単一の穂先からの4つの種子を、Braunコーヒーミル(Proctor Gamble、Cincinnati、OH)中で10秒間粉砕し、次いで、2mlの微量遠心管に、6.5mmのイットリア安定化ジルコニアセラミックボール2つ(Stanford Materials、Irvine、CA)とともに入れ、30秒間、ミニ−ビーズビーター−96(Biospec Products、Bartlesville、OK)中で、振動距離3.2cm及び振とう速度36回の振動/秒で撹拌した。次に、全粒小麦粉30mgを2mlチューブに秤量し、ddH2O 1.5mlを加えた。試料をThermomixer(登録商標)(Eppendorf、Hamburg、Germany)で、800rpmで連続的に混合しながら30分間、92℃にて加熱した。試料を次いで室温にて2分間冷却した後に、4℃/1,000gにて10分間遠心分離を行い、その後、水を吸引して除いた。チューブを再秤量し、小麦粉膨潤度を、最終小麦粉重量を初期小麦粉重量で除すことにより算出した。
それぞれの選択した低FSP遺伝子型と、親対照とについて、4つの種子を、Braunコーヒーミル(Proctor Gamble、Cincinnati、OH)中で10秒間粉砕し、次いで、2mlの微量遠心管に、6.5mmのジルコニアボール2つとともに入れ、30秒間、ミニ−ビーズビーター−96中で撹拌した。ジルコニアボールを微量遠心管から取り除き、0.1M NaCl 1.0mlを全穀粒小麦粉に加え、これを次いで放置して室温にて30分間浸した。30分後に、プラスチックのKontesペレットペッスル(Kimble Chase、Vineland、NJ)を用いて湿潤小麦粉を混合することにより生地のボールを作り、デンプンを圧搾した後にこのグルテンボールを試料から取り除いた。液体デンプン懸濁物を、次いで、予め秤量した新しい2.0mlチューブに入れ、ddH2O 0.5mlを最初のチューブ中の残存デンプンペレットに加えた。最初のチューブをボルテックスし、1分間放置して落ち着かせ、液体デンプン懸濁物を第2のチューブに移した。デンプン懸濁物含有チューブを5,000gにて遠心分離し、液体を吸引して除いた。次に、SDS抽出緩衝液(55 mM Tris-Cl pH 6.8、2.3% SDS、5% BME、10%グリセロール)0.5mlを加え、懸濁されるまで試料をボルテックスし、次いで5,000gで遠心分離した。SDS緩衝液を吸引して除き、SDS緩衝液抽出をもう1度繰り返した。次に、80%CsCl 0.5mlをデンプンペレットに加え、懸濁されるまで試料をボルテックスし、7,500gで遠心分離した。CsClを吸引して除き、10,000gの遠心分離速度を用いてddH2O 0.5mlで2回及びアセトンで1回デンプンペレットを洗浄した。上清の吸引の後に、デンプンペレットを1晩、ドラフト中で放置して乾燥させた。
デンプンを精製するために、SDSローディング緩衝液(SDS抽出緩衝液とブロモフェノールブルー)7.5μlをデンプン1ミリグラムあたり加えた。試料を15分間、70℃にて加熱し、10,000gにて1分間遠心分離し、次いで、30%アクリルアミド/0.8%ピペラジンジアクリルアミドw/vストック溶液を用いて調製した10%(w/v)アクリルアミドゲルに試料40μlをロードした。ゲルは、30%アクリルアミド/0.8%ピペラジンジアクリルアミドw/vストック溶液を用いて調製した標準的な4%w/vアクリルアミドスタッキングゲルを有した。ゲルを泳動し(25 mA/ゲルで45分間、次いで35 mA/ゲルで3時間)、標準的な手順に従って銀染色し、デジタルカメラを用いてライトボックス上で写真撮影した。
ssIIa−B変異を有することが疑われるM2植物及び親系統からの葉組織を、Feekes成長段階1.3にて回収し、−80℃にて貯蔵し、DNAを、Riede及びAnderson(1996)に従って抽出した。以前に記載されたプライマー及びPCR条件(Chibbarら、2005、Shimbataら、2005、Sestiliら、2010a)を用いて、2重のDNA試料からのSSIIa−A及びSSIIa−Bのコード領域を増幅した。アンプリコンを、University of California Berkeley配列決定施設にて配列決定し、得られたDNA配列を、1ヌクレオチド多型について、Lasergene 10.1 Suite(DNASTAR、Madison、WI)中のSeqman Proを用いて分析した。見出された2つのデュラム高アミロース(DHA)SGP−1 2重変異体は、Mountrail/PI−330546交雑種からのDHA175と、Mountrail/IG−86304交雑種からのDHA55であった。
Mountrailについて、Hansenら(2010)に記載される方法に従って、Pyris 7 Diamond DSC(Perkin Elmer、Norwalk CT、USA)を用いてMountrail/PI330546(SGP-A1ヌル)、DHA175及びDHA55の示差走査熱量分析(DSC)を行った。各遺伝子型について、3つの生物学的反復を3重で実験した。試料あたりデンプンおよそ10mg(実際の重量を記録した)を、ddH2O 55μLとともに高圧ステンレス鋼のパンに入れた。パンをOリングで密閉して覆い、デンプンを放置して室温にて1晩水和させた。試料を次の日に再秤量し、次いで25℃に2分間置いて平衡化した後に、120℃まで10℃/分にて加熱した。試料中の熱伝導を、参照としての空のステンレス鋼のパンと比較した。Pyrisソフトウェアを用いてサーモグラムを作製し、遷移温度及び物理的遷移熱を算出した。アミロースは、Polaskeら(2005)に記載される方法を用いてDSCにより決定した。アミロース含量についての統計解析は、SAS9.0(SAS Institute、Cary、NC)での0.05のアルファを用いるPROC GLM及びt検定を用いて行った。
