JP2013521491A - 非蛍光性蛍光蛋白質を用いた遺伝毒性を判定するための方法 - Google Patents
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Abstract
【選択図】図4
Description
(a)変異(mutation)がある非蛍光性蛍光蛋白質をコードするヌクレオチド配列に細胞又は魚類を形質転換させる工程;
(b)上記形質転換された細胞又は魚類を試験物質で処理する工程;及び
(c)上記試験物質が処理された細胞又は魚類内の蛍光を測定する工程であって、前記蛍光が、前記試験物質で処理された魚類において、上記導入されたヌクレオチド配列の復帰変異(back mutation)により上記非蛍光性蛍光蛋白質が蛍光性蛋白質に変異されることにより発生する工程。
(a)本発明は、蛍光蛋白質変異体、好ましくは野生型EGFP変異体(EGFPmut)を用いた遺伝毒性を判定するための方法に関する。
(b)本発明によれば、本発明の蛍光蛋白質変異体、好ましくは野生型EGFP変異体が形質転換されたゼブラフィッシュ(Danio rerio)系統であるMutaFishシステムは試験物質処理により蛍光蛋白質変異体の復帰(reversion)が誘発された蛍光仔稚魚を生産して試験物質の遺伝毒性を測定できる非常に優れる動物システムを提供する。
(c)本発明のMutaFishシステムは、従来技術(例えば、エームステスト)の限界点であった真核生物で試験物質の遺伝毒性を非常に簡単で、かつ速かに判定することができる。
実験材料及び実験方法
サルモネラ株
エームステスト用S.チフィムリウム株であるTA98及びTAを購入して製造者の指示によって培養した(Xenometrix AG、Switzerland)。染色体の上にEGFPmut DNAを保有するCH4001及びCH4003株(表1)を実験結果に記載した通り製造した。
突然変異を誘発するプライマーを用いた位置指定突然変異誘発法(site directed mutagenesis)により非蛍光突然変異されたEGFPを得た。次のような4セットのプライマーを用いた:lacプロモーターの上流にpEGFP(Clontech Laboratories,Palo Alto,CA)(Yang,Cheng et al.,1996)のBamHI位置を含む正方向プライマー(プライマー1)及び停止コドンの下流にEcoRI位置を含む逆方向プライマー(プライマー4)(表2)。好ましい突然変異を含む第2セットのプライマー(プライマー2−x及びプライマー3−x)は必要な変異(change)を生産するためにデザインされた(Joseph Sambrook、2001)。EGFPmut1を製作するために、プライマー1及び3dを用いて最初のPCR(95℃、30秒間;55℃、30秒間;72℃、1分間)を実施し、プライマー2d及び4を用いて第2セットのPCR(95℃、30秒間;55℃、30秒間;72℃、1分間)を実施した。EGFPmut2を製作するために、プライマー1及び3aを用いて最初のPCR(95℃、30秒間;55℃、30秒間;72℃、1分間)を実施し、プライマー2a及び4を用いて第2セットのPCR(95℃、30秒間;55℃、30秒間;72℃、1分間)を実施した。EGFPmut3を製作するために、プライマー1及び3bを用いて最初のPCR(95℃、30秒間;55℃、30秒間;72℃、1分間)を実施し、プライマー2b及び4を用いて第2セットのPCR(95℃、30秒間;55℃、30秒間;72℃、1分間)を実施した。2つ反応のPCR産物を混合し、最適化してアニーリングさせ、以後、プライマー1及び4を用いた最終PCRのテンプルレートとして用いた。最終PCR産物をEcoR1及びBamH1で切断してpEGFP空ベクターに再ライゲーションさせた。前述したプラスミドはlacプロモーターの調節の下で非蛍光EGFP遺伝子を含んでいる。サルモネラ染色体にEGFPmut遺伝子を位置させるために、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)遺伝子をプラスミドのStuI位置に挿入させてpEGFPmut::CATプラスミドを作った(図1)。EGFPmutの配列変更は図2に記載されている。
