JP2012520072A - 組織特異的な加齢バイオマーカー - Google Patents
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Abstract
Description
Claims (56)
- ある種の多数の系統、種族又は民族において、事前に決定された有意性レベルで示差的に発現されるという基準を用いて、若齢の対象と比較して高齢の対象中の組織において示差的に発現される1つ又は複数の遺伝子を選択するステップを含む、選択された組織中の加齢の遺伝子発現マーカーを同定する方法。
- 前記選択される遺伝子が、3つ以上の系統、種族又は民族において示差的に発現される、請求項1に記載の方法。
- 前記選択される遺伝子が、5つ以上の系統、種族又は民族において示差的に発現される、請求項1に記載の方法。
- 前記選択される遺伝子が、試験される系統、種族又は民族の少なくとも50%において示差的に発現される、請求項1に記載の方法。
- 前記選択される遺伝子が、試験される系統、種族又は民族の少なくとも75%において示差的に発現される、請求項1に記載の方法。
- 組織が心臓、筋肉、脳又は脂肪組織である、請求項1に記載の方法。
- 有意性レベルがp<0.10、p<0.05、又はp<0.01である、請求項1に記載の方法。
- 若齢の対象と比較して高齢の対象において示差的に発現される遺伝子の示差的な発現が、カロリー制限によって少なくとも部分的に逆転されるという基準をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 若齢の対象と比較して高齢の対象において示差的に発現される遺伝子が、1つ又は複数の加齢関連の生理的機能に関連していることが知られている又は疑われるという基準をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 種がイヌ科又はネコ科である、請求項1に記載の方法。
- 若齢の対象と比較して高齢の対象中の選択された組織において示差的に発現される複数のポリヌクレオチドを含む組合せであって、前記選択された組織が心臓、脂肪、脳又は筋肉組織であり、前記ポリヌクレオチドが、表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片をコードしている遺伝子から選択される、組合せ。
- 前記選択された組織が心臓であり、前記ポリヌクレオチドが、Amy1、Apod、Bdh1、C3、Casq1、Ccl8、Kcnd2、Lcn2、Mt2、Myot、Pah、Prkcq、Serpina3n、Skap2、Tmem16k、及びVgll2のうちの2つ以上をコードしている遺伝子から選択される、請求項11に記載の組合せ。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記ポリヌクレオチドが、C3、Ccl8、Lcn2、Mt2、Pah、Prkcq、Serpina3n、Tmem16k、及びVgll2のうちの2つ以上をコードしている遺伝子から選択される、請求項12に記載の組合せ。
- 前記選択された組織が脂肪であり、前記ポリヌクレオチドが、Aspn、Clec4n、Col6a2、Col18a1、Cox8b、Crip2、Earl1、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、Slc6a13、及びSycp3のうちの2つ以上をコードしている遺伝子から選択される、請求項11に記載の組合せ。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記ポリヌクレオチドが、Aspn、Col6a2、Crip2、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、及びSlc6a13のうちの2つ以上をコードしている遺伝子から選択される、請求項14に記載の組合せ。
- 前記選択された組織が脳であり、前記ポリヌクレオチドが、Apod、B2m、C1qa、C1qb、Cd68、Clec7a、Cst7、Ctsd、Gfap、Il33、Lgals3、Lyzs、及びSpp1のうちの2つ以上をコードしている遺伝子から選択される、請求項11に記載の組合せ。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記ポリヌクレオチドが、Apod、B2m、C1qa、C1qb、Ctsd、Gfap、Il33、Lyzs、及びSpp1のうちの2つ以上をコードしている遺伝子から選択される、請求項16に記載の組合せ。
- 前記選択された組織が筋肉であり、前記ポリヌクレオチドが、C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Dusp26、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、Rhpn2、及びSyt9のうちの2つ以上をコードしている遺伝子から選択される、請求項11に記載の組合せ。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記ポリヌクレオチドが、C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、及びSyt9のうちの2つ以上をコードしている遺伝子から選択される、請求項18に記載の組合せ。
- 前記ポリヌクレオチドがイヌ科又はネコ科のポリヌクレオチドである、請求項11に記載の組合せ。
- 若齢の対象と比較して高齢の対象中の選択された組織において示差的な遺伝子発現を検出するための2つ以上のプローブを含む組成物であって、前記選択された組織が心臓、脂肪、脳又は筋肉組織であり、前記プローブが、
a)表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片をコードしている2つ以上の遺伝子と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチド、又は