Mountrail、Mountrail/PI330546(SGP-A1ヌル)、DHA175及びDHA55からの精製デンプン粒を、試料あたり3つの生物学的反復から、上記の方法を用いて得た。個別のデンプン試料をカーボンテープ上に置き、これを次いでイリジウムでスパッタリングした(20 mAで30秒間)。デンプン粒を次いで観察し、Zeiss Supra 55VP電界放射電子銃−SEM(Carl Zeiss Microscopy、Peabody、MA)を用いて写真撮影した。
デンプン合成遺伝子の発現レベルを解析するために、開花14日後の発達中の種子を、Mountrail、DHA55及びDHA175から回収し、−80℃にて貯蔵した。各遺伝子型について、発達中の種子を3つの別々の植物から回収し、各植物試料は、3つの異なる下穂の中間部からの4つの種子(合計12の種子)で構成された。種子を、次いで、予め冷却した乳鉢と乳棒で、液体N2中で微細粉末に粉砕した。過剰のデンプンを除去するために各試料をまず予備抽出した後に、トータルRNAを未熟仁からRNeasy植物ミニキット(Qiagen、Valencia、CA)を用いて抽出した。このことを達成するために、種子粉末100mgを、予め冷却した1.5mLチューブに移し、RNA抽出緩衝液(100 mM Tris pH 8.0、150mM LiCl、50 mM EDTA、1.5%(w/v)SDS、0.15%(v/v)BME)0.5mLを加え、均質になるまでボルテックスした。次に、1:1(v/v)フェノール−クロロホルム(pH 4.7)0.25mLを加え、試料を逆さまにして混合した後に、13,000×gにて15分間、室温にて遠心分離した。上清をQIAshredderスピンカラムに移し、トータルRNAを製造者の使用説明に従って抽出した。トータルRNAを定量し、その質をBioanalyzer(Agilent Technologies、Santa Clara、CA)を用いて評価した。RNA−Seq分析のために、トータルRNA 1μgを、製造者の使用説明に従ってTruSeq RNA−Seqライブラリーキット(Illumina、San Diego、CA)を用いてcDNAライブラリーを作出するために用いた。cDNAライブラリーからのアンプリコンを、LifeTech SOLiD 5500xl(Life Technologies、Carlsbad、CA)を用いて単一50bp読み取りとして配列決定した。RNA−Seqデータを、ArrayStar v5.0(DNASTAR、Madison、WI)中のQ−Seqを用いて分析した。対象の遺伝子は、マー最小化をオフにして少なくとも40bpについて100%に設定したQSeqでのマッチ設定を用いる分析のために、NCBIデータベースから選択した。全てのその他の設定はデフォルトのままにし、配列は、1百万のマッピングされた読み取りあたりのエキソンモデル1キロベースあたりの読み取り(Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads)(RPKM)法を用いて標準化した。得られた線形計数を、次いで、ハウスキーピング遺伝子グリセルアルデヒド−3−リン酸脱水素酵素(Ga3pd)の発現レベルに対してさらに標準化した。スチューデントのt検定を用いて、Mountrailと、2つのssIIaヌル遺伝子型DHA55及びDHA175との間の発現レベルを比較した。
EMS変異誘発デュラム系統のスクリーニング
Mountrail/PI−330546及びMountrail/IG−86304 M1系統からの種子を、SSIIa−B中の変異について、小麦粉膨潤度試験を用いて間接的にスクリーニングした(表4)。小麦粉膨潤度が6.5未満の系統を、SGPのSDS−PAGEによる分析のために選択した。Mountrail/PI−330546交雑種からの1つの系統DHA175は、SGP−A1/B1、SGP−2及びSGP−3を欠き、Mountrail/IG−86304交雑種からの系統DHA55は、Mountrail/IG−86304(野生型)対照の強度のほぼ半分のSGP−B1バンドを有し(データは示さず)、このことは、ヘテロ接合体の可能性を示した。この系統をさらに1世代(M2:M3)成長させた後に、これは、個別の植物からのSGPのヘテロ接合体であることがSDS−PAGEを用いて確認された。Mountrail/PI−330546(野生型)、Mountrail/PI−330546(SGP-A1ヌル)、DHA175及びホモ接合性SGP−1 2重ヌルDHA55からのデンプン粒タンパク質を、次いで、系列希釈を用いてSDS−PAGEにより分析して、他のSGPの結合に対するSGP−1 2重ヌルの影響を調べた(図3)。DHA175及びDHA55ではともに、SGP−A1及びSGP−B1バンドは完全になくし、SGP−2及びSGP−3バンドは、野生型対照のロードの0.0625×未満の強度を有した。WXバンドは、両方のSGP−1 2重ヌル系統において通常であると見られた。SGP−A1ヌル対照では、SGPバンドはいずれも、野生型対照と比較して変化しているように見られなかった。
