JP2013505012A5

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Publication number: JP2013505012A5
Application number: JP2012529340A
Authority: JP
Filing date: 2010-09-21
Publication date: 2013-11-07
Anticipated expiration: 2030-09-21

Claims

細胞培養データを処理する方法であって、前記データは多数の試料の結果を含み、前記結果は前記各試料について細胞培養の複数の段階を順次実行することによって得られ、前記各段階は一組の特定条件をもつ細胞培養処理を表し、そのため前記各試料は前記細胞培養に適用された前記処理の固有性および順序によって定義される手順をたどり、
望ましい細胞培養成果を生み出した前記試料のサブセットを特定する工程と、
前記サブセット内の前記試料の前記結果をコンピュータで解析して前記結果を順序付けまたは分類する工程とを含み、前記結果を順序付けまたは分類する工程は前記望ましい細胞培養成果を得るために効果的な一つ以上の手順の特定に役立ち、前記順序付けまたは分類するための前記解析は異なる手順の間の類似性に関する情報を利用する、方法。
前記順序付けまたは分類するための前記解析は、前記各手順をたどる前記サブセットの試料の数をさらに利用する、請求項１に記載の方法。
前記異なる手順の間の前記類似性を評価する工程は、前記異なる手順の間の隔たりの程度を決定する工程を含む、請求項１または２に記載の方法。
前記異なる手順の間の前記隔たりの程度を決定する工程は、関心のある前記手順に共通の段階の数を数える工程を含む、請求項３に記載の方法。
前記隔たりの程度は、前記手順の個々の段階の処理の類似性の程度を与える、請求項３に記載の方法。
前記解析は前記サブセット内の前記各試料の記録を含む一組のデータに対して実行される、請求項１乃至５のいずれかに記載の方法。
前記各記録は、前記試料の識別子および前記試料に適用された前記手順に関する情報を含む、請求項６に記載の方法。
前記試料に適用された前記手順に関する前記情報は、前記試料に適用された前記処理の順序の一覧を含む、請求項７に記載の方法。
前記順序の一覧は二進列で表され、前記二進列の各桁は異なる段階の異なる処理に対応し、前記桁の値は前記処理がその特定の段階で前記試料に適用されたか否かを示す、請求項８に記載の方法。
前記結果を分類および順序付けする前記工程は、前記結果を集団化する工程を含む、請求項１乃至９のいずれかに記載の方法。
前記集団化する工程は階層的に集団化する工程を含む、請求項１０に記載の方法。
前記階層的に集団化する工程はウォード連鎖に基づく、請求項１１に記載の方法。
前記集団化する工程は自己組織化マップを含む、請求項１０に記載の方法。
前記分類および順序付けする工程を用いて追加検討のための細胞培養処理を特定する工程をさらに含む、請求項１乃至１３のいずれかに記載の方法。
前記特定した細胞培養処理を前記追加検討する工程をさらに含む、請求項１４に記載の方法。
前記方法は、望ましい細胞培養成果を生み出した試料の少なくとも前記サブセットの測定値を解析して、前記サブセット内の前記各試料用の前記手順を決定する工程をさらに含む、請求項１乃至１５のいずれかに記載の方法。
前記測定値によってその試料用の前記手順の信頼性のある決定ができない場合は、試料の前記結果を廃棄する工程をさらに含む、請求項１６に記載の方法。
前記測定値は流れ細胞測定または走査細胞測定によって得られて前記試料に関連する蛍光標識を識別し、異なる処理は前記試料に異なる蛍光標識を与える、請求項１６または１７に記載の方法。
前記望ましい細胞培養成果は一つ以上の試験に合格することによって決定され、結果の前記分類を解析する工程をさらに含んで前記一つ以上の試験に合格する試料の異なる分類を特定し、前記異なる分類は異なる細胞培養特性をもつ、請求項１乃至１８のいずれかに記載の方法。
前記異なる分類は異なる細胞表現型に対応する、請求項１９に記載の方法。
前記細胞培養の前記複数の段階を実行して処理のための結果を生成する工程をさらに含む、請求項１乃至２０のいずれかに記載の方法。
請求項１乃至２１のいずれかに記載の方法を実行するためのコンピュータプログラム。
請求項２２に記載の前記コンピュータプログラムをその中に保存したコンピュータで読み取り可能な持続性媒体。
細胞培養データを処理する方法を実行するコンピュータプログラムであって、前記データは多数の試料の結果を含み、前記結果は前記各試料について細胞培養の複数の段階を順次実行することによって得られ、前記各段階は一組の特定条件をもつ細胞培養処理を表し、そのため前記各試料は前記細胞培養に適用された前記処理の固有性および順序によって定義される手順をたどり、
望ましい細胞培養の成果を生み出した前記試料のサブセットを特定する工程と、
前記サブセット内の前記試料の前記結果をコンピュータで解析して前記結果を順序付けまたは分類する工程とを含み、前記結果を順序付けまたは分類する工程は前記望ましい細胞培養成果を得るために効果的な一つ以上の手順の特定に役立ち、前記順序付けまたは分類するための前記解析は異なる手順の間の類似性に関する情報を利用する、コンピュータプログラム。
請求項１乃至２１のいずれかに記載の方法を実行するように構成された装置。
細胞培養データを処理する装置であって、前記データは多数の試料の結果を含み、前記結果は前記各試料について細胞培養の複数の段階を順次実行することによって得られ、前記各段階は一組の特定条件をもつ細胞培養処理を表し、そのため前記各試料は前記細胞培養に適用された前記処理の固有性および順序によって定義される手順をたどり、
望ましい細胞培養成果を生み出した前記試料のサブセットを特定するデータを含む記憶装置と、
前記サブセット内の前記試料の前記結果をコンピュータで解析して前記結果を順序付けまたは分類するよう構成された演算素子とを備え、前記結果の順序付けまたは分類する工程は前記望ましい細胞培養の成果を得るために効果的な一つ以上の手順の特定に役立ち、前記順序付けまたは分類するための前記解析は異なる手順の間の類似性に関する情報を利用する、装置。
前記装置は前記試料を受け取り、前記結果を決定する測定システムをさらに備える、請求項２６に記載の装置。
前記測定システムは細胞測定システムを備える、請求項２７に記載の装置。
細胞培養データを処理する手段であって、前記データは多数の試料の結果を含み、前記結果は前記各試料について細胞培養の複数の段階を順次実行することによって得られ、前記各段階は一組の特定条件をもつ細胞培養処理を表し、そのため前記各試料は前記細胞培養に適用された前記処理の固有性および順序によって定義される手順をたどり、
望ましい細胞培養の成果を生み出した前記試料のサブセットを特定するデータを含む手段と、
前記サブセット内の前記試料の前記結果をコンピュータで解析して前記結果を順序付けまたは分類する手段とを備え、前記結果の順序付けまたは分類する工程は前記望ましい細胞培養の成果を得るために効果的な一つ以上の手順の特定に役立ち、前記順序付けまたは分類するための前記解析は異なる手順の間の類似性に関する情報を利用する、手段。