b)表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片から選択される2つ以上のポリペプチドと特異的に結合するポリペプチド結合剤
を含む、組成物。 - ポリペプチド結合剤が抗体である、請求項21に記載の組成物。
- (a)前記選択された組織が心臓であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Amy1、Apod、Bdh1、C3、Casq1、Ccl8、Kcnd2、Lcn2、Mt2、Myot、Pah、Prkcq、Serpina3n、Skap2、Tmem16k、及びVgll2であり、(b)前記選択された組織が脂肪であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Aspn、Clec4n、Col6a2、Col18a1、Cox8b、Crip2、Earl1、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、Slc6a13、及びSycp3であり、(c)前記選択された組織が脳であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Apod、B2m、C1qa、C1qb、Cd68、Clec7a、Cst7、Ctsd、Gfap、Il33、Lgals3、Lyzs、及びSpp1であり、又は(d)前記選択された組織が筋肉であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Dusp26、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、Rhpn2、及びSyt9である、請求項21に記載の組成物。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、(a)C3、Ccl8、Lcn2、Mt2、Pah、Prkcq、Serpina3n、Tmem16k、及びVgll2、(b)Aspn、Col6a2、Crip2、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、及びSlc6a13、(c)Apod、B2m、C1qa、C1qb、Ctsd、Gfap、Il33、Lyzs、及びSpp1、又は(d)C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、及びSyt9である、請求項23に記載の組成物。
- 前記プローブが、イヌ科又はネコ科のポリヌクレオチド又はポリペプチドと特異的にハイブリダイズ又は結合する、請求項21に記載の組成物。
- 若齢の対象と比較して高齢の対象中の選択された組織において示差的な遺伝子発現を検出するための複数のプローブを含むアレイが固定された、固体担体を備えた装置であって、前記組織が心臓、脂肪、脳又は筋肉であり、前記プローブが、
a)表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片をコードしている2つ以上の遺伝子と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチド、又は
b)表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片から選択される2つ以上のポリペプチドと特異的に結合するポリペプチド結合剤
を含む、装置。 - ポリペプチド結合剤が抗体である、請求項26に記載の装置。
- (a)前記選択された組織が心臓であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Amy1、Apod、Bdh1、C3、Casq1、Ccl8、Kcnd2、Lcn2、Mt2、Myot、Pah、Prkcq、Serpina3n、Skap2、Tmem16k、及びVgll2であり、(b)前記選択された組織が脂肪であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Aspn、Clec4n、Col6a2、Col18a1、Cox8b、Crip2、Earl1、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、Slc6a13、及びSycp3であり、(c)前記選択された組織が脳であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Apod、B2m、C1qa、C1qb、Cd68、Clec7a、Cst7、Ctsd、Gfap、Il33、Lgals3、Lyzs、及びSpp1であり、又は(d)前記選択された組織が筋肉であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Dusp26、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、Rhpn2、及びSyt9である、請求項26に記載の装置。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、(a)C3、Ccl8、Lcn2、Mt2、Pah、Prkcq、Serpina3n、Tmem16k、及びVgll2、(b)Aspn、Col6a2、Crip2、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、及びSlc6a13、(c)Apod、B2m、C1qa、C1qb、Ctsd、Gfap、Il33、Lyzs、及びSpp1、又は(d)C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、及びSyt9である、請求項28に記載の装置。