EGFPmut DNAが染色体の終結(ter)部位から約5min位離れたputA位置を用いてサルモネラティフィムリウムLT2株の染色体に挿入された(Elliott、1992)。サルモネラエンテリカ血清型ティフィムリウムのputA位置の配列を含む次のプライマーを用いてlacP−EGFPmut::CAT DNAを増幅した:5’プライマー、5’−GAAATCGCCTGTTAATGGTA CCAATAGCCTTGACGCAATAGAGTAATGACTCACTCACTCATTAGGCACCCCAGGCTTT−3’及び3’プライマー、5’−CGTCATTGTCAGTCTCTTACAGAAAGATTACACGATTATTTCA TCGGCAGGAGACGCGTAGCACCAGGCGTTTAAG−3’。前述したプライマーは、pEGFPmut::CATプラスミドをテンプレートでlacP−nonEGFP::catに隣接した50−nt又は55−ntのputA(アンダーラインした配列)、及び25−nt配列又は22−nt配列で各々構成された。1.4−kbpのPCR産物を精製してレッドヘルパープラスミド(pKD46)を有するバクテリアに電気穿孔法により形質転換した(Datsenko and Wanner、2000)。線形DNAはエームステストのサルモネラティフィムリウム株であるTA100及びTA98でp22形質導入するためのマーカーとしてクロラムフェニコール遺伝子を含み、結果的にCH4001及びCH4003を各々製造した(Davis, et al.,1980)。
プレート−挿入アッセイ(plate−incorporation assay)を以前の記述したように実施した(OECD、1997)。簡略には、ストック溶液からバクテリア細胞を液体培地で12時間の間37℃で培養した。0.1mLのバクテリア懸濁液を0.6%アガー、0.6%NaCl、20.96μgのl−ヒスチジン及びd−バイオチン(Sigma)を含む2mLのトップアガー(Difco)培地に添加した。また、テスト溶液(又は、溶媒照合群、又は製剤陽性照合群)、及びS9−混合物(S9−mix;0.5mL/プレート;10v/v%S9;Sigma)、又はカリウムリン酸緩衝液(0.5mL/プレート;0.2M、pH7.4)(Sigma)をトップアガーに添加して混合した後、Vogel−Bonner最小培地アガープレートの塗抹した(処理実験群の場合、投与当たり独立的な3個の複製群及び溶媒照合群の場合、投与当たり独立的な6個の複製群)。コロニーを37℃で48時間の間培養した後、カウントした。プレートに添加されたテスト溶液の最も大きい容量は最初実験の場合100μLに制限し、再確認実験では200μLまで増加させた。
組成:1mLのS9−混合物は0.1mLのS9、0.01mLの0.4M MgCl2(Sigma)、0.01mLの1.65M KCl(Sigma)、0.5mLの0.2M phosphate buffer(pH7.4;Sigma)、0.04mLの0.1M NADP(Sigma)、0.005mLの1M glucose−6−phosphate(Sigma)及び0.335mLの蒸溜水を含んでいる。全ての補助因子(co−factor)は使用前に0.45−μmの滅菌膜(Millipore)を通して濾過した。
5mM 2−(N−モルフォリノ)エテインスルホン酸(pH6.0)(Sigma)で緩衝化した0.008% Instant Ocean salts(Senju Pharmaceutical,Hyogo,Japan)105.5mLにENU(isopack N−3385;Sigma Chemical Co.,St.Louis,MO,USA)1gを溶解させて81mM ENUのストック溶液を製造し、−80℃に格納した。2mg/mL ICR−191(Polyscience Inc.,Warrington、PA、USA)のストック溶液は10mLの滅菌蒸溜水に20mgのICR−191を溶解させて製作した。