親のSGP−A1ヌル系統PI−330546及びIG−86304において、29bpの欠失が、プライマーセットSgp−A1F3/Sgp−A1R3(Shimbataら、2005)を用いて第1エキソン中に145〜174位において見出された。系統DHA175では、SSIIa−B中の点変異が第3エキソン中で979位において見出され、ここでは、プライマーセットSgp−B1F1/Sgp−B1R1(Sestiliら、2010a)を用いて、G/CからA/Tへの移行が生じていた。これは、327番目のアミノ酸をアスパラギン酸(GAT)からアスパラギン(AAT)に変化させた。系統DHA55では、点変異が、プライマーセットSgp−B1F2/Sgp−B1R2(Shimbataら、2005)を用いて、SSIIa−Bにおいて第8エキソン中で1,864位に見出された。これも、アミノ酸622においてアスパラギン酸(GAC)からアスパラギン(AAC)への変化をもたらすG/CからA/Tへの移行であった。
代表的で偏りのないデンプン粒画像を試みて得るために、各デンプン試料のいくつかの画像を様々な拡大レベルで得た。Mountrail/PI−330546(野生型)系統では、より大きいA型顆粒は、平滑でレンズ形であり、より小さいB型顆粒は、球状で平滑であった(図4)。Mountrail/PI−330546(SGP-A1ヌル)系統では、A型デンプン粒は、広い範囲の小さい変形を有したが、平滑さとサイズを維持していると見られた。SGP−A1ヌル系統におけるB型顆粒は、野生型試料で観察されたものと同様であった(図4)。SGP−1 2重ヌル系統であるDHA175及びDHA55では、A型顆粒は変形し、野生型及びSGP−A1ヌル試料よりもほっそりし、ざらざら又は割れた表面を有した(図4)。デンプン粒計数は行わなかったが、SGP−1 2重ヌル系統は、B型顆粒の数が少なかったと見られ、B型顆粒も変形し、へこんだ外観を有した。
SGP−1 2重ヌル及び対照デンプンの糊化特性及びアミロース含量を、DSCを用いて調べた。組み合わせた熱走査サーモグラムは、60℃付近にて観察される第1ピークで表される、SGP−1 2重ヌル系統におけるアミロペクチンの糊化の明確な変化があることを示す(図5)。SGP−1 2重ヌル系統は、野生型コムギ系統から変化した糊化特性を有した。SGP−1 2重ヌル系統は、ピーク高さに基づく著しくより低い糊化温度と、エンタルピーの劇的により小さい変化とを有した(図5、表5)。これらのデータは、アミロペクチン合成の破壊を示す。アミロース糊化と関連する105℃付近の第2ピークは、対照と比較してより低い糊化温度及びエンタルピーのより大きい変化を有するSGP−1 2重ヌル系統と全ての試料にわたって形状及びサイズが類似していた(図5、表5)。SGP−A1ヌル系統におけるアミロース含量は、野生型対照と比較して変化しなかったが、SGP−1 2重ヌル系統は、著しくより高いアミロース含量を有した(表5)。系統DHA175では、41.1%のアミロースの増加があり、DHA55について28.6%の増加があった。
SGP−1 2重ヌル系統におけるデンプン合成に関与する遺伝子のRNA発現レベルを見るために、RNA−Seqを採用した。2つのSGP−1 2重ヌル系統からのデータを組み合わせ、Mountrail(SGP-1野生型)と比較した場合に、転写産物レベルが著しく変化したデンプン合成遺伝子がいくつかあった(表6)。DHA175及びDHA55の両方においてSSIIa−Aに存在する欠失は、SSIIa−A転写産物の劇的な低減を引き起こした(表6)。SSIIa−A及びSsIIa−B遺伝子の高い相同性のために、SSIIa−Aについて検出された少数のヒットは、2つの遺伝子が100%同一である領域から生じたと考えられる。この可能性を評価するために、SSIIa−AヒットをSSIIa−A遺伝子(Genbank:AJ269503)と、Seqman NGEN(DNASTAR、Madison、WI)を用いて整列させた。実質的に全ての40〜50bpヒットが、2つのアイソフォーム間に塩基対の差が存在する遺伝子のセグメントと整列され、このことは、これらがSSIIa−A転写産物からの断片であり、SSIIa−B転写産物の断片ではないことを示した(データは示さず)。SSIIa−B中の2つの独立した点変異は、SSIIa−A中の欠失と同じ効果を生じなかったが、対照的に、SSIIa−Bの著しい上方制御があった(表6)。転写産物の著しい上方制御は、デンプン合成遺伝子Wx−A1、SsI−1、Sbel−A、SbeIIa−A、SbeIIa−B、SSIII、AGPアーゼの大サブユニット及びPho1についても示された。試料はいずれも、選択したグルテニン遺伝子、又はCyp3を除くいずれのハウスキーピング遺伝子についても転写産物レベルの著しい差を示さなかった(表6)。
我々の目標は、SSIIa(SGP-1)の突然変異誘発により高アミロースデュラム系統を開発することであった。これは重要なデンプン生合成酵素であるので、この遺伝子座には自然の変動はほとんどなく、255のTriticum durum受託物のスクリーニング後に、我々は、SGP−A1ヌルであった系統を2つだけ発見し、SGP−B1ヌルであったものはなかった。興味深いことに、SGP−A1ヌルであった2つの系統PI−330546及びIG−86304は、第1エキソン中に同じ29bpの欠失を有した。2つのSGP−1 2重ヌル系統においてその転写産物レベルの著しい低減があったので、この欠失は、不安定なmRNAを生じると見られる。これは、Shimbataら(2005)により報告されたパンコムギにおけるSGP−A1変異体についてと同じ欠失でない(Yamamori及びEndo 1996)。EMS突然変異誘発によりSSIIa−Bにおいて作出された2つの別々の点変異は、同じ効果を生じなかった。実際に、SSIIa−Bの発現は、栽培変種Mountrailと比較してSGP−1 2重ヌル系統において著しくより高かった。SSIIa−Bにおける点変異のいずれも停止コドンを導入しなかったが、アスパラギン酸からアスパラギンへのもたらされたアミノ酸の変化(DHA175において327及びDHA55において622)は、酵素の安定性に明らかに影響した。これらのアミノ酸が、酵素活性のために重要であるのか、又はタンパク質の折り畳みに影響するのかはわからない。
