JP2015518716A - Mhcクラスiプロモーターを含有するレンチウイルスベクター - Google Patents
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Abstract
Description
(i)パッケージングプラスミド(少なくともGag、Pol Rev、Tatおよび、幾つかの場合ではトランスファー構築物のパッケージングに必要な構造タンパク質および酵素タンパク質を発現する);
(ii)トランスファープラスミド(発現カセットならびにパッケージング、逆転写、および組み込みに必要なHIVシス作用性因子を含有する);ならびに
(iii)エンベロープコードプラスミド(ほとんどの場合、幅広い種類の細胞、特には、DCを含む主要組織適合(MHC)抗原提示細胞(APC)を標的にすることができる混合粒子(偽型)の形成を可能にするタンパク質、水疱性口内炎ウイルスの糖タンパク質(VSV.G))
によりHEK 293Tヒト培養細胞を一過性トランスフェクションしたときに組換え技術により作製することができる。
1.最大の免疫応答を誘導するための、樹状細胞を含む抗原提示細胞における高発現;
2.誘導された免疫応答による排除に十分な他の形質導入細胞タイプにおける発現;および
3.挿入による影響を回避するためのエンハンサーエレメントの欠如
attggggagtcccagccttggggattccccaactccgcagtttcttttctccctctcccaacctatgtagggtccttcttcctggatactcacgacgcggacccagttctcactcccattgggtgtcgggtttccagagaagccaatcagtgtcgtcgcggtcgcggttctaaagtccgcacgcacccaccgggactcagattctccccagacgccgagg
(配列番号1)
ggggaggcgcagcgttggggattccccactcccctgagtttcacttcttctcccaacttgtgtcgggtccttcttccaggatactcgtgacgcgtccccacttcccactcccattgggtattggatatctagagaagccaatcagcgtcgccgcggtcccagttctaaagtccccacgcacccacccggactcagag
(配列番号2)
cactggggaggcgccgcgttgaggattctccactcccctcagtttcacttcttctcccaacctgcgtcgggtccttcttcctgaatactcatgacgcgtccccaattcccactcccattgggtgtcgggttctagagaagccaatcagcgtctccgcagtcccggtctaaagtccccagtcacccacccggactcagattctccccagacgccgag
(配列番号3)
taagaactgctgattgctgggaaactctgcagtttcccgttcctctcgtaacctggtcatgtgtccttcttcctggatactcatgacgcagactcagttctcattcccaatgggtgtcgggtttctagagaagccaatcagcgtcgccacgactcccgactataaagtccccatccggactcaagaagttctcaggactcagagg
(配列番号4)
aggccccgaggcggtgtctggggttggaaggctcagtattgagaattccccatctccccagagtttctctttctctcccaacccgtgtcaggtccttcatcctggatactcataacgcggccccatttctcactcccattgggcgtcgcgtttctagagaagccaatcagtgtcgccgcagttcccaggttctaaagtcccacgcaccccgcgggactcatatttttcccagacgcggaggttggggtcatg
(配列番号5)
本発明の文脈内では「レンチウイルスベクター」は、シス作用性レンチウイルスRNAまたはDNA配列を含み、トランスで提供されるレンチウイルスタンパク質(例えば、Gag、Pol、および/またはEnv)を必要とする導入遺伝子による宿主細胞の形質導入のための非複製ベクターを意味する。レンチウイルスベクターは、機能性Gag、Pol、およびEnvタンパク質の発現を欠く。レンチウイルスベクターは、前記レトロウイルスベクターの作製または開発の段階に応じてRNAまたはDNA分子の形態で存在してもよい。
本発明の文脈内で「導入遺伝子」は、レンチウイルスベクターで形質導入される細胞に普通は存在しない、レンチウイルスベクター内の核酸配列である。レンチウイルスベクターは、形質導入細胞にこの配列を導入するのに役立つ。用語「導入遺伝子」は、導入遺伝子の形質導入を促進するようなベクターの配列を含まない。導入遺伝子は、別の生物由来の核酸配列であってもよい。あるいは、導入遺伝子は、同じ生物由来であるが、発現を制御する異なる調節配列を有する核酸配列であってもよい。導入遺伝子は、センスまたはアンチセンス核酸分子であってもよい。本発明の好ましい実施形態によれば、導入遺伝子配列は免疫原性ポリペプチドをコードする。
本発明は、レンチウイルスベクターへのMHCクラスI(MHCI)プロモーターの挿入を包含する。本明細書で使用されるとき、「MHCクラスI(MHCI)プロモーター」は、自然発生または合成MHCクラスIプロモーターを含む。用語「MHCクラスIプロモーター」は、β2mプロモーターを含まない。