pEGFPmut::CATプラスミド内のEGFPmut遺伝子を正方向プライマー(attB1)及び逆方向プライマー(attB2)を用いてPCR増幅した。プライマー配列は、次の通りである:5’−GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTCCACCATGGTGAGCAAGGGCGAG−3’(正方向);5’−GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTTGGCTGATTATGATCTAGAG−3’(逆方向)。増幅されたPCR産物をTo12プラスミドでゲートウェイクローニングしたが、EGFPmut遺伝子はCMVプロモーターにより発現された(To12キット:To12トランスポゾン形質転換コンストラクトのための多位置ゲートウェイ−基盤構築キット(Fisher,et al.,2006;Kwan,et al.,2007))。To12プラスミドは心臓−特異的CMLC2プロモーターにより調節されるmCherry遺伝子を保有するが、これは生殖系列伝逹の指示子として用いられる。最終的なコンストラクトであるpCMV−Mut−EGFP::pCMLC2−mCherry(図3)は、制限酵素切断及びDNAシーケンシングにより確認した。
前述した通り製作されたEGFPmutプラスミドはトランスポサーゼmRNAを有するAB*ゼブラフィッシュ系列(Oregon University、Corvallis、OR、USA)で作られた単一細胞段階受精卵にマイクロインジェクションされた。マイクロインジェクションされた受精卵は、性成熟(sexual maturity)が誘発され、野生型AB*ゼブラフィッシュと交配(mate)した。以後、生成された胚(embryos)の心臓でmCherry蛍光の存否に対してスクリーニングした。突然変異されたEGFPのゲノム組込み(挿入)を確認するために、スクリーンされた胚(F1)でRT−PCR、ウェスタンブロッティング及びサザンブロッティングを実施した。F1胚にまた性成熟が誘発され、互いに交配(mate)してEGFPmutに対して同型接合であるF2胚を発生させた。F2ゼブラフィッシュ間の交配を通じて発生したF3胚で再び性成熟を誘発した。
受精卵を、トランスジェニックF3雌及び非トランスジェニック雄フィッシュを交配して得た。本発明者らは相変らずコリオンで囲まれた24時間胚を3グループ(266胚/グループ)に分類した後、0.1% Instant Ocean salts(Senja Pharmaceutical,Hyogo,Japan)に含まれた0、2mM、又は5mM ENU 10mLで処理して30分間26℃で反応した。以後、突然変異誘発された胚をリンスし、28.5℃培養器で3日間維持した。ほとんど全ての胚が培養期間の間に孵化した。合わせられた生存稚魚を形態的な非正常稚魚とEGFP+稚魚をカウントした。
全ての分析をウィンドウ統計パッケージ用 SPSS version 11.0を用いて実施した。エームステストで得られた実験的な値に対する統計的分析は、母数的方法、即ちDunnett’s t−検定(Dunnett、1955;Dunnett、1964)、及び投与量に従う反応を観察した線形回帰分析(Kirkland、1994)により実施した。SCEテストの場合、一元変量分析(ANOVA)を実施した後、Student’s t−検定及びpost−hoc Dunnett’s t−検定を遂行した。TF分析はχ2−テストを用いて実施した。実施された全てのテストで≦0.05のp−値が統計的に留意性を有することと見なした。
非蛍光EGFPの製造
エームステストと遺伝的に類似のEGFPを用いた視覚的遺伝毒性テストシステムを作るための試みとして、本発明者らはエームステストで採択された2つの突然変異、hisG46(TA100)及びhisD6610(TA97)に注目した。hisG46突然変異はLeu(CTC)がPro(CCC)に置換された塩基対を有し、hisD6610突然変異はC1フレームシフト突然変異により6個のシトシン(−C−C−C−C−C−C−)をもたらす。これら突然変異は、反復的なC−G−C−G−C−G−C−G−配列のリーディングフレームに影響を及ぼすhisD3052(TA98)の−1フレームシフト突然変異を復帰させる幾つかの突然変異誘発因子に感受性がある(Isono and Yourno,1974;Levin,Yamasaki et al.,1982)。本発明者らはEGFPで類似の突然変異を誘発させて非蛍光蛋白質を作るために位置指定突然変異誘発法を用いた。まず、本発明者らはhisG46突然変異と類似するようにLeu137をProに置換した。このような置換は、突然変異EGFPを非蛍光蛋白質に変化させた(図4)。