デンプンが改変されたデュラムコムギ植物を用いるコムギ育種プログラム
コムギ育種についての非限定的な方法及び農業上重要な形質(例えばコムギ収率、生物ストレス抵抗性及び無生物ストレス抵抗性の改善など)は、Slafer及びAraus、2007(「Physiological traits for improving wheat yield under a wide range of conditions」、Scale and Complexity in Plant Systems Research: Gene-Plant-Crop Relations、147-156);Reynolds(「Physiological approaches to wheat breeding」、Agriculture and Consumer Protection. Food and Agriculture Organization of the United Nations);Richardら(「Physiological Traits to Improve the Yield of Rainfed Wheat: Can Molecular Genetics Help」、International Maize and Wheat Improvement Center出版);Reynoldsら(「Evaluating Potential Genetic Gains in Wheat Associated with Stress-Adaptive Trait Expression in Elite Genetic Resources under Drought and Heat Stress Crop science」、Crop Science 2007 47:補遺3: S-172-S-189);Setterら(Review of wheat improvement for waterlogging tolerance in Australia and India: the importance of anaerobiosis and element toxicities associated with different soils. Annals of Botany、103巻(2): 221-235);Foulkesら(Major Genetic Chan
ges in Wheat with Potential to Affect Disease Tolerance. Phytopathology、7月、第96巻、第7号、680-688頁(doi: 10.1094/PHYTO-96-0680);Rosyaraら、2006(Yield and yield components response to defoliation of spring wheat genotypes with different level of resistance to Helminthosporium leaf blight. Journal of Institute of Agriculture and Animal Science 27. 42-48.);米国特許第7,652,204号、第6,197,518号、第7,034,208号、第7,528,297号、第6,407,311号;米国特許出願公開第20080040826号、第20090300783号、第20060223707号、第20110027233号、第20080028480号、第20090320152号、第20090320151号;WO/2001/029237A2;WO/2008/025097A1;並びにWO/2003/057848A2に記載されている。
さらなる特徴決定
デンプン含量
SGP−1 2重ヌル系統及び野生型対照デュラムコムギ系統のデンプン含量は、本明細書に記載する1若しくは複数の方法、又はそれぞれが参照によりその全体が組み込まれているMoreelsら(Measurement of Starch Content of Commercial Starches、Starch 39(12):414-416、1987)若しくはChiangら(Measurement of Total and Gelatinized Starch by Glucoamylase and o-toluidine reagent、Cereal Chem. 54(3):429-435)に記載される方法により測定される。SGP−1 2重ヌル系統におけるデンプン含量は、野生型対照デュラムコムギ系統のものと比較してわずかに低減されることが期待される。
SGP−1 2重ヌル系統及び野生型対照デュラムコムギ系統のグリセミック指数は、本明細書に記載する1若しくは複数の方法、又はそれぞれが参照によりその全体が組み込まれているBrounsら(Glycemic index methodology、Nutrition Research Reviews、18(1): 145-171、2005)、Woleverら(The glycemic index: methodology and clinical implications. Am. J. Clin. Nutr. 54(5): 846-54、1991)又はGoniら(A Starch hydrolysis procedure to estimate glycemic index、Human Study、17(3):427-437、1997)に記載される方法により測定される。