自然発生MHCIプロモーターの例は、HLA−A2、HLA−B7、HLA−Cw5、HLA−E、HLA−F遺伝子プロモーターである。これらの自然発生MHCIプロモーターは通常、MHCクラスIタンパク質をコードする遺伝子、またはゲノムデータベース(例えば:NCBIポリヌクレオチドデータベースhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/dna−rna)中のこのようなタンパク質を推定的にコードすると見なされる遺伝子のプロモーター領域からクローン化または複製される。β2mおよびクラスI MHCタンパク質は両方とも、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)に進入する。
MHCクラスIプロモーターはまた、合成であってもよい。合成MHCクラスIプロモーターには、MHCクラスIプロモーターの個々の成分を会合するために分子生物学的手法を用いて合成されるプロモーター、または分子生物学的手法を用いる自然発生MHCクラスIプロモーターに由来するプロモーターが含まれる。
MHCクラス遺伝子の転写は、通常は2つの主要な調節エレメント:インターフェロン刺激応答エレメント(ISRE)およびSXYモジュール(W/S、X1X2/部位αおよびY/エンハンサーB調節エレメントを包含する)(図1参照)により媒介される。Van den Elsen、Immunogenetics(1998) 48:208〜211頁も参照のこと。
別の調節エレメント、エンハンサーA(核内転写因子κB(NF−κB)に対する結合部位を含有する)は、ほとんどの場合で存在する。故に、核内転写因子κB(NF−κB)に結合することはMHCクラスIプロモーターの特性である。これは、例えば、ゲルシフトアッセイにより検証することができる。
ISREに加えて、MHCクラスIプロモーターは通常、合わせてSXYモジュールと呼ばれる3つの調節エレメント:SまたはWボックス、X1/CREX2ボックスまたは部位α、およびYボックスまたはエンハンサーBからなる保存された上流配列モチーフの別のセットを共有する。このSXYモジュールは通常、調節因子X(RFX;RFX5、RFXB/ANKおよびRFXAPからなる)、cAMP応答エレメント結合タンパク質(CREB)/活性化転写因子(ATF)、および核内因子Y(NFY)を含有する多タンパク質複合体により協同的に結合され、これらの遺伝子のトランス活性化を駆動するエンハンセオソームとして作用する。故に、これらの因子に結合することはMHCクラスIプロモーターの特性である。これは、例えば、ゲルシフトアッセイにより検証することができる。
本発明は、好ましくはエンハンサー配列を含まないが、代わりにクラスI MHCプロモーターを含有するレンチウイルス粒子ベクターの作製方法を提供する。レンチウイルス粒子ベクター(またはレンチウイルスベクター粒子)は、ウイルスタンパク質に関連してレンチウイルスベクターを含む。該ベクターは、組み込みまたは非組み込みベクターであってもよい。
1)エンハンサー配列に関連した挿入変異のリスクを減少させる;および
2)MHCクラスIプロモーターは、全てでないとしてもほとんどのヒト細胞タイプで活性化されるため、ひとたび免疫応答が導入遺伝子の産物に対して誘発されれば、ベクターが組み込まれた細胞は全て、どんな細胞タイプであれ免疫系により排除される。故に、一定の期間後、人体はこのようなベクターのいかなる複製物も含有し得ない。
−細菌複製起源(例えば:pUC ori)、
−選択のための抗生物質耐性遺伝子(例えば:KanR)、およびより特定すると
−MHCクラスIプロモーターに転写的に連結された少なくとも1つの導入遺伝子を含むレンチウイルスベクター
を含み得る。
i)適切な宿主細胞にレンチウイルスベクターをトランスフェクトするステップと、
ii)前記宿主細胞に、レトロウイルス(好ましくはレンチウイルス)の少なくとも構造活性およびポリメラーゼ(+/−インテグラーゼ)活性をコードするウイルスDNA配列を含有するパッケージングプラスミドベクターをトランスフェクトするステップと(このようなパッケージングプラスミドは当技術分野で記載されている(Dullら、1998、J Virol、72(11):8463〜71頁;Zuffereyら、1998、J Virol 72(12):9873〜80頁))、
iii)前記レンチウイルスベクターの発現およびレンチウイルスベクター粒子へのパッケージングを得るために、前記トランスフェクト宿主細胞を培養するステップと、
iv)前記培養宿主細胞におけるステップiii)の発現およびパッケージングの結果生じるレンチウイルスベクター粒子を回収するステップと
を含む、本発明による組換えベクター粒子の作製を可能にする。
−cPPT/CTSポリヌクレオチド配列と、
−MHCクラスIプロモーターの制御下の導入遺伝子配列、および場合により、上に記載された追加のエレメントの1つと
を含むことができる。
本発明は、導入遺伝子を細胞、好ましくは非分裂細胞で発現させる方法を包含する。方法は、導入遺伝子の発現を可能にする条件下で、細胞を本発明のレンチウイルスベクターまたはレンチウイルス粒子ベクターで形質導入するステップを含む。
本発明はさらに、エピトープ、より特にMHCクラスIプロモーターの転写制御下でベクター中に存在する導入遺伝子によりコードされたエピトープに対する免疫学的反応の発生または改善を誘発するまたはこれに寄与することができる治療組成物またはワクチンを調製するための、本発明によるレンチウイルスベクター(特にはレンチウイルス粒子ベクターの形態で)の使用に関する。
