JP2015503911A - 遺伝子情報管理装置および方法 - Google Patents
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Abstract
本発明は、個人の遺伝子情報を安全に保管し、照会することができるようにする遺伝子情報管理装置および方法を提供する。遺伝子情報管理装置は、被検者の塩基配列を標準塩基配列と比較して最大共通塩基配列を確認し、最大共通塩基配列に合わせて標準塩基配列を基準に被検者の塩基配列を整列する。遺伝子情報管理装置は、整列した塩基配列を複数の塩基コード群に分離し、複数の塩基コード群に複数の区分子をそれぞれ割り当てた後、複数の塩基コード群を対応する区分子と関連付けて複数の保存部にそれぞれ保存する。
Description
本発明は、遺伝子情報管理装置および方法に関する。
ヒトの遺伝情報は、アデニン(Adenine)、グアニン(Guanine)、シトシン(Cytosine)、チミン(Thymine)から構成された約30億個の塩基配列に保存される。被検者の全体塩基配列自体を解読する(decode)技術はすでに商用化されているが、この塩基配列により暗号化されている3万余りの遺伝子のうち、極めて一部分のみがその意味が明らかになっている。
塩基配列により暗号化されている遺伝子情報は、今後も持続的に明らかになるため、塩基配列を解読した被検者は、新たに明らかになった遺伝子の特定の塩基配列に対する本人の保有有無を確認するために本人の塩基配列に対する反復的且つ持続的な照会を必要とする。
塩基配列により暗号化されている遺伝子情報は、今後も持続的に明らかになるため、塩基配列を解読した被検者は、新たに明らかになった遺伝子の特定の塩基配列に対する本人の保有有無を確認するために本人の塩基配列に対する反復的且つ持続的な照会を必要とする。
しかしながら、個人の遺伝子情報は、本人だけでなく、血縁家族の遺伝的特性を総網羅しているため、ハッキングなどにより当該情報に対する侵害事件が発生する時には想像を超越する程度に深刻な被害を招くおそれがある。
金融や医療サービス、移動通信など生活全般に情報通信技術の適用範囲が拡大することに伴って暗号化技術のように個人情報侵害を予防するための多様な技術が導入されつつあり、個人の遺伝子情報の場合、他の如何なる個人情報よりも高い水準の強力な個人情報保護手段が必要な状況である。
金融や医療サービス、移動通信など生活全般に情報通信技術の適用範囲が拡大することに伴って暗号化技術のように個人情報侵害を予防するための多様な技術が導入されつつあり、個人の遺伝子情報の場合、他の如何なる個人情報よりも高い水準の強力な個人情報保護手段が必要な状況である。
本発明の課題は、個人の遺伝子情報を安全に保管し、照会することができるようにする遺伝子情報管理装置および方法を提供することにある。
本発明の一実施態様によれば、塩基配列受信部と、塩基コード群分離部と、区分子割当部と、複数の保存部と、保存制御部と、を含む遺伝子情報管理装置が提供される。前記塩基配列受信部は、解読した被検者の塩基配列を受信し、前記塩基コード群分離部は、前記塩基配列を複数の塩基コード群に分離する。前記区分子割当部は、前記複数の塩基コード群に複数の区分子をそれぞれ割り当て、前記保存制御部は、前記複数の塩基コード群を対応する区分子と関連付けて前記複数の保存部にそれぞれ保存する。
本発明の別の実施態様によれば、遺伝子情報管理装置で被検者の遺伝子情報を管理する方法が提供される。この方法は、解読した被検者の塩基配列を受信する段階と、前記塩基配列を複数の塩基コード群に分離する段階と、前記複数の塩基コード群に複数の区分子をそれぞれ割り当てる段階と、前記複数の塩基コード群を対応する区分子と関連付けて複数の保存部にそれぞれ保存する段階と、を含む。
本発明のさらに別の実施態様によれば、区分子受信部と、複数の保存部と、塩基コード群収集部と、塩基配列組み立て部と、照会対象塩基配列受信部と、比較部と、出力部と、を含む遺伝子情報管理装置が提供される。前記区分子受信部は、複数の区分子を含む被検者の区分子情報を受信し、前記複数の保存部は、塩基配列が分離されて形成された塩基コード群を区分子と関連付けて保存している。前記塩基コード群収集部は、前記複数の保存部で前記複数の区分子にそれぞれ対応する複数の塩基コード群を収集し、前記塩基配列組み立て部は、前記複数の塩基コード群を前記塩基配列の分離に用いられた規則により組み立てて被検者の塩基配列を生成する。前記照会対象塩基配列受信部は、照会対象塩基配列を受信し、前記比較部は、前記被検者の塩基配列と前記照会対象塩基配列とを比較して前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断し、前記出力部は、前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かに対する情報を出力する。