SGP−1 2重ヌル系統及び野生型対照デュラムコムギ系統の小麦粉から作られたパスタの質は、本明細書に記載する1若しくは複数の方法、又はそれぞれが参照によりその全体が組み込まれているLandi(Durum wheat, semolina and pasta quality characteristics for an Italian food company、Cheam-Options Mediterraneennes、33-42頁)又はCole(Prediction and measurement of pasta quality、International Journal of Food Science and Technology、26(2): 133-151、1991)に記載される方法により試験される。
SGP−1 2重ヌル系統及び野生型対照デュラムコムギ系統のデンプンは、ラピッドビスコアナライザ(RVA)において、本明細書に記載する1若しくは複数の方法、又はそれぞれが参照によりその全体が組み込まれているNewport科学法ST−00改訂3(General Method for Testing Starch in Rapid Visco Analyzer、1998)、Ross(Amylose, amylopectin, and amylase: Wheat in the RVA、Oregon State University、第55回発表、2008)、Baoら(Starch RVA profile parameters of rice are mainly controlled by Wx gene、Chinese Science Bulletin、44(22):2047-2051、1999)、Raviら(Use of Rapid Visco Analyzer(RVA)for measuring the pasting characteristics of wheat flour as influenced by additives、Journal of the Science of Food and Agriculture、79(12): 1571-1576、1999)又はGamelら(Application of the Rapid Visco Analyzer(RVA)as an Effective Rheological Tool for Measurement of β-Glucan Viscosity、89(1):52-58、2012)に記載される方法により試験される。
SGP−1 2重ヌル系統及び野生型対照デュラムコムギ系統の難消化性デンプン含量は、本明細書に記載する1若しくは複数の方法、又はそれぞれが参照によりその全体が組み込まれているMcClearyら(Measurement of resistant starch、J. AOAC Int. 2002、85(3):665-675)、Muir及びO’Dea(Measurement of resistant starch: factors affecting the amount of starch escaping digestion in vitro、Am. J. Clin. Nutr. 56: 123-127、1992)、Berry(Resistant starch: Formation and measurement of starch that survives exhaustive digestion with amylolytic enzymes during the determination of dietary fibre、Journal of Cereal Science、4(4):301-314、1986)、Englystら(Measurement of resistant starch in vitro and in vivo、British Journal of Nutrition、75(5):749-755、1996)に記載される方法により試験される。
麺硬さ
DHA175及び野生型姉妹系統を圃場で栽培した。穀粒を浄化し、製粉し、得られたセモリナを用いてパスタを調製した。製粉及びパスタ加工手順は、以前に記載されたとおりであった(Carreraら、2007)。簡単に述べると、2つのMiag実験室スケール清浄機を取り付けたBuhler実験ミル(Buhler-Miag、Minneapolis、MN、USA)を用いてデュラムをセモリナに製粉した。水和したセモリナを、DeMaCo半商業的実験室押出機(DeFrancisci Machine Corp、Melbourne、FL、USA)を用いて減圧下でスパゲッティとして押し出した。スパゲッティを、実験室パスタ乾燥機(Standard Industries、Fargo、ND、USA)中で低温(40℃)乾燥サイクルを用いて乾燥させた。
食品の分析
SGP−1 2重ヌル遺伝子型DHA175及びその野生型姉妹系統デュラムコムギ(「野生型」)の穀粒から作製したパスタをさらに分析して、それらの栄養組成を決定した。DHA175及び野生型はともに、Mountrail×PI330546の間の交雑種からのF5由来系統からであった。突然変異していない根源的な種子を野生型と称し、次いでこの種子を突然変異させ、得られたSGP−1 2重ヌルDHA175を回収した。乾燥パスタ及び調理後パスタの両方を分析した。
SGP−A1及びSGP−B1変異体の分離