様々なプロモーターを包含するレンチベクター構築物を用いてHEK293T(線維芽細胞系)およびBDCM(樹状様細胞系)細胞を形質導入し、GFP発現を駆動するプロモーターの能力をフローサイトメトリーにより評価した。BDCM細胞におけるMFI(平均蛍光強度)を293T細胞で得られたMFIの%で表す。
様々なプロモーターを包含するレンチベクターを用いて、様々なインターフェロン分子の存在下でHEK293TおよびBDCM細胞を形質導入した。GFP発現を駆動するプロモーターの能力を次いで評価した。MHC−Iおよびβ2mプロモーターの縮小バージョン、HLA−A2、HLA−B7、HLA−Eおよびβ2m−SXYプロモーター(κΒおよびISRE調節配列を除去し、MHCII様プロモーターに形質転換したプロモーター)もテストした。
C57BI/6jマウスを、HIV抗原発現が様々なプロモーター(ウイルス、ユビキタス、MHCIおよびMHCII)により駆動される1×106TUのレンチベクターで免疫した。免疫12日後、特異的T細胞応答をIFN−γ ELISPOTによりマウス脾臓細胞でモニターした。図4に示されているように、MHCIプロモーターを包含するレンチベクターによる免疫化は、ウイルスプロモーターが抗原発現を駆動しているときでさえ、使用された他のレンチベクターより高い特異的T細胞応答を示した。
Claims (14)
- 免疫原性ポリペプチドをコードする導入遺伝子配列を含むレンチウイルスベクターであって、導入遺伝子配列がMHCクラスIプロモーターの転写制御下にある、レンチウイルスベクター。
- コードされた免疫原性ポリペプチドに対し、導入遺伝子配列がCMVプロモーターの転写制御下にあるベクターより大きなCTL応答をインビボで誘導する、請求項1のレンチウイルスベクター。
- MHCクラスIプロモーターが、HLA−A2プロモーター、HLA−B7プロモーター、HLA−Cw5プロモーター、HLA−F、またはHLA−Eプロモーターである、請求項1または2に記載のレンチウイルスベクター。
- 前記プロモーター配列が、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、または配列番号5のプロモーター配列と90%を超える、好ましくは95%を超える、より好ましくは99%を超える同一性を共有するポリヌクレオチド配列を含む、請求項1または2に記載のレンチウイルスベクター。
- U3のプロモーターおよびエンハンサーが欠失しているLTR、レンチウイルス由来のcPPT/CTS配列、Ψ(プサイ)配列、または2つのレンチウイルスLTRを含む、請求項1〜4のいずれか1項に記載のレンチウイルスベクター。
- レンチウイルスベクターがエンハンサーを含有しない、請求項1〜5のいずれか1項に記載のレンチウイルスベクター。
- 前記免疫原性ポリペプチドが、HIVウイルス由来のGag、Polおよび/またはNefタンパク質由来の抗原、または少なくとも1つの腫瘍抗原を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載のレンチウイルスベクター。
- 請求項1〜7のいずれか1項に記載のレンチウイルスベクターを含む単離された宿主細胞。
- レンチウイルスベクター粒子の作製方法であって、
a)適切な宿主細胞に請求項1〜7のいずれか1項に記載のレンチウイルスベクターをトランスフェクトするステップと、
b)前記宿主細胞に、レトロウイルスの少なくとも構造活性およびポリメラーゼ活性をコードするウイルスDNA配列を含有するパッケージングプラスミドベクターをトランスフェクトするステップと、
c)前記レンチウイルスベクターの発現およびレンチウイルスベクター粒子へのパッケージングを得るために、前記トランスフェクト宿主細胞を培養するステップと、
d)前記培養宿主細胞におけるステップc)の発現およびパッケージングの結果生じるレンチウイルスベクター粒子を回収するステップと
を含む、方法。 - 請求項1〜7のいずれか1項に記載のレンチウイルスベクターを含む、レンチウイルスベクター粒子。
- 少なくとも以下の配列エレメント:
a)cPPT/CTSポリヌクレオチド配列と、
b)U3のプロモーターおよびエンハンサーが欠失しているLTRと、
c)MHCクラスIプロモーターの制御下の導入遺伝子配列と
を含むレンチウイルスベクター粒子。 - 前記プロモーター配列が、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、または配列番号5のプロモーター配列と90%を超える、好ましくは95%を超える、より好ましくは99%を超える同一性を共有するポリヌクレオチド配列を含む、請求項11に記載のレンチウイルスベクター粒子。
- T細胞応答の誘導方法であって、cPPT/CTSポリヌクレオチド配列と、U3のプロモーターおよびエンハンサーが欠失しているLTRと、MHCクラスIプロモーターの制御下の導入遺伝子配列とを含むレンチウイルスベクター粒子を患者に投与するステップを含む、方法。
- 医薬品またはワクチンとして使用するための、請求項1〜7および11〜13のいずれか1項に記載のレンチウイルスベクターまたはレンチウイルスベクター粒子。
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