JP2015500472A - 生体分子の濃度を測定するための方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は全体として、神経性および神経変性の疾患、障害、および関連する過程を診断および治療するための方法に関する。
アルツハイマー病(AD)は、認知症の最も多い原因であり、公衆の健康問題を増加させている。それは、現在、米国では500万人を悩ませていると推定され、2050年までに1300万人に増加すると予測される(Herbertら、2001、Alzheimer Dis.Assoc.Disord.15(4):169-173(非特許文献1))。ADは、その他の中枢神経系(CNS)変性疾患のように、タンパク質の産生、蓄積、およびクリアランスの障害を特徴とする。ADの場合、タンパク質であるアミロイド-β(Aβ)の代謝の調節不全は、当該疾患を有する人々の脳におけるアミロイドプラークの形態でのこのタンパク質の大量の蓄積によって示される。さらに、タンパク質であるタウが、タウ濃縮体の形態で脳に蓄積する。ADは記憶、認知機能、および最終的には自立の喪失、ならびに死をもたらす。この疾患は、患者、家族および社会に重い個人的および経済的犠牲を課す。当該疾患の重症度および人口における罹患率の増加により、より良い治療の開発が急務である。
本発明は部分的に、生体分子の安定同位体標識が、生体分子の分子量に小さな差をもたらすが、生体分子の物理的または化学的特性を変化させないという発見に基づく。本明細書に提供される技術を使用して、生体分子を用いて神経性障害または神経変性障害を有するかまたは発病するリスクのある対象を診断および/または治療することができる。したがって、本発明は、対象における1つ以上の関心対象の生体分子の濃度を計算するために有用な方法およびキットを提供する。
(i)非標識の濃度=(標識に対する非標識の比)×(標識の濃度)
この等式は以下のように単純化してもよい。
(ii)非標識の濃度=(非標識:定量標準物質の比)×(定量標準物質の濃度)
(iii)標識の濃度=(非標識に対する標識の比)×(非標識の濃度)
(iv)標識2の濃度=(標識1に対する標識2の比)×(標識1の濃度)
(v)標識2の濃度=(標識1に対する標識2の比)×(標識1の濃度)
(vi)標識3の濃度=(標識1に対する標識3の比)×(標識1の濃度)
(vii)標識2の濃度=(標識1に対する標識2の比)×(標識1の濃度)
(viii)非標識の濃度=(標識1に対する非標識の比)×(標識1の濃度)
タウの代謝標識法
この実施例は、タウを産生する細胞が、安定同位体で標識したアミノ酸を、新たに合成されたタウに代謝的に取り込むことを説明する。
SISAQによるタウの定量化
13C6ロイシンで標識したタウを定量標準物質として使用し、5ng/mL〜51pg/mLの濃度のタウを含む、標準曲線の試料にスパイクした。その他に、定量標準物質を2つの別の個体由来のCSFにスパイクした。タウを、免疫沈降を使用して試料から単離し、その後、トリプシンで消化し、質量分析によって分析した。定量標準物質に対する非標識のタウの比を全サンプルについて計算し、標準曲線を生成した。標準曲線は、試験した範囲内(5ng/mL〜51pg/mL)では直線的であり、CSF試料中のタウの濃度を計算するために使用した。CSF試料中のタウの濃度は約1.2ng/mLであり、タウ濃度の三つ組の測定値のCVは、1つのCSF試料では4%、他のCSF試料では7%であった。
Claims (92)
- 以下のステップを含む、対象における生体分子の濃度を計算する方法:
(a)該対象由来の試料を、標識された既知濃度の関心対象の生体分子で構成される定量標準物質に接触させるステップ;
(b)該試料から該関心対象の生体分子を単離するステップであって、(a)および(b)が逆順に行われてもよい、ステップ;
(c)該試料中の非標識の生体分子に対する標識された生体分子の比を測定するステップ;ならびに
(d)該試料中の該非標識の生体分子の濃度を計算するステップ。 - 前記非標識の生体分子の濃度を計算するステップが、前記定量標準物質の前記既知濃度に、前記試料中の非標識の生体分子に対する標識された生体分子の比を掛けることを含む、請求項1に記載の方法。
- 計算された前記濃度を標準曲線に正規化するステップをさらに含み、該標準曲線が、定量標準物質に対する非標識の比を2つ以上測定することによって生成され、前記非標識の生体分子の濃度が既知である、請求項1に記載の方法。
- 前記定量標準物質が、1つ以上の標識された部分を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記1つ以上の標識された部分が、2H、13C、15N、17O、18O、33S、34S、および36Sから成る群から選択される非放射性同位体を含む、請求項4に記載の方法。