本発明のさらに別の実施態様によれば、遺伝子情報管理装置で被検者の遺伝子情報を管理する方法が提供される。この方法は、複数の区分子を含む被検者の区分子情報を受信する段階と、複数の保存部で各区分子に対応する塩基コード群を照会して前記複数の区分子にそれぞれ対応する複数の塩基コード群を収集する段階と、塩基配列を塩基コード群に分離することに用いられた規則により前記複数の塩基コード群を組み立てて被検者の塩基配列を生成する段階と、照会対象塩基配列を受信する段階と、前記被検者の塩基配列と前記照会対象塩基配列とを比較して前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断する段階と、前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かに対する情報を出力する段階と、を含む。
本発明の一実施態様によれば、被検者の複数の塩基コード群に対する区分子情報を正確に知っている場合には、被検者の塩基配列が正確に復旧され、照会され得る。しかしながら、被検者の複数の塩基コード群に対する区分子情報を知らない場合には、被検者の実際の塩基配列を発見できない。
また、被検者が自分の遺伝子情報に対する破棄を希望する場合、本人の複数の塩基コード群に対する区分子情報を自ら破棄することだけで本人の個人遺伝子情報をDB自体から削除するのと同一の効果を得ることができる。
また、被検者が自分の遺伝子情報に対する破棄を希望する場合、本人の複数の塩基コード群に対する区分子情報を自ら破棄することだけで本人の個人遺伝子情報をDB自体から削除するのと同一の効果を得ることができる。
以下、添付の図面を参照して本発明の実施形態について本発明が属する技術分野における通常の知識を有する者が容易に実施することができるように詳しく説明する。ただし、本発明は、多様な異なる形態に実現することができ、ここで説明する実施形態に限定されない。そして、図面において、本発明を明確に説明するために説明上不要な部分は省略し、明細書全体にわたって類似する部分については類似する図面符号を付した。
明細書全体で、ある部分がある構成要素を「含む」とする時、これは特に反対の記載がない限り、他の構成要素を除外するのではなく、他の構成要素をさらに包含することができることを意味する。
明細書全体で、ある部分がある構成要素を「含む」とする時、これは特に反対の記載がない限り、他の構成要素を除外するのではなく、他の構成要素をさらに包含することができることを意味する。
以下、図面を参照して本発明の実施形態に係る遺伝子情報管理装置および方法について説明する。
図1は、本発明の一実施形態に係る遺伝子情報管理装置のブロック図である。
図1を参照すれば、本発明の一実施形態に係る遺伝子情報管理装置100は、塩基配列受信部105、最大共通塩基配列確認部110、整列部115、塩基コード群分離部120、区分子割当部125、保存制御部130、複数の保存部135、区分子受信部140、塩基コード群収集部145、塩基配列組み立て部150、照会対象塩基配列受信部155、比較部160および出力部165を含む。
図1は、本発明の一実施形態に係る遺伝子情報管理装置のブロック図である。
図1を参照すれば、本発明の一実施形態に係る遺伝子情報管理装置100は、塩基配列受信部105、最大共通塩基配列確認部110、整列部115、塩基コード群分離部120、区分子割当部125、保存制御部130、複数の保存部135、区分子受信部140、塩基コード群収集部145、塩基配列組み立て部150、照会対象塩基配列受信部155、比較部160および出力部165を含む。
塩基配列受信部105は、解読した(decoded)被検者の塩基配列(base sequence)を受信する。
最大共通塩基配列確認部110は、受信した塩基配列を標準塩基配列と比較して、共通した塩基配列区間中の最も長い区間に該当する最大共通塩基配列(the longest common base sequence)を確認する。
整列部115は、最大共通塩基配列確認部110が確認した最大共通塩基配列に合わせて標準塩基配列に被検者の塩基配列を整列する。
最大共通塩基配列確認部110は、受信した塩基配列を標準塩基配列と比較して、共通した塩基配列区間中の最も長い区間に該当する最大共通塩基配列(the longest common base sequence)を確認する。