- 前記プローブが、イヌ又はネコのポリヌクレオチド又はポリペプチドと特異的にハイブリダイズ又は結合する、請求項26に記載の装置。
- 標準又は若齢の対象と比較して高齢の対象中の選択された組織において示差的に発現される、1つ又は複数の遺伝子の示差的な発現を検出する方法であって、前記組織が心臓、脂肪、脳又は筋肉であり、前記方法は、
a)(i)表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片をコードしている2つ以上の遺伝子と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチド、又は(ii)表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片から選択される2つ以上のポリペプチドと特異的に結合するポリペプチド結合剤を含むプローブを用意するステップと、
b)プローブと試料中のmRNA又はタンパク質とのハイブリダイゼーション又は結合を可能にすることによって、試料中でハイブリダイゼーション又は結合複合体を形成するように、プローブを、高齢の対象由来のmRNA又はタンパク質を含む試料に加えるステップと、
c)任意選択で、プローブと第2の試料中のmRNA又はタンパク質とのハイブリダイゼーション又は結合を可能にすることによって、もう一方の試料中でハイブリダイゼーション又は結合複合体を形成するように、プローブを、若齢の対象由来のmRNA又はタンパク質を含む別の試料に加えるステップと、
d)試料又は複数の試料中のハイブリダイゼーション複合体を検出するステップと、
e)標準試料又は任意選択のもう一方の試料と比較した、試料中のハイブリダイゼーション又は結合の量の間の少なくとも1つの差異が、高齢の対象において示差的に発現される1つ又は複数の遺伝子の示差的な発現を示す、第1の試料からのハイブリダイゼーション又は結合複合体を、標準試料、又は任意選択でもう一方の試料のハイブリダイゼーション又は結合複合体とを、比較するステップと
を含む、方法。 - (a)前記選択された組織が心臓であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Amy1、Apod、Bdh1、C3、Casq1、Ccl8、Kcnd2、Lcn2、Mt2、Myot、Pah、Prkcq、Serpina3n、Skap2、Tmem16k、及びVgll2であり、(b)前記選択された組織が脂肪であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Aspn、Clec4n、Col6a2、Col18a1、Cox8b、Crip2、Earl1、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、Slc6a13、及びSycp3であり、(c)前記選択された組織が脳であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Apod、B2m、C1qa、C1qb、Cd68、Clec7a、Cst7、Ctsd、Gfap、Il33、Lgals3、Lyzs、及びSpp1であり、又は(d)前記選択された組織が筋肉であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Dusp26、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、Rhpn2、及びSyt9である、請求項31に記載の方法。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、(a)C3、Ccl8、Lcn2、Mt2、Pah、Prkcq、Serpina3n、Tmem16k、及びVgll2、(b)Aspn、Col6a2、Crip2、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、及びSlc6a13、(c)Apod、B2m、C1qa、C1qb、Ctsd、Gfap、Il33、Lyzs、及びSpp1、又は(d)C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、及びSyt9である、請求項32に記載の方法。
- 前記プローブが、イヌ科又はネコ科のポリヌクレオチド又はポリペプチドと特異的にハイブリダイズ又は結合する、請求項31に記載の方法。
- 前記プローブが基板と結合している、請求項31に記載の方法。
- 前記プローブがアレイ中にある、請求項35に記載の方法。
- 前記検出ステップが間隔を置いて行われ、少なくとも1つの選択された組織における動物の加齢プロセスを監視するために使用される、請求項31に記載の方法。
- 動物に投与された場合に試験物質が少なくとも1つの選択された組織において加齢プロセスの逆転又は遅延に有用である可能性が高いかどうかを決定する方法であって、
a)試験物質の非存在下で試験系において、表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片をコードしている遺伝子から選択される2つ以上のポリヌクレオチドの転写又は翻訳産物を測定することによって、第1の遺伝子発現プロファイルを決定するステップと、
b)試験物質の存在下で試験系において、表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片をコードしている遺伝子から選択される2つ以上のポリヌクレオチドの転写又は翻訳産物を測定することによって、第2の遺伝子発現プロファイルを決定するステップと、
c)第1の遺伝子発現プロファイルと、第2の遺伝子発現プロファイルとを比較するステップであって、第1の遺伝子発現プロファイルと比較した第2の遺伝子発現プロファイルの変化が、動物に投与された場合に試験物質が加齢プロセスの逆転又は遅延に有用である可能性が高いことを示す、ステップと