これをEGFPmut1と命名し、hisG46突然変異のように突然変異誘発因子により塩基対置換を検出できることと期待した。以後、本発明者らはGFPのコア構造で空のシリンダーを形成するβ−バレルに連結されたα−ヘリックスの部位(reviewed in Tsien、1998)に位置したGly51(GGG)の次にGly(GGG)が追加された更に他の突然変異EGFPを作った。これは、Gly51(GGG)の次に追加的なグリシンがEGFP分子にほとんど影響を及ぼさないので、蛍光蛋白質を生産する。図4は、追加的なGlyを持つEGFP蛋白質(EGFPmut2)が蛍光を発することを示す結果である。一方、フレームシフト突然変異のための6個のグアノシンを有する頻発部位(hot spot)DNA配列を製作した。したがって、5個のグアノシンを有するEGFPmut2から−1Gフレームシフト突然変異が誘発されてEGFPmut3が製作された。この場合、EGFP蛋白質翻訳がGly51以後の10番目のアミノ酸である62番目のアミノ酸で中断される。この蛋白質は非蛍光性を有するものと分かった(図4)。5個のグアノシンを保有するEGFPmut3はフレームシフト突然変異の検出に用いられる株であるhisD6610と類似するものと予想された。
次に、エームステストと類似の突然変異テスト株を確立するためにEGFPmut遺伝子を関連サルモネラティフィムリウムの染色体に移した。EGFPmut遺伝子が野生型サルモネラ(LT2)染色体の上のputAP位置(Elliott、1992)に入るようにλレッドシステムを用いた線形DNA形質転換方法(Datsenko and Wanner、2000)を実施した。一般的な形質導入ファージであるP22を用いてEGFPmut1及びEGFPmut3遺伝子を各々TA100及びTA98に挿入させてCH4001及びCH4003を製作した。
本発明者らはEGFPmutをコードするTo12プラスミド及びトランスポサーゼmRNAを単一細胞段階ゼブラフィッシュ受精卵に注入した。実験プロトコルに記載されたように、生殖系列伝達によるF1子孫をPCR及びサダンブロット分析により選択した。1つの高い導入遺伝子(transgene)−陽性系列を同定した。この系列のF3子孫をF2ゼブラフィッシュと非トランスジェニックゼブラフィッシュとを交配させて得た場合、F2ゼブラフィッシュはF3子孫ゼブラフィッシュの約50%に導入遺伝子を伝達したが、これは導入遺伝子が安定的にゼブラフィッシュ染色体のうちの1つに統合されることを表す。結果的に、本発明者らはEGFPmut1を保有するMutaFish1及びEGFPmut3を保有するMutaFish3を確立した。
EGFP復帰突然変異システムを用いるMutaFishシステムは遺伝毒性テストのための選択的動物テストを提供する。MutaFishシステムの最も大きい長所は遺伝毒性の視覚化ということができる:UV光の下でEGFP+稚魚の定量化は化学物質の遺伝毒性の反映であり、稚魚に対するいかなる追加的な操作も必要としない。医薬品を登録するための調節システムは遺伝毒性テストを実施する必要があるが(Billinton,Hastwell,et al.,2008;CPM/ICH 1995)、このようなテストはゲノムを損傷させたり、又は他の方法を通じてゲノムを修飾させて癌発病率(carcinogenicity)及び/又は遺伝性突然変異の危険を増加させる化合物を同定するために考案された。例え化学物質の環境的な危険を予測する多様な選択的接近方法が用いられるが、本発明者らは本研究でMutaFishが最も便利な動物アッセイシステムということを証明した。ゼブラフィッシュは利用可能な研究内容、技法、及び接近方法的な面で独特である。しかしながら、本発明でゼブラフィッシュに適用されたEGFPmutシステムを用いた本発明の視覚的技法はメダカ(medaka;Oryzias latipes)及びファットヘッドミノー(fathead Minnow;Pimephales promelas)のような他の実験モデルフィッシュ種にも適用できる。また、これら種の稚魚が稚魚/成魚に対する急性毒性テストを置換することができる方法として提案できる(Braunbeck,Boettcher,et al.,2005;Scholz,Fischer,et al.,2008)。