整列部115は、最大共通塩基配列確認部110が確認した最大共通塩基配列に合わせて標準塩基配列に被検者の塩基配列を整列する。
塩基コード群分離部120は、整列部115が整列した塩基配列を特定規則により複数の塩基コード群に分離する。ここで特定規則は、複数の数列に該当し得る。
区分子割当部125は、塩基コード群分離部120により分離された複数の塩基コード群に複数の区分子をそれぞれ割り当てる。
保存制御部130は、複数の塩基コード群を複数の保存部135にそれぞれ保存する。
複数の保存部135は、物理的または論理的に区分され得る。
区分子割当部125は、塩基コード群分離部120により分離された複数の塩基コード群に複数の区分子をそれぞれ割り当てる。
保存制御部130は、複数の塩基コード群を複数の保存部135にそれぞれ保存する。
複数の保存部135は、物理的または論理的に区分され得る。
区分子受信部140は、入力装置を通じて被検者から複数の区分子から構成された区分子情報を受信する。
塩基コード群収集部145は、各区分子に対応する保存部135で各区分子に対応する塩基コード群を照会して複数の区分子にそれぞれ対応する複数の塩基コード群を収集する。
塩基配列組み立て部150は、塩基コード群収集部145により収集された複数の塩基コード群を塩基配列の分離に用いられた特定規則により組み立てて、区分子情報に該当する被検者の塩基配列を生成する。
塩基コード群収集部145は、各区分子に対応する保存部135で各区分子に対応する塩基コード群を照会して複数の区分子にそれぞれ対応する複数の塩基コード群を収集する。
塩基配列組み立て部150は、塩基コード群収集部145により収集された複数の塩基コード群を塩基配列の分離に用いられた特定規則により組み立てて、区分子情報に該当する被検者の塩基配列を生成する。
照会対象塩基配列受信部155は、入力装置を通じて被検者から照会対象塩基配列を受信する。
比較部160は、塩基配列組み立て部150により組み立てられた塩基配列と照会対象塩基配列受信部155により受信された照会対象塩基配列とを比較して、組み立てられた塩基配列が照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断する。
出力部165は、比較部160の比較結果を出力した後、組み立てられた塩基配列をメモリから削除する。
比較部160は、塩基配列組み立て部150により組み立てられた塩基配列と照会対象塩基配列受信部155により受信された照会対象塩基配列とを比較して、組み立てられた塩基配列が照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断する。
出力部165は、比較部160の比較結果を出力した後、組み立てられた塩基配列をメモリから削除する。
次に、図2を参照して本発明の一実施形態に係る遺伝子情報保存方法について説明する。
図2は、本発明の一実施形態に係る遺伝子情報保存方法を示したフローチャートである。
図2を参照すれば、塩基配列受信部105は、解読した被検者の塩基配列を受信する(S101)。
図2は、本発明の一実施形態に係る遺伝子情報保存方法を示したフローチャートである。
図2を参照すれば、塩基配列受信部105は、解読した被検者の塩基配列を受信する(S101)。
最大共通塩基配列確認部110は、受信した塩基配列を標準塩基配列と比較して共通した塩基配列区間中の最も長い区間に該当する最大共通塩基配列を確認する(S103)。例えば、被検者の塩基配列が「...AAGCATCC...」であり、標準塩基配列が「...ATGCATGC...」である場合、最大共通塩基配列は「GCAT」に該当する。
整列部115は、確認された最大共通塩基配列に合わせて標準塩基配列を基準に被検者の塩基配列を整列する(S105)。
整列部115は、確認された最大共通塩基配列に合わせて標準塩基配列を基準に被検者の塩基配列を整列する(S105)。
塩基コード群分離部120は、整列した塩基配列を特定規則により複数の塩基コード群に分離する(S107)。塩基コード群分離部120は、整列した塩基配列から複数の数列にそれぞれ該当する複数の塩基コード群を抽出することができる。例えば、塩基コード群分離部120が2個の塩基コード群を形成するとすれば、塩基コード群分離部120は、塩基配列から数列2n(nは自然数)に該当する一つの塩基コード群を抽出し、数列2n−1に該当する他の一つの塩基コード群を抽出することができる。つまり、被検者の塩基配列が「...AAGCATCC...」である場合、塩基コード群分離部120は数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」を形成し、数列2n+1に該当する塩基コード群「...AXGXAXCX...」を形成することができる。ここでは奇数番目要素(element)を抽出する数列(2n−1)と偶数番目要素を抽出する数列(2n)とを用いて塩基配列から2個の塩基コード群を形成する場合を例に挙げたが、塩基コード群分離部120が用いる複数の数列は、重複した要素を有してもよく、有さなくてもよい。また、塩基コード群分離部120は、より複雑な数列を用いて塩基配列をより多くの塩基コード群に分離して情報保護の水準を高めることができる。