を含む、方法。 - 少なくとも第2の遺伝子発現プロファイルを、動物に投与された場合に少なくとも1つの選択された組織の加齢プロセスを逆転又は遅延させることが知られている参照物質の存在下で試験系において、表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片をコードしている遺伝子から選択される2つ以上のポリヌクレオチドの転写又は翻訳産物を測定することによって得られる参照遺伝子発現プロファイルと比較するステップをさらに含む、請求項38に記載の方法。
- (a)前記選択された組織が心臓であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Amy1、Apod、Bdh1、C3、Casq1、Ccl8、Kcnd2、Lcn2、Mt2、Myot、Pah、Prkcq、Serpina3n、Skap2、Tmem16k、及びVgll2であり、(b)前記選択された組織が脂肪であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Aspn、Clec4n、Col6a2、Col18a1、Cox8b、Crip2、Earl1、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、Slc6a13、及びSycp3であり、(c)前記選択された組織が脳であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Apod、B2m、C1qa、C1qb、Cd68、Clec7a、Cst7、Ctsd、Gfap、Il33、Lgals3、Lyzs、及びSpp1であり、又は(d)前記選択された組織が筋肉であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Dusp26、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、Rhpn2、及びSyt9である、請求項38に記載の方法。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、(a)C3、Ccl8、Lcn2、Mt2、Pah、Prkcq、Serpina3n、Tmem16k、及びVgll2、(b)Aspn、Col6a2、Crip2、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、及びSlc6a13、(c)Apod、B2m、C1qa、C1qb、Ctsd、Gfap、Il33、Lyzs、及びSpp1、又は(d)C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、及びSyt9である、請求項40に記載の方法。
- 試験系が培養細胞の集団を含む、請求項38に記載の方法。
- 試験系が動物を含む、請求項38に記載の方法。
- プローブが基質と結合している、請求項38に記載の方法。
- プローブがアレイ中にある、請求項38に記載の方法。
- 試料が、イヌ科又はネコ科由来のmRNA又はタンパク質を含有する、請求項38に記載の方法。
- 請求項38に記載の方法によって、動物に投与された場合に選択された組織において加齢プロセスを逆転又は遅延させる可能性が高いと同定される物質。
- 単一パッケージ中の別々の容器、又は仮想パッケージ中の別々の容器中に、若齢の対象と比較して高齢の対象中の選択された組織において示差的な遺伝子発現を検出するための2つ以上のプローブを含むキットであって、前記組織が心臓、脂肪、脳又は筋肉であり、前記プローブが、(a)表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片をコードしている2つ以上の遺伝子と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチド、又は(b)表2、表5、表8若しくは表10に記載のタンパク質、又はその断片から選択される2つ以上のポリペプチドと特異的に結合するポリペプチド結合剤を含み;前記キットは、(1)対象の選択された組織における示差的な遺伝子発現を検出するための遺伝子発現アッセイにおける前記プローブの使用法の指示、(2)前記プローブを使用するための試薬及び機器、並びに(3)対象に投与された場合に、選択された組織において加齢プロセスを逆転又は遅延させることが知られている組成物、のうちの少なくとも1つをさらに含む。
- (a)前記選択された組織が心臓であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Amy1、Apod、Bdh1、C3、Casq1、Ccl8、Kcnd2、Lcn2、Mt2、Myot、Pah、Prkcq、Serpina3n、Skap2、Tmem16k、及びVgll2であり、(b)前記選択された組織が脂肪であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Aspn、Clec4n、Col6a2、Col18a1、Cox8b、Crip2、Earl1、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、Slc6a13、及びSycp3であり、(c)前記選択された組織が脳であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、Apod、B2m、C1qa、C1qb、Cd68、Clec7a、Cst7、Ctsd、Gfap、Il33、Lgals3、Lyzs、及びSpp1であり、又は(d)前記選択された組織が筋肉であり、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Dusp26、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、Rhpn2、及びSyt9である、請求項48に記載のキット。