- 前記生体分子が、ペプチド、脂質、核酸、および炭水化物から成る群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記生体分子が、中枢神経系(CNS)で合成されるタンパク質である、請求項6に記載の方法。
- 前記ペプチドが、タウ、アミロイド-β(Aβ)、α-シヌクレイン、アポリポタンパク質E、アポリポタンパク質J、アミロイド前駆体タンパク質(APP)、α-2-マクログロブリン、S100B、ミエリン塩基性タンパク質、TDP-43、スーパーオキシドジスムターゼ1、ハンチンチン、インターロイキン、およびTNFから成る群から選択されるタンパク質である、請求項7に記載の方法。
- 前記標識された部分が、標識されたアミノ酸である、請求項4に記載の方法。
- 前記アミノ酸が必須アミノ酸または非必須アミノ酸である、請求項9に記載の方法。
- 前記必須アミノ酸または前記非必須アミノ酸が、スレオニン、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、およびフェニルアラニンから成る群から選択される、請求項10に記載の方法。
- 前記標識された部分が、x=1〜4である13Cx-スレオニンである、請求項4に記載の方法。
- 前記標識された部分が、x=1〜5である13Cx-グルタミン酸である、請求項4に記載の方法。
- 前記標識された部分が、x=1〜6である13Cx-ロイシンである、請求項4に記載の方法。
- 前記標識された部分が15Nで標識されたアミノ酸である、請求項4に記載の方法。
- 前記標識された部分が、x=1〜9である13Cxで標識されたフェニルアラニンである、請求項4に記載の方法。
- 前記標識された部分が、x=1〜6である13Cxで標識されたイソロイシンである、請求項4に記載の方法。
- 前記標識された部分が、x=1〜6およびy=1〜9である13Cxで標識されたイソロイシンおよび13Cyで標識されたフェニルアラニンである、請求項4に記載の方法。
- 前記試料を2つ以上の定量標準物質に接触させ、かつ、非標識の2つ以上の前記生体分子の濃度を計算する、請求項1に記載の方法。
- 前記2つ以上の生体分子が、同じタンパク質のアイソフォームである、請求項19に記載の方法。
- 前記生体分子が、タウ-4R2N、タウ-4R1N、タウ-4R0N、タウ-3R2N、タウ-3R1N、タウ-3R0Nから成る群から選択される、請求項10に記載の方法。
- 前記生体分子が、翻訳後修飾されたタウから成る群から選択される、請求項10に記載の方法。
- 前記試料が、脳脊髄液(CSF)、血液、血漿、尿、唾液、涙、および生物組織から成る群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記試料が、CSFであり、かつ、アミロイド-βタンパク質、アミロイド-βタンパク質の変異体、アミロイド-βタンパク質の消化産物、アミロイド前駆体タンパク質(APP)、アポリポタンパク質E、アポリポタンパク質J、タウ、α-シヌクレイン、α-2-マクログロブリン、S100B、ミエリン塩基性タンパク質、TDP-43、スーパーオキシドジスムターゼ1、ハンチンチン、インターロイキン、TNF、またはそれらの任意の組み合わせを含む、請求項23に記載の方法。
- 質量分析、タンデム質量分析、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される手段によって、前記試料中の前記非標識の生体分子に対する標識された生体分子の比を検出する、請求項1に記載の方法。
- 前記生体分子が、ペプチドであり、かつ、前記比を測定する前にエンドプロテアーゼで消化される、請求項25に記載の方法。
- 前記エンドプロテアーゼがトリプシン、LysN、またはV8プロテアーゼである、請求項26に記載の方法。
- 消化された前記ペプチドが、前記比を測定する前にクロマトグラフィー分離によって分離される、請求項26に記載の方法。
- 前記クロマトグラフィー分離が液体クロマトグラフィーまたはガスクロマトグラフィーを含む、請求項28に記載の方法。
- 前記生体分子が免疫沈降によって単離される、請求項1に記載の方法。
- 非標識の前記関心対象の生体分子の濃度を、対応する正常な試料中の同じ生体分子の濃度と、既知の神経性疾患状態もしくは神経変性疾患状態の対象における同じ生体分子の濃度と、以前の時点で測定された同じ対象由来の同じ生体分子の濃度と、またはそれらの任意の組み合わせと比較するステップをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記神経性疾患または前記神経変性疾患が、アルツハイマー病、パーキンソン病、卒中、前頭側頭型認知症(FTD)、ハンチントン舞踏病、進行性核上性麻痺(PSP)、皮質基底核変性症(CBD)、加齢が関連する障害および認知症、多発性硬化症、プリオン病、レビー小体病、ならびに筋萎縮性側索硬化症から成る群から選択される、請求項29に記載の方法。