区分子割当部125は、複数の塩基コード群に互いに異なる区分子をそれぞれ割り当てる(S109)。この複数の区分子は、遺伝子情報を照会するためのパスワードまたは認証情報の役割を果たす。例えば、区分子割当部125は、数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」に区分子5を割り当て、数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXCX...」に区分子8を割り当てることができる。区分子割当部125は、乱数表、乱数生成などを利用して複数の区分子を生成し、複数の塩基コード群に複数の区分子をそれぞれ割り当てることができる。
保存制御部130は、複数の塩基コード群を複数の保存部135にそれぞれ保存する(S111)。この時、保存制御部130は、各塩基コード群を対応する区分子と関連付けて対応する保存部135に保存する。保存部135は、物理的または論理的に分離していられる複数の保存部で形成され得る。この場合、保存制御部130は、複数の保存部135のうち、数列2nに該当する塩基コード群の保存のための保存部に区分子5と関連付けて数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」を保存し、数列2n−1に該当する塩基コード群の保存のための保存部に区分子8と関連付けて数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXCX...」を保存することができる。
複数の塩基コード群の保存が完了すると、塩基配列受信部105は、解読した被検者の塩基配列をメモリから削除する(S113)。
そして、区分子割当部125は、出力装置などを通じて被検者に区分子情報を伝達する(S115)。
区分子割当部125が入力装置を通じて被検者から区分子情報に対する受信確認応答を正常に受信すると、区分子割当部125は、区分子情報をメモリから削除する(S117)。このように、区分子割当部125で区分子情報を削除することによって、遺伝子情報管理装置はそれ以上如何なる被検者に如何なる区分子が割り当てられたかに対する情報を有さず、ただし、保存部135に被検者と関係なしに塩基コード群が区分子と関連付けられて保存されている。
そして、区分子割当部125は、出力装置などを通じて被検者に区分子情報を伝達する(S115)。
区分子割当部125が入力装置を通じて被検者から区分子情報に対する受信確認応答を正常に受信すると、区分子割当部125は、区分子情報をメモリから削除する(S117)。このように、区分子割当部125で区分子情報を削除することによって、遺伝子情報管理装置はそれ以上如何なる被検者に如何なる区分子が割り当てられたかに対する情報を有さず、ただし、保存部135に被検者と関係なしに塩基コード群が区分子と関連付けられて保存されている。
次に、図3を参照して本発明の一実施形態に係る遺伝子情報照会方法について説明する。
図3は、本発明の一実施形態に係る遺伝子情報照会方法を示したフローチャートである。
図3を参照すれば、区分子受信部140は、入力装置を通じて被検者から複数の区分子から構成された区分子情報を受信する(S201)。
図3は、本発明の一実施形態に係る遺伝子情報照会方法を示したフローチャートである。
図3を参照すれば、区分子受信部140は、入力装置を通じて被検者から複数の区分子から構成された区分子情報を受信する(S201)。
塩基コード群収集部145は、各区分子に対応する保存部135で各区分子に対応する塩基コード群を照会して複数の区分子にそれぞれ対応する複数の塩基コード群を収集する(S203)。
塩基配列組み立て部150は、塩基配列の分離に用いられた特定規則により収集された複数の塩基コード群を組み立てて、区分子情報に該当する被検者の塩基配列を生成する(S205)。塩基配列組み立て部150は、塩基配列の分離に用いられた複数の数列に合わせて複数の塩基コード群を組み立てることができる。