- 前記示差的な発現がカロリー制限によって逆転され、前記示差的に発現される遺伝子によってコードされているタンパク質が、(a)C3、Ccl8、Lcn2、Mt2、Pah、Prkcq、Serpina3n、Tmem16k、及びVgll2、(b)Aspn、Col6a2、Crip2、Emilin2、Otop1、Pla2g2d、Rhbdl3、及びSlc6a13、(c)Apod、B2m、C1qa、C1qb、Ctsd、Gfap、Il33、Lyzs、及びSpp1、又は(d)C4、Cdkn2c、Cds1、Col1a1、Col1a2、Col3a1、Edg2、Igh−6、Mt2、Plk2、及びSyt9である、請求項49に記載のキット。
- 前記プローブが、既知の位置で固体担体に固定されている、請求項48に記載のキット。
- ポリペプチド結合剤が抗体である、請求項48に記載のキット。
- 前記プローブが、イヌ科又はネコ科のポリヌクレオチド又はポリペプチドと結合又はハイブリダイズする、請求項48に記載のキット。
- 若齢の対象と比較して高齢の対象の選択された組織において示差的に発現される1つ又は複数のポリヌクレオチドの発現レベルを同定する情報を収容するデータベースと、ユーザがデータベース中の情報を入手又は操作することを可能にするユーザインターフェースとを含み、前記ポリヌクレオチドが、表2、表5、表8及び表10のいずれかに記載のタンパク質、又はその断片をコードしている遺伝子から選択される、コンピュータシステム。
- (1)若齢の対象と比較して高齢の対象の選択された組織において示差的に発現される遺伝子の発現の検出のために、表2、表5、表8若しくは表10のいずれかに記載のタンパク質をコードしているポリヌクレオチド、若しくはそれによってコードされているタンパク質、又はその断片を使用すること、(2)若齢の対象と比較して高齢の対象の選択された組織において示差的に発現される遺伝子の発現に対する試験物質の効果を測定するために、表2、表5、表8若しくは表10のいずれかに記載のタンパク質をコードしているポリヌクレオチド、若しくはそれによってコードされているタンパク質、又はその断片を使用すること、(3)若齢の対象と比較して高齢の対象の選択された組織において示差的に発現される遺伝子の発現を調節する可能性が高いかどうかを判定する試験物質をスクリーニングのために、表2、表5、表8若しくは表10のいずれかに記載のタンパク質をコードしているポリヌクレオチド、若しくはそれによってコードされているタンパク質、又はその断片を使用すること、(4)若齢の対象と比較して高齢の対象の選択された組織において示差的に発現される1つ又は複数の遺伝子の発現の調節のために、表2、表5、表8若しくは表10のいずれかに記載のタンパク質をコードしているポリヌクレオチド、若しくはそれによってコードされているタンパク質、又はその断片を使用すること、(5)若齢の対象と比較して高齢の対象の選択された組織において示差的に発現される1つ又は複数のポリヌクレオチドの発現レベルを同定する情報を収容するデータベースを含むコンピュータシステムの使用であって、前記ポリヌクレオチドが、表2、表5、表8若しくは表10のいずれかに記載のタンパク質又はその断片をコードしている遺伝子から選択される、使用、(6)表2、表5、表8又は表10のいずれかに記載のタンパク質をコードしている1つ又は複数の遺伝子の示差的な発現を引き起こす能力によって、動物に投与された場合に選択された組織において加齢プロセスの逆転又は遅延に有用である可能性が高いと同定された物質を投与すること、のうちの1つ又は複数に関する情報又は指示を通信する媒体であって、前記情報又は指示を含有する文書、デジタル記憶媒体、光学的記憶媒体、音声表現又は画像表示のうちの1つ又は複数を含む、媒体。
- 表示されるウェブサイト、キオスク、冊子、製品ラベル、添付文書、広告、ちらし、公示、オーディオテープ、ビデオテープ、DVD、CD、コンピュータで読取り可能なチップ、コンピュータで読取り可能なカード、コンピュータで読取り可能なディスク、コンピュータメモリ、又はそれらの組合せである、請求項55に記載の媒体。
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Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101576179B1 (ko) | 2013-03-22 | 2015-12-09 | 한국생명공학연구원 | 근육 노화 탐지 마커 및 이의 용도 |
JP2017197571A (ja) * | 2017-07-25 | 2017-11-02 | 株式会社Mcbi | 認知機能障害疾患のバイオマーカーおよび該バイオマーカーを用いる認知機能障害疾患の検出方法 |
JP2020511674A (ja) * | 2017-03-09 | 2020-04-16 | クリラ バイオテック ベー.フェー. | 細胞老化バイオマーカー |
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---|---|---|---|---|
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CN107385027B (zh) * | 2017-07-06 | 2020-11-03 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 | 筛查与肝脏衰老相关mRNA的基因芯片及其制备方法和应用 |
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CN111337688A (zh) * | 2020-03-31 | 2020-06-26 | 中国科学院昆明动物研究所 | 健康衰老血清蛋白标志物及应用 |
CN111380979A (zh) * | 2020-03-31 | 2020-07-07 | 中国科学院昆明动物研究所 | 健康老龄诊断标志物及应用 |