- 以下のステップを含む、対象における1つ以上の生体分子の濃度を定量化するインビボ方法:
(a)該対象における関心対象の生体分子に取り込まれる1つ以上の標識されたアミノ酸を、該対象に投与するステップ;
(b)該対象から体液または生物組織の試料を得るステップであって、該試料が、標識された生体分子の画分および非標識の生体分子の画分を含む、ステップ;
(c)該試料を定量標準物質と接触させるステップであって、該対象に投与された該1つ以上の標識されたアミノ酸とは異なる分子量を有する部分で標識された、既知濃度の生体分子で、該定量標準物質が構成される、ステップ;
(d)該試料中の非標識の生体分子に対する標識された生体分子の比、該定量標準物質に対する標識された生体分子の比、および該定量標準物質に対する非標識の生体分子の比を測定するステップ;ならびに
(e)該試料中の該非標識の生体分子の濃度および該標識された生体分子の濃度を計算するステップ。 - 前記非標識の生体分子の濃度を計算するステップが、前記定量標準物質の濃度に、該定量標準物質に対する非標識の生体分子の測定された前記比を掛けることを含む、請求項33に記載の方法。
- 前記標識された生体分子の濃度を計算するステップが、前記定量標準物質の濃度に、該定量標準物質に対する標識された生体分子の測定された前記比を掛けることを含む、請求項33に記載の方法。
- 非標識の生体分子の計算された前記濃度を非標識の標準曲線に正規化するステップ、および、標識された生体分子の計算された前記濃度を標識された標準曲線に正規化するステップをさらに含み、該標準曲線のそれぞれが、定量標準物質に対する非標識の生体分子または標識された生体分子の比を2つ以上測定することによって生成され、非標識の生体分子または標識された生体分子の該濃度が既知である、請求項33に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸および前記定量標準物質が、2H、13C、15N、17O、18O、33S、34S、および36Sから成る群から選択される非放射性同位体で独立して標識されている、請求項33に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸が必須アミノ酸または非必須アミノ酸である、請求項37に記載の方法。
- 前記必須アミノ酸または前記非必須アミノ酸が、スレオニン、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、およびフェニルアラニンから成る群から選択される、請求項38に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸または前記定量標準物質が、x=1〜4である13Cx-スレオニンを含む、請求項37に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸または前記定量標準物質が、x=1〜5である13Cx-グルタミン酸を含む、請求項37に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸または前記定量標準物質が、x=1〜6である13Cx-ロイシンを含む、請求項37に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸または前記定量標準物質が、x=1〜6である13Cx-イソロイシンを含むか、または、x=1〜6およびy=1〜9である13Cxで標識されたイソロイシンおよび13Cyで標識されたフェニルアラニンを含む、請求項37に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸または前記定量標準物質が、x=1〜9である13Cx-フェニルアラニンを含む、請求項37に記載の方法。
- 前記定量標準物質が15Nを含む、請求項37に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸が経口的、静脈内、筋肉内、または皮下に投与される、請求項33に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸が単回経口用量として投与される、請求項46に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸が6〜12時間の間、1時間毎に投与される、請求項46に記載の方法。