塩基配列組み立て部150は、塩基配列の分離に用いられた特定規則により収集された複数の塩基コード群を組み立てて、区分子情報に該当する被検者の塩基配列を生成する(S205)。塩基配列組み立て部150は、塩基配列の分離に用いられた複数の数列に合わせて複数の塩基コード群を組み立てることができる。
照会対象塩基配列受信部155は、入力装置を通じて被検者から照会対象塩基配列を受信する(S207)。このような照会対象塩基配列は、特定遺伝子情報に対する塩基配列であって、例えば、特定疾病を誘発できる遺伝子情報に対する塩基配列でありうる。
比較部160は、塩基配列組み立て部150により組み立てられた塩基配列と照会対象塩基配列受信部155により受信された照会対象塩基配列とを比較して、組み立てられた塩基配列が照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断する(S209)。
出力部165は、組み立てられた塩基配列が照会対象塩基配列を含んでいるか否かに対する情報を出力した後(S211)、組み立てられた塩基配列をメモリから削除する(S213)。
比較部160は、塩基配列組み立て部150により組み立てられた塩基配列と照会対象塩基配列受信部155により受信された照会対象塩基配列とを比較して、組み立てられた塩基配列が照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断する(S209)。
出力部165は、組み立てられた塩基配列が照会対象塩基配列を含んでいるか否かに対する情報を出力した後(S211)、組み立てられた塩基配列をメモリから削除する(S213)。
図4は、本発明の一実施形態に係る塩基配列の整列、分離、区分子割当および保存を示す。
図4では、被検者Aの塩基配列(..AAGCATCC..)と被検者Bの塩基配列(..AAGCATGC..)とが例示される。標準塩基配列は「..ATGCATGC..」と仮定し、被検者の塩基配列の安全な保存のために2個の区分子のみを使用することを仮定するが、これに限定されない。
図4では、被検者Aの塩基配列(..AAGCATCC..)と被検者Bの塩基配列(..AAGCATGC..)とが例示される。標準塩基配列は「..ATGCATGC..」と仮定し、被検者の塩基配列の安全な保存のために2個の区分子のみを使用することを仮定するが、これに限定されない。
被検者Aの塩基配列のための最大共通塩基配列は、「GCAT」になるので、被検者Aの塩基配列は最大共通塩基配列(GCAT)に合わせて整列する。
以降、被検者Aの塩基配列(..AAGCATCC..)は、数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」と数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXCX...」とに分離され、2個の塩基コード群に区分子5と8がそれぞれ割り当てることができる。
数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」は、区分子5と関連付けられて第1保存部に保存され、数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXCX...」は、区分子8と関連付けられて第2保存部に保存される。
以降、被検者Aの塩基配列(..AAGCATCC..)は、数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」と数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXCX...」とに分離され、2個の塩基コード群に区分子5と8がそれぞれ割り当てることができる。
数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」は、区分子5と関連付けられて第1保存部に保存され、数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXCX...」は、区分子8と関連付けられて第2保存部に保存される。
また、被検者Bの塩基配列のための最大共通塩基配列は「GCATG」になるので、被検者Bの塩基配列は、最大共通塩基配列(GCATG)に合わせて整列する。
以降、被検者Bの塩基配列(..AAGCATGC..)は、数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」と数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXGX...」とに分離され、2個の塩基コード群に区分子3と6がそれぞれ割り当てることができる。