SGP−1 2重ヌル遺伝子型DHA175及びDHA55をそれぞれ、野生型品種「Mountrail」及び「Divide」と、各交配において雌性として野生型品種の親を用いて交配させた。4つの個体群のそれぞれからのおよそ150のF2植物の遺伝子型を、SGP−A1又はSGP−B1変異のいずれかに特異的なマーカーを用いて決定した。分離型変異の存在又は非存在についてホモ接合性の遺伝子型は、ホモ接合性クラスのそれぞれについて、ほぼ期待されたメンデル比1/16にて見出された(表10)。遺伝子型決定により、単一(個体)SGP−A1及び単一SGP−B1コムギ植物が回収されるSGP−1変異の分離が明らかになった。
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Claims (55)
- デュラムデンプン粒タンパク質−B1(SGP-B1)遺伝子の1つ又は複数の変異と、デュラムデンプン粒タンパク質−A1(SGP-A1)遺伝子の1つ又は複数の変異とを含むデュラムコムギ植物から生成される高アミロース穀粒。
- 前記穀粒のデンプン中のアミロースの割合が、示差走査熱量分析により測定して、少なくとも40%である、請求項1に記載の高アミロース穀粒。
- 前記穀粒のデンプン中のアミロースの割合が、示差走査熱量分析により測定して、少なくとも50%である、請求項1に記載の高アミロース穀粒。
- 前記変異が、SGP−A1遺伝子の第1エキソン中の欠失を含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記欠失が、SGP−A1遺伝子のヌクレオチド145〜174位にある、請求項4に記載の高アミロース穀粒。
- 前記変異が、SGP−B1遺伝子のヌクレオチド979位及び/又は1864位におけるヌクレオチド置換を含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記変異が、SGP−B1のアミノ酸327位におけるアスパラギン酸からアスパラギンへのアミノ酸置換、及び/又はSGP−B1のアミノ酸622位におけるアスパラギン酸からアスパラギンへのアミノ酸置換を導く、請求項6に記載の高アミロース穀粒。
- 約7.5未満の小麦粉膨潤度(FSP)を有する、請求項1〜7のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 請求項1〜8のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒から製造される小麦粉。
- 請求項1〜8のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒から製造されるデンプン。
- 請求項1〜8のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒を含む小麦粉ベース製品。
- 乾燥パスタである、請求項11に記載の小麦粉ベース製品。
- 当該小麦粉ベース製品が、少なくとも17%のタンパク質含量を有し、前記少なくとも17%のタンパク質含量が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項11又は12に記載の小麦粉ベース製品。
- 当該小麦粉ベース製品が、少なくとも20%のタンパク質含量を有し、前記少なくとも20%のタンパク質含量が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項11又は12に記載の小麦粉ベース製品。
- 当該小麦粉ベース製品が、少なくとも3%の食物繊維含量を有し、前記少なくとも3%の食物繊維含量が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項11又は12に記載の小麦粉ベース製品。
- 当該小麦粉ベース製品が、少なくとも7%の食物繊維含量を有し、前記少なくとも7%の食物繊維含量が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項11又は12に記載の小麦粉ベース製品。
- 当該小麦粉ベース製品が、少なくとも2%の難消化性デンプン含量を有し、前記少なくとも2%の難消化性デンプン含量が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項11又は12に記載の小麦粉ベース製品。
- 当該小麦粉ベース製品が、少なくとも3%の難消化性デンプン含量を有し、前記少なくとも3%の難消化性デンプン含量が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項11又は12に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記高アミロース穀粒のデンプン中のアミロース含量が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒のデンプンと比較して増加している、請求項1に記載の高アミロース穀粒。
- 前記変異が、SGP−A1遺伝子の第1エキソン中の欠失を含む、請求項19に記載の高アミロース穀粒。
- 前記欠失が、SGP−A1遺伝子のヌクレオチド145〜174位にある、請求項20に記載の高アミロース穀粒。