- 前記標識されたアミノ酸が9〜12時間の間、1時間毎に投与される、請求項46に記載の方法。
- 前記生体分子が、ペプチド、脂質、核酸、および炭水化物から成る群から選択される、請求項33に記載の方法。
- 前記生体分子が、中枢神経系(CNS)で合成されるペプチドである、請求項50に記載の方法。
- 前記ペプチドが、アミロイド-β(Aβ)、α-シヌクレイン、タウ、アポリポタンパク質E、アポリポタンパク質J、アミロイド前駆体タンパク質(APP)、α-2-マクログロブリン、S100B、ミエリン塩基性タンパク質、TDP-43、スーパーオキシドジスムターゼ1、ハンチンチン、インターロイキン、およびTNFから成る群から選択されるタンパク質である、請求項51に記載の方法。
- 前記ペプチドがタウであり、かつ、前記定量標準物質が15Nで標識されたアミノ酸を含む、請求項50に記載の方法。
- 前記ペプチドがタウであり、かつ、前記定量標準物質が、x=1〜4である13Cx-スレオニンを含む、請求項50に記載の方法。
- 前記ペプチドがタウであり、かつ、前記定量標準物質が、x=1〜5である13Cx-グルタミン酸を含む、請求項50に記載の方法。
- 前記ペプチドがタウであり、かつ、前記定量標準物質が、x=1〜6である13Cx-ロイシンを含む、請求項50に記載の方法。
- 前記ペプチドがタウであり、かつ、前記定量標準物質が、x=1〜9である13Cxで標識されたフェニルアラニンを含む、請求項50に記載の方法。
- 前記ペプチドがタウであり、かつ、前記定量標準物質が、x=1〜6である13Cxで標識されたイソロイシンを含む、請求項50に記載の方法。
- 前記ペプチドがタウであり、かつ、前記定量標準物質が、x=1〜6およびy=1〜9である13Cxで標識されたイソロイシンと13Cyで標識されたフェニルアラニンの両方を含む、請求項50に記載の方法。
- 前記生体分子がタウであり、前記標識されたアミノ酸が13C6ロイシンであり、かつ、前記定量標準物質が13C6で標識されたイソロイシンと13C6で標識されたフェニルアラニンの両方を含む、請求項50に記載の方法。
- 2つ以上の標識されたアミノ酸の既知濃度を前記対象に投与し、かつ、1つ以上の生体分子の前記濃度を計算する、請求項33に記載の方法。
- 1つ以上の標識されたアミノ酸の既知濃度を前記対象に投与し、かつ、2つ以上の生体分子の前記濃度を計算する、請求項33に記載の方法。
- 前記2つ以上の生体分子が、同じタンパク質のアイソフォームである、請求項62に記載の方法。
- 前記生体分子が、タウ-4R2N、タウ-4R1N、タウ-4R0N、タウ-3R2N、タウ-3R1N、タウ-3R0Nから成る群から選択される、請求項63に記載の方法。
- 前記生体分子が、翻訳後修飾されたタウから成る群から選択される、請求項63に記載の方法。
- 前記試料が、脳脊髄液(CSF)、血液、血漿、尿、唾液、および涙から成る群から選択される、請求項33に記載の方法。
- 前記試料が、CSFであり、かつ、アミロイド-βタンパク質、アミロイド-βタンパク質の変異体、アミロイド-βタンパク質の消化産物、アミロイド前駆体タンパク質(APP)、アポリポタンパク質E、アポリポタンパク質J、タウ、α-シヌクレイン、α-2-マクログロブリン、S100B、ミエリン塩基性タンパク質、TDP-43、スーパーオキシドジスムターゼ1、ハンチンチン、インターロイキン、TNF、またはそれらの任意の組み合わせを含む、請求項66に記載の方法。
- 単一の事前に決められた時点で前記試料を得る、請求項66に記載の方法。
- 0〜12時間、0〜24時間、または0〜36時間の間、1時間毎に前記対象から前記試料を得る、請求項66に記載の方法。
- 質量分析、タンデム質量分析、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される手段によって、前記試料中の前記非標識の生体分子に対する標識された生体分子の比を検出する、請求項33に記載の方法。
- 前記生体分子が、ペプチドであり、かつ、前記比を測定する前にエンドプロテアーゼで消化される、請求項33に記載の方法。
- 前記エンドプロテアーゼがトリプシンまたはV8プロテアーゼである、請求項71に記載の方法。
- 消化された前記ペプチドが、前記比を測定する前にクロマトグラフィー分離によって分離される、請求項71に記載の方法。
- 前記クロマトグラフィー分離が液体クロマトグラフィーまたはガスクロマトグラフィーを含む、請求項73に記載の方法。
- 前記試料から前記関心対象の生体分子を単離するステップをさらに含む、請求項33に記載の方法。