数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」は、区分子3と関連付けられて第1保存部に保存され、数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXGX...」は、区分子6と関連付けられて第2保存部に保存される。
以降、被検者Bの塩基配列(..AAGCATGC..)は、数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」と数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXGX...」とに分離され、2個の塩基コード群に区分子3と6がそれぞれ割り当てることができる。
数列2nに該当する塩基コード群「...XAXCXTXC...」は、区分子3と関連付けられて第1保存部に保存され、数列2n−1に該当する塩基コード群「...AXGXAXGX...」は、区分子6と関連付けられて第2保存部に保存される。
したがって、区分子受信部140が被検者Aから区分子5と8に該当する区分子情報を受信すると、塩基コード群収集部145は、保存部135で区分子5と8にそれぞれ対応する塩基コード群を収集することができる。塩基配列組み立て部150は、塩基配列の分離に用いられた特定規則、この場合、数列2nと2n−1により2個の塩基コード群を組み立てて被検者Aの塩基配列を生成する。そして、比較部160は、塩基配列組み立て部150で組み立てた被検者Aの塩基配列と照会対象塩基配列受信部155が受信した照会対象塩基配列とを比較して、被検者Aの塩基配列が照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断することができる。
このように本発明の一実施形態によると、被検者の複数の塩基コード群に対する区分子情報を正確に知っている場合には、被検者の塩基配列全体が正確に復旧され、照会され得るが、被検者の複数の塩基コード群に対する区分子情報を知らない場合には、たとえデータベースに保存された塩基配列全体情報がハッキングなどにより外部に流出しても塩基コード群の間のすべての組み合わせ結果が生物学的に存在可能な塩基配列に該当するため、被検者の実際の塩基配列を知ることができない。
また、被検者が自分の遺伝子情報に対する破棄を希望する場合、本人の複数の塩基コード群に対する区分子情報を自ら破棄することだけで本人の個人遺伝子情報をデータベース自体から削除するのと同一の効果を得ることができるため、強力な個人情報の保護手段を提供することができる。
以上で説明した本発明の実施形態は、通常の暗号化手段と組み合わせ得る。また、以上で説明した本発明の実施形態は、装置および方法を通じてのみ実現されるのではなく、本発明の実施形態の構成に対応する機能を実現するプログラムまたはそのプログラムが記録された記録媒体を通じて実現されることもでき、このような実現は、以上で説明した実施形態の記載から本発明が属する技術分野における通常の知識を有する者であれば簡単に実現することができる。
以上で本発明の実施形態について詳細に説明したが、本発明の権利範囲はこれに限定されるのではなく、特許請求の範囲で定義している本発明の基本概念を利用した当業者の多様な変形および改良形態も本発明の権利範囲に属する。
100 遺伝子情報管理装置
105 塩基配列受信部
110 最大共通塩基配列確認部
115 整列部
120 塩基コード群分離部
125 区分子割当部
130 保存制御部
135 保存部
140 区分子受信部
145 塩基コード群収集部
150 塩基配列組み立て部
155 照合対象塩基配列受信部
160 比較部
165 出力部
105 塩基配列受信部
110 最大共通塩基配列確認部
115 整列部
120 塩基コード群分離部
125 区分子割当部
130 保存制御部
135 保存部
140 区分子受信部
145 塩基コード群収集部
150 塩基配列組み立て部
155 照合対象塩基配列受信部
160 比較部
165 出力部
Claims (16)
- 解読した被検者の塩基配列を受信する塩基配列受信部と、
前記塩基配列を複数の塩基コード群に分離する塩基コード群分離部と、
前記複数の塩基コード群に複数の区分子をそれぞれ割り当てる区分子割当部と、
複数の保存部と、
前記複数の塩基コード群を対応する区分子と関連付けて前記複数の保存部にそれぞれ保存する保存制御部と、
を含む遺伝子情報管理装置。 - 前記塩基配列と標準塩基配列との間の共通した塩基配列区間に該当する最大共通塩基配列を確認する最大共通塩基配列確認部と、