CN111424098A (zh) * | 2020-03-31 | 2020-07-17 | 中国科学院昆明动物研究所 | 基于特异性外周血dna甲基化位点的人类健康长寿标志物及应用 |
US11139064B1 (en) * | 2020-12-29 | 2021-10-05 | Kpn Innovations, Llc. | Systems and methods for generating a body degradation reduction program |
US20220208347A1 (en) * | 2020-12-29 | 2022-06-30 | Kpn Innovations, Llc. | Systems and methods for generating a body degradation reduction program |
CN114480618B (zh) * | 2022-01-12 | 2023-05-26 | 中山大学附属第一医院 | 一种用于预测男性生殖功能衰退的标志物及其应用 |
CN115044684A (zh) * | 2022-06-22 | 2022-09-13 | 四川大学华西医院 | lcn2基因作为生物标记物在检测Stat5基因是否缺失中的用途 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20060068438A1 (en) * | 2001-03-19 | 2006-03-30 | Prolla Tomas A | Identification of gene expression alterations underlying the aging process in mammals |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6408308B1 (en) * | 1998-01-29 | 2002-06-18 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | System and method for generating, analyzing and storing normalized expression datasets from raw expression datasets derived from microarray includes nucleic acid probe sequences |
EP1200629B1 (en) * | 1999-08-12 | 2008-01-16 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Identification of genetic markers of biological age and metabolism |
WO2003002712A2 (en) * | 2001-06-26 | 2003-01-09 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Gene expression alterations underlying the retardation of aging by caloric restriction in mammals |
US20050013776A1 (en) * | 2003-07-16 | 2005-01-20 | Spindler Stephen R. | Methods of evaluating the dynamics of caloric restriction and identifying caloric restriction mimetics |
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Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20060068438A1 (en) * | 2001-03-19 | 2006-03-30 | Prolla Tomas A | Identification of gene expression alterations underlying the aging process in mammals |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
JPN6014032530; Journal of Nutrition Vol.131, 2001, p.918S-923S * |
JPN6014032531; Cardiovascular Research Vol.66, 2005, p.205-212 * |
JPN6014032532; Mechanisms of Ageing and Development Vol.127, 2006, p.905-916 * |
JPN6014032533; Nucleic Acids Research Vol.30, No.17, 2002, p.3788-3794 * |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101576179B1 (ko) | 2013-03-22 | 2015-12-09 | 한국생명공학연구원 | 근육 노화 탐지 마커 및 이의 용도 |
JP2020511674A (ja) * | 2017-03-09 | 2020-04-16 | クリラ バイオテック ベー.フェー. | 細胞老化バイオマーカー |
JP2017197571A (ja) * | 2017-07-25 | 2017-11-02 | 株式会社Mcbi | 認知機能障害疾患のバイオマーカーおよび該バイオマーカーを用いる認知機能障害疾患の検出方法 |
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