- 前記関心対象の生体分子を免疫沈降によって単離する、請求項75に記載の方法。
- 非標識の前記関心対象の生体分子の濃度を、対応する正常な試料中の同じ生体分子の濃度と、既知の神経性疾患状態もしくは神経変性疾患状態の対象における同じ生体分子の濃度と、以前の時点で測定された同じ対象由来の同じ生体分子の濃度と、またはそれらの任意の組み合わせと比較するステップをさらに含む、請求項33に記載の方法。
- 前記神経性疾患または前記神経変性疾患が、アルツハイマー病、パーキンソン病、卒中、前頭側頭型認知症(FTD)、ハンチントン舞踏病、進行性核上性麻痺(PSP)、皮質基底核変性症(CBD)、加齢が関連する障害および認知症、多発性硬化症、プリオン病、レビー小体病、ならびに筋萎縮性側索硬化症から成る群から選択される、請求項77に記載の方法。
- 対象における神経性疾患または神経変性疾患の進行または治療を診断またはモニタリングするためのキットであって、
(a)1つ以上の標識されたアミノ酸;
(b)該1つ以上の標識されたアミノ酸を該対象に投与するための手段であって、それによって、該標識されたアミノ酸が、該対象における関心対象の生体分子に取り込まれ、かつ該生体分子を標識することができる、手段;
(c)一定の時間間隔で、該対象から生物試料を得るための手段であって、該試料が、標識された生体分子の画分および非標識の生体分子の画分を含む、手段;
(d)非標識の関心対象の生体分子に対する標識された生体分子の比を経時的に検出および測定するため、ならびに該試料中の該非標識の生体分子の濃度を計算するための説明書であって、それによって、該非標識の生体分子の濃度を、対応する正常な試料中の同じ生体分子の濃度と、既知の神経性疾患状態もしくは神経変性疾患状態の対象における同じ生体分子の濃度と、以前の時点で測定された同じ対象由来の同じ生体分子の濃度と、またはそれらの任意の組み合わせと比較することができる、説明書
を含む、キット。 - 前記標識されたアミノ酸が必須アミノ酸または非必須アミノ酸である、請求項79に記載のキット。
- 前記必須アミノ酸または前記非必須アミノ酸が、スレオニン、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、およびフェニルアラニンから成る群から選択される、請求項80に記載のキット。
- 前記標識されたアミノ酸が非放射性原子を含む、請求項79に記載のキット。
- 前記非放射性原子が、2H、13C、15N、17O、18O、33S、34S、および36Sから成る群から選択される、請求項82に記載のキット。
- 前記生体分子が、ペプチド、脂質、核酸、および炭水化物から成る群から選択される、請求項79に記載のキット。
- 前記生体分子が、中枢神経系(CNS)で合成されるペプチドである、請求項84に記載のキット。
- 前記ペプチドが、アミロイド-β(Aβ)、α-シヌクレイン、タウ、アポリポタンパク質E、アポリポタンパク質J、アミロイド前駆体タンパク質(APP)、α-2-マクログロブリン、S100B、ミエリン塩基性タンパク質、TDP-43、スーパーオキシドジスムターゼ1、ハンチンチン、インターロイキン、およびTNFから成る群から選択されるタンパク質である、請求項85に記載のキット。
- 1つ以上の追加の標識されたアミノ酸を前記対象に投与するための手段、ならびに、1つ以上の追加の生体分子の比および1つ以上の追加の生体分子の濃度を測定するための説明書をさらに含む、請求項79に記載のキット。
- 前記1つ以上の追加の生体分子が、同じタンパク質のアイソフォームである、請求項87に記載のキット。
- 前記試料中の前記非標識の生体分子に対する標識された生体分子の比を、質量分析、タンデム質量分析、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される手段によって検出される標識および非標識の生体分子の量から測定する、請求項79に記載のキット。
- 前記神経性疾患または前記神経変性疾患が、アルツハイマー病、パーキンソン病、卒中、前頭側頭型認知症(FTD)、ハンチントン舞踏病、進行性核上性麻痺(PSP)、皮質基底核変性症(CBD)、加齢が関連する障害および認知症、多発性硬化症、プリオン病、レビー小体病、ならびに筋萎縮性側索硬化症から成る群から選択される、請求項79に記載のキット。
- 前記タウタンパク質が、SEQ ID NO:1〜11から成る群から選択される、請求項86に記載のキット。
- 前記タウタンパク質が、SEQ ID NO:1〜11から成る群から選択される、請求項8、24、52、および67のいずれか一項に記載の方法。
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