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Claims (21)
- 下記工程を含むことを特徴とする試験物質の遺伝毒性を判定するための方法:
(a)変異がある非蛍光性蛍光蛋白質をコードするヌクレオチド配列で魚類を形質転換させる工程と、
(b)前記形質転換された魚類を試験物質で処理する工程と、
(c)前記試験物質で処理された魚類内の蛍光を測定する工程であって、前記蛍光が、前記試験物質で処理された魚類において、前記導入されたヌクレオチド配列の復帰変異(back mutation)により前記非蛍光性蛍光蛋白質が蛍光性蛋白質に変異されることにより発生する工程。 - 蛍光性蛋白質は、GFP(green fluorescent protein)、RFP(red fluorescent protein)、CFP(cyan fluorescent protein)、YFP(yellow fluorescent protein)、BFP(blue fluorescent protein)、EGFP(enhanced green fluorescent protein)、ECFP(enhanced cyan fluorescent protein)、EYFP(enhanced yellow fluorescent protein)、ERFP(enhanced red fluorescent protein)、mCherry、mTomato、又はEBFP(enhanced blue fluorescent protein)である請求項1に記載の方法。
- 蛍光性蛋白質は、EGFPである請求項2に記載の方法。
- 変異がある非蛍光性蛍光蛋白質は、野生型蛍光蛋白質のヌクレオチド配列において(i)フレームシフト変異、又は(ii)ミスセンス変異を誘発する置換変異により変異された請求項1に記載の方法。
- 復帰変異は、フレームシフト変異がある非蛍光性蛍光蛋白質を蛍光性蛋白質に変異させる請求項4に記載の方法。
- 復帰変異は、置換変異がある非蛍光性蛍光蛋白質を蛍光性蛋白質に変異させる請求項4に記載の方法。
- 魚類は、ゼブラフィッシュである請求項1に記載の方法。
- 試験物質で処理される形質転換された魚類は、胚(embryo)である請求項1に記載の方法。
- 方法は、工程(b)以後、試験物質で処理された形質転換魚類の胚を培養して孵化させて仔稚魚(frylarvae)を得る工程をさらに含む請求項8に記載の方法。
- 工程(c)は、試験物質で処理された魚類に対してフローサイトメトリーにより実施される請求項1に記載の方法。
- 工程(c)は、試験物質で処理された胚を培養して孵化して得た仔稚魚に対してフローサイトメトリーにより実施される請求項9に記載の方法。
- 変異がある非蛍光性蛍光蛋白質をコードするヌクレオチド配列で形質転換された魚類を含み、前記形質転換された魚類を試験物質で処理して復帰変異(back mutation)が生じることを観察することを特徴とする遺伝毒性を判定するための組成物。
- 蛍光性蛋白質は、GFP、RFP、CFP、YFP、BFP、EGFP、ECFP、EYFP、ERFP、又はEBFPである請求項12に記載の組成物。
- 蛍光性蛋白質は、EGFPである請求項13に記載の組成物。
- 変異がある非蛍光性蛍光蛋白質は、野生型蛍光蛋白質のヌクレオチド配列において(i)フレームシフト変異、又は(ii)ミスセンス変異を誘発する置換変異により変異された請求項12に記載の組成物。
- 変異があるEGFP蛋白質は、配列番号1又は配列番号2のヌクレオチド配列によりコードされる請求項14に記載の組成物。
- 復帰変異は、フレームシフト変異がある非蛍光性蛍光蛋白質を蛍光性蛋白質に変異させる請求項15に記載の組成物。
- 復帰変異は、置換変異がある非蛍光性蛍光蛋白質を蛍光性蛋白質に変異させる請求項15に記載の組成物。
- 魚類は、ゼブラフィッシュである請求項12に記載の組成物。
- 形質転換された魚類は、胚(embryo)である請求項19に記載の組成物。
- EGFP変異体(EGFPmut)をコードする配列番号1又は配列番号2のヌクレオチド配列、又はそれらの相補的なヌクレオチド配列であることを特徴とするヌクレオチド配列。
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