前記最大共通塩基配列に合わせて前記標準塩基配列を基準に前記塩基配列を整列する整列部と、
をさらに含み、
前記塩基コード群分離部は、整列した塩基配列を前記複数の塩基コード群に分離する、請求項1に記載の遺伝子情報管理装置。 - 前記最大共通塩基配列は、前記共通した塩基配列区間中の最も長い区間に該当する、請求項2に記載の遺伝子情報管理装置。
- 前記塩基コード群分離部は、前記整列した塩基配列から複数の数列にそれぞれ該当する前記複数の塩基コード群を抽出する、請求項2に記載の遺伝子情報管理装置。
- 前記複数の数列は、重複した要素を有する、請求項4に記載の遺伝子情報管理装置。
- 前記複数の数列は、重複した要素を有さない、請求項4に記載の遺伝子情報管理装置。
- 前記区分子割当部は、乱数を生成して前記複数の区分子を生成し、前記複数の塩基コード群に前記複数の区分子をそれぞれ割り当てる、請求項1に記載の遺伝子情報管理装置。
- 前記塩基配列受信部は、前記複数の塩基コード群を前記複数の保存部に保存した後、前記被検者の塩基配列をメモリから削除し、
前記区分子割当部は、被検者に区分子情報を伝達した後、前記複数の区分子をメモリから削除する、請求項1に記載の遺伝子情報管理装置。 - 遺伝子情報管理装置で被検者の遺伝子情報を管理する方法であって、
解読した被検者の塩基配列を受信する段階と、
前記塩基配列を複数の塩基コード群に分離する段階と、
前記複数の塩基コード群に複数の区分子をそれぞれ割り当てる段階と、
前記複数の塩基コード群を対応する区分子と関連付けて複数の保存部にそれぞれ保存する段階と、
を含む遺伝子情報管理方法。 - 前記塩基配列と標準塩基配列との間の共通した塩基配列区間に該当する最大共通塩基配列を確認する段階と、
前記最大共通塩基配列に合わせて前記標準塩基配列を基準に前記塩基配列を整列する段階と、
をさらに含み、
前記複数の塩基コード群に分離する段階は、整列した塩基配列を前記複数の塩基コード群に分離する段階を含む、請求項9に記載の遺伝子情報管理方法。 - 前記整列した塩基配列を前記複数の塩基コード群に分離する段階は、前記整列した塩基配列から複数の数列にそれぞれ該当する前記複数の塩基コード群を抽出する段階を含む、請求項9に記載の遺伝子情報管理方法。
- 複数の区分子を含む被検者の区分子情報を受信する区分子受信部と、
塩基配列が分離されて形成された塩基コード群を区分子と関連付けて保存している複数の保存部と、
複数の保存部で前記複数の区分子にそれぞれ対応する複数の塩基コード群を収集する塩基コード群収集部と、
前記複数の塩基コード群を前記塩基配列の分離に用いられた規則により組み立てて被検者の塩基配列を生成する塩基配列組み立て部と、
照会対象塩基配列を受信する照会対象塩基配列受信部と、
前記被検者の塩基配列と前記照会対象塩基配列とを比較して、前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断する比較部と、
前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かに対する情報を出力する出力部と、
を含む遺伝子情報管理装置。 - 任意の塩基配列は、複数の数列により複数の塩基コード群に分離され、
前記規則は、前記複数の数列に該当する、請求項12に記載の遺伝子情報管理装置。 - 前記出力部は、前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かを出力した後、前記被検者の塩基配列をメモリから削除する、請求項12に記載の遺伝子情報管理装置。
- 遺伝子情報管理装置で被検者の遺伝子情報を管理する方法であって、
複数の区分子を含む被検者の区分子情報を受信する段階と、
複数の保存部で各区分子に対応する塩基コード群を照会して前記複数の区分子にそれぞれ対応する複数の塩基コード群を収集する段階と、
塩基配列を塩基コード群に分離することに用いられた規則により前記複数の塩基コード群を組み立てて被検者の塩基配列を生成する段階と、
照会対象塩基配列を受信する段階と、
前記被検者の塩基配列と前記照会対象塩基配列とを比較して、前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かを判断する段階と、
前記被検者の塩基配列が前記照会対象塩基配列を含んでいるか否かに対する情報を出力する段階と、
を含む遺伝子情報管理方法。 - 任意の塩基配列は、複数の数列により複数の塩基コード群に分離され、
前記規則は、前記複数の数列に該当する、請求項15に記載の遺伝子情報管理方法。
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