- 前記変異が、SGP−B1遺伝子のヌクレオチド979位及び/又は1864位におけるヌクレオチド置換を含む、請求項19〜21のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記変異が、SGP−B1のアミノ酸327位におけるアスパラギン酸からアスパラギンへのアミノ酸置換、及び/又はSGP−B1のアミノ酸622位におけるアスパラギン酸からアスパラギンへのアミノ酸置換を導く、請求項22に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒の食物繊維、難消化性デンプン及びタンパク質含量の割合が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒と比較して増加している、請求項19〜23のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒から作られるデンプンのアミロース含量が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から作られるデンプンのアミロース含量より少なくとも12%高い、請求項19〜23のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒から作られるデンプンのアミロース含量が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から作られるデンプンのアミロース含量より少なくとも25%高い、請求項19〜23のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒から作られるデンプンのアミロース含量が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から作られるデンプンのアミロース含量より少なくとも40%高い、請求項19〜23のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒からのデンプンが、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒からのデンプンと比較して、B型デンプン粒の量において全体として減少している、請求項19〜27のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒からのデンプンが、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒からのデンプンと比較して、糊化特性が変化している、請求項19〜28のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒から作られるパスタ又は麺類が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から作られるパスタ又は麺類と比較して、硬さが増加している、請求項19〜29のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒から作られるパスタ又は麺類が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造されるパスタ又は麺類と比較して、グリセミック指数が低減している、請求項19〜30のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒から作られるパスタ又は麺類が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造されるパスタ又は麺類と比較して、加熱過多に対する抵抗性が増加している、請求項19〜31のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 前記高アミロース穀粒から作られるパスタ又は麺類が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造されるパスタ又は麺類と比較して、タンパク質含量が増加している、請求項19〜32のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒。
- 請求項19〜33のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒から製造される小麦粉。
- 請求項19〜33のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒から製造されるデンプン。
- 請求項19〜33のいずれか一項に記載の高アミロース穀粒を含む小麦粉ベース製品。
- 乾燥パスタである、請求項36に記載の小麦粉ベース製品。
- 同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも10%高い、増加したタンパク質含量を有し、タンパク質含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記小麦粉ベース製品が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも20%高い、増加したタンパク質含量を有し、前記タンパク質含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記小麦粉ベース製品が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも30%高い、増加したタンパク質含量を有し、前記タンパク質含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記小麦粉ベース製品が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも50%高い、増加した食物繊維含量を有し、前記食物繊維含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記小麦粉ベース製品が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも100%高い、増加した食物繊維含量を有し、前記食物繊維含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記小麦粉ベース製品が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも200%高い、増加した食物繊維含量を有し、前記食物繊維含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記小麦粉ベース製品が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも50%高い、増加した難消化性デンプン含量を有し、前記難消化性デンプン含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記小麦粉ベース製品が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも100%高い、増加した難消化性デンプン含量を有し、前記難消化性デンプン含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- 前記小麦粉ベース製品が、同様の圃場条件で栽培した適当なデュラムコムギ指標品種の穀粒から製造される小麦粉ベース製品より少なくとも200%高い、増加した難消化性デンプン含量を有し、前記難消化性デンプン含量の増加が、高アミロース穀粒によりもたらされる、請求項36又は37に記載の小麦粉ベース製品。
- デュラムデンプン粒タンパク質(SGP-B1)の1つ又は複数の変異と、デュラムデンプン粒タンパク質−A1(SGP-A1)遺伝子の1つ又は複数の変異とを有するデュラムコムギ植物を生成する方法であって、
a.デュラムデンプン粒タンパク質−A1(SGP-A1)遺伝子の1つ又は複数の変異を含有するデュラムコムギ穀粒に突然変異を誘発して、突然変異誘発穀粒の個体群を形成することと、
b.前記突然変異誘発デュラムコムギ穀粒から1種又は複数のデュラムコムギ植物を栽培することと、
c.得られた植物をスクリーニングして、デュラムSGP−B1変異遺伝子を有するデュラムコムギ植物を同定することと、
d.デュラムSGP−B1変異遺伝子を含有する1種又は複数のデュラムコムギ植物を選択することと
を含み、
前記デュラムコムギ植物が、デュラムデンプン粒タンパク質−B1(SGP-B1)遺伝子の1つ又は複数の変異と、デュラムデンプン粒タンパク質−A1(SGP-A1)遺伝子の1つ又は複数の変異とを含み、前記植物が、高アミロース穀粒を生成する、方法。 - デュラムデンプン粒タンパク質(SGP-B1)の1つ又は複数の変異と、デュラムデンプン粒タンパク質−A1(SGP-A1)遺伝子の1つ又は複数の変異とを有するデュラムコムギ植物を生成する方法であって、
a.デュラムSGP−A1遺伝子上に1つ又は複数の変異を含有するデュラムコムギ植物と、デュラムSGP−B1遺伝子上に1つ又は複数の変異を含有する第2のデュラムコムギ植物とを交配させることと、
b.得られる穀粒を収穫することと、
c.収穫した穀粒を植物まで栽培することと
を含み、
得られるデュラムコムギ植物が、デュラムデンプン粒タンパク質−B1(SGP-B1)遺伝子の1つ又は複数の変異と、デュラムデンプン粒タンパク質−A1(SGP-A1)遺伝子の1つ又は複数の変異とを含み、前記植物が、高アミロース穀粒を生成する、方法。 - 前記変異が、SGP−A1遺伝子の第1エキソン中の欠失を含む、請求項47又は48に記載の方法。
- 前記欠失が、SGP−A1遺伝子のヌクレオチド145〜174位にある、請求項49に記載の方法。
- 前記変異が、SGP−B1遺伝子のヌクレオチド979位及び/又は1864位におけるヌクレオチド置換を含む、請求項47〜50のいずれか一項に記載の方法。
- 前記変異が、SGP−B1のアミノ酸327位におけるアスパラギン酸からアスパラギンへのアミノ酸置換、及び/又はSGP−B1のアミノ酸622位におけるアスパラギン酸からアスパラギンへのアミノ酸置換を導く、請求項51に記載の方法。
- 植物組織を培養及び再生する方法であって、請求項47〜52のいずれか一項に記載の方法により生成されるコムギ植物の少なくとも一部分を培養することを含み、前記植物の一部分が、植物再生を促す条件下で培養され、そのことにより前記植物が再生される、方法。
- 雑種種子を生成する方法であって、請求項47〜53のいずれか一項に記載の方法により生成されるコムギ植物を別の植物と交配させることと、得られる種子を収穫することとを含む方法。
- 高アミロースデュラム穀粒を有するデュラムコムギ植物を育種する方法であって、
i)請求項47〜54のいずれか一項に記載の方法により生成される第1植物と、第2植物との間の交雑種を作製して、F1植物を生成することと、
ii)F1植物を第2植物に戻し交配することと、
iii)戻し交配工程を1又は複数回反復して、近同質遺伝子又は同質遺伝子系統を得ることと
を含み、
請求項49〜52のいずれか一項に記載のSGP−A1及びSGP−B1変異が、第2植物、並びにSGP−A1及び/又はSBP−B1変異を有する第2植物に由来する近同質遺伝子又は同質遺伝子系統のゲノム中に組み込まれている、方法。
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